View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF9568_low_5 (Length: 403)

Name: NF9568_low_5
Description: NF9568
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF9568_low_5
NF9568_low_5
[»] chr6 (10 HSPs)
chr6 (7-386)||(6319364-6319741)
chr6 (7-307)||(24722765-24723063)
chr6 (157-381)||(24087552-24087779)
chr6 (155-271)||(27617777-27617893)
chr6 (155-271)||(6202210-6202326)
chr6 (155-271)||(11689177-11689293)
chr6 (155-271)||(22302242-22302358)
chr6 (155-271)||(30828547-30828663)
chr6 (7-67)||(24087870-24087930)
chr6 (341-386)||(21601667-21601712)
[»] chr8 (31 HSPs)
chr8 (7-381)||(35552538-35552910)
chr8 (7-381)||(34821821-34822193)
chr8 (22-386)||(37327734-37328090)
chr8 (7-381)||(5303045-5303417)
chr8 (7-386)||(45128612-45128984)
chr8 (7-381)||(5677932-5678297)
chr8 (31-386)||(39845795-39846151)
chr8 (7-259)||(40076184-40076434)
chr8 (31-271)||(43188967-43189205)
chr8 (155-381)||(34369355-34369581)
chr8 (155-381)||(34370683-34370909)
chr8 (155-386)||(41248923-41249154)
chr8 (111-381)||(2985105-2985368)
chr8 (155-386)||(39602632-39602863)
chr8 (156-360)||(39938042-39938246)
chr8 (155-271)||(39253044-39253160)
chr8 (155-386)||(43212550-43212781)
chr8 (156-308)||(45065237-45065389)
chr8 (157-308)||(15035603-15035754)
chr8 (7-144)||(20858158-20858293)
chr8 (155-271)||(42484495-42484611)
chr8 (155-271)||(24433-24549)
chr8 (155-271)||(488614-488730)
chr8 (155-271)||(1053586-1053702)
chr8 (155-271)||(23021216-23021332)
chr8 (155-271)||(26660508-26660624)
chr8 (7-70)||(15035842-15035905)
chr8 (7-70)||(39602483-39602546)
chr8 (7-70)||(41249222-41249285)
chr8 (7-70)||(43212401-43212464)
chr8 (7-70)||(39252895-39252958)
[»] chr3 (44 HSPs)
chr3 (13-386)||(48563832-48564203)
chr3 (7-386)||(20916817-20917194)
chr3 (7-386)||(20925779-20926156)
chr3 (7-386)||(49195266-49195643)
chr3 (7-386)||(42757047-42757423)
chr3 (7-381)||(41613229-41613601)
chr3 (7-381)||(44230597-44230969)
chr3 (7-381)||(20351500-20351872)
chr3 (7-386)||(17566896-17567273)
chr3 (154-381)||(30254802-30255032)
chr3 (154-386)||(48889740-48889975)
chr3 (155-386)||(47073004-47073235)
chr3 (155-386)||(4007146-4007378)
chr3 (155-308)||(16612109-16612262)
chr3 (155-308)||(22046991-22047144)
chr3 (155-386)||(52390186-52390417)
chr3 (155-386)||(597927-598158)
chr3 (155-381)||(3976751-3976977)
chr3 (7-181)||(49268274-49268446)
chr3 (155-386)||(36128642-36128872)
chr3 (159-386)||(50997045-50997272)
chr3 (155-381)||(2273726-2273952)
chr3 (157-386)||(50215736-50215963)
chr3 (155-271)||(29009921-29010037)
chr3 (285-381)||(50757325-50757421)
chr3 (155-271)||(34046437-34046553)
chr3 (155-271)||(42903085-42903201)
chr3 (155-271)||(46700921-46701037)
chr3 (155-271)||(50479702-50479818)
chr3 (155-271)||(54387185-54387301)
chr3 (155-230)||(49143399-49143474)
chr3 (7-70)||(30255117-30255180)
chr3 (157-230)||(46390014-46390087)
chr3 (16-70)||(2274038-2274092)
chr3 (16-70)||(36128502-36128556)
chr3 (232-386)||(49268094-49268247)
chr3 (154-214)||(8731754-8731814)
chr3 (154-214)||(9083641-9083701)
chr3 (7-70)||(3976602-3976665)
chr3 (7-70)||(42166059-42166122)
chr3 (7-70)||(50216051-50216114)
chr3 (7-70)||(50963853-50963916)
chr3 (7-70)||(52390503-52390566)
chr3 (16-70)||(597805-597859)
[»] chr7 (29 HSPs)
chr7 (7-386)||(37341200-37341577)
chr7 (7-381)||(16677924-16678295)
chr7 (7-381)||(17652160-17652531)
chr7 (7-381)||(39461353-39461726)
chr7 (7-386)||(47777146-47777521)
chr7 (7-386)||(27452416-27452796)
chr7 (7-261)||(19798168-19798420)
chr7 (7-386)||(5540381-5540752)
chr7 (154-381)||(9493604-9493834)
chr7 (138-381)||(11635784-11636027)
chr7 (155-386)||(46739311-46739542)
chr7 (154-381)||(36978622-36978852)
chr7 (157-386)||(34739410-34739642)
chr7 (154-381)||(47671921-47672151)
chr7 (135-264)||(11635575-11635704)
chr7 (157-386)||(17836123-17836352)
chr7 (155-271)||(15073180-15073296)
chr7 (155-271)||(42506989-42507105)
chr7 (7-68)||(9493921-9493982)
chr7 (155-271)||(17462200-17462316)
chr7 (155-271)||(17590898-17591014)
chr7 (155-271)||(9370285-9370401)
chr7 (155-271)||(35609321-35609437)
chr7 (155-271)||(41881552-41881668)
chr7 (155-271)||(48404419-48404535)
chr7 (285-381)||(11633870-11633966)
chr7 (7-70)||(15073382-15073445)
chr7 (7-70)||(34739259-34739322)
chr7 (7-67)||(42507194-42507254)
[»] chr1 (32 HSPs)
chr1 (7-386)||(47656741-47657118)
chr1 (7-381)||(45825772-45826143)
chr1 (7-333)||(38126359-38126682)
chr1 (7-381)||(50342797-50343169)
chr1 (7-386)||(52803029-52803405)
chr1 (7-386)||(47503180-47503560)
chr1 (16-386)||(21141759-21142130)
chr1 (7-381)||(23274949-23275300)
chr1 (154-381)||(51321748-51321978)
chr1 (155-386)||(96737-96968)
chr1 (154-381)||(49856768-49856998)
chr1 (154-381)||(35257689-35257919)
chr1 (155-386)||(22525245-22525476)
chr1 (155-308)||(19157061-19157214)
chr1 (155-271)||(13638916-13639032)
chr1 (157-265)||(19524111-19524219)
chr1 (7-70)||(51321600-51321663)
chr1 (158-271)||(2366158-2366271)
chr1 (155-348)||(31782568-31782755)
chr1 (155-271)||(26876704-26876820)
chr1 (155-271)||(30891026-30891142)
chr1 (7-70)||(35258004-35258067)
chr1 (154-271)||(3731276-3731393)
chr1 (7-70)||(49857083-49857144)
chr1 (7-70)||(97036-97099)
chr1 (7-70)||(19156912-19156975)
chr1 (7-70)||(19524307-19524370)
chr1 (7-70)||(19525155-19525218)
chr1 (7-70)||(19525816-19525879)
chr1 (7-70)||(19526290-19526353)
chr1 (7-70)||(30890910-30890973)
chr1 (7-70)||(31782841-31782904)
[»] chr4 (38 HSPs)
chr4 (8-386)||(30704897-30705273)
chr4 (7-381)||(51684097-51684469)
chr4 (7-381)||(50194351-50194723)
chr4 (7-386)||(46437094-46437464)
chr4 (79-381)||(50022420-50022722)
chr4 (130-386)||(55406216-55406472)
chr4 (7-386)||(50902363-50902728)
chr4 (214-386)||(10752285-10752457)
chr4 (214-386)||(10966054-10966226)
chr4 (214-386)||(14316426-14316598)
chr4 (155-381)||(44678860-44679086)
chr4 (157-386)||(50275762-50275991)
chr4 (155-381)||(21021691-21021917)
chr4 (7-186)||(10752443-10752617)
chr4 (7-186)||(10966212-10966386)
chr4 (7-300)||(41932539-41932833)
chr4 (155-271)||(37020991-37021106)
chr4 (155-271)||(30725704-30725820)
chr4 (7-133)||(55406841-55406965)
chr4 (155-271)||(1308066-1308182)
chr4 (7-67)||(11083129-11083189)
chr4 (111-381)||(21537290-21537557)
chr4 (155-239)||(41797922-41798006)
chr4 (258-381)||(11049379-11049502)
chr4 (155-271)||(6180685-6180801)
chr4 (155-271)||(31422750-31422866)
chr4 (155-271)||(49166077-49166193)
chr4 (155-230)||(49091482-49091557)
chr4 (159-230)||(40357234-40357305)
chr4 (284-380)||(70361-70457)
chr4 (7-70)||(21022003-21022066)
chr4 (111-195)||(11049559-11049640)
chr4 (111-211)||(11083002-11083099)
chr4 (155-186)||(14316409-14316440)
chr4 (7-70)||(30725906-30725969)
chr4 (7-70)||(50275611-50275674)
chr4 (7-67)||(3184889-3184949)
chr4 (7-67)||(37021195-37021255)
[»] scaffold0238 (1 HSPs)
scaffold0238 (7-386)||(17756-18133)
[»] chr5 (24 HSPs)
chr5 (16-381)||(40623726-40624095)
chr5 (14-386)||(8701033-8701394)
chr5 (7-381)||(5197835-5198207)
chr5 (155-386)||(7758350-7758581)
chr5 (154-381)||(19227746-19227976)
chr5 (158-381)||(38969128-38969351)
chr5 (7-173)||(42538044-42538208)
chr5 (155-308)||(13690-13843)
chr5 (155-308)||(8579381-8579534)
chr5 (154-262)||(42941408-42941516)
chr5 (155-304)||(30706147-30706296)
chr5 (155-271)||(19040012-19040128)
chr5 (173-359)||(27972252-27972435)
chr5 (7-70)||(19228061-19228124)
chr5 (155-308)||(27672528-27672680)
chr5 (155-271)||(28240735-28240851)
chr5 (7-66)||(17659217-17659276)
chr5 (7-66)||(42941605-42941664)
chr5 (155-310)||(28877685-28877840)
chr5 (13-70)||(38969000-38969057)
chr5 (285-386)||(42941300-42941401)
chr5 (7-70)||(27672766-27672829)
chr5 (7-70)||(13911-13974)
chr5 (7-70)||(7758201-7758264)
[»] chr2 (21 HSPs)
chr2 (31-381)||(36655196-36655544)
chr2 (7-386)||(39948496-39948873)
chr2 (155-386)||(29400364-29400595)
chr2 (155-386)||(10827818-10828049)
chr2 (159-271)||(7187817-7187929)
chr2 (155-271)||(17421573-17421689)
chr2 (155-271)||(15832179-15832295)
chr2 (155-271)||(45429635-45429751)
chr2 (155-271)||(43979581-43979697)
chr2 (155-308)||(20931620-20931773)
chr2 (155-271)||(30495842-30495958)
chr2 (155-271)||(43538633-43538749)
chr2 (155-230)||(5353016-5353091)
chr2 (7-66)||(25515002-25515061)
chr2 (155-271)||(3939635-3939751)
chr2 (155-230)||(28469685-28469760)
chr2 (13-70)||(10828117-10828174)
chr2 (7-70)||(28469536-28469599)
chr2 (7-70)||(29400712-29400775)
chr2 (7-70)||(45429486-45429549)
chr2 (7-70)||(45136420-45136483)
[»] scaffold0155 (1 HSPs)
scaffold0155 (7-70)||(11157-11220)


Alignment Details
Target: chr6 (Bit Score: 231; Significance: 1e-127; HSPs: 10)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 7 - 386
Target Start/End: Complemental strand, 6319741 - 6319364
Alignment:
Q  7 atgacacaaagccaccggaaggaaaggcaaagcgggcacatcccaaagaggggaagaggtcggannnnnnnnatggttcagggacttcgcaggaggctcc 106  Q
    ||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |        || ||||||||||||||||||||||| |    
T  6319741 atgactcaaagccatcggaaggagaggcaaagcgggcacatcccaaagaggggaagaggtcgtacggtgg--atagttcagggacttcgcaggaggcttc 6319644  T
Q  107 ccatgctacacagcttgaagagtcacaagtggttgatccgaaccagaaggtggagtacctgaattatcaggatcatatacaacatgatgtgactgatggt 206  Q
     || |||||||||| ||||||||| || ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||    
T  6319643 tcaggctacacagcctgaagagtcgcatgtggttgatccgagccaggaggtggagtacctgaattatcaggataatgtacaccatgatgtgactgatggt 6319544  T
Q  207 gggtatgatcaggatcatataccagagcagcagcatataacagatgatgatgacattgcagcagcgactgacccagcagtgttacctttggagcctccct 306  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||| ||||||||||    
T  6319543 gggtatgaccaggatcatataccagagcagcagcatatagcagatgatgatgacattgcagcagcgcctgccctagcagtgttacctttcgagcctccct 6319444  T
Q  307 tttcaggatgaccggaagatatatctcagctacactcttatgccaaacatgtggtattgccgctttggtataatttagat 386  Q
    || | ||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  6319443 ttcctggaggaccggaagatatatctctgctgcactcttatgccaagcatgtggcattgccgctttggtataattcagat 6319364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 136; E-Value: 8e-71
Query Start/End: Original strand, 7 - 307
Target Start/End: Original strand, 24722765 - 24723063
Alignment:
Q  7 atgacacaaagccaccggaaggaaaggcaaagcgggcacatcccaaagaggggaagaggtcggannnnnnnnatggttcagggacttcgcaggaggctcc 106  Q
    ||||| |||| ||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||        |||||||||||||||||||||||||| |    
T  24722765 atgactcaaacccaccagaaggagaggcaaagcgggcacattccaaagaggggaagaggttagagagggg--atggttcagggacttcgcaggaggcttc 24722862  T
Q  107 ccatgctacacagcttgaagagtcacaagtggttgatccgaaccagaaggtggagtacctgaattatcaggatcatatacaacatgatgtgactgatggt 206  Q
     || |||||||||| | ||||||| || |||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||| |||||  |||| || ||||||||| |||||    
T  24722863 tcaggctacacagccttaagagtcgcaggtggttgatctgagccaggaggtggagtacctgaattatcaagatcaggtacaccacgatgtgactaatggt 24722962  T
Q  207 gggtatgatcaggatcatataccagagcagcagcatataacagatgatgatgacattgcagcagcgactgacccagcagtgttacctttggagcctccct 306  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||   ||||||||| || |||| ||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||    
T  24722963 gggtatgaccaggatcatataccagagtgacagcatatagcatatgacgatgacattgcagaagcggctgccccagcagtgttacctttggagcctacct 24723062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 157 - 381
Target Start/End: Complemental strand, 24087779 - 24087552
Alignment:
Q  157 tggagtacctgaattatcaggatcatatacaacatgatgtgactgatggtgggtatgatcaggatcatataccagagcagcagc-atat--aacagatga 253  Q
    |||||||||||||||||||||||||  |||| || ||||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||| | ||||  | || |  |    
T  24087779 tggagtacctgaattatcaggatcaggtacaccacgatgtgactgatggtgggtatgaccatgatcatatactagagcagcaacaatatgaaccaaacaa 24087680  T
Q  254 tgatgacattgcagcagcgactgacccagcagtgttacctttggagcctcccttttcaggatgaccggaagatatatctcagctacactcttatgccaaa 353  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||| |  ||||||||| |||| |||||||||   | | |||||||| |  |||||||||| | ||||||||||||     
T  24087679 tgatgacattgcagcagcggctgtcccggaggtgttacctgtggaccctccctttcttgaaggaccggaaaacctatctcagctgcgctcttatgccaag 24087580  T
Q  354 catgtggtattgccgctttggtataatt 381  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  24087579 catgtggcattgccgcttttgtataatt 24087552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 155 - 271
Target Start/End: Original strand, 27617777 - 27617893
Alignment:
Q  155 ggtggagtacctgaattatcaggatcatatacaacatgatgtgactgatggtgggtatgatcaggatcatataccagagcagcagcatataacagatgat 254  Q
    ||||||||||||||| |||||| ||||  |||| ||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||| ||  |  ||| ||     
T  27617777 ggtggagtacctgaactatcagaatcaggtacagcatgatgtgacggatggtggatatgaccaggatcatataccacagcagcaggatgcaggagacgag 27617876  T
Q  255 gatgacattgcagcagc 271  Q
    |||||||||||||||||    
T  27617877 gatgacattgcagcagc 27617893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 155 - 271
Target Start/End: Original strand, 6202210 - 6202326
Alignment:
Q  155 ggtggagtacctgaattatcaggatcatatacaacatgatgtgactgatggtgggtatgatcaggatcatataccagagcagcagcatataacagatgat 254  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||  |||| ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||| |  ||||| ||  |  ||| ||     
T  6202210 ggtggagtacctgaactatcaggatcaggtacatcatgatgtgacggacggtggatatgaccaggatcatataccacatgagcaggatgcaggagacgag 6202309  T
Q  255 gatgacattgcagcagc 271  Q
    |||||||||||||||||    
T  6202310 gatgacattgcagcagc 6202326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 155 - 271
Target Start/End: Original strand, 11689177 - 11689293
Alignment:
Q  155 ggtggagtacctgaattatcaggatcatatacaacatgatgtgactgatggtgggtatgatcaggatcatataccagagcagcagcatataacagatgat 254  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||  |||| ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||| |  ||||| ||  |  ||| ||     
T  11689177 ggtggagtacctgaactatcaggatcaggtacatcatgatgtgacggacggtggatatgaccaggatcatataccacatgagcaggatgcaggagacgag 11689276  T
Q  255 gatgacattgcagcagc 271  Q
    |||||||||||||||||    
T  11689277 gatgacattgcagcagc 11689293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 155 - 271
Target Start/End: Original strand, 22302242 - 22302358
Alignment:
Q  155 ggtggagtacctgaattatcaggatcatatacaacatgatgtgactgatggtgggtatgatcaggatcatataccagagcagcagcatataacagatgat 254  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||  |||| ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||| |  ||||| ||  |  ||| ||     
T  22302242 ggtggagtacctgaactatcaggatcaggtacatcatgatgtgacggacggtggatatgaccaggatcatataccacatgagcaggatgcaggagacgag 22302341  T
Q  255 gatgacattgcagcagc 271  Q
    |||||||||||||||||    
T  22302342 gatgacattgcagcagc 22302358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 155 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 30828663 - 30828547
Alignment:
Q  155 ggtggagtacctgaattatcaggatcatatacaacatgatgtgactgatggtgggtatgatcaggatcatataccagagcagcagcatataacagatgat 254  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||  |||| ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||| |  ||||| ||  |  ||| ||     
T  30828663 ggtggagtacctgaactatcaggatcaggtacatcatgatgtgacggacggtggatatgaccaggatcatataccacatgagcaggatgcaggagacgag 30828564  T
Q  255 gatgacattgcagcagc 271  Q
    |||||||||||||||||    
T  30828563 gatgacattgcagcagc 30828547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 7 - 67
Target Start/End: Complemental strand, 24087930 - 24087870
Alignment:
Q  7 atgacacaaagccaccggaaggaaaggcaaagcgggcacatcccaaagaggggaagaggtc 67  Q
    ||||| ||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||| |||||| |||||    
T  24087930 atgacccaaagccaccggaaggagaggcaaaacaggcacatcccaaagcggggaaaaggtc 24087870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 341 - 386
Target Start/End: Original strand, 21601667 - 21601712
Alignment:
Q  341 ctcttatgccaaacatgtggtattgccgctttggtataatttagat 386  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||| ||||    
T  21601667 ctcttatgccaaccatgttgtattgccgctctggtataattcagat 21601712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 206; Significance: 1e-112; HSPs: 31)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 7 - 381
Target Start/End: Original strand, 35552538 - 35552910
Alignment:
Q  7 atgacacaaagccaccggaaggaaaggcaaagcgggcacatcccaaagaggggaagaggtcggannnnnnnnatggttcagggacttcgcaggaggctcc 106  Q
    ||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        ||||||||||||||||||| |||||| |    
T  35552538 atgactcaaagccaccggaagaagaggcaaagcgggcacatcccaaagaggggaagaggtcggagggggg--atggttcagggacttcgcacgaggcttc 35552635  T
Q  107 ccatgctacacagcttgaagagtcacaagtggttgatccgaaccagaaggtggagtacctgaattatcaggatcatatacaacatgatgtgactgatggt 206  Q
     || |||||||||| ||||||||| || ||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||| || |||||||||| ||||    
T  35552636 tcaggctacacagcctgaagagtcgcatgtggttgattcgagccaggaggtggagtacctgaattatcaggatcaggtacaccacgatgtgactggtggt 35552735  T
Q  207 gggtatgatcaggatcatataccagagcagcagcatataacagatgatgatgacattgcagcagcgactgacccagcagtgttacctttggagcctccct 306  Q
    |||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  35552736 gggtatgaccaggatcatatatcagagcagcatcatatagcagatgatgatgacattgcagcagtggctgccccagcagtgttacctttggagcctccct 35552835  T
Q  307 tttcaggatgaccggaagatatatctcagctacactcttatgccaaacatgtggtattgccgctttggtataatt 381  Q
    ||   ||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||| ||||| |||||| |||||||    
T  35552836 ttcttggaggaccggaagatatatctctgctgcactcttatgccaagcatgtggcattgctgctttgatataatt 35552910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 7 - 381
Target Start/End: Complemental strand, 34822193 - 34821821
Alignment:
Q  7 atgacacaaagccaccggaaggaaaggcaaagcgggcacatcccaaagaggggaagaggtcggannnnnnnnatggttcagggacttcgcaggaggctcc 106  Q
    ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        |||||||||||||||||||||||||| |    
T  34822193 atgactcaaagccaccggaaggagaggcaaagcgggcacatcccaaagaggggaagaggtcggagggtgg--atggttcagggacttcgcaggaggcttc 34822096  T
Q  107 ccatgctacacagcttgaagagtcacaagtggttgatccgaaccagaaggtggagtacctgaattatcaggatcatatacaacatgatgtgactgatggt 206  Q
      | |||||||||| ||||||||| || |||||| |||| | |||| |||||||||||||||||||||||||| |  |||| ||  ||||||||||||||    
T  34822095 ttaggctacacagcctgaagagtcgcaggtggttcatccaagccaggaggtggagtacctgaattatcaggattaggtacaccacaatgtgactgatggt 34821996  T
Q  207 gggtatgatcaggatcatataccagagcagcagcatataacagatgatgatgacattgcagcagcgactgacccagcagtgttacctttggagcctccct 306  Q
    |||||||| || ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||| || ||| |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  34821995 gggtatgaccatgatcatataccagagtagcaacatataacagatgatgatgactttgcagcaacggctgccccaacagtgttacctttggagcctccct 34821896  T
Q  307 tttcaggatgaccggaagatatatctcagctacactcttatgccaaacatgtggtattgccgctttggtataatt 381  Q
    || | ||| || ||||||||||||||| | | |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  34821895 ttcctggaggatcggaagatatatctctgttgcactcttatgccaagcatgtggcattgccgctttggtataatt 34821821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 143; E-Value: 5e-75
Query Start/End: Original strand, 22 - 386
Target Start/End: Original strand, 37327734 - 37328090
Alignment:
Q  22 cggaaggaaaggcaaagcgggcacatcccaaagaggggaagaggtcggannnnnnnnatggttcagggacttcgcaggaggctccccatgctacacagct 121  Q
    ||||| || |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||        |||||||||||||||| || |   || | || ||||||||||     
T  37327734 cggaaagagaggcaaag-gggcacatcccaaagaggggtagaggtcggagggggg--atggttcagggacttctcatg---cttctcaagctacacagcc 37327827  T
Q  122 tgaagagtcacaagtggttgatccgaaccagaaggtggagtacctgaattatcaggatcatatacaacatgatgtgactgatggtgggtatgatcaggat 221  Q
    ||||||||| || |||||| | |||| |||| ||||||||||  ||||||||||||||||  |||| || ||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  37327828 tgaagagtcgcatgtggttaacccgacccaggaggtggagtatttgaattatcaggatcaggtacaccacgatgtgactgatgg--ggtatgatcaggat 37327925  T
Q  222 catataccagagcagcagcatataacagatgatgatgacattgcagcagcgactgacccagcagtgttacctttggagcctcccttttcaggatgaccgg 321  Q
    ||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||| |||| || ||||| || ||||||||||||||   ||| ||||||    
T  37327926 catatactagagcagcagcatataccagatgataatgacattgcagcagcggctgccccaacaatgttagctgtggagcctccctttcttggaggaccgg 37328025  T
Q  322 aagatatatctcagctacactcttatgccaaacatgtggtattgccgctttggtataatttagat 386  Q
    || ||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  37328026 aaaatatatctctgctgcactcttatgccaaccatgtggcattgccgctttggtataattcagat 37328090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 7 - 381
Target Start/End: Complemental strand, 5303417 - 5303045
Alignment:
Q  7 atgacacaaagccaccggaaggaaaggcaaagcgggcacatcccaaagaggggaagaggtcggannnnnnnnatggttcagggacttcgcaggaggctcc 106  Q
    ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||        |||||||||||| |||||| |||||| |    
T  5303417 atgactcaaagccaccggaaggagaggcaaagcgggcacatcccaaagatgagaagaggtcggagggtgg--atggttcagggagttcgcaagaggcttc 5303320  T
Q  107 ccatgctacacagcttgaagagtcacaagtggttgatccgaaccagaaggtggagtacctgaattatcaggatcatatacaacatgatgtgactgatggt 206  Q
     ||  ||||||||| ||||||||| || ||||||||| ||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||  |||| || ||||| || ||||||    
T  5303319 tcagactacacagcctgaagagtcgcaggtggttgattcgagccagcagggggagtacctgaattatcaggatcaggtacaccacgatgttacggatggt 5303220  T
Q  207 gggtatgatcaggatcatataccagagcagcagcatataacagatgatgatgacattgcagcagcgactgacccagcagtgttacctttggagcctccct 306  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||||| || |||||| |||||||||||||||||||| ||||   || ||| |  ||||||||| |||| |||||||    
T  5303219 gggtatgaccaggatcatatgccagagcatcaacatatagcagatgatgatgacattgcaacagctgttgccccggaggtgttacctgtggaccctccct 5303120  T
Q  307 tttcaggatgaccggaagatatatctcagctacactcttatgccaaacatgtggtattgccgctttggtataatt 381  Q
    ||   ||| ||||||||||  |||||  | | |||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  5303119 ttcttggaggaccggaagacctatctttgatgcactcttatgtcaatcatgtggcattgccgctttggtataatt 5303045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 7 - 386
Target Start/End: Original strand, 45128612 - 45128984
Alignment:
Q  7 atgacacaaagccaccggaaggaaaggcaaagcgggcacatcccaaagaggggaagaggtcggannnnnnnnatggttcagggacttcgcaggaggctcc 106  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||        |||||||||| ||||| |||||||||      
T  45128612 atgacacaaagccaccggaaggagaggcaaggcgggcacatcccaaagaggggaagaggtcagagggggga-atggttcaggtacttctcaggaggctgt 45128710  T
Q  107 ccatgctacacagcttgaagagtcacaagtggttgatccgaaccagaaggtggagtacctgaattatcaggatcatatacaacatgatgtgactgatggt 206  Q
     || |||| ||||| ||||||||| || |||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||       |||||||| |||||||||    
T  45128711 tcaggctagacagcctgaagagtcgcaggtggttgacccgagccaggaggtggagtacctgaattatcaggatcac------catgatgtcactgatggt 45128804  T
Q  207 gggtatgatcaggatcatataccagagcagcagcatataacagatgatgatgacattgcagcagcgactgacccagcagtgttacctttggagcctccct 306  Q
    |||||  |  |  |  |||| ||||||||||| |||||| |||| || |||||||||||||  ||| ||| ||| || |||||||||||||||||||| |    
T  45128805 gggtacaacgaacagtatatgccagagcagcaacatataccagacgaggatgacattgcagttgcggctgcccctgcggtgttacctttggagcctcc-t 45128903  T
Q  307 tttcag-gatgaccggaagatatatctcagctacactcttatgccaaacatgtggtattgccgctttggtataatttagat 386  Q
    |||||  || |||||||| |||||||||  || |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  45128904 tttcatagaggaccggaaaatatatctctactgcactcttatgccaaccatgtggcattgccgctttggtataattcagat 45128984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 7 - 381
Target Start/End: Original strand, 5677932 - 5678297
Alignment:
Q  7 atgacacaaagccaccggaaggaaaggcaaagcgggcacatcccaaagaggggaagaggtcggannnnnnnnatggttcagggacttcgcaggaggctcc 106  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||        |||||||| ||| ||| ||||   || |    
T  5677932 atgacacaaagccaccggaaggagaggtaaagcgggaacatcccaaagaggggaagaggtcggagggggg--atggttcaaggatttctcagg---cttc 5678026  T
Q  107 ccatgctacacagcttgaagagtcacaagtggttgatccgaaccagaaggtggagtacctgaattatcaggatcatatacaacatgatgtgactgatggt 206  Q
     || |||||||||| |||||||||||| |||||||| |||| ||||   ||||||||||||||||||||||||||       |||||||| |||||||||    
T  5678027 tcaggctacacagcctgaagagtcacaggtggttgacccgagccag---gtggagtacctgaattatcaggatcac------catgatgtcactgatggt 5678117  T
Q  207 gggtatgatcaggatca---tataccagagcagcagcatataacagatgatgatgacattgc--agcagcgactgacccagcagtgttacctttggagcc 301  Q
    ||||||||| || ||||   ||||||||||||||| |||||| ||||  | |||||||| ||  | ||||||||| |||||| |||||||||||||| ||    
T  5678118 gggtatgatgagcatcagcatataccagagcagcaacatataccagaccaggatgacatggcgcaacagcgactgccccagcggtgttacctttggatcc 5678217  T
Q  302 tcccttttcaggatgaccggaagatatatctcagctacactcttatgccaaacatgtggtattgccgctttggtataatt 381  Q
    ||||||| | ||| |||||||| |||||||||  || ||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  5678218 tccctttcctggaggaccggaaaatatatctctactgcactcttgtgccaaccatgtggcattgccgctttggtataatt 5678297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 31 - 386
Target Start/End: Complemental strand, 39846151 - 39845795
Alignment:
Q  31 aggcaaagcgggcacatcccaaagaggggaagaggtcggannnnnnnnatggttcagggacttcgcaggaggctccccatgctacacagcttgaagagtc 130  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||| |        |||||||||||| ||||||||||||| | || |||||||| | |||||||||    
T  39846151 aggcaaagcggccacatcccaaagaggggtaaaggtcgtagtgtgg--atggttcagggagttcgcaggaggcttctcaggctacacaacctgaagagtc 39846054  T
Q  131 acaagtggttgatccgaaccagaaggtggagtacctgaattatcaggatcatatacaacatgatgtgactgatggtgggtatgatcaggatcatatacca 230  Q
     || |||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||| || ||||| || |||||||||||||| || ||||||||||||    
T  39846053 gcaggtggttgacccgagccagcaggtggagtacctgaattatcaggatcaggtacaccacgatgttacggatggtgggtatgaccaagatcatatacca 39845954  T
Q  231 gagcagcag---catataacagatgatgatgacattgcagcagcgactgacccagcagtgttacctttggagcctcccttttcaggatgaccggaagata 327  Q
     ||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||| |  ||||||||| |||| ||| ||||||| ||| ||||||  ||      
T  39845953 cagcagcagcaacatataacagatgatgatgacattgcagcagctgctgccccggatgtgttacctctggacccttccttttctggaggaccggtggacc 39845854  T
Q  328 tatctcagctacactcttatgccaaacatgtggtattgccgctttggtataatttagat 386  Q
    |||||  ||| |||||||||| ||| |||||||  |||||||||| |||||||| ||||    
T  39845853 tatctttgctgcactcttatgtcaatcatgtggcgttgccgcttttgtataattcagat 39845795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 7 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 40076434 - 40076184
Alignment:
Q  7 atgacacaaagccaccggaaggaaaggcaaagcgggcacatcccaaagaggggaagaggtcggannnnnnnnatggttcagggacttcgcaggaggctcc 106  Q
    ||||| ||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||        |||||||||||||||||||||||||| |    
T  40076434 atgactcaaagccaccgaaaggagaggcaaagcaggcacattccaaataggggaagaggtcggagggtgg--atggttcagggacttcgcaggaggcttc 40076337  T
Q  107 ccatgctacacagcttgaagagtcacaagtggttgatccgaaccagaaggtggagtacctgaattatcaggatcatatacaacatgatgtgactgatggt 206  Q
     || |||||||||   ||||| || |||||||| |||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||| || |||||||||||| ||    
T  40076336 tcaggctacacagtcagaagattcgcaagtggtcgatccgagtcaggaggtggagtacctgaattatcaggatcaggtacaccacgatgtgactgatagt 40076237  T
Q  207 gggtatgatcaggatcatataccagagcagcagcatataacagatgatgatga 259  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  40076236 gggtatgaccaggatcatataccagagcagcaacatataacagatgatgatga 40076184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 31 - 271
Target Start/End: Original strand, 43188967 - 43189205
Alignment:
Q  31 aggcaaagcgggcacatcccaaagaggggaagaggtcggannnnnnnnatggttcagggacttcgcaggaggctccccatgctacacagcttgaagagtc 130  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||        |||||||| ||| ||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||    
T  43188967 aggcaaagcggccacatcccaaagaagggtagaggtcggagggtgg--atggttcatggaattcgcaggaggcttctcaggctacacagcttgaagagtc 43189064  T
Q  131 acaagtggttgatccgaaccagaaggtggagtacctgaattatcaggatcatatacaacatgatgtgactgatggtgggtatgatcaggatcatatacca 230  Q
      | ||| ||||||||| |||| | || |||||||||||||||||||||||  |||| || ||||| || |||||||||||||| |||||||||||| ||    
T  43189065 gtaggtgattgatccgagccagcaagtagagtacctgaattatcaggatcaggtacaccacgatgttacggatggtgggtatgaccaggatcatatatca 43189164  T
Q  231 gagcagcagcatataacagatgatgatgacattgcagcagc 271  Q
    |||||||| ||| ||  ||||||||||||||||||||||||    
T  43189165 gagcagcaacatgtaggagatgatgatgacattgcagcagc 43189205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 91; E-Value: 6e-44
Query Start/End: Original strand, 155 - 381
Target Start/End: Complemental strand, 34369581 - 34369355
Alignment:
Q  155 ggtggagtacctgaattatcaggatcatatacaacatgatgtgactgatggtgggtatgatcaggatcatataccagagcagcagcatataacagatgat 254  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  |||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||  ||| |||    
T  34369581 ggtggagtacctgaattatcaggatcaggtacaccacgatgtgactgatggtgggtatgaccaggatcatataccacagcagcagcatgtaggagacgat 34369482  T
Q  255 gatgacattgcagcagcgactgacccagcagtgttacctttggagcctcccttttcaggatgaccggaagatatatctcagctacactcttatgccaaac 354  Q
    ||||||||| || |||   |||  ||    ||||||||| ||||  |||||||| | ||| ||||||||  |||||||| ||| |||||||||||||| |    
T  34369481 gatgacattccaacagttgctgcaccgaaggtgttacctgtggactctccctttcctggaggaccggaaattatatctctgctgcactcttatgccaatc 34369382  T
Q  355 atgtggtattgccgctttggtataatt 381  Q
    |||||| |||||||||||| |||||||    
T  34369381 atgtggcattgccgctttgatataatt 34369355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 91; E-Value: 6e-44
Query Start/End: Original strand, 155 - 381
Target Start/End: Complemental strand, 34370909 - 34370683
Alignment:
Q  155 ggtggagtacctgaattatcaggatcatatacaacatgatgtgactgatggtgggtatgatcaggatcatataccagagcagcagcatataacagatgat 254  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  |||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||  ||| |||    
T  34370909 ggtggagtacctgaattatcaggatcaggtacaccacgatgtgactgatggtgggtatgaccaggatcatataccacagcagcagcatgtaggagacgat 34370810  T
Q  255 gatgacattgcagcagcgactgacccagcagtgttacctttggagcctcccttttcaggatgaccggaagatatatctcagctacactcttatgccaaac 354  Q
    ||||||||| || |||   |||  ||    ||||||||| ||||  |||||||| | ||| ||||||||  |||||||| ||| |||||||||||||| |    
T  34370809 gatgacattccaacagttgctgcaccgaaggtgttacctgtggactctccctttcctggaggaccggaaattatatctctgctgcactcttatgccaatc 34370710  T
Q  355 atgtggtattgccgctttggtataatt 381  Q
    |||||| |||||||||||| |||||||    
T  34370709 atgtggcattgccgctttgatataatt 34370683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 84; E-Value: 8e-40
Query Start/End: Original strand, 155 - 386
Target Start/End: Complemental strand, 41249154 - 41248923
Alignment:
Q  155 ggtggagtacctgaattatcaggatcatatacaacatgatgtgactgatggtgggtatgatcaggatcatataccagagcagcagcatataacagatgat 254  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  |||| || ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||| ||  |||||||    
T  41249154 ggtggagtacctgaattatcaggatcaggtacaccacgatatgactgatggtgggtatgaccaggatcatataccacagcagcaacatgtaggagatgat 41249055  T
Q  255 gatgacattgcagcagcgactgacccagcagtgttacctttggagcctcccttttcaggatgaccggaagatatatctcagctacactcttatgccaaac 354  Q
     | ||||||||||||||  ||| ||| |  ||||||||| |||| ||||||||| | ||  |||||| |||  |||||  ||| |||||||||||||  |    
T  41249054 aacgacattgcagcagctgctgccccggaggtgttacctgtggaccctccctttcctggcggaccggcagacttatctttgctgcactcttatgccagtc 41248955  T
Q  355 atgtggtattgccgctttggtataatttagat 386  Q
    |||| | |||||| ||||||||||||| ||||    
T  41248954 atgttgcattgccactttggtataattcagat 41248923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 111 - 381
Target Start/End: Original strand, 2985105 - 2985368
Alignment:
Q  111 gctacacagcttgaagagtcacaagtggttgatccgaaccagaaggtggagtacctgaattatcaggatcatatacaacatgatgtgactgatggtgggt 210  Q
    |||||||||| |||| ||||||| |||||||| |||| |||| |||   |||||||||||||||||||| |  |||| || ||||| |||||||||||||    
T  2985105 gctacacagcctgaa-agtcacaggtggttgacccgacccaggagg---agtacctgaattatcaggattaggtacaccacgatgtcactgatggtgggt 2985200  T
Q  211 atgatcaggatcatataccagagcagcagcatataacagatgatgatgacattgcagcagcgactgacccagcagtgttacctttggagcctcccttttc 310  Q
    |||| ||| | ||||||||||   ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||  ||| |||||| | |||||||    | |||||||||||    
T  2985201 atgaccagcaacatataccag---agcagcatataccagatcatgatgacattgcagcagcagctgccccagcggcgttacctgatcaacctcccttttc 2985297  T
Q  311 aggatgaccggaagatatatctcagctacactcttatgccaaacatgtggtattgccgctttggtataatt 381  Q
     ||| |||| ||||||| ||||  ||| ||||||||||||||  || ||  ||||||||||||||||||||    
T  2985298 tggaggaccagaagatacatctttgctgcactcttatgccaactatatgacattgccgctttggtataatt 2985368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 155 - 386
Target Start/End: Original strand, 39602632 - 39602863
Alignment:
Q  155 ggtggagtacctgaattatcaggatcatatacaacatgatgtgactgatggtgggtatgatcaggatcatataccagagcagcagcatataacagatgat 254  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  |||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||| ||  ||| | |    
T  39602632 ggtggagtacctgaattatcaggatcaggtacaccacgatgtgactgatggtgggtatgaccaggatcatataccacaacagcagcatgtaggagacggt 39602731  T
Q  255 gatgacattgcagcagcgactgacccagcagtgttacctttggagcctcccttttcaggatgaccggaagatatatctcagctacactcttatgccaaac 354  Q
    |||||||||||||||||  |||  || |  ||||||||| |||| ||||||||| | ||  |||||| |||  |||||   || |||||||||||||  |    
T  39602732 gatgacattgcagcagctgctgcaccggaggtgttacctatggaccctccctttcctggtggaccggcagacttatctttactccactcttatgccagtc 39602831  T
Q  355 atgtggtattgccgctttggtataatttagat 386  Q
    ||||||  ||||| ||||||||||||| ||||    
T  39602832 atgtggcgttgccactttggtataattcagat 39602863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 156 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 39938246 - 39938042
Alignment:
Q  156 gtggagtacctgaattatcaggatcatatacaacatgatgtgactgatggtgggtatgatcaggatcatataccagagcagcagcatataacagatgatg 255  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  |||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||| ||| ||  ||| ||||    
T  39938246 gtggagtacctgaattatcaggatcaggtacaccacgatgtgactgatggtgggtatgaccaggatcatataccacaacagcaacatgtaggagacgatg 39938147  T
Q  256 atgacattgcagcagcgactgacccagcagtgttacctttggagcctcccttttcaggatgaccggaagatatatctcagctacactcttatgccaaaca 355  Q
    ||||||||||||||||  ||| ||| |  ||||||||| |||| ||||||||| | ||  |||||| |||  |||||  ||| |||||||||||||  ||    
T  39938146 atgacattgcagcagctgctgccccggaggtgttacctgtggaccctccctttcctggtggaccggcagacttatctttgctccactcttatgccagtca 39938047  T
Q  356 tgtgg 360  Q
    |||||    
T  39938046 tgtgg 39938042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 155 - 271
Target Start/End: Original strand, 39253044 - 39253160
Alignment:
Q  155 ggtggagtacctgaattatcaggatcatatacaacatgatgtgactgatggtgggtatgatcaggatcatataccagagcagcagcatataacagatgat 254  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  |||| || ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| | ||||||||| ||  |||||||    
T  39253044 ggtggagtacctgaattatcaggatcaggtacaccacgatgtgactgatggtggatatgaccaggatcatataccacaacagcagcatgtaggagatgat 39253143  T
Q  255 gatgacattgcagcagc 271  Q
    |||||||||||||||||    
T  39253144 gatgacattgcagcagc 39253160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 155 - 386
Target Start/End: Original strand, 43212550 - 43212781
Alignment:
Q  155 ggtggagtacctgaattatcaggatcatatacaacatgatgtgactgatggtgggtatgatcaggatcatataccagagcagcagcatataacagatgat 254  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  |||| || |||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||| ||| ||  ||| |||    
T  43212550 ggtggagtacctgaattatcaggatcaggtacaccacgatgcgactgatggtggatatgaccaggatcatataccacagcagcaacatgtaggagacgat 43212649  T
Q  255 gatgacattgcagcagcgactgacccagcagtgttacctttggagcctcccttttcaggatgaccggaagatatatctcagctacactcttatgccaaac 354  Q
    |||||||||||||||||  |||  || |  |||||| || |||| ||||||||| | ||  |||||  | |  |||||  ||| |||||||||||||  |    
T  43212650 gatgacattgcagcagctgctgcaccggaggtgttatctgtggaccctccctttcctggtggaccgacatacttatctttgctccactcttatgccagtc 43212749  T
Q  355 atgtggtattgccgctttggtataatttagat 386  Q
    ||||||  ||||| ||||||||||||| ||||    
T  43212750 atgtggcgttgccactttggtataattcagat 43212781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 156 - 308
Target Start/End: Original strand, 45065237 - 45065389
Alignment:
Q  156 gtggagtacctgaattatcaggatcatatacaacatgatgtgactgatggtgggtatgatcaggatcatataccagagcagcagcatataacagatgatg 255  Q
    |||||||||||||| |||||||||||  |||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||| ||  |  ||| || |    
T  45065237 gtggagtacctgaactatcaggatcaggtacagcatgatgtgactgatggtggatatgaccaggatcatataccacagcagcaggatgcaggagacgagg 45065336  T
Q  256 atgacattgcagcagcgactgacccagcagtgttacctttggagcctcccttt 308  Q
    ||||||||||||||||  |||  || |  ||||||||| |||| |||||||||    
T  45065337 atgacattgcagcagctgctgcaccggaggtgttacctgtggaccctcccttt 45065389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 157 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 15035754 - 15035603
Alignment:
Q  157 tggagtacctgaattatcaggatcatatacaacatgatgtgactgatggtgggtatgatcaggatcatataccagagcagcagcatataacagatgatga 256  Q
    ||||||||||||| |||||||||||  |||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||| ||  |   || |||||    
T  15035754 tggagtacctgaactatcaggatcaggtacagcatgatgtgactgatggtggatatgaccaggatcatataccacagcagcaggatgcaggtgacgatga 15035655  T
Q  257 tgacattgcagcagcgactgacccagcagtgttacctttggagcctcccttt 308  Q
    |||||||||||||||  |||  || |  ||||||||| |||| |||||||||    
T  15035654 tgacattgcagcagctgctgcaccggaggtgttacctgtggaccctcccttt 15035603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 7 - 144
Target Start/End: Original strand, 20858158 - 20858293
Alignment:
Q  7 atgacacaaagccaccggaaggaaaggcaaagcgggcacatcccaaagaggggaagaggtcggannnnnnnnatggttcagggacttcgcaggaggctcc 106  Q
    ||||| || |||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||        |||||||||||| ||| ||||||||| |    
T  20858158 atgactcagagccaccggagggagaggcaaagcggtcacatcccaaagaggggaagaggtcgga--gagtggatggttcagggagttcacaggaggcttc 20858255  T
Q  107 ccatgctacacagcttgaagagtcacaagtggttgatc 144  Q
     || |||||||||| ||||||||| || ||||||||||    
T  20858256 tcaagctacacagcctgaagagtcgcaggtggttgatc 20858293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 155 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 42484611 - 42484495
Alignment:
Q  155 ggtggagtacctgaattatcaggatcatatacaacatgatgtgactgatggtgggtatgatcaggatcatataccagagcagcagcatataacagatgat 254  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||  |||| ||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||| |  ||||| ||  |  ||| |||    
T  42484611 ggtggagtacctgaactatcaggatcaagtacatcatgatgtgacggatggtggatatgaccaggatcatataccacattagcaggatgcaggagacgat 42484512  T
Q  255 gatgacattgcagcagc 271  Q
    |||||||||||||||||    
T  42484511 gatgacattgcagcagc 42484495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 155 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 24549 - 24433
Alignment:
Q  155 ggtggagtacctgaattatcaggatcatatacaacatgatgtgactgatggtgggtatgatcaggatcatataccagagcagcagcatataacagatgat 254  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||  |||| ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||| |  ||||| ||  |  ||| ||     
T  24549 ggtggagtacctgaactatcaggatcaggtacatcatgatgtgacggacggtggatatgaccaggatcatataccacatgagcaggatgcaggagacgag 24450  T
Q  255 gatgacattgcagcagc 271  Q
    |||||||||||||||||    
T  24449 gatgacattgcagcagc 24433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 155 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 488730 - 488614
Alignment:
Q  155 ggtggagtacctgaattatcaggatcatatacaacatgatgtgactgatggtgggtatgatcaggatcatataccagagcagcagcatataacagatgat 254  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||  |||| ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||| |  ||||| ||  |  ||| ||     
T  488730 ggtggagtacctgaactatcaggatcaggtacatcatgatgtgacggacggtggatatgaccaggatcatataccacatgagcaggatgcaggagacgag 488631  T
Q  255 gatgacattgcagcagc 271  Q
    |||||||||||||||||    
T  488630 gatgacattgcagcagc 488614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 155 - 271
Target Start/End: Original strand, 1053586 - 1053702
Alignment:
Q  155 ggtggagtacctgaattatcaggatcatatacaacatgatgtgactgatggtgggtatgatcaggatcatataccagagcagcagcatataacagatgat 254  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||  |||| ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||| |  ||||| ||  |  ||| ||     
T  1053586 ggtggagtacctgaactatcaggatcaggtacatcatgatgtgacggacggtggatatgaccaggatcatataccacatgagcaggatgcaggagacgag 1053685  T
Q  255 gatgacattgcagcagc 271  Q
    |||||||||||||||||    
T  1053686 gatgacattgcagcagc 1053702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 155 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 23021332 - 23021216
Alignment:
Q  155 ggtggagtacctgaattatcaggatcatatacaacatgatgtgactgatggtgggtatgatcaggatcatataccagagcagcagcatataacagatgat 254  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||  |||| ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||| |  ||||| ||  |  ||| ||     
T  23021332 ggtggagtacctgaactatcaggatcaggtacatcatgatgtgacggacggtggatatgaccaggatcatataccacatgagcaggatgcaggagacgag 23021233  T
Q  255 gatgacattgcagcagc 271  Q
    |||||||||||||||||    
T  23021232 gatgacattgcagcagc 23021216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 155 - 271
Target Start/End: Original strand, 26660508 - 26660624
Alignment:
Q  155 ggtggagtacctgaattatcaggatcatatacaacatgatgtgactgatggtgggtatgatcaggatcatataccagagcagcagcatataacagatgat 254  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||  |||| ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||| |  ||||| ||  |  ||| ||     
T  26660508 ggtggagtacctgaactatcaggatcaggtacatcatgatgtgacggacggtggatatgaccaggatcatataccacatgagcaggatgcaggagacgag 26660607  T
Q  255 gatgacattgcagcagc 271  Q
    |||||||||||||||||    
T  26660608 gatgacattgcagcagc 26660624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 7 - 70
Target Start/End: Complemental strand, 15035905 - 15035842
Alignment:
Q  7 atgacacaaagccaccggaaggaaaggcaaagcgggcacatcccaaagaggggaagaggtcgga 70  Q
    ||||| || |||||||||| ||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  15035905 atgactcagagccaccggagggagaggcagagcggccacatcccaaagaggggtagaggtcgga 15035842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 7 - 70
Target Start/End: Original strand, 39602483 - 39602546
Alignment:
Q  7 atgacacaaagccaccggaaggaaaggcaaagcgggcacatcccaaagaggggaagaggtcgga 70  Q
    ||||| || |||||||||| ||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  39602483 atgactcagagccaccggagggagaggcagagcggccacatcccaaagaggggtagaggtcgga 39602546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 7 - 70
Target Start/End: Complemental strand, 41249285 - 41249222
Alignment:
Q  7 atgacacaaagccaccggaaggaaaggcaaagcgggcacatcccaaagaggggaagaggtcgga 70  Q
    ||||| ||||||||||||| ||| ||||| ||||| |||||||||||||| || ||||||||||    
T  41249285 atgacccaaagccaccggagggagaggcagagcggccacatcccaaagagaggtagaggtcgga 41249222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 7 - 70
Target Start/End: Original strand, 43212401 - 43212464
Alignment:
Q  7 atgacacaaagccaccggaaggaaaggcaaagcgggcacatcccaaagaggggaagaggtcgga 70  Q
    ||||| || |||||||||| ||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  43212401 atgactcagagccaccggagggagaggcagagcggccacatcccaaagaggggtagaggtcgga 43212464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 7 - 70
Target Start/End: Original strand, 39252895 - 39252958
Alignment:
Q  7 atgacacaaagccaccggaaggaaaggcaaagcgggcacatcccaaagaggggaagaggtcgga 70  Q
    ||||| || ||||||| || ||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  39252895 atgactcagagccaccagagggagaggcagagcggccacatcccaaagaggggtagaggtcgga 39252958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 197; Significance: 1e-107; HSPs: 44)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 13 - 386
Target Start/End: Original strand, 48563832 - 48564203
Alignment:
Q  13 caaagccaccggaaggaaaggcaaagcgggcacatcccaaagaggggaagaggtcggannnnnnnnatggttcagggacttcgcaggaggctccccatgc 112  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||        |||||||| ||| || |||||||||| | || ||    
T  48563832 caaagccaccggaaggagaggcaaagcgggcacatcccaaataggggaagaggtcggagggtgg--atggttcaaggagtttgcaggaggcttctcaggc 48563929  T
Q  113 tacacagcttgaagagtcacaagtggttgatccgaaccagaaggtggagtacctgaattatcaggatcatatacaacatgatgtgactgatggtgggtat 212  Q
    |||||| | ||||||||| || |||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||||   ||| || |||||||| |||| |||||||    
T  48563930 tacacaacctgaagagtcgcaggtggttgatctgagccagtaggtggagtacctgaattatcaggatcaggaacaccacgatgtgaccgatgatgggtat 48564029  T
Q  213 gatcaggatcatataccagagcagcagcatataacagatgatgatgacattgcagcagcgactgacccagcagtgttacctttggagcctcccttttcag 312  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||   |    
T  48564030 gaccaggatcatataccagagcagcagcatatagcagatgataatgacattgcagcagcggctgccccagcagtgttacctttggagcctctctttcatg 48564129  T
Q  313 gatgaccggaagatatatctcagctacactcttatgccaaacatgtggtattgccgctttggtataatttagat 386  Q
    || |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  48564130 gaggaccggaagatatatctctgctgcactcttatgccaagcatgtggcattgccgctttggtataattcagat 48564203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 7 - 386
Target Start/End: Complemental strand, 20917194 - 20916817
Alignment:
Q  7 atgacacaaagccaccggaaggaaaggcaaagcgggcacatcccaaagaggggaagaggtcggannnnnnnnatggttcagggacttcgcaggaggctcc 106  Q
    ||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |        ||||||||||||||||||| |||||| |    
T  20917194 atgactcagagccaccggaaggagaggcaaagcgggcacatcccaaagaggggaagaggtcgaagggtgg--atggttcagggacttcgcatgaggcttc 20917097  T
Q  107 ccatgctacacagcttgaagagtcacaagtggttgatccgaaccagaaggtggagtacctgaattatcaggatcatatacaacatgatgtgactgatggt 206  Q
     || |||||||| | ||||||||| || ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||| || ||||||    
T  20917096 tcaggctacacaacctgaagagtcgcaggtggttgatccgagccaggaggtggagtacctgaattatcaggatcaggtacaccatgatgttacggatggt 20916997  T
Q  207 gggtatgatcaggatcatataccagagcagcagcatataacagatgatgatgacattgcagcagcgactgacccagcagtgttacctttggagcctccct 306  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||| | ||||||| |||||||||||||||||||    
T  20916996 gggtatgaccagaatcatataccagagcagcaacatatagcagatgatgatgacaatgcagcagcggctgcctcagcagttttacctttggagcctccct 20916897  T
Q  307 tttcaggatgaccggaagatatatctcagctacactcttatgccaaacatgtggtattgccgctttggtataatttagat 386  Q
    || | ||| || ||||||||||||||  ||| |||||||||| ||| ||||||  ||||||||||| |||||||| ||||    
T  20916896 ttcctggaggatcggaagatatatctttgctgcactcttatgtcaagcatgtgacattgccgctttagtataattcagat 20916817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 7 - 386
Target Start/End: Complemental strand, 20926156 - 20925779
Alignment:
Q  7 atgacacaaagccaccggaaggaaaggcaaagcgggcacatcccaaagaggggaagaggtcggannnnnnnnatggttcagggacttcgcaggaggctcc 106  Q
    ||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |        ||||||||||||||||||| |||||| |    
T  20926156 atgactcagagccaccggaaggagaggcaaagcgggcacatcccaaagaggggaagaggtcgaagggtgg--atggttcagggacttcgcatgaggcttc 20926059  T
Q  107 ccatgctacacagcttgaagagtcacaagtggttgatccgaaccagaaggtggagtacctgaattatcaggatcatatacaacatgatgtgactgatggt 206  Q
     || |||||||| | ||||||||| || ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||| || ||||||    
T  20926058 tcaggctacacaacctgaagagtcgcaggtggttgatccgagccaggaggtggagtacctgaattatcaggatcaggtacaccatgatgttacggatggt 20925959  T
Q  207 gggtatgatcaggatcatataccagagcagcagcatataacagatgatgatgacattgcagcagcgactgacccagcagtgttacctttggagcctccct 306  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||| | ||||||| |||||||||||||||||||    
T  20925958 gggtatgaccagaatcatataccagagcagcaacatatagcagatgatgatgacaatgcagcagcggctgcctcagcagttttacctttggagcctccct 20925859  T
Q  307 tttcaggatgaccggaagatatatctcagctacactcttatgccaaacatgtggtattgccgctttggtataatttagat 386  Q
    || | ||| || ||||||||||||||  ||| |||||||||| ||| ||||||  ||||||||||| |||||||| ||||    
T  20925858 ttcctggaggatcggaagatatatctttgctgcactcttatgtcaagcatgtgacattgccgctttagtataattcagat 20925779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 163; E-Value: 6e-87
Query Start/End: Original strand, 7 - 386
Target Start/End: Complemental strand, 49195643 - 49195266
Alignment:
Q  7 atgacacaaagccaccggaaggaaaggcaaagcgggcacatcccaaagaggggaagaggtcggannnnnnnnatggttcagggacttcgcaggaggctcc 106  Q
    ||||| || |||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||        |||||||||||| ||||||||||||| |    
T  49195643 atgactcagagccaccggaaggagagcgaaagcgggcacatcccaaagaggggaagaggtcggagggtgg--atggttcagggagttcgcaggaggcttc 49195546  T
Q  107 ccatgctacacagcttgaagagtcacaagtggttgatccgaaccagaaggtggagtacctgaattatcaggatcatatacaacatgatgtgactgatggt 206  Q
     |  |||||||||| ||||||||| || ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||| || |||||||| ||||||    
T  49195545 tcgggctacacagcctgaagagtcgcaggtggttgatccgagccagcaggtggagtacctgaattatcaggatcaggtacaccacgatgtgaccgatggt 49195446  T
Q  207 gggtatgatcaggatcatataccagagcagcagcatataacagatgatgatgacattgcagcagcgactgacccagcagtgttacctttggagcctccct 306  Q
    || ||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| ||  |  ||||||||| |||| |||||||    
T  49195445 ggatatgaccaggatcatatactagaggagcagcatatagcagatgatgatgacattgcagcagcggctgccctggaggtgttacctgtggaccctccct 49195346  T
Q  307 tttcaggatgaccggaagatatatctcagctacactcttatgccaaacatgtggtattgccgctttggtataatttagat 386  Q
    || |  || ||||||||||  |||||  ||| |||||||||| ||| ||||||| ||||||||||| |||||||| ||||    
T  49195345 ttcctagaggaccggaagacctatctttgctgcactcttatgtcaagcatgtggcattgccgctttagtataattcagat 49195266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 7 - 386
Target Start/End: Original strand, 42757047 - 42757423
Alignment:
Q  7 atgacacaaagccaccggaaggaaaggcaaagcgggcacatcccaaagaggggaagaggtcggannnnnnnnatggttcagggacttcgcaggaggctcc 106  Q
    ||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||        |||||||||||||||||||||||||| |    
T  42757047 atgactcaaagccaccggaaggagagacaaagcgggcacatcccaaagaagggaagaggtcggagggtgg--atggttcagggacttcgcaggaggctgc 42757144  T
Q  107 ccatgctacacagcttgaagagtcacaagtggttgatccgaaccagaaggtggagtacctgaattatcaggatcatatacaacatgatgtgactgatggt 206  Q
     || |||||| ||| ||||||||| || ||||||||||||| |||| ||| ||||| ||||||||||||| ||||  |||| || | |||||||||||||    
T  42757145 tcaggctacagagcctgaagagtcgcaggtggttgatccgagccaggaggcggagt-cctgaattatcagaatcaggtacaccacgttgtgactgatggt 42757243  T
Q  207 gggtatgatcaggatcatataccagagcagcagcatataacagatgatgatgacattgcagcagcgactgacccagcagtgttacctttggagcctccct 306  Q
     ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||  ||| |  ||||||| | |||| |||||||    
T  42757244 tggtatgaccaggattatataccagagcagcagcatatagcagatgatgatgacattgcagcagaggctcccccggaggtgttacttgtggaccctccct 42757343  T
Q  307 tttcaggatgaccggaagatatatctcagctacactcttatgccaaacatgtggtattgccgctttggtataatttagat 386  Q
    || |  || || ||||| |  |||||  ||| |||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  42757344 ttcctagaggatcggaaaacctatctttgctgcacttttatgccaagcatgtggcattgccgctttggtataattcagat 42757423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 146; E-Value: 8e-77
Query Start/End: Original strand, 7 - 381
Target Start/End: Original strand, 41613229 - 41613601
Alignment:
Q  7 atgacacaaagccaccggaaggaaaggcaaagcgggcacatcccaaagaggggaagaggtcggannnnnnnnatggttcagggacttcgcaggaggctcc 106  Q
    ||||| || |||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||        || ||||||||| ||||||||||||| |    
T  41613229 atgactcagagccaccggagggagaggcaaagcggccacatcccaaagaggggtagaggtcggatggtgg--atagttcagggagttcgcaggaggcttc 41613326  T
Q  107 ccatgctacacagcttgaagagtcacaagtggttgatccgaaccagaaggtggagtacctgaattatcaggatcatatacaacatgatgtgactgatggt 206  Q
     || |||||||||| ||||||||| || ||||||||||||| |||  |||| |||||||||||||||||||||||| |||| || ||||| |||||||||    
T  41613327 tcaggctacacagcctgaagagtcgcaggtggttgatccgagccaacaggtagagtacctgaattatcaggatcatgtacaccacgatgttactgatggt 41613426  T
Q  207 gggtatgatcaggatcatataccagagcagcagcatataacagatgatgatgacattgcagcagcgactgacccagcagtgttacctttggagcctccct 306  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||  ||||||||||||||||||||||||  ||| ||| |  ||| ||||| |||| |||||||    
T  41613427 gggtatgaccaggatcatataccagagcagcaacatgtaggagatgatgatgacattgcagcagctgctgccccggaggtgatacctgtggaccctccct 41613526  T
Q  307 tttcaggatgaccggaagatatatctcagctacactcttatgccaaacatgtggtattgccgctttggtataatt 381  Q
    || |  || || |||| ||  |||||  ||| |||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||    
T  41613527 ttcctagaggagcggacgacctatctttgctgcactcttatgccaatcatgtggcgttgccgctttggtataatt 41613601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 146; E-Value: 8e-77
Query Start/End: Original strand, 7 - 381
Target Start/End: Original strand, 44230597 - 44230969
Alignment:
Q  7 atgacacaaagccaccggaaggaaaggcaaagcgggcacatcccaaagaggggaagaggtcggannnnnnnnatggttcagggacttcgcaggaggctcc 106  Q
    ||||| || ||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        |||||||||||| |||| |||||| | |    
T  44230597 atgactcagagcaaccggagggagaggcaaagcgggcacatcccaaagaggggaagaggtcggagggtgg--atggttcagggagttcgtaggaggattc 44230694  T
Q  107 ccatgctacacagcttgaagagtcacaagtggttgatccgaaccagaaggtggagtacctgaattatcaggatcatatacaacatgatgtgactgatggt 206  Q
     || |||||||||| ||||||||| || ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||| || ||||| || ||||||    
T  44230695 tcaggctacacagcctgaagagtcgcatgtggttgatccgagccagcaggtggagtacctgaattatcaggatcaggtacaccacgatgttacggatggt 44230794  T
Q  207 gggtatgatcaggatcatataccagagcagcagcatataacagatgatgatgacattgcagcagcgactgacccagcagtgttacctttggagcctccct 306  Q
    |||||||| || ||||||||||||||| |||| |||||| || ||||||||||||||||||||||   || |||||  ||||||||| ||||  ||||||    
T  44230795 gggtatgaccaagatcatataccagagtagcaacatatagcatatgatgatgacattgcagcagctgttgtcccagaggtgttacctgtggactctccct 44230894  T
Q  307 tttcaggatgaccggaagatatatctcagctacactcttatgccaaacatgtggtattgccgctttggtataatt 381  Q
    || |  || ||||||||||  |||||  ||| ||||||| |||||| ||||||| |||| |||||||||||||||    
T  44230895 ttccttgaagaccggaagacctatctttgctgcactcttgtgccaatcatgtggcattgtcgctttggtataatt 44230969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 7 - 381
Target Start/End: Original strand, 20351500 - 20351872
Alignment:
Q  7 atgacacaaagccaccggaaggaaaggcaaagcgggcacatcccaaagaggggaagaggtcggannnnnnnnatggttcagggacttcgcaggaggctcc 106  Q
    ||||| || ||||||| || ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||        |||||||||||| ||||||||| ||| |    
T  20351500 atgactcagagccacctgagggagaggcaaagcggccacatcccaaagaggggaagaggtcggagggtgg--atggttcagggagttcgcaggaagcttc 20351597  T
Q  107 ccatgctacacagcttgaagagtcacaagtggttgatccgaaccagaaggtggagtacctgaattatcaggatcatatacaacatgatgtgactgatggt 206  Q
     || |||||||||| ||||||||| || ||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||| || ||||||    
T  20351598 tcaggctacacagcctgaagagtcgcaggtggttgatccaagccagcaggtggagtacctgaattatcaggatcaggtacaccatgatgttacggatggt 20351697  T
Q  207 gggtatgatcaggatcatataccagagcagcagcatataacagatgatgatgacattgcagcagcgactgacccagcagtgttacctttggagcctccct 306  Q
    ||||||||  |||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||| |||| |||||||||  ||| ||| |  ||||||||| |||| ||||| |    
T  20351698 gggtatgactaggatcatataccaaagcagcaacatatagcagatgatgacgacactgcagcagctgctgccccggaggtgttacctgtggaccctcctt 20351797  T
Q  307 tttcaggatgaccggaagatatatctcagctacactcttatgccaaacatgtggtattgccgctttggtataatt 381  Q
    || | ||| ||||||| ||  |||||  ||| |||||||||| ||| |||||||  |||||||||||||||||||    
T  20351798 ttcctggaggaccggacgacctatctttgctgcactcttatgtcaatcatgtggcgttgccgctttggtataatt 20351872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 7 - 386
Target Start/End: Complemental strand, 17567273 - 17566896
Alignment:
Q  7 atgacacaaagccaccggaaggaaaggcaaagcgggcacatcccaaagaggggaagaggtcggannnnnnnnatggttcagggacttcgcaggaggctcc 106  Q
    ||||| || |||||||||| ||| || |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||        |||||||||||| ||||||||||||| |    
T  17567273 atgactcagagccaccggagggagagtcaaagcggccacatcccaaagaggggtagaggtcggagggtgg--atggttcagggagttcgcaggaggcttc 17567176  T
Q  107 ccatgctacacagcttgaagagtcacaagtggttgatccgaaccagaaggtggagtacctgaattatcaggatcatatacaacatgatgtgactgatggt 206  Q
     |||  |||||||| | |||||||| | || ||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||| || ||||| || ||||||    
T  17567175 tcatattacacagcctaaagagtcataggtagttgacccgagccagcaggtggagtacctgaattatcaggatcaggtacaccacgatgttacagatggt 17567076  T
Q  207 gggtatgatcaggatcatataccagagcagcagcatataacagatgatgatgacattgcagcagcgactgacccagcagtgttacctttggagcctccct 306  Q
    |||||||| ||||||||||||||| | || || ||| ||  ||||||||||||||||||||||||  ||| ||| |  ||||||||| |||| |||||||    
T  17567075 gggtatgaccaggatcatataccacaacaacaacatgtagaagatgatgatgacattgcagcagctgctgccccggaggtgttacctgtggaccctccct 17566976  T
Q  307 tttcaggatgaccggaagatatatctcagctacactcttatgccaaacatgtggtattgccgctttggtataatttagat 386  Q
    || |  || ||||||| |   |||||  ||| |||||||| ||||| |||||||  ||||||||||||||||||| ||||    
T  17566975 ttccttgaggaccggacggcctatctttgctgcactcttacgccaatcatgtggcgttgccgctttggtataattcagat 17566896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 101; E-Value: 6e-50
Query Start/End: Original strand, 154 - 381
Target Start/End: Complemental strand, 30255032 - 30254802
Alignment:
Q  154 aggtggagtacctgaattatcaggatcatatacaacatgatgtgactgatggtgggtatgatcaggatcatataccagagcagcagca---tataacaga 250  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  |||| || |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||   |  | ||||    
T  30255032 aggtggagtacctgaattatcaggatcaggtacaccacgatgtgaccgatggtgggtatgatcatgatcatataccagagcagcagcagcatgaaccaga 30254933  T
Q  251 tgatgatgacattgcagcagcgactgacccagcagtgttacctttggagcctcccttttcaggatgaccggaagatatatctcagctacactcttatgcc 350  Q
      ||||||||||||| |||||| ||| ||| |  ||||||||| |||| ||||||||| | ||| |||||||| ||||||||  ||| ||||||||||||    
T  30254932 caatgatgacattgctgcagcggctgccccggaggtgttacctatggaccctccctttcctggaggaccggaaaatatatctttgctgcactcttatgcc 30254833  T
Q  351 aaacatgtggtattgccgctttggtataatt 381  Q
    || ||||||| | ||||||||||||||||||    
T  30254832 aagcatgtggcactgccgctttggtataatt 30254802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 154 - 386
Target Start/End: Original strand, 48889740 - 48889975
Alignment:
Q  154 aggtggagtacctgaattatcaggatcatatacaacatgatgtgactgatggtgggtatgatcaggatcatataccagagca---gcagcatataacaga 250  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  |||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||   |||||||  |  |||    
T  48889740 aggtggagtacctgaattatcaggatcaggtacaccacgatgtgactgatggtgggtatgaccaggatcatataccagagcagcagcagcatgaactaga 48889839  T
Q  251 tgatgatgacattgcagcagcgactgacccagcagtgttacctttggagcctcccttttcaggatgaccggaagatatatctcagctacactcttatgcc 350  Q
     |||||| |||||||||||||| ||| ||| |  ||||||||| |||| |||||||||   ||| ||| |||| ||||||||| |||  ||||||||| |    
T  48889840 cgatgataacattgcagcagcggctgccccggaggtgttacctgtggaccctccctttgttggaggacaggaaaatatatctctgctgaactcttatgtc 48889939  T
Q  351 aaacatgtggtattgccgctttggtataatttagat 386  Q
    || ||||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  48889940 aatcatgtggcattgccgctttggtataattcagat 48889975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 155 - 386
Target Start/End: Complemental strand, 47073235 - 47073004
Alignment:
Q  155 ggtggagtacctgaattatcaggatcatatacaacatgatgtgactgatggtgggtatgatcaggatcatataccagagcagcagcatataacagatgat 254  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  |||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||| || |||| |||    
T  47073235 ggtggagtacctgaattatcaggatcaggtacaccacgatgtgactgatggtgggtatgaccaggatcatataccacagcagcaacatgtagcagacgat 47073136  T
Q  255 gatgacattgcagcagcgactgacccagcagtgttacctttggagcctcccttttcaggatgaccggaagatatatctcagctacactcttatgccaaac 354  Q
    |||||||||||||||||  ||| ||  |  ||||||| | |||| ||||||||| | ||  |||||| |||  |||||  ||| |||||||||||||  |    
T  47073135 gatgacattgcagcagctgctgcccttgaggtgttacatgtggaccctccctttcctggtggaccggcagacttatctttgctccactcttatgccagtc 47073036  T
Q  355 atgtggtattgccgctttggtataatttagat 386  Q
    ||||||  ||||| ||||||||||||| ||||    
T  47073035 atgtggcgttgccactttggtataattcagat 47073004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 155 - 386
Target Start/End: Complemental strand, 4007378 - 4007146
Alignment:
Q  155 ggtggagtacctgaattatcaggatcat-atacaacatgatgtgactgatggtgggtatgatcaggatcatataccagagcagcagcatataacagatga 253  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  ||||| || ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||  ||| ||    
T  4007378 ggtggagtacctgaattatcaggatcaggatacaccacgatgtgactgatggtggatatgaccaggatcatataccacagcagcagcatgtaggagacga 4007279  T
Q  254 tgatgacattgcagcagcgactgacccagcagtgttacctttggagcctcccttttcaggatgaccggaagatatatctcagctacactcttatgccaaa 353  Q
    ||| ||||||||||||||  |||  || |  ||||||||| |||| ||||||||| | ||  |||||| |||  |||||  |||  ||||||||||||      
T  4007278 tgacgacattgcagcagctgctgcaccggaggtgttacctgtggaccctccctttcctggtggaccggcagacttatctttgctctactcttatgccagt 4007179  T
Q  354 catgtggtattgccgctttggtataatttagat 386  Q
    |||||||| ||||| ||||||||||||| ||||    
T  4007178 catgtggtgttgccactttggtataattcagat 4007146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 155 - 308
Target Start/End: Original strand, 16612109 - 16612262
Alignment:
Q  155 ggtggagtacctgaattatcaggatcatatacaacatgatgtgactgatggtgggtatgatcaggatcatataccagagcagcagcatataacagatgat 254  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  |||| || |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||| ||  ||| |||    
T  16612109 ggtggagtacctgaattatcaggatcaggtacaccacgatgtgactgatggtgggtatgactaggatcatataccatagcagcagcatgtaggagacgat 16612208  T
Q  255 gatgacattgcagcagcgactgacccagcagtgttacctttggagcctcccttt 308  Q
    |||||||||||||||||  ||| ||| |  ||||||||| |||| |||||||||    
T  16612209 gatgacattgcagcagctgctgccccggaggtgttacctatggaccctcccttt 16612262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 155 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 22047144 - 22046991
Alignment:
Q  155 ggtggagtacctgaattatcaggatcatatacaacatgatgtgactgatggtgggtatgatcaggatcatataccagagcagcagcatataacagatgat 254  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  |||| || |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||| ||  ||| |||    
T  22047144 ggtggagtacctgaattatcaggatcaggtacaccacgatgtgactgatggtgggtatgactaggatcatataccatagcagcagcatgtaggagacgat 22047045  T
Q  255 gatgacattgcagcagcgactgacccagcagtgttacctttggagcctcccttt 308  Q
    |||||||||||||||||  ||| ||| |  ||||||||| |||| |||||||||    
T  22047044 gatgacattgcagcagctgctgccccggaggtgttacctatggaccctcccttt 22046991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 155 - 386
Target Start/End: Complemental strand, 52390417 - 52390186
Alignment:
Q  155 ggtggagtacctgaattatcaggatcatatacaacatgatgtgactgatggtgggtatgatcaggatcatataccagagcagcagcatataacagatgat 254  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  |||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||| ||  ||| |||    
T  52390417 ggtggagtacctgaattatcaggatcaggtacaccacgatgtgactgatggtgggtatgaccaggatcatataccacatcagcagcatgtaggagacgat 52390318  T
Q  255 gatgacattgcagcagcgactgacccagcagtgttacctttggagcctcccttttcaggatgaccggaagatatatctcagctacactcttatgccaaac 354  Q
    |||||||||||||||||  |||  ||    ||||||||| |||| ||||||||| | ||  |||||| |||  |||||   || |||||||||||||  |    
T  52390317 gatgacattgcagcagctgctgcaccgaaggtgttacctgtggaccctccctttcctggtggaccggtagacttatctttactccactcttatgccagtc 52390218  T
Q  355 atgtggtattgccgctttggtataatttagat 386  Q
    ||||||  ||||| || |||||||||| ||||    
T  52390217 atgtggcgttgccactctggtataattcagat 52390186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 155 - 386
Target Start/End: Original strand, 597927 - 598158
Alignment:
Q  155 ggtggagtacctgaattatcaggatcatatacaacatgatgtgactgatggtgggtatgatcaggatcatataccagagcagcagcatataacagatgat 254  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||  |||| || |||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||  ||| ||     
T  597927 ggtggagtacctgaactatcaggatcaggtacaccacgatacgactgatggtgggtatgaccaggatcatataccacagcagcagcatgtaggagacgac 598026  T
Q  255 gatgacattgcagcagcgactgacccagcagtgttacctttggagcctcccttttcaggatgaccggaagatatatctcagctacactcttatgccaaac 354  Q
    |||||||||||||||||  ||| ||| |  ||||||||| |||| ||||||||| |  || |||||| |||  |||||  ||| ||| |||||||||       
T  598027 gatgacattgcagcagctgctgccccggaggtgttacctgtggaccctccctttcctagaggaccggcagacttatctttgctgcacacttatgccagta 598126  T
Q  355 atgtggtattgccgctttggtataatttagat 386  Q
    ||||||  ||||| ||||||||||||| ||||    
T  598127 atgtggcgttgccactttggtataattcagat 598158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 155 - 381
Target Start/End: Original strand, 3976751 - 3976977
Alignment:
Q  155 ggtggagtacctgaattatcaggatcatatacaacatgatgtgactgatggtgggtatgatcaggatcatataccagagcagcagcatataacagatgat 254  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  |||| || ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| | ||||||||| ||  ||| |||    
T  3976751 ggtggagtacctgaattatcaggatcaggtacaccacgatgtgactgatggtggatatgaccaggatcatataccacaacagcagcatgtaggagacgat 3976850  T
Q  255 gatgacattgcagcagcgactgacccagcagtgttacctttggagcctcccttttcaggatgaccggaagatatatctcagctacactcttatgccaaac 354  Q
    || ||||||||||||||  |||  || |   ||||| || |||| ||||||||| | ||  |||||| |||  |||||  ||| || ||||||||||  |    
T  3976851 gacgacattgcagcagctgctgcaccggtgatgttatctgtggaccctccctttcctggtggaccggcagacttatctttgctccattcttatgccagtc 3976950  T
Q  355 atgtggtattgccgctttggtataatt 381  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||||    
T  3976951 atgtggtgttgccactttggtataatt 3976977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 7 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 49268446 - 49268274
Alignment:
Q  7 atgacacaaagccaccggaaggaaaggcaaagcgggcacatcccaaagaggggaagaggtcggannnnnnnnatggttcagggacttcgcaggaggctcc 106  Q
    ||||| || |||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||        |||||||||||| ||||||||||||| |    
T  49268446 atgactcagagccaccggagggagaggcaaagcggtcacatcccaaacaggggtagaggtcggagggtgg--atggttcagggagttcgcaggaggcttc 49268349  T
Q  107 ccatgctacacagcttgaagagtcacaagtggttgatccgaaccagaaggtggagtacctgaattatcaggatca 181  Q
     || |||||||||  ||||||||| || |||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  49268348 tcaggctacacagtctgaagagtcgcaggtggttgacccgagccagcaggtggagtacctgaattatcagcatca 49268274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 155 - 386
Target Start/End: Original strand, 36128642 - 36128872
Alignment:
Q  155 ggtggagtacctgaattatcaggatcatatacaacatgatgtgactgatggtgggtatgatcaggatcatataccagagcagcagcatataacagatgat 254  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  |||| ||  |||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||| | ||||||||| ||  ||| |||    
T  36128642 ggtggagtacctgaattatcaggatcaagtacaccacaatgtgactga-ggtggatatgaccaggatcatataccacaacagcagcatgtaggagacgat 36128740  T
Q  255 gatgacattgcagcagcgactgacccagcagtgttacctttggagcctcccttttcaggatgaccggaagatatatctcagctacactcttatgccaaac 354  Q
    |||||||||||||||||  |||  || |  ||||||||| |||| ||||||||| | ||  |||||  |||  |||||  ||| |||||||||||||  |    
T  36128741 gatgacattgcagcagctgctgcaccggaggtgttacctgtggaccctccctttcctggtggaccgacagacttatctttgctccactcttatgccagtc 36128840  T
Q  355 atgtggtattgccgctttggtataatttagat 386  Q
    ||||||  ||||| ||||||||||||| ||||    
T  36128841 atgtggcgttgccactttggtataattcagat 36128872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 159 - 386
Target Start/End: Original strand, 50997045 - 50997272
Alignment:
Q  159 gagtacctgaattatcaggatcatatacaacatgatgtgactgatggtgggtatgatcaggatcatataccagagcagcagcatataacagatgatgatg 258  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||| || ||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||| ||||| ||||| ||  ||| |||||||    
T  50997045 gagtacctgaattatcaggatcaggtacaccacgatgtgactgatggtggatatgacaaggatcatataccacagcagtagcatgtaggagacgatgatg 50997144  T
Q  259 acattgcagcagcgactgacccagcagtgttacctttggagcctcccttttcaggatgaccggaagatatatctcagctacactcttatgccaaacatgt 358  Q
    |||||||||||||  |||  || |  ||||||||| |||| | ||||| | | ||  |||||| |||  |||||  ||| |||||||||||||  |||||    
T  50997145 acattgcagcagctgctgcaccggaggtgttacctgtggaacttccctctcctggtggaccggcagacttatctttgctccactcttatgccagtcatgt 50997244  T
Q  359 ggtattgccgctttggtataatttagat 386  Q
    ||  ||||| ||||||||||||| ||||    
T  50997245 ggcgttgccactttggtataattcagat 50997272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 155 - 381
Target Start/End: Complemental strand, 2273952 - 2273726
Alignment:
Q  155 ggtggagtacctgaattatcaggatcatatacaacatgatgtgactgatggtgggtatgatcaggatcatataccagagcagcagcatataacagatgat 254  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||| || |||| ||| ||  |||  ||    
T  2273952 ggtggagtacctgaactatcaggatcaggtacaacatgatgtgactgatggtggatatgaacaggaacatataccacagaagcaacatgtaggagactat 2273853  T
Q  255 gatgacattgcagcagcgactgacccagcagtgttacctttggagcctcccttttcaggatgaccggaagatatatctcagctacactcttatgccaaac 354  Q
    |||||||||||||||||  |||  || |  ||||||||| |||| ||||||||| | ||  ||||||  ||  |||||  ||| ||||||||||||   |    
T  2273852 gatgacattgcagcagctgctgcaccggaggtgttacctgtggaccctccctttcctggtggaccggcggacttatctttgctccactcttatgccggtc 2273753  T
Q  355 atgtggtattgccgctttggtataatt 381  Q
    ||||||  ||||| |||||||||||||    
T  2273752 atgtggcgttgccactttggtataatt 2273726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 157 - 386
Target Start/End: Complemental strand, 50215963 - 50215736
Alignment:
Q  157 tggagtacctgaattatcaggatcatatacaacatgatgtgactgatggtgggtatgatcaggatcatataccagagcagcagcatataacagatgatga 256  Q
    |||||||||||||||||||||  ||  |||| ||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | || |||||| ||  |||||||||    
T  50215963 tggagtacctgaattatcagg--caggtacaccacaatgtgactgatggtgggtatgaccaggatcatataccacaacaacagcatgtaggagatgatga 50215866  T
Q  257 tgacattgcagcagcgactgacccagcagtgttacctttggagcctcccttttcaggatgaccggaagatatatctcagctacactcttatgccaaacat 356  Q
    |||||||| ||||||  ||| ||| |  ||||||||| |||| ||||||||| |  || |||||  |||  |||||  ||| |||||||||| ||| |||    
T  50215865 tgacattgtagcagctgctgccccggaggtgttacctgtggaccctccctttcctagaggaccgacagacttatctttgctgcactcttatgtcaatcat 50215766  T
Q  357 gtggtattgccgctttggtataatttagat 386  Q
    | ||  ||||||||||||||||||| ||||    
T  50215765 gcggcgttgccgctttggtataattcagat 50215736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 155 - 271
Target Start/End: Original strand, 29009921 - 29010037
Alignment:
Q  155 ggtggagtacctgaattatcaggatcatatacaacatgatgtgactgatggtgggtatgatcaggatcatataccagagcagcagcatataacagatgat 254  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||||  |||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||| ||  |  ||| ||     
T  29009921 ggtggagtacctgaactatcaagatcaggtacaacatgatgtgacggatggtggatatgaccaggatcatataccacagcagcaggatgcaggagacgag 29010020  T
Q  255 gatgacattgcagcagc 271  Q
    |||||||||||||||||    
T  29010021 gatgacattgcagcagc 29010037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 285 - 381
Target Start/End: Original strand, 50757325 - 50757421
Alignment:
Q  285 gtgttacctttggagcctcccttttcaggatgaccggaagatatatctcagctacactcttatgccaaacatgtggtattgccgctttggtataatt 381  Q
    ||||||||| |||| ||||||||| | ||| |||||||| |||||| || ||| |||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  50757325 gtgttacctgtggaccctccctttcctggaggaccggaaaatatatatctgctgcactcttatgccaatcatatggcattgccgctttggtataatt 50757421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 155 - 271
Target Start/End: Original strand, 34046437 - 34046553
Alignment:
Q  155 ggtggagtacctgaattatcaggatcatatacaacatgatgtgactgatggtgggtatgatcaggatcatataccagagcagcagcatataacagatgat 254  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||  |||| ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||| |  ||||| ||  |  ||| ||     
T  34046437 ggtggagtacctgaactatcaggatcaggtacatcatgatgtgacggacggtggatatgaccaggatcatataccacatgagcaggatgcaggagacgag 34046536  T
Q  255 gatgacattgcagcagc 271  Q
    |||||||||||||||||    
T  34046537 gatgacattgcagcagc 34046553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 155 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 42903201 - 42903085
Alignment:
Q  155 ggtggagtacctgaattatcaggatcatatacaacatgatgtgactgatggtgggtatgatcaggatcatataccagagcagcagcatataacagatgat 254  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||  |||| ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||| |  ||||| ||  |  ||| ||     
T  42903201 ggtggagtacctgaactatcaggatcaggtacatcatgatgtgacggacggtggatatgaccaggatcatataccacatgagcaggatgcaggagacgag 42903102  T
Q  255 gatgacattgcagcagc 271  Q
    |||||||||||||||||    
T  42903101 gatgacattgcagcagc 42903085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 155 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 46701037 - 46700921
Alignment:
Q  155 ggtggagtacctgaattatcaggatcatatacaacatgatgtgactgatggtgggtatgatcaggatcatataccagagcagcagcatataacagatgat 254  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||| ||  |||| ||||| ||||||||||||||| |  ||||| ||  |  ||| ||     
T  46701037 ggtggagtacctgaactatcaggatcatgtacatcatgatgtgacagacagtggatatgaccaggatcatataccacatgagcaggatgcaggagacgag 46700938  T
Q  255 gatgacattgcagcagc 271  Q
    |||||||||||||||||    
T  46700937 gatgacattgcagcagc 46700921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 155 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 50479818 - 50479702
Alignment:
Q  155 ggtggagtacctgaattatcaggatcatatacaacatgatgtgactgatggtgggtatgatcaggatcatataccagagcagcagcatataacagatgat 254  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||  |||| ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||| |  ||||| ||  |  ||| ||     
T  50479818 ggtggagtacctgaactatcaggatcaggtacatcatgatgtgacggacggtggatatgaccaggatcatataccacatgagcaggatgcaggagacgag 50479719  T
Q  255 gatgacattgcagcagc 271  Q
    |||||||||||||||||    
T  50479718 gatgacattgcagcagc 50479702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 155 - 271
Target Start/End: Original strand, 54387185 - 54387301
Alignment:
Q  155 ggtggagtacctgaattatcaggatcatatacaacatgatgtgactgatggtgggtatgatcaggatcatataccagagcagcagcatataacagatgat 254  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||  |||| ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||| |  ||||| ||  |  ||| ||     
T  54387185 ggtggagtacctgaactatcaggatcaggtacatcatgatgtgacggacggtggatatgaccaggatcatataccacatgagcaggatgcaggagacgag 54387284  T
Q  255 gatgacattgcagcagc 271  Q
    |||||||||||||||||    
T  54387285 gatgacattgcagcagc 54387301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 155 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 49143474 - 49143399
Alignment:
Q  155 ggtggagtacctgaattatcaggatcatatacaacatgatgtgactgatggtgggtatgatcaggatcatatacca 230  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||  |||| ||||||||||| || ||||| ||||| |||||||||||||||    
T  49143474 ggtggagtacctgaactatcaggatcaggtacatcatgatgtgacggacggtggatatgaccaggatcatatacca 49143399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 7 - 70
Target Start/End: Complemental strand, 30255180 - 30255117
Alignment:
Q  7 atgacacaaagccaccggaaggaaaggcaaagcgggcacatcccaaagaggggaagaggtcgga 70  Q
    ||||| ||||||||  ||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  30255180 atgacccaaagccattggaaggagaggcaaagtgggcacatcccaaagaagggaagaggtcgga 30255117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 157 - 230
Target Start/End: Original strand, 46390014 - 46390087
Alignment:
Q  157 tggagtacctgaattatcaggatcatatacaacatgatgtgactgatggtgggtatgatcaggatcatatacca 230  Q
    ||||||||||||| |||||||||||  |||| || |||||||| || ||||| ||||| |||||||||||||||    
T  46390014 tggagtacctgaactatcaggatcaggtacatcacgatgtgacggacggtggatatgaccaggatcatatacca 46390087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 16 - 70
Target Start/End: Complemental strand, 2274092 - 2274038
Alignment:
Q  16 agccaccggaaggaaaggcaaagcgggcacatcccaaagaggggaagaggtcgga 70  Q
    |||||||||| ||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  2274092 agccaccggagggagaggcagagcggccacatcccaaagaggggtagaggtcgga 2274038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 16 - 70
Target Start/End: Original strand, 36128502 - 36128556
Alignment:
Q  16 agccaccggaaggaaaggcaaagcgggcacatcccaaagaggggaagaggtcgga 70  Q
    |||||||||| ||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  36128502 agccaccggagggagaggcagagcggccacatcccaaagaggggtagaggtcgga 36128556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 232 - 386
Target Start/End: Complemental strand, 49268247 - 49268094
Alignment:
Q  232 agcagcagcatataacagatgatgatgacattgcagcagcgactgacccagcagtgttacctttggagcctcccttttcaggatgaccggaagatatatc 331  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||  ||| ||| |  ||||||||| |||| ||| ||||| | ||| || ||  | |  ||||    
T  49268247 agcagcagcatatagcagatgatgatgacattgcaacagctgctg-cccggaggtgttacctgtggacccttcctttcctggaggatcgacaaacctatc 49268149  T
Q  332 tcagctacactcttatgccaaacatgtggtattgccgctttggtataatttagat 386  Q
    |  | | |||||||||||||| |||||||  ||||| ||||||||||||| ||||    
T  49268148 tttgttgcactcttatgccaatcatgtggcgttgccactttggtataattcagat 49268094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 154 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 8731814 - 8731754
Alignment:
Q  154 aggtggagtacctgaattatcaggatcatatacaacatgatgtgactgatggtgggtatga 214  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||  ||||||||||| |||||    
T  8731814 aggtcgagtacctgaattatcaggatcagatacaccacgatgccactgatggtggttatga 8731754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 154 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 9083701 - 9083641
Alignment:
Q  154 aggtggagtacctgaattatcaggatcatatacaacatgatgtgactgatggtgggtatga 214  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||  ||||||||||| |||||    
T  9083701 aggtcgagtacctgaattatcaggatcagatacaccacgatgccactgatggtggttatga 9083641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 7 - 70
Target Start/End: Original strand, 3976602 - 3976665
Alignment:
Q  7 atgacacaaagccaccggaaggaaaggcaaagcgggcacatcccaaagaggggaagaggtcgga 70  Q
    ||||| || |||||||||| ||| ||||| || || ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  3976602 atgactcagagccaccggagggagaggcagagtggccacatcccaaagaggggtagaggtcgga 3976665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 7 - 70
Target Start/End: Original strand, 42166059 - 42166122
Alignment:
Q  7 atgacacaaagccaccggaaggaaaggcaaagcgggcacatcccaaagaggggaagaggtcgga 70  Q
    ||||| || ||||||| || ||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  42166059 atgactcagagccaccagagggagaggcagagcggccacatcccaaagaggggtagaggtcgga 42166122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 7 - 70
Target Start/End: Complemental strand, 50216114 - 50216051
Alignment:
Q  7 atgacacaaagccaccggaaggaaaggcaaagcgggcacatcccaaagaggggaagaggtcgga 70  Q
    ||||| ||||| || |||| ||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  50216114 atgactcaaagtcatcggagggacaggcagagcggccacatcccaaagaggggtagaggtcgga 50216051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 7 - 70
Target Start/End: Original strand, 50963853 - 50963916
Alignment:
Q  7 atgacacaaagccaccggaaggaaaggcaaagcgggcacatcccaaagaggggaagaggtcgga 70  Q
    ||||| || ||| |||||| ||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  50963853 atgactcagagctaccggagggagaggcagagcggccacatcccaaagaggggtagaggtcgga 50963916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 7 - 70
Target Start/End: Complemental strand, 52390566 - 52390503
Alignment:
Q  7 atgacacaaagccaccggaaggaaaggcaaagcgggcacatcccaaagaggggaagaggtcgga 70  Q
    ||||| || |||||||||| ||| | ||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  52390566 atgactcagagccaccggagggagaagcagagcggccacatcccaaagaggggtagaggtcgga 52390503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 16 - 70
Target Start/End: Original strand, 597805 - 597859
Alignment:
Q  16 agccaccggaaggaaaggcaaagcgggcacatcccaaagaggggaagaggtcgga 70  Q
    |||||||||| ||| ||||| ||||  ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  597805 agccaccggagggagaggcagagcgcccacatcccaaagaggggtagaggtcgga 597859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 195; Significance: 1e-106; HSPs: 29)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 7 - 386
Target Start/End: Original strand, 37341200 - 37341577
Alignment:
Q  7 atgacacaaagccaccggaaggaaaggcaaagcgggcacatcccaaagaggggaagaggtcggannnnnnnnatggttcagggacttcgcaggaggctcc 106  Q
    ||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |        |||||||||||||||||||||||||| |    
T  37341200 atgactcaaagccaccggaagcagaggcaaagcgggcacatcccaaagaggggaagaggtcgaagggggg--atggttcagggacttcgcaggaggcttc 37341297  T
Q  107 ccatgctacacagcttgaagagtcacaagtggttgatccgaaccagaaggtggagtacctgaattatcaggatcatatacaacatgatgtgactgatggt 206  Q
     || |||||||||| | ||||||| || ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||| || |||||||||||||||    
T  37341298 tcaggctacacagcctaaagagtcgcaggtggttgatccgagccaggaggtggagtacctgaattatcaggatcaggtacaccacgatgtgactgatggt 37341397  T
Q  207 gggtatgatcaggatcatataccagagcagcagcatataacagatgatgatgacattgcagcagcgactgacccagcagtgttacctttggagcctccct 306  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  37341398 gggtatgaccaggatcatataccagagtagcagcatatagcatatgatgatgacattgcagcagcggctaccccagcagtgttacctttggagcctccct 37341497  T
Q  307 tttcaggatgaccggaagatatatctcagctacactcttatgccaaacatgtggtattgccgctttggtataatttagat 386  Q
     |   | | |||||||||||||||||| | |  ||||||||| ||| ||||||  |||||||||||||||||||| ||||    
T  37341498 ctcttgaaggaccggaagatatatctctgatgaactcttatgacaagcatgtgacattgccgctttggtataattcagat 37341577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 7 - 381
Target Start/End: Original strand, 16677924 - 16678295
Alignment:
Q  7 atgacacaaagccaccggaaggaaaggcaaagcgggcacatcccaaagaggggaagaggtcggannnnnnnnatggttcagggacttcgcaggaggctcc 106  Q
    ||||| || |||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||        |||||||||||| ||||||||||||| |    
T  16677924 atgactcagagccaccggagggagaggcaaagcggccacatcccaaagaggggaagaggtcggagggtgg--atggttcagggagttcgcaggaggcttc 16678021  T
Q  107 ccatgctacacagcttgaagagtcacaagtggttgatccgaaccagaaggtggagtacctgaattatcaggatcatatacaacatgatgtgactgatggt 206  Q
     || |||||||| || |||||||| || ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||  |||| || ||||||    
T  16678022 tcaggctacacaact-gaagagtcgcaggtggttgatccgagccagcaggtggagtacctgaattatcaggatcaggtacaccacaatgttacagatggt 16678120  T
Q  207 gggtatgatcaggatcatataccagagcagcagcatataacagatgatgatgacattgcagcagcgactgacccagcagtgttacctttggagcctccct 306  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |  ||  ||  | |||||||||| |||| ||||| |    
T  16678121 gggtatgaccaggatcatataccagaggagcaacatatagcagatgatgatgacattgcagcaactgctaccctggaagtgttacctgtggaccctcctt 16678220  T
Q  307 tttcaggatgaccggaagatatatctcagctacactcttatgccaaacatgtggtattgccgctttggtataatt 381  Q
    || | ||| |||  || ||  |||||  ||| |||||||||| ||| |||||||  ||||||||||| |||||||    
T  16678221 ttcctggaggacatgatgacctatctttgctgcactcttatgtcaatcatgtggcgttgccgctttgatataatt 16678295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 7 - 381
Target Start/End: Original strand, 17652160 - 17652531
Alignment:
Q  7 atgacacaaagccaccggaaggaaaggcaaagcgggcacatcccaaagaggggaagaggtcggannnnnnnnatggttcagggacttcgcaggaggctcc 106  Q
    ||||| || |||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||        |||||||||||| ||||||||||||| |    
T  17652160 atgactcagagccaccggagggagaggcaaagcggccacatcccaaagaggggaagaggtcggagggtgg--atggttcagggagttcgcaggaggcttc 17652257  T
Q  107 ccatgctacacagcttgaagagtcacaagtggttgatccgaaccagaaggtggagtacctgaattatcaggatcatatacaacatgatgtgactgatggt 206  Q
     || |||||||| || |||||||| || ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||  |||| || ||||||    
T  17652258 tcaggctacacaact-gaagagtcgcaggtggttgatccgagccagcaggtggagtacctgaattatcaggatcaggtacaccacaatgttacagatggt 17652356  T
Q  207 gggtatgatcaggatcatataccagagcagcagcatataacagatgatgatgacattgcagcagcgactgacccagcagtgttacctttggagcctccct 306  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |  ||  ||  | |||||||||| |||| ||||| |    
T  17652357 gggtatgaccaggatcatataccagaggagcaacatatagcagatgatgatgacattgcagcaactgctaccctggaagtgttacctgtggaccctcctt 17652456  T
Q  307 tttcaggatgaccggaagatatatctcagctacactcttatgccaaacatgtggtattgccgctttggtataatt 381  Q
    || | ||| |||  || ||  |||||  ||| |||||||||| ||| |||||||  ||||||||||| |||||||    
T  17652457 ttcctggaggacatgatgacctatctttgctgcactcttatgtcaatcatgtggcgttgccgctttgatataatt 17652531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 7 - 381
Target Start/End: Original strand, 39461353 - 39461726
Alignment:
Q  7 atgacacaaagccaccggaaggaaaggcaaagcgggcacatcccaaagaggggaagaggtcggannnnnnnnatggttcagggacttcgcaggaggctcc 106  Q
    ||||| || |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||        || ||||||||| |||||| |||||| |    
T  39461353 atgactcagagccaccggagggagaggcaaagcgggcacatcccaaaaaggggaaaaggtcggagggtgg--attgttcagggagttcgcatgaggctgc 39461450  T
Q  107 ccatgctacacagcttgaagagtcacaagtggttgatccgaaccagaaggtggagtacctgaattatcaggatcatatacaacatgatgtgactgatggt 206  Q
     || |||||| ||| ||||||| | || |||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||| || ||||| ||  |||||    
T  39461451 tcaggctacatagcctgaagagccccaggtggttgatctgagccagcaggtggagtacctgaattatcaggatcaagtacaccacgatgttacgaatggt 39461550  T
Q  207 -gggtatgatcaggatcatataccagagcagcagcatataacagatgatgatgacattgcagcagcgactgacccagcagtgttacctttggagcctccc 305  Q
     |||||||| ||||||||||||||||| || || |||||| ||||||||||||||||||||||| |  ||| |||    ||||||||| |||| ||||||    
T  39461551 ggggtatgaccaggatcatataccagatcaacaacatatagcagatgatgatgacattgcagcatctgctgccccgaaggtgttacctatggaccctccc 39461650  T
Q  306 ttttcaggatgaccggaagatatatctcagctacactcttatgccaaacatgtggtattgccgctttggtataatt 381  Q
    ||| | ||| || || || |  |||||  ||| |||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  39461651 tttcctggaggatcgaaaaacctatctttgctgcactcttatgtcaatcatgtggcattgccgctttggtataatt 39461726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 7 - 386
Target Start/End: Original strand, 47777146 - 47777521
Alignment:
Q  7 atgacacaaagccaccggaaggaaaggcaaagcgggcacatcccaaagaggggaagaggtcggannnnnnnnatggttcagggacttcgcaggaggctcc 106  Q
    ||||| |||||| ||||||  || ||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||        |||||||||||| ||||||||||||| |    
T  47777146 atgactcaaagctaccggagcgagaggcaaagcggccacatcccaaagagaggtagaggtcggagggtgg--atggttcagggagttcgcaggaggctgc 47777243  T
Q  107 ccatgctacacagcttgaagagtcacaagtggttgatccgaaccagaaggtggagtacctgaattatcaggatcatatacaacatgatgtgactgatggt 206  Q
     || |||||||||| ||||||||| || |||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||| || ||||| || ||||||    
T  47777244 tcaggctacacagcctgaagagtcgcaggtggttgacccgagccagcaggtggagtacctgaattatcaggatcaggtacaccacgatgttacggatggt 47777343  T
Q  207 gggtatgatcaggatcatataccagagcagcagcatataacagatgatgatgacattgcagcagcgactgacccagcagtgttacctttggagcctccct 306  Q
    |||||||| ||||||||||| ||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||  || || | |||| |||    ||||||| | |||| |||||||    
T  47777344 gggtatgaccaggatcatatgccacagcagtagcatatagcagatgatgatgacat--catcaactactgccccgaaggtgttacttgtggaccctccct 47777441  T
Q  307 tttcaggatgaccggaagatatatctcagctacactcttatgccaaacatgtggtattgccgctttggtataatttagat 386  Q
    || | ||| | |||  | |  |||||  ||| |||||||||| ||| |||||||  ||||||||||||||||||| ||||    
T  47777442 ttcctggagggccgacatacctatctttgctgcactcttatgtcaatcatgtggcgttgccgctttggtataattcagat 47777521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 7 - 386
Target Start/End: Complemental strand, 27452796 - 27452416
Alignment:
Q  7 atgacacaaagccaccggaaggaaaggcaaagcgggcacatcccaaagaggggaagaggtcggannnnnnnnatggttcagggacttcgcaggaggctcc 106  Q
    ||||| || ||||||| || ||| ||||||||||| ||||||||||| ||||| |||| |||||        |||||||||||| ||||||||||||| |    
T  27452796 atgactcagagccaccagagggagaggcaaagcggccacatcccaaaaaggggtagagatcggagggtgg--atggttcagggagttcgcaggaggcttc 27452699  T
Q  107 ccatgctacacagcttgaagagtcacaagtggttgatccgaaccagaaggtggagtacctgaattatcaggatcatatacaacatgatgtgactgatggt 206  Q
     || |||||||||| ||||||||| || |||||||| | || |||| |||||||| |||||||||||||||||||  |||| || ||||| || ||||||    
T  27452698 tcaggctacacagcctgaagagtcgcacgtggttgacctgagccagcaggtggagcacctgaattatcaggatcaggtacaccacgatgttacggatggt 27452599  T
Q  207 gggtatgatcaggatcatataccagagcag---cagcatataacagatgatgatgacattgcagcagcgactgacccagcagtgttacctttggagcctc 303  Q
    |||||||| ||||||||||||||| |||||   || |||||| |||||||||| |||||||||||| |  ||| | | |  ||||||||| |||| ||||    
T  27452598 gggtatgaccaggatcatataccacagcagcaacatcatatagcagatgatgacgacattgcagcaacagctgtctcggaggtgttacctgtggaccctc 27452499  T
Q  304 ccttttcaggatgaccggaagatatatctcagctacactcttatgccaaacatgtggtattgccgctttggtataatttagat 386  Q
    ||||| | ||| |||||  | |  |||||  ||| |||||||||| ||| |||||||| ||||||||||| ||||||| ||||    
T  27452498 cctttcctggaggaccgacaaacctatctttgctgcactcttatgtcaatcatgtggtgttgccgctttgctataattcagat 27452416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 7 - 261
Target Start/End: Original strand, 19798168 - 19798420
Alignment:
Q  7 atgacacaaagccaccggaaggaaaggcaaagcgggcacatcccaaagaggggaagaggtcggannnnnnnnatggttcagggacttcgcaggaggctcc 106  Q
    ||||| || |||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||        |||||||||||| |||| |||||||| |    
T  19798168 atgactcagagccaccggagggagaggcaaagcggccacatcccaaagaggggaagaggtcggatggtgg--atggttcagggagttcgaaggaggcttc 19798265  T
Q  107 ccatgctacacagcttgaagagtcacaagtggttgatccgaaccagaaggtggagtacctgaattatcaggatcatatacaacatgatgtgactgatggt 206  Q
     || |||||||||| ||||||||| || ||||||||||||| |||| ||||| |||||||| |||||||||||||  |||| || ||||| || |||| |    
T  19798266 tcaggctacacagcctgaagagtcgcaggtggttgatccgagccagcaggtgcagtacctggattatcaggatcaagtacaccacgatgttacggatgat 19798365  T
Q  207 gggtatgatcaggatcatataccagagcagcagcatataacagatgatgatgaca 261  Q
    |||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||| ||  |||||| |||||||    
T  19798366 gggtatgaccaggatcatatactagagcagcaacatgtaggagatgaagatgaca 19798420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 99; E-Value: 9e-49
Query Start/End: Original strand, 7 - 386
Target Start/End: Complemental strand, 5540752 - 5540381
Alignment:
Q  7 atgacacaaagccaccggaaggaaaggcaaagcgggcacatcccaaagaggggaagaggtcggannnnnnnnatggttcagggacttcgcaggaggctcc 106  Q
    ||||| || |||||||||| ||| ||| |||| || ||||||||||||||||| ||||||||||        |||||||||||| ||| |||||||||      
T  5540752 atgactcagagccaccggagggagaggaaaagtggccacatcccaaagaggggtagaggtcggagggtgg--atggttcagggagttcacaggaggct-- 5540657  T
Q  107 ccatgctacacagcttgaagagtcacaagtggttgatccgaaccagaaggtggagtacctgaattatcaggatcatatacaacatgatgtgactgatggt 206  Q
        |||   |||| |||||||||||| ||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||  |||| || ||||| || || |||    
T  5540656 ----gct---cagcctgaagagtcacaggtggttgatccgagccaataggtggagtacctgaattatcaggatcaagtacaccacgatgttacggagggt 5540564  T
Q  207 gggtatgatcaggatcatataccagagcagcagca---tataacagatgatgatgacattgcagcagcgactgacccagcagtgttacctttggagcctc 303  Q
    |||||||| ||| || |||||||| | ||||| ||   |||| |||||||||||||||||||||||||  ||| ||| |  ||||||| | |||| ||||    
T  5540563 gggtatgaccagaatgatataccacaacagcaacaacatatagcagatgatgatgacattgcagcagctgctgccccggaggtgttacatgtggaccctc 5540464  T
Q  304 ccttttcaggatgaccggaagatatatctcagctacactcttatgccaaacatgtggtattgccgctttggtataatttagat 386  Q
    ||||| | ||| |||||| |||  |||||  ||| |||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||| ||||    
T  5540463 cctttcctggaggaccggcagacctatctttgctgcactcttatgccaatcatgtggcgttgccgctttggtataattcagat 5540381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 154 - 381
Target Start/End: Complemental strand, 9493834 - 9493604
Alignment:
Q  154 aggtggagtacctgaattatcaggatcatatacaacatgatgtgactgatggtgggtatgatcaggatcatataccagagcag---cagcatataacaga 250  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||  |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||   ||||||  |  |||    
T  9493834 aggtggagtacctgaattatcaggatcaggtacagcacaatgtgactgatggtggatatgaccaggatcatataccagagcagtagcagcatgaactaga 9493735  T
Q  251 tgatgatgacattgcagcagcgactgacccagcagtgttacctttggagcctcccttttcaggatgaccggaagatatatctcagctacactcttatgcc 350  Q
     ||||||||||||||||||||| ||| ||| |  | ||||||| |||| ||||||||| | ||| |||||||| |  |||||| ||| ||||||||||||    
T  9493734 cgatgatgacattgcagcagcggctgccccggaggggttacctgtggaccctccctttcctggaggaccggaaaacctatctctgctgcactcttatgcc 9493635  T
Q  351 aaacatgtggtattgccgctttggtataatt 381  Q
    || ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  9493634 aagcatgtggcattgccgctttggtataatt 9493604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 138 - 381
Target Start/End: Original strand, 11635784 - 11636027
Alignment:
Q  138 gttgatccgaaccagaaggtggagtacctgaattatcaggatcatatacaacatgatgtgactgatggtgggtatgatcaggatcatataccagagcagc 237  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||| || ||||| || |||||||| ||||| ||| ||||||||| |||| |||    
T  11635784 gttgatccgagccagcaggtggagtacctgaattatcaggatcaggtacaccacgatgttacggatggtggatatgaccagcatcatatactagagtagc 11635883  T
Q  238 agcatataacagatgatgatgacattgcagcagcgactgacccagcagtgttacctttggagcctcccttttcaggatgaccggaagatatatctcagct 337  Q
    | |||||| |||||||| ||||||||  ||||||  ||| ||| |  || |||||| |||| ||||||||| | ||| ||||||||||  ||| |  |||    
T  11635884 aacatatagcagatgataatgacattatagcagctgctgccccggaggtattacctgtggaccctccctttcctggaggaccggaagacctatatttgct 11635983  T
Q  338 acactcttatgccaaacatgtggtattgccgctttggtataatt 381  Q
     |||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  11635984 gcactcttatgccaatcatgtggcattgcagctttggtataatt 11636027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 84; E-Value: 8e-40
Query Start/End: Original strand, 155 - 386
Target Start/End: Complemental strand, 46739542 - 46739311
Alignment:
Q  155 ggtggagtacctgaattatcaggatcatatacaacatgatgtgactgatggtgggtatgatcaggatcatataccagagcagcagcatataacagatgat 254  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  |||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||| |||    
T  46739542 ggtggagtacctgaattatcaggatcaggtacaccacgatgtgactgatggtgggtatgaccaggatcatataccacagcagcagcatgtaagagacgat 46739443  T
Q  255 gatgacattgcagcagcgactgacccagcagtgttacctttggagcctcccttttcaggatgaccggaagatatatctcagctacactcttatgccaaac 354  Q
    |||||||||||| ||||   || |||||  ||||||||| | || ||||||||| | ||  |||||  |||  |||||  ||| |||||||||||||  |    
T  46739442 gatgacattgcaacagctgatgccccagaggtgttacctatagatcctccctttcctggtggaccgacagacttatctttgctccactcttatgccagtc 46739343  T
Q  355 atgtggtattgccgctttggtataatttagat 386  Q
    ||||||  ||||| |||| |||||||| ||||    
T  46739342 atgtggcgttgccacttttgtataattcagat 46739311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 154 - 381
Target Start/End: Original strand, 36978622 - 36978852
Alignment:
Q  154 aggtggagtacctgaattatcaggatcatatacaacatgatgtgactgatggtgggtatgatcaggatcatataccag---agcagcagcatataacaga 250  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |  |||| || ||||||| ||||||||||||||| || ||||||||| |||   |||||||||||  | ||||    
T  36978622 aggtggagtacctgaattatcaggattaggtacaccacgatgtgattgatggtgggtatgaccaagatcatatatcagagaagcagcagcatgaaccaga 36978721  T
Q  251 tgatgatgacattgcagcagcgactgacccagcagtgttacctttggagcctcccttttcaggatgaccggaagatatatctcagctacactcttatgcc 350  Q
     ||||||||||||||||||||| ||| ||| |  ||||||| | |||| ||||||||| | ||| |||||||| ||||||||  | |  ||||||||| |    
T  36978722 cgatgatgacattgcagcagcggctgccccggaggtgttacatgtggaccctccctttcctggaggaccggaaaatatatctttgttgtactcttatgtc 36978821  T
Q  351 aaacatgtggtattgccgctttggtataatt 381  Q
    || ||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  36978822 aatcatgtggcattaccgctttggtataatt 36978852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 79; E-Value: 8e-37
Query Start/End: Original strand, 157 - 386
Target Start/End: Original strand, 34739410 - 34739642
Alignment:
Q  157 tggagtacctgaattatcaggatcatatacaacatgatgtgactgatggtgggtatgatcaggatcatataccagagcagcagcatataaca---gatga 253  Q
    |||||||||| || |||||||||||  |||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| | ||||||||| ||  |   |||||    
T  34739410 tggagtacctaaaatatcaggatcaggtacaccacgatgtgactgatggtgggtatgaccaggatcacataccacaacagcagcatgtaggagatgatga 34739509  T
Q  254 tgatgacattgcagcagcgactgacccagcagtgttacctttggagcctcccttttcaggatgaccggaagatatatctcagctacactcttatgccaaa 353  Q
    ||||||||||||||||||  ||| ||| |  ||||||||| |||| ||||||||| | ||| |||||| |||  |||||  ||| ||||||||||||||     
T  34739510 tgatgacattgcagcagctcctgccccggaggtgttacctgtggaccctccctttcctggaggaccggcagacttatctttgctgcactcttatgccaat 34739609  T
Q  354 catgtggtattgccgctttggtataatttagat 386  Q
    |||||||  |||| |||||||||||||| ||||    
T  34739610 catgtggcgttgctgctttggtataattcagat 34739642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 154 - 381
Target Start/End: Complemental strand, 47672151 - 47671921
Alignment:
Q  154 aggtggagtacctgaattatcaggatcatatacaacatgatgtgactgatggtgggtatgatcaggatcatataccagagcagcagca---tataacaga 250  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||  |||| || ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||   |  | ||||    
T  47672151 aggtggagtaccagaattatcaggatcaggtacaccacgatgtgactgatggtgggtatgaccagaatcatataccaaagcagcagcaacatgaaccaga 47672052  T
Q  251 tgatgatgacattgcagcagcgactgacccagcagtgttacctttggagcctcccttttcaggatgaccggaagatatatctcagctacactcttatgcc 350  Q
     |||||||| |||||||||| | ||| ||| |  ||||||||| |||| ||||||||| |  || |||||||| |  |||||| ||| ||||| ||||||    
T  47672051 cgatgatgaaattgcagcagtggctgccccggaggtgttacctgtggaccctccctttcctagaggaccggaaaacctatctctgctgcactcgtatgcc 47671952  T
Q  351 aaacatgtggtattgccgctttggtataatt 381  Q
    || ||||||  ||||||||||| ||||||||    
T  47671951 aagcatgtgacattgccgctttagtataatt 47671921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 135 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 11635704 - 11635575
Alignment:
Q  135 gtggttgatccgaaccagaaggtggagtacctgaattatcaggatcatatacaacatgatgtgactgatggtgggtatgatcaggatcatataccagagc 234  Q
    |||||||||| ||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||| || ||||| || |||||||||||||| || |||||||||||||||     
T  11635704 gtggttgatctgagtcagcaggtggagtacctgaattatcaggatcaggtacaccacgatgtaaccgatggtgggtatgaccaagatcatataccagagt 11635605  T
Q  235 agcagcatataacagatgatgatgacattg 264  Q
    |||| |||||| |||||||||| |||||||    
T  11635604 agcaacatatagcagatgatgaggacattg 11635575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 157 - 386
Target Start/End: Original strand, 17836123 - 17836352
Alignment:
Q  157 tggagtacctgaattatcaggatcatatacaacatgatgtgactgatggtgggtatgatcaggatcatataccagagcagcagcatataacagatgatga 256  Q
    |||||||| ||||||||||||||||  |||| || ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| | ||||| ||| ||  ||| |||||    
T  17836123 tggagtacatgaattatcaggatcaggtacaccacgatgtgactgatggtggatatgaccaggatcatataccacaacagcaacatgtaggagacgatga 17836222  T
Q  257 tgacattgcagcagcgactgacccagcagtgttacctttggagcctcccttttcaggatgaccggaagatatatctcagctacactcttatgccaaacat 356  Q
    |||||||||||||||  |||   | |  ||||||||| |||| ||||||||| | ||  |||||  |||  |||||  ||| |||||||||||||  |||    
T  17836223 tgacattgcagcagctgctgcatcggaggtgttacctgtggaccctccctttcctggtggaccgacagacttatctttgctccactcttatgccagtcat 17836322  T
Q  357 gtggtattgccgctttggtataatttagat 386  Q
    ||||  ||||| ||||||||||||| ||||    
T  17836323 gtggcgttgccactttggtataattcagat 17836352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 155 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 15073296 - 15073180
Alignment:
Q  155 ggtggagtacctgaattatcaggatcatatacaacatgatgtgactgatggtgggtatgatcaggatcatataccagagcagcagcatataacagatgat 254  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||  |||| ||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||| ||  |  ||| ||     
T  15073296 ggtggagtacctgaactatcaggatcaggtacagcatgatgtgacggatggtggatatgaccaggatcatataccacagcagcaggatgcaggagacgag 15073197  T
Q  255 gatgacattgcagcagc 271  Q
    |||||||||||||||||    
T  15073196 gatgacattgcagcagc 15073180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 155 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 42507105 - 42506989
Alignment:
Q  155 ggtggagtacctgaattatcaggatcatatacaacatgatgtgactgatggtgggtatgatcaggatcatataccagagcagcagcatataacagatgat 254  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||  |||| ||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||| ||  |  ||| ||     
T  42507105 ggtggagtacctgaactatcaggatcaggtacagcatgatgtgacggatggtggatatgaccaggatcatataccacagcagcaggatgcaggagacgag 42507006  T
Q  255 gatgacattgcagcagc 271  Q
    |||||||||||||||||    
T  42507005 gatgacattgcagcagc 42506989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 7 - 68
Target Start/End: Complemental strand, 9493982 - 9493921
Alignment:
Q  7 atgacacaaagccaccggaaggaaaggcaaagcgggcacatcccaaagaggggaagaggtcg 68  Q
    ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9493982 atgacccaaagccaccggaaggagaggcaaagcgggcacatcccaaagaggggaagaggtcg 9493921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 155 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 17462316 - 17462200
Alignment:
Q  155 ggtggagtacctgaattatcaggatcatatacaacatgatgtgactgatggtgggtatgatcaggatcatataccagagcagcagcatataacagatgat 254  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||  |||| ||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||| | |||||| ||  |  ||| ||     
T  17462316 ggtggagtacctgaactatcaggatcaggtacagcatgatgtgacggatggtggatatgaccaggatcatataccacatcagcaggatgcaggagacgag 17462217  T
Q  255 gatgacattgcagcagc 271  Q
    |||||||||||||||||    
T  17462216 gatgacattgcagcagc 17462200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 155 - 271
Target Start/End: Original strand, 17590898 - 17591014
Alignment:
Q  155 ggtggagtacctgaattatcaggatcatatacaacatgatgtgactgatggtgggtatgatcaggatcatataccagagcagcagcatataacagatgat 254  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||  |||| ||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||| | |||||| ||  |  ||| ||     
T  17590898 ggtggagtacctgaactatcaggatcaggtacagcatgatgtgacggatggtggatatgaccaggatcatataccacatcagcaggatgcaggagacgag 17590997  T
Q  255 gatgacattgcagcagc 271  Q
    |||||||||||||||||    
T  17590998 gatgacattgcagcagc 17591014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 155 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 9370401 - 9370285
Alignment:
Q  155 ggtggagtacctgaattatcaggatcatatacaacatgatgtgactgatggtgggtatgatcaggatcatataccagagcagcagcatataacagatgat 254  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||  |||| ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||| |  ||||| ||  |  ||| ||     
T  9370401 ggtggagtacctgaactatcaggatcaggtacatcatgatgtgacggacggtggatatgaccaggatcatataccacatgagcaggatgcaggagacgag 9370302  T
Q  255 gatgacattgcagcagc 271  Q
    |||||||||||||||||    
T  9370301 gatgacattgcagcagc 9370285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 155 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 35609437 - 35609321
Alignment:
Q  155 ggtggagtacctgaattatcaggatcatatacaacatgatgtgactgatggtgggtatgatcaggatcatataccagagcagcagcatataacagatgat 254  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||  |||| ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||| |  ||||| ||  |  ||| ||     
T  35609437 ggtggagtacctgaactatcaggatcaggtacatcatgatgtgacggacggtggatatgaccaggatcatataccacatgagcaggatgcaggagacgag 35609338  T
Q  255 gatgacattgcagcagc 271  Q
    |||||||||||||||||    
T  35609337 gatgacattgcagcagc 35609321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 155 - 271
Target Start/End: Original strand, 41881552 - 41881668
Alignment:
Q  155 ggtggagtacctgaattatcaggatcatatacaacatgatgtgactgatggtgggtatgatcaggatcatataccagagcagcagcatataacagatgat 254  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||  |||| ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||| |  ||||| ||  |  ||| ||     
T  41881552 ggtggagtacctgaactatcaggatcaggtacatcatgatgtgacggacggtggatatgaccaggatcatataccacatgagcaggatgcaggagacgag 41881651  T
Q  255 gatgacattgcagcagc 271  Q
    |||||||||||||||||    
T  41881652 gatgacattgcagcagc 41881668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 155 - 271
Target Start/End: Original strand, 48404419 - 48404535
Alignment:
Q  155 ggtggagtacctgaattatcaggatcatatacaacatgatgtgactgatggtgggtatgatcaggatcatataccagagcagcagcatataacagatgat 254  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||  |||| ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||| |  ||||| ||  |  ||| ||     
T  48404419 ggtggagtacctgaactatcaggatcaggtacatcatgatgtgacggacggtggatatgaccaggatcatataccacatgagcaggatgcaggagacgag 48404518  T
Q  255 gatgacattgcagcagc 271  Q
    |||||||||||||||||    
T  48404519 gatgacattgcagcagc 48404535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 285 - 381
Target Start/End: Complemental strand, 11633966 - 11633870
Alignment:
Q  285 gtgttacctttggagcctcccttttcaggatgaccggaagatatatctcagctacactcttatgccaaacatgtggtattgccgctttggtataatt 381  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||  || ||||||||||   ||||  | | ||||||||| | || ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  11633966 gtgttacctgtggaccctcccttttctagaggaccggaagaccaatctttgttgcactcttatacaaatcatgtggcattgccgctttggtataatt 11633870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 7 - 70
Target Start/End: Complemental strand, 15073445 - 15073382
Alignment:
Q  7 atgacacaaagccaccggaaggaaaggcaaagcgggcacatcccaaagaggggaagaggtcgga 70  Q
    ||||| || |||||||| | ||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  15073445 atgactcagagccaccgcagggagaggcagagcggccacatcccaaagaggggtagaggtcgga 15073382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 7 - 70
Target Start/End: Original strand, 34739259 - 34739322
Alignment:
Q  7 atgacacaaagccaccggaaggaaaggcaaagcgggcacatcccaaagaggggaagaggtcgga 70  Q
    ||||| |||||||||| || ||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  34739259 atgacccaaagccaccagagggagaggcagagcggccacattccaaagaggggtagaggtcgga 34739322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 7 - 67
Target Start/End: Complemental strand, 42507254 - 42507194
Alignment:
Q  7 atgacacaaagccaccggaaggaaaggcaaagcgggcacatcccaaagaggggaagaggtc 67  Q
    ||||| || |||||||| | ||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  42507254 atgactcagagccaccgcagggagaggcagagcggccacatcccaaagaggggtagaggtc 42507194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 191; Significance: 1e-103; HSPs: 32)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 7 - 386
Target Start/End: Original strand, 47656741 - 47657118
Alignment:
Q  7 atgacacaaagccaccggaaggaaaggcaaagcgggcacatcccaaagaggggaagaggtcggannnnnnnnatggttcagggacttcgcaggaggctcc 106  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||        ||| |||||||||||||||||||||| |    
T  47656741 atgactcaaagccaccggaaggagaggcaaagtgggcacatcccaaagaggggaagaggtcggaggtggg--atgattcagggacttcgcaggaggcttc 47656838  T
Q  107 ccatgctacacagcttgaagagtcacaagtggttgatccgaaccagaaggtggagtacctgaattatcaggatcatatacaacatgatgtgactgatggt 206  Q
     ||  ||||||||| ||||||||| || ||||||||||||| |||  ||||||||||| ||||||||||||||||  |||| || |||||||||||||||    
T  47656839 tcagactacacagcctgaagagtcgcaggtggttgatccgagccaagaggtggagtacttgaattatcaggatcaggtacaccacgatgtgactgatggt 47656938  T
Q  207 gggtatgatcaggatcatataccagagcagcagcatataacagatgatgatgacattgcagcagcgactgacccagcagtgttacctttggagcctccct 306  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||| || |||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||| ||    
T  47656939 gggtatgaccatgatcatataccagagcaacaacatatagcagacgatgatgacattgcagcagcggctgccccagaagtgttacctttggagcctctct 47657038  T
Q  307 tttcaggatgaccggaagatatatctcagctacactcttatgccaaacatgtggtattgccgctttggtataatttagat 386  Q
    || | ||| ||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||  |||| ||||||||||||||| ||||    
T  47657039 ttcctggaggaccgaaagatatatctctgctgcactcttatgccaagcatgtgacattggcgctttggtataattcagat 47657118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 7 - 381
Target Start/End: Original strand, 45825772 - 45826143
Alignment:
Q  7 atgacacaaagccaccggaaggaaaggcaaagcgggcacatcccaaagaggggaagaggtcggannnnnnnnatggttcagggacttcgcaggaggctcc 106  Q
    ||||| || |||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||        |||||||||||||||||||||||| | |    
T  45825772 atgactcagagccaccggaaggagagacaaagtgggcacatcccaaagaggggaagaggtcggaggttgg--atggttcagggacttcgcaggaggtttc 45825869  T
Q  107 ccatgctacacagcttgaagagtcacaagtggttgatccgaaccagaaggtggagtacctgaattatcaggatcatatacaacatgatgtgactgatggt 206  Q
     || |||||||| | | ||||||| || ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||| || ||||| || ||||||    
T  45825870 tcaggctacacaaccttaagagtcgcatgtggttgatccgagccaggaggtggagtacctgaattatcaggatcaggtacaccacgatgttacggatggt 45825969  T
Q  207 gggtatgatcaggatcatataccagagcagcagcatataacagatgatgatgacattgcagcagcgactgacccagcagtgttacctttggagcctccct 306  Q
    |  ||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  45825970 ga-tatgaccaggatcatataccaaagcagcaacatataatagatgatgatgacattgcagcagcggctgtcccagcagtgttacctttggagcctccct 45826068  T
Q  307 tttcaggatgaccggaagatatatctcagctacactcttatgccaaacatgtggtattgccgctttggtataatt 381  Q
    || | ||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||    
T  45826069 ttcctggaggaccggaagatatatctctgctgcactcttatgccaagcatgtggcattgccgccttggtataatt 45826143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 178; E-Value: 7e-96
Query Start/End: Original strand, 7 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 38126682 - 38126359
Alignment:
Q  7 atgacacaaagccaccggaaggaaaggcaaagcgggcacatcccaaagaggggaagaggtcggannnnnnnnatggttcagggacttcgcaggaggctcc 106  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||        ||||||||||||||||| |||||| |      
T  38126682 atgactcaaagccaccggaaggagaggcaaagtgggcacatcccaaagaggggaagaggtcggaggggg---atggttcagggacttcgtaggaggattt 38126586  T
Q  107 ccatgctacacagcttgaagagtcacaagtggttgatccgaaccagaaggtggagtacctgaattatcaggatcatatacaacatgatgtgactgatggt 206  Q
     ||| ||||||||| ||||||||| || ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||  ||||  | |||||||||||||||    
T  38126585 tcatactacacagcctgaagagtcgcaggtggttgatccgagccaggaggtggagtacctgaattattaggatcaggtacacaacgatgtgactgatggt 38126486  T
Q  207 gggtatgatcaggatcatataccagagcagcagcatataacagatgatgatgacattgcagcagcgactgacccagcagtgttacctttggagcctccct 306  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||| ||    
T  38126485 gggtatgaccaggatcatataccagagcagcaacatatagtagatgatgatgacattgcagcagcggctgccccagtagtgttacctttggagcctctct 38126386  T
Q  307 tttcaggatgaccggaagatatatctc 333  Q
    |||| ||| ||||||||||||||||||    
T  38126385 tttctggaggaccggaagatatatctc 38126359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 7 - 381
Target Start/End: Complemental strand, 50343169 - 50342797
Alignment:
Q  7 atgacacaaagccaccggaaggaaaggcaaagcgggcacatcccaaagaggggaagaggtcggannnnnnnnatggttcagggacttcgcaggaggctcc 106  Q
    ||||| || |||||||||| |||  |||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||        |||||||||||| ||||||||||||| |    
T  50343169 atgactcagagccaccggagggagcggcaaagcggccacatcccaaagaggggtagaggccggagggtgg--atggttcagggagttcgcaggaggcttc 50343072  T
Q  107 ccatgctacacagcttgaagagtcacaagtggttgatccgaaccagaaggtggagtacctgaattatcaggatcatatacaacatgatgtgactgatggt 206  Q
     || |||||||||| ||||||||| || ||||||||||||| |||| || |||||||||||||||||||||| ||  |||| || ||||| || ||||||    
T  50343071 tcaggctacacagcctgaagagtcgcaggtggttgatccgagccagcagatggagtacctgaattatcaggaccaggtacaccacgatgttacggatggt 50342972  T
Q  207 gggtatgatcaggatcatataccagagcagcagcatataacagatgatgatgacattgcagcagcgactgacccagcagtgttacctttggagcctccct 306  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||| |||||||||||||  ||| |||||  |||||| || |||| |||||||    
T  50342971 gggtatgaccaggatcatataccagagcagcagcatgtaggagatgatgataacattgcagcagctgctgccccagaggtgttatctgtggaccctccct 50342872  T
Q  307 tttcaggatgaccggaagatatatctcagctacactcttatgccaaacatgtggtattgccgctttggtataatt 381  Q
    || | ||| || |||| ||  |||||  ||| |||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||    
T  50342871 ttcctggaggatcggacgacctatctttgctgcactcttatgccaatcatgtggcgttgccgctttggtataatt 50342797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 131; E-Value: 8e-68
Query Start/End: Original strand, 7 - 386
Target Start/End: Original strand, 52803029 - 52803405
Alignment:
Q  7 atgacacaaagccaccggaaggaaaggcaaagcgggcacatcccaaagaggggaagaggtcggannnnnnnnatggttcagggacttcgcaggaggctcc 106  Q
    ||||| || |||||||||| ||| ||||| ||||| |||||||||||||||| | |||||||||        |||||||||||| |||||| |||||| |    
T  52803029 atgactcagagccaccggagggagaggcagagcggccacatcccaaagagggta-gaggtcggaggggag--atggttcagggagttcgcatgaggcttc 52803125  T
Q  107 ccatgctacacagcttgaagagtcacaagtggttgatccgaaccagaaggtggagtacctgaattatcaggatcatatacaacatgatgtgactgatggt 206  Q
     || |||||||||| ||||||||| || |||||||| |||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||  |||| || |||||||||||||||    
T  52803126 tcaagctacacagcctgaagagtcgcatgtggttgacccgagccagcaggaggagtacctgaattatcaggatcaggtacaccacgatgtgactgatggt 52803225  T
Q  207 gggtatgatcaggatcatataccagagcagcagcatataacagatgatgatgacattgcagcagcgactgacccagcagtgttacctttggagcctccct 306  Q
    || ||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |   |||||||||||||||||||||| |  ||| ||| |  ||||||||| |||| |||||||    
T  52803226 ggatatgaccaggatcatataccacagcagcagcatgtggtagatgatgatgacattgcagcaacagctgcccccgaggtgttacctgtggaccctccct 52803325  T
Q  307 tttcaggatgaccggaagatatatctcagctacactcttatgccaaacatgtggtattgccgctttggtataatttagat 386  Q
    |||| ||| |||| | |||  |||||  ||  |||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||| ||||    
T  52803326 tttctggaggaccagcagacttatctttgccgcactcttatgccaatcatgtggcgttgccgctttggtataattcagat 52803405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 7 - 386
Target Start/End: Original strand, 47503180 - 47503560
Alignment:
Q  7 atgacacaaagccaccggaaggaaaggcaaagcgggcacatcccaaagaggggaagaggtcggannnnnnnnatggttcagggacttcgcaggaggctcc 106  Q
    ||||| || |||||||||| ||| || |||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||        |||||||||||| ||||||||||||| |    
T  47503180 atgactcagagccaccggagggagagacaaagcggccacatctcaaagaggggtagaggtcggagggtgg--atggttcagggagttcgcaggaggcttc 47503277  T
Q  107 ccatgctacacagcttgaagagtcacaagtggttgatccgaaccagaaggtggagtacctgaattatcaggatcatatacaacatgatgtgactgatggt 206  Q
     || |||  ||||| ||||||||| || |||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||| || ||||| || ||||||    
T  47503278 tcaggctcaacagcatgaagagtcgcaggtggttgacccgagccagcaggtggagtacctgaattatcaggatcaggtacaccacgatgttacagatggt 47503377  T
Q  207 gggtatgatcaggatcatatacca---gagcagcagcatataacagatgatgatgacattgcagcagcgactgacccagcagtgttacctttggagcctc 303  Q
    |||||||| |||||||||||||||    | ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||  ||| |||||  ||||||||| |||| ||||    
T  47503378 gggtatgaccaggatcatataccacatcaacagcatcatatagcagatgatgatgacattgcagcagctgctgccccagaggtgttacctgtggaccctc 47503477  T
Q  304 ccttttcaggatgaccggaagatatatctcagctacactcttatgccaaacatgtggtattgccgctttggtataatttagat 386  Q
    ||||| | ||| |||||| | |  |||||  ||| ||||||| |||||| |||||||  ||||| ||||||||||||| ||||    
T  47503478 cctttcctggaggaccggcatacctatctttgctgcactcttttgccaatcatgtggcgttgccactttggtataattcagat 47503560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 123; E-Value: 4e-63
Query Start/End: Original strand, 16 - 386
Target Start/End: Original strand, 21141759 - 21142130
Alignment:
Q  16 agccaccggaaggaaaggcaaagcgggcacatcccaaagaggggaagaggtcggannnnnnnnatggttcagggacttcgcaggaggctccccatgctac 115  Q
    |||||||||| ||| |||||||| || ||||||||||||||||| ||||||| ||        |||||||||||| ||| ||||||||| | ||||||||    
T  21141759 agccaccggagggagaggcaaagtggccacatcccaaagaggggtagaggtctgagggtgg--atggttcagggagttcacaggaggcttctcatgctac 21141856  T
Q  116 acagcttgaagagtcacaagtggttgatccgaaccagaaggtggagtacctgaattatcaggatcatatacaacatgatgtgactgatggtgggtatgat 215  Q
    ||| | ||||||||| || |||||| |||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||   |||| || ||||| || ||||||||||||||     
T  21141857 acaacctgaagagtcgcaggtggttaatccgagccatcaggtggagtacctgaattatcaggatcgggtacaccacgatgttacagatggtgggtatgac 21141956  T
Q  216 caggatcatataccagagcagcagc---atataacagatgatgatgacattgcagcagcgactgacccagcagtgttacctttggagcctcccttttcag 312  Q
    ||||||||||||||| | |||||||   ||||| |||||||||||||||||||||||||  ||| ||| |  ||||||||| |||| ||||||||| | |    
T  21141957 caggatcatataccacaacagcagcaaaatatagcagatgatgatgacattgcagcagctgctgccccggaggtgttacctgtggaccctccctttcctg 21142056  T
Q  313 gatgaccggaagatatatctcagctacactcttatgccaaacatgtggtattgccgctttggtataatttagat 386  Q
    || |||||| |||  |||||  | | ||||||||| |||| |||||||  ||||||||||||||||||| ||||    
T  21142057 gaggaccggcagacctatctttgttgcactcttattccaatcatgtggcgttgccgctttggtataattcagat 21142130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 7 - 381
Target Start/End: Complemental strand, 23275300 - 23274949
Alignment:
Q  7 atgacacaaagccaccggaaggaaaggcaaagcgggcacatcccaaagaggggaagaggtcggannnnnnnnatggttcagggacttcgcaggaggctcc 106  Q
    ||||| |||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        |||||||||||| ||||||||||||| |    
T  23275300 atgactcaaagccatcgaaaggagaggcaaagcgggcacatcccaaagaggggaagaggtcggatggtgg--atggttcagggagttcgcaggaggcttc 23275203  T
Q  107 ccatgctacacagcttgaagagtcacaagtggttgatccgaaccagaaggtggagtacctgaattatcaggatcatatacaacatgatgtgactgatggt 206  Q
     || |||||||||| ||||||||| ||                     |||||||||||||||||||||||||||  |||| || ||||| || ||||||    
T  23275202 tcaggctacacagcctgaagagtcgca---------------------ggtggagtacctgaattatcaggatcaggtacaccacgatgttacggatggt 23275124  T
Q  207 gggtatgatcaggatcatataccagagcagcagcatataacagatgatgatgacattgcagcagcgactgacccagcagtgttacctttggagcctccct 306  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| |||| ||| |  ||||||||| || | |||||||    
T  23275123 gggtatgatcaggatcatataccagagcagcagcatatagcagacgatgatgacattgcagcagctactgccccggaggtgttacctgtgaaccctccct 23275024  T
Q  307 tttcaggatgaccggaagatatatctcagctacactcttatgccaaacatgtggtattgccgctttggtataatt 381  Q
    ||   ||| || |||||||  |||||  ||| |||||||||||||| ||||||  |||||| | |||||||||||    
T  23275023 ttcttggaggatcggaagacctatctttgctgcactcttatgccaatcatgtgccattgccaccttggtataatt 23274949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 154 - 381
Target Start/End: Original strand, 51321748 - 51321978
Alignment:
Q  154 aggtggagtacctgaattatcaggatcatatacaacatgatgtgactgatggtgggtatgatcaggatcatataccagagcagcagca---tataacaga 250  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  |||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||   |  | ||||    
T  51321748 aggtggagtacctgaattatcaggatcaggtacaccacgatgtgactgatggtgggtatgaccaggatcatataccagagcagcagcaacatgaaccaga 51321847  T
Q  251 tgatgatgacattgcagcagcgactgacccagcagtgttacctttggagcctcccttttcaggatgaccggaagatatatctcagctacactcttatgcc 350  Q
     |||||||||||||||||||||  || ||| |  ||||||||| |||| ||||||||| | ||  |||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||    
T  51321848 cgatgatgacattgcagcagcggatgccccggaggtgttacctgtggaccctccctttcctggcggaccggaaaatatatctctgctgcactcttatgcc 51321947  T
Q  351 aaacatgtggtattgccgctttggtataatt 381  Q
    || ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  51321948 aatcatgtggcattgccgctttggtataatt 51321978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 155 - 386
Target Start/End: Complemental strand, 96968 - 96737
Alignment:
Q  155 ggtggagtacctgaattatcaggatcatatacaacatgatgtgactgatggtgggtatgatcaggatcatataccagagcagcagcatataacagatgat 254  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  |||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||  ||| |||    
T  96968 ggtggagtacctgaattatcaggatcaggtacaccacgatgtgactgatggtgggtatgaccaggatcatataccacagcagcagcatgtaggagacgat 96869  T
Q  255 gatgacattgcagcagcgactgacccagcagtgttacctttggagcctcccttttcaggatgaccggaagatatatctcagctacactcttatgccaaac 354  Q
    |||||||||||||||||  |||  || |  ||||||||| |||| ||||||||||| ||  |||||  |||  |||||  ||| |||||||||||||  |    
T  96868 gatgacattgcagcagctgctgcaccggaggtgttacctgtggaccctcccttttctggtggaccgacagacttatctttgctccactcttatgccagtc 96769  T
Q  355 atgtggtattgccgctttggtataatttagat 386  Q
    || |||| ||||| ||||||||||||| ||||    
T  96768 atttggtgttgccactttggtataattcagat 96737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 89; E-Value: 9e-43
Query Start/End: Original strand, 154 - 381
Target Start/End: Complemental strand, 49856998 - 49856768
Alignment:
Q  154 aggtggagtacctgaattatcaggatcatatacaacatgatgtgactgatggtgggtatgatcaggatcatataccagagcagcagca---tataacaga 250  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||  |||| || |||||||||| |||| ||||||| || |||||||||||||||||||| ||   |  | ||||    
T  49856998 aggtggagtaccagaattatcaggatcaagtacaccacgatgtgactggtggtaggtatgaccaagatcatataccagagcagcaacaacatgaaccaga 49856899  T
Q  251 tgatgatgacattgcagcagcgactgacccagcagtgttacctttggagcctcccttttcaggatgaccggaagatatatctcagctacactcttatgcc 350  Q
     ||||||||||||||||||||| |||  || |   |||||||| |||| ||||||||| | ||| |||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||    
T  49856898 cgatgatgacattgcagcagcggctgctccggagctgttacctgtggaccctccctttcctggaggaccggaaaatatatctctgctgcactcttatgcc 49856799  T
Q  351 aaacatgtggtattgccgctttggtataatt 381  Q
    || ||||||| |||| |||||||||||||||    
T  49856798 aagcatgtggcattgtcgctttggtataatt 49856768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 154 - 381
Target Start/End: Complemental strand, 35257919 - 35257689
Alignment:
Q  154 aggtggagtacctgaattatcaggatcatatacaacatgatgtgactgatggtgggtatgatcaggatcatataccag---agcagcagcatataacaga 250  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||  |||| || |||||||||||||||| |||||| | ||||||||||| ||   |||||||||||  | ||||    
T  35257919 aggtggagtacctgaattatcaggctcaggtacaccacgatgtgactgatggtgagtatgaccgggatcatatactagcgtagcagcagcatgaaccaga 35257820  T
Q  251 tgatgatgacattgcagcagcgactgacccagcagtgttacctttggagcctcccttttcaggatgaccggaagatatatctcagctacactcttatgcc 350  Q
     ||||||||||||||||||||| ||  |||||  ||||||||| |||| |||| |||| | ||| | | | || ||||||||| ||| ||||||||||||    
T  35257819 cgatgatgacattgcagcagcggctaccccagaggtgttacctgtggaccctctctttcctggagggctgaaaaatatatctctgctgcactcttatgcc 35257720  T
Q  351 aaacatgtggtattgccgctttggtataatt 381  Q
    || ||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  35257719 aatcatgtggcattgcagctttggtataatt 35257689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 155 - 386
Target Start/End: Original strand, 22525245 - 22525476
Alignment:
Q  155 ggtggagtacctgaattatcaggatcatatacaacatgatgtgactgatggtgggtatgatcaggatcatataccagagcagcagcatataacagatgat 254  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||  |||| || |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||  ||| ||     
T  22525245 ggtggagtacctgaactatcaggatcaggtacaccacgatgggactgatggtgggtatgaccaggatcatataccacagcagcagcatgtaggagacgag 22525344  T
Q  255 gatgacattgcagcagcgactgacccagcagtgttacctttggagcctcccttttcaggatgaccggaagatatatctcagctacactcttatgccaaac 354  Q
    |||||||||||||||||  |||  ||||  ||||||||| |||| ||||| ||| | ||  |||||| |||  |||||  ||| |||||||||| ||  |    
T  22525345 gatgacattgcagcagctgctgcaccagaggtgttacctgtggaccctccatttcctggtggaccggtagacttatctttgctccactcttatgtcagtc 22525444  T
Q  355 atgtggtattgccgctttggtataatttagat 386  Q
    ||||||  ||||| || |||||||||| ||||    
T  22525445 atgtggcgttgccactctggtataattcagat 22525476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 155 - 308
Target Start/End: Original strand, 19157061 - 19157214
Alignment:
Q  155 ggtggagtacctgaattatcaggatcatatacaacatgatgtgactgatggtgggtatgatcaggatcatataccagagcagcagcatataacagatgat 254  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||  |||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||| ||  |  ||| ||     
T  19157061 ggtggagtacctgaactatcaggatcaggtacagcatgatgtgactgatggtggatatgaccaggatcatataccacagcagcaggatgcaggagacgag 19157160  T
Q  255 gatgacattgcagcagcgactgacccagcagtgttacctttggagcctcccttt 308  Q
    ||||||| |||||||||  |||  || |  ||||||||| |||| |||||||||    
T  19157161 gatgacactgcagcagctgctgcaccggaggtgttacctgtggaccctcccttt 19157214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 155 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 13639032 - 13638916
Alignment:
Q  155 ggtggagtacctgaattatcaggatcatatacaacatgatgtgactgatggtgggtatgatcaggatcatataccagagcagcagcatataacagatgat 254  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||| |||| ||| ||||| ||||||||||||||| |||||||| ||  |  ||| ||     
T  13639032 ggtggagtacctgaactatcaggatcaggtacaacatgatgtgacggatgatggatatgaccaggatcatataccacagcagcaggatgcaggagacgag 13638933  T
Q  255 gatgacattgcagcagc 271  Q
    |||||||||||||||||    
T  13638932 gatgacattgcagcagc 13638916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 157 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 19524219 - 19524111
Alignment:
Q  157 tggagtacctgaattatcaggatcatatacaacatgatgtgactgatggtgggtatgatcaggatcatataccagagcagcagcatataacagatgatga 256  Q
    |||||||||| ||||||||||||||  |||| || ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| |  |||||||| ||  |||||||||    
T  19524219 tggagtacctaaattatcaggatcaggtacaccacgatgtgactgatggtgggtatgaccaagatcatataccacaatagcagcatgtaggagatgatga 19524120  T
Q  257 tgacattgc 265  Q
    |||||||||    
T  19524119 tgacattgc 19524111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 7 - 70
Target Start/End: Original strand, 51321600 - 51321663
Alignment:
Q  7 atgacacaaagccaccggaaggaaaggcaaagcgggcacatcccaaagaggggaagaggtcgga 70  Q
    ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51321600 atgacccaaagccaccggaaggagaggcaaagcgggcacatcccaaagaggggaagaggtcgga 51321663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 158 - 271
Target Start/End: Original strand, 2366158 - 2366271
Alignment:
Q  158 ggagtacctgaattatcaggatcatatacaacatgatgtgactgatggtgggtatgatcaggatcatataccagagcagcagcatataacagatgatgat 257  Q
    |||||||||||| ||||| |||||  |||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||| ||  |  ||| || |||    
T  2366158 ggagtacctgaactatcaagatcaggtacaacatgatgtgacggatggtggatatgaccaggatcatataccacagcagcaggatgcaggagacgaggat 2366257  T
Q  258 gacattgcagcagc 271  Q
    ||||||||||||||    
T  2366258 gacattgcagcagc 2366271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 155 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 31782755 - 31782568
Alignment:
Q  155 ggtggagtacctgaattatcaggatcatatacaacatgatgtgactgatggtgggtatgatcaggatcatataccagagcagcagcatataacagatgat 254  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  |||| |      ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||  ||| |||    
T  31782755 ggtggagtacctgaattatcaggatcaggtacacc------tgactgatggtggatatgaccaggatcatataccacagcagcagcatgtaggagacgat 31782662  T
Q  255 gatgacattgcagcagcgactgacccagcagtgttacctttggagcctcccttttcaggatgaccggaagatatatctcagctacactcttatg 348  Q
     |||||| |||||||||  |||  || |  ||||||||| |||| ||||||||||| ||  |||||| |||  |||||  ||| ||||||||||    
T  31782661 tatgacactgcagcagctgctgcaccggaggtgttacctgtggaccctcccttttctggtggaccggcagacttatctttgctccactcttatg 31782568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 155 - 271
Target Start/End: Original strand, 26876704 - 26876820
Alignment:
Q  155 ggtggagtacctgaattatcaggatcatatacaacatgatgtgactgatggtgggtatgatcaggatcatataccagagcagcagcatataacagatgat 254  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||  |||| ||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||| |  ||||| ||  |  ||| ||     
T  26876704 ggtggagtacctgaactatcaggatcaggtacatcatgatgtgacggatggtggatatgaccaggatcatataccacatgagcaggatgcaggagacgag 26876803  T
Q  255 gatgacattgcagcagc 271  Q
    |||||||||||||||||    
T  26876804 gatgacattgcagcagc 26876820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 155 - 271
Target Start/End: Original strand, 30891026 - 30891142
Alignment:
Q  155 ggtggagtacctgaattatcaggatcatatacaacatgatgtgactgatggtgggtatgatcaggatcatataccagagcagcagcatataacagatgat 254  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||  |||| ||||||||||| |||||||| ||||| || |||||||||||| | |||||| ||  |  ||| ||     
T  30891026 ggtggagtacctgaactatcaggatcaggtacagcatgatgtgacggatggtggatatgaccatgatcatataccacatcagcaggatgcaggagacgag 30891125  T
Q  255 gatgacattgcagcagc 271  Q
    |||||||||||||||||    
T  30891126 gatgacattgcagcagc 30891142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 7 - 70
Target Start/End: Complemental strand, 35258067 - 35258004
Alignment:
Q  7 atgacacaaagccaccggaaggaaaggcaaagcgggcacatcccaaagaggggaagaggtcgga 70  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  35258067 atgacccaaagccaccggaaggagaggcaaagcgggcacatcccaaagaaaggaagaggtcgga 35258004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 154 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 3731393 - 3731276
Alignment:
Q  154 aggtggagtacctgaattatcaggatcatatacaacatgatgtgactgatggtgggtatgatcaggatcatataccagagcagcagcatataacagatga 253  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||  |||| ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||| |  ||||| ||  |  ||| ||    
T  3731393 aggtggagtacctgaactatcaggatcaggtacatcatgatgtgacggacggtggatatgaccaggatcatataccacatgagcaggatgcaggagacga 3731294  T
Q  254 tgatgacattgcagcagc 271  Q
     |||||||||||||||||    
T  3731293 ggatgacattgcagcagc 3731276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 7 - 70
Target Start/End: Complemental strand, 49857144 - 49857083
Alignment:
Q  7 atgacacaaagccaccggaaggaaaggcaaagcgggcacatcccaaagaggggaagaggtcgga 70  Q
    ||||| |||||||| ||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  49857144 atgacccaaagccatcggaagga--ggcaaagcgggcacatcctaaagaggggaagaggtcgga 49857083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 7 - 70
Target Start/End: Complemental strand, 97099 - 97036
Alignment:
Q  7 atgacacaaagccaccggaaggaaaggcaaagcgggcacatcccaaagaggggaagaggtcgga 70  Q
    ||||| || |||||||||| ||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  97099 atgactcagagccaccggagggagaggcagagcggccacatcccaaagaggggtagaggtcgga 97036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 7 - 70
Target Start/End: Original strand, 19156912 - 19156975
Alignment:
Q  7 atgacacaaagccaccggaaggaaaggcaaagcgggcacatcccaaagaggggaagaggtcgga 70  Q
    ||||| || |||||||||| ||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  19156912 atgactcagagccaccggagggagaggcagagcggccacatcccaaagaggggtagaggtcgga 19156975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 7 - 70
Target Start/End: Complemental strand, 19524370 - 19524307
Alignment:
Q  7 atgacacaaagccaccggaaggaaaggcaaagcgggcacatcccaaagaggggaagaggtcgga 70  Q
    ||||| |||||||||||||  || ||||| ||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  19524370 atgacccaaagccaccggagagagaggcagagcggccacatcccaaagaaggggagaggtcgga 19524307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 7 - 70
Target Start/End: Complemental strand, 19525218 - 19525155
Alignment:
Q  7 atgacacaaagccaccggaaggaaaggcaaagcgggcacatcccaaagaggggaagaggtcgga 70  Q
    ||||| |||||||||||||  || ||||| ||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  19525218 atgacccaaagccaccggagagagaggcagagcggccacatcccaaagaagggtagaggtcgga 19525155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 7 - 70
Target Start/End: Complemental strand, 19525879 - 19525816
Alignment:
Q  7 atgacacaaagccaccggaaggaaaggcaaagcgggcacatcccaaagaggggaagaggtcgga 70  Q
    ||||| |||||||||||||  || ||||| ||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  19525879 atgacccaaagccaccggagagagaggcagagcggccacatcccaaagaagggtagaggtcgga 19525816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 7 - 70
Target Start/End: Complemental strand, 19526353 - 19526290
Alignment:
Q  7 atgacacaaagccaccggaaggaaaggcaaagcgggcacatcccaaagaggggaagaggtcgga 70  Q
    ||||| |||||||||||||  || ||||| ||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  19526353 atgacccaaagccaccggagagagaggcagagcggccacatcccaaagaagggtagaggtcgga 19526290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 7 - 70
Target Start/End: Original strand, 30890910 - 30890973
Alignment:
Q  7 atgacacaaagccaccggaaggaaaggcaaagcgggcacatcccaaagaggggaagaggtcgga 70  Q
    ||||| || |||||||| ||||| || || ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  30890910 atgactcagagccaccgcaaggagagacagagcggccacatcccaaagaggggtagaggtcgga 30890973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 7 - 70
Target Start/End: Complemental strand, 31782904 - 31782841
Alignment:
Q  7 atgacacaaagccaccggaaggaaaggcaaagcgggcacatcccaaagaggggaagaggtcgga 70  Q
    ||||| || ||||||| || ||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  31782904 atgactcagagccaccagagggagaggcagagcggccacatcccaaagaggggtagaggtcgga 31782841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 186; Significance: 1e-100; HSPs: 38)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 8 - 386
Target Start/End: Original strand, 30704897 - 30705273
Alignment:
Q  8 tgacacaaagccaccggaaggaaaggcaaagcgggcacatcccaaagaggggaagaggtcggannnnnnnnatggttcagggacttcgcaggaggctccc 107  Q
    |||| |||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||        ||||||||||||||||||||||||||       
T  30704897 tgactcaaaaccaccgaaaggagaggcaaagcgggcacatcccaaagaggggaagacgtgggagggggg--atggttcagggacttcgcaggaggcttat 30704994  T
Q  108 catgctacacagcttgaagagtcacaagtggttgatccgaaccagaaggtggagtacctgaattatcaggatcatatacaacatgatgtgactgatggtg 207  Q
    || |||||||||| |||| |||| || ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||  |||| ||  ||| |||||||||||    
T  30704995 caggctacacagcctgaaaagtcgcaggtggttgatccgagccaggaggtggagtacctgaattattaggatcaggtacaccacaatgggactgatggtg 30705094  T
Q  208 ggtatgatcaggatcatataccagagcagcagcatataacagatgatgatgacattgcagcagcgactgacccagcagtgttacctttggagcctccctt 307  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30705095 ggtatgaccaggatcatataccagagcagcaacatatagcagatgatgatgatattgcagcagcggttgccccagcagtgttacctttggagcctccctt 30705194  T
Q  308 ttcaggatgaccggaagatatatctcagctacactcttatgccaaacatgtggtattgccgctttggtataatttagat 386  Q
    | | ||| || ||||||||||||||| | | |||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||| ||||    
T  30705195 tcctggaggatcggaagatatatctctgttgcactcttatgccaagcatgtggcattgccgctttagtataattgagat 30705273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 146; E-Value: 8e-77
Query Start/End: Original strand, 7 - 381
Target Start/End: Original strand, 51684097 - 51684469
Alignment:
Q  7 atgacacaaagccaccggaaggaaaggcaaagcgggcacatcccaaagaggggaagaggtcggannnnnnnnatggttcagggacttcgcaggaggctcc 106  Q
    ||||| |||||| |||| ||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||        |||||||||||| |||| |||||||| |    
T  51684097 atgactcaaagctaccgaaaggagaggcaaagtgggcgcatcccaaagaggggaagaggtcagagggtgg--atggttcagggagttcgtaggaggcttc 51684194  T
Q  107 ccatgctacacagcttgaagagtcacaagtggttgatccgaaccagaaggtggagtacctgaattatcaggatcatatacaacatgatgtgactgatggt 206  Q
     || |||||||||| | ||||||| || ||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||  |||| || ||||| || ||||||    
T  51684195 tcaggctacacagcctaaagagtcgcaggtggttgatccgagccagcaggtggagtacctaaattatcaggatcaggtacaccacgatgttacggatggt 51684294  T
Q  207 gggtatgatcaggatcatataccagagcagcagcatataacagatgatgatgacattgcagcagcgactgacccagcagtgttacctttggagcctccct 306  Q
    | |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||  || |  ||||||||| |||| |||||||    
T  51684295 gagtatgaccaggatcatataccagagcagcaacatataatagatgatgatgacattgcagcagctgctgctccggaggtgttacctgtggaccctccct 51684394  T
Q  307 tttcaggatgaccggaagatatatctcagctacactcttatgccaaacatgtggtattgccgctttggtataatt 381  Q
    || | ||| ||||||||||  |||||  ||| ||||||||| |||| ||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  51684395 ttcctggaggaccggaagacctatctttgctgcactcttataccaatcatgtggcattgccgctttagtataatt 51684469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 7 - 381
Target Start/End: Original strand, 50194351 - 50194723
Alignment:
Q  7 atgacacaaagccaccggaaggaaaggcaaagcgggcacatcccaaagaggggaagaggtcggannnnnnnnatggttcagggacttcgcaggaggctcc 106  Q
    ||||| || |||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||        |||||||||||| ||||||||||||| |    
T  50194351 atgactcagagccaccggagggagaggcaaagcggccacatcccaaagaggggaagaggtcggagggtgg--atggttcagggagttcgcaggaggcttc 50194448  T
Q  107 ccatgctacacagcttgaagagtcacaagtggttgatccgaaccagaaggtggagtacctgaattatcaggatcatatacaacatgatgtgactgatggt 206  Q
     || |||||||||| ||||||||| || ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||  | ||||| || ||||||    
T  50194449 tcaggctacacagcctgaagagtcgcaggtggttgatccgagccagcaggtggagtacctgaattatcaggatcaagtacactacgatgttacggatggt 50194548  T
Q  207 gggtatgatcaggatcatataccagagcagcagcatataacagatgatgatgacattgcagcagcgactgacccagcagtgttacctttggagcctccct 306  Q
    ||||||||  | |||||||||||||||||||| ||| ||  ||||||||||||||||||||||||  ||| ||| |  ||||||||| |||| |||||||    
T  50194549 gggtatgactaagatcatataccagagcagcaacatgtaggagatgatgatgacattgcagcagctgctgccccggaggtgttacctgtggaccctccct 50194648  T
Q  307 tttcaggatgaccggaagatatatctcagctacactcttatgccaaacatgtggtattgccgctttggtataatt 381  Q
    || | ||| ||||| | ||  |||||  ||| |||||||||||||| |||||||  ||  |||||||||||||||    
T  50194649 ttcctggaggaccgaacgacctatctttgctgcactcttatgccaatcatgtggcgttatcgctttggtataatt 50194723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 138; E-Value: 5e-72
Query Start/End: Original strand, 7 - 386
Target Start/End: Original strand, 46437094 - 46437464
Alignment:
Q  7 atgacacaaagccaccggaaggaaaggcaaagcgggcacatcccaaagaggggaagaggtcggannnnnnnnatggttcagggacttcgcaggaggctcc 106  Q
    ||||| || ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||        ||| ||||||||||||  |||           
T  46437094 atgactcagagctaccggaaggagaggcaaagcgggcacatcccaaagaggggtagaggtcggagggggg--atgattcagggacttcttagg------- 46437184  T
Q  107 ccatgctacacagcttgaagagtcacaagtggttgatccgaa--ccagaaggtggagtacctgaattatcaggatcatatacaacatgatgtgactgatg 204  Q
         ||||| ||| ||||||||| ||||||||| | ||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| || || ||||||||||    
T  46437185 -----ctacatagcctgaagagtcgcaagtggttaacccgagacccagaaggtggagtacctgaattatcaggatcaggtacaccacgaagtgactgatg 46437279  T
Q  205 gtgggtatgatcaggatcatataccagagcagcagca---tataacagatgatgatgacattgcagcagcgactgacccagcagtgttacctttggagcc 301  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||   |  | |||||||||||||||||| ||||| | ||| |||||||||||||||| |||||||    
T  46437280 gtgggtatgaccaggatcatataccagagcagcatcaacatgaaccagatgatgatgacattgtagcagtggctgccccagcagtgttacctgtggagcc 46437379  T
Q  302 tcccttttcaggatgaccggaagatatatctcagctacactcttatgccaaacatgtggtattgccgctttggtataatttagat 386  Q
    ||||||| | ||| |||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  46437380 tccctttcctggaggaccggaaaatatatctctgctgcactcttatgccaaccatgtggcatttccgctttggtataatttagat 46437464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 131; E-Value: 8e-68
Query Start/End: Original strand, 79 - 381
Target Start/End: Complemental strand, 50022722 - 50022420
Alignment:
Q  79 atggttcagggacttcgcaggaggctccccatgctacacagcttgaagagtcacaagtggttgatccgaaccagaaggtggagtacctgaattatcagga 178  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| | || ||||||||||  |||||||| || ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  50022722 atggttcagggagttcgcaggaggcttctcaagctacacagcccgaagagtcgcaggtggttgatccgagccagcaggtggagtacctgaattatcagga 50022623  T
Q  179 tcatatacaacatgatgtgactgatggtgggtatgatcaggatcatataccagagcagcagcatataacagatgatgatgacattgcagcagcgactgac 278  Q
    |||  |||| || ||||| |  ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||  ||| |    
T  50022622 tcaggtacaccacgatgttatggatggtgagtatgaccaggatcatataccagagcagcagcatatagcagatgatgatgaaattgcagcagctgctgcc 50022523  T
Q  279 ccagcagtgttacctttggagcctcccttttcaggatgaccggaagatatatctcagctacactcttatgccaaacatgtggtattgccgctttggtata 378  Q
    || |  ||||||||| |||| ||||| ||| |  || ||||||| ||  |||||  ||| |||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||    
T  50022522 ccggaggtgttacctgtggaccctccttttcctagaggaccggacgacctatctttgctgcactcttatgccaatcatgtggcgttgccgctttggtata 50022423  T
Q  379 att 381  Q
    |||    
T  50022422 att 50022420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 130 - 386
Target Start/End: Complemental strand, 55406472 - 55406216
Alignment:
Q  130 cacaagtggttgatccgaaccagaaggtggagtacctgaattatcaggatcatatacaacatgatgtgactgatggtgggtatgatcaggatcatatacc 229  Q
    |||| ||||||||| ||| |||  |||| ||||||||||||||| |||||||  |||| || ||||| ||||| |||| |||||| || |||||||||||    
T  55406472 cacaggtggttgattcgagccaagaggtagagtacctgaattattaggatcaggtacaccacgatgttactgacggtgagtatgaccacgatcatatacc 55406373  T
Q  230 agagcagcagcatataacagatgatgatgacattgcagcagcgactgacccagcagtgttacctttggagcctcccttttcaggatgaccggaagatata 329  Q
    ||||||||| |||||| |||||||||||||| || |||||||| ||| ||||  ||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||    
T  55406372 agagcagcatcatatagcagatgatgatgacgttacagcagcggctgccccaatagtgttacctttggagcctccctttcctggaggaccggaagatata 55406273  T
Q  330 tctcagctacactcttatgccaaacatgtggtattgccgctttggtataatttagat 386  Q
    |||| | | |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  55406272 tctctgatgcactcttatgtcaagcatgtggtattgccgctttggtataattcagat 55406216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 7 - 386
Target Start/End: Original strand, 50902363 - 50902728
Alignment:
Q  7 atgacacaaagccaccggaaggaaaggcaaagcgggcacatcccaaagaggggaagaggtcggannnnnnnnatggttcagggacttcgcaggaggctcc 106  Q
    ||||| || ||||||| || ||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||        |||||||||||||||| |||||          
T  50902363 atgactcagagccaccagagggagaggcaaagcagccacatcccaaagaggggaagaggtcggagggtgg--atggttcagggacttctcagga------ 50902454  T
Q  107 ccatgctacacagcttgaagagtcacaagtggttgatccgaaccagaaggtggagtacctgaattatcaggatcatatacaacatgatgtgactgatggt 206  Q
          |||||||| ||||||||||||||| ||||| |||  |||  ||||||||||||||||||||||||||||  |||| || ||||| || ||||||    
T  50902455 ------tacacagcctgaagagtcacaagttgttgacccgtcccactaggtggagtacctgaattatcaggatcaggtacaccacgatgttacagatggt 50902548  T
Q  207 gggtatgatcaggatcatataccagagcagcagcatataacagatgatgatgacattgcagcagcgactgacccagcagtgttacctttggagcctccct 306  Q
    |||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||  ||| ||| |  ||||||||| |||| |||||||    
T  50902549 gggtatgaccaggatcatataccacaacagcagcatataggagatgatgatgacattgcagcagctgctgccccggaggtgttacctgtggaccctccct 50902648  T
Q  307 tttcaggatgaccggaagatatatctcagctacactcttatgccaaacatgtggtattgccgctttggtataatttagat 386  Q
    || | ||| |||||| |||  |||||  ||| |||||||||| ||| |||||||  |||||||||| |||||||| ||||    
T  50902649 ttcctggaggaccggcagacctatctttgctgcactcttatgtcaatcatgtggcgttgccgctttcgtataattcagat 50902728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 214 - 386
Target Start/End: Complemental strand, 10752457 - 10752285
Alignment:
Q  214 atcaggatcatataccagagcagcagcatataacagatgatgatgacattgcagcagcgactgacccagcagtgttacctttggagcctcccttttcagg 313  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||| || ||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| | ||    
T  10752457 atcaggatcatataccagagcagtagcatatacaagacgaagatgacattgcagcaacgactgccccatcagtgttacctttggagcctccctttcctgg 10752358  T
Q  314 atgaccggaagatatatctcagctacactcttatgccaaacatgtggtattgccgctttggtataatttagat 386  Q
    | |||||||| ||||||||  ||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||| ||||    
T  10752357 aggaccggaaaatatatctttgctgcactcttatgccaagcatgtggcattgccgctttggtgtaattcagat 10752285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 214 - 386
Target Start/End: Complemental strand, 10966226 - 10966054
Alignment:
Q  214 atcaggatcatataccagagcagcagcatataacagatgatgatgacattgcagcagcgactgacccagcagtgttacctttggagcctcccttttcagg 313  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||| || ||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| | ||    
T  10966226 atcaggatcatataccagagcagtagcatatacaagacgaagatgacattgcagcaacgactgccccatcagtgttacctttggagcctccctttcctgg 10966127  T
Q  314 atgaccggaagatatatctcagctacactcttatgccaaacatgtggtattgccgctttggtataatttagat 386  Q
    | |||||||| ||||||||  ||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||| ||||    
T  10966126 aggaccggaaaatatatctttgctgcactcttatgccaagcatgtggcattgccgctttggtgtaattcagat 10966054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 214 - 386
Target Start/End: Original strand, 14316426 - 14316598
Alignment:
Q  214 atcaggatcatataccagagcagcagcatataacagatgatgatgacattgcagcagcgactgacccagcagtgttacctttggagcctcccttttcagg 313  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| || ||||||||||||||||||  || |||||  ||||||||| |||||||||| ||||| ||    
T  14316426 atcaggatcatataccagagcagcaacatataccagacgaggatgacattgcagcagcggttgccccagaggtgttacctgtggagcctccattttctgg 14316525  T
Q  314 atgaccggaagatatatctcagctacactcttatgccaaacatgtggtattgccgctttggtataatttagat 386  Q
    | |||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  14316526 aggaccggaaaatatatctctgctgcactcttatgccaagcatgtggcattgccgctttggtataattcagat 14316598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 155 - 381
Target Start/End: Complemental strand, 44679086 - 44678860
Alignment:
Q  155 ggtggagtacctgaattatcaggatcatatacaacatgatgtgactgatggtgggtatgatcaggatcatataccagagcagcagcatataacagatgat 254  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  |||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || |||||||| ||  ||| |||    
T  44679086 ggtggagtacctgaattatcaggatcaggtacaccacgatgtgactgatggtgggtatgaccaggatcatataccacagtagcagcatgtaggagacgat 44678987  T
Q  255 gatgacattgcagcagcgactgacccagcagtgttacctttggagcctcccttttcaggatgaccggaagatatatctcagctacactcttatgccaaac 354  Q
    |||||||||||||||||  |||  || |  ||||||||| |||| ||||||||| | ||  |||||| |||  |||||  ||| |||||||||||||  |    
T  44678986 gatgacattgcagcagctgctgctccggaggtgttacctgtggaccctccctttcctggtggaccggtagacttatctttgctccactcttatgccagtc 44678887  T
Q  355 atgtggtattgccgctttggtataatt 381  Q
    ||||||  ||||| |||||||||||||    
T  44678886 atgtggcgttgccactttggtataatt 44678860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 157 - 386
Target Start/End: Original strand, 50275762 - 50275991
Alignment:
Q  157 tggagtacctgaattatcaggatcatatacaacatgatgtgactgatggtgggtatgatcaggatcatataccagagcagcagcatataacagatgatga 256  Q
    |||||| ||||||||||||||||||  |||| || ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||  |||||||||    
T  50275762 tggagtgcctgaattatcaggatcaggtacaccacgatgtgactgatggtaggtatgaccaggatcatataccacagcagcagcatgtaggagatgatga 50275861  T
Q  257 tgacattgcagcagcgactgacccagcagtgttacctttggagcctcccttttcaggatgaccggaagatatatctcagctacactcttatgccaaacat 356  Q
     |||||||||||| |  ||| ||| |  ||||||||| |||| ||||||||| | | | |||||| |||  |||||  ||| |||||||||||||| |||    
T  50275862 agacattgcagcaactgctgccccggaggtgttacctgtggaccctccctttcctgcaggaccggcagacttatctttgctgcactcttatgccaatcat 50275961  T
Q  357 gtggtattgccgctttggtataatttagat 386  Q
    ||||  ||||||||| | ||||||| ||||    
T  50275962 gtggcgttgccgcttcgatataattcagat 50275991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 155 - 381
Target Start/End: Complemental strand, 21021917 - 21021691
Alignment:
Q  155 ggtggagtacctgaattatcaggatcatatacaacatgatgtgactgatggtgggtatgatcaggatcatataccagagcagcagcatataacagatgat 254  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||  |||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||| || ||  ||| |||    
T  21021917 ggtggagtacctgaactatcaggatcaggtacatcatgatgtgactgatggtggatatgaccaggatcatataccacagcagcaggatgtaggagacgat 21021818  T
Q  255 gatgacattgcagcagcgactgacccagcagtgttacctttggagcctcccttttcaggatgaccggaagatatatctcagctacactcttatgccaaac 354  Q
    |||||||||||||||||  |||  ||||  ||||||||| |||| ||||||||| | ||  ||| ||  ||  |||||  ||| ||||||||||||   |    
T  21021817 gatgacattgcagcagctgctgcaccagatgtgttacctgtggaccctccctttcctggtggactggcggacttatctttgctccactcttatgccggtc 21021718  T
Q  355 atgtggtattgccgctttggtataatt 381  Q
    ||||||  ||||| |||||||||||||    
T  21021717 atgtggcgttgccactttggtataatt 21021691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 7 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 10752617 - 10752443
Alignment:
Q  7 atgacacaaagccaccggaaggaaaggcaaagcgggcacatcccaaagaggggaagaggtcggannnnnnnnatggttcagggacttcgcaggaggctcc 106  Q
    |||||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||        |||||||| ||||||| |||    || |    
T  10752617 atgacacaaagccatcagaaggagaggcaaagcgggcacatcccaaagaggggaagatgtcggagggggg--atggttcaaggacttctcaga---cttc 10752523  T
Q  107 ccatgctacacagcttgaagagtcacaagtggttgatccgaaccagaaggtggagtacctgaattatcaggatcatatac 186  Q
      | |||||||||| |||| ||||||| |||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10752522 ttaggctacacagcctgaacagtcacaggtggttgacccgagccagtaggtggagtacctgaattatcaggatcatatac 10752443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 7 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 10966386 - 10966212
Alignment:
Q  7 atgacacaaagccaccggaaggaaaggcaaagcgggcacatcccaaagaggggaagaggtcggannnnnnnnatggttcagggacttcgcaggaggctcc 106  Q
    |||||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||        |||||||| ||||||| |||    || |    
T  10966386 atgacacaaagccatcagaaggagaggcaaagcgggcacatcccaaagaggggaagatgtcggagggggg--atggttcaaggacttctcaga---cttc 10966292  T
Q  107 ccatgctacacagcttgaagagtcacaagtggttgatccgaaccagaaggtggagtacctgaattatcaggatcatatac 186  Q
      | |||||||||| |||| ||||||| |||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10966291 ttaggctacacagcctgaacagtcacaggtggttgacccgagccagtaggtggagtacctgaattatcaggatcatatac 10966212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 7 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 41932833 - 41932539
Alignment:
Q  7 atgacacaaagccaccggaaggaaaggcaaagcgggcacatcccaaagaggggaagaggtcggannnnnnnnatggttcagggacttcgcaggaggctcc 106  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||        ||| |||||| ||||| ||||||||| |    
T  41932833 atgacacaaagccaccggaaggagaggcaaggcgggcacatcccaaagaggggaagaggtcgga--ggggggatgtttcaggtacttctcaggaggcttc 41932736  T
Q  107 cca---------tgctacacagcttgaagagtcacaagtggttgatccgaaccagaaggtggagtacctgaattatcaggatcatatacaacatgatgtg 197  Q
     ||          |||||| |||||||| | || || |||||||| |||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||      || ||||||||     
T  41932735 tcaagcttctccggctacatagcttgaataatcgcaggtggttgacccgagccaggaggtggactacctgaattatcaggat------caccatgatgtc 41932642  T
Q  198 actgatggtgggtatgatcaggatcatataccagagcagcagcatataacagatgatgatgacattgcagcagcgactgacccagcagtgttacctttgg 297  Q
    |||||||||||||| ||  |  |  |||| ||||||||||||||||||  ||| || ||||| |||||| ||||| ||| || ||  |||||||||||||    
T  41932641 actgatggtgggtaagacgaccagtatatgccagagcagcagcatatacgagacgaggatgatattgcatcagcggctgccctagtggtgttacctttgg 41932542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 155 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 37021106 - 37020991
Alignment:
Q  155 ggtggagtacctgaattatcaggatcatatacaacatgatgtgactgatggtgggtatgatcaggatcatataccagagcagcagcatataacagatgat 254  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| ||||| || || |||||||||| ||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||| ||  ||| |||    
T  37021106 ggtggagtacctgaattatcaagatcagatacaccacga-gtgactgatgatgggtatgaccaggataatataccacagcagcagcatgtaggagacgat 37021008  T
Q  255 gatgacattgcagcagc 271  Q
    |||||||||||||||||    
T  37021007 gatgacattgcagcagc 37020991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 155 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 30725820 - 30725704
Alignment:
Q  155 ggtggagtacctgaattatcaggatcatatacaacatgatgtgactgatggtgggtatgatcaggatcatataccagagcagcagcatataacagatgat 254  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||  |||| ||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||| ||  |  ||| ||     
T  30725820 ggtggagtacctgaactatcaggatcaggtacagcatgatgtgacggatggtggatatgaccaggatcatataccacagcagcaggatgcaggagacgag 30725721  T
Q  255 gatgacattgcagcagc 271  Q
    |||||||||||||||||    
T  30725720 gatgacattgcagcagc 30725704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 7 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 55406965 - 55406841
Alignment:
Q  7 atgacacaaagccaccggaaggaaaggcaaagcgggcacatcccaaagaggggaagaggtcggannnnnnnnatggttcagggacttcgcaggaggctcc 106  Q
    ||||| || |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||        ||||||||||||||||| ||||||||      
T  55406965 atgactcagagccaccggaaggagaggcaaatcgggcacatcccaaagatgggaagaggtcgga--gggtggatggttcagggacttcggaggaggctta 55406868  T
Q  107 ccatgctacacagcttgaagagtcaca 133  Q
     ||||||||||| | ||||||||||||    
T  55406867 tcatgctacacaacctgaagagtcaca 55406841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 155 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 1308182 - 1308066
Alignment:
Q  155 ggtggagtacctgaattatcaggatcatatacaacatgatgtgactgatggtgggtatgatcaggatcatataccagagcagcagcatataacagatgat 254  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||| |  ||||| ||  |  ||| ||     
T  1308182 ggtggagtacctgaactatcaggatcaggtacaacatgatgtgacggatggtggatatgaccaggatcatataccacataagcaggatgcaggagacgag 1308083  T
Q  255 gatgacattgcagcagc 271  Q
    |||||||||||||||||    
T  1308082 gatgacattgcagcagc 1308066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 7 - 67
Target Start/End: Complemental strand, 11083189 - 11083129
Alignment:
Q  7 atgacacaaagccaccggaaggaaaggcaaagcgggcacatcccaaagaggggaagaggtc 67  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  11083189 atgacacaaagccaccggaaggagaggcaaagcgggcacatcccaaagaggggcagaggtc 11083129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 111 - 381
Target Start/End: Complemental strand, 21537557 - 21537290
Alignment:
Q  111 gctacacagcttgaagagtcacaagtggttgatccgaaccagaaggtggagtacctgaattatcaggatcatatacaacatgatgtgactgatggtggg- 209  Q
    |||||||| | |||||||||||| |||||||| |||| | ||    |||||||||| ||||||||||||||  |||| || ||||| |||||||||||      
T  21537557 gctacacaacctgaagagtcacacgtggttgacccgacctagt---tggagtacctaaattatcaggatcaggtacaccacgatgtcactgatggtggtg 21537461  T
Q  210 --tatgatcaggatcatataccagagcagcagcatataacagatgatgatgacattgcagcagcgactgacccagcagtgttacctttggagcctccctt 307  Q
      ||||| ||| | ||||||| |||||| ||   |||| ||||  | |||||||||||||||||| ||| |||| |   ||||| |||| ||||||||||    
T  21537460 gctatgaccagcagcatatactagagcaaca---tataccagaccaggatgacattgcagcagcggctgccccaacgacgttacttttgcagcctccctt 21537364  T
Q  308 ttcaggatgaccggaagatatatctcagctacactcttatgccaaacatgtggtattgccgctttggtataatt 381  Q
    |   ||| ||||| || ||| ||||| | | ||||||||||| || ||||||| |||||| |||||||||||||    
T  21537363 tcatggaggaccgaaaaatacatctctgttgcactcttatgctaaccatgtggcattgccactttggtataatt 21537290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 155 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 41798006 - 41797922
Alignment:
Q  155 ggtggagtacctgaattatcaggatcatatacaacatgatgtgactgatggtgggtatgatcaggatcatataccagagcagcag 239  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||  ||||  |||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  41798006 ggtggagtacctgaactatcaggatcaggtacattatgatgtgacggatggtggatatgaccaggatcatataccacagcagcag 41797922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 258 - 381
Target Start/End: Complemental strand, 11049502 - 11049379
Alignment:
Q  258 gacattgcagcagcgactgacccagcagtgttacctttggagcctcccttttcaggatgaccggaagatatatctcagctacactcttatgccaaacatg 357  Q
    ||||||||||||||| ||| |||| | |  ||||||||| ||||||||||| | ||| |||||||||||| |||||  || |||||||||||||| ||||    
T  11049502 gacattgcagcagcggctgccccatcggcattacctttgcagcctccctttcctggaggaccggaagatacatctctactgcactcttatgccaaccatg 11049403  T
Q  358 tggtattgccgctttggtataatt 381  Q
    ||| |||   ||||||||||||||    
T  11049402 tggcatttttgctttggtataatt 11049379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 155 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 6180801 - 6180685
Alignment:
Q  155 ggtggagtacctgaattatcaggatcatatacaacatgatgtgactgatggtgggtatgatcaggatcatataccagagcagcagcatataacagatgat 254  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||  |||| ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||| |  ||||| ||  |  ||| ||     
T  6180801 ggtggagtacctgaactatcaggatcaggtacatcatgatgtgacggacggtggatatgaccaggatcatataccacatgagcaggatgcaggagacgag 6180702  T
Q  255 gatgacattgcagcagc 271  Q
    |||||||||||||||||    
T  6180701 gatgacattgcagcagc 6180685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 155 - 271
Target Start/End: Original strand, 31422750 - 31422866
Alignment:
Q  155 ggtggagtacctgaattatcaggatcatatacaacatgatgtgactgatggtgggtatgatcaggatcatataccagagcagcagcatataacagatgat 254  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||  |||| ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||| |  ||||| ||  |  ||| ||     
T  31422750 ggtggagtacctgaactatcaggatcaggtacatcatgatgtgacggacggtggatatgaccaggatcatataccacatgagcaggatgcaggagacgag 31422849  T
Q  255 gatgacattgcagcagc 271  Q
    |||||||||||||||||    
T  31422850 gatgacattgcagcagc 31422866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 155 - 271
Target Start/End: Original strand, 49166077 - 49166193
Alignment:
Q  155 ggtggagtacctgaattatcaggatcatatacaacatgatgtgactgatggtgggtatgatcaggatcatataccagagcagcagcatataacagatgat 254  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||  |||| ||||||||||| |||||||| ||||| || |||||||||||| |  ||||| ||  |  ||| ||     
T  49166077 ggtggagtacctgaactatcaggatcaggtacatcatgatgtgacggatggtggatatgaccatgatcatataccacatgagcaggatgcaggagacgag 49166176  T
Q  255 gatgacattgcagcagc 271  Q
    |||||||||||||||||    
T  49166177 gatgacattgcagcagc 49166193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 155 - 230
Target Start/End: Original strand, 49091482 - 49091557
Alignment:
Q  155 ggtggagtacctgaattatcaggatcatatacaacatgatgtgactgatggtgggtatgatcaggatcatatacca 230  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||  |||| ||||||||||| || ||||| ||||| |||||||||||||||    
T  49091482 ggtggagtacctgaactatcaggatcaggtacatcatgatgtgacggacggtggatatgaccaggatcatatacca 49091557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 159 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 40357305 - 40357234
Alignment:
Q  159 gagtacctgaattatcaggatcatatacaacatgatgtgactgatggtgggtatgatcaggatcatatacca 230  Q
    ||||||||||| |||||||||||  ||||  |||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  40357305 gagtacctgaactatcaggatcaggtacagtatgatgtgacggatggtggatatgaccaggatcatatacca 40357234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 284 - 380
Target Start/End: Original strand, 70361 - 70457
Alignment:
Q  284 agtgttacctttggagcctcccttttcaggatgaccggaagatatatctcagctacactcttatgccaaacatgtggtattgccgctttggtataat 380  Q
    |||||||||| |||| |||||||||   ||| |||||| | || |||||| |||  ||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||    
T  70361 agtgttacctgtggaccctccctttcttggaggaccggtaaatctatctctgctgtactcttatgccaagcatgtggcattgccactttggtataat 70457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 7 - 70
Target Start/End: Complemental strand, 21022066 - 21022003
Alignment:
Q  7 atgacacaaagccaccggaaggaaaggcaaagcgggcacatcccaaagaggggaagaggtcgga 70  Q
    ||||| || |||||||||| ||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  21022066 atgactcagagccaccggagggagaggcagagcggccacatcccaaagaggggtagaggtcgga 21022003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 111 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 11049640 - 11049559
Alignment:
Q  111 gctacacagcttgaagagtcacaagtggttgatccgaaccagaaggtggagtacctgaattatcaggatcatatacaacatgatg 195  Q
    |||||||| | |||||||||||| |||||||  |||| ||||   ||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||    
T  11049640 gctacacatcctgaagagtcacaggtggttggcccgacccag---gtggagtacctgaattatcaggatcaggtacaccatgatg 11049559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 111 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 11083099 - 11083002
Alignment:
Q  111 gctacacagcttgaagagtcacaagtggttgatccgaaccagaaggtggagtacctgaattatcaggatcatatacaacatgatgtgactgatggtgggt 210  Q
    |||||||| | ||| |||||||| ||| |||| |||| ||||   ||| ||| ||||||||||||||||||  |||| || |||||||||||||||||||    
T  11083099 gctacacaacctgatgagtcacaggtgcttgacccgacccag---gtgtagtgcctgaattatcaggatcaggtacaccacgatgtgactgatggtgggt 11083003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 155 - 186
Target Start/End: Original strand, 14316409 - 14316440
Alignment:
Q  155 ggtggagtacctgaattatcaggatcatatac 186  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14316409 ggtggagtacctgaattatcaggatcatatac 14316440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 7 - 70
Target Start/End: Complemental strand, 30725969 - 30725906
Alignment:
Q  7 atgacacaaagccaccggaaggaaaggcaaagcgggcacatcccaaagaggggaagaggtcgga 70  Q
    ||||| || |||||||| | ||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  30725969 atgactcagagccaccgcagggagaggcagagcggccacatcccaaagaggggtagaggtcgga 30725906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 7 - 70
Target Start/End: Original strand, 50275611 - 50275674
Alignment:
Q  7 atgacacaaagccaccggaaggaaaggcaaagcgggcacatcccaaagaggggaagaggtcgga 70  Q
    ||||| ||||||||  ||| ||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  50275611 atgacccaaagccattggagggagaggcagagcggccacatcccaaagaggggtagaggtcgga 50275674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 7 - 67
Target Start/End: Original strand, 3184889 - 3184949
Alignment:
Q  7 atgacacaaagccaccggaaggaaaggcaaagcgggcacatcccaaagaggggaagaggtc 67  Q
    ||||| || |||||||||| ||| || || ||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  3184889 atgactcagagccaccggagggagagacagagcggccacatcccaaagaggggtagaggtc 3184949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 7 - 67
Target Start/End: Complemental strand, 37021255 - 37021195
Alignment:
Q  7 atgacacaaagccaccggaaggaaaggcaaagcgggcacatcccaaagaggggaagaggtc 67  Q
    ||||| || ||||| |||| ||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  37021255 atgactcagagccatcggagggagaggcagagcggccacatcccaaagaggggtagaggtc 37021195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0238 (Bit Score: 160; Significance: 4e-85; HSPs: 1)
Name: scaffold0238
Description:

Target: scaffold0238; HSP #1
Raw Score: 160; E-Value: 4e-85
Query Start/End: Original strand, 7 - 386
Target Start/End: Complemental strand, 18133 - 17756
Alignment:
Q  7 atgacacaaagccaccggaaggaaaggcaaagcgggcacatcccaaagaggggaagaggtcggannnnnnnnatggttcagggacttcgcaggaggctcc 106  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||         ||||||||||| ||||||||||||| |    
T  18133 atgactcaaagccaccggaaggagaggcaaagcgagcacatcctaaagaggggaagaggtcggagggtggg--tggttcagggagttcgcaggaggcttc 18036  T
Q  107 ccatgctacacagcttgaagagtcacaagtggttgatccgaaccagaaggtggagtacctgaattatcaggatcatatacaacatgatgtgactgatggt 206  Q
     || | |||||||| |||| ||||  | |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||| || |||||||| ||| ||    
T  18035 tcaggatacacagcctgaaaagtcgtaggtgggtgatccgaaccagcaggtggagtacctgaattatcaggatcaggtacaccacgatgtgaccgatagt 17936  T
Q  207 gggtatgatcaggatcatataccagagcagcagcatataacagatgatgatgacattgcagcagcgactgacccagcagtgttacctttggagcctccct 306  Q
    |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |  ||||||||| |||| |||||||    
T  17935 gggtatgaccaggatcatataccaaagcagcagcatatagaagatgatgatgacattgcagcagtgactgcccccgaggtgttacctgtggaccctccct 17836  T
Q  307 tttcaggatgaccggaagatatatctcagctacactcttatgccaaacatgtggtattgccgctttggtataatttagat 386  Q
    ||   ||| || |||||||  |||||  ||| ||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  17835 ttcttggaggatcggaagacctatctttgctgcactcttatgctaagcaagtggtattgccgctttggtataattcagat 17756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 156; Significance: 9e-83; HSPs: 24)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 156; E-Value: 9e-83
Query Start/End: Original strand, 16 - 381
Target Start/End: Complemental strand, 40624095 - 40623726
Alignment:
Q  16 agccaccggaaggaaaggcaaagcgggcacatcccaaagaggggaagaggtcggannnnnnnnatggttcagggacttcgcagg------aggctcccca 109  Q
    ||||| || ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||        |||||||||||||||| ||||      ||||| | ||    
T  40624095 agccatcgaaaggagaggcaaagggggcacatcccaaagaggggtagaggtcggagggggg--atggttcagggacttctcaggcttctaaggcttcgca 40623998  T
Q  110 tgctacacagcttgaagagtcacaagtggttgatccgaaccagaaggtggagtacctgaattatcaggatcatatacaacatgatgtgactgatggtggg 209  Q
     |||||||||  ||||||||| || |||||||  |||| | || ||||||||||||||||||||||||||||  |||| || |||| |||||||||||||    
T  40623997 ggctacacagtctgaagagtcgcaggtggttggcccgacctaggaggtggagtacctgaattatcaggatcaggtacaccacgatgcgactgatggtggg 40623898  T
Q  210 tatgatcaggatcatataccagagcagcagcatataacagatgatgatgacattgcagcagcgactgacccagcagtgttacctttggagcctccctttt 309  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||     
T  40623897 tatgaccaggatcatataccagagcaacaacatataccagatgatgatgacattgcagcagcggctgccccagtagtgttacctgtggagcctccctttc 40623798  T
Q  310 caggatgaccggaagatatatctcagctacactcttatgccaaacatgtggtattgccgctttggtataatt 381  Q
    | ||| |||||||| ||||||||| ||| ||||||||| |||| ||||||  ||||||||||||||||||||    
T  40623797 ctggaggaccggaaaatatatctctgctgcactcttattccaaccatgtgtcattgccgctttggtataatt 40623726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 148; E-Value: 5e-78
Query Start/End: Original strand, 14 - 386
Target Start/End: Complemental strand, 8701394 - 8701033
Alignment:
Q  14 aaagccaccggaaggaaaggcaaagcgggcacatcccaaagaggggaagaggtcggannnnnnnnatggttcagggacttcgcaggaggctccccatgct 113  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||        |||||||||||||||| ||||          || |    
T  8701394 aaagccaccggaaggagaggcaaagcgggcacatccaaaagaggggaagaggtcggaggggat--atggttcagggacttctcaggc---------tgtt 8701306  T
Q  114 acacagcttgaagagtcacaagtggttgatccgaaccagaaggtggagtacctgaattatcaggatcatatacaacatgatgtgactgatggtgggtatg 213  Q
    ||||||| |||||||||||| || | ||| | || |||| ||||| ||||||||||||||||||||||  |||| || ||||||||||||||||||||||    
T  8701305 acacagcctgaagagtcacaggttgctgaccagacccaggaggtgaagtacctgaattatcaggatcaggtacaccacgatgtgactgatggtgggtatg 8701206  T
Q  214 atcaggatcatataccagagcagcagcatataacagatgatgatgacattgcagcagcgactgacccagcagtgttacctttggagcctcccttttcagg 313  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||  | || | ||||||| |||||||||||||  || ||| |  |||||||||||||| ||||||||||| ||    
T  8701205 atcaggatcatataccagagcagcaacatgaaccatacgatgatgtcattgcagcagcggttgccccggaggtgttacctttggaccctcccttttctgg 8701106  T
Q  314 atgaccggaagatatatctcagctacactcttatgccaaacatgtggtattgccgctttggtataatttagat 386  Q
    | |||||||| |||||||||  || |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  8701105 aggaccggaaaatatatctcttctgcactcttatgccaatcatgtggcattgccgctttggtataattcagat 8701033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 7 - 381
Target Start/End: Original strand, 5197835 - 5198207
Alignment:
Q  7 atgacacaaagccaccggaaggaaaggcaaagcgggcacatcccaaagaggggaagaggtcggannnnnnnnatggttcagggacttcgcaggaggctcc 106  Q
    ||||| || ||||| |||| ||| ||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||        |||||||||||| ||| ||||||||| |    
T  5197835 atgactcagagccatcggagggagaggcaaagcggccacatcccaaataggggtagaggtcggagggtgg--atggttcagggagttcacaggaggcttc 5197932  T
Q  107 ccatgctacacagcttgaagagtcacaagtggttgatccgaaccagaaggtggagtacctgaattatcaggatcatatacaacatgatgtgactgatggt 206  Q
     || |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||| || ||||| || ||||||    
T  5197933 tcaggctacacagcctgaagagtcacatgtggttgatccgagccagcaggtggagtacctgaattatcaggatcaggtacaccacgatgttacggatggt 5198032  T
Q  207 gggtatgatcaggatcatataccagagcagcagcatataacagatgatgatgacattgcagcagcgactgacccagcagtgttacctttggagcctccct 306  Q
    |||||||| ||||||||| ||| ||||||||| ||| ||  |||| |||||||||||||||||||  ||| ||| |  ||||||||| |||| ||||| |    
T  5198033 gggtatgaccaggatcatttactagagcagcaacatgtaggagataatgatgacattgcagcagctgctgccccggaggtgttacctgtggaccctcctt 5198132  T
Q  307 tttcaggatgaccggaagatatatctcagctacactcttatgccaaacatgtggtattgccgctttggtataatt 381  Q
    || | | | ||||||| ||  |||||  ||| |||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||    
T  5198133 ttcctgtaggaccggacgacctatctttgctgcactcttatgccaatcatgtggcgttgccgctttggtataatt 5198207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 96; E-Value: 6e-47
Query Start/End: Original strand, 155 - 386
Target Start/End: Original strand, 7758350 - 7758581
Alignment:
Q  155 ggtggagtacctgaattatcaggatcatatacaacatgatgtgactgatggtgggtatgatcaggatcatataccagagcagcagcatataacagatgat 254  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||  |||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||  ||| |||    
T  7758350 ggtggaatacctgaattatcaggatcaggtacaccacgatgtgactgatggtgggtatgaccaggatcatataccacagcagcagcatgtaggagacgat 7758449  T
Q  255 gatgacattgcagcagcgactgacccagcagtgttacctttggagcctcccttttcaggatgaccggaagatatatctcagctacactcttatgccaaac 354  Q
    |||||||||||||||||  |||  ||||  ||||||||| |||| ||||||||||| ||  |||||| |||  |||||  ||| |||||||||||||  |    
T  7758450 gatgacattgcagcagctgctgcaccagaggtgttacctgtggaccctcccttttctggtggaccggcagacttatctttgctccactcttatgccagtc 7758549  T
Q  355 atgtggtattgccgctttggtataatttagat 386  Q
    ||||||  ||||| ||||||||||||| ||||    
T  7758550 atgtggcgttgccactttggtataattcagat 7758581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 154 - 381
Target Start/End: Complemental strand, 19227976 - 19227746
Alignment:
Q  154 aggtggagtacctgaattatcaggatcatatacaacatgatgtgactgatggtgggtatgatcaggatcatataccagagcagca---gcatataacaga 250  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| ||  |||| || ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||   ||||  | ||||    
T  19227976 aggtggagtacttgaattatcaggaccaggtacaccacgatgtgactgatggtgggtatgaccatgatcatataccagagcaacatcagcatgaaccaga 19227877  T
Q  251 tgatgatgacattgcagcagcgactgacccagcagtgttacctttggagcctcccttttcaggatgaccggaagatatatctcagctacactcttatgcc 350  Q
     | ||||||||||||||||||| ||| ||| |  ||||||||| |||| ||||||||| | ||| |||||||| |  |||||| |||||||||||||| |    
T  19227876 cggtgatgacattgcagcagcggctgccccggaggtgttacctgtggaccctccctttcctggaggaccggaaaacctatctctgctacactcttatgac 19227777  T
Q  351 aaacatgtggtattgccgctttggtataatt 381  Q
    || ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  19227776 aagcatgtggcattgccgctttggtataatt 19227746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 158 - 381
Target Start/End: Original strand, 38969128 - 38969351
Alignment:
Q  158 ggagtacctgaattatcaggatcatatacaacatgatgtgactgatggtgggtatgatcaggatcatataccagagcagcagcatataacagatgatgat 257  Q
    |||||||||| |||||||||||||  |||| || ||||||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||  | |||| ||||||    
T  38969128 ggagtacctgcattatcaggatcaggtacaccacgatgtgactaatggtgggtatgaccgggatcatataccagagcagcagcatgaaccagacgatgat 38969227  T
Q  258 gacattgcagcagcgactgacccagcagtgttacctttggagcctcccttttcaggatgaccggaagatatatctcagctacactcttatgccaaacatg 357  Q
    |||||||||||||||  || || ||  ||||||| | |||| |||| |||| | ||| |||||||| |  |||||  | | |||||||| ||||||||||    
T  38969228 gacattgcagcagcggttgccctagaggtgttacatgtggaccctctctttcctggaggaccggaaaacctatctttgttgcactcttaagccaaacatg 38969327  T
Q  358 tggtattgccgctttggtataatt 381  Q
    ||| ||||||||||||||||||||    
T  38969328 tggcattgccgctttggtataatt 38969351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 74; E-Value: 8e-34
Query Start/End: Original strand, 7 - 173
Target Start/End: Original strand, 42538044 - 42538208
Alignment:
Q  7 atgacacaaagccaccggaaggaaaggcaaagcgggcacatcccaaagaggggaagaggtcggannnnnnnnatggttcagggacttcgcaggaggctcc 106  Q
    ||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||        |||||||||||| ||||||||||||| |    
T  42538044 atgactcaaagccaccggaaggagagacaaagcgggcacatcccaaagaggggaagaggtcgga--gggtggatggttcagggagttcgcaggaggctgc 42538141  T
Q  107 ccatgctacacagcttgaagagtcacaagtggttgatccgaaccagaaggtggagtacctgaattat 173  Q
     || || ||||| | ||||||||| || ||||||||||||| |||| | |||||||| |||||||||    
T  42538142 tcaggccacacaacctgaagagtcgcaggtggttgatccgagccagcatgtggagtatctgaattat 42538208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 155 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 13843 - 13690
Alignment:
Q  155 ggtggagtacctgaattatcaggatcatatacaacatgatgtgactgatggtgggtatgatcaggatcatataccagagcagcagcatataacagatgat 254  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||  || |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||| || ||  ||| |||    
T  13843 ggtggagtacctgaactatcaggatcaggtataacatgatgtgactgatggtggatatgaccaggatcatataccacagcagcaggatgtaggagacgat 13744  T
Q  255 gatgacattgcagcagcgactgacccagcagtgttacctttggagcctcccttt 308  Q
    |||||||||||||||||  |||  ||||  |||||||||  ||| |||||||||    
T  13743 gatgacattgcagcagctgctgcaccagatgtgttacctgcggaccctcccttt 13690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 155 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 8579534 - 8579381
Alignment:
Q  155 ggtggagtacctgaattatcaggatcatatacaacatgatgtgactgatggtgggtatgatcaggatcatataccagagcagcagcatataacagatgat 254  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||| ||  |  ||| ||     
T  8579534 ggtggagtacctgaactatcaagatcaggtacaacatgatgtgactgatggtggatatgaccaggatcatataccacagcagcaggatgcaggagacgag 8579435  T
Q  255 gatgacattgcagcagcgactgacccagcagtgttacctttggagcctcccttt 308  Q
    |||||||||||||||||  |||  || |  ||||||||| |||| |||||||||    
T  8579434 gatgacattgcagcagctgctgcaccggaggtgttacctgtggaccctcccttt 8579381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 154 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 42941516 - 42941408
Alignment:
Q  154 aggtggagtacctgaattatcaggatcatatacaacatgatgtgactgatggtgggtatgatcaggatcatataccagagcagcagcatataacagatga 253  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||  |||| || ||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||  ||||||    
T  42941516 aggtggagtacctggattatcaggatcaggtacaccacgatgttacagatggtgggtatgaccaggatcatataccacagcagcagcatgtaggagatga 42941417  T
Q  254 tgatgacat 262  Q
    |||||||||    
T  42941416 tgatgacat 42941408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 155 - 304
Target Start/End: Original strand, 30706147 - 30706296
Alignment:
Q  155 ggtggagtacctgaattatcaggatcatatacaacatgatgtgactgatggtgggtatgatcaggatcatataccagagcagcagcatataacagatgat 254  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||  |||| ||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||| ||  |  ||| ||     
T  30706147 ggtggagtacctgaactatcaggatcaggtacagcatgatgtgacggatggtggatatgaccaggatcatataccacagcagcaggatgcaggagacgag 30706246  T
Q  255 gatgacattgcagcagcgactgacccagcagtgttacctttggagcctcc 304  Q
    |||||||||||||||||  |||  || |  ||||||||| ||||||||||    
T  30706247 gatgacattgcagcagctgctgcaccggaggtgttacctatggagcctcc 30706296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 155 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 19040128 - 19040012
Alignment:
Q  155 ggtggagtacctgaattatcaggatcatatacaacatgatgtgactgatggtgggtatgatcaggatcatataccagagcagcagcatataacagatgat 254  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||  |||| ||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||| ||  |  ||| ||     
T  19040128 ggtggagtacctgaactatcaggatcaggtacatcatgatgtgacggatggtggatatgaccaggatcatataccacagcagcaggatgcagtagacgag 19040029  T
Q  255 gatgacattgcagcagc 271  Q
    |||||||||||||||||    
T  19040028 gatgacattgcagcagc 19040012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 173 - 359
Target Start/End: Original strand, 27972252 - 27972435
Alignment:
Q  173 tcaggatcatatacaacatgatgtgactgatggtgggtatgatcaggatcatataccagagcagcagcatataacagatgatgatgacattgcagcagcg 272  Q
    ||||||| | ||||| || ||||| ||||||||||||||||| ||  | |||||||||||| ||||   |||| ||||  | ||| ||||||||||||||    
T  27972252 tcaggatgagatacaccacgatgtcactgatggtgggtatgaccaacaacatataccagagtagca---tataccagaccaggataacattgcagcagcg 27972348  T
Q  273 actgacccagcagtgttacctttggagcctcccttttcaggatgaccggaagatatatctcagctacactcttatgccaaacatgtg 359  Q
    || | |||| |   |||||||||| ||||||||||| | ||| |||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||| ||||||    
T  27972349 acagtcccaacgacgttacctttgcagcctccctttcctggaggaccggaagatacatctctgctgcactcttatgccaaccatgtg 27972435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 7 - 70
Target Start/End: Complemental strand, 19228124 - 19228061
Alignment:
Q  7 atgacacaaagccaccggaaggaaaggcaaagcgggcacatcccaaagaggggaagaggtcgga 70  Q
    ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19228124 atgacccaaagccaccggaaggagaggcaaagcgggcacatcccaaagaggggaagaggtcgga 19228061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 155 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 27672680 - 27672528
Alignment:
Q  155 ggtggagtacctgaattatcaggatcatatacaacatgatgtgactgatggtgggtatgatcaggatcatataccagagcagcagcatataacagatgat 254  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||  |||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||| |||||||| ||  |  ||| ||     
T  27672680 ggtggagtacctgaactatcaggatcaggtacagcatgatgtgactgatggtggatatgaccaggatcgtataccacagcagcaggatgcaggagacga- 27672582  T
Q  255 gatgacattgcagcagcgactgacccagcagtgttacctttggagcctcccttt 308  Q
    |||||||||||||||||  |||  || |  ||||||||| |||| |||||||||    
T  27672581 gatgacattgcagcagctgctgcaccggaggtgttacctgtggaccctcccttt 27672528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 155 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 28240851 - 28240735
Alignment:
Q  155 ggtggagtacctgaattatcaggatcatatacaacatgatgtgactgatggtgggtatgatcaggatcatataccagagcagcagcatataacagatgat 254  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||  |||| ||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||| | |||||| ||  |  ||| ||     
T  28240851 ggtggagtacctgaactatcaggatcaggtacatcatgatgtgacggatggtggatatgaccaggatcatataccacatcagcaggatgcaggagacgag 28240752  T
Q  255 gatgacattgcagcagc 271  Q
    |||||||||||||||||    
T  28240751 gatgacattgcagcagc 28240735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 7 - 66
Target Start/End: Original strand, 17659217 - 17659276
Alignment:
Q  7 atgacacaaagccaccggaaggaaaggcaaagcgggcacatcccaaagaggggaagaggt 66  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  17659217 atgacacaaagccaccggaaggagaggcaaagcgggtacatcccaaagaggggaagaggt 17659276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 7 - 66
Target Start/End: Complemental strand, 42941664 - 42941605
Alignment:
Q  7 atgacacaaagccaccggaaggaaaggcaaagcgggcacatcccaaagaggggaagaggt 66  Q
    ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42941664 atgacccaaagccaccggaaggagaggcaaagcgggcacatcccaaagaggggaagaggt 42941605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 155 - 310
Target Start/End: Original strand, 28877685 - 28877840
Alignment:
Q  155 ggtggagtacctgaattatcaggatcatatacaacatgatgtgactgatggtgggtatgatcaggatcatataccagagcagcagcatataacagatgat 254  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||  |||| ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||  ||  |  ||| ||     
T  28877685 ggtggagtatctgaactatcaggatcaggtacagcatgatgtgacggacggtggatatgaccaggatcatataccacagcagcatgatgcaggagacgag 28877784  T
Q  255 gatgacattgcagcagcgactgacccagcagtgttacctttggagcctcccttttc 310  Q
    |||||||||||||||||  |||  ||||  |||||||||  ||| |||||||||||    
T  28877785 gatgacattgcagcagctgctgcaccagatgtgttacctacggaccctcccttttc 28877840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 13 - 70
Target Start/End: Original strand, 38969000 - 38969057
Alignment:
Q  13 caaagccaccggaaggaaaggcaaagcgggcacatcccaaagaggggaagaggtcgga 70  Q
    |||||||||| ||| || |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38969000 caaagccaccagaaagagaggctaagtgggcacatcccaaagaggggaagaggtcgga 38969057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 285 - 386
Target Start/End: Complemental strand, 42941401 - 42941300
Alignment:
Q  285 gtgttacctttggagcctcccttttcaggatgaccggaagatatatctcagctacactcttatgccaaacatgtggtattgccgctttggtataatttag 384  Q
    ||||||||| ||||  |||||||| | ||| |||||| |||  |||||  ||| |||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||    
T  42941401 gtgttacctatggactctccctttcctggaggaccggtagacctatctttgctgcactcttatgtcaatcatttggtattgccgctttggtataattcag 42941302  T
Q  385 at 386  Q
    ||    
T  42941301 at 42941300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 7 - 70
Target Start/End: Complemental strand, 27672829 - 27672766
Alignment:
Q  7 atgacacaaagccaccggaaggaaaggcaaagcgggcacatcccaaagaggggaagaggtcgga 70  Q
    ||||| || |||||||||| ||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  27672829 atgactcagagccaccggagggagaggcagagcggccacatcccaaagaggggtagaggtcgga 27672766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 7 - 70
Target Start/End: Complemental strand, 13974 - 13911
Alignment:
Q  7 atgacacaaagccaccggaaggaaaggcaaagcgggcacatcccaaagaggggaagaggtcgga 70  Q
    |||||||| |||||||||| ||| ||||| ||||| |||||||||||||  || ||||||||||    
T  13974 atgacacagagccaccggagggagaggcagagcggccacatcccaaagaatggtagaggtcgga 13911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 7 - 70
Target Start/End: Original strand, 7758201 - 7758264
Alignment:
Q  7 atgacacaaagccaccggaaggaaaggcaaagcgggcacatcccaaagaggggaagaggtcgga 70  Q
    ||||| || |||||||||| ||| ||||| |||||  |||||||||||||||| ||||||||||    
T  7758201 atgactcagagccaccggagggagaggcagagcggcgacatcccaaagaggggtagaggtcgga 7758264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 122; Significance: 2e-62; HSPs: 21)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 31 - 381
Target Start/End: Complemental strand, 36655544 - 36655196
Alignment:
Q  31 aggcaaagcgggcacatcccaaagaggggaagaggtcggannnnnnnnatggttcagggacttcgcaggaggctccccatgctacacagcttgaagagtc 130  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||        ||| |||||||| |||||| |||||| | || |||||||| | |||||||||    
T  36655544 aggcaaagcggccacatcccaaagaggggtagaggtcggagggtgg--atgtttcagggagttcgcaagaggcttctcaggctacacaacctgaagagtc 36655447  T
Q  131 acaagtggttgatccgaaccagaaggtggagtacctgaattatcaggatcatatacaacatgatgtgactgatggtgggtatgatcaggatcatatacca 230  Q
    ||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||| || || || || |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  36655446 acaggtggttgatccgagccagcaggtggagtacctgaattatcaggatcaggtacaccacgacgttacagatggtgggtatgaccaggatcatatacca 36655347  T
Q  231 gagcagcagcatataacagatgatgatgacattgcagcagcgactgacccagcagtgttacctttggagcctcccttttcaggatgaccggaagatatat 330  Q
    |||||||| ||| ||  |||||||||| |||||||||||||  ||| ||| |  ||||||| | |||| ||| ||||| | ||| ||||||| ||  |||    
T  36655346 gagcagcaacatgtaggagatgatgataacattgcagcagctgctgccccggaggtgttacatgtggacccttcctttcctggaggaccggacgacctat 36655247  T
Q  331 ctcagctacactcttatgccaaacatgtggtattgccgctttggtataatt 381  Q
    ||  | | |||||||||||||| |||||||  |||||| ||||||||||||    
T  36655246 ctttgttgcactcttatgccaatcatgtggcgttgccggtttggtataatt 36655196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 7 - 386
Target Start/End: Original strand, 39948496 - 39948873
Alignment:
Q  7 atgacacaaagccaccggaaggaaaggcaaagcgggcacatcccaaagaggggaagaggtcggannnnnnnnatggttcagggacttcgcaggaggctcc 106  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||| | ||||||||        |||||||||||| |   ||||||||| |    
T  39948496 atgactcaaagccaccggagggaaaggcagagcggccacatcccaaagaggggtaaaggtcggaggggag--atggttcagggagtgaacaggaggcttc 39948593  T
Q  107 ccatgctacacagcttgaagagtcacaagtggttgatccgaaccagaaggtggagtacctgaattatcaggatcatatacaacatgatgtgactgatggt 206  Q
     || |||||||||| | ||||||| || ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||| || |||||||||||||||    
T  39948594 tcaggctacacagcctaaagagtcgcaggtggttgatccgagccagcaggtggagtacctgaattatcaggatcaggtacaccacgatgtgactgatggt 39948693  T
Q  207 gggtatgatcaggatcatataccagagcagcagcatataacagatgatgatgacattgcagcagcgactgacccagcagtgttacctttggagcctccct 306  Q
    || ||||| || |||||||||||| ||||||||||| ||  ||| ||||||||||||||||||||  |||  || |  ||||||||| |||| |||| ||    
T  39948694 ggatatgaccatgatcatataccacagcagcagcatgtaggagacgatgatgacattgcagcagctgctgcaccggaggtgttacctgtggaccctctct 39948793  T
Q  307 tttcaggatgaccggaagatatatctcagctacactcttatgccaaacatgtggtattgccgctttggtataatttagat 386  Q
    || | ||  |||||| |||  |||||   || |||||||||| ||  |||||||  ||||| ||||||||||||| ||||    
T  39948794 ttcctggtggaccggcagacttatctttactccactcttatgtcagtcatgtggcgttgccactttggtataattcagat 39948873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 84; E-Value: 8e-40
Query Start/End: Original strand, 155 - 386
Target Start/End: Complemental strand, 29400595 - 29400364
Alignment:
Q  155 ggtggagtacctgaattatcaggatcatatacaacatgatgtgactgatggtgggtatgatcaggatcatataccagagcagcagcatataacagatgat 254  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||  |||| || |||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||| ||| ||| ||| |||    
T  29400595 ggtggagtacctgaattatcatgatcaggtacaccacgatgtgacggatggtgggtatgaccagaatcatataccacagcagcaacatgtaagagacgat 29400496  T
Q  255 gatgacattgcagcagcgactgacccagcagtgttacctttggagcctcccttttcaggatgaccggaagatatatctcagctacactcttatgccaaac 354  Q
    |||||||||||| ||||  ||| ||| |  ||||||||| |||| ||||||||| | ||| |||||| |||  |||||  ||| |||||||||||||| |    
T  29400495 gatgacattgcaacagctgctgccccggaggtgttacctgtggaccctccctttcctggaggaccggcagacttatctttgctccactcttatgccaatc 29400396  T
Q  355 atgtggtattgccgctttggtataatttagat 386  Q
    ||||||  ||||| | ||||||||||| ||||    
T  29400395 atgtggcgttgccacattggtataattcagat 29400364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 155 - 386
Target Start/End: Complemental strand, 10828049 - 10827818
Alignment:
Q  155 ggtggagtacctgaattatcaggatcatatacaacatgatgtgactgatggtgggtatgatcaggatcatataccagagcagcagcatataacagatgat 254  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||  |||| || |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||  ||| |||    
T  10828049 ggtggagtacctgaattatcaagatcaggtacaccacgatgtgacagatggtgggtatgaccaggatcatataccacagcagcagcatgtaggagacgat 10827950  T
Q  255 gatgacattgcagcagcgactgacccagcagtgttacctttggagcctcccttttcaggatgaccggaagatatatctcagctacactcttatgccaaac 354  Q
    |||||||||||||||||  ||| ||| |  ||||||||| |||  ||||||||| | ||   ||||  |||  |||||  ||| |||||||||| ||  |    
T  10827949 gatgacattgcagcagctgctgcccctgaggtgttacctgtggtccctccctttcctggtgaaccgacagacttatctttgctccactcttatgtcagtc 10827850  T
Q  355 atgtggtattgccgctttggtataatttagat 386  Q
    ||||||  ||||| ||||||||||||| ||||    
T  10827849 atgtggcgttgccactttggtataattcagat 10827818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 159 - 271
Target Start/End: Original strand, 7187817 - 7187929
Alignment:
Q  159 gagtacctgaattatcaggatcatatacaacatgatgtgactgatggtgggtatgatcaggatcatataccagagcagcagcatataacagatgatgatg 258  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||| || ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| | ||||||||| ||  ||| |||||||    
T  7187817 gagtacctgaattatcaggatcaggtacaccacgatgtgactgatggtggatatgaccaggatcatataccacaacagcagcatgtaggagacgatgatg 7187916  T
Q  259 acattgcagcagc 271  Q
    |||||||||||||    
T  7187917 acattgcagcagc 7187929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 155 - 271
Target Start/End: Original strand, 17421573 - 17421689
Alignment:
Q  155 ggtggagtacctgaattatcaggatcatatacaacatgatgtgactgatggtgggtatgatcaggatcatataccagagcagcagcatataacagatgat 254  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||  |||| ||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||| ||  |  ||| ||     
T  17421573 ggtggagtacctgaactatcaggatcaggtacatcatgatgtgacggatggtggatatgaccaggatcatataccacagcagcaggatgcagtagacgag 17421672  T
Q  255 gatgacattgcagcagc 271  Q
    |||||||||||||||||    
T  17421673 gatgacattgcagcagc 17421689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 155 - 271
Target Start/End: Original strand, 15832179 - 15832295
Alignment:
Q  155 ggtggagtacctgaattatcaggatcatatacaacatgatgtgactgatggtgggtatgatcaggatcatataccagagcagcagcatataacagatgat 254  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||  |||| ||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||| | |||||| ||  |  ||| ||     
T  15832179 ggtggagtacctgaactatcaggatcaggtacatcatgatgtgacggatggtggatatgaccaggatcatataccacatcagcaggatgcaggagacgag 15832278  T
Q  255 gatgacattgcagcagc 271  Q
    |||||||||||||||||    
T  15832279 gatgacattgcagcagc 15832295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 155 - 271
Target Start/End: Original strand, 45429635 - 45429751
Alignment:
Q  155 ggtggagtacctgaattatcaggatcatatacaacatgatgtgactgatggtgggtatgatcaggatcatataccagagcagcagcatataacagatgat 254  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||  |||| ||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||| | |||||| ||  |  ||| ||     
T  45429635 ggtggagtacctgaactatcaggatcaggtacatcatgatgtgacggatggtggatatgaccaggatcatataccacatcagcaggatgcaggagacgag 45429734  T
Q  255 gatgacattgcagcagc 271  Q
    |||||||||||||||||    
T  45429735 gatgacattgcagcagc 45429751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 155 - 271
Target Start/End: Original strand, 43979581 - 43979697
Alignment:
Q  155 ggtggagtacctgaattatcaggatcatatacaacatgatgtgactgatggtgggtatgatcaggatcatataccagagcagcagcatataacagatgat 254  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||| |  ||||| ||  |  ||| ||     
T  43979581 ggtggagtacctgaactatcaggatcagatacatcatgatgtgacggacggtggatatgaccaggatcatataccacatgagcaggatgcaggagacgag 43979680  T
Q  255 gatgacattgcagcagc 271  Q
    |||||||||||||||||    
T  43979681 gatgacattgcagcagc 43979697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 155 - 308
Target Start/End: Original strand, 20931620 - 20931773
Alignment:
Q  155 ggtggagtacctgaattatcaggatcatatacaacatgatgtgactgatggtgggtatgatcaggatcatataccagagcagcagcatataacagatgat 254  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||  |||| ||||||||||| |||||||| ||||| || |||||||||||| |  ||||| ||  |  ||| ||     
T  20931620 ggtggagtacctgaactatcaggatcaggtacagcatgatgtgacggatggtggatatgaccaagatcatataccacaaaagcaggatgaaggagacgag 20931719  T
Q  255 gatgacattgcagcagcgactgacccagcagtgttacctttggagcctcccttt 308  Q
    |||||||||||||||||  |||  || |  ||||||||| |||| |||||||||    
T  20931720 gatgacattgcagcagctgctgcaccggaggtgttacctgtggaccctcccttt 20931773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 155 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 30495958 - 30495842
Alignment:
Q  155 ggtggagtacctgaattatcaggatcatatacaacatgatgtgactgatggtgggtatgatcaggatcatataccagagcagcagcatataacagatgat 254  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||  |||| ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||| |  ||||| ||  |  ||| ||     
T  30495958 ggtggagtacctgaactatcaggatcaggtacatcatgatgtgacggacggtggatatgaccaggatcatataccacatgagcaggatgcaggagacgag 30495859  T
Q  255 gatgacattgcagcagc 271  Q
    |||||||||||||||||    
T  30495858 gatgacattgcagcagc 30495842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 155 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 43538749 - 43538633
Alignment:
Q  155 ggtggagtacctgaattatcaggatcatatacaacatgatgtgactgatggtgggtatgatcaggatcatataccagagcagcagcatataacagatgat 254  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||  |||| ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||| |  ||||| ||  |  ||| ||     
T  43538749 ggtggagtacctgaactatcaggatcaggtacatcatgatgtgacggacggtggatatgaccaggatcatataccacatgagcaggatgcaggagacgag 43538650  T
Q  255 gatgacattgcagcagc 271  Q
    |||||||||||||||||    
T  43538649 gatgacattgcagcagc 43538633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 155 - 230
Target Start/End: Original strand, 5353016 - 5353091
Alignment:
Q  155 ggtggagtacctgaattatcaggatcatatacaacatgatgtgactgatggtgggtatgatcaggatcatatacca 230  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||  |||| ||||||||||| || ||||| ||||| |||||||||||||||    
T  5353016 ggtggagtacctgaactatcaggatcaggtacatcatgatgtgacggacggtggatatgaccaggatcatatacca 5353091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 7 - 66
Target Start/End: Complemental strand, 25515061 - 25515002
Alignment:
Q  7 atgacacaaagccaccggaaggaaaggcaaagcgggcacatcccaaagaggggaagaggt 66  Q
    |||||||||||||||||||| || ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  25515061 atgacacaaagccaccggaatgagaggcaagacgggcacatcccaaagaggggaagaggt 25515002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 155 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 3939751 - 3939635
Alignment:
Q  155 ggtggagtacctgaattatcaggatcatatacaacatgatgtgactgatggtgggtatgatcaggatcatataccagagcagcagcatataacagatgat 254  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||  |||| ||||||||||| || ||||| |||||  |||||||||||||| |  ||||| ||  |  ||| ||     
T  3939751 ggtggagtacctgaactatcaggatcaggtacatcatgatgtgacggacggtggatatgactaggatcatataccacatgagcaggatgcaggagacgag 3939652  T
Q  255 gatgacattgcagcagc 271  Q
    |||||||||||||||||    
T  3939651 gatgacattgcagcagc 3939635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 155 - 230
Target Start/End: Original strand, 28469685 - 28469760
Alignment:
Q  155 ggtggagtacctgaattatcaggatcatatacaacatgatgtgactgatggtgggtatgatcaggatcatatacca 230  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||| ||||| || ||||| ||||| || ||||||||||||    
T  28469685 ggtggagtacctgaactatcaggataagatacaacatgaagtgacagaaggtggatatgaacaagatcatatacca 28469760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 13 - 70
Target Start/End: Complemental strand, 10828174 - 10828117
Alignment:
Q  13 caaagccaccggaaggaaaggcaaagcgggcacatcccaaagaggggaagaggtcgga 70  Q
    ||||||||||||| ||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  10828174 caaagccaccggagggagaggcagagcggtcacatcccaaagaggggtagaggtcgga 10828117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 7 - 70
Target Start/End: Original strand, 28469536 - 28469599
Alignment:
Q  7 atgacacaaagccaccggaaggaaaggcaaagcgggcacatcccaaagaggggaagaggtcgga 70  Q
    ||||| || |||||||||| ||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  28469536 atgacccagagccaccggagggagaggcagagcggccacatcccaaagaggggtagaggtcgga 28469599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 7 - 70
Target Start/End: Complemental strand, 29400775 - 29400712
Alignment:
Q  7 atgacacaaagccaccggaaggaaaggcaaagcgggcacatcccaaagaggggaagaggtcgga 70  Q
    ||||| || |||||||||| ||| ||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  29400775 atgactcagagccaccggagggagaggcaaagcagccacatcccaaagaggggtagaggtcgga 29400712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 7 - 70
Target Start/End: Original strand, 45429486 - 45429549
Alignment:
Q  7 atgacacaaagccaccggaaggaaaggcaaagcgggcacatcccaaagaggggaagaggtcgga 70  Q
    ||||| || |||||||||| ||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  45429486 atgactcagagccaccggagggagaggcagagcggccacatcccaaagaggggtagaggtcgga 45429549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 7 - 70
Target Start/End: Complemental strand, 45136483 - 45136420
Alignment:
Q  7 atgacacaaagccaccggaaggaaaggcaaagcgggcacatcccaaagaggggaagaggtcgga 70  Q
    ||||| || |||||||||| ||| || |||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  45136483 atgactcagagccaccggagggagagacaaagcgaccacatcccaaagaggggtagaggtcgga 45136420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0155 (Bit Score: 60; Significance: 2e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0155
Description:

Target: scaffold0155; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 7 - 70
Target Start/End: Original strand, 11157 - 11220
Alignment:
Q  7 atgacacaaagccaccggaaggaaaggcaaagcgggcacatcccaaagaggggaagaggtcgga 70  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11157 atgacacaaagccaccggaaggagaggcaaagcgggcacatcccaaagaggggaagaggtcgga 11220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University