View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF9495_low_2 (Length: 450)

Name: NF9495_low_2
Description: NF9495
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF9495_low_2
NF9495_low_2
[»] chr1 (55 HSPs)
chr1 (80-436)||(1547401-1547770)
chr1 (184-429)||(27532776-27533027)
chr1 (184-429)||(7078857-7079110)
chr1 (185-429)||(27227280-27227532)
chr1 (184-429)||(47279318-47279571)
chr1 (184-429)||(38823343-38823596)
chr1 (185-429)||(16415775-16416027)
chr1 (185-427)||(4330412-4330662)
chr1 (184-429)||(2959877-2960130)
chr1 (184-427)||(238307-238558)
chr1 (184-429)||(8222257-8222510)
chr1 (184-429)||(51128988-51129239)
chr1 (184-429)||(15383062-15383316)
chr1 (185-429)||(10181802-10182055)
chr1 (184-429)||(15168225-15168478)
chr1 (184-429)||(32216184-32216437)
chr1 (184-429)||(34012176-34012424)
chr1 (184-429)||(23999476-23999730)
chr1 (184-429)||(25160761-25161015)
chr1 (184-429)||(39393512-39393766)
chr1 (184-429)||(3535061-3535305)
chr1 (185-429)||(19899563-19899816)
chr1 (185-429)||(27266995-27267246)
chr1 (184-428)||(32267164-32267416)
chr1 (184-427)||(37451416-37451667)
chr1 (187-429)||(47682291-47682541)
chr1 (184-429)||(9902848-9903101)
chr1 (185-429)||(27563700-27563952)
chr1 (184-429)||(10922856-10923109)
chr1 (184-429)||(11742162-11742398)
chr1 (184-429)||(30254552-30254805)
chr1 (190-429)||(30326751-30326999)
chr1 (184-429)||(46931540-46931792)
chr1 (184-429)||(28564577-28564828)
chr1 (184-429)||(28769781-28770035)
chr1 (184-429)||(15752158-15752411)
chr1 (184-429)||(3309276-3309536)
chr1 (184-429)||(22170840-22171093)
chr1 (184-429)||(42721168-42721418)
chr1 (184-429)||(14758170-14758414)
chr1 (184-427)||(27763104-27763356)
chr1 (184-366)||(48353735-48353924)
chr1 (204-429)||(18422780-18423006)
chr1 (184-429)||(31621342-31621600)
chr1 (194-429)||(40884942-40885185)
chr1 (185-429)||(41926292-41926537)
chr1 (185-319)||(21289847-21289981)
chr1 (199-321)||(1359744-1359866)
chr1 (184-429)||(33725405-33725647)
chr1 (184-321)||(31962861-31962999)
chr1 (218-429)||(37618729-37618939)
chr1 (348-429)||(48620766-48620847)
chr1 (253-429)||(38759662-38759846)
chr1 (184-239)||(48620916-48620971)
chr1 (18-52)||(1547798-1547832)
[»] chr5 (58 HSPs)
chr5 (184-429)||(39572952-39573197)
chr5 (184-429)||(38528026-38528279)
chr5 (184-429)||(19119992-19120245)
chr5 (184-429)||(22980926-22981179)
chr5 (184-429)||(31786435-31786688)
chr5 (184-429)||(40133518-40133771)
chr5 (184-429)||(8741674-8741928)
chr5 (184-429)||(35934028-35934282)
chr5 (184-429)||(36866895-36867148)
chr5 (184-429)||(15992329-15992582)
chr5 (184-429)||(27330437-27330690)
chr5 (185-436)||(5830019-5830278)
chr5 (185-429)||(12910488-12910740)
chr5 (184-429)||(25500715-25500968)
chr5 (184-429)||(5837688-5837941)
chr5 (184-429)||(22973871-22974124)
chr5 (184-429)||(35511271-35511519)
chr5 (185-429)||(699283-699535)
chr5 (184-429)||(30969113-30969366)
chr5 (184-426)||(33908369-33908618)
chr5 (184-429)||(42342864-42343107)
chr5 (184-429)||(7208653-7208906)
chr5 (184-429)||(22019765-22020009)
chr5 (184-429)||(31705401-31705654)
chr5 (184-429)||(35504498-35504751)
chr5 (184-429)||(23116019-23116264)
chr5 (184-429)||(36860556-36860810)
chr5 (184-429)||(7693363-7693607)
chr5 (184-429)||(22255315-22255568)
chr5 (184-429)||(32563282-32563526)
chr5 (184-415)||(25669733-25669962)
chr5 (184-429)||(27318277-27318529)
chr5 (184-429)||(28416340-28416569)
chr5 (184-411)||(2888234-2888469)
chr5 (184-429)||(17157820-17158073)
chr5 (184-424)||(35826275-35826521)
chr5 (184-429)||(9200366-9200610)
chr5 (184-429)||(15724621-15724874)
chr5 (184-428)||(8437099-8437351)
chr5 (184-321)||(24886336-24886473)
chr5 (220-429)||(13956187-13956404)
chr5 (184-429)||(21088558-21088808)
chr5 (184-321)||(14409130-14409267)
chr5 (184-429)||(43308449-43308694)
chr5 (185-321)||(25889619-25889755)
chr5 (184-429)||(23954591-23954831)
chr5 (243-427)||(6824329-6824519)
chr5 (184-308)||(8466988-8467112)
chr5 (184-305)||(26269074-26269195)
chr5 (219-321)||(1428983-1429088)
chr5 (185-271)||(43254154-43254240)
chr5 (184-429)||(14919328-14919570)
chr5 (329-429)||(26268207-26268307)
chr5 (368-429)||(1429126-1429187)
chr5 (370-429)||(14409310-14409369)
chr5 (320-422)||(5112247-5112348)
chr5 (377-429)||(8466877-8466929)
chr5 (384-429)||(24886237-24886282)
[»] chr7 (57 HSPs)
chr7 (184-429)||(22687347-22687592)
chr7 (184-418)||(26587892-26588126)
chr7 (184-429)||(15612559-15612812)
chr7 (184-429)||(6546627-6546880)
chr7 (184-429)||(9355626-9355879)
chr7 (184-429)||(18797435-18797688)
chr7 (184-427)||(8861395-8861646)
chr7 (185-429)||(37109980-37110234)
chr7 (184-429)||(25691344-25691597)
chr7 (185-429)||(17842385-17842639)
chr7 (184-429)||(21991744-21991988)
chr7 (186-429)||(30055635-30055886)
chr7 (184-429)||(4583027-4583280)
chr7 (184-429)||(32432560-32432813)
chr7 (184-436)||(37703298-37703558)
chr7 (184-429)||(15672559-15672815)
chr7 (184-429)||(31578864-31579117)
chr7 (184-429)||(5657280-5657534)
chr7 (184-429)||(10359014-10359268)
chr7 (190-427)||(27283854-27284100)
chr7 (184-429)||(32820853-32821106)
chr7 (184-429)||(41764878-41765131)
chr7 (184-429)||(23111298-23111553)
chr7 (184-436)||(46480929-46481189)
chr7 (184-429)||(44598774-44599027)
chr7 (184-429)||(24211849-24212103)
chr7 (202-429)||(11071314-11071546)
chr7 (184-429)||(7334902-7335154)
chr7 (184-429)||(10481713-10481966)
chr7 (214-429)||(12165860-12166074)
chr7 (184-389)||(35353256-35353469)
chr7 (239-429)||(33688117-33688315)
chr7 (184-422)||(37347137-37347382)
chr7 (184-429)||(48928097-48928350)
chr7 (184-427)||(43925211-43925456)
chr7 (184-429)||(29173648-29173883)
chr7 (184-429)||(26980431-26980667)
chr7 (255-429)||(43686148-43686330)
chr7 (184-321)||(31520541-31520678)
chr7 (185-321)||(12390450-12390586)
chr7 (189-321)||(44411345-44411477)
chr7 (202-321)||(37704406-37704525)
chr7 (184-321)||(32593007-32593143)
chr7 (184-321)||(34361976-34362115)
chr7 (274-429)||(38258653-38258816)
chr7 (318-427)||(27421322-27421431)
chr7 (318-427)||(37704267-37704376)
chr7 (184-257)||(38258867-38258940)
chr7 (350-429)||(44413353-44413432)
chr7 (329-429)||(48928517-48928617)
chr7 (368-429)||(12390622-12390683)
chr7 (368-422)||(31520716-31520770)
chr7 (368-429)||(38053586-38053647)
chr7 (238-302)||(27421219-27421283)
chr7 (255-321)||(38053685-38053751)
chr7 (368-429)||(32593181-32593242)
chr7 (184-219)||(12166215-12166250)
[»] chr8 (49 HSPs)
chr8 (184-429)||(38644110-38644363)
chr8 (184-429)||(5299751-5300004)
chr8 (184-429)||(11727156-11727409)
chr8 (184-429)||(16446680-16446933)
chr8 (184-380)||(24823199-24823395)
chr8 (184-423)||(37970324-37970571)
chr8 (184-429)||(1149437-1149690)
chr8 (184-429)||(27082643-27082896)
chr8 (184-429)||(34895099-34895347)
chr8 (184-429)||(36694771-36695024)
chr8 (184-429)||(43643400-43643653)
chr8 (184-429)||(1205059-1205312)
chr8 (185-429)||(4132492-4132743)
chr8 (186-429)||(6098320-6098576)
chr8 (184-420)||(40862560-40862805)
chr8 (184-427)||(44869631-44869882)
chr8 (187-429)||(465974-466214)
chr8 (184-429)||(12876241-12876495)
chr8 (184-429)||(7890762-7891015)
chr8 (184-429)||(16222995-16223248)
chr8 (184-429)||(39098924-39099177)
chr8 (184-427)||(8803621-8803873)
chr8 (184-429)||(1953793-1954047)
chr8 (184-429)||(33906344-33906595)
chr8 (208-429)||(9864280-9864509)
chr8 (184-429)||(23854236-23854489)
chr8 (184-429)||(35459516-35459769)
chr8 (184-321)||(34951862-34951999)
chr8 (184-429)||(30654388-30654641)
chr8 (184-429)||(31933691-31933944)
chr8 (184-321)||(12587830-12587967)
chr8 (184-415)||(18259229-18259464)
chr8 (184-321)||(35859182-35859319)
chr8 (255-429)||(13307755-13307936)
chr8 (184-429)||(10555010-10555260)
chr8 (184-314)||(33198057-33198187)
chr8 (318-429)||(41910935-41911046)
chr8 (215-321)||(1149756-1149862)
chr8 (320-429)||(43025834-43025943)
chr8 (184-268)||(41362723-41362807)
chr8 (184-269)||(43025974-43026059)
chr8 (356-429)||(1150090-1150163)
chr8 (368-428)||(7998427-7998488)
chr8 (368-429)||(34952028-34952089)
chr8 (248-321)||(34463722-34463792)
chr8 (369-429)||(41362647-41362707)
chr8 (184-217)||(13307931-13307964)
chr8 (336-380)||(12585297-12585341)
chr8 (184-216)||(41910863-41910895)
[»] chr4 (55 HSPs)
chr4 (184-429)||(33341531-33341784)
chr4 (184-436)||(47253866-47254126)
chr4 (184-436)||(7703635-7703895)
chr4 (184-430)||(30002466-30002711)
chr4 (187-429)||(34947923-34948175)
chr4 (184-429)||(28002811-28003064)
chr4 (184-429)||(37775800-37776044)
chr4 (184-429)||(55477716-55477969)
chr4 (184-416)||(55240930-55241170)
chr4 (186-429)||(37663568-37663819)
chr4 (184-429)||(1815434-1815687)
chr4 (184-429)||(17167846-17168099)
chr4 (184-429)||(17272097-17272350)
chr4 (184-429)||(29584025-29584278)
chr4 (186-429)||(19089280-19089531)
chr4 (184-429)||(50764863-50765106)
chr4 (184-429)||(17173423-17173676)
chr4 (184-429)||(23761205-23761457)
chr4 (184-429)||(25184246-25184499)
chr4 (184-429)||(3042752-3043005)
chr4 (184-429)||(27396749-27397000)
chr4 (184-429)||(46887983-46888235)
chr4 (184-427)||(32912404-32912656)
chr4 (184-429)||(35020856-35021113)
chr4 (184-429)||(50697374-50697628)
chr4 (184-429)||(879373-879626)
chr4 (184-429)||(19440473-19440726)
chr4 (184-430)||(37287858-37288115)
chr4 (184-421)||(34361316-34361562)
chr4 (184-429)||(32579579-32579832)
chr4 (184-429)||(32592226-32592470)
chr4 (184-427)||(6864170-6864421)
chr4 (184-429)||(4598125-4598368)
chr4 (184-429)||(49376100-49376353)
chr4 (184-422)||(36493514-36493759)
chr4 (184-427)||(33816341-33816609)
chr4 (184-429)||(25700881-25701135)
chr4 (185-429)||(9139378-9139612)
chr4 (184-321)||(7152029-7152166)
chr4 (184-321)||(39400257-39400394)
chr4 (184-429)||(5047791-5048043)
chr4 (184-308)||(35025392-35025515)
chr4 (184-429)||(42199862-42200116)
chr4 (184-321)||(4205233-4205370)
chr4 (184-299)||(23431826-23431941)
chr4 (184-420)||(46883939-46884177)
chr4 (187-429)||(4934040-4934280)
chr4 (184-310)||(26896346-26896474)
chr4 (255-429)||(38011987-38012169)
chr4 (184-264)||(38012568-38012648)
chr4 (331-429)||(54499217-54499316)
chr4 (356-422)||(39398049-39398115)
chr4 (329-430)||(35025574-35025675)
chr4 (266-321)||(56050179-56050234)
chr4 (103-137)||(7982770-7982804)
[»] scaffold0318 (1 HSPs)
scaffold0318 (184-429)||(12042-12294)
[»] chr6 (19 HSPs)
chr6 (184-429)||(3879737-3879990)
chr6 (184-429)||(6090980-6091234)
chr6 (190-429)||(4318626-4318874)
chr6 (184-429)||(33892810-33893054)
chr6 (184-429)||(20768217-20768468)
chr6 (184-421)||(1945975-1946221)
chr6 (184-429)||(21016916-21017163)
chr6 (184-429)||(29182296-29182547)
chr6 (184-429)||(7234830-7235086)
chr6 (184-429)||(5627524-5627778)
chr6 (184-429)||(8513366-8513607)
chr6 (184-320)||(33619080-33619219)
chr6 (184-429)||(6089041-6089282)
chr6 (318-429)||(15491748-15491859)
chr6 (184-309)||(7054570-7054696)
chr6 (284-429)||(30353256-30353409)
chr6 (329-429)||(7055166-7055266)
chr6 (189-244)||(33724062-33724117)
chr6 (386-429)||(33618967-33619010)
[»] chr3 (62 HSPs)
chr3 (184-427)||(44891623-44891874)
chr3 (184-429)||(22622517-22622770)
chr3 (184-429)||(33698277-33698530)
chr3 (185-429)||(52040722-52040974)
chr3 (184-429)||(4015584-4015836)
chr3 (184-429)||(7327281-7327534)
chr3 (184-429)||(39282776-39283029)
chr3 (184-429)||(32373594-32373846)
chr3 (184-429)||(46297561-46297814)
chr3 (186-429)||(42505876-42506127)
chr3 (184-429)||(26941059-26941312)
chr3 (184-429)||(24707914-24708169)
chr3 (185-429)||(53228952-53229204)
chr3 (184-429)||(2008057-2008316)
chr3 (184-429)||(33378584-33378837)
chr3 (184-424)||(37157836-37158085)
chr3 (184-427)||(1089819-1090070)
chr3 (208-429)||(34133059-34133288)
chr3 (184-429)||(37203191-37203445)
chr3 (184-429)||(14586479-14586722)
chr3 (184-429)||(48355065-48355318)
chr3 (184-424)||(25579868-25580116)
chr3 (185-421)||(3362385-3362631)
chr3 (184-429)||(21193730-21193984)
chr3 (184-429)||(22451092-22451345)
chr3 (184-429)||(36012261-36012517)
chr3 (184-429)||(40552058-40552311)
chr3 (184-429)||(29099479-29099723)
chr3 (184-429)||(29163942-29164179)
chr3 (184-429)||(3654998-3655254)
chr3 (184-429)||(24488761-24489014)
chr3 (184-429)||(44186316-44186553)
chr3 (184-421)||(47481654-47481900)
chr3 (184-429)||(21009600-21009854)
chr3 (214-423)||(46994490-46994707)
chr3 (185-321)||(11357181-11357317)
chr3 (184-429)||(11466948-11467187)
chr3 (185-429)||(22445865-22446116)
chr3 (184-429)||(4761447-4761701)
chr3 (184-421)||(54505939-54506185)
chr3 (255-429)||(43348381-43348563)
chr3 (208-429)||(38591822-38592051)
chr3 (184-429)||(43975691-43975940)
chr3 (230-429)||(54828546-54828753)
chr3 (184-321)||(40936213-40936350)
chr3 (246-429)||(45174629-45174821)
chr3 (246-427)||(11835494-11835678)
chr3 (184-319)||(50475053-50475195)
chr3 (184-321)||(51212576-51212707)
chr3 (184-367)||(11356957-11357140)
chr3 (191-321)||(27480164-27480298)
chr3 (184-396)||(20373062-20373263)
chr3 (329-429)||(35844450-35844550)
chr3 (351-429)||(51212955-51213033)
chr3 (329-429)||(53176178-53176278)
chr3 (368-429)||(11357355-11357416)
chr3 (366-429)||(27480368-27480431)
chr3 (248-321)||(53811597-53811670)
chr3 (381-429)||(20373300-20373348)
chr3 (184-231)||(35844577-35844624)
chr3 (390-429)||(40936115-40936154)
chr3 (184-219)||(43348556-43348591)
[»] chr2 (47 HSPs)
chr2 (184-426)||(33709049-33709299)
chr2 (184-429)||(4167055-4167308)
chr2 (184-429)||(41960973-41961226)
chr2 (184-429)||(18494098-18494350)
chr2 (184-436)||(2325195-2325455)
chr2 (184-429)||(44913796-44914053)
chr2 (184-429)||(4763764-4764017)
chr2 (184-429)||(31570551-31570804)
chr2 (184-429)||(43648062-43648315)
chr2 (184-429)||(19424459-19424698)
chr2 (184-429)||(26357710-26357963)
chr2 (184-429)||(3177072-3177325)
chr2 (184-429)||(5881672-5881915)
chr2 (184-429)||(33660194-33660438)
chr2 (184-429)||(11366197-11366451)
chr2 (184-429)||(41465634-41465887)
chr2 (185-429)||(29241963-29242208)
chr2 (184-429)||(39167186-39167433)
chr2 (184-429)||(19289140-19289393)
chr2 (184-429)||(35959030-35959278)
chr2 (208-429)||(27349789-27350009)
chr2 (184-429)||(37905841-37906097)
chr2 (184-429)||(43770665-43770909)
chr2 (217-429)||(4263926-4264147)
chr2 (184-429)||(31861985-31862238)
chr2 (184-429)||(33550800-33551056)
chr2 (184-424)||(7006755-7006986)
chr2 (218-429)||(4478502-4478717)
chr2 (234-429)||(44286082-44286285)
chr2 (184-429)||(13711597-13711845)
chr2 (231-429)||(19313984-19314186)
chr2 (191-321)||(19500739-19500869)
chr2 (265-429)||(45327853-45328025)
chr2 (265-429)||(36642119-36642293)
chr2 (184-305)||(41051117-41051238)
chr2 (276-429)||(17071646-17071807)
chr2 (329-429)||(17054066-17054166)
chr2 (184-289)||(41463407-41463512)
chr2 (329-421)||(18258257-18258349)
chr2 (184-282)||(18257355-18257453)
chr2 (184-267)||(33902317-33902400)
chr2 (329-429)||(33902199-33902299)
chr2 (296-429)||(41463779-41463920)
chr2 (184-232)||(45328028-45328076)
chr2 (199-241)||(17053963-17054005)
chr2 (199-241)||(17071604-17071646)
chr2 (184-214)||(4263726-4263756)
[»] scaffold0002 (4 HSPs)
scaffold0002 (184-429)||(408228-408481)
scaffold0002 (184-429)||(267-514)
scaffold0002 (184-321)||(93900-94036)
scaffold0002 (324-429)||(94330-94435)
[»] scaffold0291 (1 HSPs)
scaffold0291 (186-429)||(8020-8271)
[»] scaffold0061 (1 HSPs)
scaffold0061 (184-429)||(44090-44342)
[»] scaffold0017 (1 HSPs)
scaffold0017 (184-429)||(154445-154697)
[»] scaffold0022 (1 HSPs)
scaffold0022 (184-429)||(145814-146068)
[»] scaffold0008 (1 HSPs)
scaffold0008 (184-429)||(267417-267662)
[»] scaffold0009 (2 HSPs)
scaffold0009 (225-292)||(100993-101058)
scaffold0009 (377-418)||(100894-100935)


Alignment Details
Target: chr1 (Bit Score: 228; Significance: 1e-125; HSPs: 55)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 228; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 80 - 436
Target Start/End: Complemental strand, 1547770 - 1547401
Alignment:
Q  80 aacacttaagttgaagtggctgataattgagtgattttaattgattgataatgtaaagnnnnnnnacaattctaactagggagcttctacggtgcagnnn 179  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||       |||||||||| ||||||| ||||||||| ||        
T  1547770 aacacttaagttgaagtggctaataattgagtgattttaattgattgatagtgtaaagttgttttacaattctaattagggagtttctacggtacaatta 1547671  T
Q  180 nnnna-------------aaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagta 266  Q
        |             |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  1547670 tgaaactgacttttttgaaaaaattaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatggtaattcatctagta 1547571  T
Q  267 atgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttatcgttgacatctttaacagaattgttgatatcatgtgatagttttgagtgttacactttgtgg 366  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1547570 atgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttatcgttggtatctttaacagagttgttgatatcatgtgatagttttgagtgttacactttgtgg 1547471  T
Q  367 ggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgatcctatg 436  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  1547470 ggtgttacacttaaaacaaagtaggataaaattagattaagtgtatttttgttaatctgatgatactatg 1547401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 184 - 429
Target Start/End: Original strand, 27532776 - 27533027
Alignment:
Q  184 aaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttg 283  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27532776 aaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaa-ttgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttg 27532874  T
Q  284 gacttacatgtactattttatcgttgacatcttt--------aacagaattgttgatatcatgtgatagttttgagtgttacactttgtggggtgttaca 375  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||        |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  27532875 gacttacatgtactattttatcgttggcatctttaacttgcaaacagaattgctgatatcatgtgatagtcttgagtgttacactttgtgaggtgttaca 27532974  T
Q  376 cttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatga 429  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  27532975 cttaaaacaaggtaggataaaatt-gattaagtgtattcttgttaatctgatga 27533027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 173; E-Value: 7e-93
Query Start/End: Original strand, 184 - 429
Target Start/End: Original strand, 7078857 - 7079110
Alignment:
Q  184 aaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttg 283  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||     
T  7078857 aaaaagttaattttaatcttaatgattgattcatttttaaattgttgattattgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgtttgcaatatctta 7078956  T
Q  284 gacttacatgtactattttatcgttgacatcttt--------aacagaattgttgatatcatgtgatagttttgagtgttacactttgtggggtgttaca 375  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| |||||||        |||||| ||||||||||||||||||||| || ||| ||| ||||||||||||||||||    
T  7078957 gacttacatatactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacagagttgttgatatcatgtgatagtcttaagtcttatactttgtggggtgttaca 7079056  T
Q  376 cttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatga 429  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  7079057 cttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatttgatga 7079110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 172; E-Value: 3e-92
Query Start/End: Original strand, 185 - 429
Target Start/End: Original strand, 27227280 - 27227532
Alignment:
Q  185 aaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttgg 284  Q
    ||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27227280 aaaagttaattttgatattaatgtttaattcatttttaaatggttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttgg 27227379  T
Q  285 acttacatgtactattttatcgttgacatcttt--------aacagaattgttgatatcatgtgatagttttgagtgttacactttgtggggtgttacac 376  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||||||||        |||| | ||| ||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||    
T  27227380 acttacagatactattttatcgttgacatctttaacatgcaaacatagttgatgatatcatgtgatagtcttaagtgttgcactttgtggggtgttacac 27227479  T
Q  377 ttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatga 429  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  27227480 ttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtaatcttgttaatctgatga 27227532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 169; E-Value: 2e-90
Query Start/End: Original strand, 184 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 47279571 - 47279318
Alignment:
Q  184 aaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttg 283  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  47279571 aaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactaattaatgatcaatagtaattcatctaataatgtttgcaacatcttg 47279472  T
Q  284 gacttacatgtactattttatcgttgacatcttt--------aacagaattgttgatatcatgtgatagttttgagtgttacactttgtggggtgttaca 375  Q
    ||||||||  ||||||||||| |||| |||||||        |||| | ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||| |||||||    
T  47279471 gacttacagatactattttattgttggcatctttaacatgcaaacatagttgttgatatcatgtgatagtcttaagtgttacactttatgggatgttaca 47279372  T
Q  376 cttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatga 429  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47279371 attaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatga 47279318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 165; E-Value: 4e-88
Query Start/End: Original strand, 184 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 38823596 - 38823343
Alignment:
Q  184 aaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttg 283  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||     
T  38823596 aaaaagttaattttaatcttaatatttgtttcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatttta 38823497  T
Q  284 gacttacatgtactattttatcgttgacatcttt--------aacagaattgttgatatcatgtgatagttttgagtgttacactttgtggggtgttaca 375  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||| ||||| |        |||||| ||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||||||    
T  38823496 gacttacaggtattattttatcgttggcatctctaacatgcaaacagagttgctgatatcatgtgatagtcttaagtgttacactttgttgggtgttaca 38823397  T
Q  376 cttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatga 429  Q
    ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38823396 cttaaaataaagtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatga 38823343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 164; E-Value: 2e-87
Query Start/End: Original strand, 185 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 16416027 - 16415775
Alignment:
Q  185 aaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttgg 284  Q
    |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  16416027 aaaaattaattttgatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctaataatgcttgcaacatcttgg 16415928  T
Q  285 acttacatgtactattttatcgttgacatcttt--------aacagaattgttgatatcatgtgatagttttgagtgttacactttgtggggtgttacac 376  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||        |||||| ||| |||||| |||||||||| || ||| ||||| | |||||||| ||||||    
T  16415927 acttacatgtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtgatagtcttaagtattacaatatgtggggtattacac 16415828  T
Q  377 ttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatga 429  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  16415827 ttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctaatga 16415775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 162; E-Value: 3e-86
Query Start/End: Original strand, 185 - 427
Target Start/End: Complemental strand, 4330662 - 4330412
Alignment:
Q  185 aaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttgg 284  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  4330662 aaaaattaattttgatcttaatgtttgattcatttttatattgttgattactgattaatgatcaattgtaattcatctagtaatgcttgcaacatattgg 4330563  T
Q  285 acttacatgtactattttatcgttgacatctttaac--------agaattgttgatatcatgtgatagttttgagtgttacactttgtggggtgttacac 376  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||        ||| ||| |||||| |||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||    
T  4330562 acttacaagtactattttatctttgacatctttaacatgcaaaaagagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacattttgtggggtgttacac 4330463  T
Q  377 ttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgat 427  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  4330462 ttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgat 4330412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 161; E-Value: 1e-85
Query Start/End: Original strand, 184 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 2960130 - 2959877
Alignment:
Q  184 aaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttg 283  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2960130 aaaaagttaattttgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttg 2960031  T
Q  284 gacttacatgtactattttatcgttgacatcttt--------aacagaattgttgatatcatgtgatagttttgagtgttacactttgtggggtgttaca 375  Q
    ||||||||  |||||||||||||||| |||||||        |||| | ||| |||||| |||||||||| || ||||||||| |||||||| |||||||    
T  2960030 gacttacagatactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacatatttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacaatttgtgggatgttaca 2959931  T
Q  376 cttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatga 429  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  2959930 cttgaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtggtcttgttaatctgatga 2959877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 159; E-Value: 2e-84
Query Start/End: Original strand, 184 - 427
Target Start/End: Original strand, 238307 - 238558
Alignment:
Q  184 aaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttg 283  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  238307 aaaaagttgattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgtggattactgattcatgattaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttg 238406  T
Q  284 gacttacatgtactattttatcgttgacatcttt--------aacagaattgttgatatcatgtgatagttttgagtgttacactttgtggggtgttaca 375  Q
    ||||||||  || ||||||||||||| |||||||        |||| | ||| |||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||    
T  238407 gacttacagatattattttatcgttggcatctttaacatacaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttaca 238506  T
Q  376 cttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgat 427  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  238507 cttaaaacaaggtagaataaaattagattaagtgtattcttgttagtctgat 238558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 158; E-Value: 7e-84
Query Start/End: Original strand, 184 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 8222510 - 8222257
Alignment:
Q  184 aaaaagttaattttaatcttaatgtttgatt-catttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatctt 282  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8222510 aaaaagttaattttgattttaatgtttgatttcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaata-taattcatctagtaatgcttgcaacatctt 8222412  T
Q  283 ggacttacatgtactattttatcgttgacatcttt--------aacagaattgttgatatcatgtgatagttttgagtgttacactttgtggggtgttac 374  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  ||||||        |||||| ||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  8222411 ggacttacatgtactattttatcgttggaatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtgatagttttaagtgttacactttgtggggtgttac 8222312  T
Q  375 acttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatga 429  Q
     |||| |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  8222311 gcttataacaaggtaggataaaatgagattaagtgtagtcttgttaatatgatga 8222257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 158; E-Value: 7e-84
Query Start/End: Original strand, 184 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 51129239 - 51128988
Alignment:
Q  184 aaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttg 283  Q
    |||||||||||||  || |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51129239 aaaaagttaattt--attttaatacttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttg 51129142  T
Q  284 gacttacatgtactattttatcgttgacatcttt--------aacagaattgttgatatcatgtgatagttttgagtgttacactttgtggggtgttaca 375  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||        |||||| ||| |||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  51129141 gacttacatgtactattttatcgttgaaatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtgatagttttaattgttacactttgtggggtgttaca 51129042  T
Q  376 cttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatga 429  Q
    |||| ||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||    
T  51129041 cttataacaaggtatgataaaattatattaagtgtagtcttgttaatatgatga 51128988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 154; E-Value: 2e-81
Query Start/End: Original strand, 184 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 15383316 - 15383062
Alignment:
Q  184 aaaaagttaattttaatcttaatgtttgatt-catttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatctt 282  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15383316 aaaaagttaattttgattttaatgtttgatttcatttttaaattgttgattgctgattaataatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatctt 15383217  T
Q  283 ggacttacatgtactattttatcgttgacatcttta--------acagaattgttgatatcatgtgatagttttgagtgttacactttgtggggtgttac 374  Q
    ||| ||||| |||||||||||||||||  |||||||        ||| | ||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  15383216 ggatttacaggtactattttatcgttggaatctttaacatgcatacatagttgatgatattatgtgatagttttaagtgttacactttgtggggtgttac 15383117  T
Q  375 acttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatga 429  Q
     |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  15383116 gcttataacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatga 15383062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 153; E-Value: 6e-81
Query Start/End: Original strand, 185 - 429
Target Start/End: Original strand, 10181802 - 10182055
Alignment:
Q  185 aaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttgg 284  Q
    ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  10181802 aaaagttaattatgatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattgttgattaatgttcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacattttgg 10181901  T
Q  285 acttac-atgtactattttatcgttgacatctttaa--------cagaattgttgatatcatgtgatagttttgagtgttacactttgtggggtgttaca 375  Q
    |||||| | |||||||| ||| |||| |||||||||        |||| ||| |||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||    
T  10181902 acttacaaggtactattgtattgttgtcatctttaacatacaaccagagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttaca 10182001  T
Q  376 cttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatga 429  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  10182002 cttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtaatcttgttaatctgatga 10182055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 153; E-Value: 6e-81
Query Start/End: Original strand, 184 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 15168478 - 15168225
Alignment:
Q  184 aaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttg 283  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  15168478 aaaaagttaattttgatcttaatgttcgattcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatagtaattcatctaataatgcttgcaacatcttg 15168379  T
Q  284 gacttacatgtactattttatcgttgacatcttt--------aacagaattgttgatatcatgtgatagttttgagtgttacactttgtggggtgttaca 375  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||        |||| | ||| |||||| ||| |||||  || ||||||||||||| || |||||||||    
T  15168378 tacttacatgtactattttatcgttgacatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgcgatagccttaagtgttacactttctgaggtgttaca 15168279  T
Q  376 cttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatga 429  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||||||    
T  15168278 cttaaaacaaggtaggataaaattagattaactgcagtcttgttaatctgatga 15168225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 153; E-Value: 6e-81
Query Start/End: Original strand, 184 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 32216437 - 32216184
Alignment:
Q  184 aaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttg 283  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  32216437 aaaaagttaattttgatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctaataatgcttgcaacatcttg 32216338  T
Q  284 gacttacatgtactattttatcgttgacatcttt--------aacagaattgttgatatcatgtgatagttttgagtgttacactttgtggggtgttaca 375  Q
    ||||||||  || |||||||||||||  ||||||        |||||| ||  |||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||    
T  32216337 gacttacaaatattattttatcgttggaatctttaacatgcaaacagagtttatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttaca 32216238  T
Q  376 cttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatga 429  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| || | |||||||||| ||||    
T  32216237 cttaaaacaaggtaggataaaatttgattaagtttagttttgttaatctaatga 32216184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 153; E-Value: 6e-81
Query Start/End: Original strand, 184 - 429
Target Start/End: Original strand, 34012176 - 34012424
Alignment:
Q  184 aaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttg 283  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  34012176 aaaaagttaattttgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatatagtaatgcttgcaacatcttg 34012275  T
Q  284 gacttacatgtactattttatcgttgacatcttt--------aacagaattgttgatatcatgtgatagttttgagtgttacactttgtggggtgttaca 375  Q
     |||||||| |||||||||||||||| |||||||        |||||| ||| |||||| ||||||||||     |||||||| ||||||||||||||||    
T  34012276 aacttacatatactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacagatttgatgatattatgtgatagt-----gtgttacattttgtggggtgttaca 34012370  T
Q  376 cttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatga 429  Q
    ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  34012371 cttgaaacaaggttggataaaattagattaagtgtaatcttgttaatctgatga 34012424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 150; E-Value: 4e-79
Query Start/End: Original strand, 184 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 23999730 - 23999476
Alignment:
Q  184 aaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagta-attcatctagtaatgcttgcaacatctt 282  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  23999730 aaaaagttaattttgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtatattcatctagtaatgcttgcaacatctt 23999631  T
Q  283 ggacttacatgtactattttatcgttgacatctttaac--------agaattgttgatatcatgtgatagttttgagtgttacactttgtggggtgttac 374  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||        ||| ||| |||||| |||||||||| || ||||||||||||||| ||||||||     
T  23999630 ggacttacaggtactattttatcgttgaaatctttaacatgcaaatagagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtagggtgttat 23999531  T
Q  375 acttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatga 429  Q
     |||| ||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||    
T  23999530 gcttagaacaaggtatgataaaattatattaagtgtagtcttgttaacctgatga 23999476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 150; E-Value: 4e-79
Query Start/End: Original strand, 184 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 25161015 - 25160761
Alignment:
Q  184 aaaaagttaattttaatcttaatgtttgatt-catttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatctt 282  Q
    |||| ||||||||| || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  25161015 aaaaggttaattttgattttaatgtttgatttcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatatagtaatgcttgcaacatctt 25160916  T
Q  283 ggacttacatgtactattttatcgttgacatcttt--------aacagaattgttgatatcatgtgatagttttgagtgttacactttgtggggtgttac 374  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  ||||||        |||| | ||| |||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  25160915 ggacttacatgtactattttatcgttggaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagttttaagtgttatactttgtggggtgttac 25160816  T
Q  375 acttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatga 429  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||| ||||    
T  25160815 acttataacaaggtaggataaaatgagattaagtgtagtcttattaatctaatga 25160761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 150; E-Value: 4e-79
Query Start/End: Original strand, 184 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 39393766 - 39393512
Alignment:
Q  184 aaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttg 283  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  39393766 aaaaagttaattttaattttaatgttttattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgtttgcaacatcttg 39393667  T
Q  284 gacttacatgtactattttatcgttgacatcttt--------aacagaattgttgatatcatgtgatagttttgagtgttacactttgtggggtgttaca 375  Q
    || ||||  ||||||||||||| ||| |||||||        |||||| ||| | ||||||| ||||||| || ||||||||||||||| || |||||||    
T  39393666 gatttaccggtactattttatcattggcatctttaacatggaaacagagttgctaatatcatatgatagtcttaagtgttacactttgtaggatgttaca 39393567  T
Q  376 cttaaaacaaggtaggat-aaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatga 429  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  39393566 cttaaaacaaggtaggataaaaattagatgaagtgtattcttgttaatctgatga 39393512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 149; E-Value: 2e-78
Query Start/End: Original strand, 184 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 3535305 - 3535061
Alignment:
Q  184 aaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttg 283  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3535305 aaaaagttagttttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattgttgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttg 3535206  T
Q  284 gacttacatgtactattttatcgttgacatcttt--------aacagaattgttgatatcatgtgatagttttgagtgttacactttgtggggtgttaca 375  Q
    |||||| | ||||||||||||||||| |||||||        |||||| ||| ||||||||||         | ||||||||||||||||||||||||||    
T  3535205 gacttaaaggtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacagagttgctgatatcatg---------taagtgttacactttgtggggtgttaca 3535115  T
Q  376 cttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatga 429  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  3535114 cttaaaacaaggcaggataaaattagattaaatgtattcttgttaatctgatga 3535061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 149; E-Value: 2e-78
Query Start/End: Original strand, 185 - 429
Target Start/End: Original strand, 19899563 - 19899816
Alignment:
Q  185 aaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagta-attcatctagtaatgcttgcaacatcttg 283  Q
    ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  19899563 aaaagttaattttgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtatattcatctagtaatgcttgcaacatcttg 19899662  T
Q  284 gacttacatgtactattttatcgttgacatctttaac--------agaattgttgatatcatgtgatagttttgagtgttacactttgtggggtgttaca 375  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||        ||| ||| |||||| |||||||||| || ||||||||||||||| |||||||||     
T  19899663 gacttacatgtactattttatcgttggaatctttaacatgcaaatagagttggtgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtagggtgttacg 19899762  T
Q  376 cttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatga 429  Q
    |||| ||||| ||| |||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||    
T  19899763 cttagaacaatgtatgataaaattatattaagtgtagtcttgttaacctgatga 19899816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 148; E-Value: 6e-78
Query Start/End: Original strand, 185 - 429
Target Start/End: Original strand, 27266995 - 27267246
Alignment:
Q  185 aaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttgg 284  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  27266995 aaaagttaattttgatcttaatgtttaattcatttttaaattattgattattgattaattatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttag 27267094  T
Q  285 acttacatgtactattttatcgttgacatcttt--------aacagaattgttgatatcatgtgatagttttgagtgttacactttgtggggtgttacac 376  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||||||||        |||||| ||| |||||| |||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||    
T  27267095 acttacagatactattttatcgttgacatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttgcactttgtggggtgttacac 27267194  T
Q  377 ttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatga 429  Q
    | ||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  27267195 tcaaaacaaggta-gattaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatga 27267246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 148; E-Value: 6e-78
Query Start/End: Original strand, 184 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 32267416 - 32267164
Alignment:
Q  184 aaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttg 283  Q
    ||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32267416 aaaaaattaattttgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgttcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttg 32267317  T
Q  284 gacttacatgtactattttatcgttgacatcttt--------aacagaattgttgatatcatgtgatagttttgagtgttacactttgtggggtgttaca 375  Q
    ||| |||| |||||||||||| ||||  || |||        |||| | ||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||     
T  32267316 gacctacaggtactattttatagttggaatatttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtcttgagtgttacactttgtggagtgttacg 32267217  T
Q  376 cttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatg 428  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  32267216 cttataacaaggtaggataaaattagattaagtgtaatcttgttaatctgatg 32267164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 184 - 427
Target Start/End: Complemental strand, 37451667 - 37451416
Alignment:
Q  184 aaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttg 283  Q
    |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  37451667 aaaaagttaatttttattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgtttgcaacatcttg 37451568  T
Q  284 gacttacatgtactattttatcgttgacatcttt--------aacagaattgttgatatcatgtgatagttttgagtgttacactttgtggggtgttaca 375  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||  ||||||        |||||| ||| |||||| |||||||||| || ||||||||||||| || |||||||||    
T  37451567 gacttacagatactattttatcgttggaatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttttgaggtgttaca 37451468  T
Q  376 cttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgat 427  Q
    |||| ||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  37451467 cttataacaaggtcagataaaattagattaagtgtagtcttgttaatatgat 37451416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 146; E-Value: 9e-77
Query Start/End: Original strand, 187 - 429
Target Start/End: Original strand, 47682291 - 47682541
Alignment:
Q  187 aagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggac 286  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||     
T  47682291 aagttaattttaatcttaatgtttaattcttttttaaattgttaattactgattaatgatcaatagtaattcatttagtaatgcttgcaacatcttggat 47682390  T
Q  287 ttacatgtactattttatcgttgacatcttt--------aacagaattgttgatatcatgtgatagttttgagtgttacactttgtggggtgttacactt 378  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||        |||| | ||| |||||| || ||||||| || |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  47682391 ttacaggtactattttatcgttgacatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatatgatagtcttaagtgttacactttgtgaggtgttacactt 47682490  T
Q  379 aaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatga 429  Q
    ||||||||| || |||||||||| |||| |||| |||||||||||||||||    
T  47682491 aaaacaaggcagaataaaattagtttaaatgtagtcttgttaatctgatga 47682541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 145; E-Value: 4e-76
Query Start/End: Original strand, 184 - 429
Target Start/End: Original strand, 9902848 - 9903101
Alignment:
Q  184 aaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttg 283  Q
    |||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  9902848 aaaaagttaattttgattttaatatttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtagtgcttgcagcatcttg 9902947  T
Q  284 gacttacatgtactattttatcgttgacatcttt--------aacagaattgttgatatcatgtgatagttttgagtgttacactttgtggggtgttaca 375  Q
    |||||||  ||||||||||||||||| |||||||        |||| | ||| |||||| |||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||    
T  9902948 gacttactggtactattttatcgttgtcatctttaacatgcaaacaaatttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacattttgtggggtgttaca 9903047  T
Q  376 cttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatga 429  Q
    ||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  9903048 cttgaaacaatgtaagataaaattagattaagtgtagtcttgttaatttgatga 9903101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 185 - 429
Target Start/End: Original strand, 27563700 - 27563952
Alignment:
Q  185 aaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttgg 284  Q
    ||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  27563700 aaaagttaattatgatcttaatgtttgattcttttttaaattgttgattactgattaatgatcaatattaattcatctagtaatacttgcaacatcttgg 27563799  T
Q  285 acttacatgtactattttatcgttgacatcttt--------aacagaattgttgatatcatgtgatagttttgagtgttacactttgtggggtgttacac 376  Q
    |||||||| |||||||||||||||  |||||||        |||||| ||| ||| || || ||||||| || |||||| | ||||||||||| ||| ||    
T  27563800 acttacatatactattttatcgtttgcatctttaacatgcaaacagagttgatgaaattatatgatagtcttaagtgttcctctttgtggggtattatac 27563899  T
Q  377 ttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatga 429  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  27563900 ttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatga 27563952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 141; E-Value: 9e-74
Query Start/End: Original strand, 184 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 10923109 - 10922856
Alignment:
Q  184 aaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttg 283  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  10923109 aaaaagttaattttgatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacattttg 10923010  T
Q  284 gacttacatgtactattttatcgttgacatcttt--------aacagaattgttgatatcatgtgatagttttgagtgttacactttgtggggtgttaca 375  Q
    ||||||||  ||||||||||| ||    ||||||        |||||| ||| |||||| |||||| ||| || |||||||||||||||| ||||||||     
T  10923009 gacttacagatactattttattgtcagaatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtgacagtcttaagtgttacactttgtgaggtgttacc 10922910  T
Q  376 cttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatga 429  Q
    |||| ||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  10922909 cttataacaaggtatgataaaataagattaagtgtagtcttgttaatctgatga 10922856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 141; E-Value: 9e-74
Query Start/End: Original strand, 184 - 429
Target Start/End: Original strand, 11742162 - 11742398
Alignment:
Q  184 aaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttg 283  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11742162 aaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttg 11742261  T
Q  284 gacttacatgtactattttatcgttgacatctttaac--------agaattgttgatatcatgtgatagttttgagtgttacactttgtggggtgttaca 375  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||        ||| ||| ||||||||||||||||| || |                  |||||||    
T  11742262 gacttacatgtactattttatcgttgacatctttaacatacaaagagagttgctgatatcatgtgatagtcttaa-----------------ttgttaca 11742344  T
Q  376 cttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatga 429  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  11742345 cttaaaacaaggtaagataaaattagattaagtgtattcttgttaatccgatga 11742398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 141; E-Value: 9e-74
Query Start/End: Original strand, 184 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 30254805 - 30254552
Alignment:
Q  184 aaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttg 283  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30254805 aaaaagttaattttgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattgattaataatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttg 30254706  T
Q  284 gacttacatgtactattttatcgttgacatcttt--------aacagaattgttgatatcatgtgatagttttgagtgttacactttgtggggtgttaca 375  Q
    |||||||||||| |||||||||||||  ||||||        |||||| ||| || ||| |||||| ||| || ||||||||||||| | ||||||||      
T  30254705 gacttacatgtattattttatcgttggaatctttaacatgcaaacagagttgatgttattatgtgacagtcttaagtgttacactttatagggtgttatg 30254606  T
Q  376 cttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatga 429  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  30254605 cttataacaaggtaggataaaattagattaagtctagtcttgttaatctgatga 30254552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 140; E-Value: 4e-73
Query Start/End: Original strand, 190 - 429
Target Start/End: Original strand, 30326751 - 30326999
Alignment:
Q  190 ttaattttaatcttaatgtttgatt-catttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggactt 288  Q
    |||||||| || ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30326751 ttaattttgattttaatatttgatttcatttttaaattgttgattactgattgatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggactt 30326850  T
Q  289 acatgtactattttatcgttgacatcttt--------aacagaattgttgatatcatgtgatagttttgagtgttacactttgtggggtgttacacttaa 380  Q
    | ||||| |||||||||||||  ||||||        |||| | ||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||     
T  30326851 aaatgtattattttatcgttggaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagttttaagtgttacactttgtggggtgttacgcttat 30326950  T
Q  381 aacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatga 429  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||| | |||||||||||||||    
T  30326951 aacaaggtaggataaaatgagattaagtgtagttttgttaatctgatga 30326999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 184 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 46931792 - 46931540
Alignment:
Q  184 aaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagta-attcatctagtaatgcttgcaacatctt 282  Q
    |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  46931792 aaaaagttaattttgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaataatatattcatctagtaatgcttgcaacatctt 46931693  T
Q  283 ggacttacatgtactattttatcgttgacatctttaac--------agaattgttgatatcatgtgatagttttgagtgttacactttgtggggtgttac 374  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||        ||| ||| |||||| |||||||||| || ||||||||||||||| |||||||||    
T  46931692 ggacttacaggtactattttatcgttgaaatctttaacatgcaaatagagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtagggtgttac 46931593  T
Q  375 acttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatga 429  Q
     ||   ||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||    
T  46931592 gct--gaacaaggtatgataaaattatattaagtgtagtcttgttaacctgatga 46931540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 138; E-Value: 6e-72
Query Start/End: Original strand, 184 - 429
Target Start/End: Original strand, 28564577 - 28564828
Alignment:
Q  184 aaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttg 283  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  28564577 aaaaagttaattttgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgtttgcaacatcttg 28564676  T
Q  284 gacttacatgtactattttatcgttgacatcttt--------aacagaattgttgatatcatgtgatagttttgagtgttacactttgtggggtgttaca 375  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| ||||||        |||||| ||| |||||| |||||||||  || |||||||||||||  |||||||||      
T  28564677 gacttacatgtattattttatcgttgaaatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtgatag--ttaagtgttacactttacggggtgttatg 28564774  T
Q  376 cttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatga 429  Q
    |||| ||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  28564775 cttataacaaggcatgataaaattagattaagtgtagtcttgttaatatgatga 28564828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 138; E-Value: 6e-72
Query Start/End: Original strand, 184 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 28770035 - 28769781
Alignment:
Q  184 aaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttg 283  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  28770035 aaaaagttaattttaattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattaattaatgatcaatagtaattcatctagcaatgtttgcaacatcttg 28769936  T
Q  284 gacttacatgtactattttatcgttgacatcttt--------aacagaattgttgatatcatgtgatagttttgagtgttacactttgt-ggggtgttac 374  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| ||||||        ||||||  || |||||| |||||||||| || || |||||||||||| ||||||||||    
T  28769935 gacttacaggtactattttatcgttgaaatctttaacatgcaaacagaggtgatgatattatgtgatagtcttaagcgttacactttgtgggggtgttac 28769836  T
Q  375 acttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatga 429  Q
      ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  28769835 gtttataacaaggtatgataaaattagattaagtgtagtcttgttaatatgatga 28769781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 184 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 15752411 - 15752158
Alignment:
Q  184 aaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttg 283  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||| |||||    
T  15752411 aaaaaattaattttgatcttaatgtttaattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaaaaattgcaacttcttg 15752312  T
Q  284 gacttacatgtactattttatcgttgacatcttt--------aacagaattgttgatatcatgtgatagttttgagtgttacactttgtggggtgttaca 375  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||  || |||        |||||| ||  |||||| |||||||| | || ||||||||||||| |||||||||||     
T  15752311 gacttacatgtattattttgtcgttggaatttttaacatgcaaacagagttaatgatattatgtgatactcttaagtgttacactttatggggtgttacg 15752212  T
Q  376 cttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatga 429  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  15752211 cttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatga 15752158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 136; E-Value: 9e-71
Query Start/End: Original strand, 184 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 3309536 - 3309276
Alignment:
Q  184 aaaaagttaattttaa-tcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatctt 282  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  3309536 aaaaagttaattttaaatctaaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaatatctt 3309437  T
Q  283 ggacttacatgtactattttatcgttgacatcttt--------aacagaattgttgatatcatgtgatagttttgagtgttacact-----ttgtggggt 369  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||| |||||||        |||||| ||| ||||||||| ||||||| || |||||||||||     | ||| |||    
T  3309436 ggacttacgggtactattttatcgttggcatctttaacatacaaacagagttgctgatatcatttgatagtcttaagtgttacacttagtgtagtgaggt 3309337  T
Q  370 gttacacttaaaacaaggtaggat-aaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatga 429  Q
    |||||| ||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3309336 gttacatttaaaacaaagtaggttaaaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatga 3309276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 133; E-Value: 5e-69
Query Start/End: Original strand, 184 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 22171093 - 22170840
Alignment:
Q  184 aaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttg 283  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||     
T  22171093 aaaaagttaattttgattttaatgtttgatttatttttaaattgttgattactaattaatgatcaatagtaatttatctaataatgtttgcaacatctta 22170994  T
Q  284 gacttacatgtactattttatcgttgacatcttt--------aacagaattgttgatatcatgtgatagttttgagtgttacactttgtggggtgttaca 375  Q
    |||||||| | | |||||||||||||||||||||        |||||| ||| |||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||    
T  22170993 gacttacaagaattattttatcgttgacatctttaacatgcaaacagatttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttaca 22170894  T
Q  376 cttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatga 429  Q
     || |||||||||||||| ||||||||||||||||| | || ||||||| ||||    
T  22170893 tttgaaacaaggtaggatgaaattagattaagtgtagtgttattaatctaatga 22170840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 131; E-Value: 8e-68
Query Start/End: Original strand, 184 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 42721418 - 42721168
Alignment:
Q  184 aaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttg 283  Q
    |||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||    
T  42721418 aaaaagttaattatgattttaatgtttgattcatttttaaattattgattactcattaatgatcaatagtaattaatctagtaataattgcaacatcttg 42721319  T
Q  284 gacttacatgtactattttatcgttgacatcttt--------aacagaattgttgatatcatgtgatagttttgagtgttacactttgtggggtgttaca 375  Q
    |||||||||||| |||||||||||||   |||||        |||| | ||| |||||| | |||||| | || ||||||| |||||||||||| |||||    
T  42721318 gacttacatgtaatattttatcgttg---tctttaacatgcaaacaaagttgatgatattacgtgataatcttaagtgttatactttgtggggtattaca 42721222  T
Q  376 cttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatga 429  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  42721221 cttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatga 42721168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 184 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 14758414 - 14758170
Alignment:
Q  184 aaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttg 283  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14758414 aaaaagttaattttgatcttaatgttcgattcatttttaaattgttgattgttgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttg 14758315  T
Q  284 gacttacatgtactattttatcgttgacatcttt--------aacagaattgttgatatcatgtgatagttttgagtgttacactttgtggggtgttaca 375  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||        |||| | ||| |||||| ||| |||||| ||         | ||| ||||||||||||    
T  14758314 gacttacatgtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgcgatagtctt---------aatttctggggtgttaca 14758224  T
Q  376 cttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatga 429  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||    
T  14758223 cttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgcagtcttgttaatctaatga 14758170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 128; E-Value: 5e-66
Query Start/End: Original strand, 184 - 427
Target Start/End: Original strand, 27763104 - 27763356
Alignment:
Q  184 aaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagta-attcatctagtaatgcttgcaacatctt 282  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  27763104 aaaaagttaattttgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtatatttatctagtaatgcttgcaacatctt 27763203  T
Q  283 ggacttacatgtactattttatcgttgacatctttaac--------agaattgttgatatcatgtgatagttttgagtgttacactttgtggggtgttac 374  Q
    | |||||||  ||||||||||||||||  |||||||||        ||| ||| | |||| |||||||||| || ||| ||||||||||| |||||||||    
T  27763204 gaacttacagatactattttatcgttggaatctttaacatgcaaatagagttgattatattatgtgatagtcttaagtattacactttgtagggtgttac 27763303  T
Q  375 acttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgat 427  Q
     |||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  27763304 gcttagaactaggtatgataaaattagattaagtgtagtcttgttaacctgat 27763356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 126; E-Value: 8e-65
Query Start/End: Original strand, 184 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 48353924 - 48353735
Alignment:
Q  184 aaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttg 283  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  48353924 aaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaataataattcatctagtaatgcttgcaatatcttg 48353825  T
Q  284 gacttacatgtactattttatcgttgacatcttt--------aacagaattgttgatatcatgtgatagttttgagtgttacactttgtgg 366  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||||||        |||||| ||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  48353824 gacttacagatactattttatcgttgacatctttaacatgcaaacagagttgctgatatcatgtgatagtctt-agtgttacactttgtgg 48353735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 204 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 18423006 - 18422780
Alignment:
Q  204 aatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactatttta 303  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||       ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  18423006 aatgtttgattcatttttaaattgttgatta-------atgatcaatagtaattcatctagcaatgcttgcaacatcttggacttacatgtgctttttta 18422914  T
Q  304 tcgttgacatctttaaca--------gaattgttgatatcatgtgatagttttgagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggataa 395  Q
    ||||||  ||||||||||        ||  || |||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||    
T  18422913 tcgttggaatctttaacatgcaaacggaggtgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacgcatataacaaggtaggataa 18422814  T
Q  396 aattagattaagtgtattcttgttaatctgatga 429  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  18422813 aattagattaagtgtaatcttgttaatctgatga 18422780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 116; E-Value: 8e-59
Query Start/End: Original strand, 184 - 429
Target Start/End: Original strand, 31621342 - 31621600
Alignment:
Q  184 aaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttt-taaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatctt 282  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||    
T  31621342 aaaaagttaattttgatcttaatgttcgattcattttttaaattgttgattgatgattaatgatcaatagtagttcatctactaatgcttgcaacatatt 31621441  T
Q  283 ggacttacatgtactattttatcgttgacatcttt-------------aacagaattgttgatatcatgtgatagttttgagtgttacactttgtggggt 369  Q
    | ||||||||||||||||||||||||| |||||||             |||| | |||||||||| ||| |||||| || ||||| |||| || ||||||    
T  31621442 gaacttacatgtactattttatcgttggcatctttaacttaacatgcaaacatagttgttgatattatgcgatagtcttaagtgtcacac-ttctggggt 31621540  T
Q  370 gttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatga 429  Q
     || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  31621541 attgcacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatga 31621600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 111; E-Value: 7e-56
Query Start/End: Original strand, 194 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 40885185 - 40884942
Alignment:
Q  194 ttttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatg 293  Q
    |||||| |||||| || ||||||||||| |||| |||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  40885185 ttttaaccttaatattcgattcatttttgaattattgattgctaattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgtttgcaacatcttggacttacatg 40885086  T
Q  294 tactattttatcgttgacatcttt--------aacagaattgttgatatcatgtgatagttttgagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaa 385  Q
    |||||||||||| | | |||||||        |||| | ||| |||||| ||| |||||| || |||||||||||||  ||  |||||||||||||||||    
T  40885085 tactattttatcatcggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgcgatagtcttaagtgttacacttttcggaatgttacacttaaaacaa 40884986  T
Q  386 ggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatga 429  Q
    | |||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  40884985 gataggataaaactagattaagtgcaatcttgttaatctgatga 40884942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 185 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 41926537 - 41926292
Alignment:
Q  185 aaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttgg 284  Q
    |||| |||||| | || ||||||||||||||| ||||||||  ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  41926537 aaaaattaattatgattttaatgtttgattcaattttaaatcattgattattaattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttg-aatatcttgg 41926439  T
Q  285 acttacatgtactattttatcgttgacatcttt--------aacagaattgttgatatcatgtgatagttttgagtgttacactttgtggggtgttacac 376  Q
    ||||||| |||||||||||| |||| |||||||        |||||| ||| |||||| || | |||      ||||||||||||||||| |||||||||    
T  41926438 acttacaagtactattttattgttggcatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatttaata------agtgttacactttgtggagtgttacac 41926345  T
Q  377 ttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatga 429  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  41926344 ttaaaacaaagtaggataaaattagattaagtgtaatcttgttaatctgatga 41926292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 185 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 21289981 - 21289847
Alignment:
Q  185 aaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttgg 284  Q
    |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  21289981 aaaaattaattttgatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaataataattcatctagtaatgtttgcaacatcttgg 21289882  T
Q  285 acttacatgtactattttatcgttgacatctttaa 319  Q
    ||||| | ||  ||||||||||||| |||||||||    
T  21289881 acttataagtgttattttatcgttggcatctttaa 21289847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 199 - 321
Target Start/End: Original strand, 1359744 - 1359866
Alignment:
Q  199 atcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtacta 298  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||    
T  1359744 atcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcgatagtaattcatccagtaatgcttgcaacattttgaacttacaggtacta 1359843  T
Q  299 ttttatcgttgacatctttaaca 321  Q
    |||||||||||  ||||||||||    
T  1359844 ttttatcgttggaatctttaaca 1359866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #49
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 184 - 429
Target Start/End: Original strand, 33725405 - 33725647
Alignment:
Q  184 aaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcattttta-aattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatctt 282  Q
    |||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||            | ||||||||| ||    
T  33725405 aaaaagtttattttgatcttaatgttcgattcatttttttaattgttgattgctgattaatgatcaatagtaat------------gtttgcaacatttt 33725492  T
Q  283 ggacttacatgtactattttatcgttgacatctttaacag--------aattgttgatatcatgtgatagttttgagtgttacactttgtggggtgttac 374  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||         | ||| |||||| ||| |||||| || | ||||||||||| |||||||||||    
T  33725493 ggtcttacatgtactattttatcgttgacatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgcgatagtcttaaatgttacactttctggggtgttac 33725592  T
Q  375 acttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatga 429  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||    
T  33725593 acttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatatgatga 33725647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #50
Raw Score: 91; E-Value: 6e-44
Query Start/End: Original strand, 184 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 31962999 - 31962861
Alignment:
Q  184 aaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaa-ttgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatctt 282  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||    
T  31962999 aaaaagttaattttaatcttaatgtttgatttatttttaaaattgttgattaccgattaatgatcaatagtagttcatctaataatgcttgcaacatctt 31962900  T
Q  283 ggacttacatgtactattttatcgttgacatctttaaca 321  Q
      |||||||| || ||||||||||||||  |||||||||    
T  31962899 aaacttacatatattattttatcgttgatttctttaaca 31962861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #51
Raw Score: 91; E-Value: 6e-44
Query Start/End: Original strand, 218 - 429
Target Start/End: Original strand, 37618729 - 37618939
Alignment:
Q  218 ttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttatcgttgacatcttt 317  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||    
T  37618729 ttttaaattgttgattattgattaatggtcaatactaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtattattttatcgttggaatcttt 37618828  T
Q  318 --------aacagaattgttgatatcatgtgatagttttgagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtg 409  Q
            |||||| ||| |||||| |         | ||||||||||||||| |||| |||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  37618829 aacatgcaaacagagttgatgatatta---------tatgagtgttacactttatgggatgttatgcttataacaaggtaggataaaattagattaagtg 37618919  T
Q  410 tattcttgttaatctgatga 429  Q
    || | |||||||||||||||    
T  37618920 tagtattgttaatctgatga 37618939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #52
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 348 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 48620847 - 48620766
Alignment:
Q  348 tgagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatga 429  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48620847 tgagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaagtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatga 48620766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #53
Raw Score: 64; E-Value: 8e-28
Query Start/End: Original strand, 253 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 38759846 - 38759662
Alignment:
Q  253 taattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttatcgttgacatctttaacag--------aattgttgatatcatgtgatag 344  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| || |||||||| ||||||| ||||||||         | ||| |||||| || ||||||    
T  38759846 taattaatctagtaatgcttgcaacatcttggagttacatatattattttatagttgacacctttaacatgcaaacatagttggtgatattatctgatag 38759747  T
Q  345 ttttgagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatga 429  Q
    | |  ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||||||||| ||||| |||| | || ||||| ||||||    
T  38759746 tctcaagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaataagatatgataaaattaaattaaatgtagttttattaatatgatga 38759662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #54
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 184 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 48620971 - 48620916
Alignment:
Q  184 aaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgat 239  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  48620971 aaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcattttaaaattgttgattaatgat 48620916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #55
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 18 - 52
Target Start/End: Complemental strand, 1547832 - 1547798
Alignment:
Q  18 aaattaagaaacgtgggatatgacatttgttggaa 52  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1547832 aaattaagaaacgtgggatatgacatttgttggaa 1547798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 222; Significance: 1e-122; HSPs: 58)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 184 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 39573197 - 39572952
Alignment:
Q  184 aaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttg 283  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39573197 aaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttg 39573098  T
Q  284 gacttacatgtactattttatcgttgacatctttaacagaattgttgatatcatgtgatagttttgagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaac 383  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  39573097 gacttacatgtactattttatcattggcatctttaacagagttgttgatatcatgtgatagtctcgagtgttacactttgtgggatgttacacttaaaac 39572998  T
Q  384 aaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatga 429  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39572997 aaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatga 39572952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 173; E-Value: 7e-93
Query Start/End: Original strand, 184 - 429
Target Start/End: Original strand, 38528026 - 38528279
Alignment:
Q  184 aaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttg 283  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38528026 aaaaagttaattttgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttg 38528125  T
Q  284 gacttacatgtactattttatcgttgacatctttaac--------agaattgttgatatcatgtgatagttttgagtgttacactttgtggggtgttaca 375  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||        ||| ||| |||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||    
T  38528126 gacttacaagtactattttatcgttgatatctttaacatgtaaatagatttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttaca 38528225  T
Q  376 cttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatga 429  Q
    ||| |||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  38528226 cttgaaacaaggtaagataaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatga 38528279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 169; E-Value: 2e-90
Query Start/End: Original strand, 184 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 19120245 - 19119992
Alignment:
Q  184 aaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttg 283  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  19120245 aaaaagttaattttaatcttaatgattgattcatttttaaattgttgatcactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatctta 19120146  T
Q  284 gacttacatgtactattttatcgttgacatctttaaca--------gaattgttgatatcatgtgatagttttgagtgttacactttgtggggtgttaca 375  Q
    |||||  | ||||||||||||||||| |||||||||||        || ||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| |    
T  19120145 gactttgaggtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacggagttgctgatatcatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttata 19120046  T
Q  376 cttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatga 429  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  19120045 cttaaaacaaggtaggataaaattagagtaagtttattcttgttaatctgatga 19119992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 169; E-Value: 2e-90
Query Start/End: Original strand, 184 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 22981179 - 22980926
Alignment:
Q  184 aaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttg 283  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  22981179 aaaaagttaattttgatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaataataattcatctagtaatgattgcaacatcttg 22981080  T
Q  284 gacttacatgtactattttatcgttgacatcttt--------aacagaattgttgatatcatgtgatagttttgagtgttacactttgtggggtgttaca 375  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| |||||||        |||||| ||  |||||| |||||||||| || ||||||||| |||||| |||||||||    
T  22981079 gacttacatatactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacagagtttatgatattatgtgatagtcttaagtgttacattttgtgaggtgttaca 22980980  T
Q  376 cttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatga 429  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  22980979 cttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatga 22980926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 169; E-Value: 2e-90
Query Start/End: Original strand, 184 - 429
Target Start/End: Original strand, 31786435 - 31786688
Alignment:
Q  184 aaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttg 283  Q
    |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31786435 aaaaagttaattttgatattaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgaacaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttg 31786534  T
Q  284 gacttacatgtactattttatcgttgacatctttaa--------cagaattgttgatatcatgtgatagttttgagtgttacactttgtggggtgttaca 375  Q
    || ||||| ||||||||||||||||| |||||||||        |||| ||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  31786535 gatttacaggtactattttatcgttggcatctttaacatgcaatcagagttgatgatattatgtgatagttttaagtgttacactttgtagggtgttaca 31786634  T
Q  376 cttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatga 429  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  31786635 cttaaaacaagataggataaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatga 31786688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 169; E-Value: 2e-90
Query Start/End: Original strand, 184 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 40133771 - 40133518
Alignment:
Q  184 aaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttg 283  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  40133771 aaaaagttaattttaatcttaatgtttaattcatttttaaattgttgattactgattcatgattaatagtaattcatccagtaatgcttgcaacatcttg 40133672  T
Q  284 gacttacatgtactattttatcgttgacatcttt--------aacagaattgttgatatcatgtgatagttttgagtgttacactttgtggggtgttaca 375  Q
    ||||||||  || |||||||||||||||||||||        |||| | ||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  40133671 gacttacaaatattattttatcgttgacatctttaacatacaaacatagttgatgatattatgtgatagttttaagtgttacactttgtggggtgttaca 40133572  T
Q  376 cttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatga 429  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  40133571 cttaaaacaaggtaggataaaattagattaaatgtattcttgttagtctgatga 40133518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 166; E-Value: 1e-88
Query Start/End: Original strand, 184 - 429
Target Start/End: Original strand, 8741674 - 8741928
Alignment:
Q  184 aaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttg 283  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||    
T  8741674 aaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtatttcatctagtgatgcttgcaacattttg 8741773  T
Q  284 gacttacatgtactattttatcgttgacatcttt--------aacagaattgttgat-atcatgtgatagttttgagtgttacactttgtggggtgttac 374  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||        |||||| ||| | || ||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||||    
T  8741774 gacttacatgtactattttatcgttgacatctttaacatgcaaacagagttgctcataatcatgtgatagtcttaagtgttacactttgtagggtgttac 8741873  T
Q  375 acttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatga 429  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  8741874 acttaaaacaaggtatgacaaaattagattaattgtattcttgttaatttgatga 8741928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 165; E-Value: 4e-88
Query Start/End: Original strand, 184 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 35934282 - 35934028
Alignment:
Q  184 aaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttg 283  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  35934282 aaaaagttaattttaattttaatgtttgaatcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaataataattcaactagtaatgcttgcaacatcttg 35934183  T
Q  284 gacttacatgtactattttatcgttgacatctttaaca--gaa------ttgttgatatcatgtgatagttttgagtgttacactttgtggggtgttaca 375  Q
    |||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||  |||      ||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||||||    
T  35934182 gacttaccggtactattttattgttgacatctttaacatggaaacaaagttgctgatatcatgtgatagtcttaagtgttacactttgtagggtgttaca 35934083  T
Q  376 cttaaaacaaggtaggat-aaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatga 429  Q
    |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35934082 cttaaaacaaggtaggataaaaactagattaagtgtattcttgttaatctgatga 35934028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 165; E-Value: 4e-88
Query Start/End: Original strand, 184 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 36867148 - 36866895
Alignment:
Q  184 aaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttg 283  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  36867148 aaaaagttaattttaatcttaatgtttaattcatttttaaattgttgattactgattcatgattaatagtaattcatccagtaatgtttgcaacatcttg 36867049  T
Q  284 gacttacatgtactattttatcgttgacatcttt--------aacagaattgttgatatcatgtgatagttttgagtgttacactttgtggggtgttaca 375  Q
    ||||||||  || |||||||||||||||||||||        |||| | ||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  36867048 gacttacaaatattattttatcgttgacatctttaacatacaaacatagttgatgatattatgtgatagttttaagtgttacactttgtggggtgttaca 36866949  T
Q  376 cttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatga 429  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  36866948 cttaaaacaaggtaggataaaattagattaaatgtattcttgttagtctgatga 36866895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 161; E-Value: 1e-85
Query Start/End: Original strand, 184 - 429
Target Start/End: Original strand, 15992329 - 15992582
Alignment:
Q  184 aaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttg 283  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15992329 aaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttaattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttg 15992428  T
Q  284 gacttacatgtactattttatcgttgacatcttt--------aacagaattgttgatatcatgtgatagttttgagtgttacactttgtggggtgttaca 375  Q
    |||||||  ||||||||||||||||| |||||||        |||||| ||  |||||||||| |||||| || ||||| ||||||||||||||||| ||    
T  15992429 gacttaccggtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacagagttcctgatatcatgcgatagtcttaagtgtgacactttgtggggtgttgca 15992528  T
Q  376 cttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatga 429  Q
    || ||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  15992529 ctcaaatcaaggtagaataaaattagatcaagtgtattcttgttaatctgatga 15992582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 161; E-Value: 1e-85
Query Start/End: Original strand, 184 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 27330690 - 27330437
Alignment:
Q  184 aaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttg 283  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27330690 aaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaatcgttcattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttg 27330591  T
Q  284 gacttacatgtactattttatcgttgacatctttaac--------agaattgttgatatcatgtgatagttttgagtgttacactttgtggggtgttaca 375  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||        ||| ||| |||||||||| |||||| || ||||| ||||||  ||||||||||||    
T  27330590 gacttacatgtaccattttattgttgaaatctttaacatgcaaatagagttgctgatatcatgcgatagtcttaagtgtgacacttcatggggtgttaca 27330491  T
Q  376 cttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatga 429  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  27330490 cttaaaacaaggtagaataaaattagattaagtgtattctcattaatctgatga 27330437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 160; E-Value: 4e-85
Query Start/End: Original strand, 185 - 436
Target Start/End: Complemental strand, 5830278 - 5830019
Alignment:
Q  185 aaaagttaattttaatcttaatgtttgatt-catttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttg 283  Q
    ||||||||||||| || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5830278 aaaagttaattttgattttaatgtttgatttcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttg 5830179  T
Q  284 gacttacatgtactattttatcgttgacatcttt--------aacagaattgttgatatcatgtgatagttttgagtgttacactttgtggggtgttaca 375  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  ||||||        |||||| ||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||     
T  5830178 gacttacatgtactattttatcgttggaatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtgatagttttaagtgttacactttgtggggtgttacg 5830079  T
Q  376 cttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgatcctatg 436  Q
    |||| ||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||    
T  5830078 cttataacaaggtaagataaaatgagattaagtgtagtcttgttaat-tgatgatactatg 5830019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 160; E-Value: 4e-85
Query Start/End: Original strand, 185 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 12910740 - 12910488
Alignment:
Q  185 aaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttgg 284  Q
    ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12910740 aaaagttaattatgatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattgctgattaatgttcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttgg 12910641  T
Q  285 acttacatgtactattttatcgttgacatctttaa--------cagaattgttgatatcatgtgatagttttgagtgttacactttgtggggtgttacac 376  Q
    ||||||||||| |||| ||| |||| |||||||||        |||| ||| |||||| |||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  12910640 acttacatgtattattgtattgttggcatctttaacatacaaccagagttgatgatattatgtgatagtcttaggtgttacactttgtggggtgttacac 12910541  T
Q  377 ttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatga 429  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  12910540 ttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcatgttaatctgatga 12910488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 160; E-Value: 4e-85
Query Start/End: Original strand, 184 - 429
Target Start/End: Original strand, 25500715 - 25500968
Alignment:
Q  184 aaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttg 283  Q
    ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||     
T  25500715 aaaaagttaattttaatcttagtatttgattcatttttaaattgttaattactgattaatgatcaacagtatttcatctagtaatgcttgcaacatctta 25500814  T
Q  284 gacttacatgtactattttatcgttgacatctttaac------agaa--ttgttgatatcatgtgatagttttgagtgttacactttgtggggtgttaca 375  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||      ||||  ||| ||||||||||||||  | || ||||||||||||||||||||||||||    
T  25500815 gacttacaggtactattttatcgttggcatctttaacatctaaagaaagttgctgatatcatgtgatgatcttaagtgttacactttgtggggtgttaca 25500914  T
Q  376 cttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatga 429  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  25500915 cttaaaacaaggtaggataaaattaaattaagtttattcttgttaatctgatga 25500968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 157; E-Value: 3e-83
Query Start/End: Original strand, 184 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 5837941 - 5837688
Alignment:
Q  184 aaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttg 283  Q
    |||| |||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5837941 aaaaggttaattttaattttaatgattgattcatttttaaattgttgattattgattaatgatcaacagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttg 5837842  T
Q  284 gacttacatgtactattttatcgttgacatctttaac--------agaattgttgatatcatgtgatagttttgagtgttacactttgtggggtgttaca 375  Q
    ||||| || |||||||||| |||||| ||||||||||        ||| ||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||    
T  5837841 gacttgcaggtactattttgtcgttgtcatctttaacatgcaaagagagttgctgatatcatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtattaca 5837742  T
Q  376 cttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatga 429  Q
    |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  5837741 cttaaaacaatgtaggattaaattagattaagtgtattcttgttaatatgatga 5837688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 157; E-Value: 3e-83
Query Start/End: Original strand, 184 - 429
Target Start/End: Original strand, 22973871 - 22974124
Alignment:
Q  184 aaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttg 283  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22973871 aaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttg 22973970  T
Q  284 gacttacatgtactattttatcgttgacatcttt--------aacagaattgttgatatcatgtgatagttttgagtgttacactttgtggggtgttaca 375  Q
    ||||||||||||||||||||| || || ||||||        |||||| ||| | |||| |||| ||||| || ||||||||| |||||| ||||||||     
T  22973971 gacttacatgtactattttattgtcgaaatctttaacatgcaaacagagttgataatattatgtaatagtcttaagtgttacattttgtgaggtgttacg 22974070  T
Q  376 cttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatga 429  Q
    |||| |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  22974071 cttataacaagataggataaaattagattaagtgtagtcttgttattctgatga 22974124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 157; E-Value: 3e-83
Query Start/End: Original strand, 184 - 429
Target Start/End: Original strand, 35511271 - 35511519
Alignment:
Q  184 aaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttg 283  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  35511271 aaaaagttaattttgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatatagtaatgcttgcaacatcttg 35511370  T
Q  284 gacttacatgtactattttatcgttgacatcttt--------aacagaattgttgatatcatgtgatagttttgagtgttacactttgtggggtgttaca 375  Q
     ||||||||||||||||||||||||| |||||||        |||||| ||| |||||| ||||||||||     |||||||| ||||||||||||||||    
T  35511371 aacttacatgtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacagatttgatgatattatgtgatagt-----gtgttacattttgtggggtgttaca 35511465  T
Q  376 cttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatga 429  Q
    ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  35511466 cttgaaacaaggttggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatga 35511519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 156; E-Value: 1e-82
Query Start/End: Original strand, 185 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 699535 - 699283
Alignment:
Q  185 aaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttgg 284  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  699535 aaaagttaattttgatcttaatgtttgattcatttttaaattgttaattactgattaataatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttgg 699436  T
Q  285 acttacatgtactattttatcgttgacatcttt--------aacagaattgttgatatcatgtgatagttttgagtgttacactttgtggggtgttacac 376  Q
    |||||||  |||||||||||||||| |||||||        |||| | ||| |||||| |||||||||| || ||| ||||||||||||| |||||||||    
T  699435 acttacagatactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtattacactttgtggagtgttacac 699336  T
Q  377 ttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatga 429  Q
    |||||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  699335 ttaaaataaggtatgataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatga 699283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 153; E-Value: 6e-81
Query Start/End: Original strand, 184 - 429
Target Start/End: Original strand, 30969113 - 30969366
Alignment:
Q  184 aaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttg 283  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||| |||||||    
T  30969113 aaaaagttaattttaattttaatgtttgattcatttttaaattgtggattactgattaatgattaatagtaactcatctagtaatacttgcagcatcttg 30969212  T
Q  284 gacttacatgtactattttatcgttgacatcttt--------aacagaattgttgatatcatgtgatagttttgagtgttacactttgtggggtgttaca 375  Q
     ||||| |  ||||||||||| ||||||||||||        |||| | ||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||| |||||||||    
T  30969213 aacttatagatactattttattgttgacatctttaacatgcaaacaaagttgctgatatcatgtgatagtcttaagtgttacactttgtgaggtgttaca 30969312  T
Q  376 cttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatga 429  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30969313 cttaaaacaaagtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatga 30969366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 153; E-Value: 6e-81
Query Start/End: Original strand, 184 - 426
Target Start/End: Complemental strand, 33908618 - 33908369
Alignment:
Q  184 aaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttg 283  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  33908618 aaaaagttaattttgatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatagtaatt-atctagtaatgcttgcaacatcttg 33908520  T
Q  284 gacttacatgtactattttatcgttgacatctttaacaga-----attgtt---gatatcatgtgatagttttgagtgttacactttgtggggtgttaca 375  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |     || |||   ||||| ||| |||||| || ||||||||||||| ||||||||||||    
T  33908519 gacttacatgtactattttatcgttggcatctttaacatacaaacatagttgacgatattatgcgatagtcttaagtgttacactttctggggtgttaca 33908420  T
Q  376 cttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctga 426  Q
     ||||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  33908419 tttaaaacaaggtatgataaaattagattaagtgcagtcttgttaatctga 33908369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 153; E-Value: 6e-81
Query Start/End: Original strand, 184 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 42343107 - 42342864
Alignment:
Q  184 aaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttg 283  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||     
T  42343107 aaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatggtaattcatctagtaatgcttgcaacatctta 42343008  T
Q  284 gacttacatgtactattttatcgttgacatcttt--------aacagaattgttgatatcatgtgatagttttgagtgttacactttgtggggtgttaca 375  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||        |||||| ||| ||||||||||         ||||||||||||||||||| || |||||    
T  42343007 gacttacatgtcctattttatcgttgacatctttaacatgcaaacagagttgatgatatcatg---------tgagtgttacactttgtggtgtattaca 42342917  T
Q  376 cttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatga 429  Q
    |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42342916 cttaaaacaa-gtaagataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatga 42342864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 149; E-Value: 2e-78
Query Start/End: Original strand, 184 - 429
Target Start/End: Original strand, 7208653 - 7208906
Alignment:
Q  184 aaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttg 283  Q
    |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  7208653 aaaaagttaatttttattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaataataattcatctagtaatacttgcaacatcttg 7208752  T
Q  284 gacttacatgtactattttatcgttgacatcttt--------aacagaattgttgatatcatgtgatagttttgagtgttacactttgtggggtgttaca 375  Q
     |||||||||||||||||||||||||  ||||||        |||||| |||   |||| |||||||||| || |||||||||||||||| ||||||||     
T  7208753 aacttacatgtactattttatcgttggaatctttaacatgcaaacagagttgaaaatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtgaggtgttacg 7208852  T
Q  376 cttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatga 429  Q
     ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  7208853 tttataacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatga 7208906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 149; E-Value: 2e-78
Query Start/End: Original strand, 184 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 22020009 - 22019765
Alignment:
Q  184 aaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttg 283  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||     
T  22020009 aaaaagttaattttaatcttaatatttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttacaacatctta 22019910  T
Q  284 gacttacatgtactattttatcgttgacatctttaac--------agaattgttgatatcatgtgatagttttgagtgttacactttgtggggtgttaca 375  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||        ||| ||| ||||||||||         ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  22019909 gacttacaagtattattttatcgttggcatctttaacatgcaaatagagttgctgatatcatg---------tgagtgttatactttgtggggtgttaca 22019819  T
Q  376 cttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatga 429  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  22019818 cttaaaataaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatatgatga 22019765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 149; E-Value: 2e-78
Query Start/End: Original strand, 184 - 429
Target Start/End: Original strand, 31705401 - 31705654
Alignment:
Q  184 aaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttg 283  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31705401 aaaaagttaatttttattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttg 31705500  T
Q  284 gacttacatgtactattttatcgttgacatcttt--------aacagaattgttgatatcatgtgatagttttgagtgttacactttgtggggtgttaca 375  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||  ||||||        |||||| ||| |||||| ||||||| || || ||||||||| |||||| | ||||||     
T  31705501 gacttatatgtactattttatctttggaatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtgatggtcttaagtgttacattttgtgagatgttacg 31705600  T
Q  376 cttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatga 429  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  31705601 cttataacaaggtatgataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatga 31705654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 149; E-Value: 2e-78
Query Start/End: Original strand, 184 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 35504751 - 35504498
Alignment:
Q  184 aaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttg 283  Q
    ||||||| |||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  35504751 aaaaagtcaattttgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaataatcaatagtaattcatctagtaatacttgcaacatcttg 35504652  T
Q  284 gacttacatgtactattttatcgttgacatcttt--------aacagaattgttgatatcatgtgatagttttgagtgttacactttgtggggtgttaca 375  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||        |||||| ||| | |||| |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||     
T  35504651 gacttacatgtactattttatcgttgaaatctttaacatgcaaacagatttgataatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacg 35504552  T
Q  376 cttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatga 429  Q
    |||| || | ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||    
T  35504551 cttataatatggtaggataaaattatattaagtgtagtcttgttaatatgatga 35504498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 148; E-Value: 6e-78
Query Start/End: Original strand, 184 - 429
Target Start/End: Original strand, 23116019 - 23116264
Alignment:
Q  184 aaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttg 283  Q
    |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |        ||||||||||||||||||||    
T  23116019 aaaaagttaattttgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtca--------gtaatgcttgcaacatcttg 23116110  T
Q  284 gacttacatgtactattttatcgttgacatctttaaca--------gaattgttgatatcatgtgatagttttgagtgttacactttgtggggtgttaca 375  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||        || ||| |||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||    
T  23116111 gacttacaggtactattttatcgttgacatctttaacatgcaaacagatttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttaca 23116210  T
Q  376 cttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatga 429  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  23116211 cttgaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtaatattgttaatctgatga 23116264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 146; E-Value: 9e-77
Query Start/End: Original strand, 184 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 36860810 - 36860556
Alignment:
Q  184 aaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttg 283  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  36860810 aaaaagttaattttaatcttaatgcttgattcatttttaaattgttgattactaattcatgattaatagtaattcatttagtaatgcttgcaacatcttg 36860711  T
Q  284 gacttacatgtactattttatcgttgacatcttt--------aacagaattgttgatatcatgtgatagttttgagtgttacactttgtggggtgttaca 375  Q
    ||||||||  || |||||||||||||||||||||        |||| | ||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  36860710 gacttacaaatattattttatcgttgacatctttaacatacaaacatagttgatgatattatgtgatagttttaagtgttacactttgtggggtgttaca 36860611  T
Q  376 ctt-aaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatga 429  Q
    ||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| | ||||||    
T  36860610 cttaaaaaaaaggtaggataaaattagattaaatgtactcttgttagtatgatga 36860556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 145; E-Value: 4e-76
Query Start/End: Original strand, 184 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 7693607 - 7693363
Alignment:
Q  184 aaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttg 283  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  7693607 aaaaagttaattttaattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgaacaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatctta 7693508  T
Q  284 gacttacatgtactattttatcgttgacatcttt--------aacagaattgttgatatcatgtgatagttttgagtgttacactttgtggggtgttaca 375  Q
    |||||||| ||| |||||||||||||||||||||        |||||| ||| | ||||||||         ||||||||||||||||||||||||||||    
T  7693507 gacttacaagtattattttatcgttgacatctttaacatgcaaacagagttgctaatatcatg---------tgagtgttacactttgtggggtgttaca 7693417  T
Q  376 cttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatga 429  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||    
T  7693416 cttaaaacaaggtaagataaaattagattaagcgtattcatgttaatctaatga 7693363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 145; E-Value: 4e-76
Query Start/End: Original strand, 184 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 22255568 - 22255315
Alignment:
Q  184 aaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttg 283  Q
    |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  22255568 aaaaagttaattttgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaaggcttgcaacatcttg 22255469  T
Q  284 gacttacatgtactattttatcgttgacatcttt--------aacagaattgttgatatcatgtgatagttttgagtgttacactttgtggggtgttaca 375  Q
    |||||||| |||||||||||||||||  || |||        |||| | ||| |||||| |||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||     
T  22255468 gacttacaggtactattttatcgttggaatatttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtaatagttttaagtgttacactttgtgtggtgttacg 22255369  T
Q  376 cttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatga 429  Q
    |||| |||||  |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  22255368 cttataacaaaataggctaaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatga 22255315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 145; E-Value: 4e-76
Query Start/End: Original strand, 184 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 32563526 - 32563282
Alignment:
Q  184 aaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttg 283  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||     
T  32563526 aaaaagttaattttaattttaatgtttgattcatttttaaattgttaattgctgattaatgatcaataataatttatctagtaattcttgcaacatctta 32563427  T
Q  284 gacttacatgtactattttatcgttgacatcttt--------aacagaattgttgatatcatgtgatagttttgagtgttacactttgtggggtgttaca 375  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||| |        |||||| ||| ||||||||||         |||||||||||||||||||| |||||||    
T  32563426 gacttacatgtactattttatcgttggcatctataacatgcaaacagagttgctgatatcatg---------tgagtgttacactttgtgggctgttaca 32563336  T
Q  376 cttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatga 429  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32563335 cttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatga 32563282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 143; E-Value: 6e-75
Query Start/End: Original strand, 184 - 415
Target Start/End: Complemental strand, 25669962 - 25669733
Alignment:
Q  184 aaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttg 283  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||     
T  25669962 aaaaagttaattttaattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatttta 25669863  T
Q  284 gacttacatgtactattttatcgttgacatcttt--------aacagaattgttgatatcatgtgatagttttgagtgttacactttgtggggtgttaca 375  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||        |||||| ||| ||||||||||         |||||||||||| |||||| ||||||||    
T  25669862 gacttacatgtactattttatcgttgacatctttaacatgcaaacagagttgatgatatcatg---------tgagtgttacac-ttgtggagtgttaca 25669773  T
Q  376 cttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattct 415  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  25669772 cttaaaacaaagtaggataaaattagattaagtgtattct 25669733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 143; E-Value: 6e-75
Query Start/End: Original strand, 184 - 429
Target Start/End: Original strand, 27318277 - 27318529
Alignment:
Q  184 aaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaa-ttgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatctt 282  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  27318277 aaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaaattgttgatttttgattaatgatcaatagtaattcatatagtaatgtttgcaacatctt 27318376  T
Q  283 ggacttacatgtactattttatcgttgacatcttt--------aacagaattgttgatatcatgtgatagttttgagtgttacactttgtggggtgttac 374  Q
      ||||  |||||||||||||||||||| ||||||        |||||| ||| |||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  27318377 aaactt--atgtactattttatcgttgaaatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttac 27318474  T
Q  375 acttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatga 429  Q
     ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  27318475 gcttaaaataaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatatgatga 27318529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 140; E-Value: 4e-73
Query Start/End: Original strand, 184 - 429
Target Start/End: Original strand, 28416340 - 28416569
Alignment:
Q  184 aaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttg 283  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  28416340 aaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcttttttaaattgttgattgttgattaatgatcaatagtaattcatcaagtaatgcttgcaacatcttg 28416439  T
Q  284 gacttacatgtactattttatcgttgacatctttaacagaattgttgatatcatgtgatagttttgagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaac 383  Q
    |||||| | ||||||||||||||||| ||||       || ||| ||||||||||         |||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  28416440 gacttaaaagtactattttatcgttggcatc-------gagttgctgatatcatg---------tgagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaat 28416523  T
Q  384 aaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatga 429  Q
    |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28416524 aaggcagaataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatga 28416569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 184 - 411
Target Start/End: Original strand, 2888234 - 2888469
Alignment:
Q  184 aaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttg 283  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  2888234 aaaaagttaattttaattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgtaacatcttg 2888333  T
Q  284 gacttacatgtactattttatcgttgacatcttt--------aacagaattgttgatatcatgtgatagttttgagtgttacactttgtggggtgttaca 375  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||        |||| | ||| |||||| || ||||||| || ||||||||||||| |||  ||||| |    
T  2888334 gacttacaggtactattttatcgttgacatctttaacatgcaaacatatttgatgatattatctgatagtcttaagtgttacactttatggaatgttaaa 2888433  T
Q  376 cttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgta 411  Q
    ||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  2888434 cttgaaacaaggtaaaataaaattagattaagtgta 2888469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 184 - 429
Target Start/End: Original strand, 17157820 - 17158073
Alignment:
Q  184 aaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttg 283  Q
    ||||||| || ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17157820 aaaaagtcaagtttgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaataataattcatctagtaatgcttgcaacatcttg 17157919  T
Q  284 gacttacatgtactattttatcgttgacatcttt--------aacagaattgttgatatcatgtgatagttttgagtgttacactttgtggggtgttaca 375  Q
    |||||| | |||||||||||||||||| ||||||        |||||| ||| | |||| ||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||    
T  17157920 gacttaaaagtactattttatcgttgaaatctttatcatgcaaacagagttgataatattatgtgatggtcttaagtgttacactttgtggggtgttaca 17158019  T
Q  376 cttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatga 429  Q
    |||| || |||||| |||| ||||| | |||||||| |||||||||||||||||    
T  17158020 cttataataaggtaagatacaattatactaagtgtagtcttgttaatctgatga 17158073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 184 - 424
Target Start/End: Original strand, 35826275 - 35826521
Alignment:
Q  184 aaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttg 283  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35826275 aaaaagttaattttgatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttg 35826374  T
Q  284 gacttacatgtactattttatcgttgacatcttt--------aacagaattgttgatatcatgtgatagttttgagtgttacactttgtggggtgttaca 375  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||        |||||| ||| ||||||  | ||||| | || || |||||||||||||| |||||||     
T  35826375 gacttacatgtactattttatcgttgaaatctttaacatgcaaacagagttgatgatat--tatgataatcttaagggttacactttgtggagtgttacg 35826472  T
Q  376 cttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatct 424  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||||||| |||  | ||||||||||    
T  35826473 cttaaaacaatgtagaataaaattagattaaatgtggtattgttaatct 35826521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 133; E-Value: 5e-69
Query Start/End: Original strand, 184 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 9200610 - 9200366
Alignment:
Q  184 aaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttg 283  Q
    ||||| ||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  9200610 aaaaaattaattttaattttaaattttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatctta 9200511  T
Q  284 gacttacatgtactattttatcgttgacatcttt--------aacagaattgttgatatcatgtgatagttttgagtgttacactttgtggggtgttaca 375  Q
    |||||| |  |||||||||||||||| |||||||        |||||| ||| ||||||||||         |||||||||||||||||||  |||||||    
T  9200510 gacttatagatactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacagagttgctgatatcatg---------tgagtgttacactttgtggaatgttaca 9200420  T
Q  376 cttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatga 429  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  9200419 cttaaaacaaggtaggataaaattagattaaatgtattcttgttaatatgatga 9200366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 133; E-Value: 5e-69
Query Start/End: Original strand, 184 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 15724874 - 15724621
Alignment:
Q  184 aaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttg 283  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| || |||    
T  15724874 aaaaagttaattttaactttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattgattaatgattaatagtaattcatctagtaatgcttacaatattttg 15724775  T
Q  284 gacttacatgtactattttatcgttgacatcttt--------aacagaattgttgatatcatgtgatagttttgagtgttacactttgtggggtgttaca 375  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||||||||||        |||| | ||||||||||||| ||||||| || | || ||||||||| || |||||| |    
T  15724774 gacttacaagtactattttatagttgacatctttaacatgtaaacaaagttgttgatatcatatgatagtcttaattgatacactttggggcgtgttata 15724675  T
Q  376 cttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatga 429  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  15724674 cttaaaataaggtagaataaaattaaattaagtgtattcttgttaatttgatga 15724621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 184 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 8437351 - 8437099
Alignment:
Q  184 aaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttg 283  Q
    |||||||||||||| || ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  8437351 aaaaagttaattttgattttaatatttaattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgttttcaacatcttg 8437252  T
Q  284 gacttacatgtactattttatcgttgacatcttt--------aacagaattgttgatatcatgtgatagttttgagtgttacactttgtggggtgttaca 375  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| |||||||        |||||| ||| | |||| |||||||| | || |||||||||| |||||||||||   |    
T  8437251 gacttacaggtactattttatcgttggcatctttaacattcaaacagagttgatcatattatgtgataatcttaagtgttacacattgtggggtgtataa 8437152  T
Q  376 cttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatg 428  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||  || | |||| |||||||||    
T  8437151 cttaaaacaaggcaggataaaattagattaagcatagttttgtaaatctgatg 8437099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 118; E-Value: 5e-60
Query Start/End: Original strand, 184 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 24886473 - 24886336
Alignment:
Q  184 aaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttg 283  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24886473 aaaaagttaattttgatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgatttctgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttg 24886374  T
Q  284 gacttacatgtactattttatcgttgacatctttaaca 321  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||    
T  24886373 gacttacatgtactattttattgttggaatctttaaca 24886336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 113; E-Value: 5e-57
Query Start/End: Original strand, 220 - 429
Target Start/End: Original strand, 13956187 - 13956404
Alignment:
Q  220 ttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttatcgttgacatcttt-- 317  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||      
T  13956187 ttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggactaacaggtactattttatcgttggcatctttaa 13956286  T
Q  318 ------aacagaattgttgatatcatgtgatagttttgagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgta 411  Q
          |||| | ||| |||||| || ||||||| || |||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||| ||  |||||||||||||||||| |    
T  13956287 catgcaaacaaatttgatgatattatatgatagtcttaagtgttacgctttgtagggtgttacacttgaaacaagataaaataaaattagattaagtgaa 13956386  T
Q  412 ttcttgttaatctgatga 429  Q
     | |||||||||||||||    
T  13956387 gttttgttaatctgatga 13956404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 111; E-Value: 7e-56
Query Start/End: Original strand, 184 - 429
Target Start/End: Original strand, 21088558 - 21088808
Alignment:
Q  184 aaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttg 283  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||   |||| | ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  21088558 aaaaaattaactttaatcttaatgtttgattcatttttaaattg---attatttattcatgattaatagtaattcatctagtaatgcttacaacatcttg 21088654  T
Q  284 gacttacatgtactattttatcgttgacatcttt--------aacagaattgttgatatcatgtgatagttttgagtgttacactttgtggggtgttaca 375  Q
    || |||||  |  ||||||||||||| |||||||        |||| | ||| |||||| |||||||| | || |||||||||||||||||| |||||||    
T  21088655 gatttacagatgttattttatcgttggcatctttaacatacaaacatagttgatgatattatgtgataatcttaagtgttacactttgtgggatgttaca 21088754  T
Q  376 cttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatga 429  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| | ||||||    
T  21088755 cttaaaacaaggtaggataaagttagattaaatgtattcttgttagtatgatga 21088808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 106; E-Value: 7e-53
Query Start/End: Original strand, 184 - 321
Target Start/End: Original strand, 14409130 - 14409267
Alignment:
Q  184 aaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttg 283  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  14409130 aaaaatttaattttaattttaatgttcgattcatttttaaattgttgattgctgaataatgatcaatagtaattcatttagtaatgtttgcaacatcttg 14409229  T
Q  284 gacttacatgtactattttatcgttgacatctttaaca 321  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  14409230 gacttacaagtactattttatcgttgacatctttaaca 14409267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 106; E-Value: 7e-53
Query Start/End: Original strand, 184 - 429
Target Start/End: Original strand, 43308449 - 43308694
Alignment:
Q  184 aaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttg 283  Q
    |||||||||||||| || ||| | |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  43308449 aaaaagttaattttgattttagtatttgattcgtttttaaattgttgatttctgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttc 43308548  T
Q  284 gacttacatgtactattttatcgttgacatctttaacagaattgttgatatcatgtgatagttttgagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaac 383  Q
    |||||||| |||||||||||| || |  ||||||||||     |  ||  | |||  ||||| || |||||||||||||   |||||||||||||| |||    
T  43308549 gacttacaggtactattttattgtcggaatctttaacatgcaagaagagttgatgatatagtcttaagtgttacacttttcagggtgttacacttataac 43308648  T
Q  384 aaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatga 429  Q
    |||||| |||||||||||||||||| || | ||||||| |||||||    
T  43308649 aaggtaagataaaattagattaagtatagttttgttaagctgatga 43308694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 105; E-Value: 3e-52
Query Start/End: Original strand, 185 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 25889755 - 25889619
Alignment:
Q  185 aaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttgg 284  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  25889755 aaaagttaattttgatcttaatgtttaattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgctttcaacatcttgg 25889656  T
Q  285 acttacatgtactattttatcgttgacatctttaaca 321  Q
    | ||||| |||||||||||| ||||  ||||||||||    
T  25889655 atttacaggtactattttattgttggtatctttaaca 25889619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 184 - 429
Target Start/End: Original strand, 23954591 - 23954831
Alignment:
Q  184 aaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttg 283  Q
    |||||||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||       |||||||||||||||||||| ||||||| |     |||||||    
T  23954591 aaaaagttaattatgatcttaatgtttaattcatttttaaattgttgatta-------atgatcaatagtaattcatcaagtaatgtt-----catcttg 23954678  T
Q  284 gacttacatgtactattttatcgttgacatcttta-------acagaattgttgatatcatgtgatagttttgagtgttacactttgtggggtgttacac 376  Q
     |||||||  || ||||||||||||| ||| || |       ||||| ||| |||||| |||||||||| || ||||||||| |||||| ||||||||||    
T  23954679 cacttacaaatattattttatcgttggcattttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacattttgtgaggtgttacac 23954778  T
Q  377 ttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatga 429  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  23954779 ttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatatgatga 23954831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 96; E-Value: 7e-47
Query Start/End: Original strand, 243 - 427
Target Start/End: Original strand, 6824329 - 6824519
Alignment:
Q  243 tgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttatcgttgacatctttaaca--------gaattgttgatat 334  Q
    ||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||| |||||||||||||||        || ||| | ||||    
T  6824329 tgatcaatagtatctcatctagtgatgcttgcaacatcttagacttacatgtattgttttatc-ttgacatctttaacatgcaaacagagttgct-atat 6824426  T
Q  335 catgtgatagttttgagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgat 427  Q
    | ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6824427 cttgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacatttaaaacaaggtatgataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgat 6824519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 184 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 8467112 - 8466988
Alignment:
Q  184 aaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttg 283  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  8467112 aaaaagttaattttatttttaatgtttgattcatttttaaactgttgattactaattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacattttg 8467013  T
Q  284 gacttacatgtactattttatcgtt 308  Q
    ||||||||  || ||||||||||||    
T  8467012 gacttacaaataatattttatcgtt 8466988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 86; E-Value: 6e-41
Query Start/End: Original strand, 184 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 26269195 - 26269074
Alignment:
Q  184 aaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttg 283  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||||     
T  26269195 aaaaagttaattttaatcttaatgattggttcatttttaaattgttgattactgattaatgatcagtagtaatttatctagtattgcttacaacatctta 26269096  T
Q  284 gacttacatgtactattttatc 305  Q
     ||||||| |||||||||||||    
T  26269095 aacttacaggtactattttatc 26269074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 84; E-Value: 9e-40
Query Start/End: Original strand, 219 - 321
Target Start/End: Original strand, 1428983 - 1429088
Alignment:
Q  219 tttaaattgttga---ttactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttatcgttgacatct 315  Q
    |||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  1428983 tttaaattgttgaatattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttggcatct 1429082  T
Q  316 ttaaca 321  Q
    ||||||    
T  1429083 ttaaca 1429088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 185 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 43254240 - 43254154
Alignment:
Q  185 aaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgct 271  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43254240 aaaagttaattttgatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgct 43254154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 81; E-Value: 6e-38
Query Start/End: Original strand, 184 - 429
Target Start/End: Original strand, 14919328 - 14919570
Alignment:
Q  184 aaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttg 283  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||||||||||| |||||||||||      | |||||| ||||||    
T  14919328 aaaaaattaattttgatcttaatgtttgattcatttttaaattttagatttctgattaatgatcaat-gtaattcatct------gattgcaatatcttg 14919420  T
Q  284 gacttacatgtactattttatcgttgacatctttaaca--------gaattgttgatatcatgtgatagttttgagtgttacactttgtggggtgttaca 375  Q
    ||||||    ||| ||||||| ||||  ||||||||||        || ||| |||||| |||||||||| || ||| ||||| |||||| |||||||||    
T  14919421 gactta----tacaattttattgttggaatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtgatagtcttaagtattacaatttgtgaggtgttaca 14919516  T
Q  376 cttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatga 429  Q
    |||| || |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||    
T  14919517 cttataataaggtaggataaaattagattaagtgtagttttgttaatatgatga 14919570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 329 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 26268307 - 26268207
Alignment:
Q  329 tgatatcatgtgatagttttgagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatg 428  Q
    ||||||||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  26268307 tgatatcatgtgatagtcttaagtgttacactttgtgcggtgttacacttaaaacaaggtatgataaaatttgattaattgtattcttgttaatctgatg 26268208  T
Q  429 a 429  Q
    |    
T  26268207 a 26268207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 368 - 429
Target Start/End: Original strand, 1429126 - 1429187
Alignment:
Q  368 gtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatga 429  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||    
T  1429126 gtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaaatgtagtcttgttaatttgatga 1429187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #55
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 370 - 429
Target Start/End: Original strand, 14409310 - 14409369
Alignment:
Q  370 gttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatga 429  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  14409310 gttacacttaaaacaaggtagaataaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatga 14409369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #56
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 320 - 422
Target Start/End: Original strand, 5112247 - 5112348
Alignment:
Q  320 cagaattgttgatatcatgtgatagttttgagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgtt 419  Q
    |||| ||| |||||| |||||| ||| || ||||||  |||||||||||| |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| || |||||||    
T  5112247 cagagttgatgatattatgtgaaagtcttaagtgttgtactttgtggggt-ttacacttaaaacatggtatgataaaattagattaagtatagtcttgtt 5112345  T
Q  420 aat 422  Q
    |||    
T  5112346 aat 5112348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #57
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 377 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 8466929 - 8466877
Alignment:
Q  377 ttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatga 429  Q
    |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  8466929 ttaaaacaaggtagaataaaattaaattaagtgtattcttgttaatttgatga 8466877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #58
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 384 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 24886282 - 24886237
Alignment:
Q  384 aaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatga 429  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  24886282 aaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatatgatga 24886237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 214; Significance: 1e-117; HSPs: 57)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 184 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 22687592 - 22687347
Alignment:
Q  184 aaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttg 283  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  22687592 aaaaagttaattttaatcttaatgtatgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctattaatgcttgcaacatcttg 22687493  T
Q  284 gacttacatgtactattttatcgttgacatctttaacagaattgttgatatcatgtgatagttttgagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaac 383  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22687492 gacttacatgtactattttatcgttggcatccttaacagagttgttgatatcatgagatagtcttgagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaac 22687393  T
Q  384 aaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatga 429  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  22687392 aaggtaggataaaattagattaagtgtattattgttaatctgatga 22687347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 184 - 418
Target Start/End: Original strand, 26587892 - 26588126
Alignment:
Q  184 aaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttg 283  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  26587892 aaaaagttaattttaatcttaatgtttgatttatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcctgcaacatcttg 26587991  T
Q  284 gacttacatgtactattttatcgttgacatctttaacagaattgttgatatcatgtgatagttttgagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaac 383  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26587992 gacttacatgtattattttatcgttggcatctttaacagagttgttgatatcatgtgatagtcttgagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaac 26588091  T
Q  384 aaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgt 418  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26588092 aaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgt 26588126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 177; E-Value: 3e-95
Query Start/End: Original strand, 184 - 429
Target Start/End: Original strand, 15612559 - 15612812
Alignment:
Q  184 aaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttg 283  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||     
T  15612559 aaaaagttaattttaatcttaatgattgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaacaataattcatctagtaatgcttgcaacatctta 15612658  T
Q  284 gacttacatgtactattttatcgttgacatcttt--------aacagaattgttgatatcatgtgatagttttgagtgttacactttgtggggtgttaca 375  Q
    |||||||| ||||||||||||| ||| |||||||        |||||| ||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||    
T  15612659 gacttacaggtactattttatcattggcatctttaacatgcaaacagagttgctgatatcatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttaca 15612758  T
Q  376 cttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatga 429  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  15612759 cttaaaacaaggtaggataaaattaaattaagtgtattcttgttaatctgatga 15612812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 173; E-Value: 7e-93
Query Start/End: Original strand, 184 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 6546880 - 6546627
Alignment:
Q  184 aaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttg 283  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||     
T  6546880 aaaaagttaattttaatcttaatgattgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcctcatctta 6546781  T
Q  284 gacttacatgtactattttatcgttgacatcttt--------aacagaattgttgatatcatgtgatagttttgagtgttacactttgtggggtgttaca 375  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| |||||||        |||||| ||| ||||||||||||||| | || ||||||| ||||||||||||||||||    
T  6546780 gacttacaggtactattttatcgttggcatctttaacatacaaacagagttgctgatatcatgtgataatattaagtgttatactttgtggggtgttaca 6546681  T
Q  376 cttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatga 429  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  6546680 cttaaaacaaggtaggataaaattagattaaatgtattcttgttaatctgatga 6546627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 173; E-Value: 7e-93
Query Start/End: Original strand, 184 - 429
Target Start/End: Original strand, 9355626 - 9355879
Alignment:
Q  184 aaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttg 283  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9355626 aaaaagttaattttgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattgattaatgatcaatagcaattcatctagtaatgcttgcaacatcttg 9355725  T
Q  284 gacttacatgtactattttatcgttgacatcttt--------aacagaattgttgatatcatgtgatagttttgagtgttacactttgtggggtgttaca 375  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| |||||||        |||| | ||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  9355726 gacttacaagtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagttttaagtgttacactttgtggggtgttaca 9355825  T
Q  376 cttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatga 429  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  9355826 cttaaaacaaggtaggatgaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatga 9355879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 169; E-Value: 2e-90
Query Start/End: Original strand, 184 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 18797688 - 18797435
Alignment:
Q  184 aaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttg 283  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18797688 aaaaagttaattttgatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttg 18797589  T
Q  284 gacttacatgtactattttatcgttgacatcttt--------aacagaattgttgatatcatgtgatagttttgagtgttacactttgtggggtgttaca 375  Q
    |||||||| |||||||||||| || |  ||||||        |||||| ||| |||||| |||||||||| || |||||||||||||||| |||||||||    
T  18797588 gacttacaggtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtgaggtgttaca 18797489  T
Q  376 cttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatga 429  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  18797488 cttataacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatga 18797435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 167; E-Value: 3e-89
Query Start/End: Original strand, 184 - 427
Target Start/End: Complemental strand, 8861646 - 8861395
Alignment:
Q  184 aaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttg 283  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||     
T  8861646 aaaaagttaattttaatcttagtgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtatttcatctagtaatgcatgcaacatctta 8861547  T
Q  284 gacttacatgtactattttatcgttgacatctttaac--------agaattgttgatatcatgtgatagttttgagtgttacactttgtggggtgttaca 375  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||        ||| ||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  8861546 gacttacatgtactattttatcgttggtatctttaacatgcaaagagagttgctgatatcatgtgatggtcttgagtgttacactttgcggggtgttaca 8861447  T
Q  376 cttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgat 427  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  8861446 cttaaaataaggtaggataaaattagattaaatgtattgttgttaatctgat 8861395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 167; E-Value: 3e-89
Query Start/End: Original strand, 185 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 37110234 - 37109980
Alignment:
Q  185 aaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttgg 284  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37110234 aaaagttaattttaattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttgg 37110135  T
Q  285 acttacatgtactattttatcgttgacatcttt--------aacagaattgttgatatcatgtgatagttttgagtgttacactttgtggggtgttacac 376  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||        |||||| ||| |||||| ||||| |||| || ||||||||||||||||||||||||| |    
T  37110134 acttacatgtactattttatcgttgaaatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtggtagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacgc 37110035  T
Q  377 ttaaaacaagg--taggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatga 429  Q
    ||| |||||||  ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||    
T  37110034 ttataacaaggtataggataaaattatattaagtgtagtcttgttaatctgatga 37109980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 161; E-Value: 1e-85
Query Start/End: Original strand, 184 - 429
Target Start/End: Original strand, 25691344 - 25691597
Alignment:
Q  184 aaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttg 283  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||    
T  25691344 aaaaatttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgtttgcaacattttg 25691443  T
Q  284 gacttacatgtactattttatcgttgacatcttt--------aacagaattgttgatatcatgtgatagttttgagtgttacactttgtggggtgttaca 375  Q
     ||||||||||  |||||||||||| ||||||||        |||||| ||| ||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||    
T  25691444 aacttacatgtgttattttatcgttaacatctttaacgtgcaaacagagttgctgatatcatgtgatagtcttaagtgtgacactttgtggggtgttaca 25691543  T
Q  376 cttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatga 429  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||    
T  25691544 cttaaaataaggtaggataaaattagattaaatgtatttttgttaatatgatga 25691597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 159; E-Value: 2e-84
Query Start/End: Original strand, 185 - 429
Target Start/End: Original strand, 17842385 - 17842639
Alignment:
Q  185 aaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttgg 284  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  17842385 aaaagttaattttaattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctaataatgcttgcaacatcttgg 17842484  T
Q  285 acttacatgtactattttatcgttgacatcttt--------aacagaattgttgatatcatgtgatagttttgagtgttacactttgtggggtgttacac 376  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||        |||||| ||| |||||| ||||| |||| || |||||||||||||||||| |||||| |    
T  17842485 acttacatgtactattttatcgttgaaatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtggtagtcttaagtgttacactttgtgggatgttacgc 17842584  T
Q  377 ttaaaacaagg--taggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatga 429  Q
    ||| |||||||  ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||    
T  17842585 ttataacaaggtataggataaaattatattaagtgtagtcttgttaatctgatga 17842639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 156; E-Value: 1e-82
Query Start/End: Original strand, 184 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 21991988 - 21991744
Alignment:
Q  184 aaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttg 283  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    |||||||||||||||||||     ||||||||||||||||    
T  21991988 aaaaggttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattaatgat----gatcaatagtaattcatct-----tgcttgcaacatcttg 21991898  T
Q  284 gacttacatgtactattttatcgttgacatctttaacag--------aattgttgatatcatgtgatagttttgagtgttacactttgtggggtgttaca 375  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||         | ||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||    
T  21991897 gacttacaggtactattttatcgttgacatctttaacatgcaaacaaagttgctgatatcatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttaca 21991798  T
Q  376 cttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatga 429  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21991797 cttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatga 21991744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 154; E-Value: 2e-81
Query Start/End: Original strand, 186 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 30055886 - 30055635
Alignment:
Q  186 aaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttgga 285  Q
    |||||||||||| || |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30055886 aaagttaattttgattttaacgattgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttgga 30055787  T
Q  286 cttacatgtactattttatcgttgacatctttaaca---gaa-----ttgttgatatcatgtgatagttttgagtgttacactttgtggggtgttacact 377  Q
    |||||| |||||||||||||||||  ||||||||||   |||     ||| |||||| |||||||||| || ||||||||||||||| ||||||||| ||    
T  30055786 cttacaggtactattttatcgttggaatctttaacatgcgaacaacgttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtagggtgttacgct 30055687  T
Q  378 taaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatga 429  Q
    || | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  30055686 tatagcaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatga 30055635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 153; E-Value: 6e-81
Query Start/End: Original strand, 184 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 4583280 - 4583027
Alignment:
Q  184 aaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttg 283  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  4583280 aaaaagttaattttaatcttaatgtttaattcatttttaaattgttgatgactgattcatgattaatagtaattcatccagtaatgcttgcaacatcttg 4583181  T
Q  284 gacttacatgtactattttatcgttgacatcttt--------aacagaattgttgatatcatgtgatagttttgagtgttacactttgtggggtgttaca 375  Q
     |||||||  || ||||| |||||||||||||||        |||| | ||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  4583180 aacttacaaatattatttgatcgttgacatctttaacatacaaacatagttgatgatattatgtgatagttttaagtgttacactttgtggggtgttaca 4583081  T
Q  376 cttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatga 429  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  4583080 cttaaaacaaagtaggataaaattagattaaatgtattcttgttagtctgatga 4583027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 153; E-Value: 6e-81
Query Start/End: Original strand, 184 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 32432813 - 32432560
Alignment:
Q  184 aaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttg 283  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  32432813 aaaaagttacttttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattgattcatgattaataataattcatctagtaatgcttgcaacaccttg 32432714  T
Q  284 gacttacatgtactattttatcgttgacatcttt--------aacagaattgttgatatcatgtgatagttttgagtgttacactttgtggggtgttaca 375  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||        |||||  ||| |||||| |||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||    
T  32432713 gacttacatgtactattttatcgttggcatctttaatatgcaaacagtgttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacattttgtggggtgttaca 32432614  T
Q  376 cttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatga 429  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  32432613 cttaaaataaggtaggataaaattatattaactgtattcttgttagtctgatga 32432560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 184 - 436
Target Start/End: Original strand, 37703298 - 37703558
Alignment:
Q  184 aaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttg 283  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  37703298 aaaaagttaattttgatcttaatgtttaattcatttttaaattgttgattattgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgtttgcaacatcttg 37703397  T
Q  284 gacttacatgtactattttatcgttgacatcttt--------aacagaattgttgatatcatgtgatagttttgagtgttacactttgtggggtgttaca 375  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||||||        |||| | ||| |||||| |||||||||| || |||| ||||||||||||| |||||||    
T  37703398 gacttacagatactattttatcgttgacatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtggtacactttgtgggatgttaca 37703497  T
Q  376 cttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgatcctatg 436  Q
    ||||||| ||| || ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||    
T  37703498 cttaaaataagatatgataaaattagattaagtgtagtcttattaatctgatgatactatg 37703558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 150; E-Value: 4e-79
Query Start/End: Original strand, 184 - 429
Target Start/End: Original strand, 15672559 - 15672815
Alignment:
Q  184 aaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttg 283  Q
    ||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  15672559 aaaaaattaattttaaccttaatgtttaattcatttttaaattgttgattattgatgcatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacattttg 15672658  T
Q  284 gacttacatgtac---tattttatcgttgacatctttaac--------agaattgttgatatcatgtgatagttttgagtgttacactttgtggggtgtt 372  Q
    |||||||| ||||   ||||||||||||| ||||||||||        ||| ||| |||||| |||||||||| || ||||||||||||||||| |||||    
T  15672659 gacttacaggtactattattttatcgttggcatctttaacattcaaatagagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggagtgtt 15672758  T
Q  373 acacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatga 429  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  15672759 acacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttagtctgatga 15672815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 149; E-Value: 2e-78
Query Start/End: Original strand, 184 - 429
Target Start/End: Original strand, 31578864 - 31579117
Alignment:
Q  184 aaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttg 283  Q
    |||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31578864 aaaaagttaattttgattttattgtttgattcatttttaaattattgattattgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttg 31578963  T
Q  284 gacttacatgtactattttatcgttgacatctttaac--------agaattgttgatatcatgtgatagttttgagtgttacactttgtggggtgttaca 375  Q
    |||||||||||| |||||||||||||  |||||||||        | | ||| |||||| |||||||||| || ||||||||||||| | |||||||| |    
T  31578964 gacttacatgtattattttatcgttggaatctttaacatgcaaataaagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttatagggtgttata 31579063  T
Q  376 cttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatga 429  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  31579064 cttataacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatga 31579117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 146; E-Value: 9e-77
Query Start/End: Original strand, 184 - 429
Target Start/End: Original strand, 5657280 - 5657534
Alignment:
Q  184 aaaaagttaattttaatctt-aatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatctt 282  Q
    |||||||||||||||||||| |||| || ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5657280 aaaaagttaattttaatctttaatgatttattcatttttaaatttttgattactcattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatctt 5657379  T
Q  283 ggacttacatgtactattttatcgttgacatcttt--------aacagaattgttgatatcatgtgatagttttgagtgttacactttgtggggtgttac 374  Q
     |||||||||||||||||||||||||| |||||||        |||| | ||| |||||||||| |||||| || ||| |||||||||||||| ||||||    
T  5657380 agacttacatgtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgctgatatcatgcgatagtcttaagtattacactttgtgggctgttac 5657479  T
Q  375 acttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatga 429  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||    
T  5657480 acttaaaacaaagtaggataaaattaaattaagtgtatttttgttaatatgatga 5657534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 146; E-Value: 9e-77
Query Start/End: Original strand, 184 - 429
Target Start/End: Original strand, 10359014 - 10359268
Alignment:
Q  184 aaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttg 283  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||    
T  10359014 aaaaagttaattttgatcataatgtttgattcatttttaaattgttgattattgattaatgatcaatagtaaatcatttagtaatgcttgcaaaatcttg 10359113  T
Q  284 gacttacatgtactattttatcgttgacatcttt--------aacagaattgttgatatcatgtgatagttttgagtgttacactttgtggggtgttaca 375  Q
    |||||||| |||||| ||||||||||||||||||        |||||| ||| || | | |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||    
T  10359114 gacttacaagtactaatttatcgttgacatctttaacatgcaaacagagttgatgttgttatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttaca 10359213  T
Q  376 cttaaaacaaggtaggataaaattaga-ttaagtgtattcttgttaatctgatga 429  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||    
T  10359214 cttaaaacaaggtatgataaaattagatttaagtgtagtcttgttgatctgatga 10359268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 146; E-Value: 9e-77
Query Start/End: Original strand, 190 - 427
Target Start/End: Complemental strand, 27284100 - 27283854
Alignment:
Q  190 ttaattttaatcttaatgtttgattc-atttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggactt 288  Q
    |||||||| || |||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27284100 ttaattttgattttaatgtttgattttatttttaaattattgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggactt 27284001  T
Q  289 acatgtactattttatcgttgacatcttt--------aacagaattgttgatatcatgtgatagttttgagtgttacactttgtggggtgttacacttaa 380  Q
    ||| |||||||||||||||||  ||||||        |||| | ||| | |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||     
T  27284000 acaggtactattttatcgttggaatctttaacatgcaaacatagttgataatattatgtgatagttttaagtgttacactttgtggggtgttacacttat 27283901  T
Q  381 aacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgat 427  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  27283900 aacaaggtaggataaaattagattaagtatagtcttgttaatctgat 27283854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 145; E-Value: 4e-76
Query Start/End: Original strand, 184 - 429
Target Start/End: Original strand, 32820853 - 32821106
Alignment:
Q  184 aaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttg 283  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  32820853 aaaaagttaattttgatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattgatgaatgattaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatctta 32820952  T
Q  284 gacttacatgtactattttatcgttgacatcttt--------aacagaattgttgatatcatgtgatagttttgagtgttacactttgtggggtgttaca 375  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  ||||||        |||||| ||| |||||| ||| |||||| || ||||||||||||| |||||||||||     
T  32820953 gacttacatgtactattttatcgttggaatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatgcgatagtcttaagtgttacactttatggggtgttacg 32821052  T
Q  376 cttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatga 429  Q
    |||||||||||||||||||||| || ||||| |||| |||||||||||| ||||    
T  32821053 cttaaaacaaggtaggataaaactaaattaactgtagtcttgttaatctaatga 32821106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 141; E-Value: 9e-74
Query Start/End: Original strand, 184 - 429
Target Start/End: Original strand, 41764878 - 41765131
Alignment:
Q  184 aaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttg 283  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  41764878 aaaaggttaattttgatcttaatgttcggttcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaataataattcatccagtaatgcttgcaaaatcttg 41764977  T
Q  284 gacttacatgtactattttatcgttgacatcttt--------aacagaattgttgatatcatgtgatagttttgagtgttacactttgtggggtgttaca 375  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| |||||||        |||| | ||| |||||| |||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||    
T  41764978 gacttacatgtactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttctggggtgttaca 41765077  T
Q  376 cttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatga 429  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  41765078 cttaaaacaaggtagagtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatga 41765131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 140; E-Value: 4e-73
Query Start/End: Original strand, 184 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 23111553 - 23111298
Alignment:
Q  184 aaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttg 283  Q
    |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||     
T  23111553 aaaaagttaactttgatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgatttatgatcaatagtaattcttctagtaatgctttcaacatcttt 23111454  T
Q  284 gacttacatgtactattttatcgttgacatcttt--------aacagaattgttgatatcatgtgatagttttgagtgttacactttgtggggtgttaca 375  Q
    || |||||||||||||||||||||||  ||||||        |||||| ||| |||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||     
T  23111453 gatttacatgtactattttatcgttgttatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacg 23111354  T
Q  376 cttaaaacaaggtagg--ataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatga 429  Q
    |||||||||| ||| |  |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  23111353 cttaaaacaaagtatgatataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctaatga 23111298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 140; E-Value: 4e-73
Query Start/End: Original strand, 184 - 436
Target Start/End: Original strand, 46480929 - 46481189
Alignment:
Q  184 aaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttg 283  Q
    |||||||||||| | |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||     
T  46480929 aaaaagttaattatgatcttaatgttttatttatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgtttgcaacatctta 46481028  T
Q  284 gacttacatgtactattttatcgttgacatcttt--------aacagaattgttgatatcatgtgatagttttgagtgttacactttgtggggtgttaca 375  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||        |||| | ||  |||||| |||||||||| || ||||||||||||| || | |||||||    
T  46481029 gacttacatgtactattttatcgttgacatctttaacatgcaaacaaagttaatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttatgagatgttaca 46481128  T
Q  376 cttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgatcctatg 436  Q
    |||||||||| |||| ||||||||| || |||| || |||||||||||||||||| |||||    
T  46481129 cttaaaacaatgtagaataaaattacatcaagtatagtcttgttaatctgatgatactatg 46481189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 184 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 44599027 - 44598774
Alignment:
Q  184 aaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattact---gattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatc 280  Q
    ||||| |||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||| |   |||||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||    
T  44599027 aaaaaattaattttaatcttaacgattgattcatttt-aaattgttgattattattgattaatgatcaatagt--ttcatctagtaatgcttgtaacatc 44598931  T
Q  281 ttggacttacatgtactattttatcgttgacatctttaaca--------gaattgttgatatcatgtgatagttttgagtgttacactttgtggggtgtt 372  Q
    || |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||        || ||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||    
T  44598930 ttagacttacatgtattattttatcgttgtcatctttaacatgcaaacagagttgttgatatcatgtgatagtcttaggtgttacactttgtggggtgtt 44598831  T
Q  373 acacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatga 429  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  44598830 acacttaaaacaaggtagaataaaattagattaaatgtattcttgttaatctgatga 44598774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 138; E-Value: 6e-72
Query Start/End: Original strand, 184 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 24212103 - 24211849
Alignment:
Q  184 aaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagta-attcatctagtaatgcttgcaacatctt 282  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  24212103 aaaaagttaattttgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtatattcatctagtaatgcttgcaacatctt 24212004  T
Q  283 ggacttacatgtactattttatcgttgacatctttaac--------agaattgttgatatcatgtgatagttttgagtgttacactttgtggggtgttac 374  Q
    ||||||| | |||||||||||||||||  |||||||||        | | ||| |||||| |||||||||| ||  |||||||||||||| || ||||||    
T  24212003 ggacttataggtactattttatcgttggaatctttaacatgcaaataaagttgatgatattatgtgatagtcttaggtgttacactttgtaggatgttac 24211904  T
Q  375 acttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatga 429  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||    
T  24211903 acttagaacaaggtatgataaaattatattaagtgtagtcttgttaacctgatga 24211849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 136; E-Value: 9e-71
Query Start/End: Original strand, 202 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 11071546 - 11071314
Alignment:
Q  202 ttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattt 301  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||    
T  11071546 ttaatgtttgattcatttttaaattgttgattaatgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgtttgcaacatcttggacttacaggtattattt 11071447  T
Q  302 tatcgttgacatctttaaca---gaa-----ttgttgatatcatgtgatagttttgagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggat 393  Q
    ||||||||   |||||||||   |||     ||| |||||| |||||||| | || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  11071446 tatcgttg---tctttaacatgcgaacaaagttgatgatattatgtgataatcttaagtgttacactttgtggggtattacacttaaaacaaggtaggat 11071350  T
Q  394 aaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatga 429  Q
    |||||||||||||| ||| | |||||||||||||||    
T  11071349 aaaattagattaagcgtagtgttgttaatctgatga 11071314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 184 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 7335154 - 7334902
Alignment:
Q  184 aaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttg 283  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7335154 aaaaaattaattttgatcttaatgtttgattcatttttaaattattgatttctgattaatgattaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttg 7335055  T
Q  284 gacttacatgtactattttatcgttgacatctttaaca-------gaattgttgatatcatgtgatagttttgagtgttacactttgtggggtgttacac 376  Q
    || ||||| |||||||||||| || |  ||||||||||        | ||| |||||| || ||||| | || ||||||||||| |||||||||||||||    
T  7335054 gatttacaggtactattttattgtcggaatctttaacattcaaactagttgatgatattatctgataatcttaagtgttacactctgtggggtgttacac 7334955  T
Q  377 ttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatga 429  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  7334954 ttataacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaagctgatga 7334902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 133; E-Value: 5e-69
Query Start/End: Original strand, 184 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 10481966 - 10481713
Alignment:
Q  184 aaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttg 283  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||| ||| |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  10481966 aaaaagttaattttgatcttaatatttaatttatttttaaattgttaattactgattaacgatcaatagtaattcatctagtaatacttgcaacatcttg 10481867  T
Q  284 gacttacatgtactattttatcgttgacatcttt--------aacagaattgttgatatcatgtgatagttttgagtgttacactttgtggggtgttaca 375  Q
    |||||||   ||||||||||| ||||  ||||||        || ||| ||| |||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||    
T  10481866 gacttacggatactattttattgttggaatctttgacatgcaaagagagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttaca 10481767  T
Q  376 cttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatga 429  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  10481766 cttataacaaggtaagataaaattagattaagcgtagtcttgttaatctgatga 10481713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 131; E-Value: 8e-68
Query Start/End: Original strand, 214 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 12166074 - 12165860
Alignment:
Q  214 tcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttatcgttgacat 313  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||| |||    
T  12166074 tcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttagacttacagatactattttatcgttgtcat 12165975  T
Q  314 cttt--------aacagaattgttgatatcatgtgatagttttgagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagatta 405  Q
    ||||        |||||| ||| |||||| |||         ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  12165974 ctttaacatgcaaacagagttgctgatattatg---------tgagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtagaataaaattagatta 12165884  T
Q  406 agtgtattcttgttaatctgatga 429  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  12165883 agtgtattcttgttaatctgatga 12165860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 184 - 389
Target Start/End: Complemental strand, 35353469 - 35353256
Alignment:
Q  184 aaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttg 283  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  35353469 aaaaagttaattttgatcttaatgttcgattcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatagtgattcatctagtaatgcttgcaacatcttg 35353370  T
Q  284 gacttacatgtactattttatcgttgacatctttaac--------agaattgttgatatcatgtgatagttttgagtgttacactttgtggggtgttaca 375  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||        | | ||| |||||| ||| |||||| || ||||||||| ||| ||||||||||||    
T  35353369 gacttaaatgtactattttatcgttgacatctttaacatgcaaatatagttgatgatattatgagatagtcttaagtgttacattttctggggtgttaca 35353270  T
Q  376 cttaaaacaaggta 389  Q
    ||||||||||||||    
T  35353269 cttaaaacaaggta 35353256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 126; E-Value: 8e-65
Query Start/End: Original strand, 239 - 429
Target Start/End: Original strand, 33688117 - 33688315
Alignment:
Q  239 ttaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttatcgttgacatctttaac--------agaattgttg 330  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||        ||| ||| ||    
T  33688117 ttaatgatcaatagcaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttatcattgacatctttaacttgcaaacagagttgctg 33688216  T
Q  331 atatcatgtgatagttttgagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatga 429  Q
    ||||||| ||||||| |||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33688217 atatcatatgatagtcttgaatgttacactttatggagtgttacacttaaaacaaagtatgataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatga 33688315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 126; E-Value: 8e-65
Query Start/End: Original strand, 184 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 37347382 - 37347137
Alignment:
Q  184 aaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttg 283  Q
    |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  37347382 aaaaagttaattatgatcttaatgtttgattcatttttaaattgttaattacggattaatgatcaatagtaattcatcgagtaatgcttgcaatatcttg 37347283  T
Q  284 gacttacatgtactattttatcgttgacatcttt--------aacagaattgttgatatcatgtgatagttttgagtgttacactttgtggggtgttaca 375  Q
    ||||||||  |||||||||||| ||| |||||||        |||||| ||| |||||| ||||| |||| || ||||||||||||||||| || |||||    
T  37347282 gacttacagatactattttatcattggcatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtggtagtcttaagtgttacactttgtggagt-ttaca 37347184  T
Q  376 cttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaat 422  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  37347183 cttaaaacaatgtatgataaaattagattaagtgtagtcctgttaat 37347137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 184 - 429
Target Start/End: Original strand, 48928097 - 48928350
Alignment:
Q  184 aaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttg 283  Q
    ||||| |||||||| |||| |||||| |||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  48928097 aaaaaattaattttgatctaaatgttcgatttatttttaaattgttgattgttgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgtttgcaacatcttg 48928196  T
Q  284 gacttacatgtactattttatcgttgacatcttt--------aacagaattgttgatatcatgtgatagttttgagtgttacactttgtggggtgttaca 375  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| ||| |||        |||| | ||| |||||| ||| |||||| || ||  ||||||||| || |||||||||    
T  48928197 gacttacatgtactatttcatcgttggcatttttaacatgcaaacatagttgatgatattatgcgatagtcttaagcattacactttctgaggtgttaca 48928296  T
Q  376 cttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatga 429  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  48928297 cttaaaacaatgtaggataaaattagattaagtgcaatcttgttaatctgatga 48928350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 184 - 427
Target Start/End: Complemental strand, 43925456 - 43925211
Alignment:
Q  184 aaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttg 283  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43925456 aaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattagtgattcatgattaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttg 43925357  T
Q  284 gacttacatgtactattttatcgttgacatcttt--------aacagaattgttgatatcatgtgatagttttgagtgttacactttgtggggtgttaca 375  Q
    |||      ||| ||||||||||||| |||||||        |||||| ||| |||||| ||||||| || || ||| ||| || ||||| |||||| ||    
T  43925356 gac------gtattattttatcgttggcatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtgattgtattaagtattaaacgttgtgaggtgttgca 43925263  T
Q  376 cttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgat 427  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  43925262 cttaaaacaaggtatgataaaattagattaagtgtattattgttagtctgat 43925211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 184 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 29173883 - 29173648
Alignment:
Q  184 aaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttg 283  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29173883 aaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattcatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttg 29173784  T
Q  284 gacttacatgtactattttatcgttgacatctt-------taacagaattgttgatatcatgtgatagttttgagtgttacactttgtggggtgttacac 376  Q
    ||||||||  |||||||||||||||| ||| ||        |||||| ||| |||||| |||||||||| || |                 |||| ||||    
T  29173783 gacttacagatactattttatcgttggcattttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtgatagtcttaa-----------------gtgtaacac 29173701  T
Q  377 ttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatga 429  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  29173700 ttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttagtttgatga 29173648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 113; E-Value: 5e-57
Query Start/End: Original strand, 184 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 26980667 - 26980431
Alignment:
Q  184 aaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttg 283  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||||||||     
T  26980667 aaaaagttaattttaatcttaatgattgattcatttttaaattgttgattaccgattaatgatcaacaataattcatctagtaatacttgcaacatctta 26980568  T
Q  284 gacttacatgtactattttatcgttgacatctttaac--------agaattgttgatatcatgtgatagttttgagtgttacactttgtggggtgttaca 375  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||        ||| ||| ||||||||||||||||| || |                 ||||||||    
T  26980567 gacttacagatactattttatcgttgacatctttaacatgcaaatagagttgctgatatcatgtgatagtcttaa-----------------gtgttaca 26980485  T
Q  376 cttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatga 429  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  26980484 cttaaaacaaggtagaataaaattagattaagtgtattcttgttaatttgatga 26980431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 255 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 43686330 - 43686148
Alignment:
Q  255 attcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttatcgttgacatctttaacagaa--------ttgttgatatcatgtgatagtt 346  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||| |         ||| |||||| |||||||||||    
T  43686330 attcatccagtaatgcttgcaacatcttggacttacaaatattattttatcgttgacatctttaacatacaaacatagttgatgatattatgtgatagtt 43686231  T
Q  347 ttgagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatga 429  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  43686230 ttaagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaaatgtattcttgttagtctgatga 43686148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 106; E-Value: 7e-53
Query Start/End: Original strand, 184 - 321
Target Start/End: Original strand, 31520541 - 31520678
Alignment:
Q  184 aaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttg 283  Q
    |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  31520541 aaaaagttaattatgatcttaatgtttgattcatttttaaattgttaattacggattaatgatcaatagtaattcatcgagtaatgcttgcaacatcttg 31520640  T
Q  284 gacttacatgtactattttatcgttgacatctttaaca 321  Q
    ||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||    
T  31520641 gacttacagatactattttatcgttggcatctttaaca 31520678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 101; E-Value: 7e-50
Query Start/End: Original strand, 185 - 321
Target Start/End: Original strand, 12390450 - 12390586
Alignment:
Q  185 aaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttgg 284  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  12390450 aaaagttaattttgatcttaatgtttatttcatttttaaattgtcaattactgattaatgataaatagtaattcatctagtaatggttgcaacatcttgg 12390549  T
Q  285 acttacatgtactattttatcgttgacatctttaaca 321  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  12390550 acttacatgtactattttatcattggcatctttaaca 12390586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 189 - 321
Target Start/End: Original strand, 44411345 - 44411477
Alignment:
Q  189 gttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggactt 288  Q
    ||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44411345 gttaattatgatcttaatgtttcattcatttttaaattgttgattactgattaatggtcaatattaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggactt 44411444  T
Q  289 acatgtactattttatcgttgacatctttaaca 321  Q
    |||  || ||||||||||||| |||||||||||    
T  44411445 acagataatattttatcgttggcatctttaaca 44411477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 96; E-Value: 7e-47
Query Start/End: Original strand, 202 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 37704525 - 37704406
Alignment:
Q  202 ttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattt 301  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  37704525 ttaatgtttgattcatttgtaaattgttgattactaattaatgatcaatagtaattcatctggtaatgcttgcaacatcttggacttacagatactattt 37704426  T
Q  302 tatcgttgacatctttaaca 321  Q
    |||||||| |||||||||||    
T  37704425 tatcgttggcatctttaaca 37704406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 184 - 321
Target Start/End: Original strand, 32593007 - 32593143
Alignment:
Q  184 aaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttg 283  Q
    |||||||||||||| |||||||||||  ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||  ||| |||||||||    
T  32593007 aaaaagttaattttgatcttaatgttcaattcatttt-aaattgttgattgctgattaatgatccatagtaatttatctagtaatatttgtaacatcttg 32593105  T
Q  284 gacttacatgtactattttatcgttgacatctttaaca 321  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  32593106 gacttacatgtactattttaacgttgacatctttaaca 32593143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 184 - 321
Target Start/End: Original strand, 34361976 - 34362115
Alignment:
Q  184 aaaaagttaattttaa-tctt-aatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatct 281  Q
    |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  34361976 aaaaagttaattttaaatctttaatgtttgattcatttttaaattgttaatgactgattaatgatcaaaagtaattcatctagtaatgtttgcaatatct 34362075  T
Q  282 tggacttacatgtactattttatcgttgacatctttaaca 321  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||| || |||||||    
T  34362076 tggacttacagatactattttatcgttgatatttttaaca 34362115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 274 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 38258816 - 38258653
Alignment:
Q  274 caacatcttggacttacatgtactattttatcgttgacatctttaacag--------aattgttgatatcatgtgatagttttgagtgttacactttgtg 365  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||         | ||| |||||| |||||||||| || ||||||||||||||||    
T  38258816 caacatcttggacttacaggtactattttatcgttggaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtg 38258717  T
Q  366 gggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatga 429  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  38258716 gggtgttacgcttataacaaggtaggataaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatga 38258653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 318 - 427
Target Start/End: Original strand, 27421322 - 27421431
Alignment:
Q  318 aacagaattgttgatatcatgtgatagttttgagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttg 417  Q
    |||||| ||| |||||||||  |||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27421322 aacagagttgctgatatcatacgatagtcttaagtgttacactttgtgggatgttacacttaaaataaggtaggataaaattagattaagtgtattcttg 27421421  T
Q  418 ttaatctgat 427  Q
    ||||||||||    
T  27421422 ttaatctgat 27421431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 318 - 427
Target Start/End: Complemental strand, 37704376 - 37704267
Alignment:
Q  318 aacagaattgttgatatcatgtgatagttttgagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttg 417  Q
    |||||| ||| |||||| || ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  37704376 aacagagttgatgatattatatgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattaaattaagtgtagtcttg 37704277  T
Q  418 ttaatctgat 427  Q
    ||||||||||    
T  37704276 ttaatctgat 37704267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 184 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 38258940 - 38258867
Alignment:
Q  184 aaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaatt 257  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38258940 aaaaagttaattttgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaatt 38258867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 64; E-Value: 8e-28
Query Start/End: Original strand, 350 - 429
Target Start/End: Original strand, 44413353 - 44413432
Alignment:
Q  350 agtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatga 429  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||    
T  44413353 agtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtatgataaaattagattaagtgtagccttgttaatttgatga 44413432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 329 - 429
Target Start/End: Original strand, 48928517 - 48928617
Alignment:
Q  329 tgatatcatgtgatagttttgagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatg 428  Q
    |||||| ||| |||||| || ||  ||||||||| || |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  48928517 tgatattatgcgatagtcttaagcattacactttctgaggtgttacacttaaaataatgtaggataaaattagattaagtgcaatcttgttaatctgatg 48928616  T
Q  429 a 429  Q
    |    
T  48928617 a 48928617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 368 - 429
Target Start/End: Original strand, 12390622 - 12390683
Alignment:
Q  368 gtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatga 429  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  12390622 gtgttacacttaaaagaaggtagaataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatga 12390683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 368 - 422
Target Start/End: Original strand, 31520716 - 31520770
Alignment:
Q  368 gtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaat 422  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  31520716 gtgttacacttaaaacaaggtatgataaaattagattaagtgtagtcttgttaat 31520770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 368 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 38053647 - 38053586
Alignment:
Q  368 gtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatga 429  Q
    |||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  38053647 gtgttacacttataacaaagtatgataaaattagattaagtgtagtcttgttaatttgatga 38053586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 238 - 302
Target Start/End: Original strand, 27421219 - 27421283
Alignment:
Q  238 attaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactatttt 302  Q
    |||||||||||||| || ||||||| ||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27421219 attaatgatcaatattatttcatcttgtaacatttgcaacatcttggacttacatgtactatttt 27421283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 255 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 38053751 - 38053685
Alignment:
Q  255 attcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttatcgttgacatctttaaca 321  Q
    ||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||  ||||||||||    
T  38053751 attcatcaaataatgtttgcaacatcttggacttacaggtactattttattgttggaatctttaaca 38053685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 368 - 429
Target Start/End: Original strand, 32593181 - 32593242
Alignment:
Q  368 gtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatga 429  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || | | ||| |||||||||||    
T  32593181 gtgttacacttaaaacaaggtatgataaaattagattaaatgcagttttgataatctgatga 32593242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 184 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 12166250 - 12166215
Alignment:
Q  184 aaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcattt 219  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12166250 aaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcattt 12166215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 189; Significance: 1e-102; HSPs: 49)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 184 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 38644363 - 38644110
Alignment:
Q  184 aaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttg 283  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38644363 aaaaagttaattttaatcttaatgtttgatttatttttaaatttttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttg 38644264  T
Q  284 gacttacatgtactattttatcgttgacatcttt--------aacagaattgttgatatcatgtgatagttttgagtgttacactttgtggggtgttaca 375  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||        |||||| ||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  38644263 gacttacatgtactattttatcattgacatctttaacttgcaaacagagttgctgatatcatatgatagtcttgagtgttacactttatggagtgttaca 38644164  T
Q  376 cttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatga 429  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38644163 cttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatga 38644110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 181; E-Value: 1e-97
Query Start/End: Original strand, 184 - 429
Target Start/End: Original strand, 5299751 - 5300004
Alignment:
Q  184 aaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttg 283  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5299751 aaaaagttaattttaatcttaatgtttaattcatttttaaattgttgattactgattaatgattaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttg 5299850  T
Q  284 gacttacatgtactattttatcgttgacatcttt--------aacagaattgttgatatcatgtgatagttttgagtgttacactttgtggggtgttaca 375  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  ||||||        |||| ||||| ||||||||| ||||| | || ||||||||||||||||||||||||||    
T  5299851 gacttacatgtactattttatcgttgttatctttaacatgcaaacaaaattgctgatatcatttgataatcttaagtgttacactttgtggggtgttaca 5299950  T
Q  376 cttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatga 429  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5299951 cttaaaacaaggttggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatga 5300004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 173; E-Value: 7e-93
Query Start/End: Original strand, 184 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 11727409 - 11727156
Alignment:
Q  184 aaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttg 283  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  11727409 aaaaagttaattttaatcttaataattgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatctta 11727310  T
Q  284 gacttacatgtactattttatcgttgacatcttt--------aacagaattgttgatatcatgtgatagttttgagtgttacactttgtggggtgttaca 375  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| |||||||        |||| | ||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||    
T  11727309 gacttacatatactattttatcgttggcatctttaacattcaaacaaagttgttgatatcatgtgatagtcttaagtgttacattttgtggggtgttaca 11727210  T
Q  376 cttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatga 429  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  11727209 cttaaaataaggtaggataaaattagattaaatgtattcttgttaatttgatga 11727156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 165; E-Value: 4e-88
Query Start/End: Original strand, 184 - 429
Target Start/End: Original strand, 16446680 - 16446933
Alignment:
Q  184 aaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttg 283  Q
    |||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16446680 aaaaagttaattttgattttaatgttagattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttg 16446779  T
Q  284 gacttacatgtactattttatcgttgacatcttt--------aacagaattgttgatatcatgtgatagttttgagtgttacactttgtggggtgttaca 375  Q
    |||||||| ||||||||||||| ||| |||||||        |||||| ||| |||||| |||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||    
T  16446780 gacttacaggtactattttatcattggcatctttaacatgcaaacagatttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacgctttgtggggtgttaca 16446879  T
Q  376 cttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatga 429  Q
    ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||    
T  16446880 cttgaaacaaggtaggataaaattaaattaagtgtagtcttgttaatctgatga 16446933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 165; E-Value: 4e-88
Query Start/End: Original strand, 184 - 380
Target Start/End: Original strand, 24823199 - 24823395
Alignment:
Q  184 aaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttg 283  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24823199 aaaaagttaattttaatcttaatgtttgatttatttttaaattgttgattactgattaatgaacaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttg 24823298  T
Q  284 gacttacatgtactattttatcgttgacatctttaacagaattgttgatatcatgtgatagttttgagtgttacactttgtggggtgttacacttaa 380  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  24823299 gacttacatgtactattttatcgttggcatctttaacagagttgttgatatcatgtgataatcttgagtattatactttgtggggtgttacacttaa 24823395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 155; E-Value: 4e-82
Query Start/End: Original strand, 184 - 423
Target Start/End: Original strand, 37970324 - 37970571
Alignment:
Q  184 aaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttg 283  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37970324 aaaaagttaattttgatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgatttctgattaatgatcaacagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttg 37970423  T
Q  284 gacttacatgtactattttatcgttgacatcttt--------aacagaattgttgatatcatgtgatagttttgagtgttacactttgtggggtgttaca 375  Q
    |||||||| |||||||||||| ||    ||||||        |||||| ||| |||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||    
T  37970424 gacttacaggtactattttattgtaaggatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttaca 37970523  T
Q  376 cttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatc 423  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  37970524 cttataacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatc 37970571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 153; E-Value: 6e-81
Query Start/End: Original strand, 184 - 429
Target Start/End: Original strand, 1149437 - 1149690
Alignment:
Q  184 aaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttg 283  Q
    ||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1149437 aaaaaattaattttgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattaccgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttg 1149536  T
Q  284 gacttacatgtactattttatcgttgacatcttt--------aacagaattgttgatatcatgtgatagttttgagtgttacactttgtggggtgttaca 375  Q
    |||||||| |||||||||||||||||  ||||||        |||| | ||| | |||| |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||     
T  1149537 gacttacaggtactattttatcgttggaatctttaacatgcaaacaaagttgataatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacg 1149636  T
Q  376 cttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatga 429  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  1149637 cttataacaaggtaagataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatga 1149690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 153; E-Value: 6e-81
Query Start/End: Original strand, 184 - 429
Target Start/End: Original strand, 27082643 - 27082896
Alignment:
Q  184 aaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttg 283  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27082643 aaaaagttaattttgatcttaatgtttaattcatttttaaattgttgattattgattaatgataagtagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttg 27082742  T
Q  284 gacttacatgtactattttatcgttgacatcttt--------aacagaattgttgatatcatgtgatagttttgagtgttacactttgtggggtgttaca 375  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||        |||| | ||  |||||| |||||||||| || |||||||||||||| ||||||||| |    
T  27082743 gacttacatgtactattttatcgttgacatctttaacatgcaaacatagtttatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgcggggtgttaga 27082842  T
Q  376 cttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatga 429  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  27082843 cttaaaacatggtaagataaaattagattaagtgtagtcttgttaatttgatga 27082896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 153; E-Value: 6e-81
Query Start/End: Original strand, 184 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 34895347 - 34895099
Alignment:
Q  184 aaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttg 283  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  34895347 aaaaagttaattttgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatatagtaatgcttgcaacatcttg 34895248  T
Q  284 gacttacatgtactattttatcgttgacatcttt--------aacagaattgttgatatcatgtgatagttttgagtgttacactttgtggggtgttaca 375  Q
     |||||||||||||||||| |||||| |||||||        |||||| ||| |||||| ||||||||||     |||||||| ||||||||||||||||    
T  34895247 aacttacatgtactattttttcgttggcatctttaacatgcaaacagatttgatgatattatgtgatagt-----gtgttacattttgtggggtgttaca 34895153  T
Q  376 cttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatga 429  Q
    ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  34895152 cttgaaacaaggttggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatga 34895099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 153; E-Value: 6e-81
Query Start/End: Original strand, 184 - 429
Target Start/End: Original strand, 36694771 - 36695024
Alignment:
Q  184 aaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttg 283  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  36694771 aaaaagttacttttaattttaatgtttgatttatttttaaattattgattacttattcatgataaatagtaattcatctagtgatgcttgcaacatcttg 36694870  T
Q  284 gacttacatgtactattttatcgttgacatcttt--------aacagaattgttgatatcatgtgatagttttgagtgttacactttgtggggtgttaca 375  Q
    || ||||||||||||||||||||||| |||||||        |||||| ||| |||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||    
T  36694871 gatttacatgtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttaca 36694970  T
Q  376 cttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatga 429  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  36694971 cttaaaacaatgtaggataaaattagattaagtgtattcttcttagtctgatga 36695024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 153; E-Value: 6e-81
Query Start/End: Original strand, 184 - 429
Target Start/End: Original strand, 43643400 - 43643653
Alignment:
Q  184 aaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttg 283  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43643400 aaaaagttaattttgatcttaatgtttgattcatttttaaattgtcgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttg 43643499  T
Q  284 gacttacatgtactattttatcgttgacatcttt--------aacagaattgttgatatcatgtgatagttttgagtgttacactttgtggggtgttaca 375  Q
    ||||||||||||||||||||| || |  || |||        |||||| ||| | |||| |||||||||| || |||||||||||||||| ||||||||     
T  43643500 gacttacatgtactattttattgtcggaatttttaacatgcaaacagagttgataatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtgaggtgttacg 43643599  T
Q  376 cttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatga 429  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  43643600 cttataacaaggtaggataaaattagatcaagtgtagtcttgttaatctgatga 43643653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 149; E-Value: 2e-78
Query Start/End: Original strand, 184 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 1205312 - 1205059
Alignment:
Q  184 aaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttg 283  Q
    |||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  1205312 aaaaagttaattttgatcttgttgtttgattcatttttaaattgctgattagtgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatacttgcaacatcttg 1205213  T
Q  284 gacttacatgtactattttatcgttgacatcttt--------aacagaattgttgatatcatgtgatagttttgagtgttacactttgtggggtgttaca 375  Q
    |||||||| |||||||||||||||| | ||||||        |||||| ||| |||||| ||| |||||| || |||||||||||||||||||||||||     
T  1205212 gacttacaggtactattttatcgttaaaatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatgcgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacg 1205113  T
Q  376 cttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatga 429  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  1205112 cttaaaacaaggtaagataaaattagattaagtgtaatcttgttaatatgatga 1205059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 148; E-Value: 6e-78
Query Start/End: Original strand, 185 - 429
Target Start/End: Original strand, 4132492 - 4132743
Alignment:
Q  185 aaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttgg 284  Q
    ||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4132492 aaaagttaattttgatcttaatgtgtaattcatttttaaattgttgattacaaattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttgg 4132591  T
Q  285 acttacatgtactattttatcgttgacatcttt--------aacagaattgttgatatcatgtgatagttttgagtgttacactttgtggggtgttacac 376  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| |||||||        |||| | ||| |||||| |||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  4132592 acttacaggtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttatgtgttacactttgtggggtgttacac 4132691  T
Q  377 ttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatga 429  Q
    || ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  4132692 tt-aaacaaggtagaataaaattagattaagtgtagtcttgttaatttgatga 4132743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 148; E-Value: 6e-78
Query Start/End: Original strand, 186 - 429
Target Start/End: Original strand, 6098320 - 6098576
Alignment:
Q  186 aaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttgga 285  Q
    |||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6098320 aaagttaatcatgatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactaattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttgga 6098419  T
Q  286 cttacatgtac-----tattttatcgttgacatcttt--------aacagaattgttgatatcatgtgatagttttgagtgttacactttgtggggtgtt 372  Q
    |||||| ||||     |||| |||||||| |||||||        |||||| ||| |||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  6098420 cttacaagtactattgtattgtatcgttggcatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgtt 6098519  T
Q  373 acacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatga 429  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  6098520 acacttaaaacaagataggataaaattagattaaatgtagtcttgttaatctgatga 6098576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 148; E-Value: 6e-78
Query Start/End: Original strand, 184 - 420
Target Start/End: Complemental strand, 40862805 - 40862560
Alignment:
Q  184 aaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcattttt-aaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatctt 282  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40862805 aaaaagttacttttaatcttaatgtttgattcattttttaaattgtcgattactgatttatgacaaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatctt 40862706  T
Q  283 ggacttacatgtactattttatcgttgacatctttaacaga-----attgttg---atatcatgtgatagttttgagtgttacactttgtggggtgttac 374  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |     || ||||   |||| |||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||    
T  40862705 ggacttacatgtactattttatcgttgacatctttaacatacaaacatagttgataatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggagtgttac 40862606  T
Q  375 acttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgtta 420  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  40862605 acttagaacaaagtaggataaaattagattaagtgtatttttgtta 40862560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 184 - 427
Target Start/End: Complemental strand, 44869882 - 44869631
Alignment:
Q  184 aaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttg 283  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  44869882 aaaaagttaattttaattttaatgtttgattcatttttaaattgttggttactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaatatcttg 44869783  T
Q  284 gacttacatgtactattttatcgttgacatctttaaca--gaa------ttgttgatatcatgtgatagttttgagtgttacactttgtggggtgttaca 375  Q
    ||||||   |||||||||||||||||||||||||||||  |||      ||| ||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||    |||    
T  44869782 gacttatcggtactattttatcgttgacatctttaacatggaaacaaagttgctgatatcatttgatagtcttaagtgttacactttgtgggg-acaaca 44869684  T
Q  376 cttaaaacaaggtaggat-aaaattagattaagtgtattcttgttaatctgat 427  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  44869683 cttaaaacaaggtaggataaaaattagattaagtgtattattgttaatctgat 44869631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 146; E-Value: 9e-77
Query Start/End: Original strand, 187 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 466214 - 465974
Alignment:
Q  187 aagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggac 286  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  466214 aagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttagac 466115  T
Q  287 ttacatgtactattttatcgttgacatcttt--------aacagaattgttgatatcatgtgatagttttgagtgttacactttgtggggtgttacactt 378  Q
    ||||| ||| ||||||||| ||| |||||||        |||||| ||| |||||| |||         |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  466114 ttacaggtattattttatcattggcatctttaacatgcaaacagagttgctgatat-atg---------tgagtgttacactttgtggggtgttacactt 466025  T
Q  379 aaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatga 429  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  466024 aaaacaatgtaagataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatga 465974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 146; E-Value: 9e-77
Query Start/End: Original strand, 184 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 12876495 - 12876241
Alignment:
Q  184 aaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttg 283  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  12876495 aaaaagttacttttaattttaatgtttgatttattttcaaactgttgattacttattcatgataaatagtaattcatctagtaatgcctgtaacatcttg 12876396  T
Q  284 gacttacatgtactattttatcgttgacatcttt--------aacagaattgttgatatcatgtgatagt-tttgagtgttacactttgtggggtgttac 374  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||        |||||| ||| |||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  12876395 gacttacatgtactattttatcgttgacatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtgatagtctttaagtgttacactttgtggggtgttac 12876296  T
Q  375 acttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatga 429  Q
     ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||    
T  12876295 gcttaaaataaggtaggataaaattagattaagtgtatccttcttaatctgatga 12876241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 145; E-Value: 4e-76
Query Start/End: Original strand, 184 - 429
Target Start/End: Original strand, 7890762 - 7891015
Alignment:
Q  184 aaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttg 283  Q
    |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||     
T  7890762 aaaaagttaattttgatcttaatatttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatttta 7890861  T
Q  284 gacttacatgtactattttatcgttgacatctttaa--------cagaattgttgatatcatgtgatagttttgagtgttacactttgtggggtgttaca 375  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||        |||| ||| |||||| |||||||| | || |||||||||| ||||||||||||||     
T  7890862 gacttacatgtactattttatcgttggaatctttaacatgcaaccagagttgatgatattatgtgataatcttaagtgttacacgttgtggggtgttacg 7890961  T
Q  376 cttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatga 429  Q
    |||| ||||| ||| ||||||| |||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  7890962 cttataacaaagtaagataaaactagattgagtgtagtcttgttaatctgatga 7891015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 145; E-Value: 4e-76
Query Start/End: Original strand, 184 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 16223248 - 16222995
Alignment:
Q  184 aaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttg 283  Q
    ||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  16223248 aaaaaattaattttgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatctta 16223149  T
Q  284 gacttacatgtactattttatcgttgacatcttt--------aacagaattgttgatatcatgtgatagttttgagtgttacactttgtggggtgttaca 375  Q
    |||||||||||||||||||||| |||  ||||||        |||| | ||| |||||| |||||||| | || ||||||||||||| |||||||||||     
T  16223148 gacttacatgtactattttatcattggaatctttaaaatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatactcttaagtgttacactttttggggtgttacg 16223049  T
Q  376 cttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatga 429  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  16223048 tttaaaacaaggaaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatcggatga 16222995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 145; E-Value: 4e-76
Query Start/End: Original strand, 184 - 429
Target Start/End: Original strand, 39098924 - 39099177
Alignment:
Q  184 aaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttg 283  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  39098924 aaaaaattaattttaattttaatgtttgatgcatttttaaattattgattattaattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacattttg 39099023  T
Q  284 gacttacatgtactattttatcgttgacatcttt--------aacagaattgttgatatcatgtgatagttttgagtgttacactttgtggggtgttaca 375  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||| |||        |||||| ||| |||||||||| |||||| || ||||| | |||||||||| |||||||    
T  39099024 gacttacatatactattttatcgttgacatatttaacatgcaaacagagttgctgatatcatgcgatagtcttaagtgtgatactttgtgggatgttaca 39099123  T
Q  376 cttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatga 429  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  39099124 cttaaaacagggtaagataaaattagattaagtgtatttttgttaatctgatga 39099177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 140; E-Value: 4e-73
Query Start/End: Original strand, 184 - 427
Target Start/End: Original strand, 8803621 - 8803873
Alignment:
Q  184 aaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagta-attcatctagtaatgcttgcaacatctt 282  Q
    |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||    
T  8803621 aaaaagttaattttgattttaatgtttgattcatttttaaattgttcattactgattaatgatcaatagtatattcatctggtaatgcttgcaacatctt 8803720  T
Q  283 ggacttacatgtactattttatcgttgacatctttaac--------agaattgttgatatcatgtgatagttttgagtgttacactttgtggggtgttac 374  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||        ||| ||| |||||| |||||||||| || ||||||||||||| | |||||||||    
T  8803721 ggacttacatgtactattttatcgttggaatctttaacatgcaaatagagttgatgatattatgtgatagtattaagtgttacactttttagggtgttac 8803820  T
Q  375 acttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgat 427  Q
     |||| ||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||    
T  8803821 gcttagaacaaggtatgataaaattatattaagtgtagtcttgttaacctgat 8803873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 138; E-Value: 6e-72
Query Start/End: Original strand, 184 - 429
Target Start/End: Original strand, 1953793 - 1954047
Alignment:
Q  184 aaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttg 283  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||    
T  1953793 aaaaaattaattttgatcttaatgtttgattcattttaaaattgttgattattgattaatgatcaatagtaattcatctaataatgcttgcaaaatcttg 1953892  T
Q  284 gacttacatgtactattttatcgttgacatcttt--------aacagaattgttgatatcatgtgatagttttgagtgttacactttgtgggg-tgttac 374  Q
    || ||||| |||||||||||||||||||| ||||        |||||| ||| |||| | |||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||    
T  1953893 gatttacaggtactattttatcgttgacaactttaacatgcaaacagagttgatgatgttatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggatgttac 1953992  T
Q  375 acttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatga 429  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| || | ||||||||||||    
T  1953993 acttaaaacaaggtatgataaaattagatttagtgtagtcatattaatctgatga 1954047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 138; E-Value: 6e-72
Query Start/End: Original strand, 184 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 33906595 - 33906344
Alignment:
Q  184 aaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttg 283  Q
    |||||||||||||| |||||| | || ||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33906595 aaaaagttaattttgatcttactattcgattcatttttaaatt--tgattgctgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttg 33906498  T
Q  284 gacttacatgtactattttatcgttgacatcttt--------aacagaattgttgatatcatgtgatagttttgagtgttacactttgtggggtgttaca 375  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||        |||| | ||| |||||| ||| |||||| || ||||||||||||| |||  ||||||     
T  33906497 gacttacatgtactattttatcgttgacatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgcgatagtcttaagtgttacactttttggaatgttacc 33906398  T
Q  376 cttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatga 429  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  33906397 cttaaaacaaggtatgataaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatga 33906344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 208 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 9864509 - 9864280
Alignment:
Q  208 tttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttatcgt 307  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  9864509 tttgattcatttttaaattgttgattaccgattcatgattactagttattcatctagtaatgcttgcaacatcttgaacttacaggtactattttatcgt 9864410  T
Q  308 tgacatcttt--------aacagaattgttgatatcatgtgatagttttgagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaatt 399  Q
    || |||||||        |||| ||||| |||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9864409 tggcatctttaacatgcaaacaaaattgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaatt 9864310  T
Q  400 agattaagtgtattcttgttaatctgatga 429  Q
    | ||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  9864309 atattaagtgtattcttattagtctgatga 9864280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 184 - 429
Target Start/End: Original strand, 23854236 - 23854489
Alignment:
Q  184 aaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttg 283  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23854236 aaaaagttaattttgatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgatttctgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttg 23854335  T
Q  284 gacttacatgtactattttatcgttgacatctttaa--------cagaattgttgatatcatgtgatagttttgagtgttacactttgtggggtgttaca 375  Q
    |||||||| |||||||||||| || |  ||||||||        |||| ||| |||||| ||||||| || || ||||||||||||| || |||||||||    
T  23854336 gacttacaggtactattttattgtcggaatctttaacatgcaagcagagttgatgatattatgtgattgtcttaagtgttacactttatgcggtgttaca 23854435  T
Q  376 cttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatga 429  Q
    |||| ||| ||||| |||||||||||||||| |||| | |||||||||| ||||    
T  23854436 cttataactaggtaagataaaattagattaattgtagtattgttaatctaatga 23854489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 184 - 429
Target Start/End: Original strand, 35459516 - 35459769
Alignment:
Q  184 aaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttg 283  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||    
T  35459516 aaaaagttaattttgatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgatttctgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgtttgcaacattttg 35459615  T
Q  284 gacttacatgtactattttatcgttgacatcttt--------aacagaattgttgatatcatgtgatagttttgagtgttacactttgtggggtgttaca 375  Q
    ||||||||  ||||||||||| || || ||||||        |||||||||| |||||| |||| ||||| || ||||||| | | |||||| |||||||    
T  35459616 gacttacagatactattttattgtcgaaatctttaacatacaaacagaattgatgatattatgtaatagtcttaagtgttataatctgtgggatgttaca 35459715  T
Q  376 cttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatga 429  Q
     ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  35459716 tttataacaaagtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatga 35459769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 184 - 321
Target Start/End: Original strand, 34951862 - 34951999
Alignment:
Q  184 aaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttg 283  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||     
T  34951862 aaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatgtagtaagacttgcaacatctta 34951961  T
Q  284 gacttacatgtactattttatcgttgacatctttaaca 321  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34951962 gacttacatgtactattttatcgttgacatctttaaca 34951999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 118; E-Value: 5e-60
Query Start/End: Original strand, 184 - 429
Target Start/End: Original strand, 30654388 - 30654641
Alignment:
Q  184 aaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagta-attcatctagtaatgcttgcaacatctt 282  Q
    |||||||||||||| || ||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||    
T  30654388 aaaaagttaattttgattttaatatttgattcatttt-aaattgttaattactgattaatgatcaataatatattcatttagtaatgcttgcaacatctt 30654486  T
Q  283 ggacttacatgtactattttatcgttgacatctttaac--------agaattgttgatatcatgtgatagttttgagtgttacactttgtggggtgttac 374  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| || ||||||        ||| ||  |||||| |||||||||| || ||||||||||||||| |||||||||    
T  30654487 ggacttacaggtactattttatcgttgaaatttttaacatgcaaatagagtttatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtagggtgttac 30654586  T
Q  375 acttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatga 429  Q
     |||||||||| ||| | |||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||    
T  30654587 gcttaaaacaatgtatggtaaaattaaattaagtgtagtcttgttaacctgatga 30654641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 184 - 429
Target Start/End: Original strand, 31933691 - 31933944
Alignment:
Q  184 aaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttg 283  Q
    ||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||| |||||     
T  31933691 aaaaaattaattttgatcttaatatttgattcatttttaaatcgttgattactgattaatgatcaataataattcatctagtaatgtctgcaatatctta 31933790  T
Q  284 gacttacatgtactattttatcgttgacatcttt--------aacagaattgttgatatcatgtgatagttttgagtgttacactttgtggggtgttaca 375  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||  ||| ||        |||||| ||| |||||| |||||||| |||| |||||||||||||||| ||| |||      
T  31933791 gacttacaagtactattttattgttggaatccttaacatgcaaacagacttgatgatattatgtgataattttaagtgttacactttgtgcggtattatg 31933890  T
Q  376 cttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatga 429  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  31933891 cttataacaaggtatgataaaattagattaagtgtagtcttgttaatcggatga 31933944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 184 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 12587967 - 12587830
Alignment:
Q  184 aaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttg 283  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||     
T  12587967 aaaaaattaattttgatcttaatgtttgattcatttttaaattgttaattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaaaatcttt 12587868  T
Q  284 gacttacatgtactattttatcgttgacatctttaaca 321  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  12587867 gacttacaggtactattttatcgttgacatctttaaca 12587830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 184 - 415
Target Start/End: Complemental strand, 18259464 - 18259229
Alignment:
Q  184 aaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttg 283  Q
    |||| |||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||     
T  18259464 aaaaggttaattttaattttaatgattgattcatttttaaattgttgattactcattactgatcaacaataattcatctagtaatgcttgcaacatctta 18259365  T
Q  284 gacttacatgtactattttatcgttgacatctttaaca--------gaattgttgatatcatgtgatagttttgagtgttacactttgtggggtgttaca 375  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||         ||||| ||||||| |||||     ||  ||||||||||||||||| |||||||    
T  18259364 gacttacatgtactattttatcgttgacatttttaacatgcaaattaaattgctgatatcttgtga----cttaggtgttacactttgtgggatgttaca 18259269  T
Q  376 cttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattct 415  Q
    ||||||| |||||| |||||||||| ||||| ||||||||    
T  18259268 cttaaaataaggtatgataaaattaaattaaatgtattct 18259229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 184 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 35859319 - 35859182
Alignment:
Q  184 aaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttg 283  Q
    |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  35859319 aaaaagttaattttgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatattaattcatctagtaatgcttgcaacatctcg 35859220  T
Q  284 gacttacatgtactattttatcgttgacatctttaaca 321  Q
     ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  35859219 aacttacaagtactattttatcgttggcatctttaaca 35859182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 255 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 13307936 - 13307755
Alignment:
Q  255 attcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttatcgttgacatcttta-------acagaattgttgatatcatgtgatagttt 347  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||| || |       ||||| ||||||||||||||||||||| |    
T  13307936 attcatcttgtaatgcttgcaacatcttgaacttacgggtactattttatcgttgacattttaacatgcaaacagagttgttgatatcatgtgatagtct 13307837  T
Q  348 tgagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatga 429  Q
    | |||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  13307836 taagtgttacactttgtggggtgttacatttaaaataaagtaggataaaattagattaagtgtattcttgctaatctgatga 13307755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 184 - 429
Target Start/End: Original strand, 10555010 - 10555260
Alignment:
Q  184 aaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagt--aattcatctagtaatgcttgcaacatct 281  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||   ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  10555010 aaaaaattaattttgatcttaatgtttgattcatttttaaattgtttattact---taatgatcaatagtgtaattcatctagtaatgcttgcaatatct 10555106  T
Q  282 tggacttacatgtactattttatcgttgacatcttt--------aacagaattgttgatatcatgtgatagttttgagtgttacactttgtggggtgtta 373  Q
    |||||||||| |||||||||||| || |  ||||||        |||| | ||| |||||| |||||||||  |  ||||||||  |||||| ||||||     
T  10555107 tggacttacaggtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatag--tcaagtgttacgttttgtgaggtgttg 10555204  T
Q  374 cacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatga 429  Q
    | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  10555205 cgcttataacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatga 10555260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 184 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 33198187 - 33198057
Alignment:
Q  184 aaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttg 283  Q
    ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||     
T  33198187 aaaaagttaatcttaatcttaatgattgattcatttttaaattgttgattattgattaatgatcaatagtaattcatctagtgatgcttgcaacatttta 33198088  T
Q  284 gacttacatgtactattttatcgttgacatc 314  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  33198087 gacttacatgtactattttatcgttggcatc 33198057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 318 - 429
Target Start/End: Original strand, 41910935 - 41911046
Alignment:
Q  318 aacagaattgttgatatcatgtgatagttttgagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttg 417  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  41910935 aacagagttggtgatatcatgtgatagtattaagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaaatgtattcttg 41911034  T
Q  418 ttaatctgatga 429  Q
    ||||||||||||    
T  41911035 ttaatctgatga 41911046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 91; E-Value: 6e-44
Query Start/End: Original strand, 215 - 321
Target Start/End: Original strand, 1149756 - 1149862
Alignment:
Q  215 catttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttatcgttgacatc 314  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||  |||    
T  1149756 catttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttagacttacaagtactattttatcgttggaatc 1149855  T
Q  315 tttaaca 321  Q
    |||||||    
T  1149856 tttaaca 1149862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 320 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 43025943 - 43025834
Alignment:
Q  320 cagaattgttgatatcatgtgatagttttgagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgtt 419  Q
    |||| ||| |||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||    
T  43025943 cagagttgatgatattatgtgatagttttaagtgttacattttgtggggtgttacagttaaaataaggtaggataaaattagattaaatgtattcttctt 43025844  T
Q  420 aatctgatga 429  Q
    | ||||||||    
T  43025843 agtctgatga 43025834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 69; E-Value: 8e-31
Query Start/End: Original strand, 184 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 41362807 - 41362723
Alignment:
Q  184 aaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaat 268  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41362807 aaaaaattaattttgatcttaatgtttaattcatttttaaattgttgattactggttaatgatcaatagtaattcatctagtaat 41362723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 184 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 43026059 - 43025974
Alignment:
Q  184 aaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatg 269  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||    
T  43026059 aaaaagttaattttaattttaatgtttgattcatttttaaattgttgatcactgattcatgatcaatagtaatttatctaataatg 43025974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 356 - 429
Target Start/End: Original strand, 1150090 - 1150163
Alignment:
Q  356 acactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatga 429  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  1150090 acactttgtggggtgttacgcttataacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatga 1150163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 54; E-Value: 8e-22
Query Start/End: Original strand, 368 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 7998488 - 7998427
Alignment:
Q  368 gtgttacacttaaaacaaggtaggataaaa-ttagattaagtgtattcttgttaatctgatg 428  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7998488 gtgttacacttaaaacaaggtaggataaaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatg 7998427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 368 - 429
Target Start/End: Original strand, 34952028 - 34952089
Alignment:
Q  368 gtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatga 429  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  34952028 gtgttacacttaaaacaaagtaggataaaattagattaagtgtattcttattaatttgatga 34952089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 248 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 34463792 - 34463722
Alignment:
Q  248 aatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttatcgttgacatctttaaca 321  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||   ||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  34463792 aatagtaattcatttagtaatgcttgcaacat---ggacttataggtattattttatcgttgacatctttaaca 34463722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 369 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 41362707 - 41362647
Alignment:
Q  369 tgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatga 429  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||| || |||| || |||||||||||||||||    
T  41362707 tgttacacttaaaacaaggtatgataaaattatatcaagtttagtcttgttaatctgatga 41362647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 184 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 13307964 - 13307931
Alignment:
Q  184 aaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcat 217  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13307964 aaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcat 13307931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 336 - 380
Target Start/End: Complemental strand, 12585341 - 12585297
Alignment:
Q  336 atgtgatagttttgagtgttacactttgtggggtgttacacttaa 380  Q
    |||||||||| || ||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  12585341 atgtgatagtattaagtgttagattttgtggggtgttacacttaa 12585297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 184 - 216
Target Start/End: Original strand, 41910863 - 41910895
Alignment:
Q  184 aaaaagttaattttaatcttaatgtttgattca 216  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  41910863 aaaaagttaattttaatctgaatgtttgattca 41910895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 189; Significance: 1e-102; HSPs: 55)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 184 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 33341784 - 33341531
Alignment:
Q  184 aaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttg 283  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  33341784 aaaaaattaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttacaacatcttg 33341685  T
Q  284 gacttacatgtactattttatcgttgacatcttt--------aacagaattgttgatatcatgtgatagttttgagtgttacactttgtggggtgttaca 375  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||        |||||| ||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||| |||||||||    
T  33341684 gacttacatgtactattttatcgttgacatctttaacatgcaaacagagttgctgatatcatgtgatagtcttaagtgttacactttgtgaggtgttaca 33341585  T
Q  376 cttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatga 429  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  33341584 cttaaaacaaggtaggataaaattatattaagtatattcttgttaatctgatga 33341531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 184 - 436
Target Start/End: Complemental strand, 47254126 - 47253866
Alignment:
Q  184 aaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttg 283  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  47254126 aaaaagttaattttaatcttaatgattgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatctta 47254027  T
Q  284 gacttacatgtactattttatcgttgacatcttt--------aacagaattgttgatatcatgtgatagttttgagtgttacactttgtggggtgttaca 375  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||| |||||||        |||||| ||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||    
T  47254026 gacttgcatgtactattttattgttggcatctttaacatgcaaacagagttgctgatatcatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttaca 47253927  T
Q  376 cttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgatcctatg 436  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  47253926 cttaaaacaaggtaggataaaattaaattaagtgtattcttgttaatctgatgatactatg 47253866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 184; E-Value: 2e-99
Query Start/End: Original strand, 184 - 436
Target Start/End: Complemental strand, 7703895 - 7703635
Alignment:
Q  184 aaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttg 283  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  7703895 aaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgataaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttc 7703796  T
Q  284 gacttacatgtactattttatcgttgacatcttt--------aacagaattgttgatatcatgtgatagttttgagtgttacactttgtggggtgttaca 375  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| |||||||        |||||| ||| ||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||| ||||||||    
T  7703795 gacttacaggtactattttatcgttggcatctttaacgtgcaaacagagttgctgatatcatgtgatagtcttaagtgtgacactttgtggagtgttaca 7703696  T
Q  376 cttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgatcctatg 436  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  7703695 cttaaaacaaggtagaataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgatactatg 7703635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 170; E-Value: 5e-91
Query Start/End: Original strand, 184 - 430
Target Start/End: Original strand, 30002466 - 30002711
Alignment:
Q  184 aaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttg 283  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  30002466 aaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgtttattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatctta 30002565  T
Q  284 gacttacatgtactattttatcgttgacatcttt--------aacagaattgttgatatcatgtgatagttttgagtgttacactttgtggggtgttaca 375  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||        |||||| ||| ||||||||||         ||||||||||||||||||||||||||||    
T  30002566 gacttaaatgtactattttatcgttgacatctttaacatgcaaacagagttgctgatatcatg---------tgagtgttacactttgtggggtgttaca 30002656  T
Q  376 cttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgat 430  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30002657 cttaaaataaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgat 30002711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 169; E-Value: 2e-90
Query Start/End: Original strand, 187 - 429
Target Start/End: Original strand, 34947923 - 34948175
Alignment:
Q  187 aagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggac 286  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34947923 aagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaacgatcaatagtatttcatctagtaatgcttgcaacatcttggac 34948022  T
Q  287 ttacatgtactattttatcgttgacatcttt--------aacagaattgttgatatcatgtgatagttttgagt--gttacactttgtggggtgttacac 376  Q
    ||||||||| ||||||||||||| |||||||        |||||| ||||||||||||||||||||| || |||  |||||||||||||||||||| |||    
T  34948023 ttacatgtattattttatcgttggcatctttaacatgcaaacagagttgttgatatcatgtgatagtcttaagtacgttacactttgtggggtgttgcac 34948122  T
Q  377 ttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatga 429  Q
    || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  34948123 tttaaacaagataggataaaattagattaagtgtattcttgttaatatgatga 34948175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 165; E-Value: 4e-88
Query Start/End: Original strand, 184 - 429
Target Start/End: Original strand, 28002811 - 28003064
Alignment:
Q  184 aaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttg 283  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  28002811 aaaaagttaattttgatcttaatgttcgattcatttttaaattgttgattgttgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgttagcaacatcttg 28002910  T
Q  284 gacttacatgtactattttatcgttgacatcttt--------aacagaattgttgatatcatgtgatagttttgagtgttacactttgtggggtgttaca 375  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||        |||| | ||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||    
T  28002911 gacttacatgtactattttatcgttgacatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagttttaagtgttacactttctggggtgttaca 28003010  T
Q  376 cttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatga 429  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||    
T  28003011 cttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgcagtcttgttaatccgatga 28003064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 161; E-Value: 1e-85
Query Start/End: Original strand, 184 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 37776044 - 37775800
Alignment:
Q  184 aaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttg 283  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  37776044 aaaaagttaatttcaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatctta 37775945  T
Q  284 gacttacatgtactattttatcgttgacatcttt--------aacagaattgttgatatcatgtgatagttttgagtgttacactttgtggggtgttaca 375  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  ||||||        |||| | ||| ||||||||||         ||||||||||||||||||||||||||||    
T  37775944 gacttacatgtactattttatcgttggtatctttaacatgcaaacaaagttgctgatatcatg---------tgagtgttacactttgtggggtgttaca 37775854  T
Q  376 cttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatga 429  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37775853 cttaaaacaaggtagaataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatga 37775800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 161; E-Value: 1e-85
Query Start/End: Original strand, 184 - 429
Target Start/End: Original strand, 55477716 - 55477969
Alignment:
Q  184 aaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttg 283  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  55477716 aaaaaattaattttgatcttaatgtttgattcatttttaaattgttaattactgattaatgattaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttg 55477815  T
Q  284 gacttacatgtactattttatcgttgacatcttt--------aacagaattgttgatatcatgtgatagttttgagtgttacactttgtggggtgttaca 375  Q
    |||||| |||||||||||||||||||  ||||||        |||||| ||| |||||| |||||||||| || |||||||||| |||||||||||||||    
T  55477816 gacttaaatgtactattttatcgttggaatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtgatagtcttcagtgttacacgttgtggggtgttaca 55477915  T
Q  376 cttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatga 429  Q
    |||| |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  55477916 cttataacaagttaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatga 55477969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 160; E-Value: 4e-85
Query Start/End: Original strand, 184 - 416
Target Start/End: Original strand, 55240930 - 55241170
Alignment:
Q  184 aaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttg 283  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  55240930 aaaaatttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattgattaatgattaatagtaatttatctagtaatgtttgcaacatcttg 55241029  T
Q  284 gacttacatgtactattttatcgttgacatcttt--------aacagaattgttgatatcatgtgatagttttgagtgttacactttgtggggtgttaca 375  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||        |||||| ||| ||| ||||||||||||| || |||||||||||||||| |||||||||    
T  55241030 gacttacatgtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacagagttgctgacatcatgtgatagtcttaagtgttacactttgtgaggtgttaca 55241129  T
Q  376 cttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattctt 416  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  55241130 cttaaaacaaggtatgataaaattagattaagtgtattctt 55241170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 158; E-Value: 7e-84
Query Start/End: Original strand, 186 - 429
Target Start/End: Original strand, 37663568 - 37663819
Alignment:
Q  186 aaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttgga 285  Q
    |||||||||||| || |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37663568 aaagttaattttgattttaacgattgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttgga 37663667  T
Q  286 cttacatgtactattttatcgttgacatctttaaca---gaa-----ttgttgatatcatgtgatagttttgagtgttacactttgtggggtgttacact 377  Q
    |||||| |||||||||||||||||  ||||||||||   |||     ||| |||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||    
T  37663668 cttacaggtactattttatcgttggaatctttaacatgcgaacaacgttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacgct 37663767  T
Q  378 taaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatga 429  Q
    || | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  37663768 tatagcaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatga 37663819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 157; E-Value: 3e-83
Query Start/End: Original strand, 184 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 1815687 - 1815434
Alignment:
Q  184 aaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttg 283  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  1815687 aaaaagttaattttgatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaattgtaattcatctagtaatgtttgcaacatcttg 1815588  T
Q  284 gacttacatgtactattttatcgttgacatctttaac--------agaattgttgatatcatgtgatagttttgagtgttacactttgtggggtgttaca 375  Q
    || ||||| |||||||||||||||||  |||||||||        ||| ||| |||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||     
T  1815587 gatttacaggtactattttatcgttggaatctttaacatgcaaatagagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacc 1815488  T
Q  376 cttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatga 429  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||| ||||||    
T  1815487 cttaaaacaaggtaggataaaattagagtaaatgtagtcttgttaatatgatga 1815434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 157; E-Value: 3e-83
Query Start/End: Original strand, 184 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 17168099 - 17167846
Alignment:
Q  184 aaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttg 283  Q
    ||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||     
T  17168099 aaaaaattacttttaattttaatgtttgattcatttttaaattattgattactaattaatgataaatagtaattcatctagtgatgcttgcaacatctta 17168000  T
Q  284 gacttacatgtactattttatcgttgacatctttaac--------agaattgttgatatcatgtgatagttttgagtgttacactttgtggggtgttaca 375  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||        ||| ||| |||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||    
T  17167999 gacttacatgtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaatagagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttaca 17167900  T
Q  376 cttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatga 429  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  17167899 cttaaaacaatgtaggataaaattagattaagtgtattcttcttagtctgatga 17167846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 157; E-Value: 3e-83
Query Start/End: Original strand, 184 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 17272350 - 17272097
Alignment:
Q  184 aaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttg 283  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17272350 aaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaatcgttcattaccgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttg 17272251  T
Q  284 gacttacatgtactattttatcgttgacatcttt--------aacagaattgttgatatcatgtgatagttttgagtgttacactttgtggggtgttaca 375  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||        || ||| ||| |||||||||| |||||| || ||||| ||||||  ||||||||||||    
T  17272250 gacttacatgtactattttattgttgaaatctttaatatgcaaatagagttgctgatatcatgcgatagtcttaagtgtgacacttcatggggtgttaca 17272151  T
Q  376 cttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatga 429  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  17272150 cttaaaacaaggtagaataaaattagattaagtgtattctcattaatctgatga 17272097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 157; E-Value: 3e-83
Query Start/End: Original strand, 184 - 429
Target Start/End: Original strand, 29584025 - 29584278
Alignment:
Q  184 aaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttg 283  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29584025 aaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaatcgttcattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttg 29584124  T
Q  284 gacttacatgtactattttatcgttgacatctttaac--------agaattgttgatatcatgtgatagttttgagtgttacactttgtggggtgttaca 375  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||        ||| ||| |||||||||| |||||| || ||||| ||||||  |||||||| |||    
T  29584125 gacttacatgtaccattttattgttgaaatctttaacatgcaaatagagttgctgatatcatgcgatagtcttaagtgtgacacttcatggggtgtaaca 29584224  T
Q  376 cttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatga 429  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  29584225 cttaaaacaaggtagaataaaattagattaagtgtattctcattaatctgatga 29584278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 154; E-Value: 2e-81
Query Start/End: Original strand, 186 - 429
Target Start/End: Original strand, 19089280 - 19089531
Alignment:
Q  186 aaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttgga 285  Q
    |||||||||||| || |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19089280 aaagttaattttgattttaacgattgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttgga 19089379  T
Q  286 cttacatgtactattttatcgttgacatctttaaca---gaa-----ttgttgatatcatgtgatagttttgagtgttacactttgtggggtgttacact 377  Q
    |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||   |||     ||| |||||| |||||||||| || ||||||||||||||| ||||||||| |     
T  19089380 cttacaggtactattttatcgttgaaatctttaacatgcgaacaacgttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtagggtgttacgca 19089479  T
Q  378 taaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatga 429  Q
    || | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  19089480 tatagcaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatga 19089531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 154; E-Value: 2e-81
Query Start/End: Original strand, 184 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 50765106 - 50764863
Alignment:
Q  184 aaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttg 283  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  50765106 aaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatctta 50765007  T
Q  284 gacttacatgtactattttatcgttgacatcttt--------aacagaattgttgatatcatgtgatagttttgagtgttacactttgtggggtgttaca 375  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||        |||| | ||| ||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  50765006 gacttacatgtactattttatcgttgacatctttaacttgcaaacatagttgctgatatcatgtgataatattgagtgtttcactttgtggggtgttaca 50764907  T
Q  376 cttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatga 429  Q
    |          |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  50764906 c----------gtaggataaaattagattaaatgtattcttgttaatctaatga 50764863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 153; E-Value: 6e-81
Query Start/End: Original strand, 184 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 17173676 - 17173423
Alignment:
Q  184 aaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttg 283  Q
    ||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||     
T  17173676 aaaaaattacttttaattttaatgtttgattcatttttaaattattgattacttattcatgataaatagtaattcatctagtgatgcttgcaacatctta 17173577  T
Q  284 gacttacatgtactattttatcgttgacatcttt--------aacagaattgttgatatcatgtgatagttttgagtgttacactttgtggggtgttaca 375  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||        |||||| ||| |||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||    
T  17173576 gacttacatgtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttaca 17173477  T
Q  376 cttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatga 429  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  17173476 cttaaaacaatgtaggataaaattagattaagtgtattcttcttagtctgatga 17173423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 153; E-Value: 6e-81
Query Start/End: Original strand, 184 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 23761457 - 23761205
Alignment:
Q  184 aaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttg 283  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23761457 aaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattattgattactgattaatgatcaataataattcatctagtaatgcttgcaacatcttg 23761358  T
Q  284 gacttacatgtactattttatcgttgacatcttt--------aacagaattgttgatatcatgtgatagttttgagtgttacactttgtggggtgttaca 375  Q
    |||||| | |||| ||||||||||||  ||||||        |||||| ||| |||||||||| |||||| || | ||| ||||||| || |||||||||    
T  23761357 gacttataggtacaattttatcgttggtatctttaacgtgcaaacagagttgctgatatcatgcgatagtcttaaatgtgacactttatgaggtgttaca 23761258  T
Q  376 cttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatga 429  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23761257 cttaaaacaaggta-gataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatga 23761205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 153; E-Value: 6e-81
Query Start/End: Original strand, 184 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 25184499 - 25184246
Alignment:
Q  184 aaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttg 283  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25184499 aaaaagttaattttgatcttaatgtttgattcatttttaaattgtcgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttg 25184400  T
Q  284 gacttacatgtactattttatcgttgacatcttt--------aacagaattgttgatatcatgtgatagttttgagtgttacactttgtggggtgttaca 375  Q
    ||||||||||||||||||||| || |  || |||        |||||| ||| | |||| |||||||||| || |||||||||||||||| ||||||||     
T  25184399 gacttacatgtactattttattgtcggaatttttaacatgcaaacagagttgataatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtgaggtgttacg 25184300  T
Q  376 cttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatga 429  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  25184299 cttataacaaggtaggataaaattagatcaagtgtagtcttgttaatctgatga 25184246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 149; E-Value: 2e-78
Query Start/End: Original strand, 184 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 3043005 - 3042752
Alignment:
Q  184 aaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttg 283  Q
    |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  3043005 aaaaagttaattttgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaataatcaatactaattcatctagtaatgcttgcaacatgttg 3042906  T
Q  284 gacttacatgtactattttatcgttgacatcttt--------aacagaattgttgatatcatgtgatagttttgagtgttacactttgtggggtgttaca 375  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||        |||| | ||| |||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||     
T  3042905 gacttacatgtactattttatcgttgaaatctttaacaagcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacg 3042806  T
Q  376 cttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatga 429  Q
    |||| || |||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||    
T  3042805 cttataataaggtatgataaaattatattaagtgtaatcttgttaatatgatga 3042752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 146; E-Value: 9e-77
Query Start/End: Original strand, 184 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 27397000 - 27396749
Alignment:
Q  184 aaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttg 283  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  27397000 aaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattac--attaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacattttg 27396903  T
Q  284 gacttacatgtactattttatcgttgacatcttt--------aacagaattgttgatatcatgtgatagttttgagtgttacactttgtggggtgttaca 375  Q
    |||||| | |||| | ||||||||||||||||||        |||||  ||| |||||||||| ||| || || ||||| ||||||| |||| |||||||    
T  27396902 gacttataggtaccactttatcgttgacatctttaacatgcaaacagcgttgctgatatcatgcgatggtcttaagtgtgacactttatgggatgttaca 27396803  T
Q  376 cttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatga 429  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  27396802 cttaaaacaaggtagaataaaattaaattaagtgtattcttgttaatctgatga 27396749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 145; E-Value: 4e-76
Query Start/End: Original strand, 184 - 429
Target Start/End: Original strand, 46887983 - 46888235
Alignment:
Q  184 aaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttg 283  Q
    |||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  46887983 aaaaagttaattttgattttaatatttgattcatttttaaattgttgattagtgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgtaacatcttg 46888082  T
Q  284 gacttacatgtactattttatcgttgacatctttaaca--------gaattgttgatatcatgtgatagttttgagtgttacactttgtggggtgttaca 375  Q
    || ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||        || ||| |||||| ||||||||| | | ||||||||  ||||||||||||||||    
T  46888083 gatttacaggtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaaccgatttgatgatattatgtgatag-tctaagtgttacgttttgtggggtgttaca 46888181  T
Q  376 cttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatga 429  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  46888182 cttgaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagttttgttaatctgatga 46888235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 184 - 427
Target Start/End: Original strand, 32912404 - 32912656
Alignment:
Q  184 aaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagta-attcatctagtaatgcttgcaacatctt 282  Q
    ||||| || ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  32912404 aaaaaattcattttgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtatattcatctagtaatgcttgcaacatctt 32912503  T
Q  283 ggacttacatgtactattttatcgttgacatctttaac--------agaattgttgatatcatgtgatagttttgagtgttacactttgtggggtgttac 374  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||        ||| ||| |||||| |||||||||| || ||||||||||||||| |||||||||    
T  32912504 ggacttacaggtactattttatcgttgaaatctttaacatacaaatagagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtagggtgttac 32912603  T
Q  375 acttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgat 427  Q
     |||| ||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||    
T  32912604 gcttagaacaaggtatgataaaattatattaagtgtagtcttgttaacctgat 32912656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 184 - 429
Target Start/End: Original strand, 35020856 - 35021113
Alignment:
Q  184 aaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatca----atagtaattcatctagtaatgcttgcaacat 279  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    ||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  35020856 aaaaagttaattttgatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattaccgattaatgatcaatatatagtaattcatctagtaatgtttgcaatat 35020955  T
Q  280 cttggacttacatgtactattttatcgttgacatcttt--------aacagaattgttgatatcatgtgatagttttgagtgttacactttgtggggtgt 371  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||||||  ||||||        |||||| ||| |||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  35020956 cttggacttacagatactattttatcgttggaatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgt 35021055  T
Q  372 tacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatga 429  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||    
T  35021056 tacgcttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagttttgttaatctaatga 35021113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 143; E-Value: 6e-75
Query Start/End: Original strand, 184 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 50697628 - 50697374
Alignment:
Q  184 aaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttg 283  Q
    ||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  50697628 aaaaaattaatttttattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactaattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttacaacatcttg 50697529  T
Q  284 gacttacatgtactattttatcgttgacatcttt---------aacagaattgttgatatcatgtgatagttttgagtgttacactttgtggggtgttac 374  Q
    || ||||| |||||||||||||||||  ||||||         |||||| ||| |||||| |||||||||| || |||||| ||||||||| ||||||||    
T  50697528 gaattacaggtactattttatcgttggaatctttaacattgcaaacagagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttgcactttgtgtggtgttac 50697429  T
Q  375 acttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatga 429  Q
     |||| |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||    
T  50697428 gcttataacaaggtaggataaaattatattaagtgtagtcttgttaatctgatga 50697374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 141; E-Value: 9e-74
Query Start/End: Original strand, 184 - 429
Target Start/End: Original strand, 879373 - 879626
Alignment:
Q  184 aaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttg 283  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  879373 aaaaagttaattttgatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattacttattaatgatcaataataattcatctagtaatgcttgcaacatcttg 879472  T
Q  284 gacttacatgtactattttatcgttgacatcttt--------aacagaattgttgatatcatgtgatagttttgagtgttacactttgtggggtgttaca 375  Q
    |||||||| |||||||||||| ||    ||||||        |||| | ||| |||||| |||||||||| || | |||||||||||||| ||||||||     
T  879473 gacttacaggtactattttattgtcagaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtcttaaatgttacactttgtgaggtgttacg 879572  T
Q  376 cttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatga 429  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  879573 cttataacaaggtaggataaaattagattatgtgtagtcttgttaatctgatga 879626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 141; E-Value: 9e-74
Query Start/End: Original strand, 184 - 429
Target Start/End: Original strand, 19440473 - 19440726
Alignment:
Q  184 aaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttg 283  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19440473 aaaaagttaattttgatcttaatgtttgattaatttttaaattattgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttg 19440572  T
Q  284 gacttacatgtactattttatcgttgacatcttt--------aacagaattgttgatatcatgtgatagttttgagtgttacactttgtggggtgttaca 375  Q
    |||||||||||||||||||||| |||  ||||||        |||||| ||| |||||| |||| |||   || || ||||||| ||||||||||||||     
T  19440573 gacttacatgtactattttatcattggaatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatgttataaacttaagggttacacgttgtggggtgttacg 19440672  T
Q  376 cttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatga 429  Q
    |||| |||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  19440673 cttataacaagctaagataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatga 19440726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 141; E-Value: 9e-74
Query Start/End: Original strand, 184 - 430
Target Start/End: Complemental strand, 37288115 - 37287858
Alignment:
Q  184 aaaaagttaattttaa-tcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatctt 282  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  37288115 aaaaagttaattttaaatcttaatgtttgattcatttttaaattattgattactgattaatgctcaatagtaattcatctaataatgcttgcaacatctt 37288016  T
Q  283 ggacttacatgtactattttatcgttgacatctt--------taacagaattgttgatatcatgtgatagttttgagtgttacactttgt-ggggtgtta 373  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||         |||| | ||| |||||||||||| |||| || ||||||||| ||||| |||| ||||    
T  37288015 ggacttacatgtactattttatcgttggcatcttcaacatgcaaacaaagttgctgatatcatgtgctagtcttaagtgttacattttgtgggggcgtta 37287916  T
Q  374 cacttaaaacaaggtaggat-aaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgat 430  Q
    |||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  37287915 cacttaaaacaaagtaggttaaaaattagattaagtgtattcttgttaatcttatgat 37287858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 138; E-Value: 6e-72
Query Start/End: Original strand, 184 - 421
Target Start/End: Original strand, 34361316 - 34361562
Alignment:
Q  184 aaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagta-attcatctagtaatgcttgcaacatctt 282  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  34361316 aaaaagttaattttgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtatattcatctagtaatgcttgcaacatctt 34361415  T
Q  283 ggacttacatgtactattttatcgttgacatctttaac--------agaattgttgatatcatgtgatagttttgagtgttacactttgtggggtgttac 374  Q
    ||||||| | |||||||||||||||||  |||||||||        ||| ||| |||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  34361416 ggacttataggtactattttatcgttggaatctttaacatgcaaatagagttgatgatattatgtgatagctttaagtgttacactttgtagggtgttac 34361515  T
Q  375 acttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaa 421  Q
     |||| ||||||||| |||||||||| |||||||||| | |||||||    
T  34361516 gcttagaacaaggtatgataaaattatattaagtgtaattttgttaa 34361562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 184 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 32579832 - 32579579
Alignment:
Q  184 aaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttg 283  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  32579832 aaaaaattaattttgatcttaatgtttgatttatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgtttgcaacatcttg 32579733  T
Q  284 gacttacatgtactattttatcgttgacatcttt--------aacagaattgttgatatcatgtgatagttttgagtgttacactttgtggggtgttaca 375  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||        |||| | ||| |||||| ||  |||||| || || |||||||||| || ||| |||||    
T  32579732 gacttacatgtactattttatcgttgacatttttaacatgcaaacatagttgatgatattataagatagtcttaagagttacactttctgaggtcttaca 32579633  T
Q  376 cttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatga 429  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||  | || ||||||||||||||    
T  32579632 cttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtacagtcatgttaatctgatga 32579579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 184 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 32592470 - 32592226
Alignment:
Q  184 aaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttg 283  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  32592470 aaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattgattaacgatcaatagtaattcatttagtaatgctttcaacatcttg 32592371  T
Q  284 gacttacatgtactattttatcgttgacatcttt--------aacagaattgttgatatcatgtgatagttttgagtgttacactttgtggggtgttaca 375  Q
     ||||||| ||||||||||||||| |||||||||        |||| | ||| ||| ||||         | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  32592370 aacttacaggtactattttatcgtagacatctttaacatgcaaacaaagttgctgaaatca---------tatgagtgttacactttgtggggtgttaca 32592280  T
Q  376 cttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatga 429  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  32592279 cttaaaacaaggtaggataaaattaaattaaatgtattcttgttaatctgatga 32592226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 184 - 427
Target Start/End: Complemental strand, 6864421 - 6864170
Alignment:
Q  184 aaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttg 283  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6864421 aaaaagttaattttgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttg 6864322  T
Q  284 gacttacatgtactattttatcgttgacatcttt--------aacagaattgttgatatcatgtgatagttttgagtgttacactttgtggggtgttaca 375  Q
     |||||||  || |||||||||||||  ||||||        |||| | ||| |||||| |||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||     
T  6864321 aacttacaaatattattttatcgttgtaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtcttaagtattacactttgtggggtgttacg 6864222  T
Q  376 cttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgat 427  Q
    |||| ||||||||| |||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||    
T  6864221 cttataacaaggtatgataaaattaaattaaatgtagtcttgttaatctgat 6864170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 133; E-Value: 5e-69
Query Start/End: Original strand, 184 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 4598368 - 4598125
Alignment:
Q  184 aaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttg 283  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  4598368 aaaatgttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatagtaattaatctaataatgcttgcaacatcttg 4598269  T
Q  284 gacttacatgtactattttatcgttgacatcttt--------aacagaattgttgatatcatgtgatagttttgagtgttacactttgtggggtgttaca 375  Q
    || ||| ||||| ||||||||||||| |||||||        |||||| ||| ||||||||||         ||||||||||||||||||||||||||||    
T  4598268 gatttaaatgtattattttatcgttggcatctttaacatgaaaacagagttgctgatatcatg---------tgagtgttacactttgtggggtgttaca 4598178  T
Q  376 cttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatga 429  Q
    |||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  4598177 cttaaaacaa-gcaggataaaattaaattaagtgtattcttgttaatatgatga 4598125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 133; E-Value: 5e-69
Query Start/End: Original strand, 184 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 49376353 - 49376100
Alignment:
Q  184 aaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttg 283  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||    
T  49376353 aaaaagttaattttgatcttaatgtttaattcatttttaaattcttgattactgattaatgatcaatagtaattcatttagtaatgctttcaacttcttg 49376254  T
Q  284 gacttacatgtactattttatcgttgacatcttt--------aacagaattgttgatatcatgtgatagttttgagtgttacactttgtggggtgttaca 375  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||        |||| | ||| |||||| |||||||| | || |||||||||| |||||||||||   |    
T  49376253 gacttacatgtactattttatcgttgacatctttaacatccaaacaaagttgatgatattatgtgataatcttaagtgttacacattgtggggtgtataa 49376154  T
Q  376 cttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatga 429  Q
    |||||| ||||| || |||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||    
T  49376153 cttaaatcaaggcagaataaaattagatcaagcgtaatcttgttaatctgatga 49376100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 184 - 422
Target Start/End: Original strand, 36493514 - 36493759
Alignment:
Q  184 aaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttg 283  Q
    |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||     
T  36493514 aaaaagttaattatgatcttaatgtttgattcatttttaaattgttaattacggattaatgatcaatagtaattcatcgagtaatgcttgcaatatctta 36493613  T
Q  284 gacttacatgtactattttatcgttgacatcttt--------aacagaattgttgatatcatgtgatagttttgagtgttacactttgtggggtgttaca 375  Q
    ||||||||  |||||||||||||||| |||||||        |||||| ||| |||||| ||||| |||| || ||||||||||||||||| || |||||    
T  36493614 gacttacagatactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtggtagtcttaagtgttacactttgtggagt-ttaca 36493712  T
Q  376 cttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaat 422  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  36493713 cttaaaacaatgtatgataaaattagattaagtgtagtcttgttaat 36493759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 128; E-Value: 5e-66
Query Start/End: Original strand, 184 - 427
Target Start/End: Original strand, 33816341 - 33816609
Alignment:
Q  184 aaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttg 283  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  33816341 aaaaagttaattttgatcttaatgttcgattcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgtttgcaacatcttg 33816440  T
Q  284 gacttacatgtactattttatcgttgacatcttt--------aacagaattgttgatatcatgtgatagttttgagtgttacactttg------------ 363  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||        |||| | ||| |||||| ||| |||||| || ||||||||||||||                
T  33816441 gacttacatgaactattttatcgttgacatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgcgatagtcttaagtgttacactttgtggggtattaca 33816540  T
Q  364 -----tggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgat 427  Q
         |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  33816541 ctttctggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgcaatcttgttaatctgat 33816609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 184 - 429
Target Start/End: Original strand, 25700881 - 25701135
Alignment:
Q  184 aaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttg 283  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||     
T  25700881 aaaaagttaattttgatcttaatgtttgattcatttttaaattgtacattattgattaatgatcaatagtaattcatctaacaatgcttgcaaaatctta 25700980  T
Q  284 gacttacatgtactattttatcgttgacatcttt--------aacagaattgttgatatcatgtgatagttttgagtgttacactttgtgggg-tgttac 374  Q
    || ||||   |||||||||||||||||| |||||        |||| | ||| |||| | |||||||| | || ||||||||||||||||||| ||||||    
T  25700981 gatttacggatactattttatcgttgacttctttaacatgcaaacaaagttgatgatgttatgtgataatcttaagtgttacactttgtggggatgttac 25701080  T
Q  375 acttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatga 429  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||||    
T  25701081 acttaaaacaaggtaggataaaattagatttagtgtagtcctgttaatctgatga 25701135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 185 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 9139612 - 9139378
Alignment:
Q  185 aaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttgg 284  Q
    ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||   ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  9139612 aaaagttaattatgatcttaatgtttgattcatttttaaatta--gattattgattaatgatcaatagtaattcgtctagtaatgcttgcaacatcttgg 9139515  T
Q  285 acttacatgtactattttatcgttgacatctttaacagaattgttgatatcatgtgatagttttgagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaaca 384  Q
    ||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||       ||  | || | | |  | || ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  9139514 acttacatgtactacgttatcgttggcatctttaaca-------tgcaaaca-gagtttatcttaagtgttacactttgtagggtgttacagttaaaaca 9139423  T
Q  385 aggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatga 429  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  9139422 aggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatga 9139378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 184 - 321
Target Start/End: Original strand, 7152029 - 7152166
Alignment:
Q  184 aaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttg 283  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||    
T  7152029 aaaaagttatttttcatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattgattaatgatcaatagtaattcatctaataatgcttgcaaaatcttg 7152128  T
Q  284 gacttacatgtactattttatcgttgacatctttaaca 321  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  7152129 gacttacaggtactattttatcgttgacatatttaaca 7152166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 184 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 39400394 - 39400257
Alignment:
Q  184 aaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttg 283  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  39400394 aaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatagtcattcatctagtaatgcttgcaacatcttg 39400295  T
Q  284 gacttacatgtactattttatcgttgacatctttaaca 321  Q
     ||||| | |||| |||||||||||| |||||||||||    
T  39400294 aacttaaaggtaccattttatcgttggcatctttaaca 39400257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 184 - 429
Target Start/End: Original strand, 5047791 - 5048043
Alignment:
Q  184 aaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttg 283  Q
    ||||| |||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||| |||  |||||| ||||||||| ||||| |||||||||  ||||||||||||||    
T  5047791 aaaaaattaattttgattttaatgttcgattcatttttaaattgtttattgttgattactgatcaataataatttatctagtaaaacttgcaacatcttg 5047890  T
Q  284 gacttacatgtactattttatcgttgacatcttt--------aacagaattgttgatatcatgtgatagttttgagtgttacactttgtggggtgttaca 375  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| |||||||        |||| | ||  ||||||||||||||||| || ||||||||| ||||  |||| |||||    
T  5047891 gacttacatgtactattttattgttggcatctttaacatgcaaacatagtttatgatatcatgtgatagtcttaagtgttacattttg-cgggtattaca 5047989  T
Q  376 cttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatga 429  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||| ||||    
T  5047990 cttaaaacaaggtaggataaaattagattaaatgcagtcttgttaatctcatga 5048043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 184 - 308
Target Start/End: Original strand, 35025392 - 35025515
Alignment:
Q  184 aaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttg 283  Q
    |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35025392 aaaaagttaattttgat-ttaatgtttgattcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttg 35025490  T
Q  284 gacttacatgtactattttatcgtt 308  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  35025491 gacttacatgtactattttatcgtt 35025515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 184 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 42200116 - 42199862
Alignment:
Q  184 aaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagta-attcatctagtaatgcttgcaacatctt 282  Q
    ||||||||||||| | | || |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  42200116 aaaaagttaatttgatt-ttgatgtttgattaatttttaaattattgattactgattaatgaacagtagtatattcatctagtaatgcttgcaacatctt 42200018  T
Q  283 ggacttac-atgtactattttatcgttgacatctttaac--------agaattgttgatatcatgtgatagttttgagtgttacactttgtggggtgtta 373  Q
    |||||||| | ||| |||||||||||||  |||||||||        ||| ||  |||||| |||||||||| || ||||||||||||||| ||||||||    
T  42200017 ggacttacaaggtattattttatcgttggaatctttaacatgcaaatagagtttatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtagggtgtta 42199918  T
Q  374 cacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatga 429  Q
      |||| ||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||    
T  42199917 tgcttagaacaaggtatgataaaattatattaagtgtagtcttgttaatctgatga 42199862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 106; E-Value: 7e-53
Query Start/End: Original strand, 184 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 4205370 - 4205233
Alignment:
Q  184 aaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttg 283  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  4205370 aaaaagttacttttaattttaatgtttgattcatttttaaattattgattacttattcatgataaatagtaattcatctagtgatgcttgcaacatcttg 4205271  T
Q  284 gacttacatgtactattttatcgttgacatctttaaca 321  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  4205270 gacttacatgtactattttatcgttggcatctttaaca 4205233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 96; E-Value: 7e-47
Query Start/End: Original strand, 184 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 23431941 - 23431826
Alignment:
Q  184 aaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttg 283  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  23431941 aaaaagttaattttaattttaatgtttgatgcatttttaaattgttgattactaattaatgatcaatagtaattcatctactaatgcttgcaacatcttg 23431842  T
Q  284 gacttacatgtactat 299  Q
    |||||||| |||||||    
T  23431841 gacttacaggtactat 23431826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 184 - 420
Target Start/End: Original strand, 46883939 - 46884177
Alignment:
Q  184 aaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttg 283  Q
    ||||| |||||||| || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |    
T  46883939 aaaaaattaatttttattttaatgtttgatttatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatc--g 46884036  T
Q  284 gacttacatgtactattttatcgttgacatcttt--------aacagaattgttgatatcatgtgatagttttgagtgttacactttgtggggtgttaca 375  Q
    ||||||||  |||||||||||| |||  || |||        |||| ||||  |||||| ||||||||| ||| ||||||||| |||||| | |||||      
T  46884037 gacttaca--tactattttatctttggaatttttaacatgcaaacaaaatttatgatattatgtgatag-tttaagtgttacattttgtgagatgtta-g 46884132  T
Q  376 cttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgtta 420  Q
    |||| |||||| || ||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  46884133 cttataacaagatatgataaaattagattaagtgtagtctcgtta 46884177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 187 - 429
Target Start/End: Original strand, 4934040 - 4934280
Alignment:
Q  187 aagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaa-ttgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttgga 285  Q
    ||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||| ||||||||          
T  4934040 aagttaattttgatcttaatgtttaatttatttttaaaatttttgattactgattaatgattaatagaaattcatctattaatgcgtgcaacat------ 4934133  T
Q  286 cttacatgtactattttatcgttgacatctttaacag--------aattgttgatatcatgtgatagttttgagtgttacactttgtggggtgttacact 377  Q
         | ||||||||||||||||| |||||||||||         | ||| |||||| || ||||||| || |||||||||||||||| ||||||  |||    
T  4934134 -----aggtactattttatcgttgtcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatatgatagtcttaagtgttacactttgtgaggtgttggact 4934228  T
Q  378 taaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatga 429  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  4934229 taaaacaaggtagaataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatga 4934280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 184 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 26896474 - 26896346
Alignment:
Q  184 aaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagta-attcatctagtaatgcttgcaacatctt 282  Q
    |||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||    
T  26896474 aaaaagttaattttgattttaatgttcgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtatattcatctagtaatgtttgcaacatttt 26896375  T
Q  283 -ggacttacatgtactattttatcgttga 310  Q
     ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  26896374 cggacttacaagtactattttatcgttga 26896346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 255 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 38012169 - 38011987
Alignment:
Q  255 attcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttatcgttgacatctttaac--------agaattgttgatatcatgtgatagtt 346  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||        | | ||| |||||| ||||||||||     
T  38012169 attcatctagtaatatttgcaacatcttggacttacatgtactattttattgttggcatttttaacgtgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtc 38012070  T
Q  347 ttgagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatga 429  Q
    || || |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||    
T  38012069 ttaagcgttacactttctgggatgttacacttaaaacaaggtataataaaattaaattaagtgtagtcttgttaatctgatga 38011987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 184 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 38012648 - 38012568
Alignment:
Q  184 aaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctag 264  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38012648 aaaaagttaattttgatcttaatgttcgatttatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatagtaattcatctag 38012568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 331 - 429
Target Start/End: Original strand, 54499217 - 54499316
Alignment:
Q  331 atatcatgtgatagttttgagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggat-aaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatga 429  Q
    ||||||||||||||| || |  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  54499217 atatcatgtgatagtcttaaaagttacactttgtagggtgttacacttaaaacaaggtatgataaaaattagattaagtatattcttgttaatatgatga 54499316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 59; E-Value: 8e-25
Query Start/End: Original strand, 356 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 39398115 - 39398049
Alignment:
Q  356 acactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaat 422  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39398115 acactttgtggggtgttacacttaaaataaggcaggataaaattagattaagtgtattcttgttaat 39398049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 329 - 430
Target Start/End: Original strand, 35025574 - 35025675
Alignment:
Q  329 tgatatcatgtgatagttttgagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatg 428  Q
    |||||| ||| |||||| || ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| ||||| || | ||||||||||||||||    
T  35025574 tgatattatgcgatagtcttaagtgttacactttctggggtgtgacacttaaaacaagataggataaaattatattaaatgcagtcttgttaatctgatg 35025673  T
Q  429 at 430  Q
    ||    
T  35025674 at 35025675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 266 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 56050234 - 56050179
Alignment:
Q  266 aatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttatcgttgacatctttaaca 321  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||    
T  56050234 aatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttgaagtctttaaca 56050179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 103 - 137
Target Start/End: Original strand, 7982770 - 7982804
Alignment:
Q  103 taattgagtgattttaattgattgataatgtaaag 137  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  7982770 taattgggtgattttaattgattgataatgtaaag 7982804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0318 (Bit Score: 181; Significance: 1e-97; HSPs: 1)
Name: scaffold0318
Description:

Target: scaffold0318; HSP #1
Raw Score: 181; E-Value: 1e-97
Query Start/End: Original strand, 184 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 12294 - 12042
Alignment:
Q  184 aaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttg 283  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  12294 aaaaagttaattttaatcttaatgtttgatt-atttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatctta 12196  T
Q  284 gacttacatgtactattttatcgttgacatcttt--------aacagaattgttgatatcatgtgatagttttgagtgttacactttgtggggtgttaca 375  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||        |||||| ||| |||||||||| |||||| || ||||| ||||||||||||||||||||    
T  12195 gacttacatgtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacagagttgctgatatcatgcgatagtcttaagtgtgacactttgtggggtgttaca 12096  T
Q  376 cttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatga 429  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12095 cttaaaacaagataggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatga 12042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 181; Significance: 1e-97; HSPs: 19)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 181; E-Value: 1e-97
Query Start/End: Original strand, 184 - 429
Target Start/End: Original strand, 3879737 - 3879990
Alignment:
Q  184 aaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttg 283  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3879737 aaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattcatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttg 3879836  T
Q  284 gacttacatgtactattttatcgttgacatcttt--------aacagaattgttgatatcatgtgatagttttgagtgttacactttgtggggtgttaca 375  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||        |||||| ||| |||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||    
T  3879837 gacttacaagtactattttatcgttgacatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttaca 3879936  T
Q  376 cttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatga 429  Q
     |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||    
T  3879937 tttaaaacaaggtaggataaaattagaataagtatattcttgttagtctgatga 3879990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 158; E-Value: 7e-84
Query Start/End: Original strand, 184 - 429
Target Start/End: Original strand, 6090980 - 6091234
Alignment:
Q  184 aaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttg 283  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6090980 aaaaagttaattttgatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttg 6091079  T
Q  284 gacttacatgtactattttatcgttgacatcttt--------aacagaattgttgatatcatgtgatagt-tttgagtgttacactttgtggggtgttac 374  Q
    |||||||| ||||||||||||||||   ||||||        |||||| ||| |||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  6091080 gacttacaggtactattttatcgtttgaatctttaatatgcaaacagagttgatgatattatgtgatagtctttaagtgttacactttgttgggtgttac 6091179  T
Q  375 acttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatga 429  Q
     |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||    
T  6091180 gcttaaaacaaggtatgataaaattagattaagtgtagttttgttaatctaatga 6091234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 156; E-Value: 1e-82
Query Start/End: Original strand, 190 - 429
Target Start/End: Original strand, 4318626 - 4318874
Alignment:
Q  190 ttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggactta 289  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  4318626 ttaattttaattttaatgtttgatttatttttaaattgttgattaatgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttt 4318725  T
Q  290 catgtactattttatcgttgacatcttt--------aacagaattgttgatatcatgtgatagttttgagtgttacactttgtggggtgttacacttaaa 381  Q
    |  ||||||||| |||||||||||||||        |||||| ||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  4318726 cccgtactatttcatcgttgacatctttaacatgaaaacagagttgctgatatcatgtgatagtcttaagtgttacactttatagggtgttacacttaaa 4318825  T
Q  382 acaaggtaggat-aaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatga 429  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  4318826 acaaggtaggataaaaattagattaagtgtattcttgttaatctaatga 4318874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 153; E-Value: 6e-81
Query Start/End: Original strand, 184 - 429
Target Start/End: Original strand, 33892810 - 33893054
Alignment:
Q  184 aaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttg 283  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  33892810 aaaaagttaattttaaccttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattgattaatgatcaatagtaattcatttagtaatgtttgcaacatcttg 33892909  T
Q  284 gacttacatgtactattttatcgttgacatctttaaca--------gaattgttgatatcatgtgatagttttgagtgttacactttgtggggtgttaca 375  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||        || ||| ||||||||||         |||||||||||||||||||||||||| |    
T  33892910 gacttacatgtactattttattgttggcatctttaacatgcaaactgagttgctgatatcatg---------tgagtgttacactttgtggggtgttata 33893000  T
Q  376 cttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatga 429  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33893001 cataaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatga 33893054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 150; E-Value: 4e-79
Query Start/End: Original strand, 184 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 20768468 - 20768217
Alignment:
Q  184 aaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttg 283  Q
    |||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  20768468 aaaaagttaattttgatcttaatgttcaattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacaccttg 20768369  T
Q  284 gacttacatgtactattttatcgttgacatcttt--------aacagaattgttgatatcatgtgatagttttgagtgttacactttgtggggtgttaca 375  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||        |||| ||||| |||||| ||| |||  | || ||||||||||||| |||| |||||||    
T  20768368 gacttacatgtactattttatcgttgacatctttaacatgcaaacataattgatgatattatgcgatgatcttaagtgttacactttatgggatgttaca 20768269  T
Q  376 cttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatga 429  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||    
T  20768268 cttaaaacaaagtaggataaaattagattaa--gtaatcttgttaatctgatga 20768217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 184 - 421
Target Start/End: Complemental strand, 1946221 - 1945975
Alignment:
Q  184 aaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagta-attcatctagtaatgcttgcaacatctt 282  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  1946221 aaaaagttaattttgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtatattcatctaataatgcttgtaacatctt 1946122  T
Q  283 ggacttacatgtactattttatcgttgacatctttaac--------agaattgttgatatcatgtgatagttttgagtgttacactttgtggggtgttac 374  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||        ||| ||| |||||| |||||||||| || ||||||||||||||| |||||||||    
T  1946121 ggacttacatgtactattttatcgttggaatctttaacatgcaaatagagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtagggtgttac 1946022  T
Q  375 acttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaa 421  Q
     |||| ||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  1946021 gcttagaacaaggtatgataaaattatattaagtgtagtcttgttaa 1945975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 184 - 429
Target Start/End: Original strand, 21016916 - 21017163
Alignment:
Q  184 aaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttg 283  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  21016916 aaaaagttaattttaatcttaatatttgattcatttataaattgttgattactgattcatgattaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatctta 21017015  T
Q  284 gacttacatgtactattttatcgttgacatcttt--------aacagaattgttgatatcatgtgatagttttgagtgttacactttgtggggtgttaca 375  Q
    |||      ||||||||||||||||||||| |||        |||||| ||| |||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||    
T  21017016 gac------gtactattttatcgttgacatatttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttaca 21017109  T
Q  376 cttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatga 429  Q
    ||||||| || |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  21017110 cttaaaataacgtaggataaaattagattaagtttattcttgttagtctgatga 21017163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 140; E-Value: 4e-73
Query Start/End: Original strand, 184 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 29182547 - 29182296
Alignment:
Q  184 aaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttg 283  Q
    ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||   ||||||||||||||||| |||||||||||||     
T  29182547 aaaaagttaattttagtcttaatgattgattcatttttaaattgttgattgttgattaatgatca---gtaattcatctagtaatacttgcaacatctta 29182451  T
Q  284 gacttacatgtactattttatcgttgacatctttaac--------agaattgttgatatcatgtgatagttttgagtgttacactttgt-ggggtgttac 374  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||        ||| ||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||| | ||||||||||    
T  29182450 gacttacaagtactattttatcgttggcatctttaacctgcaaatagagttgctgatatcatgtgatagtcttaagtgttacactttatgggggtgttac 29182351  T
Q  375 acttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatga 429  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  29182350 acttaaaatatggtaggataaaattagattaagtgtattcttattaatctgatga 29182296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 138; E-Value: 6e-72
Query Start/End: Original strand, 184 - 429
Target Start/End: Original strand, 7234830 - 7235086
Alignment:
Q  184 aaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactg---attaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatc 280  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||  ||   |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  7234830 aaaaagttaattttgatcttaatgttcgatttatttttaaattgttgattgttgttgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgtttgcaacatc 7234929  T
Q  281 ttggacttacatgtactattttatcgttgacatcttt--------aacagaattgttgatatcatgtgatagttttgagtgttacactttgtggggtgtt 372  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||        |||| | ||| |||||| ||| |||||| || || |||||||||| |||||||||    
T  7234930 ttggacttacatgtactattttatcgttggcatttttaacatgcaaacatagttgatgatattatgcgatagtcttaagcgttacactttctggggtgtt 7235029  T
Q  373 acacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatga 429  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  7235030 acacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatga 7235086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 184 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 5627778 - 5627524
Alignment:
Q  184 aaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagta-attcatctagtaatgcttgcaacatctt 282  Q
    ||||| |||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  5627778 aaaaaattaattttgattttaatatttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtatattcacctagtaatgcttgcaacatctt 5627679  T
Q  283 ggacttacatgtactattttatcgttgacatctttaac--------agaattgttgatatcatgtgatagttttgagtgttacactttgtggggtgttac 374  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||        ||| ||| |||||| |||||||||| || ||| ||||||||||| ||||||||     
T  5627678 ggacttacaggtactattttatcgttgaaatctttaacatgcaaatagagttgatgatattatgtgatagtcttaagtattacactttgtagggtgttat 5627579  T
Q  375 acttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatga 429  Q
     |||| ||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||    
T  5627578 gcttagaacaaggtatgataaaattatattaagtgtagtcttgttaacctgatga 5627524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 113; E-Value: 5e-57
Query Start/End: Original strand, 184 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 8513607 - 8513366
Alignment:
Q  184 aaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttg 283  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||       ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||    
T  8513607 aaaaagttaattttaattttaatgtttgattcatttttaaattgttgatta-------atgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaagattttg 8513515  T
Q  284 gacttacatgtactattttatcgttgacatcttt--------aacagaattgttgatatcatgtgatagttttgagtgttacactttgtggggtgttaca 375  Q
    |||||||  ||||||||||||| ||| |||||||        |||||| ||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||         
T  8513514 gacttaccggtactattttatcattggcatctttaacatggaaacagagttgctgatatcatgtgatagtcttaagtgttacactttgtagggtg----- 8513420  T
Q  376 cttaaaacaaggtaggat-aaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatga 429  Q
     ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||    
T  8513419 -ttaaaacaaggtaggataaaaattagatcaagtgtattcttgttaatatgatga 8513366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 184 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 33619219 - 33619080
Alignment:
Q  184 aaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgat---taatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatc 280  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  33619219 aaaaagttaattttaatcttaatgttcgattcatttttaaattgttgattgctgatcattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacata 33619120  T
Q  281 ttggacttacatgtactattttatcgttgacatctttaac 320  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  33619119 ttggacttacatgtactattttatcgttggcatctttaac 33619080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 184 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 6089282 - 6089041
Alignment:
Q  184 aaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttg 283  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||       ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||    
T  6089282 aaaaaattaattttaattttaatgtttgattcatttttaaattgttgatta-------atgatcaatagtaattcatatagtaatgcttgcaacattttg 6089190  T
Q  284 gacttacatgtactattttatcgttgacatcttt--------aacagaattgttgatatcatgtgatagttttgagtgttacactttgtggggtgttaca 375  Q
    |||||||  ||||||||||||||||| |||||||        |||||| ||| ||||||||||||||||| || ||||||| || |||| | |||         
T  6089189 gacttactggtactattttatcgttggcatctttaacatggaaacagagttgctgatatcatgtgatagtcttaagtgttataccttgtagagtg----- 6089095  T
Q  376 cttaaaacaaggtaggat-aaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatga 429  Q
     ||||||||||||||||| |||||||||| |||  ||||||||||||||||||||    
T  6089094 -ttaaaacaaggtaggataaaaattagatcaaggatattcttgttaatctgatga 6089041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 318 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 15491859 - 15491748
Alignment:
Q  318 aacagaattgttgatatcatgtgatagttttgagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttg 417  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  15491859 aacagaattgctgatatcatgtgatatttttaagtgttacattttgtggggtgttacacttaaaataaggtaggataaaattagattaagtgcattcttg 15491760  T
Q  418 ttaatctgatga 429  Q
    ||||||||||||    
T  15491759 ttaatctgatga 15491748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 184 - 309
Target Start/End: Original strand, 7054570 - 7054696
Alignment:
Q  184 aaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagta-attcatctagtaatgcttgcaacatctt 282  Q
    |||||||||||||| || |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||    
T  7054570 aaaaagttaattttgattttaatgtttgattcatctttaaattgttgattaatgattaatgatcaatagtatattcatttagtaatgtttgcaacatctt 7054669  T
Q  283 ggacttacatgtactattttatcgttg 309  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||    
T  7054670 ggacttacagttactattttatcgttg 7054696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 284 - 429
Target Start/End: Original strand, 30353256 - 30353409
Alignment:
Q  284 gacttacatgtactattttatcgttgacatctttaaca--------gaattgttgatatcatgtgatagttttgagtgttacactttgtggggtgttaca 375  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||        || ||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||    
T  30353256 gacttacatgtactattttatcgttgacatttttaacatgcaaacagagttgctgatatcatgtgatagtcttaagtgttacactttgtgggatgttaca 30353355  T
Q  376 cttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatga 429  Q
    |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  30353356 cttaaaacaaggcatgataaaattagattaagtgtattcttgtttatatgatga 30353409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 329 - 429
Target Start/End: Original strand, 7055166 - 7055266
Alignment:
Q  329 tgatatcatgtgatagttttgagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatg 428  Q
    |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||    
T  7055166 tgatattatgtgatagttttaagtgttacactttgtagcgtgttacacttagaacaaggtatgataaaattatattaagtgtagtcttgttaacctgatg 7055265  T
Q  429 a 429  Q
    |    
T  7055266 a 7055266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 189 - 244
Target Start/End: Original strand, 33724062 - 33724117
Alignment:
Q  189 gttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatg 244  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  33724062 gttaattttgatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgcttaatgattaatg 33724117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 386 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 33619010 - 33618967
Alignment:
Q  386 ggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatga 429  Q
    |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  33619010 ggtaggataaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatga 33618967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 179; Significance: 2e-96; HSPs: 62)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 179; E-Value: 2e-96
Query Start/End: Original strand, 184 - 427
Target Start/End: Complemental strand, 44891874 - 44891623
Alignment:
Q  184 aaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttg 283  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  44891874 aaaaagttaattttaatcttaatgattgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaacagtaattcatctagtaatgcttgcaacatctta 44891775  T
Q  284 gacttacatgtactattttatcgttgacatcttt--------aacagaattgttgatatcatgtgatagttttgagtgttacactttgtggggtgttaca 375  Q
    |||||  | |||||||||||||||||||||||||        |||||| ||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||    
T  44891774 gacttgtaggtactattttatcgttgacatctttaacatacaaacagagttgctgatatcatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggagtgttaca 44891675  T
Q  376 cttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgat 427  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44891674 cttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgat 44891623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 173; E-Value: 7e-93
Query Start/End: Original strand, 184 - 429
Target Start/End: Original strand, 22622517 - 22622770
Alignment:
Q  184 aaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttg 283  Q
    |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22622517 aaaaagttaattttgattttaatgtttgattcatttttaaatagttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttg 22622616  T
Q  284 gacttacatgtactattttatcgttgacatcttt--------aacagaattgttgatatcatgtgatagttttgagtgttacactttgtggggtgttaca 375  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||        |||||| ||| |||||| |||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||    
T  22622617 gacttacatgtactattttatcgttgacatctttaacatccaaacagatttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacgctttgtggggtgttaca 22622716  T
Q  376 cttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatga 429  Q
    ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  22622717 cttgaaacaaggtatgataaaattagattaagtgtagttttgttaatctgatga 22622770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 173; E-Value: 7e-93
Query Start/End: Original strand, 184 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 33698530 - 33698277
Alignment:
Q  184 aaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttg 283  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||     
T  33698530 aaaaagttaattttaatcttaatgactgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatattaattcatctagtaatgcttgcaatatctta 33698431  T
Q  284 gacttacatgtactattttatcgttgacatcttt--------aacagaattgttgatatcatgtgatagttttgagtgttacactttgtggggtgttaca 375  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| |||||||        |||||| |||  ||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||||||||||    
T  33698430 gacttacaggtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacagagttgccgatatcatgcgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttaca 33698331  T
Q  376 cttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatga 429  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33698330 cttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatga 33698277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 172; E-Value: 3e-92
Query Start/End: Original strand, 185 - 429
Target Start/End: Original strand, 52040722 - 52040974
Alignment:
Q  185 aaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttgg 284  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  52040722 aaaagttaattttgatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactcattaatgatcaataatcattcatctagtaatgtttgcaacatcttgg 52040821  T
Q  285 acttacatgtactattttatcgttgacatcttt--------aacagaattgttgatatcatgtgatagttttgagtgttacactttgtggggtgttacac 376  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||        |||||| ||| |||||| |||||||||| || ||||||||||| |||||||| ||||||    
T  52040822 acttacatgtactattttatcgttgacatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactatgtggggtattacac 52040921  T
Q  377 ttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatga 429  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  52040922 ttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtaatcttgttaatctgatga 52040974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 167; E-Value: 3e-89
Query Start/End: Original strand, 184 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 4015836 - 4015584
Alignment:
Q  184 aaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttg 283  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4015836 aaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttg 4015737  T
Q  284 gacttacatgtactattttatcgttgacatctttaaca-------gaattgttgatatcatgtgatagttttgagtgttacactttgtggggtgttacac 376  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||        | |||||||||  ||| |||||| || ||||| |||||||||||||||||||||    
T  4015736 gacttacatgtactattttaccgttggcatctttaacatgcaaacaagttgttgatacaatgcgatagtcttaagtgtgacactttgtggggtgttacac 4015637  T
Q  377 ttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatga 429  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| ||| | ||||||||||||| ||||||    
T  4015636 ttaaaacaatgtaggataaaattagactaattatattcttgttaatatgatga 4015584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 165; E-Value: 4e-88
Query Start/End: Original strand, 184 - 429
Target Start/End: Original strand, 7327281 - 7327534
Alignment:
Q  184 aaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttg 283  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  7327281 aaaaagttaattttaatcttaataattgattcatttttaaattgttgattactgattaatgattaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatctta 7327380  T
Q  284 gacttacatgtactattttatcgttgacatctttaac--------agaattgttgatatcatgtgatagttttgagtgttacactttgtggggtgttaca 375  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||        ||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||    
T  7327381 gacttacaagtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaatagagttgttgatatcatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttaca 7327480  T
Q  376 cttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatga 429  Q
    ||  ||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| |||||    
T  7327481 ctagaaagaaggtaggataaaaataaattaagtgtattcttgttaatccgatga 7327534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 165; E-Value: 4e-88
Query Start/End: Original strand, 184 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 39283029 - 39282776
Alignment:
Q  184 aaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttg 283  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  39283029 aaaaagttaattttgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgattaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacattttg 39282930  T
Q  284 gacttacatgtactattttatcgttgacatctttaacag--------aattgttgatatcatgtgatagttttgagtgttacactttgtggggtgttaca 375  Q
    || |||||  ||||||||||| |||||||||||||||||        | ||| |||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||    
T  39282929 gatttacagatactattttattgttgacatctttaacaggcaaacatatttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttaca 39282830  T
Q  376 cttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatga 429  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  39282829 cttgaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatga 39282776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 161; E-Value: 1e-85
Query Start/End: Original strand, 184 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 32373846 - 32373594
Alignment:
Q  184 aaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttg 283  Q
    ||||||||||||||||||||| || |  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||     
T  32373846 aaaaagttaattttaatcttattgatgaattcatttt-aaattgttgattactgattaatgatcaatagaaattcatctagtaatgcttgcaacatctta 32373748  T
Q  284 gacttacatgtactattttatcgttgacatcttt--------aacagaattgttgatatcatgtgatagttttgagtgttacactttgtggggtgttaca 375  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||        |||||| ||| ||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||| |||||||    
T  32373747 gacttacaagtactattttatcgttgacatctttaatatgcaaacagagttgctgatatcatgtgatagtcttaagtgtcacactttgtgggatgttaca 32373648  T
Q  376 cttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatga 429  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  32373647 cttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatatgatga 32373594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 161; E-Value: 1e-85
Query Start/End: Original strand, 184 - 429
Target Start/End: Original strand, 46297561 - 46297814
Alignment:
Q  184 aaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttg 283  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46297561 aaaaagttaattttgatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactaattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttg 46297660  T
Q  284 gacttacatgtactattttatcgttgacatcttt--------aacagaattgttgatatcatgtgatagttttgagtgttacactttgtggggtgttaca 375  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||  ||||||        |||||| ||| |||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||    
T  46297661 gacttacaaatactattttatcgttggaatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttaca 46297760  T
Q  376 cttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatga 429  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||||||||||| | |||||||||| ||||    
T  46297761 cttaaaacaaggtaggataaagtttgattaagtgtagttttgttaatctaatga 46297814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 158; E-Value: 7e-84
Query Start/End: Original strand, 186 - 429
Target Start/End: Original strand, 42505876 - 42506127
Alignment:
Q  186 aaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttgga 285  Q
    |||||||||||| || |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42505876 aaagttaattttgattttaacgattgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttgga 42505975  T
Q  286 cttacatgtactattttatcgttgacatctttaaca---gaa-----ttgttgatatcatgtgatagttttgagtgttacactttgtggggtgttacact 377  Q
    |||||| |||||||||||||||||  ||||||||||   |||     ||| |||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||    
T  42505976 cttacaggtactattttatcgttggaatctttaacatgcgaacaacgttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacgct 42506075  T
Q  378 taaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatga 429  Q
    || | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  42506076 tatagcaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatga 42506127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 157; E-Value: 3e-83
Query Start/End: Original strand, 184 - 429
Target Start/End: Original strand, 26941059 - 26941312
Alignment:
Q  184 aaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttg 283  Q
    |||||||||||||| || |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26941059 aaaaagttaattttgattttaacgcttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttg 26941158  T
Q  284 gacttacatgtactattttatcgttgacatcttt--------aacagaattgttgatatcatgtgatagttttgagtgttacactttgtggggtgttaca 375  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  ||||||        |||||| ||| |||||| || |||||||||| ||||||||||||| || ||| ||||     
T  26941159 gacttacatgtactattttatcgttggaatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatatgatagttttaagtgttacactttatgaggtattacg 26941258  T
Q  376 cttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatga 429  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  26941259 cttataacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatga 26941312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 156; E-Value: 1e-82
Query Start/End: Original strand, 184 - 429
Target Start/End: Original strand, 24707914 - 24708169
Alignment:
Q  184 aaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttg 283  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||    
T  24707914 aaaaagttaattttaattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgattaatagtaatttatctaataatgcttgcaacttcttg 24708013  T
Q  284 gacttacatgtactattttatcgttgacatcttt--------aacagaattgttgatatcatgtgatagttttgagtgttacactttgtggggtgttaca 375  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||        |||| | ||| |||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  24708014 gacttacatgtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacaaatttgatgatattatgtgattgttttaagtgttacactttgtggggtgttaca 24708113  T
Q  376 cttaaaacaaggtaggataaaattagat--taagtgtattcttgttaatctgatga 429  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||   ||||||| |||||||||||||||||    
T  24708114 cttgaaacaaggtaggataaaattagatcaaaagtgtagtcttgttaatctgatga 24708169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 156; E-Value: 1e-82
Query Start/End: Original strand, 185 - 429
Target Start/End: Original strand, 53228952 - 53229204
Alignment:
Q  185 aaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttgg 284  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||     
T  53228952 aaaagttaattttgatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattgattaatgatcaatactaattcatctagtaatgcttgcaacatcttga 53229051  T
Q  285 acttacatgtactattttatcgttgacatcttt--------aacagaattgttgatatcatgtgatagttttgagtgttacactttgtggggtgttacac 376  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| |||||||        |||| | ||| |||||  |||||||||| || ||||||||||||||||||| |||||||    
T  53229052 acttacatgtattattttatcgttggcatctttaacatgcaaacaaagttgatgatactatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggagttacac 53229151  T
Q  377 ttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatga 429  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  53229152 ttaaaataaggtaggataaaattagattaactgtagtcttgttaatctgatga 53229204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 154; E-Value: 2e-81
Query Start/End: Original strand, 184 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 2008316 - 2008057
Alignment:
Q  184 aaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgatta-------ctgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaa 276  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  2008316 aaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattaatgattactgattaatgatcaatattatttcatctagtaatgcttgcaa 2008217  T
Q  277 catcttggacttacatgtactattttatcgttgacatcttt--------aacagaattgttgatatcatgtgatagttttgagtgttacactttgtgggg 368  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||        |||||| ||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |    
T  2008216 catcttggacttacaagtactattttatcgttgtcatctttaacatgcaaacagagttgctgatatcatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggag 2008117  T
Q  369 tgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatga 429  Q
    || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  2008116 tg-tacacttaaaacgaggtaggataaaattagattaagtatattcttgttaatctgatga 2008057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 153; E-Value: 6e-81
Query Start/End: Original strand, 184 - 429
Target Start/End: Original strand, 33378584 - 33378837
Alignment:
Q  184 aaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttg 283  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  33378584 aaaaaattaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaatcgttgattattgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgtttgcaacatcttg 33378683  T
Q  284 gacttacatgtactattttatcgttgacatcttt--------aacagaattgttgatatcatgtgatagttttgagtgttacactttgtggggtgttaca 375  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||        |||| | ||| ||| || ||| |||||| || ||| ||||||||  ||||||||||||    
T  33378684 aacttacatgtactattttatcgttgacatctttaacatgcaaacatagttgatgagattatgcgatagtcttaagtattacacttcttggggtgttaca 33378783  T
Q  376 cttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatga 429  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  33378784 cttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatga 33378837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 150; E-Value: 4e-79
Query Start/End: Original strand, 184 - 424
Target Start/End: Complemental strand, 37158085 - 37157836
Alignment:
Q  184 aaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttg 283  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||    
T  37158085 aaaaagttaattttgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactcattaatgatcaatggtaattcatctagtaatgcttgcgacatattg 37157986  T
Q  284 gacttacatgtactattttatcgttgacatctttaac---------agaattgttgatatcatgtgatagttttgagtgttacactttgtggggtgttac 374  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||         | | ||| |||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  37157985 gacttacatgtactattttatcattggcatctttaacatacaaacaatatttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttac 37157886  T
Q  375 acttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatct 424  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  37157885 acttgaaataaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatct 37157836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 148; E-Value: 6e-78
Query Start/End: Original strand, 184 - 427
Target Start/End: Complemental strand, 1090070 - 1089819
Alignment:
Q  184 aaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttg 283  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  1090070 aaaaagttaattttgatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaaaatcttg 1089971  T
Q  284 gacttacatgtactattttatcgttgacatctttaac--------agaattgttgatatcatgtgatagttttgagtgttacactttgtgggg-tgttac 374  Q
    || ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||        ||| |||||||| | |||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||    
T  1089970 gattta-atgtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaatagagttgttgatgttatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggatgttac 1089872  T
Q  375 acttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgat 427  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| | |||| || |||| |||||||    
T  1089871 acttaaaacaaggtaggataaaattagatttaatgtagtcctgttgatctgat 1089819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 145; E-Value: 4e-76
Query Start/End: Original strand, 208 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 34133288 - 34133059
Alignment:
Q  208 tttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttatcgt 307  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  34133288 tttgattcatttttaaattgttgattaccgattcatgattactagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgt 34133189  T
Q  308 tgacatcttt--------aacagaattgttgatatcatgtgatagttttgagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaatt 399  Q
    || |||||||        |||| ||||| |||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34133188 tggcatctttaacatgcaaacaaaattgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaatt 34133089  T
Q  400 agattaagtgtattcttgttaatctgatga 429  Q
    | ||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  34133088 atattaagtgtattcttattagtctgatga 34133059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 143; E-Value: 6e-75
Query Start/End: Original strand, 184 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 37203445 - 37203191
Alignment:
Q  184 aaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttg 283  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | || |||    
T  37203445 aaaaagttaattttgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactcattaatgatcaatggtaattcatctagtaatgcttgcgatatattg 37203346  T
Q  284 gacttacatgtactattttatcgttgacatctttaac---------agaattgttgatatcatgtgatagttttgagtgttacactttgtggggtgttac 374  Q
    |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||         | | ||| |||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||    
T  37203345 gacttacaggtactattttatcattgacatctttaacatacaaacaatatttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgatac 37203246  T
Q  375 acttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatga 429  Q
    ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  37203245 actaaaaataaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatcttatga 37203191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 141; E-Value: 9e-74
Query Start/End: Original strand, 184 - 429
Target Start/End: Original strand, 14586479 - 14586722
Alignment:
Q  184 aaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttg 283  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  14586479 aaaaaattaattttaatcttaatgtttgatttatttttaaattgttgattactgattaatgatcagtagtaatttatctagtaatgcttgcaacatcttg 14586578  T
Q  284 gacttacatgtactattttatcgttgacatcttt--------aacagaattgttgatatcatgtgatagttttgagtgttacactttgtggggtgttaca 375  Q
    |||||||  ||||||||||||||||| |||||||        |||| | ||||||||||||         |  |||||||||||||||||||||||||||    
T  14586579 gacttac-cgtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgttgatatca---------tacgagtgttacactttgtggggtgttaca 14586668  T
Q  376 cttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatga 429  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14586669 cttaaaacaaggtaggataaagttagattaagtgtattcttgttaatctgatga 14586722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 141; E-Value: 9e-74
Query Start/End: Original strand, 184 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 48355318 - 48355065
Alignment:
Q  184 aaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttg 283  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  48355318 aaaaagttaattttgatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgcttactgattaatgatcaataataattcatctagtaatacttgcaacatcttg 48355219  T
Q  284 gacttacatgtactattttatcgttgacatcttt--------aacagaattgttgatatcatgtgatagttttgagtgttacactttgtggggtgttaca 375  Q
    ||||||||  ||||||||||| || |  ||||||        |||||| ||| |||||| |||||||||| || |||||||||||||||||  |||||||    
T  48355218 gacttacagatactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggtatgttaca 48355119  T
Q  376 cttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatga 429  Q
     ||| |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  48355118 tttataacaaggtaggataaaattagactaagtgtagtcttgttaatctgatga 48355065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 140; E-Value: 4e-73
Query Start/End: Original strand, 184 - 424
Target Start/End: Complemental strand, 25580116 - 25579868
Alignment:
Q  184 aaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttg 283  Q
    ||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||     
T  25580116 aaaaagttaatcttaatcttaatgattggttcatttttaaattgttgattgcggattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaatatctta 25580017  T
Q  284 gacttacatgtactattttatcgttgacatcttt--------aacagaattgttgatatcatgtgatagttttgagtgttacactttgtggggtgttaca 375  Q
    || ||| | ||||  ||||||||||| |||||||        |||||| ||| ||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||    
T  25580016 gatttataggtacagttttatcgttggcatctttaacatgcaaacagagttgctgatatcatgtaatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttaca 25579917  T
Q  376 cttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatct 424  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  25579916 ctaaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtatttttgttaatct 25579868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 185 - 421
Target Start/End: Complemental strand, 3362631 - 3362385
Alignment:
Q  185 aaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttgg 284  Q
    ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  3362631 aaaagttaattatgatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatccagtaatgcttgcaacatattgg 3362532  T
Q  285 acttacatgtactattttatcgttgacatcttt--------aacagaattgttgatatcatgtgatagttttgagtgttacactttgtggggtgttacac 376  Q
    ||||  | |||| ||||||||||||||||||||        |||||| ||| |||| | |||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||    
T  3362531 acttctaagtacaattttatcgttgacatctttaacatgcaaacagagttgatgatgttatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgtttcac 3362432  T
Q  377 ttaaaacaaggtaggataaaattagatta--agtgtattcttgttaa 421  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||    
T  3362431 ttaaaataaggtaggataaaattagattaatagtgtagtcttgttaa 3362385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 138; E-Value: 6e-72
Query Start/End: Original strand, 184 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 21193984 - 21193730
Alignment:
Q  184 aaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttg 283  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  21193984 aaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaataatcaatagtaattcatttagtaatggttgcaacatcttg 21193885  T
Q  284 gacttacatgtactattttatcgttgacatcttt--------aacagaattgttgatatcatgtgatagt-tttgagtgttacactttgtggggtgttac 374  Q
     ||||||   ||||||||||||||    ||||||        |||||| ||| ||||||||| ||||||| ||| |||||||  |||| ||| |||||||    
T  21193884 aacttacggctactattttatcgtgagaatctttaacatgcaaacagagttgctgatatcatatgatagtctttaagtgttatcctttatggagtgttac 21193785  T
Q  375 acttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatga 429  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  21193784 acttaaaacaaggtaggataaaattagattaaatgtattcttgttaatctgatga 21193730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 184 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 22451345 - 22451092
Alignment:
Q  184 aaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttg 283  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22451345 aaaaagttaattttgatcttaatgttcgattcatttttaaatttttgattgctgattaatgatcaataataattcatctagtaatgcttgcaacatcttg 22451246  T
Q  284 gacttacatgtactattttatcgttgacatcttt--------aacagaattgttgatatcatgtgatagttttgagtgttacactttgtggggtgttaca 375  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||        |||| | ||| |||||| ||  |||||| || | ||||||||||  ||||||||||||    
T  22451245 gacttacatgtactattttattgttgacatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatacgatagtgttaaatgttacacttactggggtgttaca 22451146  T
Q  376 cttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatga 429  Q
    |||||||||||||| | ||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||    
T  22451145 cttaaaacaaggtaaggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatatgatga 22451092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 184 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 36012517 - 36012261
Alignment:
Q  184 aaaaagttaa-ttttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatctt 282  Q
    |||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||    
T  36012517 aaaaagttaaattttaattttaatgtttgatttatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcagcatttt 36012418  T
Q  283 ggacttacatgtactattttatcgttgacatctttaac---------agaattgttgatatcatgtgatagttttgagtgttacactttgtggggtgtta 373  Q
    |||||||   ||||||||||||||||| ||||||||||         ||| ||| ||||||||| ||||||| || ||||||||| |||||||| |||||    
T  36012417 ggacttatcggtactattttatcgttggcatctttaacatggaaacaagagttgctgatatcatttgatagtcttaagtgttacattttgtgggatgtta 36012318  T
Q  374 cacttaaaacaaggtaggat-aaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatga 429  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  36012317 cactgaaaacaaggtaggataaaaattagattaggtgtattcttgttcatctgatga 36012261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 184 - 429
Target Start/End: Original strand, 40552058 - 40552311
Alignment:
Q  184 aaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttg 283  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  40552058 aaaaagttaattttgatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaataatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcatg 40552157  T
Q  284 gacttacatgtactattttatcgttgacatcttt--------aacagaattgttgatatcatgtgatagttttgagtgttacactttgtggggtgttaca 375  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  ||||||        |||||| ||| |||||| |||||| | |  | |||||||||| ||||||| ||||||     
T  40552158 gacttacatgtactattttatcgttggaatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtgacaatcctaagtgttacacgttgtgggatgttacg 40552257  T
Q  376 cttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatga 429  Q
    |||| |||||| || |||||||||| |||||||||| | |||||||||||||||    
T  40552258 cttataacaagctaagataaaattaaattaagtgtagtgttgttaatctgatga 40552311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 133; E-Value: 5e-69
Query Start/End: Original strand, 184 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 29099723 - 29099479
Alignment:
Q  184 aaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttg 283  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29099723 aaaaagttaattttaatattaatgtttgattcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatggtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttg 29099624  T
Q  284 gacttacatgtactattttatcgttgacatcttt--------aacagaattgttgatatcatgtgatagttttgagtgttacactttgtggggtgttaca 375  Q
    |||||| | ||||||||||||||||  |||||||        |||||| ||| ||||||||||||| |         |||||||||||||||||||||||    
T  29099623 gacttaaaggtactattttatcgttagcatctttaacatgcaaacagagttgctgatatcatgtgaaa---------gttacactttgtggggtgttaca 29099533  T
Q  376 cttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatga 429  Q
    ||||||| |||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  29099532 cttaaaataaggcacgataaaattaaattaagtgtattcttgttaatatgatga 29099479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 131; E-Value: 8e-68
Query Start/End: Original strand, 184 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 29164179 - 29163942
Alignment:
Q  184 aaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttg 283  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||       |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||     
T  29164179 aaaaagttaattttaatcttaatgtttgatttatttttaaattgttgatta-------atgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgtaacatctta 29164087  T
Q  284 gacttacatgtactattttatcgttgacatctttaaca--------gaattgttgatatcatgtgatagttttgagtgttacactttgtggggtgttaca 375  Q
    |||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||        || ||| |||||||||||||         |||||||||||||||||||||||||    
T  29164086 gacttacaagtactattttatcgttagcatctttaacatgcaaacagagttgctgatatcatgtga---------gtgttacactttgtggggtgttaca 29163996  T
Q  376 cttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatga 429  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  29163995 cttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttattaatctgatga 29163942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 184 - 429
Target Start/End: Original strand, 3654998 - 3655254
Alignment:
Q  184 aaaaagttaattttaatcttaatgtttgattc-atttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattc--atctagtaatgcttgcaacatc 280  Q
    |||| ||||||||| || |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  3654998 aaaatgttaattttgattttaatgtttgattttatttttaaattgttgattactgattaataatcaatagtaattcatatctagtaatgcttgcaacatc 3655097  T
Q  281 ttggacttacatgtactattttatcgttgacatcttt--------aacagaattgttgatatcatgtgatagttttgagtgttacactttgtggggtgtt 372  Q
    ||||||||| ||||  |||||||||| ||  ||||||        ||||||  || |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||    
T  3655098 ttggacttatatgtgttattttatcgatggaatctttaacatgcaaacagagctgatgatatcatgtgatagttttaagtgttacattttgtggtgtgtt 3655197  T
Q  373 acacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatga 429  Q
    || |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3655198 acgcttctaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatga 3655254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 184 - 429
Target Start/End: Original strand, 24488761 - 24489014
Alignment:
Q  184 aaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttg 283  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  24488761 aaaaagttaattttaatattaatgtttgattcatttttaaattattgattattgattcatgattaatagtaatgcatctagtaatgcttgcaacatcttg 24488860  T
Q  284 gacttacatgtactattttatcgttgacatctttaac--------agaattgttgatatcatgtgatagttttgagtgttacactttgtggggtgttaca 375  Q
     ||||||    |||||||||| |||| ||||||||||        ||| ||| ||||||  ||||||||| || |||||||||| ||||| |||||||||    
T  24488861 aacttactgacactattttattgttggcatctttaacatgcaaatagagttgatgatattgtgtgatagtcttaagtgttacaccttgtgaggtgttaca 24488960  T
Q  376 cttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatga 429  Q
    |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  24488961 cttaaaacaatgtaagataaaattagattaagtgtattcttgttagtctgatga 24489014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 128; E-Value: 5e-66
Query Start/End: Original strand, 184 - 429
Target Start/End: Original strand, 44186316 - 44186553
Alignment:
Q  184 aaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttg 283  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||     
T  44186316 aaaatgttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaatttatctagtaatgcttgcaacatctta 44186415  T
Q  284 gacttacatgtactattttatcgttgacatcttt--------aacagaattgttgatatcatgtgatagttttgagtgttacactttgtggggtgttaca 375  Q
    |||||| | ||||||||||||| ||| |||||||        |||||| ||||||||||||||||||||                |||||||||||||||    
T  44186416 gacttagaggtactattttatcattggcatctttaacatgcaaacagagttgttgatatcatgtgatag----------------ttgtggggtgttaca 44186499  T
Q  376 cttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatga 429  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  44186500 tttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtatttttgttaatttgatga 44186553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 126; E-Value: 8e-65
Query Start/End: Original strand, 184 - 421
Target Start/End: Complemental strand, 47481900 - 47481654
Alignment:
Q  184 aaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagta-attcatctagtaatgcttgcaacatctt 282  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  47481900 aaaaagttaattttgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtatattcatctagtaatgcttgcaacatctt 47481801  T
Q  283 ggacttacatgtactattttatcgttgacatcttt--------aacagaattgttgatatcatgtgatagttttgagtgttacactttgtggggtgttac 374  Q
    | ||||||| |||||||||||||||||| ||||||        || ||| ||  |||||| |||||||||| || ||||||||||||||| ||||||||     
T  47481800 gaacttacaagtactattttatcgttgaaatctttaatatgcaaatagagtttatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtagggtgttat 47481701  T
Q  375 acttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaa 421  Q
     |||| || ||||||  ||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  47481700 gcttagaataaggtataataaaattatattaagtgtagtcttgttaa 47481654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 184 - 429
Target Start/End: Original strand, 21009600 - 21009854
Alignment:
Q  184 aaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagta-attcatctagtaatgcttgcaacatctt 282  Q
    ||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  21009600 aaaaaattaattttgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtatattcatctagtaatgcttgcaacatctt 21009699  T
Q  283 ggacttacatgtactattttatcgttgacatctttaaca-gaa-------ttgttgatatcatgtgatagttttgagtgttacactttgtggggtgttac 374  Q
     |||||||| |||||||||||||||||  |||||||||| | |       ||| |||||| |||||||||| || ||||||||||||||| | ||||||     
T  21009700 agacttacaggtactattttatcgttggaatctttaacatgcaaatattgttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtagagtgttat 21009799  T
Q  375 acttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatga 429  Q
     |||| |||||| || |||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||    
T  21009800 gcttagaacaagttatgataaaattatattaagtgtagtcttgttaacctgatga 21009854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 214 - 423
Target Start/End: Original strand, 46994490 - 46994707
Alignment:
Q  214 tcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttatcgttgacat 313  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| || |  ||    
T  46994490 tcatttttaaattgttgatttctgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaatatcttggacttacaggtactattttattgtcggaat 46994589  T
Q  314 cttt--------aacagaattgttgatatcatgtgatagttttgagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagatta 405  Q
    ||||        |||| ||||| |||||| |||||||||| || ||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  46994590 ctttagcatgcaaacataattgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacattttgtggggcgttacacttataacaaggtaggataaaattagatta 46994689  T
Q  406 agtgtattcttgttaatc 423  Q
    |||||| |||||||||||    
T  46994690 agtgtagtcttgttaatc 46994707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 121; E-Value: 8e-62
Query Start/End: Original strand, 185 - 321
Target Start/End: Original strand, 11357181 - 11357317
Alignment:
Q  185 aaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttgg 284  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11357181 aaaagttaattttgatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttgg 11357280  T
Q  285 acttacatgtactattttatcgttgacatctttaaca 321  Q
    ||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||    
T  11357281 acttacaagtactattttatcgttggtatctttaaca 11357317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 121; E-Value: 8e-62
Query Start/End: Original strand, 184 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 11467187 - 11466948
Alignment:
Q  184 aaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttg 283  Q
    ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||       ||||||||||||||||||||||       ||||||||||||     
T  11467187 aaaaagttaattttattcttaatgattgattcatttttaaattgttgatta-------atgatcaatagtaattcatcta-------ttgcaacatctta 11467102  T
Q  284 gacttacatgtactattttatcgttgacatctttaaca--------gaattgttgatatcatgtgatagttttgagtgttacactttgtggggtgttaca 375  Q
    ||||| || |||||||||| ||||||  ||||| ||||        || ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||    
T  11467101 gacttgcaggtactattttgtcgttggtatcttaaacatgcaaacagagttgttgatatcatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtattaca 11467002  T
Q  376 cttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatga 429  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11467001 cttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatga 11466948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 185 - 429
Target Start/End: Original strand, 22445865 - 22446116
Alignment:
Q  185 aaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttgg 284  Q
    ||||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||    
T  22445865 aaaagttaattatgatcttaatgtttgattcatatttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatccagtaatacttgcaacattttgg 22445964  T
Q  285 acttacatgtactattttatcgttgacatctttaa----cagaa----ttgttgatatcatgtgatagttttgagtgttacactttgtggggtgttacac 376  Q
    ||||| | |||||||||||||||||  ||||||||    || ||    ||| |||||| || ||||||| |||||||||| || |||| | |||||||||    
T  22445965 acttaaaggtactattttatcgttggtatctttaatatgcaaaaatagttgatgatattatatgatagtcttgagtgttatacattgt-gagtgttacac 22446063  T
Q  377 ttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatga 429  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| || || ||||||    
T  22446064 ttaaaacaatgtaggataaaattagattaagtgtagtcttatttatatgatga 22446116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 118; E-Value: 5e-60
Query Start/End: Original strand, 184 - 429
Target Start/End: Original strand, 4761447 - 4761701
Alignment:
Q  184 aaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttg 283  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||    
T  4761447 aaaaagttaattttgattttaatgtttgattcattttcaaattgttgatttctgattaatgattaatagtaattcatctggtaatgtttgcaacattttg 4761546  T
Q  284 gacttacatgtactattttatcgttgacatctttaac--------agaattgttgatatcatgtgatagttttgagtgttacactttgt-ggggtgttac 374  Q
    |||||| | |||||||||||| || |  |||||||||        | | ||| |||||| |||||||||| || ||||||| ||||||| |||||||||     
T  4761547 gacttataggtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaatatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttatactttgtgggggtgttat 4761646  T
Q  375 acttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatga 429  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  4761647 acttataacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatcagatga 4761701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 118; E-Value: 5e-60
Query Start/End: Original strand, 184 - 421
Target Start/End: Complemental strand, 54506185 - 54505939
Alignment:
Q  184 aaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagta-attcatctagtaatgcttgcaacatctt 282  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||    
T  54506185 aaaaagttaattttgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtatattcatctagtaatgcttgcaacatttt 54506086  T
Q  283 ggacttacatgtactattttatcgttgacatctttaac--------agaattgttgatatcatgtgatagttttgagtgttacactttgtggggtgttac 374  Q
    ||||||| |  ||||||||||||||||  |||||||||        | | | | |||||| |||||||||| || ||||||||||||||| | ||||||     
T  54506085 ggacttataaatactattttatcgttggaatctttaacatgcaaataaagtagatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtagagtgttat 54505986  T
Q  375 acttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaa 421  Q
     |||| ||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  54505985 gcttagaacaaggtatgataaaattatattaagtgtagtcttgttaa 54505939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 255 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 43348563 - 43348381
Alignment:
Q  255 attcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttatcgttgacatctttaaca--------gaattgttgatatcatgtgatagtt 346  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||        || |||||||||||||||||||||     
T  43348563 attcatttagtaatgcttgcaacatcttaaacttacaagtactattttatcgttgacatctttaacatgcaaatagagttgttgatatcatgtgatagtc 43348464  T
Q  347 ttgagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatga 429  Q
    || ||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43348463 ttaagtgtcacactttatgggatgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatga 43348381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 113; E-Value: 5e-57
Query Start/End: Original strand, 208 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 38592051 - 38591822
Alignment:
Q  208 tttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttatcgt 307  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | || ||||||||||||||||||||| |||||  |||| |||||||||    
T  38592051 tttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaatttgtttaataatgcttgcaacatcttggatttacaaatacttttttatcgt 38591952  T
Q  308 tgacatcttt--------aacagaattgttgatatcatgtgatagttttgagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaatt 399  Q
    || |||||||        || ||| ||| |||||| |||||||||| || ||||| ||  |||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  38591951 tgtcatctttgacatgcaaatagatttgatgatattatgtgatagtcttaagtgtcacgttttgtggggtattacacttgaaacaagataggataaaatt 38591852  T
Q  400 agattaagtgtattcttgttaatctgatga 429  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  38591851 agattaagtgtagtcttgttaatctgatga 38591822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 113; E-Value: 5e-57
Query Start/End: Original strand, 184 - 429
Target Start/End: Original strand, 43975691 - 43975940
Alignment:
Q  184 aaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttg 283  Q
    ||||| ||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  43975691 aaaaaattaatcttgatcttaatgttcgattcatttttaaattgttgattgctgattaatgatcaatattaattcatctagtaatgcttgcaaaatcttg 43975790  T
Q  284 gacttacatgtactattttatcgttgacatcttt-----------aacagaattgttgatatcatgtgatagttttgagtgttacactttgtggggtgtt 372  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| |||||||           |||| | ||| |||||| ||| |||       ||||||||||||| |||||||||    
T  43975791 gacttacaagtactattttatcgttggcatctttaacatgtaaacaacatagttgatgatattatgcgat-------agtgttacactttctggggtgtt 43975883  T
Q  373 acacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatga 429  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||    
T  43975884 acacttaaaacaagataagataaaattagattaagtgcaattttgttaatctgatga 43975940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 111; E-Value: 7e-56
Query Start/End: Original strand, 230 - 429
Target Start/End: Original strand, 54828546 - 54828753
Alignment:
Q  230 gattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttatcgttgacatcttt--------aaca 321  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  || |||        ||||    
T  54828546 gattactgattaatgatcaatagtaatttatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttatagttggaatttttaacatacaaaca 54828645  T
Q  322 gaattgttgatatcatgtgatagttttgagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaa 421  Q
     | ||| |||||| || |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |    
T  54828646 tagttgatgatattatttgatagttttaagtgttacactttgtgggatgttacacttataataaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttca 54828745  T
Q  422 tctgatga 429  Q
    | ||||||    
T  54828746 tatgatga 54828753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 106; E-Value: 7e-53
Query Start/End: Original strand, 184 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 40936350 - 40936213
Alignment:
Q  184 aaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttg 283  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||     
T  40936350 aaaaagttaatttcaatcttaatgattgatttatttttaaattgttgattaccgattaatgatcaatagtaatttatctagtaatgcttgcaacatctta 40936251  T
Q  284 gacttacatgtactattttatcgttgacatctttaaca 321  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  40936250 gacttgcatgtactattttatcgttggcatctttaaca 40936213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 246 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 45174821 - 45174629
Alignment:
Q  246 tcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttatcgttgacatctttaaca--------gaattgttgatatcat 337  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||| |||||||||||        || ||| |||||||||    
T  45174821 tcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttaccgttactattttatcgttggcatctttaacatggaaacagagttgctgatatcat 45174722  T
Q  338 gtgatagttttgagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggat-aaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatga 429  Q
     | ||||| || ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  45174721 attatagtcttaagtgttacactttgtagagtgttacacttaaaacaaggtaggataaaaattaaattaaatgtattcttgttaatctgatga 45174629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 246 - 427
Target Start/End: Original strand, 11835494 - 11835678
Alignment:
Q  246 tcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttatcgttgacatctt--taacagaattgttgatatcatgtgata 343  Q
    ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||| |   || ||| ||| |||||||||||||||    
T  11835494 tcaatagtaattcatttagtaatgtttgcaacatcttggacttacaaatactattttatcgttaacatcatgcaaatagagttgatgatatcatgtgata 11835593  T
Q  344 gttttgagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaa-attagattaagtgtattcttgttaatctgat 427  Q
    || || | ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  11835594 gtcttaattgttacactttgtaggttgttacacttaaaacaaggtaggataaatattagattaagtgtatttttgttaatatgat 11835678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 184 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 50475195 - 50475053
Alignment:
Q  184 aaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgat-------caatagtaattcatctagtaatgcttgcaa 276  Q
    ||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||       ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  50475195 aaaaatttaattttgattttaatgtttgattcatttttaaattattgattactgattaatgattaatgatcaatactaattcatctagtaatgcttgcaa 50475096  T
Q  277 catcttggacttacatgtactattttatcgttgacatctttaa 319  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||    
T  50475095 catcttggacttacaagtattattttatccttgacatctttaa 50475053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 79; E-Value: 9e-37
Query Start/End: Original strand, 184 - 321
Target Start/End: Original strand, 51212576 - 51212707
Alignment:
Q  184 aaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttg 283  Q
    |||||||||||||| ||||||||      |||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51212576 aaaaagttaattttgatcttaat------ttcatttttaaattgttgatttttaattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttg 51212669  T
Q  284 gacttacatgtactattttatcgttgacatctttaaca 321  Q
    |||||||| |||||||||||| || |  ||||||||||    
T  51212670 gacttacaggtactattttattgtcggaatctttaaca 51212707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 184 - 367
Target Start/End: Original strand, 11356957 - 11357140
Alignment:
Q  184 aaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttg 283  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||        |||||||||||||||||||    
T  11356957 aaaaagttaattttgatcttaatgttggattcatttttaaattgttgattactaattaatgatgaatagtaat--------taatgcttgcaacatcttg 11357048  T
Q  284 gacttacatgtactattttatcgttgacatctttaa--------cagaattgttgatatcatgtgatagttttgagtgttacactttgtggg 367  Q
    ||||||||  |||||||||||| ||| ||| |||||        |||| ||| |||||| || ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  11357049 gacttacaaatactattttatcattggcatatttaacatacaaccagagttgatgatattatatgatagtcttgagtgttacactttgtggg 11357140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 191 - 321
Target Start/End: Original strand, 27480164 - 27480298
Alignment:
Q  191 taattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttg----caacatcttggac 286  Q
    |||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||     ||||| ||||||    
T  27480164 taattttgttcttaatgttcgattcatttttaaattgttgatcgctgattaataatcaatagtaattcatctagtaatgtttgtaattaacattttggac 27480263  T
Q  287 ttacatgtactattttatcgttgacatctttaaca 321  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  27480264 ttacatgtactattttatcgttggcatctttaaca 27480298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 74; E-Value: 9e-34
Query Start/End: Original strand, 184 - 396
Target Start/End: Original strand, 20373062 - 20373263
Alignment:
Q  184 aaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttg 283  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||                   |||||||    
T  20373062 aaaaagttaattttgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaatt-------------------catcttg 20373142  T
Q  284 gacttacatgtactattttatcgttgacatcttt--------aacagaattgttgatatcatgtgatagttttgagtgttacactttgtggggtgttaca 375  Q
    |||||| |||||||||||||||||||  ||||||        |||||| ||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||| | ||||     
T  20373143 gacttatatgtactattttatcgttggaatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtgatagttttaagtgttacactttatgggatattacg 20373242  T
Q  376 cttaaaacaaggtaggataaa 396  Q
    |||| ||||||||||||||||    
T  20373243 cttataacaaggtaggataaa 20373263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 329 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 35844550 - 35844450
Alignment:
Q  329 tgatatcatgtgatagttttgagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggat-aaaattagattaagtgtattcttgttaatctgat 427  Q
    ||||||||||||||| | || ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35844550 tgatatcatgtgata-tcttaagtgttacactttgtagggtgttacacttaaaactaggtaggataaaaattagattaagtgtattcttgttaatctgat 35844452  T
Q  428 ga 429  Q
    ||    
T  35844451 ga 35844450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 351 - 429
Target Start/End: Original strand, 51212955 - 51213033
Alignment:
Q  351 gtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatga 429  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||    
T  51212955 gtgttacactttgtggggtgttacacttataacaaggtaggataaaattatattaagtgtagtcttgttaatctgatga 51213033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 329 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 53176278 - 53176178
Alignment:
Q  329 tgatatcatgtgatagttttgagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatg 428  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||| | ||||||  |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  53176278 tgatatcatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggagtgttatatttaaaatgaggttggataaaattagattaagtgtaatcttgttaatctgatg 53176179  T
Q  429 a 429  Q
    |    
T  53176178 a 53176178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 368 - 429
Target Start/End: Original strand, 11357355 - 11357416
Alignment:
Q  368 gtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatga 429  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  11357355 gtgttacacttaaaataaggtaggataaaattagattaaatgtagtcttgttaatctgatga 11357416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 366 - 429
Target Start/End: Original strand, 27480368 - 27480431
Alignment:
Q  366 gggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatga 429  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||    
T  27480368 gggtgttacacttaaaacaatgtaggataaaattagattaagtgcagtcttgttaatatgatga 27480431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 248 - 321
Target Start/End: Original strand, 53811597 - 53811670
Alignment:
Q  248 aatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttatcgttgacatctttaaca 321  Q
    ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||  ||||||||||    
T  53811597 aatagtaattcatctaggaatgcctgcaacatcttggacttacgagtattattttatcgttggtatctttaaca 53811670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 381 - 429
Target Start/End: Original strand, 20373300 - 20373348
Alignment:
Q  381 aacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatga 429  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  20373300 aacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatttgatga 20373348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 184 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 35844624 - 35844577
Alignment:
Q  184 aaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttga 231  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  35844624 aaaaagttaattttaattttaatgtttgatttatttttaaattgttga 35844577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 390 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 40936154 - 40936115
Alignment:
Q  390 ggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatga 429  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  40936154 ggataaaattatattaagtgtattcttgttaatctgatga 40936115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 184 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 43348591 - 43348556
Alignment:
Q  184 aaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcattt 219  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  43348591 aaaaagttaattttaatcttaatgattgattcattt 43348556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 170; Significance: 5e-91; HSPs: 47)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 170; E-Value: 5e-91
Query Start/End: Original strand, 184 - 426
Target Start/End: Original strand, 33709049 - 33709299
Alignment:
Q  184 aaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttg 283  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33709049 aaaaagttaattttaattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattaatgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttg 33709148  T
Q  284 gacttacatgtactattttatcgttgacatcttt--------aacagaattgttgatatcatgtgatagttttgagtgttacactttgtggggtgttaca 375  Q
    || ||||| ||||||||||||| |||||||||||        |||||| ||| |||||||||| |||||| || ||||| ||||||||| ||||||||||    
T  33709149 gatttacaagtactattttatcattgacatctttaacatgcaaacagagttgctgatatcatgcgatagtcttaagtgtgacactttgtagggtgttaca 33709248  T
Q  376 cttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctga 426  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  33709249 cttaaaacaaggtaggataaaattagattaagcgtattcttgttaatctga 33709299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 169; E-Value: 2e-90
Query Start/End: Original strand, 184 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 4167308 - 4167055
Alignment:
Q  184 aaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttg 283  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  4167308 aaaaagttaattttaatcttaatgtttaattcatttttaaattgttgattactgattcatgattaatagtaattcatccagtaatgcttgcaacatcttg 4167209  T
Q  284 gacttacatgtactattttatcgttgacatcttt--------aacagaattgttgatatcatgtgatagttttgagtgttacactttgtggggtgttaca 375  Q
    ||||||||  || |||||||||||||||||||||        |||| | ||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  4167208 gacttacaaatattattttatcgttgacatctttaacatacaaacatagttgatgatattatgtgatagttttaagtgttacactttgtggggtgttaca 4167109  T
Q  376 cttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatga 429  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  4167108 cttaaaacaaggtaggataaaattagattaaatgtattcttgttagtctgatga 4167055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 169; E-Value: 2e-90
Query Start/End: Original strand, 184 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 41961226 - 41960973
Alignment:
Q  184 aaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttg 283  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41961226 aaaaagttaattttgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattattgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttg 41961127  T
Q  284 gacttacatgtactattttatcgttgacatctttaaca--------gaattgttgatatcatgtgatagttttgagtgttacactttgtggggtgttaca 375  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||        || ||| |||||| |||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||    
T  41961126 gacttacaggtattattttatcgttggcatctttaacatgcaaaccgatttgatgatattatgtgataatcttaagtgttacactttgtggggtgttaca 41961027  T
Q  376 cttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatga 429  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  41961026 cttgaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatga 41960973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 161; E-Value: 1e-85
Query Start/End: Original strand, 184 - 429
Target Start/End: Original strand, 18494098 - 18494350
Alignment:
Q  184 aaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttg 283  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  18494098 aaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagcaattcatctagtaatgcttacaacatcttg 18494197  T
Q  284 gacttacatgtactattttatcgttgacatcttt--------aacagaattgttgatatcatgtgatagttttgagtgttacactttgtggggtgttaca 375  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||        |||||| | ||||||||||||||||||| || ||||| || ||||||| ||| |||||    
T  18494198 gacttacatgtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacagagtcgttgatatcatgtgatagtcttaagtgtgactctttgtgaggt-ttaca 18494296  T
Q  376 cttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatga 429  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||    
T  18494297 cttaatacaaggtaggataaaattagatcaagtgtattctagtgaatctgatga 18494350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 160; E-Value: 4e-85
Query Start/End: Original strand, 184 - 436
Target Start/End: Original strand, 2325195 - 2325455
Alignment:
Q  184 aaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttg 283  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2325195 aaaaagttaattttgatcttaatgtttgatttatttttaaattgttgattactgattaataatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttg 2325294  T
Q  284 gacttacatgtactattttatcgttgacatcttt--------aacagaattgttgatatcatgtgatagttttgagtgttacactttgtggggtgttaca 375  Q
    || ||||| |||||||||||||||||  ||||||        |||| | ||| |||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||     
T  2325295 gatttacaggtactattttatcgttgtaatctttaacatgcaaacaaatttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacg 2325394  T
Q  376 cttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgatcctatg 436  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||    
T  2325395 cttaaaataaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatttgatgatactatg 2325455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 159; E-Value: 2e-84
Query Start/End: Original strand, 184 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 44914053 - 44913796
Alignment:
Q  184 aaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattca---tctagtaatgcttgcaacatc 280  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||   |||| ||||||||||||||||    
T  44914053 aaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattcatgattaatagtaattcattttctaataatgcttgcaacatc 44913954  T
Q  281 ttggacttacatgtactattttatcgttgacatcttt--------aacagaattgttgatatcatgtgatagttttgagtgttacactttgt-ggggtgt 371  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||        |||||| ||| |||||| |||||||||| || ||||||||||||||| |||||||    
T  44913953 ttggacttacatgtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtgggggtgt 44913854  T
Q  372 tacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatga 429  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  44913853 tacacttaaaacaatgtatgataaaattagattaagtgtattcttgttagtctgatga 44913796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 157; E-Value: 3e-83
Query Start/End: Original strand, 184 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 4764017 - 4763764
Alignment:
Q  184 aaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttg 283  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  4764017 aaaaagttaattttgattttaatgtttgattcatttttaaattattgattactgattaatgatcaatagtaattcaactagtaatgcttgcaatatcttg 4763918  T
Q  284 gacttacatgtactattttatcgttgacatctttaac--------agaattgttgatatcatgtgatagttttgagtgttacactttgtggggtgttaca 375  Q
    |||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||        ||||||| |||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||    
T  4763917 gacttacaggtactattttatcgttagcatctttaacatgcaaaaagaattgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgctaca 4763818  T
Q  376 cttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatga 429  Q
    ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  4763817 cttgaaacaaggtagaataaaattagattaagtgtagttttgttaatctgatga 4763764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 157; E-Value: 3e-83
Query Start/End: Original strand, 184 - 429
Target Start/End: Original strand, 31570551 - 31570804
Alignment:
Q  184 aaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttg 283  Q
    |||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||     
T  31570551 aaaaagttaattttcattttaatgattgattcatttttaaatatttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagcaatgcttgcaacatctta 31570650  T
Q  284 gacttacatgtactattttatcgttgacatcttt--------aacagaattgttgatatcatgtgatagttttgagtgttacactttgtggggtgttaca 375  Q
     ||||||| ||||||||||||||||| |||||||        |||||| ||||||||||||||||| ||| || ||||||||| ||||||||||||||||    
T  31570651 aacttacaagtactattttatcgttggcatctttaacatgtaaacagagttgttgatatcatgtgacagtcttaagtgttacattttgtggggtgttaca 31570750  T
Q  376 cttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatga 429  Q
    |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31570751 cttaaaacaatgtaagataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatga 31570804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 156; E-Value: 1e-82
Query Start/End: Original strand, 184 - 429
Target Start/End: Original strand, 43648062 - 43648315
Alignment:
Q  184 aaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttg 283  Q
    |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  43648062 aaaaagttaattttgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgtttgcgacatcttg 43648161  T
Q  284 gacttacatgtactattttatcgttgacatctttaaca--gaa------ttgttgatatcatgtgatagttttgagtgttacactttgtggggtgttaca 375  Q
    |||||||| || ||||||||||||||| ||||||||||  |||      ||| |||||| |||||||||| || ||||||| |||||||| |||||||||    
T  43648162 gacttacaagtgctattttatcgttgaaatctttaacatggaaacaaagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttatactttgtgtggtgttaca 43648261  T
Q  376 cttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatga 429  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  43648262 cttataacaaggtatgataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatga 43648315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 154; E-Value: 2e-81
Query Start/End: Original strand, 184 - 429
Target Start/End: Original strand, 19424459 - 19424698
Alignment:
Q  184 aaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttg 283  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  19424459 aaaaagttaattttaatcttaatgattgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatctta 19424558  T
Q  284 gacttacatgtactattttatcgttgacatctttaacagaattgttgatatcatgtgatagttttgagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaac 383  Q
    ||||| || ||||     |||| || ||||    |||||| ||| ||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19424559 gacttgcaggtac-----tatctttaacat-gcaaacagagttgctgatatcatgtgatagtcttaaatgttacactttgtggggtgttacacttaaaac 19424652  T
Q  384 aaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatga 429  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  19424653 aaggtaagataaaattagattaagcgtattcttgttaatctgatga 19424698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 153; E-Value: 6e-81
Query Start/End: Original strand, 184 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 26357963 - 26357710
Alignment:
Q  184 aaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttg 283  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26357963 aaaaagttaattttgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttg 26357864  T
Q  284 gacttacatgtactattttatcgttgacatcttt--------aacagaattgttgatatcatgtgatagttttgagtgttacactttgtggggtgttaca 375  Q
    |||||| |  |||||||||||||||| |||||||        |||| | ||| | |||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||    
T  26357863 gacttaaaaatactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacacatttgataatattatgtgatagttttaagtgttacaatttgtgggatgttaca 26357764  T
Q  376 cttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatga 429  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||    
T  26357763 cttgaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtgatcttgttaatatgatga 26357710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 149; E-Value: 2e-78
Query Start/End: Original strand, 184 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 3177325 - 3177072
Alignment:
Q  184 aaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttg 283  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  3177325 aaaaagttacttttaattttaatgtttgatttattttcaaattgttgattacttattcatgataaatagtaattcatctagtaatgcttgtaatatcttg 3177226  T
Q  284 gacttacatgtactattttatcgttgacatcttt--------aacagaattgttgatatcatgtgatagttttgagtgttacactttgtggggtgttaca 375  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||        |||| | ||| |||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||    
T  3177225 gacttacatgtactattttatagttgacatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttaca 3177126  T
Q  376 cttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatga 429  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  3177125 cttaaaacaaggtaagataaaattagattaagtgtattcttcttagtctgatga 3177072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 149; E-Value: 2e-78
Query Start/End: Original strand, 184 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 5881915 - 5881672
Alignment:
Q  184 aaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttg 283  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  5881915 aaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgaataatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatctta 5881816  T
Q  284 gacttacatgtactattttatcgttgacatcttt--------aacagaattgttgatatcatgtgatagttttgagtgttacactttgtggggtgttaca 375  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||        |||| ||||||||||||||||         |||||||||||||||||| ||| |||||    
T  5881815 gacttacatgtactattttattgttgacatctttaacatgcaaacaaaattgttgatatcatg---------tgagtgttacactttgtgaggtattaca 5881725  T
Q  376 cttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatga 429  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  5881724 cttaaaacaaggtatgat-aaattagattaaatgtattcttgttaatatgatga 5881672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 149; E-Value: 2e-78
Query Start/End: Original strand, 184 - 429
Target Start/End: Original strand, 33660194 - 33660438
Alignment:
Q  184 aaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttg 283  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      
T  33660194 aaaaagttaattttaattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatctca 33660293  T
Q  284 gacttacatgtactattttatcgttgacatcttt--------aacagaattgttgatatcatgtgatagttttgagtgttacactttgtggggtgttaca 375  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||||||        |||| | ||| ||||||||||         || |||||||||||||||||||||||||    
T  33660294 gacttacagatactattttatcgttgacatctttaacatgcaaacaaagttgctgatatcatg---------tgggtgttacactttgtggggtgttaca 33660384  T
Q  376 cttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatga 429  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  33660385 cttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcctgttaatctaatga 33660438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 184 - 429
Target Start/End: Original strand, 11366197 - 11366451
Alignment:
Q  184 aaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagta-attcatctagtaatgcttgcaacatctt 282  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  11366197 aaaaagttaattttaattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtatattcatctagtaatgcttgcaacatctt 11366296  T
Q  283 ggacttacatgtactattttatcgttgacatctttaac--------agaattgttgatatcatgtgatagttttgagtgttacactttgtggggtgttac 374  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||        ||| ||| |||||| |||||||||| || ||||||||||||||| ||||||||     
T  11366297 ggacttacaggtactattttatcgttgaaatctttaacatgcaaatagagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtagggtgttat 11366396  T
Q  375 acttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatga 429  Q
      ||| |||||| || |||||||||| ||||| |||| ||||||||| |||||||    
T  11366397 gtttagaacaagatatgataaaattatattaaatgtagtcttgttaacctgatga 11366451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 141; E-Value: 9e-74
Query Start/End: Original strand, 184 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 41465887 - 41465634
Alignment:
Q  184 aaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttg 283  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  41465887 aaaaagttaattttgatcttaatgttcgattcaattttaaattgttgattgctgattaatgatcaatagtaattcatatagtaatgtttgcaacatcttg 41465788  T
Q  284 gacttacatgtactattttatcgttgacatcttt--------aacagaattgttgatatcatgtgatagttttgagtgttacactttgtggggtgttaca 375  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||        |||| ||||| |||||| ||| |||||| || ||||||||||||| || |||||||||    
T  41465787 gacttacatgtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacataattgatgatattatgcgatagtcttaagtgttacactttctgaggtgttaca 41465688  T
Q  376 cttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatga 429  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||  | |||||| ||||| ||||    
T  41465687 cttaaaacaaggtagaataaaattagattaagttcagtcttgtgaatctaatga 41465634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 138; E-Value: 6e-72
Query Start/End: Original strand, 185 - 429
Target Start/End: Original strand, 29241963 - 29242208
Alignment:
Q  185 aaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttgg 284  Q
    ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |       |||||||    
T  29241963 aaaagttaattatgatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattgctgattaatgttcaatagtaattcatctagtaattc-------atcttgg 29242055  T
Q  285 acttacatgtactattttatcgttgacatctttaaca--------gaattgttgatatcatgtgatagttttgagtgttacactttgtggggtgttacac 376  Q
    ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||        || ||| |||||| |||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  29242056 acttacaggtactattgtatcgttgacatctttaacatacaaccagagttgatgatattatgtgatagtcttaggtgttacactttgtggggtgttacac 29242155  T
Q  377 ttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatga 429  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  29242156 ttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagttttgttaatctgatga 29242208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 138; E-Value: 6e-72
Query Start/End: Original strand, 184 - 429
Target Start/End: Original strand, 39167186 - 39167433
Alignment:
Q  184 aaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttg 283  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||| ||||||  |||    
T  39167186 aaaaagttaattttaatcttaatgttttattcatttttaaattgttgattactgattcataattaatagtaattcatctagtaatgctagcaacaatttg 39167285  T
Q  284 gacttacatgtactattttatcgttgacatcttt--------aacagaattgttgatatcatgtgatagttttgagtgttacactttgtggggtgttaca 375  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||        |||||| ||| |||||| ||||||||||      |||||||||||||||| |||||||    
T  39167286 gacttacatgtactattttatcgttgacatctttaacatacaaacagagttgatgatattatgtgatagt------tgttacactttgtgggatgttaca 39167379  T
Q  376 cttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatga 429  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||    
T  39167380 cttaaaacaaggtataataaaattagaataagtgtattcttgttactctaatga 39167433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 184 - 429
Target Start/End: Original strand, 19289140 - 19289393
Alignment:
Q  184 aaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttg 283  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  19289140 aaaaagttaattttgatcttaatgtttaattcatttttaaattgttaatttctgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaatatcttg 19289239  T
Q  284 gacttacatgtactattttatcgttgacatcttta--------acagaattgttgatatcatgtgatagttttgagtgttacactttgtggggtgttaca 375  Q
    |||||||| ||| |||||||| || |  |||||||        ||||| ||| |||||| |||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||    
T  19289240 gacttacaggtattattttattgtcggaatctttaacatgcacacagagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtgggatgttaca 19289339  T
Q  376 cttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatga 429  Q
     ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  19289340 tttataacaatgtaggataaaattagattaagtgtagtcttattaatctgatga 19289393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 136; E-Value: 9e-71
Query Start/End: Original strand, 184 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 35959278 - 35959030
Alignment:
Q  184 aaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttg 283  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35959278 aaaaagttaattttgattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttg 35959179  T
Q  284 gacttacatgtactattttatcgttgacatcttt--------aacagaattgttgatatcatgtgatagttttgagtgttacactttgtggggtgttaca 375  Q
    |    |||||||||||||||||||||| ||||||        |||| | ||| |||||| |||||||||| || | |||||||||||||||||||||||     
T  35959178 g----acatgtactattttatcgttgaaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtcttaactgttacactttgtggggtgttacg 35959083  T
Q  376 cttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatga 429  Q
    |||| ||||||||||||| |||||| |||||||| | |||||||||| ||||||    
T  35959082 cttataacaaggtaggat-aaattatattaagtgcagtcttgttaatatgatga 35959030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 133; E-Value: 5e-69
Query Start/End: Original strand, 208 - 429
Target Start/End: Original strand, 27349789 - 27350009
Alignment:
Q  208 tttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttatcgt 307  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||    
T  27349789 tttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttagacttacagatactattttatcgt 27349888  T
Q  308 tgacatcttt--------aacagaattgttgatatcatgtgatagttttgagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaatt 399  Q
    ||  ||||||        |||||| ||  ||||||||||         ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  27349889 tggaatctttaacttgcaaacagagttcctgatatcatg---------tgagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggttggataaaatt 27349979  T
Q  400 agattaagtgtattcttgttaatctgatga 429  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27349980 agattaagtgtattcttgttaatctgatga 27350009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 133; E-Value: 5e-69
Query Start/End: Original strand, 184 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 37906097 - 37905841
Alignment:
Q  184 aaaaagttaattttaatcttaatgtttgatt-catttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatctt 282  Q
    ||||| |||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  37906097 aaaaaattaattttgattttaatgtttgatttcatttttaaattgttaattactgattaatgatcaatagtaattcatccagtaattcttgcaacatctt 37905998  T
Q  283 ggacttacatgtactattttatcgttgacatcttt--------aacagaattgttgatatcatgtgatagttttgagtgttacactttgt--ggggtgtt 372  Q
    ||||||||||||  ||||||||| |||  ||||||        |||||| ||  |||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||  ||||||||    
T  37905997 ggacttacatgtgttattttatcattggaatctttaacatgcaaacagagttaatgatattatgcgatagttttaagtgttacactttgtggggggtgtt 37905898  T
Q  373 acacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatga 429  Q
    || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37905897 acgcttataacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatga 37905841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 133; E-Value: 5e-69
Query Start/End: Original strand, 184 - 429
Target Start/End: Original strand, 43770665 - 43770909
Alignment:
Q  184 aaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttg 283  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43770665 aaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgatttctaattaatgatcaatagaaattcatctagtaatgcttgcaacatcttg 43770764  T
Q  284 gacttacatgtactattttatcgttgacatcttt--------aacagaattgttgatatcatgtgatagttttgagtgttacactttgtggggtgttaca 375  Q
     ||||| |  ||||||||||| |||| |||||||        |||||| ||| ||||||||||         |||||||||||||||||| |||||||||    
T  43770765 aacttaaagatactattttattgttggcatctttaacatgcaaacagagttgctgatatcatg---------tgagtgttacactttgtgaggtgttaca 43770855  T
Q  376 cttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatga 429  Q
    |||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  43770856 cttaaaacaaggcaggataaaattaaattaagtatattcttgttaatctgatga 43770909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 217 - 429
Target Start/End: Original strand, 4263926 - 4264147
Alignment:
Q  217 tttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttatcgttgacatctt 316  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||| ||||||    
T  4263926 tttttaaattgttgattactgatcaatgatcaatattatttcatctagtaatgcttgcaacatcttgaacttatatgtactattttattgttggcatctt 4264025  T
Q  317 t--------aacagaattgttgatatcatg-tgatagttttgagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaag 407  Q
    |        |||||| ||| |||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4264026 taacatgcaaacagagttgctgatatcatgttgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttaaacttaaaacaaggtaggataaaattagattaag 4264125  T
Q  408 tgtattcttgttaatctgatga 429  Q
    ||||||||| ||||| ||||||    
T  4264126 tgtattcttcttaatatgatga 4264147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 184 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 31862238 - 31861985
Alignment:
Q  184 aaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttg 283  Q
    |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||| ||||||    
T  31862238 aaaaagttaattttgatcttaatatttgattcatttttaaatcgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgtctacaatatcttg 31862139  T
Q  284 gacttacatgtactattttatcgttgacatcttt--------aacagaattgttgatatcatgtgatagttttgagtgttacactttgtggggtgttaca 375  Q
    |||||||| |||||||||||| || |  ||| ||        |||||| ||| |||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||     
T  31862138 gacttacaagtactattttattgtcggaatccttaacatgcaaacagacttgatgatattatgtgataattttaagtgttacactttgtggggtgttacg 31862039  T
Q  376 cttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatga 429  Q
    |||| ||||| ||| | ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  31862038 cttataacaatgtatgttaaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatga 31861985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 128; E-Value: 5e-66
Query Start/End: Original strand, 184 - 429
Target Start/End: Original strand, 33550800 - 33551056
Alignment:
Q  184 aaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatga----tcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacat 279  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |    |||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  33550800 aaaaagttaattttgatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactggttaataaataatcaatagttattcatctagtaatgcttgcaacat 33550899  T
Q  280 cttggacttacatgtactattttatcgttgacatcttt--------aacagaattgttgatatcatgtgatagttttgagtgttacactttgtggggtgt 371  Q
     |||||||| || |||||||||||||||||| ||||||        |||| | ||| |||||| ||  | |||| || ||||||||||||||||||||||    
T  33550900 attggactttcaagtactattttatcgttgaaatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatacg-tagtcttaagtgttacactttgtggggtgt 33550998  T
Q  372 tacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatga 429  Q
    ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  33550999 tacgcttaaaacaacgtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatga 33551056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 184 - 424
Target Start/End: Original strand, 7006755 - 7006986
Alignment:
Q  184 aaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttg 283  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7006755 aaaaagttaattttaatcataatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagaaattcatctagtaatgcttgcaacatcttg 7006854  T
Q  284 gacttacatgtactattttatcgttgacatcttt--------aacagaattgttgatatcatgtgatagttttgagtgttacactttgtggggtgttaca 375  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| |||||||        |||||| ||| ||||||||||||||| | || ||                 |||||||    
T  7006855 gacttacaagtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacagagttgctgatatcatgtgatattcttaag-----------------tgttaca 7006937  T
Q  376 cttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatct 424  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7006938 cttaaaacaaggtatgataaaattagattaagtgtattcttgttaatct 7006986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 218 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 4478717 - 4478502
Alignment:
Q  218 ttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttatcgttgacatcttt 317  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||| ||| |||||||    
T  4478717 ttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagcaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttaccgatactattttatcattggcatcttt 4478618  T
Q  318 --------aacagaattgttgatatcatgtgatagttttgagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggat-aaaattagattaagt 408  Q
            |||||| ||| ||||||||||||||||  || |||||||||||||     |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  4478617 aacatggaaacagagttggtgatatcatgtgatagacttaagtgttacacttt-----gtgttacacttaaaacaaggtaggataaaaattagattaagt 4478523  T
Q  409 gtattcttgttaatctgatga 429  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  4478522 gtattcttgttaatctgatga 4478502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 234 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 44286285 - 44286082
Alignment:
Q  234 actgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttatcgttgacatctttaacag--------aat 325  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||  ||| |||||||         | |    
T  44286285 actgattaatgatcaatagtaattcatctaacaatgcttgcaacatcttagacttacagatactattttatcgttagcatatttaacatgcaaacaaagt 44286186  T
Q  326 tgttgatatcatgtgatagttttgagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctg 425  Q
    |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  44286185 tgttgatatcatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtagaataaaattagattaagtgtattattgttaatctg 44286086  T
Q  426 atga 429  Q
    ||||    
T  44286085 atga 44286082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 184 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 13711845 - 13711597
Alignment:
Q  184 aaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttg 283  Q
    ||||| ||||||||||| | |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||     
T  13711845 aaaaaattaattttaatttaaatgattgattcatttttaaatcgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtattgtttgcaacatctta 13711746  T
Q  284 gacttacatgtactattttatcgttgacatcttta--------acagaattgttgatatcatgtgatagttttgagtgttacactttgtggggtgttaca 375  Q
    |||||||| |||||||||||||| || ||||||||        ||||| ||| ||||||||||| ||||| || | | ||| ||||| ||||||||||||    
T  13711745 gacttacaggtactattttatcgctggcatctttaacatgcatacagagttgctgatatcatgtcatagtcttaactattatactttatggggtgttaca 13711646  T
Q  376 cttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatga 429  Q
    ||||||||     | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  13711645 cttaaaac-----atgataaaattagattaaatgtattcttgttaatctgatga 13711597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 113; E-Value: 5e-57
Query Start/End: Original strand, 231 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 19314186 - 19313984
Alignment:
Q  231 attactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggactta---catgtactattttatcgttgacatctttaacag----- 322  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||   ||||||||||||||||| ||||||||||||||          
T  19314186 attactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttagacttataacatgtactattttatcgctgacatctttaacatgcaaa 19314087  T
Q  323 ---aattgttgatatcatgtgatagttttgagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgtt 419  Q
       | ||| |||||||||||||||||       ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  19314086 catagttgctgatatcatgtgatagt-------gttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattcgattaagtgtattcttgtt 19313994  T
Q  420 aatctgatga 429  Q
    ||||||||||    
T  19313993 aatctgatga 19313984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 111; E-Value: 7e-56
Query Start/End: Original strand, 191 - 321
Target Start/End: Original strand, 19500739 - 19500869
Alignment:
Q  191 taattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttac 290  Q
    ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||    
T  19500739 taattttgatcttaatatttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttgaaattac 19500838  T
Q  291 atgtactattttatcgttgacatctttaaca 321  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  19500839 atgtactattttatcgttaacatctttaaca 19500869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 265 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 45328025 - 45327853
Alignment:
Q  265 taatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttatcgttgacatctttaacag--------aattgttgatatcatgtgatagttttgagtgtta 356  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||         | ||  |||||| ||| |||||| ||  ||||||    
T  45328025 taatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttatcgttgacatctttaacatgcaaacatagtttatgatattatgcgatagtcttatgtgtta 45327926  T
Q  357 cactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatga 429  Q
    |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  45327925 cactttctgaggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatga 45327853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 91; E-Value: 6e-44
Query Start/End: Original strand, 265 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 36642293 - 36642119
Alignment:
Q  265 taatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttatcgttgacatctttaaca--------gaattgttgatatcatgtgatagttttgagtgtta 356  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||        || ||| || |||||||||||||| || |||||||    
T  36642293 taatgcttgcaacatcttgaacttaccggtactattttatcgttggcatctttaacatggaaacagagttgctggtatcatgtgatagtcttaagtgtta 36642194  T
Q  357 cactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggat--aaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatga 429  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  36642193 cactttgtagggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaaaattagattaagtgtattcttgttaatttgatga 36642119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 184 - 305
Target Start/End: Original strand, 41051117 - 41051238
Alignment:
Q  184 aaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttg 283  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  41051117 aaaaaattaattttaattttaatgtttgattcatttttgaattgttgattattgattaatgatcaataacaattcatctagcaatgcttacaacatcttg 41051216  T
Q  284 gacttacatgtactattttatc 305  Q
     ||||||| |||||||||||||    
T  41051217 aacttacaggtactattttatc 41051238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 81; E-Value: 6e-38
Query Start/End: Original strand, 276 - 429
Target Start/End: Original strand, 17071646 - 17071807
Alignment:
Q  276 acatcttggacttacatgtactattttatcgttgacatctttaacag--------aattgttgatatcatgtgatagttttgagtgttacactttgtggg 367  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||||||||  ||||||||||         | ||| |||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  17071646 acatcttggatttacaggtactattttatcgttggaatctttaacatgcaaacaaatttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggg 17071745  T
Q  368 gtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatga 429  Q
    ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  17071746 gtgttacgcttaaaataaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatga 17071807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 74; E-Value: 9e-34
Query Start/End: Original strand, 329 - 429
Target Start/End: Original strand, 17054066 - 17054166
Alignment:
Q  329 tgatatcatgtgatagttttgagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatg 428  Q
    |||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  17054066 tgatattatgtgatagtnttaagtgttacactttgtggggtgttacgcttaaaataaggtaggataaaattagattaagtgtggtcttgttaatctgatg 17054165  T
Q  429 a 429  Q
    |    
T  17054166 a 17054166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 184 - 289
Target Start/End: Original strand, 41463407 - 41463512
Alignment:
Q  184 aaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttg 283  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||||| || |||||||||     
T  41463407 aaaaagttaattttaatcttaatgattgattcatttttaaattattaattattgattaatgatcaatagtaatttatctattaatgtttacaacatctta 41463506  T
Q  284 gactta 289  Q
    ||||||    
T  41463507 gactta 41463512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 69; E-Value: 8e-31
Query Start/End: Original strand, 329 - 421
Target Start/End: Original strand, 18258257 - 18258349
Alignment:
Q  329 tgatatcatgtgatagttttgagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaa 421  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  18258257 tgatatcatgtgatagtcttaagtgttacactttatggggtgttacacttaaaaaaatgtaggataaaattagattaagtttattcttgttaa 18258349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 184 - 282
Target Start/End: Original strand, 18257355 - 18257453
Alignment:
Q  184 aaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatctt 282  Q
    ||||||||||||||||| |||||  || ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18257355 aaaaagttaattttaatattaataatttattcattttaaaattgtcgattactgattaatgataaataataattcatctagtaatgcttgcaacatctt 18257453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 64; E-Value: 8e-28
Query Start/End: Original strand, 184 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 33902400 - 33902317
Alignment:
Q  184 aaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaa 267  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  33902400 aaaaagttaattttgatcttaatgtttgatttatttttaaattgttgattacagattaataatcaataataattcatctagtaa 33902317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 329 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 33902299 - 33902199
Alignment:
Q  329 tgatatcatgtgatagttttgagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatg 428  Q
    |||||| |||||||| | || ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||||| | || ||||||||||||||||    
T  33902299 tgatattatgtgatactattaagtgttacactttgtggggtgctacccttaaaacaaggtaggataaaattcgattaaatatagtcttgttaatctgatg 33902200  T
Q  429 a 429  Q
    |    
T  33902199 a 33902199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 296 - 429
Target Start/End: Original strand, 41463779 - 41463920
Alignment:
Q  296 ctattttatcgttgacatctttaaca--------gaattgttgatatcatgtgatagttttgagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaagg 387  Q
    ||||||||||||||||||||||||||        || ||||||||||||||||||||| || | ||||||| |||||| ||||||||| ||||||||| |    
T  41463779 ctattttatcgttgacatctttaacatgcaaacagagttgttgatatcatgtgatagtcttaaatgttacattttgtgaggtgttacaattaaaacaaag 41463878  T
Q  388 taggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatga 429  Q
    || |||||||||| |||||  |||||||||||||| ||||||    
T  41463879 tatgataaaattatattaaaagtattcttgttaatatgatga 41463920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 184 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 45328076 - 45328028
Alignment:
Q  184 aaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgat 232  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45328076 aaaaagttaattttgatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgat 45328028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 199 - 241
Target Start/End: Original strand, 17053963 - 17054005
Alignment:
Q  199 atcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgatta 241  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  17053963 atcttaatgtttgattcatttttacattgttgattactgatta 17054005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 199 - 241
Target Start/End: Original strand, 17071604 - 17071646
Alignment:
Q  199 atcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgatta 241  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  17071604 atcttaatgtttgattcatttttacattgttgattactgatta 17071646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 184 - 214
Target Start/End: Original strand, 4263726 - 4263756
Alignment:
Q  184 aaaaagttaattttaatcttaatgtttgatt 214  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4263726 aaaaagttaattttaatcttaatgtttgatt 4263756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0002 (Bit Score: 161; Significance: 1e-85; HSPs: 4)
Name: scaffold0002
Description:

Target: scaffold0002; HSP #1
Raw Score: 161; E-Value: 1e-85
Query Start/End: Original strand, 184 - 429
Target Start/End: Original strand, 408228 - 408481
Alignment:
Q  184 aaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttg 283  Q
    ||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  408228 aaaaaattaatttttattttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttg 408327  T
Q  284 gacttacatgtactattttatcgttgacatcttt--------aacagaattgttgatatcatgtgatagttttgagtgttacactttgtggggtgttaca 375  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  ||||||        |||||| ||| ||||||  ||||||||| || |||||| ||||||||| ||||||||     
T  408328 gacttacatgtactattttatcgttggaatctttaacatgcaaacagagttgatgatattgtgtgatagtcttaagtgttccactttgtgaggtgttacg 408427  T
Q  376 cttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatga 429  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  408428 cttataacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatga 408481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0002; HSP #2
Raw Score: 150; E-Value: 4e-79
Query Start/End: Original strand, 184 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 514 - 267
Alignment:
Q  184 aaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttg 283  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  514 aaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattcatgattaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttg 415  T
Q  284 gacttacatgtactattttatcgttgacatcttt--------aacagaattgttgatatcatgtgatagttttgagtgttacactttgtggggtgttaca 375  Q
    |||      ||||||||||||||||| |||||||        |||||| ||| |||||| |||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||    
T  414 gac------gtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttatggggtgttaca 321  T
Q  376 cttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatga 429  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  320 cttaaaataagataggataaaattagattaaatgtattcttgttagtctgatga 267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0002; HSP #3
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 184 - 321
Target Start/End: Original strand, 93900 - 94036
Alignment:
Q  184 aaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttg 283  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  93900 aaaaagttaattttgattttaatgtttgattcatttt-aaattgttgattagtgattaatgatcaatagcaattcatctagtaatgcttgcaacatcttg 93998  T
Q  284 gacttacatgtactattttatcgttgacatctttaaca 321  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  93999 gacttacaagtactattttatcgttgacatctttaaca 94036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0002; HSP #4
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 324 - 429
Target Start/End: Original strand, 94330 - 94435
Alignment:
Q  324 attgttgatatcatgtgatagttttgagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatc 423  Q
    |||| |||||| |||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  94330 attgatgatattatgtaatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacacttgaaacaagctagaataaaattaaattaagtgtagtcttgttaatc 94429  T
Q  424 tgatga 429  Q
    | ||||    
T  94430 tcatga 94435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0291 (Bit Score: 158; Significance: 7e-84; HSPs: 1)
Name: scaffold0291
Description:

Target: scaffold0291; HSP #1
Raw Score: 158; E-Value: 7e-84
Query Start/End: Original strand, 186 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 8271 - 8020
Alignment:
Q  186 aaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttgga 285  Q
    |||||||||||| || |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8271 aaagttaattttgattttaacgattgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttgga 8172  T
Q  286 cttacatgtactattttatcgttgacatctttaaca---gaa-----ttgttgatatcatgtgatagttttgagtgttacactttgtggggtgttacact 377  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||   |||     ||| |||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||    
T  8171 cttacatgtactattttatcgttggaatctttaacatgcgaacaacgttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacgct 8072  T
Q  378 taaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatga 429  Q
    || | |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  8071 tatagcaagttaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatga 8020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0061 (Bit Score: 125; Significance: 3e-64; HSPs: 1)
Name: scaffold0061
Description:

Target: scaffold0061; HSP #1
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 184 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 44342 - 44090
Alignment:
Q  184 aaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttg 283  Q
    |||||||| ||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||    
T  44342 aaaaagttgattttgattttaatgtttaattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcattcagtaatgcttgcaacaacttg 44243  T
Q  284 gacttacatgtactattttatcgttgacatcttt--------aacagaattgttgatatcatgtgatagttttgagtgttacactttgtggggtgttaca 375  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||        |||| | ||| |||||| |||||||||  || ||||||||||||||||||||||||      
T  44242 gacttacatgtactattttatcgttgaaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatag-cttaagtgttacactttgtggggtgttaag 44144  T
Q  376 cttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatga 429  Q
    |||| |||||| || |||||||||| ||||| |||| |||| ||||||||||||    
T  44143 cttataacaagatatgataaaattatattaaatgtagtcttattaatctgatga 44090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017 (Bit Score: 125; Significance: 3e-64; HSPs: 1)
Name: scaffold0017
Description:

Target: scaffold0017; HSP #1
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 184 - 429
Target Start/End: Original strand, 154445 - 154697
Alignment:
Q  184 aaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttg 283  Q
    |||||||| ||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||    
T  154445 aaaaagttgattttgattttaatgtttaattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcattcagtaatgcttgcaacaacttg 154544  T
Q  284 gacttacatgtactattttatcgttgacatcttt--------aacagaattgttgatatcatgtgatagttttgagtgttacactttgtggggtgttaca 375  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||        |||| | ||| |||||| |||||||||  || ||||||||||||||||||||||||      
T  154545 gacttacatgtactattttatcgttgaaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatag-cttaagtgttacactttgtggggtgttaag 154643  T
Q  376 cttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatga 429  Q
    |||| |||||| || |||||||||| ||||| |||| |||| ||||||||||||    
T  154644 cttataacaagatatgataaaattatattaaatgtagtcttattaatctgatga 154697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022 (Bit Score: 118; Significance: 5e-60; HSPs: 1)
Name: scaffold0022
Description:

Target: scaffold0022; HSP #1
Raw Score: 118; E-Value: 5e-60
Query Start/End: Original strand, 184 - 429
Target Start/End: Original strand, 145814 - 146068
Alignment:
Q  184 aaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagta-attcatctagtaatgcttgcaacatctt 282  Q
    |||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  145814 aaaaagttaattttgattttaatgtttaattcatttttaaattttttattactgattaatgatcaattgtatattcatttagtaatgcttgcaacatctt 145913  T
Q  283 ggacttacatgtactattttatcgttgacatctttaac--------agaattgttgatatcatgtgatagttttgagtgttacactttgtggggtgttac 374  Q
    |||||||||   |||||||||||||||  |||||||||        ||| ||| |||||| |||||||||| || ||||||||||||||| ||||||||     
T  145914 ggacttacagacactattttatcgttggaatctttaacatgcaaatagagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtagggtgttat 146013  T
Q  375 acttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatga 429  Q
     |||| ||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||    
T  146014 gcttagaacaaggtatgataaaattatattaagtgtagtcttgttaacctgatga 146068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008 (Bit Score: 110; Significance: 3e-55; HSPs: 1)
Name: scaffold0008
Description:

Target: scaffold0008; HSP #1
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 184 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 267662 - 267417
Alignment:
Q  184 aaaaagttaattttaatcttaatgtttgattcatttttaaattgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttg 283  Q
    ||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  |         |||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  267662 aaaaaattaattttgatcttaatatttgattcatttttaaattgttgattactgattggt---------taattcatctagtaattcttgcagcatcttg 267572  T
Q  284 gacttacatgtactattttatcgttgacatctttaacag--------aattgttgatatcatgtgatagt-tttgagtgttacactttgtggggtgttac 374  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||         | ||| |||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||    
T  267571 gacttacatgtattattttatcgttggcatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtctttaagtgttacactttgtgggatgttac 267472  T
Q  375 acttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatga 429  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||    
T  267471 atttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgctaatctaatga 267417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009 (Bit Score: 49; Significance: 7e-19; HSPs: 2)
Name: scaffold0009
Description:

Target: scaffold0009; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 225 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 101058 - 100993
Alignment:
Q  225 ttgttgattactgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacat 292  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  101058 ttgttgattactgattaatgatc--tagtaatgcatttagtaatgcttgcaacatcttggacttacat 100993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009; HSP #2
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 377 - 418
Target Start/End: Complemental strand, 100935 - 100894
Alignment:
Q  377 ttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgt 418  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  100935 ttaaaacaaggtaggataaaattaaattaagtgtagtcttgt 100894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University