View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF9573_high_12 (Length: 305)

Name: NF9573_high_12
Description: NF9573
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF9573_high_12
NF9573_high_12
[»] chr5 (23 HSPs)
chr5 (5-299)||(36200424-36200719)
chr5 (5-297)||(2075819-2076112)
chr5 (7-297)||(12492734-12493025)
chr5 (5-297)||(1274909-1275202)
chr5 (5-297)||(1287934-1288227)
chr5 (75-297)||(3394354-3394580)
chr5 (45-297)||(3301493-3301746)
chr5 (5-297)||(10638941-10639234)
chr5 (5-297)||(20318635-20318924)
chr5 (4-205)||(27631-27832)
chr5 (106-297)||(24178168-24178360)
chr5 (6-295)||(28977203-28977493)
chr5 (148-297)||(16347891-16348040)
chr5 (4-197)||(34272767-34272960)
chr5 (31-192)||(17340843-17341004)
chr5 (165-235)||(43423578-43423648)
chr5 (135-207)||(16779417-16779489)
chr5 (140-232)||(20077297-20077389)
chr5 (140-295)||(43558294-43558450)
chr5 (5-126)||(16347723-16347844)
chr5 (135-283)||(27302425-27302571)
chr5 (212-297)||(17341753-17341839)
chr5 (118-202)||(3096916-3097000)
[»] chr2 (21 HSPs)
chr2 (9-297)||(2610172-2610461)
chr2 (5-295)||(11992451-11992742)
chr2 (6-297)||(8180424-8180716)
chr2 (5-283)||(451967-452246)
chr2 (5-297)||(4807236-4807529)
chr2 (45-297)||(45368009-45368261)
chr2 (106-297)||(38453066-38453258)
chr2 (5-297)||(3865716-3866009)
chr2 (5-220)||(41197573-41197791)
chr2 (5-297)||(41763386-41763687)
chr2 (33-237)||(6238127-6238330)
chr2 (140-262)||(17581148-17581270)
chr2 (6-297)||(24583952-24584244)
chr2 (6-297)||(37281753-37282043)
chr2 (5-297)||(30743267-30743560)
chr2 (135-297)||(13148957-13149120)
chr2 (5-119)||(38429707-38429821)
chr2 (5-262)||(3243996-3244254)
chr2 (5-126)||(36183267-36183388)
chr2 (5-126)||(23997433-23997554)
chr2 (30-126)||(12734522-12734617)
[»] chr4 (34 HSPs)
chr4 (5-297)||(27450518-27450811)
chr4 (5-297)||(23906646-23906939)
chr4 (5-297)||(31960159-31960452)
chr4 (5-297)||(435873-436166)
chr4 (5-297)||(33226853-33227146)
chr4 (1-283)||(1211731-1212014)
chr4 (70-297)||(1777425-1777653)
chr4 (6-236)||(55578740-55578967)
chr4 (31-297)||(16002573-16002838)
chr4 (5-297)||(48174438-48174731)
chr4 (5-297)||(53707438-53707731)
chr4 (5-205)||(35690042-35690241)
chr4 (5-283)||(50286629-50286908)
chr4 (5-297)||(39708101-39708395)
chr4 (4-233)||(46583168-46583397)
chr4 (5-297)||(56374934-56375227)
chr4 (5-205)||(43433655-43433855)
chr4 (5-297)||(47265547-47265842)
chr4 (85-297)||(48622952-48623165)
chr4 (140-262)||(17666518-17666641)
chr4 (147-275)||(54787732-54787861)
chr4 (144-244)||(17667813-17667913)
chr4 (212-295)||(30807244-30807328)
chr4 (6-90)||(45205194-45205278)
chr4 (135-237)||(3273127-3273229)
chr4 (6-67)||(11389595-11389656)
chr4 (6-121)||(7092565-7092680)
chr4 (162-229)||(41009855-41009922)
chr4 (106-180)||(54914635-54914708)
chr4 (6-85)||(1793317-1793396)
chr4 (165-239)||(1629134-1629208)
chr4 (167-294)||(7092719-7092847)
chr4 (140-232)||(8917807-8917899)
chr4 (6-126)||(52569861-52569981)
[»] chr3 (18 HSPs)
chr3 (6-294)||(27917219-27917508)
chr3 (5-297)||(38849738-38850031)
chr3 (5-297)||(25191023-25191316)
chr3 (100-298)||(30345174-30345369)
chr3 (5-297)||(47542057-47542349)
chr3 (5-297)||(51448054-51448347)
chr3 (75-297)||(29817149-29817371)
chr3 (5-183)||(52138559-52138737)
chr3 (5-294)||(26489964-26490254)
chr3 (5-171)||(5168599-5168765)
chr3 (118-295)||(48221430-48221608)
chr3 (109-262)||(54425355-54425509)
chr3 (5-233)||(28245146-28245374)
chr3 (194-297)||(19757712-19757816)
chr3 (31-205)||(3186506-3186680)
chr3 (5-125)||(43695110-43695230)
chr3 (222-297)||(52138472-52138548)
chr3 (140-176)||(43111535-43111571)
[»] chr6 (17 HSPs)
chr6 (6-294)||(5631464-5631754)
chr6 (5-297)||(10100202-10100495)
chr6 (56-297)||(5258546-5258788)
chr6 (1-297)||(9706420-9706717)
chr6 (6-283)||(2689314-2689592)
chr6 (5-296)||(20427981-20428273)
chr6 (5-187)||(6056115-6056297)
chr6 (135-244)||(33495895-33496004)
chr6 (5-183)||(14030565-14030743)
chr6 (135-276)||(26291444-26291586)
chr6 (74-192)||(30679224-30679342)
chr6 (7-199)||(607902-608094)
chr6 (9-206)||(2065105-2065303)
chr6 (137-298)||(27790799-27790961)
chr6 (4-102)||(33496024-33496122)
chr6 (135-236)||(6641885-6641986)
chr6 (5-122)||(28085196-28085313)
[»] chr1 (33 HSPs)
chr1 (5-297)||(32083090-32083383)
chr1 (6-298)||(34827448-34827741)
chr1 (5-297)||(8671564-8671857)
chr1 (5-297)||(43240726-43241019)
chr1 (30-297)||(37463237-37463503)
chr1 (4-294)||(51441109-51441399)
chr1 (6-283)||(19936179-19936458)
chr1 (5-297)||(49347738-49348032)
chr1 (5-297)||(1210389-1210682)
chr1 (5-233)||(30202475-30202703)
chr1 (6-184)||(9599740-9599918)
chr1 (106-294)||(27445545-27445734)
chr1 (5-297)||(51601702-51601995)
chr1 (5-197)||(9592479-9592671)
chr1 (162-295)||(32066773-32066904)
chr1 (5-126)||(15085750-15085871)
chr1 (9-205)||(22089831-22090027)
chr1 (5-192)||(46226627-46226814)
chr1 (135-237)||(51234319-51234421)
chr1 (5-126)||(696085-696206)
chr1 (11-229)||(11331415-11331633)
chr1 (11-229)||(11489436-11489654)
chr1 (9-83)||(18469429-18469503)
chr1 (109-294)||(7921574-7921760)
chr1 (5-143)||(39140313-39140450)
chr1 (49-150)||(41560228-41560329)
chr1 (135-191)||(8391521-8391577)
chr1 (213-247)||(16273359-16273393)
chr1 (162-244)||(52640927-52641009)
chr1 (162-236)||(52739969-52740043)
chr1 (222-298)||(16142411-16142488)
chr1 (162-235)||(52421136-52421208)
chr1 (194-297)||(35828927-35829031)
[»] scaffold0024 (1 HSPs)
scaffold0024 (1-297)||(82365-82662)
[»] chr8 (29 HSPs)
chr8 (9-297)||(36565590-36565879)
chr8 (5-297)||(42854349-42854642)
chr8 (74-297)||(4032909-4033132)
chr8 (5-297)||(12492187-12492480)
chr8 (106-278)||(13984698-13984870)
chr8 (5-237)||(18124881-18125112)
chr8 (106-298)||(29735460-29735645)
chr8 (6-218)||(25299961-25300173)
chr8 (6-229)||(25288613-25288838)
chr8 (85-229)||(25439249-25439393)
chr8 (106-297)||(36544796-36544988)
chr8 (5-205)||(37077502-37077702)
chr8 (5-197)||(39946602-39946794)
chr8 (6-298)||(15215617-15215909)
chr8 (99-187)||(6510855-6510944)
chr8 (140-295)||(28300588-28300741)
chr8 (74-278)||(8879848-8880053)
chr8 (147-275)||(19293767-19293896)
chr8 (143-262)||(33830716-33830836)
chr8 (5-119)||(18752218-18752332)
chr8 (147-244)||(38667255-38667352)
chr8 (135-219)||(13589163-13589247)
chr8 (140-237)||(35601703-35601799)
chr8 (133-181)||(10824561-10824609)
chr8 (140-187)||(43732359-43732406)
chr8 (5-126)||(36395295-36395419)
chr8 (133-206)||(44681549-44681622)
chr8 (135-179)||(30113671-30113715)
chr8 (109-181)||(45231195-45231267)
[»] chr7 (27 HSPs)
chr7 (50-297)||(46356241-46356489)
chr7 (45-295)||(38606651-38606902)
chr7 (5-297)||(31004868-31005160)
chr7 (5-297)||(36651638-36651931)
chr7 (5-297)||(33350151-33350444)
chr7 (5-229)||(43281389-43281613)
chr7 (5-297)||(11593604-11593897)
chr7 (5-233)||(35906546-35906774)
chr7 (6-297)||(36869635-36869927)
chr7 (113-294)||(48919035-48919217)
chr7 (5-197)||(34869165-34869357)
chr7 (74-297)||(37616560-37616784)
chr7 (5-230)||(33072666-33072891)
chr7 (6-202)||(7272780-7272975)
chr7 (6-297)||(32630251-32630531)
chr7 (162-294)||(21517827-21517959)
chr7 (13-297)||(39906728-39907017)
chr7 (5-179)||(23404181-23404355)
chr7 (7-179)||(49029044-49029211)
chr7 (6-205)||(7189579-7189777)
chr7 (179-236)||(24177714-24177771)
chr7 (140-244)||(23087582-23087686)
chr7 (6-126)||(12841621-12841741)
chr7 (5-125)||(25579416-25579536)
chr7 (16-87)||(28628286-28628357)
chr7 (141-304)||(43793524-43793685)
chr7 (212-297)||(49028911-49028997)
[»] scaffold0570 (1 HSPs)
scaffold0570 (7-297)||(2617-2908)
[»] scaffold0113 (1 HSPs)
scaffold0113 (135-293)||(12073-12232)
[»] scaffold0018 (1 HSPs)
scaffold0018 (5-297)||(31112-31405)
[»] scaffold0171 (1 HSPs)
scaffold0171 (223-297)||(5836-5911)
[»] scaffold0045 (1 HSPs)
scaffold0045 (164-244)||(87113-87193)


Alignment Details
Target: chr5 (Bit Score: 236; Significance: 1e-130; HSPs: 23)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 5 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 36200719 - 36200424
Alignment:
Q  5 gcaacatcctcatctctgatacgctcacttgattctcgcattggttcttaaccgcccaccacttagtatcatacaacattgccggtttgactgttgtctg 104  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| |    
T  36200719 gcaacatcctcatctctgatacgcttacttgattctcacgttggttcttaaccgcctaccactttgtatcatacaacattgccagtttgactgttgtccg 36200620  T
Q  105 gtagaattttcctttcaacttatgcagcattttcttatcacataaaacacatgagtttcttctccatttcaaccacccaacttaaatatgatgatttaca 204  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36200619 gtagaattttcctttcaacttaaacagcattttcttatcacataaaacacatgagtctcttctccatttcaaccacccaacttaaatatgatgatttaca 36200520  T
Q  205 tatgcgactatttctctgtcattttgtactatgaacccaaaa-atttaaacggtgtaacctgaggtatgatatgacctcccactttcacctccata 299  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36200519 tatgctactatttctatgtcattttgtactatgaacccaaaatatttaaacggtgtaacttgaggtatgatatgacctcccactttcacctccata 36200424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 5 - 297
Target Start/End: Original strand, 2075819 - 2076112
Alignment:
Q  5 gcaacatcctcatctctgatacgctcacttgattctcgcattggttcttaaccgcccaccacttagtatcatacaacattgccggtttgactgttgtctg 104  Q
    |||||||||||||||||| ||| || |||| ||||||   |||  ||||||||||||| ||||  ||| |||||||||  ||||||  ||||| |||| |    
T  2075819 gcaacatcctcatctctgctacacttacttaattctcatgttgactcttaaccgcccaacactccgtaccatacaacaacgccggtcggactgctgtccg 2075918  T
Q  105 gtagaattttcctttcaacttatgcagcattttcttatcacataaaacacatgagtttcttctccatttcaaccacccaacttaaatatgatgatttaca 204  Q
     ||||| ||||||||||||||| |  | | ||||||||  || ||||||| ||||  |||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||  |||||    
T  2075919 atagaactttcctttcaacttaagtggtactttcttattgcacaaaacacctgaggctcttcttcatttcaaccacccaacttgaatacgatggcttaca 2076018  T
Q  205 tatgcgactatttctctgtcattttgtactatgaacccaa-aaatttaaacggtgtaacctgaggtatgatatgacctcccactttcacctcca 297  Q
    | |||  |||||||||||||||||||||| | | |||||| | |||||||| ||||||| || |||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  2076019 tctgcttctatttctctgtcattttgtacgaaggacccaagatatttaaaccgtgtaacttggggtatgatatgatctccaactttcacctcca 2076112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 7 - 297
Target Start/End: Original strand, 12492734 - 12493025
Alignment:
Q  7 aacatcctcatctctgatacgctcacttgattctcgcattggttcttaaccgcccaccacttagtatcatacaacattgccggtttgactgttgtctggt 106  Q
    |||||||||||||||| ||| || |||||||||||   |||  ||||||||||||| ||||  ||| |||||||||  ||||||  ||||| |||| | |    
T  12492734 aacatcctcatctctgctacacttacttgattctcatgttgactcttaaccgcccaacactccgtaccatacaacaaagccggtcggactgctgtccgat 12492833  T
Q  107 agaattttcctttcaacttatgcagcattttcttatcacataaaacacatgagtttcttctccatttcaaccacccaacttaaatatgatgatttacata 206  Q
    |||| ||||||||||||||| |  | | ||||||||  || ||||||| ||||  |||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||  ||||||     
T  12492834 agaactttcctttcaacttaagtggtactttcttattgcacaaaacacctgaggctcttctccatttcaaccacccagcttgaatacgatggcttacatc 12492933  T
Q  207 tgcgactatttctctgtcattttgtactatgaacccaa-aaatttaaacggtgtaacctgaggtatgatatgacctcccactttcacctcca 297  Q
    |||  ||||||||| |||||||||||| | | |||||| | |||||||| ||||||| || |||||||||||| |||| ||||| |||||||    
T  12492934 tgcttctatttctccgtcattttgtacgaaggacccaagatatttaaaccgtgtaacttggggtatgatatgatctccaacttttacctcca 12493025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 5 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 1275202 - 1274909
Alignment:
Q  5 gcaacatcctcatctctgatacgctcacttgattctcgcattggttcttaaccgcccaccacttagtatcatacaacattgccggtttgactgttgtctg 104  Q
    |||||||||||||||||| || ||| |||||||||||   |||  || |||||||||| ||||  ||| |||||||||  |||||| |||||| |||| |    
T  1275202 gcaacatcctcatctctgctatgcttacttgattctcatgttgactcgtaaccgcccaacactccgtaccatacaacaacgccggtctgactgctgtccg 1275103  T
Q  105 gtagaattttcctttcaacttatgcagcattttcttatcacataaaacacatgagtttcttctccatttcaaccacccaacttaaatatgatgatttaca 204  Q
     ||||| ||||||||||||||| |  | | ||||||||| || ||||||| | ||  |||||| ||||||||||||||| ||| |||| ||||  |||||    
T  1275102 atagaactttcctttcaacttaagtggtactttcttatcgcacaaaacaccttaggctcttcttcatttcaaccacccagcttgaatacgatggcttaca 1275003  T
Q  205 tatgcgactatttctctgtcattttgtactatgaacccaa-aaatttaaacggtgtaacctgaggtatgatatgacctcccactttcacctcca 297  Q
    | |||  ||||||||| |||||||||||| | | |||||| | |||||||| ||||||| || |||||||||||| |||| ||||||| |||||    
T  1275002 tctgcttctatttctccgtcattttgtacgaaggacccaagatatttaaaccgtgtaacttggggtatgatatgatctccaactttcatctcca 1274909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 5 - 297
Target Start/End: Original strand, 1287934 - 1288227
Alignment:
Q  5 gcaacatcctcatctctgatacgctcacttgattctcgcattggttcttaaccgcccaccacttagtatcatacaacattgccggtttgactgttgtctg 104  Q
    |||||||||||||||||| ||| || |||||||||||   |||  ||||||||||||| ||||  ||| |||||||||  |||| |  ||||| |||  |    
T  1287934 gcaacatcctcatctctgctacacttacttgattctcatgttgactcttaaccgcccaacactccgtaccatacaacaacgccgatcggactgctgttcg 1288033  T
Q  105 gtagaattttcctttcaacttatgcagcattttcttatcacataaaacacatgagtttcttctccatttcaaccacccaacttaaatatgatgatttaca 204  Q
     ||||| |||||||||||||||    | | ||||||||| || ||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||  |||||    
T  1288034 atagaactttcctttcaacttaaatggtactttcttatcgcacaaaacacatgaggctcttctccatttcaaccatccaacttgaatacgatggcttaca 1288133  T
Q  205 tatgcgactatttctctgtcattttgtactatgaacccaa-aaatttaaacggtgtaacctgaggtatgatatgacctcccactttcacctcca 297  Q
    | |||  ||||||||| |||||||||||| | | || ||| | |||||||| ||||||| || |||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  1288134 tctgcttctatttctccgtcattttgtacgaaggactcaagatatttaaaccgtgtaacttggggtatgatatgatctccaactttcacctcca 1288227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 75 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 3394580 - 3394354
Alignment:
Q  75 atacaacattgccggtttgactgttgtctggtagaattttcct---ttcaacttatgcagcattttcttatcacataaaacacatgagtttcttctccat 171  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||| | ||||| ||||||   |||| |||| |  | | ||||||||| || ||||||| ||||  || |||||||    
T  3394580 atacaacattgccggtctgactgctgtccgatagaactttcctcctttcagcttaagtggtactttcttatcgcacaaaacacctgaggctcatctccat 3394481  T
Q  172 ttcaaccacccaacttaaatatgatgatttacatatgcgactatttctctgtcattttgtactatgaacccaa-aaatttaaacggtgtaacctgaggta 270  Q
    |||||||||||| ||| |||| |||||||||||| |||  ||||||||| |||||||||||||||| |||||| | |||||||| ||||||| || ||||    
T  3394480 ttcaaccacccagcttgaatacgatgatttacatctgcttctatttctccgtcattttgtactatggacccaagatatttaaaccgtgtaacttggggta 3394381  T
Q  271 tgatatgacctcccactttcacctcca 297  Q
    |||||||| |||| |||||||||||||    
T  3394380 tgatatgatctccaactttcacctcca 3394354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 45 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 3301746 - 3301493
Alignment:
Q  45 ttggttcttaaccgcccaccacttagtatcatacaacattgccggtttgactgttgtctggtagaattttcctttcaacttatgcagcattttcttatca 144  Q
    |||| ||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||| | || |||||  |||| | ||||| ||||||||||| ||| |  | | |||||||||     
T  3301746 ttggctcttaaccgcccaacacttcgtaccatacaacattgtcagtctgactactgtccgatagaactttcctttcaatttaagtggtactttcttatcg 3301647  T
Q  145 cataaaacacatgagtttcttctccatttcaaccacccaacttaaatatgatgatttacatatgcgactatttctctgtcattttgtactatgaacccaa 244  Q
    || ||||||| ||||  || |||| |||||||||||||| ||| |||| |||||||| ||| |||  |||||||||  |||||| |||||||| ||||||    
T  3301646 cacaaaacacctgaggctcatctctatttcaaccacccagcttgaatacgatgatttgcatctgcttctatttctccttcatttggtactatggacccaa 3301547  T
Q  245 -aaatttaaacggtgtaacctgaggtatgatatgacctcccactttcacctcca 297  Q
     | |||||||| ||||||| || |||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  3301546 gatatttaaaccgtgtaacttggggtatgatatgatctccaactttcacctcca 3301493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 74; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 5 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 10639234 - 10638941
Alignment:
Q  5 gcaacatcctcatctctgatacgctcacttgattctcgcattggttcttaaccgcccaccacttagtatcatacaacattgccggtttgactgttgtctg 104  Q
    |||||||||||||||||| ||| || |||||||||||   |||  |||| |||||||| ||||  ||| |||||||||  | ||||  ||||| |||  |    
T  10639234 gcaacatcctcatctctgctacacttacttgattctcatgttgactcttcaccgcccaacactccgtaccatacaacaacgtcggtcggactgctgttcg 10639135  T
Q  105 gtagaattttcctttcaacttatgcagcattttcttatcacataaaacacatgagtttcttctccatttcaaccacccaacttaaatatgatgatttaca 204  Q
     ||||| ||||||||||||||| |  | | ||||||||| || ||||||| | ||  |||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||  |||||    
T  10639134 atagaactttcctttcaacttaagtggtactttcttatcgcacaaaacacctaaggctcttctccatttcaaccacccagcttgaatacgatggcttaca 10639035  T
Q  205 tatgcgactatttctctgtcattttgtactatgaacccaa-aaatttaaacggtgtaacctgaggtatgatatgacctcccactttcacctcca 297  Q
    | |||  ||||||||| |||||||||||| | | |||||| | |||||||| ||||||| || ||||||||||||  ||| |||||||||||||    
T  10639034 tctgcttctatttctccgtcattttgtacgaaggacccaagatatttaaaccgtgtaacttggggtatgatatgatttccaactttcacctcca 10638941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 5 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 20318924 - 20318635
Alignment:
Q  5 gcaacatcctcatctctgatacgctcacttgattctcgcattggttcttaaccgcccaccacttagtatcatacaacattgccggtttgactgttgtctg 104  Q
    |||||||||||||||||| ||| || |||||||||||   |||  |||||||||| || ||||  ||| |||||||||  ||||||  ||||| | || |    
T  20318924 gcaacatcctcatctctgctacacttacttgattctcatgttgactcttaaccgcgcaacactccgtaccatacaacaacgccggtcggactgctatccg 20318825  T
Q  105 gtagaattttcctttcaacttatgcagcattttcttatcacataaaacacatgagtttcttctccatttcaaccacccaacttaaatatgatgatttaca 204  Q
     || || ||||||||||||||| |  | |    |||||| || ||||||| ||||  |||||||||||||||||||||| ||| |||||||||  |||||    
T  20318824 atataactttcctttcaacttaagtggta----cttatcgcacaaaacacctgaggctcttctccatttcaaccacccagcttgaatatgatggcttaca 20318729  T
Q  205 tatgcgactatttctctgtcattttgtactatgaacccaa-aaatttaaacggtgtaacctgaggtatgatatgacctcccactttcacctcca 297  Q
    | |||  ||||||||| |||||||||||| | | |||||| | |||||||| ||||||| || |||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  20318728 tctgcttctatttctccgtcattttgtacgaaggacccaagatatttaaaccgtgtaacttggggtatgatatgatctccaactttcacctcca 20318635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 4 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 27832 - 27631
Alignment:
Q  4 tgcaacatcctcatctctgatacgctcacttgattctcgcattggttcttaaccgcccaccacttagtatcatacaacattgccggtttgactgttgtct 103  Q
    ||||||||||||||||| | || ||| |||| ||||||   |||||||||||||||||| ||||  ||| |||||||||| | | ||  |||| |||||     
T  27832 tgcaacatcctcatctccgttatgcttacttaattctcatgttggttcttaaccgcccaacactccgtaccatacaacatcgtctgtccgactattgtca 27733  T
Q  104 ggtagaattttcctttcaacttatgcagcattttcttatcacataaaacacatgagtttcttctccatttcaaccacccaacttaaatatgatgatttac 203  Q
    | ||||||||||||||||||||| |  | | ||||||||||| ||||||||  |||  ||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||||    
T  27732 gatagaattttcctttcaacttaagtggtactttcttatcacgtaaaacactcgagactcttctctatttccaccacccaacttgaatatgatgatttac 27633  T
Q  204 at 205  Q
    ||    
T  27632 at 27631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 106 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 24178360 - 24178168
Alignment:
Q  106 tagaattttcctttcaacttatgcagcattttcttatcacataaaacacatgagtttcttctccatttcaaccacccaacttaaatatgatgatttacat 205  Q
    ||||| ||||||||||||||| |  | | ||||||||| || ||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||    
T  24178360 tagaactttcctttcaacttaagtggtactttcttatcgcacaaaacacttgaggctcttctccatttcaaccacccaacttgaatatgatggcttacat 24178261  T
Q  206 atgcgactatttctctgtcattttgtactatgaacccaa-aaatttaaacggtgtaacctgaggtatgatatgacctcccactttcacctcca 297  Q
     |||  ||||||||| |||||||||||| | | |||||| |  ||||||| ||||||| |  |||||||||||| |||| |||||||| ||||    
T  24178260 ctgcttctatttctccgtcattttgtacgaaggacccaagatctttaaaccgtgtaacttagggtatgatatgatctccaactttcacttcca 24178168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 6 - 295
Target Start/End: Original strand, 28977203 - 28977493
Alignment:
Q  6 caacatcctcatctctgatacgctcacttgattctcgcattggttcttaaccgcccaccacttagtatcatacaacattgccggtttgactgttgtctgg 105  Q
    |||||| |||||||||| ||| || |||||||||||   |||  ||||||||||||| ||||  ||| |||||||||  | || |  ||||| |||| |     
T  28977203 caacatactcatctctgctacacttacttgattctcatgttgactcttaaccgcccaacactccgtaccatacaacaacgtcgttcggactgatgtccga 28977302  T
Q  106 tagaattttcctttcaacttatgcagcattttcttatcacataaaacacatgagtttcttctccatttcaaccacccaacttaaatatgatgatttacat 205  Q
    ||||| ||||||||||||||| |  | | ||||||||| || |||||||  |||  |||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||  ||||||    
T  28977303 tagaactttcctttcaacttaagtggtactttcttatcgcacaaaacacccgaggctcttctccatttcaaccacccagcttgaatacgatggcttacat 28977402  T
Q  206 atgcgactatttctctgtcattttgtactatgaacccaa-aaatttaaacggtgtaacctgaggtatgatatgacctcccactttcacctc 295  Q
     | |  ||||| ||| |||||||||||| | | |||||| | |||||||| |||| || || |||||||||||| |||| |||||||||||    
T  28977403 ctacttctattactccgtcattttgtacgaaggacccaagatatttaaaccgtgtgacttggggtatgatatgatctccaactttcacctc 28977493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 148 - 297
Target Start/End: Original strand, 16347891 - 16348040
Alignment:
Q  148 aaaacacatgagtttcttctccatttcaaccacccaacttaaatatgatgatttacatatgcgactatttctctgtcattttgtactatgaacccaaaa- 246  Q
    ||||||| ||||  |||||||||||||||||||| | ||| |||| ||||||||||||| ||   |||||||| |||||||||||||||| || ||| |     
T  16347891 aaaacacctgaggctcttctccatttcaaccaccta-cttgaatacgatgatttacatacgcttttatttctccgtcattttgtactatggacacaagat 16347989  T
Q  247 atttaaacggtgtaacctgaggtatgatatgacctcccactttcacctcca 297  Q
    |||||||| ||||||| || |||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  16347990 atttaaaccgtgtaacttggggtatgatatgatctccaactttcacctcca 16348040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 4 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 34272960 - 34272767
Alignment:
Q  4 tgcaacatcctcatctctgatacgctcacttgattctcgcattggttcttaaccgcccaccacttagtatcatacaacattgccggtttgactgttgtct 103  Q
    ||||||||||||||||||| ||| || |||||||||||  ||||  ||||||||||||| ||||  ||| |||||||||  | |||   ||||| ||||     
T  34272960 tgcaacatcctcatctctgctacacttacttgattctcatattgactcttaaccgcccaacactccgtaccatacaacaacgtcggccggactgctgtcc 34272861  T
Q  104 ggtagaattttcctttcaacttatgcagcattttcttatcacataaaacacatgagtttcttctccatttcaaccacccaacttaaatatgatg 197  Q
    | | ||| ||||||||||||||| |  | | ||||||||| || ||||||| ||||  |||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||    
T  34272860 gattgaactttcctttcaacttaagtggtactttcttatcgcacaaaacacctgaggctcttctccattttaaccacccaacttgaatacgatg 34272767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 31 - 192
Target Start/End: Original strand, 17340843 - 17341004
Alignment:
Q  31 acttgattctcgcattggttcttaaccgcccaccacttagtatcatacaacattgccggtttgactgttgtctggtagaattttcctttcaacttatgca 130  Q
    ||||||||||||  || ||| |||||| |||| ||||| |||||||| ||||||| |||| ||||| ||||| | || ||||||| |||||||||| ||     
T  17340843 acttgattctcgtgttagttattaaccacccaacactttgtatcatataacattgtcggtctgactattgtccgatacaattttcttttcaacttaagcg 17340942  T
Q  131 gcattttcttatcacataaaacacatgagtttcttctccatttcaaccacccaacttaaata 192  Q
    | ||| |||||  |||||| |||| |||  | ||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  17340943 gtattctcttacaacataagacacttgatgtccttctccatttcaaccacctaacttgaata 17341004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 165 - 235
Target Start/End: Original strand, 43423578 - 43423648
Alignment:
Q  165 tctccatttcaaccacccaacttaaatatgatgatttacatatgcgactatttctctgtcattttgtacta 235  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||  || |||||| ||||||||||||||    
T  43423578 tctccatttcaaccacccaacttgaatatgatgatttacatctgcttctgtttctccgtcattttgtacta 43423648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 135 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 16779489 - 16779417
Alignment:
Q  135 tttcttatcacataaaacacatgagtttcttctccatttcaaccacccaacttaaatatgatgatttacatat 207  Q
    |||| ||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||| ||| || ||| ||||| |||||||||    
T  16779489 tttcgtatcacataaaacatctgagtctcttctccatttcaaccactcaaattgaatttgatggtttacatat 16779417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 140 - 232
Target Start/End: Original strand, 20077297 - 20077389
Alignment:
Q  140 tatcacataaaacacatgagtttcttctccatttcaaccacccaacttaaatatgatgatttacatatgcgactatttctctgtcattttgta 232  Q
    ||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||| ||||| | || |||||||||| ||| |||    ||||||| |||||||||||    
T  20077297 tatcacataaaacacctgaggctcttctccatttcaaccatccaacctgaaaatgatgatttgcatctgctttaatttctccgtcattttgta 20077389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 140 - 295
Target Start/End: Original strand, 43558294 - 43558450
Alignment:
Q  140 tatcacataaaacacatgagtttcttctccatttcaaccacccaacttaaatatgatgatttacatatgcgactatttctctgtcattttgtactatgaa 239  Q
    ||||||||||||||| | ||  | ||||||||||| || ||||  ||| |||  |||||||||||| |||  ||||||||||||  |||||||| ||| |    
T  43558294 tatcacataaaacactttaggctattctccatttccactaccctgcttgaattcgatgatttacatctgcttctatttctctgtggttttgtacaatgga 43558393  T
Q  240 cccaa-aaatttaaacggtgtaacctgaggtatgatatgacctcccactttcacctc 295  Q
    || || | |||||||  ||||||| || |||||| ||||| |||| |||||||||||    
T  43558394 cctaagatatttaaatcgtgtaacttgtggtatgctatgatctccaactttcacctc 43558450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 5 - 126
Target Start/End: Original strand, 16347723 - 16347844
Alignment:
Q  5 gcaacatcctcatctctgatacgctcacttgattctcgcattggttcttaaccgcccaccacttagtatcatacaacattgccggtttgactgttgtctg 104  Q
    |||||||||||||||| | ||| || |||| | |||||  |||| |||||||||| || ||||  ||| ||||||| || | |||| ||| ||||||| |    
T  16347723 gcaacatcctcatctccgctacacttacttaactctcgtgttggctcttaaccgctcaacactccgtaccatacaatatcgtcggtctgagtgttgtccg 16347822  T
Q  105 gtagaattttcctttcaactta 126  Q
     ||||| |||||||||||||||    
T  16347823 atagaactttcctttcaactta 16347844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 135 - 283
Target Start/End: Original strand, 27302425 - 27302571
Alignment:
Q  135 tttcttatcacataaaacacatgagtttcttctccatttcaaccacccaacttaaatatgatgatttacatatgcgactatttctctgtcattttgtact 234  Q
    |||||||||||||||| || ||  |  |||| |||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||   |  ||||||||| | | ||||||| |    
T  27302425 tttcttatcacataaagcatatatggctcttttccatttcaaccactcaacttgaatacgatgatttacat---cttctatttctccgccgttttgtatt 27302521  T
Q  235 atgaacccaa-aaatttaaacggtgtaacctgaggtatgatatgacctcc 283  Q
    ||| || ||| | |||||||| |||||   ||||||||||||||| ||||    
T  27302522 atggacacaagatatttaaaccgtgtagtttgaggtatgatatgatctcc 27302571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 212 - 297
Target Start/End: Original strand, 17341753 - 17341839
Alignment:
Q  212 ctatttctctgtcattttgtactatgaacccaaaa-atttaaacggtgtaacctgaggtatgatatgacctcccactttcacctcca 297  Q
    |||||||||| ||||||| ||||||| |||||| | ||||||||  |||||  | ||||||||||||| |||| |||| ||||||||    
T  17341753 ctatttctctatcattttctactatggacccaatatatttaaaccatgtaatttcaggtatgatatgatctccaacttccacctcca 17341839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 118 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 3097000 - 3096916
Alignment:
Q  118 ttcaacttatgcagcattttcttatcacataaaacacatgagtttcttctccatttcaaccacccaacttaaatatgatgattta 202  Q
    ||||||||| || | ||||||  |||||||||||||| | ||  |||  ||||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||    
T  3097000 ttcaacttaagcggtattttcacatcacataaaacacctaaggctctcatccatttcaaccacccaacttgaatttgatggttta 3096916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 110; Significance: 2e-55; HSPs: 21)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 9 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 2610461 - 2610172
Alignment:
Q  9 catcctcatctctgatacgctcacttgattctcgcattggttcttaaccgcccaccacttagtatcatacaacattgccggtttgactgttgtctggtag 108  Q
    |||||||||||||| ||| || |||||||||||   |||  ||||||||||||| ||||  ||| |||||||||  ||| || ||||||||||| | |||    
T  2610461 catcctcatctctgctacacttacttgattctcatgttgactcttaaccgcccaacactccgtaccatacaacaacgccagtctgactgttgtccgatag 2610362  T
Q  109 aattttcctttcaacttatgcagcattttcttatcacataaaacacatgagtttcttctccatttcaaccacccaacttaaatatgatgatttacatatg 208  Q
    || ||||||||||||||| |  | | ||||||||| |||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||| ||    
T  2610361 aactttcctttcaacttaagtggtactttcttatcgcataaaacacctgaggctcttctccatttcaaccacccagcttgaatatgatggtttacatctg 2610262  T
Q  209 cgactatttctctgtcattttgtactatgaacccaa-aaatttaaacggtgtaacctgaggtatgatatgacctcccactttcacctcca 297  Q
    |  |||||||||||||||||||||| | | |||||| | |||||||| ||||||| || |||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  2610261 cttctatttctctgtcattttgtacgaaggacccaagatatttaaaccgtgtaacttggggtatgatatgatctccaactttcacctcca 2610172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 5 - 295
Target Start/End: Original strand, 11992451 - 11992742
Alignment:
Q  5 gcaacatcctcatctctgatacgctcacttgattctcgcattggttcttaaccgcccaccacttagtatcatacaacattgccggtttgactgttgtctg 104  Q
    |||||||||||||||| | ||| || |||| | |||||  |||  ||||||||||||| ||||  ||| |||||||||||||||||  ||||| |||| |    
T  11992451 gcaacatcctcatctccgctacacttactttactctcgtgttgactcttaaccgcccatcactccgtaccatacaacattgccggtcagactgctgtccg 11992550  T
Q  105 gtagaattttcctttcaacttatgcagcattttcttatcacataaaacacatgagtttcttctccatttcaaccacccaacttaaatatgatgatttaca 204  Q
     ||||| |||||||||| |||| |  | | ||||||||| || ||||||| ||||  |||||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||    
T  11992551 atagaactttcctttcagcttaagtggtactttcttatcgcacaaaacacctgaggctcttctccatttcaaccacccagcttgaatacgatgatttaca 11992650  T
Q  205 tatgcgactatttctctgtcattttgtactatgaacccaa-aaatttaaacggtgtaacctgaggtatgatatgacctcccactttcacctc 295  Q
    | |||  |||||||||  ||||||||||||||  |||||| | |||||||| ||||||| || |||||||||||| |||| |||||||||||    
T  11992651 tctgcttctatttctccatcattttgtactatagacccaagatatttaaaccgtgtaacttggggtatgatatgatctccaactttcacctc 11992742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 77; E-Value: 9e-36
Query Start/End: Original strand, 6 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 8180716 - 8180424
Alignment:
Q  6 caacatcctcatctctgatacgctcacttgattctcgcattggttcttaaccgcccaccacttagtatcatacaacattgccggtttgactgttgtctgg 105  Q
    ||||||||||||||||| ||| || |||||||||||   |||  ||||||||| ||| ||||  ||| |||||||||  || ||| |||||| |||| |     
T  8180716 caacatcctcatctctgctacacttacttgattctcatgttgactcttaaccgtccaacactccgtaccatacaacaacgctggtctgactgatgtccga 8180617  T
Q  106 tagaattttcctttcaacttatgcagcattttcttatcacataaaacacatgagtttcttctccatttcaaccacccaacttaaatatgatgatttacat 205  Q
    ||||| ||||||||||||||| |  | | ||||||||| || ||||| | ||||  |||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||  ||||||    
T  8180616 tagaactttcctttcaacttaagtggtactttcttatcgcacaaaactcttgaggctcttctccatttcaaccacccagcttgaatacgatggcttacat 8180517  T
Q  206 atgcgactatttctctgtcattttgtactatgaacccaaaa-atttaaacggtgtaacctgaggtatgatatgacctcccactttcacctcca 297  Q
     |||  ||||||||| |||||||| ||  | | |||||||| |||||||| ||||||| ||  ||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  8180516 ctgcttctatttctccgtcattttataagaaggacccaaaatatttaaaccgtgtaacttggagtatgatatgatctccaactttcacctcca 8180424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 5 - 283
Target Start/End: Original strand, 451967 - 452246
Alignment:
Q  5 gcaacatcctcatctctgatacgctcacttgattctcgcattggttcttaaccgcccaccacttagtatcatacaacattgccggtttgactgttgtctg 104  Q
    ||||||| |||||||||| ||| || |||||||||||   |||  ||||||||||||| ||||  ||| |||||||||  | ||||  ||||| |||| |    
T  451967 gcaacatactcatctctgctacacttacttgattctcatgttgactcttaaccgcccaacactccgtaccatacaacaacgtcggtcggactgctgtccg 452066  T
Q  105 gtagaattttcctttcaacttatgcagcattttcttatcacataaaacacatgagtttcttctccatttcaaccacccaacttaaatatgatgatttaca 204  Q
     ||||| ||||||||||||||| |  | | ||||||||| || ||||||| ||||  |||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||  |||||    
T  452067 atagaactttcctttcaacttaagtggtactttcttatcgcacaaaacacctgaggctcttctccatttcaaccacccagcttgaatacgatggcttaca 452166  T
Q  205 tatgcgactatttctctgtcattttgtactatgaacccaa-aaatttaaacggtgtaacctgaggtatgatatgacctcc 283  Q
    | |||  ||||||||| |||||||||||| | | |||||| | |||||||| ||||||| || |||||||||||| ||||    
T  452167 tctgcttctatttctccgtcattttgtacgaaggacccaagatatttaaaccgtgtaacttggggtatgatatgatctcc 452246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 74; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 5 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 4807529 - 4807236
Alignment:
Q  5 gcaacatcctcatctctgatacgctcacttgattctcgcattggttcttaaccgcccaccacttagtatcatacaacattgccggtttgactgttgtctg 104  Q
    |||||||||||||||||| ||| || |||| ||||||   |||  |||||||||| || ||||  || ||||||||||  | ||||  ||||| |||| |    
T  4807529 gcaacatcctcatctctgctacacttacttaattctcatgttgactcttaaccgctcaacactctgtgtcatacaacaacgtcggtcggactgctgtccg 4807430  T
Q  105 gtagaattttcctttcaacttatgcagcattttcttatcacataaaacacatgagtttcttctccatttcaaccacccaacttaaatatgatgatttaca 204  Q
     ||||| |||||||||||||||    | | ||||||||| || ||||||| ||||  |||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||  |||||    
T  4807429 atagaactttcctttcaacttaaatggtactttcttatcgcacaaaacacctgagactcttctccatttcaaccacccatcttgaatacgatggcttaca 4807330  T
Q  205 tatgcgactatttctctgtcattttgtactatgaacccaa-aaatttaaacggtgtaacctgaggtatgatatgacctcccactttcacctcca 297  Q
    | |||  ||||||||| |||||||||||| |   |||||| | |||||||| ||||||| || |||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  4807329 tctgcttctatttctccgtcattttgtacgaaagacccaagatatttaaactgtgtaacttggggtatgatatgatctccaactttcacctcca 4807236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 74; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 45 - 297
Target Start/End: Original strand, 45368009 - 45368261
Alignment:
Q  45 ttggttcttaaccgcccaccacttagtatcatacaacattgccggtttgactgttgtctggtagaattttcctttcaacttatgcagcattttcttatca 144  Q
    |||| |||||| |||||| ||||  ||| | |||||||||| |||| ||||||||||| | || || |||||||||| |||| |  | | |||||||||     
T  45368009 ttggctcttaatcgcccagcactccgtaccttacaacattgtcggtctgactgttgtccgataaaactttcctttcagcttaagtggtactttcttatcg 45368108  T
Q  145 cataaaacacatgagtttcttctccatttcaaccacccaacttaaatatgatgatttacatatgcgactatttctctgtcattttgtactatgaacccaa 244  Q
    || ||||||| ||||  |||||||||||||||||||||| ||| |||| ||| |||||||| |||  |||||||||  |||||||||| |||| ||||||    
T  45368109 cacaaaacacctgagactcttctccatttcaaccacccagcttgaatacgataatttacatctgcttctatttctccatcattttgtattatggacccaa 45368208  T
Q  245 -aaatttaaacggtgtaacctgaggtatgatatgacctcccactttcacctcca 297  Q
     | |||||||| ||||||  || |||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  45368209 gatatttaaaccgtgtaatttg-ggtatgatatgatctccaactttcacctcca 45368261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 106 - 297
Target Start/End: Original strand, 38453066 - 38453258
Alignment:
Q  106 tagaattttcctttcaacttatgcagcattttcttatcacataaaacacatgagtttcttctccatttcaaccacccaacttaaatatgatgatttacat 205  Q
    ||||| ||||||||||||||| |  | | ||||||||| || ||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||| |||||||||  ||||||    
T  38453066 tagaactttcctttcaacttaagtggtactttcttatcgcacaaaacacatgaggctcttctccatttcaaccacccagcttgaatatgatggcttacat 38453165  T
Q  206 atgcgactatttctctgtcattttgtactatgaacccaa-aaatttaaacggtgtaacctgaggtatgatatgacctcccactttcacctcca 297  Q
    ||||  ||||||||| |||||||||||  | | |||||| | |||||||  ||||||| || |||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  38453166 atgcttctatttctccgtcattttgtatgaaggacccaagatatttaaatcgtgtaacttggggtatgatatgatctccaactttcacctcca 38453258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 5 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 3866009 - 3865716
Alignment:
Q  5 gcaacatcctcatctctgatacgctcacttgattctcgcattggttcttaaccgcccaccacttagtatcatacaacattgccggtttgactgttgtctg 104  Q
    |||||||| ||||||||| ||| || |||||||||||   |||  ||||||||| ||| ||||  ||| |||||||||  | |||| ||||||||||| |    
T  3866009 gcaacatcatcatctctgctacacttacttgattctcatgttgactcttaaccgtccaacactccgtaccatacaacaacgtcggtctgactgttgtccg 3865910  T
Q  105 gtagaattttcctttcaacttatgcagcattttcttatcacataaaacacatgagtttcttctccatttcaaccacccaacttaaatatgatgatttaca 204  Q
     ||||| ||||||||||||||| | || | |||||||||||| ||||||  ||||  |||||||||||||||||||||| ||| |||| |||   |||||    
T  3865909 atagaactttcctttcaacttaagtagtactttcttatcacacaaaacatctgaggctcttctccatttcaaccacccagcttgaatacgatagcttaca 3865810  T
Q  205 tatgcgactatttctctgtcattttgtactatgaacccaa-aaatttaaacggtgtaacctgaggtatgatatgacctcccactttcacctcca 297  Q
    | |||  ||||||||| |||||||||||| | | ||||||   ||| |||| ||||||| || | ||  |||||| |||| |||||||||||||    
T  3865809 tttgcttctatttctccgtcattttgtacgaaggacccaagttattgaaaccgtgtaacttgggatacaatatgatctccaactttcacctcca 3865716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 5 - 220
Target Start/End: Original strand, 41197573 - 41197791
Alignment:
Q  5 gcaacatcctcatctctgatacgctcacttgattctcgcattggttcttaaccgcccaccacttagtatcatacaacattgccggtttgactgttgtctg 104  Q
    |||||||||||||||| | ||| || |||| | |||||  |||| ||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||| ||| ||||||||||  |    
T  41197573 gcaacatcctcatctccgctacacttactttactctcgtgttggctcttaaccgcccaacactttgtaccatacaacattgctggtctgactgttgttcg 41197672  T
Q  105 gtagaattttcctttcaacttatgcagcattttcttatcacataaaacacatgagtttcttctccatttcaaccacccaacttaaat---atgatgattt 201  Q
     ||||| |||||||||| |||| |  | | ||| ||||| || ||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||| |||   |||||||||     
T  41197673 atagaactttcctttcagcttaagtggtacttttttatcgcacaaaacacctgagactcttctccatttcaaccacccaacttgaatacgatgatgattc 41197772  T
Q  202 acatatgcgactatttctc 220  Q
    ||||||||  |||||||||    
T  41197773 acatatgcttctatttctc 41197791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 5 - 297
Target Start/End: Original strand, 41763386 - 41763687
Alignment:
Q  5 gcaacatcctcatctctgatacgctcacttgattctcgcattggttcttaaccgcccaccacttagtatcatacaacattgccggtttgactgttgtctg 104  Q
    |||||||||||||||| | ||| || |||| | |||||  |||||||||||||||||| ||||  ||| ||||||||||||||||| ||| |||| |  |    
T  41763386 gcaacatcctcatctccgctacacttactttactctcgtgttggttcttaaccgcccaacactctgtaccatacaacattgccggtctgattgttcttcg 41763485  T
Q  105 gtagaattttcctttcaacttatgcagcattttcttatcacataaaacacatgagtttcttctcca--------tttcaaccacccaacttaaatatgat 196  Q
     ||||| |||||||| | |||| |  | | ||||||||| || ||||||| ||||  |||||||||        ||||||||||||| ||| |||| |||    
T  41763486 atagaactttccttttagcttaagtggtactttcttatcgcacaaaacacctgaggctcttctccatttcaagttttcaaccacccagcttgaatacgat 41763585  T
Q  197 gatttacatatgcgactatttctctgtcattttgtactatgaacccaa-aaatttaaacggtgtaacctgaggtatgatatgacctcccactttcacctc 295  Q
    ||||||||| |||  ||||||||| | |||||||||||||| |||||| | |||||||  ||| ||| || |||||||||| | |||| |||||||||||    
T  41763586 gatttacatctgcttctatttctccgacattttgtactatggacccaagatatttaaatcgtgcaacttggggtatgatataatctccaactttcacctc 41763685  T
Q  296 ca 297  Q
    ||    
T  41763686 ca 41763687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 33 - 237
Target Start/End: Original strand, 6238127 - 6238330
Alignment:
Q  33 ttgattctcgcattggttcttaaccgcccaccacttagtatcatacaacattgccggtttgactgttgtctggtagaattttcctttcaacttatgcagc 132  Q
    ||||||||||  |||  |||||||| |||| ||||  ||| |||||||||| | | || | ||||||||| | |||||||||| |||||||||| |  |     
T  6238127 ttgattctcgtgttgactcttaaccacccaacactccgtaccatacaacatcgtcagtctaactgttgtccgatagaattttcttttcaacttaagtggt 6238226  T
Q  133 attttcttatcacataaaacacatgagtttcttctccatttcaaccacccaacttaaatatgatgatttacatatgcgactatttctctgtcattttgta 232  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||    |||||||| | |||||||||    
T  6238227 atttt-ttatcacacaaaacacatgaggctcttctccatttcaaccatccaacttgaatacgatgatttacatatgtttttatttctccgacattttgta 6238325  T
Q  233 ctatg 237  Q
    |||||    
T  6238326 ctatg 6238330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 140 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 17581270 - 17581148
Alignment:
Q  140 tatcacataaaacacatgagtttcttctccatttcaaccacccaacttaaatatgatgatttacatatgcgactatttctctgtcattttgtactatgaa 239  Q
    ||||||||||||||| ||||  |||||||||||| ||||| ||||||| ||||||| ||||||||| |||   ||||||| ||||||||||||| |||||    
T  17581270 tatcacataaaacacctgagactcttctccatttgaaccatccaacttgaatatgaggatttacatctgcttttatttctttgtcattttgtacaatgaa 17581171  T
Q  240 cccaaaaatttaaacggtgtaac 262  Q
    ||||| ||||||||| |||||||    
T  17581170 cccaagaatttaaactgtgtaac 17581148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 6 - 297
Target Start/End: Original strand, 24583952 - 24584244
Alignment:
Q  6 caacatcctcatctctgatacgctcacttgattctcgcattggttcttaaccgcccaccacttagtatcatacaacattgccggtttgactgttgtctgg 105  Q
    ||||||| ||||||||| ||| || ||||||||||||  |||  ||||||||||||| || || ||| |||||||||| | |||| ||  |  | |||      
T  24583952 caacatcttcatctctgctacacttacttgattctcgtgttgactcttaaccgcccaacattttgtaccatacaacatcgtcggtctggatactatctaa 24584051  T
Q  106 tagaattttcctttcaacttatgcagcattttcttatcacataaaacacatgagtttcttctccatttcaaccacccaacttaaatatgatgatttacat 205  Q
     |||| ||| ||||||||||| |  | |||||||| || || |||||||| |||  | ||||||||||| |||||||| ||| |||||||||  ||| ||    
T  24584052 cagaacttttctttcaacttaagtggtattttcttttcgcacaaaacacacgaggctattctccatttccaccacccagcttgaatatgatggcttaaat 24584151  T
Q  206 atgcgactatttctctgtcattttgtactatgaacccaa-aaatttaaacggtgtaacctgaggtatgatatgacctcccactttcacctcca 297  Q
     |||   ||||||||  ||||||||||||||| |||||| | |||||||| ||||||| || ||| |||||||| |||| |||||||||||||    
T  24584152 ctgcctatatttctccatcattttgtactatggacccaagatatttaaaccgtgtaacttgcggtctgatatgatctccaactttcacctcca 24584244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 6 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 37282043 - 37281753
Alignment:
Q  6 caacatcctcatctctgatacgctcacttgattctcgcattggttcttaaccgcccaccacttagtatcatacaacattgccggtttgactgttgtctgg 105  Q
    |||||||||||||||   ||  || |||||||||||| |||| |||||||||||  | ||||  |||||||||||||| | | |||| ||  |||||| |    
T  37282043 caacatcctcatctcaactatacttacttgattctcgtattgattcttaaccgcttaacactctgtatcatacaacatcgtccgtttaaca-ttgtcttg 37281945  T
Q  106 tagaattttcctttcaacttatgcagcattttcttatcacataaaacacatgagtttcttctccatttcaaccacccaacttaaatatgatgatttacat 205  Q
    || ||  || ||||||||||||| || ||||||||  ||| ||||||||| ||| ||| ||| ||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  37281944 taaaaaatttctttcaacttatggagtattttcttgccacgtaaaacaca-gaggttcatcttcatctcaaccacccaacttgaataggatgatttacat 37281846  T
Q  206 atgcgactatttctctgtcattttgtactatgaacccaa-aaatttaaacggtgtaacctgaggtatgatatgacctcccactttcacctcca 297  Q
     | |  |||||||||  ||||||| ||||||| | | || | |||||||  ||||||| || ||||||| |||| |||  |||||||||||||    
T  37281845 ctacttctatttctccttcattttatactatggagctaagatatttaaaatgtgtaacttggggtatgacatgatctcaaactttcacctcca 37281753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 5 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 30743560 - 30743267
Alignment:
Q  5 gcaacatcctcatctctgatacgctcacttgattctcgcattggttcttaaccgcccaccacttagtatcatacaacattgccggtttgactgttgtctg 104  Q
    ||||||||||||||||    || || ||||||||||||  |||| | |||| |||| | | ||  ||| |||||||||| | |||| |||| | | || |    
T  30743560 gcaacatcctcatctccacaacacttacttgattctcgtgttggcttttaatcgcctaactctccgtaccatacaacatcgtcggtctgaccgctatccg 30743461  T
Q  105 gtagaattttcctttcaacttatgcagcattttcttatcacataaaacacatgagtttcttctccatttcaaccacccaacttaaatatgatgatttaca 204  Q
    ||| || ||||||||||||||| |  | | |||||||||||| ||||||||||||  ||||||| ||||||| ||| || ||| |||| ||||||||| |    
T  30743460 gtaaaactttcctttcaacttaagtggtactttcttatcacacaaaacacatgaggctcttctcaatttcaatcactcagcttgaatacgatgatttata 30743361  T
Q  205 tatgcgactatttctctgtcattttgtactatgaacccaa-aaatttaaacggtgtaacctgaggtatgatatgacctcccactttcacctcca 297  Q
    | | |  |||||| || |||||||||||||||  ||| || | |||||||| ||||||| || | |||| ||||| |||| |||||||||||||    
T  30743360 tctacttctatttatccgtcattttgtactattgacctaagatatttaaaccgtgtaacttgggatatggtatgatctccaactttcacctcca 30743267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 135 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 13149120 - 13148957
Alignment:
Q  135 tttcttatcacataaaacacatgagtttcttctccatttcaaccacccaacttaaatatgatgatttacatatgcgactatttctctgtcattttgtact 234  Q
    |||||||||| || |||||| |||   |||||| ||||||||||| ||||||| |||| ||||||||  || | |  ||||||||| |||||||||||||    
T  13149120 tttcttatcatatgaaacacctgaagctcttcttcatttcaaccatccaacttgaatacgatgatttgtatctacttctatttctccgtcattttgtact 13149021  T
Q  235 atgaacccaaaa-atttaaacggtgtaacctgaggtatgatatgacctcccactttcacctcca 297  Q
    ||| |||  | | |||||||| ||||||| || |||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  13149020 atggacctgagatatttaaaccgtgtaacttggggtatgatatgatctccaactttcacctcca 13148957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 5 - 119
Target Start/End: Complemental strand, 38429821 - 38429707
Alignment:
Q  5 gcaacatcctcatctctgatacgctcacttgattctcgcattggttcttaaccgcccaccacttagtatcatacaacattgccggtttgactgttgtctg 104  Q
    |||||||||||||||| | ||| || |||  | |||||  |||||||||||||||||| ||||  ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  38429821 gcaacatcctcatctccgctacacttactctactctcgtgttggttcttaaccgcccaacactccgtaccatacaacattgccggtttgactgctgtctg 38429722  T
Q  105 gtagaattttccttt 119  Q
     ||||| ||||||||    
T  38429721 atagaactttccttt 38429707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 5 - 262
Target Start/End: Original strand, 3243996 - 3244254
Alignment:
Q  5 gcaacatcctcatctctgatacgctcacttgattctcgcattggttcttaaccgcccaccacttagtatcatacaacattgccggtttgactgttgtctg 104  Q
    |||||||||| ||||||| ||| || |||||||||||   |||  ||||||| | ||| ||||  ||| ||| |||||  ||||||  ||||| |||| |    
T  3243996 gcaacatccttatctctgctacacttacttgattctcatgttgactcttaactgtccaacactccgtaccattcaacaacgccggtcggactgctgtccg 3244095  T
Q  105 gtagaattttcctttcaacttatgcagcattttcttatcacataaaacacatgagtttcttctccatttcaaccacccaacttaaatatgatgatttaca 204  Q
     ||||| |||||||||||| || |  | | ||||||||| || ||||||| ||||  || |||||||||| |||||||| ||| |||| ||||  |||||    
T  3244096 atagaactttcctttcaacataagtggtactttcttatcgcacaaaacacctgaggctcatctccatttctaccacccagcttgaatacgatggcttaca 3244195  T
Q  205 tatgcgactatttctctgtcattttgtactatgaacccaa-aaatttaaacggtgtaac 262  Q
    | |||  ||||||||| |||||||||||| | | |||||| | |||||||| |||||||    
T  3244196 tctgcttctatttctccgtcattttgtacgaaggacccaagatatttaaaccgtgtaac 3244254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 5 - 126
Target Start/End: Complemental strand, 36183388 - 36183267
Alignment:
Q  5 gcaacatcctcatctctgatacgctcacttgattctcgcattggttcttaaccgcccaccacttagtatcatacaacattgccggtttgactgttgtctg 104  Q
    |||||||||||||||||| ||| || |||||||||||   |||  ||||||||||||| ||||  ||| |||||||||  ||||||  |||||||||| |    
T  36183388 gcaacatcctcatctctgctacacttacttgattctcatgttgactcttaaccgcccaacactccgtaccatacaacaacgccggtcggactgttgtccg 36183289  T
Q  105 gtagaattttcctttcaactta 126  Q
     ||||| |||||||||||||||    
T  36183288 atagaactttcctttcaactta 36183267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 5 - 126
Target Start/End: Complemental strand, 23997554 - 23997433
Alignment:
Q  5 gcaacatcctcatctctgatacgctcacttgattctcgcattggttcttaaccgcccaccacttagtatcatacaacattgccggtttgactgttgtctg 104  Q
    |||||||| ||||||| | ||| || |||||  |||||  |||  ||||||| ||||| ||||| ||| |||||||||||| |||| | ||||||||| |    
T  23997554 gcaacatcttcatctccgttacacttacttggctctcgtgttgactcttaactgcccaacacttcgtaccatacaacattgtcggtcttactgttgtccg 23997455  T
Q  105 gtagaattttcctttcaactta 126  Q
     ||||| |||||||||| ||||    
T  23997454 atagaactttcctttcagctta 23997433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 30 - 126
Target Start/End: Complemental strand, 12734617 - 12734522
Alignment:
Q  30 cacttgattctcgcattggttcttaaccgcccaccacttagtatcatacaacattgccggtttgactgttgtctggtagaattttcctttcaactta 126  Q
    ||||||||||||   |||| ||| ||||||||| ||||  ||| |||||||||| |  ||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||    
T  12734617 cacttgattctcatgttggctctaaaccgcccaacactctgtaccatacaacatcgatggtttgactgttgtc-gatagaactttcctttcaactta 12734522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 106; Significance: 5e-53; HSPs: 34)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 106; E-Value: 5e-53
Query Start/End: Original strand, 5 - 297
Target Start/End: Original strand, 27450518 - 27450811
Alignment:
Q  5 gcaacatcctcatctctgatacgctcacttgattctcgcattggttcttaaccgcccaccacttagtatcatacaacattgccggtttgactgttgtctg 104  Q
    |||||||||||||||| | ||| || |||| | |||||  |||| ||||||| ||||| ||||  ||| |||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  27450518 gcaacatcctcatctccgctacacttactttactctcgtgttggctcttaactgcccaacactccgtaccatacaacattgtcggtctgactgttgtctg 27450617  T
Q  105 gtagaattttcctttcaacttatgcagcattttcttatcacataaaacacatgagtttcttctccatttcaaccacccaacttaaatatgatgatttaca 204  Q
     |||||||||||||||| |||| |  | | ||||||||| || ||||||| ||||  |||||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||    
T  27450618 atagaattttcctttcagcttaagtggtactttcttatcgcacaaaacacttgaggctcttctccatttcaaccacccagcttgaatacgatgatttaca 27450717  T
Q  205 tatgcgactatttctctgtcattttgtactatgaacccaa-aaatttaaacggtgtaacctgaggtatgatatgacctcccactttcacctcca 297  Q
    | |||  |||||||||  |||||||| |||||| |||||| | || ||||| ||||||| || |||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  27450718 tctgcttctatttctccatcattttgcactatggacccaagatatgtaaactgtgtaacttggggtatgatatgatctccaactttcacctcca 27450811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 5 - 297
Target Start/End: Original strand, 23906646 - 23906939
Alignment:
Q  5 gcaacatcctcatctctgatacgctcacttgattctcgcattggttcttaaccgcccaccacttagtatcatacaacattgccggtttgactgttgtctg 104  Q
    |||||||||||||||||| ||| || |||||||||||   |||  ||||||||||||| ||||| ||| |||||||||  ||||||  ||||| |||| |    
T  23906646 gcaacatcctcatctctgctacacttacttgattctcatgttgactcttaaccgcccaacacttcgtaccatacaacaacgccggtcggactgctgtccg 23906745  T
Q  105 gtagaattttcctttcaacttatgcagcattttcttatcacataaaacacatgagtttcttctccatttcaaccacccaacttaaatatgatgatttaca 204  Q
     ||||| ||||||||||||||| |  | | ||||||||| || ||||||| ||||  |||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||  |||||    
T  23906746 atagaactttcctttcaacttaagtggtactttcttatcgcacaaaacacctgaggctcttctccatttcaaccacccagcttgaatacgatggcttaca 23906845  T
Q  205 tatgcgactatttctctgtcattttgtactatgaacccaa-aaatttaaacggtgtaacctgaggtatgatatgacctcccactttcacctcca 297  Q
    | |||  ||||||||| |||||||||||| | | |||||| | |||||||| ||||||| || |||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  23906846 tctgcttctatttctccgtcattttgtacgaaggacccaagatatttaaaccgtgtaacttggggtatgatatgatctccaactttcacctcca 23906939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 5 - 297
Target Start/End: Original strand, 31960159 - 31960452
Alignment:
Q  5 gcaacatcctcatctctgatacgctcacttgattctcgcattggttcttaaccgcccaccacttagtatcatacaacattgccggtttgactgttgtctg 104  Q
    |||||||||||||||||| ||| || |||||||||||   |||  ||||||||||||| ||||  ||| |||||||||  |||||| |||||| |||| |    
T  31960159 gcaacatcctcatctctgctacacttacttgattctcatgttgactcttaaccgcccaacactccgtaccatacaacaacgccggtctgactgctgtccg 31960258  T
Q  105 gtagaattttcctttcaacttatgcagcattttcttatcacataaaacacatgagtttcttctccatttcaaccacccaacttaaatatgatgatttaca 204  Q
     ||||| ||||||||||||||| |  | | ||||||||| || |||||| |||||  |||||||||||||||||||||| ||| |||||||||  |||||    
T  31960259 atagaactttcctttcaacttaagtggtactttcttatcgcacaaaacatatgaggctcttctccatttcaaccacccagcttgaatatgatggcttaca 31960358  T
Q  205 tatgcgactatttctctgtcattttgtactatgaacccaa-aaatttaaacggtgtaacctgaggtatgatatgacctcccactttcacctcca 297  Q
    | |||  ||||||||| |||||||||||| | | |||||| | |||||||| ||||||  || |||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  31960359 tctgcttctatttctccgtcattttgtacgaaggacccaagatatttaaaccgtgtaaattggggtatgatatgatctccaactttcacctcca 31960452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 5 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 436166 - 435873
Alignment:
Q  5 gcaacatcctcatctctgatacgctcacttgattctcgcattggttcttaaccgcccaccacttagtatcatacaacattgccggtttgactgttgtctg 104  Q
    |||||||||||||||||| ||| || |||||||||||   |||  ||||||||||||| ||||  ||| |||||||||  ||||||  ||||| |||| |    
T  436166 gcaacatcctcatctctgctacacttacttgattctcatgttgactcttaaccgcccaacactccgtaccatacaacaacgccggtcggactgctgtccg 436067  T
Q  105 gtagaattttcctttcaacttatgcagcattttcttatcacataaaacacatgagtttcttctccatttcaaccacccaacttaaatatgatgatttaca 204  Q
     ||||| ||||||||||||||| |  | | ||||||||| || ||||||| ||||  ||||||||||||||||||| || ||| |||| ||||| |||||    
T  436066 atagaactttcctttcaacttaagtggtactttcttatcgcacaaaacacctgaggctcttctccatttcaaccactcagcttgaatacgatgacttaca 435967  T
Q  205 tatgcgactatttctctgtcattttgtactatgaacccaa-aaatttaaacggtgtaacctgaggtatgatatgacctcccactttcacctcca 297  Q
    | |||  ||||||||| |||||||| ||| | | |||||| | |||||||| ||||||| || |||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  435966 tctgcttctatttctccgtcattttatacgaaggacccaagatatttaaaccgtgtaacttggggtatgatatgatctccaactttcacctcca 435873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 5 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 33227146 - 33226853
Alignment:
Q  5 gcaacatcctcatctctgatacgctcacttgattctcgcattggttcttaaccgcccaccacttagtatcatacaacattgccggtttgactgttgtctg 104  Q
    |||||||||||||||||| ||| || || ||||||||   |||  ||||||||||||| ||||  ||| |||||||||  ||||||  ||||| |||| |    
T  33227146 gcaacatcctcatctctgctacacttacatgattctcatgttgactcttaaccgcccaacactccgtaccatacaacaacgccggtcggactgctgtccg 33227047  T
Q  105 gtagaattttcctttcaacttatgcagcattttcttatcacataaaacacatgagtttcttctccatttcaaccacccaacttaaatatgatgatttaca 204  Q
     ||||| ||||||||||||||| |  | | |||||||||  | ||||||| ||||  |||||||||||||||||||||| ||| |||||||||  |||||    
T  33227046 atagaactttcctttcaacttaagtggtactttcttatcgtacaaaacacctgagactcttctccatttcaaccacccagcttgaatatgatggcttaca 33226947  T
Q  205 tatgcgactatttctctgtcattttgtactatgaacccaa-aaatttaaacggtgtaacctgaggtatgatatgacctcccactttcacctcca 297  Q
    | |||  ||||||||| |||||||||||| | | |||||| | |||||||| ||||||| || |||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  33226946 tctgcttctatttctccgtcattttgtacgaaggacccaagatatttaaaccgtgtaacttggggtatgatatgatctccaactttcacctcca 33226853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 283
Target Start/End: Original strand, 1211731 - 1212014
Alignment:
Q  1 cagtgcaacatcctcatctctgatacgctcacttgattctcgcattggttcttaaccgcccaccacttagtatcatacaacattgccggtttgactgttg 100  Q
    ||||||||||||||||| || | ||| || ||||||||||||  |||| ||||||||| ||| ||||  ||| || |||||||  ||||| |||||||||    
T  1211731 cagtgcaacatcctcatatccgctacacttacttgattctcgtgttggctcttaaccgtccaacactctgtaccacacaacatcaccggtctgactgttg 1211830  T
Q  101 tctggtagaattttcctttcaacttatgcagcattttcttatcacataaaacacatgagtttcttctccatttcaaccacccaacttaaatatgatgatt 200  Q
    || | ||||| ||||||||||||||| |  | |||||||||||| | ||||||  ||||  |||||||||||||||| ||| ||||| |||| |||||||    
T  1211831 tccgatagaactttcctttcaacttaagtggtattttcttatcatacaaaacatttgaggctcttctccatttcaactacctaacttgaatacgatgatt 1211930  T
Q  201 tacatatgcgactatttctctgtcattttgtactatgaacccaa-aaatttaaacggtgtaacctgaggtatgatatgacctcc 283  Q
    ||||  |||  |||||||||||| ||||||||||||| || ||| | ||||||||  |||||| | ||||||||||||| ||||    
T  1211931 tacacctgcttctatttctctgttattttgtactatggacacaagatatttaaactatgtaacgtaaggtatgatatgatctcc 1212014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 77; E-Value: 9e-36
Query Start/End: Original strand, 70 - 297
Target Start/End: Original strand, 1777425 - 1777653
Alignment:
Q  70 gtatcatacaacattgccggtttgactgttgtctggtagaattttcctttcaacttatgcagcattttcttatcacataaaacacatgagtttcttctcc 169  Q
    |||||||||||||  | |||| |||||| |||| | ||||| ||||||||||||||| |  | | ||||||||| || ||||||| ||||  ||||||||    
T  1777425 gtatcatacaacaacgtcggtctgactgctgtccgatagaactttcctttcaacttaagtggtactttcttatcgcacaaaacacctgaggctcttctcc 1777524  T
Q  170 atttcaaccacccaacttaaatatgatgatttacatatgcgactatttctctgtcattttgtactatgaacccaa-aaatttaaacggtgtaacctgagg 268  Q
    |||||||||||||| ||| |||| ||||| |||||| |||  |||||||||||||||||||||| | | |||||| | |||||||  ||||||| || ||    
T  1777525 atttcaaccacccagcttgaatacgatgacttacatttgcttctatttctctgtcattttgtacgaaggacccaagatatttaaaacgtgtaacttgggg 1777624  T
Q  269 tatgatatgacctcccactttcacctcca 297  Q
    ||||||||||  ||| |||||||||||||    
T  1777625 tatgatatgatttccaactttcacctcca 1777653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 6 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 55578967 - 55578740
Alignment:
Q  6 caacatcctcatctctgatacgctcacttgattctcgcattggttcttaaccgcccaccacttagtatcatacaacattgccggtttgactgttgtctgg 105  Q
    |||||||||||| | || ||| || | ||||||||||  |||||||||||||||||| |||||  || ||||||||||||  ||| ||||||||||| |     
T  55578967 caacatcctcatatatgctacacttaattgattctcgtgttggttcttaaccgcccaacacttcataccatacaacattgttggtctgactgttgtccga 55578868  T
Q  106 tagaattttcctttcaacttatgcagcattttcttatcacataaaacacatgagtttcttctccatttcaaccacccaacttaaatatgatgatttacat 205  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||  ||   | |||||||||||||||  |||   |||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||  |    
T  55578867 tagaattttccttccaacttaagcgaca---tgttatcacataaaacatctgaagatcttctccattttaaccacctaacttaaatacgatgatttatgt 55578771  T
Q  206 atgcgactatttctctgtcattttgtactat 236  Q
    ||||  ||||||||| |||||||| ||||||    
T  55578770 atgcttctatttctcagtcattttatactat 55578740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 31 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 16002838 - 16002573
Alignment:
Q  31 acttgattctcgcattggttcttaaccgcccaccacttagtatcatacaacattgccggtttgactgttgtctggtagaattttcctttcaacttatgca 130  Q
    ||||||||||||  |||  |||||||| |||| ||||| || ||||||||||| || ||| | |||| |||||| || || ||| |||| |||||| |      
T  16002838 acttgattctcgtgttgactcttaacctcccaacacttcgt-tcatacaacatcgctggtctaactgatgtctgataaaacttttctttgaacttaagtg 16002740  T
Q  131 gcattttcttatcacataaaacacatgagtttcttctccatttcaaccacccaacttaaatatgatgatttacatatgcgactatttctctgtcattttg 230  Q
    | | |||||||||||| ||||||| ||||  ||||||| ||||||||||| || |||||||| |||||||||||| |||  |||| |||| |||||||||    
T  16002739 gtactttcttatcacacaaaacacctgaggctcttctcaatttcaaccactcagcttaaatacgatgatttacatctgcttctatgtctccgtcattttg 16002640  T
Q  231 tactatgaacccaaaaatttaaacggtgtaacctgaggtatgatatgacctcccactttcacctcca 297  Q
    ||||||| | |||| | ||||||| ||||||  || ||||||||||||  ||| ||||| |||||||    
T  16002639 tactatggaaccaagattttaaaccgtgtaatttggggtatgatatgatttccaacttttacctcca 16002573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 5 - 297
Target Start/End: Original strand, 48174438 - 48174731
Alignment:
Q  5 gcaacatcctcatctctgatacgctcacttgattctcgcattggttcttaaccgcccaccacttagtatcatacaacattgccggtttgactgttgtctg 104  Q
    ||||||||||||||| || ||  || |||||||| ||   |||  ||||||||| ||| ||||  ||| |||||||||  |||||| |||||| |||| |    
T  48174438 gcaacatcctcatctttgctatacttacttgattttcatgttgactcttaaccgtccaacactccgtaccatacaacaacgccggtctgactgctgtccg 48174537  T
Q  105 gtagaattttcctttcaacttatgcagcattttcttatcacataaaacacatgagtttcttctccatttcaaccacccaacttaaatatgatgatttaca 204  Q
     ||||| ||||||||||||||| |  | | ||||||||  || ||||||| ||||  |||||||||||||||||||| | ||| |||| ||||  |||||    
T  48174538 atagaactttcctttcaacttaagtggtactttcttattgcacaaaacacctgaggctcttctccatttcaaccacctagcttgaatacgatggcttaca 48174637  T
Q  205 tatgcgactatttctctgtcattttgtactatgaacccaa-aaatttaaacggtgtaacctgaggtatgatatgacctcccactttcacctcca 297  Q
    | |||  ||||||||| |||| ||||||| | | |||||| | |||||||| ||||||| || |||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  48174638 tctgcttctatttctccgtcactttgtacgaaggacccaagatatttaaaccgtgtaacttggggtatgatatgatctccaactttcacctcca 48174731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 5 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 53707731 - 53707438
Alignment:
Q  5 gcaacatcctcatctctgatacgctcacttgattctcgcattggttcttaaccgcccaccacttagtatcatacaacattgccggtttgactgttgtctg 104  Q
    |||||||||||||||||| ||| || |||||||||||   |||  ||||||||||||| ||||   || |||||| ||  ||||||  || || || | |    
T  53707731 gcaacatcctcatctctgctacacttacttgattctcatgttgactcttaaccgcccaacactctctaccatacatcaacgccggtcggaatgctggccg 53707632  T
Q  105 gtagaattttcctttcaacttatgcagcattttcttatcacataaaacacatgagtttcttctccatttcaaccacccaacttaaatatgatgatttaca 204  Q
     ||||| ||||||||||||||| |  | | ||||||||| || ||||||  ||||| |||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||  |||||    
T  53707631 atagaactttcctttcaacttaagtggtactttcttatcgcacaaaacatctgagtctcttctccatttcaaccacccagcttgaatacgatggcttaca 53707532  T
Q  205 tatgcgactatttctctgtcattttgtactatgaacccaa-aaatttaaacggtgtaacctgaggtatgatatgacctcccactttcacctcca 297  Q
    | |||  ||||||||| |||||||||||| | | |||||| | ||||| || ||||||| || |||||||||||| || | |||||||||||||    
T  53707531 tctgcttctatttctccgtcattttgtacgaaggacccaagatatttagaccgtgtaacttggggtatgatatgatcttcaactttcacctcca 53707438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 5 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 35690241 - 35690042
Alignment:
Q  5 gcaacatcctcatctctgatacgctcacttgattctcgcattggttcttaaccgcccaccacttagtatcatacaacattgccggtttgactgttgtctg 104  Q
    |||||||||||||||| | ||| || |||||||||||   ||||||||||||| | || || |   ||||||||||||| | |||| | |||||||||||    
T  35690241 gcaacatcctcatctcggctacacttacttgattctcatgttggttcttaaccacacaacattccatatcatacaacatcgtcggtctaactgttgtctg 35690142  T
Q  105 gtagaattttcctttcaacttatgcagcattttcttatcacataaaacacatgagtttcttctccatttcaaccacccaacttaaatatgatgatttaca 204  Q
     |||||||||||| ||||||||  | ||| ||||||||||||||||||||  |    |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||    
T  35690141 atagaattttcctctcaacttaaacggcactttcttatcacataaaacacccg-cactcttctccatttcaaccacccaacttgaatacgatgatttaca 35690043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 5 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 50286908 - 50286629
Alignment:
Q  5 gcaacatcctcatctctgatacgctcacttgattctcgcattggttcttaaccgcccaccacttagtatcatacaacattgccggtttgactgttgtctg 104  Q
    ||||| |||||||||||| ||| || |||||||||||   |||  ||||||||||||| ||||  |||||||||||||  | || | |||| |||||| |    
T  50286908 gcaacttcctcatctctgctacacttacttgattctcatgttgactcttaaccgcccaacactccgtatcatacaacaacgtcgatctgacggttgtccg 50286809  T
Q  105 gtagaattttcctttcaacttatgcagcattttcttatcacataaaacacatgagtttcttctccatttcaaccacccaacttaaatatgatgatttaca 204  Q
     ||||| |||||||||||||||    | | ||||||||| || |||||||||| |  |||||| ||||||||||||||| ||| |||| ||||  |||||    
T  50286808 atagaactttcctttcaacttaaatggtactttcttatcgcacaaaacacatgtgactcttcttcatttcaaccacccagcttgaatacgatggcttaca 50286709  T
Q  205 tatgcgactatttctctgtcattttgtactatgaacccaa-aaatttaaacggtgtaacctgaggtatgatatgacctcc 283  Q
    | |||  ||||||||| |||||||||||| | | || ||| | |||||||| ||||||| || |||||||||||| ||||    
T  50286708 tctgcttctatttctccgtcattttgtacgaaggacacaatatatttaaaccgtgtaacttggggtatgatatgatctcc 50286629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 5 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 39708395 - 39708101
Alignment:
Q  5 gcaacatcctcatctctgatacgctcacttgattctcgcattggttcttaaccgcccaccacttagtatcatacaacattgccggtttgactgttgtctg 104  Q
    |||||||||||||||    ||| || ||||||||||||  |||  ||||||||||||| ||||  ||| |||||||||||| || |  |||||||| | |    
T  39708395 gcaacatcctcatctgcactacacttacttgattctcgtgttgcctcttaaccgcccaacactccgtaccatacaacattgtcgatcggactgttgcccg 39708296  T
Q  105 gtagaattttcctttcaacttatgcagcattttcttatcacataaaa-cacatgagtttcttctccatttcaaccacccaacttaaatatgatgatttac 203  Q
     ||||| ||||||||||||||| |  | | |||||||||||| |||| ||| | ||  |||| ||||||||||||| ||| ||| |||| || |||||||    
T  39708295 atagaactttcctttcaacttaagtggtactttcttatcacaaaaaaccacctaaggctcttatccatttcaaccatccagcttgaatacgaggatttac 39708196  T
Q  204 atatgcgactatttctctgtcattttgtactatgaacccaa-aaatttaaacggtgtaacctgaggtatgatatgacctcccactttcacctcca 297  Q
    |  |||  ||||||||| |||||||||||||||  |||||| | |||||||| |  |||| |||||||| |||||| |||| | |||||||||||    
T  39708195 acctgcttctatttctccgtcattttgtactatcgacccaagatatttaaaccgcataacttgaggtataatatgatctccaaatttcacctcca 39708101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 62; E-Value: 8e-27
Query Start/End: Original strand, 4 - 233
Target Start/End: Original strand, 46583168 - 46583397
Alignment:
Q  4 tgcaacatcctcatctctgatacgctcacttgattctcgcattggttcttaaccgcccaccacttagtatcatacaacattgccggtttgactgttgtct 103  Q
    ||||||||||||||||||| ||| || |||||||||||   |||  ||||||||||||| ||||  ||| |||||||||  |||| | |||||| ||||     
T  46583168 tgcaacatcctcatctctgctacacttacttgattctcatgttgactcttaaccgcccaacactccgtaccatacaacagcgccgatctgactgctgtcc 46583267  T
Q  104 ggtagaattttcctttcaacttatgcagcattttcttatcacataaaacacatgagtttcttctccatttcaaccacccaacttaaatatgatgatttac 203  Q
      ||||| ||||||||||| ||| |    | ||||||||| || |||| || ||||  |||||||||||||||||||||| ||| |||||||||  ||||    
T  46583268 aatagaactttcctttcaaattaagtgatactttcttatcgcacaaaatacctgaggctcttctccatttcaaccacccagcttgaatatgatggcttac 46583367  T
Q  204 atatgcgactatttctctgtcattttgtac 233  Q
    || |||  ||||||||| ||||||||||||    
T  46583368 atctgcttctatttctccgtcattttgtac 46583397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 62; E-Value: 8e-27
Query Start/End: Original strand, 5 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 56375227 - 56374934
Alignment:
Q  5 gcaacatcctcatctctgatacgctcacttgattctcgcattggttcttaaccgcccaccacttagtatcatacaacattgccggtttgactgttgtctg 104  Q
    |||||||||||||||||| ||| ||   |||||||||   |||  ||||||||||||| ||||  ||| ||||||| |  || ||| |||||| |||| |    
T  56375227 gcaacatcctcatctctgctacacttgtttgattctcatgttgactcttaaccgcccaacactccgtaccatacaataacgctggtctgactgctgtccg 56375128  T
Q  105 gtagaattttcctttcaacttatgcagcattttcttatcacataaaacacatgagtttcttctccatttcaaccacccaacttaaatatgatgatttaca 204  Q
     ||||  ||||||||||| ||| |  | | ||||||||| || ||||||| ||||  ||||||| |||||||||||||| ||| |||| ||||  ||| |    
T  56375127 atagatctttcctttcaaattaagtggtactttcttatcgcacaaaacacctgaggctcttctcaatttcaaccacccagcttgaatacgatggcttata 56375028  T
Q  205 tatgcgactatttctctgtcattttgtactatgaacccaa-aaatttaaacggtgtaacctgaggtatgatatgacctcccactttcacctcca 297  Q
    | |||  ||||||||| |||||||||||| | | |||||| | |||||||| ||||||| || |||||||||||  |||| |||||||||||||    
T  56375027 tctgcttctatttctccgtcattttgtacgaaggacccaagatatttaaaccgtgtaacttggggtatgatatgctctccaactttcacctcca 56374934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 5 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 43433855 - 43433655
Alignment:
Q  5 gcaacatcctcatctctgatacgctcacttgattctcgcattggttcttaaccgcccaccacttagtatcatacaacattgccggtttgactgttgtctg 104  Q
    |||||||||||||||||| ||| || |||||||||||   |||  ||||||||||||| ||||  ||| |||||||||  |||||| ||| || |||| |    
T  43433855 gcaacatcctcatctctgctacacttacttgattctcatgttgactcttaaccgcccaacactccgtaccatacaacaacgccggtctgattgctgtccg 43433756  T
Q  105 gtagaattttcctttcaacttatgcagcattttcttatcacataaaacacatgagtttcttctccatttcaaccacccaacttaaatatgatgatttaca 204  Q
     ||||| ||||||||||||||| |   || ||||||||| || ||||||| ||||  ||||||||||||||| |||||| ||| |||| |||| ||||||    
T  43433755 atagaactttcctttcaacttaagtgacactttcttatcgcacaaaacacctgaggctcttctccatttcaatcacccagcttgaatacgatggtttaca 43433656  T
Q  205 t 205  Q
    |    
T  43433655 t 43433655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 5 - 297
Target Start/End: Original strand, 47265547 - 47265842
Alignment:
Q  5 gcaacatcctcatctctgatacgctcacttgattctcgcattggttcttaaccgcccaccacttagtatcatacaacattgccggtttgactgttgtctg 104  Q
    ||||||||||||||| || ||| |  ||||||||||||  |||  ||||||||| |||  |||| ||| |||||||||| || ||| ||||||||||| |    
T  47265547 gcaacatcctcatctttgctacacctacttgattctcgtgttgactcttaaccgtccaatactttgtaccatacaacatcgctggtctgactgttgtcag 47265646  T
Q  105 gtagaattttcctttcaacttatgcagcatt---ttcttatcacataaaacacatgagtttcttctccatttcaaccacccaacttaaatatgatgattt 201  Q
     ||||| |||| |||||||||| |  | | |   |||||||| || ||||||| | ||  |||||| |||||||| |||||| ||| || | ||||  ||    
T  47265647 atagaactttcatttcaacttaagtggtactactttcttatcgcacaaaacacctaaggctcttcttcatttcaatcacccagcttgaa-acgatggctt 47265745  T
Q  202 acatatgcgactatttctctgtcattttgtactatgaacccaaaa-atttaaacggtgtaacctgaggtatgatatgacctcccactttcacctcca 297  Q
    |||| |||  ||||||||| |||||||| ||||||| | |||| | ||||||||  |||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  47265746 acatttgcttctatttctccgtcattttatactatggatccaagatatttaaactatgtaacttggggtatgatatgacctccaactttcacctcca 47265842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 85 - 297
Target Start/End: Original strand, 48622952 - 48623165
Alignment:
Q  85 gccggtttgactgttgtctggtagaattttcctttcaacttatgcagcattttcttatcacataaaacacatgagtttcttctccatttcaaccacccaa 184  Q
    |||||| |||||| |||| | ||||| ||||||||||||||| |  | | ||||||||| || ||||||| ||||  | ||||||||||||||||||||     
T  48622952 gccggtctgactgctgtccgatagaactttcctttcaacttaagtggtactttcttatcgcacaaaacacctgaggcttttctccatttcaaccacccag 48623051  T
Q  185 cttaaatatgatgatttacatatgcgactatttctctgtcattttgtactatgaacccaa-aaatttaaacggtgtaacctgaggtatgatatgacctcc 283  Q
    ||| |||| ||||  |||||| |||  ||||||||| |||||||||||| | | |||||| | |||||||  ||||||  || |||||||||||  ||||    
T  48623052 cttgaatacgatggcttacatctgcttctatttctccgtcattttgtacgaaggacccaagatatttaaatcgtgtaatttggggtatgatatgctctcc 48623151  T
Q  284 cactttcacctcca 297  Q
     |||||||||||||    
T  48623152 aactttcacctcca 48623165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 140 - 262
Target Start/End: Original strand, 17666518 - 17666641
Alignment:
Q  140 tatcacataaaacacatgagtttcttctccatttcaaccacccaacttaaatatgatgatttacatatgcgactatttctctgtcattttgtactatgaa 239  Q
    |||||||||||||||||||   |||||||||||||||| | ||||||| |||| |||||||||||| |||   |||||||  | ||||||||||| ||||    
T  17666518 tatcacataaaacacatgatgctcttctccatttcaacaatccaacttgaatacgatgatttacatttgcttttatttcttcgacattttgtactttgaa 17666617  T
Q  240 cccaa-aaatttaaacggtgtaac 262  Q
    ||||| | |||||||| |||||||    
T  17666618 cccaagatatttaaactgtgtaac 17666641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 147 - 275
Target Start/End: Original strand, 54787732 - 54787861
Alignment:
Q  147 taaaacacatgagtttcttctccatttcaaccacccaacttaaatatgatgatttacatatgcgactatttctctgtcattttgtactatgaacccaa-a 245  Q
    ||||| |||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| |||   | ||||||||| |||||||||| || ||| || |    
T  54787732 taaaagacatgagactattctccatttcaaccacccaacttaaatacgattatttacatctgcttttttttctctgtgattttgtactctggaccaaaga 54787831  T
Q  246 aatttaaacggtgtaacctgaggtatgata 275  Q
     |||||||| |||||| ||| ||| |||||    
T  54787832 tatttaaaccgtgtaatctggggtttgata 54787861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 144 - 244
Target Start/End: Original strand, 17667813 - 17667913
Alignment:
Q  144 acataaaacacatgagtttcttctccatttcaaccacccaacttaaatatgatgatttacatatgcgactatttctctgtcattttgtactatgaaccca 243  Q
    ||||||||||| |||  || ||||| ||||  |||| ||||||| |||| |||||||||||| ||||  |||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  17667813 acataaaacacctgaagtttttctctatttataccatccaacttgaatacgatgatttacatttgcgtttatttctaagtcattttgtactatgaaccca 17667912  T
Q  244 a 244  Q
    |    
T  17667913 a 17667913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 212 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 30807328 - 30807244
Alignment:
Q  212 ctatttctctgtcattttgtactatgaac-ccaaaaatttaaacggtgtaacctgaggtatgatatgacctcccactttcacctc 295  Q
    ||||||||| |||||||||||||||  || ||||| |||||||| ||||||| || |||||||||||| |||| |||||||||||    
T  30807328 ctatttctcagtcattttgtactatagactccaaacatttaaaccgtgtaacttgtggtatgatatgatctccaactttcacctc 30807244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 6 - 90
Target Start/End: Original strand, 45205194 - 45205278
Alignment:
Q  6 caacatcctcatctctgatacgctcacttgattctcgcattggttcttaaccgcccaccacttagtatcatacaacattgccggt 90  Q
    ||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||  |||||||||||| ||||| ||||  ||| |||||||||| ||||||    
T  45205194 caacatcctcatctccgctacgcttacttgattctcgtgttggttcttaactgcccaacactccgtaccatacaacatcgccggt 45205278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 135 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 3273229 - 3273127
Alignment:
Q  135 tttcttatcacataaaacacatgagtttcttctccatttcaaccacccaacttaaatatgatgatttacatatgcgactatttctctgtcattttgtact 234  Q
    |||| |||||||||||||| |||||  || ||||||||||||||| ||||||| |||  |||| |||| || |||  |||||||| |||| |||||||||    
T  3273229 tttcgtatcacataaaacaaatgaggctcatctccatttcaaccatccaacttgaattcgatggtttatatttgcttctatttctttgtcgttttgtact 3273130  T
Q  235 atg 237  Q
    |||    
T  3273129 atg 3273127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 6 - 67
Target Start/End: Complemental strand, 11389656 - 11389595
Alignment:
Q  6 caacatcctcatctctgatacgctcacttgattctcgcattggttcttaaccgcccaccact 67  Q
    ||||||||||||||||| |||||| |||| |||||||  |||||||||||||||||| ||||    
T  11389656 caacatcctcatctctgctacgcttactttattctcgagttggttcttaaccgcccaacact 11389595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 6 - 121
Target Start/End: Original strand, 7092565 - 7092680
Alignment:
Q  6 caacatcctcatctctgatacgctcacttgattctcgcattggttcttaaccgcccaccacttagtatcatacaacattgccggtttgactgttgtctgg 105  Q
    ||||||||||||||||| ||| || ||||| ||||||  |||||||||||| ||| |  |||  ||| |||||||||| |||| | | |||| |||||      
T  7092565 caacatcctcatctctgctacacttacttgcttctcgtgttggttcttaactgcctaaaactccgtaccatacaacatcgccgatctaactgctgtctaa 7092664  T
Q  106 tagaattttcctttca 121  Q
    ||||||||||||||||    
T  7092665 tagaattttcctttca 7092680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 162 - 229
Target Start/End: Original strand, 41009855 - 41009922
Alignment:
Q  162 tcttctccatttcaaccacccaacttaaatatgatgatttacatatgcgactatttctctgtcatttt 229  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| |||| || ||||||||| |||  ||||||||| ||||||||    
T  41009855 tcttctccatttcaaccacctaacttgaatacgaagatttacatttgcttctatttctccgtcatttt 41009922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 106 - 180
Target Start/End: Original strand, 54914635 - 54914708
Alignment:
Q  106 tagaattttcctttcaacttatgcagcattttcttatcacataaaacacatgagtttcttctccatttcaaccac 180  Q
    ||||||||||||||||||||| |  | ||||||||||||||||||||||   || || |||||||||||||||||    
T  54914635 tagaattttcctttcaacttaagtggtattttcttatcacataaaacaccaaagctt-ttctccatttcaaccac 54914708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 6 - 85
Target Start/End: Complemental strand, 1793396 - 1793317
Alignment:
Q  6 caacatcctcatctctgatacgctcacttgattctcgcattggttcttaaccgcccaccacttagtatcatacaacattg 85  Q
    ||||||||||||||| | ||| || |||||||||| |  |||| ||||||||||| | ||||  ||||||||||||||||    
T  1793396 caacatcctcatctccgctacacttacttgattctagtgttggctcttaaccgccaaacactctgtatcatacaacattg 1793317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 165 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 1629208 - 1629134
Alignment:
Q  165 tctccatttcaaccacccaacttaaatatgatgatttacatatgcgactatttctctgtcattttgtactatgaa 239  Q
    |||||||||||||||| ||| || |||| |||||||||||| |||  |||||||||  || |||| |||||||||    
T  1629208 tctccatttcaaccactcaagttgaatacgatgatttacatctgcttctatttctccatcgttttatactatgaa 1629134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 167 - 294
Target Start/End: Original strand, 7092719 - 7092847
Alignment:
Q  167 tccatttcaaccacccaacttaaatatgatgatttacatatgcgactatttctctgtcattttgtactatgaaccca-aaaatttaaacggtgtaacctg 265  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||  ||||| ||||| |||  |||||| |  || ||||| ||||||  ||||| || |||||||| ||||||  |     
T  7092719 tccatttcaaccacccaacttgaataatatgatgtacatctgcatctatttattcgttattttatactatagacccacaatatttaaaccgtgtaattta 7092818  T
Q  266 aggtatgatatgacctcccactttcacct 294  Q
    || |||||||||| || | ||||||||||    
T  7092819 agatatgatatgatcttcaactttcacct 7092847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 140 - 232
Target Start/End: Original strand, 8917807 - 8917899
Alignment:
Q  140 tatcacataaaacacatgagtttcttctccatttcaaccacccaacttaaatatgatgatttacatatgcgactatttctctgtcattttgta 232  Q
    ||||||||||||||| ||||  ||||||| |||||||  | ||||||| || | |||||||||  | |||   ||||||||||||||||||||    
T  8917807 tatcacataaaacacttgaggctcttctcaatttcaattatccaacttgaaaacgatgatttatgtctgcttttatttctctgtcattttgta 8917899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 6 - 126
Target Start/End: Original strand, 52569861 - 52569981
Alignment:
Q  6 caacatcctcatctctgatacgctcacttgattctcgcattggttcttaaccgcccaccacttagtatcatacaacattgccggtttgactgttgtctgg 105  Q
    ||||||||| ||||||| ||| || |||||||||||   |||  |||||||||  || ||||  ||| |||||||||   ||||| |||||||||||       
T  52569861 caacatcctgatctctgctacacttacttgattctcatgttgactcttaaccgaacaacactccgtaccatacaacaacaccggtctgactgttgtccaa 52569960  T
Q  106 tagaattttcctttcaactta 126  Q
    ||||| |||||||||||||||    
T  52569961 tagaactttcctttcaactta 52569981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 106; Significance: 5e-53; HSPs: 18)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 106; E-Value: 5e-53
Query Start/End: Original strand, 6 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 27917508 - 27917219
Alignment:
Q  6 caacatcctcatctctgatacgctcacttgattctcgcattggttcttaaccgcccaccacttagtatcatacaacattgccggtttgactgttgtctgg 105  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||  |||||||||||| || || ||||| ||| |||||||||| |||||| |||||| |||  |     
T  27917508 caacatcctcatctctgctacgcttacttgattctcgttttggttcttaactgcacatcactttgtaccatacaacatcgccggtgtgactgatgttcga 27917409  T
Q  106 tagaattttcctttcaacttatgcagcattttcttatcacataaaacacatgagtttcttctccatttcaaccacccaacttaaatatgatgatttacat 205  Q
    ||||||||| | ||||||||| |  | | ||| |||||||||||||||||||||  ||||||| |||||| | ||||||||| |||| ||||||||| ||    
T  27917408 tagaatttttcattcaacttaagtggtacttttttatcacataaaacacatgaggctcttctctatttcagctacccaacttgaatacgatgatttatat 27917309  T
Q  206 atgcgactatttctctgtcattttgtactatgaacccaa-aaatttaaacggtgtaacctgaggtatgatatgacctcccactttcacct 294  Q
    ||||   |||||||| |||||||||||||||| || ||| | |||||||| ||||||| || | |||||||||| |||| ||||||||||    
T  27917308 atgcttatatttctccgtcattttgtactatggactcaagatatttaaaccgtgtaacttgggatatgatatgatctccaactttcacct 27917219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 94; E-Value: 7e-46
Query Start/End: Original strand, 5 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 38850031 - 38849738
Alignment:
Q  5 gcaacatcctcatctctgatacgctcacttgattctcgcattggttcttaaccgcccaccacttagtatcatacaacattgccggtttgactgttgtctg 104  Q
    |||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||  |||  ||||||||||||| ||||| ||| |||||||||| | |||| ||||||||||| |    
T  38850031 gcaacatcctcatctctgctacacttacttgattctcgtgttgactcttaaccgcccaacactttgtaccatacaacatcgtcggtgtgactgttgtccg 38849932  T
Q  105 gtagaattttcctttcaacttatgcagcattttcttatcacataaaacacatgagtttcttctccatttcaaccacccaacttaaatatgatgatttaca 204  Q
     || ||  || ||||||||||| |  | | ||| ||||| || ||||||| ||||  |||||||||||||||||||||| ||| ||||  |||  |||||    
T  38849931 ataaaaaatttctttcaacttaagtggtactttgttatcgcacaaaacacctgaggctcttctccatttcaaccacccagcttgaatacaatggcttaca 38849832  T
Q  205 tatgcgactatttctctgtcattttgtactatgaacccaa-aaatttaaacggtgtaacctgaggtatgatatgacctcccactttcacctcca 297  Q
    | |||  ||||||||| ||||||||||||| || |||||| | |||||||| ||||||  ||||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  38849831 tctgcttctatttctccgtcattttgtactgtggacccaagatatttaaaccgtgtaaattgaggtatgatatgatctccaactttcacctcca 38849738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 5 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 25191316 - 25191023
Alignment:
Q  5 gcaacatcctcatctctgatacgctcacttgattctcgcattggttcttaaccgcccaccacttagtatcatacaacattgccggtttgactgttgtctg 104  Q
    |||||||||||||||||| ||| || |||| | |||||  |||  ||||||| ||||| ||||  ||| ||||||||||| ||||| ||||| ||||  |    
T  25191316 gcaacatcctcatctctgctacacttactttactctcgtgttgactcttaacagcccaacactctgtaccatacaacatttccggtctgactattgttcg 25191217  T
Q  105 gtagaattttcctttcaacttatgcagcattttcttatcacataaaacacatgagtttcttctccatttcaaccacccaacttaaatatgatgatttaca 204  Q
     |||||  |||||||||||||| |  | | ||||||||| || ||||||| ||||  |||||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||    
T  25191216 atagaaccttcctttcaacttaagtggtactttcttatcgcacaaaacacctgagactcttctccatttcaaccacccagcttgaatacgatgatttaca 25191117  T
Q  205 tatgcgactatttctctgtcattttgtactatgaacccaa-aaatttaaacggtgtaacctgaggtatgatatgacctcccactttcacctcca 297  Q
    | |||  |||||||||  ||||||||||||||  |||||| | |||||||| ||||||| || | |||||||||| |||| |||||||||||||    
T  25191116 tttgcttctatttctccatcattttgtactatagacccaagatatttaaaccgtgtaacttgggctatgatatgatctccaactttcacctcca 25191023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 77; E-Value: 9e-36
Query Start/End: Original strand, 100 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 30345369 - 30345174
Alignment:
Q  100 gtctggtagaattttcctttcaacttatgcagcattttcttatcacataaaacacatgagtttcttctccatttcaaccacccaacttaaatatgatgat 199  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| || | | ||||||||| |||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||    
T  30345369 gtctggtagaattttcctttcaatttaagcggtactttcttatcgcataaaacacctgagactcttctccatttcaaccacccaacttgaatactatgat 30345270  T
Q  200 ttacatatgcgactatttctctgtcattttgtactatgaacccaaaaatttaaacggtgtaacctgaggtatgatatgacctcccactttcacctccat 298  Q
    ||| |||||    ||||||||| || ||||||||||||||||   | ||||||||  |||| | || |||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  30345269 ttatatatgtttttatttctctttctttttgtactatgaacc---atatttaaaccttgtagcttggggtatgatatgagcttccactttcacctccat 30345174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 74; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 5 - 297
Target Start/End: Original strand, 47542057 - 47542349
Alignment:
Q  5 gcaacatcctcatctctgatacgctcacttgattctcgcattggttcttaaccgcccaccacttagtatcatacaacattgccggtttgactgttgtctg 104  Q
    |||||||||||||||||| ||| ||  ||| ||||||   |||  ||||||| ||||| ||||  ||| |||||||||  ||||||  ||| | |||| |    
T  47542057 gcaacatcctcatctctgctacactttctt-attctcatgttgactcttaactgcccaacactccgtaccatacaacaacgccggtcagaccgctgtccg 47542155  T
Q  105 gtagaattttcctttcaacttatgcagcattttcttatcacataaaacacatgagtttcttctccatttcaaccacccaacttaaatatgatgatttaca 204  Q
     ||||| ||||||||||||||| |  | | ||||||||| || ||||||| ||||  |||||||||||||||||||||| ||| |||||||||  |||||    
T  47542156 atagaactttcctttcaacttaagtggtactttcttatcgcacaaaacacctgaggctcttctccatttcaaccacccagcttgaatatgatggcttaca 47542255  T
Q  205 tatgcgactatttctctgtcattttgtactatgaacccaa-aaatttaaacggtgtaacctgaggtatgatatgacctcccactttcacctcca 297  Q
    | |||  ||||||||| |||||||||||| | | |||||| | |||||||| ||||||| || ||||||| |||| |||| |||||||||||||    
T  47542256 tctgcttctatttctccgtcattttgtacgaaggacccaagatatttaaaccgtgtaacttggggtatgaaatgatctccaactttcacctcca 47542349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 5 - 297
Target Start/End: Original strand, 51448054 - 51448347
Alignment:
Q  5 gcaacatcctcatctctgatacgctcacttgattctcgcattggttcttaaccgcccaccacttagtatcatacaacattgccggtttgactgttgtctg 104  Q
    |||||||||||||||||| ||| || | |||||||||   |||  ||||||||||| | ||||  ||| |||||||||  | ||||  ||||| |||| |    
T  51448054 gcaacatcctcatctctgctacacttagttgattctcatgttgactcttaaccgcctaacactccgtaccatacaacaacgtcggtcggactgctgtccg 51448153  T
Q  105 gtagaattttcctttcaacttatgcagcattttcttatcacataaaacacatgagtttcttctccatttcaaccacccaacttaaatatgatgatttaca 204  Q
     || || ||||||||||||||| |  | | ||||||||| || |||||||  |||  |||||||||||||||||||||| ||| |||| |||   |||||    
T  51448154 atataactttcctttcaacttaagtggtactttcttatcgcacaaaacacccgaggctcttctccatttcaaccacccagcttgaatacgatagcttaca 51448253  T
Q  205 tatgcgactatttctctgtcattttgtactatgaacccaa-aaatttaaacggtgtaacctgaggtatgatatgacctcccactttcacctcca 297  Q
    | |||  ||||||||| |||||||||||| | | |||||| | |||||||| ||||||| || |||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  51448254 tctgcttctatttctccgtcattttgtacgaaggacccaagatatttaaaccgtgtaacttggggtatgatatgatctccaactttcacctcca 51448347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 75 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 29817371 - 29817149
Alignment:
Q  75 atacaacattgccggtttgactgttgtctggtagaattttcctttcaacttatgcagcattttcttatcacataaaacacatgagtttcttctccatttc 174  Q
    ||||||||||  |||| | ||||||||| ||||||| ||| ||||||||||| ||   | ||||||||||||||||||| |  ||  | ||||| |||||    
T  29817371 atacaacattatcggtctaactgttgtccggtagaaattttctttcaacttaagcgttactttcttatcacataaaacataacagactattctctatttc 29817272  T
Q  175 aaccacccaacttaaatatgatgatttacatatgcgactatttctctgtcattttgtactatgaacccaaaaatttaaacggtgtaacctgaggtatgat 274  Q
    ||||||||||||| |||| |||||||||||| |||   ||||| || ||||||||||||||||  |  | | |||| ||| ||||||| |  ||||||||    
T  29817271 aaccacccaacttgaatacgatgatttacatctgccgttatttatccgtcattttgtactatggtcaaagatatttgaaccgtgtaacttatggtatgat 29817172  T
Q  275 atgacctcccactttcacctcca 297  Q
    |||| |||| |||||||||||||    
T  29817171 atgatctccaactttcacctcca 29817149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 5 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 52138737 - 52138559
Alignment:
Q  5 gcaacatcctcatctctgatacgctcacttgattctcgcattggttcttaaccgcccaccacttagtatcatacaacattgccggtttgactgttgtctg 104  Q
    |||||||||||||||||| ||| || |||||||||||   |||  ||||||||||||| ||||| ||| |||||||||  ||||||  ||||| |||| |    
T  52138737 gcaacatcctcatctctgctacacttacttgattctcatcttgactcttaaccgcccaacacttcgtaccatacaacaacgccggtcggactgctgtccg 52138638  T
Q  105 gtagaattttcctttcaacttatgcagcattttcttatcacataaaacacatgagtttcttctccatttcaaccaccca 183  Q
     ||||| ||||||||||||||| |  | ||||||||||| || || |||| ||||  ||||||||||||||||||||||    
T  52138637 atagaactttcctttcaacttaagtggtattttcttatcgcacaagacacctgagactcttctccatttcaaccaccca 52138559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 62; E-Value: 8e-27
Query Start/End: Original strand, 5 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 26490254 - 26489964
Alignment:
Q  5 gcaacatcctcatctctgatacgctcacttgattctcgcattggttcttaaccgcccacca--cttagtatcatacaacattgccggtttgactgttgtc 102  Q
    |||||||||||||||| | ||| || |||||||||||   |||||||||||||||||| ||  ||||  || | ||||||| |||||| |||||||||||    
T  26490254 gcaacatcctcatctccgctacacttacttgattctcttgttggttcttaaccgcccaacatacttaccat-acacaacatcgccggtctgactgttgtc 26490156  T
Q  103 tggtagaattttcctttcaacttatgcagcattttcttatcacataaaacacatgagtttcttctccatttcaaccacccaacttaaatatgatgattta 202  Q
     | || ||||||||||| || ||| || | ||||||| || ||||||||| | | ||  | |||| ||| |||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  26490155 cgatataattttcctttaaatttaagcggtattttctcattacataaaactc-taaggctattcttcatctcaaccactcaacttcaatatgatgattta 26490057  T
Q  203 catatgcgactatttctctgtcattttgtactat-gaacccaaaaatttaaacggtgtaacctgaggtatgatatgacctcccactttcacct 294  Q
    ||| |||  ||||||||| |||||||| ||  || ||||| | | |||||||   |||||| ||  ||||||||||| |||||||||||||||    
T  26490056 catctgcttctatttctccgtcattttatatcatggaaccaagatatttaaatcatgtaacttggagtatgatatgatctcccactttcacct 26489964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 5 - 171
Target Start/End: Complemental strand, 5168765 - 5168599
Alignment:
Q  5 gcaacatcctcatctctgatacgctcacttgattctcgcattggttcttaaccgcccaccacttagtatcatacaacattgccggtttgactgttgtctg 104  Q
    |||||||||||||||| | ||| || |||| | ||||   |||| ||||||||||||| ||||  ||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |    
T  5168765 gcaacatcctcatctccgctacacttactttactctcatgttggctcttaaccgcccagcactccgtaccatacaacattgccggtctgactgttgtccg 5168666  T
Q  105 gtagaattttcctttcaacttatgcagcattttcttatcacataaaacacatgagtttcttctccat 171  Q
     |||||||||||||||| |||| |  | | ||||||||| || ||||||| ||||  ||||||||||    
T  5168665 atagaattttcctttcagcttaagtggtactttcttatcgcacaaaacacctgaggctcttctccat 5168599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 118 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 48221608 - 48221430
Alignment:
Q  118 ttcaacttatgcagcattttcttatcacataaaacacatgagtttcttctccatttcaaccacccaacttaaatatgatgatttacatatgcgactattt 217  Q
    ||||||||  |||| | |||| ||||||| ||||||   ||| ||||||| ||||||||||| |||  || |||  ||||||||||||||||  ||| ||    
T  48221608 ttcaacttgagcagtactttcgtatcacacaaaacattggaggttcttcttcatttcaaccatccagtttgaattcgatgatttacatatgcttctactt 48221509  T
Q  218 ctctgtcattttgtactatgaacccaa-aaatttaaacggtgtaacctgaggtatgatatgacctcccactttcacctc 295  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| | |||||||  ||||||| || |||||||||||| || | |||||||||||    
T  48221508 ctctgtcattttgtactatgaatccaagatatttaaaatgtgtaacttgtggtatgatatgatcttcaactttcacctc 48221430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 109 - 262
Target Start/End: Original strand, 54425355 - 54425509
Alignment:
Q  109 aattttcctttcaacttatgcagcattttcttatcacataaaacacatgagtttcttctccatttcaaccacccaacttaaatatgatgatttacatatg 208  Q
    |||||||||| ||||||| |  | | |||||||||||| ||||||||||||  |||| | |||||||||| || | |||||||| |||||||||||||||    
T  54425355 aattttccttccaacttaagtggtactttcttatcacacaaaacacatgagactctttttcatttcaaccgcctagcttaaatacgatgatttacatatg 54425454  T
Q  209 cgactatttctctgtcattttgtactatgaacccaa-aaatttaaacggtgtaac 262  Q
    |  ||||||||| |||||||| ||||||| | |||| | |||||||| |||||||    
T  54425455 cttctatttctccgtcattttttactatggatccaagatatttaaaccgtgtaac 54425509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 5 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 28245374 - 28245146
Alignment:
Q  5 gcaacatcctcatctctgatacgctcacttgattctcgcattggttcttaaccgcccaccacttagtatcatacaacattgccggtttgactgttgtctg 104  Q
    ||||||||||||||| || ||| || |||| ||||||   |||  | ||||||||||| ||||  ||| | |||||||  |||||| |||||| |||| |    
T  28245374 gcaacatcctcatctttgctacacttacttaattctcatgttgacttttaaccgcccaacactccgtaccgtacaacaacgccggtctgactgctgtccg 28245275  T
Q  105 gtagaattttcctttcaacttatgcagcattttcttatcacataaaacacatgagtttcttctccatttcaaccacccaacttaaatatgatgatttaca 204  Q
     ||||| ||||||||||||||| |  | | ||||||||| || ||||||  ||||  |||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||  |||||    
T  28245274 atagaactttcctttcaacttaagtggtactttcttatcgcacaaaacaactgagactcttctccatttcaaccacccagcttgaatacgatggcttaca 28245175  T
Q  205 tatgcgactatttctctgtcattttgtac 233  Q
    | |||  |||||||||  |||||||||||    
T  28245174 tctgcttctatttctccatcattttgtac 28245146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 194 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 19757816 - 19757712
Alignment:
Q  194 gatgatttacatatgcgactatttctctgtcattttgtactatgaacccaaaa-atttaaacggtgtaacctgaggtatgatatgacctcccactttcac 292  Q
    |||||||||||| |||   ||||||||||| ||||||||||||| |||||| | ||||||||  |||||| || |||||||||||| |||| ||||||||    
T  19757816 gatgatttacatctgctcttatttctctgttattttgtactatggacccaagatatttaaaccatgtaacttggggtatgatatgatctccaactttcac 19757717  T
Q  293 ctcca 297  Q
    |||||    
T  19757716 ctcca 19757712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 31 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 3186680 - 3186506
Alignment:
Q  31 acttgattctcgcattggttcttaaccgcccaccacttagtatcatacaacattgccggtttgactgttgtctggtagaattttcctttcaacttatgca 130  Q
    ||||||||||||  |||  |||||| |||||| ||||   ||||||||||||| |  |||  |||||||||| | || || ||||||||||||||| |      
T  3186680 acttgattctcgtgttgactcttaatcgcccaacactatatatcatacaacatcgttggtgggactgttgtccgatataactttcctttcaacttaagtg 3186581  T
Q  131 gcattttcttatcacataaaacacatgagtttcttctccatttcaaccacccaacttaaatatgatgatttacat 205  Q
      | ||||||||||| ||||||||||||   | |||| ||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||    
T  3186580 atactttcttatcacctaaaacacatgaaaatattcttcatttcaaccacccaacttgaatacgatgttttacat 3186506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 5 - 125
Target Start/End: Original strand, 43695110 - 43695230
Alignment:
Q  5 gcaacatcctcatctctgatacgctcacttgattctcgcattggttcttaaccgcccaccacttagtatcatacaacattgccggtttgactgttgtctg 104  Q
    |||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||  ||  |||| |||| |||| ||||  ||| |||||||||| |||||| | |||| |||| |    
T  43695110 gcaacatcctcatctctgttacacttacttgattctcgtgttaattctcaaccacccaacactccgtaccatacaacatcgccggtctaactgctgtccg 43695209  T
Q  105 gtagaattttcctttcaactt 125  Q
     ||||| ||| ||||||||||    
T  43695210 atagaacttttctttcaactt 43695230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 222 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 52138548 - 52138472
Alignment:
Q  222 gtcattttgtactatgaacccaaaa-atttaaacggtgtaacctgaggtatgatatgacctcccactttcacctcca 297  Q
    |||||||||||| | | |||||| | |||||||| ||||||| || |||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  52138548 gtcattttgtacgaaggacccaagatatttaaaccgtgtaacttggggtatgatatgatctccaactttcacctcca 52138472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 140 - 176
Target Start/End: Original strand, 43111535 - 43111571
Alignment:
Q  140 tatcacataaaacacatgagtttcttctccatttcaa 176  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  43111535 tatcacataaaacacatgaggctcttctccatttcaa 43111571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 104; Significance: 7e-52; HSPs: 17)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 104; E-Value: 7e-52
Query Start/End: Original strand, 6 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 5631754 - 5631464
Alignment:
Q  6 caacatcctcatctctgatacgctcacttgattctcgcattggttcttaaccgcccaccacttagtatcatacaacattgccggtttgactgttgtctgg 105  Q
    ||||||||||||||  | ||| || |||| | |||||| |||| ||||||||||||| ||||   || |||||||||||| |||| ||||||||||| |     
T  5631754 caacatcctcatcttcgctacacttactttactctcgcgttggctcttaaccgcccaacactccataccatacaacattgtcggtctgactgttgtccga 5631655  T
Q  106 tagaattttcctttcaacttatgcagcattttcttatcacataaaacacatgagtttcttctccatttcaaccacccaacttaaatatgatgatttacat 205  Q
    |||||||||||||||| |||| |  | | ||||||||| || |||||||  |||  |||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||    
T  5631654 tagaattttcctttcagcttaagtggtactttcttatcgcacaaaacacccgagactcttctccatttcaaccacccagcttgaatacgatgatttacat 5631555  T
Q  206 atgcgactatttctctgtcattttgtactatgaacccaaaa--atttaaacggtgtaacctgaggtatgatatgacctcccactttcacct 294  Q
     |||  ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||  |||||||| ||||||| || |||||||||||| |||  ||||||||||    
T  5631554 ctgcttctatttctccgtcattttgtactatggacccaaaaatatttaaaccgtgtaacttggggtatgatatgatctctaactttcacct 5631464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 94; E-Value: 7e-46
Query Start/End: Original strand, 5 - 297
Target Start/End: Original strand, 10100202 - 10100495
Alignment:
Q  5 gcaacatcctcatctctgatacgctcacttgattctcgcattggttcttaaccgcccaccacttagtatcatacaacattgccggtttgactgttgtctg 104  Q
    |||||||||||||||| | ||| || |||||| |||||  |||| |||||||| |||| ||||  ||| |||||||||| | |||| |||||  |||| |    
T  10100202 gcaacatcctcatctccgctacacttacttgactctcgtcttggctcttaacctcccaacactccgtaccatacaacatcgtcggtctgactactgtccg 10100301  T
Q  105 gtagaattttcctttcaacttatgcagcattttcttatcacataaaacacatgagtttcttctccatttcaaccacccaacttaaatatgatgatttaca 204  Q
     ||||| ||||||||||||||| |  | | ||||||||| || ||||||||||||  ||||||||||| |||||||||| ||| |||| ||||||||| |    
T  10100302 atagaactttcctttcaacttaagtggtactttcttatctcacaaaacacatgaggctcttctccattccaaccacccagcttgaatacgatgatttata 10100401  T
Q  205 tatgcgactatttctctgtcattttgtactatgaacccaa-aaatttaaacggtgtaacctgaggtatgatatgacctcccactttcacctcca 297  Q
    |  ||  ||||||||| | |||||||||||||| |||||| | |||||||| ||||||| || |||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  10100402 tcagcttctatttctccgacattttgtactatggacccaagatatttaaaccgtgtaacttggggtatgatatgatctccaactttcacctcca 10100495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 56 - 297
Target Start/End: Original strand, 5258546 - 5258788
Alignment:
Q  56 ccgcccaccacttagtatcatacaacattgccggtttgactgttgtctggtagaattttcctttcaacttatgcagcattttcttatcacataaaacaca 155  Q
    ||||||| ||||  ||| ||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||| |||||||||| |||| |  | | ||||| ||| || ||||||||    
T  5258546 ccgcccaacactccgtaccatacaacattgccggtctgactgttgtccgatagaactttcctttcagcttaagtggtactttctcatcgcaaaaaacaca 5258645  T
Q  156 tgagtttcttctccatttcaaccacccaacttaaatatgatgatttacatatgcgactatttctctgtcattttgtactatgaacccaa-aaatttaaac 254  Q
    ||||  |||||||||||||||||||||| ||| |||| |||||| |||||  ||  ||||||||| |||||||||||||||| |||||| | ||||||||    
T  5258646 tgaggctcttctccatttcaaccacccagcttgaatacgatgatgtacatcagcttctatttctccgtcattttgtactatggacccaagatatttaaac 5258745  T
Q  255 ggtgtaacctgaggtatgatatgacctcccactttcacctcca 297  Q
     ||||||| || |||||||||||| |||| |||||||| ||||    
T  5258746 tgtgtaacttggggtatgatatgatctccaactttcacttcca 5258788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 1 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 9706717 - 9706420
Alignment:
Q  1 cagtgcaacatcctcatctctgatacgctcacttgattctcgcattggttcttaaccgcccaccacttagtatcatacaacattgccggtttgactgttg 100  Q
    |||||||||||||||||||| | ||| || |||| | |||||  |||  |||||||| || | ||||| ||| ||||||||||||||||| |||||| ||    
T  9706717 cagtgcaacatcctcatctccgctacacttactttactctcgtgttgactcttaaccacctaacacttcgtaccatacaacattgccggtctgactgctg 9706618  T
Q  101 tctggtagaattttcctttcaacttatgcagcattttcttatcacataaaacacatgagtttcttctccatttcaaccacccaacttaaatatgatgatt 200  Q
    |  | ||||| |||||||||| |||| |  | | ||||||||| || ||||||| |||   |||||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||    
T  9706617 ttcgatagaactttcctttcagcttaagtggtactttcttatcgcacaaaacacctgatgctcttctccatttcaaccacccagcttgaatacgatgatt 9706518  T
Q  201 tacatatgcgactatttctctgtcattttgtactatgaacccaa-aaatttaaacggtgtaacctgaggtatgatatgacctcccactttcacctcca 297  Q
    ||||  |||  |||||||||  ||||||||||| ||| |||||| | |||||||| ||||||| || |||||||||||| |||| ||||||| |||||    
T  9706517 tacacctgcttctatttctccatcattttgtaccatggacccaagatatttaaaccgtgtaacttggggtatgatatgatctccaactttcatctcca 9706420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 67; E-Value: 9e-30
Query Start/End: Original strand, 6 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 2689592 - 2689314
Alignment:
Q  6 caacatcctcatctctgatacgctcacttgattctcgcattggttcttaaccgcccaccacttagtatcatacaacattgccggtttgactgttgtctgg 105  Q
    |||||||||||||||   |||  | |||| |||||||| |||| | ||||||||||| ||||  ||| |||||||||| | |||| |||||| |||| |     
T  2689592 caacatcctcatctccactacatttacttaattctcgcgttggctgttaaccgcccaacactccgtaccatacaacatcgacggtctgactgctgtccga 2689493  T
Q  106 tagaattttcctttcaacttatgcagcattttcttatcacataaaacacatgagtttcttctccatttcaaccacccaacttaaatatgatgatttacat 205  Q
    | ||| ||||||||||||||| | ||   |||||||||||| |||| |||||||   |||||||||||||| || ||| ||| | || ||||||||||||    
T  2689492 ttgaactttcctttcaacttaagtagtgctttcttatcacacaaaatacatgaggcacttctccatttcaatcatccagcttgactacgatgatttacat 2689393  T
Q  206 atgcgactatttctctgtcattttgtactatgaacccaaaa-atttaaacggtgtaacctgaggtatgatatgacctcc 283  Q
     ||   ||||||||| ||| |||||||||||  |||||||| |||||||| ||||||| |  |||||||||||| ||||    
T  2689392 ctgattctatttctccgtcgttttgtactatagacccaaaatatttaaaccgtgtaacttagggtatgatatgatctcc 2689314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 5 - 296
Target Start/End: Original strand, 20427981 - 20428273
Alignment:
Q  5 gcaacatcctcatctctgatacgctcacttgattctcgcattggttcttaaccgcccaccacttagtatcatacaacattgccggtttgactgttgtctg 104  Q
    |||||||||||||||| | ||| || | |||| |||||  |||| |||||||| |||| ||||  |||  ||||||||||    ||||||||| ||||      
T  20427981 gcaacatcctcatctccgctacacttatttgactctcgtgttggctcttaaccacccaacactctgtactatacaacatttttagtttgactgctgtcca 20428080  T
Q  105 gtagaattttcctttcaacttatgcagcattttcttatcacataaaacacatgagtttcttctccatttcaaccacccaacttaaatatgatgatttaca 204  Q
     ||||| |||||||||| |||| |  | | ||||||||| || |||||||  |||  |||||||||||||||||||||| |||  ||| |||||||||||    
T  20428081 atagaactttcctttcagcttaagtggtactttcttatcgcacaaaacacccgaggctcttctccatttcaaccacccagcttggatacgatgatttaca 20428180  T
Q  205 tatgcgactatttctctgtcattttgtactatgaacccaa-aaatttaaacggtgtaacctgaggtatgatatgacctcccactttcacctcc 296  Q
    | |||  |||||| || ||| ||||||||| || |||||| | |||||||| | ||||| || |||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  20428181 tctgcttctatttttccgtcgttttgtactgtggacccaatatatttaaaccgcgtaacttgtggtatgatatgatctccaactttcacctcc 20428273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 5 - 187
Target Start/End: Original strand, 6056115 - 6056297
Alignment:
Q  5 gcaacatcctcatctctgatacgctcacttgattctcgcattggttcttaaccgcccaccacttagtatcatacaacattgccggtttgactgttgtctg 104  Q
    ||||||||| ||| |||  |||||| |||||||| |||  ||||||||||||| |||| ||||  |||||||| ||||||| |||| |||| |||||| |    
T  6056115 gcaacatccgcatttctactacgcttacttgattttcgtgttggttcttaaccacccaacactccgtatcatataacattgtcggtctgaccgttgtccg 6056214  T
Q  105 gtagaattttcctttcaacttatgcagcattttcttatcacataaaacacatgagtttcttctccatttcaaccacccaactt 187  Q
     ||||||| |||||||||||||      ||||||||||| |||||||||| |||   |||||| |||||||||||||||||||    
T  6056215 atagaattatcctttcaacttaaatgatattttcttatcgcataaaacacttgaagctcttctacatttcaaccacccaactt 6056297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 135 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 33496004 - 33495895
Alignment:
Q  135 tttcttatcacataaaacacatgagtttcttctccatttcaaccacccaacttaaatatgatgatttacatatgcgactatttctctgtcattttgtact 234  Q
    |||||||||||| ||||||  ||||  |||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||| ||||||||||  ||||||||| || ||||||||||    
T  33496004 tttcttatcacacaaaacatctgagactcttctccatttcaaccatccagcttgaatatgatgagttacatatgcttctatttctccgttattttgtact 33495905  T
Q  235 atgaacccaa 244  Q
    ||| ||||||    
T  33495904 atggacccaa 33495895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 5 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 14030743 - 14030565
Alignment:
Q  5 gcaacatcctcatctctgatacgctcacttgattctcgcattggttcttaaccgcccaccacttagtatcatacaacattgccggtttgactgttgtctg 104  Q
    |||||||||||||||||| ||| || |||| | |||||  |||  | ||||||||||| ||||  ||| |||||||||||||  |||||||||||||| |    
T  14030743 gcaacatcctcatctctgctacacttactttactctcgtgttgacttttaaccgcccaacactccgtaccatacaacattgctagtttgactgttgtccg 14030644  T
Q  105 gtagaattttcctttcaacttatgcagcattttcttatcacataaaacacatgagtttcttctccatttcaaccaccca 183  Q
     ||||| |||| ||||| |||| |  | | ||||||||| || ||||||| ||||  | ||||||||||||||||||||    
T  14030643 atagaactttcatttcagcttaagtggtactttcttatcgcacaaaacacctgagactattctccatttcaaccaccca 14030565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 135 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 26291586 - 26291444
Alignment:
Q  135 tttcttatcacataaaacacatgagtttcttctccatttcaaccacccaacttaaatatgatgatttacatatgcgactatttctctgtcattttgtact 234  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| || |||| ||||||||||| ||||||| |||| | |||||| | |||||  |||||||||  ||||||| ||||    
T  26291586 tttcttatcacataaaatacatgaggttattctacatttcaaccatccaacttgaatacgttgatttgcgtatgcttctatttctccatcattttctact 26291487  T
Q  235 atgaacccaa-aaatttaaacggtgtaacctgaggtatgatat 276  Q
    ||| || ||| | |||||||||||||||| |  ||||||||||    
T  26291486 atggactcaagatatttaaacggtgtaacttagggtatgatat 26291444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 74 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 30679342 - 30679224
Alignment:
Q  74 catacaacattgccggtttgactgttgtctggtagaattttcctttcaacttatgcagcattttcttatcacataaaacacatgagtttcttctccattt 173  Q
    |||||||||| | |||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||  | | ||||||||| |  ||||||| ||||  ||||||| ||||    
T  30679342 catacaacatcgtcggtctgactgttgtctgatagaactttcctttcaacttatgtggtactttcttatcgctcaaaacacctgagcctcttctctattt 30679243  T
Q  174 caaccacccaacttaaata 192  Q
    |||||||||||||| ||||    
T  30679242 caaccacccaacttgaata 30679224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 7 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 608094 - 607902
Alignment:
Q  7 aacatcctcatctctgatacgctcacttgattctcgcattggttcttaaccgcccaccacttagtatcatacaacattgccggtttgactgttgtctggt 106  Q
    |||||||||||||| | ||| || |||| |||||||  |||| ||||||||||||| ||||  |||  |||||||||||||||| |||||| |||| | |    
T  608094 aacatcctcatctccgctacacttactttattctcgtgttggctcttaaccgcccaacactccgtacaatacaacattgccggtctgactgctgtccgat 607995  T
Q  107 agaattttcctttcaacttatgcagcattttcttatcacataaaacacatgagtttcttctccatttcaaccacccaacttaaatatgatgat 199  Q
    |||| ||| ||||||  ||| |  |   | ||||||| || ||||||| ||||  |||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||    
T  607994 agaacttttctttcagtttaagtggtcatgtcttatcgcacaaaacacctgaggctcttctccatttcaaccacccagcttgaatacgatgat 607902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 9 - 206
Target Start/End: Original strand, 2065105 - 2065303
Alignment:
Q  9 catcctcatctctgatacgctcacttgattctcgcattggttcttaaccgcccaccacttagtatcatacaacattgccggtttgactgttgtctggtag 108  Q
    |||||||||||| | ||| |  ||||||||||||  |||| ||||||||| ||| || |  ||| |||||||||| ||| |||| || |||||| | |||    
T  2065105 catcctcatctccgctacacgtacttgattctcgtgttggctcttaaccgtccaacattccgtaccatacaacatcgccagttttacggttgtccgatag 2065204  T
Q  109 aattttcctttcaacttatgcagcattttcttatcacataaaacacatga-gtttcttctccatttcaaccacccaacttaaatatgatgatttacata 206  Q
    || ||||||||||||||| |  | | |||||||||| |||||||||   | || |||| ||||||||||| || || ||| |||| |||||||||||||    
T  2065205 aagtttcctttcaacttaagatgtactttcttatcaaataaaacacccaaagtctcttttccatttcaacaacacatcttgaatacgatgatttacata 2065303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 137 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 27790961 - 27790799
Alignment:
Q  137 tcttatcacataaaacacatgagtttcttctccatttcaaccacccaacttaaatatgatgatttacatatgcgactatttctctgtcattttgtactat 236  Q
    ||||||||| |||||||| ||||  ||||||| ||||||||||| |||||| | |||||||||||| |  |||  |||||| |  |||||||||||||||    
T  27790961 tcttatcacgtaaaacacttgaggctcttctctatttcaaccactcaactttattatgatgatttagacttgcttctatttatgcgtcattttgtactat 27790862  T
Q  237 gaacccaa-aaatttaaacggtgtaacctgaggtatgatatgacctcccactttcacctccat 298  Q
    | | |||| | ||||||||  |||||  ||  ||||  ||||||||||||| |||||||||||    
T  27790861 ggatccaagatatttaaaccatgtaatttggagtattttatgacctcccaccttcacctccat 27790799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 4 - 102
Target Start/End: Complemental strand, 33496122 - 33496024
Alignment:
Q  4 tgcaacatcctcatctctgatacgctcacttgattctcgcattggttcttaaccgcccaccacttagtatcatacaacattgccggtttgactgttgtc 102  Q
    ||||||||| ||||||| | ||| || |||||||||||   |||||| ||||||| ||| ||||  ||| ||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  33496122 tgcaacatcatcatctccgttacacttacttgattctcatgttggtttttaaccgtccaacactctgtaccatacaacattgcaggtctgactgttgtc 33496024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 135 - 236
Target Start/End: Original strand, 6641885 - 6641986
Alignment:
Q  135 tttcttatcacataaaacacatgagtttcttctccatttcaaccacccaacttaaatatgatgatttacatatgcgactatttctctgtcattttgtact 234  Q
    |||| |||||||||||||||  ||| |  | |||||||||||||||||||||| |||   ||| ||||||| | |  |||||||||| ||||||||||||    
T  6641885 tttcatatcacataaaacacccgaggtcatcctccatttcaaccacccaactttaattcaatggtttacatctccttctatttctctctcattttgtact 6641984  T
Q  235 at 236  Q
    ||    
T  6641985 at 6641986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 5 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 28085313 - 28085196
Alignment:
Q  5 gcaacatcctcatctctgatacgctcacttgattctcgcattggttcttaaccgcccaccacttagtatcatacaacattgccggtttgactgttgtctg 104  Q
    |||||||||||||||||| ||| || |||||||||||   |||  ||||| ||||||| ||||  ||| |||||| ||   ||||| |||||| |||| |    
T  28085313 gcaacatcctcatctctgctacacttacttgattctcatgttgactcttagccgcccaacactccgtaccatacagcaacaccggtctgactgctgtccg 28085214  T
Q  105 gtagaattttcctttcaa 122  Q
     ||||| |||||||||||    
T  28085213 atagaactttcctttcaa 28085196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 102; Significance: 1e-50; HSPs: 33)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 5 - 297
Target Start/End: Original strand, 32083090 - 32083383
Alignment:
Q  5 gcaacatcctcatctctgatacgctcacttgattctcgcattggttcttaaccgcccaccacttagtatcatacaacattgccggtttgactgttgtctg 104  Q
    |||||||||||||||| | ||| |  |||| | |||||  |||  ||||||||||||| ||||  ||| |||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  32083090 gcaacatcctcatctccgctacacatactttactctcgtgttgactcttaaccgcccaacactctgtaccatacaacattgtcggtctgactgttgtctg 32083189  T
Q  105 gtagaattttcctttcaacttatgcagcattttcttatcacataaaacacatgagtttcttctccatttcaaccacccaacttaaatatgatgatttaca 204  Q
     ||||| |||||||||| |||| |  | | ||||||||| |||| ||||| ||||  |||||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||    
T  32083190 atagaactttcctttcagcttaagtggtactttcttatcgcatagaacacctgaggctcttctccatttcaaccacccagcttgaatacgatgatttaca 32083289  T
Q  205 tatgcgactatttctctgtcattttgtactatgaacccaa-aaatttaaacggtgtaacctgaggtatgatatgacctcccactttcacctcca 297  Q
    | |||  ||||||||| |||||||||||||||| |||||| | |||||||  ||| ||| || |||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  32083290 tttgcctctatttctccgtcattttgtactatggacccaagatatttaaattgtgcaacttggggtatgatatgatctccaactttcacctcca 32083383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 6 - 298
Target Start/End: Original strand, 34827448 - 34827741
Alignment:
Q  6 caacatcctcatctctgatacgctcacttgattctcgcattggttcttaaccgcccaccacttagtatcatacaacattgccggtttgactgttgtctgg 105  Q
    ||||||||||||||| | ||| || | ||| || |||  ||||||||||||||  || ||||  ||| |||||||||| |  | | |||||||||||       
T  34827448 caacatcctcatctcagttacacttatttgtttttcgtgttggttcttaaccgaacaacactctgtaccatacaacatcgttgatctgactgttgtccaa 34827547  T
Q  106 tagaattttcctttcaacttatgcagcattttcttatcacataaaacacatgagtttcttctccatttcaaccacccaacttaaatatgatgatttacat 205  Q
    || |||||||||||||| ||| |||| | |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||  |||||| ||||  |||||||||||    
T  34827548 tataattttcctttcaatttaagcagtactttcttatcacataaaacacatgaggctcttctccatttcaaccattcaacttgaatacaatgatttacat 34827647  T
Q  206 atgcgactatttctctgtcattttgtactatgaacccaa-aaatttaaacggtgtaacctgaggtatgatatgacctcccactttcacctccat 298  Q
    ||||  ||||||||| |||||||||||||||| |||||| | ||||||||  |||||| |  |||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  34827648 atgcttctatttctccgtcattttgtactatggacccaagatatttaaaccttgtaacttagggtatgatatgatctcccactttcacctccat 34827741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 94; E-Value: 7e-46
Query Start/End: Original strand, 5 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 8671857 - 8671564
Alignment:
Q  5 gcaacatcctcatctctgatacgctcacttgattctcgcattggttcttaaccgcccaccacttagtatcatacaacattgccggtttgactgttgtctg 104  Q
    |||||||||| ||||||| ||| || |||||||||||   |||  ||||||||| ||| || || ||| |||||||||  |||||| |||||||||||||    
T  8671857 gcaacatccttatctctgctacacttacttgattctcatgttgactcttaaccgtccaacatttcgtaccatacaacaacgccggtctgactgttgtctg 8671758  T
Q  105 gtagaattttcctttcaacttatgcagcattttcttatcacataaaacacatgagtttcttctccatttcaaccacccaacttaaatatgatgatttaca 204  Q
     ||||| ||||||||||||||| |  | | ||||||||| || ||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||| ||| |||| ||||| |||||    
T  8671757 atagaactttcctttcaacttaagtggtactttcttatcgcacaaaacacctgagtctcttctccattttaaccacccagcttgaatacgatgacttaca 8671658  T
Q  205 tatgcgactatttctctgtcattttgtactatgaacccaa-aaatttaaacggtgtaacctgaggtatgatatgacctcccactttcacctcca 297  Q
    | |||  ||||||||  |||||||||||| | | |||||| | |||||||| ||||||| |  |||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  8671657 tctgcttctatttcttcgtcattttgtacgaaggacccaagatatttaaaccgtgtaacttagggtatgatatgatctccaactttcacctcca 8671564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 5 - 297
Target Start/End: Original strand, 43240726 - 43241019
Alignment:
Q  5 gcaacatcctcatctctgatacgctcacttgattctcgcattggttcttaaccgcccaccacttagtatcatacaacattgccggtttgactgttgtctg 104  Q
    |||||||||||||||||| ||| || |||||||||||   |||  |||||||| |||| ||||  |||||||||||||  ||||||  ||||| |||| |    
T  43240726 gcaacatcctcatctctgctacacttacttgattctcatgttgactcttaacctcccaacactccgtatcatacaacaacgccggtcggactgctgtccg 43240825  T
Q  105 gtagaattttcctttcaacttatgcagcattttcttatcacataaaacacatgagtttcttctccatttcaaccacccaacttaaatatgatgatttaca 204  Q
     ||||| ||||||||||||||| |  | | ||||||||  || ||||||| ||||  |||||||||||||||||||||| ||| |||||||||  |||||    
T  43240826 atagaactttcctttcaacttaagtggtactttcttattgcacaaaacacctgaggctcttctccatttcaaccacccagcttgaatatgatggcttaca 43240925  T
Q  205 tatgcgactatttctctgtcattttgtactatgaacccaa-aaatttaaacggtgtaacctgaggtatgatatgacctcccactttcacctcca 297  Q
    | |||  | ||||||| |||||||||||| | | | |||| | |||||||| ||||||| || |||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  43240926 tctgcttccatttctccgtcattttgtacgaaggatccaagatatttaaaccgtgtaacttggggtatgatatgatctccaactttcacctcca 43241019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 30 - 297
Target Start/End: Original strand, 37463237 - 37463503
Alignment:
Q  30 cacttgattctcgcattggttcttaaccgcccaccacttagtatcatacaacattgccggtttgactgttgtctggtagaattttcctttcaacttatgc 129  Q
    ||||||||||| |  ||||||||||||| |||| ||||  ||| |||||||||||||  || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |    
T  37463237 cacttgattcttgtgttggttcttaaccacccaacactctgtaccatacaacattgctagtctgactgttgtctgatagaattttcctttcaacttaatc 37463336  T
Q  130 agcattttcttatcacataaaacacatgagtttcttctccatttcaaccacccaacttaaatatgatgatttacatatgcgactatttctctgtcatttt 229  Q
    ||   ||||||||||| |  ||||| | ||  |||||||||| ||||||||| | ||||||||  ||||| ||||| |||  ||||||||| ||||||||    
T  37463337 agtgctttcttatcacct--aacacctaaggctcttctccatatcaaccacctagcttaaatacaatgatatacatctgcttctatttctccgtcatttt 37463434  T
Q  230 gtactatgaacccaa-aaatttaaacggtgtaacctgaggtatgatatgacctcccactttcacctcca 297  Q
    |||||||| || ||| | |||||||| |||||||  |  ||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  37463435 gtactatggactcaagatatttaaactgtgtaactcggagtatgatatgatctccaactttcacctcca 37463503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 4 - 294
Target Start/End: Original strand, 51441109 - 51441399
Alignment:
Q  4 tgcaacatcctcatctctgatacgctcacttgattctcgcattggttcttaaccgcccaccacttagtatcatacaacattgccggtttgactgttgtct 103  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||   |||  ||||||||||||| ||||  ||| |||||||||  | ||||  ||||| ||||     
T  51441109 tgcaacatcctcatctctgctacactcacttgattctcatgttgactcttaaccgcccaacactccgtaccatacaacaacgtcggtcggactgctgtcc 51441208  T
Q  104 ggtagaattttcctttcaacttatgcagcattttcttatcacataaaacacatgagtttcttctccatttcaaccacccaacttaaatatgatgatttac 203  Q
    | ||||| ||||||||||||||| |  | | ||||||||| || ||||||| ||||  |||||||||||||||||||||| ||| |||||||||  |||     
T  51441209 gatagaactttcctttcaacttaagtggtactttcttatcgca-aaaacacttgaggctcttctccatttcaaccacccagcttgaatatgatggcttag 51441307  T
Q  204 atatgcgactatttctctgtcattttgtactatgaacccaa-aaatttaaacggtgtaacctgaggtatgatatgacctcccactttcacct 294  Q
    || |||  ||||||||| |||||||||||  |   |||||| | |||||||| ||||||| || |||||||||||| |||| ||||||||||    
T  51441308 atctgcttctatttctccgtcattttgtatgaaagacccaagatatttaaactgtgtaacttggggtatgatatgatctccaactttcacct 51441399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 6 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 19936458 - 19936179
Alignment:
Q  6 caacatcctcatctctgatacgctcacttgattctcgcattggttcttaaccgcccaccacttagtatcatacaacattgccggtttgactgttgtctgg 105  Q
    |||||| |||||||| | || ||| | |||||||||   |||||||||||||||||| ||||   || | || |||||||| ||| | |||| |||| |     
T  19936458 caacattctcatctccgctatgcttatttgattctcatgttggttcttaaccgcccaacactctataccctataacattgctggtctaactgctgtccga 19936359  T
Q  106 tagaattttcctttcaacttatgcagcattttcttatcacataaaacacatgagtttcttctccatttcaaccacccaacttaaatatgatgatttacat 205  Q
    || |||||||||||||  ||| || | | |||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||    
T  19936358 tataattttcctttcattttaagcggtactttcttatcacataaaacacttgaggttcttatccatttcaaccacccagcttgaatacgatgatttacat 19936259  T
Q  206 atgcgactatttctctgtca-ttttgtactatgaacccaa-aaatttaaacggtgtaacctgaggtatgatatgacctcc 283  Q
    ||||  |||||||||  ||| ||||||| |||| |||||| | ||||||||  |||||| || |||||||||||| ||||    
T  19936258 atgcttctatttctccttcatttttgtattatggacccaagatatttaaaccatgtaacttggggtatgatatgatctcc 19936179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 5 - 297
Target Start/End: Original strand, 49347738 - 49348032
Alignment:
Q  5 gcaacatcctcatctctgatacgctcacttgattctcgcattggttcttaaccgcccaccacttagtatcatacaacattgccggtttgactgttgtctg 104  Q
    ||||||||||||||| || ||| || |||||||||||   |||  ||||||||||||| ||||| ||| |||||||||  |  |||  ||||| |||| |    
T  49347738 gcaacatcctcatctttgctacacttacttgattctcatgttgactcttaaccgcccaacacttcgtaccatacaacaaggttggtcggactgctgtccg 49347837  T
Q  105 gtagaattttcctttcaacttatgcagcattttcttatcacataaaacacatgagtttcttctccatttcaaccacccaacttaaatatgatgatttaca 204  Q
     |||| |||||||||||||||| |  | | ||||||||| || ||||||| ||||  |||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||  |||||    
T  49347838 atagatttttcctttcaacttaagtggtactttcttatcgcacaaaacacctgaggctcttctccatttcaaccacccagcttgaatacgatggcttaca 49347937  T
Q  205 tatgcgactatttctctgtcattttgtactatgaacccaa-aaatttaaa-cggtgtaacctgaggtatgatatgacctcccactttcacctcca 297  Q
      |||  ||||||||| |||||||||||| | | |||||| | ||||||| | ||||||| || |||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  49347938 cctgcttctatttctccgtcattttgtacgaaggacccaagatatttaaaccagtgtaacttggggtatgatatgatctccaactttcacctcca 49348032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 5 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 1210682 - 1210389
Alignment:
Q  5 gcaacatcctcatctctgatacgctcacttgattctcgcattggttcttaaccgcccaccacttagtatcatacaacattgccggtttgactgttgtctg 104  Q
    |||||||||||||||||| ||| || |||||||||||   |||  ||||||||||||| ||||  ||| |||||||||  ||||||   |||| |||| |    
T  1210682 gcaacatcctcatctctgctacacttacttgattctcatgttgactcttaaccgcccaacactccgtaccatacaacaacgccggtcgaactgctgtccg 1210583  T
Q  105 gtagaattttcctttcaacttatgcagcattttcttatcacataaaacacatgagtttcttctccatttcaaccacccaacttaaatatgatgatttaca 204  Q
     ||||| ||||||||||||||| |  | | ||||||||| || ||||||| | ||  |||||| ||||||||||||||| ||| |||| ||||  |||||    
T  1210582 atagaactttcctttcaacttaagtggtactttcttatcgcacaaaacacctcaggctcttcttcatttcaaccacccagcttgaatacgatggcttaca 1210483  T
Q  205 tatgcgactatttctctgtcattttgtactatgaacccaaaa-atttaaacggtgtaacctgaggtatgatatgacctcccactttcacctcca 297  Q
    | |||   ||||||||  ||||||||||| |   |||||| | |||||||| ||||||| || |||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  1210482 tctgcttttatttctccatcattttgtacgaaagacccaagatatttaaactgtgtaacttggggtatgatatgatctccaactttcacctcca 1210389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 5 - 233
Target Start/End: Original strand, 30202475 - 30202703
Alignment:
Q  5 gcaacatcctcatctctgatacgctcacttgattctcgcattggttcttaaccgcccaccacttagtatcatacaacattgccggtttgactgttgtctg 104  Q
    |||||||||||||||||| ||| || |||||||||||   |||  ||||||||||||| ||||  ||| || ||||||  ||||||  |||||||||| |    
T  30202475 gcaacatcctcatctctgctacacttacttgattctcatgttgactcttaaccgcccaacactctgtaccacacaacaacgccggtcggactgttgtccg 30202574  T
Q  105 gtagaattttcctttcaacttatgcagcattttcttatcacataaaacacatgagtttcttctccatttcaaccacccaacttaaatatgatgatttaca 204  Q
     ||||| ||||||||||||||| |  | | ||||||||| || ||||||| ||||  |||||||||||||||||||||  ||| |||| ||||  |||||    
T  30202575 atagaactttcctttcaacttaagtggtactttcttatcgcacaaaacacctgaggctcttctccatttcaaccacccggcttgaatacgatggcttaca 30202674  T
Q  205 tatgcgactatttctctgtcattttgtac 233  Q
    | |||  ||||||||| ||||||||||||    
T  30202675 tctgcttctatttctccgtcattttgtac 30202703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 67; E-Value: 9e-30
Query Start/End: Original strand, 6 - 184
Target Start/End: Original strand, 9599740 - 9599918
Alignment:
Q  6 caacatcctcatctctgatacgctcacttgattctcgcattggttcttaaccgcccaccacttagtatcatacaacattgccggtttgactgttgtctgg 105  Q
    ||||||||||||||||| |||||| |||||||| | |  |||||||| |||||| || ||||| ||||||||| |||| || ||| ||||||  |||||     
T  9599740 caacatcctcatctctgctacgcttacttgattattgtgttggttctcaaccgcacaacactttgtatcataccacatcgctggtctgactgcggtctga 9599839  T
Q  106 tagaattttcctttcaacttatgcagcattttcttatcacataaaacacatgagtttcttctccatttcaaccacccaa 184  Q
    |||||||||| |||||||| | || | | |||||||||||||||||||| ||||  |||| ||||||| ||||||||||    
T  9599840 tagaattttcatttcaactgaagcggtactttcttatcacataaaacacttgaggctcttatccatttaaaccacccaa 9599918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 62; E-Value: 8e-27
Query Start/End: Original strand, 106 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 27445734 - 27445545
Alignment:
Q  106 tagaattttcctttcaacttatgcagcattttcttatcacataaaacacatgagtttcttctccatttcaaccacccaacttaaatatgatgatttacat 205  Q
    ||||| ||||||||||| ||| |  | | ||||||||||||||||||||  |    |||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||    
T  27445734 tagaactttcctttcaatttaagtggtactttcttatcacataaaacactcggaactcttctccatttcaaccaaccaacttgaatacgatgatttacat 27445635  T
Q  206 atgcgactatttctctgtcattttgtactatgaacccaa-aaatttaaacggtgtaacctgaggtatgatatgacctcccactttcacct 294  Q
     |||  |||||||||  ||||||||||||||| |||||| | | |||||| ||||||| || ||||||||| || |||| ||||||||||    
T  27445634 ctgcttctatttctccatcattttgtactatggacccaacataattaaaccgtgtaacttggggtatgataagatctccaactttcacct 27445545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 62; E-Value: 8e-27
Query Start/End: Original strand, 5 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 51601995 - 51601702
Alignment:
Q  5 gcaacatcctcatctctgatacgctcacttgattctcgcattggttcttaaccgcccaccacttagtatcatacaacattgccggtttgactgttgtctg 104  Q
    ||||||||||||| |||  ||| || |||||||||||   |||  |||||||| |||| ||||  ||| |||||||||  ||||||  ||||  |||| |    
T  51601995 gcaacatcctcatatctactacacttacttgattctcatgttgactcttaaccacccaacactccgtaccatacaacaacgccggtcggactactgtccg 51601896  T
Q  105 gtagaattttcctttcaacttatgcagcattttcttatcacataaaacacatgagtttcttctccatttcaaccacccaacttaaatatgatgatttaca 204  Q
     ||||| |||| |||||||||| |  | | |||||||||  | ||||||| ||||  ||||||| ||||| |||||||| ||| |||| ||||  |||||    
T  51601895 atagaactttcatttcaacttaaggggtactttcttatcgaacaaaacacctgagactcttctctatttccaccacccagcttgaatacgatggcttaca 51601796  T
Q  205 tatgcgactatttctctgtcattttgtactatgaacccaaaa-atttaaacggtgtaacctgaggtatgatatgacctcccactttcacctcca 297  Q
    | |||  ||||||||| |||||||||||| | | |||||| | |||||||| ||||||| || |||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  51601795 tctgcttctatttctccgtcattttgtacgaaggacccaagatatttaaaccgtgtaacttggggtatgatatgatctccaactttcacctcca 51601702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 5 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 9592671 - 9592479
Alignment:
Q  5 gcaacatcctcatctctgatacgctcacttgattctcgcattggttcttaaccgcccaccacttagtatcatacaacattgccggtttgactgttgtctg 104  Q
    |||||||||||||||||| ||| || |||||||||||   ||| |||||||||||||| ||||  ||| |||||||||  | | || ||||| ||||| |    
T  9592671 gcaacatcctcatctctgctacacttacttgattctcatgttgattcttaaccgcccaacactccgtaccatacaacaacgtcagtctgactattgtccg 9592572  T
Q  105 gtagaattttcctttcaacttatgcagcattttcttatcacataaaacacatgagtttcttctccatttcaaccacccaacttaaatatgatg 197  Q
     ||||| ||||||||||||||| |  | | ||||||||| || |||||||  |||  |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  9592571 atagaactttcctttcaacttaagtggtactttcttatcgcacaaaacacccgagactcttctccatttcaaccacccaacttgaatacgatg 9592479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 162 - 295
Target Start/End: Original strand, 32066773 - 32066904
Alignment:
Q  162 tcttctccatttcaaccacccaacttaaatatgatgatttacatatgcgactatttctctgtcattttgtactatgaacccaaaa-atttaaacggtgta 260  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||| |||| |||||||||||| |||   |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  32066773 tcttctccattttaaccatccaacttgaatacgatgatttacatttgcttttatttctctgtcattttgtactatgaacccaaaatatttaaactgtgta 32066872  T
Q  261 acctgaggtatgatatgacctcccactttcacctc 295  Q
    || |   ||||||||||| |||| | |||||||||    
T  32066873 actt---gtatgatatgatctccaattttcacctc 32066904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 5 - 126
Target Start/End: Complemental strand, 15085871 - 15085750
Alignment:
Q  5 gcaacatcctcatctctgatacgctcacttgattctcgcattggttcttaaccgcccaccacttagtatcatacaacattgccggtttgactgttgtctg 104  Q
    |||||||||||||||| | ||| || |||| | |||||  |||| ||||||||||||| ||||  ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  15085871 gcaacatcctcatctccgctacacttactttactctcgtgttggctcttaaccgcccaacactccgtaccatacaacattgccggtttgactgctgtctg 15085772  T
Q  105 gtagaattttcctttcaactta 126  Q
     ||||| |||||||||| ||||    
T  15085771 atagaactttcctttcagctta 15085750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 9 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 22090027 - 22089831
Alignment:
Q  9 catcctcatctctgatacgctcacttgattctcgcattggttcttaaccgcccaccacttagtatcatacaacattgccggtttgactgttgtctggtag 108  Q
    |||||||||||||| ||| || |||||||||||   |||  ||||||||||||| ||||  ||| || ||||||  ||||||  ||||| |||| | |||    
T  22090027 catcctcatctctgctacacttacttgattctcatgttgactcttaaccgcccaacactccgtaccacacaacaacgccggtcggactgctgtccgatag 22089928  T
Q  109 aattttcctttcaacttatgcagcattttcttatcacataaaacacatgagtttcttctccatttcaaccacccaacttaaatatgatgatttacat 205  Q
    || ||||||||||||||| |  | ||||||||||  || ||||||  ||||  |||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||| ||||||    
T  22089927 aactttcctttcaacttaagtggtattttcttattgcacaaaacatctgagactcttctccatttcaaccacccagcttgaatacgatgacttacat 22089831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 5 - 192
Target Start/End: Original strand, 46226627 - 46226814
Alignment:
Q  5 gcaacatcctcatctctgatacgctcacttgattctcgcattggttcttaaccgcccaccacttagtatcatacaacattgccggtttgactgttgtctg 104  Q
    |||||||| ||||||| | ||  || ||||||||||||  |||||| ||||  || || || || ||| |||||||||| | |  | |||| ||||||||    
T  46226627 gcaacatcatcatctccgctaaacttacttgattctcgtgttggttgttaattgctcaacatttcgtaccatacaacatcgtcactatgacagttgtctg 46226726  T
Q  105 gtagaattttcctttcaacttatgcagcattttcttatcacataaaacacatgagtttcttctccatttcaaccacccaacttaaata 192  Q
     ||||||||| ||||||||||| |||  | ||||||| |||||||||||| |||   |||||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  46226727 atagaatttttctttcaacttaagcactactttcttagcacataaaacacttgatgctcttctccatttcaaccatccaacttgaata 46226814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 135 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 51234421 - 51234319
Alignment:
Q  135 tttcttatcacataaaacacatgagtttcttctccatttcaaccacccaacttaaatatgatgatttacatatgcgactatttctctgtcattttgtact 234  Q
    |||| |||||||||||| || ||||  | |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||  | |||||||  |||||||| |||    
T  51234421 tttcgtatcacataaaagacctgaggctattctccatttcaaccacccaacttgaatttgatgatttacatctgcttcaatttctccatcattttgcact 51234322  T
Q  235 atg 237  Q
    |||    
T  51234321 atg 51234319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 5 - 126
Target Start/End: Complemental strand, 696206 - 696085
Alignment:
Q  5 gcaacatcctcatctctgatacgctcacttgattctcgcattggttcttaaccgcccaccacttagtatcatacaacattgccggtttgactgttgtctg 104  Q
    |||||||||||||||| | ||| || |||| | |||||  |||| |||||||| |||| ||||  ||| ||||||||||||||||| |||||| |||| |    
T  696206 gcaacatcctcatctccgctacacttactttactctcgtgttggctcttaaccacccaacactccgtaccatacaacattgccggtctgactgctgtccg 696107  T
Q  105 gtagaattttcctttcaactta 126  Q
     ||||| |||||||||| ||||    
T  696106 atagaactttcctttcagctta 696085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 11 - 229
Target Start/End: Original strand, 11331415 - 11331633
Alignment:
Q  11 tcctcatctctgatacgctcacttgattctcgcattggttcttaaccgcccaccacttagtatcatacaacattgccggtttgactgttgtctggtagaa 110  Q
    |||||||||| | || ||| |||||||||| |  ||||||| || |||| || ||||  ||| |||||||||| | |  | ||| ||||||||| || ||    
T  11331415 tcctcatctccgctatgctaacttgattcttgtgttggttcctagccgcacaacactctgtaccatacaacatcgtcaatctgattgttgtctgatataa 11331514  T
Q  111 ttttcctttcaacttatgcagcattttcttatcacataaaacacatgagtttcttctccatttcaaccacccaacttaaatatgatgatttacatatgcg 210  Q
    ||||||||||||||||  ||| |  || |||||||||||||||| |  |    |||||||||| ||||| ||||||||||   | | |||||||| |||     
T  11331515 ttttcctttcaacttaatcagtacatttttatcacataaaacacctacggccattctccatttaaaccatccaacttaaaagcggtaatttacatctgct 11331614  T
Q  211 actatttctctgtcatttt 229  Q
     ||||||||||||||||||    
T  11331615 tctatttctctgtcatttt 11331633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 11 - 229
Target Start/End: Original strand, 11489436 - 11489654
Alignment:
Q  11 tcctcatctctgatacgctcacttgattctcgcattggttcttaaccgcccaccacttagtatcatacaacattgccggtttgactgttgtctggtagaa 110  Q
    |||||||||| | || ||| |||||||||| |  ||||||| || |||| || ||||  ||| |||||||||| | |  | ||| ||||||||| || ||    
T  11489436 tcctcatctccgctatgctaacttgattcttgtgttggttcctagccgcacaacactctgtaccatacaacatcgtcaatctgattgttgtctgatataa 11489535  T
Q  111 ttttcctttcaacttatgcagcattttcttatcacataaaacacatgagtttcttctccatttcaaccacccaacttaaatatgatgatttacatatgcg 210  Q
    ||||||||||||||||  ||| |  || |||||||||||||||| |  |    |||||||||| ||||| ||||||||||   | | |||||||| |||     
T  11489536 ttttcctttcaacttaatcagtacatttttatcacataaaacacctacggccattctccatttaaaccatccaacttaaaagcggtaatttacatctgct 11489635  T
Q  211 actatttctctgtcatttt 229  Q
     ||||||||||||||||||    
T  11489636 tctatttctctgtcatttt 11489654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 9 - 83
Target Start/End: Original strand, 18469429 - 18469503
Alignment:
Q  9 catcctcatctctgatacgctcacttgattctcgcattggttcttaaccgcccaccacttagtatcatacaacat 83  Q
    |||| ||||||| | |||| | ||||||||||||  ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  18469429 catcgtcatctccgctacgtttacttgattctcgtgttggttcttaaccgcccagtacttagtatcatacaacat 18469503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 109 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 7921760 - 7921574
Alignment:
Q  109 aattttcctttcaacttatgcagcattttcttatcacataaaacacatgagtttcttctccatttcaaccacccaacttaaatatgatgatttacatatg 208  Q
    |||||||| ||||||||  |||||| |||||||| |||| ||| || ||||   ||  ||||||||||| ||||||||| |||  |||| ||||||| |     
T  7921760 aattttcccttcaacttgagcagcactttcttattacatgaaatacctgagaccctcatccatttcaacaacccaacttgaattcgatggtttacatctc 7921661  T
Q  209 cgactatttctctgtcattttgtactatgaacccaa-aaatttaaacggtgtaacctgaggtatgatatgacctcccactttcacct 294  Q
    |  |||||||||  || |||||||||||| | |||| | || ||||  ||||||| || |||| ||||||| |||| ||||||||||    
T  7921660 cttctatttctcaatcgttttgtactatggatccaagatatataaatcgtgtaacttgtggtaagatatgatctccaactttcacct 7921574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 5 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 39140450 - 39140313
Alignment:
Q  5 gcaacatcctcatctctgatacgctcacttgattctcgcattggttcttaaccgcccaccacttagtatcatacaacattgccggtttgactgttgtctg 104  Q
    |||||||||||||||||  |||||| |||||||| ||    ||||||||||| ||||| ||| | ||| ||||||||||  ||||| |||||| |||| |    
T  39140450 gcaacatcctcatctctactacgcttacttgattttcatgatggttcttaactgcccaacac-tcgtaccatacaacatcaccggtctgactgctgtccg 39140352  T
Q  105 gtagaattttcctttcaacttatgcagcattttcttatc 143  Q
     |||||||| |||||||| ||| || | | |||||||||    
T  39140351 atagaatttgcctttcaatttaagcggtactttcttatc 39140313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 49 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 41560329 - 41560228
Alignment:
Q  49 ttcttaaccgcccaccacttagtatcatacaacattgccggtttgactgttgtctggtagaattttcctttcaacttatgcagcattttcttatcacata 148  Q
    ||||||||||||||  |||  |||||||||||||| || ||| |||| |   || | ||||||||||||||||||||| || | | ||||||||||||||    
T  41560329 ttcttaaccgcccaatactccgtatcatacaacatcgctggtctgacagcgttcggatagaattttcctttcaacttaagcggtactttcttatcacata 41560230  T
Q  149 aa 150  Q
    ||    
T  41560229 aa 41560228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 135 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 8391577 - 8391521
Alignment:
Q  135 tttcttatcacataaaacacatgagtttcttctccatttcaaccacccaacttaaat 191  Q
    ||||||||| || ||||||| ||||  |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  8391577 tttcttatcgcacaaaacacctgaggctcttctccatttcaaccacccagcttaaat 8391521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 213 - 247
Target Start/End: Original strand, 16273359 - 16273393
Alignment:
Q  213 tatttctctgtcattttgtactatgaacccaaaaa 247  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  16273359 tatttctctgtcattttgtaatatgaacccaaaaa 16273393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 162 - 244
Target Start/End: Original strand, 52640927 - 52641009
Alignment:
Q  162 tcttctccatttcaaccacccaacttaaatatgatgatttacatatgcgactatttctctgtcattttgtactatgaacccaa 244  Q
    |||||| ||||||||| |  |||||| |||| ||| ||||||||||||   ||| ||||||||||||||||| || |||||||    
T  52640927 tcttcttcatttcaacaattcaacttgaatacgataatttacatatgcttttatctctctgtcattttgtaccataaacccaa 52641009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 162 - 236
Target Start/End: Original strand, 52739969 - 52740043
Alignment:
Q  162 tcttctccatttcaaccacccaacttaaatatgatgatttacatatgcgactatttctctgtcattttgtactat 236  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| | || ||||| |||||| | |  ||||||||| |||| ||||||||||    
T  52739969 tcttctccatttcaaccatccaacttgagtaagatgacttacatctacttctatttctccgtcactttgtactat 52740043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 222 - 298
Target Start/End: Original strand, 16142411 - 16142488
Alignment:
Q  222 gtcattttgtactatgaacccaaaa-atttaaacggtgtaacctgaggtatgatatgacctcccactttcacctccat 298  Q
    ||||||||||| ||||||||||| | |||||||  |||| || || | ||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  16142411 gtcattttgtattatgaacccaagatatttaaaatgtgtcacttgggatatgatatgccctcccaccttcacctccat 16142488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 162 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 52421208 - 52421136
Alignment:
Q  162 tcttctccatttcaaccacccaacttaaatatgatgatttacatatgcgactatttctctgtcattttgtacta 235  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| |||  ||||||| ||||||||   ||||||| |||| ||||||||||    
T  52421208 tcttctctatttcaaccacccaacttgaattcgatgattaacatatgcttttatttctatgtc-ttttgtacta 52421136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 194 - 297
Target Start/End: Original strand, 35828927 - 35829031
Alignment:
Q  194 gatgatttacatatgcgactatttctctgtcattttgtactatgaacccaa-aaatttaaacggtgtaacctgaggtatgatatgacctcccactttcac 292  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||| |||  ||||||||||| |||||| |  ||||| | | ||||| || |||||||||||| |||   |||||||    
T  35828927 gatgatttacatatgcttctatttctccgtcgctttgtactatggacccaagatgtttaagcagcgtaacttgtggtatgatatgatctctagctttcac 35829026  T
Q  293 ctcca 297  Q
    |||||    
T  35829027 ctcca 35829031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0024 (Bit Score: 98; Significance: 3e-48; HSPs: 1)
Name: scaffold0024
Description:

Target: scaffold0024; HSP #1
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 82662 - 82365
Alignment:
Q  1 cagtgcaacatcctcatctctgatacgctcacttgattctcgcattggttcttaaccgcccaccacttagtatcatacaacattgccggtttgactgttg 100  Q
    |||||||||||||||||||| | | | || |||||||||||   |||| ||||||||||||| ||||  ||| ||||||| || | |||| |||||||||    
T  82662 cagtgcaacatcctcatctccgctgcacttacttgattctcatgttggctcttaaccgcccaacactccgtaccatacaagatcgtcggtctgactgttg 82563  T
Q  101 tctggtagaattttcctttcaacttatgcagcattttcttatcacataaaacacatgagtttcttctccatttcaaccacccaacttaaatatgatgatt 200  Q
    || | ||||| ||||||||||||||| | || | ||||||||| || ||||||||||||  ||||  ||||| |||||||||| ||| |||| |||||||    
T  82562 tccgatagaactttcctttcaacttaaggagtactttcttatcgcacaaaacacatgaggctctttcccattgcaaccacccagcttgaatacgatgatt 82463  T
Q  201 tacatatgcgactatttctctgtcattttgtactatgaacccaa-aaatttaaacggtgtaacctgaggtatgatatgacctcccactttcacctcca 297  Q
    ||||| |||  ||||||||| |||||||| ||||||| |||||| | |||||||| ||||||| || |||||||||| | |||| |||||| ||||||    
T  82462 tacatctgcttctatttctccgtcattttttactatggacccaagatatttaaaccgtgtaacttgtggtatgatataatctccaactttcgcctcca 82365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 98; Significance: 3e-48; HSPs: 29)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 9 - 297
Target Start/End: Original strand, 36565590 - 36565879
Alignment:
Q  9 catcctcatctctgatacgctcacttgattctcgcattggttcttaaccgcccaccacttagtatcatacaacattgccggtttgactgttgtctggtag 108  Q
    |||||||||||||| ||| || |||||||||||  ||||  ||||||||||||| ||||  ||| |||||||||  |||||| |||||| |||| | |||    
T  36565590 catcctcatctctgctacacttacttgattctcatattgactcttaaccgcccaacactccgtaccatacaacaacgccggtctgactgctgtccgatag 36565689  T
Q  109 aattttcctttcaacttatgcagcattttcttatcacataaaacacatgagtttcttctccatttcaaccacccaacttaaatatgatgatttacatatg 208  Q
    || ||||||||||||||| |  | | ||||||||| || ||||||| ||||  |||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||  |||||| ||    
T  36565690 aactttcctttcaacttaagtggtactttcttatcgcacaaaacacctgaggctcttctccatttcaaccacccagcttgaatacgatggcttacatctg 36565789  T
Q  209 cgactatttctctgtcattttgtactatgaacccaa-aaatttaaacggtgtaacctgaggtatgatatgacctcccactttcacctcca 297  Q
    |  ||||||||| |||||||||||| | | |||||| | |||||||| ||||||| || |||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  36565790 cttctatttctccgtcattttgtacaaaggacccaagatatttaaaccgtgtaacttggggtatgatatgatctccaactttcacctcca 36565879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 5 - 297
Target Start/End: Original strand, 42854349 - 42854642
Alignment:
Q  5 gcaacatcctcatctctgatacgctcacttgattctcgcattggttcttaaccgcccaccacttagtatcatacaacattgccggtttgactgttgtctg 104  Q
    |||||||| ||||||| | ||| || |||| | |||||  |||| ||||||||||||| ||||  ||| |||||||||||| |||| |||||| |||| |    
T  42854349 gcaacatcgtcatctccgctacactaactttactctcgtgttggctcttaaccgcccaacactccgtaccatacaacattgtcggtctgactgctgtccg 42854448  T
Q  105 gtagaattttcctttcaacttatgcagcattttcttatcacataaaacacatgagtttcttctccatttcaaccacccaacttaaatatgatgatttaca 204  Q
     |||||||||||||||| |||| |  | | ||||||||| || ||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||    
T  42854449 atagaattttcctttcagcttaagtggtactttcttatcgcacaaaacacatgaggctcttctccatttcaaccacccagcttgaatacgatgatttaca 42854548  T
Q  205 tatgcgactatttctctgtcattttgtactatgaacccaa-aaatttaaacggtgtaacctgaggtatgatatgacctcccactttcacctcca 297  Q
    | |||  |||||||||   |||||||||| ||| |||||| | |||||||| ||||||| || |||||||||||| ||||  ||||||||||||    
T  42854549 tctgcttctatttctcaaacattttgtacgatggacccaagatatttaaaccgtgtaacttggggtatgatatgatctccacctttcacctcca 42854642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 74 - 297
Target Start/End: Original strand, 4032909 - 4033132
Alignment:
Q  74 catacaacattgccggtttgactgttgtctggtagaattttcctttcaacttatgcagcattttcttatcacataaaacacatgagtttcttctccattt 173  Q
    |||||||| ||| |||| ||||||||||| | || || ||||||||||||||| |  | | ||||||||| || ||||||| ||||  ||||||||||||    
T  4032909 catacaac-ttgtcggtctgactgttgtccgataaaactttcctttcaacttaagtggtactttcttatcgcacaaaacacctgaggctcttctccattt 4033007  T
Q  174 caaccacccaacttaaatatgatgatttacatatgcgactatttctctgtcattttgtactatgaacccaa-aaatttaaacggtgtaacctgaggtatg 272  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||   ||||||||  ||||| |||||||||||||||| | | |||||| ||||||| || ||||||    
T  4033008 caaccacccaacttgaatatgatgatttacatatgcttttatttctccatcattgtgtactatgaacccaagatacttaaaccgtgtaacttggggtatg 4033107  T
Q  273 atatgacctcccactttcacctcca 297  Q
    |||||| |||| ||||||| |||||    
T  4033108 atatgatctccaactttcatctcca 4033132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 74; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 5 - 297
Target Start/End: Original strand, 12492187 - 12492480
Alignment:
Q  5 gcaacatcctcatctctgatacgctcacttgattctcgcattggttcttaaccgcccaccacttagtatcatacaacattgccggtttgactgttgtctg 104  Q
    ||||||||||||| |||| ||| || || ||||||||   |||  ||||||||||||| ||||  ||| ||| |||||  ||||||  ||| | |||| |    
T  12492187 gcaacatcctcatatctgctacacttacatgattctcatgttgactcttaaccgcccaacactccgtaccatgcaacaacgccggtcggacggctgtccg 12492286  T
Q  105 gtagaattttcctttcaacttatgcagcattttcttatcacataaaacacatgagtttcttctccatttcaaccacccaacttaaatatgatgatttaca 204  Q
     ||||| |||||||||| |||| |  | | ||||||||| || ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| | |||| |||   |||||    
T  12492287 atagaactttcctttcatcttaagtggtactttcttatcgcacaaaacacatgaggctcttctccatttcaaccacccaacctgaatacgatagcttaca 12492386  T
Q  205 tatgcgactatttctctgtcattttgtactatgaacccaa-aaatttaaacggtgtaacctgaggtatgatatgacctcccactttcacctcca 297  Q
    | |||  ||||||||| |||||||||||| | | |||||| | |||||||| ||||||| || |||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  12492387 tctgcttctatttctccgtcattttgtacgaaggacccaagatatttaaaccgtgtaacttggggtatgatatgatctccaactttcacctcca 12492480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 106 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 13984870 - 13984698
Alignment:
Q  106 tagaattttcctttcaacttatgcagcattttcttatcacataaaacacatgagtttcttctccatttcaaccacccaacttaaatatgatgatttacat 205  Q
    |||||||||||||| ||||||  ||  |||||||||||||||||||||| ||||  |||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  13984870 tagaattttccttttaacttaaacaatattttcttatcacataaaacacttgaggctcttcttcatttcaaccatccaacttaaatacgatgatttacat 13984771  T
Q  206 atgcgactatttctctgtcattttgtactatgaacccaa-aaatttaaacggtgtaacctgaggtatgatatga 278  Q
     |||   ||||||| ||||||||| ||||||| |||||| | |||||||| ||||| | || ||||||||||||    
T  13984770 ctgcttttatttctttgtcatttt-tactatggacccaagatatttaaaccgtgtatcttggggtatgatatga 13984698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 5 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 18125112 - 18124881
Alignment:
Q  5 gcaacatcctcatctctgatacgctcacttgattctcgcattggttcttaaccgcccaccacttagtatcatacaacattgccggtttgactgttgtctg 104  Q
    ||||||| |||||||| | ||| || |||||||||||   |||| ||||||||||||| ||||  ||| ||||||||||||  ||| ||||||||||| |    
T  18125112 gcaacatgctcatctccgctacacttacttgattctcatgttggctcttaaccgcccaacactccgtaccatacaacattgttggtctgactgttgtccg 18125013  T
Q  105 gtagaattttcctttcaacttatgcagcattttcttatcacataaaacacatgagtttcttctccatttcaaccacccaacttaaatatgatgatttaca 204  Q
     ||||| |||||||||||| || |  | | |||||||||||||||||||| |||| || ||||||||||||||||  || ||| |||  ||||| |||||    
T  18125012 atagaactttcctttcaac-taagtggtactttcttatcacataaaacacctgaggtttttctccatttcaaccattcagcttgaattcgatgagttaca 18124914  T
Q  205 tatgcgactatttctctgtcattttgtactatg 237  Q
    | |||  |||||||||  |||||||||| ||||    
T  18124913 tctgcttctatttctccatcattttgtattatg 18124881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 62; E-Value: 8e-27
Query Start/End: Original strand, 106 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 29735645 - 29735460
Alignment:
Q  106 tagaattttcctttcaacttatgcagcattttcttatcacataaaacacatgagtttcttctccatttcaaccacccaacttaaatatgatgatttacat 205  Q
    |||||||||| |||||||||| ||||   ||||||| || |||| ||||||||  | | ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  29735645 tagaattttcatttcaacttaagcagtgctttcttaccagataacacacatgaact-catctccatttcaaccacccaacttgaataagatgatttacat 29735547  T
Q  206 atgcgactatttctctgtcattttgtactatgaacccaaaaatttaaacggtgtaacctgaggtatgatatgacctcccactttcacctccat 298  Q
    ||||  ||||||||| ||||||||| |||||| ||       ||||||  || |||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  29735546 atgcttctatttctccgtcattttgaactatggac------gtttaaatcgtataacttggggtatgatatgatctcccactttcacctccat 29735460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 6 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 25300173 - 25299961
Alignment:
Q  6 caacatcctcatctctgatacgctcacttgattctcgcattggttcttaaccgcccaccacttagtatcatacaacattgccggtttgactgttgtctgg 105  Q
    |||||||||||| |||| ||| || | ||||||||||  |||| ||||||||||||| ||||  ||| |||||||||| ||||||   |||||||| ||     
T  25300173 caacatcctcatatctgctacacttatttgattctcgtgttggctcttaaccgcccaacactccgtagcatacaacatcgccggtcgaactgttgtgtga 25300074  T
Q  106 tagaattttcctttcaacttatgcagcattttcttatcacataaaacacatgagtttcttctccatttcaaccacccaacttaaatatgatgatttacat 205  Q
    ||||| |||||||||||||||    | | ||||||||| || ||||||| ||||  ||||||||||||||| | |||  |||  ||| ||||||||||||    
T  25300073 tagaactttcctttcaacttaattggtactttcttatcgcacaaaacacctgaggctcttctccatttcaaaccccctgcttgcatacgatgatttacat 25299974  T
Q  206 atgcgactatttc 218  Q
    ||||  |||||||    
T  25299973 atgcttctatttc 25299961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 6 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 25288838 - 25288613
Alignment:
Q  6 caacatcctcatctctgatacgctcacttgattctcgcattggttcttaaccgcccaccacttagtatcatacaacattgccggtttgactgttgtctgg 105  Q
    |||||||||||| |||| ||| || | ||||||||||  |||| ||||||||||||| ||||  ||| |||||||||| ||||||   |||||||| ||     
T  25288838 caacatcctcatatctgctacacttatttgattctcgtgttggctcttaaccgcccaacactccgtagcatacaacatcgccggtcgaactgttgtgtga 25288739  T
Q  106 tagaattttcctttcaacttatgcagcattttcttatcacataaaacacatgagtttcttctccatttcaacca--cccaacttaaatatgatgatttac 203  Q
    ||||| |||||||||||||||    | | ||||||||| || ||||||| ||||  ||||||||||||||| ||  |||  |||  ||| ||||||||||    
T  25288738 tagaactttcctttcaacttaattggtactttcttatcgcacaaaacacctgaggctcttctccatttcaaacaccccctgcttgcatacgatgatttac 25288639  T
Q  204 atatgcgactatttctctgtcatttt 229  Q
    ||||||  ||||||| | ||||||||    
T  25288638 atatgcttctatttccccgtcatttt 25288613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 85 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 25439393 - 25439249
Alignment:
Q  85 gccggtttgactgttgtctggtagaattttcctttcaacttatgcagcattttcttatcacataaaacacatgagtttcttctccatttcaaccacccaa 184  Q
    |||||| |||||||||| || ||||| ||||||||||||||| |  | | |||||||||||| |||||||  |||  |||||||||||||||||| ||      
T  25439393 gccggtctgactgttgtgtgatagaactttcctttcaacttaagtggtactttcttatcacacaaaacacccgagactcttctccatttcaaccatcctg 25439294  T
Q  185 cttaaatatgatgatttacatatgcgactatttctctgtcatttt 229  Q
    |||  ||| ||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||    
T  25439293 cttgcatacgatgatttacatatgcttctatttctccgtcatttt 25439249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 106 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 36544988 - 36544796
Alignment:
Q  106 tagaattttcctttcaacttatgcagcattttcttatcacataaaacacatgagtttcttctccatttcaaccacccaacttaaatatgatgatttacat 205  Q
    ||||| |||| |||||||||| |  | | ||||||||| || ||||||| ||||  |||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||    
T  36544988 tagaactttcttttcaacttaagtggtactttcttatcgcacaaaacacctgaggctcttatccatttcaaccacccaacttgaatacgatgacttacat 36544889  T
Q  206 atgcgactatttctctgtcattttgtactatgaaccca-aaaatttaaacggtgtaacctgaggtatgatatgacctcccactttcacctcca 297  Q
     |||  ||||||||| |||||||||||| |    ||||  | ||||||||  |||||| || |||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  36544888 ctgcttctatttctccgtcattttgtacgaaagccccatgatatttaaaccttgtaacttggggtatgatatgatctccaactttcacctcca 36544796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 5 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 37077702 - 37077502
Alignment:
Q  5 gcaacatcctcatctctgatacgctcacttgattctcgcattggttcttaaccgcccaccacttagtatcatacaacattgccggtttgactgttgtctg 104  Q
    |||||||||||||||| |  || || ||||||||||||  |||| ||||||| ||||| ||||  ||| |||||| ||| | |||| |||||||||||||    
T  37077702 gcaacatcctcatctccgccacacttacttgattctcgtgttggctcttaactgcccaacactccgtaccatacagcatcgacggtctgactgttgtctg 37077603  T
Q  105 gtagaattttcctttcaacttatgcagcattttcttatcacataaaacacatgagtttcttctccatttcaaccacccaacttaaatatgatgatttaca 204  Q
      | || || |||||||||||| |  | | || ||||||||| ||||||| ||||  |||||||||||||||||||  | ||| |||| |||||||||||    
T  37077602 acataacttccctttcaacttaagtggtacttacttatcacacaaaacacctgagactcttctccatttcaaccacttagcttgaatacgatgatttaca 37077503  T
Q  205 t 205  Q
    |    
T  37077502 t 37077502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 5 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 39946794 - 39946602
Alignment:
Q  5 gcaacatcctcatctctgatacgctcacttgattctcgcattggttcttaaccgcccaccacttagtatcatacaacattgccggtttgactgttgtctg 104  Q
    |||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||  |||  ||||||||||||| || |  ||| |||||||||| |||||  |||||| |||| |    
T  39946794 gcaacatcctcatctctgctacacttacttgattctcgtgttgactcttaaccgcccaacattccgtaccatacaacatcgccggcctgactgctgtccg 39946695  T
Q  105 gtagaattttcctttcaacttatgcagcattttcttatcacataaaacacatgagtttcttctccatttcaaccacccaacttaaatatgatg 197  Q
     ||||| ||||||||||| ||| |  | | ||||||||| || ||||||| | ||  |||||||||||||||||| ||| ||| |||| ||||    
T  39946694 atagaactttcctttcaatttaagtggtactttcttatcgcacaaaacacctaaggctcttctccatttcaaccatccagcttgaatacgatg 39946602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 6 - 298
Target Start/End: Original strand, 15215617 - 15215909
Alignment:
Q  6 caacatcctcatctctgatacgctcacttgattctcgcattggttcttaaccgcccaccacttagtatcatacaacattgccggtttgactgttgtctgg 105  Q
    ||||||||||||||| | | | || |||| | |||||  |||| ||||||||||||| ||||  ||| |||||||||||  |||| |||||  |||  |     
T  15215617 caacatcctcatctccgcttcacttactttactctcgtgttggctcttaaccgcccaacactccgtaccatacaacattttcggtctgactactgttcga 15215716  T
Q  106 tagaattttcctttcaacttatgcagcattttcttatcacataaaacacatgagtttcttctccatttcaaccacccaacttaaatatgatgatttacat 205  Q
    ||||| |||||||||| |||| |    | ||||||| | || || ||||  |||  |||||||||||||||||||| | ||| |||| ||||||||||||    
T  15215717 tagaactttcctttcagcttaagtgatactttcttaccgcacaagacactggaggctcttctccatttcaaccacctagcttgaatacgatgatttacat 15215816  T
Q  206 atgc-gactatttctctgtcattttgtactatgaacccaa-aaatttaaacggtgtaacctgaggtatgatatgacctcccactttcacctccat 298  Q
     |||   |||||  ||||||| ||||||||||| |||||| | |||||||| ||||||| |  |||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  15215817 ctgctttctatt--tctgtcactttgtactatggacccaatatatttaaaccgtgtaactttgggtatgatatgatctccaactttcacctccat 15215909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 99 - 187
Target Start/End: Original strand, 6510855 - 6510944
Alignment:
Q  99 tgtctggtagaattttcctttcaacttatgcagcattttcttatcacat-aaaacacatgagtttcttctccatttcaaccacccaactt 187  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||||| |||| | ||||||||||||| ||| ||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||    
T  6510855 tgtctgttagaactttcctttcaacttaagcagtactttcttatcacatcaaaccacatgagactcttctccatttcaaccactcaactt 6510944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 140 - 295
Target Start/End: Original strand, 28300588 - 28300741
Alignment:
Q  140 tatcacataaaacacatgagtttcttctccatttcaaccacccaacttaaatatgatgatttacatatgcgactatttctctgtcattttgtactatgaa 239  Q
    ||||||||||||||   |||| ||||||||| || ||||| ||||||| |||| |||||| ||||| |||   ||| |||| |||||||||||| |||||    
T  28300588 tatcacataaaacatccgagtctcttctccaatttaaccatccaacttgaatacgatgatgtacatctgcttttatatctcagtcattttgtaccatgaa 28300687  T
Q  240 cccaa-aaatttaaacggtgtaacctgaggtatgatatgacctcccactttcacctc 295  Q
    ||||| | |||||||| ||||||| |   ||||||||||| ||||  ||||||||||    
T  28300688 cccaagatatttaaactgtgtaactt---gtatgatatgatctccagctttcacctc 28300741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 74 - 278
Target Start/End: Original strand, 8879848 - 8880053
Alignment:
Q  74 catacaacattgccggtttgactgttgtctggtagaattttcctttcaacttatgcagcattttcttatcacataaaacacatgagtttcttctccattt 173  Q
    |||||||||| |  ||| |||||| |||| | ||||| ||| ||||||||||| |  | | ||||||||| || ||||||| | || |||||||| ||||    
T  8879848 catacaacatagtaggtctgactgctgtccgatagaacttttctttcaacttaagtggtactttcttatcgcacaaaacacctaaggttcttctctattt 8879947  T
Q  174 caaccacccaacttaaatatgatgatttacatatgcgactatttctctgtcattttgtactatgaacccaa-aaatttaaacggtgtaacctgaggtatg 272  Q
    |||||| ||||| | |||| |||| | | ||| ||   |||||||||  |||||||||||||||| ||||| | |||||||| ||||||| || | ||||    
T  8879948 caaccatccaacatgaatacgatgctattcatctggttctatttctccttcattttgtactatgagcccaagatatttaaaccgtgtaacttgggatatg 8880047  T
Q  273 atatga 278  Q
    ||||||    
T  8880048 atatga 8880053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 147 - 275
Target Start/End: Original strand, 19293767 - 19293896
Alignment:
Q  147 taaaacacatgagtttcttctccatttcaaccacccaacttaaatatgatgatttacatatgcgactatttctctgtcattttgtactatgaacccaa-a 245  Q
    ||||| |||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| |||   | ||||||||| |||||||||| || ||| || |    
T  19293767 taaaagacatgagactattctccatttcaaccacccaacttaaatacgattatttacatctgcttttttttctctgtgattttgtactctggaccaaaga 19293866  T
Q  246 aatttaaacggtgtaacctgaggtatgata 275  Q
     |||||||| |||||| ||| ||| |||||    
T  19293867 tatttaaaccgtgtaatctggggtttgata 19293896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 143 - 262
Target Start/End: Original strand, 33830716 - 33830836
Alignment:
Q  143 cacataaaacacatgagtttcttctccatttcaaccacccaacttaaatatgatgatttacatatgcgactatttctctgtcattttgtactatgaaccc 242  Q
    |||||||||||| ||||  |||||  ||||| ||||| ||||||| || | ||||||||||||||||   |||||||  |||||||||||| ||| ||||    
T  33830716 cacataaaacacttgagactcttcaacattttaaccatccaacttgaacacgatgatttacatatgcttttatttcttcgtcattttgtacaatggaccc 33830815  T
Q  243 aaaa-atttaaacggtgtaac 262  Q
    |||| |||||||| |||||||    
T  33830816 aaaatatttaaactgtgtaac 33830836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 5 - 119
Target Start/End: Original strand, 18752218 - 18752332
Alignment:
Q  5 gcaacatcctcatctctgatacgctcacttgattctcgcattggttcttaaccgcccaccacttagtatcatacaacattgccggtttgactgttgtctg 104  Q
    ||||||| |||||||| | ||| || |||| | |||||  |||| ||||||||| ||| ||||  ||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |    
T  18752218 gcaacattctcatctccgctacacttactttactctcgtgttggctcttaaccgtccagcactccgtaccatacaacattgccggtctgactgttgtccg 18752317  T
Q  105 gtagaattttccttt 119  Q
     ||||| ||||||||    
T  18752318 atagaactttccttt 18752332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 147 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 38667352 - 38667255
Alignment:
Q  147 taaaacacatgagtttcttctccatttcaaccacccaacttaaatatgatgatttacatatgcgactatttctctgtcattttgtactatgaacccaa 244  Q
    |||||||||| ||  ||| ||| |||||||||| ||||||| |||| |||||||||||| | |   ||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  38667352 taaaacacattaggctctactctatttcaaccatccaactttaatacgatgatttacatcttcttttatttctctatcgttttgtactatgaacccaa 38667255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 135 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 13589247 - 13589163
Alignment:
Q  135 tttcttatcacataaaacacatgagtttcttctccatttcaaccacccaacttaaatatgatgatttacatatgcgactatttct 219  Q
    ||||||||  |||||||||||| ||  |||||||||||||||||| ||| ||| |||||| |||||| |||||||  ||||||||    
T  13589247 tttcttatagcataaaacacatcaggctcttctccatttcaaccatccaccttgaatatggtgattttcatatgcttctatttct 13589163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 140 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 35601799 - 35601703
Alignment:
Q  140 tatcacataaaacacatgagtttcttctccatttcaaccacccaacttaaatatgatgatttacatatgcgactatttctctgtcattttgtactatg 237  Q
    ||||||| ||||||| ||||  ||||||||||||| | ||||||| || |||  ||| |||||||| | || ||||||||||||||||||||| ||||    
T  35601799 tatcacacaaaacacttgagagtcttctccatttctatcacccaa-ttgaattcgataatttacatctacgtctatttctctgtcattttgtattatg 35601703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 133 - 181
Target Start/End: Original strand, 10824561 - 10824609
Alignment:
Q  133 attttcttatcacataaaacacatgagtttcttctccatttcaaccacc 181  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||    
T  10824561 attttcgtatcacataaaacacctgagactcttctccatttcaaccacc 10824609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 140 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 43732406 - 43732359
Alignment:
Q  140 tatcacataaaacacatgagtttcttctccatttcaaccacccaactt 187  Q
    ||||||||| ||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  43732406 tatcacatataacacttgagactcttctccatttcaaccacccaactt 43732359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 5 - 126
Target Start/End: Original strand, 36395295 - 36395419
Alignment:
Q  5 gcaacatcctcatctctgatacg---ctcacttgattctcgcattggttcttaaccgcccaccacttagtatcatacaacattgccggtttgactgttgt 101  Q
    |||||||||||||||||| |||    || |||||||||||   |||  ||||||||||||| ||||  ||| |||||||||  ||||||  ||||| |||    
T  36395295 gcaacatcctcatctctgctacaacacttacttgattctcatgttgactcttaaccgcccaacactccgtaccatacaacaacgccggtcggactgctgt 36395394  T
Q  102 ctggtagaattttcctttcaactta 126  Q
    | | ||||| |||||||||||||||    
T  36395395 ccgatagaactttcctttcaactta 36395419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 133 - 206
Target Start/End: Original strand, 44681549 - 44681622
Alignment:
Q  133 attttcttatcacataaaacacatgagtttcttctccatttcaaccacccaacttaaatatgatgatttacata 206  Q
    |||||| ||||||||| ||||| |||   ||||||||||||||| ||| |||||| |||| | |||||||||||    
T  44681549 attttcgtatcacatagaacacttgatgctcttctccatttcaaacactcaacttgaatacgctgatttacata 44681622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 135 - 179
Target Start/End: Original strand, 30113671 - 30113715
Alignment:
Q  135 tttcttatcacataaaacacatgagtttcttctccatttcaacca 179  Q
    |||||||||||||||||||| || |  ||||||||||||||||||    
T  30113671 tttcttatcacataaaacacctgcgactcttctccatttcaacca 30113715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 109 - 181
Target Start/End: Original strand, 45231195 - 45231267
Alignment:
Q  109 aattttcctttcaacttatgcagcattttcttatcacataaaacacatgagtttcttctccatttcaaccacc 181  Q
    |||||| | ||||||||| |||  | ||| ||||||||||||| |||||||  |||||||||| |||||||||    
T  45231195 aatttttcgttcaacttaagcaatacttttttatcacataaaatacatgagactcttctccatctcaaccacc 45231267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 93; Significance: 3e-45; HSPs: 27)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 50 - 297
Target Start/End: Original strand, 46356241 - 46356489
Alignment:
Q  50 tcttaaccgcccaccacttagtatcatacaacattgccggtttgactgttgtctggtagaattttcctttcaacttatgcagcattttcttatcacataa 149  Q
    ||||||||||||| ||||  ||| ||||||||| ||||||| |||||  |||| | ||||| ||||||||||||||| | || | ||||||||| || ||    
T  46356241 tcttaaccgcccaacactccgtaccatacaacaatgccggtctgactactgtccgatagaactttcctttcaacttaagtagtactttcttatcgcacaa 46356340  T
Q  150 aacacatgagtttcttctccatttcaaccacccaacttaaatatgatgatttacatatgcgactatttctctgtcattttgtactatgaacccaa-aaat 248  Q
    ||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||  |||||| |||  ||||||||| |||||||||||| | | |||||| | ||    
T  46356341 aacacctgaggctcttctccatttcaaccacccaacttgaatacgatggcttacatctgcttctatttctccgtcattttgtacaaaggacccaagatat 46356440  T
Q  249 ttaaacggtgtaacctgaggtatgatatgacctcccactttcacctcca 297  Q
    |||||| ||||||| || |||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  46356441 ttaaaccgtgtaacttggggtatgatatgatctccaactttcacctcca 46356489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 45 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 38606902 - 38606651
Alignment:
Q  45 ttggttcttaaccgcccaccacttagtatcatacaacattgccggtttgactgttgtctggtagaattttcctttcaacttatgcagcattttcttatca 144  Q
    |||| ||||||||||||| ||||  ||| ||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||| |||||||||| |||| |  | | |||||||||     
T  38606902 ttggctcttaaccgcccaacactccgtaccatacaacattgccggtctgactgttgtccgatagaactttcctttcagcttaagtggtactttcttatcg 38606803  T
Q  145 cataaaacacatgagtttcttctccatttcaaccacccaacttaaatatgatgatttacatatgcgactatttctctgtcattttgtactatgaacccaa 244  Q
    || ||||||| | ||  |||||||||||||||||||||| ||| |||| |||| ||||||| |||  ||||||||  |||||||||||||||| ||||||    
T  38606802 cacaaaacacctaaggctcttctccatttcaaccacccagcttgaatacgatggtttacatctgcttctatttcttcgtcattttgtactatggacccaa 38606703  T
Q  245 -aaatttaaacggtgtaacctgaggtatgatatgacctcccactttcacctc 295  Q
     | |||||||| ||||||| || | |||||||||| |||| |||||||||||    
T  38606702 gatatttaaaccgtgtaacttgggatatgatatgatctccaactttcacctc 38606651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 5 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 31005160 - 31004868
Alignment:
Q  5 gcaacatcctcatctctgatacgctcacttgattctcgcattggttcttaaccgcccaccacttagtatcatacaacattgccggtttgactgttgtctg 104  Q
    |||||||||||||||||| ||| || |||||||||||   |||  ||||||||||| | ||||  ||| |||||||||  ||||||  ||||| |||| |    
T  31005160 gcaacatcctcatctctgctacacttacttgattctcatgttgactcttaaccgcctaacactccgtaccatacaacaacgccggtcggactgctgtccg 31005061  T
Q  105 gtagaattttcctttcaacttatgcagcattttcttatcacataaaacacatgagtttcttctccatttcaaccacccaacttaaatatgatgatttaca 204  Q
     ||||| ||||||||||||||| |  | | ||||||||| || ||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||  |||||    
T  31005060 atagaactttcctttcaacttaagtggtactttcttatcgcacaaaacacctgaggctcttctccatttcaaccacccaacttgaatacgatggcttaca 31004961  T
Q  205 tatgcgactatttctctgtcattttgtactatgaacccaa-aaatttaaacggtgtaacctgaggtatgatatgacctcccactttcacctcca 297  Q
    | |||  ||||||||| |||||||||||| | | | |||| | |||||||| ||||||| || |||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  31004960 tctgcttctatttctccgtcattttgtacgaaggagccaagatatttaaac-gtgtaacttggggtatgatatgatctccaactttcacctcca 31004868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 5 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 36651931 - 36651638
Alignment:
Q  5 gcaacatcctcatctctgatacgctcacttgattctcgcattggttcttaaccgcccaccacttagtatcatacaacattgccggtttgactgttgtctg 104  Q
    |||||||||||||||||| ||| || |||||||||||   |||  ||||||||||||| ||||  ||| |||||||||  ||||||  || || |||| |    
T  36651931 gcaacatcctcatctctgttacacttacttgattctcatgttgactcttaaccgcccaacactccgtaccatacaacaacgccggtcggattgctgtccg 36651832  T
Q  105 gtagaattttcctttcaacttatgcagcattttcttatcacataaaacacatgagtttcttctccatttcaaccacccaacttaaatatgatgatttaca 204  Q
     ||||| ||||||||||||||| |  | | ||||||||| || ||||||| ||||  |||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||  |||||    
T  36651831 atagaactttcctttcaacttaagtggtactttcttatcgcacaaaacacctgaggctcttctccatttcaaccacccagcttgaatacgatggcttaca 36651732  T
Q  205 tatgcgactatttctctgtcattttgtactatgaacccaa-aaatttaaacggtgtaacctgaggtatgatatgacctcccactttcacctcca 297  Q
    | |||  ||||||||| |||||||||||| | | |||||| | |||||||| | ||||| || |||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  36651731 tctgcttctatttctccgtcattttgtacgaaggacccaagatatttaaaccgcgtaacttggggtatgatatgatctccaactttcacctcca 36651638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 5 - 297
Target Start/End: Original strand, 33350151 - 33350444
Alignment:
Q  5 gcaacatcctcatctctgatacgctcacttgattctcgcattggttcttaaccgcccaccacttagtatcatacaacattgccggtttgactgttgtctg 104  Q
    |||||||||||||||||| ||| || |||||||||||   |||  ||||||||||||| ||||  ||| |||||||||  ||||||  ||||| |||| |    
T  33350151 gcaacatcctcatctctgctacacttacttgattctcatgttgactcttaaccgcccaacactccgtaccatacaacaacgccggtcggactgctgtccg 33350250  T
Q  105 gtagaattttcctttcaacttatgcagcattttcttatcacataaaacacatgagtttcttctccatttcaaccacccaacttaaatatgatgatttaca 204  Q
     ||||| |||||| |||||||| |  | | ||||||||| || ||||||| ||||  |||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||  |||||    
T  33350251 atagaactttcctgtcaacttaagtggtactttcttatcgcacaaaacacttgaggctcttctccatttcaaccacccagcttgaatacgatggcttaca 33350350  T
Q  205 tatgcgactatttctctgtcattttgtac-tatgaacccaaaaatttaaacggtgtaacctgaggtatgatatgacctcccactttcacctcca 297  Q
    | |||  ||||||||| ||||||||||||  | || || | | |||||||| ||||||| || |||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  33350351 tctgcttctatttctccgtcattttgtacgaaagaccctagatatttaaaccgtgtaacttggggtatgatatgatctccaactttcacctcca 33350444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 77; E-Value: 9e-36
Query Start/End: Original strand, 5 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 43281613 - 43281389
Alignment:
Q  5 gcaacatcctcatctctgatacgctcacttgattctcgcattggttcttaaccgcccaccacttagtatcatacaacattgccggtttgactgttgtctg 104  Q
    |||||||||||||| | | ||| || |||| | ||| || |||| ||||||||||||| ||||  ||| |||||||||||||||||||||||| |||| |    
T  43281613 gcaacatcctcatccccgctacacttactttactcttgcgttggctcttaaccgcccaacactctgtaccatacaacattgccggtttgactgctgtccg 43281514  T
Q  105 gtagaattttcctttcaacttatgcagcattttcttatcacataaaacacatgagtttcttctccatttcaaccacccaacttaaatatgatgatttaca 204  Q
     ||||| |||||||||| |||| |  | | ||||||||| || ||||| | ||||  |||||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||    
T  43281513 atagaactttcctttcagcttaagtggtactttcttatcgcacaaaacgcctgaggctcttctccatttcaaccacccagcttgaatacgatgatttaca 43281414  T
Q  205 tatgcgactatttctctgtcatttt 229  Q
    | |||  ||||||||| ||||||||    
T  43281413 tctgcttctatttctccgtcatttt 43281389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 74; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 5 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 11593897 - 11593604
Alignment:
Q  5 gcaacatcctcatctctgatacgctcacttgattctcgcattggttcttaaccgcccaccacttagtatcatacaacattgccggtttgactgttgtctg 104  Q
    |||||||||||||||||| ||| || |||||||||||   |||  ||||||||| ||| ||||  ||| |||||||||  ||||||   ||||||||| |    
T  11593897 gcaacatcctcatctctgctacacttacttgattctcatgttgactcttaaccgtccaacactccgtaccatacaacaacgccggtcgaactgttgtccg 11593798  T
Q  105 gtagaattttcctttcaacttatgcagcattttcttatcacataaaacacatgagtttcttctccatttcaaccacccaacttaaatatgatgatttaca 204  Q
     ||||| ||||||||||||||| |  | | ||| ||||| || ||||||| ||||  |||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||  |||||    
T  11593797 atagaactttcctttcaacttaagtggtacttttttatcgcacaaaacacctgaggctcttctccatttcaaccacccagcttgaatacgatggcttaca 11593698  T
Q  205 tatgcgactatttctctgtcattttgtactatgaacccaa-aaatttaaacggtgtaacctgaggtatgatatgacctcccactttcacctcca 297  Q
    | |||  |||||||||  ||||||||||| | | |||||| | |||||||| || |||| || |||||||||||| || | |||||||||||||    
T  11593697 tctgcttctatttctccatcattttgtacgaaggacccaagatatttaaaccgtctaacttggggtatgatatgatcttcaactttcacctcca 11593604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 5 - 233
Target Start/End: Original strand, 35906546 - 35906774
Alignment:
Q  5 gcaacatcctcatctctgatacgctcacttgattctcgcattggttcttaaccgcccaccacttagtatcatacaacattgccggtttgactgttgtctg 104  Q
    |||||||||||||||||| ||| || |||||||||||   |||  |||||||| |||| ||||  |||||||||||||  ||||||  ||||| |||| |    
T  35906546 gcaacatcctcatctctgctacacttacttgattctcatgttgactcttaaccacccaacactccgtatcatacaacaacgccggtcggactgctgtccg 35906645  T
Q  105 gtagaattttcctttcaacttatgcagcattttcttatcacataaaacacatgagtttcttctccatttcaaccacccaacttaaatatgatgatttaca 204  Q
     ||||| ||||||||||||||| |  | | ||||||||| || ||||||| |||   |||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||  |||||    
T  35906646 atagaactttcctttcaacttaagtggtactttcttatcgcacaaaacacctgaagatcttctccatttcaaccacccagcttgaatacgatggcttaca 35906745  T
Q  205 tatgcgactatttctctgtcattttgtac 233  Q
    | |||  ||||||||| ||||||||||||    
T  35906746 tctgcttctatttctccgtcattttgtac 35906774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 6 - 297
Target Start/End: Original strand, 36869635 - 36869927
Alignment:
Q  6 caacatcctcatctctgatacgctcacttgattctcgcattggttcttaaccgcccaccacttagtatcatacaacattgccggtttgactgttgtctgg 105  Q
    ||||||||||||||||| ||| || ||||||||| ||  |||  |||||  ||| || || |  ||| |||||||||| |||||  ||||||||||| |     
T  36869635 caacatcctcatctctgctacacttacttgattcacgtgttgactcttagtcgctcaacattccgtaccatacaacatcgccggcctgactgttgtccga 36869734  T
Q  106 tagaattttcctttcaacttatgcagcattttcttatcacataaaacacatgagtttcttctccatttcaaccacccaacttaaatatgatgatttacat 205  Q
    ||||| ||||||||||||||| |  | | ||||||||| || ||||| | ||||  |||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||  ||||||    
T  36869735 tagaactttcctttcaacttaagtggtactttcttatcgcacaaaacccctgaggctcttctccatttcaaccacccagcttgaatacgatggcttacat 36869834  T
Q  206 atgcgactatttctctgtcattttgtactatgaacccaa-aaatttaaacggtgtaacctgaggtatgatatgacctcccactttcacctcca 297  Q
     |||   |||||||  |||||||||||||||| | |||| | |||||||| | ||||  || |||||||||||  |||| |||||||||||||    
T  36869835 ctgcttttatttcttcgtcattttgtactatggatccaagatatttaaaccgcgtaatttggggtatgatatgctctccaactttcacctcca 36869927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 113 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 48919217 - 48919035
Alignment:
Q  113 ttcctttcaacttatgcagcattttcttatcacataaaacacatgagtttcttctccatttcaaccacccaacttaaatatgatgatttacatatgcgac 212  Q
    |||||||||||||| |  | | ||||||||| || ||||||| ||||  |||||||||||||||| ||||| ||| |||| ||||||| ||||||||  |    
T  48919217 ttcctttcaacttaaggggtactttcttatcgcacaaaacacctgaggctcttctccatttcaactacccagcttgaatacgatgattcacatatgcttc 48919118  T
Q  213 tatttctctgtcattttgtactatgaacccaaaa-atttaaacggtgtaacctgaggtatgatatgacctcccactttcacct 294  Q
    |||||||| |||||||||||||||| | |||||| |||||||| ||||||| || ||| | |||||| |||| ||||| ||||    
T  48919117 tatttctccgtcattttgtactatggatccaaaatatttaaaccgtgtaacttggggtgtaatatgatctcctacttttacct 48919035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 5 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 34869357 - 34869165
Alignment:
Q  5 gcaacatcctcatctctgatacgctcacttgattctcgcattggttcttaaccgcccaccacttagtatcatacaacattgccggtttgactgttgtctg 104  Q
    |||||||||||||||||  ||| || |||||||||||   |||  ||||||||||||| ||||  ||| |||||||||  |||||| |||||| |||| |    
T  34869357 gcaacatcctcatctctactacacttacttgattctcatgttgactcttaaccgcccaacactccgtaccatacaacaacgccggtctgactgctgtccg 34869258  T
Q  105 gtagaattttcctttcaacttatgcagcattttcttatcacataaaacacatgagtttcttctccatttcaaccacccaacttaaatatgatg 197  Q
     ||||| ||||||||||||||| |  | | ||||||||| || ||||| | ||||  ||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||    
T  34869257 atagaactttcctttcaacttaagtggtactttcttatcgcacaaaacgcctgaggctcttctccaattcaaccacccagcttgaatatgatg 34869165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 74 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 37616784 - 37616560
Alignment:
Q  74 catacaacattgccggtttgactgttgtctggtagaattttcctttcaacttatgcagcattttcttatcacataaaacacatgagtttcttctccattt 173  Q
    ||||||||| || |||| |||||| || | | || || ||||||||||||||| |  | | ||||||||| || ||||||| ||||  ||||||||||||    
T  37616784 catacaacaatgtcggtctgactgctggccgatataactttcctttcaacttaagtggtactttcttatcgcacaaaacacttgaggctcttctccattt 37616685  T
Q  174 caaccacccaacttaaatatgatgatttacatatgcgactatttctctgtcattttgtactatgaacccaa-aaatttaaacggtgtaacctgaggtatg 272  Q
    |||||||||| ||| ||||  |||  |||||| |||  ||||||||| |||||||||||| | | |||||| | |||||||  ||||||| || ||||||    
T  37616684 caaccacccagcttgaatacaatggcttacatctgcttctatttctccgtcattttgtacaaaggacccaagatatttaaatcgtgtaacttggggtatg 37616585  T
Q  273 atatgacctcccactttcacctcca 297  Q
    |||||| ||||  ||||||||||||    
T  37616584 atatgatctccacctttcacctcca 37616560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 5 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 33072891 - 33072666
Alignment:
Q  5 gcaacatcctcatctctgatacgctcacttgattctcgcattggttcttaaccgcccaccacttagtatcatacaacattgccggtttgactgttgtctg 104  Q
    |||||||| ||||||||| ||| || | |||||||||   |||  ||||||||||||| ||||  ||| |||||||||  |||||| | ||||||||| |    
T  33072891 gcaacatcatcatctctgctacacttatttgattctcatgttgactcttaaccgcccaacactctgtaccatacaacaacgccggtctaactgttgtccg 33072792  T
Q  105 gtagaattttcctttcaacttatgcagcattttcttatcacataaaacacatgagtttcttctccatttcaaccacccaacttaaatatgatgatttaca 204  Q
     ||||| |||||||| |||||| |  | | ||||||||| || ||||||| ||||  |||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||  |||||    
T  33072791 atagaactttccttttaacttaagtggtactttcttatcgcacaaaacacttgaggctcttctccatttcaaccatccaacttgaatacgatggcttaca 33072692  T
Q  205 tatgcgactatttctctgtcattttg 230  Q
    | |||  ||| || || |||||||||    
T  33072691 tctgcttctaattatccgtcattttg 33072666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 6 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 7272975 - 7272780
Alignment:
Q  6 caacatcctcatctctgatacgctcacttgattctcgcattggttcttaaccgcccaccacttagtatcatacaacattgccggtttgactgttgtctgg 105  Q
    ||||||||||||||| | ||| || ||||||||||||  |||| ||| ||||||||| ||||  |||||||||||||||| ||||||||||| || | |     
T  7272975 caacatcctcatctccggtacacttacttgattctcgtgttggctctcaaccgcccaacactctgtatcatacaacattgtcggtttgactgctgaccga 7272876  T
Q  106 tagaattttcctttcaacttatgcagcattttcttatcacataaaacacatgagtttcttctccatttcaaccacccaacttaaatatgatgattta 202  Q
    || || |||||| |||||||| |  | | |||||||||||| |||| || ||||  | ||||| || ||||||||||| ||| |||| |||||||||    
T  7272875 tacaactttcctctcaacttaagtggtactttcttatcacacaaaatacctgaggct-ttctcaatctcaaccacccagcttgaatacgatgattta 7272780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 6 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 32630531 - 32630251
Alignment:
Q  6 caacatcctcatctctgatacgctcacttgattctcgcattggttcttaaccgcccaccacttagtatcatacaacattgccggtttgactgttgtctgg 105  Q
    ||||||||||||||| | ||| || |||| | |||||  |||||||||||||||||| ||||  ||| |||||||||||| |||| ||| || |||| |     
T  32630531 caacatcctcatctccgctacacttactttactctcgtgttggttcttaaccgcccagcactccgtaccatacaacattgtcggtctgattgatgtccga 32630432  T
Q  106 tagaattttcctttcaacttatgcagcattttcttatcacataaaacacatgagtttcttctccatttcaaccacccaacttaaatatgatgatttacat 205  Q
    ||||| |||||||||| |||| |    | ||||||||| || |||||||  |||  |||||||||||||||| ||||| ||| |||| ||||||          
T  32630431 tagaactttcctttcagcttaagtgatactttcttatcgcacaaaacactcgaggctcttctccatttcaactacccagcttgaatacgatgat------ 32630338  T
Q  206 atgcgactatttctctgtcattttgtactatgaacccaa-aaatttaaacggtgtaacctgaggtatgatatgacctcccactttcacctcca 297  Q
           || |||||  |||||||||| |||| |||||| | |||||||| ||||||| || |||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  32630337 ------gtaattctccatcattttgtaatatggacccaagatatttaaaccgtgtaacttggggtatgatatgatctccaactttcacctcca 32630251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 162 - 294
Target Start/End: Original strand, 21517827 - 21517959
Alignment:
Q  162 tcttctccatttcaaccacccaacttaaatatgatgatttacatatgcgactatttctctgtcattttgtactatgaacccaa-aaatttaaacggtgta 260  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  | |||||||  |||| ||||||||||||| |||| | |||||||| |||||    
T  21517827 tcttctcgatttcaaccacccaacttgaatatgatgatttacatatgttattatttcttcgtca-tttgtactatgaatccaagatatttaaactgtgta 21517925  T
Q  261 acctgaggtatgatatgacctcccactttcacct 294  Q
    |  |||||||| || ||  |||| ||||||||||    
T  21517926 aattgaggtatcatgtggtctccaactttcacct 21517959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 13 - 297
Target Start/End: Original strand, 39906728 - 39907017
Alignment:
Q  13 ctcatctctgatacgctcacttgattctcgcattggttcttaaccgcccaccacttagtatcatacaacattgccggtttgactgttgtctggtagaatt 112  Q
    |||||||||| ||| || |||||||||||   |||  |||||| |||| | ||||  ||| |||||||||  |||||| |||||| |||| | ||||| |    
T  39906728 ctcatctctgctacacttacttgattctcatgttgactcttaatcgcctaacactccgtaccatacaacaacgccggtctgactgctgtccgatagaact 39906827  T
Q  113 ttcctttcaacttatgcagcattttcttatcacataaaacacatgagtttcttctccatttcaacca----cccaacttaaatatgatgatttacatatg 208  Q
    |||||||||||||| |  | | ||||||||| || ||||||  ||||  ||||||||||||||||||    |||| ||| |||| ||||  || ||| |     
T  39906828 ttcctttcaacttaagtggtactttcttatcgcacaaaacatctgaggctcttctccatttcaaccaaccacccagcttgaatacgatggcttgcatcta 39906927  T
Q  209 cgactatttctctgtcattttgtactatgaacccaaaa-atttaaacggtgtaacctgaggtatgatatgacctcccactttcacctcca 297  Q
    |  ||||||||| |||||||||||| |   |||||| | |||||||| ||||||| || | |||||||||| |||| |||||||||||||    
T  39906928 cttctatttctccgtcattttgtacgaatgacccaagatatttaaaccgtgtaacatgggatatgatatgatctccaactttcacctcca 39907017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 5 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 23404355 - 23404181
Alignment:
Q  5 gcaacatcctcatctctgatacgctcacttgattctcgcattggttcttaaccgcccaccacttagtatcatacaacattgccggtttgactgttgtctg 104  Q
    ||||||||||||| ||  |||| || ||||||||||||   ||| | |||||||||||  |||| ||| ||||||| || | |||| ||||||||||| |    
T  23404355 gcaacatcctcatttccaatacacttacttgattctcgtgctggcttttaaccgcccaaaacttcgtaccatacaatatcgtcggtctgactgttgtccg 23404256  T
Q  105 gtagaattttcctttcaacttatgcagcattttcttatcacataaaacacatgagtttcttctccatttcaacca 179  Q
     ||||||||||||||||||||| |  |   ||||||||| || ||||||| ||||  |||||||||||| |||||    
T  23404255 atagaattttcctttcaacttaagtggtcctttcttatctcagaaaacacctgaggctcttctccattttaacca 23404181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 7 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 49029211 - 49029044
Alignment:
Q  7 aacatcctcatctctgatacgctcacttgattctcgcattggttcttaaccgcccaccacttagtatcatacaacattgccggtttgactgttgtctggt 106  Q
    |||||||||||||||| ||| || |||||||||||   |||  ||||||||||||| ||||  ||| |||||||||   |||||| ||||| |||| | |    
T  49029211 aacatcctcatctctgctacacttacttgattctcatgttgactcttaaccgcccaacactccgtaccatacaacaacaccggttggactgctgtccgat 49029112  T
Q  107 agaattttcctttcaacttatgcagcattttcttatcacataaaacacatgagtttcttctccatttcaacca 179  Q
    |||| |||||||||||     |  | ||||||||||| || ||||||| ||||  ||||||||||||||||||    
T  49029111 agaactttcctttcaa-----gtggtattttcttatcgcacaaaacacctgaggctcttctccatttcaacca 49029044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 6 - 205
Target Start/End: Original strand, 7189579 - 7189777
Alignment:
Q  6 caacatcctcatctctgatacgctcacttgattctcgcattggttcttaaccgcccaccacttagtatcatacaacattgccggtttgactgttgtctgg 105  Q
    |||||||||||||||   || ||| |||||||| | |  ||||||||||||| |||| ||||  ||| |||||||||| | |||| |||||  |||||      
T  7189579 caacatcctcatctccactatgcttacttgatttttgtgttggttcttaaccacccaacactctgtaccatacaacatcgtcggtctgactactgtcta- 7189677  T
Q  106 tagaattttcctttcaacttatgcagcattttcttatcacataaaacacatgagtttcttctccatttcaaccacccaacttaaatatgatgatttacat 205  Q
    || |||||  ||||||| ||| | |  | |||||||||| ||||||||| ||||  | ||||||||||||||||| |||| ||||||  |||||||||||    
T  7189678 taaaatttctctttcaatttaagtaatactttcttatcaaataaaacacctgagacttttctccatttcaaccactcaacataaatacaatgatttacat 7189777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 179 - 236
Target Start/End: Original strand, 24177714 - 24177771
Alignment:
Q  179 acccaacttaaatatgatgatttacatatgcgactatttctctgtcattttgtactat 236  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| |||  ||||||||| |||||||||||||||    
T  24177714 acccaacttgaatatgatgatttacatctgcttctatttctccgtcattttgtactat 24177771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 140 - 244
Target Start/End: Original strand, 23087582 - 23087686
Alignment:
Q  140 tatcacataaaacacatgagtttcttctccatttcaaccacccaacttaaatatgatgatttacatatgcgactatttctctgtcattttgtactatgaa 239  Q
    |||||||||||||| | |||  |||| ||||||||||||| | ||||| ||||  ||||||||||||  |   ||||||||  |||||||||||||||||    
T  23087582 tatcacataaaacagacgaggctcttttccatttcaaccatctaacttgaatacaatgatttacatacacttttatttctccttcattttgtactatgaa 23087681  T
Q  240 cccaa 244  Q
    |||||    
T  23087682 cccaa 23087686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 6 - 126
Target Start/End: Original strand, 12841621 - 12841741
Alignment:
Q  6 caacatcctcatctctgatacgctcacttgattctcgcattggttcttaaccgcccaccacttagtatcatacaacattgccggtttgactgttgtctgg 105  Q
    ||||||||||||||||| ||| || |||||||||||   |||  |||||||| |||| ||||  ||| |||||||||  ||||||  ||||| |||  |     
T  12841621 caacatcctcatctctgctacacttacttgattctcatgttgactcttaaccacccaacactccgtaccatacaacaacgccggtcagactgctgtacga 12841720  T
Q  106 tagaattttcctttcaactta 126  Q
    ||||| |||||||||||||||    
T  12841721 tagaactttcctttcaactta 12841741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 5 - 125
Target Start/End: Original strand, 25579416 - 25579536
Alignment:
Q  5 gcaacatcctcatctctgatacgctcacttgattctcgcattggttcttaaccgcccaccacttagtatcatacaacattgccggtttgactgttgtctg 104  Q
    ||||||||||||||||   |||||| | || |||||||  |||||||||||||||||| || |  ||  |||||||||| |||||| | || | |||| |    
T  25579416 gcaacatcctcatctcctctacgcttattttattctcgtgttggttcttaaccgcccaacattccgttccatacaacatcgccggtcttacagctgtccg 25579515  T
Q  105 gtagaattttcctttcaactt 125  Q
     ||||||||||| ||||||||    
T  25579516 atagaattttcccttcaactt 25579536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 16 - 87
Target Start/End: Original strand, 28628286 - 28628357
Alignment:
Q  16 atctctgatacgctcacttgattctcgcattggttcttaaccgcccaccacttagtatcatacaacattgcc 87  Q
    ||||||| |||||| |||| |||||||  |||||||| ||||||||| ||||| ||  ||||||||||||||    
T  28628286 atctctgctacgcttactttattctcgtgttggttctcaaccgcccaacactttgttccatacaacattgcc 28628357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 141 - 304
Target Start/End: Original strand, 43793524 - 43793685
Alignment:
Q  141 atcacataaaacacatgagtttcttctccatttcaaccacccaacttaaatatgatgatttacatatgcgactatttctctgtcattttgtactatgaac 240  Q
    ||||||||| |||| ||||   || |||||||||||||||| | |||| || ||||| |||||||   |  ||||||||  |||||||||||||||  ||    
T  43793524 atcacataatacacctgaggaactcctccatttcaaccacctagcttagatttgatggtttacat---ctcctatttcttcgtcattttgtactatagac 43793620  T
Q  241 ccaa-aaatttaaacggtgtaacctgaggtatgatatgacctcccactttcacctccatactcga 304  Q
    |||| | |||||||  |||||||  | |||||||||||| |||  ||||||||||| | ||||||    
T  43793621 ccaagatatttaaaatgtgtaactagtggtatgatatgatctctaactttcacctctacactcga 43793685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 212 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 49028997 - 49028911
Alignment:
Q  212 ctatttctctgtcattttgtactatgaacccaaaa-atttaaacggtgtaacctgaggtatgatatgacctcccactttcacctcca 297  Q
    |||||||||  ||||||||||| | | |||||| | |||||||| ||||||| || |||||||| ||| |||| |||||||||||||    
T  49028997 ctatttctccatcattttgtacaaaggacccaagatatttaaaccgtgtaacttggggtatgatctgatctccaactttcacctcca 49028911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0570 (Bit Score: 80; Significance: 2e-37; HSPs: 1)
Name: scaffold0570
Description:

Target: scaffold0570; HSP #1
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 7 - 297
Target Start/End: Original strand, 2617 - 2908
Alignment:
Q  7 aacatcctcatctctgatacgctcacttgattctcgcattggttcttaaccgcccaccacttagtatcatacaacattgccggtttgactgttgtctggt 106  Q
    |||||||||||||||| ||| || |||||||| ||   |||  ||||||||||||| ||||   || |||||||||  | | || |||||| |||| | |    
T  2617 aacatcctcatctctgctacacttacttgattatcatgttgactcttaaccgcccaacactccataccatacaacaacgtcagtctgactgctgtccgat 2716  T
Q  107 agaattttcctttcaacttatgcagcattttcttatcacataaaacacatgagtttcttctccatttcaaccacccaacttaaatatgatgatttacata 206  Q
    |||| ||||||||||||||| |  | | ||||||||| || ||||||| ||||  |||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||| ||||||     
T  2717 agaactttcctttcaacttaagtggtactttcttatcgcacaaaacacctgaggctcttctccatttcaaccacccagcttgaatacgatgacttacatc 2816  T
Q  207 tgcgactatttctctgtcattttgtactatgaacccaa-aaatttaaacggtgtaacctgaggtatgatatgacctcccactttcacctcca 297  Q
    |||  ||||||||  |||||||||||| | | |||||| | |||||||| ||||||| || |||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  2817 tgcttctatttcttcgtcattttgtacgaaggacccaagatatttaaaccgtgtaacttggggtatgatatgatctccaactttcacctcca 2908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0113 (Bit Score: 72; Significance: 9e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold0113
Description:

Target: scaffold0113; HSP #1
Raw Score: 72; E-Value: 9e-33
Query Start/End: Original strand, 135 - 293
Target Start/End: Original strand, 12073 - 12232
Alignment:
Q  135 tttcttatcacataaaacacatgagtttcttctccatttcaaccacccaacttaaatatgatgatttacatatgcgactatttctctgtcattttgtact 234  Q
    ||||||||| || ||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||  ||||||||||  ||||||||| |||||||||||||    
T  12073 tttcttatcgcacaaaacacttgaggttcttctccatttcaacgacccagcttaaatacgatggcttacatatgcttctatttctccgtcattttgtact 12172  T
Q  235 atgaacccaa-aaatttaaacggtgtaacctgaggtatgatatgacctcccactttcacc 293  Q
    ||| |||||| | ||||||||  |||||| || |||||||||||| |||| |||||||||    
T  12173 atggacccaagatatttaaaccatgtaacttggggtatgatatgatctccaactttcacc 12232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0018 (Bit Score: 62; Significance: 8e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold0018
Description:

Target: scaffold0018; HSP #1
Raw Score: 62; E-Value: 8e-27
Query Start/End: Original strand, 5 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 31405 - 31112
Alignment:
Q  5 gcaacatcctcatctctgatacgctcacttgattctcgcattggttcttaaccgcccaccacttagtatcatacaacattgccggtttgactgttgtctg 104  Q
    |||||||||| ||||||| ||| || |||||||||||   |||  |||||||| |||| ||||  ||| | |||||||  |||||| |||||| |||  |    
T  31405 gcaacatcctaatctctgctacacttacttgattctcatgttgactcttaaccacccaacactccgtaccgtacaacaccgccggtctgactgctgttcg 31306  T
Q  105 gtagaattttcctttcaacttatgcagcattttcttatcacataaaacacatgagtttcttctccatttcaaccacccaacttaaatatgatgatttaca 204  Q
     ||||| ||||||||||||||| |  | | ||||||||| || ||||||| ||||  |||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||   ||||    
T  31305 atagaactttcctttcaacttaagtggtactttcttatcgcacaaaacacttgaggctcttctccatttcaaccacccagcttgaatacgatggcctaca 31206  T
Q  205 tatgcgactatttctctgtcattttgtactatgaacccaa-aaatttaaacggtgtaacctgaggtatgatatgacctcccactttcacctcca 297  Q
    | | |   |||||||| |||||||||||| | | |||||| |  ||||||| ||||||| || |||||||||||| |||| |||||||| ||||    
T  31205 tctacttttatttctccgtcattttgtacgaaggacccaagatgtttaaaccgtgtaacttggggtatgatatgatctccaactttcacttcca 31112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0171 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0171
Description:

Target: scaffold0171; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 223 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 5911 - 5836
Alignment:
Q  223 tcattttgtactatgaacccaaaa-atttaaacggtgtaacctgaggtatgatatgacctcccactttcacctcca 297  Q
    |||||||||| | || |||||| | |||||||| ||||||| || |||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  5911 tcattttgtattgtggacccaagatatttaaaccgtgtaacttggggtatgatatgatctccaactttcacctcca 5836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0045 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0045
Description:

Target: scaffold0045; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 164 - 244
Target Start/End: Original strand, 87113 - 87193
Alignment:
Q  164 ttctccatttcaaccacccaacttaaatatgatgatttacatatgcgactatttctctgtcattttgtactatgaacccaa 244  Q
    |||||||||||||||| | ||| | |||||||||| |||||| ||   ||||||||| | |||||| ||||||| ||||||    
T  87113 ttctccatttcaaccatcaaacatgaatatgatgagttacatctgattctatttctccgacattttatactatggacccaa 87193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University