View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF9568_low_28 (Length: 258)

Name: NF9568_low_28
Description: NF9568
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF9568_low_28
NF9568_low_28
[»] chr4 (3 HSPs)
chr4 (1-239)||(16843625-16843863)
chr4 (55-225)||(24218374-24218544)
chr4 (8-239)||(16846293-16846523)
[»] chr3 (1 HSPs)
chr3 (23-239)||(14552687-14552903)
[»] chr5 (15 HSPs)
chr5 (27-239)||(37593523-37593735)
chr5 (27-239)||(37695914-37696126)
chr5 (27-239)||(37532419-37532631)
chr5 (23-239)||(37393506-37393722)
chr5 (23-239)||(37823219-37823435)
chr5 (23-239)||(37401627-37401843)
chr5 (23-239)||(37639061-37639277)
chr5 (56-239)||(37702031-37702214)
chr5 (50-239)||(37710846-37711035)
chr5 (23-239)||(37382955-37383171)
chr5 (8-239)||(37435010-37435241)
chr5 (8-219)||(37428352-37428562)
chr5 (125-239)||(37413794-37413908)
chr5 (64-152)||(26437679-26437767)
chr5 (64-152)||(26451048-26451136)


Alignment Details
Target: chr4 (Bit Score: 239; Significance: 1e-132; HSPs: 3)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 239; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 1 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 16843863 - 16843625
Alignment:
Q  1 atcgttgtagtaattgtccgtgcccatgtattgcaaaccaatctggctatcatccacattcatcattccttgaaagttctggatgcatgatgttggcaag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16843863 atcgttgtagtaattgtccgtgcccatgtattgcaaaccaatctggctatcatccacattcatcattccttgaaagttctggatgcatgatgttggcaag 16843764  T
Q  101 gtgccactaaaattgttgttagagacatcaaaaattctcaacttaggaaatggatgcttggtgctagaacaagtgattactccatgaagattattagatc 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16843763 gtgccactaaaattgttgttagagacatcaaaaattctcaacttaggaaatggatgcttggtgctagaacaagtgattactccatgaagattattagatc 16843664  T
Q  201 gtaaaacgagtacctgtaactcttgtagagtttcaagcc 239  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16843663 gtaaaacgagtacctgtaactcttgtagagtttcaagcc 16843625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 55 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 24218544 - 24218374
Alignment:
Q  55 cacattcatcattccttgaaagttctggatgcatgatgttggcaaggtgccactaaaattgttgttagagacatcaaaaattctcaacttaggaaatgga 154  Q
    |||||| |||||||||||||| |||| || ||| |||||||||| || |||||  ||||| ||   |||||||||  ||||||||| ||| |||||||      
T  24218544 cacattaatcattccttgaaaattcttgaggcaagatgttggcacggggccacggaaattattaccagagacatcgtaaattctcatcttcggaaatgat 24218445  T
Q  155 tgcttggtgctagaacaagtgattactccatgaagattattagatcgtaaaacgagtacctgtaactcttg 225  Q
    || ||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||| |||||||||  ||||||||||||||||||    
T  24218444 tgtttggtgctagaacaagtgattccaccatgaagatgatttgatcgtaaactgagtacctgtaactcttg 24218374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 8 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 16846523 - 16846293
Alignment:
Q  8 tagtaattgtccgtgcccatgtattgcaaaccaatctggctatcatccacattcatcattccttgaaagttctggatgcatgatgttggcaaggtgccac 107  Q
    ||||||||| || | |||||||| ||||||||| | |   |||||| | | ||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||| |  ||||    
T  16846523 tagtaattgacctttcccatgtactgcaaaccagttttattatcattcgcgttcatcattccttgaaaattcttgatacatgatgttggcaacggtccac 16846424  T
Q  108 taaaattgttgttagagacatcaaaaattctcaacttaggaaatggatgcttggtgctagaacaagtgattactccatgaagattattagatcgtaaaac 207  Q
    | || ||||| |   |||  || ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||||   |||| ||| ||||| || | ||||      
T  16846423 tgaatttgttatcgaagatgtccaaaattctcaattt-ggaaatggatgcttggtgctagaacatgtgattgaaccataaagtttatttgaccttaaact 16846325  T
Q  208 gagtacctgtaactcttgtagagtttcaagcc 239  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  16846324 gagtacatgtaactcttgtagagtttcaagcc 16846293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 145; Significance: 2e-76; HSPs: 1)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 23 - 239
Target Start/End: Original strand, 14552687 - 14552903
Alignment:
Q  23 cccatgtattgcaaaccaatctggctatcatccacattcatcattccttgaaagttctggatgcatgatgttggcaaggtgccactaaaattgttgttag 122  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14552687 cccatgtattgcaaaccaatttggctgtcattcacgttcatcattccttgaaagttcttgatgcatgatgttggcaaggtgccactaaaattgttgttag 14552786  T
Q  123 agacatcaaaaattctcaacttaggaaatggatgcttggtgctagaacaagtgattactccatgaagattattagatcgtaaaacgagtacctgtaactc 222  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||| |||| ||||||| ||| |||||||||   || || ||||||||    
T  14552787 agacatcaaaaattctcaacttaggaaatgaatgcttgatgctagaacaggtgattgctccgtgaagatgatttgatcgtaaacttagcacttgtaactc 14552886  T
Q  223 ttgtagagtttcaagcc 239  Q
    |||||||||||| ||||    
T  14552887 ttgtagagtttctagcc 14552903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 137; Significance: 1e-71; HSPs: 15)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 27 - 239
Target Start/End: Original strand, 37593523 - 37593735
Alignment:
Q  27 tgtattgcaaaccaatctggctatcatccacattcatcattccttgaaagttctggatgcatgatgttggcaaggtgccactaaaattgttgttagagac 126  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||| ||    
T  37593523 tgtattgcaaaccaatttggctgtcattcacattcatcattccttgaaagttcttgatgcatgatgttggcaagggcccactaaaattgttgatagaaac 37593622  T
Q  127 atcaaaaattctcaacttaggaaatggatgcttggtgctagaacaagtgattactccatgaagattattagatcgtaaaacgagtacctgtaactcttgt 226  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||    || || ||||||||||||    
T  37593623 atcaaaaattctcaacttaggaaatgaatgcttggtgctagaacaagtgattgcaccatgaagattatttgatcgtaagcttagaacttgtaactcttgt 37593722  T
Q  227 agagtttcaagcc 239  Q
    |||||||| ||||    
T  37593723 agagtttctagcc 37593735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 27 - 239
Target Start/End: Original strand, 37695914 - 37696126
Alignment:
Q  27 tgtattgcaaaccaatctggctatcatccacattcatcattccttgaaagttctggatgcatgatgttggcaaggtgccactaaaattgttgttagagac 126  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||| ||    
T  37695914 tgtattgcaaaccaatttggctgtcattcacattcatcattccttgaaagttcttgatgcatgatgttggcaagggcccactaaaattgttgatagaaac 37696013  T
Q  127 atcaaaaattctcaacttaggaaatggatgcttggtgctagaacaagtgattactccatgaagattattagatcgtaaaacgagtacctgtaactcttgt 226  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||    || || ||||||||||||    
T  37696014 atcaaaaattctcaacttaggaaatgaatgcttggtgctagaacaagtgattgcaccatgaagattatttgatcgtaagcttagaacttgtaactcttgt 37696113  T
Q  227 agagtttcaagcc 239  Q
    |||||||| ||||    
T  37696114 agagtttctagcc 37696126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 27 - 239
Target Start/End: Original strand, 37532419 - 37532631
Alignment:
Q  27 tgtattgcaaaccaatctggctatcatccacattcatcattccttgaaagttctggatgcatgatgttggcaaggtgccactaaaattgttgttagagac 126  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||| ||    
T  37532419 tgtattgcaaaccaatttggctgtcattcacattcatcattcctttaaagttcttgatgcatgatattggcaagggcccactaaaattgttgttagaaac 37532518  T
Q  127 atcaaaaattctcaacttaggaaatggatgcttggtgctagaacaagtgattactccatgaagattattagatcgtaaaacgagtacctgtaactcttgt 226  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||    || || ||||||||||||    
T  37532519 atcaaaaattctcaacttaggaaatgaatgcttggtgctagaacaagtgattgcaccatgaagattatttgatcgtaagcttagaacttgtaactcttgt 37532618  T
Q  227 agagtttcaagcc 239  Q
    |||||||| ||||    
T  37532619 agagtttctagcc 37532631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 129; E-Value: 7e-67
Query Start/End: Original strand, 23 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 37393722 - 37393506
Alignment:
Q  23 cccatgtattgcaaaccaatctggctatcatccacattcatcattccttgaaagttctggatgcatgatgttggcaaggtgccactaaaattgttgttag 122  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| | || ||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||    
T  37393722 cccatgtattgcaaaccaatttggctgttattcacatccatcattccttgaaagttcttgaagcatgatgttggcaaggggccactaaaattgttactag 37393623  T
Q  123 agacatcaaaaattctcaacttaggaaatggatgcttggtgctagaacaagtgattactccatgaagattattagatcgtaaaacgagtacctgtaactc 222  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||   |||||||||| ||| |||||||||   || |||||||||||    
T  37393622 agacatcataaattctcaacttaggaaatggatgcttggtgctagaacatgtgattgacccatgaagatgatttgatcgtaaacttagcacctgtaactc 37393523  T
Q  223 ttgtagagtttcaagcc 239  Q
    |||||||||||| ||||    
T  37393522 ttgtagagtttctagcc 37393506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 129; E-Value: 7e-67
Query Start/End: Original strand, 23 - 239
Target Start/End: Original strand, 37823219 - 37823435
Alignment:
Q  23 cccatgtattgcaaaccaatctggctatcatccacattcatcattccttgaaagttctggatgcatgatgttggcaaggtgccactaaaattgttgttag 122  Q
    |||||||||||||||||||| |||   |||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  37823219 cccatgtattgcaaaccaatttggtcgtcactcacattcatcattccttgaaagttcttgatgcatgatgttggcaagggcccactaaaattgttgttag 37823318  T
Q  123 agacatcaaaaattctcaacttaggaaatggatgcttggtgctagaacaagtgattactccatgaagattattagatcgtaaaacgagtacctgtaactc 222  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||| |||||||||   |  |||||||||||    
T  37823319 agacatcaaaaattctcaacttgggaaatgtatgcttggtgctagaacaggtgattgcaccatgaagattatttgatcgtaaacttatcacctgtaactc 37823418  T
Q  223 ttgtagagtttcaagcc 239  Q
    | |||||||||| ||||    
T  37823419 tggtagagtttctagcc 37823435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 23 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 37401843 - 37401627
Alignment:
Q  23 cccatgtattgcaaaccaatctggctatcatccacattcatcattccttgaaagttctggatgcatgatgttggcaaggtgccactaaaattgttgttag 122  Q
    |||||||||||||||||| | |   | |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  37401843 cccatgtattgcaaaccagtgttattgtcattcacattcatcattccttgaaagttcttgatgcatgatgttggcaagggcccactaaaattgttgttag 37401744  T
Q  123 agacatcaaaaattctcaacttaggaaatggatgcttggtgctagaacaagtgattactccatgaagattattagatcgtaaaacgagtacctgtaactc 222  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||| |||||||||   |  |||||||||||    
T  37401743 agacatcaaaaattctcaacttgggaaatgtatgcttggtgctagaacaggtgattgcaccatgaagattatttgatcgtaaacttatcacctgtaactc 37401644  T
Q  223 ttgtagagtttcaagcc 239  Q
    | |||||||||| ||||    
T  37401643 tggtagagtttctagcc 37401627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 23 - 239
Target Start/End: Original strand, 37639061 - 37639277
Alignment:
Q  23 cccatgtattgcaaaccaatctggctatcatccacattcatcattccttgaaagttctggatgcatgatgttggcaaggtgccactaaaattgttgttag 122  Q
    |||||||||||||||||| | |   | |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  37639061 cccatgtattgcaaaccagtgttattgtcattcacattcatcattccttgaaagttcttgatgcatgatgttggcaagggcccactaaaattgttgttag 37639160  T
Q  123 agacatcaaaaattctcaacttaggaaatggatgcttggtgctagaacaagtgattactccatgaagattattagatcgtaaaacgagtacctgtaactc 222  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||| |||||||||   |  |||||||||||    
T  37639161 agacatcaaaaattctcaacttgggaaatgtatgcttggtgctagaacaggtgattgcaccatgaagattatttgatcgtaaacttatcacctgtaactc 37639260  T
Q  223 ttgtagagtttcaagcc 239  Q
    | |||||||||| ||||    
T  37639261 tggtagagtttctagcc 37639277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 56 - 239
Target Start/End: Original strand, 37702031 - 37702214
Alignment:
Q  56 acattcatcattccttgaaagttctggatgcatgatgttggcaaggtgccactaaaattgttgttagagacatcaaaaattctcaacttaggaaatggat 155  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  37702031 acattaatcattccttgaaagttcttgatgcatgatgttggcaaggggccactaaaattgttgttagaggcatcaaaaattctcaacttaggaaatgaat 37702130  T
Q  156 gcttggtgctagaacaagtgattactccatgaagattattagatcgtaaaacgagtacctgtaactcttgtagagtttcaagcc 239  Q
    ||||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||| |||||||||   || |||||||||||| ||| |||||| ||||    
T  37702131 gcttggtgctagaacaagtgattgcaccatgaagatgatttgatcgtaaactcagcacctgtaactctggtaaagtttctagcc 37702214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 114; E-Value: 7e-58
Query Start/End: Original strand, 50 - 239
Target Start/End: Original strand, 37710846 - 37711035
Alignment:
Q  50 tcatccacattcatcattccttgaaagttctggatgcatgatgttggcaaggtgccactaaaattgttgttagagacatcaaaaattctcaacttaggaa 149  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  37710846 tcattcaccttcatcattccttgaaagttcttgatgcatgatgctggcaagggcccactaaaattgttgttagagacatcaaaaattctcaacttgggaa 37710945  T
Q  150 atggatgcttggtgctagaacaagtgattactccatgaagattattagatcgtaaaacgagtacctgtaactcttgtagagtttcaagcc 239  Q
    ||| |||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||| |||||||||   |  |||||||||||| |||||||||| ||||    
T  37710946 atgtatgcttggtgctagaacaggtgattgcaccatgaagattatttgatcgtaaacttatcacctgtaactctggtagagtttctagcc 37711035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 23 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 37383171 - 37382955
Alignment:
Q  23 cccatgtattgcaaaccaatctggctatcatccacattcatcattccttgaaagttctggatgcatgatgttggcaaggtgccactaaaattgttgttag 122  Q
    |||||||||||||||||| | |   | |||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||  ||| |||||||||||||||    
T  37383171 cccatgtattgcaaaccagtgttattgtcattcacattcatcattccttgaaaattcttgatgcacgatgttggcaagggcccaataaaattgttgttag 37383072  T
Q  123 agacatcaaaaattctcaacttaggaaatggatgcttggtgctagaacaagtgattactccatgaagattattagatcgtaaaacgagtacctgtaactc 222  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| || |||||| | |||||||| ||||| |||| ||||  ||| |||||||| ||    
T  37383071 agacatcaaaaattctcaacttgggaaatggatgtttggtgctagagcatgtgattgcgccatgaagtttatttgatcttaaactgagcacctgtaattc 37382972  T
Q  223 ttgtagagtttcaagcc 239  Q
    |||||||||||||||||    
T  37382971 ttgtagagtttcaagcc 37382955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 8 - 239
Target Start/End: Original strand, 37435010 - 37435241
Alignment:
Q  8 tagtaattgtccgtgcccatgtattgcaaaccaatctggctatcatccacattcatcattccttgaaagttctggatgcatgatgttggcaaggtgccac 107  Q
    |||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||  ||||    
T  37435010 tagtaattgttcttacccatgtattgcaaaccaatctggctatcattcacattcatcattccttgaaagttcttgatacatgatgttggcaaggatccac 37435109  T
Q  108 taaaattgttgttagagacatcaaaaattctcaacttaggaaatggatgcttggtgctagaacaagtgattactccatgaagattattagatcgtaaaac 207  Q
    ||||||||||     |||  ||||||||||| ||||||| ||| ||||| |||||| ||||||| ||||||   |||| ||| ||||| |||| ||||      
T  37435110 taaaattgttaccgaagatgtcaaaaattcttaacttagaaaaaggatggttggtgttagaacaggtgattgaaccattaagtttatttgatcttaaact 37435209  T
Q  208 gagtacctgtaactcttgtagagtttcaagcc 239  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  37435210 gagtacctgtaactcttgtagagtttctagcc 37435241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 72; E-Value: 8e-33
Query Start/End: Original strand, 8 - 219
Target Start/End: Original strand, 37428352 - 37428562
Alignment:
Q  8 tagtaattgtccgtgcccatgtattgcaaaccaatctggctatcatccacattcatcattccttgaaagttctggatgcatgatgttggcaaggtgccac 107  Q
    ||||||||| || | |||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||  |||||||| ||| |||||||  ||||    
T  37428352 tagtaattggccttacccatgtactgcaaaccaatttggctatcattcacattcatcattccttgaaaattcctgatgcatgttgtcggcaagggaccac 37428451  T
Q  108 taaaattgttgttagagacatcaaaaattctcaacttaggaaatggatgcttggtgctagaacaagtgattactccatgaagattattagatcgtaaaac 207  Q
    ||||| | || ||| |||  || |||||||||||||| || |||||||| |||||  ||||||||||||||   ||||| || ||||| |||| |||||     
T  37428452 taaaaattttattatagatgtcgaaaattctcaactt-gggaatggatgtttggtcatagaacaagtgattgtaccatgcagtttatttgatcttaaaat 37428550  T
Q  208 gagtacctgtaa 219  Q
    ||| ||||||||    
T  37428551 gagaacctgtaa 37428562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 125 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 37413908 - 37413794
Alignment:
Q  125 acatcaaaaattctcaacttaggaaatggatgcttggtgctagaacaagtgattactccatgaagattattagatcgtaaaacgagtacctgtaactctt 224  Q
    |||| ||| ||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||| |||||| | |||||||||||||| |||||||||   || |||||||||||||    
T  37413908 acataaaatattctcaacttgggaaatgtatgctttgtgctagaacaggtgattgcaccatgaagattatttgatcgtaaacttagcacctgtaactctt 37413809  T
Q  225 gtagagtttcaagcc 239  Q
    |||||||||| ||||    
T  37413808 gtagagtttctagcc 37413794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 64 - 152
Target Start/End: Original strand, 26437679 - 26437767
Alignment:
Q  64 cattccttgaaagttctggatgcatgatgttggcaaggtgccactaaaattgttgttagagacatcaaaaattctcaacttaggaaatg 152  Q
    |||||||| |||||| | |||| | | ||| ||||| | |||||||||||| ||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  26437679 cattcctttaaagtttttgatgtacgttgtgggcaaagagccactaaaattattgttggagacatcaaaaaccctcaacttaggaaatg 26437767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 64 - 152
Target Start/End: Original strand, 26451048 - 26451136
Alignment:
Q  64 cattccttgaaagttctggatgcatgatgttggcaaggtgccactaaaattgttgttagagacatcaaaaattctcaacttaggaaatg 152  Q
    |||||||| |||||| | |||| | | ||| ||||| | |||||||||||| ||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  26451048 cattcctttaaagtttttgatgtacgttgtgggcaaagagccactaaaattattgttggagacatcaaaaaccctcaacttaggaaatg 26451136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University