View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF9530_low_7 (Length: 350)

Name: NF9530_low_7
Description: NF9530
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF9530_low_7
NF9530_low_7
[»] chr5 (31 HSPs)
chr5 (4-197)||(9008073-9008266)
chr5 (1-198)||(1579034-1579231)
chr5 (1-198)||(1605584-1605781)
chr5 (1-201)||(27679182-27679382)
chr5 (3-197)||(27420857-27421051)
chr5 (1-193)||(16069356-16069548)
chr5 (1-197)||(24105684-24105880)
chr5 (1-197)||(33491209-33491405)
chr5 (1-191)||(16737460-16737650)
chr5 (1-190)||(3386499-3386688)
chr5 (1-197)||(4120936-4121132)
chr5 (1-197)||(19358525-19358721)
chr5 (5-197)||(20992163-20992355)
chr5 (1-200)||(8374352-8374550)
chr5 (3-198)||(33991138-33991333)
chr5 (1-189)||(1165614-1165802)
chr5 (1-197)||(31883143-31883339)
chr5 (3-197)||(35782659-35782853)
chr5 (4-198)||(38598466-38598660)
chr5 (1-193)||(3921584-3921776)
chr5 (4-196)||(5202972-5203164)
chr5 (1-196)||(31410476-31410671)
chr5 (3-196)||(26602957-26603140)
chr5 (1-151)||(27025001-27025151)
chr5 (61-197)||(20992354-20992494)
chr5 (55-188)||(33284642-33284775)
chr5 (44-203)||(25634575-25634732)
chr5 (1-46)||(35420437-35420482)
chr5 (60-184)||(31638157-31638281)
chr5 (77-130)||(41818552-41818605)
chr5 (62-145)||(19516044-19516127)
[»] chr8 (38 HSPs)
chr8 (1-196)||(14422702-14422897)
chr8 (1-198)||(39206583-39206780)
chr8 (1-197)||(18594535-18594731)
chr8 (1-196)||(29938060-29938255)
chr8 (1-193)||(13110406-13110598)
chr8 (1-201)||(22260643-22260843)
chr8 (3-198)||(10836770-10836965)
chr8 (1-191)||(2042537-2042727)
chr8 (1-198)||(24113179-24113376)
chr8 (3-196)||(35118046-35118239)
chr8 (1-192)||(144397-144588)
chr8 (1-198)||(39218774-39218971)
chr8 (1-197)||(6144286-6144482)
chr8 (1-195)||(34842378-34842572)
chr8 (1-190)||(34679470-34679659)
chr8 (1-197)||(4035845-4036041)
chr8 (1-201)||(33278394-33278594)
chr8 (1-193)||(34998909-34999101)
chr8 (1-198)||(7774761-7774958)
chr8 (3-192)||(41575516-41575705)
chr8 (1-196)||(38167168-38167363)
chr8 (1-194)||(7791412-7791605)
chr8 (1-189)||(44804957-44805145)
chr8 (3-198)||(7811992-7812187)
chr8 (3-197)||(36491155-36491349)
chr8 (39-197)||(40117903-40118061)
chr8 (1-198)||(28639275-28639474)
chr8 (1-196)||(5320563-5320758)
chr8 (4-193)||(8021721-8021902)
chr8 (39-198)||(33287076-33287235)
chr8 (3-191)||(42571598-42571783)
chr8 (56-197)||(26783801-26783942)
chr8 (1-192)||(66192-66384)
chr8 (1-116)||(9807339-9807454)
chr8 (44-197)||(2322068-2322221)
chr8 (67-190)||(5005171-5005294)
chr8 (44-193)||(39220258-39220407)
chr8 (108-193)||(9806875-9806960)
[»] chr3 (41 HSPs)
chr3 (1-198)||(37698142-37698339)
chr3 (3-197)||(42307906-42308100)
chr3 (4-196)||(25999382-25999574)
chr3 (3-194)||(38856089-38856280)
chr3 (3-197)||(15520143-15520337)
chr3 (1-203)||(22174989-22175191)
chr3 (1-201)||(29445477-29445677)
chr3 (1-198)||(50528921-50529118)
chr3 (1-197)||(8042600-8042796)
chr3 (1-197)||(20842347-20842543)
chr3 (1-193)||(32244117-32244309)
chr3 (1-197)||(46452161-46452357)
chr3 (1-196)||(25494284-25494479)
chr3 (1-198)||(15520628-15520825)
chr3 (1-190)||(21581042-21581231)
chr3 (1-198)||(54870173-54870370)
chr3 (1-195)||(20699144-20699338)
chr3 (1-198)||(35226439-35226636)
chr3 (1-198)||(38933938-38934134)
chr3 (1-198)||(54534327-54534522)
chr3 (3-197)||(12117659-12117853)
chr3 (3-190)||(44609334-44609521)
chr3 (1-198)||(24835698-24835895)
chr3 (1-193)||(32359256-32359448)
chr3 (6-196)||(26122808-26122998)
chr3 (1-198)||(34700333-34700530)
chr3 (1-186)||(42104970-42105155)
chr3 (1-196)||(2895179-2895378)
chr3 (1-198)||(53028217-53028406)
chr3 (1-196)||(44688760-44688949)
chr3 (38-195)||(35643212-35643369)
chr3 (1-190)||(48925002-48925189)
chr3 (1-145)||(16354391-16354535)
chr3 (56-190)||(50529827-50529961)
chr3 (62-197)||(49128042-49128177)
chr3 (5-167)||(12915930-12916091)
chr3 (1-76)||(24366143-24366218)
chr3 (1-69)||(13696914-13696982)
chr3 (148-197)||(24366085-24366134)
chr3 (3-36)||(50528883-50528916)
chr3 (163-198)||(10449111-10449147)
[»] chr7 (44 HSPs)
chr7 (1-201)||(24792335-24792535)
chr7 (5-202)||(30181031-30181228)
chr7 (1-197)||(12101181-12101377)
chr7 (1-197)||(42964999-42965195)
chr7 (1-197)||(43067976-43068172)
chr7 (3-194)||(7164184-7164375)
chr7 (1-196)||(33359093-33359288)
chr7 (1-195)||(20346487-20346681)
chr7 (3-196)||(22649699-22649892)
chr7 (1-193)||(3511324-3511516)
chr7 (1-197)||(42204151-42204348)
chr7 (1-197)||(933282-933478)
chr7 (1-193)||(5280861-5281053)
chr7 (1-197)||(15655909-15656105)
chr7 (1-192)||(4477324-4477515)
chr7 (1-196)||(25748485-25748680)
chr7 (1-191)||(1803029-1803219)
chr7 (1-198)||(33846532-33846724)
chr7 (1-197)||(6394748-6394944)
chr7 (4-198)||(32041538-32041732)
chr7 (5-197)||(4347270-4347462)
chr7 (1-197)||(36890833-36891028)
chr7 (1-189)||(43156718-43156906)
chr7 (1-196)||(12097593-12097788)
chr7 (1-192)||(42673467-42673654)
chr7 (7-195)||(8630665-8630853)
chr7 (1-193)||(9452591-9452783)
chr7 (1-191)||(38866547-38866737)
chr7 (1-194)||(17753600-17753793)
chr7 (1-193)||(46891342-46891535)
chr7 (3-194)||(46134309-46134500)
chr7 (1-159)||(48865665-48865826)
chr7 (1-197)||(16894510-16894696)
chr7 (49-197)||(19828267-19828415)
chr7 (1-197)||(43021583-43021775)
chr7 (44-197)||(37005857-37006010)
chr7 (44-197)||(43405017-43405170)
chr7 (99-197)||(37704977-37705075)
chr7 (44-197)||(15655458-15655611)
chr7 (51-196)||(36849590-36849735)
chr7 (44-196)||(30075277-30075426)
chr7 (105-189)||(27691433-27691517)
chr7 (60-198)||(20163815-20163953)
chr7 (163-198)||(22032910-22032946)
[»] chr6 (23 HSPs)
chr6 (1-201)||(6086612-6086812)
chr6 (1-196)||(26704352-26704547)
chr6 (1-196)||(26946889-26947084)
chr6 (1-198)||(2837542-2837739)
chr6 (1-197)||(3347536-3347732)
chr6 (1-196)||(30691850-30692045)
chr6 (4-194)||(3955782-3955972)
chr6 (1-199)||(21893451-21893649)
chr6 (1-198)||(17261086-17261283)
chr6 (1-196)||(9459562-9459757)
chr6 (1-196)||(20726790-20726981)
chr6 (1-197)||(18613536-18613732)
chr6 (3-198)||(16307023-16307218)
chr6 (1-192)||(34887305-34887496)
chr6 (1-198)||(11167237-11167434)
chr6 (1-203)||(28199521-28199724)
chr6 (1-185)||(1153603-1153787)
chr6 (9-198)||(35198281-35198469)
chr6 (32-198)||(52833-52999)
chr6 (1-191)||(30698942-30699132)
chr6 (1-125)||(33464399-33464523)
chr6 (1-102)||(53001-53102)
chr6 (121-202)||(33463694-33463775)
[»] scaffold0167 (1 HSPs)
scaffold0167 (1-196)||(22964-23159)
[»] scaffold0012 (1 HSPs)
scaffold0012 (1-198)||(36700-36897)
[»] chr4 (63 HSPs)
chr4 (1-198)||(50055102-50055299)
chr4 (4-196)||(23776463-23776655)
chr4 (1-197)||(54189541-54189737)
chr4 (1-196)||(19913631-19913826)
chr4 (1-203)||(53717465-53717667)
chr4 (1-197)||(15241029-15241225)
chr4 (3-194)||(1756767-1756958)
chr4 (2-196)||(38055154-38055348)
chr4 (1-198)||(27488649-27488846)
chr4 (1-198)||(28032713-28032910)
chr4 (1-193)||(20877047-20877239)
chr4 (1-197)||(50353797-50353993)
chr4 (1-198)||(2481409-2481606)
chr4 (1-198)||(6611361-6611558)
chr4 (3-195)||(11639581-11639773)
chr4 (1-197)||(14987788-14987984)
chr4 (1-197)||(44784918-44785114)
chr4 (1-197)||(45424535-45424731)
chr4 (1-195)||(40428721-40428915)
chr4 (1-198)||(48909841-48910038)
chr4 (1-194)||(54412627-54412820)
chr4 (1-193)||(8591093-8591285)
chr4 (1-197)||(8932179-8932375)
chr4 (1-193)||(52139203-52139395)
chr4 (1-192)||(16700782-16700973)
chr4 (3-197)||(23704212-23704406)
chr4 (1-199)||(43289961-43290159)
chr4 (5-198)||(35490778-35490971)
chr4 (1-193)||(1617084-1617276)
chr4 (1-196)||(6688628-6688817)
chr4 (1-193)||(30423566-30423757)
chr4 (1-197)||(37464717-37464913)
chr4 (1-195)||(47632032-47632227)
chr4 (1-195)||(37968758-37968952)
chr4 (1-198)||(15669178-15669375)
chr4 (1-192)||(19164974-19165164)
chr4 (1-193)||(31969681-31969873)
chr4 (1-192)||(53875658-53875849)
chr4 (1-198)||(27536105-27536298)
chr4 (1-197)||(53353051-53353255)
chr4 (1-184)||(33703850-33704033)
chr4 (1-204)||(44379188-44379391)
chr4 (1-194)||(44375844-44376037)
chr4 (1-189)||(27583633-27583821)
chr4 (1-192)||(30171581-30171772)
chr4 (1-199)||(55344826-55345024)
chr4 (22-190)||(28360433-28360602)
chr4 (3-198)||(40680041-40680236)
chr4 (44-198)||(50053438-50053592)
chr4 (4-184)||(38071327-38071504)
chr4 (5-198)||(16703820-16704009)
chr4 (1-116)||(23269047-23269162)
chr4 (108-193)||(23265865-23265950)
chr4 (44-197)||(44548185-44548339)
chr4 (1-75)||(53408137-53408212)
chr4 (45-119)||(51780763-51780837)
chr4 (44-186)||(17493340-17493482)
chr4 (1-51)||(23261887-23261937)
chr4 (1-91)||(9595903-9595982)
chr4 (148-199)||(9595983-9596033)
chr4 (1-54)||(48748197-48748250)
chr4 (49-106)||(55344724-55344781)
chr4 (1-37)||(50055301-50055337)
[»] chr1 (48 HSPs)
chr1 (1-198)||(1168498-1168695)
chr1 (1-198)||(25897369-25897566)
chr1 (1-198)||(39260359-39260556)
chr1 (1-198)||(26580283-26580480)
chr1 (1-194)||(26663257-26663450)
chr1 (1-190)||(29078519-29078708)
chr1 (1-198)||(52753160-52753357)
chr1 (1-197)||(16052092-16052288)
chr1 (1-197)||(20089467-20089663)
chr1 (4-198)||(41928511-41928705)
chr1 (1-198)||(1940760-1940957)
chr1 (1-198)||(33510479-33510676)
chr1 (2-190)||(38829072-38829260)
chr1 (1-197)||(43905650-43905846)
chr1 (1-196)||(52696788-52696983)
chr1 (1-198)||(29288144-29288339)
chr1 (1-197)||(1170457-1170653)
chr1 (1-193)||(19715174-19715366)
chr1 (1-200)||(8079722-8079921)
chr1 (1-196)||(42370808-42371003)
chr1 (5-197)||(32671575-32671767)
chr1 (1-196)||(970537-970734)
chr1 (1-194)||(5215384-5215577)
chr1 (1-196)||(12682817-12683012)
chr1 (1-198)||(2347651-2347849)
chr1 (1-198)||(17591686-17591880)
chr1 (1-198)||(46760961-46761158)
chr1 (4-196)||(40092488-40092680)
chr1 (1-192)||(8120870-8121061)
chr1 (1-196)||(51359230-51359424)
chr1 (3-197)||(13996738-13996932)
chr1 (1-198)||(2473717-2473914)
chr1 (4-196)||(15203109-15203301)
chr1 (1-197)||(46409431-46409629)
chr1 (6-197)||(49146168-49146359)
chr1 (1-194)||(6765458-6765651)
chr1 (1-193)||(7145207-7145399)
chr1 (3-196)||(23498457-23498650)
chr1 (1-177)||(17587518-17587694)
chr1 (1-191)||(15717787-15717976)
chr1 (1-198)||(15554165-15554354)
chr1 (1-159)||(40149497-40149655)
chr1 (27-195)||(29695673-29695842)
chr1 (64-198)||(52086262-52086396)
chr1 (1-197)||(38171828-38172011)
chr1 (45-180)||(23322897-23323032)
chr1 (44-198)||(5217840-5217993)
chr1 (122-197)||(5675101-5675176)
[»] chr2 (29 HSPs)
chr2 (1-196)||(31517228-31517423)
chr2 (1-197)||(33906060-33906256)
chr2 (1-199)||(18806897-18807095)
chr2 (3-196)||(3873259-3873452)
chr2 (3-197)||(26323201-26323395)
chr2 (8-197)||(1108276-1108464)
chr2 (1-198)||(39635447-39635644)
chr2 (3-197)||(4232157-4232351)
chr2 (1-193)||(4016039-4016231)
chr2 (1-198)||(42937714-42937912)
chr2 (1-198)||(6174841-6175038)
chr2 (1-193)||(28329852-28330042)
chr2 (1-197)||(5733395-5733591)
chr2 (3-197)||(19901153-19901346)
chr2 (1-198)||(2178782-2178979)
chr2 (1-192)||(1482916-1483106)
chr2 (2-201)||(16588790-16588989)
chr2 (1-193)||(850997-851189)
chr2 (1-197)||(30270692-30270888)
chr2 (44-194)||(30420223-30420373)
chr2 (1-189)||(16066307-16066495)
chr2 (1-179)||(19383948-19384126)
chr2 (3-192)||(429817-430006)
chr2 (1-195)||(44947562-44947749)
chr2 (44-199)||(42446625-42446780)
chr2 (198-302)||(8808723-8808830)
chr2 (44-192)||(3585291-3585439)
chr2 (51-195)||(22101210-22101353)
chr2 (60-190)||(12517256-12517385)
[»] scaffold0920 (1 HSPs)
scaffold0920 (3-195)||(3708-3900)
[»] scaffold1777 (1 HSPs)
scaffold1777 (1-198)||(19-216)
[»] scaffold0172 (1 HSPs)
scaffold0172 (1-197)||(10234-10430)
[»] scaffold0018 (1 HSPs)
scaffold0018 (1-193)||(145258-145450)
[»] scaffold0038 (1 HSPs)
scaffold0038 (1-203)||(19-222)
[»] scaffold0482 (1 HSPs)
scaffold0482 (1-194)||(308-501)
[»] scaffold2089 (1 HSPs)
scaffold2089 (169-200)||(1063-1094)


Alignment Details
Target: chr5 (Bit Score: 186; Significance: 1e-100; HSPs: 31)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 4 - 197
Target Start/End: Original strand, 9008073 - 9008266
Alignment:
Q  4 aggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataag 103  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9008073 aggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataag 9008172  T
Q  104 ctatttttatttatttgcccaaacacctttaaaaaggcttataggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggcct 197  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9008173 ctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggcct 9008266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 1579231 - 1579034
Alignment:
Q  1 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1579231 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgat 1579132  T
Q  101 aagctatttttatttatttgcccaaacacctttaaaaaggcttataggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggccta 198  Q
    || |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1579131 aaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccatataagctcaaaataagccaatccaaacggggccta 1579034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Original strand, 1605584 - 1605781
Alignment:
Q  1 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1605584 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgat 1605683  T
Q  101 aagctatttttatttatttgcccaaacacctttaaaaaggcttataggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggccta 198  Q
    || |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1605684 aaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccatataagctcaaaataagccaatccaaacggggccta 1605781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 181; E-Value: 9e-98
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Original strand, 27679182 - 27679382
Alignment:
Q  1 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgat 100  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27679182 aggagattacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgat 27679281  T
Q  101 aagctatttttatttatttgcccaaacacctttaaaaaggcttataggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggcctata 200  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27679282 aagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgagagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggcctata 27679381  T
Q  201 t 201  Q
    |    
T  27679382 t 27679382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 175; E-Value: 4e-94
Query Start/End: Original strand, 3 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 27421051 - 27420857
Alignment:
Q  3 gaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataa 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27421051 gaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataa 27420952  T
Q  103 gctatttttatttatttgcccaaacacctttaaaaaggcttataggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggcct 197  Q
     |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27420951 actatttttatttatttactcaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccatataagctcaaaataagccaatccaaacggggcct 27420857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 173; E-Value: 6e-93
Query Start/End: Original strand, 1 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 16069548 - 16069356
Alignment:
Q  1 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16069548 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgat 16069449  T
Q  101 aagctatttttatttatttgcccaaacacctttaaaaaggcttataggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggg 193  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  16069448 aagctatttttatttatttactcaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcctacataagctcaaaataagtcaatccaaacggg 16069356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 173; E-Value: 6e-93
Query Start/End: Original strand, 1 - 197
Target Start/End: Original strand, 24105684 - 24105880
Alignment:
Q  1 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  24105684 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgataatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgat 24105783  T
Q  101 aagctatttttatttatttgcccaaacacctttaaaaaggcttataggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggcct 197  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  24105784 aagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggagcct 24105880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 173; E-Value: 6e-93
Query Start/End: Original strand, 1 - 197
Target Start/End: Original strand, 33491209 - 33491405
Alignment:
Q  1 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  33491209 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcaaaagcagcttatgaaactatgat 33491308  T
Q  101 aagctatttttatttatttgcccaaacacctttaaaaaggcttataggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggcct 197  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33491309 aagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgagagtagataaacccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggcct 33491405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 171; E-Value: 9e-92
Query Start/End: Original strand, 1 - 191
Target Start/End: Original strand, 16737460 - 16737650
Alignment:
Q  1 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16737460 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgat 16737559  T
Q  101 aagctatttttatttatttgcccaaacacctttaaaaaggcttataggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacg 191  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  16737560 aagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggtttatgggagtagataagcccatataagctcaaaataagccaattcaaacg 16737650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 170; E-Value: 3e-91
Query Start/End: Original strand, 1 - 190
Target Start/End: Original strand, 3386499 - 3386688
Alignment:
Q  1 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgat 100  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3386499 aggaggttacataaattcataggctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgat 3386598  T
Q  101 aagctatttttatttatttgcccaaacacctttaaaaaggcttataggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaac 190  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3386599 aagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgagagtagataagtccacataagctcaaaataagccaatccaaac 3386688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 165; E-Value: 3e-88
Query Start/End: Original strand, 1 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 4121132 - 4120936
Alignment:
Q  1 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4121132 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgat 4121033  T
Q  101 aagctatttttatttatttgcccaaacacctttaaaaaggcttataggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggcct 197  Q
    ||  |||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  4121032 aaattatttttacttatttacccaaacacctttaaaagggcttatgggagtagataaacccacataagctcaaaataagccattccaaacggggcct 4120936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 165; E-Value: 3e-88
Query Start/End: Original strand, 1 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 19358721 - 19358525
Alignment:
Q  1 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgat 100  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19358721 aggagattacataaattcataagctccttgttaagttggagggtaagctgaaaatttaggcttactaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgat 19358622  T
Q  101 aagctatttttatttatttgcccaaacacctttaaaaaggcttataggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggcct 197  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  19358621 aagctatttttatttatttacccaaacacttttaaaaaggcttataggagtagataagctcacataagctcaaaataaggcaatccaaacggggcct 19358525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 165; E-Value: 3e-88
Query Start/End: Original strand, 5 - 197
Target Start/End: Original strand, 20992163 - 20992355
Alignment:
Q  5 ggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagc 104  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||    
T  20992163 ggttacataaattcataagctccttgttaagctggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataatcagcttatgaaactatgatatgc 20992262  T
Q  105 tatttttatttatttgcccaaacacctttaaaaaggcttataggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggcct 197  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  20992263 tatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttataggagtagataagaccacataagctcaaaataagccaattcaaacggggcct 20992355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 1 - 200
Target Start/End: Original strand, 8374352 - 8374550
Alignment:
Q  1 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgat 100  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8374352 aggaggttacataaat-cataagctccttgttaagccgaagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgat 8374450  T
Q  101 aagctatttttatttatttgcccaaacacctttaaaaaggcttataggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggcctata 200  Q
    || |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  8374451 aaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtagataagcccacataagcttaaaataaggcaatccaaacggggcctata 8374550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 160; E-Value: 3e-85
Query Start/End: Original strand, 3 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 33991333 - 33991138
Alignment:
Q  3 gaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataa 102  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  33991333 gaggttacataaattcataagctccttgttaagccgaagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcaacttatgaaactatgataa 33991234  T
Q  103 gctatttttatttatttgcccaaacacctttaaaaaggcttataggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggccta 198  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| |||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  33991233 gctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtagataagtccacataaactcaaaataagtcaattcaaacggggccta 33991138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 189
Target Start/End: Original strand, 1165614 - 1165802
Alignment:
Q  1 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  1165614 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagctggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcaacttatgaaactatgat 1165713  T
Q  101 aagctatttttatttatttgcccaaacacctttaaaaaggcttataggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaa 189  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  1165714 aagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtagataagctcacataagctcaaaataagtcaatccaaa 1165802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 31883339 - 31883143
Alignment:
Q  1 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  31883339 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctaaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgat 31883240  T
Q  101 aagctatttttatttatttgcccaaacacctttaaaaaggcttataggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggcct 197  Q
    || |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  31883239 aaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttatgagagtagataagtccacataagctcaaaataagtcaatccaaacggagcct 31883143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 156; E-Value: 8e-83
Query Start/End: Original strand, 3 - 197
Target Start/End: Original strand, 35782659 - 35782853
Alignment:
Q  3 gaggttacataaattcataagctccttgttaagc-cggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgata 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35782659 gaggttacataaattcataagctccttg-taagcacggagggtaggctgaaaatttaagcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgata 35782757  T
Q  102 agctatttttatttatttgcccaaacacctttaaaaaggcttataggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggcct 197  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  35782758 agctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgcgagtagataagcccacataagctcaaaataaggcaatccaaacggggcct 35782853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 155; E-Value: 3e-82
Query Start/End: Original strand, 4 - 198
Target Start/End: Original strand, 38598466 - 38598660
Alignment:
Q  4 aggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataag 103  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38598466 aggttacataaattcataagctccttgttaagccgaagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataag 38598565  T
Q  104 ctatttttatttatttgcccaaacacctttaaaaaggcttataggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggccta 198  Q
    ||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  38598566 ctatttttacttatttacccaaacacatttaaaaaggcttatgagagtagataagctcacataagttcaaagtaagccaatccaaaccgggccta 38598660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 153; E-Value: 5e-81
Query Start/End: Original strand, 1 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 3921776 - 3921584
Alignment:
Q  1 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3921776 aggaggttacataaattcataagctcctttttaagctggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgat 3921677  T
Q  101 aagctatttttatttatttgcccaaacacctttaaaaaggcttataggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggg 193  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||  |||||||||||||    
T  3921676 aagctatttttatttatttatccaaacacctttaaaaagacttatgggagtagataagcccatataaactcaaaataaatcaatccaaacggg 3921584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 153; E-Value: 5e-81
Query Start/End: Original strand, 4 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 5203164 - 5202972
Alignment:
Q  4 aggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataag 103  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  5203164 aggtgacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattgaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaa 5203065  T
Q  104 ctatttttatttatttgcccaaacacctttaaaaaggcttataggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggcc 196  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| || |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  5203064 ctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttatgggagtagataaaccaacataaactcaaaataagtcaatccaaacggggcc 5202972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 128; E-Value: 4e-66
Query Start/End: Original strand, 1 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 31410671 - 31410476
Alignment:
Q  1 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgat 100  Q
    ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  31410671 aggaggtcacataaattcataaactccttgttaagccggagggtaagttgaaaatttaggcttattgaaatatggcataagcagcttataaaactatgat 31410572  T
Q  101 aagctatttttatttatttgcccaaacacctttaaaaaggcttataggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggcc 196  Q
    ||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||| ||||| || |||||||| |||| |||| ||||||||||  ||||||||||| ||||    
T  31410571 aagctatttttatttgtttactcaaacacctttaaaaagacttatgggggtagataaacccatataaactcaaaataaatcaatccaaacgcggcc 31410476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 123; E-Value: 4e-63
Query Start/End: Original strand, 3 - 196
Target Start/End: Original strand, 26602957 - 26603140
Alignment:
Q  3 gaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataa 102  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  26602957 gaggttacataaattcataagctccttgttaaaccagagagtaaactgaaaaattatgcttattaaaatatggcataagcagtttatgaaactatgataa 26603056  T
Q  103 gctatttttatttatttgcccaaacacctttaaaaaggcttataggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggcc 196  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||          |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26603057 gctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtag----------ataagctcaaaataagccaatccaaacggggcc 26603140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 119; E-Value: 9e-61
Query Start/End: Original strand, 1 - 151
Target Start/End: Complemental strand, 27025151 - 27025001
Alignment:
Q  1 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgat 100  Q
    ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  27025151 aggaggttacataaatttataaactccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaaaatggcataagcagcttatgaaactatgat 27025052  T
Q  101 aagctatttttatttatttgcccaaacacctttaaaaaggcttataggagt 151  Q
    ||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||| ||||| |||||    
T  27025051 aagctatttttatttatttacccgaacatctttaaaaagtcttatgggagt 27025001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 61 - 197
Target Start/End: Original strand, 20992354 - 20992494
Alignment:
Q  61 cttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttgcccaaacacctttaaaaaggcttataggagtagataagcc 160  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  20992354 cttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgatatgctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcc 20992453  T
Q  161 c----acataagctcaaaataagccaatccaaacggggcct 197  Q
    |    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  20992454 catgtacataagctcaaaataagccaatccaaacagggcct 20992494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 94; E-Value: 8e-46
Query Start/End: Original strand, 55 - 188
Target Start/End: Original strand, 33284642 - 33284775
Alignment:
Q  55 tttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttgcccaaacacctttaaaaaggcttataggagtaga 154  Q
    |||||||||||| |||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  33284642 tttaggcttattgaaatatggtataagcagtttataaaactatgataagctatttttatttatttacttaaacacctttaaaaaggcttatgggagtaga 33284741  T
Q  155 taagcccacataagctcaaaataagccaatccaa 188  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  33284742 taagcccatataagctcaaaataagtcaatccaa 33284775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 44 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 25634732 - 25634575
Alignment:
Q  44 taagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttgcccaaacacctttaaaaaggctt 143  Q
    |||||| ||||||  || |||||||||||||| |||||| |||||||||| | | ||||||||||||   |||||| |||||||   ||| |||  ||||    
T  25634732 taagctcaaaattatggtttattaaaatatggtataagcggcttatgaaattgttataagctatttta--ttatttacccaaacgtatttgaaagagctt 25634635  T
Q  144 ataggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggcctatatat 203  Q
    ||   ||||||||| | | |||||||| |||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  25634634 atgttagtagataaactctcataagcttaaaataagccaatctaaacggggcctaaatat 25634575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 1 - 46
Target Start/End: Original strand, 35420437 - 35420482
Alignment:
Q  1 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaa 46  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  35420437 aggaggttacataaattcataagctctttgttaagccggagggtaa 35420482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 60 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 31638281 - 31638157
Alignment:
Q  60 gcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttgcccaaacacctttaaaaaggcttataggagtagataagc 159  Q
    ||||||||||||||| |||||| ||||||| ||| | ||||||| |||||||||  ||||  |||||||| |||| ||||||||||   ||||| |||||    
T  31638281 gcttattaaaatatgacataagaagcttataaaattgtgataagttatttttatcgatttatccaaacacttttacaaaggcttatgttagtaggtaagc 31638182  T
Q  160 ccacataagctcaaaataagccaat 184  Q
     ||||||| |  |||||||| ||||    
T  31638181 tcacataaacataaaataagtcaat 31638157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 77 - 130
Target Start/End: Original strand, 41818552 - 41818605
Alignment:
Q  77 ataagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttgcccaaacacc 130  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||| || |||||||    
T  41818552 ataagcagcttataaaaatatgataagctatttttattaatttacctaaacacc 41818605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 62 - 145
Target Start/End: Original strand, 19516044 - 19516127
Alignment:
Q  62 ttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttgcccaaacacctttaaaaaggcttat 145  Q
    ||||||||||||  ||||||||| |||||||| |   ||||||||||||||||  |||| |||||| || |||||||| |||||    
T  19516044 ttattaaaatattacataagcagtttatgaaattgatataagctatttttattactttgtccaaacgccgttaaaaagacttat 19516127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 184; Significance: 2e-99; HSPs: 38)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 184; E-Value: 2e-99
Query Start/End: Original strand, 1 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 14422897 - 14422702
Alignment:
Q  1 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14422897 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgat 14422798  T
Q  101 aagctatttttatttatttgcccaaacacctttaaaaaggcttataggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggcc 196  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  14422797 aagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataaaccaatccaaacggggcc 14422702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 39206780 - 39206583
Alignment:
Q  1 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39206780 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttagacttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgat 39206681  T
Q  101 aagctatttttatttatttgcccaaacacctttaaaaaggcttataggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggccta 198  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39206680 aagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggccta 39206583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 181; E-Value: 9e-98
Query Start/End: Original strand, 1 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 18594731 - 18594535
Alignment:
Q  1 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  18594731 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgat 18594632  T
Q  101 aagctatttttatttatttgcccaaacacctttaaaaaggcttataggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggcct 197  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18594631 aagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggcct 18594535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 176; E-Value: 9e-95
Query Start/End: Original strand, 1 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 29938255 - 29938060
Alignment:
Q  1 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29938255 aggaggttacataaattcataagctccttgttaaaccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgat 29938156  T
Q  101 aagctatttttatttatttgcccaaacacctttaaaaaggcttataggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggcc 196  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29938155 aagctatttttacttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtatataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggcc 29938060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 173; E-Value: 6e-93
Query Start/End: Original strand, 1 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 13110598 - 13110406
Alignment:
Q  1 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgat 100  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  13110598 aggaggttacataaactcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttattaaactatgat 13110499  T
Q  101 aagctatttttatttatttgcccaaacacctttaaaaaggcttataggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggg 193  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13110498 aagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcatatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggg 13110406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 173; E-Value: 6e-93
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Original strand, 22260643 - 22260843
Alignment:
Q  1 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  22260643 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactaggat 22260742  T
Q  101 aagctatttttatttatttgcccaaacacctttaaaaaggcttataggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggcctata 200  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22260743 aagctatttttattgatttacccaaacgcctttaaaaagacttatgggagtagataagctcacataagctcaaaataagccaatccaaacggggcctata 22260842  T
Q  201 t 201  Q
    |    
T  22260843 t 22260843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 3 - 198
Target Start/End: Original strand, 10836770 - 10836965
Alignment:
Q  3 gaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataa 102  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  10836770 gaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagtttatgaaactatgataa 10836869  T
Q  103 gctatttttatttatttgcccaaacacctttaaaaaggcttataggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggccta 198  Q
     |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  10836870 actatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacgaggccta 10836965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 171; E-Value: 9e-92
Query Start/End: Original strand, 1 - 191
Target Start/End: Original strand, 2042537 - 2042727
Alignment:
Q  1 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  2042537 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgat 2042636  T
Q  101 aagctatttttatttatttgcccaaacacctttaaaaaggcttataggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacg 191  Q
    ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2042637 aagctgtttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgagagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacg 2042727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 170; E-Value: 3e-91
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Original strand, 24113179 - 24113376
Alignment:
Q  1 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  24113179 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgat 24113278  T
Q  101 aagctatttttatttatttgcccaaacacctttaaaaaggcttataggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggccta 198  Q
    || || ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  24113279 aatctgtttttatttatttacccaaacacctttaaaaagggttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacggggccta 24113376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 170; E-Value: 3e-91
Query Start/End: Original strand, 3 - 196
Target Start/End: Original strand, 35118046 - 35118239
Alignment:
Q  3 gaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataa 102  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  35118046 gaggttacataaattcataagcttcttgttaagccgaagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataa 35118145  T
Q  103 gctatttttatttatttgcccaaacacctttaaaaaggcttataggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggcc 196  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35118146 gctatttttatttatttacccaaacacctttcaaaaggcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggcc 35118239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 1 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 144588 - 144397
Alignment:
Q  1 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  144588 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgat 144489  T
Q  101 aagctatttttatttatttgcccaaacacctttaaaaaggcttataggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacgg 192  Q
    || ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  144488 aaactatttttatttacttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagtccacatatgctcaaaataagtcaatccaaacgg 144397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 39218971 - 39218774
Alignment:
Q  1 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgat 100  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  39218971 aggaggtcacataaattcatcagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattgaaatatggcataagcagcttatgaagctatgat 39218872  T
Q  101 aagctatttttatttatttgcccaaacacctttaaaaaggcttataggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggccta 198  Q
    || | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39218871 aaaccatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgagagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggccta 39218774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 161; E-Value: 8e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 197
Target Start/End: Original strand, 6144286 - 6144482
Alignment:
Q  1 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6144286 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagctggagggtaagctgaaaatttatgcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgat 6144385  T
Q  101 aagctatttttatttatttgcccaaacacctttaaaaaggcttataggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggcct 197  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  6144386 aagctatttttatttatttacccaaacactgttaaaaaggcatatgggagtagataagcccatataagctcaaaataagtcaatccaaacggggcct 6144482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 1 - 195
Target Start/End: Original strand, 34842378 - 34842572
Alignment:
Q  1 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgat 100  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34842378 aggaggtcacataaattaataagctccttgttaagacggtgggtaagctggaaatttaggcttattgaaatatggcataagcagcttatgaaactatgat 34842477  T
Q  101 aagctatttttatttatttgcccaaacacctttaaaaaggcttataggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggc 195  Q
    || |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34842478 aaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggc 34842572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 158; E-Value: 5e-84
Query Start/End: Original strand, 1 - 190
Target Start/End: Original strand, 34679470 - 34679659
Alignment:
Q  1 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  34679470 aggaggttacataaattcataagctcattgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggtataagcagcttatgaaactatgat 34679569  T
Q  101 aagctatttttatttatttgcccaaacacctttaaaaaggcttataggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaac 190  Q
    || ||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  34679570 aaactatttttatttatttattcaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccatataagctcaaaataagccaatccaaac 34679659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 4036041 - 4035845
Alignment:
Q  1 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4036041 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgat 4035942  T
Q  101 aagctatttttatttatttgcccaaacacctttaaaaaggcttataggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggcct 197  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||  ||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  4035941 aagctatttttatttgtttacccaaacacctttaataaaacttatgggagtagataagcccatataagctaaaaataaaccaatccaaacggggcct 4035845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 33278594 - 33278394
Alignment:
Q  1 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33278594 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgat 33278495  T
Q  101 aagctatttttatttatttgcccaaacacctttaaaaaggcttataggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggcctata 200  Q
    || ||||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||   |||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  33278494 aaactatttttatttatttatccaaacacctttaaaaagacttatgaaagtagataagtccatataaactcaaaataagccaatccaaacggggcccata 33278395  T
Q  201 t 201  Q
    |    
T  33278394 t 33278394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 193
Target Start/End: Original strand, 34998909 - 34999101
Alignment:
Q  1 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgat 100  Q
    ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  34998909 aggagattaaataaattcataagctccttgttaagccggagggcaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactaagat 34999008  T
Q  101 aagctatttttatttatttgcccaaacacctttaaaaaggcttataggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggg 193  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  34999009 aagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttataggagtagataaacccgtataagctcaaaataagccaatccatacggg 34999101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 7774958 - 7774761
Alignment:
Q  1 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  7774958 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaagcttaataaaatatgacataagcagcttatgaaactatgat 7774859  T
Q  101 aagctatttttatttatttgcccaaacacctttaaaaaggcttataggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggccta 198  Q
    || |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  7774858 aatctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttatgggagtagataaacccgcataagctcaaaataagccaatctaaacgaggccta 7774761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 3 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 41575705 - 41575516
Alignment:
Q  3 gaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataa 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  41575705 gaggttacataaattcataagctccttgttaagtcggagggtaagctgaaaatttaggcttattgaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataa 41575606  T
Q  103 gctatttttatttatttgcccaaacacctttaaaaaggcttataggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacgg 192  Q
    || ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41575605 gcaatttttatttatttatccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagtctacataagctcaaaataagccaatccaaacgg 41575516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 196
Target Start/End: Original strand, 38167168 - 38167363
Alignment:
Q  1 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38167168 aggaggttacataaattcataagcttcttgttaagccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgat 38167267  T
Q  101 aagctatttttatttatttgcccaaacacctttaaaaaggcttataggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggcc 196  Q
    || ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| |||||    
T  38167268 aaactagttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttatgggaatagataagcccacataaactcaaaataggccaatccaaacagggcc 38167363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 1 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 7791605 - 7791412
Alignment:
Q  1 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  7791605 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaagtttaagcttattgaaatatgacataagcagcttatgaaactatgat 7791506  T
Q  101 aagctatttttatttatttgcccaaacacctttaaaaaggcttataggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacgggg 194  Q
    || |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  7791505 aatctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttatgggagtagataaactcacataaactcaaaataagccaatccaaacgggg 7791412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 1 - 189
Target Start/End: Original strand, 44804957 - 44805145
Alignment:
Q  1 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  44804957 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagctggagggtaagttgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgat 44805056  T
Q  101 aagctatttttatttatttgcccaaacacctttaaaaaggcttataggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaa 189  Q
    |||||||||||||||||||  | ||||||||||||||| |||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  44805057 aagctatttttatttatttatctaaacacctttaaaaatgcttatgggagtagataaacctacataagctcaaaataagccaattcaaa 44805145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 3 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 7812187 - 7811992
Alignment:
Q  3 gaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataa 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  7812187 gaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagagtaagctgaaaatttaagcttattgaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataa 7812088  T
Q  103 gctatttttatttatttgcccaaacacctttaaaaaggcttataggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggccta 198  Q
     |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || || | ||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  7812087 tctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagactaatggaagtagataaactcacataaactcaaaataagccaatcaaaacggggccta 7811992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 3 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 36491349 - 36491155
Alignment:
Q  3 gaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataa 102  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||    
T  36491349 gaggttacataaattcataagcttcttgttaagtcggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataaacaagttatgaaactatgataa 36491250  T
Q  103 gctatttttatttatttgcccaaacacctttaaaaaggcttataggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggcct 197  Q
    ||| ||||||||||||| |||||||||||| |||||| |||||  || ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||    
T  36491249 gctgtttttatttatttacccaaacaccttcaaaaagacttatgcgattagataatcccacataagcttaaaataagccaatccaaatggggcct 36491155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 39 - 197
Target Start/End: Original strand, 40117903 - 40118061
Alignment:
Q  39 gagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttgcccaaacacctttaaaaa 138  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  40117903 gagggtaagctgaaaatttaagcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacttttaaaaa 40118002  T
Q  139 ggcttataggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggcct 197  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40118003 ggcttatgggagtagataaacccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggcct 40118061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 28639474 - 28639275
Alignment:
Q  1 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgat 100  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28639474 aggaggttacataa--tcataagctctatgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgat 28639377  T
Q  101 aagctatttttatttatttgcccaaacacctttaaaaaggct----tataggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggcc 196  Q
    || |||||||||||||||| || ||||||||||||||| |||    ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||    
T  28639376 aaactatttttatttatttaccaaaacacctttaaaaaagcttgtatataggagtagataagctcacataagcttaaaataagccaattcaaacgggacc 28639277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 5320758 - 5320563
Alignment:
Q  1 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgat 100  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||| ||| ||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  5320758 aggaggtcacataaattcataagctccttgttaagccagatggtaagttgaaaatttaggcttattgaaacatgacataagcaacttatgaaactatgat 5320659  T
Q  101 aagctatttttatttatttgcccaaacacctttaaaaaggcttataggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggcc 196  Q
    ||  ||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5320658 aaattatttttatttatttaccaaaacaactttaaaaaggcttatgggagtagataaactcacataagctcaaaataagccaatccaaacggggcc 5320563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 4 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 8021902 - 8021721
Alignment:
Q  4 aggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataag 103  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||        |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||     
T  8021902 aggttatataaactcataagctccttgttaagccgga--------tgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataaa 8021811  T
Q  104 ctatttttatttatttgcccaaacacctttaaaaaggcttataggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggg 193  Q
    |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8021810 ctatttttatttatttacccaaacatctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccatataagctcaaaataagccaatccaaacggg 8021721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 128; E-Value: 4e-66
Query Start/End: Original strand, 39 - 198
Target Start/End: Original strand, 33287076 - 33287235
Alignment:
Q  39 gagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttgcccaaacacctttaaaaa 138  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  33287076 gagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttatccaaacacctttaaaaa 33287175  T
Q  139 ggcttataggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggccta 198  Q
     || ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  33287176 agcatatgggagtagataaacccacataagctcaaaataagtcaatccaaacggggccta 33287235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 126; E-Value: 6e-65
Query Start/End: Original strand, 3 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 42571783 - 42571598
Alignment:
Q  3 gaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataa 102  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||  ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  42571783 gaggttgcataaattcataagttccttgttaagccgaagggtaagctaaaaatttaggc--attgaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataa 42571686  T
Q  103 gctatttttatttatttgcccaaacacctttaaaaaggcttataggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacg 191  Q
    |||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42571685 gctatttttatt-atttacccaaacacttttaaaaaggcttatggaagtagataaacccacataagctcaaaataagccaatccaaacg 42571598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 56 - 197
Target Start/End: Original strand, 26783801 - 26783942
Alignment:
Q  56 ttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttgcccaaacacctttaaaaaggcttataggagtagat 155  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  26783801 ttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatatttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgagagtagat 26783900  T
Q  156 aagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggcct 197  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  26783901 aagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacgaggcct 26783942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 1 - 192
Target Start/End: Original strand, 66192 - 66384
Alignment:
Q  1 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccgga-gggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 99  Q
    ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  66192 aggaggtcacgtaaattcataagctccttgttaagccgaaagggtaagctgaaaatttaaacttattgaaatatggcataagcagcttatgaaactatta 66291  T
Q  100 taagctatttttatttatttgcccaaacacctttaaaaaggcttataggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacgg 192  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| | ||| ||| |||||||||| ||| || ||||||||||||||||| ||||||    
T  66292 taagttatttttatttatttacccaaacacttttaaaaagacatatgggaatagataagcctacagaaactcaaaataagccaatctaaacgg 66384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 116
Target Start/End: Complemental strand, 9807454 - 9807339
Alignment:
Q  1 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgat 100  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  9807454 aggaggtttcataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagttgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaagctatgat 9807355  T
Q  101 aagctatttttattta 116  Q
    ||||||||||||||||    
T  9807354 aagctatttttattta 9807339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 44 - 197
Target Start/End: Original strand, 2322068 - 2322221
Alignment:
Q  44 taagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttgcccaaacacctttaaaaaggctt 143  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||    
T  2322068 taagcttaaaatttaggcttatcaaaatatgatataagcagcttatgaaattgtgataagctgtttttattgatttacccaaacacctttaaaaaagctt 2322167  T
Q  144 ataggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggcct 197  Q
    ||   |||||||||  ||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  2322168 atgttagtagataaatccatataagctccgaataagccaatccaaacggggcct 2322221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 67 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 5005294 - 5005171
Alignment:
Q  67 aaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttgcccaaacacctttaaaaaggcttataggagtagataagcccacata 166  Q
    ||||||| |||||||||| |||||| | ||  |||||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||    
T  5005294 aaaatatagcataagcagtttatgagagtagcataagctatttttattgatttacccaaacgcctttaaaaaagcttatggaagtagataagcccacata 5005195  T
Q  167 agctcaaaataagccaatccaaac 190  Q
    |||| || ||||||||||||||||    
T  5005194 agcttaagataagccaatccaaac 5005171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 44 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 39220407 - 39220258
Alignment:
Q  44 taagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttgcccaaacacctttaaaaaggctt 143  Q
    |||||| |||||||  |||||||||||||| | || |||||||||||||| |   |||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||| | |    
T  39220407 taagctcaaaatttgagcttattaaaatatagtatgagcagcttatgaaattggaataagctatttttattgatttactcaaacacctttaaaaagacat 39220308  T
Q  144 ataggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggg 193  Q
    || |  |||||||||  || |||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  39220307 atggatgtagataagttcatataagctcaaaataagtcaattcaaacggg 39220258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 108 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 9806960 - 9806875
Alignment:
Q  108 ttttatttatttgcccaaacacctttaaaaaggcttataggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggg 193  Q
    |||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||| || |||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  9806960 ttttatttatttacccaaacacatttaaaaaggcatatgggagtagataagcacatataaactcaaaataagtcaatccaaacggg 9806875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 182; Significance: 2e-98; HSPs: 41)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Original strand, 37698142 - 37698339
Alignment:
Q  1 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  37698142 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgat 37698241  T
Q  101 aagctatttttatttatttgcccaaacacctttaaaaaggcttataggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggccta 198  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37698242 aagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggccta 37698339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 3 - 197
Target Start/End: Original strand, 42307906 - 42308100
Alignment:
Q  3 gaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataa 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42307906 gaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataa 42308005  T
Q  103 gctatttttatttatttgcccaaacacctttaaaaaggcttataggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggcct 197  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42308006 gctatttttatttatttacccaaacgcctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggcct 42308100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 4 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 25999574 - 25999382
Alignment:
Q  4 aggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataag 103  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25999574 aggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataag 25999475  T
Q  104 ctatttttatttatttgcccaaacacctttaaaaaggcttataggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggcc 196  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25999474 ctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggcc 25999382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 176; E-Value: 9e-95
Query Start/End: Original strand, 3 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 38856280 - 38856089
Alignment:
Q  3 gaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataa 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38856280 gaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataa 38856181  T
Q  103 gctatttttatttatttgcccaaacacctttaaaaaggcttataggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacgggg 194  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38856180 gctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccatataagctcaaaataagccaatccaaacgggg 38856089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 175; E-Value: 4e-94
Query Start/End: Original strand, 3 - 197
Target Start/End: Original strand, 15520143 - 15520337
Alignment:
Q  3 gaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataa 102  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  15520143 gaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagtttatgaaacgatgataa 15520242  T
Q  103 gctatttttatttatttgcccaaacacctttaaaaaggcttataggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggcct 197  Q
    | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15520243 gttatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggcct 15520337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 175; E-Value: 4e-94
Query Start/End: Original strand, 1 - 203
Target Start/End: Original strand, 22174989 - 22175191
Alignment:
Q  1 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22174989 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgat 22175088  T
Q  101 aagctatttttatttatttgcccaaacacctttaaaaaggcttataggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggcctata 200  Q
    ||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  22175089 aagctgtttttatttatttacccaaacaccttcaaaaaggcttatgcgagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggcctcta 22175188  T
Q  201 tat 203  Q
    |||    
T  22175189 tat 22175191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 173; E-Value: 6e-93
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 29445677 - 29445477
Alignment:
Q  1 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  29445677 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatagggcataaacagcttatgaaactatgat 29445578  T
Q  101 aagctatttttatttatttgcccaaacacctttaaaaaggcttataggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggcctata 200  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29445577 aagctatttttatttatttacccaaacacatttaaaaaggcttatgggagtagataaactcacataagctcaaaataagccaatccaaacggggcctata 29445478  T
Q  201 t 201  Q
    |    
T  29445477 t 29445477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 170; E-Value: 3e-91
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 50529118 - 50528921
Alignment:
Q  1 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgat 100  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50529118 aggaggttacataaattcataaactccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgat 50529019  T
Q  101 aagctatttttatttatttgcccaaacacctttaaaaaggcttataggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggccta 198  Q
    ||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50529018 aagctgtttttatttatttacccaaacaccttcaaaaaggcttatgcgagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggccta 50528921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 1 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 8042796 - 8042600
Alignment:
Q  1 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8042796 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgat 8042697  T
Q  101 aagctatttttatttatttgcccaaacacctttaaaaaggcttataggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggcct 197  Q
    || ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  8042696 aaactatttttacttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtagataagctcacataagctcaaaataagcccatccaaacggggcct 8042600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 165; E-Value: 3e-88
Query Start/End: Original strand, 1 - 197
Target Start/End: Original strand, 20842347 - 20842543
Alignment:
Q  1 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  20842347 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatgatataagcagcttatgaaactatgat 20842446  T
Q  101 aagctatttttatttatttgcccaaacacctttaaaaaggcttataggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggcct 197  Q
    ||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20842447 aagttgtttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgcgagtagataagctcacataagctcaaaataagccaatccaaacggggcct 20842543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 165; E-Value: 3e-88
Query Start/End: Original strand, 1 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 32244309 - 32244117
Alignment:
Q  1 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32244309 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaagcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgat 32244210  T
Q  101 aagctatttttatttatttgcccaaacacctttaaaaaggcttataggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggg 193  Q
    || |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32244209 aaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtagataaatccacataagctcaaaataagccaatccaaacggg 32244117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 165; E-Value: 3e-88
Query Start/End: Original strand, 1 - 197
Target Start/End: Original strand, 46452161 - 46452357
Alignment:
Q  1 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  46452161 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtgagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcaacttatgaaactatgat 46452260  T
Q  101 aagctatttttatttatttgcccaaacacctttaaaaaggcttataggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggcct 197  Q
    || |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  46452261 aaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccatataagctcaacttaagccaatccaaacggggcct 46452357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 1 - 196
Target Start/End: Original strand, 25494284 - 25494479
Alignment:
Q  1 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgat 100  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25494284 aggaggttgcataaattcataagctccttgttaagcaggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgat 25494383  T
Q  101 aagctatttttatttatttgcccaaacacctttaaaaaggcttataggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggcc 196  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  25494384 aagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttatgggaatagataaacccacataagctcaaaataagtcaatccaaacggggcc 25494479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 15520825 - 15520628
Alignment:
Q  1 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgat 100  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15520825 aggaggttacaaaaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgat 15520726  T
Q  101 aagctatttttatttatttgcccaaacacctttaaaaaggcttataggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggccta 198  Q
    ||||| ||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15520725 aagctgtttttgtttatttacccaaacaccttcaaaaaggcttatgcgagtagataaacccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggccta 15520628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 21581231 - 21581042
Alignment:
Q  1 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgat 100  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21581231 aggatgttacataaattcataagctccttgttaagccagatggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgat 21581132  T
Q  101 aagctatttttatttatttgcccaaacacctttaaaaaggcttataggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaac 190  Q
    ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  21581131 aagttatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaac 21581042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Original strand, 54870173 - 54870370
Alignment:
Q  1 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  54870173 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagctggagggtaagctaaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaacgatgat 54870272  T
Q  101 aagctatttttatttatttgcccaaacacctttaaaaaggcttataggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggccta 198  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54870273 aagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtagataaacccacataaactcaaaataagccaatccaaacggggccta 54870370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 1 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 20699338 - 20699144
Alignment:
Q  1 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgat 100  Q
    ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20699338 aggaggttacaaaaattcctaagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgat 20699239  T
Q  101 aagctatttttatttatttgcccaaacacctttaaaaaggcttataggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggc 195  Q
    ||||| ||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20699238 aagctgtttttgtttatttacccaaacaccttcaaaaaggcttatgcgagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggc 20699144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 158; E-Value: 5e-84
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 35226636 - 35226439
Alignment:
Q  1 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35226636 aggaggttacataaattcataagctccttgttaggctggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgat 35226537  T
Q  101 aagctatttttatttatttgcccaaacacctttaaaaaggcttataggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggccta 198  Q
    |||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  35226536 aagctgattttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaaatagataagcccacataagctcaaaataggccaatccaaacagggccta 35226439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 158; E-Value: 5e-84
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 38934134 - 38933938
Alignment:
Q  1 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  38934134 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaaactggaaatttagacttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgat 38934035  T
Q  101 aagctatttttatttatttgcccaaacacctttaaaaaggcttataggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggccta 198  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38934034 aagctgtttttatttatttacccaaacacctttgaaaaggcttatgggagtagataag-ccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggccta 38933938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 158; E-Value: 5e-84
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Original strand, 54534327 - 54534522
Alignment:
Q  1 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgat 100  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  54534327 aggaggtcacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattgaa-tatggcataagcagcttat-aaaccatgat 54534424  T
Q  101 aagctatttttatttatttgcccaaacacctttaaaaaggcttataggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggccta 198  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54534425 aagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggccta 54534522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 155; E-Value: 3e-82
Query Start/End: Original strand, 3 - 197
Target Start/End: Original strand, 12117659 - 12117853
Alignment:
Q  3 gaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataa 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||    
T  12117659 gaggttacataaattcataagctccttgttaagccagatggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcaacttatgaaactatgataa 12117758  T
Q  103 gctatttttatttatttgcccaaacacctttaaaaaggcttataggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggcct 197  Q
     ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  12117759 actatttttatttatttatccaaacacctttaaaaaggcttatgggaatagataagcccacataagctcaaaataagccaattcaaacggggcct 12117853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 3 - 190
Target Start/End: Original strand, 44609334 - 44609521
Alignment:
Q  3 gaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataa 102  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44609334 gaggttacataaattcataaactccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataa 44609433  T
Q  103 gctatttttatttatttgcccaaacacctttaaaaaggcttataggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaac 190  Q
    ||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||   |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44609434 gctgtttttatttatttacccaaacaccttcaaaaaggcttatgcaagtagataagtccacataagctcaaaataagccaatccaaac 44609521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Original strand, 24835698 - 24835895
Alignment:
Q  1 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgat 100  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  24835698 aggagtttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattgaaatatggcataagcagcttatgaaactataat 24835797  T
Q  101 aagctatttttatttatttgcccaaacacctttaaaaaggcttataggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggccta 198  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| | | |||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  24835798 aagctatttttatttatttatccaaacacctttaaaaaggcttatgggagttgataagtctatataagctcaaaataaatcaatccaaacggggccta 24835895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 1 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 32359448 - 32359256
Alignment:
Q  1 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32359448 aggaggttacataaattcataagctctttgttaagctggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgat 32359349  T
Q  101 aagctatttttatttatttgcccaaacacctttaaaaaggcttataggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggg 193  Q
    || |||||||||||||||| | |||||||||||| ||| |||||| | | |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32359348 aaactatttttatttatttactcaaacacctttataaaagcttatggaaatagataaatccacataagctcaaaataagccaatccaaacggg 32359256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 143; E-Value: 4e-75
Query Start/End: Original strand, 6 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 26122998 - 26122808
Alignment:
Q  6 gttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagct 105  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26122998 gttacgtaaattcataagctacttgttaagccggaggataagctgaaaatttaggcttattgaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataagct 26122899  T
Q  106 atttttatttatttgcccaaacacctttaaaaaggcttataggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggcc 196  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  26122898 atttttatttatttatccaaacacctttaaaaaggctcatgggaatagataaacccacataagctcaaaataagccaatccaaactgggcc 26122808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 34700530 - 34700333
Alignment:
Q  1 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgat 100  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  34700530 aggaggttatataaattcataagcttcttcttaagccggagggtaaactaaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgat 34700431  T
Q  101 aagctatttttatttatttgcccaaacacctttaaaaaggcttataggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggccta 198  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| | |||| |||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  34700430 aagctatttttatttatttactcaaacacctttaaaaaggcttatggaagtaaataaacccacataagctcaaaataaaccaatctaaacggggccta 34700333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 186
Target Start/End: Original strand, 42104970 - 42105155
Alignment:
Q  1 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  42104970 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagcatgagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgat 42105069  T
Q  101 aagctatttttatttatttgcccaaacacctttaaaaaggcttataggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatcc 186  Q
    || |||||||||||| |||  ||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  42105070 aaactatttttatttttttatccaaacacctttaaaaatgtttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatcc 42105155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 2895378 - 2895179
Alignment:
Q  1 aggaggttacataaattcata----agctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaacta 96  Q
    ||||||||| |||||||||||    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2895378 aggaggttatataaattcatatataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaacta 2895279  T
Q  97 tgataagctatttttatttatttgcccaaacacctttaaaaaggcttataggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggcc 196  Q
    ||||||  | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||    
T  2895278 tgataatttttttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgcgagtagataaacccacataagctcaaaataagtcaattcaaatggggcc 2895179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 133; E-Value: 4e-69
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 53028406 - 53028217
Alignment:
Q  1 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||    
T  53028406 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagtttatgaaaatatgat 53028307  T
Q  101 aagctatttttatttatttgcccaaacacctttaaaaaggcttataggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggccta 198  Q
    |||||||||||||||||||        |||| ||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  53028306 aagctatttttatttattt--------acctctaaaaagacttatgggaatagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacagggccta 53028217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 128; E-Value: 4e-66
Query Start/End: Original strand, 1 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 44688949 - 44688760
Alignment:
Q  1 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgat 100  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  44688949 aggaggttgcataaattcataagctcattgttaagccggagggtaagctgaaaatttaagcttattaaaatatg-cataagcagcttatgaaactatgat 44688851  T
Q  101 aagctatttttatttatttgcccaaacacctttaaaaaggcttataggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggcc 196  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||     |||||||||| |||||||||||    
T  44688850 aagctatttttatttatttatccaaacatctttaaaaaggcttatggaagtagataaacccacataagc-----ataagccaattcaaacggggcc 44688760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 38 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 35643369 - 35643212
Alignment:
Q  38 ggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttgcccaaacacctttaaaa 137  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  35643369 ggagggtaagctcaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaagcacctttaaaa 35643270  T
Q  138 aggcttataggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggc 195  Q
    |||||||| | ||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  35643269 aggcttatggaagtagataagttcacataagctcaaaataagtcaatccaaacggggc 35643212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 119; E-Value: 9e-61
Query Start/End: Original strand, 1 - 190
Target Start/End: Original strand, 48925002 - 48925189
Alignment:
Q  1 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  48925002 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaggataagctaaaaatttagacttattaaaatatgacataaacagcttatgaaactatgat 48925101  T
Q  101 aagctatttttatttatttgcccaaacacctttaaaaaggcttataggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaac 190  Q
    || |||||||||||||||| |||||  || |||||||| |||||| | ||||||||| |||| |||| ||| ||||||||||||||||||    
T  48925102 aaactatttttatttatttacccaa--acttttaaaaaagcttatggaagtagataaacccatataaactctaaataagccaatccaaac 48925189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 1 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 16354535 - 16354391
Alignment:
Q  1 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  16354535 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagcaggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaacatggcattagcagcttatgaaactatgat 16354436  T
Q  101 aagctatttttatttatttgcccaaacacctttaaaaaggcttat 145  Q
    ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  16354435 aagttatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttat 16354391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 111; E-Value: 6e-56
Query Start/End: Original strand, 56 - 190
Target Start/End: Original strand, 50529827 - 50529961
Alignment:
Q  56 ttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttgcccaaacacctttaaaaaggcttataggagtagat 155  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  50529827 ttaggctcattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagat 50529926  T
Q  156 aagcccacataagctcaaaataagccaatccaaac 190  Q
    ||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  50529927 aagtccacataaactcaaaataagtcaatccaaac 50529961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 62 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 49128177 - 49128042
Alignment:
Q  62 ttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttgcccaaacacctttaaaaaggcttataggagtagataagccc 161  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||| |||| |||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  49128177 ttattaaaatatagcataagcagcttatgaaattacgataagttatttttattgatttacccaaacatctttaaaaagacttataggagtagataagccc 49128078  T
Q  162 acataagctcaaaataagccaatccaaacggggcct 197  Q
    ||||||| | |||||||| |||||||||||||||||    
T  49128077 acataagtttaaaataagtcaatccaaacggggcct 49128042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 5 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 12916091 - 12915930
Alignment:
Q  5 ggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagc 104  Q
    |||||||||||||||||| ||| || |||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||| ||||||||| |||||||| |||||||| |    
T  12916091 ggttacataaattcataaactctttcttaaaccggagggtaagctgaaaacttaagcttatttaaatatgacataagcagtttatgaaattatgataaac 12915992  T
Q  105 tatttttatttatttgcccaaacacctttaaaaaggcttataggagtagataagcccacataa 167  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||||||||||  |||| |||||| ||||||||||||||    
T  12915991 tatttttatttatttatccaaacacctttaaaaagatttat-ggagtaaataagcccacataa 12915930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 1 - 76
Target Start/End: Complemental strand, 24366218 - 24366143
Alignment:
Q  1 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggc 76  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  24366218 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttatgcttattaaaatatggc 24366143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 69
Target Start/End: Complemental strand, 13696982 - 13696914
Alignment:
Q  1 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaa 69  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13696982 aggaggttacacaaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaa 13696914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 148 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 24366134 - 24366085
Alignment:
Q  148 gagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggcct 197  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  24366134 gagtagataaacccacataagctcaaaataagtcaatccaaaaggggcct 24366085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 3 - 36
Target Start/End: Original strand, 50528883 - 50528916
Alignment:
Q  3 gaggttacataaattcataagctccttgttaagc 36  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50528883 gaggttacataaattcataagctccttgttaagc 50528916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 163 - 198
Target Start/End: Original strand, 10449111 - 10449147
Alignment:
Q  163 cataagctcaaaataag-ccaatccaaacggggccta 198  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  10449111 cataagctcaaaataagcccaatccaaacggggccta 10449147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 181; Significance: 9e-98; HSPs: 44)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 181; E-Value: 9e-98
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Original strand, 24792335 - 24792535
Alignment:
Q  1 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24792335 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgat 24792434  T
Q  101 aagctatttttatttatttgcccaaacacctttaaaaaggcttataggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggcctata 200  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  24792435 aagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccagataagctcaacttaagccaatccaaacggggcctata 24792534  T
Q  201 t 201  Q
    |    
T  24792535 t 24792535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 178; E-Value: 6e-96
Query Start/End: Original strand, 5 - 202
Target Start/End: Original strand, 30181031 - 30181228
Alignment:
Q  5 ggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagc 104  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30181031 ggttacataaattcataagttccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagc 30181130  T
Q  105 tatttttatttatttgcccaaacacctttaaaaaggcttataggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggcctatata 202  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  30181131 tatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggcctttata 30181228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 173; E-Value: 6e-93
Query Start/End: Original strand, 1 - 197
Target Start/End: Original strand, 12101181 - 12101377
Alignment:
Q  1 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12101181 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccatagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgat 12101280  T
Q  101 aagctatttttatttatttgcccaaacacctttaaaaaggcttataggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggcct 197  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  12101281 aagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataaacccacataagctcaaaataagccaatccaaatggggcct 12101377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 173; E-Value: 6e-93
Query Start/End: Original strand, 1 - 197
Target Start/End: Original strand, 42964999 - 42965195
Alignment:
Q  1 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42964999 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagctggagggtaagctaaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgat 42965098  T
Q  101 aagctatttttatttatttgcccaaacacctttaaaaaggcttataggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggcct 197  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  42965099 aagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaaaggggcct 42965195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 173; E-Value: 6e-93
Query Start/End: Original strand, 1 - 197
Target Start/End: Original strand, 43067976 - 43068172
Alignment:
Q  1 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  43067976 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagaagcttatgaaactatgat 43068075  T
Q  101 aagctatttttatttatttgcccaaacacctttaaaaaggcttataggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggcct 197  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  43068076 aagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccatataagctcaaaataagtcaatccaaacggggcct 43068172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 3 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 7164375 - 7164184
Alignment:
Q  3 gaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataa 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7164375 gaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataa 7164276  T
Q  103 gctatttttatttatttgcccaaacacctttaaaaaggcttataggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacgggg 194  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7164275 gctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaaacttatgggagtagataagcccatataagctcaaaataagccaatccaaacgggg 7164184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 1 - 196
Target Start/End: Original strand, 33359093 - 33359288
Alignment:
Q  1 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33359093 aggaggttacataaattcataagctccttgttaaaccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgat 33359192  T
Q  101 aagctatttttatttatttgcccaaacacctttaaaaaggcttataggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggcc 196  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33359193 aagctatttttatttatttacccaaacaccttcaaaaaggcttatggaagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggcc 33359288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 171; E-Value: 9e-92
Query Start/End: Original strand, 1 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 20346681 - 20346487
Alignment:
Q  1 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgat 100  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20346681 aggaggtttcataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttagacttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgat 20346582  T
Q  101 aagctatttttatttatttgcccaaacacctttaaaaaggcttataggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggc 195  Q
    || |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20346581 aatctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgagagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggc 20346487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 170; E-Value: 3e-91
Query Start/End: Original strand, 3 - 196
Target Start/End: Original strand, 22649699 - 22649892
Alignment:
Q  3 gaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataa 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  22649699 gaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagttgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaattatgataa 22649798  T
Q  103 gctatttttatttatttgcccaaacacctttaaaaaggcttataggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggcc 196  Q
     |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  22649799 actatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaattcaaacggggcc 22649892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 1 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 3511516 - 3511324
Alignment:
Q  1 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3511516 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctaaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgat 3511417  T
Q  101 aagctatttttatttatttgcccaaacacctttaaaaaggcttataggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggg 193  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  3511416 aagctatttttatctatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtagataagcccacataagctcaaaataagacaatccaaacggg 3511324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 166; E-Value: 8e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 42204348 - 42204151
Alignment:
Q  1 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgat 100  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42204348 aggaggttgcataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgat 42204249  T
Q  101 aagctatttttatttatttgcccaaacaccttta-aaaaggcttataggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggcct 197  Q
    |||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42204248 aagctatttttacttatttacccaaacacctttaaaaaagacttatgagagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggcct 42204151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 161; E-Value: 8e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 933478 - 933282
Alignment:
Q  1 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  933478 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgat 933379  T
Q  101 aagctatttttatttatttgcccaaacacctttaaaaaggcttataggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggcct 197  Q
    || |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  933378 aaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtagataagtccacatgagctcaaaataagccaattcaaacagggcct 933282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 161; E-Value: 8e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 5281053 - 5280861
Alignment:
Q  1 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5281053 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattgaaatatggcataagcagcttatgaaactatgat 5280954  T
Q  101 aagctatttttatttatttgcccaaacacctttaaaaaggcttataggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggg 193  Q
    || |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||  || ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5280953 aaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttatgtgaatagataagctcacataagctcaaaataagccaatccaaacggg 5280861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 161; E-Value: 8e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 15656105 - 15655909
Alignment:
Q  1 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15656105 aggaggttacataaattcataagcttcttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgat 15656006  T
Q  101 aagctatttttatttatttgcccaaacacctttaaaaaggcttataggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggcct 197  Q
    ||||| ||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15656005 aagctgtttttgtttatttacccaaacaccttcaaaaaggcttatgcgagcagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggcct 15655909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 160; E-Value: 3e-85
Query Start/End: Original strand, 1 - 192
Target Start/End: Original strand, 4477324 - 4477515
Alignment:
Q  1 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgat 100  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  4477324 aggaggtcacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagttgaaaatttaggcttattgaaatatggcataagcagcttatgaaaccatgat 4477423  T
Q  101 aagctatttttatttatttgcccaaacacctttaaaaaggcttataggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacgg 192  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4477424 aagctatttttatttatttacccaaacacctttgaaaagacttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacgg 4477515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 160; E-Value: 3e-85
Query Start/End: Original strand, 1 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 25748680 - 25748485
Alignment:
Q  1 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25748680 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgat 25748581  T
Q  101 aagctatttttatttatttgcccaaacacctttaaaaaggcttataggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggcc 196  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |  | ||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  25748580 aagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttatgggagtagataaactaatataagctcaacttaagccaatccaaacggggcc 25748485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 1 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 1803219 - 1803029
Alignment:
Q  1 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  1803219 aggaggttacataaattcataagcttcttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttaataaaatatcgtataagcagcttatgaaactatgat 1803120  T
Q  101 aagctatttttatttatttgcccaaacacctttaaaaaggcttataggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacg 191  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  1803119 aagctatttttatttatttacccaaatacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacg 1803029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 158; E-Value: 5e-84
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Original strand, 33846532 - 33846724
Alignment:
Q  1 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||      ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  33846532 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccc-----taagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagtttatgaaactatgat 33846626  T
Q  101 aagctatttttatttatttgcccaaacacctttaaaaaggcttataggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggccta 198  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33846627 aagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggccta 33846724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 6394944 - 6394748
Alignment:
Q  1 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgat 100  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  6394944 aggaggtcacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaaactgaaaatttaggcttattgaaatatggcataagcagcttatgaaaccatgat 6394845  T
Q  101 aagctatttttatttatttgcccaaacacctttaaaaaggcttataggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggcct 197  Q
    || ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  6394844 aaactatttttatttatttatccaaacacctttaaaaaggcttatgggaatagataagcccacataagctcaaaataagccaatctaaacggggcct 6394748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 155; E-Value: 3e-82
Query Start/End: Original strand, 4 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 32041732 - 32041538
Alignment:
Q  4 aggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataag 103  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  32041732 aggttacataaatttataagctccttgttaagctggagggtaagctgaaaatttaggcttatgaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataag 32041633  T
Q  104 ctatttttatttatttgcccaaacacctttaaaaaggcttataggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggccta 198  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  32041632 ctatttttatttatttacccaaacacatttaaaaagacttatggaagtagataagcccacataagcacaaaataagccaatccaaacggggccta 32041538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 153; E-Value: 5e-81
Query Start/End: Original strand, 5 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 4347462 - 4347270
Alignment:
Q  5 ggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagc 104  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  4347462 ggttacataaattcataagctccttgttaagctcgagggtaagctgaaaatttaggcttgttaaaatatggcataagcagcttatgaaactatggtaagc 4347363  T
Q  105 tatttttatttatttgcccaaacacctttaaaaaggcttataggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggcct 197  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  4347362 tatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaagtttatgggagtagataagcccacataagcttaaaataagtcaatccaaacggggcct 4347270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 153; E-Value: 5e-81
Query Start/End: Original strand, 1 - 197
Target Start/End: Original strand, 36890833 - 36891028
Alignment:
Q  1 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  36890833 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccgaagggtaagctgaaaacttaggcttattgaaatatggcataagcaacttatgaaactatgat 36890932  T
Q  101 aagctatttttatttatttgcccaaacacctttaaaaaggcttataggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggcct 197  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  36890933 aagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcctacataagctc-aaataagtcaatccaaacggggcct 36891028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 153; E-Value: 5e-81
Query Start/End: Original strand, 1 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 43156906 - 43156718
Alignment:
Q  1 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || ||||| |||||||||||||||||||    
T  43156906 aggaggttacataaattcataagttctttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattgaaatttgccataaacagcttatgaaactatgat 43156807  T
Q  101 aagctatttttatttatttgcccaaacacctttaaaaaggcttataggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaa 189  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43156806 aagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggaatagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaa 43156718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 196
Target Start/End: Original strand, 12097593 - 12097788
Alignment:
Q  1 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  12097593 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagtagcttatgaaactatgat 12097692  T
Q  101 aagctatttttatttatttgcccaaacacctttaaaaaggcttataggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggcc 196  Q
    || |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| || ||||||||||  |||||||||||||| ||||||    
T  12097693 aatctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgagagtagataagctcatataagctcaacttaagccaatccaaatggggcc 12097788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 151; E-Value: 8e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 42673654 - 42673467
Alignment:
Q  1 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42673654 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgat 42673555  T
Q  101 aagctatttttatttatttgcccaaacacctttaaaaaggcttataggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacgg 192  Q
    ||||| ||||||||||    |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  42673554 aagctgtttttattta----cccaaacacctttaaaaaggcttatgcgagtagataagcccacataagctccaaataagtcaatccaaacgg 42673467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 7 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 8630853 - 8630665
Alignment:
Q  7 ttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagcta 106  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  8630853 ttacataaattcataagctctttgttaagccggagggtaagttgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaacta 8630754  T
Q  107 tttttatttatttgcccaaacacctttaaaaaggcttataggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggc 195  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||    
T  8630753 tttttatttatttacccgaacacctttaaaaaggcttatgggagtagatcaacccacataacctcaaaataaacaaatccaaacggggc 8630665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 1 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 9452783 - 9452591
Alignment:
Q  1 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  9452783 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagtgtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcatagacagcttatgaaactatgat 9452684  T
Q  101 aagctatttttatttatttgcccaaacacctttaaaaaggcttataggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggg 193  Q
    || ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||  || ||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  9452683 aaactatttttacttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgagaatagataagttcacataagctcaaaataagtcaatccaaacggg 9452591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 143; E-Value: 4e-75
Query Start/End: Original strand, 1 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 38866737 - 38866547
Alignment:
Q  1 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  38866737 aggaggttacataaattcataagctccttcttaagccggagggtaagctgaaaatttatgcttattaaaatatggcataaacagcttatgaaactatgat 38866638  T
Q  101 aagctatttttatttatttgcccaaacacctttaaaaaggcttataggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacg 191  Q
    || |||||||||||||||| ||||||||||||||||||   |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  38866637 aaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaaaattatgggagtagataaacccacataagctcaaaataagtcgatccaaacg 38866547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 138; E-Value: 4e-72
Query Start/End: Original strand, 1 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 17753793 - 17753600
Alignment:
Q  1 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgat 100  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  17753793 aggagattacataaattcataagctccttgttaagttgaagggtaagctaaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgtt 17753694  T
Q  101 aagctatttttatttatttgcccaaacacctttaaaaaggcttataggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacgggg 194  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  17753693 aagctatttttatttatttacccaaacaccttctaaaaggcttataggagtagataagcttgtataagctcaaaataagctaatccaaacgggg 17753600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 138; E-Value: 4e-72
Query Start/End: Original strand, 1 - 193
Target Start/End: Original strand, 46891342 - 46891535
Alignment:
Q  1 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgat 100  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||     
T  46891342 aggaggttacataaactcataagctccttgttaagctgaagggtaagctgaaaatttaggctaattaaaatatgacataagcagcttataaaactatgac 46891441  T
Q  101 aagctatttttatttatttgcccaaacaccttt-aaaaaggcttataggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggg 193  Q
    || |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46891442 aaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaaggtttataggagtagataagcctatataagctcaaaataagccaatccaaacggg 46891535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 136; E-Value: 7e-71
Query Start/End: Original strand, 3 - 194
Target Start/End: Original strand, 46134309 - 46134500
Alignment:
Q  3 gaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataa 102  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||    
T  46134309 gaggttacataaattaataagctccttgttaagctggagggtaagctgaaaatttaggcttattgaaatatggcgtaaacagcttatgaaactataataa 46134408  T
Q  103 gctatttttatttatttgcccaaacacctttaaaaaggcttataggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacgggg 194  Q
     |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||  |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  46134409 actatttttatttatttacccaaacatctttaaaaagagttataggagtagataaactcacataagctcaaaataagtcaatccaaacgggg 46134500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 1 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 48865826 - 48865665
Alignment:
Q  1 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48865826 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagcctgatgttaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgat 48865727  T
Q  101 aagctatttttatttatttgcccaaacaccttta---aaaaggcttataggagtagataagc 159  Q
    || |||||||||||||||| ||||||||||||||   ||||||||||| | |||||||||||    
T  48865726 aaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaaaaggcttatggaagtagataagc 48865665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 197
Target Start/End: Original strand, 16894510 - 16894696
Alignment:
Q  1 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgat 100  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| |||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16894510 aggatgttacataaattcataagctccctgttaagttgaagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgat 16894609  T
Q  101 aagctatttttatttatttgcccaaacacctttaaaaaggcttataggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggcct 197  Q
    || |||||||||||| ||| |||||| ||||||||||| |||||| |||||||          ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16894610 aaactatttttatttgtttacccaaatacctttaaaaaagcttatgggagtag----------ataagctcaaaataagccaatccaaacggggcct 16894696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 49 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 19828415 - 19828267
Alignment:
Q  49 tgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttgcccaaacacctttaaaaaggcttatagg 148  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||    
T  19828415 tgaaaattttggcttattaaaatatggcataagcaatttatgaaactatgataagctatttttatttatttagccaaacacctttaaaaaggcttatggg 19828316  T
Q  149 agtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggcct 197  Q
    |||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  19828315 agtagataagccaacataaactcaaaataagccaattcaaacggggcct 19828267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 197
Target Start/End: Original strand, 43021583 - 43021775
Alignment:
Q  1 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |  |    |||||| |||||||||||||||||||||| ||    
T  43021583 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcggagagtaagctgaaaatttagaccga----aatatgccataagcagcttatgaaactataat 43021678  T
Q  101 aagctatttttatttatttgcccaaacacctttaaaaaggcttataggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggcct 197  Q
    ||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||| | |||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||| |||||||    
T  43021679 aagttatttttatttatttacccaaacatctttaaaaagacttattgaagtagataagtccacataaacttaaaataagccaatccaaatggggcct 43021775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 44 - 197
Target Start/End: Original strand, 37005857 - 37006010
Alignment:
Q  44 taagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttgcccaaacacctttaaaaaggctt 143  Q
    |||||| |||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| | |||| ||||||| ||||||||||  |||    
T  37005857 taagctaaaaaattagccttattaaaatatagcataagcagcttatgaaattacgataagctatttttactgatttacccaaacgcctttaaaaaaactt 37005956  T
Q  144 ataggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggcct 197  Q
    |||| ||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  37005957 atagaagtagataaactcacataagcttaaaataagccaatccaaacggagcct 37006010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 44 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 43405170 - 43405017
Alignment:
Q  44 taagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttgcccaaacacctttaaaaaggctt 143  Q
    |||||| |||| || ||||||||||||||| | | || || ||||||||| || ||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||| |||    
T  43405170 taagctaaaaaattgggcttattaaaatatagtagaaacaacttatgaaattacgataagctatttttattgatttacccaaacgcctttaaaaagactt 43405071  T
Q  144 ataggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggcct 197  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||    
T  43405070 ataggagtagataagccaacataagcttaaaataagtcaattcaaacggggcct 43405017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 79; E-Value: 7e-37
Query Start/End: Original strand, 99 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 37705075 - 37704977
Alignment:
Q  99 ataagctatttttatttatttgcccaaacacctttaaaaaggcttataggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggcct 197  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  37705075 ataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgagagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaacccaaacggggcct 37704977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 44 - 197
Target Start/End: Original strand, 15655458 - 15655611
Alignment:
Q  44 taagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttgcccaaacacctttaaaaaggctt 143  Q
    |||||| |||||||  |||||||||||| ||| |||||||| |||| ||| | || ||||||||||||||| ||||  ||||| |  ||||||||| |||    
T  15655458 taagctcaaaatttgagcttattaaaatttggtataagcagtttataaaattgtggtaagctatttttattgatttatccaaatagttttaaaaagactt 15655557  T
Q  144 ataggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggcct 197  Q
    ||   |||||| |||| |||||||| | | |||||||||||||||||| |||||    
T  15655558 atgttagtagacaagctcacataagtttagaataagccaatccaaacgcggcct 15655611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 51 - 196
Target Start/End: Original strand, 36849590 - 36849735
Alignment:
Q  51 aaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttgcccaaacacctttaaaaaggcttataggag 150  Q
    |||||||  ||||||||||||||| ||||| ||| |||||||| | |||||||||  ||||||| ||||  |||||||||||||||||  | |||   ||    
T  36849590 aaaatttgagcttattaaaatatgacataaacagtttatgaaattgtgataagctgattttattgatttatccaaacacctttaaaaaaacatatgttag 36849689  T
Q  151 tagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggcc 196  Q
    |||| || ||||||||||||   |||||| ||||||||||||||||    
T  36849690 tagacaaacccacataagcttcgaataagtcaatccaaacggggcc 36849735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 44 - 196
Target Start/End: Original strand, 30075277 - 30075426
Alignment:
Q  44 taagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttgcccaaacacctttaaaaaggctt 143  Q
    |||||| ||||||  ||||||||||||||||| |||||| | |||||||| ||| |||||||||||||||| |||| |||||||   | | ||| |||||    
T  30075277 taagctcaaaattatggcttattaaaatatggtataagcggtttatgaaa-tat-ataagctatttttatt-atttacccaaacgtatctgaaagggctt 30075373  T
Q  144 ataggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggcc 196  Q
    ||   ||||||||| | |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  30075374 atgttagtagataaactcacataagcttaaaataagtcaatccaaacggggcc 30075426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 105 - 189
Target Start/End: Original strand, 27691433 - 27691517
Alignment:
Q  105 tatttttatttatttgcccaaacacctttaaaaaggcttataggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaa 189  Q
    ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||  |||| |||||||||||||||| ||||  ||||||||| ||||| ||||    
T  27691433 tatttttatttatttacccaaacatctttaaaaagatttatgggagtagataagcccatataaattcaaaataaaccaattcaaa 27691517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 60 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 20163953 - 20163815
Alignment:
Q  60 gcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttgcccaaacacctttaaaaaggcttataggagtagataagc 159  Q
    |||| ||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||  ||||||| | || | ||||| ||||    ||| ||||||    
T  20163953 gcttgttaaaatatgctataagcagcttatgaaactgtgataagctattttaattaattcacccaaacgcattcacaaaggattatgttggtaaataagc 20163854  T
Q  160 ccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggccta 198  Q
     || |||||| ||||||||| |||||||||  |||||||    
T  20163853 tcatataagcccaaaataagtcaatccaaaaagggccta 20163815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 163 - 198
Target Start/End: Original strand, 22032910 - 22032946
Alignment:
Q  163 cataagctcaaaataagc-caatccaaacggggccta 198  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  22032910 cataagctcaaaataagctcaatccaaacggggccta 22032946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 181; Significance: 9e-98; HSPs: 23)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 181; E-Value: 9e-98
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Original strand, 6086612 - 6086812
Alignment:
Q  1 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  6086612 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgat 6086711  T
Q  101 aagctatttttatttatttgcccaaacacctttaaaaaggcttataggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggcctata 200  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6086712 aagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaatgcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggcctata 6086811  T
Q  201 t 201  Q
    |    
T  6086812 t 6086812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 180; E-Value: 4e-97
Query Start/End: Original strand, 1 - 196
Target Start/End: Original strand, 26704352 - 26704547
Alignment:
Q  1 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26704352 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgat 26704451  T
Q  101 aagctatttttatttatttgcccaaacacctttaaaaaggcttataggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggcc 196  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  26704452 aagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttataggagtagataagcccacgtaagctcaaaataaaccaatccaaacggggcc 26704547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 180; E-Value: 4e-97
Query Start/End: Original strand, 1 - 196
Target Start/End: Original strand, 26946889 - 26947084
Alignment:
Q  1 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  26946889 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgat 26946988  T
Q  101 aagctatttttatttatttgcccaaacacctttaaaaaggcttataggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggcc 196  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26946989 aagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccatataagctcaaaataagccaatccaaacggggcc 26947084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 178; E-Value: 6e-96
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 2837739 - 2837542
Alignment:
Q  1 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  2837739 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcatgagcagctcatgaaactatgat 2837640  T
Q  101 aagctatttttatttatttgcccaaacacctttaaaaaggcttataggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggccta 198  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2837639 aagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggccta 2837542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 173; E-Value: 6e-93
Query Start/End: Original strand, 1 - 197
Target Start/End: Original strand, 3347536 - 3347732
Alignment:
Q  1 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  3347536 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgat 3347635  T
Q  101 aagctatttttatttatttgcccaaacacctttaaaaaggcttataggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggcct 197  Q
    ||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3347636 aagctgtttttatttatttatccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggcct 3347732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 1 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 30692045 - 30691850
Alignment:
Q  1 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30692045 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcagatggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgat 30691946  T
Q  101 aagctatttttatttatttgcccaaacacctttaaaaaggcttataggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggcc 196  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  30691945 aagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacgaggcc 30691850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 4 - 194
Target Start/End: Original strand, 3955782 - 3955972
Alignment:
Q  4 aggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataag 103  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  3955782 aggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatagcataagcagtttatgaaactatgataag 3955881  T
Q  104 ctatttttatttatttgcccaaacacctttaaaaaggcttataggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacgggg 194  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3955882 ctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataaacccacataagctcaaaataagccaatccaaacgggg 3955972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 21893649 - 21893451
Alignment:
Q  1 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21893649 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaaattaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgat 21893550  T
Q  101 aagctatttttatttatttgcccaaacacctttaaaaaggcttataggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggcctat 199  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||    
T  21893549 aagctatttttatatatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataaacccacataagctcaaaataaatcgatccaaacggggcctat 21893451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 166; E-Value: 8e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Original strand, 17261086 - 17261283
Alignment:
Q  1 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||    
T  17261086 aggaggttacataaattcataagttccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatagcataagcagcttatgaaaatattat 17261185  T
Q  101 aagctatttttatttatttgcccaaacacctttaaaaaggcttataggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggccta 198  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  17261186 aagctatttttatttatttacccaaacacctttagaaaggcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacgggaccta 17261283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 1 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 9459757 - 9459562
Alignment:
Q  1 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgat 100  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9459757 aggaggatacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgat 9459658  T
Q  101 aagctatttttatttatttgcccaaacacctttaaaaaggcttataggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggcc 196  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| | | ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  9459657 aagctatttttatttatttacccaaatacctttaaaaaggcttatggaaatagataagctcacataaactcaaaataagccaatccaaacggggcc 9459562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 163; E-Value: 5e-87
Query Start/End: Original strand, 1 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 20726981 - 20726790
Alignment:
Q  1 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20726981 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctaaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgat 20726882  T
Q  101 aagctatttttatttatttgcccaaacacctttaaaaaggcttataggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggcc 196  Q
    ||| ||||||||||||    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20726881 aagttatttttattta----cccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccatataagctcaaaataagccaatccaaacggggcc 20726790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 161; E-Value: 8e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 18613732 - 18613536
Alignment:
Q  1 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  18613732 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagctggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatggaactatgat 18613633  T
Q  101 aagctatttttatttatttgcccaaacacctttaaaaaggcttataggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggcct 197  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  18613632 aagctgtttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagtccgcataagctcaaaataagtcaatccaaacggggcct 18613536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 160; E-Value: 3e-85
Query Start/End: Original strand, 3 - 198
Target Start/End: Original strand, 16307023 - 16307218
Alignment:
Q  3 gaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataa 102  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16307023 gaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttatgcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataa 16307122  T
Q  103 gctatttttatttatttgcccaaacacctttaaaaaggcttataggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggccta 198  Q
    ||| |||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  16307123 gctgtttttatttatttatccaaacaccttcaaaaaggcttatgcgagtagataagccaacataagctcaaaataagtcaatccaaacggggccta 16307218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 156; E-Value: 8e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 192
Target Start/End: Original strand, 34887305 - 34887496
Alignment:
Q  1 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgat 100  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  34887305 aggaggtcacataaattcattagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattgaaatatggcataaacagcttatgaaactatgat 34887404  T
Q  101 aagctatttttatttatttgcccaaacacctttaaaaaggcttataggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacgg 192  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  34887405 aagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggaggagataaacccacataagctcaaaataagtcaatccaaacgg 34887496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 11167434 - 11167237
Alignment:
Q  1 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  11167434 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggtgggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgat 11167335  T
Q  101 aagctatttttatttatttgcccaaacacctttaaaaaggcttataggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggccta 198  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||   | || |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11167334 aagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaaacttatgaaaataaataagcacacataagctcaaaataagccaatccaaacggggccta 11167237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 203
Target Start/End: Original strand, 28199521 - 28199724
Alignment:
Q  1 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  28199521 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattgaaa-atggcataagcagcatatgaaactatgat 28199619  T
Q  101 aagctatttttatttatttgcccaaacacctttaaaaaggcttataggagta---gataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggcct 197  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||   |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||    
T  28199620 aagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttat-ggagtagatgataagtccacataagctcaaaataagtcaatccaaacgggacct 28199718  T
Q  198 atatat 203  Q
    ||||||    
T  28199719 atatat 28199724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 1 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 1153787 - 1153603
Alignment:
Q  1 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgat 100  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1153787 aggaggttacataaatacataagcaccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgat 1153688  T
Q  101 aagctatttttatttatttgcccaaacacctttaaaaaggcttataggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatc 185  Q
    || ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  1153687 aatctatttttacttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtagataagccaacataagcttaaaataagccaatc 1153603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 146; E-Value: 7e-77
Query Start/End: Original strand, 9 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 35198469 - 35198281
Alignment:
Q  9 acataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatt 108  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35198469 acataaattcataagttccttgttaagccggagagtaaactgaaaatttaggcttattgaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatt 35198370  T
Q  109 tttatttatttgcccaaacacctttaaaaaggcttataggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggccta 198  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  35198369 tttatttatttacccaaacacctttaaaaa-gcttatggaagtagataagcccacataagttcaaaataagccaattcaaacggggccta 35198281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 32 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 52999 - 52833
Alignment:
Q  32 taagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttgcccaaacacct 131  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  52999 taagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacct 52900  T
Q  132 ttaaaaaggcttataggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggccta 198  Q
    ||||||| ||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52899 ttaaaaatgcttatgttagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggccta 52833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 1 - 191
Target Start/End: Original strand, 30698942 - 30699132
Alignment:
Q  1 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  30698942 aggaggttacataaattcataagctcattgttaagtcggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagctaataaaactatgat 30699041  T
Q  101 aagctatttttatttatttgcccaaacacctttaaaaaggcttataggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacg 191  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| | || |||||| ||||||| |||| |||||| |||||||||||    
T  30699042 aagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttatagaaataaataagctcacataaactcataataagtcaatccaaacg 30699132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 1 - 125
Target Start/End: Complemental strand, 33464523 - 33464399
Alignment:
Q  1 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33464523 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgat 33464424  T
Q  101 aagctatttttatttatttgcccaa 125  Q
    || ||||||||| |||||| |||||    
T  33464423 aaactatttttacttatttacccaa 33464399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 94; E-Value: 8e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 102
Target Start/End: Complemental strand, 53102 - 53001
Alignment:
Q  1 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  53102 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgat 53003  T
Q  101 aa 102  Q
    ||    
T  53002 aa 53001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 121 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 33463775 - 33463694
Alignment:
Q  121 cccaaacacctttaaaaaggcttataggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggcctatata 202  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  33463775 cccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagctcacataagctcaaaataagccaatccaaacgggacctttata 33463694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0167 (Bit Score: 180; Significance: 4e-97; HSPs: 1)
Name: scaffold0167
Description:

Target: scaffold0167; HSP #1
Raw Score: 180; E-Value: 4e-97
Query Start/End: Original strand, 1 - 196
Target Start/End: Original strand, 22964 - 23159
Alignment:
Q  1 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22964 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgat 23063  T
Q  101 aagctatttttatttatttgcccaaacacctttaaaaaggcttataggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggcc 196  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23064 aagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgagagtagataagcccatataagctcaaaataagccaatccaaacggggcc 23159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012 (Bit Score: 178; Significance: 6e-96; HSPs: 1)
Name: scaffold0012
Description:

Target: scaffold0012; HSP #1
Raw Score: 178; E-Value: 6e-96
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 36897 - 36700
Alignment:
Q  1 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  36897 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgat 36798  T
Q  101 aagctatttttatttatttgcccaaacacctttaaaaaggcttataggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggccta 198  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36797 aagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaatgcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggccta 36700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 178; Significance: 6e-96; HSPs: 63)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 178; E-Value: 6e-96
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Original strand, 50055102 - 50055299
Alignment:
Q  1 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  50055102 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaaccatgat 50055201  T
Q  101 aagctatttttatttatttgcccaaacacctttaaaaaggcttataggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggccta 198  Q
    |||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50055202 aagctattttcatttatttatccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggccta 50055299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 4 - 196
Target Start/End: Original strand, 23776463 - 23776655
Alignment:
Q  4 aggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataag 103  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23776463 aggttacataaattcataagatccttgttaagctggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataag 23776562  T
Q  104 ctatttttatttatttgcccaaacacctttaaaaaggcttataggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggcc 196  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23776563 ctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggcc 23776655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 1 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 54189737 - 54189541
Alignment:
Q  1 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54189737 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgat 54189638  T
Q  101 aagctatttttatttatttgcccaaacacctttaaaaaggcttataggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggcct 197  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54189637 aagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgttagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggcct 54189541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 176; E-Value: 9e-95
Query Start/End: Original strand, 1 - 196
Target Start/End: Original strand, 19913631 - 19913826
Alignment:
Q  1 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  19913631 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgat 19913730  T
Q  101 aagctatttttatttatttgcccaaacacctttaaaaaggcttataggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggcc 196  Q
    ||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19913731 aagctgttttaatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggcc 19913826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 175; E-Value: 4e-94
Query Start/End: Original strand, 1 - 203
Target Start/End: Original strand, 53717465 - 53717667
Alignment:
Q  1 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  53717465 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatagggcataagcagcttatgaaactatgat 53717564  T
Q  101 aagctatttttatttatttgcccaaacacctttaaaaaggcttataggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggcctata 200  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  53717565 aagctatttttatttatttacccaaacacatttaaaaaggcttatgggagtagataaactcacataagctcaaaataagccaatccaaacggggcctaaa 53717664  T
Q  201 tat 203  Q
    |||    
T  53717665 tat 53717667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 173; E-Value: 6e-93
Query Start/End: Original strand, 1 - 197
Target Start/End: Original strand, 15241029 - 15241225
Alignment:
Q  1 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  15241029 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgat 15241128  T
Q  101 aagctatttttatttatttgcccaaacacctttaaaaaggcttataggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggcct 197  Q
    || || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  15241129 aaactgtttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttataggagtagataaacccacataagctcaaaataagccaatccaaacgaggcct 15241225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 3 - 194
Target Start/End: Original strand, 1756767 - 1756958
Alignment:
Q  3 gaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataa 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1756767 gaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataa 1756866  T
Q  103 gctatttttatttatttgcccaaacacctttaaaaaggcttataggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacgggg 194  Q
     |||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1756867 tctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccatataagctcaaaataagccaatccaaacgggg 1756958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 171; E-Value: 9e-92
Query Start/End: Original strand, 2 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 38055348 - 38055154
Alignment:
Q  2 ggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgata 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38055348 ggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagagtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgata 38055249  T
Q  102 agctatttttatttatttgcccaaacacctttaaaaaggcttataggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggcc 196  Q
    |  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  38055248 aaatatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacggggcc 38055154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 170; E-Value: 3e-91
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Original strand, 27488649 - 27488846
Alignment:
Q  1 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27488649 aggaggttacataaattcataagctctttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaagcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgat 27488748  T
Q  101 aagctatttttatttatttgcccaaacacctttaaaaaggcttataggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggccta 198  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  27488749 aagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccagataagctcaacttaagccaatccaaacggggccta 27488846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 170; E-Value: 3e-91
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Original strand, 28032713 - 28032910
Alignment:
Q  1 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  28032713 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttagacttattaaaatatggcataagcagcttatgatactatgat 28032812  T
Q  101 aagctatttttatttatttgcccaaacacctttaaaaaggcttataggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggccta 198  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||||    
T  28032813 aagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatctaaacagggccta 28032910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 1 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 20877239 - 20877047
Alignment:
Q  1 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgat 100  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  20877239 aggaggttacgtaaatccataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgat 20877140  T
Q  101 aagctatttttatttatttgcccaaacacctttaaaaaggcttataggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggg 193  Q
    || |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20877139 aaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggg 20877047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 1 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 50353993 - 50353797
Alignment:
Q  1 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  50353993 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcggagggtaagctgaaaaattaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatcat 50353894  T
Q  101 aagctatttttatttatttgcccaaacacctttaaaaaggcttataggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggcct 197  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50353893 aagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagctcacagaagctcaaaataagccaatccaaacggggcct 50353797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 166; E-Value: 8e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Original strand, 2481409 - 2481606
Alignment:
Q  1 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2481409 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaattttggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgat 2481508  T
Q  101 aagctatttttatttatttgcccaaacacctttaaaaaggcttataggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggccta 198  Q
    ||||| ||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2481509 aagctgtttttgtttatttacccaaacaccttcaaaaaggcttatgcgagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggccta 2481606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 166; E-Value: 8e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Original strand, 6611361 - 6611558
Alignment:
Q  1 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  6611361 aggaggttacataaattcataagctctttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttatcaaaatatgacataaacagcttatgaaactatgat 6611460  T
Q  101 aagctatttttatttatttgcccaaacacctttaaaaaggcttataggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggccta 198  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  6611461 aagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagtccacataagctcaaaataaaccaatccaaacggggccta 6611558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 165; E-Value: 3e-88
Query Start/End: Original strand, 3 - 195
Target Start/End: Original strand, 11639581 - 11639773
Alignment:
Q  3 gaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataa 102  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11639581 gaggttacataaattcataagctccttgttaagctggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataa 11639680  T
Q  103 gctatttttatttatttgcccaaacacctttaaaaaggcttataggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggc 195  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  11639681 gctatttttatttatttacccaaacacatttaaaaaggcttatgagagtagataagcccacataagttcaaaataaaccaatccaaacggggc 11639773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 165; E-Value: 3e-88
Query Start/End: Original strand, 1 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 14987984 - 14987788
Alignment:
Q  1 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  14987984 aggaggttacataaattcataagctcattgttaagcaagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgat 14987885  T
Q  101 aagctatttttatttatttgcccaaacacctttaaaaaggcttataggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggcct 197  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14987884 aagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaatggcttatgggagtatataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggcct 14987788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 165; E-Value: 3e-88
Query Start/End: Original strand, 1 - 197
Target Start/End: Original strand, 44784918 - 44785114
Alignment:
Q  1 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  44784918 aggaggttacataaattcataagctcattgttaagccggagggtaagctgaaagtttaggcttattaaaatatggcataagcaacttatgaaactatgat 44785017  T
Q  101 aagctatttttatttatttgcccaaacacctttaaaaaggcttataggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggcct 197  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44785018 aagctatttttatttgtttacccaaacacttttacaaaggcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggcct 44785114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 165; E-Value: 3e-88
Query Start/End: Original strand, 1 - 197
Target Start/End: Original strand, 45424535 - 45424731
Alignment:
Q  1 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45424535 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgat 45424634  T
Q  101 aagctatttttatttatttgcccaaacacctttaaaaaggcttataggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggcct 197  Q
    || |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  45424635 aaactatttttatttatttacccaaacaccttcaaaaaggcttatgcgagtagataagccaacataagctcaaaataagtcaatccaaacggggcct 45424731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 163; E-Value: 5e-87
Query Start/End: Original strand, 1 - 195
Target Start/End: Original strand, 40428721 - 40428915
Alignment:
Q  1 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  40428721 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagctggagggtaagctgaaaatttaggcttatcaaaatatggtataagcagcttatgaaactatgat 40428820  T
Q  101 aagctatttttatttatttgcccaaacacctttaaaaaggcttataggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggc 195  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  40428821 aagctatttttatttatttacccaaacacttttaaaaaggcttatgggagtagataaacccacataagctcaaaataagccaattcaaacggggc 40428915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 48910038 - 48909841
Alignment:
Q  1 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgat 100  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48910038 aggagattacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggtttgttaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgat 48909939  T
Q  101 aagctatttttatttatttgcccaaacacctttaaaaaggcttataggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggccta 198  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  48909938 aagctatttttatttatttatccaaacacctttaaaaaggtttatgggagtagataaacccacataagctcaaaataagccaatccaaacagggccta 48909841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 54412820 - 54412627
Alignment:
Q  1 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgat 100  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  54412820 aggaggttacataaattcatatgctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttagacttattagaatatgacataagcagcttatgaaactatgat 54412721  T
Q  101 aagctatttttatttatttgcccaaacacctttaaaaaggcttataggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacgggg 194  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54412720 aagctatttttatttatttatccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacgggg 54412627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 161; E-Value: 8e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 193
Target Start/End: Original strand, 8591093 - 8591285
Alignment:
Q  1 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8591093 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaacatatggcataagcagcttatgaaactatgat 8591192  T
Q  101 aagctatttttatttatttgcccaaacacctttaaaaaggcttataggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggg 193  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||  ||||||||    
T  8591193 aagctatttttatttatttacccaaacatctttaaaaaggcttatagaagtagataaacccacataaactcaaaataagccaagtcaaacggg 8591285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 161; E-Value: 8e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 197
Target Start/End: Original strand, 8932179 - 8932375
Alignment:
Q  1 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |    
T  8932179 aggaggttacataaattcataagttccttgttaagctgaagggtaagctgaaaatttaggtttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactacgtt 8932278  T
Q  101 aagctatttttatttatttgcccaaacacctttaaaaaggcttataggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggcct 197  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8932279 aagctatttttatttatttactcaaacacctttaaaaaggcttataggagtagataagcccgcataagctcaaaataagccaatccaaacggggcct 8932375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 161; E-Value: 8e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 52139395 - 52139203
Alignment:
Q  1 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52139395 aggaggttacataaattcataagcttcttgttaagccggatggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgat 52139296  T
Q  101 aagctatttttatttatttgcccaaacacctttaaaaaggcttataggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggg 193  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  52139295 aagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttatagaaatagataaacccacataagttcaaaataagccaatccaaacggg 52139203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 160; E-Value: 3e-85
Query Start/End: Original strand, 1 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 16700973 - 16700782
Alignment:
Q  1 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgat 100  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  16700973 aggaggttacataaatttataagctccttgttaagctagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgat 16700874  T
Q  101 aagctatttttatttatttgcccaaacacctttaaaaaggcttataggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacgg 192  Q
    ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16700873 aagctgtttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggtttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacgg 16700782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 3 - 197
Target Start/End: Original strand, 23704212 - 23704406
Alignment:
Q  3 gaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataa 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  23704212 gaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatagcataagcagcttatgaaactatgataa 23704311  T
Q  103 gctatttttatttatttgcccaaacacctttaaaaaggcttataggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggcct 197  Q
     |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  23704312 actatttttatttatttacccaaacacctttcaaaaggcttatgtgagtagataagctcatataagctcaaaataagccaatccaaacagggcct 23704406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 1 - 199
Target Start/End: Original strand, 43289961 - 43290159
Alignment:
Q  1 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43289961 aggaggttacataaattcataagctccttattaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgat 43290060  T
Q  101 aagctatttttatttatttgcccaaacacctttaaaaaggcttataggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggcctat 199  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||  |||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  43290061 aagctatttttatttatttactcaaacacctttaaaaaggcttatgtgagtagataagcacataaaagctcaaaataagccaatccaaacggagcctat 43290159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 158; E-Value: 5e-84
Query Start/End: Original strand, 5 - 198
Target Start/End: Original strand, 35490778 - 35490971
Alignment:
Q  5 ggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagc 104  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  35490778 ggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcaacttatgaaactatgataagc 35490877  T
Q  105 tatttttatttatttgcccaaacacctttaaaaaggcttataggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggccta 198  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||  |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  35490878 tatttttatttatttatccaaacacctttaaaaaagcttatgagagtggataagcccatataagctcaaaataagccaatccaaacgggaccta 35490971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 1617276 - 1617084
Alignment:
Q  1 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  1617276 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacacaagcagcttatgaaactatgat 1617177  T
Q  101 aagctatttttatttatttgcccaaacacctttaaaaaggcttataggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggg 193  Q
    ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||  || ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1617176 aagttatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttatgagaatagataagctcacataagctcaaaataagccaatccaaacggg 1617084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 196
Target Start/End: Original strand, 6688628 - 6688817
Alignment:
Q  1 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      ||||||||||    
T  6688628 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcag------aaactatgat 6688721  T
Q  101 aagctatttttatttatttgcccaaacacctttaaaaaggcttataggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggcc 196  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  6688722 aagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccacataaactcaaaataagtcaatccaaacggggcc 6688817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 193
Target Start/End: Original strand, 30423566 - 30423757
Alignment:
Q  1 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgat 100  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30423566 aggaggttacataaattc-taagctccttgttaagccgaagggtaagctgaaaatttatgcttattgaaatatggcataagcagcttatgaaactatgat 30423664  T
Q  101 aagctatttttatttatttgcccaaacacctttaaaaaggcttataggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggg 193  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  30423665 aagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtagataagcccacataaactcaaaataagccaatccaaacggg 30423757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 37464913 - 37464717
Alignment:
Q  1 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37464913 aggaggttacataaattcataagctctttgttaaaccggagggtaaactgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgat 37464814  T
Q  101 aagctatttttatttatttgcccaaacacctttaaaaaggcttataggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggcct 197  Q
    || || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  37464813 aaactgtttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgcgaatagataagcccacataagctcaaaataagccaattcaaacggggcct 37464717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 156; E-Value: 8e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 47632227 - 47632032
Alignment:
Q  1 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  47632227 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaagcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgag 47632128  T
Q  101 aagctatttttatttatttgcccaaacacc-tttaaaaaggcttataggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggc 195  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||  ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  47632127 aagctatttttatttatttacccaaacaccttttaaaaaggtttatgagagtagataagtccacataaactcaaaataagccaatccaaacggggc 47632032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 155; E-Value: 3e-82
Query Start/End: Original strand, 1 - 195
Target Start/End: Original strand, 37968758 - 37968952
Alignment:
Q  1 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgat 100  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37968758 aggaggtcacataaattcataagctccttgttaagctggagggtaagctgaaaatttaggcttattgaaatatggcataagcagcttatgaaactatgat 37968857  T
Q  101 aagctatttttatttatttgcccaaacacctttaaaaaggcttataggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggc 195  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||    
T  37968858 aagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaaacttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataaaccaatctaaatggggc 37968952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 15669375 - 15669178
Alignment:
Q  1 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  15669375 aggaggttacataaattcataagctctttgttaagccggacggtaagctgaaaatttaggcttattaaagtatgacataagcagcttatgaaactatgat 15669276  T
Q  101 aagctatttttatttatttgcccaaacacctttaaaaaggcttataggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggccta 198  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||  || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15669275 aagctgtttttatttatttacccaaacacctttaaaaagtcttatgtgattagataagctcacataagctcaaaataagccaatccaaacggggccta 15669178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 153; E-Value: 5e-81
Query Start/End: Original strand, 1 - 192
Target Start/End: Original strand, 19164974 - 19165164
Alignment:
Q  1 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19164974 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccg-agggtaagctgaaaatttaggcttattaaa-tatggcataagcagcttatgaaactatgat 19165071  T
Q  101 aagctatttttatttatttgcccaaacaccttt-aaaaaggcttataggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacgg 192  Q
    || |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19165072 aaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaagacttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacgg 19165164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 153; E-Value: 5e-81
Query Start/End: Original strand, 1 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 31969873 - 31969681
Alignment:
Q  1 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  31969873 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatagcataagcagcttatgaaactatgat 31969774  T
Q  101 aagctatttttatttatttgcccaaacacctttaaaaaggcttataggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggg 193  Q
    || |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||  |||| ||||||||    
T  31969773 aaactatttttatttatttacccaaacatctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccatataagctcaaaataaatcaattcaaacggg 31969681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 53875849 - 53875658
Alignment:
Q  1 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgat 100  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  53875849 aggaggttgcataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagttgaaaatttaggcttattgaaatatgacataagcagcttataaaactatgat 53875750  T
Q  101 aagctatttttatttatttgcccaaacacctttaaaaaggcttataggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacgg 192  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  53875749 aagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgagagtatataagcccacataagcttaaaataagccaatccaaacgg 53875658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Original strand, 27536105 - 27536298
Alignment:
Q  1 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  27536105 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagctggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagtttatgaaactatgat 27536204  T
Q  101 aagctatttttatttatttgcccaaacacctttaaaaaggcttataggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggccta 198  Q
    || |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||    |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27536205 aaactatttttatttatttacccaaacacctttaagaaggcttatgggag----taagcccgtataagctcaaaataagccaatccaaacggggccta 27536298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 53353255 - 53353051
Alignment:
Q  1 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttat----taaaatatggcataagcagcttatgaaacta 96  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  53353255 aggaggttacataaatccataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttatatattaaaatatggcataagcagcttatgaaacta 53353156  T
Q  97 tgataagctatttttatttatttgcccaaacacctttaaaaaggcttataggagtagataagcccaca----taagctcaaaataagccaatccaaacgg 192  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||| |    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  53353155 tgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacatatgggagtagataagcccatataattaagctcaaaataagccaatccaaacgg 53353056  T
Q  193 ggcct 197  Q
    |||||    
T  53353055 ggcct 53353051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 1 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 33704033 - 33703850
Alignment:
Q  1 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  33704033 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgat 33703934  T
Q  101 aagctatttttatttatttgcccaaacacctttaaaaaggcttataggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaat 184  Q
    ||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||    
T  33703933 aagttgtttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatccgagtagataaactcacataagctcaaaataagtcaat 33703850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 1 - 204
Target Start/End: Original strand, 44379188 - 44379391
Alignment:
Q  1 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgat 100  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  44379188 aggaggttgcataaattcataagctccttgttaagccgaagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcaacttatgaaactatgat 44379287  T
Q  101 aagctatttttatttatttgcccaaacacctttaaaaaggcttataggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggcctata 200  Q
    || |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||| | |||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||     
T  44379288 aaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggtttatggaagtagataagcctatataaactcaaaataagtcaatccaaacagggcctatg 44379387  T
Q  201 tatc 204  Q
    ||||    
T  44379388 tatc 44379391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 138; E-Value: 4e-72
Query Start/End: Original strand, 1 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 44376037 - 44375844
Alignment:
Q  1 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  44376037 aggaggttacataaattcataagctcttttttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagtttatgaaactatgat 44375938  T
Q  101 aagctatttttatttatttgcccaaacacctttaaaaaggcttataggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacgggg 194  Q
    || |||||||||||||||| ||| ||||||| |||||| |  ||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  44375937 aaactatttttatttatttacccgaacacctataaaaatggctattggaatagataagcccacataagcttaaaataagccaatccaaacgggg 44375844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 1 - 189
Target Start/End: Original strand, 27583633 - 27583821
Alignment:
Q  1 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgat 100  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  27583633 aggagattacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctaaaaatttaggcttatgaaaatatggcataagcagcttatgcaactatgat 27583732  T
Q  101 aagctatttttatttatttgcccaaacacctttaaaaaggcttataggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaa 189  Q
    ||| |||||||||||||||  ||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||    
T  27583733 aagttatttttatttatttatccaaacatctttaaaaaagcttatgggagtagataagcctacataagctcaaaataagtcaatccaaa 27583821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 136; E-Value: 7e-71
Query Start/End: Original strand, 1 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 30171772 - 30171581
Alignment:
Q  1 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgat 100  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  30171772 aggaggttaaataaattcataagctccttgttaaaccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattgaaatatggtataagcagcttatgaaactatgat 30171673  T
Q  101 aagctatttttatttatttgcccaaacacctttaaaaaggcttataggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacgg 192  Q
    |||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||| |||||| | |  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30171672 aagctattttcatttatttatccaaacacctttaaaaaagcttatggaataagataagctcacataagctcaaaataagccaatccaaacgg 30171581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 199
Target Start/End: Original strand, 55344826 - 55345024
Alignment:
Q  1 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| || || ||| || ||||||    
T  55344826 aggaggttacataaattcataagctccttgttaaaccggatggtaagctgaaaattttggcttattaaaatatggtataaacaactcatgcaaatatgat 55344925  T
Q  101 aagctatttttatttatttgcccaaacacctttaaaaaggcttataggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggcctat 199  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  55344926 aagctatttttatttatttacccaaacatctttaaaaaggcttatgagagtagataaacccacataagctcaaaataagtcaattcaaacggggcctat 55345024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 22 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 28360602 - 28360433
Alignment:
Q  22 agctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaata-tggcataagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttg 120  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||     
T  28360602 agctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttataaaaataatggcataagcagcttataaaactatgataaactatttttatttattta 28360503  T
Q  121 cccaaacacctttaaaaaggcttataggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaac 190  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  28360502 cccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagaaaagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaac 28360433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 3 - 198
Target Start/End: Original strand, 40680041 - 40680236
Alignment:
Q  3 gaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataa 102  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40680041 gaggttacataaattcataagcttcttgttaagccgaagggtaagctaaaaatttaggcttatgaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataa 40680140  T
Q  103 gctatttttatttatttgcccaaacacctttaaaaaggcttataggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggccta 198  Q
    |||||||||||||||||  ||||| |||||||||||| ||||| | ||||||||||| |||||||  |||||||||| |||||||||  |||||||    
T  40680141 gctatttttatttatttatccaaatacctttaaaaagacttatggaagtagataagctcacataaattcaaaataagtcaatccaaagcgggccta 40680236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 131; E-Value: 6e-68
Query Start/End: Original strand, 44 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 50053592 - 50053438
Alignment:
Q  44 taagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttgcccaaacacctttaaaaaggctt 143  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  50053592 taagatgaaaatttagacttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttgcccaaacacatttaaaaaggctt 50053493  T
Q  144 ataggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggccta 198  Q
    || |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50053492 atgggagtagataagtccatataagctcaaaataagccaatccaaacggggccta 50053438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 4 - 184
Target Start/End: Original strand, 38071327 - 38071504
Alignment:
Q  4 aggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataag 103  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||     |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  38071327 aggttacataaattcataagctccttgttaagcccc---gtaaactgaaaattcaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaa 38071423  T
Q  104 ctatttttatttatttgcccaaacacctttaaaaaggcttataggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaat 184  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  38071424 ctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggattatgagagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaat 38071504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 5 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 16704009 - 16703820
Alignment:
Q  5 ggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagc 104  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  16704009 ggttacataaatttataggctccttgttaagccggaggataaactgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaac 16703910  T
Q  105 tatttttatttatttgcccaaacacctttaaaaaggcttataggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggccta 198  Q
    |||||||||||||||   |||||| ||||||||| |||||| | ||||||||||  |||||||||||    |||| ||||||||||| ||||||    
T  16703909 tatttttatttatttattcaaacaactttaaaaaagcttatggaagtagataagttcacataagctc----taagtcaatccaaacgaggccta 16703820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 1 - 116
Target Start/End: Original strand, 23269047 - 23269162
Alignment:
Q  1 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgat 100  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  23269047 aggagattacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatagcataagcagcttatgaaactatgat 23269146  T
Q  101 aagctatttttattta 116  Q
    ||||||||||||||||    
T  23269147 aagctatttttattta 23269162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 108 - 193
Target Start/End: Original strand, 23265865 - 23265950
Alignment:
Q  108 ttttatttatttgcccaaacacctttaaaaaggcttataggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggg 193  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23265865 ttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatccgagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggg 23265950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 44 - 197
Target Start/End: Original strand, 44548185 - 44548339
Alignment:
Q  44 taagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttgcccaaacacctttaaaaaggctt 143  Q
    |||||| ||||||| |||||| ||||||| ||||||| || ||||| ||| | ||||||| | |||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||    
T  44548185 taagcttaaaatttgggcttaataaaatagggcataaacaacttataaaattgtgataagatgtttttattgatttatccaaacacctttaaaaaggctt 44548284  T
Q  144 ataggagtagataagcccacataagctcaaaataa-gccaatccaaacggggcct 197  Q
    ||   ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||    
T  44548285 atgttagtagataagcccacataagctccaaataaggccaattcaaacggggcct 44548339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 75
Target Start/End: Complemental strand, 53408212 - 53408137
Alignment:
Q  1 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccgg-agggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatgg 75  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  53408212 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaagggtaagctgaaaatttaggcttaataaaatatgg 53408137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 45 - 119
Target Start/End: Original strand, 51780763 - 51780837
Alignment:
Q  45 aagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttattt 119  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  51780763 aagcttaaaatttgggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaattatgataagctatttttattgattt 51780837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 44 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 17493482 - 17493340
Alignment:
Q  44 taagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttgcccaaacacctttaaaaaggctt 143  Q
    |||||| |||||||  ||||||||||| |||| ||||||||||||| ||| ||  ||||| |||||||||| |||| | ||||| || ||||||| ||||    
T  17493482 taagctcaaaatttgagcttattaaaacatggtataagcagcttataaaattagaataagatatttttattgatttactcaaacgcccttaaaaatgctt 17493383  T
Q  144 ataggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatcc 186  Q
    ||||||||||||| |  || ||||  |||||||||| ||||||    
T  17493382 ataggagtagatatgttcatataaattcaaaataagtcaatcc 17493340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 1 - 51
Target Start/End: Original strand, 23261887 - 23261937
Alignment:
Q  1 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctga 51  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23261887 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctga 23261937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #59
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 91
Target Start/End: Original strand, 9595903 - 9595982
Alignment:
Q  1 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatga 91  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||           | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  9595903 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggag-----------agtttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatga 9595982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #60
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 148 - 199
Target Start/End: Original strand, 9595983 - 9596033
Alignment:
Q  148 gagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggcctat 199  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  9595983 gagtagataagcccacataaactcaaa-taagccaatccaaacggggcctat 9596033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #61
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 54
Target Start/End: Complemental strand, 48748250 - 48748197
Alignment:
Q  1 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaa 54  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||    
T  48748250 aggagattacataaattcataagctccttattaagacggagggtatgctgaaaa 48748197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #62
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 49 - 106
Target Start/End: Original strand, 55344724 - 55344781
Alignment:
Q  49 tgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagcta 106  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||| || || |||||| ||||||||||||    
T  55344724 tgaaaattttggcttattaaaatatggcataaacaactcatgaaaatatgataagcta 55344781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #63
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 1 - 37
Target Start/End: Complemental strand, 50055337 - 50055301
Alignment:
Q  1 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagcc 37  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50055337 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagcc 50055301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 178; Significance: 6e-96; HSPs: 48)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 178; E-Value: 6e-96
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 1168695 - 1168498
Alignment:
Q  1 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgat 100  Q
    ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1168695 aggagattacataaattcataaactccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgat 1168596  T
Q  101 aagctatttttatttatttgcccaaacacctttaaaaaggcttataggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggccta 198  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1168595 aagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggccta 1168498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 178; E-Value: 6e-96
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 25897566 - 25897369
Alignment:
Q  1 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25897566 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgat 25897467  T
Q  101 aagctatttttatttatttgcccaaacacctttaaaaaggcttataggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggccta 198  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  25897466 aagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagatatgcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacggggccta 25897369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 178; E-Value: 6e-96
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Original strand, 39260359 - 39260556
Alignment:
Q  1 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  39260359 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcaacttatgaaactatgat 39260458  T
Q  101 aagctatttttatttatttgcccaaacacctttaaaaaggcttataggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggccta 198  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39260459 aagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaatgcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggccta 39260556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Original strand, 26580283 - 26580480
Alignment:
Q  1 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26580283 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgat 26580382  T
Q  101 aagctatttttatttatttgcccaaacacctttaaaaaggcttataggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggccta 198  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26580383 aagctatttttatttacttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggaatagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggccta 26580480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 1 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 26663450 - 26663257
Alignment:
Q  1 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  26663450 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataaacagcttatgaaactatgat 26663351  T
Q  101 aagctatttttatttatttgcccaaacacctttaaaaaggcttataggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacgggg 194  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26663350 aagctatttttatttatttatccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacgggg 26663257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 1 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 29078708 - 29078519
Alignment:
Q  1 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29078708 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggtttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgat 29078609  T
Q  101 aagctatttttatttatttgcccaaacacctttaaaaaggcttataggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaac 190  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29078608 aagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaac 29078519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Original strand, 52753160 - 52753357
Alignment:
Q  1 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  52753160 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagatggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagtagcttatgaaactatgat 52753259  T
Q  101 aagctatttttatttatttgcccaaacacctttaaaaaggcttataggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggccta 198  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52753260 aagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaatgcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggccta 52753357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 173; E-Value: 6e-93
Query Start/End: Original strand, 1 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 16052288 - 16052092
Alignment:
Q  1 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16052288 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaattcaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgat 16052189  T
Q  101 aagctatttttatttatttgcccaaacacctttaaaaaggcttataggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggcct 197  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  16052188 aagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatggaagtagataagcccacataaactcaaaataagccaatccaaacggggcct 16052092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 173; E-Value: 6e-93
Query Start/End: Original strand, 1 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 20089663 - 20089467
Alignment:
Q  1 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  20089663 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgat 20089564  T
Q  101 aagctatttttatttatttgcccaaacacctttaaaaaggcttataggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggcct 197  Q
    ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20089563 aagctatttttatttatttacctaaacacctttaaaaatgcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggcct 20089467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 171; E-Value: 9e-92
Query Start/End: Original strand, 4 - 198
Target Start/End: Original strand, 41928511 - 41928705
Alignment:
Q  4 aggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataag 103  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  41928511 aggttacataaattcataagctccttgttaagctggagggtaagctgaaaatttaggcttgttaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaa 41928610  T
Q  104 ctatttttatttatttgcccaaacacctttaaaaaggcttataggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggccta 198  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  41928611 ctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttataggagtagataagtccacataagttcaaaataagccaatccaaacggggccta 41928705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 170; E-Value: 3e-91
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Original strand, 1940760 - 1940957
Alignment:
Q  1 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||    
T  1940760 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataaacaacttatgaaactatgat 1940859  T
Q  101 aagctatttttatttatttgcccaaacacctttaaaaaggcttataggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggccta 198  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1940860 aagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccatataagctcaaaataagccaatccaaacggggccta 1940957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 170; E-Value: 3e-91
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 33510676 - 33510479
Alignment:
Q  1 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33510676 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgat 33510577  T
Q  101 aagctatttttatttatttgcccaaacacctttaaaaaggcttataggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggccta 198  Q
    || ||||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33510576 aaactatttttatttatttatccaaacacctttaaaaagacttatgggagtagataagctcatataagctcaaaataagccaatccaaacggggccta 33510479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 2 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 38829260 - 38829072
Alignment:
Q  2 ggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgata 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  38829260 ggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcacaagcagcttatgaaactatgata 38829161  T
Q  102 agctatttttatttatttgcccaaacacctttaaaaaggcttataggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaac 190  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  38829160 agctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtagataagccgacataagctcaaaataagccaatccaaac 38829072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 1 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 43905846 - 43905650
Alignment:
Q  1 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgat 100  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43905846 aggaggttacgtaaattcataagctccttcttaagccggagggtaaactaaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgat 43905747  T
Q  101 aagctatttttatttatttgcccaaacacctttaaaaaggcttataggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggcct 197  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  43905746 aagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttataggagtagataagcccaaataagctcaaaataagccaatccaaacggagcct 43905650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 168; E-Value: 5e-90
Query Start/End: Original strand, 1 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 52696983 - 52696788
Alignment:
Q  1 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52696983 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgat 52696884  T
Q  101 aagctatttttatttatttgcccaaacacctttaaaaaggcttataggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggcc 196  Q
    ||||| ||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52696883 aagctgtttttgtttatttacccaaacaccttcaaaaaggcttatgcgagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggcc 52696788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 29288339 - 29288144
Alignment:
Q  1 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgat 100  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29288339 aggaggttacata--ttcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgat 29288242  T
Q  101 aagctatttttatttatttgcccaaacacctttaaaaaggcttataggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggccta 198  Q
    || |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  29288241 aaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacggggccta 29288144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 165; E-Value: 3e-88
Query Start/End: Original strand, 1 - 197
Target Start/End: Original strand, 1170457 - 1170653
Alignment:
Q  1 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgat 100  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  1170457 aggaggttacataaattcataaactccttgttaagccggatggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgat 1170556  T
Q  101 aagctatttttatttatttgcccaaacacctttaaaaaggcttataggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggcct 197  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1170557 aagctgtttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtagataagcccacaaaagctcaaaataagccaatccaaacggggcct 1170653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 165; E-Value: 3e-88
Query Start/End: Original strand, 1 - 193
Target Start/End: Original strand, 19715174 - 19715366
Alignment:
Q  1 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  19715174 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctaaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaacaatgat 19715273  T
Q  101 aagctatttttatttatttgcccaaacacctttaaaaaggcttataggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggg 193  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  19715274 aagctatttttatttatttatccaaacacctttaaaaaggcttataggagtagataagctcacataagctcaaaataaaccaatccaaacggg 19715366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 1 - 200
Target Start/End: Original strand, 8079722 - 8079921
Alignment:
Q  1 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgat 100  Q
    ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  8079722 aggagattacataaattcataaactccttgttaagccagagggtaagctgaaaacttaggcttattaaaatatggcataagtagcttatgaaactatgat 8079821  T
Q  101 aagctatttttatttatttgcccaaacacctttaaaaaggcttataggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggcctata 200  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  8079822 aagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgagagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacgggacctata 8079921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 1 - 196
Target Start/End: Original strand, 42370808 - 42371003
Alignment:
Q  1 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  42370808 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacacaagcagcttatgaaactatgat 42370907  T
Q  101 aagctatttttatttatttgcccaaacacctttaaaaaggcttataggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggcc 196  Q
    ||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  42370908 aagttttttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagctcacataagctcaaaataagtcaatccaaacggggcc 42371003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 161; E-Value: 8e-86
Query Start/End: Original strand, 5 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 32671767 - 32671575
Alignment:
Q  5 ggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagc 104  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  32671767 ggttacataaattcataagctccttgttaagccgaagggtaagttgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagtagcttatgaaactatgataagc 32671668  T
Q  105 tatttttatttatttgcccaaacacctttaaaaaggcttataggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggcct 197  Q
    ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32671667 tatttttatttatttacccaaacatctttaaaaaggcttatgggagtagataaatccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggcct 32671575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 1 - 196
Target Start/End: Original strand, 970537 - 970734
Alignment:
Q  1 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactat--g 98  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |    
T  970537 aggagattacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggtttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatatg 970636  T
Q  99 ataagctatttttatttatttgcccaaacacctttaaaaaggcttataggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggcc 196  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  970637 ataatctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacggggcc 970734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 158; E-Value: 5e-84
Query Start/End: Original strand, 1 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 5215577 - 5215384
Alignment:
Q  1 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  5215577 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaagttaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcaacttatgaaactatgat 5215478  T
Q  101 aagctatttttatttatttgcccaaacacctttaaaaaggcttataggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacgggg 194  Q
    |||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5215477 aagctatttttacttatttacccaaacatctttaaaaaggcttatgaaagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacgggg 5215384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 156; E-Value: 8e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 12683012 - 12682817
Alignment:
Q  1 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12683012 aggaggttacataaattcataagcttcttgttaagccggagggtaagctaaagatttaggcttatgaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgat 12682913  T
Q  101 aagctatttttatttatttgcccaaacacctttaaaaaggcttataggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggcc 196  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||    
T  12682912 aagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttatgggagtagataagcccacataaactcaaaataagtcaatccaaacagggcc 12682817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 155; E-Value: 3e-82
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 2347849 - 2347651
Alignment:
Q  1 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaa-tatggcataagcagcttatgaaactatga 99  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  2347849 aggaggttacataaattcataagctcattgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaaatatgacataagcagcttatgaaactatga 2347750  T
Q  100 taagctatttttatttatttgcccaaacacctttaaaaaggcttataggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggccta 198  Q
    ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||| | |||||||||||||||||    
T  2347749 taaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccgcataaactcaaaataaacaaatccaaacggggccta 2347651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 155; E-Value: 3e-82
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 17591880 - 17591686
Alignment:
Q  1 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  17591880 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctggaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgat 17591781  T
Q  101 aagctatttttatttatttgcccaaacacctttaaaaaggcttataggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggccta 198  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  17591780 aagctgtttttatttatttacccaaacacctttgaaaaggcttatgggagtagataag-ccacataagctc--aataagccaatccaaacggggccta 17591686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 46761158 - 46760961
Alignment:
Q  1 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgat 100  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  46761158 aggaagttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagtttatgaaactatgat 46761059  T
Q  101 aagctatttttatttatttgcccaaacacctttaaaaaggcttataggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggccta 198  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||   ||||||||||| || ||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  46761058 aagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgcaagtagataagctcatataagttcaaaataagtcaatccaaacgggaccta 46760961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 153; E-Value: 5e-81
Query Start/End: Original strand, 4 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 40092680 - 40092488
Alignment:
Q  4 aggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataag 103  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40092680 aggttacataaattcataagctccttgttaagccggaagataagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataag 40092581  T
Q  104 ctatttttatttatttgcccaaacacctttaaaaaggcttataggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggcc 196  Q
     ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| || |||||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  40092580 atatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttatgggagtagataagctcatataagctcaaaataagtcaatccaaacagggcc 40092488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 8121061 - 8120870
Alignment:
Q  1 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  8121061 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaaactgaaaatttaagcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgat 8120962  T
Q  101 aagctatttttatttatttgcccaaacacctttaaaaaggcttataggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacgg 192  Q
    || || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8120961 aaactgtttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgcgagtagataagtccacataagctcaaaataagccaatccaaacgg 8120870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 148; E-Value: 5e-78
Query Start/End: Original strand, 1 - 196
Target Start/End: Original strand, 51359230 - 51359424
Alignment:
Q  1 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgat 100  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  51359230 aggaggttacataaattcataaactccttgttaagctggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcaccttatgaaactatgat 51359329  T
Q  101 aagctatttttatttatttgcccaaacacctttaaaaaggcttataggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggcc 196  Q
    |||||||||||| |||||| |||||| |||||||| ||||||||| | |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51359330 aagctatttttaattatttacccaaa-acctttaagaaggcttatggcagtaaataagcccgcataagctcaaaataagccaatccaaacggggcc 51359424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 3 - 197
Target Start/End: Original strand, 13996738 - 13996932
Alignment:
Q  3 gaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataa 102  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||    
T  13996738 gaggttacataaattcataaactccttgttaagccggagggtaagttgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaaccattataa 13996837  T
Q  103 gctatttttatttatttgcccaaacacctttaaaaaggcttataggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggcct 197  Q
    |||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  13996838 gctatttttatttatttatccaaacatctttaaaaaggcttatgggagtagataaacccacataatttcaaaataagccaatccaaacagggcct 13996932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 146; E-Value: 7e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 2473914 - 2473717
Alignment:
Q  1 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgat 100  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| ||    
T  2473914 aggaggtaacataaattcataagctccttgttaagtaggagggtaagctgaaaatttaggcttattgaaatatgacataagcagcttatgaaactataat 2473815  T
Q  101 aagctatttttatttatttgcccaaacacctttaaaaaggcttataggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggccta 198  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||    
T  2473814 aagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggcgtagataagcccacataagctcaaaataaaccgatccaaacgggaccta 2473717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 4 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 15203301 - 15203109
Alignment:
Q  4 aggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataag 103  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  15203301 aggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggttggctgaaaatttaggcttattgaaatatggcataaacagcttatgaaactatgataag 15203202  T
Q  104 ctatttttatttatttgcccaaacacctttaaaaaggcttataggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggcc 196  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||| |||||||| |||| |||||||||||    
T  15203201 ctatttttatttatttaccctaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataaacccacaaaagcttaaaataagtcaattcaaacggggcc 15203109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 1 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 46409629 - 46409431
Alignment:
Q  1 aggaggttacataaattcataagctccttgttaa--gccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatg 98  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||  | || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46409629 aggaggtcacataaattcataagctccttgttaattgtcgaagggtaagctgaaaatttaggcttattgaaatatggcataagcagcttatgaaactatg 46409530  T
Q  99 ataagctatttttatttatttgcccaaacacctttaaaaaggcttataggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggcct 197  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  || |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  46409529 ataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgagattagataagtccacataagctcaaaataagtcaatccaaacggagcct 46409431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 6 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 49146359 - 49146168
Alignment:
Q  6 gttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagct 105  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49146359 gttacataaattcataagctctttgttaagccggagggtaagatgaaaatttaggcttattgaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagct 49146260  T
Q  106 atttttatttatttgcccaaacacctttaaaaaggcttataggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggcct 197  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||||||||  ||||| |||||| ||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  49146259 atttttatttatttatccaaacacctttaaaaaaacttatgggagtatataaatccacataagctcaaaataaaccaatccaaacggagcct 49146168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 138; E-Value: 4e-72
Query Start/End: Original strand, 1 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 6765651 - 6765458
Alignment:
Q  1 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgat 100  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||    
T  6765651 aggagattacataaattcataaactccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagctcatgaaaatatgat 6765552  T
Q  101 aagctatttttatttatttgcccaaacacctttaaaaaggcttataggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacgggg 194  Q
    || |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||   ||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  6765551 aaactatttttatttatttacccaaacacttttaaaaaggcttataaaagtagataaattcacataaactcaaaataagccaatccaaacgggg 6765458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 138; E-Value: 4e-72
Query Start/End: Original strand, 1 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 7145399 - 7145207
Alignment:
Q  1 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7145399 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgat 7145300  T
Q  101 aagctatttttatttatttgcccaaacacctttaaaaaggcttataggagtagataagcccacataagctc-aaaataagccaatccaaacggg 193  Q
    || |||||||| ||||||| ||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||||   ||||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  7145299 aaactatttttgtttatttaccc-aacacttttaaaaaggcttatgggagtagataaatacacataagctcaaaaataagtcaatccaaacggg 7145207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 138; E-Value: 4e-72
Query Start/End: Original strand, 3 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 23498650 - 23498457
Alignment:
Q  3 gaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataa 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||| |    
T  23498650 gaggttacataaattcataagctccttgttaagtcggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatgatataagcaacttatgaaactatgatga 23498551  T
Q  103 gctatttttatttatttgcccaaacacctttaaaaaggcttataggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggcc 196  Q
     |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| | | |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||    
T  23498550 actatttttatttatttacccaaacaccttgaaaaaggcttgtggaagtagataagcccacataagcttaaaataagccaattcaaacagggcc 23498457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 1 - 177
Target Start/End: Original strand, 17587518 - 17587694
Alignment:
Q  1 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  17587518 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagtgtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaaatatgat 17587617  T
Q  101 aagctatttttatttatttgcccaaacacctttaaaaaggcttataggagtagataagcccacataagctcaaaata 177  Q
    ||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||  || ||||||||| |||||||||||||||||    
T  17587618 aagctgtttttatttatttagccaaacacctttaaaaaggcttatgcgaatagataagctcacataagctcaaaata 17587694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 15717976 - 15717787
Alignment:
Q  1 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgat 100  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||     
T  15717976 aggaggttacataaaatcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaattatggcataagcagcttatgaaactatga- 15717878  T
Q  101 aagctatttttatttatttgcccaaacacctttaaaaaggcttataggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacg 191  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||   | |||||| ||| |||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  15717877 aagctatttttatttatttactcaaacacctttaaaaaggcttatgaaattagataggccaacataaactcaaaataagtcaatccaaacg 15717787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 133; E-Value: 4e-69
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Original strand, 15554165 - 15554354
Alignment:
Q  1 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||            
T  15554165 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagttgaaaatttaggcttattaaaatatggcatcagcagtttatgaa-------- 15554256  T
Q  101 aagctatttttatttatttgcccaaacacctttaaaaaggcttataggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggccta 198  Q
    | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  15554257 atgctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccatataagctcaacttaagccaatccaaacggggccta 15554354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 123; E-Value: 4e-63
Query Start/End: Original strand, 1 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 40149655 - 40149497
Alignment:
Q  1 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  40149655 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcggagggtaaactgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttataaaactatgat 40149556  T
Q  101 aagctatttttatttatttgcccaaacacctttaaaaaggcttataggagtagataagc 159  Q
    ||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  40149555 aaattatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagc 40149497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 114; E-Value: 9e-58
Query Start/End: Original strand, 27 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 29695842 - 29695673
Alignment:
Q  27 cttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttgcccaaa 126  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||  |||||    
T  29695842 cttgttaagtcggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataaattatttttatttatttatccaaa 29695743  T
Q  127 cacctttaaaaaggc-ttataggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggc 195  Q
    ||||||||||||    |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  29695742 cacctttaaaaaaaaattatgggagtagataagcccacgtaagctcaaaataagccaatccaaacagggc 29695673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 64 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 52086396 - 52086262
Alignment:
Q  64 attaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttgcccaaacacctttaaaaaggcttataggagtagataagcccac 163  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| | |||| |||||||||||||||||||| |||| |||| |||||| |||||    
T  52086396 attaaattatggcataagcagcttatgaaattatgataagttatttttactgatttacccaaacacctttaaaaaggtttatgggagcagataaacccac 52086297  T
Q  164 ataagctcaaaataagccaatccaaacggggccta 198  Q
    ||||||| |||||||| |||||||||| |||||||    
T  52086296 ataagcttaaaataagtcaatccaaacagggccta 52086262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 1 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 38172011 - 38171828
Alignment:
Q  1 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||              |||||||||||||||||||||||||    
T  38172011 aggaggttacataaattcataagctcattcttaagccggaggataagctgaaaatttaggca-------------cataagcagcttatgaaactatgat 38171925  T
Q  101 aagctatttttatttatttgcccaaacacctttaaaaaggcttataggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggcct 197  Q
    || || |||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||  |||||||  |||||||||| |||| ||||||| ||||    
T  38171924 aaactgtttttatttatttatccaaacacctttaaaaaggtttatgtgagtagataagttcacataaattcaaaataagtcaatgcaaacggagcct 38171828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 45 - 180
Target Start/End: Original strand, 23322897 - 23323032
Alignment:
Q  45 aagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttgcccaaacacctttaaaaaggctta 144  Q
    ||||| |||||||  |||||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||   ||||| |||| ||||| | |||    
T  23322897 aagcttaaaatttgcgcttattaaagtatgacataagcagcttatgaaattatgataaactatttttattgatttattcaaacgccttaaaaaaagttta 23322996  T
Q  145 taggagtagataagcccacataagctcaaaataagc 180  Q
    | |||||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  23322997 tgggagtagataagcctatataagctcaaaataagc 23323032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 44 - 198
Target Start/End: Original strand, 5217840 - 5217993
Alignment:
Q  44 taagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttgcccaaacacctttaaaaaggctt 143  Q
    |||||| ||||||  ||||||| ||||||||| |||||| |||||||||| |   |||||||||||||||| |||| ||||||    ||| |||  ||||    
T  5217840 taagctcaaaattatggcttataaaaatatggtataagcggcttatgaaattggtataagctatttttatt-atttacccaaatgtatttgaaagagctt 5217938  T
Q  144 ataggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggccta 198  Q
    ||   ||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||    
T  5217939 atgttagtagataagctctcataagcttaaaataagccaatccaaacgaggccta 5217993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 122 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 5675176 - 5675101
Alignment:
Q  122 ccaaacacctttaaaaaggcttataggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggcct 197  Q
    ||||||| |||| |||| ||||||   |||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  5675176 ccaaacatctttcaaaaagcttatgttagtagataagctaacataagcttaaaataagccaatccaaacggggcct 5675101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 176; Significance: 9e-95; HSPs: 29)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 176; E-Value: 9e-95
Query Start/End: Original strand, 1 - 196
Target Start/End: Original strand, 31517228 - 31517423
Alignment:
Q  1 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  31517228 aggaggttacataaattcataagctccttattaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagtttatgaaactatgat 31517327  T
Q  101 aagctatttttatttatttgcccaaacacctttaaaaaggcttataggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggcc 196  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31517328 aagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccaaataagctcaaaataagccaatccaaacggggcc 31517423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 173; E-Value: 6e-93
Query Start/End: Original strand, 1 - 197
Target Start/End: Original strand, 33906060 - 33906256
Alignment:
Q  1 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33906060 aggaggttacataaattcataagctccttcttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgat 33906159  T
Q  101 aagctatttttatttatttgcccaaacacctttaaaaaggcttataggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggcct 197  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||    
T  33906160 aagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccacataagttcaaaataagtcaatccaaacagggcct 33906256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 171; E-Value: 9e-92
Query Start/End: Original strand, 1 - 199
Target Start/End: Original strand, 18806897 - 18807095
Alignment:
Q  1 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  18806897 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctaaaaatttaggcttattaaaatatagcataagcagcttatgaaactatgat 18806996  T
Q  101 aagctatttttatttatttgcccaaacacctttaaaaaggcttataggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggcctat 199  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18806997 aagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgagagtagataagctcatataagctcaaaataagccaatccaaacggggcctat 18807095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 170; E-Value: 3e-91
Query Start/End: Original strand, 3 - 196
Target Start/End: Original strand, 3873259 - 3873452
Alignment:
Q  3 gaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataa 102  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3873259 gaggttatataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataa 3873358  T
Q  103 gctatttttatttatttgcccaaacacctttaaaaaggcttataggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggcc 196  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  3873359 gctatatttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgagagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacgaggcc 3873452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 3 - 197
Target Start/End: Original strand, 26323201 - 26323395
Alignment:
Q  3 gaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataa 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26323201 gaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataa 26323300  T
Q  103 gctatttttatttatttgcccaaacacctttaaaaaggcttataggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggcct 197  Q
    |||||||||||||||||  ||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  26323301 gctatttttatttatttatccaaacatctttaaaaagacttatgggagtagataagtccacataagctcaaaataaaccaatccaaacggggcct 26323395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 8 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 1108464 - 1108276
Alignment:
Q  8 tacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctat 107  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  1108464 tacataaattcataagctccttgttaagtcggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcaacttatgaaactatgataaactat 1108365  T
Q  108 ttttatttatttgcccaaacacctttaaaaaggcttataggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggcct 197  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  1108364 ttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagcc-atccaaacggggcct 1108276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 39635644 - 39635447
Alignment:
Q  1 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgat 100  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  39635644 aggaggttacataaattgataagctcgttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttaataaaatatgacataagcagcttatgaaactatgat 39635545  T
Q  101 aagctatttttatttatttgcccaaacacctttaaaaaggcttataggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggccta 198  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  39635544 aagctatatttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagtccacataagctcaaaataagctaatccaaacggggccta 39635447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 3 - 197
Target Start/End: Original strand, 4232157 - 4232351
Alignment:
Q  3 gaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataa 102  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4232157 gaggttacataaattcataagctctttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttgtgaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataa 4232256  T
Q  103 gctatttttatttatttgcccaaacacctttaaaaaggcttataggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggcct 197  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  4232257 gctatttttatttatttacccaaacacatttaaaaagacttatggaagtagataagcccacataagcacaaaataagccaatccaaacggggcct 4232351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 4016231 - 4016039
Alignment:
Q  1 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4016231 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccgaagggtaagctgaaaatttaggcttgttaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgat 4016132  T
Q  101 aagctatttttatttatttgcccaaacacctttaaaaaggcttataggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggg 193  Q
    | | ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4016131 acgttatttttatttattcacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataaactcacataagctcaaaataagccaatccaaacggg 4016039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 155; E-Value: 3e-82
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 42937912 - 42937714
Alignment:
Q  1 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggctt-attaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42937912 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcggagggtaagctgaaaatttaggctttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 42937813  T
Q  100 taagctatttttatttatttgcccaaacacctttaaaaaggcttataggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggccta 198  Q
    ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | | ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  42937812 taaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaaatagataaactcacataagctcaaaataagccaatccaaacggagccta 42937714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Original strand, 6174841 - 6175038
Alignment:
Q  1 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgat 100  Q
    ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  6174841 aggaggtcacgtaaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttaatgaaatatgacataagcagcttatgaaactatgat 6174940  T
Q  101 aagctatttttatttatttgcccaaacacctttaaaaaggcttataggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggccta 198  Q
    ||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6174941 aaaatatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtatataagctcacataagctcaaaataagccaatccaaacggggccta 6175038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 1 - 193
Target Start/End: Original strand, 28329852 - 28330042
Alignment:
Q  1 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgat 100  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  28329852 aggaggttacataaattcatatgctccttgttaagct--agggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagtttatgaaactatgat 28329949  T
Q  101 aagctatttttatttatttgcccaaacacctttaaaaaggcttataggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggg 193  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  28329950 aagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggtgtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacggg 28330042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 153; E-Value: 5e-81
Query Start/End: Original strand, 1 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 5733591 - 5733395
Alignment:
Q  1 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgat 100  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  5733591 aggaggttgcataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgat 5733492  T
Q  101 aagctatttttatttatttgcccaaacacctttaaaaaggcttataggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggcct 197  Q
    ||| | ||||||||||||  |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||    
T  5733491 aagttgtttttatttattcacccaaacacctttaaaaaggctgatgggagtagataagcccacataagctcaaaataaaccaatctaaatggggcct 5733395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 3 - 197
Target Start/End: Original strand, 19901153 - 19901346
Alignment:
Q  3 gaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataa 102  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  19901153 gaggttacataaattcataagctccttgttaagccgaagggtgggctgaaaatttaggcttattgaaatatggcataagcagtttatgaaactatgataa 19901252  T
Q  103 gctatttttatttatttgcccaaacacctttaaaaaggcttataggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggcct 197  Q
    |||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19901253 gctattttta-ttatttacccaaacacttttaaaaaggcttatggaagtagagaagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggcct 19901346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 146; E-Value: 7e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Original strand, 2178782 - 2178979
Alignment:
Q  1 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2178782 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgat 2178881  T
Q  101 aagctatttttatttatttgcccaaacacctttaaaaaggcttataggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggccta 198  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||  || |||||||| |||||||| || |||||||  ||||||||||||||||||    
T  2178882 aagctgtttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttatgcgaatagataagtccacataaacttaaaataaatcaatccaaacggggccta 2178979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 1 - 192
Target Start/End: Original strand, 1482916 - 1483106
Alignment:
Q  1 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgat 100  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||    
T  1482916 aggatgttacataaattcataagctccttgttaagtcgaagggtaaactgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaacaataat 1483015  T
Q  101 aagctatttttatttatttgcccaaacacctttaaaaaggcttataggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacgg 192  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  1483016 aagctatttttatttatttacccaaacacttttaaaaaagcttat-ggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatcaaaacgg 1483106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 2 - 201
Target Start/End: Original strand, 16588790 - 16588989
Alignment:
Q  2 ggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgata 101  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  16588790 ggaggttacattaattcataagctccttattaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttatgaaaatatggcataagcagcttatgaaactataata 16588889  T
Q  102 agctatttttatttatttgcccaaacacctttaaaaaggcttataggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggcctatat 201  Q
    |||||||||||||||||| |||||||  |||||||||| |||||   ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  16588890 agctatttttatttatttacccaaacttctttaaaaagacttatgaaagtagataagcccacataaacacaaaataagccaatccaaacggagcctatat 16588989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 141; E-Value: 7e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 851189 - 850997
Alignment:
Q  1 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  851189 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctaaaaatttaagcttattaaaatatggcataagcagcttataaaattatgat 851090  T
Q  101 aagctatttttatttatttgcccaaacacctttaaaaaggcttataggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggg 193  Q
    ||||| | ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  851089 aagctctatttatttatttacccaaacacttttaaaaaggcttatgagagtagataagcctacataagcttaaaataagcaaatccaaacggg 850997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 141; E-Value: 7e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 197
Target Start/End: Original strand, 30270692 - 30270888
Alignment:
Q  1 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgat 100  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  30270692 aggagattacataaattcataagctccttgttaagccgaagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgat 30270791  T
Q  101 aagctatttttatttatttgcccaaacacctttaaaaaggcttataggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggcct 197  Q
    || |||||||  |||||||  |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| | || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  30270792 aaactattttattttatttatccaaacacttttaaaaaggcttatgggagtagataaactcatataagcttaaaataagccaatccaaacggggcct 30270888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 44 - 194
Target Start/End: Original strand, 30420223 - 30420373
Alignment:
Q  44 taagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttgcccaaacacctttaaaaaggctt 143  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  30420223 taagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaacctatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggctt 30420322  T
Q  144 ataggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacgggg 194  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30420323 atgggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacgggg 30420373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 1 - 189
Target Start/End: Original strand, 16066307 - 16066495
Alignment:
Q  1 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16066307 aggaggttacataaattcataagctccttattaaatcagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgat 16066406  T
Q  101 aagctatttttatttatttgcccaaacacctttaaaaaggcttataggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaa 189  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||| |||||   || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  16066407 aagctatttttatttatttacccaaacactttaaaaaagacttatgaaagcagataagcccacataagctcaaaataagccaattcaaa 16066495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 179
Target Start/End: Original strand, 19383948 - 19384126
Alignment:
Q  1 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  19383948 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataaacaacttatgaaactatgat 19384047  T
Q  101 aagctatttttatttatttgcccaaacacctttaaaaaggcttataggagtagataagcccacataagctcaaaataag 179  Q
    || |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||  || ||||||||| || |||| |||||||||||    
T  19384048 aaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttatgagaatagataagctcatataaactcaaaataag 19384126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 114; E-Value: 9e-58
Query Start/End: Original strand, 3 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 430006 - 429817
Alignment:
Q  3 gaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataa 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |  ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  430006 gaggttacataaattcataagctccttgttaagtcgaattgtaagttgaaaatttaggcttattaaaatatcgcataagcaacttatgaaattatgataa 429907  T
Q  103 gctatttttatttatttgcccaaacacctttaaaaaggcttataggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacgg 192  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||  ||||||||  ||||||||||  ||| |||||||    
T  429906 gctatttttatttatttacccaaacacttttaaaaaggcttatgagagtagataaatccacataaattcaaaataagggaattcaaacgg 429817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 1 - 195
Target Start/End: Original strand, 44947562 - 44947749
Alignment:
Q  1 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgat 100  Q
    |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||        |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44947562 aggaggttacataaattcataaacttcttgttaagccggagggtaaactgaaaatttagc-------aaatatggcataagcagcttatgaaactatgat 44947654  T
Q  101 aagctatttttatttatttgcccaaacacctttaaaaaggcttataggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggc 195  Q
    || ||||||||||||||||  |||||||| |||||||| |||||| | | ||||||| | |||||||| ||||||||||||||| |||| |||||    
T  44947655 aaactatttttatttatttatccaaacacttttaaaaatgcttatggcactagataaactcacataagatcaaaataagccaatacaaatggggc 44947749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 44 - 199
Target Start/End: Original strand, 42446625 - 42446780
Alignment:
Q  44 taagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttgcccaaacacctttaaaaaggctt 143  Q
    |||||| |||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| | |||||||| |||| || ||||||||||||||||||||    
T  42446625 taagcttaaaatttgatcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaattgtgataagttgtttttattgatttacctaaacacctttaaaaaggctt 42446724  T
Q  144 ataggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggcctat 199  Q
    ||   ||||||||||  | ||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  42446725 atgttagtagataagttcgcataaactccgaataagccaatccaaacggggcctat 42446780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 198 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 8808830 - 8808723
Alignment:
Q  198 atatatcatgagttcttaaattttgcatatacgtgaaccagtatgtatcgtagccgtaatgcgtatctcgactttccccataactcaatt----gccagt 293  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||    ||||||    
T  8808830 atatatcatgagttcttaaattttgcatatacgtgaaccagtatgtattgtagtcgtaatgtgtatctcgacttt-cccataactctattgtcagccagt 8808732  T
Q  294 atcaaaggc 302  Q
    |||||||||    
T  8808731 atcaaaggc 8808723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 44 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 3585439 - 3585291
Alignment:
Q  44 taagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttgcccaaacacctttaaaaaggctt 143  Q
    |||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||  | |||||||| |||| || |||||| ||||| |||| ||    
T  3585439 taagctcataattcaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaattgtgataaattgtttttattaatttaccaaaacacatttaataaggttt 3585340  T
Q  144 ataggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacgg 192  Q
    ||   ||| |||||  |||||||||||   |||||||| ||||||||||    
T  3585339 atgttagtggataaatccacataagctttgaataagccgatccaaacgg 3585291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 51 - 195
Target Start/End: Original strand, 22101210 - 22101353
Alignment:
Q  51 aaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttgcccaaacacctttaaaaaggcttataggag 150  Q
    ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||| | |||||||| ||||   |||| ||||||||||||||||||   ||    
T  22101210 aaaatttgggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaattgtgataagttgtttttattgatttatacaaatacctttaaaaaggcttatgttag 22101309  T
Q  151 tagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggc 195  Q
    |||||||  ||||||||  ||  ||||| ||||| ||||||||||    
T  22101310 tagataa-accacataaattctgaataacccaattcaaacggggc 22101353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 60 - 190
Target Start/End: Original strand, 12517256 - 12517385
Alignment:
Q  60 gcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttgcccaaacacctttaaaaaggcttataggagtagataagc 159  Q
    |||| ||||||||| || ||||| |||||||||| || |||||||| |||| ||| |  |  |||||||| ||||  || ||||||   |||||||||||    
T  12517256 gcttgttaaaatattgcttaagctgcttatgaaattaggataagctcttttaattaaggtatccaaacacttttaggaaagcttattttagtagataagc 12517355  T
Q  160 ccacataagctcaaaataagccaatccaaac 190  Q
     ||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  12517356 tcacataagct-taaataagccaatccaaac 12517385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0920 (Bit Score: 165; Significance: 3e-88; HSPs: 1)
Name: scaffold0920
Description:

Target: scaffold0920; HSP #1
Raw Score: 165; E-Value: 3e-88
Query Start/End: Original strand, 3 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 3900 - 3708
Alignment:
Q  3 gaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataa 102  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3900 gaggttacataaattcataagctccttgttaagctggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataa 3801  T
Q  103 gctatttttatttatttgcccaaacacctttaaaaaggcttataggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggc 195  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  3800 gctatttttatttatttacccaaacacatttaaaaaggcttatgagagtagataagcccacataagttcaaaataaaccaatccaaacggggc 3708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1777 (Bit Score: 162; Significance: 2e-86; HSPs: 1)
Name: scaffold1777
Description:

Target: scaffold1777; HSP #1
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Original strand, 19 - 216
Alignment:
Q  1 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggattattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgat 118  T
Q  101 aagctatttttatttatttgcccaaacacctttaaaaaggcttataggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggccta 198  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||  ||||||||| |||||||||||||    
T  119 aagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccatataaactcaacttaagccaatacaaacggggccta 216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0172 (Bit Score: 157; Significance: 2e-83; HSPs: 1)
Name: scaffold0172
Description:

Target: scaffold0172; HSP #1
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 10430 - 10234
Alignment:
Q  1 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  10430 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagctggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggtataagcagcttatgaaactatgat 10331  T
Q  101 aagctatttttatttatttgcccaaacacctttaaaaaggcttataggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggcct 197  Q
    || |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||  |||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  10330 aaactatttttatttatttacccaaacacctttaagaaggcttatgagagtagataaacccatataagctcaaaataagtcaatccaaacggggcct 10234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0018 (Bit Score: 157; Significance: 2e-83; HSPs: 1)
Name: scaffold0018
Description:

Target: scaffold0018; HSP #1
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 193
Target Start/End: Original strand, 145258 - 145450
Alignment:
Q  1 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgat 100  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  145258 aggaggttacataaatttataagctccttgttaagccgaagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgat 145357  T
Q  101 aagctatttttatttatttgcccaaacacctttaaaaaggcttataggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggg 193  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  145358 aagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagtccacataaactcaaaataagtcaatccaaacggg 145450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0038 (Bit Score: 152; Significance: 2e-80; HSPs: 1)
Name: scaffold0038
Description:

Target: scaffold0038; HSP #1
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 203
Target Start/End: Original strand, 19 - 222
Alignment:
Q  1 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  19 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattgaaa-atggcataagcagcatatgaaactatgat 117  T
Q  101 aagctatttttatttatttgcccaaacacctttaaaaaggcttataggagta---gataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggcct 197  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||   |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||    
T  118 aagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttat-ggagtagatgataagtccacataagctcaaaataagtcaatccaaacgggacct 216  T
Q  198 atatat 203  Q
    ||||||    
T  217 atatat 222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0482 (Bit Score: 150; Significance: 3e-79; HSPs: 1)
Name: scaffold0482
Description:

Target: scaffold0482; HSP #1
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 1 - 194
Target Start/End: Original strand, 308 - 501
Alignment:
Q  1 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  308 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaagtttaagcttattgaaatatgacataagcagcttatgaaactatgat 407  T
Q  101 aagctatttttatttatttgcccaaacacctttaaaaaggcttataggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacgggg 194  Q
    || |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  408 aatctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttatgggagtagataaactcacataaactcaaaataagccaatccaaacgggg 501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold2089 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000008; HSPs: 1)
Name: scaffold2089
Description:

Target: scaffold2089; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 169 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 1094 - 1063
Alignment:
Q  169 ctcaaaataagccaatccaaacggggcctata 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1094 ctcaaaataagccaatccaaacggggcctata 1063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University