View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF9495_1 (Length: 1110)

Name: NF9495_1
Description: NF9495
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF9495_1
NF9495_1
[»] chr2 (95 HSPs)
chr2 (539-974)||(27736869-27737297)
chr2 (12-237)||(27737322-27737547)
chr2 (235-514)||(13753934-13754213)
chr2 (242-498)||(13000912-13001168)
chr2 (235-513)||(26342559-26342837)
chr2 (236-501)||(14541311-14541576)
chr2 (235-513)||(41885604-41885882)
chr2 (233-514)||(34399179-34399460)
chr2 (235-513)||(10812178-10812456)
chr2 (236-513)||(11222302-11222579)
chr2 (242-514)||(44360420-44360691)
chr2 (235-514)||(15182986-15183265)
chr2 (247-510)||(43077283-43077546)
chr2 (231-513)||(15893566-15893848)
chr2 (236-514)||(31024925-31025203)
chr2 (242-498)||(478974-479231)
chr2 (236-501)||(14295755-14296020)
chr2 (252-501)||(32543785-32544034)
chr2 (246-514)||(9706778-9707045)
chr2 (234-513)||(35158337-35158616)
chr2 (256-514)||(3363584-3363842)
chr2 (242-513)||(37093436-37093706)
chr2 (236-513)||(19594331-19594607)
chr2 (242-514)||(25558171-25558440)
chr2 (236-513)||(34357158-34357435)
chr2 (236-499)||(9369954-9370217)
chr2 (236-511)||(13965587-13965862)
chr2 (245-508)||(30264593-30264856)
chr2 (236-432)||(32674191-32674391)
chr2 (236-513)||(32854768-32855043)
chr2 (244-513)||(36375559-36375830)
chr2 (236-499)||(11560047-11560310)
chr2 (243-433)||(2012848-2013038)
chr2 (236-514)||(13849700-13849978)
chr2 (236-513)||(14288411-14288686)
chr2 (236-513)||(13215373-13215650)
chr2 (233-470)||(15677321-15677557)
chr2 (233-501)||(28145569-28145838)
chr2 (236-514)||(4654699-4654977)
chr2 (12-149)||(27635589-27635726)
chr2 (243-498)||(36404842-36405098)
chr2 (243-514)||(38072217-38072482)
chr2 (236-514)||(1395544-1395821)
chr2 (288-510)||(10263788-10264010)
chr2 (254-514)||(4883601-4883861)
chr2 (12-132)||(21797800-21797920)
chr2 (12-132)||(21802954-21803074)
chr2 (246-514)||(34884523-34884791)
chr2 (265-480)||(6013484-6013699)
chr2 (288-497)||(38186054-38186263)
chr2 (295-513)||(14308434-14308650)
chr2 (242-475)||(37077156-37077389)
chr2 (310-513)||(31011704-31011905)
chr2 (12-116)||(44801760-44801864)
chr2 (235-476)||(29041931-29042167)
chr2 (242-514)||(8443677-8443936)
chr2 (232-501)||(4952694-4952954)
chr2 (247-400)||(34309149-34309301)
chr2 (262-501)||(7529702-7529942)
chr2 (234-373)||(14284106-14284245)
chr2 (243-441)||(25787324-25787522)
chr2 (288-513)||(37116589-37116804)
chr2 (369-510)||(3376266-3376407)
chr2 (250-398)||(30544514-30544662)
chr2 (270-385)||(25187241-25187356)
chr2 (290-441)||(38148094-38148244)
chr2 (233-438)||(33947490-33947695)
chr2 (243-508)||(28967222-28967486)
chr2 (236-475)||(45065052-45065291)
chr2 (242-334)||(37660130-37660222)
chr2 (158-237)||(26370530-26370609)
chr2 (19-85)||(15010872-15010938)
chr2 (388-513)||(25186816-25186941)
chr2 (242-514)||(838055-838327)
chr2 (405-513)||(34262808-34262916)
chr2 (242-410)||(42088880-42089048)
chr2 (155-231)||(10950159-10950234)
chr2 (232-410)||(928122-928298)
chr2 (274-383)||(2991829-2991937)
chr2 (260-412)||(18904007-18904150)
chr2 (358-438)||(34721564-34721644)
chr2 (629-708)||(27726730-27726808)
chr2 (249-480)||(3041557-3041784)
chr2 (351-402)||(36824486-36824537)
chr2 (290-516)||(37354023-37354249)
chr2 (290-383)||(42263619-42263712)
chr2 (254-328)||(28301670-28301744)
chr2 (297-410)||(1646390-1646503)
chr2 (339-392)||(20682902-20682955)
chr2 (295-395)||(14117661-14117761)
chr2 (406-513)||(1259615-1259722)
chr2 (440-507)||(32674635-32674702)
chr2 (364-475)||(37660845-37660956)
chr2 (423-508)||(29056179-29056264)
chr2 (971-1008)||(29750377-29750414)
[»] chr6 (64 HSPs)
chr6 (236-513)||(9838106-9838383)
chr6 (236-510)||(23777276-23777550)
chr6 (234-519)||(24663357-24663642)
chr6 (236-501)||(26470719-26470984)
chr6 (235-514)||(22050028-22050306)
chr6 (235-514)||(17193137-17193416)
chr6 (232-513)||(1751415-1751696)
chr6 (232-506)||(22784659-22784933)
chr6 (246-513)||(3621580-3621847)
chr6 (243-514)||(34378846-34379117)
chr6 (242-510)||(17123972-17124239)
chr6 (236-501)||(23923709-23923974)
chr6 (276-519)||(30416053-30416296)
chr6 (236-513)||(31244733-31245010)
chr6 (235-497)||(373702-373964)
chr6 (236-513)||(24356038-24356315)
chr6 (242-513)||(17251239-17251511)
chr6 (235-514)||(34607077-34607356)
chr6 (235-514)||(34730539-34730817)
chr6 (235-513)||(17835872-17836150)
chr6 (236-514)||(24635688-24635966)
chr6 (236-498)||(8176416-8176675)
chr6 (251-501)||(1249543-1249784)
chr6 (264-514)||(7056123-7056375)
chr6 (246-501)||(8992538-8992794)
chr6 (246-501)||(9016985-9017241)
chr6 (234-513)||(364526-364806)
chr6 (242-514)||(22400547-22400819)
chr6 (236-513)||(11676599-11676872)
chr6 (247-441)||(30236969-30237163)
chr6 (236-513)||(33260680-33260962)
chr6 (236-499)||(17601131-17601401)
chr6 (235-514)||(31854472-31854753)
chr6 (243-421)||(52650-52828)
chr6 (236-421)||(30388701-30388886)
chr6 (279-459)||(7235463-7235643)
chr6 (234-501)||(7632033-7632294)
chr6 (302-511)||(11128877-11129086)
chr6 (288-497)||(11431157-11431366)
chr6 (266-514)||(12732186-12732433)
chr6 (354-513)||(26485669-26485826)
chr6 (236-463)||(27313480-27313710)
chr6 (275-514)||(7170171-7170410)
chr6 (274-501)||(1923869-1924097)
chr6 (289-462)||(13597443-13597615)
chr6 (235-412)||(24948222-24948399)
chr6 (235-513)||(32359424-32359696)
chr6 (229-344)||(3849038-3849153)
chr6 (236-475)||(19811936-19812175)
chr6 (247-513)||(1252157-1252423)
chr6 (374-514)||(19645705-19645847)
chr6 (235-319)||(19645850-19645934)
chr6 (406-514)||(24949257-24949365)
chr6 (259-499)||(32250950-32251188)
chr6 (242-513)||(1135165-1135430)
chr6 (247-438)||(11000868-11001059)
chr6 (236-501)||(15432651-15432915)
chr6 (373-513)||(3850437-3850577)
chr6 (322-397)||(7632509-7632584)
chr6 (235-438)||(2381068-2381271)
chr6 (295-410)||(30734542-30734657)
chr6 (452-513)||(30388962-30389023)
chr6 (432-511)||(53807-53886)
chr6 (447-513)||(30237431-30237496)
[»] chr1 (111 HSPs)
chr1 (236-514)||(35700354-35700632)
chr1 (236-516)||(10506793-10507071)
chr1 (242-513)||(32347964-32348234)
chr1 (246-513)||(30686401-30686668)
chr1 (233-514)||(32168291-32168572)
chr1 (246-514)||(13507760-13508028)
chr1 (246-514)||(13514948-13515216)
chr1 (236-510)||(19929449-19929723)
chr1 (233-513)||(35531275-35531555)
chr1 (236-514)||(21927677-21927953)
chr1 (235-513)||(37609284-37609559)
chr1 (236-510)||(9361953-9362227)
chr1 (243-513)||(13699161-13699431)
chr1 (236-514)||(37437032-37437310)
chr1 (242-499)||(45226571-45226828)
chr1 (234-514)||(51613389-51613669)
chr1 (234-500)||(15660565-15660831)
chr1 (247-501)||(30702282-30702536)
chr1 (236-513)||(10675882-10676159)
chr1 (235-513)||(32994450-32994731)
chr1 (235-514)||(13566655-13566937)
chr1 (243-499)||(35255473-35255729)
chr1 (243-514)||(35483760-35484029)
chr1 (242-513)||(38648443-38648714)
chr1 (246-513)||(43500496-43500763)
chr1 (235-513)||(45368067-45368345)
chr1 (236-485)||(19455408-19455655)
chr1 (242-514)||(19349358-19349630)
chr1 (242-514)||(36318339-36318610)
chr1 (243-513)||(18033806-18034076)
chr1 (234-513)||(31588720-31588998)
chr1 (236-514)||(38597570-38597849)
chr1 (235-513)||(1429263-1429541)
chr1 (242-501)||(9127653-9127914)
chr1 (235-513)||(18344305-18344583)
chr1 (235-513)||(50825553-50825830)
chr1 (235-514)||(31570616-31570895)
chr1 (236-510)||(51974154-51974428)
chr1 (228-499)||(48508105-48508376)
chr1 (243-514)||(1024543-1024814)
chr1 (242-513)||(20605604-20605875)
chr1 (236-507)||(44182740-44183009)
chr1 (251-521)||(4100881-4101151)
chr1 (247-501)||(7782942-7783195)
chr1 (234-498)||(52748995-52749257)
chr1 (236-499)||(28679001-28679264)
chr1 (250-510)||(31487762-31488022)
chr1 (245-498)||(51972276-51972529)
chr1 (232-514)||(1677192-1677456)
chr1 (242-509)||(52649713-52649980)
chr1 (236-513)||(37735119-37735396)
chr1 (248-507)||(43808890-43809155)
chr1 (289-513)||(12124677-12124901)
chr1 (323-513)||(29830820-29831010)
chr1 (242-513)||(17013408-17013683)
chr1 (236-513)||(40926733-40927000)
chr1 (235-499)||(49908173-49908440)
chr1 (242-510)||(48174656-48174923)
chr1 (242-441)||(43952774-43952973)
chr1 (283-501)||(46096576-46096791)
chr1 (236-457)||(48265072-48265293)
chr1 (244-513)||(12721428-12721697)
chr1 (321-513)||(12231051-12231243)
chr1 (243-506)||(49497139-49497402)
chr1 (246-475)||(8008188-8008414)
chr1 (236-501)||(1427660-1427924)
chr1 (242-441)||(44818440-44818639)
chr1 (331-513)||(2059792-2059974)
chr1 (236-421)||(38817997-38818177)
chr1 (235-357)||(8464585-8464707)
chr1 (251-501)||(36850640-36850882)
chr1 (349-513)||(8464237-8464401)
chr1 (245-501)||(42800097-42800351)
chr1 (311-421)||(24781806-24781916)
chr1 (242-355)||(19093254-19093367)
chr1 (236-476)||(37296745-37296982)
chr1 (244-502)||(1038071-1038333)
chr1 (244-502)||(1044977-1045239)
chr1 (242-514)||(52759014-52759286)
chr1 (247-353)||(5597814-5597920)
chr1 (380-514)||(35605722-35605856)
chr1 (331-501)||(39412503-39412673)
chr1 (344-506)||(5598143-5598295)
chr1 (246-441)||(50152423-50152618)
chr1 (235-441)||(1039420-1039625)
chr1 (235-441)||(1046326-1046531)
chr1 (370-501)||(1428519-1428650)
chr1 (242-353)||(35605444-35605555)
chr1 (155-237)||(20491569-20491651)
chr1 (290-475)||(11248815-11249000)
chr1 (301-501)||(8973444-8973643)
chr1 (298-450)||(42787329-42787481)
chr1 (318-513)||(33720579-33720774)
chr1 (242-318)||(1428205-1428281)
chr1 (245-403)||(1859084-1859240)
chr1 (290-380)||(52825311-52825401)
chr1 (301-501)||(2572016-2572215)
chr1 (340-498)||(38569616-38569773)
chr1 (452-510)||(42787136-42787194)
chr1 (172-237)||(13246499-13246563)
chr1 (278-375)||(51064796-51064893)
chr1 (447-498)||(1039067-1039118)
chr1 (447-498)||(1045973-1046024)
chr1 (229-270)||(2626785-2626826)
chr1 (295-410)||(321729-321844)
chr1 (295-410)||(40783716-40783831)
chr1 (295-410)||(47037911-47038026)
chr1 (295-373)||(23526379-23526457)
chr1 (303-389)||(49756678-49756764)
chr1 (243-300)||(2571936-2571993)
chr1 (345-406)||(22154694-22154755)
[»] chr8 (134 HSPs)
chr8 (236-509)||(43553020-43553292)
chr8 (243-476)||(12763422-12763654)
chr8 (230-514)||(14263518-14263802)
chr8 (236-513)||(15596324-15596601)
chr8 (229-513)||(23429882-23430166)
chr8 (242-501)||(9954635-9954894)
chr8 (242-514)||(18842516-18842787)
chr8 (235-513)||(167460-167738)
chr8 (237-513)||(33935043-33935319)
chr8 (235-500)||(34046830-34047095)
chr8 (235-515)||(34981808-34982088)
chr8 (227-513)||(38482775-38483055)
chr8 (236-513)||(2888451-2888728)
chr8 (236-514)||(35052033-35052311)
chr8 (236-513)||(14061132-14061409)
chr8 (233-513)||(6757383-6757663)
chr8 (246-513)||(35296034-35296301)
chr8 (236-513)||(39303498-39303776)
chr8 (236-514)||(23855536-23855815)
chr8 (243-514)||(7483731-7484000)
chr8 (242-514)||(10180356-10180628)
chr8 (246-514)||(13173919-13174187)
chr8 (242-514)||(23848538-23848810)
chr8 (235-514)||(36058212-36058490)
chr8 (235-513)||(18291443-18291720)
chr8 (280-514)||(26740119-26740353)
chr8 (235-474)||(17718482-17718721)
chr8 (242-527)||(38128516-38128794)
chr8 (236-514)||(8730811-8731087)
chr8 (235-513)||(25703561-25703838)
chr8 (288-513)||(12248753-12248978)
chr8 (235-512)||(26062687-26062963)
chr8 (288-501)||(43641984-43642197)
chr8 (236-514)||(8553998-8554276)
chr8 (235-513)||(14228305-14228583)
chr8 (243-501)||(2335420-2335678)
chr8 (235-513)||(25812732-25813009)
chr8 (243-515)||(8453217-8453486)
chr8 (288-506)||(1245344-1245562)
chr8 (236-513)||(3720660-3720937)
chr8 (236-513)||(21651729-21652006)
chr8 (250-510)||(12342600-12342860)
chr8 (292-514)||(32010066-32010288)
chr8 (236-513)||(45281361-45281638)
chr8 (234-510)||(17074568-17074842)
chr8 (234-510)||(17573428-17573702)
chr8 (236-513)||(38221793-38222069)
chr8 (235-499)||(16656680-16656943)
chr8 (261-501)||(40228300-40228540)
chr8 (290-513)||(27911655-27911878)
chr8 (290-513)||(27958074-27958297)
chr8 (236-513)||(19972260-19972536)
chr8 (236-513)||(21020297-21020573)
chr8 (233-429)||(6750592-6750788)
chr8 (243-403)||(13327766-13327926)
chr8 (235-421)||(11707560-11707742)
chr8 (235-478)||(40603869-40604112)
chr8 (247-514)||(11993884-11994139)
chr8 (235-501)||(31028633-31028898)
chr8 (276-514)||(35498053-35498290)
chr8 (236-480)||(27518729-27518967)
chr8 (247-501)||(7605895-7606146)
chr8 (242-400)||(16700989-16701147)
chr8 (246-513)||(23793254-23793525)
chr8 (288-501)||(4057320-4057533)
chr8 (288-499)||(1202441-1202652)
chr8 (236-421)||(43553318-43553503)
chr8 (235-513)||(11163245-11163523)
chr8 (243-501)||(33314530-33314789)
chr8 (242-513)||(38074262-38074532)
chr8 (349-513)||(35029640-35029803)
chr8 (243-513)||(9687497-9687752)
chr8 (233-401)||(40521337-40521506)
chr8 (289-438)||(15647457-15647606)
chr8 (341-513)||(36111926-36112096)
chr8 (248-514)||(14511411-14511686)
chr8 (288-514)||(41701464-41701690)
chr8 (289-438)||(15623669-15623818)
chr8 (244-441)||(41890510-41890707)
chr8 (289-457)||(3513390-3513558)
chr8 (236-501)||(13132113-13132376)
chr8 (274-499)||(39615450-39615674)
chr8 (288-514)||(2456097-2456318)
chr8 (283-441)||(9808029-9808187)
chr8 (413-507)||(31964726-31964820)
chr8 (289-441)||(35051879-35052031)
chr8 (243-410)||(43553536-43553704)
chr8 (338-513)||(41643473-41643648)
chr8 (234-501)||(45317630-45317897)
chr8 (242-501)||(15281379-15281624)
chr8 (242-501)||(15461748-15461993)
chr8 (230-501)||(6660927-6661198)
chr8 (230-501)||(6741329-6741600)
chr8 (346-514)||(8672584-8672752)
chr8 (243-475)||(8954720-8954952)
chr8 (235-367)||(41305623-41305755)
chr8 (374-513)||(41308013-41308153)
chr8 (243-441)||(9301598-9301794)
chr8 (159-237)||(10544034-10544112)
chr8 (305-403)||(17313126-17313224)
chr8 (242-351)||(8672288-8672397)
chr8 (236-378)||(13935194-13935336)
chr8 (251-501)||(10086151-10086398)
chr8 (236-475)||(29125882-29126120)
chr8 (290-499)||(42352773-42352980)
chr8 (407-513)||(13328121-13328227)
chr8 (433-498)||(29091083-29091148)
chr8 (243-343)||(35028595-35028693)
chr8 (29-93)||(4167950-4168014)
chr8 (244-497)||(30205448-30205697)
chr8 (236-441)||(27193108-27193313)
chr8 (163-237)||(96201-96275)
chr8 (265-375)||(28568056-28568166)
chr8 (265-375)||(28575649-28575759)
chr8 (443-513)||(35052309-35052379)
chr8 (444-501)||(1739881-1739938)
chr8 (871-919)||(14684328-14684376)
chr8 (423-499)||(39663945-39664021)
chr8 (290-441)||(40602812-40602963)
chr8 (244-327)||(40608022-40608106)
chr8 (295-410)||(43275458-43275573)
chr8 (396-513)||(17313282-17313399)
chr8 (19-85)||(29516077-29516147)
chr8 (295-410)||(7147016-7147131)
chr8 (295-410)||(11174282-11174397)
chr8 (432-499)||(11707451-11707518)
chr8 (290-441)||(11727617-11727768)
chr8 (264-375)||(26628844-26628955)
chr8 (295-410)||(40058362-40058477)
chr8 (295-410)||(40918790-40918905)
chr8 (443-514)||(43552950-43553021)
chr8 (431-501)||(10077196-10077266)
chr8 (265-375)||(28562559-28562669)
chr8 (265-367)||(45400799-45400901)
[»] chr7 (94 HSPs)
chr7 (246-513)||(33257871-33258138)
chr7 (236-513)||(12838064-12838341)
chr7 (234-498)||(35112407-35112671)
chr7 (234-508)||(26723902-26724177)
chr7 (243-514)||(42841851-42842122)
chr7 (236-514)||(31430539-31430817)
chr7 (236-513)||(33099821-33100096)
chr7 (237-513)||(30866722-30866998)
chr7 (246-513)||(10227246-10227513)
chr7 (251-513)||(7312612-7312874)
chr7 (236-514)||(32528313-32528591)
chr7 (245-509)||(36922228-36922493)
chr7 (236-510)||(32966038-32966312)
chr7 (236-501)||(18470287-18470552)
chr7 (233-501)||(35746643-35746910)
chr7 (246-513)||(33173797-33174064)
chr7 (234-514)||(28608573-28608852)
chr7 (243-510)||(31815058-31815322)
chr7 (250-498)||(36298175-36298423)
chr7 (247-510)||(22950807-22951070)
chr7 (243-441)||(41889375-41889573)
chr7 (236-501)||(3837842-3838107)
chr7 (243-463)||(20035035-20035255)
chr7 (243-463)||(20045446-20045666)
chr7 (234-480)||(44480161-44480407)
chr7 (235-444)||(17896578-17896787)
chr7 (250-463)||(26632216-26632428)
chr7 (245-513)||(41891258-41891527)
chr7 (234-514)||(18194199-18194479)
chr7 (251-510)||(36406746-36407008)
chr7 (236-513)||(3310196-3310462)
chr7 (234-499)||(7477198-7477463)
chr7 (236-513)||(33921760-33922037)
chr7 (247-499)||(29497534-29497786)
chr7 (243-514)||(8264934-8265207)
chr7 (242-489)||(46285855-46286102)
chr7 (233-514)||(41675172-41675452)
chr7 (280-478)||(36648026-36648224)
chr7 (235-499)||(31398932-31399195)
chr7 (233-501)||(43874081-43874348)
chr7 (242-510)||(24283568-24283833)
chr7 (305-513)||(5732059-5732267)
chr7 (242-514)||(29722290-29722561)
chr7 (370-513)||(47408227-47408370)
chr7 (232-501)||(3177906-3178175)
chr7 (245-513)||(47459633-47459895)
chr7 (331-514)||(8381901-8382084)
chr7 (236-513)||(1553495-1553770)
chr7 (242-478)||(45324014-45324243)
chr7 (234-513)||(8965886-8966165)
chr7 (236-402)||(6799103-6799270)
chr7 (242-507)||(46563115-46563380)
chr7 (236-501)||(19327789-19328049)
chr7 (295-462)||(22057447-22057620)
chr7 (245-480)||(37353889-37354113)
chr7 (321-513)||(38168774-38168967)
chr7 (341-514)||(8380577-8380750)
chr7 (288-501)||(34368658-34368870)
chr7 (235-403)||(42880946-42881114)
chr7 (236-514)||(48981364-48981643)
chr7 (283-510)||(44820596-44820813)
chr7 (242-441)||(17354084-17354283)
chr7 (236-506)||(9601886-9602156)
chr7 (236-506)||(9829457-9829727)
chr7 (246-475)||(26803454-26803683)
chr7 (234-420)||(22382153-22382339)
chr7 (236-410)||(30586765-30586939)
chr7 (245-393)||(36339303-36339453)
chr7 (246-344)||(2408817-2408914)
chr7 (390-501)||(24233668-24233779)
chr7 (380-495)||(41409872-41409987)
chr7 (244-382)||(33071894-33072032)
chr7 (443-513)||(41888980-41889050)
chr7 (236-296)||(47408118-47408178)
chr7 (427-498)||(41408793-41408864)
chr7 (290-441)||(46715360-46715511)
chr7 (233-319)||(13431311-13431397)
chr7 (435-513)||(17896477-17896555)
chr7 (423-501)||(36340553-36340631)
chr7 (290-501)||(9142262-9142470)
chr7 (290-507)||(35860001-35860216)
chr7 (230-309)||(8921020-8921099)
chr7 (19-85)||(28394148-28394217)
chr7 (352-397)||(35684249-35684294)
chr7 (295-410)||(27813914-27814029)
chr7 (295-410)||(36453183-36453298)
chr7 (235-281)||(5732273-5732319)
chr7 (230-313)||(15127083-15127168)
chr7 (339-497)||(22785963-22786120)
chr7 (373-499)||(33072162-33072288)
chr7 (432-513)||(6799595-6799676)
chr7 (301-410)||(32049458-32049567)
chr7 (299-344)||(41409765-41409810)
chr7 (295-360)||(41480628-41480693)
[»] chr5 (130 HSPs)
chr5 (236-513)||(4175460-4175737)
chr5 (235-513)||(18437303-18437581)
chr5 (233-513)||(4985155-4985434)
chr5 (234-513)||(18794743-18795022)
chr5 (236-501)||(26854087-26854351)
chr5 (236-513)||(28463365-28463642)
chr5 (234-514)||(38297595-38297876)
chr5 (236-512)||(28024240-28024516)
chr5 (242-513)||(34261280-34261551)
chr5 (236-513)||(38910236-38910512)
chr5 (242-514)||(4098299-4098571)
chr5 (234-510)||(12664818-12665094)
chr5 (235-513)||(7579647-7579926)
chr5 (243-514)||(6007852-6008125)
chr5 (233-513)||(8825016-8825296)
chr5 (242-514)||(14793769-14794041)
chr5 (235-498)||(24074833-24075096)
chr5 (234-513)||(25343920-25344199)
chr5 (234-513)||(39073004-39073283)
chr5 (259-513)||(9076056-9076310)
chr5 (236-513)||(28446965-28447241)
chr5 (236-501)||(42911512-42911777)
chr5 (245-513)||(8229784-8230051)
chr5 (242-513)||(36239425-36239697)
chr5 (246-513)||(40198760-40199027)
chr5 (281-510)||(7408338-7408567)
chr5 (234-509)||(1795101-1795376)
chr5 (235-513)||(4427385-4427664)
chr5 (243-513)||(38363160-38363428)
chr5 (235-513)||(6072413-6072691)
chr5 (236-513)||(16124240-16124517)
chr5 (236-501)||(38702103-38702368)
chr5 (243-511)||(2133890-2134156)
chr5 (236-475)||(19831560-19831797)
chr5 (250-501)||(4017390-4017641)
chr5 (242-515)||(6754157-6754427)
chr5 (230-508)||(5143983-5144261)
chr5 (236-514)||(12784422-12784699)
chr5 (236-513)||(38017257-38017528)
chr5 (235-506)||(7403815-7404084)
chr5 (262-506)||(18020755-18020999)
chr5 (251-506)||(6689576-6689831)
chr5 (236-499)||(10359229-10359492)
chr5 (243-496)||(32388953-32389208)
chr5 (230-478)||(4694720-4694968)
chr5 (236-476)||(21606275-21606515)
chr5 (236-480)||(32439925-32440169)
chr5 (236-499)||(31985044-31985307)
chr5 (236-514)||(425091-425363)
chr5 (236-514)||(12722938-12723216)
chr5 (243-441)||(31802758-31802955)
chr5 (234-507)||(5119138-5119411)
chr5 (236-513)||(9127331-9127608)
chr5 (271-498)||(24228945-24229172)
chr5 (288-514)||(1087912-1088138)
chr5 (235-510)||(18465662-18465933)
chr5 (233-513)||(1297717-1297998)
chr5 (245-514)||(2673957-2674226)
chr5 (251-510)||(12869882-12870141)
chr5 (242-513)||(13703063-13703336)
chr5 (288-514)||(39893788-39894014)
chr5 (251-498)||(4962183-4962429)
chr5 (242-375)||(25027842-25027975)
chr5 (252-501)||(26906470-26906717)
chr5 (243-513)||(31803293-31803563)
chr5 (234-513)||(38502784-38503059)
chr5 (230-499)||(37306693-37306961)
chr5 (246-513)||(37809731-37809998)
chr5 (299-505)||(7466207-7466413)
chr5 (251-499)||(3892790-3893036)
chr5 (289-513)||(38308106-38308330)
chr5 (246-513)||(37633648-37633915)
chr5 (236-510)||(40208957-40209225)
chr5 (242-475)||(21150460-21150693)
chr5 (242-513)||(21157601-21157872)
chr5 (236-506)||(5842980-5843250)
chr5 (374-513)||(25027555-25027694)
chr5 (234-501)||(37303099-37303366)
chr5 (283-501)||(13461019-13461237)
chr5 (234-379)||(42394242-42394387)
chr5 (241-421)||(4688870-4689049)
chr5 (301-498)||(3243823-3244020)
chr5 (242-410)||(25785875-25786043)
chr5 (310-513)||(22582508-22582710)
chr5 (247-508)||(18392956-18393217)
chr5 (231-421)||(38297874-38298061)
chr5 (242-475)||(18676433-18676664)
chr5 (236-513)||(9958863-9959134)
chr5 (247-507)||(11413516-11413776)
chr5 (243-513)||(24469617-24469886)
chr5 (234-501)||(4440051-4440316)
chr5 (244-500)||(12637940-12638189)
chr5 (236-375)||(3686356-3686494)
chr5 (234-513)||(4608984-4609264)
chr5 (242-343)||(10889244-10889345)
chr5 (312-514)||(18000377-18000572)
chr5 (376-498)||(42393743-42393865)
chr5 (288-441)||(7735135-7735288)
chr5 (283-498)||(17869297-17869513)
chr5 (331-480)||(23418603-23418752)
chr5 (236-498)||(13957155-13957417)
chr5 (259-501)||(8849130-8849373)
chr5 (236-369)||(30368239-30368372)
chr5 (380-501)||(6330927-6331048)
chr5 (374-498)||(3686790-3686914)
chr5 (384-498)||(30368130-30368244)
chr5 (374-480)||(31546012-31546118)
chr5 (425-507)||(38297511-38297593)
chr5 (276-513)||(36481077-36481314)
chr5 (233-501)||(40927112-40927379)
chr5 (273-360)||(38160291-38160378)
chr5 (242-314)||(3818165-3818237)
chr5 (446-513)||(7734764-7734831)
chr5 (259-367)||(1056648-1056754)
chr5 (247-314)||(3818259-3818326)
chr5 (391-498)||(10734155-10734261)
chr5 (346-392)||(10734559-10734605)
chr5 (283-379)||(17872404-17872500)
chr5 (295-375)||(16054249-16054329)
chr5 (264-335)||(10735457-10735528)
chr5 (295-410)||(40886669-40886784)
chr5 (224-262)||(1583358-1583396)
chr5 (425-499)||(7834059-7834133)
chr5 (958-1008)||(14001119-14001169)
chr5 (295-373)||(25683288-25683366)
chr5 (447-509)||(31803110-31803172)
chr5 (295-367)||(6330814-6330887)
chr5 (452-513)||(10889168-10889229)
chr5 (297-410)||(25773752-25773865)
chr5 (267-336)||(35796179-35796248)
[»] chr3 (115 HSPs)
chr3 (237-507)||(48151966-48152236)
chr3 (235-513)||(53745271-53745548)
chr3 (233-501)||(32980617-32980885)
chr3 (235-498)||(17102733-17102996)
chr3 (230-513)||(47069846-47070129)
chr3 (243-513)||(19550233-19550503)
chr3 (236-514)||(54106243-54106521)
chr3 (234-513)||(41425607-41425886)
chr3 (236-514)||(34266428-34266704)
chr3 (243-513)||(43554377-43554646)
chr3 (244-513)||(33874535-33874804)
chr3 (236-501)||(54898087-54898352)
chr3 (250-513)||(3643185-3643448)
chr3 (242-514)||(50091931-50092203)
chr3 (235-510)||(790529-790804)
chr3 (246-513)||(27039595-27039862)
chr3 (233-513)||(40139831-40140098)
chr3 (243-513)||(33491128-33491398)
chr3 (233-499)||(39866852-39867117)
chr3 (246-514)||(43775378-43775646)
chr3 (236-501)||(48214047-48214300)
chr3 (243-501)||(11473389-11473647)
chr3 (235-507)||(52663421-52663693)
chr3 (235-501)||(32853948-32854214)
chr3 (245-514)||(30861532-30861799)
chr3 (235-513)||(35315111-35315389)
chr3 (236-513)||(41351183-41351461)
chr3 (251-513)||(29651667-29651925)
chr3 (242-513)||(27483777-27484046)
chr3 (234-513)||(40318917-40319196)
chr3 (243-514)||(55141460-55141732)
chr3 (236-507)||(47104150-47104421)
chr3 (265-514)||(45145138-45145386)
chr3 (233-513)||(52627227-52627507)
chr3 (236-514)||(36234347-36234622)
chr3 (243-513)||(28885665-28885934)
chr3 (236-502)||(51064863-51065129)
chr3 (243-514)||(13158427-13158700)
chr3 (246-514)||(5243924-5244191)
chr3 (245-518)||(42515158-42515429)
chr3 (235-513)||(42671879-42672157)
chr3 (235-499)||(46973399-46973666)
chr3 (246-513)||(40010653-40010920)
chr3 (242-441)||(45513676-45513875)
chr3 (243-441)||(7328442-7328640)
chr3 (245-510)||(29697980-29698245)
chr3 (236-510)||(51244604-51244878)
chr3 (247-501)||(54334184-54334437)
chr3 (242-403)||(20105178-20105339)
chr3 (288-513)||(45101347-45101572)
chr3 (290-501)||(24065-24276)
chr3 (236-462)||(54911341-54911568)
chr3 (235-513)||(20848713-20848986)
chr3 (236-501)||(33074279-33074543)
chr3 (277-513)||(27028004-27028240)
chr3 (283-494)||(51697571-51697783)
chr3 (234-498)||(45055165-45055429)
chr3 (302-510)||(27992286-27992494)
chr3 (234-469)||(36370861-36371098)
chr3 (235-436)||(13167995-13168197)
chr3 (236-501)||(3376305-3376574)
chr3 (236-498)||(24981275-24981532)
chr3 (242-507)||(49168350-49168615)
chr3 (288-514)||(41926709-41926938)
chr3 (242-441)||(23771273-23771472)
chr3 (234-498)||(41168739-41169000)
chr3 (289-514)||(49123556-49123780)
chr3 (236-514)||(35077367-35077645)
chr3 (242-514)||(2642696-2642960)
chr3 (321-513)||(43945444-43945636)
chr3 (270-513)||(51219082-51219316)
chr3 (288-511)||(52175752-52175974)
chr3 (296-498)||(25983667-25983868)
chr3 (360-498)||(29458207-29458345)
chr3 (288-511)||(52173779-52174000)
chr3 (309-459)||(42671456-42671605)
chr3 (243-417)||(53281966-53282140)
chr3 (270-499)||(6902292-6902521)
chr3 (235-375)||(44544296-44544436)
chr3 (321-501)||(32853361-32853539)
chr3 (236-513)||(53290750-53291027)
chr3 (332-513)||(28943523-28943704)
chr3 (242-439)||(28226413-28226608)
chr3 (251-436)||(22099890-22100075)
chr3 (243-436)||(22173906-22174099)
chr3 (247-403)||(43159859-43160015)
chr3 (12-134)||(53127563-53127689)
chr3 (236-410)||(47843935-47844104)
chr3 (236-500)||(26748333-26748596)
chr3 (323-513)||(29803727-29803905)
chr3 (290-513)||(35458493-35458716)
chr3 (423-513)||(2858566-2858656)
chr3 (276-450)||(31610161-31610334)
chr3 (243-501)||(34750642-34750899)
chr3 (288-357)||(2154184-2154253)
chr3 (374-447)||(44544082-44544155)
chr3 (236-327)||(1201043-1201134)
chr3 (371-501)||(8236896-8237026)
chr3 (235-443)||(24569529-24569737)
chr3 (245-329)||(29803624-29803708)
chr3 (246-350)||(44092181-44092285)
chr3 (288-445)||(42634403-42634561)
chr3 (372-501)||(3114391-3114520)
chr3 (242-356)||(29458865-29458982)
chr3 (437-507)||(31610081-31610151)
chr3 (278-375)||(18355910-18356007)
chr3 (450-499)||(44543734-44543783)
chr3 (247-383)||(40113366-40113502)
chr3 (436-513)||(7329004-7329081)
chr3 (452-513)||(45513307-45513368)
chr3 (295-410)||(198958-199073)
chr3 (295-410)||(13364946-13365061)
chr3 (295-410)||(23087990-23088105)
chr3 (295-410)||(46694169-46694284)
chr3 (371-441)||(53055346-53055416)
[»] chr4 (158 HSPs)
chr4 (236-497)||(37502004-37502266)
chr4 (236-514)||(44217689-44217967)
chr4 (235-500)||(26933769-26934033)
chr4 (233-513)||(13629177-13629457)
chr4 (236-514)||(53599769-53600047)
chr4 (243-514)||(55935097-55935368)
chr4 (236-513)||(22828385-22828662)
chr4 (242-513)||(23719768-23720039)
chr4 (235-513)||(44069013-44069291)
chr4 (236-513)||(31861970-31862247)
chr4 (235-498)||(42099690-42099953)
chr4 (242-501)||(46871910-46872169)
chr4 (236-514)||(39671308-39671586)
chr4 (236-509)||(19093141-19093414)
chr4 (243-495)||(53125240-53125492)
chr4 (236-511)||(5374336-5374611)
chr4 (235-498)||(48782182-48782444)
chr4 (243-513)||(55147044-55147315)
chr4 (243-513)||(16464766-16465036)
chr4 (243-513)||(42629307-42629577)
chr4 (236-514)||(44013896-44014174)
chr4 (251-514)||(52057435-52057699)
chr4 (236-513)||(56576088-56576364)
chr4 (251-514)||(353964-354227)
chr4 (235-498)||(3436066-3436329)
chr4 (242-513)||(30939144-30939415)
chr4 (236-498)||(29295337-29295599)
chr4 (236-513)||(38617293-38617568)
chr4 (243-513)||(47751527-47751790)
chr4 (235-514)||(21044731-21045009)
chr4 (252-510)||(52257778-52258036)
chr4 (236-493)||(16664224-16664481)
chr4 (233-498)||(50623394-50623658)
chr4 (254-513)||(6195025-6195284)
chr4 (236-513)||(12252083-12252352)
chr4 (242-513)||(35232282-35232552)
chr4 (243-513)||(42513009-42513280)
chr4 (222-420)||(52677222-52677422)
chr4 (236-514)||(52061546-52061819)
chr4 (242-510)||(35231679-35231947)
chr4 (242-473)||(53691678-53691909)
chr4 (289-511)||(54231574-54231797)
chr4 (247-512)||(55702914-55703179)
chr4 (245-513)||(8735382-8735649)
chr4 (250-514)||(26620334-26620598)
chr4 (235-499)||(36408705-36408969)
chr4 (235-499)||(36422871-36423135)
chr4 (236-495)||(18781462-18781721)
chr4 (235-510)||(33809069-33809344)
chr4 (242-501)||(38542272-38542531)
chr4 (247-513)||(47251407-47251673)
chr4 (264-513)||(36659411-36659660)
chr4 (232-513)||(39683698-39683979)
chr4 (234-514)||(43887964-43888242)
chr4 (242-506)||(47596604-47596868)
chr4 (235-506)||(33084460-33084726)
chr4 (236-501)||(19527216-19527469)
chr4 (236-476)||(41414991-41415230)
chr4 (242-513)||(44549632-44549902)
chr4 (236-443)||(47428512-47428719)
chr4 (236-498)||(30151655-30151917)
chr4 (236-513)||(42133020-42133297)
chr4 (236-513)||(9220025-9220302)
chr4 (236-420)||(4201395-4201579)
chr4 (231-507)||(34464255-34464531)
chr4 (236-514)||(22678292-22678571)
chr4 (236-402)||(9834247-9834413)
chr4 (288-514)||(19399569-19399794)
chr4 (246-496)||(47884988-47885247)
chr4 (236-499)||(18135048-18135311)
chr4 (248-501)||(40411938-40412191)
chr4 (236-499)||(49122258-49122521)
chr4 (252-513)||(6091337-6091599)
chr4 (243-499)||(35381417-35381668)
chr4 (288-498)||(26906388-26906598)
chr4 (242-403)||(27492348-27492510)
chr4 (288-514)||(31369836-31370062)
chr4 (283-513)||(45725566-45725796)
chr4 (242-391)||(23623601-23623750)
chr4 (236-401)||(32239383-32239547)
chr4 (236-444)||(8741677-8741885)
chr4 (235-474)||(34361038-34361276)
chr4 (242-458)||(47093801-47094017)
chr4 (246-402)||(36750170-36750326)
chr4 (288-510)||(3036420-3036640)
chr4 (236-501)||(34603607-34603872)
chr4 (246-499)||(56499610-56499865)
chr4 (243-478)||(36750539-36750774)
chr4 (293-506)||(23237667-23237883)
chr4 (309-510)||(44176576-44176777)
chr4 (242-513)||(1180885-1181157)
chr4 (236-514)||(36292608-36292877)
chr4 (236-356)||(33755223-33755343)
chr4 (242-401)||(29833022-29833181)
chr4 (234-475)||(1146068-1146312)
chr4 (325-514)||(33755014-33755201)
chr4 (235-397)||(37551765-37551927)
chr4 (235-513)||(38009750-38010028)
chr4 (234-358)||(37394298-37394422)
chr4 (235-472)||(3802142-3802379)
chr4 (236-441)||(6150677-6150882)
chr4 (242-514)||(18091231-18091503)
chr4 (243-410)||(14090230-14090397)
chr4 (246-462)||(7242234-7242446)
chr4 (243-501)||(38865894-38866149)
chr4 (234-399)||(27918583-27918747)
chr4 (288-475)||(41955707-41955883)
chr4 (289-499)||(27654742-27654953)
chr4 (380-499)||(31984150-31984269)
chr4 (290-444)||(54029135-54029289)
chr4 (236-393)||(20294267-20294424)
chr4 (371-499)||(42645379-42645507)
chr4 (229-501)||(48509866-48510137)
chr4 (242-513)||(8456895-8457166)
chr4 (246-501)||(14949080-14949335)
chr4 (290-475)||(1615077-1615260)
chr4 (155-237)||(17777809-17777891)
chr4 (236-501)||(48087681-48087946)
chr4 (242-441)||(41813631-41813831)
chr4 (156-231)||(32663760-32663835)
chr4 (243-361)||(38617806-38617924)
chr4 (295-383)||(8752182-8752270)
chr4 (288-384)||(51347297-51347393)
chr4 (290-507)||(1391161-1391378)
chr4 (234-327)||(17698549-17698642)
chr4 (288-501)||(20087211-20087418)
chr4 (369-501)||(53467547-53467680)
chr4 (243-445)||(43086397-43086595)
chr4 (406-513)||(49089059-49089166)
chr4 (242-392)||(30151934-30152084)
chr4 (236-438)||(55430362-55430564)
chr4 (274-383)||(17978090-17978198)
chr4 (262-395)||(34925444-34925577)
chr4 (301-410)||(52978313-52978421)
chr4 (242-302)||(31984296-31984356)
chr4 (407-514)||(29511197-29511304)
chr4 (290-417)||(56486422-56486549)
chr4 (321-403)||(25098341-25098423)
chr4 (321-514)||(9746296-9746489)
chr4 (452-513)||(9834479-9834540)
chr4 (301-514)||(51654856-51655068)
chr4 (278-410)||(19692826-19692957)
chr4 (278-410)||(19703411-19703542)
chr4 (243-319)||(42645298-42645373)
chr4 (246-501)||(39308924-39309178)
chr4 (278-408)||(6128991-6129120)
chr4 (443-513)||(38027559-38027629)
chr4 (19-85)||(36183497-36183565)
chr4 (434-514)||(17698643-17698723)
chr4 (449-513)||(52677150-52677214)
chr4 (241-300)||(23237398-23237457)
chr4 (295-357)||(24948658-24948720)
chr4 (39-85)||(28378914-28378960)
chr4 (470-514)||(36408969-36409013)
chr4 (470-514)||(36423135-36423179)
chr4 (301-383)||(7037047-7037129)
chr4 (364-410)||(13435248-13435294)
chr4 (451-513)||(33751327-33751389)
[»] scaffold0192 (1 HSPs)
scaffold0192 (235-456)||(14762-14983)
[»] scaffold0018 (1 HSPs)
scaffold0018 (234-498)||(184126-184390)
[»] scaffold0024 (2 HSPs)
scaffold0024 (246-513)||(49137-49403)
scaffold0024 (452-498)||(89366-89412)
[»] scaffold0280 (1 HSPs)
scaffold0280 (254-513)||(8152-8411)
[»] scaffold0001 (2 HSPs)
scaffold0001 (286-513)||(419476-419703)
scaffold0001 (233-291)||(419840-419897)
[»] scaffold0831 (1 HSPs)
scaffold0831 (235-514)||(2786-3067)
[»] scaffold0009 (1 HSPs)
scaffold0009 (242-513)||(147111-147383)
[»] scaffold0343 (1 HSPs)
scaffold0343 (249-513)||(7417-7681)
[»] scaffold0172 (1 HSPs)
scaffold0172 (243-514)||(26110-26381)
[»] scaffold0886 (1 HSPs)
scaffold0886 (245-512)||(4505-4770)
[»] scaffold0274 (1 HSPs)
scaffold0274 (235-514)||(223-501)
[»] scaffold0040 (1 HSPs)
scaffold0040 (236-513)||(69080-69356)
[»] scaffold0002 (4 HSPs)
scaffold0002 (243-514)||(148288-148561)
scaffold0002 (235-436)||(138791-138993)
scaffold0002 (242-469)||(369390-369616)
scaffold0002 (290-383)||(492454-492547)
[»] scaffold0007 (1 HSPs)
scaffold0007 (288-513)||(77120-77345)
[»] scaffold1213 (1 HSPs)
scaffold1213 (235-463)||(1-233)
[»] scaffold0135 (1 HSPs)
scaffold0135 (236-513)||(30676-30953)
[»] scaffold0325 (1 HSPs)
scaffold0325 (235-501)||(294-560)
[»] scaffold0006 (1 HSPs)
scaffold0006 (246-513)||(96045-96312)
[»] scaffold0003 (1 HSPs)
scaffold0003 (236-513)||(252574-252851)
[»] scaffold0036 (1 HSPs)
scaffold0036 (250-513)||(23130-23394)
[»] scaffold0236 (1 HSPs)
scaffold0236 (242-508)||(14239-14505)
[»] scaffold2146 (1 HSPs)
scaffold2146 (303-513)||(599-809)
[»] scaffold0471 (1 HSPs)
scaffold0471 (341-513)||(1802-1973)
[»] scaffold0019 (1 HSPs)
scaffold0019 (236-377)||(72067-72208)
[»] scaffold0014 (2 HSPs)
scaffold0014 (236-353)||(195882-195999)
scaffold0014 (346-498)||(195586-195737)
[»] scaffold1254 (1 HSPs)
scaffold1254 (278-392)||(1055-1169)
[»] scaffold0419 (1 HSPs)
scaffold0419 (278-392)||(6460-6574)
[»] scaffold0250 (1 HSPs)
scaffold0250 (160-237)||(21735-21812)
[»] scaffold0102 (1 HSPs)
scaffold0102 (280-447)||(20996-21163)


Alignment Details
Target: chr2 (Bit Score: 369; Significance: 0; HSPs: 95)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 369; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 539 - 974
Target Start/End: Complemental strand, 27737297 - 27736869
Alignment:
Q  539 tgttcaaagtcgtctctctagcaattaggcattctgaattgcacttgagtacacctatcgcaattaaaagatggtgcaaatgcaatcaccacattcaatt 638  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27737297 tgttcaaagtcgtctctctagcaattaggcattctgaattgcacttgagtacacctatcgcaattaaaagatggtgcaaatgcaatcaccacattcaatt 27737198  T
Q  639 tttcgtttttctatttaattttctttaattataatcaaatgcaggtacaaccactacatcgagacattcaccgccaattcatcattatcacaattaattg 738  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        ||| ||||||||||||||||||    
T  27737197 tttcgtttttctatttaattttctttaattataatcaaatgcaggtacaaccactacatcgagacattcaa-------tcaccattatcacaattaattg 27737105  T
Q  739 ctgattactcttttctctctcaattaacggtcatattctttttactaaaatcaaccgtcatataannnnnnnaaaggaaaatcaaccgtcatatttactt 838  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||       ||||||||||||||||||||||||||||    
T  27737104 ctgattactcttttctctctcaattaacggtcatatcctttttactaaaatcaaccgtcatataatttttttaaaggaaaatcaaccgtcatatttactt 27737005  T
Q  839 ccacttcatttgaatttgatcactaattaactgatctttctgtcaaaaaataatataaatattccttcaaaaacaaatattatatttagataagagtttg 938  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27737004 ccacttcatttgaatttgatcactaattaactgatctttctgtcaaaaaataatataaatattccttcaaaaacaaatattatatttagataagagtttg 27736905  T
Q  939 aatcctagacactcacttgattttgttgatgccatt 974  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  27736904 aattctagacactcacttgattttgttgatgtcatt 27736869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 12 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 27737547 - 27737322
Alignment:
Q  12 catcatctataaggcccaataaggaactagaaaaacaaggagcattgtacaactccaaattaaaagtaatctaaattttaaaactaaattatttattaca 111  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  27737547 catcacctataaggcccaataaggaactagaaaaacaaggagcattgtacaactccaaattaaaagtaatctaaattttaaaactaaactatttattaca 27737448  T
Q  112 aacaagattcactaaagaaagataaaatattggtcctcgtcaagcggccttattgtcaactagtctccgagttctatttaaaataccagattgtattgaa 211  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  27737447 aacaagattcactaaagaaagataacatattggtcctcgtcaagcggccttattgtcaactagtctccaagttctatttaaaataccagattgtattaaa 27737348  T
Q  212 aatactttgatcaatgaaatattata 237  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  27737347 aatactttgatcaatgaaatattata 27737322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 173; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 235 - 514
Target Start/End: Original strand, 13753934 - 13754213
Alignment:
Q  235 atactcactccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttatttcaatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaactttaaatgttatttt 334  Q
    |||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||  ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||    
T  13753934 atactcccttcgttcctttttaagtgtctcttttggagaacatttttgttccaatttaactgtcactttcaaagttcaatacaacattaaatgttgtttt 13754033  T
Q  335 atcaatattacccttagttatttattgtggagatagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggatattatggtaaaagta-tcaattattgtat 433  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||| | |||||||||||    
T  13754034 atcaatattacccttagttatttattgcggagagagaaatatatgacatgaaatattaaatgaataaggctattatagtaaaagtagtaaattattgtat 13754133  T
Q  434 caaaagtaataacatttattgattgtcttgctttgtgtaaaatgtcataaaatgacaattaaaaaggagcggaggtagtaa 514  Q
    |||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||| |||||||    
T  13754134 caaaagtagtaacatttaatgattgtcttggtttgtgtaaaatgtca-aaagtgacaattaaaaaggaacggaagtagtaa 13754213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 169; E-Value: 5e-90
Query Start/End: Original strand, 242 - 498
Target Start/End: Complemental strand, 13001168 - 13000912
Alignment:
Q  242 ctccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttatttcaatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaactttaaatgttattttatcaata 341  Q
    |||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||    
T  13001168 ctccgttcgttcttaagtgttacttttggagaaattttttgttccaatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaactttaaatcttgttttatcagta 13001069  T
Q  342 ttacccttagttatttattgtggagatagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggatattatggtaaaagtatcaattattgtatcaaaagta 441  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| | |||| ||| |||||||||||||||||||    
T  13001068 ttacccttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaataaataaggctattatagcaaaaatattaattattgtatcaaaagta 13000969  T
Q  442 ataacatttattgattgtcttgctttgtgtaaaatgtcataaaatgacaattaaaaa 498  Q
     ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||| | |||||||||||    
T  13000968 gtaacatttattgattgtcttaatttgtgtaaaatgtcacaaagtaacaattaaaaa 13000912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 167; E-Value: 7e-89
Query Start/End: Original strand, 235 - 513
Target Start/End: Original strand, 26342559 - 26342837
Alignment:
Q  235 atactcactccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttatttcaatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaactttaaatgttatttt 334  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  26342559 atactccctccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaatttttggttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgtttt 26342658  T
Q  335 atcaatattacccttagttatttattgtggagatagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggatattatggtaaaagtatcaattattgtatc 434  Q
    | |||||||  |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||   |||||| |||    
T  26342659 accaatattgtccttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtatagcttattgcatc 26342758  T
Q  435 aaaagtaataacatttattgattgtcttgctttgtgtaaaatgtcataaaatgacaattaaaaaggagcggaggtagta 513  Q
    ||||||| || || || |||||||||||| |||||||||||||||| ||  |||||||||||||||| |||||||||||    
T  26342759 aaaagtagtatcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaacgtgacaattaaaaaggaacggaggtagta 26342837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 166; E-Value: 3e-88
Query Start/End: Original strand, 236 - 501
Target Start/End: Original strand, 14541311 - 14541576
Alignment:
Q  236 tactcactccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttatttcaatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaactttaaatgttatttta 335  Q
    ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||  | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||    
T  14541311 tactccctccgttcctttttaaatgtcacttttggagaaaaatattgtttcaatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaacgttgtttta 14541410  T
Q  336 tcaatattacccttagttatttattgtggagatagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggatattatggtaaaagtatcaattattgtatca 435  Q
     |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| || ||| ||||||    
T  14541411 ccaatattatccttagttatttattgtggagagagaaatatataaaatgagatattaaatgaataaggttattatagtaaaagtatgaagtatcgtatca 14541510  T
Q  436 aaagtaataacatttattgattgtcttgctttgtgtaaaatgtcataaaatgacaattaaaaagga 501  Q
    |||||| ||| ||||||||||||| ||| ||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  14541511 aaagtagtaatatttattgattgtattggtttgtataaaatgtcaaaaagtgacaattaaaaagga 14541576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 163; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 235 - 513
Target Start/End: Original strand, 41885604 - 41885882
Alignment:
Q  235 atactcactccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttatttcaatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaactttaaatgttatttt 334  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  41885604 atactccctccgttcctttttaggtgtcacttttggagaaattttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttatttt 41885703  T
Q  335 atcaatattacccttagttatttattgtggagatagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggatattatggtaaaagtatcaattattgtatc 434  Q
    | |||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||  |||||||||    |||||| |||    
T  41885704 accaatattgtccttagttatttattgtggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattacagtaaaagtacagcttattgcatc 41885803  T
Q  435 aaaagtaataacatttattgattgtcttgctttgtgtaaaatgtcataaaatgacaattaaaaaggagcggaggtagta 513  Q
    ||||||| || || || |||||||||||| |||||||||||||||| ||  ||||||| |||||||| |||||||||||    
T  41885804 aaaagtagtatcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaatgaaaaaggaacggaggtagta 41885882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 162; E-Value: 7e-86
Query Start/End: Original strand, 233 - 514
Target Start/End: Original strand, 34399179 - 34399460
Alignment:
Q  233 ttatactcactccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttatttcaatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaactttaaatgttatt 332  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||| || ||    
T  34399179 ttatactccctccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttattcctatttaaccatcactttcaaagttcaatgcaacattaaatattgtt 34399278  T
Q  333 ttatcaatattacccttagttatttattgtggagatagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggatattatggtaaaagtatcaattattgta 432  Q
    ||| |||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||   |||||| |    
T  34399279 ttaccaatattatccttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtatagtttattgca 34399378  T
Q  433 tcaaaagtaataacatttattgattgtcttgctttgtgtaaaatgtcataaaatgacaattaaaaaggagcggaggtagtaa 514  Q
    ||||||||| || || || |||||||||||| |||||||||| ||||| ||  ||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  34399379 tcaaaagtagtatcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaagtgtcaaaatgtgataattaaaaaggaacggaggtagtaa 34399460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 159; E-Value: 4e-84
Query Start/End: Original strand, 235 - 513
Target Start/End: Original strand, 10812178 - 10812456
Alignment:
Q  235 atactcactccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttatttcaatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaactttaaatgttatttt 334  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  10812178 atactccctccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaaaattttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgtttt 10812277  T
Q  335 atcaatattacccttagttatttattgtggagatagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggatattatggtaaaagtatcaattattgtatc 434  Q
    | |||||||| ||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||   |||| | |||    
T  10812278 accaatattatccttaattatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtatagcttatggcatc 10812377  T
Q  435 aaaagtaataacatttattgattgtcttgctttgtgtaaaatgtcataaaatgacaattaaaaaggagcggaggtagta 513  Q
    ||||||| || || || |||||||||||| |||||||||||||||| ||  |||||||||||||||| |||||||||||    
T  10812378 aaaagtagtatcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaacggaggtagta 10812456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 154; E-Value: 4e-81
Query Start/End: Original strand, 236 - 513
Target Start/End: Complemental strand, 11222579 - 11222302
Alignment:
Q  236 tactcactccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttatttcaatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaactttaaatgttatttta 335  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  11222579 tactccctccgttcctttttaagtgtctcttttgaagaaattttttgtttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgtttta 11222480  T
Q  336 tcaatattacccttagttatttattgtggagatagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggatattatggtaaaagtatcaattattgtatca 435  Q
     |||||||| ||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||  ||||||||  | |||||| ||||    
T  11222479 ccaatattatccttagttatttattgcagagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatattaaaagtacaacttattgcatca 11222380  T
Q  436 aaagtaataacatttattgattgtcttgctttgtgtaaaatgtcataaaatgacaattaaaaaggagcggaggtagta 513  Q
    |||||| ||||| | ||||| | ||||| ||| |||||||||||| ||  |||||||||||||||| |||||||||||    
T  11222379 aaagtagtaacaatcattgactatcttggtttatgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaacggaggtagta 11222302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 153; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 242 - 514
Target Start/End: Original strand, 44360420 - 44360691
Alignment:
Q  242 ctccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttatttcaatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaactttaaatgttattttatcaata 341  Q
    ||||||||||||||||  ||| ||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||    
T  44360420 ctccgttcctttttaatcgtctcttttggagaatttttttgtttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgatgttttatcaata 44360519  T
Q  342 ttacccttagttatttattgtggagatagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggatattatggtaaaagtatcaattattgtatcaaaagta 441  Q
    | |||||||  ||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||  ||||||||| | |||||| ||||||||||    
T  44360520 t-acccttaaatatttattgcggagagagaaatatatgaaataagatattaaatgaataaggtcattataataaaagtataacttattgcatcaaaagta 44360618  T
Q  442 ataacatttattgattgtcttgctttgtgtaaaatgtcataaaatgacaattaaaaaggagcggaggtagtaa 514  Q
     ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||  |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  44360619 gtaacaattattgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaacggaggtagtaa 44360691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 152; E-Value: 6e-80
Query Start/End: Original strand, 235 - 514
Target Start/End: Complemental strand, 15183265 - 15182986
Alignment:
Q  235 atactcactccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttatttcaatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaactttaaatgttatttt 334  Q
    |||||| || |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  15183265 atactcccttcgttcctttttaagtgtcactttttgagaaattttttgtttctatttaattgtcactttcgaagttcaatgcaacattaaatgttgtttt 15183166  T
Q  335 atcaatattacccttagttatttattgtggagatagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggatattatggtaaaagtatcaattattgtatc 434  Q
    | |||||||  |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||| |||   |||||| |||    
T  15183165 accaatattgtccttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaaatatagcttattgcatc 15183066  T
Q  435 aaaagtaataacatttattgattgtcttgctttgtgtaaaatgtcataaaatgacaattaaaaaggagcggaggtagtaa 514  Q
    ||||||| || || || |||||| ||||| |||||||||||||||| ||  |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  15183065 aaaagtagtatcaattgttgattatcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaacggaggtagtaa 15182986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 148; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 247 - 510
Target Start/End: Original strand, 43077283 - 43077546
Alignment:
Q  247 ttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttatttcaatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaactttaaatgttattttatcaatattacc 346  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||| ||||||||||    
T  43077283 ttcctttttaattgtcacttttgaagaaattttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatattgttttaccaatattacc 43077382  T
Q  347 cttagttatttattgtggagatagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggatattatggtaaaagtatcaattattgtatcaaaagtaataac 446  Q
    ||||| ||||||||| ||||| ||||| ||||||||| | ||||||||| |||||||  | ||| |||||||||  ||  ||||||||||||||||||||    
T  43077383 cttagatatttattgcggagagagaaacatatgaaataaaatattaaattaataaggccaatatagtaaaagtaataacaattgtatcaaaagtaataac 43077482  T
Q  447 atttattgattgtcttgctttgtgtaaaatgtcataaaatgacaattaaaaaggagcggaggta 510  Q
    | ||||||||||||||| |||||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  43077483 acttattgattgtcttggtttgtgtaaaatgttaaaaaatgacaattaaaaaggaacggaggta 43077546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 147; E-Value: 6e-77
Query Start/End: Original strand, 231 - 513
Target Start/End: Complemental strand, 15893848 - 15893566
Alignment:
Q  231 tattatactcactccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttatttcaatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaactttaaatgtta 330  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| ||    ||| || | |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||     
T  15893848 tattgtactccctccgttcctttttaagtgtcaattttggaaaataaatttgttcctatttaactgtcattttcaaagttcaatgcaacattaaatgttg 15893749  T
Q  331 ttttatcaatattacccttagttatttattgtggagatagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggatattatggtaaaagtatcaattattg 430  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||   ||||||    
T  15893748 ttttaccaatattatccttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggttattatagtaaaagtatagcttattg 15893649  T
Q  431 tatcaaaagtaataacatttattgattgtcttgctttgtgtaaaatgtcataaaatgacaattaaaaaggagcggaggtagta 513  Q
     |||||||||| || || || |||||||||||| |||||||||||| ||| ||  |||||||||||||||| |||||||||||    
T  15893648 catcaaaagtagtatcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatatcaaaatgtgacaattaaaaaggaacggaggtagta 15893566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 147; E-Value: 6e-77
Query Start/End: Original strand, 236 - 514
Target Start/End: Complemental strand, 31025203 - 31024925
Alignment:
Q  236 tactcactccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttatttcaatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaactttaaatgttatttta 335  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| || |||||    
T  31025203 tactccctccgttcctttttaagtgtcattttgggagaaattttttgtttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacaataaatcttgtttta 31025104  T
Q  336 tcaatattacccttagttatttattgtggagatagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggatattatggtaaaagtatcaattattgtatca 435  Q
     ||| |||||||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||| ||||||||||| |    
T  31025103 ccaacattacccttagttatttattatggagagataaatatatgaaataagatattaaatgactaaggctattatagtaaaagtatgaattattgtataa 31025004  T
Q  436 aaagtaataacatttattgattgtcttgctttgtgtaaaatgtcataaaatgacaattaaaaaggagcggaggtagtaa 514  Q
     ||  | ||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||| ||| | ||| |||||||||| |||| |||||||    
T  31025003 gaaaaagtaacatttattgagtgtcttggtttgtgtaaaatatcaaaaagttacagttaaaaaggaacggatgtagtaa 31024925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 146; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 242 - 498
Target Start/End: Complemental strand, 479231 - 478974
Alignment:
Q  242 ctccgttccttttt-aagtgtcacttttggagaaattttttatttcaatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaactttaaatgttattttatcaat 340  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  479231 ctccgttccttttttaagtgtcacttttggagaaaaattttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttatcaat 479132  T
Q  341 attacccttagttatttattgtggagatagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggatattatggtaaaagtatcaattattgtatcaaaagt 440  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||   |||||| |||||||||    
T  479131 attatccttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaagt 479032  T
Q  441 aataacatttattgattgtcttgctttgtgtaaaatgtcataaaatgacaattaaaaa 498  Q
    | || || ||||||||| ||||| |||||||||||||| | ||  |||||||||||||    
T  479031 agtatcaattattgattatcttggtttgtgtaaaatgttaaaatgtgacaattaaaaa 478974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 146; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 236 - 501
Target Start/End: Complemental strand, 14296020 - 14295755
Alignment:
Q  236 tactcactccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttatttcaatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaactttaaatgttatttta 335  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || | ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||    
T  14296020 tactccctccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaaatttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatacaacattaaatgttgtttta 14295921  T
Q  336 tcaatattacccttagttatttattgtggagatagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggatattatggtaaaagtatcaattattgtatca 435  Q
     |||||||  |||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||| ||||||||||   |||||| ||||    
T  14295920 ccaatattgtccttagttatttattgcgaagagagaaatatatgaaatgaaatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtataccttattgcatca 14295821  T
Q  436 aaagtaataacatttattgattgtcttgctttgtgtaaaatgtcataaaatgacaattaaaaagga 501  Q
    |||||| || || || |||||||||||| |||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||    
T  14295820 aaagtagtatcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaagga 14295755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 146; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 252 - 501
Target Start/End: Complemental strand, 32544034 - 32543785
Alignment:
Q  252 ttttaagtgtcacttttggagaaattttttatttcaatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaactttaaatgttattttatcaatattacccttag 351  Q
    ||||||| |||| |||||||||| |||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  32544034 ttttaagagtcatttttggagaatttttttgttctaatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaactttaaatgttgttttatcaatattacctttag 32543935  T
Q  352 ttatttattgtggagatagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggatattatggtaaaagtatcaattattgtatcaaaagtaataacattta 451  Q
    |||||||||   |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||  ||||||||||||||||||||| |||| || ||| |||||    
T  32543934 ttatttattacagagaaaaaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaaactattatattaaaagtatcaattattgtataaaaattagtaatattta 32543835  T
Q  452 ttgattgtcttgctttgtgtaaaatgtcataaaatgacaattaaaaagga 501  Q
    |||||||| ||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  32543834 ttgattgttttggtttatgtaaaatgttataaaatgacaattaaaaagga 32543785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 145; E-Value: 9e-76
Query Start/End: Original strand, 246 - 514
Target Start/End: Original strand, 9706778 - 9707045
Alignment:
Q  246 gttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttatttcaatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaactttaaatgttattttatcaatattac 345  Q
    |||| ||||||||||||| ||||| |||||  |||  ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||     
T  9706778 gttcttttttaagtgtcatttttgaagaaaaatttgtttt-aatttaactgtcacttttaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattat 9706876  T
Q  346 ccttagttatttattgtggagatagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggatattatggtaaaagtatcaattattgtatcaaaagtaataa 445  Q
    ||||||||||||||| |||||| | |||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||| |||||||||| || |||||||||||||||| |||    
T  9706877 ccttagttatttattatggagagataaatatataaaatgagatatcaaatgaataaggttattatagtaaaagtatgaaatattgtatcaaaagtagtaa 9706976  T
Q  446 catttattgattgtcttgctttgtgtaaaatgtcataaaatgacaattaaaaaggagcggaggtagtaa 514  Q
     ||||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  9706977 tatttattgattgtattggtttgtgtaaaatgtcaaaaagtgacaattaaaaaggaacgggggtagtaa 9707045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 144; E-Value: 4e-75
Query Start/End: Original strand, 234 - 513
Target Start/End: Complemental strand, 35158616 - 35158337
Alignment:
Q  234 tatactcactccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttatttcaatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaactttaaatgttattt 333  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || | ||||||||||||||||| || ||||||||||  ||||||||| |||    
T  35158616 tatactccctctgttcctttttaagtgtcacttttgaagaaattttttgttcctatttaactgtcactttcgaaattcaatgcaatattaaatgttgttt 35158517  T
Q  334 tatcaatattacccttagttatttattgtggagatagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggatattatggtaaaagtatcaattattgtat 433  Q
    || |||||||| ||||  ||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||  ||||||||||  ||||||||||    
T  35158516 taccaatattatccttgcttatttactgtggagaaagaaatatatgaaatgaaatagtaaatgaataaggttattacagtaaaagtatatattattgtat 35158417  T
Q  434 caaaagtaataacatttattgattgtcttgctttgtgtaaaatgtcataaaatgacaattaaaaaggagcggaggtagta 513  Q
    |||||||| ||| ||||||||| ||||||| ||  |||||||||||| ||| |||||||||||||| | |||||||||||    
T  35158416 caaaagtagtaatatttattgaatgtcttggttcatgtaaaatgtcaaaaagtgacaattaaaaagaaacggaggtagta 35158337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 143; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 256 - 514
Target Start/End: Original strand, 3363584 - 3363842
Alignment:
Q  256 aagtgtcacttttggagaaattttttatttcaatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaactttaaatgttattttatcaatattacccttagttat 355  Q
    ||||||||||||||||||||  |||| ||   |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||    
T  3363584 aagtgtcacttttggagaaaagttttgttcttatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattatccttagttat 3363683  T
Q  356 ttattgtggagatagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggatattatggtaaaagtatcaattattgtatcaaaagtaataacatttattga 455  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||| ||||||||||   |||||| |||||||||| || || |||||||    
T  3363684 ttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatcaataaggtcattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaagtagtatcaattattga 3363783  T
Q  456 ttgtcttgctttgtgtaaaatgtcataaaatgacaattaaaaaggagcggaggtagtaa 514  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||   ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  3363784 ttgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgcgacaattaaaaaggaacggaggtagtaa 3363842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 140; E-Value: 9e-73
Query Start/End: Original strand, 242 - 513
Target Start/End: Original strand, 37093436 - 37093706
Alignment:
Q  242 ctccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttatttcaatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaactttaaatgttattttatcaata 341  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||| |||||||||||    
T  37093436 ctccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatacaatattaaatgttgttttatcaata 37093535  T
Q  342 ttacccttagttatttattgtggagatagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggatattatggtaaaagtatcaattattgtatcaaaagta 441  Q
    ||  ||||||||||||||||  || | ||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||| |||||||||| | |||||| ||||||||||    
T  37093536 ttgtccttagttatttattgcagaaagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataa-gtcattatagtaaaagtataacttattgcatcaaaagta 37093634  T
Q  442 ataacatttattgattgtcttgctttgtgtaaaatgtcataaaatgacaattaaaaaggagcggaggtagta 513  Q
     || || || || ||||||||| |||||||||||||||| ||  |||||||||||||||  |||||| ||||    
T  37093635 gtatcaattgttaattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggtacggagggagta 37093706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 138; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 236 - 513
Target Start/End: Original strand, 19594331 - 19594607
Alignment:
Q  236 tactcactccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttatttcaatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaactttaaatgttatttta 335  Q
    ||||| |||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| || | |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||    
T  19594331 tactccctccgttcctttttaattgtcactttttgagaaattttttgttcctatttaactgtcactttcaaa-ttcaatgcaacattaaatgttgtttta 19594429  T
Q  336 tcaatattacccttagttatttattgtggagatagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggatattatggtaaaagtatcaattattgtatca 435  Q
     |||||||  || ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||| |||   |||||| ||||    
T  19594430 ccaatattgtccatagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaaatatagcttattgcatca 19594529  T
Q  436 aaagtaataacatttattgattgtcttgctttgtgtaaaatgtcataaaatgacaattaaaaaggagcggaggtagta 513  Q
    ||||||||| || || |||||| ||||  |||||||||||||||| ||  |||||||||||||| | |||||||||||    
T  19594530 aaagtaatatcaattgttgattatctttgtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaagtaacggaggtagta 19594607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 138; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 242 - 514
Target Start/End: Complemental strand, 25558440 - 25558171
Alignment:
Q  242 ctccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttatttcaatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaactttaaatgttattttatcaata 341  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  25558440 ctccgtttctttttaagtgtcacttttggagaaaatttttgtttctatttaactgtcactttcaaagtt-aatgcaacattaaatgttgttttatcaata 25558342  T
Q  342 ttacccttagttatttattgtggagatagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggatattatggtaaaagtatcaattattgtatcaaaagta 441  Q
    ||| |||||||||||||||| |||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||| |   |||||||||||||||||    
T  25558341 ttatccttagttatttattgcggaga--gatatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtctagcttattgtatcaaaagta 25558244  T
Q  442 ataacatttattgattgtcttgctttgtgtaaaatgtcataaaatgacaattaaaaaggagcggaggtagtaa 514  Q
     || || || |||||||||||| |||||||||||||||| ||  | ||||| || || || ||||||||||||    
T  25558243 gtatcaatttttgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtaacaatcaagaaagaacggaggtagtaa 25558171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 134; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 236 - 513
Target Start/End: Original strand, 34357158 - 34357435
Alignment:
Q  236 tactcactccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttatttcaatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaactttaaatgttatttta 335  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||| || | |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  34357158 tactccctccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaaaaatttgttcctatttaattgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgtttta 34357257  T
Q  336 tcaatattacccttagttatttattgtggagatagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggatattatggtaaaagtatcaattattgtatca 435  Q
     |||||||| ||||||||||||| |||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||| ||| | |||||| ||||    
T  34357258 ccaatattatccttagttatttactgtggaaagagaaatatataaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaaatataacttattgcatca 34357357  T
Q  436 aaagtaataacatttattgattgtcttgctttgtgtaaaatgtcataaaatgacaattaaaaaggagcggaggtagta 513  Q
    ||| || ||  | || |||||| ||||| |||||||||||||||  ||  |||||||||||||||| |||||||||||    
T  34357358 aaaatagtataaattgttgattatcttggtttgtgtaaaatgtcgaaatgtgacaattaaaaaggaacggaggtagta 34357435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 132; E-Value: 5e-68
Query Start/End: Original strand, 236 - 499
Target Start/End: Original strand, 9369954 - 9370217
Alignment:
Q  236 tactcactccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttatttcaatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaactttaaatgttatttta 335  Q
    ||||| ||| ||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||| |||||    
T  9369954 tactccctcagtttctttttaattgtcatttttggagaaattttttgtttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaatattaagtgttgtttta 9370053  T
Q  336 tcaatattacccttagttatttattgtggagatagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggatattatggtaaaagtatcaattattgtatca 435  Q
    |||||||||||||||  ||||||||| ||||| ||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||  ||||| |||||||||  ||  |||||||||    
T  9370054 tcaatattacccttaaatatttattgcggagagagaaacatatgaaatgaaatattaaattaataaggtcattatagtaaaagtaaaaacaattgtatca 9370153  T
Q  436 aaagtaataacatttattgattgtcttgctttgtgtaaaatgtcataaaatgacaattaaaaag 499  Q
    |||||| ||||| ||||| || |||||| ||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  9370154 aaagtagtaacacttattaatggtcttggtttatgtaaaatgtcaaaaagtgacaattaaaaag 9370217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 132; E-Value: 5e-68
Query Start/End: Original strand, 236 - 511
Target Start/End: Original strand, 13965587 - 13965862
Alignment:
Q  236 tactcactccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttatttcaatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaactttaaatgttatttta 335  Q
    ||||| |||| || |||||||| |||| |||||||||||||||||| ||   |||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||  | ||    
T  13965587 tactccctccattactttttaaatgtctcttttggagaaattttttgttcatatttaactgttacttttaaagttcaatgcaacattaaatgttgatata 13965686  T
Q  336 tcaatattacccttagttatttattgtggagatagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggatattatggtaaaagtatcaattattgtatca 435  Q
     |||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||  ||||| ||||||| || | |||||| ||||    
T  13965687 ccaatattatccttagttatttattgcggagagagaaatatattaaatgagatgttaaatgaacaaggtcattatagtaaaagcataacttattggatca 13965786  T
Q  436 aaagtaataacatttattgattgtcttgctttgtgtaaaatgtcataaaatgacaattaaaaaggagcggaggtag 511  Q
    || |||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  13965787 aatgtaaaaacaattattgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaaagtgacaattaaaaaggaacggaggtag 13965862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 132; E-Value: 5e-68
Query Start/End: Original strand, 245 - 508
Target Start/End: Complemental strand, 30264856 - 30264593
Alignment:
Q  245 cgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttatttcaatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaactttaaatgttattttatcaatatta 344  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||   |||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||| ||||| |||||||     
T  30264856 cgttcctttttaagtgtcacttttggagaaaaattttgttcttatttaactgtcattttcaaagttcaatacaacattaaatgttgttttaccaatattg 30264757  T
Q  345 cccttagttatttattgtggagatagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggatattatggtaaaagtatcaattattgtatcaaaagtaata 444  Q
     |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||| ||||||||||   |||||| |||||||||| ||    
T  30264756 tccttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgaaatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtatagtttattgcatcaaaagtagta 30264657  T
Q  445 acatttattgattgtcttgctttgtgtaaaatgtcataaaatgacaattaaaaaggagcggagg 508  Q
     || || |||||||||||| ||| |||||||||||| ||  |||||||||||||||| ||||||    
T  30264656 tcaattgttgattgtcttggtttatgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaacggagg 30264593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 132; E-Value: 5e-68
Query Start/End: Original strand, 236 - 432
Target Start/End: Original strand, 32674191 - 32674391
Alignment:
Q  236 tactcactccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttatttcaatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaactttaaatgttatttta 335  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  32674191 tactccctccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttgttccaatttaacaatcactttcaaagttcaatgcaactttaaatgttgtttta 32674290  T
Q  336 tcaatattacccttagttatttattgtggagatagaaatatatgaaatgaga----tattaaatgaataaggatattatggtaaaagtatcaattattgt 431  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||    |||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||    
T  32674291 tcaatattacccgtagttatttattgcggagagaaaaatatatgaaatgagaggagtattaaatgaataaggctattatagtaaaaatatcaattattgt 32674390  T
Q  432 a 432  Q
    |    
T  32674391 a 32674391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 131; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 236 - 513
Target Start/End: Complemental strand, 32855043 - 32854768
Alignment:
Q  236 tactcactccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttatttcaatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaactttaaatgttatttta 335  Q
    ||||| |||||||| ||| ||| |||||||||| |||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  32855043 tactccctccgttcatttataattgtcacttttagagaaattttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgtttta 32854944  T
Q  336 tcaatattacccttagttatttattgtggagatagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggatattatggtaaaagtatcaattattgtatca 435  Q
     ||||||||||||||| | ||||||| ||||| ||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||  ||| | |||||||||  ||  |||||||||    
T  32854943 ccaatattacccttagatgtttattgcggagagagaaacatatgaaatgaaatattaaattaataaggccattgtagtaaaagtaaaaacaattgtatca 32854844  T
Q  436 aaagtaataacatttattgattgtcttgctttgtgtaaaatgtcataaaatgacaattaaaaaggagcggaggtagta 513  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||  ||  |||||||||| | ||| ||||| |||||||||| |||||||||||    
T  32854843 aaagtaataacatttattgattatcttagtt--tgtaaaatgttaaaaagtgacagttaaaaaggaacggaggtagta 32854768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 129; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 244 - 513
Target Start/End: Original strand, 36375559 - 36375830
Alignment:
Q  244 ccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttatttcaatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaactttaaatgttattttatcaatatt 343  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||  |||| || | |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |    
T  36375559 ccgttcctttttaagtgtcatttttggagaaaaattttgttcctatttgactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttatcaatagt 36375658  T
Q  344 acc--cttagttatttattgtggagatagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggatattatggtaaaagtatcaattattgtatcaaaagta 441  Q
    |    ||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||| |||   |||||| |||||| |||    
T  36375659 attatcttggttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaattatagcttattgcatcaaaggta 36375758  T
Q  442 ataacatttattgattgtcttgctttgtgtaaaatgtcataaaatgacaattaaaaaggagcggaggtagta 513  Q
     || || || |||||||||||| |||||||||||||||| ||  |||||||||||||||| |||||||||||    
T  36375759 gtatcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaacggaggtagta 36375830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 128; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 236 - 499
Target Start/End: Complemental strand, 11560310 - 11560047
Alignment:
Q  236 tactcactccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttatttcaatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaactttaaatgttatttta 335  Q
    ||||| ||||||| ||| |||||||||| ||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  11560310 tactccctccgtttcttcttaagtgtcagttttggagaaaatttttgtttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgtttta 11560211  T
Q  336 tcaatattacccttagttatttattgtggagatagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggatattatggtaaaagtatcaattattgtatca 435  Q
     |||||||  |||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||   ||||| |||||||||    |||||  ||||    
T  11560210 ccaatattgtccttagttatttattgtgaagagagaaatatatgcaatgagatattaaatgaataagataattatagtaaaagtacagcttattacatca 11560111  T
Q  436 aaagtaataacatttattgattgtcttgctttgtgtaaaatgtcataaaatgacaattaaaaag 499  Q
    ||||||||| || || |||||||||||| ||| |||||||||||| ||  ||| ||||||||||    
T  11560110 aaagtaatatcaattgttgattgtcttggtttatgtaaaatgtcaaaatgtgataattaaaaag 11560047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 127; E-Value: 5e-65
Query Start/End: Original strand, 243 - 433
Target Start/End: Original strand, 2012848 - 2013038
Alignment:
Q  243 tccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttatttcaatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaactttaaatgttattttatcaatat 342  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||| ||| ||    
T  2012848 tccgttcctttttaagtgtcatttttggagaaattttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacaataaatgttgttttaccaacat 2012947  T
Q  343 tacccttagttatttattgtggagatagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggatattatggtaaaagtatcaattattgtat 433  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| | ||||| |||||| |||||||||| |||||||||||    
T  2012948 tacccttagttatttattgtggagagagaaatatatgaaataagatattaaattactaaggttattatagtaaaagtataaattattgtat 2013038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 127; E-Value: 5e-65
Query Start/End: Original strand, 236 - 514
Target Start/End: Complemental strand, 13849978 - 13849700
Alignment:
Q  236 tactcactccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttatttcaatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaactttaaatgttatttta 335  Q
    ||||| ||||||| |||||||| ||||||||||  ||||||||||| ||   |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||    
T  13849978 tactccctccgtttctttttaattgtcacttttaaagaaattttttgttcttatttaactgtcactttcaaagttcaatgcatcattaaatgttgtttta 13849879  T
Q  336 tcaatattacccttagttatttattgtggagatagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggatattatggtaaaagtatcaattattgtatca 435  Q
    ||||||||||| |||| |||||||||  |||| ||||| ||||||||||| ||||||||| || ||||  ||||| |||||||||  |   |||||||||    
T  13849878 tcaatattacctttagatatttattgcagagagagaaacatatgaaatgaaatattaaattaacaaggtcattatagtaaaagtaatagcaattgtatca 13849779  T
Q  436 aaagtaataacatttattgattgtcttgctttgtgtaaaatgtcataaaatgacaattaaaaaggagcggaggtagtaa 514  Q
    ||| |||||| ||||||||||||| ||| ||| | |||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  13849778 aaactaataatatttattgattgttttggtttatataaaatatcaaaaaatgacaattaaaaaggaacggaggtagtaa 13849700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 127; E-Value: 5e-65
Query Start/End: Original strand, 236 - 513
Target Start/End: Original strand, 14288411 - 14288686
Alignment:
Q  236 tactcactccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttatttcaatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaactttaaatgttatttta 335  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| || | |||||||||||| ||||||||||||||  ||| ||||||||| |||||    
T  14288411 tactccctccgtttctttttaagtgtcacttttggagaaaatttttgttcctatttaactgtcattttcaaagttcaatataacattaaatgttgtttta 14288510  T
Q  336 tcaatattacccttagttatttattgtggagatagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggatattatggtaaaagtatcaattattgtatca 435  Q
    ||||||||  ||||| |||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||   |||||| || |    
T  14288511 tcaatattgtccttaattatttatcgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtatagcttattgcataa 14288610  T
Q  436 aaagtaataacatttattgattgtcttgctttgtgtaaaatgtcataaaatgacaattaaaaaggagcggaggtagta 513  Q
    |||||| || || ||||||||||||||  ||||| |||||| ||| ||  |||||||||||||||| |||| ||||||    
T  14288611 aaagtagtatcaattattgattgtctt--tttgtataaaatatcaaaatgtgacaattaaaaaggaacggaagtagta 14288686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 122; E-Value: 5e-62
Query Start/End: Original strand, 236 - 513
Target Start/End: Original strand, 13215373 - 13215650
Alignment:
Q  236 tactcactccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttatttcaatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaactttaaatgttatttta 335  Q
    ||||| ||| || |||||||||||||| ||||| ||||| | |||| || | ||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||| |||||    
T  13215373 tactccctctgtacctttttaagtgtctcttttagagaattattttgttcctatttaactgtcactttcgaagttcaatgtaacattaaatgttgtttta 13215472  T
Q  336 tcaatattacccttagttatttattgtggagatagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggatattatggtaaaagtatcaattattgtatca 435  Q
     |||||||| ||||| |||||||||  ||||| ||||||||||||||| |||| |||||| |||| || |||||| |||||| ||   || |||||||||    
T  13215473 ccaatattatccttacttatttattacggagagagaaatatatgaaattagattttaaattaatagggttattatagtaaaaatacatatcattgtatca 13215572  T
Q  436 aaagtaataacatttattgattgtcttgctttgtgtaaaatgtcataaaatgacaattaaaaaggagcggaggtagta 513  Q
    |||||| ||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||| ||| | |||||||||||||| |||||||||||    
T  13215573 aaagtagtaacatttattgagtgtattggtttgtgtaaaatgtcaaaaagtaacaattaaaaaggaacggaggtagta 13215650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 122; E-Value: 5e-62
Query Start/End: Original strand, 233 - 470
Target Start/End: Complemental strand, 15677557 - 15677321
Alignment:
Q  233 ttatactcactccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttatttcaatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaactttaaatgttatt 332  Q
    |||||||| |||||||  ||||||||||||| |||||||||||  |||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  15677557 ttatactccctccgttattttttaagtgtcatttttggagaaaaattttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatattatt 15677458  T
Q  333 ttatcaatattacccttagttatttattgtggagatagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggatattatggtaaaagtatcaattattgta 432  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||  ||||||||| | |||||| |    
T  15677457 ttatcaatattatccttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgtgatattaaatgaataaggtcattataataaaagtataacttattgca 15677358  T
Q  433 tcaaaagtaataacatttattgattgtcttgctttgtg 470  Q
    ||||||||| || ||  | |||||||||||| ||||||    
T  15677357 tcaaaagtagtatca-atgttgattgtcttggtttgtg 15677321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 120; E-Value: 8e-61
Query Start/End: Original strand, 233 - 501
Target Start/End: Complemental strand, 28145838 - 28145569
Alignment:
Q  233 ttatactcactccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttatttcaatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaactttaaatgttatt 332  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||    
T  28145838 ttatacttcctccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaaatttttcttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgtt 28145739  T
Q  333 ttatcaatattacccttagttatttattgtggagatagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggatattatggtaaaagtatcaattattgta 432  Q
    ||| |||||||  |||||||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| |  ||||| || |||||||   |||||| |    
T  28145738 ttaccaatattgtccttagttatttattgcggagagagaattatatgaaatgagatattaaatgaataatgtcattatagt-aaagtatagcttattgca 28145640  T
Q  433 tcaaaagtaataacatttattgattgtcttgctttgtgt--aaaatgtcataaaatgacaattaaaaagga 501  Q
    ||||||||| || || || |||||||||||| ||| | |  ||||| ||| ||  ||||||||||||||||    
T  28145639 tcaaaagtagtatcaattgttgattgtcttgatttatataaaaaatatcaaaatgtgacaattaaaaagga 28145569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 119; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 236 - 514
Target Start/End: Original strand, 4654699 - 4654977
Alignment:
Q  236 tactcactccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttatttcaatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaactttaaatgttatttta 335  Q
    ||||| ||||||||||| ||| |||||  ||||| ||||||||||  |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  4654699 tactccctccgttccttcttacgtgtcttttttgaagaaatttttcgtttctatttaactgtcacttgcaaagttcaatgcaacattaaatattatttta 4654798  T
Q  336 tcaatattacccttagttatttattgtggagatagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggatattatggtaaaagtatcaattattgtatca 435  Q
     |||||||| |||||||||||||| | ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||  |  | |||||| ||||    
T  4654799 ccaatattatccttagttatttatagcggagagagaaatgtatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaaacacaacttattgcatca 4654898  T
Q  436 aaagtaataacatttattgattgtcttgctttgtgtaaaatgtcataaaatgacaattaaaaaggagcggaggtagtaa 514  Q
    |||||| ||||| | ||||| | | ||| ||| |||||||||||| ||   ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  4654899 aaagtagtaacaatcattgactattttggtttatgtaaaatgtcaaaatgagacaattaaaaaggaacggaggtagtaa 4654977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 118; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 12 - 149
Target Start/End: Original strand, 27635589 - 27635726
Alignment:
Q  12 catcatctataaggcccaataaggaactagaaaaacaaggagcattgtacaactccaaattaaaagtaatctaaattttaaaactaaattatttattaca 111  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  27635589 catcacctataaggcccaataagaaactagaaaaacaaggagcattatacaactccaaattaaaagtaatctaaattttaaaactaaactatttattaca 27635688  T
Q  112 aacaagattcactaaagaaagataaaatattggtcctc 149  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  27635689 aacaagattcactaaagaaagataacatattggtcctc 27635726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 117; E-Value: 5e-59
Query Start/End: Original strand, 243 - 498
Target Start/End: Complemental strand, 36405098 - 36404842
Alignment:
Q  243 tccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttatttcaatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaactttaaatgttattttatcaatat 342  Q
    ||||||| |||||||||||| |||||| ||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||    
T  36405098 tccgttcatttttaagtgtctcttttgaagaaaatttttgtttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaatattaaatgttattttaccaatat 36404999  T
Q  343 tacccttagttatttattgt-ggagatagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggatattatggtaaaagtatcaattattgtatcaaaagta 441  Q
    || |||||||||||||||   ||| | | ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||| | |||||| ||||||||||    
T  36404998 tatccttagttatttatttacggatagataaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggttattatagtaaaaatataacttattgcatcaaaagta 36404899  T
Q  442 ataacatttattgattgtcttgctttgtgtaaaatgtcataaaatgacaattaaaaa 498  Q
     ||||| | ||||| | ||||| ||  |||||||| ||| ||  |||||||||||||    
T  36404898 gtaacaatcattgactatcttggttcatgtaaaatatcaaaatgtgacaattaaaaa 36404842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 117; E-Value: 5e-59
Query Start/End: Original strand, 243 - 514
Target Start/End: Complemental strand, 38072482 - 38072217
Alignment:
Q  243 tccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttatttcaatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaactttaaatgttattttatcaatat 342  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||  |||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||    
T  38072482 tccgttccttttcaagtgtcacttttggagaaattttttgtttctatttaactgtcatttttgaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatat 38072383  T
Q  343 tacccttagttatttattgtggagatagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggatattatggtaaaagtatcaattattgtatcaaaagtaa 442  Q
    |  | |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||      | |||   |||||| ||||||||||     
T  38072382 tgtctttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataagttcattat------aatatagcttattgcatcaaaagtag 38072289  T
Q  443 taacatttattgattgtcttgctttgtgtaaaatgtcataaaatgacaattaaaaaggagcggaggtagtaa 514  Q
    || || || |||||||| ||| |||||||||||||| | || ||||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  38072288 tatcaattgttgattgttttggtttgtgtaaaatgttaaaatatgacaaataaaaaggaacggaggtagtaa 38072217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 116; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 236 - 514
Target Start/End: Original strand, 1395544 - 1395821
Alignment:
Q  236 tactcactccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttatttca-atttaactgtcactttcaaagttcaatgcaactttaaatgttatttt 334  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||  |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||    
T  1395544 tactccctccgttcctttttaagtgtcacatttgtagaaattttttcgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacaataaatgtt-tttt 1395642  T
Q  335 atcaatattacccttagttatttattgtggagatagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggatattatggtaaaagtatcaattattgtatc 434  Q
    | ||| |||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||| | |||||||| || ||||  |||||| |||||| ||| |||||||||||     
T  1395643 accaacattacccttagttaattattgcggagagagaaatatatgaaataaaatattaaaagactaagactattatagtaaaaatataaattattgtata 1395742  T
Q  435 aaaagtaataacatttattgattgtcttgctttgtgtaaaatgtcataaaatgacaattaaaaaggagcggaggtagtaa 514  Q
    | ||  | ||||||||||| | ||| ||| |||||||||||||||| ||||  ||| |||||||||| ||||||||||||    
T  1395743 agaaaaagtaacatttattaagtgtattggtttgtgtaaaatgtca-aaaagtacagttaaaaaggaacggaggtagtaa 1395821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 112; E-Value: 5e-56
Query Start/End: Original strand, 288 - 510
Target Start/End: Original strand, 10263788 - 10264010
Alignment:
Q  288 atttaactgtcactttcaaagttcaatgcaactttaaatgttattttatcaatattacccttagtt-atttattgtggagatagaaatatatgaaatgag 386  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||| ||||| |||||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  10263788 atttaactgtcactttcaaatttcaatgcaatattaaatgttgttttaccaatattatccttagtttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgag 10263887  T
Q  387 atattaaatgaataaggatattatggtaaaagtatcaattattgtatcaaaagtaataacatttattgattgtcttgctttgtgtaaaatgtcataaaat 486  Q
    |||||||||||||||||  ||||| ||||||||||   |||||| |||||||||| || || || ||| |||||||| |||||||||||||||| || ||    
T  10263888 atattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtatagtttattgcatcaaaagtagtatcaatt-ttggttgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatat 10263986  T
Q  487 gacaattaaaaaggagcggaggta 510  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||    
T  10263987 gacaatttaaaaggaacggaggta 10264010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 109; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 254 - 514
Target Start/End: Original strand, 4883601 - 4883861
Alignment:
Q  254 ttaagtgtcacttttggagaaattttttatttcaatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaactttaaatgttattttatcaatattacccttagtt 353  Q
    ||||||||| |||||| ||||||||||| || | |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||| | ||||||    
T  4883601 ttaagtgtctcttttgaagaaattttttgttcctatttaactgtcattttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattatctttagtt 4883700  T
Q  354 atttattgtggagatagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggatattatggtaaaagtatcaattattgtatcaaaagtaataacatttatt 453  Q
    ||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||  | |||||  |||||||||| ||||| | |||    
T  4883701 atttattgcagagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtacaacttattacatcaaaagtagtaacaatcatt 4883800  T
Q  454 gattgtcttgctttgtgtaaaatgtcataaaatgacaattaaaaaggagcggaggtagtaa 514  Q
    |  | | ||  ||| |||||||||||| ||  ||||||||||||||||  ||| |||||||    
T  4883801 ggctatattagtttatgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaatggatgtagtaa 4883861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 109; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 12 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 21797920 - 21797800
Alignment:
Q  12 catcatctataaggcccaataaggaactagaaaaacaaggagcattgtacaactccaaattaaaagtaatctaaattttaaaactaaattatttattaca 111  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  21797920 catcacctataaggcccaataaggaactagaaaaacaaggagcattatacaactccaaattaaaagtaatctaaattttaaaactaaactatttattaca 21797821  T
Q  112 aacaagattcactaaagaaag 132  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  21797820 aacaagattcactaaagaaag 21797800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 109; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 12 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 21803074 - 21802954
Alignment:
Q  12 catcatctataaggcccaataaggaactagaaaaacaaggagcattgtacaactccaaattaaaagtaatctaaattttaaaactaaattatttattaca 111  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  21803074 catcacctataaggcccaataaggaactagaaaaacaaggagcattatacaactccaaattaaaagtaatctaaattttaaaactaaactatttattaca 21802975  T
Q  112 aacaagattcactaaagaaag 132  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  21802974 aacaagattcactaaagaaag 21802954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 109; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 246 - 514
Target Start/End: Complemental strand, 34884791 - 34884523
Alignment:
Q  246 gttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttatttcaatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaactttaaatgttattttatcaatattac 345  Q
    |||||||||||| |||||||||| |||||||||||| || | |||||||| ||||||| |||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  34884791 gttcctttttaactgtcacttttagagaaattttttgttcctatttaactttcacttttaaagttcattgcaacattaaatgttgttttatcaatattac 34884692  T
Q  346 ccttagttatttattgtggagatagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggatattatggtaaaagtatcaattattgtatcaaaagtaataa 445  Q
    | |||| | ||||||| ||| | | ||| ||||||||| | | ||||||| |||||||  ||||| |||||||||  ||  ||||||||||||||| |||    
T  34884691 ctttagatgtttattgcggaaagaaaaacatatgaaataaaacattaaattaataaggtcattatagtaaaagtaaaaacaattgtatcaaaagtagtaa 34884592  T
Q  446 catttattgattgtcttgctttgtgtaaaatgtcataaaatgacaattaaaaaggagcggaggtagtaa 514  Q
     ||||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||| ||||| || |||| || || |||||||||    
T  34884591 tatttattgattatcttggtttgtgtaaaatgtcaaaaagtgacagtttaaaatgaacgaaggtagtaa 34884523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #49
Raw Score: 108; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 265 - 480
Target Start/End: Original strand, 6013484 - 6013699
Alignment:
Q  265 ttttggagaaattttttatttcaatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaactttaaatgttattttatcaatattacccttagttatttattgtgg 364  Q
    |||| |||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||    
T  6013484 tttttgagaaattttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacaataaatgttgttttaccaacattacccttagttatttattgcgg 6013583  T
Q  365 agatagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggatattatggtaaaagtatcaattattgtatcaaaagtaataacatttattgattgtcttgc 464  Q
    | | ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||  ||||||  ||||||||| ||| ||||||| | ||  | ||||||||||||| |||||||     
T  6013584 aaagagaaatatatgaaataagatattaaatgactaagactattataataaaagtataaatgattgtataagaaaaagtaacatttattgaatgtcttga 6013683  T
Q  465 tttgtgtaaaatgtca 480  Q
    ||||||||||||||||    
T  6013684 tttgtgtaaaatgtca 6013699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #50
Raw Score: 102; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 288 - 497
Target Start/End: Complemental strand, 38186263 - 38186054
Alignment:
Q  288 atttaactgtcactttcaaagttcaatgcaactttaaatgttattttatcaatattacccttagttatttattgtggagatagaaatatatgaaatgaga 387  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  38186263 atttaactgtcattttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgtggagaaagaaatatatgaaatgaga 38186164  T
Q  388 tattaaatgaataaggatattatggtaaaagtatcaattattgtatcaaaagtaataacatttattgattgtcttgctttgtgtaaaatgtcataaaatg 487  Q
    ||||||||||||||||  ||||| |||||| |||   |||||  ||||||| ||||| || || |||||||||||  |||||||||||| ||| ||  ||    
T  38186163 tattaaatgaataaggtcattatagtaaaaatatagtttattacatcaaaaataatatcaattgttgattgtcttagtttgtgtaaaatatcaaaatgtg 38186064  T
Q  488 acaattaaaa 497  Q
    ||||| ||||    
T  38186063 acaataaaaa 38186054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #51
Raw Score: 96; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 295 - 513
Target Start/End: Original strand, 14308434 - 14308650
Alignment:
Q  295 tgtcactttcaaagttcaatgcaactttaaatgttattttatcaatattacccttagttatttattgtggagatagaaatatatgaaatgagatattaaa 394  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||| |  ||||||||||  |||  ||| |||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  14308434 tgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatatcgttttatcaattgtac--ttaattatttattgaggagagataaatatatgaaatgagatattaaa 14308531  T
Q  395 tgaataaggatattatggtaaaagtatcaattattgtatcaaaagtaataacatttattgattgtcttgctttgtgtaaaatgtcataaaatgacaatta 494  Q
    |||||||||  ||||| ||||||||||   |||||| |||||||||| || || || |||||||||||| |||||||||||||||| ||  |||||||||    
T  14308532 tgaataaggtcattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaagtagtatcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaatta 14308631  T
Q  495 aaaaggagcggaggtagta 513  Q
    ||||| | |||| ||||||    
T  14308632 aaaagaaacggatgtagta 14308650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #52
Raw Score: 94; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 242 - 475
Target Start/End: Original strand, 37077156 - 37077389
Alignment:
Q  242 ctccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttatttcaatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaactttaaatgttattttatcaata 341  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||  |||||| ||||| |||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||| ||    
T  37077156 ctccgttcatttttaattgtcacttttgaagaaattttttgtttttatttaagtgtcattttcaaagttcaatacaacattaaatgttattttgtcatta 37077255  T
Q  342 ttacccttagttatttattgtggagatagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggatattatggtaaaagtatcaattattgtatcaaaagta 441  Q
    ||||| || |||||||||||  || | ||||||||||||||||||||||||||| |  |||| |||||| | ||||  || ||||||||||| |||||||    
T  37077256 ttaccattggttatttattgcagatagagaaatatatgaaatgagatattaaattatgaaggttattatagaaaaaagataaattattgtataaaaagta 37077355  T
Q  442 ataacatttattgattgtcttgctttgtgtaaaa 475  Q
     ||| || ||||  || ||||| |||||||||||    
T  37077356 gtaaaatgtatttgttatcttggtttgtgtaaaa 37077389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #53
Raw Score: 92; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 310 - 513
Target Start/End: Complemental strand, 31011905 - 31011704
Alignment:
Q  310 tcaatgcaactttaaatgttattttatcaatattacccttagttatttattgtggagatagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggatatta 409  Q
    |||||||||| |||||||||||||||  ||||||||| ||| ||||| |||||||||| |||||| |||| ||| ||||||||||| || |||| |||||    
T  31011905 tcaatgcaacattaaatgttattttactaatattacctttatttatt-attgtggagagagaaatgtatgtaataagatattaaataaacaaggttatta 31011807  T
Q  410 tggtaaaagtatcaattattgtatcaaaagtaataacatttattgattgtcttgctttgtgtaaaatgtcataaaatgacaattaaaaaggagcggaggt 509  Q
    | |||||| ||  |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||  | |||||||||||||| |||||||    
T  31011806 tagtaaaaatag-aattattgtatcaaaagtagcaacatttattgattgtcttggtttgtataaaatgtcaaaatgtaacaattaaaaaggaacggaggt 31011708  T
Q  510 agta 513  Q
    ||||    
T  31011707 agta 31011704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #54
Raw Score: 89; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 12 - 116
Target Start/End: Original strand, 44801760 - 44801864
Alignment:
Q  12 catcatctataaggcccaataaggaactagaaaaacaaggagcattgtacaactccaaattaaaagtaatctaaattttaaaactaaattatttattaca 111  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  44801760 catcacctataaggcccaataaggaactagaaaaacaaggagcattatacaactccaaattaaaagtaatctaaattttaaaaccaaactatttattaca 44801859  T
Q  112 aacaa 116  Q
    |||||    
T  44801860 aacaa 44801864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #55
Raw Score: 88; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 235 - 476
Target Start/End: Original strand, 29041931 - 29042167
Alignment:
Q  235 atactcactccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttatttcaatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaactttaaatgttatttt 334  Q
    |||||| |||||||||||||||| |||||||||| || |||||||||  ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| || || ||||    
T  29041931 atactcgctccgttcctttttaattgtcacttttagataaatttttt--ttctatttaactgtcactttcaaagtccaatgcaacattagatattgtttt 29042028  T
Q  335 atcaatattacccttagttatttattgtggagatagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggatattatggtaaaagtatcaattattgtatc 434  Q
    | ||||||||||| ||| |||||||  || ||| ||||| ||||||||||| | ||||||| ||||| |  ||||| |||||||||  ||  ||||||||    
T  29042029 accaatattacccgtagatatttat--tgcagagagaaacatatgaaatga-aaattaaattaataacgtcattattgtaaaagtaaaaacaattgtatc 29042125  T
Q  435 aaaagtaataacatttattgattgtcttgctttgtgtaaaat 476  Q
    |||| || ||||||||| ||||||||| | ||||||||||||    
T  29042126 aaaaatagtaacatttactgattgtctcgatttgtgtaaaat 29042167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #56
Raw Score: 86; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 242 - 514
Target Start/End: Original strand, 8443677 - 8443936
Alignment:
Q  242 ctccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttatttcaatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaactttaaatgttatttt-atcaat 340  Q
    ||||| || ||||||| ||||| ||||| ||||||||||| |  | ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||| | ||||    
T  8443677 ctccgctcatttttaattgtcatttttgaagaaattttttgtccctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaaatt-aaatgttgtttttaccaat 8443775  T
Q  341 attacccttagttatttattgtggagatagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggatattatggtaaaagtatcaattattgtatcaaaagt 440  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||| ||||| | ||||||||| ||||||||| |||||||  ||||| |||||||||  ||  |||||             
T  8443776 attacccttagatatttattgcggagagagaaacaaatgaaatgaaatattaaattaataaggtcattatagtaaaagtaaaaacaattgt--------- 8443866  T
Q  441 aataacatttattgattgtcttgctttgtgtaaaatgtcataaaatgacaattaaaaaggagcggaggtagtaa 514  Q
        ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| | ||||||||||    
T  8443867 ----acacttattgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaaagtgacaattaaaaaggaacagaggtagtaa 8443936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #57
Raw Score: 79; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 232 - 501
Target Start/End: Complemental strand, 4952954 - 4952694
Alignment:
Q  232 attatactcactccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttatttcaatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaactttaaatgttat 331  Q
    ||||||||| |||| ||| ||||||| ||||| |||| |||||||||||| ||   |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||        
T  4952954 attatactccctcctttc-tttttaattgtcatttttagagaaattttttgttcttatttaactgtcattttcaaagttcaatgcaacattaaatga--- 4952859  T
Q  332 tttatcaatattacccttagttattt-attgtggagatagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggatattatggtaaaagtatcaattattg 430  Q
          |||||||||||||  ||||| |||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||   |||| |||||||||  ||  || |    
T  4952858 ------aatattacccttaaatattttattgtggagagagaaacatatgaaatgaaatattaaattaataaggccgttatagtaaaagtaaaaacaatag 4952765  T
Q  431 tatcaaaagtaataacatttattgattgtcttgctttgtgtaaaatgtcataaaatgacaattaaaaagga 501  Q
    ||| ||||||| ||||||||||||||  | ||| ||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  4952764 tattaaaagtagtaacatttattgatcattttggtttatgtaaaatgtcaaaaagtgacaattaaaaagga 4952694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #58
Raw Score: 78; E-Value: 9e-36
Query Start/End: Original strand, 247 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 34309301 - 34309149
Alignment:
Q  247 ttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttatttcaatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaactttaaatgttattttatcaatattacc 346  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| |||||| || | ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||| |||| ||| |    
T  34309301 ttcctttttaagtgtcacttttgaagaattttttt-ttcctatttaactgtcactttcgaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatgttatc 34309203  T
Q  347 cttagttatttattgtggagatagaaatatatgaaatgagatattaaatgaata 400  Q
     ||  ||||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  34309202 attgcttattcattgtggagagagaaatatatgaaatgaaatattaaattaata 34309149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #59
Raw Score: 77; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 262 - 501
Target Start/End: Complemental strand, 7529942 - 7529702
Alignment:
Q  262 cacttttggagaaattttttatttcaatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaactttaaatgttattttatcaatattacccttagttatttattg 361  Q
    |||||||| | ||||||||| |||| |  ||| | |||||||||||||||||  |||  ||||||| | | ||| | |||||||||||||||||||||||    
T  7529942 cacttttgtataaattttttgtttctaaataagtttcactttcaaagttcaacacaatattaaatgatgtgttacctatattacccttagttatttattg 7529843  T
Q  362 tggagatagaaatatatgaaatg-agatattaaatgaataaggatattatggtaaaagtatcaattattgtatcaaaagtaataacatttattgattgtc 460  Q
      |||| |||||||||||||||| | |||||||||||  |||| |||||| | ||||  || |||| |||||||||||||| ||| |||||||  |||||    
T  7529842 cagagagagaaatatatgaaatgaaaatattaaatgatgaaggctattataggaaaatgataaattgttgtatcaaaagtagtaaaatttattagttgtc 7529743  T
Q  461 ttgctttgtgtaaaatgtcataaaatgacaattaaaaagga 501  Q
    ||  ||||||||||| | || ||||||||||||||||||||    
T  7529742 ttcatttgtgtaaaaagacaaaaaatgacaattaaaaagga 7529702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #60
Raw Score: 76; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 234 - 373
Target Start/End: Original strand, 14284106 - 14284245
Alignment:
Q  234 tatactcactccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttatttcaatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaactttaaatgttattt 333  Q
    |||||||  |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |  ||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  14284106 tatactccatccgtttctttttaagtgtcacttttgaagaaattttttattcctgtttagttgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttattt 14284205  T
Q  334 tatcaatattacccttagttatttattgtggagatagaaa 373  Q
    || |||||||  ||||| |||||||||| ||||| |||||    
T  14284206 taccaatattgtccttaattatttattgcggagagagaaa 14284245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #61
Raw Score: 71; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 243 - 441
Target Start/End: Original strand, 25787324 - 25787522
Alignment:
Q  243 tccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttatttcaatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaactttaaatgttattttatcaatat 342  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||||| | |||| |||| |||  | |||||||||  ||||||||||||||| | | |||||||| | |||| | ||||    
T  25787324 tccgttcctttataattgtcacttttgcataaatattttgtttttaattaactgtcgttttcaaagttcaatgtatcattaaatgtgactttacctatat 25787423  T
Q  343 tacccttagttatttattgtggagatagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggatattatggtaaaagtatcaattattgtatcaaaagta 441  Q
    ||||||||  |||||||||   ||| |||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||| | ||||| || |||| ||||||||||||||    
T  25787424 tacccttatatatttattgcatagagagaaatatatgaaatgaagtattaaatgattaaggatattataggaaaaggataaattgttgtatcaaaagta 25787522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #62
Raw Score: 71; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 288 - 513
Target Start/End: Complemental strand, 37116804 - 37116589
Alignment:
Q  288 atttaactgtcactttcaaagttcaatgcaactttaaatgttattttatcaatattacccttagttatttattgtggagatagaaatatatgaaatgaga 387  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||| || |||||  ||||| | ||| | | ||||| | |    
T  37116804 atttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttatcaatcttacccttagataattattacggagagaaaaacacaagaaataaaa 37116705  T
Q  388 tattaaatgaataaggatattatggtaaaagtatcaattattgtatcaaaagtaataacatttattgattgtcttgctttgtgtaaaatgtcataaaatg 487  Q
    |||||||| ||||||   |          ||||  ||  |||||||||||| || |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| | ||||    
T  37116704 tattaaataaataagacca----------agtaaaaacaattgtatcaaaaatagtaacatttattggttgtcttggtttgtgtaaaatgtcagagaatg 37116615  T
Q  488 acaattaaaaaggagcggaggtagta 513  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||    
T  37116614 acaattaaaaaggaacggagatagta 37116589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #63
Raw Score: 70; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 369 - 510
Target Start/End: Complemental strand, 3376407 - 3376266
Alignment:
Q  369 agaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggatattatggtaaaagtatcaattattgtatcaaaagtaataacatttattgattgtcttgctttg 468  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||  ||||| |||   ||||| ||| ||||||| || || ||||||||||||||| ||||    
T  3376407 agaaatatatgaaatgagatattaaatgaataatgttattataataaaaatatagcttattatattaaaagtagtatcaattattgattgtcttgatttg 3376308  T
Q  469 tgtaaaatgtcataaaatgacaattaaaaaggagcggaggta 510  Q
    |||||||||||| ||  |||||||||||||||| ||||||||    
T  3376307 tgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaacggaggta 3376266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #64
Raw Score: 69; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 250 - 398
Target Start/End: Original strand, 30544514 - 30544662
Alignment:
Q  250 ctttttaagtgtcacttttggagaaattttttatttcaatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaactttaaatgttattttatcaatattaccctt 349  Q
    |||||||| ||||||||||| | ||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |  ||||||||||    
T  30544514 ctttttaattgtcacttttgcataaattttttgtttctaattaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttacctttattaccctt 30544613  T
Q  350 agttatttattgtggagatagaaatatatgaaatgagatattaaatgaa 398  Q
      ||||||| ||| |||  | || |||||||||| ||||||||||||||    
T  30544614 gattatttactgtagagggataagtatatgaaataagatattaaatgaa 30544662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #65
Raw Score: 68; E-Value: 8e-30
Query Start/End: Original strand, 270 - 385
Target Start/End: Complemental strand, 25187356 - 25187241
Alignment:
Q  270 gagaaattttttatttcaatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaactttaaatgttattttatcaatattacccttagttatttattgtggagata 369  Q
    |||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||| ||||  ||||||||| ||||| |    
T  25187356 gagaaattttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaatattaaatgttattttaccaatattactcttaaatatttattgcggagaga 25187257  T
Q  370 gaaatatatgaaatga 385  Q
    |||| |||||||||||    
T  25187256 gaaacatatgaaatga 25187241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #66
Raw Score: 68; E-Value: 8e-30
Query Start/End: Original strand, 290 - 441
Target Start/End: Complemental strand, 38148244 - 38148094
Alignment:
Q  290 ttaactgtcactttcaaagttcaatgcaactttaaatgttattttatcaatattacccttagttatttattgtggagatagaaatatatgaaatgagata 389  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||  |  ||||||||||  ||||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||    
T  38148244 ttaactgtcactttcaaagttcaatacaacattaaatgttatttttcctttattacccttgattatttattgtagagagagaagtatatgaaatgagata 38148145  T
Q  390 ttaaatgaataaggatattatggtaaaagtatcaattattgtatcaaaagta 441  Q
    ||||||||  || | |||||| | ||||| || ||||||| |||||||||||    
T  38148144 ttaaatgatgaaagttattatagaaaaag-atgaattattttatcaaaagta 38148094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #67
Raw Score: 66; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 233 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 33947695 - 33947490
Alignment:
Q  233 ttatactcactccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttatttcaatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaactttaaatgttatt 332  Q
    |||||||  |||||||||||| ||| ||||||||||  ||||||||||| |||| | |||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||| | ||    
T  33947695 ttatactacctccgttcctttataactgtcacttttacagaaattttttgtttctaattaagtgtcactttcaaagttcaatgtaacattaaatggtgtt 33947596  T
Q  333 ttatcaatattacccttagttatttattgtggagatagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggatattatggtaaaagtatcaattattgta 432  Q
     |  | ||| |  ||||||| ||||||||| |||| |||||||||| ||||  |||||||||| | |||||||||||| |  |||  || ||||||||||    
T  33947595 cttcctataatgtccttagtaatttattgtagagagagaaatatataaaatatgatattaaataattaaggatattataggcaaaacataaattattgta 33947496  T
Q  433 tcaaaa 438  Q
    ||||||    
T  33947495 tcaaaa 33947490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #68
Raw Score: 63; E-Value: 8e-27
Query Start/End: Original strand, 243 - 508
Target Start/End: Complemental strand, 28967486 - 28967222
Alignment:
Q  243 tccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttatttcaatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaactttaaatgttattttatcaatat 342  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| | || |||||  |||| | |||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||  |  |||    
T  28967486 tccgttcctttttaattgtcacttttgcataa-tttttagtttctaattaaatgtcactttcaaagttcaatacaacattaaatgttgttttgcctttat 28967388  T
Q  343 tacccttagttatttattgtggagatagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggatattatggtaaaagtatcaattattgtatcaaaagtaa 442  Q
    |||||||  |||||||| || |||| |||| || |||||||||||||||||||||  |||| |||||| | ||||  || |||| ||| ||||||| ||     
T  28967387 tacccttgattatttatcgtagagagagaagtaaatgaaatgagatattaaatgataaaggttattataggaaaaagatgaattgttgcatcaaaaatag 28967288  T
Q  443 taacatttattgattgtcttgctttgtgt-aaaatgtcataaaatgacaattaaaaaggagcggagg 508  Q
    ||| |  ||||  |||| ||| ||||||| ||||  ||| ||||||||||||||||| || ||||||    
T  28967287 taaaaagtatttgttgttttggtttgtgtaaaaaactca-aaaatgacaattaaaaatgaacggagg 28967222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #69
Raw Score: 60; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 236 - 475
Target Start/End: Original strand, 45065052 - 45065291
Alignment:
Q  236 tactcactccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttatttcaatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaactttaaatgttatttta 335  Q
    ||||| |||||||| ||||||| ||||||||||| | |  |||||| |||| | |||| ||| |||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||     
T  45065052 tactccctccgttcttttttaattgtcacttttgcatattttttttgtttctaattaagtgttactttcaaagttcaatacaacattaaatgttgttttg 45065151  T
Q  336 tcaatattacccttagttatttattgtggagatagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggatattatggtaaaagtatcaattattgtatca 435  Q
     |  ||||||||||  |||||||||||  ||| |||| || ||||||| |||||||||||||  || | |||||| | ||||  || |||| ||| ||||    
T  45065152 cctttattacccttgattatttattgtaaagagagaagtaaatgaaataagatattaaatgatgaatgttattatagaaaaaagatgaattgttgcatca 45065251  T
Q  436 aaagtaataacatttattgattgtcttgctttgtgtaaaa 475  Q
    |||||| ||| |  ||||  |||||||| |||||||||||    
T  45065252 aaagtagtaaaaaatatttgttgtcttggtttgtgtaaaa 45065291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #70
Raw Score: 57; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 242 - 334
Target Start/End: Original strand, 37660130 - 37660222
Alignment:
Q  242 ctccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttatttcaatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaactttaaatgttatttt 334  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||    
T  37660130 ctccgttcatttttaattgtcacttttgcagaaattttttgtttctaattaactgtcactttcaaagttcaatacaacattaaatgttgtttt 37660222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #71
Raw Score: 56; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 158 - 237
Target Start/End: Original strand, 26370530 - 26370609
Alignment:
Q  158 gccttattgtcaactagtctccgagttctatttaaaataccagattgtattgaaaatactttgatcaatgaaatattata 237  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  26370530 gccttattgtcaactagtctccaggttctatttgaaataccaaattgtattgaaaatactttgattaatgaaatgttata 26370609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #72
Raw Score: 55; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 19 - 85
Target Start/End: Original strand, 15010872 - 15010938
Alignment:
Q  19 tataaggcccaataaggaactagaaaaacaaggagcattgtacaactccaaattaaaagtaatctaa 85  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||    
T  15010872 tataaggcccaataaggaactagaaaaacaaggagcattatccaactccaaaataaaagtaatctaa 15010938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #73
Raw Score: 54; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 388 - 513
Target Start/End: Complemental strand, 25186941 - 25186816
Alignment:
Q  388 tattaaatgaataaggatattatggtaaaagtatcaattattgtatcaaaagtaataacatttattgattgtcttgctttgtgtaaaatgtcataaaatg 487  Q
    |||||||| |||||||| | |||||| ||||||  ||  ||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||| ||| ||    
T  25186941 tattaaattaataaggacactatggtgaaagtaaaaacaattgtatcaaaagtagtaacatatattgattatcttggtttgtgtaaaatgtcaaaaagtg 25186842  T
Q  488 acaattaaaaaggagcggaggtagta 513  Q
    ||  |||||||||| |||| ||||||    
T  25186841 acggttaaaaaggaacggaagtagta 25186816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #74
Raw Score: 53; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 242 - 514
Target Start/End: Complemental strand, 838327 - 838055
Alignment:
Q  242 ctccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttatttcaatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaactttaaatgttattttatcaata 341  Q
    |||||||| ||| ||| |||| |||||  | || |||||| |||| | |||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||  | ||     
T  838327 ctccgttcttttataactgtcgcttttatataatttttttgtttctaattaactgtcattttcaaagttcaatgtaacattaaatgttgtttttcctatt 838228  T
Q  342 ttacccttagttatttattgtggagatagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggatattatggtaaaagtatcaattattgtatcaaaagta 441  Q
     |  ||||||| ||||||||  |||| |||||||||||||||  |||||||||| | ||| |||||||| |  |||  || | |||||| ||||||||||    
T  838227 atgtccttagtaatttattgcagagagagaaatatatgaaatatgatattaaataattaaagatattataggcaaaacataagttattgcatcaaaagta 838128  T
Q  442 ataacatttattgattgtcttgctttgtgtaaaatgtcataaaatgacaattaaaaaggagcggaggtagtaa 514  Q
     | | ||  ||| | ||||||| |||||||||||  ||| ||   ||||||||||||||||| |||| |||||    
T  838127 gtgaaatgcatttagtgtcttggtttgtgtaaaaaatcaaaatgcgacaattaaaaaggagcagagggagtaa 838055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #75
Raw Score: 53; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 405 - 513
Target Start/End: Complemental strand, 34262916 - 34262808
Alignment:
Q  405 tattatggtaaaagtatcaattattgtatcaaaagtaataacatttattgattgtcttgctttgtgtaaaatgtcataaaatgacaattaaaaaggagcg 504  Q
    |||||| |||||| |||  |||||| ||||||||||| ||||| ||||||| ||||||| |||||||||||| | | ||| |||||||||||||||| ||    
T  34262916 tattatagtaaaaatatatattattatatcaaaagtagtaacaattattgaatgtcttggtttgtgtaaaatataaaaaattgacaattaaaaaggaacg 34262817  T
Q  505 gaggtagta 513  Q
    |||||||||    
T  34262816 gaggtagta 34262808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #76
Raw Score: 53; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 242 - 410
Target Start/End: Original strand, 42088880 - 42089048
Alignment:
Q  242 ctccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttatttcaatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaactttaaatgttattttatcaata 341  Q
    |||||||| ||| ||| ||||||||||  | || || ||| |||| | |||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||  | |||    
T  42088880 ctccgttcttttataactgtcacttttacataatttctttgtttctaattaagtgtcactttcaaagttcaatgtaacattaaatgttgtttttcctata 42088979  T
Q  342 ttacccttagttatttattgtggagatagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggatattat 410  Q
     | |||||||| ||||||||  |||| ||||||||| |||||  |||||||||| | ||||||||||||    
T  42088980 atgcccttagtaatttattgcagagagagaaatataagaaatatgatattaaataattaaggatattat 42089048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #77
Raw Score: 49; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 155 - 231
Target Start/End: Original strand, 10950159 - 10950234
Alignment:
Q  155 gcggccttattgtcaactagtctccgagttctatttaaaataccagattgtattgaaaatactttgatcaatgaaat 231  Q
    |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  10950159 gcggccttattgtcaattagtctccaagttctatttaaaatacctaattgtattgaaaatac-ttgattaatgaaat 10950234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #78
Raw Score: 48; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 232 - 410
Target Start/End: Complemental strand, 928298 - 928122
Alignment:
Q  232 attatactcactccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttatttcaatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaactttaaatgttat 331  Q
    ||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||| | ||| ||||| |||| | |||||||||  |||||||||  ||| || | ||||||||| |    
T  928298 attatactccctccgttcctttataattgtcacttttgcataaaatttttgtttctaattaactgtcgttttcaaagtctaatacatcattaaatgttgt 928199  T
Q  332 tttatcaatattacccttagttatttattgtggagatagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggatattat 410  Q
    ||||   ||||||  ||||  ||||||||||  ||| |||||||||| ||||||  |||||||||| ||||| ||||||    
T  928198 tttacatatattattcttaaatatttattgt--agagagaaatatattaaatgaagtattaaatgattaaggttattat 928122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #79
Raw Score: 46; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 274 - 383
Target Start/End: Original strand, 2991829 - 2991937
Alignment:
Q  274 aattttttatttcaatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaactttaaatgttattttatcaatattacccttagttatttattgtggagatagaaa 373  Q
    |||||||| || |||||||||  |||||||||||||| ||| |||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||| || ||||| ||| |    
T  2991829 aatttttttttccaatttaacattcactttcaaagttgaat-caacattaaatgttgttttaccaatattacccttagatatttaatgcggagagagaca 2991927  T
Q  374 tatatgaaat 383  Q
     |||||||||    
T  2991928 catatgaaat 2991937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #80
Raw Score: 45; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 260 - 412
Target Start/End: Complemental strand, 18904150 - 18904007
Alignment:
Q  260 gtcacttttggagaaattttttatttcaatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaactttaaatgttattttatcaatattacccttagttatttat 359  Q
    |||||||||  ||||| ||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||         |||  ||||||||| ||||||    
T  18904150 gtcacttttatagaaaatttttgtttctaattaactgtcactttcaaagttcaatgtaacattaaatgtt---------ataaaacccttagtaatttat 18904060  T
Q  360 tgtggagatagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggatattatgg 412  Q
    ||  |||| |||||||||| ||||  |||||||||| | ||||||||||||||    
T  18904059 tgcagagagagaaatatataaaatatgatattaaataattaaggatattatgg 18904007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #81
Raw Score: 45; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 358 - 438
Target Start/End: Original strand, 34721564 - 34721644
Alignment:
Q  358 attgtggagatagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggatattatggtaaaagtatcaattattgtatcaaaa 438  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||| | ||||||||||| ||||| |||||| |||||||||| ||||||||||| ||||    
T  34721564 attgcggagagagaaatatatgaaataatatattaaatgactaaggttattatagtaaaagtataaattattgtataaaaa 34721644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #82
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 629 - 708
Target Start/End: Complemental strand, 27726808 - 27726730
Alignment:
Q  629 acattcaatttttcgtttttctatttaattttctttaattataatcaaatgcaggtacaaccactacatcgagacattca 708  Q
    |||||||||||||||| || | |||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||| ||||||||||| ||||||    
T  27726808 acattcaatttttcgtctt-caatttaattttctttgattataattaaatgcaggtgcaacaactacatcgaggcattca 27726730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #83
Raw Score: 41; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 249 - 480
Target Start/End: Original strand, 3041557 - 3041784
Alignment:
Q  249 cctttttaagtgtcacttttggagaaattttttatttcaatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaactttaaatgttattttatcaatattaccct 348  Q
    ||||| ||| ||||||||||| | ||| ||||  ||| |||| |||| ||| |||||||||| |||| | | ||||||||   |||| | ||||||||||    
T  3041557 cctttataattgtcacttttgcataaaattttgtttttaatt-aactatcattttcaaagtttaatgtatcattaaatgtggctttacctatattaccct 3041655  T
Q  349 tagttatttattgtggagatagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggatattatggtaaaagtatcaattattgtatcaaaagtaataacat 448  Q
     |  |||||||||| ||||  |||||| |||||||||  |||||||||| |||| ||||||| | ||||  || |||| |||||| ||||||||||| |     
T  3041656 aatatatttattgtagaga--gaaatacatgaaatgaagtattaaatgattaagaatattataggaaaaagataaattgttgtattaaaagtaataa-aa 3041752  T
Q  449 ttattgattgtcttgctttgtgtaaaatgtca 480  Q
     ||||  |||||||| ||||||||||| ||||    
T  3041753 gtatttgttgtcttggtttgtgtaaaaagtca 3041784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #84
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 351 - 402
Target Start/End: Original strand, 36824486 - 36824537
Alignment:
Q  351 gttatttattgtggagatagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataag 402  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  36824486 gttatttattgcggagaaagaaatatatgaaatgagatattaaataaataag 36824537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #85
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 290 - 516
Target Start/End: Original strand, 37354023 - 37354249
Alignment:
Q  290 ttaactgtcactttcaaagttcaatgcaactttaaatgttattttatcaatattacccttagttatttattgtggagatagaaatatatgaaatgagata 389  Q
    |||||||||||||||||||||||| |  || ||||||||| ||||  | |||   |||||||| |||||||   |||| | |||||||| ||||  ||||    
T  37354023 ttaactgtcactttcaaagttcaacgtgacattaaatgttgtttttcctataaagcccttagtaatttattagagagagaaaaatatataaaatatgata 37354122  T
Q  390 ttaaatgaataaggatattatggtaaaagtatcaattattgtatcaaaagtaataacatttattgattgtcttgctttgtgtaaaatgtcataaaatgac 489  Q
    |||||| | ||| |||||||| |  |||  || | ||||||||||||||||| | | || || |   ||||||| |||||||||||  | | ||  ||||    
T  37354123 ttaaataattaaagatattataggcaaaacataagttattgtatcaaaagtagtgaaatataattggtgtcttgatttgtgtaaaaaattaaaatgtgac 37354222  T
Q  490 aattaaaaaggagcggaggtagtaagt 516  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||||    
T  37354223 aattaaaatggaacggaggtagtaagt 37354249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #86
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 290 - 383
Target Start/End: Complemental strand, 42263712 - 42263619
Alignment:
Q  290 ttaactgtcactttcaaagttcaatgcaactttaaatgttattttatcaatattacccttagttatttattgtggagatagaaatatatgaaat 383  Q
    |||| |||||||||||||||| |||| ||| ||||||||| ||||  | ||| | || ||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  42263712 ttaagtgtcactttcaaagtttaatgtaacattaaatgttgtttttcctataatgcctttagtaatttattgcagagatagaaatatatgaaat 42263619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #87
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 254 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 28301744 - 28301670
Alignment:
Q  254 ttaagtgtcacttttggagaaattttttatttcaatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaactttaaatgt 328  Q
    ||||||||| |||||| |||||  |||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||| || |||||    
T  28301744 ttaagtgtctcttttgaagaaaaattttgtttcaatttaaatgtcactttcaaagatcaatacaacattgaatgt 28301670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #88
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 297 - 410
Target Start/End: Complemental strand, 1646503 - 1646390
Alignment:
Q  297 tcactttcaaagttcaatgcaactttaaatgttattttatcaatattacccttagttatttattgtggagatagaaatatatgaaatgagatattaaatg 396  Q
    ||||||||||  ||||||||||| |||| | |||| || |||||| |||||||   |||||||||| |||| ||||| | || |||||| ||| ||||||    
T  1646503 tcactttcaagtttcaatgcaacattaagtattatcttgtcaataatacccttgcatatttattgtagagagagaaaaaaataaaatgaaataataaatg 1646404  T
Q  397 aataaggatattat 410  Q
    | ||||| ||||||    
T  1646403 attaagggtattat 1646390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #89
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 339 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 20682955 - 20682902
Alignment:
Q  339 atattacccttagttatttattgtggagatagaaatatatgaaatgagatatta 392  Q
    |||||| |||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||    
T  20682955 atattatccttagatatttattgtagatatagaaatatatgaaatgaggtatta 20682902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #90
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 295 - 395
Target Start/End: Original strand, 14117661 - 14117761
Alignment:
Q  295 tgtcactttcaaagttcaatgcaactttaaatgttattttatcaatattacccttagttatttattgtggagatagaaatatatgaaatgagatattaaa 394  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||| |||| ||||||||| |||||| ||||||||  | ||||||   |||| | ||||| ||||||| ||||| ||||    
T  14117661 tgtcattttcaaagttcaatgtaacgttaactgttattttgtcaataatacccttaactgtttattccagagagataaatagatgaaataagataataaa 14117760  T
Q  395 t 395  Q
    |    
T  14117761 t 14117761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #91
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 406 - 513
Target Start/End: Complemental strand, 1259722 - 1259615
Alignment:
Q  406 attatggtaaaagtatcaattattgtatcaaaagtaataacatttattgattgtcttgctttgtgtaaaatgtcataaaatgacaattaaaaaggagcgg 505  Q
    |||||||||||| |||   ||||||  ||||||||| || || || |||||| ||||| |||||||||||| ||| ||  | |||||||||||| | |||    
T  1259722 attatggtaaaattatagtttattgcgtcaaaagtagtatcaattgttgattctcttggtttgtgtaaaatatcaaaatgtaacaattaaaaagaaacgg 1259623  T
Q  506 aggtagta 513  Q
    ||||||||    
T  1259622 aggtagta 1259615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #92
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 440 - 507
Target Start/End: Original strand, 32674635 - 32674702
Alignment:
Q  440 taataacatttattgattgtcttgctttgtgtaaaatgtcataaaatgacaattaaaaaggagcggag 507  Q
    ||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||| ||| ||| ||||| |||| ||||| |||||    
T  32674635 taataacctttattgactgtcttggtttgtgtaaaatatcacaaagtgacagttaagaaggaacggag 32674702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #93
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 364 - 475
Target Start/End: Original strand, 37660845 - 37660956
Alignment:
Q  364 gagatagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggatattatggtaaaagtatcaattattgtatcaaaagtaataacatttattgattgtcttg 463  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||||||||||  |||| |||||| | ||||  |  |||| |||||| ||||||| ||| ||  |||  ||||||||    
T  37660845 gagagagaaacatatgaaatgagatattaaatgaggaaggttattataggaaaaagaaaaattgttgtattaaaagtagtaaaatgcatttgttgtcttg 37660944  T
Q  464 ctttgtgtaaaa 475  Q
     |||||||||||    
T  37660945 gtttgtgtaaaa 37660956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #94
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 423 - 508
Target Start/End: Original strand, 29056179 - 29056264
Alignment:
Q  423 aattattgtatcaaaagtaataacatttattgattgtcttgctttgtgtaaaatgtcataaaatgacaattaaaaaggagcggagg 508  Q
    |||| ||| |||||||||| ||| || ||||  |||||||| |||||||| || |||| ||| ||||||||||| || ||||||||    
T  29056179 aattgttgcatcaaaagtagtaaaatatatttgttgtcttggtttgtgtagaaagtcaaaaagtgacaattaaatagcagcggagg 29056264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #95
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 971 - 1008
Target Start/End: Complemental strand, 29750414 - 29750377
Alignment:
Q  971 cattcaataaggtaagaatatatgttatatttgttata 1008  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  29750414 cattcaataaggtaagaatatatattacatttgttata 29750377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 214; Significance: 1e-117; HSPs: 64)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 236 - 513
Target Start/End: Complemental strand, 9838383 - 9838106
Alignment:
Q  236 tactcactccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttatttcaatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaactttaaatgttatttta 335  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  9838383 tactccctccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttgttccaatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaactttaaatgttgtttta 9838284  T
Q  336 tcaatattacccttagttatttattgtggagatagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggatattatggtaaaagtatcaattattgtatca 435  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  9838283 tcaatattacccttagttatttattgcggagagggaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggctattatagtaaaagtatcaattattgtatca 9838184  T
Q  436 aaagtaataacatttattgattgtcttgctttgtgtaaaatgtcataaaatgacaattaaaaaggagcggaggtagta 513  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  9838183 aaagtagtaacatttattgattgttttgatttgtgtaaaatatcacaaaatgacaattaaaaaggaacagaggtagta 9838106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 163; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 236 - 510
Target Start/End: Original strand, 23777276 - 23777550
Alignment:
Q  236 tactcactccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttatttcaatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaactttaaatgttatttta 335  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || | |||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  23777276 tactccctccgttcctttttaagtgtcaattttggagaaattttttgttcctatttaactatcactttcgaagttcaatgcaacattaaatgttgtttta 23777375  T
Q  336 tcaatattacccttagttatttattgtggagatagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggatattatggtaaaagtatcaattattgtatca 435  Q
     |||||||| ||||  | |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||  ||||||||||||    
T  23777376 ccaatattatccttgctcatttattgtggagagagaaatatatgaaatgaaatattaaatgaataaggttattatagtaaaagtatatattattgtatca 23777475  T
Q  436 aaagtaataacatttattgattgtcttgctttgtgtaaaatgtcataaaatgacaattaaaaaggagcggaggta 510  Q
    |||||| ||||||||||| | ||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| || |||||    
T  23777476 aaagtagtaacatttatttaatgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaaagtgacaattaaaaaggaacgaaggta 23777550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 158; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 234 - 519
Target Start/End: Original strand, 24663357 - 24663642
Alignment:
Q  234 tatactcactccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttatttcaatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaactttaaatgttattt 333  Q
    |||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||    
T  24663357 tatactccatccgttcctttttaagtatcacttttggagaaaatttttattcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttt 24663456  T
Q  334 tatcaatattacccttagttatttattgtggagatagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggatattatggtaaaagtatcaattattgtat 433  Q
    || |||||||   ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||| ||||||||||   |||||| ||    
T  24663457 taccaatattgttcttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataatgtcattatagtaaaagtatagcttattgcat 24663556  T
Q  434 caaaagtaataacatttattgattgtcttgctttgtgtaaaatgtcataaaatgacaattaaaaaggagcggaggtagtaagtttg 519  Q
    ||||||||||| || || |||||||||||| |||||||||||||||| ||  |||||||||||||||| |||| ||||||| ||||    
T  24663557 caaaagtaatatcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaacggatgtagtaattttg 24663642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 158; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 236 - 501
Target Start/End: Complemental strand, 26470984 - 26470719
Alignment:
Q  236 tactcactccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttatttcaatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaactttaaatgttatttta 335  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| || | |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||     
T  26470984 tactccctccgttcctttttaagtgtctcttttgaagaaattttttgttcctatttaattgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttg 26470885  T
Q  336 tcaatattacccttagttatttattgtggagatagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggatattatggtaaaagtatcaattattgtatca 435  Q
     |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||  ||||| |||||||||| | |||||| ||||    
T  26470884 ccaatattatccttagttatttattgtggagagagaaatatatgaaatgagatgttaaatgaacaaggtcattatagtaaaagtataacttattgcatca 26470785  T
Q  436 aaagtaataacatttattgattgtcttgctttgtgtaaaatgtcataaaatgacaattaaaaagga 501  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  26470784 aaagtagtaacaattattgattgtcttggtttatgtaaaatgtcaaaaagtgacaattaaaaagga 26470719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 156; E-Value: 3e-82
Query Start/End: Original strand, 235 - 514
Target Start/End: Original strand, 22050028 - 22050306
Alignment:
Q  235 atactcactccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttatttcaatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaactttaaatgttatttt 334  Q
    |||||| ||||||||||||||||  ||| ||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||    
T  22050028 atactccctccgttcctttttaatcgtctcttttggagaatttttttgtttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgatgtttt 22050127  T
Q  335 atcaatattacccttagttatttattgtggagatagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggatattatggtaaaagtatcaattattgtatc 434  Q
    |||||||| |||||||  ||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||  ||||||||| | |||||| |||    
T  22050128 atcaatat-acccttaaatatttattgcggagagagaaatatatgaaataagatattaaatgaataaggtcattataataaaagtataacttattgcatc 22050226  T
Q  435 aaaagtaataacatttattgattgtcttgctttgtgtaaaatgtcataaaatgacaattaaaaaggagcggaggtagtaa 514  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||  |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  22050227 aaaagtagtaacaattattgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaacggaggtagtaa 22050306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 148; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 235 - 514
Target Start/End: Original strand, 17193137 - 17193416
Alignment:
Q  235 atactcactccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttatttcaatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaactttaaatgttatttt 334  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  17193137 atactccctccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttgttcctatttaaatgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgtttt 17193236  T
Q  335 atcaatattacccttagttatttattgtggagatagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggatattatggtaaaagtatcaattattgtatc 434  Q
    | |||||||  |||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||  || | |||||| |||    
T  17193237 accaatattgtccttagttatttattgcggagagagatatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaataataacttattgcatc 17193336  T
Q  435 aaaagtaataacatttattgattgtcttgctttgtgtaaaatgtcataaaatgacaattaaaaaggagcggaggtagtaa 514  Q
    |||||||  | || || |||||||||||| ||| | |||||||||| ||  |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  17193337 aaaagtaggatcaattgttgattgtcttggtttatataaaatgtcaaaacgtgacaattaaaaaggaacggaggtagtaa 17193416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 146; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 232 - 513
Target Start/End: Complemental strand, 1751696 - 1751415
Alignment:
Q  232 attatactcactccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttatttcaatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaactttaaatgttat 331  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || | |||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||| |    
T  1751696 attatactccctccgttcctttttaagtgtcacttttgaagaaattttttgttcctatttaactttcactttcgaagttcaatgcaacattaaatgttgt 1751597  T
Q  332 tttatcaatattacccttagttatttattgtggagatagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggatattatggtaaaagtatcaattattgt 431  Q
    |||| |||||||  ||||| ||||||||||  |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||| | ||||||     
T  1751596 tttaccaatattgtccttaattatttattgcagagaaagaaatatatgaaaagagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtataacttattgc 1751497  T
Q  432 atcaaaagtaataacatttattgattgtcttgctttgtgtaaaatgtcataaaatgacaattaaaaaggagcggaggtagta 513  Q
    |||||||||| || || || |||||| ||||| |||||||||||||||| ||  ||||||||||||| || |||||||||||    
T  1751496 atcaaaagtagtatcaattgttgattatcttgatttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaagaacggaggtagta 1751415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 143; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 232 - 506
Target Start/End: Complemental strand, 22784933 - 22784659
Alignment:
Q  232 attatactcactccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttatttcaatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaactttaaatgttat 331  Q
    |||||||||  ||| |||||||||||||||| |||||| |||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |    
T  22784933 attatactccttcctttcctttttaagtgtctcttttgaagaatttttttgtttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgt 22784834  T
Q  332 tttatcaatattacccttagttatttattgtggagatagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggatattatggtaaaagtatcaattattgt 431  Q
    |||| |||||||| ||||| |||||||||||||||| | |||||||| |||| |  |||||||||||||||| |||||| ||||||||||  ||||||||    
T  22784833 tttaccaatattatccttacttatttattgtggagagaaaaatatattaaataaattattaaatgaataaggctattatagtaaaagtatacattattgt 22784734  T
Q  432 atcaaaagtaataacatttattgattgtcttgctttgtgtaaaatgtcataaaatgacaattaaaaaggagcgga 506  Q
    |||||||||| || |||||||||| | ||||| ||| |||||||||| | ||| |||||||||||||||| ||||    
T  22784733 atcaaaagtagtatcatttattgaatatcttggtttatgtaaaatgttaaaaagtgacaattaaaaaggaacgga 22784659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 140; E-Value: 9e-73
Query Start/End: Original strand, 246 - 513
Target Start/End: Original strand, 3621580 - 3621847
Alignment:
Q  246 gttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttatttcaatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaactttaaatgttattttatcaatattac 345  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||   |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| || || || ||||||||     
T  3621580 gttcctttttaagtgtcacttttgaagaaaaaatttatttctatttaactatcactttcaaagttcaatgcaacattaaatattgttctaccaatattat 3621679  T
Q  346 ccttagttatttattgtggagatagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggatattatggtaaaagtatcaattattgtatcaaaagtaataa 445  Q
    ||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||| |||||||||| | |||||| |||||||||| ||     
T  3621680 ccttagttatttattgcagagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataatgtcattatagtaaaagtataacttattgcatcaaaagtagtat 3621779  T
Q  446 catttattgattgtcttgctttgtgtaaaatgtcataaaatgacaattaaaaaggagcggaggtagta 513  Q
    || || |||||||||||| |||||||||||||||| ||  |||||||||||||||| | |||||||||    
T  3621780 caattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaacagaggtagta 3621847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 140; E-Value: 9e-73
Query Start/End: Original strand, 243 - 514
Target Start/End: Original strand, 34378846 - 34379117
Alignment:
Q  243 tccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttatttcaatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaactttaaatgttattttatcaatat 342  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| |||   ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||| ||| ||    
T  34378846 tccgttcctttttaagtgtcatttttggaaaaaaaatttgtttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacaataaatgttgttttaccaacat 34378945  T
Q  343 tacccttagttatttattgtggagatagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggatattatggtaaaagtatcaattattgtatcaaaagtaa 442  Q
    |||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||| ||||||||||||| ||||| | |||| |||||||||| ||||||||||| | ||  |     
T  34378946 tacccttagttatttattatggagagtgaaatatatgaaataagatattaaatgactaaggcttttatagtaaaagtatgaattattgtataagaaaaag 34379045  T
Q  443 taacatttattgattgtcttgctttgtgtaaaatgtcataaaatgacaattaaaaaggagcggaggtagtaa 514  Q
    ||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||| ||| ||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  34379046 taacatttattgagtgtcttggtttgtgtaaaatatcaaaaagtgacagttaaaaaggaacggaggtagtaa 34379117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 139; E-Value: 4e-72
Query Start/End: Original strand, 242 - 510
Target Start/End: Complemental strand, 17124239 - 17123972
Alignment:
Q  242 ctccgttcctttttaagtgtcactttt-ggagaaattttttatttcaatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaactttaaatgttattttatcaat 340  Q
    |||||||||||||||  |||||||||| |||||||  |||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||    
T  17124239 ctccgttcctttttagatgtcactttttggagaaaagttttgtttttatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaat 17124140  T
Q  341 attacccttagttatttattgtggagatagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggatattatggtaaaagtatcaattattgtatcaaaagt 440  Q
    |||| |||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||| | |||||| |||||||||    
T  17124139 attatccttagttatttattgcggaga--gaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtataacttattgcatcaaaagt 17124042  T
Q  441 aataacatttattgattgtcttgctttgtgtaaaatgtcataaaatgacaattaaaaaggagcggaggta 510  Q
    | || || ||||||||||||||  |||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||  |||||||    
T  17124041 agtatcaattattgattgtcttagtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaatggaggta 17123972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 138; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 236 - 501
Target Start/End: Complemental strand, 23923974 - 23923709
Alignment:
Q  236 tactcactccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttatttcaatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaactttaaatgttatttta 335  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| | |||||    
T  23923974 tactccctccgttcctttttaagtgtcacttttggagagattttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatacaacgttaaatgctgtttta 23923875  T
Q  336 tcaatattacccttagttatttattgtggagatagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggatattatggtaaaagtatcaattattgtatca 435  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||| ||||||||||   |||||  || |    
T  23923874 tcaatattatccttagttatttattgcggagagaaaaatatatgaaatgagatattaactgaataaggtcattatagtaaaagtatagcttattacatta 23923775  T
Q  436 aaagtaataacatttattgattgtcttgctttgtgtaaaatgtcataaaatgacaattaaaaagga 501  Q
    |||||| || || || |||||||||||| |||||| ||||||||| ||  ||||||||||||||||    
T  23923774 aaagtagtatcaattgttgattgtcttggtttgtgcaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaagga 23923709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 136; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 276 - 519
Target Start/End: Complemental strand, 30416296 - 30416053
Alignment:
Q  276 ttttttatttcaatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaactttaaatgttattttatcaatattacccttagttatttattgtggagatagaaata 375  Q
    |||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||    
T  30416296 ttttttgtttctatttaactgttactttcaaagttcaatgcaacattaaatgatgttttatcaatattacccttagttatttatggcggagagagaaata 30416197  T
Q  376 tatgaaatgagatattaaatgaataaggatattatggtaaaagtatcaattattgtatcaaaagtaataacatttattgattgtcttgctttgtgtaaaa 475  Q
    |||||||    ||||||||||||||||| |||||| |||||||||| | ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||| |||||||    
T  30416196 tatgaaacagaatattaaatgaataaggttattatagtaaaagtataacttattgtatcaaaagtagtaacaattattgattgtcttggtttatgtaaaa 30416097  T
Q  476 tgtcataaaatgacaattaaaaaggagcggaggtagtaagtttg 519  Q
    |||||  | |||| |||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  30416096 tgtcaacatatgataattaaaaaggaacggaggtagtaggtttg 30416053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 134; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 236 - 513
Target Start/End: Complemental strand, 31245010 - 31244733
Alignment:
Q  236 tactcactccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttatttcaatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaactttaaatgttatttta 335  Q
    ||||| |||||||| ||||||| ||||| |||| |||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | || |||||    
T  31245010 tactctctccgttcatttttaattgtcatttttagagaaattttttgtttgtatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaattcttgtttta 31244911  T
Q  336 tcaatattacccttagttatttattgtggagatagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggatattatggtaaaagtatcaattattgtatca 435  Q
    |||||||||  ||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||  ||||| |||||||||  ||  |||||||||    
T  31244910 tcaatattattcttagatatttattgtggagagagaaacatatgaaatgaaatattaaattaataaggtcattatagtaaaagtaaaaacaattgtatca 31244811  T
Q  436 aaagtaataacatttattgattgtcttgctttgtgtaaaatgtcataaaatgacaattaaaaaggagcggaggtagta 513  Q
    |||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||  ||| ||  |||||||||||||||| |||| ||||||    
T  31244810 aaagtactaccatttattgattgtcttggtttgtgtaaaaaatcaaaatgtgacaattaaaaaggaacggatgtagta 31244733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 131; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 235 - 497
Target Start/End: Original strand, 373702 - 373964
Alignment:
Q  235 atactcactccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttatttcaatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaactttaaatgttatttt 334  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||   ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  373702 atactctctccgttcatttttaagtgtcacttttggagaaattttttgttcatatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaattttaaatgttgtttt 373801  T
Q  335 atcaatattacccttagttatttattgtggagatagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggatattatggtaaaagtatcaattattgtatc 434  Q
    | |||||||  | ||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||| ||||||||||   |||||| |||    
T  373802 accaatattgtcattatttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataagatcattatagtaaaagtatagtttattgcatc 373901  T
Q  435 aaaagtaataacatttattgattgtcttgctttgtgtaaaatgtcataaaatgacaattaaaa 497  Q
    ||||||| || || ||  ||||||||||| ||| |||||||||||| ||  ||||||||||||    
T  373902 aaaagtagtatcaattgctgattgtcttggtttatgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaa 373964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 130; E-Value: 8e-67
Query Start/End: Original strand, 236 - 513
Target Start/End: Complemental strand, 24356315 - 24356038
Alignment:
Q  236 tactcactccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttatttcaatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaactttaaatgttatttta 335  Q
    ||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| || || | |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||    
T  24356315 tactccctccgttcctttttaattgtcacttttagagaaatttattgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcatcattaaatgttgtttta 24356216  T
Q  336 tcaatattacccttagttatttattgtggagatagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggatattatggtaaaagtatcaattattgtatca 435  Q
    |||||||||||||||| ||||||||  ||||| ||||| ||||||||||| ||||||||| || ||||  ||||| |||||||||| |   || ||||||    
T  24356215 tcaatattacccttagatatttattccggagagagaaacatatgaaatgaaatattaaatcaacaaggtcattatagtaaaagtattagcaatggtatca 24356116  T
Q  436 aaagtaataacatttattgattgtcttgctttgtgtaaaatgtcataaaatgacaattaaaaaggagcggaggtagta 513  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||| ||||  |||||| ||| ||| |||||||||||||| | |||| ||||||    
T  24356115 aaagtagtaacatttattgattgttttggtttggataaaatatcaaaaagtgacaattaaaaagaaacggatgtagta 24356038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 129; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 242 - 513
Target Start/End: Complemental strand, 17251511 - 17251239
Alignment:
Q  242 ctccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttatttcaatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaactttaaatgttattttatcaata 341  Q
    |||||||| ||||||| | ||||||||| ||||||||||| || | ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||    
T  17251511 ctccgttcttttttaattatcacttttgaagaaattttttgttcctatttaaccgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaata 17251412  T
Q  342 ttacccttagttatttattgtggagatagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggatattatggtaaaagtatcaattattgtatcaaaagta 441  Q
    |||||||||| |||||||||   ||| ||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||  ||||| |||||||||  |   |||||||||||||||    
T  17251411 ttacccttagatatttattgcaaagagagaaacatatgaaatgaaatattaaattaataaggtcattatagtaaaagtaaaagcaattgtatcaaaagta 17251312  T
Q  442 ataaca-tttattgattgtcttgctttgtgtaaaatgtcataaaatgacaattaaaaaggagcggaggtagta 513  Q
     ||||| || ||||||||||||| |||||||||||||| | ||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  17251311 gtaacacttaattgattgtcttggtttgtgtaaaatgttaaaaagtgacaattaaaaaggaacggaggtagta 17251239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 128; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 235 - 514
Target Start/End: Original strand, 34607077 - 34607356
Alignment:
Q  235 atactcactccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttatttcaatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaactttaaatgttatttt 334  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||  |||||| | |||| |||| || |||||||||||||||||| ||||||||||| ||  ||||||| | ||||    
T  34607077 atactcgctccgttcctttttaagtgtttcttttgaacaaatattttgttccaatttaactgtcacttttaaagttcaatgtaatattaaatggtgtttt 34607176  T
Q  335 atcaatattacccttagttatttattgtggagatagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggatattatggtaaaagtatcaattattgtatc 434  Q
    | |||||||| ||||| ||||||||||  |||| ||| ||||||||||| |||||||||| |||||||  |||||| ||||||||||  ||| |||||||    
T  34607177 accaatattatccttacttatttattgcagagagagacatatatgaaattagatattaaacgaataagattattatagtaaaagtatacattgttgtatc 34607276  T
Q  435 aaaagtaataacatttattgattgtcttgctttgtgtaaaatgtcataaaatgacaattaaaaaggagcggaggtagtaa 514  Q
    ||||||| ||||||| ||||| ||||||| ||||| |||||||||| ||| | |||||||||||||| ||||||||||||    
T  34607277 aaaagtagtaacattcattgaatgtcttggtttgtataaaatgtcaaaaattaacaattaaaaaggaacggaggtagtaa 34607356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 128; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 235 - 514
Target Start/End: Original strand, 34730539 - 34730817
Alignment:
Q  235 atactcactccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttatttcaatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaactttaaatgttatttt 334  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||  |||||| | |||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||| ||||||| | ||||    
T  34730539 atactcgctccgttcctttttaagtgtttcttttgaacaaatattttgtttcaatttaactgtcacttttaaagttcaacgtaacattaaatggtgtttt 34730638  T
Q  335 atcaatattacccttagttatttattgtggagatagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggatattatggtaaaagtatcaattattgtatc 434  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||   ||| | ||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||| |||||| |||  ||| |||||||    
T  34730639 atcaatattatccttacttatttattgcaaagagataaatatatgaaattagatattgaatgaataaggttattatagtaaaaatatacattgttgtatc 34730738  T
Q  435 aaaagtaataacatttattgattgtcttgctttgtgtaaaatgtcataaaatgacaattaaaaaggagcggaggtagtaa 514  Q
    ||||||| ||||||| ||||| ||||||| ||||| |||||| ||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  34730739 aaaagtagtaacattcattgaatgtcttggtttgtataaaatatca-aaaatgataattaaaaaggaacggaggtagtaa 34730817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 127; E-Value: 5e-65
Query Start/End: Original strand, 235 - 513
Target Start/End: Original strand, 17835872 - 17836150
Alignment:
Q  235 atactcactccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttatttcaatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaactttaaatgttatttt 334  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| || | |||||||||| ||||||||| || |||||||| ||||||||| ||||    
T  17835872 atactccctccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaaaattttgttcctatttaactgttactttcaaattttaatgcaacattaaatgttttttt 17835971  T
Q  335 atcaatattacccttagttatttattgtggagatagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggatattatggtaaaagtatcaattattgtatc 434  Q
    | |||||||| ||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||| ||||||||||   |||||| ||     
T  17835972 accaatattatccttaattatttattgcggagagagaaatatatgaaatgatatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtatagcttattgcatt 17836071  T
Q  435 aaaagtaataacatttattgattgtcttgctttgtgtaaaatgtcataaaatgacaattaaaaaggagcggaggtagta 513  Q
    |||||||  | || || |||||||||||| |||||||||||| |||  |  |||||||||||||||| |||| ||||||    
T  17836072 aaaagtagaatcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatatcaatatgtgacaattaaaaaggaacggatgtagta 17836150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 127; E-Value: 5e-65
Query Start/End: Original strand, 236 - 514
Target Start/End: Original strand, 24635688 - 24635966
Alignment:
Q  236 tactcactccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttatttcaatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaactttaaatgttatttta 335  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||| |||  | |||||| |||||    
T  24635688 tactccctccgttcctttttaagtgtcccttttggagaaattttttgtttctatttaactgtcattttcaaagttcaatgtaacaatgaatgttgtttta 24635787  T
Q  336 tcaatattacccttagttatttattgtggagatagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggatattatggtaaaagtatcaattattgtatca 435  Q
     ||| |||||||||||||||||||||  |||| |||||||| ||| || ||||||||||||| ||||| |||||| ||||| |||| ||||||||||| |    
T  24635788 ccaacattacccttagttatttattgcagagagagaaatatgtgatataagatattaaatgactaaggctattatagtaaatgtataaattattgtataa 24635887  T
Q  436 aaagtaataacatttattgattgtcttgctttgtgtaaaatgtcataaaatgacaattaaaaaggagcggaggtagtaa 514  Q
     ||  | ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| | ||| ||||| ||||| || | ||||||| ||||    
T  24635888 gaaaaagtaacatttattgattatcttggtttgtgtaaaatgttaaaaagtgacatttaaagagaaacggaggtggtaa 24635966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 125; E-Value: 8e-64
Query Start/End: Original strand, 236 - 498
Target Start/End: Original strand, 8176416 - 8176675
Alignment:
Q  236 tactcactccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttatttcaatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaactttaaatgttatttta 335  Q
    ||||| || |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||   |||    
T  8176416 tactcccttcgttcctttttaagtgtctcttttgaagaaattttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcatcattaaatgtt---tta 8176512  T
Q  336 tcaatattacccttagttatttattgtggagatagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggatattatggtaaaagtatcaattattgtatca 435  Q
     |||||||| | || ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| || |||||| |||||||  ||||| |||||||||| | |||||| ||||    
T  8176513 ccaatattatcttttgttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgatatgttaaattaataaggtcattatagtaaaagtataacttattgcatca 8176612  T
Q  436 aaagtaataacatttattgattgtcttgctttgtgtaaaatgtcataaaatgacaattaaaaa 498  Q
    ||||||  |||| ||||||||||||||| |||||||||||||| | ||| |||||||||||||    
T  8176613 aaagtagaaacaattattgattgtcttgatttgtgtaaaatgttaaaaagtgacaattaaaaa 8176675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 122; E-Value: 5e-62
Query Start/End: Original strand, 251 - 501
Target Start/End: Original strand, 1249543 - 1249784
Alignment:
Q  251 tttttaagtgtcacttttggagaaattttttatttcaatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaactttaaatgttattttatcaatattaccctta 350  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||  || |||||||||||        |||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  1249543 tttttaaatgtcacttttggagaaatttttg-ttccaatttaactg--------aaagttcaattcaattttaaatgttgttttatcaatattaccctta 1249633  T
Q  351 gttatttattgtggagatagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggatattatggtaaaagtatcaattattgtatcaaaagtaataacattt 450  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||   ||||| |||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  1249634 gttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgaaatattaaatgaatgagacaattatagtaaaaatatcaattattgtatcaaaaatagtaacattt 1249733  T
Q  451 attgattgtcttgctttgtgtaaaatgtcataaaatgacaattaaaaagga 501  Q
    ||||||||||||  ||| | |||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  1249734 attgattgtcttagtttatataaaatatcataaagtgacaattaaaaagga 1249784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 122; E-Value: 5e-62
Query Start/End: Original strand, 264 - 514
Target Start/End: Complemental strand, 7056375 - 7056123
Alignment:
Q  264 cttttggagaaattttttatttcaatttaact--gtcactttcaaagttcaatgcaactttaaatgttattttatcaatattacccttagttatttattg 361  Q
    ||||| ||||| |||||| |||| ||||||||  |||||||||||| |||||| |||| |||||||||  ||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  7056375 cttttagagaatttttttgtttctatttaactctgtcactttcaaaattcaatccaacattaaatgttgatttatcaatattatctttagttatttattg 7056276  T
Q  362 tggagatagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggatattatggtaaaagtatcaattattgtatcaaaagtaataacatttattgattgtct 461  Q
     ||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||| ||||||| || | |||||| ||||||||||| || | ||||||||| |||    
T  7056275 cggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaccaaggttattatagtaaaagaataacttattgcatcaaaagtaaaaataattattgattatct 7056176  T
Q  462 tgctttgtgtaaaatgtcataaaatgacaattaaaaaggagcggaggtagtaa 514  Q
    || |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||  ||||||||||||    
T  7056175 tgatttgtgtaaaatgtcaaaaagtgacaattaaaaaggtacggaggtagtaa 7056123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 121; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 246 - 501
Target Start/End: Original strand, 8992538 - 8992794
Alignment:
Q  246 gttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttatttcaatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaactttaaatgttattttatcaatattac 345  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||   |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||  |||||||     
T  8992538 gttcctttttaagtgtctcttttgaagaaattttttgttcatatttaactatcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttactaatattat 8992637  T
Q  346 ccttagttatttattgtggagatagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggatattatggtaaaagtatcaattattgtatcaaaagtaataa 445  Q
    |||||||||||||||  ||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||| |||||||||| | |||||| |||||||||| |||    
T  8992638 ccttagttatttattacggagagataaatatatgaaatgagatgttaaatgaataaggtcattatagtaaaagtataacttattgcatcaaaagtagtaa 8992737  T
Q  446 c-atttattgattgtcttgctttgtgtaaaatgtcataaaatgacaattaaaaagga 501  Q
    | | ||| ||||| ||||| |||||||||||| ||| ||  ||||||||||||||||    
T  8992738 caaattactgattatcttggtttgtgtaaaatatcaaaatgtgacaattaaaaagga 8992794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 121; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 246 - 501
Target Start/End: Original strand, 9016985 - 9017241
Alignment:
Q  246 gttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttatttcaatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaactttaaatgttattttatcaatattac 345  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||   |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||  |||||||     
T  9016985 gttcctttttaagtgtctcttttgaagaaattttttgttcatatttaactatcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttactaatattat 9017084  T
Q  346 ccttagttatttattgtggagatagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggatattatggtaaaagtatcaattattgtatcaaaagtaataa 445  Q
    |||||||||||||||  ||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||| |||||||||| | |||||| |||||||||| |||    
T  9017085 ccttagttatttattacggagagataaatatatgaaatgagatgttaaatgaataaggtcattatagtaaaagtataacttattgcatcaaaagtagtaa 9017184  T
Q  446 c-atttattgattgtcttgctttgtgtaaaatgtcataaaatgacaattaaaaagga 501  Q
    | | ||| ||||| ||||| |||||||||||| ||| ||  ||||||||||||||||    
T  9017185 caaattactgattatcttggtttgtgtaaaatatcaaaatgtgacaattaaaaagga 9017241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 117; E-Value: 5e-59
Query Start/End: Original strand, 234 - 513
Target Start/End: Complemental strand, 364806 - 364526
Alignment:
Q  234 tatactcactccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttatttcaatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaactttaaatgtt-att 332  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || | |||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||  ||    
T  364806 tatactcgatccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaaatttttgttactatttaactgtcattttcaaaattcaatgcaacattaaatgttgttt 364707  T
Q  333 ttatcaatattacccttagttatttattgtggagatagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggatattatggtaaaagtatcaattattgta 432  Q
    ||| |||||||  | ||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||    ||||| ||||||||||   |||||| |    
T  364706 ttaccaatattgtcattaattatttattgcggagagagaaatatatgaaatgaaatattaaatgaagaaaatcattatagtaaaagtatagcttattgca 364607  T
Q  433 tcaaaagtaataacatttattgattgtcttgctttgtgtaaaatgtcataaaatgacaattaaaaaggagcggaggtagta 513  Q
    |||||||||| | || || |||||||||||| |||||||||||| ||| ||  |||||||||||||| | |||||||||||    
T  364606 tcaaaagtaagatcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatatcaaaatgtgacaattaaaaagaaacggaggtagta 364526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 117; E-Value: 5e-59
Query Start/End: Original strand, 242 - 514
Target Start/End: Complemental strand, 22400819 - 22400547
Alignment:
Q  242 ctccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttatttcaatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaactttaaatgttattttatcaata 341  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||   ||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||| || ||||| |||||    
T  22400819 ctccgttcctttttaagtgtctcttttggagaaattttttgttcttatttaactgtcacttttgaagttcaatgcaacattaaatattgttttaccaata 22400720  T
Q  342 ttacccttagttatttattgtggagatagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggatattatggtaaaagtatcaattattgtatcaaaagta 441  Q
    ||| ||||| ||||||||| ||  || |||||| |||||| | ||  ||||||||||||| | |||||| ||||||||||  ||| || |||||||||||    
T  22400719 ttatccttacttatttattatgaggagagaaatgtatgaagttagtgattaaatgaataatgttattatagtaaaagtatgcattgttctatcaaaagta 22400620  T
Q  442 ataacatttattgattgtcttgctttgtgtaaaatgtcataaaatgacaattaaaaaggagcggaggtagtaa 514  Q
     ||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||| |||| ||||| ||||| | || ||||||||||||    
T  22400619 gtaacatttattgaatgtattggtttgtgtaaaatgtcttaaagtgacacttaaacaagaacggaggtagtaa 22400547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 115; E-Value: 8e-58
Query Start/End: Original strand, 236 - 513
Target Start/End: Complemental strand, 11676872 - 11676599
Alignment:
Q  236 tactcactccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttatttcaatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaactttaaatgttatttta 335  Q
    ||||| |||||||||||||||  ||| ||||||  ||||||||||| || | ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  11676872 tactccctccgttcctttttat-tgtaacttttaaagaaattttttgttcctatttaactgtcactt-caaagttcaatgcaacattaaatgttatttta 11676775  T
Q  336 tcaatattacccttagttatttattgtggagatagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggatattatggtaaaagtatcaattattgtatca 435  Q
     ||||||||| ||||| |||||||||  ||||  |||| ||||||||||| ||||||||| |||||||  ||||| |||||||||  ||  |||||||||    
T  11676774 ccaatattactcttagatatttattgcagaga--gaaacatatgaaatgaaatattaaattaataaggtcattatagtaaaagtaaaaacaattgtatca 11676677  T
Q  436 aaagtaataacatttattgattgtcttgctttgtgtaaaatgtcataaaatgacaattaaaaaggagcggaggtagta 513  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||| | ||||||||||| ||  ||||||||||    
T  11676676 aaagtagtaatatttattgattgtcttggtttgtgtaaaatatcaaaaagtaacaattaaaaatgaatggaggtagta 11676599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 115; E-Value: 8e-58
Query Start/End: Original strand, 247 - 441
Target Start/End: Original strand, 30236969 - 30237163
Alignment:
Q  247 ttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttatttcaatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaactttaaatgttattttatcaatattacc 346  Q
    ||||||||||| ||| |||||||||||||   ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||| ||||| ||||||||||    
T  30236969 ttcctttttaaatgttacttttggagaaaaaatttgtttcaatttaactgtcactttcaaaattcaatgcaacattaaacgttgttttaccaatattacc 30237068  T
Q  347 cttagttatttattgtggagatagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggatattatggtaaaagtatcaattattgtatcaaaagta 441  Q
    |||||||||||||||| || | |||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||| || ||||||||||||||||    
T  30237069 cttagttatttattgttgaaagagaaatatataaaatgagatattaaattaataaggttattatagtaaaagtatgaagtattgtatcaaaagta 30237163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 115; E-Value: 8e-58
Query Start/End: Original strand, 236 - 513
Target Start/End: Original strand, 33260680 - 33260962
Alignment:
Q  236 tactcactccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttatttcaatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaactttaaatgttatttta 335  Q
    ||||| ||| |||||||| |||  |||| |||| |||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  33260680 tactccctctgttcctttataatggtcagttttagagaaattttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgtttta 33260779  T
Q  336 tcaatattacccttagttatttattgtggagatagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggatattatggtaaaagtatcaattattgtatca 435  Q
     ||||||||||||||| | ||||||| ||||| ||||| ||||||||||| | ||||||| |||||||  ||||| || ||||||  ||  |||||||||    
T  33260780 ccaatattacccttagatgtttattgcggagagagaaacatatgaaatgaaacattaaattaataaggtcattatagtgaaagtaaaaacaattgtatca 33260879  T
Q  436 aaagtaataac-----atttattgattgtcttgctttgtgtaaaatgtcataaaatgacaattaaaaaggagcggaggtagta 513  Q
    |||||| ||||     ||||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||| ||||| ||| |||||| |||||||||||    
T  33260880 aaagtagtaacattatatttattgattatcttggtttgtgtaaaatgtcaaaaagtgacagttataaaggaacggaggtagta 33260962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 114; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 236 - 499
Target Start/End: Complemental strand, 17601401 - 17601131
Alignment:
Q  236 tactcactccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttatttcaatttaactgtcacttt-caaagttcaatgcaactttaaatgttatttt 334  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||   |||||| ||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  17601401 tactccctccattcctttttaagtgtcacttttggagattttttttgttcttatttaagtgtcactttacatagttcaatgcaacattaaatgttatttt 17601302  T
Q  335 atcaatattacccttagttatttattgtggagatagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggatattatggta-------aaagtatcaatta 427  Q
    |  ||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||| |||       ||| ||| |||||    
T  17601301 actaatattacccttatttatt-attgtggagagagaaatatatgtaatgagatattaaataaataaggttattatagtaaaaatagaaaatataaatta 17601203  T
Q  428 ttgtatcaaaagtaataacatttattgattgtcttgctttgtgtaaaatgtcataaaatgacaattaaaaag 499  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||||||||||  ||||||||||| |||| ||  ||||||||||||||    
T  17601202 ttgtatcaaaagtagcaacatttattgattgtcttagtttgtgtaaaacgtcaaaatgtgacaattaaaaag 17601131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 111; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 235 - 514
Target Start/End: Complemental strand, 31854753 - 31854472
Alignment:
Q  235 atactcactccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttatttcaatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaactttaaatgttatttt 334  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||| |||  |||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  31854753 atactccctccgttcctttttaagtgttacttttggagaaaaattttgtttttatttaattgtcactttcaaagttcaatgcaacaataaatgttatttt 31854654  T
Q  335 atcaatattacccttagttatttattg--tggagatagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggatattatggtaaaagtatcaattattgta 432  Q
    | ||| |||||||||||||||||||||    |||| | ||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||| ||||| |||| |||| |||||    
T  31854653 accaacattacccttagttatttattgcaaagagagataaatatatgaaataagatattaaatgactaaggctattatagtaaaggtataaatttttgta 31854554  T
Q  433 tcaaaagtaataacatttattgattgtcttgctttgtgtaaaatgtcataaaatgacaattaaaaaggagcggaggtagtaa 514  Q
    |   ||  | ||||||||||| | ||||||  |||||||||||| ||| || |||||| ||||||| ||  |||||||||||    
T  31854553 tacgaaaaagtaacatttattaaatgtcttaatttgtgtaaaatatcaaaagatgacagttaaaaaagataggaggtagtaa 31854472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 107; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 243 - 421
Target Start/End: Original strand, 52650 - 52828
Alignment:
Q  243 tccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttatttcaatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaactttaaatgttattttatcaatat 342  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||||  |||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||  | ||||||||||||    
T  52650 tccgttcctttttaagtgtttcttttggagattttttttgtttctatttaactgtcacttttaaagttcaatgcaacattaaattatgttttatcaatat 52749  T
Q  343 tacccttagttatttattgtggagatagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggatattatggtaaaagtat 421  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||  |||||||||    
T  52750 tacccttaattatttattgtggagagagaaatatatgaaataagatattaaatgaataaggtcattataataaaagtat 52828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 106; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 236 - 421
Target Start/End: Original strand, 30388701 - 30388886
Alignment:
Q  236 tactcactccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttatttcaatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaactttaaatgttatttta 335  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| || | | |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||||    
T  30388701 tactccctccgttcctttttaagtgtcacttttgaagaaaatttttgttcctaattaactgtcactttcaaagttcaatgaaacattaaatgttgtttta 30388800  T
Q  336 tcaatattacccttagttatttattgtggagatagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggatattatggtaaaagtat 421  Q
     ||||||||  ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||   ||||| ||||||||||    
T  30388801 ccaatattatgcttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaataagatattaaatgaataagatcattatagtaaaagtat 30388886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 105; E-Value: 7e-52
Query Start/End: Original strand, 279 - 459
Target Start/End: Original strand, 7235463 - 7235643
Alignment:
Q  279 tttatttcaatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaactttaaatgttattttatcaatattacccttagttatttattgtggagatagaaatatat 378  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||  ||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||    
T  7235463 tttattttaatttaactgtcactttcaaagtttaatgtaatattaaatgttgttttactaatattacccttagttatttattgtggagagagggatatat 7235562  T
Q  379 gaaatgagatattaaatgaataaggatattatggtaaaagtatcaattattgtatcaaaagtaataacatttattgattgt 459  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||    |||||||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  7235563 gaaatgagatattaaatgaataaggttattatagtaaaagtatattgtattgtatcaaaagtagtaatatttattgattgt 7235643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 104; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 234 - 501
Target Start/End: Complemental strand, 7632294 - 7632033
Alignment:
Q  234 tatactcactccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttatttcaatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaactttaaatgttattt 333  Q
    |||||||  ||||||||||| |||||||| ||||||||||   ||||| |||   ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| || |||    
T  7632294 tatactccatccgttcctttgtaagtgtctcttttggaga---ttttttttt---tttaactgtcactttcaaagttcaaagcaacattaaatattgttt 7632201  T
Q  334 tatcaatattacccttagttatttattgtggagatagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggatattatggtaaaagtatcaattattgtat 433  Q
    || |||||||| |||||||||||||||| | ||| | |||||||||||||||||| |||||| |||||||  ||||| |||||||||| | |||||| ||    
T  7632200 taccaatattatccttagttatttattgcgaagagataaatatatgaaatgagatgttaaataaataaggtcattatagtaaaagtataacttattgcat 7632101  T
Q  434 caaaagtaataacatttattgattgtcttgctttgtgtaaaatgtcataaaatgacaattaaaaagga 501  Q
    ||||| || ||| | ||||||||||||||| ||| | |||||||||| ||| |||  |||||||||||    
T  7632100 caaaaatagtaataattattgattgtcttgatttatataaaatgtcaaaaagtgattattaaaaagga 7632033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 98; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 302 - 511
Target Start/End: Original strand, 11128877 - 11129086
Alignment:
Q  302 ttcaaagttcaatgcaactttaaatgttattttatcaatattacccttagttatttattgtggagatagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataa 401  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||| | ||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||| | ||||||| ||| ||||||||| |||||    
T  11128877 ttcaaagttcaattcaacattaaatgatgttttaccaatattacccttagatatttattgcggagagagatacatatgaattgaaatattaaattaataa 11128976  T
Q  402 ggatattatggtaaaagtatcaattattgtatcaaaagtaataacatttattgattgtcttgctttgtgtaaaatgtcataaaatgacaattaaaaagga 501  Q
    ||  ||||| |||||| ||  ||  ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  11128977 ggtcattatagtaaaaataaaaacaattgtatcaaaagtagtaacatttattaattgtcttgatttgtgtaaaatgtcaaaaagtgacaattaaaaagga 11129076  T
Q  502 gcggaggtag 511  Q
     | |||||||    
T  11129077 acagaggtag 11129086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 98; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 288 - 497
Target Start/End: Complemental strand, 11431366 - 11431157
Alignment:
Q  288 atttaactgtcactttcaaagttcaatgcaactttaaatgttattttatcaatattacccttagttatttattgtggagatagaaatatatgaaatgaga 387  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||| | ||||||| ||||| |||    
T  11431366 atttaattgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattaaccttagttatttattgtcgagagataaatataggaaataaga 11431267  T
Q  388 tattaaatgaataaggatattatggtaaaagtatcaattattgtatcaaaagtaataacatttattgattgtcttgctttgtgtaaaatgtcataaaatg 487  Q
    |||||||| | ||| | |||||| |||||||||| | |||||||||||||||||  || |  |||||||||||||| ||||||||| |||| | ||  ||    
T  11431266 tattaaattagtaaagttattatcgtaaaagtataagttattgtatcaaaagtaggaatagctattgattgtcttgatttgtgtaacatgtaaaaatgtg 11431167  T
Q  488 acaattaaaa 497  Q
    ||||||||||    
T  11431166 acaattaaaa 11431157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 97; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 266 - 514
Target Start/End: Original strand, 12732186 - 12732433
Alignment:
Q  266 tttggagaaattttttatttcaatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaactttaaatgttattttatcaatattacccttagttatttattgtgga 365  Q
    ||||||||||  |||| || | ||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||| ||||| || ||||| ||| |||||||||||| |||    
T  12732186 tttggagaaaaattttgttcctatttaactgtcactttcaaagtttaatgtaacattaaatgttgttttaccactattatcct-agttatttattgcgga 12732284  T
Q  366 gatagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggatattatggtaaaagtatcaattattgtatcaaaagtaataacatttattgattgtcttgct 465  Q
    || ||||||||||||||||| |||||||||||||||    ||||| ||||||||||   |||||| |||||||||| || || || || ||||||||| |    
T  12732285 gagagaaatatatgaaatgaaatattaaatgaataatatcattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaagtagtatcaattgttaattgtcttgtt 12732384  T
Q  466 ttgtgtaaaatgtcataaaatgacaattaaaaaggagcggaggtagtaa 514  Q
    ||||||||||||| | ||  |||||||||||||||| |||| |||||||    
T  12732385 ttgtgtaaaatgttaaaatgtgacaattaaaaaggaacggaagtagtaa 12732433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 97; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 354 - 513
Target Start/End: Complemental strand, 26485826 - 26485669
Alignment:
Q  354 atttattgtggagatagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggatattatggtaaaagtatcaattattgtatcaaaagtaataacatttatt 453  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  26485826 atttattgtggaga--gaaatatatgaaatgaaatattaaatgaataaggttattatagtaaaagtatatattattgtatcaaaagtagtaacatttatt 26485729  T
Q  454 gattgtcttgctttgtgtaaaatgtcataaaatgacaattaaaaaggagcggaggtagta 513  Q
    || ||||||| ||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||| | |||||||||    
T  26485728 gaatgtcttggtttatgtaaaatgtcaaaaagtgacaattaaaaaggaacagaggtagta 26485669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 97; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 236 - 463
Target Start/End: Original strand, 27313480 - 27313710
Alignment:
Q  236 tactcactccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttatttcaatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaactttaaatgttatttta 335  Q
    ||||| |||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||| || | |||||| |||||||||||||||||| |||||| |||||||||  ||||    
T  27313480 tactccctccgtttttttttaagtgtctcttttggagaaattttttgttcctatttaaatgtcactttcaaagttcattgcaacattaaatgttgattta 27313579  T
Q  336 tcaatattacccttagttatttattgtggagatagaaa---tatatgaaatgagatattaaatgaataaggatattatggtaaaagtatcaattattgta 432  Q
     |||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||   ||||||||||||||| ||||||||| |||   ||||| | ||||| || | |||||| |    
T  27313580 ccaatattatccttagttatttattgcggagagagaaatagtatatgaaatgagatgttaaatgaacaagataattatagaaaaagaataacttattgca 27313679  T
Q  433 tcaaaagtaataacatttattgattgtcttg 463  Q
    |||||||||| |||| ||||||||| |||||    
T  27313680 tcaaaagtaaaaacaattattgattatcttg 27313710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 96; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 275 - 514
Target Start/End: Original strand, 7170171 - 7170410
Alignment:
Q  275 attttttatttcaatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaactttaaatgttattttatcaatattacccttagttatttattgtggagatagaaat 374  Q
    ||||||| |||  |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||| || |||||||| ||  ||||||||| ||||| |||||     
T  7170171 attttttctttatatttaactgtcactttcaaaattcaatgcaacattaaatgttgttttaccattattacccctaaatatttattgcggagagagaaac 7170270  T
Q  375 atatgaaatgagatattaaatgaataaggatattatggtaaaagtatcaattattgtatcaaaagtaataacatttattgattgtcttgctttgtgtaaa 474  Q
    |||| |||||| |||||||||  |||||| ||||||  ||||||||  ||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  7170271 atataaaatgaaatattaaatttataaggttattataataaaagtaaaaacaattgtatcaaaagtagtaacatttattgattgtcttaatttgtgtaaa 7170370  T
Q  475 atgtcataaaatgacaattaaaaaggagcggaggtagtaa 514  Q
    ||   | |||||| ||||||||||||| || | |||||||    
T  7170371 atactaaaaaatggcaattaaaaaggaacgtatgtagtaa 7170410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 89; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 274 - 501
Target Start/End: Original strand, 1923869 - 1924097
Alignment:
Q  274 aattttttatttcaatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaactttaaatgttatttt-atcaatattacccttagttatttattgtggagatagaa 372  Q
    |||||||| |||| |||||| ||||||||| ||| || |||||||| |||||| || |||| |||||||||||| ||||||||||||||    || | ||    
T  1923869 aattttttgtttctatttaattgtcacttttaaattttaatgcaaccttaaatattgtttttatcaatattacctttagttatttattgcaatgagataa 1923968  T
Q  373 atatatgaaatgagatattaaatgaataaggatattatggtaaaagtatcaattattgtatcaaaagtaataacatttattgattgtcttgctttgtgta 472  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||   | |||| |||||||||| |||||||  ||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||| | ||    
T  1923969 atatatgaaatgagatattaaatgaataatactgttatagtaaaagtataaattatttcatcaaaattaataacatttattgattatcttggtttatata 1924068  T
Q  473 aaatgtcataaaatgacaattaaaaagga 501  Q
    |||||| | ||| ||||||||||| ||||    
T  1924069 aaatgtgaaaaagtgacaattaaagagga 1924097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 86; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 289 - 462
Target Start/End: Original strand, 13597443 - 13597615
Alignment:
Q  289 tttaactgtcactttcaaagttcaatgcaactttaaatgttattttatcaatattacccttagttatttattgtggagatagaaatatatgaaatgagat 388  Q
    ||||| ||| |||||||||||| |||| ||  |||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||    
T  13597443 tttaattgttactttcaaagtttaatgtaaaattaa-tgttattttatcaatattattcttagttatttattgcggagaaagaaatttatgaaatgagat 13597541  T
Q  389 attaaatgaataaggatattatggtaaaagtatcaattattgtatcaaaagtaataacatttattgattgtctt 462  Q
    |||||||| | |||| |||||| |||||| ||| ||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  13597542 attaaatgtaaaaggttattatagtaaaaatataaattattatatcaaaagtagtaacatttatcgattgtctt 13597615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 82; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 235 - 412
Target Start/End: Original strand, 24948222 - 24948399
Alignment:
Q  235 atactcactccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttatttcaatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaactttaaatgttatttt 334  Q
    |||||| ||||||||| |||||  |||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||  | ||||    
T  24948222 atactcgctccgttccgttttatatgtcacttttagagaaattttttgtttctatttaactgtcactttcaaaattcaatgcaacattaaatagtgtttt 24948321  T
Q  335 atcaatattacccttagttatttattgtggagatagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggatattatgg 412  Q
    |  |||||||||||| | ||||||||| ||||| |||||  |||||||||| ||||||||| |||||||  |||||||    
T  24948322 actaatattacccttggatatttattgcggagagagaaacgtatgaaatgaaatattaaattaataaggtcattatgg 24948399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 81; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 235 - 513
Target Start/End: Complemental strand, 32359696 - 32359424
Alignment:
Q  235 atactcactccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttatttcaatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaactttaaatgttatttt 334  Q
    |||||| ||| ||||||| |||||||| ||||||||| |||    || || | |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||    
T  32359696 atactccctctgttccttgttaagtgttacttttggaaaaaaaaattgtt-ctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaat-ttgtttt 32359599  T
Q  335 atcaatattacccttagttatttattgtggagatagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggatattatggtaaaagtatcaattattgtatc 434  Q
    | ||||  || |||||||||||||||| ||||| |||  |||||||||||||||||| ||||||||||   ||||| ||||||||||   |||||| |||    
T  32359598 accaat--tatccttagttatttattgcggagagaga--tatatgaaatgagatatttaatgaataagatcattatagtaaaagtatagcttattgcatc 32359503  T
Q  435 aaaagtaataacatttattgattgtcttgctttgtgtaaaatgtcataaaatgacaattaaaaaggagcggaggtagta 513  Q
    ||||| | |  || ||||| ||||||||| ||||| |||||| ||| ||  | |||||||||||||| |||||||||||    
T  32359502 aaaagaagtgtcaattattaattgtcttggtttgtataaaatatcaaaatgtaacaattaaaaaggaacggaggtagta 32359424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 80; E-Value: 6e-37
Query Start/End: Original strand, 229 - 344
Target Start/End: Original strand, 3849038 - 3849153
Alignment:
Q  229 aatattatactcactccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttatttcaatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaactttaaatgt 328  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  3849038 aatattatactccctccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaaaattttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgt 3849137  T
Q  329 tattttatcaatatta 344  Q
    | ||||| ||||||||    
T  3849138 tgttttaccaatatta 3849153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 80; E-Value: 6e-37
Query Start/End: Original strand, 236 - 475
Target Start/End: Original strand, 19811936 - 19812175
Alignment:
Q  236 tactcactccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttatttcaatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaactttaaatgttatttta 335  Q
    ||||| |||||||||||||||| |||||| |||| | || |||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||     
T  19811936 tactccctccgttcctttttaattgtcacgtttgcataatttttttgtttctaattaactgtcactttcaaagttcaatacaacattaaatgttgttttg 19812035  T
Q  336 tcaatattacccttagttatttattgtggagatagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggatattatggtaaaagtatcaattattgtatca 435  Q
     |  ||||||||||| ||||||||||| |||| |||| || |||||||||||||||||||||  |||| ||||||   ||||  || |||| ||| ||||    
T  19812036 cctttattacccttaattatttattgtagagagagaagtaaatgaaatgagatattaaatgatgaaggttattataagaaaaagatgaattgttgcatca 19812135  T
Q  436 aaagtaataacatttattgattgtcttgctttgtgtaaaa 475  Q
    |||||| ||| |  ||||  |||| ||| |||||||||||    
T  19812136 aaagtagtaaaaagtatttgttgttttggtttgtgtaaaa 19812175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #50
Raw Score: 72; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 247 - 513
Target Start/End: Original strand, 1252157 - 1252423
Alignment:
Q  247 ttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttatttcaatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaactttaaatgttattttatcaatattacc 346  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| |||   ||  || | |||||| ||||  ||||||||||||||||||| |||||| || ||||| |||||||| |    
T  1252157 ttcctttttaagtgtcatttttggaaaaaaaattg-ttcctatttaattgtctttttcaaagttcaatgcaacattaaatattgttttaccaatattatc 1252255  T
Q  347 cttagttattt-attgtggagatagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggatattatggtaaaagtatcaattattgtatcaaaagtaataa 445  Q
    ||||||| ||| |||  ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||| |||||| |||   |||||  |||||||||| ||     
T  1252256 cttagttgttttattacggagagagaaatatatgaaataagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaaatatagtttattacatcaaaagtagtat 1252355  T
Q  446 catttattgattgtcttgctttgtgtaaaatgtcataaaatgacaattaaaaaggagcggaggtagta 513  Q
    || || |||||||||||  ||| | |||||||||| ||  ||| ||||||||| || ||||| |||||    
T  1252356 caattgttgattgtcttagtttatataaaatgtcaaaatgtgataattaaaaatgaacggagatagta 1252423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #51
Raw Score: 68; E-Value: 8e-30
Query Start/End: Original strand, 374 - 514
Target Start/End: Complemental strand, 19645847 - 19645705
Alignment:
Q  374 tatatgaaatgagatattaaatgaataaggatattatggtaaaagtatcaattattgtat--caaaagtaataacatttattgattgtcttgctttgtgt 471  Q
    |||||||||||  |||||||||||| |||| |||||| |||||||||| || ||||||||  |||||||| |||||| |||||||||||||  |||||||    
T  19645847 tatatgaaatgtaatattaaatgaacaaggctattatagtaaaagtataaagtattgtatatcaaaagtagtaacatctattgattgtcttagtttgtgt 19645748  T
Q  472 aaaatgtcataaaatgacaattaaaaaggagcggaggtagtaa 514  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||||| || |||| |||||||    
T  19645747 aaaatgtcaaaaagtgacaattaaaaaagaacggaagtagtaa 19645705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #52
Raw Score: 65; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 235 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 19645934 - 19645850
Alignment:
Q  235 atactcactccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttatttcaatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaac 319  Q
    |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  19645934 atactccctctgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttgtttctatttaactgtcactttcaaaggtcaatgcaac 19645850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #53
Raw Score: 65; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 406 - 514
Target Start/End: Original strand, 24949257 - 24949365
Alignment:
Q  406 attatggtaaaagtatcaattattgtatcaaaagtaataacatttattgattgtcttgctttgtgtaaaatgtcataaaatgacaattaaaaaggagcgg 505  Q
    ||||| |||||||||  ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||| |||    
T  24949257 attatagtaaaagtaaaaataattgtatcaaaagtagtaacatttattgattgttttggtttgtgtaaaatatcaaaaaataacaattaaaaaggaacgg 24949356  T
Q  506 aggtagtaa 514  Q
    |||||||||    
T  24949357 aggtagtaa 24949365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #54
Raw Score: 65; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 259 - 499
Target Start/End: Complemental strand, 32251188 - 32250950
Alignment:
Q  259 tgtcacttttggagaaattttttatttcaatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaactttaaatgttattttatcaatattacccttagttattta 358  Q
    ||||||||||| | ||| ||||| |||| | |||||||||  ||||||||| |||| || | ||||||||| ||||| | ||||||||||||| |||| |    
T  32251188 tgtcacttttgcataaaatttttgtttctaattaactgtcgttttcaaagtccaatacatcattaaatgttgttttacctatattacccttagatatt-a 32251090  T
Q  359 ttgtggagatagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggatattatggtaaaagtatcaattattgtatcaaaagtaataacatttattgattg 458  Q
    |||  |||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||| | ||||  || |||| ||| |||||||||| ||| |  ||||  |||    
T  32251089 ttgcagagagagaaatatatgaaatgaggtattaaatgattaaggttattataggaaaaagataaattcttgcatcaaaagtagtaa-aagtatttgttg 32250991  T
Q  459 tcttgctttgtgtaaaatgtcataaaatgacaattaaaaag 499  Q
    ||||| ||||||||||| |||| ||  ||| ||||||||||    
T  32250990 tcttggtttgtgtaaaaagtcaaaatgtgataattaaaaag 32250950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #55
Raw Score: 60; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 242 - 513
Target Start/End: Complemental strand, 1135430 - 1135165
Alignment:
Q  242 ctccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttatttcaatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaactttaaatgttattttatcaata 341  Q
    |||| |||||||||||||||| |||||  ||||| ||||| |||| |||||||| |||||     ||||||||||||  |||||||||   |||||||||    
T  1135430 ctcctttcctttttaagtgtctcttttatagaaaatttttgtttctatttaactatcactg----agttcaatgcaatattaaatgtt---ttatcaata 1135338  T
Q  342 ttacccttagttatttattgtggagatagaaatata--tgaaatgagatattaaatgaataaggatattatggtaaaagtatcaattattgtatcaaaag 439  Q
    |||  |||||||| ||||  | || | ||||| |||  |||||  |||||||||||||||| || |||| | | ||||| || | ||||| |||||||||    
T  1135337 ttattcttagttaattata-tagatagagaaaaataattgaaacaagatattaaatgaatatggttatttttggaaaaggataatttattatatcaaaag 1135239  T
Q  440 taataacatttattgattgtcttgctttgtgtaaaatgtcataaaatgacaattaaaaaggagcggaggtagta 513  Q
    |||||||||||||||| | | | | | | |||||||||||| ||| |||||||||||||||| || ||||||||    
T  1135238 taataacatttattgagtttatcggtctctgtaaaatgtcaaaaagtgacaattaaaaaggaacgaaggtagta 1135165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #56
Raw Score: 60; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 247 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 11001059 - 11000868
Alignment:
Q  247 ttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttatttcaatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaactttaaatgttattttatcaatattacc 346  Q
    ||||||| ||| ||||||||||| | |||  |||| |||| | |||||||||  ||||||||||||||| | | ||||||||  ||||| | ||||||||    
T  11001059 ttcctttataattgtcacttttgcataaagattttgtttctaattaactgtcgttttcaaagttcaatgtatcattaaatgtggttttacctatattacc 11000960  T
Q  347 cttagttatttattgtggagatagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggatattatggtaaaagtatcaattattgtatcaaaa 438  Q
    ||||  |||||||||   ||| |||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||| | ||||  || |||| |||||||||||    
T  11000959 cttatatatttattgcatagagagaaatatatgaaatgaagtattaaatgattaaggatattataggaaaaagataaattgttgtatcaaaa 11000868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #57
Raw Score: 59; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 236 - 501
Target Start/End: Original strand, 15432651 - 15432915
Alignment:
Q  236 tactcactccgttcctttttaagtgtcacttttggaga-aattttttatttcaatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaactttaaatgttatttt 334  Q
    ||||| |||||||||||| ||| ||||||||||| | | ||  ||| ||||||||| |||||||  ||||||||| ||||| | | ||||||||  ||||    
T  15432651 tactccctccgttcctttataattgtcacttttgcatacaaaatttgatttcaatt-aactgtcgttttcaaagtccaatgtatcattaaatgtggtttt 15432749  T
Q  335 atcaatattacccttagttatttattgtggagatagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggatattatggtaaaagtatcaattattgtatc 434  Q
    | | ||||||||||||  ||||||||   |||| | ||||||||||||||| ||||||||| | ||||| |||||| | ||||  || |||| |||||||    
T  15432750 acctatattacccttatatatttattactgagagataaatatatgaaatgaaatattaaattattaaggttattataggaaaaagataaattgttgtatc 15432849  T
Q  435 aaaagtaataacatttattgattgtcttgctttgtgtaaaatgtcataaaatgacaattaaaaagga 501  Q
    ||||||| ||| |  ||||  |||||||  |||||||| || |||| || |||||||||||||||||    
T  15432850 aaaagtagtaa-aagtatttgttgtcttagtttgtgtagaaagtcaaaatatgacaattaaaaagga 15432915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #58
Raw Score: 57; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 373 - 513
Target Start/End: Original strand, 3850437 - 3850577
Alignment:
Q  373 atatatgaaatgagatattaaatgaataaggatattatggtaaaagtatcaattattgtatcaaaagtaataacatttattgattgtcttgctttgtgta 472  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||| |||   || | | |||||||||| || || || |||||||||||| ||||||||    
T  3850437 atatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaaatatagcttgtggcatcaaaagtagtatcaattgttgattgtcttggtttgtgta 3850536  T
Q  473 aaatgtcataaaatgacaattaaaaaggagcggaggtagta 513  Q
    |||| ||| ||  |||||||||||||| | |||||||||||    
T  3850537 aaatatcaaaatgtgacaattaaaaagtaacggaggtagta 3850577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #59
Raw Score: 48; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 322 - 397
Target Start/End: Original strand, 7632509 - 7632584
Alignment:
Q  322 taaatgttattttatcaatattacccttagttatttattgtggagatagaaatatatgaaatgagatattaaatga 397  Q
    |||||||| ||||||  ||||||| ||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  7632509 taaatgttgttttatttatattactcttagatatttattgtagagataaaaatatatgaaatgagatattaaatga 7632584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #60
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 235 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 2381271 - 2381068
Alignment:
Q  235 atactcactccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttatttcaatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaactttaaatgttatttt 334  Q
    |||||| |||||||||||| ||| ||||||||||| | |||  |||| |||  | |||||||||  ||||||||||||||| |   ||||||||   |||    
T  2381271 atactctctccgttcctttataattgtcacttttgcataaaaattttgttttcaattaactgtcgttttcaaagttcaatgtattattaaatgtggcttt 2381172  T
Q  335 atcaatattacccttagttatttattgtggagatagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggatattatggtaaaagtatcaattattgtatc 434  Q
    | | ||||||||||||  |||||||||   ||| |||||||||||||||||   ||||||| | ||||| |||||| | ||||  || | || |||||||    
T  2381171 acctatattacccttatatatttattgcaaagagagaaatatatgaaatgaagcattaaataattaaggttattataggaaaaagataatttgttgtatc 2381072  T
Q  435 aaaa 438  Q
    ||||    
T  2381071 aaaa 2381068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #61
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 295 - 410
Target Start/End: Original strand, 30734542 - 30734657
Alignment:
Q  295 tgtcactttcaaagttcaatgcaactttaaatgttattttatcaatattacccttagttatttattgtggagatagaaatatatgaaatgagatattaaa 394  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||| |||| | |||| ||||||||| |||||||   |||||||||| |||| ||||| | || |||||| ||| ||||    
T  30734542 tgtcattttcaaatttcaatgcaacattaattattatcttatcaataatacccttgcatatttattgtagagagagaaaaaaataaaatgaaataataaa 30734641  T
Q  395 tgaataaggatattat 410  Q
    ||| ||||| ||||||    
T  30734642 tgattaagggtattat 30734657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #62
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 452 - 513
Target Start/End: Original strand, 30388962 - 30389023
Alignment:
Q  452 ttgattgtcttgctttgtgtaaaatgtcataaaatgacaattaaaaaggagcggaggtagta 513  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| ||  ||| |||||||||||| |||||||||||    
T  30388962 ttgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgataattaaaaaggaacggaggtagta 30389023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #63
Raw Score: 36; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 432 - 511
Target Start/End: Original strand, 53807 - 53886
Alignment:
Q  432 atcaaaagtaataacatttattgattgtcttgctttgtgtaaaatgtcataaaatgacaattaaaaaggagcggaggtag 511  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||| | | |||||||| ||| ||  |||||||||||||| | |||||||||    
T  53807 atcaaaagtagtaacaattattgattgtcttggtatatgtaaaatatcaaaatgtgacaattaaaaagaaacggaggtag 53886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #64
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 447 - 513
Target Start/End: Original strand, 30237431 - 30237496
Alignment:
Q  447 atttattgattgtcttgctttgtgtaaaatgtcataaaatgacaattaaaaaggagcggaggtagta 513  Q
    |||||||||||||  |  |||||||||||||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  30237431 atttattgattgttattttttgtgtaaaatgtaa-aaaatgacaattaaaaaggaacggaggtagta 30237496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 195; Significance: 1e-105; HSPs: 111)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 195; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 236 - 514
Target Start/End: Complemental strand, 35700632 - 35700354
Alignment:
Q  236 tactcactccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttatttcaatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaactttaaatgttatttta 335  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| |||    || || |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||    
T  35700632 tactccctccgtttctttttaagtgtcacttttggaaaaaaaaattgttccaatttaactgtcactttcaaaattcaatgcaactttaaatgttgtttta 35700533  T
Q  336 tcaatattacccttagttatttattgtggagatagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggatattatggtaaaagtatcaattattgtatca 435  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  35700532 tcaatattacccttagttatttattgcggagaaagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggctattatagtaaaagtatcaattattatatca 35700433  T
Q  436 aaagtaataacatttattgattgtcttgctttgtgtaaaatgtcataaaatgacaattaaaaaggagcggaggtagtaa 514  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  35700432 aaagtagtaacatttattgattgtcttgatttgtgtaaaatatcacaaaatgacaattaaaaaggaacggaggtagtaa 35700354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 236 - 516
Target Start/End: Original strand, 10506793 - 10507071
Alignment:
Q  236 tactcactccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttatttcaatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaactttaaatgttatttta 335  Q
    ||||| |||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10506793 tactccctccattcattttaaagtgtcacttttggagaaattttttgttctaatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaactttaaatgttatttta 10506892  T
Q  336 tcaatattacccttagttatttattgtggagatagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggatattatggtaaaagtatcaattattgtatca 435  Q
    || ||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||| ||||    
T  10506893 tcgatattacccttagttatttattgcggaga--gaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggctattatagtacaagtatcaattattgcatca 10506990  T
Q  436 aaagtaataacatttattgattgtcttgctttgtgtaaaatgtcataaaatgacaattaaaaaggagcggaggtagtaagt 516  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| || || ||||||||    
T  10506991 aaagtagtaatatttattgattgtcttgatttgtgtaaaatatcacaaaatgacaattaaaaaggaacgtagttagtaagt 10507071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 184; E-Value: 5e-99
Query Start/End: Original strand, 242 - 513
Target Start/End: Original strand, 32347964 - 32348234
Alignment:
Q  242 ctccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttatttcaatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaactttaaatgttattttatcaata 341  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||    
T  32347964 ctccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaaaattttgtttcaatttaactgccactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaata 32348063  T
Q  342 ttacccttagttatttattgtggagatagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggatattatggtaaaagtatcaattattgtatcaaaagta 441  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||| || ||||||||||||||||    
T  32348064 ttacccttagttatttattgtggagaaagaaatatataaaatgagatattaaatgaataaggttattctagtaaaagtatgaagtattgtatcaaaagta 32348163  T
Q  442 ataacatttattgattgtcttgctttgtgtaaaatgtcataaaatgacaattaaaaaggagcggaggtagta 513  Q
     ||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  32348164 gtaatatttattgattgtattggtttgtgtaaaatgtca-aaagtgacaattaaaaaggaacggaggtagta 32348234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 164; E-Value: 4e-87
Query Start/End: Original strand, 246 - 513
Target Start/End: Original strand, 30686401 - 30686668
Alignment:
Q  246 gttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttatttcaatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaactttaaatgttattttatcaatattac 345  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||      
T  30686401 gttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgt 30686500  T
Q  346 ccttagttatttattgtggagatagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggatattatggtaaaagtatcaattattgtatcaaaagtaataa 445  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||| | |||||| |||||||||| ||     
T  30686501 ccttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtataacttattgcatcaaaagtagtat 30686600  T
Q  446 catttattgattgtcttgctttgtgtaaaatgtcataaaatgacaattaaaaaggagcggaggtagta 513  Q
    || || |||||||||||| |||||||||||| ||| ||  |||||||||||||||| |||||||||||    
T  30686601 caattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatatcaaaacgtgacaattaaaaaggaacggaggtagta 30686668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 158; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 233 - 514
Target Start/End: Complemental strand, 32168572 - 32168291
Alignment:
Q  233 ttatactcactccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttatttcaatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaactttaaatgttatt 332  Q
    |||||||| |||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||| ||    
T  32168572 ttatactccctccgttcctttttaattgtcacttttagagaaaatttttgtttctatttaactgtcagtttcaaagttcaatgcatcattaaatgttgtt 32168473  T
Q  333 ttatcaatattacccttagttatttattgtggagatagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggatattatggtaaaagtatcaattattgta 432  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||| ||||||||||| ||||||||| || ||||  ||||| |||||||||  ||  ||||||    
T  32168472 ttatcaatattacccttagatatttattgcggagagagaaacatatgaaatgaaatattaaattaacaaggtcattatagtaaaagtaataacaattgta 32168373  T
Q  433 tcaaaagtaataacatttattgattgtcttgctttgtgtaaaatgtcataaaatgacaattaaaaaggagcggaggtagtaa 514  Q
    ||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  32168372 tcaaaagtagtaccatttattgattgtcttggtttgtgtaaaatatcaaaaagtgacaattaaaaaggaacggaggtagtaa 32168291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 153; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 246 - 514
Target Start/End: Original strand, 13507760 - 13508028
Alignment:
Q  246 gttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttatttcaatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaactttaaatgttattttatcaatattac 345  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||| ||||||||     
T  13507760 gttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgtaacattaaatgttgttttaccaatattat 13507859  T
Q  346 ccttagttatttattgtggagatagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggatattatggtaaaagtatcaattattgtatcaaaagtaataa 445  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |  ||||| ||||||||||   |||||| ||| |||||| ||     
T  13507860 ccttagttatttattgtggagagagaaatatatgaaatgagatattaaattaataaagtcattatagtaaaagtatagcttattgcatccaaagtagtat 13507959  T
Q  446 catttattgattgtcttgctttgtgtaaaatgtcataaaatgacaattaaaaaggagcggaggtagtaa 514  Q
    || ||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||  ||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  13507960 caattattgattgtcttgatttatgtaaaatgtcaaaatgtgataattaaaaaggaacggaggtagtaa 13508028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 153; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 246 - 514
Target Start/End: Original strand, 13514948 - 13515216
Alignment:
Q  246 gttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttatttcaatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaactttaaatgttattttatcaatattac 345  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||| ||||||||     
T  13514948 gttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgtaacattaaatgttgttttaccaatattat 13515047  T
Q  346 ccttagttatttattgtggagatagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggatattatggtaaaagtatcaattattgtatcaaaagtaataa 445  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |  ||||| ||||||||||   |||||| ||| |||||| ||     
T  13515048 ccttagttatttattgtggagagagaaatatatgaaatgagatattaaattaataaagtcattatagtaaaagtatagcttattgcatccaaagtagtat 13515147  T
Q  446 catttattgattgtcttgctttgtgtaaaatgtcataaaatgacaattaaaaaggagcggaggtagtaa 514  Q
    || ||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||  ||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  13515148 caattattgattgtcttgatttatgtaaaatgtcaaaatgtgataattaaaaaggaacggaggtagtaa 13515216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 151; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 236 - 510
Target Start/End: Complemental strand, 19929723 - 19929449
Alignment:
Q  236 tactcactccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttatttcaatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaactttaaatgttatttta 335  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| || | ||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||    
T  19929723 tactccctccgtttctttttaagtgtctcttttggagaaattttttgttcctatttaaccgtcactttcaaagttcaatgcatcattaaatgttgtttta 19929624  T
Q  336 tcaatattacccttagttatttattgtggagatagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggatattatggtaaaagtatcaattattgtatca 435  Q
     ||||||||  ||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||  ||||| |||||||||| | |||||| ||||    
T  19929623 ccaatattattctttgttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatgttaaattaataaggtcattatagtaaaagtataacttattgcatca 19929524  T
Q  436 aaagtaataacatttattgattgtcttgctttgtgtaaaatgtcataaaatgacaattaaaaaggagcggaggta 510  Q
    ||||||  |||| ||||||||||||||| |||||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  19929523 aaagtagaaacaattattgattgtcttggtttgtgtaaaatgttaaaaaatgacaattaaaaaggaacggaggta 19929449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 149; E-Value: 4e-78
Query Start/End: Original strand, 233 - 513
Target Start/End: Complemental strand, 35531555 - 35531275
Alignment:
Q  233 ttatactcactccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttatttcaatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaactttaaatgttatt 332  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||    
T  35531555 ttatactccctccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaaaattttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgtt 35531456  T
Q  333 ttatcaatattacccttagttatttattgtggagatagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggatattatggtaaaagtatcaattattgta 432  Q
    ||| |||||||| ||||||||||||||||  |||| | |||||||||||||  ||||| ||||||||||||  ||||| ||||||||||   |||||| |    
T  35531455 ttaccaatattatccttagttatttattgcagagagataaatatatgaaataggatatcaaatgaataaggtcattatagtaaaagtatagcttattgca 35531356  T
Q  433 tcaaaagtaataacatttattgattgtcttgctttgtgtaaaatgtcataaaatgacaattaaaaaggagcggaggtagta 513  Q
    ||||||||| || || || |||||||||||| |||||||||||||||| ||  |||||||||||||||| |||||||||||    
T  35531355 tcaaaagtagtatcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaacggaggtagta 35531275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 148; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 236 - 514
Target Start/End: Complemental strand, 21927953 - 21927677
Alignment:
Q  236 tactcactccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttatttcaatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaactttaaatgttatttta 335  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||   |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  21927953 tactccctccgttcctttttaagtgtcacttttgcagaaattttttgttcttatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttatttta 21927854  T
Q  336 tcaatattacccttagttatttattgtggagatagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggatattatggtaaaagtatcaattattgtatca 435  Q
     |||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||  ||||| ||||||||||   |||||| ||||    
T  21927853 ccaatattatccttagttatttattgcggagagagaaatatataaaatgaaatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtatagcttattgcatca 21927754  T
Q  436 aaagtaataacatttattgattgtcttgctttgtgtaaaatgtcataaaatgacaattaaaaaggagcggaggtagtaa 514  Q
    |||||| || || || |||||||||||  |||||||||||||||  ||  |||||||||||||||| |||| |||||||    
T  21927753 aaagtagtatcaattgttgattgtcttagtttgtgtaaaatgtc--aatgtgacaattaaaaaggaacggatgtagtaa 21927677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 145; E-Value: 9e-76
Query Start/End: Original strand, 235 - 513
Target Start/End: Complemental strand, 37609559 - 37609284
Alignment:
Q  235 atactcactccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttatttcaatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaactttaaatgttatttt 334  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||   |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  37609559 atactctctccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaaatttttgttcttatttaactgtcattttcaaagttcaatgcaacgttaaatgttgtttt 37609460  T
Q  335 atcaatattacccttagttatttattgtggagatagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggatattatggtaaaagtatcaattattgtatc 434  Q
    | |||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||   |||||| |||    
T  37609459 accaatattatccttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtatagcttattgcatc 37609360  T
Q  435 aaaagtaataacatttattgattgtcttgctttgtgtaaaatgtcataaaatgacaattaaaaaggagcggaggtagta 513  Q
    |||||||  ||   || |||||||||||| ||| |||||||||||| ||  |||||||||||||||| ||||| |||||    
T  37609359 aaaagtatcaa---ttgttgattgtcttgatttatgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaacggagatagta 37609284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 143; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 236 - 510
Target Start/End: Original strand, 9361953 - 9362227
Alignment:
Q  236 tactcactccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttatttcaatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaactttaaatgttatttta 335  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||    
T  9361953 tactccctccgttcctttttaagtgtcatttttgaagaaattttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacaataaatgttgtttta 9362052  T
Q  336 tcaatattacccttagttatttattgtggagatagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggatattatggtaaaagtatcaattattgtatca 435  Q
     ||| ||||||||||||||||||||  | ||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||| ||||||||||| |    
T  9362053 ccaacattacccttagttatttattacgaagagagaaatatatgaaataagatattaaatgactaaggttattatagtaaaagtataaattattgtataa 9362152  T
Q  436 aaagtaataacatttattgattgtcttgctttgtgtaaaatgtcataaaatgacaattaaaaaggagcggaggta 510  Q
     ||  | ||| ||||||||| ||||||| ||||| |||||||||| ||| ||||| |||||||||| ||||||||    
T  9362153 gaaaaagtaaaatttattgagtgtcttgatttgtataaaatgtcaaaaagtgacagttaaaaaggaacggaggta 9362227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 143; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 243 - 513
Target Start/End: Original strand, 13699161 - 13699431
Alignment:
Q  243 tccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttatttcaatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaactttaaatgttattttatcaatat 342  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||  ||||     
T  13699161 tccgttcctttttaagtgtcgcttttgaataaattttttatttctatttaactgttactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttacgaatac 13699260  T
Q  343 tacccttagttatttattgtggagatagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggatattatggtaaaagtatcaattattgtatcaaaagtaa 442  Q
    || |||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||| | |||||| ||||||||||     
T  13699261 tatccttagttatttattacggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtataacttattgcatcaaaagtag 13699360  T
Q  443 taacatttattgattgtcttgctttgtgtaaaatgtcataaaatgacaattaaaaaggagcggaggtagta 513  Q
    ||||| | ||||| | ||||| ||| |||||||||||| || ||| ||||||||||||| ||||| |||||    
T  13699361 taacaatcattgactatcttggtttatgtaaaatgtcaaaatatggcaattaaaaaggaacggagatagta 13699431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 143; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 236 - 514
Target Start/End: Complemental strand, 37437310 - 37437032
Alignment:
Q  236 tactcactccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttatttcaatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaactttaaatgttatttta 335  Q
    ||||| |||| ||| |||||||||||||| || ||| ||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  37437310 tactctctcccttcttttttaagtgtcacgttaggataaattttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgtttta 37437211  T
Q  336 tcaatattacccttagttatttattgtggagatagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggatattatggtaaaagtatcaattattgtatca 435  Q
     |||||||   ||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||   |||||| ||||    
T  37437210 ccaatattgttcttagttatttattgcggagataaaaatatattaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtatagcttattgcatca 37437111  T
Q  436 aaagtaataacatttattgattgtcttgctttgtgtaaaatgtcataaaatgacaattaaaaaggagcggaggtagtaa 514  Q
    |||||  || || ||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  37437110 aaagtggtatcaattattgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatatgacaattaaaaaggaacagaggtagtaa 37437032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 142; E-Value: 6e-74
Query Start/End: Original strand, 242 - 499
Target Start/End: Complemental strand, 45226828 - 45226571
Alignment:
Q  242 ctccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttatttcaatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaactttaaatgttattttatcaata 341  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  45226828 ctccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttatcaata 45226729  T
Q  342 ttacccttagttatttattgtggagatagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggatattatggtaaaagtatcaattattgtatcaaaagta 441  Q
    ||  |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||  |||||||||   |||||  ||||||||||    
T  45226728 ttgtccttagttatttattgtggaaagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaagtcattataataaaagtatagcttattacatcaaaagta 45226629  T
Q  442 ataacatttattgattgtcttgctttgtgtaaaatgtcataaaatgacaattaaaaag 499  Q
     || || || |||||||||||  ||||| |||||||||| ||  ||||||||||||||    
T  45226628 gtatcaattgttgattgtcttaatttgtataaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaag 45226571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 141; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 234 - 514
Target Start/End: Original strand, 51613389 - 51613669
Alignment:
Q  234 tatactcactccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttatttcaatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaactttaaatgttattt 333  Q
    ||||||| |||| ||||||||||| |||||||||| |||||| ||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||    
T  51613389 tatactccctccattcctttttaattgtcacttttagagaaaatttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcatcattaaatgttgttt 51613488  T
Q  334 tatcaatattacccttagttatttattgtggagatagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggatattatggtaaaagtatcaattattgtat 433  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||||| ||| | ||||| ||||||||||| ||||||||| || ||||  ||||| |||||||||  ||  |||||||    
T  51613489 tatcaatattactcttagatatttattgcggatagagaaacatatgaaatgaaatattaaattaacaaggtcattatagtaaaagtaataacaattgtat 51613588  T
Q  434 caaaagtaataacatttattgattgtcttgctttgtgtaaaatgtcataaaatgacaattaaaaaggagcggaggtagtaa 514  Q
    |||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||| | | ||| |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  51613589 caaaagtagtatcatttattgattgtcttggtttgtgtaaaatataaaaaagtgacaattaaaaaggaacggaggtagtaa 51613669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 139; E-Value: 4e-72
Query Start/End: Original strand, 234 - 500
Target Start/End: Original strand, 15660565 - 15660831
Alignment:
Q  234 tatactcactccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttatttcaatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaactttaaatgttattt 333  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||    
T  15660565 tatactctctccgttcctttttaagtgtcatttttggagaaatattttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacaataaatgttgttt 15660664  T
Q  334 tatcaatattacccttagttatttattgtggagatagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggatattatggtaaaagtatcaattattgtat 433  Q
    || ||| ||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||| | ||||||||||| ||||  |||||| |||||||||| |||||||||||    
T  15660665 taccaacattacccttagttatttattacggagagagaaatatatgaaataaaatattaaatgactaagactattatagtaaaagtataaattattgtat 15660764  T
Q  434 caaaagtaataacatttattgattgtcttgctttgtgtaaaatgtcataaaatgacaattaaaaagg 500  Q
     | ||  ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||| ||| ||| | |||||||||    
T  15660765 aagaaaaaataacatttattgagtgtcttggtttgtgtaaaatatcaaaaagtgatagttaaaaagg 15660831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 139; E-Value: 4e-72
Query Start/End: Original strand, 247 - 501
Target Start/End: Complemental strand, 30702536 - 30702282
Alignment:
Q  247 ttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttatttcaatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaactttaaatgttattttatcaatattacc 346  Q
    |||||||||||||||  |||||| | ||||||||| ||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||| |    
T  30702536 ttcctttttaagtgtttcttttgcataaattttttgttttaatttaaatctcactttcaaagttcaatgcaacgttaaatgttgttttaccaatattatc 30702437  T
Q  347 cttagttatttattgtggagatagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggatattatggtaaaagtatcaattattgtatcaaaagtaataac 446  Q
    |||||||||||||||| |||| | |||||||| |||||||||| ||||| ||||| | |||||| |||||||||| || |||||||||||||||  ||||    
T  30702436 cttagttatttattgtagagaaaaaaatatataaaatgagataataaataaataatgttattatagtaaaagtataaaatattgtatcaaaagtggtaac 30702337  T
Q  447 atttattgattgtcttgctttgtgtaaaatgtcataaaatgacaattaaaaagga 501  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  30702336 atttattgattgtattggtttgtgtaaaatgtcaaaaagtgacaattaaaaagga 30702282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 138; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 236 - 513
Target Start/End: Original strand, 10675882 - 10676159
Alignment:
Q  236 tactcactccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttatttcaatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaactttaaatgttatttta 335  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  10675882 tactccctccgttcttttttaagtgtctcttttgaagaaattttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgtttta 10675981  T
Q  336 tcaatattacccttagttatttattgtggagatagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggatattatggtaaaagtatcaattattgtatca 435  Q
     |||||||| ||| |||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||  | |||||| ||||    
T  10675982 ccaatattatcctaagttatttattgcggagagagaaatatataaaatgagatattaaataaataaggttattatagtaaaagtacaacttattgcatca 10676081  T
Q  436 aaagtaataacatttattgattgtcttgctttgtgtaaaatgtcataaaatgacaattaaaaaggagcggaggtagta 513  Q
    |||||||||||| | ||||| | | ||| ||| |||||||||||| ||  ||| |||||||||||| | |||||||||    
T  10676082 aaagtaataacaatcattgactatattgatttatgtaaaatgtcaaaatgtgataattaaaaaggaacagaggtagta 10676159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 138; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 235 - 513
Target Start/End: Complemental strand, 32994731 - 32994450
Alignment:
Q  235 atactcactccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaatt----ttttatttcaatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaactttaaatgtta 330  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| |||||  |||||||    | || ||   |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||     
T  32994731 atactccctccgttcctttttaagtgtctcttttaaagaaattaatttgttgttcttatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttg 32994632  T
Q  331 ttttatcaatattacccttagttatttattgtggagatagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggatattatggtaaaagtatcaattattg 430  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||| |||||||||  | ||||||    
T  32994631 ttttaccaatattatccttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatgttaaatgaataaggtcattatagtaaaagtacaacttattg 32994532  T
Q  431 tatcaaaagtaataacatttattgattgtcttgctttgtgtaaaatgtcataaaatgacaattaaaaaggagcggaggtagta 513  Q
     |||||||||| ||| | ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||| || |||||||||||    
T  32994531 catcaaaagtagtaataattattgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaaaaagacaattaaaaa-gaacggaggtagta 32994450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 137; E-Value: 6e-71
Query Start/End: Original strand, 235 - 514
Target Start/End: Original strand, 13566655 - 13566937
Alignment:
Q  235 atactcactccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttatttcaatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaactttaaatgttatttt 334  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||||||  ||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  13566655 atactccctccgttcctttttaagtgtcattttttgagaaaaattttatttttatttaaccgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgtttt 13566754  T
Q  335 atcaatattacccttagttatt---tattgtggagatagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggatattatggtaaaagtatcaattattgt 431  Q
    | |||||||  ||||| |||||   ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||| |||   ||||||     
T  13566755 accaatattgtccttaattattatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaaatatagcttattgc 13566854  T
Q  432 atcaaaagtaataacatttattgattgtcttgctttgtgtaaaatgtcataaaatgacaattaaaaaggagcggaggtagtaa 514  Q
    |||||||||| || || || |||||||||||| |||||||||||||||| ||  |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  13566855 atcaaaagtagtatcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaacggaggtagtaa 13566937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 137; E-Value: 6e-71
Query Start/End: Original strand, 243 - 499
Target Start/End: Original strand, 35255473 - 35255729
Alignment:
Q  243 tccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttatttcaatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaactttaaatgttattttatcaatat 342  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| || | |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||| ||||||    
T  35255473 tccgttcctttttaagtgtctcttttgaagaaattttttgttcctatttaattgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgatttaccaatat 35255572  T
Q  343 tacccttagttatttattgtggagatagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggatattatggtaaaagtatcaattattgtatcaaaagtaa 442  Q
    || |||||||||||||||| | ||| | |||||||||||||||||| ||||||||| ||||  ||||| ||||||| || | |||||| |||||||||||    
T  35255573 tatccttagttatttattgcgaagagataaatatatgaaatgagatgttaaatgaacaaggtcattatagtaaaagcataacttattgcatcaaaagtaa 35255672  T
Q  443 taacatttattgattgtcttgctttgtgtaaaatgtcataaaatgacaattaaaaag 499  Q
     |||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  35255673 aaacaattattgattgtcttggtttatgtaaaatgtcaaaaagtgacaattaaaaag 35255729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 137; E-Value: 6e-71
Query Start/End: Original strand, 243 - 514
Target Start/End: Complemental strand, 35484029 - 35483760
Alignment:
Q  243 tccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttatttcaatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaactttaaatgttattttatcaatat 342  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||| || | |||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||| ||||| ||||||    
T  35484029 tccgttcatttttaagtgtcatttttggagaaaatttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgtaatattaaatgttgttttaccaatat 35483930  T
Q  343 tacccttagttatttattgtggagatagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggatattatggtaaaagtatcaattattgtatcaaaagtaa 442  Q
    || ||||||||||||||||  ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||   |||||| ||||||| |||    
T  35483929 tatccttagttatttattgcagaga--gaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaaataa 35483832  T
Q  443 taacatttattgattgtcttgctttgtgtaaaatgtcataaaatgacaattaaaaaggagcggaggtagtaa 514  Q
    || || || |||||||| ||| |||||||||||||||| || |||||||||||||| || ||||||||||||    
T  35483831 tatcaattgttgattgttttggtttgtgtaaaatgtcaaaatatgacaattaaaaaagaacggaggtagtaa 35483760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 136; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 242 - 513
Target Start/End: Original strand, 38648443 - 38648714
Alignment:
Q  242 ctccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttatttcaatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaactttaaatgttattttatcaata 341  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||| ||||||  |||| || | |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||| |||||    
T  38648443 ctccattcctttttaaatgtcactttttgagaaaaattttgttcctatttaactgtcactttcaaacttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaata 38648542  T
Q  342 ttacccttagttatttattgtggagatagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggatattatggtaaaagtatcaattattgtatcaaaagta 441  Q
    ||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||| ||||||||||   |||||| ||||||| ||    
T  38648543 ttatccttagttatttattgcggagaaagaaatatatgaaatgagatatcaaatgaataaggtcattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaaata 38648642  T
Q  442 ataacatttattgattgtcttgctttgtgtaaaatgtcataaaatgacaattaaaaaggagcggaggtagta 513  Q
     || || || |||||||||||| |||||||||||||||| ||  |||||||||||||| | |||||||||||    
T  38648643 gtatcaattgttgattgtcttgatttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaagaaacggaggtagta 38648714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 136; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 246 - 513
Target Start/End: Original strand, 43500496 - 43500763
Alignment:
Q  246 gttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttatttcaatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaactttaaatgttattttatcaatattac 345  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| | ||| || | |||||| ||||||||| |||||||||||||   ||||||||| ||||| ||||||||     
T  43500496 gttcctttttaagtgtcatttttggagaaaatatttgttcctatttaagtgtcacttttaaagttcaatgcagtattaaatgttgttttaccaatattat 43500595  T
Q  346 ccttagttatttattgtggagatagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggatattatggtaaaagtatcaattattgtatcaaaagtaataa 445  Q
    ||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||   |||||| |||||||||| ||     
T  43500596 ccttagttatttattgcagagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaagtagtat 43500695  T
Q  446 catttattgattgtcttgctttgtgtaaaatgtcataaaatgacaattaaaaaggagcggaggtagta 513  Q
    || || |||||||||||| |||||||||||||||| ||  |||||||||||||||| |||||||||||    
T  43500696 caattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaacggaggtagta 43500763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 135; E-Value: 9e-70
Query Start/End: Original strand, 235 - 513
Target Start/End: Original strand, 45368067 - 45368345
Alignment:
Q  235 atactcactccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttatttcaatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaactttaaatgttatttt 334  Q
    |||||| |||| ||||||||||| |||||||||||| |||| ||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||| || |||||| ||||    
T  45368067 atactccctcctttcctttttaaatgtcacttttggggaaaatttttgtttctatttatctgtcactttcaaagttcaatgaaacattgaatgttgtttt 45368166  T
Q  335 atcaatattacccttagttatttattgtggagatagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggatattatggtaaaagtatcaattattgtatc 434  Q
    | |||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||   |||||| |||    
T  45368167 accaatattatccttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtatagcttattgcatc 45368266  T
Q  435 aaaagtaataacatttattgattgtcttgctttgtgtaaaatgtcataaaatgacaattaaaaaggagcggaggtagta 513  Q
    ||||||| || || || |||||||| ||| |||||||||||||||| ||   |||||||||||| || | |||||||||    
T  45368267 aaaagtagtatcaattgttgattgttttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgcgacaattaaaaaagaactgaggtagta 45368345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 134; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 236 - 485
Target Start/End: Complemental strand, 19455655 - 19455408
Alignment:
Q  236 tactcactccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttatttcaatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaactttaaatgttatttta 335  Q
    ||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  19455655 tactccctctgttcctttataagtgtcacttttggagaaatttttg-tttcaatttaattgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgtttta 19455557  T
Q  336 tcaatattacccttagttatttattgtggagatagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggatattatggtaaaagtatcaattattgtatca 435  Q
     |||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||| |||||||    ||||||||||||||||  |||| | ||||| |||| |||||||||||||    
T  19455556 ccaatattacccttaattatttattgcggagagagaaatctatgaaacataatattaaatgaataagactattttagtaaaggtataaattattgtatca 19455457  T
Q  436 aaagtaataacatttattgattgtcttgctttgtgtaaaatgtcataaaa 485  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  19455456 aaagtagtaaca-ttattgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaaaa 19455408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 133; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 242 - 514
Target Start/End: Complemental strand, 19349630 - 19349358
Alignment:
Q  242 ctccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttatttcaatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaactttaaatgttattttatcaata 341  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| |||||||  |||| || | ||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||| |||||    
T  19349630 ctccgttcctttttaaatgtcactttcggagaaaaattttgttcctatttaacagtcactttcaaagttgaatgcaacattaaatgttgttttaccaata 19349531  T
Q  342 ttacccttagttatttattgtggagatagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggatattatggtaaaagtatcaattattgtatcaaaagta 441  Q
    ||  |||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||   |||||| ||||||||||    
T  19349530 ttgtccttagttatttattgcggagagataaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaagta 19349431  T
Q  442 ataacatttattgattgtcttgctttgtgtaaaatgtcataaaatgacaattaaaaaggagcggaggtagtaa 514  Q
     || || || |||||||||||| |||||||||||||||| ||  |||||||||||||||| | | ||||||||    
T  19349430 gtatcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcagaatgtgacaattaaaaaggaacagtggtagtaa 19349358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 133; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 242 - 514
Target Start/End: Original strand, 36318339 - 36318610
Alignment:
Q  242 ctccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttatttcaatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaactttaaatgttattttatcaata 341  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  36318339 ctccgttcctttttaagtgtcacttttagataaattttttgtttctatttaactgtcgctttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttatcaata 36318438  T
Q  342 ttacccttagttatttattgtggagatagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggatattatggtaaaagtatcaattattgtatcaaaagta 441  Q
    ||| ||||| |||||||||    ||| | |||| |||||||||| | ||||||  ||||||| |||||| ||||| || | |||||||||||||||||||    
T  36318439 ttatccttatttatttattacaaagagaaaaat-tatgaaatgacacattaaacaaataaggttattatagtaaaggtgtaaattattgtatcaaaagta 36318537  T
Q  442 ataacatttattgattgtcttgctttgtgtaaaatgtcataaaatgacaattaaaaaggagcggaggtagtaa 514  Q
     | ||||||||||| ||| ||| |||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  36318538 gtgacatttattgaatgtattggtttgtgtaaattgtcaaaaagtgacaattaaaaaggaacggaggtagtaa 36318610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 132; E-Value: 5e-68
Query Start/End: Original strand, 243 - 513
Target Start/End: Complemental strand, 18034076 - 18033806
Alignment:
Q  243 tccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttatttcaatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaactttaaatgttattttatcaatat 342  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| || ||||||||||||    
T  18034076 tccgttcctttttaagtgtcactttttgagaaattttttattcctatttaactgtcactttcaaagttcaatccaacattaaatattgttttatcaatat 18033977  T
Q  343 tacccttagttatttattgtggagatagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggatattatggtaaaag-tatcaattattgtatcaaaagta 441  Q
    || |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||  |||   |||||| |||||||  |    
T  18033976 tatccttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaaaatatagcttattgcatcaaaatga 18033877  T
Q  442 ataacatttattgattgtcttgctttgtgtaaaatgtcataaaatgacaattaaaaaggagcggaggtagta 513  Q
     || || || |||||||||||| |||| ||||||||  | ||  |||||||||||||||| |||||||||||    
T  18033876 gtatcaattgttgattgtcttggtttgcgtaaaatg-aaaaatgtgacaattaaaaaggaacggaggtagta 18033806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 132; E-Value: 5e-68
Query Start/End: Original strand, 234 - 513
Target Start/End: Complemental strand, 31588998 - 31588720
Alignment:
Q  234 tatactcactccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttatttcaatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaactttaaatgttattt 333  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  31588998 tatactccctccgttcctttttaagtgtcatttttagagaaaatttttgtttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttattt 31588899  T
Q  334 tatcaatattacccttagttatttattgtggagatagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggatattatggtaaaagtatcaattattgtat 433  Q
    || |||||||| |||||||||||||||| | ||| | ||||||||||||||||||| |||||||||||||  || || ||||||||||   |||||||||    
T  31588898 taccaatattatccttagttatttattgcgaagagataaatatatgaaatgagata-taaatgaataaggtcatcatagtaaaagtatagcttattgtat 31588800  T
Q  434 caaaagtaataacatttattgattgtcttgctttgtgtaaaatgtcataaaatgacaattaaaaaggagcggaggtagta 513  Q
    |||||||| ||  | || |||||| ||||| |||||||||||||  | ||  ||||||||||||| || || ||||||||    
T  31588799 caaaagtagtattaatttttgattatcttggtttgtgtaaaatgctaaaatgtgacaattaaaaaagaacgtaggtagta 31588720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 132; E-Value: 5e-68
Query Start/End: Original strand, 236 - 514
Target Start/End: Original strand, 38597570 - 38597849
Alignment:
Q  236 tactcactccgttcctttttaa-gtgtcacttttggagaaattttttatttcaatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaactttaaatgttatttt 334  Q
    ||||| ||| |||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||  || | ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| || ||||    
T  38597570 tactccctctgttcctttttaaagtgtcatttttggagaaacttttcgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacaataaatattgtttt 38597669  T
Q  335 atcaatattacccttagttatttattgtggagatagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggatattatggtaaaagtatcaattattgtatc 434  Q
    | ||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||| |||||||||||     
T  38597670 accaacattacccttagttatttattatggagagagaaatatatgaaataagatattaaatgactaaggttattatagtaaaagtataaattattgtata 38597769  T
Q  435 aaaagtaataacatttattgattgtcttgctttgtgtaaaatgtcataaaatgacaattaaaaaggagcggaggtagtaa 514  Q
    | ||  | ||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||| | ||| ||||||    
T  38597770 agaaaaagtaacatttattgagtgtcttagtttgtgtaaaatgtcaaaaagtgacagttaaaaaggaacagagatagtaa 38597849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 131; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 235 - 513
Target Start/End: Original strand, 1429263 - 1429541
Alignment:
Q  235 atactcactccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttatttcaatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaactttaaatgttatttt 334  Q
    |||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||| || | |||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||| ||||    
T  1429263 atactccctccgttcttttctaagtgtcacttttggagaaaatttttgttcctatttaactgtcacttttaaagttcattgcaacattaaatgttgtttt 1429362  T
Q  335 atcaatattacccttagttatttattgtggagatagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggatattatggtaaaagtatcaattattgtatc 434  Q
    | |||||||  |||||||||||||||| ||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||   |||||| |||    
T  1429363 accaatattgtccttagttatttattgcggagagagaaatatacaaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtatagcttattgcatc 1429462  T
Q  435 aaaagtaataacatttattgattgtcttgctttgtgtaaaatgtcataaaatgacaattaaaaaggagcggaggtagta 513  Q
    ||||||| || ||||| | |||||||||  |||||||||||| ||| ||  |||||||||||||||| || ||||||||    
T  1429463 aaaagtagtatcatttgtagattgtcttagtttgtgtaaaatatcaaaatgtgacaattaaaaaggaacgaaggtagta 1429541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 131; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 242 - 501
Target Start/End: Original strand, 9127653 - 9127914
Alignment:
Q  242 ctccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttatttcaatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaactttaaatgttattttatcaata 341  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | |  |||||| |||||||||| |||||||||||||  ||||||||| ||||  || ||    
T  9127653 ctcccttcctttttaagtgtcacttttggataaattttttgtgtttatttaattgtcactttcgaagttcaatgcaatattaaatgttgtttttccagta 9127752  T
Q  342 ttacccttagttatttattgtggagataga--aatatatgaaatgagatattaaatgaataaggatattatggtaaaagtatcaattattgtatcaaaag 439  Q
    ||| ||||  | |||||||||||||| |||  |||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||  ||||||||||||||||    
T  9127753 ttatccttgctcatttattgtggagagagagaaatatatgaagtgaaatattaaatgaataaggttattatagtaaaagtatatattattgtatcaaaag 9127852  T
Q  440 taataacatttattgattgtcttgctttgtgtaaaatgtcataaaatgacaattaaaaagga 501  Q
    || ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  9127853 tagtaacatttattgaatgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaaagtgacaattaaaaagga 9127914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 131; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 235 - 513
Target Start/End: Original strand, 18344305 - 18344583
Alignment:
Q  235 atactcactccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttatttcaatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaactttaaatgttatttt 334  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||||| |||||   |||| ||||| ||||||||||| ||||| ||| ||| ||||||| ||| ||||||||| ||||    
T  18344305 atactccctccgtttctttttaagtgtctcttttaacgaaaatttttgtttcaatttaagtgtcaattttaaaattcaatgtaacattaaatgttgtttt 18344404  T
Q  335 atcaatattacccttagttatttattgtggagatagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggatattatggtaaaagtatcaattattgtatc 434  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||  ||||||| |||||| |||||||||| || |||||||||    
T  18344405 accaatattacccttagttatttattgtgcagagagaaatatatgaaatgagataataaacaaataaggttattatagtaaaagtataaagtattgtatc 18344504  T
Q  435 aaaagtaataacatttattgattgtcttgctttgtgtaaaatgtcataaaatgacaattaaaaaggagcggaggtagta 513  Q
    ||||||  ||| ||||||| ||| | ||| |||||||||||||| | ||| ||||||||||||| || |||||||||||    
T  18344505 aaaagtggtaatatttattaattatattgatttgtgtaaaatgttaaaaagtgacaattaaaaatgaacggaggtagta 18344583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 131; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 235 - 513
Target Start/End: Complemental strand, 50825830 - 50825553
Alignment:
Q  235 atactcactccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttatttcaatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaactttaaatgttatttt 334  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||   | ||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||| ||||    
T  50825830 atactccctccgttcctttttaagtgtctcttttgaagaaattttttgttcttacttaactgtcactttcaaagtttaatgcaatattaaatgttgtttt 50825731  T
Q  335 atcaatattacccttagttatttattgtggagatagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggatattatggtaaaagtatcaattattgtatc 434  Q
    | |||||||| |||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||| |||||||||| | |||||| |||    
T  50825730 accaatattatccttagttatttattacggagagagaaatatatgaaatgagatgttaaatgaataaggtcattatagtaaaagtataacttattgcatc 50825631  T
Q  435 aaaagtaataacatttattgattgtcttgctttgtgtaaaatgtcataaaatgacaattaaaaaggagcggaggtagta 513  Q
    ||||||| || ||  | |||||||||||| |||||| ||||||||| ||| |||||||||||||  | |||||||||||    
T  50825630 aaaagtagtagca-atgttgattgtcttggtttgtgaaaaatgtcaaaaagtgacaattaaaaaaaaacggaggtagta 50825553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 128; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 235 - 514
Target Start/End: Complemental strand, 31570895 - 31570616
Alignment:
Q  235 atactcactccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttatttcaatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaactttaaatgttatttt 334  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||   ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||    
T  31570895 atactccctccgttcctttttaagtgtctcttttggagaaattttttgttcatatttaactgtcactttcgaagttcaatgcaacattaaatattatttt 31570796  T
Q  335 atcaatattacccttagttatttattgtggagatagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggatattatggtaaaagtatcaattattgtatc 434  Q
    | |||||||| ||||| ||||||||   ||||  |||||| |||||| | ||  ||||||||||||||| |||||| ||||||||||  ||| || ||||    
T  31570795 accaatattatccttacttatttatcacggagtgagaaatgtatgaagttagtgattaaatgaataaggttattatagtaaaagtatgcattgttctatc 31570696  T
Q  435 aaaagtaataacatttattgattgtcttgctttgtgtaaaatgtcataaaatgacaattaaaaaggagcggaggtagtaa 514  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||| | |||| ||||| |||||||||| |||| |||||||    
T  31570695 aaaagtagtaacatttattgaatgtattggtttgtgtaaaatgccttaaagtgacacttaaaaaggaacggatgtagtaa 31570616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 127; E-Value: 5e-65
Query Start/End: Original strand, 236 - 510
Target Start/End: Complemental strand, 51974428 - 51974154
Alignment:
Q  236 tactcactccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttatttcaatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaactttaaatgttatttta 335  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| ||||  | |||    || |||| |||||||||||| |||| |||||||||||||  |||||| || |||||    
T  51974428 tactccctccgttcctttttaagtgtcatttttttaaaaaaaaattgtttccatttaactgtcattttcgaagttcaatgcaatattaaatattgtttta 51974329  T
Q  336 tcaatattacccttagttatttattgtggagatagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggatattatggtaaaagtatcaattattgtatca 435  Q
     |||||||| ||||  |||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||  ||||||||||||    
T  51974328 ccaatattatccttgcttatttattgtgaagagagaaatatatgaaatgaaatattaaatgaataaggttattatagtaaaagtatacattattgtatca 51974229  T
Q  436 aaagtaataacatttattgattgtcttgctttgtgtaaaatgtcataaaatgacaattaaaaaggagcggaggta 510  Q
    |||||| ||| ||||||||| ||| ||| || ||||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  51974228 aaagtagtaatatttattgaatgttttggttcgtgtaaaatgtcaaaaagtgacaattaaaaaggaacggaggta 51974154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 125; E-Value: 8e-64
Query Start/End: Original strand, 228 - 499
Target Start/End: Original strand, 48508105 - 48508376
Alignment:
Q  228 aaatattatactcactccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttatttcaatttaactgtcacttt-caaagttcaatgcaactttaaat 326  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||||||||||  ||||| |||| |||| | || | |||||| ||||||||| || ||||||||||||| |||||     
T  48508105 aaattttatactccctccgttcctttttaagtgtctattttgaagaatttttatgttcctatttaattgtcactttacacagttcaatgcaacattaaaa 48508204  T
Q  327 gttattttatcaatattacccttagttatttattgtggagatagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggatattatggtaaaagtatcaatt 426  Q
    |||||||||  ||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||| ||  ||||    
T  48508205 gttattttactaatattacccttatttatt-attgtggagagagaaatatatgtaatgagatattaaataaataaggttattatagtaaaaataaaaatt 48508303  T
Q  427 attgtatcaaaagtaataacatttattgattgtcttgctttgtgtaaaatgtcataaaatgacaattaaaaag 499  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||| | ||| ||||| |||||||||| ||  ||||||||||||||    
T  48508304 attgtatcaaaagtaacaacatttattgattattttggtttgtataaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaag 48508376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 124; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 243 - 514
Target Start/End: Original strand, 1024543 - 1024814
Alignment:
Q  243 tccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttatttcaatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaactttaaatgttattttatcaatat 342  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | |||    ||||||  |||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||| ||||||    
T  1024543 tccgttcctttttaagtgtcacttttgaaaaaaaaaattatttttatttaactgttactttcaaagttcaatgtaacattaaatgttgttttaccaatat 1024642  T
Q  343 tacccttagttatttattgtggagatagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggatattatggtaaaagtatcaattattgtatcaaaagtaa 442  Q
    |  | |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||| ||||||||||   |||||| ||||||||||     
T  1024643 tgtcgttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataagatcattatagtaaaagtatagtttattgcatcaaaagtag 1024742  T
Q  443 taacatttattgattgtcttgctttgtgtaaaatgtcataaaatgacaattaaaaaggagcggaggtagtaa 514  Q
    || || || |||||||| ||| |||||||||||| ||| ||  |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  1024743 tatcaattgttgattgttttggtttgtgtaaaatatcaaaatgtgacaattaaaaaggaacggaggtagtaa 1024814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 124; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 242 - 513
Target Start/End: Complemental strand, 20605875 - 20605604
Alignment:
Q  242 ctccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttatttcaatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaactttaaatgttattttatcaata 341  Q
    |||||||  ||||||||||||| |||||||||||  |||| ||   ||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||| |||||    
T  20605875 ctccgtttttttttaagtgtcatttttggagaaaaattttgttcttattaaactgtcactttcaaacttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaata 20605776  T
Q  342 ttacccttagttatttattgtggagatagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggatattatggtaaaagtatcaattattgtatcaaaagta 441  Q
    ||| | || ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||  |||||||||   |||||| ||||||||||    
T  20605775 ttatcattggttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattataataaaagtatagcttattgcatcaaaagta 20605676  T
Q  442 ataacatttattgattgtcttgctttgtgtaaaatgtcataaaatgacaattaaaaaggagcggaggtagta 513  Q
     || || || |||||||||||| |||||||||||||||| || |||||||||||||| ||  ||||||||||    
T  20605675 gtatcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatatgacaattaaaaatgaatggaggtagta 20605604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 124; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 236 - 507
Target Start/End: Original strand, 44182740 - 44183009
Alignment:
Q  236 tactcactccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttatttcaatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaactttaaatgttatttta 335  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||   ||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  44182740 tactccctccgttcctttttaagtgtcaattttggagaaaaaatttgtttctatttaactgtcactctcaaagttcaatgcaacattaaatgttgtttta 44182839  T
Q  336 tcaatattacccttagttatttattgtggagatagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggatattatggtaaaagtatcaattattgtatca 435  Q
     |||||||| |||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||| ||||| |||||||  ||||| ||||||||||   ||||| ||||     
T  44182840 ccaatattatccttagttatttattgcggagagataaatatatgaaatgagata-taaataaataaggtcattatagtaaaagtatatcttattatatc- 44182937  T
Q  436 aaagtaataacatttattgattgtcttgctttgtgtaaaatgtcataaaatgacaattaaaaaggagcggag 507  Q
    ||||||||| || || |||||||||||| |||||||||||||  | ||  |||||||||||||||| |||||    
T  44182938 aaagtaatatcaatttttgattgtcttggtttgtgtaaaatgctaaaatgtgacaattaaaaaggaacggag 44183009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 123; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 251 - 521
Target Start/End: Complemental strand, 4101151 - 4100881
Alignment:
Q  251 tttttaagtgtcacttttggagaaattttttatttcaatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaactttaaatgttattttatcaatattaccctta 350  Q
    ||||||| ||||||||||||| |||| |||| || | |||||||||||||||| ||||||||||| | | ||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  4101151 tttttaattgtcacttttggaaaaatcttttgttcctatttaactgtcacttttaaagttcaatgtagcattaaatgttgttttaccaatattaccctta 4101052  T
Q  351 gttatttattgtggagatagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggatattatggtaaaagtatcaattattgtatcaaaagtaataacattt 450  Q
      ||||||||| ||||| | ||| ||||||||||| ||||||||| ||||||   ||||| |||||||||  ||  ||||||||||||||||||||||||    
T  4101051 tatatttattgcggagagaaaaacatatgaaatgaaatattaaattaataagatcattatagtaaaagtaaaaacaattgtatcaaaagtaataacattt 4100952  T
Q  451 attgattgtcttgctttgtgtaaaatgtcataaaatgacaattaaaaaggagcggaggtagtaagtttgtt 521  Q
    ||||||||||||  |||||||||||| ||| ||| | | |||||||||||| |||||||||||| ||||||    
T  4100951 attgattgtcttagtttgtgtaaaatatcaaaaagtaataattaaaaaggaacggaggtagtaattttgtt 4100881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 123; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 247 - 501
Target Start/End: Original strand, 7782942 - 7783195
Alignment:
Q  247 ttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttatttcaatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaactttaaatgttattttatcaatattacc 346  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||       
T  7782942 ttcctttttaagtgtcacttttggagaaaatttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattagatgttgttttatcaatattgtt 7783041  T
Q  347 cttagttatttattgtggagatagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggatattatggtaaaagtatcaattattgtatcaaaagtaataac 446  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | || ||||||||||||||  ||||| ||||||||||   | |||| |||||||||| || |    
T  7783042 cttagttatttattgtggagagagaaatatatgaaat-aaatgttaaatgaataaggtcattatagtaaaagtatagttaattgcatcaaaagtagtatc 7783140  T
Q  447 atttattgattgtcttgctttgtgtaaaatgtcataaaatgacaattaaaaagga 501  Q
    | || |||||| ||||| ||||| |||||||||| ||  ||||||||||||||||    
T  7783141 aattgttgattatcttggtttgtataaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaagga 7783195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 118; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 234 - 498
Target Start/End: Original strand, 52748995 - 52749257
Alignment:
Q  234 tatactcactccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttatttcaatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaactttaaatgttattt 333  Q
    ||||||| ||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||||||||| || | |||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||| | ||     
T  52748995 tatactccctccgtttctttttaaatgtcatttttgaagaaattttttgttcctatttgactgtcactttcaaagttcaatgcaatattaaatgatgtta 52749094  T
Q  334 tatcaatattacccttagttatttattgtggagatagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggatattatggtaaaagtatcaattattgtat 433  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||   |||||| ||    
T  52749095 tatcaatattatccttagttatttattgtggag--agaaatatatgaaataagatattaaatgaataagattattatagtaaaagtatagtttattgcat 52749192  T
Q  434 caaaagtaataacatttattgattgtcttgctttgtgtaaaatgtcataaaatgacaattaaaaa 498  Q
    ||||| || || || || |||||||||||| || ||||||||||||| || || || ||||||||    
T  52749193 caaaaatagtatcaattgttgattgtcttgattcgtgtaaaatgtcaaaatataacgattaaaaa 52749257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 116; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 236 - 499
Target Start/End: Original strand, 28679001 - 28679264
Alignment:
Q  236 tactcactccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttatttcaatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaactttaaatgttatttta 335  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  28679001 tactccctccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaaaattttgttcttgtttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgtttta 28679100  T
Q  336 tcaatattacccttagttatttattgtggagatagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggatattatggtaaaagtatcaattattgtatca 435  Q
     |||||||  | |||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||| | |||||| ||||    
T  28679101 ccaatattgtctttagttatttattgcggagagagaaatatatcaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtataatttattgcatca 28679200  T
Q  436 aaagtaataacatttattgattgtcttgctttgtgtaaaatgtcataaaatgacaattaaaaag 499  Q
    |||||| ||  | || || ||||||||  ||| | |||||||||| ||  ||| ||||||||||    
T  28679201 aaagtagtataaattgttaattgtcttaatttatataaaatgtcaaaatgtgataattaaaaag 28679264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 114; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 250 - 510
Target Start/End: Complemental strand, 31488022 - 31487762
Alignment:
Q  250 ctttttaagtgtcacttttggagaaattttttatttcaatttaactgtcactttcaa-agttcaatgcaactttaaatgttattttatcaatattaccct 348  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||| |||||| || | ||| || |||||||||  | ||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||    
T  31488022 ctttttaagtgtctctttttgagaatttttttgttcctattcaagtgtcactttatatagttcaatgcaacattaaatgttattttactaatattaccct 31487923  T
Q  349 tagttatttattgtggagatagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggatattatggtaaaagtatcaattattgtatcaaaagtaataacat 448  Q
    || ||||| ||||| || | | ||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||| ||  |||||||||||||||||||  || ||    
T  31487922 tatttatt-attgtagaaagaaaaatatatgtaatgagatattaaataaataaggttattatagtaaaaatagaaattattgtatcaaaagtagcaatat 31487824  T
Q  449 ttattgattgtcttgctttgtgtaaaatgtcataaaatgacaattaaaaaggagcggaggta 510  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||  |||||||||||||||| ||||||||    
T  31487823 ttattgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaacggaggta 31487762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 114; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 245 - 498
Target Start/End: Complemental strand, 51972529 - 51972276
Alignment:
Q  245 cgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttatttcaatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaactttaaatgttattttatcaatatta 344  Q
    |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||   |||||| ||||||||||||| ||||||||||| | |||| |||||||| ||||||||    
T  51972529 cgttcctttttaagtgtctcttttgaagaaattttttgttcttatttaattgtcactttcaaaattcaatgcaacatgaaatattattttaccaatatta 51972430  T
Q  345 cccttagttatttattgtggagatagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggatattatggtaaaagtatcaattattgtatcaaaagtaata 444  Q
     | |||| |||||||||  |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||    ||||| |||||||||| | |||||| |||||||||| ||    
T  51972429 tcattagctatttattgcagagagataaatatatgaaatgagatattaaatgaataatatcattatagtaaaagtataacttattgcatcaaaagtagta 51972330  T
Q  445 acatttattgattgtcttgctttgtgtaaaatgtcataaaatgacaattaaaaa 498  Q
    |||  |||||||||||||  |||||||||||||||| ||| | |||||||||||    
T  51972329 acaactattgattgtcttaatttgtgtaaaatgtcaaaaagtaacaattaaaaa 51972276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #49
Raw Score: 112; E-Value: 5e-56
Query Start/End: Original strand, 232 - 514
Target Start/End: Original strand, 1677192 - 1677456
Alignment:
Q  232 attatactcactccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttatttcaatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaactttaaatgttat 331  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||| |||                  || ||||||||| |    
T  1677192 attatactccctccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttgttcctatttaactatca------------------acattaaatgttgt 1677273  T
Q  332 tttatcaatattacccttagttatttattgtggagatagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggatattatggtaaaagtatcaattattgt 431  Q
    |||| |||||||| ||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||| ||||||||||   ||||||     
T  1677274 tttaccaatattatccttaattatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcaatatagtaaaagtatagcttattgc 1677373  T
Q  432 atcaaaagtaataacatttattgattgtcttgctttgtgtaaaatgtcataaaatgacaattaaaaaggagcggaggtagtaa 514  Q
    || ||||||| || || ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  1677374 attaaaagtagtatcaattattgattgtcttgatttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggagcggaggtagtaa 1677456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #50
Raw Score: 112; E-Value: 5e-56
Query Start/End: Original strand, 242 - 509
Target Start/End: Complemental strand, 52649980 - 52649713
Alignment:
Q  242 ctccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttatttcaatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaactttaaatgttattttatcaata 341  Q
    |||||||||||||||| ||||  |||   |||||  |||| |||  |||||| | ||||||||||||||||| ||||  ||||||||| ||||| |||||    
T  52649980 ctccgttcctttttaaatgtccttttcatagaaaagttttgtttatatttaattatcactttcaaagttcaaagcaatattaaatgttgttttaccaata 52649881  T
Q  342 ttacccttagttatttattgtggagatagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggatattatggtaaaagtatcaattattgtatcaaaagta 441  Q
    |||||||||||||||||||   ||||  |||||||||||||  ||||||||||||||| ||| |||||| | ||||| ||  ||||||||||||||||||    
T  52649880 ttacccttagttatttattacagagagtgaaatatatgaaacaagatattaaatgaatgaggctattattggaaaaggatatattattgtatcaaaagta 52649781  T
Q  442 ataacatttattgattgtcttgctttgtgtaaaatgtcataaaatgacaattaaaaaggagcggaggt 509  Q
     ||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||    
T  52649780 gtaacatttattgattgtcttgattagtgaaaaatgtcaaaaagtgacaattaaaaaggaacggaggt 52649713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #51
Raw Score: 110; E-Value: 7e-55
Query Start/End: Original strand, 236 - 513
Target Start/End: Complemental strand, 37735396 - 37735119
Alignment:
Q  236 tactcactccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttatttcaatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaactttaaatgttatttta 335  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||||||||||  |||||   ||| || | |||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||| || |||||    
T  37735396 tactctctccgttcctttttaactgtcacttttaaagaaaaaatttgttcctatttaactgtcactgtcaaagttcaatgcaaaattaaatattgtttta 37735297  T
Q  336 tcaatattacccttagttatttattgtggagatagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggatattatggtaaaagtatcaattattgtatca 435  Q
     ||| ||||||||||  ||||||||| ||||| ||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||| ||||||  |  ||  |||||||||    
T  37735296 ccaacattacccttatatatttattgcggagagagaaacatatgaaatgaaatattaaattaataaggctattatagtaaaatcaaaaacaattgtatca 37735197  T
Q  436 aaagtaataacatttattgattgtcttgctttgtgtaaaatgtcataaaatgacaattaaaaaggagcggaggtagta 513  Q
    |||||| || |||||||||||||||||| |||| ||||||| | | ||| ||| |||||||||||| |||||||||||    
T  37735196 aaagtagtatcatttattgattgtcttggtttgcgtaaaatttgaaaaagtgataattaaaaaggaacggaggtagta 37735119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #52
Raw Score: 110; E-Value: 7e-55
Query Start/End: Original strand, 248 - 507
Target Start/End: Original strand, 43808890 - 43809155
Alignment:
Q  248 tcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttatttcaatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaactttaaatgtt-attttatcaatattacc 346  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||| || | |||||||  |||||||||||||||||| |||| |||||||||  ||||| ||||||||||    
T  43808890 tcctttttaattgtcacttttggagaaattttttgttcctatttaaccatcactttcaaagttcaatacaacattaaatgttgtttttaccaatattacc 43808989  T
Q  347 cttagttatttattgtggagatagaaatatatgaaatgaga-----tattaaatgaataaggatattatggtaaaagtatcaattattgtatcaaaagta 441  Q
    ||||| |||||||||  |||| ||||| ||||||||||| |     |||||||| ||||||| |||||| |||||||||  ||| ||||||||||||| |    
T  43808990 cttagatatttattgcagagagagaaacatatgaaatgaaatactgtattaaattaataaggctattatagtaaaagtaaaaataattgtatcaaaagca 43809089  T
Q  442 ataacatttattgattgtcttgctttgtgtaaaatgtcataaaatgacaattaaaaaggagcggag 507  Q
     ||||| ||||||||||||||  ||| |||||||||| | ||| |||||||||||||||| |||||    
T  43809090 gtaacacttattgattgtcttaatttatgtaaaatgttaaaaagtgacaattaaaaaggaacggag 43809155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #53
Raw Score: 109; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 289 - 513
Target Start/End: Original strand, 12124677 - 12124901
Alignment:
Q  289 tttaactgtcactttcaaagttcaatgcaactttaaatgttattttatcaatattacccttagttatttattgtggagatagaaatatatgaaatgagat 388  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||  | ||||  |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  12124677 tttaagtgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttactagtattgtccttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagat 12124776  T
Q  389 attaaatgaataaggatattatggtaaaagtatcaattattgtatcaaaagtaataacatttattgattgtcttgctttgtgtaaaatgtcataaaatga 488  Q
    ||||||||||||||  |||||| |||||||||| | |||||| ||||||||||  | || || |||||| ||||| ||||||||||||| || ||  |||    
T  12124777 attaaatgaataagattattatagtaaaagtataacttattgcatcaaaagtagcatcaattgttgattatcttgatttgtgtaaaatggcaaaatgtga 12124876  T
Q  489 caattaaaaaggagcggaggtagta 513  Q
    ||||||||||||| || ||||||||    
T  12124877 caattaaaaaggaacgaaggtagta 12124901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #54
Raw Score: 107; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 323 - 513
Target Start/End: Original strand, 29830820 - 29831010
Alignment:
Q  323 aaatgttattttatcaatattacccttagttatttattgtggagatagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggatattatggtaaaagtatc 422  Q
    |||| |||||||| |||||||   ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||     
T  29830820 aaattttattttaccaatattggtcttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtata 29830919  T
Q  423 aattattgtatcaaaagtaataacatttattgattgtcttgctttgtgtaaaatgtcataaaatgacaattaaaaaggagcggaggtagta 513  Q
      |||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||  |||||||||||||||| |||||||||||    
T  29830920 gcttattgcatcaaaagtaatatcaattattgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaacggaggtagta 29831010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #55
Raw Score: 106; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 242 - 513
Target Start/End: Original strand, 17013408 - 17013683
Alignment:
Q  242 ctccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttatttcaatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaactttaaatgttattttatcaata 341  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||  ||| ||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||| || ||||| |||||    
T  17013408 ctccgttcctttttaagtgtttcttttggagaattttttttcttctatttaactgtcacttttgaagttcaatgcaacattaaatattgttttaccaata 17013507  T
Q  342 ttacccttagttatttattgtggagatagaaatatatgaaatgag---at-attaaatgaataaggatattatggtaaaagtatcaattattgtatcaaa 437  Q
    ||| | ||| |||||||||  ||||| |||||| |||||| | ||   || ||||||||||||||| |||||| ||||||||||   || || |||||||    
T  17013508 ttatctttacttatttattacggagagagaaatgtatgaagttagtgaatgattaaatgaataaggttattatagtaaaagtatgcgttgttctatcaaa 17013607  T
Q  438 agtaataacatttattgattgtcttgctttgtgtaaaatgtcataaaatgacaattaaaaaggagcggaggtagta 513  Q
    |||| ||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||  |||| ||||| |||||||||| |||||||||||    
T  17013608 agtagtaacatttattgaatgtattggtttgtgtaaaatgttttaaattgacacttaaaaaggaacggaggtagta 17013683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #56
Raw Score: 106; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 236 - 513
Target Start/End: Complemental strand, 40927000 - 40926733
Alignment:
Q  236 tactcactccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttatttcaatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaactttaaatgttatttta 335  Q
    ||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| | | |||||    
T  40927000 tactccctctgttcctttttaagtgtctcttttggagaatttttttgtttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacaataaacgatgtttta 40926901  T
Q  336 tcaatattacccttagttatttattgtggagatagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggatattatggtaaaagtatcaattattgtatca 435  Q
    |||||||||| |||| |||||||| | ||||| |||||||||||||| || ||         ||||||   |||| |||||||||| | |||||||||||    
T  40926900 tcaatattactctta-ttatttatggcggagagagaaatatatgaaacgaaat---------ataaggtcgttatagtaaaagtataacttattgtatca 40926811  T
Q  436 aaagtaataacatttattgattgtcttgctttgtgtaaaatgtcataaaatgacaattaaaaaggagcggaggtagta 513  Q
    |||||| ||||| ||||||||||| ||| ||| |||||||||||| ||  ||||||||||||| || |||||||||||    
T  40926810 aaagtagtaacaattattgattgtattggtttatgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaagaacggaggtagta 40926733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #57
Raw Score: 106; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 235 - 499
Target Start/End: Complemental strand, 49908440 - 49908173
Alignment:
Q  235 atactcactccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttatttcaatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaactttaaatgttatttt 334  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||  |||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| || ||||    
T  49908440 atactccctccgttcctttttaagtgtcacttttaaagaaaaattttgtttctatttaactgtcacttttaaagttcaatgcaacattaaatattgtttt 49908341  T
Q  335 atcaatattacccttagttatttattgtggagatagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggatattatggtaaaagtatca---attattgt 431  Q
    | |||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||  ||| |||||||  ||||| |||||| ||| |    ||||||     
T  49908340 accaatattatccttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatatcgaattaataaggtcattatagtaaaaatataatagtttattgc 49908241  T
Q  432 atcaaaagtaataacatttattgattgtcttgctttgtgtaaaatgtcataaaatgacaattaaaaag 499  Q
    |||||||||| || || || |||||||||||  || || |||||||||| ||  ||| ||||||||||    
T  49908240 atcaaaagtagtatcaattgttgattgtcttagttcgtataaaatgtcaaaatgtgataattaaaaag 49908173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #58
Raw Score: 105; E-Value: 7e-52
Query Start/End: Original strand, 242 - 510
Target Start/End: Complemental strand, 48174923 - 48174656
Alignment:
Q  242 ctccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttatttcaatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaactttaaatgttattttatcaata 341  Q
    |||||||||||||||| ||| | |||| |||||||||||| |||  |||||||||||||||| |||||||||||||   ||||||| | |||||| ||||    
T  48174923 ctccgttcctttttaattgttatttttagagaaattttttgtttttatttaactgtcacttttaaagttcaatgcatagttaaatgctcttttatgaata 48174824  T
Q  342 ttacccttagttatttattgtggagatagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggatattatggtaaaagtatcaattattgtatcaaaagta 441  Q
    |||||||||  ||||||||| ||||| ||||| ||||||||||| || |||||| || ||||  ||||| |||||||||   |  |||||||||||| ||    
T  48174823 ttacccttaaatatttattgcggagagagaaacatatgaaatgaaatgttaaattaacaaggtcattatagtaaaagtaattacaattgtatcaaaa-ta 48174725  T
Q  442 ataacatttattgattgtcttgctttgtgtaaaatgtcataaaatgacaattaaaaaggagcggaggta 510  Q
     || |||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||| ||| |||||||||||| ||||||||    
T  48174724 gtatcatttattgattgtcttgatttgtgtaaaatatcaaaaagtgataattaaaaaggaacggaggta 48174656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #59
Raw Score: 104; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 242 - 441
Target Start/End: Original strand, 43952774 - 43952973
Alignment:
Q  242 ctccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttatttcaatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaactttaaatgttattttatcaata 341  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||   |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||||  ||||    
T  43952774 ctccgtttctttttaagtgtcatttttggagaaattttttgttcttatttaactgtcactttcaaagttcaatgaaacattaaatgttgttttacaaata 43952873  T
Q  342 ttacccttagttatttattgtggagatagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggatattatggtaaaagtatcaattattgtatcaaaagta 441  Q
    ||| | |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||  ||||| |||||||||| | |||||  ||||||||||    
T  43952874 ttatctttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgcgatgttaaatgaataaggtcattatagtaaaagtataacttattacatcaaaagta 43952973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #60
Raw Score: 101; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 283 - 501
Target Start/End: Original strand, 46096576 - 46096791
Alignment:
Q  283 tttcaatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaactttaaatgttattttatcaatattacccttagttatttattgtggagatagaaatatatgaaa 382  Q
    ||||||||||||||||||||   || ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| | ||||||||| ||| ||| || |||||||||| |||    
T  46096576 tttcaatttaactgtcactt---aaattcaatgcaacattaaatgttgttttatcaatattatctttagttattaattatggggagagaaatatataaaa 46096672  T
Q  383 tgagatattaaatgaataaggatattatggtaaaagtatcaattattgtatcaaaagtaataacatttattgattgtcttgctttgtgtaaaatgtcata 482  Q
    ||||||||||||||||||||  |||| | |||||||||| || |||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||| | ||| |||||| ||| |    
T  46096673 tgagatattaaatgaataagattattgtagtaaaagtatgaaatattgtatcaaaagtagtaatatttattgattgtattgatgtgtataaaatatcaaa 46096772  T
Q  483 aaatgacaattaaaaagga 501  Q
    || |||||||||| |||||    
T  46096773 aagtgacaattaagaagga 46096791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #61
Raw Score: 99; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 236 - 457
Target Start/End: Complemental strand, 48265293 - 48265072
Alignment:
Q  236 tactcactccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttatttcaatttaactgtcacttt-caaagttcaatgcaactttaaatgttatttt 334  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||  |||||| || | |||||| ||||||||| |  ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  48265293 tactccctccgttcttttttaagtgtcacttttcgagattttttttgttcctatttaagtgtcactttacgtagttcaatgcaacattaaatgttatttt 48265194  T
Q  335 atcaatattacccttagttatttattgtggagatagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggatattatggtaaaagtatcaattattgtatc 434  Q
    |  ||||||||||||| ||||| ||| |||||| ||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||| |||||| |||||| ||  ||||||||||||    
T  48265193 actaatattacccttatttatt-attatggagagagaaatatatgtaatgagacattaaataaataaggttattatagtaaaaatagaaattattgtatc 48265095  T
Q  435 aaaagtaataacatttattgatt 457  Q
    |||||||  ||||||||||||||    
T  48265094 aaaagtagcaacatttattgatt 48265072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #62
Raw Score: 98; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 244 - 513
Target Start/End: Original strand, 12721428 - 12721697
Alignment:
Q  244 ccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttatttcaatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaactttaaatgttattttatcaatatt 343  Q
    ||||| |||||||| |||||||||| ||||||    || || | |||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||| |||    
T  12721428 ccgtttctttttaattgtcacttttagagaaaaaaattgttcctatttaactatcattttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaagatt 12721527  T
Q  344 acccttagttatttattgtggagatagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggatattatggtaaaagtatcaattattgtatcaaaagtaat 443  Q
     ||||||| |||||||||  |||| ||||| ||||||||| | ||||||||| |||||||  ||||| ||||| |||  ||  ||||||||||||||| |    
T  12721528 tcccttagatatttattgcagagagagaaacatatgaaataaaatattaaattaataaggtcattatagtaaaggtaaaaacaattgtatcaaaagtagt 12721627  T
Q  444 aacatttattgattgtcttgctttgtgtaaaatgtcataaaatgacaattaaaaaggagcggaggtagta 513  Q
    || ||||||| ||||||||| ||| |||||||||| | ||| |||||||||||||||| | |||||||||    
T  12721628 aatatttatttattgtcttggtttatgtaaaatgttaaaaagtgacaattaaaaaggaacagaggtagta 12721697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #63
Raw Score: 97; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 321 - 513
Target Start/End: Complemental strand, 12231243 - 12231051
Alignment:
Q  321 ttaaatgttattttatcaatattacccttagttatttattgtggagatagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggatattatggtaaaagta 420  Q
    ||||||||| ||||| |||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||| |||||||||    
T  12231243 ttaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgtggagagagaaatatatgaaatgggatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagta 12231144  T
Q  421 tcaattattgtatcaaaagtaataacatttattgattgtcttgctttgtgtaaaatgtcataaaatgacaattaaaaaggagcggaggtagta 513  Q
        |||||| |||||||||| || || || |||||||||||| ||| |||||||||||| ||  |||||||||||||||| |||||||||||    
T  12231143 cagcttattgcatcaaaagtagtatcaattgttgattgtcttggtttatgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaacggaggtagta 12231051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #64
Raw Score: 96; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 243 - 506
Target Start/End: Original strand, 49497139 - 49497402
Alignment:
Q  243 tccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttatttcaatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaactttaaatgttattttatcaatat 342  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||  |||| |||||| ||   |||||||||| | |||  |||||||||| ||| ||||||||| ||||| ||||||    
T  49497139 tccgttcttttttaagtgtcacttttaaagaatttttttgttcttatttaactgttatttttgaagttcaatgaaacattaaatgttgttttaccaatat 49497238  T
Q  343 tacccttagttatttattgtggagatagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggatattatggtaaaagtatcaattattgtatcaaaagtaa 442  Q
    |  |||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||| |||||||||| | |||||| ||||||| |||    
T  49497239 tgtccttagttatttattgcggagagataaatatatgaaatgtgatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtataacttattgcatcaaaaataa 49497338  T
Q  443 taacatttattgattgtcttgctttgtgtaaaatgtcataaaatgacaattaaaaaggagcgga 506  Q
    || || || || ||||||||  ||||| |||||| ||| ||  | |||||||||||||| ||||    
T  49497339 tatcaattgttaattgtcttagtttgtataaaatatcaaaatgtaacaattaaaaaggaacgga 49497402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #65
Raw Score: 95; E-Value: 6e-46
Query Start/End: Original strand, 246 - 475
Target Start/End: Complemental strand, 8008414 - 8008188
Alignment:
Q  246 gttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttatttcaatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaactttaaatgttattttatcaatattac 345  Q
    |||||||||||||| ||  |||||||||||   ||| | ||||||||||||||||||| |||| ||||| |||  ||||||||| |||||||||||||||    
T  8008414 gttcctttttaagtctc--ttttggagaaaaaatttgtctcaatttaactgtcacttttaaagatcaatacaatattaaatgttgttttatcaatattac 8008317  T
Q  346 ccttagttatttattgtggagatagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggatattatggtaaaagtatcaattattgtatcaaaagtaataa 445  Q
     |||| |||||||||||||||| |||| |||||||||  ||||||||||| ||||||   |||||||||||| |||  | |||||||| |||||||||||    
T  8008316 tcttaattatttattgtggagagagaagtatatgaaagaagatattaaattaataagatcattatggtaaaattatacactattgtataaaaagtaataa 8008217  T
Q  446 catttattgattgtcttgctttgtgtaaaa 475  Q
    ||||| || ||||||||||| |||||||||    
T  8008216 cattt-tttattgtcttgctatgtgtaaaa 8008188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #66
Raw Score: 94; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 236 - 501
Target Start/End: Original strand, 1427660 - 1427924
Alignment:
Q  236 tactcactccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttatttcaatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaactttaaatgttatttta 335  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||| | |||| |||||||||||  | | | ||||||||||| |||||||| ||||||||||  |||||||| |||||    
T  1427660 tactccctccgatcctttttaagtgttattttttgagaaatttttgttctta-tttaactgtcattttcaaaggtcaatgcaacaataaatgttgtttta 1427758  T
Q  336 tcaatattacccttagttatttattgtggagatagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggatattatggtaaaagtatcaattattgtatca 435  Q
     ||| |||| ||||||||||||||||   ||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||| | |||||| |||||||||  ||||||||||| |    
T  1427759 ccaacattatccttagttatttattgcaaagagagaaatatatgaaataagatattaaatgactaatgctattatagtaaaagtaaaaattattgtataa 1427858  T
Q  436 aaagtaataacatttattgattgtcttgctttgtgtaaaatgtcataaaatgacaattaaaaagga 501  Q
     ||  | |||||||||| |  | ||||  |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  1427859 gaaaaagtaacatttatagtgtatcttagtttgtgtaaaatgtcaaaaaatgataattaaaaagga 1427924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #67
Raw Score: 92; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 242 - 441
Target Start/End: Original strand, 44818440 - 44818639
Alignment:
Q  242 ctccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttatttcaatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaactttaaatgttattttatcaata 341  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| ||||| | ||| || | |||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||| || ||||| |||||    
T  44818440 ctccgttcctttttaagcgtcacttttgcagaaaatctttgttcctatttaactttcattttcaaagttcaatgcaacattaaatattgttttaccaata 44818539  T
Q  342 ttacccttagttatttattgtggagatagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggatattatggtaaaagtatcaattattgtatcaaaagta 441  Q
    ||| ||||||||||||||||   ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||  |||||| |||   |||||| ||||||||||    
T  44818540 ttatccttagttatttattgcatagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattacagtaaaactatagcttattgcatcaaaagta 44818639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #68
Raw Score: 91; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 331 - 513
Target Start/End: Complemental strand, 2059974 - 2059792
Alignment:
Q  331 ttttatcaatattacccttagttatttattgtggagatagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggatattatggtaaaagtatcaattattg 430  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||| || ||||||| | ||||||    
T  2059974 ttttatcaatattatccttagttatttattgcggagagaaaaatatatgaaataagatattaaatgaataaggtcattatagtgaaagtataacttattg 2059875  T
Q  431 tatcaaaagtaataacatttattgattgtcttgctttgtgtaaaatgtcataaaatgacaattaaaaaggagcggaggtagta 513  Q
     |||||| ||| ||||| ||||||||| | ||| |||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||  ||||||||||    
T  2059874 catcaaatgtagtaacaattattgattattttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaatggaggtagta 2059792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #69
Raw Score: 90; E-Value: 6e-43
Query Start/End: Original strand, 236 - 421
Target Start/End: Complemental strand, 38818177 - 38817997
Alignment:
Q  236 tactcactccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttatttcaatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaactttaaatgttatttta 335  Q
    |||||||||||||| |||||||||||     || ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||  |||||||| |||||    
T  38818177 tactcactccgttcgtttttaagtgt-----ttcgagaaattttttatttctatttaactgtcacttttaaaattcaatgcaacaataaatgttgtttta 38818083  T
Q  336 tcaatattacccttagttatttattgtggagatagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggatattatggtaaaagtat 421  Q
     ||| ||||||||||||||||||||  ||||| |||||||| |||||| | ||||||||||||||||| | |||| ||||||||||    
T  38818082 gcaacattacccttagttatttattacggagagagaaatatgtgaaataatatattaaatgaataaggctgttatagtaaaagtat 38817997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #70
Raw Score: 83; E-Value: 9e-39
Query Start/End: Original strand, 235 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 8464707 - 8464585
Alignment:
Q  235 atactcactccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttatttcaatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaactttaaatgttatttt 334  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  8464707 atactccctccgttcgtttttaagtgtcacttttggagaaattttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgtttt 8464608  T
Q  335 atcaatattacccttagttattt 357  Q
    | |||||||  ||||||||||||    
T  8464607 accaatattgtccttagttattt 8464585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #71
Raw Score: 83; E-Value: 9e-39
Query Start/End: Original strand, 251 - 501
Target Start/End: Original strand, 36850640 - 36850882
Alignment:
Q  251 tttttaagtgtcacttttggagaaattttttatttcaatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaactttaaatgttattttatcaatattaccctta 350  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||  |||||||| |||||| |||||||||  |||    
T  36850640 ttttttagtgtcacttttgtagaaattttttgtttctatttaaccgtcactttcaaagttca-tgcaatattaaatgt-attttaccaatattactttta 36850737  T
Q  351 gttatttattgtggagatagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggatattatggtaaaagtatcaattattgtatcaaaagtaataacattt 450  Q
    |||||||||| | |||   ||||||||| | |  | |||||||||    |||| | |||| | ||||  || ||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  36850738 gttatttattatagagt--gaaatatataatacaatatattaaat----aaggttgttattgaaaaatgataaattattatatcaaaagtagtaacattt 36850831  T
Q  451 attgattgtcttgctttgtgtaaaatgtcataaaatgacaattaaaaagga 501  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  36850832 attgactgtcttgatttgtgtaaaatatcaaaaaatgacaattaaaaagga 36850882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #72
Raw Score: 81; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 349 - 513
Target Start/End: Complemental strand, 8464401 - 8464237
Alignment:
Q  349 tagttatttattgtggagatagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggatattatggtaaaagtatcaattattgtatcaaaagtaataacat 448  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||   |||||| |||||||||| || ||     
T  8464401 tagttatttattgcggagagagaaatatatgaaataagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaagtagtatcaa 8464302  T
Q  449 ttattgattgtcttgctttgtgtaaaatgtcataaaatgacaattaaaaaggagcggaggtagta 513  Q
    || |||||||||||| ||| |||||||||||| ||  |||||||||||||||| |||| ||||||    
T  8464301 ttgttgattgtcttggtttatgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaacggaagtagta 8464237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #73
Raw Score: 79; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 245 - 501
Target Start/End: Original strand, 42800097 - 42800351
Alignment:
Q  245 cgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttatttcaatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaactttaaatgttattttatcaatatta 344  Q
    |||| |||||||| ||||| |||| ||||||   ||| |||  |||||||||| ||||||||| ||||||| ||  ||||||||| ||||| ||||||||    
T  42800097 cgtttctttttaattgtcattttttgagaaaagatttgtttatatttaactgttactttcaaa-ttcaatgtaatattaaatgttgttttaccaatatta 42800195  T
Q  345 cccttagttatttattgtggagatagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggatattatggtaaaagtatcaatta-ttgtatcaaaagtaat 443  Q
     |||||  |||||||||  |||| ||||| ||||||||||| ||||||||| ||||| |  ||| | |||||||||  ||  | ||||||||| |||| |    
T  42800196 tccttatatatttattg--gagagagaaacatatgaaatgaaatattaaattaataatgccattttagtaaaagtaaaaaacaattgtatcaagagtagt 42800293  T
Q  444 aacatttattgattgtcttgctttgtgtaaaatgtcataaaatgacaattaaaaagga 501  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  42800294 aacatttattgattgttttggtttgtgtaaaatgtcaaaaagtgacaattaaaaagga 42800351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #74
Raw Score: 75; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 311 - 421
Target Start/End: Complemental strand, 24781916 - 24781806
Alignment:
Q  311 caatgcaactttaaatgttattttatcaatattacccttagttatttattgtggagatagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggatattat 410  Q
    ||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||    
T  24781916 caatgcaacattaaatgttgttttatcaatattatccttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgaaatattaaatgaataaggtcattat 24781817  T
Q  411 ggtaaaagtat 421  Q
     ||||||||||    
T  24781816 agtaaaagtat 24781806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #75
Raw Score: 74; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 242 - 355
Target Start/End: Original strand, 19093254 - 19093367
Alignment:
Q  242 ctccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttatttcaatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaactttaaatgttattttatcaata 341  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| || | ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||    
T  19093254 ctccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaaaattttgttcctatttacctgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatattattttaccaata 19093353  T
Q  342 ttacccttagttat 355  Q
    ||| ||||||||||    
T  19093354 ttatccttagttat 19093367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #76
Raw Score: 74; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 236 - 476
Target Start/End: Complemental strand, 37296982 - 37296745
Alignment:
Q  236 tactcactccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttatttcaatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaactttaaatgttatttta 335  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| ||   ||||||||||||||||| |||||||| ||||| || ||| ||||||||    
T  37296982 tactccctccgttcgtttttaagtgtctcttttggagaaattttttgttcatatttaactgtcactttcgaagttcaacgcaacattgaatattatttta 37296883  T
Q  336 tcaatattacccttagttatttattgtggagatagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggatattatggtaaaagtatcaattattgtatca 435  Q
     |||||||| ||||| |||||||||  || || |||||| |||||| | |   ||||||| ||||||  |||||  |||||| ||   ||| || |||||    
T  37296882 ccaatattatccttacttatttatt-aggggagagaaatgtatgaagttactgattaaataaataagattatta--gtaaaaatagacattgttctatca 37296786  T
Q  436 aaagtaataacatttattgattgtcttgctttgtgtaaaat 476  Q
    |||||| ||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||    
T  37296785 aaagtagtaacatttattgaatgtattggtttgtgtaaaat 37296745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #77
Raw Score: 73; E-Value: 9e-33
Query Start/End: Original strand, 244 - 502
Target Start/End: Original strand, 1038071 - 1038333
Alignment:
Q  244 ccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttatttcaatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaactttaaatgtt-attttatcaatat 342  Q
    |||||||||||||| |||||||||| ||||||   ||| || | ||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||  ||||| ||||||    
T  1038071 ccgttcctttttaattgtcacttttagagaaaaaatttgttcctatttaactgtcactttcaaagtttaatgcaatattaaatgttgtttttaccaatat 1038170  T
Q  343 tacccttagttatttattgtggagatagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggatattatggtaaaagtatcaattattgtatcaaaagtaa 442  Q
    || ||||   ||||||||  ||||| ||||| ||||||||||| ||||||||| |||||    |||||  ||||||||  ||  ||||| ||||||||||    
T  1038171 tatccttgaatatttattacggagagagaaacatatgaaatgaaatattaaattaataaaatcattataataaaagtaaaaacaattgtttcaaaagtaa 1038270  T
Q  443 ---taacatttattgattgtcttgctttgtgtaaaatgtcataaaatgacaattaaaaaggag 502  Q
       ||| ||||||||||||||||  || ||||||||| ||  ||||| |||||||||||||||    
T  1038271 tagtaatatttattgattgtctttattcgtgtaaaatatctaaaaataacaattaaaaaggag 1038333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #78
Raw Score: 73; E-Value: 9e-33
Query Start/End: Original strand, 244 - 502
Target Start/End: Original strand, 1044977 - 1045239
Alignment:
Q  244 ccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttatttcaatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaactttaaatgtt-attttatcaatat 342  Q
    |||||||||||||| |||||||||| ||||||   ||| || | ||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||  ||||| ||||||    
T  1044977 ccgttcctttttaattgtcacttttagagaaaaaatttgttcctatttaactgtcactttcaaagtttaatgcaatattaaatgttgtttttaccaatat 1045076  T
Q  343 tacccttagttatttattgtggagatagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggatattatggtaaaagtatcaattattgtatcaaaagtaa 442  Q
    || ||||   ||||||||  ||||| ||||| ||||||||||| ||||||||| |||||    |||||  ||||||||  ||  ||||| ||||||||||    
T  1045077 tatccttgaatatttattacggagagagaaacatatgaaatgaaatattaaattaataaaatcattataataaaagtaaaaacaattgtttcaaaagtaa 1045176  T
Q  443 ---taacatttattgattgtcttgctttgtgtaaaatgtcataaaatgacaattaaaaaggag 502  Q
       ||| ||||||||||||||||  || ||||||||| ||  ||||| |||||||||||||||    
T  1045177 tagtaatatttattgattgtctttattcgtgtaaaatatctaaaaataacaattaaaaaggag 1045239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #79
Raw Score: 73; E-Value: 9e-33
Query Start/End: Original strand, 242 - 514
Target Start/End: Original strand, 52759014 - 52759286
Alignment:
Q  242 ctccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttatttcaatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaactttaaatgttattttatcaata 341  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||||  ||||||||||| |||| | |||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||| | || |  | |||    
T  52759014 ctccgttcctttataactgtcacttttacagaaattttttgtttctaattaagtgtcactttcaaagttcaatgtaacattaaatgatgttcttcctata 52759113  T
Q  342 ttacccttagttatttattgtggagatagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggatattatggtaaaagtatcaattattgtatcaaaagta 441  Q
     | |||||||| ||||||||  |||| |||||||||||||||  |||||||||| | ||||||||||||  | |||  || | ||||||||| |||||||    
T  52759114 atgcccttagtaatttattgcagagagagaaatatatgaaatatgatattaaataattaaggatattataattaaaacataagttattgtataaaaagta 52759213  T
Q  442 ataacatttattgattgtcttgctttgtgtaaaatgtcataaaatgacaattaaaaaggagcggaggtagtaa 514  Q
     | | ||  ||| | ||||||| |||||||| || |||| ||  ||||||||||||| || |||||| |||||    
T  52759214 gtgaaatacatttagtgtcttggtttgtgtataaagtcaaaatgtgacaattaaaaaagaacggagggagtaa 52759286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #80
Raw Score: 71; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 247 - 353
Target Start/End: Original strand, 5597814 - 5597920
Alignment:
Q  247 ttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttatttcaatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaactttaaatgttattttatcaatattacc 346  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||  | ||||||||||||||||    
T  5597814 ttcctttttaagtgtctcttttggagaatttttttgtttctatttaactgtcacttccaaagttcaatgcaacattaaataatgttttatcaatattacc 5597913  T
Q  347 cttagtt 353  Q
    |||||||    
T  5597914 cttagtt 5597920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #81
Raw Score: 71; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 380 - 514
Target Start/End: Original strand, 35605722 - 35605856
Alignment:
Q  380 aaatgagatattaaatgaataaggatattatggtaaaagtatcaattattgtatcaaaagtaataacatttattgattgtcttgctttgtgtaaaatgtc 479  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||||| || |||| |||||||| |||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  35605722 aaatgaaatattaaatgaataaggttattatagtaaaagtatgaagtattatatcaaaattaataatatttattgattgtattggtttgtgtaaaatgtc 35605821  T
Q  480 ataaaatgacaattaaaaaggagcggaggtagtaa 514  Q
    | | | |||||||||||||||| || || ||||||    
T  35605822 aaatagtgacaattaaaaaggaacgaagatagtaa 35605856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #82
Raw Score: 71; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 331 - 501
Target Start/End: Complemental strand, 39412673 - 39412503
Alignment:
Q  331 ttttatcaatattacccttagttatttattgtggagatagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggatattatggtaaaagtatcaattattg 430  Q
    ||||| |||||||| | || |||||||||||  |||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||  ||||| |||||| ||| | ||||||    
T  39412673 ttttaccaatattatcttttgttatttattgcagagagagaaatatatgaaatgagatgttaaattaataaggtcattatagtaaaaatataacttattg 39412574  T
Q  431 tatcaaaagtaataacatttattgattgtcttgctttgtgtaaaatgtcataaaatgacaattaaaaagga 501  Q
     ||||||||||  |||| ||||||||||| ||| ||||| |||||||| | ||| ||||||||||||||||    
T  39412573 catcaaaagtagaaacaattattgattgttttggtttgtataaaatgttaaaaagtgacaattaaaaagga 39412503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #83
Raw Score: 68; E-Value: 8e-30
Query Start/End: Original strand, 344 - 506
Target Start/End: Original strand, 5598143 - 5598295
Alignment:
Q  344 acccttagttatttattgtggagatagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggatattatggtaaaagtatcaattattgtatcaaaagtaat 443  Q
    |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||||  ||||| ||||||          ||| |||||||||| |    
T  5598143 acccttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaataaaatattaaatgaataaggtcattatagtaaaa----------ttgcatcaaaagtagt 5598232  T
Q  444 aacatttattgattgtcttgctttgtgtaaaatgtcataaaatgacaattaaaaaggagcgga 506  Q
    || | ||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||    
T  5598233 aataattattgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatatgacaattaaaaaggaacgga 5598295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #84
Raw Score: 68; E-Value: 8e-30
Query Start/End: Original strand, 246 - 441
Target Start/End: Original strand, 50152423 - 50152618
Alignment:
Q  246 gttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttatttcaatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaactttaaatgttattttatcaatattac 345  Q
    |||||||||||| |||| |||||| | |||| |||| |||| | |||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |  ||||||    
T  50152423 gttcctttttaattgtcgcttttgcataaatgttttgtttctaattaacttttactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttacctttattac 50152522  T
Q  346 ccttagttatttattgtggagatagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggatattatggtaaaagtatcaattattgtatcaaaagta 441  Q
    ||||  ||||||||||| || ||| || |||||||||| |||||||||||||  |||| |||| | | ||||  || |||| ||||||||||||||    
T  50152523 ccttgattatttattgtagaaatataattatatgaaataagatattaaatgatgaaggttattgtaggaaaaagatgaattgttgtatcaaaagta 50152618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #85
Raw Score: 67; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 235 - 441
Target Start/End: Complemental strand, 1039625 - 1039420
Alignment:
Q  235 atactcactccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttatttcaatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaactttaaatgttatttt 334  Q
    |||||| |||||||||||||||| |||||| ||| ||||||   ||| ||   ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||    
T  1039625 atactccctccgttcctttttaattgtcacctttagagaaaaaatttgttcttatttaactgtcactttcaaagtttaatgcaacattaaatgttgtttt 1039526  T
Q  335 atcaatattacccttagttatttattgtggagatagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggatattatggtaaaagtatcaattattgtatc 434  Q
    | ||| ||||| ||||| |||||||||   ||| | ||| ||||||||||| ||||||||| |||||||  ||||| ||||| |||  ||  ||||||||    
T  1039525 accaagattacacttagatatttattg-caagagaaaaacatatgaaatgaaatattaaattaataaggtcattatagtaaaggtaaaaacaattgtatc 1039427  T
Q  435 aaaagta 441  Q
    |||||||    
T  1039426 aaaagta 1039420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #86
Raw Score: 67; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 235 - 441
Target Start/End: Complemental strand, 1046531 - 1046326
Alignment:
Q  235 atactcactccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttatttcaatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaactttaaatgttatttt 334  Q
    |||||| |||||||||||||||| |||||| ||| ||||||   ||| ||   ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||    
T  1046531 atactccctccgttcctttttaattgtcacctttagagaaaaaatttgttcttatttaactgtcactttcaaagtttaatgcaacattaaatgttgtttt 1046432  T
Q  335 atcaatattacccttagttatttattgtggagatagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggatattatggtaaaagtatcaattattgtatc 434  Q
    | ||| ||||| ||||| |||||||||   ||| | ||| ||||||||||| ||||||||| |||||||  ||||| ||||| |||  ||  ||||||||    
T  1046431 accaagattacacttagatatttattg-caagagaaaaacatatgaaatgaaatattaaattaataaggtcattatagtaaaggtaaaaacaattgtatc 1046333  T
Q  435 aaaagta 441  Q
    |||||||    
T  1046332 aaaagta 1046326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #87
Raw Score: 64; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 370 - 501
Target Start/End: Original strand, 1428519 - 1428650
Alignment:
Q  370 gaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggatattatggtaaaagtatcaattattgtatcaaaagtaataacatttattgattgtcttgctttgt 469  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||| ||||||||||| | ||  |||||||||||||   | ||||  |||||    
T  1428519 gaaatatatgaaataagatattaaatgactaaggctattatagtaaaagtataaattattgtataagaaaaaataacatttattaggtatcttagtttgt 1428618  T
Q  470 gtaaaatgtcataaaatgacaattaaaaagga 501  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  1428619 gtaaaatgtcaaaaaatgacagttaaaaagga 1428650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #88
Raw Score: 64; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 242 - 353
Target Start/End: Original strand, 35605444 - 35605555
Alignment:
Q  242 ctccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttatttcaatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaactttaaatgttattttatcaata 341  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| || |||||||  ||||||||| ||||| |||||    
T  35605444 ctccgttgatttttaagtgtcacttttgaagaaattttttgtttaaatttaactgtcactttcaaaatttaatgcaaaattaaatgttgttttaccaata 35605543  T
Q  342 ttacccttagtt 353  Q
    ||| ||||||||    
T  35605544 ttatccttagtt 35605555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #89
Raw Score: 63; E-Value: 8e-27
Query Start/End: Original strand, 155 - 237
Target Start/End: Original strand, 20491569 - 20491651
Alignment:
Q  155 gcggccttattgtcaactagtctccgagttctatttaaaataccagattgtattgaaaatactttgatcaatgaaatattata 237  Q
    |||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  20491569 gcggccttattgtcaactagtctccaggttctatttgaaataccagattgtattgaaaatactttgattaatgaaatgttata 20491651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #90
Raw Score: 62; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 290 - 475
Target Start/End: Original strand, 11248815 - 11249000
Alignment:
Q  290 ttaactgtcactttcaaagttcaatgcaactttaaatgttattttatcaatattacccttagttatttattgtggagatagaaatatatgaaatgagata 389  Q
    |||| |||| ||||||||||||||| |||| ||||||||| |||| ||| ||||||||||  |||||||||   |||| |||||||||||||||||||||    
T  11248815 ttaagtgtcgctttcaaagttcaatacaacattaaatgttgttttgtcattattacccttgattatttatttcagagagagaaatatatgaaatgagata 11248914  T
Q  390 ttaaatgaataaggatattatggtaaaagtatcaattattgtatcaaaagtaataacatttattgattgtcttgctttgtgtaaaa 475  Q
    ||| ||||  |||| || |||   ||||  || ||||||||||||||||||| ||| || ||||  |||||||  |||||||||||    
T  11248915 ttacatgatgaaggttactataagaaaaagataaattattgtatcaaaagtagtaaaatgtatttgttgtcttagtttgtgtaaaa 11249000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #91
Raw Score: 57; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 301 - 501
Target Start/End: Complemental strand, 8973643 - 8973444
Alignment:
Q  301 tttcaaagttcaatgcaactttaaatgttattttatcaatattacccttagttatttattgtggagatagaaatatatgaaatgagatattaaatgaata 400  Q
    ||||||||||||||| | | |||||||| |||||| | ||||||||||||  |||||||||| | || |||||||||||||||||  |||||||||| |     
T  8973643 tttcaaagttcaatgtatcattaaatgtgattttacctatattacccttatatatttattgtagggagagaaatatatgaaatgaagtattaaatgattg 8973544  T
Q  401 aggatattatggtaaaagtatcaattattgtatcaaaagtaataacatttattgattgtcttgctttgtgtaaaatgtcataaaatgacaattaaaaagg 500  Q
    | | |||||| | ||||  || |||| |||||| ||||||| ||| |  ||||  |||||||| ||| ||||||| |||| || ||||||||||||||||    
T  8973543 atgttattataggaaaaagataaattgttgtataaaaagtagtaa-aagtatttgttgtcttgatttatgtaaaaagtcaaaatatgacaattaaaaagg 8973445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #92
Raw Score: 57; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 298 - 450
Target Start/End: Complemental strand, 42787481 - 42787329
Alignment:
Q  298 cactttcaaagttcaatgcaactttaaatgttattttatcaatattacccttagttatttattgtggagatagaaatatatgaaatgagatattaaatga 397  Q
    |||||||||| ||||||| ||  |||| |||| ||||| |||||||| |||||||||||||||  ||||| ||||||| || | |  |||||||||||||    
T  42787481 cactttcaaaattcaatggaatattaactgttcttttaccaatattatccttagttatttattacggagagagaaatacattatacaagatattaaatga 42787382  T
Q  398 ataaggatattatggtaaaagtatcaattattgtatcaaaagtaataacattt 450  Q
    |||||| |||||| |  |||| || ||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  42787381 ataaggttattattgagaaaggataaattattgtatcaaaagtagtaatattt 42787329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #93
Raw Score: 53; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 318 - 513
Target Start/End: Original strand, 33720579 - 33720774
Alignment:
Q  318 actttaaatgttattttatcaatattacccttagttatttattgtggagatagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggatattatggtaaaa 417  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||||||||||  || |||||| ||||| ||||| | ||||||||| ||||||||| ||||||   ||||| ||||||    
T  33720579 actttaaatgttgttttaccaatattacccttaaata-ttattgcggagagagaaaaacatgaaatgaaatattaaattaataagaccattatagtaaaa 33720677  T
Q  418 gt-atcaattattgtatcaaaagtaataacatttattgattgtcttgctttgtgtaaaatgtcataaaatgacaattaaaaaggagcggaggtagta 513  Q
    || |  ||  |||||||||||| || || |||||||||||  ||||| |||||||||||| ||| ||  | |||||||||||| | |||| ||||||    
T  33720678 gtaaaaaacaattgtatcaaaaatagtatcatttattgataatcttggtttgtgtaaaatatcaaaatgtaacaattaaaaagaaacggatgtagta 33720774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #94
Raw Score: 49; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 242 - 318
Target Start/End: Original strand, 1428205 - 1428281
Alignment:
Q  242 ctccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttatttcaatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaa 318  Q
    |||| ||||||||||||| ||| |||| |||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  1428205 ctcccttcctttttaagtatcagttttagagaaattttttgtttctattcaactgtcactttcaaagttcaatgcaa 1428281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #95
Raw Score: 48; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 245 - 403
Target Start/End: Original strand, 1859084 - 1859240
Alignment:
Q  245 cgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttatttcaatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaactttaaatgttattttatcaatatta 344  Q
    ||||||||| ||  ||| ||||||| | |||||||||||||  | |||| ||||| |||||||||| ||| || | ||||||||| ||||| | ||||||    
T  1859084 cgttcctttatatttgttacttttgcataaattttttatttttagttaagtgtcattttcaaagtttaatacatcattaaatgttgttttacctatatta 1859183  T
Q  345 cccttagttatttattgtggagatagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataagg 403  Q
    ||||||  |||||||| |  ||| |||| ||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  1859184 cccttatatatttattat--agagagaagtatatgaaatgagatattagatgattaagg 1859240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #96
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 290 - 380
Target Start/End: Original strand, 52825311 - 52825401
Alignment:
Q  290 ttaactgtcactttcaaagttcaatgcaactttaaatgttattttatcaatattacccttagttatttattgtggagatagaaatatatga 380  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||  | ||| | |||||| | ||||||||| |||| ||||||||||||    
T  52825311 ttaactgtcactttcaaagttcaatgtaacattaaatgttgtttttcctataatgcccttaataatttattgtagagagagaaatatatga 52825401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #97
Raw Score: 41; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 301 - 501
Target Start/End: Original strand, 2572016 - 2572215
Alignment:
Q  301 tttcaaagttcaatgcaactttaaatgttattttatcaatattacccttagttatttattgtggagatagaaatatatgaaatgagatattaaatgaata 400  Q
    ||||||||||||||| | | ||||||||   |||| | |||||||| |||  |||||||||  ||||  |||||||||||||||| ||||||||| | ||    
T  2572016 tttcaaagttcaatgtatcattaaatgtggctttacctatattacctttatatatttattgcagagagtgaaatatatgaaatgaaatattaaataatta 2572115  T
Q  401 aggatattatggtaaaagtatcaattattgtatcaaaagtaataacatttattgattgtcttgctttgtgtaaaatgtcataaaatgacaattaaaaagg 500  Q
    ||| |||||| | ||||  || | ||||| ||||||||||| ||| |  |||| ||| ||||| | ||||||||| |||| ||   ||||||||||||||    
T  2572116 aggttattatagaaaaaagataatttattatatcaaaagtagtaa-aaatatttattatcttgatatgtgtaaaaagtcaaaatgagacaattaaaaagg 2572214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #98
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 340 - 498
Target Start/End: Complemental strand, 38569773 - 38569616
Alignment:
Q  340 tattacccttagttatttattgtggagatagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggatattatggtaaaagtatcaattattgtatcaaaag 439  Q
    |||||||||||  |||||||||  |||| ||||||||||| |||||  |||||||| | ||||| ||||||   ||||  || ||||||||||| ||||     
T  38569773 tattacccttatatatttattgccgagagagaaatatatggaatgaagtattaaattattaaggttattataagaaaaagataaattattgtattaaaaa 38569674  T
Q  440 taataacatttattgattgtcttgctttgtgtaaaatgtcataaaatgacaattaaaaa 498  Q
    |||||| |  ||||  |||||||| ||||| ||||| |||| || ||||||||||||||    
T  38569673 taataa-aagtatttgttgtcttgatttgtataaaaagtcaaaatatgacaattaaaaa 38569616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #99
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 452 - 510
Target Start/End: Complemental strand, 42787194 - 42787136
Alignment:
Q  452 ttgattgtcttgctttgtgtaaaatgtcataaaatgacaattaaaaaggagcggaggta 510  Q
    |||||||||||| |||  ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  42787194 ttgattgtcttgatttaggtaaaatgtcaaaaaatgacaattaaaaaggaacggaggta 42787136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #100
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 172 - 237
Target Start/End: Original strand, 13246499 - 13246563
Alignment:
Q  172 tagtctccgagttctatttaaaataccagattgtattgaaaatactttgatcaatgaaatattata 237  Q
    ||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||    
T  13246499 tagtctccaggttctatttgaaataccagattgtattg-aaatactttgattaatgaaatgttata 13246563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #101
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 278 - 375
Target Start/End: Original strand, 51064796 - 51064893
Alignment:
Q  278 ttttatttcaatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaactttaaatgttattttatcaatattacccttagttatttattgtggagatagaaata 375  Q
    |||| ||||| ||||  ||||||||||||  ||||||||||| |||| | ||| |||||||||| ||||||||  |||||||||| |||| |||||||    
T  51064796 ttttgtttcactttatttgtcactttcaagtttcaatgcaacgttaattattagtttatcaataatacccttacctatttattgtagagagagaaata 51064893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #102
Raw Score: 36; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 447 - 498
Target Start/End: Complemental strand, 1039118 - 1039067
Alignment:
Q  447 atttattgattgtcttgctttgtgtaaaatgtcataaaatgacaattaaaaa 498  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||| |||||||||||||    
T  1039118 atttattgattgtcttgatttgtgtaaaatgttaaaaagtgacaattaaaaa 1039067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #103
Raw Score: 36; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 447 - 498
Target Start/End: Complemental strand, 1046024 - 1045973
Alignment:
Q  447 atttattgattgtcttgctttgtgtaaaatgtcataaaatgacaattaaaaa 498  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||| |||||||||||||    
T  1046024 atttattgattgtcttgatttgtgtaaaatgttaaaaagtgacaattaaaaa 1045973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #104
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 229 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 2626826 - 2626785
Alignment:
Q  229 aatattatactcactccgttcctttttaagtgtcacttttgg 270  Q
    |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  2626826 aatattatactccctccgttcctttataagtgtcacttttgg 2626785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #105
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 295 - 410
Target Start/End: Complemental strand, 321844 - 321729
Alignment:
Q  295 tgtcactttcaaagttcaatgcaactttaaatgttattttatcaatattacccttagttatttattgtggagatagaaatatatgaaatgagatattaaa 394  Q
    ||||||||||||  ||||||||||| |||| | || | || |||||| |||||||   |||||||||| |||| | ||| | || |||||| ||| ||||    
T  321844 tgtcactttcaagtttcaatgcaacattaattattgtcttgtcaataatacccttgcatatttattgtagagagaaaaaaaaataaaatgaaataataaa 321745  T
Q  395 tgaataaggatattat 410  Q
    ||| ||||||||||||    
T  321744 tgattaaggatattat 321729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #106
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 295 - 410
Target Start/End: Original strand, 40783716 - 40783831
Alignment:
Q  295 tgtcactttcaaagttcaatgcaactttaaatgttattttatcaatattacccttagttatttattgtggagatagaaatatatgaaatgagatattaaa 394  Q
    ||||||||||||  ||||||||||| |||| | || | || |||||| |||||||   |||||||||| |||| ||||| | || |||||| ||| ||||    
T  40783716 tgtcactttcaagtttcaatgcaacattaattattgtcttgtcaataatacccttgcatatttattgtagagagagaaaaaaataaaatgaaataataaa 40783815  T
Q  395 tgaataaggatattat 410  Q
    ||| ||||| ||||||    
T  40783816 tgattaagggtattat 40783831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #107
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 295 - 410
Target Start/End: Original strand, 47037911 - 47038026
Alignment:
Q  295 tgtcactttcaaagttcaatgcaactttaaatgttattttatcaatattacccttagttatttattgtggagatagaaatatatgaaatgagatattaaa 394  Q
    ||||||||||||  ||||||||||| |||| | || | || |||||| |||||||   |||||||||| |||| ||||| | || |||||| ||| ||||    
T  47037911 tgtcactttcaagtttcaatgcaacattaattattgtcttgtcaataatacccttgcatatttattgtagagagagaaaaaaataaaatgaaataataaa 47038010  T
Q  395 tgaataaggatattat 410  Q
    ||| ||||| ||||||    
T  47038011 tgattaagggtattat 47038026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #108
Raw Score: 31; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 295 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 23526457 - 23526379
Alignment:
Q  295 tgtcactttcaaagttcaatgcaactttaaatgttattttatcaatattacccttagttatttattgtggagatagaaa 373  Q
    ||||||||||||  ||||||||||| |||| | || | || |||||| ||||||||  |||||||||| ||||||||||    
T  23526457 tgtcactttcaagtttcaatgcaacattaattattgtcttgtcaataatacccttacatatttattgtagagatagaaa 23526379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #109
Raw Score: 31; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 303 - 389
Target Start/End: Original strand, 49756678 - 49756764
Alignment:
Q  303 tcaaagttcaatgcaactttaaatgttattttatcaatattacccttagttatttattgtggagatagaaatatatgaaatgagata 389  Q
    |||||||||||||||||  ||| | || |||| |||||  ||||||||  |||||||||  ||||||||||||| || |||||||||    
T  49756678 tcaaagttcaatgcaacaataattattgttttgtcaattatacccttaagtatttattgcagagatagaaatatgtgtaatgagata 49756764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #110
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 243 - 300
Target Start/End: Original strand, 2571936 - 2571993
Alignment:
Q  243 tccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttatttcaatttaactgtcac 300  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||||| | ||||||||| |||| | |||||||||||    
T  2571936 tccgttcctttataattgtcacttttgcataaattttttgtttctaattaactgtcac 2571993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #111
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 345 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 22154755 - 22154694
Alignment:
Q  345 cccttagttatttattgtggagatagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggata 406  Q
    |||||||| ||||||||  |||| |||||||||||||||  |||||||||| | ||||||||    
T  22154755 cccttagtaatttattgcagagaaagaaatatatgaaatatgatattaaataattaaggata 22154694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 186; Significance: 1e-100; HSPs: 134)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 236 - 509
Target Start/End: Original strand, 43553020 - 43553292
Alignment:
Q  236 tactcactccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttatttcaatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaactttaaatgttatttta 335  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||   ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||    
T  43553020 tactccctccgttcctttttaagtgtcacttttggaaaaaaaattg-tttcaatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaactttaaacgttgtttta 43553118  T
Q  336 tcaatattacccttagttatttattgtggagatagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggatattatggtaaaagtatcaattattgtatca 435  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  43553119 tcaatattacccttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgaaatattaaatgaataaggatattatagtaaaagtatcaattattgtatca 43553218  T
Q  436 aaagtaataacatttattgattgtcttgctttgtgtaaaatgtcataaaatgacaattaaaaaggagcggaggt 509  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| |||  ||||||||||||| | |||||||    
T  43553219 aaagtagtaacatttattgattgtcttggtttgcgtaaaatgtcacaaagcgacaattaaaaagaaacggaggt 43553292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 174; E-Value: 5e-93
Query Start/End: Original strand, 243 - 476
Target Start/End: Original strand, 12763422 - 12763654
Alignment:
Q  243 tccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttatttcaatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaactttaaatgttattttatcaatat 342  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  12763422 tccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaatttttg-tttcaatttaaccgtcactttcaaagttcaatgcaactttaaatgttgttttatcaatat 12763520  T
Q  343 tacccttagttatttattgtggagatagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggatattatggtaaaagtatcaattattgtatcaaaagtaa 442  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||  |     
T  12763521 tacccttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataatgatattatagtaaaagtatcaattattgtatcaaaaacag 12763620  T
Q  443 taacatttattgattgtcttgctttgtgtaaaat 476  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||| |||||    
T  12763621 taacatttattgattgtcttaatttgtgcaaaat 12763654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 169; E-Value: 5e-90
Query Start/End: Original strand, 230 - 514
Target Start/End: Original strand, 14263518 - 14263802
Alignment:
Q  230 atattatactcactccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttatttcaatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaactttaaatgtt 329  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || | |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  14263518 atattgtactccctccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaaatttttgttcctatttaactgtcactttaaaagttcaatgcaacattaaatgtt 14263617  T
Q  330 attttatcaatattacccttagttatttattgtggagatagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggatattatggtaaaagtatcaattatt 429  Q
     ||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||| | |||||    
T  14263618 gttttaccaatattatccttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtataacttatt 14263717  T
Q  430 gtatcaaaagtaataacatttattgattgtcttgctttgtgtaaaatgtcataaaatgacaattaaaaaggagcggaggtagtaa 514  Q
    | ||||||||||||| || || |||||||||||| |||||||||||||||| ||  ||||||||||||| || ||||| ||||||    
T  14263718 gcatcaaaagtaatatcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaagaacggagttagtaa 14263802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 166; E-Value: 3e-88
Query Start/End: Original strand, 236 - 513
Target Start/End: Original strand, 15596324 - 15596601
Alignment:
Q  236 tactcactccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttatttcaatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaactttaaatgttatttta 335  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||| | |||||    
T  15596324 tactccctccgttcctttttaagtgtctcttttggagaatttttttgtttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgtaaaattaaatgatgtttta 15596423  T
Q  336 tcaatattacccttagttatttattgtggagatagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggatattatggtaaaagtatcaattattgtatca 435  Q
    ||||||||||| ||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| | |||||| || |    
T  15596424 tcaatattacctttaattatttattgcggagagagaaatatatgaaataagatattaaatgaataaggttattatagtaaaagtataacttattgcataa 15596523  T
Q  436 aaagtaataacatttattgattgtcttgctttgtgtaaaatgtcataaaatgacaattaaaaaggagcggaggtagta 513  Q
    |||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||  |||||||||||||||| |||||||||||    
T  15596524 aaagtaataacaattattgattatcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaacggaggtagta 15596601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 157; E-Value: 7e-83
Query Start/End: Original strand, 229 - 513
Target Start/End: Original strand, 23429882 - 23430166
Alignment:
Q  229 aatattatactcactccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttatttcaatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaactttaaatgt 328  Q
    |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  23429882 aataatatactccctccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaaatttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgt 23429981  T
Q  329 tattttatcaatattacccttagttatttattgtggagatagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggatattatggtaaaagtatcaattat 428  Q
    | ||||| |||||||| ||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||   ||||    
T  23429982 tgttttaccaatattatccttagttatttattgcagagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtatagcttat 23430081  T
Q  429 tgtatcaaaagtaataacatttattgattgtcttgctttgtgtaaaatgtcataaaatgacaattaaaaaggagcggaggtagta 513  Q
    || |||||||||| || || || |||||||||||| |||||||||||||| | ||  |||| |||||||||||  ||||||||||    
T  23430082 tgcatcaaaagtagtatcaattgttgattgtcttgatttgtgtaaaatgttaaaatgtgacgattaaaaaggaatggaggtagta 23430166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 156; E-Value: 3e-82
Query Start/End: Original strand, 242 - 501
Target Start/End: Original strand, 9954635 - 9954894
Alignment:
Q  242 ctccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttatttcaatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaactttaaatgttattttatcaata 341  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||  || | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||    
T  9954635 ctccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaaaatttagttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaata 9954734  T
Q  342 ttacccttagttatttattgtggagatagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggatattatggtaaaagtatcaattattgtatcaaaagta 441  Q
    ||  |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| | |||||| ||||||||||    
T  9954735 ttgtccttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatggtaaaagtataacttattgcatcaaaagta 9954834  T
Q  442 ataacatttattgattgtcttgctttgtgtaaaatgtcataaaatgacaattaaaaagga 501  Q
    ||| || || |||||||||||| ||| |||||||||| | || |||||||||||||||||    
T  9954835 atatcaattgttgattgtcttggtttatgtaaaatgttaaaatatgacaattaaaaagga 9954894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 153; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 242 - 514
Target Start/End: Original strand, 18842516 - 18842787
Alignment:
Q  242 ctccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttatttcaatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaactttaaatgttattttatcaata 341  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || | |||||| |||||||||   ||||||||||||  |||||||||||||||  ||||    
T  18842516 ctccgttcctttttaagtgtcacttttggagaatttttttgttcctatttaagtgtcactttactagttcaatgcaatattaaatgttattttactaata 18842615  T
Q  342 ttacccttagttatttattgtggagatagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggatattatggtaaaagtatcaattattgtatcaaaagta 441  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||| ||  |||||||||||||||||||    
T  18842616 ttacccttatttatt-attgtggagagagaaatatatgtaatgagatattaaataaataaggttattatagtaaaaataaaaattattgtatcaaaagta 18842714  T
Q  442 ataacatttattgattgtcttgctttgtgtaaaatgtcataaaatgacaattaaaaaggagcggaggtagtaa 514  Q
     ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||  |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  18842715 gtaacatttattgattatcttgatttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaacggaggtagtaa 18842787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 152; E-Value: 6e-80
Query Start/End: Original strand, 235 - 513
Target Start/End: Complemental strand, 167738 - 167460
Alignment:
Q  235 atactcactccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttatttcaatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaactttaaatgttatttt 334  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  167738 atactccctccgtttctttttaagtgtcacttttggagaaaaattttgttttaatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgtttt 167639  T
Q  335 atcaatattacccttagttatttattgtggagatagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggatattatggtaaaagtatcaattattgtatc 434  Q
    | |||||||| |||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||| | || |||||||||    
T  167638 accaatattatccttagttatttattgtggagagataaatatataaaatgagatattaaattaataaggttattatagtaaaagt-tgaagtattgtatc 167540  T
Q  435 aaaagtaataacatttattgattgtcttgctttgtgtaaaatgtcataaaa-tgacaattaaaaaggagcggaggtagta 513  Q
    ||||||| ||| ||||||||||| | ||| ||||||| |||||| | |||| |||||||||||||||| | |||||||||    
T  167539 aaaagtagtaatatttattgattatattggtttgtgtgaaatgttaaaaaagtgacaattaaaaaggaacagaggtagta 167460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 149; E-Value: 4e-78
Query Start/End: Original strand, 237 - 513
Target Start/End: Complemental strand, 33935319 - 33935043
Alignment:
Q  237 actcactccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttatttcaatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaactttaaatgttattttat 336  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||| || | ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| || |||||     
T  33935319 actccctccgttcctttttaagtgttacttttgaagaaaatttttgttcctatttaactgtcactttcaaagtttaatgcaacattaaatattgttttac 33935220  T
Q  337 caatattacccttagttatttattgtggagatagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggatattatggtaaaagtatcaattattgtatcaa 436  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||| |||   |||||| |||||    
T  33935219 caatattatccttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaattatagcttattgcatcaa 33935120  T
Q  437 aagtaataacatttattgattgtcttgctttgtgtaaaatgtcataaaatgacaattaaaaaggagcggaggtagta 513  Q
    ||||| || || ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||  |||||||||||||||| || ||||||||    
T  33935119 aagtagtatcaattattgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaacgaaggtagta 33935043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 146; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 235 - 500
Target Start/End: Original strand, 34046830 - 34047095
Alignment:
Q  235 atactcactccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttatttcaatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaactttaaatgttatttt 334  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||    
T  34046830 atactccctccgttcctttttaagtgtcacttttagagaaattttttgtttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatattgtttt 34046929  T
Q  335 atcaatattacccttagttatttattgtggagatagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggatattatggtaaaagtatcaattattgtatc 434  Q
    | |||||||  |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||   |||||| |||    
T  34046930 accaatattgtccttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtatagtttattgcatc 34047029  T
Q  435 aaaagtaataacatttattgattgtcttgctttgtgtaaaatgtcataaaatgacaattaaaaagg 500  Q
    |||| || || || || |||||  ||||| |||||||||||||||| ||  |||||||||||||||    
T  34047030 aaaaatagtatcaattgttgatattcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaagg 34047095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 145; E-Value: 9e-76
Query Start/End: Original strand, 235 - 515
Target Start/End: Original strand, 34981808 - 34982088
Alignment:
Q  235 atactcactccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttatttcaatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaactttaaatgttatttt 334  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| || | | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  34981808 atactccctccgttactttttaagtgtcgcttttggagaaattttttgttcctacttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgtttt 34981907  T
Q  335 atcaatattacccttagttatttattgtggagatagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggatattatggtaaaagtatcaattattgtatc 434  Q
    | |||||||  |||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||   |||||| |||    
T  34981908 accaatattgtccttagttatttattgcggagagagaaatacatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtatagcttattgcatc 34982007  T
Q  435 aaaagtaataacatttattgattgtcttgctttgtgtaaaatgtcataaaatgacaattaaaaaggagcggaggtagtaag 515  Q
    ||||||| ||  | || |||||||| ||| |||||||||||| ||| ||  |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  34982008 aaaagtagtattaattgttgattgttttggtttgtgtaaaatatcaaaatgtgacaattaaaaaggaacggaggtagtaag 34982088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 144; E-Value: 4e-75
Query Start/End: Original strand, 227 - 513
Target Start/End: Complemental strand, 38483055 - 38482775
Alignment:
Q  227 gaaatattatactcactccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttatttcaatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaactttaaat 326  Q
    |||||||  ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||      |||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  38483055 gaaatatgttactccctccgttcctttttaagtttcacttttgga------ttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaat 38482962  T
Q  327 gttattttatcaatattacccttagttatttattgtggagatagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggatattatggtaaaagtatcaatt 426  Q
    ||| ||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||   ||    
T  38482961 gttgttttaccaatattatccttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtatagctt 38482862  T
Q  427 attgtatcaaaagtaataacatttattgattgtcttgctttgtgtaaaatgtcataaaatgacaattaaaaaggagcggaggtagta 513  Q
    |||| |||||||||| || || || |||||||||||| |||||||||||| ||| ||  |||||||||||||||| |||||||||||    
T  38482861 attgcatcaaaagtagtatcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatatcaaaatgtgacaattaaaaaggaacggaggtagta 38482775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 143; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 236 - 513
Target Start/End: Complemental strand, 2888728 - 2888451
Alignment:
Q  236 tactcactccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttatttcaatttaactgtcacttt-caaagttcaatgcaactttaaatgttatttt 334  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| || | |||||| ||||||||| || ||||||||||||| |||||||||| |||    
T  2888728 tactccctccgttcctttttaagtgtctcttttggagaatttttttgttcctatttaagtgtcactttacatagttcaatgcaacattaaatgttacttt 2888629  T
Q  335 atcaatattacccttagttatttattgtggagatagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggatattatggtaaaagtatcaattattgtatc 434  Q
    |  ||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||  |||||| ||  ||||||||||||    
T  2888628 actaatattacccttatttatt-attgtggagagagaaatatatgtaatgagatattaaataaataaggttattaaagtaaaaatagaaattattgtatc 2888530  T
Q  435 aaaagtaataacatttattgattgtcttgctttgtgtaaaatgtcataaaatgacaattaaaaaggagcggaggtagta 513  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||  |||||||||||||||| |||||||||||    
T  2888529 aaaagtagcaacatttattgattgtcttggtttgtgtaaaatgttaaaatgtgacaattaaaaaggaacggaggtagta 2888451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 143; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 236 - 514
Target Start/End: Original strand, 35052033 - 35052311
Alignment:
Q  236 tactcactccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttatttcaatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaactttaaatgttatttta 335  Q
    ||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||   ||| ||   |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  35052033 tactccctccgttcctttttatttgtcacttttggagaaaaaatttgttcatatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgtttta 35052132  T
Q  336 tcaatattacccttagttatttattgtggagatagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggatattatggtaaaagtatcaattattgtatca 435  Q
     |||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||| ||||||||||   |||||| ||||    
T  35052133 ccaatattatccttatttatttattgtggagagagaaatatatgaaatgagatattaaataaataaggtcattatagtaaaagtatagcttattgcatca 35052232  T
Q  436 aaagtaataacatttattgattgtcttgctttgtgtaaaatgtcataaaatgacaattaaaaaggagcggaggtagtaa 514  Q
    ||| || || || || |||||||||||| |||||||||||||||| ||  |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  35052233 aaaatagtatcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaacggaggtagtaa 35052311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 142; E-Value: 6e-74
Query Start/End: Original strand, 236 - 513
Target Start/End: Complemental strand, 14061409 - 14061132
Alignment:
Q  236 tactcactccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttatttcaatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaactttaaatgttatttta 335  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| |||| || |||  |||| ||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||| |||||    
T  14061409 tactctctccgttcctttttaagtgtcattttttgaaaaaaattttgtttctgtttaactgtcactttcaaaggtcaatgcaacattaaaagttgtttta 14061310  T
Q  336 tcaatattacccttagttatttattgtggagatagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggatattatggtaaaagtatcaattattgtatca 435  Q
    |||||||| ||||||||||||||||   |||| ||||||| || |||||  ||||||||||| ||| | |||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  14061309 tcaatattgcccttagttatttattacagagagagaaataaataaaatgtaatattaaatgactaaagctattatagtaaaagtataaattattgtatca 14061210  T
Q  436 aaagtaataacatttattgattgtcttgctttgtgtaaaatgtcataaaatgacaattaaaaaggagcggaggtagta 513  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  14061209 aaagtagtaatatttattgattgtcttggtttgtgtaaaatgttaaaaagtgacaattaaaaaggaacggaggtagta 14061132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 141; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 233 - 513
Target Start/End: Original strand, 6757383 - 6757663
Alignment:
Q  233 ttatactcactccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttatttcaatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaactttaaatgttatt 332  Q
    |||| ||| ||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||    
T  6757383 ttatgctccctctgttcctttttaattgtcatttttggagaaattttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacaataaatgttgtt 6757482  T
Q  333 ttatcaatattacccttagttatttattgtggagatagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggatattatggtaaaagtatcaattattgta 432  Q
    ||| ||| ||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||  |||||| |||||||||| ||||||| ||    
T  6757483 ttaccaacattacccttagttatttattacggagagagaaatatatgaaataagatattaaatgactaagactattatagtaaaagtataaattattata 6757582  T
Q  433 tcaaaagtaataacatttattgattgtcttgctttgtgtaaaatgtcataaaatgacaattaaaaaggagcggaggtagta 513  Q
    | | ||  | ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||| ||||| | |||||||| |||||||||||    
T  6757583 taagaaaaagtaacatttattgagtgtcttgatttgtgtaaaatgtcaaaaagtgacagtaaaaaaggaacggaggtagta 6757663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 140; E-Value: 9e-73
Query Start/End: Original strand, 246 - 513
Target Start/End: Original strand, 35296034 - 35296301
Alignment:
Q  246 gttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttatttcaatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaactttaaatgttattttatcaatattac 345  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| || ||||| | | |||||    
T  35296034 gttcctttttaagtgtcactttagtagaaattttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacaataaatattgttttaccgacattac 35296133  T
Q  346 ccttagttatttattgtggagatagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggatattatggtaaaagtatcaattattgtatcaaaagtaataa 445  Q
    | |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||  ||||||||||| | ||  |||||    
T  35296134 ctttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaataagatattaaatgattaaggctattatagtaaaagtactaattattgtataagaaaaaataa 35296233  T
Q  446 catttattgattgtcttgctttgtgtaaaatgtcataaaatgacaattaaaaaggagcggaggtagta 513  Q
    |||||||||| ||||||| |||||||||||| ||| ||| ||||| |||||||||| |||||||||||    
T  35296234 catttattgagtgtcttggtttgtgtaaaatatcaaaaagtgacagttaaaaaggaacggaggtagta 35296301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 139; E-Value: 4e-72
Query Start/End: Original strand, 236 - 513
Target Start/End: Complemental strand, 39303776 - 39303498
Alignment:
Q  236 tactcactccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttatttcaatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaactttaaatgttatttta 335  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  39303776 tactccctccgttcctttttaagtgtcatttttggagaaattttttgttcctatttaactgtcactttcgaagttcaatgcaacattaaatgttgtttta 39303677  T
Q  336 tcaatattacccttagttatttattgtggagatagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggatattatggtaaaagtatcaattattgtatca 435  Q
     |||||||  | |||||| ||||||| ||||| |||||||||||| || |||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||   |||||| ||||    
T  39303676 ccaatattgtctttagttttttattgcggagagagaaatatatgatataagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtatagcttattgcatca 39303577  T
Q  436 aaagtaataacatttattgattgtcttgctttgtgtaaaatgtcataaaatgac-aattaaaaaggagcggaggtagta 513  Q
    |||||| || || || |||||||||||| |||||||||||||||| ||  |||| |||||||||||| |||||||||||    
T  39303576 aaagtagtatcaattgttgattgtcttgatttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaaattaaaaaggaacggaggtagta 39303498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 138; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 236 - 514
Target Start/End: Original strand, 23855536 - 23855815
Alignment:
Q  236 tactcactccgttcctttttaagtgtcacttttggag--aaattttttatttcaatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaactttaaatgttattt 333  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||||| ||||| |   |||   ||| |||||||||||| ||||||||||||||| | |||||| ||||||||| |||    
T  23855536 tactccctccgttcttttttaagtgtcatttttgaaagaaaaaaatttgtttcaatttaaccgtcactttcaaagtttattgcaacattaaatgttgttt 23855635  T
Q  334 tatcaatattacccttagttatttattgtggagatagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggatattatggtaaaagtatcaattattgtat 433  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||| |  ||||||||    
T  23855636 -atcaatattacccttagttatttattgtggagagataaatatataaaatgagatattaaataaataaggttattatagtaaaagtatgacgtattgtat 23855734  T
Q  434 caaaagtaataacatttattgattgtcttgctttgtgtaaaatgtcataaaatgacaattaaaaaggagcggaggtagtaa 514  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||| ||| ||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  23855735 caaaagtagtaatatttattgattgtattggtttatgtaaaatgtcaaaaaatgacgattaaaaaggaacggaggtagtaa 23855815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 137; E-Value: 6e-71
Query Start/End: Original strand, 243 - 514
Target Start/End: Original strand, 7483731 - 7484000
Alignment:
Q  243 tccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttatttcaatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaactttaaatgttattttatcaatat 342  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || | |||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||| ||| ||    
T  7483731 tccgttcctttttaagtgtcatttttggagaaattttttgttcctatttcactgtcactttcaaagttcaatgcaacaataaatgttgttttaccaacat 7483830  T
Q  343 tacccttagttatttattgtggagatagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggatattatggtaaaagtatcaattattgtatcaaaagtaa 442  Q
    |||||||| ||||||||| |||||  ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||| ||||||||||| | ||  |     
T  7483831 tacccttaattatttattatggag--agaaatatatgaaataagatattaaatgactaaggctattatagtaaaagtatgaattattgtataagaaaaag 7483928  T
Q  443 taacatttattgattgtcttgctttgtgtaaaatgtcataaaatgacaattaaaaaggagcggaggtagtaa 514  Q
    ||||||||||| | ||||||  |||||||||||| ||| ||| ||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  7483929 taacatttatttagtgtcttagtttgtgtaaaatatcaaaaagtgacagttaaaaaggaacggaggtagtaa 7484000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 137; E-Value: 6e-71
Query Start/End: Original strand, 242 - 514
Target Start/End: Original strand, 10180356 - 10180628
Alignment:
Q  242 ctccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttatttcaatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaactttaaatgttattttatcaata 341  Q
    |||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||||| || | |||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||| |||||    
T  10180356 ctccattcctttttaagtgtctcttttgaagaaattttttgttcctatttaattgtcactttcaaagtttaatgcaacattaaacgttattttaccaata 10180455  T
Q  342 ttacccttagttatttattgtggagatagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggatattatggtaaaagtatcaattattgtatcaaaagta 441  Q
    ||| | |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||  | |||||| ||||||||||    
T  10180456 ttatctttagttatttattgcggagaaagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtacaacttattgcatcaaaagta 10180555  T
Q  442 ataacatttattgattgtcttgctttgtgtaaaatgtcataaaatgacaattaaaaaggagcggaggtagtaa 514  Q
     ||||| | ||||| | ||||| ||| |||||||||||| || ||||||||||||||| | |||| |||||||    
T  10180556 gtaacaatcattgactatcttgatttatgtaaaatgtcaaaatatgacaattaaaaagaaacggatgtagtaa 10180628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 137; E-Value: 6e-71
Query Start/End: Original strand, 246 - 514
Target Start/End: Original strand, 13173919 - 13174187
Alignment:
Q  246 gttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttatttcaatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaactttaaatgttattttatcaatattac 345  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||| ||||| || | |||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||| |||||  || |||||    
T  13173919 gttcctttttaagtgtcactttaagagaaagtttttgttcctatttaactgtcacttttaaagttcaatgcaacaataaatgttgttttactaacattac 13174018  T
Q  346 ccttagttatttattgtggagatagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggatattatggtaaaagtatcaattattgtatcaaaagtaataa 445  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||  ||||||||||| | ||  | |||    
T  13174019 ccttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaataagatattaaatgactaaggctattatagtaaaagtactaattattgtataagaaaaagtaa 13174118  T
Q  446 catttattgattgtcttgctttgtgtaaaatgtcataaaatgacaattaaaaaggagcggaggtagtaa 514  Q
    |||||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||| |||||| |||||    
T  13174119 catttattgagtgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaaagtgacagttaaaaaggaacggagggagtaa 13174187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 137; E-Value: 6e-71
Query Start/End: Original strand, 242 - 514
Target Start/End: Complemental strand, 23848810 - 23848538
Alignment:
Q  242 ctccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttatttcaatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaactttaaatgttattttatcaata 341  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| || | |||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||| ||||| |||||    
T  23848810 ctccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaaaattttgttcctatttaactgtcactttcaaaatttaatgcaacattaaatgttgttttaccaata 23848711  T
Q  342 ttacccttagttatttattgtggagatagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggatattatggtaaaagtatcaattattgtatcaaaagta 441  Q
    ||| |||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||  ||||| |||   |||||| ||||||||||    
T  23848710 ttatccttggttatttattgcggagagagaaatatatgaaataagatattaaatgaataaggtcattataataaaaatatagtttattgcatcaaaagta 23848611  T
Q  442 ataacatttattgattgtcttgctttgtgtaaaatgtcataaaatgacaattaaaaaggagcggaggtagtaa 514  Q
     || || ||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||  |||||||||||||||| | ||||||||||    
T  23848610 gtatcaattattgattgtcttggtttgtgtcaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaacagaggtagtaa 23848538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 136; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 235 - 514
Target Start/End: Original strand, 36058212 - 36058490
Alignment:
Q  235 atactcactccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttatttcaatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaactttaaatgttatttt 334  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  36058212 atactcactccgttcctttttaagtgtctcttttgaagaaattttttgtttctatttaactatcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgtttt 36058311  T
Q  335 atcaatattacccttagttatttattgtggagatagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggatattatggtaaaagtatcaattattgtatc 434  Q
    | |||||||| ||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||| |||||||||  | |||||| |||    
T  36058312 a-caatattatccttagttatttattgctgagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataagatcattatagtaaaagtacaacttattgcatc 36058410  T
Q  435 aaaagtaataacatttattgattgtcttgctttgtgtaaaatgtcataaaatgacaattaaaaaggagcggaggtagtaa 514  Q
    ||||||| ||||| | ||||| | | ||  ||| |||||||||||| ||   ||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  36058411 aaaagtagtaacaatcattgactattttaatttatgtaaaatgtcaaaatgcgacaattaaaaaggaacggagatagtaa 36058490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 135; E-Value: 9e-70
Query Start/End: Original strand, 235 - 513
Target Start/End: Original strand, 18291443 - 18291720
Alignment:
Q  235 atactcactccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttatttcaatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaactttaaatgttatttt 334  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| || ||||    
T  18291443 atactccctccgttcctttttaagtgtctcctttgaagaaattttttgttgctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaatattaaatattgtttt 18291542  T
Q  335 atcaatattacccttagttatttattgtggagatagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggatattatggtaaaagtatcaattattgtatc 434  Q
    | || ||||| |||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||| |||||||||| | |||||| |||    
T  18291543 acca-tattatccttagttatttattacggagagagaaatatatgaaatgaaatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtataacttattgcatc 18291641  T
Q  435 aaaagtaataacatttattgattgtcttgctttgtgtaaaatgtcataaaatgacaattaaaaaggagcggaggtagta 513  Q
    ||||||| ||||| | ||||| | ||||| ||| |||||||||||| ||  |||||||||||||||| |||||||||||    
T  18291642 aaaagtagtaacaatcattgactatcttgatttttgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaacggaggtagta 18291720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 135; E-Value: 9e-70
Query Start/End: Original strand, 280 - 514
Target Start/End: Complemental strand, 26740353 - 26740119
Alignment:
Q  280 ttatttcaatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaactttaaatgttattttatcaatattacccttagttatttattgtggagatagaaatatatg 379  Q
    ||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||| |||||    
T  26740353 ttatttctatttaactctcacttttaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattacccttagatatttattgcggagaaagaaacatatg 26740254  T
Q  380 aaatgagatattaaatgaataaggatattatggtaaaagtatcaattattgtatcaaaagtaataacatttattgattgtcttgctttgtgtaaaatgtc 479  Q
    |||||| ||||||||| ||||||| |||||| |||||||||  ||  ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  26740253 aaatgaaatattaaattaataaggctattatagtaaaagtaaaaacaattgtatcaaaagtagtaacacttattgattgtcttggtttgtgtaaaatgtc 26740154  T
Q  480 ataaaatgacaattaaaaaggagcggaggtagtaa 514  Q
    | ||| |||||||||||||||| || |||||||||    
T  26740153 aaaaagtgacaattaaaaaggaacgaaggtagtaa 26740119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 132; E-Value: 5e-68
Query Start/End: Original strand, 235 - 474
Target Start/End: Original strand, 17718482 - 17718721
Alignment:
Q  235 atactcactccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttatttcaatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaactttaaatgttatttt 334  Q
    |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||    
T  17718482 atactccctccgttcctttttaattgtcacttttggataaattttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaacgttgtttt 17718581  T
Q  335 atcaatattacccttagttatttattgtggagatagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggatattatggtaaaagtatcaattattgtatc 434  Q
    | ||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||  ||||| |||||||||  ||  ||||||||    
T  17718582 accaatattacccttagatatttattgcggagaaagaaacatatgaaatgaaatattaaattaataaggccattatagtaaaagtaaaaacaattgtatc 17718681  T
Q  435 aaaagtaataacatttattgattgtcttgctttgtgtaaa 474  Q
    |||| || ||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  17718682 aaaaatagtaacaattattgattgtcttggtttgtgtaaa 17718721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 132; E-Value: 5e-68
Query Start/End: Original strand, 242 - 527
Target Start/End: Complemental strand, 38128794 - 38128516
Alignment:
Q  242 ctccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttatttcaatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaactttaaatgttattttatcaata 341  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||| |||||||||||||||||||       |||||| ||||||||| ||||| |||||    
T  38128794 ctccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaaaattttgtttctatttaactgtcactttcaa-------tgcaacattaaatgttgttttaccaata 38128702  T
Q  342 ttacccttagttatttattgtggagatagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggatattatggtaaaagtatcaattattgtatcaaaagta 441  Q
    ||| ||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||   |||||| ||||||||||    
T  38128701 ttatccttagttatttactacggagatagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaagta 38128602  T
Q  442 ataacatttattgattgtcttgctttgtgtaaaatgtcataaaatgacaattaaaaaggagcggaggtagtaagtttgttttctct 527  Q
     || || || |||||||||||| ||||| |||||||||| ||  | |||||||||||||| ||||||||||| |||| | ||||||    
T  38128601 gtatcaattgttgattgtcttggtttgtataaaatgtcaaaatgtaacaattaaaaaggaacggaggtagtatgtttttattctct 38128516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 131; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 236 - 514
Target Start/End: Complemental strand, 8731087 - 8730811
Alignment:
Q  236 tactcactccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttatttcaatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaactttaaatgttatttta 335  Q
    ||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||    
T  8731087 tactccctccgttcctttctaagtgtcatttttggagaaattttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacaataaatgttgtttta 8730988  T
Q  336 tcaatattacccttagttatttattgtggagatagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggatattatggtaaaagtatcaattattgtatca 435  Q
     ||| ||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||| ||| ||||| ||||||| ||||| |||||| |||||||||| ||||||||||| |    
T  8730987 ccaacattacccttag-tatttattgcggagagagaaatatatg-aataagataataaatgattaaggctattatagtaaaagtataaattattgtataa 8730890  T
Q  436 aaagtaataacatttattgattgtcttgctttgtgtaaaatgtcataaaatgacaattaaaaaggagcggaggtagtaa 514  Q
     ||  | ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| | ||| || || ||||||||||  |||||||||||    
T  8730889 gaaaaagtaacatttattgagtgtcttggtttgtgtaaaatgttaaaaagtggcacttaaaaaggaatggaggtagtaa 8730811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 131; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 235 - 513
Target Start/End: Complemental strand, 25703838 - 25703561
Alignment:
Q  235 atactcactccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttatttcaatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaactttaaatgttatttt 334  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| || | ||||||||| || ||||||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  25703838 atactccctccgttcctttttaagtgtcacttttgaagaaatattttgttcctatttaactggcattttcaaagttcaatgcagcattaaatgttatttt 25703739  T
Q  335 atcaatattacccttagttatttattgtggagatagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggatattatggtaaaagtatcaattattgtatc 434  Q
    | |||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||   ||||| ||||||||||   |||||| ||     
T  25703738 accaatattgtccttagttatttattgtggagagagaaatatatgaaatga-atattaaatgaataagatcattatagtaaaagtatagcttattgcata 25703640  T
Q  435 aaaagtaataacatttattgattgtcttgctttgtgtaaaatgtcataaaatgacaattaaaaaggagcggaggtagta 513  Q
    ||||||| ||  | || |||||| ||||| |||||||||||||||| ||  |||||||||||||| | |||||||||||    
T  25703639 aaaagtagtattaattgttgattatcttgttttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaagaaacggaggtagta 25703561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 130; E-Value: 8e-67
Query Start/End: Original strand, 288 - 513
Target Start/End: Complemental strand, 12248978 - 12248753
Alignment:
Q  288 atttaactgtcactttcaaagttcaatgcaactttaaatgttattttatcaatattacccttagttatttattgtggagatagaaatatatgaaatgaga 387  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||| ||||| |||||||| ||||  |||||||||||||||| |||||||||| |||||| |    
T  12248978 atttaactgtcactttcgaagttcaatgcaatattaaatgttgttttaccaatattatccttgcttatttattgtggagaaagaaatatataaaatgaaa 12248879  T
Q  388 tattaaatgaataaggatattatggtaaaagtatcaattattgtatcaaaagtaataacatttattgattgtcttgctttgtgtaaaatgtcataaaatg 487  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||||||||||  |||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||| || ||||||||||||| ||| ||    
T  12248878 tattaaatgaataaggttattatagtaaaagtatatattattgtatcaaaagtagtaatatttattgaatgtcttggttcgtgtaaaatgtcaaaaactg 12248779  T
Q  488 acaattaaaaaggagcggaggtagta 513  Q
     ||||||||||||| |||||||||||    
T  12248778 tcaattaaaaaggaacggaggtagta 12248753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 130; E-Value: 8e-67
Query Start/End: Original strand, 235 - 512
Target Start/End: Original strand, 26062687 - 26062963
Alignment:
Q  235 atactcactccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttatttcaatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaactttaaatgttatttt 334  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||| |||| || || |||||| || | ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| |||| ||||    
T  26062687 atactctctccgttcctttttaagtgtcatttttagaaaatttttttgttcctatttaactgtcactttcgaagttcaatgcaacattaa-tgttgtttt 26062785  T
Q  335 atcaatattacccttagttatttattgtggagatagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggatattatggtaaaagtatcaattattgtatc 434  Q
    | |||||||  |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||| |||   |||||| |||    
T  26062786 accaatattgtccttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaaatatagcttattgcatc 26062885  T
Q  435 aaaagtaataacatttattgattgtcttgctttgtgtaaaatgtcataaaatgacaattaaaaaggagcggaggtagt 512  Q
    ||||||| || || || |||||| ||||| |||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||  |||||||||    
T  26062886 aaaagtagtatcaattgttgattatcttgatttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaatggaggtagt 26062963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 130; E-Value: 8e-67
Query Start/End: Original strand, 288 - 501
Target Start/End: Complemental strand, 43642197 - 43641984
Alignment:
Q  288 atttaactgtcactttcaaagttcaatgcaactttaaatgttattttatcaatattacccttagttatttattgtggagatagaaatatatgaaatgaga 387  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| || || ||||||||||||||| |||    
T  43642197 atttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttattttaccaatattatccttagttatttattgcggggagagaaatatatgaaattaga 43642098  T
Q  388 tattaaatgaataaggatattatggtaaaagtatcaattattgtatcaaaagtaataacatttattgattgtcttgctttgtgtaaaatgtcataaaatg 487  Q
    | ||||| ||||||||  ||||| |||||||||| | |||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||| ||| ||    
T  43642097 tgttaaaagaataaggtcattatagtaaaagtataatttattgcatcaaaagtagtaacaattattgattgtcttagtttgtgtaaaatgtcaaaaagtg 43641998  T
Q  488 acaattaaaaagga 501  Q
    ||||||||||||||    
T  43641997 acaattaaaaagga 43641984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 128; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 236 - 514
Target Start/End: Complemental strand, 8554276 - 8553998
Alignment:
Q  236 tactcactccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttatttcaatttaactgtcacttt-caaagttcaatgcaactttaaatgttatttt 334  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| || ||| |||| |||||| ||   |||||| ||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  8554276 tactccctccgttcctttttaagtgtctctcttgtagaatttttttgttcttatttaagtgtcactttacatagttcaatgcaacattaaatgttatttt 8554177  T
Q  335 atcaatattacccttagttatttattgtggagatagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggatattatggtaaaagtatcaattattgtatc 434  Q
    |  ||||||| ||||| ||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||| ||||||| |||||| |||||| ||  ||||||||||||    
T  8554176 actaatattatccttatttatt-attgtggagagagaaatatatgtaatgagatgttaaataaataaggttattatagtaaaaataaaaattattgtatc 8554078  T
Q  435 aaaagtaataacatttattgattgtcttgctttgtgtaaaatgtcataaaatgacaattaaaaaggagcggaggtagtaa 514  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||  |||||||| ||||||| || |||||||||    
T  8554077 aaaagtagcaacatttattgattgtcttgatttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattgaaaaggaacgaaggtagtaa 8553998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 128; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 235 - 513
Target Start/End: Complemental strand, 14228583 - 14228305
Alignment:
Q  235 atactcactccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttatttca-atttaactgtcactttcaaagttcaatgcaactttaaatgttattt 333  Q
    |||||| || |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||  |||  ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||    
T  14228583 atactctctacgttcctttttaagtgtcacttttggagatttttttttcttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatacaacattaaatgttgttt 14228484  T
Q  334 tatcaatattacccttagttatttattgtggagatagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggatattatggtaaaagtatcaattattgtat 433  Q
    || |||||||| |||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||| ||||||||||   ||||   ||    
T  14228483 taccaatattatcctt-gttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgaaatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtatagcttatgacat 14228385  T
Q  434 caaaagtaataacatttattgattgtcttgctttgtgtaaaatgtcataaaatgacaattaaaaaggagcggaggtagta 513  Q
    |||||||| || || || |||||||||||| |||||||||||||||| ||  ||||||||||||| || |||||||||||    
T  14228384 caaaagtagtatcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaatgaacggaggtagta 14228305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 127; E-Value: 5e-65
Query Start/End: Original strand, 243 - 501
Target Start/End: Original strand, 2335420 - 2335678
Alignment:
Q  243 tccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttatttcaatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaactttaaatgttattttatcaatat 342  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||| ||| ||    
T  2335420 tccgttcctttttaagtgtcatttttggagaaattttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacaataaatgttgttttaccaacat 2335519  T
Q  343 tacccttagttatttattgtggagatagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggatattatggtaaaagtatcaattattgtatcaaaagtaa 442  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||  |||||| ||||||||||  |||||||||| | ||  |     
T  2335520 tacccttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaataagatattaaatgactaagactattatagtaaaagtatagattattgtataagaaaaag 2335619  T
Q  443 taacatttattgattgtcttgctttgtgtaaaatgtcataaaatgacaattaaaaagga 501  Q
     || ||||||||| | ||||| |||||||||||||||| ||| | ||  ||||||||||    
T  2335620 aaatatttattgagtatcttggtttgtgtaaaatgtcaaaaagtaaccgttaaaaagga 2335678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 127; E-Value: 5e-65
Query Start/End: Original strand, 235 - 513
Target Start/End: Complemental strand, 25813009 - 25812732
Alignment:
Q  235 atactcactccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttatttcaatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaactttaaatgttatttt 334  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| || | ||||||||| || ||||||||||||||||| | ||||||||| ||||    
T  25813009 atactccctccgttcctttttaagtgtcacttttgaagaaatattttgttcctatttaactggcattttcaaagttcaatgcagcattaaatgttgtttt 25812910  T
Q  335 atcaatattacccttagttatttattgtggagatagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggatattatggtaaaagtatcaattattgtatc 434  Q
    | |||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||   ||||| ||||||||||   |||||| ||     
T  25812909 accaatattgtccttagttatttattgtggagagagaaatatatgaaatga-atattaaatgaataagttcattatagtaaaagtatagcttattgcata 25812811  T
Q  435 aaaagtaataacatttattgattgtcttgctttgtgtaaaatgtcataaaatgacaattaaaaaggagcggaggtagta 513  Q
    ||||||| ||  | || |||||| ||||| |||||||||||||||| ||  |||||||||||||| | |||||||||||    
T  25812810 aaaagtagtattaattgttgattatcttgttttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaagaaacggaggtagta 25812732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 126; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 243 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 8453486 - 8453217
Alignment:
Q  243 tccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttatttcaatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaactttaaatgttattttatcaatat 342  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||| |||| ||||||  ||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||    
T  8453486 tccgttcctttttaagcgtctcttttgaagaa-ttttttgcttctatttaactgtcaattttaaagttcaatgcaacattaaatgatgttttatcaatat 8453388  T
Q  343 tacccttagttatttattgtggagatagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggatattatggtaaaagtatcaattattgtatcaaaagtaa 442  Q
    ||||||   ||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||| |  |||||  ||||||||| | |||||| ||||||||||     
T  8453387 taccctcgattatttattgtggagata--aatatatgaaataagatattaaatgaataatgtcattataataaaagtataatttattgcatcaaaagtag 8453290  T
Q  443 taacatttattgattgtcttgctttgtgtaaaatgtcataaaatgacaattaaaaaggagcggaggtagtaag 515  Q
    ||||| ||||||||| ||||  |||||||||||||||| ||  |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  8453289 taacaattattgattatcttagtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaacggaggtagtaag 8453217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 123; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 288 - 506
Target Start/End: Original strand, 1245344 - 1245562
Alignment:
Q  288 atttaactgtcactttcaaagttcaatgcaactttaaatgttattttatcaatattacccttagttatttattgtggagatagaaatatatgaaatgaga 387  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||  | |||||||||||||||||    
T  1245344 atttaattgtcattttcaaagttcaatgcaacattaaatgttattttaccaatattatccttaattatttattgtggagtgaaaaatatatgaaatgaga 1245443  T
Q  388 tattaaatgaataaggatattatggtaaaagtatcaattattgtatcaaaagtaataacatttattgattgtcttgctttgtgtaaaatgtcataaaatg 487  Q
      ||||||||||||||  ||||| |||||||||| | |||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||| ||    
T  1245444 atttaaatgaataaggtcattatagtaaaagtataacttattgaatcaaaagtagtaacaattattgattgtcttgatttatgtaaaatgtcaaaaagtg 1245543  T
Q  488 acaattaaaaaggagcgga 506  Q
    |||||||||||||| ||||    
T  1245544 acaattaaaaaggaacgga 1245562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 122; E-Value: 5e-62
Query Start/End: Original strand, 236 - 513
Target Start/End: Original strand, 3720660 - 3720937
Alignment:
Q  236 tactcactccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttatttcaatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaactttaaatgttatttta 335  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  3720660 tactccctccgttcctttttaattgtcacttttgaataaattttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgtttta 3720759  T
Q  336 tcaatattacccttagttatttattgtggagatagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggatattatggtaaaagtatcaattattgtatca 435  Q
     ||||||||| || || |||||||||  |||| ||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||| |||||||||  |   |||||||||    
T  3720760 ccaatattactctaagatatttattgcagagagagaaacatatgaaatgaaatattaaattaataaggctattatagtaaaagtaaaagcaattgtatca 3720859  T
Q  436 aaagtaataacatttattgattgtcttgctttgtgtaaaatgtcataaaatgacaattaaaaaggagcggaggtagta 513  Q
    |||| | | | | ||||||||||| ||  |||||||||||||| | ||| |||||||||||||||| ||||| |||||    
T  3720860 aaagcagtcaaacttattgattgttttagtttgtgtaaaatgttaaaaagtgacaattaaaaaggaacggagatagta 3720937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 122; E-Value: 5e-62
Query Start/End: Original strand, 236 - 513
Target Start/End: Complemental strand, 21652006 - 21651729
Alignment:
Q  236 tactcactccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttatttcaatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaactttaaatgttatttta 335  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||| || | ||||||| | |||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  21652006 tactctctccgttcctttttaagtgtcttttttgaagaaattttttgttcctatttaaccgccacttttaaagttcaatgcaacattaaatgttgtttta 21651907  T
Q  336 tcaatattacccttagttatttattgtggagatagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggatattatggtaaaagtatcaattattgtatca 435  Q
     |||||||| |||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||  | |||||| ||||    
T  21651906 ccaatattatccttagttatttattgcggaaagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtacaagttattgcatca 21651807  T
Q  436 aaagtaataacatttattgattgtcttgctttgtgtaaaatgtcataaaatgacaattaaaaaggagcggaggtagta 513  Q
    |||||| ||||  | ||||  | ||||| ||| |||||||||||| ||  |||||||||||||| | ||||| |||||    
T  21651806 aaagtagtaacgatcattggctatcttggtttatgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaagaaacggagttagta 21651729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 121; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 250 - 510
Target Start/End: Complemental strand, 12342860 - 12342600
Alignment:
Q  250 ctttttaagtgtcacttttggagaaattttttatttcaatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaactttaaatgttattttatcaatattaccctt 349  Q
    |||||||| | || |||||| ||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||| |||||||| | ||    
T  12342860 ctttttaactctctcttttgaagaaattttttgtttctatttaactatcactttcaaagttcaatgcaacattaaatattgttttaccaatattatcttt 12342761  T
Q  350 agttatttattgtggagatagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggatattatggtaaaagtatcaattattgtatcaaaagtaataacatt 449  Q
    |  ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||  | |||||| |||||||||| ||||| |    
T  12342760 aactatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtacaacttattgcatcaaaagtagtaacaat 12342661  T
Q  450 tattgattgtcttgctttgtgtaaaatgtcataaaatgacaattaaaaaggagcggaggta 510  Q
     ||||| | ||||| ||| |||||||||||| || ||||||||||||||||| | ||||||    
T  12342660 cattgactatcttggtttatgtaaaatgtcaaaatatgacaattaaaaaggaacagaggta 12342600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 119; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 292 - 514
Target Start/End: Complemental strand, 32010288 - 32010066
Alignment:
Q  292 aactgtcactttcaaagttcaatgcaactttaaatgttattttatcaatattacccttagttatttattgtggagatagaaatatatgaaatgagatatt 391  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||  ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||    
T  32010288 aactgtcactttcaaatttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattattcttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatgtt 32010189  T
Q  392 aaatgaataaggatattatggtaaaagtatcaattattgtatcaaaagtaataacatttattgattgtcttgctttgtgtaaaatgtcataaaatgacaa 491  Q
    ||||||| ||||  ||||| |||||||||| |||||||| |||||||||| || || ||||||||||||||| |||||| ||||||| | ||| ||||||    
T  32010188 aaatgaacaaggtcattatagtaaaagtataaattattgcatcaaaagtagtagcaattattgattgtcttggtttgtgaaaaatgttaaaaagtgacaa 32010089  T
Q  492 ttaaaaaggagcggaggtagtaa 514  Q
    ||||||| || |||| |||||||    
T  32010088 ttaaaaatgaacggaagtagtaa 32010066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 119; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 236 - 513
Target Start/End: Complemental strand, 45281638 - 45281361
Alignment:
Q  236 tactcactccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattt-tttatttcaatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaactttaaatgttatttt 334  Q
    ||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||||    ||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  45281638 tactccctccattcttttttaagtgtcacttttggagaaaaaaatttcttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgtttt 45281539  T
Q  335 atcaatattacccttagttatttattgtggagatagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggatattatggtaaaagtatcaattattgtatc 434  Q
      |||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||   |||||| |||    
T  45281538 gccaatattatccttagttatttattgtggagagggaaatatatgaaatg-gatattaaatgaataaggtgattatagtaaaagtatagtttattgcatc 45281440  T
Q  435 aaaagtaataacatttattgattgtcttgctttgtgtaaaatgtcataaaatgacaattaaaaaggagcggaggtagta 513  Q
    ||||||| || || || |||||| ||||| |||||||||||||| | ||  |||||||||||| ||| ||||| |||||    
T  45281439 aaaagtagtatcaattgttgattatcttggtttgtgtaaaatgttaaaatgtgacaattaaaagggaacggagctagta 45281361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 114; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 234 - 510
Target Start/End: Complemental strand, 17074842 - 17074568
Alignment:
Q  234 tatactcactccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttatttcaatttaactgtcacttt-caaagttcaatgcaactttaaatgttatt 332  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||| |||| |||||| || | |||||| ||||||||| || ||||||||||||| |||||||| |||    
T  17074842 tatactccctccgttccttttta-gtgtctcttttgtagaa-ttttttgttcctatttaaatgtcactttacatagttcaatgcaacattaaatgtaatt 17074745  T
Q  333 ttatcaatattacccttagttatttattgtggagatagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggatattatggtaaaagtatcaattattgta 432  Q
    |||  ||||||| ||||| ||||| |||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||| ||  |||||||| |    
T  17074744 ttactaatattatccttatttatt-attgtggagagaaaaatatatgtaatgagatattaaataaataaggttattatagtaaaaataaaaattattgca 17074646  T
Q  433 tcaaaagtaataacatttattgattgtcttgctttgtgtaaaatgtcataaaatgacaattaaaaaggagcggaggta 510  Q
    |||||||||  || ||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||  |||||||||||||||| ||||||||    
T  17074645 tcaaaagtagcaatatttattgattgtcttggtttgtgtaaaatgttaaaatgtgacaattaaaaaggaacggaggta 17074568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 114; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 234 - 510
Target Start/End: Original strand, 17573428 - 17573702
Alignment:
Q  234 tatactcactccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttatttcaatttaactgtcacttt-caaagttcaatgcaactttaaatgttatt 332  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||| |||| |||||| || | |||||| ||||||||| || ||||||||||||| |||||||| |||    
T  17573428 tatactccctccgttccttttta-gtgtctcttttgtagaa-ttttttgttcctatttaaatgtcactttacatagttcaatgcaacattaaatgtaatt 17573525  T
Q  333 ttatcaatattacccttagttatttattgtggagatagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggatattatggtaaaagtatcaattattgta 432  Q
    |||  ||||||| ||||| ||||| |||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||| ||  |||||||| |    
T  17573526 ttactaatattatccttatttatt-attgtggagagaaaaatatatgtaatgagatattaaataaataaggttattatagtaaaaataaaaattattgca 17573624  T
Q  433 tcaaaagtaataacatttattgattgtcttgctttgtgtaaaatgtcataaaatgacaattaaaaaggagcggaggta 510  Q
    |||||||||  || ||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||  |||||||||||||||| ||||||||    
T  17573625 tcaaaagtagcaatatttattgattgtcttggtttgtgtaaaatgttaaaatgtgacaattaaaaaggaacggaggta 17573702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 114; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 236 - 513
Target Start/End: Original strand, 38221793 - 38222069
Alignment:
Q  236 tactcactccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttatttcaatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaactttaaatgttatttta 335  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||||| |||| |||||||||||| |  | |||||| ||||||||||||||||||||  |||  |||||||| |||||    
T  38221793 tactctctccgtttctttttaagtgtcatttttagagaaattttttgtc-ctatttaattgtcactttcaaagttcaatataacaataaatgttgtttta 38221891  T
Q  336 tcaatattacccttagttatttattgtggagatagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggatattatggtaaaagtatcaattattgtatca 435  Q
      || |||||||||| ||||||||  |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||| ||||||| ||| |    
T  38221892 caaacattacccttaattatttatcatggagaaagaaatatatgaaataagatattaaatgactaaggctattatagtaaaagtataaattattatataa 38221991  T
Q  436 aaagtaataacatttattgattgtcttgctttgtgtaaaatgtcataaaatgacaattaaaaaggagcggaggtagta 513  Q
     ||  ||||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||| ||| ||||  |||||||||| ||||| |||||    
T  38221992 gaaaaaataacatttattgaatgtcttggtttgtgtaaagtgtcaaaaagtgaccgttaaaaaggaacggagttagta 38222069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 113; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 235 - 499
Target Start/End: Original strand, 16656680 - 16656943
Alignment:
Q  235 atactcactccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttatttcaatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaactttaaatgttatttt 334  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||   ||| ||   |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||    
T  16656680 atactccctccgtttctttttaagtgtcacttttggagaaaaaatttgttctcatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaaaattaaatgttgtttt 16656779  T
Q  335 atcaatattacccttagttatttattgtggagatagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggatattatggtaaaagtatcaattattgtatc 434  Q
    | ||||||||  |||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||   ||||| ||||||||||   |||||| |||    
T  16656780 agcaatattattcttagttatt-attgcggagagagaaatatatgaaataagatattaaatgaataagttcattatagtaaaagtatagtttattgcatc 16656878  T
Q  435 aaaagtaataacatttattgattgtcttgctttgtgtaaaatgtcataaaatgacaattaaaaag 499  Q
    |||| || || || || |||| ||||||| |||||||||||||||| ||  ||||||||||||||    
T  16656879 aaaattagtatcaattgttgagtgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaag 16656943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 113; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 261 - 501
Target Start/End: Original strand, 40228300 - 40228540
Alignment:
Q  261 tcacttttggagaaattttttatttcaatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaactttaaatgttattttatcaatattacccttagttatttatt 360  Q
    |||||||||||||||   ||| || | |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||| ||||||||  ||||||||||||||    
T  40228300 tcacttttggagaaaaaatttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgtaacattaaatgttgttttaccaatattattcttagttatttatt 40228399  T
Q  361 gtggagatagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggatattatggtaaaagtatcaattattgtatcaaaagtaataacatttattgattgtc 460  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||| |||||||||    |||||| ||||||| || || || || |||||||||    
T  40228400 gtggagagagaaatatatgaaatgacatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtacagcttattgcatcaaaaatagtatcaattgttgattgtc 40228499  T
Q  461 ttgctttgtgtaaaatgtcataaaatgacaattaaaaagga 501  Q
    ||| ||||||||||| |||| ||  ||||||||||||||||    
T  40228500 ttggtttgtgtaaaacgtcaaaatgtgacaattaaaaagga 40228540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 112; E-Value: 5e-56
Query Start/End: Original strand, 290 - 513
Target Start/End: Complemental strand, 27911878 - 27911655
Alignment:
Q  290 ttaactgtcactttcaaagttcaatgcaactttaaatgttattttatcaatattacccttagttatttattgtggagatagaaatatatgaaatgagata 389  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||||  ||||||||| ||||| ||||||| ||||||| ||||||||| ||||| ||||| |||| |||||| |||    
T  27911878 ttaattgtcactttcaaagttccatgcaatattaaatgttgttttaccaatattgcccttagatatttattgcggagagagaaacatataaaatgaaata 27911779  T
Q  390 ttaaatgaataaggatattatggtaaaagtatcaattattgtatcaaaagtaataacatttattgattgtcttgctttgtgtaaaatgtcataaaatgac 489  Q
    |||||| |||||||  ||||| |||||||||  ||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| ||    
T  27911778 ttaaattaataaggccattatagtaaaagtaaaaacaattgtatcaaaagtagtaacatttattgattgtcttgatttgtgtaaaatgtcaaaaaataac 27911679  T
Q  490 aattaaaaaggagcggaggtagta 513  Q
    | |||||||||  |||||||||||    
T  27911678 acttaaaaaggtacggaggtagta 27911655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #51
Raw Score: 112; E-Value: 5e-56
Query Start/End: Original strand, 290 - 513
Target Start/End: Complemental strand, 27958297 - 27958074
Alignment:
Q  290 ttaactgtcactttcaaagttcaatgcaactttaaatgttattttatcaatattacccttagttatttattgtggagatagaaatatatgaaatgagata 389  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||||  ||||||||| ||||| ||||||| ||||||| ||||||||| ||||| ||||| |||| |||||| |||    
T  27958297 ttaattgtcactttcaaagttccatgcaatattaaatgttgttttaccaatattgcccttagatatttattgcggagagagaaacatataaaatgaaata 27958198  T
Q  390 ttaaatgaataaggatattatggtaaaagtatcaattattgtatcaaaagtaataacatttattgattgtcttgctttgtgtaaaatgtcataaaatgac 489  Q
    |||||| |||||||  ||||| |||||||||  ||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| ||    
T  27958197 ttaaattaataaggccattatagtaaaagtaaaaacaattgtatcaaaagtagtaacatttattgattgtcttgatttgtgtaaaatgtcaaaaaataac 27958098  T
Q  490 aattaaaaaggagcggaggtagta 513  Q
    | |||||||||  |||||||||||    
T  27958097 acttaaaaaggtacggaggtagta 27958074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #52
Raw Score: 110; E-Value: 7e-55
Query Start/End: Original strand, 236 - 513
Target Start/End: Original strand, 19972260 - 19972536
Alignment:
Q  236 tactcactccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttatttcaatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaactttaaatgttatttta 335  Q
    ||||| |||||||| ||||||||| ||||||||  | |||  |||  |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||| |||||    
T  19972260 tactccctccgttcttttttaagtatcacttttaaaaaaaaatttg-tttctatttaactgtcactttcaaaattcaatgcaacaataaatgttgtttta 19972358  T
Q  336 tcaatattacccttagttatttattgtggagatagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggatattatggtaaaagtatcaattattgtatca 435  Q
     ||| ||||||||||||||||||||   |||| |||||||||| |||| |||||||||| || ||||| |||||| |||||||||| ||||||||||| |    
T  19972359 ccaacattacccttagttatttattacagagagagaaatatattaaataagatattaaacgactaaggctattatagtaaaagtataaattattgtataa 19972458  T
Q  436 aaagtaataacatttattgattgtcttgctttgtgtaaaatgtcataaaatgacaattaaaaaggagcggaggtagta 513  Q
     ||    ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||| ||||  |||||||||| |||||||||||    
T  19972459 gaaaatgtaacatttattgagtgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaaagtgaccgttaaaaaggaacggaggtagta 19972536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #53
Raw Score: 110; E-Value: 7e-55
Query Start/End: Original strand, 236 - 513
Target Start/End: Complemental strand, 21020573 - 21020297
Alignment:
Q  236 tactcactccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttatttcaatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaactttaaatgttatttta 335  Q
    ||||| |||||||| ||||||||| ||||||||  | |||  |||  |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||| |||||    
T  21020573 tactccctccgttcttttttaagtatcacttttaaaaaaaaatttg-tttctatttaactgtcactttcaaaattcaatgcaacaataaatgttgtttta 21020475  T
Q  336 tcaatattacccttagttatttattgtggagatagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggatattatggtaaaagtatcaattattgtatca 435  Q
     ||| ||||||||||||||||||||   |||| |||||||||| |||| |||||||||| || ||||| |||||| |||||||||| ||||||||||| |    
T  21020474 ccaacattacccttagttatttattacagagagagaaatatattaaataagatattaaacgactaaggctattatagtaaaagtataaattattgtataa 21020375  T
Q  436 aaagtaataacatttattgattgtcttgctttgtgtaaaatgtcataaaatgacaattaaaaaggagcggaggtagta 513  Q
     ||    ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||| ||||  |||||||||| |||||||||||    
T  21020374 gaaaatgtaacatttattgagtgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaaagtgaccgttaaaaaggaacggaggtagta 21020297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #54
Raw Score: 109; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 233 - 429
Target Start/End: Original strand, 6750592 - 6750788
Alignment:
Q  233 ttatactcactccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttatttcaatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaactttaaatgttatt 332  Q
    |||| ||| ||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||    
T  6750592 ttatgctccctctgttcctttttaattgtcatttttggagaaattttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacaataaatgttgtt 6750691  T
Q  333 ttatcaatattacccttagttatttattgtggagatagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggatattatggtaaaagtatcaattatt 429  Q
    ||| ||| ||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||  |||||| |||||||||| |||||||    
T  6750692 ttaccaacattacccttagttatttattacggagagagaaatatatgaaataagatattaaatgactaagactattatagtaaaagtataaattatt 6750788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #55
Raw Score: 109; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 243 - 403
Target Start/End: Original strand, 13327766 - 13327926
Alignment:
Q  243 tccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttatttcaatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaactttaaatgttattttatcaatat 342  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||  ||||||    
T  13327766 tccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaaaattttgtttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttgccaatat 13327865  T
Q  343 tacccttagttatttattgtggagatagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataagg 403  Q
    || | |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  13327866 tatctttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaataaataagg 13327926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #56
Raw Score: 106; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 235 - 421
Target Start/End: Complemental strand, 11707742 - 11707560
Alignment:
Q  235 atactcactccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttatttcaatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaactttaaatgttatttt 334  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||    |||||||  |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||    
T  11707742 atactccctccgttcctttttaagtgtc----ttggagattttttttgtttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgatgtttt 11707647  T
Q  335 atcaatattacccttagttatttattgtggagatagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggatattatggtaaaagtat 421  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |  ||||| ||||||||||    
T  11707646 atcaatattacccttaattatttattgcggagagagaaatatatgaaataagatattaaatgaataaagtcattatagtaaaagtat 11707560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #57
Raw Score: 104; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 235 - 478
Target Start/End: Complemental strand, 40604112 - 40603869
Alignment:
Q  235 atactcactccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttatttcaatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaactttaaatgttatttt 334  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||  |||| |||  |||| || | |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  40604112 atactccctccgttcctttttaagtgtcactgatggataaaaattttgttcctatttaactgtcattttcaaagttcaatgcaacattaaatgttatttt 40604013  T
Q  335 atcaatattacccttagttatttattgtggagatagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggatattatggtaaaagtatcaattattgtatc 434  Q
    | |||||||| ||||| |||||||||| ||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||||||  || || |||||||| |   |||||  |||    
T  40604012 accaatattatccttaattatttattgcggagagataaatatatgaaatgaaatattaaatgaataaggtcatcatagtaaaagtttagtttattacatc 40603913  T
Q  435 aaaagtaataacatttattgattgtcttgctttgtgtaaaatgt 478  Q
    |||| || || || || |||||||||||| ||||| ||||||||    
T  40603912 aaaaatagtatcaattgttgattgtcttgatttgtataaaatgt 40603869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #58
Raw Score: 103; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 247 - 514
Target Start/End: Original strand, 11993884 - 11994139
Alignment:
Q  247 ttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttatttcaatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaactttaaatgttattttatcaatattacc 346  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||| |||||||  |    
T  11993884 ttcctttttaagtgtcacttttggagaaaaattttgtttctatttaactgtcactttcaaagtttaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtc 11993983  T
Q  347 cttagttatttattgtggagatagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggatattatggtaaaagtatcaattattgtatcaaaagtaataac 446  Q
    ||||||||||||| | ||||| ||||||            |||||||||||||||||  ||||| ||||||||||   |||||| |||||||||| || |    
T  11993984 cttagttatttatagcggagagagaaat------------atattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaagtagtatc 11994071  T
Q  447 atttattgattgtcttgctttgtgtaaaatgtcataaaatgacaattaaaaaggagcggaggtagtaa 514  Q
    | || || ||||||||| |||||||||||||||| ||  |||||||||||||||| |||| |||||||    
T  11994072 aattgtttattgtcttgatttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaacggatgtagtaa 11994139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #59
Raw Score: 103; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 235 - 501
Target Start/End: Original strand, 31028633 - 31028898
Alignment:
Q  235 atactcactccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttatttcaatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaactttaaatgttatttt 334  Q
    |||||| ||||||| |||| ||| |||||||||| | |||| ||||| |||  |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  31028633 atactctctccgtttctttataattgtcacttttagggaaaatttttgtttttatttaactgtcactttaaaagttcaatgcaacattaaatgttgtttt 31028732  T
Q  335 atcaatattacccttagttatttattgtggagatagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggatattatggtaaaagtatcaattattgtatc 434  Q
    | ||||||||||||||| | ||||||| ||||| ||||| ||||||||||| | ||||||| |||||||  ||||| |||||||||  ||  |||||||     
T  31028733 accaatattacccttagatgtttattgcggagagagaaacatatgaaatgaaacattaaattaataaggtcattatagtaaaagtaaaaacaattgtatt 31028832  T
Q  435 aaaagtaataacatttattgattgtcttgctttgtgtaaaatgtcataaaatgacaattaaaaagga 501  Q
    |||| ||||||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||||| ||| | ||  ||||||||||    
T  31028833 aaaa-taataacatatattgattatcttggtttgtataaaatgtcaaaaagtaaccgttaaaaagga 31028898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #60
Raw Score: 103; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 276 - 514
Target Start/End: Complemental strand, 35498290 - 35498053
Alignment:
Q  276 ttttttatttcaatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaactttaaatgttattttatcaatattacccttagttatttattgtggagatagaaata 375  Q
    |||||| |||| |||||||||||||||| |||||| |||||||| ||| ||||  |||||||||||||  |||||||||||||||   ||||||||||||    
T  35498290 ttttttgtttctatttaactgtcacttttaaagtttaatgcaacattagatgtagttttatcaatattgtccttagttatttattacagagatagaaata 35498191  T
Q  376 tatgaaatgagatattaaatgaataaggatattatggtaaaagtatcaattattgtatcaaaagtaataacatttattgattgtcttgctttgtgtaaaa 475  Q
    ||||| ||| |||||| ||| ||||||  |||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||  ||||||||| |||||||||||    
T  35498190 tatgatatgtgatattgaataaataagactattatagtaaaagtataaattattatatcaaaagtagtaacatttatgaattgtcttggtttgtgtaaaa 35498091  T
Q  476 tgtcataaaatgacaattaaaaaggagcggaggtagtaa 514  Q
    | |||  |||| | | |||||||||| ||||||||||||    
T  35498090 tttca-gaaattaaacttaaaaaggaacggaggtagtaa 35498053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #61
Raw Score: 102; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 236 - 480
Target Start/End: Complemental strand, 27518967 - 27518729
Alignment:
Q  236 tactcactccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttatttcaatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaactttaaatgttatttta 335  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||      
T  27518967 tactctctccgttcctttttaagtgtctcttttgaagaaattttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatacaacattaaatgttattt-- 27518870  T
Q  336 tcaatattacccttagttatttattgtggagatagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggatattatggtaaaagtatcaattattgtatca 435  Q
        ||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |  ||||| |||| ||||  | |||||| || |    
T  27518869 ----tattatccttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaataaataaagtcattatagtaacagtacaacttattgcataa 27518774  T
Q  436 aaagtaataacatttattgattgtcttgctttgtgtaaaatgtca 480  Q
    |||||| ||||| | ||||| | | ||| ||| ||||||||||||    
T  27518773 aaagtagtaacaatcattgactatattggtttatgtaaaatgtca 27518729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #62
Raw Score: 100; E-Value: 7e-49
Query Start/End: Original strand, 247 - 501
Target Start/End: Complemental strand, 7606146 - 7605895
Alignment:
Q  247 ttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttatttcaatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaactttaaatgttattttatcaatattacc 346  Q
    |||||||||||||||  |||||| ||||||||||| ||   ||||||||||||||||  ||||||||| |||  ||||||||||||||| |||||||| |    
T  7606146 ttcctttttaagtgtatcttttgaagaaattttttgttcttatttaactgtcacttttcaagttcaatacaatattaaatgttattttaccaatattatc 7606047  T
Q  347 cttagttatttattgtggagatagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggatattatggtaaaagtatcaattattgtatcaaaagtaataac 446  Q
    |||| |||||||| ||  ||| ||||||||||||||| |||| |||||| ||||||   ||||| |||||||||| | |||||| || |||||||||||     
T  7606046 cttaattatttatggt--agagagaaatatatgaaattagatgttaaataaataagatcattatagtaaaagtataacttattgcattaaaagtaataat 7605949  T
Q  447 atttattgattgtcttgctttgtgtaaaatgtcataaaatgacaattaaaaagga 501  Q
      ||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||    
T  7605948 gattattgattgtcttgatttgtgtaaaatgtta-aaaataacaattaaaaagga 7605895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #63
Raw Score: 99; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 242 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 16701147 - 16700989
Alignment:
Q  242 ctccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttatttcaatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaactttaaatgttattttatcaata 341  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| || | |||||||||||||||| |||||||||| |||  ||||||||| ||||| |||||    
T  16701147 ctccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaaaattttgttcctatttaactgtcacttttaaagttcaatacaatattaaatgttgttttaccaata 16701048  T
Q  342 ttacccttagttatttattgtggagatagaaatatatgaaatgagatattaaatgaata 400  Q
    ||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  16701047 ttatccttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaataagatattaaatgaata 16700989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #64
Raw Score: 99; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 246 - 513
Target Start/End: Complemental strand, 23793525 - 23793254
Alignment:
Q  246 gttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttatttcaatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaactttaaatgttattttatcaatattac 345  Q
    |||||||||||| ||||| ||||  | |||| |||| |||| |||||| ||||| ||||||||||||||| ||| || |||||| ||||| ||||||||     
T  23793525 gttcctttttaattgtcatttttaaaaaaatattttgtttctatttaattgtcattttcaaagttcaatgtaacattgaatgttgttttaccaatattat 23793426  T
Q  346 ccttagttatttattgtggagatagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggatattatggtaaaagtatcaattattgtatcaaaagtaataa 445  Q
    |||||| ||||||||  ||||| | ||| |||| |||||| ||||||||| |||||||  ||||| |||||||||  ||| |||||||||||| || |||    
T  23793425 ccttagatatttattacggagagaaaaacatataaaatgaaatattaaattaataaggtcattatagtaaaagtaaaaataattgtatcaaaaatagtaa 23793326  T
Q  446 catt----tattgattgtcttgctttgtgtaaaatgtcataaaatgacaattaaaaaggagcggaggtagta 513  Q
    ||||    |||| ||||||||| |||||||||||||| | |||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  23793325 catttatttattaattgtcttggtttgtgtaaaatgttaaaaaatgacaattaaaaaggaacagaggtagta 23793254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #65
Raw Score: 98; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 288 - 501
Target Start/End: Original strand, 4057320 - 4057533
Alignment:
Q  288 atttaactgtcactttcaaagttcaatgcaactttaaatgttattttatcaatattacccttagttatttattgtggagatagaaatatatgaaatgaga 387  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||| |||||||  ||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  4057320 atttaactgtcactttcaaagttcaatgcaatattaaatgttgttttaccaatattgtccttaattatttattgcggagagagaaatatatgaaatgaga 4057419  T
Q  388 tattaaatgaataaggatattatggtaaaagtatcaattattgtatcaaaagtaataacatttattgattgtcttgctttgtgtaaaatgtcataaaatg 487  Q
    |||||||| ||||||   ||||| ||||||||||   |||| | || ||||||| || || || || ||||||||| |||||||||||||||| ||  ||    
T  4057420 tattaaattaataagatcattatagtaaaagtatagcttatggcataaaaagtagtatcaattgttaattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtg 4057519  T
Q  488 acaattaaaaagga 501  Q
    ||||||||||||||    
T  4057520 acaattaaaaagga 4057533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #66
Raw Score: 96; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 288 - 499
Target Start/End: Complemental strand, 1202652 - 1202441
Alignment:
Q  288 atttaactgtcactttcaaagttcaatgcaactttaaatgttattttatcaatattacccttagttatttattgtggagatagaaatatatgaaatgaga 387  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||| || |||||||||||||  | |||||||||||||| ||| | |||||||||| |||| |||    
T  1202652 atttaactgtcacttttaaagtttaatgcaacattaaatattgttttatcaatattgtctttagttatttattgcggaaagagaaatatataaaataaga 1202553  T
Q  388 tattaaatgaataaggatattatggtaaaagtatcaattattgtatcaaaagtaataacatttattgattgtcttgctttgtgtaaaatgtcataaaatg 487  Q
    ||||||||||||||||  ||||| |||||||||| | |||||| ||||||| || || || || |||||||||||| |||||||||||||| | ||  ||    
T  1202552 tattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtataacttattgcatcaaaaatagtatcaattgttgattgtcttgatttgtgtaaaatgttaaaatgtg 1202453  T
Q  488 acaattaaaaag 499  Q
    ||||||||||||    
T  1202452 acaattaaaaag 1202441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #67
Raw Score: 94; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 236 - 421
Target Start/End: Complemental strand, 43553503 - 43553318
Alignment:
Q  236 tactcactccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttatttcaatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaactttaaatgttatttta 335  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || | |||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  43553503 tactccctccgttcctttttaagtgtctcttttggagaaattttttgttcctatttaactgtcattttcgaagttcaatgcaacattaaatattatttta 43553404  T
Q  336 tcaatattacccttagttatttattgtggagatagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggatattatggtaaaagtat 421  Q
     |||||||| ||||| |||||||||  ||||| |||||| |||||| | ||   |||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  43553403 ccaatattatccttacttatttattacggagagagaaatgtatgaagttagtgcttaaatgaataaggttattatagtaaaagtat 43553318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #68
Raw Score: 92; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 235 - 513
Target Start/End: Original strand, 11163245 - 11163523
Alignment:
Q  235 atactcactccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttatttcaatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaactttaaatgttatttt 334  Q
    |||||| ||| |||||||||||| ||||||||||| | || |||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||    
T  11163245 atactccctctgttcctttttaattgtcacttttgcataatttttttgtttctaattaactgtcactttcaaagttcaatacaacattaaatgttgtttt 11163344  T
Q  335 atcaatattacccttagttatttattgtggagatagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggatattatggtaaaagtatcaattattgtatc 434  Q
      |  ||||||||||  ||||||||||| |||| |||| || |||||||||||||||||||||  |||| |||||| | ||||  || |||| ||| |||    
T  11163345 gcctttattacccttgattatttattgtagagagagaagtaaatgaaatgagatattaaatgatgaaggttattataggaaaaagatgaattgttgcatc 11163444  T
Q  435 aaaagtaataacatttattgattgtcttgctttgtgt-aaaatgtcataaaatgacaattaaaaaggagcggaggtagta 513  Q
    ||||||| ||| |  ||||  |||||||| ||||||| ||||| ||| ||| |||||||||||||||| |||||| ||||    
T  11163445 aaaagtagtaaaaagtatttgttgtcttggtttgtgtaaaaatctca-aaagtgacaattaaaaaggaacggagggagta 11163523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #69
Raw Score: 92; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 243 - 501
Target Start/End: Original strand, 33314530 - 33314789
Alignment:
Q  243 tccgttcctttttaagtgtcacttttgga-gaaattttttatttcaatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaactttaaatgttattttatcaata 341  Q
    |||||||||||||||||||  ||||| || |||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||  | ||    
T  33314530 tccgttcctttttaagtgtttctttttgaagaaattttttgtttccatttgactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttactagta 33314629  T
Q  342 ttacccttagttatttattgtggagatagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggatattatggtaaaagtatcaattattgtatcaaaagta 441  Q
    | | ||||| |||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||| ||||||| |  | |||||| || |||| ||    
T  33314630 tgatccttaattatttattacggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaagtcattatagtaaaaggacaacttattgcataaaaaata 33314729  T
Q  442 ataacatttattgattgtcttgctttgtgtaaaatgtcataaaatgacaattaaaaagga 501  Q
     ||||| | ||||| | | ||| ||| |||||||||||| ||   |||||||||||||||    
T  33314730 gtaacaatcattgactatattggtttatgtaaaatgtcaaaatgcgacaattaaaaagga 33314789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #70
Raw Score: 92; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 242 - 513
Target Start/End: Original strand, 38074262 - 38074532
Alignment:
Q  242 ctccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttatttcaatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaactttaaatgttattttatcaata 341  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||| ||||  || ||    
T  38074262 ctccgttcctttttaattgtcacttttgtagaaattttttgtttctaattaactgtcactttcaaagtttaatacaacattaaatgttgttttgacatta 38074361  T
Q  342 ttacccttagttatttattgtggagatagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggatattatggtaaaagtatcaattattgtatcaaaagta 441  Q
    ||||||||  ||||||||||  |||| | |||||||||||||||||||||||||||  |||  |||||| | ||||  |  |||| ||||||||||||||    
T  38074362 ttacccttgattatttattgcagagagataaatatatgaaatgagatattaaatgagcaagattattataggaaaaagaaaaattgttgtatcaaaagta 38074461  T
Q  442 ataacatttattgattgtcttgctttgtgtaaaatgtcataaaatgacaattaaaaaggagcggaggtagta 513  Q
     ||| || ||||  |||||||| ||||| |||||   | |||| ||||||||||||| || |||||| ||||    
T  38074462 gtaaaatatatttgttgtcttgatttgtataaaa-aacttaaagtgacaattaaaaaagaacggagggagta 38074532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #71
Raw Score: 89; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 349 - 513
Target Start/End: Original strand, 35029640 - 35029803
Alignment:
Q  349 tagttatttattgtggagatagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggatattatggtaaaagtatcaattattgtatcaaaagtaataacat 448  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||||| || |||||||||||||||| | | ||    
T  35029640 tagttatttattgtggagagagaaatatat-aaatgaaatattaaatgaataaggttattatagtaaaagtatgaagtattgtatcaaaagtagtgatat 35029738  T
Q  449 ttattgattgtcttgctttgtgtaaaatgtcataaaatgacaattaaaaaggagcggaggtagta 513  Q
    |||| |||| | ||| ||||| |||||||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  35029739 ttatggattatattgatttgtataaaatgttaaaaaatgacaattaaaaaggaacggaggtagta 35029803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #72
Raw Score: 88; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 243 - 513
Target Start/End: Complemental strand, 9687752 - 9687497
Alignment:
Q  243 tccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttatttcaatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaactttaaatgttattttatcaatat 342  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||           ||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||| ||| |     
T  9687752 tccgttcttttttaagtgtcacttttggagaatttttttgtt-----------gtcactttcaaagttcaatgcaacaataaatgttgttttaccaacaa 9687664  T
Q  343 tacccttagttatttattgtggagatagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggatattatggtaaaagtatcaattattgtatcaaaagtaa 442  Q
    ||||     |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||| ||||||||||| | ||  |     
T  9687663 tacc----attatttattgtggagagagaaatatatgaaataagatattaaatgactaaggttattatagtaaaagtataaattattgtataagaaaaag 9687568  T
Q  443 taacatttattgattgtcttgctttgtgtaaaatgtcataaaatgacaattaaaaaggagcggaggtagta 513  Q
    ||||||||||||  | ||||| |||||||||||||||| ||| ||| | |||| ||||| || ||||||||    
T  9687567 taacatttattgcgtatcttgatttgtgtaaaatgtcaaaaagtgatagttaacaaggaacgaaggtagta 9687497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #73
Raw Score: 88; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 233 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 40521506 - 40521337
Alignment:
Q  233 ttatactcactccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttatttcaatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaactttaaatgttatt 332  Q
    |||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||    
T  40521506 ttatactccccccgttcctttttaattgtcacttttggagaaatttttt-ttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaatattaaatgttgtt 40521408  T
Q  333 ttatcaatattacccttagttatttattgtggagatagaa--atatatgaaatgagatattaaatgaataa 401  Q
    ||| |||||||||| |||  ||||||||| ||||| ||||  ||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  40521407 ttaccaatattacctttaaatatttattgcggagagagaaacatatatgaaatgaaatattaaattaataa 40521337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #74
Raw Score: 86; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 289 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 15647606 - 15647457
Alignment:
Q  289 tttaactgtcactttcaaagttcaatgcaactttaaatgttattttatcaatattacccttagttatttattgtggagatagaaatatatgaaatgagat 388  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| | |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||    
T  15647606 tttaactgtcactttcaaagttcaatgcaatattaaatgatgttttatcaatattacccttaattatttattgcggagagagaaatatatgaaataagat 15647507  T
Q  389 attaaatgaataaggatattatggtaaaagtatcaattattgtatcaaaa 438  Q
    ||||||||||||| |  ||||| |||||||||| | |||||  |||||||    
T  15647506 attaaatgaataatgtcattatagtaaaagtataacttattacatcaaaa 15647457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #75
Raw Score: 86; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 341 - 513
Target Start/End: Complemental strand, 36112096 - 36111926
Alignment:
Q  341 attacccttagttatttattgtggagatagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggatattatggtaaaagtatcaattattgtatcaaaagt 440  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||  |||||||||| | ||      
T  36112096 attacccttagttatttattacggagagagaaatatatgaaataagatattaaatgactaaggttattatagtaaaagtatagattattgtataagaaaa 36111997  T
Q  441 aataacatttattgattgtcttgctttgtgtaaaatgtcataaaatgacaattaaaaaggagcggaggtagta 513  Q
    | ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||  ||| ||||| |||||||||| |||||||||||    
T  36111996 agtaacatttattgagtgtcttggtttgtgtaaaatgtc--aaagtgacagttaaaaaggaacggaggtagta 36111926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #76
Raw Score: 83; E-Value: 9e-39
Query Start/End: Original strand, 248 - 514
Target Start/End: Complemental strand, 14511686 - 14511411
Alignment:
Q  248 tcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttatttcaatttaactgtcactttcaaagttcaatgc--------aactttaaatgttattttatcaa 339  Q
    |||||||||| |||||||||| ||||||  |||| ||   |||||||||||| |||||||||||||| |        ||  ||||||||| |||||  ||    
T  14511686 tcctttttaattgtcacttttagagaaaaattttgttcttatttaactgtcattttcaaagttcaatacttcaatgtaatattaaatgttgttttactaa 14511587  T
Q  340 tattacccttagttatttattgtggagatagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggatattatggtaaaagtatcaattattgtatcaaaag 439  Q
    |||||||||||| ||||||||| ||||| ||||  |||| |||||| ||||||||| |||||||  ||||| |||||||||  ||  ||||||||||||     
T  14511586 tattacccttagatatttattgcggagagagaagcatataaaatgaaatattaaattaataaggtcattatagtaaaagtaaaaacaattgtatcaaaaa 14511487  T
Q  440 taataacatttattgattgtcttgctttgtgtaaaatgtcataaaatgacaatta-aaaaggagcggaggtagtaa 514  Q
    || ||||||||||| ||||||||| |||||||||||| ||| ||| ||||||||| ||||||| ||||| ||||||    
T  14511486 tagtaacatttattaattgtcttggtttgtgtaaaatttcaaaaagtgacaattaaaaaaggaacggagatagtaa 14511411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #77
Raw Score: 83; E-Value: 9e-39
Query Start/End: Original strand, 288 - 514
Target Start/End: Complemental strand, 41701690 - 41701464
Alignment:
Q  288 atttaactgtcactttcaaagttcaatgcaactttaaatgttattttatcaatattacccttagttatttattgtggagatagaaatatatgaaatgaga 387  Q
    ||||||||| |||||| |||||||||||||||  |||||||| ||||| ||| |||||  ||||||||||||||  || | ||||||||||||||| | |    
T  41701690 atttaactgacacttttaaagttcaatgcaacaataaatgttcttttaccaacattacttttagttatttattgcagaaagagaaatatatgaaataaaa 41701591  T
Q  388 tattaaatgaataaggatattatggtaaaagtatcaattattgtatcaaaagtaataacatttattgattgtcttgctttgtgtaaaatgtcataaaatg 487  Q
    |||||||||| ||||  |||||| |||||| ||| ||||||||||  | ||  | ||| ||||||||| ||||||| |||||||||||| | | ||| ||    
T  41701590 tattaaatgactaagactattatagtaaaaatataaattattgtacaagaaaaagtaatatttattgagtgtcttgatttgtgtaaaatattaaaaagtg 41701491  T
Q  488 acaattaaaaaggagcggaggtagtaa 514  Q
    ||| |||||||||| ||||||||||||    
T  41701490 acagttaaaaaggaacggaggtagtaa 41701464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #78
Raw Score: 82; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 289 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 15623818 - 15623669
Alignment:
Q  289 tttaactgtcactttcaaagttcaatgcaactttaaatgttattttatcaatattacccttagttatttattgtggagatagaaatatatgaaatgagat 388  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||| | |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||    
T  15623818 tttaaccgtcactttcaaagttcaatgcaatattaaatgatgttttatcaatattacccttaattatttattgcggagagagaaatatatgaaataagat 15623719  T
Q  389 attaaatgaataaggatattatggtaaaagtatcaattattgtatcaaaa 438  Q
    ||||||||||||| |  ||||| |||||||||| | |||||  |||||||    
T  15623718 attaaatgaataatgtcattatagtaaaagtataacttattacatcaaaa 15623669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #79
Raw Score: 82; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 244 - 441
Target Start/End: Original strand, 41890510 - 41890707
Alignment:
Q  244 ccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttatttcaatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaactttaaatgttattttatcaatatt 343  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |  ||||    
T  41890510 ccgttcctttttaattgtcacttttgcataaattttttgtttctaattaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttacctttatt 41890609  T
Q  344 acccttagttatttattgtggagatagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggatattatggtaaaagtatcaattattgtatcaaaagta 441  Q
    || |||  |||||| |||| |||| | || |||||||||| |||||||||||||  |||| |||||| | ||||  || |||| ||||||||||||||    
T  41890610 acacttgattatttcttgtagagagataagtatatgaaataagatattaaatgatgaaggttattatagaaaaaagatgaattgttgtatcaaaagta 41890707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #80
Raw Score: 81; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 289 - 457
Target Start/End: Original strand, 3513390 - 3513558
Alignment:
Q  289 tttaactgtcactttcaaagttcaatgcaactttaaatgttattttatcaatattacccttagttatttattgtggagatagaaatatatgaaatgagat 388  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||| | |||||| | |||||||||||||   |||| | ||||||||||||||||||    
T  3513390 tttaactgtcactttcaaagtttaatgcaacattaaatgttgttttacctatattatcattagttatttattacagagagataaatatatgaaatgagat 3513489  T
Q  389 attaaatgaataaggatattatggtaaaagtatcaattattgtatcaaaagtaataacatttattgatt 457  Q
    |||||||||||||||  ||||| ||||| ||||   |||||||||||||||||||| || || ||||||    
T  3513490 attaaatgaataaggtcattatagtaaatgtatagcttattgtatcaaaagtaatatcaatttttgatt 3513558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #81
Raw Score: 79; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 236 - 501
Target Start/End: Complemental strand, 13132376 - 13132113
Alignment:
Q  236 tactcactccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttatttcaatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaactttaaatgttatttta 335  Q
    ||||| |||||||||||| ||| ||||||||||  |||| |||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||     
T  13132376 tactcgctccgttcctttataactgtcacttttacagaatttttttgtttctaattaactgtcactttcaaagttcaatgtaacattaaatgttgttttt 13132277  T
Q  336 tcaatattacccttagttatttattgtggagatagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggatattatggtaaaagtatcaattattgtatca 435  Q
     | ||| |  ||||||| ||||||||  |||| ||||||||| |||||  |||||||||| | |||||||||||| |  |||  || | |||||| ||||    
T  13132276 cctataatgtccttagtaatttattgcagagagagaaatataggaaatatgatattaaataattaaggatattataggcaaaacataagttattgcatca 13132177  T
Q  436 aaagtaataacatttattgattgtcttgctttgtgtaaaatgtcataaaatgacaattaaaaagga 501  Q
    |||||| | | ||  ||| | ||||||| ||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||    
T  13132176 aaagtagtgaaatacatttagtgtcttggtttgtgtaaaaagtc--aaaatgacaattaaaaagga 13132113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #82
Raw Score: 79; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 274 - 499
Target Start/End: Complemental strand, 39615674 - 39615450
Alignment:
Q  274 aattttttatttcaatttaactgtcacttt-caaagttcaatgcaactttaaatgttattttatcaatattacccttagttatttattgtggagatagaa 372  Q
    |||||||| || | |||||| ||||||||| ||  |||||||||||| |||||||||||||||  ||||||| ||||| ||||| |||||| |   ||||    
T  39615674 aattttttgttgctatttaagtgtcactttacatcgttcaatgcaacattaaatgttattttactaatattatccttatttatt-attgtgaaatgagaa 39615576  T
Q  373 atatatgaaatgagatattaaatgaataaggatattatggtaaaagtatcaattattgtatcaaaagtaataacatttattgattgtcttgctttgtgta 472  Q
    ||||||  ||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||| ||  |||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||| ||| ||||    
T  39615575 atatatataatgagatattaaataaataaggttattatagtaaaaataaaaattattgtatcaaaagtaacaaca-ttattaattgtcttggtttatgta 39615477  T
Q  473 aaatgtcataaaatgacaattaaaaag 499  Q
    |||| ||| ||  ||||||||||||||    
T  39615476 aaatatcaaaatgtgacaattaaaaag 39615450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #83
Raw Score: 78; E-Value: 9e-36
Query Start/End: Original strand, 288 - 514
Target Start/End: Complemental strand, 2456318 - 2456097
Alignment:
Q  288 atttaactgtcactttcaaagttcaatgcaactttaaatgttattttatcaatattacccttagttatttattgtggagatagaaatatatgaaatgaga 387  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||| | ||| |||   |||| |||||  ||||||||| |||| | |    
T  2456318 atttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattatctttaatta---attgcggaga--gaaatatataaaataaaa 2456224  T
Q  388 tattaaatgaataaggatattatggtaaaagtatcaattattgtatcaaaagtaataacatttattgattgtcttgctttgtgtaaaatgtcataaaatg 487  Q
    ||||||||||||||||  ||||| |||||||||  | |||||| |||||||||| ||||| | ||||| | | ||| ||| |||||||||||| ||  ||    
T  2456223 tattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtacaacttattgcatcaaaagtagtaacaatcattgactatattgatttatgtaaaatgtcaaaatgtg 2456124  T
Q  488 acaattaaaaaggagcggaggtagtaa 514  Q
    || ||||||||| | ||||||||||||    
T  2456123 acgattaaaaagaatcggaggtagtaa 2456097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #84
Raw Score: 75; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 283 - 441
Target Start/End: Complemental strand, 9808187 - 9808029
Alignment:
Q  283 tttcaatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaactttaaatgttattttatcaatattacccttagttatttattgtggagatagaaatatatgaaa 382  Q
    |||| |||||||| ||| |||||||||||||| |||  ||||||||| |||||  ||||||  | |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  9808187 tttctatttaactctcattttcaaagttcaatacaatattaaatgttgttttactaatattgtcattagttatttattgcggagagagaaatatatgaaa 9808088  T
Q  383 tgagatattaaatgaataaggatattatggtaaaagtatcaattattgtatcaaaagta 441  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||  ||||||||| | |||||| ||||||||||    
T  9808087 tgagatattaaatgaataaggtcattataataaaagtataacttattgcatcaaaagta 9808029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #85
Raw Score: 75; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 413 - 507
Target Start/End: Original strand, 31964726 - 31964820
Alignment:
Q  413 taaaagtatcaattattgtatcaaaagtaataacatttattgattgtcttgctttgtgtaaaatgtcataaaatgacaattaaaaaggagcggag 507  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  31964726 taaaagtatcaattattgtatcaaaaatagtaacatttattgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcataaaatgacaattaaagaggaacggag 31964820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #86
Raw Score: 73; E-Value: 9e-33
Query Start/End: Original strand, 289 - 441
Target Start/End: Original strand, 35051879 - 35052031
Alignment:
Q  289 tttaactgtcactttcaaagttcaatgcaactttaaatgttattttatcaatattacccttagttatttattgtggagatagaaatatatgaaatgagat 388  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| || ||||| |||||||| ||||| |||||||||  ||||| |||||| |||||||| ||      
T  35051879 tttaactgtcactttcgaagttcaatgcaacattaaatattgttttaccaatattatccttacttatttattacggagagagaaatgtatgaaattagtg 35051978  T
Q  389 attaaatgaataaggatattatggtaaaagtatcaattattgtatcaaaagta 441  Q
    ||||||||||||||| |||||| ||||||||||  ||| || |||||||||||    
T  35051979 attaaatgaataaggttattatagtaaaagtatgcattgttttatcaaaagta 35052031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #87
Raw Score: 73; E-Value: 9e-33
Query Start/End: Original strand, 243 - 410
Target Start/End: Complemental strand, 43553704 - 43553536
Alignment:
Q  243 tccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttatttcaatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaactttaaatgttattttatcaatat 342  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||| || | ||| ||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||| ||||| | ||||    
T  43553704 tccgttcctttttaagtgtctcttttagagaatttttttgttcctattaaactgtcactttcgaagttaaatgcaacattaaatgttgttttaccgatat 43553605  T
Q  343 tacccttagtta-tttattgtggagatagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggatattat 410  Q
     | ||||| ||| ||||||| ||||| | ||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||    
T  43553604 catccttacttattttattgcggagagaaaaatatatgaaattagatattgaatgaataaggctattat 43553536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #88
Raw Score: 72; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 338 - 513
Target Start/End: Complemental strand, 41643648 - 41643473
Alignment:
Q  338 aatattacccttagttatttattgtggagatagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggatattatggtaaaagtatcaattattgtatcaaa 437  Q
    |||||||||||||||||||||||  | ||| |||||||  |||||  ||||||||||||||| ||| |||||| | ||||| || | ||||| |||||||    
T  41643648 aatattacccttagttatttattacgaagagagaaataattgaaacaagatattaaatgaatgaggttattattggaaaaggataatttattatatcaaa 41643549  T
Q  438 agtaataacatttattgattgtcttgctttgtgtaaaatgtcataaaatgacaattaaaaaggagcggaggtagta 513  Q
    |||| ||||||||||||| | | ||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||| || ||||| |||||    
T  41643548 agtagtaacatttattgactttattggtttgtgtaaaatgtcaaaaaattacaattaaaaatgaacggagatagta 41643473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #89
Raw Score: 72; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 234 - 501
Target Start/End: Original strand, 45317630 - 45317897
Alignment:
Q  234 tatactcactccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttatttcaatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaactttaaatgttattt 333  Q
    ||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||  |||| |||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||    
T  45317630 tatactccctccgttcctttataactgtcacttttacagaatttttttgtttccaattaactgtcactttcaaagttcaatgtaacattaaatgttgttt 45317729  T
Q  334 tatcaatattacccttagttatttattgtggagatagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggatattatggtaaaagtatcaattattgtat 433  Q
    |  | |||   |||||| | ||||||||  |||| | |||||||||||||  |||| ||||| |  ||||||||||| |  |||  || | |||||||||    
T  45317730 ttcctataaagcccttaataatttattggagagagaaaaatatatgaaatatgataataaataatcaaggatattataggcaaaacataagttattgtat 45317829  T
Q  434 caaaagtaataacatttattgattgtcttgctttgtgtaaaatgtcataaaatgacaattaaaaagga 501  Q
    |||||||| | | ||  ||| | ||||||| ||||||||||| |||| ||  ||||||||||||||||    
T  45317830 caaaagtagtgaaatacatttagtgtcttggtttgtgtaaaaagtcaaaatgtgacaattaaaaagga 45317897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #90
Raw Score: 71; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 242 - 501
Target Start/End: Original strand, 15281379 - 15281624
Alignment:
Q  242 ctccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaatttttta-tttcaatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaactttaaatgttattttatcaat 340  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||  |||||||||| || |||| |||||||||||||||| | | |||                   
T  15281379 ctccgttcctttttaagtgtctcttttggagaattttttttgtttcaatttatctatcacattcaaagttcaatgcagcatgaaag-------------- 15281464  T
Q  341 attacccttagttatttattgtggagatagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggatattatggtaaaagtatcaattattgtatcaaaagt 440  Q
     ||||||||||||||||||||| || | |||||||||| |||||||||||| ||||| ||||  ||||||  ||||| ||| ||||||||||| ||||||    
T  15281465 -ttacccttagttatttattgtagaaagagaaatatataaaatgagatattgaatgactaagactattataataaaaatataaattattgtataaaaagt 15281563  T
Q  441 aataacatttattgattgtcttgctttgtgtaaaatgtcataaaatgacaattaaaaagga 501  Q
    |  |||||||||||||  ||||| ||| || || |||||| ||||| ||||||||||||||    
T  15281564 agcaacatttattgatgatcttggtttatgcaatatgtcaaaaaataacaattaaaaagga 15281624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #91
Raw Score: 71; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 242 - 501
Target Start/End: Original strand, 15461748 - 15461993
Alignment:
Q  242 ctccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaatttttta-tttcaatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaactttaaatgttattttatcaat 340  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||  |||||||||| || |||| |||||||||||||||| | | |||                   
T  15461748 ctccgttcctttttaagtgtctcttttggagaattttttttgtttcaatttatctatcacattcaaagttcaatgcagcatgaaag-------------- 15461833  T
Q  341 attacccttagttatttattgtggagatagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggatattatggtaaaagtatcaattattgtatcaaaagt 440  Q
     ||||||||||||||||||||| || | |||||||||| |||||||||||| ||||| ||||  ||||||  ||||| ||| ||||||||||| ||||||    
T  15461834 -ttacccttagttatttattgtagaaagagaaatatataaaatgagatattgaatgactaagactattataataaaaatataaattattgtataaaaagt 15461932  T
Q  441 aataacatttattgattgtcttgctttgtgtaaaatgtcataaaatgacaattaaaaagga 501  Q
    |  |||||||||||||  ||||| ||| || || |||||| ||||| ||||||||||||||    
T  15461933 agcaacatttattgatgatcttggtttatgcaatatgtcaaaaaataacaattaaaaagga 15461993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #92
Raw Score: 68; E-Value: 8e-30
Query Start/End: Original strand, 230 - 501
Target Start/End: Original strand, 6660927 - 6661198
Alignment:
Q  230 atattatactcactccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttatttcaatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaactttaaatgtt 329  Q
    ||||| ||||| |||||||||||| ||| ||||||||||  | || |||||| |||| | |||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  6660927 atattgtactccctccgttcctttataactgtcacttttacataatttttttgtttctaattaagtgtcactttcaaagttcaatgtaacattaaatgtt 6661026  T
Q  330 attttatcaatattacccttagttatttattgtggagatagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggatattatggtaaaagtatcaattatt 429  Q
     |||| || ||| |  ||||||| ||||||||  |||| | ||||| | |||||  |||||||||| | ||| |||||||| |  |||  || | |||||    
T  6661027 gttttttctataatgtccttagtaatttattgcagagagaaaaataaaagaaatatgatattaaataattaaagatattataggcaaaccataagttatt 6661126  T
Q  430 gtatcaaaagtaataacatttattgattgtcttgctttgtgtaaaatgtcataaaatgacaattaaaaagga 501  Q
    |||||||||||| | | || |||| | ||| ||| ||||||||||| |||| ||  ||||||||||||||||    
T  6661127 gtatcaaaagtagtgaaatatatttagtgtgttggtttgtgtaaaaagtcaaaatgtgacaattaaaaagga 6661198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #93
Raw Score: 68; E-Value: 8e-30
Query Start/End: Original strand, 230 - 501
Target Start/End: Original strand, 6741329 - 6741600
Alignment:
Q  230 atattatactcactccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttatttcaatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaactttaaatgtt 329  Q
    ||||| ||||| |||||||||||| ||| ||||||||||  | || |||||| |||| | |||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  6741329 atattgtactccctccgttcctttataactgtcacttttacataatttttttgtttctaattaagtgtcactttcaaagttcaatgtaacattaaatgtt 6741428  T
Q  330 attttatcaatattacccttagttatttattgtggagatagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggatattatggtaaaagtatcaattatt 429  Q
     |||| || ||| |  ||||||| ||||||||  |||| | ||||| | |||||  |||||||||| | ||| |||||||| |  |||  || | |||||    
T  6741429 gttttttctataatgtccttagtaatttattgcagagagaaaaataaaagaaatatgatattaaataattaaagatattataggcaaaccataagttatt 6741528  T
Q  430 gtatcaaaagtaataacatttattgattgtcttgctttgtgtaaaatgtcataaaatgacaattaaaaagga 501  Q
    |||||||||||| | | || |||| | ||| ||| ||||||||||| |||| ||  ||||||||||||||||    
T  6741529 gtatcaaaagtagtgaaatatatttagtgtgttggtttgtgtaaaaagtcaaaatgtgacaattaaaaagga 6741600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #94
Raw Score: 65; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 346 - 514
Target Start/End: Original strand, 8672584 - 8672752
Alignment:
Q  346 ccttagttatttattgtggagatagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggatattatggtaaaagtatcaattattgtatcaaaagtaataa 445  Q
    |||||| || ||||||  |||| ||||| |||  |||||| ||| ||||| |||||||  ||||| |||||||||  ||  |||||||||||| ||||||    
T  8672584 ccttagataattattgccgagagagaaacataaaaaatgaaatagtaaataaataaggtcattatagtaaaagtaaaaacaattgtatcaaaaataataa 8672683  T
Q  446 catttattgattgtcttgctttgtgtaaaatgtcataaaatgacaattaaaaaggagcggaggtagtaa 514  Q
    |||||||||||| | ||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  8672684 catttattgattattttggtttgtgtaaaatatcaaaaaatgacaattaaaaaggaacggaagtagtaa 8672752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #95
Raw Score: 65; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 243 - 475
Target Start/End: Complemental strand, 8954952 - 8954720
Alignment:
Q  243 tccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttatttcaatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaactttaaatgttattttatcaatat 342  Q
    |||||| |||||||| ||||| ||||| |||| |||||| |||| | |||||||| |||||||||||||||| |||  ||||||||| |||||||  |||    
T  8954952 tccgtttctttttaattgtcatttttgtagaatttttttgtttctaattaactgttactttcaaagttcaatacaatattaaatgttgttttatctttat 8954853  T
Q  343 tacccttagttatttattgtggagatagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggatattatggtaaaagtatcaattattgtatcaaaagtaa 442  Q
    || ||||  ||||||||||| |||| | || |||||||||| |||||||||||||  |||  |||||| | ||||  || |||| || |||||||||||     
T  8954852 tatccttgattatttattgtagagagataagtatatgaaataagatattaaatgatgaagattattataggaaaaaaataaattgttttatcaaaagtag 8954753  T
Q  443 taacatttattgattgtcttgctttgtgtaaaa 475  Q
    ||| |  ||||  |||||||  |||||||||||    
T  8954752 taaaaagtatttgttgtcttagtttgtgtaaaa 8954720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #96
Raw Score: 65; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 235 - 367
Target Start/End: Original strand, 41305623 - 41305755
Alignment:
Q  235 atactcactccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttatttcaatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaactttaaatgttatttt 334  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| ||  ||||| |||  | |||| |||  |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| | ||||    
T  41305623 atactcactccgttcttttttaagtatcttttttgaagatttcttttgtttttatttaactgtcacttttaaagttcaatgcaacattaaatgatgtttt 41305722  T
Q  335 atcaatattacccttagttatttattgtggaga 367  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  41305723 atcaatattacccttaattatttattgcggaga 41305755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #97
Raw Score: 65; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 374 - 513
Target Start/End: Original strand, 41308013 - 41308153
Alignment:
Q  374 tatatgaaatgagatattaaatgaataaggatattatggtaaaagtatcaattattgta-tcaaaagtaataacatttattgattgtcttgctttgtgta 472  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||  ||||| |||||||||| | |||||| | ||||||||| ||||| ||||| ||||||||| | | ||||    
T  41308013 tatatgaaataagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtataacttattgcaatcaaaagtagtaacaattattaattgtcttggtatatgta 41308112  T
Q  473 aaatgtcataaaatgacaattaaaaaggagcggaggtagta 513  Q
    |||||||| || ||||||||||||||| | |||||||||||    
T  41308113 aaatgtcaaaatatgacaattaaaaagaaacggaggtagta 41308153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #98
Raw Score: 64; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 243 - 441
Target Start/End: Complemental strand, 9301794 - 9301598
Alignment:
Q  243 tccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttatttcaatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaactttaaatgttattttatcaatat 342  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| |  |||||||| |||| | |||||||||||||| ||| |||||| |||| ||||||||| ||||     |||    
T  9301794 tccgttcctttttaattgtcacttttgca--aattttttgtttctaattaactgtcacttttaaatttcaatacaacattaaatgttgttttgcttttat 9301697  T
Q  343 tacccttagttatttattgtggagatagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggatattatggtaaaagtatcaattattgtatcaaaagta 441  Q
    |||||||  || || ||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||| | |||| ||| |||| ||| ||||||||||    
T  9301696 tacccttgatttttaattgtagggagagaaatatatgaaatgagatattaaatgatgaaggttattataggaaaaatatgaattgttgcatcaaaagta 9301598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #99
Raw Score: 63; E-Value: 8e-27
Query Start/End: Original strand, 159 - 237
Target Start/End: Original strand, 10544034 - 10544112
Alignment:
Q  159 ccttattgtcaactagtctccgagttctatttaaaataccagattgtattgaaaatactttgatcaatgaaatattata 237  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  10544034 ccttattgtcaactagtctccaagttctatttgaaataccagattgtattgaaaatactttgattaatgaaatgttata 10544112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #100
Raw Score: 63; E-Value: 8e-27
Query Start/End: Original strand, 305 - 403
Target Start/End: Original strand, 17313126 - 17313224
Alignment:
Q  305 aaagttcaatgcaactttaaatgttattttatcaatattacccttagttatttattgtggagatagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataagg 403  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||| ||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  17313126 aaagttcaacgcaacattaaatgttattttacaaatattaaccttagttatttattgcggagtgagaaatatattaaatgagatattaaatgaataagg 17313224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #101
Raw Score: 58; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 242 - 351
Target Start/End: Original strand, 8672288 - 8672397
Alignment:
Q  242 ctccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttatttcaatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaactttaaatgttattttatcaata 341  Q
    ||||||| |||||||| |||||||||| || |||   ||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||    
T  8672288 ctccgtttctttttaattgtcacttttagaaaaaaaatttgtatctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaata 8672387  T
Q  342 ttacccttag 351  Q
    ||||||||||    
T  8672388 ttacccttag 8672397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #102
Raw Score: 55; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 236 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 13935336 - 13935194
Alignment:
Q  236 tactcactccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttatttcaatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaactttaaatgttatttta 335  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||  ||||||| |||   |||| ||   |||||||||| |||||| ||||||||| |||| |||||| ||||||||    
T  13935336 tactccctccgttcctttttaagtgtttcttttggtgaataattttgttcatatttaactgttactttcgaagttcaatacaacattaaatattatttta 13935237  T
Q  336 tcaatattacccttagttatttattgtggagatagaaatatat 378  Q
     |||||||| || || ||||||||| |||||| ||||||||||    
T  13935236 ccaatattatccctacttatttattatggagagagaaatatat 13935194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #103
Raw Score: 52; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 251 - 501
Target Start/End: Complemental strand, 10086398 - 10086151
Alignment:
Q  251 tttttaagtgtcacttttggagaaattttttatttcaatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaactttaaatgttattttatcaatattaccctta 350  Q
    ||||||||||||| |||| |||||||||| |  ||   ||||||||||||||| |||||| | ||||||  |||||||| ||||| | | || | |||||    
T  10086398 tttttaagtgtcattttttgagaaattttgttcttg--tttaactgtcacttttaaagtttagtgcaacaataaatgttgttttaccgacatcatcctta 10086301  T
Q  351 gttatttattgtggagatagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggatattatggtaaaagtatcaattattgtatcaaaagtaataacattt 450  Q
     ||||||||||  |||| ||||||||||||||| | ||||||||| | ||||  ||||||  | ||||||| ||||||||||| | ||  | || |||||    
T  10086300 attatttattgcagagagagaaatatatgaaataatatattaaataactaagactattataat-aaagtataaattattgtataagaaaaagtagcattt 10086202  T
Q  451 attgattgtcttgctttgtgtaaaatgtcataaaatgacaattaaaaagga 501  Q
    ||||| ||||||  ||| |||||||| | | ||| |||||||| |||||||    
T  10086201 attgaatgtcttaatttatgtaaaatataaaaaagtgacaatttaaaagga 10086151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #104
Raw Score: 52; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 236 - 475
Target Start/End: Original strand, 29125882 - 29126120
Alignment:
Q  236 tactcactccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttatttcaatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaactttaaatgttatttta 335  Q
    ||||| |||||||||||| ||| ||||||||||| | |||   ||| |||  | |||||||||  ||||||||| |||||||   ||||||||  |||||    
T  29125882 tactccctccgttcctttataaatgtcacttttgcataaaaaatttgtttttaattaactgtcgttttcaaagtccaatgcattattaaatgtggtttta 29125981  T
Q  336 tcaatattacccttagttatttattgtggagatagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggatattatggtaaaagtatcaattattgtatca 435  Q
     | ||||||| ||||  |||||||||  |||| |||||||||||||||||  |||||||||| ||||| ||| || | ||||  || |||| ||||||||    
T  29125982 cctatattacgcttatatatttattgcagagagagaaatatatgaaatgaagtattaaatgattaaggttatcataggaaaaagataaattgttgtatca 29126081  T
Q  436 aaagtaataacatttattgattgtcttgctttgtgtaaaa 475  Q
    |||||| ||| |  ||||  |||||||| |||||||||||    
T  29126082 aaagtagtaa-aagtatttgttgtcttggtttgtgtaaaa 29126120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #105
Raw Score: 50; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 290 - 499
Target Start/End: Original strand, 42352773 - 42352980
Alignment:
Q  290 ttaactgtcactttcaaagttcaatgcaactttaaatgttattttatcaatattacccttagttatttattgtggagatagaaatatatgaaatgagata 389  Q
    |||||| ||| ||| |||||||| | || | ||||||||| ||||| | ||||||||||||| |||||||||  ||   | |||||||||||||||| ||    
T  42352773 ttaactctcatttttaaagttcattacatcattaaatgttgtttta-ctatattacccttagatatttattgcagaatgataaatatatgaaatgaggta 42352871  T
Q  390 ttaaatgaataaggatattatggtaaaagtatcaattattgtatcaaaagtaataacatttattgattgtcttgctttgtgtaaaatgtcataaaatgac 489  Q
    |||||||||||||| ||||||   ||||  || |||| ||| |||||||||| ||| |  ||||  |||| ||| ||||||||||| |||| || |||||    
T  42352872 ttaaatgaataaggttattatatgaaaaagataaattgttgcatcaaaagtagtaa-aagtatttgttgttttggtttgtgtaaaaagtcaaaacatgac 42352970  T
Q  490 aattaaaaag 499  Q
    ||||||||||    
T  42352971 aattaaaaag 42352980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #106
Raw Score: 47; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 407 - 513
Target Start/End: Original strand, 13328121 - 13328227
Alignment:
Q  407 ttatggtaaaagtatcaattattgtatcaaaagtaataacatttattgattgtcttgctttgtgtaaaatgtcataaaatgacaattaaaaaggagcgga 506  Q
    |||| |||||||||| | ||||||||| ||||||| || || || |||||||||||  |||||||||||||||| ||  |||||||||||||||| ||||    
T  13328121 ttatagtaaaagtataacttattgtattaaaagtagtatcaatttttgattgtcttagtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaacgga 13328220  T
Q  507 ggtagta 513  Q
    | |||||    
T  13328221 gatagta 13328227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #107
Raw Score: 46; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 433 - 498
Target Start/End: Complemental strand, 29091148 - 29091083
Alignment:
Q  433 tcaaaagtaataacatttattgattgtcttgctttgtgtaaaatgtcataaaatgacaattaaaaa 498  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  29091148 tcaaaagtagtaatatttattgattgtcttgatttgtgtaaaatgtcaaaaagtgacaattaaaaa 29091083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #108
Raw Score: 46; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 243 - 343
Target Start/End: Original strand, 35028595 - 35028693
Alignment:
Q  243 tccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttatttcaatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaactttaaatgttattttatcaatat 342  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| |||||  |||| ||||||||||  ||||| ||| ||||||||||||||| |||||| || ||||| ||||||    
T  35028595 tccgttcctttttaaatgtcacttttgaagaaaaattttgtttcaattta--tgtcaattttaaagttcaatgcaacattaaatattgttttaccaatat 35028692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #109
Raw Score: 45; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 29 - 93
Target Start/End: Complemental strand, 4168014 - 4167950
Alignment:
Q  29 aataaggaactagaaaaacaaggagcattgtacaactccaaattaaaagtaatctaaattttaaa 93  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  4168014 aataaagaactagaaaaacaaagagcattatacaactccaacataaaagtaatctaaattttaaa 4167950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #110
Raw Score: 45; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 244 - 497
Target Start/End: Original strand, 30205448 - 30205697
Alignment:
Q  244 ccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttatttcaatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaactttaaatgttattttatcaatatt 343  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||  | || ||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||  | ||| |    
T  30205448 ccgttcctttataactgtcacttttacataatttttttatttctaattaagtgtcactttcaaagttcaatgtaacattaaatgttgtttttcctataat 30205547  T
Q  344 acccttagttatttattgtggagatagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggatattatggtaaaagtatcaattattgtatcaaaagtaat 443  Q
      | ||||| ||||||||     | ||| |||||  ||||  |||||||||| | |||||||||||| |  |||  || ||||||||||||||||||| |    
T  30205548 gtctttagtaatttattg----cagagagatataaaaaatatgatattaaataattaaggatattatagacaaaccataaattattgtatcaaaagtagt 30205643  T
Q  444 aacatttattgattgtcttgctttgtgtaaaatgtcataaaatgacaattaaaa 497  Q
     | ||  ||| | ||||||| |||||||||||  ||| ||  ||||||||||||    
T  30205644 gaaatacatttagtgtcttggtttgtgtaaaaaatcaaaatgtgacaattaaaa 30205697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #111
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 236 - 441
Target Start/End: Complemental strand, 27193313 - 27193108
Alignment:
Q  236 tactcactccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttatttcaatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaactttaaatgttatttta 335  Q
    ||||| |||||||||||| ||| ||||||||||| | | |   ||| |||| | |||| |||   ||||||||||||||  | | |||||||| ||||||    
T  27193313 tactccctccgttcctttataattgtcacttttgtatacaaaatttgtttccaattaattgttgttttcaaagttcaatttatcattaaatgtgatttta 27193214  T
Q  336 tcaatattacccttagttatttattgtggagatagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggatattat-ggtaaaagtatcaattattgtatc 434  Q
     | |||||||| |||  |||||||||  |||| ||||||||||| |||||  |||||||| | ||||| |||||| |||||||| || |||| |||||||    
T  27193213 cctatattacctttatatatttattgctgagagagaaatatatggaatgaagtattaaattattaaggttattataggtaaaag-ataaattgttgtatc 27193115  T
Q  435 aaaagta 441  Q
    |||||||    
T  27193114 aaaagta 27193108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #112
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 163 - 237
Target Start/End: Original strand, 96201 - 96275
Alignment:
Q  163 attgtcaactagtctccgagttctatttaaaataccagattgtattgaaaatactttgatcaatgaaatattata 237  Q
    ||||||||||||||| |  ||||||||| ||||| |||||||||||||| | |||||||| |||||||| |||||    
T  96201 attgtcaactagtcttcaggttctatttgaaatatcagattgtattgaacacactttgattaatgaaatgttata 96275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #113
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 265 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 28568166 - 28568056
Alignment:
Q  265 ttttggagaaattttttatttcaatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaactttaaatgttattttatcaatattacccttagttatttattgtgg 364  Q
    |||||||||| | |||| ||||| ||||  ||||||||| ||  ||||||||||| |||| | ||  |||||||||||||||||||  |||||||||| |    
T  28568166 ttttggagaattattttgtttcattttacttgtcactttgaagtttcaatgcaacattaattattggtttatcaatattacccttacctatttattgttg 28568067  T
Q  365 agatagaaata 375  Q
    ||| |||||||    
T  28568066 agagagaaata 28568056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #114
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 265 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 28575759 - 28575649
Alignment:
Q  265 ttttggagaaattttttatttcaatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaactttaaatgttattttatcaatattacccttagttatttattgtgg 364  Q
    |||||||||| | |||| ||||| ||||  ||||||||| ||  ||||||||||| |||| | ||  |||||||||||||||||||  |||||||||| |    
T  28575759 ttttggagaattattttgtttcattttacttgtcactttgaagtttcaatgcaacattaattattggtttatcaatattacccttacctatttattgttg 28575660  T
Q  365 agatagaaata 375  Q
    ||| |||||||    
T  28575659 agagagaaata 28575649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #115
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 443 - 513
Target Start/End: Original strand, 35052309 - 35052379
Alignment:
Q  443 taacatttattgattgtcttgctttgtgtaaaatgtcataaaatgacaattaaaaaggagcggaggtagta 513  Q
    ||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||| |||| ||||| ||||||| || |||||||||||    
T  35052309 taacatttattgaatgtattgatttgtgtaaaatgtcttaaagtgacacttaaaaaagaacggaggtagta 35052379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #116
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 444 - 501
Target Start/End: Original strand, 1739881 - 1739938
Alignment:
Q  444 aacatttattgattgtcttgctttgtgtaaaatgtcataaaatgacaattaaaaagga 501  Q
    |||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  1739881 aacatttattgattgtgttgatttatgtaaaatgtcaaaaagtgacaattaaaaagga 1739938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #117
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 871 - 919
Target Start/End: Complemental strand, 14684376 - 14684328
Alignment:
Q  871 gatctttctgtcaaaaaataatataaatattccttcaaaaacaaatatt 919  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  14684376 gatctttttgtcaaaaaataatataaatattctctcaaaaacaaatatt 14684328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #118
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 423 - 499
Target Start/End: Original strand, 39663945 - 39664021
Alignment:
Q  423 aattattgtatcaaaagtaataacatttattgattgtcttgctttgtgtaaaatgtcataaaatgacaattaaaaag 499  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||| || ||||||||||  |||| ||| | ||||||||||||    
T  39663945 aattattctatcaaaagtaataatatttatttattgtcatgatttgtgtaaagagtcaaaaagtaacaattaaaaag 39664021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #119
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 290 - 441
Target Start/End: Complemental strand, 40602963 - 40602812
Alignment:
Q  290 ttaactgtcactttcaaagttcaatgcaactttaaatgttattttatcaatattacccttagttatttattgtggagatagaaatatatgaaatgagata 389  Q
    |||| ||||||||||||||||||||  ||| ||||||  | || | || ||| |  | ||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||   |||    
T  40602963 ttaagtgtcactttcaaagttcaatataacattaaataatgttctttctataatgtctttagtcatttattgcggagagagaaatatatgaaatataata 40602864  T
Q  390 ttaaatgaataaggatattat-ggtaaaagtatcaattattgtatcaaaagta 441  Q
    |||||| | |||||||||||| ||||||| ||| ||||||| ||| |||||||    
T  40602863 ttaaataattaaggatattataggtaaaa-tataaattattatataaaaagta 40602812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #120
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 244 - 327
Target Start/End: Original strand, 40608022 - 40608106
Alignment:
Q  244 ccgttcctttttaagtgtcacttttggag-aaattttttatttcaatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaactttaaatg 327  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||  || ||||||||| |||| | |||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  40608022 ccgttcctttataactgtcacttttacaggaaattttttgtttctaattaagtgtcactttcaaagttcaatgtaacattaaatg 40608106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #121
Raw Score: 36; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 295 - 410
Target Start/End: Original strand, 43275458 - 43275573
Alignment:
Q  295 tgtcactttcaaagttcaatgcaactttaaatgttattttatcaatattacccttagttatttattgtggagatagaaatatatgaaatgagatattaaa 394  Q
    ||||||||||||  ||||||||||| |||| | |||| || |||||| |||||||   |||||||||| |||| ||||| | || |||||| ||| ||||    
T  43275458 tgtcactttcaagtttcaatgcaacattaattattatcttgtcaataatacccttgcatatttattgtagagagagaaaaaaataaaatgaaataataaa 43275557  T
Q  395 tgaataaggatattat 410  Q
    ||| ||||| ||||||    
T  43275558 tgattaagggtattat 43275573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #122
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 396 - 513
Target Start/End: Original strand, 17313282 - 17313399
Alignment:
Q  396 gaataaggatattatggtaaaagtatcaattattgtatcaaaagtaataacatttattgattgtcttgctttgtgtaaaatgtcataaaatgacaattaa 495  Q
    ||||||||  ||||| |||||||||  | |||||| |||||||||||||||| | ||||| | ||||  ||| ||||| |||||| ||  | ||||||||    
T  17313282 gaataaggtcattatagtaaaagtagaacttattgcatcaaaagtaataacaataattgactatcttcgtttatgtaagatgtcaaaatgtaacaattaa 17313381  T
Q  496 aaaggagcggaggtagta 513  Q
    || ||| |||||||||||    
T  17313382 aagggaacggaggtagta 17313399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #123
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 19 - 85
Target Start/End: Original strand, 29516077 - 29516147
Alignment:
Q  19 tataaggcccaataaggaactag----aaaaacaaggagcattgtacaactccaaattaaaagtaatctaa 85  Q
    |||||||||||||||||||||||    |||||||||||||||| | |||| | ||| ||||||||||||||    
T  29516077 tataaggcccaataaggaactagaaaaaaaaacaaggagcattatccaacactaaaataaaagtaatctaa 29516147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #124
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 295 - 410
Target Start/End: Complemental strand, 7147131 - 7147016
Alignment:
Q  295 tgtcactttcaaagttcaatgcaactttaaatgttattttatcaatattacccttagttatttattgtggagatagaaatatatgaaatgagatattaaa 394  Q
    ||||||||||||  ||||||||||| |||| | || | || |||||| |||||||   |||||||||| |||| ||||| | || |||||| ||| ||||    
T  7147131 tgtcactttcaagtttcaatgcaacattaattattgtcttgtcaataatacccttgcatatttattgtagagagagaaaaaaataaaatgaaataataaa 7147032  T
Q  395 tgaataaggatattat 410  Q
    ||| ||||| ||||||    
T  7147031 tgattaagggtattat 7147016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #125
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 295 - 410
Target Start/End: Original strand, 11174282 - 11174397
Alignment:
Q  295 tgtcactttcaaagttcaatgcaactttaaatgttattttatcaatattacccttagttatttattgtggagatagaaatatatgaaatgagatattaaa 394  Q
    ||||||||||||  ||||||||||| |||| | || | || |||||| |||||||   |||||||||| |||| ||||| | || |||||| ||| ||||    
T  11174282 tgtcactttcaagtttcaatgcaacattaattattgtcttgtcaataatacccttgcatatttattgtagagagagaaaaaaataaaatgaaataataaa 11174381  T
Q  395 tgaataaggatattat 410  Q
    ||| ||||| ||||||    
T  11174382 tgattaagggtattat 11174397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #126
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 432 - 499
Target Start/End: Complemental strand, 11707518 - 11707451
Alignment:
Q  432 atcaaaagtaataacatttattgattgtcttgctttgtgtaaaatgtcataaaatgacaattaaaaag 499  Q
    |||||||||| ||| | ||||||||||||||  ||| |||||||||| | || |||||||||||||||    
T  11707518 atcaaaagtagtaataattattgattgtcttaatttatgtaaaatgtaaaaatatgacaattaaaaag 11707451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #127
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 290 - 441
Target Start/End: Original strand, 11727617 - 11727768
Alignment:
Q  290 ttaactgtcactttcaaagttcaatgcaactttaaatgttattttatcaatattacccttagttatttattgtggagatagaaatatatgaaatgagata 389  Q
    |||||||||  ||||||||||||||| | | | ||||||   ||||   ||||||||||||  |||||||||  |||| ||||||||||| |||||  ||    
T  11727617 ttaactgtcgttttcaaagttcaatgtatcatcaaatgtggctttacttatattacccttatatatttattgctgagagagaaatatatggaatgaagta 11727716  T
Q  390 ttaaatgaataaggatattatggtaaaagtatcaattattgtatcaaaagta 441  Q
    |||||| | ||||  |||||| | ||||  || |||| ||||||||||||||    
T  11727717 ttaaattattaagattattatagaaaaaagataaatttttgtatcaaaagta 11727768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #128
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 264 - 375
Target Start/End: Original strand, 26628844 - 26628955
Alignment:
Q  264 cttttggagaaattttttatttcaatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaactttaaatgttattttatcaatattacccttagttatttattgtg 363  Q
    |||||||||||   |||| ||||| ||||  ||||| ||||||  ||||||||||| |||| | ||  |||||||||| ||||||||  ||||||||||     
T  26628844 cttttggagaataattttgtttcactttatttgtcattttcaagtttcaatgcaacattaattattgatttatcaataatacccttacctatttattgta 26628943  T
Q  364 gagatagaaata 375  Q
    |||| |||||||    
T  26628944 gagagagaaata 26628955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #129
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 295 - 410
Target Start/End: Original strand, 40058362 - 40058477
Alignment:
Q  295 tgtcactttcaaagttcaatgcaactttaaatgttattttatcaatattacccttagttatttattgtggagatagaaatatatgaaatgagatattaaa 394  Q
    ||||||||||||  ||||||||||| |||| | || | || |||||| |||||||   |||||||||| |||| ||||| | || |||||| ||| ||||    
T  40058362 tgtcactttcaagtttcaatgcaacattaattattgtcttgtcaataatacccttgcatatttattgtagagagagaaaaaaataaaatgaaataataaa 40058461  T
Q  395 tgaataaggatattat 410  Q
    ||| ||||| ||||||    
T  40058462 tgattaagggtattat 40058477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #130
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 295 - 410
Target Start/End: Original strand, 40918790 - 40918905
Alignment:
Q  295 tgtcactttcaaagttcaatgcaactttaaatgttattttatcaatattacccttagttatttattgtggagatagaaatatatgaaatgagatattaaa 394  Q
    ||||||||||||  ||||||||||| |||| | || | || |||||| |||||||   |||||||||| |||| ||||| | || |||||| ||| ||||    
T  40918790 tgtcactttcaagtttcaatgcaacattaattattgtcttgtcaataatacccttgcatatttattgtagagagagaaaaaaataaaatgaaataataaa 40918889  T
Q  395 tgaataaggatattat 410  Q
    ||| ||||| ||||||    
T  40918890 tgattaagggtattat 40918905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #131
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 443 - 514
Target Start/End: Complemental strand, 43553021 - 43552950
Alignment:
Q  443 taacatttattgattgtcttgctttgtgtaaaatgtcataaaatgacaattaaaaaggagcggaggtagtaa 514  Q
    ||||||||||||| ||| ||  ||||| ||||||||| |||| ||||  |||||||||| ||||||||||||    
T  43553021 taacatttattgaatgtattagtttgtataaaatgtcttaaagtgacttttaaaaaggaacggaggtagtaa 43552950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #132
Raw Score: 31; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 431 - 501
Target Start/End: Original strand, 10077196 - 10077266
Alignment:
Q  431 tatcaaaagtaataacatttattgattgtcttgctttgtgtaaaatgtcataaaatgacaattaaaaagga 501  Q
    ||||||||||||||| |||||||| |||||||| |  || ||| | ||| ||||||||||| |||||||||    
T  10077196 tatcaaaagtaataagatttattggttgtcttggtaagtataagaagtcctaaaatgacaactaaaaagga 10077266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #133
Raw Score: 31; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 265 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 28562669 - 28562559
Alignment:
Q  265 ttttggagaaattttttatttcaatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaactttaaatgttattttatcaatattacccttagttatttattgtgg 364  Q
    ||||| |||| | |||| ||||| ||||  ||||||||||||  ||||||||||| |||| | ||  |||||||||||||| ||||  |||||||| | |    
T  28562669 ttttgaagaattattttgtttcattttacttgtcactttcaagtttcaatgcaacattaattattggtttatcaatattactcttacctatttatttttg 28562570  T
Q  365 agatagaaata 375  Q
    ||| |||||||    
T  28562569 agagagaaata 28562559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #134
Raw Score: 31; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 265 - 367
Target Start/End: Original strand, 45400799 - 45400901
Alignment:
Q  265 ttttggagaaattttttatttcaatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaactttaaatgttattttatcaatattacccttagttatttattgtgg 364  Q
    ||||||||||   |||| ||||| ||||  ||||||||| ||| ||||||||||| |||| | ||| |||||||||| ||  |||| ||||||||||| |    
T  45400799 ttttggagaataattttgtttcactttatttgtcacttttaaatttcaatgcaacattaattattaatttatcaataatattcttacttatttattgtag 45400898  T
Q  365 aga 367  Q
    |||    
T  45400899 aga 45400901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 184; Significance: 5e-99; HSPs: 94)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 184; E-Value: 5e-99
Query Start/End: Original strand, 246 - 513
Target Start/End: Original strand, 33257871 - 33258138
Alignment:
Q  246 gttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttatttcaatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaactttaaatgttattttatcaatattac 345  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||    
T  33257871 gttcctttttaagtgtcacttttggagaaaaattttgtttcaatttaactatcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattac 33257970  T
Q  346 ccttagttatttattgtggagatagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggatattatggtaaaagtatcaattattgtatcaaaagtaataa 445  Q
    |||| |||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| || |||||||||||||||| |||    
T  33257971 ccttggttatttattatggagagagaaatatataaaatgagatattaaatgaataaggttattatagtaaaagtatgaagtattgtatcaaaagtagtaa 33258070  T
Q  446 catttattgattgtcttgctttgtgtaaaatgtcataaaatgacaattaaaaaggagcggaggtagta 513  Q
     ||||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  33258071 tatttattgattgtattgatttgtgtaaaatgtcaaaaaatgacaattaaaaaggaacggaggtagta 33258138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 162; E-Value: 7e-86
Query Start/End: Original strand, 236 - 513
Target Start/End: Complemental strand, 12838341 - 12838064
Alignment:
Q  236 tactcactccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttatttcaatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaactttaaatgttatttta 335  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||     
T  12838341 tactccctccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaaaattttgtttctatttaactgtcactttcaaagttcagtgcaacattaaatgttgttttg 12838242  T
Q  336 tcaatattacccttagttatttattgtggagatagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggatattatggtaaaagtatcaattattgtatca 435  Q
     |||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||| ||||   |||||||||||    
T  12838241 ccaatattatccttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaataaataaggttattatagtaaaggtatagcttattgtatca 12838142  T
Q  436 aaagtaataacatttattgattgtcttgctttgtgtaaaatgtcataaaatgacaattaaaaaggagcggaggtagta 513  Q
    ||||||||| || || |||||||||||| |||||||||||| ||| ||  |||||||||||||||| |||||||||||    
T  12838141 aaagtaatatcaatttttgattgtcttggtttgtgtaaaatatcaaaatgtgacaattaaaaaggatcggaggtagta 12838064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 161; E-Value: 3e-85
Query Start/End: Original strand, 234 - 498
Target Start/End: Original strand, 35112407 - 35112671
Alignment:
Q  234 tatactcactccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttatttcaatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaactttaaatgttattt 333  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| || |||    
T  35112407 tatactccctccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaaaattttgtttcaatttaactgtcactttcaaagttcattgcaacattaaatattgttt 35112506  T
Q  334 tatcaatattacccttagttatttattgtggagatagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggatattatggtaaaagtatcaattattgtat 433  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||| ||||| | |||||| |||||| ||| || ||||||||    
T  35112507 taccaatattacccttagttatttattgtggagagaaaaatatataaaatgagatattaaataaataaagttattatagtaaaaatatgaagtattgtat 35112606  T
Q  434 caaaagtaataacatttattgattgtcttgctttgtgtaaaatgtcataaaatgacaattaaaaa 498  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||| ||  |||||||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  35112607 caaaagtagtaatatttattgattgtatttgtttgtgtaaaatgtcaaaaagtgacaattaaaaa 35112671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 160; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 234 - 508
Target Start/End: Original strand, 26723902 - 26724177
Alignment:
Q  234 tatactcactccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttatttcaatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaactttaaatgttattt 333  Q
    ||||||| |||| |||||||||||||||| |||| |||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||    
T  26723902 tatactccctccattcctttttaagtgtctctttcggagaatttttttgtttctatttaactgtcactttcaaaattcaatgcaacattaaatgatattt 26724001  T
Q  334 tatcaatattacccttagttatttattgtggagatagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggatattatggtaaaagtatcaattattgtat 433  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||| |||||||||| | |||||| ||    
T  26724002 tatcaatattacccttaattatttattgtggagagagaaatatatgaaataagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtataacttattgcat 26724101  T
Q  434 caaaagtaataacatttattgattgtcttgctttgtgtaaaatgtcataaa-atgacaattaaaaaggagcggagg 508  Q
    |||||||| ||| | | ||||||||||||| |||||||||||||||| |||  |||||||||||||||| ||||||    
T  26724102 caaaagtagtaataatcattgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaaatgtgacaattaaaaaggaacggagg 26724177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 160; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 243 - 514
Target Start/End: Complemental strand, 42842122 - 42841851
Alignment:
Q  243 tccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttatttcaatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaactttaaatgttattttatcaatat 342  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  42842122 tccgttcctttttaattgtcacttttagagaaattttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcatcattaaatgttattttatcaatat 42842023  T
Q  343 tacccttagttatttattgtggagatagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggatattatggtaaaagtatcaattattgtatcaaaagtaa 442  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||| ||||| ||||||||||| ||||||||| || ||||  ||||| |||||||||  ||  |||||||||||||||     
T  42842022 tacccttagatatttattgcggagagagaaacatatgaaatgaaatattaaattaacaaggtcattatagtaaaagtaataacaattgtatcaaaagtag 42841923  T
Q  443 taacatttattgattgtcttgctttgtgtaaaatgtcataaaatgacaattaaaaaggagcggaggtagtaa 514  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||| |||| |||||||    
T  42841922 taacatttattgattgtcttggtttgtgtaaaatatcaaaaagtgacaattaaaaaggaacggatgtagtaa 42841851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 159; E-Value: 4e-84
Query Start/End: Original strand, 236 - 514
Target Start/End: Original strand, 31430539 - 31430817
Alignment:
Q  236 tactcactccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttatttcaatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaactttaaatgttatttta 335  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  31430539 tactccctccgttcctttttaagtgtcacttttgtagaaattttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgtttta 31430638  T
Q  336 tcaatattacccttagttatttattgtggagatagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggatattatggtaaaagtatcaattattgtatca 435  Q
     |||||||  |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||   |||||| || |    
T  31430639 ccaatattgtccttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggttattatagtaaaagtatagcttattgcatga 31430738  T
Q  436 aaagtaataacatttattgattgtcttgctttgtgtaaaatgtcataaaatgacaattaaaaaggagcggaggtagtaa 514  Q
    ||| || || || || |||||||||||| |||||||||||||||| ||  |||||||||||||||| | ||||||||||    
T  31430739 aaaatagtatcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaacagaggtagtaa 31430817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 155; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 236 - 513
Target Start/End: Complemental strand, 33100096 - 33099821
Alignment:
Q  236 tactcactccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttatttcaatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaactttaaatgttatttta 335  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || |||||    
T  33100096 tactccctccgttcttttttaagtgtcacttttggagaaattttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatcttgtttta 33099997  T
Q  336 tcaatattacccttagttatttattgtggagatagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggatattatggtaaaagtatcaattattgtatca 435  Q
     |||||||  |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||| | |||||| ||||    
T  33099996 ccaatattgtccttagttatttattgtggagat--aaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtataacttattgcatca 33099899  T
Q  436 aaagtaataacatttattgattgtcttgctttgtgtaaaatgtcataaaatgacaattaaaaaggagcggaggtagta 513  Q
    |||||| || || || |||||||||||| |||||||||||| ||| ||  ||||||||||||| || |||||||||||    
T  33099898 aaagtagtatcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatatcaaaatgtgacaattaaaaaagaacggaggtagta 33099821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 145; E-Value: 9e-76
Query Start/End: Original strand, 237 - 513
Target Start/End: Complemental strand, 30866998 - 30866722
Alignment:
Q  237 actcactccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttatttcaatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaactttaaatgttattttat 336  Q
    |||| |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||  ||||     
T  30866998 actccctccgttcttttttaagtgtcatttttggagaaattttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacaataaatgttggtttac 30866899  T
Q  337 caatattacccttagttatttattgtggagatagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggatattatggtaaaagtatcaattattgtatcaa 436  Q
    ||| ||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||| |||| ||||||||||||| ||||| |||||| |||||  ||| ||||||||||| |     
T  30866898 caacattacccttagttatttattacggagagagaaatatataaaataagatattaaatgactaaggctattatagtaaacatataaattattgtataag 30866799  T
Q  437 aagtaataacatttattgattgtcttgctttgtgtaaaatgtcataaaatgacaattaaaaaggagcggaggtagta 513  Q
    ||  | ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  30866798 aaaaagtaacatttattgagtgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaaaatgacagttaaaaaggaacggaggtagta 30866722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 144; E-Value: 4e-75
Query Start/End: Original strand, 246 - 513
Target Start/End: Original strand, 10227246 - 10227513
Alignment:
Q  246 gttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttatttcaatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaactttaaatgttattttatcaatattac 345  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| || | |||||||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||     
T  10227246 gttcctttttaagtgtctcttttgaagaaattttttgttcctatttaactgtcactttcaaaattcaatgcatcattaaatgttattttatcaatattat 10227345  T
Q  346 ccttagttatttattgtggagatagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggatattatggtaaaagtatcaattattgtatcaaaagtaataa 445  Q
    |||| ||||||||||| ||||  |||||||||| ||||||||| |||||| |||||||  ||||| |||||||||| | |||||| ||||||||||  ||    
T  10227346 cctttgttatttattgcggagggagaaatatataaaatgagatgttaaattaataaggtcattatagtaaaagtataacttattgcatcaaaagtagaaa 10227445  T
Q  446 catttattgattgtcttgctttgtgtaaaatgtcataaaatgacaattaaaaaggagcggaggtagta 513  Q
     | ||||||||||||||| |||||||||||||| | ||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  10227446 taattattgattgtcttgatttgtgtaaaatgttaaaaagtgacaattaaaaaggaacggaggtagta 10227513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 143; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 251 - 513
Target Start/End: Original strand, 7312612 - 7312874
Alignment:
Q  251 tttttaagtgtcacttttggagaaattttttatttcaatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaactttaaatgttattttatcaatattaccctta 350  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||  |||||    
T  7312612 tttttaagtgtcacttttggataaattttttatttctatttaagtgtcactttcgaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtcctta 7312711  T
Q  351 gttatttattgtggagatagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggatattatggtaaaagtatcaattattgtatcaaaagtaataacattt 450  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||| |||||||||| | |||||| |||||||||| || || ||    
T  7312712 gttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaataaataaggtcattatagtaaaagtataacttattgcatcaaaagtagtatcaatt 7312811  T
Q  451 attgattgtcttgctttgtgtaaaatgtcataaaatgacaattaaaaaggagcggaggtagta 513  Q
     |||||||||||| |||||||||||| ||| ||  ||||||||| |||||| || ||||||||    
T  7312812 gttgattgtcttgatttgtgtaaaatatcaaaatgtgacaattacaaaggaacgaaggtagta 7312874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 143; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 236 - 514
Target Start/End: Complemental strand, 32528591 - 32528313
Alignment:
Q  236 tactcactccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttatttcaatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaactttaaatgttatttta 335  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||| ||||||| ||||| ||||| || | |||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||| |||||    
T  32528591 tactctctccgttcttttttaagtgttacttttgaagaaaatttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgaaatattaaatgttgtttta 32528492  T
Q  336 tcaatattacccttagttatttattgtggagatagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggatattatggtaaaagtatcaattattgtatca 435  Q
     |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||| ||||||||||   |||||| ||||    
T  32528491 ccaatattatccttagttatttattgtggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataagatcattatagtaaaagtatagcttattgcatca 32528392  T
Q  436 aaagtaataacatttattgattgtcttgctttgtgtaaaatgtcataaaatgacaattaaaaaggagcggaggtagtaa 514  Q
    ||||||  | || || |||||||||||| ||||| |||||||||| || |||||||||||||| || ||||||||||||    
T  32528391 aaagtagcatcaattgttgattgtcttgatttgtataaaatgtcaaaatatgacaattaaaaatgaacggaggtagtaa 32528313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 142; E-Value: 6e-74
Query Start/End: Original strand, 245 - 509
Target Start/End: Original strand, 36922228 - 36922493
Alignment:
Q  245 cgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttatttcaatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaactttaaatgttattttatcaatatta 344  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||    
T  36922228 cgttcctttttaagtgtcacttttagagaaaatttttatttctatttaactgtcacttttaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatatta 36922327  T
Q  345 cccttagttatttattgtggagatagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggatattatggtaaaagtatcaattattgtatc-aaaagtaat 443  Q
     |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||  ||   |||||| ||| |||||||||    
T  36922328 tccttagttatttattgcggagaaagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaaacatagcttattgcatcaaaaagtaat 36922427  T
Q  444 aacatttattgattgtcttgctttgtgtaaaatgtcataaaatgacaattaaaaaggagcggaggt 509  Q
    | || || |||||||||||| ||| | |||||||||| ||  |||||||||||||||| |||||||    
T  36922428 atcaattgttgattgtcttgatttatttaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaacggaggt 36922493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 139; E-Value: 4e-72
Query Start/End: Original strand, 236 - 510
Target Start/End: Complemental strand, 32966312 - 32966038
Alignment:
Q  236 tactcactccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttatttcaatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaactttaaatgttatttta 335  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||  ||||    
T  32966312 tactccctccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttattcctatttaactgtcattttcaaagttaaatgcaacattaaatgttggttta 32966213  T
Q  336 tcaatattacccttagttatttattgtggagatagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggatattatggtaaaagtatcaattattgtatca 435  Q
     |||||||  |||||||||||||||   |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||   |||||| ||||    
T  32966212 ccaatattgtccttagttatttattacagagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtatagcttattgcatca 32966113  T
Q  436 aaagtaataacatttattgattgtcttgctttgtgtaaaatgtcataaaatgacaattaaaaaggagcggaggta 510  Q
    |||||  || || || |||||||||||  |||||||||||||| | ||  |||||||||||||||| ||||||||    
T  32966112 aaagtggtatcaattgttgattgtcttaatttgtgtaaaatgttaaaatgtgacaattaaaaaggaacggaggta 32966038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 138; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 236 - 501
Target Start/End: Original strand, 18470287 - 18470552
Alignment:
Q  236 tactcactccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttatttcaatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaactttaaatgttatttta 335  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||   |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  18470287 tactccctccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttgttcttatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgtttta 18470386  T
Q  336 tcaatattacccttagttatttattgtggagatagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggatattatggtaaaagtatcaattattgtatca 435  Q
     |||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||| ||||||||||   |||||| || |    
T  18470387 ccaatattatccttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcgttatagtaaaagtatagcttattgcataa 18470486  T
Q  436 aaagtaataacatttattgattgtcttgctttgtgtaaaatgtcataaaatgacaattaaaaagga 501  Q
    |||||| || || || |||||||||||| |||| ||||||| | | ||   |||||||||||||||    
T  18470487 aaagtagtatcaattgttgattgtcttggtttgcgtaaaatattaaaatgcgacaattaaaaagga 18470552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 137; E-Value: 6e-71
Query Start/End: Original strand, 233 - 501
Target Start/End: Complemental strand, 35746910 - 35746643
Alignment:
Q  233 ttatactcactccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttatttcaatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaactttaaatgttatt 332  Q
    |||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||    
T  35746910 ttatactccctccgtacctttttaattgtcacttttggagaaaatttttatttctatttaaatgtcactttcaaagttcaatacaacattaaatgttgtt 35746811  T
Q  333 ttatcaatattacccttagttatttattgtggagatagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggatattatggtaaaagtatcaattattgta 432  Q
    ||| ||||||||||||||| |||||||||  || | ||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||  ||||| |||||||||  ||| ||||||    
T  35746810 ttaccaatattacccttagatatttattg-cgaaagagaaacatatgaaatgaaatattaaattaataaggccattatagtaaaagtaaaaataattgta 35746712  T
Q  433 tcaaaagtaataacatttattgattgtcttgctttgtgtaaaatgtcataaaatgacaattaaaaagga 501  Q
    |||||| || ||||||||||||||||||||  ||| |||||||||| | ||| ||||||||||||||||    
T  35746711 tcaaaaatagtaacatttattgattgtcttaatttatgtaaaatgttaaaaagtgacaattaaaaagga 35746643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 136; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 246 - 513
Target Start/End: Original strand, 33173797 - 33174064
Alignment:
Q  246 gttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttatttcaatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaactttaaatgttattttatcaatattac 345  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||     
T  33173797 gttcctttttaagtgtctcttttgaagaaattttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattat 33173896  T
Q  346 ccttagttatttattgtggagatagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggatattatggtaaaagtatcaattattgtatcaaaagtaataa 445  Q
    ||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||   |||||  ||||||||  | ||||||||||||||||| |||    
T  33173897 ccttagttatttattgcagagagagaaatatatgaaatgagattttaaatgaataagatcattatattaaaagtacaacttattgtatcaaaagtagtaa 33173996  T
Q  446 catttattgattgtcttgctttgtgtaaaatgtcataaaatgacaattaaaaaggagcggaggtagta 513  Q
    || | ||||| | | ||| ||| |||||||||||| ||  |||||||||||||||| |||||||||||    
T  33173997 caatcattgactattttggtttatgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaacggaggtagta 33174064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 129; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 234 - 514
Target Start/End: Original strand, 28608573 - 28608852
Alignment:
Q  234 tatactcactccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttatttcaatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaactttaaatgttattt 333  Q
    ||||||| |||||||||||||||| |||| |||||| |||| |||||| ||   |||||| ||||  || || ||||||||||||| |||||||||||||    
T  28608573 tatactccctccgttcctttttaaatgtctcttttgtagaatttttttgttcttatttaagtgtcctttacatagttcaatgcaacattaaatgttattt 28608672  T
Q  334 tatcaatattacccttagttatttattgtggagatagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggatattatggtaaaagtatcaattattgtat 433  Q
    ||  ||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||| |||||| |||||| ||  |||||||||||    
T  28608673 tactaatattacccttatttatt-attgtggagagagaaatatatgtaatgatatattaaataaataaggttattatagtaaaaataaaaattattgtat 28608771  T
Q  434 caaaagtaataacatttattgattgtcttgctttgtgtaaaatgtcataaaatgacaattaaaaaggagcggaggtagtaa 514  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| || ||||||||||||||||| | || |||||||    
T  28608772 caaaagtagcaacatttattgattgtcttgatttgtgtaaaatatcaaaatatgacaattaaaaaggaacagatgtagtaa 28608852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 129; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 243 - 510
Target Start/End: Complemental strand, 31815322 - 31815058
Alignment:
Q  243 tccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttatttcaatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaactttaaatgttattttatcaatat 342  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||| |  ||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||| || ||||| ||||||    
T  31815322 tccgttcctttttaactgtcatttttggagaaaatttgt--ttctatttaactgttactttcaaaattcaatgcaacattaaatattgttttaccaatat 31815225  T
Q  343 tacccttagttatttattgtggagatagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggatattatggtaaaagtatcaattattgtatcaaaagtaa 442  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||| ||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||   ||||| |||||||||  ||| |||||||||||||||     
T  31815224 tacccttagatatttattgcggagagagaaacatatgaaatgaaatattaaattaataagaccattatagtaaaagtaaaaataattgtatcaaaagtag 31815125  T
Q  443 taacatttattgattgtcttgctttgtgtaaaatgtcataaaatgacaattaaaaaggagcggaggta 510  Q
    ||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  31815124 taaca-ttattgattatcttgatttgtgtaaaatgttaaaaaatgacaattaaaaaggaacggaggta 31815058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 129; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 250 - 498
Target Start/End: Complemental strand, 36298423 - 36298175
Alignment:
Q  250 ctttttaagtgtcacttttggagaaattttttatttcaatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaactttaaatgttattttatcaatattaccctt 349  Q
    ||||||||||||| |||||| |||| |||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| | |||||||| ||||||||||    
T  36298423 ctttttaagtgtctcttttgaagaatttttttgtttctatttaactgtcactttcaatgttcaatgcaacattaaatgatgttttatcagtattaccctt 36298324  T
Q  350 agttatttattgtggagatagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggatattatggtaaaagtatcaattattgtatcaaaagtaataacatt 449  Q
    | |||||||||  ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |  ||||| |||||| ||| | |||||| |||||||||| ||||| |    
T  36298323 aattatttatttcggagagagaaatatatgaaataagatattaaatgaataaagtcattatagtaaaaatataacttattgcatcaaaagtagtaacaat 36298224  T
Q  450 tattgattgtcttgctttgtgtaaaatgtcataaaatgacaattaaaaa 498  Q
    |||||||||| ||| |||||||||||||||| ||  |||||||||||||    
T  36298223 tattgattgttttgatttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaa 36298175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 128; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 247 - 510
Target Start/End: Complemental strand, 22951070 - 22950807
Alignment:
Q  247 ttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttatttcaatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaactttaaatgttattttatcaatattacc 346  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||  ||||| |||||||  |    
T  22951070 ttcctttttaagtgtcacttttgaagaaaatttttgtttctatttaactgtcactttcaaaattcaatgcaacattaaatgtagttttaccaatattctc 22950971  T
Q  347 cttagttatttattgtggagatagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggatattatggtaaaagtatcaattattgtatcaaaagtaataac 446  Q
    ||||||||||||||   |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||  |||||||||   ||||||||||||||||| || |    
T  22950970 cttagttatttattacagagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataatgtcattataataaaagtatagcttattgtatcaaaagtagtatc 22950871  T
Q  447 atttattgattgtcttgctttgtgtaaaatgtcataaaatgacaattaaaaaggagcggaggta 510  Q
    | || || ||||||||| |||||||||||||||| || || |||||||||||||| | ||||||    
T  22950870 aattttttattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatataacaattaaaaaggaacagaggta 22950807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 127; E-Value: 5e-65
Query Start/End: Original strand, 243 - 441
Target Start/End: Complemental strand, 41889573 - 41889375
Alignment:
Q  243 tccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttatttcaatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaactttaaatgttattttatcaatat 342  Q
    |||||| |||||||||||||||||||  |||| |||||| || |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  41889573 tccgtttctttttaagtgtcacttttaaagaatttttttgttccaatttaactgtcatttttaaagttcaatgcaactttaaatattgttttatcaatat 41889474  T
Q  343 tacccttagttatttattgtggagatagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggatattatggtaaaagtatcaattattgtatcaaaagta 441  Q
    ||  ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41889473 tattcttagttatttattgcgaagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataagactattatagtaaaagtatcaattattgtatcaaaagta 41889375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 126; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 236 - 501
Target Start/End: Original strand, 3837842 - 3838107
Alignment:
Q  236 tactcactccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttatttcaatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaactttaaatgttatttta 335  Q
    ||||| ||| |||| |||||||||||  ||||||||||||   ||| ||   ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| || |||||    
T  3837842 tactccctctgttcatttttaagtgtttcttttggagaaaaaatttgttcttatttaactgtcactttcaaagtttaatgcaacattaaatattgtttta 3837941  T
Q  336 tcaatattacccttagttatttattgtggagatagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggatattatggtaaaagtatcaattattgtatca 435  Q
    ||||||||| | |||||||||||||| ||| | | |||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||| |||||||||| | |||| | ||||    
T  3837942 tcaatattatctttagttatttattgcggaaagataaatatatgaaatgagatgttaaatgaataaggtcattatagtaaaagtataacttatggcatca 3838041  T
Q  436 aaagtaataacatttattgattgtcttgctttgtgtaaaatgtcataaaatgacaattaaaaagga 501  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  3838042 aaagtaataacaattattgattgtcttgatttgcgtaaaatgtcaaaaagtgacaattaaaaagga 3838107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 125; E-Value: 8e-64
Query Start/End: Original strand, 243 - 463
Target Start/End: Original strand, 20035035 - 20035255
Alignment:
Q  243 tccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttatttcaatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaactttaaatgttattttatcaatat 342  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || | ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||    
T  20035035 tccgttcctttttaagtgtcacttttgcagaaattttttgttcctatttaactggcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatat 20035134  T
Q  343 tacccttagttatttattgtggagatagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggatattatggtaaaagtatcaattattgtatcaaaagtaa 442  Q
    || |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||| ||||||||||   |||||| || ||||| ||    
T  20035135 tatccttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataagatcattatagtaaaagtatagcttattgcattaaaaggaa 20035234  T
Q  443 taacatttattgattgtcttg 463  Q
    || || || ||||||||||||    
T  20035235 tatcaattgttgattgtcttg 20035255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 125; E-Value: 8e-64
Query Start/End: Original strand, 243 - 463
Target Start/End: Original strand, 20045446 - 20045666
Alignment:
Q  243 tccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttatttcaatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaactttaaatgttattttatcaatat 342  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || | ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||    
T  20045446 tccgttcctttttaagtgtcacttttgcagaaattttttgttcctatttaactggcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatat 20045545  T
Q  343 tacccttagttatttattgtggagatagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggatattatggtaaaagtatcaattattgtatcaaaagtaa 442  Q
    || |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||| ||||||||||   |||||| || ||||| ||    
T  20045546 tatccttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataagatcattatagtaaaagtatagcttattgcattaaaaggaa 20045645  T
Q  443 taacatttattgattgtcttg 463  Q
    || || || ||||||||||||    
T  20045646 tatcaattgttgattgtcttg 20045666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 123; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 234 - 480
Target Start/End: Complemental strand, 44480407 - 44480161
Alignment:
Q  234 tatactcactccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttatttcaatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaactttaaatgttattt 333  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||||   ||| ||   ||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  44480407 tatactccctccgttcctttttaagtgtctcttttgaagaaaaaatttgttcttatttaaccgtcacttttaaagttcaatgcaacattaaatgttattt 44480308  T
Q  334 tatcaatattacccttagttatttattgtggagatagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggatattatggtaaaagtatcaattattgtat 433  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||| |||   |||||| ||    
T  44480307 tatcaatattatccttagttatttattgtgaagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaaatatagcttattgcat 44480208  T
Q  434 caaaagtaataacatttattgattgtcttgctttgtgtaaaatgtca 480  Q
     |||| || || || || |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  44480207 aaaaaatagtatcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatgtca 44480161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 122; E-Value: 5e-62
Query Start/End: Original strand, 235 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 17896787 - 17896578
Alignment:
Q  235 atactcactccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttatttcaatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaactttaaatgttatttt 334  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||    
T  17896787 atactccctccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaaaattttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaatattaaatgttgtttt 17896688  T
Q  335 atcaatattacccttagttatttattgtggagatagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggatattatggtaaaagtatcaattattgtatc 434  Q
    | |||||||  |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||| |||   |||||| |||    
T  17896687 accaatattgtccttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaaatatagcttattgcatc 17896588  T
Q  435 aaaagtaata 444  Q
    ||||||||||    
T  17896587 aaaagtaata 17896578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 122; E-Value: 5e-62
Query Start/End: Original strand, 250 - 463
Target Start/End: Complemental strand, 26632428 - 26632216
Alignment:
Q  250 ctttttaagtgtcacttttggagaaattttttatttcaatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaactttaaatgttattttatcaatattaccctt 349  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  26632428 ctttttaagtgtcacttttggagaaaatttttatc-ctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttattttaccaatattatcctt 26632330  T
Q  350 agttatttattgtggagatagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggatattatggtaaaagtatcaattattgtatcaaaagtaataacatt 449  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||   |||||| ||||||| || || ||||    
T  26632329 agttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaaatagtatcatt 26632230  T
Q  450 tattgattgtcttg 463  Q
    | ||  ||||||||    
T  26632229 tgttatttgtcttg 26632216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 122; E-Value: 5e-62
Query Start/End: Original strand, 245 - 513
Target Start/End: Original strand, 41891258 - 41891527
Alignment:
Q  245 cgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattt-tttatttcaatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaactttaaatgttattttatcaatatt 343  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    ||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||| |||||||    
T  41891258 cgttcctttttaagtgtcacttttggagaaaaaaatttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattgaatgttgttttaccaatatt 41891357  T
Q  344 acccttagttatttattgtggagatagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggatattatggtaaaagtatcaattattgtatcaaaagtaat 443  Q
      ||| |||||||||||| ||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||  ||||| |||||||||| | |||||| ||||||| || |    
T  41891358 gtcctgagttatttattgcggagagagaaatatataaaatgatatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtataacttattgcatcaaaattagt 41891457  T
Q  444 aacatttattgattgtcttgctttgtgtaaaatgtcataaaatgacaattaaaaaggagcggaggtagta 513  Q
    | || || |||||||||||| |||||||||||||||| ||  |||||||||||||||  | |||||||||    
T  41891458 atcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggcacagaggtagta 41891527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 117; E-Value: 5e-59
Query Start/End: Original strand, 234 - 514
Target Start/End: Complemental strand, 18194479 - 18194199
Alignment:
Q  234 tatactcactccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttatttcaatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaactttaaatgttattt 333  Q
    ||||||| |||||||| ||||||| |||||||||| ||||||   ||| || | |||||||| ||| ||||||| ||||||||||  ||||||||| |||    
T  18194479 tatactccctccgttcttttttaactgtcacttttagagaaaaaatttgttcctatttaactatcattttcaaatttcaatgcaaaattaaatgttgttt 18194380  T
Q  334 tatcaatattacccttagttatttattgtggagatagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggatattatggtaaaagtatcaattattgtat 433  Q
    || ||| ||||||||||  ||||||||| ||||| ||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||| ||||||| |  ||  |||||||    
T  18194379 taccaacattacccttatatatttattgcggagagagaaacatatgaaatgaaatattaaattaataaggctattatagtaaaagcaaaaacaattgtat 18194280  T
Q  434 caaaagtaataacatttattgattgtcttgctttgtgtaaaatgtcataaaatgacaattaaaaaggagcggaggtagtaa 514  Q
    |||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||| | | ||| |||||||||||||||| |||| |||||||    
T  18194279 caaaagtagtatcatttattgattgtcttggtttgtgtaaaatttgaaaaactgacaattaaaaaggaacggatgtagtaa 18194199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 117; E-Value: 5e-59
Query Start/End: Original strand, 251 - 510
Target Start/End: Original strand, 36406746 - 36407008
Alignment:
Q  251 tttttaagtgtcacttttggagaaattttttatttcaatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaactttaaatgttattttatcaatattaccctta 350  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||   |||||||||| ||||||||||||||||| |||  |||||||| ||||| ||| ||||||||||    
T  36406746 tttttaagtgtcacttttgaagaaattttttgttcttatttaactgttactttcaaagttcaatgtaacaataaatgttgttttaccaacattaccctta 36406845  T
Q  351 gttatttattgtggagatagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggatattatggtaaaagtatcaattattgtatcaaaagtaataacattt 450  Q
    ||||||||||| ||| | |||||||||| |||| ||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||| ||||||||||| | ||  | ||||||||    
T  36406846 gttatttattgcggatagagaaatatattaaataagatattaaatgactaaggttattatagtaaaagtataaattattgtataagaaaaagtaacattt 36406945  T
Q  451 attgattg---tcttgctttgtgtaaaatgtcataaaatgacaattaaaaaggagcggaggta 510  Q
    ||||| ||   ||||| |||||||||||||||| ||| ||||| |||||||| | ||||||||    
T  36406946 attgagtgtcttcttggtttgtgtaaaatgtcaaaaagtgacagttaaaaagaaacggaggta 36407008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 115; E-Value: 8e-58
Query Start/End: Original strand, 236 - 513
Target Start/End: Original strand, 3310196 - 3310462
Alignment:
Q  236 tactcactccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttatttcaatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaactttaaatgttatttta 335  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||| |||  |||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||  | |||||    
T  3310196 tactccctccgttcctttttaagtgtctcttttggagattttttttgtttttatttaactgtcacttctaaagttcaatgcaacattaaataatgtttta 3310295  T
Q  336 tcaatattacccttagttatttattgtggagatagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggatattatggtaaaagtatcaattattgtatca 435  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||| || | |||||||||||||||||  ||||| |||||          |||| ||||    
T  3310296 tcaatattactcttagttatttattgcggagagagaaatatatgatataaaatattaaatgaataaggtcattatagtaaa----------attgcatca 3310385  T
Q  436 aaagtaataacatttattgattgtcttgctttgtgtaaaatgtcataaaatgacaattaaaaaggagcggaggtagta 513  Q
    |||||||||| | ||||||||||||||| |||| ||||||||||| || |||||| |||||||||| |||||||||||    
T  3310386 aaagtaataata-ttattgattgtcttggtttgcgtaaaatgtcaaaatatgacagttaaaaaggaacggaggtagta 3310462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 114; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 234 - 499
Target Start/End: Complemental strand, 7477463 - 7477198
Alignment:
Q  234 tatactcactccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttatttcaatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaactttaaatgttattt 333  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||| || | |||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||| |||    
T  7477463 tatactccctcagttcctttttaagtgtctcttttgaagaaaatttttgttcctatttaactgttactttcaaagttcaatgcaatattaaatgttgttt 7477364  T
Q  334 tatcaatattacccttagttatttattgtggagatagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggatattatggtaaaagtatcaattattgtat 433  Q
    || | |||||| |||||||||||||||  | ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||| |||||||||| | |||||| ||    
T  7477363 taccgatattatccttagttatttattacgaagagagaaatatatgaaatgagatattaaattaataaggtcattatagtaaaagtataacttattgcat 7477264  T
Q  434 caaaagtaataacatttattgattgtcttgctttgtgtaaaatgtcataaaatgacaattaaaaag 499  Q
    |||||||| ||||| | ||||| | ||||  ||| |||||||||||| ||  | ||||||||||||    
T  7477263 caaaagtagtaacaatcattgactatcttagtttatgtaaaatgtcaaaatgtaacaattaaaaag 7477198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 114; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 236 - 513
Target Start/End: Complemental strand, 33922037 - 33921760
Alignment:
Q  236 tactcactccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttatttcaatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaactttaaatgttatttta 335  Q
    ||||| ||| |||| |||||||||||| |||||| ||||| ||| | || | |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||    
T  33922037 tactccctcagttcatttttaagtgtctcttttgaagaaaatttgtgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattgaatgttgtttta 33921938  T
Q  336 tcaatattacccttagttatttattgtggagatagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggatattatggtaaaagtatcaattattgtatca 435  Q
     | |||||| ||||| |||||||||  | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||| ||| | |||||| ||||    
T  33921937 ccgatattatccttaattatttattacgaagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaaatataatttattgcatca 33921838  T
Q  436 aaagtaataacatttattgattgtcttgctttgtgtaaaatgtcataaaatgacaattaaaaaggagcggaggtagta 513  Q
    |||||| ||||| | ||||| | ||||  ||| |||||||||| | ||  |||||||||||||||| |||||||||||    
T  33921837 aaagtagtaacaatcattgactatcttagtttatgtaaaatgttaaaatgtgacaattaaaaaggaacggaggtagta 33921760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 113; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 247 - 499
Target Start/End: Complemental strand, 29497786 - 29497534
Alignment:
Q  247 ttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttatttcaatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaactttaaatgttattttatcaatattacc 346  Q
    ||||| ||||| |||||||||| ||||||  ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||       
T  29497786 ttcctatttaactgtcactttttgagaaaaattttattcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttatcaatattgtt 29497687  T
Q  347 cttagttatttattgtggagatagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggatattatggtaaaagtatcaattattgtatcaaaagtaataac 446  Q
    ||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||   |||| | || ||||||| || |    
T  29497686 cttcgttatttattgcggagagagaaatatatgaaataagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtatagcttatggcataaaaagtagtatc 29497587  T
Q  447 atttattgattgtcttgctttgtgtaaaatgtcataaaatgacaattaaaaag 499  Q
    | || ||||||||| || |||||||||||||||| ||  ||| ||||||||||    
T  29497586 aattgttgattgtcctggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgataattaaaaag 29497534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 112; E-Value: 5e-56
Query Start/End: Original strand, 243 - 514
Target Start/End: Original strand, 8264934 - 8265207
Alignment:
Q  243 tccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttatttcaatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaact----ttaaatgttattttatca 338  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||     ||||||||| |||||  |    
T  8264934 tccgttcctttttaagtgtcacttttagagaaaatttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaaccaacattaaatgttgttttacta 8265033  T
Q  339 atattacccttagttatttattgtggagatagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggatattatggtaaaagtatcaattattgtatcaaaa 438  Q
    |||||| |||||||||||||||| ||||| ||| |||| |  ||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||| |||   |||||| |||||||    
T  8265034 atattatccttagttatttattgcggagagagagatatgt--aatgagatattaaattaataaggttattatagtaaaaatatagtttattgcatcaaaa 8265131  T
Q  439 gtaataacatttattgattgtcttgctttgtgtaaaatgtcataaaatgacaattaaaaaggagcggaggtagtaa 514  Q
    | | || || || |||||||||||| |||||||||||| ||| ||  ||||||||||||| || ||||||||||||    
T  8265132 ggagtatcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatttcaaaatgtgacaattaaaaaagaacggaggtagtaa 8265207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 112; E-Value: 5e-56
Query Start/End: Original strand, 242 - 489
Target Start/End: Complemental strand, 46286102 - 46285855
Alignment:
Q  242 ctccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttatttcaatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaactttaaatgttattttatcaata 341  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||   |||||||||||||||||||||||||||||||   ||||| || ||||| ||| |    
T  46286102 ctccgttcttttttaactgtcacttttggagaaattttttgttcttatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaagaataaatattgttttaccaaca 46286003  T
Q  342 ttacccttagttatttattgtggagatagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggatattatggtaaaagtatcaattattgtatcaaaagta 441  Q
    |||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||| | ||||||||| | ||||| || ||| |||||||||| ||||| ||||| | ||  |    
T  46286002 ttacccttagttatttattgcgtagagagaaatatatgaaataaaatattaaattactaaggctaatatagtaaaagtataaattactgtataagaaaaa 46285903  T
Q  442 ataacatttattgattgtcttgctttgtgtaaaatgtcataaaatgac 489  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||| ||| ||||    
T  46285902 ataacatttattgagtgtcttggtttgtataaaatgtcaaaaagtgac 46285855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 110; E-Value: 7e-55
Query Start/End: Original strand, 233 - 514
Target Start/End: Complemental strand, 41675452 - 41675172
Alignment:
Q  233 ttatactcactccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttatttcaatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaactttaaatgttatt 332  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||    ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||    
T  41675452 ttatactccctccgttcctttttaagtgtcacttttgcagaaaatttttgttcttgtttaactgtcactttcaaagttcaatgtaacattaaatgttgtt 41675353  T
Q  333 ttatcaatattacccttagttatttattgtggagatagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggatattatggtaaaagtatcaattattgta 432  Q
    ||| |||||||| ||||||||||||||||   ||| | |||||||| |||| | |||||||||||||||||   |||| |||||| |||   |||||| |    
T  41675352 ttaccaatattatccttagttatttattgcaaagaaataaatatattaaataaaatattaaatgaataaggtcgttatagtaaaactatagcttattgca 41675253  T
Q  433 tcaaaagtaataacatttattgattgtcttgctttgtgtaaaatgtcataaaatgacaattaaaaaggagcggaggtagtaa 514  Q
    |||||| | | | || ||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||  |||||||||||||||| | ||||||||||    
T  41675252 tcaaaaat-agatcaattattgattgtcttggtttatgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaacagaggtagtaa 41675172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 107; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 280 - 478
Target Start/End: Complemental strand, 36648224 - 36648026
Alignment:
Q  280 ttatttcaatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaactttaaatgttattttatcaatattacccttagttatttattgtggagatagaaatatatg 379  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||  ||||| |||||||||||    
T  36648224 ttatttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaatattaaatgttaatttatcaatattatccttagctatttatttcggagagagaaatatatg 36648125  T
Q  380 aaatgagatattaaatgaataaggatattatggtaaaagtatcaattattgtatcaaaagtaataacatttattgattgtcttgctttgtgtaaaatgt 478  Q
    ||||||||| |||||| || ||||  ||||| ||||||| || | |||||| ||||||||||| || | ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  36648124 aaatgagatgttaaattaacaaggtcattatagtaaaagcataacttattgcatcaaaagtaaaaataattattgattgtcttggtttgtgtaaaatgt 36648026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 105; E-Value: 7e-52
Query Start/End: Original strand, 235 - 499
Target Start/End: Complemental strand, 31399195 - 31398932
Alignment:
Q  235 atactcactccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttatttcaatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaactttaaatgttatttt 334  Q
    |||||| |||| ||||||||||||| ||| |||||||||||   ||| ||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  31399195 atactccctccattcctttttaagtatcatttttggagaaaaaatttgtttctttttaattgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgtttt 31399096  T
Q  335 atcaatattacccttagttatttattgtggagatagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggatattatggtaaaagtatcaattattgtatc 434  Q
    | |||||||| | |||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||| ||||||||||   ||||| ||||    
T  31399095 accaatattatctttagttatttattgaggagagataaatatatgaaatgagata-taaatgaataaggtcattatagtaaaagtatagtttattatatc 31398997  T
Q  435 aaaagtaataacatttattgattgtcttgctttgtgtaaaatgtcataaaatgacaattaaaaag 499  Q
    ||||||| || || || || ||||||||| ||| |||||||||  | ||  ||||||||||||||    
T  31398996 aaaagtagtatcaatttttaattgtcttggtttatgtaaaatgctaaaatgtgacaattaaaaag 31398932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 105; E-Value: 7e-52
Query Start/End: Original strand, 233 - 501
Target Start/End: Complemental strand, 43874348 - 43874081
Alignment:
Q  233 ttatactcactccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttatttcaatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaactttaaatgttatt 332  Q
    ||||||||  |||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||| || | ||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||    
T  43874348 ttatactccatccgtttctttttaagtgtcacttttagagaatttttttgttcctatttaactgtcactttcgaaattcaatgcaacattaaatgttatt 43874249  T
Q  333 ttatcaatattacccttagttatttattgtggagatagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggatattatggtaaaagtatcaattattgta 432  Q
    ||  |||||||| | ||| ||||||||||  || | ||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||| |||||| |||||||  |  ||| |||||    
T  43874248 ttgccaatattatcattacttatttattgcagata-agaaatacatgaaattagatattcaatgaataaggttattatagtaaaagagtatattgttgta 43874150  T
Q  433 tcaaaagtaataacatttattgattgtcttgctttgtgtaaaatgtcataaaatgacaattaaaaagga 501  Q
    ||||||||| ||||||||||||| ||| ||  || ||||||||||||| |||  ||| |||||||||||    
T  43874149 tcaaaagtagtaacatttattgaatgtatttgttcgtgtaaaatgtcaaaaagagaccattaaaaagga 43874081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 102; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 242 - 510
Target Start/End: Original strand, 24283568 - 24283833
Alignment:
Q  242 ctccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttatttcaatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaactttaaatgttattttatcaata 341  Q
    ||||||||||||||||  ||||||| | ||||||   ||| || | ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||    
T  24283568 ctccgttcctttttaacggtcacttctagagaaaaaatttgttcctatttacctgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgatgttttatcaata 24283667  T
Q  342 ttacccttagttatttattgtggagatagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggatattatggtaaaagtatcaattattgtatcaaaagta 441  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||  ||||| |||| || ||| ||||||||| || || |  ||||| |||||||||  ||| ||| |||||||||||    
T  24283668 ttacccttagatatttattgcggag--agaaacatataaattgaaatattaaattaacaaagtcattatagtaaaagta-aaataattatatcaaaagta 24283764  T
Q  442 ataacatttattgattgtcttgctttgtgtaaaatgtcataaaatgacaattaaaaaggagcggaggta 510  Q
     ||||||||||| ||||||||  ||||||||||| || | |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  24283765 gtaacatttattaattgtcttagtttgtgtaaaaggtaaaaaaatgacaattaaaaaggaacggaggta 24283833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 101; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 305 - 513
Target Start/End: Complemental strand, 5732267 - 5732059
Alignment:
Q  305 aaagttcaatgcaactttaaatgttattttatcaatattacccttagttatttattgtggagatagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataagga 404  Q
    ||||||||||||||| ||||||| | ||||| |||||||| |||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||     
T  5732267 aaagttcaatgcaacattaaatgctgttttaccaatattatccttagttatttatttcggagagagaaatatatgaaatgagattttaaatgaataaggt 5732168  T
Q  405 tattatggtaaaagtatcaattattgtatcaaaagtaataacatttattgattgtcttgctttgtgtaaaatgtcataaaatgacaattaaaaaggagcg 504  Q
     ||||| |||||||||  | |||||| |||||||||| ||||| | ||||| | ||||| ||| |||||||||||| ||  |||||||||||||||| ||    
T  5732167 cattatagtaaaagtacaacttattgcatcaaaagtagtaacaatcattgactatcttggtttatgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaacg 5732068  T
Q  505 gaggtagta 513  Q
    |||||||||    
T  5732067 gaggtagta 5732059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 101; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 242 - 514
Target Start/End: Complemental strand, 29722561 - 29722290
Alignment:
Q  242 ctccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttatttcaatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaactttaaatgttattttatcaata 341  Q
    |||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||  | |||||| ||||||||| | ||||||||||  ||||||||| |||||  ||||    
T  29722561 ctccattcctttttaatcgtcacttttggagaaattttttgtttatacttaactttcactttcataattcaatgcaatattaaatgttgttttactaata 29722462  T
Q  342 ttacccttagttatttattgtggagatagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggatattatggtaaaagtatcaattattgtatcaaaagta 441  Q
    ||  ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |  ||||| |||||||||| | |||||| ||||||||||    
T  29722461 ttgtccttaattatttattgcggagatagaaatatatgaaataagatattaaataaataa-gtcattatagtaaaagtataacttattgcatcaaaagta 29722363  T
Q  442 ataacatttattgattgtcttgctttgtgtaaaatgtcataaaatgacaattaaaaaggagcggaggtagtaa 514  Q
     || |  || |||||||||||| |||| ||||||||| | ||  ||||||||| |||||| | ||||||||||    
T  29722362 gtatcgattgttgattgtcttggtttgcgtaaaatgttaaaatgtgacaattataaaggaacagaggtagtaa 29722290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 100; E-Value: 7e-49
Query Start/End: Original strand, 370 - 513
Target Start/End: Original strand, 47408227 - 47408370
Alignment:
Q  370 gaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggatattatggtaaaagtatcaattattgtatcaaaagtaataacatttattgattgtcttgctttgt 469  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||    
T  47408227 gaaatatatgaaatgaaatattaaatgaataaggttattatagtaaaagtatatattattgtatcaaaagtagtaacatttattgaatgtcttggtttgt 47408326  T
Q  470 gtaaaatgtcataaaatgacaattaaaaaggagcggaggtagta 513  Q
    ||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  47408327 gtaaaatgtcaaaaagtgacaattaaaaaggaacggaggtagta 47408370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 98; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 232 - 501
Target Start/End: Original strand, 3177906 - 3178175
Alignment:
Q  232 attatactcactccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttatttcaatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaactttaaatgttat 331  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||  |||| |||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| |    
T  3177906 attatactccctccgttcctttttaattgtcacttttacagaatttttttgtttctaattaactgtcactttcaaagttcaatacaacattaaatgttgt 3178005  T
Q  332 tttatcaatattacccttagttatttattgtggagatagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggatattatggtaaaagtatcaattattgt 431  Q
    |||  |  |||||||||| |||||||||||  |||| |||||||||||||| || |||||||||||  |||| |||||| | ||||  || |||| ||||    
T  3178006 tttgccgttattacccttggttatttattgcagagagagaaatatatgaaaagatatattaaatgacgaaggttattatagaaaaaagataaattgttgt 3178105  T
Q  432 atcaaaagtaataacatttattgattgtcttgctttgtgtaaaatgtcataaaatgacaattaaaaagga 501  Q
    |||||||||| ||| || || |  |||||||| ||||||| |||  ||  ||| ||||||||||||||||    
T  3178106 atcaaaagtagtaaaatgtaattgttgtcttggtttgtgtcaaaaatctaaaagtgacaattaaaaagga 3178175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 98; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 245 - 513
Target Start/End: Original strand, 47459633 - 47459895
Alignment:
Q  245 cgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttatttcaatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaactttaaatgttattttat-caatatt 343  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||   |||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||| || |||| | |||||||    
T  47459633 cgtttctttttaagtgtcacttttggagaaattttttgttcatatttaactgtcattttcgaagttcaatgcaacattaaatatttttttttccaatatt 47459732  T
Q  344 acccttagttatttattgtggagatagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggatattatggtaaaagtatcaattattgtatcaaaagtaat 443  Q
    | ||||  | |||||||||||||  |||||||||| |||||| ||||||||| ||||||| |||||| |||||| |||  |||||||| ||||           
T  47459733 atccttgctcatttattgtggag--agaaatatatcaaatgaaatattaaataaataaggttattatagtaaaaatatatattattgt-tcaa----tgc 47459825  T
Q  444 aacatttattgattgtcttgctttgtgtaaaatgtcataaaatgacaattaaaaaggagcggaggtagta 513  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  47459826 aacatttattgaatgtcttgatttgtgtaaaatatcaaaaaataacaattaaaaaggaacggaggtagta 47459895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 96; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 331 - 514
Target Start/End: Original strand, 8381901 - 8382084
Alignment:
Q  331 ttttatcaatattacccttagttatttattgtggagatagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggatattatggtaaaagtatcaattattg 430  Q
    |||||| ||||||  |||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||   ||||||    
T  8381901 ttttattaatattgtccttagttatttattgcggggagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtatatcttattg 8382000  T
Q  431 tatcaaaagtaataacatttattgattgtcttgctttgtgtaaaatgtcataaaatgacaattaaaaaggagcggaggtagtaa 514  Q
     ||||||||||||| || || |||||||||||| |||||||||||||||| ||  ||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  8382001 catcaaaagtaatatcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgataattaaaaaggaacggaggtagtaa 8382084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 95; E-Value: 6e-46
Query Start/End: Original strand, 236 - 513
Target Start/End: Original strand, 1553495 - 1553770
Alignment:
Q  236 tactcactccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttatttcaatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaactttaaatgttatttta 335  Q
    ||||| ||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| || |||||    
T  1553495 tactccctccgttcctttttaatcgtctcttttggagaaattttttgttcctatttaactgtcactttcgaagttcaatgcaacattaaatattgtttta 1553594  T
Q  336 tcaatattacccttagttatttattgtggagatagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggatattatggtaaaagtatcaattattgtatca 435  Q
     |||||||| ||||| ||||||||  |  ||| |||||| |||||| | ||  ||||||||||||||| |||||| |||||| |||  ||| || |||||    
T  1553595 ccaatattatccttacttatttat--tacagagagaaatgtatgaagttagtgattaaatgaataaggttattatagtaaaaatatgcattgttctatca 1553692  T
Q  436 aaagtaataacatttattgattgtcttgctttgtgtaaaatgtcataaaatgacaattaaaaaggagcggaggtagta 513  Q
    |||||| ||||||||||| | | | ||| ||||| |||||| || |||| ||||| ||||||| || |||| ||||||    
T  1553693 aaagtagtaacatttattaaatatattggtttgtataaaatatcttaaagtgacacttaaaaaagaacggatgtagta 1553770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 90; E-Value: 6e-43
Query Start/End: Original strand, 242 - 478
Target Start/End: Original strand, 45324014 - 45324243
Alignment:
Q  242 ctccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttatttcaatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaactttaaatgttattttatcaata 341  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||||    || |||| | |||||||||||    
T  45324014 ctccgttccttttcaagtgtctcttttggagaatttttttgtttctatttaactgttactttcaaagttcaatgc----ttgaatgatgttttatcaata 45324109  T
Q  342 ttacccttagttatttattgtggagatagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggatattatggtaaaagtatcaattattgtatcaaaagta 441  Q
    |||| |||| |||||||||| ||||| |||||||||| |||| ||||||||||| |||||    |||||  ||||||||| | |||||| ||||||| ||    
T  45324110 ttactcttaattatttattgcggagagagaaatatataaaataagatattaaataaataaaatcattataataaaagtataacttattgcatcaaaaata 45324209  T
Q  442 ataacatttattgattgtcttgctttgtgtaaaatgt 478  Q
    ||||   | ||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  45324210 ataa---taattgattgtattggtttgtgtaaaatgt 45324243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 89; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 234 - 513
Target Start/End: Complemental strand, 8966165 - 8965886
Alignment:
Q  234 tatactcactccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttatttcaatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaactttaaatgttattt 333  Q
    ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| | |||  |||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||| |||||  || |||    
T  8966165 tatactccctccgttcctttttaattgtcacttttgcataaaaattttgtttctaattaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaacattgttt 8966066  T
Q  334 tatcaatattacccttagttatttattgtggagatagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggatattatggtaaaagtatcaattattgtat 433  Q
    || |  ||||||||||  ||||||||||| |||| ||||||| ||||||| |||||||||||||  |||| |||||| | ||||  || |||| ||||||    
T  8966065 tacctttattacccttgattatttattgtagagagagaaatacatgaaataagatattaaatgatgaaggttattataggaaaaagatgaattgttgtat 8965966  T
Q  434 caaaagtaataacatttattgattgtcttgctttgtgtaaaatg-tcataaaatgacaattaaaaaggagcggaggtagta 513  Q
    |||||||| ||| |  ||||  |||||||| |||| ||||||   ||| ||| |||||||||||||||| |||||| ||||    
T  8965965 caaaagtagtaaaaagtatttgttgtcttggtttgcgtaaaaaactca-aaagtgacaattaaaaaggaacggagggagta 8965886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 88; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 236 - 402
Target Start/End: Original strand, 6799103 - 6799270
Alignment:
Q  236 tactcactccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttatttcaatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaactttaaatgttatttta 335  Q
    ||||| |||| ||| ||||||||||||  ||||||||||||||||| ||   |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  6799103 tactccctccattcatttttaagtgtctgttttggagaaattttttgttctcatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgtttta 6799202  T
Q  336 tcaatattacccttagttatttattgtggagatagaaatatatgaaatgagat-attaaatgaataag 402  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||  ||||| |||||||||| |||||| || ||||||||||||||    
T  6799203 tcaatattatccttaattatttattacggagagagaaatatataaaatgatataattaaatgaataag 6799270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 87; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 242 - 507
Target Start/End: Complemental strand, 46563380 - 46563115
Alignment:
Q  242 ctccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttatttcaatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaactttaaatgttattttatcaata 341  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||  | ||||||||||||||||||||||| | |||| |||||| || ||||  || ||    
T  46563380 ctccgttcctttttaattgtcacttttgcagaaattttttgtttataattaactgtcactttcaaagttcagtacaacattaaatattgttttgacatta 46563281  T
Q  342 ttacccttagttatttattgtggagatagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggatattatggtaaaagtatcaattattgtatcaaaagta 441  Q
    ||||||||  ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||| | ||||  |  |||| || |||||||||||    
T  46563280 ttacccttgattatttattgtagagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaggaaggttattataggaaaaagaaaaattgttatatcaaaagta 46563181  T
Q  442 ataacatttattgattgtcttgctttgtgtaaaatgtcataaaa-tgacaattaaaaaggagcggag 507  Q
     ||| ||  |||  ||||||||  ||||||||||   ||||||| ||||||||||||| || |||||    
T  46563180 gtaaaatgcatttgttgtcttgtattgtgtaaaa-aacataaaagtgacaattaaaaatgaacggag 46563115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 86; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 236 - 501
Target Start/End: Complemental strand, 19328049 - 19327789
Alignment:
Q  236 tactcactccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttatttcaatttaactgtcacttt-caaagttcaatgcaactttaaatgttatttt 334  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||||  |||||||||  |||||| || | |||||| ||||| ||| || ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  19328049 tactccctccgtttctttttaagtgtcttttttggagattttttttgttcctatttaaatgtcattttacatagttcaatgcaacattaaatgttatttt 19327950  T
Q  335 atcaatattacccttagttatttattgtggagatagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggatattatggtaaaagtatcaattattgtatc 434  Q
    |  |||||||| |||| ||| ||| |||||||  ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| || |||    ||| ||  ||||||||||||    
T  19327949 actaatattactcttattta-ttactgtggagggagaaatatatgtaatgagatattaaataaataaggtta-tat----aaaataaaaattattgtatc 19327856  T
Q  435 aaaagtaataacatttattgattgtcttgctttgtgtaaaatgtcataaaatgacaattaaaaagga 501  Q
    |||||||  || ||||||||||||| ||| |||||||||||||| | ||  ||||||||||||||||    
T  19327855 aaaagtagcaatatttattgattgttttggtttgtgtaaaatgttaaaatgtgacaattaaaaagga 19327789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 82; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 295 - 462
Target Start/End: Complemental strand, 22057620 - 22057447
Alignment:
Q  295 tgtcactttcaaagttcaatgcaactttaaatgttattttatcaatattacccttagttatttatt-----gtg-gagatagaaatatatgaaatgagat 388  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||     | | |||| ||||||||||||||  ||||    
T  22057620 tgtcactttcaaagttcaatgcaatattaaatgttgttttagcaatattacccttagttatttattacagagagagagagagaaatatatgaaacaagat 22057521  T
Q  389 attaaatgaataaggatattatggtaaaagtatcaattattgtatcaaaagtaataacatttattgattgtctt 462  Q
    ||||||||||| ||| |||||| | ||||  |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22057520 attaaatgaatgaggctattattgaaaaatgacaaattattgtatcaaaagtaataacatttattgattgtctt 22057447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 82; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 245 - 480
Target Start/End: Complemental strand, 37354113 - 37353889
Alignment:
Q  245 cgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttatttcaatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaactttaaatgttattttatcaatatta 344  Q
    |||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||  |   |||||||||||||||||||||||||||||           || ||||| ||||||||    
T  37354113 cgttcctttttaagtgtctcttttgaagaaattatttgatcatatttaactgtcactttcaaagttcaatgc-----------ttgttttaccaatatta 37354025  T
Q  345 cccttagttatttattgtggagatagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggatattatggtaaaagtatcaattattgtatcaaaagtaata 444  Q
     |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||  ||||| |||||| | | | |||||| |||| ||||| ||    
T  37354024 tccttagttatttattgtggagagagaaatatatgaaatgaaatgttaaatgaataaggtcattatagtaaaaatgtaacttattgcatcagaagtagta 37353925  T
Q  445 acatttattgattgtcttgctttgtgtaaaatgtca 480  Q
    ||| ||||||||||| ||| ||  ||||||||||||    
T  37353924 acaattattgattgttttgattcatgtaaaatgtca 37353889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 82; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 321 - 513
Target Start/End: Complemental strand, 38168967 - 38168774
Alignment:
Q  321 ttaaatgttattttatcaatattacccttagttatttattgtggagatagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggatattatggtaaaagta 420  Q
    |||| |||| ||||| |||||||| |||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||  ||||||||    
T  38168967 ttaagtgttgttttaccaatattatccttagttatttattacggagagagaaatatatgaaatgagatgttaaatgaataaggtcattataataaaagta 38168868  T
Q  421 tcaattattgtatcaaaagtaataac-atttattgattgtcttgctttgtgtaaaatgtcataaaatgacaattaaaaaggagcggaggtagta 513  Q
    | | |||||| ||||||| || |||| | ||| ||||||||||| |||||||||||| | | ||| |||||||||||||| | |||||||||||    
T  38168867 taacttattgcatcaaaaatagtaacaaattaatgattgtcttggtttgtgtaaaatattaaaaagtgacaattaaaaagaaacggaggtagta 38168774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 78; E-Value: 9e-36
Query Start/End: Original strand, 341 - 514
Target Start/End: Complemental strand, 8380750 - 8380577
Alignment:
Q  341 attacccttagttatttattgtggagatagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggatattatggtaaaagtatcaattattgtatcaaaagt 440  Q
    ||||||||||||||||||||  || || ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||  ||||||||||| | ||      
T  8380750 attacccttagttatttattacggggagagaaatatatgaaataagatattaaatgactaaggttattatagtaaaagtaaaaattattgtataagaaaa 8380651  T
Q  441 aataacatttattgattgtcttgctttgtgtaaaatgtcataaaatgacaattaaaaaggagcggaggtagtaa 514  Q
      ||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||| |||  |||| |||||||||| ||||||||||||    
T  8380650 ggtaacatttattgagtgtcttggtttgtgtaaaatatcaaaaatggacagttaaaaaggaacggaggtagtaa 8380577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 78; E-Value: 9e-36
Query Start/End: Original strand, 288 - 501
Target Start/End: Complemental strand, 34368870 - 34368658
Alignment:
Q  288 atttaactgtcactttcaaagttcaatgcaactttaaatgttattttatcaatattacccttagttatttattgtggagatagaaatatatgaaatgaga 387  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||| |||||||||| ||   ||||||||| | ||| | ||| ||||||||||| |    
T  34368870 atttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacaataaatgttgttttaccaatattacctttgaatatttattgcgaagagaaaaacatatgaaatgaaa 34368771  T
Q  388 tattaaatgaataaggatattatggtaaaagtatcaattattgtatcaaaagtaataacatttattgattgtcttgctttgtgtaaaatgtcataaaatg 487  Q
    |||||||| |||||||  |||   |||||||||  ||  ||||||||||||||||||| | ||||| ||| ||||  |||||||||||| ||| ||| ||    
T  34368770 tattaaattaataaggtcattgcagtaaaagtaaaaacaattgtatcaaaagtaataata-ttattaattttcttaatttgtgtaaaatatcaaaaagtg 34368672  T
Q  488 acaattaaaaagga 501  Q
    ||||||||||||||    
T  34368671 acaattaaaaagga 34368658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #59
Raw Score: 77; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 235 - 403
Target Start/End: Original strand, 42880946 - 42881114
Alignment:
Q  235 atactcactccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttatttcaatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaactttaaatgttatttt 334  Q
    ||||||| |||| || |||||||||||   ||||||||||| ||||| |||| |||||||| |||||||  ||| |||||||||| ||||||||| ||||    
T  42880946 atactcattccgctcttttttaagtgttttttttggagaaaatttttgtttctatttaactatcactttttaaggtcaatgcaacattaaatgttgtttt 42881045  T
Q  335 atcaatattacccttagttatttattgtggagatagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataagg 403  Q
    |||||||||| |||| |||||| |||| ||||| |||||||||| |||| |||| ||||||||||||||    
T  42881046 atcaatattatccttggttattgattgcggagagagaaatatataaaattagatgttaaatgaataagg 42881114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #60
Raw Score: 77; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 236 - 514
Target Start/End: Complemental strand, 48981643 - 48981364
Alignment:
Q  236 tactcactccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttatttcaatttaactgtca-ctttcaaagttcaatgcaactttaaatgttatttt 334  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||| |||| | ||| |||||| |||||||||||||||  ||| ||||||||| ||||    
T  48981643 tactctctccgttcctttttaattgtcacttttgcagaatttttttgtttctaattacctgtcaactttcaaagttcaatataacattaaatgttgtttt 48981544  T
Q  335 atcaatattacccttagttatttattgtggagatagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggatattatggtaaaagtatcaattattgtatc 434  Q
      |  ||||||||||||||||||||||  |||||  ||||||||||||  | |||||||||||  |||| |||||| | ||||  || |||| |||||||    
T  48981543 gcctttattacccttagttatttattgcagagatgaaaatatatgaaaaaaaatattaaatgatgaaggttattataggaaaaagataaattgttgtatc 48981444  T
Q  435 aaaagtaataacatttattgattgtcttgctttgtgt-aaaatgtcataaaatgacaattaaaaaggagcggaggtagtaa 514  Q
    ||||||| ||| || || |  |||||||| ||||||| ||||  ||| ||| |||||||||||||||| | |||| |||||    
T  48981443 aaaagtagtaaaatgtaattgttgtcttggtttgtgtcaaaaactca-aaagtgacaattaaaaaggaacagaggaagtaa 48981364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #61
Raw Score: 73; E-Value: 9e-33
Query Start/End: Original strand, 283 - 510
Target Start/End: Complemental strand, 44820813 - 44820596
Alignment:
Q  283 tttcaatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaactttaaatgttattttatcaatattacccttagttatttattgtggagatagaaatatatgaaa 382  Q
    |||| |||||||||| | ||| ||||||||||||||| ||||||  | |||||||||||||||  |||||||||||||  ||||| | ||||||||||||    
T  44820813 tttctatttaactgttatttttaaagttcaatgcaacattaaataatgttttatcaatattacatttagttatttatttcggagagaaaaatatatgaaa 44820714  T
Q  383 tgagatattaaatgaataaggatattatggtaaaagtatcaattattgtatcaaaagtaataacatttattgattgtcttgctttgtgtaaaatgtcata 482  Q
    | | ||||||||||||||||| |||||| |||||          || | |||||||||| ||| | ||||||||||||||| ||||| |||||||||| |    
T  44820713 taaaatattaaatgaataaggttattatagtaaa----------atggcatcaaaagtagtaataattattgattgtcttggtttgtataaaatgtcaaa 44820624  T
Q  483 aaatgacaattaaaaaggagcggaggta 510  Q
    | |||||| ||||||| || ||||||||    
T  44820623 atatgacagttaaaaatgaacggaggta 44820596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #62
Raw Score: 68; E-Value: 8e-30
Query Start/End: Original strand, 242 - 441
Target Start/End: Complemental strand, 17354283 - 17354084
Alignment:
Q  242 ctccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttatttcaatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaactttaaatgttattttatcaata 341  Q
    |||||||||||| ||| |||||||||| ||||||   | | ||   |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||  ||||    
T  17354283 ctccgttcctttataattgtcacttttagagaaaaaatatgttcatatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttacgaata 17354184  T
Q  342 ttacccttagttatttattgtggagatagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggatattatggtaaaagtatcaattattgtatcaaaagta 441  Q
    |||||||||| ||| ||||| | | | ||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||  |||||   |||||||  ||  |||||||||||||||    
T  17354183 ttacccttagatatatattgcgaaaagagaaacatatgaaatgaaatattaaattaataaggtcattataagaaaagtaaaaacaattgtatcaaaagta 17354084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #63
Raw Score: 67; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 236 - 506
Target Start/End: Complemental strand, 9602156 - 9601886
Alignment:
Q  236 tactcactccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttatttcaatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaactttaaatgttatttta 335  Q
    ||||| |||||||||||| ||   |||||||||  | || |||||| |||| | |||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||     
T  9602156 tactccctccgttcctttatacccgtcacttttacataatttttttgtttctaattaagtgtcactttcaaagttcaatgtaacattaaatgttgttttt 9602057  T
Q  336 tcaatattacccttagttatttattgtggagatagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggatattatggtaaaagtatcaattattgtatca 435  Q
     | ||| | |||||||| ||||||||  |||| ||||||||| |||||  |||||||||| | ||||||||||||    |||  || | |||||||||||    
T  9602056 cctataatgcccttagtaatttattgcagagagagaaatataagaaatatgatattaaataattaaggatattataagcaaaccataagttattgtatca 9601957  T
Q  436 aaagtaataacatttattgattgtcttgctttgtgtaaaatgtcataaaatgacaattaaaaaggagcgga 506  Q
    |||||| | | ||  ||| | ||||||| ||||||||||| |||| ||  |||||||||||||||| ||||    
T  9601956 aaagtagtgaaatacatttaatgtcttggtttgtgtaaaaagtcaaaatgtgacaattaaaaaggaacgga 9601886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #64
Raw Score: 67; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 236 - 506
Target Start/End: Complemental strand, 9829727 - 9829457
Alignment:
Q  236 tactcactccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttatttcaatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaactttaaatgttatttta 335  Q
    ||||| |||||||||||| ||   |||||||||  | || |||||| |||| | |||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||     
T  9829727 tactccctccgttcctttatacccgtcacttttacataatttttttgtttctaattaagtgtcactttcaaagttcaatgtaacattaaatgttgttttt 9829628  T
Q  336 tcaatattacccttagttatttattgtggagatagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggatattatggtaaaagtatcaattattgtatca 435  Q
     | ||| | |||||||| ||||||||  |||| ||||||||| |||||  |||||||||| | ||||||||||||    |||  || | |||||||||||    
T  9829627 cctataatgcccttagtaatttattgcagagagagaaatataagaaatatgatattaaataattaaggatattataagcaaaccataagttattgtatca 9829528  T
Q  436 aaagtaataacatttattgattgtcttgctttgtgtaaaatgtcataaaatgacaattaaaaaggagcgga 506  Q
    |||||| | | ||  ||| | ||||||| ||||||||||| |||| ||  |||||||||||||||| ||||    
T  9829527 aaagtagtgaaatacatttaatgtcttggtttgtgtaaaaagtcaaaatgtgacaattaaaaaggaacgga 9829457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #65
Raw Score: 67; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 246 - 475
Target Start/End: Complemental strand, 26803683 - 26803454
Alignment:
Q  246 gttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttatttcaatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaactttaaatgttattttatcaatattac 345  Q
    ||||||||||||  |||||||||| |||| |||||| |||  | ||||||||| |||| |||||||||| |||| |||||| || ||||  |  ||||||    
T  26803683 gttcctttttaatagtcacttttgcagaatttttttgtttttaattaactgtcgcttttaaagttcaatacaacattaaatattgttttccccttattac 26803584  T
Q  346 ccttagttatttattgtggagatagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggatattat-ggtaaaagtatcaattattgtatcaaaagtaata 444  Q
    ||||  |||||||| || |||| |||||||||| ||||||||||||||||||  |||| |||||| || ||||| || |||| |||||||||||||| ||    
T  26803583 ccttgattatttatcgtagagagagaaatatataaaatgagatattaaatgatgaaggttattatagggaaaag-atgaattgttgtatcaaaagtagta 26803485  T
Q  445 acatttattgattgtcttgctttgtgtaaaa 475  Q
    | |  ||||  |||||||| |||||||||||    
T  26803484 aaaagtatttgttgtcttggtttgtgtaaaa 26803454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #66
Raw Score: 63; E-Value: 8e-27
Query Start/End: Original strand, 234 - 420
Target Start/End: Complemental strand, 22382339 - 22382153
Alignment:
Q  234 tatactcactccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttatt--tcaatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaactttaaatgttat 331  Q
    ||||||| ||||||||||||||||  ||||||||| ||||||   ||| ||  || | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | |    
T  22382339 tatactccctccgttcctttttaaccgtcacttttagagaaaaaatttgttcctctaattaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgatgt 22382240  T
Q  332 tttatcaatattacccttagttatttattgtggagatagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggatattatggtaaaagta 420  Q
    |||| |||||||| |||||| |||||||  || ||| ||||| ||||||| ||| ||||||||| || ||||  ||||| |||||||||    
T  22382239 tttaccaatattatccttagatatttat--tgcagagagaaacatatgaattgaaatattaaattaacaaggtcattatagtaaaagta 22382153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #67
Raw Score: 63; E-Value: 8e-27
Query Start/End: Original strand, 236 - 410
Target Start/End: Complemental strand, 30586939 - 30586765
Alignment:
Q  236 tactcactccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttatttcaatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaactttaaatgttatttta 335  Q
    ||||| ||||| || ||| ||| ||||||||||| | ||||||||| |||| | |||||| ||| ||| ||||| |||  || | |||||||||  ||||    
T  30586939 tactccctccgctcttttataattgtcacttttgcataaattttttgtttccaattaactttcatttttaaagtccaacacatcattaaatgttgattta 30586840  T
Q  336 tcaatattacccttagttatttattgtggagatagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggatattat 410  Q
    || ||||||||||||| |||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  30586839 tctatattacccttagatatttactgcagagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgattaaggttattat 30586765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #68
Raw Score: 56; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 245 - 393
Target Start/End: Complemental strand, 36339453 - 36339303
Alignment:
Q  245 cgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttatttcaatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaactttaa--atgttattttatcaatat 342  Q
    |||||||||||||||||| |||||| |||||  |||| |||  |||||| |||||||||||||||| |||||||  ||||  || || ||||| ||||||    
T  36339453 cgttcctttttaagtgtctcttttgtagaaaagttttgtttttatttaagtgtcactttcaaagtttaatgcaatattaaatatatttttttaccaatat 36339354  T
Q  343 tacccttagttatttattgtggagatagaaatatatgaaatgagatattaa 393  Q
    |||||||  ||||| ||| |||||| ||||||||||||||  |||||||||    
T  36339353 tacccttgattattaattatggagagagaaatatatgaaacaagatattaa 36339303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #69
Raw Score: 55; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 246 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 2408914 - 2408817
Alignment:
Q  246 gttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttatttcaatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaactttaaatgttattttatcaatatta 344  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||   ||| ||   |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||    
T  2408914 gttcctttttaagtgtcacttttggagaaaaaatttgttcttatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgtt-gtttatcaatatta 2408817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #70
Raw Score: 48; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 390 - 501
Target Start/End: Original strand, 24233668 - 24233779
Alignment:
Q  390 ttaaatgaataaggatattatggtaaaagtatcaattattgtatcaaaagtaataacatttattgattgtcttgctttgtgtaaaatgtcataaaatgac 489  Q
    |||||||||||||  |||||| |||||||| | |||| |||||| |||| || |||  |||||||| ||||||| ||| |||||||||| | ||||||||    
T  24233668 ttaaatgaataagattattatagtaaaagtgtaaattcttgtattaaaattagtaatttttattgaatgtcttgatttttgtaaaatgttaaaaaatgac 24233767  T
Q  490 aattaaaaagga 501  Q
    ||||||||||||    
T  24233768 aattaaaaagga 24233779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #71
Raw Score: 48; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 380 - 495
Target Start/End: Complemental strand, 41409987 - 41409872
Alignment:
Q  380 aaatgagatattaaatgaataaggatattatggtaaaagtatcaattattgtatcaaaagtaataacatttattgattgtcttgctttgtgtaaaatgtc 479  Q
    |||||| ||||||||| |||||||  |||||  ||||||||  ||  |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||      
T  41409987 aaatgaaatattaaattaataaggccattataataaaagtaaaaacaattgtatcaaaattaataacatttattaattgtcttgatttgtgtaaaatgat 41409888  T
Q  480 ataaaatgacaattaa 495  Q
    | ||| ||||||||||    
T  41409887 aaaaagtgacaattaa 41409872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #72
Raw Score: 47; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 244 - 382
Target Start/End: Original strand, 33071894 - 33072032
Alignment:
Q  244 ccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttatttcaatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaactttaaatgttattttatcaatatt 343  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||  |||| |||||| |||| | ||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||| ||||  | |||      
T  33071894 ccgttcctttataactgtcacttttacagaatttttttgtttctaattaactgtcactttcaaagtttaatgtaacattaaatgttgtttttcctataac 33071993  T
Q  344 acccttagttatttattgtggagatagaaatatatgaaa 382  Q
     |||||| | ||||||||  |||| ||||||||||||||    
T  33071994 gcccttaataatttattgcagagagagaaatatatgaaa 33072032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #73
Raw Score: 47; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 443 - 513
Target Start/End: Complemental strand, 41889050 - 41888980
Alignment:
Q  443 taacatttattgattgtcttgctttgtgtaaaatgtcataaaatgacaattaaaaaggagcggaggtagta 513  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||| ||||| |||||    
T  41889050 taacatttattgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcacaaagtgataattaaaaaggaacggagatagta 41888980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #74
Raw Score: 45; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 236 - 296
Target Start/End: Original strand, 47408118 - 47408178
Alignment:
Q  236 tactcactccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttatttcaatttaactg 296  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||    
T  47408118 tactccctccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttgttcctatttaactg 47408178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #75
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 427 - 498
Target Start/End: Complemental strand, 41408864 - 41408793
Alignment:
Q  427 attgtatcaaaagtaataacatttattgattgtcttgctttgtgtaaaatgtcataaaatgacaattaaaaa 498  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||  | ||| |||||||||||||    
T  41408864 attgtatcaaaattaataacatttattaattgtcttgatttgtgtaaaatgataaaaagtgacaattaaaaa 41408793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #76
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 290 - 441
Target Start/End: Complemental strand, 46715511 - 46715360
Alignment:
Q  290 ttaactgtcactttcaaagttcaatgcaactttaaatgttattttatcaatattacccttagttatttattgtggagatagaaatatatgaaatgagata 389  Q
    |||||||||  ||||||||| ||||| | | ||||||||  ||||||| ||||||||||||  |||||||||  |||| ||||||||||| ||| | |||    
T  46715511 ttaactgtcgttttcaaagtccaatgtatcattaaatgtggttttatctatattacccttatatatttattgctgagagagaaatatatggaataaaata 46715412  T
Q  390 ttaaatgaataaggatattatggtaaaagtatcaattattgtatcaaaagta 441  Q
    |||||| | ||||| |||||| | ||||  || |||| |||||| |||||||    
T  46715411 ttaaattattaaggttattataggaaaaagataaattgttgtatgaaaagta 46715360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #77
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 233 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 13431397 - 13431311
Alignment:
Q  233 ttatactcactccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttatttcaatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaac 319  Q
    |||||||| |||||||| ||||||| |||||||||| ||||||   ||| || | |||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  13431397 ttatactccctccgttcttttttaattgtcacttttagagaaaaaatttgttcctatttaactgtcactttcaaaattcaatgcaac 13431311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #78
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 435 - 513
Target Start/End: Complemental strand, 17896555 - 17896477
Alignment:
Q  435 aaaagtaataacatttattgattgtcttgctttgtgtaaaatgtcataaaatgacaattaaaaaggagcggaggtagta 513  Q
    ||||||| || || || |||||||||||| |||||||||||||||| ||  |||||||||||||||| |||||||||||    
T  17896555 aaaagtagtatcaattgttgattgtcttgatttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaacggaggtagta 17896477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #79
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 423 - 501
Target Start/End: Original strand, 36340553 - 36340631
Alignment:
Q  423 aattattgtatcaaaagtaataacatttattgattgtcttgctttgtgtaaaatgtcataaaatgacaattaaaaagga 501  Q
    |||||||||||| |||| |  |||||||| ||||||||||| |||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||    
T  36340553 aattattgtatcgaaaggagcaacatttactgattgtcttggtttgtgtaaaatgtaaaaaaataacaattaaaaagga 36340631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #80
Raw Score: 41; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 290 - 501
Target Start/End: Complemental strand, 9142470 - 9142262
Alignment:
Q  290 ttaactgtcactttcaaagttcaatgcaactttaaatgttattttatcaatattacccttagttatttattgtggagatagaaatatatgaaatgagata 389  Q
    |||||||||  ||||||| ||||||| | | || |||||   |||||| ||| ||||||||  |||||||||   | |||||||||||| ||||||  ||    
T  9142470 ttaactgtcgttttcaaaattcaatgtatcatttaatgtggctttatctatactacccttatatatttattgc--acatagaaatatataaaatgaagta 9142373  T
Q  390 ttaaatgaataaggatattatggtaaaagtatcaattattgtatcaaaagtaataacatttattgattgtcttgctttgtgtaaaatgtcataaaatgac 489  Q
    |||||||| |||||||||||| | ||||  || |||| || ||||||||||| ||| |  ||||  |||||||| ||||||||||| |||| || |  ||    
T  9142372 ttaaatgattaaggatattataggaaaaagataaattgttatatcaaaagtagtaa-aagtatttgttgtcttgatttgtgtaaaaagtcaaaataaaac 9142274  T
Q  490 aattaaaaagga 501  Q
    ||||||||||||    
T  9142273 aattaaaaagga 9142262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #81
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 290 - 507
Target Start/End: Original strand, 35860001 - 35860216
Alignment:
Q  290 ttaactgtcactttcaaagttcaatgcaactttaaatgttattttatcaatattacccttagttatttattgtggagatagaaatatatgaaatgagata 389  Q
    |||| ||||| |||||||||| |||| ||| ||||||||| ||||  | |||   |||||||| ||||||||  ||||  |||||||| |||||  ||||    
T  35860001 ttaagtgtcattttcaaagtttaatgtaacattaaatgttgtttttcctataacgcccttagtaatttattgcagaga--gaaatataagaaatatgata 35860098  T
Q  390 ttaaatgaataaggatattatggtaaaagtatcaattattgtatcaaaagtaataacatttattgattgtcttgctttgtgtaaaatgtcataaaatgac 489  Q
    |||||| | |||| ||||||| | ||||  || | |||||| |||||||||| | | ||  ||| | ||||||| ||||||||||| |||| ||  | ||    
T  35860099 ttaaataattaagaatattatagaaaaaccataagttattgcatcaaaagtagtgaaatacatttagtgtcttggtttgtgtaaaaagtcaaaatgtaac 35860198  T
Q  490 aattaaaaaggagcggag 507  Q
    |||||||||||| |||||    
T  35860199 aattaaaaaggaacggag 35860216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #82
Raw Score: 36; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 230 - 309
Target Start/End: Original strand, 8921020 - 8921099
Alignment:
Q  230 atattatactcactccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttatttcaatttaactgtcactttcaaagt 309  Q
    ||||||||||| |||||||||||| ||| |||| |||||  | || |||||| |||| | ||||||||||||||||||||    
T  8921020 atattatactccctccgttcctttataactgtcgcttttacataatttttttgtttctaattaactgtcactttcaaagt 8921099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #83
Raw Score: 36; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 19 - 85
Target Start/End: Original strand, 28394148 - 28394217
Alignment:
Q  19 tataaggcccaataaggaactag---aaaaacaaggagcattgtacaactccaaattaaaagtaatctaa 85  Q
    |||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||| | |||| | ||| ||||||||||||||    
T  28394148 tataaggcccaataaggaactagaaaaaaaacaaggagcattatccaacactaaaataaaagtaatctaa 28394217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #84
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 352 - 397
Target Start/End: Original strand, 35684249 - 35684294
Alignment:
Q  352 ttatttattgtggagatagaaatatatgaaatgagatattaaatga 397  Q
    ||||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  35684249 ttatttattgtagagagagaagtatatgaaatgagatattaaatga 35684294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #85
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 295 - 410
Target Start/End: Complemental strand, 27814029 - 27813914
Alignment:
Q  295 tgtcactttcaaagttcaatgcaactttaaatgttattttatcaatattacccttagttatttattgtggagatagaaatatatgaaatgagatattaaa 394  Q
    ||||||||||||  ||||||||||| |||| | || | || |||||| |||||||   |||||||||| |||| ||||| | || |||||| ||| ||||    
T  27814029 tgtcactttcaagtttcaatgcaacattaattattgtgttgtcaataatacccttgcatatttattgtagagagagaaaaaaataaaatgaaataataaa 27813930  T
Q  395 tgaataaggatattat 410  Q
    ||| ||||| ||||||    
T  27813929 tgattaagggtattat 27813914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #86
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 295 - 410
Target Start/End: Original strand, 36453183 - 36453298
Alignment:
Q  295 tgtcactttcaaagttcaatgcaactttaaatgttattttatcaatattacccttagttatttattgtggagatagaaatatatgaaatgagatattaaa 394  Q
    ||||||||||||  ||||||||||| |||| | || | || |||||| |||||||   |||||||||| |||| ||||| | || |||||| ||| ||||    
T  36453183 tgtcactttcaagtttcaatgcaacattaattattgtcttgtcaataatacccttgcatatttattgtagagagagaaaaaaataaaatgaaataataaa 36453282  T
Q  395 tgaataaggatattat 410  Q
    ||| ||||| ||||||    
T  36453283 tgattaagggtattat 36453298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #87
Raw Score: 31; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 235 - 281
Target Start/End: Complemental strand, 5732319 - 5732273
Alignment:
Q  235 atactcactccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaatttttt 281  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||    
T  5732319 atactccctccgttcctttttaagcgtctcttttgaagaaatttttt 5732273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #88
Raw Score: 31; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 230 - 313
Target Start/End: Original strand, 15127083 - 15127168
Alignment:
Q  230 atattatactcactccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaatttttta--tttcaatttaactgtcactttcaaagttcaa 313  Q
    |||||||| || || ||||| ||||||| ||||||||||| |||| |||||||  |||  | |||| |||||||||||||||||||    
T  15127083 atattatattctcttcgttcatttttaattgtcacttttgcagaatttttttacttttttaattaaatgtcactttcaaagttcaa 15127168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #89
Raw Score: 31; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 339 - 497
Target Start/End: Original strand, 22785963 - 22786120
Alignment:
Q  339 atattacccttagttatttattgtggagatagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggatattatggtaaaagtatcaattattgtatcaaaa 438  Q
    ||||||||||||  ||||| |||  |||| ||||||||||  |||||  |||||||| | ||||| |||||| | ||||  || |||| |||||||||||    
T  22785963 atattacccttatatattttttgctgagagagaaatatattgaatgaagtattaaattattaaggttattataggaaaaagataaattgttgtatcaaaa 22786062  T
Q  439 gtaataacatttattgattgtcttgctttgtgtaaaatgtcataaaatgacaattaaaa 497  Q
    ||| ||| |  ||||  |||| ||| ||||||||||| |||| ||  ||||||||||||    
T  22786063 gtagtaa-aagtatttgttgttttggtttgtgtaaaaagtcaaaatgtgacaattaaaa 22786120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #90
Raw Score: 31; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 373 - 499
Target Start/End: Original strand, 33072162 - 33072288
Alignment:
Q  373 atatatgaaatgagatattaaatgaataaggatattatggtaaaagtatcaattattgtatcaaaagtaataacatttattgattgtcttgctttgtgta 472  Q
    |||||||||||  |||||||||| | |||||||||||| |  |||  || |||||||||||||||| || ||| ||  ||| | | | ||| ||||||||    
T  33072162 atatatgaaatatgatattaaataattaaggatattataggcaaaacataaattattgtatcaaaaatagtaaaatacatttagtatattggtttgtgta 33072261  T
Q  473 aaatgtcataaaatgacaattaaaaag 499  Q
    ||| |||| || || ||||||||||||    
T  33072262 aaaagtcaaaatataacaattaaaaag 33072288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #91
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 432 - 513
Target Start/End: Original strand, 6799595 - 6799676
Alignment:
Q  432 atcaaaagtaataacatttattgattgtcttgctttgtgtaaaatgtcataaaatgacaattaaaaaggagcggaggtagta 513  Q
    ||||||| || ||||| | | ||| ||||||| ||| ||||||||||||  |  |||||||||||||||| |||||||||||    
T  6799595 atcaaaaatagtaacaatcactgactgtcttggtttatgtaaaatgtcaacatgtgacaattaaaaaggaacggaggtagta 6799676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #92
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 301 - 410
Target Start/End: Original strand, 32049458 - 32049567
Alignment:
Q  301 tttcaaagttcaatgcaactttaaatgttattttatcaatattacccttagttatttattgtggagatagaaatatatgaaatgagatattaaatgaata 400  Q
    ||||||||||||||| | | ||||||||   |||| | ||||||| ||||  |||||||||  |||| | ||||| |||||||||  |||||||||| ||    
T  32049458 tttcaaagttcaatgtatcattaaatgtgtctttacctatattactcttatatatttattgcagagagataaatacatgaaatgaagtattaaatgatta 32049557  T
Q  401 aggatattat 410  Q
    || |||||||    
T  32049558 agaatattat 32049567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #93
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 299 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 41409810 - 41409765
Alignment:
Q  299 actttcaaagttcaatgcaactttaaatgttattttatcaatatta 344  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||| ||||||||    
T  41409810 actttcaaagttcaacgcaacattaaatgttgttttaccaatatta 41409765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #94
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 295 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 41480693 - 41480628
Alignment:
Q  295 tgtcactttcaaagttcaatgcaactttaaatgttattttatcaatattacccttagttatttatt 360  Q
    ||||| ||| ||||||||||||||  |||| | || |||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  41480693 tgtcattttgaaagttcaatgcaatattaactattgttttgtcaataatacccttagttatttatt 41480628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 178; Significance: 2e-95; HSPs: 130)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 178; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 236 - 513
Target Start/End: Complemental strand, 4175737 - 4175460
Alignment:
Q  236 tactcactccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttatttcaatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaactttaaatgttatttta 335  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  4175737 tactccctccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaaatttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgtttta 4175638  T
Q  336 tcaatattacccttagttatttattgtggagatagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggatattatggtaaaagtatcaattattgtatca 435  Q
    ||||||||  |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||   |||||||||||    
T  4175637 tcaatattgtccttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggttattatagtaaaagtatagcttattgtatca 4175538  T
Q  436 aaagtaataacatttattgattgtcttgctttgtgtaaaatgtcataaaatgacaattaaaaaggagcggaggtagta 513  Q
    |||||| || || || || |||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||| |||||||||||    
T  4175537 aaagtagtatcaattgtttattgtcttgctttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaacggaggtagta 4175460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 159; E-Value: 4e-84
Query Start/End: Original strand, 235 - 513
Target Start/End: Complemental strand, 18437581 - 18437303
Alignment:
Q  235 atactcactccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttatttcaatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaactttaaatgttatttt 334  Q
    |||||| ||| ||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| | ||||| ||| ||||||||| ||||    
T  18437581 atactccctctgtttctttttaagtgtctcttttgaagaaattttttgtttcaatttaagtgtcactttcaaaatccaatgtaacattaaatgttgtttt 18437482  T
Q  335 atcaatattacccttagttatttattgtggagatagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggatattatggtaaaagtatcaattattgtatc 434  Q
    | |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||| |||||||||| || |||||||||    
T  18437481 accaatattacccttagttatttattatggagagagaaatatatgaaatgagataataaataaataaggttattatagtaaaagtataaagtattgtatc 18437382  T
Q  435 aaaagtaataacatttattgattgtcttgctttgtgtaaaatgtcataaaatgacaattaaaaaggagcggaggtagta 513  Q
    |||| |  ||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  18437381 aaaaatggtaacatttattgattgtattggtttgtgtaaaatatcaaaaagtgacaattaaaaaggaacggaggtagta 18437303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 157; E-Value: 7e-83
Query Start/End: Original strand, 233 - 513
Target Start/End: Complemental strand, 4985434 - 4985155
Alignment:
Q  233 ttatactcactccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttatttcaatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaactttaaatgttatt 332  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  | ||    
T  4985434 ttatactccctccgttcctttttaagtgtctcttttggagat-ttttttgtttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaataatgtt 4985336  T
Q  333 ttatcaatattacccttagttatttattgtggagatagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggatattatggtaaaagtatcaattattgta 432  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||| |||||| ||| | |||||| |    
T  4985335 ttatcaatattacccttaattatttattgaggagagagaaatatatgaaataagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaaatataacttattgca 4985236  T
Q  433 tcaaaagtaataacatttattgattgtcttgctttgtgtaaaatgtcataaaatgacaattaaaaaggagcggaggtagta 513  Q
    ||||||||| |||||  |||||||||||||| | |||||||||||||| ||  |||||||||||||||| |||||||||||    
T  4985235 tcaaaagtagtaacaactattgattgtcttggtatgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaacggaggtagta 4985155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 156; E-Value: 3e-82
Query Start/End: Original strand, 234 - 513
Target Start/End: Original strand, 18794743 - 18795022
Alignment:
Q  234 tatactcactccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttatttcaatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaactttaaatgttattt 333  Q
    ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||    
T  18794743 tatactccctccattcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttgtttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttt 18794842  T
Q  334 tatcaatattacccttagttatttattgtggagatagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggatattatggtaaaagtatcaattattgtat 433  Q
    || |||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||   |||||  ||    
T  18794843 taccaatattgtccttagttatttattgtggagagagaaatatatgaaataagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtatagcttattacat 18794942  T
Q  434 caaaagtaataacatttattgattgtcttgctttgtgtaaaatgtcataaaatgacaattaaaaaggagcggaggtagta 513  Q
    ||||||||  | || || |||||||||||| |||||||||||||||| |   ||| |||||||||||| |||||||||||    
T  18794943 caaaagtatgatcaattgttgattgtcttgatttgtgtaaaatgtcaaagtgtgaaaattaaaaaggaacggaggtagta 18795022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 154; E-Value: 4e-81
Query Start/End: Original strand, 236 - 501
Target Start/End: Complemental strand, 26854351 - 26854087
Alignment:
Q  236 tactcactccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttatttcaatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaactttaaatgttatttta 335  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  26854351 tactccctctgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttgttcctatttaactgtcacttccaaagttcaatgcaacattaaatgttgtttta 26854252  T
Q  336 tcaatattacccttagttatttattgtggagatagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggatattatggtaaaagtatcaattattgtatca 435  Q
     |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||   |||||| ||||    
T  26854251 ccaatattatccttagttatttattgtggagagagaaatatatgaaatg-gatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtatagcttattgcatca 26854153  T
Q  436 aaagtaataacatttattgattgtcttgctttgtgtaaaatgtcataaaatgacaattaaaaagga 501  Q
    |||||| || || ||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||    
T  26854152 aaagtagtatcaattattgattatcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaagga 26854087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 154; E-Value: 4e-81
Query Start/End: Original strand, 236 - 513
Target Start/End: Complemental strand, 28463642 - 28463365
Alignment:
Q  236 tactcactccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttatttcaatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaactttaaatgttatttta 335  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||    
T  28463642 tactccctccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttgtttttatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacaataaatgttgtttta 28463543  T
Q  336 tcaatattacccttagttatttattgtggagatagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggatattatggtaaaagtatcaattattgtatca 435  Q
     ||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||| ||||||||||| |    
T  28463542 ccaacattacccttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaataagatattaaatgactaaggttattatagtaaaagtataaattattgtataa 28463443  T
Q  436 aaagtaataacatttattgattgtcttgctttgtgtaaaatgtcataaaatgacaattaaaaaggagcggaggtagta 513  Q
     ||  | ||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||| |||  || | |||||||| | |||||||||||    
T  28463442 gaaaaagtaacatttattgagtgtcttggtttgtgtaaaatatcaaaaagcgatagttaaaaagaaacggaggtagta 28463365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 154; E-Value: 4e-81
Query Start/End: Original strand, 234 - 514
Target Start/End: Complemental strand, 38297876 - 38297595
Alignment:
Q  234 tatactcactccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttatttca-atttaactgtcactttcaaagttcaatgcaactttaaatgttatt 332  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||    
T  38297876 tatactccctccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaatttttttgttcatatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacaataaatgttgtt 38297777  T
Q  333 ttatcaatattacccttagttatttattgtggagatagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggatattatggtaaaagtatcaattattgta 432  Q
    ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||| |||||  ||||| |||||||||| ||||||||||    
T  38297776 ttaccaacattacccttagttatttattgtggagagagaaatatatgaaataagatattacatgattaaggcgattatagtaaaagtataaattattgta 38297677  T
Q  433 tcaaaagtaataacatttattgattgtcttgctttgtgtaaaatgtcataaaatgacaattaaaaaggagcggaggtagtaa 514  Q
    | | ||  | ||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||| ||| ||||  |||||||||| | ||||||||||    
T  38297676 taagaaaaagtaacatttattgagtgtcttagtttgtgtaaaatgtcaaaaagtgacggttaaaaaggaactgaggtagtaa 38297595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 153; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 236 - 512
Target Start/End: Complemental strand, 28024516 - 28024240
Alignment:
Q  236 tactcactccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttatttcaatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaactttaaatgttatttta 335  Q
    ||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||  |||| || | |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||||    
T  28024516 tactctctctgttcctttttaagtgtctcttttggagaaaaattttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgtaacattaaatgttgtttta 28024417  T
Q  336 tcaatattacccttagttatttattgtggagatagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggatattatggtaaaagtatcaattattgtatca 435  Q
     |||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||  ||||| |||||||||| | |||||| ||||    
T  28024416 ccaatattatccttagttatttattgcggagagagaaatatataaaatgagatgttaaatgaataaggtcattatagtaaaagtataacttattgcatca 28024317  T
Q  436 aaagtaataacatttattgattgtcttgctttgtgtaaaatgtcataaaatgacaattaaaaaggagcggaggtagt 512  Q
    |||||| ||| | ||||||||||||||| || ||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  28024316 aaagtagtaataattattgattgtcttggttggtgtaaaatgtcaaaatatgacaattaaaaaggaacggaggtagt 28024240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 152; E-Value: 6e-80
Query Start/End: Original strand, 242 - 513
Target Start/End: Original strand, 34261280 - 34261551
Alignment:
Q  242 ctccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttatttcaatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaactttaaatgttattttatcaata 341  Q
    |||| ||| ||||||||||||| ||||| ||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||    
T  34261280 ctccattcttttttaagtgtcaattttgcagaaaatttttgtttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacgttaaatgttgttttaccaata 34261379  T
Q  342 ttacccttagttatttattgtggagatagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggatattatggtaaaagtatcaattattgtatcaaaagta 441  Q
    ||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||| |||   |||||||||||||||||    
T  34261380 ttatccttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaaatatagcttattgtatcaaaagta 34261479  T
Q  442 ataacatttattgattgtcttgctttgtgtaaaatgtcataaaatgacaattaaaaaggagcggaggtagta 513  Q
     || || || |||||||||||| ||||| |||||||||| || ||||||||||||||||| | |||||||||    
T  34261480 gtatcaattgttgattgtcttggtttgtctaaaatgtcaaaatatgacaattaaaaaggaacagaggtagta 34261551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 150; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 236 - 513
Target Start/End: Original strand, 38910236 - 38910512
Alignment:
Q  236 tactcactccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttatttcaatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaactttaaatgttatttta 335  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  38910236 tactctctccgttcttttttaagtgtcacttttggagaaattttttgtttctatttaactgtcacttttaaagttcaatgcaacattaaatgttgtttta 38910335  T
Q  336 tcaatattacccttagttatttattgtggagatagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggatattatggtaaaagtatcaattattgtatca 435  Q
     |||||||| ||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||| |||||||||||||||| |  ||||| ||||||||||   |||||| ||||    
T  38910336 ccaatattatccttagttatttattatggagagataaatatatgaaatg-gatattaaatgaataaagtcattatagtaaaagtatagcttattgcatca 38910434  T
Q  436 aaagtaataacatttattgattgtcttgctttgtgtaaaatgtcataaaatgacaattaaaaaggagcggaggtagta 513  Q
    |||||| || || || |||||| ||||| |||||||||||||||| ||  |||||||||||||||| |||||||||||    
T  38910435 aaagtagtatcaattgttgattatcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaacggaggtagta 38910512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 149; E-Value: 4e-78
Query Start/End: Original strand, 242 - 514
Target Start/End: Original strand, 4098299 - 4098571
Alignment:
Q  242 ctccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttatttcaatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaactttaaatgttattttatcaata 341  Q
    ||||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| | |||| ||||||||| ||||  |||||    
T  4098299 ctccgtttctttttaagtatcacttttggagaaaatttttgtttcaatttaactgtcacttttaaagttcagtacaacattaaatgttgttttgccaata 4098398  T
Q  342 ttacccttagttatttattgtggagatagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggatattatggtaaaagtatcaattattgtatcaaaagta 441  Q
    ||| |||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||| |||| | |||||||||||||||||    
T  4098399 ttatcctttgttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaggtataacttattgtatcaaaagta 4098498  T
Q  442 ataacatttattgattgtcttgctttgtgtaaaatgtcataaaatgacaattaaaaaggagcggaggtagtaa 514  Q
    ||| || || |||||||||||| |||||||||||||||| ||  |||||||||||||| | ||||| ||||||    
T  4098499 atatcaatttttgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaagaaacggagatagtaa 4098571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 149; E-Value: 4e-78
Query Start/End: Original strand, 234 - 510
Target Start/End: Original strand, 12664818 - 12665094
Alignment:
Q  234 tatactcactccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttatttcaatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaactttaaatgttattt 333  Q
    ||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||    
T  12664818 tatactccctccgtttctttttaagtgttacttttggagaaaatttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgtagttt 12664917  T
Q  334 tatcaatattacccttagttatttattgtggagatagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggatattatggtaaaagtatcaattattgtat 433  Q
    || |||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||     ||||| ||    
T  12664918 taccaatattgtccttagttatttattgtggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtacatcatattgcat 12665017  T
Q  434 caaaagtaataacatttattgattgtcttgctttgtgtaaaatgtcataaaatgacaattaaaaaggagcggaggta 510  Q
    |||||||| || || || |||||||||||| ||| |||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||    
T  12665018 caaaagtagtatcaattgttgattgtcttggtttatgtaaaatgtcaaaatatgacaattaaaaaggaacggaggta 12665094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 148; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 235 - 513
Target Start/End: Complemental strand, 7579926 - 7579647
Alignment:
Q  235 atactcactccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttatttcaatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaactttaaatgttatttt 334  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  7579926 atactccctccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttgtttctatttaactgtcactttcgaagttcaatgcaacattaaatgttgtttt 7579827  T
Q  335 atcaatattacccttagttatttattgtggagatagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggatattatggtaaaagtatcaattattgtatc 434  Q
    | |||||||  |||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||   |||||| | |    
T  7579826 accaatattgtccttagttatttattgcggaaagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtatagtttattgcaac 7579727  T
Q  435 -aaaagtaataacatttattgattgtcttgctttgtgtaaaatgtcataaaatgacaattaaaaaggagcggaggtagta 513  Q
     ||||||| || || || |||||||| ||| |||||||||||| ||| ||  |||||||||||||||| |||||||||||    
T  7579726 aaaaagtagtatcaattgttgattgttttggtttgtgtaaaatatcaaaatgtgacaattaaaaaggaacggaggtagta 7579647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 146; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 243 - 514
Target Start/End: Original strand, 6007852 - 6008125
Alignment:
Q  243 tccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttatttcaatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaactttaaatgttattttatcaatat 342  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||    
T  6007852 tccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttgtttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcatcattaaatgttgttttatcaatat 6007951  T
Q  343 tacccttagttatttattgtggagatagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggatattat-ggtaaaagtatcaattattgtatcaaaagta 441  Q
    |  | |||||||| ||||   |||| |||||||||||||||| | |||||||| ||||||| |||||| | ||||| ||| ||| |||||||||||||||    
T  6007952 tgtctttagttatatattacagagagagaaatatatgaaatgtggtattaaattaataaggctattatagttaaaaatataaatcattgtatcaaaagta 6008051  T
Q  442 ataacatttattgattgtcttgctttgtgtaaaatgtcataaaa-tgacaattaaaaaggagcggaggtagtaa 514  Q
     ||||| ||||||||||| ||| |||||||||||| ||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  6008052 gtaacaattattgattgtattggtttgtgtaaaatatcaaaaaagtgacaattaaaaaggaacggaggtagtaa 6008125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 145; E-Value: 9e-76
Query Start/End: Original strand, 233 - 513
Target Start/End: Original strand, 8825016 - 8825296
Alignment:
Q  233 ttatactcactccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttatttcaatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaactttaaatgttatt 332  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||   |||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||| ||    
T  8825016 ttatactccttccgttcctttttaagtgtcattttttgagaaattttttgttcatatttaactgtcattttcgaagttcaatgcaacattaaatgttgtt 8825115  T
Q  333 ttatcaatattacccttagttatttattgtggagatagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggatattatggtaaaagtatcaattattgta 432  Q
    ||| |||||||  |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||   |||||| |    
T  8825116 ttaccaatattgtccttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtatagtttattgca 8825215  T
Q  433 tcaaaagtaataacatttattgattgtcttgctttgtgtaaaatgtcataaaatgacaattaaaaaggagcggaggtagta 513  Q
    ||||||||| || || || |||||||||||| |||||||||||||||| ||  ||| |||||||||||| |||||||||||    
T  8825216 tcaaaagtagtatcaattgttgattgtcttgatttgtgtaaaatgtcaaaatgtgataattaaaaaggaacggaggtagta 8825296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 145; E-Value: 9e-76
Query Start/End: Original strand, 242 - 514
Target Start/End: Complemental strand, 14794041 - 14793769
Alignment:
Q  242 ctccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttatttcaatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaactttaaatgttattttatcaata 341  Q
    |||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||| |||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  14794041 ctccgttcctttttaaatgtctgttttggagaaattttttgtttctatttaaatgttactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttatcaata 14793942  T
Q  342 ttacccttagttatttattgtggagatagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggatattatggtaaaagtatcaattattgtatcaaaagta 441  Q
    ||| |||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||| |||||||||| | |||||| ||||||| ||    
T  14793941 ttatccttagttatttattgcggaaagagaaatatatgaaatgagatgttaaatgaataaggtcattatagtaaaagtataacttattgcatcaaaaata 14793842  T
Q  442 ataacatttattgattgtcttgctttgtgtaaaatgtcataaaatgacaattaaaaaggagcggaggtagtaa 514  Q
     ||| | ||||||||| | ||| |||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||  |||||||||||    
T  14793841 gtaataattattgattatattggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaagggaggtagtaa 14793769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 144; E-Value: 4e-75
Query Start/End: Original strand, 235 - 498
Target Start/End: Complemental strand, 24075096 - 24074833
Alignment:
Q  235 atactcactccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttatttcaatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaactttaaatgttatttt 334  Q
    |||||| |||| |||||||||||||||| |||||  |||| |||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  24075096 atactccctccattcctttttaagtgtctcttttaaagaatttttttgtttatatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgatatttt 24074997  T
Q  335 atcaatattacccttagttatttattgtggagatagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggatattatggtaaaagtatcaattattgtatc 434  Q
    ||||||||||| |||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||   ||||| |||||||||| | |||||| |||    
T  24074996 atcaatattactcttaattatttattgcggagagagaaatatatgaaataagatattaaatgaataagttcattatagtaaaagtataacttattgcatc 24074897  T
Q  435 aaaagtaataacatttattgattgtcttgctttgtgtaaaatgtcataaaatgacaattaaaaa 498  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||  |||||||||||||    
T  24074896 aaaagtagtaacaattattgattgttttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaa 24074833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 144; E-Value: 4e-75
Query Start/End: Original strand, 234 - 513
Target Start/End: Original strand, 25343920 - 25344199
Alignment:
Q  234 tatactcactccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttatttcaatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaactttaaatgttattt 333  Q
    |||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||| || ||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||    
T  25343920 tatactccttccgttcctttgtaagtgtcacttttggagaaaatttttgtttctatttaaccgttactttcaaatttcaatgcaacattaaatgttgttt 25344019  T
Q  334 tatcaatattacccttagttatttattgtggagatagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggatattatggtaaaagtatcaattattgtat 433  Q
    || |||||||  |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| |||   |||||| ||    
T  25344020 taccaatattgtccttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggttattatagtaaaaatatagcttattgcat 25344119  T
Q  434 caaaagtaataacatttattgattgtcttgctttgtgtaaaatgtcataaaatgacaattaaaaaggagcggaggtagta 513  Q
    ||||||||  | || || |||||||||||| ||||||||||||| || ||  |||||||||||||||| |||||||||||    
T  25344120 caaaagtaggatcaattgttgattgtcttgatttgtgtaaaatgacaaaatgtgacaattaaaaaggaacggaggtagta 25344199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 144; E-Value: 4e-75
Query Start/End: Original strand, 234 - 513
Target Start/End: Original strand, 39073004 - 39073283
Alignment:
Q  234 tatactcactccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttatttcaatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaactttaaatgttattt 333  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| |||   ||| || | |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||    
T  39073004 tatactccctccgttcctttttaagtgtcaattttggaaaaaaaatttgttcctatttaactgtcattttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttt 39073103  T
Q  334 tatcaatattacccttagttatttattgtggagatagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggatattatggtaaaagtatcaattattgtat 433  Q
    || |||||||| |||||||||||||||| | ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||   |||||| ||    
T  39073104 taccaatattatccttagttatttattgcgaagtgagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggttattatagtaaaagtatagcttattgcat 39073203  T
Q  434 caaaagtaataacatttattgattgtcttgctttgtgtaaaatgtcataaaatgacaattaaaaaggagcggaggtagta 513  Q
    |||||||| || || || |||||||||||| |||||||||||| ||| ||  |||||||||||||||| |||||||||||    
T  39073204 caaaagtagtatcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatatcaaaatgtgacaattaaaaaggaacggaggtagta 39073283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 143; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 259 - 513
Target Start/End: Original strand, 9076056 - 9076310
Alignment:
Q  259 tgtcacttttggagaaattttttatttcaatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaactttaaatgttattttatcaatattacccttagttattta 358  Q
    ||||||||||||| |||  |||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||    
T  9076056 tgtcacttttggataaaaattttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttatcaatattgtccttagttattta 9076155  T
Q  359 ttgtggagatagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggatattatggtaaaagtatcaattattgtatcaaaagtaataacatttattgattg 458  Q
    ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||| | |||||| |||||||||| || || || |||||||    
T  9076156 ttgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtataatttattgcatcaaaagtagtatcaattgttgattg 9076255  T
Q  459 tcttgctttgtgtaaaatgtcataaaatgacaattaaaaaggagcggaggtagta 513  Q
    ||||| |||||||||||||||| |  ||||||||||||||||| || ||||||||    
T  9076256 tcttggtttgtgtaaaatgtcaaattatgacaattaaaaaggaacgaaggtagta 9076310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 142; E-Value: 6e-74
Query Start/End: Original strand, 236 - 513
Target Start/End: Complemental strand, 28447241 - 28446965
Alignment:
Q  236 tactcactccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttatttcaatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaactttaaatgttatttta 335  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| || | |||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  28447241 tactccctccgttcctttttaagtgtctcttttggagaaaatttttgttcctatttaactctcactttcaaagttaaatgcaacattaaatgttatttta 28447142  T
Q  336 tcaatattacccttagttatttattgtggagatagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggatattatggtaaaagtatcaattattgtatca 435  Q
    | ||||||| ||||||| |||||||| | | | ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||| |||||||||| | |||||||||||    
T  28447141 taaatattatccttagt-atttattgagaaaagagatatatatgaaatgagatgttaaatgaataaggtcattatagtaaaagtataacttattgtatca 28447043  T
Q  436 aaagtaataacatttattgattgtcttgctttgtgtaaaatgtcataaaatgacaattaaaaaggagcggaggtagta 513  Q
    ||| || ||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||||| | ||||| |||||    
T  28447042 aaaatagtaacaattattgattatcttggtttgtgtaaaatgtcaaaaagtgacaattaaaaagaaacggagatagta 28446965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 142; E-Value: 6e-74
Query Start/End: Original strand, 236 - 501
Target Start/End: Original strand, 42911512 - 42911777
Alignment:
Q  236 tactcactccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttatttcaatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaactttaaatgttatttta 335  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || |||||    
T  42911512 tactccctccgtttctttttaagtgtctcttttggagaaaatttttgttactatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatattgtttta 42911611  T
Q  336 tcaatattacccttagttatttattgtggagatagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggatattatggtaaaagtatcaattattgtatca 435  Q
     |||||||| |||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||| |   ||||| |||||||||| | |||||| ||||    
T  42911612 ccaatattatccttagttatttattgcggagagataaatatatgaaatgagatgttaaatgaatatgatcattatagtaaaagtataacttattgcatca 42911711  T
Q  436 aaagtaataacatttattgattgtcttgctttgtgtaaaatgtcataaaatgacaattaaaaagga 501  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||  ||||||||||||||||    
T  42911712 aaagtagtaacaattattgattgtcttggtttgtgtaaaatatcaaaatgtgacaattaaaaagga 42911777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 141; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 245 - 513
Target Start/End: Complemental strand, 8230051 - 8229784
Alignment:
Q  245 cgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttatttcaatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaactttaaatgttattttatcaatatta 344  Q
    ||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||| | |||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||    
T  8230051 cgttcctttttaagtgtctattttgaagaaattttttattcctatttaactgtcattttccaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatatta 8229952  T
Q  345 cccttagttatttattgtggagatagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggatattatggtaaaagtatcaattattgtatcaaaagtaata 444  Q
     |||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||  | ||| |||||||||| | |||||| |||||||||| ||    
T  8229951 tccttagttatttattccggagagagaaatatatgaaatgagatgttaaatgaataaggtcactatagtaaaagtataacttattgcatcaaaagtatta 8229852  T
Q  445 acatttattgattgtcttgctttgtgtaaaatgtcataaaatgacaattaaaaaggagcggaggtagta 513  Q
    ||| ||||||||||||||  ||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||| || ||||||||    
T  8229851 acaattattgattgtcttaatttgtgtaagatgtca-aaagtgacaattaaaaaggaacgaaggtagta 8229784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 141; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 242 - 513
Target Start/End: Original strand, 36239425 - 36239697
Alignment:
Q  242 ctccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaatttttta-tttcaatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaactttaaatgttattttatcaat 340  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||    
T  36239425 ctccgttcctttttaagtgtctcttttggagatttttttttgtttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgatgttttatcaat 36239524  T
Q  341 attacccttagttatttattgtggagatagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggatattatggtaaaagtatcaattattgtatcaaaagt 440  Q
    |||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||  ||||| |||||| ||| | |||||| |||||||||    
T  36239525 attacccttaattatttattgcggagagagaaatatatgaaataagatattaaattaataaggtcattatagtaaaaatataacttattgcatcaaaagt 36239624  T
Q  441 aataacatttattgattgtcttgctttgtgtaaaatgtcataaaatgacaattaaaaaggagcggaggtagta 513  Q
    | |||||  |||||||||||||| | |||||||||||||| ||  ||||||||||||| || ||||| |||||    
T  36239625 agtaacaactattgattgtcttgatatgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaatgaacggagatagta 36239697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 140; E-Value: 9e-73
Query Start/End: Original strand, 246 - 513
Target Start/End: Original strand, 40198760 - 40199027
Alignment:
Q  246 gttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttatttcaatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaactttaaatgttattttatcaatattac 345  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||| ||||||||     
T  40198760 gttcctttttaagtgtctcttttggagaaattttttgttactatttaactgtcactttcaaagttcaatacaacattaaatgttgttttaccaatattat 40198859  T
Q  346 ccttagttatttattgtggagatagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggatattatggtaaaagtatcaattattgtatcaaaagtaataa 445  Q
    || ||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||  ||||| |||||||||| | |||||| |||||||||| |||    
T  40198860 ccgtagttatttattgcggagagagaaataaatgaaatgagatgttaaatgaataaggtcattatagtaaaagtataacttattgcatcaaaagtagtaa 40198959  T
Q  446 catttattgattgtcttgctttgtgtaaaatgtcataaaatgacaattaaaaaggagcggaggtagta 513  Q
    || || |||||||||||| | |||||||||| ||| ||| | ||||||||||| || ||||| |||||    
T  40198960 caattgttgattgtcttgatctgtgtaaaatatcaaaaagtaacaattaaaaaagaacggagatagta 40199027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 134; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 281 - 510
Target Start/End: Original strand, 7408338 - 7408567
Alignment:
Q  281 tatttcaatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaactttaaatgttattttatcaatattacccttagttatttattgtggagatagaaatatatga 380  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||  |||||| || ||||| ||||||||| |||| ||||||||| |||||| | ||||||||||    
T  7408338 tatttcaatttaattgtcactttcaaagttcaaagcaatattaaatattgttttaccaatattactcttacttatttattatggagagaaaaatatatga 7408437  T
Q  381 aatgagatattaaatgaataaggatattatggtaaaagtatcaattattgtatcaaaagtaataacatttattgattgtcttgctttgtgtaaaatgtca 480  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| |||  |||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  7408438 aatgagatattaaatgaataaggttattatagtaaaagtataaattattgtatcaaaagtattaatgtttattgattgttttggtttgtgtaaaatgtca 7408537  T
Q  481 taaaatgacaattaaaaaggagcggaggta 510  Q
     || ||||||||||||||||| || |||||    
T  7408538 aaagatgacaattaaaaaggaacgaaggta 7408567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 132; E-Value: 5e-68
Query Start/End: Original strand, 234 - 509
Target Start/End: Complemental strand, 1795376 - 1795101
Alignment:
Q  234 tatactcactccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttatttcaatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaactttaaatgttattt 333  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||   ||||||||||||||||||||||||||||  ||  |||||||| |||    
T  1795376 tatactccctccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttgttctcatttaactgtcactttcaaagttcaatgttacaataaatgttgttt 1795277  T
Q  334 tatcaatattacccttagttatttattgtggagatagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggatattatggtaaaagtatcaattattgtat 433  Q
    || ||| |||||||||| |||||||||| | ||| ||||||||| ||||| ||||||||||||| ||| | |||||| |||||||||| |||||||||||    
T  1795276 taccaacattacccttatttatttattgcgaagagagaaatatacgaaataagatattaaatgactaaagctattatagtaaaagtataaattattgtat 1795177  T
Q  434 caaaagtaataacatttattgattgtcttgctttgtgtaaaatgtcataaaatgacaattaaaaaggagcggaggt 509  Q
     | ||  | ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||| | ||  |||||||||| |||||||    
T  1795176 aagaaaaagtaacatttattgagtgtcttgatttgtgtaaaatgtcaaaaagtaaccgttaaaaaggaacggaggt 1795101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 132; E-Value: 5e-68
Query Start/End: Original strand, 235 - 513
Target Start/End: Complemental strand, 4427664 - 4427385
Alignment:
Q  235 atactcactccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttatttcaatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaactttaaatgttatttt 334  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||   ||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||    
T  4427664 atactctctccgttcctttttaagtgtttcttttggagaaattttttgttcatattcaactgtcactttcaaagttcaatgaaacattaaatgttgtttt 4427565  T
Q  335 atcaatattacccttagttatttattgtggagatagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggatattatggtaaaagtatcaattattgtatc 434  Q
    | |||||||| |||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||| |||||||| | |||  ||||| |||||||||| | ||||||||||    
T  4427564 accaatattatccttagttatttattacggagagagaaatatatgaaatgagatgttaaatgagtgaggtcattatagtaaaagtataacttattgtatc 4427465  T
Q  435 aaaagtaataa-catttattgattgtcttgctttgtgtaaaatgtcataaaatgacaattaaaaaggagcggaggtagta 513  Q
    |||||||  ||  | ||| ||||||||||| || ||||||||| ||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  4427464 aaaagtagcaataaattactgattgtcttgattcgtgtaaaatatcaaaaagtgacaattaaaaaggaacggaggtagta 4427385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 132; E-Value: 5e-68
Query Start/End: Original strand, 243 - 513
Target Start/End: Original strand, 38363160 - 38363428
Alignment:
Q  243 tccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttatttcaatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaactttaaatgttattttatcaatat 342  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||    
T  38363160 tccgttcctttttaagtgttacttttggagaaaatttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatat 38363259  T
Q  343 tacccttagttatttattgtggagatagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggatattatggtaaaagtatcaattattgtatcaaaagtaa 442  Q
    |  ||||||||||| |||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||| ||||||||||   |||||| ||||||| ||     
T  38363260 t--ccttagttattaattgcgaagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaagtcattatagtaaaagtatagtttattgcatcaaaattag 38363357  T
Q  443 taacatttattgattgtcttgctttgtgtaaaatgtcataaaatgacaattaaaaaggagcggaggtagta 513  Q
    || || || |||||||||||| |||||||||||||||| |   |||||||||||||||| || ||||||||    
T  38363358 tatcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaattgtgacaattaaaaaggaacgaaggtagta 38363428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 131; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 235 - 513
Target Start/End: Original strand, 6072413 - 6072691
Alignment:
Q  235 atactcactccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttatttcaatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaactttaaatgttatttt 334  Q
    |||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||| ||   |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  6072413 atactccctccgtttctttttaagcgtcacttttggagaaaatttttgttcttatttaactgttactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgtttt 6072512  T
Q  335 atcaatattacccttagttatttattgtggagatagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggatattatggtaaaagtatcaattattgtatc 434  Q
    | |||||||  |||||||||||||||  ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||| | |||||| |||    
T  6072513 accaatattgtccttagttatttattacggagagagaaatatattaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtataacttattgcatc 6072612  T
Q  435 aaaagtaataacatttattgattgtcttgctttgtgtaaaatgtcataaaatgacaattaaaaaggagcggaggtagta 513  Q
    ||||||| || || || |||||||||||  ||||||||||||||   ||  ||| |||||||||||| |||||||||||    
T  6072613 aaaagtagtatcaattgttgattgtcttaatttgtgtaaaatgtttaaatgtgataattaaaaaggaacggaggtagta 6072691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 130; E-Value: 8e-67
Query Start/End: Original strand, 236 - 513
Target Start/End: Complemental strand, 16124517 - 16124240
Alignment:
Q  236 tactcactccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttatttcaatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaactttaaatgttatttta 335  Q
    ||||| |||||||| ||||||||| || |||||| | |||||||||||| | |||||||||| || ||||||||| |||||||| ||||||||| |||||    
T  16124517 tactccctccgttcatttttaagtatctcttttgaataaattttttattactatttaactgttaccttcaaagtttaatgcaacattaaatgttgtttta 16124418  T
Q  336 tcaatattacccttagttatttattgtggagatagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggatattatggtaaaagtatcaattattgtatca 435  Q
     |||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||| ||  | |||||| ||||    
T  16124417 ccaatattatccttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaaatacaacttattgcatca 16124318  T
Q  436 aaagtaataacatttattgattgtcttgctttgtgtaaaatgtcataaaatgacaattaaaaaggagcggaggtagta 513  Q
    |||||| ||||| | ||||| | | ||| ||| |||||||||||| ||  |||||||||||||||| |||||||||||    
T  16124317 aaagtagtaacaatcattgactatattggtttatgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaacggaggtagta 16124240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 130; E-Value: 8e-67
Query Start/End: Original strand, 236 - 501
Target Start/End: Original strand, 38702103 - 38702368
Alignment:
Q  236 tactcactccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttatttcaatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaactttaaatgttatttta 335  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||| |||||    
T  38702103 tactccctccgttcctttttaagtgtcaattttggagaaattttttgttcctatttaactgtcactttcgaagttcaatgcaacaataaatgttgtttta 38702202  T
Q  336 tcaatattacccttagttatttattgtggagatagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggatattatggtaaaagtatcaattattgtatca 435  Q
     |||||||  ||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||  ||||| ||||||||||   |||||| ||||    
T  38702203 ccaatattgtccttaattatttattgcggagagagaaatatatgaaataagatattaaataaataaggtcattatagtaaaagtatagcttattgcatca 38702302  T
Q  436 aaagtaataacatttattgattgtcttgctttgtgtaaaatgtcataaaatgacaattaaaaagga 501  Q
    |||||| || || || |||||||||||| ||| |||||||| | | || |||||||||||||||||    
T  38702303 aaagtagtatcaattgttgattgtcttggtttatgtaaaatattaaaatatgacaattaaaaagga 38702368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 129; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 243 - 511
Target Start/End: Complemental strand, 2134156 - 2133890
Alignment:
Q  243 tccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttatttcaatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaactttaaatgttattttatcaatat 342  Q
    |||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||| ||   |||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||  ||||||    
T  2134156 tccgttcctttttaagtgtctcttttaaagaaattttttgttcttatttaattgttactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttgccaatat 2134057  T
Q  343 tacccttagttatttattgtggagatagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggatattatggtaaaagtatcaattattgtatcaaaagtaa 442  Q
    || |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||  ||||| |||||||||| | |||||| ||||||| ||     
T  2134056 tatccttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatgttaaattaataaggtcattatagtaaaagtataacttattgcatcaaaa-tag 2133958  T
Q  443 taacatttattgattgtcttgctttgtgtaaaatgtcataaaatgacaattaaaaaggagcggaggtag 511  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||  |||||||||    
T  2133957 taacaattattgattgtcttggtttatgtaaaatgtca-aaaatgataattaaaaaggcacggaggtag 2133890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 129; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 236 - 475
Target Start/End: Complemental strand, 19831797 - 19831560
Alignment:
Q  236 tactcactccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttatttcaatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaactttaaatgttatttta 335  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||||  |||| |||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  19831797 tactccctctgttcctttttaagtgtcttttttagagaaattttttgtttctatttaactctcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgtttta 19831698  T
Q  336 tcaatattacccttagttatttattgtggagatagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggatattatggtaaaagtatcaattattgtatca 435  Q
     ||||||||||||||  ||||||||||||| | ||||  |||| ||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||  ||| |||||||||||||    
T  19831697 ccaatattacccttaactatttattgtggaaagagaa--atattaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaacatataaattattgtatca 19831600  T
Q  436 aaagtaataacatttattgattgtcttgctttgtgtaaaa 475  Q
    ||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  19831599 aaaatattaacatttattgattgtcttggtttgtgtaaaa 19831560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 128; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 250 - 501
Target Start/End: Original strand, 4017390 - 4017641
Alignment:
Q  250 ctttttaagtgtcacttttggagaaattttttatttcaatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaactttaaatgttattttatcaatattaccctt 349  Q
    ||||||||  ||| |||||| ||||||||||| ||   |||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||  |||| |||||||| ||||    
T  4017390 ctttttaaccgtctcttttgaagaaattttttgttcttatttaactgtcacttttaaagttcaatgcaatattaaatgttgatttaccaatattatcctt 4017489  T
Q  350 agttatttattgtggagatagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggatattatggtaaaagtatcaattattgtatcaaaagtaataacatt 449  Q
    |||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||| || | |||||| ||||||||||| |||| |    
T  4017490 agttatttattgcggaaagagaaatatatgaaatgagatgttaaatgaataaggttattatagtaaaagaataacttattgcatcaaaagtaaaaacaat 4017589  T
Q  450 tattgattgtcttgctttgtgtaaaatgtcataaaatgacaattaaaaagga 501  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  4017590 tattgattatcttgatttgtgtaaaatgtcaaaaagtgacaattaaaaagga 4017641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 128; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 242 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 6754427 - 6754157
Alignment:
Q  242 ctccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttatttcaatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaactttaaatgttattttatcaata 341  Q
    ||||||||||||||||||||||||    ||||||  |||| || | ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||    
T  6754427 ctccgttcctttttaagtgtcacta---gagaaaagttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatacaacattaaatgttgttttatcaata 6754331  T
Q  342 ttacccttagttatttattgtggagatagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggatattatggtaaaagtatcaattattgtatcaaaagta 441  Q
    | |   |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||   |||||| ||||||||||    
T  6754330 tcatttttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaataagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaagta 6754231  T
Q  442 ataacatttattgattgtcttgctttgtgtaaaatgtcataaaatgacaattaaaaaggagcggaggtagtaag 515  Q
      | || ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||  |||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  6754230 tgatcaattattgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaacggaagtagtaag 6754157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 127; E-Value: 5e-65
Query Start/End: Original strand, 230 - 508
Target Start/End: Complemental strand, 5144261 - 5143983
Alignment:
Q  230 atattatactcactccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttatttcaatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaactttaaatgtt 329  Q
    |||| |||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| || | |||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||| ||    
T  5144261 atataatactccctccgttcctttttaattgtcatttttggagaaattttttgttcctatttaagtgtcactttcaaagttcaatgcaacaataaatctt 5144162  T
Q  330 attttatcaatattacccttagttatttattgtggagatagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggatattatggtaaaagtatcaattatt 429  Q
     ||||| ||| |||||||||| |||||||||  ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||  ||||||||| |||||||    
T  5144161 gttttaccaacattacccttaattatttattacggagagagaaatatatgaaataagatattaaatgactaaggctattataataaaagtataaattatt 5144062  T
Q  430 gtatcaaaagtaataacatttattgattgtcttgctttgtgtaaaatgtcataaaatgacaattaaaaaggagcggagg 508  Q
    |||| || |  | ||||||||||||| ||||||  |||||||||||| ||| ||||| ||  |||||||||| ||||||    
T  5144061 gtataaataaaagtaacatttattgagtgtcttaatttgtgtaaaatatcaaaaaataacggttaaaaaggaacggagg 5143983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 127; E-Value: 5e-65
Query Start/End: Original strand, 236 - 514
Target Start/End: Complemental strand, 12784699 - 12784422
Alignment:
Q  236 tactcactccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttatttcaatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaactttaaatgttatttta 335  Q
    ||||| ||||||| |||||||| ||||| |||||||||||  |||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||| |||||    
T  12784699 tactccctccgtttctttttaactgtcatttttggagaaaaattttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacactaattgttgtttta 12784600  T
Q  336 tcaatattacccttagttatttattgtggagatagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggatattatggtaaaagtatcaattattgtatca 435  Q
     ||||||||||||||  ||||||||| ||||| ||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||   ||| | |||||||||  ||  |||||||||    
T  12784599 ccaatattacccttatatatttattgcggagagagaaacatatgaaatgaaatattaaattaataagatcattttagtaaaagta-aaacaattgtatca 12784501  T
Q  436 aaagtaataacatttattgattgtcttgctttgtgtaaaatgtcataaaatgacaattaaaaaggagcggaggtagtaa 514  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||| | ||||||||||    
T  12784500 aaagtagtaacatttattgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaaagtgagaattaaaaaggaacagaggtagtaa 12784422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 127; E-Value: 5e-65
Query Start/End: Original strand, 236 - 513
Target Start/End: Complemental strand, 38017528 - 38017257
Alignment:
Q  236 tactcactccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttatttcaatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaactttaaatgttatttta 335  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||      | ||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  38017528 tactccctccgttcctttttaagtgtc------gtagaaattttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgtttta 38017435  T
Q  336 tcaatattacccttagttatttattgtggagatagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggatattatggtaaaagtatcaattattgtatca 435  Q
     |||||||| | |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||   |||||| ||||    
T  38017434 ccaatattatctttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgtgatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtatagcttattgcatca 38017335  T
Q  436 aaagtaataacatttattgattgtcttgctttgtgtaaaatgtcataaaatgacaattaaaaaggagcggaggtagta 513  Q
    ||||||||| || || |||||||||||  |||||||||||||| | ||  ||||||||||||| || || ||||||||    
T  38017334 aaagtaatatcaattgttgattgtcttcgtttgtgtaaaatgttaaaatgtgacaattaaaaaagaacgaaggtagta 38017257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 125; E-Value: 8e-64
Query Start/End: Original strand, 235 - 506
Target Start/End: Original strand, 7403815 - 7404084
Alignment:
Q  235 atactcactccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttatttcaatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaactttaaatgttatttt 334  Q
    |||||| |||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||| ||   |||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||    
T  7403815 atactccctccgttcctttataagtgtcacttt--gagaaattttttgttcatatttaactctcactttcaaagttcaatgcaatattaaatgttgtttt 7403912  T
Q  335 atcaatattacccttagttatttattgtggagatagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggatattatggtaaaagtatcaattattgtatc 434  Q
    | |||||||| |||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||| | |||||| |||    
T  7403913 accaatattatccttagttatttattgcggagaaataaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtataatttattgcatc 7404012  T
Q  435 aaaagtaataacatttattgattgtcttgctttgtgtaaaatgtcataaaatgacaattaaaaaggagcgga 506  Q
    |||| || || || || |||||| ||||| ||| |||||||| ||| ||  |||||||||||||||| ||||    
T  7404013 aaaaatagtatcaattgttgattatcttggtttatgtaaaatatcaaaatgtgacaattaaaaaggaacgga 7404084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 125; E-Value: 8e-64
Query Start/End: Original strand, 262 - 506
Target Start/End: Complemental strand, 18020999 - 18020755
Alignment:
Q  262 cacttttggagaaattttttatttcaatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaactttaaatgttattttatcaatattacccttagttatttattg 361  Q
    |||||||| ||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  18020999 cacttttgaagaaaatttttgtttctatttaactgtcactttcaaaattcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattg 18020900  T
Q  362 tggagatagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggatattatggtaaaagtatcaattattgtatcaaaagtaataacatttattgattgtct 461  Q
     ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||| ||||||||||   |||||| || ||||||| || || || ||||||||||    
T  18020899 cggagagagaaatatatgaaatgagatatcaaatgaataaggtcattatagtaaaagtatagcttattgcattaaaagtagtatcaattgttgattgtct 18020800  T
Q  462 tgctttgtgtaaaatgtcataaaatgacaattaaaaaggagcgga 506  Q
    || | |||||||||||||| ||  |||||||||||||||| ||||    
T  18020799 tggtctgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaacgga 18020755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 124; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 251 - 506
Target Start/End: Original strand, 6689576 - 6689831
Alignment:
Q  251 tttttaagtgtcacttttggagaaattttttatttcaatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaactttaaatgttattttatcaatattaccctta 350  Q
    |||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||  |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||  ||||    
T  6689576 ttttcaagtgtctcttttggagaaattttttgtttctgtttatctgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattattctta 6689675  T
Q  351 gttatttattgtggagatagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggatattatggtaaaagtatcaattattgtatcaaaagtaataacattt 450  Q
     |||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||||   ||||| ||||||||||   |||||||||||||| || ||||| ||    
T  6689676 attatttattgcggagagagaaatatataaaatgagatgttaaatgaataagatcattatagtaaaagtatagcttattgtatcaaaaatagtaacaatt 6689775  T
Q  451 attgattgtcttgctttgtgtaaaatgtcataaaatgacaattaaaaaggagcgga 506  Q
    ||| ||||| ||| |||||||||||||| | ||||| |||||||||||||| ||||    
T  6689776 attaattgttttgatttgtgtaaaatgtaaaaaaataacaattaaaaaggaacgga 6689831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 124; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 236 - 499
Target Start/End: Complemental strand, 10359492 - 10359229
Alignment:
Q  236 tactcactccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttatttcaatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaactttaaatgttatttta 335  Q
    ||||| ||||||| |||| ||| ||| ||||||||||||| ||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  10359492 tactctctccgtttctttataactgtaacttttggagaaaatttttgtttctatttaactgtcattttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgtttta 10359393  T
Q  336 tcaatattacccttagttatttattgtggagatagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggatattatggtaaaagtatcaattattgtatca 435  Q
     |||||||  |||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||||||  || || ||||||||||   |||||| ||||    
T  10359392 ccaatattgtccttagttatttattgcggagaaaaaaatatatgaaatgatatattaaatgaataaggtcatcatagtaaaagtatagcttattgcatca 10359293  T
Q  436 aaagtaataacatttattgattgtcttgctttgtgtaaaatgtcataaaatgacaattaaaaag 499  Q
    |||||| || || || |||||||| ||| |||||||||||||||| ||  ||||||||||||||    
T  10359292 aaagtagtatcaattgttgattgttttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaag 10359229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 124; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 243 - 496
Target Start/End: Original strand, 32388953 - 32389208
Alignment:
Q  243 tccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaatttttta-tttca-atttaactgtcactttcaaagttcaatgcaactttaaatgttattttatcaat 340  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||| |||  ||||||  ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||    
T  32388953 tccgttcctttttaattgtcatttttgaagatttttttttctttcttatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaat 32389052  T
Q  341 attacccttagttatttattgtggagatagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggatattatggtaaaagtatcaattattgtatcaaaagt 440  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||| ||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||  ||||| |||||||||  ||| ||||||||||||||    
T  32389053 attacccttagatatttattgcggagaaagaaacatatgaaatgaaatattaaattaataaggccattatagtaaaagtaaaaataattgtatcaaaagt 32389152  T
Q  441 aataacatttattgattgtcttgctttgtgtaaaatgtcataaaatgacaattaaa 496  Q
    | ||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||| | ||| |||||||||||    
T  32389153 agtaacacttattgattgtcttggtttatgtaaaatgttaaaaagtgacaattaaa 32389208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 121; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 230 - 478
Target Start/End: Original strand, 4694720 - 4694968
Alignment:
Q  230 atattatactcactccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttatttcaatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaactttaaatgtt 329  Q
    |||| |||||| |||||||| ||||||||| || ||||||||||| |||||| ||   |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||    
T  4694720 atataatactccctccgttcatttttaagtatctcttttggagaatttttttgttcatatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattagatgtt 4694819  T
Q  330 attttatcaatattacccttagttatttattgtggagatagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggatattatggtaaaagtatcaattatt 429  Q
    ||||||  ||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||  ||||| |||||||||| | |||||    
T  4694820 attttactaatattatccttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatgttaaatgaacaaggtcattatagtaaaagtataacttatt 4694919  T
Q  430 gtatcaaaagtaataacatttattgattgtcttgctttgtgtaaaatgt 478  Q
      |||||||||| || || ||||||||| ||||| |||||| |||||||    
T  4694920 acatcaaaagtattagcaattattgattatcttggtttgtgaaaaatgt 4694968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 121; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 236 - 476
Target Start/End: Complemental strand, 21606515 - 21606275
Alignment:
Q  236 tactcactccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttatttcaatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaactttaaatgttatttta 335  Q
    ||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||    
T  21606515 tactccctccgttcctttttaaatgtctcttttggagaaattttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacaataaatgttgtttta 21606416  T
Q  336 tcaatattacccttagttatttattgtggagatagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggatattatggtaaaagtatcaattattgtatca 435  Q
     ||| |||||||||| |||||||||  ||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||| |    
T  21606415 ccaacattacccttaattatttattacggagaaagaaatatatgaaataaaatattaaatgaataaggatattatagtaaaaatataaattattgtataa 21606316  T
Q  436 aaagtaataacatttattgattgtcttgctttgtgtaaaat 476  Q
     ||  | ||| ||||||| | ||||||  ||||||||||||    
T  21606315 gaaaaagtaatatttattaagtgtcttagtttgtgtaaaat 21606275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 121; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 236 - 480
Target Start/End: Complemental strand, 32440169 - 32439925
Alignment:
Q  236 tactcactccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttatttcaatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaactttaaatgttatttta 335  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||    
T  32440169 tactccctctgttcctttttaagtgtcactttaggagaaaatttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacaataaatgttgtttta 32440070  T
Q  336 tcaatattacccttagttatttattgtggagatagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggatattatggtaaaagtatcaattattgtatca 435  Q
     ||| |||||| ||||||||||||||  |||| ||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||  ||||||||  ||||||||||| |    
T  32440069 ccaacattacctttagttatttattgcagagagagaaatacatgaaataagatattaaatgactaaggctattataataaaagtactaattattgtataa 32439970  T
Q  436 aaagtaataacatttattgattgtcttgctttgtgtaaaatgtca 480  Q
     ||  | ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  32439969 gaaaaagtaacatttattgagtgtcttggtttgtgtaaaatgtca 32439925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 120; E-Value: 8e-61
Query Start/End: Original strand, 236 - 499
Target Start/End: Complemental strand, 31985307 - 31985044
Alignment:
Q  236 tactcactccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttatttcaatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaactttaaatgttatttta 335  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||| |||  ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  31985307 tactccctccgttcctttttaagtgtctcttgcggagaaattttttgtttatattcaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaaagttatttta 31985208  T
Q  336 tcaatattacccttagttatttattgtggagatagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggatattatggtaaaagtatcaattattgtatca 435  Q
     | |||||||||||| ||||||||  || | | |||||||||| ||| |||| ||||||||||||||  |||| | |||||| ||| ||||||| ||| |    
T  31985207 ccgatattacccttaattatttatcttgaacaaagaaatatataaaacgagacattaaatgaataagactattctagtaaaaatataaattattatatta 31985108  T
Q  436 aaagtaataacatttattgattgtcttgctttgtgtaaaatgtcataaaatgacaattaaaaag 499  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||| ||| ||||| ||||    
T  31985107 aaagtaatgacatttattgattgtcttgatttatgtaaaatgtcaaaaagtgataattagaaag 31985044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 119; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 236 - 514
Target Start/End: Original strand, 425091 - 425363
Alignment:
Q  236 tactcactccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttatttcaatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaactttaaatgttatttta 335  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||| |||||    
T  425091 tactccctccgttcatttttaagtgtcacttttggagaaattttttgtttctgtttaactgtcattttcaaagttcaatgcaacaataaatgttgtttta 425190  T
Q  336 tcaatattacccttagttatttattgtggagatagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggatattatggtaaaagtatcaattattgtatca 435  Q
     ||| ||| | ||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||     || |||||| |||||| |||  ||||| || | |    
T  425191 ccaacatttctcttagttatttattgcggagagagaaataaatgaaataagatattaaatg-----ggttattatagtaaaaatatacattatagtctaa 425285  T
Q  436 aaagtaataacatttattgattgtcttgctttgtgtaaaatgtcataaaatgacaattaaaaaggagcggaggtagtaa 514  Q
     ||  | ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  425286 gaaaaagtaacatttattgagtgtcttgatttgtgtaaaatgtca-aaaatgacagttaaaaaggaacggaggtagtaa 425363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 119; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 236 - 514
Target Start/End: Complemental strand, 12723216 - 12722938
Alignment:
Q  236 tactcactccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttatttcaatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaactttaaatgttatttta 335  Q
    ||||| ||| |||||||||||| ||||| |||||||||||  |||| || | |||||| ||||||||| |||||||||||||||  ||| |||| |||||    
T  12723216 tactccctctgttcctttttaactgtcatttttggagaaaaattttgttcctatttaattgtcacttttaaagttcaatgcaacactaattgttgtttta 12723117  T
Q  336 tcaatattacccttagttatttattgtggagatagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggatattatggtaaaagtatcaattattgtatca 435  Q
     ||||||||||||||  ||||||||| ||||| ||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||   ||| | |||||||||  ||  |||||||||    
T  12723116 ccaatattacccttatatatttattgcggagagagaaacatatgaaatgaaatattaaattaataagatcattttagtaaaagtaaaaacaattgtatca 12723017  T
Q  436 aaagtaataacatttattgattgtcttgctttgtgtaaaatgtcataaaatgacaattaaaaaggagcggaggtagtaa 514  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||| | ||||||||||    
T  12723016 aaagtagtaatatttattgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaaagtgagaattaaaaaggaacagaggtagtaa 12722938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 119; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 243 - 441
Target Start/End: Original strand, 31802758 - 31802955
Alignment:
Q  243 tccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttatttcaatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaactttaaatgttattttatcaatat 342  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||    
T  31802758 tccgtttctttttaagtgtctcttttggagaaaattttg-tttcaatttaactgtcattttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatat 31802856  T
Q  343 tacccttagttatttattgtggagatagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggatattatggtaaaagtatcaattattgtatcaaaagta 441  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | || |||||||||  ||||||||||| |||||||  |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  31802857 tacccttagttatttattgtggagagaaaattatatgaaagaagatattaaattaataaggtcattatgataaaagtataaattattgtatcaaaagta 31802955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 118; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 234 - 507
Target Start/End: Original strand, 5119138 - 5119411
Alignment:
Q  234 tatactcactccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttatttcaatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaactttaaatgttattt 333  Q
    |||||||  ||| ||||||||||||| || ||||||||||| |||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||| | |||||| || |||    
T  5119138 tatactccatcctttcctttttaagtttctcttttggagaatttttttgtttctatttaactgccactttcaaagttcaatgcatcattaaatattgttt 5119237  T
Q  334 tatcaatattacccttagttatttattgtggagatagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggatattatggtaaaagtatcaattattgtat 433  Q
    || |||||||| |||| ||||||||||   |||| | |||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||| |||||||||| | |||||| ||    
T  5119238 taccaatattatcctttgttatttattactgagagaaaaatatatgaaatgagatgttaaattaataaggttattatagtaaaagtataacttattgcat 5119337  T
Q  434 caaaagtaataacatttattgattgtcttgctttgtgtaaaatgtcataaaatgacaattaaaaaggagcggag 507  Q
    ||||||||  |||| ||||||||||| ||  ||||| |||||| | | |||||||||||||||||||| |||||    
T  5119338 caaaagtagaaacaattattgattgtattaatttgtataaaatattaaaaaatgacaattaaaaaggaacggag 5119411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 118; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 236 - 513
Target Start/End: Complemental strand, 9127608 - 9127331
Alignment:
Q  236 tactcactccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttatttcaatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaactttaaatgttatttta 335  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||  |||||  |||||||||| ||   |||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  9127608 tactccctccgttcctttttaagtgtctattttgatgaaattttttgttcgtatttaattgtcacttttaaagttcaatgcaacattaaatgttatttta 9127509  T
Q  336 tcaatattacccttagttatttattgtggagatagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggatattatggtaaaagtatcaattattgtatca 435  Q
     |||||||| | ||| |||||||||  ||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||||  ||||| |||||||||  | |||||| ||||    
T  9127508 ccaatattatctttaattatttattacggagagagaaatatataaaataagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtacaacttattgcatca 9127409  T
Q  436 aaagtaataacatttattgattgtcttgctttgtgtaaaatgtcataaaatgacaattaaaaaggagcggaggtagta 513  Q
    ||||| |||||| | ||||| | | ||| ||| |||||||||||| ||  |||||||||||||||| |||||||||||    
T  9127408 aaagtgataacaatcattgactattttggtttatgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaacggaggtagta 9127331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 116; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 271 - 498
Target Start/End: Original strand, 24228945 - 24229172
Alignment:
Q  271 agaaattttttatttcaatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaactttaaatgttattttatcaatattacccttagttatttattgtggagatag 370  Q
    |||||||||||  | | |||||| ||| |||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| | ||| |||||||||| ||||| ||    
T  24228945 agaaattttttgctcctatttaattgttactttcgaagttcaatgcaacattaaatgttgttttatcaatattatctttacttatttattgcggagagag 24229044  T
Q  371 aaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggatattatggtaaaagtatcaattattgtatcaaaagtaataacatttattgattgtcttgctttgtg 470  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||| |||||||| |  ||| |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  24229045 aaatatatgaaattagatattgaatgaataaggttattatagtaaaagtgtatattgttgtatcaaaagtagtaacatttattgaatgtcttggtttgtg 24229144  T
Q  471 taaaatgtcataaaatgacaattaaaaa 498  Q
    |||||| ||| |||| ||||||||||||    
T  24229145 taaaatatcagaaaaagacaattaaaaa 24229172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #55
Raw Score: 115; E-Value: 8e-58
Query Start/End: Original strand, 288 - 514
Target Start/End: Complemental strand, 1088138 - 1087912
Alignment:
Q  288 atttaactgtcactttcaaagttcaatgcaactttaaatgttattttatcaatattacccttagttatttattgtggagatagaaatatatgaaatgaga 387  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||  |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  1088138 atttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgaga 1088039  T
Q  388 tattaaatgaataaggatattatggtaaaagtatcaattattgtatcaaaagtaataacatttattgattgtcttgctttgtgtaaaatgtcataaaatg 487  Q
    |||||||||||||| |   |||| |||||| |||   |||||| |||||||||| || || || |||||||||||| |||||||||||||| | ||  ||    
T  1088038 tattaaatgaataaagtcgttatagtaaaaatatagtttattgcatcaaaagtagtatcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatgttaaaatgtg 1087939  T
Q  488 acaattaaaaaggagcggaggtagtaa 514  Q
    |||||||||||| | ||||||||||||    
T  1087938 acaattaaaaagaaacggaggtagtaa 1087912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #56
Raw Score: 115; E-Value: 8e-58
Query Start/End: Original strand, 235 - 510
Target Start/End: Original strand, 18465662 - 18465933
Alignment:
Q  235 atactcactccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttatttcaatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaactttaaatgttatttt 334  Q
    |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || | ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| || ||||    
T  18465662 atactcccaccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaaatttttgttcctatttaactgccactttcaaagttcaatgcaacattaaatattgtttt 18465761  T
Q  335 atcaatattacccttagttatttattgtggagatagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggatattatggtaaaagtatcaattattgtatc 434  Q
    | |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    |||||||||| ||   |||||| |||||||||| | |||||  |||    
T  18465762 accaatattatccttagttatttattgtggagagagaaatatatgaaatg----attaaatgaacaaaattattatagtaaaagtataacttattacatc 18465857  T
Q  435 aaaagtaataacatttattgattgtcttgctttgtgtaaaatgtcataaaatgacaattaaaaaggagcggaggta 510  Q
    ||||||| || || || |||||||| ||| ||| || ||||| ||| || |||| ||||||||||||  |||||||    
T  18465858 aaaagtagtatcaattgttgattgttttggtttctgaaaaatatcaaaatatgataattaaaaaggaatggaggta 18465933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #57
Raw Score: 114; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 233 - 513
Target Start/End: Complemental strand, 1297998 - 1297717
Alignment:
Q  233 ttatactcactccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttatttcaatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaactttaaatgttatt 332  Q
    |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| || | |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| || ||    
T  1297998 ttatactctctccgttcttttttaagtgtcacttttggagaaaatttttgttcctatttaactgtcactttcaaaattcaatgcaacattaaatattgtt 1297899  T
Q  333 ttatcaatattacccttagttatttattgtggagatagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggatattatggtaaaagtatcaattattgta 432  Q
    ||| |||||||  |||||||||||||||| | ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||   |||||| |    
T  1297898 ttaccaatattgtccttagttatttattgcgaagagataaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtatagcttattgca 1297799  T
Q  433 tc-aaaagtaataacatttattgattgtcttgctttgtgtaaaatgtcataaaatgacaattaaaaaggagcggaggtagta 513  Q
    || |||| || ||  | || |||||||||||  ||| | |||||||||| ||  | ||||||||||||||  ||||||||||    
T  1297798 tcaaaaaatagtattaattgttgattgtcttagtttatataaaatgtcaaaatgtaacaattaaaaaggaatggaggtagta 1297717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #58
Raw Score: 114; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 245 - 514
Target Start/End: Complemental strand, 2674226 - 2673957
Alignment:
Q  245 cgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttatttcaatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaactttaaatgttattttatcaatatta 344  Q
    ||||||||||||||| | | ||||||| |||   ||| |||  || |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||    
T  2674226 cgttcctttttaagtattatttttggaaaaaaaatttgtttgtatataactgccactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatatta 2674127  T
Q  345 cccttagttatttattgtggagatagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggatattatggtaaaagtatcaattattgtatcaaaagtaata 444  Q
     ||| ||||||||| || | ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||    ||||| ||||||||||   |||||| |||||||||||||    
T  2674126 tcctcagttatttactgcgaagagagaaatatatgaaattagatattaaatgaataaaatcattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaagtaata 2674027  T
Q  445 acatttattgattgtcttgctttgtgtaaaatgtcataaaatgacaattaaaaaggagcggaggtagtaa 514  Q
     || || |||||||||||| |||||||||||||||| ||  |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  2674026 tcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaacggaggtagtaa 2673957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #59
Raw Score: 112; E-Value: 5e-56
Query Start/End: Original strand, 251 - 510
Target Start/End: Complemental strand, 12870141 - 12869882
Alignment:
Q  251 tttttaagtgtcacttttggagaaattttttatttcaatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaactttaaatgttattttatcaatattaccctta 350  Q
    |||||||||||||||||| ||||||   ||| || | ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||| |||||||   ||||    
T  12870141 tttttaagtgtcacttttagagaaaaaatttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatacaacattaaatgttgttttaccaatattgttctta 12870042  T
Q  351 gttatttattgtggagatagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggatattatggtaaaagtatcaattattgtatcaaaagtaataacattt 450  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||  ||||| |||||||||| | |||||| |||||||||| || || ||    
T  12870041 gttatttattgcggagagagaaatatataaaatgaaatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtataacttattgcatcaaaagtagtatcaatt 12869942  T
Q  451 attgattgtcttgctttgtgtaaaatgtcataaaatgacaattaaaaaggagcggaggta 510  Q
     |||||| ||||| ||||| |||||| ||| ||  ||||||||||||| || ||||||||    
T  12869941 gttgattatcttggtttgtataaaatatcaaaatgtgacaattaaaaatgaacggaggta 12869882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #60
Raw Score: 112; E-Value: 5e-56
Query Start/End: Original strand, 242 - 513
Target Start/End: Original strand, 13703063 - 13703336
Alignment:
Q  242 ctccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttatttcaatttaa--ctgtcactttcaaagttcaatgcaactttaaatgttattttatcaa 339  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||  ||||  |||||||||||||||||||| ||||||||  ||||| |||    
T  13703063 ctccgttcctttttaatcgtcacttttagagaaattttttatttctatttaagactgttgctttcaaagttcaatgcaacattaaatgtagttttaccaa 13703162  T
Q  340 tattacccttagttatttattgtggagatagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggatattatggtaaaagt-atcaattattgtatcaaaa 438  Q
    ||||||| |||| ||||||||| ||||| ||||| ||||||| ||| || |||||| ||||||  |||||| |||||||| |  ||  ||||||||||||    
T  13703163 tattacctttagatatttattgcggagagagaaacatatgaagtgaaat-ttaaatcaataagactattatagtaaaagtaaaaaacaattgtatcaaaa 13703261  T
Q  439 gtaataacatttattgattgtcttgctttgtgtaaaatgtcataaaatgacaattaaaaaggagcggaggtagta 513  Q
     || ||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||| ||||| |||||    
T  13703262 atagtaatatttattgattgtcttgatttgtgtaaaatatcaaaaagtgacaattaaaaaggaacggagatagta 13703336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #61
Raw Score: 111; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 288 - 514
Target Start/End: Complemental strand, 39894014 - 39893788
Alignment:
Q  288 atttaactgtcactttcaaagttcaatgcaactttaaatgttattttatcaatattacccttagttatttattgtggagatagaaatatatgaaatgaga 387  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| || ||||| ||||||||||||||  ||||||||| ||||| ||||| ||||||||||| |    
T  39894014 atttaactgtcacttttaaagttcaatgcaacattaaatattgttttaccaatattacccttaaatatttattgcggagagagaaacatatgaaatgaaa 39893915  T
Q  388 tattaaatgaataaggatattatggtaaaagtatcaattattgtatcaaaagtaataacatttattgattgtcttgctttgtgtaaaatgtcataaaatg 487  Q
    |||||||| |||||||  ||||| |||||||||  ||  ||||||||||||||| ||||| ||||||||| | ||| |||||||||||||| | ||| ||    
T  39893914 tattaaattaataaggtcattatagtaaaagtaaaaacaattgtatcaaaagtagtaacacttattgattattttggtttgtgtaaaatgttaaaaagtg 39893815  T
Q  488 acaattaaaaaggagcggaggtagtaa 514  Q
    |||||||||||||| |||| |||||||    
T  39893814 acaattaaaaaggaacggatgtagtaa 39893788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #62
Raw Score: 110; E-Value: 7e-55
Query Start/End: Original strand, 251 - 498
Target Start/End: Complemental strand, 4962429 - 4962183
Alignment:
Q  251 tttttaagtgtcacttttggagaaattttttatttca-atttaactgtcactttcaaagttcaatgcaactttaaatgttattttatcaatattaccctt 349  Q
    |||||||||||| ||||| || ||| ||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||||  ||||||| | ||    
T  4962429 tttttaagtgtctcttttagaaaaactttttgtttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatggaacattaaatgttgttttacaaatattatcttt 4962330  T
Q  350 agttatttattgtggagatagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggatattatggtaaaagtatcaattattgtatcaaaagtaataacatt 449  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||    ||||| |||||||||| | |||||| ||||||||| |||||  |    
T  4962329 agttatttattgcggagaaagaaatatatgaaatgagatgttaaatgaataaaatcattatagtaaaagtataacttattgcatcaaaagtgataacggt 4962230  T
Q  450 tattgattgtcttgctttgtgtaaaatgtcataaaatgacaattaaaaa 498  Q
    |||||||| ||||| ||| |||||||||||  |||||||||||||||||    
T  4962229 tattgattatcttggtttatgtaaaatgtc--aaaatgacaattaaaaa 4962183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #63
Raw Score: 110; E-Value: 7e-55
Query Start/End: Original strand, 242 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 25027975 - 25027842
Alignment:
Q  242 ctccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttatttcaatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaactttaaatgttattttatcaata 341  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  25027975 ctccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttgttccaatttaactgtcattttcaaagttcaatgcaactttaaatgttgttttatcaata 25027876  T
Q  342 ttacccttagttatttattgtggagatagaaata 375  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  25027875 ttacccttagttatttattgcggagagagaaata 25027842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #64
Raw Score: 108; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 252 - 501
Target Start/End: Original strand, 26906470 - 26906717
Alignment:
Q  252 ttttaagtgtcacttttggagaaattttttatttcaatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaactttaaatgttatttt-atcaatattaccctta 350  Q
    |||||||| ||||||||| ||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||| | |||||| |||||||    
T  26906470 ttttaagtatcacttttgtagaaatttttg-tttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcagcattaaatgttgtttttaccaatatcaccctta 26906568  T
Q  351 gttatttattgtggagatagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggatattatggtaaaagtatcaattattgtatcaaaagtaataacattt 450  Q
    ||||||||||   ||||  |||||||||||||  ||||||||||||||| | | |||||| | ||||| || ||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  26906569 gttatttattacagaga--gaaatatatgaaacaagatattaaatgaatgatgttattattggaaaaggataaattattgtatcaaaagtagtaagattt 26906666  T
Q  451 attgattgtcttgctttgtgtaaaatgtcataaaatgacaattaaaaagga 501  Q
    ||||| ||| ||| |||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||    
T  26906667 attgaatgttttggtttgtgtaaaatatcaaaaagtgacaattaaaaagga 26906717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #65
Raw Score: 107; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 243 - 513
Target Start/End: Original strand, 31803293 - 31803563
Alignment:
Q  243 tccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttatttcaatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaactttaaatgttattttatcaatat 342  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||| ||||||   ||| ||   |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| | | |||||  |||||    
T  31803293 tccgttcctttttaactgtcatttttagagaaaaaatttgttcttatttaactatcactttcaaagttcaatgcaacattaaacgatgttttactaatat 31803392  T
Q  343 tacccttagttatttattgtggagatagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggatattatggtaaaagtatcaattattgtatcaaaagtaa 442  Q
    || |||||| ||||||||| ||||| ||||| ||||||| ||| ||||||||| || ||||   || | |||||||||  ||| |||||||||||||||     
T  31803393 tatccttagatatttattgcggagagagaaacatatgaattgaaatattaaattaacaaggtcgttttagtaaaagtaaaaataattgtatcaaaagtag 31803492  T
Q  443 taacatttattgattgtcttgctttgtgtaaaatgtcataaaatgacaattaaaaaggagcggaggtagta 513  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||||| || |||||||||||    
T  31803493 taacatttattaattgtcttgatttgtgtaaaatgtcaaaaagtgacaattaaaaaagaacggaggtagta 31803563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #66
Raw Score: 107; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 234 - 513
Target Start/End: Complemental strand, 38503059 - 38502784
Alignment:
Q  234 tatactcactccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttatttcaatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaactttaaatgttattt 333  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||   |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||    
T  38503059 tatactccctccgttcctttttaagtgtctcttttgaagaaattttttgttcatatttaactgtcactttcaaaattcaatgcaacattaaatattattt 38502960  T
Q  334 tatcaatattacccttagttatttattgtggagatagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggatattatggtaaaagtatcaattattgtat 433  Q
    || |||||||| |||||  ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||    |||  ||||| |||||||||  | |||||  ||    
T  38502959 taccaatattatccttaactatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatg----aggtcattatagtaaaagtacaacttattacat 38502864  T
Q  434 caaaagtaataacatttattgattgtcttgctttgtgtaaaatgtcataaaatgacaattaaaaaggagcggaggtagta 513  Q
    |||||||| ||||| | ||||| | | ||| |||||||||||||| | ||  | |||||||||||| | | |||||||||    
T  38502863 caaaagtagtaacaatcattgactattttggtttgtgtaaaatgttaaaatgtaacaattaaaaagaaacagaggtagta 38502784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #67
Raw Score: 106; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 230 - 499
Target Start/End: Complemental strand, 37306961 - 37306693
Alignment:
Q  230 atattatactcactccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttatttcaatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaactttaaatgtt 329  Q
    ||||| |||||  ||||||||||||||| |||||||||| ||||||  |||  || | | |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |    
T  37306961 atattttactccatccgttcctttttaactgtcacttttagagaaaaatttg-ttcctaattaactgtcacttttaaagttcaatgcaacattaaatgat 37306863  T
Q  330 attttatcaatattacccttagttatttattgtggagatagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggatattatggtaaaagtatcaattatt 429  Q
     ||||| ||||||||||||||| |||||||||  |||| | ||| ||||||| ||| ||||||||| || ||||  ||||| |||||||||  ||  |||    
T  37306862 gttttaccaatattacccttagatatttattgcagagagaaaaacatatgaattgaaatattaaattaacaaggtcattatagtaaaagtaagaacaatt 37306763  T
Q  430 gtatcaaaagtaataacatttattgattgtcttgctttgtgtaaaatgtcataaaatgacaattaaaaag 499  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| | ||| ||||||||||||||    
T  37306762 gtatcaaaagtagtaacatttattaattgtcttggtttgtgtaaaatgttaaaaagtgacaattaaaaag 37306693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #68
Raw Score: 104; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 246 - 513
Target Start/End: Original strand, 37809731 - 37809998
Alignment:
Q  246 gttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttatttcaatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaactttaaatgttattttatcaatattac 345  Q
    |||||||||||| |||||||||| ||||||   ||| || | | ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| | ||||| |||||||||    
T  37809731 gttcctttttaactgtcacttttagagaaaaaatttgttcctaattaactgtcactttcaaagttcattgcaacattaaatgatgttttaccaatattac 37809830  T
Q  346 ccttagttatttattgtggagatagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggatattatggtaaaagtatcaattattgtatcaaaagtaataa 445  Q
    |||||  |||||||||  |||| ||||| ||||||| | | ||||||||| || |||   ||||| |||||||||  ||  |||| |||||||||| |||    
T  37809831 ccttatatatttattgcagagagagaaacatatgaattaaaatattaaattaacaagatcattatagtaaaagtaaaaacaattgcatcaaaagtagtaa 37809930  T
Q  446 catttattgattgtcttgctttgtgtaaaatgtcataaaatgacaattaaaaaggagcggaggtagta 513  Q
    |||||||| ||||||||| |||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  37809931 catttattaattgtcttggtttgtgtaaaatatcaaaaagtgacaattaaaaaggatcggaggtagta 37809998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #69
Raw Score: 103; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 299 - 505
Target Start/End: Original strand, 7466207 - 7466413
Alignment:
Q  299 actttcaaagttcaatgcaactttaaatgttattttatcaatattacccttagttatttattgtggagatagaaatatatgaaatgagatattaaatgaa 398  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||||  | ||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||| ||||||||||| ||||||||| ||    
T  7466207 actttcaaacttcaatgcaacattaaatagtgttttaccaatattacccttagatatttattgcggagagagaaacatatgaaatgaaatattaaattaa 7466306  T
Q  399 taaggatattatggtaaaagtatcaattattgtatcaaaagtaataacatttattgattgtcttgctttgtgtaaaatgtcataaaatgacaattaaaaa 498  Q
    |||||  ||||| | |||||||  ||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||| ||| ||||| |||||||||||    
T  7466307 taaggtcattatagcaaaagtaaaaataattgtattaaaagtaataacatttattaattgtcttgatttatgtaaaatatcaaaaaataacaattaaaaa 7466406  T
Q  499 ggagcgg 505  Q
    |||||||    
T  7466407 ggagcgg 7466413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #70
Raw Score: 101; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 251 - 499
Target Start/End: Original strand, 3892790 - 3893036
Alignment:
Q  251 tttttaagtgtcacttttggagaaattttttatttcaatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaactttaaatgttattttatcaatattaccctta 350  Q
    |||||||  |||| ||||||||||||||||| || | |||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| || |||||||||||    
T  3892790 tttttaaccgtcatttttggagaaattttttgttcctatttaactatcacttt-aaagttcaatgcaacgttaaatgttattttaccagtattaccctta 3892888  T
Q  351 gttatttattgtggagatagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggatattatggtaaaagtatcaattattgtatcaaaagtaataacattt 450  Q
      ||||||||| ||||| ||||| ||||  ||| | ||||||||| |||||||  ||||| |||||||||  ||  |||||||||||| |||||| | ||    
T  3892889 aatatttattgcggagagagaaacatatataataaaatattaaattaataaggtcattatagtaaaagtaaaaacaattgtatcaaaaataataata-tt 3892987  T
Q  451 attgattgtcttgctttgtgtaaaatgtcataaaatgacaattaaaaag 499  Q
    |||||||| |||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  3892988 attgattgacttgatttgtgtaaaatgtcaaaaaataacaattaaaaag 3893036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #71
Raw Score: 101; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 289 - 513
Target Start/End: Complemental strand, 38308330 - 38308106
Alignment:
Q  289 tttaactgtcactttcaaagttcaatgcaactttaaatgttattttatcaatattacccttagttatttattgtggagatagaaatatatgaaatgagat 388  Q
    ||||||| ||||||||||| |||| || ||   |||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||||  ||| ||| ||| ||||||| ||||    
T  38308330 tttaactatcactttcaaaattcattgtaataataaatgttgttttatcaacattacccttagttatatattgtaaagagagacatacatgaaataagat 38308231  T
Q  389 attaaatgaataaggatattatggtaaaagtatcaattattgtatcaaaagtaataacatttattgattgtcttgctttgtgtaaaatgtcataaaatga 488  Q
    ||||||||| ||||| |||||| |||||||||| ||||||||||| ||||  | ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||| |||    
T  38308230 attaaatgactaaggctattatagtaaaagtatgaattattgtataaaaaaaagtaacatttattgagtgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaaagtga 38308131  T
Q  489 caattaaaaaggagcggaggtagta 513  Q
    |  |||||||||| |||||||||||    
T  38308130 ccgttaaaaaggaacggaggtagta 38308106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #72
Raw Score: 100; E-Value: 7e-49
Query Start/End: Original strand, 246 - 513
Target Start/End: Original strand, 37633648 - 37633915
Alignment:
Q  246 gttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttatttcaatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaactttaaatgttattttatcaatattac 345  Q
    ||||||||||||  ||||||||| ||||||   ||| |||| | ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| | ||||| |||||||||    
T  37633648 gttcctttttaaccgtcacttttagagaaaaaatttgtttctaattaactgtcactttcaaagttcattgcaacattaaatgatgttttaccaatattac 37633747  T
Q  346 ccttagttatttattgtggagatagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggatattatggtaaaagtatcaattattgtatcaaaagtaataa 445  Q
    |||||  |||||||||  || | ||||| ||||||| | | ||||||||| || |||   ||||| |||||||||  ||  ||||||||||||||| |||    
T  37633748 ccttatatatttattgcagaaagagaaacatatgaattaaaatattaaattaacaagatcattatagtaaaagtaaaaacaattgtatcaaaagtagtaa 37633847  T
Q  446 catttattgattgtcttgctttgtgtaaaatgtcataaaatgacaattaaaaaggagcggaggtagta 513  Q
    |||||||| ||||||||| |||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||| |||| ||||||    
T  37633848 catttattaattgtcttggtttgtgtaaaatatcaaaaagtgacaattaaaaaggatcggacgtagta 37633915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #73
Raw Score: 100; E-Value: 7e-49
Query Start/End: Original strand, 236 - 510
Target Start/End: Complemental strand, 40209225 - 40208957
Alignment:
Q  236 tactcactccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttatttcaatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaactttaaatgttatttta 335  Q
    ||||| |||||||  || ||||||||||||| |||||||||||||| || | |||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||| |||||    
T  40209225 tactccctccgttttttattaagtgtcacttctggagaaattttttgttcctatttaactgtcactttcaaaattcaatgcaacaataaatgttgtttta 40209126  T
Q  336 tcaatattacccttagttatttattgtggagatagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggatattatggtaaaagtatcaattattgtatca 435  Q
     ||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||  ||||||||||||       |||||| |||||||||| |||||||| || |    
T  40209125 ccaacattacccttagttatttattgtggatagagaaatataggaaatatgatattaaatga------ctattatagtaaaagtataaattattgcataa 40209032  T
Q  436 aaagtaataacatttattgattgtcttgctttgtgtaaaatgtcataaaatgacaattaaaaaggagcggaggta 510  Q
     ||  | ||| ||||||||| ||||||  ||| |||||||||||| ||| ||||  |||||||||| ||||||||    
T  40209031 gaaaaagtaatatttattgagtgtcttagtttatgtaaaatgtcaaaaactgacggttaaaaaggaacggaggta 40208957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #74
Raw Score: 98; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 242 - 475
Target Start/End: Original strand, 21150460 - 21150693
Alignment:
Q  242 ctccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttatttcaatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaactttaaatgttattttatcaata 341  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |  ||    
T  21150460 ctccgttcctttttaattgtcacttttgcataaattttttgtttctaattaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccttta 21150559  T
Q  342 ttacccttagttatttattgtggagatagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggatattatggtaaaagtatcaattattgtatcaaaagta 441  Q
    ||||||||  ||||||||||| |||| | || |||||||||| |||||||||||||  |||| | |||| | ||||  || |||| ||||||||||||||    
T  21150560 ttacccttgattatttattgtagagagataagtatatgaaataagatattaaatgatgaaggtttttatagaaaaaagatgaattgttgtatcaaaagta 21150659  T
Q  442 ataacatttattgattgtcttgctttgtgtaaaa 475  Q
     ||| || ||||  |||||||| |||||||||||    
T  21150660 gtaaaatgtatttgttgtcttggtttgtgtaaaa 21150693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #75
Raw Score: 97; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 242 - 513
Target Start/End: Original strand, 21157601 - 21157872
Alignment:
Q  242 ctccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttatttcaatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaactttaaatgttattttatcaata 341  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| | ||| ||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |  ||    
T  21157601 ctccgttcctttttaattgtcacttttgcataaaatttttgtttctaattaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccttta 21157700  T
Q  342 ttacccttagttatttattgtggagatagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggatattatggtaaaagtatcaattattgtatcaaaagta 441  Q
    ||||||||  ||||||||||| |||| | || |||||||||| |||||||||||||  |||| | |||| | ||||  || |||| ||||||||||||||    
T  21157701 ttacccttgattatttattgtagagagataagtatatgaaataagatattaaatgatgaaggtttttatagaaaaaagatgaattgttgtatcaaaagta 21157800  T
Q  442 ataacatttattgattgtcttgctttgtgtaaaatg-tcataaaatgacaattaaaaaggagcggaggtagta 513  Q
     ||| || ||||  |||||||| |||||||||||   ||| ||| |||||||||||||||| |||||| ||||    
T  21157801 gtaaaatgtatttgttgtcttggtttgtgtaaaaaactca-aaagtgacaattaaaaaggaacggagggagta 21157872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #76
Raw Score: 96; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 236 - 506
Target Start/End: Complemental strand, 5843250 - 5842980
Alignment:
Q  236 tactcactccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttatttcaatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaactttaaatgttatttta 335  Q
    ||||| ||| ||||||||||||  || |||||| |||||||||||| || | |||||||||||  ||||||||||||||||||  ||||||||  |||||    
T  5843250 tactccctctgttcctttttaatcgttacttttagagaaattttttgttcctatttaactgtcgttttcaaagttcaatgcaatattaaatgtagtttta 5843151  T
Q  336 tcaatattacccttagttatttattgtggagatagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggatattatggtaaaagt-atcaattattgtatc 434  Q
    ||||||| ||| |||| |||||||||  |||  ||||| ||||||| ||| || |||||| ||||||  |||||| |||||||| |  ||  ||||||||    
T  5843150 tcaatatcacctttagatatttattgcagagtgagaaacatatgaagtgaaat-ttaaatcaataagactattatagtaaaagtaaaaaacaattgtatc 5843052  T
Q  435 aaaagtaataacatttattgattgtcttgctttgtgtaaaatgtcataaaatgacaattaaaaaggagcgga 506  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||| ||| |||||||||||| ||||    
T  5843051 aaaagtagtaacatttattgattgtcttggtttatgtaaaatgtcaaaaagtgataattaaaaaggaacgga 5842980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #77
Raw Score: 96; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 374 - 513
Target Start/End: Complemental strand, 25027694 - 25027555
Alignment:
Q  374 tatatgaaatgagatattaaatgaataaggatattatggtaaaagtatcaattattgtatcaaaagtaataacatttattgattgtcttgctttgtgtaa 473  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||| |||||    
T  25027694 tatatgaaatgaaatattaaatgaataaggatattatagtaaaagtatcaattattgtatcaaaagtagtaacatttattgattgtcttagtttatgtaa 25027595  T
Q  474 aatgtcataaaatgacaattaaaaaggagcggaggtagta 513  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||| | |||| ||||||    
T  25027594 aatgtcacaaagtgacaattaaaaagaaacggatgtagta 25027555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #78
Raw Score: 96; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 234 - 501
Target Start/End: Complemental strand, 37303366 - 37303099
Alignment:
Q  234 tatactcactccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttatttcaatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaactttaaatgttattt 333  Q
    ||||||| ||||||| ||||||| |||||  ||||| |||  |||| | |||| |||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||| |||    
T  37303366 tatactctctccgtttctttttatgtgtcttttttgaagattttttctgtttctatttaactgtcactttcaaaattcaatacaacattaaatgttgttt 37303267  T
Q  334 tatcaatattacccttagttatttattgtggagatagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggatattatggtaaaagtatcaattattgtat 433  Q
     | |||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||| |||||| ||  | |||||  ||    
T  37303266 caccaatattatccttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataagatcattatagtaaaaatacaacttattacat 37303167  T
Q  434 caaaagtaataacatttattgattgtcttgctttgtgtaaaatgtcataaaatgacaattaaaaagga 501  Q
    |||||||| ||| | | || || |  |||  ||| |||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  37303166 caaaagtagtaataatcatcgactaccttagtttatgtaaaatgtcaaaatatgacaattaaaaagga 37303099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #79
Raw Score: 95; E-Value: 6e-46
Query Start/End: Original strand, 283 - 501
Target Start/End: Original strand, 13461019 - 13461237
Alignment:
Q  283 tttcaatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaactttaaatgttattttatcaatattacccttagttatttattgtggagatagaaatatatgaaa 382  Q
    |||| |||||||||||||||| || ||| ||||||||  |||||||| ||||| ||| ||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||| |||    
T  13461019 tttctatttaactgtcacttttaatgttgaatgcaacaataaatgttgttttaccaacattactcttaattatttattgtggagagagaaatatataaaa 13461118  T
Q  383 tgagatattaaatgaataaggatattatggtaaaagtatcaattattgtatcaaaagtaataacatttattgattgtcttgctttgtgtaaaatgtcata 482  Q
    | |||||||||||||| |||  ||||||  ||||| ||| ||||||||||| | ||  | ||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||| |    
T  13461119 taagatattaaatgaaaaagattattataataaaaatataaattattgtataacaaaaagtaacatttattgagtgtattggtttgtgtaaaatgtcaaa 13461218  T
Q  483 aaatgacaattaaaaagga 501  Q
    || ||||||||||||||||    
T  13461219 aagtgacaattaaaaagga 13461237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #80
Raw Score: 94; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 234 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 42394387 - 42394242
Alignment:
Q  234 tatactcactccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttatttcaatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaactttaaatgttattt 333  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||    
T  42394387 tatactccctccgttcctttttaagtgtcacttttgaagaaattttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacaataaatgttgttt 42394288  T
Q  334 tatcaatattacccttagttatttattgtggagatagaaatatatg 379  Q
    ||| || ||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||    
T  42394287 tatgaacattacccttaggtatttattggggagagagaaatatatg 42394242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #81
Raw Score: 93; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 241 - 421
Target Start/End: Complemental strand, 4689049 - 4688870
Alignment:
Q  241 actccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttatttcaatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaactttaaatgttattttatcaat 340  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||  |||| ||   |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||    
T  4689049 actccgttcctttttaagtgtca-ttttgaagaaaaattttgttcatatttaactgtcacttttaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaat 4688951  T
Q  341 attacccttagttatttattgtggagatagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggatattatggtaaaagtat 421  Q
    |||| ||||||||||||||||  |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||  ||||||||||    
T  4688950 attatccttagttatttattgcagagagaaaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattaaagtaaaagtat 4688870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #82
Raw Score: 90; E-Value: 6e-43
Query Start/End: Original strand, 301 - 498
Target Start/End: Original strand, 3243823 - 3244020
Alignment:
Q  301 tttcaaagttcaatgcaactttaaatgttattttatcaatattacccttagttatttattgtggagatagaaatatatgaaatgagatattaaatgaata 400  Q
    |||||||  |||||||||  ||||||||| |||||||||  ||  |||| ||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  3243823 tttcaaaaatcaatgcaatattaaatgttgttttatcaaatttgtcctttgttatttattgtggagagaaaaatatataaaatgagatattaaatgaata 3243922  T
Q  401 aggatattatggtaaaagtatcaattattgtatcaaaagtaataacatttattgattgtcttgctttgtgtaaaatgtcataaaatgacaattaaaaa 498  Q
    ||| |||||| | ||||  |  ||||||||||| |||| || ||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  3243923 aggctattataggaaaaacaaaaattattgtataaaaaatagtaacatttattaattgtcttgatttatgtaaaatgtcaaaaaatgacaattaaaaa 3244020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #83
Raw Score: 89; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 242 - 410
Target Start/End: Original strand, 25785875 - 25786043
Alignment:
Q  242 ctccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttatttcaatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaactttaaatgttattttatcaata 341  Q
    |||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||  |||| | ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||  || ||    
T  25785875 ctccgttcctttttaattgtcacttctgcagaaatttttagtttctaattaactgtcactttcaaagttcaatacaacattaaatgttgttttggcatta 25785974  T
Q  342 ttacccttagttatttattgtggagatagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggatattat 410  Q
    ||||||||  ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||    
T  25785975 ttacccttgattatttattgtagagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaggaaggttattat 25786043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #84
Raw Score: 88; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 310 - 513
Target Start/End: Original strand, 22582508 - 22582710
Alignment:
Q  310 tcaatgcaactttaaatgttattttatcaatattacccttagttatttattgtggagatagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggatatta 409  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||    
T  22582508 tcaatgtaacattaaatgttattttatcaatattattcttagttatttattgcggagagaaaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcatta 22582607  T
Q  410 tggtaaaagtatcaattattgtatcaaaagtaataacatttattgattgtcttgctttgtgtaaaatgtcataaaatgacaattaaaaaggagcggaggt 509  Q
    | ||| ||||||   |||||| |||||||||| ||  | || |||||||||||| ||||| |||||||||| ||  |||  ||||||||||| |||||||    
T  22582608 tagtacaagtatagtttattgcatcaaaagtagtataaattgttgattgtcttgatttgtataaaatgtcaaaatgtga-tattaaaaaggaacggaggt 22582706  T
Q  510 agta 513  Q
    ||||    
T  22582707 agta 22582710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #85
Raw Score: 83; E-Value: 9e-39
Query Start/End: Original strand, 247 - 508
Target Start/End: Complemental strand, 18393217 - 18392956
Alignment:
Q  247 ttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttatttcaatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaactttaaatgttattttatcaatattacc 346  Q
    ||||||||||| ||||||||||| | || |||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||  |  |||||||    
T  18393217 ttcctttttaattgtcacttttgcataatttttttgtttctaattaactgtcactttcaaagttcaatacaacattaaatgttgttttgcctttattacc 18393118  T
Q  347 cttagttatttattgtggagatagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggatattatggtaaaagtatcaattattgtatcaaaagtaataac 446  Q
    |||  ||||||||||| |||| |||| || |||||||||||||||||||||  |||| |||||| | ||||  || |||| ||| |||||||||| |||     
T  18393117 cttgattatttattgtagagagagaagtaaatgaaatgagatattaaatgatgaaggttattataggaaaaagatgaattgttgcatcaaaagtagtaaa 18393018  T
Q  447 atttattgattgtcttgctttgtgt-aaaatgtcataaaatgacaattaaaaaggagcggagg 508  Q
    |  ||||  |||||||| ||| ||| ||||| ||| ||| |||||||||||||||| ||||||    
T  18393017 aagtatttgttgtcttggtttatgtaaaaatctca-aaagtgacaattaaaaaggaacggagg 18392956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #86
Raw Score: 80; E-Value: 6e-37
Query Start/End: Original strand, 231 - 421
Target Start/End: Complemental strand, 38298061 - 38297874
Alignment:
Q  231 tattatactcactccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttatttcaatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaactttaaatgtta 330  Q
    |||||||||| ||||||| ||||||||||| | |||||| | || |||||| || | |||||||||||||||||||||||  ||||| | |||||||||     
T  38298061 tattatactccctccgtttctttttaagtgcctcttttgaataattttttt-ttcctatttaactgtcactttcaaagtt--atgcatcattaaatgttg 38297965  T
Q  331 ttttatcaatattacccttagttatttattgtggagatagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggatattatggtaaaagtat 421  Q
    ||||| |||||||| |||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| || |||||| ||||||| ||||||  |||||||||    
T  38297964 ttttaccaatattatcctttgttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgatatgttaaattaataaggttattatactaaaagtat 38297874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #87
Raw Score: 79; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 242 - 475
Target Start/End: Complemental strand, 18676664 - 18676433
Alignment:
Q  242 ctccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttatttcaatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaactttaaatgttattttatcaata 341  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||| |||  | |||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |  ||    
T  18676664 ctccgttcctttttaattgtcacttttgcataaattttttgtttttaatta--tgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccttta 18676567  T
Q  342 ttacccttagttatttattgtggagatagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggatattatggtaaaagtatcaattattgtatcaaaagta 441  Q
    ||| ||||  ||||||||||| |||| |||| ||||||||||  ||||||||||||  |||| |||||| | ||||  || |||| ||||||||||||||    
T  18676566 ttatccttgattatttattgtagagagagaagtatatgaaataggatattaaatgatgaaggttattataggaaaaagatgaattgttgtatcaaaagta 18676467  T
Q  442 ataacatttattgattgtcttgctttgtgtaaaa 475  Q
     ||| |  ||||  |||||||| |||||||||||    
T  18676466 gtaaaaagtatttgttgtcttgatttgtgtaaaa 18676433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #88
Raw Score: 77; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 236 - 513
Target Start/End: Complemental strand, 9959134 - 9958863
Alignment:
Q  236 tactcactccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttatttcaatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaactttaaatgttatttta 335  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||||||| ||| |||||| ||||| |||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||  | ||||||| |||||    
T  9959134 tactccctccgttcctttttacgtgtcacatttagagaaaatttttgtttctatttaaccgtcgctttcaaagttcaatgcaatatcaaatgttgtttta 9959035  T
Q  336 tcaatattacccttagttatttattgtggagatagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggatattatggtaaaagtatcaattattgtatca 435  Q
     |||||||| |||||  ||||||||    ||| | |||| ||||    || | || |||  ||||||  |||||| |||||||| | |||||||||||||    
T  9959034 ccaatattatccttacctatttattacaaagagaaaaat-tatg----gacaaat-aaacaaataagattattatagtaaaagtgtaaattattgtatca 9958941  T
Q  436 aaagtaataacatttattgattgtcttgctttgtgtaaaatgtcataaaatgacaattaaaaaggagcggaggtagta 513  Q
    |||||| | ||||||||||| ||| ||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||| || || ||||||||    
T  9958940 aaagtagtgacatttattgaatgtattgatttgtgtaaattgtcaaaaaatgacaattaaaaatgaacgaaggtagta 9958863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #89
Raw Score: 74; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 247 - 507
Target Start/End: Complemental strand, 11413776 - 11413516
Alignment:
Q  247 ttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttatttcaatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaactttaaatgttattttatcaatattacc 346  Q
    ||||||||||| ||||||||||| | ||||||||| |||  | |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||    |||||||    
T  11413776 ttcctttttaattgtcacttttgcataaattttttgtttttaattaactatcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttacatttattacc 11413677  T
Q  347 cttagttatttattgtggagatagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggatattatggtaaaagtatcaattattgtatcaaaagtaataac 446  Q
     ||  ||||||||| | |||| |||| ||| |||||| |||||||||||||  |||| |||||| | ||||  || |||| |||||||||||||| |||     
T  11413676 tttgattatttattatagagagagaagtatgtgaaattagatattaaatgatgaaggttattataggaaaaagatgaattgttgtatcaaaagtagtaaa 11413577  T
Q  447 atttattgattgtcttgctttgtgtaaaatg-tcataaaatgacaattaaaaaggagcggag 507  Q
    |  ||||  |||||||| |||||||||||   ||| ||||||| |||||||||||| |||||    
T  11413576 aagtatttgttgtcttggtttgtgtaaaaaactca-aaaatgataattaaaaaggaacggag 11413516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #90
Raw Score: 74; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 243 - 513
Target Start/End: Complemental strand, 24469886 - 24469617
Alignment:
Q  243 tccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttatttca-atttaactgtcactttcaaa-gttcaatgcaactttaaatgttattttatcaat 340  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||   |||| |||||||||||||||| ||| |||||||| |||  |||||||| ||||| |||     
T  24469886 tccgttcctttttaagtatcacttt-gaagaaatttttg--ttcatatttaactgtcactttaaaaagttcaatgtaacaataaatgttgttttaccaac 24469790  T
Q  341 attacccttagttatttattgtggagatagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggatattatggtaaaagtatcaattattgtatcaaaagt 440  Q
    |||| ||||| ||||||||||  ||||   |||| ||| |||| ||||||||||||| ||||| |||||| |||||| ||| ||| ||||||| | ||      
T  24469789 attatccttaattatttattgcagagaggaaaatttattaaataagatattaaatgactaaggttattatagtaaaaatataaatcattgtataagaaaa 24469690  T
Q  441 aataacatttattgattgtcttgctttgtgtaaaatgtcataaaatgacaattaaaaaggagcggaggtagta 513  Q
    | |||||||||| |  ||||||| |||||||||||||| | ||| ||||| | |||||||| |||||||||||    
T  24469689 agtaacatttatagtgtgtcttggtttgtgtaaaatgttaaaaattgacagtcaaaaaggaacggaggtagta 24469617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #91
Raw Score: 73; E-Value: 9e-33
Query Start/End: Original strand, 234 - 501
Target Start/End: Original strand, 4440051 - 4440316
Alignment:
Q  234 tatactcactccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttatttcaatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaactttaaatgttattt 333  Q
    ||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||  ||   |||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  4440051 tatactccctccgttcctttataactgtcacttttacagt--ttttttgtttctaattaactgtcactttcaaagttcaatgtaacattaaatgttattt 4440148  T
Q  334 tatcaatattacccttagttatttattgtggagatagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggatattatggtaaaagtatcaattattgtat 433  Q
    |  | ||| | |||||||| ||||||||  ||   | |||||||| ||||  |||||||||| | ||| |||||||| |  |||  || |||||||||||    
T  4440149 ttcctataatgcccttagtaatttattggagactgaaaaatatataaaatatgatattaaataattaaagatattataggcaaaacataaattattgtat 4440248  T
Q  434 caaaagtaataacatttattgattgtcttgctttgtgtaaaatgtcataaaatgacaattaaaaagga 501  Q
    |||||||| ||| ||  ||| | ||||||| ||||||||||| || | || |||||||||||||||||    
T  4440249 caaaagtagtaaaatacatttagtgtcttggtttgtgtaaaaagttaaaatatgacaattaaaaagga 4440316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #92
Raw Score: 71; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 244 - 500
Target Start/End: Complemental strand, 12638189 - 12637940
Alignment:
Q  244 ccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttatttcaatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaactttaaatgttattttatcaatatt 343  Q
    |||||||||||||| ||| |||||| ||||||   ||| ||   |||||| ||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||    
T  12638189 ccgttcctttttaattgttacttttagagaaaaaatttgttcgtatttaattgttacttttaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttatcaaaatt 12638090  T
Q  344 acccttagttatttattgtggagatagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggatattatggtaaaagtatcaattattgtatcaaaagtaat 443  Q
    ||| |||| |||||||||  || | ||||| ||||||||||| |||||||||       |  ||||| |||||  ||  ||  ||||||||||||||| |    
T  12638089 acctttagatatttattgcagaaagagaaacatatgaaatgaaatattaaat-------gtcattatagtaaagataaaaacaattgtatcaaaagtagt 12637997  T
Q  444 aacatttattgattgtcttgctttgtgtaaaatgtcataaaatgacaattaaaaagg 500  Q
    || ||||||||||||||||| ||| |||||||||| | ||| |||||||||||||||    
T  12637996 aatatttattgattgtcttgatttatgtaaaatgttaaaaagtgacaattaaaaagg 12637940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #93
Raw Score: 69; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 236 - 375
Target Start/End: Original strand, 3686356 - 3686494
Alignment:
Q  236 tactcactccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttatttcaatttaactgtcacttt-caaagttcaatgcaactttaaatgttatttt 334  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| || | |||||| ||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  3686356 tactccctccgttcctttttaagtgtcacttttggag-atttttttgttcctatttaagtgtcactttacatagttcaatgcaacattaaatgttatttt 3686454  T
Q  335 atcaatattacccttagttatttattgtggagatagaaata 375  Q
    |  ||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||    
T  3686455 actaatattacccttattta-ttattgtggagagagaaata 3686494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #94
Raw Score: 69; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 234 - 513
Target Start/End: Original strand, 4608984 - 4609264
Alignment:
Q  234 tatactcactccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttatttcaatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaactttaaatgttattt 333  Q
    ||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||| | || |||||| |||  | |||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||    
T  4608984 tatactccctccattcctttttaattgtcacttttgcataatttttttgtttttaattaagtgtcactttcaaagttcaatacaacattaaatgttgttt 4609083  T
Q  334 tatcaatattacccttagttatttattgtggagatagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggatattatggtaaaagtatcaattattgtat 433  Q
    |  |  ||||||| ||  ||||||||||| |||| |||| || |||||||||||||||||||||  |||| |||||  | ||||  || |||| ||| ||    
T  4609084 tgcctttattacctttgattatttattgtagagagagaagtaaatgaaatgagatattaaatgatgaaggttattacaggaaaaagatgaattgttgcat 4609183  T
Q  434 caaaagtaataacatttattgattgtcttgctttgtgtaaaatgtcataaaa-tgacaattaaaaaggagcggaggtagta 513  Q
    |||||||| ||| |  |||   |||||||| |||||||||||   |  |||| |||||||||||||||| |||||| ||||    
T  4609184 caaaagtagtaaaaagtatgtgttgtcttggtttgtgtaaaaaaactcaaaagtgacaattaaaaaggaacggagggagta 4609264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #95
Raw Score: 66; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 242 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 10889345 - 10889244
Alignment:
Q  242 ctccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttatttcaatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaactttaaatgttattttatcaata 341  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || | |||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||    
T  10889345 ctccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaaatttttgttcctatttaactgtcatttttaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaata 10889246  T
Q  342 tt 343  Q
    ||    
T  10889245 tt 10889244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #96
Raw Score: 64; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 312 - 514
Target Start/End: Original strand, 18000377 - 18000572
Alignment:
Q  312 aatgcaactttaaatgttattttatcaatattacccttagttatttattgtggagatagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggatattatg 411  Q
    |||||||| ||||||| | |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||| ||||| | ||| ||||||||| || ||||      |     
T  18000377 aatgcaacattaaatgatgttttatcaatattaaccttagatatttattgtggagagagaaacatatgtattgaaatattaaattaacaagg------tc 18000470  T
Q  412 gtaaaagtatcaattattgtatcaaaagtaataacatttattgattgtcttgctttgtgtaaaatgtcataaaatgacaattaaaaaggagcggaggtag 511  Q
     ||||||||  ||| ||| ||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||| |||||||||||||||| ||  | |||||||||||||| |||||||||    
T  18000471 ataaaagtaaaaataattctatcaaaagtagtaaca-ttattaattgttttggtttgtgtaaaatgtcaaaaggtaacaattaaaaaggaacggaggtag 18000569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #97
Raw Score: 63; E-Value: 8e-27
Query Start/End: Original strand, 376 - 498
Target Start/End: Complemental strand, 42393865 - 42393743
Alignment:
Q  376 tatgaaatgagatattaaatgaataaggatattatggtaaaagtatcaattattgtatcaaaagtaataacatttattgattgtcttgctttgtgtaaaa 475  Q
    |||||||| ||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||| ||||||||||| | ||  ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  42393865 tatgaaataagatattaaatgactaaggctattatagtaaaagtataaattattgtataagaaaaaataacatttattgattatcttggtttgtgtaaaa 42393766  T
Q  476 tgtcataaaatgacaattaaaaa 498  Q
    ||||| |||  |||| |||||||    
T  42393765 tgtcaaaaagcgacagttaaaaa 42393743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #98
Raw Score: 62; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 288 - 441
Target Start/End: Complemental strand, 7735288 - 7735135
Alignment:
Q  288 atttaactgtcactttcaaagttcaatgcaactttaaatgttattttatcaatattacccttagttatttattgtggagatagaaatatatgaaatgaga 387  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||  || |||||| ||||| ||| |||| |||||  ||||||||| ||||| ||||| ||||||||||| |    
T  7735288 atttaactgtcactgtcaaaattcaatgcaaaattcaatgttgttttaccaacattatccttatatatttattgcggagagagaaacatatgaaatgaaa 7735189  T
Q  388 tattaaatgaataaggatattatggtaaaagtatcaattattgtatcaaaagta 441  Q
    |||||||| ||||||| |||||| ||||||| |  ||  |||||||||||||||    
T  7735188 tattaaattaataaggctattatagtaaaagcaaaaacaattgtatcaaaagta 7735135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #99
Raw Score: 62; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 283 - 498
Target Start/End: Complemental strand, 17869513 - 17869297
Alignment:
Q  283 tttcaatttaactgtcacttt-caaagttcaatgcaactttaaatgttattttatcaatattacccttagttatttattgtggagatagaaatatatgaa 381  Q
    |||| |||||| ||||| ||| || |||| |||| ||| |||||||||||||||  ||||||||||||| ||||| || ||||||  ||||||||||| |    
T  17869513 tttctatttaagtgtcattttacatagttaaatggaacattaaatgttattttactaatattacccttatttatt-atcgtggagtaagaaatatatgta 17869415  T
Q  382 atgagatattaaatgaataaggatattatggtaaaagtatcaattattgtatcaaaagtaataacatttattgattgtcttgctttgt-gtaaaatgtca 480  Q
    |||||||||||||| ||||||  ||||||  ||||| ||  ||||||| |||||||||||  ||||||||||||  |||||  ||||| | |||||||||    
T  17869414 atgagatattaaataaataagattattataataaaaatagaaattattatatcaaaagtagcaacatttattgaccgtcttagtttgtggaaaaatgtca 17869315  T
Q  481 taaaatgacaattaaaaa 498  Q
     ||  |||||||||||||    
T  17869314 aaatgtgacaattaaaaa 17869297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #100
Raw Score: 62; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 331 - 480
Target Start/End: Original strand, 23418603 - 23418752
Alignment:
Q  331 ttttatcaatattacccttagttatttattgtggagatagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggatattatggtaaaagtatcaattattg 430  Q
    ||||| ||||||||   |||||||||||||   || | ||||||||| ||||| | ||||||||||||| ||| |||||    ||||| || ||||||||    
T  23418603 ttttaccaatattatggttagttatttattagagatagagaaatatacgaaataaaatattaaatgaatgaggctattaataaaaaaggataaattattg 23418702  T
Q  431 tatcaaaagtaataacatttattgattgtcttgctttgtgtaaaatgtca 480  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  23418703 tatcaaaggtaataacatttattgattgtcttgatttgtgtaaaatgtca 23418752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #101
Raw Score: 59; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 236 - 498
Target Start/End: Complemental strand, 13957417 - 13957155
Alignment:
Q  236 tactcactccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttatttcaatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaactttaaatgttatttta 335  Q
    ||||| |||||||||||| ||| ||||||||||  |||| |||||| |||| | |||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||| ||||     
T  13957417 tactccctccgttcctttataactgtcacttttacagaatttttttgtttccaattaactgtcactctcaaagttcaatgtaacattaaatgttgttttt 13957318  T
Q  336 tcaatattacccttagttatttattgtggagatagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggatattatggtaaaagtatcaattattgtatca 435  Q
    || |||   | |||||| ||||||||  |||| |  | ||||||||||  |||||||||| |  ||||||||||| |  |||  || | |||||||||||    
T  13957317 tctataaagctcttagtaatttattgaagagagaagagtatatgaaatatgatattaaataatcaaggatattataggcaaaacataagttattgtatca 13957218  T
Q  436 aaagtaataacatttattgattgtcttgctttgtgtaaaatgtcataaaatgacaattaaaaa 498  Q
    |||||| | | ||  ||| | ||||||| ||| ||||||| |||| ||  |||||||||||||    
T  13957217 aaagtagtgaaatacatttagtgtcttggtttatgtaaaaagtcaaaatgtgacaattaaaaa 13957155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #102
Raw Score: 58; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 259 - 501
Target Start/End: Complemental strand, 8849373 - 8849130
Alignment:
Q  259 tgtcacttttggagaaattttttatttcaatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaactttaaatgttattttatcaatattacccttagttattta 358  Q
    ||||||||||| | ||||||||| |||| | |||||| ||  ||||||||||||||| | | |||||||| | |||| | ||||||||||||  ||||||    
T  8849373 tgtcacttttgcataaattttttgtttctaattaactatcgttttcaaagttcaatgtatcattaaatgtgactttacctatattacccttatatattta 8849274  T
Q  359 ttgtggagatagaaatatatgaaatgaga--tattaaatgaataaggatattatggtaaaagtatcaattattgtatcaaaagtaataacatttattgat 456  Q
    |||  |||| |||||| ||||||||||||  |||||||||| ||||| |||||| | ||||  || | || |||||||||||||| ||| |  ||||  |    
T  8849273 ttgcagagagagaaatgtatgaaatgagaagtattaaatgattaaggttattatagaaaaaagataattttttgtatcaaaagtagtaa-aagtatttgt 8849175  T
Q  457 tgtcttgctttgtgtaaaatgtcataaaatgacaattaaaaagga 501  Q
    |||| || ||||||||||| |||| ||   |||||||||||||||    
T  8849174 tgtcatgatttgtgtaaaaagtcaaaatgagacaattaaaaagga 8849130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #103
Raw Score: 55; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 236 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 30368372 - 30368239
Alignment:
Q  236 tactcactccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttatttcaatttaactgtcacttt-caaagttcaatgcaactttaaatgttatttt 334  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| |||||  |||| |||||| ||   |||||| ||||||||| || || |||||||||| ||||||||||||||    
T  30368372 tactccctccgttcctttttaagtgtctcttttaaagaatttttttgttcttatttaagtgtcactttacatagatcaatgcaacattaaatgttatttt 30368273  T
Q  335 atcaatattacccttagttatttattgtggagata 369  Q
    |  ||||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  30368272 actaatattacccttattta-ttattgtggagata 30368239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #104
Raw Score: 54; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 380 - 501
Target Start/End: Original strand, 6330927 - 6331048
Alignment:
Q  380 aaatgagatattaaatgaataaggatattatggtaaaagtatcaattattgtatcaaaagtaataacatttattgattgtcttgctttgtgtaaaatgtc 479  Q
    ||||||||||||| |||||||||  |||||| |||||| ||| ||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||   ||| |||||||||||    
T  6330927 aaatgagatattacatgaataagattattatagtaaaaatataaattattttatcaaaagtagtaatatttattgattgtctaagtttatgtaaaatgtc 6331026  T
Q  480 ataaaatgacaattaaaaagga 501  Q
    | |||  || ||||||||||||    
T  6331027 aaaaagagataattaaaaagga 6331048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #105
Raw Score: 53; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 374 - 498
Target Start/End: Original strand, 3686790 - 3686914
Alignment:
Q  374 tatatgaaatgagatattaaatgaataaggatattatggtaaaagtatcaattattgtatcaaaagtaataacatttattgattgtcttgctttgtgtaa 473  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||| ||  |||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||| ||| | |||    
T  3686790 tatatgtaatgagatattaaataaataaggttattatagtaaaaatagaaattattgtatcaaaagtagcaacatttattgattgttttggtttatataa 3686889  T
Q  474 aatgtcataaaatgacaattaaaaa 498  Q
    || |||| ||  ||| |||||||||    
T  3686890 aacgtcaaaatgtgataattaaaaa 3686914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #106
Raw Score: 51; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 384 - 498
Target Start/End: Complemental strand, 30368244 - 30368130
Alignment:
Q  384 gagatattaaatgaataaggatattatggtaaaagtatcaattattgtatcaaaagtaataacatttattgattgtcttgctttgtgtaaaatgtcataa 483  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||| |||||| ||  ||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||  |||||||||||||| | ||    
T  30368244 gagatattaaataaataaggttattatagtaaaaataaaaattattatatcaaaaatagtaacatttattgattgtcttagtttgtgtaaaatgttaaaa 30368145  T
Q  484 aatgacaattaaaaa 498  Q
      | |||||||||||    
T  30368144 tgtaacaattaaaaa 30368130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #107
Raw Score: 51; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 374 - 480
Target Start/End: Complemental strand, 31546118 - 31546012
Alignment:
Q  374 tatatgaaatgagatattaaatgaataaggatattatggtaaaagtatcaattattgtatcaaaagtaataacatttattgattgtcttgctttgtgtaa 473  Q
    ||||||||||| | |||||| ||||| |||  ||| | |||||||||| | |||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  31546118 tatatgaaatgtgttattaattgaatcaggtcattgtagtaaaagtataacttattgcatcaaaagtagtaacaattattgattgtcttggtttgtgtaa 31546019  T
Q  474 aatgtca 480  Q
    |||||||    
T  31546018 aatgtca 31546012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #108
Raw Score: 47; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 425 - 507
Target Start/End: Complemental strand, 38297593 - 38297511
Alignment:
Q  425 ttattgtatcaaaagtaataacatttattgattgtcttgctttgtgtaaaatgtcataaaatgacaattaaaaaggagcggag 507  Q
    |||||| ||||||||||  |||| ||||||||||||||| |||||||||||||| | ||| |||||||||||||||| |||||    
T  38297593 ttattgcatcaaaagtagaaacaattattgattgtcttgttttgtgtaaaatgttaaaaagtgacaattaaaaaggaacggag 38297511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #109
Raw Score: 46; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 276 - 513
Target Start/End: Original strand, 36481077 - 36481314
Alignment:
Q  276 ttttttatttcaatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaactttaaatgttattttatcaatattacccttagttatttattgtggagatagaaata 375  Q
    |||||| |||| | |||| ||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||    ||| | |||||||| ||||||||  |||| | ||||     
T  36481077 ttttttgtttctaattaagtgtcattttcaaagttcaatgtaacattaaatgttgtttttcttataatgcccttagtaatttattgcagagagataaatt 36481176  T
Q  376 tatgaaatgagatattaaatgaataaggatattatggtaaaagtatcaattattgtatcaaaagtaataacatttattgattgtcttgctttgtgtaaaa 475  Q
    || |||||   ||||||||| | |||||||||||| |  |||  || | ||||||||||||||||| | | ||  ||| | ||| ||| |||||||||||    
T  36481177 taagaaatataatattaaataattaaggatattataggcaaaccataagttattgtatcaaaagtagtgaaatacatttaatgttttggtttgtgtaaaa 36481276  T
Q  476 tgtcataaaatgacaattaaaaaggagcggaggtagta 513  Q
     |||| || |||| |||||||||||| |||||| ||||    
T  36481277 agtcaaaatatgataattaaaaaggaacggagggagta 36481314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #110
Raw Score: 45; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 233 - 501
Target Start/End: Original strand, 40927112 - 40927379
Alignment:
Q  233 ttatactcactccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttatttcaatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaactttaaatgttatt 332  Q
    ||||||||  ||||||||||| ||| ||||||||||| | |||  |||| |||| | |||| ||||  ||||||| ||||||| | | ||||||||  ||    
T  40927112 ttatactccatccgttcctttataattgtcacttttgcataaaaattttgtttctaattaattgtcgttttcaaaattcaatgtatcattaaatgtggtt 40927211  T
Q  333 ttatcaatattacccttagttatttattgtggagatagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggatattatggtaaaagtatcaattattgta 432  Q
    ||| | ||||||| ||||  |||||||||  |||| || ||||||| ||||||  |||||||||| ||||  |||||| | ||||  || |||| ||| |    
T  40927212 ttacctatattactcttatatatttattgcagagagagcaatatataaaatgaagtattaaatgattaagattattataggaaaaagataaattgttgca 40927311  T
Q  433 tcaaaagtaataacatttattgattgtcttgctttgtgtaaaatgtcataaaatgacaattaaaaagga 501  Q
    ||||||||| ||| |  ||||  |||||||  |||||||||||  ||| ||  ||||||||||||||||    
T  40927312 tcaaaagtagtaa-aagtatttgttgtcttaatttgtgtaaaaaatcaaaacgtgacaattaaaaagga 40927379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #111
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 273 - 360
Target Start/End: Original strand, 38160291 - 38160378
Alignment:
Q  273 aaattttttatttcaatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaactttaaatgttattttatcaatattacccttagttatttatt 360  Q
    ||||||||| || | ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||  ||||| |||||||| |||||  ||||||||    
T  38160291 aaattttttgttcctatttaactgtcgctttcaaagttcaatgcaacattaaatgtagttttaccaatattatccttaaatatttatt 38160378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #112
Raw Score: 41; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 242 - 314
Target Start/End: Original strand, 3818165 - 3818237
Alignment:
Q  242 ctccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttatttcaatttaactgtcactttcaaagttcaat 314  Q
    |||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||| | | || | ||||||||||||||||||    
T  3818165 ctccgttcctttttaattgccacttttgaagaaattttttatttctaatcaagtatcactttcaaagttcaat 3818237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #113
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 446 - 513
Target Start/End: Complemental strand, 7734831 - 7734764
Alignment:
Q  446 catttattgattgtcttgctttgtgtaaaatgtcataaaatgacaattaaaaaggagcggaggtagta 513  Q
    |||||||||||||||||| ||| |||||||| | | |||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  7734831 catttattgattgtcttgatttatgtaaaatttgaaaaaatgacaattaaaaaggaacggatgtagta 7734764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #114
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 259 - 367
Target Start/End: Original strand, 1056648 - 1056754
Alignment:
Q  259 tgtcacttttggagaaattttttatttcaatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaactttaaatgttattttatcaatattacccttagttattta 358  Q
    ||||||||||||||||   |||||||||||||  ||| ||||||||||  ||||||||||| |||| | ||| ||| |||||| ||| |||| |||||||    
T  1056648 tgtcacttttggagaataattttatttcaatt--actatcactttcaagtttcaatgcaacattaattattagtttgtcaataatactcttatttattta 1056745  T
Q  359 ttgtggaga 367  Q
    |||| ||||    
T  1056746 ttgtagaga 1056754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #115
Raw Score: 36; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 247 - 314
Target Start/End: Original strand, 3818259 - 3818326
Alignment:
Q  247 ttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttatttcaatttaactgtcactttcaaagttcaat 314  Q
    ||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||| | | || | ||||||||||||||||||    
T  3818259 ttcctttttaattgccacttttgaagaaattttttatttctaatcaagtatcactttcaaagttcaat 3818326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #116
Raw Score: 36; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 391 - 498
Target Start/End: Complemental strand, 10734261 - 10734155
Alignment:
Q  391 taaatgaataaggatattatggtaaaagtatcaattattgtatcaaaagtaataacatttattgattgtcttgctttgtgtaaaatgtcataaaatgaca 490  Q
    ||||||||||||  |||||| |||||| ||| ||||||| | ||||||||| ||||||||| | ||| ||||| |||  |||||||| || ||| |||||    
T  10734261 taaatgaataagactattatagtaaaattataaattattatctcaaaagtagtaacatttacttattatcttggtttaagtaaaatg-caaaaagtgaca 10734163  T
Q  491 attaaaaa 498  Q
    ||||||||    
T  10734162 attaaaaa 10734155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #117
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 346 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 10734605 - 10734559
Alignment:
Q  346 ccttagttatttattgtggagatagaaatatatgaaatgagatatta 392  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||    
T  10734605 ccttagttatttattgtggagagagaaatataagaaattagatatta 10734559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #118
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 283 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 17872500 - 17872404
Alignment:
Q  283 tttcaatttaactgtcacttt-caaagttcaatgcaactttaaatgttattttatcaatattacccttagttatttattgtggagatagaaatatatg 379  Q
    |||| |||||| ||||||||| || |||| |||| ||| |||||||||||||||  ||||||||||||| ||| |||| ||||||  |||||||||||    
T  17872500 tttctatttaagtgtcactttacatagttaaatggaacattaaatgttattttactaatattacccttattta-ttatcgtggagtaagaaatatatg 17872404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #119
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 295 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 16054329 - 16054249
Alignment:
Q  295 tgtcactttcaaagttcaatgcaactttaaatgttattttatcaatattacccttagttatttattgtggagatagaaata 375  Q
    ||||||||||||  ||||||||||| |||| | ||| ||| |||||| ||||||||  |||||||||| |||| |||||||    
T  16054329 tgtcactttcaagtttcaatgcaacattaattattagtttgtcaataatacccttatctatttattgtagagagagaaata 16054249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #120
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 264 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 10735528 - 10735457
Alignment:
Q  264 cttttggagaaattttttatttcaatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaactttaaatgttatttta 335  Q
    |||||||||||||||||| ||   |||||| ||||||||| |||||| || ||||| |||||| ||||||||    
T  10735528 cttttggagaaattttttgttcatatttaaatgtcacttttaaagtttaacgcaacattaaatattatttta 10735457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #121
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 295 - 410
Target Start/End: Original strand, 40886669 - 40886784
Alignment:
Q  295 tgtcactttcaaagttcaatgcaactttaaatgttattttatcaatattacccttagttatttattgtggagatagaaatatatgaaatgagatattaaa 394  Q
    ||||||||||||  ||||||||||| |||| | || | || |||||| |||||||   |||||||||| |||| ||||| | || |||||| ||| ||||    
T  40886669 tgtcactttcaagtttcaatgcaacattaattattgtcttgtcaataatacccttgcatatttattgtagagagagaaaaaaataaaatgaaataataaa 40886768  T
Q  395 tgaataaggatattat 410  Q
    ||| ||||| ||||||    
T  40886769 tgattaagggtattat 40886784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #122
Raw Score: 31; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 224 - 262
Target Start/End: Original strand, 1583358 - 1583396
Alignment:
Q  224 aatgaaatattatactcactccgttcctttttaagtgtc 262  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  1583358 aatgaaatatattactcactccgttcctttttaagtgtc 1583396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #123
Raw Score: 31; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 425 - 499
Target Start/End: Complemental strand, 7834133 - 7834059
Alignment:
Q  425 ttattgtatcaaaagtaataacatttattgattgtcttgctttgtgtaaaatgtcataaaatgacaattaaaaag 499  Q
    |||||| ||||||||||| || | ||||||||| | ||| |||||||||||| ||| ||  ||||||||||||||    
T  7834133 ttattgcatcaaaagtaaaaataattattgattattttgatttgtgtaaaatatcaaaaggtgacaattaaaaag 7834059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #124
Raw Score: 31; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 958 - 1008
Target Start/End: Complemental strand, 14001169 - 14001119
Alignment:
Q  958 attttgttgatgccattcaataaggtaagaatatatgttatatttgttata 1008  Q
    |||||||||||| ||||||| ||| ||||||| ||| ||||||||||||||    
T  14001169 attttgttgatgtcattcaaaaagataagaatttatattatatttgttata 14001119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #125
Raw Score: 31; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 295 - 373
Target Start/End: Original strand, 25683288 - 25683366
Alignment:
Q  295 tgtcactttcaaagttcaatgcaactttaaatgttattttatcaatattacccttagttatttattgtggagatagaaa 373  Q
    ||||||||||||  ||||||||||| |||| | || |||| |||||| ||||||||  |||||||||| |||| |||||    
T  25683288 tgtcactttcaagtttcaatgcaacattaattattgttttgtcaataatacccttacatatttattgtagagagagaaa 25683366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #126
Raw Score: 31; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 447 - 509
Target Start/End: Original strand, 31803110 - 31803172
Alignment:
Q  447 atttattgattgtcttgctttgtgtaaaatgtcataaaatgacaattaaaaaggagcggaggt 509  Q
    ||||||| ||||||||| | |||||||||| ||| ||  |||||||||||||||| |||||||    
T  31803110 atttatttattgtcttggtatgtgtaaaatatcaaaaggtgacaattaaaaaggaacggaggt 31803172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #127
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 295 - 367
Target Start/End: Original strand, 6330814 - 6330887
Alignment:
Q  295 tgtcactttcaaagttcaatgcaactttaaatgttatttt-atcaatattacccttagttatttattgtggaga 367  Q
    ||||| |||||||||| |||  ||| ||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||| ||||| |||||    
T  6330814 tgtcattttcaaagtttaatataacattaaatgttgtttttatcaatattacccctagttatatattgcggaga 6330887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #128
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 452 - 513
Target Start/End: Complemental strand, 10889229 - 10889168
Alignment:
Q  452 ttgattgtcttgctttgtgtaaaatgtcataaaatgacaattaaaaaggagcggaggtagta 513  Q
    |||||||||||| ||| |||||||||| | ||  |||||||||||||| | |||||||||||    
T  10889229 ttgattgtcttggtttatgtaaaatgttaaaatgtgacaattaaaaagaaacggaggtagta 10889168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #129
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 297 - 410
Target Start/End: Complemental strand, 25773865 - 25773752
Alignment:
Q  297 tcactttcaaagttcaatgcaactttaaatgttattttatcaatattacccttagttatttattgtggagatagaaatatatgaaatgagatattaaatg 396  Q
    ||||||||||  ||||||||||| |||| | || | || |||||| |||||||   |||||||||| |||||||| | | || |||||| ||| ||||||    
T  25773865 tcactttcaagtttcaatgcaacattaattattgtcttgtcaataatacccttgcatatttattgtagagatagagaaaaataaaatgaaataataaatg 25773766  T
Q  397 aataaggatattat 410  Q
    | ||||| ||||||    
T  25773765 attaagggtattat 25773752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #130
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 267 - 336
Target Start/End: Original strand, 35796179 - 35796248
Alignment:
Q  267 ttggagaaattttttatttcaatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaactttaaatgttattttat 336  Q
    |||||||  |||||| ||||||||||| ||||| || ||||||||||||| || ||||||| | ||||||    
T  35796179 ttggagattttttttttttcaatttaagtgtcatttgcaaagttcaatgcgacattaaatgatgttttat 35796248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 175; Significance: 1e-93; HSPs: 115)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 175; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 237 - 507
Target Start/End: Original strand, 48151966 - 48152236
Alignment:
Q  237 actcactccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttatttcaatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaactttaaatgttattttat 336  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||     
T  48151966 actccctccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaaaaatttgtttcaatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttac 48152065  T
Q  337 caatattacccttagttatttattgtggagatagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggatattatggtaaaagtatcaattattgtatcaa 436  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||| |||||||||| || |||||||||||    
T  48152066 caatattacccttagttatttattgttgaaagagaaatatataaaatgagatatcaaatgaataaggttattatagtaaaagtatgaagtattgtatcaa 48152165  T
Q  437 aagtaataacatttattgattgtcttgctttgtgtaaaatgtcataaaatgacaattaaaaaggagcggag 507  Q
    ||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||| | | |||||||||||||||||||| |||||    
T  48152166 aagtaataatatttattgattgtattgatttgtgtaaaatataaaaaaatgacaattaaaaaggaacggag 48152236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 159; E-Value: 4e-84
Query Start/End: Original strand, 235 - 513
Target Start/End: Complemental strand, 53745548 - 53745271
Alignment:
Q  235 atactcactccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttatttcaatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaactttaaatgttatttt 334  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  53745548 atactccctccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgtttt 53745449  T
Q  335 atcaatattacccttagttatttattgtggagatagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggatattatggtaaaagtatcaattattgtatc 434  Q
    | |||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||   |||||| |||    
T  53745448 accaatattatccttagttatttcttgtggagagagaaatatatgaaatg-gatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtatagcttattgcatc 53745350  T
Q  435 aaaagtaataacatttattgattgtcttgctttgtgtaaaatgtcataaaatgacaattaaaaaggagcggaggtagta 513  Q
    ||||||| || || || |||||| ||||| |||||||||||||||| ||  |||||||||||||||| |||| ||||||    
T  53745349 aaaagtagtatcaattgttgattatcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaacggatgtagta 53745271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 153; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 233 - 501
Target Start/End: Original strand, 32980617 - 32980885
Alignment:
Q  233 ttatactcactccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttatttcaatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaactttaaatgttatt 332  Q
    |||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||  | ||    
T  32980617 ttatactccctccgttcttttttaagtgtctcttttggagaatttttttgtttctatttaactgtcactttcaaaattcaatacaacattaaataatgtt 32980716  T
Q  333 ttatcaatattacccttagttatttattgtggagatagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggatattatggtaaaagtatcaattattgta 432  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||  | |||  ||||||||| | |||||| |    
T  32980717 ttatcaatattacccttagttatttattgtagagagagaaatatatgaaataagatattaaatgaataaggtcagtataataaaagtataacttattgca 32980816  T
Q  433 tcaaaagtaataacatttattgattgtcttgctttgtgtaaaatgtcataaaatgacaattaaaaagga 501  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||    
T  32980817 tcaaaagtattaacaattattgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaagga 32980885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 148; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 235 - 498
Target Start/End: Original strand, 17102733 - 17102996
Alignment:
Q  235 atactcactccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttatttcaatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaactttaaatgttatttt 334  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||    
T  17102733 atactccctccgttcttttttaagtgtctcttttggagaaattttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatacaacattaaatgttgtttt 17102832  T
Q  335 atcaatattacccttagttatttattgtggagatagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggatattatggtaaaagtatcaattattgtatc 434  Q
    | |||||||| |||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||  ||||||||| |||||||| |||    
T  17102833 accaatattatccttagttatttattgcggaaagagaaatatatgaaatgagatgttaaatgaataaggtcattataataaaagtataaattattgcatc 17102932  T
Q  435 aaaagtaataacatttattgattgtcttgctttgtgtaaaatgtcataaaatgacaattaaaaa 498  Q
    ||||||| ||||| ||||| ||||| ||  |||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  17102933 aaaagtagtaacaattattaattgttttaatttgtgtaaaatgtcaaaaaataacaattaaaaa 17102996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 148; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 230 - 513
Target Start/End: Complemental strand, 47070129 - 47069846
Alignment:
Q  230 atattatactcactccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttatttcaatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaactttaaatgtt 329  Q
    |||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||| || | ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  47070129 atatgatactccctccattcctttttaagtgtcactttcgtagaaattttttgttcctatttaaccgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgtt 47070030  T
Q  330 attttatcaatattacccttagttatttattgtggagatagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggatattatggtaaaagtatcaattatt 429  Q
     ||||| |||||||  |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||| |||||||||| | |||||    
T  47070029 gttttaccaatattgtccttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaaattattatagtaaaagtataacttatt 47069930  T
Q  430 gtatcaaaagtaataacatttattgattgtcttgctttgtgtaaaatgtcataaaatgacaattaaaaaggagcggaggtagta 513  Q
    | |||||||||| || || || |||||||||||| |||||||||||||||| ||  |||||||||||||| | |||| ||||||    
T  47069929 gcatcaaaagtagtatcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaagaaacggatgtagta 47069846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 147; E-Value: 6e-77
Query Start/End: Original strand, 243 - 513
Target Start/End: Original strand, 19550233 - 19550503
Alignment:
Q  243 tccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttatttcaatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaactttaaatgttattttatcaatat 342  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||    
T  19550233 tccgttcctttttaaatgttacttttggagaaattttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaaaattaaatgttgttttatcaatat 19550332  T
Q  343 tacccttagttatttattgtggagatagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggatattatggtaaaagtatcaattattgtatcaaaagtaa 442  Q
    |   ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||| |||   |||||| |||||||||||    
T  19550333 tgttcttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaaatatagcttattgcatcaaaagtaa 19550432  T
Q  443 taacatttattgattgtcttgctttgtgtaaaatgtcataaaatgacaattaaaaaggagcggaggtagta 513  Q
    || || || |||||||||||  |||||||||||||||| ||  |||||||||||||||| ||| |||||||    
T  19550433 tatcaattgttgattgtcttagtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaacgggggtagta 19550503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 147; E-Value: 6e-77
Query Start/End: Original strand, 236 - 514
Target Start/End: Original strand, 54106243 - 54106521
Alignment:
Q  236 tactcactccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttatttcaatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaactttaaatgttatttta 335  Q
    ||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||  |||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  54106243 tactccctccattcctttttaagtgtcacttttgaagaaaaattttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgtttta 54106342  T
Q  336 tcaatattacccttagttatttattgtggagatagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggatattatggtaaaagtatcaattattgtatca 435  Q
     |||||||| ||||||||||||||||   ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||   |||||| ||||    
T  54106343 ccaatattatccttagttatttattgcatagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtatagtttattgcatca 54106442  T
Q  436 aaagtaataacatttattgattgtcttgctttgtgtaaaatgtcataaaatgacaattaaaaaggagcggaggtagtaa 514  Q
    ||||||||| || || |||||||||||| ||| |||||||||||| ||  | |||||||||||||| ||||||||||||    
T  54106443 aaagtaatatcaattgttgattgtcttggtttatgtaaaatgtcaaaatgtaacaattaaaaaggaacggaggtagtaa 54106521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 145; E-Value: 9e-76
Query Start/End: Original strand, 234 - 513
Target Start/End: Original strand, 41425607 - 41425886
Alignment:
Q  234 tatactcactccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttatttcaatttaactgtcacttt-caaagttcaatgcaactttaaatgttatt 332  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| || | |||||| ||||||||| || ||||||||||||| |||||||||| |    
T  41425607 tatactccctccgttcctttttaagtgtctcttttggagaatttttttgttcctatttaagtgtcactttacatagttcaatgcaacattaaatgttact 41425706  T
Q  333 ttatcaatattacccttagttatttattgtggagatagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggatattatggtaaaagtatcaattattgta 432  Q
    |||  ||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||  |||||| ||  ||||||||||    
T  41425707 ttactaatattacccttatttatt-attgtggagagagaaatatatgtaatgagatattaaataaataaggttattaaagtaaaaatagaaattattgta 41425805  T
Q  433 tcaaaagtaataacatttattgattgtcttgctttgtgtaaaatgtcataaaatgacaattaaaaaggagcggaggtagta 513  Q
    |||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||  |||||||||||||||| |||||||||||    
T  41425806 tcaaaagtagcaacatttattgattgtcttggtttgtgtaaaatgttaaaatgtgacaattaaaaaggaacggaggtagta 41425886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 144; E-Value: 4e-75
Query Start/End: Original strand, 236 - 514
Target Start/End: Complemental strand, 34266704 - 34266428
Alignment:
Q  236 tactcactccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttatttcaatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaactttaaatgttatttta 335  Q
    ||||| ||| |||| | ||||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  34266704 tactccctctgttcttctttaagtgtcacttttggagaaaatttttgtttctatttaactgtcattttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgtttta 34266605  T
Q  336 tcaatattacccttagttatttattgtggagatagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggatattatggtaaaagtatcaattattgtatca 435  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||  | |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||| | |||||| ||||    
T  34266604 tcaatattgtccttagttatttattgctgcg--agaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtataacttattgcatca 34266507  T
Q  436 aaagtaataacatttattgattgtcttgctttgtgtaaaatgtcataaaatgacaattaaaaaggagcggaggtagtaa 514  Q
    |||||| || || || |||||||||||| |||||||||||||||| ||  |||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  34266506 aaagtagtatcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacgattaaaaaggaacggaggtagtaa 34266428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 143; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 243 - 513
Target Start/End: Original strand, 43554377 - 43554646
Alignment:
Q  243 tccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttatttcaatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaactttaaatgttattttatcaatat 342  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||    
T  43554377 tccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaaatttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatat 43554476  T
Q  343 tacccttagttatttattgtggagatagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggatattatggtaaaagtatcaattattgtatcaaaagtaa 442  Q
    |  |||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||| ||||||||||   |||||| ||||||||||     
T  43554477 tgtccttagttatttattgcggaaagagaaatatatgaaatga-atattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaagtat 43554575  T
Q  443 taacatttattgattgtcttgctttgtgtaaaatgtcataaaatgacaattaaaaaggagcggaggtagta 513  Q
     | || || |||||||||||| |||||||||||||||| ||  |||||||||||||| | |||||||||||    
T  43554576 gatcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaagtaacggaggtagta 43554646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 142; E-Value: 6e-74
Query Start/End: Original strand, 244 - 513
Target Start/End: Complemental strand, 33874804 - 33874535
Alignment:
Q  244 ccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttatttcaatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaactttaaatgttattttatcaatatt 343  Q
    |||||||||||||  |||||||||| |||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  | ||||| |||||||    
T  33874804 ccgttcctttttatctgtcacttttagagaaattttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatagtgttttaccaatatt 33874705  T
Q  344 acccttagttatttattgtggagatagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggatattatggtaaaagtatcaattattgtatcaaaagtaat 443  Q
    |||||||| ||||||||| ||||| |||||  |||||||||| ||||||||| |||||||  ||||| |||||||    ||  ||||||||||||||| |    
T  33874704 acccttagatatttattgcggagagagaaacgtatgaaatgaaatattaaattaataaggccattatagtaaaaggtaaaacaattgtatcaaaagtagt 33874605  T
Q  444 aacatttattgattgtcttgctttgtgtaaaatgtcataaaatgacaattaaaaaggagcggaggtagta 513  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  33874604 aacatttattgattgttttggtttgtgtaaaatgtcaaaaaatgacaattaaaaaggaacggaggtagta 33874535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 142; E-Value: 6e-74
Query Start/End: Original strand, 236 - 501
Target Start/End: Complemental strand, 54898352 - 54898087
Alignment:
Q  236 tactcactccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttatttcaatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaactttaaatgttatttta 335  Q
    ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||  |||| || | |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  54898352 tactccctctgttcctttttaagtgtcacttttggagaaaaattttgttcctatttaactatcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgtttta 54898253  T
Q  336 tcaatattacccttagttatttattgtggagatagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggatattatggtaaaagtatcaattattgtatca 435  Q
     |||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||  |||||||||   |||||| ||||    
T  54898252 ccaatattatccttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattataataaaagtatagcttattgcatca 54898153  T
Q  436 aaagtaataacatttattgattgtcttgctttgtgtaaaatgtcataaaatgacaattaaaaagga 501  Q
    |||||| || || || |||||||||||| ||| |||||||||||| ||  ||||||||||||||||    
T  54898152 aaagtagtatcaattgttgattgtcttggtttatgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaagga 54898087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 141; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 250 - 513
Target Start/End: Complemental strand, 3643448 - 3643185
Alignment:
Q  250 ctttttaagtgtcacttttggagaaattttttatttca-atttaactgtcactttcaaagttcaatgcaactttaaatgttattttatcaatattaccct 348  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||||||||  |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  3643448 ctttttaattgtcacttttagagaaatttttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaactt-aaatgttgttttatcaatattaccct 3643350  T
Q  349 tagttatttattgtggagatagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggatattatggtaaaagtatcaattattgtatcaaaagtaataacat 448  Q
    ||| ||||||||| ||||| ||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||  ||||| |||||||||  ||| ||||||||||||||| ||||||    
T  3643349 tagatatttattgcggagagagaaacatatgaaatgaaatattaaattaataaggtcattatagtaaaagtaaaaataattgtatcaaaagtagtaacat 3643250  T
Q  449 ttattgattgtcttgctttgtgtaaaatgtcataaaatgacaattaaaaaggagcggaggtagta 513  Q
    || |||||||| ||| |||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||  ||||||||||    
T  3643249 ttcttgattgtattgatttgtgtaaaatgtcaaaaagtgacacttaaaaaggaatggaggtagta 3643185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 141; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 242 - 514
Target Start/End: Original strand, 50091931 - 50092203
Alignment:
Q  242 ctccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttatttcaatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaactttaaatgttattttatcaata 341  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||| || | | ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||| |||||    
T  50091931 ctccgttcctttttaagtgttatttttggagaaactttttgttcctacttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacaataaatgttgttttaccaata 50092030  T
Q  342 ttacccttagttatttattgtggagatagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggatattatggtaaaagtatcaattattgtatcaaaagta 441  Q
    ||  |||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||| ||||||||||| | ||  |    
T  50092031 ttttccttagttatttattacggagagagaaatatatgaaataagatattaaatgactaaggttattatagtaaaagtataaattattgtataagaaaaa 50092130  T
Q  442 ataacatttattgattgtcttgctttgtgtaaaatgtcataaaatgacaattaaaaaggagcggaggtagtaa 514  Q
    |||||||||||| | ||||||| |||||||||||||||| |||  |||| |||||||||| ||||||||||||    
T  50092131 ataacatttatttagtgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaaagcgacagttaaaaaggaacggaggtagtaa 50092203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 140; E-Value: 9e-73
Query Start/End: Original strand, 235 - 510
Target Start/End: Original strand, 790529 - 790804
Alignment:
Q  235 atactcactccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttatttcaatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaactttaaatgttatttt 334  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  790529 atactccctccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaaatttatgtttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgtttt 790628  T
Q  335 atcaatattacccttagttatttattgtggagatagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggatattatggtaaaagtatcaattattgtatc 434  Q
    | |||||||  |||||||||||||||| ||||| |||| |||||||| || ||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||   |||||| |||    
T  790629 accaatattgtccttagttatttattgcggagagagaattatatgaactgggatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtatagcttattgcatc 790728  T
Q  435 aaaagtaataacatttattgattgtcttgctttgtgtaaaatgtcataaaatgacaattaaaaaggagcggaggta 510  Q
    ||||||| || || || |||||||||||| |||||||||||| ||| ||  |||  ||||||||||| ||||||||    
T  790729 aaaagtagtatcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatatcaaaatgtgatcattaaaaaggaacggaggta 790804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 140; E-Value: 9e-73
Query Start/End: Original strand, 246 - 513
Target Start/End: Complemental strand, 27039862 - 27039595
Alignment:
Q  246 gttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttatttcaatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaactttaaatgttattttatcaatattac 345  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||| ||| |||||    
T  27039862 gttcctttttaagtgtcactttaggagaaaatttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacaataaatgttgttttaccaacattac 27039763  T
Q  346 ccttagttatttattgtggagatagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggatattatggtaaaagtatcaattattgtatcaaaagtaataa 445  Q
    ||||  |||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||  ||||||||||| | ||  | |||    
T  27039762 ccttgattatttattgcggagagagaaatatatgaaataagatattaaatgaataaggctattatagtaaaagtactaattattgtataagaaaaagtaa 27039663  T
Q  446 catttattgattgtcttgctttgtgtaaaatgtcataaaatgacaattaaaaaggagcggaggtagta 513  Q
    |||||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||| ||||  |||||||||| | |||||||||    
T  27039662 catttattgaatgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaaagtgacggttaaaaaggaacagaggtagta 27039595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 140; E-Value: 9e-73
Query Start/End: Original strand, 233 - 513
Target Start/End: Complemental strand, 40140098 - 40139831
Alignment:
Q  233 ttatactcactccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttatttcaatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaactttaaatgttatt 332  Q
    |||||||| ||||  ||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||     ||||||||||| ||||||| ||||    
T  40140098 ttatactccctcctatcctttttaagtgtctcttttggagaatttttttgtttctatttaactgtcacttt-----ttcaatgcaacattaaatgatatt 40140004  T
Q  333 ttatcaatattacccttagttatttattgtggagatagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggatattatggtaaaagtatcaattattgta 432  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||| |||||||||| | |||||| |    
T  40140003 ttatcaatattacccttaattatttattgcggagagagaaatatatgaaataagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtataacttattgca 40139904  T
Q  433 tcaaaagtaataacatttattgattgtcttgctttgtgtaaaatgtcataaaatgacaattaaaaaggagcggaggtagta 513  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||        |||||||||||||||| |||||||||||    
T  40139903 tcaaaagtagtaacaattattgattgtcttggtttgtgtaaaatg--------tgacaattaaaaaggaacggaggtagta 40139831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 139; E-Value: 4e-72
Query Start/End: Original strand, 243 - 513
Target Start/End: Complemental strand, 33491398 - 33491128
Alignment:
Q  243 tccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttatttcaatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaactttaaatgttattttatcaatat 342  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| || | |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||    
T  33491398 tccgttcctttttaagtgtctcttttgaagaaattttttgttcctatttaactgttactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatat 33491299  T
Q  343 tacccttagttatttattgtggagatagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggatattatggtaaaagtatcaattattgtatcaaaagtaa 442  Q
    || ||||| |||||||||  |||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||| | |||||| ||||||||||     
T  33491298 tatccttaattatttattacggagagtgaaatatatgaaatgagatattaaataaataaggttattatagtaaaagtataacttattgcatcaaaagtag 33491199  T
Q  443 taacatttattgattgtcttgctttgtgtaaaatgtcataaaatgacaattaaaaaggagcggaggtagta 513  Q
    ||||| | ||||| | ||||  ||| |||||||||||| ||  |||||||||||||||| |||||||||||    
T  33491198 taacaatcattgactatcttagtttatgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaacggaggtagta 33491128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 139; E-Value: 4e-72
Query Start/End: Original strand, 233 - 499
Target Start/End: Complemental strand, 39867117 - 39866852
Alignment:
Q  233 ttatactcactccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttatttcaatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaactttaaatgttatt 332  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| || | |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||  |    
T  39867117 ttatactccatccgttcctttttaagtgtctcttttggagaattttttt-ttcctatttaactgtcacttttaaagttcaatgcaacattaaatgttgat 39867019  T
Q  333 ttatcaatattacccttagttatttattgtggagatagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggatattatggtaaaagtatcaattattgta 432  Q
    ||| ||||||||  ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||| || ||||  ||||| ||||||| || | |||||| |    
T  39867018 ttaccaatattattcttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatgttaaattaacaaggtcattatagtaaaagcataacttattgca 39866919  T
Q  433 tcaaaagtaataacatttattgattgtcttgctttgtgtaaaatgtcataaaatgacaattaaaaag 499  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  39866918 tcaaaagtaaaaacaattattgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaaagtgacaattaaaaag 39866852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 137; E-Value: 6e-71
Query Start/End: Original strand, 246 - 514
Target Start/End: Complemental strand, 43775646 - 43775378
Alignment:
Q  246 gttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttatttcaatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaactttaaatgttattttatcaatattac 345  Q
    |||||||||||| |||| |||||| ||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||| ||||||||     
T  43775646 gttcctttttaactgtctcttttgaagaaattttttgttttcatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatattgttttaccaatattat 43775547  T
Q  346 ccttagttatttattgtggagatagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggatattatggtaaaagtatcaattattgtatcaaaagtaataa 445  Q
    |||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||  | |||||| |||||||||| |||    
T  43775546 ccttagctatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtacaacttattgcatcaaaagtagtaa 43775447  T
Q  446 catttattgattgtcttgctttgtgtaaaatgtcataaaatgacaattaaaaaggagcggaggtagtaa 514  Q
    || | ||||| | ||||| ||| |||||||||||| ||  ||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  43775446 caatcattgactatcttggtttatgtaaaatgtcaaaatgtgaaaattaaaaaggaacggaggtagtaa 43775378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 137; E-Value: 6e-71
Query Start/End: Original strand, 236 - 501
Target Start/End: Original strand, 48214047 - 48214300
Alignment:
Q  236 tactcactccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttatttcaatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaactttaaatgttatttta 335  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  48214047 tactccctccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaaaaatttgtttcaatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgtttta 48214146  T
Q  336 tcaatattacccttagttatttattgtggagatagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggatattatggtaaaagtatcaattattgtatca 435  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||            |||| |||||||||||  |||||| |||||||||| || ||||||||||    
T  48214147 ccaatattacccttagttatttattgtggagagagaaat------------atataaaatgaataagactattatagtaaaagtatgaagtattgtatca 48214234  T
Q  436 aaagtaataacatttattgattgtcttgctttgtgtaaaatgtcataaaatgacaattaaaaagga 501  Q
    |||||| ||| ||||||||||||| ||| | |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  48214235 aaagtagtaatatttattgattgtattggtgtgtgtaaaatgtcaaaaagtgacaattaaaaagga 48214300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 135; E-Value: 9e-70
Query Start/End: Original strand, 243 - 501
Target Start/End: Original strand, 11473389 - 11473647
Alignment:
Q  243 tccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttatttcaatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaactttaaatgttattttatcaatat 342  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |  ||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||| ||| ||    
T  11473389 tccgttcctttttaaatgtcacttttggagaaattttttgttcctgtttaactttcactttcaaagttcaatgcaacaataaatgttgttttaccaacat 11473488  T
Q  343 tacccttagttatttattgtggagatagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggatattatggtaaaagtatcaattattgtatcaaaagtaa 442  Q
    ||||||||||||||||||| ||| | |||| |||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||| ||||||||||| | ||  |     
T  11473489 tacccttagttatttattgcggaaagagaagtatatgaaataagatattaaatgactaaggttattatagtaaaagtataaattattgtataagaaaaag 11473588  T
Q  443 taacatttattgattgtcttgctttgtgtaaaatgtcataaaatgacaattaaaaagga 501  Q
    ||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||| |||  |||||||||||||||    
T  11473589 taacatttattgaatgtcttagtttgtgtaaaatgtcaaaaagcgacaattaaaaagga 11473647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 133; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 235 - 507
Target Start/End: Original strand, 52663421 - 52663693
Alignment:
Q  235 atactcactccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttatttcaatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaactttaaatgttatttt 334  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| || | |||||| ||||| ||||||||||||| ||||  ||||| ||| ||||    
T  52663421 atactctctccgttcatttttaagtgtcagttttggagaaattttttgttactatttaattgtcattttcaaagttcaaagcaatattaaacgttgtttt 52663520  T
Q  335 atcaatattacccttagttatttattgtggagatagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggatattatggtaaaagtatcaattattgtatc 434  Q
    | |||||||  |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| | ||||||||   |||||| |||    
T  52663521 accaatattgtccttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagcaaaagtatagcttattgcatc 52663620  T
Q  435 aaaagtaataacatttattgattgtcttgctttgtgtaaaatgtcataaaatgacaattaaaaaggagcggag 507  Q
    ||||||| || || ||||||||||||||| ||||||| |||||||| || |||||||||||||| || |||||    
T  52663621 aaaagtagtatcaattattgattgtcttggtttgtgtgaaatgtcaaaatatgacaattaaaaatgaacggag 52663693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 132; E-Value: 5e-68
Query Start/End: Original strand, 235 - 501
Target Start/End: Complemental strand, 32854214 - 32853948
Alignment:
Q  235 atactcactccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttatttcaatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaactttaaatgttatttt 334  Q
    |||||| |||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||| ||||    
T  32854214 atactccctccattcctttttaggt-tcacttttggagaaattttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgtaacaataaatgttgtttt 32854116  T
Q  335 atcaatattacccttagttatttattgtggagatagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggatattatggtaaaagtatcaattattgtatc 434  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| | ||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||  ||||||||||     
T  32854115 atcaacattacccttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaataaaatattaaatgactaaggttattatagtaaaagtatacattattgtata 32854016  T
Q  435 aaaagtaataacatttattgattgtcttgctttgtgtaaaatgtc-ataaaatgacaattaaaaagga 501  Q
    | ||  | ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| | ||||||||  ||||||||||    
T  32854015 agaaaaagtaacatttattgagtgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaaaaatgacggttaaaaagga 32853948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 131; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 245 - 514
Target Start/End: Complemental strand, 30861799 - 30861532
Alignment:
Q  245 cgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttatttcaatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaactttaaatgttattttatcaatatta 344  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| | |||||||||||||||||  |||||||| ||||| ||| ||||    
T  30861799 cgttcatttttaagtgtcacttttggagaaattttttattcctatttaactgtcattatcaaagttcaatgcaacaataaatgttgttttaccaacatta 30861700  T
Q  345 cccttagttatttattgtggagatagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggatattatggtaaaagtatcaattattgtatcaaaagtaata 444  Q
    ||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||  |||||| |||||||||| ||||||||||| | ||  ||||    
T  30861699 cccttagctatttattgcggagagagaaatatatgaaataagatattaaatgactaagactattatagtaaaagtataaattattgtataagaaaaaata 30861600  T
Q  445 acatttattgattgtcttgctttgtgtaaaatgtcataaaatgacaattaaaaaggagcggaggtagtaa 514  Q
    |||||| |||  ||||||| |||||||||||| ||| ||| |||   |||||||||| ||||||||||||    
T  30861599 acatttgttg--tgtcttggtttgtgtaaaatatcaaaaagtgaacgttaaaaaggaacggaggtagtaa 30861532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 131; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 235 - 513
Target Start/End: Original strand, 35315111 - 35315389
Alignment:
Q  235 atactcactccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttatttcaatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaactttaaatgttatttt 334  Q
    ||||||||||  || |||||||||||||  ||||  |||| |||||| |||| |||||| ||||| |||||||||||||| |||| ||||||||| ||||    
T  35315111 atactcactctctttctttttaagtgtctttttttaagaatttttttttttctatttaattgtcattttcaaagttcaatacaaccttaaatgttgtttt 35315210  T
Q  335 atcaatattacccttagttatttattgtggagatagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggatattatggtaaaagtatcaattattgtatc 434  Q
    | |||||||| | |||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||| ||||||||| ||||  |||||  ||||||||| | |||||| |||    
T  35315211 accaatattatctttagttatttattgcggagagataaatatatgaaatgagatgttaaatgaacaaggtcattataataaaagtataacttattgcatc 35315310  T
Q  435 aaaagtaataacatttattgattgtcttgctttgtgtaaaatgtcataaaatgacaattaaaaaggagcggaggtagta 513  Q
    ||||||| ||||| || |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  35315311 aaaagtagtaacaattgttgattgtcttgatttgtgtaaaatgtcaaaaaatgacaattaaaaaggaacggagttagta 35315389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 131; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 236 - 513
Target Start/End: Complemental strand, 41351461 - 41351183
Alignment:
Q  236 tactcactccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttatttcaatttaactgtcactttca-aagttcaatgcaactttaaatgttatttt 334  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||   |||||||||||| | |||||| || ||||    
T  41351461 tactccctccgttcttttttaagtgtcacttttggagaaattttttgttcctatttaactgtcactttttgaagttcaatgcatcattaaatattgtttt 41351362  T
Q  335 atcaatattacccttagttatttattgtggagatagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggatattatggtaaaagtatcaattattgtatc 434  Q
    | |||||||| | ||  |  ||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||  |||||| ||||    
T  41351361 accaatattatctttgttcgtttattgtgaagagagaaatatatgaaatgaaatattaaatgaataaggttattatagtaaaagtatatattattatatc 41351262  T
Q  435 aaaagtaataacatttattgattgtcttgctttgtgtaaaatgtcataaaatgacaattaaaaaggagcggaggtagta 513  Q
    ||||||| ||||||| ||||| ||||||| ||| |||||||| ||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  41351261 aaaagtagtaacattaattgaatgtcttgatttatgtaaaatatcagaaagtgacaattaaaaaggaacggaggtagta 41351183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 130; E-Value: 8e-67
Query Start/End: Original strand, 251 - 513
Target Start/End: Original strand, 29651667 - 29651925
Alignment:
Q  251 tttttaagtgtcacttttggagaaattttttatttcaatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaactttaaatgttattttatcaatattaccctta 350  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||  ||||||||||    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  29651667 tttttaagtgtcacttttggagaaaatttttgtttttatttaactgt----ttcaaagttcaatgcaacattaaatgttattttatcaatattatcctta 29651762  T
Q  351 gttatttattgtggagatagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggatattatggtaaaagtatcaattattgtatcaaaagtaataacattt 450  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||| ||||||||||   |||||| |||||||||| || ||  |    
T  29651763 gttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaagtcattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaagtagtatcaact 29651862  T
Q  451 attgattgtcttgctttgtgtaaaatgtcataaaatgacaattaaaaaggagcggaggtagta 513  Q
     |||||||| ||| |||||||||||||| | ||  ||||||||||||| || |||||||||||    
T  29651863 gttgattgttttggtttgtgtaaaatgtaaaaatgtgacaattaaaaaagaacggaggtagta 29651925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 129; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 242 - 513
Target Start/End: Complemental strand, 27484046 - 27483777
Alignment:
Q  242 ctccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttatttcaatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaactttaaatgttattttatcaata 341  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||  ||||| ||||| || | |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||    
T  27484046 ctccgttcctttttaagtgttactttttaagaaagtttttgttcctatttaactgtcacttttaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaata 27483947  T
Q  342 ttacccttagttatttattgtggagatagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggatattatggtaaaagtatcaattattgtatcaaaagta 441  Q
    ||  |||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||| ||| | |||||| ||||||||||    
T  27483946 ttgtccttagttatttattgcggag--agaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaaatataacttattgcatcaaaagta 27483849  T
Q  442 ataacatttattgattgtcttgctttgtgtaaaatgtcataaaatgacaattaaaaaggagcggaggtagta 513  Q
     || || || ||||||||| || ||||| |||||||| | || ||||||||||||||||| | |||||||||    
T  27483848 gtatcaattgttgattgtcctgatttgtataaaatgttaaaatatgacaattaaaaaggaacagaggtagta 27483777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 129; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 234 - 513
Target Start/End: Complemental strand, 40319196 - 40318917
Alignment:
Q  234 tatactcactccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttatttcaatttaactgtcacttt-caaagttcaatgcaactttaaatgttatt 332  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| || | |||||| ||||||||| || ||||||||||||| |||||||||| |    
T  40319196 tatactccatccgttcctttttaagtgtctcttttggagaatttttttgttcctatttaagtgtcactttacatagttcaatgcaacattaaatgttact 40319097  T
Q  333 ttatcaatattacccttagttatttattgtggagatagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggatattatggtaaaagtatcaattattgta 432  Q
    |||  ||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||| ||||||| |||||  |||||| ||  ||||||||||    
T  40319096 ttactaatattacccttatttatt-attgtggagagagaaatatatctaatgagatattaaataaataaggttattaaagtaaaaatagaaattattgta 40318998  T
Q  433 tcaaaagtaataacatttattgattgtcttgctttgtgtaaaatgtcataaaatgacaattaaaaaggagcggaggtagta 513  Q
    |||||||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| | ||  ||||||||||||| || |||||||||||    
T  40318997 tcaaaagtagcaacatttattgattatcttggtttgtgtaaaatgttaaaatgtgacaattaaaaatgaacggaggtagta 40318917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 129; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 243 - 514
Target Start/End: Complemental strand, 55141732 - 55141460
Alignment:
Q  243 tccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttatttcaatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaactttaaatgttattttatcaatat 342  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||    |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||    
T  55141732 tccgtttctttttaagtgtcacttttggagaaaatttttgtttcaatttaactc---ctttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatat 55141636  T
Q  343 tacccttagttatttattgtggagatagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggatattatggtaaaagtatcaattattgtatcaaaagtaa 442  Q
    |||||||||||||||||||| || | | |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| || |||| |||||||| ||     
T  55141635 tacccttagttatttattgttgaaagataaatatataaaatgagatattaaatgaataaggttattatagtaaaagtatgaagtattatatcaaaaatag 55141536  T
Q  443 taacatttattgattgtcttgctttgtgtaaaatgt----cataaaatgacaattaaaaaggagcggaggtagtaa 514  Q
    ||| ||||||||||||| ||| |||| ||||| | |     | |||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  55141535 taatatttattgattgtattgatttgcgtaaagtataaaaaaaaaaatgacaattaaaaaggaaccgaggtagtaa 55141460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 128; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 236 - 507
Target Start/End: Complemental strand, 47104421 - 47104150
Alignment:
Q  236 tactcactccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttatttcaatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaactttaaatgttatttta 335  Q
    ||||| |||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  47104421 tactccctccgttcctttttaattgtcacttttagagaaattttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgtttta 47104322  T
Q  336 tcaatattacccttagttatttattgtggagatagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggatattatggtaaaagtatcaattattgtatca 435  Q
     |||||||| | |||| ||||||||||| ||| ||||| ||||||||||| ||||||||| ||||| |  ||||| |||||||||  |   ||| |||||    
T  47104321 ccaatattatcattagatatttattgtgaagagagaaacatatgaaatgaaatattaaattaataaagtcattatagtaaaagtaaaatcaattatatca 47104222  T
Q  436 aaagtaataacatttattgattgtcttgctttgtgtaaaatgtcataaaatgacaattaaaaaggagcggag 507  Q
    ||| || ||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||| ||| || ||||||||||||| |||||    
T  47104221 aaaatagtaacatttattgattgttttgatttatgtaaaatgtcaaaaagtggcaattaaaaaggaacggag 47104150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 126; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 265 - 514
Target Start/End: Original strand, 45145138 - 45145386
Alignment:
Q  265 ttttggagaaattttttatttcaatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaactttaaatgttattttatcaatattacccttagttatttattgtgg 364  Q
    ||||||||||| ||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||||| ||    
T  45145138 ttttggagaaaatttttattcttatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaatattaaatgttgttttaccaatattatcctta-ttatttattgcgg 45145236  T
Q  365 agatagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggatattatggtaaaagtatcaattattgtatcaaaagtaataacatttattgattgtcttgc 464  Q
    | | ||| |||||||||||||||| |||||||||||||   ||||| |||||||||| | |||||| | |||||||||||| | |||||||||||||||     
T  45145237 aaagagatatatatgaaatgagatgttaaatgaataagatcattatagtaaaagtataacttattgcagcaaaagtaataataattattgattgtcttgg 45145336  T
Q  465 tttgtgtaaaatgtcataaaatgacaattaaaaaggagcggaggtagtaa 514  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  45145337 tttgtgtaaaatatcaaaaaatgacaattaaaaaggaaaggaggtagtaa 45145386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 126; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 233 - 513
Target Start/End: Complemental strand, 52627507 - 52627227
Alignment:
Q  233 ttatactcactccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttatttcaatttaactgtcactttcaaa-gttcaatgcaactttaaatgttat 331  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| |||||| ||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||| |    
T  52627507 ttatactccttccgttcctttttaagtgtcacttttggagaagttttttgtttctatttaattgtcacttttaaaagttcaatgcaacattaaatgttgt 52627408  T
Q  332 tttatcaatattacccttagttatttattgtggagatagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggatattatggtaaaagtatcaattattgt 431  Q
    |||| |||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| |  ||||| |||||||||| | ||||||     
T  52627407 tttaccaatattgtccttagttatttattgtggagagagaaatatatgaaatg-gatattaaatgaataaagtcattatagtaaaagtataacttattgc 52627309  T
Q  432 atcaaaagtaataacatttattgattgtcttgctttgtgtaaaatgtcataaaatgacaattaaaaaggagcggaggtagta 513  Q
    ||||||||||||| || |  || ||| ||||| | || | ||||||||| ||  |||||||||||||||| ||||| |||||    
T  52627308 atcaaaagtaatatcaatcgttaattatcttggtatgaggaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaacggagatagta 52627227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 125; E-Value: 8e-64
Query Start/End: Original strand, 236 - 514
Target Start/End: Original strand, 36234347 - 36234622
Alignment:
Q  236 tactcactccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttatttcaatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaactttaaatgttatttta 335  Q
    ||||| |||||||||||| |||||||||||| || ||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  36234347 tactccctccgttcctttgtaagtgtcacttatgaagaaaatttttgtttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacgttaaatgttgtttta 36234446  T
Q  336 tcaatattacccttagttatttattgtggagatagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggatattatggtaaaagtatcaattattgtatca 435  Q
     |||||||| |||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||   ||||  ||||||||||   |||||||||||    
T  36234447 ccaatattatccttagttattttttgcggagagagaaatatatgaaataggatattaaatgaataagatcattacagtaaaagtatagcttattgtatca 36234546  T
Q  436 aaagtaataacatttattgattgtcttgctttgtgtaaaatgtcataaaatgacaattaaaaaggagcggaggtagtaa 514  Q
    ||||||    || || |||||||||||  |||||||||||| ||| ||  |||||||||||||||| |||| |||||||    
T  36234547 aaagtat---cactttttgattgtcttaatttgtgtaaaatatcaaaatgtgacaattaaaaaggaacggatgtagtaa 36234622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 123; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 243 - 513
Target Start/End: Original strand, 28885665 - 28885934
Alignment:
Q  243 tccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttatttcaatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaactttaaatgttattttatcaatat 342  Q
    ||||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||| || | ||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||    
T  28885665 tccgttcatttttaagtgtctcttttgaagaaattttttgttcctatttaaccgtcacttttaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatat 28885764  T
Q  343 tacccttagttatttattgtggagatagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggatattatggtaaaagtatcaattattgtatcaaaagtaa 442  Q
    || |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| || ||||||  | |||||| ||||||||||     
T  28885765 tatccttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagt-aaagtacaacttattgcatcaaaagtag 28885863  T
Q  443 taacatttattgattgtcttgctttgtgtaaaatgtcataaaatgacaattaaaaaggagcggaggtagta 513  Q
    ||||| | ||||| | ||||| ||| |||||||||| | ||  ||||||||||||| |||| || ||||||    
T  28885864 taacaataattgactatcttggtttatgtaaaatgttaaaatgtgacaattaaaaaagagcagatgtagta 28885934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 123; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 236 - 502
Target Start/End: Original strand, 51064863 - 51065129
Alignment:
Q  236 tactcactccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttatttcaatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaactttaaatgttatttta 335  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||| || |   ||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||| ||    
T  51064863 tactccctccgttcctttttaattgtcatttttggagaatttttttgttcctgattaactgtcactttcaaagttcaatacaatattaaatgttattata 51064962  T
Q  336 tcaatattacccttagttatttattgtggagatagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggatattatggtaaaagtatcaattattgtatca 435  Q
     |||||||| |||||| ||||||||| ||||| ||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||   ||||| || ||||||  ||  |||||||||    
T  51064963 ccaatattatccttagatatttattgcggagagagaaacatatgaaatgaaatattaaattaataagatcattatagtgaaagtaaaaacaattgtatca 51065062  T
Q  436 aaagtaataacatttattgattgtcttgctttgtgtaaaatgtcataaaatgacaattaaaaaggag 502  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||| ||| |||||||||||||    
T  51065063 aaagtagtaacatttattgattgtcttggtttgtgtaaaatgttaaaaagtgataattaaaaaggag 51065129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 122; E-Value: 5e-62
Query Start/End: Original strand, 243 - 514
Target Start/End: Complemental strand, 13158700 - 13158427
Alignment:
Q  243 tccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaatttt-ttatttcaatttaactgtcacttt-caaagttcaatgcaactttaaatgttattttatcaat 340  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||     || |||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||    
T  13158700 tccgttcctttttaagtgtcacttttgaagaaaaaaaattgtttctatttaactgtcatttttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaat 13158601  T
Q  341 attacccttagttatttattgtggagatagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggatattatggtaaaagtatcaattattgtatcaaaagt 440  Q
    || | |||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||  ||||| |||||||||| | ||||| ||||||||||    
T  13158600 ataatccttagttatttattgcggagagagaaatataagaaatgatatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtataacttattatatcaaaagt 13158501  T
Q  441 aataacatttattgattgtcttgctttgtgtaaaatgtcataaaatgacaattaaaaaggagcggaggtagtaa 514  Q
    | || || || || ||||||||| ||| |||||||||||| || || |||||||||||||| ||||||||||||    
T  13158500 agtatcaattttttattgtcttggtttatgtaaaatgtcaaaatataacaattaaaaaggaacggaggtagtaa 13158427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 121; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 246 - 514
Target Start/End: Complemental strand, 5244191 - 5243924
Alignment:
Q  246 gttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttatttcaatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaactttaaatgttattttatcaatattac 345  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||| ||| ||||| || | |||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||| ||| |||||    
T  5244191 gttcctttttacgtgtcactttcggataaaatttttgttcctatttaactatcactttcaaagttcaatgcaacaataaatgttgttttaccaacattac 5244092  T
Q  346 ccttagttatttattgtggagatagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggatattatggtaaaagtatcaattattgtatcaaaagtaataa 445  Q
    ||||||||||||||||  |||| ||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||| ||| ||||||| | ||  | |||    
T  5244091 ccttagttatttattgcagagagagaaatatatggaataagatattaaatgactaaggttattatagtaaaagtataaatgattgtataagaaaaagtaa 5243992  T
Q  446 catttattgattgtcttgctttgtgtaaaatgtcataaaatgacaattaaaaaggagcggaggtagtaa 514  Q
    |||||||||| |||| || ||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||| | ||||||||||    
T  5243991 catttattgagtgtcctgatttatgtaaaatgtca-aaaatgacagttaaaaaggaacagaggtagtaa 5243924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 119; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 245 - 518
Target Start/End: Complemental strand, 42515429 - 42515158
Alignment:
Q  245 cgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttatttcaatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaactttaaatgttattttatcaatatta 344  Q
    ||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||  | |||||    
T  42515429 cgttcctctttaattgtcactttttgagaaattttttgtttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttacaattatta 42515330  T
Q  345 cccttagttatttattgtggagatagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggatattatggtaaaagtatcaattattgtatcaaaagtaata 444  Q
    || |||| ||| ||||  ||||| ||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||  ||||| |||||||||  ||  |||||||||||| || ||    
T  42515329 cctttagatatctattacggagagagaaacatatgaaatgaaatattaaattaataaggcgattatagtaaaagtaaaaacaattgtatcaaaaatagta 42515230  T
Q  445 acatttattgattgtcttgctttgtgtaaaatgtcataaaatgacaattaaaaaggagcggaggtagtaagttt 518  Q
    ||  ||||||||||||||| |||||||||||||| | ||| | |||||||||||||| |||| |||||| ||||    
T  42515229 ac--ttattgattgtcttggtttgtgtaaaatgttaaaaagttacaattaaaaaggaacggatgtagtatgttt 42515158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 119; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 235 - 513
Target Start/End: Complemental strand, 42672157 - 42671879
Alignment:
Q  235 atactcactccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttatttcaatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaactttaaatgttatttt 334  Q
    |||||| |||| |||||||||||| |||| ||||||||||| ||||| || | ||| |||||||||||| ||||||||||| ||  ||||||||| ||||    
T  42672157 atactccctccattcctttttaagcgtcatttttggagaaaatttttgttcctattcaactgtcacttttaaagttcaatgtaatattaaatgttgtttt 42672058  T
Q  335 atcaatattacccttagttatttattgtggagatagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggatattatggtaaaagtatcaattattgtatc 434  Q
    | |||||||  ||||||||||||||||  || | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||   |||||| |||    
T  42672057 accaatattgtccttagttatttattgcagaaagagaaatatatgaaataagatattaaatgaataaggttattatagtaaaagtatagtttattgcatc 42671958  T
Q  435 aaaagtaataacatttattgattgtcttgctttgtgtaaaatgtcataaaatgacaattaaaaaggagcggaggtagta 513  Q
    |||||||||| || || |||||||||||  ||| | |||||||||| ||  ||||||||||||| || |||||||||||    
T  42671957 aaaagtaatatcaattgttgattgtcttagtttatataaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaagaacggaggtagta 42671879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 118; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 235 - 499
Target Start/End: Original strand, 46973399 - 46973666
Alignment:
Q  235 atactcactccgttcctttttaagtgtc---acttttggagaaattttttatttcaatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaactttaaatgttat 331  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||   |||||||||||||  |||| ||   ||||||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||    
T  46973399 atactccctccgttcctttttaagtgtcttcacttttggagaaaaattttgttcttatttaactgtcactttcaaagttcaatacaacatcaaatgttat 46973498  T
Q  332 tttatcaatattacccttagttatttattgtggagatagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggatattatggtaaaagtatcaattattgt 431  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||  ||||||||| | ||||||     
T  46973499 tttaccaatattatccttagttatttattgcggagaaagaaatatatgaaatgatatattaaatgaataaggtcattataataaaagtataacttattgc 46973598  T
Q  432 atcaaaagtaataacatttattgattgtcttgctttgtgtaaaatgtcataaaatgacaattaaaaag 499  Q
    |||||||||| || || || |||||||  ||| |||||||||||| ||| ||  | ||||||||||||    
T  46973599 atcaaaagtagtatcaattgttgattgctttggtttgtgtaaaatatcaaaatgtaacaattaaaaag 46973666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 116; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 246 - 513
Target Start/End: Complemental strand, 40010920 - 40010653
Alignment:
Q  246 gttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttatttcaatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaactttaaatgttattttatcaatattac 345  Q
    |||||| |||||||||||||||  ||||||  |||| ||   |||||||| ||| |||||||||||||||||||  |||||||| ||||| | | |||||    
T  40010920 gttcctatttaagtgtcactttaagagaaaaattttgttcatatttaactttcattttcaaagttcaatgcaacaataaatgttgttttaccgacattac 40010821  T
Q  346 ccttagttatttattgtggagatagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggatattatggtaaaagtatcaattattgtatcaaaagtaataa 445  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||  ||||||||||| | ||  | |||    
T  40010820 ccttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaataagatattaaatgactaaggttattatagtaaaagtactaattattgtataagaaaaagtaa 40010721  T
Q  446 catttattgattgtcttgctttgtgtaaaatgtcataaaatgacaattaaaaaggagcggaggtagta 513  Q
    |||||||||| ||||||| |||||||||||| ||| ||| | ||| |||||||||| |||||||||||    
T  40010720 catttattgagtgtcttggtttgtgtaaaatatcaaaaagtaacacttaaaaaggaacggaggtagta 40010653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 116; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 242 - 441
Target Start/End: Complemental strand, 45513875 - 45513676
Alignment:
Q  242 ctccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttatttcaatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaactttaaatgttattttatcaata 341  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| || | |||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||    
T  45513875 ctccgttcttttttaagtgttacttttggagaaattttttgttcctatttaactgtcacttttaaagttcaatacaacattaaatgttgttttatcaata 45513776  T
Q  342 ttacccttagttatttattgtggagatagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggatattatggtaaaagtatcaattattgtatcaaaagta 441  Q
    ||  |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||| |||   |||||| ||||||||||    
T  45513775 ttgtccttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaaatatagtttattgcatcaaaagta 45513676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 115; E-Value: 8e-58
Query Start/End: Original strand, 243 - 441
Target Start/End: Original strand, 7328442 - 7328640
Alignment:
Q  243 tccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttatttcaatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaactttaaatgttattttatcaatat 342  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || | |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||  |||||    
T  7328442 tccgttcctttttaagtgtctcttttggagaaattttttgttcctatttaactatcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttactaatat 7328541  T
Q  343 tacccttagttatttattgtggagatagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggatattatggtaaaagtatcaattattgtatcaaaagta 441  Q
    || |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||  | ||||||| | |||||| ||||||||||    
T  7328542 tatccttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatgttaaatgaataaggtcattataatgaaagtataacttattgcatcaaaagta 7328640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 115; E-Value: 8e-58
Query Start/End: Original strand, 245 - 510
Target Start/End: Original strand, 29697980 - 29698245
Alignment:
Q  245 cgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttatttcaatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaactttaaatgttattttatcaatatta 344  Q
    |||| |||||||||||||| |||| |||||| ||||| || | |||||| ||||| ||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||     
T  29697980 cgtttctttttaagtgtcattttttgagaaagtttttgttcctatttaattgtcattttcaaagttcaatgcaatattaaatgttgttttatcaatattg 29698079  T
Q  345 cccttagttatttattgtggagatagaaatatatgaaatgagatattaaatgaata-aggatattatggtaaaagtatcaattattgtatcaaaagtaat 443  Q
     |||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||  ||||| ||||||||||   |||||| ||||||| || |    
T  29698080 tccttagttatttattgcggagagagaaatatatg-aatgagatattaaatgaatagaggtcattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaaatagt 29698178  T
Q  444 aacatttattgattgtcttgctttgtgtaaaatgtcataaaatgacaattaaaaaggagcggaggta 510  Q
    | || || |||||||||||  |||||||||||||||| ||  |||||||||||||||| ||||||||    
T  29698179 atcaattgttgattgtcttaatttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaacggaggta 29698245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 115; E-Value: 8e-58
Query Start/End: Original strand, 236 - 510
Target Start/End: Original strand, 51244604 - 51244878
Alignment:
Q  236 tactcactccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttatttcaatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaactttaaatgttatttta 335  Q
    ||||| ||| |||||||||||| ||||||||||| |||||  |||| ||   |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||    
T  51244604 tactccctctgttcctttttaaatgtcacttttgaagaaaaattttgttcttatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaatattaaatgttgtttta 51244703  T
Q  336 tcaatattacccttagttatttattgtggagatagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggatattatggtaaaagtatcaattattgtatca 435  Q
     |||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||  ||||| |||   |||||| ||||    
T  51244704 ccaatattatccttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataagatcattataataaaaatatggcttattgcatca 51244803  T
Q  436 aaagtaataacatttattgattgtcttgctttgtgtaaaatgtcataaaatgacaattaaaaaggagcggaggta 510  Q
    ||| || || || || |||||||||||| |||||||||||| ||| || || |||| ||||||| | ||||||||    
T  51244804 aaactagtatcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatatcaaaatattacaagtaaaaagaaacggaggta 51244878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 115; E-Value: 8e-58
Query Start/End: Original strand, 247 - 501
Target Start/End: Complemental strand, 54334437 - 54334184
Alignment:
Q  247 ttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttatttcaatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaactttaaatgttattttatcaatattacc 346  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||| ||| ||||||    
T  54334437 ttcctttttaagtgtca-ttttggagaaattttttgtttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacaataaatgttgttttaccaacattacc 54334339  T
Q  347 cttagttatttattgtggagatagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggatattatggtaaaagtatcaattattgtatcaaaagtaataac 446  Q
    |||| |||||||| | ||||| | |||||||||| || ||||||||||| | ||||| ||||||  ||||||||| ||||||||||| | ||  | ||||    
T  54334338 cttatttatttatcgcggagagaaaaatatatgacataagatattaaataactaaggctattataataaaagtataaattattgtataagaaaaagtaac 54334239  T
Q  447 atttattgattgtcttgctttgtgtaaaatgtcataaaatgacaattaaaaagga 501  Q
    ||||||||| ||||||| |||| || |||||||| ||| ||| | ||||||||||    
T  54334238 atttattgagtgtcttggtttgagttaaatgtcaaaaagtgatagttaaaaagga 54334184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 114; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 242 - 403
Target Start/End: Original strand, 20105178 - 20105339
Alignment:
Q  242 ctccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttatttcaatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaactttaaatgttattttatcaata 341  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||    
T  20105178 ctccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaaatttttgttcctctttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaata 20105277  T
Q  342 ttacccttagttatttattgtggagatagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataagg 403  Q
    ||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  20105278 ttgtccttagttatttattgtggagagagaaatatatgaaatgggatattaaatgaataagg 20105339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 114; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 288 - 513
Target Start/End: Complemental strand, 45101572 - 45101347
Alignment:
Q  288 atttaactgtcactttcaaagttcaatgcaactttaaatgttattttatcaatattacccttagttatttattgtggagatagaaatatatgaaatgaga 387  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||| ||| ||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  45101572 atttaactgtcactttgaaagttccatgaaacattaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgaga 45101473  T
Q  388 tattaaatgaataaggatattatggtaaaagtatcaattattgtatcaaaagtaataacatttattgattgtcttgctttgtgtaaaatgtcataaaatg 487  Q
    ||||||||||||||||  ||||| | ||||||||   |||||| ||||||||||  | ||  | |||||||||||| |||||||||||||||| ||  ||    
T  45101472 tattaaatgaataaggtcattataggaaaagtatagcttattgcatcaaaagtagcatcagctgttgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtg 45101373  T
Q  488 acaattaaaaaggagcggaggtagta 513  Q
    |||||||||||||| |||||||||||    
T  45101372 acaattaaaaaggaacggaggtagta 45101347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 112; E-Value: 5e-56
Query Start/End: Original strand, 290 - 501
Target Start/End: Complemental strand, 24276 - 24065
Alignment:
Q  290 ttaactgtcactttcaaagttcaatgcaactttaaatgttattttatcaatattacccttagttatttattgtggagatagaaatatatgaaatgagata 389  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||| | ||  | ||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||    
T  24276 ttaactgtcactttcgaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattatctttgctaatttattttggagaaagaaatatatgaaatgaaata 24177  T
Q  390 ttaaatgaataaggatattatggtaaaagtatcaattattgtatcaaaagtaataacatttattgattgtcttgctttgtgtaaaatgtcataaaatgac 489  Q
    |||||||||||||| |||||| ||||||||||  |||||||||||||||||| ||| ||||||| | ||||||| ||| |||||||||||| ||| ||||    
T  24176 ttaaatgaataaggttattatagtaaaagtatatattattgtatcaaaagtagtaatatttattaaatgtcttggtttatgtaaaatgtcacaaagtgac 24077  T
Q  490 aattaaaaagga 501  Q
    | ||||||||||    
T  24076 acttaaaaagga 24065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 112; E-Value: 5e-56
Query Start/End: Original strand, 236 - 462
Target Start/End: Complemental strand, 54911568 - 54911341
Alignment:
Q  236 tactcactccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttatttca-atttaactgtcactttcaaagttcaatgcaactttaaatgttatttt 334  Q
    ||||| ||||||| |||||||| ||||  |||||||||  ||||||  || | |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| | ||||    
T  54911568 tactccctccgtttctttttaaatgtctattttggagatttttttttgtttatatttaactgtcactttcaaagttcaatgtaacattaaatgatgtttt 54911469  T
Q  335 atcaatattacccttagttatttattgtggagatagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggatattatggtaaaagtatcaattattgtatc 434  Q
    |||||||||||| ||| |||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||| |||||||||| | |||||| |||    
T  54911468 atcaatattacctttaattatttattgtggagtgagaaatatatgaaataagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtataacttattgcatc 54911369  T
Q  435 aaaagtaataacatttattgattgtctt 462  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  54911368 aaaagtagtaacaattattgattgtctt 54911341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 111; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 235 - 513
Target Start/End: Complemental strand, 20848986 - 20848713
Alignment:
Q  235 atactcactccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttatttcaatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaactttaaatgttatttt 334  Q
    |||||| |||||||||||| ||| |||||||||| ||||||   ||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  20848986 atactccctccgttcctttataattgtcacttttagagaaaaaatttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgtttt 20848887  T
Q  335 atcaatattacccttagttatttattgtggagatagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggatattatggtaaaagtatcaattattgtatc 434  Q
    | ||||||||| ||||| |     ||| ||| | ||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||  ||||| |||||||||  ||  ||||||||    
T  20848886 accaatattactcttagat-----ttgcggaaagagaaacatatgaaatgaaatattaaattaataaggccattatagtaaaagtaaaaacaattgtatc 20848792  T
Q  435 aaaagtaataacatttattgattgtcttgctttgtgtaaaatgtcataaaatgacaattaaaaaggagcggaggtagta 513  Q
    ||||||| ||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||| ||  ||||| |||||||||| |||||||||||    
T  20848791 aaaagtagtaacatttattgattattttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacagttaaaaaggaacggaggtagta 20848713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 111; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 236 - 501
Target Start/End: Complemental strand, 33074543 - 33074279
Alignment:
Q  236 tactcactccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttatttcaatttaactgtcacttt-caaagttcaatgcaactttaaatgttatttt 334  Q
    ||||| |||| |||| ||||||||||| |||||  |||| ||||||||| | |||||| | ||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  33074543 tactccctccattccattttaagtgtctcttttaaagaa-ttttttattcctatttaagtatcactttacatagttcaatgcaacattaaatgttatttt 33074445  T
Q  335 atcaatattacccttagttatttattgtggagatagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggatattatggtaaaagtatcaattattgtatc 434  Q
    |  |||||||| |||| ||||| |||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||| ||  ||||||||||||    
T  33074444 actaatattactcttatttatt-attgcggagagagaaatatatgtaatgagatattaaataaataaggttattatagtaaaaataaaaattattgtatc 33074346  T
Q  435 aaaagtaataacatttattgattgtcttgctttgtgtaaaatgtcataaaatgacaattaaaaagga 501  Q
    |||||||  | |||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||  |||||| |||||||||    
T  33074345 aaaagtagcagcatttattgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaaataaaaagga 33074279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 105; E-Value: 7e-52
Query Start/End: Original strand, 277 - 513
Target Start/End: Complemental strand, 27028240 - 27028004
Alignment:
Q  277 tttttatttcaatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaactttaaatgttattttatcaatattacccttagttatttattgtggagatagaaatat 376  Q
    ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| || ||||| ||| ||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||    
T  27028240 tttttgtttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacaataaatattgttttaccaacattacccttggttatttattgcggagagagaaatat 27028141  T
Q  377 atgaaatgagatattaaatgaataaggatattatggtaaaagtatcaattattgtatcaaaagtaataacatttattgattgtcttgctttgtgtaaaat 476  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||  ||||||  ||||||||  |||| |||||| | ||  | ||||||||||| | ||| ||| | ||||||||||    
T  27028140 atgaaataagatattaaatgaataagactattataataaaagtactaatttttgtataagaaaaagtaacatttatttaatgtattggtatgtgtaaaat 27028041  T
Q  477 gtcataaaatgacaattaaaaaggagcggaggtagta 513  Q
    |||| ||||||||  |||||||||| |||||||||||    
T  27028040 gtcaaaaaatgacggttaaaaaggaacggaggtagta 27028004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 101; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 283 - 494
Target Start/End: Complemental strand, 51697783 - 51697571
Alignment:
Q  283 tttcaatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaactttaaatgttattttatcaatattacccttagttatttattgtggagatagaaatatatgaaa 382  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||||  ||||||  |||||||||||||||| || || ||||||||||||||    
T  51697783 tttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgtaacattaaatgttgttttacgaatattgtccttagttatttattgcggggagagaaatatatgaaa 51697684  T
Q  383 tgagatattaaatgaataaggatattatggt-aaaagtatcaattattgtatcaaaagtaataacatttattgattgtcttgctttgtgtaaaatgtcat 481  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||| || ||||||||   |||||| ||||||| || || || || |||||||||||| ||||||||||||||||     
T  51697683 tgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaaagtatagcttattgcatcaaaaatagtatcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaa 51697584  T
Q  482 aaaatgacaatta 494  Q
    || ||||||||||    
T  51697583 aatatgacaatta 51697571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 98; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 234 - 498
Target Start/End: Original strand, 45055165 - 45055429
Alignment:
Q  234 tatactcactccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttatttc-aatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaactttaaatgttatt 332  Q
    ||||||| |||||||| ||||||||||||  ||||| |||| ||||||  ||| |||||||| ||||||||||||||| |||||| | ||||||||| ||    
T  45055165 tatactccctccgttcatttttaagtgtctattttgaagaattttttttgttccaatttaac-gtcactttcaaagtttaatgcatcattaaatgttgtt 45055263  T
Q  333 ttatcaatattacccttagttatttattgtggagatagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggatattatggtaaaagtatcaattattgta 432  Q
    |||  ||||||| | ||  |||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||| |||||| ||||| |  ||||| |||||||||| | ||||||||    
T  45055264 ttactaatattatcttttattatttattgcggagagagaaatataagaaatgagatgttaaattaataatgtcattatagtaaaagtataacttattgta 45055363  T
Q  433 tcaaaagtaataacatttattgattgtcttgctttgtgtaaaatgtcataaaatgacaattaaaaa 498  Q
    |||||||||| || | ||||||||||||||| ||| |||||||| | | ||| |||||||||||||    
T  45055364 tcaaaagtaaaaataattattgattgtcttgatttatgtaaaatattaaaaattgacaattaaaaa 45055429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 97; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 302 - 510
Target Start/End: Original strand, 27992286 - 27992494
Alignment:
Q  302 ttcaaagttcaatgcaactttaaatgttattttatcaatattacccttagttatttattgtggagatagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataa 401  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||  ||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  27992286 ttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattgtccttagttatttattgccgagagagaaatatatgaaatgaaatattaaatgaataa 27992385  T
Q  402 ggatattatggtaaaagtatcaattattgtatcaaaagtaataacatttattgattgtcttgctttgtgtaaaatgtcataaaatgacaattaaaaagga 501  Q
    ||  ||||| ||||||||||   |||||| |||||||||| || || || |||||||| |||  ||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||    
T  27992386 ggtcattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaagtagtatcaattgttgattgtattgggttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaagga 27992485  T
Q  502 gcggaggta 510  Q
     | ||||||    
T  27992486 acagaggta 27992494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 96; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 234 - 469
Target Start/End: Complemental strand, 36371098 - 36370861
Alignment:
Q  234 tatactcactccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttattt--caatttaactgtcacttt-caaagttcaatgcaactttaaatgtta 330  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| | |  | |||||| ||||||||| || ||||||||||||  ||||||||||    
T  36371098 tatactccctccgttcctttttaagtgtctcttttggagaatttttttttgttcctatttaagtgtcactttacatagttcaatgcaatattaaatgtta 36370999  T
Q  331 ttttatcaatattacccttagttatttattgtggagatagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggatattatggtaaaagtatcaattattg 430  Q
     ||||  ||||||||||||| ||||| | |||||||| | |||||||||  |||||||||||||| ||||||| |||||  |||||| ||  ||||||||    
T  36370998 ctttactaatattacccttatttatt-actgtggagagaaaaatatatgttatgagatattaaataaataaggttattaaagtaaaaatagaaattattg 36370900  T
Q  431 tatcaaaagtaataacatttattgattgtcttgctttgt 469  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||    
T  36370899 tatcaaaagtagcaacatttattgattgtcttggtttgt 36370861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 95; E-Value: 6e-46
Query Start/End: Original strand, 235 - 436
Target Start/End: Original strand, 13167995 - 13168197
Alignment:
Q  235 atactcactccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttatttcaatttaactgtcacttt-caaagttcaatgcaactttaaatgttattt 333  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| || || ||   |||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||| |||    
T  13167995 atactccctccgttcctttttaagtgtcacttttagagaaaattattgttcttatttaactgtcatttttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttt 13168094  T
Q  334 tatcaatattacccttagttatttattgtggagatagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggatattatggtaaaagtatcaattattgtat 433  Q
    || |||||||| |||||||||||||||   |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||   || || |||||||||| | |||||| ||    
T  13168095 taccaatattatccttagttatttattacagagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataagctaatcatagtaaaagtataacttattgcat 13168194  T
Q  434 caa 436  Q
    |||    
T  13168195 caa 13168197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 93; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 236 - 501
Target Start/End: Complemental strand, 3376574 - 3376305
Alignment:
Q  236 tactcactccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttatttcaatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaactttaaatgttatttta 335  Q
    ||||| ||| ||||||||||||||||| |||||  ||| | | ||| |||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  3376574 tactccctctgttcctttttaagtgtctcttttaaagataatatttgtttctatttaactgtcagtttcaaagtccaatgcaacattaaatgttatttta 3376475  T
Q  336 tcaatattacccttagttatttattgtggagatag----aaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggatattatggtaaaagtatcaattattgt 431  Q
     |||||||| |||||||||||||||| ||||| ||    |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||| ||  | |||||      
T  3376474 ccaatattatccttagttatttattgcggagagagagaaaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaaatacaacttattac 3376375  T
Q  432 atcaaaagtaataacatttattgattgtcttgctttgtgtaaaatgtcataaaatgacaattaaaaagga 501  Q
    || |||| || ||||| | ||||||| ||||  ||| |||||||||||| ||  |||||  |||||||||    
T  3376374 ataaaaaatagtaacaatcattgattatcttagtttatgtaaaatgtcaaaatgtgacagataaaaagga 3376305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 93; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 236 - 498
Target Start/End: Original strand, 24981275 - 24981532
Alignment:
Q  236 tactcactccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttatttcaatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaactttaaatgttatttta 335  Q
    ||||| |||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||| || |||   |||| ||||||||||||||| ||||||| |||||| || |||||    
T  24981275 tactccctccattcctttttaagtgtcacttt-gaagaaattttttgtt-caa---aactatcactttcaaagttcgatgcaacattaaatattgtttta 24981369  T
Q  336 tcaatattacccttagttatttattgtggagatagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggatattatggtaaaagtatcaattattgtatca 435  Q
     |||||||  | ||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||| ||||||||||   |||||| ||||    
T  24981370 ccaatattgtctttagttatttattgcagagagagaaatatatgaaatgatatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtatagtttattgcatca 24981469  T
Q  436 aaagtaataacatttattgattgtcttgctttgtgtaaaatgtcataaaatgacaattaaaaa 498  Q
    |||||| || || || |||||| ||||  |||||| ||||||||| ||  |||||||||||||    
T  24981470 aaagtagtatcaattgttgattatcttagtttgtgcaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaa 24981532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 90; E-Value: 6e-43
Query Start/End: Original strand, 242 - 507
Target Start/End: Original strand, 49168350 - 49168615
Alignment:
Q  242 ctccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttatttcaatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaactttaaatgttattttatcaata 341  Q
    |||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||| | |||| |||||| ||||| ||| |||||||||||||||  ||||| || ||||| ||| |    
T  49168350 ctccgttcttttttaagtatcatttttggagaaattttctgtttctatttaattgtcaattttaaagttcaatgcaacaataaatattgttttaccaaca 49168449  T
Q  342 ttacccttagttatttattgtggagatagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggatattatggtaaaagtatcaattattgtatcaaaagta 441  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||| | |||||| |||||| | ||||||||||| ||||  ||||||  ||||| ||| ||||||||||| | ||  |    
T  49168450 ttactcttagttatttattgaggagagaaaaatatttgaaataatatattaaatgactaagattattataataaaaatataaattattgtattagaaaaa 49168549  T
Q  442 ataacatttattgattgtcttgctttgtgtaaaatgtcataaaatgacaattaaaaaggagcggag 507  Q
     ||||||||||| | | ||||| ||||| |||||||||| ||||||| | ||||||| || |||||    
T  49168550 gtaacatttattaagtatcttggtttgtttaaaatgtcaaaaaatgatagttaaaaatgaacggag 49168615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 89; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 288 - 514
Target Start/End: Original strand, 41926709 - 41926938
Alignment:
Q  288 atttaactgtcactttcaaagttcaatgcaactttaaatgttattttatcaatattacccttagttatttattgtggagat-agaaatatatgaaatgag 386  Q
    |||||||| ||||||||||||||  ||| ||| ||||||||| ||||| |||||||| | |||||||||||||| |||||| | ||| ||||||||||||    
T  41926709 atttaactatcactttcaaagtttcatgtaacattaaatgttgttttaccaatattatcgttagttatttattgcggagataaaaaaaatatgaaatgag 41926808  T
Q  387 atattaaatgaataaggatattatggtaaaagtatcaattattgtatcaaa---agtaataacatttattgattgtcttgctttgtgtaaaatgtcataa 483  Q
    || |||||||||||||   || || |||||||||| | |||||| ||||||   |||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| | ||    
T  41926809 atgttaaatgaataagatcatcatagtaaaagtataacttattgcatcaaaagtagtagtaacaattattgattgtcttggtttgtgtaaaatgt-aaaa 41926907  T
Q  484 aatgacaattaaaaaggagcggaggtagtaa 514  Q
    | |||||||||||||||| | ||||||||||    
T  41926908 agtgacaattaaaaaggaacagaggtagtaa 41926938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 88; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 242 - 441
Target Start/End: Original strand, 23771273 - 23771472
Alignment:
Q  242 ctccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttatttcaatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaactttaaatgttattttatcaata 341  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| | ||| ||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||| |  ||    
T  23771273 ctccgttcctttttaattgtcacttttgcataaaatttttgtttctaattaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatattgttttaccttta 23771372  T
Q  342 ttacccttagttatttattgtggagatagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggatattatggtaaaagtatcaattattgtatcaaaagta 441  Q
    ||||||||  ||||||||||| |||| ||||||| ||||||| |||||||||||||  |||| |||||| | ||||  || |||| ||||||||||||||    
T  23771373 ttacccttgattatttattgtagagagagaaatacatgaaataagatattaaatgatgaaggttattatagaaaaaagataaattgttgtatcaaaagta 23771472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 87; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 234 - 498
Target Start/End: Original strand, 41168739 - 41169000
Alignment:
Q  234 tatactcactccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttatttcaatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaactttaaatgttattt 333  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||||| || | |||    || || | |||||||||||| ||||||| |||||||||||  |||||||| |||    
T  41168739 tatactccatccgttcctttttaagtgtcacttctgcaaaaaaaaattgttcctatttaactgtcattttcaaacttcaatgcaacaataaatgttgttt 41168838  T
Q  334 tatcaatattacccttagttatttattgtggagatagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggatattatggtaaaagtatcaattattgtat 433  Q
    || |||||||| | |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||      |||||   |||||| ||    
T  41168839 taccaatattatctttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattat------agtatagcttattgcat 41168932  T
Q  434 caaa---agtaataacatttattgattgtcttgctttgtgtaaaatgtcataaaatgacaattaaaaa 498  Q
    ||||   |||| || || || |||||||||||| |||||||||||||||| ||  |||||||||||||    
T  41168933 caaaagtagtagtatcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaa 41169000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 87; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 289 - 514
Target Start/End: Original strand, 49123556 - 49123780
Alignment:
Q  289 tttaactgtcactttcaaagttcaatgcaactttaaatgttattttatcaatattacccttagttatttattgtggagatagaaatatatgaaatgagat 388  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||| || |||||  ||||||   ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  49123556 tttaagtgtcactttcaaagatcaatgcaacattaaatattgttttactaatattgttcttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagat 49123655  T
Q  389 attaaatgaataaggatattatggtaaaa--gtatcaattattgtatcaaaagtaataacatttattgattgtcttgctttgtgtaaaatgtcataaaat 486  Q
    |||||||||||||||  ||||| ||||||  ||||   |||||| |||||| ||| || ||   ||||||| ||||| |||||||||||||||| ||  |    
T  49123656 attaaatgaataaggtcattatagtaaaagtgtatagtttattgcatcaaatgtagtatca---attgattatcttgatttgtgtaaaatgtcaaaatgt 49123752  T
Q  487 gacaattaaaaaggagcggaggtagtaa 514  Q
    ||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  49123753 gactattaaaaaggaacggaggtagtaa 49123780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 83; E-Value: 9e-39
Query Start/End: Original strand, 236 - 514
Target Start/End: Original strand, 35077367 - 35077645
Alignment:
Q  236 tactcactccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttatttcaatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaactttaaatgttatttta 335  Q
    ||||| |||||||||||| ||| ||||||||||  |||| |||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||     
T  35077367 tactccctccgttcctttataactgtcacttttacagaatttttttgtttctaattaactgtcactttcaaagttcaatgtaacattaaatgttgttttt 35077466  T
Q  336 tcaatattacccttagttatttattgtggagatagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggatattatggtaaaagtatcaattattgtatca 435  Q
     | ||| |  ||||||| ||||||||  |||| ||||||||| |||||  |||||||||| | |||||||||||| |  |||  || | |||||| ||||    
T  35077467 cctataatgtccttagtaatttattgcagagagagaaatataggaaatatgatattaaataattaaggatattataggcaaaacataagttattgcatca 35077566  T
Q  436 aaagtaataacatttattgattgtcttgctttgtgtaaaatgtcataaaatgacaattaaaaaggagcggaggtagtaa 514  Q
    |||||| | | ||  ||| | ||||||| ||||||||||| |||| || ||||||||||||||||| | |||| |||||    
T  35077567 aaagtagtgaaatacatttagtgtcttggtttgtgtaaaaagtcaaaatatgacaattaaaaaggaacagagggagtaa 35077645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 81; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 242 - 514
Target Start/End: Original strand, 2642696 - 2642960
Alignment:
Q  242 ctccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttatttcaatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaactttaaatgttattttatcaata 341  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||| | ||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |  ||    
T  2642696 ctccgttcctttttaattgtcacatttgcataaattttttgtttctaattaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccttta 2642795  T
Q  342 ttacccttagttatttattgtggagatagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggatattatggtaaaagtatcaattattgtatcaaaagta 441  Q
    ||||||||  |||||||||||        | ||||||||||| |||||||||||||  |||| |||||| | ||||  || |||| ||||||||||||||    
T  2642796 ttacccttgattatttattgt--------agatatatgaaataagatattaaatgatgaaggttattattggaaaaagatgaattgttgtatcaaaagta 2642887  T
Q  442 ataacatttattgattgtcttgctttgtgt-aaaatgtcataaaatgacaattaaaaaggagcggaggtagtaa 514  Q
     ||| |  ||||  |||||||| ||||||| ||||  ||| ||| |||||||||||||||| |||||| |||||    
T  2642888 gtaaaaagtatttgttgtcttggtttgtgtaaaaaactca-aaagtgacaattaaaaaggaacggagggagtaa 2642960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #70
Raw Score: 81; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 321 - 513
Target Start/End: Original strand, 43945444 - 43945636
Alignment:
Q  321 ttaaatgttattttatcaatattacccttagttatttattgtggagatagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggatattatggtaaaagta 420  Q
    ||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||  |||||||||    
T  43945444 ttaaatgttgttttatcaatattgtccttagttatttattgcgaagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataagatcattacagtaaaagta 43945543  T
Q  421 tcaattattgtatcaaaagtaataacatttattgattgtcttgctttgtgtaaaatgtcataaaatgacaattaaaaaggagcggaggtagta 513  Q
    |   |||||| ||||||| || || || || |||||||||||| ||| | |||||||||| ||  |||||| ||||||||| |||||||||||    
T  43945544 tagtttattgcatcaaaaatagtatcaattgttgattgtcttggtttatataaaatgtcaaaatgtgacaactaaaaaggaacggaggtagta 43945636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #71
Raw Score: 80; E-Value: 6e-37
Query Start/End: Original strand, 270 - 513
Target Start/End: Complemental strand, 51219316 - 51219082
Alignment:
Q  270 gagaaattttttatttcaatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaactttaaatgttattttatcaatattacccttagttatttattgtggagata 369  Q
    |||||| ||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||| |    
T  51219316 gagaaaatttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatattgttttaccaatattatccttagttatttattgcggagaga 51219217  T
Q  370 gaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggatattatggtaaaagtatcaattattgtatcaaaagtaataaca---tttattgattgtcttgctt 466  Q
    ||||||||||||            |||||||||   ||||| |||||||||| | |||||| |||||||||| || ||    || |||||||||||| ||    
T  51219216 gaaatatatgaa------------atgaataagatcattatagtaaaagtataacttattgcatcaaaagtagtatcaattgttgttgattgtcttggtt 51219129  T
Q  467 tgtgtaaaatgtcataaaatgacaattaaaaaggagcggaggtagta 513  Q
    ||||||||||||||  |  |||||||||||||||| |||||||||||    
T  51219128 tgtgtaaaatgtcaatatgtgacaattaaaaaggaacggaggtagta 51219082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #72
Raw Score: 80; E-Value: 6e-37
Query Start/End: Original strand, 288 - 511
Target Start/End: Original strand, 52175752 - 52175974
Alignment:
Q  288 atttaactgtcactttcaaagttcaatgcaactttaaatgttattttatcaatattacccttagttatttattgtggagatagaaatatatgaaatgaga 387  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||| |||||||| | ||   ||||||||| ||||| | ||| ||||||||||| |    
T  52175752 atttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacaataaatgttgttttaccaatattatctttgaatatttattgcggagagaaaaacatatgaaatgaaa 52175851  T
Q  388 tattaaatgaataaggatattatggtaaaagtatcaattattgtatcaaaagtaataacatttattgattgtcttgctttgtgtaaaatgtcataaaatg 487  Q
    |||||||| ||||| |  ||||  |||||||||  ||  ||||||||||||||||||||| || || ||||||||| |||||||||||||||| ||  |     
T  52175852 tattaaattaataaagtcattacagtaaaagtaaaaacaattgtatcaaaagtaataaca-ttgttaattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtc 52175950  T
Q  488 acaattaaaaaggagcggaggtag 511  Q
    | |||||||||||| |||| ||||    
T  52175951 ataattaaaaaggaacggatgtag 52175974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #73
Raw Score: 79; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 296 - 498
Target Start/End: Complemental strand, 25983868 - 25983667
Alignment:
Q  296 gtcactttcaaagttcaatgcaactttaaatgttattttatcaatattacccttagttatttattgtggagatagaaatatatgaaatgagatattaaat 395  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||| | ||| | |||||||| ||||||||  ||||||    
T  25983868 gtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgcgaagagataaatatataaaatgagaagttaaat 25983769  T
Q  396 gaataaggatattatggtaaaagtatcaattattgtatcaaaagtaataacatttattgattgtcttgctttgtgtaaaatgtcataaaatgacaattaa 495  Q
    ||| || |  ||||| |||||||||| | |||||  ||||||| || ||||| || | |||| ||||  |||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  25983768 gaacaaagtcattatagtaaaagtataacttatt-catcaaaaatagtaacaattgtagattatcttaatttgtgtaaaatgtcaaaaactgacaattaa 25983670  T
Q  496 aaa 498  Q
    |||    
T  25983669 aaa 25983667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #74
Raw Score: 79; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 360 - 498
Target Start/End: Complemental strand, 29458345 - 29458207
Alignment:
Q  360 tgtggagatagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggatattatggtaaaagtatcaattattgtatcaaaagtaataacatttattgattgt 459  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||| ||  |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  29458345 tgtggagagagaaatatatgtaatgagatattaaataaataaggttattatagtaaaaatagaaattattgtatcaaaagtagcaacatttattgattgt 29458246  T
Q  460 cttgctttgtgtaaaatgtcataaaatgacaattaaaaa 498  Q
    |||| |||||||||||||||| ||  |||| ||||||||    
T  29458245 cttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacgattaaaaa 29458207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #75
Raw Score: 76; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 288 - 511
Target Start/End: Original strand, 52173779 - 52174000
Alignment:
Q  288 atttaactgtcactttcaaagttcaatgcaactttaaatgttattttatcaatattacccttagttatttattgtggagatagaaatatatgaaatgaga 387  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||| |||||||||| ||   |||||||||  |||| | ||| ||||||||||| |    
T  52173779 atttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacaataaatgttgttttaccaatattacctttgaatatttattgcagagagaaaaacatatgaaatgaaa 52173878  T
Q  388 tattaaatgaataaggatattatggtaaaagtatcaattattgtatcaaaagtaataacatttattgattgtcttgctttgtgtaaaatgtcataaaatg 487  Q
    |||||||  |||||||  |||   |||||||||  ||  ||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||| |||| ||| ||| ||    
T  52173879 tattaaactaataaggtcattgcagtaaaagtaaaaacaattatatcaaaagtaataaca-ttattaattgtcttggtttgtgt-aaatatcaaaaagtg 52173976  T
Q  488 acaattaaaaaggagcggaggtag 511  Q
    |||||||||||||| |||| ||||    
T  52173977 acaattaaaaaggaacggatgtag 52174000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #76
Raw Score: 75; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 309 - 459
Target Start/End: Complemental strand, 42671605 - 42671456
Alignment:
Q  309 ttcaatgcaactttaaatgttattttatcaatattacccttagttatttattgtggagatagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggatatt 408  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||| ||||| ||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||| | ||||    
T  42671605 ttcaatgcaacattaaatgttaatttattaatattatccttatttatt-attgtggagagagaaatatatgtaatgagatattaaataaataaagttatt 42671507  T
Q  409 atggtaaaagtatcaattattgtatcaaaagtaataacatttattgattgt 459  Q
    || ||| || ||| |||||||||||||||||||   |||||||||||||||    
T  42671506 atagtacaaatataaattattgtatcaaaagtagccacatttattgattgt 42671456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #77
Raw Score: 75; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 243 - 417
Target Start/End: Original strand, 53281966 - 53282140
Alignment:
Q  243 tccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttatttcaatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaactttaaatgttattttatcaatat 342  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||  | | |||| | | |||||||||| |||||||||| |  |||||||| ||||| ||| ||    
T  53281966 tccgttcctttttaagggtcacttttggagaaattctttgctcctatttgagtatcactttcaaggttcaatgcagcaataaatgttgttttaccaacat 53282065  T
Q  343 tacccttagttatttattgtggagatagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggatattatggtaaaa 417  Q
    |||||||| |||||||||  ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||  |||||| ||||||    
T  53282066 tacccttaattatttattacggagagagaaatatatgaaataagatattaaatgactaagactattatagtaaaa 53282140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #78
Raw Score: 74; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 270 - 499
Target Start/End: Original strand, 6902292 - 6902521
Alignment:
Q  270 gagaaattttttatttcaatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaactttaaatgttattttatcaatattacccttagttatttattgtggagata 369  Q
    |||||| ||||| |||| ||||||||||| |||| ||||||||||  ||| |||||| || |||||||||||||   ||||||||||||||   |||| |    
T  6902292 gagaaaatttttgtttctatttaactgtcccttttaaagttcaatttaacattaaattttgttttatcaatattgttcttagttatttattacagagaga 6902391  T
Q  370 gaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggatattatggtaaaagtatcaattattgtatcaaaagtaataacatttattgattgtcttgctttgt 469  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| |||||||  ||||| |||||| |||   |||||| |||||| ||| || || || ||||| |||||| |||||    
T  6902392 gaaatatatgaaatgaaatattaaataaataaggtcattatagtaaaattatagcttattgcatcaaatgtagtatcaattgttgatggtcttggtttgt 6902491  T
Q  470 gtaaaatgtcataaaatgacaattaaaaag 499  Q
    ||||||| ||| ||  ||||| ||||||||    
T  6902492 gtaaaatatcaaaatgtgacagttaaaaag 6902521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #79
Raw Score: 73; E-Value: 9e-33
Query Start/End: Original strand, 235 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 44544436 - 44544296
Alignment:
Q  235 atactcactccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttatttcaatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaactttaaatgttatttt 334  Q
    |||||| || |||||||||||||||||| |||||| | |||    || |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  44544436 atactctcttcgttcctttttaagtgtctcttttgaaaaaaaaaattgtttctatttaactgtcactttcaaaattcaatgcaacattaaatgttatttt 44544337  T
Q  335 atcaatattacccttagttatttattgtggagatagaaata 375  Q
    | |||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  44544336 accaatattatccttagttatttattgcggagagagaaata 44544296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #80
Raw Score: 70; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 321 - 501
Target Start/End: Complemental strand, 32853539 - 32853361
Alignment:
Q  321 ttaaatgttattttatcaatattacccttagttatttattgtggagatagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggatattatggtaaaagta 420  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||| |||  |||||||||  |||| ||||| ||  ||||||| ||||||||| |||||||   |||| |||||||||    
T  32853539 ttaaatgttgttttaccaatattacctttaaatatttattgcagagagagaaacat--gaaatgaaatattaaattaataaggtcgttatagtaaaagta 32853442  T
Q  421 tcaattattgtatcaaaagtaataacatttattgattgtcttgctttgtgtaaaatgtcataaaatgacaattaaaaagga 501  Q
      ||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||    
T  32853441 aaaacaattgtatcaaaagtagtaacatttattgattgtcttagtttgtgtaaaatgtcaaaaagttacaattaaaaagga 32853361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #81
Raw Score: 70; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 236 - 513
Target Start/End: Complemental strand, 53291027 - 53290750
Alignment:
Q  236 tactcactccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttatttcaatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaactttaaatgttatttta 335  Q
    ||||| |||||||||||| ||| ||||||| ||  | || |||||| |||  | |||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||     
T  53291027 tactccctccgttcctttataactgtcactcttacataatttttttgtttttaattaagtgtcactttcaaagttcaatgtaacattaaatgttattttt 53290928  T
Q  336 tcaatattacccttagttatttattgtggagatagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggatattatggtaaaagtatcaattattgtatca 435  Q
    || ||| | |||||| | ||||||||  |||| ||||||||| |||||  |||||||||| | |||||||||||| |   ||  || | |||||||||||    
T  53290927 tctataatgcccttaataatttattgcagagagagaaatataagaaatatgatattaaataattaaggatattatagacgaaccataagttattgtatca 53290828  T
Q  436 aaagtaataacatttattgattgtcttgctttgtgtaaaatgtcataaaatgacaattaaaaaggagcggaggtagta 513  Q
    |||||| | | ||  ||| | |||| || |||||||||||  ||| || ||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  53290827 aaagtagtgaaatacatttagtgtcatggtttgtgtaaaaaatcaaaatatgacaattaaaaaggaacggaggaagta 53290750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #82
Raw Score: 67; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 332 - 513
Target Start/End: Complemental strand, 28943704 - 28943523
Alignment:
Q  332 tttatcaatattacccttagttatttattgtggagatagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggatattatggtaaaagtatcaattattgt 431  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||  |||||| |||||||||| |||||||||    
T  28943704 tttaccaatattatccttagttatttattacggagagagaaatatatgaaataagatattaaatgactaagactattatagtaaaagtataaattattgt 28943605  T
Q  432 atcaaaagtaataacatttattgattgtc-ttgctttgtgtaaaatgtcataaaatgacaattaaaaaggagcggaggtagta 513  Q
    || | ||  | ||||||||||||| || | ||| |||||||||||||| | ||| ||||  ||||||| || |||||||||||    
T  28943604 ataagaaaaagtaacatttattgagtgcctttgatttgtgtaaaatgtta-aaagtgaccgttaaaaaagaacggaggtagta 28943523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #83
Raw Score: 63; E-Value: 8e-27
Query Start/End: Original strand, 242 - 439
Target Start/End: Original strand, 28226413 - 28226608
Alignment:
Q  242 ctccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttatttcaatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaactttaaatgttattttatcaata 341  Q
    |||||||||||| ||| |||| |||||  | ||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||  | |||    
T  28226413 ctccgttcctttataactgtcgcttttacataaattttttgtttctaattaactgtcactttcaaagttcaatgtaacattaaatgttgtttttcctata 28226512  T
Q  342 ttacccttagttatttattgtggagatagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggatattatggtaaaagtatcaattattgtatcaaaag 439  Q
     | |||||||| ||||||  || ||| |||||||||||||||  |||||||||| | |||||||||||| |  |||  || | |||||||||||||||    
T  28226513 atgcccttagtaatttat--tgcagagagaaatatatgaaatatgatattaaataattaaggatattataggcaaaacataagttattgtatcaaaag 28226608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #84
Raw Score: 58; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 251 - 436
Target Start/End: Complemental strand, 22100075 - 22099890
Alignment:
Q  251 tttttaagtgtcacttttggagaaattttttatttcaatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaactttaaatgttattttatcaatattaccctta 350  Q
    ||||||||| || |||||||||||| ||||| |||  |||||||||| | |||| |||||||||||||| |||||| ||| ||||  ||||||| |||||    
T  22100075 tttttaagtatctcttttggagaaaatttttgtttttatttaactgttattttcgaagttcaatgcaacattaaatattactttactaatattatcctta 22099976  T
Q  351 gttatttattgtggagatagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggatattatggtaaaagtatcaattattgtatcaa 436  Q
     ||||||||| |||| | |||||| || ||| |  |  ||||||||||||||  |||||| ||||||||||  |||||| ||||||    
T  22099975 cttatttattatggaaagagaaatgtaagaagtttgtgattaaatgaataagattattatagtaaaagtatgcattattttatcaa 22099890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #85
Raw Score: 58; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 243 - 436
Target Start/End: Complemental strand, 22174099 - 22173906
Alignment:
Q  243 tccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttatttcaatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaactttaaatgttattttatcaatat 342  Q
    ||||||| ||||||||||||  ||||||| ||||||||| |||  |||||||||| | |||| |||||||||||||| |||||| ||| ||||  |||||    
T  22174099 tccgttcatttttaagtgtcttttttggataaattttttgtttttatttaactgttattttcgaagttcaatgcaacattaaatattactttactaatat 22174000  T
Q  343 tacccttagttatttattgtggagatagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggatattatggtaaaagtatcaattattgtatcaa 436  Q
    || | ||| ||||||||| |||| | |||||| || ||| |  |  ||||||||||||||  |||||| ||||||||||  |||||| ||||||    
T  22173999 tatctttacttatttattatggaaagagaaatgtaagaagtttgtgattaaatgaataagattattatagtaaaagtatgcattattttatcaa 22173906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #86
Raw Score: 57; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 247 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 43160015 - 43159859
Alignment:
Q  247 ttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttatttcaatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaactttaaatgttattttatcaatattacc 346  Q
    ||||||||||| | |||||||| ||||||    || |||  |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||    
T  43160015 ttcctttttaattatcacttttagagaaaaaaattgtttttatttaactgtcactttcaaaattcaatgcaacattaaatgttgatttatcaatattacc 43159916  T
Q  347 cttagttatttattgtggagatagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataagg 403  Q
    ||||  |||||||||  |||| | ||| |||| |||| | ||||||||| |||||||    
T  43159915 cttaaatatttattgcagagagaaaaacatataaaataaaatattaaattaataagg 43159859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #87
Raw Score: 57; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 12 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 53127689 - 53127563
Alignment:
Q  12 catcatctataaggcccaataaggaactagaaaaa-caaggagcattgtacaactccaaattaaaagtaatctaaattttaaaacta---aattatttat 107  Q
    ||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||  ||||||| |||||||||||   ||||  ||||    
T  53127689 catcacctataaggcccaataaagaactagaaaaaacaaggagcattatacaaatccaaattaaaaacaatctaagttttaaaactaaacaatttattat 53127590  T
Q  108 tacaaacaagattcactaaagaaagat 134  Q
    ||||| ||| ||||||| |||||||||    
T  53127589 tacaagcaatattcactgaagaaagat 53127563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #88
Raw Score: 55; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 236 - 410
Target Start/End: Complemental strand, 47844104 - 47843935
Alignment:
Q  236 tactcactccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttatttcaatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaactttaaatgttatttta 335  Q
    ||||| |||||||||||| ||| ||||||||||  | |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||| ||||     
T  47844104 tactccctccgttcctttataactgtcacttttacataaattttttatttctaattaactgtcactttcaaagttcaatgtaatattaaatgttgttttt 47844005  T
Q  336 tcaatattacccttagttatttattgtggagatagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggatattat 410  Q
     | ||| |||| ||||| ||||||||  |||| |     |||||||||  |||||||||| | ||||||||||||    
T  47844004 cctataataccgttagtaatttattgcagagaga-----atatgaaatatgatattaaataattaaggatattat 47843935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #89
Raw Score: 54; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 236 - 500
Target Start/End: Original strand, 26748333 - 26748596
Alignment:
Q  236 tactcactccgttcctttttaagtgtcacttttggaga-aattttttatttcaatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaactttaaatgttatttt 334  Q
    ||||| |||||||||||| ||| ||||||||||| | | ||  |||  |||||||| |||||||  ||||||||| ||||| | | ||||||||  ||||    
T  26748333 tactccctccgttcctttataattgtcacttttgcatacaaaatttgttttcaatt-aactgtcgttttcaaagtccaatgtatcattaaatgtggtttt 26748431  T
Q  335 atcaatattacccttagttatttattgtggagatagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggatattatggtaaaagtatcaattattgtatc 434  Q
    | | ||||||||||||  |||||||||  |||| ||||||||||| |||||  |||||||| | ||||| |||||| | ||||  || |||| |||||||    
T  26748432 acctatattacccttatatatttattgctgagagagaaatatatggaatgaagtattaaattattaaggttattatagaaaaaagataaattgttgtatc 26748531  T
Q  435 aaaagtaataacatttattgattgtcttgctttgtgtaaaatgtcataaaatgacaattaaaaagg 500  Q
    ||||||| ||| |   |||  |||||||| ||||||||||| |||| ||  |||||||||||||||    
T  26748532 aaaagtagtaa-aagcatttgttgtcttgatttgtgtaaaaagtcaaaatgtgacaattaaaaagg 26748596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #90
Raw Score: 54; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 323 - 513
Target Start/End: Original strand, 29803727 - 29803905
Alignment:
Q  323 aaatgttattttatcaatattacccttagttatttattgtggagatagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggatattatggtaaaagtatc 422  Q
    ||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||            ||||||||||||   ||||| ||||||||||     
T  29803727 aaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgtggagagagaaatatat------------taaatgaataagatcattatagtaaaagtata 29803814  T
Q  423 aattattgtatcaaaagtaataacatttattgattgtcttgctttgtgtaaaatgtcataaaatgacaattaaaaaggagcggaggtagta 513  Q
    | |||||| ||||| | || || || || |||||||||||| || ||||||||| ||| ||  |||||||||||||||| |||||||||||    
T  29803815 acttattgcatcaataatagtatcaattgttgattgtcttggttcgtgtaaaatatcaaaatgtgacaattaaaaaggaacggaggtagta 29803905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #91
Raw Score: 52; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 290 - 513
Target Start/End: Complemental strand, 35458716 - 35458493
Alignment:
Q  290 ttaactgtcactttcaaagttcaatgcaactttaaatgttattttatcaatattacccttagttatttattgtggagatagaaatatatgaaatgagata 389  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||| ||||  | |||   |||||||| |||||||   |||| | |||||||||||||  ||||    
T  35458716 ttaactgtcactttcaaagttcaatgtgacattaaatgttgtttttcctataaagcccttagtaatttattagagagagaaaaatatatgaaatatgata 35458617  T
Q  390 ttaaatgaataaggatattatggtaaaagtatcaattattgtatcaaaagtaataacatttattgattgtcttgctttgtgtaaaatgtcataaaatgac 489  Q
    |||||| | |||||||||||| |  |||  || | ||||||||||||||||| | | ||  | | | ||||||| ||||||||||| || | ||  ||||    
T  35458616 ttaaataattaaggatattataggcaaaacataagttattgtatcaaaagtagtgaaatacaattagtgtcttggtttgtgtaaaaagttaaaatgtgac 35458517  T
Q  490 aattaaaaaggagcggaggtagta 513  Q
    |||||||||| | |||||||||||    
T  35458516 aattaaaaagaaacggaggtagta 35458493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #92
Raw Score: 51; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 423 - 513
Target Start/End: Complemental strand, 2858656 - 2858566
Alignment:
Q  423 aattattgtatcaaaagtaataacatttattgattgtcttgctttgtgtaaaatgtcataaaatgacaattaaaaaggagcggaggtagta 513  Q
    |||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||| | |||||||||||| | ||  |||||||||||||||| |||||||||||    
T  2858656 aattattgtatcaaaagtagcaacctttattgattgtcttggtctgtgtaaaatgttaaaatgtgacaattaaaaaggaacggaggtagta 2858566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #93
Raw Score: 51; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 276 - 450
Target Start/End: Complemental strand, 31610334 - 31610161
Alignment:
Q  276 ttttttatttcaatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaactttaaatgttattttatcaatattacccttagttatttattgtggagatagaaata 375  Q
    |||||| |||| |||||| ||||| |||||||||| ||| |||  ||||||||||||||| |||||| || | | |||||||||| | |||| |||||||    
T  31610334 ttttttctttctatttaagtgtcattttcaaagtttaatacaatattaaatgttattttaccaatat-actcatggttatttattatagagagagaaata 31610236  T
Q  376 tatgaaatgagatattaaatgaataaggatattatggtaaaagtatcaattattgtatcaaaagtaataacattt 450  Q
    |||||||  | ||||||||| ||| ||| |||||| | ||||  || ||| ||||||| ||||||| ||||||||    
T  31610235 tatgaaacaatatattaaataaatgaggctattattgaaaaatgataaataattgtattaaaagtagtaacattt 31610161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #94
Raw Score: 51; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 243 - 501
Target Start/End: Original strand, 34750642 - 34750899
Alignment:
Q  243 tccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttatttcaatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaactttaaatgttattttatcaatat 342  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||||| | |||  |||| |||| | |||||||||  ||||||||||||||| | | ||||||||   |||  | ||||    
T  34750642 tccgttcctttataattgtcacttttgcataaaaattttgtttctaattaactgtcgttttcaaagttcaatgtatcattaaatgtggctttgcctatat 34750741  T
Q  343 tacccttagttatttattgtggagatagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggatattatggtaaaagtatcaattattgtatcaaaagtaa 442  Q
    ||||||||  |||||||||  |||| |||||||||||||||||   ||||||| | ||||| |||||| | ||||  || | || ||||||||||||||     
T  34750742 tacccttatatatttattgcagagagagaaatatatgaaatgaagcattaaataattaaggttattataggaaaaagataatttgttgtatcaaaagtag 34750841  T
Q  443 taacatttattgattgtcttgctttgtgtaaaatgtcataaaatgacaattaaaaagga 501  Q
    ||| |  ||||  |||||||| ||||||||||| | || ||   |||||||||||||||    
T  34750842 taa-aagtatttgttgtcttgatttgtgtaaaaagacaaaatgagacaattaaaaagga 34750899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #95
Raw Score: 50; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 288 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 2154253 - 2154184
Alignment:
Q  288 atttaactgtcactttcaaagttcaatgcaactttaaatgttattttatcaatattacccttagttattt 357  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||| ||||| |||||    
T  2154253 atttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgtcttatcaatattactcttagatattt 2154184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #96
Raw Score: 50; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 374 - 447
Target Start/End: Complemental strand, 44544155 - 44544082
Alignment:
Q  374 tatatgaaatgagatattaaatgaataaggatattatggtaaaagtatcaattattgtatcaaaagtaataaca 447  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||||| | ||||||||||||||||| |||||    
T  44544155 tatatgaaatgagatattaaatgaaaaaggttattatagtaaaagtataacttattgtatcaaaagtattaaca 44544082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #97
Raw Score: 48; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 236 - 327
Target Start/End: Original strand, 1201043 - 1201134
Alignment:
Q  236 tactcactccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttatttcaatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaactttaaatg 327  Q
    ||||| |||||||||||||||| |||||| |||| | || |||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  1201043 tactccctccgttcctttttaattgtcacatttgcataatttttttgtttctaattaactgtcactttcaaagttcaatacaacattaaatg 1201134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #98
Raw Score: 47; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 371 - 501
Target Start/End: Complemental strand, 8237026 - 8236896
Alignment:
Q  371 aaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggatattatggtaaaagtatcaattattgtatcaaaagtaataacatttattgattgtcttgctttgtg 470  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| |||| |||||| |||||||||| ||||||| || |||||||| | |||||||| || | | ||| ||| |     
T  8237026 aaatatatgaaattagatattaaatgaacaaggttattatagtaaaagtataaattattataacaaaagtagttacatttatggacttttttgatttata 8236927  T
Q  471 taaaatgtcataaaatgacaattaaaaagga 501  Q
    |||||||||| ||  || || ||||||||||    
T  8236926 taaaatgtcaaaatgtgtcagttaaaaagga 8236896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #99
Raw Score: 45; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 235 - 443
Target Start/End: Original strand, 24569529 - 24569737
Alignment:
Q  235 atactcactccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttatttcaatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaactttaaatgttatttt 334  Q
    |||||| ||||||| |||| ||| |||| |||||  | || |||||| |||| | |||| ||| ||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||    
T  24569529 atactccctccgtttctttataattgtcgcttttacataatttttttgtttctaattaattgttactttcaaagttcaatgtaatattaaatgttatttt 24569628  T
Q  335 atcaatattacccttagttatttattgtggagatagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggatattatggtaaaagtatcaattattgtatc 434  Q
      | ||| | | |||| | ||||||||  |||| | |||||||||||||  |||||||||| | |||| ||||||| |  |||  || | ||||||||||    
T  24569629 tcctataatgctcttaataatttattgcagagacaaaaatatatgaaatatgatattaaataattaagaatattataggcaaaacataacttattgtatc 24569728  T
Q  435 aaaagtaat 443  Q
    |||||||||    
T  24569729 aaaagtaat 24569737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #100
Raw Score: 45; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 245 - 329
Target Start/End: Original strand, 29803624 - 29803708
Alignment:
Q  245 cgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttatttcaatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaactttaaatgtt 329  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||   ||| ||   |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  29803624 cgttcatttttaagtgtcacttttggagaaaaaatttgttcatatttaattgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgtt 29803708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #101
Raw Score: 45; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 246 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 44092285 - 44092181
Alignment:
Q  246 gttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttatttcaatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaactttaaatgttattttatcaatattac 345  Q
    |||||||||||| |||||||||| |||||   |||| ||   |||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||     
T  44092285 gttcctttttaattgtcacttttagagaagaattttgttcatatttaactgttacttttaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattat 44092186  T
Q  346 cctta 350  Q
    |||||    
T  44092185 cctta 44092181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #102
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 288 - 445
Target Start/End: Complemental strand, 42634561 - 42634403
Alignment:
Q  288 atttaactgtcactttcaaagttcaatgcaactttaaatgttattttatcaatattaccctta---gttatttattgtggagatagaaatatatgaaatg 384  Q
    ||||||||||||||||  ||||||| |||||  |||||| || |||||| ||||||| | |||    ||||||||| |||||  ||||||||||||| |     
T  42634561 atttaactgtcacttttgaagttcagtgcaatattaaatattgttttataaatattatcgttacttcttatttattatggag--agaaatatatgaagtt 42634464  T
Q  385 agatattaaatgaataaggatattatggtaaaagtatcaattattgtatcaaaagtaataa 445  Q
    ||  ||||||| ||||||| |||||| ||||||||||  ||| || |||||||||||||||    
T  42634463 agtgattaaataaataaggttattatagtaaaagtatgcattgttctatcaaaagtaataa 42634403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #103
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 372 - 501
Target Start/End: Complemental strand, 3114520 - 3114391
Alignment:
Q  372 aatatatgaaatgagatattaaatgaataaggatattatggtaaaagt-atcaattattgtatcaaaagtaataacatttattgattgtcttgctttgtg 470  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||   |||| | |  ||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||| ||| |||| |    
T  3114520 aatatatgaaatgaaatattaaatgaataaggctgttatatgaaaaatgaaaaattattgtattaaaagtagtaacatttactgattgt-ttggtttgag 3114422  T
Q  471 taaaatgtcataaaatgacaattaaaaagga 501  Q
    |||||| | | ||| ||||||||||||||||    
T  3114421 taaaatattaaaaagtgacaattaaaaagga 3114391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #104
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 242 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 29458982 - 29458865
Alignment:
Q  242 ctccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttattt--caatttaactgtcacttt-caaagttcaatgcaactttaaatgttattttatca 338  Q
    ||||||| ||||||||||||| |||||| |||  |||||| |||  | |||||| ||||||| | || ||||||||||||| |||||||||||||||  |    
T  29458982 ctccgtttctttttaagtgtctcttttgaagatttttttttttttcctatttaagtgtcactctacatagttcaatgcaacattaaatgttattttacta 29458883  T
Q  339 atattacccttagttatt 356  Q
    |||||||||||| |||||    
T  29458882 atattacccttatttatt 29458865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #105
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 437 - 507
Target Start/End: Complemental strand, 31610151 - 31610081
Alignment:
Q  437 aagtaataacatttattgattgtcttgctttgtgtaaaatgtcataaaatgacaattaaaaaggagcggag 507  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||| ||| ||||||||| ||| || |||||    
T  31610151 aagtaataacatttattgattgtcttgatttatgtaaaatatcaaaaagtgacaattataaaagaacggag 31610081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #106
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 278 - 375
Target Start/End: Original strand, 18355910 - 18356007
Alignment:
Q  278 ttttatttcaatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaactttaaatgttattttatcaatattacccttagttatttattgtggagatagaaata 375  Q
    |||| ||||| ||||  ||||||||||||  ||||||||||| |||| | ||  |||||||||| |||||||| ||||||||||| |||| |||||||    
T  18355910 ttttgtttcactttacttgtcactttcaagtttcaatgcaacattaattattgatttatcaataatacccttacttatttattgtagagagagaaata 18356007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #107
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 450 - 499
Target Start/End: Complemental strand, 44543783 - 44543734
Alignment:
Q  450 tattgattgtcttgctttgtgtaaaatgtcataaaatgacaattaaaaag 499  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  44543783 tattgattatcttggtttgtgtaaaatgtcaaaaaatgacaattaaaaag 44543734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #108
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 247 - 383
Target Start/End: Complemental strand, 40113502 - 40113366
Alignment:
Q  247 ttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttatttcaatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaactttaaatgttattttatcaatattacc 346  Q
    ||||||| ||| ||||||||||  |||| || ||| |||  | |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||| || |||   ||    
T  40113502 ttcctttataactgtcacttttacagaatttgtttgttttcaattaactgtcactttcaaagttcaatgtaacattaaatgttgttttttctataaagcc 40113403  T
Q  347 cttagttatttattgtggagatagaaatatatgaaat 383  Q
    |||| | ||||||||  |||| | || ||||||||||    
T  40113402 cttaataatttattggagagagaaaagtatatgaaat 40113366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #109
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 436 - 513
Target Start/End: Original strand, 7329004 - 7329081
Alignment:
Q  436 aaagtaataacatttattgattgtcttgctttgtgtaaaatgtcataaaatgacaattaaaaaggagcggaggtagta 513  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||||  |||||||||||||| | ||  |||||||||||||| |  ||||||||||    
T  7329004 aaagtagtaacaattattgattgtcttagtttgtgtaaaatgttaaaatgtgacaattaaaaagaaatggaggtagta 7329081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #110
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 452 - 513
Target Start/End: Complemental strand, 45513368 - 45513307
Alignment:
Q  452 ttgattgtcttgctttgtgtaaaatgtcataaaatgacaattaaaaaggagcggaggtagta 513  Q
    |||||||| ||| |||||||||||| ||| || ||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  45513368 ttgattgttttgatttgtgtaaaatatcaaaatatgacaattaaaaaggaacggatgtagta 45513307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #111
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 295 - 410
Target Start/End: Complemental strand, 199073 - 198958
Alignment:
Q  295 tgtcactttcaaagttcaatgcaactttaaatgttattttatcaatattacccttagttatttattgtggagatagaaatatatgaaatgagatattaaa 394  Q
    ||||| ||||||  ||||||||||| |||| | || |||| |||||| |||||||   |||||||||| |||| ||||| | || |||||| ||| ||||    
T  199073 tgtcattttcaagtttcaatgcaacattaattattgttttgtcaataatacccttgcatatttattgtagagagagaaaaaaataaaatgaaataataaa 198974  T
Q  395 tgaataaggatattat 410  Q
    ||| ||||| ||||||    
T  198973 tgattaagggtattat 198958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #112
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 295 - 410
Target Start/End: Complemental strand, 13365061 - 13364946
Alignment:
Q  295 tgtcactttcaaagttcaatgcaactttaaatgttattttatcaatattacccttagttatttattgtggagatagaaatatatgaaatgagatattaaa 394  Q
    ||||||||||||  ||||||||||| |||| | || | || |||||| |||||||   |||||||||| |||| ||||| | || |||||| ||| ||||    
T  13365061 tgtcactttcaagtttcaatgcaacattaattattgtcttgtcaataatacccttgcatatttattgtagagagagaaaaaaataaaatgaaataataaa 13364962  T
Q  395 tgaataaggatattat 410  Q
    ||| ||||| ||||||    
T  13364961 tgattaagggtattat 13364946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #113
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 295 - 410
Target Start/End: Original strand, 23087990 - 23088105
Alignment:
Q  295 tgtcactttcaaagttcaatgcaactttaaatgttattttatcaatattacccttagttatttattgtggagatagaaatatatgaaatgagatattaaa 394  Q
    ||||||||||||  ||||||||||| |||| | || | || |||||| |||||||   |||||||||| |||| ||||| | || |||||| ||| ||||    
T  23087990 tgtcactttcaagtttcaatgcaacattaattattgtcttgtcaataatacccttgcatatttattgtagagagagaaaaaaataaaatgaaataataaa 23088089  T
Q  395 tgaataaggatattat 410  Q
    ||| ||||| ||||||    
T  23088090 tgattaagggtattat 23088105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #114
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 295 - 410
Target Start/End: Original strand, 46694169 - 46694284
Alignment:
Q  295 tgtcactttcaaagttcaatgcaactttaaatgttattttatcaatattacccttagttatttattgtggagatagaaatatatgaaatgagatattaaa 394  Q
    ||||||||||||  ||||||||||| |||| | || | || |||||| |||||||   |||||||||| |||| ||||| | || |||||| ||| ||||    
T  46694169 tgtcactttcaagtttcaatgcaacattaattattgtcttgtcaataatacccttgcatatttattgtagagagagaaaaaaataaaatgaaataataaa 46694268  T
Q  395 tgaataaggatattat 410  Q
    ||| ||||| ||||||    
T  46694269 tgattaagggtattat 46694284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #115
Raw Score: 31; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 371 - 441
Target Start/End: Original strand, 53055346 - 53055416
Alignment:
Q  371 aaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggatattatggtaaaagtatcaattattgtatcaaaagta 441  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||| | ||||  || |||| || |||||||||||    
T  53055346 aaatatatgaaatgagatattaaatgataaaggttattatagaaaaaagatgaattgttttatcaaaagta 53055416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 171; Significance: 3e-91; HSPs: 158)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 171; E-Value: 3e-91
Query Start/End: Original strand, 236 - 497
Target Start/End: Original strand, 37502004 - 37502266
Alignment:
Q  236 tactcactccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttatttcaatttaactgtcactttcaaagt-tcaatgcaactttaaatgttatttt 334  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||  |||||||||| ||||||||| ||||    
T  37502004 tactccctccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttgtttctatttaaccgtcactttcaaagggtcaatgcaacattaaatgttgtttt 37502103  T
Q  335 atcaatattacccttagttatttattgtggagatagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggatattatggtaaaagtatcaattattgtatc 434  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  37502104 atcaatattacccttagttatttattatggagagataaatatatgaaatgtaatattaaatgaataaggttattatagtaaaagtataaattattgtatc 37502203  T
Q  435 aaaagtaataacatttattgattgtcttgctttgtgtaaaatgtcataaaatgacaattaaaa 497  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||| ||||||| ||||    
T  37502204 aaaagtagtaacatttattgattgtcttggtttgtataaaatgtcaaaaagtgacaatcaaaa 37502266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 171; E-Value: 3e-91
Query Start/End: Original strand, 236 - 514
Target Start/End: Original strand, 44217689 - 44217967
Alignment:
Q  236 tactcactccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttatttcaatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaactttaaatgttatttta 335  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  44217689 tactctctccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttgtttctatttaactgtcactttcgaagttcaatgcaacattaaatgttgtttta 44217788  T
Q  336 tcaatattacccttagttatttattgtggagatagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggatattatggtaaaagtatcaattattgtatca 435  Q
     |||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||| ||||||||||   |||||| ||||    
T  44217789 ccaatattatccttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaagaaggtcattatagtaaaagtatatcttattgcatca 44217888  T
Q  436 aaagtaataacatttattgattgtcttgctttgtgtaaaatgtcataaaatgacaattaaaaaggagcggaggtagtaa 514  Q
    |||||| || || || |||||||||||| |||||||||||||||| ||  |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  44217889 aaagtagtatcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaacggaggtagtaa 44217967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 170; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 235 - 500
Target Start/End: Complemental strand, 26934033 - 26933769
Alignment:
Q  235 atactcactccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttatttcaatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaactttaaatgttatttt 334  Q
    |||||| ||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  26934033 atactccctccgttcctttttaagcgttatttttggagaaattttttgtttcaatttaactgtcatttttaaagttcaatgcaactttaaatgttgtttt 26933934  T
Q  335 atcaatattacccttagttatttattgtggagatagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggatattatggtaaaagtatcaattattgtatc 434  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |  |||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||    
T  26933933 atcaatattacccttagttatttatcgcagagagagaaatatatgaaatgaaatattaaa-gaataaggatattatagtaaaagtatcaattattgtgtc 26933835  T
Q  435 aaaagtaataacatttattgattgtcttgctttgtgtaaaatgtcataaaatgacaattaaaaagg 500  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||| ||||  |||||||||    
T  26933834 aaaagtagtaacatttattgattgttttggtttgtgtaaaatgtcacaaagtgacggttaaaaagg 26933769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 161; E-Value: 3e-85
Query Start/End: Original strand, 233 - 513
Target Start/End: Complemental strand, 13629457 - 13629177
Alignment:
Q  233 ttatactcactccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttatttcaatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaactttaaatgttatt 332  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||    
T  13629457 ttatactccctccgttcctttttaagtgtcacttttgtagaaattttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgtt 13629358  T
Q  333 ttatcaatattacccttagttatttattgtggagatagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggatattatggtaaaagtatcaattattgta 432  Q
    ||| |||||||  |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||   |||||| |    
T  13629357 ttaccaatattgtccttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggttattatagtaaaagtatagcttattgca 13629258  T
Q  433 tcaaaagtaataacatttattgattgtcttgctttgtgtaaaatgtcataaaatgacaattaaaaaggagcggaggtagta 513  Q
    | |||| || || || || |||||||||||| |||||||||||||||| ||  |||||||||||||||| | |||||||||    
T  13629257 tgaaaaatagtatcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaacagaggtagta 13629177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 159; E-Value: 4e-84
Query Start/End: Original strand, 236 - 514
Target Start/End: Complemental strand, 53600047 - 53599769
Alignment:
Q  236 tactcactccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttatttcaatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaactttaaatgttatttta 335  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || |||||    
T  53600047 tactccctccgttcctttttaagtgtcatttttggagaaaaattttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatattgtttta 53599948  T
Q  336 tcaatattacccttagttatttattgtggagatagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggatattatggtaaaagtatcaattattgtatca 435  Q
     |||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||| |||||||||| | |||||| ||||    
T  53599947 ccaatattatccttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgtgatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtataacttattgcatca 53599848  T
Q  436 aaagtaataacatttattgattgtcttgctttgtgtaaaatgtcataaaatgacaattaaaaaggagcggaggtagtaa 514  Q
    ||||||||| || || |||||||||||| |||||||||||||| | ||  |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  53599847 aaagtaatatcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatgttaaaatgtgacaattaaaaaggaacggaggtagtaa 53599769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 156; E-Value: 3e-82
Query Start/End: Original strand, 243 - 514
Target Start/End: Original strand, 55935097 - 55935368
Alignment:
Q  243 tccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttatttcaatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaactttaaatgttattttatcaatat 342  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||| ||| ||    
T  55935097 tccgttcctttttaagtgttatttttggagaaattttttgtttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacaataaatgttgttttaccaacat 55935196  T
Q  343 tacccttagttatttattgtggagatagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggatattatggtaaaagtatcaattattgtatcaaaagtaa 442  Q
    |||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||| ||||||||||| | ||  |     
T  55935197 tacccttagttatttattatggagagagaaatacatgaaataagatattaaatgactaaggctattatagtaaaagtatgaattattgtataagaaaaag 55935296  T
Q  443 taacatttattgattgtcttgctttgtgtaaaatgtcataaaatgacaattaaaaaggagcggaggtagtaa 514  Q
    ||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||| ||| ||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  55935297 taacatttattgagtgtcttgatttgtgtaaaatatcaaaaagtgacagttaaaaaggaacggaggtagtaa 55935368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 154; E-Value: 4e-81
Query Start/End: Original strand, 236 - 513
Target Start/End: Complemental strand, 22828662 - 22828385
Alignment:
Q  236 tactcactccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttatttcaatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaactttaaatgttatttta 335  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| | |||||    
T  22828662 tactccctccgttcctttttaagtgtctcttttggagaatttttttgtttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattacatgatgtttta 22828563  T
Q  336 tcaatattacccttagttatttattgtggagatagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggatattatggtaaaagtatcaattattgtatca 435  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||  || | ||||||||||||||| | |||||||||||||||||  ||||| |||||||||| | |||||| ||||    
T  22828562 tcaatattacccttaattatttattgcagatagagaaatatatgaaataatatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtataacttattgcatca 22828463  T
Q  436 aaagtaataacatttattgattgtcttgctttgtgtaaaatgtcataaaatgacaattaaaaaggagcggaggtagta 513  Q
    |||||| || || |||||| |||||||| |||||||||||||||| ||  |||||||||||||||| |||||||||||    
T  22828462 aaagtagtagcaattattggttgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaacggaggtagta 22828385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 152; E-Value: 6e-80
Query Start/End: Original strand, 242 - 513
Target Start/End: Complemental strand, 23720039 - 23719768
Alignment:
Q  242 ctccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttatttcaatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaactttaaatgttattttatcaata 341  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || |  |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||    
T  23720039 ctccgttcctttttaagtgtcacttttagagaaattttttgttcctgtttaactgtcactttcgaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaata 23719940  T
Q  342 ttacccttagttatttattgtggagatagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggatattatggtaaaagtatcaattattgtatcaaaagta 441  Q
    |||  |||  | |||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  23719939 ttattcttgctcatttattgtggagaaagaaatatatgaaaagaaatattaaatgaataaggttattatagtaaaagtatatattattgtatcaaaagta 23719840  T
Q  442 ataacatttattgattgtcttgctttgtgtaaaatgtcataaaatgacaattaaaaaggagcggaggtagta 513  Q
     ||| ||||||||| ||||||  ||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  23719839 gtaatatttattgaatgtcttagtttatgtaaaatgtcaaaaaataacaattaaaaaggaacggaggtagta 23719768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 151; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 235 - 513
Target Start/End: Original strand, 44069013 - 44069291
Alignment:
Q  235 atactcactccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttatttcaatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaactttaaatgttatttt 334  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||| || | |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  44069013 atactccctccgttcctttttaagtgtcacttttgtagaaaaattttgttcctatttaagtgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgtttt 44069112  T
Q  335 atcaatattacccttagttatttattgtggagatagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggatattatggtaaaagtatcaattattgtatc 434  Q
    |||||||||   ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||   |||||| |||    
T  44069113 atcaatattgttcttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtatagcttattgcatc 44069212  T
Q  435 aaaagtaataacatttattgattgtcttgctttgtgtaaaatgtcataaaatgacaattaaaaaggagcggaggtagta 513  Q
    ||||||| || || || |||||||||||| |||||||||||||||| ||  |||||||||||||| | |||||||||||    
T  44069213 aaaagtagtatcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaagaaacggaggtagta 44069291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 150; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 236 - 513
Target Start/End: Complemental strand, 31862247 - 31861970
Alignment:
Q  236 tactcactccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttatttcaatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaactttaaatgttatttta 335  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  31862247 tactccctccgttcctttttaagtgtctcttttggagaaaatttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgtttta 31862148  T
Q  336 tcaatattacccttagttatttattgtggagatagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggatattatggtaaaagtatcaattattgtatca 435  Q
     |||||||| ||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||  ||||| |||||||||| | || ||| ||||    
T  31862147 ccaatattatccttatttatttattgcggagaaagaaatatatgaaatgatatgttaaatgaataaggtcattatagtaaaagtataattttttgcatca 31862048  T
Q  436 aaagtaataacatttattgattgtcttgctttgtgtaaaatgtcataaaatgacaattaaaaaggagcggaggtagta 513  Q
    |||||| ||||| ||||||||| ||||  |||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||| ||||| |||||    
T  31862047 aaagtagtaacaattattgattatcttagtttgtgtaaaatttcaaaaaataacaattaaaaaggaacggagatagta 31861970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 148; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 235 - 498
Target Start/End: Original strand, 42099690 - 42099953
Alignment:
Q  235 atactcactccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttatttcaatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaactttaaatgttatttt 334  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||    
T  42099690 atactccctccgttcctttttaagtgtctcttttggagaatttttttgtttctatttaactatcactttcaaagttcaatgcaacattaaatggtgtttt 42099789  T
Q  335 atcaatattacccttagttatttattgtggagatagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggatattatggtaaaagtatcaattattgtatc 434  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| ||| | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||  |||||||||| | |||||| |||    
T  42099790 atcaatattacccttaattatttattgcggaaagagaaatatatgaaataagatattaaatgaataaggtcattacagtaaaagtataacttattgcatc 42099889  T
Q  435 aaaagtaataacatttattgattgtcttgctttgtgtaaaatgtcataaaatgacaattaaaaa 498  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||  ||||||| ||  |||||||||||||    
T  42099890 aaaagtagtaacaattattgattgtcttggtttgtgtttaatgtcaaaatgtgacaattaaaaa 42099953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 148; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 242 - 501
Target Start/End: Original strand, 46871910 - 46872169
Alignment:
Q  242 ctccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttatttcaatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaactttaaatgttattttatcaata 341  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||    
T  46871910 ctccgttcctttttaagtgtcacttttggataaattttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaata 46872009  T
Q  342 ttacccttagttatttattgtggagatagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggatattatggtaaaagtatcaattattgtatcaaaagta 441  Q
    ||  |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||| ||||||| || | |||||| ||||||||||    
T  46872010 ttgtccttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgaaatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagaataacttattgcatcaaaagta 46872109  T
Q  442 ataacatttattgattgtcttgctttgtgtaaaatgtcataaaatgacaattaaaaagga 501  Q
     || || || |||||||||||| |||||||||||||||| ||  |||||||| |||||||    
T  46872110 gtatcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaatttaaaagga 46872169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 147; E-Value: 6e-77
Query Start/End: Original strand, 236 - 514
Target Start/End: Original strand, 39671308 - 39671586
Alignment:
Q  236 tactcactccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttatttcaatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaactttaaatgttatttta 335  Q
    ||||| |||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||| ||   |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||    
T  39671308 tactctctccgttccttcataattgtcacttttggagaaattttttgttcttatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgtagtttta 39671407  T
Q  336 tcaatattacccttagttatttattgtggagatagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggatattatggtaaaagtatcaattattgtatca 435  Q
     |||||||  ||||| ||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||   |||||| ||||    
T  39671408 ccaatattgtccttaattatttattgcagagaaagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtatagcttattgcatca 39671507  T
Q  436 aaagtaataacatttattgattgtcttgctttgtgtaaaatgtcataaaatgacaattaaaaaggagcggaggtagtaa 514  Q
    ||||||||| || || |||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  39671508 aaagtaatatcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcataatgtgacaattaaataggaacggaggtagtaa 39671586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 146; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 236 - 509
Target Start/End: Complemental strand, 19093414 - 19093141
Alignment:
Q  236 tactcactccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttatttcaatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaactttaaatgttatttta 335  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||| |||||  ||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  19093414 tactccctccgtttctttttaagtgtctcttttaaagaaattttttgtttctatttaaccgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgtttta 19093315  T
Q  336 tcaatattacccttagttatttattgtggagatagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggatattatggtaaaagtatcaattattgtatca 435  Q
     |||||||| |||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||  | |||||| ||||    
T  19093314 ccaatattatccttagttatttattgcggagagaggaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtacaacttattgcatca 19093215  T
Q  436 aaagtaataacatttattgattgtcttgctttgtgtaaaatgtcataaaatgacaattaaaaaggagcggaggt 509  Q
    |||||| ||||| ||||||| | ||||| ||| |||||||||||| ||  |||||||||||||||| |||||||    
T  19093214 aaagtagtaacaattattgactatcttggtttatgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaacggaggt 19093141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 145; E-Value: 9e-76
Query Start/End: Original strand, 243 - 495
Target Start/End: Complemental strand, 53125492 - 53125240
Alignment:
Q  243 tccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttatttcaatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaactttaaatgttattttatcaatat 342  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||    
T  53125492 tccgttcctttttaagtgtctcttttggagaatttttttgtttctatttaactttcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgatgttttatcaatat 53125393  T
Q  343 tacccttagttatttattgtggagatagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggatattatggtaaaagtatcaattattgtatcaaaagtaa 442  Q
    |||||||| |||||||||| ||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||||  ||||| |||||||||| | |||||| || |||| ||     
T  53125392 tacccttaattatttattgcggagaaagaaatgtatgaaataagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtataacttattgcataaaaaatag 53125293  T
Q  443 taacatttattgattgtcttgctttgtgtaaaatgtcataaaatgacaattaa 495  Q
    ||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||| || |||||||||||    
T  53125292 taacaattattgattatcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatatgacaattaa 53125240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 144; E-Value: 4e-75
Query Start/End: Original strand, 236 - 511
Target Start/End: Complemental strand, 5374611 - 5374336
Alignment:
Q  236 tactcactccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttatttcaatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaactttaaatgttatttta 335  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||    |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||    
T  5374611 tactccctccgtttctttttaagtgtcacttttggagaaattttttgttcttgtttaactgtcactttcaaagctcaatgcaacattaaatgttgtttta 5374512  T
Q  336 tcaatattacccttagttatttattgtggagatagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggatattatggtaaaagtatcaattattgtatca 435  Q
     |||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||| |||||| |||   |||||| ||||    
T  5374511 ccaatattatccttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataagatcattatagtaaaaatatagcttattgcatca 5374412  T
Q  436 aaagtaataacatttattgattgtcttgctttgtgtaaaatgtcataaaatgacaattaaaaaggagcggaggtag 511  Q
    |||||| || || || |||||||||||| ||||| |||||||||| || ||||||||||||||| | |||||||||    
T  5374411 aaagtagtatcaattgttgattgtcttgatttgtataaaatgtcaaaatatgacaattaaaaagaaacggaggtag 5374336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 144; E-Value: 4e-75
Query Start/End: Original strand, 235 - 498
Target Start/End: Original strand, 48782182 - 48782444
Alignment:
Q  235 atactcactccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttatttcaatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaactttaaatgttatttt 334  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  48782182 atactccctccgtttctttttaagtgtcacttttggataaattttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgtttt 48782281  T
Q  335 atcaatattacccttagttatttattgtggagatagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggatattatggtaaaagtatcaattattgtatc 434  Q
    | |||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||   |||||| |||    
T  48782282 accaatattgtccttagttatttattgtggagagagaaatatatgaaat-agatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtattgcttattgcatc 48782380  T
Q  435 aaaagtaataacatttattgattgtcttgctttgtgtaaaatgtcataaaatgacaattaaaaa 498  Q
    ||||||| || || || |||||| ||||| |||||||||||||||| ||  |||||||||||||    
T  48782381 aaaagtagtatcaattgttgattatcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaa 48782444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 144; E-Value: 4e-75
Query Start/End: Original strand, 243 - 513
Target Start/End: Complemental strand, 55147315 - 55147044
Alignment:
Q  243 tccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttatttcaatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaactttaaatgttattttatcaatat 342  Q
    ||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||    
T  55147315 tccgttcttttttaagtgtcttttttggagaaattttttgttttcatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatat 55147216  T
Q  343 tacccttagttatttattgtggagatagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggatattatggtaaaagtatcaattattgtatcaaaagtaa 442  Q
    || ||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||  ||||||||||   |||||| |||||||||||    
T  55147215 tatccttacttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatgttaaatgaataaggtcattacagtaaaagtatagcttattgcatcaaaagtaa 55147116  T
Q  443 taacatttattgattgtcttgctttgtgtaaaatgt-cataaaatgacaattaaaaaggagcggaggtagta 513  Q
    ||||| ||||| ||||||||| ||| ||||||||||  | ||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  55147115 taacaattattaattgtcttggtttatgtaaaatgtaaaaaaaatgacaattaaaaaagaacggaggtagta 55147044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 143; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 243 - 513
Target Start/End: Complemental strand, 16465036 - 16464766
Alignment:
Q  243 tccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttatttcaatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaactttaaatgttattttatcaatat 342  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||    
T  16465036 tccgttcctttttaagtgtcacttttgaagaaattttttgttactatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatat 16464937  T
Q  343 tacccttagttatttattgtggagatagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggatattatggtaaaagtatcaattattgtatcaaaagtaa 442  Q
    |  ||||||||||||| ||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||   |||||| ||||||| ||     
T  16464936 tgtccttagttatttagtgcagagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaaatag 16464837  T
Q  443 taacatttattgattgtcttgctttgtgtaaaatgtcataaaatgacaattaaaaaggagcggaggtagta 513  Q
    || || || |||||||||| | |||||||||||||||| ||  |||||| ||||||||| |||||||||||    
T  16464836 tatcaattgttgattgtctaggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaactaaaaaggaacggaggtagta 16464766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 143; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 243 - 513
Target Start/End: Original strand, 42629307 - 42629577
Alignment:
Q  243 tccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttatttcaatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaactttaaatgttattttatcaatat 342  Q
    ||||||| ||| ||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||    
T  42629307 tccgttcatttataattgtcatttttagagaaattttttatttcaatttaattgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaattttgttttatcaatat 42629406  T
Q  343 tacccttagttatttattgtggagatagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggatattatggtaaaagtatcaattattgtatcaaaagtaa 442  Q
    |||||||| ||||||| || ||||| |||||| |||||||  | |||||||||||| |||| |||| | ||| |||||| ||||| |||| ||||||||     
T  42629407 tacccttaattatttaatgcggagagagaaatttatgaaacaaaatattaaatgaaaaaggctattttagtacaagtataaattactgtaccaaaagtag 42629506  T
Q  443 taacatttattgattgtcttgctttgtgtaaaatgtcataaaatgacaattaaaaaggagcggaggtagta 513  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||||| || |||| ||||||    
T  42629507 taacatttattgattgtcttggtttgtgtaaaatatcaaaaaatgacaattaaaaacgaacggatgtagta 42629577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 143; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 236 - 514
Target Start/End: Complemental strand, 44014174 - 44013896
Alignment:
Q  236 tactcactccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttatttcaatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaactttaaatgttatttta 335  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||||   ||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  44014174 tactccctccgttcctttttatgtgtcatttttggagaaaaaatttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgtttta 44014075  T
Q  336 tcaatattacccttagttatttattgtggagatagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggatattatggtaaaagtatcaattattgtatca 435  Q
     |||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||| ||||||||||   |||||| ||||    
T  44014074 ccaatattatccttagttatttattgtggagagataaatatatgaaatgagatattaaataaataaggtcattatagtaaaagtatagcttattgcatca 44013975  T
Q  436 aaagtaataacatttattgattgtcttgctttgtgtaaaatgtcataaaatgacaattaaaaaggagcggaggtagtaa 514  Q
    ||| || |  || || |||||||||||| |||||||||||||||| ||  |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  44013974 aaaatagtttcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaacggaggtagtaa 44013896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 143; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 251 - 514
Target Start/End: Complemental strand, 52057699 - 52057435
Alignment:
Q  251 tttttaagtgtcacttttggagaaattttttattt--caatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaactttaaatgttattttatcaatattaccct 348  Q
    ||||||||||||||||||| |||| |||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||    
T  52057699 tttttaagtgtcacttttgaagaatttttttttttttcaatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaaaattaaatgttattttatcaatattatcct 52057600  T
Q  349 tagttatttattgtggagatagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggatattatggtaaaagtatcaattattgtatcaaaagtaataacat 448  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||| ||||||  |||||| |||||||||| || |||||||||||||||| ||| ||    
T  52057599 tagttatttattgtggagagagaaatatataaaatgaaatattaaataaataagattattatagtaaaagtatgaagtattgtatcaaaagtagtaatat 52057500  T
Q  449 ttattgattgtcttgctttgtgtaaaatgtcataaaatgacaattaaaaaggagcggaggtagtaa 514  Q
    ||||||||||  ||| |||||||||||||||| || |  ||| ||||||||||  |||||||||||    
T  52057499 ttattgattggattggtttgtgtaaaatgtca-aatagtacagttaaaaaggaagggaggtagtaa 52057435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 142; E-Value: 6e-74
Query Start/End: Original strand, 236 - 513
Target Start/End: Complemental strand, 56576364 - 56576088
Alignment:
Q  236 tactcactccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttatttcaatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaactttaaatgttatttta 335  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || |||||    
T  56576364 tactccctccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaaaattttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatattgtttta 56576265  T
Q  336 tcaatattacccttagttatttattgtggagatagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggatattatggtaaaagtatcaattattgtatca 435  Q
     |||||||| |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||   |||||| ||||    
T  56576264 ccaatattatccttagttatttattgtggagagaaaaatatatgaaatg-gatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtatagcttattgcatca 56576166  T
Q  436 aaagtaataacatttattgattgtcttgctttgtgtaaaatgtcataaaatgacaattaaaaaggagcggaggtagta 513  Q
    || ||| || || || |||||| ||||| ||||||||||| |||| ||  |||||||||||||||| |||||||||||    
T  56576165 aaggtagtatcaattgttgattatcttggtttgtgtaaaacgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaacggaggtagta 56576088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 140; E-Value: 9e-73
Query Start/End: Original strand, 251 - 514
Target Start/End: Original strand, 353964 - 354227
Alignment:
Q  251 tttttaagtgtcacttttggagaaattttttatttcaatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaactttaaatgttattttatcaatattaccctta 350  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||||||| || | |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  353964 tttttaagtgtctcttttgaagaaattttttgttcctatttaattgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttattttaccaatattatcctta 354063  T
Q  351 gttatttattgtggagatagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggatattatggtaaaagtatcaattattgtatcaaaagtaataacattt 450  Q
    ||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||  | |||||| ||||||| || ||||| |     
T  354064 gttatttattgcggagagataaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtacaacttattgcatcaaaaatagtaacaatc 354163  T
Q  451 attgattgtcttgctttgtgtaaaatgtcataaaatgacaattaaaaaggagcggaggtagtaa 514  Q
    ||||| | ||||| ||| |||||||||||| ||  |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  354164 attgactatcttggtttatgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaacggaggtagtaa 354227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 140; E-Value: 9e-73
Query Start/End: Original strand, 235 - 498
Target Start/End: Complemental strand, 3436329 - 3436066
Alignment:
Q  235 atactcactccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttatttcaatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaactttaaatgttatttt 334  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  3436329 atactccctccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaaaattttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgtttt 3436230  T
Q  335 atcaatattacccttagttatttattgtggagatagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggatattatggtaaaagtatcaattattgtatc 434  Q
    | |||||||| |||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||   |||||| |||    
T  3436229 accaatattatccttagttatttattacggagagagaaatatatgaaatgaaatattaaattaataaggttattatagtaaaagtatagtttattgcatc 3436130  T
Q  435 aaaagtaataacatttattgattgtcttgctttgtgtaaaatgtcataaaatgacaattaaaaa 498  Q
    ||||||| ||  | || |||||||||||| |||||||||||||||| ||  ||| |||||||||    
T  3436129 aaaagtagtattaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgataattaaaaa 3436066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 140; E-Value: 9e-73
Query Start/End: Original strand, 242 - 513
Target Start/End: Original strand, 30939144 - 30939415
Alignment:
Q  242 ctccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttatttcaatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaactttaaatgttattttatcaata 341  Q
    ||||||| |||||||| |||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||    
T  30939144 ctccgtttctttttaattgtcacttttagagaaattttttgtttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaata 30939243  T
Q  342 ttacccttagttatttattgtggagatagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggatattatggtaaaagtatcaattattgtatcaaaagta 441  Q
    |||||||| | ||||||||| ||||| |||||  |||||||||| ||||||||| |||||||  ||||| |||||||||  ||  |||||||||||||||    
T  30939244 ttacccttggatatttattgcggagagagaaacgtatgaaatgaaatattaaattaataaggtcattatagtaaaagtaaaaacaattgtatcaaaagta 30939343  T
Q  442 ataacatttattgattgtcttgctttgtgtaaaatgtcataaaatgacaattaaaaaggagcggaggtagta 513  Q
     || ||||||||||  |||||| |||||||||||  ||| || ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  30939344 ctaccatttattgaccgtcttggtttgtgtaaaaaatcaaaatatgacaattaaaaaggaacggaggtagta 30939415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 139; E-Value: 4e-72
Query Start/End: Original strand, 236 - 498
Target Start/End: Original strand, 29295337 - 29295599
Alignment:
Q  236 tactcactccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttatttcaatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaactttaaatgttatttta 335  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||| || | |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  29295337 tactccctcctttcctttttaagtgtcacttttggagaaaaattttgttcctatttaactgtgactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgtttta 29295436  T
Q  336 tcaatattacccttagttatttattgtggagatagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggatattatggtaaaagtatcaattattgtatca 435  Q
     |||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||  ||||||||| | |||||| |||     
T  29295437 ccaatattatccttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatattaaaagtataacttattgcatcg 29295536  T
Q  436 aaagtaataacatttattgattgtcttgctttgtgtaaaatgtcataaaatgacaattaaaaa 498  Q
    |||||| || || ||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||  ||| |||||||||    
T  29295537 aaagtagtatcaattattgattgtcttggtttgtgtaaaatatcaaaatgtgataattaaaaa 29295599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 139; E-Value: 4e-72
Query Start/End: Original strand, 236 - 513
Target Start/End: Complemental strand, 38617568 - 38617293
Alignment:
Q  236 tactcactccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttatttcaatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaactttaaatgttatttta 335  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || | |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  38617568 tactccctccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaatattttgttcctatttaactgtcattttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgtttta 38617469  T
Q  336 tcaatattacccttagttatttattgtggagatagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggatattatggtaaaagtatcaattattgtatca 435  Q
     |||||||  |||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||| |||   |||||| ||||    
T  38617468 ccaatattgtccttagttatttattgcggagagataaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaaatatagcttattgcatca 38617369  T
Q  436 aaagtaataacatttattgattgtcttgctttgtgtaaaatgtcataaaatgacaattaaaaaggagcggaggtagta 513  Q
    |||||| || || || |||||||  ||| |||||||||||| ||| ||  |||||||||||||||| |||||||||||    
T  38617368 aaagtagtatcaattgttgattg--ttggtttgtgtaaaatatcaaaatgtgacaattaaaaaggaacggaggtagta 38617293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 139; E-Value: 4e-72
Query Start/End: Original strand, 243 - 513
Target Start/End: Original strand, 47751527 - 47751790
Alignment:
Q  243 tccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttatttcaatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaactttaaatgttattttatcaatat 342  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||| || || |||||||||||||||||||   |||||||| |    
T  47751527 tccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttgttccaatttaactgtcatttttaaggt-caatgcaactttaaatgtt---ttatcaatgt 47751622  T
Q  343 tacccttagttatttattgtggagatagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggatattatggtaaaagtatcaattattgtatcaaaagtaa 442  Q
    |||||||||||||||   | ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||   |||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||     
T  47751623 tacccttagttattt---gcggagagagaaatatctgaaatgagatattaaatgaataaaactattatagtaaaagtatcaattattgtatcaaaaatag 47751719  T
Q  443 taacatttattgattgtcttgctttgtgtaaaatgtcataaaatgacaattaaaaaggagcggaggtagta 513  Q
    ||||||||||  ||| | ||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| | |||||||||    
T  47751720 taacatttataaattattttggtttgtgtaaaatgtcacaaagtgacaattaaaaaggaactgaggtagta 47751790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 136; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 235 - 514
Target Start/End: Complemental strand, 21045009 - 21044731
Alignment:
Q  235 atactcactccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttatttcaatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaactttaaatgttatttt 334  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  21045009 atactccctcagttcctttttaagtgtcactttttgagaaaatttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgtttt 21044910  T
Q  335 atcaatattacccttagttatttattgtggagatagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggatattatggtaaaagtatcaattattgtatc 434  Q
    | |||||||| | |||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||  ||||| ||||||||||   |||||| |||    
T  21044909 accaatattatctttagttatttattgcggagagagaaatatatgcaatgagatattaaataaataaggtcattatagtaaaagtatagcttattgcatc 21044810  T
Q  435 aaaagtaataacatttattgattgtcttgctttgtgtaaaatgtcataaaatgacaattaaaaaggagcggaggtagtaa 514  Q
    |||| || || || || |||||||||||| |||||||||||||||| ||  ||| || ||||||||| ||||||||||||    
T  21044809 aaaaatagtatcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgataa-taaaaaggaacggaggtagtaa 21044731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 135; E-Value: 9e-70
Query Start/End: Original strand, 252 - 510
Target Start/End: Complemental strand, 52258036 - 52257778
Alignment:
Q  252 ttttaagtgtcacttttggagaaattttttatttcaatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaactttaaatgttattttatcaatattacccttag 351  Q
    |||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||| ||| |||| | ||||    
T  52258036 ttttaagtgtcattttttgagaaattttttatttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacaataaatgttgttttaccaacattatctttag 52257937  T
Q  352 ttatttattgtggagatagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggatattatggtaaaagtatcaattattgtatcaaaagtaataacattta 451  Q
    |||||||||| ||||| | ||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||| ||||||||||| | ||  |||||||||||    
T  52257936 ttatttattgcggagagaaaaatatatgaaataagatattaaatgactaaggctattatagtaaaagtataaattattgtataagaaaaaataacattta 52257837  T
Q  452 ttgattgtcttgctttgtgtaaaatgtcataaaatgacaattaaaaaggagcggaggta 510  Q
    |||| ||||||  ||| |||||||||||| ||| ||||| |||||||| | ||||||||    
T  52257836 ttgagtgtcttagtttatgtaaaatgtcaaaaagtgacagttaaaaagaaacggaggta 52257778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 134; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 236 - 493
Target Start/End: Original strand, 16664224 - 16664481
Alignment:
Q  236 tactcactccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttatttcaatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaactttaaatgttatttta 335  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |  | ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  16664224 tactccctccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaatattttgtccctatttaacggtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgtttta 16664323  T
Q  336 tcaatattacccttagttatttattgtggagatagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggatattatggtaaaagtatcaattattgtatca 435  Q
     || ||||  |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||   |||||| ||||    
T  16664324 ccagtattgtccttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaataagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtatagcttattgcatca 16664423  T
Q  436 aaagtaataacatttattgattgtcttgctttgtgtaaaatgtcataaaatgacaatt 493  Q
    |||||| || || || |||||||||||| |||||||||||||||| ||  ||||||||    
T  16664424 aaagtagtatcaattgttgattgtcttgatttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaatt 16664481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 134; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 233 - 498
Target Start/End: Original strand, 50623394 - 50623658
Alignment:
Q  233 ttatactcactccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttatttcaatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaactttaaatgttatt 332  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||   ||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||    
T  50623394 ttatactccctccgttcctttttaagtgtcactttaggagaaaaaatttgtttctatttaattgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgtt 50623493  T
Q  333 ttatcaatattacccttagttatttattgtggagatagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggatattatggtaaaagtatcaattattgta 432  Q
    ||| |||||||| ||||| |||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||| ||||||||||   ||||||||    
T  50623494 ttaccaatattatccttaattatttattgcggagagataaatatatgaaatgagata-taaatgaataaggtcattatagtaaaagtatagcttattgta 50623592  T
Q  433 tcaaaagtaataacatttattgattgtcttgctttgtgtaaaatgtcataaaatgacaattaaaaa 498  Q
    ||||||||| || || || |||||||||||| |||||||||||||| | ||  |||||||||||||    
T  50623593 tcaaaagtagtatcaatttttgattgtcttggtttgtgtaaaatgttaaaatgtgacaattaaaaa 50623658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 132; E-Value: 5e-68
Query Start/End: Original strand, 254 - 513
Target Start/End: Original strand, 6195025 - 6195284
Alignment:
Q  254 ttaagtgtcacttttggagaaattttttatttcaatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaactttaaatgttattttatcaatattacccttagtt 353  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| || | ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||| ||||||||    
T  6195025 ttaagtgtctcttttggagaaattttttgttcctatttaactgtcacattcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattatccttagtt 6195124  T
Q  354 atttattgtggagatagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggatattatggtaaaagtatcaattattgtatcaaaagtaataacatttatt 453  Q
    |||||||| ||||| | |||||||||||||||||| |||||| || ||||  || || |||||||||| | |||||| |||||||||| || || ||||     
T  6195125 atttattgcggagagataaatatatgaaatgagatgttaaataaacaaggtcatcatagtaaaagtataacttattgcatcaaaagtagtagcaattatg 6195224  T
Q  454 gattgtcttgctttgtgtaaaatgtcataaaatgacaattaaaaaggagcggaggtagta 513  Q
    |||||||||| |||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||| | |||||||||    
T  6195225 gattgtcttggtttgtgaaaaatgtcaaaaagtgacaattaaaaaggaacagaggtagta 6195284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 132; E-Value: 5e-68
Query Start/End: Original strand, 236 - 513
Target Start/End: Original strand, 12252083 - 12252352
Alignment:
Q  236 tactcactccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttatttcaatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaactttaaatgttatttta 335  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  12252083 tactccctccgttcctttttaagtgtcacttttgaagaaaatttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgtttta 12252182  T
Q  336 tcaatattacccttagttatttattgtggagatagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggatattatggtaaaagtatcaattattgtatca 435  Q
     |||||||| ||||||||||||||       || |||||||||||||| ||||||||||||||||| |  ||||| |||||||||| | |||||| ||||    
T  12252183 ccaatattatccttagttatttat-------at-gaaatatatgaaataagatattaaatgaataaagtcattatagtaaaagtataacttattgcatca 12252274  T
Q  436 aaagtaataacatttattgattgtcttgctttgtgtaaaatgtcataaaatgacaattaaaaaggagcggaggtagta 513  Q
    |||||| || || || |||||||||||| ||| |||||||||||| || |||||| |||||||||| |||||||||||    
T  12252275 aaagtattatcaattgttgattgtcttgatttatgtaaaatgtcaaaatatgacagttaaaaaggaacggaggtagta 12252352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 132; E-Value: 5e-68
Query Start/End: Original strand, 242 - 513
Target Start/End: Complemental strand, 35232552 - 35232282
Alignment:
Q  242 ctccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttatttcaatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaactttaaatgttattttatcaata 341  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||  || | |||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||    
T  35232552 ctccgttcctttttaagtgtca-ttttggagaaaattttggttcctatttaactatcacgttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaata 35232454  T
Q  342 ttacccttagttatttattgtggagatagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggatattatggtaaaagtatcaattattgtatcaaaagta 441  Q
    ||| ||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||   |||||| |||||||| |    
T  35232453 ttatccttacttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtatatcttattgcatcaaaagca 35232354  T
Q  442 ataacatttattgattgtcttgctttgtgtaaaatgtcataaaatgacaattaaaaaggagcggaggtagta 513  Q
     || || || |||||||||||| |||||||||||||||| ||  ||||||||||||| || |||| ||||||    
T  35232353 gtatcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaagaacggatgtagta 35232282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 132; E-Value: 5e-68
Query Start/End: Original strand, 243 - 513
Target Start/End: Complemental strand, 42513280 - 42513009
Alignment:
Q  243 tccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttatttcaatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaactttaaatgttattttatcaatat 342  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| || | |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||    
T  42513280 tccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaaaattttgttactatttaagtgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatat 42513181  T
Q  343 tacccttagttatttattgtggagatagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggatattatggtaaaagtatcaattattgtatcaaaagtaa 442  Q
    || |||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||  || || ||||||||||   |||||| ||||||||||     
T  42513180 tatccttagttatttattgcggagagagaaatatataaaatgtgatattaaatgaataaggtcatgatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaagtag 42513081  T
Q  443 taacatttattgattgtcttgctttgtgtaaaatgtcataaa-atgacaattaaaaaggagcggaggtagta 513  Q
    ||  | || |||||||||||| |||||||||||| ||| |||  ||||||||||||| || |||||||||||    
T  42513080 tattaattgttgattgtcttgatttgtgtaaaatttcaaaaatgtgacaattaaaaatgaacggaggtagta 42513009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 130; E-Value: 8e-67
Query Start/End: Original strand, 222 - 420
Target Start/End: Complemental strand, 52677422 - 52677222
Alignment:
Q  222 tcaatgaaatatta--tactcactccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttatttcaatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaac 319  Q
    |||||| |||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52677422 tcaatgcaatattaattactccctccgttcctttttaagtgtcacttttagagaaattttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaac 52677323  T
Q  320 tttaaatgttattttatcaatattacccttagttatttattgtggagatagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggatattatggtaaaagt 419  Q
     ||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||    
T  52677322 attaaatgttgttttaccaatattatccttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagt 52677223  T
Q  420 a 420  Q
    |    
T  52677222 a 52677222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 127; E-Value: 5e-65
Query Start/End: Original strand, 236 - 514
Target Start/End: Original strand, 52061546 - 52061819
Alignment:
Q  236 tactcactccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttatttcaatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaactttaaatgttatttta 335  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||  ||||||  ||  |||||| | |||||||||||||     ||||| ||||||| | |||||    
T  52061546 tactccctccgttcctttttaagtgtctcttttgaagatttttttttgttttatttaattatcactttcaaagt-----gcaacattaaatgatgtttta 52061640  T
Q  336 tcaatattacccttagttatttattgtggagatagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggatattatggtaaaagtatcaattattgtatca 435  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| ||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||| |  ||||| |||||||||| | |||||| ||||    
T  52061641 tcaatattacccttaattatttattgcggagagaaaaatatatgaaataagatattaaatgaataaagtcattatagtaaaagtataacttattgcatca 52061740  T
Q  436 aaagtaataacatttattgattgtcttgctttgtgtaaaatgtcataaaatgacaattaaaaaggagcggaggtagtaa 514  Q
    |||||| ||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  52061741 aaagtagtaacaatgattgattgtcttgatttgtgtaaaatgtcaaaatatgacaattaaaaaggaacggaggtagtaa 52061819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 125; E-Value: 8e-64
Query Start/End: Original strand, 242 - 510
Target Start/End: Original strand, 35231679 - 35231947
Alignment:
Q  242 ctccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttatttcaatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaactttaaatgttattttatcaata 341  Q
    |||||||| ||||||||| ||| |||||||||||  ||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||    
T  35231679 ctccgttcttttttaagtatcatttttggagaaaaattttatttttatttaaccgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaata 35231778  T
Q  342 ttacccttagttatttattgtggagatagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggatattatggtaaaagtatcaattattgtatcaaaagta 441  Q
    ||  ||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||| |  ||||| ||||||||||   |||||| ||||||||||    
T  35231779 ttgtccttaattatttattgcggagagagaaatatatgaaataaaatattaaatgaataaagtcattatagtaaaagtatagtttattgcatcaaaagta 35231878  T
Q  442 ataacatttattgattgtcttgctttgtgtaaaatgtcataaaatgacaattaaaaaggagcggaggta 510  Q
     || || || |||||||||||  |||||||||||||||| ||  |||||||||||||||| ||||||||    
T  35231879 gtatcaattgttgattgtcttaatttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaacggaggta 35231947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 124; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 242 - 473
Target Start/End: Complemental strand, 53691909 - 53691678
Alignment:
Q  242 ctccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttatttcaatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaactttaaatgttattttatcaata 341  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||| |||||||||||    
T  53691909 ctccgttcctttttaattgtcacttttagagaaattttttgttccaatttaactgtcactttcaaagttcaatacatcattaaatgttgttttatcaata 53691810  T
Q  342 ttacccttagttatttattgtggagatagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggatattatggtaaaagtatcaattattgtatcaaaagta 441  Q
    |||||||||  ||||||||||||| | ||||| ||||||||| | ||||||||| || ||||  ||||| |||||||||  ||  |||||||||||||||    
T  53691809 ttacccttaaatatttattgtggaaagagaaacatatgaaataaaatattaaattaacaaggtcattatagtaaaagtaataacaattgtatcaaaagta 53691710  T
Q  442 ataacatttattgattgtcttgctttgtgtaa 473  Q
     || |||||||||||||||||| |||||||||    
T  53691709 gtatcatttattgattgtcttggtttgtgtaa 53691678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 124; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 289 - 511
Target Start/End: Original strand, 54231574 - 54231797
Alignment:
Q  289 tttaactgtcactttcaaagttcaatgcaact-ttaaatgttattttatcaatattacccttagttatttattgtggagatagaaatatatgaaatgaga 387  Q
    ||||||||||| ||| |||||||||| ||||  |||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||| |||| | |||||||||| ||||||||    
T  54231574 tttaactgtcatttttaaagttcaattcaacaattaaatgttattttactaatattatccttagttatttattatggaaagagaaatatattaaatgaga 54231673  T
Q  388 tattaaatgaataaggatattatggtaaaagtatcaattattgtatcaaaagtaataacatttattgattgtcttgctttgtgtaaaatgtcataaaatg 487  Q
    | ||||||||||||||  ||||| |||||||||| | |||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  54231674 tgttaaatgaataaggtcattatagtaaaagtataacttattgcatcaaaagtagtaacaattattgattgtcttgatttgtgtaaaatgtcaaaaaatg 54231773  T
Q  488 acaattaaaaaggagcggaggtag 511  Q
    |||||||||||||| |||||||||    
T  54231774 acaattaaaaaggaacggaggtag 54231797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 122; E-Value: 5e-62
Query Start/End: Original strand, 247 - 512
Target Start/End: Original strand, 55702914 - 55703179
Alignment:
Q  247 ttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttatttcaatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaactttaaatgttattttatcaatattacc 346  Q
    ||||||||||||  || |||||| |||  |||||| |||  |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||| |||||||||    
T  55702914 ttcctttttaagcatctcttttgaagattttttttgtttttatttaactatcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgataatttattaatattacc 55703013  T
Q  347 cttagttatttattgtggagatagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggatattatggtaaaagtatcaattattgtatcaaaagtaataac 446  Q
    |||| ||||||||||  |||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||   |||| |||||| ||| | |||||| |||||||||||||||    
T  55703014 cttaattatttattgcagagagagaaatatatgaaataagataataaatgaataaggtcgttatagtaaaaatataacttattgcatcaaaagtaataac 55703113  T
Q  447 atttattgattgtcttgctttgtgtaaaatgtcataaaatgacaattaaaaaggagcggaggtagt 512  Q
    | ||||||||||||||| | | |||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  55703114 aattattgattgtcttggtatatgtaaaatgtcaaaatatgacaattaaaaaggaacggagatagt 55703179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 121; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 245 - 513
Target Start/End: Original strand, 8735382 - 8735649
Alignment:
Q  245 cgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttatttcaatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaactttaaatgttattttatcaatatta 344  Q
    ||||| ||||||||||||| |||| ||||||  |||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||| || ||||| ||||||||    
T  8735382 cgttcatttttaagtgtca-ttttagagaaaaattttgtttctatttaattgtcactttcaaagttcaatgcaatattaaatattgttttaccaatatta 8735480  T
Q  345 cccttagttatttattgtggagatagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggatattatggtaaaagtatcaattattgtatcaaaagtaata 444  Q
      ||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||| ||||||||||   |||||| |||||||||| ||    
T  8735481 ttcttagttatttattgcggagagaaaaatatatgaaatgagatattaaatgaataagatcattatagtaaaagtatagcttattgcatcaaaagtagta 8735580  T
Q  445 acatttattgattgtcttgctttgtgtaaaatgtcataaaatgacaattaaaaaggagcggaggtagta 513  Q
     || || |||||||||||| |||||||||||| ||| ||  |||||||||||||||| |||||||||||    
T  8735581 tcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatatcaaaatgtgacaattaaaaaggaacggaggtagta 8735649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 121; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 250 - 514
Target Start/End: Complemental strand, 26620598 - 26620334
Alignment:
Q  250 ctttttaagtgtcacttttggagaaattttttatttcaatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaactttaaatgttattttatcaatattaccctt 349  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||  |||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||| ||||    
T  26620598 ctttttaagtgtcacatttggagaaaaattttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattatcctt 26620499  T
Q  350 agttatttattgtggagatagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggatattatggtaaaagtatcaattattgtatcaaaagtaataacatt 449  Q
    |||||||||||| ||| | | ||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||  |||||||||   |||||| |||||||||| || || |    
T  26620498 agttatttattgcggataaataaatatatgaaatgagatattaaattaataaggtcattataataaaagtatagcttattgcatcaaaagtagtatcaat 26620399  T
Q  450 tattgattgtcttgctttgtgtaaaatgtcataaaatgacaattaaaaaggagcggaggtagtaa 514  Q
    | ||| |||| ||| |||||| ||||||||| ||  |||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  26620398 tgttgtttgttttggtttgtgcaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaacggagttagtaa 26620334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 121; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 235 - 499
Target Start/End: Original strand, 36408705 - 36408969
Alignment:
Q  235 atactcactccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttatttcaatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaactttaaatgttatttt 334  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || | |||||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  36408705 atactccctccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaaatttttgttcctatttaattgtaattttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgtttt 36408804  T
Q  335 atcaatattacccttagttatttattgtggagatagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggatattatggtaaaagtatcaattattgtatc 434  Q
    | |||||||  | |||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||  ||||| ||||||||||   |||||| |||    
T  36408805 aacaatattctctttagttatttatagcggagagagaaatatatgaaatgagatattgaattaataaggtcattatagtaaaagtatagcttattgcatc 36408904  T
Q  435 aaaagtaataacatttattgattgtcttgctttgtgtaaaatgtcataaaatgacaattaaaaag 499  Q
    ||||||| || ||  | || ||||||||| |||||||||||||||| ||  ||||||||||||||    
T  36408905 aaaagtagtatcaaatgtttattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaag 36408969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 121; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 235 - 499
Target Start/End: Original strand, 36422871 - 36423135
Alignment:
Q  235 atactcactccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttatttcaatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaactttaaatgttatttt 334  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || | |||||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  36422871 atactccctccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaaatttttgttcctatttaattgtaattttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgtttt 36422970  T
Q  335 atcaatattacccttagttatttattgtggagatagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggatattatggtaaaagtatcaattattgtatc 434  Q
    | |||||||  | |||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||  ||||| ||||||||||   |||||| |||    
T  36422971 aacaatattctctttagttatttatagcggagagagaaatatatgaaatgagatattgaattaataaggtcattatagtaaaagtatagcttattgcatc 36423070  T
Q  435 aaaagtaataacatttattgattgtcttgctttgtgtaaaatgtcataaaatgacaattaaaaag 499  Q
    ||||||| || ||  | || ||||||||| |||||||||||||||| ||  ||||||||||||||    
T  36423071 aaaagtagtatcaaatgtttattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaag 36423135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 120; E-Value: 8e-61
Query Start/End: Original strand, 236 - 495
Target Start/End: Original strand, 18781462 - 18781721
Alignment:
Q  236 tactcactccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttatttcaatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaactttaaatgttatttta 335  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||||||  | | ||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||| || |||||    
T  18781462 tactcattccgttcctttttaagtctcacttttgttggattttttttcttcaatttaactgtcactttcaaatttcaatgcaatattaaatattctttta 18781561  T
Q  336 tcaatattacccttagttatttattgtggagatagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggatattatggtaaaagtatcaattattgtatca 435  Q
     |||||||| | |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||  |||||  |||||||||   |||||| ||||    
T  18781562 ccaatattatctttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgaaatattaattgaataaggtaattataataaaagtatatcttattgcatca 18781661  T
Q  436 aaagtaataacatttattgattgtcttgctttgtgtaaaatgtcataaaatgacaattaa 495  Q
    |||||||||| | ||||||||| ||||  |||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  18781662 aaagtaataataattattgattatcttaatttgtgtaaaatgtcgaaaaatgacaattaa 18781721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 120; E-Value: 8e-61
Query Start/End: Original strand, 235 - 510
Target Start/End: Original strand, 33809069 - 33809344
Alignment:
Q  235 atactcactccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttatttcaatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaactttaaatgttatttt 334  Q
    |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||   ||||||||||||| ||||||||| |||||||   |||||||| ||||    
T  33809069 atactctctccgttcctttttaattgtcacttttggagaaaatttttgttcttatttaactgtcacattcaaagtttaatgcaatagtaaatgttgtttt 33809168  T
Q  335 atcaatattacccttagttatttattgtggagatagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggatattatggtaaaagtatcaattattgtatc 434  Q
    | ||||||||||| ||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||  ||||| || ||  ||  ||  |||| |||    
T  33809169 accaatattacccctagatatttattgcggagagagaaatatatgaaatgaaatattaaattaataaggccattatagtcaatataaaaacaattgcatc 33809268  T
Q  435 aaaagtaataacatttattgattgtcttgctttgtgtaaaatgtcataaaatgacaattaaaaaggagcggaggta 510  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| | ||| |||||||||||||||| | ||||||    
T  33809269 aaaagtagtaacatttattgattgttttgatttgtgtaaaatgttaaaaagtgacaattaaaaaggaacagaggta 33809344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 120; E-Value: 8e-61
Query Start/End: Original strand, 242 - 501
Target Start/End: Complemental strand, 38542531 - 38542272
Alignment:
Q  242 ctccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttatttcaatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaactttaaatgttattttatcaata 341  Q
    ||||||||||||||||  |||  |||||||||||  |||| || | |||||| ||||||||||||| |||| |||||| |||||| || ||||| |||||    
T  38542531 ctccgttcctttttaatcgtcttttttggagaaaaattttgttcctatttaaatgtcactttcaaaattcagtgcaacattaaatattgttttaccaata 38542432  T
Q  342 ttacccttagttatttattgtggagatagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggatattatggtaaaagtatcaattattgtatcaaaagta 441  Q
    ||| |||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||   ||||| |||||||| | | |||||| ||||||||||    
T  38542431 ttatccttagttatttattgcgaagagagaaatatatgaaatgagatgttaaatgaataagttcattatagtaaaagtctaacttattgcatcaaaagta 38542332  T
Q  442 ataacatttattgattgtcttgctttgtgtaaaatgtcataaaatgacaattaaaaagga 501  Q
     ||||| ||||| ||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  38542331 gtaacaattattaattgtcttggtttatgtaaaatgtcaaaaaatgacaattaaaaagga 38542272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 119; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 247 - 513
Target Start/End: Original strand, 47251407 - 47251673
Alignment:
Q  247 ttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttatttcaatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaactttaaatgttattttatcaatattacc 346  Q
    ||||||||||| |||| |||||| ||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||      
T  47251407 ttcctttttaactgtctcttttgaagaaattttttgtttctattcaactgtcactttcaaagttcaatgcaatattaaatgttgttttatcaatattatt 47251506  T
Q  347 cttagttatttattgtggagatagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggatattatggtaaaagtatcaattattgtatcaaaagtaataac 446  Q
    ||||| ||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||  ||||||||  | |||||| |||||||||| ||||    
T  47251507 cttagctatttattgcggagagataaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattataataaaagtacaacttattgcatcaaaagtagtaac 47251606  T
Q  447 atttattgattgtcttgctttgtgtaaaatgtcataaaatgacaattaaaaaggagcggaggtagta 513  Q
    | | ||||||| | ||| ||| |||||||||  | ||  |||||||||||||| | |||||||||||    
T  47251607 aatcattgattattttggtttatgtaaaatgataaaatgtgacaattaaaaagaaacggaggtagta 47251673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 118; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 264 - 513
Target Start/End: Complemental strand, 36659660 - 36659411
Alignment:
Q  264 cttttggagaaattttttatttcaatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaactttaaatgttattttatcaatattacccttagttatttattgtg 363  Q
    ||||| |||||||||||| || | |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||| |||||||  ||||||||||||||| |    
T  36659660 cttttagagaaattttttgttcctatttaactgttactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgatttattaatattattcttagttatttattgcg 36659561  T
Q  364 gagatagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggatattatggtaaaagtatcaattattgtatcaaaagtaataacatttattgattgtcttg 463  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||| || || || |  ||||| ||||||| || | |||||| || |||| ||| |||| |||||||||||||||    
T  36659560 gagagagaaatatatgaaatgagatgttagataaacaatgtcattatagtaaaagcataacttattgcattaaaaataaaaacaattattgattgtcttg 36659461  T
Q  464 ctttgtgtaaaatgtcataaaatgacaattaaaaaggagcggaggtagta 513  Q
     |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  36659460 atttgtgtaaaatgtcaaaaaatgacaattaagaaggaacggaggtagta 36659411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 118; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 232 - 513
Target Start/End: Complemental strand, 39683979 - 39683698
Alignment:
Q  232 attatactcactccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttatttcaatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaactttaaatgttat 331  Q
    |||||||||  ||||||| ||||||||||||| ||||| |||||  |||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| || |    
T  39683979 attatactccttccgttcttttttaagtgtcatttttgtagaaaaattttgtttctatttaactgtcacttttaaagttcaatgcaacattaaatattgt 39683880  T
Q  332 tttatcaatattacccttagttatttattgtggagatagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggatattatggtaaaagtatcaattattgt 431  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||||   |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    ||||  ||||| |||   ||||||     
T  39683879 tttatcaatattgtccttagttatttattacagagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataagatcgttatactaaaaatatagcttattgc 39683780  T
Q  432 atcaaaagtaataacatttattgattgtcttgctttgtgtaaaatgtcataaaatgacaattaaaaaggagcggaggtagta 513  Q
    |||||||||| || || || |||||||||||| |||||||||||||| | ||  ||| |||||||||||| |||||||||||    
T  39683779 atcaaaagtagtatcaattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatgtgaaaatgtgataattaaaaaggaacggaggtagta 39683698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 117; E-Value: 5e-59
Query Start/End: Original strand, 234 - 514
Target Start/End: Original strand, 43887964 - 43888242
Alignment:
Q  234 tatactcactccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttatttcaatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaactttaaatgttattt 333  Q
    ||||||| |||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||| || | |||||| |||||||||||||||||||| || | || |||||| |||    
T  43887964 tatactccctccgttcctttttaattgtcacttttagataaattttttgttcctatttaattgtcactttcaaagttcaatacatcatt-aatgttgttt 43888062  T
Q  334 tatcaatattacccttagttatttattgtggagatagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggatattatggtaaaagtatcaattattgtat 433  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| ||| | ||||| ||||||||||| ||||||||| || ||||  ||||| |||||||||  |   |||||||    
T  43888063 tatcaatattacccttagatatttattgcggatagagaaacatatgaaatgaaatattaaattaacaaggtcattatagtaaaagtaatagcaattgtat 43888162  T
Q  434 caaaagtaataacatttattgattgtcttgctttgtgtaaaatgtcataaaatgacaattaaaaaggagcggaggtagtaa 514  Q
    | |||||| ||||||||||||||| ||||| ||| |||||||| ||| ||| |||||||||||||||| || |||||||||    
T  43888163 c-aaagtagtaacatttattgattctcttggtttatgtaaaatatcaaaaagtgacaattaaaaaggaacgaaggtagtaa 43888242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 117; E-Value: 5e-59
Query Start/End: Original strand, 242 - 506
Target Start/End: Complemental strand, 47596868 - 47596604
Alignment:
Q  242 ctccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttatttcaatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaactttaaatgttattttatcaata 341  Q
    ||||||| ||||||||||||| |||||| ||||| ||||| |||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||  || | | || |||||||||||    
T  47596868 ctccgtttctttttaagtgtctcttttgtagaaaatttttgtttctatttaattgtcattttcaaagttcaatgcaatattgagtattgttttatcaata 47596769  T
Q  342 ttacccttagttatttattgtggagatagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggatattatggtaaaagtatcaattattgtatcaaaagta 441  Q
    |||| |||| |||||||||  ||||| |||||||  |||||  | ||||||||||||||||| |||||| | ||||| || | |||||||||||||||||    
T  47596768 ttactcttaattatttattacggagacagaaataattgaaacaatatattaaatgaataaggttattattggaaaaggataatttattgtatcaaaagta 47596669  T
Q  442 ataacatttattgattgtcttgctttgtgtaaaatgtcataaaatgacaattaaaaaggagcgga 506  Q
     ||||||||||||| | | ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  47596668 gtaacatttattgactttattggtttgtgtaaaatgtcaaaaaatgacaattaaaaaggaacgga 47596604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 116; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 235 - 506
Target Start/End: Original strand, 33084460 - 33084726
Alignment:
Q  235 atactcactccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttatttcaatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaactttaaatgttatttt 334  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||||| |||||| ||||| ||||| ||   |||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||    
T  33084460 atactccctccgtttctttttaagtgtctcttttgaagaaactttttgttcttatttaactgttactttcaaagttcaatacaacattaaatgttgtttt 33084559  T
Q  335 atcaatattacccttagttatttattgtggagatagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggatattatggtaaaagtatcaattattgtatc 434  Q
    | |||||||| | |||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||  ||||| |||||||||| | |||||| |||    
T  33084560 accaatattatctttagttatttgttgcggagagagaaatatatgaaatgagatgttaaataaataaggtcattatagtaaaagtataacttattgcatc 33084659  T
Q  435 aaaagtaataacatttattgattgtcttgctttgtgtaaaatgtcataaaatgacaattaaaaaggagcgga 506  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||      ||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||    
T  33084660 aaaagtagtaacaattattgattgg-----tttctgtaaaatgtcaaaaagtgacaattaaaaaggaacgga 33084726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 113; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 236 - 501
Target Start/End: Complemental strand, 19527469 - 19527216
Alignment:
Q  236 tactcactccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttatttcaatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaactttaaatgttatttta 335  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  19527469 tactccctccgtttctttttaagtgtcacttttggagaaaatttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgtttta 19527370  T
Q  336 tcaatattacccttagttatttattgtggagatagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggatattatggtaaaagtatcaattattgtatca 435  Q
     |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||            ||||||||||  ||||| |||||| |||   |||||||||||    
T  19527369 ccaatattatccttagttatttattgtggagagagaaatatatgaa------------atgaataaggtcattatagtaaaattatagcttattgtatca 19527282  T
Q  436 aaagtaataacatttattgattgtcttgctttgtgtaaaatgtcataaaatgacaattaaaaagga 501  Q
    |||||| || || || |||||| ||||| ||||||||||| |||| ||  ||||||||||||||||    
T  19527281 aaagtagtatcaattgttgattatcttggtttgtgtaaaacgtcaaaatgtgacaattaaaaagga 19527216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 113; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 236 - 476
Target Start/End: Original strand, 41414991 - 41415230
Alignment:
Q  236 tactcactccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttatttcaatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaactttaaatgttatttta 335  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||  |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||    
T  41414991 tactctctccgtttctttttaagtgtcatttttgaagaaatttttg-tttctatttaattgtcactttcaaagttcaatgcaacaataaatgttgtttta 41415089  T
Q  336 tcaatattacccttagttatttattgtggagatagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggatattatggtaaaagtatcaattattgtatca 435  Q
     ||| ||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||  |||||| |||||||||| ||||||| ||| |    
T  41415090 ccaacattacccttagctatttattatggagagagaaatatatgaaataagatattaaatgactaagactattatagtaaaagtatgaattattatataa 41415189  T
Q  436 aaagtaataacatttattgattgtcttgctttgtgtaaaat 476  Q
     ||  | ||||||||||||| ||||||  ||||||||||||    
T  41415190 gaaaaagtaacatttattgagtgtcttaatttgtgtaaaat 41415230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #59
Raw Score: 108; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 242 - 513
Target Start/End: Original strand, 44549632 - 44549902
Alignment:
Q  242 ctccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttatttcaatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaactttaaatgttattttatcaata 341  Q
    |||| ||||||||||||| ||  ||||||||||||||||| ||   ||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||| | |||||||||||    
T  44549632 ctccattcctttttaagtatcttttttggagaaattttttgttattatttaactgtcgctttcaaagtttaatgcaacattaaatgctgttttatcaata 44549731  T
Q  342 ttacccttagttatttattgtggagatagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggatattatggtaaaagtatcaattattgtatcaaaagta 441  Q
    |||  ||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||  ||||||||| | |||||||||||||||||    
T  44549732 ttattcttagttatttattgcgaagagagaaatatatgaaatgagatgttaaatgaataaggtcattataataaaagtataacttattgtatcaaaagta 44549831  T
Q  442 ataacatttattgattgtcttgctttgtgtaaaatgtcataaaatgacaattaaaaaggagcggaggtagta 513  Q
     ||| | |||||||| || ||| ||| | |||||| ||| | | ||| |||| ||||||| |||||||||||    
T  44549832 gtaataattattgatcgttttgatttatataaaatatcaaacagtgataatt-aaaaggaacggaggtagta 44549902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #60
Raw Score: 108; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 236 - 443
Target Start/End: Original strand, 47428512 - 47428719
Alignment:
Q  236 tactcactccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttatttcaatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaactttaaatgttatttta 335  Q
    ||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||||  |||| || | ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  47428512 tactccctccattcctttataagtgtcacttttggagaaaaattttgttcctatttaactgtcgctttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgtttta 47428611  T
Q  336 tcaatattacccttagttatttattgtggagatagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggatattatggtaaaagtatcaattattgtatca 435  Q
     |||||||  |||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||| |||||||||| | |||||| ||||    
T  47428612 ccaatattgtccttagttatttattgcggagaaataaatatatgaaatgagatattaaatgaataatgtcattatagtaaaagtattacttattgcatca 47428711  T
Q  436 aaagtaat 443  Q
    ||| ||||    
T  47428712 aaaataat 47428719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #61
Raw Score: 107; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 236 - 498
Target Start/End: Original strand, 30151655 - 30151917
Alignment:
Q  236 tactcactccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttatttcaatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaactttaaatgttatttta 335  Q
    |||||||||||||||||||||||| |  ||||| ||||| |||||| ||   |||||||||||| |||| |||||||| ||||| ||||||||| |||||    
T  30151655 tactcactccgttcctttttaagtatatcttttagagaatttttttgttcttatttaactgtcattttcgaagttcaacgcaacattaaatgttgtttta 30151754  T
Q  336 tcaatattacccttagttatttattgtggagatagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggatattatggtaaaagtatcaattattgtatca 435  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||| | | | ||||||||||||||| | ||||| ||||||||||| |||||| |||||||  |  ||| ||||||||    
T  30151755 tcaatattatccttacttatttattgcgcatagagaaatatatgaaattaaatattgaatgaataaggctattatagtaaaagagtatattgttgtatca 30151854  T
Q  436 aaagtaataacatttattgattgtcttgctttgtgtaaaatgtcataaaatgacaattaaaaa 498  Q
    |||| | ||||||||||||| ||||||| |||||||||||| | | |||  ||||||||||||    
T  30151855 aaagcagtaacatttattgaatgtcttggtttgtgtaaaatattaaaaagagacaattaaaaa 30151917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #62
Raw Score: 107; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 236 - 513
Target Start/End: Original strand, 42133020 - 42133297
Alignment:
Q  236 tactcactccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttatttcaatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaactttaaatgttatttta 335  Q
    ||||| ||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||| || | ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||  |||||    
T  42133020 tactccctccgttcctttttaatcgtcacttttagagaaattttttgttcctatttaactgtcgctttcaaagttcaatgcaacattaaatgtagtttta 42133119  T
Q  336 tcaatattacccttagttatttattgtggagatagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggatattatggtaaaagt-atcaattattgtatc 434  Q
    ||||||||| |||||| ||||||||| ||||  ||||| ||||||  ||| || |||||| ||||||| |||||| |||||||| |  ||  ||||||||    
T  42133120 tcaatattatccttagatatttattgcggagtgagaaacatatgatgtgaaat-ttaaatcaataaggctattatagtaaaagtaaaaaacaattgtatc 42133218  T
Q  435 aaaagtaataacatttattgattgtcttgctttgtgtaaaatgtcataaaatgacaattaaaaaggagcggaggtagta 513  Q
    |||| || ||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |   ||| |||||||||||||| | || ||||||||    
T  42133219 aaaaatagtaacatttattgattgttttggtttgtgtaaaatattgaaaagtgacaattaaaaagaaacgaaggtagta 42133297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #63
Raw Score: 106; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 236 - 513
Target Start/End: Complemental strand, 9220302 - 9220025
Alignment:
Q  236 tactcactccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttatttcaatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaactttaaatgttatttta 335  Q
    ||||| |||||||| ||||||| |||||||||| ||||||   ||| || | | |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| | |||||    
T  9220302 tactccctccgttcttttttaactgtcacttttagagaaaaaatttgttcctaattaactgtcactttcaaagttcaatgtaacattaaatgatgtttta 9220203  T
Q  336 tcaatattacccttagttatttattgtggagatagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggatattatggtaaaagtatcaattattgtatca 435  Q
     ||||||||||||||| |||||||||  |||| ||||| ||||||| ||| ||||||||| |  ||||   |||| |||||||||  ||  |||||||||    
T  9220202 ccaatattacccttagatatttattgcagagagagaaacatatgaattgaaatattaaattagcaaggtctttatagtaaaagtaaaaacaattgtatca 9220103  T
Q  436 aaagtaataacatttattgattgtcttgctttgtgtaaaatgtcataaaatgacaattaaaaaggagcggaggtagta 513  Q
    |||||| ||| ||||||| ||||||||| |||||||||||| ||| ||| |||||||||||||| | |||||||||||    
T  9220102 aaagtagtaagatttattaattgtcttgttttgtgtaaaatttcaaaaagtgacaattaaaaagaaacggaggtagta 9220025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #64
Raw Score: 105; E-Value: 7e-52
Query Start/End: Original strand, 236 - 420
Target Start/End: Complemental strand, 4201579 - 4201395
Alignment:
Q  236 tactcactccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttatttcaatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaactttaaatgttatttta 335  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||    
T  4201579 tactccctccgttcctttttaagtgtctcttttgaagaaattttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaattcaacattaaatgttgtttta 4201480  T
Q  336 tcaatattacccttagttatttattgtggagatagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggatattatggtaaaagta 420  Q
      ||||||| ||||| |||||||||| ||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||| |||||||||    
T  4201479 ctaatattatccttaattatttattgcggagagataaatatatgaaatgaaatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagta 4201395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #65
Raw Score: 105; E-Value: 7e-52
Query Start/End: Original strand, 231 - 507
Target Start/End: Original strand, 34464255 - 34464531
Alignment:
Q  231 tattatactcactccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttatttcaatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaactttaaatgtta 330  Q
    ||||||||||  || ||| |||||||||||||| ||||| |||||   ||| || | |||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||     
T  34464255 tattatactccatctgtttctttttaagtgtcatttttgaagaaaaaatttgttcctatttaactgtcactttcatagttcaatgcaatattaaatgttg 34464354  T
Q  331 ttttatcaatattacccttagttatttattgtggagatagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggatattatggtaaaagtatcaattattg 430  Q
    |||||||||||||| | |||||||||||||||| ||| | ||||||||||||| | |||||||||||||||||  |||||  |||||||||   ||||||    
T  34464355 ttttatcaatattatcattagttatttattgtgaagagataaatatatgaaataaaatattaaatgaataaggtcattatattaaaagtatagcttattg 34464454  T
Q  431 tatcaaaagtaataacatttattgattgtcttgctttgtgtaaaatgtcataaaatgacaattaaaaaggagcggag 507  Q
     ||||||||||||| || ||||||||||| ||  ||||| |||||| ||| ||  | |||||||||||||| |||||    
T  34464455 catcaaaagtaatatcaattattgattgttttaatttgtataaaatatcaaaatgtaacaattaaaaaggaacggag 34464531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #66
Raw Score: 104; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 236 - 514
Target Start/End: Complemental strand, 22678571 - 22678292
Alignment:
Q  236 tactcactccgttcctttttaagtgtcacttttggaga----aattttttatttcaatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaactttaaatgttat 331  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |    || || || ||   ||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||| |    
T  22678571 tactccctcagttcctttttaagtgtcacttttggaaagaaaaaattgttctt---atttaactgtcgctttcaaagttcaatgcaatattaaatgttgt 22678475  T
Q  332 tttatcaatattacccttagttatttattgtggagatagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggatattatggtaaaagtatcaattattgt 431  Q
    |||| |||||||| ||||||| |||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||   ||||||     
T  22678474 tttaccaatattatccttagtaatttattgcggagagataaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtatagcttattgc 22678375  T
Q  432 atcaaaagtaataacatttattgattgtcttgctttgtgtaaaatgtcataaaatgacaattaaaaaggagcggaggtagtaa 514  Q
    ||||| |||| || || || |||||| ||||| ||| | |||||||||| ||  ||||||||||||| || ||||||||||||    
T  22678374 atcaatagtagtatcaattgttgattatcttggtttatataaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaatgaacggaggtagtaa 22678292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #67
Raw Score: 103; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 236 - 402
Target Start/End: Original strand, 9834247 - 9834413
Alignment:
Q  236 tactcactccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttatttcaatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaactttaaatgttatttta 335  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  9834247 tactccctcagttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttgttcctatttaactgtcacttttaaagttcaatgcaacattaaatcttatttta 9834346  T
Q  336 tcaatattacccttagttatttattgtggagatagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataag 402  Q
       |||||  |||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  9834347 catatattgtccttagttatttattgcggagagagaaatatattaaatgagatattaaatgaataag 9834413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #68
Raw Score: 103; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 288 - 514
Target Start/End: Original strand, 19399569 - 19399794
Alignment:
Q  288 atttaactgtcactttcaaagttcaatgcaactttaaatgttattttatcaatattacccttagttatttattgtggagatagaaatatatgaaatgaga 387  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||   |||| ||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||    
T  19399569 atttaactgtcactttcaaagttcaatgcaataataaa-gttgttttaccaacattacccttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaataaga 19399667  T
Q  388 tattaaatgaataaggatattatggtaaaagtatcaattattgtatcaaaagtaataacatttattgattgtcttgctttgtgtaaaatgtcataaaatg 487  Q
    |||||||| | ||||| ||||||  ||||||||| ||||||||||| | ||  | ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||  |    
T  19399668 tattaaattactaaggctattatattaaaagtataaattattgtataagaaaaagtaacatttattgagtgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaaagcg 19399767  T
Q  488 acaattaaaaaggagcggaggtagtaa 514  Q
    | | |||||||| | ||||||||||||    
T  19399768 aaagttaaaaagaaacggaggtagtaa 19399794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #69
Raw Score: 103; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 246 - 496
Target Start/End: Complemental strand, 47885247 - 47884988
Alignment:
Q  246 gttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttatttcaatttaactgtcactttcaa--------agttcaatgcaactttaaatgttattttatc 337  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||        |||| |||||||| ||||||| | |||||||    
T  47885247 gttcctttttaagtgtctcttatggagaatttttttgtttctatttaactgtcactttcaagttcaataagtttaatgcaacattaaatgatgttttatc 47885148  T
Q  338 aatattacccttagttatttattgtggagatagaaatatatgaaatgagatattaaatg-aataaggatattatggtaaaagtatcaattattgtatcaa 436  Q
    ||||||||||||| ||||||||||  |||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||  ||||| ||||||||   | |||||| |||||    
T  47885147 aatattacccttaattatttattggagagagagaaatatatgaaataagatattaaatgaaataaggtcattatagtaaaagtcaaacttattgcatcaa 47885048  T
Q  437 aagtaataacatttattgattgtcttgctttgtgtaaaatgtcataaaatgacaattaaa 496  Q
    ||||||||| | ||||||||||| ||| || ||||||||||||| ||  |||||||||||    
T  47885047 aagtaataataattattgattgttttggttcgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaa 47884988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #70
Raw Score: 102; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 236 - 499
Target Start/End: Complemental strand, 18135311 - 18135048
Alignment:
Q  236 tactcactccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttatttcaatttaactgtcacttt-caaagttcaatgcaactttaaatgttatttt 334  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| |||||| | |||   ||  ||||| ||||| ||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  18135311 tactccctccgttcctttttaagtgtctcttttgtaaaaaaaattgttttca-tttaagtgtcactttacatagttcaatgcaacattaaatgttatttt 18135213  T
Q  335 atcaatattacccttagttatttattgtggagatagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggatattatggtaaaagtatcaattattgtatc 434  Q
    |  ||||||||||||| ||||| ||| | |||| ||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||| |||||| |||||| ||  ||||||||||||    
T  18135212 actaatattacccttatttatt-attatagagagagaaatatatgtaatgaaatattaaataaataaggttattatagtaaaaataaaaattattgtatc 18135114  T
Q  435 -aaaagtaataacatttattgattgtcttgctttgtgtaaaatgtcataaaatgacaattaaaaag 499  Q
     |||| || ||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  18135113 aaaaaatagtaatatttattgattgttttggtttgtgtaaaatgtcaaaatatgacaattaaaaag 18135048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #71
Raw Score: 102; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 248 - 501
Target Start/End: Original strand, 40411938 - 40412191
Alignment:
Q  248 tcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttatttcaatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaactttaaatgttattttatcaatattaccc 347  Q
    ||||||||||||||| |||||||| |||    || || | |||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||| || |||||||||||||| ||    
T  40411938 tcctttttaagtgtctcttttggaaaaaaaaattgttcctatttaactgtcattttcaaagttcaatgtaacattaaatattgttttatcaatattatcc 40412037  T
Q  348 ttagttatttattgtggagatagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggatattatggtaaaagtatcaattattgtatcaaaagtaataaca 447  Q
    ||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||  ||||| |||||| ||| | |||||  ||||||| || |||||    
T  40412038 ttaattatttattgcggagagagaaatatatgaaatgaaatgttaaatgaataaggtcattatagtaaaaatataacttattacatcaaaaatagtaaca 40412137  T
Q  448 tttattgattgtcttgctttgtgtaaaatgtcataaaatgacaattaaaaagga 501  Q
     ||||| ||||||||  ||| |||||||||||| ||||||||| ||||| ||||    
T  40412138 attattaattgtcttaatttatgtaaaatgtcaaaaaatgacagttaaatagga 40412191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #72
Raw Score: 102; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 236 - 499
Target Start/End: Complemental strand, 49122521 - 49122258
Alignment:
Q  236 tactcactccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttatttcaatttaactgtcacttt-caaagttcaatgcaactttaaatgttatttt 334  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| |||||| | |||   ||  ||||| ||||| ||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  49122521 tactccctccgttcctttttaagtgtctcttttgtaaaaaaaattgttttca-tttaagtgtcactttacatagttcaatgcaacattaaatgttatttt 49122423  T
Q  335 atcaatattacccttagttatttattgtggagatagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggatattatggtaaaagtatcaattattgtatc 434  Q
    |  ||||||||||||| ||||| ||| | |||| ||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||| |||||| |||||| ||  ||||||||||||    
T  49122422 actaatattacccttatttatt-attatagagagagaaatatatgtaatgaaatattaaataaataaggttattatagtaaaaataaaaattattgtatc 49122324  T
Q  435 -aaaagtaataacatttattgattgtcttgctttgtgtaaaatgtcataaaatgacaattaaaaag 499  Q
     |||| || ||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  49122323 aaaaaatagtaatatttattgattgttttggtttgtgtaaaatgtcaaaatatgacaattaaaaag 49122258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #73
Raw Score: 101; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 252 - 513
Target Start/End: Complemental strand, 6091599 - 6091337
Alignment:
Q  252 ttttaagtgtcacttttggagaaattttttatttcaatttaactgt--cactttcaaagttcaatgcaactttaaatgttattttatcaatattaccctt 349  Q
    |||||| |||||||||| ||||| |||||| || | |||||||| |  |||||||||| |||||||||||  ||||| || |||| |||||||||   ||    
T  6091599 ttttaaatgtcactttttgagaattttttt-ttcctatttaactatatcactttcaaaattcaatgcaacaataaatattgttttttcaatattattttt 6091501  T
Q  350 agttatttattgtggagatagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggatattatggtaaaagtatcaattattgtatcaaaagtaataacatt 449  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||| | |||||| |||||||||| ||||||||||| |||| |||||| |||    
T  6091500 agttatttattgtgcagagagaaatatatgaaataagatattaaatgactaaagctattatagtaaaagtataaattattgtataaaaaataataagatt 6091401  T
Q  450 tattgattgtcttgctttgtgtaaaatgtcataaaatgacaattaaaaaggagcggaggtagta 513  Q
    |||||| ||||||| ||||| | |||| ||| ||||  ||| |||||||||| |||||||||||    
T  6091400 tattgagtgtcttgatttgtatgaaatctcaaaaaacaacacttaaaaaggaacggaggtagta 6091337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #74
Raw Score: 100; E-Value: 7e-49
Query Start/End: Original strand, 243 - 499
Target Start/End: Complemental strand, 35381668 - 35381417
Alignment:
Q  243 tccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttatttcaatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaactttaaatgttattttatcaatat 342  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||| |||  |||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||  |||||    
T  35381668 tccgttcctttttatgtgtctcttttgaagat-ttttttgtttctatttaattgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttactaatat 35381570  T
Q  343 tacccttagttatttattgtggagatagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggatattatggtaaaagtatcaattattgtatcaaaagtaa 442  Q
    || |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||  ||||||||  | |||    ||||||||||     
T  35381569 tatccttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattataataaaagtacaactta----atcaaaagtag 35381474  T
Q  443 taacatttattgattgtcttgctttgtgtaaaatgtcataaaatgacaattaaaaag 499  Q
    ||||| | ||| | | ||||  ||| |||||||||||| ||  ||||||||||||||    
T  35381473 taacaatcattaactatcttaatttatgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaag 35381417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #75
Raw Score: 99; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 288 - 498
Target Start/End: Complemental strand, 26906598 - 26906388
Alignment:
Q  288 atttaactgtcactttcaaagttcaatgcaactttaaatgttattttatcaatattacccttagttatttattgtggagatagaaatatatgaaatgaga 387  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| || |||||  |||||||  ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  26906598 atttaactgtcactttcaaggttcaatgcaacattaaatattgttttactaatattattcttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgaga 26906499  T
Q  388 tattaaatgaataaggatattatggtaaaagtatcaattattgtatcaaaagtaataacatttattgattgtcttgctttgtgtaaaatgtcataaaatg 487  Q
    |||||||| |||||||  ||||  |||||||||| | |||||| || |||||||||| || || |||||||| ||  |||||||||||| ||| || |||    
T  26906498 tattaaattaataaggtcattaaagtaaaagtataacttattgcataaaaagtaatatcaattgttgattgttttagtttgtgtaaaatatcaaaatatg 26906399  T
Q  488 acaattaaaaa 498  Q
    |||||||||||    
T  26906398 acaattaaaaa 26906388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #76
Raw Score: 99; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 242 - 403
Target Start/End: Original strand, 27492348 - 27492510
Alignment:
Q  242 ctccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttatttcaatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaactttaaatgttattttatcaata 341  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||    
T  27492348 ctccgtttctttttaagtgtcacttttggagaaaatttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaata 27492447  T
Q  342 ttacccttagt-tatttattgtggagatagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataagg 403  Q
    |||  ||||||  |||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  27492448 ttatgcttagtcaatttattgcggagagagaaatatatgaaatgaaatattaaatgaataagg 27492510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #77
Raw Score: 99; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 288 - 514
Target Start/End: Original strand, 31369836 - 31370062
Alignment:
Q  288 atttaactgtcactttcaaagttcaatgcaactttaaatgttattttatcaatattacccttagttatttattgtggagatagaaatatatgaaatgaga 387  Q
    |||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||| || ||||| |||||||| ||||| |||||||||  ||||| |||||| |||||| | ||     
T  31369836 atttaactgtcattttcgaagttcaatgcaacattaaatattgttttaccaatattatccttacttatttattacggagagagaaatgtatgaagttagt 31369935  T
Q  388 tattaaatgaataaggatattatggtaaaagtatcaattattgtatcaaaagtaataacatttattgattgtcttgctttgtgtaaaatgtcataaaatg 487  Q
     ||||||  ||||||| |||||| ||||||||||  ||| || ||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||| |||| ||    
T  31369936 gattaaacaaataaggttattatagtaaaagtatgcattgttctatcaaaagtaataacatttattgaatgtattggtttgtgtaaaatgtcttaaagtg 31370035  T
Q  488 acaattaaaaaggagcggaggtagtaa 514  Q
    ||| |||||||| | ||||||||||||    
T  31370036 acacttaaaaagaaacggaggtagtaa 31370062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #78
Raw Score: 99; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 283 - 513
Target Start/End: Original strand, 45725566 - 45725796
Alignment:
Q  283 tttcaatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaactttaaatgttattttatcaatattacccttagttatttattgtggagatagaaatatatgaaa 382  Q
    |||| |||||| ||||| ||| ||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||   |||| |||||||  |||||    
T  45725566 tttctatttaattgtcatttttaaagttcaatgcaatattaaatattattttatcaatattatccttaattatttattacagagagagaaataattgaaa 45725665  T
Q  383 tgagatattaaatgaataaggatattatggtaaaagtatcaattattgtatcaaaagtaataacatttattgattgtcttgctttgtgtaaaatgtcata 482  Q
      ||||||||||||||| ||| |||||| | ||||  || | ||||||||||||||||| ||||||||||||| | | ||  |||||||||||||||| |    
T  45725666 caagatattaaatgaatgaggttattattggaaaatgataatttattgtatcaaaagtagtaacatttattgactttatttgtttgtgtaaaatgtcaaa 45725765  T
Q  483 aaatgacaattaaaaaggagcggaggtagta 513  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  45725766 aaatgacaattaaaaaggaacggaggtagta 45725796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #79
Raw Score: 98; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 242 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 23623750 - 23623601
Alignment:
Q  242 ctccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttatttcaatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaactttaaatgttattttatcaata 341  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||    
T  23623750 ctccgttcctttttaagtgtcactttttgagaaaatttttgttactatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaata 23623651  T
Q  342 ttacccttagttatttattgtggagatagaaatatatgaaatgagatatt 391  Q
    ||| |||||  ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  23623650 ttatccttaagtatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatatt 23623601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #80
Raw Score: 98; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 236 - 401
Target Start/End: Original strand, 32239383 - 32239547
Alignment:
Q  236 tactcactccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttatttcaatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaactttaaatgttatttta 335  Q
    ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||| ||   |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| || |||||    
T  32239383 tactccctccgttcctttttaaatgtcacttttggagaaaaattttgttcatatttaactgtcacttttaaagttcaatgcaacattaaatattgtttta 32239482  T
Q  336 tcaatattacccttagttatttattgtggagatagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataa 401  Q
     |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  32239483 ccaatattatccttagttatttattgtggagaaagaaatatatgaaatga-atattaaatgaataa 32239547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #81
Raw Score: 97; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 236 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 8741885 - 8741677
Alignment:
Q  236 tactcactccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttatttcaatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaactttaaatgttatttta 335  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||||| ||||| |||||  |||  ||   |||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||| |||||    
T  8741885 tactccctctgttcctttttaagtgtcaattttgaagaaaaatttggttcatatttaactgtcattttcaaagttcaatacaacattaaatgttgtttta 8741786  T
Q  336 tcaatattacccttagttatttattgtggagatagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggatattatggtaaaagtatcaattattgtatca 435  Q
     |||||||| | ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||  |||||||||   |||||| ||||    
T  8741785 ccaatattatctttagttatttattgtggagagtgaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattataataaaagtatagcttattgcatca 8741686  T
Q  436 aaagtaata 444  Q
    |||||||||    
T  8741685 aaagtaata 8741677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #82
Raw Score: 97; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 235 - 474
Target Start/End: Original strand, 34361038 - 34361276
Alignment:
Q  235 atactcactccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttatttcaatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaactttaaatgttatttt 334  Q
    |||||| ||||||| |||||||| |||||||||| |||||||||||| || | |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||   ||||    
T  34361038 atactccctccgtttctttttaattgtcacttttagagaaattttttgttcctatttaactgtcactttcaaaattcaatgcaacattaaatg---tttt 34361134  T
Q  335 atcaatattacccttagttatttattgtggagatagaaatatatgaaatg--agatattaaatgaataaggatattatggtaaaagtatcaattattgta 432  Q
    | | ||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||| ||||||||||  | ||||||||| ||||||   ||||| |||||| |   ||  ||||||    
T  34361135 accgatattacccttagatatttattgcggagagagaaacatatgaaatgaaaaatattaaattaataagaccattatagtaaaaatgaaaacaattgta 34361234  T
Q  433 tcaaaagtaataacatttattgattgtcttgctttgtgtaaa 474  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  34361235 tcaaaagtagtaacatttattgattgtcttagtttgtgtaaa 34361276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #83
Raw Score: 97; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 242 - 458
Target Start/End: Original strand, 47093801 - 47094017
Alignment:
Q  242 ctccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttatttcaatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaactttaaatgttattttatcaata 341  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || | ||||||| |||||||||||||||||||||| | ||| ||||| ||||| |||||    
T  47093801 ctccattcctttttaagtgtcacttttgaagaaattttttgttcctatttaaccgtcactttcaaagttcaatgcatcattatatgttgttttaccaata 47093900  T
Q  342 ttacccttagttatttattgtggagatagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggatattatggtaaaagtatcaattattgtatcaaaagta 441  Q
    ||| |||| ||||||||||| | ||| |||||||||| |||||| || |||||| ||||||   ||||| |||||||||| | |||||| ||||||||||    
T  47093901 ttatcctttgttatttattgcgaagagagaaatatataaaatgatatgttaaattaataagatcattatagtaaaagtataacttattgcatcaaaagta 47094000  T
Q  442 ataacatttattgattg 458  Q
      |||| ||||||||||    
T  47094001 gaaacaattattgattg 47094017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #84
Raw Score: 93; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 246 - 402
Target Start/End: Original strand, 36750170 - 36750326
Alignment:
Q  246 gttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttatttcaatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaactttaaatgttattttatcaatattac 345  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || | ||||||||||||||||| ||||||||| |||  ||||||||| ||||| ||||||||     
T  36750170 gttcctttttaagtgtcacttttgaagaaattttttgttcctatttaactgtcactttcgaagttcaatacaatattaaatgttgttttaccaatattaa 36750269  T
Q  346 ccttagttatttattgtggagatagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataag 402  Q
     |||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  36750270 tcttacttatttattgtggagagacaaatatatgaaatgaaatattaaatgaataag 36750326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #85
Raw Score: 92; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 288 - 510
Target Start/End: Original strand, 3036420 - 3036640
Alignment:
Q  288 atttaactgtcactttcaaagttcaatgcaactttaaatgttattttatcaatattacccttagttatttattgtggagatagaaatatatgaaatgaga 387  Q
    |||||| |||||||||||||||| |||| ||  ||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||| |  ||| ||||||||||||||| |||    
T  3036420 atttaattgtcactttcaaagtttaatgtaatattaaatgttattttaccgatattacccttagtaatttattat--agagagaaatatatgaaataaga 3036517  T
Q  388 tattaaatgaataaggatattatggtaaaagtatcaattattgtatcaaaagtaataacatttattgattgtcttgctttgtgtaaaatgtcataaaatg 487  Q
    |||||||||||| |   |||||| | |||   || ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||| |||||||||| | || |||    
T  3036518 tattaaatgaatgaaactattattggaaagagataaatcattgtatcaaaagtaataacatttattgattgttatgatttatgtaaaatgtaaaaatatg 3036617  T
Q  488 acaattaaaaaggagcggaggta 510  Q
    |||||||||||||| ||||||||    
T  3036618 acaattaaaaaggaacggaggta 3036640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #86
Raw Score: 90; E-Value: 6e-43
Query Start/End: Original strand, 236 - 501
Target Start/End: Original strand, 34603607 - 34603872
Alignment:
Q  236 tactcactccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttatttcaatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaactttaaatgttatttta 335  Q
    ||||| |||||||||||| ||| ||||||||||  ||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||     
T  34603607 tactccctccgttcctttataactgtcacttttacagaaattttttgtttctaattaactgtcactttcaaagttcaatgtaacattaaatgttgttttt 34603706  T
Q  336 tcaatattacccttagttatttattgtggagatagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggatattatggtaaaagtatcaattattgtatca 435  Q
    || ||| |||||||||| ||||||||  |||| |||||||||||||||  |||||||||| | |||||||||||| |  |||  |  | |||||||||||    
T  34603707 tctataatacccttagtaatttattgcagagagagaaatatatgaaatatgatattaaataattaaggatattataggcaaaacacaagttattgtatca 34603806  T
Q  436 aaagtaataacatttattgattgtcttgctttgtgtaaaatgtcataaaatgacaattaaaaagga 501  Q
    || ||| | | ||  ||| | ||||||| |||||||||||  ||| ||  ||||||||||||||||    
T  34603807 aatgtagtgaaatacatttagtgtcttgatttgtgtaaaaaatcaaaatgtgacaattaaaaagga 34603872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #87
Raw Score: 89; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 246 - 499
Target Start/End: Complemental strand, 56499865 - 56499610
Alignment:
Q  246 gttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttatttcaatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaactttaaatgttattttatcaatattac 345  Q
    ||||| |||||| | ||||||||| ||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||| ||||    |||||||    
T  56499865 gttcccttttaattttcacttttgcagaaattttttgtttctaattaactgtcactttcaaagtttaatacaacattaaatgttgtttttcttatattac 56499766  T
Q  346 ccttagttatttattgtggagatagaaa--tatatgaaatgagatattaaatgaataaggatattatggtaaaagtatcaattattgtatcaaaagtaat 443  Q
    ||||| ||||||||||  |||| |||||  |||||||||||||||||||||||| || || |||||| | ||||  || |||| ||||||||||| || |    
T  56499765 ccttatttatttattgcagagagagaaaaatatatgaaatgagatattaaatgattagggctattataggaaaaagataaattgttgtatcaaaaatagt 56499666  T
Q  444 aacatttattgattgtcttgctttgtgtaaaatgtcataaaatgacaattaaaaag 499  Q
    || || ||||  |||||||| ||||||||||| |||| ||  ||||||||||||||    
T  56499665 aaaatgtatttgttgtcttggtttgtgtaaaaagtcaaaaggtgacaattaaaaag 56499610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #88
Raw Score: 88; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 243 - 478
Target Start/End: Original strand, 36750539 - 36750774
Alignment:
Q  243 tccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttatttcaatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaactttaaatgttattttatcaatat 342  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||||| |||    || ||   ||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||| ||||| ||| ||    
T  36750539 tccgttcctttttaagtgttatttttggaaaaaaaaattgttcttatttaactgtcacttacaaagttcaatgcaacaataaatgttgttttaccaacat 36750638  T
Q  343 tacccttagttatttattgtggagatagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggatattatggtaaaagtatcaattattgtatcaaaagtaa 442  Q
    |||||||| |||||||||| ||||| |||||||||| |||| | ||||||||||| ||||| |||||| ||| || ||| ||||||||||| | ||  |     
T  36750639 tacccttaattatttattgcggagagagaaatatataaaataatatattaaatgattaaggctattatagtacaaatataaattattgtataagaaaaag 36750738  T
Q  443 taacatttattgattgtcttgctttgtgtaaaatgt 478  Q
    ||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||    
T  36750739 taacatttattgagtgtcttagtttgtgtaaaatgt 36750774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #89
Raw Score: 87; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 293 - 506
Target Start/End: Original strand, 23237667 - 23237883
Alignment:
Q  293 actgtcactttcaaagttcaatgcaactttaaatgttattttatcaatattacccttagttatttattgtggaga---tagaaatatatgaaatgagata 389  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||  ||||| |||||||||| |||||   || |||||||||||||||||||    
T  23237667 actgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttattttaccaatattgtccttaattatttattgcggagagattataaatatatgaaatgagata 23237766  T
Q  390 ttaaatgaataaggatattatggtaaaagtatcaattattgtatcaaaagtaataacatttattgattgtcttgctttgtgtaaaatgtcataaaatgac 489  Q
    ||||||||||||||  ||||| ||||||||||   |||| | |||||||||| || || || ||||||||  |  |||||||||||||| | ||  | ||    
T  23237767 ttaaatgaataaggtcattatagtaaaagtatagcttatcgcatcaaaagtagtatcaattgttgattgttctagtttgtgtaaaatgttaaaatgtaac 23237866  T
Q  490 aattaaaaaggagcgga 506  Q
    |||||||||||| ||||    
T  23237867 aattaaaaaggaacgga 23237883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #90
Raw Score: 86; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 309 - 510
Target Start/End: Complemental strand, 44176777 - 44176576
Alignment:
Q  309 ttcaatgcaactttaaatgttattttatcaatattacccttagttatttattgtggagatagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggatatt 408  Q
    ||||||||||  |||||| || ||||| ||||||||  |||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||    
T  44176777 ttcaatgcaaaattaaattttgttttaccaatattattcttgcttatttattgtggagagagaaatatatgaaatgaaatattaaatgaataaagttatt 44176678  T
Q  409 atggtaaaagtatcaattattgtatcaaaagtaataacatttattgattgtcttgctttgtgtaaaatgtcataaaatgacaattaaaaaggagcggagg 508  Q
    ||  |||||||||  |||||||||||||||||| ||| ||||||| | ||| ||| ||| |||||||||| | ||| |||||||||||||| | ||||||    
T  44176677 ataataaaagtatatattattgtatcaaaagtagtaatatttattaaatgttttggtttatgtaaaatgttaaaaagtgacaattaaaaagaaacggagg 44176578  T
Q  509 ta 510  Q
    ||    
T  44176577 ta 44176576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #91
Raw Score: 85; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 242 - 513
Target Start/End: Complemental strand, 1181157 - 1180885
Alignment:
Q  242 ctccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaatttttta-tttcaatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaactttaaatgttattttatcaat 340  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||  |||| | ||| ||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||| ||||  || |    
T  1181157 ctccgttcctttttaattgtcacttttgcagaaatttttttgtttctaattacctgtcactttcaaagtttaatacaacattaaatgttgttttggcatt 1181058  T
Q  341 attacccttagttatttattgtggagatagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggatattatggtaaaagtatcaattattgtatcaaaagt 440  Q
     ||||| ||  ||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||| | ||||  |  |||| |||||||||||||    
T  1181057 cttacctttgattatttattgcagagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgagaaaggttattataggaaaaagaaaaattgttgtatcaaaagt 1180958  T
Q  441 aataacatttattgattgtcttgctttgtgtaaaatgtcataaaatgacaattaaaaaggagcggaggtagta 513  Q
    | ||| ||  |||  |||||||| |||||||||||   |  ||| |||||||||||||||| |||||| ||||    
T  1180957 agtaaaatgcatttgttgtcttggtttgtgtaaaaaacctaaaagtgacaattaaaaaggaacggagggagta 1180885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #92
Raw Score: 82; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 236 - 514
Target Start/End: Original strand, 36292608 - 36292877
Alignment:
Q  236 tactcactccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttatttcaatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaactttaaatgttatttta 335  Q
    ||||| |||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||| || || ||||| ||||||||        ||||||||| ||||||||| |||||    
T  36292608 tactccctccgttcctttttaattctcacttttagagaaattttttgttcca-tttaagtgtcactt--------caatgcaacattaaatgttgtttta 36292698  T
Q  336 tcaatattacccttagttatttattgtggagatagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggatattatggtaaaagtatcaattattgtatca 435  Q
    ||||||||||  |||| |||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||   |||||  ||||||||  ||| | ||||||     
T  36292699 tcaatattacttttagatatttaatgcggagagagaaacatatgaaatgaaatattaaattaataagacaattataataaaagtaaaaataactgtatcg 36292798  T
Q  436 aaagtaataacatttattgattgtcttgctttgtgtaaaatgtcataaaatgacaattaaaaaggagcggaggtagtaa 514  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||| ||| | |  |||||||||  ||||| |||||||    
T  36292799 aaagtagtaacatttattgattgttttggttagtgtaaaatgtcaaaaagtaatcattaaaaagtggcggatgtagtaa 36292877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #93
Raw Score: 81; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 236 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 33755343 - 33755223
Alignment:
Q  236 tactcactccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttatttcaatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaactttaaatgttatttta 335  Q
    ||||| || |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  33755343 tactcccttcgttcctttttaagtgtcacttttagagaaaatttttatttctctttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgtttta 33755244  T
Q  336 tcaatattacccttagttatt 356  Q
     |||||||| |||||||||||    
T  33755243 ccaatattatccttagttatt 33755223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #94
Raw Score: 80; E-Value: 6e-37
Query Start/End: Original strand, 242 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 29833181 - 29833022
Alignment:
Q  242 ctccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttatttcaatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaactttaaatgttattttatcaata 341  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| || || | |||||||||| ||||| |||||||||||||||  |||||||| ||||| ||||     
T  29833181 ctccgttcatttttaagtgtctcttttggagaaatttcttgttcctatttaactgttacttttaaagttcaatgcaacaataaatgttgttttaccaatg 29833082  T
Q  342 ttacccttagttatttattgtggagatagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataa 401  Q
    ||| | || ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  29833081 ttatcgttggttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatgctaaatgaataa 29833022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #95
Raw Score: 79; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 234 - 475
Target Start/End: Complemental strand, 1146312 - 1146068
Alignment:
Q  234 tatactcactccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttatttcaatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaactttaaatgttattt 333  Q
    |||||||  ||||||||||||||| ||||||||||| |||  |||||| ||||   |||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||    
T  1146312 tatactccatccgttcctttttaattgtcacttttgcagattttttttgtttcttattaactatcactttcaaatttcaatgcaacattaaatgttgttt 1146213  T
Q  334 tatcaatattacccttagttatttattgtggagatagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataagg---atattatggtaaaagtatcaattattg 430  Q
    |  |  ||||||||||  ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||    |||||| | |||| ||| |||| |||    
T  1146212 tgcctttattacccttgattatttattgtagagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgatgaaggtaattattatagaaaaaatatgaattgttg 1146113  T
Q  431 tatcaaaagtaataacatttattgattgtcttgctttgtgtaaaa 475  Q
     |||||||||| ||| |  |||| ||| ||||| |||||||||||    
T  1146112 catcaaaagtagtaaaaagtatttattatcttggtttgtgtaaaa 1146068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #96
Raw Score: 79; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 325 - 514
Target Start/End: Complemental strand, 33755201 - 33755014
Alignment:
Q  325 atgttattttatcaatattacccttagttatttattgtggagatagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggatattatggtaaaagtatcaa 424  Q
    ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||       
T  33755201 atgttgttttaccaatattatccttagttatttattgcggaga--gaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtatagc 33755104  T
Q  425 ttattgtatcaaaagtaataacatttattgattgtcttgctttgtgtaaaatgtcataaaatgacaattaaaaaggagcggaggtagtaa 514  Q
    |||||| || ||||| | || || || |||||||||||  ||| |||||||||| | ||  |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  33755103 ttattgcattaaaaggagtatcaattgttgattgtcttagtttatgtaaaatgttaaaatgtgacaattaaaaaggaacggaggtagtaa 33755014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #97
Raw Score: 79; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 235 - 397
Target Start/End: Complemental strand, 37551927 - 37551765
Alignment:
Q  235 atactcactccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttatttcaatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaactttaaatgttatttt 334  Q
    |||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||| | |||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||||| || |    
T  37551927 atactccctccgttcctttttaattgtcacttttgtagaaattttttgtttctaattaagtgtcactttcaaagttcaatacaacattaaatgttgttgt 37551828  T
Q  335 atcaatattacccttagttatttattgtggagatagaaatatatgaaatgagatattaaatga 397  Q
      |  |||||||||| |||||||||||  |||| ||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  37551827 gcctttattacccttggttatttattgcagagagagaaacatatgaaatgaaatattaaatga 37551765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #98
Raw Score: 79; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 235 - 513
Target Start/End: Complemental strand, 38010028 - 38009750
Alignment:
Q  235 atactcactccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttatttcaatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaactttaaatgttatttt 334  Q
    |||||| |||||||||||| ||| ||||||||||  | || |||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  38010028 atactccctccgttcctttataactgtcacttttacataatttttttgtttccaattaactgtcactttcaaagttcaatgtaactttaaatgttgtttt 38009929  T
Q  335 atcaatattacccttagttatttattgtggagatagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggatattatggtaaaagtatcaattattgtatc 434  Q
      | |||   |||||||| ||||||||  |||| | || ||||||||||  |||||||||| |  || |||||||| |  |||  || | ||||||||||    
T  38009928 tcctataaagcccttagtaatttattggagagagaaaagtatatgaaatatgatattaaataatcaatgatattataggcaaaacataagttattgtatc 38009829  T
Q  435 aaaagtaataacatttattgattgtcttgctttgtgtaaaatgtcataaaatgacaattaaaaaggagcggaggtagta 513  Q
    ||||||| | | ||  ||| | ||||||| ||||||||||| |||| ||  |||||||||||||||| |||||||||||    
T  38009828 aaaagtagtgaaatacatttagtgtcttggtttgtgtaaaaagtcaaaatgtgacaattaaaaaggaacggaggtagta 38009750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #99
Raw Score: 77; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 234 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 37394422 - 37394298
Alignment:
Q  234 tatactcactccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttatttcaatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaactttaaatgttattt 333  Q
    ||||||| |||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||    
T  37394422 tatactctctccgttcctttctaaatgtcatttttggagaaattttttgtttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacaataaatgttgttt 37394323  T
Q  334 tatcaatattacccttagttattta 358  Q
    || ||| |||||||||| |||||||    
T  37394322 taccaacattacccttaattattta 37394298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #100
Raw Score: 74; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 235 - 472
Target Start/End: Original strand, 3802142 - 3802379
Alignment:
Q  235 atactcactccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttatttcaatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaactttaaatgttatttt 334  Q
    |||||| |||||||||||||||| ||||| ||||| | ||||||||| |||| | ||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||| || ||||    
T  3802142 atactccctccgttcctttttaattgtcatttttgcataaattttttgtttctaattaaccgtcactttcaaagttcaatgtaacattaaatattgtttt 3802241  T
Q  335 atcaatattacccttagttatttattgtggagatagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggatattatggtaaaagtatcaattattgtatc 434  Q
    | |  ||||||||||  ||||||||||| |||| |||| |||||||||| | |||||||||||  |||| ||||||   ||||  ||  |||  ||||||    
T  3802242 acctttattacccttgattatttattgtagagagagaagtatatgaaataaaatattaaatgatgaaggttattatacgaaaaagatggattgatgtatc 3802341  T
Q  435 aaaagtaataacatttattgattgtcttgctttgtgta 472  Q
    ||||||||||| |  ||||  |||||||| ||||||||    
T  3802342 aaaagtaataaaaagtatttgttgtcttggtttgtgta 3802379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #101
Raw Score: 74; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 236 - 441
Target Start/End: Original strand, 6150677 - 6150882
Alignment:
Q  236 tactcactccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttatttcaatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaactttaaatgttatttta 335  Q
    ||||| |||| ||||||||||| ||||||||||| | || |||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||     
T  6150677 tactccctccattcctttttaattgtcacttttgcataatttttttgtttctaattaactgtcactttcaaagttcaatacaacattaaatgttgttttg 6150776  T
Q  336 tcaatattacccttagttatttattgtggagatagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggatattatggtaaaagtatcaattattgtatca 435  Q
     |  ||||||||||  ||||||||||| |||| |||| || ||||| |||||||||||||||  |||| |||||| | ||||  || |||| ||| ||||    
T  6150777 cctttattacccttgattatttattgtagagagagaagtaaatgaagtgagatattaaatgatgaaggttattataggaaaaagatgaattgttgcatca 6150876  T
Q  436 aaagta 441  Q
    ||||||    
T  6150877 aaagta 6150882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #102
Raw Score: 73; E-Value: 9e-33
Query Start/End: Original strand, 242 - 514
Target Start/End: Original strand, 18091231 - 18091503
Alignment:
Q  242 ctccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttatttcaatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaactttaaatgttattttatcaata 341  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||||  ||||||||||| |||| | |||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||| | || |  | |||    
T  18091231 ctccgttcctttataactgtcacttttacagaaattttttgtttctaattaagtgtcactttcaaagttcaatgtaacattaaatgatgttcttcctata 18091330  T
Q  342 ttacccttagttatttattgtggagatagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggatattatggtaaaagtatcaattattgtatcaaaagta 441  Q
     | |||||||| ||||||||  |||| |||||||||||||||  |||||||||| | ||||||||||||  | |||  || | |||||| ||||||||||    
T  18091331 atgcccttagtaatttattgcagagagagaaatatatgaaatatgatattaaataattaaggatattataattaaaacataagttattgcatcaaaagta 18091430  T
Q  442 ataacatttattgattgtcttgctttgtgtaaaatgtcataaaatgacaattaaaaaggagcggaggtagtaa 514  Q
     | | ||  ||| | ||||||| |||||||| || |||| ||  ||||||||||||| || |||||| |||||    
T  18091431 gtgaaatacatttagtgtcttggtttgtgtataaagtcaaaatgtgacaattaaaaaagaacggagggagtaa 18091503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #103
Raw Score: 72; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 243 - 410
Target Start/End: Original strand, 14090230 - 14090397
Alignment:
Q  243 tccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttatttcaatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaactttaaatgttattttatcaatat 342  Q
    ||||||| ||| ||| ||||||||||  ||||||||||| |||  | |||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||| || |||     
T  14090230 tccgttcatttataactgtcacttttatagaaattttttgtttataattaactgttactttcaaagttcaatgtaacattaaatgttgttttttctataa 14090329  T
Q  343 tacccttagttatttattgtggagatagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggatattat 410  Q
    |||||||||| ||||||||  |||| |||||||||||||||  |||||||||| | ||||||||||||    
T  14090330 tacccttagtaatttattgcagagagagaaatatatgaaatatgatattaaataattaaggatattat 14090397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #104
Raw Score: 71; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 246 - 462
Target Start/End: Original strand, 7242234 - 7242446
Alignment:
Q  246 gttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttatttcaatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaactttaaatgttattttatcaatattac 345  Q
    |||| ||||||| |||| ||||||||||||| |||   ||| || |||||||| ||||||||||| ||| |||| |||||| || ||||||||||||||     
T  7242234 gttcttttttaactgtctcttttggagaaatgtttc--ttctatgtaactgtcgctttcaaagtttaatacaacattaaatattgttttatcaatattat 7242331  T
Q  346 ccttagttatttattgtggagatagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggatattatggtaaaagtatcaattattgtatcaaaagtaataa 445  Q
    | |||||||||||||   |||| | | |||| |||||||||||||||||| ||||||| ||| || |||||||| | |||| |  |||||||||||| ||    
T  7242332 ctttagttatttattaatgagagaaatatatgtgaaatgagatattaaattaataaggctatcatagtaaaagtgtaaattgt--tatcaaaagtaacaa 7242429  T
Q  446 catttattgattgtctt 462  Q
    ||| |||||||||||||    
T  7242430 catatattgattgtctt 7242446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #105
Raw Score: 68; E-Value: 8e-30
Query Start/End: Original strand, 243 - 501
Target Start/End: Original strand, 38865894 - 38866149
Alignment:
Q  243 tccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttatttcaatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaactttaaatgttattttatcaatat 342  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||||| | |||  |||| |||| | || ||||||| ||||||||| |||| || | ||||||||| ||| | | ||||    
T  38865894 tccgttcctttataattgtcacttttgtataaaaattttgtttctaattcactgtcattttcaaagtccaatacatcattaaatgttgttt-acctatat 38865992  T
Q  343 tacccttagttatttattgtggagatagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggatattatggtaaaagtatcaattattgtatcaaaagtaa 442  Q
    ||||||| | ||||| |||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||| | ||||  || |||| ||| ||||||||||     
T  38865993 tacccttggatatttgttgtagagagagaaatatatgtaatgagatattaaatgattaaggttattatagaaaaaagataaattgttgcatcaaaagtag 38866092  T
Q  443 taacatttattgattgtcttgctttgtgtaaaatgtcataaaatgacaattaaaaagga 501  Q
    ||| |  ||||  |||||||  ||| ||||||| |||| || |||||||||||||||||    
T  38866093 taaaa--tatttgttgtcttaatttatgtaaaaagtcaaaatatgacaattaaaaagga 38866149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #106
Raw Score: 66; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 234 - 399
Target Start/End: Original strand, 27918583 - 27918747
Alignment:
Q  234 tatactcactccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttatttcaatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaactttaaatgttattt 333  Q
    |||||||  ||||||||||||||||| || |||||| |||||| |||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||  ||  |||||||||  ||    
T  27918583 tatactccttccgttcctttttaagtatctcttttgtagaaatgttttgtttctatttagctgtcactttcaaagttcaatcaaatattaaatgtt-gtt 27918681  T
Q  334 tatcaatattacccttagttatttattgtggagatagaaatatatgaaatgagatattaaatgaat 399  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||||   ||| ||||||||||||||  |||||| ||||||||    
T  27918682 tatcaatattaccattagttatatattgcaaagagagaaatatatgaaacaagatataaaatgaat 27918747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #107
Raw Score: 66; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 288 - 475
Target Start/End: Complemental strand, 41955883 - 41955707
Alignment:
Q  288 atttaactgtcactttcaaagttcaatgcaactttaaatgttattttatcaatattacccttagttatttattgtggagatagaaatatatgaaatgaga 387  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||| |||||| |||||||||  |||| ||||| ||||||||||| |    
T  41955883 atttaactgtcacttttaaagttcaatgcaacattaaatataattttatcaatattatccttagatatttattgcagagagagaaaaatatgaaatgaaa 41955784  T
Q  388 tattaaatgaataaggatattatggtaaaagtatcaattattgtatcaaaagtaataacatttattgattgtcttgctttgtgtaaaa 475  Q
    ||||||||           |||| |||||||||  ||  ||||||||||||||| ||| ||||||||||| | ||| |||||||||||    
T  41955783 tattaaat-----------ttatagtaaaagtaaaaacaattgtatcaaaagtattaatatttattgattattttggtttgtgtaaaa 41955707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #108
Raw Score: 64; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 289 - 499
Target Start/End: Complemental strand, 27654953 - 27654742
Alignment:
Q  289 tttaactgtcactttcaaagttcaatgcaact-ttaaatgttattttatcaatattacccttagttatttattgtggagatagaaatatatgaaatgaga 387  Q
    ||||| |||||||||||||||||||  ||| | ||||||  | | ||||| |||||||||||||||||||||||  ||   | ||||||||||||||| |    
T  27654953 tttaattgtcactttcaaagttcaacacaaatattaaattatgtgttatctatattacccttagttatttattgcagattgataaatatatgaaatgaaa 27654854  T
Q  388 tattaaatgaataaggatattatggtaaaagtatcaattattgtatcaaaagtaataacatttattgattgtcttgctttgtgtaaaatgtcataaaatg 487  Q
    ||||||||||  || | |||||| | ||||  || |||| |||||||||||||| ||| |||||||  |||||||  ||||||||||| || | ||||||    
T  27654853 tattaaatgatgaaagctattatagaaaaatgataaattgttgtatcaaaagtagtaaaatttattagttgtcttagtttgtgtaaaaagttaaaaaatg 27654754  T
Q  488 acaattaaaaag 499  Q
    ||||||||||||    
T  27654753 acaattaaaaag 27654742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #109
Raw Score: 64; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 380 - 499
Target Start/End: Complemental strand, 31984269 - 31984150
Alignment:
Q  380 aaatgagatattaaatgaataaggatattatggtaaaagtatcaattattgtatcaaaagtaataacatttattgattgtcttgctttgtgtaaaatgtc 479  Q
    ||||||||| ||||||||||||||  ||||  |||||||||| | |||||| |||||||||| ||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  31984269 aaatgagatgttaaatgaataaggtcattacagtaaaagtataacttattgcatcaaaagtagtaacaattattgattgtgttggtttgtgtaaaatgtc 31984170  T
Q  480 ataaaatgacaattaaaaag 499  Q
    | ||| ||||||||||||||    
T  31984169 aaaaagtgacaattaaaaag 31984150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #110
Raw Score: 63; E-Value: 8e-27
Query Start/End: Original strand, 290 - 444
Target Start/End: Original strand, 54029135 - 54029289
Alignment:
Q  290 ttaactgtcactttcaaagttcaatgcaactttaaatgttattttatcaatattacccttagttatttattgtggagatagaaatatatgaaatgagata 389  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |  ||||| ||||  ||||||||||| |||| | || |||||||||| |||||    
T  54029135 ttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttattttacctttattaaccttgattatttattgtagagagataattatatgaaataagata 54029234  T
Q  390 ttaaatgaataaggatattatggtaaaagtatcaattattgtatcaaaagtaata 444  Q
    ||||||||  |||| |||||| | ||||  || |||| || |||||||| |||||    
T  54029235 ttaaatgatgaaggttattataggaaaaagatgaattgttatatcaaaaataata 54029289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #111
Raw Score: 62; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 236 - 393
Target Start/End: Original strand, 20294267 - 20294424
Alignment:
Q  236 tactcactccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttatttcaatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaactttaaatgttatttta 335  Q
    ||||| ||||||| |||||||| ||||||||||| | || |||||| |||| | |||||| |||||||||||||||||| |||| |||||| || ||||     
T  20294267 tactccctccgtttctttttaattgtcacttttgcataatttttttgtttctaattaactatcactttcaaagttcaatacaacattaaatcttgttttg 20294366  T
Q  336 tcaatattacccttagttatttattgtggagatagaaatatatgaaatgagatattaa 393  Q
    ||  |||||||| |  ||||||||| | || | |||||||||||||||||||||||||    
T  20294367 tctttattacccgtgattatttattctagaaagagaaatatatgaaatgagatattaa 20294424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #112
Raw Score: 61; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 371 - 499
Target Start/End: Original strand, 42645379 - 42645507
Alignment:
Q  371 aaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggatattatggtaaaagtatcaattattgtatcaaaagtaataacatttattgattgtcttgctttgtg 470  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||   |||||||||||||||| | |||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||  | | ||    
T  42645379 aaatatatgaaataagatattaaatgaataagatcattatggtaaaagtataacttattgcatcaaaagtaataacaattattgattatcttagtatatg 42645478  T
Q  471 taaaatgtcataaaatgacaattaaaaag 499  Q
    |||||||||| ||  ||| ||||||||||    
T  42645479 taaaatgtcaaaatgtgataattaaaaag 42645507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #113
Raw Score: 61; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 229 - 501
Target Start/End: Complemental strand, 48510137 - 48509866
Alignment:
Q  229 aatattatactcactccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttatttcaatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaactttaaatgt 328  Q
    ||||| |||||| ||||||| |||| ||| ||||||||||| | |||  |||| |||  | |||||||||  ||||||||||||||| | | ||||||||    
T  48510137 aatataatactccctccgtttctttataattgtcacttttgcataaagattttgtttttaattaactgtcgttttcaaagttcaatgtatcattaaatgt 48510038  T
Q  329 tattttatcaatattacccttagttatttattgtggagatagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggatattatggtaaaagtatcaattat 428  Q
       |||| | ||||||| ||||  |||||||||   ||| |||||||||||||||||  |||||||||| |||| ||||||| | ||||  || |||| |    
T  48510037 ggctttacctatattactcttatatatttattgcatagagagaaatatatgaaatgaagtattaaatgattaagaatattatagaaaaatgataaatttt 48509938  T
Q  429 tgtatcaaaagtaataacatttattgattgtcttgctttgtgtaaaatgtcataaaatgacaattaaaaagga 501  Q
    ||||||||||||| ||| |  ||||  |||||||| ||| ||||||| |||| ||  ||||||||||||||||    
T  48509937 tgtatcaaaagtagtaa-aaatatttgttgtcttgatttatgtaaaaagtcaaaatgtgacaattaaaaagga 48509866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #114
Raw Score: 60; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 242 - 513
Target Start/End: Complemental strand, 8457166 - 8456895
Alignment:
Q  242 ctccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttatttcaatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaactttaaatgttattttatcaata 341  Q
    |||||||||||| |||  |||||||||  |||| |||||| ||||   |||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||| | | || |    |||    
T  8457166 ctccgttcctttataaccgtcacttttacagaatttttttgtttcttattaagtgtcactttcaaagttcaatgtaacattaaagggtgttcttcttata 8457067  T
Q  342 ttacccttagttatttattgtggagatagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggatattatggtaaaagtatcaattattgtatcaaaagta 441  Q
     | |||||||| ||||||||  |||| |||||||||||||||  |||||||||| | |||||||||||| |  |||  || | |||||||||||||||||    
T  8457066 atgcccttagtaatttattgcagagagagaaatatatgaaatatgatattaaataattaaggatattataggcaaaacataagttattgtatcaaaagta 8456967  T
Q  442 ataacatttattgattgtcttgctttgtgtaaaatgtcataaaatgacaattaaaaaggagcggaggtagta 513  Q
     | | ||  ||| | ||||||| |||||||| || |||| ||  |||||||||||||||| |||||| ||||    
T  8456966 gtgaaatacatttagtgtcttggtttgtgtagaaagtcaaaatgtgacaattaaaaaggaacggagggagta 8456895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #115
Raw Score: 60; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 246 - 501
Target Start/End: Complemental strand, 14949335 - 14949080
Alignment:
Q  246 gttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttatttcaatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaactttaaatgttattttatcaatattac 345  Q
    |||||||| ||| ||||||||||    || |||||| |||| | |||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||  | ||| | |    
T  14949335 gttcctttataattgtcacttttacgtaatttttttgtttctaattaagtgtcactttcaaagttcaatgtaacattaaatgttgtttttcctataatgc 14949236  T
Q  346 ccttagttatttattgtggagatagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggatattatggtaaaagtatcaattattgtatcaaaagtaataa 445  Q
    ||||||| ||||||||  |||| ||||||||| |||||  |||||||||| | |||||||||||| |  |||  || | ||||||||||||||||| | |    
T  14949235 ccttagtaatttattgcagagagagaaatataagaaatatgatattaaataattaaggatattataggcaaaccataagttattgtatcaaaagtagtga 14949136  T
Q  446 catttattgattgtcttgctttgtgtaaaatgtcataaaatgacaattaaaaagga 501  Q
     ||  ||| | ||| ||| ||||||||||| |||| ||  || |||||||||||||    
T  14949135 aatacatttagtgtattggtttgtgtaaaacgtcaaaatgtggcaattaaaaagga 14949080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #116
Raw Score: 59; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 290 - 475
Target Start/End: Complemental strand, 1615260 - 1615077
Alignment:
Q  290 ttaactgtcactttcaaagttcaatgcaactttaaatgttattttatcaatattacccttagttatttattgtggagatagaaatatatgaaatgagata 389  Q
    |||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||| ||||  |  ||||||| ||  ||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||    
T  1615260 ttaactgtcactttcaaatttcaatacaacattaaatgttgttttgcctttattaccattgattatttattgtagaga--gaaatatatgaaatgagata 1615163  T
Q  390 ttaaatgaataaggatattatggtaaaagtatcaattattgtatcaaaagtaataacatttattgattgtcttgctttgtgtaaaa 475  Q
    ||||||||  |||| |||||| | |||| ||| || | ||| |||||||||| ||| |  ||||  |||||||| |||||||||||    
T  1615162 ttaaatgatgaaggttattataggaaaaatatgaactgttgcatcaaaagtagtaaaaagtatttgttgtcttggtttgtgtaaaa 1615077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #117
Raw Score: 59; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 155 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 17777891 - 17777809
Alignment:
Q  155 gcggccttattgtcaactagtctccgagttctatttaaaataccagattgtattgaaaatactttgatcaatgaaatattata 237  Q
    |||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  17777891 gcggccttattgtcaactagtctccagactctatttaaaataccagattgtattgaaaatactttgattaatgaaatgttata 17777809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #118
Raw Score: 58; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 236 - 501
Target Start/End: Original strand, 48087681 - 48087946
Alignment:
Q  236 tactcactccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttatttcaatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaactttaaatgttatttta 335  Q
    ||||| |||||||||||| ||| ||||||||||    ||||||||| |||  | |||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||     
T  48087681 tactccctccgttcctttataactgtcacttttacttaaattttttgtttttaattaactctcactttcaaagttcaatgtaacattaaatgttgttttt 48087780  T
Q  336 tcaatattacccttagttatttattgtggagatagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggatattatggtaaaagtatcaattattgtatca 435  Q
     | ||| |||||||||| ||||||||  |||| | |||||||||||||  |||||||||| | ||| |||||| | |  |||  |  | |||||||||||    
T  48087781 cctataatacccttagtaatttattgcagagagaaaaatatatgaaatatgatattaaataattaaagatattgtaggcaaaacacaagttattgtatca 48087880  T
Q  436 aaagtaataacatttattgattgtcttgctttgtgtaaaatgtcataaaatgacaattaaaaagga 501  Q
    || ||| | | ||  ||| | ||||||| |||||||||||  ||| ||  ||||||||||||||||    
T  48087881 aatgtagtgaaatacatttagtgtcttggtttgtgtaaaaaatcaaaatgtgacaattaaaaagga 48087946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #119
Raw Score: 57; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 242 - 441
Target Start/End: Original strand, 41813631 - 41813831
Alignment:
Q  242 ctccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttatttcaatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaactttaaatgttattttatc-aat 340  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||||| | ||| ||||| |||| | |||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||| |   |    
T  41813631 ctccgttcctttttaattgttacttttgcataaaatttttgtttctaattaagtgtcactttcaaagttcaatgcaatattaaatgttgttttacctttt 41813730  T
Q  341 attacccttagttatttattgtggagatagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggatattatggtaaaagtatcaattattgtatcaaaagt 440  Q
    |||||||||  ||||||||||| |||| | || | |||||||| | |||||||||||  |||| |||||| | ||||  || |||| || ||||||||||    
T  41813731 attacccttgattatttattgtagagagataagtgtatgaaataatatattaaatgatgaaggttattataggaaaaagatgaattgttatatcaaaagt 41813830  T
Q  441 a 441  Q
    |    
T  41813831 a 41813831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #120
Raw Score: 56; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 156 - 231
Target Start/End: Original strand, 32663760 - 32663835
Alignment:
Q  156 cggccttattgtcaactagtctccgagttctatttaaaataccagattgtattgaaaatactttgatcaatgaaat 231  Q
    |||||||||||||||||||||| |  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  32663760 cggccttattgtcaactagtcttcaggttctatttgaaataccagattgtattgaaaatactttgattaatgaaat 32663835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #121
Raw Score: 55; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 243 - 361
Target Start/End: Original strand, 38617806 - 38617924
Alignment:
Q  243 tccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttatttcaatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaactttaaatgttattttatcaatat 342  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| |||||| | | | || | |||||| |||||||||||||||| |||||||| |||||| || ||||||||||||    
T  38617806 tccgttcctttttaattgtcacttttagagaaactatctgttcctatttaattgtcactttcaaagtttaatgcaacattaaatattgttttatcaatat 38617905  T
Q  343 tacccttagttatttattg 361  Q
    || |||||  |||||||||    
T  38617906 tatccttatatatttattg 38617924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #122
Raw Score: 53; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 295 - 383
Target Start/End: Original strand, 8752182 - 8752270
Alignment:
Q  295 tgtcactttcaaagttcaatgcaactttaaatgttattttatcaatattacccttagttatttattgtggagatagaaatatatgaaat 383  Q
    ||||| ||||||| || || ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||    
T  8752182 tgtcaatttcaaattttaaagcaacattaaatgttattttagcaatattacccttagttatttattaaggagagagaaatatatgaaat 8752270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #123
Raw Score: 53; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 288 - 384
Target Start/End: Original strand, 51347297 - 51347393
Alignment:
Q  288 atttaactgtcactttcaaagttcaatgcaactttaaatgttattttatcaatattacccttagttatttattgtggagatagaaatatatgaaatg 384  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||| | ||| ||||||||||    
T  51347297 atttatctgtcactttcaaagtttaatgtaacattaaatgttgttttaccaatattacccttagatatttattgcggagagaaaaacatatgaaatg 51347393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #124
Raw Score: 51; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 290 - 507
Target Start/End: Complemental strand, 1391378 - 1391161
Alignment:
Q  290 ttaactgtcactttcaaagttcaatgcaactttaaatgttattttatcaatattacccttagttatttattgtggagatagaaatatatgaaatgagata 389  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| |||  |||||||| ||||  | ||| |  ||||||| ||||||||| |||| |||||||| |||||   ||||    
T  1391378 ttaagtgtcactttcaaagttcaatgtaacactaaatgttgtttttcctataatgtccttagtaatttattgtagagagagaaatatgtgaaaaatgata 1391279  T
Q  390 ttaaatgaataaggatattat-ggtaaaagtatcaattattgtatcaaaagtaataacatttattgattgtcttgctttgtgtaaaatgtcataaaatga 488  Q
    |||||| | ||||||||||||  ||||||  || | ||||||||||||||||| | | ||  ||| | | ||||| ||||||||||| |||| ||| |||    
T  1391278 ttaaataattaaggatattatacgtaaaa-cataagttattgtatcaaaagtagtgaaatacatttagtatcttggtttgtgtaaaaagtcaaaaagtga 1391180  T
Q  489 caattaaaaaggagcggag 507  Q
    ||| ||||||||| |||||    
T  1391179 caaataaaaaggaacggag 1391161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #125
Raw Score: 50; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 234 - 327
Target Start/End: Original strand, 17698549 - 17698642
Alignment:
Q  234 tatactcactccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttatttcaatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaactttaaatg 327  Q
    ||||||| ||| |||||||||| ||||||  ||||| ||||||||||| |||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  17698549 tatactccctctgttccttttttagtgtcgtttttgaagaaattttttgtttctatttaattgtcacttttaaagttcaatgcaacattaaatg 17698642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #126
Raw Score: 50; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 288 - 501
Target Start/End: Original strand, 20087211 - 20087418
Alignment:
Q  288 atttaactgtcactttcaaagttcaatgcaactttaaatgttattttatcaatattacccttagttatttattgtggagatagaaatatatgaaatgaga 387  Q
    |||||||||| ||||  |||||| |||||||  ||||||||| |||||| ||| |||  |||| |||||||||| ||||| |||||||||  |||| | |    
T  20087211 atttaactgttacttataaagtttaatgcaatgttaaatgttgttttattaatgttattcttatttatttattgcggagagagaaatatagaaaataata 20087310  T
Q  388 tattaaatgaataaggatattatggtaaaagtatcaattattgtatcaaaagtaataacatttattgattgtcttgctttgtgtaaaatgtcataaaatg 487  Q
    |||||||||| ||||  |||| | ||| |||     || | | ||||||||||| |||||||||||||| || ||| ||||  |||||||||| ||||||    
T  20087311 tattaaatgagtaagtttattgtagtagaag-----atcactctatcaaaagtagtaacatttattgatagttttgatttgcctaaaatgtca-aaaatg 20087404  T
Q  488 acaattaaaaagga 501  Q
    | ||||||||||||    
T  20087405 ataattaaaaagga 20087418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #127
Raw Score: 50; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 369 - 501
Target Start/End: Complemental strand, 53467680 - 53467547
Alignment:
Q  369 agaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggatattatggtaaaagtatcaattattgtatcaaaagtaataacatttattgattgtcttgctttg 468  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| ||  ||| ||   ||||  || ||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||   ||| ||||    
T  53467680 agaagtatatgaaatgagatattaaatgaatgagactataattaaaaaatgataaattattatatcaaaagtagtaatatttattgattcatttgatttg 53467581  T
Q  469 tgtaaaatgtc-ataaaatgacaattaaaaagga 501  Q
    ||||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  53467580 tgtaaaatgtcaaaaaaatgacaattaaaaagga 53467547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #128
Raw Score: 49; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 243 - 445
Target Start/End: Original strand, 43086397 - 43086595
Alignment:
Q  243 tccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttatttcaatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaactttaaatgttattttatcaatat 342  Q
    |||||||| |||||| ||||| ||||  ||||  |||||||||  | |||||||| ||||||||||||||||  ||| ||||||||| ||||  |  |||    
T  43086397 tccgttccattttaattgtcatttttacagaa--tttttatttttaattaactgtgactttcaaagttcaatataacattaaatgttgtttttcctttat 43086494  T
Q  343 tacccttagttatttattgtggagatagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggatattatggtaaaagtatcaattattgtatcaaaagtaa 442  Q
    |||||||  ||||||| ||  ||||  ||||||||||||| || |||||||||||  |||| |||||| | ||||  || |||| |||||||||||||||    
T  43086495 tacccttgattatttactgcagaga--gaaatatatgaaaagaaatattaaatgatgaaggttattataggaaaaagataaattgttgtatcaaaagtaa 43086592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #129
Raw Score: 48; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 406 - 513
Target Start/End: Original strand, 49089059 - 49089166
Alignment:
Q  406 attatggtaaaagtatcaattattgtatcaaaagtaataacatttattgattgtcttgctttgtgtaaaatgtcataaaatgacaattaaaaaggagcgg 505  Q
    ||||| |||||||||  ||  ||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||| || | ||||||| ||| ||| |||||||||||||||| |||    
T  49089059 attatagtaaaagtaataacaattgtatcaaacgtagtaatatttattgattgtcttggttcgagtaaaatatcaaaaagtgacaattaaaaaggaacgg 49089158  T
Q  506 aggtagta 513  Q
    ||||||||    
T  49089159 aggtagta 49089166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #130
Raw Score: 47; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 242 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 30152084 - 30151934
Alignment:
Q  242 ctccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttatttcaatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaactttaaatgttattttatcaata 341  Q
    |||| ||||||| ||| ||||||||||  | ||||||||| |||| | |||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||| | || |  | |||    
T  30152084 ctccattcctttataactgtcacttttacataaattttttgtttctaattaagtgtcactttcaaagttcaatgtaacattaaatggtgttattcctata 30151985  T
Q  342 ttacccttagttatttattgtggagatagaaatatatgaaatgagatatta 392  Q
     | |||||| | ||||||||  ||||||||||||||||||||  |||||||    
T  30151984 atgcccttaataatttattgcagagatagaaatatatgaaatatgatatta 30151934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #131
Raw Score: 47; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 236 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 55430564 - 55430362
Alignment:
Q  236 tactcactccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttatttcaatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaactttaaatgttatttta 335  Q
    ||||| |||||||||||| ||| ||||||||||| | |||   ||| |||| | |||||||||  |||||||||||| || | | ||||||||  |||||    
T  55430564 tactccctccgttcctttataattgtcacttttgcataaaaaatttgtttctaattaactgtcgttttcaaagttcattgtatcattaaatgtggtttta 55430465  T
Q  336 tcaatattacccttagttatttattgtggagatagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggatattatggtaaaagtatcaattattgtatca 435  Q
     | |||||| |||||| || |||||||| ||| | ||||||||||||| |  |||||||||| | ||| |||||| | ||||  || |||| ||||||||    
T  55430464 cctatattatccttagatacttattgtgaagagataaatatatgaaattaagtattaaatgattgaggttattataggaaaaagataaattgttgtatca 55430365  T
Q  436 aaa 438  Q
    |||    
T  55430364 aaa 55430362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #132
Raw Score: 46; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 274 - 383
Target Start/End: Original strand, 17978090 - 17978198
Alignment:
Q  274 aattttttatttcaatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaactttaaatgttattttatcaatattacccttagttatttattgtggagatagaaa 373  Q
    |||||||| || |||||||||  |||||||||||||| ||| |||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||| || ||||| ||| |    
T  17978090 aatttttttttccaatttaacattcactttcaaagttgaat-caacattaaatgttgttttaccaatattacccttagatatttaatgcggagagagaca 17978188  T
Q  374 tatatgaaat 383  Q
     |||||||||    
T  17978189 catatgaaat 17978198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #133
Raw Score: 46; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 262 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 34925577 - 34925444
Alignment:
Q  262 cacttttggagaaattttttatttcaatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaactttaaatgttattttatcaatattacccttagttatttattg 361  Q
    |||||||| ||||||||||| |||  | |||| ||||||||||||| ||||||  ||| ||||||||| |||||  | | ||| ||||  ||||||||||    
T  34925577 cacttttgcagaaattttttgtttttaattaattgtcactttcaaaattcaatataacattaaatgttgttttaatattgttatccttgattatttattg 34925478  T
Q  362 tggagatagaaatatatgaaatgagatattaaat 395  Q
      || | |||||||||||||||||||||||||||    
T  34925477 cagaaagagaaatatatgaaatgagatattaaat 34925444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #134
Raw Score: 46; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 301 - 410
Target Start/End: Complemental strand, 52978421 - 52978313
Alignment:
Q  301 tttcaaagttcaatgcaactttaaatgttattttatcaatattacccttagttatttattgtggagatagaaatatatgaaatgagatattaaatgaata 400  Q
    ||||||||||||||  ||  ||||||||| || || |||  ||||||||  |||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  52978421 tttcaaagttcaatttaatattaaatgttgttcta-caagtttaccctttattatttattgtgtagagagaaatatatgaaaagagatattaaatgaata 52978323  T
Q  401 aggatattat 410  Q
    ||| ||||||    
T  52978322 aggctattat 52978313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #135
Raw Score: 45; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 242 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 31984356 - 31984296
Alignment:
Q  242 ctccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttatttcaatttaactgtcactt 302  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || | |||||||||||||||    
T  31984356 ctccgttcctttttaagtgtctcttttggagaaattttttgttcctatttaactgtcactt 31984296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #136
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 407 - 514
Target Start/End: Original strand, 29511197 - 29511304
Alignment:
Q  407 ttatggtaaaagtatcaattattgtatcaaaagtaataacatttattgattgtcttgctttgtgtaaaatgtcataaaatgacaattaaaaaggagcgga 506  Q
    |||| ||||||||||  ||| |||||||||||||| ||||||||||  | | ||||| ||| |||||||||||| ||  ||||||||||||| || ||||    
T  29511197 ttatagtaaaagtatacattgttgtatcaaaagtagtaacatttatgaaatttcttggtttatgtaaaatgtcaaaaggtgacaattaaaaatgaacgga 29511296  T
Q  507 ggtagtaa 514  Q
    ||||||||    
T  29511297 ggtagtaa 29511304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #137
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 290 - 417
Target Start/End: Original strand, 56486422 - 56486549
Alignment:
Q  290 ttaactgtcactttcaaagttcaatgcaactttaaatgttattttatcaatattacccttagttatttattgtggagatagaaatatatgaaatgagata 389  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || | |||||||||  |||||| |||||||| |||  ||||||||||  | | |||||||||| |||||| |||    
T  56486422 ttaattgtcattttcaaagttcaatacatcattaaatgttggtttatctatattacctttaaatatttattgtaaataaagaaatatataaaatgaaata 56486521  T
Q  390 ttaaatgaataaggatattatggtaaaa 417  Q
    |||||||| ||||| |||| | ||||||    
T  56486522 ttaaatgattaaggttattgtagtaaaa 56486549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #138
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 321 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 25098423 - 25098341
Alignment:
Q  321 ttaaatgttattttatcaatattacccttagttatttattgtggagatagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataagg 403  Q
    ||||||||| |||||| ||||||||||||  |||||||||  ||||| |||||| |||||||| ||||||||||| |||||||    
T  25098423 ttaaatgttgttttattaatattacccttgtttatttattacggagagagaaatgtatgaaataagatattaaataaataagg 25098341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #139
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 321 - 514
Target Start/End: Original strand, 9746296 - 9746489
Alignment:
Q  321 ttaaatgttattttatcaatattacccttagttatttattgtggagatagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggatattatggtaaaagta 420  Q
    ||||||||| |||| ||  ||||||||||  ||||||||||| |||| |||| || ||||| |||||||||||||||  |||  |||||| | ||||  |    
T  9746296 ttaaatgttgttttgtctttattacccttgattatttattgtagagaaagaagtaaatgaactgagatattaaatgatgaagattattataggaaaaaga 9746395  T
Q  421 tcaattattgtatcaaaagtaataacatttattgattgtcttgctttgtgtaaaatgtcataaaatgacaattaaaaaggagcggaggtagtaa 514  Q
    | |||| ||| |||||| ||||||| |  ||||  |||||||| |||||||||||  |   ||| |||||||||||||||| || ||| |||||    
T  9746396 tgaattgttgcatcaaaggtaataaaaagtatttgttgtcttggtttgtgtaaaaaattcaaaagtgacaattaaaaaggaacgaaggaagtaa 9746489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #140
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 452 - 513
Target Start/End: Original strand, 9834479 - 9834540
Alignment:
Q  452 ttgattgtcttgctttgtgtaaaatgtcataaaatgacaattaaaaaggagcggaggtagta 513  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| ||  |||||||||||||||| |||||||||||    
T  9834479 ttgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaacggaggtagta 9834540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #141
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 301 - 514
Target Start/End: Complemental strand, 51655068 - 51654856
Alignment:
Q  301 tttcaaagttcaatgcaactttaaatgttattttatcaatattacccttagttatttattgtggagatagaaatatatgaaatgagatattaaatgaata 400  Q
    ||||||||| ||||| | | ||||||||   |||||| ||||||||||||  |||||||||  |||| ||||||||||| |||||  |||||||| | ||    
T  51655068 tttcaaagtccaatgtatcattaaatgtggctttatctatattacccttatatatttattgctgagagagaaatatatggaatgaactattaaattatta 51654969  T
Q  401 aggatattatggtaaaagtatcaattattgtatcaaaagtaataacatttattgattgtcttgctttgtgtaaaatgtcataaaatgacaattaaaaagg 500  Q
    ||| |||||  ||||||  || |||| ||||||||||||| | || |  |||| ||| | ||| ||||||||||| |||| ||  |||| ||||||||||    
T  51654968 aggttattacagtaaaaagataaattgttgtatcaaaagt-agaaaaagtatttattattttggtttgtgtaaaaagtcaaaatgtgacgattaaaaagg 51654870  T
Q  501 agcggaggtagtaa 514  Q
    | | |||| |||||    
T  51654869 aacagaggaagtaa 51654856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #142
Raw Score: 41; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 278 - 410
Target Start/End: Complemental strand, 19692957 - 19692826
Alignment:
Q  278 ttttatttcaatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaactttaaatgttattttatcaatattacccttagttatttattgtggagatagaaatata 377  Q
    |||| ||||| ||||  ||||||||||||  ||||||||||| |||| | ||  ||||||||||  ||||||| ||||||||||| |||| ||||||| |    
T  19692957 ttttgtttcactttacttgtcactttcaagtttcaatgcaacattaattattggtttatcaataacacccttacttatttattgtagagagagaaata-a 19692859  T
Q  378 tgaaatgagatattaaatgaataaggatattat 410  Q
    |  ||||| ||| ||||||| ||||||||||||    
T  19692858 tagaatgaaataataaatgagtaaggatattat 19692826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #143
Raw Score: 41; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 278 - 410
Target Start/End: Complemental strand, 19703542 - 19703411
Alignment:
Q  278 ttttatttcaatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaactttaaatgttattttatcaatattacccttagttatttattgtggagatagaaatata 377  Q
    |||| ||||| ||||  ||||||||||||  ||||||||||| |||| | ||  ||||||||||  ||||||| ||||||||||| |||| ||||||| |    
T  19703542 ttttgtttcactttacttgtcactttcaagtttcaatgcaacattaattattggtttatcaataacacccttacttatttattgtagagagagaaata-a 19703444  T
Q  378 tgaaatgagatattaaatgaataaggatattat 410  Q
    |  ||||| ||| ||||||| ||||||||||||    
T  19703443 tagaatgaaataataaatgagtaaggatattat 19703411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #144
Raw Score: 41; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 243 - 319
Target Start/End: Original strand, 42645298 - 42645373
Alignment:
Q  243 tccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttatttcaatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaac 319  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||| |||  |||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42645298 tccgttcctttttaagcgtctcttttgaagatttttttt-tctctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaac 42645373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #145
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 246 - 501
Target Start/End: Original strand, 39308924 - 39309178
Alignment:
Q  246 gttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttatttcaatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaactttaaatgttattttatcaatattac 345  Q
    |||||||| ||| | ||| ||||| | ||| ||||| |||| | |||||||| | ||| ||||| ||||| | | ||||||||  ||||| | ||||||     
T  39308924 gttcctttataattatcatttttgcataaaatttttgtttctaattaactgtaatttttaaagtacaatgtatcattaaatgtagttttacctatattat 39309023  T
Q  346 ccttagttatttattgtggagatagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggatattatggtaaaagtatcaattattgtatcaaaagtaataa 445  Q
    |||||  |||||||||  |||| |||||||||||||||||  |||||||| | ||||| |||||| | ||||  || ||||||| ||| ||||||  |||    
T  39309024 ccttatatatttattgcagagagagaaatatatgaaatgaagtattaaattattaaggttattataggaaaaagataaattattatattaaaagtggtaa 39309123  T
Q  446 catttattgattgtcttgctttgtgtaaaatgtcataaaatgacaattaaaaagga 501  Q
     |  ||||  || ||||  ||| ||||||| |||| || |||||||||||||||||    
T  39309124 -aagtatttgttatcttagtttatgtaaaaagtcaaaatatgacaattaaaaagga 39309178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #146
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 278 - 408
Target Start/End: Original strand, 6128991 - 6129120
Alignment:
Q  278 ttttatttcaatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaactttaaatgttattttatcaatattacccttagttatttattgtggagatagaaatata 377  Q
    |||| ||||| ||||  ||||||||||||  ||||||||||| |||| | ||  |||||||||| ||||||||  |||||||||| |||| ||||||| |    
T  6128991 ttttgtttcattttacttgtcactttcaagtttcaatgcaacattaattattggtttatcaataatacccttatctatttattgtagagagagaaata-a 6129089  T
Q  378 tgaaatgagatattaaatgaataaggatatt 408  Q
    || ||||| ||| ||||||| ||||| ||||    
T  6129090 tggaatgaaataataaatgattaagggtatt 6129120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #147
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 443 - 513
Target Start/End: Complemental strand, 38027629 - 38027559
Alignment:
Q  443 taacatttattgattgtcttgctttgtgtaaaatgtcataaaatgacaattaaaaaggagcggaggtagta 513  Q
    ||||||||||||| ||| ||| ||| |||||||| ||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  38027629 taacatttattgagtgttttggtttatgtaaaatatcaaaaagtgacaattaaaaaggaacggaggtagta 38027559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #148
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 19 - 85
Target Start/End: Complemental strand, 36183565 - 36183497
Alignment:
Q  19 tataaggcccaataaggaactaga--aaaacaaggagcattgtacaactccaaattaaaagtaatctaa 85  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| | |||| | ||| ||||||||||||||    
T  36183565 tataaggcccaataaggaactagaaaaaaacaaggagcattatccaacactaaaataaaagtaatctaa 36183497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #149
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 434 - 514
Target Start/End: Original strand, 17698643 - 17698723
Alignment:
Q  434 caaaagtaataacatttattgattgtcttgctttgtgtaaaatgtcataaaatgacaattaaaaaggagcggaggtagtaa 514  Q
    |||||||| ||||| | ||||| | ||||| ||| |||||||||||| || ||||||||||||||||| || |||||||||    
T  17698643 caaaagtagtaacaatcattgactatcttggtttatgtaaaatgtcaaaatatgacaattaaaaaggaacgaaggtagtaa 17698723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #150
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 449 - 513
Target Start/End: Complemental strand, 52677214 - 52677150
Alignment:
Q  449 ttattgattgtcttgctttgtgtaaaatgtcataaaatgacaattaaaaaggagcggaggtagta 513  Q
    ||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||  ||||||||||    
T  52677214 ttattgattgttttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaatggaggtagta 52677150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #151
Raw Score: 36; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 241 - 300
Target Start/End: Original strand, 23237398 - 23237457
Alignment:
Q  241 actccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttatttcaatttaactgtcac 300  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| || | ||||| |||||||    
T  23237398 actccgttcctttttaagtgtcatttttggagaatttttttgttcctatttatctgtcac 23237457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #152
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 295 - 357
Target Start/End: Original strand, 24948658 - 24948720
Alignment:
Q  295 tgtcactttcaaagttcaatgcaactttaaatgttattttatcaatattacccttagttattt 357  Q
    ||||| ||| ||||||||||| ||| |||| ||||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  24948658 tgtcatttttaaagttcaatgaaacattaattgttattttgtcaataatacccttagttattt 24948720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #153
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 39 - 85
Target Start/End: Original strand, 28378914 - 28378960
Alignment:
Q  39 tagaaaaacaaggagcattgtacaactccaaattaaaagtaatctaa 85  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||    
T  28378914 tagaaaaacaaggagcattatccaactccaaaataaaagtaatctaa 28378960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #154
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 470 - 514
Target Start/End: Original strand, 36408969 - 36409013
Alignment:
Q  470 gtaaaatgtcataaaatgacaattaaaaaggagcggaggtagtaa 514  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  36408969 gtaaaatgtcaaaatatgacaattaaaaaggaacggaggtagtaa 36409013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #155
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 470 - 514
Target Start/End: Original strand, 36423135 - 36423179
Alignment:
Q  470 gtaaaatgtcataaaatgacaattaaaaaggagcggaggtagtaa 514  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  36423135 gtaaaatgtcaaaatatgacaattaaaaaggaacggaggtagtaa 36423179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #156
Raw Score: 31; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 301 - 383
Target Start/End: Complemental strand, 7037129 - 7037047
Alignment:
Q  301 tttcaaagttcaatgcaactttaaatgttattttatcaatattacccttagttatttattgtggagatagaaatatatgaaat 383  Q
    |||||||||||||| |||  |||||| ||  |||| |  |||| |||||||||||||||| | |||| |||||||||||||||    
T  7037129 tttcaaagttcaatacaatattaaatattgctttacctgtattgcccttagttatttattatagagaaagaaatatatgaaat 7037047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #157
Raw Score: 31; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 364 - 410
Target Start/End: Complemental strand, 13435294 - 13435248
Alignment:
Q  364 gagatagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggatattat 410  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||    
T  13435294 gagaaagaaatatatgaaatgagatattaaattaataatgttattat 13435248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #158
Raw Score: 31; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 451 - 513
Target Start/End: Complemental strand, 33751389 - 33751327
Alignment:
Q  451 attgattgtcttgctttgtgtaaaatgtcataaaatgacaattaaaaaggagcggaggtagta 513  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||||| ||  | |||||||||||||| ||||| |||||    
T  33751389 attgattgtcttagtttgtgtaaaatgtcaaaatgtaacaattaaaaaggaacggagatagta 33751327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0192 (Bit Score: 166; Significance: 3e-88; HSPs: 1)
Name: scaffold0192
Description:

Target: scaffold0192; HSP #1
Raw Score: 166; E-Value: 3e-88
Query Start/End: Original strand, 235 - 456
Target Start/End: Complemental strand, 14983 - 14762
Alignment:
Q  235 atactcactccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttatttcaatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaactttaaatgttatttt 334  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  14983 atactccctccgttcctttttaagtgtcactttcggagaaactttttgttccaatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaactttaaatgttgtttt 14884  T
Q  335 atcaatattacccttagttatttattgtggagatagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggatattatggtaaaagtatcaattattgtatc 434  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  14883 atcaatattacccctagttatttattgcggagagagaaatatatgacatgagatattaaatgaataagtctattatagtaaaagtatcaattattgtatc 14784  T
Q  435 aaaagtaataacatttattgat 456  Q
    ||||||| ||||||||||||||    
T  14783 aaaagtagtaacatttattgat 14762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0018 (Bit Score: 153; Significance: 2e-80; HSPs: 1)
Name: scaffold0018
Description:

Target: scaffold0018; HSP #1
Raw Score: 153; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 234 - 498
Target Start/End: Complemental strand, 184390 - 184126
Alignment:
Q  234 tatactcactccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttatttcaatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaactttaaatgttattt 333  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||| || |||    
T  184390 tatactccctccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttattcctatttaactgtcgctttcaaagttcaatgcaacaataaatattgttt 184291  T
Q  334 tatcaatattacccttagttatttattgtggagatagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggatattatggtaaaagtatcaattattgtat 433  Q
    || ||| ||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||| |||||||||||    
T  184290 taccaacattacccttagttatttattgcggagagataaatatatgaaataagatattaaatgactaaggctattatagtaaaagtataaattattgtat 184191  T
Q  434 caaaagtaataacatttattgattgtcttgctttgtgtaaaatgtcataaaatgacaattaaaaa 498  Q
     | ||  | ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| | ||||||||| |||||||    
T  184190 aagaaaaagtaacatttattgagtgtcttggtttgtgtaaaatgttaaaaaatgacacttaaaaa 184126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0024 (Bit Score: 148; Significance: 2e-77; HSPs: 2)
Name: scaffold0024
Description:

Target: scaffold0024; HSP #1
Raw Score: 148; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 246 - 513
Target Start/End: Original strand, 49137 - 49403
Alignment:
Q  246 gttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttatttcaatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaactttaaatgttattttatcaatattac 345  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||     
T  49137 gttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattat 49236  T
Q  346 ccttagttatttattgtggagatagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggatattatggtaaaagtatcaattattgtatcaaaagtaataa 445  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||||  |||||  |||||||||   |||||| |||||||||| ||     
T  49237 ccttagttatttattgtggagagagaaatatatgaaatga-aaattaaatgaataaggtcattataataaaagtatagtttattgcatcaaaagtagtat 49335  T
Q  446 catttattgattgtcttgctttgtgtaaaatgtcataaaatgacaattaaaaaggagcggaggtagta 513  Q
    || || |||||||||||| |||| ||||||||||| ||  |||||||||||||||| |||| ||||||    
T  49336 caattgttgattgtcttggtttgcgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaacggatgtagta 49403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0024; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 452 - 498
Target Start/End: Original strand, 89366 - 89412
Alignment:
Q  452 ttgattgtcttgctttgtgtaaaatgtcataaaatgacaattaaaaa 498  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| ||  |||||||||||||    
T  89366 ttgattgtcttgatttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaa 89412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0280 (Bit Score: 144; Significance: 4e-75; HSPs: 1)
Name: scaffold0280
Description:

Target: scaffold0280; HSP #1
Raw Score: 144; E-Value: 4e-75
Query Start/End: Original strand, 254 - 513
Target Start/End: Original strand, 8152 - 8411
Alignment:
Q  254 ttaagtgtcacttttggagaaattttttatttcaatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaactttaaatgttattttatcaatattacccttagtt 353  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||   |||||||    
T  8152 ttaagtgtcacttttgaagaaattttttgtttctatttaactgtcattttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatattcttcttagtt 8251  T
Q  354 atttattgtggagatagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggatattatggtaaaagtatcaattattgtatcaaaagtaataacatttatt 453  Q
    ||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||| |||||||||| | |||||| |||||||||| || || || ||    
T  8252 atttattgcagagaaagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataagatcattatagtaaaagtataacttattgcatcaaaagtagtatcaattgtt 8351  T
Q  454 gattgtcttgctttgtgtaaaatgtcataaaatgacaattaaaaaggagcggaggtagta 513  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| ||  |||||||||||||||| |||||||||||    
T  8352 gattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaaggaacggaggtagta 8411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001 (Bit Score: 144; Significance: 4e-75; HSPs: 2)
Name: scaffold0001
Description:

Target: scaffold0001; HSP #1
Raw Score: 144; E-Value: 4e-75
Query Start/End: Original strand, 286 - 513
Target Start/End: Complemental strand, 419703 - 419476
Alignment:
Q  286 caatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaactttaaatgttattttatcaatattacccttagttatttattgtggagatagaaatatatgaaatga 385  Q
    |||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||  ||| | |||||||||||||||||    
T  419703 caatttatttgtcactttcaaaattcaatgcaactttaaatgttgttttatcaatattactcttagttatttattacggaaagagaaatatatgaaatga 419604  T
Q  386 gatattaaatgaataaggatattatggtaaaagtatcaattattgtatcaaaagtaataacatttattgattgtcttgctttgtgtaaaatgtcataaaa 485  Q
    |||||||||| ||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||     
T  419603 gatattaaataaataagattattatagtaaaagtatcaattattgtatcaaaagtagtaacatttattgattgtcttggtttatgtaaaatgtcacaaag 419504  T
Q  486 tgacaattaaaaaggagcggaggtagta 513  Q
    |||||||||||||| | | |||||||||    
T  419503 tgacaattaaaaagaaacagaggtagta 419476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #2
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 233 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 419897 - 419840
Alignment:
Q  233 ttatactcactccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttatttcaattt 291  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  419897 ttatactc-ctccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttgttccaattt 419840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0831 (Bit Score: 142; Significance: 6e-74; HSPs: 1)
Name: scaffold0831
Description:

Target: scaffold0831; HSP #1
Raw Score: 142; E-Value: 6e-74
Query Start/End: Original strand, 235 - 514
Target Start/End: Original strand, 2786 - 3067
Alignment:
Q  235 atactcactccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttatttcaatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaactttaaatgttatttt 334  Q
    |||||| ||| |||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  2786 atactccctctgttcatttttaagtgtctcttttggagaatttttttatttctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgtttt 2885  T
Q  335 atcaatattacccttagttatttattgtggagatagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggatattatggtaaaagtatcaattattgtatc 434  Q
    | |||||||| |||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||||  |||||  ||||||||| | |||||| |||    
T  2886 accaatattatccttagttatttattacggagagagaaatatatgaaatgagttgttaaatgaataaggtcattataataaaagtataacttattgcatc 2985  T
Q  435 aaaagtaataac-atttattgattgtcttgctttgtgtaaaatgtcataaaa-tgacaattaaaaaggagcggaggtagtaa 514  Q
    ||||||| |||| | ||| ||||||||||| |||||||||||| | | |||| |||||||||||||||| |||||| |||||    
T  2986 aaaagtagtaacaaattactgattgtcttggtttgtgtaaaatataaaaaaagtgacaattaaaaaggaacggagggagtaa 3067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009 (Bit Score: 141; Significance: 2e-73; HSPs: 1)
Name: scaffold0009
Description:

Target: scaffold0009; HSP #1
Raw Score: 141; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 242 - 513
Target Start/End: Complemental strand, 147383 - 147111
Alignment:
Q  242 ctccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttatttcaatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaactttaaatgttattttatcaata 341  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||   |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  147383 ctccgttcctttttaattgtcacttttagagaaattttttgttcatatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttatcaata 147284  T
Q  342 ttacccttagttatttattgtggagatagaaatatatgaaat-gagatattaaatgaataaggatattatggtaaaagtatcaattattgtatcaaaagt 440  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||| ||||| |||||||||  | ||||||||| |||||||  ||||| |||||| |   ||  ||||||||||||||    
T  147283 ttacccttagatatttattgtgaagagagaaacatatgaaataaaaatattaaattaataaggccattatagtaaaaatgaaaacaattgtatcaaaagt 147184  T
Q  441 aataacatttattgattgtcttgctttgtgtaaaatgtcataaaatgacaattaaaaaggagcggaggtagta 513  Q
    | ||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  147183 agtaacatttattaattgttttgatttgtgtaaaatgtcaaaaagtgacaattaaaaaggaacggaggtagta 147111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0343 (Bit Score: 133; Significance: 1e-68; HSPs: 1)
Name: scaffold0343
Description:

Target: scaffold0343; HSP #1
Raw Score: 133; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 249 - 513
Target Start/End: Original strand, 7417 - 7681
Alignment:
Q  249 cctttttaagtgtcacttttggagaaattttttatttcaatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaactttaaatgttattttatcaatattaccct 348  Q
    ||||||||| ||||| |||| |||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  7417 cctttttaattgtcatttttagagaaattttttgttcctatttaactgtcactttcaaagttcaatgcatcattaaatgttattttatcaatattaccct 7516  T
Q  349 tagttatttattgtggagatagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggatattatggtaaaagtatcaattattgtatcaaaagtaataacat 448  Q
    ||| ||||||||| || || ||||| ||| ||||||| || |||||| || ||||  ||||| |||||||||  ||  ||||||||||||||| ||| ||    
T  7517 tagatatttattgcggggagagaaacatacgaaatgaaatcttaaattaacaaggtcattatagtaaaagtaataacaattgtatcaaaagtagtaatat 7616  T
Q  449 ttattgattgtcttgctttgtgtaaaatgtcataaaatgacaattaaaaaggagcggaggtagta 513  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||| || ||||||||    
T  7617 ttattgattgtcttgatttgtgtaaaatatcaaaaagtgacaattaaaaaggaacgaaggtagta 7681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0172 (Bit Score: 132; Significance: 5e-68; HSPs: 1)
Name: scaffold0172
Description:

Target: scaffold0172; HSP #1
Raw Score: 132; E-Value: 5e-68
Query Start/End: Original strand, 243 - 514
Target Start/End: Complemental strand, 26381 - 26110
Alignment:
Q  243 tccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttatttcaatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaactttaaatgttattttatcaatat 342  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||   ||| |||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||    
T  26381 tccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaaaaatttgtttctatttaattgtcacttttaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaatat 26282  T
Q  343 tacccttagttatttattgtggagatagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggatattatggtaaaagtatcaattattgtatcaaaagtaa 442  Q
    |  |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||   |||||||||||||||||  |||||  |||||||||   |||||| |||||||||||    
T  26281 tgtccttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaattgaatattaaatgaataaggtcattataataaaagtatagcttattgcatcaaaagtaa 26182  T
Q  443 taacatttattgattgtcttgctttgtgtaaaatgtcataaaatgacaattaaaaaggagcggaggtagtaa 514  Q
    || || || |||||||||||| ||| |||||||||||| || |||||||||||||| || | ||||||||||    
T  26181 tatcaattgttgattgtcttggtttatgtaaaatgtcaaaatatgacaattaaaaacgaacagaggtagtaa 26110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0886 (Bit Score: 128; Significance: 1e-65; HSPs: 1)
Name: scaffold0886
Description:

Target: scaffold0886; HSP #1
Raw Score: 128; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 245 - 512
Target Start/End: Original strand, 4505 - 4770
Alignment:
Q  245 cgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttatttcaatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaactttaaatgttattttatcaatatta 344  Q
    |||||||||||||| |||  ||||| |||| |||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||| ||||| |    
T  4505 cgttcctttttaagcgtcttttttgaagaatttttttgtttttatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgatgttttattaatat-a 4603  T
Q  345 cccttagttatttattgtggagatagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggatattatggtaaaagtatcaattattgtatcaaaagtaata 444  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||  ||||| |||||| ||| | |||||| |||||||||| ||    
T  4604 cccttagttatttattgtggagagagaaatatatgaaataagatattaaataaataaggtcattatagtaaaaatataacttattgcatcaaaagtagta 4703  T
Q  445 acatttattgattgtcttgctttgtgtaaaatgtcataaaatgacaattaaaaaggagcggaggtagt 512  Q
    ||| ||||||||||||||| ||| ||||||||  || ||  |||||||||||||||| ||||||||||    
T  4704 acaattattgattgtcttggtttatgtaaaatacca-aatgtgacaattaaaaaggaacggaggtagt 4770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0274 (Bit Score: 128; Significance: 1e-65; HSPs: 1)
Name: scaffold0274
Description:

Target: scaffold0274; HSP #1
Raw Score: 128; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 235 - 514
Target Start/End: Complemental strand, 501 - 223
Alignment:
Q  235 atactcactccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttatttcaatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaactttaaatgttatttt 334  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||  |||||| | |||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||| ||||||| | ||||    
T  501 atactcgctccgttcctttttaagtgtttcttttgaacaaatattttgtttcaatttaactgtcacttttaaagttcaacgtaacattaaatggtgtttt 402  T
Q  335 atcaatattacccttagttatttattgtggagatagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggatattatggtaaaagtatcaattattgtatc 434  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||   ||| | ||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||| |||||| |||  ||| |||||||    
T  401 atcaatattatccttacttatttattgcaaagagataaatatatgaaattagatattgaatgaataaggttattatagtaaaaatatacattgttgtatc 302  T
Q  435 aaaagtaataacatttattgattgtcttgctttgtgtaaaatgtcataaaatgacaattaaaaaggagcggaggtagtaa 514  Q
    ||||||| ||||||| ||||| ||||||| ||||| |||||| ||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  301 aaaagtagtaacattcattgaatgtcttggtttgtataaaatatca-aaaatgataattaaaaaggaacggaggtagtaa 223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0040 (Bit Score: 126; Significance: 2e-64; HSPs: 1)
Name: scaffold0040
Description:

Target: scaffold0040; HSP #1
Raw Score: 126; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 236 - 513
Target Start/End: Original strand, 69080 - 69356
Alignment:
Q  236 tactcactccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttatttcaatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaactttaaatgttatttta 335  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||| || | |||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||    
T  69080 tactccctccgtttctttttaagtgtcacttttgaagaaaatttttgttcctatttaattgtcactttcaaagttcaatgcaatattaaatgttgtttta 69179  T
Q  336 tcaatattacccttagttatttattgtggagatagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggatattatggtaaaagtatcaattattgtatca 435  Q
     |||||||  |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||   ||||| ||||||||||   |||||| ||||    
T  69180 ccaatattgtccttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaataagatattaaatgaataagttcattatagtaaaagtatagcttattgcatca 69279  T
Q  436 aaagtaataacatttattgattgtcttgctttgtgtaaaatgtcataaaatgacaattaaaaaggagcggaggtagta 513  Q
    ||| || | | | || |||||||||||| |||||||||||||||| ||  |||||||| ||||||| |||||||||||    
T  69280 aaaatagt-ataattgttgattgtcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattgaaaaggaacggaggtagta 69356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0002 (Bit Score: 122; Significance: 5e-62; HSPs: 4)
Name: scaffold0002
Description:

Target: scaffold0002; HSP #1
Raw Score: 122; E-Value: 5e-62
Query Start/End: Original strand, 243 - 514
Target Start/End: Original strand, 148288 - 148561
Alignment:
Q  243 tccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaatttt-ttatttcaatttaactgtcacttt-caaagttcaatgcaactttaaatgttattttatcaat 340  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||     || |||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||    
T  148288 tccgttcctttttaagtgtcacttttgaagaaaaaaaattgtttctatttaactgtcatttttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttttaccaat 148387  T
Q  341 attacccttagttatttattgtggagatagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggatattatggtaaaagtatcaattattgtatcaaaagt 440  Q
    || | |||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||  ||||| |||||||||| | ||||| ||||||||||    
T  148388 ataatccttagttatttattgcggagagagaaatataagaaatgatatattaaatgaataaggtcattatagtaaaagtataacttattatatcaaaagt 148487  T
Q  441 aataacatttattgattgtcttgctttgtgtaaaatgtcataaaatgacaattaaaaaggagcggaggtagtaa 514  Q
    | || || || || ||||||||| ||| |||||||||||| || || |||||||||||||| ||||||||||||    
T  148488 agtatcaattttttattgtcttggtttatgtaaaatgtcaaaatataacaattaaaaaggaacggaggtagtaa 148561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0002; HSP #2
Raw Score: 95; E-Value: 6e-46
Query Start/End: Original strand, 235 - 436
Target Start/End: Complemental strand, 138993 - 138791
Alignment:
Q  235 atactcactccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttatttcaatttaactgtcacttt-caaagttcaatgcaactttaaatgttattt 333  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| || || ||   |||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||| |||    
T  138993 atactccctccgttcctttttaagtgtcacttttagagaaaattattgttcttatttaactgtcatttttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgttt 138894  T
Q  334 tatcaatattacccttagttatttattgtggagatagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggatattatggtaaaagtatcaattattgtat 433  Q
    || |||||||| |||||||||||||||   |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||   || || |||||||||| | |||||| ||    
T  138893 taccaatattatccttagttatttattacagagagagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataagctaatcatagtaaaagtataacttattgcat 138794  T
Q  434 caa 436  Q
    |||    
T  138793 caa 138791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0002; HSP #3
Raw Score: 74; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 242 - 469
Target Start/End: Original strand, 369390 - 369616
Alignment:
Q  242 ctccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaatttttta-tttcaatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaactttaaatgttattttatcaat 340  Q
    ||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||  |||| | |||| ||| |||||||||||||||| |||| ||||||||| |||| ||| |    
T  369390 ctccgttccttcttaattgtcacttttgaagaaatttttttgtttctagttaagtgtgactttcaaagttcaatacaacattaaatgttgttttgtcatt 369489  T
Q  341 attacccttagttatttattgtggagatagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggatattatggtaaaagtatcaattattgtatcaaaagt 440  Q
    ||||||||| |||||||||  || ||| ||||||||||||||||| |||||||||||  || | |||||| | ||||  || || | |||||||||||||    
T  369490 attacccttggttatttat--tgcagagagaaatatatgaaatgaaatattaaatgataaaagttattataggaaaaagataaactgttgtatcaaaagt 369587  T
Q  441 aataacatttattgattgtcttgctttgt 469  Q
    | ||| || ||||  |||||||| |||||    
T  369588 agtaaaatgtatttgttgtcttgatttgt 369616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0002; HSP #4
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 290 - 383
Target Start/End: Complemental strand, 492547 - 492454
Alignment:
Q  290 ttaactgtcactttcaaagttcaatgcaactttaaatgttattttatcaatattacccttagttatttattgtggagatagaaatatatgaaat 383  Q
    |||| |||||||||||||||| |||| ||| ||||||||| ||||  | ||| | || ||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  492547 ttaagtgtcactttcaaagtttaatgtaacattaaatgttgtttttcctataatgcctttagtaatttattgcagagatagaaatatatgaaat 492454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0007 (Bit Score: 118; Significance: 1e-59; HSPs: 1)
Name: scaffold0007
Description:

Target: scaffold0007; HSP #1
Raw Score: 118; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 288 - 513
Target Start/End: Original strand, 77120 - 77345
Alignment:
Q  288 atttaactgtcactttcaaagttcaatgcaactttaaatgttattttatcaatattacccttagttatttattgtggagatagaaatatatgaaatgaga 387  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||| |||||  ||||||| | |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  77120 atttaactgtcactttcaaagtccaatgcaatattaaatgttgttttactaatattatctttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgaga 77219  T
Q  388 tattaaatgaataaggatattatggtaaaagtatcaattattgtatcaaaagtaataacatttattgattgtcttgctttgtgtaaaatgtcataaaatg 487  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||||||||||   |||||| |||||||||| || || || |||||||||||| |||||||||||||| | ||  ||    
T  77220 tattaaatgaataaggttattatagtaaaagtatagtttattgcatcaaaagtagtatcaattgttgattgtcttgatttgtgtaaaatgttaaaatgtg 77319  T
Q  488 acaattaaaaaggagcggaggtagta 513  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||    
T  77320 acaattaagaaggaacggaggtagta 77345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1213 (Bit Score: 112; Significance: 5e-56; HSPs: 1)
Name: scaffold1213
Description:

Target: scaffold1213; HSP #1
Raw Score: 112; E-Value: 5e-56
Query Start/End: Original strand, 235 - 463
Target Start/End: Complemental strand, 233 - 1
Alignment:
Q  235 atactcactccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaatt----ttttatttcaatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaactttaaatgtta 330  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| |||||  |||||||    | || ||   |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||     
T  233 atactccctccgttcctttttaagtgtctcttttaaagaaattaatttgttgttcttatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttg 134  T
Q  331 ttttatcaatattacccttagttatttattgtggagatagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggatattatggtaaaagtatcaattattg 430  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||| |||||||||  | ||||||    
T  133 ttttaccaatattatccttagttatttattgcggagagagaaatatatgaaatgagatgttaaatgaataaggtcattatagtaaaagtacaacttattg 34  T
Q  431 tatcaaaagtaataacatttattgattgtcttg 463  Q
     |||||||||| ||| | |||||||||||||||    
T  33 catcaaaagtagtaataattattgattgtcttg 1  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0135 (Bit Score: 106; Significance: 2e-52; HSPs: 1)
Name: scaffold0135
Description:

Target: scaffold0135; HSP #1
Raw Score: 106; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 236 - 513
Target Start/End: Complemental strand, 30953 - 30676
Alignment:
Q  236 tactcactccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttatttcaatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaactttaaatgttatttta 335  Q
    ||||| |||||||| ||||||| |||||||||| ||||||   ||| || | | |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| | |||||    
T  30953 tactccctccgttcttttttaactgtcacttttagagaaaaaatttgttcctaattaactgtcactttcaaagttcaatgtaacattaaatgatgtttta 30854  T
Q  336 tcaatattacccttagttatttattgtggagatagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggatattatggtaaaagtatcaattattgtatca 435  Q
     ||||||||||||||| |||||||||  |||| ||||| ||||||| ||| ||||||||| |  ||||   |||| |||||||||  ||  |||||||||    
T  30853 ccaatattacccttagatatttattgcagagagagaaacatatgaattgaaatattaaattagcaaggtctttatagtaaaagtaaaaacaattgtatca 30754  T
Q  436 aaagtaataacatttattgattgtcttgctttgtgtaaaatgtcataaaatgacaattaaaaaggagcggaggtagta 513  Q
    |||||| ||| ||||||| ||||||||| |||||||||||| ||| ||| |||||||||||||| | |||||||||||    
T  30753 aaagtagtaagatttattaattgtcttgttttgtgtaaaatttcaaaaagtgacaattaaaaagaaacggaggtagta 30676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0325 (Bit Score: 103; Significance: 1e-50; HSPs: 1)
Name: scaffold0325
Description:

Target: scaffold0325; HSP #1
Raw Score: 103; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 235 - 501
Target Start/End: Original strand, 294 - 560
Alignment:
Q  235 atactcactccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttatttcaatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaactttaaatgttatttt 334  Q
    |||||| ||||||| |||||||| |||||||||| ||||||   ||| || | |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  294 atactccctccgtttctttttaattgtcacttttagagaaaaaatttgttactatttaattgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgtttt 393  T
Q  335 atcaatattacccttagttatttattgtggagatagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggatattatggtaaaagtatcaattattgtatc 434  Q
    | ||| |||||  |||| |||||||||  ||||  |||| ||||||||||| ||||||||| ||||||   ||||| ||||| |||  ||  ||||||||    
T  394 accaaaattacttttagatatttattgcagagagggaaacatatgaaatgaaatattaaattaataagaccattatagtaaaggtaaaaacaattgtatc 493  T
Q  435 aaaagtaataacatttattgattgtcttgctttgtgtaaaatgtcataaaatgacaattaaaaagga 501  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||  |||  ||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  494 aaaagtaataatatttattgattgtcttagtttacgtaaaatgttaaaaaatgacaattaaaaagga 560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006 (Bit Score: 89; Significance: 2e-42; HSPs: 1)
Name: scaffold0006
Description:

Target: scaffold0006; HSP #1
Raw Score: 89; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 246 - 513
Target Start/End: Complemental strand, 96312 - 96045
Alignment:
Q  246 gttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttatttcaatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaactttaaatgttattttatcaatattac 345  Q
    |||||||||||| ||||||||||| | || |||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||  |  ||||||    
T  96312 gttcctttttaattgtcacttttgcataatttttttgtttctaattaactgtcactttcaaagttcaatacaacattaaatgttgttttgcctttattac 96213  T
Q  346 ccttagttatttattgtggagatagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggatattatggtaaaagtatcaattattgtatcaaaagtaataa 445  Q
    ||||  ||||||||||| |||| |||| || |||||||||||||||||||||  |||| |||||| | ||||  || |||| ||| |||||||||| |||    
T  96212 ccttgattatttattgtagagagagaagtaaatgaaatgagatattaaatgatgaaggttattataggaaaaagatgaattgttgcatcaaaagtagtaa 96113  T
Q  446 catttattgattgtcttgctttgtgt-aaaatgtcataaaatgacaattaaaaaggagcggaggtagta 513  Q
     |  ||||  |||||||| ||||||| ||||| ||| ||| |||||||||||||||| |||||| ||||    
T  96112 aaagtatttgttgtcttggtttgtgtaaaaatctca-aaagtgacaattaaaaaggaacggagggagta 96045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003 (Bit Score: 87; Significance: 4e-41; HSPs: 1)
Name: scaffold0003
Description:

Target: scaffold0003; HSP #1
Raw Score: 87; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 236 - 513
Target Start/End: Original strand, 252574 - 252851
Alignment:
Q  236 tactcactccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttatttcaatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaactttaaatgttatttta 335  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||||||||||| | || |||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| || ||||     
T  252574 tactccctccgttcctttttaattgtcacttttgcataatttttttgtttctaattaactgtcactttcaaagttcaatacaacattaaatattgttttg 252673  T
Q  336 tcaatattacccttagttatttattgtggagatagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggatattatggtaaaagtatcaattattgtatca 435  Q
    ||  ||||||||||  ||||||||||| |||| |||| || |||||||||||||||||||||  |||| |||||| | ||||  || |||| ||| || |    
T  252674 tctttattacccttgattatttattgtagagagagaagtaaatgaaatgagatattaaatgatgaaggttattataggaaaaagatgaattgttgcataa 252773  T
Q  436 aaagtaataacatttattgattgtcttgctttgtgtaaaatg-tcataaaatgacaattaaaaaggagcggaggtagta 513  Q
    |||||| ||| |  ||||  |||||||| |||||||||||   ||| ||| |||||||||||||||| |||||| ||||    
T  252774 aaagtagtaaaaagtatttcttgtcttggtttgtgtaaaaaactca-aaagtgacaattaaaaaggaacggagggagta 252851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0036 (Bit Score: 85; Significance: 6e-40; HSPs: 1)
Name: scaffold0036
Description:

Target: scaffold0036; HSP #1
Raw Score: 85; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 250 - 513
Target Start/End: Original strand, 23130 - 23394
Alignment:
Q  250 ctttttaagtgtcacttttggagaaattttttatttcaatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaactttaaatgttattttatcaatattaccctt 349  Q
    |||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| |||| | |||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||| ||| ||||||||||    
T  23130 ctttttaattgtcatttttgaagaaaatttttgtttctaattaagtgtcactttcaaagttcaatacaacattaaatgttgttttgtcattattaccctt 23229  T
Q  350 agttatttattgtggagatagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggatattatggtaaaagtatcaattattgtatcaaaagtaataacatt 449  Q
     |||||||||||  |||| | |||||||| ||||||||||||||||||  |||| |||||| | || |  || |||| |||||||||||||| ||| ||     
T  23230 ggttatttattgccgagagaaaaatatataaaatgagatattaaatgataaaggttattataggaagaagataaattgttgtatcaaaagtagtaaaatg 23329  T
Q  450 tattgattgtcttgctttgtgtaaaatgtcataaaa-tgacaattaaaaaggagcggaggtagta 513  Q
    ||||  |||||||  |||||||||||   |  |||| |||||||||||||||| |||||| ||||    
T  23330 tatttgttgtcttagtttgtgtaaaaaaactcaaaagtgacaattaaaaaggaacggagggagta 23394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0236 (Bit Score: 84; Significance: 2e-39; HSPs: 1)
Name: scaffold0236
Description:

Target: scaffold0236; HSP #1
Raw Score: 84; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 242 - 508
Target Start/End: Complemental strand, 14505 - 14239
Alignment:
Q  242 ctccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttatttcaatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaactttaaatgttattttatcaata 341  Q
    ||||||||||||| || ||||||||||| | || ||||||||||| | ||||  |||| |||||||||||||| |||| ||||||||| |||| ||  ||    
T  14505 ctccgttccttttaaattgtcacttttgcataatttttttatttctaattaagcgtcattttcaaagttcaatacaacattaaatgttgttttgtcttta 14406  T
Q  342 ttacccttagttatttattgtggagatagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggatattatggtaaaagtatcaattattgtatcaaaagta 441  Q
    ||||||||  ||||||||||| |||| |||| || |||||||||||||||||||||  |||| |||||| | ||||  || |||||||| ||||||||||    
T  14405 ttacccttgattatttattgtagagagagaagtaaatgaaatgagatattaaatgatgaaggttattataggaaaaaaataaattattgcatcaaaagta 14306  T
Q  442 ataacatttattgattgtcttgctttgtgtaaaa-tgtcataaaatgacaattaaaaaggagcggagg 508  Q
     ||| | |||||  |||||||| ||| |||||||   ||| ||| |||||||||||||||| ||||||    
T  14305 gtaaaaattatttgttgtcttgatttctgtaaaagactca-aaagtgacaattaaaaaggaacggagg 14239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold2146 (Bit Score: 79; Significance: 2e-36; HSPs: 1)
Name: scaffold2146
Description:

Target: scaffold2146; HSP #1
Raw Score: 79; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 303 - 513
Target Start/End: Original strand, 599 - 809
Alignment:
Q  303 tcaaagttcaatgcaactttaaatgttattttatcaatattacccttagttatttattgtggagatagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataag 402  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||    ||| ||||||||||||||  | ||||||||||||| ||    
T  599 tcaaagttcaatgcaatattaaatgttgttttttcaatattacccttaattatttattacaaagagagaaatatatgaaacaatatattaaatgaatgag 698  T
Q  403 gatattatggtaaaagtatcaattattgtatcaaaagtaataacatttattgattgtcttgctttgtgtaaaatgtcataaaatgacaattaaaaaggag 502  Q
    | |||||| | |||   || ||||||||||||| ||||| | | ||||||||||||| ||| ||| |||||||||| | ||| ||| ||||||||||||     
T  699 gctattattggaaattgataaattattgtatcagaagtagttatatttattgattgtattgatttatgtaaaatgttaaaaagtgaaaattaaaaaggaa 798  T
Q  503 cggaggtagta 513  Q
    |||||||||||    
T  799 cggaggtagta 809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0471 (Bit Score: 79; Significance: 2e-36; HSPs: 1)
Name: scaffold0471
Description:

Target: scaffold0471; HSP #1
Raw Score: 79; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 341 - 513
Target Start/End: Complemental strand, 1973 - 1802
Alignment:
Q  341 attacccttagttatttattgtggagatagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggatattatggtaaaagtatcaattattgtatcaaaagt 440  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||  |||||||||| | ||      
T  1973 attacccttagttatttattacggagagagaaatatatgaaataagatattaaatgactaaggttattatagtaaaagtatagattattgtataagaaaa 1874  T
Q  441 aataacatttattgattgtcttgctttgtgtaaaatgtcataaaatgacaatt-aaaaaggagcggaggtagta 513  Q
    | ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||  ||| ||||| || |||||||| |||||||||||    
T  1873 agtaacatttattgagtgtcttggtttgtgtaaaatgtc--aaagtgacagttaaaaaaggaacggaggtagta 1802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0019 (Bit Score: 74; Significance: 2e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold0019
Description:

Target: scaffold0019; HSP #1
Raw Score: 74; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 236 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 72208 - 72067
Alignment:
Q  236 tactcactccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttatttcaatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaactttaaatgttatttta 335  Q
    ||||| |||||||  |||||||||||  |||||||||||||||||| ||   |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||    
T  72208 tactccctccgtttttttttaagtgtatcttttggagaaattttttgttcttatttaattgtcactttcaaagttcaatgcaacattaaatgttgattta 72109  T
Q  336 tcaatattacccttagttatttattgtggagatagaaatata 377  Q
     |||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  72108 ccaatattatccttagttatttattgcggagagagaaatata 72067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0014 (Bit Score: 74; Significance: 2e-33; HSPs: 2)
Name: scaffold0014
Description:

Target: scaffold0014; HSP #1
Raw Score: 74; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 236 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 195999 - 195882
Alignment:
Q  236 tactcactccgttcctttttaagtgtcacttttggagaaattttttatttcaatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaactttaaatgttatttta 335  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||   |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  195999 tactccctccgttcctttttaagtgtcatttttggagaaaatttttgttcttatttaactgtcacttttaaagttcaatgcaacattaaatgttgtttta 195900  T
Q  336 tcaatattacccttagtt 353  Q
    ||||||||| ||||||||    
T  195899 tcaatattatccttagtt 195882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0014; HSP #2
Raw Score: 57; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 346 - 498
Target Start/End: Complemental strand, 195737 - 195586
Alignment:
Q  346 ccttagttatttattgtggagatagaaatatatgaaatgagatattaaatgaataaggatattatggtaaaagtatcaattattgtatcaaaagtaataa 445  Q
    |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||||||||||    |||| ||||||||||   |||||||||||||  || ||     
T  195737 ccttagttatttattgtggagagaaaaatatatgaaatg-gatattaaatgaataagatcgttatagtaaaagtatagtttattgtatcaaacatagtat 195639  T
Q  446 catttattgattgtcttgctttgtgtaaaatgtcataaaatgacaattaaaaa 498  Q
    || || | |||| ||||| |||||||||||||||| ||  |||||||||||||    
T  195638 caattgtcgattatcttggtttgtgtaaaatgtcaaaatgtgacaattaaaaa 195586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1254 (Bit Score: 59; Significance: 2e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold1254
Description:

Target: scaffold1254; HSP #1
Raw Score: 59; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 278 - 392
Target Start/End: Original strand, 1055 - 1169
Alignment:
Q  278 ttttatttcaatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaactttaaatgttattttatcaatattacccttagttatttattgtggagatagaaatata 377  Q
    |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| |||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||   || | | |||||||    
T  1055 ttttgtttcaatttaactgtcattttcaaagttcaatacaacattaaatattattttaccaatattaaccttagttatttattacagaaagataaatata 1154  T
Q  378 tgaaatgagatatta 392  Q
    |||||||| ||||||    
T  1155 tgaaatgaaatatta 1169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0419 (Bit Score: 59; Significance: 2e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0419
Description:

Target: scaffold0419; HSP #1
Raw Score: 59; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 278 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 6574 - 6460
Alignment:
Q  278 ttttatttcaatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaactttaaatgttattttatcaatattacccttagttatttattgtggagatagaaatata 377  Q
    |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| |||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||   || | | |||||||    
T  6574 ttttgtttcaatttaactgtcattttcaaagttcaatacaacattaaatattattttaccaatattaaccttagttatttattacagaaagataaatata 6475  T
Q  378 tgaaatgagatatta 392  Q
    |||||||| ||||||    
T  6474 tgaaatgaaatatta 6460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0250 (Bit Score: 46; Significance: 1e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0250
Description:

Target: scaffold0250; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 160 - 237
Target Start/End: Original strand, 21735 - 21812
Alignment:
Q  160 cttattgtcaactagtctccgagttctatttaaaataccagattgtattgaaaatactttgatcaatgaaatattata 237  Q
    |||||||||||||||||||   |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||    
T  21735 cttattgtcaactagtctcgaggttctatttaaaatcctagattgtattgaaaatactttcattaatgaaatgttata 21812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0102 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0102
Description:

Target: scaffold0102; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 280 - 447
Target Start/End: Original strand, 20996 - 21163
Alignment:
Q  280 ttatttcaatttaactgtcactttcaaagttcaatgcaactttaaatgttattttatcaatattacccttagttatttattgtggagatagaaatatatg 379  Q
    ||||||| ||||| | |||  ||||||||||||||||||| |||||| || |||||  |||| ||  |||||| ||||||  | || | |||||||||      
T  20996 ttatttctatttagccgtcgttttcaaagttcaatgcaacattaaattttgttttactaatactattcttagtcatttatcctagatagagaaatataaa 21095  T
Q  380 aaatgagatattaaatgaataaggatattatggtaaaagtatcaattattgtatcaaaagtaataaca 447  Q
     || ||||||| |||||||||| | |||||| | ||||  || ||||||| |||||||||||||||||    
T  21096 taacgagatatcaaatgaataaaggtattataggaaaaagataaattattatatcaaaagtaataaca 21163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University