View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF9499_low_8 (Length: 466)

Name: NF9499_low_8
Description: NF9499
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF9499_low_8
NF9499_low_8
[»] chr1 (27 HSPs)
chr1 (7-449)||(4245798-4246242)
chr1 (93-418)||(26972383-26972709)
chr1 (93-421)||(13165246-13165572)
chr1 (183-444)||(1973252-1973513)
chr1 (106-449)||(14745735-14746079)
chr1 (93-449)||(11667814-11668171)
chr1 (198-444)||(17851331-17851577)
chr1 (92-421)||(20841246-20841564)
chr1 (187-449)||(23477888-23478151)
chr1 (199-443)||(12753016-12753260)
chr1 (199-444)||(17038203-17038445)
chr1 (231-444)||(15804070-15804282)
chr1 (235-449)||(17379577-17379790)
chr1 (159-304)||(20859641-20859786)
chr1 (90-221)||(9451987-9452117)
chr1 (288-444)||(47941298-47941454)
chr1 (261-415)||(45599317-45599471)
chr1 (235-449)||(17355785-17355998)
chr1 (235-415)||(51472080-51472260)
chr1 (195-444)||(10340116-10340364)
chr1 (248-444)||(8281924-8282119)
chr1 (261-413)||(33062402-33062555)
chr1 (262-415)||(40313211-40313364)
chr1 (261-413)||(17012019-17012172)
chr1 (234-415)||(18390092-18390273)
chr1 (195-313)||(41330891-41331009)
chr1 (261-444)||(52436778-52436962)
[»] scaffold0003 (1 HSPs)
scaffold0003 (91-449)||(26251-26609)
[»] chr7 (66 HSPs)
chr7 (91-449)||(16436621-16436979)
chr7 (93-421)||(11998728-11999057)
chr7 (91-418)||(644980-645308)
chr7 (95-421)||(16207862-16208189)
chr7 (93-449)||(4458588-4458946)
chr7 (95-418)||(11588315-11588639)
chr7 (92-421)||(11521391-11521720)
chr7 (190-449)||(20991488-20991748)
chr7 (93-421)||(14165015-14165343)
chr7 (93-421)||(13455093-13455421)
chr7 (92-449)||(29546091-29546440)
chr7 (248-449)||(42636251-42636452)
chr7 (191-449)||(10279761-10280018)
chr7 (193-444)||(14926596-14926847)
chr7 (193-444)||(15350062-15350313)
chr7 (199-441)||(26132877-26133118)
chr7 (92-421)||(12325673-12325991)
chr7 (195-444)||(7586488-7586737)
chr7 (195-444)||(24902059-24902305)
chr7 (195-427)||(20925077-20925305)
chr7 (199-444)||(9566861-9567103)
chr7 (199-444)||(9564212-9564454)
chr7 (261-444)||(4794546-4794730)
chr7 (261-444)||(42782772-42782956)
chr7 (261-401)||(48797620-48797760)
chr7 (232-366)||(10658371-10658505)
chr7 (261-414)||(14984688-14984841)
chr7 (261-414)||(15414299-15414452)
chr7 (261-415)||(11560493-11560647)
chr7 (198-444)||(23956831-23957077)
chr7 (235-444)||(10038686-10038902)
chr7 (270-414)||(30226111-30226256)
chr7 (261-444)||(3290642-3290826)
chr7 (261-415)||(7620097-7620251)
chr7 (261-449)||(15506284-15506471)
chr7 (270-444)||(15708197-15708370)
chr7 (250-415)||(9894054-9894219)
chr7 (261-415)||(14975449-14975603)
chr7 (261-415)||(15404925-15405079)
chr7 (235-415)||(23579941-23580121)
chr7 (235-444)||(7508426-7508633)
chr7 (235-444)||(10251431-10251640)
chr7 (261-449)||(15436065-15436252)
chr7 (248-415)||(23296504-23296674)
chr7 (271-415)||(24813952-24814096)
chr7 (248-415)||(14687371-14687538)
chr7 (250-444)||(23082733-23082926)
chr7 (362-449)||(10660981-10661068)
chr7 (261-415)||(11628656-11628811)
chr7 (272-413)||(23174870-23175011)
chr7 (192-346)||(21260462-21260617)
chr7 (234-312)||(23057196-23057274)
chr7 (248-415)||(20588695-20588861)
chr7 (274-455)||(26195407-26195586)
chr7 (248-309)||(20596918-20596979)
chr7 (233-309)||(31269148-31269224)
chr7 (362-444)||(24049568-24049649)
chr7 (248-316)||(6045325-6045392)
chr7 (251-413)||(10309480-10309641)
chr7 (252-414)||(11406938-11407100)
chr7 (361-413)||(4547800-4547852)
chr7 (359-415)||(19353245-19353301)
chr7 (261-304)||(2076522-2076565)
chr7 (261-304)||(2082941-2082984)
chr7 (372-415)||(31269044-31269087)
chr7 (257-307)||(19353143-19353193)
[»] chr3 (46 HSPs)
chr3 (93-449)||(13790528-13790886)
chr3 (92-449)||(295308-295665)
chr3 (90-441)||(15635833-15636186)
chr3 (92-421)||(17702255-17702584)
chr3 (87-440)||(18064168-18064524)
chr3 (92-421)||(24195372-24195701)
chr3 (92-421)||(18034877-18035207)
chr3 (93-418)||(44452329-44452655)
chr3 (183-449)||(28051075-28051341)
chr3 (92-449)||(20748117-20748473)
chr3 (92-417)||(1919228-1919546)
chr3 (93-393)||(19633736-19634035)
chr3 (93-316)||(19531970-19532193)
chr3 (93-421)||(23954538-23954869)
chr3 (250-449)||(17042707-17042906)
chr3 (232-421)||(6580848-6581037)
chr3 (189-421)||(18547593-18547826)
chr3 (159-371)||(13524713-13524924)
chr3 (265-444)||(9036728-9036907)
chr3 (214-444)||(9031340-9031569)
chr3 (191-445)||(13913739-13913990)
chr3 (270-444)||(7479097-7479269)
chr3 (251-444)||(21718884-21719076)
chr3 (270-410)||(7495921-7496060)
chr3 (201-435)||(15686126-15686361)
chr3 (272-449)||(18476957-18477134)
chr3 (196-444)||(286850-287103)
chr3 (231-445)||(13917831-13918042)
chr3 (248-440)||(31649695-31649884)
chr3 (270-421)||(8224865-8225013)
chr3 (264-415)||(8749059-8749210)
chr3 (253-444)||(21094660-21094850)
chr3 (261-449)||(11656038-11656227)
chr3 (231-415)||(11558311-11558489)
chr3 (231-415)||(11567580-11567758)
chr3 (199-397)||(12054454-12054650)
chr3 (299-444)||(21253951-21254097)
chr3 (248-415)||(3552202-3552368)
chr3 (253-444)||(980325-980514)
chr3 (330-449)||(18483323-18483444)
chr3 (233-415)||(14406616-14406799)
chr3 (170-274)||(17140434-17140539)
chr3 (351-444)||(215305-215397)
chr3 (379-449)||(13515548-13515619)
chr3 (355-415)||(13100710-13100770)
chr3 (250-444)||(3444965-3445157)
[»] chr2 (29 HSPs)
chr2 (93-418)||(23758474-23758800)
chr2 (93-421)||(22610741-22611070)
chr2 (90-421)||(24790140-24790472)
chr2 (93-421)||(12910338-12910667)
chr2 (90-449)||(36398748-36399110)
chr2 (230-444)||(19466482-19466696)
chr2 (191-444)||(21530331-21530584)
chr2 (194-444)||(21250157-21250407)
chr2 (270-449)||(26860249-26860430)
chr2 (272-444)||(29566039-29566211)
chr2 (233-444)||(24317770-24317981)
chr2 (248-453)||(24317141-24317346)
chr2 (261-415)||(13314954-13315109)
chr2 (261-413)||(18765692-18765845)
chr2 (233-444)||(20475235-20475446)
chr2 (235-415)||(27111071-27111250)
chr2 (235-444)||(31587467-31587674)
chr2 (195-316)||(22582363-22582485)
chr2 (250-415)||(25347199-25347364)
chr2 (260-415)||(20476565-20476720)
chr2 (234-312)||(12952462-12952540)
chr2 (233-413)||(20649547-20649727)
chr2 (250-415)||(19198267-19198431)
chr2 (262-348)||(15328326-15328412)
chr2 (290-415)||(27107556-27107681)
chr2 (248-312)||(24283620-24283684)
chr2 (248-346)||(23801865-23801962)
chr2 (405-449)||(15328480-15328524)
chr2 (362-415)||(12952590-12952643)
[»] scaffold0226 (3 HSPs)
scaffold0226 (94-449)||(7494-7849)
scaffold0226 (93-449)||(18081-18435)
scaffold0226 (93-449)||(27475-27829)
[»] chr5 (34 HSPs)
chr5 (92-449)||(22404714-22405073)
chr5 (131-449)||(23420514-23420834)
chr5 (92-444)||(26329173-26329525)
chr5 (93-449)||(30605645-30605998)
chr5 (90-421)||(24189709-24190040)
chr5 (198-449)||(23623831-23624082)
chr5 (111-448)||(26036677-26037014)
chr5 (195-444)||(13338543-13338791)
chr5 (93-421)||(13734955-13735284)
chr5 (93-371)||(25105452-25105732)
chr5 (93-371)||(25164545-25164825)
chr5 (213-445)||(18221079-18221311)
chr5 (198-435)||(20714704-20714942)
chr5 (194-444)||(13941956-13942207)
chr5 (191-444)||(20740897-20741148)
chr5 (186-449)||(20845747-20846011)
chr5 (93-316)||(9422555-9422778)
chr5 (214-444)||(7897874-7898103)
chr5 (272-444)||(22184557-22184729)
chr5 (286-421)||(22252023-22252159)
chr5 (261-415)||(26183222-26183377)
chr5 (261-411)||(17920776-17920926)
chr5 (261-415)||(20498141-20498296)
chr5 (277-421)||(22246333-22246478)
chr5 (199-444)||(22130809-22131037)
chr5 (231-415)||(17661399-17661583)
chr5 (235-444)||(24117586-24117795)
chr5 (270-444)||(9522561-9522733)
chr5 (270-453)||(11756160-11756338)
chr5 (235-444)||(22979736-22979946)
chr5 (275-444)||(20127026-20127194)
chr5 (261-304)||(11204738-11204781)
chr5 (376-421)||(9422499-9422544)
chr5 (91-123)||(23420830-23420862)
[»] scaffold0103 (1 HSPs)
scaffold0103 (93-421)||(25655-25984)
[»] chr6 (59 HSPs)
chr6 (93-421)||(13195172-13195501)
chr6 (90-449)||(17855040-17855401)
chr6 (93-421)||(14258759-14259088)
chr6 (90-421)||(33665639-33665971)
chr6 (92-449)||(25805301-25805659)
chr6 (91-449)||(20989718-20990077)
chr6 (88-421)||(15897656-15897989)
chr6 (92-394)||(12039691-12039993)
chr6 (93-421)||(9281690-9282019)
chr6 (93-421)||(17234440-17234769)
chr6 (96-418)||(8465657-8465975)
chr6 (93-449)||(20558151-20558507)
chr6 (191-449)||(20470156-20470415)
chr6 (186-444)||(23882653-23882912)
chr6 (186-449)||(29254870-29255132)
chr6 (195-444)||(26965529-26965779)
chr6 (93-274)||(25948377-25948558)
chr6 (232-417)||(24501812-24501997)
chr6 (183-421)||(17527866-17528105)
chr6 (92-449)||(17864379-17864723)
chr6 (168-439)||(21706310-21706585)
chr6 (93-327)||(25782659-25782894)
chr6 (252-422)||(21723389-21723560)
chr6 (261-415)||(16309346-16309499)
chr6 (272-445)||(3567380-3567553)
chr6 (272-433)||(28623556-28623717)
chr6 (210-449)||(34657104-34657344)
chr6 (261-415)||(15038364-15038518)
chr6 (261-415)||(16137570-16137724)
chr6 (272-421)||(25964722-25964872)
chr6 (272-421)||(25969369-25969519)
chr6 (272-421)||(25973809-25973959)
chr6 (195-444)||(11960430-11960683)
chr6 (231-415)||(12444710-12444891)
chr6 (274-415)||(9384643-9384784)
chr6 (93-250)||(21717698-21717855)
chr6 (93-250)||(21725534-21725691)
chr6 (261-415)||(15003150-15003305)
chr6 (277-415)||(19215985-19216124)
chr6 (261-415)||(20003153-20003308)
chr6 (270-415)||(21323262-21323407)
chr6 (248-444)||(20764954-20765149)
chr6 (281-449)||(19171452-19171622)
chr6 (235-444)||(30424926-30425135)
chr6 (93-181)||(13870518-13870606)
chr6 (272-395)||(15007344-15007468)
chr6 (195-277)||(17869944-17870026)
chr6 (195-277)||(17879696-17879778)
chr6 (272-386)||(32449278-32449392)
chr6 (96-192)||(19894725-19894820)
chr6 (251-415)||(18152694-18152858)
chr6 (195-267)||(12385261-12385333)
chr6 (276-369)||(13870399-13870493)
chr6 (352-449)||(19100008-19100105)
chr6 (92-164)||(19077412-19077484)
chr6 (302-449)||(19894575-19894722)
chr6 (384-433)||(24563856-24563905)
chr6 (93-123)||(17876457-17876487)
chr6 (350-388)||(24561560-24561598)
[»] chr4 (39 HSPs)
chr4 (93-449)||(25116672-25117032)
chr4 (93-421)||(10190735-10191064)
chr4 (92-449)||(10724107-10724464)
chr4 (92-449)||(10937876-10938233)
chr4 (92-399)||(16383737-16384046)
chr4 (93-418)||(23400179-23400499)
chr4 (93-449)||(15162442-15162798)
chr4 (93-449)||(21477957-21478313)
chr4 (213-449)||(15700265-15700502)
chr4 (93-449)||(18618069-18618425)
chr4 (131-421)||(28019190-28019482)
chr4 (230-444)||(13399263-13399477)
chr4 (92-448)||(8163630-8163989)
chr4 (199-449)||(33745918-33746168)
chr4 (232-449)||(9068933-9069150)
chr4 (183-421)||(33898970-33899210)
chr4 (238-448)||(19659432-19659643)
chr4 (275-444)||(19183640-19183809)
chr4 (272-421)||(10722011-10722160)
chr4 (272-421)||(10935780-10935929)
chr4 (234-429)||(32861637-32861833)
chr4 (195-444)||(41785385-41785633)
chr4 (261-415)||(24143151-24143305)
chr4 (214-444)||(25354595-25354824)
chr4 (248-444)||(50907855-50908050)
chr4 (225-388)||(46741765-46741927)
chr4 (261-415)||(23541260-23541414)
chr4 (248-444)||(10198211-10198405)
chr4 (261-444)||(11325104-11325288)
chr4 (224-415)||(22554950-22555142)
chr4 (256-444)||(16655299-16655486)
chr4 (272-444)||(11905121-11905292)
chr4 (275-415)||(19894792-19894932)
chr4 (95-188)||(33899398-33899491)
chr4 (234-311)||(33737973-33738050)
chr4 (376-444)||(15622573-15622641)
chr4 (249-412)||(2679854-2680013)
chr4 (94-201)||(15700499-15700606)
chr4 (90-135)||(28019132-28019177)
[»] chr8 (35 HSPs)
chr8 (92-421)||(23541392-23541723)
chr8 (93-421)||(11221254-11221577)
chr8 (93-449)||(24091821-24092162)
chr8 (95-449)||(33976909-33977263)
chr8 (199-449)||(9996454-9996704)
chr8 (93-309)||(45133513-45133729)
chr8 (93-443)||(25240254-25240605)
chr8 (195-444)||(20254834-20255091)
chr8 (190-421)||(22485089-22485311)
chr8 (286-449)||(27925399-27925563)
chr8 (261-416)||(39080982-39081137)
chr8 (254-421)||(22476240-22476408)
chr8 (91-258)||(22472629-22472798)
chr8 (268-444)||(24850391-24850567)
chr8 (93-245)||(27925581-27925733)
chr8 (261-415)||(8726861-8727015)
chr8 (260-421)||(13660354-13660514)
chr8 (260-421)||(13718997-13719157)
chr8 (159-338)||(33961676-33961855)
chr8 (199-442)||(23249690-23249932)
chr8 (261-444)||(33466120-33466302)
chr8 (261-415)||(37155513-37155668)
chr8 (270-445)||(23864425-23864600)
chr8 (320-443)||(45136191-45136315)
chr8 (199-441)||(1683933-1684171)
chr8 (235-444)||(12814552-12814760)
chr8 (261-413)||(17279905-17280057)
chr8 (271-415)||(17880727-17880871)
chr8 (272-388)||(22874206-22874322)
chr8 (233-415)||(1562355-1562537)
chr8 (235-385)||(24384552-24384702)
chr8 (92-181)||(22480935-22481024)
chr8 (234-311)||(12240228-12240305)
chr8 (233-312)||(12376962-12377039)
chr8 (376-449)||(33961873-33961944)
[»] scaffold0037 (1 HSPs)
scaffold0037 (92-421)||(110238-110569)
[»] scaffold0102 (1 HSPs)
scaffold0102 (93-421)||(36854-37183)
[»] scaffold0059 (3 HSPs)
scaffold0059 (91-421)||(61455-61786)
scaffold0059 (95-349)||(50146-50401)
scaffold0059 (376-421)||(48326-48371)
[»] scaffold0259 (1 HSPs)
scaffold0259 (95-418)||(17263-17586)
[»] scaffold0185 (1 HSPs)
scaffold0185 (93-410)||(2351-2669)
[»] scaffold0006 (1 HSPs)
scaffold0006 (157-449)||(87648-87942)
[»] scaffold0338 (1 HSPs)
scaffold0338 (92-449)||(16167-16525)
[»] scaffold0190 (1 HSPs)
scaffold0190 (91-438)||(16588-16937)
[»] scaffold0008 (1 HSPs)
scaffold0008 (196-449)||(40287-40540)
[»] scaffold0333 (1 HSPs)
scaffold0333 (91-349)||(5491-5750)
[»] scaffold0064 (2 HSPs)
scaffold0064 (261-444)||(52887-53067)
scaffold0064 (345-411)||(45858-45924)
[»] scaffold0035 (1 HSPs)
scaffold0035 (235-444)||(37357-37567)
[»] scaffold0088 (1 HSPs)
scaffold0088 (250-418)||(36598-36767)
[»] scaffold0032 (1 HSPs)
scaffold0032 (261-415)||(103122-103276)
[»] scaffold0328 (1 HSPs)
scaffold0328 (261-444)||(16931-17115)
[»] scaffold0143 (1 HSPs)
scaffold0143 (261-444)||(36314-36496)
[»] scaffold0015 (1 HSPs)
scaffold0015 (195-444)||(202346-202594)
[»] scaffold0022 (1 HSPs)
scaffold0022 (248-415)||(3127-3291)
[»] scaffold0505 (1 HSPs)
scaffold0505 (235-415)||(10024-10204)
[»] scaffold0480 (1 HSPs)
scaffold0480 (351-444)||(11295-11387)
[»] scaffold0520 (1 HSPs)
scaffold0520 (235-415)||(5409-5589)
[»] scaffold0020 (1 HSPs)
scaffold0020 (360-421)||(12492-12553)
[»] scaffold0423 (1 HSPs)
scaffold0423 (248-444)||(13611-13807)


Alignment Details
Target: chr1 (Bit Score: 329; Significance: 0; HSPs: 27)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 329; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 7 - 449
Target Start/End: Original strand, 4245798 - 4246242
Alignment:
Q  7 gttaggatactccatgtccttgatttcttagtggcaatttagtctcacttgtacagatttctatcctttttgatatatattatttttgaaattctagcac 106  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  4245798 gttaggatactccatgtccttgatttcttagtggcaatttagtctcacttgtacagatttctatcctttttgatatagattatttttgaaaatctagcac 4245897  T
Q  107 acttgttttaatatgttatgtatgatgttttgacgtttgcaatgttatgattaatgtttcgacatcacgcgataagcagaaataaaaacaagaaaataaa 206  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4245898 acttgttttaatatgttatgtatgatgttttgacgtttgcaatgttatgattaatgtttcaacatcacgcgataagcagaaataaaaacaagaaaataaa 4245997  T
Q  207 tgacaggaaagtaaagaacacaatgagtttgttgacccaactcggtgacaaacacacctactatgggggctaccaagcaaggaaggaaatccactagtgt 306  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  4245998 tgacaggaaagtaaagaacacaatgagtttgttgacccagttcggtgacaaacacacctactctgggggctaccaagacaggaaggaaatccactagtgt 4246097  T
Q  307 agtccttattttgtagctctcaacaaactcctcatttacacta-aagacctaggacctacccgtattgatttcaacctaggaattcctagatctgacatc 405  Q
    ||||||||||   ||||||||| |||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||| |||| || ||||||||||||| |||||||||||| |||    
T  4246098 agtccttattcaatagctctcagcaaactcctcgtttacactatatgacctaggacctacctgtatagacttcaacctaggaactcctagatctgagatc 4246197  T
Q  406 ccatctcactatcct-acagtcaatcacagcccctgtgatctatc 449  Q
    | ||||||||||||| |  |||| ||||||||||| ||| |||||    
T  4246198 ctatctcactatcctaatggtcagtcacagcccctctgacctatc 4246242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 93 - 418
Target Start/End: Complemental strand, 26972709 - 26972383
Alignment:
Q  93 tgaaattctagcacacttgttttaatatgttatgtatgatgttttgacgtttgcaatgttatgattaatgtttcgacatcacgcgataagcagaaataaa 192  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||   |||||| | |||||| |||||||||||| |||||  ||||||| ||| ||||||    
T  26972709 tgaaattctagcgcacttgttttaatatgttctgtatgatgttacaacgttt-cgatgttacgattaatgtttcaacatccggcgataaacagtaataaa 26972611  T
Q  193 aacaagaaaataaatgacaggaaagtaaagaacacaatgagtttgttgacccaactcggtgacaaacacacctactatgggggctaccaagcaaggaagg 292  Q
    |||||||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||    
T  26972610 aacaagaaaataaaagacaggtaattaaagaacacaatgagtttgttgacccagttcggtgacaaacacacctactctgggggctaccaagccagtaagg 26972511  T
Q  293 aaatccactagtgtagtccttattttgtagctctcaacaaactcctcatttacacta-aagacctaggacctacccgtattga-tttcaacctaggaatt 390  Q
    ||||||||||||||||||||||||   ||||||||| |||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |    
T  26972510 aaatccactagtgtagtccttattcaatagctctcagcaaactcctcgtttacactatatgacctaggacctacccgtatagactttcaacctaggaact 26972411  T
Q  391 cctagatctgacatcccatctcactatc 418  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  26972410 cctagatctgagatcccatctcactatc 26972383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 183; E-Value: 8e-99
Query Start/End: Original strand, 93 - 421
Target Start/End: Original strand, 13165246 - 13165572
Alignment:
Q  93 tgaaattctagcacacttgttttaatatgttatgtatgatgttttgacgtttgcaatgttatgattaatgtttcgacatcacgcgataagcagaaataaa 192  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||| ||||    
T  13165246 tgaaattctagcacacttgttttaatacgttctgtatgatgttttaacgtttgcgatgttatgattaatgttacaacatcacgcgataaacagaattaaa 13165345  T
Q  193 aacaagaaaataaatgacaggaaagtaaagaacacaatgagtttgttgacccaactcggtgacaaacacacctactatgggggctaccaagcaaggaagg 292  Q
    |||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||  ||||||||||  ||||||||| | ||||||||||||| |||||||    
T  13165346 aacaagaaaataaaagataggaaagtaaagaacacaataagtttgttgactcagttcggtgacaa--acacctactgt-ggggctaccaagctaggaagg 13165442  T
Q  293 aaatccactagtgtagtccttattttgtagctctcaacaaactcctcatttacacta-aagacctaggacctacccgtattgatttcaacctaggaattc 391  Q
    ||||||||||||||||||||||||   ||||||||| || ||||||| |||||| || | |||||||||||||||||||| || |||||| |||||| ||    
T  13165443 aaatccactagtgtagtccttattcaatagctctcagcatactcctcgtttacagtatatgacctaggacctacccgtatagacttcaacataggaactc 13165542  T
Q  392 ctagatctgacatcccatctcactatccta 421  Q
    |||||||| | |||||||||||||||||||    
T  13165543 ctagatctaagatcccatctcactatccta 13165572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 182; E-Value: 3e-98
Query Start/End: Original strand, 183 - 444
Target Start/End: Original strand, 1973252 - 1973513
Alignment:
Q  183 cagaaataaaaacaagaaaataaatgacaggaaagtaaagaacacaatgagtttgttgacccaactcggtgacaaacacacctactatgggggctaccaa 282  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||   ||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||| |||||| ||||||    
T  1973252 cagaaataaaaacaagaaagtaaatgacaagaaaataaagaacatggtgagtttgttgacccagttcggtgacaaacactcctactctgggggataccaa 1973351  T
Q  283 gcaaggaaggaaatccactagtgtagtccttattttgtagctctcaacaaactcctcatttacactaaagacctaggacctacccgtattgatttcaacc 382  Q
    |  ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1973352 gtcaggaaggaaatccactagtgtagtccttattctatagctctcagaaaactcctcatttacactaaagacctaggacctacccgtattgatttcaacc 1973451  T
Q  383 taggaattcctagatctgacatcccatctcactatcctacagtcaatcacagcccctgtgat 444  Q
    |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  1973452 taggaactcctagatctgagatcccatctcactatcctacagtcaatcacaacccctgtgat 1973513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 174; E-Value: 2e-93
Query Start/End: Original strand, 106 - 449
Target Start/End: Complemental strand, 14746079 - 14745735
Alignment:
Q  106 cacttgttttaatatgttatgtatgatgttttgacgtttgcaatgttatgattaatgtttcgacatcacgcgataagcagaaataaaaacaagaaaataa 205  Q
    |||||||||||| | |||||||||||||||||   ||||||||||||| |||||||||||| | |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  14746079 cacttgttttaagaggttatgtatgatgttttagtgtttgcaatgttaagattaatgtttcaatatcacgcgataaacagaaacaaaaacaagaaaataa 14745980  T
Q  206 atgacaggaaagtaaagaacacaatgagtttgttgacccaactcggtgacaaacacacctactatgggggctaccaagcaaggaaggaaatccactagtg 305  Q
    |||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  14745979 atgacaggaaagtaaataacacagcgagtttgttgacccagctcggtgacaaacacaccaactctgggggctaccaagccaggaagaaaatccactagtg 14745880  T
Q  306 tagtccttattttgtagctctcaacaaactcctcatttacacta-aagacctaggacctacccgtattgatttcaacctaggaattcctagatctgacat 404  Q
    |||||||||||   ||||||||| |||||| ||| ||||||||| | ||| || ||||||||||||| || ||||||||||||| || ||||||||| ||    
T  14745879 tagtccttattcaatagctctcagcaaactactcgtttacactatatgacata-gacctacccgtatagacttcaacctaggaactcttagatctgagat 14745781  T
Q  405 cccatctcactatcct-acagtcaatcacagcccctgtgatctatc 449  Q
    | |||||||||||||| |  |||| |||||| ||| ||||||||||    
T  14745780 cacatctcactatcctaatggtcagtcacagtcccagtgatctatc 14745735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 172; E-Value: 3e-92
Query Start/End: Original strand, 93 - 449
Target Start/End: Complemental strand, 11668171 - 11667814
Alignment:
Q  93 tgaaattctagcacacttgttttaatatgttatgtatgatgttttgacgtttgcaatgttatgattaatgtttcgacatcacgcgataagcagaaataaa 192  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||  |||||| |||||||  | | |||||| | ||||||    |||| || |||||||    
T  11668171 tgaaattctagcgcacttgttttaatatgtt-tgtaagatgtttcaacgtttacaatgttccgttcaatgttccaacatcaaaaaataaacataaataaa 11668073  T
Q  193 aacaagaaaataaatgacaggaaagtaaagaacacaatgagtttgttgacccaactcggtgacaaacacacctactatgggggctaccaagcaaggaagg 292  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  11668072 aacaagaaaataaatgaaaagaaagtaaagaacacagtgagtttgttgacccagttcgatgagaaacacacctactctgggggctaccaagccaggaagg 11667973  T
Q  293 aaatccactagtgtagtccttattttgtagctctcaacaaactcctcatttacactaaagacctaggacctacccgtattgatttcaacctaggaattcc 392  Q
    ||||| |||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||| || ||||||||||||| |||    
T  11667972 aaatctactagtgtagtccttattctatagctctcagcaaactcctcgtttacactaaagaccatggacctacccgtatagacttcaacctaggaactcc 11667873  T
Q  393 tagatctgacatcccatctcactatcctaca--gtcaatcacagcccctgtgatctatc 449  Q
    ||||||||| || |||||||||||||||| |  |||| ||||| ||||||||| |||||    
T  11667872 tagatctgagattccatctcactatcctatatggtcagtcacaacccctgtgacctatc 11667814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 163; E-Value: 7e-87
Query Start/End: Original strand, 198 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 17851577 - 17851331
Alignment:
Q  198 gaaaataaatgacaggaaagtaaagaacacaatgagtttgttgacccaactcggtgacaaacacacctactatgggggctaccaagcaaggaaggaaatc 297  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| | ||||||||||    
T  17851577 gaaaataaatgacaagaaagtatagaacacagtgagtttgttgacctagttcggtgacaaacacacctactctgggggctactaagccaagaaggaaatc 17851478  T
Q  298 cactagtgtagtccttattttgtagctctcaacaaactcctcatttacactaaagacctaggacctacccgtattgatttcaacctaggaattcctagat 397  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |  ||||||||||||||| ||||||||    
T  17851477 cactagtgtagtccttattctatagctctcagcaaactcctcgtttacactaaagacctaggacctagccgtctacatttcaacctaggaactcctagat 17851378  T
Q  398 ctgacatcccatctcactatcctacagtcaatcacagcccctgtgat 444  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  17851377 ctgagatcccatctcactatcccacagtcaatcacagcccctgtgat 17851331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 152; E-Value: 3e-80
Query Start/End: Original strand, 92 - 421
Target Start/End: Complemental strand, 20841564 - 20841246
Alignment:
Q  92 ttgaaattctagcacacttgttttaatatgttatgtatgatgttttgacgtttgcaatgttatgattaatgtttcgacatcacgcgataagcagaaataa 191  Q
    ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||           | |||||||||  | | |||||||  |||||||||||||| || || |||    
T  20841564 ttgaaattctaacgcacttgttttaatatgttatgtatg-----------tatgcaatgtttcgttcaatgttttaacatcacgcgataaacaaaagtaa 20841476  T
Q  192 aaacaagaaaataaatgacaggaaagtaaagaacacaatgagtttgttgacccaactcggtgacaaacacacctactatgggggctaccaagcaaggaag 291  Q
    |||||| ||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||   |  |||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||    
T  20841475 aaacaaaaaaataaacaacaagaaagtaaagaacacaatgagtttgttgaaatagttcggtgacaaacacacctactatatgggctaccaagccaggaag 20841376  T
Q  292 gaaatccactagtgtagtccttattttgtagctctcaacaaactcctcatttacactaaagacctaggacctacccgtattgatttcaacctaggaattc 391  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||  || ||||||||||||| ||    
T  20841375 gaaatccactagtgtagtccttattttatagctcttagcaaactcctcgtttacactaaagacctaggacctacatgtacagacttcaacctaggaactc 20841276  T
Q  392 ctagatctgacatcccatctcactatccta 421  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  20841275 ctagatctgagatcccatctcactatccta 20841246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 148; E-Value: 6e-78
Query Start/End: Original strand, 187 - 449
Target Start/End: Complemental strand, 23478151 - 23477888
Alignment:
Q  187 aataaaaacaagaaaa-taaatgacaggaaagtaaagaacacaatgagtttgttgacccaactcggtgacaaacacacctactatgggggctaccaagca 285  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||   |||| |||||||||||||| |  || |||||||||||||||||| |||||||||||||||     
T  23478151 aataaaaacaagaaaaataaatgacaagaaagtaaatggcacagtgagtttgttgacctagttcagtgacaaacacacctactctgggggctaccaagcc 23478052  T
Q  286 aggaaggaaatccactagtgtagtccttattttgtagctctcaacaaactcctcatttacactaaagacctaggacctacccgtattgatttcaacctag 385  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||  ||  |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  23478051 aggaaggaaatccactagtgtagtccttattctatagctctcagcaaacaacttgtttacaataaagacctagaacctacccgtattgatttcaacctag 23477952  T
Q  386 gaattcctagatctgacatcccatctcactatcctacagtcaatcacagcccctgtgatctatc 449  Q
    ||| |||||||||||| |||||||||||  |||||  ||||||||| |||||||||||||||||    
T  23477951 gaactcctagatctgagatcccatctcagaatcctctagtcaatcatagcccctgtgatctatc 23477888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 199 - 443
Target Start/End: Original strand, 12753016 - 12753260
Alignment:
Q  199 aaaataaatgacaggaaagtaaagaacacaatgagtttgttgacccaactcggtgacaaacacacctactatgggggctaccaagcaaggaaggaaatcc 298  Q
    |||||||| |||| |||||||||   |||||  |||||||| |||||  ||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||| ||||||    
T  12753016 aaaataaaagacaagaaagtaaaaggcacaacaagtttgttaacccagttcggtgagaaacacacctactctggaggctaccaagccaggaagtaaatcc 12753115  T
Q  299 actagtgtagtccttattttgtagctctcaacaaactcctcatttacactaaagacctaggacctacccgtattgatttcaacctaggaattcctagatc 398  Q
    ||||| |||||||||||| | ||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||    
T  12753116 actagcgtagtccttattctatagctctcagcgaactcctcgtttacactaaagacctaggacctacccatattgatttcaacctagaaactcctagatc 12753215  T
Q  399 tgacatcccatctcactatcctacagtcaatcacagcccctgtga 443  Q
    ||| || ||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||    
T  12753216 tgagattccatctcactatcctatggtcagtcacagcccctgtga 12753260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 106; E-Value: 7e-53
Query Start/End: Original strand, 199 - 444
Target Start/End: Original strand, 17038203 - 17038445
Alignment:
Q  199 aaaataaatgacaggaaagtaaagaacacaatgagtttgttgacccaactcggtgacaaacacacctactatgggggctaccaagcaaggaaggaaatcc 298  Q
    |||||||| |||| ||||||||| ||||||   |||||||| |||||  |||||| |||   |||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  17038203 aaaataaaagacaagaaagtaaaaaacacaggaagtttgttaacccagttcggtg-caacgtcacctactctgggggctaccaagccagga-ggaaatcc 17038300  T
Q  299 actagtgtagtccttattttgtagctctcaacaaactcctcatttacactaaagacctaggacctacccgtattgatttcaacctaggaattcctagatc 398  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| | |||| ||||||||||||| |||||||||    
T  17038301 actagtgtagtccttattctctagctctcagcaaactcctcgtttacactaaagacataggacctacccatcttgacttcaacctaggaactcctagatc 17038400  T
Q  399 tgacatcccatctcactatcctacagtcaatcacagcccctgtgat 444  Q
    ||| |||||||||| ||  ||||||  ||||||||||||| |||||    
T  17038401 tgagatcccatctctct-ccctacaaccaatcacagccccagtgat 17038445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 231 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 15804282 - 15804070
Alignment:
Q  231 gagtttgttgacccaactcggtgacaaacacacctactatgggggctaccaagcaaggaaggaaatccactagtgtagtccttattttgtagctctcaac 330  Q
    ||||||||| |||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||| |   | ||||| |    
T  15804282 gagtttgttaacccagttcagtgacaaacacacctactatgggggctaccaagccaggaagaaaattcactagtgtagtccttattctaatgttctcagc 15804183  T
Q  331 aaactcctcatttacacta-aagacctaggacctacccgtattgatttcaacctaggaattcctagatctgacatcccatctcactatcctacagtcaat 429  Q
    ||||  | | ||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||    
T  15804182 aaac--cacgtttacaacacaagacctaggacctacccgtattgatttcaacttaagaactcctagatctgagatctcatttcactatcctacagtcaat 15804085  T
Q  430 cacagcccctgtgat 444  Q
    |||||||||||||||    
T  15804084 cacagcccctgtgat 15804070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 235 - 449
Target Start/End: Complemental strand, 17379790 - 17379577
Alignment:
Q  235 ttgttgacccaactcggtgacaaacacacctactatgggggctaccaagcaaggaaggaaatccactagtgtagtccttattttgtagctctcaacaaac 334  Q
    ||||| |||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |  |  ||||| |||||    
T  17379790 ttgttaacccagttcggtgacaaacacacctactctgggggctaccaagccaggaaggaaatccactagtgtagtccttattct-aatttctcagcaaac 17379692  T
Q  335 tcctcatttac-actaaagacctaggacctacccgtattgatttcaacctaggaattcctagatctgacatcccatctcactatcctacagtcaatcaca 433  Q
    ||||| ||||| |||  ||||||||||||||||||| |||| |||||||||| || |||||||||||| ||||||||||||| |||  || |||||||||    
T  17379691 tcctcgtttacaactctagacctaggacctacccgtcttgacttcaacctagaaactcctagatctgagatcccatctcact-tccctcaatcaatcaca 17379593  T
Q  434 gcccctgtgatctatc 449  Q
    ||||||||||| ||||    
T  17379592 gcccctgtgatttatc 17379577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 159 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 20859786 - 20859641
Alignment:
Q  159 aatgtttcgacatcacgcgataagcagaaataaaaacaagaaaataaatgacaggaaagtaaagaacacaatgagtttgttgacccaactcggtgacaaa 258  Q
    |||||||| |||||||||||||| |  || |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||    
T  20859786 aatgtttcaacatcacgcgataaacgaaagtaaaaacaagaaaataaacgacaagaaagtaaagaacacaatgattttgttgacccagttcggtgacaaa 20859687  T
Q  259 cacacctactatgggggctaccaagcaaggaaggaaatccactagt 304  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  20859686 cacacctactctgggggctaccaagccaggaaggaaatccactagt 20859641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 96; E-Value: 7e-47
Query Start/End: Original strand, 90 - 221
Target Start/End: Original strand, 9451987 - 9452117
Alignment:
Q  90 ttttgaaattctagcacacttgttttaatatgttatgtatgatgttttgacgtttgcaatgttatgattaatgtttcgacatcacgcgataagcagaaat 189  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| ||||| | ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  9451987 ttttgaaattctagcgcacttgttttaa-atgttctatatgatgttttaacgtttgcaatgttacgattaatgttccaacatcacgcgataagcagaaat 9452085  T
Q  190 aaaaacaagaaaataaatgacaggaaagtaaa 221  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9452086 aaaaacaagaaaataaatgacaggaaagtaaa 9452117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 288 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 47941454 - 47941298
Alignment:
Q  288 gaaggaaatccactagtgtagtccttattttgtagctctcaacaaactcctcatttacactaaagacctaggacctacccgtattgatttcaacctagga 387  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| | |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||| |    
T  47941454 gaaggaaatccactagtgtagtccttattctatagctcttagcaaactcctcgtttacactaaagacataggacctacccgtctagatttcaacctagta 47941355  T
Q  388 attcctagatctgacatcccatctcactatcctacagtcaatcacagcccctgtgat 444  Q
    | ||||| |||||| ||| |||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||    
T  47941354 actcctaaatctgagatctcatctcactatcctacaaccaatcacagccactgtgat 47941298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 91; E-Value: 6e-44
Query Start/End: Original strand, 261 - 415
Target Start/End: Complemental strand, 45599471 - 45599317
Alignment:
Q  261 cacctactatgggggctaccaagcaaggaaggaaatccactagtgtagtccttattttgtagctctcaacaaactcctcatttacactaaagacctagga 360  Q
    |||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||   ||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  45599471 cacctactctcggggctaccaagccaggaaggaaatccactaatgtagtccgtattcaatagttctcaacaaactcctcatttgcactaatgacctagga 45599372  T
Q  361 cctacccgtattgatttcaacctaggaattcctagatctgacatcccatctcact 415  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||    
T  45599371 cctacccgtactgacttcaacctaggaactcctagatctgagatctcatctcact 45599317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 235 - 449
Target Start/End: Complemental strand, 17355998 - 17355785
Alignment:
Q  235 ttgttgacccaactcggtgacaaacacacctactatgggggctaccaagcaaggaaggaaatccactagtgtagtccttattttgtagctctcaacaaac 334  Q
    ||||| |||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||| |  |  ||||| |||||    
T  17355998 ttgttaacccagttcggtgacaaacacacctactctgggggctaccaagcctggaaggaaatccaccagtgtagtccttattct-aatttctcagcaaac 17355900  T
Q  335 tcctcatttac-actaaagacctaggacctacccgtattgatttcaacctaggaattcctagatctgacatcccatctcactatcctacagtcaatcaca 433  Q
    ||||| ||||| |||  | ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||| |||  || |||||||||    
T  17355899 tcctcgtttacaactctacacctaggacctacccgtcttgacttcaacctaggaactcatagatctgagatcccatctcact-tccctcaatcaatcaca 17355801  T
Q  434 gcccctgtgatctatc 449  Q
     |||||||||| ||||    
T  17355800 acccctgtgatttatc 17355785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 86; E-Value: 6e-41
Query Start/End: Original strand, 235 - 415
Target Start/End: Complemental strand, 51472260 - 51472080
Alignment:
Q  235 ttgttgacccaactcggtgacaaacacacctactatgggggctaccaagcaaggaaggaaatccactagtgtagtccttattttgtagctctcaacaaac 334  Q
    ||||| |||||| || ||||||||||||| |||| ||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||||||| |  || ||||| |||||    
T  51472260 ttgttaacccaattcagtgacaaacacacatactctgggggctaccaaaccaagaaggaaatccactagtgtagtccttattct-aagttctcatcaaac 51472162  T
Q  335 tcctcatttac-actaaagacctaggacctacccgtattgatttcaacctaggaattcctagatctgacatcccatctcact 415  Q
    ||||| ||||| |||  ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||    
T  51472161 tcctcgtttacaactctagacctaggacctacccgtctttatttcaacctaggaactcctagatctgagatccaatctcact 51472080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 195 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 10340364 - 10340116
Alignment:
Q  195 caagaaaataaatgacaggaaagtaaagaacacaatgagtttgttgacccaactcggtgacaaacacacctactatgggggctaccaagcaaggaaggaa 294  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||   ||||   ||||||||||||||  ||||| ||||  ||||||||| |||||||||| |||  |||||||||    
T  10340364 caagaaaataaaagacaggaaagtaaaaggcacagaaagtttgttgacccagttcggtaacaagtacacctactctgggggctactaagtcaggaaggaa 10340265  T
Q  295 atccactagtgtagtccttattttgtagctctcaacaaactcctcatttaca-ctaaagacctaggacctacccgtattgatttcaacctaggaattcct 393  Q
    |||||||| ||||||| ||||| |  || | |||  ||||  |   |||||| || | |||||||||||||||||| |  ||||||||||||||| ||||    
T  10340264 atccactattgtagtctttattcttaagttttcagtaaac--catgtttacaacttacgacctaggacctacccgtctatatttcaacctaggaactcct 10340167  T
Q  394 agatctgacatcccatctcactatcctacagtcaatcacagcccctgtgat 444  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  10340166 agatctgagatctcatctcactatcctacaatcaatcacagcccctgtgat 10340116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 248 - 444
Target Start/End: Original strand, 8281924 - 8282119
Alignment:
Q  248 tcggtgacaaacacacctactatgggggctaccaagcaaggaaggaaatccactagtgtagtccttattttgtagctctcaacaaactcctcatttaca- 346  Q
    |||||||||||||||||||||  || ||| ||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||| |  || |||||||||||||||  ||||||     
T  8281924 tcggtgacaaacacacctactccggaggcgaccaagccaggaaggaaacccactattgtagtccttattgta-agttctcaacaaactccttgtttacaa 8282022  T
Q  347 ctaaagacctaggacctacccgtattgatttcaacctaggaattcctagatctgacatcccatctcactatcctacagtcaatcacagcccctgtgat 444  Q
    ||  ||||| ||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||  || ||||||||| |||| |||||    
T  8282023 ctctagaccaaggacctacccgtcttaacttcaacctaggaattcctagatctgagatcccatctcact-tccctcaatcaatcacaacccccgtgat 8282119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 261 - 413
Target Start/End: Original strand, 33062402 - 33062555
Alignment:
Q  261 cacctactatgggggctaccaagcaaggaaggaaatccactagtgtagtccttattttgtagctctcaacaaactcctcatttacacta-aagacctagg 359  Q
    |||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||   ||||||| | |||||||||| ||| ||||| | ||||||||    
T  33062402 cacctactctgggggctaccaagccagaaaggaaatccactagtgtagtccttattcaatagctcttagcaaactcctcgtttgcactatatgacctagg 33062501  T
Q  360 acctacccgtattgatttcaacctaggaattcctagatctgacatcccatctca 413  Q
    |||||||| || ||| ||||||||||||| |||||||||||| | |||||||||    
T  33062502 acctacccttactgacttcaacctaggaactcctagatctgagaccccatctca 33062555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 262 - 415
Target Start/End: Complemental strand, 40313364 - 40313211
Alignment:
Q  262 acctactatgggggctaccaagcaaggaaggaaatccactagtgtagtccttattttgtagctctcaacaaactcctcatttacactaaagacctaggac 361  Q
    |||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||   ||||||||| |||||||||| ||| |||||| ||||||||||    
T  40313364 acctactcagggggctaccaagccaggaaggaaatccactagtgtagtccgtattcaatagctctcagcaaactcctcgtttgcactaatgacctaggac 40313265  T
Q  362 ctacccgtattgatttcaacctaggaattcctagatctgacatcccatctcact 415  Q
    ||| ||||| ||| ||||||||||||| || || |||||| ||| |||||||||    
T  40313264 ctagccgtactgacttcaacctaggaactcatatatctgagatctcatctcact 40313211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 74; E-Value: 9e-34
Query Start/End: Original strand, 261 - 413
Target Start/End: Original strand, 17012019 - 17012172
Alignment:
Q  261 cacctactatgggggctaccaagcaaggaaggaaatccactagtgtagtccttattttgtagctctcaacaaactcctcatttacacta-aagacctagg 359  Q
    |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    |||| ||| |||||||||| ||| ||||| | ||||||||    
T  17012019 cacctactctgggggctaccaagccaggaaggaaatccactagtgtagtccttattcaacagctttcagcaaactcctcgtttgcactatatgacctagg 17012118  T
Q  360 acctacccgtattgatttcaacctaggaattcctagatctgacatcccatctca 413  Q
    ||||||| ||| ||| ||||||||||||| |||| ||||||| ||| |||||||    
T  17012119 acctacctgtactgacttcaacctaggaactcctggatctgagatctcatctca 17012172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 234 - 415
Target Start/End: Complemental strand, 18390273 - 18390092
Alignment:
Q  234 tttgttgacccaactcggtgacaaacacacctactatgggggctaccaagcaaggaaggaaatccactagtgtagtccttattttgtagctctcaacaaa 333  Q
    |||||| |||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| || || || |  || ||||| ||||    
T  18390273 tttgttaacccagttcggtgacaaacacacctactctgggggctaccaagccagtaaggaaatccactagtgtaatcattgttct-aagttctcagcaaa 18390175  T
Q  334 ctcctcatttac-actaaagacctaggacctacccgtattgatttcaacctaggaattcctagatctgacatcccatctcact 415  Q
    |||    ||||| ||| |  |||||||||| ||||||||||| |||||| ||| || |||||||||||| |||||||||||||    
T  18390174 ctcgaagtttacaacttatcacctaggaccaacccgtattgacttcaacgtagaaactcctagatctgagatcccatctcact 18390092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 195 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 41331009 - 41330891
Alignment:
Q  195 caagaaaataaatgacaggaaagtaaagaacacaatgagtttgttgacccaactcggtgacaaacacacctactatgggggctaccaagcaaggaaggaa 294  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||   ||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||| ||    
T  41331009 caagaaaataaatgacaagaatgtaaaaggcacaaagagtttgttgacccagttcggtgacaaacacacctactttgggggctactaagccaggaagtaa 41330910  T
Q  295 atccactagtgtagtcctt 313  Q
    | ||||||||||| |||||    
T  41330909 aaccactagtgtaatcctt 41330891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 261 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 52436962 - 52436778
Alignment:
Q  261 cacctactatgggggctaccaagcaaggaaggaaatccactagtgtagtccttattttgtagctctcaacaaactcctcatttacactaaa-gacctagg 359  Q
    |||||||| ||| ||||||| ||  |||||| ||||||||||||  ||||||||||   ||||| |||  ||||||||| ||  ||||| | ||| ||||    
T  52436962 cacctactctggaggctaccgagtcaggaagaaaatccactagtacagtccttattcaatagctttcagtaaactcctcgttcgcactatatgacatagg 52436863  T
Q  360 acctacccgtattgatttcaacctaggaattcctagatctgacatcccatctcactatcctacagtcaatcacagcccctgtgat 444  Q
    | ||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||| ||| |||| ||||  | ||||    |||||||||||||||||    
T  52436862 atctacccgtactgacttcaacctaggaactcctagatctgagatctcatcccactcccttacaaatgatcacagcccctgtgat 52436778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003 (Bit Score: 243; Significance: 1e-134; HSPs: 1)
Name: scaffold0003
Description:

Target: scaffold0003; HSP #1
Raw Score: 243; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 91 - 449
Target Start/End: Original strand, 26251 - 26609
Alignment:
Q  91 tttgaaattctagcacacttgttttaatatgttatgtatgatgttttgacgtttgcaatgttatgattaatgtttcgacatcacgcgataagcagaaata 190  Q
    ||||||||||||||  | ||||||||| ||||| |||| |||||||  ||||||  ||||||  | | | | || | ||||||||   ||| ||||||||    
T  26251 tttgaaattctagcgtaattgttttaaaatgttctgtaagatgtttcaacgtttataatgttccgttcatttttccaacatcacgaattaaacagaaata 26350  T
Q  191 aaaacaagaaaataaatgacaggaaagtaaagaacacaatgagtttgttgacccaactcggtgacaaacacacctactatgggggctaccaagcaaggaa 290  Q
    |||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26351 aaaacatgaaagtaaatgacaagaaagtaaagaacacagtgagtttgttgacccaattcggtgacaaacacacctactatgggggctaccaagcaaggaa 26450  T
Q  291 ggaaatccactagtgtagtccttattttgtagctctcaacaaactcctcatttacactaaagacctaggacctacccgtattgatttcaacctaggaatt 390  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  26451 ggaaatccactagtgtagtccttattctgtagctctcaacaaactcctcatttacactaaagacctaggacctacccgtattgatttcaacctaggaact 26550  T
Q  391 cctagatctgacatcccatctcactatcctacagtcaatcacagcccctgtgatctatc 449  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26551 cctagatctgacatcccatctcactatcctacagtcaatcacagcccctgtgatctatc 26609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 243; Significance: 1e-134; HSPs: 66)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 243; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 91 - 449
Target Start/End: Original strand, 16436621 - 16436979
Alignment:
Q  91 tttgaaattctagcacacttgttttaatatgttatgtatgatgttttgacgtttgcaatgttatgattaatgtttcgacatcacgcgataagcagaaata 190  Q
    ||||||||||||||  | ||||||||| ||||| |||| |||||||  ||||||  ||||||  | | | | || | ||||||||   ||| ||||||||    
T  16436621 tttgaaattctagcgtaattgttttaaaatgttctgtaagatgtttcaacgtttataatgttccgttcatttttccaacatcacgaattaaacagaaata 16436720  T
Q  191 aaaacaagaaaataaatgacaggaaagtaaagaacacaatgagtttgttgacccaactcggtgacaaacacacctactatgggggctaccaagcaaggaa 290  Q
    |||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16436721 aaaacatgaaagtaaatgacaagaaagtaaagaacacagtgagtttgttgacccaattcggtgacaaacacacctactatgggggctaccaagcaaggaa 16436820  T
Q  291 ggaaatccactagtgtagtccttattttgtagctctcaacaaactcctcatttacactaaagacctaggacctacccgtattgatttcaacctaggaatt 390  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  16436821 ggaaatccactagtgtagtccttattctgtagctctcaacaaactcctcatttacactaaagacctaggacctacccgtattgatttcaacctaggaact 16436920  T
Q  391 cctagatctgacatcccatctcactatcctacagtcaatcacagcccctgtgatctatc 449  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16436921 cctagatctgacatcccatctcactatcctacagtcaatcacagcccctgtgatctatc 16436979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 93 - 421
Target Start/End: Original strand, 11998728 - 11999057
Alignment:
Q  93 tgaaattctagcacacttgttttaatatgttatgtatgatgttttgacgtttgcaatgttatgattaatgtttcgacatcacgcgataagcagaaataaa 192  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||  | |||||||| | |||||||| ||||| |||||| |||    
T  11998728 tgaaattctagcgcacttgttttaatatgttatgtcagatgttttaacgtttgcaatgttccgtttaatgttccaacatcacgtgataaacagaaacaaa 11998827  T
Q  193 aacaagaaaataaatgacaggaaagtaaagaacacaatgagtttgttgacccaactcggtgacaaacacacctac-tatgggggctaccaagcaaggaag 291  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||| |  ||||||| |||||| ||||||    
T  11998828 aacaagaaaataaacgacaggaaagtaaagaacacaatgagtttgttgacccagttcgatgacaaacacacctacgtccgggggct-ccaagccaggaag 11998926  T
Q  292 gaaatccactagtgtagtccttattttgtagctctcaacaaactcctcatttacacta-aagacctaggacctacccgtattgatttcaacctaggaatt 390  Q
    |||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| || ||||||||||||| |    
T  11998927 gaaatccactagtgtagtccttattcaatagctctcaacaaactcctcatttacactatatgacctaggacctacccgtatagacttcaacctaggaact 11999026  T
Q  391 cctagatctgacatcccatctcactatccta 421  Q
    ||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  11999027 cctagatctgagatcccatctcattatccta 11999057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 91 - 418
Target Start/End: Original strand, 644980 - 645308
Alignment:
Q  91 tttgaaattctagcacacttgttttaatatgttatgtatgatgttttgacgtttgcaatgttatgattaatgtttcgacatcacgcgataagcagaaata 190  Q
    |||| ||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||   ||||||||||||||  | ||||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  644980 tttggaattctagcgcacttgttttaatacgttctgtatgatgtttaatcgtttgcaatgttacaactaatgtttcaacatcacgcgataaacagaaata 645079  T
Q  191 aaaacaagaaaataaatgacaggaaagtaaagaacacaatgagtttgttgacccaactcggtgacaaacacacctactatgggggctaccaagcaaggaa 290  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||  || ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  645080 aaaacaagaaaataaatgacaggaaagtaaataacacaatgaatttgttaacccagttcagtgacaaacacacctactatgggggctacgaagccaggaa 645179  T
Q  291 ggaaatccactagtgtagtccttattttgtagctctcaacaaactcctcatttacacta-aagacctaggacctacccgtattgatttcaacctaggaat 389  Q
    |||||||||| |||||||||||||||   ||||||||| |||||| ||| ||||||||| | |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||     
T  645180 ggaaatccaccagtgtagtccttattcaatagctctcagcaaacttctcgtttacactacatgacctaggacctccccgtatagatttcaacctaggaac 645279  T
Q  390 tcctagatctgacatcccatctcactatc 418  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  645280 tcctagatctgagatcccatctcactatc 645308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 95 - 421
Target Start/End: Complemental strand, 16208189 - 16207862
Alignment:
Q  95 aaattctagcacacttgttttaatatgttatgtatgatgttttgacgtttgcaatgttatgattaatgtttcgacatcacgcgataagcagaaataaaaa 194  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||  | | |||||| | ||||||||| |||| || |||||||||    
T  16208189 aaattctagcacacttgttttaatatgttatgtatgatgttttaacatttgtaatgtttcgttcaatgttccaacatcacgcaataaacataaataaaaa 16208090  T
Q  195 caagaaaataaatgacaggaaagtaaagaacacaatgagtttgttgacccaactcggtgacaaacacacctactatgggggctaccaagcaaggaaggaa 294  Q
    ||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  16208089 caataaaataaatgataggaaagtaaagaagacaatgagtttgttgacccatttcggcgacaaacacacctactctgggggctaccaagccaggaaggaa 16207990  T
Q  295 atccactagtgtagtccttattttgtagctctcaacaaactcctcatttacac-taaagacctaggacctacccgtattgatttcaacctaggaattcct 393  Q
    ||||||||||||||||||||||    |||||||| |||||||||| ||||||| | | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |    
T  16207989 atccactagtgtagtccttattcaaaagctctcagcaaactcctcgtttacactttatgacctagcacctacccgtattgatttcaacctaggaactcat 16207890  T
Q  394 agatctgacatcccatctcactatccta 421  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||    
T  16207889 agatctgagatcccatctcactatccta 16207862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 183; E-Value: 8e-99
Query Start/End: Original strand, 93 - 449
Target Start/End: Original strand, 4458588 - 4458946
Alignment:
Q  93 tgaaattctagcacacttgttttaatatgttatgtatgatgttttgacgtttgcaatgttatgattaatgtttcgacatcacgcgataagcagaaataaa 192  Q
    |||||||| ||| |||||||||||||||||| |||  |||||||| ||||||||||||||  | |||||||| | ||||| ||  | || ||||||||||    
T  4458588 tgaaattcgagcgcacttgttttaatatgttctgtcagatgttttaacgtttgcaatgttccgtttaatgttccaacatcgcgtaacaaacagaaataaa 4458687  T
Q  193 aacaagaaaataaatgacaggaaagtaaagaacacaatgagtttgttgacccaactcggtgacaaacacacctactatgggggctaccaagcaaggaagg 292  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  4458688 aacaagaaaataaatgacaggaaagtaaagaacacagtgaatttgttgaccgagttcggtgacaaacacacctactctgggggctaccaagccaggaagg 4458787  T
Q  293 aaatccactagtgtagtccttattttgtagctctcaacaaactcctcatttacac-taaagacctaggacctacccgtattgatttcaacctaggaattc 391  Q
    ||||| ||||||||||||||||||    |||||||| |||||||||| ||||||| | | |||||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||    
T  4458788 aaatctactagtgtagtccttattcaaaagctctcagcaaactcctcgtttacactttatgacctaggacctacccgtatagacttcaacctaggaactc 4458887  T
Q  392 ctagatctgacatcccatctcactatcct-acagtcaatcacagcccctgtgatctatc 449  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| |  |||| ||||||||||||||| |||||    
T  4458888 ctagatctgagatcccatctcactatcctaatggtcagtcacagcccctgtgacctatc 4458946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 182; E-Value: 3e-98
Query Start/End: Original strand, 95 - 418
Target Start/End: Original strand, 11588315 - 11588639
Alignment:
Q  95 aaattctagcacacttgttttaatatgttatgtatgatgttttgacgtttgcaatgttatgattaatgtttcgacatcacgcgataagcagaaataaaaa 194  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||| |||||| || | || ||||||||||||    
T  11588315 aaattctagcgcacttgttttaatatgttatgtatgatgttacgacgtttgcaatgttacgattaatgtttcaacatcatgcaacaaacagaaataaaaa 11588414  T
Q  195 caagaaaa-taaatgacaggaaagtaaagaacacaatgagtttgttgacccaactcggtgacaaacacacctactatgggggctaccaagcaaggaagga 293  Q
     ||||||| |||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | | ||||||||||| ||||||||    
T  11588415 taagaaaaataaaagacag-aaagtaaagaacacagtgagtttgttgacccagctcggtgacaaacacacctactctagcggctaccaagccaggaagga 11588513  T
Q  294 aatccactagtgtagtccttattttgtagctctcaacaaactcctcatttacacta-aagacctaggacctacccgtattgatttcaacctaggaattcc 392  Q
    |||||||||||||||||||||||   |||||||| | ||||||||| |||||||||   |||||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||    
T  11588514 aatccactagtgtagtccttattcaatagctctctaaaaactcctcgtttacactatttgacctaggacctacccgtatagacttcaacctaggaactcc 11588613  T
Q  393 tagatctgacatcccatctcactatc 418  Q
    || |||||| ||||||||||||||||    
T  11588614 tatatctgagatcccatctcactatc 11588639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 179; E-Value: 2e-96
Query Start/End: Original strand, 92 - 421
Target Start/End: Complemental strand, 11521720 - 11521391
Alignment:
Q  92 ttgaaattctagcacacttgttttaatatgttatgtatgatgttttgacgtttgcaatgttatgattaatgtttcgacatcacgcgataagcagaaataa 191  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||    |||||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||| | |||||||    
T  11521720 ttgaaattctagcgcacttgttttaataagttatatatgatgttacagcgtttgcaatgttacgattaatgtttcaacatcacgtgataaactgaaataa 11521621  T
Q  192 aaacaagaaaataaatgacaggaaagtaaagaacacaatgagtttgttgacccaactcggtgacaaacacacctactatgggggctaccaagcaaggaag 291  Q
    || ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||    
T  11521620 aa-caagaaagtaaatgacaggaaagtaaataacacaatgagtttgttgacccagtttggtgacaaacacacctactctaggggctaccaagccaggaag 11521522  T
Q  292 gaaatccactagtgtagtccttattttgtagctctcaacaaactcctcatttacacta-aagacctaggacctacccgtattgatttcaacctaggaatt 390  Q
    |||||| ||||||||||||||||||   ||||||||| |||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||  | | ||||||||||| |    
T  11521521 gaaatctactagtgtagtccttattcaatagctctcagcaaactcctcgtttacactatatgacctaggacctacccgtatatactccaacctaggaact 11521422  T
Q  391 cctagatctgacatcccatctcactatccta 421  Q
    ||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  11521421 cctagatctaaaatcccatctcactatccta 11521391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 177; E-Value: 3e-95
Query Start/End: Original strand, 190 - 449
Target Start/End: Original strand, 20991488 - 20991748
Alignment:
Q  190 aaaaacaagaaaataaatgacaggaaagtaaagaacacaatgagtttgttgacccaactcggtgacaaacacacctactatgggggctaccaagcaagga 289  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  20991488 aaaaacaagaaaataaatgacaggaaagtaaagaacacaatgagtttgttgacccagttcggtgacaaacacacctactctgggggctaccaagccagga 20991587  T
Q  290 aggaaatccactagtgtagtccttattttgtagctctcaacaaactcctcatttacactaaagacctaggacctacccgtattgatttcaacctaggaat 389  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||  || || |||||||||||||     
T  20991588 aggaaatccactagtgtagtccttattttatagctctcagcaaactcctcgtttacactaaagacctaggacctatccagatagacttcaacctaggaac 20991687  T
Q  390 tcctagatctgacatcccatctcactatcct-acagtcaatcacagcccctgtgatctatc 449  Q
    |||||||||||| |||| ||||||||||||| |  |||| ||||||||||||||| |||||    
T  20991688 tcctagatctgagatcctatctcactatcctaatggtcagtcacagcccctgtgacctatc 20991748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 166; E-Value: 1e-88
Query Start/End: Original strand, 93 - 421
Target Start/End: Original strand, 14165015 - 14165343
Alignment:
Q  93 tgaaattctagcacacttgttttaatatgttatgtatgatgttttgacgtttgcaatgttatgattaatgtttcgacatcacgcgataagcagaaataaa 192  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  |||  ||||||||||  |||||||| |||||| ||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||| ||    
T  14165015 tgaaattctagcacacttgttttaattagttccgtatgatgttacgacgtttgtaatgttgtgattaatgtttcaacatcatgcgataaacagaaat-aa 14165113  T
Q  193 aacaagaaaataaatgacaggaaagtaaagaacacaatgagtttgttgacccaactcggtgacaaacacacctactatgggggctaccaagcaaggaagg 292  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||      ||||||||  ||| |||||||    
T  14165114 aacaagaaagtaaatgacaggaaagtaaataacacaatgagtttgttgatccagttcggtgacaaacacacctttgtctggggctacatagccaggaagg 14165213  T
Q  293 aaatccactagtgtagtccttattttgtagctctcaacaaactcctcatttacacta-aagacctaggacctacccgtattgatttcaacctaggaattc 391  Q
    ||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||| ||||||||| | || |||| |||||||||||| || ||||||||||||| ||    
T  14165214 aaatccactagtgtagtccttattcaatagctctcaacaaactcctcgtttacactatatgatctagaacctacccgtatagacttcaacctaggaactc 14165313  T
Q  392 ctagatctgacatcccatctcactatccta 421  Q
    |||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  14165314 ctagatctgagatcacatctcactatccta 14165343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 150; E-Value: 4e-79
Query Start/End: Original strand, 93 - 421
Target Start/End: Complemental strand, 13455421 - 13455093
Alignment:
Q  93 tgaaattctagcacacttgttttaatatgttatgtatgatgttttgacgtttgcaatgttatgattaatgtttcgacatcacgcgataagcagaaataaa 192  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| | |||||| | | |||||| | ||||||||  |||| ||||| ||||    
T  13455421 tgaaattctagcaaatttgttttaatatgttctgtatgatgttttaacgttttcgatgttacgttaaatgttccaacatcacgttataaacagaactaaa 13455322  T
Q  193 aacaagaaaataaatgacaggaaagtaaagaacacaatgagtttgttgacccaactcggtgacaaacacacctactatgggggctaccaagcaaggaagg 292  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| |  |||||| |||   |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  13455321 aacaagagaataaatgacaagaaagtaaagaacacaatgagtttgttaacctagttcggtg-caacgtcacctactctgggggctaccaagcaaggaagg 13455223  T
Q  293 aaatccactagtgtagtccttattttgtagctctcaacaaactcctcatttacac-taaagacctaggacctacccgtattgatttcaacctaggaattc 391  Q
    ||||||||||||||||||||||||    ||||||   |||||||||| ||||||| | | ||| |||||||||||||| | || ||||||||||||| ||    
T  13455222 aaatccactagtgtagtccttattcaaaagctcttggcaaactcctcgtttacactttatgacttaggacctacccgtctagacttcaacctaggaactc 13455123  T
Q  392 ctagatctgacatcccatctcactatccta 421  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  13455122 ctagatctgagatcccatctcactatccta 13455093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 148; E-Value: 6e-78
Query Start/End: Original strand, 92 - 449
Target Start/End: Complemental strand, 29546440 - 29546091
Alignment:
Q  92 ttgaaattctagcacacttgttttaatatgttatgtatgatgttttgacgtttgcaatgttatgattaatgtttcgacatcacgcgataagcagaaataa 191  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||  ||||||  ||||||  | | |||||| | |||||||   |||| |||||||||    
T  29546440 ttgaaattctagcacatttgttttaatatgtt-tgtaagatgtttcaacgtttataatgttccgttcaatgttccaacatcacaaaataaacagaaataa 29546342  T
Q  192 aaacaagaaaataaatgacaggaaagtaaagaacacaatgagtttgttgacccaactcggtgacaaacacacctactatgggggctaccaagcaaggaag 291  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||       ||||||||| | ||||||||||||| ||||||    
T  29546341 aaacaaaaaaataaatgacaagaaagtaaagaacacagtgagtttgttgacccaattcagt-------acacctactctcggggctaccaagccaggaag 29546249  T
Q  292 gaaatccactagtgtagtccttattttgtagctctcaacaaactcctcatttacactaaagacctaggacctacccgtattgatttcaacctaggaattc 391  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| | || |||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || || | |||||||| ||    
T  29546248 gaaatccactactgtagtccttattctataactctcagcaaacttctcgtttacactaaagacctaggacctacccgtatagactttagcctaggaactc 29546149  T
Q  392 ctagatctgacatcccatctcactatcctacagtcaatcacagcccctgtgatctatc 449  Q
    |||||||||| ||| |||||||||||||||  | || |||||||| |||||| |||||    
T  29546148 ctagatctgagatctcatctcactatcctatggccagtcacagcctctgtgacctatc 29546091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 146; E-Value: 1e-76
Query Start/End: Original strand, 248 - 449
Target Start/End: Original strand, 42636251 - 42636452
Alignment:
Q  248 tcggtgacaaacacacctactatgggggctaccaagcaaggaaggaaatccactagtgtagtccttattttgtagctctcaacaaactcctcatttacac 347  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||  |||||||    
T  42636251 tcggtgacaaacatacctactctggaggctaccaagcaaggaaggaaatccactagtgtagtccttattctatagctctcagcaaactccttgtttacac 42636350  T
Q  348 taaagacctaggacctacccgtattgatttcaacctaggaattcctagatctgacatcccatctcactatcctacagtcaatcacagcccctgtgatcta 447  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  42636351 taaagacctaggacctacccatattgatttcaacctaggaactcctagatctgagatctcatctcactatcctagggtcaatcacagcccctgtgatcta 42636450  T
Q  448 tc 449  Q
    ||    
T  42636451 tc 42636452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 136; E-Value: 9e-71
Query Start/End: Original strand, 191 - 449
Target Start/End: Original strand, 10279761 - 10280018
Alignment:
Q  191 aaaacaagaaaataaatgacaggaaagtaaag-aacacaatgagtttgttgacccaactcggtgacaaacacacctactatgggggctaccaagcaagga 289  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| |  |||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||    
T  10279761 aaaacaagaaagtaaatgacaagaaagtaaaggaacacaatgagtttgttgacctagttcggcgacaaacacacctactctgggg-ctaccaagccagga 10279859  T
Q  290 aggaaatccactagtgtagtccttattttgtagctctcaacaaactcctcatttacactaaagacctaggacctacccgtattgatttcaacctaggaat 389  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||| ||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||     
T  10279860 aggaaattcaccagtgtagtccttattctatagctctcagcaaactcctcgtttgcactaaatacctaggacctatccgtattgatttcaacctaggaac 10279959  T
Q  390 tcctagatctgacatcccatctcactatcctacagtcaatcacagcccctgtgatctatc 449  Q
    || ||||||||| ||| ||||||| ||||| | |||||||| ||| ||||||||||||||    
T  10279960 tcgtagatctgagatctcatctcattatcccatagtcaatcccag-ccctgtgatctatc 10280018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 193 - 444
Target Start/End: Original strand, 14926596 - 14926847
Alignment:
Q  193 aacaagaaaataaatgacaggaaagtaaagaacacaatgagtttgttgacccaactcggtgacaaacacacctactatgggggctaccaagcaaggaagg 292  Q
    ||||||||| ||||||||| |||| ||||   |||||  |||||||| |||||  | ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| | |||||    
T  14926596 aacaagaaagtaaatgacaagaaattaaatggcacaacaagtttgttaacccagtttggtgacagacacacctactctgggggctaccaagccaagaagg 14926695  T
Q  293 aaatccactagtgtagtccttattttgtagctctcaacaaactcctcatttacactaaagacctaggacctacccgtattgatttcaacctaggaattcc 392  Q
    ||||| ||||||||||||||||||   ||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |    
T  14926696 aaatctactagtgtagtccttattcaatagctctcagcaaactcctcgtttacagtaaagacctaggacctacccgtattgatttcaacctagaaacttc 14926795  T
Q  393 tagatctgacatcccatctcactatcctacagtcaatcacagcccctgtgat 444  Q
    ||||| ||| ||  ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  14926796 tagatatgagatttcatctcactatcctacaatcaatcacaacccctgtgat 14926847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 193 - 444
Target Start/End: Original strand, 15350062 - 15350313
Alignment:
Q  193 aacaagaaaataaatgacaggaaagtaaagaacacaatgagtttgttgacccaactcggtgacaaacacacctactatgggggctaccaagcaaggaagg 292  Q
    ||||||||| ||||||||| |||| ||||   |||||  |||||||| |||||  | ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| | |||||    
T  15350062 aacaagaaagtaaatgacaagaaattaaatggcacaacaagtttgttaacccagtttggtgacagacacacctactctgggggctaccaagccaagaagg 15350161  T
Q  293 aaatccactagtgtagtccttattttgtagctctcaacaaactcctcatttacactaaagacctaggacctacccgtattgatttcaacctaggaattcc 392  Q
    ||||| ||||||||||||||||||   ||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |    
T  15350162 aaatctactagtgtagtccttattcaatagctctcagcaaactcctcgtttacagtaaagacctaggacctacccgtattgatttcaacctagaaacttc 15350261  T
Q  393 tagatctgacatcccatctcactatcctacagtcaatcacagcccctgtgat 444  Q
    ||||| ||| ||  ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  15350262 tagatatgagatttcatctcactatcctacaatcaatcacaacccctgtgat 15350313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 121; E-Value: 8e-62
Query Start/End: Original strand, 199 - 441
Target Start/End: Complemental strand, 26133118 - 26132877
Alignment:
Q  199 aaaataaatgacaggaaagtaaagaacacaatgagtttgttgacccaactcggtgacaaacacacctactatgggggctaccaagcaaggaaggaaatcc 298  Q
    ||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||| |||||  ||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  26133118 aaaataaatgacaagaaagtaaaagacacaatgagtttgttaacccagttcggtgacaaagacacctactctgggggctatcaagccaggaaggaaatcc 26133019  T
Q  299 actagtgtagtccttattttgtagctctcaacaaactcctcatttac-actaaagacctaggacctacccgtattgatttcaacctaggaattcctagat 397  Q
    |||||||||||||||||| |   | ||||| ||||  || ||||||| ||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  26133018 actagtgtagtccttattctaatgttctcagcaaa--ccacatttacaacacaagacctaagacctacccgtattgatttcaacctaggaactcctagat 26132921  T
Q  398 ctgacatcccatctcactatcctacagtcaatcacagcccctgt 441  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||  |||||||| |||||||    
T  26132920 ctgagatctcatctcactatcctacaaccaatcacatcccctgt 26132877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 92 - 421
Target Start/End: Original strand, 12325673 - 12325991
Alignment:
Q  92 ttgaaattctagcacacttgttttaatatgttatgtatgatgttttgacgtttgcaatgttatgattaatgtttcgacatcacgcgataagcagaaataa 191  Q
    |||||||||||   |||||||||||| ||||| ||||||||||||| || |||||||||||  | | |||||| | |||||| |   ||| |||||||||    
T  12325673 ttgaaattctaatgcacttgttttaagatgttctgtatgatgttttaacatttgcaatgttccgttcaatgttccaacatcatgaagtaaacagaaataa 12325772  T
Q  192 aaacaagaaaataaatgacaggaaagtaaagaacacaatgagtttgttgacccaactcggtgacaaacacacctactatgggggctaccaagcaaggaag 291  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||  |  ||||||||||||||||            ||||||||| ||||||    
T  12325773 aaacaagaaagtaaatgactggaaagtaaagaacaaaatgagtttgttgacttagttcggtgacaaacacac------------ctaccaagccaggaag 12325860  T
Q  292 gaaatccactagtgtagtccttattttgtagctctcaacaaactcctcatttacac-taaagacctaggacctacccgtattgatttcaacctaggaatt 390  Q
    ||||||||||||||||||| |||||    |||||||| |||||||||||||||||| | | ||||| ||||||||| |||| || ||||||||||||| |    
T  12325861 gaaatccactagtgtagtcattattcaaaagctctcagcaaactcctcatttacactttatgaccttggacctacctgtatagacttcaacctaggaact 12325960  T
Q  391 cctagatctgacatcccatctcactatccta 421  Q
    |||| |||||| |||| ||||||||||||||    
T  12325961 cctacatctgagatccaatctcactatccta 12325991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 111; E-Value: 8e-56
Query Start/End: Original strand, 195 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 7586737 - 7586488
Alignment:
Q  195 caagaaaataaatgacaggaaagtaaagaacacaatgagtttgttgacccaactcggtgacaaacacacctactatgggggctaccaagcaaggaaggaa 294  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||||   ||||   | ||||||||||||  ||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||| |||||||||    
T  7586737 caagaaaataattgacaagaaagtaaaaggcacagacaatttgttgacccagttcggtgacaaacatacctactctgggg-ctaccaagccaggaaggaa 7586639  T
Q  295 atccactagtgtagtccttattttgtagctctcaacaaactcctcatttaca-ctaaagacctaggacctacccgtattgatttcaacctaggaattcct 393  Q
    |||||||||||||||||||||| |  |  ||||| |||| ||||| |||||| || |||||||||||||||||||| | || |||||||||| || ||||    
T  7586638 atccactagtgtagtccttattctaaacttctcagcaaaatcctcgtttacaacttaagacctaggacctacccgtctagacttcaacctagaaactcct 7586539  T
Q  394 agatctgacatcccatctcactatcctacagtcaatcacagcccctgtgat 444  Q
    |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  7586538 agatctaagatcccatctcactatcctacagtcaatcacaacccctgtgat 7586488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 195 - 444
Target Start/End: Original strand, 24902059 - 24902305
Alignment:
Q  195 caagaaaataaatgacaggaaagtaaagaacacaatgagtttgttgacccaactcggtgacaaacacacctactatgggggctaccaagcaaggaaggaa 294  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||||   ||||  |||||||||||||||  || |||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||    
T  24902059 caagaaagtaaatgacaagaaagtaaaaggcaca--gagtttgttgacccagttcagtgacaaacacacctattataggggctaccaagccaggaaggaa 24902156  T
Q  295 atccactagtgtagtccttattttgtagctctcaacaaactcctcatttac-actaaagacctaggacctacccgtattgatttcaacctaggaattcct 393  Q
    |||||||||||||||||||||| |  || |||||  |||  || | ||||| ||| |||||||||||||||||||| | || ||||||||||||| ||||    
T  24902157 atccactagtgtagtccttattataaagttctcagtaaa--ccacgtttacaacttaagacctaggacctacccgtctagacttcaacctaggaactcct 24902254  T
Q  394 agatctgacatcccatctcactatcctacagtcaatcacagcccctgtgat 444  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||    
T  24902255 agatctgagatcccatctcactatcctacaatcaatcacaacccttgtgat 24902305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 195 - 427
Target Start/End: Complemental strand, 20925305 - 20925077
Alignment:
Q  195 caagaaaataaatgacaggaaagtaaagaacacaatgagtttgttgacccaactcggtgacaaacacacctactatgggggctaccaagcaaggaaggaa 294  Q
    ||||||||||||  |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||| | ||||    || | |||||||    
T  20925305 caagaaaataaaaaacaaaaaagtaaagaacacaatgagtttgttgacccagttcggtgataaacacacctactatgagagcta----gccaagaaggaa 20925210  T
Q  295 atccactagtgtagtccttattttgtagctctcaacaaactcctcatttacactaaagacctaggacctacccgtattgatttcaacctaggaattccta 394  Q
    |||||||||| | ||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| || | || |||||| |||||| |||||    
T  20925209 atccactagtttcgtccttattctatagctctcaacaaactcctcgtttacactaaagacctaagacctacctgtctagacttcaacttaggaactccta 20925110  T
Q  395 gatctgacatcccatctcactatcctacagtca 427  Q
     || ||| ||||||||||||| ||||| |||||    
T  20925109 aatttgagatcccatctcactttcctatagtca 20925077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 199 - 444
Target Start/End: Original strand, 9566861 - 9567103
Alignment:
Q  199 aaaataaatgacaggaaagtaaagaacacaatgagtttgttgacccaactcggtgacaaacacacctactatgggggctaccaagcaaggaaggaaatcc 298  Q
    |||||||| |||| ||||||||| | ||||  ||||||||| |||||  |||||| |||    |||||||  |||||||||||||| |||| ||||||||    
T  9566861 aaaataaaagacaagaaagtaaaaagcacagagagtttgttaacccagttcggtg-caacgttacctactcagggggctaccaagccagga-ggaaatcc 9566958  T
Q  299 actagtgtagtccttattttgtagctctcaacaaactcctcatttacactaaagacctaggacctacccgtattgatttcaacctaggaattcctagatc 398  Q
    || ||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||| || ||||||    
T  9566959 acaagtgtagtccttattctctagctctcagcaaactcctcatttacactaaagacctaggacctacccatcttgagttcaacctaggaactcatagatc 9567058  T
Q  399 tgacatcccatctcactatcctacagtcaatcacagcccctgtgat 444  Q
    ||| |||||||||||||  ||||||  |||||||| ||||||||||    
T  9567059 tgagatcccatctcact-ccctacaaccaatcacaacccctgtgat 9567103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 199 - 444
Target Start/End: Original strand, 9564212 - 9564454
Alignment:
Q  199 aaaataaatgacaggaaagtaaagaacacaatgagtttgttgacccaactcggtgacaaacacacctactatgggggctaccaagcaaggaaggaaatcc 298  Q
    |||||||| |||| |||||||||   ||||  ||||||||| |||||  |||||| |||   |||||||| |||||||||| |||| |||| ||||||||    
T  9564212 aaaataaaagacaagaaagtaaaaggcacagagagtttgttaacccagttcggtg-caacgtcacctactctgggggctacaaagccagga-ggaaatcc 9564309  T
Q  299 actagtgtagtccttattttgtagctctcaacaaactcctcatttacactaaagacctaggacctacccgtattgatttcaacctaggaattcctagatc 398  Q
    | |||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||| |||||||||    
T  9564310 aatagtgtagtccttattctctagctctcagcaaactcctcgtttacacaaaagacctaggacctacccgccttgacttcaacctaggaactcctagatc 9564409  T
Q  399 tgacatcccatctcactatcctacagtcaatcacagcccctgtgat 444  Q
    ||| |||||||||||||  ||||||  |||||||| |||| |||||    
T  9564410 tgagatcccatctcact-ccctacaaccaatcacatccccggtgat 9564454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 261 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 4794730 - 4794546
Alignment:
Q  261 cacctactatgggggctaccaagcaaggaaggaaatccactagtgtagtccttattttgtagctctcaacaaactcctcatttacactaaagacctagga 360  Q
    |||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||   ||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  4794730 cacctactctgggggctaccaagccagga-ggaaatccactagtgtagtccttattctctagctctcggaaaactcctcgtttacactaaagacctagga 4794632  T
Q  361 cctacccgtattgatttcaacct---aggaattcctagatctgacatcccatctcactatcctacagtcaatcacagcccctgtgat 444  Q
    ||||||||| |||| ||||||||   ||||| |||||||||||| ||| |||||||||  ||||||  |||||||||||||||||||    
T  4794631 cctacccgtcttgacttcaacctaggaggaactcctagatctgagatcgcatctcact-ccctacaaccaatcacagcccctgtgat 4794546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 261 - 444
Target Start/End: Original strand, 42782772 - 42782956
Alignment:
Q  261 cacctactatgggggctaccaagcaaggaaggaaatccactagtgtagtccttattttgtagctctcaacaaactcctcatttacactaaa-gacctagg 359  Q
    |||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||   ||||||||| |||||||||| ||| || || | ||||||||    
T  42782772 cacctactctgggggctaccaagccaggaagaaaatccactagtgtagtccttattcaatagctctcagcaaactcctcgtttgcaatatatgacctagg 42782871  T
Q  360 acctacccgtattgatttcaacctaggaattcctagatctgacatcccatctcactatcctacagtcaatcacagcccctgtgat 444  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||  | ||||  |||||||||||||||||||    
T  42782872 acctacccgtactgacttcaacctaggaactcctagatctgagatctcatctcactcccttacaaccaatcacagcccctgtgat 42782956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 261 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 48797760 - 48797620
Alignment:
Q  261 cacctactatgggggctaccaagcaaggaaggaaatccactagtgtagtccttattttgtagctctcaacaaactcctcatttacactaaagacctagga 360  Q
    |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||| |||||||||| ||| |||||| |||||||||    
T  48797760 cacctactctgggggctaccaagccaggaaggaaatccactagtgtagtccttattcaatagctctcagcaaactcctcgtttgcactaatgacctagga 48797661  T
Q  361 cctacccgtattgatttcaacctaggaattcctagatctga 401  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||    
T  48797660 cctacccgtactgacttcaacctaggaactcctagatctga 48797620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 91; E-Value: 6e-44
Query Start/End: Original strand, 232 - 366
Target Start/End: Original strand, 10658371 - 10658505
Alignment:
Q  232 agtttgttgacccaactcggtgacaaacacacctactatgggggctaccaagcaaggaaggaaatccactagtgtagtccttattttgtagctctcaaca 331  Q
    |||||||| |||||  || |||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||    
T  10658371 agtttgttaacccagttccgtgacaaacacacctactctggaggctaccaagccaggaaggaaatccactagtgtagtccttattctatagctctcagca 10658470  T
Q  332 aactcctcatttacactaaagacctaggacctacc 366  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  10658471 aactcctcgtttacactaaagacctaggacctacc 10658505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 261 - 414
Target Start/End: Original strand, 14984688 - 14984841
Alignment:
Q  261 cacctactatgggggctaccaagcaaggaaggaaatccactagtgtagtccttattttgtagctctcaacaaactcctcatttacactaaagacctagga 360  Q
    |||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||   || |||||||||||||||   ||| |||||| ||||||| |    
T  14984688 cacctactctgggggctatcaagccaggaaggaaatccactagtgtagtccttattcaatatctctcaacaaactccctgtttgcactaatgacctagaa 14984787  T
Q  361 cctacccgtattgatttcaacctaggaattcctagatctgacatcccatctcac 414  Q
    |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  14984788 cctacccgtactgacttcaacctaggaattcctagatctgagatcccatctcac 14984841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 261 - 414
Target Start/End: Original strand, 15414299 - 15414452
Alignment:
Q  261 cacctactatgggggctaccaagcaaggaaggaaatccactagtgtagtccttattttgtagctctcaacaaactcctcatttacactaaagacctagga 360  Q
    |||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||   || |||||||||||||||   ||| |||||| ||||||| |    
T  15414299 cacctactctgggggctatcaagccaggaaggaaatccactagtgtagtccttattcaatatctctcaacaaactccctgtttgcactaatgacctagaa 15414398  T
Q  361 cctacccgtattgatttcaacctaggaattcctagatctgacatcccatctcac 414  Q
    |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  15414399 cctacccgtactgacttcaacctaggaattcctagatctgagatcccatctcac 15414452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 261 - 415
Target Start/End: Complemental strand, 11560647 - 11560493
Alignment:
Q  261 cacctactatgggggctaccaagcaaggaaggaaatccactagtgtagtccttattttgtagctctcaacaaactcctcatttacactaaagacctagga 360  Q
    |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||| ||||||   |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||  |    
T  11560647 cacctactctgggggctaccaagctaggaaggaaatccgctattgtagtgcttattcaatagctctcagtaaactcctcatttacactaaagacctacaa 11560548  T
Q  361 cctacccgtattgatttcaacctaggaattcctagatctgacatcccatctcact 415  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||| ||| |||||||||    
T  11560547 cctacccgtattgacttcaacctaggaactcctggatctgatatctcatctcact 11560493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 198 - 444
Target Start/End: Original strand, 23956831 - 23957077
Alignment:
Q  198 gaaaataaatgacaggaaagtaaagaacacaatgagtttgttgacccaactcggtgacaaacacacctactatgggggctaccaagcaaggaaggaaatc 297  Q
    ||||||||| |||| |||||||||   ||||  ||||||||||||| |  ||||||||||||||| ||||| | | ||||||||||| |||||| |||||    
T  23956831 gaaaataaaagacaagaaagtaaaaggcacagagagtttgttgacctagttcggtgacaaacacatctactttagaggctaccaagccaggaagaaaatc 23956930  T
Q  298 cactagtgtagtccttattttgtagctctcaacaaactcctcatttaca--ctaaagacctaggacctacccgtattgatttcaacctaggaattcctag 395  Q
    ||||||||||||||||||| |  || ||||| ||||  || | ||||||   | |||||||||||||||||||| | || ||||||||||||| ||||||    
T  23956931 cactagtgtagtccttattctaaagttctcagcaaa--ccacgtttacaactttaagacctaggacctacccgtctagacttcaacctaggaactcctag 23957028  T
Q  396 atctgacatcccatctcactatcctacagtcaatcacagcccctgtgat 444  Q
    |||||| ||| |||||| |||||||||| ||||||||| |||| |||||    
T  23957029 atctgagatctcatctccctatcctacaatcaatcacaacccccgtgat 23957077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 86; E-Value: 6e-41
Query Start/End: Original strand, 235 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 10038902 - 10038686
Alignment:
Q  235 ttgttgacccaactcggtgacaaacacacctactatggg------ggctaccaagcaaggaaggaaatccactagtgtagtccttattttgtagctctca 328  Q
    ||||| |||||  ||||||||||||||||||||| ||||      |||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |  || ||||     
T  10038902 ttgttaacccagttcggtgacaaacacacctactctgggtttgggggctactaagcaaataaggaaatccactagtgtagtccttattctaaagttctcg 10038803  T
Q  329 acaaactcctcatttaca-ctaaagacctaggacctacccgtattgatttcaacctaggaattcctagatctgacatcccatctcactatcctacagtca 427  Q
     ||||||| || |||||| || |||||||||||||| | ||| | || ||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||    
T  10038802 gcaaactcttcgtttacaacttaagacctaggacctgctcgtctagacttcaacctaagaactcctagatctgagatcccatctcactatcctacaatca 10038703  T
Q  428 atcacagcccctgtgat 444  Q
    |||||||||||||||||    
T  10038702 atcacagcccctgtgat 10038686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 86; E-Value: 6e-41
Query Start/End: Original strand, 270 - 414
Target Start/End: Original strand, 30226111 - 30226256
Alignment:
Q  270 tgggggctaccaagcaaggaaggaaatccactagtgtagtccttattttgtagctctcaacaaactcctcatttacacta-aagacctaggacctacccg 368  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||| |||||||||| ||| ||||| | |||||||||||||||||    
T  30226111 tgggggctaccaagtcaggaaggaaatccactagtgtagtccttattcaatagctctcagcaaactcctcgtttgcactatatgacctaggacctacccg 30226210  T
Q  369 tattgatttcaacctaggaattcctagatctgacatcccatctcac 414  Q
    || ||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  30226211 tactgacttcaacctaggaactcctagatctgagatcccatctcac 30226256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 261 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 3290826 - 3290642
Alignment:
Q  261 cacctactatgggggctaccaagcaaggaaggaaatccactagtgtagtccttattttgtagctctcaacaaactcctcatttacacta-aagacctagg 359  Q
    |||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||| |||||||||| ||| ||||| | ||||||||    
T  3290826 caccaactctgggggctaccaagccaggaaggaaatccactagtgtagtccttattcaatagctctcagcaaactcctcgttttcactatatgacctagg 3290727  T
Q  360 acctacccgtattgatttcaacctaggaattcctagatctgacatcccatctcactatcctacagtcaatcacagcccctgtgat 444  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||| ||| ||| |||||  | ||||    |||||||||||||||||    
T  3290726 acctacccgtactgacttcaacctaggaactcctagatctgagatctcatttcactcccttacaactgatcacagcccctgtgat 3290642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 261 - 415
Target Start/End: Original strand, 7620097 - 7620251
Alignment:
Q  261 cacctactatgggggctaccaagcaaggaaggaaatccactagtgtagtccttattttgtagctctcaacaaactcctcatttacactaaagacctagga 360  Q
    |||||||| ||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||| |||| ||||| ||| |||||| |||||||||    
T  7620097 cacctactttggaggctaccaagtcaggaaggaaatccactagtgtagtccttattcaatagctctcagcaaaatcctcgtttgcactaatgacctagga 7620196  T
Q  361 cctacccgtattgatttcaacctaggaattcctagatctgacatcccatctcact 415  Q
    | |||||||| | | ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  7620197 cttacccgtactaacttcaacctaggaactcctagatctgagatcccatctcact 7620251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 261 - 449
Target Start/End: Original strand, 15506284 - 15506471
Alignment:
Q  261 cacctactatgggggctaccaagcaaggaaggaaatccactagtgtagtccttattttgtagctctcaacaaactcctcatttacactaaa-gacctagg 359  Q
    |||||||| | ||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||    |||||||| |||||||||| |||||| |  | ||||||||    
T  15506284 cacctactctaggggctaccaagccagaatggaaatccactagtgtagtccttattcaaaagctctcagcaaactcctcgtttacattttatgacctagg 15506383  T
Q  360 acctacccgtattgatttcaacctaggaattcctagatctgacatcccatctcactatcctacagtcaatcacagcccctgtgatctatc 449  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||  |||| ||||| ||||||||| |||||    
T  15506384 acctacccgtatagacttcaacctaggaactcctagatctg--atcccatctcactatcctatggtcagtcacaacccctgtgacctatc 15506471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 270 - 444
Target Start/End: Original strand, 15708197 - 15708370
Alignment:
Q  270 tgggggctaccaagcaaggaaggaaatccactagtgtagtccttattttgtagctctcaacaaactcctcatttaca-ctaaagacctaggacctacccg 368  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  || | |||  ||||||||| |||||| ||  ||||||| ||||||||||    
T  15708197 tggggtctaccaagctaggaaggaaatccactagtgtagtccttatttta-agttttcagaaaactcctcgtttacaactctagacctacgacctacccg 15708295  T
Q  369 tattgatttcaacctaggaattcctagatctgacatcccatctcactatcctacagtcaatcacagcccctgtgat 444  Q
    |||||| || |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||  || ||||||||||||||||||||    
T  15708296 tattgacttgaacctaggaactcctagatctgagatcccatctcact-tccctcaatcaatcacagcccctgtgat 15708370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 79; E-Value: 9e-37
Query Start/End: Original strand, 250 - 415
Target Start/End: Complemental strand, 9894219 - 9894054
Alignment:
Q  250 ggtgacaaacacacctactatgggggctaccaagcaaggaaggaaatccactagtgtagtccttattttgtagctctcaacaaactcctcatttaca-ct 348  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||| |  || ||||| |||| |||   |||||| ||    
T  9894219 ggtgacaaacacacctactctggggactaccaagtcagtaaggaaatccactagtgtagtccttattcta-agttctcagcaaattccaagtttacaact 9894121  T
Q  349 aaagacctaggacctacccgtattgatttcaacctaggaattcctagatctgacatcccatctcact 415  Q
     |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  9894120 taagacctaggacatacccgtattgacttcaacctaggaactcctagatctgagatcccatctcact 9894054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 79; E-Value: 9e-37
Query Start/End: Original strand, 261 - 415
Target Start/End: Original strand, 14975449 - 14975603
Alignment:
Q  261 cacctactatgggggctaccaagcaaggaaggaaatccactagtgtagtccttattttgtagctctcaacaaactcctcatttacactaaagacctagga 360  Q
    ||||||||  |||||| |||| || ||||| |||||| ||||||||| ||||||||   |||||||||||||||| ||| ||| |||||| |||||||||    
T  14975449 cacctactccgggggcaaccatgccaggaacgaaatctactagtgtattccttattcaatagctctcaacaaacttctcgtttgcactaatgacctagga 14975548  T
Q  361 cctacccgtattgatttcaacctaggaattcctagatctgacatcccatctcact 415  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  14975549 cctacccgtactgacttcaacctaggaactcctagatctgagatcccatctcact 14975603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 79; E-Value: 9e-37
Query Start/End: Original strand, 261 - 415
Target Start/End: Original strand, 15404925 - 15405079
Alignment:
Q  261 cacctactatgggggctaccaagcaaggaaggaaatccactagtgtagtccttattttgtagctctcaacaaactcctcatttacactaaagacctagga 360  Q
    ||||||||  |||||| |||| || ||||| |||||| ||||||||| ||||||||   |||||||||||||||| ||| ||| |||||| |||||||||    
T  15404925 cacctactccgggggcaaccatgccaggaacgaaatctactagtgtattccttattcaatagctctcaacaaacttctcgtttgcactaatgacctagga 15405024  T
Q  361 cctacccgtattgatttcaacctaggaattcctagatctgacatcccatctcact 415  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  15405025 cctacccgtactgacttcaacctaggaactcctagatctgagatcccatctcact 15405079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 235 - 415
Target Start/End: Complemental strand, 23580121 - 23579941
Alignment:
Q  235 ttgttgacccaactcggtgacaaacacacctactatgggggctaccaagcaaggaaggaaatccactagtgtagtccttattttgtagctctcaacaaac 334  Q
    ||||| |||||  |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||  || | ||| |||||    
T  23580121 ttgttaacccagttcggtgactaacacacctactatgggggttaccaagccaagaaggaaatctactagtgtagtccttatttt-aagttttcagcaaac 23580023  T
Q  335 tcctcatttac-actaaagacctaggacctacccgtattgatttcaacctaggaattcctagatctgacatcccatctcact 415  Q
    ||||| ||||| |||| | ||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||| |||||||||||  ||| |||||||||    
T  23580022 tcctcgtttacaactataaacctaggacctacccgtcttgaattcaacctaagaactcctagatctgggatctcatctcact 23579941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 71; E-Value: 6e-32
Query Start/End: Original strand, 235 - 444
Target Start/End: Original strand, 7508426 - 7508633
Alignment:
Q  235 ttgttgacccaactcggtgacaaacacacctactatgggggctaccaagcaaggaaggaaatccactagtgtagtccttattttgtagctctcaacaaac 334  Q
    ||||| |||||  ||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| |  || |||||| ||||    
T  7508426 ttgttaacccagttcgatgacaaacacacctacttttggggctaccaagccaggaaggaaatccactagtgtagtctttattct-aagttctcaaaaaac 7508524  T
Q  335 tcctcatttac-actaaagacctaggacctacccgtattgatttcaacctaggaattcctagatctgacatcccatctcactatcctacagtcaatcaca 433  Q
    ||||| ||||| |||  |||||||| |||||  ||  |||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||   | |||| ||||    
T  7508525 tcctcgtttacaactctagacctagaaccta-tcggcttgacttcaacctaggaactcctagatctgagatcccatctcact-tcccttaatcaaccaca 7508622  T
Q  434 gcccctgtgat 444  Q
    |||||||||||    
T  7508623 gcccctgtgat 7508633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 71; E-Value: 6e-32
Query Start/End: Original strand, 235 - 444
Target Start/End: Original strand, 10251431 - 10251640
Alignment:
Q  235 ttgttgacccaactcggtgacaaacacacctactatgggggctaccaagcaaggaaggaaatccactagtgtagtccttattttgtagctctcaacaaac 334  Q
    ||||| |||||  ||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||| |  || ||||| |||||    
T  10251431 ttgttaacccagttcggtgataaacacacctactctggaggctaccaagccaggaaggaaatcttctagtgtagtccttattct-aagttctcagcaaac 10251529  T
Q  335 tcctcatttac-actaaagacctaggacctacccgtattgatttcaacctaggaattcctagatctgacatcccatctcactatcctacagtcaatcaca 433  Q
    |||    |||| |||  |||||||||||||||||||||||| |||||| || ||| || ||||||||| ||||||||||||| ||   || |||||||||    
T  10251530 tccaagcttacaactctagacctaggacctacccgtattgacttcaacataagaactcttagatctgagatcccatctcactttcactcaatcaatcaca 10251629  T
Q  434 gcccctgtgat 444  Q
     ||||||||||    
T  10251630 tcccctgtgat 10251640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 71; E-Value: 6e-32
Query Start/End: Original strand, 261 - 449
Target Start/End: Original strand, 15436065 - 15436252
Alignment:
Q  261 cacctactatgggggctaccaagcaaggaaggaaatccactagtgtagtccttattttgtagctctcaacaaactcctcatttacac-taaagacctagg 359  Q
    |||||||| | ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||    |||||||| |||||||||| ||||||| | | ||| ||||    
T  15436065 cacctactctaggggctaccaagccagaaaggaaatccactagtgtagtccttattcaaaagctctcagcaaactcctcgtttacactttatgacttagg 15436164  T
Q  360 acctacccgtattgatttcaacctaggaattcctagatctgacatcccatctcactatcctacagtcaatcacagcccctgtgatctatc 449  Q
    |||||||| ||| || |||||| |||||| ||||| || ||  |||||||||| ||||||||  |||| ||||||||||||||| |||||    
T  15436165 acctacccatatagacttcaacgtaggaactcctatatttg--atcccatctcgctatcctatggtcagtcacagcccctgtgacctatc 15436252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 248 - 415
Target Start/End: Original strand, 23296504 - 23296674
Alignment:
Q  248 tcggtgacaaacacacctactatgggggctaccaagcaa---ggaaggaaatccactagtgtagtccttattttgtagctctcaacaaactcctcattta 344  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |   ||||||||||||| |||||||||||||||| | |  || | | |||||||||   |||    
T  23296504 tcggtgacaaacacacctactttggaggctaccaagctaataggaaggaaatccattagtgtagtccttattctatgtct-tgaccaaactccttgctta 23296602  T
Q  345 ca-ctaaagacctaggacctacccgtattgatttcaacctaggaattcctagatctgacatcccatctcact 415  Q
    || ||  ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  23296603 caactctagacctaggacctacccgtcttgacttcaacctaggaactcctagatctgagatcccatctcact 23296674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 271 - 415
Target Start/End: Original strand, 24813952 - 24814096
Alignment:
Q  271 gggggctaccaagcaaggaaggaaatccactagtgtagtccttattttgtagctctcaacaaactcctcattt-acactaaagacctaggacctacccgt 369  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||| |||||| ||  ||| | |||  |||||||||||||||||||    
T  24813952 gggggctaccaagccaggaaggaaatccactagtgtagtccttattgt-aagctctcagcaaactactagtttaaaactctagacctaggacctacccgt 24814050  T
Q  370 attgatttcaacctaggaattcctagatctgacatcccatctcact 415  Q
    ||  | ||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||    
T  24814051 atcaacttcaacctaggaactcctagatctgagatcctatctcact 24814096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 248 - 415
Target Start/End: Original strand, 14687371 - 14687538
Alignment:
Q  248 tcggtgacaaacacacctactatgggggctaccaagcaaggaaggaaatccactagtgtagtccttattttgtagctctcaacaaactcctcatttac-a 346  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| || || |  || ||||| |||| |||  ||| || |    
T  14687371 tcggtgacaaacacacctactatggaggctaccaagctaggaaggaaattcactagtgtagtctttgttct-aagttctcagcaaattccaaattcacaa 14687469  T
Q  347 ctaaagacctaggacctacccgtattgatttcaacctaggaattcctagatctgacatcccatctcact 415  Q
    || |  ||||||||||||||| || ||| ||||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||    
T  14687470 cttataacctaggacctacccatactgacttcaacctaggaactcctagatctgagattccatctcact 14687538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 250 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 23082926 - 23082733
Alignment:
Q  250 ggtgacaaacacacctactatgggggctaccaagcaaggaaggaaatccactagtgtagtccttattttgtagctctcaacaaactcctcatttac-act 348  Q
    ||||| ||||||||||||| |  |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| |  || ||||| ||||  || | ||||| |||    
T  23082926 ggtgagaaacacacctactctacgggctaccaagtcaggaaggaaatccactagtgtagtccttattctaaagttctcagcaaa--ccacgtttacaact 23082829  T
Q  349 aaagacctaggacctacccgtattgatttcaacctaggaattcctagatctgacatcccatctcactatcctacagtcaatcacagcccctgtgat 444  Q
     ||||| ||||| ||| |||| | || ||||||||||||| || ||||||||| ||||||| ||||| |||||||  |||||||| ||||| ||||    
T  23082828 taagacgtaggatctagccgtctagacttcaacctaggaactcatagatctgagatcccatgtcactgtcctacaaccaatcacaacccctatgat 23082733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 362 - 449
Target Start/End: Original strand, 10660981 - 10661068
Alignment:
Q  362 ctacccgtattgatttcaacctaggaattcctagatctgacatcccatctcactatcctacagtcaatcacagcccctgtgatctatc 449  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||| |||||    
T  10660981 ctactcgtattgatttcaacctaggaactcctagatctgagatcccatctcactatcttatagtcagtcacagcccctgtgacctatc 10661068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 261 - 415
Target Start/End: Original strand, 11628656 - 11628811
Alignment:
Q  261 cacctactatgggggctaccaagcaaggaaggaaatccactagtgtagtccttattttgtagctctcaacaaactcctcatttacacta-aagacctagg 359  Q
    |||||||| |||||| |||||| | ||||||||||||||||  |||||||||||||   ||||||| | |||||||||| ||| ||||| | ||||||||    
T  11628656 cacctactttgggggttaccaaactaggaaggaaatccactcttgtagtccttattcaatagctcttagcaaactcctcgtttgcactatatgacctagg 11628755  T
Q  360 acctacccgtattgatttcaacctaggaattcctagatctgacatcccatctcact 415  Q
    ||||||||||| ||| |||| |||||||| |||||||||  | |||||| ||||||    
T  11628756 acctacccgtactgacttcagcctaggaactcctagatcgaagatcccacctcact 11628811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 59; E-Value: 8e-25
Query Start/End: Original strand, 272 - 413
Target Start/End: Complemental strand, 23175011 - 23174870
Alignment:
Q  272 ggggctaccaagcaaggaaggaaatccactagtgtagtccttattttgtagctctcaacaaactcctcatttaca-ctaaagacctaggacctacccgta 370  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |  || | ||| ||||   ||| |||||| ||  ||||||||||| ||||||||    
T  23175011 ggggctaccaagccaggaaggaaatccactagtgtagtccttattcta-agttatcagcaaatctctcgtttacaactctagacctaggacttacccgta 23174913  T
Q  371 ttgatttcaacctaggaattcctagatctgacatcccatctca 413  Q
    |||| |||||| |||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  23174912 ttgacttcaacataggaactcctagatctgagatcccatctca 23174870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 192 - 346
Target Start/End: Original strand, 21260462 - 21260617
Alignment:
Q  192 aaacaagaaaataaatgacaggaaagtaaagaa-cacaatgagtttgttgacccaactcggtgacaaacacacctactatgggggctaccaagcaaggaa 290  Q
    |||||||||||||||||||| ||| |||||    ||||   |||||||||| |||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||   |||||    
T  21260462 aaacaagaaaataaatgacaagaaggtaaaatggcacagacagtttgttgatccagttcggtgacaaacacacctactctgggggctaccaacttaggaa 21260561  T
Q  291 ggaaatccactagtgtagtccttattttgtagctctcaacaaactcctcatttaca 346  Q
    | ||||||| |||||||||||||||| |  || |||||||||||| ||| ||||||    
T  21260562 gaaaatccattagtgtagtccttattctaaagttctcaacaaactactcgtttaca 21260617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 234 - 312
Target Start/End: Original strand, 23057196 - 23057274
Alignment:
Q  234 tttgttgacccaactcggtgacaaacacacctactatgggggctaccaagcaaggaaggaaatccactagtgtagtcct 312  Q
    |||||| |||||  ||||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  23057196 tttgttaacccagttcggtgacaaacacacctactctgagggctaccaagccaggaaggaaattcactagtgtagtcct 23057274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 248 - 415
Target Start/End: Complemental strand, 20588861 - 20588695
Alignment:
Q  248 tcggtgacaaacacacctactatgggggctaccaagcaaggaaggaaatccactagtgtagtccttattttgtagctctcaacaaactcctcatttacac 347  Q
    ||||||||||||| || |||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| || || |  || ||||||||||||||   ||||||     
T  20588861 tcggtgacaaacaaac-tactttgggggctaccaagccaggaaggaaatcaactagtgtagtcgttgttct-aagttctcaacaaactccaagtttacaa 20588764  T
Q  348 ta-aagacctaggacctacccgtattgatttcaacctaggaattcctagatctgacatcccatctcact 415  Q
    || |  ||||||||||||| || | | | ||||||||| ||| |||||||||||| ||| |||||||||    
T  20588763 tatatcacctaggacctactcgcactaacttcaacctaagaactcctagatctgagatctcatctcact 20588695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 274 - 455
Target Start/End: Complemental strand, 26195586 - 26195407
Alignment:
Q  274 ggctaccaagcaaggaaggaaatccactagtgtagtccttattttgtagctctcaacaaactcctcatttaca-ctaaagacctaggacctacccgtatt 372  Q
    ||||||||||| | |||| |||| ||||| |||| |||||||| |  || ||||| |||| ||||| |||||| ||  |||||||||||||||| |||||    
T  26195586 ggctaccaagccaagaagaaaattcactactgtattccttattcta-agttctcagcaaattcctcgtttacaactctagacctaggacctacctgtatt 26195488  T
Q  373 gatttcaacctaggaattcctagatctgacatcccatctcactatcctacagtcaatcacagcccctgtgatctatctgatga 455  Q
     | ||||||||||||| ||||| |||||| || |||||||||| |||  || | ||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  26195487 aaattcaacctaggaactcctaaatctgagattccatctcact-tccctcaattaatcacagcccttgtgat-tatctgatga 26195407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 248 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 20596979 - 20596918
Alignment:
Q  248 tcggtgacaaacacacctactatgggggctaccaagcaaggaaggaaatccactagtgtagt 309  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||| |||||||||||    
T  20596979 tcggtgacaaacacacctactctgggggctaccaagccaagaaggaaatcgactagtgtagt 20596918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 233 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 31269224 - 31269148
Alignment:
Q  233 gtttgttgacccaactcggtgacaaacacacctactatgggggctaccaagcaaggaaggaaatccactagtgtagt 309  Q
    ||||||| |||||  |||||||||||| ||||||||  |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  31269224 gtttgttaacccagttcggtgacaaactcacctactccgggggctaccaagccatgaaggaaatccactagtgtagt 31269148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 362 - 444
Target Start/End: Original strand, 24049568 - 24049649
Alignment:
Q  362 ctacccgtattgatttcaacctaggaattcctagatctgacatcccatctcactatcctacagtcaatcacagcccctgtgat 444  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||  ||||||   ||||||||||||||||||    
T  24049568 ctacccgtattgacttcaacctaggaactcctagatctgagatcacatctcact-ccctacaaataatcacagcccctgtgat 24049649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 248 - 316
Target Start/End: Original strand, 6045325 - 6045392
Alignment:
Q  248 tcggtgacaaacacacctactatgggggctaccaagcaaggaaggaaatccactagtgtagtccttatt 316  Q
    ||||||| |||||| |||||| ||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  6045325 tcggtgaaaaacacgcctactctgggg-ctaccaagccaggaagaaaatccactagtgtagtccttatt 6045392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #59
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 251 - 413
Target Start/End: Complemental strand, 10309641 - 10309480
Alignment:
Q  251 gtgacaaacacacctactatgggggctaccaagcaaggaaggaaatccactagtgtagtccttattttgtagctctcaacaaactcctcatttac-acta 349  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||| ||| || |  |||||||| ||||||||   ||||| |||     
T  10309641 gtgacaaacgcacctactctgggggctaccaagccaagaaggaagtccactagtgtagttcttgttct-aagctctcagcaaactccaagtttacaactt 10309543  T
Q  350 aagacctaggacctacccgtattgatttcaacctaggaattcctagatctgacatcccatctca 413  Q
    |  ||||||   ||||||||||||| || |||||| ||| |||||||| ||| ||| |||||||    
T  10309542 atcacctagacactacccgtattgactt-aacctaagaactcctagatttgagatctcatctca 10309480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #60
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 252 - 414
Target Start/End: Complemental strand, 11407100 - 11406938
Alignment:
Q  252 tgacaaacacacctactatgggggctaccaagcaaggaaggaaatccactagtgtagtccttattttgtagctctcaacaaactcctcatttaca-ctaa 350  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||||||| ||| ||| |||||||||  || |  || ||||| || ||||    |||||| || |    
T  11407100 tgacaaacacacctactctgggggctaccatgccaggaaggaagtccgctaatgtagtcctagttata-agttctcagcacactcgaagtttacagctta 11407002  T
Q  351 agacctaggacctacccgtattgatttcaacctaggaattcctagatctgacatcccatctcac 414  Q
      ||||||   ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| || |||||||||    
T  11407001 tcacctagacactacccgtattgacttcaacctaggaactcctagatctgagattccatctcac 11406938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #61
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 361 - 413
Target Start/End: Complemental strand, 4547852 - 4547800
Alignment:
Q  361 cctacccgtattgatttcaacctaggaattcctagatctgacatcccatctca 413  Q
    |||||||||||| | ||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||    
T  4547852 cctacccgtatttacttcaacctaagaactcctagatctgagatcccatctca 4547800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #62
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 359 - 415
Target Start/End: Original strand, 19353245 - 19353301
Alignment:
Q  359 gacctacccgtattgatttcaacctaggaattcctagatctgacatcccatctcact 415  Q
    |||||||||||||| | ||||||| ||||| |||||||||||| || ||||||||||    
T  19353245 gacctacccgtattcacttcaaccgaggaactcctagatctgagattccatctcact 19353301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #63
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 261 - 304
Target Start/End: Original strand, 2076522 - 2076565
Alignment:
Q  261 cacctactatgggggctaccaagcaaggaaggaaatccactagt 304  Q
    |||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  2076522 cacctactctgggggctaccaagccatgaaggaaatccactagt 2076565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #64
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 261 - 304
Target Start/End: Original strand, 2082941 - 2082984
Alignment:
Q  261 cacctactatgggggctaccaagcaaggaaggaaatccactagt 304  Q
    |||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  2082941 cacctactctgggggctaccaagccatgaaggaaatccactagt 2082984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #65
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 372 - 415
Target Start/End: Complemental strand, 31269087 - 31269044
Alignment:
Q  372 tgatttcaacctaggaattcctagatctgacatcccatctcact 415  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||    
T  31269087 tgatttcaacctaggaactcctagatctgagatctcatctcact 31269044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #66
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 257 - 307
Target Start/End: Original strand, 19353143 - 19353193
Alignment:
Q  257 aacacacctactatgggggctaccaagcaaggaaggaaatccactagtgta 307  Q
    |||||||||||| || ||||||| |||| | ||||||||||||||||||||    
T  19353143 aacacacctactctgagggctactaagccaagaaggaaatccactagtgta 19353193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 223; Significance: 1e-122; HSPs: 46)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 223; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 93 - 449
Target Start/End: Original strand, 13790528 - 13790886
Alignment:
Q  93 tgaaattctagcacacttgttttaatatgttatgtatgatgttttgacgtttgcaatgttatgattaatgtttcgacatcacgcgataagcagaaataaa 192  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  | |||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  13790528 tgaaattctagcacacttgttttaatatgttctgtatgatgttacggcgtttgcaatgttacgattaatgtttcaacatcacgcgataaacagaaataaa 13790627  T
Q  193 aacaagaaaataaatgacaggaaagtaaagaacacaatgagtttgttgacccaactcggtgacaaacacacctactatgggggctaccaagcaaggaagg 292  Q
    |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||    
T  13790628 aacaagaaaataaaagacatgaaagtaaagaacacaatgagtttgttgacccagttcggtgacaaacacacctactatgggggctaccaagccaagaagg 13790727  T
Q  293 aaatccactagtgtagtccttattttgtagctctcaacaaactcctcatttacacta-aagacctaggacctacccgtattgatttcaacctaggaattc 391  Q
    ||||  ||||||||||||||||||   ||||||||| |||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||    
T  13790728 aaatatactagtgtagtccttattcaatagctctcagcaaactcctcgtttacactatatgacctaggacctacccgtatagacttcaacctaggaactc 13790827  T
Q  392 ctagatctgacatcccatctcactatcctacag-tcaatcacagcccctgtgatctatc 449  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| |||  | ||| ||||||||||||||| |||||    
T  13790828 ctagatctgagatcccatctcactattctaatgatcagtcacagcccctgtgacctatc 13790886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 92 - 449
Target Start/End: Original strand, 295308 - 295665
Alignment:
Q  92 ttgaaattctagcacacttgttttaatatgttatgtatgatgttttgacgtttgcaatgttatgattaatgtttcgacatcacgcgataagcagaaataa 191  Q
    ||||||||||| | |||||||| ||||||||| |||| |||||||  | ||||  ||||||  | | ||||||   ||||| ||  |||| ||| |||||    
T  295308 ttgaaattctaacgcacttgttctaatatgttctgtaagatgtttcaatgtttataatgttccgttcaatgttctaacatctcgaaataaacaggaataa 295407  T
Q  192 aaacaagaaaataaatgacaggaaagtaaagaacacaatgagtttgttgacccaactcggtgacaaacacacctactatgggggctaccaagcaaggaag 291  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  295408 aaacaagaaaataattgacaagaaagtaaagaacacagtgagtttgttgacccagttcggtgacaaacacacctactctgggggctaccaagccaggaag 295507  T
Q  292 gaaatccactagtgtagtccttattttgtagctctcaacaaactcctcatttacactaaagacctaggacctacccgtattgatttcaacctaggaattc 391  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  295508 gaaatccactagtgtagtccttattctatagctctcagcaaactcctcgtttacactaaagacctaggacctacccgtattgatttcaacttaggaactc 295607  T
Q  392 ctagatctgacatcccatctcactatcctacagtcaatcacagcccctgtgatctatc 449  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||    
T  295608 ctagatctgagatcccatctcactatcctatagtcagtcacagcccttgtgatctatc 295665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 90 - 441
Target Start/End: Complemental strand, 15636186 - 15635833
Alignment:
Q  90 ttttgaaattctagcacacttgttttaatatgttatgtatgatgttttgacgtttgcaatgttatgattaatgtttcgacatcacgcgataagcagaaat 189  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||  ||||| ||||| || |||||||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  15636186 ttttgaaattctagcacacttgttttaatacgttctgtttgatgttttagcgttttcaatgctacgattaatgtttcaacatcacgcgataaacagaaat 15636087  T
Q  190 aaaaacaagaaaataaatgacaggaaagtaaagaacacaatgagtttgttgacccaactcggtgacaaacacacctactatgggggctaccaagcaagga 289  Q
    |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  15636086 aaaaacaagaaaataaataacatgaaagtaaagaacacaatgagtttgatgacccagttcggtgacaaacacacctactctgggggctaccaagccagga 15635987  T
Q  290 aggaaatccactagtgtagtccttattttgtagctctcaacaaactcctcatttacacta-aagacctaggacctacccgtattgatttcaacctaggaa 388  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||   |||||||||  ||||||||| ||||||||| | || ||||||||||||||||| || ||||| |||||||    
T  15635986 aggaaattcactagtgtagtccttattcaatagctctcagtaaactcctcgtttacactatatgatctaggacctacccgtatagacttcaaactaggaa 15635887  T
Q  389 ttcctagatctgacatcccatctcactatcct-acagtcaatcacagcccctgt 441  Q
     |||||||| ||| |||||||| ||||||||| |  |||||||||||| |||||    
T  15635886 ctcctagatatgagatcccatcacactatcctaatggtcaatcacagctcctgt 15635833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 92 - 421
Target Start/End: Original strand, 17702255 - 17702584
Alignment:
Q  92 ttgaaattctagcacacttgttttaatatgttatgtatgatgttttgacgtttgcaatgttatgattaatgtttcgacatcacgcgataagcagaaataa 191  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||  | ||||||  |||||| ||||||| |||| |||||  ||||||| |||||||||    
T  17702255 ttgaaattctagcgcacttgttttaataagttatgtatgatgttacggcgtttgtgatgttacgattaat-tttcaacatccggcgataaacagaaataa 17702353  T
Q  192 aaacaagaaaataaatgacaggaaagtaaagaacacaatgagtttgttgacccaactcggtgacaaacacacctactatgggggctaccaagcaaggaag 291  Q
    ||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  17702354 aaacaagaaaataaaagactgaaaagtaaagaacacaatgagtttgttgacccagttcggtgacaaacacaactactctgggggctaccaagccaggaag 17702453  T
Q  292 gaaatccactagtgtagtccttattttgtagctctcaacaaactcctcatttacacta-aagacctaggacctacccgtattgatttcaacctaggaatt 390  Q
    |||||||||||||||||||||||||   ||||||||| |||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||| || || |||||||||| |    
T  17702454 gaaatccactagtgtagtccttattcaatagctctcagcaaactcctcgtttacactatatgacctaggacctacccgtatagacttaaacctaggaact 17702553  T
Q  391 cctagatctgacatcccatctcactatccta 421  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  17702554 cctagatctgagatcccatctcactatccta 17702584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 87 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 18064524 - 18064168
Alignment:
Q  87 tatttttgaaattctagcacacttgttttaatat--gttatgtatgatgttttgacgtttgcaatgttatgattaatgtttcgacatcacgcgata-agc 183  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||||||  |||||||| |||||||  ||||||| | |||| || ||||| |||| |||||||| | || | |    
T  18064524 tatttttgaaattcaagcgcacttgttttaatatatgttatgtacgatgtttaaacgtttgtagtgttctgtttaatatttcaacatcacgagttataac 18064425  T
Q  184 agaaataaaaacaagaaaataaatgacaggaaagtaaagaacacaatgagtttgttgacccaactcggtgacaaacacacctactatgggggctaccaag 283  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||| | | ||||||||||    
T  18064424 agaaataaaaataagaaaataaatgacaggaaagtaaaagacacaatgagtttgttaacccagttcggtgacaaacacacctactctagaggctaccaag 18064325  T
Q  284 caaggaaggaaatccactagtgtagtccttattttgtagctctcaacaaactcctcatttacactaaagacctaggacctacccgtattgatttcaacct 383  Q
      ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  18064324 gcaggaaggaaatccactagtgtagtccttattctatagctctcaacaaactcctcgtttacactaaagacctaggacctaaccgtattgatttcaacct 18064225  T
Q  384 aggaattcctagatctgacatcccatctcactatcctacagtcaatcacagcccctg 440  Q
    ||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||  |  |||| ||||||||||||    
T  18064224 aggaactcctagatctgagatctcatctcactatctaatggtcagtcacagcccctg 18064168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 92 - 421
Target Start/End: Original strand, 24195372 - 24195701
Alignment:
Q  92 ttgaaattctagcacacttgttttaatatgttatgtatgatgttttgacgtttgcaatgttatgattaatgtttcgacatcacgcgataagcagaaataa 191  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||  | ||||||  |||||| |||||||||||| |||||  ||| ||| |||||||||    
T  24195372 ttgaaattctagcacacttgttttgataagttatgtatgatgttacggcgtttgagatgttacgattaatgtttcaacatccggcgttaaacagaaataa 24195471  T
Q  192 aaacaagaaaataaatgacaggaaagtaaagaacacaatgagtttgttgacccaactcggtgacaaacacacctactatgggggctaccaagcaaggaag 291  Q
    ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||| | ||||    
T  24195472 aaacaagaaaataaaagacaggaatgtaaagaacacaatgagtttgttgacccagttcggtgaaaaacacacctactct-ggggctaccaagccaagaag 24195570  T
Q  292 gaaatccactagtgtagtccttattttgtagctctcaacaaactcctcatttacacta-aagacctaggacctacccgtattgatttcaacctaggaatt 390  Q
    |||||||||||||||||||||||||   ||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||| |||| || ||||||||||||| |    
T  24195571 gaaatccactagtgtagtccttattcaatagctctcagcaaactcctcatttacactatatgacctaggagctacctgtatagacttcaacctaggaact 24195670  T
Q  391 cctagatctgacatcccatctcactatccta 421  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  24195671 cctagatctgagatcccatctcactatccta 24195701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 175; E-Value: 5e-94
Query Start/End: Original strand, 92 - 421
Target Start/End: Complemental strand, 18035207 - 18034877
Alignment:
Q  92 ttgaaattctagcacacttgttttaatatgttatgtatgatgttttgacgtttgcaatgttatgattaatgtttcgacatcacgcgata-agcagaaata 190  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||  ||||||| | ||||    ||||  |||| |||||||| | || | || |||||    
T  18035207 ttgaaattctagcgcacttgttttaatatgttttgtacgatgtttaaacgtttgtagtgttccatttaagttttcaacatcacgagttataacaaaaata 18035108  T
Q  191 aaaacaagaaaataaatgacaggaaagtaaagaacacaatgagtttgttgacccaactcggtgacaaacacacctactatgggggctaccaagcaaggaa 290  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||| | | ||||||||||| |||||    
T  18035107 aaaacaagaaaataaatgagaggaaagtaaaagacacaatgagtttgttaacccagttcggtgacaaacacacctactcttgaggctaccaagccaggaa 18035008  T
Q  291 ggaaatccactagtgtagtccttattttgtagctctcaacaaactcctcatttacactaaagacctaggacctacccgtattgatttcaacctaggaatt 390  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |    
T  18035007 ggaaatccactagtgtagtccttattctataggtctcagcaaactcctcatttacaccaaagacctaggacctacccgtatctatttcaacctaggaact 18034908  T
Q  391 cctagatctgacatcccatctcactatccta 421  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  18034907 cctagatctgagatcccatctcactatccta 18034877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 172; E-Value: 3e-92
Query Start/End: Original strand, 93 - 418
Target Start/End: Original strand, 44452329 - 44452655
Alignment:
Q  93 tgaaattctagcacacttgttttaatatgttatgtatgatgttttgacgtttgcaatgttatgattaatgtttcgacatcacgcgataagcagaaataaa 192  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||| |||  |||||||| ||||||||||||||  | |||||||| | |||||||| |||||  |||||||||    
T  44452329 tgaaattctagcgcacttgttttaatatgttctgtcagatgttttaacgtttgcaatgtttcgtttaatgttccaacatcacgtgataaaaagaaataaa 44452428  T
Q  193 aacaagaaaataaatgacaggaaagtaaagaacacaatgagtttgttgacccaactcggtgacaaacacacctac-tatgggggctaccaagcaaggaag 291  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| | | |||||| |||||| ||||||    
T  44452429 aacaagaaaataaacgacaggaaagtaaagaacacaatgagtttgttgacccagttcggtgacaaacacacctacgtctaggggct-ccaagccaggaag 44452527  T
Q  292 gaaatccactagtgtagtccttattttgtagctctcaacaaactcctcatttacacta-aagacctaggacctacccgtattgatttcaacctaggaatt 390  Q
    |||||||||||||||||| ||||||   ||||||||| |||||||||| ||||||||| | |||| | ||||||||||||| || ||||||||||||| |    
T  44452528 gaaatccactagtgtagttcttattcaatagctctcagcaaactcctcgtttacactatatgacccatgacctacccgtatagacttcaacctaggaact 44452627  T
Q  391 cctagatctgacatcccatctcactatc 418  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  44452628 cctagatctgagatcccatctcattatc 44452655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 171; E-Value: 1e-91
Query Start/End: Original strand, 183 - 449
Target Start/End: Original strand, 28051075 - 28051341
Alignment:
Q  183 cagaaataaaaacaagaaaataaatgacaggaaagtaaagaacacaatgagtttgttgacccaactcggtgacaaacacacctactatgggggctaccaa 282  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  28051075 cagaaataaaaacaagaaagtaaatgacaagaaagtaaagaacacggtgagtttgttgacccagtttggtgacaaacacacctactctgggggctaccaa 28051174  T
Q  283 gcaaggaaggaaatccactagtgtagtccttattttgtagctctcaacaaactcctcatttacactaaagacctaggacctacccgtattgatttcaacc 382  Q
    || |||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||    
T  28051175 gccaggaaggaaatccaatagtgtagtccttattctatagctctcagcaaactcctcgtttacactaaaggcctaggacatacctgtattgatttcaacc 28051274  T
Q  383 taggaattcctagatctgacatcccatctcactatcctacagtcaatcacagcccctgtgatctatc 449  Q
    |||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||| | ||||| |||||||||||||||    
T  28051275 taggaactcctagatctgagatctcatctcactatcctatagttagtcacaacccctgtgatctatc 28051341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 167; E-Value: 3e-89
Query Start/End: Original strand, 92 - 449
Target Start/End: Complemental strand, 20748473 - 20748117
Alignment:
Q  92 ttgaaattctagcacacttgttttaatatgttatgtatgatgttttgacgtttgcaatgttatgattaatgtttcgacatcacgcgataagcagaaataa 191  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||| | | |||||| | |||||||||||||| |||||||||    
T  20748473 ttgaaattctagcgcacttgttttaatatgttttgtatgatgttttaacgtttgcgatgttacgttcaatgttccaacatcacgcgataaacagaaataa 20748374  T
Q  192 aaacaagaaaataaatgacaggaaagtaaagaacacaatgagtttgttgacccaactcggtgacaaacacacctactatgggggctaccaagcaaggaag 291  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| |||||  |||||| |||   |||||||| | ||||||||||||| ||||||    
T  20748373 aaacaagaaaataaatgacaagaaagtaaagaacataatgagtttgttaacccagttcggtg-caacatcacctact-ttggggctaccaagccaggaag 20748276  T
Q  292 gaaatccactagtgtagtccttattttgtagctctcaacaaactcctcatttacac-taaagacctaggacctacccgtattgatttcaacctaggaatt 390  Q
    |||||||||||||||||||||||||    |||||||||||||||| || ||||||| | | |||||||||||||||  | | || |||||||||| || |    
T  20748275 gaaatccactagtgtagtccttattgaaaagctctcaacaaactcatcgtttacactttatgacctaggacctaccaatctagacttcaacctagaaact 20748176  T
Q  391 cctagatctgacatcccatctcactatcctacagtcaatcacagcccctgtgatctatc 449  Q
    ||||||||||| ||| || ||||||||||||  |||| ||||| |||||||||||||||    
T  20748175 cctagatctgagatctcaactcactatcctatggtcagtcacaacccctgtgatctatc 20748117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 155; E-Value: 4e-82
Query Start/End: Original strand, 92 - 417
Target Start/End: Complemental strand, 1919546 - 1919228
Alignment:
Q  92 ttgaaattctagcacacttgttttaatatgttatgtatgatgttttgacgtttgcaatgttatgattaatgtttcgacatcacgcgataagcagaaataa 191  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||| |||||   ||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  1919546 ttgaaattctagcgcacttgttttaatacgttctgtatgttgtttccgcgtttgcaatgttacaattaatgtttcaacatcacgcgataaacagaaataa 1919447  T
Q  192 aaacaagaaaataaatgacaggaaagtaaagaacacaatgagtttgttgacccaactcggtgacaaacacacctactatgggggctaccaagcaaggaag 291  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||    
T  1919446 aaacaagaaagtaaatgacaggaaagtaaataacacaatgagtttgttgacccagttccatgacaaacacacctactat-ggggctaccaagccaagaag 1919348  T
Q  292 gaaatccactagtgtagtccttattttgtagctctcaacaaactcctcatttacactaaagacctaggacctacccgtattgatttcaacctaggaattc 391  Q
    ||||||||||  |||||||||||||   ||||| ||| ||||||| || |||||||||      || ||||||||||||| | |||||||||||||| ||    
T  1919347 gaaatccactgatgtagtccttattcaatagctttcagcaaactcttcgtttacacta------tatgacctacccgtatagttttcaacctaggaactc 1919254  T
Q  392 ctagatctgacatcccatctcactat 417  Q
    ||| || ||| |||||||||||||||    
T  1919253 ctaaatatgagatcccatctcactat 1919228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 153; E-Value: 7e-81
Query Start/End: Original strand, 93 - 393
Target Start/End: Original strand, 19633736 - 19634035
Alignment:
Q  93 tgaaattctagcacacttgttttaatatgttatgtatgatgttttgacgtttgcaatgttatgattaatgtttcgacatcacgcgataagcagaaataaa 192  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||||||| | | |||||| | |||||| ||||||| ||||||||||    
T  19633736 tgaaattctagcgtacttgttttaatatgttttgcatgatgttttaacgtttgcaatgttacgttcaatgttccaacatcatgcgataaacagaaataaa 19633835  T
Q  193 aacaagaaaataaatgacaggaaagtaaagaacacaatgagtttgttgacccaactcggtgacaaacacacctactatgggggctaccaagcaaggaagg 292  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||| |  || | |||||||||| ||||| |  |||||||||||| |||||||    
T  19633836 aacaagaaaataattgacaagaaagtaaataacacagtgagtttgttgacctagttcagcgacaaacacatctactct-agggctaccaagccaggaagg 19633934  T
Q  293 aaatccactagtgtagtccttattttgtagctctcaacaaactcctcatttacactaaagacctaggacctacccgtattgatttcaacctaggaattcc 392  Q
    |||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||| || ||||||||| ||| |||    
T  19633935 aaatccactagtgtagtccttattctatagctctcagcaaactcctcgtttacactaaagatataggacctacccgtatagacttcaacctaagaactcc 19634034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 144; E-Value: 2e-75
Query Start/End: Original strand, 93 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 19532193 - 19531970
Alignment:
Q  93 tgaaattctagcacacttgttttaatatgttatgtatgatgttttgacgtttgcaatgttatgattaatgtttcgacatcacgcgataagcagaaataaa 192  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||    ||||| |||||||| ||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  19532193 tgaatttctagcacacttgttttaatatgttctatatgatgttacagcgttttcaatgttacgatcaatgtttcaacatcacgcgataaacagaaataaa 19532094  T
Q  193 aacaagaaaataaatgacaggaaagtaaagaacacaatgagtttgttgacccaactcggtgacaaacacacctactatgggggctaccaagcaaggaagg 292  Q
    |||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  19532093 aacaagaaaatacaagaaaggaaagtaaagaacacaatgagtttgttgatccaattcggtgacaaacacacctactttgggggctaccaagccaggaagg 19531994  T
Q  293 aaatccactagtgtagtccttatt 316  Q
    |||||||||||||| |||||||||    
T  19531993 aaatccactagtgtcgtccttatt 19531970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 140; E-Value: 4e-73
Query Start/End: Original strand, 93 - 421
Target Start/End: Complemental strand, 23954869 - 23954538
Alignment:
Q  93 tgaaattctagcacacttgttttaatatgttatgt-atgatgttttgacgtttgcaatgttatgattaatgtttcgacatcacgcgataagcagaaataa 191  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  | | | | ||||||||  ||| ||||||| |||| |||||||||||| |||||| || |||| || ||||||    
T  23954869 tgaaattctagcacacttgttttaattagctctattatgatgttacgacatttgcaaagttacgattaatgtttcaacatcatgcaataaacataaataa 23954770  T
Q  192 aaa-caagaaaataaatgacaggaaagtaaagaacacaatgagtttgttgacccaactcggtgacaaacacacctactatgggggctaccaagcaaggaa 290  Q
    ||| |||||||||||| |||| | |||||||||| |||||||||||||||| |||  |||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||    
T  23954769 aaaacaagaaaataaaagacatgtaagtaaagaatacaatgagtttgttgatccagttcggtggcaaacacacctactctggaggctaccaagccaggaa 23954670  T
Q  291 ggaaatccactagtgtagtccttattttgtagctctcaacaaactcctcatttacacta-aagacctaggacctacccgtattgatttcaacctaggaat 389  Q
    ||||||||| |||| ||||| |||||   ||||||||| |||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||| ||||  | |||||||||||||     
T  23954669 ggaaatccattagtttagtcattattcaatagctctcagcaaactcctcgtttacactatatgacctaggacctacctgtatatacttcaacctaggaac 23954570  T
Q  390 tcctagatctgacatcccatctcactatccta 421  Q
    |||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  23954569 tcctagatttgagatcccatctcactatccta 23954538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 136; E-Value: 9e-71
Query Start/End: Original strand, 250 - 449
Target Start/End: Complemental strand, 17042906 - 17042707
Alignment:
Q  250 ggtgacaaacacacctactatgggggctaccaagcaaggaaggaaatccactagtgtagtccttattttgtagctctcaacaaactcctcatttacacta 349  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  17042906 ggtgacaaacacacctactctggaggctaccaaggcaggaaggaaatccactagtgtagtccttattctatagctctcaacaaactcctcgtttaaacta 17042807  T
Q  350 aagacctaggacctacccgtattgatttcaacctaggaattcctagatctgacatcccatctcactatcctacagtcaatcacagcccctgtgatctatc 449  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||  |||| | ||||||||||||| |||||    
T  17042806 aagacctaggacctacccgtattgatttcaacccaggaactcctagatctgagatcccatctcactatcctatggtcagtgacagcccctgtgacctatc 17042707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 232 - 421
Target Start/End: Complemental strand, 6581037 - 6580848
Alignment:
Q  232 agtttgttgacccaactcggtgacaaacacacctactatgggggctaccaagcaaggaaggaaatccactagtgtagtccttattttgtagctctcaaca 331  Q
    |||||||| |||||  ||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||    
T  6581037 agtttgttaacccagttcggtgacaaacacacctactctgaaggctaccaagccagcaaggaaatccactagtgtagtccttattctatagctctcagca 6580938  T
Q  332 aactcctcatttacactaaagacctaggacctacccgtattgatttcaacctaggaattcctagatctgacatcccatctcactatccta 421  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  6580937 aactcctcgtttacactaaagacctaggacctacccgtattgatttcaacctaggaactcctagatctgagatcccatctcactatccta 6580848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 189 - 421
Target Start/End: Original strand, 18547593 - 18547826
Alignment:
Q  189 taaaaacaagaaaataaatgacaggaaagtaaagaacacaatgagtttgttgacccaactcggtgacaaacacacctactatgggggctaccaagcaagg 288  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||    
T  18547593 taaaaacaacaaaataaatgacaggaaagtagagaatacaatgagtttgttgacccaattcggtgacaaacacacctactctgggggctaccaagccagg 18547692  T
Q  289 aaggaaatccactagtgtagtccttattttgtagctctcaacaaactcctcatttacacta-aagacctaggacctacccgtattgatttcaacctagga 387  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||   |||||||   |||||||||| ||||||||| | |||||| ||||||||||||| || ||||||||||||    
T  18547693 aaggaaatccaatagtgtagtccttattcaatagctcttggcaaactcctcgtttacactatatgacctaagacctacccgtatagacttcaacctagga 18547792  T
Q  388 attcctagatctgacatcccatctcactatccta 421  Q
    | || ||||||| | ||||||||| |||||||||    
T  18547793 actcatagatctaagatcccatcttactatccta 18547826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 113; E-Value: 5e-57
Query Start/End: Original strand, 159 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 13524924 - 13524713
Alignment:
Q  159 aatgtttcgacatcacgcgataagcagaaataaaaacaagaaaataaatgacaggaaagtaaagaacacaatgagtttgttgacccaactcggtgacaaa 258  Q
    |||||||| |||||||||||||| || || | ||||||||||||||||  ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||| |||||    
T  13524924 aatgtttcaacatcacgcgataaacataagtcaaaacaagaaaataaacaacaagaaagtaaagaacaaaatgagtttgttgacccagttcggtcacaaa 13524825  T
Q  259 cacacctactatgggggctaccaagcaaggaaggaaatccactagtgtagtccttattttgtagctctcaacaaactcctcatttacactaaagacctag 358  Q
     ||||||||| ||||||||||||||  | |||||||||||||| |||||||||||||| | ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  13524824 -acacctactctgggggctaccaagtcaagaaggaaatccactggtgtagtccttattctatagttctcagcaaactcctcatttacactaaagacctag 13524726  T
Q  359 gacctacccgtat 371  Q
     ||||| ||||||    
T  13524725 tacctatccgtat 13524713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 265 - 444
Target Start/End: Original strand, 9036728 - 9036907
Alignment:
Q  265 tactatgggggctaccaagcaaggaaggaaatccactagtgtagtccttattttgtagctctcaacaaactcctcatttacactaaagacctaggaccta 364  Q
    |||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  9036728 tactctgggggctaccaaaccaggaaggaaatccactagtgtagtccttattcaatagctctcagcaaactcctcgtttgcactaaagacctaggaccta 9036827  T
Q  365 cccgtattgatttcaacctaggaattcctagatctgacatcccatctcactatcctacagtcaatcacagcccctgtgat 444  Q
    |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||  | |||| |  |||||| ||||||||||    
T  9036828 cccgtattgacttcaacctaggaactcctagatctgagatcccatctcactcccttacaattgatcacaacccctgtgat 9036907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 214 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 9031569 - 9031340
Alignment:
Q  214 aaagtaaagaacacaatgagtttgttgacccaactcggtgacaaacacacctactatgggggctaccaagcaaggaaggaaatccactagtgtagtcctt 313  Q
    |||||||| | ||||||||||||||| |||||  |||||| |||   |||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  9031569 aaagtaaaaagcacaatgagtttgttaacccagttcggtg-caacgtcacctactctgggggctaccaagtcaggaaggaaatccactagtgtagtcctt 9031471  T
Q  314 attttgtagctctcaacaaactcctcatttacactaaagacctaggacctacccgtattgatttcaacctaggaattcctagatctgacatcccatctca 413  Q
    |||   ||||||||| |||||||||| |||   |||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  9031470 attcaatagctctcagcaaactcctcgtttgtgctaatgacctaggacctacccgtactgacttcaacctaggaactcctagatctgagatcccatctca 9031371  T
Q  414 ctatcctacagtcaatcacagcccctgtgat 444  Q
    ||  | |||| |  |||||| ||||||||||    
T  9031370 ctcccttacaattgatcacatcccctgtgat 9031340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 191 - 445
Target Start/End: Original strand, 13913739 - 13913990
Alignment:
Q  191 aaaacaagaaaataaatgacaggaaagtaaagaacacaatgagtttgttgacccaactcggtgacaaacacacctactatgggggctaccaagcaaggaa 290  Q
    ||||||| |||||||| |||| ||||||||| ||||||  ||||||||| ||||   |||||| |||   |||||||| ||||||||||||||| ||||     
T  13913739 aaaacaacaaaataaaagacaagaaagtaaaaaacacagagagtttgttaacccggttcggtg-caacgtcacctactctgggggctaccaagccagga- 13913836  T
Q  291 ggaaatccactagtgtagtccttattttgtagctctcaacaaactcctcatttacactaaagacctaggacctacccgtattgatttcaacctaggaatt 390  Q
    |||||||| |||||||| |||||||| | ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| || | ||||||||||||| |    
T  13913837 ggaaatccgctagtgtactccttattctctagctctcagcaaactcctcgtttacactaaagacctaggatctacccgttttaacttcaacctaggaact 13913936  T
Q  391 cctagatctgacatcccatctcactatcctacagtcaatcacagcccctgtgatc 445  Q
    ||||||||||| ||  |||||||||  |||| |  ||||||||||||||||||||    
T  13913937 cctagatctgagatttcatctcact-ccctagaaccaatcacagcccctgtgatc 13913990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 270 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 7479269 - 7479097
Alignment:
Q  270 tgggggctaccaagcaaggaaggaaatccactagtgtagtccttattttgtagctctcaacaaactcctcatttacactaaagacctaggacctacccgt 369  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |    
T  7479269 tgggggctaccaagccagga-ggaaatccactagtgtagtccttattctctagctctcagcaaactcctcgtttacactaaagacctaggacctacccat 7479171  T
Q  370 attgatttcaacctaggaattcctagatctgacatcccatctcactatcctacagtcaatcacagcccctgtgat 444  Q
    ||||| |||||| || ||| |||||||||||| |||||||||| ||  ||||||  |||||||| ||||||||||    
T  7479170 attgacttcaacatatgaagtcctagatctgagatcccatctccct-ccctacaaccaatcacatcccctgtgat 7479097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 251 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 21719076 - 21718884
Alignment:
Q  251 gtgacaaacacacctactatgggggctaccaagcaaggaaggaaatccactagtgtagtccttattttgtagctctcaacaaactcctcatttacactaa 350  Q
    |||||||||||||||||| |  || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |  || | |||||||| ||||| |||||||| |    
T  21719076 gtgacaaacacacctactctaagg-ctaccaagccaggaaggaaatccactagtgtagtccttattctaaagttttcaacaaaatcctcgtttacactta 21718978  T
Q  351 agacctaggacctacccgtattgatttcaacctaggaattcctagatctgacatcccatctcactatcctacagtcaatcacagcccctgtgat 444  Q
    |||||||||| |||||||| | || || |||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||    
T  21718977 agacctaggatctacccgtctagactttaacctaggaactcctagatctgagatctcatctcactatcctacagtcaaccatagcccatgtgat 21718884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 270 - 410
Target Start/End: Complemental strand, 7496060 - 7495921
Alignment:
Q  270 tgggggctaccaagcaaggaaggaaatccactagtgtagtccttattttgtagctctcaacaaactcctcatttacactaaagacctaggacctacccgt 369  Q
    ||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |    
T  7496060 tgggggctatcaagccagga-ggaaatccactagtgtagtccttattctctagctctcagcaaactcctcgtttacactaaagacctaggacctacccat 7495962  T
Q  370 attgatttcaacctaggaattcctagatctgacatcccatc 410  Q
    ||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  7495961 attgacttcaacctaggaactcctagatctgagatcccatc 7495921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 201 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 15686361 - 15686126
Alignment:
Q  201 aataaatgacaggaaagtaaagaa--cacaatgagtttgttgacccaactcggtgacaaacacacctactatgggggctaccaagcaaggaaggaaatcc 298  Q
    |||||| ||||| |||||||| ||  ||||  |||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||    
T  15686361 aataaaggacagaaaagtaaaaaaggcacatagagtttgttgacccagttcgatgacaaacacacctactctaggggctaccaagccaggaaggaaatcc 15686262  T
Q  299 actagtgtagtccttattttgtagctctcaacaaactcctcatttac-actaaagacctaggacctacccgtattgatttcaacctaggaattcctagat 397  Q
    | |||||||||||||||| |  || ||||| ||||  || | ||||| ||| |||||||| |||||||| || | || ||||||| ||||| ||||||||    
T  15686261 attagtgtagtccttattctaaagttctcagcaaa--ccacgtttacaacttaagacctatgacctacctgtctagacttcaacccaggaactcctagat 15686164  T
Q  398 ctgacatcccatctcactatcctacagtcaatcacagc 435  Q
    |||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  15686163 ctgagatcccatctcactatcctacgatcaatcacagc 15686126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 86; E-Value: 6e-41
Query Start/End: Original strand, 272 - 449
Target Start/End: Original strand, 18476957 - 18477134
Alignment:
Q  272 ggggctaccaagcaaggaaggaaatccactagtgtagtccttattttgtagctctcaacaaactcctcatttacactaaagacctaggacctacccgtat 371  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||| |||||||||| |||||||| ||||| || ||||||| |||||    
T  18476957 ggggctaccaagccaggaaggaaatccactagtgtagtccttattctaaagctctcagcaaactcctcgtttacacttaagacataagacctactcgtat 18477056  T
Q  372 tgatttcaacctaggaattcctagatctgacatcccatctcactatcctacagtcaatcacagcccctgtgatctatc 449  Q
     || ||||| ||||||| |||||||| ||| |||||| ||||||||||||  |||| ||||||||  ||||| |||||    
T  18477057 agacttcaaactaggaactcctagatttgagatcccacctcactatcctatggtcagtcacagccattgtgacctatc 18477134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 196 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 287103 - 286850
Alignment:
Q  196 aagaaaataaatgacaggaaagtaaagaacacaa----tgagtttgttgacccaactcggtgacaaacacacctactatgggggctaccaagcaaggaag 291  Q
    |||||||||||||||| || |||||| || | ||    |||||||||| ||| |  ||| |||||||||||| |||||||||| ||||||| | ||||||    
T  287103 aagaaaataaatgacaagagagtaaaaaaaaaaaacagtgagtttgttaacctagttcgatgacaaacacacttactatggggactaccaaaccaggaag 287004  T
Q  292 gaaatccactagtgtagtccttattttgtagctctcaacaaactcctcatttacacta-aagacctaggacctacccgtattgatttcaacctaggaatt 390  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| |   | |||||  ||||||||  |||| |  | |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| |    
T  287003 gaaatccactagtatagtccttattctaatgttctcaggaaactccttgtttataacacaagacctaggacctacccgtctagatttcaacctaggaact 286904  T
Q  391 cctagatctgacatcccatctcactatcctacagtcaatcacagcccctgtgat 444  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||    |||||||| ||||||||||    
T  286903 cctagatctgagatcccatctcactatcctaacaccaatcacaacccctgtgat 286850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 231 - 445
Target Start/End: Original strand, 13917831 - 13918042
Alignment:
Q  231 gagtttgttgacccaactcggtgacaaacacacctactatgggggctaccaagcaaggaaggaaatccactagtgtagtccttattttgtagctctcaac 330  Q
    ||||||||| |||||| |||||| |||   |||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||| |||||||| | ||||||||| |    
T  13917831 gagtttgttaacccaattcggtg-caacgtcacctactctgggggctaccaagccag-aaggaaatccaatagtgtactccttattctctagctctcagc 13917928  T
Q  331 aaactcctcatttacactaaagacctaggacctacccgtattgatttcaacctaggaattcctagatctgacatcccatctcactatcctacagtcaatc 430  Q
    ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||  ||| ||||||||||||| |||||||| ||| ||  |||||||||  |||| |  |||||    
T  13917929 aaattcctcgtttacactaaagacctaggacctacctgtcctgacttcaacctaggaactcctagatatgagatttcatctcact-ccctaaaaccaatc 13918027  T
Q  431 acagcccctgtgatc 445  Q
    |||||||||||||||    
T  13918028 acagcccctgtgatc 13918042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 79; E-Value: 9e-37
Query Start/End: Original strand, 248 - 440
Target Start/End: Original strand, 31649695 - 31649884
Alignment:
Q  248 tcggtgacaaacacacctactatgggggctaccaagcaaggaaggaaatccactagtgtagtccttattttgtagctctcaacaaactcctcatttaca- 346  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| |  || ||||| |||||||||| ||||||     
T  31649695 tcggtgacaaacacacctactctgggt-ctaccaagccaggaaggaaatccactcgtgtagtccttattct--agttctcagcaaactcctcgtttacaa 31649791  T
Q  347 ctaaagacctaggacctacccgtattgatttcaacctaggaattcctagatctgacatcccatctcactatcctacagtcaatcacagcccctg 440  Q
    ||  ||||||||||||||||||| |||| |||||||||| || ||||| |||||| ||||||||||||| |||  || ||||||||| ||||||    
T  31649792 ctctagacctaggacctacccgtcttgacttcaacctagaaaatcctatatctgagatcccatctcact-tccctcaatcaatcacaacccctg 31649884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 76; E-Value: 6e-35
Query Start/End: Original strand, 270 - 421
Target Start/End: Original strand, 8224865 - 8225013
Alignment:
Q  270 tgggggctaccaagcaaggaaggaaatccactagtgtagtccttattttgtagctctcaacaaactcctcatttacacta-aagacctaggacctacccg 368  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||| |||||||||| ||||||||| | |||||| ||||||||||    
T  8224865 tgggggctaccaagccaggaaggaaatccactagtgtagtccttattcaatagctctcagcaaactcctcgtttacactatatgacctaagacctacccg 8224964  T
Q  369 tattgatttcaacctaggaattcctagatctgacatcccatctcactatccta 421  Q
    ||| |  ||||||||||||| |||    ||||| |||||||||||||||||||    
T  8224965 tatagtcttcaacctaggaactcc----tctgagatcccatctcactatccta 8225013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 76; E-Value: 6e-35
Query Start/End: Original strand, 264 - 415
Target Start/End: Original strand, 8749059 - 8749210
Alignment:
Q  264 ctactatgggggctaccaagcaaggaaggaaatccactagtgtagtccttattttgtagctctcaacaaactcctcatttacactaaagacctaggacct 363  Q
    ||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||   ||||||||| ||| |||||| ||| |||||| ||||||||| ||    
T  8749059 ctactctggggactaccaagctaggaaggaaatccactagtgtagtccgtattcaatagctctcagcaagctcctcgtttgcactaatgacctaggatct 8749158  T
Q  364 acccgtattgatttcaacctaggaattcctagatctgacatcccatctcact 415  Q
    ||||||| | | ||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||    
T  8749159 acccgtactaacttcaacctaggaactcctagatctgagatctcatctcact 8749210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 71; E-Value: 6e-32
Query Start/End: Original strand, 253 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 21094850 - 21094660
Alignment:
Q  253 gacaaacacacctactatgggggctaccaagcaaggaaggaaatccactagtgtagtccttattttgtagctctcaacaaactcctcatttaca-ctaaa 351  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||| |  || |||||  ||||  | | |||||| || ||    
T  21094850 gacaaacacacctactctgggg-ctaccaagtcaggaaggaaattcactagtgtagtccttattctaaagttctcagtaaac--cacgtttacaacttaa 21094754  T
Q  352 gacctaggacctacccgtattgat-ttcaacctaggaattcctagatctgacatcccatctcactatcctacagtcaatcacagcccctgtgat 444  Q
    |||||||||||||||||| | ||  ||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||    
T  21094753 gacctaggacctacccgtctagaacttcaacctaggaactcctagatctgagatcccgtctcactatcctacaattaatcacagcccctatgat 21094660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 261 - 449
Target Start/End: Original strand, 11656038 - 11656227
Alignment:
Q  261 cacctactatgggggctaccaagcaaggaaggaaatccactagtgtagtccttattttgtagctctcaacaaactcctcatttacactaaa-gacctagg 359  Q
    |||||||| ||| ||||||||||  ||||| ||||| ||||||||||||||||||     |||||||| |||||||||| ||||||||  | ||||||||    
T  11656038 cacctactctggaggctaccaagtcaggaaagaaattcactagtgtagtccttatccaaaagctctcagcaaactcctcgtttacactttatgacctagg 11656137  T
Q  360 acctacccgtattgatttcaacctaggaattcctagatctgacatcccatctcactatcctacagtcaatcacagcccctgtgatctatc 449  Q
    |||| ||||||| |  ||||||||||||| |||||||| |||  ||||||||||||||||||  | || |||||||| |||||| |||||    
T  11656138 acctgcccgtatagccttcaacctaggaactcctagatttgagttcccatctcactatcctatggccagtcacagccactgtgacctatc 11656227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 64; E-Value: 8e-28
Query Start/End: Original strand, 231 - 415
Target Start/End: Complemental strand, 11558489 - 11558311
Alignment:
Q  231 gagtttgttgacccaactcggtgacaaacacacctactatgggggctaccaagcaaggaaggaaatccactagtgtagtccttattttgtagctctcaac 330  Q
    ||||||||| ||| |  |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||    |||| ||| |    
T  11558489 gagtttgttaaccaagttcggtgacaa-cacacctactatggaggctaccaagccaggaaggaaatccactagtgtaatccgtattcaaaagctttcagc 11558391  T
Q  331 aaactcctcatttacactaaagacctaggacctacccgtattgatttcaacctaggaattcctagatctgacatcccatctcact 415  Q
    |||  || | ||| |||||| |||||||||||||||   | ||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||    
T  11558390 aaa--ccacgtttgcactaatgacctaggacctacc---actgatttcaacctaggaactcctagatttgagatcccatctcact 11558311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 64; E-Value: 8e-28
Query Start/End: Original strand, 231 - 415
Target Start/End: Complemental strand, 11567758 - 11567580
Alignment:
Q  231 gagtttgttgacccaactcggtgacaaacacacctactatgggggctaccaagcaaggaaggaaatccactagtgtagtccttattttgtagctctcaac 330  Q
    ||||||||| ||| |  |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||    |||| ||| |    
T  11567758 gagtttgttaaccaagttcggtgacaa-cacacctactatggaggctaccaagccaggaaggaaatccactagtgtaatccgtattcaaaagctttcagc 11567660  T
Q  331 aaactcctcatttacactaaagacctaggacctacccgtattgatttcaacctaggaattcctagatctgacatcccatctcact 415  Q
    |||  || | ||| |||||| |||||||||||||||   | ||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||    
T  11567659 aaa--ccacgtttgcactaatgacctaggacctacc---actgatttcaacctaggaactcctagatttgagatcccatctcact 11567580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 199 - 397
Target Start/End: Complemental strand, 12054650 - 12054454
Alignment:
Q  199 aaaataaatgacaggaaagtaaagaacacaatgagtttgttgacccaactcggtgacaaacacacctactatgggggctaccaagcaaggaaggaaatcc 298  Q
    |||||||| |||| |||||||||   |||| ||||||| || |||||  |||||| |||   |||||||| | |||| ||||||||  ||| |||||||     
T  12054650 aaaataaaagacaagaaagtaaatggcacagtgagtttcttaacccagttcggtg-caatgtcacctactctaggggataccaagctcgga-ggaaatct 12054553  T
Q  299 actagtgtagtccttattttgtagctctcaacaaactcctcatttacactaaagacctaggacctacccgtattgatttcaacctaggaattcctagat 397  Q
    || ||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| || |||| |||||||||| || ||||||||    
T  12054552 acaagtgtagtccttattctctagctctcagcaaactcctcgtttacactaaagaccttggacctacctgtcttgacttcaacctagaaactcctagat 12054454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 299 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 21254097 - 21253951
Alignment:
Q  299 actagtgtagtccttattttgtagctctcaacaaactcctcatttaca-ctaaagacctaggacctacccgtattgatttcaacctaggaattcctagat 397  Q
    |||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||| || | || ||||||||||||| |  |||||    
T  21254097 actagtgtagtccttattctatagttctcaacaaactcctcgttcacaactaaagacctaggacctacctgtctagacttcaacctaggaacttttagat 21253998  T
Q  398 ctgacatcccatctcactatcctacagtcaatcacagcccctgtgat 444  Q
    |||| ||| ||||| ||||||||| |||||| |||| | ||||||||    
T  21253997 ctgagatctcatctaactatcctatagtcaaccacaacacctgtgat 21253951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 248 - 415
Target Start/End: Complemental strand, 3552368 - 3552202
Alignment:
Q  248 tcggtgacaaacacacctactatgggggctaccaagcaaggaaggaaatccactagtgtagtccttattttgtagctctcaacaaactcctcatttac-a 346  Q
    |||||||||||| |||||||| | ||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||| |  || ||| |||||||||||| ||||| |    
T  3552368 tcggtgacaaacgcacctactcttggggctaccaagccaggaagaaaatccagtagtgtagtccttattct-aagttctaaacaaactcctcgtttacaa 3552270  T
Q  347 ctaaagacctaggacctacccgtattgatttcaacctaggaattcctagatctgacatcccatctcact 415  Q
    ||  ||||||| ||||||| ||| |||| |||||| |||||| |||| ||||||| || ||||||||||    
T  3552269 ctctagacctaagacctactcgtcttgacttcaacttaggaactccttgatctgagat-ccatctcact 3552202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 253 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 980514 - 980325
Alignment:
Q  253 gacaaacacacctactatgggggctaccaagcaaggaaggaaatccactagtgtagtccttattttgtagctctcaacaaactcctcatttac-actaaa 351  Q
    |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |  || | |||  |||  || | ||||| ||| ||    
T  980514 gacaaacacacctattttgggggctaccaagcaaggaaggaaatccactagtgtagtccttatactaaagttttcagtaaa--ccacgtttacaacttaa 980417  T
Q  352 gacctaggacctacccgtattgatttcaacctaggaattcctagatctgacatcccatctcactatcctacagtcaatcacagcccctgtgat 444  Q
    ||| ||| ||||||| || | || ||||||||| ||| |||||||||| | ||| |||||||| |||||||| ||||||||| ||||| ||||    
T  980416 gacatagaacctacctgtctagacttcaaccta-gaactcctagatctaagatctcatctcacgatcctacaatcaatcacaacccctttgat 980325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 54; E-Value: 8e-22
Query Start/End: Original strand, 330 - 449
Target Start/End: Complemental strand, 18483444 - 18483323
Alignment:
Q  330 caaactcctcatttacactaaa-gacctaggacctacccgtattgatttcaacctaggaattcctagatctgacatcccatctcactatcct-acagtca 427  Q
    |||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||| || |||||||||||||  ||| ||||||| |||||||||||||||||| |  ||||    
T  18483444 caaactcctcgtttacactatatgacctaggacctacccgtatagacttcaacctaggaacacctggatctgagatcccatctcactatcctgatggtca 18483345  T
Q  428 atcacagcccctgtgatctatc 449  Q
     ||||| ||||||||| |||||    
T  18483344 gtcacaacccctgtgacctatc 18483323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 233 - 415
Target Start/End: Complemental strand, 14406799 - 14406616
Alignment:
Q  233 gtttgttgacccaactcggtgacaaacacacctactatgggggctaccaagcaaggaaggaaatccactagtgtagtccttattttgtagctctcaacaa 332  Q
    ||||||| |||||  ||||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||| || || |  || | ||| |||    
T  14406799 gtttgttaacccagttcggtgacaaacacacctactttgtgggctaccaagccaggaaggaaatccaccaatgtagtctttgttataaagttttcatcaa 14406700  T
Q  333 actcctcatttac-actaaagacctaggacctacccgtattgatttcaacctaggaattcctagatctgacatcccatctcact 415  Q
    | |||  |||||| ||  |  | |||| ||||||||||| |||  |||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  14406699 attccaaatttacaacgtacaatctagaacctacccgtactgacctcaacctaagaactcctagatctgagatcccatctcact 14406616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 170 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 17140539 - 17140434
Alignment:
Q  170 atcacgcgataagcagaaataaaaacaagaaaa-taaatgacaggaaagtaaagaacacaatgagtttgttgacccaactcggtgacaaacacacctact 268  Q
    |||| ||||||| || |||| |||||||||||| |||| | ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||| | ||||| ||||||||    
T  17140539 atcatgcgataaacataaatcaaaacaagaaaaataaaagccaggaaagtaaagaacataatgaatttgttgacccaattcggcgtcaaactcacctact 17140440  T
Q  269 atgggg 274  Q
    ||||||    
T  17140439 atgggg 17140434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 351 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 215397 - 215305
Alignment:
Q  351 agacctaggacctacccgtattgatttcaacctaggaattcctagatctgacatcccatctcactatcctacagtcaatcacagcccctgtgat 444  Q
    |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||| ||| ||| ||||||||| |||  || ||||||||||||||||||||    
T  215397 agacctagaacctacccgtattgacttcaacctaggaacttctagatatgagatctcatctcact-tccctcaatcaatcacagcccctgtgat 215305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 379 - 449
Target Start/End: Complemental strand, 13515619 - 13515548
Alignment:
Q  379 aacctaggaattcctagatctgacatcccatctcactatcct-acagtcaatcacagcccctgtgatctatc 449  Q
    |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| |  |||| ||||| ||||||||| |||||    
T  13515619 aacctaggaactcctagatctgagatcccatctcactatcctaatggtcagtcacaacccctgtgacctatc 13515548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 355 - 415
Target Start/End: Complemental strand, 13100770 - 13100710
Alignment:
Q  355 ctaggacctacccgtattgatttcaacctaggaattcctagatctgacatcccatctcact 415  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||| ||||||| | |||||||||| |||| ||||||||    
T  13100770 ctaggacctacccgtcttgacttcaatctaggaacttctagatctgagatcctatctcact 13100710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 250 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 3445157 - 3444965
Alignment:
Q  250 ggtgacaaacacacctactatgggggctaccaagcaaggaaggaaatccactagtgtagtccttattttgtagctctcaacaaactcctcatttac-act 348  Q
    ||||| ||||||||||||| || || ||| ||||  |||||||||||||||||||||||| |||| ||   || |||||||||||| |   ||||| |||    
T  3445157 ggtgataaacacacctactctgagg-ctatcaagtcaggaaggaaatccactagtgtagt-cttagttctaagttctcaacaaactgcaagtttacaact 3445060  T
Q  349 aaagacctaggacctacccgtattgatttcaacctaggaattcctagatctgacatcccatctcactatcctacagtcaatcacagcccctgtgat 444  Q
     |  ||||||   |||||| |||||| ||||||||||||  | |||||||||| || |||||||||| |||  ||  |||||||||||||| ||||    
T  3445059 tatcacctagacactacccatattgacttcaacctaggagctactagatctgagat-ccatctcactttccctcaaccaatcacagcccctatgat 3444965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 215; Significance: 1e-118; HSPs: 29)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 93 - 418
Target Start/End: Original strand, 23758474 - 23758800
Alignment:
Q  93 tgaaattctagcacacttgttttaatatgttatgtatgatgttttgacgtttgcaatgttatgattaatgtttcgacatcacgcgataagcagaaataaa 192  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||    ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  23758474 tgaaattctagcacacttgttttaattagttttgtatgatgtttcagtgtttgcaatgttacgattaatgtttcaacatcacgcgataaacagaaataaa 23758573  T
Q  193 aacaagaaaataaatgacaggaaagtaaagaacacaatgagtttgttgacccaactcggtgacaaacacacctactatgggggctaccaagcaaggaagg 292  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  23758574 aacaagaaaataaaagacaggaaagtaaagaacacaatgagtttgttgacccagttcggtgacaaacacaactactctgggggctaccaagccaggaagg 23758673  T
Q  293 aaatccactagtgtagtccttattttgtagctctcaacaaactcctcatttacacta-aagacctaggacctacccgtattgatttcaacctaggaattc 391  Q
    ||||||||||||||||||||||||   ||| |||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||    
T  23758674 aaatccactagtgtagtccttattcaatagttctcaacaaactcctcgtttacactatatgacctaggacctacccgtatagacttcaacctaggaactc 23758773  T
Q  392 ctagatctgacatcccatctcactatc 418  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||    
T  23758774 ctagatctgagatcccatctcactatc 23758800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 93 - 421
Target Start/End: Original strand, 22610741 - 22611070
Alignment:
Q  93 tgaaattctagcacacttgttttaatatgttatgtatgatgttttgacgtttgcaatgttatgattaatgtttcgacatcacgcgataagcagaaataaa 192  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||  |  ||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  22610741 tgaaattctagcgcacttattttaatatgttctgtatgatgttacggagtttgcaatattacgattaatgtttcaacatcacgcgataaacagaaataaa 22610840  T
Q  193 aacaagaaaataaatgacaggaaagtaaagaacacaatgagtttgttgacccaactcggtgacaaacacacctactatgggggctaccaagcaaggaagg 292  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |  ||||  |||||| ||||||||    
T  22610841 aacaagaaaataaaagacaggaaagtaaagaacacaatgagtttgttgacccagttcggtgacaaacacacctacaaaaggggaaaccaagaaaggaagg 22610940  T
Q  293 aaatccactagtgtagtccttattttgtagctctcaacaaactcctcatttacacta-aagacctaggacctacccgtattgatttcaacctaggaattc 391  Q
    ||||||||||||||||||||||||   ||||||||| |||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||    
T  22610941 aaatccactagtgtagtccttattcaatagctctcagcaaactcctcgtttacactatatgacctaggacctacccgtatagacttcaacctaggaactc 22611040  T
Q  392 ctagatctgacatcccatctcactatccta 421  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  22611041 ctagatctgagatcccatctcactatccta 22611070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 90 - 421
Target Start/End: Complemental strand, 24790472 - 24790140
Alignment:
Q  90 ttttgaaattctagcacacttgttttaatatgttatgtatgatgttttgacgtttgcaatgttatgattaatgtttcgacatcacgcgataagcagaaat 189  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||| ||||||  |  ||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||  |||||||    
T  24790472 ttttgaaattctagcccacttattttaatatgttttgtacgatgttacggagtttgtaatgttacgattaatgtttcaacatcacgcgatagacagaaat 24790373  T
Q  190 aaaaacaagaaaataaatgacaggaaagtaaagaacacaatgagtttgttgacccaactcggtgacaaacacacctactatgggggctaccaagcaagga 289  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||    
T  24790372 aaaaacaagaaaataaaagacaggaaagtaaagaacacaatgagtttgttgacccagttcggtgacaaacacacctactctgggggctaccaagtcagga 24790273  T
Q  290 aggaaatccactagtgtagtccttattttgtagctctcaacaaactcctcatttacacta-aagacctaggacctacccgtattgatttcaacctaggaa 388  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||   || |||||| |||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||| || |||||||||||||    
T  24790272 aggaaatccactagagtagtccttattcaatatctctcagcaaactcctcgtttacactatatgacctaggacctacccgtatagacttcaacctaggaa 24790173  T
Q  389 ttcctagatctgacatcccatctcactatccta 421  Q
     |||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  24790172 ctcctagatctgagatcccatatcactatccta 24790140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 93 - 421
Target Start/End: Original strand, 12910338 - 12910667
Alignment:
Q  93 tgaaattctagcacacttgttttaatatgttatgtatgatgttttgacgtttgcaatgttatgattaatgtttcgacatcacgcgataagcagaaataaa 192  Q
    ||||||| |||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||   |||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  12910338 tgaaattttagcgcacttgttttaatacgttctgtatgatgtttcagcgtttgcaatgttacgattaaagtttcaacatcacgcgataaacagaaataaa 12910437  T
Q  193 aacaagaaaataaatgacaggaaagtaaagaacacaatgagtttgttgacccaactcggtgacaaacacacctactatgggggctaccaagcaaggaagg 292  Q
    |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  12910438 aacaagaaaataaatgacagaaaattaaagaacacagtgagtttgttgacccagttcggtgacaaacatacctactctgggggctaccaagccaggaagg 12910537  T
Q  293 aaatccactagtgtagtccttattttgtagctctcaacaaactcctcatttacacta-aagacctaggacctacccgtattgatttcaacctaggaattc 391  Q
    |||||||| |||||||||||||||   ||||| ||| ||||||| || ||||||||| | | |||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||    
T  12910538 aaatccacaagtgtagtccttattcaatagctttcagcaaactcgtcgtttacactatatggcctaggacctacccgtatagacttcaacctaggaactc 12910637  T
Q  392 ctagatctgacatcccatctcactatccta 421  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  12910638 ctagatctgagatcccatctcactatccta 12910667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 178; E-Value: 8e-96
Query Start/End: Original strand, 90 - 449
Target Start/End: Complemental strand, 36399110 - 36398748
Alignment:
Q  90 ttttgaaattctagcacacttgttttaatatgttat--gtatgatgttttga-cgtttgcaatgttatgattaatgtttcgacatcac-gcgataagcag 185  Q
    |||||||||||| ||  ||||||||||| |||||||  |||||||||||| | | ||||| |||||  |||||||||||| ||||||  ||| ||| |||    
T  36399110 ttttgaaattctggcgtacttgttttaa-atgttatatgtatgatgtttttaacatttgcgatgtttcgattaatgtttcaacatcatagcg-taaacag 36399013  T
Q  186 aaataaaaacaagaaaataaatgacaggaaagtaaagaacacaatgagtttgttgacccaactcggtgacaaacacacctactatgggggctaccaagca 285  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||     
T  36399012 aaataaaaacaagaaaataaacgacaggaaagtaaagaacgcaatgagtttgttgacccagttcggtgacaaacacacctactctgggggctaccaagcc 36398913  T
Q  286 aggaaggaaatccactagtgtagtccttattttgtagctctcaacaaactcctcatttacac-taaagacctaggacctacccgtattgatttcaaccta 384  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    |||||||| |||||||||| ||||||| | | |||||||||||||||||| | || |||||||||    
T  36398912 aggaaggaaatccactagtgtagtccttattcaaaagctctcagcaaactcctcgtttacactttatgacctaggacctacccgtctagacttcaaccta 36398813  T
Q  385 ggaattcctagatctgacatcccatctcactatcctacagtcaatcacagcccctgtgatctatc 449  Q
    |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||| |||||    
T  36398812 ggaactcctagatctgagatcccatctcactatcctatggtcagtcacagcccctgtgacctatc 36398748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 230 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 19466696 - 19466482
Alignment:
Q  230 tgagtttgttgacccaactcggtgacaaacacacctactatgggggctaccaagcaaggaaggaaatccactagtgtagtccttattttgtagctctcaa 329  Q
    ||||||| || |||||  ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||     
T  19466696 tgagtttcttaacccagttcggtgataaacacacctactctgggggctaccaagccaggaaggaaatccactagtgtagtccttattctatagctctcag 19466597  T
Q  330 caaactcctcatttacactaaagacctaggacctacccgtattgatttcaacctaggaattcctagatctgacatcccatctcactatcctacagtcaat 429  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||     
T  19466596 aaaactcctcatttacactaaagacctaggacctacccgtattaatttcaacctaggaactcctagatctgagatccaatctcactatcctacagtcaac 19466497  T
Q  430 cacagcccctgtgat 444  Q
    |||| ||||||||||    
T  19466496 cacaacccctgtgat 19466482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 123; E-Value: 5e-63
Query Start/End: Original strand, 191 - 444
Target Start/End: Original strand, 21530331 - 21530584
Alignment:
Q  191 aaaacaagaaaa-taaatgacaggaaagtaaagaacacaatgagtttgttgacccaactcggtgacaaacacacctactatgggggctaccaagcaagga 289  Q
    |||||||||||| ||||||||| |||||||||   ||||| ||||||||| | |||  |||||||||||||  |||||| | ||||||||||||| | ||    
T  21530331 aaaacaagaaaaataaatgacaagaaagtaaatggcacaacgagtttgtttatccagttcggtgacaaacatgcctactctaggggctaccaagccaaga 21530430  T
Q  290 aggaaatccactagtgtagtccttattttgtagctctcaacaaactcctcatttacactaaagacctaggacctacccgtattgatttcaacctaggaat 389  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| | ||||||||| |||| ||||| ||||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||     
T  21530431 aggaaatccactagtgtagttcttattctatagctctcagcaaattcctcgtttacgctaaagacctaggaccta-ccatattgatttcaacttaggaac 21530529  T
Q  390 tcctagatctgacatcccatctcactatcctacagtcaatcacagcccctgtgat 444  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  21530530 tcctaaatctgagatcccatctcactatcctacaatcaatcacaacccctgtgat 21530584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 194 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 21250407 - 21250157
Alignment:
Q  194 acaagaaaataaatgacaggaaagtaaagaacacaatgagtttgttgacccaact-cggtgacaaacacacctactatgggggctaccaagcaaggaagg 292  Q
    ||||| |||||||||||| |||||||||   |||| ||||||||||||||| | | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  21250407 acaagtaaataaatgacaagaaagtaaaaggcacagtgagtttgttgaccccagttcggtgacaaacacacctactctgggggctaccaagctaggaagg 21250308  T
Q  293 aaatccactagtgtagtccttattttgtagctctcaacaaactcctcatttac-actaaagacctaggacctacccgtattgatttcaacctaggaattc 391  Q
    ||||||  |||||||||| |||||||  || |||||  |||  || | ||||| ||| |||||||||||||||||||| | || ||||||||||||  ||    
T  21250307 aaatccgttagtgtagtcgttattttaaagttctcagtaaa--ccacgtttacaacttaagacctaggacctacccgtctagacttcaacctaggatctc 21250210  T
Q  392 ctagatctgacatcccatctcactatcctacagtcaatcacagcccctgtgat 444  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  21250209 ctagatctgagatctcatctcactatcctacaatcaatcacagcccctgtgat 21250157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 270 - 449
Target Start/End: Complemental strand, 26860430 - 26860249
Alignment:
Q  270 tgggggctaccaagcaaggaaggaaatccactagtgtagtccttattttgtagctctcaacaaactcctcatttacacta-aagacctaggacctacccg 368  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||| |||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||    
T  26860430 tgggggctaccaagccaggaaggaaatccactagtgtagtccttattcaatagctctcagcaaactcctcgtttacactatatgacctaggacctacccg 26860331  T
Q  369 tattgatttcaacctaggaattcctagatctgacatcccatctcactatcct-acagtcaatcacagcccctgtgatctatc 449  Q
    ||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||| |  |||| |||||||| |||||| |||||    
T  26860330 tatagatttcaacctaggaactcctagatctgagatctcatctcactatcctaatggtcagtcacagccactgtgacctatc 26860249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 272 - 444
Target Start/End: Original strand, 29566039 - 29566211
Alignment:
Q  272 ggggctaccaagcaaggaaggaaatccactagtgtagtccttattttgtagctctcaacaaactcctcatttacactaaagacctaggacctacccgtat 371  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||| |||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||||     
T  29566039 ggggctaccaagccaggaaggaaatccactagtgtagtccttattcaatagctctcagcaaactcctcgtttgcactaatgacctaggacctacccgtac 29566138  T
Q  372 tgatttcaacctaggaattcctagatctgacatcccatctcactatcctacagtcaatcacagcccctgtgat 444  Q
    ||| |||||||||| || |||||||||||| |||||||||||||  | ||||    |||||||||||||||||    
T  29566139 tgacttcaacctagaaactcctagatctgagatcccatctcactcccttacaaatgatcacagcccctgtgat 29566211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 233 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 24317981 - 24317770
Alignment:
Q  233 gtttgttgacccaactcggtgacaaacacacctac-tatgggggctaccaagcaaggaaggaaatccactagtgtagtccttattttgtagctctcaaca 331  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||||||||||| | |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |  || ||||| ||    
T  24317981 gtttgttaacccaattcggtgacaaacacacctacatctgggggttaccaagccaggaaggaaatccactagtgtagtccttattct-aagttctcagca 24317883  T
Q  332 aactcctcattta-cactaaagacctaggacctacccgtattgatttcaacctaggaattcctagatctgacatcccatctcactatcctacagtcaatc 430  Q
    |||||||  ||||  |||  ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||  ||| ||||||||| |||  || ||||||    
T  24317882 aactcctggtttataactctagacctaggacctacccatattgacttcaacctaggaagtcctagatctgtgatcgcatctcact-tccctcaatcaatc 24317784  T
Q  431 acagcccctgtgat 444  Q
    ||| ||| ||||||    
T  24317783 acaacccttgtgat 24317770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 81; E-Value: 6e-38
Query Start/End: Original strand, 248 - 453
Target Start/End: Complemental strand, 24317346 - 24317141
Alignment:
Q  248 tcggtgacaaacacacctac-tatggggg-ctaccaagcaaggaaggaaatccactagtgtagtccttattttgtagctctcaacaaactcctcatttac 345  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||| ||||||||  |  |||||||||||||||||||||||||||| |  || |||||||||||||||| |||||    
T  24317346 tcggtgacaaacacacctacatctggggggctaccaagttataaaggaaatccactagtgtagtccttattcta-agttctcaacaaactcctcgtttac 24317248  T
Q  346 a-ctaaagacctaggacctacccgtattgatttcaacctaggaattcctagatctgacatcccatctcactatcctacagtcaatcacagcccctgtgat 444  Q
    | ||  |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||| ||| |||  || ||||||| ||||||||||||    
T  24317247 aactctagacctaggacctacccgtattgacttcaaactaggaactcctagatctgagatcccatctaact-tccctcaatcaatcatagcccctgtgat 24317149  T
Q  445 ctatctgat 453  Q
     ||||||||    
T  24317148 -tatctgat 24317141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 261 - 415
Target Start/End: Complemental strand, 13315109 - 13314954
Alignment:
Q  261 cacctactatggggg-ctaccaagcaaggaaggaaatccactagtgtagtccttattttgtagctctcaacaaactcctcatttacactaaagacctagg 359  Q
    ||||||||||||||| |||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||    |||||||| |||||||||| ||| |||||| ||||||||    
T  13315109 cacctactatggggggctactaagccaggaagaaaatccactagtgtagtccttattcaagagctctcagcaaactcctcgtttgcactaatgacctagg 13315010  T
Q  360 acctacccgtattgatttcaacctaggaattcctagatctgacatcccatctcact 415  Q
    ||||||||||| ||| ||||| | ||||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  13315009 acctacccgtactgacttcaatcaaggaactcctagatctgagatcccatctcact 13314954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 261 - 413
Target Start/End: Original strand, 18765692 - 18765845
Alignment:
Q  261 cacctactatgggggctaccaagcaaggaaggaaatccactagtgtagtccttattttgtagctctcaacaaactcctcatttacacta-aagacctagg 359  Q
    |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||  ||||||||| ||| ||||| | ||||||||    
T  18765692 cacctactctgggggctaccaagccaggaaggaaatccactagtgtagtccttattcaatagctctcagtaaactcctcgtttgcactatatgacctagg 18765791  T
Q  360 acctacccgtattgatttcaacctaggaattcctagatctgacatcccatctca 413  Q
    || |||||||| | | ||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||    
T  18765792 acttacccgtactaacttcaacctaggaactcgtagatctgagatcccatctca 18765845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 233 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 20475446 - 20475235
Alignment:
Q  233 gtttgttgacccaactcggtgacaaacacacctactatgggggctaccaagcaaggaaggaaatccactagtgtagtccttattttgtagctctcaacaa 332  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||||  ||| || ||||||| ||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||  || | ||| ||||| |||    
T  20475446 gtttgttaacccaattcggtgacaaacatgcctgctttgggggcaaccaagccaggaaagaaattcactagtgtagtcctagttct-tagttctcagcaa 20475348  T
Q  333 actcctcatttaca-ctaaagacctaggacctacccgtattgatttcaacctaggaattcctagatctgacatcccatctcactatcctacagtcaatca 431  Q
    |||||   |||||| || |  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||| |||  || |||||||    
T  20475347 actccaagtttacaacttatcacctaggacctacccgtattgacttcaacctaggagctcctagatctgagatcccatctcactttccctcaatcaatca 20475248  T
Q  432 cagcccctgtgat 444  Q
    || ||||| ||||    
T  20475247 caacccctatgat 20475235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 235 - 415
Target Start/End: Original strand, 27111071 - 27111250
Alignment:
Q  235 ttgttgacccaactcggtgacaaacacacctactatgggggctaccaagcaaggaaggaaatccactagtgtagtccttattttgtagctctcaacaaac 334  Q
    ||||| |||||  ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| |  || ||||| |||||    
T  27111071 ttgttaacccagatcggtgacaaacacacctactctgggg-ctaccaagccaggaaggaagtccactagtgtagtccttattct-aagttctcagcaaac 27111168  T
Q  335 tcctcatttac-actaaagacctaggacctacccgtattgatttcaacctaggaattcctagatctgacatcccatctcact 415  Q
    | |   ||||| ||| |||| |||||||||||||||| | | ||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||    
T  27111169 ttcaagtttacaacttaagaactaggacctacccgtacttacttcaacctaggaactcctagatctgagatctcatctcact 27111250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 235 - 444
Target Start/End: Original strand, 31587467 - 31587674
Alignment:
Q  235 ttgttgacccaactcggtgacaaacacacctactatgggggctaccaagcaaggaaggaaatccactagtgtagtccttattttgtagctctcaacaaac 334  Q
    ||||| |||||  ||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |  || ||||| |||||    
T  31587467 ttgttaacccagttcggtgacaaacacacctactctggag-ctaccaagccaggaaggaaatccactagtgtagtccttattct-aagttctcagcaaac 31587564  T
Q  335 tcctcatttac-actaaagacctaggacctacccgtattgatttcaacctaggaattcctagatctgacatcccatctcactatcctacagtcaatcaca 433  Q
    |||   ||||| |||  |||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||| |||||||||| | ||| |||| |||| |||  || |||||||||    
T  31587565 tccaagtttacaactctagacctaggacctacatgtattgacttcaacctaggaactcctagatcttagatctcatcccact-tccctcaatcaatcaca 31587663  T
Q  434 gcccctgtgat 444  Q
     | ||||||||    
T  31587664 actcctgtgat 31587674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 195 - 316
Target Start/End: Original strand, 22582363 - 22582485
Alignment:
Q  195 caagaaaataaatgacaggaaagtaaagaa-cacaatgagtttgttgacccaactcggtgacaaacacacctactatgggggctaccaagcaaggaagga 293  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| || ||||  |||||||||||| ||  ||| ||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||| |    
T  22582363 caagaaaataaatgacaagaaagtaaaaaaacacagagagtttgttgactcagttcgatgacaaacacacctactacaggagctaccaagcaaggaagaa 22582462  T
Q  294 aatccactagtgtagtccttatt 316  Q
    ||| |||||||||||||||||||    
T  22582463 aatacactagtgtagtccttatt 22582485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 59; E-Value: 8e-25
Query Start/End: Original strand, 250 - 415
Target Start/End: Original strand, 25347199 - 25347364
Alignment:
Q  250 ggtgacaaacacacctactatgggggctaccaagcaaggaaggaaatccactagtgtagtccttattttgtagctctcaacaaactcctcatttac-act 348  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||||||| |  || ||| | ||||||||   ||||| |||    
T  25347199 ggtgacaaacacacctactctgggggctaccaagccagaaaggaaacccactagtgtagtccttattct-aagttcttagcaaactccaagtttacaact 25347297  T
Q  349 aaagacctaggacctacccgtattgatttcaacctaggaattcctagatctgacatcccatctcact 415  Q
     |||| |||||||||||||||| | | ||||||||| ||| |||| ||||| | |||||| ||||||    
T  25347298 taagaactaggacctacccgtactaacttcaacctatgaactcctcgatctaagatcccagctcact 25347364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 260 - 415
Target Start/End: Complemental strand, 20476720 - 20476565
Alignment:
Q  260 acacctactatgggggctaccaagcaaggaaggaaatccactagtgtagtccttattttgtagctctcaacaaactcctcatttaca-ctaaagacctag 358  Q
    |||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||  || | ||| ||||| ||||||||   |||||| || |  ||||||    
T  20476720 acacgtactttgggggctaccaagctaggaaggaaattcactggtgtagtcctagttct-tagttctcagcaaactccaagtttacaacttatcacctag 20476622  T
Q  359 gacctacccgtattgatttcaacctaggaattcctagatctgacatcccatctcact 415  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| || || ||||||||| |||||||||||||    
T  20476621 gacctacccgtattgacttcaacctagaaactcttagatctgagatcccatctcact 20476565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 234 - 312
Target Start/End: Original strand, 12952462 - 12952540
Alignment:
Q  234 tttgttgacccaactcggtgacaaacacacctactatgggggctaccaagcaaggaaggaaatccactagtgtagtcct 312  Q
    |||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  12952462 tttgttaacccagttcggtgacaaacacacctactatggaggctaccaagtcaggaaggaaatccactagtgtagtcct 12952540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 54; E-Value: 8e-22
Query Start/End: Original strand, 233 - 413
Target Start/End: Complemental strand, 20649727 - 20649547
Alignment:
Q  233 gtttgttgacccaactcggtgacaaacacacctactatgggggctaccaagcaaggaaggaaatccactagtgtagtccttattttgtagctctcaacaa 332  Q
    ||||||| |||||  |||| |||||||||||||||| | |||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||| || |  || ||| | |||    
T  20649727 gtttgttaacccagttcggggacaaacacacctactctaggggctacaaagtcaggaaggaaatccactagtgtagtccttgttct-aagttcttagcaa 20649629  T
Q  333 actcctcatttac-actaaagacctaggacctacccgtattgatttcaacctaggaattcctagatctgacatcccatctca 413  Q
    |||||   ||||| ||| |  |||||||||||||||||| ||  ||||||||||||| |||||||| ||| ||| |||||||    
T  20649628 actccaagtttacaacttatcacctaggacctacccgtactggcttcaacctaggaactcctagatttgagatctcatctca 20649547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 250 - 415
Target Start/End: Complemental strand, 19198431 - 19198267
Alignment:
Q  250 ggtgacaaacacacctactatgggggctaccaagcaaggaaggaaatccactagtgtagtccttattttgtagctctcaacaaactcctcatt-tacact 348  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| || |  || ||||| ||||||||   ||  | |||    
T  19198431 ggtgacaaacacacctactctgggg-ctatcaagccaggaaggaaatccactagtgtagtccttgttct-aagttctcagcaaactccgagttccaaact 19198334  T
Q  349 aaagacctaggacctacccgtattgatttcaacctaggaattcctagatctgacatcccatctcact 415  Q
     |  ||||| |||||||||||  ||| |||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||    
T  19198333 tataacctaagacctacccgttctgacttcaacctaggaacgcctagatctgagatcccatctcact 19198267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 262 - 348
Target Start/End: Original strand, 15328326 - 15328412
Alignment:
Q  262 acctactatgggggctaccaagcaaggaaggaaatccactagtgtagtccttattttgtagctctcaacaaactcctcatttacact 348  Q
    ||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||    |||||| | |||||||||||||||||||    
T  15328326 acctactctgggggctaccaagccaagaaggaaatccattagtgtagtccttattcaaaagctctaagcaaactcctcatttacact 15328412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 290 - 415
Target Start/End: Original strand, 27107556 - 27107681
Alignment:
Q  290 aggaaatccactagtgtagtccttattttgtagctctcaacaaactcctcatttaca-ctaaagacctaggacctacccgtattgatttcaacctaggaa 388  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| |  || ||||| ||||||||   |||||| || ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  27107556 aggaaatccactattgtagtccttattcta-agttctcagcaaactccaagtttacaacttaagacctaggacctacccgtactgacttcaacctaggaa 27107654  T
Q  389 ttcctagatctgacatcccatctcact 415  Q
     |||||||| ||| ||| | |||||||    
T  27107655 ctcctagatttgagatctcgtctcact 27107681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 248 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 24283684 - 24283620
Alignment:
Q  248 tcggtgacaaacacacctactatgggggctaccaagcaaggaaggaaatccactagtgtagtcct 312  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||    
T  24283684 tcggtgacaaacacacctattctgggggctaccaagtcaggaaggaaatctactagtgtagtcct 24283620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 248 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 23801962 - 23801865
Alignment:
Q  248 tcggtgacaaacacacctactatgggggctaccaagcaaggaaggaaatccactagtgtagtccttattttgtagctctcaacaaactcctcatttaca 346  Q
    ||||||| |||||||| ||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||| |  || ||||| |||||||||| ||||||    
T  23801962 tcggtgagaaacacacatacttggggggctaccaagcaaggaatgaaatccactaaagtagtccttattct-aagttctcaccaaactcctcgtttaca 23801865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 405 - 449
Target Start/End: Original strand, 15328480 - 15328524
Alignment:
Q  405 cccatctcactatcctacagtcaatcacagcccctgtgatctatc 449  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  15328480 cccatctcactatcctatagtcaatcacaacccctgtgatctatc 15328524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 362 - 415
Target Start/End: Original strand, 12952590 - 12952643
Alignment:
Q  362 ctacccgtattgatttcaacctaggaattcctagatctgacatcccatctcact 415  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||||  ||||||| |||| |||||||||||||    
T  12952590 ctacccgtactgacttcaacctaggagctcctagacctgagatcccatctcact 12952643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0226 (Bit Score: 212; Significance: 1e-116; HSPs: 3)
Name: scaffold0226
Description:

Target: scaffold0226; HSP #1
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 94 - 449
Target Start/End: Complemental strand, 7849 - 7494
Alignment:
Q  94 gaaattctagcacacttgttttaatatgttatgtatgatgttttgacgtttgcaatgttatgattaatgtttcgacatcacgcgataagcagaaataaaa 193  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||| ||| ||||||||||||| ||| | |||||| | | |||||| ||||| |||||||||||    
T  7849 gaaattctagcgcacttgttttaatatgttctgtaagatgatttaacgtttgcaatgtcatgttcaatgttccaatatcacgagataaacagaaataaaa 7750  T
Q  194 acaagaaaataaatgacaggaaagtaaagaacacaatgagtttgttgacccaactcggtgacaaacacacctactatgggggctaccaagcaaggaagga 293  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||| |  |||||||||||||||| |||| | ||||||||||||| ||||||||    
T  7749 acaagaaaataaattacaagaaagtaaagaacacagtgagtttgttgacctagttcggtgacaaacacacttactctaggggctaccaagccaggaagga 7650  T
Q  294 aatccactagtgtagtccttattttgtagctctcaacaaactcctcatttacactaaagacctaggacctacccgtattgatttcaacctaggaattcct 393  Q
    ||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||| ||||    
T  7649 aattcactagtgtagtccttattctatagctctcaacaaactcctcatttacactaaagacctaggacctacccatatagacttcaacctaggaactcct 7550  T
Q  394 agatctgacatcccatctcactatcctacagtcaatcacagcccctgtgatctatc 449  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||  |||| ||||| ||||||||| |||||    
T  7549 agatctgagatcccatctcactatcctatggtcagtcacaacccctgtgacctatc 7494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0226; HSP #2
Raw Score: 171; E-Value: 1e-91
Query Start/End: Original strand, 93 - 449
Target Start/End: Complemental strand, 18435 - 18081
Alignment:
Q  93 tgaaattctagcacacttgttttaatatgttatgtatgatgttttgacgtttgcaatgttatgattaatgtttcgacatcacgcgataagcagaaataaa 192  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||   | | || ||| | ||||||||  |||| || |||||||    
T  18435 tgaaattctagcgcacttgttttaatatgttctgtaagatgttttaacgtttgcaatgtcccgttcaacgttccaacatcacg--ataaacaaaaataaa 18338  T
Q  193 aacaagaaaataaatgacaggaaagtaaagaacacaatgagtttgttgacccaactcggtgacaaacacacctactat-gggggctaccaagcaaggaag 291  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||| | |||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||| | ||||    
T  18337 aacaagaaaataaatgacaagaaagtaaagaacatagtgagtttgttgacctagttcggtgacaaacacacctactctggggggctacgaagccaagaag 18238  T
Q  292 gaaatccactagtgtagtccttattttgtagctctcaacaaactcctcatttacactaaagacctaggacctacccgtattgatttcaacctaggaattc 391  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||    
T  18237 gaaatccactagtgtagtccttattctatagctctcagcaaactcctcgattacactaaaga-ctaggacctacccgtatagacttcaacctaggaactc 18139  T
Q  392 ctagatctgacatcccatctcactatcctacagtcaatcacagcccctgtgatctatc 449  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||| ||  |||| ||||| ||||||||| |||||    
T  18138 ctagatctgagatcccatcacactatcttatggtcagtcacaacccctgtgacctatc 18081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0226; HSP #3
Raw Score: 171; E-Value: 1e-91
Query Start/End: Original strand, 93 - 449
Target Start/End: Complemental strand, 27829 - 27475
Alignment:
Q  93 tgaaattctagcacacttgttttaatatgttatgtatgatgttttgacgtttgcaatgttatgattaatgtttcgacatcacgcgataagcagaaataaa 192  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||   | | || ||| | ||||||||  |||| || |||||||    
T  27829 tgaaattctagcgcacttgttttaatatgttctgtaagatgttttaacgtttgcaatgtcccgttcaacgttccaacatcacg--ataaacaaaaataaa 27732  T
Q  193 aacaagaaaataaatgacaggaaagtaaagaacacaatgagtttgttgacccaactcggtgacaaacacacctactat-gggggctaccaagcaaggaag 291  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||| | |||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||| | ||||    
T  27731 aacaagaaaataaatgacaagaaagtaaagaacatagtgagtttgttgacctagttcggtgacaaacacacctactctggggggctacgaagccaagaag 27632  T
Q  292 gaaatccactagtgtagtccttattttgtagctctcaacaaactcctcatttacactaaagacctaggacctacccgtattgatttcaacctaggaattc 391  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||    
T  27631 gaaatccactagtgtagtccttattctatagctctcagcaaactcctcgattacactaaaga-ctaggacctacccgtatagacttcaacctaggaactc 27533  T
Q  392 ctagatctgacatcccatctcactatcctacagtcaatcacagcccctgtgatctatc 449  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||| ||  |||| ||||| ||||||||| |||||    
T  27532 ctagatctgagatcccatcacactatcttatggtcagtcacaacccctgtgacctatc 27475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 212; Significance: 1e-116; HSPs: 34)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 92 - 449
Target Start/End: Complemental strand, 22405073 - 22404714
Alignment:
Q  92 ttgaaattctagcacacttgttttaatatgttatgtatgatgttttgacgtttgcaatgttatgattaatgtttcgacatcacgcgataagcagaaataa 191  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||   | |||||||||||| |||||||||||| |||||| ||||||| |||||| ||    
T  22405073 ttgaaattctagcacacttgttttaataggttatgtatgatgtttcagcatttgcaatgttacgattaatgtttcaacatcatgcgataaacagaaacaa 22404974  T
Q  192 aaacaagaaaataaatgacaggaaagtaaagaacacaatgagtttgttgacccaactcggtgacaaacacacctactatgggggctaccaagcaaggaag 291  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| || | ||||||||||||| ||||||    
T  22404973 aaacaagaaaataaatgaaaggaaagtaaataacacaatgagtttgttgacccagttcggtgacaaacacacctgctctaggggctaccaagccaggaag 22404874  T
Q  292 gaaatccactagtgtagtccttattttgtagctctcaacaaactcctcatttacacta-aagacctaggacctacccgtattgatttcaacctaggaatt 390  Q
    ||||||||||||| |||||||||||   ||||||||| |||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||| || ||||||||||||| |    
T  22404873 gaaatccactagtatagtccttattcaatagctctcagcaaactcctcgtttacactatatgacctaggacctacccgtatagacttcaacctaggaact 22404774  T
Q  391 cctagatctgacatcccatctcactatcct-acagtcaatcacagcccctgtgatctatc 449  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||| |  |||| ||||||||||||||| |||||    
T  22404773 cctagatctgagatcccatctcactatcctaatggtcagtcacagcccctgtgacctatc 22404714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 131 - 449
Target Start/End: Complemental strand, 23420834 - 23420514
Alignment:
Q  131 atgttttgacgtttgcaatgttatgattaatgtttcgacatcacgcgataagcagaaataaaaacaagaaaataaatgacaggaaagtaaagaacacaat 230  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  23420834 atgttttgacgtttacaatgttacgattaatgtttcatcatcacacgataagcagaaataaaaacaagaaaataaatgacaggaaagtaaggagcacaat 23420735  T
Q  231 gagtttgttgacccaactcggtgacaaacacacctactatgggggctaccaagcaaggaaggaaatccactagtgtagtccttattttgtagctctcaac 330  Q
    ||||||| |||||||  ||||||||||| ||||||||| |  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||| |    
T  23420734 gagtttgctgacccagttcggtgacaaatacacctactctaagggctaccaagctaggaaggaaatccactagtgtagtccttattcaatagctctcagc 23420635  T
Q  331 aaactcctcatttacacta-aagacctaggacctacccgtattgatttcaacctaggaattcctagatctgacatcccatctcactatcct-acagtcaa 428  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| || ||||||||||||| |  ||||||||| |||||||||||||||||| |  ||||     
T  23420634 aaactcctcatttacactatatgacctaggacctacccgtatagacttcaacctaggaactgttagatctgagatcccatctcactatcctaatggtcag 23420535  T
Q  429 tcacagcccctgtgatctatc 449  Q
    ||||||||||||||| |||||    
T  23420534 tcacagcccctgtgacctatc 23420514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 178; E-Value: 8e-96
Query Start/End: Original strand, 92 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 26329525 - 26329173
Alignment:
Q  92 ttgaaattctagcacacttgttttaatatgttatgtatgatgttttgacgtttgcaatgttatgattaatgtttcgacatcacgcgataagcagaaataa 191  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||||   |  |||| || |||||||  ||||||||| | |||||| | |||||| |   ||| |||||||||    
T  26329525 ttgaaattctagcgtacttgttttaatatgttccatgagatggttcgacgtttataatgttatgctcaatgttccaacatcatgaagtaaacagaaataa 26329426  T
Q  192 aaacaagaaaa-taaatgacaggaaagtaaagaacacaatgagtttgttgacccaactcggtgacaaacacacctactatgggggctaccaagcaaggaa 290  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||| ||||| |||||| ||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||| || | |||||||||| |||||    
T  26329425 aaacaagaaaaataaatgacaagaaggtaaa-aacacagtgagtttgttgacccagttcggtgataaacacacctactctgtgagctaccaagccaggaa 26329327  T
Q  291 ggaaatccactagtgtagtccttattttgtagctctcaacaaactcctcatttacactaaagacctaggacctacccgtattgatttcaacctaggaatt 390  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  26329326 ggaaatccactggtgtagtccttattctatagctctcagcaaactcctcgtttacactaaagacctaggacctacccgtattgatttcaacctaggaact 26329227  T
Q  391 cctagatctgacatcccatctcactatcctacagtcaatcacagcccctgtgat 444  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||||    
T  26329226 cctagatctgagatcccatctcactatccaacaatcaaccacagcccctgtgat 26329173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 168; E-Value: 7e-90
Query Start/End: Original strand, 93 - 449
Target Start/End: Complemental strand, 30605998 - 30605645
Alignment:
Q  93 tgaaattctagcacacttgttttaatatgttatgtatgatgttttgacgtttgcaatgttatgattaatgtttcgacatcacgcgataagcagaaataaa 192  Q
    |||||||||| | |||||||||||||||||| |||| |||||||  |||||   ||||||  | | |||||| | |||| |||  |||| |||| |||||    
T  30605998 tgaaattctaacgcacttgttttaatatgttctgtaagatgtttcaacgtt---aatgttccgttcaatgttccaacattacgaaataaacagagataaa 30605902  T
Q  193 aa-caagaaaataaatgacaggaaagtaaagaacacaatgagtttgttgacccaactcggtgacaaacacacctactatgggggctaccaagcaaggaag 291  Q
    || ||||||| |||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||    
T  30605901 aaacaagaaa-taaaagacaagaaagtaaagaacacagtgagtttgttgacccagttcggtgacaaacacacctactctgggggctaccaatccaggaag 30605803  T
Q  292 gaaatccactagtgtagtccttattttgtagctctcaacaaactcctcatttacactaaagacctaggacctacccgtattgatttcaacctaggaattc 391  Q
    |||||||||||||| |||||||||| | ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||    
T  30605802 gaaatccactagtgcagtccttattctatagctctcagcaaactcctcgtttacactaaagacctaggacctacccatattgatttcaatctaggaactc 30605703  T
Q  392 ctagatctgacatcccatctcactatcctacagtcaatcacagcccctgtgatctatc 449  Q
    |||||||||| ||| |||||||||||||||  |||||||||| ||| ||||| |||||    
T  30605702 ctagatctgagatctcatctcactatcctatggtcaatcacaacccatgtgacctatc 30605645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 161; E-Value: 1e-85
Query Start/End: Original strand, 90 - 421
Target Start/End: Original strand, 24189709 - 24190040
Alignment:
Q  90 ttttgaaattctagcacacttgttttaatatgttatgtatgatgttttgacgtttgcaatgttatgattaatgtttcgacatcacgcgataagcagaaat 189  Q
    |||||||||||||||  || | |||||||||||| |||||||||||  |  ||||   |||||| |||||||||||| |||| ||||||||| || |||     
T  24189709 ttttgaaattctagcgtacatcttttaatatgttctgtatgatgttacggagttttttatgttacgattaatgtttcaacattacgcgataaacaaaaa- 24189807  T
Q  190 aaaaacaagaaaataaatgacaggaaagtaaagaacacaatgagtttgttgacccaactcggtgacaaacacacctactatgggggctaccaagcaagga 289  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |  |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||  |||    
T  24189808 aaaaacaagaaaataaaagacaggaaagtaaagaacacagtgagtttgttgacctagttcggtgacaaacacacatactctgggggctaccaagccggga 24189907  T
Q  290 aggaaatccactagtgtagtccttattttgtagctctcaacaaactcctcatttacacta-aagacctaggacctacccgtattgatttcaacctaggaa 388  Q
    ||||||| ||||||||||||| |||||   ||||||||| |||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||| || |||||||||||||    
T  24189908 aggaaattcactagtgtagtctttattcaatagctctcagcaaactcctcgtttacactatatgacctaggacctacccgtatagacttcaacctaggaa 24190007  T
Q  389 ttcctagatctgacatcccatctcactatccta 421  Q
     || ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  24190008 ctcatagatctgagatcccatctcactatccta 24190040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 156; E-Value: 1e-82
Query Start/End: Original strand, 198 - 449
Target Start/End: Original strand, 23623831 - 23624082
Alignment:
Q  198 gaaaataaatgacaggaaagtaaagaacacaatgagtttgttgacccaactcggtgacaaacacacctactatgggggctaccaagcaaggaaggaaatc 297  Q
    |||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||| |||||||||| || | ||||||||||||    
T  23623831 gaaaataaaatacaagaaagtaaagaacacaatgagtttgttgacctatttcggtgacaaacacacctactctgggggctactaacctaggaaggaaatc 23623930  T
Q  298 cactagtgtagtccttattttgtagctctcaacaaactcctcatttacactaaagacctaggacctacccgtattgatttcaacctaggaattcctagat 397  Q
    ||||||||||||| ||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  23623931 cactagtgtagtcgttattctatagctctcagcaaactcctcatttacactaaatacctaggacctacccgtattgatttcaacctaggaactcttagat 23624030  T
Q  398 ctgacatcccatctcactatcctacagtcaatcacagcccctgtgatctatc 449  Q
     ||| ||| ||||||||| ||||| ||| ||||||| |||||||||||||||    
T  23624031 ttgagatctcatctcactttcctatagttaatcacaacccctgtgatctatc 23624082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 154; E-Value: 2e-81
Query Start/End: Original strand, 111 - 448
Target Start/End: Original strand, 26036677 - 26037014
Alignment:
Q  111 gttttaatatgttatgtatgatgttttgacgtttgcaatgttatgattaatgtttcgacatcacgcgataagcagaaataaaaacaagaaaataaatgac 210  Q
    ||||||||||||| |||| |||||||  ||||||  ||||||  | |  ||||| | ||||||||  |||| || ||||||||| |||||||||||||||    
T  26036677 gttttaatatgttctgtaagatgtttcaacgtttataatgtttcgttcgatgttccaacatcacgaaataaacaaaaataaaaataagaaaataaatgac 26036776  T
Q  211 aggaaagtaaagaacacaatgagtttgttgacccaactcggtgacaaacacacctactatgggggctaccaagcaaggaaggaaatccactagtgtagtc 310  Q
    | ||||||||| |||| | ||||||||||||||||  ||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||    
T  26036777 aagaaagtaaacaacaaagtgagtttgttgacccagttcggtggaaaacacacctactctgggggctaccaagccaggaaggaaatccactagtgttgtc 26036876  T
Q  311 cttattttgtagctctcaacaaactcctcatttacactaaagacctaggacctacccgtattgatttcaacctaggaattcctagatctgacatcccatc 410  Q
    |||||| | ||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| |  ||||||||| |||||||     
T  26036877 cttattctatagctctcagcaaactcatcgtttacactaaagacctaggacctacccgtatagacttcaacctaggaacttgtagatctgagatcccatt 26036976  T
Q  411 tcactatcctacagtcaatcacagcccctgtgatctat 448  Q
    |||||||| ||  |||| ||||||||||||||| ||||    
T  26036977 tcactatcatatggtcagtcacagcccctgtgacctat 26037014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 146; E-Value: 1e-76
Query Start/End: Original strand, 195 - 444
Target Start/End: Original strand, 13338543 - 13338791
Alignment:
Q  195 caagaaaataaatgacaggaaagtaaagaacacaatgagtttgttgacccaactcggtgacaaacacacctactatgggggctaccaagcaaggaaggaa 294  Q
    |||||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||| |||||  |||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||| |||||||||    
T  13338543 caagaaaataaaagacaagaaagtaaagaacacagtgagtttgttaacccagttcggtgacaaacacacatactctgggg-ctaccaagccaggaaggaa 13338641  T
Q  295 atccactagtgtagtccttattttgtagctctcaacaaactcctcatttacactaaagacctaggacctacccgtattgatttcaacctaggaattccta 394  Q
    ||||||||||||| |||||||| | || |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||| |||||    
T  13338642 atccactagtgtaatccttattctataactctcagcaaactcctcgtttacactaaagacctaggacataccggtattgatttctacctaggaactccta 13338741  T
Q  395 gatctgacatcccatctcactatcctacagtcaatcacagcccctgtgat 444  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||    
T  13338742 gatctgagatctcatctcactatcctacagtcaaccacaacccttgtgat 13338791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 146; E-Value: 1e-76
Query Start/End: Original strand, 93 - 421
Target Start/End: Complemental strand, 13735284 - 13734955
Alignment:
Q  93 tgaaattctagcacacttgttttaatatgttatgtatgatgttttgacgtttgcaatgttatgattaatgtttcgacatcacgcgataagcagaaataaa 192  Q
    |||||||||||   ||||||||||||||||| ||   |||||||  ||||||  ||||||  | | |||||| | ||||||||   ||| ||||||||||    
T  13735284 tgaaattctagtgaacttgttttaatatgttctgcgagatgtttcaacgtttataatgttccgttcaatgttccaacatcacgaagtaaacagaaataaa 13735185  T
Q  193 aacaagaaaataaatgacaggaaagtaaagaacacaatgagtttgttgacccaactcggtgacaaacacacctactatgggggctaccaagcaaggaagg 292  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||  |||||||    
T  13735184 aacaagaaaataaatgacaggaaagtaaaagacacagtgagtttgttgacccacttcggtgacaaacacacctactctgggggttaccaagtcaggaagg 13735085  T
Q  293 aaatccactagtgtagtccttattttgtagctctcaacaaactcctcatttacac-taaagacctaggacctacccgtattgatttcaacctaggaattc 391  Q
    ||||||| ||||||||||||||||    |||||||| |||||||||| ||||||| | | |||||||||||||||||| | || ||||||||||||| ||    
T  13735084 aaatccattagtgtagtccttattcaaaagctctcagcaaactcctcgtttacactttatgacctaggacctacccgtctagacttcaacctaggaactc 13734985  T
Q  392 ctagatctgacatcccatctcactatccta 421  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  13734984 ctagatctgagatcccatctcactatccta 13734955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 145; E-Value: 4e-76
Query Start/End: Original strand, 93 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 25105732 - 25105452
Alignment:
Q  93 tgaaattctagcacacttgttttaatatgttatgtatgatgttttgacgtttgcaatgttatgattaatgtttcgacatcacgcgataagcagaaataaa 192  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||  | |||||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||    
T  25105732 tgaaattctagcgcacttgttttaatatgttctgtatgatgttacggcgtttgcaatgttacgattaatgtttcaacatcacacgataaacagaaataaa 25105633  T
Q  193 aacaag-aaaataaatgacaggaaagtaaagaacacaatgagtttgttgacccaactcggtgacaaacacacctactatgggggctaccaagcaaggaag 291  Q
    |||||| |||||||| || |||||| ||||||||||| |||| |||||||||||  |||||||||| | |||||||  | ||||||||||||  ||||||    
T  25105632 aacaagaaaaataaaagataggaaactaaagaacacagtgagcttgttgacccagttcggtgacaagcgcacctacactaggggctaccaagtcaggaag 25105533  T
Q  292 gaaatccactagtgtagtccttattttgtagctctcaacaaactcctcatttacacta-aagacctaggacctacccgtat 371  Q
    |||||||||||||||||||||||||   ||||| ||| |||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  25105532 gaaatccactagtgtagtccttattcaatagctttcagcaaactcctcgtttacactatatgacctaggacctacccgtat 25105452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 145; E-Value: 4e-76
Query Start/End: Original strand, 93 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 25164825 - 25164545
Alignment:
Q  93 tgaaattctagcacacttgttttaatatgttatgtatgatgttttgacgtttgcaatgttatgattaatgtttcgacatcacgcgataagcagaaataaa 192  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||  | |||||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||    
T  25164825 tgaaattctagcgcacttgttttaatatgttctgtatgatgttacggcgtttgcaatgttacgattaatgtttcaacatcacacgataaacagaaataaa 25164726  T
Q  193 aacaag-aaaataaatgacaggaaagtaaagaacacaatgagtttgttgacccaactcggtgacaaacacacctactatgggggctaccaagcaaggaag 291  Q
    |||||| |||||||| || |||||| ||||||||||| |||| |||||||||||  |||||||||| | |||||||  | ||||||||||||  ||||||    
T  25164725 aacaagaaaaataaaagataggaaactaaagaacacagtgagcttgttgacccagttcggtgacaagcgcacctacactaggggctaccaagtcaggaag 25164626  T
Q  292 gaaatccactagtgtagtccttattttgtagctctcaacaaactcctcatttacacta-aagacctaggacctacccgtat 371  Q
    |||||||||||||||||||||||||   ||||| ||| |||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  25164625 gaaatccactagtgtagtccttattcaatagctttcagcaaactcctcgtttacactatatgacctaggacctacccgtat 25164545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 213 - 445
Target Start/End: Original strand, 18221079 - 18221311
Alignment:
Q  213 gaaagtaaagaacacaatgagtttgttgacccaactcggtgacaaacacacctactatgggggctaccaagcaaggaaggaaatccactagtgtagtcct 312  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  18221079 gaaagtaaagaacaagatgagtttgttgatccagttcggtgacaaacacacctactttggggtctaccaagccaagaaggaaatccactagtgtagtcct 18221178  T
Q  313 tattttgtagctctcaacaaactcctcatttacactaaagacctaggacctacccgtattgatttcaacctaggaattcctagatctgacatcccatctc 412  Q
    ||||   ||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  18221179 tattccatagctctcaccaaacttctcgtttacactaaagacctaggagctaccagtattgagttcaacctaggaactcctagatctgagatcccatctc 18221278  T
Q  413 actatcctacagtcaatcacagcccctgtgatc 445  Q
    ||||||||| ||||||||||  | |||||||||    
T  18221279 actatcctatagtcaatcacgactcctgtgatc 18221311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 198 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 20714942 - 20714704
Alignment:
Q  198 gaaaataaatgacaggaaagtaaagaacacaatgagtttgttgacccaactcggtgacaaacacacctactatgggggctaccaagcaaggaaggaaatc 297  Q
    ||||||||| |||| ||| |||||  ||| | |||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||| || |||||||||||  ||| ||||||||    
T  20714942 gaaaataaacgacaagaatgtaaaagacatagtgagtttgttgacctagttcggtgacaaacacacctactctgagggctaccaagtcaggtaggaaatc 20714843  T
Q  298 cactagtgtagtccttattttgtagctctcaacaaactcctcatttacacta-aagacctaggacctacccgtattgatttcaacctaggaattcctaga 396  Q
    ||||||||||||||||||| |   | ||||| |||||||||| ||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  20714842 cactagtgtagtccttattctaatgttctcagcaaactcctcgtttacaacacaagacctaggacctacccgtattgatttcaacctaggaactcctaga 20714743  T
Q  397 tctgacatcccatctcactatcctacagtcaatcacagc 435  Q
    ||||| ||  ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  20714742 tctgagatttcatctcactatcctacaatcaatcacagc 20714704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 113; E-Value: 5e-57
Query Start/End: Original strand, 194 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 13942207 - 13941956
Alignment:
Q  194 acaagaaaataaatgacaggaaagtaaagaacacaatgagt-ttgttgacccaactcggtgacaaacacacctactatgggggctaccaagcaaggaagg 292  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||   |||| ||||  ||||| ||| |  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||    
T  13942207 acaagaaaataaatgacaagaaagtaaatggcaca-tgagagttgttaacctagttcggtgacaaacacacctactctgggggctaccaagtcaggaagg 13942109  T
Q  293 aaatccactagtgtagtccttattttgtagctctcaacaaactcctcatttac-actaaagacctaggacctacccgtattgatttcaacctaggaattc 391  Q
    |||||||||||||||||||||||| |  || ||||| |||||||||| ||||| ||| || ||||||||||||||||| |  | ||||||||||||| ||    
T  13942108 aaatccactagtgtagtccttattctaaagttctcagcaaactcctcgtttacaacttaaaacctaggacctacccgtctacacttcaacctaggaactc 13942009  T
Q  392 ctagatctgacatcccatctcactatcctacagtcaatcacagcccctgtgat 444  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  13942008 ctagatctgagatcccatctcattatcctacaatcaatcacaacccctgtgat 13941956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 106; E-Value: 7e-53
Query Start/End: Original strand, 191 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 20741148 - 20740897
Alignment:
Q  191 aaaacaagaaaataaatgacaggaaagtaaagaacacaatgagtttgttgacccaactcggtgacaaacacacctactatgggggctaccaagcaaggaa 290  Q
    ||||||| |||||||| |||| |||||| ||   |||| ||||| |||| |||||| |||||  |||   |||||||| ||||||||||||||| ||||     
T  20741148 aaaacaacaaaataaaagacaagaaagtcaatggcacagtgagtctgttaacccaattcggtt-caacgtcacctactctgggggctaccaagcgaggag 20741050  T
Q  291 ggaaatccactagtgtagtccttattttgtagctctcaacaaactcctcatttacactaaagacctaggacctacccgtattgatttcaacctaggaatt 390  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||||||| |    
T  20741049 ggaaatccactagtgtagtccttattctctagctctcagcaaactcctcgtttacactaaagacctaggacctatccgtcttgacttcaacctaggaact 20740950  T
Q  391 cctagatctgacatcccatctcactatcctacagtcaatcacagcccctgtgat 444  Q
    ||||||||||| ||| |||||||||  ||||||  |||||||||| | ||||||    
T  20740949 cctagatctgagatctcatctcact-ccctacaaccaatcacagctcttgtgat 20740897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 106; E-Value: 7e-53
Query Start/End: Original strand, 186 - 449
Target Start/End: Complemental strand, 20846011 - 20845747
Alignment:
Q  186 aaataaaaacaagaaaataaatgacaggaaagtaaagaacacaatgagtttgttgacccaactcggtgacaaacacacctactatgggggctaccaagca 285  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||  ||||||||| |||||  |||||| |||   |||||||||||||||||||||||      
T  20846011 aaataaaaacaagaaaataaatgacaggaaagtaaaaggcacacagagtttgttaacccagttcggtg-caacgtcacctactatgggggctaccaagtc 20845913  T
Q  286 aggaaggaaatccactagtgtagtccttattttgtagctctcaacaaactcctcatttacac-taaagacctaggacctacccgtattgatttcaaccta 384  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    | |||||| |||||||||| ||||||| | | |||||||||||||||||| | || |||||||||    
T  20845912 aggaaggaaatccactagtgtagtccttattcaaaatctctcagcaaactcctcgtttacactttatgacctaggacctacccgtctagacttcaaccta 20845813  T
Q  385 ggaattcctagatctgacatcccatctcactatcctacagtcaatcac-agcccctgtgatctatc 449  Q
    |||| |||||||||||| |||  ||||||||||||||  || | |||| | |||||||||||||||    
T  20845812 ggaactcctagatctgagatcttatctcactatcctatggtgagtcacaaccccctgtgatctatc 20845747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 105; E-Value: 3e-52
Query Start/End: Original strand, 93 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 9422778 - 9422555
Alignment:
Q  93 tgaaattctagcacacttgttttaatatgttatgtatgatgttttgacgtttgcaatgttatgattaatgtttcgacatcacgcgataagcagaaataaa 192  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||||| |||  |||||||| || |||||||||||  | ||| |||| | |||||||  ||||| ||||||||||    
T  9422778 tgaaattctagtgcacttgttttaatatgttctgtcagatgttttaacatttgcaatgttccgtttagtgttccaacatcacatgataaacagaaataaa 9422679  T
Q  193 aacaagaaaataaatgacaggaaagtaaagaacacaatgagtttgttgacccaactcggtgacaaacacacctac-tatgggggctaccaagcaaggaag 291  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||| | ||||| || |||||  ||||||    
T  9422678 aacaagaaaataaacgacagaaaagtaaagaacacaatgagtttgttgacctagttcggtgacaaacacacctacatctggggact-ccaagtcaggaag 9422580  T
Q  292 gaaatccactagtgtagtccttatt 316  Q
    ||||||||||||||| |||||||||    
T  9422579 gaaatccactagtgttgtccttatt 9422555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 214 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 7898103 - 7897874
Alignment:
Q  214 aaagtaaagaacacaatgagtttgttgacccaactcggtgacaaacacacctactatgggggctaccaagcaaggaaggaaatccactagtgtagtcctt 313  Q
    ||||||||  ||||| |||||||||| |||||  |||||| |||   |||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  7898103 aaagtaaaagacacagtgagtttgttaacccagttcggtg-caacgtcacctactctggaggctaccaagccaggaaggaaatccactagtgtagtcctt 7898005  T
Q  314 attttgtagctctcaacaaactcctcatttacactaaagacctaggacctacccgtattgatttcaacctaggaattcctagatctgacatcccatctca 413  Q
    |||   ||||||||| |||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||    
T  7898004 attcaatagctctcagcaaactcctcgtttgcactaatgacctaggacctacccgtactgacttcaacctaggaactcttagatctgagatcccatctca 7897905  T
Q  414 ctatcctacagtcaatcacagcccctgtgat 444  Q
    ||  | ||||    |||||||||||||||||    
T  7897904 ctcccttacaactgatcacagcccctgtgat 7897874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 272 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 22184729 - 22184557
Alignment:
Q  272 ggggctaccaagcaaggaaggaaatccactagtgtagtccttattttgtagctctcaacaaactcctcatttacactaaagacctaggacctacccgtat 371  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||  ||| |  |||||||| |||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||| ||    
T  22184729 ggggctaccaagccaggaaggaaatccattagtctagtccgaattctaaagctctcagcaaactcctcgtttacacttaagacctatgacctacccgcat 22184630  T
Q  372 tgatttcaacctaggaattcctagatctgacatcccatctcactatcctacagtcaatcacagcccctgtgat 444  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||  |||||||    
T  22184629 tgatttcaacctaggaactcctagatctgagatcccatctcactatcctacaaccaatcacagctactgtgat 22184557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 286 - 421
Target Start/End: Complemental strand, 22252159 - 22252023
Alignment:
Q  286 aggaaggaaatccactagtgtagtccttattttgtagctctcaacaaactcctcatttacacta-aagacctaggacctacccgtattgatttcaaccta 384  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  22252159 aggaaggaaatccactagtgtagtccttattcaatagctctcaacaaactcctcatttacactatatgacctaggacctacccgtatagacttcaaccta 22252060  T
Q  385 ggaattcctagatctgacatcccatctcactatccta 421  Q
    |||| |||||||||| | |||| |||||| |||||||    
T  22252059 ggaactcctagatcttagatcctatctcattatccta 22252023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 261 - 415
Target Start/End: Complemental strand, 26183377 - 26183222
Alignment:
Q  261 cacctactatgggggctaccaagcaaggaaggaaatccactagtgtagtccttattttgtagctctcaacaaactcctcatttacacta-aagacctagg 359  Q
    |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||   ||||||||| |||||| ||| ||| ||||| | |||||||     
T  26183377 cacctactctgggggctaccaagccaggaaggaaatacactagtgtagtccttattcaatagctctcagcaaacttctcgtttgcactatatgacctaga 26183278  T
Q  360 acctacccgtattgatttcaacctaggaattcctagatctgacatcccatctcact 415  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  26183277 acctacccgtactgacttcaacctaggaactcctagatctgagatcccatctcact 26183222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 261 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 17920926 - 17920776
Alignment:
Q  261 cacctactatgggggctaccaagcaaggaaggaaatccactagtgtagtccttattttgtagctctcaacaaactcctcatttacactaaagacctagga 360  Q
    |||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||    |||||||| |||||||||| ||| |||| | |||||||||    
T  17920926 cacctactctaggggctaccaagccaggaaggaaatccactagtgtagtccgtattcaaaagctctcagcaaactcctcgtttgcacttatgacctagga 17920827  T
Q  361 cctacccgtattgatttcaacctaggaattcctagatctgacatcccatct 411  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  17920826 cctacccgtactgacttcaacctaggaactcctagatctgagatcccatct 17920776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 261 - 415
Target Start/End: Complemental strand, 20498296 - 20498141
Alignment:
Q  261 cacctactatgggggctaccaagcaaggaaggaaatccactagtgtagtccttattttgtagctctcaacaaactcctcatttacacta-aagacctagg 359  Q
    |||||||| ||| ||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||   ||||||||| |||||||||| ||| ||||| | ||||||||    
T  20498296 cacctactctggaggctaccaagtcaggaaggaaatccactcgtgtagtccttattcaatagctctcagcaaactcctcgtttgcactatatgacctagg 20498197  T
Q  360 acctacccgtattgatttcaacctaggaattcctagatctgacatcccatctcact 415  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||    
T  20498196 acctacccgtactgacttcaacctaggaactcctagatctgagatctcatctcact 20498141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 277 - 421
Target Start/End: Complemental strand, 22246478 - 22246333
Alignment:
Q  277 taccaagcaaggaaggaaatccactagtgtagtccttattttgtagctctcaacaaactcctcatttacacta-aagacctaggacctacccgtattgat 375  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||| |||||||||| |||||||||   |||||||||||||||||||| ||     
T  22246478 taccaagccaggaaggaaatccactagtgtagtccttattcaatagctctcagcaaactcctcgtttacactatttgacctaggacctacccgtatagac 22246379  T
Q  376 ttcaacctaggaattcctagatctgacatcccatctcactatccta 421  Q
    ||||||||||||| |||||||||  | ||| |||||||||||||||    
T  22246378 ttcaacctaggaactcctagatcatagatcacatctcactatccta 22246333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 199 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 22131037 - 22130809
Alignment:
Q  199 aaaataaatgacaggaaagtaaagaacacaatgagtttgttgacccaactcggtgacaaacacacctactatgggggctaccaagcaaggaaggaaatcc 298  Q
    |||||||| |||| ||||||||| | ||||  ||||||||| |||||  |||||| |||   |||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  22131037 aaaataaaagacaagaaagtaaaaagcacagagagtttgttaacccagttcggtg-caacgtcacctactctgggggctaccaagccagga-ggaaatcc 22130940  T
Q  299 actagtgtagtccttattttgtagctctcaacaaactcctcatttacactaaagacctaggacctacccgtattgatttcaacctaggaattcctagatc 398  Q
    ||||||||| |||||||| | ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||              |||||||||| || |||||||||    
T  22130939 actagtgtaatccttattctctagctctcagcaaactcctcgtttacactaaagacctaggac--------------ttcaacctagaaactcctagatc 22130854  T
Q  399 tgacatcccatctcactatcctacagtcaatcacagcccctgtgat 444  Q
    ||| |||||||||||||  ||||||  |||||||||||||||||||    
T  22130853 tgagatcccatctcact-ccctacaaccaatcacagcccctgtgat 22130809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 74; E-Value: 9e-34
Query Start/End: Original strand, 231 - 415
Target Start/End: Complemental strand, 17661583 - 17661399
Alignment:
Q  231 gagtttgttgacccaactcggtgacaaacacacctactatgggggctaccaagcaaggaaggaaatccactagtgtagtccttattttgtagctctcaac 330  Q
    ||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||| |||||| || |  || ||||| |    
T  17661583 gagtttgttaacccagttcggtgacaaacacacctactatgggggctaccaagcctggaaggaaattcactagtgttgtccttgttct-aagttctcagc 17661485  T
Q  331 aaactcctcatttac-actaaagacctaggacctacccgtattgatttcaacctaggaattcctagatctgacatcccatctcact 415  Q
    ||| |||  ||| || ||| |  ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||    
T  17661484 aaattccaaattcacaacttataacctaggacctacccatattgacttcaacctaggaactcctagatctgagattccatctcact 17661399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 235 - 444
Target Start/End: Original strand, 24117586 - 24117795
Alignment:
Q  235 ttgttgacccaactcggtgacaaacacacctactatgggggctaccaagcaaggaaggaaatccactagtgtagtccttattttgtagctctcaacaaac 334  Q
    ||||| |||||  |||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| |  |  ||||| |||||    
T  24117586 ttgttaacccagttcggtgacaaacacgcctactctggtggctaccaagccaggaatgaaatccactagtgtagtccttattgt-aaattctcagcaaac 24117684  T
Q  335 tcctca-tttac-actaaagacctaggacctacccgtattgatttcaacctaggaattcctagatctgacatcccatctcactatcctacagtcaatcac 432  Q
     ||||| ||||| |||  |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| || ||||||| |||||||||||||  |   || ||||||||    
T  24117685 -cctcagtttacaacttcagacctaggacctacccgtattgactttaacctaggaatttcttgatctgagatcccatctcacttccactcaatcaatcac 24117783  T
Q  433 agcccctgtgat 444  Q
    ||||| ||||||    
T  24117784 agcccttgtgat 24117795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 270 - 444
Target Start/End: Original strand, 9522561 - 9522733
Alignment:
Q  270 tgggggctaccaagcaaggaaggaaatccactagtgtagtccttattttgtagctctcaacaaactcctcatttacactaaagacctaggacctacccgt 369  Q
    ||||||||||||||  | ||||||||| ||||||||||||||||||| |  || | |||||||||||||| ||||||    |||||||||||||||||||    
T  9522561 tgggggctaccaagtcaagaaggaaattcactagtgtagtccttattcta-agttatcaacaaactcctcttttaca----agacctaggacctacccgt 9522655  T
Q  370 at----tgatttcaacctaggaattcctagatctgacatcccatctcactatcctacagtcaatcacagcccctgtgat 444  Q
    ||    ||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||  || ||||||||| ||||||||||    
T  9522656 atatattgacttcaacctaggaactcctagatctgagatcccatctcact-tccctcaatcaatcacaacccctgtgat 9522733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 59; E-Value: 8e-25
Query Start/End: Original strand, 270 - 453
Target Start/End: Complemental strand, 11756338 - 11756160
Alignment:
Q  270 tgggggctaccaagcaaggaaggaaatccactagtgtagtccttattttgtagctctcaacaaactcctcatttaca-ctaaagacctaggacctacccg 368  Q
    ||||||||| ||||  ||||||||||| |||| ||||| || ||||| |  || |||||||||| |||||||||||| ||  ||||||||||||||||||    
T  11756338 tgggggctaacaaggcaggaaggaaattcacttgtgtattcattattcta-agttctcaacaaattcctcatttacaactctagacctaggacctacccg 11756240  T
Q  369 tattgatttcaacctaggaattcctagatctgacatcccatctcactatcctacagtcaatcacagcccctgtgatctatctgat 453  Q
    |||||| ||||||||||||| || ||||||    ||||||||||||| |||  || |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  11756239 tattgacttcaacctaggaactcttagatc---gatcccatctcact-tccctcaatcaatcacagcccctgtgat-tatctgat 11756160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 54; E-Value: 8e-22
Query Start/End: Original strand, 235 - 444
Target Start/End: Original strand, 22979736 - 22979946
Alignment:
Q  235 ttgttgacccaactcggtgacaaacacacctactatgggggctaccaagcaaggaaggaaatccactagtgtagtccttattttgtagctctcaacaa-- 332  Q
    ||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| || |  || ||||| |||      
T  22979736 ttgttaacccagttcggtgacaaacacacctactatgggg-ctaccaagcaaggaagcaaatacactagtgtagtccttgttct-aagttctcagcaaat 22979833  T
Q  333 actcctcatttac-actaaagacctaggacctacccgtattgatttcaacctaggaattcctagatctgacatcccatctcactatcctacagtcaatca 431  Q
    |||||   ||||| ||| |  ||||| ||| | |||||||||| ||||||||||||| || ||||||||| ||| |||||||||  |   || |||||||    
T  22979834 actccaagtttacaacttatcacctaagacttgcccgtattgacttcaacctaggaactcttagatctgagatctcatctcacttccactcaatcaatca 22979933  T
Q  432 cagcccctgtgat 444  Q
    || ||||||||||    
T  22979934 caacccctgtgat 22979946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 275 - 444
Target Start/End: Original strand, 20127026 - 20127194
Alignment:
Q  275 gctaccaagcaaggaaggaaatccactagtgtagtccttattttgtagctctcaacaaactcctcatttac-actaaagacctaggacctacccgtattg 373  Q
    |||||||| | |||||||||||||||||||||| |||||||| |  || ||||| |||||||||| ||||| |||  | ||||||||||||||||| |||    
T  20127026 gctaccaatctaggaaggaaatccactagtgtaatccttattct-aagttctcagcaaactcctcgtttacaactctaaacctaggacctacccgtcttg 20127124  T
Q  374 atttcaacctaggaattcctagatctgacatcccatctcactatcctacagtcaatcacagcccctgtgat 444  Q
    | ||||||| | ||| | ||||||||   ||||||||||||| |||  || ||||| ||| ||||||||||    
T  20127125 acttcaacccatgaacttctagatcttggatcccatctcact-tccctcaatcaattacaacccctgtgat 20127194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 261 - 304
Target Start/End: Original strand, 11204738 - 11204781
Alignment:
Q  261 cacctactatgggggctaccaagcaaggaaggaaatccactagt 304  Q
    |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  11204738 cacctactctgggggctaccaagccaggaaggaaatccactagt 11204781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 376 - 421
Target Start/End: Complemental strand, 9422544 - 9422499
Alignment:
Q  376 ttcaacctaggaattcctagatctgacatcccatctcactatccta 421  Q
    ||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  9422544 ttcaacctatgaactcctagatctgagatcccatctcactatccta 9422499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 91 - 123
Target Start/End: Complemental strand, 23420862 - 23420830
Alignment:
Q  91 tttgaaattctagcacacttgttttaatatgtt 123  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  23420862 tttgaaattctagcacacttgtattaatatgtt 23420830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0103 (Bit Score: 202; Significance: 1e-110; HSPs: 1)
Name: scaffold0103
Description:

Target: scaffold0103; HSP #1
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 93 - 421
Target Start/End: Complemental strand, 25984 - 25655
Alignment:
Q  93 tgaaattctagcacacttgttttaatatgttatgtatgatgttttgacgtttgcaatgttatgattaatgtttcgacatcacgcgataagcagaaataaa 192  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||| ||| ||||||||||||   ||||||||||| || |||||||||||| |||||||||||||| || |||||||    
T  25984 tgaaattctagcgtacttgttttaatacgttctgtatgatgtttcagcgtttgcaatgctacgattaatgtttcaacatcacgcgataaacataaataaa 25885  T
Q  193 aacaagaaaataaatgacaggaaagtaaagaacacaatgagtttgttgacccaactcggtgacaaacacacctactatgggggctaccaagcaaggaagg 292  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||||    
T  25884 aacaagaaaataaatgacaggaaagtaaataacacaatgagtttattgacccagttcggtgacaaacacacctactctgggagctaccaagccaggaagg 25785  T
Q  293 aaatccactagtgtagtccttattttgtagctctcaacaaactcctcatttacacta-aagacctaggacctacccgtattgatttcaacctaggaattc 391  Q
    ||||||||| ||||||||||||||   |||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||| || ||||||||| ||| ||    
T  25784 aaatccactggtgtagtccttattcaatagctctcaacaaactcctcgtttacactagatgacctaggacctacccgtatagacttcaacctacgaactc 25685  T
Q  392 ctagatctgacatcccatctcactatccta 421  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  25684 ctagatctgagatcccatctcactatccta 25655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 202; Significance: 1e-110; HSPs: 59)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 93 - 421
Target Start/End: Original strand, 13195172 - 13195501
Alignment:
Q  93 tgaaattctagcacacttgttttaatatgttatgtatgatgttttgacgtttgcaatgttatgattaatgtttcgacatcacgcgataagcagaaataaa 192  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||  ||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||| |||| || |||||||    
T  13195172 tgaaattctagcacacgtgttttaatatgtttggtatgatgttttagcgtttgcaatgttacaattaatgtttcaacatcacgcaataaacataaataaa 13195271  T
Q  193 aacaagaaaataaatgacaggaaagtaaagaacacaatgagtttgttgacccaactcggtgacaaacacacctactatgggggctaccaagcaaggaagg 292  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||| | |||||    
T  13195272 aacaagaaaataaatgacaggaaagtaaagaacacaatgagtttgttgacctagttcgatgacaaacacacctactctaggggctaccaagccatgaagg 13195371  T
Q  293 aaatccactagtgtagtccttattttgtagctctcaacaaactcctcatttacacta-aagacctaggacctacccgtattgatttcaacctaggaattc 391  Q
    ||||||||||||||||||||||||   |||||||||  ||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||    
T  13195372 aaatccactagtgtagtccttattcaatagctctcagaaaactcctcgtttacactatatgacctaggacctacccgtatagacttcaacctaggaactc 13195471  T
Q  392 ctagatctgacatcccatctcactatccta 421  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  13195472 ctagatctgagatcccatctcactatccta 13195501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 90 - 449
Target Start/End: Original strand, 17855040 - 17855401
Alignment:
Q  90 ttttgaaattctagcacacttgttttaatatgttatgtatgatgttttgacgtttgcaatgttatgattaatgtttcgacatcacgcgataagcagaaat 189  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |  ||||| |||||| |||||||||||| ||||||| ||||||  |||| |    
T  17855040 ttttgaaattctagcacacttgttttaatacgttttgtatgatgttttaatatttgcgatgttacgattaatgtttcaacatcacacgataaatagaatt 17855139  T
Q  190 aaaaacaagaaaataaatgacaggaaagtaaagaacacaatgagtttgttgacccaactcggtgacaaacacacctactatgggggctaccaagcaagga 289  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||| ||||    
T  17855140 aaaaacaagaaaataaaagacaggaaagtaaagaacgcaatgagtttgttgacccagatcggtgacaaacacacctactctggaggctatcaagccagga 17855239  T
Q  290 aggaaatccactagtgtagtccttattttgtagctctcaacaaactcctcatttacacta-aagacctaggacctacccgtattgatttcaacctaggaa 388  Q
    |||||||||||||||||||||||||||   ||||||||| |||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||| || |||||||||||||    
T  17855240 aggaaatccactagtgtagtccttattcaatagctctcagcaaactcctcgtttacactatatgacctaggacctacccgtatagacttcaacctaggaa 17855339  T
Q  389 ttcctagatctgacatcccatctcactatcct-acagtcaatcacagcccctgtgatctatc 449  Q
     |||||||||||| ||| |||||||||||||| |  |||| |||||||| |||||| |||||    
T  17855340 ctcctagatctgagatctcatctcactatcctaatggtcagtcacagccgctgtgacctatc 17855401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 93 - 421
Target Start/End: Original strand, 14258759 - 14259088
Alignment:
Q  93 tgaaattctagcacacttgttttaatatgttatgtatgatgttttgacgtttgcaatgttatgattaatgtttcgacatcacgcgataagcagaaataaa 192  Q
    ||||||| || | |||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  14258759 tgaaattttaacgcacttgttttaatatgttttttatgatgttttaacgtttgcaatgttacgattaatgtttcaacatcacgcgataagcagaaataaa 14258858  T
Q  193 aacaagaaaataaatgacaggaaagtaaagaacacaatgagtttgttgacccaactcggtgacaaacacacctactatgggggctaccaagcaaggaagg 292  Q
    ||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  14258859 aacaagaaaataaacaataggaaagtaaagaacacaatgagtttgttgacccagttcggtgagaaacacacctactttgggggctaccaagcgaggaagg 14258958  T
Q  293 aaatccactagtgtagtccttattttgtagctctcaacaaactcctcatttacacta-aagacctaggacctacccgtattgatttcaacctaggaattc 391  Q
    ||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||  || |||||| || | |||||||||||||||||||| || ||| || || ||| ||    
T  14258959 aaatccactagtgtagtccttattcaatagctctcaacaaacttatcgtttacaatatatgacctaggacctacccgtatagacttccacttatgaactc 14259058  T
Q  392 ctagatctgacatcccatctcactatccta 421  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  14259059 ctagatctgagatcccatctcactatccta 14259088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 90 - 421
Target Start/End: Original strand, 33665639 - 33665971
Alignment:
Q  90 ttttgaaattctagcacacttgttttaatatgttatgtatgatgttttgacgtttgcaatgttatgattaatgtttcgacatcacgcgataagcagaaat 189  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||  |  ||||||||||||| |||||||||||  ||||||| |||||| |||||||    
T  33665639 ttttgaaattctagcgcacttgttttaatatgttctgtatgatgttacggtgtttgcaatgttacgattaatgttttaacatcacacgataaacagaaat 33665738  T
Q  190 aaaaacaagaaaataaatgacaggaaagtaaagaacacaatgagtttgttgacccaactcggtgacaaacacacctactatgggggctaccaagcaagga 289  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||    
T  33665739 aaaaacaagaaaataaatgataggaaagtaaataacacaatgagtttgttgacctagttcggtgacaaacacacctactctgggggctactaagccagga 33665838  T
Q  290 aggaaatccactagtgtagtccttattttgtagctctcaacaaactcctcatttacacta-aagacctaggacctacccgtattgatttcaacctaggaa 388  Q
    |||||||||||||||||||||||||||   ||||||||| |||||||||| ||||||||| | ||| |||||||||||||||| || ||||||| |||||    
T  33665839 aggaaatccactagtgtagtccttattcaatagctctcagcaaactcctcgtttacactatatgacataggacctacccgtatagacttcaaccaaggaa 33665938  T
Q  389 ttcctagatctgacatcccatctcactatccta 421  Q
     |||||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  33665939 ctcctagatctgagatctcatctcactatccta 33665971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 92 - 449
Target Start/End: Original strand, 25805301 - 25805659
Alignment:
Q  92 ttgaaattctagcacacttgttttaatatgttatgtatgatgttttgacgtttgcaatgttatgattaatgtttcgacatcacgcgataagcagaaataa 191  Q
    ||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||   |||||  ||||||  | | |||||||| ||||| |  |||||  ||||||||    
T  25805301 ttgaaattctatcgcacttgttttaatatgttctgtatgatgtttaagcgtttataatgtttcgttcaatgtttcaacatcgcttgataaaaagaaataa 25805400  T
Q  192 aaacaagaaaataaatgacaggaaagtaaagaacacaatgagtttgttgacccaactcggtgacaaacacacctactatgggggctaccaagcaaggaag 291  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||  ||||||||||||||||||||| | | ||||||||||| ||||||    
T  25805401 aaacaagaaagtaaatgacaggaaagtaaagaacacaatgattttgttaaaccagatcggtgacaaacacacctactctagaggctaccaagccaggaag 25805500  T
Q  292 gaaatccactagtgtagtccttattttgtagctctcaacaaactcctcatttacactaaagacctaggacctacccgtattgatttcaacctaggaattc 391  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  25805501 gaaatccactagtgtagtccttattatatagctctcagcaaactcctcgtttacactaaagacctaggacctacccgtattgatttcaacctaggaactc 25805600  T
Q  392 ctagatctgacatcccatctcactat-cctacagtcaatcacagcccctgtgatctatc 449  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| || |  |||| ||||||||||||||| |||||    
T  25805601 ctagatctgagatcccatctcactatcccaatggtcagtcacagcccctgtgacctatc 25805659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 91 - 449
Target Start/End: Complemental strand, 20990077 - 20989718
Alignment:
Q  91 tttgaaattctagcacacttgttttaatatgttatgtatgatgttttgacgtttgcaatgttatgattaatgtttcgacatcacgcgataagcagaaata 190  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||  | |||||||||||  ||| |||||| | ||||||| ||||||| |||||||    
T  20990077 tttgaaattctagctcacttgttttaatatgttctgtatgatgttttagcatttgcaatgttccgatcaatgttccaacatcacacgataagtagaaata 20989978  T
Q  191 aaaacaagaaaataaatgacaggaaagtaaagaacacaatgagtttgttgacccaactcggtgacaaacacacctactatgggggctaccaagcaaggaa 290  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||  || ||    
T  20989977 aaaacaagaaaataaatgatgggaaagtaaataacacaatgagtttgttgacccagttcggtgacagacacacctactctgggggctaccaagtcagaaa 20989878  T
Q  291 ggaaatccactagtgtagtccttattttgtagctctcaacaaactcctcatttacactaaagacctaggacctacccgtattgatttcaacctaggaatt 390  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||| |||||||| |||| || || ||||||| || |    
T  20989877 ggaaatccactagtgtagtccttattctatagctctcagcaaactcctcgtttacattaaagacctatgacctacctgtatagacttgaacctagaaact 20989778  T
Q  391 cctagatctgacatcccatctcactatcct-acagtcaatcacagcccctgtgatctatc 449  Q
    |||||||| || ||| |||||||||||||| |  |||||||||||||||||||| |||||    
T  20989777 cctagatccgagatctcatctcactatcctaatggtcaatcacagcccctgtgacctatc 20989718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 88 - 421
Target Start/End: Complemental strand, 15897989 - 15897656
Alignment:
Q  88 atttttgaaattctagcacacttgttttaatatgttatgtatgatgttttgacgtttgcaatgttatgattaatgtttcgacatcacgcgataagcagaa 187  Q
    |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||| || | || ||||| |||||||||||||| |||||    
T  15897989 atttatgaaattctaacacacttgttttaatatgttatgtacgatgttttaacgtatgcaatgttttgttcaaggtttcaacatcacgcgataaacagaa 15897890  T
Q  188 ataaaaacaagaaaataaatgacaggaaagtaaagaacacaatgagtttgttgacccaactcggtgacaaacacacctactatgggggctaccaagcaag 287  Q
     |||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||    
T  15897889 gtaaaaataagaaaataaaagacaagaaagtaaagaacaaaatgagtttgttgacccagttcggtgacaaacacacctactctgggggctaccaagctag 15897790  T
Q  288 gaaggaaatccactagtgtagtccttattttgtagctctcaacaaactcctcatttacactaaagacctaggacctacccgtattgatttcaacctagga 387  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| | ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||| ||  | |||||||||    
T  15897789 gaaggaaatccactagtgtagtccttattctatagctcttagcaaactcctcatttacaataacgacctaggacctacccatatagacgtaaacctagga 15897690  T
Q  388 attcctagatctgacatcccatctcactatccta 421  Q
    |   |||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  15897689 acgactagatctgagatccaatctcactatccta 15897656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 179; E-Value: 2e-96
Query Start/End: Original strand, 92 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 12039993 - 12039691
Alignment:
Q  92 ttgaaattctagcacacttgttttaatatgttatgtatgatgttttgacgtttgcaatgttatgattaatgtttcgacatcacgcgataagcagaaataa 191  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |  | |||||||| ||||||||||||||  | | |||||| | | |||||| ||||| |||||||||    
T  12039993 ttgaaattctagcacacttgttttaatatgttctacacgatgttttaacgtttgcaatgtttcgttcaatgttccaatatcacgagataaacagaaataa 12039894  T
Q  192 aaacaagaaaataaatgacaggaaagtaaagaacacaatgagtttgttgacccaactcggtgacaaacacacctactatgggggctaccaagcaaggaag 291  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  12039893 aaacaagaaaataaacgacaagaaagtaaagaacacaatgagtttgttgacctagttcggtgacgaacacacctactttgggggctaccaagctaggaag 12039794  T
Q  292 gaaatccactagtgtagtccttattttgtagctctcaacaaactcctcatttacactaaagacctaggacctacccgtattgatttcaacctaggaattc 391  Q
    ||||||  ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||| ||    
T  12039793 gaaatcttctagtgtagtccttattctatagctctcaacaaactcctcgtttacactaaagacctaggacctactcgtatagacttcaacctaggaactc 12039694  T
Q  392 cta 394  Q
    |||    
T  12039693 cta 12039691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 178; E-Value: 8e-96
Query Start/End: Original strand, 93 - 421
Target Start/End: Complemental strand, 9282019 - 9281690
Alignment:
Q  93 tgaaattctagcacacttgttttaatatgttatgtatgatgttttgacgtttgcaatgttatgattaatgtttcgacatcacgcgataagcagaaataaa 192  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||| |||||||| | | |||||| | |||||| ||||||| ||||||||||    
T  9282019 tgaaattctagcgcacttgttttaatacgttatgtatgatgttttaaagttttcaatgttaagttcaatgttccaacatcaagcgataaacagaaataaa 9281920  T
Q  193 aacaagaaaataaatgacaggaaagtaaagaacacaatgagtttgttgacccaactcggtgacaaacacacctactatgggggctaccaagcaaggaagg 292  Q
    |||||  ||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||| | |  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||    
T  9281919 aacaattaaataaaagacagaaaagtaatgaacacaatgagtttgttgatctagttcggtgacaaacacacctactctgggggctaccaagcctggaagg 9281820  T
Q  293 aaatccactagtgtagtccttattttgtagctctcaacaaactcctcatttacacta-aagacctaggacctacccgtattgatttcaacctaggaattc 391  Q
    ||||||||||||||||||||||||   ||||||||| |||||||||| ||||||||| | |||||| ||||||||||||| || ||||||||||||| ||    
T  9281819 aaatccactagtgtagtccttattcaatagctctcagcaaactcctcgtttacactatatgacctaagacctacccgtatagacttcaacctaggaactc 9281720  T
Q  392 ctagatctgacatcccatctcactatccta 421  Q
    |||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  9281719 ctagatttgagatcccatctcactatccta 9281690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 178; E-Value: 8e-96
Query Start/End: Original strand, 93 - 421
Target Start/End: Original strand, 17234440 - 17234769
Alignment:
Q  93 tgaaattctagcacacttgttttaatatgttatgtatgatgttttgacgtttgcaatgttatgattaatgtttcgacatcacgcgataagcagaaataaa 192  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | | |||||||||||| ||||||| |||| |||||||| |||||  |||||||||    
T  17234440 tgaaattctagcacacttgttttaatatattatgtatgatgtttcggcatttgcaatgttacgattaatatttcaacatcacgtgataaatagaaataaa 17234539  T
Q  193 aacaagaaaataaatgacaggaaagtaaagaacacaatgagtttgttgacccaactcggtgacaaacacacctactatgggggctaccaagcaaggaagg 292  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||| | |||||||||||||   |||||    
T  17234540 aataagaaaataaatgacaggaaagtaaagaacacaatgagtttgttgacccagtttggtgacaaacacacctactctaggggctaccaagcccagaagg 17234639  T
Q  293 aaatccactagtgtagtccttattttgtagctctcaacaaactcctcatttacacta-aagacctaggacctacccgtattgatttcaacctaggaattc 391  Q
    |||||||| |||||||||||||||   ||||||||  ||||||||   ||||||||| | |||||| ||||||||||||| || ||||||||||||| ||    
T  17234640 aaatccaccagtgtagtccttattcaatagctctctgcaaactccctgtttacactatatgacctatgacctacccgtatagacttcaacctaggaactc 17234739  T
Q  392 ctagatctgacatcccatctcactatccta 421  Q
    |||||||||| ||| ||||| |||||||||    
T  17234740 ctagatctgatatctcatcttactatccta 17234769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 170; E-Value: 5e-91
Query Start/End: Original strand, 96 - 418
Target Start/End: Complemental strand, 8465975 - 8465657
Alignment:
Q  96 aattctagcacacttgttttaatatgttatgtatgatgttttgacgtttgcaatgttatgattaatgtttcgacatcacgcgataagcagaaataaaaac 195  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||  | | |||||| | ||||||||  |||| | |||||||||||    
T  8465975 aattctagcgcacttgttttaatatgttctatatgatgttttaacgtttgcaatgttccgttcaatgttccaacatcacgaaataaactgaaataaaaac 8465876  T
Q  196 aagaaaataaatgacaggaaagtaaagaacacaatgagtttgttgacccaactcggtgacaaacacacctactatgggggctaccaagcaaggaaggaaa 295  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||     |||||     
T  8465875 aagaaagtaaatgacaggaaagtaaagaacacaatgagtttgttgacccatttcggtgacaaacacacctactctgggggctgccaagc----caggaat 8465780  T
Q  296 tccactagtgtagtccttattttgtagctctcaacaaactcctcatttacactaaagacctaggacctacccgtattgatttcaacctaggaattcctag 395  Q
    ||| ||||||||||||||| | | ||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| || |||| ||||||    
T  8465779 tccgctagtgtagtccttactctatagctctcagcaaactccaaatttacactaaagacctaggacctacccgtatagacttcaatcttggaactcctag 8465680  T
Q  396 atctgacatcccatctcactatc 418  Q
    |||||| ||||||||||||||||    
T  8465679 atctgagatcccatctcactatc 8465657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 166; E-Value: 1e-88
Query Start/End: Original strand, 93 - 449
Target Start/End: Original strand, 20558151 - 20558507
Alignment:
Q  93 tgaaattctagcacacttgttttaatatgttatgtatgatgttttgacgtttgcaatgttatgattaatgtttcgacatcacgcgataagcagaaataaa 192  Q
    |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| | | |||||| | |||||||||||||| ||||||||||    
T  20558151 tgaaattcgagcgcacttgttttaatatgttatgtatgatgttttaacgtttgcgatgttacgttcaatgttccaacatcacgcgataaacagaaataaa 20558250  T
Q  193 aacaagaaaataaatgacaggaaagtaaagaacacaatgagtttgttgacccaactcggtgacaaacacacctactatgggggctaccaagcaaggaagg 292  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| |||||  |||||| |||   |||||| | ||| ||||||||||| |||||||    
T  20558251 aacaagaaaataaatgacaagaaagtaaagaacacagtgagtttgttaacccagttcggtg-caacgtcacctagtctggaggctaccaagccaggaagg 20558349  T
Q  293 aaatccactagtgtagtccttattttgtagctctcaacaaactcctcatttacac-taaagacctaggacctacccgtattgatttcaacctaggaattc 391  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |  | |||||| |||||||||| ||||||| | | |||||||||||||||||| | || ||||||||| ||| ||    
T  20558350 aaatccactagtgtagcccttattctaaaactctcagcaaactcctcgtttacactttatgacctaggacctacccgtctagacttcaacctaagaactc 20558449  T
Q  392 ctagatctgacatcccatctcactatcctacagtcaatcacagcccctgtgatctatc 449  Q
    |||||| ||| ||| |||||||||||| ||  |||| ||||||||||||||| |||||    
T  20558450 ctagatatgagatctcatctcactatcttatggtcagtcacagcccctgtgacctatc 20558507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 164; E-Value: 2e-87
Query Start/End: Original strand, 191 - 449
Target Start/End: Complemental strand, 20470415 - 20470156
Alignment:
Q  191 aaaacaagaaaataaatgacaggaaagtaaagaacacaatgagtttgttgacccaactcggtgacaaacacacctactatgggggctaccaagcaaggaa 290  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||| ||||| |||||||||| ||| ||||||||||| |||||    
T  20470415 aaaacaagaaaataaatgacaggaaagtaaagaacataatgagtttgttgacccagttcggcgacaatcacacctactctggaggctaccaagccaggaa 20470316  T
Q  291 ggaaatccactagtgtagtccttattttgtagctctcaacaaactcctcatttacactaaagacctaggacctacccgtattgatttcaacctaggaatt 390  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| |    
T  20470315 ggaaatccactagtgtactccttattctatagctctcagcaaactcctcgtttacactaaagacctaggacctacccgtatagacttcaacctaggaact 20470216  T
Q  391 cctagatctgacatcccatctcactatcct-acagtcaatcacagcccctgtgatctatc 449  Q
    ||||||||||| ||| |||||||||||||| |  |||| ||||||||||||||| |||||    
T  20470215 cctagatctgagatctcatctcactatcctaatggtcagtcacagcccctgtgacctatc 20470156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 164; E-Value: 2e-87
Query Start/End: Original strand, 186 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 23882912 - 23882653
Alignment:
Q  186 aaataaaaa-caagaaaataaatgacaggaaagtaaagaacacaatgagtttgttgacccaactcggtgacaaacacacctactatgggggctaccaagc 284  Q
    ||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||      
T  23882912 aaataaaaagcatgaaaataaatgacacgaaagtaaagaacacaatgagtttgttgacccagttcggtgacaaacacacctactctgggggctaccaaat 23882813  T
Q  285 aaggaaggaaatccactagtgtagtccttattttgtagctctcaacaaactcctcatttacactaaagacctaggacctacccgtattgatttcaaccta 384  Q
     ||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||| || ||||||| |  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  23882812 caggaaggaaatccactagtgtagtctttattctatagctcccagcaaactctttgtttacactaaagacctaggacctacctgtattgatttcaaccta 23882713  T
Q  385 ggaattcctagatctgacatcccatctcactatcctacagtcaatcacagcccctgtgat 444  Q
     ||| |||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  23882712 tgaactcctagatctgatatctcatctcactatcttacagtcaatcacagcccctgtgat 23882653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 164; E-Value: 2e-87
Query Start/End: Original strand, 186 - 449
Target Start/End: Complemental strand, 29255132 - 29254870
Alignment:
Q  186 aaataaaaacaagaaaataaatgacaggaaagtaaagaacacaatgagtttgttgacccaactcggtgacaaacacacctactatgggggctaccaagca 285  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||  || ||| |||||||||||||| | ||| ||| |||||     
T  29255132 aaataaaaacaagaaagtaaatgacaagaaagtaaagaacacggtgagtttgttgacccagttcagtggcaaacacacctactctaggg-ctatcaagcc 29255034  T
Q  286 aggaaggaaatccactagtgtagtccttattttgtagctctcaacaaactcctcatttacactaaagacctaggacctacccgtattgatttcaacctag 385  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||     
T  29255033 aggaagaaaatccactagtgtagtccttattctatagctctcagcaaactcctcgtttacactaaagacctaggacctacccgtattgatttcaacttat 29254934  T
Q  386 gaattcctagatctgacatcccatctcactatcctacagtcaatcacagcccctgtgatctatc 449  Q
    ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||    
T  29254933 gaactcctagatctgagatcccatctcactatcctatagtcaatcacagcccatgtgatctatc 29254870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 195 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 26965779 - 26965529
Alignment:
Q  195 caagaaaataaatgacaggaaagtaaagaacacaatgagtttgttgacccaactcggtgacaaacacacctactatgggggctaccaagcaaggaaggaa 294  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||   |||||  ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||  |||||||||    
T  26965779 caagaaaataaatgacaagaaagtaaaaggcacaaacagtttgttgacccagttcggtgacaaacacacctactctggaggctatcaagtcaggaaggaa 26965680  T
Q  295 atccactagtgtagtccttattttgtagctctcaacaaactcctcatttac-actaaagacctaggacctacccgtattgatttcaacctaggaattcct 393  Q
    |||||||||||||||||||||| |  || ||||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| | || ||||||||||||| ||||    
T  26965679 atccactagtgtagtccttattctaaagttctcagcaaactcctcatttacaacttaagacctaggacctacccgtctagacttcaacctaggaactcct 26965580  T
Q  394 agatctgacatcccatctcactatcctacagtcaatcacagcccctgtgat 444  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  26965579 agatctgagatcccatctcactatcctacaatcaatcacaacccctgtgat 26965529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 93 - 274
Target Start/End: Original strand, 25948377 - 25948558
Alignment:
Q  93 tgaaattctagcacacttgttttaatatgttatgtatgatgttttgacgtttgcaatgttatgattaatgtttcgacatcacgcgataagcagaaataaa 192  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||   ||||||||||| || |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  25948377 tgaaattctagcacacttgttttaatacattatgtatgttgtttcagcgtttgcaatgatacgattaatgtttcaacatcacgcgataaacagaaataaa 25948476  T
Q  193 aacaagaaaataaatgacaggaaagtaaagaacacaatgagtttgttgacccaactcggtgacaaacacacctactatgggg 274  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||    
T  25948477 aacaagaaaataaatgacaggaaagtaaagaacacaatgagtttgttgacccagttcggtgacaaacacacctactctgggg 25948558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 126; E-Value: 8e-65
Query Start/End: Original strand, 232 - 417
Target Start/End: Original strand, 24501812 - 24501997
Alignment:
Q  232 agtttgttgacccaactcggtgacaaacacacctactatgggggctaccaagcaaggaaggaaatccactagtgtagtccttattttgtagctctcaaca 331  Q
    |||||||| |||||  ||||||||||||||||||||| | | ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||    
T  24501812 agtttgttaacccagttcggtgacaaacacacctactctagaggctaccaagccagaaaggaaatccactagtgtagtccttattctatagctctcagca 24501911  T
Q  332 aactcctcatttacactaaagacctaggacctacccgtattgatttcaacctaggaattcctagatctgacatcccatctcactat 417  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| | |||||||||||||||    
T  24501912 aactcctcatttacactaaagacctaggacctacccgtattgatttcaacctagaaactcctagatctaagatcccatctcactat 24501997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 183 - 421
Target Start/End: Complemental strand, 17528105 - 17527866
Alignment:
Q  183 cagaaataaaaacaagaaaataaatgacaggaaagtaaagaacacaatgagtttgttgacccaactcggtgacaaacacacctactatgggggctaccaa 282  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||  || |||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  17528105 cagaaataaaaacaagaaaataaaagacaggaaagtaaagaacacagtgagtttgttaacccagttcagtgacaaacacacctactattggggctaccaa 17528006  T
Q  283 gcaaggaaggaaatccactagtgtagtccttattttgtagctctcaacaaactcctcatttacacta-aagacctaggacctacccgtattgatttcaac 381  Q
    || || |||  |||||||||||||||||||||||   ||| ||||| |||||||||  ||||||||| | |||||||||||||||| ||| || ||||||    
T  17528005 gccagaaagttaatccactagtgtagtccttattcaatagttctcagcaaactccttgtttacactatatgacctaggacctacccatatagacttcaac 17527906  T
Q  382 ctaggaattcctagatctgacatcccatctcactatccta 421  Q
    ||||||| || |||||| || || ||||||||||||||||    
T  17527905 ctaggaactcatagatcagagattccatctcactatccta 17527866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 92 - 449
Target Start/End: Complemental strand, 17864723 - 17864379
Alignment:
Q  92 ttgaaattctagcacacttgttttaatatgttatgtatgatgttttgacgtttgcaatgttatgattaatgtttcgacatcacgcgataagcagaaataa 191  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||| ||||||   | | |||||| | ||||||||  ||||  ||||||||    
T  17864723 ttgaaattctagcgcacttgttttaatatgttatgtaagatgtttcaacgtttacaatgtaccgttcaatgttgcaacatcacgaaataaatagaaataa 17864624  T
Q  192 aaacaagaaaataaatgacaggaaagtaaa-gaacacaatgagtttgttgacccaactcggtgacaaacacacctactatgggggctaccaagcaaggaa 290  Q
    |||              ||| ||||||| | ||||||| | |||||||||||| |  ||||||||||||||||||||| |||||| |||||| | |||||    
T  17864623 aaa--------------acaagaaagtagatgaacacagtaagtttgttgacctagttcggtgacaaacacacctactctgggggttaccaatccaggaa 17864538  T
Q  291 ggaaatccactagtgtagtccttattttgtagctctcaacaaactcctcatttacactaaagacctaggacctacccgtattgatttcaacctaggaatt 390  Q
    | |||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||| ||||||||||||  |||||||||||| |||| || ||||||||||||| |    
T  17864537 gaaaatccactagtgtagtccttattctatagctctcagcaaactcctcgtttacactaaagtactaggacctacctgtatagacttcaacctaggaact 17864438  T
Q  391 cctagatctgacatcccatctcactatcctacagtcaatcacagcccctgtgatctatc 449  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||  || | ||||| ||||||||| |||||    
T  17864437 cctagatctgagatcccatctcactatcctatggtaagtcacaacccctgtgacctatc 17864379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 168 - 439
Target Start/End: Complemental strand, 21706585 - 21706310
Alignment:
Q  168 acatcacgcgataagcagaaataaaaacaagaaaataaatgacaggaaagtaaagaacacaatgagtttgttgacccaactcggtgacaaacacacctac 267  Q
    |||||| | ||||| || ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  | ||||||||||||||||||    
T  21706585 acatcaagtgataaacataaataaaaacaagaaaataatcgacaggaaagtaaagaacacaatgagtttgttaacccagtttggtgacaaacacacctac 21706486  T
Q  268 -tatgggggctaccaagcaaggaaggaaatccactagtgtagtccttattttgtagctctcaacaaactcctcatttacacta-aagacctaggacctac 365  Q
     |  ||||||| || ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||   ||||||||| |||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||    
T  21706485 gtccgggggct-cctagctaggaagaaaatccactagtgtagtccttattcaatagctctcagcaaactcctcgtttacactatatgacctaggacctac 21706387  T
Q  366 ccgtattgatttcaacctaggaattcctag--atctgacatcccatctcactatcctac-agtcaatcacagcccct 439  Q
    |||| | ||| |||||||||||| ||||||  |||||| ||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||    
T  21706386 ccgtctagatatcaacctaggaactcctagatatctgagatcccatctcactatcctactggtcagtcacagcccct 21706310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 101; E-Value: 7e-50
Query Start/End: Original strand, 93 - 327
Target Start/End: Original strand, 25782659 - 25782894
Alignment:
Q  93 tgaaattctagcacacttgttttaatatgttatgtatgatgttttgacgtttgcaatgttatgatt-aatgtttcgacatcacgcgataagcagaaataa 191  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||   | |||| |||||| | ||| |||| ||| ||||| || ||||| |||||||||    
T  25782659 tgaaattctagcgcacttgttttaatatgttatgtacgatgtttaagcatttgtaatgtt-tcattcaatgcttcaacatcgcgagataaacagaaataa 25782757  T
Q  192 aaacaagaaaataaatgacaggaaagtaaagaaca-caatgagtttgttgacccaactcggtgacaaacacacctactatgggggctaccaagcaaggaa 290  Q
    |||||||||| |||||||||||||| | ||||||| || |||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| || ||    
T  25782758 aaacaagaaagtaaatgacaggaaatttaagaacaacagtgagtttgttaacccagttcggtgacaaacacacctactctggaggctaccaagccagtaa 25782857  T
Q  291 ggaaatccactagtgtagtccttattttgtagctctc 327  Q
    |||||||||||||||||| | ||||| | ||||||||    
T  25782858 ggaaatccactagtgtagccattattctatagctctc 25782894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 252 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 21723560 - 21723389
Alignment:
Q  252 tgacaaacacacctac-tatgggggctaccaagcaaggaaggaaatccactagtgtagtccttattttgtagctctcaacaaactcctcatttacactaa 350  Q
    ||||||| |||||||| | |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||| |||||||||| |||||||||     
T  21723560 tgacaaatacacctacgtctgggggct-ccaagccaggaaggaaatccactagtgtagtccttattcaatagctctcagcaaactcctcgtttacactat 21723462  T
Q  351 a-gacctaggacctacccgtattgatttcaacctaggaattcctagatctgacatcccatctcactatcctac 422  Q
    | |||||||||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  21723461 atgacctaggacctacccgtctagatttcaacctaggaactcctagatctgagatcccatctcactatcctac 21723389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 261 - 415
Target Start/End: Complemental strand, 16309499 - 16309346
Alignment:
Q  261 cacctactatgggggctaccaagcaaggaaggaaatccactagtgtagtccttattttgtagctctcaacaaactcctcatttacactaaagacctagga 360  Q
    |||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  16309499 cacctactctgggggctaccaagccagga-ggaaatccactagtatagtccttattctctagctctcagcaaactcctcgtttacactaaagacctagga 16309401  T
Q  361 cctacccgtattgatttcaacctaggaattcctagatctgacatcccatctcact 415  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||||| || ||||||||| ||| |||||||||    
T  16309400 cctacccgtcttgacttcaacctaggaactcgtagatctgagatctcatctcact 16309346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 272 - 445
Target Start/End: Complemental strand, 3567553 - 3567380
Alignment:
Q  272 ggggctaccaagcaaggaaggaaatccactagtgtagtccttattttgtagctctcaacaaactcctcatttacactaaagacctaggacctacccgtat 371  Q
    ||||||||||||  ||||| | |||||||||||||||| |||||| |  |||||||| |||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  3567553 ggggctaccaagttaggaaagtaatccactagtgtagttcttattctaaagctctcagcaaaatcctcgtttacacttaagacctaggacctacccgtat 3567454  T
Q  372 tgatttcaacctaggaattcctagatctgacatcccatctcactatcctacagtcaatcacagcccctgtgatc 445  Q
    ||||||||||||| ||| | |||||||| | ||| |||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||    
T  3567453 tgatttcaacctaagaacttctagatctaagatctcatctcactatcctacaaccaatcacagccactgtgatc 3567380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 272 - 433
Target Start/End: Original strand, 28623556 - 28623717
Alignment:
Q  272 ggggctaccaagcaaggaaggaaatccactagtgtagtccttattttgtagctctcaacaaactcctcatttacactaaagacctaggacctacccgtat 371  Q
    ||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||| |  |||||| | |||| || || |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  28623556 ggggctaccaagccaggaaggaaataaactagtgtagtccttattctaaagctctgagcaaaatcttcgtttacacttaagacctaggacctacccgtat 28623655  T
Q  372 tgatttcaacctaggaattcctagatctgacatcccatctcactatcctacagtcaatcaca 433  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| ||| ||| |||||||||||||||||  ||||||||    
T  28623656 tgatttcaacctaggaactcctagatttgagatctcatctcactatcctacaaccaatcaca 28623717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 210 - 449
Target Start/End: Complemental strand, 34657344 - 34657104
Alignment:
Q  210 caggaaagtaaagaacacaatgagtttgttgacccaactcggtgacaaacacacctac-tatgggggctaccaagcaaggaaggaaatccactagtgtag 308  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||| |||||  ||||  |||| | ||||||| | | ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  34657344 caggaaagtaaagaacacagagagtttgttaacccagttcggc-acaa-ctcacctacatctaggggctaccaagccaagaaggaaatccactagtgtag 34657247  T
Q  309 tccttattttgtagctctcaacaaactcctcatttacacta-aagacctaggacctacccgtattgatttcaacctaggaattcctagatctgacatccc 407  Q
    ||||||||   ||||||||| |||||||||| ||||||||| | ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||| ||  |    
T  34657246 tccttattcaatagctctcagcaaactcctcgtttacactatatgacctaggaccaacccgtatagatttcaacctaggaactcccagatctgagatatc 34657147  T
Q  408 atctcactatcct-acagtcaatcacagcccctgtgatctatc 449  Q
    ||||||||||||| |  |||| |||||||| |||||| |||||    
T  34657146 atctcactatcctaatggtcagtcacagccactgtgacctatc 34657104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 79; E-Value: 9e-37
Query Start/End: Original strand, 261 - 415
Target Start/End: Original strand, 15038364 - 15038518
Alignment:
Q  261 cacctactatgggggctaccaagcaaggaaggaaatccactagtgtagtccttattttgtagctctcaacaaactcctcatttacactaaagacctagga 360  Q
    |||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||   |||||||||  ||||||||| ||| ||| || |||||||||    
T  15038364 cacctactctgggggctaccaagtcaggaaggaaatccactagtgtagtccgtattcaatagctctcaggaaactcctcgtttgcacaaatgacctagga 15038463  T
Q  361 cctacccgtattgatttcaacctaggaattcctagatctgacatcccatctcact 415  Q
    || ||||||| ||| |||||||||| || |||||||||||| |||||||||||||    
T  15038464 ccaacccgtactgacttcaacctagtaactcctagatctgagatcccatctcact 15038518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 79; E-Value: 9e-37
Query Start/End: Original strand, 261 - 415
Target Start/End: Complemental strand, 16137724 - 16137570
Alignment:
Q  261 cacctactatgggggctaccaagcaaggaaggaaatccactagtgtagtccttattttgtagctctcaacaaactcctcatttacactaaagacctagga 360  Q
    |||||||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||| |||||||||| ||| || ||| |||||||||    
T  16137724 cacctactctgagggctaccaagccaggaaggaaatccactagtgtagtccttattcaatagctctcagcaaactcctcgtttgcagtaatgacctagga 16137625  T
Q  361 cctacccgtattgatttcaacctaggaattcctagatctgacatcccatctcact 415  Q
     ||||||||| ||| ||||||||||||| || || |||||| ||| |||||||||    
T  16137624 tctacccgtactgacttcaacctaggaactcataaatctgagatcacatctcact 16137570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 79; E-Value: 9e-37
Query Start/End: Original strand, 272 - 421
Target Start/End: Original strand, 25964722 - 25964872
Alignment:
Q  272 ggggctaccaagcaaggaaggaaatccactagtgtagtccttattttgtagctctcaacaaactcctcatttacactaaa-gacctaggacctacccgta 370  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| | |||| || |  |||||| || ||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  25964722 ggggctaccaagccaggaaggaaatccactagggtagtccttattctatagcccttagaaaactcatcgtttacactatatgacctaggacctacccgta 25964821  T
Q  371 ttgatttcaacctaggaattcctagatctgacatcccatctcactatccta 421  Q
    | || ||||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  25964822 tagacttcaacctaggaactcctagatctgagatcccatatcactatccta 25964872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 79; E-Value: 9e-37
Query Start/End: Original strand, 272 - 421
Target Start/End: Original strand, 25969369 - 25969519
Alignment:
Q  272 ggggctaccaagcaaggaaggaaatccactagtgtagtccttattttgtagctctcaacaaactcctcatttacactaaa-gacctaggacctacccgta 370  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| | |||| || |  |||||| || ||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  25969369 ggggctaccaagccaggaaggaaatccactagggtagtccttattctatagcccttagaaaactcatcgtttacactatatgacctaggacctacccgta 25969468  T
Q  371 ttgatttcaacctaggaattcctagatctgacatcccatctcactatccta 421  Q
    | || ||||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  25969469 tagacttcaacctaggaactcctagatctgagatcccatatcactatccta 25969519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 79; E-Value: 9e-37
Query Start/End: Original strand, 272 - 421
Target Start/End: Original strand, 25973809 - 25973959
Alignment:
Q  272 ggggctaccaagcaaggaaggaaatccactagtgtagtccttattttgtagctctcaacaaactcctcatttacactaaa-gacctaggacctacccgta 370  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| | |||| || |  |||||| || ||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  25973809 ggggctaccaagccaggaaggaaatccactagggtagtccttattctatagcccttagaaaactcatcgtttacactatatgacctaggacctacccgta 25973908  T
Q  371 ttgatttcaacctaggaattcctagatctgacatcccatctcactatccta 421  Q
    | || ||||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  25973909 tagacttcaacctaggaactcctagatctgagatcccatatcactatccta 25973959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 195 - 444
Target Start/End: Original strand, 11960430 - 11960683
Alignment:
Q  195 caagaaaataaatgacaggaaagtaaagaacaca-atgagt-ttgttgacccaactcggtgacaaacacacctactatgggggctaccaagcaaggaagg 292  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||  ||||| | |||  ||||| |||||| || |||||||||||||||||  |   ||||||||||| | |||||    
T  11960430 caagaaaataaatgacaagaaagtaaatgacacagaggagagttgttaacccaattcagtgacaaacacacctaccctcaaggctaccaagccacgaagg 11960529  T
Q  293 aaatccactagtgtagtcctt-attttgtagctctcaacaaactcctcatttaca-ctaaagacctaggacctacccgtattgatttcaacctaggaatt 390  Q
    ||||| | |||||||||| || ||| |  || ||||| |||||||||| |||||| || |||||||||||||||||||| | || ||||||||||||| |    
T  11960530 aaatctattagtgtagtcttttattctaaagttctcagcaaactcctcgtttacaactgaagacctaggacctacccgtctagacttcaacctaggaact 11960629  T
Q  391 cctagatctgacatcccatctcactatcctacagtcaatcacagcccctgtgat 444  Q
    |||| |||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||| ||| ||| ||||    
T  11960630 cctacatctgatatctcatctcactatcctacaatcaatcatagctcctatgat 11960683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 74; E-Value: 9e-34
Query Start/End: Original strand, 231 - 415
Target Start/End: Complemental strand, 12444891 - 12444710
Alignment:
Q  231 gagtttgttgacccaactcggtgacaaacacacctactatgggggctaccaagcaaggaaggaaatccactagtgtagtccttattttgtagctctcaac 330  Q
    ||||||||| |||||  |||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||    |||||||| |    
T  12444891 gagtttgttaacccagttcggtgacaa-cacacctactctggaggctaccaagctaggaaggaactccactagtgtagtccgtattcaaaagctctcagc 12444793  T
Q  331 aaactcctcatttacactaaagacctaggacctacccgtattgatttcaacctaggaattcctagatctgacatcccatctcact 415  Q
    ||||  | | ||| |||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||| ||| |||||| ||||||    
T  12444792 aaac--cacgtttgcactaatgacctaggacctacccgtactgacttcaacctaggaactcctagatttgagatcccacctcact 12444710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 71; E-Value: 6e-32
Query Start/End: Original strand, 274 - 415
Target Start/End: Original strand, 9384643 - 9384784
Alignment:
Q  274 ggctaccaagcaaggaaggaaatccactagtgtagtccttattttgtagctctcaacaaactcctcatttacacta-aagacctaggacctacccgtatt 372  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||| |||||||||| ||| ||||| | ||||||||||||||||||| |    
T  9384643 ggctaccaagtcaggaaggaaatccactagtgtagtccttattcaatagctctcagcaaactcctcgtttgcactatatgacctaggacctacccgtact 9384742  T
Q  373 gatttcaacctaggaattcctagatctgacatcccatctcact 415  Q
    || ||||||||||||| | || ||||||| |||||||||||||    
T  9384743 gacttcaacctaggaact-cttgatctgagatcccatctcact 9384784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 93 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 21717855 - 21717698
Alignment:
Q  93 tgaaattctagcacacttgttttaatatgttatgtatgatgttttgacgtttgcaatgttatgattaatgtttcgacatcacgcgataagcagaaataaa 192  Q
    ||||||||||||   ||||||||| ||  || |||  |||||||| | ||||||||||||  | |||||||| | |||||||| ||||| ||||||||||    
T  21717855 tgaaattctagcgttcttgttttattaaattctgtcagatgttttaatgtttgcaatgttccgtttaatgttccaacatcacgtgataaacagaaataaa 21717756  T
Q  193 aacaagaaaataaatgacaggaaagtaaagaacacaatgagtttgttgacccaactcg 250  Q
    | |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  21717755 atcaagaaaataaacgactggaaagtaaagaacacaatgagtttgttgacccagctcg 21717698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 93 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 21725691 - 21725534
Alignment:
Q  93 tgaaattctagcacacttgttttaatatgttatgtatgatgttttgacgtttgcaatgttatgattaatgtttcgacatcacgcgataagcagaaataaa 192  Q
    ||||||||||||   ||||||||| ||  || |||  |||||||| | ||||||||||||  | |||||||| | |||||||| ||||| ||||||||||    
T  21725691 tgaaattctagcgttcttgttttattaaattctgtcagatgttttaatgtttgcaatgttccgtttaatgttccaacatcacgtgataaacagaaataaa 21725592  T
Q  193 aacaagaaaataaatgacaggaaagtaaagaacacaatgagtttgttgacccaactcg 250  Q
    | |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  21725591 atcaagaaaataaacgactggaaagtaaagaacacaatgagtttgttgacccagctcg 21725534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 261 - 415
Target Start/End: Complemental strand, 15003305 - 15003150
Alignment:
Q  261 cacctactatgggggctaccaagcaaggaaggaaatccactagtgtagtccttattttgtagctctcaacaaactcctcatttacacta-aagacctagg 359  Q
    |||||||| ||| || |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||| |||||||||  ||| ||||| | ||||||||    
T  15003305 cacctactctggtggataccaagccatgaaggaaatccactagtgtagtccttattcaatagctctcagcaaactccttgtttgcactatatgacctagg 15003206  T
Q  360 acctacccgtattgatttcaacctaggaattcctagatctgacatcccatctcact 415  Q
    ||||||||||| ||| |||||| |||||| |||||||| ||| ||| |||||||||    
T  15003205 acctacccgtactgacttcaacataggaactcctagatttgagatctcatctcact 15003150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 277 - 415
Target Start/End: Original strand, 19215985 - 19216124
Alignment:
Q  277 taccaagcaaggaaggaaatccactagtgtagtccttattttgtagctctcaacaaactcctcatttacacta-aagacctaggacctacccgtattgat 375  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||   ||||||||| |||||||||| ||| ||||| | ||||||||||||||||||| | |     
T  19215985 taccaagccaggaaggaaatccactagtgtagtccgtattcaatagctctcagcaaactcctcgttttcactatatgacctaggacctacccgtactaac 19216084  T
Q  376 ttcaacctaggaattcctagatctgacatcccatctcact 415  Q
    |||||| |||||| |||||||| ||| |||||||||||||    
T  19216085 ttcaacttaggaactcctagatttgagatcccatctcact 19216124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 261 - 415
Target Start/End: Original strand, 20003153 - 20003308
Alignment:
Q  261 cacctactatgggggctaccaagcaaggaaggaaatccactagtgtagtccttattttgtagctctcaacaaactcctcatttacactaaa-gacctagg 359  Q
    |||||||| | ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||   |||||||||  |||| |||| ||| ||||| | ||||||||    
T  20003153 cacctactttaggggctaccaagccaggaaggaaatcaactagtgtagttcttattcaatagctctcaggaaacccctcgtttgcactatatgacctagg 20003252  T
Q  360 acctacccgtattgatttcaacctaggaattcctagatctgacatcccatctcact 415  Q
    ||||||||||| | | ||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||    
T  20003253 acctacccgtacttacttcaacctaggaactcctagatttgagatcccatctcact 20003308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 270 - 415
Target Start/End: Complemental strand, 21323407 - 21323262
Alignment:
Q  270 tgggggctaccaagcaaggaaggaaatccactagtgtagtccttattttgtagctctcaacaaactcctcatttaca-ctaaagacctaggacctacccg 368  Q
    |||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||| |  || | ||||||||||||||||||||| ||  ||| |||||| ||| |||    
T  21323407 tgggggctaccaaatcaggaaggaaatccactagtgtagtccttattcta-agttatcaacaaactcctcatttacaactctagaactaggatctaaccg 21323309  T
Q  369 tattgatttcaacctaggaattcctagatctgacatcccatctcact 415  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||    
T  21323308 tattgacttcaacctaggaactcctagatctgagatctcatctcact 21323262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 248 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 20765149 - 20764954
Alignment:
Q  248 tcggtgacaaacacacctactatgggggctaccaagcaaggaaggaaatccactagtgtagtccttattttgtagctctcaacaaactcctcatttac-a 346  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||| |||||| || ||||||||||||||||||||| |  || ||||||||||||   | ||||| |    
T  20765149 tcggtgacaaacacacttactctgggggcgaccaagccaggaagaaagtccactagtgtagtccttattct-aagttctcaacaaactttccgtttacaa 20765051  T
Q  347 ctaaagacctaggacctacccgtattgatttcaacctaggaattcctagatctgacatcccatctcactatcctacagtcaatcacagcccctgtgat 444  Q
    ||  ||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||| || ||||||||| ||| ||||||||| |||  || |||| |||| ||||||||||    
T  20765050 ctctagacctaggacctacccgtcttgacttcaacctaagaactcttagatctgagatctcatctcact-tccctcaatcaaccacaacccctgtgat 20764954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 281 - 449
Target Start/End: Original strand, 19171452 - 19171622
Alignment:
Q  281 aagcaaggaaggaaatccactagtgtagtccttattttgtagctctcaacaaactcctcatttacactaaa-gacctaggacctacccgtattgatttca 379  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||   || |||||| |||| ||||   ||| |||| | |||||||||||||||||||| || ||||    
T  19171452 aagctaggaaggaaatccactagtgtagtccttattcaataactctcagcaaagtccttgcttatactatatgacctaggacctacccgtatagacttca 19171551  T
Q  380 acctaggaattcctagatctgacatcccatctcactatcct-acagtcaatcacagcccctgtgatctatc 449  Q
    ||||| ||| |||||||||||| || ||||||||||||||| |  |||| ||||||||| ||||| |||||    
T  19171552 acctatgaactcctagatctgagattccatctcactatcctaatggtcagtcacagcccatgtgacctatc 19171622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 235 - 444
Target Start/End: Original strand, 30424926 - 30425135
Alignment:
Q  235 ttgttgacccaactcggtgacaaacacacctactatgggggctaccaagcaaggaaggaaatccactagtgtagtccttattttgtagctctcaacaaac 334  Q
    ||||||| |||  ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| | |||||||||||| ||||||| | |||||| |  || ||||| |||||    
T  30424926 ttgttgaaccagttcggtgacaaacacacctactctaggggctaccaagccaagaaggaaatccattagtgtaattcttattct-aagttctcagcaaac 30425024  T
Q  335 tcctcatttac-actaaagacctaggacctacccgtattgatttcaacctaggaattcctagatctgacatcccatctcactatcctacagtcaatcaca 433  Q
    |||   ||||| |||  |||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||| | |||||||||| |||| ||||||||  |   || |||||||||    
T  30425025 tccaagtttacaactctagacctaggacctacttgtattgacttcaacctaggaacttctagatctgagatcctatctcacttccactcaatcaatcaca 30425124  T
Q  434 gcccctgtgat 444  Q
     ||||||||||    
T  30425125 acccctgtgat 30425135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 93 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 13870606 - 13870518
Alignment:
Q  93 tgaaattctagcacacttgttttaatatgttatgtatgatgttttgacgtttgcaatgttatgattaatgtttcgacatcacgcgataa 181  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||   |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  13870606 tgaaattctagcgcacttgttttaatatgttctgaatgatgtttcagcgtttgcaatgttacgattaatgtttcaacatcacgcgataa 13870518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 272 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 15007468 - 15007344
Alignment:
Q  272 ggggctaccaagcaaggaaggaaatccactagtgtagtccttattttgtagctctcaacaaactcctcatttacacta-aagacctaggacctacccgta 370  Q
    |||| |||||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||   ||||||||| |||||||||| ||| ||||| | ||||||||||||||||||     
T  15007468 ggggataccaagccatgaaggaaatccactagtgtagtacttattcaatagctctcagcaaactcctcgtttgcactatatgacctaggacctacccgtg 15007369  T
Q  371 ttgatttcaacctaggaattcctag 395  Q
     ||| ||||||||||||| ||||||    
T  15007368 ctgacttcaacctaggaactcctag 15007344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 195 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 17870026 - 17869944
Alignment:
Q  195 caagaaaataaatgacaggaaagtaaagaacacaatgagtttgttgacccaactcggtgacaaacacacctactatgggggct 277  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  17870026 caagaaaataaatgacaagaaagtaaaggacacagtgagtttgttgacccagttcggtgacaaacacacctactctaggggct 17869944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 195 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 17879778 - 17879696
Alignment:
Q  195 caagaaaataaatgacaggaaagtaaagaacacaatgagtttgttgacccaactcggtgacaaacacacctactatgggggct 277  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  17879778 caagaaaataaatgacaagaaagtaaaggacacagtgagtttgttgacccagttcggtgacaaacacacctactctaggggct 17879696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 272 - 386
Target Start/End: Original strand, 32449278 - 32449392
Alignment:
Q  272 ggggctaccaagcaaggaaggaaatccactagtgtagtccttattttgtagctctcaacaaactcctcatttacactaaagacctaggacctacccgtat 371  Q
    ||||||||||| | |||||||||||||| ||||||| |||||||||  ||| ||||| |||||||||| ||| |||||| | |||||||||||||||||     
T  32449278 ggggctaccaaaccaggaaggaaatccattagtgtattccttatttaatagttctcagcaaactcctcgtttgcactaatgtcctaggacctacccgtac 32449377  T
Q  372 tgatttcaacctagg 386  Q
    ||| || ||||||||    
T  32449378 tgactttaacctagg 32449392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #50
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 96 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 19894820 - 19894725
Alignment:
Q  96 aattctagcacacttgttttaatatgttatgtatgatgttttgacgtttgcaatgttatgattaatgtttcgacatcacgcgataagcagaaataaa 192  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||   ||||||| ||| ||| |||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||    
T  19894820 aattctagcacacttgttttaatatgttctgtatgatgttacaacgtttgtaatattacgattaatgtttcaacatcatgcgataa-cagaaataaa 19894725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #51
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 251 - 415
Target Start/End: Complemental strand, 18152858 - 18152694
Alignment:
Q  251 gtgacaaacacacctactatgggggctaccaagcaaggaaggaaatccactagtgtagtccttattttgtagctctcaacaaactcctcatttac-acta 349  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||| || |   | ||||||||||||||   || || |||     
T  18152858 gtgacaaacacacctactatggaggctaccaaggcaggaaggaaatccactagcgtagtccttgttct-acgttctcaacaaactccaagttcacaactt 18152760  T
Q  350 aagacctaggacctacccgtattgatttcaacctaggaattcctagatctgacatcccatctcact 415  Q
    |  || || |||||||| | | ||| ||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||    
T  18152759 ataacataagacctacctgcactgacttcaacctaggaactcctagatctgagatctcatctcact 18152694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #52
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 195 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 12385333 - 12385261
Alignment:
Q  195 caagaaaataaatgacaggaaagtaaagaacacaatgagtttgttgacccaactcggtgacaaacacacctac 267  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||  ||| ||||||||||||||||    
T  12385333 caagaaaataaatgacaagaaagtaaagaacacagtgagtttgttggcccagttcgatgacaaacacacctac 12385261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #53
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 276 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 13870493 - 13870399
Alignment:
Q  276 ctaccaagcaaggaaggaaatccactagtgtagtccttattttgtagctctcaacaaactcctcatttacacta-aagacctaggacctacccgt 369  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||| ||| ||| |  ||||||||| | |||| |||||||||||||    
T  13870493 ctaccaagccaggaaggaaatccactagtgtagtccttattcaatagctctcatcaagctcattgtttacactatatgaccgaggacctacccgt 13870399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #54
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 352 - 449
Target Start/End: Original strand, 19100008 - 19100105
Alignment:
Q  352 gacctaggacctacccgtattgatttcaacctaggaattcctagatctgacatcccatctcactatcct-acagtcaatcacagcccctgtgatctatc 449  Q
    |||||||||| ||||||||| || ||||||||||||| | ||| |||||| |||||||||||||||||| |  |||| ||||||||||||||| |||||    
T  19100008 gacctaggac-tacccgtatagacttcaacctaggaacttctacatctgagatcccatctcactatcctaatggtcagtcacagcccctgtgacctatc 19100105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #55
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 92 - 164
Target Start/End: Original strand, 19077412 - 19077484
Alignment:
Q  92 ttgaaattctagcacacttgttttaatatgttatgtatgatgttttgacgtttgcaatgttatgattaatgtt 164  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||| |||| || |||||||||||| ||| ||||||    
T  19077412 ttgaaattctagtgcacttgttttaatatgttctgtatgatattttaacatttgcaatgttacgatcaatgtt 19077484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #56
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 302 - 449
Target Start/End: Complemental strand, 19894722 - 19894575
Alignment:
Q  302 agtgtagtccttattttgtagctctcaacaaactcctcatttacactaaa-gacctaggacctacccgtattgatttcaacctaggaattcctagatctg 400  Q
    |||||||||||||||   ||||||||| |||| ||||  |||||| || | |||||||||||||||| ||| || |||||| |  ||| ||||||||||     
T  19894722 agtgtagtccttattcaatagctctcatcaaattccttgtttacattatatgacctaggacctaccc-tatagacttcaacttctgaactcctagatct- 19894625  T
Q  401 acatcccatctcactatcctacag-tcaatcacagcccctgtgatctatc 449  Q
    | |||||||||||||||||||  | ||| ||||||||| ||||| |||||    
T  19894624 agatcccatctcactatcctaatgctcagtcacagcccttgtgacctatc 19894575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #57
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 384 - 433
Target Start/End: Original strand, 24563856 - 24563905
Alignment:
Q  384 aggaattcctagatctgacatcccatctcactatcctacagtcaatcaca 433  Q
    ||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  24563856 aggaactcctggatctgagatcccatctcactatcctacaatcaatcaca 24563905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #58
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 93 - 123
Target Start/End: Complemental strand, 17876487 - 17876457
Alignment:
Q  93 tgaaattctagcacacttgttttaatatgtt 123  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17876487 tgaaattctagcacacttgttttaatatgtt 17876457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #59
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 350 - 388
Target Start/End: Original strand, 24561560 - 24561598
Alignment:
Q  350 aagacctaggacctacccgtattgatttcaacctaggaa 388  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  24561560 aagacctaggacctacccgtctagatttcaacctaggaa 24561598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 198; Significance: 1e-108; HSPs: 39)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 93 - 449
Target Start/End: Original strand, 25116672 - 25117032
Alignment:
Q  93 tgaaattctagcacacttgttttaatatgttatgtatgatgttttgacgtttgcaatgttatgattaatgtttcgacatcacgcgataagcagaaataaa 192  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||   | ||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  25116672 tgaaattctagcacacttgttttaatacgttctgtataatgtttcagcatttacaatgttacgattaatgtttcaacatcacgcgataaacagaaataaa 25116771  T
Q  193 aacaagaaaataaatgacaggaaagtaaagaacacaatgagtttgttgacccaactcggtgacaaacacacctactatgggggct--accaagcaaggaa 290  Q
    || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||| |||||    
T  25116772 aataagaaaataaacgacaggaaagtaaagaacacaatgagtttattgacccagttcggtgacaaacacacctactctgggggctacaccaagccaggaa 25116871  T
Q  291 ggaaatccactagtgtagtccttattttgtagctctcaacaaactcctcatttacacta-aagacctaggacctacccgtattgatttcaacctaggaat 389  Q
    ||||||||||||||||||||||||||   ||||||||| |||||| ||| ||||||||| | |||||||||||||||||||| || |||||||||||||     
T  25116872 ggaaatccactagtgtagtccttattcaatagctctcagcaaacttctcgtttacactatatgacctaggacctacccgtatagacttcaacctaggaac 25116971  T
Q  390 tcctagatctgacatcccatctcactatcct-acagtcaatcacagcccctgtgatctatc 449  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||| |  |||| ||||| ||||||||| |||||    
T  25116972 tcctagatctgagatcccatctcactatcctaatggtcagtcacaacccctgtgacctatc 25117032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 93 - 421
Target Start/End: Original strand, 10190735 - 10191064
Alignment:
Q  93 tgaaattctagcacacttgttttaatatgttatgtatgatgttttgacgtttgcaatgttatgattaatgtttcgacatcacgcgataagcagaaataaa 192  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||   | |||||||||||| |||||||||||| |||||| ||||||| || |||||||    
T  10190735 tgaaattctagcgcacttgttttaatatgttctgtatgatgtttcagcatttgcaatgttaagattaatgtttcaacatcaagcgataaacaaaaataaa 10190834  T
Q  193 aacaagaaaataaatgacaggaaagtaaagaacacaatgagtttgttgacccaactcggtgacaaacacacctactatgggggctaccaagcaaggaagg 292  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  10190835 aacaagaaaataaatgacaggaaagtaaagaaaacaatgagtttgttgacccagttcggtgacaaacacacctactctgggggctaccaagccaggaagg 10190934  T
Q  293 aaatccactagtgtagtccttattttgtagctctcaacaaactcctcatttacacta-aagacctaggacctacccgtattgatttcaacctaggaattc 391  Q
    |||||||| |||||||||||||||   ||||||| | |||||||||| ||||||||| | ||| |||||| ||| ||||| || |||||||||| || ||    
T  10190935 aaatccaccagtgtagtccttattcaatagctctaagcaaactcctcgtttacactatatgacataggacttactcgtatagacttcaacctagaaactc 10191034  T
Q  392 ctagatctgacatcccatctcactatccta 421  Q
    |||||||||| || ||||||||||||||||    
T  10191035 ctagatctgagattccatctcactatccta 10191064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 92 - 449
Target Start/End: Original strand, 10724107 - 10724464
Alignment:
Q  92 ttgaaattctagcacacttgttttaatatgttatgtatgatgttttgacgtttgcaatgttatgattaatgtttcgacatcacgcgataagcagaaataa 191  Q
    ||||||||||| | |||||||||||||||||| |||| ||||||||  |||||| ||||||  | | |||||| | |||||||   |||| |||||||||    
T  10724107 ttgaaattctaacgcacttgttttaatatgttttgtaagatgttttaccgtttggaatgttccgttcaatgttccaacatcacaaaataaacagaaataa 10724206  T
Q  192 aaacaagaaaataaatgacaggaaagtaaagaacacaatgagtttgttgacccaactcggtgacaaacacacctactatgggggctaccaagcaaggaag 291  Q
    |||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||| |||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||    
T  10724207 aaacaagaaaataaatgacaagaaattaaagaatacagtgagtttgttgacctagttcggtgacaaacacacctactttgggggctacaaagccaggaag 10724306  T
Q  292 gaaatccactagtgtagtccttattttgtagctctcaacaaactcctcatttacactaaagacctaggacctacccgtattgatttcaacctaggaattc 391  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||| || ||||||||||||| ||    
T  10724307 gaaattcactagtgtagtccttattctatagctctcagcaaactcctcatttacattaaagacctaaaacctacccgtatagacttcaacctaggaactc 10724406  T
Q  392 ctagatctgacatcccatctcactatcctacagtcaatcacagcccctgtgatctatc 449  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||  |||| ||||| ||||||||| |||||    
T  10724407 ctagatctgagatcccatctcactatcctatggtcagtcacaacccctgtgacctatc 10724464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 92 - 449
Target Start/End: Original strand, 10937876 - 10938233
Alignment:
Q  92 ttgaaattctagcacacttgttttaatatgttatgtatgatgttttgacgtttgcaatgttatgattaatgtttcgacatcacgcgataagcagaaataa 191  Q
    ||||||||||| | |||||||||||||||||| |||| ||||||||  |||||| ||||||  | | |||||| | |||||||   |||| |||||||||    
T  10937876 ttgaaattctaacgcacttgttttaatatgttttgtaagatgttttaccgtttggaatgttccgttcaatgttccaacatcacaaaataaacagaaataa 10937975  T
Q  192 aaacaagaaaataaatgacaggaaagtaaagaacacaatgagtttgttgacccaactcggtgacaaacacacctactatgggggctaccaagcaaggaag 291  Q
    |||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||| |||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||    
T  10937976 aaacaagaaaataaatgacaagaaattaaagaatacagtgagtttgttgacctagttcggtgacaaacacacctactttgggggctacaaagccaggaag 10938075  T
Q  292 gaaatccactagtgtagtccttattttgtagctctcaacaaactcctcatttacactaaagacctaggacctacccgtattgatttcaacctaggaattc 391  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||| || ||||||||||||| ||    
T  10938076 gaaattcactagtgtagtccttattctatagctctcagcaaactcctcatttacattaaagacctaaaacctacccgtatagacttcaacctaggaactc 10938175  T
Q  392 ctagatctgacatcccatctcactatcctacagtcaatcacagcccctgtgatctatc 449  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||  |||| ||||| ||||||||| |||||    
T  10938176 ctagatctgagatcccatctcactatcctatggtcagtcacaacccctgtgacctatc 10938233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 92 - 399
Target Start/End: Original strand, 16383737 - 16384046
Alignment:
Q  92 ttgaaattctagcacacttgttttaatatgttatgtatgatgttttgacgtttgcaatgttatgattaatgtttcgacatcacgcgataagcagaaataa 191  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||| || |||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  16383737 ttgaaattctagcgcacttgttttaatatgttctgtaagatgttatggcgtttgtaatgttacgattaatgtttcaacatcacgcgataaacagaaataa 16383836  T
Q  192 aa-acaagaaaataaatgacaggaaagtaaagaacacaatgagtttgttgacccaactcggtgacaaacacacctactatgggggctaccaagcaaggaa 290  Q
    || ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| |  ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||    
T  16383837 aaaacaagaaaataaaagacaggaaattaaagaacacaatgagattgttgacctagttcggtgacaaacacacctactctgggggcttccaagccaggaa 16383936  T
Q  291 ggaaatccactagtgtagtccttattttgtagctctcaacaaactcctcatttacacta-aagacctaggacctacccgtattgatttcaacctaggaat 389  Q
    ||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||     
T  16383937 ggaaatccactagtgtagtccttattcaatagctctcaacaaactcctcgtttacactatatgacctaggacctacccgtattaacttcaacctatgaac 16384036  T
Q  390 tcctagatct 399  Q
    ||||||||||    
T  16384037 tcctagatct 16384046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 177; E-Value: 3e-95
Query Start/End: Original strand, 93 - 418
Target Start/End: Complemental strand, 23400499 - 23400179
Alignment:
Q  93 tgaaattctagcacacttgttttaatatgttatgtatgatgttttgacgtttgcaatgttatgattaatgtttcgacatcacgcgataagcagaaataaa 192  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||  | | |||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||| || |||||||    
T  23400499 tgaaattctagcacacttgttttaatatgctctgtatgatgttacggcatttgtaatgttatgattaatgtttcaacatcacgtgataa-cataaataaa 23400401  T
Q  193 aacaag-aaaataaatgacaggaaagtaaagaacacaatgagtttgttgacccaactcggtgacaaacacacctactatgggggctaccaagcaaggaag 291  Q
    |||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||      |||||||||||| ||||||    
T  23400400 aacaagaaaaataaaagacatgaaagtaaagaacacaatgagtttgttgacctagttcggtgacaaacacaccta------gggctaccaagccaggaag 23400307  T
Q  292 gaaatccactagtgtagtccttattttgtagctctcaacaaactcctcatttacacta-aagacctaggacctacccgtattgatttcaacctaggaatt 390  Q
    |||||||||||||||||||||||||   ||||||||| |||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||| || ||||||||||||| |    
T  23400306 gaaatccactagtgtagtccttattcaatagctctcagcaaactcctcgtttacactatatgacctaggacctacccgtatagacttcaacctaggaact 23400207  T
Q  391 cctagatctgacatcccatctcactatc 418  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  23400206 cctagatctgatatcccatctcactatc 23400179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 165; E-Value: 4e-88
Query Start/End: Original strand, 93 - 449
Target Start/End: Complemental strand, 15162798 - 15162442
Alignment:
Q  93 tgaaattctagcacacttgttttaatatgttatgtatgatgttttgacgtttgcaatgttatgattaatgtttcgacatcacgcgataagcagaaataaa 192  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||| |||||  |||||||||| | ||||||     ||| ||||||||||    
T  15162798 tgaaattctagcatacttgttttaatatgttatgtaagatgtttcaacgtttgcgatgtttcgattaatgttccaacatcatagtgtaaacagaaataaa 15162699  T
Q  193 aacaagaaaataaatgacaggaaagtaaagaacacaatgagtttgttgacccaactcggtgacaaacacacctactatgggggctaccaagcaaggaagg 292  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||| |||||||||||| |  ||||||||||||||||||||| |||||||| |||| | | |||||    
T  15162698 aacaagaaaataaatggcaggaaagtaaaagacacaataagtttgttgacctagttcggtgacaaacacacctactctgggggctgccaacccaagaagg 15162599  T
Q  293 aaatccactagtgtagtccttattttgtagctctcaacaaactcctcatttacactaaagacctaggacctacccgtattgatttcaacctaggaattcc 392  Q
    |||||||||||||||||||||||| | || |||||||||||||| || ||||||||||||||| || ||||||||||||  | ||||||||||||| |||    
T  15162598 aaatccactagtgtagtccttattctataactctcaacaaactcttcgtttacactaaagaccgagaacctacccgtataaacttcaacctaggaactcc 15162499  T
Q  393 tagatctgacatcccatctcactatcctacagtcaatcacagcccctgtgatctatc 449  Q
    | ||| ||| ||||||||||| ||||||   |||| ||||| ||||||||| |||||    
T  15162498 tcgatttgagatcccatctcaatatcctttggtcagtcacaacccctgtgacctatc 15162442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 162; E-Value: 3e-86
Query Start/End: Original strand, 93 - 449
Target Start/End: Original strand, 21477957 - 21478313
Alignment:
Q  93 tgaaattctagcacacttgttttaatatgttatgtatgatgttttgacgtttgcaatgttatgattaatgtttcgacatcacgcgataagcagaaataaa 192  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||| | |||||  |||| |   | |||||| | |||||||||||||| ||||||||||    
T  21477957 tgaaattctagcgcacttgttttaatacgttctgtatgatgttttaatgtttgtgatgtcacattcaatgttccaacatcacgcgataaccagaaataaa 21478056  T
Q  193 aacaagaaaataaatgacaggaaagtaaagaacacaatgagtttgttgacccaactcggtgacaaacacacctactatgggggctaccaagcaaggaagg 292  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||| |||||  |||||| |||   |||||||| ||| ||||||||||| |||||||    
T  21478057 aacaagaaaataaatgacaagaaagtaaagaacacggtgagtttgttaacccagttcggtg-caacgtcacctactctggaggctaccaagccaggaagg 21478155  T
Q  293 aaatccactagtgtagtccttattttgtagctctcaacaaactcctcatttacactaaa-gacctaggacctacccgtattgatttcaacctaggaattc 391  Q
    |||| |||||||||||||||||||    |||||||| |||||||||| ||||||||  | |||||||||||||||||| | || ||||||||||||| ||    
T  21478156 aaatacactagtgtagtccttattcaaaagctctcagcaaactcctcgtttacactttatgacctaggacctacccgtctagacttcaacctaggaactc 21478255  T
Q  392 ctagatctgacatcccatctcactatcctacagtcaatcacagcccctgtgatctatc 449  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||| |||||    
T  21478256 ctagatctgagatcccatctcactatcctatggtcagtcacagcccctgtgacctatc 21478313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 158; E-Value: 7e-84
Query Start/End: Original strand, 213 - 449
Target Start/End: Complemental strand, 15700502 - 15700265
Alignment:
Q  213 gaaagtaaagaacacaatgagtttgttgacccaactcggtgacaaacacacctactat-gggggctaccaagcaaggaaggaaatccactagtgtagtcc 311  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  15700502 gaaagtaaagaacacagtgagtttgttgacccagttcggtgacaaacacacctactcttgggggctaccaagccaggaaggaaatccactagtgtagtcc 15700403  T
Q  312 ttattttgtagctctcaacaaactcctcatttacactaaagacctaggacctacccgtattgatttcaacctaggaattcctagatctgacatcccatct 411  Q
    ||||| | ||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||    
T  15700402 ttattctatagctttcagcaaactcctcgtttacactaaagacctaggacctacccatattgatttcaacctaggaactcctagatctcagatcccatct 15700303  T
Q  412 cactatcctacagtcaatcacagcccctgtgatctatc 449  Q
    |||||||||| |||||| |||| ||||| |||||||||    
T  15700302 cactatcctatagtcaaccacatcccctatgatctatc 15700265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 152; E-Value: 3e-80
Query Start/End: Original strand, 93 - 449
Target Start/End: Complemental strand, 18618425 - 18618069
Alignment:
Q  93 tgaaattctagcacacttgttttaatatgttatgtatgatgttttga-cgtttgcaatgttatgattaatgtttcgacatcacgcgataagcagaaataa 191  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||| | ||||    ||||| || | |||||||| |||| ||||||||| ||| ||||     
T  18618425 tgaaattctagcacacttgttttaatatgttctgtgtaatgttttaagcgtt----atgttctgttcaatgtttcaacattacgcgataaccagtaatat 18618330  T
Q  192 aaacaagaaaa-taaatgacaggaaagtaaagaacacaatgagtttgttgacccaactcggtgacaaacacacctactatgggggctaccaagcaaggaa 290  Q
    ||||||||||| |||| |||| |||||||||||||| | |||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  18618329 aaacaagaaaaataaacgacaagaaagtaaagaacatagtgagtttgttgagccaagtcggtgacaaacatacctactctgggggctaccaagccaggaa 18618230  T
Q  291 ggaaatccactagtgtagtccttattttgtagctctcaacaaactcctcatttacacta-aagacctaggacctacccgtattgatttcaacctaggaat 389  Q
    ||||||||||||||||||||||||||   || ||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||| ||||||| | || ||||||||||| |     
T  18618229 ggaaatccactagtgtagtccttattcaatatctctcaacaaactcctcgtttacactatatgacctaggacatacccgtctagacttcaacctagggac 18618130  T
Q  390 tcctagatctgacatcccatctcactatcct-acagtcaatcacagcccctgtgatctatc 449  Q
    | |||||||||| |||||||||||||||||| |  |||| ||||| ||||||||| |||||    
T  18618129 tactagatctgagatcccatctcactatcctaatggtcagtcacaacccctgtgaactatc 18618069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 150; E-Value: 4e-79
Query Start/End: Original strand, 131 - 421
Target Start/End: Original strand, 28019190 - 28019482
Alignment:
Q  131 atgttttgacgtttgcaatgttatgattaatgtttcgacatcacgcgataagcagaaataaaaac-aagaaaa-taaatgacaggaaagtaaagaacaca 228  Q
    ||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||    
T  28019190 atgttatgacgtttgtaatgttacgattaatgtttcaacatcacgcgataa-cagaaataaaaaagaagaaaagtaaatgacaggaaagtaaataacaca 28019288  T
Q  229 atgagtttgttgacccaactcggtgacaaacacacctactatgggggctaccaagcaaggaaggaaatccactagtgtagtccttattttgtagctctca 328  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||| | || ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||    
T  28019289 atgagtttgttgacccagttcggtgacaaacacacatgctctgggggctaccaagccaagaaggaaatccactagtgtagtccttattcaatagctctca 28019388  T
Q  329 acaaactcctcatttacacta-aagacctaggacctacccgtattgatttcaacctaggaattcctagatctgacatcccatctcactatccta 421  Q
     |||||||||| ||||||||| | |||||||||| ||||||||| || ||||||||||||| ||||| || ||  ||||||||||| |||||||    
T  28019389 gcaaactcctcgtttacactatatgacctaggacatacccgtatagacttcaacctaggaactcctatatttgtgatcccatctcattatccta 28019482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 230 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 13399477 - 13399263
Alignment:
Q  230 tgagtttgttgacccaactcggtgacaaacacacctactatgggggctaccaagcaaggaaggaaatccactagtgtagtccttattttgtagctctcaa 329  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| |  ||||||||     
T  13399477 tgagtttgttgacccagttcggtgacaaacacacctactctaggggctaccaagccaggaagaaaatccactagtgtagtccttattctaaagctctcag 13399378  T
Q  330 caaactcctcatttacactaaagacctaggacctacccgtattgatttcaacctaggaattcctagatctgacatcccatctcactatcctacagtcaat 429  Q
    |||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  13399377 caaactcctcgtttacacttaagacttaggacctacccgtctagatttcaacctaggaactcctagatctgagattccatctcactatcctacagtcaat 13399278  T
Q  430 cacagcccctgtgat 444  Q
    |||| ||||||||||    
T  13399277 cacaacccctgtgat 13399263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 138; E-Value: 6e-72
Query Start/End: Original strand, 92 - 448
Target Start/End: Original strand, 8163630 - 8163989
Alignment:
Q  92 ttgaaattctagcacacttgttttaatatgttatgtatgatgttttgacgtttgcaatgttatgattaatgtttcgacatcacgcgataagcagaaataa 191  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||   |||||| | | |||||| | |||||||||||||| || ||||||    
T  8163630 ttgaaattctagcgcacttgttttaatacgttatgtatgatgttttaacgtttatgatgttacgttcaatgttccaacatcacgcgataaacaaaaataa 8163729  T
Q  192 aaacaagaaaataaatgacaggaaagtaaagaacacaatgagtttgttgacccaactcggtgacaaacacacctactatgggggcta-----ccaagcaa 286  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| |||||  |||||| |||   |||||||| |  ||||||     |||||| |    
T  8163730 aaacaagaaaataaatgacaagaaagtaaagaacacagtgagtttgttaacccagttcggtg-caacgtcacctactct-agggctaccaagccaagcca 8163827  T
Q  287 ggaaggaaatccactagtgtagtccttattttgtagctctcaacaaactcctcatttacactaaagacctaggacctacccgtattgatttcaacctagg 386  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||||||    ||||| || |||||||||| |||||  | | |||||||||||||||||| | || |||||||||||    
T  8163828 ggaaggaaattcactagtgcagtccttattcaaaagctcccagcaaactcctcgtttacctttatgacctaggacctacccgtctagacttcaacctagg 8163927  T
Q  387 aattcctagatctgacatcccatctcactatcctacagtcaatcacagcccctgtgatctat 448  Q
    || |||||||||||| |||||||||||||||||||  |||| ||||| ||||||||| ||||    
T  8163928 aactcctagatctgagatcccatctcactatcctatggtcagtcacaacccctgtgacctat 8163989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 131; E-Value: 9e-68
Query Start/End: Original strand, 199 - 449
Target Start/End: Original strand, 33745918 - 33746168
Alignment:
Q  199 aaaataaatgacaggaaagtaaagaacacaatgagtttgttgacccaactcggtgacaaacacacctactatgggggctaccaagcaaggaaggaaatcc 298  Q
    |||||||| |||| |||||||||   |||||  |||||||| || ||  ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  33745918 aaaataaaagacaagaaagtaaaaggcacaacaagtttgttaacacagttcggtgacaaaaacacctactatggaggctaccaagctaggaaggaaatcc 33746017  T
Q  299 actagtgtagtccttattttgtagctctcaacaaactcctcatttacactaaagacctaggacctacccgtattgatttcaacctaggaattcctagatc 398  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||  ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||    
T  33746018 actagtgtagtccttattttatagctctcagtaaattcctcgtttacactaaagacctaggacctacccgtattaatttcaacctaggaacttctagatc 33746117  T
Q  399 tgacatcccatctcactatcctacagtcaatcacagcccctgtgatctatc 449  Q
    ||| ||| |||||||||||||||  |||| ||||| ||| ||||| |||||    
T  33746118 tgagatctcatctcactatcctatggtcagtcacaacccgtgtgacctatc 33746168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 126; E-Value: 8e-65
Query Start/End: Original strand, 232 - 449
Target Start/End: Original strand, 9068933 - 9069150
Alignment:
Q  232 agtttgttgacccaactcggtgacaaacacacctactatgggggctaccaagcaaggaaggaaatccactagtgtagtccttattttgtagctctcaaca 331  Q
    |||||||| |||||  ||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||| ||    
T  9068933 agtttgttaacccagttcggtaacaaacacacctactctggaggctaccaagcgaggaaggaaatccactagtgtagtccttattctattgctctcagca 9069032  T
Q  332 aactcctcatttacactaaagacctaggacctacccgtattgatttcaacctaggaattcctagatctgacatcccatctcactatcctacagtcaatca 431  Q
    |||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||  |||| |||    
T  9069033 aactcctcgtttacactaaagatctaggacctacccgtattgatttcaatctaggaactcctagatctgagatctcatctcactatcctatggtcagtca 9069132  T
Q  432 cagcccctgtgatctatc 449  Q
    || || |||||| |||||    
T  9069133 caacctctgtgacctatc 9069150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 121; E-Value: 8e-62
Query Start/End: Original strand, 183 - 421
Target Start/End: Complemental strand, 33899210 - 33898970
Alignment:
Q  183 cagaaataaaaacaagaaaa-taaatgacaggaaagtaaagaacacaatgagtttgttgacccaactcggtgacaaacacacctactatgggggctacca 281  Q
    |||||| || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  33899210 cagaaacaataacaagaaaaataaatgacaggaaagtaaagaacacaatgagtttgttgacccagttcggtgacaaacacacctactctaggggctacca 33899111  T
Q  282 agcaaggaaggaaatccactagtgtagtccttattttgtagctctcaacaaactcctcatttacacta-aagacctaggacctacccgtattgatttcaa 380  Q
    ||  |||||| ||||||||| |||||||||| |||   ||||||| | |||||| ||| ||||||||| | |||||||||||||||||||| || |||||    
T  33899110 agtcaggaagaaaatccactggtgtagtcctcattcaatagctcttagcaaacttctcgtttacactatatgacctaggacctacccgtatagacttcaa 33899011  T
Q  381 cctaggaattcctagatctgacatcccatctcactatccta 421  Q
    |||||||| |||||| | ||| ||| |||||||||||||||    
T  33899010 cctaggaactcctaggtttgagatctcatctcactatccta 33898970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 238 - 448
Target Start/End: Original strand, 19659432 - 19659643
Alignment:
Q  238 ttgacccaactcggtgacaaacacacctactatgggggctaccaagcaaggaaggaaatccactagtgtagtccttattttgtagctctcaacaaactcc 337  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||   ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    |||||||| ||||||||    
T  19659432 ttgacccaattcggtgacaaacacacctaagctgggggccaccaagccaggaaggaaatccactagtgtagtccttattcaaaagctctcagcaaactcc 19659531  T
Q  338 tcatttacac-taaagacctaggacctacccgtattgatttcaacctaggaattcctagatctgacatcccatctcactatcctacagtcaatcacagcc 436  Q
    || ||||||| | | ||||||||||||||  || | || ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||| ||    
T  19659532 tcgtttacactttatgacctaggacctacatgtttagacttcaacctaggaactcctagatctgagatcccatctcactatcctacagtcagacacaacc 19659631  T
Q  437 cctgtgatctat 448  Q
    ||| ||| ||||    
T  19659632 cctatgacctat 19659643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 275 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 19183809 - 19183640
Alignment:
Q  275 gctaccaagcaaggaaggaaatccactagtgtagtccttattttgtagctctcaacaaactcctcatttacactaaagacctaggacctacccgtattga 374  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||  |||| | |||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||| | |||| | ||    
T  19183809 gctaccaagccaggaaggaaatccactagtgtattctgtattctatagctctcaacaaacttcttgtttacactaaagacctaggacccatccgtctaga 19183710  T
Q  375 tttcaacctaggaattcctagatctgacatcccatctcactatcctacagtcaatcacagcccctgtgat 444  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||    
T  19183709 tttcaacctaggaactcctagatctgagatcccatctcactatcctacggtcaaccacagcccttgtgat 19183640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 272 - 421
Target Start/End: Original strand, 10722011 - 10722160
Alignment:
Q  272 ggggctaccaagcaaggaaggaaatccactagtgtagtccttattttgtagctctcaacaaactcctcatttacactaaagacctaggacctacccgtat 371  Q
    |||| |||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  10722011 ggggttaccaatccaggaaggaaatctactagtgtagtccttattctaaagctctcaacaaactcctcgtttacacttaagacctaggacctacccgtat 10722110  T
Q  372 tgatttcaacctaggaattcctagatctgacatcccatctcactatccta 421  Q
     || ||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  10722111 agacttcaacctaggaactcctagatctgagatctcatctcactatccta 10722160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 272 - 421
Target Start/End: Original strand, 10935780 - 10935929
Alignment:
Q  272 ggggctaccaagcaaggaaggaaatccactagtgtagtccttattttgtagctctcaacaaactcctcatttacactaaagacctaggacctacccgtat 371  Q
    |||| |||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  10935780 ggggttaccaatccaggaaggaaatctactagtgtagtccttattctaaagctctcaacaaactcctcgtttacacttaagacctaggacctacccgtat 10935879  T
Q  372 tgatttcaacctaggaattcctagatctgacatcccatctcactatccta 421  Q
     || ||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  10935880 agacttcaacctaggaactcctagatctgagatctcatctcactatccta 10935929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 234 - 429
Target Start/End: Original strand, 32861637 - 32861833
Alignment:
Q  234 tttgttgacccaactcggtgacaaacacacctactatgggggctaccaagcaaggaaggaaatccactagtgtagtccttattttgtagctctcaacaaa 333  Q
    |||||||| |||  ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||| |  || ||||||||||    
T  32861637 tttgttgatccagttcggtgacaaacacacctactctaggggctaccaagtcaggaagaaaatccactagtgtagtccttattctaaagttctcaacaaa 32861736  T
Q  334 ctcctcattta-cactaaagacctaggacctacccgtattgatttcaacctaggaattcctagatctgacatcccatctcactatcctacagtcaat 429  Q
    |||||| ||||  ||| |||||||||||||||| ||| | || ||||||||||||| |||||||| ||| |||| |||||||| ||||||| |||||    
T  32861737 ctcctcgtttataacttaagacctaggacctactcgtctagacttcaacctaggaactcctagatttgagatcctatctcactgtcctacaatcaat 32861833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 195 - 444
Target Start/End: Original strand, 41785385 - 41785633
Alignment:
Q  195 caagaaaataaatgacaggaaagtaaagaacacaatgagtttgttgacccaactcggtgacaaacacacctactatgggggctaccaagcaaggaaggaa 294  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||   || |  |||||||||||||||  || ||||||||||||| ||||| |||||||||||||| | |||||||    
T  41785385 caagaaaataaatgacaagaaagtaaaatgcatagagagtttgttgacccagttctgtgacaaacacacatactacgggggctaccaagccaagaaggaa 41785484  T
Q  295 atccactagtgtagtccttattttgtagctctcaacaaactcctcatttac-actaaagacctaggacctacccgtattgatttcaacctaggaattcct 393  Q
    ||||||||||||||||| |||| |  || ||||| ||||  || | ||||| ||| ||||  ||| ||||||| || | |||||||||||||||| || |    
T  41785485 atccactagtgtagtccctattctaaagttctcagcaaa--ccacgtttacaacttaagatatagaacctacctgtttagatttcaacctaggaactctt 41785582  T
Q  394 agatctgacatcccatctcactatcctacagtcaatcacagcccctgtgat 444  Q
    | |||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||    
T  41785583 atatctgatatcccatctcactatcttacaatcaatcacagcccctatgat 41785633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 261 - 415
Target Start/End: Original strand, 24143151 - 24143305
Alignment:
Q  261 cacctactatgggggctaccaagcaaggaaggaaatccactagtgtagtccttattttgtagctctcaacaaactcctcatttacactaaagacctagga 360  Q
    |||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||   ||||||||| |||| ||||| ||| |||||| |||||||||    
T  24143151 cacctactctgggggctaccaagtcaggaaggaaatccactagtgtagtccgtattcaatagctctcagcaaaatcctcgtttgcactaatgacctagga 24143250  T
Q  361 cctacccgtattgatttcaacctaggaattcctagatctgacatcccatctcact 415  Q
    |||||||||| ||| || |||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  24143251 cctacccgtactgactttaacctatgaactcctagatctgagatcccatctcact 24143305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 214 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 25354824 - 25354595
Alignment:
Q  214 aaagtaaagaacacaatgagtttgttgacccaactcggtgacaaacacacctactatgggggctaccaagcaaggaaggaaatccactagtgtagtcctt 313  Q
    ||||||||  ||||| |||||||||| |||||  |||||| |||   |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | |    
T  25354824 aaagtaaatgacacagtgagtttgttaacccagttcggtg-caacgtcacctactctgggggctaccaagccaggaaggaaatccactagtgtagttcgt 25354726  T
Q  314 attttgtagctctcaacaaactcctcatttacactaaagacctaggacctacccgtattgatttcaacctaggaattcctagatctgacatcccatctca 413  Q
    |||   || |||||| |||||||||  ||| |||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||| ||| ||| |||||||    
T  25354725 attcaatatctctcagcaaactccttgtttgcactaatgacctaggacctacccgtactgacttcaacctaggaactcctagatttgagatcacatctca 25354626  T
Q  414 ctatcctacagtcaatcacagcccctgtgat 444  Q
    ||  | ||||    |||||||||||||||||    
T  25354625 ctcccttacaactgatcacagcccctgtgat 25354595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 248 - 444
Target Start/End: Original strand, 50907855 - 50908050
Alignment:
Q  248 tcggtgacaaacacacctactatgggggctaccaagcaaggaaggaaatccactagtgtagtccttattttgtagctctcaacaaactcctcatttac-a 346  Q
    ||||||||||||||||||||| || |||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||| |  || | ||| |||||||||| ||||| |    
T  50907855 tcggtgacaaacacacctactctgagggctaccaagtcaggaagaaaatccactagtgtagtccttattct-aagttatcagcaaactcctcgtttacaa 50907953  T
Q  347 ctaaagacctaggacctacccgtattgatttcaacctaggaattcctagatctgacatcccatctcactatcctacagtcaatcacagcccctgtgat 444  Q
    ||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||| || |||| ||||| |||  || ||||||||| ||||||||||    
T  50907954 ctctagacctaggacctacccgtattgacttcaacctaggaactcctaaatctgagattccatttcact-tccctcaatcaatcacatcccctgtgat 50908050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 225 - 388
Target Start/End: Complemental strand, 46741927 - 46741765
Alignment:
Q  225 cacaatgagtttgttgacccaactcggtgacaaacacacctactatgggggctaccaagcaaggaaggaaatccactagtgtagtccttattttgtagct 324  Q
    ||||||||||||||| |||||  |||||| |||   |||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||   |||||    
T  46741927 cacaatgagtttgttaacccatttcggtg-caacgtcacctactctgggggctaccaagccatgaaggaaatccactagtgtaatccttattcaatagct 46741829  T
Q  325 ctcaacaaactcctcatttacactaaagacctaggacctacccgtattgatttcaacctaggaa 388  Q
    |||| |||||||||| ||| |||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  46741828 ctcagcaaactcctcgtttgcacttatgacctaggacctacccgtattgacttcaacctaggaa 46741765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 79; E-Value: 9e-37
Query Start/End: Original strand, 261 - 415
Target Start/End: Original strand, 23541260 - 23541414
Alignment:
Q  261 cacctactatgggggctaccaagcaaggaaggaaatccactagtgtagtccttattttgtagctctcaacaaactcctcatttacactaaagacctagga 360  Q
    |||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||   ||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  23541260 cacctactctggaggctaccaagccaggaaggaaatccactagtgtagtccgtattcaatagctctcagcaaactcctcgtttgcactaaagacctagga 23541359  T
Q  361 cctacccgtattgatttcaacctaggaattcctagatctgacatcccatctcact 415  Q
    |||||||||| ||| |||||||  ||||   |||||||||| ||| |||||||||    
T  23541360 cctacccgtactgacttcaacccgggaacaactagatctgagatctcatctcact 23541414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 248 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 10198405 - 10198211
Alignment:
Q  248 tcggtgacaaacacacctactatgggggctaccaagcaaggaaggaaatccactagtgtagtccttattttgtagctctcaacaaactcctcatttaca- 346  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| |  || ||||| ||||||||   ||||||     
T  10198405 tcggtgacaaacacacctactctaggg-ctaccaagccaggaaggaaatccaccagtgtagtccttattcta-agttctcagcaaactccaagtttacaa 10198308  T
Q  347 ctaaagacctaggacctacccgtattgatttcaacctaggaattcctagatctgacatcccatctcactatcctacagtcaatcacagcccctgtgat 444  Q
    ||  ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||| |||  || ||||||||| ||||||||||    
T  10198307 ctctagacctaggacctacccgtcttgacttcaacctaggaactcctagatctgagatctcatctcact-tccgtcaatcaatcacatcccctgtgat 10198211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 261 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 11325288 - 11325104
Alignment:
Q  261 cacctactatgggggctaccaagcaaggaaggaaatccactagtgtagtccttattttgtagctctcaacaaactcctcatttacacta-aagacctagg 359  Q
    ||||| || ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||| ||| ||||| | ||||||||    
T  11325288 cacctgctctggaggctaccaagccaggaaggaaatccactagtgtagtccttattcaatagctctcaacaaactcctcgtttgcactatatgacctagg 11325189  T
Q  360 acctacccgtattgatttcaacctaggaattcctagatctgacatcccatctcactatcctacagtcaatcacagcccctgtgat 444  Q
    ||||||||||| | | ||||||||||||| || ||||||| | || ||||||||||  | ||||    |||||||||||||||||    
T  11325188 acctacccgtactaacttcaacctaggaactcgtagatctaagattccatctcactcccttacaactgatcacagcccctgtgat 11325104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 224 - 415
Target Start/End: Original strand, 22554950 - 22555142
Alignment:
Q  224 acacaatgagtttgttgacccaactcggtgacaaacacacctactatgggggctaccaagcaaggaaggaaatccactagtgtagtccttattttgtagc 323  Q
    ||||| |||||||||| |||||  |||||| |||   |||||||| ||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||   ||||    
T  22554950 acacagtgagtttgttaacccagttcggtg-caacgtcacctactctgaaggctaccaagccaggaaggaaatccactagtgtagtccttattcaatagc 22555048  T
Q  324 tctcaacaaactcctcatttacactaaa--gacctaggacctacccgtattgatttcaacctaggaattcctagatctgacatcccatctcact 415  Q
    ||||| |||||||||| | | ||||| |  ||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||    
T  22555049 tctcagcaaactcctcgtatgcactatatggacctaggacctatccgtactgacttcaacctaggaactcgtagatctgagatcccatctcact 22555142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 74; E-Value: 9e-34
Query Start/End: Original strand, 256 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 16655486 - 16655299
Alignment:
Q  256 aaacacacctactatgggggctaccaagcaaggaaggaaatccactagtgtagtccttattttgtagctctcaacaaactcctcatttac-actaaagac 354  Q
    ||||||||||||| | ||||||| ||||| | |||||||||||||||| |||||||||||| |  || ||||| ||||||||| | |||| |||  ||||    
T  16655486 aaacacacctactctaggggctaacaagccaagaaggaaatccactagggtagtccttattcta-agttctcagcaaactccttagttacgactttagac 16655388  T
Q  355 ctaggacctacccgtattgatttcaacctaggaattcctagatctgacatcccatctcactatcctacagtcaatcacagcccctgtgat 444  Q
    ||||||||||||| | |||| ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||  ||| || ||||||||| ||||||||||    
T  16655387 ctaggacctacccatcttgagttcaacctaggaactcctagatctgagatcccatctcacttgcct-caatcaatcacatcccctgtgat 16655299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 69; E-Value: 9e-31
Query Start/End: Original strand, 272 - 444
Target Start/End: Original strand, 11905121 - 11905292
Alignment:
Q  272 ggggctaccaagcaaggaaggaaatccactagtgtagtccttattttgtagctctcaacaaactcctcatttacactaaagacctaggacctacccgtat 371  Q
    |||| |||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||   |||||||||  ||||| ||| ||||||||||||||||| ||| |||| ||||    
T  11905121 ggggttaccaagtcaggaaggaaatccactagtgcagtccttattcaatagctctcagtaaacttctcgtttacactaaagacctatgacttacctgtat 11905220  T
Q  372 tgatttcaacctaggaattcctagatctgacatcccatctcactatcctacagtcaatcacagcccctgtgat 444  Q
    ||| ||||||||||||| |||||||||| | ||||||||| |||  ||||||   ||||||||||| ||||||    
T  11905221 tgacttcaacctaggaactcctagatcttagatcccatctaact-ccctacaaataatcacagcccatgtgat 11905292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 69; E-Value: 9e-31
Query Start/End: Original strand, 275 - 415
Target Start/End: Complemental strand, 19894932 - 19894792
Alignment:
Q  275 gctaccaagcaaggaaggaaatccactagtgtagtccttattttgtagctctcaacaaactcctcatttacactaaagacctaggacctacccgtattga 374  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||||||||| | ||||   ||||||||| |||||||||| |||  ||||| ||||||||||||||||||| |||    
T  19894932 gctaccaagccaggaacgaaatccactagtgtagttcgtattcaatagctctcagcaaactcctcgtttgaactaatgacctaggacctacccgtactga 19894833  T
Q  375 tttcaacctaggaattcctagatctgacatcccatctcact 415  Q
     |||||||||| || ||||| |||||| |||||||||||||    
T  19894832 cttcaacctagaaactcctaaatctgagatcccatctcact 19894792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 95 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 33899491 - 33899398
Alignment:
Q  95 aaattctagcacacttgttttaatatgttatgtatgatgttttgacgtttgcaatgttatgattaatgtttcgacatcacgcgataagcagaaa 188  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||    
T  33899491 aaattctagcacacttgttttaataggttctgtatgatgtttcagcgtttgcaatgttatgattaatgttttaacatcacgcgataaacagaaa 33899398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 234 - 311
Target Start/End: Original strand, 33737973 - 33738050
Alignment:
Q  234 tttgttgacccaactcggtgacaaacacacctactatgggggctaccaagcaaggaaggaaatccactagtgtagtcc 311  Q
    |||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  33737973 tttgttaacccagttcggtgacaaacacacctactatggaggctaccaagccaggaaggaaatccactagtgtagtcc 33738050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 376 - 444
Target Start/End: Original strand, 15622573 - 15622641
Alignment:
Q  376 ttcaacctaggaattcctagatctgacatcccatctcactatcctacagtcaatcacagcccctgtgat 444  Q
    |||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  15622573 ttcatcctaggaactcctagatctgagatcccatctcactatcctacaatcaatcacagcccctgtgat 15622641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 249 - 412
Target Start/End: Original strand, 2679854 - 2680013
Alignment:
Q  249 cggtgacaaacacacctactatgggggctaccaagcaaggaaggaaatccactagtgtagtccttattttgtagctctcaacaaactcctcatttacact 348  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||  ||||||||||||||||| |||||||||| || |  || ||||| ||||||||   |||||       
T  2679854 cggtgacaaacacacctactctgggggcaaccaagttaggaaggaaatccactattgtagtccttgttct-aagttctcagcaaactccaagtttac--- 2679949  T
Q  349 aaagacctaggacctacccgtattgatttcaacctaggaattcctagatctgacatcccatctc 412  Q
     |  || |||||||||| |||| ||| ||||||||||||  |||||||||||| ||| ||||||    
T  2679950 tatcacataggacctactcgtactgacttcaacctaggagctcctagatctgagatctcatctc 2680013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 94 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 15700606 - 15700499
Alignment:
Q  94 gaaattctagcacacttgttttaatatgttatgtatgatgttttgacgtttgcaatgttatgattaatgtttcgacatcacgcgataagcagaaataaaa 193  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||||| |||| |||||||  | ||||  |||||| || | |||||| | ||||||||   ||| |||||||||||    
T  15700606 gaaattctagcatacttgttttaaaatgttttgtaagatgtttcaatgtttataatgttttgttcaatgttccaacatcacgaattaaacagaaataaaa 15700507  T
Q  194 acaagaaa 201  Q
    ||||||||    
T  15700506 acaagaaa 15700499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 90 - 135
Target Start/End: Original strand, 28019132 - 28019177
Alignment:
Q  90 ttttgaaattctagcacacttgttttaatatgttatgtatgatgtt 135  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  28019132 ttttgaaattctagcccacttgttttaatacgttctgtatgatgtt 28019177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 188; Significance: 1e-102; HSPs: 35)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 92 - 421
Target Start/End: Complemental strand, 23541723 - 23541392
Alignment:
Q  92 ttgaaattctagcacacttgttttaatatgttatgtatgatgttttgacgtttgcaatgtt-atgattaatgtttcgacatcacgcgataagcagaaata 190  Q
    ||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||| |||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  23541723 ttgaaattctaccgcacttattttaatatgttatgtatgatgttttaacgtttgcaatgtttacgatcaatgttccaacatcacgcgataagcagaaata 23541624  T
Q  191 aaaacaagaaaataaatgacaggaaagtaaagaacacaatgagtttgttgacccaactcggtgacaaacacacctactatgggggctaccaagcaaggaa 290  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |  ||||    
T  23541623 aaaacaagaaaataaatgacaggaatgtaaagaacacaatgagtttgttgacctagttcggtgacaaacacacctactctgggggctaccaaaccgggaa 23541524  T
Q  291 ggaaatccactagtgtagtccttattttgtagctctcaacaaactcctcatttacacta-aagacctaggacctacccgtattgatttcaacctaggaat 389  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||   ||||||||| |||||||  | ||||||||| |  ||||||||||||| ||||| || |||||||||||||     
T  23541523 ggaaatccactagtgtagtacttattcaatagctctcagcaaactcgccgtttacactatattacctaggacctactcgtatagaattcaacctaggaac 23541424  T
Q  390 tcctagatctgacatcccatctcactatccta 421  Q
    |||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  23541423 tcctagatctgagatcctatctcactatccta 23541392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 181; E-Value: 1e-97
Query Start/End: Original strand, 93 - 421
Target Start/End: Complemental strand, 11221577 - 11221254
Alignment:
Q  93 tgaaattctagcacacttgttttaatatgttatgtatgatgttttgacgtttgcaatgttatgattaatgtttcgacatcacgcgataagcagaaataaa 192  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| |||| |||| |||||||  |||||| |||||||  | | |||||| | |||||| |  |||| ||||||||||    
T  11221577 tgaaattctagcgcacttgttttaatttgttttgtacgatgtttaaacgttttcaatgttccgttcaatgttccaacatcatgaaataaacagaaataaa 11221478  T
Q  193 aacaagaaaataaatgacaggaaagtaaagaacacaatgagtttgttgacccaactcggtgacaaacacacctactatgggggctaccaagcaaggaagg 292  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||    
T  11221477 aacaagaaaataaatgacaggaaagtaaagaacacagtgagtttgttgacctagttcggtgacaaacacacctactctgggggctaccaaaccaggaagg 11221378  T
Q  293 aaatccactagtgtagtccttattttgtagctctcaacaaactcctcatttacactaaagacctaggacctacccgtattgatttcaacctaggaattcc 392  Q
    |||     |||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||    
T  11221377 aaa-----tagtgtagtccttattctatagctctcagcaaactcctcgtttacactaaagacctaggacctacccgtatagacttcaacctaggaactcc 11221283  T
Q  393 tagatctgacatcccatctcactatccta 421  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  11221282 tagatctgagatcccatctcactatccta 11221254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 175; E-Value: 5e-94
Query Start/End: Original strand, 93 - 449
Target Start/End: Original strand, 24091821 - 24092162
Alignment:
Q  93 tgaaattctagcacacttgttttaatatgttatgtatgatgttttgacgtttgcaatgttatgattaatgtttcgacatcacgcgataagcagaaataaa 192  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||  ||||||  |||||| || | |||||| | ||||||||  |||| ||||||||||    
T  24091821 tgaaattctagcgcacttgttttaatatgttctgtaagatgtttcaacgtttataatgttctgttcaatgttccaacatcacgaaataaacagaaataaa 24091920  T
Q  193 aacaagaaaataaatgacaggaaagtaaagaacacaatgagtttgttgacccaactcggtgacaaacacacctactatgggggctaccaagcaaggaagg 292  Q
    |||||||||               |||||||||||| |||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||    
T  24091921 aacaagaaa---------------gtaaagaacacagtgagtttgttgacctagttcggtgacaaacacacctactctaggggctaccaagccaggaagg 24092005  T
Q  293 aaatccactagtgtagtccttattttgtagctctcaacaaactcctcatttacactaaagacctaggacctacccgtattgatttcaacctaggaattcc 392  Q
    |||||||||||||||||||||||| |  |||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  24092006 aaatccactagtgtagtccttattctacagctctcagcaaactcctcgtttacactaaagacctaggacctacccgtattgatttcaacctaggaactcc 24092105  T
Q  393 tagatctgacatcccatctcactatcctacagtcaatcacagcccctgtgatctatc 449  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| || |||||    
T  24092106 tagatctgagatcccatctcactatcctatagtcagtcacagcccctgcgagctatc 24092162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 155; E-Value: 4e-82
Query Start/End: Original strand, 95 - 449
Target Start/End: Original strand, 33976909 - 33977263
Alignment:
Q  95 aaattctagcacacttgttttaatatgttatgtatgatgttttgacgtttgcaatgttatgattaatgtttcgacatcacgcgataagcagaaataaaaa 194  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||  |  |||| ||||||  | | |||||| | ||||||||  |||| ||||||| ||||    
T  33976909 aaattctagcacacttgttttaatatgttttgtaagatgtttcaatatttgtaatgttccgttcaatgttccaacatcacgaaataaacagaaatcaaaa 33977008  T
Q  195 caagaaaataaatgacaggaaagtaaagaacacaatgagtttgttgacccaactcggtgacaaacacacctactatgggggctaccaagcaaggaaggaa 294  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||| ||  ||||||||||||||||  ||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||  || ||||||    
T  33977009 caagaaaataaatgacaagaaagtaaagaatactgtgagtttgttgacccagttcggtaacaaacgcacctactctgggggctaccaagtcagaaaggaa 33977108  T
Q  295 atccactagtgtagtccttattttgtagctctcaacaaactcctcatttacactaaagacctaggacctacccgtattgatttcaacctaggaattccta 394  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||  | ||||| ||||||| |||||    
T  33977109 atccactagtgtagtccttattctatagctctcagcaaactccttgtttacactaaagacctagaacctacccgtatatacttcaatctaggaactccta 33977208  T
Q  395 gatctgacatcccatctcactatcctacagtcaatcacagcccctgtgatctatc 449  Q
    ||||||| ||  |||||||||||| ||  |||| ||| ||||||| ||| |||||    
T  33977209 gatctgagatatcatctcactatcatatggtcagtcagagcccctatgacctatc 33977263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 131; E-Value: 9e-68
Query Start/End: Original strand, 199 - 449
Target Start/End: Original strand, 9996454 - 9996704
Alignment:
Q  199 aaaataaatgacaggaaagtaaagaacacaatgagtttgttgacccaactcggtgacaaacacacctactatgggggctaccaagcaaggaaggaaatcc 298  Q
    |||||||| |||| |||||||||  |||||   |||||||| |||||  ||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||  ||||| |||||||    
T  9996454 aaaataaaagacaagaaagtaaaagacacagcaagtttgttaacccagttcggtgacaaacacacctactctggagactaccaagtcaggaatgaaatcc 9996553  T
Q  299 actagtgtagtccttattttgtagctctcaacaaactcctcatttacactaaagacctaggacctacccgtattgatttcaacctaggaattcctagatc 398  Q
    |||| ||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  9996554 actattgtagtccttattctatagctctcagcaaactcctcatttacactaaagacctaggacctacccgtattgatttcaacctaggaactcctaggtc 9996653  T
Q  399 tgacatcccatctcactatcctacagtcaatcacagcccctgtgatctatc 449  Q
    ||| ||| ||||||||||||||| || || ||||| ||| ||||| |||||    
T  9996654 tgagatcacatctcactatcctatagccagtcacaacccatgtgacctatc 9996704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 121; E-Value: 8e-62
Query Start/End: Original strand, 93 - 309
Target Start/End: Original strand, 45133513 - 45133729
Alignment:
Q  93 tgaaattctagcacacttgttttaatatgttatgtatgatgttttgacgtttgcaatgttatgattaatgtttcgacatcacgcgataagcagaaataaa 192  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||||| | || |||||||| || ||||||||||| || | ||||||   |||||| ||||||| ||||||||||    
T  45133513 tgaaattctagtgcacttgttttaatatgttctctacgatgttttaacatttgcaatgttctgttcaatgttctaacatcatgcgataaacagaaataaa 45133612  T
Q  193 aacaagaaaataaatgacaggaaagtaaagaacacaatgagtttgttgacccaactcggtgacaaacacacctactatgggggctaccaagcaaggaagg 292  Q
    |||||||||||||| |||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||    
T  45133613 aacaagaaaataaacgacaagaaagtaaaggacacattgagtttgttgacccagttcggtgacaaacacacctactctgggggctatcaagccaggaagg 45133712  T
Q  293 aaatccactagtgtagt 309  Q
    |||||||||||||||||    
T  45133713 aaatccactagtgtagt 45133729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 116; E-Value: 8e-59
Query Start/End: Original strand, 93 - 443
Target Start/End: Original strand, 25240254 - 25240605
Alignment:
Q  93 tgaaattctagcacacttgttttaatatgttatgtatgatgttttgacgtttgcaatgttatgattaatgtttcgacatcacgcgataagcagaaataaa 192  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||||||||||  |||||||  ||| ||  ||||||  | | |||||| | | ||||||   ||| || |||||||    
T  25240254 tgaaattctagcgtacttgttttaatatgttatgtgcgatgtttcaacggttataatgttccgttcaatgttccaatatcacgaagtaaacaaaaataaa 25240353  T
Q  193 aacaagaaaataaatgacaggaaagtaaagaacacaatgagtttgttgacccaactcggtgacaaacacacctactatgggggctaccaagcaaggaagg 292  Q
    |||||| |||||||||||| |||||||||    ||| |||||||||| |||||  |||||||||||||||||||| | |||||||||||| | |||||||    
T  25240354 aacaaggaaataaatgacaagaaagtaaaaggtacattgagtttgtttacccagttcggtgacaaacacacctaccaagggggctaccaaaccaggaagg 25240453  T
Q  293 aaatccactagtgtagtccttattttgtagctctcaacaaactcctcatttacac-taaagacctaggacctacccgtattgatttcaacctaggaattc 391  Q
    |||||||| |||||||||||||||    |||||||| |||||||||  ||||||| | | |||||||||||||||||| | || ||||||||| ||| ||    
T  25240454 aaatccaccagtgtagtccttattcaaaagctctcagcaaactccttctttacactttacgacctaggacctacccgtctagacttcaacctaagaactc 25240553  T
Q  392 ctagatctgacatcccatctcactatcctacagtcaatcacagcccctgtga 443  Q
    |||||||||  ||| ||||| |||||| || ||||| |||||||||||||||    
T  25240554 ctagatctgcgatctcatcttactatcttatagtcagtcacagcccctgtga 25240605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 108; E-Value: 5e-54
Query Start/End: Original strand, 195 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 20255091 - 20254834
Alignment:
Q  195 caagaaaataaatgacaggaaagtaaagaacacaatgagtttgttgacccaactcggtgacaaacacacctactatgggggctaccaagcaaggaaggaa 294  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||   ||     ||||||||||||||  |||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  20255091 caagaaaataaatgacaagaaagtaaaaggcagcgacagtttgttgacccagttcggtgacaaacacatgtactatgggggctaccaagctaggaaggaa 20254992  T
Q  295 atccactagtgtagtccttattttgtagctctcaacaaactcctcatttac-actaaagacc-------taggacctacccgtattgatttcaacctagg 386  Q
    |||||||||||| ||||||||| |  || ||||| |||||||||| ||||| ||| ||||||       |||||||||||||| | || |||||||||||    
T  20254991 atccactagtgtggtccttattctaaagttctcagcaaactcctcgtttacaactgaagacctaggacgtaggacctacccgtctagacttcaacctagg 20254892  T
Q  387 aattcctagatctgacatcccatctcactatcctacagtcaatcacagcccctgtgat 444  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||    
T  20254891 aactcctagatctgacatcccatctcactatcctacaatcaattacagccgctgtgat 20254834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 105; E-Value: 3e-52
Query Start/End: Original strand, 190 - 421
Target Start/End: Original strand, 22485089 - 22485311
Alignment:
Q  190 aaaaacaagaaaataaatgacaggaaagtaaagaacacaatgagtttgttgacccaactcggtgacaaacacacctactatgggggctaccaagcaagga 289  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||| |||||| ||         ||    
T  22485089 aaaaacaagaaaataaaagacaggaaagtaaagaacacaatgagtttgttgacccagttcggtgacaaacacaactactctggggg-ta---------ga 22485178  T
Q  290 aggaaatccactagtgtagtccttattttgtagctctcaacaaactcctcatttacacta-aagacctaggacctacccgtattgatttcaacctaggaa 388  Q
    || ||||||||||||||||||||||||   ||||||||| |||||||||| ||||||||| | |||||||||  || |||||| || ||||||||| |||    
T  22485179 agaaaatccactagtgtagtccttattcaatagctctcagcaaactcctcgtttacactatatgacctaggaattatccgtatagacttcaacctaagaa 22485278  T
Q  389 ttcctagatctgacatcccatctcactatccta 421  Q
     |||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  22485279 ctcctagatctgagatcccatctcactatccta 22485311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 105; E-Value: 3e-52
Query Start/End: Original strand, 286 - 449
Target Start/End: Complemental strand, 27925563 - 27925399
Alignment:
Q  286 aggaaggaaatccactagtgtagtccttattttgtagctctcaacaaactcctcatttacactaaagacctaggacctacccgtattgatttcaacctag 385  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||||| || |||| |||||    
T  27925563 aggaaggaaatccactagtgtagtccttattctatagctctcaacaaactccacatttacaccaaagacataggacctacccgtatagacttcatcctag 27925464  T
Q  386 gaattcctagatctgacatcccatctcactatcctaca-gtcaatcacagcccctgtgatctatc 449  Q
    ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||| |||||    
T  27925463 gaactcctagatctgagatcccatctcactatcctaaaggtcagtcacagcccctgtgacctatc 27925399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 261 - 416
Target Start/End: Original strand, 39080982 - 39081137
Alignment:
Q  261 cacctactatgggggctaccaagcaaggaaggaaatccactagtgtagtccttattttgtagctctcaacaaactcctcatttacactaaagacctagga 360  Q
    |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |    
T  39080982 cacctactctgggggctaccaagccaggaaggaaatccactagtgtagtccttattcaatagctctcaacaaactcctcatttgcactaatgacctagaa 39081081  T
Q  361 cctacccgtattgatttcaacctaggaattcctagatctgacatcccatctcacta 416  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||    
T  39081082 cctacccgtactgacttcaacctaggaactactagatctgagatcccatctcacta 39081137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 101; E-Value: 7e-50
Query Start/End: Original strand, 254 - 421
Target Start/End: Original strand, 22476240 - 22476408
Alignment:
Q  254 acaaacacacctactatgggggctaccaagcaaggaaggaaatccactagtgtagtccttattttgtagctctcaacaaactcctcatttacacta-aag 352  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||| |||||||||| ||||||||| | |    
T  22476240 acaaacacacctactttgagggctaccaagccaggaaggaaatccactagtgtagtccttattcaatagctctcagcaaactcctcgtttacactatatg 22476339  T
Q  353 acctaggacctacccgtattgatttcaacctaggaattcctagatctgacatcccatctcactatccta 421  Q
    ||||||||||||||| ||| || ||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  22476340 acctaggacctacccatatagacttcaacctaggaactcctagatttgagatcccatctcactatccta 22476408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 91 - 258
Target Start/End: Original strand, 22472629 - 22472798
Alignment:
Q  91 tttgaaattctagcacacttgttttaatatgttatgtatgatgttttgacgtttgcaatgttatgattaatgtttcgacatcacgcgataagcagaa--a 188  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||| ||||||| |||||| |||||  |    
T  22472629 tttgaaattctaggacacttgttttaatacgttctgtatgatgttttaacgtttgcgatgttacgattaatgtttcaacatcacacgataaacagaatta 22472728  T
Q  189 taaaaacaagaaaataaatgacaggaaagtaaagaacacaatgagtttgttgacccaactcggtgacaaa 258  Q
     ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||    
T  22472729 aaaaaacaagaaaataaaagacatgaaagtaaagaacacaatgagtatgttgacccagttcggtgacaaa 22472798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 268 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 24850567 - 24850391
Alignment:
Q  268 tatgggggctaccaagcaaggaaggaaatccactagtgtagtccttattttgtagctctcaacaaactcctcatttaca-ctaaagacctaggacctacc 366  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |  || | ||| |||||||||| |||||| ||  |||||||||| |||||    
T  24850567 tatgggggctaccaagctaggaaggaaatccactagtgtagtccttattcta-agttatcagcaaactcctcgtttacaactctagacctaggagctacc 24850469  T
Q  367 cgtattgatttcaacctaggaattcctagatctgacatcccatctcactatcctacagtcaatcacagcccctgtgat 444  Q
    | |||||||||||| ||||||| |||||||||| | ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  24850468 catattgatttcaatctaggaactcctagatctaagatctcatctcactatcctacaatcaatcacagcccctgtgat 24850391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 93 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 27925733 - 27925581
Alignment:
Q  93 tgaaattctagcacacttgttttaatatgttatgtatgatgttttgacgtttgcaatgttatgattaatgtttcgacatcacgcgataagcagaaataaa 192  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||||||||  |||||||| |||| |||||||||  | | |||||||| ||||||||  |||| ||||||||||    
T  27925733 tgaaattctagcgcatttgttttaatatgttatgtcagatgttttaacgtatgcaatgtttcgttcaatgtttcaacatcacgaaataaacagaaataaa 27925634  T
Q  193 aacaagaaaataaatgacaggaaagtaaagaacacaatgagtttgttgaccca 245  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  27925633 aacaagaaaataaatgacaggaaagtaaagaacacagtgagtttgttgaccca 27925581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 91; E-Value: 6e-44
Query Start/End: Original strand, 261 - 415
Target Start/End: Original strand, 8726861 - 8727015
Alignment:
Q  261 cacctactatgggggctaccaagcaaggaaggaaatccactagtgtagtccttattttgtagctctcaacaaactcctcatttacactaaagacctagga 360  Q
    |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||   ||||||||| |||||||||| ||| |||||| |||||||||    
T  8726861 cacctactctgggggctaccaagccaggaaggaaatccactagtgtagtccatattcaatagctctcagcaaactcctcgtttgcactaacgacctagga 8726960  T
Q  361 cctacccgtattgatttcaacctaggaattcctagatctgacatcccatctcact 415  Q
    |||||||||| ||| ||||||||| ||| |||||||||||| ||| |||||||||    
T  8726961 cctacccgtaatgacttcaacctatgaactcctagatctgagatctcatctcact 8727015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 260 - 421
Target Start/End: Complemental strand, 13660514 - 13660354
Alignment:
Q  260 acacctactatgggggctaccaagcaaggaaggaaatccactagtgtagtccttattttgtagctctcaacaaactcctcatttacactaaagacctagg 359  Q
    ||||||||| ||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||| ||||| |  |||||||| |||||||||| ||||| |||||||||| ||    
T  13660514 acacctactctgggggctaccaaactaggaaagaaatccactagtgtagtctttattcta-agctctcagcaaactcctcgtttactctaaagacctggg 13660416  T
Q  360 acctacccgtattgatttcaacctaggaattcctagatctgacatcccatctcactatccta 421  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  13660415 acctacccgtatagacttcaacctaggaactcctagatctgagatcccatctcactctccta 13660354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 260 - 421
Target Start/End: Complemental strand, 13719157 - 13718997
Alignment:
Q  260 acacctactatgggggctaccaagcaaggaaggaaatccactagtgtagtccttattttgtagctctcaacaaactcctcatttacactaaagacctagg 359  Q
    ||||||||| ||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||| ||||| |  |||||||| |||||||||| ||||| |||||||||| ||    
T  13719157 acacctactctgggggctaccaaactaggaaagaaatccactagtgtagtctttattcta-agctctcagcaaactcctcgtttactctaaagacctggg 13719059  T
Q  360 acctacccgtattgatttcaacctaggaattcctagatctgacatcccatctcactatccta 421  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  13719058 acctacccgtatagacttcaacctaggaactcctagatctgagatcccatctcactctccta 13718997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 159 - 338
Target Start/End: Original strand, 33961676 - 33961855
Alignment:
Q  159 aatgtttcgacatcacgcgataagcagaaataaaaacaagaaaataaatgacaggaaagtaaagaacacaatgagtttgttgacccaactcggtgacaaa 258  Q
    |||||| | ||||||||  |||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||  ||||| |||||    
T  33961676 aatgttccaacatcacgaaataaacagaaatcaaaacaagaaaataaatgacaagaaagtaaagaacactgtgagtttgttgacccagttcggtaacaaa 33961775  T
Q  259 cacacctactatgggggctaccaagcaaggaaggaaatccactagtgtagtccttattttgtagctctcaacaaactcct 338  Q
    | |||||||| |||||||||||| |  |||||||||||| ||||||||||||| |||| | |||  ||||||||||||||    
T  33961776 ctcacctactctgggggctaccacgtcaggaaggaaatcaactagtgtagtccgtattctataggactcaacaaactcct 33961855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 199 - 442
Target Start/End: Original strand, 23249690 - 23249932
Alignment:
Q  199 aaaataaatgacaggaaagtaaagaacacaatgagtttgttgacccaactcggtgacaaacacacctactatgggggctaccaagcaaggaaggaaatcc 298  Q
    |||||||| |||| |||||||||   ||||| ||||||||| |||||| |||||| |||   |||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||    
T  23249690 aaaataaaagacaagaaagtaaaaggcacaacgagtttgttaacccaattcggtg-caacgtcacctactctgggggctaccaagccaagaaggaaatcc 23249788  T
Q  299 actagtgtagtccttattttgtagctctcaacaaactcctcatttaca-ctaaagacctaggacctacccgtattgatttcaacctaggaattcctagat 397  Q
    |||||||||||||||||| |     | ||||||||||| |  ||| || ||  |||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  23249789 actagtgtagtccttattataagtttatcaacaaactcattgtttgcaactctagacctaggaccaacctgtattgacttcaacctaggaactcctagat 23249888  T
Q  398 ctgacatcccatctcactatcctacagtcaatcacagcccctgtg 442  Q
    |||| ||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||    
T  23249889 ctgagatcccatctcact-tcccacaatcaatcacagcccctgtg 23249932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 261 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 33466302 - 33466120
Alignment:
Q  261 cacctactatgggggctaccaagcaaggaaggaaatccactagtgtagtccttattttgtagctctcaacaaactcctcatttacactaaagacctagga 360  Q
    |||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||    |||||||| |||||| ||| ||| |||||| |||||||||    
T  33466302 cacctactctgggggctaccaagccaggaagaaaatccactagtgtagtccttattcaaaagctctcagcaaacttctcgtttgcactaatgacctagga 33466203  T
Q  361 cctacccgtattgatttcaacctaggaattcctagatctgacatcccatctcactatcctacagtcaatcacagcccctgtgat 444  Q
    |||||| ||| ||| ||||||||||||| |||||||||||| | |||||||||||  | ||||   ||||||||||||||||||    
T  33466202 cctaccggtactgacttcaacctaggaactcctagatctgaga-cccatctcactcccttacaaataatcacagcccctgtgat 33466120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 261 - 415
Target Start/End: Complemental strand, 37155668 - 37155513
Alignment:
Q  261 cacctactatgggggctaccaagcaaggaaggaaatccactagtgtagtccttattttgtagctctcaacaaactcctcatttacacta-aagacctagg 359  Q
    |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||   ||||||||| |||||||||| ||| ||||| | ||||||||    
T  37155668 cacctactctgggggctaccaagccaggaaggaaattcactagtgtaatccttattcaatagctctcagcaaactcctcgtttgcactatatgacctagg 37155569  T
Q  360 acctacccgtattgatttcaacctaggaattcctagatctgacatcccatctcact 415  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||    
T  37155568 acctacccgtactgacttcaacctaggaactccaagatctgagatcccatctcact 37155513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 81; E-Value: 6e-38
Query Start/End: Original strand, 270 - 445
Target Start/End: Complemental strand, 23864600 - 23864425
Alignment:
Q  270 tgggggctaccaagcaaggaaggaaatccactagtgtagtccttattttgtagctctcaacaaactcctcatttacactaa-agacctaggacctacccg 368  Q
    |||||| |||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||| |  || ||||| ||||||||||  ||||| |   ||||||||||||||||||    
T  23864600 tgggggataccaagtcaggaagaaaatccactagtgtagtccttattcta-agttctcagcaaactcctcgcttacaattctagacctaggacctacccg 23864502  T
Q  369 tattgatttcaacctaggaattcctagatctgacatcccatctcactatcctacagtcaatcacagcccctgtgatc 445  Q
    | |||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  23864501 ttttgacttcaacctaggaactcctagatctgagatcccatctcactttcctacaatcaatcacagcccatgtgatc 23864425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 81; E-Value: 6e-38
Query Start/End: Original strand, 320 - 443
Target Start/End: Original strand, 45136191 - 45136315
Alignment:
Q  320 tagctctcaacaaactcctcatttacactaaagacctaggacctacccgtattgatttcaacctaggaattcctagatctgacatcccatctcactatcc 419  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  45136191 tagctctcagcaaactcctcatttacactaaagacctaggacctacccgtatagacttcaacctaggaactcctagatatgagatcccatctcactatcc 45136290  T
Q  420 t-acagtcaatcacagcccctgtga 443  Q
    | |  |||| |||||||||||||||    
T  45136291 taatggtcagtcacagcccctgtga 45136315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 79; E-Value: 9e-37
Query Start/End: Original strand, 199 - 441
Target Start/End: Original strand, 1683933 - 1684171
Alignment:
Q  199 aaaataaatgacaggaaagtaaagaacacaatgagtttgttgacccaactcggtgacaaacacacctactatgggggctaccaagcaaggaaggaaatcc 298  Q
    |||||||| |||| |||||||||   |||||  |||||||| |||||| |||||| |||   |||||||| ||| | ||||||||| |||| ||||||||    
T  1683933 aaaataaaagacaagaaagtaaaaggcacaagaagtttgttaacccaattcggtg-caacgtcacctactctggcg-ctaccaagccagga-ggaaatcc 1684029  T
Q  299 actagtgtagtccttattttgtagctctcaacaaactcctcatttacactaaagacctaggacctacccgtattgatttcaacctaggaattcctagatc 398  Q
    |||||||||||||||||| | || ||| || |||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||| |||| ||||||||| ||| |||||| ||    
T  1684030 actagtgtagtccttattctctaactcccagcaaactcctcgtttacactaaagacctaggtcatacccgtcttgacttcaacctaagaactcctagttc 1684129  T
Q  399 tgacatcccatctcactatcctacagtcaatcacagcccctgt 441  Q
    ||| |||||||||||||  ||||||  |||||||| |||||||    
T  1684130 tgagatcccatctcact-ccctacaaccaatcacatcccctgt 1684171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 79; E-Value: 9e-37
Query Start/End: Original strand, 235 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 12814760 - 12814552
Alignment:
Q  235 ttgttgacccaactcggtgacaaacacacctactatgggggctaccaagcaaggaaggaaatccactagtgtagtccttattttgtagctctcaacaaac 334  Q
    ||||| |||||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| |  || ||||| |||||    
T  12814760 ttgttaacccaatttggtgacaaacacacctactctgggggctaccaagccaggaaggaaattcactagtgtagtccttattct-aagttctcagcaaac 12814662  T
Q  335 tcctcatttac-actaaagacctaggacctacccgtattgatttcaacctaggaattcctagatctgacatcccatctcactatcctacagtcaatcaca 433  Q
    ||||| ||||| |||  ||||||||||||||||||| ||||  ||||||||| || |||||||| | | |||| |||||||| |||  || |||| ||||    
T  12814661 tcctcgtttacaactgtagacctaggacctacccgtcttgacgtcaacctagaaactcctagatttaagatccaatctcact-tccctcaatcaaccaca 12814563  T
Q  434 gcccctgtgat 444  Q
     ||||||||||    
T  12814562 acccctgtgat 12814552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 261 - 413
Target Start/End: Original strand, 17279905 - 17280057
Alignment:
Q  261 cacctactatgggggctaccaagcaaggaaggaaatccactagtgtagtccttattttgtagctctcaacaaactcctcatttacactaaagacctagga 360  Q
    |||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||   ||||||| | |||||||||| ||| |||||| |||||||||    
T  17279905 cacctactctgggggataccaagccaggaaggaaatccactagtgtagttcgtattcaatagctctaagcaaactcctcgtttgcactaatgacctagga 17280004  T
Q  361 cctacccgtattgatttcaacctaggaattcctagatctgacatcccatctca 413  Q
    ||||||| || ||| ||||||||||||| | |||||||||| |||||||||||    
T  17280005 cctacccatactgacttcaacctaggaacttctagatctgagatcccatctca 17280057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 271 - 415
Target Start/End: Complemental strand, 17880871 - 17880727
Alignment:
Q  271 gggggctaccaagcaaggaaggaaatccactagtgtagtccttattttgtagctctcaacaaactcctcatttacactaaagacctaggacctacccgta 370  Q
    |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||   ||||||||| |||||||||| ||| |||||| ||||||||| | |||||||    
T  17880871 gggggctaccaagccaagaaggaaatccactagtgtagttcttattcaatagctctcagcaaactcctcgtttgcactaatgacctaggaacgacccgta 17880772  T
Q  371 ttgatttcaacctaggaattcctagatctgacatcccatctcact 415  Q
     ||| ||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||    
T  17880771 ctgacttcaacctaggaactcctagatctgagatctcatctcact 17880727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 272 - 388
Target Start/End: Original strand, 22874206 - 22874322
Alignment:
Q  272 ggggctaccaagcaaggaaggaaatccactagtgtagtccttattttgtagctctcaacaaactcctcatttacactaaagacctaggacctacccgtat 371  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    |||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||     
T  22874206 ggggctaccaagctaggaaggaaatccactagtgtagtccttattcaaaagctctcagcaaactcctcatttgcactaatgacctaggacctacccgtac 22874305  T
Q  372 tgatttcaacctaggaa 388  Q
    ||| |||||||| ||||    
T  22874306 tgacttcaacctgggaa 22874322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 233 - 415
Target Start/End: Complemental strand, 1562537 - 1562355
Alignment:
Q  233 gtttgttgacccaactcggtgacaaacacacctactatgggggctaccaagcaaggaaggaaatccactagtgtagtccttattttgtagctctcaacaa 332  Q
    ||||||| |||||  |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||  || || || |||    
T  1562537 gtttgttaacccagttcggcgacaaacacacctactttgggggctaccaagccaggaaggaaatccactagtgtagtccttgtttt-aagttcccagcaa 1562439  T
Q  333 actcctcatttac-actaaagacctaggacctacccgtattgatttcaacctaggaattcctagatctgacatcccatctcact 415  Q
    | | |  |||||| ||| |  |||||||||||||||||| ||| |||||||||  || ||||| |||||| |||||||||||||    
T  1562438 atttcaaatttacaacttataacctaggacctacccgtactgacttcaacctaaaaactcctacatctgagatcccatctcact 1562355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 64; E-Value: 8e-28
Query Start/End: Original strand, 235 - 385
Target Start/End: Original strand, 24384552 - 24384702
Alignment:
Q  235 ttgttgacccaactcggtgacaaacacacctactatgggggctaccaagcaaggaaggaaatccactagtgtagtccttattttgtagctctcaacaaac 334  Q
    ||||| || ||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| |  || ||||| |||||    
T  24384552 ttgttaactcaattcggtgacaaacacacgtactctgggggctaccaagccaggaagaaaatccactagtgtagtccttattct-aagttctcagcaaac 24384650  T
Q  335 tcctcatttac-actaaagacctaggacctacccgtattgatttcaacctag 385  Q
    |||   ||||| ||| |||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||    
T  24384651 tccaagtttacaacttaagacctagggcctacccgtagtgacttcaacctag 24384702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 92 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 22481024 - 22480935
Alignment:
Q  92 ttgaaattctagcacacttgttttaatatgttatgtatgatgttttgacgtttgcaatgttatgattaatgtttcgacatcacgcgataa 181  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||| |||||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  22481024 ttgaaattctagaacacttgttttaatatgttttgtatgatattttaacgtttgcgatgttacgattaatgtttcaacatcacgcgataa 22480935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 234 - 311
Target Start/End: Original strand, 12240228 - 12240305
Alignment:
Q  234 tttgttgacccaactcggtgacaaacacacctactatgggggctaccaagcaaggaaggaaatccactagtgtagtcc 311  Q
    |||||| |||||  |||||||||||||||||||||  || ||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||    
T  12240228 tttgttaacccagttcggtgacaaacacacctactccggaggctaccaaaccaggaaggaaatccgctagtgtagtcc 12240305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 233 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 12377039 - 12376962
Alignment:
Q  233 gtttgttgacccaactcggtgacaaacacacctactatgggggctaccaagcaaggaaggaaatccactagtgtagtcct 312  Q
    ||||||| |||||  ||||| |||||||||| ||||||| || |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  12377039 gtttgttaacccagttcggtaacaaacacacatactatgtgg-ctaccaagca-ggaaggaaatccacaagtgtagtcct 12376962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 376 - 449
Target Start/End: Original strand, 33961873 - 33961944
Alignment:
Q  376 ttcaacctaggaattcctagatctgacatcccatctcactatcctacagtcaatcacagcccctgtgatctatc 449  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||  ||||| ||   ||| ||||||||||||||| |||||    
T  33961873 ttcaacctaggaactcctagatctgagatcccatct--ctatcttatgttcagtcacagcccctgtgacctatc 33961944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037 (Bit Score: 184; Significance: 2e-99; HSPs: 1)
Name: scaffold0037
Description:

Target: scaffold0037; HSP #1
Raw Score: 184; E-Value: 2e-99
Query Start/End: Original strand, 92 - 421
Target Start/End: Complemental strand, 110569 - 110238
Alignment:
Q  92 ttgaaattctagcacacttgttttaatatgttatgtatgatgttttgacgtttgcaatgttatgattaatgtttcgacatcacgcgataagcagaaataa 191  Q
    |||||||| || | |||||||||||||| ||||||||||||||||   || ||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||    
T  110569 ttgaaattttaccgcacttgttttaatacgttatgtatgatgtttcagcgattgcaatgttacgattaatgtttcaacatcactcgataaacagaaataa 110470  T
Q  192 aaacaagaaaataaatgacaggaaagtaaagaacacaatgagtttgttgacccaactcggtgac-aaacacacctactatgggggctaccaagcaaggaa 290  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||  |||||||| |||||||| |||| | ||||||||||||  |||||    
T  110469 aaacaagaaagtaaatgacaggaaagtaaataacacaatgagtttgttgaaccagttcggtgacaaaacacacatactctaggggctaccaagtcaggaa 110370  T
Q  291 ggaaatccactagtgtagtccttattttgtagctctcaacaaactcctcatttacacta-aagacctaggacctacccgtattgatttcaacctaggaat 389  Q
    ||||||||||||||||||||||||||   ||||||||| |||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||| || |||||||||||||     
T  110369 ggaaatccactagtgtagtccttattcaatagctctcagcaaactcctcgtttacactatatgacctaggacctacccgtatagacttcaacctaggaac 110270  T
Q  390 tcctagatctgacatcccatctcactatccta 421  Q
    |||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  110269 tcctagatttgagatcccatctcactatccta 110238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0102 (Bit Score: 183; Significance: 8e-99; HSPs: 1)
Name: scaffold0102
Description:

Target: scaffold0102; HSP #1
Raw Score: 183; E-Value: 8e-99
Query Start/End: Original strand, 93 - 421
Target Start/End: Original strand, 36854 - 37183
Alignment:
Q  93 tgaaattctagcacacttgttttaatatgttatgtatgatgttttgacgtttgcaatgttatgattaatgtttcgacatcacgcgataagcagaaataaa 192  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||| | |||| ||||||| || || ||||    
T  36854 tgaaattctaggacacttgttttaatatgttctatatgatgttacgacgtttgcaatgttacgattaatgtttcaaaatcatgcgataaacaaaattaaa 36953  T
Q  193 aa-caagaaaataaatgacaggaaagtaaagaacacaatgagtttgttgacccaactcggtgacaaacacacctactatgggggctaccaagcaaggaag 291  Q
    || |||||||||||| |  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||    
T  36954 aaacaagaaaataaaagttaggaaagtaaa-aacacaatgagtttgttgacccagttcggtgacaaacacacctactctggaggctaccaagccaggaag 37052  T
Q  292 gaaatccactagtgtagtccttattttgtagctctcaacaaactcctcatttacacta-aagacctaggacctacccgtattgatttcaacctaggaatt 390  Q
    |||||||||||||||||||||||||   ||||||||| |||||||||| ||||||| | | |||||||||||||||||||| || ||||||||||||| |    
T  37053 gaaatccactagtgtagtccttattcaatagctctcagcaaactcctcgtttacaccatatgacctaggacctacccgtatagacttcaacctaggaact 37152  T
Q  391 cctagatctgacatcccatctcactatccta 421  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  37153 cctagatctgagatcccatctcactatccta 37183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0059 (Bit Score: 177; Significance: 3e-95; HSPs: 3)
Name: scaffold0059
Description:

Target: scaffold0059; HSP #1
Raw Score: 177; E-Value: 3e-95
Query Start/End: Original strand, 91 - 421
Target Start/End: Complemental strand, 61786 - 61455
Alignment:
Q  91 tttgaaattctagcacacttgttttaatatgttatgtatgatgttttgacgtttgcaatgttatgattaatgtttcgacatcacgcgataagcagaaat- 189  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||  | |||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||| || ||||     
T  61786 tttgaaattctagcacatttgttttaatatgttttgtatgatgttacggcgtttgcaatgttacgattaatatttcaacatcacgcgataaacaaaaata 61687  T
Q  190 aaaaacaagaaaataaatgacaggaaagtaaagaacacaatgagtttgttgacccaactcggtgacaaacacacctactatgggggctaccaagcaagga 289  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||  |||| ||||||||||||||| | ||    
T  61686 aaaaacaagaaagtaaatgacaggaaagtaaatagcacaatgagtttgttgacccagttcggtgacaaacaca-ttactctgggggctaccaagccaaga 61588  T
Q  290 aggaaatccactagtgtagtccttattttgtagctctcaacaaactcctcatttacacta-aagacctaggacctacccgtattgatttcaacctaggaa 388  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||   ||||||||| ||||||| |  ||||||||| | |||||| ||||||||||||| || |||||||||||||    
T  61587 aggaaatccactagtgtagttcttattcaatagctctcagcaaactcattgtttacactatatgacctaagacctacccgtatagacttcaacctaggaa 61488  T
Q  389 ttcctagatctgacatcccatctcactatccta 421  Q
     |||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  61487 ctcctagatctgagatcccatctcactatccta 61455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0059; HSP #2
Raw Score: 160; E-Value: 4e-85
Query Start/End: Original strand, 95 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 50401 - 50146
Alignment:
Q  95 aaattctagcacacttgttttaatatgttatgtatgatgttttgacgtttgcaatgttatgattaatgtttcgacatcacgcgataagcagaaataaaaa 194  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||  | |||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||    
T  50401 aaattctagcacacttgttttaatacgttctgtatgatgttaaggcgtttgcaatgttacgattaatgtttcaacatcacgcgataaacagaaataaaaa 50302  T
Q  195 -caagaaaataaatgacaggaaagtaaagaacacaatgagtttgttgacccaactcggtgacaaacacacctactatgggggctaccaagcaaggaagga 293  Q
     ||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||  ||||||||    
T  50301 acaagaaagtaaatgacatgaaagtaaataacacaatgagtttgttgacccagttcggtgacaaacacacctactctaggggctaccaagtcaggaagga 50202  T
Q  294 aatccactagtgtagtccttattttgtagctctcaacaaactcctcatttacacta 349  Q
    |||||||||||||||||||||||   |||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  50201 aatccactagtgtagtccttattcaatagctctcaacaaaatcctcgtttacacta 50146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0059; HSP #3
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 376 - 421
Target Start/End: Complemental strand, 48371 - 48326
Alignment:
Q  376 ttcaacctaggaattcctagatctgacatcccatctcactatccta 421  Q
    ||||||||||||| |||||||||| | ||| |||||||||||||||    
T  48371 ttcaacctaggaactcctagatctaagatctcatctcactatccta 48326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0259 (Bit Score: 168; Significance: 7e-90; HSPs: 1)
Name: scaffold0259
Description:

Target: scaffold0259; HSP #1
Raw Score: 168; E-Value: 7e-90
Query Start/End: Original strand, 95 - 418
Target Start/End: Complemental strand, 17586 - 17263
Alignment:
Q  95 aaattctagcacacttgttttaatatgttatgtatgatgttttgacgtttgcaatgttatgattaatgtttcgacatcacgcgataagcagaaataaaaa 194  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||| |||| |||||||| ||||||||||||||  | | |||||||| | |||||||||||| || ||||||||     
T  17586 aaattctagcgcacttgttttagtatgttctgtacgatgttttaacgtttgcaatgttcagttcaatgtttcaaaatcacgcgataaacaaaaataaaat 17487  T
Q  195 caagaaaataaatgacaggaaagtaaagaacacaatgagtttgttgacccaactcggtgacaaacacacctactatgggggctaccaagcaaggaaggaa 294  Q
    ||| ||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||||  |  |||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||| ||    
T  17486 caataaaataaatgacaagaaagtaaaaaacacagtgagtttgttgacccagtttcgtgacaaacacacctactctgggggctaccaagtcaggaagaaa 17387  T
Q  295 atccactagtgtagtccttattttgtagctctcaacaaactcctcatttacactaaagacctaggacctacccgtattgatttcaacctaggaattccta 394  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| || || ||    
T  17386 atccactagtgtagtccttattctatagctctcagcaaattcctcgttaacactaaagacctaggacctacccgtatagacttcaacctagaaactctta 17287  T
Q  395 gatctgacatcccatctcactatc 418  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||    
T  17286 gatctgagatctcatctcactatc 17263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0185 (Bit Score: 167; Significance: 3e-89; HSPs: 1)
Name: scaffold0185
Description:

Target: scaffold0185; HSP #1
Raw Score: 167; E-Value: 3e-89
Query Start/End: Original strand, 93 - 410
Target Start/End: Complemental strand, 2669 - 2351
Alignment:
Q  93 tgaaattctagcacacttgttttaatatgttatgtatgatgttttgacgtttgcaatgttatgattaatgtttcgacatcacgcgataagcagaaataaa 192  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||  ||||||||| ||||  | ||||||||| || | ||| ||||| || |||||||    
T  2669 tgaaattctagcacacttgttttaatacgttatgtatgattttttagcgtttgcaaagttacaactaatgtttcaacctaacgtgataaacataaataaa 2570  T
Q  193 aacaagaaaataaatgacaggaaagtaaagaacacaatgagtttgttgacccaactcggtgacaaacacacctactatgggggctaccaagcaaggaagg 292  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||| | ||||||| ||||| |||||||    
T  2569 aacaagaaaataaatgataggaaagtaaagaacacaatgagtttgttgacccatttcggtgacaagcacacctactttaggggctatcaagccaggaagg 2470  T
Q  293 aaatccactagtgtagtccttattttgtagctctcaacaaactcctcatttacacta-aagacctaggacctacccgtattgatttcaacctaggaattc 391  Q
    || |||| ||||||||||||||||   ||||||||| |||||||| | ||||||||| | ||||||||||||| |||||| || ||||||||||||| ||    
T  2469 aagtccaatagtgtagtccttattcaatagctctcagcaaactccccgtttacactatatgacctaggacctagccgtatagacttcaacctaggaactc 2370  T
Q  392 ctagatctgacatcccatc 410  Q
    |||||||||| ||||||||    
T  2369 ctagatctgagatcccatc 2351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006 (Bit Score: 164; Significance: 2e-87; HSPs: 1)
Name: scaffold0006
Description:

Target: scaffold0006; HSP #1
Raw Score: 164; E-Value: 2e-87
Query Start/End: Original strand, 157 - 449
Target Start/End: Original strand, 87648 - 87942
Alignment:
Q  157 ttaatgtttcgacatcacgcgataagcagaaataaaaacaagaaaataaatgacaggaaagtaaagaacacaatgagtttgttgacccaactcggtgaca 256  Q
    |||||||| | |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  87648 ttaatgttccaacatcacgtgataaacagaaataaaaacaagaaaataaatggcgggaaagtaaagaacacaatgagtttgttgacccagttcggtgaca 87747  T
Q  257 aacacacctac-tatgggggctaccaagcaaggaaggaaatccactagtgtagtccttattttgtagctctcaacaaactcctcatttacacta-aagac 354  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||| |||||||||| ||||||||| | |||    
T  87748 aacacacctacgtatgggggct-ccaagctaggaaggaaatccactagtgtagtccttattcaatagctctcagcaaactcctcgtttacactatatgac 87846  T
Q  355 ctaggacctacccgtattgatttcaacctaggaattcctagatctgacatcccatctcactatcctac-agtcaatcacagcccctgtgatctatc 449  Q
    ||||||||||||||| | || ||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||| ||| ||||||||||| |||||    
T  87847 ctaggacctacccgtctagacttcaacccaggaactcctagatctgagatcccatctcactatcctacgggtcagtcatagcccctgtgacctatc 87942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0338 (Bit Score: 162; Significance: 3e-86; HSPs: 1)
Name: scaffold0338
Description:

Target: scaffold0338; HSP #1
Raw Score: 162; E-Value: 3e-86
Query Start/End: Original strand, 92 - 449
Target Start/End: Complemental strand, 16525 - 16167
Alignment:
Q  92 ttgaaattctagcacacttgttttaatatgttatgtatgatgttttgacgtttgcaatgttatgattaatgtttcgacatcacgcgataagcagaa--at 189  Q
    ||||||||| ||  |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||| | ||||| || | |||||||||||||| |||||  |     
T  16525 ttgaaattcaagggcacttgttttaatacgttatgtatgatgttttaacgtttgcgatgttacgtttaat-ttccaacatcacgcgataaacagaagaaa 16427  T
Q  190 aaaaacaagaaaataaatgacaggaaagtaaagaacacaatgagtttgttgacccaactcggtgacaaacacacctactatgggggctaccaagcaagga 289  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| |||||  |||||| |||   || | ||| ||||||||||||||| ||||    
T  16426 aaaaacaagaaaataaatgacaagaaagtaaagaacacagtgagtttgttaacccagttcggtg-caacgtcaaccactttgggggctaccaagccagga 16328  T
Q  290 aggaaatccactagtgtagtccttattttgtagctctcaacaaactcctcatttacactaaa-gacctaggacctacccgtattgatttcaacctaggaa 388  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||| | || |||||||||||||    
T  16327 aggaaatccactagtgtagtccttattcaaaagctctcaacaaactcctcatttacactttatgacctaggacctacccgtctagacttcaacctaggaa 16228  T
Q  389 ttcctagatctgacatcccatctcactatcctacagtcaatcacagcccctgtgatctatc 449  Q
     |||||||||||| ||| ||||||||| |||||  |||| ||||||||||||||| |||||    
T  16227 ctcctagatctgagatctcatctcactgtcctatggtcagtcacagcccctgtgagctatc 16167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0190 (Bit Score: 150; Significance: 4e-79; HSPs: 1)
Name: scaffold0190
Description:

Target: scaffold0190; HSP #1
Raw Score: 150; E-Value: 4e-79
Query Start/End: Original strand, 91 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 16937 - 16588
Alignment:
Q  91 tttgaaattctagcacacttgttttaatatgttatgtatgatgttttgacgtttgcaatgttatgattaatgtttcgacatcacgcgataagcagaaata 190  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||||||||||  ||  |||||||  || ||||||| ||  |  |||||||||| | ||||||  |||||||||||||    
T  16937 tttgaaattttagcgcacttgttttaatatgttcagtgagatgtttcaacatttgcaaagtcctatttaatgtttcaatatcacgaaataagcagaaata 16838  T
Q  191 aaaacaagaaaataaatgacaggaaagtaaagaacacaatgagtttgttgacccaactcggtgacaaacacacctactatgggggctaccaagcaaggaa 290  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||  |||||||||||||| || ||    
T  16837 aaaacaagaaaataaatgacaagaaagtaaagaacacagtgagtttgttgactcagttcggtgacaaacacacctactccgggggctaccaagccagaaa 16738  T
Q  291 ggaaatccactagtgtagtccttattttgtagctctcaacaaactcctcatttacac-taaagacctaggacctacccgtattgatttcaacctaggaat 389  Q
    |||||||||||| |||||||||||||    |||| | | |||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||||| || |||||||||||||     
T  16737 ggaaatccactactgtagtccttattcaaaagctataagcaaactcctcatttacactttatgacctaggacctacccgtatagacttcaacctaggaac 16638  T
Q  390 tcctagatctgacatcccatctcactatcct-acagtcaatcacagcccc 438  Q
    ||||| |||| | |||||||||||||||| | |  |||||||||||||||    
T  16637 tcctatatctaagatcccatctcactatcttaatggtcaatcacagcccc 16588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008 (Bit Score: 131; Significance: 9e-68; HSPs: 1)
Name: scaffold0008
Description:

Target: scaffold0008; HSP #1
Raw Score: 131; E-Value: 9e-68
Query Start/End: Original strand, 196 - 449
Target Start/End: Original strand, 40287 - 40540
Alignment:
Q  196 aagaaaataaatgacaggaaagtaaagaacacaatgagtttgttgacccaactcggtgacaaacacacctactatgggggctaccaagcaaggaaggaaa 295  Q
    ||||||| |||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||  || ||||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  40287 aagaaaaaaaatgataagaaagtaaagaacacagtgagtttgttgacccagttcagtgacaa-cacacctactctgggggctaccaagctaggaaggaaa 40385  T
Q  296 tccactagtgtagtccttattttgtagctctcaacaaactcctcatttacactaaa-gacctaggacctacccgtattgatttcaacctaggaattccta 394  Q
    |||||||||||||||||||||    |||||||| |||||||||| ||||||||  | ||||||||||||||| |||| || ||||||||||||| |||||    
T  40386 tccactagtgtagtccttattcaaaagctctcagcaaactcctcgtttacactttatgacctaggacctaccagtatagaattcaacctaggaactccta 40485  T
Q  395 gatctgacatcccatctcactatcctacagtcaatcacagcccctgtgatctatc 449  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||  |||| ||||| ||||||||| |||||    
T  40486 gatctgagatcccatctcactatcctatggtcagtcacaacccctgtgacctatc 40540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0333 (Bit Score: 130; Significance: 3e-67; HSPs: 1)
Name: scaffold0333
Description:

Target: scaffold0333; HSP #1
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 91 - 349
Target Start/End: Original strand, 5491 - 5750
Alignment:
Q  91 tttgaaattctagcacacttgttttaatatgttatgtatgatgttttgacgtttgcaatgttatgattaatgtttcgacatcacgcgataagcagaaat- 189  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||||| ||  | ||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||  ||||||     
T  5491 tttgaaattttagcgcacttgttttaatatgttctgtatgatattacggcgtttgcaatgttacaattaatgtttcaacatcacgcgataaatagaaata 5590  T
Q  190 -aaaaacaagaaaataaatgacaggaaagtaaagaacacaatgagtttgttgacccaactcggtgacaaacacacctactatgggggctaccaagcaagg 288  Q
     |||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||| |||||||||||||| |  ||||||||||||||||    
T  5591 aaaaaacagcaaaataaaagacaggaaagtaaagaacacaatgaatttgttgacccagttcggtgtcaaacacacctactct-agggctaccaagcaagg 5689  T
Q  289 aaggaaatccactagtgtagtccttattttgtagctctcaacaaactcctcatttacacta 349  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||   ||||||||| ||||||| || |||||||||    
T  5690 aaggaaatccacaagtgtagtccttattcaatagctctcagcaaactcatcgtttacacta 5750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0064 (Bit Score: 108; Significance: 5e-54; HSPs: 2)
Name: scaffold0064
Description:

Target: scaffold0064; HSP #1
Raw Score: 108; E-Value: 5e-54
Query Start/End: Original strand, 261 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 53067 - 52887
Alignment:
Q  261 cacctactatgggggctaccaagcaaggaaggaaatccactagtgtagtccttattttgtagctctcaacaaactcctcatttacactaaagacctagga 360  Q
    |||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  53067 cacctactctgggggctaccaagccagga-ggaaatccactagtgtagtccttattctatagctctcagcaaactcctcgtttacactaaagacctagga 52969  T
Q  361 cctacccgtattgatttcaacctaggaattcctagatctgacatcccatctcactatcctacagtcaatcacagcccctgtgat 444  Q
    ||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||  ||||||  ||||||| |||||||||||    
T  52968 cctacccgt-ttggtttcaacctaggaactcctagatctgagatcccatctcact-ccctacaaccaatcactgcccctgtgat 52887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0064; HSP #2
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 345 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 45924 - 45858
Alignment:
Q  345 cactaaagacctaggacctacccgtattgatttcaacctaggaattcctagatctgacatcccatct 411  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||| ||||||| |||||||||    
T  45924 cactaaagacctaggacctacccgtattgacttcaacctaagaactccttgatctgagatcccatct 45858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0035 (Bit Score: 100; Significance: 3e-49; HSPs: 1)
Name: scaffold0035
Description:

Target: scaffold0035; HSP #1
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 235 - 444
Target Start/End: Original strand, 37357 - 37567
Alignment:
Q  235 ttgttgacccaactcggtgacaaacacacctactatgggggctaccaagcaaggaaggaaatccactagtgtagtccttattttgtagctctcaacaaac 334  Q
    ||||| |||||  ||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| |  || ||||| |||||    
T  37357 ttgttaacccagttcggtgacagacacacccactatgggg-ctaccaagtcaggaaggaaatccactagtgtagtccttattctaaagttctcagcaaac 37455  T
Q  335 tcctcatttac-actaaagacctaggacctacccgtattga-tttcaacctaggaattcctagatctgacatcccatctcactatcctacagtcaatcac 432  Q
    ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| | || |||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  37456 tcctcatttacaacttaagacctaggacctacccgtctagactttcaacctaggaactcctagatatgagatcccatctcattatcctacaatcaatcac 37555  T
Q  433 agcccctgtgat 444  Q
    |  |||||||||    
T  37556 ataccctgtgat 37567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0088 (Bit Score: 94; Significance: 1e-45; HSPs: 1)
Name: scaffold0088
Description:

Target: scaffold0088; HSP #1
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 250 - 418
Target Start/End: Original strand, 36598 - 36767
Alignment:
Q  250 ggtgacaaacacacctactatgggggctaccaagcaaggaaggaaatccactagtgtagtccttattttgtagctctcaacaaactcctcatttacacta 349  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  36598 ggtgacaaacacacctactctggaggctaccaagctaggaaggaaatccactagtgtagtccttattcaatagctctcaacaaactcctcgtttacacta 36697  T
Q  350 -aagacctaggacctacccgtattgatttcaacctaggaattcctagatctgacatcccatctcactatc 418  Q
     | ||||||||||||||| ||||  | ||||| ||||||| ||| |||||||| ||||||| ||||||||    
T  36698 tatgacctaggacctacctgtatatacttcaaactaggaactcccagatctgagatcccatttcactatc 36767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0032 (Bit Score: 87; Significance: 2e-41; HSPs: 1)
Name: scaffold0032
Description:

Target: scaffold0032; HSP #1
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 261 - 415
Target Start/End: Original strand, 103122 - 103276
Alignment:
Q  261 cacctactatgggggctaccaagcaaggaaggaaatccactagtgtagtccttattttgtagctctcaacaaactcctcatttacactaaagacctagga 360  Q
    |||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||| | |||||||||  ||| ||| ||||||||||||    
T  103122 cacctactctaggggctaccaagccaggaaggaaatccactagtgtagtccttattcaatagctctgagcaaactccttgtttgcaccaaagacctagga 103221  T
Q  361 cctacccgtattgatttcaacctaggaattcctagatctgacatcccatctcact 415  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||    
T  103222 cctacccgtactgacttcaacctaggaactcctagatctgagatcccttctcact 103276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0328 (Bit Score: 85; Significance: 2e-40; HSPs: 1)
Name: scaffold0328
Description:

Target: scaffold0328; HSP #1
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 261 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 17115 - 16931
Alignment:
Q  261 cacctactatgggggctaccaagcaaggaaggaaatccactagtgtagtccttattttgtagctctcaacaaactcctcatttacacta-aagacctagg 359  Q
    ||||||||||||||   ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||| ||| ||||| | |||||||     
T  17115 cacctactatggggctaaccaatccaggaaggaaatccactagtgtagtccttattcaatagctctcaacaaactcctcgtttgcactatatgacctagt 17016  T
Q  360 acctacccgtattgatttcaacctaggaattcctagatctgacatcccatctcactatcctacagtcaatcacagcccctgtgat 444  Q
    ||| ||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||  | ||||   ||||||||||||||||||    
T  17015 acccacccgtactgacttcaacctaggaactcctagatctgagatcccatctcactcccttacaactaatcacagcccctgtgat 16931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0143 (Bit Score: 84; Significance: 1e-39; HSPs: 1)
Name: scaffold0143
Description:

Target: scaffold0143; HSP #1
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 261 - 444
Target Start/End: Original strand, 36314 - 36496
Alignment:
Q  261 cacctactatgggggctaccaagcaaggaaggaaatccactagtgtagtccttattttgtagctctcaacaaactcctcatttacactaaagacctagga 360  Q
    |||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||    |||||||| |||||| ||| ||| |||||| |||||||||    
T  36314 cacctactctgggggctaccaagccaggaagaaaatccactagtgtagtccttattcaaaagctctcagcaaacttctcgtttgcactaatgacctagga 36413  T
Q  361 cctacccgtattgatttcaacctaggaattcctagatctgacatcccatctcactatcctacagtcaatcacagcccctgtgat 444  Q
    |||||| ||| ||| ||||||||||||| |||||||||||| | |||||||||||  | ||||   ||||||||||||||||||    
T  36414 cctaccggtactgacttcaacctaggaactcctagatctgaga-cccatctcactcccttacaaataatcacagcccctgtgat 36496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0015 (Bit Score: 81; Significance: 6e-38; HSPs: 1)
Name: scaffold0015
Description:

Target: scaffold0015; HSP #1
Raw Score: 81; E-Value: 6e-38
Query Start/End: Original strand, 195 - 444
Target Start/End: Original strand, 202346 - 202594
Alignment:
Q  195 caagaaaataaatgacaggaaagtaaagaacacaat-gagtttgttgacccaactcggtgacaaacacacctactatgggggctaccaagcaaggaagga 293  Q
    ||||||||||||| ||  ||||||||| | |||||  ||||| ||| |||||  ||| |||||||||||  |||| ||||||||||||||  ||||||||    
T  202346 caagaaaataaataactagaaagtaaatagcacaagagagtt-gttaacccagttcgttgacaaacacaagtactctgggggctaccaagtcaggaagga 202444  T
Q  294 aatccactagtgtagtccttattttgtagctctcaacaaactcctcatttaca-ctaaagacctaggacctacccgtattgatttcaacctaggaattcc 392  Q
    ||||||||||||||||||||||| |  || |||||  |||   | |||||||| || |||||||||||||||||| | | || ||||||||||||| | |    
T  202445 aatccactagtgtagtccttattctaaagttctcagtaaat--cacatttacaacttaagacctaggacctacccatctggacttcaacctaggaacttc 202542  T
Q  393 tagatctgacatcccatctcactatcctacagtcaatcacagcccctgtgat 444  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||    
T  202543 tagatctgagatcccatctcactatcctacaaccaatcacagcccctatgat 202594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022 (Bit Score: 77; Significance: 1e-35; HSPs: 1)
Name: scaffold0022
Description:

Target: scaffold0022; HSP #1
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 248 - 415
Target Start/End: Original strand, 3127 - 3291
Alignment:
Q  248 tcggtgacaaacacacctactatgggggctaccaagcaaggaaggaaatccactagtgtagtccttattttgtagctctcaacaaactcctcatttacac 347  Q
    |||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||    |||||||| |||||  | | ||| |||    
T  3127 tcggtgacaa-cacacctactctggaggctaccaagccaggaaggaaatccactagtgtagtacgtattcaacagctctcagcaaac--cacgtttgcac 3223  T
Q  348 taaagacctaggacctacccgtattgatttcaacctaggaattcctagatctgacatcccatctcact 415  Q
    ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||    
T  3224 taatgacctaggacctacccgtactgatttcaacctaggaactcctagatttgagatcccatctcact 3291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0505 (Bit Score: 58; Significance: 3e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0505
Description:

Target: scaffold0505; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 235 - 415
Target Start/End: Complemental strand, 10204 - 10024
Alignment:
Q  235 ttgttgacccaactcggtgacaaacacacctactatgggggctaccaagcaaggaaggaaatccactagtgtagtccttattttgtagctctcaacaaac 334  Q
    ||||| |||||  ||||||||||| |||| |||| | ||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||  |  |  ||||| |||||    
T  10204 ttgttaacccagttcggtgacaaatacacttactcttggggctaccaagtcagaaaggaaatccactagtgtagtccttatact-aacttctcaccaaac 10106  T
Q  335 tcctcatttac-actaaagacctaggacctacccgtattgatttcaacctaggaattcctagatctgacatcccatctcact 415  Q
    ||||  ||||| |||  |||||||||||||| |||| |||| ||||||| ||||| |||||||||||| ||| |||||||||    
T  10105 tccttgtttacaactctagacctaggacctatccgtcttgacttcaaccgaggaactcctagatctgagatctcatctcact 10024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0480 (Bit Score: 58; Significance: 3e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0480
Description:

Target: scaffold0480; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 351 - 444
Target Start/End: Original strand, 11295 - 11387
Alignment:
Q  351 agacctaggacctacccgtattgatttcaacctaggaattcctagatctgacatcccatctcactatcctacagtcaatcacagcccctgtgat 444  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  11295 agacctaggacctaccggtattgacttcaacctaggtactcctagatctgagatcccatctcact-tcccacaatcaatcacagcccctgtgat 11387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0520 (Bit Score: 50; Significance: 2e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0520
Description:

Target: scaffold0520; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 235 - 415
Target Start/End: Original strand, 5409 - 5589
Alignment:
Q  235 ttgttgacccaactcggtgacaaacacacctactatgggggctaccaagcaaggaaggaaatccactagtgtagtccttattttgtagctctcaacaaac 334  Q
    ||||| |||||  ||||||||||||||||||||| | ||||||   |||  || |||||||||||||||||||||||||| ||   || ||| | |||||    
T  5409 ttgttaacccagttcggtgacaaacacacctactctaggggctgttaagtcagaaaggaaatccactagtgtagtcctta-ttccaagttctgagcaaac 5507  T
Q  335 tcctcatttac-actaaagacctaggacctacccgtattgatttcaacctaggaattcctagatctgacatcccatctcact 415  Q
    |||   ||||| |||  ||||||||||| |||| || || | ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  5508 tccaagtttacaactctagacctaggacttacctgtcttaacttcaacctaggaactcctagatctgagatcccatctcact 5589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0020 (Bit Score: 42; Significance: 0.00000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0020
Description:

Target: scaffold0020; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 360 - 421
Target Start/End: Complemental strand, 12553 - 12492
Alignment:
Q  360 acctacccgtattgatttcaacctaggaattcctagatctgacatcccatctcactatccta 421  Q
    |||||||||||| || |||||||||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  12553 acctacccgtatagacttcaacctagaaactcctagatctgagatcccatctcactatccta 12492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0423 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0423
Description:

Target: scaffold0423; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 248 - 444
Target Start/End: Original strand, 13611 - 13807
Alignment:
Q  248 tcggtgacaaacacacctactatgggggctaccaagcaaggaaggaaatccactagtgtagtccttattttgtagctctcaacaaactcctcatttaca- 346  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||| |||| || ||||||||| ||  || |  || ||||| |||| |||   ||||||     
T  13611 tcggtgacaaacacacctactctaggggctaccaagccaggaagaaaattcattagtgtagttctagttcta-agttctcagcaaattccaagtttacaa 13709  T
Q  347 ctaaagacctaggacctacccgtattgatttcaacctaggaattcctagatctgacatcccatctcactatcctacagtcaatcacagcccctgtgat 444  Q
    || |  |||| |   ||||||||||||| ||||||||||||| || |||| |||| ||| |||||||||  ||  || ||||||||| ||||||||||    
T  13710 cttatcaccttgacactacccgtattgacttcaacctaggaactcatagacctgagatctcatctcacttcccctcaatcaatcacaacccctgtgat 13807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University