View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF9563_low_1 (Length: 443)

Name: NF9563_low_1
Description: NF9563
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF9563_low_1
NF9563_low_1
[»] chr4 (11 HSPs)
chr4 (16-433)||(5346572-5346989)
chr4 (16-429)||(5423896-5424309)
chr4 (17-429)||(5378419-5378830)
chr4 (17-428)||(5362920-5363331)
chr4 (19-429)||(5354075-5354485)
chr4 (16-336)||(5401091-5401395)
chr4 (56-428)||(5501978-5502350)
chr4 (91-428)||(5412259-5412596)
chr4 (91-428)||(5468188-5468525)
chr4 (91-428)||(5392810-5393147)
chr4 (358-428)||(5356534-5356604)
[»] chr5 (1 HSPs)
chr5 (16-429)||(20328593-20329006)


Alignment Details
Target: chr4 (Bit Score: 398; Significance: 0; HSPs: 11)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 398; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 16 - 433
Target Start/End: Complemental strand, 5346989 - 5346572
Alignment:
Q  16 caaatccatgattctttttgtaatgcatctcgtttaaggctgctagatctttcccataataaatttgttggaacaattcccaagtgttttgaaacactga 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5346989 caaatccatgattctttttgtaatgcatctcgtttaaggctgctagatctttcccataataaatttgttggaacaattcccaagtgttttgaaacactga 5346890  T
Q  116 gtagcagtctaagaatgttgaatttcggtggaaacaagcttcgaggtcatattcctagtagtatgtttccaaatttatgtgcactaaggtttttggatct 215  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5346889 gtagcagtctaagaatgttgaatttcggtggaaacaagcttcgaggtcatattcctagtagtatgtttccaaatttatgtgcactaaggtttttggatct 5346790  T
Q  216 aaatgacaatcttttagaaggtcctataccgaaatccttggtcaattgtaaggaactacaggtcttaaaccttggaaagaatgcaataacaggcaaattt 315  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5346789 aaatgacaatcatttaggaggtcctataccaaaatcattggtcaattgtaaggaactacaggtcttaaaccttggaaagaatgcaataacaggcaaattt 5346690  T
Q  316 ccatgttttttgagtaaaattccaacattgagaatcatggttttaaggtcaaataaggtgcatggctctatcggatgcccaaatagcactggtgattgga 415  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5346689 ccatgttttttgagtaaaattccaacattgagaatcatggttttaaggtcaaataagctgcatggctctatcggatgcccaaatagcactggtgattgga 5346590  T
Q  416 agatgcttcatatctctg 433  Q
    ||||||||||||||||||    
T  5346589 agatgcttcatatctctg 5346572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 298; E-Value: 1e-167
Query Start/End: Original strand, 16 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 5424309 - 5423896
Alignment:
Q  16 caaatccatgattctttttgtaatgcatctcgtttaaggctgctagatctttcccataataaatttgttggaacaattcccaagtgttttgaaacactga 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || || ||||| |||||||||||||||||||||| ||| | || | ||||||||||||||||||| ||||||    
T  5424309 caaatccatgattctttttgtaatgcaactagtctaaggttgctagatctttcccataataactttctcgggaaaattcccaagtgttttgaagcactga 5424210  T
Q  116 gtagcagtctaagaatgttgaatttcggtggaaacaagcttcgaggtcatattcctagtagtatgtttccaaatttatgtgcactaaggtttttggatct 215  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | |||||    
T  5424209 gtagcaatctaagagtgttgaatttcggtggaaacaagctccgaggtcaaattcctagtagtatgtttccaaatttatgcgcactaaggtttgttgatct 5424110  T
Q  216 aaatgacaatcttttagaaggtcctataccgaaatccttggtcaattgtaaggaactacaggtcttaaaccttggaaagaatgcaataacaggcaaattt 315  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  5424109 aaatgacaatcttttaggaggtcctataccaaaatccttgatcaattgtaaggaactacaagtcttaaaccttggaaagaatgcattaacaggcagattt 5424010  T
Q  316 ccatgttttttgagtaaaattccaacattgagaatcatggttttaaggtcaaataaggtgcatggctctatcggatgcccaaatagcactggtgattgga 415  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||||||    
T  5424009 ccatgttttctaagtaaaattccaacattgagaatcatggttttaaggtcaaataagctgcatgggtctatcagatgcccaaatagcactggttattgga 5423910  T
Q  416 agatgcttcatatc 429  Q
    ||||||||||||||    
T  5423909 agatgcttcatatc 5423896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 281; E-Value: 1e-157
Query Start/End: Original strand, 17 - 429
Target Start/End: Original strand, 5378419 - 5378830
Alignment:
Q  17 aaatccatgattctttttgtaatgcatctcgtttaaggctgctagatctttcccataataaatttgttggaacaattcccaagtgttttgaaacactgag 116  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||| |||||||| ||||| || |   |||||||    
T  5378419 aaatccatgattctttttgtaatgcatctagtctaaggctgctagatctttcccacaataactttggtggcacaattccaaagtgctt-gctgcactgag 5378517  T
Q  117 tagcagtctaagaatgttgaatttcggtggaaacaagcttcgaggtcatattcctagtagtatgtttccaaatttatgtgcactaaggtttttggatcta 216  Q
    |||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  5378518 tagcagtctacgaatgttaaattttggtggaaacaagcttcgaggtcatattcctagtagtatttttccaaattcatgtgcactaaggtttttggatcta 5378617  T
Q  217 aatgacaatcttttagaaggtcctataccgaaatccttggtcaattgtaaggaactacaggtcttaaaccttggaaagaatgcaataacaggcaaatttc 316  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||  | |||||||||||||||||| |||| |||| |||||    
T  5378618 aatgacaatcttttaggaggtcctataccaaaatccttggtcaactgtaaggaactacaagttattaaccttggaaagaatgcattaaccggcagatttc 5378717  T
Q  317 catgttttttgagtaaaattccaacattgagaatcatggttttaaggtcaaataaggtgcatggctctatcggatgcccaaatagcactggtgattggaa 416  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  5378718 catattttttgagtaaaattccaacattgagaatcatgattttaaggtcaaataagctgcatgggtctattggatgcccaaatagcactggtgattggaa 5378817  T
Q  417 gatgcttcatatc 429  Q
    |||||||||||||    
T  5378818 gatgcttcatatc 5378830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 156; E-Value: 1e-82
Query Start/End: Original strand, 17 - 428
Target Start/End: Original strand, 5362920 - 5363331
Alignment:
Q  17 aaatccatgattctttttgtaatgcatctcgtttaaggctgctagatctttcccataataaatttgttggaacaattcccaagtgttttgaaacactgag 116  Q
    |||||||||| ||||| || ||||||||  || |||| ||||||||||||||||||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||| | |||| ||    
T  5362920 aaatccatgaatctttctgcaatgcatcgagtctaagcctgctagatctttcccataataatttctttgggacaattcccaagtgttttgcagcactaag 5363019  T
Q  117 tagcagtctaagaatgttgaatttcggtggaaacaagcttcgaggtcatattcctagtagtatgtttccaaatttatgtgcactaaggtttttggatcta 216  Q
    || | ||||  | |||||||||||  ||||||| || || | ||||||||||||||  | |||||||| ||||| ||||||||| ||| |||| ||||||    
T  5363020 taaccgtcttcggatgttgaattttcgtggaaataaactccaaggtcatattcctaaaactatgtttctaaattcatgtgcactgaggattttcgatcta 5363119  T
Q  217 aatgacaatcttttagaaggtcctataccgaaatccttggtcaattgtaaggaactacaggtcttaaaccttggaaagaatgcaataacaggcaaatttc 316  Q
    |||||||||| |||||| ||  ||||||| |||||| | || ||||||  ||||||||| |||   ||| | ||||| |||||| |||| || | | |||    
T  5363120 aatgacaatcatttagacggcactataccaaaatccatagtaaattgtcgggaactacaagtcgataacatcggaaataatgcactaactggaagaattc 5363219  T
Q  317 catgttttttgagtaaaattccaacattgagaatcatggttttaaggtcaaataaggtgcatggctctatcggatgcccaaatagcactggtgattggaa 416  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  | || || | ||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  5363220 catgtttcttgagtaaaattccaaccttgagaatcatggttttaaggtcaaataaattccacgggtttattggatgcccaaatagcactggtgattggaa 5363319  T
Q  417 gatgcttcatat 428  Q
    ||||||||||||    
T  5363320 gatgcttcatat 5363331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 155; E-Value: 4e-82
Query Start/End: Original strand, 19 - 429
Target Start/End: Original strand, 5354075 - 5354485
Alignment:
Q  19 atccatgattctttttgtaatgcatctcgtttaaggctgctagatctttcccataataaatttgttggaacaattcccaagtgttttgaaacactgagta 118  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||  | |||   |||||||||||||||| ||||| |||||||| || |||||||||||||| | | |||||||||    
T  5354075 atccatgaatctttttgtaatgcatctactctaaacttgctagatctttcccacaataactttgttgggacgattcccaagtgtttcgcagcactgagta 5354174  T
Q  119 gcagtctaagaatgttgaatttcggtggaaacaagcttcgaggtcatattcctagtagtatgtttccaaatttatgtgcactaaggtttttggatctaaa 218  Q
    | ||||| |  ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||||||  || | ||||||||||||| ||||| |||||||    
T  5354175 gtagtctcaagatgttgaattttggtggaaacaagctccgaggtcatattcctactactatgtttcagaactcatgtgcactaaggcttttgaatctaaa 5354274  T
Q  219 tgacaatcttttagaaggtcctataccgaaatccttggtcaattgtaaggaactacaggtcttaaaccttggaaagaatgcaataacaggcaaatttcca 318  Q
    |||||||||||||||  ||  | |||| ||||| ||||||||||| || |||||| | ||| | ||||||||||||||| || |||| || |||||||||    
T  5354275 tgacaatcttttagacagtagtgtaccaaaatcattggtcaattgcaaagaactagaagtccttaaccttggaaagaattcattaaccggaaaatttcca 5354374  T
Q  319 tgttttttgagtaaaattccaacattgagaatcatggttttaaggtcaaataaggtgcatggctctatcggatgcccaaatagcactggtgattggaaga 418  Q
    ||||||||||| |||||| |  |  | ||| | ||||||||||||||||||||| | ||||| |||||   |||| | ||||||  ||||||||||||||    
T  5354375 tgttttttgagcaaaatttcctccctaagagtaatggttttaaggtcaaataagttccatgggtctattaaatgctctaatagctttggtgattggaaga 5354474  T
Q  419 tgcttcatatc 429  Q
    |||||||||||    
T  5354475 tgcttcatatc 5354485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 16 - 336
Target Start/End: Original strand, 5401091 - 5401395
Alignment:
Q  16 caaatccatgattctttttgtaatgcatctcgtttaaggctgctagatctttcccataataaatttgttggaacaattcccaagtgttttgaaacactga 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||| |||||||| ||||| |||||| | ||||||| ||||||||||| | ||||||    
T  5401091 caaatccatgattctttttgtaatgcatctagtcttaggctgctagacctttcccacaataactttgttaggacaattctcaagtgttttgcagcactga 5401190  T
Q  116 gtagcagtctaagaatgttgaatttcggtggaaacaagcttcgaggtcatattcctagtagtatgtttccaaatttatgtgcactaaggtttttggatct 215  Q
    |||||||||||||||||||||||||||                |||||||||||| | | ||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  5401191 gtagcagtctaagaatgttgaatttcg----------------aggtcatattccaaatggtatgtttcaaaattcatgtgcactaaggattttggatct 5401274  T
Q  216 aaatgacaatcttttagaaggtcctataccgaaatccttggtcaattgtaaggaactacaggtcttaaaccttggaaagaatgcaataacaggcaaattt 315  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||| ||||| ||||||| |||| |||| ||||    
T  5401275 aaatgacaatctttcagaaggtcctataccaaaatccttggtcaattgtaaggaacttcaagtctttaaccctggaatgaatgcattaacgggcagattt 5401374  T
Q  316 ccatgttttttgagtaaaatt 336  Q
    ||||||||| |||| ||||||    
T  5401375 ccatgttttctgagcaaaatt 5401395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 56 - 428
Target Start/End: Original strand, 5501978 - 5502350
Alignment:
Q  56 tgctagatctttcccataataaatttgttggaacaattcccaagtgttttgaaacactgagtagcagtctaagaatgttgaatttcggtggaaacaagct 155  Q
    |||||||||||||| | || || ||||  || ||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||| || ||||||||| | ||||||||||||||    
T  5501978 tgctagatctttcctacaacaactttgacgggacaattcccaagtgttttgcaacattgagtagtagtctcaggatgttgaatcttggtggaaacaagct 5502077  T
Q  156 tcgaggtcatattcctagtagtatgtttccaaatttatgtgcactaaggtttttggatctaaatgacaatcttttagaaggtcctataccgaaatccttg 255  Q
    |||||| ||||| |||  ||  || |  ||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||| || || |||  |||||| ||||| |||    
T  5502078 tcgagggcatatccctgatacaatatccccaaattcatgtgcactaagatatttggatctaaatgacaatctcttggatggtagtataccaaaatctttg 5502177  T
Q  256 gtcaattgtaaggaactacaggtcttaaaccttggaaagaatgcaataacaggcaaatttccatgttttttgagtaa-aattccaacattgagaatcatg 354  Q
    |||||||| ||| ||||||| ||| |||||||||| || |||||  ||   | || |||||||||||| ||||| || | ||||| |||| || ||||||    
T  5502178 gtcaattgcaagaaactacaagtcctaaaccttgggaacaatgctttagttgacagatttccatgtttcttgagaaacatttccaccatt-aggatcatg 5502276  T
Q  355 gttttaaggtcaaataaggtgcatggctctatcggatgcccaaatagcactggtgattggaagatgcttcatat 428  Q
    ||||| ||||| |||||| | || || ||||| || |||||| ||| ||| ||||||||| | |||||||||||    
T  5502277 gttttgaggtctaataagctccacggttctattgggtgcccacataacacgggtgattgggatatgcttcatat 5502350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 91; E-Value: 6e-44
Query Start/End: Original strand, 91 - 428
Target Start/End: Original strand, 5412259 - 5412596
Alignment:
Q  91 attcccaagtgttttgaaacactgagtagcagtctaagaatgttgaatttcggtggaaacaagcttcgaggtcatattcctagtagtatgtttccaaatt 190  Q
    ||||| |||||||||| ||| ||||||||||  || || |||||||| || || || ||||||||||  |||||||| |||  || ||| | ||||||||    
T  5412259 attcctaagtgttttgcaaccctgagtagcaaactgaggatgttgaactttggaggtaacaagcttcatggtcatatccctgatactatatctccaaatt 5412358  T
Q  191 tatgtgcactaaggtttttggatctaaatgacaatcttttagaaggtcctataccgaaatccttggtcaattgtaaggaactacaggtcttaaaccttgg 290  Q
     ||||||||| || | |||| |||||||||||||| | || || |||   ||||| ||||| ||||||||||| ||  |||| || ||||||||||||||    
T  5412359 catgtgcactgagatatttgaatctaaatgacaatttattggacggtagcataccaaaatctttggtcaattgcaataaacttcaagtcttaaaccttgg 5412458  T
Q  291 aaagaatgcaataacaggcaaatttccatgttttttgagtaaaatt-ccaacattgagaatcatggttttaaggtcaaataaggtgcatggctctatcgg 389  Q
    ||| |||    |||  | || |||||||||||| || || || ||| ||||| | | |||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||    
T  5412459 aaataattttttaagtgacagatttccatgtttcttaagcaatatttccaacct-gcgaatcatgattttaaggtcaaataagatgcatggatctattgg 5412557  T
Q  390 atgcccaaatagcactggtgattggaagatgcttcatat 428  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  5412558 atgcccaaatagcactggtgattgggagatgcttcatat 5412596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 74; E-Value: 9e-34
Query Start/End: Original strand, 91 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 5468525 - 5468188
Alignment:
Q  91 attcccaagtgttttgaaacactgagtagcagtctaagaatgttgaatttcggtggaaacaagcttcgaggtcatattcctagtagtatgtttccaaatt 190  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||||||||  ||  | |||||||| || || |||||||||||||| |||||||| |||  || ||| |  |||||||    
T  5468525 attcccaagtgttttgcaaccctgagtagcaaactggggatgttgaactttggaggaaacaagcttcgtggtcatatccctgatactatttccccaaatt 5468426  T
Q  191 tatgtgcactaaggtttttggatctaaatgacaatcttttagaaggtcctataccgaaatccttggtcaattgtaaggaactacaggtcttaaaccttgg 290  Q
     |||||||| ||| | |||| |||| ||||||||| | ||  | ||| | ||||||||||| || |||||||| ||  |||| || ||| ||||||||||    
T  5468425 catgtgcacgaagatatttgaatctgaatgacaatttgttgaacggtaccataccgaaatctttagtcaattgcaataaactgcaagtcctaaaccttgg 5468326  T
Q  291 aaagaatgcaataacaggcaaatttccatgttttttgagtaaaattccaacattgagaatcatggttttaaggtcaaataaggtgcatggctctatcgga 390  Q
    | | |||    | |  |  | |||||||||||| ||||| || ||| | ||  ||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||| ||||| | |    
T  5468325 agataattttttcagtgatagatttccatgtttcttgagaaatatttccaccctgagaatcatgattttaaggtcaaataagctccatgggtctattgaa 5468226  T
Q  391 tgcccaaatagcactggtgattggaagatgcttcatat 428  Q
    || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  5468225 tgtccaaatagcactggtgattgggagatgcttcatat 5468188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 91 - 428
Target Start/End: Original strand, 5392810 - 5393147
Alignment:
Q  91 attcccaagtgttttgaaacactgagtagcagtctaagaatgttgaatttcggtggaaacaagcttcgaggtcatattcctagtagtatgtttccaaatt 190  Q
    ||||| |||||||||| |||  |||||||||| ||    |||||||| || |  || ||||||||||  |||||||| |||  || ||| |  |||||||    
T  5392810 attcctaagtgttttgcaaccttgagtagcagactgttgatgttgaactttgaaggtaacaagcttcatggtcatatccctgatattatatccccaaatt 5392909  T
Q  191 tatgtgcactaaggtttttggatctaaatgacaatcttttagaaggtcctataccgaaatccttggtcaattgtaaggaactacaggtcttaaaccttgg 290  Q
     |||||||||||| | |||| |||| ||||||||||| ||  | |||   ||||| ||||| ||||||||||| ||  |||| || ||| ||||||||||    
T  5392910 catgtgcactaagatatttgaatctgaatgacaatctattgaacggtagcatacccaaatctttggtcaattgcaataaactgcaagtcctaaaccttgg 5393009  T
Q  291 aaagaatgcaataacaggcaaatttccatgttttttgagtaaaattccaacattgagaatcatggttttaaggtcaaataaggtgcatggctctatcgga 390  Q
    ||| |||    |||  | || |||||||||||| || || || ||| | ||  ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||| |||    
T  5393010 aaataattttttaagtgacagatttccatgtttcttaagcaatatttccaccctgagaatcatggttttaaggtcaaataagctccatgggtctattgga 5393109  T
Q  391 tgcccaaatagcactggtgattggaagatgcttcatat 428  Q
    ||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  5393110 tgcccaactagaactggtgactggaagatgcttcatat 5393147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 358 - 428
Target Start/End: Original strand, 5356534 - 5356604
Alignment:
Q  358 ttaaggtcaaataaggtgcatggctctatcggatgcccaaatagcactggtgattggaagatgcttcatat 428  Q
    |||||||| |||||  | ||||| ||||| || |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  5356534 ttaaggtctaataaactccatggttctattgggtgcccaaataacactggtgattgggagatgcttcatat 5356604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 306; Significance: 1e-172; HSPs: 1)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 306; E-Value: 1e-172
Query Start/End: Original strand, 16 - 429
Target Start/End: Original strand, 20328593 - 20329006
Alignment:
Q  16 caaatccatgattctttttgtaatgcatctcgtttaaggctgctagatctttcccataataaatttgttggaacaattcccaagtgttttgaaacactga 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||| ||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  20328593 caaatccatgattctttttgtaatgcatctagtctaaggttgctagatctttcccacaataactttgtcgggacaattcccaagtgttttgaagcactga 20328692  T
Q  116 gtagcagtctaagaatgttgaatttcggtggaaacaagcttcgaggtcatattcctagtagtatgtttccaaatttatgtgcactaaggtttttggatct 215  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | |||||    
T  20328693 gtagcagtctaagagtgttgaatttcggtggaaacaagcttcgaggtcaaattcctagtagtatgtttccaaatttatgcgcactaaggtttgttgatct 20328792  T
Q  216 aaatgacaatcttttagaaggtcctataccgaaatccttggtcaattgtaaggaactacaggtcttaaaccttggaaagaatgcaataacaggcaaattt 315  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||    
T  20328793 aaatgacaatcttttaggaggtcctataccaacatccttgatcaattgtaaggaactacaagtcttaaaccttgaaaagaatgcattaacaggcagattt 20328892  T
Q  316 ccatgttttttgagtaaaattccaacattgagaatcatggttttaaggtcaaataaggtgcatggctctatcggatgcccaaatagcactggtgattgga 415  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||||||    
T  20328893 ccatgttttctaagtaaaattccaacattgagaatcatggttttaaggtcaaataagctgcatgggtctatcagatgcccaaatagcactggttattgga 20328992  T
Q  416 agatgcttcatatc 429  Q
    ||||||||||||||    
T  20328993 agatgcttcatatc 20329006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University