View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF9533A_low_25 (Length: 400)

Name: NF9533A_low_25
Description: NF9533A
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF9533A_low_25
NF9533A_low_25
[»] chr1 (33 HSPs)
chr1 (7-236)||(44241349-44241579)
chr1 (14-236)||(29001730-29001953)
chr1 (7-236)||(9869097-9869327)
chr1 (7-236)||(31072310-31072540)
chr1 (7-236)||(1174597-1174828)
chr1 (14-238)||(4599527-4599753)
chr1 (14-236)||(26621468-26621692)
chr1 (14-236)||(6238654-6238877)
chr1 (14-236)||(39053338-39053561)
chr1 (14-236)||(39059710-39059933)
chr1 (14-236)||(42091895-42092118)
chr1 (14-236)||(45015780-45016003)
chr1 (14-236)||(41305514-41305738)
chr1 (14-236)||(44916329-44916560)
chr1 (14-236)||(41297515-41297739)
chr1 (14-236)||(32797735-32797945)
chr1 (19-236)||(11913262-11913479)
chr1 (14-205)||(27240161-27240354)
chr1 (14-236)||(43686626-43686851)
chr1 (14-236)||(41299188-41299412)
chr1 (15-236)||(1115982-1116206)
chr1 (14-147)||(23764521-23764655)
chr1 (14-172)||(5445028-5445186)
chr1 (157-236)||(23762336-23762415)
chr1 (14-231)||(28413678-28413897)
chr1 (14-79)||(2824977-2825042)
chr1 (14-84)||(38672920-38672991)
chr1 (15-231)||(39806057-39806274)
chr1 (112-227)||(47646766-47646883)
chr1 (124-230)||(23251460-23251568)
chr1 (124-231)||(5357752-5357861)
chr1 (14-47)||(23251342-23251375)
chr1 (188-232)||(9316137-9316181)
[»] chr7 (35 HSPs)
chr7 (7-236)||(37026040-37026270)
chr7 (14-236)||(26601911-26602134)
chr7 (14-236)||(15914637-15914860)
chr7 (14-236)||(15949158-15949381)
chr7 (14-236)||(39432907-39433129)
chr7 (14-236)||(3924093-3924316)
chr7 (14-236)||(36875544-36875767)
chr7 (14-236)||(5049912-5050135)
chr7 (14-236)||(14287714-14287937)
chr7 (15-236)||(14298900-14299122)
chr7 (14-236)||(6795437-6795660)
chr7 (14-236)||(23612388-23612611)
chr7 (14-236)||(9642916-9643141)
chr7 (14-236)||(1948633-1948857)
chr7 (14-236)||(6020864-6021088)
chr7 (14-236)||(8185392-8185616)
chr7 (14-236)||(8192952-8193176)
chr7 (7-233)||(45433577-45433805)
chr7 (14-236)||(48353480-48353704)
chr7 (14-236)||(2446645-2446868)
chr7 (32-236)||(21642535-21642740)
chr7 (14-236)||(19089806-19090030)
chr7 (14-236)||(48347096-48347320)
chr7 (15-236)||(33850643-33850865)
chr7 (14-236)||(5056307-5056531)
chr7 (14-236)||(1378946-1379169)
chr7 (14-236)||(8142446-8142669)
chr7 (234-379)||(42422112-42422257)
chr7 (162-236)||(13774130-13774204)
chr7 (14-231)||(10831130-10831349)
chr7 (14-231)||(11024922-11025141)
chr7 (14-231)||(21901193-21901413)
chr7 (13-65)||(1942043-1942095)
chr7 (170-231)||(27954243-27954303)
chr7 (188-231)||(28442628-28442671)
[»] scaffold0343 (1 HSPs)
scaffold0343 (13-236)||(2643-2867)
[»] chr5 (22 HSPs)
chr5 (14-236)||(22359963-22360186)
chr5 (14-236)||(22313829-22314052)
chr5 (15-236)||(4973563-4973785)
chr5 (15-236)||(5876218-5876440)
chr5 (14-236)||(34357288-34357511)
chr5 (14-236)||(34359079-34359302)
chr5 (14-236)||(2957857-2958081)
chr5 (14-236)||(2966326-2966550)
chr5 (14-236)||(29980458-29980681)
chr5 (14-236)||(30041244-30041467)
chr5 (14-236)||(40958617-40958840)
chr5 (14-236)||(25894649-25894873)
chr5 (7-236)||(2438793-2439022)
chr5 (14-234)||(42150817-42151039)
chr5 (14-236)||(12505765-12505996)
chr5 (14-236)||(29414669-29414892)
chr5 (14-231)||(33794091-33794309)
chr5 (14-231)||(9843348-9843566)
chr5 (14-231)||(2156125-2156341)
chr5 (125-227)||(19853484-19853588)
chr5 (165-231)||(12918955-12919021)
chr5 (124-231)||(30580195-30580304)
[»] chr6 (24 HSPs)
chr6 (14-236)||(13671817-13672040)
chr6 (7-236)||(27670086-27670316)
chr6 (14-236)||(31547894-31548117)
chr6 (14-236)||(32328493-32328716)
chr6 (14-236)||(34711557-34711780)
chr6 (14-236)||(9864760-9864984)
chr6 (14-236)||(1428423-1428646)
chr6 (14-236)||(4186684-4186907)
chr6 (14-236)||(11058150-11058373)
chr6 (17-236)||(21262574-21262795)
chr6 (14-236)||(4020235-4020459)
chr6 (14-236)||(4026661-4026885)
chr6 (14-236)||(34655249-34655473)
chr6 (14-236)||(34648798-34649022)
chr6 (14-236)||(4738323-4738547)
chr6 (24-236)||(7069702-7069916)
chr6 (7-169)||(29906882-29907045)
chr6 (7-169)||(30117335-30117498)
chr6 (14-141)||(7062578-7062707)
chr6 (174-236)||(7062516-7062578)
chr6 (97-236)||(1167480-1167626)
chr6 (38-231)||(10081567-10081762)
chr6 (199-236)||(29907044-29907081)
chr6 (199-236)||(30117299-30117336)
[»] chr2 (23 HSPs)
chr2 (14-236)||(21341882-21342105)
chr2 (17-236)||(2021448-2021668)
chr2 (14-236)||(21331994-21332217)
chr2 (14-236)||(42931372-42931595)
chr2 (14-236)||(16856487-16856709)
chr2 (14-236)||(16817330-16817552)
chr2 (14-236)||(36782184-36782408)
chr2 (14-236)||(12950795-12951018)
chr2 (14-236)||(34834812-34835035)
chr2 (14-236)||(34841256-34841479)
chr2 (14-236)||(29484925-29485149)
chr2 (14-236)||(45011981-45012205)
chr2 (13-236)||(2164026-2164250)
chr2 (14-236)||(15852548-15852772)
chr2 (14-236)||(43267857-43268081)
chr2 (14-236)||(2157611-2157834)
chr2 (14-236)||(13901957-13902180)
chr2 (14-236)||(21067958-21068181)
chr2 (87-236)||(45700644-45700793)
chr2 (7-231)||(41455598-41455823)
chr2 (124-231)||(17784443-17784552)
chr2 (112-236)||(11909950-11910076)
chr2 (124-231)||(17789096-17789205)
[»] chr4 (18 HSPs)
chr4 (14-236)||(55462772-55462995)
chr4 (7-236)||(16405334-16405568)
chr4 (14-236)||(16838359-16838581)
chr4 (14-236)||(27590304-27590527)
chr4 (13-236)||(41372984-41373209)
chr4 (14-235)||(37368315-37368538)
chr4 (14-236)||(13594105-13594330)
chr4 (14-236)||(7780406-7780629)
chr4 (14-236)||(8103880-8104104)
chr4 (14-236)||(30238259-30238482)
chr4 (14-236)||(17456853-17457077)
chr4 (19-236)||(36754791-36755017)
chr4 (7-236)||(30211536-30211758)
chr4 (89-236)||(5660549-5660696)
chr4 (7-84)||(13003940-13004017)
chr4 (14-231)||(2947844-2948062)
chr4 (14-84)||(48914898-48914969)
chr4 (14-46)||(5660743-5660775)
[»] chr8 (18 HSPs)
chr8 (14-236)||(12768743-12768966)
chr8 (14-236)||(11358193-11358417)
chr8 (14-236)||(7311348-7311571)
chr8 (14-236)||(8013320-8013543)
chr8 (14-236)||(36005482-36005705)
chr8 (13-236)||(36075965-36076189)
chr8 (14-236)||(36425730-36425954)
chr8 (14-236)||(6464576-6464799)
chr8 (20-236)||(15012393-15012610)
chr8 (14-236)||(36021799-36022023)
chr8 (14-236)||(41242116-41242339)
chr8 (14-236)||(1238212-1238436)
chr8 (14-236)||(16710668-16710892)
chr8 (7-236)||(31017391-31017608)
chr8 (97-236)||(26250591-26250730)
chr8 (44-236)||(45068416-45068609)
chr8 (14-231)||(7933931-7934150)
chr8 (14-67)||(14393733-14393786)
[»] chr3 (20 HSPs)
chr3 (14-236)||(4311486-4311709)
chr3 (14-236)||(32746369-32746592)
chr3 (7-236)||(10941304-10941534)
chr3 (14-236)||(6036265-6036488)
chr3 (14-236)||(24179072-24179296)
chr3 (13-236)||(9570548-9570774)
chr3 (14-236)||(27501967-27502191)
chr3 (14-236)||(13014985-13015208)
chr3 (13-236)||(9577050-9577276)
chr3 (14-236)||(25893229-25893458)
chr3 (14-236)||(43995068-43995300)
chr3 (14-236)||(43931581-43931799)
chr3 (13-236)||(23068462-23068686)
chr3 (14-140)||(41353860-41353987)
chr3 (7-226)||(20651135-20651362)
chr3 (7-164)||(41354142-41354300)
chr3 (13-80)||(3577095-3577162)
chr3 (13-231)||(4590792-4591012)
chr3 (7-47)||(20952953-20952993)
chr3 (174-231)||(2785865-2785922)
[»] scaffold0053 (1 HSPs)
scaffold0053 (7-236)||(49683-49912)
[»] scaffold0043 (1 HSPs)
scaffold0043 (14-236)||(5005-5228)
[»] scaffold0060 (1 HSPs)
scaffold0060 (7-236)||(15163-15393)
[»] scaffold0936 (1 HSPs)
scaffold0936 (14-236)||(3264-3486)
[»] scaffold0510 (2 HSPs)
scaffold0510 (14-236)||(8881-9105)
scaffold0510 (14-236)||(2560-2784)
[»] scaffold0513 (2 HSPs)
scaffold0513 (112-236)||(12031-12155)
scaffold0513 (14-78)||(11949-12014)
[»] scaffold0002 (1 HSPs)
scaffold0002 (14-120)||(99913-100020)
[»] scaffold0173 (1 HSPs)
scaffold0173 (7-84)||(24399-24476)


Alignment Details
Target: chr1 (Bit Score: 175; Significance: 4e-94; HSPs: 33)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 175; E-Value: 4e-94
Query Start/End: Original strand, 7 - 236
Target Start/End: Original strand, 44241349 - 44241579
Alignment:
Q  7 tatcatagaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaa-tgataaagttgcgattactat 105  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||| ||||| ||     
T  44241349 tatcacagaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgtttgaataactaagttgcaaatgatgaagttgagattaataa 44241448  T
Q  106 ggcgagaaacttgttagtattagcgttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatc 205  Q
    |||| |||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44241449 ggcgtgaaacttgttaggattagagttcattgatcaagcgtcacacgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatc 44241548  T
Q  206 cctcaacaacaccattcgtgtccaaacaata 236  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  44241549 cctcgacaacaccattcgtgtccaaacaata 44241579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 156; E-Value: 9e-83
Query Start/End: Original strand, 14 - 236
Target Start/End: Original strand, 29001730 - 29001953
Alignment:
Q  14 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaa-tgataaagttgcgattactatggcgaga 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||| || ||||  |    
T  29001730 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgtttgaataactaagttgcaaatgataaagttgagattaataaggcgtaa 29001829  T
Q  113 aacttgttagtattagcgttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaac 212  Q
    |||||||||| ||||| |||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  29001830 aacttgttaggattagagttccttggtcgagcgtcacacgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcgac 29001929  T
Q  213 aacaccattcgtgtccaaacaata 236  Q
    ||||| |||| |||||||| ||||    
T  29001930 aacactattcatgtccaaataata 29001953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 151; E-Value: 9e-80
Query Start/End: Original strand, 7 - 236
Target Start/End: Original strand, 9869097 - 9869327
Alignment:
Q  7 tatcatagaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaa-tgataaagttgcgattactat 105  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||| ||||| ||     
T  9869097 tatcataaaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaaagataattggtagtttgttttaatgactaagttgcaaatgataaaattgagattaataa 9869196  T
Q  106 ggcgagaaacttgttagtattagcgttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatc 205  Q
    || | |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  9869197 ggtgtgaaacttgttaggattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcatgtatc 9869296  T
Q  206 cctcaacaacaccattcgtgtccaaacaata 236  Q
    |||| |||||| | |||||||||||||||||    
T  9869297 cctcgacaacatctttcgtgtccaaacaata 9869327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 7 - 236
Target Start/End: Original strand, 31072310 - 31072540
Alignment:
Q  7 tatcatagaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgc-aatgataaagttgcgattactat 105  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||| ||| ||||| ||     
T  31072310 tatcacagaccgttcgacaccaaatatcattctaagctaaaagataatttgttgtttgttttagtaactaagttgcgaataataaaattgagattaataa 31072409  T
Q  106 ggcgagaaacttgttagtattagcgttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatc 205  Q
    |||  |||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  31072410 ggcatgaaacttgttaggattagagttccttaatcaagcgtcacacgtaacctaatgaccatacatggactctagcttttctttgatattatcatgtatc 31072509  T
Q  206 cctcaacaacaccattcgtgtccaaacaata 236  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  31072510 cctcgacaacaccattcgtgtccaaacaata 31072540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 7 - 236
Target Start/End: Original strand, 1174597 - 1174828
Alignment:
Q  7 tatcatagaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgtt-gtttgttttaataactaagttgcaatgataaa-gttgcgattacta 104  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||   |||| |||| || || ||    
T  1174597 tatcatggaccgttcgacaccaaatatcattctaagttgaaagataatttgtttgtttgttttagtaactaaattgcaaaagtaaaagttgagagtaata 1174696  T
Q  105 tggcgagaaacttgttagtattagcgttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtat 204  Q
     |||| |||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1174697 gggcgtgaaacttgttaggattagagttccttgagcaagcgtcacacgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtat 1174796  T
Q  205 ccctcaacaacaccattcgtgtccaaacaata 236  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  1174797 ccctcgacaacaccattcgtgtccaaacaata 1174828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 143; E-Value: 5e-75
Query Start/End: Original strand, 14 - 238
Target Start/End: Original strand, 4599527 - 4599753
Alignment:
Q  14 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgtt-gtttgttttaataactaagttgcaatgataaa-gttgcgattactatggcgag 111  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||   |||| |||| || || || ||||      
T  4599527 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaaagataatttgtttgtttgttttagtaactaaattgcaaaagtaaaagttgagagtaatagggcgta 4599626  T
Q  112 aaacttgttagtattagcgttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaa 211  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  4599627 aaacttgttaggattagagttccttgattaagcgtcacacgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcga 4599726  T
Q  212 caacaccattcgtgtccaaacaatact 238  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    
T  4599727 caacaccattcgtgtccaaacaatact 4599753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 14 - 236
Target Start/End: Original strand, 26621468 - 26621692
Alignment:
Q  14 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgtt-gtttgttttaataactaagttgcaatgataaa-gttgcgattactatggcgag 111  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||| || |||   |||| |||| || || || ||||      
T  26621468 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaaagataatttgtttgtttgttttagtaactaaatttcaaaagtaaaagttgagagtaatagggcgta 26621567  T
Q  112 aaacttgttagtattagcgttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaa 211  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  26621568 aaacttgttaggattagggttccttgattaagcgtcacacgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcga 26621667  T
Q  212 caacaccattcgtgtccaaacaata 236  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  26621668 caacaccattcgtgtccaaacaata 26621692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 136; E-Value: 8e-71
Query Start/End: Original strand, 14 - 236
Target Start/End: Original strand, 6238654 - 6238877
Alignment:
Q  14 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaa-tgataaagttgcgattactatggcgaga 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||  |||||||||||| ||||||  |||||| ||||||| ||| ||||| || ||||  |    
T  6238654 gaccgttcgacaccaaatatcatttcaagttaaacgatagttgattgtttgttttagtaactagattgcaaatgataaaattgagattaatagggcgtaa 6238753  T
Q  113 aacttgttagtattagcgttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaac 212  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  6238754 aacttgttaggattagagttccttgatcgagcgtcgcacgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcgac 6238853  T
Q  213 aacaccattcgtgtccaaacaata 236  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  6238854 aacaccattcgtgtccaaacaata 6238877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 136; E-Value: 8e-71
Query Start/End: Original strand, 14 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 39053561 - 39053338
Alignment:
Q  14 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaat-gataaagttgcgattactatggcgaga 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||  |||||||||||| ||||| | ||||||  |||||| ||| ||||| || |||| ||    
T  39053561 gaccgttcgacaccaaatatcatttcaagttaaacgatagttgattgtttgttttagtaactcatttgcaaacgataaaattgagattaatagggcgtga 39053462  T
Q  113 aacttgttagtattagcgttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaac 212  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  39053461 aacttgttaggattagagttccttgatcaagcgtcgcacgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcgac 39053362  T
Q  213 aacaccattcgtgtccaaacaata 236  Q
    ||||| ||||||||||||||||||    
T  39053361 aacactattcgtgtccaaacaata 39053338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 136; E-Value: 8e-71
Query Start/End: Original strand, 14 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 39059933 - 39059710
Alignment:
Q  14 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaat-gataaagttgcgattactatggcgaga 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||  |||||||||||| ||||| | ||||||  |||||| ||| ||||| || |||| ||    
T  39059933 gaccgttcgacaccaaatatcatttcaagttaaacgatagttgattgtttgttttagtaactcatttgcaaacgataaaattgagattaatagggcgtga 39059834  T
Q  113 aacttgttagtattagcgttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaac 212  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  39059833 aacttgttaggattagagttccttgatcaagcgtcgcacgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcgac 39059734  T
Q  213 aacaccattcgtgtccaaacaata 236  Q
    ||||| ||||||||||||||||||    
T  39059733 aacactattcgtgtccaaacaata 39059710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 136; E-Value: 8e-71
Query Start/End: Original strand, 14 - 236
Target Start/End: Original strand, 42091895 - 42092118
Alignment:
Q  14 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaa-tgataaagttgcgattactatggcgaga 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||  |||||||||||| ||||| | |||||| ||||||| ||| ||||| || ||||  |    
T  42091895 gaccgttcgacaccaaatatcatttcaagttaaacgatagttgattgtttgttttagtaactgaattgcaaatgataaaattgagattaatagggcgtaa 42091994  T
Q  113 aacttgttagtattagcgttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaac 212  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  42091995 aacttgttaggattagagttccttgatcgagcgtcgcacgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcgac 42092094  T
Q  213 aacaccattcgtgtccaaacaata 236  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  42092095 aacaccattcgtgtccaaacaata 42092118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 136; E-Value: 8e-71
Query Start/End: Original strand, 14 - 236
Target Start/End: Original strand, 45015780 - 45016003
Alignment:
Q  14 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaa-tgataaagttgcgattactatggcgaga 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||  |||||||||||| ||||| | |||||| ||||||| ||| ||||| || ||||  |    
T  45015780 gaccgttcgacaccaaatatcatttcaagttaaacgatagttgattgtttgttttagtaactgaattgcaaatgataaaattgagattaatagggcgtaa 45015879  T
Q  113 aacttgttagtattagcgttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaac 212  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  45015880 aacttgttaggattagagttccttgatcgagcgtcgcacgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcgac 45015979  T
Q  213 aacaccattcgtgtccaaacaata 236  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  45015980 aacaccattcgtgtccaaacaata 45016003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 14 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 41305738 - 41305514
Alignment:
Q  14 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgtt-gtttgttttaataactaagttgcaatgataaa-gttgcgattactatggcgag 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||   |||| |||| || || || ||||      
T  41305738 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagtttaaagataatttgtttgtttgttttagtaactaaattgcaaaagtaaaagttgagagtaatagggcgta 41305639  T
Q  112 aaacttgttagtattagcgttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaa 211  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  41305638 aaacttgttaggattagagttccttgattaagcgtcacacataacctaatgaccatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcga 41305539  T
Q  212 caacaccattcgtgtccaaacaata 236  Q
    ||||||||||| |||||||||||||    
T  41305538 caacaccattcatgtccaaacaata 41305514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 14 - 236
Target Start/End: Original strand, 44916329 - 44916560
Alignment:
Q  14 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagtt---------gcaatgataaagttgcgattacta 104  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||         | ||||||||||||| ||||| ||    
T  44916329 gaccattcgacaccaaatatcattctaaattaaaagatagtttgttgtttgttttaaaaactaagttaactatgttgaaatgataaagttgagattaata 44916428  T
Q  105 tggcgagaaacttgttagtattagcgttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtat 204  Q
     |||| |||||||||||| |||||  |||||| | ||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  44916429 aggcgtgaaacttgttaggattagaattccttaaccaaacgtcacacgtaacctaatgaccatacatggattctagcttttctttgatattatcatgtat 44916528  T
Q  205 ccctcaacaacaccattcgtgtccaaacaata 236  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  44916529 ccctcgacaacaccattcgtgtccaaacaata 44916560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 14 - 236
Target Start/End: Original strand, 41297515 - 41297739
Alignment:
Q  14 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgtt-gtttgttttaataactaagttgc-aatgataaagttgcgattactatggcgag 111  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||| |||||| |||||||||| ||||||| |||| || |  ||||||| || || || ||||      
T  41297515 gaccgttcgactccaaatatcattctaagttgaaagatagtttgtttgtttgttttagtaactaaattgctaaagtaaaagttgagagtaatagggcgta 41297614  T
Q  112 aaacttgttagtattagcgttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaa 211  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||||| | | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |    
T  41297615 aaacttgttaggattagagttccttgatcgatcctcacacgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacatatccctcga 41297714  T
Q  212 caacaccattcgtgtccaaacaata 236  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  41297715 caacaccattcgtgtccaaacaata 41297739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 14 - 236
Target Start/End: Original strand, 32797735 - 32797945
Alignment:
Q  14 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaatgataaagttgcgattactatggcg-aga 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||            || || || |||| | |    
T  32797735 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaa-gataatttgttgtttgttttagaaactaagttgcaa------------gagtaatagggcgtaaa 32797821  T
Q  113 aacttgttagtattagcgttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaac 212  Q
    |||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  32797822 aacttgttaggattagagttccttaatcaagcgtcacacgtaacctaatgaccatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcgac 32797921  T
Q  213 aacaccattcgtgtccaaacaata 236  Q
    ||||| ||||||||||||||||||    
T  32797922 aacacaattcgtgtccaaacaata 32797945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 111; E-Value: 6e-56
Query Start/End: Original strand, 19 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 11913479 - 11913262
Alignment:
Q  19 ttcgacaccaaatatcattctaagtt-aaacgataatttgtt-gtttgttttaataactaagttgc-aatgataaagttgcgattactatggcgagaaac 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||  ||||| |||||||| ||   ||||||||| ||| ||||| ||| ||||| || |||| |||||    
T  11913479 ttcgacaccaaatatcattctaagtttaaaagatagattgtttgtttgtttaaa---ctaagttgcgaataataaaattgagattaataaggcgtgaaac 11913383  T
Q  116 ttgttagtattagcgttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaacaac 215  Q
    ||||||| ||||| ||||||||| ||||| ||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  11913382 ttgttaggattagagttccttgaccaagcatcacatgtaacctaatgaccatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcgacaac 11913283  T
Q  216 accattcgtgtccaaacaata 236  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  11913282 accattcgtgtccaaacaata 11913262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 14 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 27240354 - 27240161
Alignment:
Q  14 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaac-gataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaat-gataaagttgcgattactatggcgag 111  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||  ||||||| ||||||||||||| ||||| | ||||||  |||||| ||| ||||| || |||| |    
T  27240354 gaccgttcgacaccaaataccattccaagttaaaaagataattggttgtttgttttagtaactcatttgcaaacgataaaattgagattaataaggcgtg 27240255  T
Q  112 aaacttgttagtattagcgttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatc 205  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27240254 aaacttgttaggattagagttccttgatcaagcgtcgcacgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatc 27240161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 14 - 236
Target Start/End: Original strand, 43686626 - 43686851
Alignment:
Q  14 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaac-gataatttgtt-gtttgttttaataactaagttgc-aatgataaagttgcgattactatggcga 110  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||  |||||| |||| |||||||||| ||||||| |||| ||||  ||||||| |||||  | ||||     
T  43686626 gaccgttcgacaccaaataccattccaagttaaaaagataatctgtttgtttgttttagtaactaaattgctaatgtaaaagttgagattaacagggcgt 43686725  T
Q  111 gaaacttgttagtattagcgttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctca 210  Q
     ||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||| ||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||     
T  43686726 aaaacttgttaggattagagttccttgatcgagcgtctcatttaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcatgtatccctcg 43686825  T
Q  211 acaacaccattcgtgtccaaacaata 236  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  43686826 acaacaccattcgtgtccaaacaata 43686851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 14 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 41299412 - 41299188
Alignment:
Q  14 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgtt-gtttgttttaataactaagttgcaatgataaa-gttgcgattactatggcgag 111  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||| ||||||| ||||||   |||| |||| || || || ||||      
T  41299412 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaaagataatttatttgtttgttttagtaactaaattgcaaaagtaaaagttgagagtaatagggcgta 41299313  T
Q  112 aaacttgttagtattagcgttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaa 211  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||  ||| ||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| |    
T  41299312 aaacttgttaggattagagttccttgattaagcgtcacatataacctaatgaccattcatggattcaagcttttctttgatattatcatgtatccctcga 41299213  T
Q  212 caacaccattcgtgtccaaacaata 236  Q
    ||||||||||| | |||||||||||    
T  41299212 caacaccattcttttccaaacaata 41299188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 15 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 1116206 - 1115982
Alignment:
Q  15 accgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaatgataaa-gttgcgattactatggcgagaa 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| | ||||||||||||||   |||| |||| || || || || | |||    
T  1116206 accgttcgacaccaaatatcattctaagttaaaagctaatttgttgtttgttt-agtaactaagttgcaagagtaaaagttgagagtaataaggtgtgaa 1116108  T
Q  114 acttgttagtattagcgttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaaca 213  Q
    |||| |||  ||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||    
T  1116107 acttcttatgattagagttccttaatcaagcgtcacacgtaacctaatgactatacatggattctaccttttctttgatattatcatgtatccctcgaca 1116008  T
Q  214 ac---accattcgtgtccaaacaata 236  Q
    ||   |||||| ||||||||||||||    
T  1116007 acactaccatttgtgtccaaacaata 1115982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 14 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 23764655 - 23764521
Alignment:
Q  14 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgc-aatgataaagttgcgattactatggcgaga 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| ||||| || ||||  |    
T  23764655 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgtttgaataactaagttgcaaatgataaagttgagattaatagggcgtaa 23764556  T
Q  113 aacttgttagtattagcgttccttgatcaagcgtc 147  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  23764555 aacttgttaggattagagttccttgatcaagcgtc 23764521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 14 - 172
Target Start/End: Complemental strand, 5445186 - 5445028
Alignment:
Q  14 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaatgataaa-gttgcgattactatggcgaga 112  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||   |||| |||| ||||| || || | ||    
T  5445186 gaccgttcgacaccaactatcattctaagttaaa-gataatttgttgtttgttttagtaactaagttgcaagagtaaaagttgagattaataaggtgtga 5445088  T
Q  113 aacttgttagtattagcgttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatg 172  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||| ||| ||||||| ||||||||    
T  5445087 aacttgttaggattagagttccttgatcaagcctcacacataacctaatgaccatacatg 5445028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 157 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 23762415 - 23762336
Alignment:
Q  157 ctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaacaacaccattcgtgtccaaacaata 236  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  23762415 ctaatgaccatacatggattctagcttttctttgatattatcatgtatccctcgacaacactattcgtgtccaaacaata 23762336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 14 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 28413897 - 28413678
Alignment:
Q  14 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgc-aatgataaagttgcgattactatggcg-ag 111  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||| || |  ||||||| || || || |||| |     
T  28413897 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaaagataatttgttgtttgttttagtaaccaagttgcaaaagtaaaagttgagagtaataaggcgtaa 28413798  T
Q  112 aaacttgttagtattagcgttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgat--catacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctc 209  Q
    ||||  ||| | ||||| |||||||||| |||||||| || ||| ||||| ||  |||| |||||||||||| |||     ||||||||||||||| |||    
T  28413797 aaac--gttggaattagagttccttgattaagcgtcaaacataacctaataatcacatatatggattctagcattttaccaatattatcacgtatcgctc 28413700  T
Q  210 aacaacaccattcgtgtccaaa 231  Q
    ||||| |  |||||||||||||    
T  28413699 aacaagattattcgtgtccaaa 28413678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 14 - 79
Target Start/End: Complemental strand, 2825042 - 2824977
Alignment:
Q  14 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagt 79  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||| ||||    
T  2825042 gaccattcgacaccaaatatcattctaagttaaaagataatatgttgtttgttttagtaaccaagt 2824977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 14 - 84
Target Start/End: Complemental strand, 38672991 - 38672920
Alignment:
Q  14 gaccgttcgacaccaaatatcattctaag-ttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaa 84  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||| ||||||  |||||||||||||    
T  38672991 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagtttgaaagataatttgttgttcgttttagaaactaagttgcaa 38672920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 15 - 231
Target Start/End: Original strand, 39806057 - 39806274
Alignment:
Q  15 accgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaa-tgataaagttgcgattactatggcg-aga 112  Q
    |||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||  |||||||||||||  |  ||| ||| || || || |||| | |    
T  39806057 accgtttgacaccaaatatcattttaagttaaa-gataatttgttgttcgttttagaaactaagttgcaagagtaaaaattgagagtaataaggcgtaaa 39806155  T
Q  113 aacttgttagtattagcgttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgat--catacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctca 210  Q
    |||  ||| | ||||| |||||||||| |||||||| || ||| ||||| ||  |||| |||||||| ||| |||    |||||||||||||||| ||||    
T  39806156 aac--gttggaattagagttccttgattaagcgtcaaacataacctaataatcacatatatggattccagcgttttaccgatattatcacgtatcgctca 39806253  T
Q  211 acaacaccattcgtgtccaaa 231  Q
    |||| |  |||||||||||||    
T  39806254 acaagattattcgtgtccaaa 39806274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 112 - 227
Target Start/End: Original strand, 47646766 - 47646883
Alignment:
Q  112 aaacttgttagtattagcgttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacat--ggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctc 209  Q
    ||||||||||  ||||| |||| |||| ||||  |||||  ||| |||||||||| | ||  ||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||    
T  47646766 aaacttgttatgattagagttcgttgaccaagaatcacatataacctaatgatcacatatacggattctagcttttaatcgatattatcacgtatccctc 47646865  T
Q  210 aacaacaccattcgtgtc 227  Q
     |||||| ||||| ||||    
T  47646866 gacaacatcattcatgtc 47646883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 124 - 230
Target Start/End: Original strand, 23251460 - 23251568
Alignment:
Q  124 attagcgttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatc--atacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaacaacaccatt 221  Q
    ||||| |||||||||| |||||||| || ||| ||||| |||  ||| |||||||||||| |||    |||||||||||||||| |||||||| |  |||    
T  23251460 attagagttccttgattaagcgtcaaacataacctaataatcgcatatatggattctagcgttttaccgatattatcacgtatcgctcaacaagattatt 23251559  T
Q  222 cgtgtccaa 230  Q
    |||||||||    
T  23251560 cgtgtccaa 23251568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 124 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 5357861 - 5357752
Alignment:
Q  124 attagcgttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatca--tacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaacaacaccatt 221  Q
    ||||| |||||||||| |||||||| || ||| ||||| ||||  || |||||||||||| |||     ||||||||||||||| |||||||| |  |||    
T  5357861 attagagttccttgattaagcgtcaaacataacctaataatcacatatatggattctagcattttcccaatattatcacgtatcgctcaacaagattatt 5357762  T
Q  222 cgtgtccaaa 231  Q
    ||||||||||    
T  5357761 cgtgtccaaa 5357752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 14 - 47
Target Start/End: Original strand, 23251342 - 23251375
Alignment:
Q  14 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaa 47  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  23251342 gaccgttcgacaccaaatatcattcgaagttaaa 23251375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 188 - 232
Target Start/End: Original strand, 9316137 - 9316181
Alignment:
Q  188 ttgatattatcacgtatccctcaacaacaccattcgtgtccaaac 232  Q
    ||||||||||||| |||  |||||||||| |||||||||||||||    
T  9316137 ttgatattatcacatattgctcaacaacatcattcgtgtccaaac 9316181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 167; Significance: 2e-89; HSPs: 35)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 7 - 236
Target Start/End: Original strand, 37026040 - 37026270
Alignment:
Q  7 tatcatagaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaa-tgataaagttgcgattactat 105  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| || ||||||||||| ||||| ||     
T  37026040 tatcacagaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgtttgactaactaagttgtaaatgataaagttgagattaataa 37026139  T
Q  106 ggcgagaaacttgttagtattagcgttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatc 205  Q
    |||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  37026140 ggcgtgaaacttgttaggattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaacctaatgatcatacattgattctagtttttctttgatattatcacgtatc 37026239  T
Q  206 cctcaacaacaccattcgtgtccaaacaata 236  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  37026240 cctcgacaacaccattcgtgtccaaacaata 37026270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 160; E-Value: 4e-85
Query Start/End: Original strand, 14 - 236
Target Start/End: Original strand, 26601911 - 26602134
Alignment:
Q  14 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaa-tgataaagttgcgattactatggcgaga 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||| || ||||  |    
T  26601911 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgtttgaataactaagttgcaaatgataaagttgagattaatagggcgtaa 26602010  T
Q  113 aacttgttagtattagcgttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaac 212  Q
    |||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  26602011 aacttgttaggattagaattccttgatcaagcgtcacacataacctaatgaacatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcgac 26602110  T
Q  213 aacaccattcgtgtccaaacaata 236  Q
    ||||| ||||||||||||||||||    
T  26602111 aacactattcgtgtccaaacaata 26602134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 156; E-Value: 9e-83
Query Start/End: Original strand, 14 - 236
Target Start/End: Original strand, 15914637 - 15914860
Alignment:
Q  14 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaa-tgataaagttgcgattactatggcgaga 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||| || ||||  |    
T  15914637 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgtttgaataactaagttgcaaatgataaagttgagattaatagggcgtaa 15914736  T
Q  113 aacttgttagtattagcgttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaac 212  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||    
T  15914737 aacttgttaggattagagttccttgatcaagcgtcgcacataacctaatgaccatacatggattctagcttttctttgatattatcacatatccctcgac 15914836  T
Q  213 aacaccattcgtgtccaaacaata 236  Q
    ||||| ||||||||||||||||||    
T  15914837 aacactattcgtgtccaaacaata 15914860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 14 - 236
Target Start/End: Original strand, 15949158 - 15949381
Alignment:
Q  14 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaa-tgataaagttgcgattactatggcgaga 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||| || ||||  |    
T  15949158 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgtttgaataactaagttgcaaatgataaagttgagattaatagggcgtaa 15949257  T
Q  113 aacttgttagtattagcgttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaac 212  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||  ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||    
T  15949258 aacttgttaggattagagttccttgatcaagcgtcgcatataacctaatgaccatacatggattctagcttttctttgatattatcacatatccctcgac 15949357  T
Q  213 aacaccattcgtgtccaaacaata 236  Q
    ||||| ||||||||||||||||||    
T  15949358 aacactattcgtgtccaaacaata 15949381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 151; E-Value: 9e-80
Query Start/End: Original strand, 14 - 236
Target Start/End: Original strand, 39432907 - 39433129
Alignment:
Q  14 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaatgataaagttgcgattactatggcgagaa 113  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||   ||||||||||||| ||||| || || | |||    
T  39432907 gaccgttcgacaacaaatatcattctaagttaaaagataatttgttgtttgttttagtaaccaagtgcaaatgataaagttgagattaataaggtgtgaa 39433006  T
Q  114 acttgttagtattagcgttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaaca 213  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  39433007 acttgttaggattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaacctaatgatcatacatgaattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcgaca 39433106  T
Q  214 acaccattcgtgtccaaacaata 236  Q
    || ||||||||||||||||||||    
T  39433107 acgccattcgtgtccaaacaata 39433129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 148; E-Value: 5e-78
Query Start/End: Original strand, 14 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 3924316 - 3924093
Alignment:
Q  14 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaa-tgataaagttgcgattactatggcgaga 112  Q
    |||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||| ||| ||||| || ||||  |    
T  3924316 gaccgttcgataccaaatatcattccaagttaaaagataattggttgtttgttttagtaactaaattgcaaatgataaaattgagattaatagggcgtaa 3924217  T
Q  113 aacttgttagtattagcgttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaac 212  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  3924216 aacttgttaggattagagttccttgatcgagcgtcacacgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcgac 3924117  T
Q  213 aacaccattcgtgtccaaacaata 236  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  3924116 aacaccattcgtgtccaaacaata 3924093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 148; E-Value: 5e-78
Query Start/End: Original strand, 14 - 236
Target Start/End: Original strand, 36875544 - 36875767
Alignment:
Q  14 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaa-tgataaagttgcgattactatggcgaga 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||| ||| ||||| || ||||  |    
T  36875544 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaaagataattggttgtttgttttagtaactaaattgcaaatgataaaattgagattaatagggcgtaa 36875643  T
Q  113 aacttgttagtattagcgttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaac 212  Q
    |||||||||| ||| | ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  36875644 aacttgttaggattggagttccttgatcgagcgtcacacgtaacctaatgatcatatatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcgac 36875743  T
Q  213 aacaccattcgtgtccaaacaata 236  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  36875744 aacaccattcgtgtccaaacaata 36875767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 14 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 5050135 - 5049912
Alignment:
Q  14 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaa-tgataaagttgcgattactatggcgaga 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||  |||||||||||| ||||| | |||||| ||||||| ||| ||||| || ||||  |    
T  5050135 gaccgttcgacaccaaatatcattccaagttaaacgatagttgattgtttgttttagtaactgaattgcaaatgataaaattgagattaatagggcgtaa 5050036  T
Q  113 aacttgttagtattagcgttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaac 212  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  5050035 aacttgttaggattagagttccttgatcgagcgtcgcacgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcgac 5049936  T
Q  213 aacaccattcgtgtccaaacaata 236  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  5049935 aacaccattcgtgtccaaacaata 5049912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 14 - 236
Target Start/End: Original strand, 14287714 - 14287937
Alignment:
Q  14 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaa-tgataaagttgcgattactatggcgaga 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||| ||| ||||| || ||||  |    
T  14287714 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaaagataattggttgtttgttttagtaactaaattgcaaatgataaaattgagattaatagggcgtaa 14287813  T
Q  113 aacttgttagtattagcgttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaac 212  Q
    | |||||||| ||||| ||||||||||| | |||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  14287814 atcttgttaggattagagttccttgatcgaacgtcgcacgtaccctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcgac 14287913  T
Q  213 aacaccattcgtgtccaaacaata 236  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  14287914 aacaccattcgtgtccaaacaata 14287937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 15 - 236
Target Start/End: Original strand, 14298900 - 14299122
Alignment:
Q  15 accgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaa-tgataaagttgcgattactatggcgagaa 113  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||| ||| ||||| || ||||  ||    
T  14298900 accgtttgacaccaaatatcattctaagttaaaagataattggttgtttgttttagtaactaaattgcaaatgataaaattgagattaatagggcgtaaa 14298999  T
Q  114 acttgttagtattagcgttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaaca 213  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||| | |||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  14299000 acttgttaggattagagttccttgatcgaacgtcgcacgtaccctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcgaca 14299099  T
Q  214 acaccattcgtgtccaaacaata 236  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  14299100 acaccattcgtgtccaaacaata 14299122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 136; E-Value: 8e-71
Query Start/End: Original strand, 14 - 236
Target Start/End: Original strand, 6795437 - 6795660
Alignment:
Q  14 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaa-tgataaagttgcgattactatggcgaga 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||  |||||||||||| ||||| | |||||| ||||||| ||| ||||| || ||||  |    
T  6795437 gaccgttcgacaccaaatatcatttcaagttaaacgatagttgattgtttgttttagtaactgaattgcaaatgataaaattgagattaatagggcgtaa 6795536  T
Q  113 aacttgttagtattagcgttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaac 212  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  6795537 aacttgttaggattagagttccttgatcgagcgtcgcacgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcgac 6795636  T
Q  213 aacaccattcgtgtccaaacaata 236  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  6795637 aacaccattcgtgtccaaacaata 6795660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 136; E-Value: 8e-71
Query Start/End: Original strand, 14 - 236
Target Start/End: Original strand, 23612388 - 23612611
Alignment:
Q  14 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaa-tgataaagttgcgattactatggcgaga 112  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||| || ||| ||||||| ||| ||||| || ||||  |    
T  23612388 gaccgttcgacacgaaatatcattccaagttaaaagataattggttgtttgttttagtaactaaattacaaatgataaaattgagattaatagggcgtaa 23612487  T
Q  113 aacttgttagtattagcgttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaac 212  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  23612488 aacttgttaggattagagttccttgatcaagcgtcacacataacctaatgaccatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcgac 23612587  T
Q  213 aacaccattcgtgtccaaacaata 236  Q
    ||||| ||||||||||||||||||    
T  23612588 aacactattcgtgtccaaacaata 23612611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 14 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 9643141 - 9642916
Alignment:
Q  14 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaac-gataatttgtt-gtttgttttaataactaagttgc-aatgataaagttgcgattactatggcga 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||| |||||||||| ||||||| |||| ||||  ||||||| |||||  | ||||     
T  9643141 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaaaagataatatgtttgtttgttttagtaactaaattgctaatgtaaaagttgagattaacagggcgt 9643042  T
Q  111 gaaacttgttagtattagcgttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctca 210  Q
     ||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  9643041 aaaacttgttaggattagagttccttgatcgagcgtcacacgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcg 9642942  T
Q  211 acaacaccattcgtgtccaaacaata 236  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  9642941 acaacaccattcgtgtccaaacaata 9642916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 133; E-Value: 5e-69
Query Start/End: Original strand, 14 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 1948857 - 1948633
Alignment:
Q  14 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgtt-gtttgttttaataactaagttgcaat-gataaagttgcgattactatggcgag 111  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||  |||||||||| ||||| || |||| |    
T  1948857 gaccgttcaacaccaaatatcattctaagttaaaagataatttgtttgtttgttttagtaactaaattgcaaaagataaagttgagattaatagggcgtg 1948758  T
Q  112 aaacttgttagtattagcgttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaa 211  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| |    
T  1948757 aaacttgttaggattagagttccttaatcaagcgtcacacataacctaatgaccatacatggattctagattttctttgagattatcacgtatccctcga 1948658  T
Q  212 caacaccattcgtgtccaaacaata 236  Q
    |||||| ||||||||||||||||||    
T  1948657 caacactattcgtgtccaaacaata 1948633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 133; E-Value: 5e-69
Query Start/End: Original strand, 14 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 6021088 - 6020864
Alignment:
Q  14 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaac-gataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaat-gataaagttgcgattactatggcgag 111  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||  ||||||| ||||||||||||| ||||| | ||||||  |||||| ||| ||||| || |||| |    
T  6021088 gaccgttcgacaccaaataccattccaagttaaaaagataattggttgtttgttttagtaactcaattgcaaacgataaaattgagattaatagggcgtg 6020989  T
Q  112 aaacttgttagtattagcgttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaa 211  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |    
T  6020988 aaacttgttaggattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacatatccctcga 6020889  T
Q  212 caacaccattcgtgtccaaacaata 236  Q
    |||||| ||||||||||||||||||    
T  6020888 caacactattcgtgtccaaacaata 6020864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 133; E-Value: 5e-69
Query Start/End: Original strand, 14 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 8185616 - 8185392
Alignment:
Q  14 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagtt-aaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaat-gataaagttgcgattactatggcgag 111  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||| ||||||| ||||||||||||| ||||| | ||||||  |||||| ||| ||||| || |||| |    
T  8185616 gaccgttcgacaccaaataccattccaagttgaaaagataattggttgtttgttttagtaactcatttgcaaacgataaaattgagattaatagggcgtg 8185517  T
Q  112 aaacttgttagtattagcgttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaa 211  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  8185516 aaacttgttaggattagagttccttgatcaagcgtcgcacgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcga 8185417  T
Q  212 caacaccattcgtgtccaaacaata 236  Q
    |||||| ||||||||||||||||||    
T  8185416 caacactattcgtgtccaaacaata 8185392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 133; E-Value: 5e-69
Query Start/End: Original strand, 14 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 8193176 - 8192952
Alignment:
Q  14 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagtt-aaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaat-gataaagttgcgattactatggcgag 111  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||| ||||||| ||||||||||||| ||||| | ||||||  |||||| ||| ||||| || |||| |    
T  8193176 gaccgttcgacaccaaataccattccaagttgaaaagataattggttgtttgttttagtaactcatttgcaaacgataaaattgagattaatagggcgtg 8193077  T
Q  112 aaacttgttagtattagcgttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaa 211  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  8193076 aaacttgttaggattagagttccttgatcaagcgtcgcacgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcga 8192977  T
Q  212 caacaccattcgtgtccaaacaata 236  Q
    |||||| ||||||||||||||||||    
T  8192976 caacactattcgtgtccaaacaata 8192952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 133; E-Value: 5e-69
Query Start/End: Original strand, 7 - 233
Target Start/End: Original strand, 45433577 - 45433805
Alignment:
Q  7 tatcatagaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaatgataaa-gttgcgattactat 105  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||   |||| |||| || || ||     
T  45433577 tatcacagaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaaagataatttgttgtttgttttagtaactaagtttcaagagtaaaagttgagagtaataa 45433676  T
Q  106 ggcg-agaaacttgttagtattagcgttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtat 204  Q
    |||| | ||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  45433677 ggcgtaaaaacttgttaggattagagttccttaatcaagcgtcacacgtaacctaatgaccatacatggattctagattttctttgatattatcatgtat 45433776  T
Q  205 ccctcaacaacaccattcgtgtccaaaca 233  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  45433777 ccctcgacaacaccattcgtgtccaaaca 45433805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 133; E-Value: 5e-69
Query Start/End: Original strand, 14 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 48353704 - 48353480
Alignment:
Q  14 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagtt-aaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaat-gataaagttgcgattactatggcgag 111  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||| ||||||| ||||||||||||| ||||| | ||||||  |||||| ||| ||||| || |||| |    
T  48353704 gaccgttcgacaccaaataccattccaagttgaaaagataattggttgtttgttttagtaactcatttgcaaacgataaaattgagattaatagggcgtg 48353605  T
Q  112 aaacttgttagtattagcgttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaa 211  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  48353604 aaacttgttaggattagagttccttgatcaagcgtcgcacgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcga 48353505  T
Q  212 caacaccattcgtgtccaaacaata 236  Q
    |||||| ||||||||||||||||||    
T  48353504 caacactattcgtgtccaaacaata 48353480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 14 - 236
Target Start/End: Original strand, 2446645 - 2446868
Alignment:
Q  14 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaa-tgataaagttgcgattactatggcgaga 112  Q
    |||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||  |||||||||||| ||||| | |||||| ||||||| ||| ||||| || ||||  |    
T  2446645 gaccattcgacaccaaatatcatttcaagttaaacgatagttgattgtttgttttagtaactgaattgcaaatgataaaattgagattaatagggcgtaa 2446744  T
Q  113 aacttgttagtattagcgttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaac 212  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  2446745 aacttgttaggattagagttccttgatcgagcgtcgcacgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcgac 2446844  T
Q  213 aacaccattcgtgtccaaacaata 236  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  2446845 aacaccattcgtgtccaaacaata 2446868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 32 - 236
Target Start/End: Original strand, 21642535 - 21642740
Alignment:
Q  32 atcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaa-tgataaagttgcgattactatggcgagaaacttgttagtattagcg 130  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||| ||| ||||| || |||| |||||||||||| ||||| |    
T  21642535 atcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttagtaactaaattgcaaatgataaaattgagattaatagggcgtgaaacttgttaggattagag 21642634  T
Q  131 ttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaacaacaccattcgtgtccaa 230  Q
    |||||||||||||| |||||| ||| ||||||| || ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  21642635 ttccttgatcaagcatcacacataacctaatgaacaaacatggattctagcttttcattgatattatcacgtatccctcgacaacactattcgtgtccaa 21642734  T
Q  231 acaata 236  Q
    ||||||    
T  21642735 acaata 21642740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 14 - 236
Target Start/End: Original strand, 19089806 - 19090030
Alignment:
Q  14 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgtt-gtttgttttaataactaagttgcaatgataaa-gttgcgattactatggcgag 111  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||   |||| |||| || || || ||||      
T  19089806 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaaagataatttgtttgtttgttttagtaactaaattgcaaaagtaaaagttgagagtaatagggcgta 19089905  T
Q  112 aaacttgttagtattagcgttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaa 211  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  19089906 aaacttgttaggattagagttccttgatcaagcgtcacacataacctaatgaccatacatggattctaacttttctttgatattatcacgtatccctcga 19090005  T
Q  212 caacaccattcgtgtccaaacaata 236  Q
    |||||| ||||||||||||||||||    
T  19090006 caacactattcgtgtccaaacaata 19090030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 14 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 48347320 - 48347096
Alignment:
Q  14 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagtt-aaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaat-gataaagttgcgattactatggcgag 111  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||| ||||||| ||||||||||||| ||||| | ||||||  |||||| ||| ||||| || |||  |    
T  48347320 gaccgttcgacaccaaataccattccaagttgaaaagataattggttgtttgttttagtaactcatttgcaaacgataaaattgagattaatagggcatg 48347221  T
Q  112 aaacttgttagtattagcgttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaa 211  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  48347220 aaacttgttaggattagagttccttgatcaagcgtcgcacgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcga 48347121  T
Q  212 caacaccattcgtgtccaaacaata 236  Q
    |||||| ||||||||||||||||||    
T  48347120 caacactattcgtgtccaaacaata 48347096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 15 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 33850865 - 33850643
Alignment:
Q  15 accgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaatgataaa-gttgcgattactatggcgagaa 113  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||| |||| || || || ||||  ||    
T  33850865 accgtttgacaccaaatatcattctaagttaaaagtcaatttgttgtttgttttagtaactaagttgcaatagtaaaagttgagagtagtaaggcgttaa 33850766  T
Q  114 acttgttagtattagcgttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaaca 213  Q
    ||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||    
T  33850765 acttgttaggattagagttccttaatcaagcgtcacacgtaacctaatgactatacatgtattctagcttttctttgatattatcatgtatccctcgaca 33850666  T
Q  214 acaccattcgtgtccaaacaata 236  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  33850665 acaccattcgtgtccaaacaata 33850643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 14 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 5056531 - 5056307
Alignment:
Q  14 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgtt-gtttgttttaataactaagttgcaa-tgataaagttgcgattactatggcgag 111  Q
    |||||||||||||||| |||||||  |||| ||| ||||| ||||| |||||||||| ||||| | |||||| ||||||| ||| ||||| || ||||      
T  5056531 gaccgttcgacaccaattatcatttcaagtaaaaagataagttgtttgtttgttttagtaactgaattgcaaatgataaaattgagattaatagggcgta 5056432  T
Q  112 aaacttgttagtattagcgttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaa 211  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  5056431 aaacttgttaggattagagttccttgatcgagcgtcgcacgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcga 5056332  T
Q  212 caacaccattcgtgtccaaacaata 236  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  5056331 caacaccattcgtgtccaaacaata 5056307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 14 - 236
Target Start/End: Original strand, 1378946 - 1379169
Alignment:
Q  14 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaa-tgataaagttgcgattactatggcgaga 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||  |||||||||||| ||||| | |||||| ||||| | ||| ||||| || ||||  |    
T  1378946 gaccgttcgacaccaaatatcatttcaagttaaacgatagttgattgtttgttttagtaactgaattgcaaatgatacaattgagattaatagggcgtaa 1379045  T
Q  113 aacttgttagtattagcgttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaac 212  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||| |||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||    
T  1379046 aacttgttaggattagagttccttgatcgagcgtcgcacgtaacctaatgagcatacatggattctagcttgtctttgatattatcacgtatccctcgac 1379145  T
Q  213 aacaccattcgtgtccaaacaata 236  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  1379146 aacaccattcgtgtccaaacaata 1379169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 14 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 8142669 - 8142446
Alignment:
Q  14 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaa-tgataaagttgcgattactatggcgaga 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||  |||||||||||| ||||| | || ||| ||||| | ||| ||||| || ||||  |    
T  8142669 gaccgttcgacaccaaatatcatttcaagttaaacgatagttgattgtttgttttagtaactgaattacaaatgatacaattgagattaatagggcgtaa 8142570  T
Q  113 aacttgttagtattagcgttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaac 212  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||| |||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||    
T  8142569 aacttgttaggattagagttccttgatcgagcgtcgcacgtaacctaatgagcatacatggattctagcttgtctttgatattatcacgtatccctcgac 8142470  T
Q  213 aacaccattcgtgtccaaacaata 236  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  8142469 aacaccattcgtgtccaaacaata 8142446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 234 - 379
Target Start/End: Original strand, 42422112 - 42422257
Alignment:
Q  234 atactataacttttaagattgacatttactttgtagaccaccaaggagtgataagcgttgtgttttatatataaacttcctctctattgtttaaaagctc 333  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||| ||| ||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42422112 atactataacttttaagattgccatttgctttgtaggccactaagaagtgataagcgctgcattttatatataaacttcctctctattgtttaaaagctc 42422211  T
Q  334 ccgatgttggactattttcaaagcagcacaagagctacatgctctc 379  Q
    ||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  42422212 ccgatgttggaatattttcacaacagcacaagagctacatgctctc 42422257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 162 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 13774204 - 13774130
Alignment:
Q  162 gatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaacaacaccattcgtgtccaaacaata 236  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  13774204 gatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcgacaacatcattcgtgtccaaacaata 13774130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 14 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 10831349 - 10831130
Alignment:
Q  14 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgc-aatgataaagttgcgattactatggcg-ag 111  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||| || |  ||||||| || || || |||| |     
T  10831349 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaaagataatttgttgtttgttttagtaaccaagttgcaaaagtaaaagttgagagtaataaggcgtaa 10831250  T
Q  112 aaacttgttagtattagcgttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgat--catacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctc 209  Q
    ||||  ||| | ||||| |||||||||| |||||||| || ||| ||||| ||  |||| |||||||||||  |||    |||||||||||||||| |||    
T  10831249 aaac--gttggaattagagttccttgattaagcgtcaaacataacctaataatcacatatatggattctagagttttaccgatattatcacgtatcgctc 10831152  T
Q  210 aacaacaccattcgtgtccaaa 231  Q
    ||||| |  |||| ||||||||    
T  10831151 aacaagattattcatgtccaaa 10831130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 14 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 11025141 - 11024922
Alignment:
Q  14 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgc-aatgataaagttgcgattactatggcg-ag 111  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||| || |  ||||||| || || || |||| |     
T  11025141 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaaagataatttgttgtttgttttagtaaccaagttgcaaaagtaaaagttgagagtaataaggcgtaa 11025042  T
Q  112 aaacttgttagtattagcgttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgat--catacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctc 209  Q
    ||||  ||| | ||||| |||||||||| |||||||| || ||| ||||| ||  |||| |||||||||||  |||    |||||||||||||||| |||    
T  11025041 aaac--gttggaattagagttccttgattaagcgtcaaacataacctaataatcacatatatggattctagagttttaccgatattatcacgtatcgctc 11024944  T
Q  210 aacaacaccattcgtgtccaaa 231  Q
    ||||| |  |||| ||||||||    
T  11024943 aacaagattattcatgtccaaa 11024922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 14 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 21901413 - 21901193
Alignment:
Q  14 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttg-ttgtttgttttaataactaagttgc-aatgataaagttgcgattactatggcg-a 110  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||| ||||||| || | || |  ||||||| || || || |||| |    
T  21901413 gaccgttcgacaccatatatcattctaagttgaaagataatttgtttgtttgttttagtaactaaatttcaaaagtaaaagttgagagtaatagggcgta 21901314  T
Q  111 gaaacttgttagtattagcgttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgat--catacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccct 208  Q
     ||||  ||||| || || |||||||||| |||||||| || ||||||||| ||  |||| |||||||||||| |||    |||||||||||||||| ||    
T  21901313 aaaac--gttagaatcagagttccttgattaagcgtcaaacataatctaataatcacatatatggattctagcgttttaccgatattatcacgtatcgct 21901216  T
Q  209 caacaacaccattcgtgtccaaa 231  Q
    |||||| |  |||||||||||||    
T  21901215 caacaagattattcgtgtccaaa 21901193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 13 - 65
Target Start/End: Original strand, 1942043 - 1942095
Alignment:
Q  13 agaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgt 65  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  1942043 agaccgttcgacaccaaatatcattataagttaaacgataatttgttgtttgt 1942095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 170 - 231
Target Start/End: Original strand, 27954243 - 27954303
Alignment:
Q  170 atggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaacaacaccattcgtgtccaaa 231  Q
    ||||||||||||||| ||  ||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  27954243 atggattctagctttactc-gatattatcacatattcctcaacaacatcattcgtgtccaaa 27954303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 188 - 231
Target Start/End: Original strand, 28442628 - 28442671
Alignment:
Q  188 ttgatattatcacgtatccctcaacaacaccattcgtgtccaaa 231  Q
    ||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  28442628 ttgatattatcacatatcgctcaacaacatcattcgtgtccaaa 28442671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0343 (Bit Score: 165; Significance: 4e-88; HSPs: 1)
Name: scaffold0343
Description:

Target: scaffold0343; HSP #1
Raw Score: 165; E-Value: 4e-88
Query Start/End: Original strand, 13 - 236
Target Start/End: Original strand, 2643 - 2867
Alignment:
Q  13 agaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaa-tgataaagttgcgattactatggcgag 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| || |||| |    
T  2643 agaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgtttgaataactaagctgcaaatgataaagttgagattaataaggcgtg 2742  T
Q  112 aaacttgttagtattagcgttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaa 211  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| |    
T  2743 aaacttgttaggattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaacctaatgatcatacatggattatagcttttctttgatattatcatgtatccctcga 2842  T
Q  212 caacaccattcgtgtccaaacaata 236  Q
    ||||||||||||| |||||||||||    
T  2843 caacaccattcgtatccaaacaata 2867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 164; Significance: 2e-87; HSPs: 22)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 164; E-Value: 2e-87
Query Start/End: Original strand, 14 - 236
Target Start/End: Original strand, 22359963 - 22360186
Alignment:
Q  14 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaa-tgataaagttgcgattactatggcgaga 112  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||| || ||||  |    
T  22359963 gaccgttcgacaccaaatattattctaagttaaacgataatttgttgtttgtttgaataactaagttgcaaatgataaagttgagattaatagggcgtaa 22360062  T
Q  113 aacttgttagtattagcgttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaac 212  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  22360063 aacttgttaggattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaacctaatgaccatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcgac 22360162  T
Q  213 aacaccattcgtgtccaaacaata 236  Q
    ||||| ||||||||||||||||||    
T  22360163 aacactattcgtgtccaaacaata 22360186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 160; E-Value: 4e-85
Query Start/End: Original strand, 14 - 236
Target Start/End: Original strand, 22313829 - 22314052
Alignment:
Q  14 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaa-tgataaagttgcgattactatggcgaga 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||| || ||||  |    
T  22313829 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttatttgtttgaataactaagttgcaaatgataaagttgagattaatagggcgtaa 22313928  T
Q  113 aacttgttagtattagcgttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaac 212  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  22313929 aacttgttaggattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaacctaatgaccgtacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcgac 22314028  T
Q  213 aacaccattcgtgtccaaacaata 236  Q
    ||||| ||||||||||||||||||    
T  22314029 aacactattcgtgtccaaacaata 22314052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 15 - 236
Target Start/End: Original strand, 4973563 - 4973785
Alignment:
Q  15 accgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaa-tgataaagttgcgattactatggcgagaa 113  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||| || || | |||    
T  4973563 accgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaaatgataaaattgagattaataaggggtgaa 4973662  T
Q  114 acttgttagtattagcgttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaaca 213  Q
    ||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||    
T  4973663 acttgttaggatcagagttccttgatcaagcgtcacacgtaacataatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacatatccctcgaca 4973762  T
Q  214 acaccattcgtgtccaaacaata 236  Q
    ||| |||||||||||||||||||    
T  4973763 acatcattcgtgtccaaacaata 4973785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 151; E-Value: 9e-80
Query Start/End: Original strand, 15 - 236
Target Start/End: Original strand, 5876218 - 5876440
Alignment:
Q  15 accgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaa-tgataaagttgcgattactatggcgagaa 113  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||| || ||||  ||    
T  5876218 accgttcaacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgtttgaataactaagttgcaaatgataaagttgagattaatagggcgtaaa 5876317  T
Q  114 acttgttagtattagcgttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaaca 213  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||| ||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  5876318 acttgttaggattagagttccttgatcaagcgtcgcacataacctaatgaccatacatggattctagattttctttgatattatcacgtatccctcgaca 5876417  T
Q  214 acaccattcgtgtccaaacaata 236  Q
    |||| ||||||||||||||||||    
T  5876418 acactattcgtgtccaaacaata 5876440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 136; E-Value: 8e-71
Query Start/End: Original strand, 14 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 34357511 - 34357288
Alignment:
Q  14 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaa-tgataaagttgcgattactatggcgaga 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||  |||||||||||| ||||| | |||||| ||||||| ||| ||||| || ||||  |    
T  34357511 gaccgttcgacaccaaatatcatttcaagttaaacgatagttgattgtttgttttagtaactgaattgcaaatgataaaattgagattaatagggcgtaa 34357412  T
Q  113 aacttgttagtattagcgttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaac 212  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  34357411 aacttgttaggattagagttccttgatcgagcgtcgcacgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcgac 34357312  T
Q  213 aacaccattcgtgtccaaacaata 236  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  34357311 aacaccattcgtgtccaaacaata 34357288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 136; E-Value: 8e-71
Query Start/End: Original strand, 14 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 34359302 - 34359079
Alignment:
Q  14 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaa-tgataaagttgcgattactatggcgaga 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||  |||||||||||| ||||| | |||||| ||||||| ||| ||||| || ||||  |    
T  34359302 gaccgttcgacaccaaatatcatttcaagttaaacgatagttgattgtttgttttagtaactgaattgcaaatgataaaattgagattaatagggcgtaa 34359203  T
Q  113 aacttgttagtattagcgttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaac 212  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  34359202 aacttgttaggattagagttccttgatcgagcgtcgcacgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcgac 34359103  T
Q  213 aacaccattcgtgtccaaacaata 236  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  34359102 aacaccattcgtgtccaaacaata 34359079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 133; E-Value: 5e-69
Query Start/End: Original strand, 14 - 236
Target Start/End: Original strand, 2957857 - 2958081
Alignment:
Q  14 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagtt-aaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaat-gataaagttgcgattactatggcgag 111  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||| ||||||| ||||||||||||| ||||| | ||||||  |||||| ||| ||||| || |||| |    
T  2957857 gaccgttcgacaccaaataccattccaagttgaaaagataattggttgtttgttttagtaactcatttgcaaacgataaaattgagattaatagggcgtg 2957956  T
Q  112 aaacttgttagtattagcgttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaa 211  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  2957957 aaacttgttaggattagagttccttgatcaagcgtcgcacgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcga 2958056  T
Q  212 caacaccattcgtgtccaaacaata 236  Q
    |||||| ||||||||||||||||||    
T  2958057 caacactattcgtgtccaaacaata 2958081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 133; E-Value: 5e-69
Query Start/End: Original strand, 14 - 236
Target Start/End: Original strand, 2966326 - 2966550
Alignment:
Q  14 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagtt-aaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaat-gataaagttgcgattactatggcgag 111  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||| ||||||| ||||||||||||| ||||| | ||||||  |||||| ||| ||||| || |||| |    
T  2966326 gaccgttcgacaccaaataccattccaagttgaaaagataattggttgtttgttttagtaactcatttgcaaacgataaaattgagattaatagggcgtg 2966425  T
Q  112 aaacttgttagtattagcgttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaa 211  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  2966426 aaacttgttaggattagagttccttgatcaagcgtcgcacgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcga 2966525  T
Q  212 caacaccattcgtgtccaaacaata 236  Q
    |||||| ||||||||||||||||||    
T  2966526 caacactattcgtgtccaaacaata 2966550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 14 - 236
Target Start/End: Original strand, 29980458 - 29980681
Alignment:
Q  14 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaa-tgataaagttgcgattactatggcgaga 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||  |||||||||||| ||||| | |||||| ||||| | ||| ||||| || ||||  |    
T  29980458 gaccgttcgacaccaaatatcatttcaagttaaacgatagttgattgtttgttttagtaactgaattgcaaatgatacaattgagattaatagggcgtaa 29980557  T
Q  113 aacttgttagtattagcgttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaac 212  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  29980558 aacttgttaggattagagttccttgatcgagcgtcgcacgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcgac 29980657  T
Q  213 aacaccattcgtgtccaaacaata 236  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  29980658 aacaccattcgtgtccaaacaata 29980681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 14 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 30041467 - 30041244
Alignment:
Q  14 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaa-tgataaagttgcgattactatggcgaga 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||  |||||||||||| ||||| | |||||| ||||| | ||| ||||| || ||||  |    
T  30041467 gaccgttcgacaccaaatatcatttcaagttaaacgatagttgattgtttgttttagtaactgaattgcaaatgatacaattgagattaatagggcgtaa 30041368  T
Q  113 aacttgttagtattagcgttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaac 212  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  30041367 aacttgttaggattagagttccttgatcgagcgtcgcacgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcgac 30041268  T
Q  213 aacaccattcgtgtccaaacaata 236  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  30041267 aacaccattcgtgtccaaacaata 30041244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 14 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 40958840 - 40958617
Alignment:
Q  14 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaa-tgataaagttgcgattactatggcgaga 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||| ||||||||| ||||||| |||||| ||||||| ||| ||||| || ||||  |    
T  40958840 gaccgttcgacaccaaatatcattccaagttaaaagataattggttatttgttttagtaactaaattgcaaatgataaaattgagattaatagggcgtaa 40958741  T
Q  113 aacttgttagtattagcgttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaac 212  Q
     ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||    
T  40958740 cacttgttaggattagagttccttgatcaagcgtcacacataacctaatgaccatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtattcctcgac 40958641  T
Q  213 aacaccattcgtgtccaaacaata 236  Q
    ||||| ||||||||||||||||||    
T  40958640 aacactattcgtgtccaaacaata 40958617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 14 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 25894873 - 25894649
Alignment:
Q  14 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaac-gataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaat-gataaagttgcgattactatggcgag 111  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||  ||||||| ||||||||||||| ||||| | ||||||  |||||| ||| ||||| || |||| |    
T  25894873 gaccgttcgacaccaaataccattccaagttaaaaagataattggttgtttgttttagtaactcatttgcaaacgataaaattgagattaatagggcgtg 25894774  T
Q  112 aaacttgttagtattagcgttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaa 211  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  25894773 aaacttgttaggattagagttccttgatcaagcgtcgcacgtaacctaatgatcatacatcgattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcga 25894674  T
Q  212 caacaccattcgtgtccaaacaata 236  Q
    |||||| ||||||||||||||||||    
T  25894673 caacactattcgtgtccaaacaata 25894649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 7 - 236
Target Start/End: Original strand, 2438793 - 2439022
Alignment:
Q  7 tatcatagaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgc-aatgataaagttgcgattactat 105  Q
    ||||| ||||||| ||| |||||| |||||| ||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||  || ||||| ||     
T  2438793 tatcacagaccgtccgataccaaaaatcattataagttaaaagaaaatttgttgtttgttttagtaactaagttgcgaataataaaagtgagattaataa 2438892  T
Q  106 ggcgagaaacttgttagtattagcgttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatc 205  Q
    |||| |||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  2438893 ggcgtgaaacttgttaggattagagttccttaatcaagcgtcacacgtaacctaatga-catgcatggattctagcttttctttgatattatcatgtatc 2438991  T
Q  206 cctcaacaacaccattcgtgtccaaacaata 236  Q
    |||| |||||| |||| ||||||||||||||    
T  2438992 cctcgacaacatcatttgtgtccaaacaata 2439022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 111; E-Value: 6e-56
Query Start/End: Original strand, 14 - 234
Target Start/End: Original strand, 42150817 - 42151039
Alignment:
Q  14 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgtt-gtttgttttaataactaagttgc-aatgataaagttgcgattactatggcgag 111  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||| |||||| |||||||||| ||||||| |||| || |  ||||||| || || || ||||      
T  42150817 gaccgttcgactccaaatatcattctaagttgaaagatagtttgtttgtttgttttagtaactaaattgctaaagtaaaagttgagagtaatagggcgta 42150916  T
Q  112 aaacttgttagtattagcgttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaa 211  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |    
T  42150917 aaacttgttaggattagagttccttaatcaagcgtcacacataacctaatgaccatacatggattctagtttttctttgatattatcacgtatccctcga 42151016  T
Q  212 caacaccattcgtgtccaaacaa 234  Q
    |||||| ||||||||||||||||    
T  42151017 caacactattcgtgtccaaacaa 42151039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 106; E-Value: 6e-53
Query Start/End: Original strand, 14 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 12505996 - 12505765
Alignment:
Q  14 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttt------taa--taactaagttgc-aatgataaagttgcgattacta 104  Q
    |||| |||||||||||||| |||| ||||||||| |||| |||||||||| |||      |||  |||||| ||||| ||| ||||||||| ||||| ||    
T  12505996 gacctttcgacaccaaataccattttaagttaaaagatagtttgttgtttatttagaaactaagttaactatgttgcgaataataaagttgagattaata 12505897  T
Q  105 tggcgagaaacttgttagtattagcgttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtat 204  Q
     |||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  12505896 aggcgtgaaacttgttaggattagagttccttgatcaagagtcccacgtaacctaatgattatacatggattctagcttctctttgatattatcacgtat 12505797  T
Q  205 ccctcaacaacaccattcgtgtccaaacaata 236  Q
    ||||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  12505796 ccctcgacaacatcattcgtgtccaaacaata 12505765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 14 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 29414892 - 29414669
Alignment:
Q  14 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgtt-gtttgttttaataactaagttgcaatgataaagttgcgattactatggcgaga 112  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||  || |   ||    ||||| | || || || ||||  |    
T  29414892 gaccgttcaacaccaaatatcattctaagttaaaagataatttgtttgtttgttttagtaagcaaatataaaattgaaagtcgagagtaatagggcgtaa 29414793  T
Q  113 aacttgttagtattagcgttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaac 212  Q
    ||||| |||| |||||  || |||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  29414792 aacttattaggattagaatttcttgatcaagcgtcacacataacctaatgaccatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcgac 29414693  T
Q  213 aacaccattcgtgtccaaacaata 236  Q
    |||| ||||| ||| |||||||||    
T  29414692 aacatcattcatgttcaaacaata 29414669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 14 - 231
Target Start/End: Original strand, 33794091 - 33794309
Alignment:
Q  14 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaa-tgataaagttgcgattactatggcgaga 112  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||  |||||||||||||  |  ||||||| || || || ||||  |    
T  33794091 gaccgtttgacaccaaatatcattctaagttaaa-gataatttgttgtatgttttagaaactaagttgcaagagtaaaagttgagagtaataaggcg-ta 33794188  T
Q  113 aacttgttagtattagcgttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgat--catacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctca 210  Q
    ||  |||| | ||||| |||| ||||| |||||||| || ||| ||||| ||  |||| |||||||||||| |||   ||||||||||||||||| ||||    
T  33794189 aaaatgttggaattagagttctttgattaagcgtcaaacataacctaataatcacatatatggattctagcgttttactgatattatcacgtatcgctca 33794288  T
Q  211 acaacaccattcgtgtccaaa 231  Q
    |||| |  |||||| ||||||    
T  33794289 acaagattattcgtatccaaa 33794309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 14 - 231
Target Start/End: Original strand, 9843348 - 9843566
Alignment:
Q  14 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaatgataaagttgcgattactatggcg-aga 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||| |||| || |   || |  ||||||| || || || |||| | |    
T  9843348 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgatagttgattgtttgttttagtaaccaaatataaaagtgaaagttgagagtaatagggcgtaaa 9843447  T
Q  113 aacttgttagtattagcgttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgat--catacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctca 210  Q
    |||   || | ||||| ||||||||||||||| ||| |  ||||||||| ||  |||| |||||||||||| |||    |||||||||||||||| ||||    
T  9843448 aac--attggaattagagttccttgatcaagcatcaaatataatctaataatcacatatatggattctagcgttttaccgatattatcacgtatcgctca 9843545  T
Q  211 acaacaccattcgtgtccaaa 231  Q
    |||| |  |||||||||||||    
T  9843546 acaagattattcgtgtccaaa 9843566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 14 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 2156341 - 2156125
Alignment:
Q  14 gaccgttcgacaccaaatatcattctaag-ttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaatgataaagttgcgattactatggcg-ag 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||   |||||||||||| |||| ||||   || |  ||||||| || || || |||| |     
T  2156341 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagtttaaaagataat---ttgtttgttttagtaaccaagtgtaaaagtgaaagttgagagtaataaggcgtaa 2156245  T
Q  112 aaacttgttagtattagcgttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgat--catacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctc 209  Q
    ||||  ||| | ||||| |||||||||| |||||||| || ||| ||||| ||  |||| |||||||||||  |||    |||||||||||||||| |||    
T  2156244 aaac--gttggaattagagttccttgattaagcgtcaaacataacctaataatcacatatatggattctagtgttttaccgatattatcacgtatcgctc 2156147  T
Q  210 aacaacaccattcgtgtccaaa 231  Q
    ||||| |  |||||||||||||    
T  2156146 aacaagattattcgtgtccaaa 2156125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 125 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 19853588 - 19853484
Alignment:
Q  125 ttagcgttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatca--tacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaacaacaccattc 222  Q
    |||| |||| ||||| |||||||| || ||||||||| ||||  || |||||||||||| |||    |||||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  19853588 ttagagttcgttgattaagcgtcaaacataatctaataatcacatatatggattctagcgttttaccgatattatcacgtatcactcaacaacatcattc 19853489  T
Q  223 gtgtc 227  Q
     ||||    
T  19853488 atgtc 19853484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 165 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 12919021 - 12918955
Alignment:
Q  165 catacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaacaacaccattcgtgtccaaa 231  Q
    |||| |||||||||||| |||    |||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||    
T  12919021 catatatggattctagcgttttaccgatattatcacgtatcgctcaacaagactattcgtgtccaaa 12918955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 124 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 30580304 - 30580195
Alignment:
Q  124 attagcgttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatca--tacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaacaacaccatt 221  Q
    ||||| |||| ||||| |||||||| || ||| ||||| ||||  || |||||||||||| |||  | ||||||||||||||||  || || ||| ||||    
T  30580304 attagagttcgttgattaagcgtcaaacataacctaataatcacatatatggattctagcgttttatcgatattatcacgtatcggtcgacgacatcatt 30580205  T
Q  222 cgtgtccaaa 231  Q
    ||||||||||    
T  30580204 cgtgtccaaa 30580195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 160; Significance: 4e-85; HSPs: 24)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 160; E-Value: 4e-85
Query Start/End: Original strand, 14 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 13672040 - 13671817
Alignment:
Q  14 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaa-tgataaagttgcgattactatggcgaga 112  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||  ||| ||    
T  13672040 gaccgttcgacaccaaatatcattataagttaaacgataatttgttgtttatttgaataactaagttgcaaatgataaagttgagattaataatgcgtga 13671941  T
Q  113 aacttgttagtattagcgttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaac 212  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  13671940 aacttgttaggattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcgac 13671841  T
Q  213 aacaccattcgtgtccaaacaata 236  Q
    ||||| ||| ||||||||||||||    
T  13671840 aacactattagtgtccaaacaata 13671817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 7 - 236
Target Start/End: Original strand, 27670086 - 27670316
Alignment:
Q  7 tatcatagaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaa-tgataaagttgcgattactat 105  Q
    |||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||     
T  27670086 tatcatggatcgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaaatgataaagttgagattaataa 27670185  T
Q  106 ggcgagaaacttgttagtattagcgttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatc 205  Q
     | | |||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27670186 agtgtgaaacttgttaggattagagttccttgatcaagtgtcacacgtaacctaataatcatacatgaattctagcttttctttgatattatcacgtatc 27670285  T
Q  206 cctcaacaacaccattcgtgtccaaacaata 236  Q
    |||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  27670286 cctcgacaacatcattcgtgtccaaacaata 27670316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 14 - 236
Target Start/End: Original strand, 31547894 - 31548117
Alignment:
Q  14 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaat-gataaagttgcgattactatggcgaga 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||| | ||||||  |||||| ||| ||||| || |||| ||    
T  31547894 gaccgttcgacaccaaatatcattcttagttaaaagataattggttgtttgttttagtaactcaattgcaaacgataaaattgagattaatagggcgtga 31547993  T
Q  113 aacttgttagtattagcgttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaac 212  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  31547994 aacttgttaggattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaacctaatgatcacacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcgac 31548093  T
Q  213 aacaccattcgtgtccaaacaata 236  Q
    ||||| ||||||||||||||||||    
T  31548094 aacactattcgtgtccaaacaata 31548117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 14 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 32328716 - 32328493
Alignment:
Q  14 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaa-tgataaagttgcgattactatggcgaga 112  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||| ||| ||||| || ||||  |    
T  32328716 gaccgttcgacaccagatatcattctaagttaaaagataattggttgtttgttttagtaactaaattgcaaatgataaaattgagattaatagggcgtaa 32328617  T
Q  113 aacttgttagtattagcgttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaac 212  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  32328616 aacttgttaggattagagttccttgatcgagcgtcacatataacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcgac 32328517  T
Q  213 aacaccattcgtgtccaaacaata 236  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  32328516 aacaccattcgtgtccaaacaata 32328493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 14 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 34711780 - 34711557
Alignment:
Q  14 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaa-tgataaagttgcgattactatggcgaga 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||  |||||||||||| ||||||| |||||| ||||||| ||| ||||| || ||||  |    
T  34711780 gaccgttcgacaccaaatatcatttcaagttaaacgatagttgattgtttgttttagtaactaaattgcaaatgataaaattgagattaatagggcgtaa 34711681  T
Q  113 aacttgttagtattagcgttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaac 212  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  34711680 aacttgttaggattagagttccttgatcgagcgtcgcacgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcgac 34711581  T
Q  213 aacaccattcgtgtccaaacaata 236  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  34711580 aacaccattcgtgtccaaacaata 34711557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 14 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 9864984 - 9864760
Alignment:
Q  14 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaac-gataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaat-gataaagttgcgattactatggcgag 111  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||| ||||| | ||||||  |||||| ||| ||||| || |||| |    
T  9864984 gaccgttcgacaccaaataccattctaagttaaaaagataattggttgtttgttttagtaactcaattgcaaacgataaaattgagattaatagggcgtg 9864885  T
Q  112 aaacttgttagtattagcgttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaa 211  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9864884 aaacttgttaggattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaacttaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaa 9864785  T
Q  212 caacaccattcgtgtccaaacaata 236  Q
    ||| || ||||||||||||||||||    
T  9864784 caatactattcgtgtccaaacaata 9864760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 136; E-Value: 8e-71
Query Start/End: Original strand, 14 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 1428646 - 1428423
Alignment:
Q  14 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaa-tgataaagttgcgattactatggcgaga 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||  |||||||||||| ||||| | |||||| ||||||| ||| ||||| || ||||  |    
T  1428646 gaccgttcgacaccaaatatcatttcaagttaaacgatagttgattgtttgttttagtaactgaattgcaaatgataaaattgagattaataaggcgtaa 1428547  T
Q  113 aacttgttagtattagcgttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaac 212  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  1428546 aacttgttaggattagagttccttgatcgagcgtcgcacgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcgac 1428447  T
Q  213 aacaccattcgtgtccaaacaata 236  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  1428446 aacaccattcgtgtccaaacaata 1428423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 136; E-Value: 8e-71
Query Start/End: Original strand, 14 - 236
Target Start/End: Original strand, 4186684 - 4186907
Alignment:
Q  14 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaa-tgataaagttgcgattactatggcgaga 112  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||| ||| ||||| || ||||       
T  4186684 gaccgttcgacaccaaatataattctaagttaaaagataattggttgtttgttttagtaactaaattgcaaatgataaaattgagattaatagggcgtag 4186783  T
Q  113 aacttgttagtattagcgttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaac 212  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||    
T  4186784 aacttgttaggattagagttccttgatcgagcgtcgcacgtaacctaatgatcatacatggattctaacttttctttgatattatcatgtatccctcgac 4186883  T
Q  213 aacaccattcgtgtccaaacaata 236  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  4186884 aacaccattcgtgtccaaacaata 4186907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 136; E-Value: 8e-71
Query Start/End: Original strand, 14 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 11058373 - 11058150
Alignment:
Q  14 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaa-tgataaagttgcgattactatggcgaga 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||  |||||||||||| ||||| | |||||| ||||||| ||| ||||| || ||||  |    
T  11058373 gaccgttcgacaccaaatatcatttcaagttaaacgatagttgattgtttgttttagtaactgaattgcaaatgataaaattgagattaatagggcgtaa 11058274  T
Q  113 aacttgttagtattagcgttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaac 212  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  11058273 aacttgttaggattagagttccttgatcgagcgtcgcacgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcgac 11058174  T
Q  213 aacaccattcgtgtccaaacaata 236  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  11058173 aacaccattcgtgtccaaacaata 11058150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 17 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 21262795 - 21262574
Alignment:
Q  17 cgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgtt-gtttgttttaataactaagttgcaatgataaa-gttgcgattactatggcgagaaa 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||   |||| |||| || || || ||||  |||    
T  21262795 cgttcgacaccaaatatcattctaagttaaaagataatttgtttgtttgttttagtaactaaattgcaaaagtaaaagttgagagtaatagggcgtaaaa 21262696  T
Q  115 cttgttagtattagcgttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaacaa 214  Q
    |||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  21262695 cttgttaggattagagttccttgattaagcgtcacacgtaacctaatgatcatacatggattctagtttttctttgatattatcacgtatccctcgacaa 21262596  T
Q  215 caccattcgtgtccaaacaata 236  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  21262595 caccattcgtgtccaaacaata 21262574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 133; E-Value: 5e-69
Query Start/End: Original strand, 14 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 4020459 - 4020235
Alignment:
Q  14 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaac-gataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaat-gataaagttgcgattactatggcgag 111  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||  ||||||| ||||||||||||| ||||| | ||||||  |||||| ||| ||||| || |||| |    
T  4020459 gaccgttcgacaccaaataccattccaagttaaaaagataattggttgtttgttttagtaactcatttgcaaacgataaaattgagattaatagggcgtg 4020360  T
Q  112 aaacttgttagtattagcgttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaa 211  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  4020359 aaacttgttaggattagagttccttgatcaagcgtcgcacgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcga 4020260  T
Q  212 caacaccattcgtgtccaaacaata 236  Q
    |||||| ||||||||||||||||||    
T  4020259 caacactattcgtgtccaaacaata 4020235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 133; E-Value: 5e-69
Query Start/End: Original strand, 14 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 4026885 - 4026661
Alignment:
Q  14 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaac-gataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaat-gataaagttgcgattactatggcgag 111  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||  ||||||| ||||||||||||| ||||| | ||||||  |||||| ||| ||||| || |||| |    
T  4026885 gaccgttcgacaccaaataccattccaagttaaaaagataattggttgtttgttttagtaactcatttgcaaacgataaaattgagattaatagggcgtg 4026786  T
Q  112 aaacttgttagtattagcgttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaa 211  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  4026785 aaacttgttaggattagagttccttgatcaagcgtcgcacgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcga 4026686  T
Q  212 caacaccattcgtgtccaaacaata 236  Q
    |||||| ||||||||||||||||||    
T  4026685 caacactattcgtgtccaaacaata 4026661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 133; E-Value: 5e-69
Query Start/End: Original strand, 14 - 236
Target Start/End: Original strand, 34655249 - 34655473
Alignment:
Q  14 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaac-gataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaat-gataaagttgcgattactatggcgag 111  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||  ||||||| ||||||||||||| ||||| | ||||||  |||||| ||| ||||| || |||| |    
T  34655249 gaccgttcgacaccaaataccattccaagttaaaaagataattggttgtttgttttagtaactcatttgcaaacgataaaattgagattaatagggcgtg 34655348  T
Q  112 aaacttgttagtattagcgttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaa 211  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  34655349 aaacttgttaggattagagttccttgatcaagcgtcgcacgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcga 34655448  T
Q  212 caacaccattcgtgtccaaacaata 236  Q
    |||||| ||||||||||||||||||    
T  34655449 caacactattcgtgtccaaacaata 34655473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 14 - 236
Target Start/End: Original strand, 34648798 - 34649022
Alignment:
Q  14 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaac-gataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaat-gataaagttgcgattactatggcgag 111  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||  ||||||| ||||||||||||| || || | ||||||  |||||| ||| ||||| || |||| |    
T  34648798 gaccgttcgacaccaaataccattccaagttaaaaagataattggttgtttgttttagtatctcatttgcaaacgataaaattgagattaatagggcgtg 34648897  T
Q  112 aaacttgttagtattagcgttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaa 211  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  34648898 aaacttgttaggattagagttccttgatcaagcgtcgcacgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcga 34648997  T
Q  212 caacaccattcgtgtccaaacaata 236  Q
    |||||| ||||||||||||||||||    
T  34648998 caacactattcgtgtccaaacaata 34649022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 14 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 4738547 - 4738323
Alignment:
Q  14 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaac-gataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaat-gataaagttgcgattactatggcgag 111  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||  ||||||| ||||||||||||| ||||| | ||||||  |||||| ||| ||||| || |||| |    
T  4738547 gaccgttcgacaccaaataccattccaagttaaaaagataattggttgtttgttttagtaactcatttgcaaacgataaaattgagattaatagggcgtg 4738448  T
Q  112 aaacttgttagtattagcgttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaa 211  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |    
T  4738447 aaacttgttaggattagagttccttgatcaagcgtcgcacgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcatgtatccctcga 4738348  T
Q  212 caacaccattcgtgtccaaacaata 236  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||    
T  4738347 caacactattcgagtccaaacaata 4738323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 24 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 7069916 - 7069702
Alignment:
Q  24 caccaaatatcattctaagttaaac-gataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaat-gataaagttgcgattactatggcgagaaacttgtta 121  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||  ||||||| ||||||||||||| ||||| | ||||||  |||||| ||| ||||| || |||| |||||||||||    
T  7069916 caccaaataccattccaagttaaaaagataattggttgtttgttttagtaactcatttgcaaacgataaaattgagattaatagggcgtgaaacttgtta 7069817  T
Q  122 gtattagcgttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaacaacaccatt 221  Q
    | ||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||    
T  7069816 ggattagagttccttgatcaagcgtcgcacgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcatgtatccctcgacaacactatt 7069717  T
Q  222 cgtgtccaaacaata 236  Q
    |||||||||||||||    
T  7069716 cgtgtccaaacaata 7069702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 7 - 169
Target Start/End: Original strand, 29906882 - 29907045
Alignment:
Q  7 tatcatagaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgc-aatgataaagttgcgattactat 105  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||| ||||| ||| ||||| ||     
T  29906882 tatcacagaccgttcgacactaaatatcattctaagttaaaatataatttgttgtttgttttagtaactaaattgctaataataaaattgagattaataa 29906981  T
Q  106 ggcgagaaacttgttagtattagcgttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatac 169  Q
    |||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  29906982 ggcgtgaaacttgttaggattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaacctaatgaccatac 29907045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 7 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 30117498 - 30117335
Alignment:
Q  7 tatcatagaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgc-aatgataaagttgcgattactat 105  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||| ||||| ||| ||||| ||     
T  30117498 tatcacagaccgttcgacactaaatatcattctaagttaaaatataatttgttgtttgttttagtaactaaattgctaataataaaattgagattaataa 30117399  T
Q  106 ggcgagaaacttgttagtattagcgttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatac 169  Q
    |||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| || |||||    
T  30117398 ggcgtgaaacttgttaggattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaacctaaggaccatac 30117335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 14 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 7062707 - 7062578
Alignment:
Q  14 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaac-gataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaat-gataaagttgcgattactatggcgag 111  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||  ||||||| ||||||||||||| ||||| | ||||||  |||||| ||| ||||| || |||| |    
T  7062707 gaccgttcgacaccaaataccattccaagttaaaaagataattggttgtttgttttagtaactcatttgcaaacgataaaattgagattaatagggcgtg 7062608  T
Q  112 aaacttgttagtattagcgttccttgatca 141  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  7062607 aaacttgttaggattagagttccttgatca 7062578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 174 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 7062578 - 7062516
Alignment:
Q  174 attctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaacaacaccattcgtgtccaaacaata 236  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  7062578 attctagcttttctttgatattatcatgtatccctcgacaacactattcgtgtccaaacaata 7062516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 97 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 1167626 - 1167480
Alignment:
Q  97 gattactatggcgagaaacttgttagtattagcgttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttt-------tcttt 189  Q
    ||||| || |||| |||||||||||| |||||  ||| ||||||||||||||||| ||| || ||||||||| | ||||||||| |||       | |||    
T  1167626 gattaataaggcgtgaaacttgttaggattagaattctttgatcaagcgtcacacataacctgatgatcatatacggattctagttttttttttattttt 1167527  T
Q  190 gatattatcacgtatccctcaacaacaccattcgtgtccaaacaata 236  Q
     ||||||||| |||||||||||||| | | |||||||||||| ||||    
T  1167526 tatattatcatgtatccctcaacaatatcgttcgtgtccaaataata 1167480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 38 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 10081762 - 10081567
Alignment:
Q  38 ctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaa-tgataaagttgcgattactatggcg-agaaacttgttagtattagcgttcct 135  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||  |  ||| ||| || || || |||| | ||||  ||| | ||||| ||||||    
T  10081762 ctaagttaaaagataatttgttgtttgttttagaaactaagttgcaagagtaaaatttgagagtaataaggcgtaaaaac--gttggaattagagttcct 10081665  T
Q  136 tgatcaagcgtcacacgtaatctaatgat--catacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaacaacaccattcgtgtccaaa 231  Q
    |||| |||||||| || ||| ||||| ||  |||| |||||||||||| |||    ||||||||||| |||| |||||||| |  |||||||||||||    
T  10081664 tgattaagcgtcaaacataacctaataatcacatatatggattctagcgttttaccgatattatcacatatcgctcaacaagattattcgtgtccaaa 10081567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 199 - 236
Target Start/End: Original strand, 29907044 - 29907081
Alignment:
Q  199 acgtatccctcaacaacaccattcgtgtccaaacaata 236  Q
    |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  29907044 acgtgtccctcgacaacaccattcgtgtccaaacaata 29907081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 199 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 30117336 - 30117299
Alignment:
Q  199 acgtatccctcaacaacaccattcgtgtccaaacaata 236  Q
    |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  30117336 acgtgtccctcgacaacaccattcgtgtccaaacaata 30117299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 160; Significance: 4e-85; HSPs: 23)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 160; E-Value: 4e-85
Query Start/End: Original strand, 14 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 21342105 - 21341882
Alignment:
Q  14 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaa-tgataaagttgcgattactatggcgaga 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||| ||| ||||| || |||| ||    
T  21342105 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaaagataattggttgtttgttttaatgactaaattgcaaatgataaaattgagattaatagggcgtga 21342006  T
Q  113 aacttgttagtattagcgttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaac 212  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  21342005 aacttgttaggattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcgac 21341906  T
Q  213 aacaccattcgtgtccaaacaata 236  Q
    |||||||||| |||||||||||||    
T  21341905 aacaccattcatgtccaaacaata 21341882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 17 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 2021668 - 2021448
Alignment:
Q  17 cgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaa-tgataaagttgcgattactatggcgagaaac 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||| || || |  ||||    
T  2021668 cgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgtttgaataactaagttgcaaatgataaagttgagattaatagggtgtaaaac 2021569  T
Q  116 ttgttagtattagcgttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaacaac 215  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  2021568 ttgttaggattagagttccttgatcaagcgtcacacataacctaatgaccatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcgacaac 2021469  T
Q  216 accattcgtgtccaaacaata 236  Q
    || ||||||||||||||||||    
T  2021468 actattcgtgtccaaacaata 2021448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 14 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 21332217 - 21331994
Alignment:
Q  14 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaa-tgataaagttgcgattactatggcgaga 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||||||||| ||||| || ||| ||||||| ||| ||||| || |||| ||    
T  21332217 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaaagatagttggttgtttgttttaatgactaaatttcaaatgataaaattgagattaatagggcgtga 21332118  T
Q  113 aacttgttagtattagcgttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaac 212  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  21332117 aacttgttaggattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcgac 21332018  T
Q  213 aacaccattcgtgtccaaacaata 236  Q
    |||||||||| |||||||||||||    
T  21332017 aacaccattcatgtccaaacaata 21331994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 14 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 42931595 - 42931372
Alignment:
Q  14 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaa-tgataaagttgcgattactatggcgaga 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||| ||| ||||| || |||| ||    
T  42931595 gaccgttcgacaccaaatatcattccaagttaacagataattggttgtttgttttagtaactaaattgcaaatgataaaattgagattaatagggcgtga 42931496  T
Q  113 aacttgttagtattagcgttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaac 212  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  42931495 aacttgttaggattagagttccttgatcaaatgtcacacgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcgac 42931396  T
Q  213 aacaccattcgtgtccaaacaata 236  Q
    ||||| ||||||||||||||||||    
T  42931395 aacactattcgtgtccaaacaata 42931372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 141; E-Value: 8e-74
Query Start/End: Original strand, 14 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 16856709 - 16856487
Alignment:
Q  14 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaa-tgataaagttgcgattactatggcgaga 112  Q
    |||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||| || ||||  |    
T  16856709 gaccgttcgacagcaaatatcattcaaagttaaa-gataatttgttgtttgtttgaataactaagttgcaaatgataaagttgagattaatagggcgtaa 16856611  T
Q  113 aacttgttagtattagcgttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaac 212  Q
     ||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||    
T  16856610 nacttgttaggattagagtttcttgatcaagcgtcacacataacctaatgaccatacatggattctagcttttctttgatattatcacatatccctcgac 16856511  T
Q  213 aacaccattcgtgtccaaacaata 236  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  16856510 aacaccattcgtgtccaaacaata 16856487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 14 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 16817552 - 16817330
Alignment:
Q  14 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaa-tgataaagttgcgattactatggcgaga 112  Q
    |||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||| || ||||  |    
T  16817552 gaccgttcgacagcaaatatcattcaaagttaaa-gataatttgttgtttgtttgaataactaagttgcaaatgataaagttgagattaatagggcgtaa 16817454  T
Q  113 aacttgttagtattagcgttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaac 212  Q
     ||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||    
T  16817453 cacttgttaggattagagtttcttgatcaagcgtcacacataacctaatgaccatacatggattctagcttttctttgatattatcacatatccctcgac 16817354  T
Q  213 aacaccattcgtgtccaaacaata 236  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  16817353 aacaccattcgtgtccaaacaata 16817330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 14 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 36782408 - 36782184
Alignment:
Q  14 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaac-gataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaa-tgataaagttgcgattactatggcgag 111  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||  ||||||| ||||||||||||| ||||| | |||||| ||||||| ||| ||||| || ||||      
T  36782408 gaccgttcgacaccaaataccattccaagttaaaaagataattggttgtttgttttagtaactcaattgcaaatgataaaattgagattaatagggcgta 36782309  T
Q  112 aaacttgttagtattagcgttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaa 211  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  36782308 aaacttgttaggattagagttccttgatcgagcgtcacacgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcga 36782209  T
Q  212 caacaccattcgtgtccaaacaata 236  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  36782208 caacaccattcgtgtccaaacaata 36782184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 136; E-Value: 8e-71
Query Start/End: Original strand, 14 - 236
Target Start/End: Original strand, 12950795 - 12951018
Alignment:
Q  14 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaa-tgataaagttgcgattactatggcgaga 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||  |||||||||||| ||||| | |||||| ||||||| ||| ||||| || ||||  |    
T  12950795 gaccgttcgacaccaaatatcatttcaagttaaacgatagttgattgtttgttttagtaactgaattgcaaatgataaaattgagattaataaggcgtaa 12950894  T
Q  113 aacttgttagtattagcgttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaac 212  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  12950895 aacttgttaggattagagttccttgatcgagcgtcgcacgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcgac 12950994  T
Q  213 aacaccattcgtgtccaaacaata 236  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  12950995 aacaccattcgtgtccaaacaata 12951018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 136; E-Value: 8e-71
Query Start/End: Original strand, 14 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 34835035 - 34834812
Alignment:
Q  14 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaa-tgataaagttgcgattactatggcgaga 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||  |||||||||||| ||||||  |||||| ||||||| ||| ||||| || ||||  |    
T  34835035 gaccgttcgacaccaaatatcatttcaagttaaacgatagttgattgtttgttttagtaactagattgcaaatgataaaattgagattaatagggcgtaa 34834936  T
Q  113 aacttgttagtattagcgttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaac 212  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  34834935 aacttgttaggattagagttccttgatcgagcgtcgcacgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcgac 34834836  T
Q  213 aacaccattcgtgtccaaacaata 236  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  34834835 aacaccattcgtgtccaaacaata 34834812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 136; E-Value: 8e-71
Query Start/End: Original strand, 14 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 34841479 - 34841256
Alignment:
Q  14 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaa-tgataaagttgcgattactatggcgaga 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||  |||||||||||| ||||||  |||||| ||||||| ||| ||||| || ||||  |    
T  34841479 gaccgttcgacaccaaatatcatttcaagttaaacgatagttgattgtttgttttagtaactagattgcaaatgataaaattgagattaatagggcgtaa 34841380  T
Q  113 aacttgttagtattagcgttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaac 212  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  34841379 aacttgttaggattagagttccttgatcgagcgtcgcacgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcgac 34841280  T
Q  213 aacaccattcgtgtccaaacaata 236  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  34841279 aacaccattcgtgtccaaacaata 34841256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 133; E-Value: 5e-69
Query Start/End: Original strand, 14 - 236
Target Start/End: Original strand, 29484925 - 29485149
Alignment:
Q  14 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaac-gataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaat-gataaagttgcgattactatggcgag 111  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||  ||||||| ||||||||||||| ||||| | ||||||  |||||| ||| ||||| || |||| |    
T  29484925 gaccgttcgacaccaaataccattccaagttaaaaagataattggttgtttgttttagtaactcatttgcaaacgataaaattgagattaatagggcgtg 29485024  T
Q  112 aaacttgttagtattagcgttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaa 211  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  29485025 aaacttgttaggattagagttccttgatcaagcgtcgcacgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcga 29485124  T
Q  212 caacaccattcgtgtccaaacaata 236  Q
    |||||| ||||||||||||||||||    
T  29485125 caacactattcgtgtccaaacaata 29485149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 133; E-Value: 5e-69
Query Start/End: Original strand, 14 - 236
Target Start/End: Original strand, 45011981 - 45012205
Alignment:
Q  14 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaac-gataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaat-gataaagttgcgattactatggcgag 111  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||  ||||||| ||||||||||||| ||||| | ||||||  |||||| ||| ||||| || |||| |    
T  45011981 gaccgttcgacaccaaataccattccaagttaaaaagataattggttgtttgttttagtaactcatttgcaaacgataaaattgagattaatagggcgtg 45012080  T
Q  112 aaacttgttagtattagcgttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaa 211  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  45012081 aaacttgttaggattagagttccttgatcaagcgtcgcacgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcga 45012180  T
Q  212 caacaccattcgtgtccaaacaata 236  Q
    |||||| ||||||||||||||||||    
T  45012181 caacactattcgtgtccaaacaata 45012205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 13 - 236
Target Start/End: Original strand, 2164026 - 2164250
Alignment:
Q  13 agaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaa-tgataaagttgcgattactatggcgag 111  Q
    |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||  |||||||||||| ||||| | |||||| ||||| | ||| ||||| || ||||      
T  2164026 agaccgttcgacaccaaatatcatttcaagttaaacgatagttgattgtttgttttagtaactgaattgcaaatgatacaattgagattaatagggcgta 2164125  T
Q  112 aaacttgttagtattagcgttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaa 211  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  2164126 aaacttgttaggattagagttccttgatcgagcgtcgcacgtaacctaatgattatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcga 2164225  T
Q  212 caacaccattcgtgtccaaacaata 236  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  2164226 caacaccattcgtgtccaaacaata 2164250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 14 - 236
Target Start/End: Original strand, 15852548 - 15852772
Alignment:
Q  14 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaac-gataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaat-gataaagttgcgattactatggcgag 111  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||  ||||||| ||||||||||||| ||||| | ||||||  |||||| ||| ||||| || |||| |    
T  15852548 gaccgttcgacaccaaataccattccaagttaaaaagataattggttgtttgttttagtaactcaattgcaaacgataaaattgagattaatagggcgtg 15852647  T
Q  112 aaacttgttagtattagcgttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaa 211  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  15852648 aaacttgttaggattagagttccttgatcaagcgtcacacttaacctaatgatcacacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcga 15852747  T
Q  212 caacaccattcgtgtccaaacaata 236  Q
    |||||| ||||||||||||||||||    
T  15852748 caacactattcgtgtccaaacaata 15852772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 14 - 236
Target Start/End: Original strand, 43267857 - 43268081
Alignment:
Q  14 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgtt-gtttgttttaataactaagttgcaa-tgataaagttgcgattactatggcgag 111  Q
    |||||||||||||||| |||||||  |||||||| ||||| ||||| |||||||||| ||||| | |||||| ||||||| ||| ||||| || ||||      
T  43267857 gaccgttcgacaccaattatcatttcaagttaaaagataagttgtttgtttgttttagtaactgaattgcaaatgataaaattgagattaatagggcgta 43267956  T
Q  112 aaacttgttagtattagcgttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaa 211  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  43267957 aaacttgttaggattagagttccttgatcgagcgtcgcacgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcga 43268056  T
Q  212 caacaccattcgtgtccaaacaata 236  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  43268057 caacaccattcgtgtccaaacaata 43268081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 128; E-Value: 5e-66
Query Start/End: Original strand, 14 - 236
Target Start/End: Original strand, 2157611 - 2157834
Alignment:
Q  14 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaa-tgataaagttgcgattactatggcgaga 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||  |||||||||||| ||||| | |||||| ||||| | ||| ||||| || ||||  |    
T  2157611 gaccgttcgacaccaaatatcatttcaagttaaacgatagttgattgtttgttttagtaactgaattgcaaatgatacaattgagattaatagggcgtaa 2157710  T
Q  113 aacttgttagtattagcgttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaac 212  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  2157711 aacttgttaggattagagttccttgatcgagcgtcgcacgtaacctaatgatcatacatggattctatcttttctttgatattatcacgtatccctcgac 2157810  T
Q  213 aacaccattcgtgtccaaacaata 236  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  2157811 aacaccattcgtgtccaaacaata 2157834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 14 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 13902180 - 13901957
Alignment:
Q  14 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaa-tgataaagttgcgattactatggcgaga 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||  |||||||||||| ||||| | |||||| ||||| | ||| ||||| || ||||  |    
T  13902180 gaccgttcgacaccaaatatcatttcaagttaaacgatagttgattgtttgttttagtaactgaattgcaaatgatacaattgagattaatagggcgtaa 13902081  T
Q  113 aacttgttagtattagcgttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaac 212  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||| |||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||    
T  13902080 aacttgttaggattagagttccttgatcgagcgtcgcacgtaacctaatgagcatacatggattctagcttgtctttgatattatcacgtatccctcgac 13901981  T
Q  213 aacaccattcgtgtccaaacaata 236  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  13901980 aacaccattcgtgtccaaacaata 13901957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 121; E-Value: 7e-62
Query Start/End: Original strand, 14 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 21068181 - 21067958
Alignment:
Q  14 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgtt-gtttgttttaataactaagttgcaatgataaa-gttgcgattactatggcgag 111  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||| ||||||| ||||||   |||| |||| || || || || | |    
T  21068181 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaaagataatttgtttgtttgtattagtaactaaattgcaaaagtaaaagttgagagtaatagggtgtg 21068082  T
Q  112 aaacttgttagtattagcgttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaa 211  Q
    |||||| |||| ||||| ||||||||| || || |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21068081 aaactt-ttaggattagagttccttgagcaggcatcacacgtaacctaatgaccatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaa 21067983  T
Q  212 caacaccattcgtgtccaaacaata 236  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  21067982 caacaccattcgtgtccaaacaata 21067958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 87 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 45700793 - 45700644
Alignment:
Q  87 ataaagttgcgattactatggcgagaaacttgttagtattagcgttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttc 186  Q
    ||||||||| ||||| || |||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  45700793 ataaagttgagattaataaggcgtgaaacttgttagaattagagttccttgatcaaacgtcacacataacctaatgatcatacctggattctagcttttc 45700694  T
Q  187 tttgatattatcacgtatccctcaacaacaccattcgtgtccaaacaata 236  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  45700693 tttgatattatcacgtatccctcgacaacatcattcgtgtccaaacaata 45700644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 7 - 231
Target Start/End: Original strand, 41455598 - 41455823
Alignment:
Q  7 tatcatagaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaatgataaagttgcgattactatg 106  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||   || |  ||||||| || || || |    
T  41455598 tatcacagaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaaagataatttgttgtttgttttagtaaccaagtgcaaaagtaaaagttgagagtaataag 41455697  T
Q  107 gcg-agaaacttgttagtattagcgttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgat--catacatggattctagcttttctttgatattatcacgta 203  Q
    ||| | ||||  ||| | ||||| |||||||||| |||||||| || ||| ||||| ||  |||| |||||||| | | |||    ||||||||||||||    
T  41455698 gcgtaaaaac--gttggaattagagttccttgattaagcgtcaaacataacctaataatcacatatatggattccaccgttttaccgatattatcacgta 41455795  T
Q  204 tccctcaacaacaccattcgtgtccaaa 231  Q
    || |||||||| |  |||||||||||||    
T  41455796 tcactcaacaagattattcgtgtccaaa 41455823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 124 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 17784552 - 17784443
Alignment:
Q  124 attagcgttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatca--tacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaacaacaccatt 221  Q
    ||||| |||||||||| |||||||| || ||| ||||| ||||  || ||| |||||||| |||    |||||||||||||||| ||| |||||| ||||    
T  17784552 attagagttccttgattaagcgtcaaacataacctaataatcacatatatgaattctagcgttttaccgatattatcacgtatcgctcgacaacatcatt 17784453  T
Q  222 cgtgtccaaa 231  Q
    ||||||||||    
T  17784452 cgtgtccaaa 17784443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 112 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 11910076 - 11909950
Alignment:
Q  112 aaacttgttagtattagcgttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatga--tcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctc 209  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||||||||| || ||  ||||| |||||   |||| | ||||||||||||||  |  |||||||||||||||  ||    
T  11910076 aaacttgttaggattagagttccttgatcaagcatcccatataatccaatgaccacatatacggattctagcttttaatctatattatcacgtatcagtc 11909977  T
Q  210 aacaacaccattcgtgtccaaacaata 236  Q
     |||| |  ||||||||||||| ||||    
T  11909976 gacaatattattcgtgtccaaataata 11909950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 124 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 17789205 - 17789096
Alignment:
Q  124 attagcgttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatca--tacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaacaacaccatt 221  Q
    ||||| |||||||||| |||||||| || |||  |||| ||||  || |||||||||||| |||    |||||||||||||||| ||| |||||| ||||    
T  17789205 attagagttccttgattaagcgtcaaacataacataataatcacatatatggattctagcgttttaccgatattatcacgtatcgctcgacaacatcatt 17789106  T
Q  222 cgtgtccaaa 231  Q
    | ||||||||    
T  17789105 cctgtccaaa 17789096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 156; Significance: 9e-83; HSPs: 18)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 156; E-Value: 9e-83
Query Start/End: Original strand, 14 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 55462995 - 55462772
Alignment:
Q  14 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaa-tgataaagttgcgattactatggcgaga 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||| ||| ||||| || |||| ||    
T  55462995 gaccgttcgacaccaaatatcattccaagttaaaagataattggttgtttgttttagtaactaaattgcaaatgataaaattgagattaatagggcgtga 55462896  T
Q  113 aacttgttagtattagcgttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaac 212  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  55462895 aacttgttaggattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcgac 55462796  T
Q  213 aacaccattcgtgtccaaacaata 236  Q
    ||||| ||||||||||||||||||    
T  55462795 aacactattcgtgtccaaacaata 55462772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 7 - 236
Target Start/End: Original strand, 16405334 - 16405568
Alignment:
Q  7 tatcatagaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaa-tgataaagttgcgattactat 105  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||     
T  16405334 tatcacagaccgttcgacaccaaatatcgttctaagttaaacgataatttgttgtttgtttgaataactaagttgcaaatgataaagttgagattaataa 16405433  T
Q  106 ggcgagaaacttgttagtattagcgttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttg----atattatcacg 201  Q
    ||||  ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    ||||||| | |    
T  16405434 ggcgtaaaacttgttaggattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatatatattataatg 16405533  T
Q  202 tatccctcaacaacaccattcgtgtccaaacaata 236  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  16405534 tatccctcgacaacaccattcgtgtccaaacaata 16405568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 14 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 16838581 - 16838359
Alignment:
Q  14 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaatgataaa-gttgcgattactatggcgaga 112  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||   |||| |||| ||||| || |||| ||    
T  16838581 gaccgttagacaccaaatatcattctaagttaaa-gatgatttgttgtttgttttagtaactaagttgcaagagtaaaagttgagattaataaggcgtga 16838483  T
Q  113 aacttgttagtattagcgttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaac 212  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||    
T  16838482 aacttgttaggattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaacctaatgaccatacatggattctatcttttctttgatattatcatgtatccctcgac 16838383  T
Q  213 aacaccattcgtgtccaaacaata 236  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  16838382 aacaccattcgtgtccaaacaata 16838359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 14 - 236
Target Start/End: Original strand, 27590304 - 27590527
Alignment:
Q  14 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaat-gataaagttgcgattactatggcgaga 112  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||| | ||||||  |||||| ||| ||||| || |||| ||    
T  27590304 gaccgttcgacaccaaataccattccaagttaaaagataattggttgtttgttttagtaactcatttgcaaacgataaaattgagattaatagggcgtga 27590403  T
Q  113 aacttgttagtattagcgttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaac 212  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  27590404 aacttgttaggattagagttccttgatcaagcgtcgcacgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcgac 27590503  T
Q  213 aacaccattcgtgtccaaacaata 236  Q
    ||||| ||||||||||||||||||    
T  27590504 aacactattcgtgtccaaacaata 27590527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 138; E-Value: 5e-72
Query Start/End: Original strand, 13 - 236
Target Start/End: Original strand, 41372984 - 41373209
Alignment:
Q  13 agaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgtt-gtttgttttaataactaagttgcaa-tgataaagttgcgattactatggcga 110  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||| ||||||| |||||| ||||||| ||| ||||| || ||||     
T  41372984 agaccgttcgacaccaattatcattctaagttaaaagataagttgtttgtttgttttagtaactaaattgcaaatgataaaattgagattaatagggcgt 41373083  T
Q  111 gaaacttgttagtattagcgttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctca 210  Q
     ||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  41373084 aaaacttgttaggattagagttccttgatcgagcgtcgcacgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcg 41373183  T
Q  211 acaacaccattcgtgtccaaacaata 236  Q
    |||||| |||||||||||||||||||    
T  41373184 acaacatcattcgtgtccaaacaata 41373209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 136; E-Value: 8e-71
Query Start/End: Original strand, 14 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 37368538 - 37368315
Alignment:
Q  14 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaac-gataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaat-gataaagttgcgattactatggcgag 111  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||  ||||||| ||||||||||||| ||||| | ||||||  |||||| ||| ||||| || |||| |    
T  37368538 gaccgttcgacaccaaataccattccaagttaaaaagataattggttgtttgttttagtaactcaattgcaaacgataaaattgagattaatagggcgtg 37368439  T
Q  112 aaacttgttagtattagcgttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaa 211  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  37368438 aaacttgttaggattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcga 37368339  T
Q  212 caacaccattcgtgtccaaacaat 235  Q
    |||||| |||||||||||||||||    
T  37368338 caacactattcgtgtccaaacaat 37368315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 14 - 236
Target Start/End: Original strand, 13594105 - 13594330
Alignment:
Q  14 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaac-gataatttgtt-gtttgttttaataactaagttgc-aatgataaagttgcgattactatggcga 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||| |||||||||| ||||||| |||| ||||  ||||||| |||||  | ||||     
T  13594105 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaaaagataatatgtttgtttgttttagtaactaaattgctaatgtaaaagttgagattaacagggcgt 13594204  T
Q  111 gaaacttgttagtattagcgttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctca 210  Q
     ||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  13594205 aaaacttgttaggattagagttccttgatcgagcgtcacacgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcg 13594304  T
Q  211 acaacaccattcgtgtccaaacaata 236  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  13594305 acaacaccattcgtgtccaaacaata 13594330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 133; E-Value: 5e-69
Query Start/End: Original strand, 14 - 236
Target Start/End: Original strand, 7780406 - 7780629
Alignment:
Q  14 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaa-tgataaa-gttgcgattactatggcgag 111  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||| || |||||| ||||||| |||| || || || ||||      
T  7780406 gaccgttcgacactaaatatcattctaagttaaa-gatgatttgttgtttgttttagtaacgaaattgcaaatgataaaagttgagagtaatagggcgta 7780504  T
Q  112 aaacttgttagtattagcgttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaa 211  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  7780505 aaacttgttaggattagagttccttgattaagcgtcacacgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcga 7780604  T
Q  212 caacaccattcgtgtccaaacaata 236  Q
    ||||| |||||||||||||||||||    
T  7780605 caacatcattcgtgtccaaacaata 7780629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 133; E-Value: 5e-69
Query Start/End: Original strand, 14 - 236
Target Start/End: Original strand, 8103880 - 8104104
Alignment:
Q  14 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaac-gataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaat-gataaagttgcgattactatggcgag 111  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||  ||||||| ||||||||||||| ||||| | ||||||  |||||| ||| ||||| || |||| |    
T  8103880 gaccgttcgacaccaaataccattccaagttaaaaagataattggttgtttgttttagtaactcaattgcaaacgataaaattgagattaatagggcgtg 8103979  T
Q  112 aaacttgttagtattagcgttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaa 211  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  8103980 aaacttgttaggattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaacctaatgatcacacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcga 8104079  T
Q  212 caacaccattcgtgtccaaacaata 236  Q
    |||||| ||||||||||||||||||    
T  8104080 caacactattcgtgtccaaacaata 8104104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 14 - 236
Target Start/End: Original strand, 30238259 - 30238482
Alignment:
Q  14 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaa-tgataaagttgcgattactatggcgaga 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||| ||| ||||| || ||||  |    
T  30238259 gaccgttcgacaccaaatatcattccaagttaaaagataattggttgtttgttttagtaactaaattgcaaatgataaaattgagattaatagggcgtaa 30238358  T
Q  113 aacttgttagtattagcgttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaac 212  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||    
T  30238359 aacttgttaggattagagttccttgatcaagcgtcacacataacctaatgaccatacatgtattctagcttttctttgatattatcatttatccctcgac 30238458  T
Q  213 aacaccattcgtgtccaaacaata 236  Q
    ||||| ||||||||||||||||||    
T  30238459 aacactattcgtgtccaaacaata 30238482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 14 - 236
Target Start/End: Original strand, 17456853 - 17457077
Alignment:
Q  14 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagtt-aaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaat-gataaagttgcgattactatggcgag 111  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||| ||||||| ||||||||||||| ||||| | ||||||  || ||| ||| ||||| || |||| |    
T  17456853 gaccgttcgacaccaaataccattccaagttgaaaagataattggttgtttgttttagtaactcatttgcaaacgacaaaattgagattaatagggcgtg 17456952  T
Q  112 aaacttgttagtattagcgttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaa 211  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  17456953 aaacttgttaggattagagttccttgatcaagcgtcgcacgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcga 17457052  T
Q  212 caacaccattcgtgtccaaacaata 236  Q
    |||||| |||| |||||||||||||    
T  17457053 caacactattcatgtccaaacaata 17457077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 111; E-Value: 6e-56
Query Start/End: Original strand, 19 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 36755017 - 36754791
Alignment:
Q  19 ttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagtt---------gcaatgataaagttgcgattactatggcg 109  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||         | ||||||||||||| ||||| || ||||    
T  36755017 ttcgacaccaaatatcattctaaattaaaagatagtttgttgtttgttttagtaactaagttaactatattgaaatgataaagttgagattaataaggcg 36754918  T
Q  110 agaaacttgttagtattagcgttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctc 209  Q
     ||||||| |||| |||   ||||||| |||||||||||||| | | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  36754917 tgaaacttattaggattgaagttccttaatcaagcgtcacacattacctaatgaccatacatggattctagcttttctttgatattatcatgtatccctc 36754818  T
Q  210 aacaacaccattcgtgtccaaacaata 236  Q
     ||||||||||||||||||||||||||    
T  36754817 gacaacaccattcgtgtccaaacaata 36754791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 7 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 30211758 - 30211536
Alignment:
Q  7 tatcatagaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgc-aatgataaagttgcgattactat 105  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||        |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||| ||| ||||| ||     
T  30211758 tatcacagaccgttcgacaccaaatat--------gttaaaagataatttgttgtttgttttagtaactaagttgcgaataataaaattgagattaataa 30211667  T
Q  106 ggcgagaaacttgttagtattagcgttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatc 205  Q
    |||  |||||||||||  ||||| ||||||| |||||||||||||| |||  |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  30211666 ggcatgaaacttgttatgattagagttccttaatcaagcgtcacacataacttaatgaccatacatggattctagattttctttgatattatcacgtatc 30211567  T
Q  206 cctcaacaacaccattcgtgtccaaacaata 236  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  30211566 cctcgacaacaccattcgtgtccaaaaaata 30211536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 89 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 5660696 - 5660549
Alignment:
Q  89 aaagttgcgattactatggcgagaaacttgttagtattagcgttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctt 188  Q
    ||||||| ||||| || |||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||| |||| |||||||||||| | |||||||| ||||||||    
T  5660696 aaagttgagattaataaggcgtgaaacttgttaggattagagttccttgatcaagcatcacatgtaacctaatgatcatatacggattctaacttttctt 5660597  T
Q  189 tgatattatcacgtatccctcaacaacaccattcgtgtccaaacaata 236  Q
    |||||| |||||||||||||| |||| | |||||||||||||| ||||    
T  5660596 tgatataatcacgtatccctcgacaatatcattcgtgtccaaataata 5660549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 7 - 84
Target Start/End: Complemental strand, 13004017 - 13003940
Alignment:
Q  7 tatcatagaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaa 84  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  13004017 tatcacagactgttcgacaccaaatatcattataagttaaaagacaatttgttgtttgttttagtaacaaagttgcaa 13003940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 14 - 231
Target Start/End: Original strand, 2947844 - 2948062
Alignment:
Q  14 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaatgataaagttgcgattactatggcg-aga 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||| |||| || |   || |  ||||||| || || || |||| | |    
T  2947844 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgatagttgattgtttgttttagtaaccaaatataaaagtgaaagttgagagtaatagggcgtaaa 2947943  T
Q  113 aacttgttagtattagcgttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgat--catacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctca 210  Q
    |||   || | ||||| ||||||||||||||| ||| |  ||||||||| ||  |||| |||||||||||| |||    |||||||||||||||| ||||    
T  2947944 aac--attggaattagagttccttgatcaagcatcaaatataatctaataatcacatatatggattctagcgttttaccgatattatcacgtatcgctca 2948041  T
Q  211 acaacaccattcgtgtccaaa 231  Q
    |||| |  |||||||||||||    
T  2948042 acaagattattcgtgtccaaa 2948062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 14 - 84
Target Start/End: Original strand, 48914898 - 48914969
Alignment:
Q  14 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagtt-aaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaa 84  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||| ||||||| ||||||||||||| ||||| | ||||||    
T  48914898 gaccgttcgacaccaaataccattccaagttgaaaagataattggttgtttgttttagtaactcatttgcaa 48914969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 14 - 46
Target Start/End: Complemental strand, 5660775 - 5660743
Alignment:
Q  14 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaa 46  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  5660775 gaccgttcgacaccaaatatcattttaagttaa 5660743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 148; Significance: 5e-78; HSPs: 18)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 148; E-Value: 5e-78
Query Start/End: Original strand, 14 - 236
Target Start/End: Original strand, 12768743 - 12768966
Alignment:
Q  14 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaa-tgataaagttgcgattactatggcgaga 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||| || |||| ||    
T  12768743 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaatgataattcgttgtttgttttaataactaaattgcaaatgataaagttgagattaataaggcgtga 12768842  T
Q  113 aacttgttagtattagcgttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaac 212  Q
    |||||||||| ||||| |||| |||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||    
T  12768843 aacttgttaggattagagttctttgatcaagcttcacacgtaacctaatgattatacatggattctagattttctttgatattatcatgtatccctcgac 12768942  T
Q  213 aacaccattcgtgtccaaacaata 236  Q
    || |||||||||||||||||||||    
T  12768943 aagaccattcgtgtccaaacaata 12768966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 14 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 11358417 - 11358193
Alignment:
Q  14 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaac-gataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaat-gataaagttgcgattactatggcgag 111  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||  ||||||| ||||||||||||| ||||| | ||||||  |||||| ||| ||||| || |||| |    
T  11358417 gaccgttcgacaccaaataccattccaagttaaaaagataattggttgtttgttttagtaactcaattgcaaacgataaaattgagattaatagggcgtg 11358318  T
Q  112 aaacttgttagtattagcgttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaa 211  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  11358317 aaacttgttaggattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcga 11358218  T
Q  212 caacaccattcgtgtccaaacaata 236  Q
    |||||| ||||||||||||||||||    
T  11358217 caacactattcgtgtccaaacaata 11358193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 136; E-Value: 8e-71
Query Start/End: Original strand, 14 - 236
Target Start/End: Original strand, 7311348 - 7311571
Alignment:
Q  14 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaa-tgataaagttgcgattactatggcgaga 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||  |||||||||||| ||||| | |||||| ||||||| ||| ||||| || ||||  |    
T  7311348 gaccgttcgacaccaaatatcatttcaagttaaacgatagttgattgtttgttttagtaactgaattgcaaatgataaaattgagattaatagggcgtaa 7311447  T
Q  113 aacttgttagtattagcgttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaac 212  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  7311448 aacttgttaggattagagttccttgatcgagcgtcgcacgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcgac 7311547  T
Q  213 aacaccattcgtgtccaaacaata 236  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  7311548 aacaccattcgtgtccaaacaata 7311571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 136; E-Value: 8e-71
Query Start/End: Original strand, 14 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 8013543 - 8013320
Alignment:
Q  14 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaa-tgataaagttgcgattactatggcgaga 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||  |||||||||||| ||||| | |||||| ||||||| ||| ||||| || ||||  |    
T  8013543 gaccgttcgacaccaaatatcatttcaagttaaacgatagttgattgtttgttttagtaactgaattgcaaatgataaaattgagattaatagggcgtaa 8013444  T
Q  113 aacttgttagtattagcgttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaac 212  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  8013443 aacttgttaggattagagttccttgatcgagcgtcgcacgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcgac 8013344  T
Q  213 aacaccattcgtgtccaaacaata 236  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  8013343 aacaccattcgtgtccaaacaata 8013320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 136; E-Value: 8e-71
Query Start/End: Original strand, 14 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 36005705 - 36005482
Alignment:
Q  14 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaa-tgataaagttgcgattactatggcgaga 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||  |||||||||||| ||||| | |||||| ||||||| ||| ||||| || ||||  |    
T  36005705 gaccgttcgacaccaaatatcatttcaagttaaacgatagttgattgtttgttttagtaactgaattgcaaatgataaaattgagattaatagggcgtaa 36005606  T
Q  113 aacttgttagtattagcgttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaac 212  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  36005605 aacttgttaggattagagttccttgatcgagcgtcgcacgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcgac 36005506  T
Q  213 aacaccattcgtgtccaaacaata 236  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  36005505 aacaccattcgtgtccaaacaata 36005482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 133; E-Value: 5e-69
Query Start/End: Original strand, 13 - 236
Target Start/End: Original strand, 36075965 - 36076189
Alignment:
Q  13 agaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaa-tgataaagttgcgattactatggcgag 111  Q
    |||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||| ||  |||||||||||| ||||| | |||||| ||||||| ||| ||||| || ||||      
T  36075965 agaccgttcgacaccaaatatcatttcaagttaaacaatagttgattgtttgttttagtaactgaattgcaaatgataaaattgagattaatagggcgta 36076064  T
Q  112 aaacttgttagtattagcgttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaa 211  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  36076065 aaacttgttaggattagagttccttgatcgagcgtcgcacgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcga 36076164  T
Q  212 caacaccattcgtgtccaaacaata 236  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  36076165 caacaccattcgtgtccaaacaata 36076189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 133; E-Value: 5e-69
Query Start/End: Original strand, 14 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 36425954 - 36425730
Alignment:
Q  14 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaac-gataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaat-gataaagttgcgattactatggcgag 111  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||  ||||||| ||||||||||||| ||||| | ||||||  |||||| ||| ||||| || |||| |    
T  36425954 gaccgttcgacaccaaataccattccaagttaaaaagataattggttgtttgttttagtaactcatttgcaaacgataaaattgagattaatagggcgtg 36425855  T
Q  112 aaacttgttagtattagcgttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaa 211  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  36425854 aaacttgttaggattagagttccttgatcaagcgtcgcacgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcga 36425755  T
Q  212 caacaccattcgtgtccaaacaata 236  Q
    |||||| ||||||||||||||||||    
T  36425754 caacactattcgtgtccaaacaata 36425730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 14 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 6464799 - 6464576
Alignment:
Q  14 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaa-tgataaagttgcgattactatggcgaga 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||  |||||||||||| ||||| | |||||| ||||||| ||| ||||| || ||||  |    
T  6464799 gaccgttcgacaccaaatatcatttcaagttaaacgatagttgattgtttgttttagtaactgaattgcaaatgataaaattgagattaatagggcgtaa 6464700  T
Q  113 aacttgttagtattagcgttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaac 212  Q
    |||| ||||| ||||| ||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  6464699 aactcgttaggattagagttccttgatcgagcgtcgcacgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcgac 6464600  T
Q  213 aacaccattcgtgtccaaacaata 236  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  6464599 aacaccattcgtgtccaaacaata 6464576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 126; E-Value: 7e-65
Query Start/End: Original strand, 20 - 236
Target Start/End: Original strand, 15012393 - 15012610
Alignment:
Q  20 tcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaatgataaa-gttgcgattactatggcgagaaacttg 118  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||   |||| |||| || || || || | ||||||||    
T  15012393 tcgacaccaaatatcattctaagttaaaagataatttgttgtttgttttagttactaagttgcaagagtaaaagttgagagtaatagggtgtgaaacttg 15012492  T
Q  119 ttagtattagcgttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaacaacacc 218  Q
    |||| ||||| ||||||| ||||||||||||||| || |||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  15012493 ttaggattagagttccttaatcaagcgtcacacggaacctaatgactatacatggattctatcttttctttgatattatcacgtatccctcgacaacacc 15012592  T
Q  219 attcgtgtccaaacaata 236  Q
    ||||||||||||||||||    
T  15012593 attcgtgtccaaacaata 15012610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 14 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 36022023 - 36021799
Alignment:
Q  14 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgtt-gtttgttttaataactaagttgcaa-tgataaagttgcgattactatggcgag 111  Q
    |||||||||||||||| |||||||  |||| ||| ||||| ||||| |||||||||| ||||| | |||||| ||||||| ||| ||||| || ||||      
T  36022023 gaccgttcgacaccaattatcatttcaagtaaaaagataagttgtttgtttgttttagtaactgaattgcaaatgataaaattgagattaatagggcgta 36021924  T
Q  112 aaacttgttagtattagcgttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaa 211  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  36021923 aaacttgttaggattagagttccttgatcgagcgtcgcacgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcga 36021824  T
Q  212 caacaccattcgtgtccaaacaata 236  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  36021823 caacaccattcgtgtccaaacaata 36021799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 14 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 41242339 - 41242116
Alignment:
Q  14 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaa-tgataaagttgcgattactatggcgaga 112  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||  |||||||| |||| ||  |||||||||||| ||||| | |||||| ||||||| ||| ||||| || ||||  |    
T  41242339 gaccgtttgacaccaaatatcttttcaagttaaatgatagttgattgtttgttttagtaactgaattgcaaatgataaaattgagattaatagggcgtaa 41242240  T
Q  113 aacttgttagtattagcgttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaac 212  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  41242239 aacttgttaggattagagttccttgatcgagcgtcgcacgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcgac 41242140  T
Q  213 aacaccattcgtgtccaaacaata 236  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  41242139 aacaccattcgtgtccaaacaata 41242116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 14 - 236
Target Start/End: Original strand, 1238212 - 1238436
Alignment:
Q  14 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgtt-gtttgttttaataactaagttgcaatgataaa-gttgcgattactatggcgag 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||| ||||||| ||| ||   |||| |||| || || ||  |||      
T  1238212 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaaaaataatttgtttgtttgttttagtaactaaattgaaaaagtaaaagttgagagtaatagagcgta 1238311  T
Q  112 aaacttgttagtattagcgttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaa 211  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||  ||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  1238312 aaacttgttaggattagagttccttgatcaagcgtcacaaataacctgatgaccatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcga 1238411  T
Q  212 caacaccattcgtgtccaaacaata 236  Q
    |||||| ||||||||||||||||||    
T  1238412 caacactattcgtgtccaaacaata 1238436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 14 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 16710892 - 16710668
Alignment:
Q  14 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgtt-gtttgttttaataactaagttgc-aatgataaagttgcgattactatggcgag 111  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||| | |||| |||||||||| ||||||| |||| || |  ||||||| ||  | || |||       
T  16710892 gaccgttcgactccaaatatcattctaagttgaaagatagtatgtttgtttgttttagtaactaaattgctaaagtaaaagttgagagcaatagggcata 16710793  T
Q  112 aaacttgttagtattagcgttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaa 211  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  16710792 aaacttgttaggattagagttccttgatcgagcgtcacacgtaacctaatgatcatacatgaattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcga 16710693  T
Q  212 caacaccattcgtgtccaaacaata 236  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  16710692 caacaccattcgtgtccaaacaata 16710668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 7 - 236
Target Start/End: Original strand, 31017391 - 31017608
Alignment:
Q  7 tatcatagaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaatgataaagttgcgattactatg 106  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||              |||||||||| || || |    
T  31017391 tatcatagaccgttcgacaccaaatatcattttaagttaaaagataatttgttgtttgttttagtaac--------------aaagttgcgaataataag 31017476  T
Q  107 gcgagaaacttgttagtattagcgttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcata--catggattctagcttttctttgatattatcacgtat 204  Q
    ||| |||||| ||||| ||||| |||| || ||||||||||||| |||| ||||||| ||||  |||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  31017477 gcgtgaaactagttaggattagagttctttaatcaagcgtcacatgtaacctaatgaccatatacatggattctaatttttctttgatattatcacgtat 31017576  T
Q  205 ccctcaacaacaccattcgtgtccaaacaata 236  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  31017577 ccctcgacaacaccattcgtgtccaaaaaata 31017608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 84; E-Value: 8e-40
Query Start/End: Original strand, 97 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 26250730 - 26250591
Alignment:
Q  97 gattactatggcgagaaacttgttagtattagcgttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatatta 196  Q
    ||||| || |||| |||| ||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  26250730 gattaataaggcgtgaaatttgttaggattagagttccttaatcaagcgtcacacgtaatctaataaccatacatggtttatagcttttctttgatatta 26250631  T
Q  197 tcacgtatccctcaacaacaccattcgtgtccaaacaata 236  Q
    ||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||    
T  26250630 tcacgtatccctcgacaatatcattcgtgtccaaacaata 26250591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 44 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 45068609 - 45068416
Alignment:
Q  44 taaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaatgataaa-gttgcgattactatggcgagaaacttgttagtattagcgttccttgatcaa 142  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||   |||| |||| || || ||   ||  ||| ||||||| ||||| |||| || |||||    
T  45068609 taaaagataatttgttgtttgttttagtaactaagttgcaagagtaaaagttgagagtaataaaacgtaaaatttgttaggattagagttctttaatcaa 45068510  T
Q  143 gcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaacaacaccattcgtgtccaaacaata 236  Q
    ||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||| | |||||||||||||||| |||||||    
T  45068509 gcgtcgcacgtaacctaatgaccatacatggattctagtttttctttgatattatcatgtaaccctcgataacaccattcgtgtccgaacaata 45068416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 14 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 7934150 - 7933931
Alignment:
Q  14 gaccgttcgacaccaaatatcattctaag-ttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaatgataaagttgcgattactatggcg-ag 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||  | |||||||||| |||| || |   || |  ||||||| || || || |||| |     
T  7934150 gaccgttcgacaccaaatatcattctaaggttaaacgatagttgatggtttgttttagtaaccaaatataaaagtgaaagttgagagtaatagggcgtaa 7934051  T
Q  112 aaacttgttagtattagcgttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatca--tacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctc 209  Q
    |||| |  | | ||||| ||||||||||||||| ||| |  ||||||||| ||||  || |||||||||||| |||    |||||||||||||||| |||    
T  7934050 aaacat--tggaattagagttccttgatcaagcatcaaatataatctaataatcacatatatggattctagcgttttaccgatattatcacgtatcgctc 7933953  T
Q  210 aacaacaccattcgtgtccaaa 231  Q
    ||||| |  |||||||||||||    
T  7933952 aacaagattattcgtgtccaaa 7933931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 14 - 67
Target Start/End: Original strand, 14393733 - 14393786
Alignment:
Q  14 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttt 67  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||| | | ||| |||||||||||    
T  14393733 gaccgttcgacaccaaatatcattttaagttaaaggttgattggttgtttgttt 14393786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 148; Significance: 5e-78; HSPs: 20)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 148; E-Value: 5e-78
Query Start/End: Original strand, 14 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 4311709 - 4311486
Alignment:
Q  14 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaa-tgataaagttgcgattactatggcgaga 112  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||| || ||||  |    
T  4311709 gaccgttcaacaccaaatatcattctaagttaaatgataatttgttgtttgtttgaataactaagttgcaaatgataaagttgagattaatagggcgtaa 4311610  T
Q  113 aacttgttagtattagcgttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaac 212  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||| |||| ||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  4311609 aacttgttaggattagagttccttgatcaatcgtcgcacataacctaatgaccatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcgac 4311510  T
Q  213 aacaccattcgtgtccaaacaata 236  Q
    ||||| ||||||||||||||||||    
T  4311509 aacactattcgtgtccaaacaata 4311486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 14 - 236
Target Start/End: Original strand, 32746369 - 32746592
Alignment:
Q  14 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaa-tgataaagttgcgattactatggcgaga 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||| ||| ||||| || ||||  |    
T  32746369 gaccgttcgacaccaaatatcattccaagttaaaagataattggttgtttgttttagtaactaaattgcaaatgataaaattgagattaatagggcgtaa 32746468  T
Q  113 aacttgttagtattagcgttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaac 212  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  32746469 aacttgttaggattagagttccttgatcaagcgtcacacataacctaatgaccatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcgac 32746568  T
Q  213 aacaccattcgtgtccaaacaata 236  Q
    ||||| ||||||||||||||||||    
T  32746569 aacactattcgtgtccaaacaata 32746592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 143; E-Value: 5e-75
Query Start/End: Original strand, 7 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 10941534 - 10941304
Alignment:
Q  7 tatcatagaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgc-aatgataaagttgcgattactat 105  Q
    ||||| |||||||| |||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||| ||| ||||| ||     
T  10941534 tatcacagaccgtttgacacctaatataattctaagttaaaagataatttgttgtttgttttagtaactaagttgcgaataataaaattgagattaataa 10941435  T
Q  106 ggcgagaaacttgttagtattagcgttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatc 205  Q
    |||| |||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  10941434 ggcgtgaaacttgttaggattagagttccttaatcaagcgtcacacgtaacctaatgaccatatatggattctaacttttctttgatattatcacgtatc 10941335  T
Q  206 cctcaacaacaccattcgtgtccaaacaata 236  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  10941334 cctcgacaacaccattcgtgtccaaacaata 10941304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 14 - 236
Target Start/End: Original strand, 6036265 - 6036488
Alignment:
Q  14 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaa-tgataaagttgcgattactatggcgaga 112  Q
    ||||||| |||||||||||| |||| |||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||| ||| || ||||||| ||| ||||| || |||| ||    
T  6036265 gaccgtttgacaccaaatataattccaagttaaaagataattggttgtttgttttagtaactaaattgaaaatgataaaattgagattaatagggcgtga 6036364  T
Q  113 aacttgttagtattagcgttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaac 212  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  6036365 aacttgttaggattagagttccttgatcaagcgtcactcgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcgac 6036464  T
Q  213 aacaccattcgtgtccaaacaata 236  Q
    ||||| ||||||||||||||||||    
T  6036465 aacactattcgtgtccaaacaata 6036488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 14 - 236
Target Start/End: Original strand, 24179072 - 24179296
Alignment:
Q  14 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaac-gataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaat-gataaagttgcgattactatggcgag 111  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||  ||||||| ||||||||||||| ||||| | ||||||  |||||| ||| ||||| || |||| |    
T  24179072 gaccgttcgacaccaaataccattccaagttaaaaagataattggttgtttgttttagtaactcaattgcaaacgataaaattgagattaatagggcgtg 24179171  T
Q  112 aaacttgttagtattagcgttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaa 211  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  24179172 aaacttgttaggattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcga 24179271  T
Q  212 caacaccattcgtgtccaaacaata 236  Q
    |||||| ||||||||||||||||||    
T  24179272 caacactattcgtgtccaaacaata 24179296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 13 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 9570774 - 9570548
Alignment:
Q  13 agaccgttcgacaccaaatatcattctaagtt-aaacgataatttgtt-gtttgttttaataactaagttgca-atgataaagttgcgattactatggcg 109  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||| ||||| |||||||||| ||||||| ||||| |||||||| ||| ||||| || ||||    
T  9570774 agaccgttcgacaccaattatcattctaagtttaaaagataagttgtttgtttgttttagtaactaaattgcagatgataaaattgagattaatagggcg 9570675  T
Q  110 agaaacttgttagtattagcgttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctc 209  Q
      ||||||||||| |||||  |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9570674 taaaacttgttaggattagaattccttgatcgagcgtcacacgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctc 9570575  T
Q  210 aacaacaccattcgtgtccaaacaata 236  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||    
T  9570574 aacaataccattcgtgtccaaacaata 9570548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 133; E-Value: 5e-69
Query Start/End: Original strand, 14 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 27502191 - 27501967
Alignment:
Q  14 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagtt-aaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaat-gataaagttgcgattactatggcgag 111  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||| ||||||| ||||||||||||| ||||| | ||||||  |||||| ||| ||||| || |||| |    
T  27502191 gaccgttcgacaccaaataccattccaagttgaaaagataattggttgtttgttttagtaactcatttgcaaacgataaaattgagattaatagggcgtg 27502092  T
Q  112 aaacttgttagtattagcgttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaa 211  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  27502091 aaacttgttaggattagagttccttgatcaagcgtcgcacgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcga 27501992  T
Q  212 caacaccattcgtgtccaaacaata 236  Q
    |||||| ||||||||||||||||||    
T  27501991 caacactattcgtgtccaaacaata 27501967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 14 - 236
Target Start/End: Original strand, 13014985 - 13015208
Alignment:
Q  14 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgc-aatgataaagttgcgattactatggcgaga 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||| |||| ||||  ||||||| |||||  | ||||  |    
T  13014985 gaccgttcgacaccaaatatcattccaagttaaaagataattggttgtttgttttagtaactaaattgctaatgtaaaagttgagattaacagggcgtaa 13015084  T
Q  113 aacttgttagtattagcgttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaac 212  Q
    |||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  13015085 aacttgttaggattagagtttcttgatcaagcgtcacacataacctaatgaccatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcgac 13015184  T
Q  213 aacaccattcgtgtccaaacaata 236  Q
    ||||| ||||||||||||||||||    
T  13015185 aacactattcgtgtccaaacaata 13015208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 131; E-Value: 7e-68
Query Start/End: Original strand, 13 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 9577276 - 9577050
Alignment:
Q  13 agaccgttcgacaccaaatatcattctaagtt-aaacgataatttgtt-gtttgttttaataactaagttgca-atgataaagttgcgattactatggcg 109  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||| ||||| ||||| |||||||||| ||||||| ||||| |||||||| ||| ||||| || ||||    
T  9577276 agaccgttcgacaccaattattattctaagtttaaaagataagttgtttgtttgttttagtaactaaattgcagatgataaaattgagattaatagggcg 9577177  T
Q  110 agaaacttgttagtattagcgttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctc 209  Q
      ||||||||||| |||||  |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9577176 taaaacttgttaggattagaattccttgatcgagcgtcacacgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctc 9577077  T
Q  210 aacaacaccattcgtgtccaaacaata 236  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||    
T  9577076 aacaataccattcgtgtccaaacaata 9577050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 14 - 236
Target Start/End: Original strand, 25893229 - 25893458
Alignment:
Q  14 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagtt-aaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgc-aatgataaagttgcgattactatggcgag 111  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| | ||||| ||||||||||||| ||||| | |||| || |||||| ||| ||||| || |||| |    
T  25893229 gaccgttcgacaccaaataccattctaagttaaaaagttaattggttgtttgttttagtaactcaattgcaaacgataaaattgagattaatagggcgtg 25893328  T
Q  112 aaacttgttagtattagcg-----ttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatcc 206  Q
    ||||||||||| ||||| |     |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25893329 aaacttgttaggattagagttaaattccttgatcaagcgtcacacgtaacttaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatcc 25893428  T
Q  207 ctcaacaacaccattcgtgtccaaacaata 236  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||||    
T  25893429 ctcaacaatactattcgtgtccaaacaata 25893458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 14 - 236
Target Start/End: Original strand, 43995068 - 43995300
Alignment:
Q  14 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgc---------aatgataaagttgcgattacta 104  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||  ||||||||||          ||||||||||||| ||||| ||    
T  43995068 gaccattcgacatcaaatatcattctaagttaaaagatagtttgttgtttgttttagaaactaagttgactatgttgaaatgataaagttgagattaata 43995167  T
Q  105 tggcgagaaacttgttagtattagcgttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttc-tttgatattatcacgta 203  Q
     |||| ||||||||| || ||||| ||||||| | |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  43995168 aggcgtgaaacttgtcaggattagagttccttaaccaagcgtcacacgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttcttttgatattattacgta 43995267  T
Q  204 tccctcaacaacaccattcgtgtccaaacaata 236  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  43995268 tccctcgacaacaccattcgtgtccaaacaata 43995300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 14 - 236
Target Start/End: Original strand, 43931581 - 43931799
Alignment:
Q  14 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgc-aatgataaagttgcgattactatggcgaga 112  Q
    |||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||  || ||||| ||| ||||| || |||| ||    
T  43931581 gaccgtccgacaccaaataccattctaagttaaaagataatttgttgtttgttttagtaactaagttgcggataataaaattgagattaataaggcgtga 43931680  T
Q  113 aacttgttagtattagcgttccttgatcaagcgtcac--acgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctca 210  Q
    |||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||  |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||       ||||||||||||||||     
T  43931681 aacttgttaggattagagttccttaatcaagcgtcacatacgtaacctaatgaccatacatggattctagcttttc-------ttatcacgtatccctcg 43931773  T
Q  211 acaacaccattcgtgtccaaacaata 236  Q
    |||||||||||||||| |||||||||    
T  43931774 acaacaccattcgtgttcaaacaata 43931799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 13 - 236
Target Start/End: Original strand, 23068462 - 23068686
Alignment:
Q  13 agaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaac-gataatttgtt-gtttgttttaataactaagttgcaatgataaa-gttgcgattactatggcg 109  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||| |||| |||||||||| ||||||| ||||||   |||| ||||  |||| || ||||    
T  23068462 agaccgttcgtcaccaaatatcattctaagttaaaaagataatctgtttgtttgttttagtaactaaattgcaaaagtaaaagttgaaattaatagggcg 23068561  T
Q  110 agaaacttgttagtattagcgttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctc 209  Q
     |||||||||||| ||||| |||| |||||| ||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  23068562 -gaaacttgttaggattagagttctttgatcgagcatcgcacgtaacctaatgatcatacatggattcta-cttttctttgatattatcacgtatccctc 23068659  T
Q  210 aacaacaccattcgtgtccaaacaata 236  Q
     ||||||||||||||||||||||||||    
T  23068660 gacaacaccattcgtgtccaaacaata 23068686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 14 - 140
Target Start/End: Original strand, 41353860 - 41353987
Alignment:
Q  14 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgc-aatgataaagttgcgattactatggcgaga 112  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| ||||| || | ||  |    
T  41353860 gaccgttcgacaccaaatatcattttaagttaaacgataatttgttgtttgtttgaataactaagttgcaaatgataaagttgagattaataggacgtaa 41353959  T
Q  113 aacttgttagtattagcgttccttgatc 140  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||    
T  41353960 aacttgttaggattagagttccttgatc 41353987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 7 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 20651362 - 20651135
Alignment:
Q  7 tatcatagaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgtt-gtttgttttaat------aactaagttgcaatgataaa-gttgcga 98  Q
    |||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||   ||||| |||||||| ||       |||||| ||||||  ||||| |||| ||    
T  20651362 tatcatggactgttcgacaccaaatatcattttaagttaaaagattggttgtttgtttgtttaaactatgtgaactaatttgcaagaataaaagttgaga 20651263  T
Q  99 ttactatggcgagaaacttgttagtattagcgttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatc 198  Q
    ||| || |||| |||||| ||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||    
T  20651262 ttaataaggcgtgaaactcgttaggattagagttccttgatcaagcatcacacgtaatttaatgatcatatacggattctaccttttctttgatattatc 20651163  T
Q  199 acgtatccctcaacaacaccattcgtgt 226  Q
    ||||||||||  |||| | |||||||||    
T  20651162 acgtatcccttgacaatatcattcgtgt 20651135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 7 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 41354300 - 41354142
Alignment:
Q  7 tatcatagaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgtt-gtttgttttaataactaagttgcaatgataaa-gttgcgattacta 104  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||   |||| |||| || || ||    
T  41354300 tatcatggaccgttcgacaccaaatatcattctaagttgaaa-ataatttgtttgtttgttttagtaactaaattgcaaaagtaaaagttgagagtaata 41354202  T
Q  105 tggcgagaaacttgttagtattagcgttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgat 164  Q
     |||| |||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  41354201 gggcgtgaaacttgttaggattagagttccttgagcaagcgtcacacgtaacctaatgat 41354142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 13 - 80
Target Start/End: Complemental strand, 3577162 - 3577095
Alignment:
Q  13 agaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagtt 80  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  3577162 agaccgttcgacaccaaatattattctaagttaaatgataatttgttgtttgtttgaataactaagtt 3577095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 13 - 231
Target Start/End: Original strand, 4590792 - 4591012
Alignment:
Q  13 agaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttg-ttgtttgttttaataactaagttgcaatgataaagttgcgattactatggcg-a 110  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| ||| |||||||||||| |||| || |   || | |||||||| || || || |||| |    
T  4590792 agaccgttcgacaccaattatcattccaagttaaaagataagttgtttgtttgttttagtaaccaaatataaaagttaaagttgagagtaatagggcgta 4590891  T
Q  111 gaaacttgttagtattagcgttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgat--catacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccct 208  Q
     ||||  ||| | ||||| ||||||||||||||| ||| |  ||||||||| ||  |||| |||||||||||| |||    |||||||||||||||| ||    
T  4590892 aaaac--gttggaattagagttccttgatcaagcatcaaatataatctaataatcacatatatggattctagcgttttaccgatattatcacgtatcgct 4590989  T
Q  209 caacaacaccattcgtgtccaaa 231  Q
    |||||| |  |||||||||||||    
T  4590990 caacaagattattcgtgtccaaa 4591012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 7 - 47
Target Start/End: Complemental strand, 20952993 - 20952953
Alignment:
Q  7 tatcatagaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaa 47  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20952993 tatcacagaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaa 20952953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 174 - 231
Target Start/End: Original strand, 2785865 - 2785922
Alignment:
Q  174 attctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaacaacaccattcgtgtccaaa 231  Q
    ||||||||||||  | |||||||||||||||||||| |||| | |||| |||||||||    
T  2785865 attctagcttttaatcgatattatcacgtatccctcgacaaaatcatttgtgtccaaa 2785922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0053 (Bit Score: 147; Significance: 2e-77; HSPs: 1)
Name: scaffold0053
Description:

Target: scaffold0053; HSP #1
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 7 - 236
Target Start/End: Original strand, 49683 - 49912
Alignment:
Q  7 tatcatagaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaa-tgataaagttgcgattactat 105  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||     
T  49683 tatcacagaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaa-gataatttgttgtttgtttgaataactaagttgcaaatgataaagttgagattaatag 49781  T
Q  106 ggcgagaaacttgttagtattagcgttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatc 205  Q
    ||||  ||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||| ||| ||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49782 ggcgtaaaacttgttaggattagagttccttcatcaagcgtcgcacataacctaatgaccatacacggattctagcttttctttgatattatcacgtatc 49881  T
Q  206 cctcaacaacaccattcgtgtccaaacaata 236  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  49882 cctcgacaacactattcgtgtccaaacaata 49912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0043 (Bit Score: 136; Significance: 8e-71; HSPs: 1)
Name: scaffold0043
Description:

Target: scaffold0043; HSP #1
Raw Score: 136; E-Value: 8e-71
Query Start/End: Original strand, 14 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 5228 - 5005
Alignment:
Q  14 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaa-tgataaagttgcgattactatggcgaga 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||  |||||||||||| ||||| | |||||| ||||||| ||| ||||| || ||||  |    
T  5228 gaccgttcgacaccaaatatcatttcaagttaaacgatagttgattgtttgttttagtaactgaattgcaaatgataaaattgagattaatagggcgtaa 5129  T
Q  113 aacttgttagtattagcgttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaac 212  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  5128 aacttgttaggattagagttccttgatcgagcgtcgcacgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcgac 5029  T
Q  213 aacaccattcgtgtccaaacaata 236  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  5028 aacaccattcgtgtccaaacaata 5005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0060 (Bit Score: 135; Significance: 3e-70; HSPs: 1)
Name: scaffold0060
Description:

Target: scaffold0060; HSP #1
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 7 - 236
Target Start/End: Original strand, 15163 - 15393
Alignment:
Q  7 tatcatagaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgc-aatgataaagttgcgattactat 105  Q
    ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||  |||| ||| ||||| ||     
T  15163 tatcacagacctttcgacacaaaatatcattctaacttaaaagataatttgttgtttgttttagtaactaagttgcgaatagtaaaattgagattaataa 15262  T
Q  106 ggcgagaaacttgttagtattagcgttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatc 205  Q
    |||| |||||||||||| ||||| |||||||  || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  15263 ggcgtgaaacttgttaggattagagttccttattccagcgtcacacgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcatgtatc 15362  T
Q  206 cctcaacaacaccattcgtgtccaaacaata 236  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  15363 cctcgacaacaccgttcgtgtccaaacaata 15393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0936 (Bit Score: 128; Significance: 5e-66; HSPs: 1)
Name: scaffold0936
Description:

Target: scaffold0936; HSP #1
Raw Score: 128; E-Value: 5e-66
Query Start/End: Original strand, 14 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 3486 - 3264
Alignment:
Q  14 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaatgataaa-gttgcgattactatggcgaga 112  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||   |||| |||| ||||| || |||| ||    
T  3486 gaccattcgacactaaatatcattctaagttaaa-gatgatttgttgtttgttttagtaactaagttgcaagagtaaaagttgagattaataaggcgtga 3388  T
Q  113 aacttgttagtattagcgttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaac 212  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||| ||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  3387 aacttgttaggattagagttccttgatcaagcttcacacttaacctaattaccatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcgac 3288  T
Q  213 aacaccattcgtgtccaaacaata 236  Q
    |||| |||||||||||||||||||    
T  3287 aacatcattcgtgtccaaacaata 3264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0510 (Bit Score: 117; Significance: 2e-59; HSPs: 2)
Name: scaffold0510
Description:

Target: scaffold0510; HSP #1
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 14 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 9105 - 8881
Alignment:
Q  14 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgtt-gtttgttttaataactaagttgc-aatgataaagttgcgattactatggcgag 111  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||| |||||| |||||||||| ||||||| |||| || |  ||||||| || || || ||||      
T  9105 gaccgttcgactccaaatatcattctaagttgaaagatagtttgtttgtttgttttagtaactaaattgctaaagtaaaagttgagagtaatagggcgta 9006  T
Q  112 aaacttgttagtattagcgttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaa 211  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||||| | | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |    
T  9005 aaacttgttaggattagagttccttgatcgatcctcacacgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacatatccctcga 8906  T
Q  212 caacaccattcgtgtccaaacaata 236  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  8905 caacaccattcgtgtccaaacaata 8881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0510; HSP #2
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 14 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 2784 - 2560
Alignment:
Q  14 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgtt-gtttgttttaataactaagttgcaatgataaa-gttgcgattactatggcgag 111  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||| ||||||| ||||||   |||| |||| || || || ||||      
T  2784 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaaagataatttatttgtttgttttagtaactaaattgcaaaagtaaaagttgagagtaatagggcgta 2685  T
Q  112 aaacttgttagtattagcgttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaa 211  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||  ||| ||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| |    
T  2684 aaacttgttaggattagagttccttgattaagcgtcacatataacctaatgaccattcatggattcaagcttttctttgatattatcatgtatccctcga 2585  T
Q  212 caacaccattcgtgtccaaacaata 236  Q
    ||||||||||| |||||||||||||    
T  2584 caacaccattcatgtccaaacaata 2560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0513 (Bit Score: 101; Significance: 6e-50; HSPs: 2)
Name: scaffold0513
Description:

Target: scaffold0513; HSP #1
Raw Score: 101; E-Value: 6e-50
Query Start/End: Original strand, 112 - 236
Target Start/End: Original strand, 12031 - 12155
Alignment:
Q  112 aaacttgttagtattagcgttccttgatcaagcgtcacacgtaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaa 211  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  12031 aaacttgttaggattagagttccttgatcgagcgtcacacgtaacctaatgatcataaatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcga 12130  T
Q  212 caacaccattcgtgtccaaacaata 236  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  12131 caacaccattcgtgtccaaacaata 12155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0513; HSP #2
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 14 - 78
Target Start/End: Original strand, 11949 - 12014
Alignment:
Q  14 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttg-ttgtttgttttaataactaag 78  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||| |||| |||||||||||| ||||||||    
T  11949 gaccgttcgactccaaatatcattctaagttgaaagatagtttgtttgtttgttttagtaactaag 12014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0002 (Bit Score: 80; Significance: 2e-37; HSPs: 1)
Name: scaffold0002
Description:

Target: scaffold0002; HSP #1
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 14 - 120
Target Start/End: Original strand, 99913 - 100020
Alignment:
Q  14 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgc-aatgataaagttgcgattactatggcgaga 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| ||||| || |||| ||    
T  99913 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgtttgaataactaagttgcaaatgataaagttgagattaatagggcgtga 100012  T
Q  113 aacttgtt 120  Q
    ||||||||    
T  100013 aacttgtt 100020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0173 (Bit Score: 50; Significance: 2e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0173
Description:

Target: scaffold0173; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 7 - 84
Target Start/End: Complemental strand, 24476 - 24399
Alignment:
Q  7 tatcatagaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaa 84  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  24476 tatcacagactgttcgacaccaaatatcattataagttaaaagacaatttgttgtttgttttagtaacaaagttgcaa 24399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University