View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF9569_low_2 (Length: 590)

Name: NF9569_low_2
Description: NF9569
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF9569_low_2
NF9569_low_2
[»] chr2 (34 HSPs)
chr2 (49-572)||(17420623-17421145)
chr2 (30-581)||(28468677-28469228)
chr2 (51-541)||(21998245-21998737)
chr2 (51-581)||(45428647-45429178)
chr2 (164-581)||(39947769-39948188)
chr2 (30-581)||(32955844-32956380)
chr2 (54-446)||(7185089-7185481)
chr2 (30-482)||(25964847-25965308)
chr2 (107-388)||(45137111-45137392)
chr2 (49-246)||(42505582-42505780)
chr2 (403-581)||(45136788-45136956)
chr2 (463-581)||(22686849-22686966)
chr2 (380-510)||(29401160-29401291)
chr2 (380-497)||(20938282-20938399)
chr2 (191-510)||(25515366-25515684)
chr2 (380-497)||(45284558-45284675)
chr2 (380-497)||(45291921-45292038)
chr2 (380-510)||(10828581-10828712)
chr2 (380-510)||(36655906-36656037)
chr2 (380-497)||(3940299-3940416)
chr2 (380-497)||(5352351-5352468)
chr2 (380-497)||(15831514-15831631)
chr2 (380-497)||(30496517-30496634)
chr2 (380-497)||(43978906-43979023)
chr2 (380-497)||(43539308-43539425)
chr2 (30-86)||(30493395-30493451)
chr2 (30-86)||(43536138-43536194)
chr2 (30-86)||(44100779-44100835)
chr2 (273-362)||(31367308-31367397)
chr2 (273-358)||(35464313-35464398)
chr2 (49-96)||(30496920-30496967)
chr2 (30-72)||(14456538-14456580)
chr2 (17-70)||(31974244-31974297)
chr2 (30-78)||(29947803-29947851)
[»] chr4 (43 HSPs)
chr4 (30-581)||(40357766-40358317)
chr4 (30-581)||(21022374-21022925)
chr4 (53-581)||(50274793-50275322)
chr4 (30-572)||(30726236-30726778)
chr4 (49-572)||(1308609-1309132)
chr4 (30-572)||(1089079-1089621)
chr4 (164-581)||(51683370-51683790)
chr4 (154-581)||(50901640-50902067)
chr4 (126-581)||(55407272-55407732)
chr4 (164-581)||(48256056-48256475)
chr4 (219-581)||(37021563-37021936)
chr4 (164-497)||(67762-68094)
chr4 (164-497)||(46436415-46436747)
chr4 (131-510)||(21538008-21538397)
chr4 (191-510)||(10752983-10753312)
chr4 (191-510)||(10966752-10967081)
chr4 (164-534)||(14315545-14315925)
chr4 (164-510)||(11083562-11083918)
chr4 (165-516)||(14297297-14297658)
chr4 (380-552)||(11050037-11050210)
chr4 (380-494)||(41798568-41798682)
chr4 (30-278)||(8109427-8109679)
chr4 (380-510)||(50023099-50023230)
chr4 (380-497)||(9892838-9892955)
chr4 (164-510)||(41933179-41933524)
chr4 (380-510)||(50030217-50030348)
chr4 (380-497)||(6181360-6181477)
chr4 (380-497)||(49090806-49090923)
chr4 (380-497)||(49165419-49165536)
chr4 (390-497)||(30704419-30704526)
chr4 (380-497)||(31422083-31422201)
chr4 (380-497)||(44679645-44679762)
chr4 (380-497)||(50193864-50193982)
chr4 (380-495)||(3184342-3184457)
chr4 (380-495)||(3185456-3185571)
chr4 (380-495)||(3185664-3185779)
chr4 (272-496)||(4719949-4720163)
chr4 (21-196)||(37021933-37022107)
chr4 (30-86)||(31425299-31425355)
chr4 (31-86)||(37563102-37563157)
chr4 (30-86)||(49169078-49169134)
chr4 (218-256)||(1308557-1308595)
chr4 (17-78)||(40832666-40832727)
[»] chr5 (24 HSPs)
chr5 (30-581)||(28876679-28877230)
chr5 (51-580)||(8579992-8580521)
chr5 (30-581)||(7757361-7757912)
chr5 (49-572)||(28241294-28241817)
chr5 (55-510)||(14246-14701)
chr5 (164-581)||(19228157-19228575)
chr5 (171-581)||(42941972-42942383)
chr5 (164-581)||(512257-512675)
chr5 (164-581)||(38968265-38968686)
chr5 (126-581)||(42537276-42537737)
chr5 (164-581)||(17658493-17658910)
chr5 (164-581)||(8701709-8702126)
chr5 (164-497)||(40624484-40624826)
chr5 (380-497)||(19040687-19040804)
chr5 (265-507)||(20422210-20422463)
chr5 (380-510)||(5197359-5197490)
chr5 (380-496)||(27673224-27673340)
chr5 (380-497)||(30705522-30705639)
chr5 (30-86)||(28238175-28238231)
chr5 (30-72)||(29430573-29430615)
chr5 (22-70)||(8044-8092)
chr5 (1-67)||(2169695-2169760)
chr5 (218-256)||(28241242-28241280)
chr5 (3-67)||(13838424-13838488)
[»] chr8 (44 HSPs)
chr8 (51-581)||(15036213-15036744)
chr8 (92-581)||(45064339-45064818)
chr8 (30-581)||(39938701-39939252)
chr8 (49-572)||(42485024-42485556)
chr8 (49-572)||(489124-489647)
chr8 (164-581)||(43211676-43212093)
chr8 (30-534)||(39601740-39602256)
chr8 (56-581)||(41249574-41250083)
chr8 (49-567)||(39846485-39847008)
chr8 (126-581)||(43188181-43188637)
chr8 (164-581)||(39252179-39252590)
chr8 (164-581)||(40076744-40077153)
chr8 (164-581)||(34822501-34822923)
chr8 (278-581)||(5303706-5304010)
chr8 (164-398)||(25864609-25864842)
chr8 (191-552)||(2984329-2984681)
chr8 (270-510)||(24249759-24249999)
chr8 (270-497)||(37327080-37327286)
chr8 (380-510)||(35552051-35552182)
chr8 (380-510)||(20857671-20857802)
chr8 (380-497)||(25097-25214)
chr8 (380-497)||(1052910-1053027)
chr8 (380-497)||(23021891-23022008)
chr8 (380-497)||(26659832-26659949)
chr8 (191-505)||(45127946-45128261)
chr8 (49-252)||(35026542-35026745)
chr8 (408-510)||(34371450-34371553)
chr8 (164-228)||(5304009-5304073)
chr8 (380-510)||(5677456-5677587)
chr8 (191-297)||(35551863-35551968)
chr8 (303-496)||(22495216-22495419)
chr8 (30-86)||(22014282-22014338)
chr8 (30-86)||(26663014-26663070)
chr8 (33-86)||(184376-184429)
chr8 (291-335)||(35026740-35026784)
chr8 (19-71)||(43520772-43520824)
chr8 (51-86)||(21817-21852)
chr8 (51-118)||(39252082-39252148)
chr8 (218-256)||(489072-489110)
chr8 (40-86)||(36677759-36677805)
chr8 (51-101)||(43211563-43211613)
chr8 (30-67)||(36127408-36127445)
chr8 (30-86)||(1056182-1056238)
chr8 (30-86)||(23018721-23018777)
[»] chr7 (35 HSPs)
chr7 (105-581)||(17835188-17835664)
chr7 (30-572)||(15073723-15074265)
chr7 (30-572)||(42507522-42508064)
chr7 (53-581)||(27453104-27453634)
chr7 (30-581)||(34738400-34738954)
chr7 (30-581)||(47776368-47776922)
chr7 (164-562)||(10517151-10517549)
chr7 (164-581)||(39460698-39461116)
chr7 (164-581)||(47672570-47672988)
chr7 (164-581)||(36977766-36978186)
chr7 (164-581)||(37340474-37340892)
chr7 (164-581)||(9494281-9494709)
chr7 (191-571)||(14689553-14689933)
chr7 (164-496)||(556217-556547)
chr7 (270-496)||(17741019-17741255)
chr7 (380-497)||(41880876-41880993)
chr7 (380-497)||(35609986-35610103)
chr7 (380-497)||(48403743-48403860)
chr7 (380-497)||(45257374-45257490)
chr7 (380-497)||(46740117-46740234)
chr7 (380-510)||(5541096-5541227)
chr7 (394-510)||(16675186-16675303)
chr7 (394-510)||(17649554-17649671)
chr7 (380-497)||(9370960-9371073)
chr7 (380-460)||(17465328-17465408)
chr7 (380-460)||(17587806-17587886)
chr7 (30-86)||(35606825-35606881)
chr7 (30-86)||(41884107-41884163)
chr7 (462-497)||(17462864-17462899)
chr7 (462-497)||(17590315-17590350)
chr7 (3-72)||(31323058-31323127)
chr7 (49-96)||(35610386-35610433)
chr7 (272-327)||(41734441-41734496)
chr7 (390-441)||(41734559-41734610)
chr7 (30-86)||(10097952-10098007)
[»] chr3 (47 HSPs)
chr3 (50-581)||(50963014-50963541)
chr3 (51-581)||(3975763-3976294)
chr3 (30-482)||(3501477-3501932)
chr3 (30-581)||(42165199-42165750)
chr3 (49-581)||(4007808-4008341)
chr3 (89-581)||(47073692-47074187)
chr3 (53-545)||(50216399-50216894)
chr3 (164-581)||(44229885-44230301)
chr3 (126-581)||(20917500-20917957)
chr3 (126-581)||(20926462-20926919)
chr3 (164-581)||(42756323-42756739)
chr3 (164-581)||(49195932-49196350)
chr3 (164-581)||(30255487-30255905)
chr3 (53-497)||(596817-597261)
chr3 (164-581)||(48888906-48889322)
chr3 (164-581)||(48563112-48563515)
chr3 (216-581)||(42805746-42806107)
chr3 (164-438)||(51807139-51807413)
chr3 (380-510)||(16611463-16611594)
chr3 (380-510)||(22047659-22047790)
chr3 (380-497)||(52390966-52391083)
chr3 (380-511)||(17567619-17567751)
chr3 (380-499)||(41612753-41612872)
chr3 (380-497)||(2274484-2274601)
chr3 (380-497)||(29009245-29009362)
chr3 (380-497)||(36127822-36127939)
chr3 (380-497)||(42903760-42903877)
chr3 (380-497)||(46389347-46389464)
chr3 (380-497)||(50480354-50480471)
chr3 (380-497)||(54386509-54386626)
chr3 (380-510)||(20351030-20351161)
chr3 (272-496)||(31045165-31045388)
chr3 (380-497)||(49144033-49144149)
chr3 (380-497)||(34045762-34045878)
chr3 (380-497)||(46701595-46701712)
chr3 (390-496)||(4178199-4178305)
chr3 (390-496)||(4172201-4172307)
chr3 (532-581)||(54681976-54682025)
chr3 (30-86)||(41844185-41844241)
chr3 (30-86)||(46697747-46697803)
chr3 (17-86)||(35743563-35743632)
chr3 (30-86)||(50477216-50477272)
chr3 (126-200)||(42807498-42807572)
chr3 (51-101)||(35743450-35743500)
chr3 (30-96)||(49144427-49144493)
chr3 (552-581)||(49268753-49268782)
chr3 (30-78)||(19988622-19988670)
[»] chr1 (42 HSPs)
chr1 (49-572)||(30890116-30890639)
chr1 (49-572)||(19924810-19925320)
chr1 (164-581)||(52802300-52802719)
chr1 (30-581)||(31783213-31783752)
chr1 (164-581)||(35258358-35258775)
chr1 (107-581)||(47502428-47502891)
chr1 (30-386)||(29622105-29622461)
chr1 (164-581)||(23275589-23276011)
chr1 (130-581)||(45825023-45825465)
chr1 (164-581)||(51320884-51321301)
chr1 (201-581)||(19527028-19527409)
chr1 (30-497)||(22524162-22524636)
chr1 (238-551)||(49857461-49857772)
chr1 (164-362)||(11183348-11183549)
chr1 (217-510)||(2424924-2425224)
chr1 (380-510)||(47656256-47656386)
chr1 (380-497)||(2365622-2365739)
chr1 (380-497)||(19156401-19156518)
chr1 (380-510)||(21141413-21141544)
chr1 (380-510)||(50343525-50343656)
chr1 (380-497)||(3731951-3732068)
chr1 (380-497)||(13639593-13639710)
chr1 (380-497)||(26876043-26876160)
chr1 (380-510)||(97504-97635)
chr1 (380-496)||(17514267-17514383)
chr1 (262-358)||(11196148-11196244)
chr1 (390-497)||(38127052-38127160)
chr1 (164-225)||(2425528-2425589)
chr1 (380-468)||(8474171-8474259)
chr1 (536-581)||(19524671-19524716)
chr1 (536-581)||(19524858-19524903)
chr1 (536-581)||(19525519-19525564)
chr1 (536-581)||(19526654-19526699)
chr1 (536-581)||(19526841-19526886)
chr1 (30-86)||(3728771-3728827)
chr1 (30-86)||(8548650-8548706)
chr1 (30-86)||(26879276-26879332)
chr1 (30-93)||(2425659-2425722)
chr1 (272-327)||(38127223-38127278)
chr1 (218-256)||(30890653-30890691)
chr1 (382-451)||(23935581-23935650)
chr1 (3-67)||(24362298-24362362)
[»] scaffold0634 (2 HSPs)
scaffold0634 (40-497)||(7464-7921)
scaffold0634 (547-581)||(7901-7935)
[»] scaffold0293 (1 HSPs)
scaffold0293 (30-562)||(233-759)
[»] scaffold0180 (1 HSPs)
scaffold0180 (164-581)||(15107-15525)
[»] chr6 (22 HSPs)
chr6 (171-581)||(31768877-31769293)
chr6 (164-581)||(24088267-24088687)
chr6 (262-581)||(6320048-6320368)
chr6 (191-534)||(3380971-3381313)
chr6 (380-497)||(6201534-6201651)
chr6 (380-497)||(11688501-11688618)
chr6 (380-497)||(22301566-22301683)
chr6 (380-497)||(30829222-30829339)
chr6 (380-496)||(21600990-21601106)
chr6 (380-510)||(24722314-24722445)
chr6 (381-510)||(26423384-26423514)
chr6 (380-497)||(27617101-27617218)
chr6 (380-510)||(3501555-3501686)
chr6 (164-224)||(6320371-6320431)
chr6 (224-297)||(24722159-24722231)
chr6 (273-358)||(30424143-30424228)
chr6 (17-78)||(2110444-2110505)
chr6 (216-297)||(7912647-7912728)
chr6 (51-86)||(30826081-30826116)
chr6 (30-72)||(17596977-17597019)
chr6 (30-96)||(27616751-27616817)
chr6 (31-72)||(14011754-14011795)
[»] scaffold0101 (1 HSPs)
scaffold0101 (95-356)||(40746-41007)
[»] scaffold0155 (2 HSPs)
scaffold0155 (164-377)||(8374-8586)
scaffold0155 (401-497)||(10761-10857)
[»] scaffold0184 (1 HSPs)
scaffold0184 (49-251)||(18111-18311)
[»] scaffold0078 (1 HSPs)
scaffold0078 (49-251)||(54533-54733)
[»] scaffold0238 (1 HSPs)
scaffold0238 (191-510)||(18489-18808)
[»] scaffold0877 (1 HSPs)
scaffold0877 (380-497)||(4224-4341)
[»] scaffold0007 (2 HSPs)
scaffold0007 (312-495)||(251048-251230)
scaffold0007 (420-468)||(246180-246228)
[»] scaffold0201 (1 HSPs)
scaffold0201 (21-77)||(22430-22486)


Alignment Details
Target: chr2 (Bit Score: 462; Significance: 0; HSPs: 34)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 462; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 49 - 572
Target Start/End: Original strand, 17420623 - 17421145
Alignment:
Q  49 ctcggcagttaactaccgaggaaatctgaacttaaacagatcgcagaaccagaacctcccatttccaaaaaaccttcaaaattctcaatttctctcccat 148  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17420623 ctcggtagttaactgccgaggaaatctgaacttaaacagatcgcagaaccagaacctcccatttccaaaaaaccttcaaaattctcaatttctctcccat 17420722  T
Q  149 ttcctaccaaatccatttcacgaattg-caagcaaatcaagtgcacattatcacaagtaagttgtgtcaatcattttaatgttaatgttaatttgtttag 247  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  ||| |   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17420723 ttcctaccaaatccatttcacgaattctcaacct--tcaagtgcacattatcacaagtaagttgtgtcaatcattttaatgttaatgttaatttgtttag 17420820  T
Q  248 gttgagttttttagaaaaattagagtagtttgcatgtggttagggttgatctcaaaattgagaatttgatgattgcatgtgtagtttagaaattgataat 347  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  17420821 gttgatttttttagaaaaattagagtagtttgcatgtggttagggttgatttcaaaattgagaatttgatgattgcatgtgtagtttagaaattgatcat 17420920  T
Q  348 tgaatgtagttgttgcctatgatgtttaaatcataatgtgggtttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacaccaagtg 447  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  17420921 tgaatgtagttgttgcctatgttgtttaaatcataatgtgggtttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacatcaagtg 17421020  T
Q  448 tttgataaaatgtctcaatgacaattttattgattatttagttagtttagttatggaaatgatagaaatgatgttaattatagtttggttaagtgtattt 547  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  17421021 tttgataaaatgtctcaatgacaattttattgattatttagttagtttagttatggaaatgatagaaatgatgttaattatagtttggttaagtttattt 17421120  T
Q  548 tgattttttagttagtttaggttac 572  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  17421121 tgattttttagttagtttaggttac 17421145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 453; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 30 - 581
Target Start/End: Original strand, 28468677 - 28469228
Alignment:
Q  30 gttaactgctgaggtaaatctcggcagttaactaccgaggaaatctgaacttaaacagatcgcagaaccagaacctcccatttccaaaaaaccttcaaaa 129  Q
    ||||||||| |||| ||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  28468677 gttaactgccgaggaaaacctcggtagttaactgccgaggaaatctgaacttaaacagatggcagaaccagaacctcccatttccaaaaaacctccaaaa 28468776  T
Q  130 ttctcaatttctctcccatttcctaccaaatccattt-cacgaattgcaagcaaatcaagtgcacattatcacaagtaagttgtgtcaatcattttaatg 228  Q
    |||||||||||||||| || | | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  28468777 ttctcaatttctctccaatcttc-accaaatccattttcacgaattgcaagcaaatcaagtgcacattatcacaagtaagttgtgtcaatcatttgaatg 28468875  T
Q  229 ttaatgttaatttgtttaggttgagttttttagaaaaattagagtagtttgcatgtggttagggttgatctcaaaattgagaatttgatgattgcatgtg 328  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||    
T  28468876 ttaatgttaatttgtttaggttgatttttttaaaaaaattagagtagtttgtatgtggttagggttgattttaaaattgacaatttgatgattgcatgtg 28468975  T
Q  329 tagtttagaaattgataattgaatgtagttgttgcctatgatgtttaaatcataatgtgggtttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgtttt 428  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28468976 tagtttagaaattgataattgaatgtaattgttgcctatgttgtttaaatcataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgtttt 28469075  T
Q  429 atactttgcacaccaagtgtttgataaaatgtctcaatgacaattttattgattatttagttagtttagttatggaaatgatagaaatgatgttaattat 528  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28469076 atactttgcacacaaagtgtttgataaaatgtctcaatgacaattttattgattatttagttagtttagttatggaaatgatagaaatgatgttaattat 28469175  T
Q  529 agtttggttaagtgtattttgattttttagttagtttaggttacgagaattat 581  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28469176 agtttggttaagtgtattttgattttttagttagtttaggttacgagaattat 28469228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 371; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 51 - 541
Target Start/End: Original strand, 21998245 - 21998737
Alignment:
Q  51 cggcagttaactaccgaggaaatctgaacttaaacagatcgcagaaccagaacctcccatttccaaaaaa--ccttcaaaattctcaatttctctcccat 148  Q
    |||||||||||| ||||||||| |||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||| ||    
T  21998245 cggcagttaactgccgaggaaaactgaacataaccagaacgcagaaccagaacctcccatttccaaaaaaaaccttctaaattctcaatttctctccaat 21998344  T
Q  149 ttcctaccaaatccattt-cacgaattgcaagcaaatcaagtgcacattatcacaagtaagttgtgtcaatcattttaatgttaatgttaatttgtttag 247  Q
     | | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21998345 cttc-accaaatccattttcacgaattgcaagcaaatcaattgtacattatcacaagtaagttgtgtcaatcattttaatgttaatgttaatttgtttag 21998443  T
Q  248 gttgagttttttagaaaaattagagtagtttgcatgtggttagggttgatctcaaaattgagaatttgatgattgcatgtgtagtttagaaattgataat 347  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  21998444 gttgatttttttaaaaaaattagagtagtttgtatgtggttagggttgattttaaaattgacaatttgatgattgcatgtgtagtttagtaattgataat 21998543  T
Q  348 tgaatgtagttgttgcctatgatgtttaaatcataatgtgggtttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacaccaagtg 447  Q
    ||||| || |||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  21998544 tgaatttatttgttgtctatgttgtttaaatcataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtg 21998643  T
Q  448 tttgataaaatgtctcaatgacaattttattgattatttagttagtttagttatggaaatgatagaaatgatgttaattatagtttggttaagt 541  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21998644 tttgataaaatgtctcaatgacaattttattgattatttagttagtttagttatggaaatgatagaaatgatgttaattatagtttggttaagt 21998737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 369; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 51 - 581
Target Start/End: Original strand, 45428647 - 45429178
Alignment:
Q  51 cggcagttaactaccgaggaaatctgaacttaaacagatcgcagaaccagaacctcccatttccaaaaaaccttcaaaattctcaatttctctcccattt 150  Q
    |||||||||||| |||| |||| ||| || ||| |||| |||||||||||||| || |||||||||||    |||||| ||  |||||||||||  || |    
T  45428647 cggcagttaactgccgaagaaaactggacataaccagaacgcagaaccagaacttctcatttccaaaaccttttcaaatttaacaatttctctcaaatct 45428746  T
Q  151 cctaccaaatccattt-cacgaattgcaagcaaatcaagtgcacattatcacaagtaagttgtgtcaatcattttaatgttaatgttaatttgtttaggt 249  Q
     || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45428747 tct-ccaaatccattttcacgaattgcaagcaaatcaagtgcacattatcacaagtaagttgtgtcaatcattttaatgttaatgttaatttgtttaggt 45428845  T
Q  250 tgagttttttagaaaa-attagagtagtttgcatgtggttagggttgatctcaaaattgagaatttgatgattgcatgtgtagtttagaaattgataatt 348  Q
    ||| ||||  | |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45428846 tgatttttaaaaaaaaaattagagtagtttgtatgtggttagggttgatttaaaaaatgacaatttgatgattgcatgtgtagtttagaaattgataatt 45428945  T
Q  349 gaatgtagttgttgcctatgatgtttaaatcataatgtgggtttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacaccaagtgt 448  Q
    |||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  45428946 gaatgtagttgttgcctacgtagtttaaatcataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgt 45429045  T
Q  449 ttgataaaatgtctcaatgacaattttattgattatttagttagtttagttatggaaatgatagaaatgatgttaattatagtttggttaagtgtatttt 548  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  45429046 ttgataaaatgtctcaatgacaattttattgattatttagttagtttagttatggaaatgatagaaatgatgttaattatagtttggttaagtgtatatt 45429145  T
Q  549 gattttttagttagtttaggttacgagaattat 581  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45429146 gattttttagttagtttaggttacgagaattat 45429178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 320; E-Value: 1e-180
Query Start/End: Original strand, 164 - 581
Target Start/End: Original strand, 39947769 - 39948188
Alignment:
Q  164 tttcacgaattgcaagcaaatcaagtgcacattatcacaagtaagttgtgtcaatcattttaatgttaatgttaatttgtttaggttgagtttttt-aga 262  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||| |||||| | |    
T  39947769 tttcacgaattgcaagcaaatcaacggcacattatcacaagtaagttgtgtcaatcattttaatcataatgttaatatgtttaggttgattttttttaaa 39947868  T
Q  263 aaaattagagtagtttgcatgtggttagggttgatctcaaaattgagaatttgatgattgcatgtgtagtttagaaattgataattgaatgtagttgttg 362  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||| |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  39947869 aaaattagagtagtttgtatgtggttagggttgattttaaaattgacaattcgatgattgcatgtgtagtttaggaattgataaatgaatgtagttgttg 39947968  T
Q  363 cctatgatgtttaaatcataatgtgggtttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacaccaagtgtttgataaaatgtct 462  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||    
T  39947969 cctatgttgtttaaatcataatgtggctttgaatggtggcaaaagaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgcct 39948068  T
Q  463 caatgacaattttattgattatttagttagttta-gttatggaaatgatagaaatgatgttaattatagtttggttaagtgtattttgattttttagtta 561  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  39948069 caatgacaattttattgattatttagttagtttaggttatggaaatgatataaatgatgttaattatagtttggttaagtgtatattgattttttagtta 39948168  T
Q  562 gtttaggttacgagaattat 581  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  39948169 gtttaggttacgagaattat 39948188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 305; E-Value: 1e-171
Query Start/End: Original strand, 30 - 581
Target Start/End: Complemental strand, 32956380 - 32955844
Alignment:
Q  30 gttaactgctgaggtaaatctcggcagttaactaccgaggaaatctgaacttaaacagatcgcagaaccagaacctcccatttccaaaaaaccttcaaaa 129  Q
    ||||||||| |||| ||||||||| ||| |||| ||||||||||||| |||||| ||  ||||||||||||||| ||||||||||||||    |||||||    
T  32956380 gttaactgccgaggaaaatctcggtagtcaactgccgaggaaatctggacttaatcat-tcgcagaaccagaacttcccatttccaaaactttttcaaaa 32956282  T
Q  130 ttctcaatttctctcccatttcctaccaaatccattt-cacgaattgcaagcaaatcaagtgcacattatcacaagtaagttgtgtcaatcattttaatg 228  Q
    |||  |||||||||              ||||||||| ||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  32956281 ttcagaatttctctag------------aatccattttcacaaatagcaagcaaatcaactgcacattatcacaagtaagttgtgccaatcattttaatg 32956194  T
Q  229 ttaatgttaatttgtttaggttgagttttttagaaaaa-ttagagtagtttgcatgtggttagggttgatctcaaaattgagaatttgatgattgcatgt 327  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||    
T  32956193 ttaatgttaatttgtttaggttgatttttttaaaaaaaattagagtagtttgtatgtggtttgggttgattttaaaattgacaatttgatgattgcatgt 32956094  T
Q  328 gtagtttagaaattgataattgaatgtagttgttgcctatgatgtttaaatcataatgtgggtttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttt 427  Q
    ||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32956093 gtagtttaggaattgataaatgaatgtacttgttgcctatgttgtttaaattataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttt 32955994  T
Q  428 tatactttgcacaccaagtgtttgataaaatgtctcaatgacaattttattgattatttagttagttta-gttatggaaatgatagaaatgatgttaatt 526  Q
    |||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32955993 tatactttgcacgcaaagtgtttgataaaatgcctcaatgacaat----ttgattatttagttagtttaggttatggaaatgatagaaatgatgttaatt 32955898  T
Q  527 atagtttggttaagtgtattttgattttttagttagtttaggttacgagaattat 581  Q
    ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32955897 atagtttgg-taagtgtatattgattttttagttagtttaggttacgagaattat 32955844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 243; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 54 - 446
Target Start/End: Original strand, 7185089 - 7185481
Alignment:
Q  54 cagttaactaccgaggaaatctgaacttaaacagatcgcagaaccagaacctcccatttccaaaaaaccttcaaaattctcaatttctctcccatttcct 153  Q
    |||| |||| ||||||||||||| |||||| ||  ||||||||||||||| |||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||| || | |     
T  7185089 cagtaaactgccgaggaaatctggacttaatcat-tcgcagaaccagaacttcccatttccaaaacaatttcaaaattctcaatttctctccaatcttc- 7185186  T
Q  154 accaaatccattt-cacgaattgcaagcaaatcaagtgcacattatcacaagtaagttgtgtcaatcattttaatgttaatgttaatttgtttaggttga 252  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  7185187 accaaatccattttcacgaattgcaagcaaatcaagtgcgcattatcacaagtaagttgtgtcaataattttaatgttaatgttgatttgtttaggttga 7185286  T
Q  253 gttttttagaaaaat-tagagtagtttgcatgtggttagggttgatctcaaaattgagaatttgatgattgcatgtgtagtttagaaattgataattgaa 351  Q
     ||||  | |||||  |||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||    
T  7185287 tttttaaaaaaaaaaatagagtagtttgtatgtggttagggttgattttaaaattgacaatttgatgattgcatgtgttgtttaggaattgataaatgaa 7185386  T
Q  352 tgtagttgttgcctatgatgtttaaatcataatgtgggtttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacaccaagt 446  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  7185387 tgtagttgttgcctatgttgtttaaatcataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagt 7185481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 220; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 30 - 482
Target Start/End: Original strand, 25964847 - 25965308
Alignment:
Q  30 gttaactgctgaggtaaatctcggcagttaactaccgaggaaatctgaacttaaacagatcgcagaaccagaacc--tcccatttccaaaaaaccttcaa 127  Q
    ||||||||| |||| ||| ||||| ||||||   ||||| |||||||||| ||| |||| ||||||| ||||| |  | |||||| |||||   ||  ||    
T  25964847 gttaactgccgaggaaaacctcggtagttaatagccgagaaaatctgaacataatcaga-cgcagaaacagaaacattaccattttcaaaacttctaaaa 25964945  T
Q  128 aattctcaatttctctcccatttcctaccaaatccattt-cacgaattgcaagcaaatcaagtgcacattatcacaagtaagttgtgtcaatcattttaa 226  Q
    |||||||||||||||||| || | | |||||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  25964946 aattctcaatttctctccaatcttc-accaaagccattttcacgaattgcaagcaaatcaactgcacattatcacaagtaagttgtatcaatcattttaa 25965044  T
Q  227 tgttaatgttaatttgtttaggttgagttttttagaaaaat--------tagagtagtttgcatgtggttagggttgatctcaaaattgagaatttgatg 318  Q
    |  |||||||| |||||||||||| | |||   | ||||||        |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||    
T  25965045 tcataatgttagtttgtttaggtttattttaaaaaaaaaataaaaaaaatagagtagtttgcatgtggttagggttgattttaaaattgacaatttgatg 25965144  T
Q  319 attgcatgtgtagtttagaaattgataattgaatgtagttgttgcctatgatgtttaaatcataatgtgggtttgaatggtggcaaatgaacacaatttg 418  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  25965145 attgcatgtgtagtttaggaattgataaatgaatgtagttgtttcctatgttgtttaaatcataatgtggctttgaatgttggcaaatgaacacaatttg 25965244  T
Q  419 aatatgttttatactttgcacaccaagtgtttgataaaatgtctcaatgacaattttattgatt 482  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  25965245 aatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgtctcaatgataattttattgatt 25965308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 151; E-Value: 1e-79
Query Start/End: Original strand, 107 - 388
Target Start/End: Complemental strand, 45137392 - 45137111
Alignment:
Q  107 ccatttccaaaaaaccttcaaaattctcaatttctctcccatttcctaccaaatccattt-cacgaattgcaagcaaatcaagtgcacattatcacaagt 205  Q
    ||||||||||||   || |||||||| |||||||||||| || | | |||||| |||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  45137392 ccatttccaaaatttctccaaaattcacaatttctctccaatcttc-accaaagccattttcacaaattgcaagcaaatcaactgcacattatcacaagt 45137294  T
Q  206 aagttgtgtcaatcattttaatgttaatgttaatttgtttaggttgagttttttagaaaaattagagtagtttgcatgtggttagggttgatctcaaaat 305  Q
    ||||||| ||||||||||||||| || ||||| |||||||||||| | ||||  | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||    
T  45137293 aagttgtatcaatcattttaatgatagtgttagtttgtttaggtttatttttaaaaaaaaattagagtagtttgcatgtggttaaggttgattttaaaat 45137194  T
Q  306 tgagaatttgatgattgcatgtgtagtttagaaattgataattgaatgtagttgttgcctatgatgtttaaatcataatgtgg 388  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||    
T  45137193 tgacaatttgatgattgcatgtgtagtttaggaattgataaatgaatgtagttcttgcctatgttatttaaatcataatgtgg 45137111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 124; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 49 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 42505780 - 42505582
Alignment:
Q  49 ctcggcagttaactaccgaggaaatctgaacttaaacagatcgcagaaccagaacctcccatttccaaaaaacc-ttcaaaattctcaatttctctccca 147  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||||| || ||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||| |||| |||||||| |    
T  42505780 ctcggtagttaactgccgaggaaatctggacataaccagaacgcagaaccagaacctcccatttacaaaaaaacattcaaaattttcaaattctctccaa 42505681  T
Q  148 tttcctaccaaatccattt-cacgaattgcaagcaaatcaagtgcacattatcacaagtaagttgtgtcaatcattttaatgttaatgttaatttgttta 246  Q
    | | | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42505680 tcttc-accaaatccattttcacgaattgcaagcaaatcaagtgcacattatcacaagtaagttgtgtcaatcattttaatgttaatgttaatttgttta 42505582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 110; E-Value: 4e-55
Query Start/End: Original strand, 403 - 581
Target Start/End: Complemental strand, 45136956 - 45136788
Alignment:
Q  403 aaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacaccaagtgtttgataaaatgtctcaatgacaattttattgattatttagttagtttag-ttat 501  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||           |||||||| ||||    
T  45136956 aaatgaacacaatttaaatatattttatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgcctcaatgacaattttatt-----------tagtttaggttat 45136868  T
Q  502 ggaaatgatagaaatgatgttaattatagtttggttaagtgtattttgattttttagttagtttaggttacgagaattat 581  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45136867 ggaaatgatagaaatgatgttaattatagtttggttaaatgtatattgattttttagttagtttaggttacgagaattat 45136788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 103; E-Value: 6e-51
Query Start/End: Original strand, 463 - 581
Target Start/End: Original strand, 22686849 - 22686966
Alignment:
Q  463 caatgacaattttattgattatttagttagtttagttatggaaatgatagaaatgatgttaattatagtttggttaagtgtattttgattttttagttag 562  Q
    |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22686849 caatgacaattt-agtgattatttagttagtttagttatggaaatggtagaaatgatgttaattatagtttggttaagtgtattttgattttttagttag 22686947  T
Q  563 tttaggttacgagaattat 581  Q
    |||||||||||||||||||    
T  22686948 tttaggttacgagaattat 22686966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 380 - 510
Target Start/End: Complemental strand, 29401291 - 29401160
Alignment:
Q  380 ataatgtgggtttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacaccaagtgtttgataaaatgtctcaatgacaattttattg 479  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  29401291 ataatgtggttttgaatggtggcaaaagaacacattttgagtatgtttgatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgcctcaatgacaattttattg 29401192  T
Q  480 attatttagttagtttag-ttatggaaatgat 510  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  29401191 attatttagttagtttagcttatggatatgat 29401160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 380 - 497
Target Start/End: Original strand, 20938282 - 20938399
Alignment:
Q  380 ataatgtgggtttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacaccaagtgtttgataaaatgtctcaatgacaattttattg 479  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  20938282 ataatgtggttttgaatggtggcaaaagaacacattttgagtatgtttgatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgtgtcaatgacaattttattg 20938381  T
Q  480 attatttagttagtttag 497  Q
    ||||||||||||||||||    
T  20938382 attatttagttagtttag 20938399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 86; E-Value: 8e-41
Query Start/End: Original strand, 191 - 510
Target Start/End: Complemental strand, 25515684 - 25515366
Alignment:
Q  191 cacattatcacaagtaagttgtgtcaatcattttaatgttaatgttaatttgtttaggttgagttttttagaaaaattagagtagtttgcatgtggttag 290  Q
    |||||||||||||||||||    | ||||| | |||| ||||||||| ||||||| |||| ||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  25515684 cacattatcacaagtaagtaacattaatcaatgtaatcttaatgttagtttgtttgggttaagtttttttaaaaaatt-gagtagtttgcatgtggttag 25515586  T
Q  291 ggttgatctcaaaattgagaatttgatgattgcatgtgtagtttagaaattga---taattgaatgtagttgttgcct--atgatgtttaaatcataatg 385  Q
    ||||||| |   |||||| | ||||||||||||||||  |||||| || ||||   || |||  | |||||| ||  |  ||||||||  | | ||||||    
T  25515585 ggttgatgtaggaattgaaattttgatgattgcatgt--agtttataa-ttgaatgtagttgctt-tagttgatgtttgaatgatgttagagt-ataatg 25515491  T
Q  386 tgggtttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacaccaagtgtttgataaaatgtctcaatgacaattttattgattatt 485  Q
    ||| |||||||||||||||| || ||| |||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||    
T  25515490 tggttttgaatggtggcaaa-gagcacgatttgagtatgtttgatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgcctcaatgagaattatattgattatt 25515392  T
Q  486 tagttagttta-gttatggaaatgat 510  Q
     |||||||||| ||||||||||||||    
T  25515391 gagttagtttaggttatggaaatgat 25515366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 86; E-Value: 8e-41
Query Start/End: Original strand, 380 - 497
Target Start/End: Original strand, 45284558 - 45284675
Alignment:
Q  380 ataatgtgggtttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacaccaagtgtttgataaaatgtctcaatgacaattttattg 479  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||| | ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  45284558 ataatgtggttttgaatggtggcaaaagaacacattttaagtatgtttgatactttgcacacaaagtgtttgataaaatggctcaatgacaattttattg 45284657  T
Q  480 attatttagttagtttag 497  Q
    ||||||||||||||||||    
T  45284658 attatttagttagtttag 45284675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 86; E-Value: 8e-41
Query Start/End: Original strand, 380 - 497
Target Start/End: Original strand, 45291921 - 45292038
Alignment:
Q  380 ataatgtgggtttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacaccaagtgtttgataaaatgtctcaatgacaattttattg 479  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||| | ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  45291921 ataatgtggttttgaatggtggcaaaagaacacattttaagtatgtttgatactttgcacacaaagtgtttgataaaatggctcaatgacaattttattg 45292020  T
Q  480 attatttagttagtttag 497  Q
    ||||||||||||||||||    
T  45292021 attatttagttagtttag 45292038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 380 - 510
Target Start/End: Complemental strand, 10828712 - 10828581
Alignment:
Q  380 ataatgtgggtttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacaccaagtgtttgataaaatgtctcaatgacaattttattg 479  Q
    ||||||||| ||||||| |||||||| |||| || ||||| ||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10828712 ataatgtggttttgaattgtggcaaaagaacgcattttgagtatgtttgatactttggacacaaagtgtttgataaaatgtctcaatgacaattttattg 10828613  T
Q  480 attatttagttagttta-gttatggaaatgat 510  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  10828612 attatttagttagtttaggttatggatatgat 10828581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 380 - 510
Target Start/End: Complemental strand, 36656037 - 36655906
Alignment:
Q  380 ataatgtgggtttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacaccaagtgtttgataaaatgtctcaatgacaattttattg 479  Q
    ||||||||| ||| |||||||||||| ||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  36656037 ataatgtggttttcaatggtggcaaaagaacacattttgagtatgtttgatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgtctcaatgaacattttattg 36655938  T
Q  480 attatttagttagttta-gttatggaaatgat 510  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  36655937 attatttagttagtttaggttatggatatgat 36655906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 380 - 497
Target Start/End: Complemental strand, 3940416 - 3940299
Alignment:
Q  380 ataatgtgggtttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacaccaagtgtttgataaaatgtctcaatgacaattttattg 479  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||  |||||| ||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  3940416 ataatgtggttttgattggtggcaaaataacacattttgagtatgtttgatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgtgtcaatgacaattttattg 3940317  T
Q  480 attatttagttagtttag 497  Q
    ||||||||||||||||||    
T  3940316 attatttagttagtttag 3940299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 380 - 497
Target Start/End: Original strand, 5352351 - 5352468
Alignment:
Q  380 ataatgtgggtttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacaccaagtgtttgataaaatgtctcaatgacaattttattg 479  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||  |||||| ||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  5352351 ataatgtggttttgattggtggcaaaataacacattttgagtatgtttgatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgtgtcaatgacaattttattg 5352450  T
Q  480 attatttagttagtttag 497  Q
    ||||||||||||||||||    
T  5352451 attatttagttagtttag 5352468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 380 - 497
Target Start/End: Original strand, 15831514 - 15831631
Alignment:
Q  380 ataatgtgggtttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacaccaagtgtttgataaaatgtctcaatgacaattttattg 479  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||  |||||| ||||| ||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  15831514 ataatgtggttttgaatggtggcaaaataacacattttgagtatgtttgatactttgcacacaaagtctttgataaaatgtgtcaatgacaattttattg 15831613  T
Q  480 attatttagttagtttag 497  Q
    ||||||||||||||||||    
T  15831614 attatttagttagtttag 15831631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 380 - 497
Target Start/End: Complemental strand, 30496634 - 30496517
Alignment:
Q  380 ataatgtgggtttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacaccaagtgtttgataaaatgtctcaatgacaattttattg 479  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||  |||||| ||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  30496634 ataatgtggttttgattggtggcaaaataacacattttgagtatgtttgatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgtgtcaatgacaattttattg 30496535  T
Q  480 attatttagttagtttag 497  Q
    ||||||||||||||||||    
T  30496534 attatttagttagtttag 30496517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 380 - 497
Target Start/End: Original strand, 43978906 - 43979023
Alignment:
Q  380 ataatgtgggtttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacaccaagtgtttgataaaatgtctcaatgacaattttattg 479  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||  |||||| ||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  43978906 ataatgtggttttgattggtggcaaaataacacattttgagtatgtttgatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgtgtcaatgacaattttattg 43979005  T
Q  480 attatttagttagtttag 497  Q
    ||||||||||||||||||    
T  43979006 attatttagttagtttag 43979023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 380 - 497
Target Start/End: Complemental strand, 43539425 - 43539308
Alignment:
Q  380 ataatgtgggtttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacaccaagtgtttgataaaatgtctcaatgacaattttattg 479  Q
    ||||| ||| ||||| ||||||||||  |||||| ||||| ||||||| ||||||||||||| | || ||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  43539425 ataatatggttttgattggtggcaaaataacacattttgagtatgtttgatactttgcacacaatgtttttgataaaatgtgtcaatgacaattttattg 43539326  T
Q  480 attatttagttagtttag 497  Q
    ||||||||||||||||||    
T  43539325 attatttagttagtttag 43539308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 30 - 86
Target Start/End: Original strand, 30493395 - 30493451
Alignment:
Q  30 gttaactgctgaggtaaatctcggcagttaactaccgaggaaatctgaacttaaaca 86  Q
    ||||||||| |||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  30493395 gttaactgccgaggaaaatctcggtagttaactgccgaggaaatctgaacttaaaca 30493451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 30 - 86
Target Start/End: Original strand, 43536138 - 43536194
Alignment:
Q  30 gttaactgctgaggtaaatctcggcagttaactaccgaggaaatctgaacttaaaca 86  Q
    ||||||||| |||| ||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  43536138 gttaactgccgaggaaaacctcggtagttaactgccgaggaaatctgaacttaaaca 43536194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 30 - 86
Target Start/End: Complemental strand, 44100835 - 44100779
Alignment:
Q  30 gttaactgctgaggtaaatctcggcagttaactaccgaggaaatctgaacttaaaca 86  Q
    ||||||||| |||| ||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  44100835 gttaactgccgaggaaaacctcggtagttaactaccgaggaaatatgaacttaaaca 44100779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 273 - 362
Target Start/End: Original strand, 31367308 - 31367397
Alignment:
Q  273 tagtttgcatgtggttagggttgatctcaaaattgagaatttgatgattgcatgtgtagtttagaaattgataattgaatgtagttgttg 362  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |   |||||| | |||||||||||||| | |||||||  |||| |||| ||||| || ||||||    
T  31367308 tagtttgcatgtggttagggttgatgtaggaattgatattttgatgattgcatatatagtttatgaatttataaatgaatttatttgttg 31367397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 273 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 35464398 - 35464313
Alignment:
Q  273 tagtttgcatgtggttagggttgatctcaaaattgagaatttgatgattgcatgtgtagtttagaaattgataattgaatgtagtt 358  Q
    ||||||||||||||||||| || || |   |||||| | | ||||||||||||||||||||||  |||| |||| |||||||||||    
T  35464398 tagtttgcatgtggttaggatttatgtatgaattgacattctgatgattgcatgtgtagtttatgaatttataaatgaatgtagtt 35464313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 49 - 96
Target Start/End: Complemental strand, 30496967 - 30496920
Alignment:
Q  49 ctcggcagttaactaccgaggaaatctgaacttaaacagatcgcagaa 96  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||| |||||||    
T  30496967 ctcggcagttaactaccgaggaaaactgaacataaccagaacgcagaa 30496920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 30 - 72
Target Start/End: Original strand, 14456538 - 14456580
Alignment:
Q  30 gttaactgctgaggtaaatctcggcagttaactaccgaggaaa 72  Q
    ||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  14456538 gttaactgccgaggaaaacctcggcagttaactaccgaggaaa 14456580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 17 - 70
Target Start/End: Complemental strand, 31974297 - 31974244
Alignment:
Q  17 gaaatcggttgctgttaactgctgaggtaaatctcggcagttaactaccgagga 70  Q
    |||||||| ||| ||||||| | |||| |||||||||||||||||| |||||||    
T  31974297 gaaatcggctgcagttaactaccgaggaaaatctcggcagttaactgccgagga 31974244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 30 - 78
Target Start/End: Original strand, 29947803 - 29947851
Alignment:
Q  30 gttaactgctgaggtaaatctcggcagttaactaccgaggaaatctgaa 78  Q
    |||||| ||||||| |||  ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  29947803 gttaaccgctgaggaaaacttcggcagttaactaccgaggaaaactgaa 29947851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 449; Significance: 0; HSPs: 43)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 449; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 30 - 581
Target Start/End: Complemental strand, 40358317 - 40357766
Alignment:
Q  30 gttaactgctgaggtaaatctcggcagttaactaccgaggaaatctgaacttaaacagatcgcagaaccagaacctcccatttccaaaaaaccttcaaaa 129  Q
    ||||||||| |||| ||| ||||| |||||||| |||||||||||||||| ||| |||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  40358317 gttaactgccgaggaaaacctcggtagttaactgccgaggaaatctgaacataaccagaacgcagaatcaaaacctcccatttccaaaaaaccttcaaaa 40358218  T
Q  130 ttctcaatttctctcccatttcctaccaaatccattt-cacgaattgcaagcaaatcaagtgcacattatcacaagtaagttgtgtcaatcattttaatg 228  Q
    |||||||||||||||| || | | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40358217 ttctcaatttctctccaatcttc-accaaatccattttcacgaattgcaagcaaatcaagtgcacattatcacaagtaagttgtgtcaatcattttaatg 40358119  T
Q  229 ttaatgttaatttgtttaggttgagttttttagaaaaattagagtagtttgcatgtggttagggttgatctcaaaattgagaatttgatgattgcatgtg 328  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40358118 ttaatgttaatttgtttaggttgattttttaaaaaaaattagagtagtttgtatgtggttagggttgatttcaaaattgagaatttgatgattgcatgtg 40358019  T
Q  329 tagtttagaaattgataattgaatgtagttgttgcctatgatgtttaaatcataatgtgggtttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgtttt 428  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  40358018 tagtttagaaattgataattgaatgtagttgttgcctatgttgtttaaatcataatgtggatttgaatggtggcaaatgaacacagtttgaatatgtttt 40357919  T
Q  429 atactttgcacaccaagtgtttgataaaatgtctcaatgacaattttattgattatttagttagtttagttatggaaatgatagaaatgatgttaattat 528  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40357918 atactttgcacaccaagtgtttgataaaatgtctcaatgacaattttattgattatttagttagtttagttatggaaatgatagaaatgatgttaattat 40357819  T
Q  529 agtttggttaagtgtattttgattttttagttagtttaggttacgagaattat 581  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  40357818 agtttggttaagtgtattttgattttttagttagtttaagttacgagaattat 40357766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 409; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 30 - 581
Target Start/End: Complemental strand, 21022925 - 21022374
Alignment:
Q  30 gttaactgctgaggtaaatctcggcagttaactaccgaggaaatctgaacttaaacagatcgcagaaccagaacctcccatttccaaaaaaccttcaaaa 129  Q
    ||||||||| |||| ||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||| || |||| |||| ||||||||| |||||||||||||| |  ||| |||    
T  21022925 gttaactgccgaggaaaacctcggtagttaactgccgaggaaatctgaactaaaccagaacgcaaaaccagaacttcccatttccaaaacaatttctaaa 21022826  T
Q  130 ttctcaatttctctcccatttcctaccaaatccattt-cacgaattgcaagcaaatcaagtgcacattatcacaagtaagttgtgtcaatcattttaatg 228  Q
    ||||||||| |||||| || | | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21022825 ttctcaattgctctccaatcttc-accaaatccattttcacgaattgcaagcaaatcaagtgcacattatcacaagtaagttgtgtcaatcattttaatg 21022727  T
Q  229 ttaatgttaatttgtttaggttgagttttttagaaaaattagagtagtttgcatgtggttagggttgatctcaaaattgagaatttgatgattgcatgtg 328  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||| | |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  21022726 ttaatgttaatttgtttaggttgattttttttaaaaaaattgagtagtttgtatgtggttagggttgatttcaaaattgacaatttgatgattgcatgtg 21022627  T
Q  329 tagtttagaaattgataattgaatgtagttgttgcctatgatgtttaaatcataatgtgggtttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgtttt 428  Q
    |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21022626 tagtttaggaattgataaatgaatgtagttgttgcctatgttgtttaaatcataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgtttt 21022527  T
Q  429 atactttgcacaccaagtgtttgataaaatgtctcaatgacaattttattgattatttagttagtttagttatggaaatgatagaaatgatgttaattat 528  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21022526 atactttgcacacaaagtgtttgataaaatgtctcaatgacaattttattgattatttagttagtttagttatggaaatgatagaaatgatgttaattat 21022427  T
Q  529 agtttggttaagtgtattttgattttttagttagtttaggttacgagaattat 581  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21022426 agtttggttaagtgtatattgattttttagttagtttaggttacgagaattat 21022374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 356; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 53 - 581
Target Start/End: Original strand, 50274793 - 50275322
Alignment:
Q  53 gcagttaactaccgaggaaatctgaacttaaacagatcgcagaaccagaacctc-ccatttccaaaaaaccttcaaaattctcaatttctctcccatttc 151  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| ||| || | ||||||||||||||||  |||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||| || |     
T  50274793 gcagttaactgccgaggaaatctgaacataatcata-cgcagaaccagaacctttccatttccaaaacatcttcaaaattcacaatttctctccaatctt 50274891  T
Q  152 ctaccaaatccattt-cacgaattgcaagcaaatcaagtgcacattatcacaagtaagttgtgtcaatcattttaatgttaatgttaatttgtttaggtt 250  Q
    | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  50274892 c-accaaatccattttcacgaattgcaagcaaatcaactgcacattatcacaagtaagttgtgtcaatcattttaatgataatgttaatttgtttaggtt 50274990  T
Q  251 gagttttttagaaaaattagagtagtttgcatgtggttagggttgatctcaaaattgagaatttgatgattgcatgtgtagtttagaaattgataattga 350  Q
     | ||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||    
T  50274991 aatttttaaaaaaaaattagagtagtttgcatgtggttagggttaattttaaaattgacaatttgatgattgcatgtgtagtttaggaattgataaatga 50275090  T
Q  351 atgtagttgttgcctatgatgtttaaatcataatgtgggtttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacaccaagtgttt 450  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  50275091 atgtagttgttgcctatgttgtttaaatcagaatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatgctttgcacacaaagtgttt 50275190  T
Q  451 gataaaatgtctcaatgacaattttattgattatttagttagttta-gttatggaaatgatagaaatgatgttaattatagtttggttaagtgtattttg 549  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||    
T  50275191 gataaaatgcctcaatgacaattttattgattatgtagttagtttaggttatggaaatgatagaaatgatgttaattatagtttggttaaatgtatattg 50275290  T
Q  550 attttttagttagtttaggttacgagaattat 581  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  50275291 attttttagttagtgtaggttacgagaattat 50275322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 345; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 30 - 572
Target Start/End: Complemental strand, 30726778 - 30726236
Alignment:
Q  30 gttaactgctgaggtaaatctcggcagttaactaccgaggaaatctgaacttaaacagatcgcagaaccagaacctcccatttccaaaaaacc-ttcaaa 128  Q
    ||||||||| |||| ||| ||||| |||||||| ||||||||||||| || |||  ||| |||||||||| |||||||||||| ||||||| | ||||||    
T  30726778 gttaactgccgaggaaaacctcggtagttaactgccgaggaaatctggacataactagaacgcagaaccacaacctcccatttacaaaaaaacattcaaa 30726679  T
Q  129 attctcaatttctctcccatttcctaccaaatccattt-cacgaattgcaagcaaatcaagtgcacattatcacaagtaagttgtgtcaatcattttaat 227  Q
    ||||||||||||||||| || | | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30726678 attctcaatttctctccaatcttc-accaaatccattttcacgaattgcaagcaaatcaagtgcacattatcacaagtaagttgtgtcaatcattttaat 30726580  T
Q  228 gttaatgttaatttgtttaggttgagttttttagaaaaattagagtagtttgcatgtggttagggttgatctcaaaattgagaatttgatgattgcatgt 327  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||||||| | ||||||| ||||||||||||| |||||||| || ||     |||||| ||||| || |||||| ||    
T  30726579 gttaatgttaatttgtttatgttaagtttttaaaaaaaatt-gagtagtttgcatttggttaggttttataaatgaattgacaatttcatcattgcacgt 30726481  T
Q  328 gtagtttagaaattgataattgaatgtagttgttgcctatgatgtttaaatcataatgtgggtttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttt 427  Q
    ||||||||   |||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30726480 gtagtttatgtattgataaatgaatgtagttgttgcctatgtagtttaaatcataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttt 30726381  T
Q  428 tatactttgcacaccaagtgtttgataaaatgtctcaatgacaattttattgattatttagttagtttagttatggaaatgatagaaatgatgttaatta 527  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30726380 tatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgtctcaatgacaattttattgattatttagttagtttagttatggaaatgatagaaatgatgttaatta 30726281  T
Q  528 tagtttggttaagtgtattttgattttttagttagtttaggttac 572  Q
    || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30726280 tactttggttaagtttattttgattttttagttagtttaggttac 30726236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 342; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 49 - 572
Target Start/End: Complemental strand, 1309132 - 1308609
Alignment:
Q  49 ctcggcagttaactaccgaggaaatctgaacttaaacagatcgcagaaccagaacctcccatttccaaaaaacc-ttcaaaattctcaatttctctccca 147  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||||| || ||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||| |||||||| |    
T  1309132 ctcggtagttaactgccgaggaaatctggacataaccagaacgcagaaccagaacctcccatttacaaaaaaacattcaaaattctcaaattctctccaa 1309033  T
Q  148 tttcctaccaaatccattt-cacgaattgcaagcaaatcaagtgcacattatcacaagtaagttgtgtcaatcattttaatgttaatgttaatttgttta 246  Q
    | | | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1309032 tcttc-accaaatccattttcacgaattgcaagcaaatcaagtgcacattatcacaagtaagttgtgtcaatcattttaatgttaatgttaatttgttta 1308934  T
Q  247 ggttgagttttttagaaaaattagagtagtttgcatgtggttagggttgatctcaaaattgagaatttgatgattgcatgtgtagtttagaaattgataa 346  Q
     ||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| || ||     |||||| ||||| || |||||||||||||||||   ||||||||    
T  1308933 tgttaagttttttaaaaaaatt-gagtagtttgcatgtggttaggttttataaatgaattgacaatttcatcattgcatgtgtagtttatgtattgataa 1308835  T
Q  347 ttgaatgtagttgttgcctatgatgtttaaatcataatgtgggtttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacaccaagt 446  Q
     ||||||||| |||||| ||||  |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  1308834 atgaatgtagatgttgcatatgtagtttaaattataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagt 1308735  T
Q  447 gtttgataaaatgtctcaatgacaattttattgattatttagttagtttagttatggaaatgatagaaatgatgttaattatagtttggttaagtgtatt 546  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  1308734 gttcgataaaatgtctcaatgacaattttattgattatttagttagtttagttatggaaatgatagaaatgatgttaattatagtttggttaagtttatt 1308635  T
Q  547 ttgattttttagttagtttaggttac 572  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  1308634 ttgattttttagttagtttaggttac 1308609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 337; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 30 - 572
Target Start/End: Complemental strand, 1089621 - 1089079
Alignment:
Q  30 gttaactgctgaggtaaatctcggcagttaactaccgaggaaatctgaacttaaacagatcgcagaaccagaacctcccatttccaaaaaacc-ttcaaa 128  Q
    ||||| ||| |||| ||| ||||| |||||||| ||||||||||||| || ||| ||||  | |||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||    
T  1089621 gttaaatgccgaggaaaacctcggtagttaactgccgaggaaatctggacataaccagaatgtagaaccagaacctcccatttacaaaaaaacattcaaa 1089522  T
Q  129 attctcaatttctctcccatttcctaccaaatccattt-cacgaattgcaagcaaatcaagtgcacattatcacaagtaagttgtgtcaatcattttaat 227  Q
    ||||||||||||||||| || | | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1089521 attctcaatttctctccaatcttc-accaaatccattttcacgaattgcaagcaaatcaagtgcacattatcacaagtaagttgtgtcaatcattttaat 1089423  T
Q  228 gttaatgttaatttgtttaggttgagttttttagaaaaattagagtagtttgcatgtggttagggttgatctcaaaattgagaatttgatgattgcatgt 327  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||| || ||     |||||| ||||| || |||||| ||    
T  1089422 gttaatgttaatttgtttatgttaagtttttttaaaaaatt-gagtagtttgcatgtggttaggttttataaatgaattgacaatttcatcattgcaagt 1089324  T
Q  328 gtagtttagaaattgataattgaatgtagttgttgcctatgatgtttaaatcataatgtgggtttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttt 427  Q
    ||||||||   |||||||| ||||||||| |||||| ||||  |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1089323 gtagtttatgtattgataaatgaatgtagatgttgcatatgtagtttaaataataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttt 1089224  T
Q  428 tatactttgcacaccaagtgtttgataaaatgtctcaatgacaattttattgattatttagttagtttagttatggaaatgatagaaatgatgttaatta 527  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1089223 tatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgtctcaatgacaattttattgattatttagttagtttagttatggaaatgatagaaatgatgttaatta 1089124  T
Q  528 tagtttggttaagtgtattttgattttttagttagtttaggttac 572  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1089123 tagtttggttaagtttattttgattttttagttagtttaggttac 1089079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 294; E-Value: 1e-165
Query Start/End: Original strand, 164 - 581
Target Start/End: Original strand, 51683370 - 51683790
Alignment:
Q  164 tttcacgaattgcaagcaaatcaagtgcacattatcacaagtaagttgtgtcaatcattttaatgttaatgttaatttgtttaggttgagtttt--ttag 261  Q
    |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| | ||||    |     
T  51683370 tttcacgaattgcaagcaaatcaactacacattatcacaagtaagttatatcaatcattttaatgataatgttagtttgtttaggtttatttttaaaaaa 51683469  T
Q  262 aaaaattagagtagtttgcatgtggttagggttgatctcaaaattgagaatttgatgattgcatgtgtagtttagaaattgataattgaatgtagttgtt 361  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||| ||||||||||||||    
T  51683470 aaaaattagagtagtttgcatgtggttagggttgattttaaaattgacaatttgatgattgcatgtgtattttatgaattgataaatgaatgtagttgtt 51683569  T
Q  362 gcctatgatgtttaaatcataatgtgggtttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacaccaagtgtttgataaaatgtc 461  Q
    | ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |    
T  51683570 gtctatgttgtttaaatcataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgatcaaatgcc 51683669  T
Q  462 tcaatgacaattttattgattatttagttagttta-gttatggaaatgatagaaatgatgttaattatagtttggttaagtgtattttgattttttagtt 560  Q
    ||||||| |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  51683670 tcaatgaaaattatattgattatttagttagtttaggttatggaaatgatagaaatgatgttaattatagtttggttaagtgtatattgattttttagtt 51683769  T
Q  561 agtttaggttacgagaattat 581  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  51683770 agtttaggttacgagaattat 51683790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 290; E-Value: 1e-162
Query Start/End: Original strand, 154 - 581
Target Start/End: Original strand, 50901640 - 50902067
Alignment:
Q  154 accaaatccatttcac-gaattgcaagcaaatcaagtgcacattatcacaagtaagttgtgtcaatcattttaatgttaatgttaatttgtttaggttga 252  Q
    ||||||||||||||   ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| |    
T  50901640 accaaatccatttccgtgaattgcaagcaaatcaatcgcacattatcacaagtaagttgcatcaatcattttaatgataatgttagtttgtttaggttta 50901739  T
Q  253 gttttttagaaaaattagagtagtttgcatgtggttagggttgatctcaaaattgagaatttgatgattgcatgtgtagtttagaaattgataattgaat 352  Q
     ||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  50901740 -tttttaaaaaaaattagagtagtttacatgtggttagggttgattttaaaattgacaatttgatgattgcatgtgtagtttaggaattgataaatgaat 50901838  T
Q  353 gtagttgttgcctatgatgtttaaatcataatgtgggtttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacaccaagtgtttga 452  Q
    |||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  50901839 gtagttgttgtctatgttgtttaattcataatgtggctttgaatggtgttaaatgaacacaatttgaatatgttttatattttgcacacaaagtgtttga 50901938  T
Q  453 taaaatgtctcaatgacaattttattgattatttagttagttt-agttatggaaatgatagaaatgatgttaattatagtttggttaagtgtattttgat 551  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  50901939 taaaatgtttcaatgacaattttattgatt-tttagttagtttaagttatggaaatgatagaaatgatgttaattatagtttggttaagtgtatattgat 50902037  T
Q  552 tttttagttagtttaggttacgagaattat 581  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50902038 tttttagttagtttaggttacgagaattat 50902067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 289; E-Value: 1e-162
Query Start/End: Original strand, 126 - 581
Target Start/End: Complemental strand, 55407732 - 55407272
Alignment:
Q  126 aaaattctcaatttctctcccatttcctaccaaatccattt-cacgaattgcaagcaaatcaagtgcacattatcacaagtaagttgtgtcaatcatttt 224  Q
    |||||||||||||||||||| || | | |||||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  55407732 aaaattctcaatttctctccaatcttc-accaaaaccattttcacgaattgcaagcaaatcaactgcacattatcacaagtaagttgtatcaatcatttt 55407634  T
Q  225 aatgttaatgttaatttgtttaggttgagttttttagaaaaa----ttagagtagtttgcatgtggttagggttgatctcaaaattgagaatttgatgat 320  Q
    |||| |||||||| |||||||||||| | |||   | |||||    ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||    
T  55407633 aatgataatgttagtttgtttaggtttattttaaaaaaaaaaaaaattagagtagtttgcatgtggttagggttgattttaaaattgacaatttgatgat 55407534  T
Q  321 tgcatgtgtagtttagaaattgataattgaatgtagttgttgcctatgatgtttaaatcataatgtgggtttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaa 420  Q
    |||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  55407533 tgcatgtgtagtttatgaattgataaatgaatgtagttgttgcctatgttgttaaaatcataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaa 55407434  T
Q  421 tatgttttatactttgcacaccaagtgtttgataaaatgtctcaatgacaattttattgattatttagttagttta-gttatggaaatgatagaaatgat 519  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||||||||  |||| |||| ||| |||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  55407433 tatgttttatactttgcacacaaaatgtttgatcgaatgcctcattgaaaattatattgattatttagttagtttaggttatggaaatgatagaaatgat 55407334  T
Q  520 gttaattatagtttggttaagtgtattttgattttttagttagtttaggttacgagaattat 581  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  55407333 gttaattatagtttcgttaagtgtatattgattttttagttagtttaggttacgagaattat 55407272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 288; E-Value: 1e-161
Query Start/End: Original strand, 164 - 581
Target Start/End: Complemental strand, 48256475 - 48256056
Alignment:
Q  164 tttcacgaattgcaagcaaatcaagtgcacattatcacaagtaagttgtgtcaatcattttaatgttaatgttaatttgtttaggttgagttttttagaa 263  Q
    ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||| ||| |||| ||||||| | ||||||| ||    
T  48256475 tttcacgaattgcaaacaaatcaactgcacattatcacaagtaaattgtatcaatcattttaatgataatattagtttgcttaggtttatttttttaaaa 48256376  T
Q  264 aaa-ttagagtagtttgcatgtggttagggttgatctcaaaattgagaatttgatgattgcatgtgtagtttagaaattgataattgaatgtagttgttg 362  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||    
T  48256375 aaaattagagtagtttgcatgtggttagggttaattttaaaattgacaatttgatgattgcatgtgtagtttatgaattgataaatgaatgtagttgttg 48256276  T
Q  363 cctatgatgtttaaatcataatgtgggtttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacaccaagtgtttgataaaatgtct 462  Q
    ||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||    
T  48256275 cctatgtagtttaaatcataatgtggctttgaatggtggcaaatgaaaacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgatcaaatgcct 48256176  T
Q  463 caatgacaattttattgattatttagttagttt-agttatggaaatgatagaaatgatgttaattatagtttggttaagtgtattttgattttttagtta 561  Q
    |||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  48256175 caatgaaaattatattgattatttagttagtttaagttatggaaatgatagaaatgatgttaattatagtttggttaagtgtatattgattttttagtta 48256076  T
Q  562 gtttaggttacgagaattat 581  Q
    |||||||||| |||||||||    
T  48256075 gtttaggttatgagaattat 48256056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 219 - 581
Target Start/End: Complemental strand, 37021936 - 37021563
Alignment:
Q  219 cattttaatgttaatgttaatttgtttaggttgagttttt---tagaa--aaattagagtagtttgcatgtggttagggttgatctcaaaattgagaatt 313  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||    || ||  |||||||||||||||| |||||||||| |||||| | |||||||| ||||    
T  37021936 cattttaatgataatgttaatttgtttaggttgatttttaaaataaaataaaattagagtagtttgtatgtggttagagttgattttaaaattgacaatt 37021837  T
Q  314 tgatgattgcatgtgtagtttagaaattgataattgaatgtagttgttgcctatgatgtttaaatcataatgtgggtttgaatggtggcaaatgaacaca 413  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  37021836 tgatgattgcatgtgtagtttaggaattgataaatgaatgtagttgttgcatatgttgtttaaatcataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacaca 37021737  T
Q  414 atttgaatatgttttatactttgcacaccaagtgtttgataaaatgtctcaatgacaattttattgattatttagttagttta-gttatggaaatgatag 512  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  37021736 atttgaatatcttttatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgcttcaatgacaattttattgattatttagttagtttaggttatgaaaatgatag 37021637  T
Q  513 aaatgatgttaattatagtttggttaagtg-----tattttgattttttagttagtttaggttacgagaattat 581  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||     ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37021636 aaatgatgttaattatagtttggttaagtgtatattatattaattttttagttagtttaggttacgagaattat 37021563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 164 - 497
Target Start/End: Original strand, 67762 - 68094
Alignment:
Q  164 tttcacgaattgcaagcaaatcaagtgcacattatcacaagtaagttgtgtcaatcattttaatgttaatgttaatttgtttaggttgagttttttagaa 263  Q
    |||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||| |||||||||||| | ||||| | ||    
T  67762 tttcacgaattgcaagaaaatcaaccgcacattatcacaagtaagttgtatcaatcattttaatga-aatgttagtttgtttaggtttattttttaaaaa 67860  T
Q  264 aaattagagtagtttgcatgtggttagggttgatctcaaaattgagaatttgatgattgcatgtgtagtttagaaattgataattgaatgtagttgttgc 363  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||| | ||||||||||||||    
T  67861 aaattagagtagtttgcatgtggttagggttgattttaaaattgacaatttaatgattgcatgtgtagtttatgaattgataaataaatgtagttgttgc 67960  T
Q  364 ctatgatgtttaaatcataatgtgggtttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacaccaagtgtttgataaaatgtctc 463  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||| |||    
T  67961 ctatgttgtttaaatgataatgtggctttgaatggtagcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacataaagtgtttgatcaaatgcctc 68060  T
Q  464 aatgacaattttattgattatttagttagtttag 497  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  68061 aatgaaaattatattgattatttagttagtttag 68094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 158; E-Value: 9e-84
Query Start/End: Original strand, 164 - 497
Target Start/End: Original strand, 46436415 - 46436747
Alignment:
Q  164 tttcacgaattgcaagcaaatcaagtgcacattatcacaagtaagttgtgtcaatcattttaatgttaatgttaatttgtttaggttgagttttttagaa 263  Q
    ||||||||||||||||| |||||    |||||||||||||||||||    | |||||||  ||||||||||||| |||||||||||| ||||||| |       
T  46436415 tttcacgaattgcaagccaatcatccccacattatcacaagtaagtaccattaatcattgcaatgttaatgttagtttgtttaggttaagtttttaattt 46436514  T
Q  264 aaattagagtagtttgcatgtggttagggttgatctcaaaattgagaatttgatgattgcatgtgtagtttagaaattgataattgaatgtagttgttgc 363  Q
       || |||||||||||| ||| |||||||| || | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||  |||||||||||||||    
T  46436515 ttttttgagtagtttgcacgtg-ttagggttaattttaaaattgacaatttgatgattgcatgtgtagtttatgaattaataaacgaatgtagttgttgc 46436613  T
Q  364 ctatgatgtttaaatcataatgtgggtttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacaccaagtgtttgataaaatgtctc 463  Q
     |||| ||||||||| ||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||    
T  46436614 ttatgctgtttaaatgatattgtggttctgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgatcaaatgcctc 46436713  T
Q  464 aatgacaattttattgattatttagttagtttag 497  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  46436714 aatggcaattttattgattatttagttagtttag 46436747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 157; E-Value: 3e-83
Query Start/End: Original strand, 131 - 510
Target Start/End: Complemental strand, 21538397 - 21538008
Alignment:
Q  131 tctcaatttctctcccatttcctaccaaatccattt-cacgaattgcaagcaaatcaagtgcacattatcacaagtaagttgtgtcaatcattttaatgt 229  Q
    |||||| ||||||||||||  | |||||| |||||| |||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||      
T  21538397 tctcaaattctctcccattctc-accaaagccattttcacgaattgcaagcaaatcaaccacacattatcacaagtaagttgcatcaatcattttaatca 21538299  T
Q  230 taatgttaatttgtttaggttgagttttttagaaaaattagagtagtttgcatgtggttagggttgatctcaaaattgagaatttgatgattgcatgtgt 329  Q
    |||||||| ||||||||| || ||||||||  ||||  || |||||||||||||||||||||||| ||     |||||| |||||||  |||||||| ||    
T  21538298 taatgttagtttgtttagtttaagtttttttaaaaatata-agtagtttgcatgtggttagggtttatgaatgaattgacaatttgaacattgcatgggt 21538200  T
Q  330 agtttagaaattgataattgaatgtagttgttgcctatgatgtttaaatcat----------aatgtgggtttgaatggtggcaaatgaacacaatttga 419  Q
    ||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||          ||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||    
T  21538199 agtttatgaattgataaatgaatgtagttgttgcctatgttgtttaaatgatgtttaatgataatgtggttttgaatgatgccaaatgaacacaatttga 21538100  T
Q  420 atatgttttatactttgcacaccaagtgtttgataaaatgtctcaatgacaattttattgattatttagttagttta-gttatggaaatgat 510  Q
    || ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  21538099 atctgtttgatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgcctcaatgataattatattgattatttagttagtttaggttatggaaatgat 21538008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 136; E-Value: 1e-70
Query Start/End: Original strand, 191 - 510
Target Start/End: Complemental strand, 10753312 - 10752983
Alignment:
Q  191 cacattatcacaagtaagttgtgtcaatcattttaatgttaatgttaatttgtttaggttgagttttttagaaaaattagagtagtttgcatgtggttag 290  Q
    |||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||  |||||||| ||||||||| || ||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||    
T  10753312 cacattatgacaagtaagttgcatcaatcattttaatcataatgttagtttgtttagtttaagtttttta-aaaaatatgagtagtttgcatgtggttag 10753214  T
Q  291 ggttgatctcaaaattgagaatttgatgattgcatgtgtagtttagaaattgataattgaatgtagttgttgcctatgatgtttaaatcat--------- 381  Q
    |||| ||     |||||| |||||||  |||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||             
T  10753213 ggtttatgaatgaattgacaatttgaacattgcatgtgtagtttatgaattgataaatgaatgtagatgttgcctatgctgtttaaatgatgtttaatga 10753114  T
Q  382 -aatgtgggtttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacaccaagtgtttgataaaatgtctcaatgacaattttattga 480  Q
     ||||||| |||||||||||||||||| ||||  ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||    
T  10753113 taatgtggttttgaatggtggcaaatggacactctttaaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgcctcaatgataattatattga 10753014  T
Q  481 ttatttagttagttta-gttatggaaatgat 510  Q
    ||||||| |||||||| ||||| ||||||||    
T  10753013 ttatttaattagtttaggttattgaaatgat 10752983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 136; E-Value: 1e-70
Query Start/End: Original strand, 191 - 510
Target Start/End: Complemental strand, 10967081 - 10966752
Alignment:
Q  191 cacattatcacaagtaagttgtgtcaatcattttaatgttaatgttaatttgtttaggttgagttttttagaaaaattagagtagtttgcatgtggttag 290  Q
    |||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||  |||||||| ||||||||| || ||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||    
T  10967081 cacattatgacaagtaagttgcatcaatcattttaatcataatgttagtttgtttagtttaagtttttta-aaaaatatgagtagtttgcatgtggttag 10966983  T
Q  291 ggttgatctcaaaattgagaatttgatgattgcatgtgtagtttagaaattgataattgaatgtagttgttgcctatgatgtttaaatcat--------- 381  Q
    |||| ||     |||||| |||||||  |||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||             
T  10966982 ggtttatgaatgaattgacaatttgaacattgcatgtgtagtttatgaattgataaatgaatgtagatgttgcctatgctgtttaaatgatgtttaatga 10966883  T
Q  382 -aatgtgggtttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacaccaagtgtttgataaaatgtctcaatgacaattttattga 480  Q
     ||||||| |||||||||||||||||| ||||  ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||    
T  10966882 taatgtggttttgaatggtggcaaatggacactctttaaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgcctcaatgataattatattga 10966783  T
Q  481 ttatttagttagttta-gttatggaaatgat 510  Q
    ||||||| |||||||| ||||| ||||||||    
T  10966782 ttatttaattagtttaggttattgaaatgat 10966752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 131; E-Value: 1e-67
Query Start/End: Original strand, 164 - 534
Target Start/End: Original strand, 14315545 - 14315925
Alignment:
Q  164 tttcacgaattgcaagcaaatcaagtgcacattatcacaagtaagttgtgtcaatcattttaatgttaatgttaatttgtttaggttgagttttttagaa 263  Q
    ||||||||||||||||| |||||    ||||||||| |||||||||    | |||||||  ||| ||||||||| |||||||||||| ||||||| | ||    
T  14315545 tttcacgaattgcaagccaatcatccccacattatcccaagtaagtaccattaatcattgcaatcttaatgttagtttgtttaggttaagtttttga-aa 14315643  T
Q  264 aaattagagtagtttgcatgtggttagggttgatctcaaaattgagaatttgatgattgcatgtgtagtttagaaattgataattgaatgtagttgttgc 363  Q
       || |||||||||||||||||||||| || ||     |||||| ||||| || |||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||    
T  14315644 ttttttgagtagtttgcatgtggttaggttttatgaatgaattgacaatttcatcattgcatgtgtagtttatgaattgataaatgaatgtagttgttgc 14315743  T
Q  364 ctatgatgtttaaatcat----------aatgtgggtttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacaccaagtgtttgat 453  Q
    ||||| ||||||||| ||          ||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||     
T  14315744 ctatgttgtttaaatgatgtataataaaaatgtggttttgaatggtgccaaatgaacacattttgagtatgttttatactttgcacgcaaagtgtttgac 14315843  T
Q  454 aaaatgtctcaatgacaattttattgattatttagttagttta-gttatggaaatgatagaaatgatgttaattatagtttg 534  Q
    |||||| |  ||||| |||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  14315844 aaaatgcccaaatgaaaattgtattgattattgagttagtttaggttatggaaatgattgaaatgatgttaattatagtttg 14315925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 115; E-Value: 4e-58
Query Start/End: Original strand, 164 - 510
Target Start/End: Complemental strand, 11083918 - 11083562
Alignment:
Q  164 tttcacgaattgcaagcaaatcaagtgcacattatcacaagtaagttgtgtcaatcattttaatgttaatgttaatttgtttaggttgagttttttagaa 263  Q
    ||||||||||||||||| |||||    |||||||||||||||||||    | |||||||  ||| ||||||||| |||||||||||| ||||||  | ||    
T  11083918 tttcacgaattgcaagccaatcatccccacattatcacaagtaagtaccattaatcattgcaatcttaatgttagtttgtttaggttaagttttgaaaaa 11083819  T
Q  264 aaattagagtagtttgcatgtggttagggttgatctcaaaattgagaatttgatgattgcatgtgtagtttagaaattgataattgaatgtagttgttgc 363  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||     |||||| |||||||| |||||||||||||||||   |||||||| ||||||||||||||||    
T  11083818 aaatt-gagtagtttgcatgtggttagggtttatgaatgaattgacaatttgatcattgcatgtgtagtttatgtattgataaatgaatgtagttgttgc 11083720  T
Q  364 ctatgatgtttaaatcat----------aatgtgggtttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacaccaagtgtttgat 453  Q
    ||||| ||||||||| ||          ||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||| || |||||||||| ||||||||||     
T  11083719 ctatgctgtttaaatgatgtataataaaaatgtggttttgaatggtgtcaaatgaacacattttgagtatgtttgatgctttgcacacaaagtgtttgac 11083620  T
Q  454 aaaatgtctcaatgacaattttattgattatttagttagttta-gttatggaaatgat 510  Q
    |||||| |  ||||| |||| || |||||||| |||||||||| |||||| |||||||    
T  11083619 aaaatgcccaaatgaaaattgtactgattattgagttagtttaggttatgaaaatgat 11083562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 165 - 516
Target Start/End: Original strand, 14297297 - 14297658
Alignment:
Q  165 ttcacgaattgcaagcaaatcaagtgcacattatcacaagtaagttgtgtcaatcattttaatgttaatgttaatttgtttaggttgagttttttagaaa 264  Q
    |||||||||||||||| |||||    ||||||||| |||||||||    | |||||||  ||| ||||||||| |||||||||||| ||||||| | ||     
T  14297297 ttcacgaattgcaagccaatcatccccacattatcccaagtaagtaccattaatcattgcaatcttaatgttagtttgtttaggttaagtttttga-aat 14297395  T
Q  265 aattagagtagtttgcatgtggttagggttgatctcaaaattgagaatttgatgattgcatgtgtagtttagaaattgataattgaatgtagttgttgcc 364  Q
      || |||||||||||||||||||||| || ||     |||||| ||||| || |||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||    
T  14297396 tttttgagtagtttgcatgtggttaggttttatgaatgaattgacaatttcatcattgcatgtgtagtttatgaattgataaatgaatgtagttgttgcc 14297495  T
Q  365 tatgatgtttaaatcat----------aatgtgggtttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacaccaagtgtttgata 454  Q
    |||| ||||||||| ||          ||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||| |    
T  14297496 tatgttgtttaaatgatgtataataaaaatgtggttttgaatggtgccaaatgaacacattttgagtatgttttatactttgcacgcaaagtgtttgaca 14297595  T
Q  455 aaatgtctcaatgacaattttattgattatttagttagttta-gttatggaaatgatagaaat 516  Q
    ||||| |  ||||| |||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  14297596 aaatgcccaaatgaaaattgtattgattattgagttagtttaggttatggaaatgattgaaat 14297658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 380 - 552
Target Start/End: Complemental strand, 11050210 - 11050037
Alignment:
Q  380 ataatgtgggtttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacaccaagtgtttgataaaatgtctcaatgacaattttattg 479  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||  ||||||| |||| |||||    
T  11050210 ataatgtggttttgaatggtgccaaatgaacacaatttgaatatgtttgatactttgcacacaaagtatttgataaaatgcatcaatgaaaattatattg 11050111  T
Q  480 attatttagttagttta-gttatggaaatgatagaaatgatgttaattatagtttggttaagtgtattttgatt 552  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||| || | ||||||||| |||||||| | |||||||| ||||||    
T  11050110 attatttagttagtttaggttatggaaatgatggagaggatgttaatgatagtttgataaagtgtatattgatt 11050037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 380 - 494
Target Start/End: Complemental strand, 41798682 - 41798568
Alignment:
Q  380 ataatgtgggtttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacaccaagtgtttgataaaatgtctcaatgacaattttattg 479  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||    
T  41798682 ataatgtgggtttgaatggtagcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgtgtcaacgacaaatttattg 41798583  T
Q  480 attatttagttagtt 494  Q
    |||||||||||||||    
T  41798582 attatttagttagtt 41798568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 30 - 278
Target Start/End: Original strand, 8109427 - 8109679
Alignment:
Q  30 gttaactgctgaggtaaatctcggcagttaactaccgaggaaatctgaacttaaacagatcgcagaaccagaacc---tcccatttccaaaaaaccttca 126  Q
    ||||||||| |||| ||| ||||| |||||||| | |||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||| |   | |||||| |||||   ||  |    
T  8109427 gttaactgccgaggaaaacctcgggagttaactgctgaggaaatctgaacataaacaga-cgcagaaacagaaacatataccattttcaaaacttctcta 8109525  T
Q  127 aaattctcaatttctctcccatttcctaccaaatccattt-cacgaattgcaagcaaatcaagtgcacattatcacaagtaagttgtgtcaatcatttta 225  Q
    || |||||||||||||||| || | | ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  8109526 aagttctcaatttctctccaatcttc-accaaattcattttcacgaattgcaagcaaatcaactgcacattatcacaagtaagttgtatcaatcatttta 8109624  T
Q  226 atgttaatgttaatttgtttaggttgagtttttt--agaaaaattagagtagttt 278  Q
    ||| |||||||| |||||||||||| | ||||||  | |||||||||||||||||    
T  8109625 atgataatgttagtttgtttaggtttatttttttaaaaaaaaattagagtagttt 8109679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 380 - 510
Target Start/End: Complemental strand, 50023230 - 50023099
Alignment:
Q  380 ataatgtgggtttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacaccaagtgtttgataaaatgtctcaatgacaattttattg 479  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  50023230 ataatgtggttttgaatggtggcaaaagaacacattttgagtatgtttgatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgcctcaatgacaattttattg 50023131  T
Q  480 attatttagttagttta-gttatggaaatgat 510  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  50023130 attatttagttagtttaggttatggatatgat 50023099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 380 - 497
Target Start/End: Complemental strand, 9892955 - 9892838
Alignment:
Q  380 ataatgtgggtttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacaccaagtgtttgataaaatgtctcaatgacaattttattg 479  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  9892955 ataatgtggttttgaatggtggcaaaagaacacattttgagtatgtttgatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgtgtcaatgacaattttattg 9892856  T
Q  480 attatttagttagtttag 497  Q
    ||||||||||||||||||    
T  9892855 attatttagttagtttag 9892838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 164 - 510
Target Start/End: Complemental strand, 41933524 - 41933179
Alignment:
Q  164 tttcacgaattgcaagcaaatcaagtgcacattatcacaagtaagttgtgtcaatcattttaatgttaatgttaatttgtttaggttgagttttttagaa 263  Q
    |||||||| |||||||||| |||  | ||||||||||||||||||| |  | ||||| | |||| ||||||||| |||||||||||| ||||||||  ||    
T  41933524 tttcacgatttgcaagcaa-tcatctccacattatcacaagtaagtagaattaatcaatgtaatcttaatgttagtttgtttaggttaagtttttttaaa 41933426  T
Q  264 aaattagagtagtttgcatgtggttagggttgatctcaaaattgagaatttgatgattgcatgtgtagtttagaaattgat--aattgaatgtagttgtt 361  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |   |||||| | ||||||||||||||||  |||||| ||||  ||  | |||  |||| ||| |    
T  41933425 aaatt-gagtagtttgcatgtggatagggttgatgtaggaattgatattttgatgattgcatgt--agtttataaatgaatgtagttgt-tgtaattgat 41933330  T
Q  362 gcct--atgatgtttaaatcataatgtgggtttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacaccaagtgtttgataaaatg 459  Q
    |  |  ||| ||||| ||  | ||||||| ||||||||||| |||||||| |  |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |    
T  41933329 gtttgaatg-tgttttaagtacaatgtggttttgaatggtgtcaaatgaagattatttgaatatgtttgatactttgcacacaaagtgtttgataaaaag 41933231  T
Q  460 tctcaatgacaattttattgattatttagttagtttag-ttatggaaatgat 510  Q
     | |||||| |||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  41933230 ccccaatgaaaattatattgattattgagttagtttagattatggaaatgat 41933179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 380 - 510
Target Start/End: Complemental strand, 50030348 - 50030217
Alignment:
Q  380 ataatgtgggtttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacaccaagtgtttgataaaatgtctcaatgacaattttattg 479  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||    
T  50030348 ataatgtggttttgaatggtggcaaaagaacacattttgagtatgtttgatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgcatcaatgacaattttactg 50030249  T
Q  480 attatttagttagttta-gttatggaaatgat 510  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  50030248 attatttagttagtttaggttatggatatgat 50030217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 380 - 497
Target Start/End: Complemental strand, 6181477 - 6181360
Alignment:
Q  380 ataatgtgggtttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacaccaagtgtttgataaaatgtctcaatgacaattttattg 479  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||  |||||| ||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  6181477 ataatgtggttttgattggtggcaaaataacacattttgagtatgtttgatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgtgtcaatgacaattttattg 6181378  T
Q  480 attatttagttagtttag 497  Q
    ||||||||||||||||||    
T  6181377 attatttagttagtttag 6181360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 380 - 497
Target Start/End: Original strand, 49090806 - 49090923
Alignment:
Q  380 ataatgtgggtttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacaccaagtgtttgataaaatgtctcaatgacaattttattg 479  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||  |||||| ||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  49090806 ataatgtggttttgattggtggcaaaataacacattttgagtatgtttgatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgtgtcaatgacaattttattg 49090905  T
Q  480 attatttagttagtttag 497  Q
    ||||||||||||||||||    
T  49090906 attatttagttagtttag 49090923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 380 - 497
Target Start/End: Original strand, 49165419 - 49165536
Alignment:
Q  380 ataatgtgggtttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacaccaagtgtttgataaaatgtctcaatgacaattttattg 479  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||  |||||| ||||| ||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  49165419 ataatgtggttttgaatggtggcaaaataacacattttgagtatgtttgatagtttgcacacaaagtgtttgataaaatgtgtcaatgacaattttattg 49165518  T
Q  480 attatttagttagtttag 497  Q
    ||||||||||||||||||    
T  49165519 attatttagttagtttag 49165536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 76; E-Value: 7e-35
Query Start/End: Original strand, 390 - 497
Target Start/End: Original strand, 30704419 - 30704526
Alignment:
Q  390 tttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacaccaagtgtttgataaaatgtctcaatgacaattttattgattatttagt 489  Q
    |||||||||||| ||| ||||||| ||| | ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30704419 tttgaatggtgggaaaagaacacatttttagtatgtttgatactttgcacacaaagtgtttgataaaatatctcaatgacaattttattgattatttagt 30704518  T
Q  490 tagtttag 497  Q
    ||||||||    
T  30704519 tagtttag 30704526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 380 - 497
Target Start/End: Original strand, 31422083 - 31422201
Alignment:
Q  380 ataatgtgggtttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacaccaagtgtttga-taaaatgtctcaatgacaattttatt 478  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||  |||||| ||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  31422083 ataatgtggttttgattggtggcaaaataacacattttgagtatgtttgatactttgcacacaaagtgtttgaataaaatgtgtcaatgacaattttatt 31422182  T
Q  479 gattatttagttagtttag 497  Q
    |||||||||||||||||||    
T  31422183 gattatttagttagtttag 31422201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 380 - 497
Target Start/End: Complemental strand, 44679762 - 44679645
Alignment:
Q  380 ataatgtgggtttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacaccaagtgtttgataaaatgtctcaatgacaattttattg 479  Q
    ||||||||  |||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||    
T  44679762 ataatgtgattttgaatggtggcaaaagaacacattttgagtatgtttgatattttgcacacaaagtgtttgataaaatgtttcaatgaccatttcattg 44679663  T
Q  480 attatttagttagtttag 497  Q
    ||||||||||||||||||    
T  44679662 attatttagttagtttag 44679645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 71; E-Value: 7e-32
Query Start/End: Original strand, 380 - 497
Target Start/End: Original strand, 50193864 - 50193982
Alignment:
Q  380 ataatgtgggtttgaatggtggcaaatgaa-cacaatttgaatatgttttatactttgcacaccaagtgtttgataaaatgtctcaatgacaattttatt 478  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||||  || |||| ||||| ||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50193864 ataatgtggttttgaatagtggcaaaaaaaacacattttgagtatgtttgatactttgcacataaagtgtttgataaaatgtctcaatgacaattttatt 50193963  T
Q  479 gattatttagttagtttag 497  Q
    ||||||||| |||||||||    
T  50193964 gattatttacttagtttag 50193982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 380 - 495
Target Start/End: Original strand, 3184342 - 3184457
Alignment:
Q  380 ataatgtgggtttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacaccaagtgtttgataaaatgtctcaatgacaattttattg 479  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| || |||| ||||| ||||||| ||||||||||| | |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||     
T  3184342 ataatgtggttttgaatggtggcaaaagatcacattttgagtatgtttgatactttgcacccaaagtgtttgagaaaatgcctcaatgacaattttattt 3184441  T
Q  480 attatttagttagttt 495  Q
     |||||||||||||||    
T  3184442 tttatttagttagttt 3184457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 380 - 495
Target Start/End: Complemental strand, 3185571 - 3185456
Alignment:
Q  380 ataatgtgggtttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacaccaagtgtttgataaaatgtctcaatgacaattttattg 479  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| || |||| ||||| ||||||| ||||||||||| | |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||     
T  3185571 ataatgtggttttgaatggtggcaaaagatcacattttgagtatgtttgatactttgcacccaaagtgtttgagaaaatgcctcaatgacaattttattt 3185472  T
Q  480 attatttagttagttt 495  Q
     |||||||||||||||    
T  3185471 tttatttagttagttt 3185456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 380 - 495
Target Start/End: Complemental strand, 3185779 - 3185664
Alignment:
Q  380 ataatgtgggtttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacaccaagtgtttgataaaatgtctcaatgacaattttattg 479  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| || |||| ||||| ||||||| ||||||||||| | |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||     
T  3185779 ataatgtggttttgaatggtggcaaaagatcacattttgagtatgtttgatactttgcacccaaagtgtttgagaaaatgcctcaatgacaattttattt 3185680  T
Q  480 attatttagttagttt 495  Q
     |||||||||||||||    
T  3185679 tttatttagttagttt 3185664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 61; E-Value: 7e-26
Query Start/End: Original strand, 272 - 496
Target Start/End: Complemental strand, 4720163 - 4719949
Alignment:
Q  272 gtagtttgcatgtggttagggttgatctcaaaattgagaatttgatgattgcatgtgtagtttagaaattgataattgaatgtagttgttgcctatgatg 371  Q
    ||||||||||||||||||||||| |  | | |||||| | |||||||||||| |||||||||||  ||||| ||| |||||||| |||         |||    
T  4720163 gtagtttgcatgtggttagggtttacgtaagaattgacattttgatgattgcgtgtgtagtttatgaattggtaaatgaatgtaattg---------atg 4720073  T
Q  372 tttaaatcataatgtgggtttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacaccaagtgtttgataaaatgtctcaatgacaa 471  Q
    ||||| | | ||||||  ||||||||||| ||||| ||||||||  |||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||| |  ||||| ||    
T  4720072 tttaagt-agaatgtgattttgaatggtgtcaaattaacacaatgagaatatgtttgatactttgcacacaaagtgtttgacaaaatgcccaaatgaaaa 4719974  T
Q  472 ttttattgattatttagttagttta 496  Q
    ||  |||||||||||| ||||||||    
T  4719973 ttgcattgattatttacttagttta 4719949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 21 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 37022107 - 37021933
Alignment:
Q  21 tcggttgctgttaactgctgaggtaaatctcggcagttaactaccgaggaaatctgaacttaaacagatcgcagaaccagaacctcccatttccaaaaaa 120  Q
    |||| ||| ||||||| | |||| ||| |||||||||||||| ||||| ||||||| |||||| ||  ||||||||||||||| | ||||||||||||      
T  37022107 tcggctgcagttaactaccgaggaaaacctcggcagttaactgccgagaaaatctggacttaatca-ttcgcagaaccagaactttccatttccaaaact 37022009  T
Q  121 ccttcaaaattctcaatttctctcccatttcctaccaaatcca-tttcacgaattgcaagcaaatcaagtgcacatt 196  Q
      |||||| ||  |||||||||||| || | | ||||||| || |||||||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  37022008 ttttcaaatttaacaatttctctccaatcttc-accaaattcattttcacgaatagcaagcaaatcaactgcacatt 37021933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 30 - 86
Target Start/End: Complemental strand, 31425355 - 31425299
Alignment:
Q  30 gttaactgctgaggtaaatctcggcagttaactaccgaggaaatctgaacttaaaca 86  Q
    ||||||||| |||| ||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  31425355 gttaactgccgaggaaaacctcggtagttaactgccgaggaaatctgaacttaaaca 31425299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 31 - 86
Target Start/End: Original strand, 37563102 - 37563157
Alignment:
Q  31 ttaactgctgaggtaaatctcggcagttaactaccgaggaaatctgaacttaaaca 86  Q
    |||||||| |||| ||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  37563102 ttaactgccgaggaaaacctcggtagttaactaccgaggaaatatgaacttaaaca 37563157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 30 - 86
Target Start/End: Complemental strand, 49169134 - 49169078
Alignment:
Q  30 gttaactgctgaggtaaatctcggcagttaactaccgaggaaatctgaacttaaaca 86  Q
    ||||||||| |||| | | ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  49169134 gttaactgccgaggaatacctcggtagttaactgccgaggaaatctgaacttaaaca 49169078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 218 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 1308595 - 1308557
Alignment:
Q  218 tcattttaatgttaatgttaatttgtttaggttgagttt 256  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||    
T  1308595 tcattttaatgttaatgttaatttgtttatgtttagttt 1308557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 17 - 78
Target Start/End: Original strand, 40832666 - 40832727
Alignment:
Q  17 gaaatcggttgctgttaactgctgaggtaaatctcggcagttaactaccgaggaaatctgaa 78  Q
    |||| ||| ||| |||||||||||||| |||  |||||||| |||||||||||||| |||||    
T  40832666 gaaaccggctgcagttaactgctgaggaaaacttcggcagtaaactaccgaggaaaactgaa 40832727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 447; Significance: 0; HSPs: 24)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 447; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 30 - 581
Target Start/End: Original strand, 28876679 - 28877230
Alignment:
Q  30 gttaactgctgaggtaaatctcggcagttaactaccgaggaaatctgaacttaaacagatcgcagaaccagaacctcccatttccaaaaaaccttcaaaa 129  Q
    ||||||| | |||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28876679 gttaactcccgaggaaaacctcggcagttaactgccgaggaaatctgaacataaccagaacgcagaaccagaacctcccatttccaaaaaaccttcaaaa 28876778  T
Q  130 ttctcaatttctctcccat-ttcctaccaaatccattt-cacgaattgcaagcaaatcaagtgcacattatcacaagtaagttgtgtcaatcattttaat 227  Q
    |||||||||||||||| || ||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28876779 ttctcaatttctctccaatcttcc--ccaaatccattttcacgaattgcaagcaaatcaagtggccattatcacaagtaagttgtgtcaatcattttaat 28876876  T
Q  228 gttaatgttaatttgtttaggttgagttttttagaaaaattagagtagtttgcatgtggttagggttgatctcaaaattgagaatttgatgattgcatgt 327  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  28876877 gttaatgttaatttgtttaggttgatttttttaaaaaaattagagtagtttgtatgtggttagggttgaattcaaaattgagaatttgatgattgcatgt 28876976  T
Q  328 gtagtttagaaattgataattgaatgtagttgttgcctatgatgtttaaatcataatgtgggtttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttt 427  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28876977 gtagtttagaaattgataattaaatgtagttgttgcctatattgtttaaatcataatgtgggtttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttt 28877076  T
Q  428 tatactttgcacaccaagtgtttgataaaatgtctcaatgacaattttattgattatttagttagtttagttatggaaatgatagaaatgatgttaatta 527  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28877077 tatactttgcacaccaagtgtttgataaaatgtctcaatgacaattttattgattatttagttagtttggttatggaaatgatagaaatgatgttaatta 28877176  T
Q  528 tagtttggttaagtgtattttgattttttagttagtttaggttacgagaattat 581  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28877177 tagtttggttaagtgtattttgattttttagttagtttaggttacgagaattat 28877230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 423; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 51 - 580
Target Start/End: Complemental strand, 8580521 - 8579992
Alignment:
Q  51 cggcagttaactaccgaggaaatctgaacttaaacagatcgcagaaccagaacctcccatttccaaaaaaccttcaaaattctcaatttctctcccattt 150  Q
    |||||||||||| |||||||||  ||||| ||| |||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || |    
T  8580521 cggcagttaactgccgaggaaaattgaacataaccagaacacagtaccagaacctcccatttccaaaaaaccttctaaattctcaatttctctccaatct 8580422  T
Q  151 cctaccaaatccattt-cacgaattgcaagcaaatcaagtgcacattatcacaagtaagttgtgtcaatcattttaatgttaatgttaatttgtttaggt 249  Q
     | ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8580421 tc-accaaatccattttcacgaattgcaagcaaaccaagtgcacattatcacaagtaagttgtgtcaatcattttaatgttaatgttaatttgtttaggt 8580323  T
Q  250 tgagttttttagaaaaattagagtagtttgcatgtggttagggttgatctcaaaattgagaatttgatgattgcatgtgtagtttagaaattgataattg 349  Q
    ||| ||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8580322 tgattttttaaaaaaaattagagtagtttgtatgtggttagggttgatttcaaaattgacaatttgatgattgcatgtgtagtttagaaattgataattg 8580223  T
Q  350 aatgtagttgttgcctatgatgtttaaatcataatgtgggtttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacaccaagtgtt 449  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  8580222 aatgtagttgttgcctatgttgtttaaatcataatgtagctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtt 8580123  T
Q  450 tgataaaatgtctcaatgacaattttattgattatttagttagtttagttatggaaatgatagaaatgatgttaattatagtttggttaagtgtattttg 549  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8580122 tgataaaatgtctcaatgacaattttattgattatttagttagtttagttatggaaatgatagaaatgatgttaattatagtttggttaagtgtattttg 8580023  T
Q  550 attttttagttagtttaggttacgagaatta 580  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8580022 attttttagttagtttaggttacgagaatta 8579992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 370; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 30 - 581
Target Start/End: Original strand, 7757361 - 7757912
Alignment:
Q  30 gttaactgctgaggtaaatctcggcagttaactaccgaggaaatctgaacttaaacagatcgcagaaccagaacctcccatttccaaaaaaccttcaaaa 129  Q
    ||||||||| |||| ||| ||||  |||||||| ||||||||||||| |||||| ||  ||||||||||||||| | |||||||||||| |  |||||||    
T  7757361 gttaactgccgaggaaaacctcgctagttaactgccgaggaaatctggacttaatcac-tcgcagaaccagaactttccatttccaaaacaatttcaaaa 7757459  T
Q  130 ttctcaatttctctcccatttcctaccaaatccattt-cacgaattgcaagcaaatcaagtgcacattatcacaagtaagttgtgtcaatcattttaatg 228  Q
    |||||||||||||||| || | | |||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7757460 ttctcaatttctctccaatcttc-accaaatctattttcacgaattgcaagcaaatcaactgcacattatcacaagtaagttgtgtcaatcattttaatg 7757558  T
Q  229 ttaatgttaatttgtttaggttgagttttttagaaaaattagagtagtttgcatgtggttagggttgatctcaaaattgagaatttgatgattgcatgtg 328  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||    
T  7757559 ttaatgttaatttgtttaggttgattttttaaaaaaaattagagtagtttgtatgtggttagggttgattttaaaattgacaatttgatgattgcatgtg 7757658  T
Q  329 tagtttagaaattgataattgaatgtagttgttgcctatgatgtttaaatcataatgtgggtttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgtttt 428  Q
    |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  7757659 tagtttaggaattgataaatgaatgtagttgttgcctatgttgtttaaattataatgtggttttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaacatgtttt 7757758  T
Q  429 atactttgcacaccaagtgtttgataaaatgtctcaatgacaattttattgattatttagttagttta-gttatggaaatgatagaaatgatgttaatta 527  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||   |||||    
T  7757759 atactttgcacacaaagtgtttgataaaatgcctcaatgacaattttattgattatttagttagtttaggttatggaaatgatagaaatgatagaaatta 7757858  T
Q  528 tagtttggttaagtgtattttgattttttagttagtttaggttacgagaattat 581  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7757859 tagtttggttaagtgtatattgattttttagttagtttaggttacgagaattat 7757912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 334; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 49 - 572
Target Start/End: Complemental strand, 28241817 - 28241294
Alignment:
Q  49 ctcggcagttaactaccgaggaaatctgaacttaaacagatcgcagaaccagaacctcccatttccaaaaaacc-ttcaaaattctcaatttctctccca 147  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||||| || ||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||| |||||||| |    
T  28241817 ctcggtagttaactgccgaggaaatctggacataaccagaacgcagaaccagaacctcccatttacaaaaaaacattcaaaattctcaaattctctccaa 28241718  T
Q  148 tttcctaccaaatccattt-cacgaattgcaagcaaatcaagtgcacattatcacaagtaagttgtgtcaatcattttaatgttaatgttaatttgttta 246  Q
    | | | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28241717 tcttc-accaaatccattttcacgaattgcaagcaaatcaagtgcacattatcacaagtaagttgtaccaatcattttaatgttaatgttaatttgttta 28241619  T
Q  247 ggttgagttttttagaaaaattagagtagtttgcatgtggttagggttgatctcaaaattgagaatttgatgattgcatgtgtagtttagaaattgataa 346  Q
     ||| ||||||| | ||||||| |||||||||||||||||||||| || ||     |||||| ||||| || |||||||||||||||||   ||||||||    
T  28241618 tgttaagtttttaaaaaaaatt-gagtagtttgcatgtggttaggttttataaatgaattgacaatttcatcattgcatgtgtagtttatgtattgataa 28241520  T
Q  347 ttgaatgtagttgttgcctatgatgtttaaatcataatgtgggtttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacaccaagt 446  Q
     ||||||||| |||||||||||  |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  28241519 atgaatgtagatgttgcctatgtagtttaaattataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagt 28241420  T
Q  447 gtttgataaaatgtctcaatgacaattttattgattatttagttagtttagttatggaaatgatagaaatgatgttaattatagtttggttaagtgtatt 546  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  28241419 gttcgataaaatgtctcaatgacaattttattgattatttagttagtttagttatggaaatgatagaaatgatgttaattatagtttggttaagtttatt 28241320  T
Q  547 ttgattttttagttagtttaggttac 572  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  28241319 ttgattttttagttagtttaggttac 28241294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 321; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 55 - 510
Target Start/End: Complemental strand, 14701 - 14246
Alignment:
Q  55 agttaactaccgaggaaatctgaacttaaacagatcgcagaaccagaacctcccatttccaaaaaaccttcaaaattctcaatttctctcccatttccta 154  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| || |||| |||||||||||||| |||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||| || | | |    
T  14701 agttaactgccgaggaaatctgaactaaaccagaacgcagaaccagaacttcccatttccaaaacaatttcaaaattctcaatttctctccaatcttcaa 14602  T
Q  155 ccaaatccattt-cacgaattgcaagcaaatcaagtgcacattatcacaagtaagttgtgtcaatcattttaatgttaatgttaatttgtttaggttgag 253  Q
    | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  14601 c-aaatccattttcacgaattgcaagcaaatcaagtgcacattatcacaagtaagttgtgtcaatcattttaatgttaatgttaatttgtttaggttgat 14503  T
Q  254 ttttttagaaaaattagagtagtttgcatgtggttagggttgatctcaaaattgagaatttgatgattgcatgtgtagtttagaaattgataattgaatg 353  Q
    ||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| | ||||    
T  14502 tttttaaaaaaaattagagtagtttgtatgtggttagggttgatttcaaaattgaaaatttgatgattgcatgcgtagtttaggaattgataaataaatg 14403  T
Q  354 tagttgttgcctatgatgtttaaatcataatgtgggtttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacaccaagtgtttgat 453  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  14402 tagttgttgcctatgttgtttaaatcataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgat 14303  T
Q  454 aaaatgtctcaatgacaattttattgattatttagttagtttagttatggaaatgat 510  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||    
T  14302 aaaatgcctcaatgataattttattgattatttagttagtttatgtatagaaatgat 14246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 295; E-Value: 1e-165
Query Start/End: Original strand, 164 - 581
Target Start/End: Complemental strand, 19228575 - 19228157
Alignment:
Q  164 tttcacgaattgcaagcaaatcaagtgcacattatcacaagtaagttgtgtcaatcattttaatgttaatgttaatttgtttaggttgagttttttagaa 263  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| | ||||||  ||    
T  19228575 tttcacgaattgcaagcaaatcaactgcacattatcacaagtaagttgtatcaatcattttaatgataatgttagtttgtttaggtttattttttttaaa 19228476  T
Q  264 aaattagagtagtttgcatgtggttagggttgatctcaaaattgagaatttgatgattgcatgtgtagtttagaaattgataattgaatgtagttgttgc 363  Q
    ||| || ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||    
T  19228475 aaaatatagtagtttgcatgtggttagggttgattttaaaattgacaatttgatgattgcatgtgtagtttatgaattgataaatgaatgtagttgttgc 19228376  T
Q  364 ctatgatgtttaaatcataatgtgggtttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacaccaagtgtttgataaaatgtctc 463  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||    
T  19228375 ctatgttgtttaaatcataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacataatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgatcaaatgcctc 19228276  T
Q  464 aatgacaattttattgattatttagttagttta-gttatggaaatgatagaaatgatgttaattatagtttggttaagtgtattttgattttttagttag 562  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  19228275 aatgaaaattatattgattatttagttagtttaggttatgaaaatgataaaaatgatgttaattatagtttgattaagtgtatattgattttttagttag 19228176  T
Q  563 tttaggttacgagaattat 581  Q
    ||||||||| |||||||||    
T  19228175 tttaggttatgagaattat 19228157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 293; E-Value: 1e-164
Query Start/End: Original strand, 171 - 581
Target Start/End: Complemental strand, 42942383 - 42941972
Alignment:
Q  171 aattgcaagcaaatcaagtgcacattatcacaagtaagttgtgtcaatcattttaatgttaatgttaatttgtttaggttgagttttttagaaaaa-tta 269  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| | ||||| | ||||| |||    
T  42942383 aattgcaagcaaatcaaccgcacattatcacaagtaagttgcatcaatcattttaatgataatgttagtttgtttaggtttattttttaaaaaaaaatta 42942284  T
Q  270 gagtagtttgcatgtggttagggttgatctcaaaattgagaatttgatgattgcatgtgtagtttagaaattgataattgaatgtagttgttgcctatga 369  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||     
T  42942283 gagtagtttgcatgtggttagggttgattttaaaattgacaatttgatgattgcatgtgtagtttaggaattgataaatgaatgtagttgttgcctatgc 42942184  T
Q  370 tgtttaaatcataatgtgggtttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacaccaagtgtttgataaaatgtctcaatgac 469  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  42942183 tgtttaaatcataatatggctttgaattgtggcaaatgaacataatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgcctcaatgac 42942084  T
Q  470 aattttattgattatttagttagttta-gttatggaaatgatagaaatgatgttaattatagtttggttaagtgtattttgattttttagttagtttagg 568  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  42942083 aattttattgatt-tttagttagtttaggttatggaaatgatagaaatgatgttaattatagtctggttaagtgtatattgattttttagttagtttagg 42941985  T
Q  569 ttacgagaattat 581  Q
    |||||||||||||    
T  42941984 ttacgagaattat 42941972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 275; E-Value: 1e-153
Query Start/End: Original strand, 164 - 581
Target Start/End: Complemental strand, 512675 - 512257
Alignment:
Q  164 tttcacgaattgcaagcaaatcaagtgcacattatcacaagtaagttgtgtcaatcattttaatgttaatgttaatttgtttaggttgagttttttagaa 263  Q
    ||||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| | ||||  | ||    
T  512675 tttcatgaattgcaagcaaatcaactgtacattatcacaagtaagttgtatcaatcattttaatgataatgttagtttgtttaggtttatttttaaaaaa 512576  T
Q  264 aaattagagtagtttgcatgtggttagggttgatctcaaaattgagaatttgatgattgcatgtgtagtttagaaattgataattgaatgtagttgttgc 363  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||     
T  512575 aaaatagagtagtttgcatgtggttagggttgattttaaaattgacaatttgatgattgcatgtgtagtttatgaattgataaatgaatgtagttgttgt 512476  T
Q  364 ctatgatgtttaaatcataatgtgggtttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacaccaagtgtttgataaaatgtctc 463  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||  |||    
T  512475 ctatgttgtttaaatcataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacccaaagtgtttgatcaaatacctc 512376  T
Q  464 aatgacaattttattgattatttagttagttta-gttatggaaatgatagaaatgatgttaattatagtttggttaagtgtattttgattttttagttag 562  Q
    ||||| |||| ||||| |||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  512375 aatgaaaattatattgcttatttagttagtttaggttatgaaaattatagaaatgatgttaattatagtttagttaagtgtatattgattttttagttag 512276  T
Q  563 tttaggttacgagaattat 581  Q
    ||||||||| |||||||||    
T  512275 tttaggttatgagaattat 512257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 271; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 164 - 581
Target Start/End: Original strand, 38968265 - 38968686
Alignment:
Q  164 tttcacgaattgcaagcaaatcaagtgcacattatcacaagtaagttgtgtcaatcattttaatgttaatgttaatttgtttaggttgagttttttagaa 263  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||   ||||  | ||    
T  38968265 tttcacgaattgcaagcaaatcaactgcacattatcacaagtaagttgtatcaatcattttaatgataatgttagtttgttaaggtttctttttaaaaaa 38968364  T
Q  264 aa--attagagtagtttgcatgtggttagggttgatctcaaaattgagaatttgatgattgcatgtgtagtttagaaattgataattgaatgtagttgtt 361  Q
    ||  ||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||    
T  38968365 aaaaattagagtagtttgcatgtggttagggtttattttaaaattgacaatttgatgattgcatgtgtagtttatgaattgataaatgaatgtagttgtt 38968464  T
Q  362 gcctatgatgtttaaatcataatgtgggtt-tgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacaccaagtgtttgataaaatgt 460  Q
    ||||||| |||| |||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||     
T  38968465 gcctatgttgttaaaatcataatgtgacttatgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgatcaaatgc 38968564  T
Q  461 ctcaatgacaattttattgattatttagttagttta-gttatggaaatgatagaaatgatgttaattatagtttggttaagtgtattttgattttttagt 559  Q
    |||||||| |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||    
T  38968565 ctcaatgaaaattatattgattatttagttagtttaggttatggaaatgatagaaatgatgttaattatagtttggttaagtgtatattgtttttttggt 38968664  T
Q  560 tagtttaggttacgagaattat 581  Q
    |||||||||||||| |||||||    
T  38968665 tagtttaggttacgggaattat 38968686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 268; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 126 - 581
Target Start/End: Original strand, 42537276 - 42537737
Alignment:
Q  126 aaaattctcaatttctctcccatttcctaccaaatccatttcacgaattgcaagcaaatcaagtgcacattatcacaagtaagttgtgtcaatcatttta 225  Q
    |||||||||||||||| ||| || | | |||||| |||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  42537276 aaaattctcaatttctttccaatctgc-accaaagccattctacgaattgcaagcaaatcaactgcacattatcacaagcaagttgtatcaatcatttta 42537374  T
Q  226 atgttaatgttaatttgtttaggttgagttttttagaaaa------attagagtagtttgcatgtggttagggttgatctcaaaattgagaatttgatga 319  Q
    ||| |||||||  |||||||||||| | |||   | ||||      ||||||||||||||||||| ||||||||| || | |||||||| ||||||||||    
T  42537375 atgataatgttggtttgtttaggtttattttaaaaaaaaaataaaaattagagtagtttgcatgttgttagggttaattttaaaattgacaatttgatga 42537474  T
Q  320 ttgcatgtgtagtttagaaattgataattgaatgtagttgttgcctatgatgtttaaatcataatgtgggtttgaatggtggcaaatgaacacaatttga 419  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  42537475 ttgcatgtgtagtttatgaattgataaatgaatgtagttgttgcctatgttgttaaaatcataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacataatttga 42537574  T
Q  420 atatgttttatactttgcacaccaagtgtttgataaaatgtctcaatgacaattttattgattatttagttagttta-gttatggaaatgatagaaatga 518  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| | || |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  42537575 atatgttttatactttgcacacaaagtgtttgatcaaatgcctcaatgaaatttatattgattatttagttagtttaggttatggaaatgatagaaatga 42537674  T
Q  519 tgttaattatagtttggttaagtgtattttgattttttagttagtttaggttacgagaattat 581  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  42537675 tgttaattatagtttggttaagtgtatattgattttttagttagttaaggttacgagaattat 42537737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 239; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 164 - 581
Target Start/End: Original strand, 17658493 - 17658910
Alignment:
Q  164 tttcacgaattgcaagcaaatcaagtgcacattatcacaagtaagttgtgtcaatcattttaatgttaatgttaatttgtttaggttgagttttttagaa 263  Q
    ||||||||||||||||  |||||    |||||||||||| ||||||    | |||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||    
T  17658493 tttcacgaattgcaagacaatcatccccacattatcacaggtaagtaccattaatcattgcaatgttaatgttaatttgtttaggttaagtttttta-aa 17658591  T
Q  264 aaattagagtagtttgcatgtggttagggttgatctcaaaattgagaatttgatgattgcatgtgtagtttagaaattgataattgaatgtagttgttgc 363  Q
    ||||| |||||||||| ||||||||||| |||||     |||||| ||||| || |||||||||||||||||   |||||||| ||||||||||||| ||    
T  17658592 aaatttgagtagtttgtatgtggttaggtttgataaatgaattgacaatttcatcattgcatgtgtagtttatttattgataaatgaatgtagttgtggc 17658691  T
Q  364 ctatgatgtttaaatcataatgtgggtttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacaccaagtgtttgataaaatgtctc 463  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||| |||    
T  17658692 ctatgttgtttaaatcataatgtggttttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcatacaaagtgtttgatcaaatgcctc 17658791  T
Q  464 aatgacaattttattgattatttagttagttta-gttatggaaatgatagaaatgatgttaattatagtttggttaagtgtattttgattttttagttag 562  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  17658792 aatgaaaattatattgattatttagttagtttaggttatggaaatgatagaaatgatgttaattatagtttggttaagtgtatattgattttttagttag 17658891  T
Q  563 tttaggttacgagaattat 581  Q
    ||||||||| |||||||||    
T  17658892 tttaggttatgagaattat 17658910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 235; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 164 - 581
Target Start/End: Complemental strand, 8702126 - 8701709
Alignment:
Q  164 tttcacgaattgcaagcaaatcaagtgcacattatcacaagtaagttgtgtcaatcattttaatgttaatgttaatttgtttaggttgagttttttagaa 263  Q
    ||||||||||||||||  |||||    |||||||||||||||||||  | | |||||||  ||| |||||||||||||||||||||| ||||||| | ||    
T  8702126 tttcacgaattgcaagttaatcatccccacattatcacaagtaagtactattaatcattgcaatcttaatgttaatttgtttaggttaagtttttaa-aa 8702028  T
Q  264 aaattagagtagtttgcatgtggttagggttgatctcaaaattgagaatttgatgattgcatgtgtagtttagaaattgataattgaatgtagttgttgc 363  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| || ||     |||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||| |||||    
T  8702027 aaatttgagtagtttgcatgtggttaggttttataaatgaattgacaatttgatgattgcatgtgtagtttatgaattgataaatgaatgtagtagttgc 8701928  T
Q  364 ctatgatgtttaaatcataatgtgggtttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacaccaagtgtttgataaaatgtctc 463  Q
     |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||    
T  8701927 atatgttgtttaaatcataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgatcaaatgcctc 8701828  T
Q  464 aatgacaattttattgattatttagttagttta-gttatggaaatgatagaaatgatgttaattatagtttggttaagtgtattttgattttttagttag 562  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||    
T  8701827 aatgaaaattatattgattatttagtttgtttaggttatggaaatgatagaaatgatgttaattatagtttgattaagtgtatattgattgtttagttag 8701728  T
Q  563 tttaggttacgagaattat 581  Q
    ||||||||| || ||||||    
T  8701727 tttaggttatgaaaattat 8701709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 145; E-Value: 5e-76
Query Start/End: Original strand, 164 - 497
Target Start/End: Complemental strand, 40624826 - 40624484
Alignment:
Q  164 tttcacgaattgcaagcaaatcaagtgcacattatcacaagtaagttgtgtcaatcattttaatgttaatgttaatttgtttaggttgagttttttagaa 263  Q
    ||||||||||||||||| |||||    |||||||||||||||||||    |  ||||||  ||||||||||||| |||||||||||| ||||||| |       
T  40624826 tttcacgaattgcaagccaatcatccccacattatcacaagtaagtaccattgatcattgcaatgttaatgttagtttgtttaggttaagtttttaattt 40624727  T
Q  264 aaattagagtagtttgcatgtggttagggttgatctcaaaattgagaatttgatgattgcatgtgtagtttagaaattgataattgaatgtagttgttgc 363  Q
       || |||||||||||||||| |||||||| || | |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||| ||||||||||||||||    
T  40624726 ttttttgagtagtttgcatgtg-ttagggttaattttaaaattgacaatttgatgattgcatgtgtattttatgaattgataaatgaatgtagttgttgc 40624628  T
Q  364 ctatgatgtttaaatcat----------aatgtgggtttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacaccaagtgtttgat 453  Q
    ||||| ||||||||| ||          ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  40624627 ctatgctgtttaaatgatgtttaatgataatgtggttttgaatggtgacaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgat 40624528  T
Q  454 aaaatgtctcaatgacaattttattgattatttagttagtttag 497  Q
    |||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40624527 aaaatgccttaataacaattttattgattatttagttagtttag 40624484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 106; E-Value: 9e-53
Query Start/End: Original strand, 380 - 497
Target Start/End: Complemental strand, 19040804 - 19040687
Alignment:
Q  380 ataatgtgggtttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacaccaagtgtttgataaaatgtctcaatgacaattttattg 479  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  19040804 ataatgtgggtttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgtgtcaatgacaaatttattg 19040705  T
Q  480 attatttagttagtttag 497  Q
    ||||||||||||||||||    
T  19040704 attatttagttagtttag 19040687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 103; E-Value: 6e-51
Query Start/End: Original strand, 265 - 507
Target Start/End: Original strand, 20422210 - 20422463
Alignment:
Q  265 aattagagtagtttgcatgtggttagggttgatctcaaaattgagaatttgatgattgcatgtgtagtttagaaattgataattgaatgtagttgttgcc 364  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||| |   |||||| ||||||||||||| ||||||||| ||  ||||||||| ||||||||||||||| |    
T  20422210 aatttgagtagtttgcatgtggttagggttgatgtaggaattgacaatttgatgattggatgtgtagtgtatgaattgataaatgaatgtagttgttgtc 20422309  T
Q  365 tatgatgtttaaatcat----------aatgtgggtttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacaccaagtgtttgata 454  Q
    |||| | ||||||| ||          ||||| | ||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||    
T  20422310 tatgttatttaaatgatgttctagtataatgtagttttaaatggtgccaaatgaacacattttgaatatgtttgatacttttcacacaaagtgtttgata 20422409  T
Q  455 aaatgtctcaatgacaattttattgattatttagttagttta-gttatggaaat 507  Q
    ||||| | ||||||||||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  20422410 aaatgccccaatgacaattattttgattatttagttagtttaggttatggaaat 20422463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 380 - 510
Target Start/End: Original strand, 5197359 - 5197490
Alignment:
Q  380 ataatgtgggtttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacaccaagtgtttgataaaatgtctcaatgacaattttattg 479  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  5197359 ataatgtggttttgaatggtggcaaaagaacacattttgagtatgtttgatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgcctcaatgacaattttattg 5197458  T
Q  480 attatttagttagttta-gttatggaaatgat 510  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  5197459 attatttagttagtttaggttatggatatgat 5197490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 380 - 496
Target Start/End: Complemental strand, 27673340 - 27673224
Alignment:
Q  380 ataatgtgggtttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacaccaagtgtttgataaaatgtctcaatgacaattttattg 479  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  27673340 ataatgtggttttgaatggtggcaaaagaacacattttgagtatgtttgatattttgcacacaaagtgtttgataaaatgtgtcaatgacaattttattg 27673241  T
Q  480 attatttagttagttta 496  Q
    |||||||||||||||||    
T  27673240 attatttagttagttta 27673224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 78; E-Value: 5e-36
Query Start/End: Original strand, 380 - 497
Target Start/End: Original strand, 30705522 - 30705639
Alignment:
Q  380 ataatgtgggtttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacaccaagtgtttgataaaatgtctcaatgacaattttattg 479  Q
    ||||||||| ||| |||||||||||| ||||||| ||| | ||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  30705522 ataatgtggttttcaatggtggcaaaagaacacatttttagtatgtttgatattttgcacacaaagtgtttgataaaatgtgtcaatgacaattttattg 30705621  T
Q  480 attatttagttagtttag 497  Q
    ||||||||||||||||||    
T  30705622 attatttagttagtttag 30705639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 30 - 86
Target Start/End: Original strand, 28238175 - 28238231
Alignment:
Q  30 gttaactgctgaggtaaatctcggcagttaactaccgaggaaatctgaacttaaaca 86  Q
    ||||||||| |||| ||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  28238175 gttaactgccgaggaaaacctcggtagttaactgccgaggaaatctgaacttaaaca 28238231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 30 - 72
Target Start/End: Complemental strand, 29430615 - 29430573
Alignment:
Q  30 gttaactgctgaggtaaatctcggcagttaactaccgaggaaa 72  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  29430615 gttaactgctgaggaaaacctcggcagttaactaccgaggaaa 29430573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 22 - 70
Target Start/End: Complemental strand, 8092 - 8044
Alignment:
Q  22 cggttgctgttaactgctgaggtaaatctcggcagttaactaccgagga 70  Q
    ||||||| ||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  8092 cggttgcagttaactgccgaggaaaatctcggtagttaactaccgagga 8044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 67
Target Start/End: Original strand, 2169695 - 2169760
Alignment:
Q  1 attgccgaattttgaagaaatcggttgctgttaactgctgaggtaaatctcggcagttaactaccga 67  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||  |||||||  |||| |||  ||||||||||||||||||    
T  2169695 attgccgaattttgaagaaatcggctgc-attaactgtcgaggaaaacttcggcagttaactaccga 2169760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 218 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 28241280 - 28241242
Alignment:
Q  218 tcattttaatgttaatgttaatttgtttaggttgagttt 256  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||    
T  28241280 tcattttaatgttaatgttaatttgtttatgtttagttt 28241242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 3 - 67
Target Start/End: Complemental strand, 13838488 - 13838424
Alignment:
Q  3 tgccgaattttgaagaaatcggttgctgttaactgctgaggtaaatctcggcagttaactaccga 67  Q
    ||||||||| |||||||| ||| ||| ||||||| | |||| ||| |||||||||||||| ||||    
T  13838488 tgccgaattctgaagaaaccggctgcagttaactaccgaggaaaacctcggcagttaactgccga 13838424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 409; Significance: 0; HSPs: 44)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 409; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 51 - 581
Target Start/End: Complemental strand, 15036744 - 15036213
Alignment:
Q  51 cggcagttaactaccgaggaaatctgaacttaaacagatcgcagaaccagaacctcccatttccaaaaaaccttcaaaattctcaatttctctcccattt 150  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||| || |    
T  15036744 cggcagttaactgccgaggaaatctgaacttaaacagatcgcagaaccagaacctcccattttcaaaaaactttctaaattctcaatttctctccaatct 15036645  T
Q  151 cctaccaaatccattt-cacgaattgcaagcaaatcaagtgcacattatcacaagtaagttgtgtcaatcattttaatgttaatgttaatttgtttaggt 249  Q
     | ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15036644 tc-accaaatccattttcgcgaattgcaagcaaatcaagtgcacattatcacaaataagttgtgtcaatcattttaatgttaatgttaatttgtttaggt 15036546  T
Q  250 tgagttttttagaaaaattagagtagtttgcatgtggttagggttgatctcaaaattgagaatttgatgattgcatgtgtagtttagaaattgataattg 349  Q
    | | ||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||    
T  15036545 ttatttttttaaaaaaattagagtggtttgtatgtggttagggttgatttcaaaattgacaatttgatgattgcatgtgtagttcaggaattgataaatg 15036446  T
Q  350 aatgtagttgttgcctatgatgtttaaatcataatgtgggtttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacaccaagtgtt 449  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  15036445 aatgtagttgttgcctatgttgtttaaatcataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtt 15036346  T
Q  450 tgataaaatgtctcaatgacaattttattgattatttagttagtttagttatggaaatgatagaaatga-tgttaattatagtttggttaagtgtatttt 548  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||| ||    
T  15036345 tgataaaatgtctcaatgacaattttattgattatttagttagtttagttatggaaatgatagaaattagggttaattatagtttggttaagtgtatatt 15036246  T
Q  549 gattttttagttagtttaggttacgagaattat 581  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15036245 gattttttagttagtttaggttacgagaattat 15036213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 372; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 92 - 581
Target Start/End: Original strand, 45064339 - 45064818
Alignment:
Q  92 cagaaccagaacctcccatttccaaaaaaccttcaaaattctcaatttctctcccatttcctaccaaatccattt-cacgaattgcaagcaaatcaagtg 190  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || | | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  45064339 cagaaccagaacctttcatttccaaaaaaccttctaaattctcaatttctctccaatcttc-accaaatccattttcacgaattgcaagcaaatcaagtg 45064437  T
Q  191 cacattatcacaagtaagttgtgtcaatcattttaatgttaatgttaatttgtttaggttgagttttttagaaaaattagagtagtttgcatgtggttag 290  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  45064438 cacattatcacaagtaagttgtgtcaatcattttaatgttaatgttaatttgtttaggttgatttttttaaaaaaattagagtagtttgtatgtggttag 45064537  T
Q  291 ggttgatctcaaaattgagaatttgatgattgcatgtgtagtttagaaattgataattgaatgtagttgttgcctatgatgtttaaatcataatgtgggt 390  Q
    ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| |    
T  45064538 ggttgatttcaaaattgacaatttgatgattgcatgtgtagtttagaaattgataattgaatgtagttgttgcctatgttgtttaaatcttaatgtggct 45064637  T
Q  391 ttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacaccaagtgtttgataaaatgtctcaatgacaattttattgattatttagtt 490  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||           ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45064638 ttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaat----------ttttgcacacaaagtgtttgataaaatgtctcaatgacaattttattgattatttagtt 45064727  T
Q  491 agtttagttatggaaatgatagaaatgatgttaattatagtttggttaagtgtattttgattttttagttagtttaggttacgagaattat 581  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  45064728 agtttagttatggaaatgatagaaatgatgttaattatagtttggttaagtgtattttgattttttagttagtttaggttaggagaattat 45064818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 346; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 30 - 581
Target Start/End: Complemental strand, 39939252 - 39938701
Alignment:
Q  30 gttaactgctgaggtaaatctcggcagttaactaccgaggaaatctgaacttaaacagatcgcagaaccagaacctcccatttccaaaaaaccttcaaaa 129  Q
    |||||||||  ||| ||| || || |||||||| || || ||||||| |||||| ||  ||||||||||||||| |||||||||||||| |  |||||||    
T  39939252 gttaactgccaaggaaaacctaggtagttaactgcctagaaaatctggacttaatcat-tcgcagaaccagaacttcccatttccaaaacaatttcaaaa 39939154  T
Q  130 ttctcaatttctctcccatttcctaccaaatccattt-cacgaattgcaagcaaatcaagtgcacattatcacaagtaagttgtgtcaatcattttaatg 228  Q
    |||||||||||||||| || | | ||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39939153 ttctcaatttctctccaatcttc-accaagtccattttcacgaattgaaagcaaatcaattgcacattatcacaagtaagttgtgtcaatcattttaatg 39939055  T
Q  229 ttaatgttaatttgtttaggttgagttttttagaaaaattagagtagtttgcatgtggttagggttgatctcaaaattgagaatttgatgattgcatgtg 328  Q
     ||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||| |||||     
T  39939054 ataatgttaatttgtttaggttgattttttaaaaaaaattagagtagtttacatgtggttagggttgattttaaaattgataatttgatgattacatgta 39938955  T
Q  329 tagtttagaaattgataattgaatgtagttgttgcctatgatgtttaaatcataatgtgggtttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgtttt 428  Q
    |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  39938954 tagtttaggaattgataaatgaatgtagttgttgcctatgttgtttaaatcataatggggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaataagtttt 39938855  T
Q  429 atactttgcacaccaagtgtttgataaaatgtctcaatgacaattttattgattatttagttagttta-gttatggaaatgatagaaatgatgttaatta 527  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39938854 atactttgcacacaaagtatttgataaaatgtctcaatgacaattttattgattatgtagttagtttaggttatggaaatgatagaaatgatgttaatta 39938755  T
Q  528 tagtttggttaagtgtattttgattttttagttagtttaggttacgagaattat 581  Q
    ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  39938754 tagtttgattaagtgtatattgattttttagttagtgtaggttacgagaattat 39938701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 327; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 49 - 572
Target Start/End: Complemental strand, 42485556 - 42485024
Alignment:
Q  49 ctcggcagttaactaccgaggaaatctgaacttaaacagatcgcagaaccagaacctcccatttccaaaaaacc-ttcaaaattctcaatttctctccca 147  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| || ||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||| |||||||| |    
T  42485556 ctcggtagttaactaccgaggaaatctggacataaccagaacgcagaaccagaacctcccatttacaaaaaaacattcaaaattctcaaattctctccaa 42485457  T
Q  148 tttcctaccaaatccattt-cacgaattgcaagcaaatcaagtgcacattatcacaagtaagttgtgtcaatcattttaatgttaatgttaatttgttta 246  Q
    | | | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42485456 tcttc-accaaatccattttcacgaattgcaagcaaatcaagtgcacattatcacaagtaagttgtgtcaatcattttaatgttaatgttaatttgttta 42485358  T
Q  247 ggttgagttttttagaaaaattagagtagtttgcatgtggttagggttgatctcaaaattgagaatttgatgattgcatgtgtagtttagaaattgataa 346  Q
     ||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| || ||     |||||| ||||| || |||||||||||||||||   ||||||||    
T  42485357 tgttaagttttttaaaaaaatt-gagtagtttgcatgtggttaggttttataaatgaattgacaatttcatcattgcatgtgtagtttatgtattgataa 42485259  T
Q  347 ttgaatgtagttgttgcctatgatgtttaaatcataatgtgggtttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacaccaagt 446  Q
     ||||||||| |||||||||||  |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  42485258 atgaatgtagatgttgcctatgtagtttaaattataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagt 42485159  T
Q  447 gtttgataaaatgtctcaatgacaattttattgattatttagttagtttagttatggaaatgatagaaa---------tgatgttaattatagtttggtt 537  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||         ||||||||||||||||||||||    
T  42485158 gttcgataaaatgtctcaatgacaattttattgattatttagttagtttagttatggaaatgatagaaatgatagaaatgatgttaattatagtttggtt 42485059  T
Q  538 aagtgtattttgattttttagttagtttaggttac 572  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42485058 aagtttattttgattttttagttagtttaggttac 42485024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 322; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 49 - 572
Target Start/End: Complemental strand, 489647 - 489124
Alignment:
Q  49 ctcggcagttaactaccgaggaaatctgaacttaaacagatcgcagaaccagaacctcccatttccaaaaaacc-ttcaaaattctcaatttctctccca 147  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||||| || ||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||| |||| |||||||| |    
T  489647 ctcggtagttaactgccgaggaaatctggacataaccagaacgcagaaccagaacctcccatttacaaaaaaacattcaaaattttcaaattctctccga 489548  T
Q  148 tttcctaccaaatccattt-cacgaattgcaagcaaatcaagtgcacattatcacaagtaagttgtgtcaatcattttaatgttaatgttaatttgttta 246  Q
    | | | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  489547 tcttc-accaaatccattttcacgaattgcaagcaaatcaagtgcacattatcacaagtaagttgtgtcaatcattttaatgttaatgttaatttgttta 489449  T
Q  247 ggttgagttttttagaaaaattagagtagtttgcatgtggttagggttgatctcaaaattgagaatttgatgattgcatgtgtagtttagaaattgataa 346  Q
     ||| | ||||| | ||||||| |||||||||||||||||||||| || |      |||||| ||||| || |||||||||||||||||   ||||||||    
T  489448 tgttaaatttttaaaaaaaatt-gagtagtttgcatgtggttaggttttacaaatgaattgacaatttcatcattgcatgtgtagtttatgtattgataa 489350  T
Q  347 ttgaatgtagttgttgcctatgatgtttaaatcataatgtgggtttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacaccaagt 446  Q
     ||||||||| |||||||||||  |||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  489349 atgaatgtagatgttgcctatgtagtttaaattataatgtggctttgaatggttgcaaatgaacacaatttaaatatgttttatactttgcacacaaagt 489250  T
Q  447 gtttgataaaatgtctcaatgacaattttattgattatttagttagtttagttatggaaatgatagaaatgatgttaattatagtttggttaagtgtatt 546  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  489249 gttcgataaaatgtctcaatgacaattttattgattatttagttagtttagttatggaaatgatagaaatgatgttaattatagtttggttaagtttatt 489150  T
Q  547 ttgattttttagttagtttaggttac 572  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  489149 ttgattttttagttagtttaggttac 489124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 315; E-Value: 1e-177
Query Start/End: Original strand, 164 - 581
Target Start/End: Original strand, 43211676 - 43212093
Alignment:
Q  164 tttcacgaattgcaagcaaatcaagtgcacattatcacaagtaagttgtgtcaatcattttaatgttaatgttaatttgtttaggttgagttttttagaa 263  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||| ||||||| ||    
T  43211676 tttcacgaattgcaagcaaatcaactgcacattaccacaagtaagttgtgtcaatcattttaatcataatgttaatttgttttggttgattttttta-aa 43211774  T
Q  264 aaattagagtagtttgcatgtggttagggttgatctcaaaattgagaatttgatgattgcatgtgtagtttagaaattgataattgaatgtagttgttgc 363  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||||||||| | |||||||| |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  43211775 aaattagagtagtttgtatgtgcttagggttgattttaaaattgacaattcgatgattgcatgtgtagtttaggaattgataaatgaatgtagttgttgc 43211874  T
Q  364 ctatgatgtttaaatcataatgtgggtttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacaccaagtgtttgataaaatgtctc 463  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||    
T  43211875 ctatgttgtttaaatcataatgtggctttgaatggtgggaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgcctc 43211974  T
Q  464 aatgacaattttattgattatttagttagttta-gttatggaaatgatagaaatgatgttaattatagtttggttaagtgtattttgattttttagttag 562  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  43211975 aatgacaattttattgattatttagttagtttaggttaaggaaatgatataaatgatgttaattatagtttggttaagtgtatattgattttttagttag 43212074  T
Q  563 tttaggttacgagaattat 581  Q
    |||||||||||||||||||    
T  43212075 tttaggttacgagaattat 43212093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 310; E-Value: 1e-174
Query Start/End: Original strand, 30 - 534
Target Start/End: Original strand, 39601740 - 39602256
Alignment:
Q  30 gttaactgctgaggtaaatctcggcagttaactaccgaggaaatctgaacttaaacagatcgcagaaccagaacctcccatttccaaaaaaccttcaaaa 129  Q
    ||||||||| |||| ||| ||||| |||||||| ||||||||||||| |||||| ||  ||||||||||||||| |||||||||||||| |  |||||||    
T  39601740 gttaactgccgaggaaaacctcgggagttaactgccgaggaaatctggacttaatcat-tcgcagaaccagaacttcccatttccaaaacaatttcaaaa 39601838  T
Q  130 ttctcaatttctctcccatttcctaccaaatccattt-cacgaattgcaagcaaatcaagtgcacattatcacaagtaagttgtgtcaatcattttaatg 228  Q
    |||||||||||||||| || | |  |||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39601839 ttctcaatttctctccaatcttcg-ccaaattcattttcacgaattgcaagcaaatcaactgcacattatcacaagtaagttgtgtcaatcattttaatg 39601937  T
Q  229 ttaatgttaatttgtttaggttgagttttttagaa------------aaattagagtagtttgcatgtggttagggttgatctcaaaattgagaatttga 316  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||                |||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||| |||||||    
T  39601938 ttaatgttaatttgtttaggttgatttttttttttttttttttttttaaattagagtagtttgtatgtggttagggttgattttaaaattgacaatttga 39602037  T
Q  317 tgattgcatgtgtagtttagaaattgataattgaatgtagttgttgcctatgatgtttaaatcataatgtgggtttgaatggtggcaaatgaacacaatt 416  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  39602038 tgattgcatgtgtagtttaggaattgataaatgaatgtagttgttgcctatgttgtttaaatcataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatt 39602137  T
Q  417 tgaatatgttttatactttgcacaccaagtgtttgataaaatgtctcaatgacaattttattgattatttagttagttta-gttatggaaatgatagaaa 515  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  39602138 tgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgcctcaatgacaattttattgattatttagttagtttaggttatggaaatgatagaaa 39602237  T
Q  516 tgatgttaattatagtttg 534  Q
    |||||||||||||| ||||    
T  39602238 tgatgttaattatattttg 39602256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 307; E-Value: 1e-172
Query Start/End: Original strand, 56 - 581
Target Start/End: Complemental strand, 41250083 - 41249574
Alignment:
Q  56 gttaactaccgaggaaatctgaacttaaacagatcgcagaaccagaacctcccatttccaaaaaaccttcaaaattctcaatttctctcccatttcctac 155  Q
    ||||||| ||||||||||||| |||||| ||  | ||||||||||||| ||||||||||||||    |||||||||| |||||||||||| || | | ||    
T  41250083 gttaactgccgaggaaatctggacttaatcattt-gcagaaccagaacttcccatttccaaaacttgttcaaaattcacaatttctctccaatcttc-ac 41249986  T
Q  156 caaatccattt-cacgaattgcaagcaaatcaagtgcacattatcacaagtaagttgtgtcaatcattttaatgttaatgttaatttgtttaggttgagt 254  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |    
T  41249985 caaatccattttcacgaattgcaagcaaatcaagtgcacattatcacaagtaagttgtgtcaatcattttaatgataatgttaatttgtttaggttgatt 41249886  T
Q  255 tttttagaaaaattagagtagtttgcatgtggttagggttgatctcaaaattgagaatttgatgattgcatgtgtagtttagaaattgataattgaatgt 354  Q
    |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  41249885 tttttttaaaaattagagtagtttgcatgtggttagggtagattttaaaattgacaatttgatgattgcatgtgtagtttaggaattgataaatgaatgt 41249786  T
Q  355 agttgttgcctatgatgtttaaatcataatgtgggtttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacaccaagtgtttgata 454  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||                   
T  41249785 agttgttgcctatgttgtttaaatcataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgctttatactttgcac--------------- 41249701  T
Q  455 aaatgtctcaatgacaattttattgattatttagttagttta-gttatggaaatgatagaaatgatgttaattatagtttggttaagtgtattttgattt 553  Q
     | || | |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  41249700 -attgccgcaatgacaattttattgattatgtagttagtttaggttatggaaatgatagaaatgatgttaattatagtttgattaagtgtatattgattt 41249602  T
Q  554 tttagttagtttaggttacgagaattat 581  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||    
T  41249601 tttagttagtgtaggttacgagaattat 41249574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 301; E-Value: 1e-169
Query Start/End: Original strand, 49 - 567
Target Start/End: Complemental strand, 39847008 - 39846485
Alignment:
Q  49 ctcggcagttaactaccgaggaaatctgaacttaaacagatcgcagaaccagaacc--tcccatttccaaaaaaccttcaaaattctcaatttctctccc 146  Q
    |||| ||||||||| |||||||||||||||||||| || | |||| || || || |  | |||||| |||||   || |||||||| ||||||||||||     
T  39847008 ctcgccagttaactgccgaggaaatctgaacttaatcata-cgcaaaaacaaaaacattaccattttcaaaacttctccaaaattcacaatttctctcca 39846910  T
Q  147 atttcctaccaaatccattt-cacgaattgcaagcaaatcaagtgcacattatcacaagtaagttgtgtcaatcattttaatgttaatgttaatttgttt 245  Q
    || | | |||||| |||||| ||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  39846909 atcttc-accaaagccattttcacaaattgcaagcaaaccaattgcacattatcacaagtaagttgtatcaatcattttaatgataatgttagtttgttt 39846811  T
Q  246 aggttgagttttt---tagaaaaattagagtagtttgcatgtggttagggttgatctcaaaattgagaatttgatgattgcatgtgtagtttagaaattg 342  Q
    ||||| | |||||    | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  39846810 aggtttattttttataaaaaaaaaatagagtagtttgcatgtggttagggttgattttaaaattgacaatttgatgattgcatgtgtagtttaggaattg 39846711  T
Q  343 ataattgaatgtagttgttgcctatgatgtttaaatcataatgtgggtttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacc 442  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||     
T  39846710 ataaatgaatgtagttgttgcctatgttgtttaaatcataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgtacaca 39846611  T
Q  443 aagtgtttgataaaatgtctcaatgacaattttattgattatttagttagttta-gttatggaaatgatagaaatgatgttaattatagtttggttaagt 541  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39846610 aagtgtttgataaactgtctccatgacaattttattgattatttagttagtttaggttatggaaatgatagaaatgatgttaattatagtttggttaagt 39846511  T
Q  542 gtattttgattttttagttagtttag 567  Q
    |||| |||||||||||||||||||||    
T  39846510 gtatattgattttttagttagtttag 39846485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 298; E-Value: 1e-167
Query Start/End: Original strand, 126 - 581
Target Start/End: Original strand, 43188181 - 43188637
Alignment:
Q  126 aaaattctcaatttctctcccatttcctaccaaa-tccatttcacgaattgcaagcaaatcaagtgcacattatcacaagtaagttgtgtcaatcatttt 224  Q
    |||||||||||||||||||| || | | |||||| ||  ||||| |||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||    
T  43188181 aaaattctcaatttctctccaatcttc-accaaagtcattttcaagaattgcaagcaaatcaactgcatattgtcacaagtaagttgtatcaatcatttt 43188279  T
Q  225 aatgttaatgttaatttgtttaggttgagttttttagaaaaattagagtagtttgcatgtggttagggttgatctcaaaattgagaatttgatgattgca 324  Q
    |||| |||||||| |||||||||||| | ||||  | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||||| |||||||||||||||    
T  43188280 aatgataatgttagtttgtttaggtttatttttaaaaaaaaattagagtagtttgcatgtggttatggttgattttaaaattgacaatttgatgattgca 43188379  T
Q  325 tgtgtagtttagaaattgataattgaatgtagttgttgcctatgatgtttaaatcataatgtgggtttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatg 424  Q
    |||||||||||| |||| |||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  43188380 tgtgtagtttaggaattaataaatgaatgtagttgttgtctatgttgtttaaatcataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacgatttgaatatg 43188479  T
Q  425 ttttatactttgcacaccaagtgtttgataaaatgtctcaatgacaattttattgattatttagttagttta-gttatggaaatgatagaaatgatgtta 523  Q
    |||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||    
T  43188480 ttttatactttgcatacaaagtgtttgataaaatgtttcaatgacaattttattgattatttagttagtttatgttatggaaatgatataaatgatgtta 43188579  T
Q  524 attatagtttggttaagtgtattttgattttttagttagtttaggttacgagaattat 581  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43188580 attatagtttgattaagtgtatattgattttttagttagtttaggttacgagaattat 43188637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 280; E-Value: 1e-156
Query Start/End: Original strand, 164 - 581
Target Start/End: Original strand, 39252179 - 39252590
Alignment:
Q  164 tttcacgaattgcaagcaaatcaagtgcacattatcacaagtaagttgtgtcaatcattttaatgttaatgttaatttgtttaggttgagtttt---tta 260  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||     |    
T  39252179 tttcacgaattgcaagcaaatcaagtgcgcgttatcacaagtaagttgtgtcaatcattttaatgttaatgttaatttgtttaggttgatttttaaaaaa 39252278  T
Q  261 gaaaaattagagtagtttgcatgtggttagggttgatctcaaaattgagaatttgatgattgcatgtgtagtttagaaattgataattgaatgtagttgt 360  Q
     |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||||||    
T  39252279 aaaaaattagagtagtttgtatgtggtta-ggttgattttaaaattgacaatttgatgattgcatgtgtagtttaggaattaataaatgaatgtagttgt 39252377  T
Q  361 tgcctatgatgtttaaatcataatgtgggtttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacaccaagtgtttgataaaatgt 460  Q
    ||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  39252378 tgcatatgttgtttaaatcataatgtggctttgaatggtggcaaatgaatacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgt 39252477  T
Q  461 ctcaatgacaattttattgattatttagttagttta-gttatggaaatgatagaaatgatgttaattatagtttggttaagtgtattttgattttttagt 559  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||         ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  39252478 ctcaatgacaattttattgattatttagttagtttaggttatg---------gaaatgatgttaattatagtttggtcaagtgtatattgattttttagt 39252568  T
Q  560 tagtttaggttacgagaattat 581  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  39252569 tagtttaggttacgagaattat 39252590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 265; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 164 - 581
Target Start/End: Complemental strand, 40077153 - 40076744
Alignment:
Q  164 tttcacgaattgcaagcaaatcaagtgcacattatcacaagtaagttgtgtcaatcattttaatgttaatgttaatttgtttaggttgagttttttagaa 263  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| | ||||| | ||    
T  40077153 tttcacgaattgcaagcaaatcaagtgcacattatcagaagtaagttgtatcaatcattttaatgataatgttagtttgtttaggtttattttttaaaaa 40077054  T
Q  264 aaattagagtagtttgcatgtggttagggttgatctcaaaattgagaatttgatgattgcatgtgtagtttagaaattgataattgaatgtagttgttgc 363  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||  ||||||||||||  ||||||||| ||||||||| ||||||    
T  40077053 aaattagagtagtttgcatgtggttagggttgattttaaaattgacaatttgatgattatatgtgtagtttatgaattgataaatgaatgtagctgttgc 40076954  T
Q  364 ctatgatgtttaaatcataatgtgggtttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacaccaagtgtttgataaaatgtctc 463  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||| |||    
T  40076953 ctatgttgtttaaatcataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttataatttgcacacaaagtgtttgatcaaatgcctc 40076854  T
Q  464 aatgacaattttattgattatttagttagtttagttatggaaatgatagaaatgatgttaattatagtttggttaagtgtattttgattttttagttagt 563  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||||||||||         | | |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  40076853 aatgaaaattatattgattatttagttagtttag--------gttacagaaatgatgataattatagtttggttaagtgtatattgattttttagttagt 40076762  T
Q  564 ttaggttacgagaattat 581  Q
    |||||||| |||||||||    
T  40076761 ttaggttatgagaattat 40076744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 264; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 164 - 581
Target Start/End: Complemental strand, 34822923 - 34822501
Alignment:
Q  164 tttcacgaattgcaagcaaatcaagtgcacattatcacaagta--agttgtgtcaatcattttaatgttaatgttaatttgtttaggttgagttttttag 261  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| | ||||| |     
T  34822923 tttcacgaattgcaagcaaattaactgcacattatcacaagtataagttgtatcaatcattttaatgataatgttagtttgtttaggtttattttttaaa 34822824  T
Q  262 aaaaa-ttagagtagtttgcatgtggttagggttgatctcaaaattgagaatttgatgattgcatgtgtagtttagaaattgataattgaatgtagttgt 360  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||    
T  34822823 aaaaaattagagtagtttgcatgtggttagggttgattttaaaattgacaatttgatgattgcatgtgtagtttatgaattgataaatgaatgtagttgt 34822724  T
Q  361 tgcctatgatgtttaaatcataatgtgggtttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacaccaagtgtttgataaaatgt 460  Q
    |||||||| || |||||||||||||||| ||||||||   ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||     
T  34822723 tgcctatgttggttaaatcataatgtggctttgaatgactgcaaatgaacacaatttaaatatgttttatactctgcacacaaagtgtttgatcaaatgc 34822624  T
Q  461 ctcaatgacaattttattgattatttagttagttta-gttatggaaatgatagaaatgatgttaattatagtttggttaagtgtattttga-ttttttag 558  Q
    |||||||| |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  34822623 ctcaatgaaaattatattgattatttagttagtttaggttatggaaatgatagaaatgatattaattatagtttggttaagtgtatattgatttttttag 34822524  T
Q  559 ttagtttaggttacgagaattat 581  Q
    ||||||||||||| |||||||||    
T  34822523 ttagtttaggttatgagaattat 34822501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 233; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 278 - 581
Target Start/End: Complemental strand, 5304010 - 5303706
Alignment:
Q  278 tgcatgtggttagggttgatctcaaaattgagaatttgatgattgcatgtgtagtttagaaattgataattgaatgtagttgttgcctatgatgtttaaa 377  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  5304010 tgcatgtggttagggttgattttaaaattgacaatttcatgattgcatgtgtagtttatgaattgataaatgaatgtagttgttgtctatgttgtttaaa 5303911  T
Q  378 tcataatgtgggtttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacaccaagtgtttgataaaatgtctcaatgacaattttat 477  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| |||| |||    
T  5303910 tcataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgatcaaatgcctcaatgaaaattatat 5303811  T
Q  478 tgattatttagttagttta-gttatggaaatgatagaaatgatgttaattatagtttggttaagtgtattttgattttttagttagtttaggttacgaga 576  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5303810 tgattatttagttagtttaggttatggaaatgatagaaatgatgttaattatagtttggttaagtgtatattgattttttagttagtttaggttacgaga 5303711  T
Q  577 attat 581  Q
    |||||    
T  5303710 attat 5303706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 143; E-Value: 8e-75
Query Start/End: Original strand, 164 - 398
Target Start/End: Complemental strand, 25864842 - 25864609
Alignment:
Q  164 tttcacgaattgcaagcaaatcaagtgcacattatcacaagtaagttgtgtcaatcattttaatgttaatgttaatttgtttaggttgagttttttagaa 263  Q
    ||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||| |||||||||||| | ||||  | ||    
T  25864842 tttcacgaattgcaatcaaatcaactacacattatcacaagtaagttgtattaatcattttaatgataatgttagtttgtttaggtttatttttaaaaaa 25864743  T
Q  264 aaattagagtagtttgcatgtggttagggttgatctcaaaattgagaatttgatgattgcatgtgtagtttagaaattgataattgaatgtagttgttgc 363  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||| |||  ||||||||| ||||||||||||||||    
T  25864742 atattagagtagtttgcatgtggttagggttgattttaaaattgacaatttgatgattgcatgtgtag-ttatgaattgataaatgaatgtagttgttgc 25864644  T
Q  364 ctatgatgtttaaatcataatgtgggtttgaatgg 398  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  25864643 ctatgttgtttaaatcataatgtggctttgaatgg 25864609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 142; E-Value: 3e-74
Query Start/End: Original strand, 191 - 552
Target Start/End: Original strand, 2984329 - 2984681
Alignment:
Q  191 cacattatcacaagtaagttgtgtcaatcattttaatgttaatgttaatttgtttaggttgagttttttagaaaaattagagtagtttgcatgtggttag 290  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||||         |||||| |||||||||||| | ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  2984329 cacattatcacaagtaagttgcatcaatcatt---------atgttagtttgtttaggtttaatttttaa-aaaaattagagtagtttgcatgtggttag 2984418  T
Q  291 ggttgatctcaaaattgagaatttgatgattgcatgtgtagtttagaaattgataattgaatgtagttgttgcct--atgatgtttaaatcataatgtgg 388  Q
    ||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||  || |||  |||||||| ||| |   |  ||||| ||||| | |||||||||    
T  2984419 ggttgattttaaaattgacaatttgatgattgcatgtgttgttaagatgtt-atagatgaatgtaattgatctttgaatgatttttaagt-ataatgtgg 2984516  T
Q  389 gtttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacaccaagtgtttgataaaatgtctcaatgacaattttattgattatttag 488  Q
     |||||||| || ||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  2984517 ttttgaatgatgccaaataaacacaatttgaataagtttcatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgcctcaacgacaattatattgattatttag 2984616  T
Q  489 ttagttta-gttatggaaatgatagaaatgatgttaattatagtttggttaagtgtattttgatt 552  Q
    |||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||    
T  2984617 ttagtttaggttatggaaatgatgaaaatgatgttaattatagtttgataaagtgtatattgatt 2984681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 122; E-Value: 3e-62
Query Start/End: Original strand, 270 - 510
Target Start/End: Original strand, 24249759 - 24249999
Alignment:
Q  270 gagtagtttgcatgtggttagggttgatctcaaaattgagaatttgatgattgcatgtgtagtttagaaattgataattgaatgtagttgttgcctatga 369  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |   |||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||    |||    
T  24249759 gagtagtttgcatgtggttagggttgatataggaattgacaatttgatgattgcatgtgtagtttatgaattgataaatgaatgtagttgttgtaattga 24249858  T
Q  370 tgtttaaatcataatgtgggtttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacaccaagtgtttgataaaatgtctcaatgac 469  Q
    ||||||| | ||||||||| ||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||  |||| |||||||||||| | ||||||     
T  24249859 tgtttaagt-ataatgtggttttgaatggtgtcaaatgagcacattttgaatatgtttgatactttgcacataaagtatttgataaaatgccccaatgag 24249957  T
Q  470 aattttattgattatttagttagttta-gttatggaaatgat 510  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  24249958 aattatattgattatttagtcagtttaggttatggaaatgat 24249999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 111; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 270 - 497
Target Start/End: Original strand, 37327080 - 37327286
Alignment:
Q  270 gagtagtttgcatgtggttagggttgatctcaaaattgagaatttgatgattgcatgtgtagtttagaaattgataattgaatgtagttgttgcctatga 369  Q
    |||||||||||||||| |||||||| || | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||                  
T  37327080 gagtagtttgcatgtg-ttagggttaattttaaaattgacaatttgatgattgcatgtgtagtttatgaattgataaatgaatgta-------------- 37327164  T
Q  370 tgtttaaatcataatgtgggtttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacaccaagtgtttgataaaatgtctcaatgac 469  Q
          ||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  37327165 ------aatgataatgtgattttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgtctcaatgac 37327258  T
Q  470 aattttattgattatttagttagtttag 497  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  37327259 aattttattgattatttagttagtttag 37327286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 380 - 510
Target Start/End: Original strand, 35552051 - 35552182
Alignment:
Q  380 ataatgtgggtttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacaccaagtgtttgataaaatgtctcaatgacaattttattg 479  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  35552051 ataatgtggttttgaatggtggcaaaagaacacattttgagtatgtttgatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgcctcaatgacaattttattg 35552150  T
Q  480 attatttagttagttta-gttatggaaatgat 510  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  35552151 attatttagttagtttaggttatggatatgat 35552182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 380 - 510
Target Start/End: Original strand, 20857671 - 20857802
Alignment:
Q  380 ataatgtgggtttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacaccaagtgtttgataaaatgtctcaatgacaattttattg 479  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||| ||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  20857671 ataatgtggttttgaatggttgcaaaagaacacattttgagtatgtttgatactttgcacacaaattgtttgataaaatgcctcaatgacaattttattg 20857770  T
Q  480 attatttagttagttta-gttatggaaatgat 510  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  20857771 attatttagttagtttaggttatggatatgat 20857802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 380 - 497
Target Start/End: Complemental strand, 25214 - 25097
Alignment:
Q  380 ataatgtgggtttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacaccaagtgtttgataaaatgtctcaatgacaattttattg 479  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||  |||||| ||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  25214 ataatgtggttttgattggtggcaaaataacacattttgagtatgtttgatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgtgtcaatgacaattttattg 25115  T
Q  480 attatttagttagtttag 497  Q
    ||||||||||||||||||    
T  25114 attatttagttagtttag 25097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 380 - 497
Target Start/End: Original strand, 1052910 - 1053027
Alignment:
Q  380 ataatgtgggtttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacaccaagtgtttgataaaatgtctcaatgacaattttattg 479  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||  |||||| ||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  1052910 ataatgtggttttgattggtggcaaaataacacattttgagtatgtttgatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgtatcaatgacaattttattg 1053009  T
Q  480 attatttagttagtttag 497  Q
    ||||||||||||||||||    
T  1053010 attatttagttagtttag 1053027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 380 - 497
Target Start/End: Complemental strand, 23022008 - 23021891
Alignment:
Q  380 ataatgtgggtttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacaccaagtgtttgataaaatgtctcaatgacaattttattg 479  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||  |||||| ||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  23022008 ataatgtggttttgattggtggcaaaataacacattttgagtatgtttgatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgtgtcaatgacaattttattg 23021909  T
Q  480 attatttagttagtttag 497  Q
    ||||||||||||||||||    
T  23021908 attatttagttagtttag 23021891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 380 - 497
Target Start/End: Original strand, 26659832 - 26659949
Alignment:
Q  380 ataatgtgggtttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacaccaagtgtttgataaaatgtctcaatgacaattttattg 479  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||  |||||| ||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  26659832 ataatgtggttttgattggtggcaaaataacacattttgagtatgtttgatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgtgtcaatgacaattttattg 26659931  T
Q  480 attatttagttagtttag 497  Q
    ||||||||||||||||||    
T  26659932 attatttagttagtttag 26659949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 191 - 505
Target Start/End: Original strand, 45127946 - 45128261
Alignment:
Q  191 cacattatcacaagtaagttgtgtcaatcattttaatgttaatgttaatttgtttaggttgagttttttagaaaaattagagtagtttgcatgtggttag 290  Q
    ||||||||||||||||||| |  | ||||| |||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||||  ||||| | ||||||||||||||||||||     
T  45127946 cacattatcacaagtaagtagcattaatcaatttaatcttaatgttagtttgtttaggttaagtttttttaaaaaaattgagtagtttgcatgtggttat 45128045  T
Q  291 ggttgatctcaaaattgagaatttgatgattgcatgtgtagtttagaaattgataattgaatgtagttgttgcctatgatgtttaaatcat--------- 381  Q
    ||||||| |   |||||| | ||||||||||||||||  ||||||        ||||||||||| |||| |     |||||||| ||| ||             
T  45128046 ggttgatgtaggaattgaaattttgatgattgcatgt--agttta--------taattgaatgtcgttgctttaattgatgtttgaatgatgttagagta 45128135  T
Q  382 -aatgtgggtttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacaccaagtgtttgataaaatgtctcaatgacaattttattga 480  Q
     ||||||| |||||||||||||||| ||||||  ||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||  |||| ||||||    
T  45128136 taatgtggttttgaatggtggcaaaagaacacgttttgagtatgtttgatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgccccaatgtgaattgtattga 45128235  T
Q  481 ttatttagttagttta-gttatggaa 505  Q
    ||||| |||||||||| |||||||||    
T  45128236 ttattgagttagtttaggttatggaa 45128261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 78; E-Value: 5e-36
Query Start/End: Original strand, 49 - 252
Target Start/End: Original strand, 35026542 - 35026745
Alignment:
Q  49 ctcggcagttaactaccgaggaaatctgaacttaaacagatcgcagaaccagaacctccc-atttccaaaaaaccttcaaaattctcaatttctctccca 147  Q
    ||||| |||||||  |||| ||||||||||| ||| || || |||| ||||||||||  | |||| ||||| | |||||||||||  ||||||||| | |    
T  35026542 ctcggtagttaaccgccgatgaaatctgaacataatcatat-gcagcaccagaacctttctattttcaaaacatcttcaaaattcgaaatttctctacaa 35026640  T
Q  148 tttcctaccaaatccattt-cacgaattgcaagcaaatcaagtgcacattatcacaagtaagttgtgtcaatcattttaatgttaatgttaatttgttta 246  Q
    | | | ||||||| ||||| |||||||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  35026641 tcttc-accaaattcattttcacgaattgcaagcaaattaactacacattatcacaagtaagttgtgtcaatcattttaatgataatgttaatttgttta 35026739  T
Q  247 ggttga 252  Q
    ||||||    
T  35026740 ggttga 35026745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 408 - 510
Target Start/End: Complemental strand, 34371553 - 34371450
Alignment:
Q  408 aacacaatttgaatatgttttatactttgcacaccaagtgtttgataaaatgtctcaatgacaattttattgattatttagttagttta-gttatggaaa 506  Q
    |||||| ||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |    
T  34371553 aacacattttgagtatgtttgatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgtgtcaatgacaatttttttgattatttagttagtttaggttatggata 34371454  T
Q  507 tgat 510  Q
    ||||    
T  34371453 tgat 34371450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 164 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 5304073 - 5304009
Alignment:
Q  164 tttcacgaattgcaagcaaatcaagtgcacattatcacaagtaagttgtgtcaatcattttaatg 228  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  5304073 tttcacgaattgcaagcaaatcaactgcacattatcacaagtaagttgtatcaatcattttaatg 5304009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 380 - 510
Target Start/End: Original strand, 5677456 - 5677587
Alignment:
Q  380 ataatgtgggtttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacaccaagtgtttgataaaatgtctcaatgacaattttattg 479  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||| ||| ||| ||||| ||||||| ||  ||||||||  ||||||||||||||||| | |||||| |||| |||||    
T  5677456 ataatgtggttttgaatggtagcaaaagaatacattttgagtatgtttgatgttttgcacagaaagtgtttgataaaatgccccaatgaaaattatattg 5677555  T
Q  480 attatttagttagttta-gttatggaaatgat 510  Q
    |||||  ||| |||||| ||||||||||||||    
T  5677556 attatcgagtaagtttaggttatggaaatgat 5677587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 191 - 297
Target Start/End: Original strand, 35551863 - 35551968
Alignment:
Q  191 cacattatcacaagtaagttgtgtcaatcattttaatgttaatgttaatttgtttaggttgagttttttagaaaaattagagtagtttgcatgtggttag 290  Q
    |||||||||||| |||||| |  | ||||| |  ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||  ||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  35551863 cacattatcacatgtaagtagcattaatcaatgcaatgttaatgttagtttgtttaggttaagtttttttaaaaaatt-gagtagttttcatgtggttag 35551961  T
Q  291 ggttgat 297  Q
    |||||||    
T  35551962 ggttgat 35551968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 303 - 496
Target Start/End: Original strand, 22495216 - 22495419
Alignment:
Q  303 aattgagaatttgatgattgcatgtgtagtttagaaattgataattgaatgtagttgttgcctatgatgtttaaatcat----------aatgtgggttt 392  Q
    |||||| | ||||||| ||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||| ||    ||||||||| || ||          ||||||| |||    
T  22495216 aattgacattttgatggttgcatgtgtagtttacgaattgataaatgaatgtagttgatgtaattgatgtttagatgatgtttaagtagaatgtggtttt 22495315  T
Q  393 gaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacaccaagtgtttgataaaatgtctcaatgacaattttattgattatttagttag 492  Q
    |||||||| ||||| ||||||||  |||||||||| ||||||||||||     | |||||||||||| |  ||||| ||||  |||||||||||| ||||    
T  22495316 gaatggtgtcaaattaacacaatgagaatatgtttgatactttgcacaaatgttttttgataaaatgcccaaatgaaaattgcattgattatttacttag 22495415  T
Q  493 ttta 496  Q
    ||||    
T  22495416 ttta 22495419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 30 - 86
Target Start/End: Original strand, 22014282 - 22014338
Alignment:
Q  30 gttaactgctgaggtaaatctcggcagttaactaccgaggaaatctgaacttaaaca 86  Q
    ||||||||| |||| ||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  22014282 gttaactgccgaggaaaacctcggtagttaactaccgaggaaatatgaacttaaaca 22014338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 30 - 86
Target Start/End: Complemental strand, 26663070 - 26663014
Alignment:
Q  30 gttaactgctgaggtaaatctcggcagttaactaccgaggaaatctgaacttaaaca 86  Q
    ||||||||| |||| ||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  26663070 gttaactgccgaggaaaacctcggtagttaactgccgaggaaatctgaacttaaaca 26663014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 33 - 86
Target Start/End: Original strand, 184376 - 184429
Alignment:
Q  33 aactgctgaggtaaatctcggcagttaactaccgaggaaatctgaacttaaaca 86  Q
    |||||| |||| ||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  184376 aactgccgaggaaaacctcggtagttaactaccgaggaaatatgaacttaaaca 184429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 291 - 335
Target Start/End: Original strand, 35026740 - 35026784
Alignment:
Q  291 ggttgatctcaaaattgagaatttgatgattgcatgtgtagttta 335  Q
    ||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  35026740 ggttgattttaaaattgacaatttgatgattgcatgtgtagttta 35026784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 19 - 71
Target Start/End: Complemental strand, 43520824 - 43520772
Alignment:
Q  19 aatcggttgctgttaactgctgaggtaaatctcggcagttaactaccgaggaa 71  Q
    |||||| ||| |||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||    
T  43520824 aatcggctgcagttaactgctgaggaaaacttcggcagttaactaccgaggaa 43520772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 51 - 86
Target Start/End: Original strand, 21817 - 21852
Alignment:
Q  51 cggcagttaactaccgaggaaatctgaacttaaaca 86  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  21817 cggcagttaactgccgaggaaatctgaacttaaaca 21852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 51 - 118
Target Start/End: Original strand, 39252082 - 39252148
Alignment:
Q  51 cggcagttaactaccgaggaaatctgaacttaaacagatcgcagaaccagaacctcccatttccaaaa 118  Q
    |||||||||||| |||||||||| || |||||| ||  ||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  39252082 cggcagttaactgccgaggaaatttggacttaatcat-tcgcagaaccagaccttcccatttccaaaa 39252148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 218 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 489110 - 489072
Alignment:
Q  218 tcattttaatgttaatgttaatttgtttaggttgagttt 256  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||    
T  489110 tcattttaatgttaatgttaatttgtttatgtttagttt 489072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 40 - 86
Target Start/End: Original strand, 36677759 - 36677805
Alignment:
Q  40 gaggtaaatctcggcagttaactaccgaggaaatctgaacttaaaca 86  Q
    |||| ||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  36677759 gaggaaaacctcggtagttaactaccgaggaaatatgaacttaaaca 36677805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 51 - 101
Target Start/End: Original strand, 43211563 - 43211613
Alignment:
Q  51 cggcagttaactaccgaggaaatctgaacttaaacagatcgcagaaccaga 101  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| || |||| || |||||||||    
T  43211563 cggcagttaactgccgaggaaatctgaactaaaccagaacgtagaaccaga 43211613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 30 - 67
Target Start/End: Original strand, 36127408 - 36127445
Alignment:
Q  30 gttaactgctgaggtaaatctcggcagttaactaccga 67  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  36127408 gttaactgctgaggaaaatctcgacagttaactaccga 36127445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 30 - 86
Target Start/End: Complemental strand, 1056238 - 1056182
Alignment:
Q  30 gttaactgctgaggtaaatctcggcagttaactaccgaggaaatctgaacttaaaca 86  Q
    ||||||||| |||| ||| || || |||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  1056238 gttaactgccgaggaaaaccttgggagttaactgctgaggaaatctgaacttaaaca 1056182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 30 - 86
Target Start/End: Original strand, 23018721 - 23018777
Alignment:
Q  30 gttaactgctgaggtaaatctcggcagttaactaccgaggaaatctgaacttaaaca 86  Q
    |||||||||  ||| ||| ||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  23018721 gttaactgccaaggaaaacctcagtagttaactgccgaggaaatctgaacttaaaca 23018777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 359; Significance: 0; HSPs: 35)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 359; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 105 - 581
Target Start/End: Original strand, 17835188 - 17835664
Alignment:
Q  105 tcccatttccaaaaaaccttcaaaattctcaatttctctcccatttcctaccaaatccattt-cacgaattgcaagcaaatcaagtgcacattatcacaa 203  Q
    |||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||| || | | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17835188 tcccatttccaaaacaatttcaaaattctcaatttctctccaatcttc-accaaatccattttcacgaattgcaagcaaatcaagtgcacattatcacaa 17835286  T
Q  204 gtaagttgtgtcaatcattttaatgttaatgttaatttgtttaggttgagttttttagaaaaattagagtagtttgcatgtggttagggttgatctcaaa 303  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| | |||    
T  17835287 gtaagttgt-tcaatcattttaatgttaatgttaatttgtttatgttgatttttttaaaaaaattagagtagtttgtatgtggttaaggttgattttaaa 17835385  T
Q  304 attgagaatttgatgattgcatgtgtagtttagaaattgataattgaatgtagttgttgcctatgatgtttaaatcataatgtgggtttgaatggtggca 403  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  17835386 attgacaatttgatgattgcatgtgtagtttaggaattgataaatgaatgtagttgttgcctatgttgtttaaatcataatgtggctttgaatggtggca 17835485  T
Q  404 aatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacaccaagtgtttgataaaatgtctcaatgacaattttattgattatttagttagttta-gttatg 502  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  17835486 aatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgcctcaatgacaattttattgattatttagttagtttaggttatg 17835585  T
Q  503 gaaatgatagaaatgatgttaattatagtttggttaagtgtattttgattttttagttagtttaggttacgagaattat 581  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17835586 gaaatgatataaatgatgttaattatagtttggttaagtgtatattgattttttagttagtttaggttacgagaattat 17835664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 357; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 30 - 572
Target Start/End: Complemental strand, 15074265 - 15073723
Alignment:
Q  30 gttaactgctgaggtaaatctcggcagttaactaccgaggaaatctgaacttaaacagatcgcagaaccagaacctcccatttccaaaaaacc-ttcaaa 128  Q
    ||||||||| |||| ||| ||||| ||||||||  |||||||||||| || ||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||    
T  15074265 gttaactgccgaggaaaacctcggtagttaactgtcgaggaaatctggacataaccagaacgcagaaccagaacctcccatttacaaaaaaacattcaaa 15074166  T
Q  129 attctcaatttctctcccatttcctaccaaatccattt-cacgaattgcaagcaaatcaagtgcacattatcacaagtaagttgtgtcaatcattttaat 227  Q
    ||||||||||||||||| || | | ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15074165 attctcaatttctctccaatcttc-accaaatccattttcacgaattgtaagcaaatcaagtgcacattatcacaagtaagttgtgtcaatcattttaat 15074067  T
Q  228 gttaatgttaatttgtttaggttgagttttttagaaaaattagagtagtttgcatgtggttagggttgatctcaaaattgagaatttgatgattgcatgt 327  Q
    |||||| |||||||||||| ||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| || ||     |||||| ||||| || |||||||||    
T  15074066 gttaatattaatttgtttatgttaagttttttaaaaaaatt-gagtagtttgcatgtggttaggttttataaatgaattgacaatttcatcattgcatgt 15073968  T
Q  328 gtagtttagaaattgataattgaatgtagttgttgcctatgatgtttaaatcataatgtgggtttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttt 427  Q
    ||||||||   |||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15073967 gtagtttatgtattgataaatgaatgtagttgttgcctatgtagtttaaatcataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttt 15073868  T
Q  428 tatactttgcacaccaagtgtttgataaaatgtctcaatgacaattttattgattatttagttagtttagttatggaaatgatagaaatgatgttaatta 527  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15073867 tatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgtctcaatgacaattttattgattatttagttagtttagttatggaaatgatagaaatgatgttaatta 15073768  T
Q  528 tagtttggttaagtgtattttgattttttagttagtttaggttac 572  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15073767 tagtttggttaagtttattttgattttttagttagtttaggttac 15073723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 353; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 30 - 572
Target Start/End: Complemental strand, 42508064 - 42507522
Alignment:
Q  30 gttaactgctgaggtaaatctcggcagttaactaccgaggaaatctgaacttaaacagatcgcagaaccagaacctcccatttccaaaaaacc-ttcaaa 128  Q
    |||||||||||||| ||||||| | |||||||| ||||||||||||| || ||| |||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||| | ||||||    
T  42508064 gttaactgctgaggaaaatctcagtagttaactgccgaggaaatctggacataaccagaacgcagaaccagaacctctcatttacaaaaaaacattcaaa 42507965  T
Q  129 attctcaatttctctcccatttcctaccaaatccattt-cacgaattgcaagcaaatcaagtgcacattatcacaagtaagttgtgtcaatcattttaat 227  Q
    ||||||||||||||||| || | | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||    
T  42507964 attctcaatttctctccaatcttc-accaaatccattttcacgaattgcaagcaaatcaagtgcacattatcacaagtaacttgtgtcaaacattttaat 42507866  T
Q  228 gttaatgttaatttgtttaggttgagttttttagaaaaattagagtagtttgcatgtggttagggttgatctcaaaattgagaatttgatgattgcatgt 327  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||| || ||     |||| | ||||| || |||||||||    
T  42507865 gttaatgttaatttgtttatgttaagttttttaaaaaaatt-gactagtttgcatgtggttaggttttataaatgaattaacaatttcatcattgcatgt 42507767  T
Q  328 gtagtttagaaattgataattgaatgtagttgttgcctatgatgtttaaatcataatgtgggtttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttt 427  Q
    ||||||||   |||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42507766 gtagtttatgtattgataaatgaatgtagttgttgcctatgtagtttaaatcataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttt 42507667  T
Q  428 tatactttgcacaccaagtgtttgataaaatgtctcaatgacaattttattgattatttagttagtttagttatggaaatgatagaaatgatgttaatta 527  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42507666 tatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgtctcaatgacaattttattgattatttagttagtttagttatggaaatgatagaaatgatgttaatta 42507567  T
Q  528 tagtttggttaagtgtattttgattttttagttagtttaggttac 572  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42507566 tagtttggttaagtttattttgattttttagttagtttaggttac 42507522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 342; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 53 - 581
Target Start/End: Complemental strand, 27453634 - 27453104
Alignment:
Q  53 gcagttaactaccgaggaaatctgaacttaaacagatcgcagaaccagaacc--tcccatttccaaaaaaccttcaaaattctcaatttctctcccattt 150  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||| || | ||||||| ||||| |  | ||||||||||||   ||||||||||| |||||||||||| || |    
T  27453634 gcagttaactgccgaggaaatctgaacttaatcata-cgcagaaacagaaacattaccatttccaaaacttcttcaaaattcacaatttctctccaatct 27453536  T
Q  151 cctaccaaatccattt-cacgaattgcaagcaaatcaagtgcacattatcacaagtaagttgtgtcaatcattttaatgttaatgttaatttgtttaggt 249  Q
     | |||||| |||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  27453535 tc-accaaagccattttcacaaattgcaagcaaatcaattgcacattatcacaagtaagttgtatcaatcattttaatgataatgttagtttgtttaggt 27453437  T
Q  250 tgagttttttagaaaaattagagtagtttgcatgtggttagggttgatctcaaaattgagaatttgatgattgcatgtgtagtttagaaattgataattg 349  Q
    | | |||   | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||    
T  27453436 ttattttaaaaaaaaaattagagtagtttgcatgtggttagagttgatttcaaaattgacaatttgatgattgcatgtgtagtttaggaattgataaatg 27453337  T
Q  350 aatgtagttgttgcctatgatgtttaaatcataatgtgggtttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacaccaagtgtt 449  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  27453336 aatgtagttgttacctatgttgtttaaatcataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtt 27453237  T
Q  450 tgataaaatgtctcaatgacaattttattgattatttagttagttta-gttatggaaatgatagaaatgatgttaattatagtttggttaagtgtatttt 548  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  27453236 tgataaaatgtctcattgacaattttattgattatttagtcagtttaggttatggaaatgatagaaatgatgttaattatagtttggttaagtgtatatt 27453137  T
Q  549 gattttttagttagtttaggttacgagaattat 581  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27453136 gattttttagttagtttaggttacgagaattat 27453104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 342; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 30 - 581
Target Start/End: Original strand, 34738400 - 34738954
Alignment:
Q  30 gttaactgctgaggtaaatctcggcagttaactaccgaggaaatctgaacttaaacagatcgcagaaccagaacctc-ccatttccaaaaaaccttcaaa 128  Q
    ||||| ||| |||| ||| ||||| |||||||| |||||||||||||||| ||| || | ||||||||||||||||  |||||||||||| | |||||||    
T  34738400 gttaaatgccgaggaaaacctcggtagttaactgccgaggaaatctgaacataatcata-cgcagaaccagaacctttccatttccaaaacatcttcaaa 34738498  T
Q  129 attctcaatttctctcccatttcctaccaaatccattt-cacgaattgcaagcaaatcaagtgcacattatcacaagtaagttgtgtcaatcattttaat 227  Q
    |||| |||||||||||| || | | |||||||| |||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34738499 attcacaatttctctccaatcttc-accaaatctattttcacgaattgcaagcaaatcatctgcacattatcacaagtaagttgtgtcaatcattttaat 34738597  T
Q  228 gttaatgttaatttgtttaggttgagtttt--ttagaaaaattagagtagtttgcatgtggttagggttgatctcaaaattgagaatttgatgattgcat 325  Q
    | ||||||||||||||||||||||| ||||    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||    
T  34738598 gataatgttaatttgtttaggttgatttttaaaaaaaaaaattagagtagtttgcatgtggttagggttgattttaaaattgacaatttgatgattgcat 34738697  T
Q  326 gtgtagtttagaaattgataattgaatgtagttgttgcctatgatgtttaaatcataatgtgggtttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgt 425  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34738698 gtgtagtttaggaattgataaatgaatgtagttgttacctatgttgtttaaatcataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgt 34738797  T
Q  426 tttatactttgcacaccaagtgtttgataaaatgtctcaatgacaattttattgattatttagttagttta-gttatggaaatgatagaaatgatgttaa 524  Q
    ||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  34738798 tttatgctttgctcacaaagtgtttgataaaatgtctcgatgacaattttattgattatgtagttagtttaggttatggaaatgatagaaatgatgttaa 34738897  T
Q  525 ttatagtttggttaagtgtattttgattttttagttagtttaggttacgagaattat 581  Q
    |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  34738898 ttatagtttgattaagtgtatattgattttttagttagtgtaagttacgagaattat 34738954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 330; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 30 - 581
Target Start/End: Original strand, 47776368 - 47776922
Alignment:
Q  30 gttaactgctgaggtaaatctcggcagttaactaccgaggaaatctgaacttaaacagatcgcagaaccagaacc--tcccatttccaaaaaaccttcaa 127  Q
    ||||||||| |||| ||| ||||| | |||||| |||||||||||||||||||| || | ||||||| ||||| |  | ||||||||||||   || |||    
T  47776368 gttaactgccgaggaaaacctcggtaattaactgccgaggaaatctgaacttaatcata-cgcagaaacagaaacattaccatttccaaaacttctccaa 47776466  T
Q  128 aattctcaatttctctcccatttcctaccaaa-tccatttcacgaattgcaagcaaatcaagtgcacattatcacaagtaagttgtgtcaatcattttaa 226  Q
    ||||| | |||||||||| || | | |||||| ||  |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  47776467 aattcaccatttctctccaatcttc-accaaagtcattttcacaaattgcaagcaaatcaactgcacattatcacaagtaaggtgtatcaatcattttaa 47776565  T
Q  227 tgttaatgttaatttgtttaggttgagttttt-tagaaaaattagagtagtttgcatgtggttagggttgatctcaaaattgagaatttgatgattgcat 325  Q
    || |||||||| |||||||||||| | |||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||    
T  47776566 tgataatgttagtttgtttaggtttattttttaaaaaaaaattagagtagtttgcatgtggttagggttgattttaaaattgacaatttgatgattgcat 47776665  T
Q  326 gtgtagtttagaaattgataattgaatgtagttgttgcctatgatgtttaaatcataatgtgggtttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgt 425  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  47776666 gtgtagtttaggaattgataaatgaatgtagttgttgcctatgttgtttaaatcataatgtggctttgaatggtgacaaatgaacacaatttgaatatgt 47776765  T
Q  426 tttatactttgcacaccaagtgtttgataaaatgtctcaatgacaattttattgattatttagttagttta-gttatggaaatgatagaaatgatgttaa 524  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  47776766 tttatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgtctcaatgacaaatttattgattatttagttagtttaggttatggaaatgatagaaatgatgttaa 47776865  T
Q  525 ttatagtttggttaagtgtattttgattttttagttagtttaggttacgagaattat 581  Q
    ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47776866 ttatagtctggttaagtgtatattgattttttagttagtttaggttacgagaattat 47776922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 320; E-Value: 1e-180
Query Start/End: Original strand, 164 - 562
Target Start/End: Original strand, 10517151 - 10517549
Alignment:
Q  164 tttcacgaattgcaagcaaatcaagtgcacattatcacaagtaagttgtgtcaatcattttaatgttaatgttaatttgtttaggttgagttttttagaa 263  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  10517151 tttcacgaattgcaagcaaatcaactgcacattatcacaagtaagctgtgtcaatcattttaatcataatgttaatttgtttaggttga-ttttttaaaa 10517249  T
Q  264 aaattagagtagtttgcatgtggttagggttgatctcaaaattgagaatttgatgattgcatgtgtagtttagaaattgataattgaatgtagttgttgc 363  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  10517250 aaattagagtagtttgtatgtggttagggttgattttaaaattgacaatttgatgattgcatgtgtagtttaggaattgataaatgaatgtagttgttgc 10517349  T
Q  364 ctatgatgtttaaatcataatgtgggtttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacaccaagtgtttgataaaatgtctc 463  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  10517350 ctatgttgtttaaatcataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgtctc 10517449  T
Q  464 aatgacaattttattgattatttagttagttta-gttatggaaatgatagaaatgatgttaattatagtttggttaagtgtattttgattttttagttag 562  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  10517450 aatgacaattttattgattatttagttagtttaggttatggaaatgatataaatgatgttaattatagtttggttaagtgtatattgattttttagttag 10517549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 315; E-Value: 1e-177
Query Start/End: Original strand, 164 - 581
Target Start/End: Original strand, 39460698 - 39461116
Alignment:
Q  164 tttcacgaattgcaagcaaatcaagtgcacattatcacaagtaagttgtgtcaatcattttaatgttaatgttaatttgtttaggttgagttttttagaa 263  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| | ||||| | ||    
T  39460698 tttcacgaattgcaagcaaatcaactgcacattatcacaagtaagttgtatcaatcattttaatgataatgttagtttgtttaggtttattttttaaaaa 39460797  T
Q  264 aaattagagtagtttgcatgtggttagggttgatctcaaaattgagaatttgatgattgcatgtgtagtttagaaattgataattgaatgtagttgttgc 363  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||    
T  39460798 aaattagagtagtttgcatgtggttagggttgattttaaaattgacaatttgatgattgcatgtgtagtttatgaattgataaatgaatgtagttgttgc 39460897  T
Q  364 ctatgatgtttaaatcataatgtgggtttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacaccaagtgtttgataaaatgtctc 463  Q
    ||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||    
T  39460898 ctattttgtttaaatcataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgcctc 39460997  T
Q  464 aatgacaattttattgattatttagttagttta-gttatggaaatgatagaaatgatgttaattatagtttggttaagtgtattttgattttttagttag 562  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  39460998 aatgacaattttattgattatttagttagtttaggttatggatatggtagaaatgatgttaattatagtttggttaagtgtatattgatgttttagttag 39461097  T
Q  563 tttaggttacgagaattat 581  Q
    |||||||||| ||||||||    
T  39461098 tttaggttacaagaattat 39461116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 291; E-Value: 1e-163
Query Start/End: Original strand, 164 - 581
Target Start/End: Complemental strand, 47672988 - 47672570
Alignment:
Q  164 tttcacgaattgcaagcaaatcaagtgcacattatcacaagtaagttgtgtcaatcattttaatgttaatgttaatttgtttaggttgagttttttagaa 263  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| | ||||  | ||    
T  47672988 tttcacgaattgcaagcaaatcaactgcacattatcacaagtaagttgtatcaatcattttaatgataatgttagtttgtttaggtttatttttaaaaaa 47672889  T
Q  264 aaattagagtagtttgcatgtggttagggttgatctcaaaattgagaatttgatgattgcatgtgtagtttagaaattgataattgaatgtagttgttgc 363  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||| || | ||  ||||||||| ||||||||||||||||    
T  47672888 aaattatagtagtttgcatgtggttagggttgattttaaaattgacaatttgatgattgcatgtataatctatgaattgataaatgaatgtagttgttgc 47672789  T
Q  364 ctatgatgtttaaatcataatgtgggtttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacaccaagtgtttgataaaatgtctc 463  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||    
T  47672788 ctatgttgtttaaatcataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgatcaaatgcctc 47672689  T
Q  464 aatgacaattttattgattatttagttagttta-gttatggaaatgatagaaatgatgttaattatagtttggttaagtgtattttgattttttagttag 562  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||    
T  47672688 aatgaaaattatattgattatttagttagtttaggttatggaaatgatagaaatgatgttaattatagtttgattaagtgtatattgattttctagttag 47672589  T
Q  563 tttaggttacgagaattat 581  Q
    ||||||||| |||||||||    
T  47672588 tttaggttatgagaattat 47672570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 290; E-Value: 1e-162
Query Start/End: Original strand, 164 - 581
Target Start/End: Original strand, 36977766 - 36978186
Alignment:
Q  164 tttcacgaattgcaagcaaatcaagtgcacattatcacaagtaagttgtgtcaatcattttaatgttaatgttaatttgtttaggttgagtttttt--ag 261  Q
    |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| | ||||||  |     
T  36977766 tttcacgaattgcaagcaaatcaactgtacattatcacaagtaagttgtatcaatcattttaatgataatgttagtttgtttaggtttattttttttaaa 36977865  T
Q  262 aaaaattagagtagtttgcatgtggttagggttgatctcaaaattgagaatttgatgattgcatgtgtagtttagaaattgataattgaatgtagttgtt 361  Q
    ||||||  |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||    
T  36977866 aaaaatctgagtagtttgcatgtggttagggttgattttaaaattgacaatttgatgattgcatgtgtagtttatgaattgataaatgaatgtagttgtt 36977965  T
Q  362 gcctatgatgtttaaatcataatgtgggtttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacaccaagtgtttgataaaatgtc 461  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |    
T  36977966 gcctatgttgtttaaatcataatgtgactttgaatggtggtaaatgaacataatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgatcaaatgcc 36978065  T
Q  462 tcaatgacaattttattgattatttagttagttta-gttatggaaatgatagaaatgatgttaattatagtttggttaagtgtattttgattttttagtt 560  Q
    ||||||| |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  36978066 tcaatgaaaattatattgattatttagttagtttaggttatggaaatgatagaaatgatgttaattatagtttggttaagtgtatattgattttttagtt 36978165  T
Q  561 agtttaggttacgagaattat 581  Q
    ||||||||||| |||||||||    
T  36978166 agtttaggttatgagaattat 36978186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 271; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 164 - 581
Target Start/End: Original strand, 37340474 - 37340892
Alignment:
Q  164 tttcacgaattgcaagcaaatcaagtgcacattatcacaagtaagttgtgtcaatcattttaatgttaatgttaatttgtttaggttgagttttttagaa 263  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||   |||||||| |||||||||||| | ||||||| ||    
T  37340474 tttcacgaattgcaagcaaatcaacagcacattatcacaagtaagttgtatcaatcattttaacaataatgttagtttgtttaggtttatttttttaaaa 37340573  T
Q  264 aaattagagtagtttgcatgtggttagggttgatctcaaaattgagaatttgatgattgcatgtgtagtttagaaattgataattgaatgtagttgttgc 363  Q
    |||||| ||||||||| ||||||||||| ||||| | |||||||| |||||||||||| |||||||||||||  |||||| || |||||||| |||||||    
T  37340574 aaattatagtagtttggatgtggttaggattgattttaaaattgacaatttgatgatttcatgtgtagtttatgaattgaaaaatgaatgtacttgttgc 37340673  T
Q  364 ctatgatgtttaaatcataatgtgggtttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacaccaagtgtttgataaaatgtctc 463  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||    
T  37340674 ctatgttgtttaaatcataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgatcaaatgcctc 37340773  T
Q  464 aatgacaattttattgattatttagttagttta-gttatggaaatgatagaaatgatgttaattatagtttggttaagtgtattttgattttttagttag 562  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| || |||| ||||||||    
T  37340774 aatgaaaattatattgattatttagttagtttaggttatggaaatgatagaaatgctgttaattatagtttggttaagagtatattaatttgttagttag 37340873  T
Q  563 tttaggttacgagaattat 581  Q
    ||||||||| |||||||||    
T  37340874 tttaggttatgagaattat 37340892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 260; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 164 - 581
Target Start/End: Complemental strand, 9494709 - 9494281
Alignment:
Q  164 tttcacgaattgcaagcaaatcaagtgcacattatcacaagtaagttgtgtcaatcattttaatgttaatgttaatttgtttaggttgagttttt----- 258  Q
    ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| | ||||          
T  9494709 tttcacgaattccaagcaaatcaactgcacattatcacaagtaagttgtatcaatcattttaatgataatgttagtttgtttaggtttatttttaaaaaa 9494610  T
Q  259 ------tagaaaaattagagtagtttgcatgtggttagggttgatctcaaaattgagaatttgatgattgcatgtgtagtttagaaattgataattgaat 352  Q
          || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||  ||||||||| |||||    
T  9494609 ataaaataaaaaaattagagtagtttgcatgtggtttgggttgattttaaaattgaaaatttgatggttgcatgtgtaatttatgaattgataaatgaat 9494510  T
Q  353 gtagttgttgcctatgatgtttaaatcataatgtgggtttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacaccaagtgtttga 452  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  9494509 gtagttgttgcctatgttgtttaaatcataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttga 9494410  T
Q  453 taaaatgtctcaatgacaattttattgattatttagttagttta-gttatggaaatgatagaaatgatgttaattatagtttggttaagtgtattttgat 551  Q
    | |||||  ||||||| |||| |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  9494409 tcaaatgcgtcaatgaaaattatattgattatttagttagtttaggttatgg-aatgatagaaatgatgttaattatagtttgattaagtgtatattgat 9494311  T
Q  552 tttttagttagtttaggttacgagaattat 581  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  9494310 tttttagttagtttaggttatgagaattat 9494281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 182; E-Value: 4e-98
Query Start/End: Original strand, 191 - 571
Target Start/End: Complemental strand, 14689933 - 14689553
Alignment:
Q  191 cacattatcacaagtaagttgtgtcaatcattttaatgttaatgttaatttgtttaggttgagttttttagaaaaattagagtagtttgcatgtggttag 290  Q
    |||||||||||||||||||    | |||||||  |||| ||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||||  ||||||||| |||||||||     
T  14689933 cacattatcacaagtaagtaccattaatcattgcaatggtaatgttaatttgtttaggttaagtttttaaaaaaaattt-agtagtttgtatgtggttaa 14689835  T
Q  291 ggttgatctcaaaattgagaatttgatgattgcatgtgtagtttagaaattgataattgaatgtagttgttgcctatgatgtttaaatcataatgtgggt 390  Q
    | |||||     |||||| ||||| || |||||||||||||||||   |||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||| | |    
T  14689834 gtttgataaatgaattgacaatttcatcattgcatgtgtagtttatttattgataaatgaatgtagttgttgtctatgttgtttaaatgataatgtagct 14689735  T
Q  391 ttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacaccaagtgtttgataaaatgtctcaatgacaattttattgattatttagtt 490  Q
    |||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||| ||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  14689734 ttgaatagtggcaaataaacacaatttgaatatcttttatactttgcatacaaagtgtttgatcaaatgcctcaatgaaaattatattgattatttagtt 14689635  T
Q  491 agttta-gttatggaaatgatagaaatgatgttaattatagtttggttaagtgtattttgattttttagttagtttaggtta 571  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||    
T  14689634 agtttatgttatggaaatgataaaaatgatgttaattattgtttggttaagtgtatattgattatttagttagtttatgtta 14689553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 86; E-Value: 8e-41
Query Start/End: Original strand, 164 - 496
Target Start/End: Complemental strand, 556547 - 556217
Alignment:
Q  164 tttcacgaattgcaagcaaatcaagtgcacattatcacaagtaagttgtgtcaatcattttaatgttaatgttaatttgtttaggttgagttttttagaa 263  Q
    |||||||| |||||||||| |||  | |||||||||||| |||||| |  | ||||| | |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||    
T  556547 tttcacgatttgcaagcaa-tcatctccacattatcacaggtaagtagcattaatcaatgtaatgttaatgttagtttgtttaggttaagttttttaaaa 556449  T
Q  264 aaattagagtagtttgcatgtggttagggttgatctcaaaattgagaatttgatgattgcatgtgtagtttagaaattgata-attgaatgtagttgttg 362  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||| |||| || |   ||||||   ||||||||||||||||  |||||| || |  ||| | |   | || ||| ||    
T  556448 aaatt-gagtagttttcatgtggttaaggtttatgtaggaattgaatttttgatgattgcatgt--agtttataattgaatatagttgctttaattgatg 556352  T
Q  363 cct--atgatgtttaaatcataatgtgggtttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacaccaagtgtttgataaaatgt 460  Q
      |  ||||||||  | | ||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||     
T  556351 attggatgatgttagagt-ataatgtggttttgaatggtggcaaatgaacatattttgagtatgtttgatactttgcatacaaagtgtttgataaaatgc 556253  T
Q  461 ctcaatgacaattttattgattatttagttagttta 496  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  556252 ctcaatgacaattttatttattatttagttagttta 556217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 86; E-Value: 8e-41
Query Start/End: Original strand, 270 - 496
Target Start/End: Complemental strand, 17741255 - 17741019
Alignment:
Q  270 gagtagtttgcatgtggttagggttgatctcaaaattgagaatttgatgattgcatgtgtagtttagaaattgataattgaatgtagttgttgcctatga 369  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||     |||||| | ||||| ||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||    |||    
T  17741255 gagtagtttgcatgtggttagggtttatgaatgaattgacattttgaagattgcatgtgtagtttatgaattgataaatgaatgtagttgttgtaattga 17741156  T
Q  370 tgtttaaatcat----------aatgtgggtttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacaccaagtgtttgataaaatg 459  Q
    | ||||||| ||          ||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||     
T  17741155 tatttaaatgatgtttaagtataatgtggttttgaatggtgccatatgaacacaatttgaatatgtttgatactttgcacacaaagtgtttgataaaatt 17741056  T
Q  460 tctcaatgacaattttattgattatttagttagttta 496  Q
     |  ||||| |||| ||||||||||||||||||||||    
T  17741055 cccaaatgagaattatattgattatttagttagttta 17741019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 86; E-Value: 8e-41
Query Start/End: Original strand, 380 - 497
Target Start/End: Original strand, 41880876 - 41880993
Alignment:
Q  380 ataatgtgggtttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacaccaagtgtttgataaaatgtctcaatgacaattttattg 479  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||  |||||| ||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  41880876 ataatgtggttttgaatggtggcaaaataacacattttgagtatgtttgatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgtgtcaatgacaattttattg 41880975  T
Q  480 attatttagttagtttag 497  Q
    ||||||||||||||||||    
T  41880976 attatttagttagtttag 41880993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 380 - 497
Target Start/End: Complemental strand, 35610103 - 35609986
Alignment:
Q  380 ataatgtgggtttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacaccaagtgtttgataaaatgtctcaatgacaattttattg 479  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||  |||||| ||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  35610103 ataatgtggttttgattggtggcaaaataacacattttgagtatgtttgatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgtgtcaatgacaattttattg 35610004  T
Q  480 attatttagttagtttag 497  Q
    ||||||||||||||||||    
T  35610003 attatttagttagtttag 35609986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 380 - 497
Target Start/End: Original strand, 48403743 - 48403860
Alignment:
Q  380 ataatgtgggtttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacaccaagtgtttgataaaatgtctcaatgacaattttattg 479  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||  |||||| ||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  48403743 ataatgtggttttgaatggtggcaaaataacacattttgagtatgtttgatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgtgtcaatgataattttattg 48403842  T
Q  480 attatttagttagtttag 497  Q
    ||||||||||||||||||    
T  48403843 attatttagttagtttag 48403860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 78; E-Value: 5e-36
Query Start/End: Original strand, 380 - 497
Target Start/End: Original strand, 45257374 - 45257490
Alignment:
Q  380 ataatgtgggtttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacaccaagtgtttgataaaatgtctcaatgacaattttattg 479  Q
    ||||||||| |||||||||||| |||  |||||| ||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  45257374 ataatgtggttttgaatggtggtaaaa-aacacattttgagtatgtttgatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgtgtcaatgacaattttattg 45257472  T
Q  480 attatttagttagtttag 497  Q
    ||||||||||||||||||    
T  45257473 attatttagttagtttag 45257490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 78; E-Value: 5e-36
Query Start/End: Original strand, 380 - 497
Target Start/End: Complemental strand, 46740234 - 46740117
Alignment:
Q  380 ataatgtgggtttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacaccaagtgtttgataaaatgtctcaatgacaattttattg 479  Q
    ||||||||  |||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  46740234 ataatgtgattttgaatggtggcaaaagaacacattttgagtatgtttgatactttgcacacaaagtgattgataaaatgtgtcaatgacaattttattg 46740135  T
Q  480 attatttagttagtttag 497  Q
    |||||||| |||||||||    
T  46740134 attatttaattagtttag 46740117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 76; E-Value: 7e-35
Query Start/End: Original strand, 380 - 510
Target Start/End: Complemental strand, 5541227 - 5541096
Alignment:
Q  380 ataatgtgggtttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacaccaagtgtttgataaaatgtctcaatgacaattttattg 479  Q
    |||| |||| |||||||||||||||| || || | ||||| ||||||| ||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  5541227 ataacgtggttttgaatggtggcaaaagatcatattttgagtatgtttgatactttgcacacaaattgtttgataaaatgcctcaatgacaattttattg 5541128  T
Q  480 attatttagttagttta-gttatggaaatgat 510  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  5541127 attatttagttagtttaggttatggatatgat 5541096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 394 - 510
Target Start/End: Original strand, 16675186 - 16675303
Alignment:
Q  394 aatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacaccaagtgtttgataaaatgtctcaatgacaattttattgattatttagttagt 493  Q
    |||||||||||| ||| ||| ||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  16675186 aatggtggcaaaagaatacattttgagtatgtttgatactttgcacacaaagtgtttaataaaatgtctcaatgacaattttattgattattttgttagt 16675285  T
Q  494 tta-gttatggaaatgat 510  Q
    ||| |||||||| |||||    
T  16675286 ttaggttatggatatgat 16675303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 394 - 510
Target Start/End: Original strand, 17649554 - 17649671
Alignment:
Q  394 aatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacaccaagtgtttgataaaatgtctcaatgacaattttattgattatttagttagt 493  Q
    |||||||||||| ||| ||| ||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  17649554 aatggtggcaaaagaatacattttgagtatgtttgatactttgcacacaaagtgtttaataaaatgtctcaatgacaattttattgattattttgttagt 17649653  T
Q  494 tta-gttatggaaatgat 510  Q
    ||| |||||||| |||||    
T  17649654 ttaggttatggatatgat 17649671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 380 - 497
Target Start/End: Complemental strand, 9371073 - 9370960
Alignment:
Q  380 ataatgtgggtttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacaccaagtgtttgataaaatgtctcaatgacaattttattg 479  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||  |||||| ||||| ||||    ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  9371073 ataatgtggttttgattggtggcaaaataacacattttgagtatg----atactttgcacacaaagtgtttgataaaatgtgtcaatgacaattttattg 9370978  T
Q  480 attatttagttagtttag 497  Q
    ||||||||||||||||||    
T  9370977 attatttagttagtttag 9370960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 380 - 460
Target Start/End: Complemental strand, 17465408 - 17465328
Alignment:
Q  380 ataatgtgggtttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacaccaagtgtttgataaaatgt 460  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||  |||||| ||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  17465408 ataatgtggttttgaatggtggcaaaataacacattttgagtatgtttgatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgt 17465328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 380 - 460
Target Start/End: Original strand, 17587806 - 17587886
Alignment:
Q  380 ataatgtgggtttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacaccaagtgtttgataaaatgt 460  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||  |||||| ||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  17587806 ataatgtggttttgaatggtggcaaaataacacattttgagtatgtttgatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgt 17587886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 30 - 86
Target Start/End: Original strand, 35606825 - 35606881
Alignment:
Q  30 gttaactgctgaggtaaatctcggcagttaactaccgaggaaatctgaacttaaaca 86  Q
    ||||||||| |||| ||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  35606825 gttaactgccgaggaaaacctcggtagttaactgccgaggaaatctgaacttaaaca 35606881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 30 - 86
Target Start/End: Complemental strand, 41884163 - 41884107
Alignment:
Q  30 gttaactgctgaggtaaatctcggcagttaactaccgaggaaatctgaacttaaaca 86  Q
    ||||||||| |||| ||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  41884163 gttaactgccgaggaaaacctcggaagttaactgccgaggaaatctgaacttaaaca 41884107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 462 - 497
Target Start/End: Complemental strand, 17462899 - 17462864
Alignment:
Q  462 tcaatgacaattttattgattatttagttagtttag 497  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17462899 tcaatgacaattttattgattatttagttagtttag 17462864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 462 - 497
Target Start/End: Original strand, 17590315 - 17590350
Alignment:
Q  462 tcaatgacaattttattgattatttagttagtttag 497  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17590315 tcaatgacaattttattgattatttagttagtttag 17590350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 3 - 72
Target Start/End: Original strand, 31323058 - 31323127
Alignment:
Q  3 tgccgaattttgaagaaatcggttgctgttaactgctgaggtaaatctcggcagttaactaccgaggaaa 72  Q
    ||||||||||||||||||  |||||  ||||||| | |||  ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  31323058 tgccgaattttgaagaaactggttgtagttaacttccgagaaaaacctcggcagttaactaccgaggaaa 31323127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 49 - 96
Target Start/End: Complemental strand, 35610433 - 35610386
Alignment:
Q  49 ctcggcagttaactaccgaggaaatctgaacttaaacagatcgcagaa 96  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||| |||||||    
T  35610433 ctcggcagttaactaccgaggaaaactgaacataaccagaacgcagaa 35610386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 272 - 327
Target Start/End: Original strand, 41734441 - 41734496
Alignment:
Q  272 gtagtttgcatgtggttagggttgatctcaaaattgagaatttgatgattgcatgt 327  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| |   |||||| ||||||||||||||||||    
T  41734441 gtagtttgcacgtggttagggttgatgttggaattgaaaatttgatgattgcatgt 41734496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 390 - 441
Target Start/End: Original strand, 41734559 - 41734610
Alignment:
Q  390 tttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacac 441  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||| | ||||||| |||||||||||||    
T  41734559 tttgaatggtggcaaaagaacacatttttagtatgtttgatactttgcacac 41734610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 30 - 86
Target Start/End: Original strand, 10097952 - 10098007
Alignment:
Q  30 gttaactgctgaggtaaatctcggcagttaactaccgaggaaatctgaacttaaaca 86  Q
    ||||||||| |||| ||| ||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||    
T  10097952 gttaactgccgaggaaaacctcggtagtta-ctaccgaggaaatatgaacttaaaca 10098007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 357; Significance: 0; HSPs: 47)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 357; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 50 - 581
Target Start/End: Original strand, 50963014 - 50963541
Alignment:
Q  50 tcggcagttaactaccgaggaaatctgaacttaaacagatcgcagaaccagaacctcccatttccaaaaaaccttcaaaattctcaatttctctcccatt 149  Q
    |||| |||||||| | ||||||||||||||| || |||| ||||||||||     |||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||| ||     
T  50963014 tcggtagttaactgctgaggaaatctgaactaaaccagaacgcagaaccat----tcccatttccaaaacaatttcaaaattctcaatttctctccaatc 50963109  T
Q  150 tcctaccaaatccattt-cacgaattgcaagcaaatcaagtgcacattatcacaagtaagttgtgtcaatcattttaatgttaatgttaatttgtttagg 248  Q
    | | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50963110 ttc-accaaatccattttcacgaattgcaagcaaatcaagtgtacattatcacaagtaagttgtgtcaatcattttaatgttaatgttaatttgtttagg 50963208  T
Q  249 ttgagttttttagaaaaattagagtagtttgcatgtggttagggttgatctcaaaattgagaatttgatgattgcatgtgtagtttagaaattgataatt 348  Q
    |||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |    
T  50963209 ttgatttttttaaaaaaattagagtagtttgtatgtggttagggttgattttaaaattgacaatttgatgattgcatgtgtagtttaggaattgataaat 50963308  T
Q  349 gaatgtagttgttgcctatgatgtttaaatcataatgtgggtttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacaccaagtgt 448  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  50963309 gaatgtagttgttgcctatgttgtttaaatcataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttacacacaaagtgt 50963408  T
Q  449 ttgataaaatgtctcaatgacaattttattgattatttagttagttta-gttatggaaatgatagaaatgatgttaattatagtttggttaagtgtattt 547  Q
    ||||||||||| |||| ||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| |    
T  50963409 ttgataaaatgcctcagtgacaattttataaattatttagttagtttaggttatggaaatgatataaatgatgttaa-tatagtttggttaagtgtatat 50963507  T
Q  548 tgattttttagttagtttaggttacgagaattat 581  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50963508 tgattttttagttagtttaggttacgagaattat 50963541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 353; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 51 - 581
Target Start/End: Original strand, 3975763 - 3976294
Alignment:
Q  51 cggcagttaactaccgaggaaatctgaacttaaacagatcgcagaaccagaacctcccatttccaaaaaaccttcaaaattctcaatttctctcccattt 150  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| || |||| |||||||| |||    ||||||| | ||||     |||||||| ||| || ||||| || |    
T  3975763 cggcagttaactgccgaggaaatctgaactaaaccagaacgcagaactagacttccccattttccaaaacttcacaaaattcacaaattttctccaatct 3975862  T
Q  151 cctaccaaatcca-tttcacgaattgcaagcaaatcaagtgcacattatcacaagtaagttgtgtcaatcattttaatgttaatgttaatttgtttaggt 249  Q
     | ||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3975863 tc-accaaatcttctttcacgaattgcaagcaaatcaagtgcacattatcacaagtaagttgtgtcaatcattttaatgttaatgttaatttgtttaggt 3975961  T
Q  250 tgagttttttagaaaaattagagtagtttgcatgtggttagggttgatctcaaaattgagaatttgatgattgcatgtgtagtttagaaattgataattg 349  Q
    ||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||    
T  3975962 tgatttttttaaaaaaattagagtagtttgtatgtggttagggttgatttaaaaattgacaatttgatgattgcatgtgtagtttagaaattggcaattg 3976061  T
Q  350 aatgtagttgttgcctatgatgtttaaatcataatgtgggtttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacaccaagtgtt 449  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  3976062 aatgtagttgttgcctatgtagtttaaatcataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtt 3976161  T
Q  450 tgataaaatgtctcaatgacaattttattgattatttagttagttta-gttatggaaatgatagaaatgatgttaattatagtttggttaagtgtatttt 548  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  3976162 tgataaaatgtctcaatgacaattttattgattatttagttagtttaggttatggaaatgatataaaggatgttaattatagtttggttaagtgtatatt 3976261  T
Q  549 gattttttagttagtttaggttacgagaattat 581  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3976262 gattttttagttagtttaggttacgagaattat 3976294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 334; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 30 - 482
Target Start/End: Complemental strand, 3501932 - 3501477
Alignment:
Q  30 gttaactgctgaggtaaatctcggcagttaactacc-gaggaaatctgaacttaaacagatcgcagaaccagaacctcccatttccaaaaaaccttcaaa 128  Q
    ||||||||| |||| ||| ||||| |||||||| || |||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  3501932 gttaactgccgaggaaaacctcggtagttaactgcccgaggaaatctgaacataaccagaacgcagaaccagaacctcccatttccaaaaaaccttctaa 3501833  T
Q  129 attctcaatttctctcccatttcctaccaaatccattt-cacgaattgcaagcaaatcaagtgcacattatcacaagtaagttgtgtcaatcattttaat 227  Q
    ||||||||||||| | | || | | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3501832 attctcaatttcttttcaatcttc-accaaatccattttcacgaattgcaagcaaatcaagtgcacattatcacaagtaagttgtgtcaatcattttaat 3501734  T
Q  228 gttaatgttaatttgtttaggttgagtttt--ttagaaaaattagagtagtttgcatgtggttagggttgatctcaaaattgagaatttgatgattgcat 325  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||    | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  3501733 gttaatgttaatttgtttaggttgatttttaaaaaaaaaaattagagtagtttgtatgtggttagggttgatttcaaaattgagaatttgatgattgcat 3501634  T
Q  326 gtgtagtttagaaattgataattgaatgtagttgttgcctatgatgtttaaatcataatgtgggtttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgt 425  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3501633 gtgtagtttagaaattgataattgaatgtagttgttgcctatgttgtttaaatcataatgtgggtttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgt 3501534  T
Q  426 tttatactttgcacaccaagtgtttgataaaatgtctcaatgacaattttattgatt 482  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3501533 tttatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgtctcaatgacaattttattgatt 3501477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 330; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 30 - 581
Target Start/End: Original strand, 42165199 - 42165750
Alignment:
Q  30 gttaactgctgaggtaaatctcggcagttaactaccgaggaaatctgaacttaaacagatcgcagaaccagaacctcccatttccaaaaaaccttcaaaa 129  Q
    ||||| ||| |||| ||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||    ||||||| | ||||     |||||    
T  42165199 gttaattgccgaggaaaacctcggtagttaactgccgaggaaatctgaactaaaccagaacgcagaaccagacttccccattttccaaaacttcacaaaa 42165298  T
Q  130 ttctcaatttctctcccatttcctaccaaatcca-tttcacgaattgcaagcaaatcaagtgcacattatcacaagtaagttgtgtcaatcattttaatg 228  Q
    ||| ||| || ||||| || | | |||||||    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||     
T  42165299 ttcacaaattttctccaatcttc-accaaatattctttcacgaattgcaagcaaatcaactgcacattatcacaagtaagttgtgtccatcattttaatc 42165397  T
Q  229 ttaatgttaatttgtttaggttgagttttttagaaaaattagagtagtttgcatgtggttagggttgatctcaaaattgagaatttgatgattgcatgtg 328  Q
     ||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||    
T  42165398 ataatgttaatttgtttaggttga-tttttaaaaaaaattagagtagtttgtatgtggttagggttgattttaaaattgacaatttgatgattgcatgtg 42165496  T
Q  329 tagtttagaaattgataattgaatgtagttgttgcctatgatgtttaaatcataatgtgggtttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgtttt 428  Q
    |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  42165497 tagtttaggaattgataaatgaatgtagttgttgcctatgttgtttaaatcataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatatttt 42165596  T
Q  429 atactttgcacaccaagtgtttgataaaatgtctcaatgacaattttattgattatttagttagttta-gttatggaaatgatagaaatgatgttaatta 527  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  42165597 atactttgcacacaaagtgtttgataaaatgcctcaatgacaattttattgattatttagttagtttaggttatggaaatgatataaatgatgttaatta 42165696  T
Q  528 tagtttggttaagtgtattttgattttttagttagtttaggttacgagaattat 581  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42165697 tagtttggttaagtgtatattgattttttagttagtttaggttacgagaattat 42165750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 324; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 49 - 581
Target Start/End: Complemental strand, 4008341 - 4007808
Alignment:
Q  49 ctcggcagttaactaccgaggaaatctgaacttaaacagatcgcagaaccagaacctccc-atttccaaaaaaccttcaaaattctcaatttctctccca 147  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||||||||| || |||| |||||||||||| | |||| |||| | ||||     |||||||| ||| || ||||| |    
T  4008341 ctcgggagttaactgccgaggaaatctgaactaaaccagaacgcagaaccaga-cttcccgattttccaaaacttcacaaaattcacaaattttctccaa 4008243  T
Q  148 tttcctaccaaatcca-tttcacgaattgcaagcaaatcaagtgcacattatcacaagtaagttgtgtcaatcattttaatgttaatgttaatttgttta 246  Q
    | | | ||||||||   |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  4008242 tcttc-accaaatcttctttcacgaatagcaagcaaatcaactgcacattatcacaagtaagttgtgtcaatcattttaatcataatgttaatttgttta 4008144  T
Q  247 ggttgagttttttagaaaaattagagtagtttgcatgtggttagggttgatctcaaaattgagaatttgatgattgcatgtgtagtttagaaattgataa 346  Q
    |||||| ||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||| |||| |||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  4008143 ggttgattttttaaaaaaaattagagtagtttgtatgtggttagggttgattttaaaattgacaattcgatgattgcatgtgtagtttaggaattgataa 4008044  T
Q  347 ttgaatgtagttgttgcctatgatgtttaaatcataatgtgggtttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacaccaagt 446  Q
     ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  4008043 atgaatgtagttgttgcctatgttgtttaaatcataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagt 4007944  T
Q  447 gtttgataaaatgtctcaatgacaattttattgattatttagttagttta-gttatggaaatgatagaaatgatgttaattatagtttggttaagtgtat 545  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  4007943 gtttgataaaatgtctcaatgacaattttattgattatttagttagtttaggttatggaaatgatataaaggatgttaattatagtttgattaagtgtat 4007844  T
Q  546 tttgattttttagttagtttaggttacgagaattat 581  Q
     |||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  4007843 attgattttttagttagtttaggttacaagaattat 4007808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 320; E-Value: 1e-180
Query Start/End: Original strand, 89 - 581
Target Start/End: Complemental strand, 47074187 - 47073692
Alignment:
Q  89 tcgcagaaccagaacctcccatttccaaaaaaccttcaaaattctcaatttctctcccatttcctaccaaatccattt-cacgaattgcaagcaaatcaa 187  Q
    |||||||| |||||| |||||||  |||||||  |||||| ||  |||||||||| | || | | ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  47074187 tcgcagaatcagaacttcccattatcaaaaaaatttcaaatttaacaatttctcttcaatcttc-accaaatccattttcacgaatagcaagcaaatcaa 47074089  T
Q  188 gtgcacattatcacaagtaagttgtgtcaatcattttaatgttaatgttaatttgtttaggttgagttttttagaaaaat---tagagtagtttgcatgt 284  Q
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||   |||||||||||| ||||    
T  47074088 ccgcacattatcacaagtaagttgtgtcaatcattttaatgataatgttaatttgtttaggttga-tttttaaaaaaaataaatagagtagtttgtatgt 47073990  T
Q  285 ggttagggttgatctcaaaattgagaatttgatgattgcatgtgtagtttagaaattgataattgaatgtagttgttgcctatgatgtttaaatcataat 384  Q
    ||||||||||||| | |||||||| |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  47073989 ggttagggttgattttaaaattgacaatttgatgaatgcatgtgtagtttaggaattgataaatgaatgtagttgttgcctatattgtttaaatcataat 47073890  T
Q  385 gtgggtttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacaccaagtgtttgataaaatgtctcaatgacaattttattgattat 484  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  47073889 gtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatattttatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgcctcaatgacaattttattgattat 47073790  T
Q  485 ttagttagttta-gttatggaaatgatagaaatgatgttaattatagtttggttaagtgtattttgattttttagttagtttaggttacgagaattat 581  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47073789 ttagttagtttaggttatggaaatgatagaaatgatgttaattatagtttggttaagtgtatattgattttttagttagtttaggttacgagaattat 47073692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 311; E-Value: 1e-175
Query Start/End: Original strand, 53 - 545
Target Start/End: Complemental strand, 50216894 - 50216399
Alignment:
Q  53 gcagttaactaccgaggaaatctgaacttaaacagatcgcagaaccagaacctc-ccatttccaaaaaaccttcaaaattctcaatttctctcccatttc 151  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||| ||| || | ||||||||||||||||  |||||||||||| |  |||||||||| |||||||||||| || |     
T  50216894 gcagttaactgccgagaaaatctgaacataatcata-cgcagaaccagaacctttccatttccaaaacatattcaaaattcacaatttctctccaatctt 50216796  T
Q  152 ctaccaaatccattt-cacgaattgcaagcaaatcaagtgcacattatcacaagtaagttgtgtcaatcattttaatgttaatgttaatttgtttaggtt 250  Q
    | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  50216795 c-accaaatccattttcacgaattgcaagcaaatcaactgcacattatcacaagtaagttgtgtcaatcattttaatgataatgtaaatttgtttaggtt 50216697  T
Q  251 gagttttttagaa--aaattagagtagtttgcatgtggttagggttgatctcaaaattgagaatttgatgattgcatgtgtagtttagaaattgataatt 348  Q
    || |||||||     |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |    
T  50216696 gatttttttatttttaaattagagtagtttgcatgtggttagggttgattttaaaattgataatttgatgattgcatgtgtaatttaggaattgataaat 50216597  T
Q  349 gaatgtagttgttgcctatgatgtttaaatcataatgtgggtttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacaccaagtgt 448  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  50216596 gaatgtagttgttgcctatgttgtttaaatcataatgtggttttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatgctttgcacacaaagtgt 50216497  T
Q  449 ttgataaaatgtctcaatgacaattttattgattatttagttagttta-gttatggaaatgatagaaatgatgttaattatagtttggttaagtgtat 545  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50216496 ttgataaaatgcttcaatgacaattttattgattatgtggttagtttaggttatggaaatgatagaaatgatgttaattatagtttggttaagtgtat 50216399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 308; E-Value: 1e-173
Query Start/End: Original strand, 164 - 581
Target Start/End: Original strand, 44229885 - 44230301
Alignment:
Q  164 tttcacgaattgcaagcaaatcaagtgcacattatcacaagtaagttgtgtcaatcattttaatgttaatgttaatttgtttaggttgagttttttagaa 263  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| |  |||  | ||    
T  44229885 tttcacgaattgcaagcaaatcaattgcacattatcacaagtaagttgtatcaatcattttaatgataatgttagtttgtttaggttta--tttaaaaaa 44229982  T
Q  264 aaattagagtagtttgcatgtggttagggttgatctcaaaattgagaatttgatgattgcatgtgtagtttagaaattgataattgaatgtagttgttgc 363  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  44229983 aaatcagagtagtttgcatgtggttagggttgattttaaaattgacaatttgatgattgcatgtgtagtttaggaattgataaatgaatgtagttgttgc 44230082  T
Q  364 ctatgatgtttaaatcataatgtgggtttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacaccaagtgtttgataaaatgtctc 463  Q
    ||||| |||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||    
T  44230083 ctatgttgtttaaaacataatgtggctttgaacggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaatgtgtttgataaaatgcctc 44230182  T
Q  464 aatgacaattttattgattatttagttagttta-gttatggaaatgatagaaatgatgttaattatagtttggttaagtgtattttgattttttagttag 562  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  44230183 aatgacaattttattgattatttagttggtttaggttatggaaatgatagaaatgatgttaattatagtttggttaagtgtatattgattttttagttag 44230282  T
Q  563 tttaggttacgagaattat 581  Q
    |||||||||||||||||||    
T  44230283 tttaggttacgagaattat 44230301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 293; E-Value: 1e-164
Query Start/End: Original strand, 126 - 581
Target Start/End: Complemental strand, 20917957 - 20917500
Alignment:
Q  126 aaaattctcaatttctctcccatttcctaccaaatccattt-cacgaattgcaagcaaatcaagtgcacattatcacaagtaagttgtgtcaatcatttt 224  Q
    |||||||||||||||||||| || | | |||||| |||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||    
T  20917957 aaaattctcaatttctctccaatcttc-accaaagccattttcacgaattgcaagcaaatcaatcgcacattatcacaagtaagttgtatcaatcatctt 20917859  T
Q  225 aatgttaatgttaatttgtttaggttgagttttttagaaaaattagagtagtttgcatgtggttagggttgatctcaaaattgagaatttgatgattgca 324  Q
    |||| || ||||| |||||||||||| | ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||    
T  20917858 aatgata-tgttagtttgtttaggtttattttttaaaaaaaattagagtagtttgcatgtggttagggttgattttaaaattgacaatttgatgattgca 20917760  T
Q  325 tgtgtagtttagaaattgataattgaatgtagttgttgcctatgatgtttaaatcataatgtgggtttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatg 424  Q
    ||| |||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20917759 tgtatagtttatgaattgataaatgaatgtagttgttgcctatgttgttaaaatcataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatg 20917660  T
Q  425 ttttatactttgcacaccaagtgtttgataaaatgtctcaatgacaattttattgattatttagttagttt-agttatggaaatgatagaaatgatgtta 523  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  20917659 ttttatactttgcacacaaagtgtttgatcaaatgcctcaatgaaaattatattgattatttagttagtttaagttatggaaatgattgaaatgatgtta 20917560  T
Q  524 attatagtttggttaa--gtgtattttgattttttagttagtttaggttacgagaattat 581  Q
    ||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20917559 attatagtttggttaagtgtgtatattgattttttagttagtttaggttacgagaattat 20917500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 293; E-Value: 1e-164
Query Start/End: Original strand, 126 - 581
Target Start/End: Complemental strand, 20926919 - 20926462
Alignment:
Q  126 aaaattctcaatttctctcccatttcctaccaaatccattt-cacgaattgcaagcaaatcaagtgcacattatcacaagtaagttgtgtcaatcatttt 224  Q
    |||||||||||||||||||| || | | |||||| |||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||    
T  20926919 aaaattctcaatttctctccaatcttc-accaaagccattttcacgaattgcaagcaaatcaatcgcacattatcacaagtaagttgtatcaatcatctt 20926821  T
Q  225 aatgttaatgttaatttgtttaggttgagttttttagaaaaattagagtagtttgcatgtggttagggttgatctcaaaattgagaatttgatgattgca 324  Q
    |||| || ||||| |||||||||||| | ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||    
T  20926820 aatgata-tgttagtttgtttaggtttattttttaaaaaaaattagagtagtttgcatgtggttagggttgattttaaaattgacaatttgatgattgca 20926722  T
Q  325 tgtgtagtttagaaattgataattgaatgtagttgttgcctatgatgtttaaatcataatgtgggtttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatg 424  Q
    ||| |||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20926721 tgtatagtttatgaattgataaatgaatgtagttgttgcctatgttgttaaaatcataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatg 20926622  T
Q  425 ttttatactttgcacaccaagtgtttgataaaatgtctcaatgacaattttattgattatttagttagttt-agttatggaaatgatagaaatgatgtta 523  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  20926621 ttttatactttgcacacaaagtgtttgatcaaatgcctcaatgaaaattatattgattatttagttagtttaagttatggaaatgattgaaatgatgtta 20926522  T
Q  524 attatagtttggttaa--gtgtattttgattttttagttagtttaggttacgagaattat 581  Q
    ||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20926521 attatagtttggttaagtgtgtatattgattttttagttagtttaggttacgagaattat 20926462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 284; E-Value: 1e-159
Query Start/End: Original strand, 164 - 581
Target Start/End: Original strand, 42756323 - 42756739
Alignment:
Q  164 tttcacgaattgcaagcaaatcaagtgcacattatcacaagtaagttgtgtcaatcattttaatgttaatgttaatttgtttaggttgagttttttagaa 263  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||  |||||||| |||||||||||| | ||||  | ||    
T  42756323 tttcacgaattgcaagcaaatcaactgcacattatcacaagtcagttgtatcaatcattttaataataatgttagtttgtttaggtttatttttaaaaaa 42756422  T
Q  264 aaattagagtagtttgcatgtggttagggttgatctcaaaattgagaatttgatgattgcatgtgtagtttagaaattgataattgaatgtagttgttgc 363  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| || ||||||||||||     
T  42756423 aaattagagtagtttgcatgtggttagggttgattttaaaattgacaatttgatgattgcatgtgtagtttatgaattgataaatggatgtagttgttgt 42756522  T
Q  364 ctatgatgtttaaatcataatgtgggtttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacaccaagtgtttgataaaatgtctc 463  Q
    ||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||    
T  42756523 ctatgttgtttaaatcataatgtcgctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgatcaaatgcctc 42756622  T
Q  464 aatgacaattttattgattatttagttagttta-gttatggaaatgatagaaatgatgttaattatagtttggttaagtgtattttgattttttagttag 562  Q
    ||||| ||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  42756623 aatgaaaa--ttattgattatttagttagtttaggttatggaaatgatagaaatgatgttaattatagtttgattaagtgtatattgattttttagttag 42756720  T
Q  563 tttaggttacgagaattat 581  Q
    ||||||||| |||||||||    
T  42756721 tttaggttatgagaattat 42756739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 283; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 164 - 581
Target Start/End: Complemental strand, 49196350 - 49195932
Alignment:
Q  164 tttcacgaattgcaagcaaatcaagtgcacattatcacaagtaagttgtgtcaatcattttaatgttaatgttaatttgtttaggttgagttttttagaa 263  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||| | ||||  | ||    
T  49196350 tttcacgaattgcaagaaaatcaactgcacattatcacaagtaagttgtatcaatcactttaatgataatgttagtttgtttaggtttatttttaaaaaa 49196251  T
Q  264 aaattagagtagtttgcatgtggttagggttgatctcaaaattgagaatttgatgattgcatgtgtagtttagaaattgataattgaatgtagttgttgc 363  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||    
T  49196250 aaattagagtagtttgcatgtggttaaggttgattttaaaattgacaatttgatgattgcatgtgtagtttatgaattgataaatgaatgtagttgttgc 49196151  T
Q  364 ctatgatgtttaaatcataatgtgggtttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacaccaagtgtttgataaaatgtctc 463  Q
    ||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||  ||    
T  49196150 ctatgttgttaaaatcataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgatcaaatgcttc 49196051  T
Q  464 aatgacaattttattgattatttagttagttta-gttatggaaatgatagaaatgatgttaattatagtttggttaagtgtattttgattttttagttag 562  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  49196050 aatgaaaattatattgattatttagttagtttaggttatgaaaatgatagaaatgatgttaattatagtttggttaattgtatattgattttttagttag 49195951  T
Q  563 tttaggttacgagaattat 581  Q
    ||||| |||| ||||||||    
T  49195950 tttagcttacaagaattat 49195932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 279; E-Value: 1e-156
Query Start/End: Original strand, 164 - 581
Target Start/End: Complemental strand, 30255905 - 30255487
Alignment:
Q  164 tttcacgaattgcaagcaaatcaagtgcacattatcacaagtaagttgtgtcaatcattttaatgttaatgttaatttgtttaggttgagttttttagaa 263  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||| | ||||  | ||    
T  30255905 tttcacgaattgcaagcaaatcaactgcacattatcacaagtaagttgtatcaatcattttaatgataaggttagtttgtttaggtttatttttaaaaaa 30255806  T
Q  264 aaattagagtagtttgcatgtggttagggttgatctcaaaattgagaatttgatgattgcatgtgtagtttagaaattgataattgaatgtagttgttgc 363  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| |||| |||||||||||||||||| ||||||   ||||| ||| ||||||||||||||||    
T  30255805 aaattagagtagtttgcatgtggttagggttgattttaaagttgacaatttgatgattgcatgtttagtttgtgaattgctaaatgaatgtagttgttgc 30255706  T
Q  364 ctatgatgtttaaatcataatgtgggtttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacaccaagtgtttgataaaatgtctc 463  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||    
T  30255705 ctatgttgtttaaatcataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgatcaaatgcctc 30255606  T
Q  464 aatgacaattttattgattatttagttagttta-gttatggaaatgatagaaatgatgttaattatagtttggttaagtgtattttgattttttagttag 562  Q
    ||||| | || |||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  30255605 aatgaaatttatattgattatttagttagttcaggttaaggaaatgatagaaatgatgttaattatagtttgattaagtgtatattgattttttagttag 30255506  T
Q  563 tttaggttacgagaattat 581  Q
    ||||||||| |||||||||    
T  30255505 tttaggttatgagaattat 30255487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 259; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 53 - 497
Target Start/End: Original strand, 596817 - 597261
Alignment:
Q  53 gcagttaactaccgaggaaatctgaacttaaacagatcgcagaaccagaacctccc-atttccaaaaaaccttcaaaattctcaatttctctcccatttc 151  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| || |||| |||||||||||||| |||| |||| | ||||     |||||||| |||||| ||||| || |     
T  596817 gcagttaactgccgaggaaatctgaactaaaccagaacgcagaaccagaacttccccattttccaaaacttcacaaaattcacaatttttctccaatctt 596916  T
Q  152 ctaccaaatccattt-cacgaattgcaagcaaatcaagtgcacattatcacaagtaagttgtgtcaatcattttaatgttaatgttaatttgtttaggtt 250  Q
    | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  596917 c-accaaatccattttcacgaattgcaagcaaatcaattgcacattatcacaagtaagttgtgtcaatcattttaatcataatgttaatttgtttaggtt 597015  T
Q  251 gagttttttagaaaaattagagtagtttgcatgtggttagggttgatctcaaaattgagaatttgatgattgcatgtgtagtttagaaattgataattga 350  Q
    || ||||||   ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | || ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||    
T  597016 gattttttttttaaa-ttagagtagtttgcatgtggttagggttgatttaaatattgacaatttgatgattgcatgtgtagtttaggaattgataaatga 597114  T
Q  351 atgtagttgttgcctatgatgtttaaatcataatgtgggtttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacaccaagtgttt 450  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  597115 atgtagttgttgcccatgttgtttaaatcataatgtggctttgaatggtggcaaaagaacacattttgattatgtttgatactttgcacacaaagtgttt 597214  T
Q  451 gataaaatgtctcaatgacaattttattgattatttagttagtttag 497  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  597215 gataaaatgtctcaatgacaattttattgattatttagttagcttag 597261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 164 - 581
Target Start/End: Original strand, 48888906 - 48889322
Alignment:
Q  164 tttcacgaattgcaagcaaatcaagtgcacattatcacaagtaagttgtgtcaatcattttaatgttaatgttaatttgtttaggttgagttttttagaa 263  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||| | ||    | ||    
T  48888906 tttcacgaattgcaagcaaatcaactgcacattatcacaagtaagttgtatcaatcattttaatgataatgttagtttgtttaagtttatttaaaaataa 48889005  T
Q  264 aa-------attagagtagtttgcatgtggttagggttgatctcaaaattgagaatttgatgattgcatgtgtagtttagaaattgataattgaatgtag 356  Q
    ||       |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||    
T  48889006 aaataaaaaattagagtagtttgcatgtggttagggttgattttaaaattgacaatttgatgattgcatgtgtagtttatgaattgataaatgaatgtag 48889105  T
Q  357 ttgttgcctatgatgtttaaatcataatgtgggtttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacaccaagtgtttgataaa 456  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||    
T  48889106 ttgttgcctatgttgtttaaatcataatgtgactttgaatggtggtaaatgaacataatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgatcaa 48889205  T
Q  457 atgtctcaatgacaattttattgattatttagttagttta-gttatggaaatgatagaaatgatgttaattatagtttggttaagtgtattttgattttt 555  Q
    | | |||||||| |||| |||||||||||||||||||||| ||||||         |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  48889206 aggcctcaatgaaaattatattgattatttagttagtttaggttatg---------gaaatgatgttaattatagtttggttaagtgtatattgattttt 48889296  T
Q  556 tagttagtttaggttacgagaattat 581  Q
    |||||||||||||||| |||||||||    
T  48889297 tagttagtttaggttatgagaattat 48889322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 164 - 581
Target Start/End: Original strand, 48563112 - 48563515
Alignment:
Q  164 tttcacgaattgcaagcaaatcaagtgcacattatcacaagtaagttgtgtcaatcattttaatgttaatgttaatttgtttaggttgagttttttagaa 263  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| | |||   | ||    
T  48563112 tttcacaaattgcaagcaaatcaactgcacattatcataagtaagttgtatcaatcattttaatgataatgttagtttgtttaggtttattttaaaaaaa 48563211  T
Q  264 aaa-ttagagtagtttgcatgtggttagggttgatctcaaaattgagaatttgatgattgcatgtgtagtttagaaattgataattgaatgtagttgttg 362  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||    || ||||||||     
T  48563212 aaaattagagtagtttgcatgtggttaaggttgattttaaaattgacaatttgatgattgcatgtgtagtctatgaattgataa----atatagttgtt- 48563306  T
Q  363 cctatgatgtttaaatcataatgtgggtttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacaccaagtgtttgataaaatgtct 462  Q
               ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| ||    
T  48563307 -----------taaatcataatgtgtctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaaatgtttgatcaaatgcct 48563395  T
Q  463 caatgacaattttattgattatttagttagttta-gttatggaaatgatagaaatgatgttaattatagtttggttaagtgtattttgattttttagtta 561  Q
    |||||| |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  48563396 caatgaaaattatattgattatttagttagtttaggttatggaaatgatagaaatgatgttaattatagtttggttaagtgtatattgattttttagtta 48563495  T
Q  562 gtttaggttacgagaattat 581  Q
    |||||| |||| ||||||||    
T  48563496 gtttagattacaagaattat 48563515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 216 - 581
Target Start/End: Complemental strand, 42806107 - 42805746
Alignment:
Q  216 aatcattttaatgttaatgttaatttgtttaggttgagtttttta--gaaaaattagagtagtttgcatgtggttagggttgatctcaaaattgagaatt 313  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||||||| ||| | ||||| |  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||| ||||    
T  42806107 aatcattttaatgataatgttagtttgtttatgtttattttttaaaagaaaaattagagtagtttgtatgtggttagggttgattttaaaattgataatt 42806008  T
Q  314 tgatgattgcatgtgtagtttagaaattgataattgaatgtagttgttgcctatgatgtttaaatcataatgtgggtttgaatggtggcaaatgaacaca 413  Q
            |||||| |||||||  ||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  42806007 --------gcatgtatagtttatgaattgataaatgaatgtagttgttgtctatgttgtttaaatgataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacaca 42805916  T
Q  414 atttgaatatgttttatactttgcacaccaagtgtttgataaaatgtctcaatgacaattttattgattatttagttagttta-gttatggaaatgatag 512  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  42805915 atttgaatatgttttatactttgcacacaaaatgtttgatcaaatgcctcaatgaaaattatattgattatttagttagtttaggttatggaaatgatag 42805816  T
Q  513 aaatgatgttaattatagtttggttaagtgtattttga-ttttttagttagtttaggttacgagaattat 581  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  42805815 aaatgatgttaattatagtttgattaggtgtatattgatttttttagttagtttaggttatgagaattat 42805746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 164 - 438
Target Start/End: Original strand, 51807139 - 51807413
Alignment:
Q  164 tttcacgaattgcaagcaaatcaagtgcacattatcacaagtaagttgtgtcaatcattttaatgttaatgttaatttgtttaggttgagttttttagaa 263  Q
    |||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| | |||||||||||| | ||||  | ||    
T  51807139 tttcacaaattgcaagcaaatcaactgtacattatcacaagtaagttgtatcaatcattttaatgataatgtcagtttgtttaggtttatttttaaaaaa 51807238  T
Q  264 aaattagagtagtttgcatgtggttagggttgatctcaaaattgagaatttgatgattgcatgtgtagtttagaaattgataattgaatgtagttgttgc 363  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | ||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||     
T  51807239 aaattagagtagtttgcatgtggttatgattgattttaaaattgacaatttgatgattgcatgtgtagtttagaaattgataaatgaatgtagttgttgt 51807338  T
Q  364 ctatgatgtttaaatcataatgtgggtttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgca 438  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51807339 ctatgttgtttaaatcataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgca 51807413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 380 - 510
Target Start/End: Original strand, 16611463 - 16611594
Alignment:
Q  380 ataatgtgggtttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacaccaagtgtttgataaaatgtctcaatgacaattttattg 479  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  16611463 ataatgtggttttgaatggtggcaaaagaacacattttgagtatgtttgatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgcctcaatgacaattttattg 16611562  T
Q  480 attatttagttagttta-gttatggaaatgat 510  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  16611563 attatttagttagtttaggttatggatatgat 16611594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 380 - 510
Target Start/End: Complemental strand, 22047790 - 22047659
Alignment:
Q  380 ataatgtgggtttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacaccaagtgtttgataaaatgtctcaatgacaattttattg 479  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  22047790 ataatgtggttttgaatggtggcaaaagaacacattttgagtatgtttgatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgcctcaatgacaattttattg 22047691  T
Q  480 attatttagttagttta-gttatggaaatgat 510  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  22047690 attatttagttagtttaggttatggatatgat 22047659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 380 - 497
Target Start/End: Complemental strand, 52391083 - 52390966
Alignment:
Q  380 ataatgtgggtttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacaccaagtgtttgataaaatgtctcaatgacaattttattg 479  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  52391083 ataatgtggttttgaatggtggcaaaataacacaatttgaatatgtttgatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgtgtcaatgacaaatttattg 52390984  T
Q  480 attatttagttagtttag 497  Q
    ||||||||||||||||||    
T  52390983 attatttagttagtttag 52390966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 380 - 511
Target Start/End: Complemental strand, 17567751 - 17567619
Alignment:
Q  380 ataatgtgggtttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacaccaagtgtttgataaaatgtctcaatgacaattttattg 479  Q
    ||||||||| ||| |||||||||||| ||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  17567751 ataatgtggttttcaatggtggcaaaagaacacattttgagtatgtttgatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgcctcaatgacaattttattg 17567652  T
Q  480 attatttagttagttta-gttatggaaatgata 511  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  17567651 attatttagttagtttaggttatggatatgata 17567619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 88; E-Value: 5e-42
Query Start/End: Original strand, 380 - 499
Target Start/End: Original strand, 41612753 - 41612872
Alignment:
Q  380 ataatgtgggtttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacaccaagtgtttgataaaatgtctcaatgacaattttattg 479  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  41612753 ataatgtggttttgaatggtggcaaaagaacacattttgagtatgtttgatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgcctcaatgacaattttattg 41612852  T
Q  480 attatttagttagtttagtt 499  Q
    ||||| ||||||||||||||    
T  41612853 attatctagttagtttagtt 41612872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 86; E-Value: 8e-41
Query Start/End: Original strand, 380 - 497
Target Start/End: Complemental strand, 2274601 - 2274484
Alignment:
Q  380 ataatgtgggtttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacaccaagtgtttgataaaatgtctcaatgacaattttattg 479  Q
    ||||||||| |||||||||||| ||| ||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  2274601 ataatgtggttttgaatggtgggaaaagaacacattttgagtatgtttgatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgtgtcaatgacaattttattg 2274502  T
Q  480 attatttagttagtttag 497  Q
    ||||||||||||||||||    
T  2274501 attatttagttagtttag 2274484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 86; E-Value: 8e-41
Query Start/End: Original strand, 380 - 497
Target Start/End: Original strand, 29009245 - 29009362
Alignment:
Q  380 ataatgtgggtttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacaccaagtgtttgataaaatgtctcaatgacaattttattg 479  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||  |||||| ||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  29009245 ataatgtggttttgaatggtggcaaaataacacattttgagtatgtttgatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgtgtcaatgacaattttattg 29009344  T
Q  480 attatttagttagtttag 497  Q
    ||||||||||||||||||    
T  29009345 attatttagttagtttag 29009362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 380 - 497
Target Start/End: Original strand, 36127822 - 36127939
Alignment:
Q  380 ataatgtgggtttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacaccaagtgtttgataaaatgtctcaatgacaattttattg 479  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||    
T  36127822 ataatgtggttttgaatggtggcaaaagaacacattttgagtatgtttgatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgtgtcaatgacaattttcttg 36127921  T
Q  480 attatttagttagtttag 497  Q
    ||||||| ||||||||||    
T  36127922 attatttggttagtttag 36127939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 380 - 497
Target Start/End: Complemental strand, 42903877 - 42903760
Alignment:
Q  380 ataatgtgggtttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacaccaagtgtttgataaaatgtctcaatgacaattttattg 479  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||  |||||| ||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  42903877 ataatgtggttttgattggtggcaaaataacacattttgagtatgtttgatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgtgtcaatgacaattttattg 42903778  T
Q  480 attatttagttagtttag 497  Q
    ||||||||||||||||||    
T  42903777 attatttagttagtttag 42903760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 380 - 497
Target Start/End: Original strand, 46389347 - 46389464
Alignment:
Q  380 ataatgtgggtttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacaccaagtgtttgataaaatgtctcaatgacaattttattg 479  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||  |||||| ||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  46389347 ataatgtggttttgattggtggcaaaataacacattttgagtatgtttgatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgtgtcaatgacaattttattg 46389446  T
Q  480 attatttagttagtttag 497  Q
    ||||||||||||||||||    
T  46389447 attatttagttagtttag 46389464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 380 - 497
Target Start/End: Complemental strand, 50480471 - 50480354
Alignment:
Q  380 ataatgtgggtttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacaccaagtgtttgataaaatgtctcaatgacaattttattg 479  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||  |||||| ||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  50480471 ataatgtggttttgattggtggcaaaataacacattttgagtatgtttgatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgtgtcaatgacaattttattg 50480372  T
Q  480 attatttagttagtttag 497  Q
    ||||||||||||||||||    
T  50480371 attatttagttagtttag 50480354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 380 - 497
Target Start/End: Original strand, 54386509 - 54386626
Alignment:
Q  380 ataatgtgggtttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacaccaagtgtttgataaaatgtctcaatgacaattttattg 479  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||  |||||| ||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  54386509 ataatgtggttttgattggtggcaaaataacacattttgagtatgtttgatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgtgtcaatgacaattttattg 54386608  T
Q  480 attatttagttagtttag 497  Q
    ||||||||||||||||||    
T  54386609 attatttagttagtttag 54386626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 81; E-Value: 8e-38
Query Start/End: Original strand, 380 - 510
Target Start/End: Original strand, 20351030 - 20351161
Alignment:
Q  380 ataatgtgggtttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacaccaagtgtttgat-aaaatgtctcaatgacaattttatt 478  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  20351030 ataatttggttttgaatggtggcaaaagaacaca-tttgagtatgtttgatactttgcacacaaagtgtttgattaaaatgtctcaatgacaattttatt 20351128  T
Q  479 gattatttagttagttta-gttatggaaatgat 510  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  20351129 gattatttagttagtttaggttatggatatgat 20351161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 81; E-Value: 8e-38
Query Start/End: Original strand, 272 - 496
Target Start/End: Complemental strand, 31045388 - 31045165
Alignment:
Q  272 gtagtttgcatgtggttagggttgatctcaaaattgagaatttgatgattgcatgtgtagtttagaaattgataattgaatgtagttgttgcctatgatg 371  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||     |||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||  ||    |||||    
T  31045388 gtagtttgcatgtggttagggtttatgaatgaattgacattttgatgattgcatgtgtagtttataaattgataaacgaatgtagttaatgtaattgatg 31045289  T
Q  372 tttaaatcataatgtgggtttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacaccaagtgtttgataaaatgtctcaatgacaa 471  Q
    ||||| | | ||||||| ||||||||||| ||||  |||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||| |  ||||| ||    
T  31045288 tttaagtaa-aatgtggttttgaatggtgtcaaaataacacaatgtgaatatgtttgatactttgcacacaaagtgtttgacaaaatgccaaaatgagaa 31045190  T
Q  472 ttttattgattatttagttagttta 496  Q
    ||  ||| |||||||||||||||||    
T  31045189 ttgcatttattatttagttagttta 31045165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 78; E-Value: 5e-36
Query Start/End: Original strand, 380 - 497
Target Start/End: Complemental strand, 49144149 - 49144033
Alignment:
Q  380 ataatgtgggtttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacaccaagtgtttgataaaatgtctcaatgacaattttattg 479  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||  |||||| ||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  49144149 ataatgtggttttgattggtggcaaaataacacattttgaatat-tttgatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgtgtcaatgacaattttattg 49144051  T
Q  480 attatttagttagtttag 497  Q
    ||||||||||||||||||    
T  49144050 attatttagttagtttag 49144033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 380 - 497
Target Start/End: Original strand, 34045762 - 34045878
Alignment:
Q  380 ataatgtgggtttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacaccaagtgtttgataaaatgtctcaatgacaattttattg 479  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||  |||||| ||||| ||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  34045762 ataatgtggttttgattggtggcaaaataacacattttgagtat-tttgatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgtgtcaatgacaattttattg 34045860  T
Q  480 attatttagttagtttag 497  Q
    ||||||||||||||||||    
T  34045861 attatttagttagtttag 34045878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 380 - 497
Target Start/End: Complemental strand, 46701712 - 46701595
Alignment:
Q  380 ataatgtgggtttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacaccaagtgtttgataaaatgtctcaatgacaattttattg 479  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||  || ||| |||||  |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  46701712 ataatgtggttttgattggtggcaaaataagacattttgagcatgtttgatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgtgtcaatgacaattttattg 46701613  T
Q  480 attatttagttagtttag 497  Q
    ||||||||||||||||||    
T  46701612 attatttagttagtttag 46701595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 390 - 496
Target Start/End: Original strand, 4178199 - 4178305
Alignment:
Q  390 tttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacaccaagtgtttgataaaatgtctcaatgacaattttattgattatttagt 489  Q
    ||||||||||| |||||||| | ||||||||||  ||| ||||||||||||| |||||||||| |||||| |  ||||| ||||||||||||||||||||    
T  4178199 tttgaatggtgtcaaatgaagataatttgaatacttttgatactttgcacacaaagtgtttgacaaaatgcccaaatgaaaattttattgattatttagt 4178298  T
Q  490 tagttta 496  Q
    |||||||    
T  4178299 tagttta 4178305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 51; E-Value: 6e-20
Query Start/End: Original strand, 390 - 496
Target Start/End: Original strand, 4172201 - 4172307
Alignment:
Q  390 tttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacaccaagtgtttgataaaatgtctcaatgacaattttattgattatttagt 489  Q
    |||||||||||  ||||||| | ||||||||||  ||| ||||||||||||  |||||||||| |||||| |  ||||| ||||||||||||||||||||    
T  4172201 tttgaatggtgttaaatgaagataatttgaatacttttgatactttgcacaaaaagtgtttgacaaaatgcccaaatgagaattttattgattatttagt 4172300  T
Q  490 tagttta 496  Q
    |||||||    
T  4172301 tagttta 4172307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 532 - 581
Target Start/End: Original strand, 54681976 - 54682025
Alignment:
Q  532 ttggttaagtgtattttgattttttagttagtttaggttacgagaattat 581  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54681976 ttggttaagtgtatattgattttttagttagtttaggttacgagaattat 54682025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 30 - 86
Target Start/End: Original strand, 41844185 - 41844241
Alignment:
Q  30 gttaactgctgaggtaaatctcggcagttaactaccgaggaaatctgaacttaaaca 86  Q
    |||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  41844185 gttaactgctgaggaaaacctcggtagttaactaccgaggaaacatgaacttaaaca 41844241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 30 - 86
Target Start/End: Original strand, 46697747 - 46697803
Alignment:
Q  30 gttaactgctgaggtaaatctcggcagttaactaccgaggaaatctgaacttaaaca 86  Q
    ||||||||| |||| ||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  46697747 gttaactgccgaggaaaacctcggtagttaactgccgaggaaatctgaacttaaaca 46697803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 17 - 86
Target Start/End: Complemental strand, 35743632 - 35743563
Alignment:
Q  17 gaaatcggttgctgttaactgctgaggtaaatctcggcagttaactaccgaggaaatctgaacttaaaca 86  Q
    ||||||||  || ||||||||| |||| ||| ||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  35743632 gaaatcggcggcagttaactgccgaggaaaacctcggtagttaactgccgaggaaatatgaacttaaaca 35743563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 30 - 86
Target Start/End: Original strand, 50477216 - 50477272
Alignment:
Q  30 gttaactgctgaggtaaatctcggcagttaactaccgaggaaatctgaacttaaaca 86  Q
    ||||||||| |||| ||| ||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  50477216 gttaactgccgaggaaaacctcggtagttaactgccgaggaaatccgaacttaaaca 50477272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 126 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 42807572 - 42807498
Alignment:
Q  126 aaaattctcaatttctctcccatttcctaccaaatccattt-cacgaattgcaagcaaatcaagtgcacattatca 200  Q
    |||||||||||||||||||| || | | |||||| |||||| ||| |||||||||||||||||  |||||||||||    
T  42807572 aaaattctcaatttctctccaatcttc-accaaagccattttcacaaattgcaagcaaatcaaccgcacattatca 42807498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 51 - 101
Target Start/End: Original strand, 35743450 - 35743500
Alignment:
Q  51 cggcagttaactaccgaggaaatctgaacttaaacagatcgcagaaccaga 101  Q
    |||||||||||| ||||||||| |||||| ||| |||| ||||||||||||    
T  35743450 cggcagttaactgccgaggaaaactgaacataaccagaacgcagaaccaga 35743500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 30 - 96
Target Start/End: Complemental strand, 49144493 - 49144427
Alignment:
Q  30 gttaactgctgaggtaaatctcggcagttaactaccgaggaaatctgaacttaaacagatcgcagaa 96  Q
    ||||||||| || | ||| ||||| |||||||| |||||||||||||||| ||| |||| |||||||    
T  49144493 gttaactgccgaagaaaacctcggtagttaactgccgaggaaatctgaacataaccagaacgcagaa 49144427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 552 - 581
Target Start/End: Complemental strand, 49268782 - 49268753
Alignment:
Q  552 tttttagttagtttaggttacgagaattat 581  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49268782 tttttagttagtttaggttacgagaattat 49268753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 30 - 78
Target Start/End: Complemental strand, 19988670 - 19988622
Alignment:
Q  30 gttaactgctgaggtaaatctcggcagttaactaccgaggaaatctgaa 78  Q
    |||||||||||||| |||  |||||||| |||||||||||||| |||||    
T  19988670 gttaactgctgaggaaaacttcggcagtaaactaccgaggaaaactgaa 19988622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 346; Significance: 0; HSPs: 42)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 346; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 49 - 572
Target Start/End: Original strand, 30890116 - 30890639
Alignment:
Q  49 ctcggcagttaactaccgaggaaatctgaacttaaacagatcgcagaaccagaacctcccatttccaaaaaacc-ttcaaaattctcaatttctctccca 147  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||||| || ||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||| |||||||| |    
T  30890116 ctcggtagttaactgccgaggaaatctggacataaccagaacgcagaaccagaacctcccatttacaaaaaaacattcaaaattctcaaattctctccaa 30890215  T
Q  148 tttcctaccaaatccattt-cacgaattgcaagcaaatcaagtgcacattatcacaagtaagttgtgtcaatcattttaatgttaatgttaatttgttta 246  Q
    | | | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30890216 tcttc-accaaatccattttcacgaattgcaagcaaatcaagtgcacattatcacaagtaagttgtgtcaatcattttaatgttaatgttaatttgttta 30890314  T
Q  247 ggttgagttttttagaaaaattagagtagtttgcatgtggttagggttgatctcaaaattgagaatttgatgattgcatgtgtagtttagaaattgataa 346  Q
     ||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| || ||     |||||| ||||| || |||||||||||||||||   ||||||||    
T  30890315 tgttaagttttttaaaaaaatt-gagtagtttgcatgtggttaggttttataaatgaattgacaatttcatcattgcatgtgtagtttatgtattgataa 30890413  T
Q  347 ttgaatgtagttgttgcctatgatgtttaaatcataatgtgggtttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacaccaagt 446  Q
     ||||||||| |||||||||||  |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  30890414 atgaatgtagatgttgcctatgtagtttaaattataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagt 30890513  T
Q  447 gtttgataaaatgtctcaatgacaattttattgattatttagttagtttagttatggaaatgatagaaatgatgttaattatagtttggttaagtgtatt 546  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  30890514 gttcgataaaatgtctcaatgacaattttattgattatttagttagtttagttatggaaatgatagaaatgatgttaattatagtttggttaagtttatt 30890613  T
Q  547 ttgattttttagttagtttaggttac 572  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  30890614 ttgattttttagttagtttaggttac 30890639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 309; E-Value: 1e-174
Query Start/End: Original strand, 49 - 572
Target Start/End: Original strand, 19924810 - 19925320
Alignment:
Q  49 ctcggcagttaactaccgaggaaatctgaacttaaacagatcgcagaaccagaacctcccatttccaaaaaa--ccttcaaaattctcaatttctctccc 146  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| || ||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||  | |||||||||||||||||||||||     
T  19924810 ctcggcagttaactgccgaggaaatctggacataaccagaacgcagaaccagaacctcccatttacaaaaaaaacattcaaaattctcaatttctctcca 19924909  T
Q  147 atttcctaccaaatccattt-cacgaattgcaagcaaatcaagtgcacattatcacaagtaagttgtgtcaatcattttaatgttaatgttaatttgttt 245  Q
    || | | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||           
T  19924910 atcttc-accaaatccattttcacgaattgcaagcaaatcaagtgcgcattatcacaagtaagttgtgtcaatcattttaatgttaatgttaa------- 19925001  T
Q  246 aggttgagttttttagaaaaattagagtagtttgcatgtggttagggttgatctcaaaattgagaatttgatgattgcatgtgtagtttagaaattgata 345  Q
           |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| || ||     |||||| ||||| || |||||||||||||||||   |||||||    
T  19925002 -------gttttttaaaaaaatt-gagtagtttgcatgtggttaggttttataaatgaattgacaatttcatcattgcatgtgtagtttatgtattgata 19925093  T
Q  346 attgaatgtagttgttgcctatgatgtttaaatcataatgtgggtttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacaccaag 445  Q
    | ||||||||| |||||||||||  |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  19925094 aatgaatgtagatgttgcctatgtagtttaaattataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaag 19925193  T
Q  446 tgtttgataaaatgtctcaatgacaattttattgattatttagttagtttagttatggaaatgatagaaatgatgttaattatagtttggttaagtgtat 545  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  19925194 tgttcgataaaatgtctcaatgacaattttattgattatttagttagtttagttatggaaatgatagaaatgatgttaattatagtttggttaagtttat 19925293  T
Q  546 tttgattttttagttagtttaggttac 572  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    
T  19925294 tttgattttttagttagtttaggttac 19925320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 308; E-Value: 1e-173
Query Start/End: Original strand, 164 - 581
Target Start/End: Original strand, 52802300 - 52802719
Alignment:
Q  164 tttcacgaattgcaagcaaatcaagtgcacattatcacaagtaagttgtgtcaatcattttaatgttaatgttaatttgtttaggttgagtttttt-aga 262  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| | |    
T  52802300 tttcacgaattgcaagcaaatcaactgcacattatcacaagtaagttgtgtcaatcattttaatgataatgttaatttgtttaggttgattttttttaaa 52802399  T
Q  263 aaaattagagtagtttgcatgtggttagggttgatctcaaaattgagaatttgatgattgcatgtgtagtttagaaattgataattgaatgtagttgttg 362  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||    
T  52802400 aaaattagagtagtttgcatgtggttagggttgattttaaaattgacaatttgatgattgcatgtgtagtttaagaattgataaatgaatgtagttgttg 52802499  T
Q  363 cctatgatgtttaaatcataatgtgggtttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacaccaagtgtttgataaaatgtct 462  Q
    | |||| ||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  52802500 cttatgttgtttaagtcataatgtgattttgaatggtggcaaaataacacaatttgaatatcttttatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgtct 52802599  T
Q  463 caatgacaattttattgattatttagttagttta-gttatggaaatgatagaaatgatgttaattatagtttggttaagtgtattttgattttttagtta 561  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  52802600 caatgacaattttattgattgtttagttagtttaggctatggaaatgatagaaatgatgttaattatagtttggttaagtgtatattgatttttttgtta 52802699  T
Q  562 gtttaggttacgagaattat 581  Q
    |||||||||| |||||||||    
T  52802700 gtttaggttaagagaattat 52802719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 304; E-Value: 1e-171
Query Start/End: Original strand, 30 - 581
Target Start/End: Complemental strand, 31783752 - 31783213
Alignment:
Q  30 gttaactgctgaggtaaatctcggcagttaactaccgaggaaatctgaacttaaacagatcgcagaaccagaacctcccatttccaaaaaaccttcaaaa 129  Q
    ||||||||| |||| ||| ||||| |||||||| ||||||||||||  |||||| ||  ||| ||||||||||| ||| |||||||||| |  |||||||    
T  31783752 gttaactgccgaggaaaacctcgggagttaactgccgaggaaatcttgacttaatcat-tcgtagaaccagaacttcctatttccaaaacaatttcaaaa 31783654  T
Q  130 ttctcaatttctctcccatttcctaccaaatccattt-cacgaattgcaagcaaatcaagtgcacattatcacaagtaagttgtgtcaatcattttaatg 228  Q
    |||||||||||||| | || | | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||                ||||||||||||||||    
T  31783653 ttctcaatttctcttcaatcttc-accaaatccattttcacgaattgcaagcaaatcaagtgcacatt----------------gtcaatcattttaatg 31783571  T
Q  229 ttaatgttaatttgtttaggttgagttttt----tagaaaaattagagtagtttgcatgtggttagggttgatctcaaaattgagaatttgatgattgca 324  Q
    |||||||||||||||||||||| | |||||     | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||| |    
T  31783570 ttaatgttaatttgtttaggtttattttttataaaaaaaaaattagagtagtttgtatgtggttagggttgattttaaaattgacaatttgatgattgta 31783471  T
Q  325 tgtgtagtttagaaattgataattgaatgtagttgttgcctatgatgtttaaatcataatgtgggtttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatg 424  Q
    |||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31783470 tgtgtagtttaggaattgataaataaatgtagttgttgcctatgttctttaaatcataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatg 31783371  T
Q  425 ttttatactttgcacaccaagtgtttgataaaatgtctcaatgacaattttattgattatttagttagtttag-ttatggaaatgatagaaatgatgtta 523  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  31783370 ttttatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgcctcaatgacaattttattgattatttagttagtttagattatggaaatgatataaatgatgtta 31783271  T
Q  524 attatagtttggttaagtgtattttgattttttagttagtttaggttacgagaattat 581  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31783270 attatagtttggttaagtgtatattgattttttagttagtttaggttacgagaattat 31783213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 291; E-Value: 1e-163
Query Start/End: Original strand, 164 - 581
Target Start/End: Complemental strand, 35258775 - 35258358
Alignment:
Q  164 tttcacgaattgcaagcaaatcaagtgcacattatcacaagtaagttgtgtcaatcattttaatgttaatgttaatttgtttaggttgagttttttagaa 263  Q
    ||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||| |||||||||||| | ||||| | ||    
T  35258775 tttcatgaattgcaagcatatcaactgcacattatcacaagtaagttgtatcaatcattttaataataatgttagtttgtttaggttta-tttttaaaaa 35258677  T
Q  264 aaattagagtagtttgcatgtggttagggttgatctcaaaattgagaatttgatgattgcatgtgtagtttagaaattgataattgaatgtagttgttgc 363  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||| ||||||||||    
T  35258676 aaattagagtagtttgcatgtggttagggttgattttaaaattgacaatttgatgattgcatgtgtagtttatgaattgataaatgaatttagttgttgc 35258577  T
Q  364 ctatgatgtttaaatcataatgtgggtttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacaccaagtgtttgataaaatgtctc 463  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||    
T  35258576 ctatgttgtttaaatcataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgatcaaatgcctc 35258477  T
Q  464 aatgacaattttattgattatttagttagttta-gttatggaaatgatagaaatgatgttaattatagtttggttaagtgtattttgattttttagttag 562  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  35258476 aatgaaaattatattgattatttagttagtttaggttatagaaatgatagaaatgatgttaattatagtttgattaagtgtatattgattttttagttag 35258377  T
Q  563 tttaggttacgagaattat 581  Q
    ||||||||| |||||||||    
T  35258376 tttaggttatgagaattat 35258358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 277; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 107 - 581
Target Start/End: Original strand, 47502428 - 47502891
Alignment:
Q  107 ccatttccaaaaaaccttcaaaattctcaatttctctcccatttcctaccaaatccatttcacgaattgcaagcaaatcaagtgcacattatcacaagta 206  Q
    ||||||||||||   || |||||||| |||||||||||| || | |  | |||||  ||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||    
T  47502428 ccatttccaaaacttctccaaaattcacaatttctctccaatcttcaccaaaatcatttttacgaattgcaaacaaatcaactgcacattatcacaagta 47502527  T
Q  207 agttgtgtcaatcattttaatgttaatgttaatttgtttaggttgagttttttagaaaaattagagtagtttgcatgtggttagggttgatctcaaaatt 306  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| | ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | ||||||    
T  47502528 agttgtatcaatcattttaatgataatgttagtttgtttaggtttattttttaaaaaaaattagagtagtttgcatgtggttagagttgattttaaaatt 47502627  T
Q  307 gagaatttgatgattgcatgtgtagtttagaaattgataattgaatgtagttgttgcctatgatgtttaaatcataatgtgggtttgaatggtggcaaat 406  Q
    || ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  47502628 gacaatttgatgattgcatgtgtaatttaggaattgataaatgaatgtagttgttgcctatgttgtttaaatcataatgtggctttgaatggtggcaaat 47502727  T
Q  407 gaacacaatttgaatatgttttatactttgcacaccaagtgtttgataaaatgtctcaatgacaattttattgattatttagttagtttagttatggaaa 506  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||           ||      
T  47502728 gaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttggtaaaatgcctcaatgacaattttattgattatttagtta-----------gagg 47502816  T
Q  507 tgatagaaatgatgttaattatagtttggttaagtgtattttgattttttagttagtttaggttacgagaattat 581  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  47502817 ttatagaaatgatgttaattatagtttggttaagtgtatattgattttttagttagtttaggttacaagaattat 47502891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 274; E-Value: 1e-153
Query Start/End: Original strand, 30 - 386
Target Start/End: Complemental strand, 29622461 - 29622105
Alignment:
Q  30 gttaactgctgaggtaaatctcggcagttaactaccgaggaaatctgaacttaaacagatcgcagaaccagaacctcccatttccaaaaaaccttcaaaa 129  Q
    ||||| ||| |||| ||| ||||| |||||||| |||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29622461 gttaattgccgaggaaaacctcggtagttaactgccgaggaaatctgaacataaccagaacgcagaaccagaacctcccatttccaaaaaaccttcaaaa 29622362  T
Q  130 ttctcaatttctctcccatttcctaccaaatccattt-cacgaattgcaagcaaatcaagtgcacattatcacaagtaagttgtgtcaatcattttaatg 228  Q
    |||||||||||||||| || | | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29622361 ttctcaatttctctccaatcttc-accaaatccattttcacgaattgcaagcaaatcaagtgcacattatcacaagtaagttgtgtcaatcattttaatg 29622263  T
Q  229 ttaatgttaatttgtttaggttgagttttttagaaaaattagagtagtttgcatgtggttagggttgatctcaaaattgagaatttgatgattgcatgtg 328  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29622262 ttaatgttaatttgtttaggttgatttttttaaaaaaattagagtagtttgtatgtggttagggttgatttcaaaattgagaatttgatgattgcatgtg 29622163  T
Q  329 tagtttagaaattgataattgaatgtagttgttgcctatgatgtttaaatcataatgt 386  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  29622162 tagtttagaaattgataattgaatgtagttgttgcctatgttgtttaaatcataatgt 29622105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 267; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 164 - 581
Target Start/End: Complemental strand, 23276011 - 23275589
Alignment:
Q  164 tttcacgaattgcaagcaaatcaagtgcacattatcacaagtaagttgtgtcaatcattttaatgttaatgttaatttgtttaggttgagttttttagaa 263  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| | |||   | ||    
T  23276011 tttcacgaattgcaagcaaatcaactgcacgttatcacaagtaagttgtatcaatcattttaatgataatgttagtttgtttaggtttattttaaaaaaa 23275912  T
Q  264 aaa----ttagagtagtttgcatgtggttagggttgatctcaaaattgagaatttgatgattgcatgtgtagtttagaaattgataattgaatgtagttg 359  Q
    |||    ||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||    
T  23275911 aaaaaaattagagtagtttgcatgtggttagggttgatttttaaattgacaatttgatgattgcatgtgtagtttatgaattgataaatgaatgtagttg 23275812  T
Q  360 ttgcctatgatgtttaaatcataatgtgggtttgaat-ggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacaccaagtgtttgataaaat 458  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  23275811 ttgcctatgttgtttaaatcataatgtgactttgaatgggtgacaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgatcaaat 23275712  T
Q  459 gtctcaatgacaattttattgattatttagttagttt-agttatggaaatgatagaaatgatgttaattatagtttggttaagtgtattttgatttttta 557  Q
    | |||||||| |||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  23275711 gcctcaatgaaaattatattgattatttagtcagtttaagttatggaaatgatagaaatgatgttaa-tatagtttggttaagtgtatattgatttttta 23275613  T
Q  558 gttagtttaggttacgagaattat 581  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  23275612 gttagtttaggttacgagaattat 23275589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 263; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 130 - 581
Target Start/End: Original strand, 45825023 - 45825465
Alignment:
Q  130 ttctcaatttctctcccatttcctaccaaatccatttcacgaattgcaagcaaatcaagtgcacattatcacaagtaagttgtgtcaatcattttaatgt 229  Q
    |||||||||||||||| || | |  | |||||  ||||||||||||| ||||||||||  ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||     
T  45825023 ttctcaatttctctccaatcttcaccaaaatcattttcacgaattgccagcaaatcaatcgcatattatcacaagtaagttgtatcaatcattttaatga 45825122  T
Q  230 taatgttaatttgtttaggttgagttttttagaaaaattagagtagtttgcatgtggttagggttgatctcaaaattgagaatttgatgattgcatgtgt 329  Q
    ||||||||    |||||       ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  45825123 taatgtta----gttta-------tttttaaaaaaaattagagtagtttgcatgtggttagggttgattttaaaattgacaatttgatgattgcatgtgt 45825211  T
Q  330 agtttagaaattgataattgaatgtagttgttgcctatgatgtttaaatcataatgtgggtttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgtttta 429  Q
    ||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45825212 agtttatgaattgataaatgaatgtagttgttgcctatgttgttaaaatcataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgtttta 45825311  T
Q  430 tac-tttgcacaccaagtgtttgataaaatgtctcaatgacaattttattgattatttagttagttta-gttatggaaatgatagaaatgatgttaatta 527  Q
    ||| ||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45825312 tacttttgcacacaaagtgtttgatcaaatgcctcaatgaaaattatattgattatttagttaatttaggttatggaaatgatagaaatgatgttaatta 45825411  T
Q  528 tagtttggttaagtgtattttgattttttagttagtttaggttacgagaattat 581  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  45825412 tagtttggttaagtgtatattgattttttagttagtttaagttacgagaattat 45825465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 263; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 164 - 581
Target Start/End: Original strand, 51320884 - 51321301
Alignment:
Q  164 tttcacgaattgcaagcaaatcaagtgcacattatcacaagtaagttgtgtca--atcattttaatgttaatgttaatttgtttaggttgagttttttag 261  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||  | |  |||||||||||| |||||||| |||||||||||| |  |||| |     
T  51320884 tttcacgaattggaagcaaatcaactgcacattatcacaagtaagttgaataataatcattttaatgataatgttagtttgtttaggttta--ttttaaa 51320981  T
Q  262 aaaaattagagtagtttgcatgtggttagggttgatctcaaaattgagaatttgatgattgcatgtgtagtttagaaattgataattgaatgtagttgtt 361  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||    
T  51320982 aaaaaatagagtagtttgcatgtggttagggttgattttaaaattgacaatttgatgattgcatgtgtagtttatgaattgataaatgaatgtagttgtt 51321081  T
Q  362 gcctatgatgtttaaatcataatgtgggtttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacaccaagtgtttgataaaatgtc 461  Q
    ||||||  ||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||| |    
T  51321082 gcctatattgtttaaatcataatgtgactttgaatagtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatattttgcacacaaagtgtttgatcaaatgcc 51321181  T
Q  462 tcaatgacaattttattgattatttagttagttta-gttatggaaatgatagaaatgatgttaattatagtttggttaagtgtattttgattttttagtt 560  Q
    ||||||| |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  51321182 tcaatgaaaattatattgattatttagttagtttaggttatggaaatgatagaaatgatgttaattatagtttggttaagtgtatattga-tttttagtt 51321280  T
Q  561 agtttaggttacgagaattat 581  Q
    ||||||||||| |||||||||    
T  51321281 agtttaggttatgagaattat 51321301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 258; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 201 - 581
Target Start/End: Complemental strand, 19527409 - 19527028
Alignment:
Q  201 caagtaagttgtgtcaatcattttaatgttaatgttaatttgtttaggttgagttttttagaaaaattagagtagtttgcatgtggttagggttgatctc 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||   | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |     
T  19527409 caagtaagttgtgtcaatcattttaatgataatgttaatttgtttaagttgattttaaaaaaaaaattagagtagtttgcatgtggttatggttgatttt 19527310  T
Q  301 aaaattgagaatttgatgattgcatgtgtagtttagaaattgataattgaatgtagttgttgcctatgatgtttaaatcataatgtgggtttgaatggtg 400  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  19527309 aaaattgacaatttgatgattgcatgtgtattttatgaattgataaatgaatgtagttgttgcctatgttgtttaaatcataatgtggctttgaatggtg 19527210  T
Q  401 gcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacaccaagtgtttgataaaatgtctcaatgacaattttattgattatttagttagttta-gtt 499  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||| |||| |||    
T  19527209 gcaaatggacacaatttgaatatgttttatgttttgcacacaaagtgtttgataaaatgcctcaataacaattttattgattatgtagttaatttaggtt 19527110  T
Q  500 atggaaatgatagaaatgatgttaattatagtttggttaagtgtattttgattttttagttagtttaggttacgagaattat 581  Q
    ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  19527109 atgaaaatgatagaaatgatgttagttatagtttggttaagtgtatattgattttttagttagtgtaggttacgagaattat 19527028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 179; E-Value: 3e-96
Query Start/End: Original strand, 30 - 497
Target Start/End: Original strand, 22524162 - 22524636
Alignment:
Q  30 gttaactgctgaggtaaatctcggcagttaactaccgaggaaatctgaacttaaacagatcgcagaaccagaacctc-ccatttccaaaaaaccttcaaa 128  Q
    ||||||| | |||| ||| ||||| |||||||| ||||| |||||||||| ||| |||| ||||||| |||||| || ||||||| |||| | || ||||    
T  22524162 gttaactcccgaggaaaacctcggtagttaactgccgagaaaatctgaacataaccagaacgcagaaacagaacttctccatttcaaaaacaactccaaa 22524261  T
Q  129 attctcaatttctctcccatttcctaccaaatccattt-cacgaattgcaagcaaatcaagtgcacattatcacaagtaagttgtgtcaatcattttaat 227  Q
    |||||||| |||||||| || | | |||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22524262 attctcaaattctctccaatcttc-accaaatcgattttcacgaattgcaagcaaatcaactgcaaattatcacaagtaagttgtgtcaatcattttaat 22524360  T
Q  228 gttaatgttaatttgtttaggttgagttttttagaaaaattagagtagtttgcatgtggttagggttgatctcaaaattgagaatttgatgattgcatgt 327  Q
    | ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||    
T  22524361 gataatgttaatttgtttaggttga-ttttttaaaaaaattagagtggtttgcatgtggttagggttgattttaaaattgataatttgatgattgcatgt 22524459  T
Q  328 gtagtttagaaattgataattgaatgtag---------ttgttgcct--atgatgtttaaatcataatgtgggtttgaatggtggcaaatgaacacaatt 416  Q
    || ||   ||  || |||  | |||||||         ||||||  |  ||||| ||||| | ||||||||| || |||||| | ||||| |||| ||||    
T  22524460 gttgtaatgatgtt-atagattaatgtagttgttataattgttgtttgaatgatttttaagt-ataatgtggtttggaatggagccaaataaacataatt 22524557  T
Q  417 tgaatatgttttatactttgcacaccaagtgtttgataaaatgtctcaatgacaattttattgattatttagttagtttag 497  Q
    |||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22524558 tga--atgttttatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgcctcaatgacaattttattgattatttagttagtttag 22524636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 165; E-Value: 6e-88
Query Start/End: Original strand, 238 - 551
Target Start/End: Complemental strand, 49857772 - 49857461
Alignment:
Q  238 atttgtttaggttgagttttttagaaaaattagagtagtttgcatgtggttagggttgatctcaaaattgagaatttgatgattgcatgtgtagtttaga 337  Q
    ||||||||| ||| ||||||||| |||||   |||||||||||||||||||||| || ||     |||||| ||||| || |||||||||||||||||      
T  49857772 atttgtttatgttaagttttttaaaaaaaaatgagtagtttgcatgtggttaggttttataaatgaattgataattttatcattgcatgtgtagtttatg 49857673  T
Q  338 aattgataattgaatgtagttgttgcctatgatgtttaaatcataatgtgggtttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgc 437  Q
      ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49857672 ttttgataaatgaatgtagttgttgcctatgttgtttaaatgagaatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgc 49857573  T
Q  438 acaccaagtgtttgataaaatgtctcaatgacaattttattgattatttagttagttta-gttatggaaatgatagaaatgatgttaattatagtttggt 536  Q
    |||| ||||||||||| ||||| ||||   | |||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  49857572 acacaaagtgtttgatcaaatgcctca---aaaattatattgattatttagttagtttaggttatggaaatgatagaaatgatgttaattatagtttgat 49857476  T
Q  537 taagtgtattttgat 551  Q
    ||||||||| |||||    
T  49857475 taagtgtatattgat 49857461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 164 - 362
Target Start/End: Original strand, 11183348 - 11183549
Alignment:
Q  164 tttcacgaattgcaagcaaatcaagtgcacattatcacaagtaagttgtgtcaatcattttaatgttaatgttaatttgtttaggttgagtttttta--- 260  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| | |||||| |||||||||||| | ||    |       
T  11183348 tttcacgaattgcaagcaaatcaactgcacattatcacaagtaagttgtatcaattattttaatgattatgttagtttgtttaggtttatttaaaaaaaa 11183447  T
Q  261 gaaaaattagagtagtttgcatgtggttagggttgatctcaaaattgagaatttgatgattgcatgtgtagtttagaaattgataattgaatgtagttgt 360  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||| |||||||||||| |||||||||||||  ||||||||| | |||||||||||    
T  11183448 gaaaaattagagtagtttgcatgtggttagagttgattttaaaattgacaatttgatgattacatgtgtagtttatgaattgataaattaatgtagttgt 11183547  T
Q  361 tg 362  Q
    ||    
T  11183548 tg 11183549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 103; E-Value: 6e-51
Query Start/End: Original strand, 217 - 510
Target Start/End: Complemental strand, 2425224 - 2424924
Alignment:
Q  217 atcattttaatgttaatgttaatttgtttaggttgagttttttagaaaaattagagtagtttgcatgtggttagggttgatctcaaaattgagaatttga 316  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| |||||| | |||||||| |||||||    
T  2425224 atcattttaatcataatgttaatttgtttaggttga-ttttttaaaaaaattagagtagtttgtatgtggttagagttgattttaaaattgataatttga 2425126  T
Q  317 tgattgcatgtgtagtttagaaattgataattgaatgtagttgttgcctatgatgtttaaatcat----------aatgtgggtttgaatggtggcaaat 406  Q
    |||||||||||||  ||  ||  || |||  |||||||||||||||    || ||||| ||| ||          ||||||| || |||||| | |||||    
T  2425125 tgattgcatgtgttattatgatgtt-atagatgaatgtagttgttgtaattgttgtttgaatgatttttaagtataatgtggtttggaatggagccaaat 2425027  T
Q  407 gaacacaatttgaatatgttttatactttgcacaccaagtgtttgataaaatgtctcaatgacaattttattgattatttagttagttta-gttatggaa 505  Q
     ||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||     
T  2425026 aaacacaatttgaat--gttttatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgcctcaataacaattttattgattatttatttagtttaggttatggat 2424929  T
Q  506 atgat 510  Q
    |||||    
T  2424928 atgat 2424924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 380 - 510
Target Start/End: Original strand, 47656256 - 47656386
Alignment:
Q  380 ataatgtgggtttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacaccaagtgtttgataaaatgtctcaatgacaattttattg 479  Q
    ||||||||  |||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47656256 ataatgtgattttgaatggtggcaaaagaacacattttgagtatgtttgatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgtctcaatgacaattttattg 47656355  T
Q  480 attatttagttagtttagttatggaaatgat 510  Q
    |||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  47656356 attatttagttagtttggttatggatatgat 47656386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 380 - 497
Target Start/End: Original strand, 2365622 - 2365739
Alignment:
Q  380 ataatgtgggtttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacaccaagtgtttgataaaatgtctcaatgacaattttattg 479  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  2365622 ataatgtggttttgaatggtggcaaaagaacacattttgagtatgtttgatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgtgtcaatgacaattttattg 2365721  T
Q  480 attatttagttagtttag 497  Q
    ||||||||||||||||||    
T  2365722 attatttagttagtttag 2365739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 380 - 497
Target Start/End: Original strand, 19156401 - 19156518
Alignment:
Q  380 ataatgtgggtttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacaccaagtgtttgataaaatgtctcaatgacaattttattg 479  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  19156401 ataatgtggttttgaatggtggcaaaagaacacattttgagtatgtttgatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgtgtcaatgacaattttattg 19156500  T
Q  480 attatttagttagtttag 497  Q
    ||||||||||||||||||    
T  19156501 attatttagttagtttag 19156518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 88; E-Value: 5e-42
Query Start/End: Original strand, 380 - 510
Target Start/End: Original strand, 21141413 - 21141544
Alignment:
Q  380 ataatgtgggtttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacaccaagtgtttgataaaatgtctcaatgacaattttattg 479  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| || |||| ||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  21141413 ataatgtggttttgaatggtggcaaaagatcacattttgagtatgtttgatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgcctcaatgacaattttattg 21141512  T
Q  480 attatttagttagttta-gttatggaaatgat 510  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  21141513 attatttagttagtttaggttatggatatgat 21141544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 88; E-Value: 5e-42
Query Start/End: Original strand, 380 - 510
Target Start/End: Complemental strand, 50343656 - 50343525
Alignment:
Q  380 ataatgtgggtttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacaccaagtgtttgataaaatgtctcaatgacaattttattg 479  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  50343656 ataatatggttttgaatggtggcaaaagaacacattttgagtatgtttgatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgcctcaatgacaattttattg 50343557  T
Q  480 attatttagttagttta-gttatggaaatgat 510  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  50343556 attatttagttagtttaggttatggatatgat 50343525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 380 - 497
Target Start/End: Complemental strand, 3732068 - 3731951
Alignment:
Q  380 ataatgtgggtttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacaccaagtgtttgataaaatgtctcaatgacaattttattg 479  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||  |||||| ||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  3732068 ataatgtggttttgattggtggcaaaataacacattttgagtatgtttgatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgtgtcaatgacaattttattg 3731969  T
Q  480 attatttagttagtttag 497  Q
    ||||||||||||||||||    
T  3731968 attatttagttagtttag 3731951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 380 - 497
Target Start/End: Complemental strand, 13639710 - 13639593
Alignment:
Q  380 ataatgtgggtttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacaccaagtgtttgataaaatgtctcaatgacaattttattg 479  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||||  |||||| ||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  13639710 ataatgtggttttgaattgtggcaaaataacacattttgagtatgtttgatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgtgtcaatgacaattttattg 13639611  T
Q  480 attatttagttagtttag 497  Q
    ||||||||||||||||||    
T  13639610 attatttagttagtttag 13639593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 380 - 497
Target Start/End: Original strand, 26876043 - 26876160
Alignment:
Q  380 ataatgtgggtttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacaccaagtgtttgataaaatgtctcaatgacaattttattg 479  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||  |||||| ||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  26876043 ataatgtggttttgattggtggcaaaataacacattttgagtatgtttgatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgtgtcaatgacaattttattg 26876142  T
Q  480 attatttagttagtttag 497  Q
    ||||||||||||||||||    
T  26876143 attatttagttagtttag 26876160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 380 - 510
Target Start/End: Complemental strand, 97635 - 97504
Alignment:
Q  380 ataatgtgggtttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacaccaagtgtttgataaaatgtctcaatgacaattttattg 479  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| || |||| ||||| ||||||| |||||||| |||| |||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||    
T  97635 ataatgtggttttgaatggtggcaaaagatcacattttgagtatgtttgatactttgtacacaaagtgtttgagaaaatgcctcaatgataattttattg 97536  T
Q  480 attatttagttagttta-gttatggaaatgat 510  Q
     |||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  97535 tttatttagttagtttaggttatggatatgat 97504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 380 - 496
Target Start/End: Complemental strand, 17514383 - 17514267
Alignment:
Q  380 ataatgtgggtttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacaccaagtgtttgataaaatgtctcaatgacaattttattg 479  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||||||||| |  ||| | |||| |||||    
T  17514383 ataatgtggttttgaatggtgccaaatgaacacaatttgaatatgtttgattctttgcacacaaagtgtttgataaaatgcccaaataaaaattatattg 17514284  T
Q  480 attatttagttagttta 496  Q
    |||||||||||| ||||    
T  17514283 attatttagttaattta 17514267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 262 - 358
Target Start/End: Original strand, 11196148 - 11196244
Alignment:
Q  262 aaaaattagagtagtttgcatgtggttagggttgatctcaaaattgagaatttgatgattgcatgtgtagtttagaaattgataattgaatgtagtt 358  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| | ||||||||||||||||||||||||  ||||||||| | |||||||||    
T  11196148 aaaaattagagtagtttgcatgtggttagggttgattttaaaattgacattttgatgattgcatgtgtagtttatgaattgataaattaatgtagtt 11196244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 390 - 497
Target Start/End: Complemental strand, 38127160 - 38127052
Alignment:
Q  390 tttgaatggtggcaaatgaa-cacaatttgaatatgttttatactttgcacaccaagtgtttgataaaatgtctcaatgacaattttattgattatttag 488  Q
    ||||||||||||||||  || |||| ||| | ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  38127160 tttgaatggtggcaaaaaaaacacatttttagtatgtttgatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgtctcaatgaaaattttattgattacttag 38127061  T
Q  489 ttagtttag 497  Q
    |||||||||    
T  38127060 ttagtttag 38127052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 164 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 2425589 - 2425528
Alignment:
Q  164 tttcacgaattgcaagcaaatcaagtgcacattatcacaagtaagttgtgtcaatcatttta 225  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2425589 tttcacgaattgcaagcaaatcaactgcgcattatcacaagtaagttgtgtcaatcatttta 2425528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 380 - 468
Target Start/End: Original strand, 8474171 - 8474259
Alignment:
Q  380 ataatgtgggtttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacaccaagtgtttgataaaatgtctcaatga 468  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||  |||||| ||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||    
T  8474171 ataatgtggttttgattggtggcaaaataacacattttgagtatgtttgatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgtgtcaatga 8474259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 536 - 581
Target Start/End: Complemental strand, 19524716 - 19524671
Alignment:
Q  536 ttaagtgtattttgattttttagttagtttaggttacgagaattat 581  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  19524716 ttaagtgtatattgattttttagttagtgtaggttacgagaattat 19524671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 536 - 581
Target Start/End: Complemental strand, 19524903 - 19524858
Alignment:
Q  536 ttaagtgtattttgattttttagttagtttaggttacgagaattat 581  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  19524903 ttaagtgtatattgattttttagttagtgtaggttacgagaattat 19524858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 536 - 581
Target Start/End: Complemental strand, 19525564 - 19525519
Alignment:
Q  536 ttaagtgtattttgattttttagttagtttaggttacgagaattat 581  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  19525564 ttaagtgtatattgattttttagttagtgtaggttacgagaattat 19525519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 536 - 581
Target Start/End: Complemental strand, 19526699 - 19526654
Alignment:
Q  536 ttaagtgtattttgattttttagttagtttaggttacgagaattat 581  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  19526699 ttaagtgtatattgattttttagttagtgtaggttacgagaattat 19526654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 536 - 581
Target Start/End: Complemental strand, 19526886 - 19526841
Alignment:
Q  536 ttaagtgtattttgattttttagttagtttaggttacgagaattat 581  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  19526886 ttaagtgtatattgattttttagttagtgtaggttacgagaattat 19526841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 30 - 86
Target Start/End: Original strand, 3728771 - 3728827
Alignment:
Q  30 gttaactgctgaggtaaatctcggcagttaactaccgaggaaatctgaacttaaaca 86  Q
    ||||||||| |||| ||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  3728771 gttaactgccgaggaaaacctcggtagttaactgccgaggaaatctgaacttaaaca 3728827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 30 - 86
Target Start/End: Complemental strand, 8548706 - 8548650
Alignment:
Q  30 gttaactgctgaggtaaatctcggcagttaactaccgaggaaatctgaacttaaaca 86  Q
    ||||||||| |||| ||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  8548706 gttaactgccgaggaaaacctcggtagttaactgccgaggaaatctgaacttaaaca 8548650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 30 - 86
Target Start/End: Complemental strand, 26879332 - 26879276
Alignment:
Q  30 gttaactgctgaggtaaatctcggcagttaactaccgaggaaatctgaacttaaaca 86  Q
    ||||||||| |||| ||| ||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  26879332 gttaactgccgaggaaaacctcggtagttaactgccaaggaaatctgaacttaaaca 26879276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 30 - 93
Target Start/End: Complemental strand, 2425722 - 2425659
Alignment:
Q  30 gttaactgctgaggtaaatctcggcagttaactaccgaggaaatctgaacttaaacagatcgca 93  Q
    ||||||||||||||  |||||||| |||||||| ||||||||||||| ||| || |||| ||||    
T  2425722 gttaactgctgaggagaatctcggtagttaactgccgaggaaatctgcactaaaccagaacgca 2425659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 272 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 38127278 - 38127223
Alignment:
Q  272 gtagtttgcatgtggttagggttgatctcaaaattgagaatttgatgattgcatgt 327  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| |   |||||| ||||||||||||||||||    
T  38127278 gtagtttgcacgtggttagggttgatgttggaattgaaaatttgatgattgcatgt 38127223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 218 - 256
Target Start/End: Original strand, 30890653 - 30890691
Alignment:
Q  218 tcattttaatgttaatgttaatttgtttaggttgagttt 256  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||    
T  30890653 tcattttaatgttaatgttaatttgtttatgtttagttt 30890691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 382 - 451
Target Start/End: Complemental strand, 23935650 - 23935581
Alignment:
Q  382 aatgtgggtttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacaccaagtgtttg 451  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||   |||| |||| ||||||||||| | |||||||||    
T  23935650 aatgtggttttgaatggtgtcaaattaacacaatggtaataagtttcatactttgcactcaaagtgtttg 23935581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 3 - 67
Target Start/End: Original strand, 24362298 - 24362362
Alignment:
Q  3 tgccgaattttgaagaaatcggttgctgttaactgctgaggtaaatctcggcagttaactaccga 67  Q
    ||||||||| ||||||||  || | ||||||||| | |||||||| |||||||||||||| ||||    
T  24362298 tgccgaattatgaagaaactggctactgttaactaccgaggtaaacctcggcagttaactgccga 24362362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0634 (Bit Score: 343; Significance: 0; HSPs: 2)
Name: scaffold0634
Description:

Target: scaffold0634; HSP #1
Raw Score: 343; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 40 - 497
Target Start/End: Original strand, 7464 - 7921
Alignment:
Q  40 gaggtaaatctcggcagttaactaccgaggaaatctgaacttaaacagatcgcagaaccagaacctcccatttccaaaaaaccttcaaaattctcaattt 139  Q
    |||| ||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||    
T  7464 gaggaaaacctcggtagttaactgccgaggaaatctgaacttaaacaaatcgcagaaccagaacctcccatttccaaaacactttctaaattctcaattt 7563  T
Q  140 ctctcccatttcctaccaaatccattt-cacgaattgcaagcaaatcaagtgcacattatcacaagtaagttgtgtcaatcattttaatgttaatgttaa 238  Q
    |||||| || | | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7564 ctctccaatcttc-accaaatccattttcacgaattgcaagcaaatcaagtgcacattatcacaagtaagttgtgtcaatcattttaatgttaatgttaa 7662  T
Q  239 tttgtttaggttgagttttttagaaaaattagagtagtttgcatgtggttagggttgatctcaaaattgagaatttgatgattgcatgtgtagtttagaa 338  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |    
T  7663 tttgtttaggttgatttttttaaaaaaattagagtagtttgtatgtggttagggttgatttcaaaattgacaatttgatgattgcatgtgtagtttagga 7762  T
Q  339 attgataattgaatgtagttgttgcctatgatgtttaaatcataatgtgggtttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgca 438  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7763 attgataaatgaatgtagttgttgcctatgttgtttaaatcataatgtggctttgaatgatggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgca 7862  T
Q  439 caccaagtgtttgataaaatgtctcaatgacaattttattgattatttagttagtttag 497  Q
    ||| |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  7863 cacaaagtatttgataaaatgcctcaatgacaattttattgattttttagttagtttag 7921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0634; HSP #2
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 547 - 581
Target Start/End: Original strand, 7901 - 7935
Alignment:
Q  547 ttgattttttagttagtttaggttacgagaattat 581  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7901 ttgattttttagttagtttaggttacgagaattat 7935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0293 (Bit Score: 343; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold0293
Description:

Target: scaffold0293; HSP #1
Raw Score: 343; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 30 - 562
Target Start/End: Complemental strand, 759 - 233
Alignment:
Q  30 gttaactgctgaggtaaatctcggcagttaactaccgaggaaatctgaacttaaacagatcgcagaaccagaacctcccatttccaaaaaaccttcaaaa 129  Q
    |||||||||  ||| ||| ||||| |||||||| ||||||||| ||| || ||| || | |||||||||||||| || |||||||||||    ||||||     
T  759 gttaactgcccaggaaaacctcggtagttaactgccgaggaaaactggacataaccataacgcagaaccagaacttctcatttccaaaactttttcaaat 660  T
Q  130 ttctcaatttctctcccatttcctaccaaatccattt-cacgaattgcaagcaaatcaagtgcacattatcacaagtaagttgtgtcaatcattttaatg 228  Q
    ||  |||||||||||  || | || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  659 ttaacaatttctctcaaatcttct-ccaaatccattttcacgaattgcaagcaaatcaagtgcacattatcacaagtaagttgtgtcaatcattttaatg 561  T
Q  229 ttaatgttaatttgtttaggttgagttttttagaaaaattagagtagtttgcatgtggttagggttgatctcaaaattgagaatttgatgattgcatgtg 328  Q
    |||||      ||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  560 ttaat------ttgtttaggttgattttttttaaaaaattagagtagtttgtatgtggttagggttgatttcaaaattgacaatttgatgattgcatgtg 467  T
Q  329 tagtttagaaattgataattgaatgtagttgttgcctatgatgtttaaatcataatgtgggtttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgtttt 428  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  466 tagtttagaaattgataattgaatgtagttgttgcctatgtagtttaaatcataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgtttt 367  T
Q  429 atactttgcacaccaagtgtttgataaaatgtctcaatgacaattttattgattatttagttagtttagttatggaaatgatagaaatgatgttaattat 528  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  366 atactttgcacacaacgtgtttgataaaatgtctcaatgacaattttattaattatttagttagtttagttatgaaaatgatagaaatgatgttaattat 267  T
Q  529 agtttggttaagtgtattttgattttttagttag 562  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  266 agtttggttaagtgtattttgattttttagttag 233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0180 (Bit Score: 320; Significance: 1e-180; HSPs: 1)
Name: scaffold0180
Description:

Target: scaffold0180; HSP #1
Raw Score: 320; E-Value: 1e-180
Query Start/End: Original strand, 164 - 581
Target Start/End: Complemental strand, 15525 - 15107
Alignment:
Q  164 tttcacgaattgcaagcaaatcaagtgcacattatcacaagtaagttgtgtcaatcattttaatgttaatgttaatttgtttaggttgagttttttagaa 263  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  15525 tttcacgaattgcaagcaaatcaactgcacattatcataagtaagttgtgtcaatcattttaatcataatgttaatttgtttaggttga-ttttttaaaa 15427  T
Q  264 aaattagagtagtttgcatgtggttagggttgatctcaaaattgagaatttgatgattgcatgtgtagtttagaaattgataattgaatgtagttgttgc 363  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  15426 aaattagagtagtttgtatgtggttagggttgattttaaaattgacaatttgatgattgcatgtgtagtttagaaattgataaatgaatgtagttattgc 15327  T
Q  364 ctatgatgtttaaatcataatgtgggtttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacaccaagtgtttgataaaatgtctc 463  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||    
T  15326 ctatgttgtttaaatcataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgcctc 15227  T
Q  464 aatgacaattttattgattatttagttagttta-gttatggaaatgatagaaatgatgttaattatagtttggttaagtgtattttga-ttttttagtta 561  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||    
T  15226 aatgacaattttattgattatttagttagtttaggttatggaaatgatataaatgatgttaattatagtttggttaagtgtatattgatttttttggtta 15127  T
Q  562 gtttaggttacgagaattat 581  Q
    ||||||||||| ||||||||    
T  15126 gtttaggttacaagaattat 15107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 296; Significance: 1e-166; HSPs: 22)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 296; E-Value: 1e-166
Query Start/End: Original strand, 171 - 581
Target Start/End: Original strand, 31768877 - 31769293
Alignment:
Q  171 aattgcaagcaaatcaagtgcacattatcacaagtaagttgtgtcaatcattttaatgttaatgttaatttgtttaggttgagttttttag-aaaaatta 269  Q
    ||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||   ||||||||    
T  31768877 aattgcaagcaaatagattgcacattatcacaagtaagttgtgtcaatcattttaatgataatgttaatttgtttaggttgattttttttttaaaaatta 31768976  T
Q  270 gagtagtttgcatgtggttagggttgatctcaaaattgagaatttgatgattgc----atgtgtagtttagaaattgataattgaatgtagttgttgcct 365  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| | ||||| || ||||||||||||||    |||||| |||||| |||||| || |||||||||||||||| |    
T  31768977 gagtagtttgcatgtggttagggttgattttaaaatcgacaatttgatgattgcttgcatgtgtggtttaggaattgacaaatgaatgtagttgttgctt 31769076  T
Q  366 atgatgtttaaatcataatgtgggtttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacaccaagtgtttgataaaatgtctcaa 465  Q
    ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  31769077 atgttgtttaaatcataatgtggttttgaatggtggcaaaagaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgtctcaa 31769176  T
Q  466 tgacaattttattgattatttagttagttta-gttatggaaatgatagaaatgatgttaattatagtttggttaagtgtattttgattttttagttagtt 564  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  31769177 tgacaaatttattgattatttagttagtttaggttatggaaatgatagaaatgatgttaattatagtttggttaagtgtatattgattttttagttagtt 31769276  T
Q  565 taggttacgagaattat 581  Q
    |||||||||||||||||    
T  31769277 taggttacgagaattat 31769293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 262; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 164 - 581
Target Start/End: Complemental strand, 24088687 - 24088267
Alignment:
Q  164 tttcacgaattgcaagcaaatcaagtgcacattatcacaagtaagttgtgtcaatcattttaatgttaatgttaatttgtttaggttgagttttttagaa 263  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| | ||||  | ||    
T  24088687 tttcacgaattgcaagcaaatcaaccgcaaattatcacaaataagttgtatcaatcattttaatgataatgttagtttgtttaggtttatttttaaaaaa 24088588  T
Q  264 aaat--tagagtagtttgcatgtggttagggttgatctcaaaattgagaatttgatgattgcatgtgtagtttagaaattgataattgaatgtagttgtt 361  Q
    |||   ||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||| |||||||| |||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||    
T  24088587 aaaaaatagagtagtttgcatgtggttagtgttgattttaaaattgacaatttgataattgcatgtgtagtttatgaattgataaatgaatgtagttgtt 24088488  T
Q  362 gcctatgatgtttaaatcataatgtgggtttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacaccaagtgtttgataaaatgtc 461  Q
    | ||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||    
T  24088487 gtctatgttgtttaaatgataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgtacacaaagtgtttgatcaaatgtc 24088388  T
Q  462 tcaatgacaattttattgattatttagttagttta-gttatggaaatgatagaaatgatgttaattatagtttggttaagtgtattttgattttttagtt 560  Q
    ||||||| |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||| ||||||||||||||    
T  24088387 tcaatgaaaattatattgattatttagttagtttaggttatggaaatgatagaaatgatgttaatgatagtttgattaggtgtatattgattttttagtt 24088288  T
Q  561 agtttaggttacgagaattat 581  Q
    ||||||||||| |||||||||    
T  24088287 agtttaggttatgagaattat 24088267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 262 - 581
Target Start/End: Complemental strand, 6320368 - 6320048
Alignment:
Q  262 aaaaattagagtagtttgcatgtggttagggttgatctcaaaattgagaatttgatgattgcatgtgtagtttagaaattgataattgaatgtagttgtt 361  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||    
T  6320368 aaaaattagagtagtttgcatgtggttagggttgattttaaaattgacaatttgatgattgcatgtgtagtttatgaattgataaatgaatgtagttgtt 6320269  T
Q  362 gcctatgatgtttaaatcataatgtgggtttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacaccaagtgtttgataaaatgtc 461  Q
    ||||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||| |    
T  6320268 gcctatgttgttaaaatcataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagcgtttgatcaaatgcc 6320169  T
Q  462 tcaatgacaattttattgattatttagttagttta-gttatggaaatgatagaaatgatgttaattatagtttggttaagtgtattttgattttttagtt 560  Q
    ||||||| |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  6320168 tcaatgaaaattatattgattatttagttagtttaggttatggaaatgatagaaatgatgttaattatagtttggttaagtgtatattgattttttagtt 6320069  T
Q  561 agtttaggttacgagaattat 581  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  6320068 agtttaggttacgagaattat 6320048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 191 - 534
Target Start/End: Original strand, 3380971 - 3381313
Alignment:
Q  191 cacattatcacaagtaagttgtgtcaatcattttaatgttaatgttaatttgtttaggttgagttttttagaaaaattagagtagtttgcatgtggttag 290  Q
    |||||||||||||||||||    | |||||||  ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  3380971 cacattatcacaagtaagtaccattaatcattgcaattttaatgttaatttgtttaggttaagttttttaaaaaaatt-gagtaatttgcatgtggttag 3381069  T
Q  291 ggttgatctcaaaattgagaatttgatgattgcatgtgtagtttagaaattgataattgaatgtagttgttgcctatgatgtttaaatcataatgtgggt 390  Q
    | || ||     |||||| ||||| || |||||||||||||||||   |||||| | ||||| ||||||||||||||| ||||| ||| |  |||| | |    
T  3381070 gttttataagtgaattgacaatttcatcattgcatgtgtagtttatgcattgatgaatgaatatagttgttgcctatgctgtttcaatga--atgtagtt 3381167  T
Q  391 t-------------tgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacaccaagtgtttgataaaatgtctcaatgacaattttat 477  Q
    |             ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||| ||||||||||| |||||                
T  3381168 tatgtattgataaatgaatggtgtcaaatgaacacaatttgaatatgttttatatattgcacacaaagtggttgataaaatgcctcaa------------ 3381255  T
Q  478 tgattatttagttagttta-gttatggaaatgatagaaatgatgttaattatagtttg 534  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  3381256 tgattatttaattagtttatgttatggaaatgattaaaatgatgttaattatagtttg 3381313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 380 - 497
Target Start/End: Original strand, 6201534 - 6201651
Alignment:
Q  380 ataatgtgggtttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacaccaagtgtttgataaaatgtctcaatgacaattttattg 479  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||  |||||| ||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  6201534 ataatgtggttttgattggtggcaaaataacacattttgagtatgtttgatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgtgtcaatgacaattttattg 6201633  T
Q  480 attatttagttagtttag 497  Q
    ||||||||||||||||||    
T  6201634 attatttagttagtttag 6201651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 380 - 497
Target Start/End: Original strand, 11688501 - 11688618
Alignment:
Q  380 ataatgtgggtttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacaccaagtgtttgataaaatgtctcaatgacaattttattg 479  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||  |||||| ||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  11688501 ataatgtggttttgattggtggcaaaataacacattttgagtatgtttgatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgtgtcaatgacaattttattg 11688600  T
Q  480 attatttagttagtttag 497  Q
    ||||||||||||||||||    
T  11688601 attatttagttagtttag 11688618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 380 - 497
Target Start/End: Original strand, 22301566 - 22301683
Alignment:
Q  380 ataatgtgggtttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacaccaagtgtttgataaaatgtctcaatgacaattttattg 479  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||||  |||||| ||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  22301566 ataatgtggttttgaattgtggcaaaataacacattttgagtatgtttgatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgtgtcaatgacaattttattg 22301665  T
Q  480 attatttagttagtttag 497  Q
    ||||||||||||||||||    
T  22301666 attatttagttagtttag 22301683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 380 - 497
Target Start/End: Complemental strand, 30829339 - 30829222
Alignment:
Q  380 ataatgtgggtttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacaccaagtgtttgataaaatgtctcaatgacaattttattg 479  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||  |||||| ||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  30829339 ataatgtggttttgattggtggcaaaataacacattttgagtatgtttgatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgtgtcaatgacaattttattg 30829240  T
Q  480 attatttagttagtttag 497  Q
    ||||||||||||||||||    
T  30829239 attatttagttagtttag 30829222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 81; E-Value: 8e-38
Query Start/End: Original strand, 380 - 496
Target Start/End: Original strand, 21600990 - 21601106
Alignment:
Q  380 ataatgtgggtttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacaccaagtgtttgataaaatgtctcaatgacaattttattg 479  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |  ||||| |||| |||||    
T  21600990 ataatgtggttttgaatggtgacaaatgaacacaatttgaatatgtttgatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgcccaaatgagaattatattg 21601089  T
Q  480 attatttagttagttta 496  Q
    |||||||||||||||||    
T  21601090 attatttagttagttta 21601106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 380 - 510
Target Start/End: Original strand, 24722314 - 24722445
Alignment:
Q  380 ataatgtgggtttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacaccaagtgtttgataaaatgtctcaatgacaattttattg 479  Q
    ||||||||  ||||||||||| |||| ||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  24722314 ataatgtgtttttgaatggtgtcaaaagaacacattttgagtatgtttgatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgcgtcaatgacaattttattg 24722413  T
Q  480 attatttagttagttta-gttatggaaatgat 510  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  24722414 attatttagttagtttaggttatggatatgat 24722445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 381 - 510
Target Start/End: Original strand, 26423384 - 26423514
Alignment:
Q  381 taatgtgggtttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacaccaagtgtttgataaaatgtctcaatgacaattttattga 480  Q
    |||| ||| |||||||||||||||| || |||| ||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||     
T  26423384 taatatggttttgaatggtggcaaaagatcacattttgagtatgtttgatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgcctcaatgacaattttattgt 26423483  T
Q  481 ttatttagttagttta-gttatggaaatgat 510  Q
    |||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  26423484 ttatttagttagtttatgttatggatatgat 26423514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 78; E-Value: 5e-36
Query Start/End: Original strand, 380 - 497
Target Start/End: Original strand, 27617101 - 27617218
Alignment:
Q  380 ataatgtgggtttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacaccaagtgtttgataaaatgtctcaatgacaattttattg 479  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||| ||| ||| ||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  27617101 ataatatggttttgaatggtggcaaaagaatacattttgagtatgtttgatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgtgtcaatgacaaatttattg 27617200  T
Q  480 attatttagttagtttag 497  Q
    ||||||||||||||||||    
T  27617201 attatttagttagtttag 27617218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 76; E-Value: 7e-35
Query Start/End: Original strand, 380 - 510
Target Start/End: Original strand, 3501555 - 3501686
Alignment:
Q  380 ataatgtgggtttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacaccaagtgtttgataaaatgtctcaatgacaattttattg 479  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| || |||| ||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||    
T  3501555 ataatgtggttttgaatggtggcaaaagatcacattttgagtatgtttgatactttgcacacaaagtgtttgagaaaatgcctcaaggacaattttattg 3501654  T
Q  480 attatttagttagttta-gttatggaaatgat 510  Q
     |||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  3501655 tttatttagttagtttaggttatggatatgat 3501686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 164 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 6320431 - 6320371
Alignment:
Q  164 tttcacgaattgcaagcaaatcaagtgcacattatcacaagtaagttgtgtcaatcatttt 224  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  6320431 tttcacgaattgcaagcaaatcaactgcacattatcacaagtaagttgtatcaatcatttt 6320371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 224 - 297
Target Start/End: Original strand, 24722159 - 24722231
Alignment:
Q  224 taatgttaatgttaatttgtttaggttgagttttttagaaaaattagagtagtttgcatgtggttagggttgat 297  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||| ||||||| | ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  24722159 taatgttaatgttagtttgtttatgttaagtttttaaaaaaaatt-gagtagttttcatgtggttagggttgat 24722231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 273 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 30424228 - 30424143
Alignment:
Q  273 tagtttgcatgtggttagggttgatctcaaaattgagaatttgatgattgcatgtgtagtttagaaattgataattgaatgtagtt 358  Q
    |||| ||||||||||||| ||| || |   |||||| | |||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  30424228 tagtgtgcatgtggttagagtttatgtatgaattgacattttgatgattgcatgtatagtttaggaattgataaatgaatgtagtt 30424143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 17 - 78
Target Start/End: Complemental strand, 2110505 - 2110444
Alignment:
Q  17 gaaatcggttgctgttaactgctgaggtaaatctcggcagttaactaccgaggaaatctgaa 78  Q
    |||||||| ||| |||||||||||||| |||  |||||||| |||||||||||||| |||||    
T  2110505 gaaatcggctgcagttaactgctgaggaaaacttcggcagtaaactaccgaggaaaactgaa 2110444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 216 - 297
Target Start/End: Original strand, 7912647 - 7912728
Alignment:
Q  216 aatcattttaatgttaatgttaatttgtttaggttgagttttttagaaaaattagagtagtttgcatgtggttagggttgat 297  Q
    ||||||| ||||  |||||||| ||||||||| || | |||| || ||||| |  |||||||||||||||||||||||||||    
T  7912647 aatcattgtaatcataatgttagtttgtttagatttatttttataaaaaaaattaagtagtttgcatgtggttagggttgat 7912728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 51 - 86
Target Start/End: Original strand, 30826081 - 30826116
Alignment:
Q  51 cggcagttaactaccgaggaaatctgaacttaaaca 86  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  30826081 cggcagttaactgccgaggaaatctgaacttaaaca 30826116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 30 - 72
Target Start/End: Original strand, 17596977 - 17597019
Alignment:
Q  30 gttaactgctgaggtaaatctcggcagttaactaccgaggaaa 72  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||    
T  17596977 gttaactgccgaggaaaatctcggcagttaactacagaggaaa 17597019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 30 - 96
Target Start/End: Original strand, 27616751 - 27616817
Alignment:
Q  30 gttaactgctgaggtaaatctcggcagttaactaccgaggaaatctgaacttaaacagatcgcagaa 96  Q
    ||||||||| || | ||| ||||| |||||||| |||||||||||||||| ||| |||| |||||||    
T  27616751 gttaactgccgaagaaaacctcggtagttaactgccgaggaaatctgaacataaccagaacgcagaa 27616817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 31 - 72
Target Start/End: Original strand, 14011754 - 14011795
Alignment:
Q  31 ttaactgctgaggtaaatctcggcagttaactaccgaggaaa 72  Q
    |||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  14011754 ttaactgccgaggaaaacctcggcagttaactaccgaggaaa 14011795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0101 (Bit Score: 144; Significance: 2e-75; HSPs: 1)
Name: scaffold0101
Description:

Target: scaffold0101; HSP #1
Raw Score: 144; E-Value: 2e-75
Query Start/End: Original strand, 95 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 41007 - 40746
Alignment:
Q  95 aaccagaacctcccatttccaaaaaacc-ttcaaaattctcaatttctctcccatttcctaccaaatccattt-cacgaattgcaagcaaatcaagtgca 192  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||| || | | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  41007 aaccagaacctcccatttacaaaaaaacattcaaaattctcaatttctctccaatcttc-accaaatccattttcacgaattgcaagcaaatcaagtgca 40909  T
Q  193 cattatcacaagtaagttgtgtcaatcattttaatgttaatgttaatttgtttaggttgagttttttagaaaaattagagtagtttgcatgtggttaggg 292  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||     
T  40908 cattatcacaagtaagttgtgtcaatcattttaatgttaatgttaatttgtttatgttaagttttttaaaaaaatt-gagtagtttgcatgtggttaggt 40810  T
Q  293 ttgatctcaaaattgagaatttgatgattgcatgtgtagtttagaaattgataattgaatgtag 356  Q
    || ||     |||||| ||||| || |||||||||||||||||   |||||||| |||||||||    
T  40809 tttataaatgaattgacaatttcatcattgcatgtgtagtttatgtattgataaatgaatgtag 40746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0155 (Bit Score: 126; Significance: 1e-64; HSPs: 2)
Name: scaffold0155
Description:

Target: scaffold0155; HSP #1
Raw Score: 126; E-Value: 1e-64
Query Start/End: Original strand, 164 - 377
Target Start/End: Original strand, 8374 - 8586
Alignment:
Q  164 tttcacgaattgcaagcaaatcaagtgcacattatcacaagtaagttgtgtcaatcattttaatgttaatgttaatttgtttaggttgagttttttagaa 263  Q
    |||| |||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||| | ||||| | ||    
T  8374 tttcgcgaattgcaagcaaatcaaccacacattatcacaagtaagttgcatcaattattttaatgataatgttagtttgtttaggtttaatttttaa-aa 8472  T
Q  264 aaattagagtagtttgcatgtggttagggttgatctcaaaattgagaatttgatgattgcatgtgtagtttagaaattgataattgaatgtagttgttgc 363  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||| |||||||  ||||||||| ||||||||||||||||    
T  8473 aaattagagtagtttgcatgtggttagggttgattttaaaattgacaatttgatgattgcatgtatagtttatgaattgataaatgaatgtagttgttgc 8572  T
Q  364 ctatgatgtttaaa 377  Q
    ||||| ||||||||    
T  8573 ctatgttgtttaaa 8586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0155; HSP #2
Raw Score: 81; E-Value: 8e-38
Query Start/End: Original strand, 401 - 497
Target Start/End: Original strand, 10761 - 10857
Alignment:
Q  401 gcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacaccaagtgtttgataaaatgtctcaatgacaattttattgattatttagttagtttag 497  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  10761 gcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttacacacaaagtgtttgaaaaaatgtctcaatgacaattatattgattatttagttagtttag 10857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0184 (Bit Score: 112; Significance: 2e-56; HSPs: 1)
Name: scaffold0184
Description:

Target: scaffold0184; HSP #1
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 49 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 18311 - 18111
Alignment:
Q  49 ctcggcagttaactaccgaggaaatctgaacttaaacagatcgcagaaccagaacctcccatttccaaaaaaccttcaaaattctcaatttctctcccat 148  Q
    ||||| |||||||| ||||| ||||||| |||||| ||  ||||||||||||||| ||||||||||||||    |||||||||| |||||||||||| ||    
T  18311 ctcggtagttaactgccgagaaaatctggacttaatcat-tcgcagaaccagaacttcccatttccaaaattt-ttcaaaattcacaatttctctccaat 18214  T
Q  149 ttcctaccaaatccattt-cacgaattgcaagcaaatcaagtgcacattatcacaagtaagttgtgtcaatcattttaatgttaatgttaatttgtttag 247  Q
     | | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  18213 cttc-accaaatccattttcacgaattgcaagcaaatcaagtgcacattatcacaagtaagttgtgtcaatcattttaatgataatgttaatttgtttag 18115  T
Q  248 gttg 251  Q
    ||||    
T  18114 gttg 18111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0078 (Bit Score: 112; Significance: 2e-56; HSPs: 1)
Name: scaffold0078
Description:

Target: scaffold0078; HSP #1
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 49 - 251
Target Start/End: Original strand, 54533 - 54733
Alignment:
Q  49 ctcggcagttaactaccgaggaaatctgaacttaaacagatcgcagaaccagaacctcccatttccaaaaaaccttcaaaattctcaatttctctcccat 148  Q
    ||||| |||||||| ||||| ||||||| |||||| ||  ||||||||||||||| ||||||||||||||    |||||||||| |||||||||||| ||    
T  54533 ctcggtagttaactgccgagaaaatctggacttaatcat-tcgcagaaccagaacttcccatttccaaaattt-ttcaaaattcacaatttctctccaat 54630  T
Q  149 ttcctaccaaatccattt-cacgaattgcaagcaaatcaagtgcacattatcacaagtaagttgtgtcaatcattttaatgttaatgttaatttgtttag 247  Q
     | | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  54631 cttc-accaaatccattttcacgaattgcaagcaaatcaagtgcacattatcacaagtaagttgtgtcaatcattttaatgataatgttaatttgtttag 54729  T
Q  248 gttg 251  Q
    ||||    
T  54730 gttg 54733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0238 (Bit Score: 96; Significance: 9e-47; HSPs: 1)
Name: scaffold0238
Description:

Target: scaffold0238; HSP #1
Raw Score: 96; E-Value: 9e-47
Query Start/End: Original strand, 191 - 510
Target Start/End: Complemental strand, 18808 - 18489
Alignment:
Q  191 cacattatcacaagtaagttgtgtcaatcattttaatgttaatgttaatttgtttaggttgagttttttagaaaaattagagtagtttgcatgtggttag 290  Q
    |||||||||||  |||||| |  | ||||| | |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  18808 cacattatcactggtaagtagcattaatcaatgtaatgttaatgttagtttgtttaggttaagttttttaaaaaaatt-gagtagttttcatgtggttag 18710  T
Q  291 ggttgatctcaaaattgagaatttgatgattgcatgtgtagtttagaaattgataattgaatgtagttgttgcctatgatgtttaaatcat--------- 381  Q
    ||||||| |   |||||| | |||||| |||||||||  ||||||        |||||||||||||||| |     |||| ||| ||||||             
T  18709 ggttgatgtaggaattgaaattttgattattgcatgt--agttta--------taattgaatgtagttgctttaattgatttttgaatcatgttagagtg 18620  T
Q  382 -aatgtgggtttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacaccaagtgtttgataaaatgtctcaatgacaattttattga 480  Q
     ||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  18619 taatgtggttttgaatggtggcaaaagaacacattttgagtatgtttgatactttgcacgcaaagtgtttgataaaatgcctcaatgacaattttattga 18520  T
Q  481 ttatttagttagttta-gttatggaaatgat 510  Q
    |||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  18519 ttatttagttagtttaggttatggatatgat 18489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0877 (Bit Score: 58; Significance: 4e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0877
Description:

Target: scaffold0877; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 380 - 497
Target Start/End: Complemental strand, 4341 - 4224
Alignment:
Q  380 ataatgtgggtttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacaccaagtgtttgataaaatgtctcaatgacaattttattg 479  Q
    ||||||||| ||| |||||||||||| ||||||| ||||| ||||||| ||  ||||||||| |||||||||||||| || | |||||| |||| |||||    
T  4341 ataatgtggtttttaatggtggcaaaagaacacattttgagtatgtttgatgttttgcacacaaagtgtttgataaagtgccccaatgagaattatattg 4242  T
Q  480 attatttagttagtttag 497  Q
    |||||| |||||||||||    
T  4241 attattgagttagtttag 4224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0007 (Bit Score: 49; Significance: 1e-18; HSPs: 2)
Name: scaffold0007
Description:

Target: scaffold0007; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 312 - 495
Target Start/End: Complemental strand, 251230 - 251048
Alignment:
Q  312 tttgatgattgcatgtgtagtttagaaattgataattgaatgtagttgttgcctatgatgtttaaatcataatgtgggtttgaatggtggcaaatgaaca 411  Q
    |||||| |||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||| ||    ||||||||||   | ||||||| ||||||||||| ||||| ||||    
T  251230 tttgataattgcatgtgtagtttatgaattgataaatgaatgtagttgatgtaattgatgtttaaga-agaatgtggttttgaatggtgtcaaattaaca 251132  T
Q  412 caatttgaatatgttttatactttgcacaccaagtgtttgataaaatgtctc-aatgacaattttattgattatttagttagttt 495  Q
    ||||  |||||||||| ||| ||| ||||  ||||| |||| |||||| ||| ||||| ||||  |||||||||||| |||||||    
T  251131 caataagaatatgtttgatattttacacataaagtgattgacaaaatg-ctcaaatgaaaattgcattgattatttacttagttt 251048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0007; HSP #2
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 420 - 468
Target Start/End: Original strand, 246180 - 246228
Alignment:
Q  420 atatgttttatactttgcacaccaagtgtttgataaaatgtctcaatga 468  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| || |||||    
T  246180 atatgttttatactttgcacccaaagtgtttgataaaatgcctaaatga 246228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0201 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0201
Description:

Target: scaffold0201; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 21 - 77
Target Start/End: Original strand, 22430 - 22486
Alignment:
Q  21 tcggttgctgttaactgctgaggtaaatctcggcagttaactaccgaggaaatctga 77  Q
    |||| ||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||| ||||    
T  22430 tcggctgcagttaactgctgaggaaaatctcggtagttaactgccgaggaaaactga 22486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University