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This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.
| Legend |
| | Query |
| | Query hiting target |
| Query hiting target's complemental strand |
| | Query's complemental strand hiting target |
| Query's complemental strand hiting target's complemental strand |
|
Alignment Overview
Query: NF9582_low_1 (Length: 637)
Name: NF9582_low_1
Description: NF9582
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)
| [»] NF9582_low_1 |
 |  |
|
| [»] scaffold0160 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0037 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0239 (3 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0011 (3 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0427 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0264 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0380 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0154 (2 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold1335 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold1515 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0768 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0060 (3 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0018 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0983 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0444 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0330 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0262 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0009 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0734 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0789 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0027 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0654 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0172 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0459 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0366 (2 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0166 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0130 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0189 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0140 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0533 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0308 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0074 (4 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0007 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0236 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0015 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0496 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0475 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0006 (2 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0001 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0005 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0187 (2 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0024 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0057 (2 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0010 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0939 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0268 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0263 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold1989 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0047 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0034 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
Alignment Details
Target: chr8 (Bit Score: 224; Significance: 1e-123; HSPs: 215)
Name: chr8
Description:
Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 188 - 463
Target Start/End: Complemental strand, 28074545 - 28074270
Alignment:
| Q |
188 |
attactccatccgtcctaaattgtatgtcattttnnnnnnnntatttgtcccaaattgtatgtcactttacaataccaatgaaacattaatgttattttt |
287 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
28074545 |
attactccctccgtcccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttacaataccaatgaaacattaatgttactttt |
28074446 |
T |
 |
| Q |
288 |
cctattataaccttaactatttattactctctcttctttcaagtcttttatttatctttttcataggacaattttgtaaaacaactcataatatctcttt |
387 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
28074445 |
cctattataaccttaactatttattactctctcttctttcaagtcttttatttatcttttccataggacaattttgtaaaacaactcataatatctcttt |
28074346 |
T |
 |
| Q |
388 |
tccacacaatattaattacatttcttaatatgtgtgaaatgcccaaaacgtcatacaatttaggatgaagggagta |
463 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| |
|
|
| T |
28074345 |
tccacacaatattaattacatttcttaatatgtgtgaaatgcccaaaacgtcatacaatttaggacggagggagta |
28074270 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 190 - 463
Target Start/End: Complemental strand, 25838754 - 25838470
Alignment:
| Q |
190 |
tactccatccgtcctaaattgtatgtcattttnnnnnnnntatttgtcccaaattgtatgtcactttacaataccaatgaaacattaatgttatttttcc |
289 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
25838754 |
tactccctccgtcccaaattgtatgtcattttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttacaataccaatgaaacattaatgttatttttcc |
25838655 |
T |
 |
| Q |
290 |
tattataaccttaactatttattactctctcttctttcaagtcttttatttatctttttcat-----------aggacaattttgtaaaacaactcataa |
378 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
25838654 |
tattataaccttaactatttattactctctcttctttcaagtcttttatttatcttttccatattatttattaaggacaattttgtaaaacaactcataa |
25838555 |
T |
 |
| Q |
379 |
tatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatatgtgtgaaatgcccaaaacgtcatacaatttaggatgaagggagta |
463 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||| |
|
|
| T |
25838554 |
tatctcttttccacacgatattaattacatttcttaatatgtgtgaaatgcccaaaacgtcatacaatttgggacggagggagta |
25838470 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 172; E-Value: 4e-92
Query Start/End: Original strand, 197 - 463
Target Start/End: Original strand, 24333015 - 24333292
Alignment:
| Q |
197 |
tccgtcctaaattgtatgtcattttnnnnnnnntatttgtcccaaattgtatgtcactttacaataccaatgaaacattaatgttatttttcctattata |
296 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |
|
|
| T |
24333015 |
tccgtcctaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgacccaaattgtatgtcactttacaataccaatgaaacattaatgttatttttcctatttta |
24333114 |
T |
 |
| Q |
297 |
accttaactatttattactctctcttctttcaagtcttttatttatctttttcat-----------aggacaattttgtaaaacaactcataatatctct |
385 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
24333115 |
accttaactatttattactctatcttctttcaagtcttttatttatctttcccatattatttattaaggacaattttgtaaaacaactcataatatctct |
24333214 |
T |
 |
| Q |
386 |
tttccacacaatattaattacatttcttaatatgtgtgaaatgcccaaaacgtcatacaatttaggatgaagggagta |
463 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| | |||||||| |
|
|
| T |
24333215 |
tttccatacaatattaattacatttcttaatatgtgtgaaatgtccaaaacgtcatacaatttgggacggagggagta |
24333292 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 166; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 187 - 463
Target Start/End: Original strand, 30526154 - 30526441
Alignment:
| Q |
187 |
aattactccatccgtcctaaattgtatgtcattttnnnnnnnntatttgtcccaaattgtatgtcactttacaataccaatgaaacattaatgttatttt |
286 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |
|
|
| T |
30526154 |
aattactccctccgtcctaaattgtatgtcattttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcgctttacaataccaatgaaaaattaatgttacttt |
30526253 |
T |
 |
| Q |
287 |
tcctattataaccttaactatttattactctctcttctttcaagtcttttatttatctttttcata-----------ggacaattttgtaaaacaactca |
375 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| || || |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
30526254 |
tcctattatatccttaacaatttattactctctcttctttcaattccttcatttatctttctcatatcatttattgaggacaattttgtaaaacaactca |
30526353 |
T |
 |
| Q |
376 |
taatatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatatgtgtgaaatgcccaaaacgtcatacaatttaggatgaagggagta |
463 |
Q |
| |
|
|||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| | |||||||| |
|
|
| T |
30526354 |
taatatctctttcccacacaatattaattacatttcttaatatgtgtgaaatgtccaaaacgtcatacaatttgggacggagggagta |
30526441 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 166; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 189 - 465
Target Start/End: Complemental strand, 39169072 - 39168785
Alignment:
| Q |
189 |
ttactccatccgtcctaaattgtatgtcattttnnnnnnnntatttgtcccaaattgtatgtcactttacaataccaatgaaacattaatgttatttttc |
288 |
Q |
| |
|
||||||| ||||| | ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |
|
|
| T |
39169072 |
ttactccctccgttccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttacaataccaatgaaaaattaatgttacttttc |
39168973 |
T |
 |
| Q |
289 |
ctattataaccttaactatttattactctctcttctttcaagtcttttatttatctttttcata-----------ggacaattttgtaaaacaactcata |
377 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
39168972 |
ctattatattcttaactatttattactctctcttctttcaattctttcatttatcttttccatataatttattgaggacaatcttgtaaaacaactcata |
39168873 |
T |
 |
| Q |
378 |
atatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatatgtgtgaaatgcccaaaacgtcatacaatttaggatgaagggagtaat |
465 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| |
|
|
| T |
39168872 |
atatctctttcccacacaatattaattacatttcttaatatgtgtgaaatgcccaaaacgtcatacaatttaggacggagggagtaat |
39168785 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 166; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 230 - 463
Target Start/End: Original strand, 40483767 - 40484000
Alignment:
| Q |
230 |
tatttgtcccaaattgtatgtcactttacaataccaatgaaacattaatgttatttttcctattataaccttaactatttattactctctcttctttcaa |
329 |
Q |
| |
|
|||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
40483767 |
tatttgtctcaaattgtctgctactttacaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattataatcttaactatttattactctatcttctttcaa |
40483866 |
T |
 |
| Q |
330 |
gtcttttatttatctttttcataggacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatatgtgtgaaatgc |
429 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
40483867 |
gtcttttatttatctttttcatatgacaattttgtaaaataactcataatatattttttccacacaatattaattacattttttaatatgtgtgaaatgt |
40483966 |
T |
 |
| Q |
430 |
ccaaaacgtcatacaatttaggatgaagggagta |
463 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||||||| ||| | |||||||| |
|
|
| T |
40483967 |
ccaaaacatcatacaatttgggacggagggagta |
40484000 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 159; E-Value: 2e-84
Query Start/End: Original strand, 188 - 466
Target Start/End: Complemental strand, 30088011 - 30087722
Alignment:
| Q |
188 |
attactccatccgtcctaaattgtatgtcattttnnnnnnnntatttgtcccaaattgtatgtcactttacaataccaatgaaacattaatgttattttt |
287 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| |||| |
|
|
| T |
30088011 |
attactccctccgtcccaaattgtacgtcattttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcgctttacaataccaatgaaaaattaatgttactttt |
30087912 |
T |
 |
| Q |
288 |
cctattataaccttaactatttattactctctcttctttcaagtcttttatttatctttt-----tcat------aggacaattttgtaaaacaactcat |
376 |
Q |
| |
|
||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
30087911 |
cctattatatccttaactatttattactctctcttctttcaattccttcatttatctttcctatatcatttattgaggacaattttgtaaaacaactcat |
30087812 |
T |
 |
| Q |
377 |
aatatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatatgtgtgaaatgcccaaaacgtcatacaatttaggatgaagggagtaatt |
466 |
Q |
| |
|
||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||| |
|
|
| T |
30087811 |
aatatctctttctcacacaatattaattacatttcttaatatgtgtgaaatgcccaaaacgtcatacaatttgggacggagggagtaatt |
30087722 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 152; E-Value: 4e-80
Query Start/End: Original strand, 189 - 463
Target Start/End: Complemental strand, 7427452 - 7427167
Alignment:
| Q |
189 |
ttactccatccgtcctaaattgtatgtcattttnnnnnnnntatttgtcccaaattgtatgtcactttacaataccaatgaaacattaatgttatttttc |
288 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||| ||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |
|
|
| T |
7427452 |
ttactccctccgtcccaaaatgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcgctttacaataccaatgaaaaattaatgttacttttc |
7427353 |
T |
 |
| Q |
289 |
ctattataaccttaactatttattactctctcttctttcaagtcttttatttatctttttcata-----------ggacaattttgtaaaacaactcata |
377 |
Q |
| |
|
|||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
7427352 |
ctattatatccttaactatttattactctctcttctttcaattccttcatttatctttcccatatcatttattgaggacaattttgtaaaacaactcata |
7427253 |
T |
 |
| Q |
378 |
atatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatatgtgtgaaatgcccaaaacgtcatacaatttaggatgaagggagta |
463 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| | |||||||| |
|
|
| T |
7427252 |
atatctctttcccacacaatattaattacatttcttaatatgtgtgaaatgcccaaaacgtcatataatttgggacggagggagta |
7427167 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 151; E-Value: 1e-79
Query Start/End: Original strand, 189 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 2099246 - 2098981
Alignment:
| Q |
189 |
ttactccatccgtcctaaattgtatgtcattttnnnnnnnntatttgtcccaaattgtatgtcactttacaataccaatgaaacattaatgttatttttc |
288 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||| |||||||||| ||||| |
|
|
| T |
2099246 |
ttactccttccgtcccaaattgtatgtcattttagaaaaaatatttgtcccaaattatatgtcgctttacaatatcaatgaaatattaatgttacttttc |
2099147 |
T |
 |
| Q |
289 |
ctattataaccttaactatttattactctctcttctttcaagtcttttatttatctttttcat------aggacaattttgtaaaacaactcataatatc |
382 |
Q |
| |
|
|||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| || || |||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
2099146 |
ctattatatccttaactatttattactctatcttctttcaattccttcatttatctttcccatttattaaggacaattttgtaaaataactcataatatc |
2099047 |
T |
 |
| Q |
383 |
tcttttccacacaatattaattacatttcttaatatgtgtgaaatgcccaaaacgtcatacaattt |
448 |
Q |
| |
|
||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
2099046 |
tctttcccacacaatattaattacatttcttaatatgtgtgaaatgaccaaaacgtcatacaattt |
2098981 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 150; E-Value: 6e-79
Query Start/End: Original strand, 190 - 463
Target Start/End: Original strand, 29938290 - 29938574
Alignment:
| Q |
190 |
tactccatccgtcctaaattgtatgtcattttnnnnnnnntatttgtcccaaattgtatgtcactttacaataccaatgaaacattaatgttatttttcc |
289 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |
|
|
| T |
29938290 |
tactccctccgtcccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcgttttacaataccaatgaaaaattaatgttacttttcc |
29938389 |
T |
 |
| Q |
290 |
tattataaccttaactatttattactctctcttctttcaagtcttttatttatcttt---------ttcat--aggacaattttgtaaaacaactcataa |
378 |
Q |
| |
|
||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||| || || ||||||||||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
29938390 |
tattatatccttaactatttattactctctcttctttcaattccttcatttatctttcctatattatttattgaggacaattttgtaaaacaacccataa |
29938489 |
T |
 |
| Q |
379 |
tatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatatgtgtgaaatgcccaaaacgtcatacaatttaggatgaagggagta |
463 |
Q |
| |
|
||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||| |
|
|
| T |
29938490 |
tatctctttcccacacaatattaattacatttcttaatatgtgtgaaatgcccaaaacgtcatacaatttgggacggagggagta |
29938574 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 149; E-Value: 2e-78
Query Start/End: Original strand, 230 - 465
Target Start/End: Complemental strand, 9268044 - 9267798
Alignment:
| Q |
230 |
tatttgtcccaaattgtatgtcactttacaataccaatgaaacattaatgttatttttcctattataaccttaactatttattactctctcttctttcaa |
329 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
9268044 |
tatttgtcccaaattatatgtcgctttacaataccaatgaaaaattaatgttacttttcctattatatccttaactatttattactctctcttctttcaa |
9267945 |
T |
 |
| Q |
330 |
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418 |
Q |
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9267845 |
T |
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465 |
Q |
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| T |
9267844 |
gtgtgaaatgcccaaaacgtcatacaatttgggacggagggagtaat |
9267798 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 149; E-Value: 2e-78
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Target Start/End: Original strand, 9724627 - 9724869
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332 |
Q |
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ttgtcccaaattatatgtcgctttaaaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttaattatttattactctctcttctttcaattc |
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T |
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421 |
Q |
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| T |
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9724826 |
T |
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422 |
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464 |
Q |
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| T |
9724827 |
tgaaatgcccaaaacgtcatacaatttgggacggagggagtaa |
9724869 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 148; E-Value: 9e-78
Query Start/End: Original strand, 190 - 468
Target Start/End: Original strand, 23606183 - 23606472
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289 |
Q |
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T |
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| Q |
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378 |
Q |
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| T |
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T |
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| Q |
379 |
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468 |
Q |
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| T |
23606383 |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 148; E-Value: 9e-78
Query Start/End: Original strand, 190 - 463
Target Start/End: Original strand, 24616516 - 24616798
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| Q |
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289 |
Q |
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tactccatccgtcccaaattgtatgccattttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttacaataccaatgaaacattaatattacttttcc |
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T |
 |
| Q |
290 |
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378 |
Q |
| |
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| T |
24616616 |
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T |
 |
| Q |
379 |
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463 |
Q |
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| T |
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tatctctttcccacacaatattaattaaatttcttaatatgtgtgaaatgcccaaaacgtcatacaatttgggacggagggagta |
24616798 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 148; E-Value: 9e-78
Query Start/End: Original strand, 230 - 463
Target Start/End: Original strand, 34908720 - 34908965
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328 |
Q |
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T |
 |
| Q |
329 |
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417 |
Q |
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| T |
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34908919 |
T |
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| Q |
418 |
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463 |
Q |
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| T |
34908920 |
tgtgtgaaatgcccaaaacgtcatacaatttgggatggagggagta |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 147; E-Value: 3e-77
Query Start/End: Original strand, 230 - 463
Target Start/End: Original strand, 13429108 - 13429352
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329 |
Q |
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13429207 |
T |
 |
| Q |
330 |
gtcttttatttatctttttcata-----------ggacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatat |
418 |
Q |
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| T |
13429208 |
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13429307 |
T |
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| Q |
419 |
gtgtgaaatgcccaaaacgtcatacaatttaggatgaagggagta |
463 |
Q |
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| T |
13429308 |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 147; E-Value: 3e-77
Query Start/End: Original strand, 181 - 463
Target Start/End: Complemental strand, 38896749 - 38896456
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T |
 |
| Q |
281 |
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Q |
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| T |
38896649 |
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38896550 |
T |
 |
| Q |
370 |
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463 |
Q |
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Back To:
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Target: chr8; HSP #18
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Query Start/End: Original strand, 189 - 465
Target Start/End: Original strand, 5830941 - 5831228
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T |
 |
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289 |
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377 |
Q |
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T |
 |
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465 |
Q |
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5831141 |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 146; E-Value: 1e-76
Query Start/End: Original strand, 190 - 463
Target Start/End: Original strand, 22578205 - 22578489
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Q |
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T |
 |
| Q |
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378 |
Q |
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| T |
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tattatatccttaactatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttccaatataatttattaaggataattttgtaaaacaactcataa |
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T |
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| Q |
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463 |
Q |
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22578405 |
tatctctttcccacacaatattaattacattccttaatatgtgtgaaatgcccaaaacgtcatacaatttgggacggagggagta |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #20
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Query Start/End: Original strand, 230 - 463
Target Start/End: Original strand, 29949137 - 29949382
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| |
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tatttgtcccaaattgtatgtcgttttacaataccagtgaaaaattaatgttacttttcctattatatccttaactatttattactctctcttctttcaa |
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T |
 |
| Q |
330 |
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417 |
Q |
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29949237 |
ttccttcatttatctttcccatatcaatttattgaggacaattttgtaaaacaactcataatatctctttcccacacaatattaattacatttcttaata |
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T |
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| Q |
418 |
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463 |
Q |
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| T |
29949337 |
tgtgtgaaatgcccaaaacgtcatacaatttgggacggagggagta |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 144; E-Value: 2e-75
Query Start/End: Original strand, 190 - 464
Target Start/End: Complemental strand, 35544274 - 35543989
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Q |
| |
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T |
 |
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tattataaccttaactatttattactctctcttctttcaagtcttttatttatctttttcata-----------ggacaattttgtaaaacaactcataa |
378 |
Q |
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| T |
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tattatttccttaactatttattactctctcttctttcaattccttcatttatttttctcatatcatttattgaggacaattttgtaaaacaactcataa |
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T |
 |
| Q |
379 |
tatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatatgtgtgaaatgcccaaaacgtcatacaatttaggatgaagggagtaa |
464 |
Q |
| |
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| T |
35544074 |
tatctctttcccatacaatattaattatatttcttaatatgtgtgaaatgcccaaaacatcgtacaatttgggacgaagggagtaa |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 144; E-Value: 2e-75
Query Start/End: Original strand, 189 - 463
Target Start/End: Original strand, 35631026 - 35631311
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288 |
Q |
| |
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ttactccctccgtcccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattatatgtcactttagaatatcaatgaaacattaatgttacttttc |
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T |
 |
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289 |
ctattataaccttaactatttattactctctcttctttcaagtcttttatttatctttttcata-----------ggacaattttgtaaaacaactcata |
377 |
Q |
| |
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| T |
35631126 |
ctattatatcattaactatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccatattatttattaaggataattttgtaaaacaactcata |
35631225 |
T |
 |
| Q |
378 |
atatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatatgtgtgaaatgcccaaaacgtcatacaatttaggatgaagggagta |
463 |
Q |
| |
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| T |
35631226 |
atatctctttcccacacaatattaattacatttcttaatatgtgtgaaatgcccaaaacgtcatacaatttgggacggagggagta |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 144; E-Value: 2e-75
Query Start/End: Original strand, 190 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 42946701 - 42946433
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289 |
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| |
|
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T |
 |
| Q |
290 |
tattataaccttaactatttattactctctcttctttcaagtcttttatttatctttttcata-----------ggacaattttgtaaaacaactcataa |
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Q |
| |
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T |
 |
| Q |
379 |
tatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatatgtgtgaaatgcccaaaacgtcatacaattt |
448 |
Q |
| |
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| T |
42946502 |
tatctctttcccacacaatattaattacatttcttaatatgtgtgaaatgcccaaaacgtcatacaattt |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 143; E-Value: 8e-75
Query Start/End: Original strand, 190 - 463
Target Start/End: Complemental strand, 18203300 - 18203016
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| |
|
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|
| T |
18203300 |
tactccctccgtcccaaattgtatgtcactttacaaaaataatttgttccaaattgtatgtcactttacaataccaatgaaacattaatgttacttttcc |
18203201 |
T |
 |
| Q |
290 |
tattataaccttaactatttattactctctcttctttcaagtcttttatttatctttttcata-----------ggacaattttgtaaaacaactcataa |
378 |
Q |
| |
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| T |
18203200 |
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T |
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463 |
Q |
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18203100 |
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18203016 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 143; E-Value: 8e-75
Query Start/End: Original strand, 189 - 463
Target Start/End: Original strand, 39284195 - 39284480
Alignment:
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288 |
Q |
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| T |
39284195 |
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39284294 |
T |
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| Q |
289 |
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377 |
Q |
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39284394 |
T |
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| Q |
378 |
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463 |
Q |
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39284480 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 143; E-Value: 8e-75
Query Start/End: Original strand, 230 - 463
Target Start/End: Original strand, 42927155 - 42927399
Alignment:
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329 |
Q |
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tatttgtcctaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttatttttcctattatatccttaactatttattactctttcttttttcaa |
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T |
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418 |
Q |
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42927354 |
T |
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463 |
Q |
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42927355 |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 142; E-Value: 3e-74
Query Start/End: Original strand, 190 - 466
Target Start/End: Complemental strand, 14433430 - 14433143
Alignment:
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Q |
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14433331 |
T |
 |
| Q |
290 |
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378 |
Q |
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| T |
14433330 |
tattatatccttaactatttattactctctcttctttcaattccttcatttatctttcccatatcatttattgaggataattttgtaaaacaactcataa |
14433231 |
T |
 |
| Q |
379 |
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466 |
Q |
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14433230 |
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14433143 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 142; E-Value: 3e-74
Query Start/End: Original strand, 231 - 463
Target Start/End: Original strand, 34356555 - 34356798
Alignment:
| Q |
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330 |
Q |
| |
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T |
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331 |
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419 |
Q |
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| T |
34356655 |
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34356754 |
T |
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| Q |
420 |
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463 |
Q |
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| T |
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tgtgaaatgcccaaaacgtcatacaatttgggacggagggagta |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 141; E-Value: 1e-73
Query Start/End: Original strand, 196 - 463
Target Start/End: Original strand, 36652440 - 36652718
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Q |
| |
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T |
 |
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384 |
Q |
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T |
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| Q |
385 |
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463 |
Q |
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36652640 |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 140; E-Value: 5e-73
Query Start/End: Original strand, 233 - 463
Target Start/End: Complemental strand, 16872598 - 16872357
Alignment:
| Q |
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332 |
Q |
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T |
 |
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421 |
Q |
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| T |
16872498 |
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16872399 |
T |
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| Q |
422 |
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463 |
Q |
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| T |
16872398 |
tgaaatgctcaaaacgtcatacaatttgggacggagggagta |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 140; E-Value: 5e-73
Query Start/End: Original strand, 190 - 464
Target Start/End: Original strand, 19715227 - 19715512
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289 |
Q |
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T |
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378 |
Q |
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| T |
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tattatatccttaattatttattactatttcttctttcaattctttcatttatctttcccatatcatttattaaggataattttgtaaaacaactcataa |
19715426 |
T |
 |
| Q |
379 |
tatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatatgtgtgaaatgcccaaaacgtcatacaatttaggatgaagggagtaa |
464 |
Q |
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| T |
19715427 |
tatttctttcccatacaatattaattatatttcttaatatatgtgaaatgcccaaaacgtcatacaatttgggacggagggagtaa |
19715512 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 139; E-Value: 2e-72
Query Start/End: Original strand, 190 - 463
Target Start/End: Original strand, 5371540 - 5371824
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Q |
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tactccctccgtctcaaattgtatgtcatttttgaaaaaatatttgtcctaaattgtatgtcactttacaataccaataaaacattaatgttacttttcc |
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T |
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| Q |
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378 |
Q |
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T |
 |
| Q |
379 |
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463 |
Q |
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| T |
5371740 |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 139; E-Value: 2e-72
Query Start/End: Original strand, 230 - 463
Target Start/End: Complemental strand, 22453556 - 22453312
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tatttgtcccaaattgtatgtcactttacaataccaatgaaacattaatgttatttttcctattataaccttaactatttattactctctcttctttcaa |
329 |
Q |
| |
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T |
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418 |
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22453357 |
T |
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463 |
Q |
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| T |
22453356 |
gtgtgaaatgcccaaaacatcatataatttgggacggagggagta |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 138; E-Value: 8e-72
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331 |
Q |
| |
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T |
 |
| Q |
332 |
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420 |
Q |
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| T |
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26393860 |
T |
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| Q |
421 |
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452 |
Q |
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| T |
26393859 |
gtgaaatgtccaaaacgtcatataatttagga |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #35
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Q |
| |
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T |
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| Q |
333 |
ttttatttatctttttcata-----------ggacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatatgtg |
421 |
Q |
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| T |
28719825 |
tttcatttatctttcccatattatttattaaggacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaatattaattgcatttcttaatatgtg |
28719924 |
T |
 |
| Q |
422 |
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465 |
Q |
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| T |
28719925 |
tgaaatgcccaaaacgtcatacaatttgagacggagggagtaat |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 137; E-Value: 3e-71
Query Start/End: Original strand, 190 - 465
Target Start/End: Complemental strand, 31873701 - 31873415
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tactccatccgtcctaaattgtatgtcattttnnnnnnnntatttgtcccaaattgtatgtcactttacaataccaatgaaacattaatgttatttttcc |
289 |
Q |
| |
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T |
 |
| Q |
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tattataaccttaactatttattactctctcttctttcaagtcttttatttatctttttcata-----------ggacaattttgtaaaacaactcataa |
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Q |
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31873601 |
tattatatccttaactatttattactctctcttctttcaattccttcatttatctttcccatatcatttattgaggataattttgtaaaacaactcataa |
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T |
 |
| Q |
379 |
tatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatatgtgtgaaatgcccaaaacgtcatacaatttaggatgaagggagtaat |
465 |
Q |
| |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 136; E-Value: 1e-70
Query Start/End: Original strand, 230 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 3598883 - 3598654
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| |
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 |
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gtcttttatttatctttttcata-----------ggacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatat |
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Q |
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T |
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gtgtgaaatgcccaaaacgtcatacaattt |
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gtgtgaaatgcccaaaacgtcatacaattt |
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T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 136; E-Value: 1e-70
Query Start/End: Original strand, 231 - 448
Target Start/End: Original strand, 21545296 - 21545525
Alignment:
| Q |
231 |
atttgtcccaaattgtatgtcactttacaataccaatgaaacattaatgttatttttcctattataaccttaactatttattactctctcttctttcaag |
330 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
21545296 |
atttgtcccaaattatatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttaactatttattactatctcttctttcaat |
21545395 |
T |
 |
| Q |
331 |
tcttttatttatctttttcat-----------aggacaattttgtaaaacaactcataatatc-tcttttccacacaatattaattacatttcttaatat |
418 |
Q |
| |
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| ||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
21545396 |
tatttcatttatctttcccatgttatttattaaggacaattttgtaaaacaactcataatatctttttttccacacaatattaattgcatttcttaatat |
21545495 |
T |
 |
| Q |
419 |
gtgtgaaatgcccaaaacgtcatacaattt |
448 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
21545496 |
gtgtgaaatgcccaaaacgtcatacaattt |
21545525 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 135; E-Value: 5e-70
Query Start/End: Original strand, 190 - 463
Target Start/End: Original strand, 11714438 - 11714722
Alignment:
| Q |
190 |
tactccatccgtcctaaattgtatgtcattttnnnnnnnntatttgtcccaaattgtatgtcactttacaataccaatgaaacattaatgttatttttcc |
289 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |
|
|
| T |
11714438 |
tactccctccgtcccaaattgtatgtcattttagaaaaaatatttgtcctaaattgtatgtcgctttacaataccaatgaaaaattaatgttacttttcc |
11714537 |
T |
 |
| Q |
290 |
tattataaccttaactatttattactctctcttctttcaagtcttttatttatctttttcata-----------ggacaattttgtaaaacaactcataa |
378 |
Q |
| |
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||||||| |||| ||||||||||||| | |||| |||||| || || |||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||| |
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|
| T |
11714538 |
tattatatccttcactatttattactttatcttatttcaattccttcatttatctttcccatatcatttattgaggacaattttgtaaaataactcataa |
11714637 |
T |
 |
| Q |
379 |
tatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatatgtgtgaaatgcccaaaacgtcatacaatttaggatgaagggagta |
463 |
Q |
| |
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||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| | |||||||| |
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|
| T |
11714638 |
tatctctttcccacacaatattaattacatttcttaatatgtgtgaaatgcccaaaacgttatacaatttgggacggagggagta |
11714722 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 135; E-Value: 5e-70
Query Start/End: Original strand, 188 - 452
Target Start/End: Complemental strand, 24422593 - 24422320
Alignment:
| Q |
188 |
attactccatccgtcctaaattgtatgtcattttnnnnnnnntatttgtcccaaattgtatgtcactttacaataccaatgaaacattaatgttattttt |
287 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||||| ||||| ||||||| ||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||| |||| |
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|
| T |
24422593 |
attactccctccgtcccaaattatatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattatatgtcgctttacaataccaatgaaaaattaatattactttt |
24422494 |
T |
 |
| Q |
288 |
cctattataaccttaactatttattactctctcttctttcaagtcttttatttatctttttcata-----------ggacaattttgtaaaacaactcat |
376 |
Q |
| |
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||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| || || |||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
24422493 |
cctattatatccttaactatttattactctctc--ctttcaattccttcatttatctttctcatatcatttattgaggataattttgtaaaacaactcat |
24422396 |
T |
 |
| Q |
377 |
aatatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatatgtgtgaaatgcccaaaacgtcatacaatttagga |
452 |
Q |
| |
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||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
24422395 |
aatatctctttcccacacaatattaattacatttcttaatatgtgtgaaatgccgaaaacgtcatacaatttagga |
24422320 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 135; E-Value: 5e-70
Query Start/End: Original strand, 235 - 448
Target Start/End: Original strand, 37505000 - 37505224
Alignment:
| Q |
235 |
gtcccaaattgtatgtcactttacaataccaatgaaacattaatgttatttttcctattataaccttaactatttattactctctcttctttcaagtctt |
334 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||| |||| |
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|
| T |
37505000 |
gtcccaaattgtatgtcactttataatatcaatgaaacattaatgttacttttcctattatatccttaactatttattactctttcttttttcaattctt |
37505099 |
T |
 |
| Q |
335 |
ttatttatctttttcat-----------aggacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatatgtgtg |
423 |
Q |
| |
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| |||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| |
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|
| T |
37505100 |
tcatttatctttctcatatcatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatatctctttcccacacaatattaattacattttttaatatgtgtg |
37505199 |
T |
 |
| Q |
424 |
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448 |
Q |
| |
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||||||||||||||||||| ||||| |
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|
| T |
37505200 |
aaatgcccaaaacgtcatataattt |
37505224 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 134; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 231 - 463
Target Start/End: Complemental strand, 1513564 - 1513322
Alignment:
| Q |
231 |
atttgtcccaaattgtatgtcactttacaataccaatgaaacattaatgttatttttcctattataaccttaactatttattactctctcttctttcaag |
330 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||| | |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
1513564 |
atttgtcccaaattatatgccgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataactttaactatttattactctatcttctttcaat |
1513465 |
T |
 |
| Q |
331 |
tcttttatttatctttttcata-----------ggacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatatg |
419 |
Q |
| |
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||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
1513464 |
tctttcatttatctttcccatattatatattatggacaattttgtaaaacaactcataatatctattttccacacaatattaattgcatttcttaatatg |
1513365 |
T |
 |
| Q |
420 |
tgtgaaatgcccaaaacgtcatacaatttaggatgaagggagta |
463 |
Q |
| |
|
||| ||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |
|
|
| T |
1513364 |
tgt-aaatgtccaaaacgtcatacaatttgggacgaagggagta |
1513322 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 134; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 233 - 454
Target Start/End: Original strand, 9470850 - 9471082
Alignment:
| Q |
233 |
ttgtcccaaattgtatgtcactttacaataccaatgaaacattaatgttatttttcctattataaccttaactatttattactctctcttctttcaagtc |
332 |
Q |
| |
|
|||||||||||| |||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| || |
|
|
| T |
9470850 |
ttgtcccaaattatatgtcgctttaaaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttaattatttattaccctctcttctttcaattc |
9470949 |
T |
 |
| Q |
333 |
ttttatttatcttt---------ttcat--aggacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatatgtg |
421 |
Q |
| |
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||| |||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
9470950 |
tttcatttatctttcctatattatttattaaggacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccatacaatattaattgcatttcttaatatgtg |
9471049 |
T |
 |
| Q |
422 |
tgaaatgcccaaaacgtcatacaatttaggatg |
454 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
9471050 |
tgaaatgcccaaaacatcatacaatttgggatg |
9471082 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 134; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 231 - 463
Target Start/End: Original strand, 39628883 - 39629126
Alignment:
| Q |
231 |
atttgtcccaaattgtatgtcactttacaataccaatgaaacattaatgttatttttcctattataaccttaactatttattactctctcttctttcaag |
330 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
39628883 |
atttgtcccaaattatatgtcgctttacaatatcaatgcaacattaatgttacttttcctattataactttagttatttattactctctcttctttcaat |
39628982 |
T |
 |
| Q |
331 |
tcttttatttatctttttcata-----------ggacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatatg |
419 |
Q |
| |
|
||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |
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|
| T |
39628983 |
tctttcatttatctttcccatattatttattaaggacaattttgtaaaataactcataatatctcttttccacacaatattaattgcatttcttaatatg |
39629082 |
T |
 |
| Q |
420 |
tgtgaaatgcccaaaacgtcatacaatttaggatgaagggagta |
463 |
Q |
| |
|
||||||||||| ||||||||||||||||| ||| | |||||||| |
|
|
| T |
39629083 |
tgtgaaatgcctaaaacgtcatacaatttgggacggagggagta |
39629126 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 134; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 231 - 463
Target Start/End: Original strand, 39638433 - 39638676
Alignment:
| Q |
231 |
atttgtcccaaattgtatgtcactttacaataccaatgaaacattaatgttatttttcctattataaccttaactatttattactctctcttctttcaag |
330 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
39638433 |
atttgtcccaaattatatgtcgctttacaatatcaatgcaacattaatgttacttttcctattataactttagttatttattactctctcttctttcaat |
39638532 |
T |
 |
| Q |
331 |
tcttttatttatctttttcata-----------ggacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatatg |
419 |
Q |
| |
|
||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
39638533 |
tctttcatttatctttcccatattatttattaaggacaattttgtaaaataactcataatatctcttttccacacaatattaattgcatttcttaatatg |
39638632 |
T |
 |
| Q |
420 |
tgtgaaatgcccaaaacgtcatacaatttaggatgaagggagta |
463 |
Q |
| |
|
||||||||||| ||||||||||||||||| ||| | |||||||| |
|
|
| T |
39638633 |
tgtgaaatgcctaaaacgtcatacaatttgggacggagggagta |
39638676 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 133; E-Value: 8e-69
Query Start/End: Original strand, 190 - 465
Target Start/End: Complemental strand, 600332 - 600046
Alignment:
| Q |
190 |
tactccatccgtcctaaattgtatgtcattttnnnnnnnntatttgtcccaaattgtatgtcactttacaataccaatgaaacattaatgttatttttcc |
289 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||| |||| | |
|
|
| T |
600332 |
tactccctccgtcccaaattgtacgtcattttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcgttttataataccaatgaaatattaatgttactttttc |
600233 |
T |
 |
| Q |
290 |
tattataaccttaactatttattactctctcttctttcaagtcttttatttatctttttcata-----------ggacaattttgtaaaacaactcataa |
378 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| || || |||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
600232 |
tattatatccttaactatttattactccatcttctttcaattccttcatttatctttcccatatcatttattaaggacaattttgtaaaataactcataa |
600133 |
T |
 |
| Q |
379 |
tatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatatgtgtgaaatgcccaaaacgtcatacaatttaggatgaagggagtaat |
465 |
Q |
| |
|
||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||||| |
|
|
| T |
600132 |
tatctctttcccacacaatattaattacatttcttaatatgtgtgaaatggccaaaacgtcatacaatttgagatggagggagtaat |
600046 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 132; E-Value: 3e-68
Query Start/End: Original strand, 230 - 448
Target Start/End: Original strand, 29342746 - 29342975
Alignment:
| Q |
230 |
tatttgtcccaaattgtatgtcactttacaataccaatgaaacattaatgttatttttcctattataaccttaactatttattactctctcttctttcaa |
329 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
29342746 |
tatttgtcccaaattatatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttaactatttattactctcttttctttcaa |
29342845 |
T |
 |
| Q |
330 |
gtcttttatttatctttttcat-----------aggacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatat |
418 |
Q |
| |
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|
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| T |
29342846 |
ttctttcatttatttttcccatgttatttattaaggacaattttgtaaaacaactcataatatatcttttctacacaatattaattgcattccttaatat |
29342945 |
T |
 |
| Q |
419 |
gtgtgaaatgcccaaaacgtcatacaattt |
448 |
Q |
| |
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|||||||||| ||||||||||||||||||| |
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|
| T |
29342946 |
gtgtgaaatgtccaaaacgtcatacaattt |
29342975 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 132; E-Value: 3e-68
Query Start/End: Original strand, 230 - 463
Target Start/End: Complemental strand, 42192467 - 42192222
Alignment:
| Q |
230 |
tatttgtcccaaattgtatgtcactttacaataccaatgaaacattaatgttatttttcctattataaccttaactatttattactctctcttcttt-ca |
328 |
Q |
| |
|
||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| | || ||| || |
|
|
| T |
42192467 |
tatttgtcctaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatccttaactatttattactctttatttttttca |
42192368 |
T |
 |
| Q |
329 |
agtcttttatttatctttttcata-----------ggacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaatattaattacatttcttaata |
417 |
Q |
| |
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| ||||| |||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
42192367 |
attctttcatttatctttctcatatcatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatatctctttccgacacaatattaattacatttcttaata |
42192268 |
T |
 |
| Q |
418 |
tgtgtgaaatgcccaaaacgtcatacaatttaggatgaagggagta |
463 |
Q |
| |
|
||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||| |
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|
| T |
42192267 |
tgtatgaaatgcccaaaacgtcatacaatttgggacggagggagta |
42192222 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 132; E-Value: 3e-68
Query Start/End: Original strand, 230 - 464
Target Start/End: Complemental strand, 44263348 - 44263103
Alignment:
| Q |
230 |
tatttgtcccaaattgtatgtcactttacaataccaatgaaacattaatgttatttttcctattataaccttaactatttattactctctcttctttcaa |
329 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
44263348 |
tatttgtcccaaattatatgtcgctttacaatactaatgcaactttaatgttatttttcgtattataaccttcactatttattactctcttttctttcaa |
44263249 |
T |
 |
| Q |
330 |
gtcttttatttatctttttcata-----------ggacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatat |
418 |
Q |
| |
|
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|
| T |
44263248 |
ttctttcatttatctttcccatattatttattaaggacaattttgtaaaacaacttataatatctcttttccacacaatattaattgcatttcttaatat |
44263149 |
T |
 |
| Q |
419 |
gtgtgaaatgcccaaaacgtcatacaatttaggatgaagggagtaa |
464 |
Q |
| |
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||||||| ||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||| |
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|
| T |
44263148 |
atgtgaaaggcccaaaacgtcatacaatttgggacggagggagtaa |
44263103 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 130; E-Value: 5e-67
Query Start/End: Original strand, 233 - 465
Target Start/End: Original strand, 28712378 - 28712621
Alignment:
| Q |
233 |
ttgtcccaaattgtatgtcactttacaataccaatgaaacattaatgttatttttcctattataaccttaactatttattactctctcttctttcaagtc |
332 |
Q |
| |
|
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|
| T |
28712378 |
ttgtcccaaattatatgttgctttaaaatatcaatgcaacattaatgttatttttcctattataaccttgattatttattactctctcttctttcaattc |
28712477 |
T |
 |
| Q |
333 |
ttttatttatctttttcata-----------ggacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatatgtg |
421 |
Q |
| |
|
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|
| T |
28712478 |
tttcatttatctttcccatattatttaataagaacaattttataaaacaactcataatatctcttttccacacaatattaattaaatttcttaatatgtg |
28712577 |
T |
 |
| Q |
422 |
tgaaatgcccaaaacgtcatacaatttaggatgaagggagtaat |
465 |
Q |
| |
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| T |
28712578 |
tgaaatgcccaaaacgtcatacaatttgagacggagggagtaat |
28712621 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #51
Raw Score: 130; E-Value: 5e-67
Query Start/End: Original strand, 230 - 450
Target Start/End: Original strand, 42981233 - 42981464
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| Q |
230 |
tatttgtcccaaattgtatgtcactttacaataccaatgaaacattaatgttatttttcctattataaccttaactatttattactctctcttctttcaa |
329 |
Q |
| |
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| T |
42981233 |
tatttgttctaaattgtatgtcgctttacaataccaatgaaaaattaatgttacttttcctattatatcattaactatttattactctctcttctttcaa |
42981332 |
T |
 |
| Q |
330 |
gtcttttatttatctttttcata-----------ggacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatat |
418 |
Q |
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42981333 |
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T |
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419 |
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450 |
Q |
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| T |
42981433 |
gtgtgaaatgtctaaaacgccatacaatttag |
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #52
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Target Start/End: Complemental strand, 30597335 - 30597045
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Q |
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T |
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284 |
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372 |
Q |
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T |
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463 |
Q |
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tcataatatctctttcccacacaatattaattacatttcttaatatgtgtgaaatggccaaaacgttatacaatttgggacggagggagta |
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #53
Raw Score: 129; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 190 - 448
Target Start/End: Original strand, 30851974 - 30852244
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T |
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378 |
Q |
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T |
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| Q |
379 |
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448 |
Q |
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #54
Raw Score: 129; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 231 - 463
Target Start/End: Complemental strand, 31602954 - 31602709
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330 |
Q |
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T |
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Q |
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T |
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| Q |
418 |
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Q |
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #55
Raw Score: 128; E-Value: 7e-66
Query Start/End: Original strand, 189 - 463
Target Start/End: Original strand, 6878511 - 6878796
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Q |
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T |
 |
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289 |
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377 |
Q |
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6878710 |
T |
 |
| Q |
378 |
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463 |
Q |
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| T |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #56
Raw Score: 128; E-Value: 7e-66
Query Start/End: Original strand, 232 - 462
Target Start/End: Complemental strand, 12988221 - 12987980
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331 |
Q |
| |
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T |
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332 |
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420 |
Q |
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| T |
12988121 |
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12988022 |
T |
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| Q |
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462 |
Q |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #57
Raw Score: 127; E-Value: 3e-65
Query Start/End: Original strand, 190 - 463
Target Start/End: Original strand, 596942 - 597225
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596942 |
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T |
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| Q |
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378 |
Q |
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| T |
597041 |
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T |
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| Q |
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463 |
Q |
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tatttttttcccacacaatattaattacattttttaatatgtgtgaaatgcccaaaacgtcatacaatttgggacggagggagta |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #58
Raw Score: 127; E-Value: 3e-65
Query Start/End: Original strand, 230 - 463
Target Start/End: Complemental strand, 32395278 - 32395034
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T |
 |
| Q |
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418 |
Q |
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| T |
32395178 |
ttccttcatttatctttctcatatcatttattgaggacagttttgtaaaacaactcataatatctctttcccacacaatattaattacatttcttaatat |
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T |
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| Q |
419 |
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463 |
Q |
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| T |
32395078 |
gtgtgaaatgcccaaaacatcataaaatttgggacggagggagta |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #59
Raw Score: 126; E-Value: 1e-64
Query Start/End: Original strand, 232 - 448
Target Start/End: Original strand, 4924447 - 4924674
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| Q |
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tttgtcctaaattatatgtcactttacaataccaatgcaacattaatgttatttttccaattataactttaactatttattattatctcttctttcaatt |
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T |
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| Q |
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420 |
Q |
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| T |
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T |
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| Q |
421 |
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4924647 |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #60
Raw Score: 126; E-Value: 1e-64
Query Start/End: Original strand, 233 - 465
Target Start/End: Original strand, 28727367 - 28727610
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332 |
Q |
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ttgtcccaaattatatgttgctttaaaatatcaatgcaacattaatgttatttttcctattataaccttgattatttattactctctcttctttcaattc |
28727466 |
T |
 |
| Q |
333 |
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421 |
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| T |
28727467 |
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28727566 |
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| Q |
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465 |
Q |
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| T |
28727567 |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #61
Raw Score: 125; E-Value: 5e-64
Query Start/End: Original strand, 189 - 448
Target Start/End: Original strand, 1042369 - 1042637
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T |
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T |
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378 |
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448 |
Q |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #62
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Query Start/End: Original strand, 190 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 26805106 - 26804839
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tattataaccttaactatttattactctctcttctttcaagtcttttatttatctttttcat-----------aggacaattttgtaaaacaactcataa |
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Q |
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tatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatatgtgtgaaatgcccaaaacgtcatacaattt |
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Q |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #63
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Query Start/End: Original strand, 230 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 32629835 - 32629605
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T |
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418 |
tgtgtgaaatgcccaaaacgtcatacaattt |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #64
Raw Score: 125; E-Value: 5e-64
Query Start/End: Original strand, 197 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 37665009 - 37664747
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #65
Raw Score: 124; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 190 - 463
Target Start/End: Complemental strand, 39645990 - 39645708
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Q |
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T |
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378 |
Q |
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T |
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tatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatatgtgtgaaatgcccaaaacgtcatacaatttaggatgaagggagta |
463 |
Q |
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|
|
| T |
39645792 |
tatctctttctcacacaatattaattacatttcttaatatgtgtgaaatgcccaaaacgtcatagaatttgggacggagggagta |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #66
Raw Score: 124; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 190 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 41256482 - 41256213
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190 |
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289 |
Q |
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|
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tactccatccgtcctaaattgtatgtcgttttggaaaaaaaatttgtcctaaattatatgtcgttttacaataccaatgaaatattaatgttatttttcc |
41256383 |
T |
 |
| Q |
290 |
tattataaccttaactatttattactctctcttctttcaagtcttttatttatctttttcat-----------aggacaattttgtaaaacaactcataa |
378 |
Q |
| |
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||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||| |
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|
| T |
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tattatatccttaactattaattactctctcttctttcaattatttaatttatcttttccataccatttattaaggataattttgtaaaacaactcataa |
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T |
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379 |
tatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatatgtgtgaaatgcccaaaacgtcatacaattt |
448 |
Q |
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| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| |
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| T |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #67
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Target Start/End: Complemental strand, 899637 - 899360
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Q |
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T |
 |
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accttaactatttattactctctcttctttcaagtcttttatttatctttt-----tcat------aggacaattttgtaaaacaactcataatatctct |
385 |
Q |
| |
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| |||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |
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T |
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386 |
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463 |
Q |
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|
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ttcccacataatattaattacatttcttaatatgtgtgaaatgctcaaaacgtcatacaatttgggacggagggagta |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #68
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Target Start/End: Complemental strand, 5449543 - 5449299
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Q |
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T |
 |
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418 |
Q |
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ttctttcatttatctttcccatattatttattaaggacaattttgtaaaacaacttataatatttattttccacacaatattaattgcatttcttaatat |
5449344 |
T |
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| Q |
419 |
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463 |
Q |
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| T |
5449343 |
atgtgaaatgcctaaaacgccatacaatttaggacggagggagta |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #69
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Target Start/End: Complemental strand, 34141658 - 34141430
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330 |
Q |
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T |
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419 |
Q |
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| T |
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T |
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| Q |
420 |
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448 |
Q |
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tgtgaaatgttcaaaacgtcataaaattt |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #70
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Query Start/End: Original strand, 231 - 470
Target Start/End: Complemental strand, 543814 - 543563
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Q |
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T |
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330 |
gtcttttatttatctttttcata-----------ggacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatat |
418 |
Q |
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| T |
543714 |
ttctttcatttatctttctcatattatttattaaggacaattttgtaaaacaactcataatatatattttccacacaatattaattgtatttcttaatat |
543615 |
T |
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470 |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #71
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Query Start/End: Original strand, 201 - 469
Target Start/End: Original strand, 26746839 - 26747118
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T |
 |
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389 |
Q |
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26747038 |
T |
 |
| Q |
390 |
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469 |
Q |
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|
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cacacaatattaattacatttcttaatatatgtgaaatgcccaaaacatcatacaatttgggacgaatggagtaatttaa |
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Back To:
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Target: chr8; HSP #72
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Query Start/End: Original strand, 233 - 448
Target Start/End: Original strand, 29867300 - 29867526
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Q |
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T |
 |
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| |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #73
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Query Start/End: Original strand, 233 - 448
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| |
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 |
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ttttatttatctttttcata-----------ggacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatatgtg |
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Q |
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37964876 |
T |
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| Q |
422 |
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448 |
Q |
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37964875 |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #74
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Query Start/End: Original strand, 187 - 448
Target Start/End: Original strand, 18673365 - 18673638
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|
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T |
 |
| Q |
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tcctattataaccttaactatttattactctctcttctttcaagtcttttatttatctttttcat-----------aggacaattttgtaaaacaactca |
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T |
 |
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taatatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatatgtgtgaaatg-cccaaaacgtcatacaattt |
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Q |
| |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #75
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Query Start/End: Original strand, 190 - 463
Target Start/End: Complemental strand, 27919707 - 27919423
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289 |
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T |
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tattataaccttaactatttattactctctcttctttcaagtcttttatttatctttttcata-----------ggacaattttgtaaaacaactcataa |
378 |
Q |
| |
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| T |
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T |
 |
| Q |
379 |
tatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatatgtgtgaaatgcccaaaacgtcatacaatttaggatgaagggagta |
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Q |
| |
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|
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27919507 |
tatctctttcccacacaaaattaattacatttcttaataagtgtgaaatgcccaaaacgtcatacaatttgggacggagggagta |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #76
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Query Start/End: Original strand, 231 - 448
Target Start/End: Original strand, 28868762 - 28868990
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| |
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|
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tcttttatttatctttttcat-----------aggacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatatg |
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420 |
tgtgaaatgcccaaaacgtcatacaattt |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #77
Raw Score: 119; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 190 - 463
Target Start/End: Original strand, 38044914 - 38045198
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| |
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|
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 |
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tattataaccttaactatttattactctctcttctttcaagtcttttatttatctttttcat-----------aggacaattttgtaaaacaactcataa |
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Q |
| |
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T |
 |
| Q |
379 |
tatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatatgtgtgaaatgcccaaaacgtcatacaatttaggatgaagggagta |
463 |
Q |
| |
|
| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||| | |||||||| |
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|
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #78
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Query Start/End: Original strand, 197 - 452
Target Start/End: Complemental strand, 37954752 - 37954486
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297 |
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385 |
Q |
| |
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|||||| ||||||||| ||| ||||||||||| ||||| |||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |
|
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| T |
37954652 |
tccttaattatttattattctttcttctttcaattctttcatttatctttcccatatcatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatatctct |
37954553 |
T |
 |
| Q |
386 |
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452 |
Q |
| |
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|| || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |
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|
| T |
37954552 |
ttctcatacaatattaattacatttcttaatatatgtgaaatgcctaaaacgtcatacaatttagga |
37954486 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #79
Raw Score: 116; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 233 - 465
Target Start/End: Original strand, 17833952 - 17834186
Alignment:
| Q |
233 |
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332 |
Q |
| |
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| T |
17833952 |
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T |
 |
| Q |
333 |
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430 |
Q |
| |
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| T |
17834052 |
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17834151 |
T |
 |
| Q |
431 |
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465 |
Q |
| |
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| T |
17834152 |
taaaacgtcatacaatttgggacggaggaagtaat |
17834186 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #80
Raw Score: 116; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 189 - 463
Target Start/End: Complemental strand, 41541262 - 41540977
Alignment:
| Q |
189 |
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288 |
Q |
| |
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|
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| T |
41541262 |
ttactccatccgtcccaaattgaatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacataaatgttaaatttc |
41541163 |
T |
 |
| Q |
289 |
ctattataaccttaactatttattactctctcttctttcaagtcttttatttatctttttcat-----------aggacaattttgtaaaacaactcata |
377 |
Q |
| |
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| T |
41541162 |
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41541063 |
T |
 |
| Q |
378 |
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463 |
Q |
| |
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|||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||| ||||| |||||||| |
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| T |
41541062 |
atatctctttcccatacaatattaattatatttcttaatatgtgtgaaatgcgcaaaacgtcgtataatttgggatggagggagta |
41540977 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #81
Raw Score: 115; E-Value: 4e-58
Query Start/End: Original strand, 270 - 463
Target Start/End: Complemental strand, 548225 - 548021
Alignment:
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270 |
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358 |
Q |
| |
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||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||| |||||||||| |||| | |||| |
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|
| T |
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aacattaatgttacttttcctattataaccttaactatttattactctatcttctttcaattatttcatttatctttcccatattatttattaagaacaa |
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T |
 |
| Q |
359 |
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458 |
Q |
| |
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|
| T |
548125 |
ttttgtaaaacaacttataatatctcttttccacacaatattaattgcatttcttaatatgtgtgaaatgcccaaaacgtcatacaatttgggacggagg |
548026 |
T |
 |
| Q |
459 |
gagta |
463 |
Q |
| |
|
||||| |
|
|
| T |
548025 |
gagta |
548021 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #82
Raw Score: 115; E-Value: 4e-58
Query Start/End: Original strand, 231 - 448
Target Start/End: Original strand, 4135728 - 4135956
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| Q |
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330 |
Q |
| |
|
|||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| | |||| ||||||||||||| |||| |||||| |
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|
| T |
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atttgtcctaaattgtatgtcactttacaataccagtgaaacattaatgttattttttctattatatcattaattatttattactctttcttttttcaat |
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T |
 |
| Q |
331 |
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419 |
Q |
| |
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|
| T |
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4135927 |
T |
 |
| Q |
420 |
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448 |
Q |
| |
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| T |
4135928 |
tgtgaaatgtccaaaatattatacaattt |
4135956 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #83
Raw Score: 115; E-Value: 4e-58
Query Start/End: Original strand, 197 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 21582996 - 21582736
Alignment:
| Q |
197 |
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296 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
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tccgtcccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtctcaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttagttttcctattata |
21582897 |
T |
 |
| Q |
297 |
accttaactatttattactctctcttctttcaagtcttttatttatctttttcat----------aggacaattttgtaaaacaactcataatatctctt |
386 |
Q |
| |
|
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| T |
21582896 |
tccttaactattta-tactctttcgtttttcaattctttcatttatctttcccatacatttattaaggataattttgtaaaacaaatcataatatctttt |
21582798 |
T |
 |
| Q |
387 |
ttccacacaatattaattacatttcttaatatgtgtgaaatgcccaaaacgtcatacaattt |
448 |
Q |
| |
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| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |
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| T |
21582797 |
tcccacacaatattaattacattttttaatatgtgtgaaatgcccaaaacgtcgtataattt |
21582736 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #84
Raw Score: 115; E-Value: 4e-58
Query Start/End: Original strand, 233 - 463
Target Start/End: Original strand, 34865667 - 34865908
Alignment:
| Q |
233 |
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332 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||| || |||||| |
|
|
| T |
34865667 |
ttgtcccaaattgtatgtagctttacaatatcaatgaatcattaatgttattttttctattatatctttaactatttattactctctctcattccaagtc |
34865766 |
T |
 |
| Q |
333 |
ttttatttatctttt-----tcat------aggacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatatgtg |
421 |
Q |
| |
|
|| |||||| |||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||| |
|
|
| T |
34865767 |
attcatttattttttcaatgtcatttattaaggacaattttgtaaaataactcataatatctctttcccacacaaaattaattacatttcttaataggtg |
34865866 |
T |
 |
| Q |
422 |
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463 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
34865867 |
tgaaatgcccaaatcgtcatacaatttgggacggagggagta |
34865908 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #85
Raw Score: 115; E-Value: 4e-58
Query Start/End: Original strand, 231 - 452
Target Start/End: Complemental strand, 40325563 - 40325331
Alignment:
| Q |
231 |
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330 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
40325563 |
atttgttccaaattatatgtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcctattatatccttaactattaattactctctcttctttcaat |
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T |
 |
| Q |
331 |
tcttttatttatctttttcata-----------ggacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatatg |
419 |
Q |
| |
|
| ||| ||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |
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| T |
40325463 |
tatttcatttatcttttccatatcatttattagggataattttgtaaaacaactcgtaatttctcttccccacacaatattaattacatttcttaatacg |
40325364 |
T |
 |
| Q |
420 |
tgtgaaatgcccaaaacgtcatacaatttagga |
452 |
Q |
| |
|
||||||||| |||||| ||||||||||||||| |
|
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| T |
40325363 |
tgtgaaatggtcaaaacatcatacaatttagga |
40325331 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #86
Raw Score: 114; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 233 - 449
Target Start/End: Complemental strand, 6010352 - 6010125
Alignment:
| Q |
233 |
ttgtcccaaattgtatgtcactttacaataccaatgaaacattaatgttatttttcctattataaccttaactatttattactctctcttctttcaagtc |
332 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| |||| ||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||| |||||| |
|
|
| T |
6010352 |
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T |
 |
| Q |
333 |
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421 |
Q |
| |
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| T |
6010252 |
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6010153 |
T |
 |
| Q |
422 |
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449 |
Q |
| |
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|
| T |
6010152 |
tgaaatgcccaaaacgtcatacaattta |
6010125 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #87
Raw Score: 114; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 233 - 465
Target Start/End: Original strand, 11181286 - 11181529
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| Q |
233 |
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332 |
Q |
| |
|
|||||||||||| |||||| |||||| ||| ||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | |
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| T |
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ttgtcccaaattatatgtcgctttacgatatcaatgcaactttaatgttacttttcctattataaccttaactatttattactctctcttatttcaatta |
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T |
 |
| Q |
333 |
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421 |
Q |
| |
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| T |
11181386 |
tttcatttatttttctcatattatttattaaagacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccatacaatattaattgcatttcttaatatgtg |
11181485 |
T |
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| Q |
422 |
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465 |
Q |
| |
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| T |
11181486 |
tgaaatgtccaaaatattatacaatttgggacggagggagtaat |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #88
Raw Score: 114; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 231 - 463
Target Start/End: Original strand, 33012104 - 33012347
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| Q |
231 |
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330 |
Q |
| |
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||||| || ||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |
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| T |
33012104 |
atttggccaaaattatatgtcgctttacaataccaatgaaatatttatgttacttttcctattatatccttaactattaattactctctcttctttcaat |
33012203 |
T |
 |
| Q |
331 |
tcttttatttatctttttcata-----------ggacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatatg |
419 |
Q |
| |
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| ||| ||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||||| | |
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| T |
33012204 |
tatttcatttatcttttccataccatttattagggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacgcaatattaattacatttcttaatacg |
33012303 |
T |
 |
| Q |
420 |
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463 |
Q |
| |
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| T |
33012304 |
tgtgaaatggccaaaacgtcttacaatttaggacggagggagta |
33012347 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #89
Raw Score: 114; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 232 - 463
Target Start/End: Complemental strand, 42827724 - 42827484
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tttgtcccaaattgtatgtcactttacaataccaatgaaacattaatgttatttttcctattataaccttaactatttattactctctcttctttcaagt |
331 |
Q |
| |
|
||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||| | |||||| | |
|
|
| T |
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tttgtcccaaattatatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgctacgtttcctattataaccttagctatttattactctct--tatttcaatt |
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T |
 |
| Q |
332 |
cttttatttatctttttcata-----------ggacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatatgt |
420 |
Q |
| |
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| T |
42827626 |
ctttcatttatctttcccatattatttattaaggacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaatattaattgcatttcttaatatgt |
42827527 |
T |
 |
| Q |
421 |
gtgaaatgcccaaaacgtcatacaatttaggatgaagggagta |
463 |
Q |
| |
|
|||||| | ||||||||||||||||| ||| | |||||||| |
|
|
| T |
42827526 |
gtgaaaaagctaaaacgtcatacaatttgggacggagggagta |
42827484 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #90
Raw Score: 113; E-Value: 7e-57
Query Start/End: Original strand, 190 - 463
Target Start/End: Complemental strand, 13779853 - 13779572
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289 |
Q |
| |
|
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| T |
13779853 |
tactccatccgttccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtctcaaattgtatgtcactttacaatatcaatgaaacattaatgttacttttcc |
13779754 |
T |
 |
| Q |
290 |
tattataaccttaactatttattactctctcttctttcaagtcttttatttatctttttcata-----------ggacaattttgtaaaacaactcataa |
378 |
Q |
| |
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||| | | |||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||| |||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||| | |
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| T |
13779753 |
tat---atcattaactattttttactctttcttctttcaattctttcatttatttttcccatatcatttattaaggacaattttgtaaaacaactcatca |
13779657 |
T |
 |
| Q |
379 |
tatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatatgtgtgaaatgcccaaaacgtcatacaatttaggatgaagggagta |
463 |
Q |
| |
|
| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||| | |||||||| |
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|
| T |
13779656 |
tttcttttttccacacaatattaattacatttattaatatgtgtgaaatgtccaaaacgtcgtacaatttgggacggagggagta |
13779572 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #91
Raw Score: 113; E-Value: 7e-57
Query Start/End: Original strand, 231 - 442
Target Start/End: Complemental strand, 14810118 - 14809896
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330 |
Q |
| |
|
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|
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atttgtcccaaattatatgtcgttttacaataccaatgaaatatcaatgttacttttcctattatatccttagctatttattactctctcttctttcaat |
14810019 |
T |
 |
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tcttttatttatctttttcat-----------aggacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatatg |
419 |
Q |
| |
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| T |
14810018 |
tccttcatttatctttctcatatcatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatatctctttcccatacaatatttattacatttcttaatatg |
14809919 |
T |
 |
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tgtgaaatgcccaaaacgtcata |
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Q |
| |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #92
Raw Score: 113; E-Value: 7e-57
Query Start/End: Original strand, 265 - 464
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265 |
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453 |
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464 |
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T |
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Target: chr8; HSP #93
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Target Start/End: Original strand, 24612883 - 24613113
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328 |
Q |
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T |
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448 |
Q |
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T |
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Target: chr8; HSP #94
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Query Start/End: Original strand, 231 - 469
Target Start/End: Complemental strand, 10709340 - 10709091
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330 |
Q |
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T |
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469 |
Q |
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| T |
10709140 |
tgtgaaatgcctaaaacgtcatacaatttaggacggagggagtaatttaa |
10709091 |
T |
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Target: chr8; HSP #95
Raw Score: 112; E-Value: 3e-56
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Target Start/End: Original strand, 12000479 - 12000761
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Q |
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T |
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365 |
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| T |
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T |
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Target: chr8; HSP #96
Raw Score: 111; E-Value: 1e-55
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Target Start/End: Original strand, 23897676 - 23897963
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Q |
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| Q |
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463 |
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| T |
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23897963 |
T |
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Target: chr8; HSP #97
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Target Start/End: Original strand, 3310852 - 3311071
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339 |
Q |
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3310951 |
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428 |
Q |
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| T |
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3311051 |
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448 |
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| T |
3311052 |
cccaaaacgtcatacaattt |
3311071 |
T |
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Target: chr8; HSP #98
Raw Score: 110; E-Value: 4e-55
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Target Start/End: Original strand, 18526376 - 18526616
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332 |
Q |
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| T |
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18526475 |
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422 |
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| T |
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18526575 |
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463 |
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| T |
18526576 |
gaaatggccaaaacgtcatataatttgggacggagggagta |
18526616 |
T |
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Back To:
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Target: chr8; HSP #99
Raw Score: 110; E-Value: 4e-55
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Target Start/End: Original strand, 28848997 - 28849240
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Q |
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atttgtcccaaattatatgtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcctattatatccttaactattaattaccatctcttctttcaat |
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28849196 |
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| T |
28849197 |
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28849240 |
T |
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Back To:
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Target: chr8; HSP #100
Raw Score: 110; E-Value: 4e-55
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Target Start/End: Original strand, 31692774 - 31693017
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| Q |
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330 |
Q |
| |
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| T |
31692774 |
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31692873 |
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| T |
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31692973 |
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| T |
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T |
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Target: chr8; HSP #101
Raw Score: 110; E-Value: 4e-55
Query Start/End: Original strand, 231 - 463
Target Start/End: Complemental strand, 38194707 - 38194464
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Q |
| |
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T |
 |
| Q |
331 |
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419 |
Q |
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| T |
38194607 |
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38194508 |
T |
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| Q |
420 |
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463 |
Q |
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| T |
38194507 |
tgtgaaatgaccaaaacgtcatacaatttgggacggagggagta |
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T |
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Target: chr8; HSP #102
Raw Score: 110; E-Value: 4e-55
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Q |
| |
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T |
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337 |
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425 |
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| T |
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40488383 |
T |
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| Q |
426 |
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448 |
Q |
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| T |
40488384 |
atgttcaaaacgtcatacaattt |
40488406 |
T |
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Back To:
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Target: chr8; HSP #103
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332 |
Q |
| |
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||||| |||||| || ||| ||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| | | ||||||||| || |
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T |
 |
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421 |
Q |
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| T |
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cttcatttatctttcccatataatttattaaggacaattttgtaaaacaactcataatatttctttcccacacaatattaattacatttcttaatatgtg |
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T |
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| Q |
422 |
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448 |
Q |
| |
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| T |
6247858 |
tgaaatgcccaaaacgtcatgcaattt |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #104
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ttgtcccaaattgtatgtcactttacaataccaatgaaacattaatgttatttttcctattataaccttaactatttattactctctcttctttcaagtc |
332 |
Q |
| |
|
||||| |||||| |||||| |||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | |
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| T |
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ttgtctcaaattatatgtcgctttacggtaccaatgaaatattaatgttacttttcctattataaccttaactatttattactccttcttctttcaatta |
17949576 |
T |
 |
| Q |
333 |
ttttatttatctttttcata-----------ggacaattttgtaaaa-caactcataatatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatatgt |
420 |
Q |
| |
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| T |
17949575 |
tttcatttatctttcccatattatttattaaggataattttgtaaaaacaactcataatatctcttttccacgtaatattaattgtatttcttaatatgt |
17949476 |
T |
 |
| Q |
421 |
gtgaaatgcccaaaacgtcatacaatttaggatgaagggagta |
463 |
Q |
| |
|
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|
| T |
17949475 |
gtgaaatgcccaaaacgtcatacaatttgggacggagggagta |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #105
Raw Score: 109; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 190 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 42373288 - 42373021
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289 |
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| |
|
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tactccctccgtcccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtctcaaattgtatgtcgctttacaataccaatgaaaaattaatgttacttttct |
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T |
 |
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290 |
tattataaccttaactatttattactctctcttctttcaagtcttttatttatctttttcat-----------aggacaattttgtaaaacaactcataa |
378 |
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tattatatccttaactatttattact--ctcttatttcaattcattcatttatctttctcatatcatttattgaggataattttgtaaaacaactcataa |
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T |
 |
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379 |
tatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatatgtgtgaaatgcccaaaacgtcatacaattt |
448 |
Q |
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42373090 |
tatctctttcccacgcaatattaattatatttcttaatatgtatgaaatgtccaaaacattatacaattt |
42373021 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #106
Raw Score: 108; E-Value: 6e-54
Query Start/End: Original strand, 231 - 465
Target Start/End: Original strand, 26513729 - 26513974
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Q |
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T |
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331 |
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419 |
Q |
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26513928 |
T |
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| Q |
420 |
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465 |
Q |
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26513929 |
tgtgaaatggccaaaacgtcttacaatttgggacgaagagagtaat |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #107
Raw Score: 108; E-Value: 6e-54
Query Start/End: Original strand, 230 - 408
Target Start/End: Original strand, 27667508 - 27667697
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T |
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330 |
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408 |
Q |
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ttctttcatttatctttcccatataatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatatctctttcccacacaatattaattacat |
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #108
Raw Score: 108; E-Value: 6e-54
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Target Start/End: Complemental strand, 44023644 - 44023403
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332 |
Q |
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T |
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421 |
Q |
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| T |
44023544 |
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T |
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| Q |
422 |
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463 |
Q |
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44023444 |
tgaaatgacaaaaacgtcttacaatttgggacggagggagta |
44023403 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #109
Raw Score: 107; E-Value: 3e-53
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Target Start/End: Complemental strand, 4395505 - 4395278
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330 |
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T |
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| Q |
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419 |
Q |
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| T |
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T |
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| Q |
420 |
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448 |
Q |
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| T |
4395306 |
tgtcaaatgttcaaaacgtcatacaattt |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #110
Raw Score: 106; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 231 - 463
Target Start/End: Original strand, 1366787 - 1367030
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Q |
| |
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T |
 |
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419 |
Q |
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| T |
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1366986 |
T |
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| Q |
420 |
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Q |
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| T |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #111
Raw Score: 106; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 231 - 463
Target Start/End: Original strand, 1953313 - 1953556
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Q |
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T |
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tcttttatttatctttttcat-----------aggacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatatg |
419 |
Q |
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| T |
1953413 |
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1953512 |
T |
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| Q |
420 |
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463 |
Q |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #112
Raw Score: 106; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 231 - 463
Target Start/End: Complemental strand, 16861989 - 16861746
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atttgtcccaaattgtatgtcactttacaataccaatgaaacattaatgttatttttcctattataaccttaactatttattactctctcttctttcaag |
330 |
Q |
| |
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T |
 |
| Q |
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419 |
Q |
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| T |
16861889 |
tatttcatttatctttcccataccatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaatattaattatatttcttaatacg |
16861790 |
T |
 |
| Q |
420 |
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463 |
Q |
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16861789 |
tgtgaaatggccaaaacgtcatacattttgggacggagggagta |
16861746 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #113
Raw Score: 106; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 233 - 449
Target Start/End: Complemental strand, 17524811 - 17524584
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332 |
Q |
| |
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17524712 |
T |
 |
| Q |
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421 |
Q |
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| T |
17524711 |
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17524612 |
T |
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| Q |
422 |
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449 |
Q |
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| T |
17524611 |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #114
Raw Score: 106; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 190 - 463
Target Start/End: Original strand, 29440864 - 29441148
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| |
|
|||||| ||||||| |||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| |
|
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T |
 |
| Q |
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Q |
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| T |
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29441063 |
T |
 |
| Q |
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463 |
Q |
| |
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| T |
29441064 |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #115
Raw Score: 106; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 233 - 449
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332 |
Q |
| |
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T |
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| Q |
333 |
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421 |
Q |
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| T |
43536946 |
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43536847 |
T |
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| Q |
422 |
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449 |
Q |
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| T |
43536846 |
tgaaatggccaaaacgtcttacaattta |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #116
Raw Score: 105; E-Value: 4e-52
Query Start/End: Original strand, 233 - 464
Target Start/End: Original strand, 16421903 - 16422145
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332 |
Q |
| |
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16422002 |
T |
 |
| Q |
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421 |
Q |
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| T |
16422003 |
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16422102 |
T |
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422 |
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464 |
Q |
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| T |
16422103 |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #117
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Query Start/End: Original strand, 203 - 463
Target Start/End: Original strand, 24450530 - 24450801
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 |
| Q |
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actatttattactctctcttctttcaagtcttttatttatctttttc---------at--aggacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttcca |
391 |
Q |
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 |
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cacaatattaattacatttcttaatatgtgtgaaatgcccaaaacgtcatacaatttaggatgaagggagta |
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Q |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #118
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Query Start/End: Original strand, 233 - 463
Target Start/End: Original strand, 6796143 - 6796384
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 |
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333 |
ttttatttatctttttcat-----------aggacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatatgtg |
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Q |
| |
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 |
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Q |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #119
Raw Score: 104; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 265 - 463
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 |
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454 |
gaagggagta |
463 |
Q |
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ggagggagta |
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #120
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Query Start/End: Original strand, 231 - 463
Target Start/End: Original strand, 45439553 - 45439799
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327 |
Q |
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atttgttccaaattatatgtcgttttacaataccaatgtaatattaatgttacttttcctattatatccttaactattaatttttactctctcttctttc |
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T |
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416 |
Q |
| |
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| T |
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45439752 |
T |
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| Q |
417 |
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463 |
Q |
| |
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acgtgcgaaatggccaaaacgtcatacaatttgggacggagggagta |
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T |
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Target: chr8; HSP #121
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
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Target Start/End: Original strand, 4174581 - 4174804
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335 |
Q |
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tcccaaattatatgtcgctttacaataccaatgaaatactaatgttatttttcctattatatccttaactattaattactctctcttctttcaaatattt |
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T |
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336 |
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424 |
Q |
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4174780 |
T |
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| Q |
425 |
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448 |
Q |
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| T |
4174781 |
aataaccaaaacgtcgtacaattt |
4174804 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #122
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 240 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 14584844 - 14584625
Alignment:
| Q |
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339 |
Q |
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aaattatatgtcgttttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcctattatatccttaactattaattactctcttttctttcaattatttcatt |
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T |
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| Q |
340 |
tatctttttcata-----------ggacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatatgtgtgaaatg |
428 |
Q |
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| T |
14584744 |
tatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaaatcataatttctcttccccacacaatattaattacatttcttaatacgtgtgaaatg |
14584645 |
T |
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| Q |
429 |
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448 |
Q |
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| T |
14584644 |
accaaaacatcatacaattt |
14584625 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #123
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 235 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 38367675 - 38367451
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334 |
Q |
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gtcctaaattgtatgtcactttagaatatcaatgaaacattaatgttacttttcctattatatctttaactatttattactttttcttttttcaattctt |
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T |
 |
| Q |
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ttatttatctt-----tttcat------aggacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatatgtgtg |
423 |
Q |
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| T |
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38367476 |
T |
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| Q |
424 |
aaatgcccaaaacgtcatacaattt |
448 |
Q |
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| T |
38367475 |
aaatgcctaaaacgtcatacaattt |
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T |
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Target: chr8; HSP #124
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 233 - 429
Target Start/End: Original strand, 44052915 - 44053122
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332 |
Q |
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ttgtcctaaattatatgtcgctttacaatatcaatgtaacattaatgttactttttctattataaccttagttatttattactctctcttctttcaattc |
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T |
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| Q |
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421 |
Q |
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| T |
44053015 |
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44053114 |
T |
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| Q |
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429 |
Q |
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| T |
44053115 |
tgaaatgc |
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T |
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Target: chr8; HSP #125
Raw Score: 101; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 232 - 463
Target Start/End: Complemental strand, 2031629 - 2031388
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331 |
Q |
| |
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| T |
2031629 |
tttgttccaaattatatgtcgctttacaatatccatgcaatattaatgttacttttcctattataacattaatcatttattattctctcttctttcaatt |
2031530 |
T |
 |
| Q |
332 |
cttttatttatctttttcata-----------ggacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatatgt |
420 |
Q |
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| T |
2031529 |
ttttcatttatcttttccatattatttattaaggacaattttgtaaaacaacttataatatcttttttccacacaatattaattgtatttcttaatatgt |
2031430 |
T |
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| Q |
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463 |
Q |
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| T |
2031429 |
gtgaaatgcccaaaacat-atacaatttgggacggagggagta |
2031388 |
T |
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Target: chr8; HSP #126
Raw Score: 101; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 231 - 450
Target Start/End: Original strand, 4393929 - 4394159
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330 |
Q |
| |
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|
| T |
4393929 |
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4394028 |
T |
 |
| Q |
331 |
tcttttatttatctttttcata-----------ggacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatatg |
419 |
Q |
| |
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| T |
4394029 |
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4394128 |
T |
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| Q |
420 |
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450 |
Q |
| |
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| T |
4394129 |
tgtgaaatgaccaaaatgtcatataatttag |
4394159 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #127
Raw Score: 101; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 230 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 4631180 - 4630950
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230 |
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329 |
Q |
| |
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| T |
4631180 |
tatttgtcctaaattgtatgtcgctttacaataccaataaaaaattaatgttatttttcttattatatcattaactatttattactctatcttctttctt |
4631081 |
T |
 |
| Q |
330 |
gtcttttatttatctttttcat-----------aggacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaatattaattacatttctt-aata |
417 |
Q |
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| T |
4631080 |
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4630981 |
T |
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| Q |
418 |
tgtgtgaaatgcccaaaacgtcatacaattt |
448 |
Q |
| |
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| T |
4630980 |
cgtgtgaaatgcccaaaacgtcatataattt |
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T |
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Back To:
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Target: chr8; HSP #128
Raw Score: 101; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 240 - 463
Target Start/End: Original strand, 38451004 - 38451238
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Q |
| |
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||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||| | ||| ||| |
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| T |
38451004 |
aaattatatgtcgctttacaataccaatgaaatatttatgttacttttcctattatatccttaattattaattactctctcttctttcaattatttcatt |
38451103 |
T |
 |
| Q |
340 |
tatctttttcata-----------ggacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatatgtgtgaaatg |
428 |
Q |
| |
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| T |
38451104 |
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38451203 |
T |
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| Q |
429 |
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463 |
Q |
| |
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| T |
38451204 |
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38451238 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #129
Raw Score: 101; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 240 - 463
Target Start/End: Original strand, 45186962 - 45187196
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aaattgtatgtcactttacaataccaatgaaacattaatgttatttttcctattataaccttaactatttattactctctcttctttcaagtcttttatt |
339 |
Q |
| |
|
||||| |||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||| |||| |||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||| | ||| ||| |
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|
| T |
45186962 |
aaattatatgtcgctttacagtaccaatgaaatattaatgttactttttctattatatccttaactattaattactccctcttctttcaattatttcatt |
45187061 |
T |
 |
| Q |
340 |
tatctttttcata-----------ggacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatatgtgtgaaatg |
428 |
Q |
| |
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| T |
45187062 |
tatcttttccataccatttattaaggataattttgtaaaacaaatcataatttctcttccccacacaatattaattacatttcttaatacatgtgaaatg |
45187161 |
T |
 |
| Q |
429 |
cccaaaacgtcatacaatttaggatgaagggagta |
463 |
Q |
| |
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|
| T |
45187162 |
accaaaacgtcatacaatttgggacggagggagta |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #130
Raw Score: 100; E-Value: 4e-49
Query Start/End: Original strand, 190 - 463
Target Start/End: Complemental strand, 12113620 - 12113343
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Q |
| |
|
|||||| ||||| ||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||| |||||||||| || ||||| |||||||||| |||||| |
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12113620 |
tactccttccgttctaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtctcaaattgtatgtcgctttacaatatcagtgaaaaattaatgttacttttcc |
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T |
 |
| Q |
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tattataaccttaactatttattactctctcttctttcaagtcttttatttatctttttcata-----------ggacaattttgtaaaacaactcataa |
378 |
Q |
| |
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| T |
12113520 |
tattatatcct-----atttattactctttttt--ttcaattccttcatttatctttcccatatcatttattgaggacaattttgtaaaacaactcataa |
12113428 |
T |
 |
| Q |
379 |
tatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatatgtgtgaaatgcccaaaacgtcatacaatttaggatgaagggagta |
463 |
Q |
| |
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| T |
12113427 |
tatctctttcccacacaatattaattacatttcttaatatgtgtgaaatgttcaaaacgtcatacaatttgggacggagggagta |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #131
Raw Score: 99; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 231 - 463
Target Start/End: Original strand, 15225880 - 15226124
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Q |
| |
|
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|
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T |
 |
| Q |
331 |
tcttttatttatctttttcata-----------ggacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttcc-acacaatattaattacatttcttaatat |
418 |
Q |
| |
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| T |
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tatttcatttatattttccataccatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttcccccacacaatattaattacatttcttaatac |
15226079 |
T |
 |
| Q |
419 |
gtgtgaaatgcccaaaacgtcatacaatttaggatgaagggagta |
463 |
Q |
| |
|
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| T |
15226080 |
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Target: chr8; HSP #132
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Query Start/End: Original strand, 253 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 8378307 - 8378101
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Q |
| |
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ctttacaataccaatgaaacattaatgttatttttcctattatattcttaactatttattactctttcttttttcaattatttcatttatctttcccata |
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T |
 |
| Q |
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441 |
Q |
| |
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| || ||||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||| |
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tcatttattaaagataattttgtaaaacaactcataatatatatttctcacacaatattaattacatttcttaataggtgtgaaatgtccaaaatgtcat |
8378108 |
T |
 |
| Q |
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Q |
| |
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| T |
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acaattt |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #133
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 231 - 426
Target Start/End: Original strand, 8738014 - 8738220
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| |
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atttgtcccaaattgtatgtcgctttacaataccaatgaatcattaatgttgcttttcctattatatcttttactatttattgccttctctactttcaag |
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T |
 |
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tcttttatttatctttttcat-----------aggacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatatg |
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Q |
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tcatttatttatcttttccatatcatttattaaagacaattttgtaaaataactcataatatttcttttccacacaaaattaattacatttcttaatacg |
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T |
 |
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420 |
tgtgaaa |
426 |
Q |
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|
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tgtgaaa |
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T |
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Target: chr8; HSP #134
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Target Start/End: Complemental strand, 2120500 - 2120271
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330 |
Q |
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T |
 |
| Q |
331 |
tcttttatttatctttttcat-----------aggacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatatg |
419 |
Q |
| |
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|
|
| T |
2120400 |
tctttcatttatctttcacatattatttattaaggacaattttgtaaaacaactcataatatctattttccatacaatattaattgcatttcttaatata |
2120301 |
T |
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| Q |
420 |
tgtgaaatgcccaaaacgtcatacaattta |
449 |
Q |
| |
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| T |
2120300 |
tgtgaaatatctaaaacgttatacatttta |
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T |
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Target: chr8; HSP #135
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tcactttacaattacaatgaaacattaatttttcttttcttattatatccttaactatttattactctttcttctttcaattctttcatttatatttctc |
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T |
 |
| Q |
350 |
ata-----------ggacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatatgtgtgaaatgcccaaaacgt |
438 |
Q |
| |
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||| ||| | |||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |
|
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atatcatttattaaggaaatttttttaaaacaactcacaatatctctttcccacacaatattgattacatttcttaatatgtgtgaaatgtccaaaacgt |
36514368 |
T |
 |
| Q |
439 |
catacaattt |
448 |
Q |
| |
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|||||||||| |
|
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36514369 |
catacaattt |
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T |
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Target: chr8; HSP #136
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Q |
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ttgttccaaattatatgtcgctttacaataccaatgaaatatttatgttacttttcctattatatccttaactattaattactctctcttctttcaatta |
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T |
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333 |
ttttatttatctttttcata-----------ggacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatatgtg |
421 |
Q |
| |
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| T |
37163672 |
tttcatttatcttttccataccatttattatggataattttgtaaaacaactcaaaatttctcttccccatgcaatattaattacatttcttaatacgtg |
37163573 |
T |
 |
| Q |
422 |
tgaaatgcccaaaacgtcatacaatttaggatgaagggagta |
463 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||||| |||||||| ||| | |||||||| |
|
|
| T |
37163572 |
tgaaattgtcaaaacgtcttacaatttgggacggagggagta |
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T |
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Target: chr8; HSP #137
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334 |
Q |
| |
|
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caaattgtatgtcgctttacaataccaatgcaactttaatgttacttttcctattataaccttaactatttattgtttttttttttttttttcaattcat |
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T |
 |
| Q |
335 |
ttatttatctttttcata-----------ggacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatatgtgtg |
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Q |
| |
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| |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||| |
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|
| T |
40734831 |
tcatttatctttcccatattatttattaaggacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaatattaattgcattttttaatatttgtg |
40734732 |
T |
 |
| Q |
424 |
aaatgcccaaaacgtcatacaat |
446 |
Q |
| |
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|
| T |
40734731 |
aaatgcccaaaacgtcatacaat |
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T |
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Target: chr8; HSP #138
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Query Start/End: Original strand, 233 - 442
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332 |
Q |
| |
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| T |
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T |
 |
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Q |
| |
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||| ||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |
|
|
| T |
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tttcatttatcttttccataccatttattagggataattttgtaaaacaactcataatttatcttccccacacaatattaattacatttcttaatacgtg |
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T |
 |
| Q |
422 |
tgaaatgcccaaaacgtcata |
442 |
Q |
| |
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| T |
7884327 |
tgaaatggtcaaaacgtcata |
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T |
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Target: chr8; HSP #139
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Query Start/End: Original strand, 233 - 463
Target Start/End: Complemental strand, 37954408 - 37954167
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332 |
Q |
| |
|
||||| |||||| || ||| |||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||| | |
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|
| T |
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T |
 |
| Q |
333 |
ttttatttatctttttcat-----------aggacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatatgtg |
421 |
Q |
| |
|
||| ||||||||||| ||| |||| |||||||||||| |||| ||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| || |
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|
| T |
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tttcatttatcttttccataccatttattaaggataattttgtaaaataacttataatttctcttccccacataatattaattacatttcttaatacatg |
37954209 |
T |
 |
| Q |
422 |
tgaaatgcccaaaacgtcatacaatttaggatgaagggagta |
463 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
37954208 |
tgaaatggtcaaaacgtcatacaatttgggacggagggagta |
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T |
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Target: chr8; HSP #140
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Q |
| |
|
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|
|
| T |
17911008 |
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17911106 |
T |
 |
| Q |
340 |
tatctttttcat-----------aggacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatatgtgtgaaatg |
428 |
Q |
| |
|
||||||| |||| |||||||||| |||| |||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| |
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| T |
17911107 |
tatctttctcatatcatttattaaggacaatttagtaagacaactcataat-tctttttcccacacaatattaattatatttcttaatatatgtgaaatg |
17911205 |
T |
 |
| Q |
429 |
cccaaaacgtcatacaattt |
448 |
Q |
| |
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| ||||| ||||| ||||| |
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| T |
17911206 |
ctcaaaatatcatataattt |
17911225 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #141
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Q |
| |
|
||||||| ||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
20091258 |
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20091159 |
T |
 |
| Q |
289 |
ctattataaccttaactatttattactctctcttctttcaagtcttttatttatcttt |
346 |
Q |
| |
|
|||||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||| | ||| |||||||||| |
|
|
| T |
20091158 |
ctattatatccttaactatttattactctttcttttttcaattttttcatttatcttt |
20091101 |
T |
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Target: chr8; HSP #142
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Q |
| |
|
|||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||||| ||||||||| || |||| |||| |
|
|
| T |
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T |
 |
| Q |
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aagtcttttatttatctttttcata-----------ggacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaatattaattacatttcttaat |
416 |
Q |
| |
|
|| ||||| |||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
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aattctttaatttatctttctcataccatttattaaggacaattttataaaacaactcataatatttcttttccatacaaaattaattatatttcttaat |
14762578 |
T |
 |
| Q |
417 |
atgtgtgaaatgcccaaaacgtcatacaatttagga |
452 |
Q |
| |
|
| |||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
14762579 |
acgtgtgacatgcccaaaacgtcatataatttagga |
14762614 |
T |
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Target: chr8; HSP #143
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351 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||| | | | |||||| |||| ||| |
|
|
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T |
 |
| Q |
352 |
----------aggacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatatgtgtgaaatgcccaaaacgtcat |
441 |
Q |
| |
|
|||| ||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||| |||| |
|
|
| T |
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ccatttattaaggataattttgtaaaacaacttataatttctcttccccacacaatattaattacattttttaatacgtgtgaaatgatcaaaacatcat |
16736452 |
T |
 |
| Q |
442 |
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448 |
Q |
| |
|
||||||| |
|
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| T |
16736451 |
acaattt |
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #144
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451 |
Q |
| |
|
|||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || |
|
|
| T |
31230587 |
aggataattttgtaaaacaactcataatatctctttcccacacaatattaattacatttcttaatatgtgtgaaatgtccaaaacgtcatacaatttggg |
31230488 |
T |
 |
| Q |
452 |
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464 |
Q |
| |
|
| | ||||||||| |
|
|
| T |
31230487 |
acggagggagtaa |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #145
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Query Start/End: Original strand, 253 - 448
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348 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||| | ||| |||||||||| | |
|
|
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ctttacaataccaatgaaacattaacgttactttttctattatatatatccttaactatttattactcttttttctttcaattatttcatttatctttct |
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T |
 |
| Q |
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cata-----------ggacaatttt-gtaaaacaactcataatatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatatgtgtgaaatgcccaaaac |
436 |
Q |
| |
|
|||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
37390861 |
catatcatttatgaaggataatttttgtaaaacaactcataatatctatttcccacacaatattaattacatttcttaatatgtgcgaaatgcccaaaac |
37390762 |
T |
 |
| Q |
437 |
gtcatacaattt |
448 |
Q |
| |
|
||| |||||||| |
|
|
| T |
37390761 |
gtcgtacaattt |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #146
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tttacaataccaatgaaacattaatgttatttttcctattataaccttaactatttattactctctcttctttcaagtcttttatttatcttt------- |
346 |
Q |
| |
|
||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||| | ||||||||| ||||||||| |||||| || ||||| |||||||||| |
|
|
| T |
5733364 |
tttacaataccaacgaaatattaatgttattttttctattatatctttaactattcattactctcgattcttttaattctttcatttatctttctatata |
5733265 |
T |
 |
| Q |
347 |
-ttcat--aggacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatatgtgtgaaatgcccaaaacgtcatac |
443 |
Q |
| |
|
|| || || | ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
5733264 |
atttattaagaataattttgtaaaacaactcataatatctctttcccacacaaaattaattacattttttaatacatgtgaaatgaccaaaacgtcatac |
5733165 |
T |
 |
| Q |
444 |
aatttaggatgaagggagta |
463 |
Q |
| |
|
||||| ||| | |||||||| |
|
|
| T |
5733164 |
aatttgggacggagggagta |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #147
Raw Score: 88; E-Value: 6e-42
Query Start/End: Original strand, 247 - 452
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346 |
Q |
| |
|
||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||| ||| ||||||||||| | ||| |||||||||| |
|
|
| T |
42159234 |
atgtcgctttacaatatcaataaaacattaatgttattttttctattatatccttaattatttattagtctttcttctttcaattttttcatttatcttt |
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T |
 |
| Q |
347 |
ttcata-----------ggacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatatgtgtgaaatgcccaaaa |
435 |
Q |
| |
|
|||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||| ||||||||||| |||||||||| ||||| |
|
|
| T |
42159134 |
cccatataatttattacggataattttgtaaaacaactcataatatctctttcccacacgatactaattagatttcttaata--tgtgaaatgctcaaaa |
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T |
 |
| Q |
436 |
cgtcatacaatttagga |
452 |
Q |
| |
|
| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
42159036 |
cctcatacaatttagga |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #148
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 240 - 346
Target Start/End: Original strand, 9267686 - 9267792
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339 |
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| |
|
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|
|
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 |
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tatcttt |
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Q |
| |
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|
|
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tatcttt |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #149
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 240 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 30157626 - 30157413
Alignment:
| Q |
240 |
aaattgtatgtcactttacaataccaatgaaacattaatgttatttttcctattataaccttaactatttattactctctcttctttcaagtcttttatt |
339 |
Q |
| |
|
||||| |||||| ||||||||| ||||| ||||||||| ||| |||| ||||| |||| |||||||||| ||||| ||| || |||||| ||||| ||| |
|
|
| T |
30157626 |
aaattatatgtcgttttacaatatcaatgcaacattaatattaatttttctattgtaactttaactattttttactatctattttttcaattctttcatt |
30157527 |
T |
 |
| Q |
340 |
tatcttt--------ttcat--aggacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatatgtgtgaaatgc |
429 |
Q |
| |
|
||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
30157526 |
tatctttccatattatttattaaggacaattttgtaaaacaactcataatatattttttccacacaatattaattacatttcttaatatgt-tgaaatgc |
30157428 |
T |
 |
| Q |
430 |
ccaaaacgtcataca |
444 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||| |
|
|
| T |
30157427 |
ccaaaacatcataca |
30157413 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #150
Raw Score: 86; E-Value: 9e-41
Query Start/End: Original strand, 233 - 463
Target Start/End: Complemental strand, 23681949 - 23681715
Alignment:
| Q |
233 |
ttgtcccaaattgtatgtcactttacaataccaatgaaacattaatgttatttttcctattataaccttaactatttattactctctcttctttcaagtc |
332 |
Q |
| |
|
|||||||||||| |||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| | ||||||||| | |
|
|
| T |
23681949 |
ttgtcccaaattatatgtcgctttacaata-------aatattaatgttatttttcctattatatccttaactattaattactcaatattctttcaatta |
23681857 |
T |
 |
| Q |
333 |
ttttatttatctttttcata-----------ggacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatatgtg |
421 |
Q |
| |
|
||| ||||||||||| |||| ||| ||||||||||| ||||||||||| |||||| |||| |||||||||||| ||||||||||| ||| |
|
|
| T |
23681856 |
tttcatttatcttttccataccatttattaaggataattttgtaaaccaactcataatttctcttccccacccaatattaattatatttcttaatacgtg |
23681757 |
T |
 |
| Q |
422 |
tgaaatgcccaaaacgtcatacaatttaggatgaagggagta |
463 |
Q |
| |
|
| ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
23681756 |
taaaatggccaaaacgtcatacaatttaggatggagggagta |
23681715 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #151
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 293 - 448
Target Start/End: Original strand, 16999294 - 16999460
Alignment:
| Q |
293 |
tataaccttaactatttattactctctcttctttcaagtcttttatttatctttt-----tcat------aggacaattttgtaaaacaactcataatat |
381 |
Q |
| |
|
|||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| || || ||||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
16999294 |
tatatccttaactatttattactctctattctttcaattccttcatttatcttttctatatcatttattgaggataattttgtaaaacaactcataatat |
16999393 |
T |
 |
| Q |
382 |
ctcttttccacacaatattaattacatttcttaatatgtgtgaaatgcccaaaacgtcatacaattt |
448 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
16999394 |
ctctttcccacacaatattaattacattttttaatatatgtgaaatgcctaaaacgtcatacaattt |
16999460 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #152
Raw Score: 83; E-Value: 5e-39
Query Start/End: Original strand, 231 - 448
Target Start/End: Original strand, 3457065 - 3457288
Alignment:
| Q |
231 |
atttgtcccaaattgtatgtcactttacaataccaatgaaacattaatgttatttttcctattataaccttaactatttattactctctcttctttcaag |
330 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||| |||||| |||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
3457065 |
atttgtcctaaattatatgtcgttttataataccaatgaaatattaatgttacttttcctattatatccttaac-----attactctctcttctttcaat |
3457159 |
T |
 |
| Q |
331 |
tcttttatttatctttttcata-----------ggacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatatg |
419 |
Q |
| |
|
| ||| |||||| |||| |||| | | ||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||||| | |
|
|
| T |
3457160 |
tatttcatttattttttccatactatttattaagaataattttgtaaaacaactcataatttcttttccccacacaatattaattacatttcttaatacg |
3457259 |
T |
 |
| Q |
420 |
tgtgaaatgcccaaaacgtcatacaattt |
448 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
3457260 |
tgtgaaatagccaaaacgtcatacaattt |
3457288 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #153
Raw Score: 81; E-Value: 8e-38
Query Start/End: Original strand, 261 - 463
Target Start/End: Original strand, 11018490 - 11018702
Alignment:
| Q |
261 |
taccaatgaaacattaatgttatttttcctattataaccttaactatttattactctctcttctttcaagtcttttatttatcttt--------ttcat- |
351 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||| ||||| ||||| ||| | || ||| |||||| ||||| |||||||||| || || |
|
|
| T |
11018490 |
taccaatgcaacattaatgttaatttttctattataatcttaattatttcttattatcccttttttcaattctttcatttatctttccatattatttatt |
11018589 |
T |
 |
| Q |
352 |
-aggacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatatgtgtgaaatgcccaaaacgtcatacaatttag |
450 |
Q |
| |
|
| || ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | |
|
|
| T |
11018590 |
aaagaaaattttgtaaaacaattcataatatcttttttccacacaatattaattgcatttattaatatgtgtgaaatgctcaaaacgtcatacaatttgg |
11018689 |
T |
 |
| Q |
451 |
gatgaagggagta |
463 |
Q |
| |
|
|||| | |||||| |
|
|
| T |
11018690 |
gatggatggagta |
11018702 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #154
Raw Score: 81; E-Value: 8e-38
Query Start/End: Original strand, 352 - 464
Target Start/End: Complemental strand, 11587867 - 11587755
Alignment:
| Q |
352 |
aggacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatatgtgtgaaatgcccaaaacgtcatacaatttagg |
451 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| || |
|
|
| T |
11587867 |
aggacaattttgtaaaacaactcataatatctctttcccatacaatattaattatatttcttaatatgtgtgaaatgctcaaaacgtcatataatttggg |
11587768 |
T |
 |
| Q |
452 |
atgaagggagtaa |
464 |
Q |
| |
|
| | ||||||||| |
|
|
| T |
11587767 |
acggagggagtaa |
11587755 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #155
Raw Score: 81; E-Value: 8e-38
Query Start/End: Original strand, 190 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 31231156 - 31231000
Alignment:
| Q |
190 |
tactccatccgtcctaaattgtatgtcattttnnnnnnnntatttgtcccaaattgtatgtcactttacaataccaatgaaacattaatgttatttttcc |
289 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |
|
|
| T |
31231156 |
tactccctccgtccaaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattatatgtcgctttacaataccaatgaaaaattaatgttacttttcg |
31231057 |
T |
 |
| Q |
290 |
tattataaccttaactatttattactctctcttctttcaagtcttttatttatcttt |
346 |
Q |
| |
|
||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| || || |||||||||| |
|
|
| T |
31231056 |
tattatatccttaactatttattactctcttttctttcaattccttcatttatcttt |
31231000 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #156
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 231 - 461
Target Start/End: Complemental strand, 32642638 - 32642399
Alignment:
| Q |
231 |
atttgtcccaaattgtatgtcactttacaataccaatgaaacattaatgttatttttcctattataaccttaactatttattactctctcttctttcaag |
330 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| ||| ||| ||| |||||||||| ||||||| |||||| |||||| |||||| |||| ||||||||||| | | || |||||| |
|
|
| T |
32642638 |
atttgtcccaaattatatatcattttccaataccaataaaacatttatgttacttttcc-attatatcctttactatttattaaaatatgttttttcaat |
32642540 |
T |
 |
| Q |
331 |
tcttttatttatctttttcata-----------ggacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatatg |
419 |
Q |
| |
|
||||| ||||||||| | |||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |
|
|
| T |
32642539 |
tctttcatttatcttatccatactatttattaaggacaatttt-taaaataactcataatatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatacg |
32642441 |
T |
 |
| Q |
420 |
tgtgaaatgcccaaaacgtcatacaatttaggatgaagggag |
461 |
Q |
| |
|
| |||||| |||||||| ||||||||||| ||| | |||||| |
|
|
| T |
32642440 |
tatgaaatacccaaaacatcatacaatttgggacggagggag |
32642399 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #157
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 236 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 3562511 - 3562290
Alignment:
| Q |
236 |
tcccaaattgtatgtcactttacaataccaatgaaacattaatgttatttttcctattataaccttaactatttattactctctcttctttcaagtcttt |
335 |
Q |
| |
|
||||||||| || ||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||| |||||||| |||| |
|
|
| T |
3562511 |
tcccaaattataagtcgttttacaataccgatgaaccattaatgttattttttctattatacccttaactgtttattactctct--tctttcaattcttc |
3562414 |
T |
 |
| Q |
336 |
tatttatctttttcata-----------ggacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatatgtgtga |
424 |
Q |
| |
|
|||||| | | || || ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||| | |||| |
|
|
| T |
3562413 |
aatttatttctctcgtaccatttattaaggacaattttgtaaaacaactcaaaatgtctctttcccatacaaaattaattacatttcttaatacgcgtga |
3562314 |
T |
 |
| Q |
425 |
aatgcccaaaacgtcatacaattt |
448 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
3562313 |
aatgcccaaaacgtcatataattt |
3562290 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #158
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 247 - 448
Target Start/End: Original strand, 23550708 - 23550920
Alignment:
| Q |
247 |
atgtcactttacaataccaatgaaacattaatgttatttttcctattataaccttaactatttattactctctcttctttcaagtcttttatttatcttt |
346 |
Q |
| |
|
||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||||| | |||||||||||||| | ||||||||||||| ||||| |||||||||| |
|
|
| T |
23550708 |
atgtctctttacaatactaatgaaacattaatgttactttttttattatatcattaactatttattattttctcttctttcaattctttaatttatcttt |
23550807 |
T |
 |
| Q |
347 |
ttcat-----------aggacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatatgtgtgaaatgcccaaaa |
435 |
Q |
| |
|
| || | ||||||||||||||||||||| |||||| | ||| |||||||| |||||||| |||| |||||| |||||||||||| |||| |
|
|
| T |
23550808 |
cttatactatctattaaagacaattttgtaaaacaactcgtaatatttatttcccacacaaaattaattatattttttaatacgtgtgaaatgccaaaaa |
23550907 |
T |
 |
| Q |
436 |
cgtcatacaattt |
448 |
Q |
| |
|
| ||||||||||| |
|
|
| T |
23550908 |
catcatacaattt |
23550920 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #159
Raw Score: 78; E-Value: 5e-36
Query Start/End: Original strand, 354 - 463
Target Start/End: Original strand, 24524357 - 24524466
Alignment:
| Q |
354 |
gacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatatgtgtgaaatgcccaaaacgtcatacaatttaggat |
453 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |
|
|
| T |
24524357 |
gacaattttgtaaaacaacttataatatctcttttccatacaatactaattgcatttcttaatacgtgtgaaatgcccaaaacgtcatacaatttgggac |
24524456 |
T |
 |
| Q |
454 |
gaagggagta |
463 |
Q |
| |
|
| |||||||| |
|
|
| T |
24524457 |
ggagggagta |
24524466 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #160
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 231 - 402
Target Start/End: Original strand, 5665712 - 5665894
Alignment:
| Q |
231 |
atttgtcccaaattgtatgtcactttacaataccaatgaaacattaatgttatttttcctattataaccttaactatttattactctctcttctttcaag |
330 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||||| |||||||||||| |||||| |||||||||| |||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
5665712 |
atttgtcccaaattatatgtcgctttacaataccgatgaaatattaatgttacttttactattatatccttaactattaattactctctcttctttcaat |
5665811 |
T |
 |
| Q |
331 |
tcttttatttatctttttcat-----------aggacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaatattaa |
402 |
Q |
| |
|
| ||| ||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||| |
|
|
| T |
5665812 |
tatttcatttatcttttccataccatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacgcaatattaa |
5665894 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #161
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 255 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 5062338 - 5062156
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| Q |
255 |
ttacaataccaatgaaacattaatgttatttttcctattataaccttaactatttattactctctcttctttcaagtcttttatttatctttt-----tc |
349 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||| || |
|
|
| T |
5062338 |
ttacaatactaatgaaacattaatgttatttatcctattatatccttacatatttattactctct--tctttcaattcttttatttatttttcctatatc |
5062241 |
T |
 |
| Q |
350 |
at------aggacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatatgtgtgaaatg |
428 |
Q |
| |
|
|| ||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||| |
|
|
| T |
5062240 |
atttattaaggacaattttataaaacaactgataatatatcttttccacacaaaattaattacattttttaatacgtgtgaaatg |
5062156 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #162
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 231 - 449
Target Start/End: Complemental strand, 9792308 - 9792079
Alignment:
| Q |
231 |
atttgtcccaaattgtatgtcactttacaataccaatgaaacattaatgttatttttcctattataaccttaactatttattactctctcttctttcaag |
330 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||| |||||| ||| |||| |||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
9792308 |
atttgttccaaattatatgtcgttttacaataccaatgaaatattaatattactttttctattatatccttaaatatttattactctatcttctttcaac |
9792209 |
T |
 |
| Q |
331 |
tcttttatttatcttt---------ttcat--aggacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatatg |
419 |
Q |
| |
|
|| || |||||||||| || || | ||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||| |
|
|
| T |
9792208 |
tccttcatttatctttcttgtatcctttattaatgacaattttataaaattgctcataatatctctttcccacacaatattaattgtatttctcaatatg |
9792109 |
T |
 |
| Q |
420 |
tgtgaaatgcccaaaacgtcatacaattta |
449 |
Q |
| |
|
|| |||||| ||||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
9792108 |
tgctaaatgctcaaaacgtcgtacaattta |
9792079 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #163
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 238 - 352
Target Start/End: Original strand, 24523984 - 24524098
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| Q |
238 |
ccaaattgtatgtcactttacaataccaatgaaacattaatgttatttttcctattataaccttaactatttattactctctcttctttcaagtctttta |
337 |
Q |
| |
|
||||||| |||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
24523984 |
ccaaattatatgtcgttttacaataccaatgcaacgttaatgttacttttcctattataaccttaactatttattactttatcttctttcaattctttta |
24524083 |
T |
 |
| Q |
338 |
tttatctttttcata |
352 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||| |
|
|
| T |
24524084 |
tttatcttttccata |
24524098 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #164
Raw Score: 73; E-Value: 5e-33
Query Start/End: Original strand, 352 - 448
Target Start/End: Original strand, 9268092 - 9268188
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| Q |
352 |
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448 |
Q |
| |
|
||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
9268092 |
aggacaattttataaaataactcataatatctcttttccacataatattaattgcatttcttaatatgtatgaaatgtccaaaacgtcatacaattt |
9268188 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #165
Raw Score: 73; E-Value: 5e-33
Query Start/End: Original strand, 233 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 11589032 - 11588924
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| Q |
233 |
ttgtcccaaattgtatgtcactttacaataccaatgaaacattaatgttatttttcctattataaccttaactatttattactctctcttctttcaagtc |
332 |
Q |
| |
|
||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||| || |
|
|
| T |
11589032 |
ttgtcacaaattatatgtcactttacaataccaataaaacattaatgttacttttcctattatatcattaactatttattactctttcttctttcaattc |
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T |
 |
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333 |
ttttattta |
341 |
Q |
| |
|
||| ||||| |
|
|
| T |
11588932 |
tttcattta |
11588924 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #166
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 240 - 352
Target Start/End: Original strand, 167348 - 167461
Alignment:
| Q |
240 |
aaattgtatgtcactttacaataccaatg--aaacattaatgttatttttcctattataaccttaactatttattactctctcttctttcaagtctttta |
337 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| || || | |
|
|
| T |
167348 |
aaattgtatgtcactttacaataccaatataaaacattaatgttatttttcctattatatccttaactatttattactctttcttctttcaattc-ttca |
167446 |
T |
 |
| Q |
338 |
tttatctttttcata |
352 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||| |
|
|
| T |
167447 |
tttatctttctcata |
167461 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #167
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 357 - 464
Target Start/End: Original strand, 167753 - 167860
Alignment:
| Q |
357 |
aattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatatgtgtgaaatgcccaaaacgtcatacaatttaggatgaa |
456 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| | | |
|
|
| T |
167753 |
aattttgtaaaacaattcataatatttctttctcacacagtattaattacatttcttaatatgtgtgaaatgtccaaaacgtcatacaatttgggacgga |
167852 |
T |
 |
| Q |
457 |
gggagtaa |
464 |
Q |
| |
|
|||||||| |
|
|
| T |
167853 |
gggagtaa |
167860 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #168
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 231 - 352
Target Start/End: Original strand, 43564626 - 43564747
Alignment:
| Q |
231 |
atttgtcccaaattgtatgtcactttacaataccaatgaaacattaatgttatttttcctattataaccttaactatttattactctctcttctttcaag |
330 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||||| |||||||||| |||| ||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
43564626 |
atttgtcccaaattatatgtcgctttacaatatcaataaaatattaatgttacttttcctattatatccttaactattaattactccctcttctttcaat |
43564725 |
T |
 |
| Q |
331 |
tcttttatttatctttttcata |
352 |
Q |
| |
|
| ||| ||||||||||| |||| |
|
|
| T |
43564726 |
tatttcatttatcttttccata |
43564747 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #169
Raw Score: 68; E-Value: 5e-30
Query Start/End: Original strand, 233 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 15286598 - 15286483
Alignment:
| Q |
233 |
ttgtcccaaattgtatgtcactttacaataccaatgaaacattaatgttatttttcctattataaccttaactatttattactctctcttctttcaagtc |
332 |
Q |
| |
|
|||||||||||| |||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| | |
|
|
| T |
15286598 |
ttgtcccaaattatatgtcgttttacaataccaatgcaacattaatgttgtttttcctattataactttaactatttattactcaatcttctttcaattt |
15286499 |
T |
 |
| Q |
333 |
ttttatttatcttttt |
348 |
Q |
| |
|
||| ||||||||||| |
|
|
| T |
15286498 |
tttcctttatcttttt |
15286483 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #170
Raw Score: 68; E-Value: 5e-30
Query Start/End: Original strand, 233 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 15466967 - 15466852
Alignment:
| Q |
233 |
ttgtcccaaattgtatgtcactttacaataccaatgaaacattaatgttatttttcctattataaccttaactatttattactctctcttctttcaagtc |
332 |
Q |
| |
|
|||||||||||| |||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| | |
|
|
| T |
15466967 |
ttgtcccaaattatatgtcgttttacaataccaatgcaacattaatgttgtttttcctattataactttaactatttattactcaatcttctttcaattt |
15466868 |
T |
 |
| Q |
333 |
ttttatttatcttttt |
348 |
Q |
| |
|
||| ||||||||||| |
|
|
| T |
15466867 |
tttcctttatcttttt |
15466852 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #171
Raw Score: 68; E-Value: 5e-30
Query Start/End: Original strand, 254 - 462
Target Start/End: Complemental strand, 33987494 - 33987272
Alignment:
| Q |
254 |
tttacaataccaatgaaacattaatgttatttttcctattataaccttaactatttattactctctcttctttcaagtcttttatttatctttttcata- |
352 |
Q |
| |
|
|||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| | ||| || |||||| | ||| ||||||||||| |||| |
|
|
| T |
33987494 |
tttataataccaataaaacattaatgttatttttgatattatatccttaactatttattattttctgttttttcaattttttaatttatcttttccatat |
33987395 |
T |
 |
| Q |
353 |
-------------ggacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatatgtgtgaaatgcccaaaacgtc |
439 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| | || |||||| |||||||||||| |||||||| |||| |||| | |||||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
33987394 |
catttattaataaggacaattttgtaaaacagtttatcatatctattttccacacaaaattaattatattttttaacaagtgtgaaatgcctaaaacgtc |
33987295 |
T |
 |
| Q |
440 |
atacaatttaggatgaagggagt |
462 |
Q |
| |
|
||||||||| ||| | ||||||| |
|
|
| T |
33987294 |
atacaatttgggacggagggagt |
33987272 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #172
Raw Score: 68; E-Value: 5e-30
Query Start/End: Original strand, 234 - 447
Target Start/End: Original strand, 36821853 - 36822076
Alignment:
| Q |
234 |
tgtcccaaattgtatgtcactttacaataccaatgaaacattaatgttatttttcctattataaccttaactatttattactctctctt--ctttcaagt |
331 |
Q |
| |
|
||||||||||| |||||| |||||||||||| | ||| |||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||| | | || ||||||| | |
|
|
| T |
36821853 |
tgtcccaaattatatgtcgttttacaataccactaaaaaattaatgttacatttcctattatatcctcaactatttattacttttttttttctttcaatt |
36821952 |
T |
 |
| Q |
332 |
cttttatttatctttttcat-----------aggacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatatgt |
420 |
Q |
| |
|
|||| ||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||||| | ||| |||||||| |||||| ||||||||||| || |
|
|
| T |
36821953 |
ctttaatttatcttttccatgccaattattgaggacaactttgtaaaacaactcataatatttatttcccacacaaaattaat---atttcttaatacgt |
36822049 |
T |
 |
| Q |
421 |
gtgaaatgcccaaaacgtcatacaatt |
447 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||||| |||||||||| |
|
|
| T |
36822050 |
gtgaaatgcctaaaacatcatacaatt |
36822076 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #173
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 234 - 352
Target Start/End: Original strand, 27421265 - 27421383
Alignment:
| Q |
234 |
tgtcccaaattgtatgtcactttacaataccaatgaaacattaatgttatttttcctattataaccttaactatttattactctctcttctttcaagtct |
333 |
Q |
| |
|
||||||||||| |||| | |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||| | |||||||||||||||||| |||| |||||| | | |
|
|
| T |
27421265 |
tgtcccaaattatatgccgctttacaatatcaatgaaacattaatgttacttttcttattatatctttaactatttattactctatcttatttcaattat |
27421364 |
T |
 |
| Q |
334 |
tttatttatctttttcata |
352 |
Q |
| |
|
|| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
27421365 |
ttaatttatctttttcata |
27421383 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #174
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 252 - 341
Target Start/End: Original strand, 17505142 - 17505231
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| Q |
252 |
actttacaataccaatgaaacattaatgttatttttcctattataaccttaactatttattactctctcttctttcaagtcttttattta |
341 |
Q |
| |
|
||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||| |
|
|
| T |
17505142 |
actttacaatatcaatgaagcattaatgttatttttcctattatatcattaactatttattactctctattctttcaattctttgattta |
17505231 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #175
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 246 - 449
Target Start/End: Complemental strand, 6900104 - 6899892
Alignment:
| Q |
246 |
tatgtcactttacaataccaatgaaacattaatgttatttttcctattataaccttaactatttattactctctcttctttcaagtcttttatttatctt |
345 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||| ||| |||||||||| | | | ||||||||||| ||||| || ||| || |
|
|
| T |
6900104 |
tatgtcattttacaataccaacgaaacattaatgttaattttcctataatatcct-aactatttatcattttttcttctttcaattctttcatatatttt |
6900006 |
T |
 |
| Q |
346 |
tttc--------at--aggacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatatgtgtgaaatgcccaaaa |
435 |
Q |
| |
|
||| || |||||||||||| |||||| |||||||||||| |||| |||| || |||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||| |
|
|
| T |
6900005 |
tttatatcttttattaaggacaattttgcaaaacatctcataatatcttttttacacagaaaattaattatatttcttaatacgtgtgaaatagccaaaa |
6899906 |
T |
 |
| Q |
436 |
cgtcatacaattta |
449 |
Q |
| |
|
||||| |||||| |
|
|
| T |
6899905 |
tttcatataattta |
6899892 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #176
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 359 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 28481942 - 28481853
Alignment:
| Q |
359 |
ttttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatatgtgtgaaatgcccaaaacgtcatacaattt |
448 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||| ||||||||| | ||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
28481942 |
ttttgtaaaacaactcataatatctcttttccatacaaaattaattacatttattaatacatgtgaaatgacaaaaacgtcatataattt |
28481853 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #177
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 254 - 450
Target Start/End: Original strand, 35455468 - 35455672
Alignment:
| Q |
254 |
tttacaataccaatgaaacattaatgttatttttcctattataaccttaactatttattactctctcttctttcaagtcttttatttatcttt------- |
346 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||||| ||||||||||| || ||||| |||||||||| |
|
|
| T |
35455468 |
tttacaatactaatgaaacattaatgttattttttctattatatctttaactatttatta--ctctcttcttttaattctttaatttatctttcatatac |
35455565 |
T |
 |
| Q |
347 |
--ttcat--aggacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatatgtgtgaaatgcccaaaacgtcata |
442 |
Q |
| |
|
|| || |||| ||||||||||| |||||||||||| | ||| |||||||| ||| |||| ||||||||||| || |||||| | ||||| ||||| |
|
|
| T |
35455566 |
catttattaaggataattttgtaaaccaactcataata-gtatttcccacacaaaattcattatatttcttaataagtttgaaatatctaaaacatcata |
35455664 |
T |
 |
| Q |
443 |
caatttag |
450 |
Q |
| |
|
|||||||| |
|
|
| T |
35455665 |
caatttag |
35455672 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #178
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 254 - 438
Target Start/End: Original strand, 44012274 - 44012469
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| Q |
254 |
tttacaataccaatgaaacattaatgttatttttcctattataaccttaactatttattactctctcttctttcaagtcttttatttatctttttcat-- |
351 |
Q |
| |
|
||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||| | ||| ||| ||||| ||||| |||||||||| |||| |
|
|
| T |
44012274 |
tttacaatatcaatgaaacattaatgttattttttctattatatcactaactatttattattatcttttcgttcaattctttaatttatctttctcatac |
44012373 |
T |
 |
| Q |
352 |
---------aggacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatatgtgtgaaatgcccaaaacgt |
438 |
Q |
| |
|
|||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||| || ||| ||||||| ||||| || ||| ||||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
44012374 |
catttattgaggataatgttgtaaaacaactcataatatttctttttcatgcaaaattaatttcattttttgatacctgtgaaatgaccaaaacgt |
44012469 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #179
Raw Score: 56; E-Value: 7e-23
Query Start/End: Original strand, 381 - 448
Target Start/End: Original strand, 15595659 - 15595726
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| Q |
381 |
tctcttttccacacaatattaattacatttcttaatatgtgtgaaatgcccaaaacgtcatacaattt |
448 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
15595659 |
tctcttttccacacaatattaattgcattttttaatatgtgtgaaatgtccaaaacgtcatacaattt |
15595726 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #180
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 254 - 448
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| Q |
254 |
tttacaataccaatgaaacattaatgttatttttcctattataaccttaactatttattactctctcttctttcaagtcttttatttatcttt------- |
346 |
Q |
| |
|
|||||||| |||| ||| |||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||| ||| ||||||| ||||| |||||||||| |
|
|
| T |
16863999 |
tttacaattccaacgaagcattaatgttatttttttgattatattcttaactacttattactctatctactttcaattctttaatttatctttcatatac |
16864098 |
T |
 |
| Q |
347 |
--ttcat--aggacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatatgtgtgaaatgcccaaaacgtcata |
442 |
Q |
| |
|
|| || || ||||||||||||||||||||||||||| | ||| || ||| ||||||||||||||||| || |||||||||| | ||||||||||| |
|
|
| T |
16864099 |
cattaattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatatttttcacattcaaaattaattacatttcttagtacgtgtgaaatgtctaaaacgtcata |
16864198 |
T |
 |
| Q |
443 |
caattt |
448 |
Q |
| |
|
||||| |
|
|
| T |
16864199 |
taattt |
16864204 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #181
Raw Score: 51; E-Value: 7e-20
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Target Start/End: Original strand, 6806716 - 6806825
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| Q |
233 |
ttgtcccaaattgtatgtcactttacaataccaatgaaacattaatgttatttttcctattataaccttaactatttattactctctcttctttcaagtc |
332 |
Q |
| |
|
||||| |||||| |||||| | |||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||| || |
|
|
| T |
6806716 |
ttgtcacaaattatatgtcgttatacaataccaatgaaatattaatgttactttttctattatattcttaact-tttattactctatcttctttcaattc |
6806814 |
T |
 |
| Q |
333 |
ttttatttatc |
343 |
Q |
| |
|
||| ||||||| |
|
|
| T |
6806815 |
tttcatttatc |
6806825 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #182
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 240 - 342
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| Q |
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aaattgtatgtcactttacaataccaatgaaacattaatgttatttttcctattataaccttaactatttattactctctcttctttcaagtcttttatt |
339 |
Q |
| |
|
||||| || ||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||| | ||| ||| |
|
|
| T |
19713070 |
aaattataagtcgctttacaatatcaatgaaatattaatgttatttttattaatataatcttaactatttataactctctctgctttcaattatttaatt |
19713169 |
T |
 |
| Q |
340 |
tat |
342 |
Q |
| |
|
||| |
|
|
| T |
19713170 |
tat |
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #183
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296 |
Q |
| |
|
||||||| |||||| |||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
43414058 |
atttgtctcaaattatatgtcgctttacaatatcaatgaaatattaatgttatttttcctattata |
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #184
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tactccatccgtcctaaattgtatgtcattttnnnnnnnntatttgtcccaaattgtatgtcactttacaataccaatgaaacattaatgtta |
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Q |
| |
|
|||||| ||||||| ||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
23597261 |
tactccctccgtcccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttatcccaaattgtatgtcgctttacaataccaatgaaaaattaatgtta |
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #185
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| Q |
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ataccaatgaaacattaatgttatttttcctattataaccttaactatttattactctctcttctttcaagtcttttatttatctttttcata |
352 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| || | |||||||| || ||| |||||||||||| ||||||||||| | ||| |||||||||| ||||| |
|
|
| T |
38503188 |
ataccaatgaaacattaatgttacttcttctattatatccataatgatttattactctatcttctttcaattttttcatttatctttctcata |
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #186
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| Q |
378 |
atatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatatgtgtgaaatgcccaaaacg |
437 |
Q |
| |
|
|||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| |
|
|
| T |
42981490 |
atatctttttcccacacaatattaattacatttcttaatatgtgtgaaatgtctaaaacg |
42981549 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #187
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Target Start/End: Complemental strand, 38832843 - 38832661
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| Q |
254 |
tttacaataccaatgaaacattaatgttatttttcctattataaccttaactatttattactctctcttctttcaagtcttttatttatctttttcat-- |
351 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| ||||||| ||| ||| ||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||| | || |||||||||| |||| |
|
|
| T |
38832843 |
tttacaataccaatgaagcattaatcttacgttttctattataa-cataactatttattaccttctcttctttcaatttcttaatttatctttctcatac |
38832745 |
T |
 |
| Q |
352 |
---------aggacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatatgtgtgaaat |
427 |
Q |
| |
|
| || ||| ||||||||||||||||||||||| ||| || |||| |||||||||||||| ||||| ||||||||| |
|
|
| T |
38832744 |
catatattaaagataatgttgtaaaacaactcataatatct-tttcacatacaaaattaattacatttcataatacgtgtgaaat |
38832661 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #188
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| Q |
395 |
aatattaattacatttcttaatatgtgtgaaatgcccaaaacgtcatacaattt |
448 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
4408139 |
aatattaatgacatttcttaatacgtgtgaaatgtccaaaacgtcatacaattt |
4408192 |
T |
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Target: chr8; HSP #189
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| Q |
262 |
accaatgaaacattaatgttatttttcctattataaccttaactatttattactctctcttctttcaagtcttttatttatctttttcat---------- |
351 |
Q |
| |
|
||||||| ||| ||||| ||| ||| |||||||||| ||||||||||||| ||| ||| ||||||||| ||||| |||||| ||| |||| |
|
|
| T |
15595495 |
accaatgcaactttaatattactttccctattataatcttaactatttataactttcttttctttcaattctttcatttatttttctcatattatttatt |
15595594 |
T |
 |
| Q |
352 |
-aggacaattttgtaaaacaactcataatatctct |
385 |
Q |
| |
|
|||| ||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
15595595 |
aaggataattttgtaaaacaactcataatatctct |
15595629 |
T |
 |
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Target: chr8; HSP #190
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| Q |
230 |
tatttgtcccaaattgtatgtcactttacaataccaatgaaacattaatgttatttttcctatta |
294 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||| ||||| |
|
|
| T |
16998933 |
tatttgtcctaaattatatgtcactttacaatatcaatgaaaaattaatgttacttttcatatta |
16998997 |
T |
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| Q |
231 |
atttgtcccaaattgtatgtcactttacaataccaatgaaacattaatgttatttttcctattataaccttaactatttattactctctcttctttcaag |
330 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| ||||| | ||||||||||||| ||||||||||||| |||| |||| | ||||||||||||||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
4408005 |
atttgtcccaaattatatgttgcgttacaataccaatacaacattaatgttactttttctatga------taactatttattactctctctcctttcaag |
4408098 |
T |
 |
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Target: chr8; HSP #192
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| Q |
240 |
aaattgtatgtcactttacaataccaatgaaacattaatgttatttttcctattataaccttaactatttatta |
313 |
Q |
| |
|
||||||||||| |||||| ||||||||| ||| ||| ||||||||||| |||||||| | |||| ||||||||| |
|
|
| T |
31154984 |
aaattgtatgttactttataataccaataaaatattgatgttattttttctattatatctttaattatttatta |
31155057 |
T |
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| Q |
240 |
aaattgtatgtcactttacaataccaatgaaacattaatgttatttttcctattataaccttaactatttattactctctcttctttcaagtcttttatt |
339 |
Q |
| |
|
||||| || ||| |||||||||| |||| || |||||||||| ||||| ||||||||| |||| ||||||||||| | |||||||| | ||||| ||| |
|
|
| T |
18185426 |
aaattataggtcgctttacaataacaataaagtattaatgttacttttcttattataactttaattatttattactttatcttcttttagttctttaatt |
18185525 |
T |
 |
| Q |
340 |
tatctttttcatag-----------gacaattttgtaaaacaactcata--atatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatatgt |
420 |
Q |
| |
|
||| ||| ||||| |||||||||||||||||| | ||| |||| |||||| || |||| |||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
18185526 |
tatttttctcataccatttattaaagacaattttgtaaaacaattaatataatatttctttttcatacaaagttaattacatttcttaatatgt |
18185619 |
T |
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| Q |
352 |
aggacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatatgtgtgaaatg |
428 |
Q |
| |
|
|||| |||||||| ||| ||| ||||| | ||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
27116722 |
aggataattttgttaaattacttataatttatcttttccatacaacattaattacatttcttaatttgtgtgaaatg |
27116798 |
T |
 |
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| Q |
352 |
aggacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaatattaattacatttcttaat |
416 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| |||||||| || | ||| |||||||| ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
38870348 |
aggacaattttgtaaaataactcatatcatatttttcccacacaaaattaattacatttcttaat |
38870412 |
T |
 |
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Target: chr8; HSP #196
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Alignment:
| Q |
254 |
tttacaataccaatgaaacattaatgttatttttcctattataaccttaactatttatta |
313 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||| |
|
|
| T |
40824228 |
tttacaatatcaatgaaacattaatgttatttttcttattat--ctttaactatttatta |
40824171 |
T |
 |
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| Q |
354 |
gacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaatattaattacatttcttaata |
417 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| | || |||||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
14515610 |
gacaattttgtaaaataactcattttatctcttttccatataaaattaattatatttcttaata |
14515547 |
T |
 |
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Target: chr8; HSP #198
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| Q |
260 |
ataccaatgaaacattaatgttatttttcctattataaccttaactatttattactctctcttctttcaagtcttttatttatcttt |
346 |
Q |
| |
|
|||||||| |||||||||| | ||||| ||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||| | ||| |||||||||| |
|
|
| T |
36648563 |
ataccaataaaacattaatatatttttt--tattatatcattaactatttattactgtctcttctttcaattttttaatttatcttt |
36648647 |
T |
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| Q |
272 |
cattaatgttatttttcctattataaccttaactatttattactctctcttctttcaagtcttttatttatctttttcataggacaattttgtaaaacaa |
371 |
Q |
| |
|
||||||||||| |||| | |||| | ||||| |||||||||||| ||||||||||| | ||| ||||||||||| |||| | |||||||||||| || |
|
|
| T |
42821055 |
cattaatgttactttttcaattacacacttaaatatttattactcattcttctttcaattatttaatttatcttttccataagttaattttgtaaaataa |
42820956 |
T |
 |
| Q |
372 |
ctcataat |
379 |
Q |
| |
|
|| ||||| |
|
|
| T |
42820955 |
cttataat |
42820948 |
T |
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Target: chr8; HSP #200
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| Q |
236 |
tcccaaattgtatgtcactttacaataccaatgaaacattaatgtta |
282 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
24530135 |
tcccaaattatatgtcattttacaataacaatgaaacattaatgtta |
24530089 |
T |
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Target: chr8; HSP #201
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| Q |
357 |
aattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatatgtgtgaaat |
427 |
Q |
| |
|
||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| || |||||||| |||| |||||| ||||||||| |
|
|
| T |
36466864 |
aattttgtaaatcaactcataatatcttttttccatgtaaaattaattatattttttaatacgtgtgaaat |
36466794 |
T |
 |
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Target: chr8; HSP #202
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| Q |
352 |
aggacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatatgtgtgaaatgcccaaaacgtcatacaattt |
448 |
Q |
| |
|
||||||||||| |||||||| ||||||||| | ||| |||| || |||||||| ||||||||||| |||| ||||| |||||| ||||| ||||| |
|
|
| T |
1214753 |
aggacaattttataaaacaattcataatattttttt--cacataaaattaattatatttcttaatacgtgttaaatgttcaaaacttcatataattt |
1214847 |
T |
 |
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| Q |
261 |
taccaatgaaacattaatgtta-tttttcctattataaccttaactatttattactctctcttctttcaagtcttttatttatctttttcataggacaat |
359 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||| | ||||| |||| | || | ||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
6893516 |
taccaatgaatcattaatgttactttttcatattatgctcttaactatttattactttatcttcagtcaatttttaaagttatctttttcat-tgacaat |
6893418 |
T |
 |
| Q |
360 |
tttgtaaaacaact |
373 |
Q |
| |
|
||| |||||||||| |
|
|
| T |
6893417 |
tttataaaacaact |
6893404 |
T |
 |
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| Q |
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ttgtcccaaattgtatgtcactttacaataccaatgaaacattaatgttatttttcctattataaccttaactatttattactctctcttctttcaagtc |
332 |
Q |
| |
|
|||||||||||| || || |||||||| ||||||| ||||||||||| |||| |||||||| | || | |||||||||||||| || |||||| || |
|
|
| T |
28482079 |
ttgtcccaaattataagttgttttacaatttcaatgaagcattaatgttactttttctattatacctttcattatttattactctccctactttcagttc |
28481980 |
T |
 |
| Q |
333 |
ttttatttatcttt |
346 |
Q |
| |
|
||| |||| ||||| |
|
|
| T |
28481979 |
tttaatttgtcttt |
28481966 |
T |
 |
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atttgtcccaaattgtatgtcactttacaataccaatgaaacattaatgttatttttcctattataaccttaactatttattactctct |
319 |
Q |
| |
|
|||||| | ||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||| ||| |||| ||||||| |||||||| ||| ||||||||| |
|
|
| T |
3360234 |
atttgtacaaaattatatgtccttttacaatattaatgaaacattaatattacttttgttattatatccttaactctttgttactctct |
3360322 |
T |
 |
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aggacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaa |
396 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||| |
|
|
| T |
42351405 |
aggacaattttgtaaaataactcataatatctttttcccacacaa |
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T |
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aattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaatattaattacatttcttaat |
416 |
Q |
| |
|
|||||||||||| |||| ||||| ||||||||| | |||| ||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
11094265 |
aattttgtaaaataactaataatttctcttttcaatacaaaattaattacattttttaat |
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T |
 |
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| Q |
357 |
aattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatatgtgtgaaatg |
428 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| |||| | || ||||| ||| |||| || ||||| ||||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
33299545 |
aattttgtaaaacaaatcatgacatttctttcccatacaaaataaattatatttcttaatacgtgtgaaatg |
33299474 |
T |
 |
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caaattgtatgtcactttacaataccaatgaaacattaatgttatttttcctatta |
294 |
Q |
| |
|
|||||| |||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
38870231 |
caaattatatgtcgttttacaataccaataaaatattaatgttattttttctatta |
38870286 |
T |
 |
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| Q |
354 |
gacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaatattaatta |
405 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| || ||||||||||| |||| ||||||| |||||||| |
|
|
| T |
43413850 |
gacaattttgtaaaataattcataatatctatttttcacacaaaattaatta |
43413799 |
T |
 |
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254 |
tttacaataccaatgaaacattaatgttatttttcctattataaccttaactatttat |
311 |
Q |
| |
|
||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
28072020 |
tttacaataataatgaaacattaatgttatttttc--gttatatccttaactatttat |
28071965 |
T |
 |
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attataaccttaactatttattactctctcttctttcaagtcttttatttatctttttcata |
352 |
Q |
| |
|
|||||| | |||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||| |||||| ||| ||||| |
|
|
| T |
9634906 |
attataccattaactatatattagtctctcttctttcaattctttaatttatttttctcata |
9634967 |
T |
 |
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412 |
ttaatatgtgtgaaatgcccaaaacgtcatacaatttaggatgaagggag |
461 |
Q |
| |
|
|||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||| |
|
|
| T |
43564804 |
ttaatacgtatgaaatgaccaaaacgtcatacaatttaggacggagggag |
43564853 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #214
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 267 - 351
Target Start/End: Original strand, 15715614 - 15715697
Alignment:
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267 |
tgaaacattaatgttatttttcctattataaccttaactatttattactctctcttctttcaagtcttttatttatctttttcat |
351 |
Q |
| |
|
|||| ||||||| ||| |||| |||||||| | ||||||||||||| | ||| ||| ||||| ||||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
15715614 |
tgaagcattaatattactttttctattatatctttaactatttattcatttcttttc-ttcaattctttaatttatctttttcat |
15715697 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #215
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 357 - 397
Target Start/End: Original strand, 43564763 - 43564803
Alignment:
| Q |
357 |
aattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaat |
397 |
Q |
| |
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||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |
|
|
| T |
43564763 |
aattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaat |
43564803 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2 (Bit Score: 211; Significance: 1e-115; HSPs: 211)
Name: chr2
Description:
Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 190 - 452
Target Start/End: Original strand, 34213127 - 34213389
Alignment:
| Q |
190 |
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289 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
34213127 |
tactccctccgtcccaaattgtatgtcatttagaaaaaaatatttgttccaaattgtatgtcactttacaataccaatgaaacattaatgttatttttcc |
34213226 |
T |
 |
| Q |
290 |
tattataaccttaactatttattactctctcttctttcaagtcttttatttatctttttcataggacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttc |
389 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
34213227 |
tattataaccttaactatttattactctctcttctttcaagtcttttatttatcttttccataggacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttc |
34213326 |
T |
 |
| Q |
390 |
cacacaatattaattacatttcttaatatgtgtgaaatgcccaaaacgtcatacaatttagga |
452 |
Q |
| |
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||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
34213327 |
cacacaatattaattacatttcttaatatgtgtgaaatgcccaaaacaccatacaatttagga |
34213389 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 230 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 1221280 - 1221062
Alignment:
| Q |
230 |
tatttgtcccaaattgtatgtcactttacaataccaatgaaacattaatgttatttttcctattataaccttaactatttattactctctcttctttcaa |
329 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
1221280 |
tatttgtcctaaattgtatgtcactttacaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattataaccttaactatttattactctctcttctttcaa |
1221181 |
T |
 |
| Q |
330 |
gtcttttatttatctttttcataggacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatatgtgtgaaatgc |
429 |
Q |
| |
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|
| T |
1221180 |
gtcttttatttatctttcccataggacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaatattaattaaatttcttaatatgtgtgaaatgc |
1221081 |
T |
 |
| Q |
430 |
ccaaaacgtcatacaattt |
448 |
Q |
| |
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| ||||||| ||||||||| |
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| T |
1221080 |
ctaaaacgttatacaattt |
1221062 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 176; E-Value: 2e-94
Query Start/End: Original strand, 190 - 468
Target Start/End: Complemental strand, 39927772 - 39927483
Alignment:
| Q |
190 |
tactccatccgtcctaaattgtatgtcattttnnnnnnnntatttgtcccaaattgtatgtcactttacaataccaatgaaacattaatgttatttttcc |
289 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
39927772 |
tactccctccgtcccaaattgtatgtcactttagaaaaaagatttgtcccaaattgtatgtcactttacaataccaatgaaacattaatgttacttttcc |
39927673 |
T |
 |
| Q |
290 |
tattataaccttaactatttattactctctcttctttcaagtcttttatttatctttttcat-----------aggacaattttgtaaaacaactcataa |
378 |
Q |
| |
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| T |
39927672 |
tattataaccttaactatttattactctctcttctttcaagtcttttatttatctttcccataatatttattaaggacaattttgtaaaacaactcataa |
39927573 |
T |
 |
| Q |
379 |
tatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatatgtgtgaaatgcccaaaacgtcatacaatttaggatgaagggagtaattta |
468 |
Q |
| |
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| T |
39927572 |
tatctcttttccacacaatattagttacatttcttaatatgtgtgaaatgcccaaaacgtcgtacaatttgggacggagggagtagttta |
39927483 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 162; E-Value: 4e-86
Query Start/End: Original strand, 231 - 463
Target Start/End: Complemental strand, 26850063 - 26849820
Alignment:
| Q |
231 |
atttgtcccaaattgtatgtcactttacaataccaatgaaacattaatgttatttttcctattataaccttaactatttattactctctcttctttcaag |
330 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
26850063 |
atttgtcccaaattgtatgtcactttacaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatccttaactatttattactctttcttttttcaat |
26849964 |
T |
 |
| Q |
331 |
tcttttatttatctttttcata-----------ggacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatatg |
419 |
Q |
| |
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||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
26849963 |
tctttcatttatctttcccatatcatttattaaggacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatatg |
26849864 |
T |
 |
| Q |
420 |
tgtgaaatgcccaaaacgtcatacaatttaggatgaagggagta |
463 |
Q |
| |
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|
| T |
26849863 |
tgtgaaatgcccaaaacgtcatacaatttgggacggagggagta |
26849820 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 160; E-Value: 6e-85
Query Start/End: Original strand, 190 - 464
Target Start/End: Complemental strand, 24000406 - 24000121
Alignment:
| Q |
190 |
tactccatccgtcctaaattgtatgtcattttnnnnnnnntatttgtcccaaattgtatgtcactttacaataccaatgaaacattaatgttatttttcc |
289 |
Q |
| |
|
||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
24000406 |
tactccatccgtctcaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttacaataccaatgaaacattaatgtttcttttcc |
24000307 |
T |
 |
| Q |
290 |
tattataaccttaactatttattactctctcttctttcaagtcttttatttatctttttcat-----------aggacaattttgtaaaacaactcataa |
378 |
Q |
| |
|
||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
24000306 |
tattatatccttaactatttattactctttcttctttcaattctttcatttatctttctcatatcatttattaaggataattttgtaaaacaactcataa |
24000207 |
T |
 |
| Q |
379 |
tatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatatgtgtgaaatgcccaaaacgtcatacaatttaggatgaagggagtaa |
464 |
Q |
| |
|
||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||| |
|
|
| T |
24000206 |
tatctttttcccacacaatattaattacatttcttaatatgtgtgaaatgcccaaaacgtcatacaatttgggacggagggagtaa |
24000121 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 159; E-Value: 2e-84
Query Start/End: Original strand, 230 - 463
Target Start/End: Original strand, 41095965 - 41096209
Alignment:
| Q |
230 |
tatttgtcccaaattgtatgtcactttacaataccaatgaaacattaatgttatttttcctattataaccttaactatttattactctctcttctttcaa |
329 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
41095965 |
tatttgtcccaaattgtatgttgctttacaataccaatgaaaaattaatgttacttttcctattatatccttaactatttattactctctcttctttcaa |
41096064 |
T |
 |
| Q |
330 |
gtcttttatttatctttttcata-----------ggacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatat |
418 |
Q |
| |
|
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|
| T |
41096065 |
ttccttcatttatctttttcatatcatttattgaggacaattttgtaaaacaactcataatatctctttcccacacaatattaattacatttcttaatat |
41096164 |
T |
 |
| Q |
419 |
gtgtgaaatgcccaaaacgtcatacaatttaggatgaagggagta |
463 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
41096165 |
gtgtgaaatgcccaaaacgtcatacaatttgggacggagggagta |
41096209 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 155; E-Value: 6e-82
Query Start/End: Original strand, 190 - 463
Target Start/End: Original strand, 14527749 - 14528033
Alignment:
| Q |
190 |
tactccatccgtcctaaattgtatgtcattttnnnnnnnntatttgtcccaaattgtatgtcactttacaataccaatgaaacattaatgttatttttcc |
289 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
14527749 |
tactccctccgtcccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcc |
14527848 |
T |
 |
| Q |
290 |
tattataaccttaactatttattactctctcttctttcaagtcttttatttatctttttcata-----------ggacaattttgtaaaacaactcataa |
378 |
Q |
| |
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|
|
| T |
14527849 |
tattatatccttaactatttattactctttattttttcaattctttcatttatctttcccatatcatttattaaggataattttgtaaaacaactcataa |
14527948 |
T |
 |
| Q |
379 |
tatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatatgtgtgaaatgcccaaaacgtcatacaatttaggatgaagggagta |
463 |
Q |
| |
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||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| |
|
|
| T |
14527949 |
tatctctttcccacacaatattaattacatttcttaatatgtgtgaaatgcccaaaacgtcatacaatttaggacggagggagta |
14528033 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 155; E-Value: 6e-82
Query Start/End: Original strand, 190 - 463
Target Start/End: Complemental strand, 14943545 - 14943261
Alignment:
| Q |
190 |
tactccatccgtcctaaattgtatgtcattttnnnnnnnntatttgtcccaaattgtatgtcactttacaataccaatgaaacattaatgttatttttcc |
289 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
14943545 |
tactccctccgtcccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttatttttcc |
14943446 |
T |
 |
| Q |
290 |
tattataaccttaactatttattactctctcttctttcaagtcttttatttatctttttcat-----------aggacaattttgtaaaacaactcataa |
378 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
14943445 |
tattatatccttaactatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttctcatatcatttattaaggataattttgtaaaacaactcataa |
14943346 |
T |
 |
| Q |
379 |
tatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatatgtgtgaaatgcccaaaacgtcatacaatttaggatgaagggagta |
463 |
Q |
| |
|
||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | | |||||||||| |
|
|
| T |
14943345 |
tatctatttcccacacaatattaattacatttcttaatatgtgtgaaatgcccaaaacatcatacaatttggaacgaagggagta |
14943261 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 154; E-Value: 2e-81
Query Start/End: Original strand, 230 - 466
Target Start/End: Complemental strand, 19240856 - 19240609
Alignment:
| Q |
230 |
tatttgtcccaaattgtatgtcactttacaataccaatgaaacattaatgttatttttcctattataaccttaactatttattactctctcttctttcaa |
329 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
19240856 |
tatttgttccaaattgtatgtcactttacaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattataatcttaactatttattactctctcttctttcaa |
19240757 |
T |
 |
| Q |
330 |
gtcttttatttatctttttcat-----------aggacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatat |
418 |
Q |
| |
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|
| T |
19240756 |
atcttttatttatatttcccatattatttattaaggacaattttgtaaaacaactcataatatttcttttccacacaatattaattacatttcttaatat |
19240657 |
T |
 |
| Q |
419 |
gtgtgaaatgcccaaaacgtcatacaatttaggatgaagggagtaatt |
466 |
Q |
| |
|
||||||||||| |||||||||||| ||||| ||| | || |||||||| |
|
|
| T |
19240656 |
gtgtgaaatgctcaaaacgtcatataatttgggacggagagagtaatt |
19240609 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 154; E-Value: 2e-81
Query Start/End: Original strand, 190 - 467
Target Start/End: Original strand, 28330744 - 28331032
Alignment:
| Q |
190 |
tactccatccgtcctaaattgtatgtcattttnnnnnnnntatttgtcccaaattgtatgtcactttacaataccaatgaaacattaatgttatttttcc |
289 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
28330744 |
tactccctccgtcccaaattgtatatcattttaaaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttacaataccaatgaaacattaatgttacttttcc |
28330843 |
T |
 |
| Q |
290 |
tattataaccttaactatttattactctctcttctttcaagtcttttatttatctttt-----tcat------aggacaattttgtaaaacaactcataa |
378 |
Q |
| |
|
||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||| || || |||||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
28330844 |
tattatatcattaactatttattactctttcttctttcaattcattcatttatctttcctatatcatttattaaggataattttgtaaaacaactcataa |
28330943 |
T |
 |
| Q |
379 |
tatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatatgtgtgaaatgcccaaaacgtcatacaatttaggatgaagggagtaattt |
467 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||| |
|
|
| T |
28330944 |
tatctctttcccacacagtattaattacatttcttaatatgtgtgaaatgcccaaaacgtcatacaatttgggacggagggagtaattt |
28331032 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 151; E-Value: 1e-79
Query Start/End: Original strand, 190 - 463
Target Start/End: Original strand, 19576046 - 19576330
Alignment:
| Q |
190 |
tactccatccgtcctaaattgtatgtcattttnnnnnnnntatttgtcccaaattgtatgtcactttacaataccaatgaaacattaatgttatttttcc |
289 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
19576046 |
tactccctccgtcttaaattgtatgtcattttagaaaaaatatttgtcccaaattatatgtcgctttacaataccaatgaaaaattaatgttatttttcc |
19576145 |
T |
 |
| Q |
290 |
tattataaccttaactatttattactctctcttctttcaagtcttttatttatctttttcat-----------aggacaattttgtaaaacaactcataa |
378 |
Q |
| |
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||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| || || |||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
19576146 |
tattatatccttaactatttattactctatcttctttcaattccttcatttatttttcccatgtcatttattgaggacaattttgtaaaacaactcataa |
19576245 |
T |
 |
| Q |
379 |
tatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatatgtgtgaaatgcccaaaacgtcatacaatttaggatgaagggagta |
463 |
Q |
| |
|
||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| | |||||||| |
|
|
| T |
19576246 |
tatctctttcccacacaatattaattacatttcttaatatgtgtgaaatgcccaaaacatcatacaatttgggacggagggagta |
19576330 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 148; E-Value: 9e-78
Query Start/End: Original strand, 190 - 463
Target Start/End: Original strand, 34036097 - 34036382
Alignment:
| Q |
190 |
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288 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |
|
|
| T |
34036097 |
tactccctccgtcctaaattgtatgtcactttaaaaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcgctttacaataccaatgaaaaattaatgttacttttc |
34036196 |
T |
 |
| Q |
289 |
ctattataaccttaactatttattactctctcttctttcaagtcttttatttatctttttcata-----------ggacaattttgtaaaacaactcata |
377 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
34036197 |
ctattatatccttaactatttattactctctcttctttcaatttcttcatttatcttttccatatcatttattgaggacaattttgtaaaacaactcata |
34036296 |
T |
 |
| Q |
378 |
atatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatatgtgtgaaatgcccaaaacgtcatacaatttaggatgaagggagta |
463 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
34036297 |
atatctctttcccacacaatattaactacatttcttaatatgtgtgaaatgcccaaaacgtcatataatttgggacggagggagta |
34036382 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 147; E-Value: 3e-77
Query Start/End: Original strand, 230 - 463
Target Start/End: Original strand, 36068144 - 36068388
Alignment:
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tatttgtcccaaattgtatgtcactttacaataccaatgaaacattaatgttatttttcctattataaccttaactatttattactctctcttctttcaa |
329 |
Q |
| |
|
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| T |
36068144 |
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36068243 |
T |
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330 |
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418 |
Q |
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| T |
36068244 |
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36068343 |
T |
 |
| Q |
419 |
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463 |
Q |
| |
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| T |
36068344 |
gtgtgaaatgcccaaaacgtcatacaaattaggacggagggagta |
36068388 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 143; E-Value: 8e-75
Query Start/End: Original strand, 190 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 3628666 - 3628398
Alignment:
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289 |
Q |
| |
|
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|
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| T |
3628666 |
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3628568 |
T |
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| Q |
290 |
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378 |
Q |
| |
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| T |
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T |
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| Q |
379 |
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448 |
Q |
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| T |
3628467 |
tatctttttttcacacaatattaattacatttcttaatatatgtgaaatgtctaaaacgtcatacaattt |
3628398 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 143; E-Value: 8e-75
Query Start/End: Original strand, 231 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 40425201 - 40424973
Alignment:
| Q |
231 |
atttgtcccaaattgtatgtcactttacaataccaatgaaacattaatgttatttttcctattataaccttaactatttattactctctcttctttcaag |
330 |
Q |
| |
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| T |
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T |
 |
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331 |
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419 |
Q |
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| T |
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40425002 |
T |
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448 |
Q |
| |
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| T |
40425001 |
tgtgaaatacccaaaacgtcgtataattt |
40424973 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 143; E-Value: 8e-75
Query Start/End: Original strand, 190 - 463
Target Start/End: Original strand, 40833468 - 40833752
Alignment:
| Q |
190 |
tactccatccgtcctaaattgtatgtcattttnnnnnnnntatttgtcccaaattgtatgtcactttacaataccaatgaaacattaatgttatttttcc |
289 |
Q |
| |
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| T |
40833468 |
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40833567 |
T |
 |
| Q |
290 |
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378 |
Q |
| |
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| T |
40833568 |
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40833667 |
T |
 |
| Q |
379 |
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463 |
Q |
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| T |
40833668 |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 142; E-Value: 3e-74
Query Start/End: Original strand, 231 - 463
Target Start/End: Original strand, 6596507 - 6596750
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| Q |
231 |
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330 |
Q |
| |
|
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| T |
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T |
 |
| Q |
331 |
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419 |
Q |
| |
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| T |
6596607 |
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6596706 |
T |
 |
| Q |
420 |
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463 |
Q |
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|
| T |
6596707 |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 142; E-Value: 3e-74
Query Start/End: Original strand, 197 - 461
Target Start/End: Complemental strand, 9047513 - 9047238
Alignment:
| Q |
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296 |
Q |
| |
|
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| T |
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tccgtcccaaattgtatgtcaatttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattata |
9047414 |
T |
 |
| Q |
297 |
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385 |
Q |
| |
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| |||||||||||||||||| |||| |||||| ||||| |||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |
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| T |
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tctttaactatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttctcatatcatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatatctct |
9047314 |
T |
 |
| Q |
386 |
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461 |
Q |
| |
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| T |
9047313 |
ttcccacgcaatattaattacatttcttaatatgtgtgaaatgcccaaaacattatacaatttgggatggagggag |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 142; E-Value: 3e-74
Query Start/End: Original strand, 235 - 463
Target Start/End: Original strand, 12467674 - 12467913
Alignment:
| Q |
235 |
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334 |
Q |
| |
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| T |
12467674 |
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12467773 |
T |
 |
| Q |
335 |
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423 |
Q |
| |
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| T |
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12467873 |
T |
 |
| Q |
424 |
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463 |
Q |
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| T |
12467874 |
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12467913 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 141; E-Value: 1e-73
Query Start/End: Original strand, 231 - 463
Target Start/End: Complemental strand, 41787126 - 41786883
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| Q |
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330 |
Q |
| |
|
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|
| T |
41787126 |
atttgtcccaaattatatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttaactatttattactctctcttctttcaat |
41787027 |
T |
 |
| Q |
331 |
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419 |
Q |
| |
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| T |
41787026 |
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41786927 |
T |
 |
| Q |
420 |
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463 |
Q |
| |
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|
| T |
41786926 |
agtgaaatgtccaaaacgtcatataatttgggacggagggagta |
41786883 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 140; E-Value: 5e-73
Query Start/End: Original strand, 233 - 463
Target Start/End: Complemental strand, 5005261 - 5005020
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| Q |
233 |
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332 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
5005261 |
ttgtcccaaattatatgtcgctttaaaataccaatgcaacattaatgttactttttctattataaccttaattatttattactctctcttctttcaattc |
5005162 |
T |
 |
| Q |
333 |
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421 |
Q |
| |
|
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|
| T |
5005161 |
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5005062 |
T |
 |
| Q |
422 |
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463 |
Q |
| |
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|
| T |
5005061 |
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5005020 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 140; E-Value: 5e-73
Query Start/End: Original strand, 190 - 448
Target Start/End: Original strand, 19002905 - 19003174
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| Q |
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289 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
19002905 |
tactccctccgtcccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcacattagaataccaatgaaacattaatgttacttttcc |
19003004 |
T |
 |
| Q |
290 |
tattataaccttaactatttattactctctcttctttcaagtcttttatttatctttttcat-----------aggacaattttgtaaaacaactcataa |
378 |
Q |
| |
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| T |
19003005 |
tattatatccttaactatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccatataatttattaaggataattttgtaaaacaactcataa |
19003104 |
T |
 |
| Q |
379 |
tatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatatgtgtgaaatgcccaaaacgtcatacaattt |
448 |
Q |
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| T |
19003105 |
tatctctttcccacacaatattaattacatttcttaatatatgtgaaatgcccaaaacgtcatataattt |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 140; E-Value: 5e-73
Query Start/End: Original strand, 189 - 463
Target Start/End: Original strand, 42056035 - 42056320
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| Q |
189 |
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288 |
Q |
| |
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| T |
42056035 |
ttactccctccgtcccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttattccaaattatatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttatgtttc |
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T |
 |
| Q |
289 |
ctattataaccttaactatttattactctctcttctttcaagtcttttatttatctttttcata-----------ggacaattttgtaaaacaactcata |
377 |
Q |
| |
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| T |
42056135 |
ctattatatccttaactatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccatatcatttattaaggataattttataaaacaactcata |
42056234 |
T |
 |
| Q |
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atatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatatgtgtgaaatgcccaaaacgtcatacaatttaggatgaagggagta |
463 |
Q |
| |
|
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|
| T |
42056235 |
atatctctttcccacacaatattaattacatttcttaatatgtgtgaaatgcccaaaacgtcatacaatttgggacggagggagta |
42056320 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 139; E-Value: 2e-72
Query Start/End: Original strand, 183 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 28787012 - 28786736
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aataaattactccatccgtcctaaattgtatgtcattttnnnnnnnntatttgtcccaaattgtatgtcactttacaataccaatgaaacattaatgtta |
282 |
Q |
| |
|
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|
| T |
28787012 |
aatatattactccctccgtcccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcctaaattatatgtcgctttacaatatcaataaaaaattaatgtta |
28786913 |
T |
 |
| Q |
283 |
tttttcctattataaccttaactatttattactctctcttctttcaagtcttttatttatctttttcata-----------ggacaattttgtaaaacaa |
371 |
Q |
| |
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| T |
28786912 |
cttttcctattatatccttaactatttattactctctcttctttcaattccttcatttatctttcccatatcatttattgaggataattttgtaaaacaa |
28786813 |
T |
 |
| Q |
372 |
ctcataatatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatatgtgtgaaatgcccaaaacgtcatacaattt |
448 |
Q |
| |
|
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|
| T |
28786812 |
ctcataatatctctttcccacacaatattaattacatttcttaatatgtgtgaaatgcccaaaacgtcatacaattt |
28786736 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 138; E-Value: 8e-72
Query Start/End: Original strand, 231 - 463
Target Start/End: Complemental strand, 1666999 - 1666756
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atttgtcccaaattgtatgtcactttacaataccaatgaaacattaatgttatttttcctattataaccttaactatttattactctctcttctttcaag |
330 |
Q |
| |
|
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1666999 |
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1666900 |
T |
 |
| Q |
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tcttttatttatctttttcata-----------ggacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatatg |
419 |
Q |
| |
|
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| T |
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T |
 |
| Q |
420 |
tgtgaaatgcccaaaacgtcatacaatttaggatgaagggagta |
463 |
Q |
| |
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|
| T |
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tgtgaaatgcctaaaacgtcatacaatttgggacggagggagta |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 138; E-Value: 8e-72
Query Start/End: Original strand, 231 - 463
Target Start/End: Original strand, 44421617 - 44421860
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atttgtcccaaattgtatgtcactttacaataccaatgaaacattaatgttatttttcctattataaccttaactatttattactctctcttctttcaag |
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| |
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atttgtcccgaattatatgtcgctttacaatacccatgcaacattaatgttacttttccaattataaccttaattaattattactctctcttctttcaat |
44421716 |
T |
 |
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331 |
tcttttatttatctttttcata-----------ggacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatatg |
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Q |
| |
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| T |
44421717 |
tctttcatttatctttctcatattatttattaaggacaattttgtaaaacaactcataatatcttttttccacacaatattaattgcatttcttaatatg |
44421816 |
T |
 |
| Q |
420 |
tgtgaaatgcccaaaacgtcatacaatttaggatgaagggagta |
463 |
Q |
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44421817 |
tgtgaaatgcccaaaacgtcatacaatttgggacggagggagta |
44421860 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 137; E-Value: 3e-71
Query Start/End: Original strand, 197 - 448
Target Start/End: Original strand, 10877311 - 10877573
Alignment:
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Q |
| |
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| T |
10877311 |
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10877410 |
T |
 |
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385 |
Q |
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| T |
10877411 |
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10877510 |
T |
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| Q |
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448 |
Q |
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10877511 |
ttcccacacaatattaattacatttcttaatatgtgtgaaatgtccaaaacgtcatacaattt |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 137; E-Value: 3e-71
Query Start/End: Original strand, 190 - 450
Target Start/End: Original strand, 16062528 - 16062799
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289 |
Q |
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tactccatccgtcccaaattgtatgtcactttagaaaaagtatttgtctcaaattgtatgtcactgtagaataccaatgaaacattaatgttatttttcc |
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T |
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| Q |
290 |
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378 |
Q |
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| T |
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T |
 |
| Q |
379 |
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450 |
Q |
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| T |
16062728 |
tatctctttagcacataatattaattacatttcttaatatgtgtgaaatgcacaaaacgtcatacaatttag |
16062799 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 137; E-Value: 3e-71
Query Start/End: Original strand, 230 - 463
Target Start/End: Complemental strand, 32674633 - 32674390
Alignment:
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329 |
Q |
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tatttatcccaaattgtatatcgctttacgataccaatgaaaaattaatgttacttttcctattatatccttaactatttattactctctcttctttcaa |
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T |
 |
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419 |
Q |
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| T |
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T |
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| Q |
420 |
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463 |
Q |
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| T |
32674433 |
tgtgaaatgttcaaaacgtcgtacaatttgggacggagggagta |
32674390 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 136; E-Value: 1e-70
Query Start/End: Original strand, 190 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 325413 - 325144
Alignment:
| Q |
190 |
tactccatccgtcctaaattgtatgtcattttnnnnnnnntatttgtcccaaattgtatgtcactttacaataccaatgaaacattaatgttatttttcc |
289 |
Q |
| |
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| T |
325413 |
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378 |
Q |
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| T |
325313 |
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325214 |
T |
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| Q |
379 |
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448 |
Q |
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| T |
325213 |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 136; E-Value: 1e-70
Query Start/End: Original strand, 233 - 463
Target Start/End: Complemental strand, 27341825 - 27341585
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332 |
Q |
| |
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27341825 |
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27341727 |
T |
 |
| Q |
333 |
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421 |
Q |
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| T |
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27341627 |
T |
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463 |
Q |
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| T |
27341626 |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 136; E-Value: 1e-70
Query Start/End: Original strand, 230 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 28181729 - 28181500
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| Q |
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329 |
Q |
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T |
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Q |
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| T |
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28181530 |
T |
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| Q |
419 |
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448 |
Q |
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| T |
28181529 |
gtgtgaaatgcccaaaacgtcatacaattt |
28181500 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 135; E-Value: 5e-70
Query Start/End: Original strand, 230 - 463
Target Start/End: Original strand, 14885058 - 14885302
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| Q |
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329 |
Q |
| |
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| T |
14885058 |
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14885157 |
T |
 |
| Q |
330 |
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418 |
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14885257 |
T |
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| Q |
419 |
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463 |
Q |
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| T |
14885258 |
gtgtgaaatgcccaaaacgtcatacaatttgggacggagggagta |
14885302 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 135; E-Value: 5e-70
Query Start/End: Original strand, 231 - 452
Target Start/End: Original strand, 29027010 - 29027242
Alignment:
| Q |
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atttgtcccaaattgtatgtcactttacaataccaatgaaacattaatgttatttttcctattataaccttaactatttattactctctcttctttcaag |
330 |
Q |
| |
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29027010 |
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T |
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| Q |
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419 |
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29027209 |
T |
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452 |
Q |
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| T |
29027210 |
tgtgaaatgcccaaaacgtcatacaatttagga |
29027242 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 135; E-Value: 5e-70
Query Start/End: Original strand, 190 - 463
Target Start/End: Original strand, 36443513 - 36443797
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Q |
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|
|||||| ||||||| ||||||||||||| ||| |||||||| |||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |
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36443612 |
T |
 |
| Q |
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378 |
Q |
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| T |
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36443712 |
T |
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| Q |
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463 |
Q |
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| T |
36443713 |
catctctttcccacacaatattaattacatttcttaatatgtgtgaaatgtccaaaacatcatacaatttaggacggagggagta |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 134; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 188 - 463
Target Start/End: Original strand, 6579698 - 6579985
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| T |
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T |
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288 |
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375 |
Q |
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| Q |
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463 |
Q |
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| T |
6579898 |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 134; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 233 - 463
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332 |
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 |
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ttttatttatctttttcataggacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatatgtgtgaaatgccca |
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Q |
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T |
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433 |
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463 |
Q |
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| T |
9110885 |
aaacgtcatacaatttgggacggagggagta |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #38
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Query Start/End: Original strand, 190 - 454
Target Start/End: Complemental strand, 40171819 - 40171544
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| Q |
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tactccatccgtcctaaattgtatgtcattttnnnnnnnntatttgtcccaaattgtatgtcactttacaataccaatgaaacattaatgttatttttcc |
289 |
Q |
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tactccctccgtcccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttacaataccaatgaaacattaatgttacttttcc |
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T |
 |
| Q |
290 |
tattataaccttaactatttattactctctcttctttcaagtcttttatttatctttttcat-----------aggacaattttgtaaaacaactcataa |
378 |
Q |
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40171719 |
tattatattcttaactatttattactttttcttctttcaattctttcatttattttttccatattatttattaaggataattttgtaaaacaactcataa |
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T |
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379 |
tatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatatgtgtgaaatgcccaaaacgtcatacaatttaggatg |
454 |
Q |
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40171619 |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 133; E-Value: 8e-69
Query Start/End: Original strand, 232 - 463
Target Start/End: Complemental strand, 2443519 - 2443277
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| |
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2443519 |
tttgtcccaaattatatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattgtaaccttagttatttattactctctcttctttcaatt |
2443420 |
T |
 |
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cttttatttatctttttcat-----------aggacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatatgt |
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Q |
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| T |
2443419 |
ctttcatttatctttctcatattatttattaaggacaattttgtaaaacaacttataatatctcttttccacacaatattaattgcattttttaatatat |
2443320 |
T |
 |
| Q |
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gtgaaatgcccaaaacgtcatacaatttaggatgaagggagta |
463 |
Q |
| |
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| T |
2443319 |
gtgaaatgcctaaaacgtcatacaatttggaacgaagggagta |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 132; E-Value: 3e-68
Query Start/End: Original strand, 190 - 448
Target Start/End: Original strand, 1204912 - 1205181
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1204912 |
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1205011 |
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378 |
Q |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 132; E-Value: 3e-68
Query Start/End: Original strand, 190 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 1420947 - 1420678
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289 |
Q |
| |
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| T |
1420947 |
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1420848 |
T |
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378 |
Q |
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| T |
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T |
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448 |
Q |
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| T |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 132; E-Value: 3e-68
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Target Start/End: Original strand, 13375301 - 13375598
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| Q |
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Q |
| |
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| T |
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13375400 |
T |
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368 |
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13375500 |
T |
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| Q |
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466 |
Q |
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| T |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 132; E-Value: 3e-68
Query Start/End: Original strand, 190 - 464
Target Start/End: Complemental strand, 28206689 - 28206404
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289 |
Q |
| |
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| T |
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T |
 |
| Q |
290 |
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378 |
Q |
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| T |
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T |
 |
| Q |
379 |
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464 |
Q |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 132; E-Value: 3e-68
Query Start/End: Original strand, 190 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 29843943 - 29843674
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| Q |
190 |
tactccatccgtcctaaattgtatgtcattttnnnnnnnntatttgtcccaaattgtatgtcactttacaataccaatgaaacattaatgttatttttcc |
289 |
Q |
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| T |
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29843844 |
T |
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| Q |
290 |
tattataaccttaactatttattactctctcttctttcaagtcttttatttatctttttcata-----------ggacaattttgtaaaacaactcataa |
378 |
Q |
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| T |
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29843744 |
T |
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| Q |
379 |
tatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatatgtgtgaaatgcccaaaacgtcatacaattt |
448 |
Q |
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| T |
29843743 |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 131; E-Value: 1e-67
Query Start/End: Original strand, 231 - 463
Target Start/End: Original strand, 518506 - 518747
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330 |
Q |
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518506 |
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T |
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| Q |
331 |
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419 |
Q |
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| T |
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T |
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| T |
518704 |
tgtgaaatacctaaaacgtcatacaatttgggacggagggagta |
518747 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 130; E-Value: 5e-67
Query Start/End: Original strand, 239 - 463
Target Start/End: Original strand, 3870805 - 3871040
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338 |
Q |
| |
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| T |
3870805 |
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T |
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| Q |
339 |
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427 |
Q |
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| T |
3870905 |
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3871004 |
T |
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428 |
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463 |
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3871005 |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 130; E-Value: 5e-67
Query Start/End: Original strand, 231 - 463
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330 |
Q |
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T |
 |
| Q |
331 |
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419 |
Q |
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| T |
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T |
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420 |
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463 |
Q |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 129; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 253 - 468
Target Start/End: Complemental strand, 19166400 - 19166174
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ctttacaataccaatgaaacattaatgttatttttcctattataaccttaactatttattactctctcttctttcaagtcttttatttatctttttcata |
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Q |
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T |
 |
| Q |
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441 |
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| T |
19166200 |
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19166174 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #49
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Query Start/End: Original strand, 230 - 463
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| |
|
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| T |
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 |
| Q |
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| |
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| T |
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19274984 |
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| T |
19274983 |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #50
Raw Score: 129; E-Value: 2e-66
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Target Start/End: Original strand, 23498077 - 23498322
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Q |
| |
|
||||||||||||||| |||||| ||||| | ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |
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|
| T |
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T |
 |
| Q |
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418 |
Q |
| |
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| T |
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23498275 |
T |
 |
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465 |
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| T |
23498276 |
gtgtgaaatgcccaaaacgtcatacaatttggaacggagggagtaat |
23498322 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #51
Raw Score: 128; E-Value: 7e-66
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ttgtcccaaattgtatgtcactttacaataccaatgaaacattaatgttatttttcctattataaccttaactatttattactctctcttctttcaagtc |
332 |
Q |
| |
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| T |
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ttgttccaaattgtatgttactttacgataccaatgaaacattaacgttatttttcctattatattcttaactatttattactcttttttttttcaattc |
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T |
 |
| Q |
333 |
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421 |
Q |
| |
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| T |
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5748497 |
T |
 |
| Q |
422 |
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463 |
Q |
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|
| T |
5748496 |
tgaaatgtccaaaacgtcatacaatttgggacggagggagta |
5748455 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #52
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Query Start/End: Original strand, 190 - 463
Target Start/End: Complemental strand, 7491735 - 7491451
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tactccatccgtcctaaattgtatgtcattttnnnnnnnntatttgtcccaaattgtatgtcactttacaataccaatgaaacattaatgttatttttcc |
289 |
Q |
| |
|
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tactccctccgtcccaaattgtatgtcattttagaaaaaatatgtgtcccaaattatatgtcgctttacaataccaataaaaaattaatgttacttttcc |
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T |
 |
| Q |
290 |
tattataaccttaactatttattactctctcttctttcaagtcttttatttatctttttcata-----------ggacaattttgtaaaacaactcataa |
378 |
Q |
| |
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| T |
7491635 |
tattatatccttaaccatttattactatctcttctttcaattccttcatttatctttcccatatcatttattgaggataattttgtaaaacaactcataa |
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T |
 |
| Q |
379 |
tatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatatgtgtgaaatgcccaaaacgtcatacaatttaggatgaagggagta |
463 |
Q |
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| T |
7491535 |
tatctctttcccacacaatattaattacaattcttaatatgtgtgaaatgttcaaaacgtcatacaatttgggacggagggagta |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #53
Raw Score: 127; E-Value: 3e-65
Query Start/End: Original strand, 230 - 463
Target Start/End: Complemental strand, 13849506 - 13849262
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| |
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| T |
13849506 |
tatttgtcctaaattgtatgtcactttagaatagcaatgaaacattagtgttatttttcctattatatccttaactatttattactatttcttttttcaa |
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T |
 |
| Q |
330 |
gtcttttatttatctttttcata-----------ggacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatat |
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Q |
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| T |
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ttctttcatttatctttcccatataatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatatctctttcccacacaatattaattacatttcttaatat |
13849307 |
T |
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| Q |
419 |
gtgtgaaatgcccaaaacgtcatacaatttaggatgaagggagta |
463 |
Q |
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| T |
13849306 |
gtgtgaaatatccaaaatatcatacaatttaggacggagggagta |
13849262 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #54
Raw Score: 127; E-Value: 3e-65
Query Start/End: Original strand, 190 - 463
Target Start/End: Original strand, 22060979 - 22061263
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289 |
Q |
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| T |
22060979 |
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22061078 |
T |
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290 |
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378 |
Q |
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22061178 |
T |
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463 |
Q |
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| T |
22061179 |
tatctttttcccatacaatattaattacatttcttaatatatgttaaatgcccaaaacgtcatacaatttgggacggagggagta |
22061263 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #55
Raw Score: 127; E-Value: 3e-65
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Target Start/End: Original strand, 27244931 - 27245155
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gtcccaaattgtatgtcacttttgaataccaatgaaacattaatgttatttttcctattatatccttaactatttattactctttcttttttcaattctt |
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T |
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| Q |
335 |
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423 |
Q |
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T |
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| Q |
424 |
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448 |
Q |
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| T |
27245131 |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #56
Raw Score: 126; E-Value: 1e-64
Query Start/End: Original strand, 230 - 465
Target Start/End: Complemental strand, 5669248 - 5669004
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Q |
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tatttgtcctaaattatatgtcgctttacaataccaatgaaacattaatgttatttttcctattatatccttaactatttattactatctcttctttcaa |
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T |
 |
| Q |
330 |
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418 |
Q |
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| T |
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5669050 |
T |
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| Q |
419 |
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465 |
Q |
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| T |
5669049 |
-tgtgaaatgtccaaaacatcatacaatttaggacggagggagtaat |
5669004 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #57
Raw Score: 125; E-Value: 5e-64
Query Start/End: Original strand, 233 - 448
Target Start/End: Original strand, 11216635 - 11216861
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| Q |
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332 |
Q |
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T |
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| Q |
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421 |
Q |
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11216735 |
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11216834 |
T |
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| Q |
422 |
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448 |
Q |
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| T |
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tgaaatggccaaaacgtcatacaattt |
11216861 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #58
Raw Score: 125; E-Value: 5e-64
Query Start/End: Original strand, 232 - 463
Target Start/End: Complemental strand, 21134646 - 21134404
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331 |
Q |
| |
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| T |
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T |
 |
| Q |
332 |
cttttatttatctttttcat-----------aggacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatatgt |
420 |
Q |
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21134546 |
ctttcatttatatttcccatattatttattaagaacaattttgtaaaataattcataatatctcttttccatacaatattaattgcatttcttaataagt |
21134447 |
T |
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| Q |
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gtgaaatgcccaaaacgtcatacaatttaggatgaagggagta |
463 |
Q |
| |
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gtgaaatgcctaaaacgtcatacaatttgggagggagggagta |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #59
Raw Score: 125; E-Value: 5e-64
Query Start/End: Original strand, 233 - 464
Target Start/End: Complemental strand, 31909814 - 31909572
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332 |
Q |
| |
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| T |
31909814 |
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T |
 |
| Q |
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ttttatttatctttttcat-----------aggacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatatgtg |
421 |
Q |
| |
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| T |
31909714 |
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31909615 |
T |
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| Q |
422 |
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464 |
Q |
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| T |
31909614 |
tgaaatgcccaaaacgtcatacaatttgggacggagggagtaa |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #60
Raw Score: 125; E-Value: 5e-64
Query Start/End: Original strand, 231 - 450
Target Start/End: Complemental strand, 40483636 - 40483406
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330 |
Q |
| |
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atttgtcccaaattatatgtcgttttacaatacaaatgaaatattaatgttatttttcctattatatccttaactattaattactctctcttctttcaat |
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T |
 |
| Q |
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419 |
Q |
| |
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| ||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |
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| T |
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tatttcatttatctttttcataccatttattatggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaatattaattacatttcttaataca |
40483437 |
T |
 |
| Q |
420 |
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450 |
Q |
| |
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| T |
40483436 |
tgtgaaatggccaaaacgtcatacaatttag |
40483406 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #61
Raw Score: 124; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 233 - 463
Target Start/End: Complemental strand, 8247376 - 8247135
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| Q |
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ttgtcccaaattgtatgtcactttacaataccaatgaaacattaatgttatttttcctattataaccttaactatttattactctctcttctttcaagtc |
332 |
Q |
| |
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| T |
8247376 |
ttgtcccaaattatatatcgctttacaataccaataaaaaattaatgttactttttctattatatcattaactatttattactctctcttctttcaattc |
8247277 |
T |
 |
| Q |
333 |
ttttatttatctttttcata-----------ggacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatatgtg |
421 |
Q |
| |
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|
| T |
8247276 |
cttcatttatctttcccatatcatttattgaggataattttgtaaaacaactcataatatctctttcccacacaatattaattacatttcttaatatgtg |
8247177 |
T |
 |
| Q |
422 |
tgaaatgcccaaaacgtcatacaatttaggatgaagggagta |
463 |
Q |
| |
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|
| T |
8247176 |
tgaaatgtccaaaacgtcatacaatttgggacggagggagta |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #62
Raw Score: 124; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 197 - 452
Target Start/End: Complemental strand, 39235257 - 39234991
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Q |
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|
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|
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tccgtcccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtctcggattgtatgtcgctttacaataccaatgaaaaattaatgttacttttcctattata |
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T |
 |
| Q |
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accttaactatttattactctctcttctttcaagtcttttatttatctttt-----tcat------aggacaattttgtaaaacaactcataatatctct |
385 |
Q |
| |
|
| |||||||||||||||||| ||||||||||| || || |||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
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tctttaactatttattactctttcttctttcaattccttaatttatctttcctatatcatttattgaagacaattttgtaaaacaactcataatatctct |
39235058 |
T |
 |
| Q |
386 |
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Q |
| |
|
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|
|
| T |
39235057 |
ttcccacacaatattaattacatttcttaatatgtatgaaatgctcaaaacgtcatacaatttagga |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #63
Raw Score: 124; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 190 - 436
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190 |
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Q |
| |
|
|||||| ||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| |
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|
| T |
39407776 |
tactccctccgtcccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcctaaattgtatgtcactttagaataccactgaaacattaatgttatttttcc |
39407875 |
T |
 |
| Q |
290 |
tattataaccttaactatttattactctctcttctttcaagtcttttatttatctttttcat-----------aggacaattttgtaaaacaactcataa |
378 |
Q |
| |
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||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||| ||||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||||| |
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| T |
39407876 |
tattatattcttaactatttattactctttcttttttcaattctttcgtttatctttctcatatcatttattaaggataattttgtaaaacaactcataa |
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T |
 |
| Q |
379 |
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436 |
Q |
| |
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|
| T |
39407976 |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #64
Raw Score: 124; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 197 - 463
Target Start/End: Original strand, 41186789 - 41187064
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| Q |
197 |
tccgtcctaaattgtatgtcattttnnnnnnnntatttgtcccaaattgtatgtcactttacaataccaatgaaacattaatgttatttttcctattata |
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| |
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T |
 |
| Q |
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accttaactatttattactctctcttctttcaagtcttttatttatctttttcata-----------ggacaattttgtaaaacaactcataatatctct |
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Q |
| |
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41186889 |
tccttaattatttattactctctcttctttcaa-tccttcatttatttttcccatatcatttattgaggataattttgtaaaacaacttaaaatatctct |
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T |
 |
| Q |
386 |
tttccacacaatattaattacatttcttaatatgtgtgaaatgcccaaaacgtcatacaatttaggatgaagggagta |
463 |
Q |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #65
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Query Start/End: Original strand, 230 - 463
Target Start/End: Complemental strand, 4646634 - 4646390
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329 |
Q |
| |
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tatttgtcccaaattgtatatcactttataataccaataaaacattaatgttacttttcctattatatccttaaccatttattactctttcttctttcaa |
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T |
 |
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gtcttttatttatctttttcat-----------aggacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatat |
418 |
Q |
| |
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4646534 |
ttctttcatttatttttctcatatcatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatatctcttccccatactgtattaattatatttcttaatat |
4646435 |
T |
 |
| Q |
419 |
gtgtgaaatgcccaaaacgtcatacaatttaggatgaagggagta |
463 |
Q |
| |
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| T |
4646434 |
gtgtgaaatgcccaaaacgtcatacaatttaagacggagggagta |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #66
Raw Score: 123; E-Value: 7e-63
Query Start/End: Original strand, 231 - 464
Target Start/End: Original strand, 38959776 - 38960020
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| |
|
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atttgtcccaaattatatgtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttatttttcctattatatccttaactattaattactctctctcctttcaat |
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T |
 |
| Q |
331 |
tcttttatttatctttttcata-----------ggacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatatg |
419 |
Q |
| |
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| T |
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tatttcatttatcttttccatacaatttattagggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacgcaatattaattacatttcttaatctg |
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T |
 |
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tgtgaaatgcccaaaacgtcatacaatttaggatgaagggagtaa |
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Q |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #67
Raw Score: 122; E-Value: 3e-62
Query Start/End: Original strand, 231 - 463
Target Start/End: Complemental strand, 22154253 - 22154010
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| |
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atttgtcccaaattatatgtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcctattatatccttaactattaattactcactcttctttcaat |
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419 |
Q |
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T |
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463 |
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22154053 |
tgtgaaatggccaaaacgtcatacaatttaggacggagggagta |
22154010 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #68
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Target Start/End: Original strand, 5421433 - 5421703
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T |
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377 |
Q |
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5421533 |
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T |
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448 |
Q |
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #69
Raw Score: 121; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 231 - 470
Target Start/End: Original strand, 23494483 - 23494733
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330 |
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T |
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419 |
Q |
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23494583 |
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T |
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470 |
Q |
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23494683 |
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T |
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Target: chr2; HSP #70
Raw Score: 120; E-Value: 4e-61
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Target Start/End: Complemental strand, 1684375 - 1684143
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T |
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419 |
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T |
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452 |
Q |
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1684143 |
T |
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Back To:
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Target: chr2; HSP #71
Raw Score: 120; E-Value: 4e-61
Query Start/End: Original strand, 233 - 463
Target Start/End: Original strand, 40649094 - 40649335
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332 |
Q |
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T |
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| T |
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T |
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Target: chr2; HSP #72
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Target Start/End: Complemental strand, 14780943 - 14780715
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330 |
Q |
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T |
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331 |
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419 |
Q |
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| T |
14780843 |
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14780744 |
T |
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| Q |
420 |
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Q |
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| T |
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T |
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Target: chr2; HSP #73
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Query Start/End: Original strand, 235 - 463
Target Start/End: Original strand, 44195607 - 44195847
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Q |
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422 |
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44195707 |
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44195806 |
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463 |
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| T |
44195807 |
gaaatgtccaaaacgtcatacaatttgggacggagggagta |
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Target: chr2; HSP #74
Raw Score: 118; E-Value: 7e-60
Query Start/End: Original strand, 233 - 448
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420 |
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12208179 |
T |
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448 |
Q |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #75
Raw Score: 118; E-Value: 7e-60
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18450018 |
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| Q |
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464 |
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18450017 |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #76
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Target Start/End: Original strand, 35669727 - 35669970
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T |
 |
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419 |
Q |
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| T |
35669827 |
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35669926 |
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463 |
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| T |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #77
Raw Score: 118; E-Value: 7e-60
Query Start/End: Original strand, 235 - 463
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| |
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424 |
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Q |
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38448357 |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #78
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| |
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9527494 |
ttgtcccaaattatatgtcactttacaataccaatgaaataataatgttacttttcctattatatctttaactattaattactctctcttctttcaatta |
9527593 |
T |
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| Q |
333 |
ttttatttatctttttcat-----------aggacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatatgtg |
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T |
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| Q |
422 |
tgaaatgcccaaaacgtcatacaatttaggatgaagggagtaa |
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Q |
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| T |
9527694 |
tgaaatggccaaaacgtcatataatttgggacggagggagtaa |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #79
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T |
 |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #80
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Query Start/End: Original strand, 190 - 448
Target Start/End: Original strand, 27832597 - 27832863
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T |
 |
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tattataaccttaactatttattactctctcttctttcaagtcttttatttatctttttcat-----------aggacaattttgtaaaacaactcataa |
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T |
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tatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatatgtgtgaaatgcccaaaacgtcatacaattt |
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| |
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 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #81
Raw Score: 117; E-Value: 3e-59
Query Start/End: Original strand, 230 - 463
Target Start/End: Original strand, 40171931 - 40172166
Alignment:
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329 |
Q |
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| T |
40171931 |
tatttgtcccaaattgtatgtcactttacaataccaatgacacattaatgttactttttctattatatctttaattatttattactctttcttttttcat |
40172030 |
T |
 |
| Q |
330 |
gtcttttatttatctttttcat--aggacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatatgtgtgaaat |
427 |
Q |
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| T |
40172031 |
ttatcttacccatatcatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatatctctttcccatacaatattaattacatttcttaatatatgtgaaat |
40172130 |
T |
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| Q |
428 |
gcccaaaacgtcatacaatttaggatgaagggagta |
463 |
Q |
| |
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| T |
40172131 |
gcccaaaacgttatacaatttgggacggagggagta |
40172166 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #82
Raw Score: 116; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 191 - 452
Target Start/End: Original strand, 12192407 - 12192680
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290 |
Q |
| |
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||||| ||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |
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actccttccgtcccaaattgtatgttattttaaaaaaaatatttgtcccaaattatatgtcactttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcct |
12192506 |
T |
 |
| Q |
291 |
attataaccttaactatttattactctctcttctttcaagtcttttatttatc-tttttcat-----------aggacaattttgtaaaacaactcataa |
378 |
Q |
| |
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| T |
12192507 |
attatatccttaattatttattactctttcttctttcaattctttcatttatcttttttcatatcatttattaagaataattttgtaaaacaactcataa |
12192606 |
T |
 |
| Q |
379 |
tatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatatgtgtgaaatgcccaaaacgtcatacaatttagga |
452 |
Q |
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12192607 |
tatctctttcccatacaatattaattatatttcttaatatatgttaaatgtctaaaacgtcgtacaaattagga |
12192680 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #83
Raw Score: 116; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 190 - 463
Target Start/End: Original strand, 29411825 - 29412114
Alignment:
| Q |
190 |
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284 |
Q |
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|
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| T |
29411825 |
tactccatccgttccaaattgtatgtcactttggaaaaattttttgtcccaaattatatgtcattttacaataccaatgaaatgaaatattaatgttact |
29411924 |
T |
 |
| Q |
285 |
tttcctattataaccttaactatttattactctctcttctttcaagtcttttatttatctttttcata-----------ggacaattttgtaaaacaact |
373 |
Q |
| |
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| T |
29411925 |
tttcctattatatccttaactattaattactctctcttctttcaattatttcatttatcttttttataccatttattagggataattttgtaaaacaact |
29412024 |
T |
 |
| Q |
374 |
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463 |
Q |
| |
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| T |
29412025 |
cataatttctcttccccacacaatattaattacatttcttaatacgtgtgaaatgaccaaaacgtcatacaatttgggacggagggagta |
29412114 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #84
Raw Score: 116; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 233 - 463
Target Start/End: Complemental strand, 30549808 - 30549567
Alignment:
| Q |
233 |
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332 |
Q |
| |
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| T |
30549808 |
ttgttccaaattatatgtcgctttacaatatcaatgaaatattaatgttatttttcctattatatccttaactattaattactccctcttctttcaatta |
30549709 |
T |
 |
| Q |
333 |
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421 |
Q |
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| T |
30549708 |
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30549609 |
T |
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| Q |
422 |
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463 |
Q |
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| T |
30549608 |
tgaaatggtcaaaacgtcatacaatttgggacggagggagta |
30549567 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #85
Raw Score: 116; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 233 - 463
Target Start/End: Complemental strand, 43521632 - 43521391
Alignment:
| Q |
233 |
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332 |
Q |
| |
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| T |
43521632 |
ttgtcctaaattatatgtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcctattatatccttcactattaattactctctcttctttcaatta |
43521533 |
T |
 |
| Q |
333 |
ttttatttatctttttcata-----------ggacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatatgtg |
421 |
Q |
| |
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| T |
43521532 |
tttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaatattaattacatttcttaatacgtg |
43521433 |
T |
 |
| Q |
422 |
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463 |
Q |
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| T |
43521432 |
tgaaatggccaaaacgtcgtacaatttgggacggagggagta |
43521391 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #86
Raw Score: 115; E-Value: 4e-58
Query Start/End: Original strand, 230 - 463
Target Start/End: Original strand, 4826331 - 4826575
Alignment:
| Q |
230 |
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329 |
Q |
| |
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| T |
4826331 |
tatttgttctaaattatacgtcgctttataatatcaataaaatattaatgttatttttcctattatatccttaactatttattattctctcttgtttcaa |
4826430 |
T |
 |
| Q |
330 |
gtcttttatttatctttttcata-----------ggacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatat |
418 |
Q |
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| T |
4826431 |
ttcatttatttaaccttctcatatcatttattaaggacaattttgtaaaataactcataatatctctttcccacacaatattaattacatttcttaatat |
4826530 |
T |
 |
| Q |
419 |
gtgtgaaatgcccaaaacgtcatacaatttaggatgaagggagta |
463 |
Q |
| |
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| T |
4826531 |
gtgtgaaatgctcaaaacgtcatacaatttgggacggagggagta |
4826575 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #87
Raw Score: 114; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 231 - 461
Target Start/End: Original strand, 1780330 - 1780562
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| Q |
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330 |
Q |
| |
|
||||||||||||| |||||| ||||| ||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||| |
|
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| T |
1780330 |
atttgtcccaaatcatatgtcgctttaaaatactaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttaactatttattattatctcttatttcatt |
1780429 |
T |
 |
| Q |
331 |
tcttttatttatctttttcat--aggacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatatgtgtgaaatg |
428 |
Q |
| |
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| | || | || || || || ||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |
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| T |
1780430 |
tatctttctcatattatttattaaggacaattttataaaacaacttataatatcttttttccacacaatattaattgcatttattaatatgtgtgaaatg |
1780529 |
T |
 |
| Q |
429 |
cccaaaacgtcatacaatttaggatgaagggag |
461 |
Q |
| |
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|| ||||||||||||||||| |||||||||||| |
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| T |
1780530 |
cctaaaacgtcatacaatttgggatgaagggag |
1780562 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #88
Raw Score: 114; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 231 - 463
Target Start/End: Original strand, 37985564 - 37985807
Alignment:
| Q |
231 |
atttgtcccaaattgtatgtcactttacaataccaatgaaacattaatgttatttttcctattataaccttaactatttattactctctcttctttcaag |
330 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| | ||||||||||| |
|
|
| T |
37985564 |
atttgtcctaaattatatgtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttatttttcctattatatccttaactattaattactttttcttctttcaat |
37985663 |
T |
 |
| Q |
331 |
tcttttatttatctttttcat-----------aggacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatatg |
419 |
Q |
| |
|
| ||| ||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| | |
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| T |
37985664 |
tatttcatttatcttttccataccatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaatattaattatatttcttaatacg |
37985763 |
T |
 |
| Q |
420 |
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463 |
Q |
| |
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|
| T |
37985764 |
tgtgaaatgatcaaaacgtcatacaatttgggacggagggagta |
37985807 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #89
Raw Score: 113; E-Value: 7e-57
Query Start/End: Original strand, 233 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 6027090 - 6026864
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332 |
Q |
| |
|
|||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| | |
|
|
| T |
6027090 |
ttgtcccaaattatatgtcgctttataataccaatgaaatattaatgttacttttcctattatatccttaactattaattactctctcttctttcaatta |
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T |
 |
| Q |
333 |
ttttatttatctttttcata-----------ggacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatatgtg |
421 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
6026990 |
tttcatttatcttttccataccatttattagagatacttttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaatattaattacatttcttaatacgtg |
6026891 |
T |
 |
| Q |
422 |
tgaaatgcccaaaacgtcatacaattt |
448 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
6026890 |
tgaaatgaccaaaacgtcatacaattt |
6026864 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #90
Raw Score: 113; E-Value: 7e-57
Query Start/End: Original strand, 233 - 464
Target Start/End: Complemental strand, 22050706 - 22050464
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332 |
Q |
| |
|
||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| | |
|
|
| T |
22050706 |
ttgtctcaaattatatgtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttattttttctattatatccttaactattaattactctctcttctttcaatta |
22050607 |
T |
 |
| Q |
333 |
ttttatttatctttttcata-----------ggacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatatgtg |
421 |
Q |
| |
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|
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| T |
22050606 |
tttcatttatcttttccataccatttattagggataattttgtaatacaactcataatttctcttccccacacaatattaattacatttcttaatacgtg |
22050507 |
T |
 |
| Q |
422 |
tgaaatgcccaaaacgtcatacaatttaggatgaagggagtaa |
464 |
Q |
| |
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||||||| ||||||||| |||||||| |||| ||||||||| |
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| T |
22050506 |
tgaaatggacaaaacgtcgtacaatttgggatagagggagtaa |
22050464 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #91
Raw Score: 113; E-Value: 7e-57
Query Start/End: Original strand, 232 - 463
Target Start/End: Complemental strand, 32068455 - 32068213
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| Q |
232 |
tttgtcccaaattgtatgtcactttacaataccaatgaaacattaatgttatttttcctattataaccttaactatttattactctctcttctttcaagt |
331 |
Q |
| |
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|
| T |
32068455 |
tttgtccaaaattatatgtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttatttttcctattatatccttaattattaattactctctcttctttcaatt |
32068356 |
T |
 |
| Q |
332 |
cttttatttatctttttcat-----------aggacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatatgt |
420 |
Q |
| |
|
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| T |
32068355 |
atttcatttatcttttccatatcatttattaaggataattttgtaaaacaacttataatttctcttccccacacaatattaattacatttcttaatacgt |
32068256 |
T |
 |
| Q |
421 |
gtgaaatgcccaaaacgtcatacaatttaggatgaagggagta |
463 |
Q |
| |
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|||||||| ||||||||| |||||||| ||| | |||||||| |
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| T |
32068255 |
gtgaaatggtcaaaacgtcgtacaatttgggacggagggagta |
32068213 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #92
Raw Score: 113; E-Value: 7e-57
Query Start/End: Original strand, 233 - 448
Target Start/End: Original strand, 36845861 - 36846087
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233 |
ttgtcccaaattgtatgtcactttacaataccaatgaaacattaatgttatttttcctattataaccttaactatttattactctctcttctttcaagtc |
332 |
Q |
| |
|
|||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||| | |
|
|
| T |
36845861 |
ttgtcccaaattatatgtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcctattatatccttaactattaattactctttcttctttcaatta |
36845960 |
T |
 |
| Q |
333 |
ttttatttatctttttcat-----------aggacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatatgtg |
421 |
Q |
| |
|
||| |||||| |||| ||| |||| ||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |
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| T |
36845961 |
tttcatttatattttccatacaatttattaaggataattttgtaaatcaactcataatttctcttctccacccaatattaattacatttcttaatacgtg |
36846060 |
T |
 |
| Q |
422 |
tgaaatgcccaaaacgtcatacaattt |
448 |
Q |
| |
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|
| T |
36846061 |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #93
Raw Score: 112; E-Value: 3e-56
Query Start/End: Original strand, 188 - 463
Target Start/End: Complemental strand, 8341764 - 8341470
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188 |
attactccatccgtcctaaattgtatgtcattttnnnnnnnntatttgtcccaaattgtatgtcactttacaataccaatgaaacattaatgttattttt |
287 |
Q |
| |
|
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8341764 |
attattccctccgtcccaaattgtatgtcattttagaaaaaatatttgtcctaaattgtatattactttagaataccaatgaaacattaatgttactttt |
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T |
 |
| Q |
288 |
cctattataaccttaactatttattactctctcttctttcaagtcttttatttatctttttcat-----------aggacaattttgtaaaacaactcat |
376 |
Q |
| |
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|||||||| | |||||||||||||||||| |||| |||||| ||||| |||||||||| |||| |||| |||||| ||||||||||||| |
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| T |
8341664 |
tctattatatctttaactatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttctcatatcatttattaaggataattttataaaacaactcat |
8341565 |
T |
 |
| Q |
377 |
aatatctcttttccacacaatattaattac--------atttcttaatatgtgtgaaatgcccaaaacgtcatacaatttaggatgaagggagta |
463 |
Q |
| |
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| T |
8341564 |
aatatctctttcccacataatattaattacatttcttaatttcttaatatgtgtgaaatgctcaaaacgtcatacaatttaggacggagggagta |
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T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #94
Raw Score: 112; E-Value: 3e-56
Query Start/End: Original strand, 238 - 464
Target Start/End: Complemental strand, 31072649 - 31072412
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31072649 |
ccaaattatatgtcgctttacaataccaatgaaatatttatgttacttttcctattatatccttaactattaattactctctcttctttcaattatttca |
31072550 |
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| T |
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T |
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464 |
Q |
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| T |
31072449 |
tgaccaaaacgtcttacaatttgggacggagggagtaa |
31072412 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #95
Raw Score: 111; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 230 - 419
Target Start/End: Complemental strand, 3873652 - 3873452
Alignment:
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Q |
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tatttgtcccaaattatatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataacctttgctatttattactctcttttctttcaa |
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T |
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418 |
Q |
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| T |
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T |
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419 |
Q |
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3873452 |
g |
3873452 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #96
Raw Score: 111; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 231 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 22375259 - 22375031
Alignment:
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231 |
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330 |
Q |
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T |
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| Q |
331 |
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419 |
Q |
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| T |
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22375060 |
T |
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| Q |
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448 |
Q |
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| T |
22375059 |
tgtgaaatggccaaaacgtcatacaattt |
22375031 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #97
Raw Score: 110; E-Value: 4e-55
Query Start/End: Original strand, 240 - 452
Target Start/End: Original strand, 8495328 - 8495551
Alignment:
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339 |
Q |
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T |
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| Q |
340 |
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428 |
Q |
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| T |
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8495527 |
T |
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| Q |
429 |
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452 |
Q |
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| T |
8495528 |
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8495551 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #98
Raw Score: 109; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 265 - 448
Target Start/End: Original strand, 25556919 - 25557113
Alignment:
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Q |
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25557018 |
T |
 |
| Q |
354 |
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448 |
Q |
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| T |
25557019 |
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25557113 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #99
Raw Score: 108; E-Value: 6e-54
Query Start/End: Original strand, 230 - 464
Target Start/End: Complemental strand, 3376673 - 3376429
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| Q |
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329 |
Q |
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| T |
3376673 |
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| Q |
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418 |
Q |
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| T |
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3376475 |
T |
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| Q |
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464 |
Q |
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| T |
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gtgtgaaatgcccaaaacgtcatacaatttgggacggagggagtaa |
3376429 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #100
Raw Score: 108; E-Value: 6e-54
Query Start/End: Original strand, 233 - 463
Target Start/End: Original strand, 12363663 - 12363904
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| Q |
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ttgtcccaaattgtatgtcactttacaataccaatgaaacattaatgttatttttcctattataaccttaactatttattactctctcttctttcaagtc |
332 |
Q |
| |
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12363663 |
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12363762 |
T |
 |
| Q |
333 |
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421 |
Q |
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| T |
12363763 |
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12363862 |
T |
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| Q |
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463 |
Q |
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| T |
12363863 |
taaaatgcccaaaacgtcatacaatttgggacggagggagta |
12363904 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #101
Raw Score: 107; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 231 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 14309145 - 14308917
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| Q |
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330 |
Q |
| |
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| T |
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14309046 |
T |
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| Q |
331 |
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419 |
Q |
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| T |
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| Q |
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Q |
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| T |
14308945 |
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14308917 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #102
Raw Score: 107; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 231 - 448
Target Start/End: Original strand, 16198433 - 16198661
Alignment:
| Q |
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atttgtcccaaattgtatgtcactttacaataccaatgaaacattaatgttatttttcctattataaccttaactatttattactctctcttctttcaag |
330 |
Q |
| |
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| T |
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T |
 |
| Q |
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419 |
Q |
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| T |
16198533 |
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16198632 |
T |
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| Q |
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tgtgaaatgcccaaaacgtcatacaattt |
448 |
Q |
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| T |
16198633 |
tgtgaaatggccaaaacgtcttacaattt |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #103
Raw Score: 106; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 232 - 463
Target Start/End: Original strand, 28248499 - 28248739
Alignment:
| Q |
232 |
tttgtcccaaattgtatgtcactttacaataccaatgaaacattaatgttatttttcctattataaccttaactatttattactctctcttctttcaagt |
331 |
Q |
| |
|
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|
| T |
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T |
 |
| Q |
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420 |
Q |
| |
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| T |
28248597 |
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28248696 |
T |
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| Q |
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463 |
Q |
| |
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| T |
28248697 |
gtgaaatgcctaaaacgtcatactatttaggacggagggagta |
28248739 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #104
Raw Score: 106; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 231 - 463
Target Start/End: Original strand, 29360789 - 29361032
Alignment:
| Q |
231 |
atttgtcccaaattgtatgtcactttacaataccaatgaaacattaatgttatttttcctattataaccttaactatttattactctctcttctttcaag |
330 |
Q |
| |
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| T |
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 |
| Q |
331 |
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419 |
Q |
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| T |
29360889 |
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29360988 |
T |
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| Q |
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463 |
Q |
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| T |
29360989 |
tgtgaaatgcccaaaacgtcatataatttgggacggagggagta |
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T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #105
Raw Score: 105; E-Value: 4e-52
Query Start/End: Original strand, 240 - 463
Target Start/End: Complemental strand, 5443893 - 5443659
Alignment:
| Q |
240 |
aaattgtatgtcactttacaataccaatgaaacattaatgttatttttcctattataaccttaactatttattactctctcttctttcaagtcttttatt |
339 |
Q |
| |
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||||| |||||| ||||||||| ||||| || ||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||| ||| |
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| T |
5443893 |
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5443794 |
T |
 |
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428 |
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| T |
5443793 |
tatcttttccatattatttattaaggacaattttgtaaaacaactcataatatcttttttccacacaatattaattgcatttcttaatatatgtaaaatg |
5443694 |
T |
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429 |
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463 |
Q |
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| T |
5443693 |
ctcaaaacgtcatataatttgggacggagggagta |
5443659 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #106
Raw Score: 105; E-Value: 4e-52
Query Start/End: Original strand, 233 - 452
Target Start/End: Original strand, 29513411 - 29513640
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| Q |
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ttgtcccaaattgtatgtcactttacaataccaatgaaacattaatgttatttttcctattataaccttaactatttattactctctcttctttcaagtc |
332 |
Q |
| |
|
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| T |
29513411 |
ttgtcctaaattatatgtcgctttaaaataccaatgcaacattaatgatactttttctattataaccttaattatttattaccctttcttctttcaattc |
29513510 |
T |
 |
| Q |
333 |
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421 |
Q |
| |
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| T |
29513511 |
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29513609 |
T |
 |
| Q |
422 |
tgaaatgcccaaaacgtcatacaatttagga |
452 |
Q |
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| T |
29513610 |
tgaaatgcccaaaacgtaatacaatttagga |
29513640 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #107
Raw Score: 104; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 233 - 463
Target Start/End: Complemental strand, 2048236 - 2047995
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| Q |
233 |
ttgtcccaaattgtatgtcactttacaataccaatgaaacattaatgttatttttcctattataaccttaactatttattactctctcttctttcaagtc |
332 |
Q |
| |
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| T |
2048236 |
ttgtcccaaattatatgtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcctattatatcattaactattaattactctctcttctttcaatta |
2048137 |
T |
 |
| Q |
333 |
ttttatttatctttttcat-----------aggacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatatgtg |
421 |
Q |
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| T |
2048136 |
tttcatttatcttttccataccatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccatacaatattaattacatttcttaatacgtg |
2048037 |
T |
 |
| Q |
422 |
tgaaatgcccaaaacgtcatacaatttaggatgaagggagta |
463 |
Q |
| |
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| T |
2048036 |
tgaaatggtcaaaacatcgtgcaatttgggatggatggagta |
2047995 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #108
Raw Score: 104; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 231 - 465
Target Start/End: Complemental strand, 27863041 - 27862796
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231 |
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| |
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| T |
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atttgtcccaaattatatgtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttatttttcctattatatcctttattattaattactctcttttctttcaat |
27862942 |
T |
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tcttttatttatctttttcata-----------ggacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatatg |
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Q |
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tatttcatttatcttttccataccatttattagggataattttgtaaaacaattcataatttctcttccctacgcaatattaattacatttcttaatacg |
27862842 |
T |
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| Q |
420 |
tgtgaaatgcccaaaacgtcatacaatttaggatgaagggagtaat |
465 |
Q |
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| T |
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tgtaaaatggccaaaacgtcttacaatttgggacggagggagtaat |
27862796 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #109
Raw Score: 104; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 231 - 464
Target Start/End: Original strand, 36173997 - 36174241
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330 |
Q |
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atttgtctcaaattatatgtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcatatt-tatccttaactattaattactctaccttctttcaat |
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T |
 |
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331 |
tcttttatttatctttttcata-----------ggacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatatg |
419 |
Q |
| |
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36174096 |
tatttcatttatctttttcataccatttattagggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaatattaattatatttcttaatatg |
36174195 |
T |
 |
| Q |
420 |
tgtgaaat-gcccaaaacgtcatacaatttaggatgaagggagtaa |
464 |
Q |
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| T |
36174196 |
tgtgaaatggccaaaaacgtcatacaatttgggacggagggagtaa |
36174241 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #110
Raw Score: 104; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 233 - 463
Target Start/End: Complemental strand, 37111240 - 37110999
Alignment:
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332 |
Q |
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37111240 |
ttgtctcaaattacatgtcgttttacaatatcaatgaaatattaatgttacttttcctattatatccttaactattaattactccatcttctttcaatta |
37111141 |
T |
 |
| Q |
333 |
ttttatttatctttttcata-----------ggacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatatgtg |
421 |
Q |
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| T |
37111140 |
tttcatttatcttttccataccatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaatattaattacatttcttaatacgtg |
37111041 |
T |
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| Q |
422 |
tgaaatgcccaaaacgtcatacaatttaggatgaagggagta |
463 |
Q |
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||||||| ||||||||||||||||||| ||| | |||||||| |
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| T |
37111040 |
tgaaatggccaaaacgtcatacaatttgggacggagggagta |
37110999 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #111
Raw Score: 103; E-Value: 6e-51
Query Start/End: Original strand, 231 - 448
Target Start/End: Original strand, 21288892 - 21289120
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330 |
Q |
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21288892 |
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21288991 |
T |
 |
| Q |
331 |
tcttttatttatctttttcata-----------ggacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatatg |
419 |
Q |
| |
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| T |
21288992 |
tatttcatttatcttttccataccatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttcttttctccacacaatattaattacatttcttaatacg |
21289091 |
T |
 |
| Q |
420 |
tgtgaaatgcccaaaacgtcatacaattt |
448 |
Q |
| |
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| T |
21289092 |
tgtgaaatgaccaaaacgttatacaattt |
21289120 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #112
Raw Score: 103; E-Value: 6e-51
Query Start/End: Original strand, 233 - 448
Target Start/End: Original strand, 30803480 - 30803697
Alignment:
| Q |
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332 |
Q |
| |
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30803480 |
ttgtcacaaattgttagtcactttacaataccaatgaaacattaatattactttttctattatatctttaactatttattactcgttcttctttcattta |
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T |
 |
| Q |
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ttttatttatctttttcat--aggacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatatgtgtgaaatgcc |
430 |
Q |
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| T |
30803580 |
tcttttccatattatttattaaggacaattttgtaaaataactcataatatttatttcccacacaatattaattatatttcttaatatatgtgaaatgcc |
30803679 |
T |
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| Q |
431 |
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448 |
Q |
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| T |
30803680 |
caaaacgtcatacaattt |
30803697 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #113
Raw Score: 103; E-Value: 6e-51
Query Start/End: Original strand, 232 - 453
Target Start/End: Complemental strand, 41285843 - 41285611
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| Q |
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331 |
Q |
| |
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|
| T |
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tttgttccaaattatatgtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcctattatatccttaactattaattactctctcttctttcaatt |
41285744 |
T |
 |
| Q |
332 |
cttttatttatctttttcat-----------aggacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatatgt |
420 |
Q |
| |
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| T |
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atttaatttatcttttccataccatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccctacacaatattaattacattttttaatacgt |
41285644 |
T |
 |
| Q |
421 |
gtgaaatgcccaaaacgtcatacaatttaggat |
453 |
Q |
| |
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| T |
41285643 |
gtgaaatagctaaaacatcatacaatttgggat |
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #114
Raw Score: 100; E-Value: 4e-49
Query Start/End: Original strand, 190 - 448
Target Start/End: Original strand, 25899000 - 25899268
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Q |
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|
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tactccatccgtcccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgttccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttactttttc |
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T |
 |
| Q |
290 |
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378 |
Q |
| |
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| T |
25899100 |
tattatatcattaactatttattaccatttcttttttcaattc-ttcatttatctttcccatatcatttattaaggataattttgtaaaacaactcataa |
25899198 |
T |
 |
| Q |
379 |
tatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatatgtgtgaaatgcccaaaacgtcatacaattt |
448 |
Q |
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| T |
25899199 |
tatctctttcccacgcaatattaattacattttttaatatatatgaaatgctcaaaacattatacaattt |
25899268 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #115
Raw Score: 98; E-Value: 6e-48
Query Start/End: Original strand, 231 - 463
Target Start/End: Complemental strand, 8444238 - 8444000
Alignment:
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330 |
Q |
| |
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| T |
8444238 |
atttgtcccaaattatatgtcgctttacaatactaatgaaatattaatgttactttttctattatatccttaactattaattactctctcttctttcaat |
8444139 |
T |
 |
| Q |
331 |
tcttttatttatctttttcat-----------aggacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatatg |
419 |
Q |
| |
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| ||| ||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||| |
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| T |
8444138 |
tatttcatttatcttttccataccatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccac-----tttaattacatttcttaatact |
8444044 |
T |
 |
| Q |
420 |
tgtgaaatgcccaaaacgtcatacaatttaggatgaagggagta |
463 |
Q |
| |
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|
| T |
8444043 |
tgtgaaatggccaaaacgtcatacaatttaggacggagggagta |
8444000 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #116
Raw Score: 98; E-Value: 6e-48
Query Start/End: Original strand, 231 - 463
Target Start/End: Original strand, 43446574 - 43446817
Alignment:
| Q |
231 |
atttgtcccaaattgtatgtcactttacaataccaatgaaacattaatgttatttttcctattataaccttaactatttattactctctcttctttcaag |
330 |
Q |
| |
|
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|
| T |
43446574 |
atttgtctcaaattatatgtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttactttttctattatatccttaactattaattattctctcttatttcaat |
43446673 |
T |
 |
| Q |
331 |
tcttttatttatctttttcata-----------ggacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatatg |
419 |
Q |
| |
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| | | ||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||| ||||| |||||| | | ||||||||||||||||||||||||||| |
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| T |
43446674 |
tatatcatttatcttttccataccatttattaaggataattttgtaaaacaactgataatttctcttccctaaacaatattaattacatttcttaatatg |
43446773 |
T |
 |
| Q |
420 |
tgtgaaatgcccaaaacgtcatacaatttaggatgaagggagta |
463 |
Q |
| |
|
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|
| T |
43446774 |
tgtggaatggccaaaacgtcatacaatttgggatggaggaagta |
43446817 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #117
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 233 - 448
Target Start/End: Original strand, 15848668 - 15848894
Alignment:
| Q |
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332 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||| |||| |||||||||| | ||||| || ||||||| |
|
|
| T |
15848668 |
ttgtcctaaattgtatgtcgctttacaataccaatgaatcattaatgttactttttctattatatccttcactatttattgccttctctactctcaagtc |
15848767 |
T |
 |
| Q |
333 |
ttttatttatctttttcata-----------ggacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatatgtg |
421 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
15848768 |
attcatttatctttcccatatcatttattaaggacaattttataaaacaactcataatatctctttcccacacaaaattaattacatttcttaatgcgtg |
15848867 |
T |
 |
| Q |
422 |
tgaaatgcccaaaacgtcatacaattt |
448 |
Q |
| |
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| T |
15848868 |
tgaaatactcaaaacgtcatacaattt |
15848894 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #118
Raw Score: 96; E-Value: 9e-47
Query Start/End: Original strand, 293 - 463
Target Start/End: Original strand, 27863081 - 27863262
Alignment:
| Q |
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381 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |
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|
| T |
27863081 |
tataaccttaactatttattgctatctcttctttcaattctttcatttatctttctcatgttatttattaaggacaattttgtaaaacaactcataatat |
27863180 |
T |
 |
| Q |
382 |
ctcttttccacacaatattaattacatttcttaatatgtgtgaaatgcccaaaacgtcatacaatttaggatgaagggagta |
463 |
Q |
| |
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|
| T |
27863181 |
cttttttccacacaatattaattgcattttttaatatgtgtgaaatgctcaaaacgtcatacaatttgggacggagggagta |
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T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #119
Raw Score: 96; E-Value: 9e-47
Query Start/End: Original strand, 238 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 30564218 - 30563997
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337 |
Q |
| |
|
||||||| |||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||| |||| ||||||| |||||||||||| | | | | |
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|
| T |
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ccaaattatatgtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcctattatatccttaagtattaattactccctcttctttcaattatatca |
30564119 |
T |
 |
| Q |
338 |
tttatctttttcata-----------ggacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatatgtgtgaaa |
426 |
Q |
| |
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| T |
30564118 |
tttatcgtttccataccatttattaaggataattttgtaaaacaacttataatttctcttccccacacaatattaattacatttcttaatacgtgtgaaa |
30564019 |
T |
 |
| Q |
427 |
tgcccaaaacgtcatacaattt |
448 |
Q |
| |
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| T |
30564018 |
tgaccaaaacttcatacaattt |
30563997 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #120
Raw Score: 95; E-Value: 4e-46
Query Start/End: Original strand, 253 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 2893961 - 2893759
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ctttacaataccaatgaaacattaatgttatttttcctattataaccttaactatttattactctctcttctttcaagtcttttatttatcttt------ |
346 |
Q |
| |
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|
|
| T |
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ctttacaataccaatgaaaaattaatgttacttttcctattatattcttaactatttactactctct--tctttcaa-tccttcatttatctttcctgta |
2893865 |
T |
 |
| Q |
347 |
---ttcatagg-acaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatatgtgtgaaatgcccaaaacgtcata |
442 |
Q |
| |
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| T |
2893864 |
catttattagggacaattttgtaaaacaactcataatatttctttcccacacaatattaattacatttcttaatatatgtgaaatgcccaaaacatcata |
2893765 |
T |
 |
| Q |
443 |
caattt |
448 |
Q |
| |
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| T |
2893764 |
caattt |
2893759 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #121
Raw Score: 95; E-Value: 4e-46
Query Start/End: Original strand, 235 - 450
Target Start/End: Complemental strand, 36174595 - 36174379
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| Q |
235 |
gtcccaaattgtatgtcactttacaataccaatgaaacattaatgttatttttcctattataaccttaactatttattactctctcttctttcaagtctt |
334 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||| | | |
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|
| T |
36174595 |
gtcccaaattgtatgtcgctttacaatactaatgaaacatta-tgttatttttcctattatatccttaattatttattaccctctcttctttcatttatc |
36174497 |
T |
 |
| Q |
335 |
ttatttatctttttcat--aggacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatatgtgtgaaatgccca |
432 |
Q |
| |
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|| || || | || || |||| || |||||||| |||||| |||||||||||| ||| | |||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||| |
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| T |
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tttttcatgtcatttattaaggaaaactttgtaaatcaactcgtaatatctctttcccataaaatattaattgtatttcttaatatgtatgaaatgtcca |
36174397 |
T |
 |
| Q |
433 |
aaacgtcatacaatttag |
450 |
Q |
| |
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| T |
36174396 |
aaacgtcatacaatttag |
36174379 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #122
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Query Start/End: Original strand, 290 - 466
Target Start/End: Complemental strand, 4898162 - 4897975
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290 |
tattataaccttaactatttattactctctcttctttcaagtcttttatttatctttttcata-----------ggacaattttgtaaaacaactcataa |
378 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||| |||| |
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|
| T |
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tattataaccttaactatttattactctttcttctttcaattctttcatttatcctttacatattatttattaaggacaattttgtaaaacaacttataa |
4898063 |
T |
 |
| Q |
379 |
tatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatatgtgtgaaatgcccaaaacgtcatacaatttaggatgaagggagtaatt |
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Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||| ||| | ||||||||||| |
|
|
| T |
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tatctcttttccacacaatattaattgcatttcttaatatatgtgaaatgtccaaattgtcatacaatttgggacggagggagtaatt |
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 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #123
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 290 - 466
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378 |
Q |
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| T |
4945556 |
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4945457 |
T |
 |
| Q |
379 |
tatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatatgtgtgaaatgcccaaaacgtcatacaatttaggatgaagggagtaatt |
466 |
Q |
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| T |
4945456 |
tatctcttttccacacaatattaattgcatttcttaatatatgtgaaatgtccaaattgtcatacaatttgggacggagggagtaatt |
4945369 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #124
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Target Start/End: Original strand, 17399810 - 17400029
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339 |
Q |
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T |
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tatctttttcata-----------ggacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatatgtgtgaaatg |
428 |
Q |
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| T |
17399910 |
tatcttttccataccatttattagggataattttgtaaaacaatttataatttctcttccccacacaatattaattacatttcttaatacgtgtgaaatg |
17400009 |
T |
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429 |
cccaaaacgtcatacaattt |
448 |
Q |
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17400010 |
gccaaaacatcttacaattt |
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #125
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
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Target Start/End: Original strand, 22060704 - 22060931
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T |
 |
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347 |
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435 |
Q |
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| T |
22060804 |
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22060903 |
T |
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436 |
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463 |
Q |
| |
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22060904 |
cgtcatacaatttgggacggagggagta |
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #126
Raw Score: 93; E-Value: 6e-45
Query Start/End: Original strand, 233 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 10198057 - 10197832
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Q |
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T |
 |
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ttttatttatctttttcat-----------aggacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatatgtg |
421 |
Q |
| |
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| T |
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tttaatttatctttcccataacatttattaaggacaattttgtaaaacaactcataatatctctttcccatacaaaattaattaca-ttcttaatacgta |
10197859 |
T |
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| Q |
422 |
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448 |
Q |
| |
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| T |
10197858 |
tgaaatgtccaaaacgtcatataattt |
10197832 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #127
Raw Score: 93; E-Value: 6e-45
Query Start/End: Original strand, 265 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 43257479 - 43257285
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Q |
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T |
 |
| Q |
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448 |
Q |
| |
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gacaattttgtaaaacaactcataatatatttttcccacacaatattaattatatttcttaatatgtgtgaaatgcccaaaacgtcatacaattt |
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #128
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Query Start/End: Original strand, 231 - 448
Target Start/End: Original strand, 38993528 - 38993754
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Q |
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T |
 |
| Q |
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419 |
Q |
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| T |
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T |
 |
| Q |
420 |
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448 |
Q |
| |
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| T |
38993726 |
tgtgaaatgaccaaaacatcttacaattt |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #129
Raw Score: 91; E-Value: 9e-44
Query Start/End: Original strand, 240 - 464
Target Start/End: Complemental strand, 33677362 - 33677129
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339 |
Q |
| |
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T |
 |
| Q |
340 |
tatctttttcata-----------ggacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatatgtgtgaaatg |
428 |
Q |
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| T |
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tatctttctcataccatttataaaggacaattttgtaaaacaactcataatatatatttcccacacaaaattatttatatttcttaatacatgttaaatg |
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T |
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| Q |
429 |
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464 |
Q |
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| T |
33677164 |
cctaaaacgtcatacaatttgagatggagggagtaa |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #130
Raw Score: 91; E-Value: 9e-44
Query Start/End: Original strand, 231 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 39958401 - 39958173
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330 |
Q |
| |
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T |
 |
| Q |
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tcttttatttatctttttcata-----------ggacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatatg |
419 |
Q |
| |
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| | | |||||| |||| |||| ||| ||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||| | |
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| T |
39958301 |
tatatcatttattttttccatatcatttattaaggataattttgtaaaacaacttataatttctcttccccacacaatattaattacattttttaatacg |
39958202 |
T |
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| Q |
420 |
tgtgaaatgcccaaaacgtcatacaattt |
448 |
Q |
| |
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| T |
39958201 |
tgtgaaatgaccaaaacgtcatataattt |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #131
Raw Score: 90; E-Value: 4e-43
Query Start/End: Original strand, 236 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 20925933 - 20925710
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| Q |
236 |
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335 |
Q |
| |
|
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| T |
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20925834 |
T |
 |
| Q |
336 |
tatttatctttttcat-----------aggacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatatgtgtga |
424 |
Q |
| |
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| T |
20925833 |
catttatttttcccatgtcatttattaattacaattttgtaaaacaactcataatatttctttcccacacaaaattaattacatttcttaatacgtatga |
20925734 |
T |
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| Q |
425 |
aatgcccaaaacgtcatacaattt |
448 |
Q |
| |
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||| ||||||||||| |||||||| |
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| T |
20925733 |
aatacccaaaacgtcgtacaattt |
20925710 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #132
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Query Start/End: Original strand, 233 - 448
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| |
|
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ttgttccaaattatatgtcgctttacaatactaatgaaatatttatgttacttttcctattatatccttaactattaaatactctctcttctttcaatta |
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T |
 |
| Q |
333 |
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Q |
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| T |
36598718 |
tttcatttatattttccatactatttattagggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccatgctatattaattacatttcttaatacgtg |
36598619 |
T |
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| Q |
422 |
tgaaatgcccaaaacgtcatacaattt |
448 |
Q |
| |
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| T |
36598618 |
tgaaatgaccaaaacgtcttacaattt |
36598592 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #133
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 233 - 448
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332 |
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| |
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T |
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ttttatttatctttttcata-----------ggacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatatgtg |
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Q |
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44987858 |
attcatttatttttctcatattatttattaaggacaattttgtaaaacaactcatattatctctttcccacacaaaattaattacattttttaatacgtg |
44987957 |
T |
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| Q |
422 |
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448 |
Q |
| |
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| T |
44987958 |
tgaaatgtccaaaacgtcatacaattt |
44987984 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #134
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332 |
Q |
| |
|
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| T |
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T |
 |
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333 |
ttttatttatctttttcatag-----------gacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatatgtg |
421 |
Q |
| |
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| T |
8059954 |
tttcatttatttttcccatattatttattaatgacaattttgtaaaacaattcataatatctgtttttcacataatattaattgcatttcttaatatgtg |
8060053 |
T |
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| Q |
422 |
tgaaatgcccaaaacgtcatacaatttagg |
451 |
Q |
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| T |
8060054 |
tgaaatgctcaaaatgtcctacaatttagg |
8060083 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #135
Raw Score: 88; E-Value: 6e-42
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339 |
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| |
|
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| T |
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aaattatatgtcactttacaataccaatacaacattaatgttactttttctgttataatcttaattatttattaccctctcttctttcaattctttcatt |
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T |
 |
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340 |
tatctttttcat-----------aggacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatatgtgtgaaa |
426 |
Q |
| |
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| T |
11154371 |
tatctttcccatattatttattaaggacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccagacaatattaattgtattttttaatatgtctgaaa |
11154274 |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #136
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339 |
Q |
| |
|
||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||| | |||||| |
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T |
 |
| Q |
340 |
tatctttttcata-----------ggacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatatgtgtgaaatg |
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Q |
| |
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| T |
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tatcttttccataccatttattagggataattctgtaaaacaactcataatttttcttccccacgcaatattaattaactttcttaatacatgtgaaatg |
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T |
 |
| Q |
429 |
cccaaaacgtcatacaatttagga |
452 |
Q |
| |
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| T |
9053776 |
gccaaaacgtcttacaatttagga |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #137
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Q |
| |
|
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|
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Q |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #138
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 253 - 465
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| Q |
253 |
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350 |
Q |
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439 |
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465 |
Q |
| |
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| T |
14834253 |
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14834278 |
T |
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Target: chr2; HSP #139
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Target Start/End: Complemental strand, 29432921 - 29432695
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332 |
Q |
| |
|
|||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||| || | |
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| T |
29432921 |
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29432822 |
T |
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| Q |
333 |
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421 |
Q |
| |
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| T |
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T |
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| Q |
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448 |
Q |
| |
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|||||| ||||||||| |||||||| |
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| T |
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29432695 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #140
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 352 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 36602136 - 36602040
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| Q |
352 |
aggacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatatgtgtgaaatgcccaaaacgtcatacaattt |
448 |
Q |
| |
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| T |
36602136 |
aggacaattttgtaaaacaactcataatatctctttcccacacaatattaattacatttcttaatatgtgtgaaatgcctaaaacgtcgtacaattt |
36602040 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #141
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Target Start/End: Original strand, 14723837 - 14724083
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327 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||| || || | ||||| | ||||||||| ||||||| |||||||||| |
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14723936 |
T |
 |
| Q |
328 |
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416 |
Q |
| |
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| T |
14723937 |
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14724036 |
T |
 |
| Q |
417 |
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463 |
Q |
| |
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| T |
14724037 |
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T |
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Target: chr2; HSP #142
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Target Start/End: Original strand, 38150531 - 38150735
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302 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||| || |||||||||| |||||||| |||||||||| |||| |||||||| ||||| |
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| T |
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38150630 |
T |
 |
| Q |
303 |
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391 |
Q |
| |
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| T |
38150631 |
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38150730 |
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 |
| Q |
392 |
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396 |
Q |
| |
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|||| |
|
|
| T |
38150731 |
gacaa |
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T |
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Target: chr2; HSP #143
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Q |
| |
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30780055 |
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30780154 |
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 |
| Q |
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346 |
Q |
| |
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| T |
30780155 |
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T |
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Target: chr2; HSP #144
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Query Start/End: Original strand, 231 - 446
Target Start/End: Complemental strand, 19505873 - 19505648
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330 |
Q |
| |
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||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||| ||| |
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| T |
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19505774 |
T |
 |
| Q |
331 |
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418 |
Q |
| |
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| T |
19505773 |
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19505676 |
T |
 |
| Q |
419 |
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446 |
Q |
| |
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|
| T |
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gtgtgaaatggccaaaacatcgtacaat |
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T |
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Target: chr2; HSP #145
Raw Score: 76; E-Value: 8e-35
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Target Start/End: Complemental strand, 44710071 - 44709890
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Q |
| |
|
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|
| T |
44710071 |
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44709972 |
T |
 |
| Q |
334 |
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404 |
Q |
| |
|
|| |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||| ||||||||||| |
|
|
| T |
44709971 |
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44709890 |
T |
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Target: chr2; HSP #146
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Target Start/End: Original strand, 13196408 - 13196630
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335 |
Q |
| |
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| T |
13196408 |
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13196505 |
T |
 |
| Q |
336 |
tatttatctttttcata-----------ggacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatatgtgtga |
424 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| | ||||| |||| ||||||||||||| ||||| |||||| |
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| T |
13196506 |
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13196604 |
T |
 |
| Q |
425 |
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450 |
Q |
| |
|
||||| |||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
13196605 |
aatgctcaaaacgtcatataatttag |
13196630 |
T |
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Target: chr2; HSP #147
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330 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
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37988321 |
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 |
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352 |
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| |
|
| ||| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
37988322 |
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T |
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332 |
Q |
| |
|
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|
| T |
27525006 |
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27525105 |
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 |
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333 |
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425 |
Q |
| |
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||| | ||||| ||| ||| |||| |||||||||||||| | |||||||||||||| ||| |||| ||| |||||||||||||||| |||||| |
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|
| T |
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27525205 |
T |
 |
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427 |
Q |
| |
|
|| |
|
|
| T |
27525206 |
at |
27525207 |
T |
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Target: chr2; HSP #149
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ttgtcccaaattgtatgtcactttacaataccaatgaaacattaatgttatttttcctattataaccttaactatttattactct |
317 |
Q |
| |
|
||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
6312260 |
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T |
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tttacaataccaatgaaacattaatgttatttttcctattataaccttaactatttattactctctcttctttcaagtcttttatttatctttttcata- |
352 |
Q |
| |
|
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| T |
39293410 |
tttacaataccaatgaaacattaatgttattttttctattatatccttaactatttatcattatatattttttcaattctttaatttatctctctcataa |
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T |
 |
| Q |
353 |
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417 |
Q |
| |
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|
|
| T |
39293510 |
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T |
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330 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||| |||||| |||| |||||||| | ||||||||| |
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|
| T |
34504382 |
atttgtcctaaattatatgtcgctttacaataccaatgaaatatttatgttacttttcctattatatccttaattattaattactctattttctttcaat |
34504481 |
T |
 |
| Q |
331 |
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352 |
Q |
| |
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| ||| ||||||||||| |||| |
|
|
| T |
34504482 |
tatttcatttatcttttccata |
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T |
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Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| | |||||| |||| | | ||||||||||||||||||||||||||||||| |
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|
| T |
4079799 |
ttaactatttattactctctcttctttcaattcatttatctgtcttttccatatcatttattaagaataattttgtaaaacaactcataatatctctttc |
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T |
 |
| Q |
389 |
ccacacaatattaattacatttcttaatatgtgtgaaatg |
428 |
Q |
| |
|
||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
4079899 |
ccacataatattaattatattttttaatatgtgtgaaatg |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #153
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346 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||| |
|
|
| T |
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tttacaataccaatataacattagtgttatttttttctattataaccttaactatttattactctttcttctttcaattctttcatttatcttt |
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T |
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Target: chr2; HSP #154
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ttgtcccaaattgtatgtcactttacaataccaatgaaacattaatgttatttttcctattataaccttaactatttattactctctcttctttcaagtc |
332 |
Q |
| |
|
||||| |||||| ||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||| ||||| ||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||| || |
|
|
| T |
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ttgtcacaaattatatgtcattttacaataccattgaaacaataatgttgcttttcttattatatccttaattatttattattctctcttctttcaattc |
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T |
 |
| Q |
333 |
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335 |
Q |
| |
|
||| |
|
|
| T |
4553463 |
ttt |
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
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aatgaaacattaatgttatttttcctattataaccttaactatttattactctctcttctttcaagtcttttatttatctttttcatag----------- |
353 |
Q |
| |
|
||||||| |||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||| |||||| || ||||| || |||||||||| |||| |
|
|
| T |
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aatgaaatattaatgttacttttcagattatatccttaactatttattactttctctttttctaagtcattcatttatctttcccatatcatttatcgtg |
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T |
 |
| Q |
354 |
-gacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatatgtgtgaaatgcccaaaacgtcatacaatttagga |
452 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||| | ||||| |||| |||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |
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|
| T |
9936680 |
tgacaattttgtaaaacaattcataatatctatttcccacacaaagtcaattatatttgttaatacgtgtgaaatatccaaaacatcatacaatttagga |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #156
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Query Start/End: Original strand, 266 - 335
Target Start/End: Original strand, 21884345 - 21884414
Alignment:
| Q |
266 |
atgaaacattaatgttatttttcctattataaccttaactatttattactctctcttctttcaagtcttt |
335 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
21884345 |
atgaaacattaatgttatttttcctattatatcattaactatttattagtctctcttctttcaattcttt |
21884414 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #157
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 254 - 416
Target Start/End: Original strand, 15269563 - 15269737
Alignment:
| Q |
254 |
tttacaataccaatgaaacattaatgttatttttcctatta-taaccttaactatttattactctctcttctttcaagtcttttatttatctttttcat- |
351 |
Q |
| |
|
||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||| || ||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||| ||||| |||| |
|
|
| T |
15269563 |
tttacaataccaaaaaaacattaatgttacttttcatattactatccttagctatttattactctatcttctttcaattctttcatttctctttctcata |
15269662 |
T |
 |
| Q |
352 |
----------aggacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaatattaattacatttcttaat |
416 |
Q |
| |
|
|||| || |||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||| |||||| ||||| |
|
|
| T |
15269663 |
ccattttttaaggagaaatttgtaaaacaactcataatatctctttctcatacaaaattaatgacattttttaat |
15269737 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #158
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 253 - 352
Target Start/End: Complemental strand, 45383560 - 45383460
Alignment:
| Q |
253 |
ctttacaataccaatgaaacattaatgtta-tttttcctattataaccttaactatttattactctctcttctttcaagtcttttatttatctttttcat |
351 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| |||||| |||||||| | ||||| | |||||| ||||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
45383560 |
ctttacaataccaatgaagcattaatgttacttttttctattatatccttaattatttattgccctctcatatttcaattctttaatttatctttttcat |
45383461 |
T |
 |
| Q |
352 |
a |
352 |
Q |
| |
|
| |
|
|
| T |
45383460 |
a |
45383460 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #159
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 302 - 454
Target Start/End: Original strand, 31839066 - 31839228
Alignment:
| Q |
302 |
aactatttattactctctcttctttcaagtcttttatttatctttttcatag----------gacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttcca |
391 |
Q |
| |
|
|||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||| || ||||||||||||||| | |||||||||||||| | |
|
|
| T |
31839066 |
aactatttattagtctctcttctttcaactctttaatttatctttctcataccatttaaaaagataattttgtaaaacaatttataatatctctttttcg |
31839165 |
T |
 |
| Q |
392 |
cacaatattaattacatttcttaatatgtgtgaaatgcccaaaacgtcatacaatttaggatg |
454 |
Q |
| |
|
|||| |||||| ||||||||||||| || ||||||| |||||||||| || |||||| |||| |
|
|
| T |
31839166 |
tacaaaattaatgacatttcttaatacgtttgaaatgaccaaaacgtcgtataatttaagatg |
31839228 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #160
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 233 - 352
Target Start/End: Original strand, 45423278 - 45423397
Alignment:
| Q |
233 |
ttgtcccaaattgtatgtcactttacaataccaatgaaacattaatgttatttttcctattataaccttaactatttattactctctcttctttcaagtc |
332 |
Q |
| |
|
||||| |||||| |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| | |||| ||| || ||||||||| ||| | ||||||||| || |
|
|
| T |
45423278 |
ttgtctcaaattatatgtctctttacaataccaataaaacattaatgttacttttcttgttatctcctcaattatttattaatcttttttctttcaattc |
45423377 |
T |
 |
| Q |
333 |
ttttatttatctttttcata |
352 |
Q |
| |
|
||| |||||||||| ||||| |
|
|
| T |
45423378 |
tttcatttatctttctcata |
45423397 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #161
Raw Score: 51; E-Value: 7e-20
Query Start/End: Original strand, 233 - 450
Target Start/End: Complemental strand, 12123107 - 12122880
Alignment:
| Q |
233 |
ttgtcccaaattgtatgtcactttacaataccaatgaaacattaatgttatttttcctattataaccttaactatttattactctctcttctttcaagtc |
332 |
Q |
| |
|
|||||| ||||| || ||| |||| |||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| | |
|
|
| T |
12123107 |
ttgtcctaaattatacgtcgttttataatatcaataaaacattaatgttattttttctattatatccttaactatttattactctccattctttcaa-tt |
12123009 |
T |
 |
| Q |
333 |
ttttatttatctttttcat-----------aggacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatatgtg |
421 |
Q |
| |
|
||| |||||||||| ||| | || ||||||||| ||||||||||||||| | || ||| ||| |||||||| |||||||| ||| | |
|
|
| T |
12123008 |
tttaatttatctttcacataccatttattaaagataattttgtagaacaactcataatattttttactcacgcaaaattaattatatttcttactatcta |
12122909 |
T |
 |
| Q |
422 |
tgaaatgcccaaaacgtcatacaatttag |
450 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
12122908 |
tgaaatatccaaaacatcatacaatttag |
12122880 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #162
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 232 - 329
Target Start/End: Original strand, 12598269 - 12598365
Alignment:
| Q |
232 |
tttgtcccaaattgtatgtcactttacaataccaatgaaacattaatgttatttttcctattataaccttaactatttattactctctcttctttcaa |
329 |
Q |
| |
|
|||||| |||||| ||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
12598269 |
tttgtcacaaattatatatcactttacaataccaataaaatattaatgttattttt-ctatcatatatttaactgtttattactctctcttctttcaa |
12598365 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #163
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 234 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 13197105 - 13196990
Alignment:
| Q |
234 |
tgtcccaaattgtatgtcactttacaataccaatgaaacattaatgttatttttcctattataaccttaactatttattactctctcttctttcaagtct |
333 |
Q |
| |
|
|||| |||||| ||| || ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||||| || | | |
|
|
| T |
13197105 |
tgtctcaaattatatatcgctttacaataccaattaaacattaatgatattttttttattatattattaattatttattactctctcttcttttaatttt |
13197006 |
T |
 |
| Q |
334 |
tttatttatctttttc |
349 |
Q |
| |
|
|| || |||||||||| |
|
|
| T |
13197005 |
ttaatatatctttttc |
13196990 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #164
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 230 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 4898369 - 4898311
Alignment:
| Q |
230 |
tatttgtcccaaattgtatgtcactttacaataccaatgaaacattaatgttatttttc |
288 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
4898369 |
tatttgtcccaaattatatgtcactttacaataccaatgcaactttaatgttatttttc |
4898311 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #165
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 230 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 4945763 - 4945705
Alignment:
| Q |
230 |
tatttgtcccaaattgtatgtcactttacaataccaatgaaacattaatgttatttttc |
288 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
4945763 |
tatttgtcccaaattatatgtcactttacaataccaatgcaactttaatgttatttttc |
4945705 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #166
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 361 - 415
Target Start/End: Original strand, 15242838 - 15242892
Alignment:
| Q |
361 |
ttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaatattaattacatttcttaa |
415 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
15242838 |
ttgtaaaacaactcataatatctcttttccatacaaaattaattacatttcttaa |
15242892 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #167
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 233 - 421
Target Start/End: Original strand, 42695616 - 42695815
Alignment:
| Q |
233 |
ttgtcccaaattgtatgtcactttacaataccaatgaaacattaatgttatttttcctattataaccttaactatttattactctctcttctttcaagtc |
332 |
Q |
| |
|
|||||| ||||| || ||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||| || |||||| | |
|
|
| T |
42695616 |
ttgtccaaaattataaatcattttacaataacattgaaacattaatgttattttttatattatatcattaactatttattactcaatccattttcaatta |
42695715 |
T |
 |
| Q |
333 |
ttttatttatctttttcat-----------aggacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatatgtg |
421 |
Q |
| |
|
||| |||||||||| |||| |||||| || |||||||||||||||||||||||||| | | || ||||||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
42695716 |
tttaatttatctttctcataacatttattaaggacatttatgtaaaacaactcataatatctctttctcgtataaaattaattacattttttaatatgtg |
42695815 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #168
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 259 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 42801115 - 42801031
Alignment:
| Q |
259 |
aataccaatgaaacattaatgttatttttcctattataaccttaactatttattactctctcttctttcaagtcttttatttatct |
344 |
Q |
| |
|
|||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||| |||||| |||| |||||||| |
|
|
| T |
42801115 |
aatatcaatgaaacattaatgttacttttcctattataa-ctttactatttattactctatcttatttcaatcctttcatttatct |
42801031 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #169
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 265 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 13995456 - 13995380
Alignment:
| Q |
265 |
aatgaaacattaatgttatttttcctattataaccttaactatttattactctctcttctttcaagtcttttattta |
341 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||| ||||| |
|
|
| T |
13995456 |
aatgaagcattaatgttatttttcctattatattattaactatttattactcgctcatctttcaattctttcattta |
13995380 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #170
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 395 - 463
Target Start/End: Original strand, 20213947 - 20214015
Alignment:
| Q |
395 |
aatattaattacatttcttaatatgtgtgaaatgcccaaaacgtcatacaatttaggatgaagggagta |
463 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| | |||| | |||||||| |
|
|
| T |
20213947 |
aatattaattacatttcttaatatgtgtggaatgtccaaaacgtcatacaaataaggacggagggagta |
20214015 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #171
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 249 - 428
Target Start/End: Original strand, 37742700 - 37742890
Alignment:
| Q |
249 |
gtcactttacaataccaatgaaacattaatgttatttttcctattataaccttaactatttattactctctcttctttcaagtcttttatttatcttttt |
348 |
Q |
| |
|
|||| ||||||||| |||||| |||||||||||| || ||||||| |||| ||||||||||| |||||||| |||| | ||| |||||||||| | |
|
|
| T |
37742700 |
gtcattttacaatattaatgaagaattaatgttattgtttatattatacaattaattatttattactttctcttctatcaattatttaatttatctttct |
37742799 |
T |
 |
| Q |
349 |
cata-----------ggacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatatgtgtgaaatg |
428 |
Q |
| |
|
|||| ||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||| || |||| ||||||||||||| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
37742800 |
cataccatttattaaggacaattttgtaaaacaattcatagtatatctttctcatacaaaattaattacattttctaatatgtgtgaaatg |
37742890 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #172
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 284 - 418
Target Start/End: Complemental strand, 15041148 - 15041004
Alignment:
| Q |
284 |
ttttcctattataaccttaactatttattactctctcttctttcaagtcttttatttatctttttcat-----------aggacaattttgtaaaacaac |
372 |
Q |
| |
|
||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| | || |||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
15041148 |
ttttcatattatatcattaactatttattactctctcttctttcaattctttgatttatctttctgataccatttattaaggacaatattgtaaaacaac |
15041049 |
T |
 |
| Q |
373 |
tcataatatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatat |
418 |
Q |
| |
|
| ||||||| | ||||||| | || ||||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
15041048 |
ttataatat-ttttttccatataaaattaattacattttttaatat |
15041004 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #173
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 394 - 465
Target Start/End: Original strand, 37988518 - 37988589
Alignment:
| Q |
394 |
caatattaattacatttcttaatatgtgtgaaatgcccaaaacgtcatacaatttaggatgaagggagtaat |
465 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||| | |||||||||| |
|
|
| T |
37988518 |
caatattaattacatttcttaatacgtgtgaaattatcaaaacgtcttacaatttaggacggagggagtaat |
37988589 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #174
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Query Start/End: Original strand, 352 - 450
Target Start/End: Complemental strand, 42141877 - 42141779
Alignment:
| Q |
352 |
aggacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatatgtgtgaaatgcccaaaacgtcatacaatttag |
450 |
Q |
| |
|
|||| |||||||||||| ||| ||||| | ||||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||| ||| |||||||| ||||||| |
|
|
| T |
42141877 |
aggataattttgtaaaatgacttataatttatcttttccatacaatattaattacacttcttaatttgtgtaaaatgatcaatacgtcatataatttag |
42141779 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #175
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 235 - 352
Target Start/End: Original strand, 625932 - 626049
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| Q |
235 |
gtcccaaattgtatgtcactttacaataccaatgaaacattaatgttatttttcctattataaccttaactatttattactctctcttctttcaagtctt |
334 |
Q |
| |
|
|||||||||| || || ||||| |||||||||||| |||||||||| ||||| | || ||||| || |||||||||| | ||||| ||||||| |||| |
|
|
| T |
625932 |
gtcccaaattataaatcgctttaaaataccaatgaagcattaatgttgttttttccataataactctacctatttattagtatctctcctttcaattctt |
626031 |
T |
 |
| Q |
335 |
ttatttatctttttcata |
352 |
Q |
| |
|
| |||||||||| ||||| |
|
|
| T |
626032 |
taatttatctttctcata |
626049 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #176
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 255 - 433
Target Start/End: Original strand, 32864036 - 32864224
Alignment:
| Q |
255 |
ttacaataccaatgaaacattaatgttatttttcctattataaccttaactatttattactctctcttctttcaagtcttttatttatctttttcatag- |
353 |
Q |
| |
|
|||||||| |||||| |||||||||||| || |||| ||| | |||| || ||||||||| |||||||| || ||||| |||||||||| ||||| |
|
|
| T |
32864036 |
ttacaatatcaatgatgtattaatgttattctttctatcatatcattaatcatatattactctatcttcttttaattctttaatttatctttctcatact |
32864135 |
T |
 |
| Q |
354 |
---------gacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatatgtgtgaaatgcccaa |
433 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||| |||||||| |||||||||| ||||||||| |||| |
|
|
| T |
32864136 |
atttttaaagacaattttgtaaaactactcataatatctctttgtcatacaaaattaattatatttcttaatgcatgtgaaatgaccaa |
32864224 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #177
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 252 - 301
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Alignment:
| Q |
252 |
actttacaataccaatgaaacattaatgttatttttcctattataacctt |
301 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |
|
|
| T |
35020354 |
actttacaataccaatgaaacattaatgttatttttcatattatatcctt |
35020305 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #178
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| Q |
359 |
ttttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatatgtgtgaaatgcccaaaacgtcatacaatttaggatgaagg |
458 |
Q |
| |
|
|||||||||||| |||||||||||||||| | |||| |||||||| |||||||| || |||||||||| |||||| ||||| | ||||||||| | | |
|
|
| T |
4979117 |
ttttgtaaaacagctcataatatctctttcttaaacaaaattaattatatttcttactacgtgtgaaatgtccaaaatttcatatactttaggatggacg |
4979216 |
T |
 |
| Q |
459 |
gagta |
463 |
Q |
| |
|
||||| |
|
|
| T |
4979217 |
gagta |
4979221 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #179
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Target Start/End: Original strand, 4997026 - 4997130
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359 |
ttttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatatgtgtgaaatgcccaaaacgtcatacaatttaggatgaagg |
458 |
Q |
| |
|
|||||||||||| |||||||||||||||| | |||| |||||||| |||||||| || |||||||||| |||||| ||||| | ||||||||| | | |
|
|
| T |
4997026 |
ttttgtaaaacagctcataatatctctttcttaaacaaaattaattatatttcttactacgtgtgaaatgtccaaaatttcatatactttaggatggacg |
4997125 |
T |
 |
| Q |
459 |
gagta |
463 |
Q |
| |
|
||||| |
|
|
| T |
4997126 |
gagta |
4997130 |
T |
 |
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| Q |
368 |
acaactcataatatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatatgtgtgaaatgcccaaaacgtcatacaattt |
448 |
Q |
| |
|
|||| ||||| ||||||||| || || | |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
14833414 |
acaattcatattatctctttcccgtacgaaattaattacatttcttaatacatgtgaaatgtccaaaacgtcatacaattt |
14833494 |
T |
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| Q |
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gacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaatattaattacattt |
410 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
20212946 |
gacaattttgtaaa-caactcataatatctctttcccacataatattaattacattt |
20213001 |
T |
 |
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| Q |
234 |
tgtcccaaattgtatgtcactttacaataccaatgaaacattaatgttatttttcctattataaccttaactattta |
310 |
Q |
| |
|
||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||| | ||||||||||| |
|
|
| T |
44019766 |
tgtccaaaattatatgtcgttttacaataccaatgaaatattaatgttactttttctattatatctttaactattta |
44019842 |
T |
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| Q |
240 |
aaattgtatgtcactttacaataccaatgaaacattaatgttatttttcctattataaccttaactatttattactctct |
319 |
Q |
| |
|
||||| || ||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
28464197 |
aaattataagtcgctttacaatatcaatgaagtattaatgttatttttcatattattttcttaactatttattactctct |
28464276 |
T |
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| Q |
398 |
attaattacatttcttaatatgtgtgaaatgcccaaaacgtcatacaattt |
448 |
Q |
| |
|
||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
44652260 |
attaattacattttttaatatgtgtgaaatgctcaaaacatcatacaattt |
44652210 |
T |
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| Q |
352 |
aggacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaatattaattaca-tttcttaatatgtgtgaaatgcccaaaac |
436 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||| |||| |||||||||| |||| |||||||| ||||||| ||||||| |
|
|
| T |
11825817 |
aggacaattttgtaaaacaacgcataatatat-ttttccgtacaaaattaattacattttcataatatgtatgaaatgtccaaaac |
11825901 |
T |
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| Q |
277 |
atgttatttttcctattataaccttaactatttattactctctcttctttca |
328 |
Q |
| |
|
||||||||||| |||||||| | |||||||||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
4979024 |
atgttattttttctattatatctttaactatttattattctctcttctttca |
4979075 |
T |
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| Q |
235 |
gtcccaaattgtatgtcactttacaataccaatgaaacattaatgttatttttcctattataacctta |
302 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||| ||||| |
|
|
| T |
8983447 |
gtcccaaattatatgttgctttacaataccaacaaaaaattaatgttatttttcatattatatcctta |
8983514 |
T |
 |
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| Q |
395 |
aatattaattacatttcttaatatgtgtgaaatgcccaaaacgtcatacaat |
446 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
40346401 |
aatatttattacatttcttaatatgtttgaaatgaccaaaacatcatacaat |
40346350 |
T |
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| Q |
197 |
tccgtcctaaattgtatgtcattttnnnnnnnntatttgtcccaaattgtatgtcactttacaataccaatgaaacattaatgttatttttc |
288 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |
|
|
| T |
44653705 |
tccgtcccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattatatattgctttacaataccaatgaaatattaatgttacttttc |
44653614 |
T |
 |
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| Q |
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aattgtatgtcactttacaataccaatgaaacattaatgttatttttcctattataaccttaacta-tttattactctctcttctttcaagtcttttatt |
339 |
Q |
| |
|
|||| |||||||||||||||||||||||| ||| | ||||| |||||| |||||| || | | || |||| |||||| |||| |||||| ||||| ||| |
|
|
| T |
35155759 |
aattatatgtcactttacaataccaatgacgcataattgttacttttccaattatatcccttattagtttactactctatcttttttcaattctttaatt |
35155660 |
T |
 |
| Q |
340 |
tatcttt |
346 |
Q |
| |
|
||||||| |
|
|
| T |
35155659 |
tatcttt |
35155653 |
T |
 |
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| Q |
365 |
aaaacaactcataatatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatatg |
419 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| ||||| ||||||| || ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
42799477 |
aaaacaactcataatatttctttctcacacaaaatcaattacatttcttaatatg |
42799423 |
T |
 |
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| Q |
234 |
tgtcccaaattgtatgtcactttacaataccaatgaaacattaatgttatttttcctattataaccttaactatttattactctct |
319 |
Q |
| |
|
|||| |||||| |||||| |||||||||||| |||| |||||||||| |||| |||||| | | |||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
33713652 |
tgtctcaaattatatgtcgttttacaataccagtgaagaattaatgttactttttctattaaatcgttaactatttattattctct |
33713567 |
T |
 |
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| Q |
352 |
aggacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatatgtgtgaaatgcccaaaacgtcatacaattt |
448 |
Q |
| |
|
|||| |||||||||||| |||||||||||| | ||| ||| |||| |||||||| |||||| |||| |||| |||| ||||||||| || ||||| |
|
|
| T |
8983586 |
aggataattttgtaaaataactcataatatttatttaccatacaaaattaattatatttctgaatacgtgtaaaataagcaaaacgtcgtataattt |
8983682 |
T |
 |
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| Q |
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aattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatatgtgtgaaatgcccaaaacgtcatacaatttaggatgaa |
456 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||| | |||| || |||| |||||||| || || ||||| ||||||||| ||||||| | || ||||||||| | | |
|
|
| T |
11134946 |
aattttgtaaaacaactcataatatat-tttttcatacaaaattaattatatctcctaatacgtgtgaaataaccaaaacaacttataatttaggacgga |
11135044 |
T |
 |
| Q |
457 |
gggagtaat |
465 |
Q |
| |
|
|| |||||| |
|
|
| T |
11135045 |
ggaagtaat |
11135053 |
T |
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| Q |
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gacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatatgtgtgaaatgcccaaaacg |
437 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||| |||||||||||||| |||| || | || ||||||||||||| |||||| || |||||| |||||||| |
|
|
| T |
8001691 |
gacaattttataaaaaaactcataatatctttttttcatataaaattaattacattt-ttaatacttgagaaatgaccaaaacg |
8001773 |
T |
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| Q |
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tgaaacattaatgttatttttcctattataaccttaactatttattactctctcttctttcaagtcttttatttatcttt |
346 |
Q |
| |
|
|||||||||||| || ||||| ||||||| | |||| |||||||||||||||| | |||||| ||||| |||||||||| |
|
|
| T |
12465626 |
tgaaacattaatatttttttttttattatatctttaa-tatttattactctctcgtttttcaattctttaatttatcttt |
12465704 |
T |
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taattacatttcttaatatgtgtgaaatgcccaaaacgtcatacaatttaggatgaagggagtaattt |
467 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||||| | ||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||| ||| ||||| |
|
|
| T |
22294485 |
taattaaatttcttaatttatgtgaaatgaccaaaatatcatataatttaggatgaagtgagaaattt |
22294552 |
T |
 |
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| Q |
246 |
tatgtcactttacaataccaatgaaacattaatgttatttttcctattataaccttaactatttattac-tctctcttctttcaagtctttt |
336 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| | |||||||| | |||||||||| ||| |||| | ||||||||| |||||||||||| | |||||| |
|
|
| T |
26775167 |
tatgtcactttacaataccaatgcatcattaatgat-tttttcctatcatatcctttatcatttattacaactctcttctttctattctttt |
26775257 |
T |
 |
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ttgtcccaaattgtatgtcactttacaataccaatgaaacattaatgttatttttcctattata |
296 |
Q |
| |
|
|||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||| |||||| ||| |||| |||||||| |
|
|
| T |
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ttgtcccaaattatatgtcgttttataataccaatgaaatattaatattactttttctattata |
40346415 |
T |
 |
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| Q |
230 |
tatttgtcccaaattgtatgtcactttacaataccaatgaaacattaatgttatttttcctattata |
296 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||| |||||| ||||||||| | |||||||||||||| || ||||||||||||| |
|
|
| T |
7669667 |
tatttgtcataaattatatgtcgttttacaatatcgatgaaacattaatgctacttttcctattata |
7669733 |
T |
 |
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| Q |
352 |
aggacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaatattaattacattt |
410 |
Q |
| |
|
||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||| ||| ||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
15257668 |
aggacaattctgtaaaccaactcaaaatatctctttcccatgcaaaattaattacattt |
15257726 |
T |
 |
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| Q |
230 |
tatttgtcccaaattgtatgtcactttacaataccaatgaaacattaatgttatttttcctattata |
296 |
Q |
| |
|
|||||||| |||||| ||| |||||||| |||| ||| ||| ||||||||||| ||||| ||||||| |
|
|
| T |
30903604 |
tatttgtctcaaattatatatcactttataatatcaacgaagcattaatgttacttttcttattata |
30903670 |
T |
 |
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| Q |
273 |
attaatgttatttttcctattataaccttaactatttattactctctcttctttcaagtcttt |
335 |
Q |
| |
|
||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||| ||||| | ||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
43428492 |
attaatgtt-tttttcttattatatccttaactattttttactatttcttctttcaattcttt |
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T |
 |
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tttttcctattataaccttaactatttattactctctcttctttca |
328 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||| | |||||||||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
4996939 |
tttttcttattatatctttaactatttattattctctcttctttca |
4996984 |
T |
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| Q |
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gacaattttgtaaaacaactcataatatctcttt |
387 |
Q |
| |
|
||||||||| |||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
5274547 |
gacaattttataaaacaactcataatatctcttt |
5274514 |
T |
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gacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaatattaattacatttcttaa |
415 |
Q |
| |
|
||||||||||||| | |||||| ||||| | ||||||| |||| |||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
31391090 |
gacaattttgtaataaaactcagaatatattttttccatacaaaattaattatatttcttaa |
31391151 |
T |
 |
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| Q |
358 |
attttgtaaaacaactcataatatctcttt |
387 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
44653608 |
attttgtaaaacaactcataatatctcttt |
44653579 |
T |
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gtatgtcactttacaataccaatgaaacattaatgttatttttcctattataaccttaactatttattactctctcttctttcaagtctttta |
337 |
Q |
| |
|
|||||||| | ||||||| ||| ||| |||||||||| |||| ||||||| ||| ||||||||||||| | |||| |||||| ||||||| |
|
|
| T |
14384678 |
gtatgtcattatacaatatcaacgaatcattaatgtttatttttctattatgttctttactatttattactttatcttttttcaattctttta |
14384586 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #209
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 357 - 417
Target Start/End: Original strand, 15913208 - 15913268
Alignment:
| Q |
357 |
aattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaatattaattacatttcttaata |
417 |
Q |
| |
|
||||||||||| || | ||||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
15913208 |
aattttgtaaagtaatttataatatctctttatcatacaaaattaattacatttcttaata |
15913268 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #210
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 260 - 342
Target Start/End: Original strand, 38766216 - 38766297
Alignment:
| Q |
260 |
ataccaatgaaacattaa-tgttatttttcctattataaccttaactatttattactctctcttctttcaagtcttttatttat |
342 |
Q |
| |
|
||||||||||| ||| || ||||| ||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||| |
|
|
| T |
38766216 |
ataccaatgaagcatcaaatgttacttttcctattatacccctaactatttatt--gatctcttctttcaattctttaatttat |
38766297 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #211
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 246 - 278
Target Start/End: Original strand, 42017929 - 42017961
Alignment:
| Q |
246 |
tatgtcactttacaataccaatgaaacattaat |
278 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
42017929 |
tatgtcgctttacaataccaatgaaacattaat |
42017961 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7 (Bit Score: 208; Significance: 1e-113; HSPs: 225)
Name: chr7
Description:
Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 208; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 188 - 463
Target Start/End: Complemental strand, 5680485 - 5680210
Alignment:
| Q |
188 |
attactccatccgtcctaaattgtatgtcattttnnnnnnnntatttgtcccaaattgtatgtcactttacaataccaatgaaacattaatgttattttt |
287 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||||| ||||| ||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
5680485 |
attactccctccgtcccaaattatatgtcactttaaaaaaaatatttgttccaaattgtatgtcactttacaataccaatgaaacattaatgttattttt |
5680386 |
T |
 |
| Q |
288 |
cctattataaccttaactatttattactctctcttctttcaagtcttttatttatctttttcataggacaattttgtaaaacaactcataatatctcttt |
387 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
5680385 |
cctattataaccttaactatttattactctctcttctttcaagttttttatttatcttttccataggacaattttgtaaaacaactcataatatcccttt |
5680286 |
T |
 |
| Q |
388 |
tccacacaatattaattacatttcttaatatgtgtgaaatgcccaaaacgtcatacaatttaggatgaagggagta |
463 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||| |
|
|
| T |
5680285 |
tccacacaatattaattacatttcttaatatgtgtgaaatgcccaaaacgtcatacaatttgggacgaatggagta |
5680210 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 208; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 188 - 463
Target Start/End: Complemental strand, 5705537 - 5705262
Alignment:
| Q |
188 |
attactccatccgtcctaaattgtatgtcattttnnnnnnnntatttgtcccaaattgtatgtcactttacaataccaatgaaacattaatgttattttt |
287 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||||| ||||| ||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
5705537 |
attactccctccgtcccaaattatatgtcactttaaaaaaaatatttgttccaaattgtatgtcactttacaataccaatgaaacattaatgttattttt |
5705438 |
T |
 |
| Q |
288 |
cctattataaccttaactatttattactctctcttctttcaagtcttttatttatctttttcataggacaattttgtaaaacaactcataatatctcttt |
387 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
5705437 |
cctattataaccttaactatttattactctctcttctttcaagttttttatttatcttttccataggacaattttgtaaaacaactcataatatcccttt |
5705338 |
T |
 |
| Q |
388 |
tccacacaatattaattacatttcttaatatgtgtgaaatgcccaaaacgtcatacaatttaggatgaagggagta |
463 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||| |
|
|
| T |
5705337 |
tccacacaatattaattacatttcttaatatgtgtgaaatgcccaaaacgtcatacaatttgggacgaatggagta |
5705262 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 190 - 465
Target Start/End: Original strand, 22918173 - 22918448
Alignment:
| Q |
190 |
tactccatccgtcctaaattgtatgtcattttnnnnnnnntatttgtcccaaattgtatgtcactttacaataccaatgaaacattaatgttatttttcc |
289 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
22918173 |
tactccctccgtcccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattatatgtcactttataataccaatgaaacattaatgttacttttcc |
22918272 |
T |
 |
| Q |
290 |
tattataaccttaactatttattactctctcttctttcaagtcttttatttatctttttcataggacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttc |
389 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
22918273 |
tattataaccttaactatttattactctctcttctttcaagtcttttatttatctttctcataggacaattttgtaaaacaactcataatatttcttttc |
22918372 |
T |
 |
| Q |
390 |
cacacaatattaattacatttcttaatatgtgtgaaatgcccaaaacgtcatacaatttaggatgaagggagtaat |
465 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
22918373 |
cacacaatattaattacatttcttaatatgtgtgaaatgtccaaaacgtcatacaatttgggacggagggagtaat |
22918448 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 179; E-Value: 3e-96
Query Start/End: Original strand, 190 - 463
Target Start/End: Complemental strand, 39403981 - 39403697
Alignment:
| Q |
190 |
tactccatccgtcctaaattgtatgtcattttnnnnnnnntatttgtcccaaattgtatgtcactttacaataccaatgaaacattaatgttatttttcc |
289 |
Q |
| |
|
|||||| || |||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
39403981 |
tactccctctgtcccaaattgtatgtcattttgaaaaaaatatttatcccaaattgtatgtcactttacaataccaataaaacattaatgttatttttcc |
39403882 |
T |
 |
| Q |
290 |
tattataaccttaactatttattactctctcttctttcaagtcttttatttatctttttcat-----------aggacaattttgtaaaacaactcataa |
378 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
39403881 |
tattataaccttaactatttattactctctcttctttcaagtcttttatttatctttctcatattatttattaaggacaattttgtaaaacaactcataa |
39403782 |
T |
 |
| Q |
379 |
tatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatatgtgtgaaatgcccaaaacgtcatacaatttaggatgaagggagta |
463 |
Q |
| |
|
|||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |
|
|
| T |
39403781 |
tatctctttttcgcacaatattaattacatttcttaatatgtgtgaaatgtccaaaacgtcatacaatttgggacgaagggagta |
39403697 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 159; E-Value: 2e-84
Query Start/End: Original strand, 190 - 463
Target Start/End: Original strand, 44480986 - 44481270
Alignment:
| Q |
190 |
tactccatccgtcctaaattgtatgtcattttnnnnnnnntatttgtcccaaattgtatgtcactttacaataccaatgaaacattaatgttatttttcc |
289 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| |||| | |
|
|
| T |
44480986 |
tactccctccgtcccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcgctttacaataccaatgaaaaattaatgttactttttc |
44481085 |
T |
 |
| Q |
290 |
tattataaccttaactatttattactctctcttctttcaagtcttttatttatctttttcata-----------ggacaattttgtaaaacaactcataa |
378 |
Q |
| |
|
||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
44481086 |
tattatatccttaactatttattactctctcttctttcaattccttcatttatctttctcatatcatttattgaggacaattttgtaaaacaactcataa |
44481185 |
T |
 |
| Q |
379 |
tatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatatgtgtgaaatgcccaaaacgtcatacaatttaggatgaagggagta |
463 |
Q |
| |
|
||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||| |
|
|
| T |
44481186 |
tatctctttcccacacaatattaattacatttcttaatatgtgtgaaatgcccaaaacgtcatacaatttgggacggagggagta |
44481270 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 156; E-Value: 1e-82
Query Start/End: Original strand, 185 - 463
Target Start/End: Complemental strand, 4513646 - 4513357
Alignment:
| Q |
185 |
taaattactccatccgtcctaaattgtatgtcattttnnnnnnnntatttgtcccaaattgtatgtcactttacaataccaatgaaacattaatgttatt |
284 |
Q |
| |
|
|||| |||||| ||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
4513646 |
taaactactccctccgtcccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcgttttacaatactaatgaaaaattaatgttatt |
4513547 |
T |
 |
| Q |
285 |
tttcctattataaccttaactatttattactctctcttctttcaagtcttttatttatctttttcata-----------ggacaattttgtaaaacaact |
373 |
Q |
| |
|
|||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
4513546 |
tttcctattatatccttaactatttattactctctcttctttcaattccttcatttatctttcccatatcatttatagaggacaatttagtaaaacaact |
4513447 |
T |
 |
| Q |
374 |
cataatatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatatgtgtgaaatgcccaaaacgtcatacaatttaggatgaagggagta |
463 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| |
|
|
| T |
4513446 |
cataatatctctttcccacacaatattaattacatttcttaatatgtgtgaaatgcccaaaacgtcatacaatttaggacggagggagta |
4513357 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 154; E-Value: 2e-81
Query Start/End: Original strand, 190 - 463
Target Start/End: Complemental strand, 45780931 - 45780659
Alignment:
| Q |
190 |
tactccatccgtcctaaattgtatgtcattttnnnnnnnntatttgtcccaaattgtatgtcactttacaataccaatgaaacattaatgttatttttcc |
289 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| |||||||||| |||||| |
|
|
| T |
45780931 |
tactccctccgtcccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcgctttacgataccaatgaaaaattaatgttacttttcc |
45780832 |
T |
 |
| Q |
290 |
tattataaccttaactatttattactctctcttctttcaagtcttttatttatctttttcataggacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttc |
389 |
Q |
| |
|
||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | |
|
|
| T |
45780831 |
tattatatccttaactatttattactctctcttctttcaa-tctttcccatatcatttattgaggacaaatttgtaaaacaactcataatatctctttcc |
45780733 |
T |
 |
| Q |
390 |
cacacaatattaattacatttcttaatatgtgtgaaatgcccaaaacgtcatacaatttaggatgaagggagta |
463 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||| |
|
|
| T |
45780732 |
cacacaatattaattacatttcttaatatgtgtgaaatgcccaaaacgtcatacaatttgggacggagggagta |
45780659 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 153; E-Value: 9e-81
Query Start/End: Original strand, 188 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 24685711 - 24685440
Alignment:
| Q |
188 |
attactccatccgtcctaaattgtatgtcattttnnnnnnnntatttgtcccaaattgtatgtcactttacaataccaatgaaacattaatgttattttt |
287 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
24685711 |
attactccctccgtcccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttacaataccaatgaaacattaatgttattttt |
24685612 |
T |
 |
| Q |
288 |
cctattataaccttaactatttattactctctcttctttcaagtcttttatttatctt-----tttcat------aggacaattttgtaaaacaactcat |
376 |
Q |
| |
|
||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||| | |||| |||| |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
24685611 |
cctattatatctttaactatttattactctttcttctttcaattctttcatttatctttccaatatcatttattaaggataattttgtaaaacaactcat |
24685512 |
T |
 |
| Q |
377 |
aatatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatatgtgtgaaatgcccaaaacgtcatacaattt |
448 |
Q |
| |
|
||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
24685511 |
aatatctctttcccacactatattaattacatttcttaatatgtgtgaaatgtccaaaacgtcatacaattt |
24685440 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 152; E-Value: 4e-80
Query Start/End: Original strand, 190 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 1643787 - 1643518
Alignment:
| Q |
190 |
tactccatccgtcctaaattgtatgtcattttnnnnnnnntatttgtcccaaattgtatgtcactttacaataccaatgaaacattaatgttatttttcc |
289 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
1643787 |
tactccctccgtcccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttacaataccaatgaaacattaatgttatttttcc |
1643688 |
T |
 |
| Q |
290 |
tattataaccttaactatttattactctctcttctttcaagtcttttatttatctttttcat-----------aggacaattttgtaaaacaactcataa |
378 |
Q |
| |
|
||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||| |||||||||| |||| |||| | ||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
1643687 |
tattatatccttaactatttattactctttcttctttcaattttttcatttatctttctcatatcatttattaaggatagttttgtaaaacaattcataa |
1643588 |
T |
 |
| Q |
379 |
tatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatatgtgtgaaatgcccaaaacgtcatacaattt |
448 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
1643587 |
tatctctttcccacacagtattaattacatttcttaatatgtgtgaaatgcccaaaacgtcatacaattt |
1643518 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 151; E-Value: 1e-79
Query Start/End: Original strand, 230 - 463
Target Start/End: Original strand, 46774149 - 46774393
Alignment:
| Q |
230 |
tatttgtcccaaattgtatgtcactttacaataccaatgaaacattaatgttatttttcctattataaccttaactatttattactctctcttctttcaa |
329 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
46774149 |
tatttgtcccaaattgtatgtcactttacaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatccttaactatttattactctttcttctttcaa |
46774248 |
T |
 |
| Q |
330 |
gtcttttatttatctttttcat-----------aggacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatat |
418 |
Q |
| |
|
||||| |||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
46774249 |
ttctttcatttatctttcccatattatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatatctctttcccacacagtattaattacatttcttaatac |
46774348 |
T |
 |
| Q |
419 |
gtgtgaaatgcccaaaacgtcatacaatttaggatgaagggagta |
463 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||| |
|
|
| T |
46774349 |
gtgtgaaatgcccaaaacgtcatacaatttgggacggagggagta |
46774393 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 150; E-Value: 6e-79
Query Start/End: Original strand, 188 - 440
Target Start/End: Original strand, 39199044 - 39199307
Alignment:
| Q |
188 |
attactccatccgtcctaaattgtatgtcattttnnnnnnnntatttgtcccaaattgtatgtcactttacaataccaatgaaacattaatgttattttt |
287 |
Q |
| |
|
|||| ||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
39199044 |
attaatccctccgtcccaaattgtatgtcatttttaaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttacaataccaatgaaacattaatgttactttt |
39199143 |
T |
 |
| Q |
288 |
cctattataaccttaactatttattactctctcttctttcaagtcttttatttatctttttcat-----------aggacaattttgtaaaacaactcat |
376 |
Q |
| |
|
||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| || ||||| |||||||||| | || |||| |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
39199144 |
cctattatatccttaactatttattactctttcttcttttaattctttcatttatctttcttatatcatttattaaggataattttgtaaaacaactcat |
39199243 |
T |
 |
| Q |
377 |
aatatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatatgtgtgaaatgcccaaaacgtca |
440 |
Q |
| |
|
||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
39199244 |
aatatctctttcccacacaatattaattacatttcttaatatgtgtgaaatgcccaaaacgtca |
39199307 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 149; E-Value: 2e-78
Query Start/End: Original strand, 188 - 463
Target Start/End: Original strand, 44186880 - 44187166
Alignment:
| Q |
188 |
attactccatccgtcctaaattgtatgtcattttnnnnnnnntatttgtcccaaattgtatgtcactttacaataccaatgaaacattaatgttattttt |
287 |
Q |
| |
|
|||||||| || |||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| |||| |
|
|
| T |
44186880 |
attactccctctgtcccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcgctttacaataccaatgaaaaattaatgttactttt |
44186979 |
T |
 |
| Q |
288 |
cctattataaccttaactatttattactctctcttctttcaagtcttttatttatctttttcat-----------aggacaattttgtaaaacaactcat |
376 |
Q |
| |
|
||||||||| |||||||||||||||||||| | || |||||| ||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
44186980 |
cctattatatccttaactatttattactcttttttttttcaattctttcatttatctttcccatgtcatttattgaggacaattttgtaaaacaactcat |
44187079 |
T |
 |
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377 |
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463 |
Q |
| |
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|
| T |
44187080 |
aatatctctttcccacacaatattaattacatttcttaatatgtgtgaaatgcccaaaacgtcatacaatttgggacggagggagta |
44187166 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #13
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T |
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377 |
Q |
| |
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|
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2648999 |
ctattatatccttaactatttattactctttcttctttcaattctttcatttatctttcatatatcatttattaaggataattttgtaaaacaactcata |
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T |
 |
| Q |
378 |
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463 |
Q |
| |
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|
| T |
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atatctctttcccacacaatattaattacatttcttaatatgtgtgaaatgtccaaaacgtcatacaatttgggacggagggagta |
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T |
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Target: chr7; HSP #14
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Q |
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T |
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Q |
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ttctttcatttatctttctcatatcatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatatctctttcccacacaatattaattacatttcttaatat |
18235124 |
T |
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| Q |
419 |
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463 |
Q |
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gtgtgaaatgtccaaaacgtcatacaatttgggacggagggagta |
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T |
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Target: chr7; HSP #15
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T |
 |
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330 |
gtcttttatttatctttttcata-----------ggacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatat |
418 |
Q |
| |
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| T |
37115872 |
ttccttcatttatctttcacatataatttattgaggacaattttgtaaaacaactcataatatctctttcccacacaatattaattacatttcttaatat |
37115971 |
T |
 |
| Q |
419 |
gtgtgaaatgcccaaaacgtcatacaatttaggatgaagggagta |
463 |
Q |
| |
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| T |
37115972 |
gtgtgaaatgcccaaaacgtcatacaatttgggacgaagggagta |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #16
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Query Start/End: Original strand, 190 - 463
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T |
 |
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378 |
Q |
| |
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| T |
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T |
 |
| Q |
379 |
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463 |
Q |
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tatttctttcccacacaatattaattacatttcttaatatgtgtgaaatgctcaaaacgtcatacaatttgggacggagggagta |
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T |
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Target: chr7; HSP #17
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T |
 |
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297 |
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385 |
Q |
| |
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| T |
8611920 |
tccttaactatttattactctctcttctttcaattcctttatttatctttctcatatcatttattgaggataattttgtaaaacaacttataatatctct |
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T |
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386 |
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Q |
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8612020 |
ttcccacacaatattaattacattttttaatatgtgtgaaatgcccaaaacgtcatacaattt |
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Back To:
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Target: chr7; HSP #18
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Target Start/End: Original strand, 18975980 - 18976223
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T |
 |
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420 |
Q |
| |
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| T |
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tctttcatttatctttctcatattattattaaggacaattttgtaaaacaaatcataatatatcttttccacacaatattaattacatttcttaatatga |
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T |
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| Q |
421 |
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Q |
| |
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18976180 |
gtgaaatgtccaaaacgtcatacaatttgggacggagggagtaa |
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Back To:
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Target: chr7; HSP #19
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25428278 |
T |
 |
| Q |
290 |
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377 |
Q |
| |
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| T |
25428279 |
tattatatccttaactatttattactctttctttttttcaattctttcatttatctttcccatatcatttattaaggataattttgtacaacaactcata |
25428378 |
T |
 |
| Q |
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atatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatatgtgtgaaatgcccaaaacgtcatacaatttaggatgaagggagta |
463 |
Q |
| |
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atatctcttttccacacaatattaattatatttcttaatatgtgtgaaatgcccaaaacgtcatacaatttgggacggagggagta |
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Target: chr7; HSP #20
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| |
|
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T |
 |
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ttttatttatctttttcata-----------ggacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatatgtg |
421 |
Q |
| |
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| T |
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ttccatttatttttctcatattatttattaaggacaattttgtaaaaaaactcataatatctcttttccacacaatattaattgcatttcttaatatgtg |
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T |
 |
| Q |
422 |
tgaaatgcccaaaacgtcatacaatttaggatgaagggagta |
463 |
Q |
| |
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| T |
42912249 |
tgaaatgcccaaaacgtcatacaatttgggacggagggagta |
42912208 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 143; E-Value: 8e-75
Query Start/End: Original strand, 190 - 463
Target Start/End: Complemental strand, 46373284 - 46373000
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Q |
| |
|
|||||| ||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| |||| | |
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|
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46373284 |
tactccctccgtcccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcgctttacaataccaatgaaaaattaatgttactttttc |
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T |
 |
| Q |
290 |
tattataaccttaactatttattactctctcttctttcaagtcttttatttatctttttcat-----------aggacaattttgtaaaacaactcataa |
378 |
Q |
| |
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| T |
46373184 |
tattatatccttaactatttattactctctcttctttcaattccttcatttatcttttccatatcatttattgagaacaattttgtaaaacaattcataa |
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T |
 |
| Q |
379 |
tatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatatgtgtgaaatgcccaaaacgtcatacaatttaggatgaagggagta |
463 |
Q |
| |
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|
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46373084 |
tatctttttcccacacaatattaattacatttcttaatatgtgtgaaatgcctaaaacgtcatacaatttgggacggagggagta |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #22
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332 |
Q |
| |
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T |
 |
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ttttatttatctttttcata-----------ggacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatatgtg |
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Q |
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tttcatttatcttttccataacatttattaaggacaattttgtaaaacaactcataatatctctttcccacacaatattaattacatttcttaatatgtg |
38074743 |
T |
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| Q |
422 |
tgaaatgcccaaaacgtcatacaatttaggatgaagggagtaa |
464 |
Q |
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| T |
38074744 |
tgatatgcccaaaacgtcatacaatttgggacggagggagtaa |
38074786 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #23
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| |
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|
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 |
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gtcttttatttatctttttcata-----------ggacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatat |
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Q |
| |
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| T |
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ttccttcatttatctttcccatatcatttattgaggacaattttgtaaaacaacttataatatctctttcccacacaatattaattacatttcttaatat |
43468316 |
T |
 |
| Q |
419 |
gtgtgaaatgcccaaaacgtcatacaattt |
448 |
Q |
| |
|
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|
| T |
43468315 |
gtgtgaaatgcccaaaacgtcatacaattt |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #24
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333 |
Q |
| |
|
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T |
 |
| Q |
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tttatttatctttttcat-----------aggacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatatgtgt |
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Q |
| |
|
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| T |
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ttcatttatctttctcatgttatttattaaggacaattttgtaaaacaactcataatatcttttttccatacaatattaattgcatttcttaatatgtgt |
3945374 |
T |
 |
| Q |
423 |
gaaatgcccaaaacgtcatacaatttaggatgaagggagta |
463 |
Q |
| |
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|
| T |
3945375 |
gaaatgctcaaaacgtcatacaatttaggacggagggagta |
3945415 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 139; E-Value: 2e-72
Query Start/End: Original strand, 230 - 463
Target Start/End: Complemental strand, 12118861 - 12118617
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tatttgtcccaaattgtatgtcactttacaataccaatgaaacattaatgttatttttcctattataaccttaactatttattactctctcttctttcaa |
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Q |
| |
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T |
 |
| Q |
330 |
gtcttttatttatctttttcata-----------ggacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatat |
418 |
Q |
| |
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| T |
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T |
 |
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gtgtgaaatgcccaaaacgtcatacaatttaggatgaagggagta |
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Q |
| |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 138; E-Value: 8e-72
Query Start/End: Original strand, 197 - 465
Target Start/End: Original strand, 5528391 - 5528670
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197 |
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296 |
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5528490 |
T |
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385 |
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T |
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5528670 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 138; E-Value: 8e-72
Query Start/End: Original strand, 230 - 466
Target Start/End: Original strand, 28586975 - 28587221
Alignment:
| Q |
230 |
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329 |
Q |
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| T |
28586975 |
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28587073 |
T |
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330 |
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418 |
Q |
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| T |
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28587173 |
T |
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| Q |
419 |
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466 |
Q |
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| T |
28587174 |
gtgtgaaatgcccaaaacgtcatacaatttgggacggagggagtaatt |
28587221 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 137; E-Value: 3e-71
Query Start/End: Original strand, 197 - 464
Target Start/End: Complemental strand, 23726650 - 23726372
Alignment:
| Q |
197 |
tccgtcctaaattgtatgtcattttnnnnnnnntatttgtcccaaattgtatgtcactttacaataccaatgaaacattaatgttatttttcctattata |
296 |
Q |
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| T |
23726650 |
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23726551 |
T |
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| Q |
297 |
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385 |
Q |
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| T |
23726550 |
tccttaactatttattactctctcttatttcaattccttaatttatctttcccatatcatttattgaggacaattttgtaaaacaactcataatatctct |
23726451 |
T |
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| Q |
386 |
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464 |
Q |
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| T |
23726450 |
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23726372 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 136; E-Value: 1e-70
Query Start/End: Original strand, 230 - 468
Target Start/End: Original strand, 31502848 - 31503097
Alignment:
| Q |
230 |
tatttgtcccaaattgtatgtcactttacaataccaatgaaacattaatgttatttttcctattataaccttaactatttattactctctcttctttcaa |
329 |
Q |
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| T |
31502848 |
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T |
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| Q |
330 |
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418 |
Q |
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| T |
31502948 |
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31503047 |
T |
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| Q |
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468 |
Q |
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| T |
31503048 |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 135; E-Value: 5e-70
Query Start/End: Original strand, 238 - 463
Target Start/End: Original strand, 3225483 - 3225719
Alignment:
| Q |
238 |
ccaaattgtatgtcactttacaataccaatgaaacattaatgttatttttcctattataaccttaactatttattactctctcttctttcaagtctttta |
337 |
Q |
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| T |
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3225582 |
T |
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| Q |
338 |
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426 |
Q |
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| T |
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3225682 |
T |
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| Q |
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463 |
Q |
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| T |
3225683 |
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3225719 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 134; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 235 - 463
Target Start/End: Complemental strand, 28234377 - 28234138
Alignment:
| Q |
235 |
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334 |
Q |
| |
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| T |
28234377 |
gtcccaaattatatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttatttttcctattatattcttaattatttattactctttcttttttcaattctt |
28234278 |
T |
 |
| Q |
335 |
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423 |
Q |
| |
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| T |
28234277 |
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28234178 |
T |
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| Q |
424 |
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463 |
Q |
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| T |
28234177 |
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28234138 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 134; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 231 - 463
Target Start/End: Complemental strand, 29410326 - 29410083
Alignment:
| Q |
231 |
atttgtcccaaattgtatgtcactttacaataccaatgaaacattaatgttatttttcctattataaccttaactatttattactctctcttctttcaag |
330 |
Q |
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29410227 |
T |
 |
| Q |
331 |
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419 |
Q |
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| T |
29410226 |
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29410127 |
T |
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| Q |
420 |
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463 |
Q |
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| T |
29410126 |
tgtgaaatgccaaaaacatcatacaatttgggacggagggagta |
29410083 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 134; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 172 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 42688825 - 42688538
Alignment:
| Q |
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271 |
Q |
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| T |
42688825 |
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42688726 |
T |
 |
| Q |
272 |
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360 |
Q |
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| T |
42688725 |
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42688626 |
T |
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| Q |
361 |
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448 |
Q |
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| T |
42688625 |
ttgtaaaataactcataatatctctttcccacacaatattaattacatttcttaatatgtatgaaatgcccaaaacgtcatacaattt |
42688538 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 133; E-Value: 8e-69
Query Start/End: Original strand, 230 - 449
Target Start/End: Complemental strand, 29986011 - 29985781
Alignment:
| Q |
230 |
tatttgtcccaaattgtatgtcactttacaataccaatgaaacattaatgttatttttcctattataaccttaactatttattactctctcttctttcaa |
329 |
Q |
| |
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| T |
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tatttgtcctaaattgtatgtcgctttacaatatcaatgaaaaattaatgttacttttcctattatatccttaactatttattactctctcttctttcaa |
29985912 |
T |
 |
| Q |
330 |
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418 |
Q |
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| T |
29985911 |
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29985812 |
T |
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| Q |
419 |
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449 |
Q |
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| T |
29985811 |
gtgtgaaatgccaaaaatgtcatacaattta |
29985781 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 133; E-Value: 8e-69
Query Start/End: Original strand, 462 - 618
Target Start/End: Original strand, 35341363 - 35341519
Alignment:
| Q |
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taatttaaatataatcacatgtgtccgagaccaaaacatgtcggatatctaatacatctttaatcagaagtattgatactacaaatatcacatagaggtg |
561 |
Q |
| |
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| T |
35341363 |
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35341462 |
T |
 |
| Q |
562 |
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618 |
Q |
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| T |
35341463 |
gtctcaaacagttgggttgtatcaccgtctaatgtgagcacgagttcataaagtatg |
35341519 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 133; E-Value: 8e-69
Query Start/End: Original strand, 190 - 465
Target Start/End: Complemental strand, 44894855 - 44894569
Alignment:
| Q |
190 |
tactccatccgtcctaaattgtatgtcattttnnnnnnnntatttgtcccaaattgtatgtcactttacaataccaatgaaacattaatgttatttttcc |
289 |
Q |
| |
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44894855 |
tactccctccgtcccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcacaaattatatgtcgctttacaatatcaatgaaaaattaatgttacttttcc |
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T |
 |
| Q |
290 |
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378 |
Q |
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| T |
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tattatatcattaactatttattactctctcttctttcaattcattcatttatctttcccatatcatttattgaggacaattttgtaaaacaactcataa |
44894656 |
T |
 |
| Q |
379 |
tatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatatgtgtgaaatgcccaaaacgtcatacaatttaggatgaagggagtaat |
465 |
Q |
| |
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| T |
44894655 |
tatctctttcccacacaatattaattacatttcttaatatgtatgaaatgctcaaaacgtcgtacaatttgggacggagggagtaat |
44894569 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 131; E-Value: 1e-67
Query Start/End: Original strand, 197 - 450
Target Start/End: Complemental strand, 29155768 - 29155504
Alignment:
| Q |
197 |
tccgtcctaaattgtatgtcattttnnnnnnnntatttgtcccaaattgtatgtcactttacaataccaatgaaacattaatgttatttttcctattata |
296 |
Q |
| |
|
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|
| T |
29155768 |
tccgtcctaaattgtatgtcgctttaaaaaaaatatgtgtcccaaattgtatgtcgctttacaataccaatgaaaaattaatgttacttttcctattgta |
29155669 |
T |
 |
| Q |
297 |
accttaactatttattactctctcttctttcaagtcttttatttatctttttcata-----------ggacaattttgtaaaacaactcataatatctct |
385 |
Q |
| |
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| T |
29155668 |
tccttagctatttattagtctctcttatttcaattccttcatttatctttctcatatcatttattgaggacaattttgtaaaacaactcataatatctct |
29155569 |
T |
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| Q |
386 |
tttccacacaatattaattacatttcttaatatgtgtgaaatgcccaaaacgtcatacaatttag |
450 |
Q |
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| T |
29155568 |
ttcccacacaatattaattacatttcttaatatgtgtgaaatgcccaaaatatcatacaatttag |
29155504 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 130; E-Value: 5e-67
Query Start/End: Original strand, 233 - 465
Target Start/End: Complemental strand, 32267767 - 32267525
Alignment:
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ttgtcccaaattgtatgtcactttacaataccaatgaaacattaatgttatttttcctattataaccttaactatttattactctctcttctttcaagtc |
332 |
Q |
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| T |
32267767 |
ttgtctcaaattatacgtcattttaaaataccaatgcaacattaatgttactttttctattataaccttaattatttattactctatcttctttcaattc |
32267668 |
T |
 |
| Q |
333 |
ttttatttatctttttcata-----------ggacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatatgtg |
421 |
Q |
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| T |
32267667 |
tttcatttatctttctcatattatttattaaggacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaatattaattgcatttcttaatatgtg |
32267568 |
T |
 |
| Q |
422 |
tgaaatgcccaaaacgtcatacaatttaggatgaagggagtaat |
465 |
Q |
| |
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| T |
32267567 |
tgaaatg-ccaaaacgtcatacaatttgggacggagggagtaat |
32267525 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 130; E-Value: 5e-67
Query Start/End: Original strand, 231 - 463
Target Start/End: Original strand, 41877741 - 41877984
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| Q |
231 |
atttgtcccaaattgtatgtcactttacaataccaatgaaacattaatgttatttttcctattataaccttaactatttattactctctcttctttcaag |
330 |
Q |
| |
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| T |
41877741 |
atttgttccaaattatatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttccaattataaccttaactatttattattatctcttctttcaat |
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T |
 |
| Q |
331 |
tcttttatttatctttttcata-----------ggacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatatg |
419 |
Q |
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| T |
41877841 |
tctttcatttatcttttccatattatttattaaggacaattttgtaaaacaactcataatatctttttttcacacaatattaaatgcatttcttaatatg |
41877940 |
T |
 |
| Q |
420 |
tgtgaaatgcccaaaacgtcatacaatttaggatgaagggagta |
463 |
Q |
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41877941 |
cgtgaaatgcccaaaacgtcatacaatttgggacggagggagta |
41877984 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 130; E-Value: 5e-67
Query Start/End: Original strand, 187 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 47578963 - 47578692
Alignment:
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187 |
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Q |
| |
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| T |
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T |
 |
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287 |
tcctattataaccttaactatttattactctctcttctttcaagtcttttatttatctttttcata-----------ggacaattttgtaaaacaactca |
375 |
Q |
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tcctattatatccttaactatttattactctattttctttcatttccttcatttatctttctcatatcatttattgaggacaattttataaaacaactca |
47578765 |
T |
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376 |
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448 |
Q |
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| T |
47578764 |
taatatatttttcccacacaatattaattacatttcttaatatgtgtgaaatgcccaaaacgtcatacaattt |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 128; E-Value: 7e-66
Query Start/End: Original strand, 190 - 463
Target Start/End: Original strand, 23059070 - 23059355
Alignment:
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Q |
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| T |
23059070 |
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T |
 |
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290 |
tattataaccttaactatttattactctctcttctttcaagtcttttatttatctttttcat-----------aggacaattttgt-aaaacaactcata |
377 |
Q |
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tattatatccttaactatttattactctctcttctttcaattccttcatttatttttcccatatcatttattgaggataattttgtaaaaacaactcata |
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T |
 |
| Q |
378 |
atatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatatgtgtgaaatgcccaaaacgtcatacaatttaggatgaagggagta |
463 |
Q |
| |
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|||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| | |||||||| |
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atatctctttcctacacaatattaattacatttcttaatatgtgtgaaatgcctaaaacgtcatacaatttgggacggagggagta |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 128; E-Value: 7e-66
Query Start/End: Original strand, 233 - 463
Target Start/End: Complemental strand, 32328080 - 32327839
Alignment:
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233 |
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332 |
Q |
| |
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ttgtcccaaattatatgtcgctttaaaataccaatgcaacattaatgatatttttcctattataaccttaattatttattaccctttcttctttcaattc |
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T |
 |
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333 |
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421 |
Q |
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| T |
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32327881 |
T |
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| Q |
422 |
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463 |
Q |
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| T |
32327880 |
tgaaatgcccaaaacatcatacaatctgggacggagggagta |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 128; E-Value: 7e-66
Query Start/End: Original strand, 230 - 448
Target Start/End: Original strand, 35542000 - 35542229
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| Q |
230 |
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329 |
Q |
| |
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35542000 |
tatttgtcataaattgtatgtcgctttacaatatcaatgaaaaataaatgttacttttcctattatatccttaattatttattactctctcttctttcaa |
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T |
 |
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gtcttttatttatctttttcata-----------ggacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatat |
418 |
Q |
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ttacttcatttattttttccatatcatttattgaggacaattttgtaaaacaactcataatatctctttcccacacaatattaattacatttcttaatat |
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T |
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| Q |
419 |
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448 |
Q |
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35542200 |
gtgtgaaatgcccaaaacgtcatacaattt |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 128; E-Value: 7e-66
Query Start/End: Original strand, 189 - 463
Target Start/End: Original strand, 36916665 - 36916950
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| Q |
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Q |
| |
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| T |
36916665 |
ttactccctccgtcctaaattgtatgtcattttaaaaaaaatatttgtcccaaattataaatcgctttacaatatcaatgaaaaattaatgttacttttc |
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T |
 |
| Q |
289 |
ctattataaccttaactatttattactctctcttctttcaagtcttttatttatctttttcata-----------ggacaattttgtaaaacaactcata |
377 |
Q |
| |
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| T |
36916765 |
atattatattcttaactatttattactctatcttctttcaattccttcatttatctttcccatatcatttattgaggataattttgtaaaacaactcata |
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T |
 |
| Q |
378 |
atatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatatgtgtgaaatgcccaaaacgtcatacaatttaggatgaagggagta |
463 |
Q |
| |
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|
| T |
36916865 |
atatctttttcccacacaatattaattacatttcttaatacgtgtgaaatgcccaaaacgtcatacaatttgggacggagggagta |
36916950 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 128; E-Value: 7e-66
Query Start/End: Original strand, 231 - 448
Target Start/End: Original strand, 42121942 - 42122171
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| Q |
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330 |
Q |
| |
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42121942 |
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42122041 |
T |
 |
| Q |
331 |
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418 |
Q |
| |
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| T |
42122042 |
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42122141 |
T |
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| Q |
419 |
gtgtgaaatgcccaaaacgtcatacaattt |
448 |
Q |
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| T |
42122142 |
gtgtgaaatgcccaaaacgtcatacaattt |
42122171 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 128; E-Value: 7e-66
Query Start/End: Original strand, 231 - 463
Target Start/End: Complemental strand, 43073971 - 43073737
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330 |
Q |
| |
|
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|
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T |
 |
| Q |
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tcttttatttatctttttcat--aggacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatatgtgtgaaatg |
428 |
Q |
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| T |
43073871 |
tatctttctcatattatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatatctattttccacacaatattaattgtatttcttaatatgtgtgaaata |
43073772 |
T |
 |
| Q |
429 |
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463 |
Q |
| |
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| T |
43073771 |
cccaaaacgtcatataatttgggacggagggagta |
43073737 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 126; E-Value: 1e-64
Query Start/End: Original strand, 232 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 19866516 - 19866289
Alignment:
| Q |
232 |
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331 |
Q |
| |
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|
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T |
 |
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420 |
Q |
| |
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| T |
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19866317 |
T |
 |
| Q |
421 |
gtgaaatgcccaaaacgtcatacaattt |
448 |
Q |
| |
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| T |
19866316 |
gtgatatgcccaaaacgtcatacaattt |
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T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 125; E-Value: 5e-64
Query Start/End: Original strand, 232 - 463
Target Start/End: Complemental strand, 26838212 - 26837970
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| Q |
232 |
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331 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
26838212 |
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T |
 |
| Q |
332 |
cttttatttatctttttcat-----------aggacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatatgt |
420 |
Q |
| |
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| T |
26838112 |
ctttcatttatctttcccatattatttattaaggataattttataaaacaactcataatacctcttttccacacaatattaattgcatttcttaatatgt |
26838013 |
T |
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| Q |
421 |
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463 |
Q |
| |
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| T |
26838012 |
gtgaaatgcctaaaacgtcatccaatttgggacggagggagta |
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T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 125; E-Value: 5e-64
Query Start/End: Original strand, 205 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 33938481 - 33938227
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304 |
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| |
|
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aaattgtatgtcattttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcgctttacaataccaatgaaaaattaatgttactttttctattatatccttaac |
33938382 |
T |
 |
| Q |
305 |
tatttattactctctcttctttcaagtcttttatttatctttttcat-----------aggacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccaca |
393 |
Q |
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| T |
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T |
 |
| Q |
394 |
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448 |
Q |
| |
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| T |
33938281 |
caatattaattacatttcttaatatgtgtgaaatgtccaaaacatcatataattt |
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T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 125; E-Value: 5e-64
Query Start/End: Original strand, 233 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 42584571 - 42584345
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| Q |
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Q |
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|
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|
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ttgtcctaaattatatgtcgcttaacaatatcaatgcaacattaatgttatttttcctattataaccttaactatttattactctctcttctttcaattc |
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T |
 |
| Q |
333 |
ttttatttatctttttcat-----------aggacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatatgtg |
421 |
Q |
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| T |
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tttaatttatctttcccatattatttattaaggataattttgtaaaacatctcataatatcttttttccacacaatattaattgtatttcttaatatgtg |
42584372 |
T |
 |
| Q |
422 |
tgaaatgcccaaaacgtcatacaattt |
448 |
Q |
| |
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| T |
42584371 |
tgaaatgcccaaaacgtcgtacaattt |
42584345 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 124; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 233 - 463
Target Start/End: Complemental strand, 17611543 - 17611302
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Q |
| |
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 |
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ttttatttatctttttcat-----------aggacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatatgtg |
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Q |
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| T |
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T |
 |
| Q |
422 |
tgaaatgcccaaaacgtcatacaatttaggatgaagggagta |
463 |
Q |
| |
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| T |
17611343 |
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 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 123; E-Value: 7e-63
Query Start/End: Original strand, 233 - 466
Target Start/End: Complemental strand, 6696859 - 6696615
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| |
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T |
 |
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ttttatttatctttttcata-----------ggacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatatgtg |
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Q |
| |
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| T |
6696759 |
tttcatttatctttcccatatcatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatatctatttcccacacaatattaattacatttcttaatatgtg |
6696660 |
T |
 |
| Q |
422 |
tgaaatgcccaaaacgtcatacaatttaggatgaagggagtaatt |
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Q |
| |
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| ||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||| |
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|
| T |
6696659 |
taaaatgcccaaaacgtcatacaatttgggacggagggagtaatt |
6696615 |
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 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 123; E-Value: 7e-63
Query Start/End: Original strand, 231 - 464
Target Start/End: Complemental strand, 27059779 - 27059539
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| |
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27059779 |
atttgtcccaaattatatgtcgctttacaatactaatgaaatattaatgttatttttcctattatatcattaactattaattactctctcttctttcaat |
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 |
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tcttttatttatctttttcatagga-------caattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatatgtgtg |
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Q |
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27059679 |
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27059580 |
T |
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424 |
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464 |
Q |
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| T |
27059579 |
aaatggccaaaacgtcatacaatttaggacggagggagtaa |
27059539 |
T |
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Target: chr7; HSP #54
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Target Start/End: Original strand, 31466089 - 31466333
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T |
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331 |
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419 |
Q |
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| T |
31466189 |
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T |
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| Q |
420 |
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464 |
Q |
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31466289 |
tgtgaaatgaccaaaacgtcatacaatttgggacggagggagtaa |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 123; E-Value: 7e-63
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Target Start/End: Original strand, 35497656 - 35497925
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289 |
Q |
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T |
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Q |
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T |
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379 |
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448 |
Q |
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 123; E-Value: 7e-63
Query Start/End: Original strand, 190 - 463
Target Start/End: Complemental strand, 38510191 - 38509907
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289 |
Q |
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tactccctccgtcccaaattgtatgtcattttagaaaaaatacttgtcctaaattatatgtcgctttacaataccaataaaagattaatgttacttttcc |
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T |
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378 |
Q |
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tattatattcttaacaatttattacactctcttctttcaattccttcatttatcttttccatatcatttattgaagacaattttgtaaaacaactcacaa |
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T |
 |
| Q |
379 |
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463 |
Q |
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| T |
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tatctctttcccacataatattaattatatttcttaatatgtatgaaatgcccaaaacatcatacaatttaggatggagggagta |
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 123; E-Value: 7e-63
Query Start/End: Original strand, 231 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 47988444 - 47988216
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330 |
Q |
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T |
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Q |
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| T |
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47988245 |
T |
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Q |
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47988244 |
tgtgaaatgcccaaaacgtcatacaattt |
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Target: chr7; HSP #58
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T |
 |
| Q |
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373 |
Q |
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T |
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448 |
Q |
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| T |
6883036 |
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T |
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Target: chr7; HSP #59
Raw Score: 121; E-Value: 1e-61
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Target Start/End: Original strand, 25756387 - 25756613
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Q |
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T |
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421 |
Q |
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| T |
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T |
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| Q |
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448 |
Q |
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| T |
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tggaatgcccaaaacgtcatacaattt |
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T |
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Target: chr7; HSP #60
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T |
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| Q |
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Q |
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tccttaactatttattactctctcttctttaaattccttcatttatttttcccatatcatttattgaggacaattttgtaaaacaactaataatatcttt |
35144162 |
T |
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| Q |
386 |
tttccacacaatattaattacatttcttaatatgtgtgaaatgcccaaaacgtcatacaattt |
448 |
Q |
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| T |
35144161 |
ttcccacacaatattaattacatttcttaatatgtgtgaaatgttcaaaacgtaatacaattt |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #61
Raw Score: 120; E-Value: 4e-61
Query Start/End: Original strand, 197 - 463
Target Start/End: Original strand, 22624321 - 22624598
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| Q |
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296 |
Q |
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tccgtcccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcctaaattgtatgtcactttagaatatcaatgaaacattaatgttactttttctattata |
22624420 |
T |
 |
| Q |
297 |
accttaactatttattactctctcttctttcaagtcttttatttatctttttcata-----------ggacaattttgtaaaacaactcataatatctct |
385 |
Q |
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| T |
22624421 |
tccttaactatttattactcttttctttttcaattctttcatttatctttcccatatcatttaataaggataattttgtaaaacaattcataatatctct |
22624520 |
T |
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| Q |
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Q |
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ttcccacacaatattaattacatttcttaatatgtgtgaaatgtccaaaacatcatacaatttgggatggagtgagta |
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #62
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Q |
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T |
 |
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gtcttttatttatctttttcata-----------ggacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatat |
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Q |
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T |
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| Q |
419 |
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448 |
Q |
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29409565 |
gtgtgaaatgcccaaaacgtcatataattt |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #63
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Q |
| |
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atttgtcccaaatttatatgtctctttacaataccaatgaaatattaatgttatttttcctattatatccttaactattaattactctctcttctttcaa |
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T |
 |
| Q |
330 |
gtcttttatttatctttttcat-----------aggacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatat |
418 |
Q |
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| T |
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32827146 |
T |
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| Q |
419 |
gtgtgaaatgcccaaaacgtcatacaatttaggatgaagggagtaa |
464 |
Q |
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| T |
32827145 |
atgtgaaatggtcaaaacgtcatacaatttgggacggagggagtaa |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #64
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| |
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32827758 |
T |
 |
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tttatttatctttttcat-----------aggacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatatgtgt |
422 |
Q |
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| T |
32827757 |
ttcatttatatttcccatgacatttattaaggacaattttgtaaaacaactcataaaatctatttctcacacaatattaattacatttcttaatatgtgc |
32827658 |
T |
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| Q |
423 |
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448 |
Q |
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| T |
32827657 |
gaaatgtccaaaacgtcatacaattt |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #65
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T |
 |
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tcttttatttatctttttcata-----------ggacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatatg |
419 |
Q |
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| T |
43576878 |
tattttatttatcttttccataccatttattagggataattttataaaacaactcataatttctcttccccaagcaatattaattacatttcttaatacg |
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T |
 |
| Q |
420 |
tgtgaaatgcccaaaacgtcatacaatttaggatgaagggagtaat |
465 |
Q |
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| T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #66
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| |
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22326766 |
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T |
 |
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tcttttatttatctttttcata-----------ggacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatatg |
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| |
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| T |
22326666 |
tctttcatttatttttcccatattatttattaaggacaattttgtaaaacaactcataaaatctcttttccacacaatattaattgcatttcttaatatg |
22326567 |
T |
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420 |
tgtgaaatgcccaaaacgtcatacaattt |
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Q |
| |
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| T |
22326566 |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #67
Raw Score: 119; E-Value: 2e-60
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330 |
Q |
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24302831 |
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24302732 |
T |
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24302632 |
T |
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Q |
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24302631 |
tgtgaaatatccaaaacgtcatacaatttgggacggagagagtaattta |
24302583 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #68
Raw Score: 119; E-Value: 2e-60
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Target Start/End: Complemental strand, 39983498 - 39983274
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334 |
Q |
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T |
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335 |
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423 |
Q |
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| T |
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T |
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448 |
Q |
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| T |
39983298 |
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #69
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Target Start/End: Original strand, 21177252 - 21177495
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330 |
Q |
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T |
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331 |
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419 |
Q |
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| T |
21177352 |
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21177451 |
T |
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| Q |
420 |
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463 |
Q |
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| T |
21177452 |
tgtgaaatggccaaaacgtcatacaatttgggacggagggagta |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #70
Raw Score: 118; E-Value: 7e-60
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Target Start/End: Original strand, 22369550 - 22369773
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T |
 |
| Q |
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424 |
Q |
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| T |
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T |
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| Q |
425 |
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448 |
Q |
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| T |
22369750 |
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T |
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Target: chr7; HSP #71
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332 |
Q |
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| T |
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T |
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| Q |
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Q |
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| T |
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T |
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465 |
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| T |
28472107 |
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #72
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T |
 |
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Q |
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| T |
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T |
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| Q |
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466 |
Q |
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| T |
39430281 |
tttctcttccccacacaatattaattacatttcttaatacgtgtgaaatgaccaaaacgtcatacaatttgggacggagggagtaatt |
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T |
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Target: chr7; HSP #73
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Target Start/End: Complemental strand, 27119078 - 27118860
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T |
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Q |
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| T |
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| Q |
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Q |
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| T |
27118878 |
ccaaaacgtcatacaattt |
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #74
Raw Score: 117; E-Value: 3e-59
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Target Start/End: Complemental strand, 45823240 - 45822957
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| |
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T |
 |
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290 |
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Q |
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| T |
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T |
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| Q |
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Q |
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T |
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Target: chr7; HSP #75
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T |
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Q |
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| T |
9603791 |
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9603692 |
T |
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| Q |
428 |
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465 |
Q |
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| T |
9603691 |
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T |
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Target: chr7; HSP #76
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338 |
Q |
| |
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| T |
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caaattgtatgttaatttacgatatcaatgaaacattaattttactttttttattatatctttaactatttattactctttcttctttcaattctttcat |
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T |
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| Q |
339 |
ttatctttttcata-----------ggacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatatgtgtgaaat |
427 |
Q |
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| T |
9831362 |
ttatctttctcatattatttattaaggacaattttgtaaaacaactcataatatctattttccacacaatattaattatatttctcaatatatgtgaaat |
9831263 |
T |
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| Q |
428 |
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465 |
Q |
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| T |
9831262 |
acccaaaacgtcatacaatttaggacggagggagtaat |
9831225 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #77
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Q |
| |
|
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T |
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| Q |
333 |
ttttatttatcttt---------ttcat------aggacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaatattaattacatttcttaata |
417 |
Q |
| |
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| T |
10316692 |
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10316791 |
T |
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| Q |
418 |
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448 |
Q |
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| T |
10316792 |
tgtgtgaaatacccaaaacgtcatacaattt |
10316822 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #78
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ttgtcccaaattgtatgtcactttacaataccaatgaaacattaatgttatttttcctattataaccttaactatttattactctctcttctttcaagtc |
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Q |
| |
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| T |
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T |
 |
| Q |
333 |
ttttatttatctttttcata-----------ggacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatatgtg |
421 |
Q |
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| T |
22706902 |
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22706803 |
T |
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| Q |
422 |
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463 |
Q |
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| T |
22706802 |
tgaaatgcctaaaacgtgatacaatttgagatggagggagta |
22706761 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #79
Raw Score: 116; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 231 - 465
Target Start/End: Complemental strand, 27116653 - 27116408
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atttgtcccaaattgtatgtcactttacaataccaatgaaacattaatgttatttttcctattataaccttaactatttattactctctcttctttcaag |
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Q |
| |
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| T |
27116653 |
atttgtcccaaattatatatcgctttataataccaatgaaatatttatgttacttttcctattatatccttaactattaattactctctcttctttcaat |
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T |
 |
| Q |
331 |
tcttttatttatctttttcata-----------ggacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatatg |
419 |
Q |
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| T |
27116553 |
tatttcatttatctttttcataccatttattagggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacgcaatattaattacatttcttaatatg |
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T |
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| Q |
420 |
tgtgaaatgcccaaaacgtcatacaatttaggatgaagggagtaat |
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Q |
| |
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| T |
27116453 |
tgtgaaatggtcaaaacgtcttacaatttgggacggagggagtaat |
27116408 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #80
Raw Score: 116; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 230 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 34275696 - 34275467
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tatttgtcccaaattgtatgtcactttacaataccaatgaaacattaatgttatttttcctattataaccttaactatttattactctctcttctttcaa |
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| |
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| T |
34275696 |
tatttgtctcaaattgtatgtcgttttacaataccaatgaaaaattaatgttacttttcatattatatccttaactatttattactctctcttttttcaa |
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 |
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gtcttttatttatctttttcata-----------ggacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatat |
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| |
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| T |
34275596 |
ttccttcatttatctttcccatatcatttattgaggacaattttgtaaaataactcataatatctctttcccacacaatattaattacatttcttaatat |
34275497 |
T |
 |
| Q |
419 |
gtgtgaaatgcccaaaacgtcatacaattt |
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| T |
34275496 |
gtatgaaatgttcaaaacgtcgtacaattt |
34275467 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #81
Raw Score: 116; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 232 - 448
Target Start/End: Original strand, 39938639 - 39938857
Alignment:
| Q |
232 |
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331 |
Q |
| |
|
|||||| |||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | |
|
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| T |
39938639 |
tttgtctcaaattatatgtcgctttacaataccaatgtaacattaatgttactttttctattataaccttagttatttattactctctcttctttcattt |
39938738 |
T |
 |
| Q |
332 |
cttttatttatctttttcat--aggacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatatgtgtgaaatgc |
429 |
Q |
| |
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| || || || || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |
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|
| T |
39938739 |
atctttcccatattatttattaaggacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccatacaatattaattgcatttcttaatatgtgtgaaatgc |
39938838 |
T |
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| Q |
430 |
ccaaaacgtcatacaattt |
448 |
Q |
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| |||| |||||||||||| |
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| T |
39938839 |
ctaaaatgtcatacaattt |
39938857 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #82
Raw Score: 116; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 231 - 465
Target Start/End: Original strand, 40704430 - 40704674
Alignment:
| Q |
231 |
atttgtcccaaattgtatgtcactttacaataccaatgaaacattaatgttatttttcctattataaccttaactatttattactctctcttctttcaag |
330 |
Q |
| |
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| T |
40704430 |
atttgtctcaaattatatgtcgctttacaataccaatgaat-attaatgttatttttcctattatatccttaactattaattactctctcttctttcaat |
40704528 |
T |
 |
| Q |
331 |
tcttttatttatctttttcata-----------ggacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatatg |
419 |
Q |
| |
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| || ||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| | |
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| T |
40704529 |
tattacatttatcttttccataccatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaatattaattatatttcttaatacg |
40704628 |
T |
 |
| Q |
420 |
tgtgaaatgcccaaaacgtcatacaatttaggatgaagggagtaat |
465 |
Q |
| |
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||||||||| ||||||||||||||||||| ||| | |||||||||| |
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| T |
40704629 |
tgtgaaatggccaaaacgtcatacaatttgggacggagggagtaat |
40704674 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #83
Raw Score: 115; E-Value: 4e-58
Query Start/End: Original strand, 231 - 464
Target Start/End: Original strand, 17832954 - 17833198
Alignment:
| Q |
231 |
atttgtcccaaattgtatgtcactttacaataccaatgaaacattaatgttatttttcctattataaccttaactatttattactctctcttctttcaag |
330 |
Q |
| |
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|
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| T |
17832954 |
atttgtcccaaattatatgtcgctttacaataccaatgaaatattaatattacttttcctattatatccttaactattaattagtctctcttctttcaat |
17833053 |
T |
 |
| Q |
331 |
tcttttatttatctttttcat-----------aggacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatatg |
419 |
Q |
| |
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| ||| ||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||||| | |
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| T |
17833054 |
tatttcatttatcttttccataccatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaaaattaattacatttcttaatacg |
17833153 |
T |
 |
| Q |
420 |
tgtgaaatgcccaaaacgtcatacaatttaggatgaagggagtaa |
464 |
Q |
| |
|
||||||||| |||||| ||||||||||| ||||| ||||||||| |
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| T |
17833154 |
tgtgaaatggtcaaaacatcatacaatttgggatggagggagtaa |
17833198 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #84
Raw Score: 115; E-Value: 4e-58
Query Start/End: Original strand, 230 - 463
Target Start/End: Complemental strand, 47834393 - 47834149
Alignment:
| Q |
230 |
tatttgtcccaaattgtatgtcactttacaataccaatgaaacattaatgttatttttcctattataaccttaactatttattactctctcttctttcaa |
329 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||| |
|
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| T |
47834393 |
tatttgtcccaaattatatgtcgctttacaatatcaatgaaaaattaatgttacttttcctattatattcttaactatttattactttctcttatttcaa |
47834294 |
T |
 |
| Q |
330 |
gtcttttatttatctttttcatag-----------gacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatat |
418 |
Q |
| |
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|
|
| T |
47834293 |
ttccttcatttttctttcccatatcatttattgaagacaattttgtaaaacaactcataatatctttttttcacacaatatcaattacatttcttaatat |
47834194 |
T |
 |
| Q |
419 |
gtgtgaaatgcccaaaacgtcatacaatttaggatgaagggagta |
463 |
Q |
| |
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| T |
47834193 |
gtgtgaaatgcccaaaacgtcttacaatttgggacggagggagta |
47834149 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #85
Raw Score: 114; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 231 - 463
Target Start/End: Original strand, 28703584 - 28703827
Alignment:
| Q |
231 |
atttgtcccaaattgtatgtcactttacaataccaatgaaacattaatgttatttttcctattataaccttaactatttattactctctcttctttcaag |
330 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
28703584 |
atttgtcccaaattatatgtcgctttacaataccaatgaaatatttatgttacttttcctattatatccttaactattaattactatctcttctttcaat |
28703683 |
T |
 |
| Q |
331 |
tcttttatttatctttttcata-----------ggacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatatg |
419 |
Q |
| |
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| ||| ||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||||| | |
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| T |
28703684 |
tatttcatttatcttttccataccatttattagggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacgcaatattaattacatttcttaatacg |
28703783 |
T |
 |
| Q |
420 |
tgtgaaatgcccaaaacgtcatacaatttaggatgaagggagta |
463 |
Q |
| |
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||||||||| |||||||||| |||||||| ||| | |||||||| |
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| T |
28703784 |
tgtgaaatgaccaaaacgtcttacaatttgggacggagggagta |
28703827 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #86
Raw Score: 114; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 231 - 463
Target Start/End: Original strand, 37798089 - 37798332
Alignment:
| Q |
231 |
atttgtcccaaattgtatgtcactttacaataccaatgaaacattaatgttatttttcctattataaccttaactatttattactctctcttctttcaag |
330 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
37798089 |
atttgtcccaaattatatgtcgctttataataccaatgaaaaattaatgttacttttcctattatatccttaactatttattactctcttttctttcaat |
37798188 |
T |
 |
| Q |
331 |
tcttttatttatctttttcat-----------aggacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatatg |
419 |
Q |
| |
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| T |
37798189 |
tccttcatttatttttcccatatcatttattgaggataattttgtaaaacaactcataatatctctttcccttacaatattaattacatttcttaatatg |
37798288 |
T |
 |
| Q |
420 |
tgtgaaatgcccaaaacgtcatacaatttaggatgaagggagta |
463 |
Q |
| |
|
||| ||||| ||||||| | ||||||||| ||| |||||||||| |
|
|
| T |
37798289 |
tgtaaaatgtccaaaacattatacaatttgggacgaagggagta |
37798332 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #87
Raw Score: 113; E-Value: 7e-57
Query Start/End: Original strand, 231 - 445
Target Start/End: Complemental strand, 16875903 - 16875677
Alignment:
| Q |
231 |
atttgtcccaaattgtatgtcactttacaataccaatgaaacattaatgttatttttcctattataaccttaactatttattactctctcttctttcaag |
330 |
Q |
| |
|
||||||| ||||| |||||| ||||||||||||| || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| |
|
|
| T |
16875903 |
atttgtcataaattatatgtcgctttacaataccagtgcaacattaatgttacttttcctattataaccttaactatttattactatctcttatttcaat |
16875804 |
T |
 |
| Q |
331 |
tcttttatttatctttttcat-----------aggacaattttgtaaaacaactcataatatctctttt-ccacacaatattaattacatttcttaatat |
418 |
Q |
| |
|
| ||| |||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
16875803 |
tatttcatttatttttcccatgttatttattaaggacaattttgtaaaacaactcataatatctttttttccacacaatattaattgcatttcttaatat |
16875704 |
T |
 |
| Q |
419 |
gtgtgaaatgcccaaaacgtcatacaa |
445 |
Q |
| |
|
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| T |
16875703 |
gtgtgaaatgcccaaaacgtcatacaa |
16875677 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #88
Raw Score: 113; E-Value: 7e-57
Query Start/End: Original strand, 233 - 448
Target Start/End: Original strand, 29669315 - 29669541
Alignment:
| Q |
233 |
ttgtcccaaattgtatgtcactttacaataccaatgaaacattaatgttatttttcctattataaccttaactatttattactctctcttctttcaagtc |
332 |
Q |
| |
|
|||||| ||||| |||||| |||||||||| |||||||| |||||||||| |||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| | |
|
|
| T |
29669315 |
ttgtccaaaattatatgtcgctttacaataacaatgaaatattaatgttactttttctattatatccttaactattaattactctctcttctttcaatta |
29669414 |
T |
 |
| Q |
333 |
ttttatttatctttttcata-----------ggacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatatgtg |
421 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
29669415 |
ttttatttatcttttccataccatttattaggaataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaatattaattacatttcttaatacgtg |
29669514 |
T |
 |
| Q |
422 |
tgaaatgcccaaaacgtcatacaattt |
448 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||||||||||||||| |
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|
| T |
29669515 |
tgaaatggccaaaacgtcatacaattt |
29669541 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #89
Raw Score: 113; E-Value: 7e-57
Query Start/End: Original strand, 231 - 463
Target Start/End: Complemental strand, 40537021 - 40536782
Alignment:
| Q |
231 |
atttgtcccaaattgtatgtcactttacaataccaatgaaacattaatgttatttttcctattataaccttaactatttattactctctcttctttcaag |
330 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||| || |
|
|
| T |
40537021 |
atttgtcccaaattatatgtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttagttttcctattatatccttaagtattaattactctctcttcttttaat |
40536922 |
T |
 |
| Q |
331 |
tcttttat-ttatctttttcat------aggacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatatgtgtg |
423 |
Q |
| |
|
| |||||| || || | ||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
40536921 |
tattttatcttttccataccatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaatattaattacatttcttaatacgtgtg |
40536822 |
T |
 |
| Q |
424 |
aaatgcccaaaacgtcatacaatttaggatgaagggagta |
463 |
Q |
| |
|
||||| ||||||||||||||||||| ||| | |||||||| |
|
|
| T |
40536821 |
aaatggccaaaacgtcatacaatttgggacggagggagta |
40536782 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #90
Raw Score: 112; E-Value: 3e-56
Query Start/End: Original strand, 190 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 9417884 - 9417615
Alignment:
| Q |
190 |
tactccatccgtcctaaattgtatgtcattttnnnnnnnntatttgtcccaaattgtatgtcactttacaataccaatgaaacattaatgttatttttcc |
289 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||| ||||||||||||| ||| |||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
9417884 |
tactccctccgtcccaaattgtatgtcactttggaaaaaaaatttgtcctaaattatatgtcgctttacaataccaatgaatcattaatgttacttttcc |
9417785 |
T |
 |
| Q |
290 |
tattataaccttaactatttattactctctcttctttcaagtcttttatttatctttttcata-----------ggacaattttgtaaaacaactcataa |
378 |
Q |
| |
|
||||||| |||| |||||||||| | ||||| || |||| || || |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
9417784 |
tattatatccttcactatttattgccttctctactctcaaatcattcatttatctttctcatatcatttattaaggacaattttgtaaaacaactcataa |
9417685 |
T |
 |
| Q |
379 |
tatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatatgtgtgaaatgcccaaaacgtcatacaattt |
448 |
Q |
| |
|
||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
9417684 |
tatctctttcccacacaaaattaattacatttcttaatacgtgtgaaatgcccaaaacatcatacaattt |
9417615 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #91
Raw Score: 111; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 233 - 463
Target Start/End: Original strand, 2887296 - 2887537
Alignment:
| Q |
233 |
ttgtcccaaattgtatgtcactttacaataccaatgaaacattaatgttatttttcctattataaccttaactatttattactctctcttctttcaagtc |
332 |
Q |
| |
|
||||| |||||| |||||| ||||| |||| ||||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || |
|
|
| T |
2887296 |
ttgtctcaaattatatgtcgctttaaaatatcaatgcaacattgatgttacttttcctattataaccttaattatttattactctctcttctttcaattc |
2887395 |
T |
 |
| Q |
333 |
ttttatttatcttt---------ttcat--aggacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatatgtg |
421 |
Q |
| |
|
||| |||||||||| || || ||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| || |
|
|
| T |
2887396 |
tttcatttatctttcccgtattatttattaaggacaaatttgtaaaacgacttataatatctcttttccatacaatattaattgcatttcttaatatatg |
2887495 |
T |
 |
| Q |
422 |
tgaaatgcccaaaacgtcatacaatttaggatgaagggagta |
463 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||||||||||| ||| | |||||||| |
|
|
| T |
2887496 |
tgaaatgcccaaaatgtcatacaatttgggacggagggagta |
2887537 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #92
Raw Score: 111; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 235 - 452
Target Start/End: Complemental strand, 5114097 - 5113871
Alignment:
| Q |
235 |
gtcccaaattgtatgtcactttacaataccaatgaaacattaatgttatttttcctattataaccttaactatttattactctctcttctttcaagtctt |
334 |
Q |
| |
|
|||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| || |||||||||||| |||| |
|
|
| T |
5114097 |
gtcctaaattatatgtcgctttacaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatccttaactatttattattccctcttctttcaattctt |
5113998 |
T |
 |
| Q |
335 |
ttatttatctttttcat---------aggacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatatgtgtgaa |
425 |
Q |
| |
|
| ||| |||||| ||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||| ||||||| |
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| T |
5113997 |
tcattcatctttcgcatatcatagtaagggtaattttgcaaaacaactcataatatctctttcccacaaaaaattaattacatttcttaatacgtgtgaa |
5113898 |
T |
 |
| Q |
426 |
atgcccaaaacgtcatacaatttagga |
452 |
Q |
| |
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|
|
| T |
5113897 |
attcccaaaacgtcatataatttagga |
5113871 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #93
Raw Score: 109; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 234 - 449
Target Start/End: Complemental strand, 2850008 - 2849784
Alignment:
| Q |
234 |
tgtcccaaattgtatgtcactttacaataccaatgaaacattaatgttatttttcctattataaccttaactatttattactctctcttctttcaagtct |
333 |
Q |
| |
|
||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||| ||| |
|
|
| T |
2850008 |
tgtcccaaattatatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttactttttctattataatcttaattatttattactctct--tctttcaattct |
2849911 |
T |
 |
| Q |
334 |
tttatttatcttt---------ttcat--aggacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatatgtgt |
422 |
Q |
| |
|
||||||||||||| || || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || | |
|
|
| T |
2849910 |
tttatttatctttcctatattatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaatattaattgcatttcttaatacgtat |
2849811 |
T |
 |
| Q |
423 |
gaaatgcccaaaacgtcatacaattta |
449 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
2849810 |
gaaatgtccaaaacaccatacaattta |
2849784 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #94
Raw Score: 109; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 233 - 448
Target Start/End: Original strand, 37277727 - 37277953
Alignment:
| Q |
233 |
ttgtcccaaattgtatgtcactttacaataccaatgaaacattaatgttatttttcctattataaccttaactatttattactctctcttctttcaagtc |
332 |
Q |
| |
|
|||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||| | |
|
|
| T |
37277727 |
ttgtcccaaattatatgtcgttttacaataccaatgaaatattaatgttatttttcctattatatctttaactattaattactctctcttctttcaatta |
37277826 |
T |
 |
| Q |
333 |
ttttatttatctttttcat-----------aggacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatatgtg |
421 |
Q |
| |
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||| ||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| | ||||||||||| ||| |
|
|
| T |
37277827 |
tttcatttatcttttccataccatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttcctcacacaatattaatcatatttcttaatacgtg |
37277926 |
T |
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| Q |
422 |
tgaaatgcccaaaacgtcatacaattt |
448 |
Q |
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| T |
37277927 |
tgaaatggccaaaacgtcatacaattt |
37277953 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #95
Raw Score: 108; E-Value: 6e-54
Query Start/End: Original strand, 232 - 463
Target Start/End: Original strand, 19293086 - 19293330
Alignment:
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232 |
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329 |
Q |
| |
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tttgtcccagattgtatgtcgcttcacaatatcaatgaaacattaatgttatttttctattattatatccttaactatttactactttctcttcttccaa |
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T |
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| Q |
330 |
gtcttttatttatctttttcata-----------ggacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatat |
418 |
Q |
| |
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| T |
19293186 |
gtcattcatttatctttctcatatcatttactaaggacaattttgtaaaacaattcataatattcctttcccacacaaaattaattacatttcttaatac |
19293285 |
T |
 |
| Q |
419 |
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463 |
Q |
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| T |
19293286 |
gtgtgaaatgcctaaaacgtcatacaatttgggacggagggagta |
19293330 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #96
Raw Score: 106; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 231 - 463
Target Start/End: Original strand, 33616419 - 33616662
Alignment:
| Q |
231 |
atttgtcccaaattgtatgtcactttacaataccaatgaaacattaatgttatttttcctattataaccttaactatttattactctctcttctttcaag |
330 |
Q |
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| T |
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atttgtctcaaattatatgtcgctttataataccaatgaaatatttatgttactttttctattatatccttaactattaattactctctcttctttcaat |
33616518 |
T |
 |
| Q |
331 |
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419 |
Q |
| |
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| T |
33616519 |
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33616618 |
T |
 |
| Q |
420 |
tgtgaaatgcccaaaacgtcatacaatttaggatgaagggagta |
463 |
Q |
| |
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| T |
33616619 |
tgtgaaatggccaaaacgtcttacaatttgggacggagggagta |
33616662 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #97
Raw Score: 106; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 232 - 464
Target Start/End: Complemental strand, 43884365 - 43884122
Alignment:
| Q |
232 |
tttgtcccaaattgtatgtcactttacaataccaatgaaacattaatgttatttttcctattataaccttaactatttattactctctcttctttcaagt |
331 |
Q |
| |
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|
| T |
43884365 |
tttgtcctaaattatatgtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttactttttctattatatccttaactattaattactctatcttctttcaatt |
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T |
 |
| Q |
332 |
cttttatttatctttttcata-----------ggacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatatgt |
420 |
Q |
| |
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| | ||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||| ||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| || |
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| T |
43884265 |
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43884166 |
T |
 |
| Q |
421 |
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464 |
Q |
| |
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|||||||| ||||||||||||||||||| ||| | ||||||||| |
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| T |
43884165 |
gtgaaatggccaaaacgtcatacaatttgggacggagggagtaa |
43884122 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #98
Raw Score: 105; E-Value: 4e-52
Query Start/End: Original strand, 233 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 584614 - 584388
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| Q |
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332 |
Q |
| |
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| T |
584614 |
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T |
 |
| Q |
333 |
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421 |
Q |
| |
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| T |
584514 |
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584415 |
T |
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| Q |
422 |
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448 |
Q |
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| T |
584414 |
tgaaatatctaaaacgtcatacaattt |
584388 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #99
Raw Score: 105; E-Value: 4e-52
Query Start/End: Original strand, 233 - 448
Target Start/End: Original strand, 12263693 - 12263919
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| Q |
233 |
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332 |
Q |
| |
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| T |
12263693 |
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12263792 |
T |
 |
| Q |
333 |
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421 |
Q |
| |
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| T |
12263793 |
tttcatttatcttttccataccatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaatattaattacatttcttaatacgtg |
12263892 |
T |
 |
| Q |
422 |
tgaaatgcccaaaacgtcatacaattt |
448 |
Q |
| |
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| T |
12263893 |
tgaaatggccaaaacgtcatacaattt |
12263919 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #100
Raw Score: 105; E-Value: 4e-52
Query Start/End: Original strand, 190 - 441
Target Start/End: Complemental strand, 25547991 - 25547730
Alignment:
| Q |
190 |
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289 |
Q |
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| T |
25547991 |
tactccctccgtcccaaattttatgtcattttagaaaaaatatttgtcc-aaattgtatgtcgctttacaataccaatgaaaagttaatattacttttca |
25547893 |
T |
 |
| Q |
290 |
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378 |
Q |
| |
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| T |
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tattatatccttaactatttattactctctcttctatcagttccttcgtttatcttttccatatcatttattgaggacaattttgtaaaacaactcataa |
25547793 |
T |
 |
| Q |
379 |
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441 |
Q |
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| T |
25547792 |
tatatttttcccacataatattaattacatttcttaatatgtgtgaaatgctcaaaacgtcat |
25547730 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #101
Raw Score: 105; E-Value: 4e-52
Query Start/End: Original strand, 236 - 463
Target Start/End: Complemental strand, 31582215 - 31581977
Alignment:
| Q |
236 |
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335 |
Q |
| |
|
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| T |
31582215 |
tcccaaattgtatgtcgttttacaatatcaatgaatcattaatgttacttttcttattatatccttcactatttattgccttctctactcccaaatcatt |
31582116 |
T |
 |
| Q |
336 |
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424 |
Q |
| |
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| T |
31582115 |
catttatctttctcatatcatttattaaggacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaaaattaattacatttcttaatacgtgtga |
31582016 |
T |
 |
| Q |
425 |
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463 |
Q |
| |
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|
| T |
31582015 |
aatgtccaaaacgtcatacaatttgggacggagggagta |
31581977 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #102
Raw Score: 104; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 233 - 447
Target Start/End: Original strand, 9818132 - 9818357
Alignment:
| Q |
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332 |
Q |
| |
|
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| T |
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ttgttccaaattatatgtcgttttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcttattatatccttaagtatttattactctatcttctttcacttc |
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T |
 |
| Q |
333 |
ttttatttatctttttcatag-----------gacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatatgtg |
421 |
Q |
| |
|
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|
| T |
9818232 |
cttcatttatctttctcatatcatttattaaagacaattttgtaaaataactcataatatctatttcccacacaatatcaattacatttcttaatatgtg |
9818331 |
T |
 |
| Q |
422 |
tgaaatgcccaaaacgtcatacaatt |
447 |
Q |
| |
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||||||| |||||||||||||||||| |
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|
| T |
9818332 |
tgaaatgtccaaaacgtcatacaatt |
9818357 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #103
Raw Score: 104; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 233 - 447
Target Start/End: Original strand, 10720057 - 10720282
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| Q |
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ttgtcccaaattgtatgtcactttacaataccaatgaaacattaatgttatttttcctattataaccttaactatttattactctctcttctttcaagtc |
332 |
Q |
| |
|
|||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||||| || |
|
|
| T |
10720057 |
ttgttccaaattatatgtcgttttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcttattatatccttaagtatttattactctatcttctttcacttc |
10720156 |
T |
 |
| Q |
333 |
ttttatttatctttttcatag-----------gacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatatgtg |
421 |
Q |
| |
|
|| |||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
10720157 |
cttcatttatctttctcatatcatttattaaagacaattttgtaaaataactcataatatctatttcccacacaatatcaattacatttcttaatatgtg |
10720256 |
T |
 |
| Q |
422 |
tgaaatgcccaaaacgtcatacaatt |
447 |
Q |
| |
|
||||||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
10720257 |
tgaaatgtccaaaacgtcatacaatt |
10720282 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #104
Raw Score: 104; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 230 - 404
Target Start/End: Original strand, 30264467 - 30264652
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| Q |
230 |
tatttgtcccaaattgtatgtcactttacaataccaatgaaacattaatgttatttttcctattataaccttaactatttattactctctcttctttcaa |
329 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
30264467 |
tatttgtcccaaattatatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttagctatttattactctcttttctttcaa |
30264566 |
T |
 |
| Q |
330 |
gtcttttatttatctttttcat-----------aggacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaatattaatt |
404 |
Q |
| |
|
||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
30264567 |
ttctttcatttatctttctcatattatttattaaggacaattttgtaaaacaactcataatatctccttttcacacaatattaatt |
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T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #105
Raw Score: 103; E-Value: 6e-51
Query Start/End: Original strand, 231 - 467
Target Start/End: Complemental strand, 30440636 - 30440392
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| Q |
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330 |
Q |
| |
|
||||||| |||||| ||||| ||||||||||| |||| || ||||||||||||||| || ||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
30440636 |
atttgtcacaaattatatgttgctttacaatactaatgcaatattaatgttattttttcttttataccattaactatttattattctctcttctttcaat |
30440537 |
T |
 |
| Q |
331 |
tcttttatttatctt-------tttcata-ggacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatatgtgt |
422 |
Q |
| |
|
||||| |||||| | ||| || |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
30440536 |
tctttcatttattctcatgttatttattatggacaattttgtaaaacaactcgtaatatctcttttccatgcaatattaattgcatttcttaatatgtgt |
30440437 |
T |
 |
| Q |
423 |
gaaatgcccaaaacgtcatacaatttaggatgaagggagtaattt |
467 |
Q |
| |
|
||||| ||||||||||||||||||||||| | | |||||||||| |
|
|
| T |
30440436 |
aaaatgtccaaaacgtcatacaatttaggacggaaggagtaattt |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #106
Raw Score: 103; E-Value: 6e-51
Query Start/End: Original strand, 190 - 463
Target Start/End: Complemental strand, 36669809 - 36669526
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| Q |
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289 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| |||| | |
|
|
| T |
36669809 |
tactccctccgtcccaaattgtatgtcgttttggaaaaaaaatttgtcccaaattatatgtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttactttttc |
36669710 |
T |
 |
| Q |
290 |
tattataaccttaactatttattactctctcttctttcaagtcttttatttatctttttcata-----------ggacaattttgtaaaacaactcataa |
378 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||| |||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
36669709 |
tattatatccttaactattaattactctctcttctttcaattatttcatttat-tttttcataccatttattagggataattttgtaaaacaactcataa |
36669611 |
T |
 |
| Q |
379 |
tatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatatgtgtgaaatgcccaaaacgtcatacaatttaggatgaagggagta |
463 |
Q |
| |
|
| |||||| ||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||| || |||||||| ||| | |||||||| |
|
|
| T |
36669610 |
tttctcttccccatgcaatattaattgcatttcttaatacgtgtgaaatgaccaaaacatcgtacaatttgggacggagggagta |
36669526 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #107
Raw Score: 103; E-Value: 6e-51
Query Start/End: Original strand, 231 - 448
Target Start/End: Original strand, 40020343 - 40020570
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330 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| ||| || ||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||| || ||||||||| ||||||||| || |
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|
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40020441 |
T |
 |
| Q |
331 |
tcttttatttatctttttcata-----------ggacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatatg |
419 |
Q |
| |
|
|| || |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
40020442 |
tccttcatttatctttcccatattatttattaaggacaattttgtaaaacaactcataatatctattttctacacaatattaattgcatttcttaatatg |
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T |
 |
| Q |
420 |
tgtgaaatgcccaaaacgtcatacaattt |
448 |
Q |
| |
|
|| |||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
40020542 |
tgcgaaatgcccaaaacgtcatacaattt |
40020570 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #108
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 231 - 463
Target Start/End: Original strand, 7979034 - 7979277
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| |
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|||||||| ||||| || ||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
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atttgtcctaaattataagtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcctattatatccttaactattaattactccctcttctttcaat |
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 |
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tcttttatttatctttttcat-----------aggacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatatg |
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Q |
| |
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| T |
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tatttcatttatcttttctataccatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttcacttccccacactatattaattacatttcttaatacg |
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 |
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420 |
tgtgaaatgcccaaaacgtcatacaatttaggatgaagggagta |
463 |
Q |
| |
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||||||||| |||||||||||||||||| ||| | |||||||| |
|
|
| T |
7979234 |
tgtgaaatggtcaaaacgtcatacaatttgggacggagggagta |
7979277 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #109
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 231 - 463
Target Start/End: Original strand, 24161675 - 24161918
Alignment:
| Q |
231 |
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330 |
Q |
| |
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| T |
24161675 |
atttatccaaaattatatgtcattttacgataccaatgaaatattaatgttatttttcctattatatccttaattattaattattctctcttctttcaat |
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T |
 |
| Q |
331 |
tcttttatttatctttttcat-----------aggacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatatg |
419 |
Q |
| |
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| ||| ||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||||| | |
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| T |
24161775 |
tatttcatttatcttttccataccatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttcctcacacaatattaattatatttcttaatacg |
24161874 |
T |
 |
| Q |
420 |
tgtgaaatgcccaaaacgtcatacaatttaggatgaagggagta |
463 |
Q |
| |
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||||||||| ||||||| ||||||||||| ||| | |||||||| |
|
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| T |
24161875 |
tgtgaaatgaccaaaacatcatacaatttgggacggagggagta |
24161918 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #110
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 239 - 452
Target Start/End: Original strand, 37411120 - 37411348
Alignment:
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239 |
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334 |
Q |
| |
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| T |
37411120 |
caaattgtatgtcgctttacaataccaatgcaactttaatgttacttttcctattataaccttaactatttattgtttttttttttttttttcaattcat |
37411219 |
T |
 |
| Q |
335 |
ttatttatctttttcata-----------ggacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatatgtgtg |
423 |
Q |
| |
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| |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |
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| T |
37411220 |
tcatttatctttcccatattatttattaaggacaattttgtaaaacaactcataatatctcgtctccacacaatattaattgcatttcttaatatgtgtg |
37411319 |
T |
 |
| Q |
424 |
aaatgcccaaaacgtcatacaatttagga |
452 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||| |
|
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| T |
37411320 |
aaatgcccaaaacgtcatacaatttagga |
37411348 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #111
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 235 - 463
Target Start/End: Original strand, 42940934 - 42941173
Alignment:
| Q |
235 |
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334 |
Q |
| |
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| T |
42940934 |
gtcccaaattatatgtcgctttataataccaatgaaatatttatgttacttttcctattatatccttaattattaattactctctcttctttcaattatt |
42941033 |
T |
 |
| Q |
335 |
ttatttatctttttcata-----------ggacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatatgtgtg |
423 |
Q |
| |
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| ||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |
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| T |
42941034 |
tcatttatcttttccataccatttattagggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccatgcaatattaattacatttcttaatacgtgtg |
42941133 |
T |
 |
| Q |
424 |
aaatgcccaaaacgtcatacaatttaggatgaagggagta |
463 |
Q |
| |
|
||||| |||||||||| |||||||| ||| | |||||||| |
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| T |
42941134 |
aaatgaccaaaacgtcttacaatttgggacggagggagta |
42941173 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #112
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 240 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 47604712 - 47604493
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| Q |
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339 |
Q |
| |
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||||| |||||| |||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||| ||| |
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| T |
47604712 |
aaattatatgtcgttttacaataccaatgaaatatttatgttacttttcctattatatccttaactattaattactctctcttctttcaattatttcatt |
47604613 |
T |
 |
| Q |
340 |
tatctttttcata-----------ggacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatatgtgtgaaatg |
428 |
Q |
| |
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| T |
47604612 |
tatcttttccataccatttattagggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacgcaatattaattacatttcttaatacgtgtgaaatg |
47604513 |
T |
 |
| Q |
429 |
cccaaaacgtcatacaattt |
448 |
Q |
| |
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| T |
47604512 |
gccaaaacgtcttacaattt |
47604493 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #113
Raw Score: 101; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 259 - 466
Target Start/End: Original strand, 3264413 - 3264630
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| Q |
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352 |
Q |
| |
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| T |
3264413 |
aataccaatgaaacattaatgttattttttctattatatc-ttaactatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttctcaaatcattt |
3264511 |
T |
 |
| Q |
353 |
-----ggacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatatgtgtgaaatgcccaaaacgtcatacaatt |
447 |
Q |
| |
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| T |
3264512 |
attaaggataattttgtaaaacaactcataatatctctttcctacgcaatattaattatatttcttaataagtgtgaaatgctcaaaacgtcatacaatt |
3264611 |
T |
 |
| Q |
448 |
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466 |
Q |
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| T |
3264612 |
tagaacggagggagtaatt |
3264630 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #114
Raw Score: 101; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 240 - 452
Target Start/End: Complemental strand, 10657213 - 10656992
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| Q |
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aaattgtatgtcactttacaataccaatgaaacattaatgttatttttcctattataaccttaactatttattactctctcttctttcaagtcttttatt |
339 |
Q |
| |
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|
| T |
10657213 |
aaattatatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttaactatttattactccctcttctttcaattatttcatt |
10657114 |
T |
 |
| Q |
340 |
tatctttttcat--------aggacaattttgt-aaaacaactcataatatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatatgtgtgaaatgcc |
430 |
Q |
| |
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| T |
10657113 |
tatttttcccatattatttaaggataattttgtaaaaataactcataatatatcttttccacgtaatattaattgcatttcttaatatgtgtgaaatgct |
10657014 |
T |
 |
| Q |
431 |
caaaacgtcatacaatttagga |
452 |
Q |
| |
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| T |
10657013 |
caaattatcatacaatttagga |
10656992 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #115
Raw Score: 101; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 231 - 448
Target Start/End: Original strand, 46578656 - 46578882
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| Q |
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atttgtcccaaattgtatgtcactttacaataccaatgaaacattaatgttatttttcctattataaccttaactatttattactctctcttctttcaag |
330 |
Q |
| |
|
||||||||||| || |||||| | ||||||||| ||| ||||||||||||| |||| | ||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
46578656 |
atttgtcccaa-ttatatgtcgcattacaatactcatgcaacattaatgttactttttcaattataaccttaattaattattactccttcttctttcaat |
46578754 |
T |
 |
| Q |
331 |
tcttttatttatctttttcata----------ggacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatatgt |
420 |
Q |
| |
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||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |
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|
| T |
46578755 |
tctttcatttatctttcccatatatttattaaggacaattttgtaaaacaactcataatatctattttccacacaatattaattgtatttcttaatatgt |
46578854 |
T |
 |
| Q |
421 |
gtgaaatgcccaaaacgtcatacaattt |
448 |
Q |
| |
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| T |
46578855 |
gtgaaatacccaaaacgtcatacaattt |
46578882 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #116
Raw Score: 100; E-Value: 4e-49
Query Start/End: Original strand, 233 - 463
Target Start/End: Complemental strand, 3458571 - 3458330
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| Q |
233 |
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332 |
Q |
| |
|
|||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||| ||||||||| | |
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|
| T |
3458571 |
ttgtcccaaattatatgtcgctttacaataccaatgaaatatttatgttacttttcctattatatccttaactattaattattctctattctttcaatta |
3458472 |
T |
 |
| Q |
333 |
ttttatttatctttttcata-----------ggacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatatgtg |
421 |
Q |
| |
|
||| ||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||||| || |
|
|
| T |
3458471 |
tttcatttatcttttctataccatttattagggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacgcaatattaattacatttcttaatacatg |
3458372 |
T |
 |
| Q |
422 |
tgaaatgcccaaaacgtcatacaatttaggatgaagggagta |
463 |
Q |
| |
|
||||||| |||||||||| |||||||| ||| | |||||||| |
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|
| T |
3458371 |
tgaaatggccaaaacgtcttacaatttgggacggagggagta |
3458330 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #117
Raw Score: 100; E-Value: 4e-49
Query Start/End: Original strand, 230 - 463
Target Start/End: Complemental strand, 11910673 - 11910431
Alignment:
| Q |
230 |
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329 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||| |
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| T |
11910673 |
tatttgtcccaaattatatgccgttttacaataccaatgaaaaattaatgttatttttcctattatatccttaactatttattgttctct--tctttcaa |
11910576 |
T |
 |
| Q |
330 |
gtcttttatttatctttttcatag-----------gacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatat |
418 |
Q |
| |
|
|| || |||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||| |
|
|
| T |
11910575 |
ttccttcatttatttttcccatatcatatattgaagacaattttgtaaaacaactcaaaatatctctttcccacacaatattaattatattttttaatat |
11910476 |
T |
 |
| Q |
419 |
gtgtgaaatgcccaaaacgtcatacaatttaggatgaagggagta |
463 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
11910475 |
gtatgaaatgcccaaaacttcatacaatttgggacggagggagta |
11910431 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #118
Raw Score: 100; E-Value: 4e-49
Query Start/End: Original strand, 244 - 463
Target Start/End: Complemental strand, 19785810 - 19785576
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244 |
tgtatgtcactttacaataccaatgaaacattaatgttatttttcctattataaccttaactatttattactctctcttctt----tcaagtcttttatt |
339 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | | || || |||| ||||| | | |
|
|
| T |
19785810 |
tgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatattatttttcctattatatccttaactatttattactttttttttttcttttcaattctttcaat |
19785711 |
T |
 |
| Q |
340 |
tatctttttcata-----------ggacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatatgtgtgaaatg |
428 |
Q |
| |
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|
| T |
19785710 |
tatctttcccatatcatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaatattaattatatttcttaatatatgtgaaatg |
19785611 |
T |
 |
| Q |
429 |
cccaaaacgtcatacaatttaggatgaagggagta |
463 |
Q |
| |
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|
| T |
19785610 |
cccaaaacatcgtaaaatttaggacggagggagta |
19785576 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #119
Raw Score: 99; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 231 - 467
Target Start/End: Complemental strand, 32466398 - 32466150
Alignment:
| Q |
231 |
atttgtcccaaattgtatgtcactttacaataccaatgaaac-attaatgttatttttcctattataaccttaactatttattactctctcttctttcaa |
329 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
32466398 |
atttgtcccaaattatatgtcgctttacaataccaataaaaatattaatgttacttttcctattatattcttgactattaattactctctcttctttcaa |
32466299 |
T |
 |
| Q |
330 |
gtcttttatttatctttttcata-----------ggacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatat |
418 |
Q |
| |
|
| ||| |||||||||| ||||| ||| |||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
32466298 |
ttatttcatttatctttctcataccatttattaaggataattttataaaacaactcataatttctctttcccacacaatattaattatatttcttaatac |
32466199 |
T |
 |
| Q |
419 |
gtgtgaaatgcccaaaacgtcatacaatttaggatgaagggagtaattt |
467 |
Q |
| |
|
|||||||| | |||||||||| |||| ||| ||| | |||||||||||| |
|
|
| T |
32466198 |
gtgtgaaacggccaaaacgtcgtacattttgggacggagggagtaattt |
32466150 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #120
Raw Score: 99; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 233 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 40353869 - 40353646
Alignment:
| Q |
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332 |
Q |
| |
|
|||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||| | |
|
|
| T |
40353869 |
ttgtcccaaattatatgtcgctttacaatactaatgaaatattaatgttatttttcctattatatccttaactattaattactc---cttctttcaatta |
40353773 |
T |
 |
| Q |
333 |
ttttatttatctttttcat-----------aggacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatatgtg |
421 |
Q |
| |
|
||| ||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |
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|
| T |
40353772 |
tttcatttatcttttccataccatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaatattaattacatttcttaatacgtg |
40353673 |
T |
 |
| Q |
422 |
tgaaatgcccaaaacgtcatacaattt |
448 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||||| || ||||| |
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| T |
40353672 |
tgaaatggtcaaaacgtcttataattt |
40353646 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #121
Raw Score: 98; E-Value: 6e-48
Query Start/End: Original strand, 231 - 464
Target Start/End: Original strand, 12804423 - 12804656
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231 |
atttgtcccaaattgtatgtcactttacaataccaatgaaacattaatgttatttttcctattataaccttaactatttattactctctcttctttcaag |
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Q |
| |
|
|||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
12804423 |
atttgtcctaaattatatgtcactttacaatactcatgcaacattaatgttacttttccaattataaccttaattatttattactccatcttctttcatt |
12804522 |
T |
 |
| Q |
331 |
tcttttatttatctttttcat--aggacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatatgtgtgaaatg |
428 |
Q |
| |
|
| |||| || || || || |||||| |||||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| |
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|
| T |
12804523 |
tatttttcccatattatttattaaggacagttttgtaaaacagctcataatatctattttccaca--atattaatttcatttcttaatatgtgtgaaata |
12804620 |
T |
 |
| Q |
429 |
cccaaaacgtcatacaatttaggatgaagggagtaa |
464 |
Q |
| |
|
||||||||||| |||||||| ||| | ||||||||| |
|
|
| T |
12804621 |
cccaaaacgtcgtacaatttgggacggagggagtaa |
12804656 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #122
Raw Score: 98; E-Value: 6e-48
Query Start/End: Original strand, 233 - 437
Target Start/End: Original strand, 48339489 - 48339704
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233 |
ttgtcccaaattgtatgtcactttacaataccaatgaaacattaatgttatttttcctattataaccttaactatttattactctctcttctttcaagtc |
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Q |
| |
|
|||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| || |||||||||| | |
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| T |
48339489 |
ttgtcccaaattatatgtcgttttacaataccgatgaaatattaatgttatttttcctattatatccttaactattaattactatcgcttctttcaatta |
48339588 |
T |
 |
| Q |
333 |
ttttatttatctttttcat-----------aggacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatatgtg |
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Q |
| |
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| T |
48339589 |
tttcatttatcttttccataccatttattaaggataattttgtaaaacaacttataatttctcttccccacacaatattaattacatttcttaatacgtg |
48339688 |
T |
 |
| Q |
422 |
tgaaatgcccaaaacg |
437 |
Q |
| |
|
||||||| |||||||| |
|
|
| T |
48339689 |
tgaaatgaccaaaacg |
48339704 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #123
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 190 - 465
Target Start/End: Complemental strand, 10453189 - 10452904
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289 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||| ||||||||||||| ||| |||||||| |||||| || ||| ||||||||||||||||||| |||| ||||| |||| | |
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| T |
10453189 |
tactccctccgtcccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtctcaaattatacgtcgctttacaataccaatgaaaaatta-tgttactttttc |
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T |
 |
| Q |
290 |
tattataaccttaactatttattactctctcttctttcaagtcttttatttatctttttcata-----------ggacaattttgtaaaacaactcataa |
378 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||| |||| ||||||||| |||||||| || || |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
10453090 |
tattatatccttaaccatttgttactctct--tctttcaattccttcatttatctttcccatatcatttattgaggacaattttgtaaaacaactcataa |
10452993 |
T |
 |
| Q |
379 |
tatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatatgtgtgaaatgcccaaaacgtc--atacaatttaggatgaagggagtaat |
465 |
Q |
| |
|
||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| | ||| |||||| |
|
|
| T |
10452992 |
tatctttttcctacacaatattaattacatttcttaatatgtgtgaaatgcccaaaacgtcgtatacaatttgggacggaggaagtaat |
10452904 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #124
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 231 - 465
Target Start/End: Original strand, 32467848 - 32468094
Alignment:
| Q |
231 |
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330 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
32467848 |
atttgtcccaaattatatgtcgctttacaatactaatgaaatattaatgttatttttcctattatatccttgactattaattactctctcttctttcaat |
32467947 |
T |
 |
| Q |
331 |
tcttttatttatctttttcat-----------aggacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatatg |
419 |
Q |
| |
|
| ||| |||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||| ||||||||||| | |
|
|
| T |
32467948 |
tatttcatttatctttcccatactatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttcttttccccacacaatattaattatatttcttaatacg |
32468047 |
T |
 |
| Q |
420 |
tgtgaaa-tgcccaaaacgtcatacaatttaggatgaagggagtaat |
465 |
Q |
| |
|
||||||| ||| ||||||||||||| ||| || | |||||||||| |
|
|
| T |
32468048 |
tgtgaaacggccaaaaacgtcatacattttgagacggagggagtaat |
32468094 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #125
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 188 - 352
Target Start/End: Complemental strand, 35421898 - 35421734
Alignment:
| Q |
188 |
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287 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||||| ||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| |
|
|
| T |
35421898 |
attactccctccgtcccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtctcaaattgtatgtcactttacaataccaatgaaaaattaatgttactttt |
35421799 |
T |
 |
| Q |
288 |
cctattataaccttaactatttattactctctcttctttcaagtcttttatttatctttttcata |
352 |
Q |
| |
|
||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||| |||| |
|
|
| T |
35421798 |
cctattatatccttaactatttattactctctcttctttcaattccttcatttatcttttccata |
35421734 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #126
Raw Score: 96; E-Value: 9e-47
Query Start/End: Original strand, 240 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 4503861 - 4503641
Alignment:
| Q |
240 |
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339 |
Q |
| |
|
||||| |||||| |||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||| | ||| ||| |
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| T |
4503861 |
aaattatatgtcgctttacaaaaccaatgaaatattaatgttacttttcctattatatccttaactattaattactccctcttctttcaattatttcatt |
4503762 |
T |
 |
| Q |
340 |
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427 |
Q |
| |
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| T |
4503761 |
tatcttttccataccatttattaagggataattttgtaaatcaactcataatttctcttccccacacaatattaattacatttcttaatacgtgtgaaat |
4503662 |
T |
 |
| Q |
428 |
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448 |
Q |
| |
|
| ||||||||| |||||||| |
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| T |
4503661 |
ggtcaaaacgtcgtacaattt |
4503641 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #127
Raw Score: 96; E-Value: 9e-47
Query Start/End: Original strand, 352 - 463
Target Start/End: Complemental strand, 28536740 - 28536629
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| Q |
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451 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
28536740 |
aggacaattttgtaaaacaactcataatatctctttcccacacaatattaattacatttcttaatatgtgtgaaatgtccaaaacgtcatacaatttagg |
28536641 |
T |
 |
| Q |
452 |
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463 |
Q |
| |
|
| | |||||||| |
|
|
| T |
28536640 |
acggagggagta |
28536629 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #128
Raw Score: 95; E-Value: 4e-46
Query Start/End: Original strand, 239 - 448
Target Start/End: Original strand, 23709608 - 23709828
Alignment:
| Q |
239 |
caaattgtatgtcactttacaataccaatgaaacattaatgttatttttcctattataaccttaactatttattactctctcttctttcaagtcttttat |
338 |
Q |
| |
|
|||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||| | ||| || |
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| T |
23709608 |
caaattatatgtcgctttacaataccaatgaaatatttatgttacttttcctattatatccttaactattaattactctctcatctttcaattatttcat |
23709707 |
T |
 |
| Q |
339 |
ttatctttttcata-----------ggacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatatgtgtgaaat |
427 |
Q |
| |
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| T |
23709708 |
ttatcttttccataccatttattagagataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacgcaatattaattatatttcttaatacgtgtgaaat |
23709807 |
T |
 |
| Q |
428 |
gcccaaaacgtcatacaattt |
448 |
Q |
| |
|
| |||||||||| |||||||| |
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|
| T |
23709808 |
ggccaaaacgtcttacaattt |
23709828 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #129
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 352 - 449
Target Start/End: Original strand, 13446140 - 13446237
Alignment:
| Q |
352 |
aggacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatatgtgtgaaatgcccaaaacgtcatacaattta |
449 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
13446140 |
aggacaattttgtaaaacaactcataatatctctttcccacacaatattaattacatttcttaatatgtgtgaaatgcccaaaacgtcatacaattta |
13446237 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #130
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 233 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 21849887 - 21849658
Alignment:
| Q |
233 |
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329 |
Q |
| |
|
||||| |||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| | || |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| |||| |
|
|
| T |
21849887 |
ttgtctcaaattatatgtcgttttacaataccaatgcaacattaatgttactatttctattagtataaccttaactatttattactatctcttctatcaa |
21849788 |
T |
 |
| Q |
330 |
gtcttttatttatctttttcata-----------ggacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatat |
418 |
Q |
| |
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|
| T |
21849787 |
tactttcatttatctttctcatattatttattaaggacaattttgtaaaacaactcataatatattttttccacacaattttaattgcatttcttaatat |
21849688 |
T |
 |
| Q |
419 |
gtgtgaaatgcccaaaacgtcatacaattt |
448 |
Q |
| |
|
||||||||| |||||||| |||||||||| |
|
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| T |
21849687 |
atgtgaaatgtccaaaacgccatacaattt |
21849658 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #131
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 352 - 461
Target Start/End: Complemental strand, 24923484 - 24923375
Alignment:
| Q |
352 |
aggacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatatgtgtgaaatgcccaaaacgtcatacaatttagg |
451 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |
|
|
| T |
24923484 |
aggacaattttgtaaaacaactcataatatctctttcccacacaatattaattacatttcttaatatgtgtgaaatgcccaaaacgtcatacaatttggg |
24923385 |
T |
 |
| Q |
452 |
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461 |
Q |
| |
|
| | |||||| |
|
|
| T |
24923384 |
acggagggag |
24923375 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #132
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 233 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 39961122 - 39960892
Alignment:
| Q |
233 |
ttgtcccaaattgtatgtcactttacaataccaatgaaacattaatgttatttttc-----ctattataaccttaactatttattactctctcttctttc |
327 |
Q |
| |
|
|||||| ||||| |||||| ||||||||||| ||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
39961122 |
ttgtcctaaattatatgtcgctttacaatacttatgcaacattaatgttttttttttttttctattataaccttaactatttattactctctcttctttt |
39961023 |
T |
 |
| Q |
328 |
aagtcttttatttatctttttcata-----------ggacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaatattaattacatttcttaat |
416 |
Q |
| |
|
|| ||||| |||||||||| ||||| | | |||||||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
39961022 |
aattcttt-atttatctttctcatattatttattaagaataattttgtaaaacatctcataatatcttttttccacgcaatattaattatatttcttaat |
39960924 |
T |
 |
| Q |
417 |
atgtgtgaaatgcccaaaacgtcatacaattt |
448 |
Q |
| |
|
|||||||||||| ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
39960923 |
atgtgtgaaatgtccaaaacgtcatacaattt |
39960892 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #133
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 231 - 465
Target Start/End: Complemental strand, 42808485 - 42808239
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| Q |
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atttgtcccaaattgtatgtcactttacaataccaatgaaacattaatgttatttttcctattataaccttaactatttattactctctcttctttcaag |
330 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||||| | |||| |||| |||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
42808485 |
atttgtcccaaattatatgtcgctttacaaaaccaatgaaatattaatgttacttttcctattatatcattaattattaattacttcctcttctttcaat |
42808386 |
T |
 |
| Q |
331 |
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418 |
Q |
| |
|
| ||| ||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |
|
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| T |
42808385 |
tatttcatttatcttttccataccatttattaagggataattttgtaaaacaattcataatttctcttccccacacaatattaattacatttcttaatac |
42808286 |
T |
 |
| Q |
419 |
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465 |
Q |
| |
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|||| ||||| ||||||| ||||||||||| | | | |||||||||| |
|
|
| T |
42808285 |
gtgtaaaatggccaaaacatcatacaatttggaacggagggagtaat |
42808239 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #134
Raw Score: 93; E-Value: 6e-45
Query Start/End: Original strand, 237 - 464
Target Start/End: Original strand, 32777853 - 32778091
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237 |
cccaaattgtatgtcactttacaataccaatgaaacattaatgttatttttcctattataaccttaactatttattactctctcttctttcaagtctttt |
336 |
Q |
| |
|
|||||||| || ||| |||||||| |||||||| || ||||| |||||||| ||||||| ||||||||| ||| |||||||||| ||||||| ||||| |
|
|
| T |
32777853 |
cccaaattataagtcgctttacaactccaatgaagcactaatgctatttttcttattatatccttaactaattaatactctctctactttcaattcttta |
32777952 |
T |
 |
| Q |
337 |
atttatctttttcata-----------ggacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatatgtgtgaa |
425 |
Q |
| |
|
||||||| || |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
32777953 |
atttatccttcccataccatttatgatggacgattttgtaaaacaactcataatatctctttcccatacataattaattacatttcttaatacgtgtgaa |
32778052 |
T |
 |
| Q |
426 |
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464 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||| |
|
|
| T |
32778053 |
atgcccaaaacgtcatataatttgggacgaagggagtaa |
32778091 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #135
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Query Start/End: Original strand, 276 - 463
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aatgttatttttcctattataaccttaactatttattactctctcttctttcaagtcttttatttatctttttcata-----------ggacaattttgt |
364 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||| |||||||||||| |
|
|
| T |
44452263 |
aatgttacttttcctattataaccttagttatttattactctctcttctttcaattctttcatttatctttcccatattatttattaaggacaattttgt |
44452362 |
T |
 |
| Q |
365 |
aaaacaactcataatatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatatgtgtgaaatgcccaaaacgtcatacaatttaggatgaagggagta |
463 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||| ||| | |||||||| |
|
|
| T |
44452363 |
aaaacaactcataatatctcttttccatacgatattaattgcatttcttaatatgtgtaaaatacttaaaacgtcatacaatttgggacggagggagta |
44452461 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #136
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 231 - 465
Target Start/End: Complemental strand, 10439438 - 10439194
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231 |
atttgtcccaaattgtatgtcactttacaataccaatgaaacattaatgttatttttcctattataaccttaactatttattactctctcttctttcaag |
330 |
Q |
| |
|
||||||| |||||| || ||| ||||||||||||||||||| |||| ||||| |||| |||||||| ||||||| |||| ||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
10439438 |
atttgtctcaaattatacgtcgctttacaataccaatgaaaaatta-tgttactttttctattatatccttaaccatttgttactctct--tctttcaat |
10439342 |
T |
 |
| Q |
331 |
tcttttatttatctttttcata-----------ggacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatatg |
419 |
Q |
| |
|
|| || |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
10439341 |
tccttcatttatctttcccatatcatttattgaggacaattttgtaaaacaactcataatatctttttcctacacaatattaattacatttcttaatatg |
10439242 |
T |
 |
| Q |
420 |
tgtgaaatgcccaaaacgtc--atacaatttaggatgaagggagtaat |
465 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||| ||||||||| ||| | ||| |||||| |
|
|
| T |
10439241 |
tgtgaaatgcccaaaacgtcgtatacaatttgggacggaggaagtaat |
10439194 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #137
Raw Score: 91; E-Value: 9e-44
Query Start/End: Original strand, 190 - 352
Target Start/End: Complemental strand, 28537042 - 28536880
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289 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
28537042 |
tactccctccgtcccaaattgtatgtcattttagaaaaaatatttgtctcaaattatatgtcgctttacaataccaatgaaaaattaatgttatttttcc |
28536943 |
T |
 |
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290 |
tattataaccttaactatttattactctctcttctttcaagtcttttatttatctttttcata |
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| |
|
||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| || || |||||||||| ||||| |
|
|
| T |
28536942 |
tattatatccttaactatttattgctctctcttctttcaattccttcatttatctttctcata |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #138
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296 |
Q |
| |
|
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|
|
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tccgtcccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcgctttacaataccaatgaaaaattaatgttacttttcctattata |
40768652 |
T |
 |
| Q |
297 |
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385 |
Q |
| |
|
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|
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| T |
40768651 |
tccttaactatttattactctctcttatttcaattccttcatttatctttcccatatcatttattgaagacaattttgtaaaacaactcataatatctct |
40768552 |
T |
 |
| Q |
386 |
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397 |
Q |
| |
|
|| ||| ||||| |
|
|
| T |
40768551 |
ttcccatacaat |
40768540 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #139
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Target Start/End: Complemental strand, 41887809 - 41887585
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332 |
Q |
| |
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|||||||||||| |||||| ||||| |||| ||| | || |||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||| || |
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| T |
41887809 |
ttgtcccaaattatatgtcgctttaaaatatcaaggcaatattaatgttacttttcctattataactttaattatttattactctct--tctttcaattc |
41887712 |
T |
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| Q |
333 |
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421 |
Q |
| |
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||| |||||| ||| |||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |
|
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| T |
41887711 |
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41887612 |
T |
 |
| Q |
422 |
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448 |
Q |
| |
|
||||||| |||||||||||| ||||| |
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| T |
41887611 |
tgaaatgttcaaaacgtcatataattt |
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #140
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Target Start/End: Complemental strand, 42149771 - 42149602
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tatttattactctctcttctttcaagtcttttatttatctttttcata-----------ggacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccaca |
393 |
Q |
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|
| T |
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tatttattactctctcttctttcaattctttcatttatctttcccatattatttattaaggacaattttgtaaaacaaatcataatatctcttttccaca |
42149672 |
T |
 |
| Q |
394 |
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463 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||| ||| | |||||||| |
|
|
| T |
42149671 |
caatattaattacatttcttaatatgtgtaaaattcccaaaacgtcgtacaatttgggacggagggagta |
42149602 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #141
Raw Score: 88; E-Value: 6e-42
Query Start/End: Original strand, 233 - 463
Target Start/End: Original strand, 45042017 - 45042258
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233 |
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332 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| | || |||||||||| | ||||| ||| |||||| |
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| T |
45042017 |
ttgtcccaaattgtatgtcgctttagaataccaatgaatcattaatgttacttttcctattatatcattcactatttattgccttctctacttccaagtc |
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T |
 |
| Q |
333 |
ttttatttatctttttcat-----------aggacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatatgtg |
421 |
Q |
| |
|
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| T |
45042117 |
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45042216 |
T |
 |
| Q |
422 |
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463 |
Q |
| |
|
| ||||| |||||| ||||| ||||| ||| | |||||||| |
|
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| T |
45042217 |
taaaatgttcaaaacatcatataatttgggacggagggagta |
45042258 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #142
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Query Start/End: Original strand, 249 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 24166835 - 24166625
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348 |
Q |
| |
|
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T |
 |
| Q |
349 |
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437 |
Q |
| |
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||| || |||||||||||||| |||| ||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| |
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| T |
24166735 |
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24166636 |
T |
 |
| Q |
438 |
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448 |
Q |
| |
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|| |||||||| |
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| T |
24166635 |
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T |
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Target: chr7; HSP #143
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Query Start/End: Original strand, 352 - 466
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451 |
Q |
| |
|
||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || |
|
|
| T |
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aggacaattttataaaacaactcataatatctctttcccacacaatattaattatattttttaatatgtgtgaaatgtccaaaacgtcatacaatttggg |
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T |
 |
| Q |
452 |
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Q |
| |
|
| | ||||||||||| |
|
|
| T |
46944497 |
acggagggagtaatt |
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T |
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Target: chr7; HSP #144
Raw Score: 81; E-Value: 8e-38
Query Start/End: Original strand, 190 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 24924453 - 24924297
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289 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||| ||||||||||||| ||| |||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |
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|
| T |
24924453 |
tactccctccgtcccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtctcaatttgtatgtcgctttacaataccaatgaaaaattaatgttattttttc |
24924354 |
T |
 |
| Q |
290 |
tattataaccttaactatttattactctctcttctttcaagtcttttatttatcttt |
346 |
Q |
| |
|
||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| || || |||||||||| |
|
|
| T |
24924353 |
tattatatccttaactatttattactttctcttctttcaattccttcatttatcttt |
24924297 |
T |
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Target: chr7; HSP #145
Raw Score: 78; E-Value: 5e-36
Query Start/End: Original strand, 231 - 415
Target Start/End: Original strand, 30803325 - 30803519
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330 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||| || ||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
30803325 |
atttgtcccaaattatatgtcgctttacaataccaatgaaatatttatattacttttcctattatatccttaactattaattactctctcttctttcaat |
30803424 |
T |
 |
| Q |
331 |
tcttttatttatctttttcata-----------ggacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaatattaattacatttcttaa |
415 |
Q |
| |
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| ||| ||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||| || || | |||| |||||||||||| ||||||||| |
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| T |
30803425 |
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T |
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Target: chr7; HSP #146
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Target Start/End: Original strand, 35341239 - 35341364
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Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
35341239 |
cttagatcaagtggccataagactctgaagcaccgattcatagaccgacacttgacaatgccaaaagcatatatatttgttgaaaaagacaatgtcaata |
35341338 |
T |
 |
| Q |
166 |
ctataataatttgagaaaataaatta |
191 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
35341339 |
ctataataatttgagaaaataaatta |
35341364 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #147
Raw Score: 78; E-Value: 5e-36
Query Start/End: Original strand, 352 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 39693915 - 39693821
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| Q |
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448 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
39693915 |
aggacaattttgtaaaacaactcataatatctctttttcacacaatattaattgcatttcttaata--tgtgaaatgcccaaaacgtcatacaattt |
39693821 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #148
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 352 - 464
Target Start/End: Original strand, 27045226 - 27045338
Alignment:
| Q |
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451 |
Q |
| |
|
|||| ||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
27045226 |
aggataattttgtaaaacaacttataatatcgctttcccacacaatattaattatatttcttaatatgtatgaaatatccaaaacgtcatacaatttagg |
27045325 |
T |
 |
| Q |
452 |
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464 |
Q |
| |
|
||| ||||||||| |
|
|
| T |
27045326 |
atggagggagtaa |
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #149
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 233 - 463
Target Start/End: Original strand, 46342777 - 46343019
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332 |
Q |
| |
|
||||| |||||| || ||| ||||||||||||| ||||||| |||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||| ||| | ||||||||| || |
|
|
| T |
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ttgtcacaaattataagtcgctttacaataccattgaaacagtaatgttactttttctattataaccttgactatttattgttctattttctttcaattc |
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T |
 |
| Q |
333 |
ttttatttatctttttca-----------taggacaattttgtaaaacaactcata--atatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatatg |
419 |
Q |
| |
|
||| ||||||||||| || ||||||||||| |||||||| | ||| |||||||||| || |||| |||||||||||||||||||| | |
|
|
| T |
46342877 |
tttaatttatcttttccacaacatttattaaggacaattttttaaaacaagt-ataatatatctctttcccgtacaaaattaattacatttcttaatacg |
46342975 |
T |
 |
| Q |
420 |
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463 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
46342976 |
tgtgaaatgcccaaaacgtcatataatttgggatggaggaagta |
46343019 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #150
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 233 - 464
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233 |
ttgtcccaaattgtatgtcactttacaataccaatgaaacattaatgttatttttcctattataaccttaactatttattactctctcttctttcaagtc |
332 |
Q |
| |
|
|||||| ||||| |||||| ||||||||| ||||| | ||||||||||||||| ||||||||| ||| | ||||||||||||| |||||||| || |
|
|
| T |
8566000 |
ttgtcctaaattatatgtcgttttacaatatcaatgcataattaatgttattttttctattataattttagccgtttattactctct--tctttcaattc |
8565903 |
T |
 |
| Q |
333 |
ttttatttatctttttcata-----------ggacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatatgtg |
421 |
Q |
| |
|
||| |||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||| |
|
|
| T |
8565902 |
tttcatttatttttcccatattatttattaaggacaattttgtaaaacaactaataatatatcttttctacacaatattaattgtatttcttaatacgtg |
8565803 |
T |
 |
| Q |
422 |
tgaaatgcccaaaacgtcatacaatttaggatgaagggagtaa |
464 |
Q |
| |
|
| |||| | |||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |
|
|
| T |
8565802 |
taaaatacacaaaacgtcatacaatttgggatggagggagtaa |
8565760 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #151
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 230 - 463
Target Start/End: Complemental strand, 26913833 - 26913581
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| Q |
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tatttgtcccaaattgtatgtcactttacaata----ccaatgaaacattaatgttatttttcctattataaccttaactatttattactctctcttctt |
325 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| |||||| |||| ||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
26913833 |
tatttgtcccaaattatatgtcgctttgcaatatataccaataaaatattaatgttatttttcctattatatctttaactatttattact--ctcttctt |
26913736 |
T |
 |
| Q |
326 |
tcaagtcttttatttatctttttcat-----------aggacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaa------tattaattacat |
408 |
Q |
| |
|
|||| || || |||||||||| |||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
26913735 |
tcaattccttcatttatctttctcatatcatttattaagaataattttgtaaaacaactcataatatctctttcccacacaatatatttattaattacat |
26913636 |
T |
 |
| Q |
409 |
ttcttaatatgtgtgaaatgcccaaaacgtcatacaatttaggatgaagggagta |
463 |
Q |
| |
|
||||||| ||| ||||||| |||||| ||||| ||||||||| | |||||||| |
|
|
| T |
26913635 |
ttcttaaaatgcgtgaaataatcaaaacatcatataatttaggacggagggagta |
26913581 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #152
Raw Score: 73; E-Value: 5e-33
Query Start/End: Original strand, 352 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 25651066 - 25650970
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448 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||| |
|
|
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25651066 |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
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336 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||| |||| |||| |||||||| |||||| ||||||||| ||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
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cccaaattacatgtcgttttataatatcaatgaaatattaat-ttatttttcttattatatctttaactatttattacttcttcttctttcaattctttc |
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T |
 |
| Q |
337 |
atttatctttttcata-----------ggacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatatgtgtgaa |
425 |
Q |
| |
|
||||||||| || || ||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |
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|
| T |
42259272 |
ttttatctttctcgtatcatttattaaggacaattttgtaaaacgacttataatatctgtttcctacacaatattaattaaatttcttaatatgtgtgaa |
42259371 |
T |
 |
| Q |
426 |
atgcccaaaacgtcatacaattt |
448 |
Q |
| |
|
||| |||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
42259372 |
atgtccaaaacgacatacaattt |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #154
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 352 - 447
Target Start/End: Original strand, 9140745 - 9140840
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447 |
Q |
| |
|
||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
9140745 |
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9140840 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #155
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Query Start/End: Original strand, 190 - 342
Target Start/End: Original strand, 13439317 - 13439469
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190 |
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289 |
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| |
|
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|
|
| T |
13439317 |
tactccctccgtcccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattatacgtcgctttacaataccaatgaaaaattaatgttacttttca |
13439416 |
T |
 |
| Q |
290 |
tattataaccttaactatttattactctctcttctttcaagtcttttatttat |
342 |
Q |
| |
|
||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||| || || |||||| |
|
|
| T |
13439417 |
tattatatccttaattatttattactatctcttctttcaattccttcatttat |
13439469 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #156
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 352 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 22369046 - 22368950
Alignment:
| Q |
352 |
aggacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatatgtgtgaaatgcccaaaacgtcatacaattt |
448 |
Q |
| |
|
|||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
22369046 |
aggataattttgtaaaacaattcataatatttctttcccacacaatattaattacatttcttaatatgtgtgaaatgctcaaaatatcatacaattt |
22368950 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #157
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 240 - 427
Target Start/End: Complemental strand, 27131549 - 27131351
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| Q |
240 |
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339 |
Q |
| |
|
||||| || |||||||| |||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||| ||| |||| |||| | ||||||| |
|
|
| T |
27131549 |
aaattataagtcactttgcaataccaatgaaaaattaatgttactttttctattatacagttaactatttattattcttctttctctcaatttttttatt |
27131450 |
T |
 |
| Q |
340 |
tatctttttcata-----------ggacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatatgtgtgaaat |
427 |
Q |
| |
|
||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
27131449 |
tatctttctcatactatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatctctttcctacacaaaattaattatatttcttaatacgtgtgaaat |
27131351 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #158
Raw Score: 68; E-Value: 5e-30
Query Start/End: Original strand, 233 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 26941420 - 26941214
Alignment:
| Q |
233 |
ttgtcccaaattgtatgtcactttacaataccaatgaaacattaatgttatttttcctattataaccttaactatttattactctctcttctttcaagtc |
332 |
Q |
| |
|
|||||| ||||| || ||| ||||||| || |||| |||||||||| ||| ||||||||||||| | |||||||||||||||| | ||||||||||| | |
|
|
| T |
26941420 |
ttgtccaaaattatacgtcgctttacactatcaataaaacattaattttacttttcctattatatctttaactatttattactttatcttctttcaatta |
26941321 |
T |
 |
| Q |
333 |
ttttatttatctttt-----tcat------aggacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatatgtg |
421 |
Q |
| |
|
||| ||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||| ||||||| | |||| || |||| |||||||||||||||||||| ||| |
|
|
| T |
26941320 |
tttaatttatcttttacttatcatttattaaggacaactttgtaaaacaacttataatatatatttttcatacaagattaattacatttcttaatacgtg |
26941221 |
T |
 |
| Q |
422 |
tgaaatg |
428 |
Q |
| |
|
||||||| |
|
|
| T |
26941220 |
tgaaatg |
26941214 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #159
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 299 - 448
Target Start/End: Original strand, 4089650 - 4089810
Alignment:
| Q |
299 |
cttaactatttattactctctcttctttcaagtcttttatttatctttttcatag-----------gacaattttgtaaaacaactcataatatctcttt |
387 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||| ||| |
|
|
| T |
4089650 |
cttaactatttattactatctcttcattcaattcttttatttttctttttcatactatttattaacgataattttgcaaaacaactcataatatcttttt |
4089749 |
T |
 |
| Q |
388 |
tccacacaatattaattacatttcttaatatgtgtgaaatgcccaaaacgtcatacaattt |
448 |
Q |
| |
|
|||| |||| |||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
4089750 |
tccatacaaaattaattacatttcttaatacgtatgaaatatccaaaacgtcatacaattt |
4089810 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #160
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 190 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 25651268 - 25651150
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| Q |
190 |
tactccatccgtcctaaattgtatgtcattttnnnnnnnntatttgtcccaaattgtatgtcactttacaataccaatgaaacattaatgttatttttcc |
289 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||| |
|
|
| T |
25651268 |
tactccctccgtcctaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttgcaataccaatgaaacattaattttacttttcc |
25651169 |
T |
 |
| Q |
290 |
tattataaccttaactatt |
308 |
Q |
| |
|
||||||| | ||||||||| |
|
|
| T |
25651168 |
tattatatctttaactatt |
25651150 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #161
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 231 - 323
Target Start/End: Original strand, 41820903 - 41820995
Alignment:
| Q |
231 |
atttgtcccaaattgtatgtcactttacaataccaatgaaacattaatgttatttttcctattataaccttaactatttattactctctcttc |
323 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
41820903 |
atttgtcccaaattatatgtcgttttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataacattaactatttattactctatcttc |
41820995 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #162
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 390 - 463
Target Start/End: Complemental strand, 35421732 - 35421659
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| Q |
390 |
cacacaatattaattacatttcttaatatgtgtgaaatgcccaaaacgtcatacaatttaggatgaagggagta |
463 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| | |||||||| |
|
|
| T |
35421732 |
cacacaatattaattacatttcttaatatgtgtgaaatgtccaaaacgtcatacaatttgggacggagggagta |
35421659 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #163
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 233 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 24729732 - 24729636
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| Q |
233 |
ttgtcccaaattgtatgtcactttacaataccaatgaaacattaatgttatttttcctattataaccttaactatttattactctctcttctttcaa |
329 |
Q |
| |
|
||||||||| || ||||| |||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
24729732 |
ttgtcccaacttatatgttgttttacaataccagtgaaatattaatgttacttttcctattatatctttaactatttattactctctcttctttcaa |
24729636 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #164
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 239 - 329
Target Start/End: Original strand, 42520123 - 42520213
Alignment:
| Q |
239 |
caaattgtatgtcactttacaataccaatgaaacattaatgttatttttcctattataaccttaactatttattactctctcttctttcaa |
329 |
Q |
| |
|
|||||| || ||| |||||||||| || |||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
42520123 |
caaattataagtcgctttacaatatcattgaaacattaatgttacttttcctataatacccttaactatttattactctttcttctttcaa |
42520213 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #165
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 233 - 342
Target Start/End: Original strand, 8670413 - 8670522
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| Q |
233 |
ttgtcccaaattgtatgtcactttacaataccaatgaaacattaatgttatttttcctattataaccttaactatttattactctctcttctttcaagtc |
332 |
Q |
| |
|
||||| |||||| || ||| ||||||||||| ||| ||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| || |
|
|
| T |
8670413 |
ttgtctcaaattatacgtcgctttacaatacaaataaaatattaatgttacttttcctattatattcttaactatttattactatctcttctttcaattc |
8670512 |
T |
 |
| Q |
333 |
ttttatttat |
342 |
Q |
| |
|
|| |||||| |
|
|
| T |
8670513 |
cttcatttat |
8670522 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #166
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 254 - 465
Target Start/End: Original strand, 39003956 - 39004178
Alignment:
| Q |
254 |
tttacaataccaatgaaacattaatgttatttttcctattataaccttaacta-tttattactctctcttctttcaagtcttttatttatctttttcat- |
351 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| | ||| || ||||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||| |||||| ||||| |||||||||| ||| |
|
|
| T |
39003956 |
tttacaataccaatgaaacttaaataatacttttcctattatacccttaactattttattactttctcttatttcaattctttaatttatctttcccata |
39004055 |
T |
 |
| Q |
352 |
----------aggacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatatgtgtgaaatgcccaaaacgtcat |
441 |
Q |
| |
|
| |||||||||||||||||| ||||| ||||| ||| ||| |||| |||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| | | |
|
|
| T |
39004056 |
ccatttattaaagacaattttgtaaaacaagtcatagtatct-tttcccatacaaaattaattacatttcataatacacgtgaaatgaccaaaacgactt |
39004154 |
T |
 |
| Q |
442 |
acaatttaggatgaagggagtaat |
465 |
Q |
| |
|
| ||||| ||| | |||||||||| |
|
|
| T |
39004155 |
ataatttgggacggagggagtaat |
39004178 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #167
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 385 - 460
Target Start/End: Original strand, 41821006 - 41821081
Alignment:
| Q |
385 |
ttttccacacaatattaattacatttcttaatatgtgtgaaatgcccaaaacgtcatacaatttaggatgaaggga |
460 |
Q |
| |
|
||||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||| |
|
|
| T |
41821006 |
ttttccacataatattaattgcatttcttaatatatgtgaaatgcccaaaacatcatacaatttgggatggaggga |
41821081 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #168
Raw Score: 51; E-Value: 7e-20
Query Start/End: Original strand, 239 - 352
Target Start/End: Original strand, 12848251 - 12848365
Alignment:
| Q |
239 |
caaattgtatgtcactttacaataccaatgaaacattaatgttatttttcctattataaccttaactatttattactc-tctcttctttcaagtctttta |
337 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||| ||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||||| | | || |||||| ||||| | |
|
|
| T |
12848251 |
caaattatatgtcaatttacaatatcaataaaacattaatattatttttcctattatatctctaactatttattactctttttttttttcaattctttaa |
12848350 |
T |
 |
| Q |
338 |
tttatctttttcata |
352 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||| |
|
|
| T |
12848351 |
tttatctttctcata |
12848365 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #169
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 233 - 294
Target Start/End: Original strand, 4089299 - 4089360
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| Q |
233 |
ttgtcccaaattgtatgtcactttacaataccaatgaaacattaatgttatttttcctatta |
294 |
Q |
| |
|
|||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
4089299 |
ttgtcccaaattatatgtagctttacaataccaatgaaacattaatgttatttttcctatta |
4089360 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #170
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 395 - 448
Target Start/End: Original strand, 17196433 - 17196486
Alignment:
| Q |
395 |
aatattaattacatttcttaatatgtgtgaaatgcccaaaacgtcatacaattt |
448 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
17196433 |
aatattaattacatttcttaatatgtgtgaaatgtccaaaacgtcatacaattt |
17196486 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #171
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 354 - 460
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| Q |
354 |
gacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatatgtgtgaaatgcccaaaacgtcatacaatttaggat |
453 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||| |||| |||||| | ||||||| ||||| || | || ||||| |||| |
|
|
| T |
7170834 |
gacaattttgtaaaacaactcataatatcttttttccatacaaaattaattatattttttaatacgcgtgaaataaccaaagcgacttataatttgggat |
7170933 |
T |
 |
| Q |
454 |
gaaggga |
460 |
Q |
| |
|
| ||||| |
|
|
| T |
7170934 |
ggaggga |
7170940 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #172
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 352 - 454
Target Start/End: Original strand, 31542496 - 31542598
Alignment:
| Q |
352 |
aggacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatatgtgtgaaatgcccaaaacgtcatacaatttagg |
451 |
Q |
| |
|
|||| |||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||| | ||||||||| |||| ||||| ||||| || |
|
|
| T |
31542496 |
aggaaaattttataaaacaattcataatatctctttcccacacaaaattaattatatttcttaatagatatgaaatgcctaaaatatcatataatttggg |
31542595 |
T |
 |
| Q |
452 |
atg |
454 |
Q |
| |
|
||| |
|
|
| T |
31542596 |
atg |
31542598 |
T |
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Back To:
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Target: chr7; HSP #173
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| Q |
258 |
caataccaatgaaacattaatgttatttttcctattataaccttaactatttattactctctcttctttcaagtcttttatttatctttttca |
350 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| || ||||||| ||||| ||||||| | |||||||||||||||| | | ||||||||| ||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
6202914 |
caataccaatgaaatatgaatgttacttttcttattatatctttaactatttattactttattttctttcaattctttcgtttatctttttca |
6203006 |
T |
 |
Back To:
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Target: chr7; HSP #174
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
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| Q |
355 |
acaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatatgtgtgaaatgcccaaaacgtcata |
442 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||| |||||||| |||||| ||||| | ||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
3340708 |
acaattttgtaaaacaatacataatatctctttcccatacaa-attaattatatttctaaatatatttgaaatgaccaaaacgtcata |
3340622 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #175
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| Q |
354 |
gacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatatgtgtgaaatgcccaaaacg |
437 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||| |||||| ||||||||| | |||||| |
|
|
| T |
21746892 |
gacaattttgtaaaataactcataatatcttttttccatacaaaattaattacattt-ttaatacatgtgaaatgactaaaacg |
21746810 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #176
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| Q |
352 |
aggacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatatgtgtgaaat |
427 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
28696216 |
aggacaattttgtaaaacaactcataatat-ttttttccgaacaaaattaattacatttcttaatacatgtgaaat |
28696142 |
T |
 |
Back To:
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Target: chr7; HSP #177
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| Q |
275 |
taatgttatttttcctattataaccttaactatttattactctctcttctttcaagtcttttatttat |
342 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||| |
|
|
| T |
42521416 |
taatgttacttttcctataatacccttaactatttattactctttcttctttcaattctttaatttat |
42521483 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #178
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| Q |
352 |
aggacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatatgtgtgaaatgcccaaaacgtcatacaattta |
449 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||| | ||| || |||| |||||||| ||||||||||| |||||| || |||||| | |||| |||||| |
|
|
| T |
553946 |
aggacaattttgtaaaacaactcataatatttatttctcatacaaaattaattatatttcttaatacgtgtgagatatccaaaatgccatataattta |
554043 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #179
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| Q |
231 |
atttgtcccaaattgtatgtcactttacaataccaatgaaacattaatgttatttttcctattata |
296 |
Q |
| |
|
|||||| | ||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
10200548 |
atttgttctaaattatatgttgctttacaatatcaatgaaacattaatgttatttttcctattata |
10200483 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #180
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Target Start/End: Original strand, 27299802 - 27299882
Alignment:
| Q |
354 |
gacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatatgtgtgaaatgcccaaaa |
435 |
Q |
| |
|
|||| |||||||||||||||||||||| || ||||||| |||| |||||||| ||||||||||| | |||||||| |||||| |
|
|
| T |
27299802 |
gacacttttgtaaaacaactcataata-cttttttccatacaaaattaattagatttcttaatacgagtgaaatgtccaaaa |
27299882 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #181
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Target Start/End: Complemental strand, 48841272 - 48841063
Alignment:
| Q |
233 |
ttgtcccaaattgtatgtcactttacaataccaatgaaacattaatgttatttttcctattataaccttaactatt---tattactctctcttctttcaa |
329 |
Q |
| |
|
|||||| ||||| | | ||| ||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||| ||||||| |||||| |||| ||||||||| | || |||||| |
|
|
| T |
48841272 |
ttgtcctaaattatctttcattttacaatatcaatgaagcattaatgttaattttcttattatatccttaattatttagtattactctatattatttcaa |
48841173 |
T |
 |
| Q |
330 |
gtcttttatttatctttttcata-----------ggacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatat |
418 |
Q |
| |
|
||||| |||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||| |||||| || || |||| |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
48841172 |
ttctttaatttatctttcacataccatttattagggacaatttaaaaaaacaactcatagtatctcattctcatacaaaattaattacatttcttaatac |
48841073 |
T |
 |
| Q |
419 |
gtgtgaaatg |
428 |
Q |
| |
|
|||| ||||| |
|
|
| T |
48841072 |
gtgtaaaatg |
48841063 |
T |
 |
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| Q |
355 |
acaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatatgtgtgaaat |
427 |
Q |
| |
|
|||||||| |||||||||||| ||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||| |||| |||| |
|
|
| T |
3783780 |
acaattttataaaacaactcaaaatatctatttctcatacaatattaattacatttcttaatacgtgtaaaat |
3783852 |
T |
 |
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Target: chr7; HSP #183
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| Q |
352 |
aggacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatatgtgtgaaat-gcccaaaacgtcatacaatttag |
450 |
Q |
| |
|
|||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||| |||| |||||||| |||| |||||| ||||||||| | ||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
8251819 |
aggataattttgtaaaacaactcataatatctccgtcccatacaaaattaattatattttttaatacgtgtgaaatatgcaaaaacgtcatataatttag |
8251918 |
T |
 |
| Q |
451 |
gatgaagggagta |
463 |
Q |
| |
|
||| ||| |||| |
|
|
| T |
8251919 |
aatggaggaagta |
8251931 |
T |
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| Q |
352 |
aggacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatatgtgtgaaatgcccaaaacgtcatacaatttagg |
451 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||| ||||||||||||| |||||| || || ||| ||||||| || |||| |||| |
|
|
| T |
17230855 |
aggacaattttgtaaaacaacttataatatctttttcgaacacaaaattaattacatttattaatacgtatggaatatccaaaacatcgtacattttaaa |
17230954 |
T |
 |
| Q |
452 |
atgaagggagta |
463 |
Q |
| |
|
||||| |||||| |
|
|
| T |
17230955 |
atgaaaggagta |
17230966 |
T |
 |
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| Q |
393 |
acaatattaattacatttcttaatatgtgtgaaatgcccaaaacgtcatacaatttaggatgaagggagtaattta |
468 |
Q |
| |
|
|||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||| || ||||||||| || ||||||||||| |
|
|
| T |
27689161 |
acaaaattaattatatttcttaatacgtgtgaaatgctcaaaacgtcttataatttaggacaaatggagtaattta |
27689086 |
T |
 |
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| Q |
401 |
aattacatttcttaatatgtgtgaaatgcccaaaacgtcatacaatttagga |
452 |
Q |
| |
|
||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
30265077 |
aattatattttttaatatgtgtgaaatgtccaaaacgtcatacaatttagga |
30265128 |
T |
 |
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| Q |
254 |
tttacaataccaatgaaacattaatgttatttttcctattataaccttaactatttattactctctcttctttcaagtcttttatttatctttt |
347 |
Q |
| |
|
||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||| | ||| |||||||||| ||||| |||||| |||| |
|
|
| T |
14314632 |
tttacaatatcaatgaaatattaatgttattttttctattatactcataactatttatga--ctcccttctttcaattctttaatttatttttt |
14314723 |
T |
 |
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| Q |
359 |
ttttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatatgtgtgaaatgcccaaaacgtcatacaattta |
449 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||| |||| |||||| | ||||||| ||||||| |||| |||||| |
|
|
| T |
21106085 |
ttttgtaaaacaactcataatatctctttttcatacaaaattaatta-attttttaatacatatgaaatgaacaaaacggcatataattta |
21105996 |
T |
 |
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| Q |
233 |
ttgtcccaaattgtatgtcactttacaataccaatgaaacattaatgttatttttcct |
290 |
Q |
| |
|
|||||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
9140636 |
ttgtcccaaattatatgtcattttacaataccaataaaatattaatgttacttttcct |
9140693 |
T |
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Target: chr7; HSP #190
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| Q |
352 |
aggacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatatgtg |
421 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||| | || ||||||||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
40065504 |
aggacaattttgtaaaacaattcataatatctttttcccata-aaaattaattacatttcttaatgtgtg |
40065436 |
T |
 |
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| Q |
264 |
caatgaaacattaatgttatttttcctattataaccttaactatttattactctctcttctttcaagtcttttatttatctttttcata |
352 |
Q |
| |
|
||||||| |||||||||| |||| |||||||| | |||| ||||||||||| | |||||||| || ||||| ||||||| |||||||| |
|
|
| T |
18517184 |
caatgaagtattaatgttaatttttctattatatcattaattatttattactttatcttctttgaattctttcatttatcgttttcata |
18517272 |
T |
 |
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| Q |
246 |
tatgtcactttacaata-ccaatgaaacattaatgttatttttcctattataaccttaactatttattactctctcttctttcaa |
329 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||| | | ||||| || |||||||| |||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
34302494 |
tatgtcactttacaatatccaatgaaacattaatgattcttttcttgtcataacatttactatttagtactctctattctttcaa |
34302578 |
T |
 |
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| Q |
276 |
aatgttatttttcctattataaccttaactatttattactctctcttctttcaagtcttttatttatctttt |
347 |
Q |
| |
|
|||||| ||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| || | |||| |||||||||| |
|
|
| T |
508982 |
aatgttgttttttctattatatctttaactatttattactctctcttcttttaa-ttttttgtttatctttt |
508912 |
T |
 |
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| Q |
357 |
aattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatatgtgtgaaatgcccaaaacgtcatacaattt |
448 |
Q |
| |
|
||||||||||||| ||| ||||| |||||||| || |||| |||| ||||| |||||||| ||||| ||||| |||||| ||||| ||||| |
|
|
| T |
2344890 |
aattttgtaaaactacttataatttctctttttcatacaacattatttacacttcttaatttgtgtaaaatgatcaaaacatcatataattt |
2344799 |
T |
 |
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Target: chr7; HSP #195
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| Q |
243 |
ttgtatgtcactttacaataccaatgaaacattaatgtta |
282 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
7399750 |
ttgtatgtcactttacaatatcaatgaaacattaatgtta |
7399789 |
T |
 |
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Target: chr7; HSP #196
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| Q |
247 |
atgtcactttacaataccaatgaaacattaatgttatttttcctattataaccttaactatttattac |
314 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||||||||||||| |||||||| || ||||| ||||||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
21747009 |
atgtcagtttacaataccaatgaatcattaatgctacttttcttattatacttttaactatttattac |
21746942 |
T |
 |
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| Q |
254 |
tttacaataccaatgaaacattaatgttatttttcctattataaccttaactatttattactctctcttctttcaagtcttttatttatcttt |
346 |
Q |
| |
|
|||||||||||| |||| ||||||||| ||||| |||| |||||||||| ||||||||| |||| | |||||| ||||| |||||||||| |
|
|
| T |
9407696 |
tttacaataccattgaattattaatgttgttttttctat---aaccttaactctttattactttctcatttttcaattctttaatttatcttt |
9407785 |
T |
 |
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| Q |
361 |
ttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatatgtgtgaaatgcccaaaacgtcatacaatttaggatgaaggga |
460 |
Q |
| |
|
||||||||||| | ||||||||| |||| || |||| |||||||| ||||||||||| || ||||||| ||||| ||| || ||||||| | ||| ||| |
|
|
| T |
21553543 |
ttgtaaaacaattaataatatctatttttcatacaaaattaattatatttcttaataagtatgaaatgttcaaaatgtcttataatttagaacgaacgga |
21553642 |
T |
 |
| Q |
461 |
gta |
463 |
Q |
| |
|
||| |
|
|
| T |
21553643 |
gta |
21553645 |
T |
 |
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235 |
gtcccaaattgtatgtcactttacaataccaatgaaacattaatgttatttttcctattataaccttaactatttattactct |
317 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| || ||||| | || | ||||||||||||| ||| |||| ||||||| ||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
27045097 |
gtcccaaattgtatatcgctttatactatcgatgaaacattaattttacttttaatattatatccttagctatttattactct |
27045179 |
T |
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| Q |
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acaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatatgtgtgaaatg |
428 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||| |||||||||||| | ||| || | || ||||||||||||||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
3336946 |
acaattttttaaaataactcataatatatttttcacatataaaattaattacatttcttaatatgtttgaaatg |
3336873 |
T |
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caattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatatgtgtgaaatgcccaaaacg |
437 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| |||||| | |||| || | || |||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
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caattttgtaaaacaacttataatagttatttttcatataaaattagttacatttcttaatacgtgtgaaatgagcaaaacg |
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T |
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aaattgtatgtcactttacaataccaatgaaacattaatgttatttttcctattataaccttaactatttattactct |
317 |
Q |
| |
|
||||| || |||| |||| |||| |||| ||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
14200506 |
aaattataagtcattttataataacaataaaatattaatgttatttttcctattttacttttaactatttattactct |
14200583 |
T |
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| Q |
356 |
caattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatatgtgtgaaatgcccaaaacg |
437 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| |||||| | |||| || | || |||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
14364207 |
caattttgtaaaacaacttataatagttatttttcatataaaattagttacatttcttaatacgtgtgaaatgagcaaaacg |
14364126 |
T |
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| Q |
352 |
aggacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaatattaattacatttcttaata |
417 |
Q |
| |
|
|||| |||||| ||||||||||||||||| | ||| || ||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
22603985 |
aggataattttataaaacaactcataatacatatttcccccacaaaattaattacatttcttaata |
22604050 |
T |
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254 |
tttacaataccaatgaaacattaatgttatttttcctattataaccttaactat----ttattactctctcttctttcaagtcttttatttatctttttc |
349 |
Q |
| |
|
|||||||||||| ||||||||| |||||| |||| ||| |||| | |||||||| |||||| ||| ||||||||||| | ||| |||||||||| || |
|
|
| T |
33746127 |
tttacaataccagtgaaacattcatgttaatttttctagtatacctttaactatttaattattattctatcttctttcaattatttaatttatctttctc |
33746226 |
T |
 |
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350 |
ata |
352 |
Q |
| |
|
||| |
|
|
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ata |
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| |
|
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|
|
| T |
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caataccaatgaagtatgagtgttacttttcttattatatctttaactatttattacattattttctttcaattttttcatttatctttttca |
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T |
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Query Start/End: Original strand, 258 - 350
Target Start/End: Original strand, 6193035 - 6193127
Alignment:
| Q |
258 |
caataccaatgaaacattaatgttatttttcctattataaccttaactatttattactctctcttctttcaagtcttttatttatctttttca |
350 |
Q |
| |
|
||||||||||||| || | ||||| ||||| ||||||| | ||||||||||||||| | | ||||||||| | ||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
6193035 |
caataccaatgaagtatgagtgttacttttcttattatatctttaactatttattacattattttctttcaattttttcatttatctttttca |
6193127 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #208
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 234 - 282
Target Start/End: Original strand, 7399682 - 7399730
Alignment:
| Q |
234 |
tgtcccaaattgtatgtcactttacaataccaatgaaacattaatgtta |
282 |
Q |
| |
|
|||| ||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
7399682 |
tgtctcaagttgtatgtcactttacaatatcgatgaaacattaatgtta |
7399730 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #209
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 361 - 441
Target Start/End: Complemental strand, 8839206 - 8839126
Alignment:
| Q |
361 |
ttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatatgtgtgaaatgcccaaaacgtcat |
441 |
Q |
| |
|
|||||||| |||||||||||| | ||| ||||| || ||||||||||||| |||||| || | ||||| ||||||| |||| |
|
|
| T |
8839206 |
ttgtaaaataactcataatatgtttttcccacataaaattaattacattttttaatacgtataaaatgtccaaaacatcat |
8839126 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #210
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 290 - 346
Target Start/End: Original strand, 21443132 - 21443188
Alignment:
| Q |
290 |
tattataaccttaactatttattactctctcttctttcaagtcttttatttatcttt |
346 |
Q |
| |
|
||||||| |||||||||||||||||| | |||| |||||| ||||| |||||||||| |
|
|
| T |
21443132 |
tattatatccttaactatttattactttatcttatttcaattctttaatttatcttt |
21443188 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #211
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 357 - 417
Target Start/End: Original strand, 21443210 - 21443270
Alignment:
| Q |
357 |
aattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaatattaattacatttcttaata |
417 |
Q |
| |
|
||||||||||||| ||| |||| |||||||| ||| |||| ||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
21443210 |
aattttgtaaaactacttataacatctctttcccatacaaaattaattacattttttaata |
21443270 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #212
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 368 - 428
Target Start/End: Original strand, 23824692 - 23824752
Alignment:
| Q |
368 |
acaactcataatatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatatgtgtgaaatg |
428 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||||| ||| ||| |||| ||||||||||||| |||||| |||||||||| |
|
|
| T |
23824692 |
acaactcatagtatctttttaccatacaaaattaattacattttttaatacgtgtgaaatg |
23824752 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #213
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 357 - 413
Target Start/End: Original strand, 29478420 - 29478476
Alignment:
| Q |
357 |
aattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaatattaattacatttctt |
413 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||| | || | || |||||||||||||||| |
|
|
| T |
29478420 |
aattttgtaaaacaactcataatatctctctatcatataaaattaattacatttctt |
29478476 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #214
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 372 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 30643122 - 30643066
Alignment:
| Q |
372 |
ctcataatatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatatgtgtgaaatg |
428 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||||||| | |||||||||| |||||| |||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
30643122 |
ctcataatttctcttttctatacaatattaactacattccttaatttgtgtgaaatg |
30643066 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #215
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 254 - 285
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Alignment:
| Q |
254 |
tttacaataccaatgaaacattaatgttattt |
285 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
40065584 |
tttacaataccaatgaaacattaatgttattt |
40065553 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #216
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Query Start/End: Original strand, 233 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 40011405 - 40011323
Alignment:
| Q |
233 |
ttgtcccaaattgtatgtcactttacaataccaatgaaacattaatgttatttttcctattataaccttaactatttattact |
315 |
Q |
| |
|
||||| |||||| |||||| |||||||||||| |||| |||||||| | |||| |||||||| | |||| ||||||||||| |
|
|
| T |
40011405 |
ttgtctcaaattatatgtcgttttacaataccattgaagtattaatgtaactttttctattatatctttaaatatttattact |
40011323 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #217
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 254 - 352
Target Start/End: Original strand, 40743958 - 40744055
Alignment:
| Q |
254 |
tttacaataccaatgaaacattaatgttatttttcctattataaccttaactatttattactctctcttctttcaagtcttttatttatctttttcata |
352 |
Q |
| |
|
||||||||| |||| ||||| || ||||||||||| ||||||| | ||| |||||| || || |||||||||||| ||||| |||||| ||| ||||| |
|
|
| T |
40743958 |
tttacaatatcaatcaaacaatagtgttatttttc-tattatagacctaaatatttaatagtccctcttctttcaattctttgatttatatttctcata |
40744055 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #218
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 255 - 352
Target Start/End: Original strand, 7170724 - 7170821
Alignment:
| Q |
255 |
ttacaataccaatgaaacattaatgttatttttcctattataaccttaactatttattactctctcttctttcaagtcttttatttatctttttcata |
352 |
Q |
| |
|
|||||||| | |||||| |||||| | | |||| | |||||| | ||||||||||||||| || | ||||||||| ||||| || ||||||| ||||| |
|
|
| T |
7170724 |
ttacaatatccatgaaatattaatatcactttttcaattatacctttaactatttattaccctatattctttcaactctttaatatatctttctcata |
7170821 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #219
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 354 - 383
Target Start/End: Original strand, 7720838 - 7720867
Alignment:
| Q |
354 |
gacaattttgtaaaacaactcataatatct |
383 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
7720838 |
gacaattttgtaaaacaactcataatatct |
7720867 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #220
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 233 - 326
Target Start/End: Original strand, 9658626 - 9658719
Alignment:
| Q |
233 |
ttgtcccaaattgtatgtcactttacaataccaatgaaacattaatgttatttttcctattataaccttaactatttattactctctcttcttt |
326 |
Q |
| |
|
|||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||| ||| ||||| |||| ||||||| |||| ||||||||||||| | |||||| |
|
|
| T |
9658626 |
ttgtcccaaattatatgtggctttacaatactaatgaaaacttattgttactttttgtattatatgtttaaatatttattactctattttcttt |
9658719 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #221
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 301 - 342
Target Start/End: Original strand, 39199313 - 39199354
Alignment:
| Q |
301 |
taactatttattactctctcttctttcaagtcttttatttat |
342 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||| |
|
|
| T |
39199313 |
taactatttattactctttcttctttcaattctttcatttat |
39199354 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #222
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 361 - 426
Target Start/End: Original strand, 46243927 - 46243992
Alignment:
| Q |
361 |
ttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatatgtgtgaaa |
426 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||||||| ||| ||||| | |||| |||| |||||||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
46243927 |
ttgtaaaattactcataatttcttttttcaatacaaaattatttacatttcttaatatgtatgaaa |
46243992 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #223
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 254 - 317
Target Start/End: Original strand, 3719717 - 3719781
Alignment:
| Q |
254 |
tttacaataccaatgaaacattaa-tgttatttttcctattataaccttaactatttattactct |
317 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||||| ||||| |||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
3719717 |
tttacaatatcaatgaattattaaatgttatttttactattatactcttaacgatttattactct |
3719781 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #224
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 355 - 435
Target Start/End: Original strand, 27330396 - 27330475
Alignment:
| Q |
355 |
acaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatatgtgtgaaatgcccaaaa |
435 |
Q |
| |
|
||||||||||||| |||| ||||||| | ||| || |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |
|
|
| T |
27330396 |
acaattttgtaaat-aacttataatatatttttctcatacaaaattaattacatttcttaatatgcatgaaatgcctaaaa |
27330475 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #225
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 232 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 30643272 - 30643186
Alignment:
| Q |
232 |
tttgtcccaaattgtatgtcactttacaataccaa--tgaaacattaatgttatttttcctattataaccttaactatttattactct |
317 |
Q |
| |
|
||||||||||||| || |||| ||||||||| ||| |||||||| |||| | ||||||||||||| |||| | ||||||||||||| |
|
|
| T |
30643272 |
tttgtcccaaatt-taagtcattttacaatatcaaaatgaaacatcaatgattcttttcctattataccctttaatatttattactct |
30643186 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5 (Bit Score: 203; Significance: 1e-110; HSPs: 188)
Name: chr5
Description:
Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 203; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 190 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 13978506 - 13978248
Alignment:
| Q |
190 |
tactccatccgtcctaaattgtatgtcattttnnnnnnnntatttgtcccaaattgtatgtcactttacaataccaatgaaacattaatgttatttttcc |
289 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
13978506 |
tactccatccgtcctaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgttccaaattgtatgtcactttacaataccaatgaaacattaatgttacttttcc |
13978407 |
T |
 |
| Q |
290 |
tattataaccttaactatttattactctctcttctttcaagtcttttatttatctttttcataggacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttc |
389 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
13978406 |
tattataactttaactatttattactctctcttctttcaagtcttttatttatctttctcataggacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttc |
13978307 |
T |
 |
| Q |
390 |
cacacaatattaattacatttcttaatatgtgtgaaatgcccaaaacgtcatacaattt |
448 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
13978306 |
cacacaatattaattatattttttaatatgtgtgaaatgcccaaaacgtcatataattt |
13978248 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 230 - 448
Target Start/End: Original strand, 37337065 - 37337283
Alignment:
| Q |
230 |
tatttgtcccaaattgtatgtcactttacaataccaatgaaacattaatgttatttttcctattataaccttaactatttattactctctcttctttcaa |
329 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
37337065 |
tatttgtcccaaattgtatgtcactttacaatacaaatgaaacattaatgttacttttcctattataaccttaactatttattactctatcttctttcaa |
37337164 |
T |
 |
| Q |
330 |
gtcttttatttatctttttcataggacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatatgtgtgaaatgc |
429 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
37337165 |
gtcttttatttatctttttcataggacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacataatattaattacatttcttaatacgtgtgaaatgt |
37337264 |
T |
 |
| Q |
430 |
ccaaaacgtcatacaattt |
448 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
37337265 |
ccaaaatgtcatacaattt |
37337283 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 161; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 181 - 464
Target Start/End: Complemental strand, 36347497 - 36347203
Alignment:
| Q |
181 |
aaaataaattactccatccgtcctaaattgtatgtcattttnnnnnnnntatttgtcccaaattgtatgtcactttacaataccaatgaaacattaatgt |
280 |
Q |
| |
|
||||| || |||||| ||||||| |||||||||| || ||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
36347497 |
aaaatcaaatactccctccgtcccaaattgtatgccactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtacgtcactttagaataccaatgaaacattaatgt |
36347398 |
T |
 |
| Q |
281 |
tatttttcctattataaccttaactatttattactctctcttctttcaagtcttttatttatctttttcata-----------ggacaattttgtaaaac |
369 |
Q |
| |
|
|| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
36347397 |
tacttttcctattatatccttaactatttattactctctcttctttcaattccttcatttatctttctcatatcatttattgaggacaattttgtaaaac |
36347298 |
T |
 |
| Q |
370 |
aactcataatatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatatgtgtgaaatgcccaaaacgtcatacaatttaggatgaagggagtaa |
464 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||| |
|
|
| T |
36347297 |
aactcataatatctctttcccacacaatattaattacatttcttaatatgtgtgaaatgcccaaaacgtcatacaatttgggacggagggagtaa |
36347203 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 158; E-Value: 9e-84
Query Start/End: Original strand, 188 - 452
Target Start/End: Complemental strand, 27187496 - 27187221
Alignment:
| Q |
188 |
attactccatccgtcctaaattgtatgtcattttnnnnnnnntatttgtcccaaattgtatgtcactttacaataccaatgaaacattaatgttattttt |
287 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
27187496 |
attactccctccgtcctaaattgtatgtcactttggaaaaaatatttgtcccaaattatatgtcgctttacaataccaatgaaaaattaatgttattttt |
27187397 |
T |
 |
| Q |
288 |
cctattataaccttaactatttattactctctcttctttcaagtcttttatttatctttttcata-----------ggacaattttgtaaaacaactcat |
376 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| || || |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
27187396 |
cctattatatccttaactatttattgatctctcttctttcaaatccttcatttatctttctcatatcatttattgaggacaattttgtaaaacaactcat |
27187297 |
T |
 |
| Q |
377 |
aatatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatatgtgtgaaatgcccaaaacgtcatacaatttagga |
452 |
Q |
| |
|
||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
27187296 |
aatatctctttcccacacaatattaattacatttcttaatatgtgtgaaatgcccaaaacgttatacaatttagga |
27187221 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 155; E-Value: 6e-82
Query Start/End: Original strand, 190 - 463
Target Start/End: Original strand, 29816204 - 29816488
Alignment:
| Q |
190 |
tactccatccgtcctaaattgtatgtcattttnnnnnnnntatttgtcccaaattgtatgtcactttacaataccaatgaaacattaatgttatttttcc |
289 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
29816204 |
tactccctccgtcccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttatttttcc |
29816303 |
T |
 |
| Q |
290 |
tattataaccttaactatttattactctctcttctttcaagtcttttatttatctttttcat-----------aggacaattttgtaaaacaactcataa |
378 |
Q |
| |
|
||||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||| |||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
29816304 |
tattatatccttaactatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccatatcatttattaaggataattttgtaaaacaactcataa |
29816403 |
T |
 |
| Q |
379 |
tatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatatgtgtgaaatgcccaaaacgtcatacaatttaggatgaagggagta |
463 |
Q |
| |
|
||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||| |
|
|
| T |
29816404 |
tatctctttccaacacaatattaattacatttcttaatatgtgtgaaatgcccaaaacgtcatacaatttgggacggagggagta |
29816488 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 155; E-Value: 6e-82
Query Start/End: Original strand, 230 - 463
Target Start/End: Complemental strand, 34607037 - 34606793
Alignment:
| Q |
230 |
tatttgtcccaaattgtatgtcactttacaataccaatgaaacattaatgttatttttcctattataaccttaactatttattactctctcttctttcaa |
329 |
Q |
| |
|
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| T |
34607037 |
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34606938 |
T |
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| Q |
330 |
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418 |
Q |
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| T |
34606937 |
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34606838 |
T |
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| Q |
419 |
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463 |
Q |
| |
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| T |
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gtgtgaaatgcccaaaacgtcatacaatttgggacggagggagta |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 153; E-Value: 9e-81
Query Start/End: Original strand, 189 - 463
Target Start/End: Original strand, 35189176 - 35189459
Alignment:
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Q |
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| T |
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T |
 |
| Q |
289 |
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377 |
Q |
| |
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| T |
35189276 |
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35189373 |
T |
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| Q |
378 |
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463 |
Q |
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| T |
35189374 |
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35189459 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 151; E-Value: 1e-79
Query Start/End: Original strand, 230 - 467
Target Start/End: Complemental strand, 27293540 - 27293292
Alignment:
| Q |
230 |
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329 |
Q |
| |
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| T |
27293540 |
tatttgtcctaaattgtatgtcgctttacaataccaatgaaaaattaatgttacttttcctattatatccttaacaatttattactctctcttctttcaa |
27293441 |
T |
 |
| Q |
330 |
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418 |
Q |
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| T |
27293440 |
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27293341 |
T |
 |
| Q |
419 |
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467 |
Q |
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| T |
27293340 |
gtgtcaaatgcccaaaacgtcatacaatttgggacggagggagtaattt |
27293292 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 148; E-Value: 9e-78
Query Start/End: Original strand, 190 - 463
Target Start/End: Original strand, 35869929 - 35870214
Alignment:
| Q |
190 |
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288 |
Q |
| |
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|
|
| T |
35869929 |
tactccctccgtcccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcgctttacaataccaaatgaaaaattaatgttacttttc |
35870028 |
T |
 |
| Q |
289 |
ctattataaccttaactatttattactctctcttctttcaagtcttttatttatctttttcata-----------ggacaattttgtaaaacaactcata |
377 |
Q |
| |
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| T |
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T |
 |
| Q |
378 |
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463 |
Q |
| |
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| T |
35870129 |
atatctctttcccacacaatattaattacatttcttaatatgtgtgaaatgttcaaaacgtcatacaatttgggacgaagggagta |
35870214 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 148; E-Value: 9e-78
Query Start/End: Original strand, 189 - 463
Target Start/End: Complemental strand, 36302541 - 36302256
Alignment:
| Q |
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ttactccatccgtcctaaattgtatgtcattttnnnnnnnntatttgtcccaaattgtatgtcactttacaataccaatgaaacattaatgttatttttc |
288 |
Q |
| |
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| T |
36302541 |
ttactccctctgtcccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattatatgtcgctttacaataccaatgaaaaattaatgttatttttc |
36302442 |
T |
 |
| Q |
289 |
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377 |
Q |
| |
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| T |
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ctattatatccttaactatttattactctcttttctttcaattccttcatttatttttcccatataatttattgaggacaattttgtaaaacaactcata |
36302342 |
T |
 |
| Q |
378 |
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463 |
Q |
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| T |
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atatctctttcccacacaatattaattacatttcttaatatgtgtgaaatgcccaaaacgtcatacaatttgggatggatggagta |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 147; E-Value: 3e-77
Query Start/End: Original strand, 190 - 463
Target Start/End: Original strand, 4456393 - 4456677
Alignment:
| Q |
190 |
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289 |
Q |
| |
|
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| T |
4456393 |
tactccctccgtcccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattatatgtcactttacaataccaatgaaacattaatgttacttttcc |
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T |
 |
| Q |
290 |
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378 |
Q |
| |
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| T |
4456493 |
tattatatccttaattatttattactctttcttctttcaattctttcatttatctttcccatatcatttattaaggataattttgtaaaacaactcataa |
4456592 |
T |
 |
| Q |
379 |
tatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatatgtgtgaaatgcccaaaacgtcatacaatttaggatgaagggagta |
463 |
Q |
| |
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|
| T |
4456593 |
tatctctttcccatacaatattaattacatttcttaatatatgtgaaatgcccaaaacgtcatacaatttgggacggagggagta |
4456677 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 147; E-Value: 3e-77
Query Start/End: Original strand, 230 - 463
Target Start/End: Original strand, 42940806 - 42941050
Alignment:
| Q |
230 |
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329 |
Q |
| |
|
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| T |
42940806 |
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42940905 |
T |
 |
| Q |
330 |
gtcttttatttatctttttcata-----------ggacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatat |
418 |
Q |
| |
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| T |
42940906 |
ttccttcatttatctttctcatatcatttattgaggacaattttgtaaaacaactcataatatctctttcccacacaatattaattacatttcttaatat |
42941005 |
T |
 |
| Q |
419 |
gtgtgaaatgcccaaaacgtcatacaatttaggatgaagggagta |
463 |
Q |
| |
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|
| T |
42941006 |
gtgtgaaatgcccaaaacgtcatacaatttgggacggagggagta |
42941050 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 144; E-Value: 2e-75
Query Start/End: Original strand, 246 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 23320519 - 23320306
Alignment:
| Q |
246 |
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345 |
Q |
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|
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23320420 |
T |
 |
| Q |
346 |
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434 |
Q |
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| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |
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| T |
23320419 |
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23320320 |
T |
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| Q |
435 |
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448 |
Q |
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| T |
23320319 |
acgtcatacaattt |
23320306 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 143; E-Value: 8e-75
Query Start/End: Original strand, 190 - 463
Target Start/End: Original strand, 34163122 - 34163407
Alignment:
| Q |
190 |
tactccatccgtcctaaattgtatgtcattttnnnnnnnntatttgtcccaaattgtatgtcactttacaataccaatgaaacattaatgttatttttcc |
289 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
34163122 |
tactccctccgtcccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcc |
34163221 |
T |
 |
| Q |
290 |
tattataaccttaactatttattactctctcttctttcaagtcttttatttatctttt-----tcat------aggac-aattttgtaaaacaactcata |
377 |
Q |
| |
|
||||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||| | ||| |||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
34163222 |
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34163321 |
T |
 |
| Q |
378 |
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463 |
Q |
| |
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|
|
| T |
34163322 |
atatctctttaccacacaatattaattacatttcttaatatgtgtgaaatgcccaaaacgtcatacaatttgggacggagggagta |
34163407 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 142; E-Value: 3e-74
Query Start/End: Original strand, 231 - 463
Target Start/End: Complemental strand, 39729801 - 39729558
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atttgtcccaaattgtatgtcactttacaataccaatgaaacattaatgttatttttcctattataaccttaactatttattactctctcttctttcaag |
330 |
Q |
| |
|
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|
|
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39729702 |
T |
 |
| Q |
331 |
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419 |
Q |
| |
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|
| T |
39729701 |
tctttcatttatctttcccatattatttattaaggataattttgtaaaacaaatcataatatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatata |
39729602 |
T |
 |
| Q |
420 |
tgtgaaatgcccaaaacgtcatacaatttaggatgaagggagta |
463 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||||||||||||||||| ||| | |||||||| |
|
|
| T |
39729601 |
tgtgaaatgtccaaaacgtcatacaatttgggacggagggagta |
39729558 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 141; E-Value: 1e-73
Query Start/End: Original strand, 183 - 463
Target Start/End: Complemental strand, 4047891 - 4047600
Alignment:
| Q |
183 |
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282 |
Q |
| |
|
|||| |||||||| |||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||| |
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|
| T |
4047891 |
aatatattactccttccgtctcaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcgctttacaataccaatgaaaaactaatgtta |
4047792 |
T |
 |
| Q |
283 |
tttttcctattataaccttaactatttattactctctcttctttcaagtcttttatttatctttt-----tcat------aggacaattttgtaaaacaa |
371 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
4047791 |
cttttcctattatatccttaactatttattactctatcttctttcaatttcttcatttatctttccaatatcatttattgaggacaattttgtaaaacaa |
4047692 |
T |
 |
| Q |
372 |
ctcataatatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatatgtgtgaaatgcccaaaacgtcatacaatttaggatgaagggagta |
463 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| | |||||||| |
|
|
| T |
4047691 |
ctcataatatctctttcccacacaatattaattacatttcttaatatgtgtgaaatgcccaaaacgtcgtacaatttgggacggagggagta |
4047600 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 141; E-Value: 1e-73
Query Start/End: Original strand, 196 - 463
Target Start/End: Original strand, 7414621 - 7414899
Alignment:
| Q |
196 |
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295 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||| |
|
|
| T |
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atccgtcccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaattatacttttcctattat |
7414720 |
T |
 |
| Q |
296 |
aaccttaactatttattactctctcttctttcaagtcttttatttatctttttcata-----------ggacaattttgtaaaacaactcataatatctc |
384 |
Q |
| |
|
| ||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||| |||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| |
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| T |
7414721 |
attcttaactatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccatatcatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatatctc |
7414820 |
T |
 |
| Q |
385 |
ttttccacacaatattaattacatttcttaatatgtgtgaaatgcccaaaacgtcatacaatttaggatgaagggagta |
463 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
7414821 |
tttcccacacaatattaattacatttcttaatatgtgtgaaatgcccaaaacgtcatacaatttgggacggagggagta |
7414899 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 140; E-Value: 5e-73
Query Start/End: Original strand, 235 - 465
Target Start/End: Complemental strand, 6517646 - 6517405
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| Q |
235 |
gtcccaaattgtatgtcactttacaataccaatgaaacattaatgttatttttcctattataaccttaactatttattactctctcttctttcaagtctt |
334 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |
|
|
| T |
6517646 |
gtcccaaattgtatgtcatttgacaatatcaatgaaacattaatgttacttttcctattatatccttaactatttattactctttcttctttcaattctt |
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T |
 |
| Q |
335 |
ttatttatctttttcat-----------aggacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatatgtgtg |
423 |
Q |
| |
|
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| T |
6517546 |
ttatttatctttctcatatcatttattaaggataattttgcaaaacaactcataatatctctttcccacacagtattaattacatttcttaatatgtgtg |
6517447 |
T |
 |
| Q |
424 |
aaatgcccaaaacgtcatacaatttaggatgaagggagtaat |
465 |
Q |
| |
|
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| T |
6517446 |
aaatacccaaaacatcatacaatttaggacggagggagtaat |
6517405 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 140; E-Value: 5e-73
Query Start/End: Original strand, 233 - 463
Target Start/End: Original strand, 13987589 - 13987830
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| Q |
233 |
ttgtcccaaattgtatgtcactttacaataccaatgaaacattaatgttatttttcctattataaccttaactatttattactctctcttctttcaagtc |
332 |
Q |
| |
|
|||||||||||| |||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || |
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|
| T |
13987589 |
ttgtcccaaattatatgtcgctttaaaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttaattatttattactctctcttctttcaattc |
13987688 |
T |
 |
| Q |
333 |
ttttatttatctttttcata-----------ggacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatatgtg |
421 |
Q |
| |
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|
| T |
13987689 |
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T |
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463 |
Q |
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13987789 |
tgaaatgcccaaaacgtcatacaatttgggacggagggagta |
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #20
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Target Start/End: Complemental strand, 27366472 - 27366231
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Q |
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T |
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333 |
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421 |
Q |
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27366372 |
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27366273 |
T |
 |
| Q |
422 |
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463 |
Q |
| |
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| T |
27366272 |
tgaaatgcccaaaacgtcatacaatttgggacggagggagta |
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 140; E-Value: 5e-73
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Target Start/End: Original strand, 43359652 - 43359937
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T |
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378 |
Q |
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T |
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Q |
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T |
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Target: chr5; HSP #22
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Query Start/End: Original strand, 190 - 463
Target Start/End: Original strand, 12360787 - 12361071
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T |
 |
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290 |
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378 |
Q |
| |
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T |
 |
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463 |
Q |
| |
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Target: chr5; HSP #23
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Target Start/End: Original strand, 26256348 - 26256564
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Q |
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T |
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Q |
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T |
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| Q |
428 |
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Q |
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Back To:
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Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 139; E-Value: 2e-72
Query Start/End: Original strand, 231 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 35809467 - 35809239
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T |
 |
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Q |
| |
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T |
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| Q |
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Q |
| |
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tgtgaaatgcccaaaacgtcatacaattt |
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Back To:
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Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 139; E-Value: 2e-72
Query Start/End: Original strand, 230 - 463
Target Start/End: Complemental strand, 39896041 - 39895797
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 |
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Q |
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T |
 |
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Q |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 138; E-Value: 8e-72
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Q |
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T |
 |
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Q |
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Target: chr5; HSP #27
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 |
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ctattataaccttaactatttattactctctcttctttcaagtcttttatttatctttttcata-----------ggacaattttgtaaaacaactcata |
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Q |
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Back To:
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Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 136; E-Value: 1e-70
Query Start/End: Original strand, 190 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 34382103 - 34381834
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378 |
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| |
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tattatatccttaactatttattactctttcttttttcaattctttcatttatgtttctcatatcatttattaaggataattttgtaaaataactcataa |
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T |
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tatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatatgtgtgaaatgcccaaaacgtcatacaattt |
448 |
Q |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #29
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 |
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Q |
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ttctttcatttatcttttccatatcatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatatatctttcccacacaatattaattacatttcttaatat |
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T |
 |
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Back To:
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 |
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gtcttttatttatctttttcat-----------aggacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatat |
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Q |
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ttctttcatttatctttcccatatcatttatgaaggataattttgtaaaaaaactcataatatttctttcccacacaatattaattacatttcttaatat |
25784573 |
T |
 |
| Q |
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gtgtgaaatgcccaaaacgtcatacaatttaggatgaagggagta |
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Q |
| |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #31
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T |
 |
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| |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #32
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| |
|
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #33
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Target Start/End: Original strand, 9461398 - 9461627
Alignment:
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230 |
tatttgtcccaaattgtatgtcactttacaataccaatgaaacattaatgttatttttcctattataaccttaactatttattactctctcttctttcaa |
329 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||| |
|
|
| T |
9461398 |
tatttgtcccaaattatatgtcgctttacaataccaatgaaaaattaatgttacttttcatattatatccttaactatttattgctctctcttttttcaa |
9461497 |
T |
 |
| Q |
330 |
gtcttttatttatctttttcata-----------ggacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatat |
418 |
Q |
| |
|
|| || |||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
9461498 |
ttccttcatttatctttctcatattatttattgagaacaattttgtaaaacaactcataatatctctttcccacacaatattaattacatttcttaatat |
9461597 |
T |
 |
| Q |
419 |
gtgtgaaatgcccaaaacgtcatacaattt |
448 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
9461598 |
gtgtgaaatgcccaaaacgtcatataattt |
9461627 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 132; E-Value: 3e-68
Query Start/End: Original strand, 230 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 14153738 - 14153509
Alignment:
| Q |
230 |
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329 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| | || |||||| |
|
|
| T |
14153738 |
tatttgtcccaaattgtatgtcactttaaaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatattcttaactatttattactctttattttttcaa |
14153639 |
T |
 |
| Q |
330 |
gtcttttatttatctttttcata-----------ggacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatat |
418 |
Q |
| |
|
||||| |||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
14153638 |
ttctttcatttatctttcccatatcatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatatctatttcccacacaatattaattatatttcttaatat |
14153539 |
T |
 |
| Q |
419 |
gtgtgaaatgcccaaaacgtcatacaattt |
448 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
14153538 |
gtgtgaaatgcccaaaacgtcatacaattt |
14153509 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 132; E-Value: 3e-68
Query Start/End: Original strand, 230 - 464
Target Start/End: Complemental strand, 40915655 - 40915410
Alignment:
| Q |
230 |
tatttgtcccaaattgtatgtcactttacaataccaatgaaacattaatgttatttttcctattataaccttaactatttattactctctcttctttcaa |
329 |
Q |
| |
|
|||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||| |
|
|
| T |
40915655 |
tatttgtcttaaattgtatgtcactttagaatactaatgaaacattaatgttactttttctattatatccttaactatttattactctttcttttttcaa |
40915556 |
T |
 |
| Q |
330 |
gtcttttatttatctttttcata-----------ggacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatat |
418 |
Q |
| |
|
||||| |||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
40915555 |
ttctttcatttatctttcccatattatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatatctctttcccacacaatattaattgcatttcttaatat |
40915456 |
T |
 |
| Q |
419 |
gtgtgaaatgcccaaaacgtcatacaatttaggatgaagggagtaa |
464 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||| |
|
|
| T |
40915455 |
gtgtgaaatgcccaaaacgtcatacaatttgggacggagggagtaa |
40915410 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 131; E-Value: 1e-67
Query Start/End: Original strand, 190 - 463
Target Start/End: Original strand, 8542760 - 8543043
Alignment:
| Q |
190 |
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289 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |
|
|
| T |
8542760 |
tactccttccgtcccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattatatgtcgctttacaataccaatgaaaaattaatgttacttttcc |
8542859 |
T |
 |
| Q |
290 |
tattataaccttaactatttattactctctcttctttcaagtcttttatttatctttttcatag-----------gacaattttgtaaaacaactcataa |
378 |
Q |
| |
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||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| || || || |||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
8542860 |
tattatatccttaactatttattggtctctcttcttttaattccttcatttatatttcccatatcatttattgaagacaattttgtaaaacaactcataa |
8542959 |
T |
 |
| Q |
379 |
tatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatatgtgtgaaatgcccaaaacgtcatacaatttaggatgaagggagta |
463 |
Q |
| |
|
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|
| T |
8542960 |
tatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatatatgtgaaatgcccaaaacatcatac-atttaggatggagggagta |
8543043 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 131; E-Value: 1e-67
Query Start/End: Original strand, 197 - 465
Target Start/End: Complemental strand, 27808015 - 27807738
Alignment:
| Q |
197 |
tccgtcctaaattgtatgtcattttnnnnnnnntatttgtcccaaattgtatgtcactttacaataccaatgaaacattaatgttatttttcctattata |
296 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
27808015 |
tccgtcccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcctaaattatatgtcgctttacaataccaataaaaaattaatgttacttttcctattata |
27807916 |
T |
 |
| Q |
297 |
accttaactatttattactctctcttctttcaagtcttttatttatctttttcata-----------ggacaattttgtaaaacaactcataatatctct |
385 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| |||||||| || || |||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
27807915 |
tccttaactatttattactctct--tctttcaattccttcatttatctttcccatatcatttattgaggataattttgtaaaacaactcataatatctct |
27807818 |
T |
 |
| Q |
386 |
tttccacacaatattaattacatttcttaatatgtgtgaaatgcccaaaacgtcatacaatttaggatgaagggagtaat |
465 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| | |||||||||| |
|
|
| T |
27807817 |
tttccacacaatattaattacatttcttaatatgtgtgaaatacccaaaacgtcatacaatttgggacggagggagtaat |
27807738 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 129; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 244 - 463
Target Start/End: Complemental strand, 29000943 - 29000713
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| Q |
244 |
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343 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||| | |||||||||||||||||| |||| |||||| ||||| ||||||| |
|
|
| T |
29000943 |
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29000844 |
T |
 |
| Q |
344 |
tttttcatag-----------gacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatatgtgtgaaatgccca |
432 |
Q |
| |
|
||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
29000843 |
tttctcatatcatttattaaagataattttgtaaaacaactcataatatctctttcccacacaatattaattacatttcttaatatgtgtgaaatgccca |
29000744 |
T |
 |
| Q |
433 |
aaacgtcatacaatttaggatgaagggagta |
463 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
29000743 |
aaacgtcatacaatttgggacgaagggagta |
29000713 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 128; E-Value: 7e-66
Query Start/End: Original strand, 230 - 452
Target Start/End: Complemental strand, 18094722 - 18094489
Alignment:
| Q |
230 |
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329 |
Q |
| |
|
||||| |||||||||||| | |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
18094722 |
tatttatcccaaattgtacgacactttacaatatcaataaaacattaatgttatttttcctattatatctttaactatttattactctttcttctttcaa |
18094623 |
T |
 |
| Q |
330 |
gtcttttatttatctttttcat-----------aggacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatat |
418 |
Q |
| |
|
||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| | ||| |||||| |||||||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
18094622 |
ttctttcatttatctttctcatatcatttattaaggacaattttgtaaaacaactcataatatatatttcccacactatattaattatatttcttaatac |
18094523 |
T |
 |
| Q |
419 |
gtgtgaaatgcccaaaacgtcatacaatttagga |
452 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
18094522 |
gtgtgaaatgcccaaaacgtcatacaatttagga |
18094489 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 128; E-Value: 7e-66
Query Start/End: Original strand, 230 - 463
Target Start/End: Complemental strand, 39990442 - 39990200
Alignment:
| Q |
230 |
tatttgtcccaaattgtatgtcactttacaataccaatgaaacattaatgttatttttcctattataaccttaactatttattactctctcttctttcaa |
329 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||| ||| | ||||||||| |
|
|
| T |
39990442 |
tatttgttccaaattgtatgtcactttacaatatcaatgaaacattaatgttatttttcctattatatcattaactatt-attattcttttttctttcaa |
39990344 |
T |
 |
| Q |
330 |
gtcttttatttatctttt----tcat------aggacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatatg |
419 |
Q |
| |
|
||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||| ||||||||||| | |
|
|
| T |
39990343 |
ttctttcatttatcttttcatatcatttattaaggacaattttgtaaaacaactcataatatatatttcccacacaatattaattatatttcttaatacg |
39990244 |
T |
 |
| Q |
420 |
tgtgaaatgcccaaaacgtcatacaatttaggatgaagggagta |
463 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||| |
|
|
| T |
39990243 |
tgtgaaatgcccaaaatgtcatacaatttaggacggagggagta |
39990200 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 127; E-Value: 3e-65
Query Start/End: Original strand, 231 - 448
Target Start/End: Original strand, 8050429 - 8050657
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| Q |
231 |
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330 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||| |||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
8050429 |
atttgtcctaaattatatgtcgctttacaacaccaatgcaacattaatgttactttttctattataaccttgactatttattactctatcttctttcaat |
8050528 |
T |
 |
| Q |
331 |
tcttttatttatctttttcata-----------ggacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatatg |
419 |
Q |
| |
|
||||| |||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
8050529 |
tctttcatttatctttcccatattatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaatattaattatatttcttaatata |
8050628 |
T |
 |
| Q |
420 |
tgtgaaatgcccaaaacgtcatacaattt |
448 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
8050629 |
tgtgaaatgcccaaaacgtcatacaattt |
8050657 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 127; E-Value: 3e-65
Query Start/End: Original strand, 230 - 447
Target Start/End: Original strand, 35288155 - 35288383
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| Q |
230 |
tatttgtcccaaattgtatgtcactttacaataccaatgaaacattaatgttatttttcctattataaccttaactatttattactctctcttctttcaa |
329 |
Q |
| |
|
|||||||| |||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
35288155 |
tatttgtctcaaattatatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttaactatttattactctatcttctttcaa |
35288254 |
T |
 |
| Q |
330 |
gtcttttatttatctttttcat-----------aggacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatat |
418 |
Q |
| |
|
| ||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |
|
|
| T |
35288255 |
ttatttcatttatctttcccatattatttattaaggacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaatattaattgcattttttaatat |
35288354 |
T |
 |
| Q |
419 |
gtgtgaaatgcccaaaacgtcatacaatt |
447 |
Q |
| |
|
| ||||||||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
35288355 |
atatgaaatgcccaaaacatcatacaatt |
35288383 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 127; E-Value: 3e-65
Query Start/End: Original strand, 231 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 36302935 - 36302707
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| Q |
231 |
atttgtcccaaattgtatgtcactttacaataccaatgaaacattaatgttatttttcctattataaccttaactatttattactctctcttctttcaag |
330 |
Q |
| |
|
|||| ||||||||| |||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
36302935 |
atttatcccaaattatatgtcgctttacaacaccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttaactatttattactctatcttctttcaat |
36302836 |
T |
 |
| Q |
331 |
tcttttatttatctttttcat-----------aggacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatatg |
419 |
Q |
| |
|
||||| |||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
36302835 |
tctttcatttatctttcccatattatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaatattaattgtatttcttaatatg |
36302736 |
T |
 |
| Q |
420 |
tgtgaaatgcccaaaacgtcatacaattt |
448 |
Q |
| |
|
||| ||||||||||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
36302735 |
tgttaaatgcccaaaacatcatacaattt |
36302707 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #44
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Query Start/End: Original strand, 231 - 463
Target Start/End: Original strand, 2914464 - 2914707
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| Q |
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atttgtcccaaattgtatgtcactttacaataccaatgaaacattaatgttatttttcctattataaccttaactatttattactctctcttctttcaag |
330 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
2914464 |
atttgtcccaaattatatgtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcctattatatccttaactattaattaccctctcttctttcaat |
2914563 |
T |
 |
| Q |
331 |
tcttttatttatctttttcat-----------aggacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatatg |
419 |
Q |
| |
|
| ||| ||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |
|
|
| T |
2914564 |
tatttcatttatcttttccataccatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaatattaattacatttcttaatacg |
2914663 |
T |
 |
| Q |
420 |
tgtgaaatgcccaaaacgtcatacaatttaggatgaagggagta |
463 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||||||||||||||||| ||| | |||||||| |
|
|
| T |
2914664 |
tgtgaaatggccaaaacgtcatacaatttgggacggagggagta |
2914707 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #45
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Query Start/End: Original strand, 187 - 465
Target Start/End: Complemental strand, 21772936 - 21772643
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187 |
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282 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
21772936 |
aattactccctccgtcctaaattgtatgtcactttagaaaaaaaatatttgtcttaaattgtatatgtcactttacaataccaatgaaacattaatgtta |
21772837 |
T |
 |
| Q |
283 |
tttttcctattataaccttaactatttattactctctcttctttcaagtcttttatttatctttttcat-----------aggacaattttgtaaaacaa |
371 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||| | || |||| |||||||||||| || |
|
|
| T |
21772836 |
tttttcctattatatctttaactatttattactctttcttctttcaattctttcatttatctttcttatatcatttattaaggataattttgtaaaataa |
21772737 |
T |
 |
| Q |
372 |
ctcataatatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatatgtgtgaaatgcccaaaacgtcatacaatttaggatgaagggagtaat |
465 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | | |||||||| |
|
|
| T |
21772736 |
ttcataatatctctttcccacacagtattaattacatttcttagtatgtgtgaaatgcccaaaacgtcatacaatttgggacggaaggagtaat |
21772643 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 126; E-Value: 1e-64
Query Start/End: Original strand, 231 - 463
Target Start/End: Original strand, 25538081 - 25538324
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231 |
atttgtcccaaattgtatgtcactttacaataccaatgaaacattaatgttatttttcctattataaccttaactatttattactctctcttctttcaag |
330 |
Q |
| |
|
|||||| | ||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
25538081 |
atttgttctaaattatatgtcgttttacaataccaatgtaacattaatgttacttttcctattataaccttaactatttattactctttcttctttcaat |
25538180 |
T |
 |
| Q |
331 |
tcttttatttatctttttcata-----------ggacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatatg |
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Q |
| |
|
||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| |||||||| ||||| |
|
|
| T |
25538181 |
tctttcatttatctttcccatattatttattaaggacaattttgtaaaacaactcataatatctctttttcatacaatattaattgcatttcttgatatg |
25538280 |
T |
 |
| Q |
420 |
tgtgaaatgcccaaaacgtcatacaatttaggatgaagggagta |
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Q |
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tgtgaaatgcctaaaacgtcatacaatttgggacggagggagta |
25538324 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 125; E-Value: 5e-64
Query Start/End: Original strand, 232 - 463
Target Start/End: Original strand, 4431554 - 4431796
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331 |
Q |
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tttgtctcaaattatatgtcgctttacaatatcaatgaaatattaatgttatttttcttattatatccttaactattaattactctctcttctttcaatt |
4431653 |
T |
 |
| Q |
332 |
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420 |
Q |
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| T |
4431654 |
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4431753 |
T |
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| Q |
421 |
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463 |
Q |
| |
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| T |
4431754 |
gtgaaatgaccaaaacgtcatacaatttgggacggagggagta |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 124; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 233 - 463
Target Start/End: Original strand, 18048617 - 18048858
Alignment:
| Q |
233 |
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332 |
Q |
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18048617 |
ttgtcccaaattatatgtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcctattatatccttaactattaattactctctcttctttcaatta |
18048716 |
T |
 |
| Q |
333 |
ttttatttatctttttcat-----------aggacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatatgtg |
421 |
Q |
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| T |
18048717 |
tttcatttatcttttccataccatttcttaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaatattaattacatttcttaatacgtg |
18048816 |
T |
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| Q |
422 |
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463 |
Q |
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| ||||| ||||||||||||||||||| ||| | |||||||| |
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| T |
18048817 |
taaaatggccaaaacgtcatacaattttggacggagggagta |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 124; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 190 - 464
Target Start/End: Original strand, 29665314 - 29665599
Alignment:
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Q |
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tactccctccgtcctaaattgtatgtcgttttggaaaaaatatttgtcccaaattatatgtcgttttacaatatcaatgaaatattaatgttacttttcc |
29665413 |
T |
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290 |
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378 |
Q |
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| T |
29665414 |
tattatatccttaactattaattactctctcttctttcaattatttcatttatcttttccataccatttattaaggataattttgtaaaacaacttataa |
29665513 |
T |
 |
| Q |
379 |
tatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatatgtgtgaaatgcccaaaacgtcatacaatttaggatgaagggagtaa |
464 |
Q |
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tttctcttccccacacaatattaattacatttcttaatatgtgtgaaatgatcaaaacgtcttacaatttgggacggagggagtaa |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 124; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 190 - 464
Target Start/End: Original strand, 32706731 - 32707016
Alignment:
| Q |
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289 |
Q |
| |
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32706731 |
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T |
 |
| Q |
290 |
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378 |
Q |
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| T |
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tattatatccttaactattaattactccctcttctttcaattatttcatttatcttttccatgccatttattaaggataattttgtaaaacaactcataa |
32706930 |
T |
 |
| Q |
379 |
tatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatatgtgtgaaatgcccaaaacgtcatacaatttaggatgaagggagtaa |
464 |
Q |
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| T |
32706931 |
tttctcttccccacacaatattaattacatttcttaatacgtgtgaaatggccaaaacgtcatacaatttgggacggagggagtaa |
32707016 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 123; E-Value: 7e-63
Query Start/End: Original strand, 231 - 463
Target Start/End: Complemental strand, 13662452 - 13662211
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| Q |
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Q |
| |
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T |
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| Q |
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419 |
Q |
| |
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| T |
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T |
 |
| Q |
420 |
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463 |
Q |
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| T |
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tgtaaaatgcccaaaacatcatacaatttgggacgaatggagta |
13662211 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 123; E-Value: 7e-63
Query Start/End: Original strand, 231 - 452
Target Start/End: Original strand, 19712523 - 19712755
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| Q |
231 |
atttgtcccaaattgtatgtcactttacaataccaatgaaacattaatgttatttttcctattataaccttaactatttattactctctcttctttcaag |
330 |
Q |
| |
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19712523 |
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T |
 |
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tcttttatttatctttttcata-----------ggacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatatg |
419 |
Q |
| |
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| T |
19712623 |
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T |
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| Q |
420 |
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452 |
Q |
| |
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| T |
19712723 |
tgtgaaatggccaaaacgtcatacaatttagga |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 123; E-Value: 7e-63
Query Start/End: Original strand, 232 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 37881670 - 37881445
Alignment:
| Q |
232 |
tttgtcccaaattgtatgtcactttacaataccaatgaaacattaatgttatttttcctattataaccttaactatttattactctctcttctttcaagt |
331 |
Q |
| |
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T |
 |
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cttttatttatctttttcata-----------ggacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatatgt |
420 |
Q |
| |
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ctttcatttatctttcccatattatttattaaggacaattttgtaaaacaactcaaaatatctcttttccacacaatattaattgcatttcttaatatgt |
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T |
 |
| Q |
421 |
gtgaaatgcccaaaacgtcatacaattt |
448 |
Q |
| |
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| T |
37881472 |
gtgaaatgcctaaaacgtcatacaattt |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 123; E-Value: 7e-63
Query Start/End: Original strand, 190 - 463
Target Start/End: Complemental strand, 38394408 - 38394124
Alignment:
| Q |
190 |
tactccatccgtcctaaattgtatgtcattttnnnnnnnntatttgtcccaaattgtatgtcactttacaataccaatgaaacattaatgttatttttcc |
289 |
Q |
| |
|
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|
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| T |
38394408 |
tactccctccgtcccaaattgtatgtcgttttggaaaaaaaatttgtcccaaattatatgtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttatttttcc |
38394309 |
T |
 |
| Q |
290 |
tattataaccttaactatttattactctctcttctttcaagtcttttatttatctttttcat-----------aggacaattttgtaaaacaactcataa |
378 |
Q |
| |
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| T |
38394308 |
tattatatccttaactattaattactctcccttcttttaattatttcatttatcttttccataccatttattaaggataattttgtaaaacaactcataa |
38394209 |
T |
 |
| Q |
379 |
tatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatatgtgtgaaatgcccaaaacgtcatacaatttaggatgaagggagta |
463 |
Q |
| |
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| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||| ||| | |||||||| |
|
|
| T |
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tttctcttccccacacaatattaattacatttcttaatacgtgtgaaatggccaaaacatcatacaatttgggacggagggagta |
38394124 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #55
Raw Score: 123; E-Value: 7e-63
Query Start/End: Original strand, 231 - 448
Target Start/End: Original strand, 39527472 - 39527700
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| Q |
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330 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
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atttgtcccaaattatatgtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttatttttcctattatatccttaactattaattactctcccttctttcaat |
39527571 |
T |
 |
| Q |
331 |
tcttttatttatctttttcat-----------aggacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatatg |
419 |
Q |
| |
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| ||| ||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |
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| T |
39527572 |
tatttcatttatcttttccataccatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaatattaattacatttcttaatatg |
39527671 |
T |
 |
| Q |
420 |
tgtgaaatgcccaaaacgtcatacaattt |
448 |
Q |
| |
|
| ||||||| |||||||| |||||||||| |
|
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| T |
39527672 |
tttgaaatggccaaaacgccatacaattt |
39527700 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #56
Raw Score: 123; E-Value: 7e-63
Query Start/End: Original strand, 231 - 463
Target Start/End: Original strand, 40040939 - 40041183
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| Q |
231 |
atttgtcccaaattgtatgtcactttacaataccaatgaaacattaatgttatttttcctattataaccttaactatttattactctctcttctttcaag |
330 |
Q |
| |
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|
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atttgttctaaattgtatgtcgctttacaatatcaatgcaactttaatgttactttttctattataaccttaactatttattactctctcttatttcaat |
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T |
 |
| Q |
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tcttttatttatctttttcata-----------ggacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaata-ttaattacatttcttaatat |
418 |
Q |
| |
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| T |
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tctttcatttatttttcccatattatttattaaggacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaatatttaattgcattttttaatat |
40041138 |
T |
 |
| Q |
419 |
gtgtgaaatgcccaaaacgtcatacaatttaggatgaagggagta |
463 |
Q |
| |
|
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| T |
40041139 |
gtgtgaaatgcccaaaacgtcatacaatttgggacggagggagta |
40041183 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #57
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Query Start/End: Original strand, 233 - 448
Target Start/End: Original strand, 12659050 - 12659274
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| Q |
233 |
ttgtcccaaattgtatgtcactttacaataccaatgaaacattaatgttatttttcctattataaccttaactatttattactctctcttctttcaagtc |
332 |
Q |
| |
|
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12659050 |
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T |
 |
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ttttatttatctttttcat-----------aggacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatatgtg |
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| |
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|
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ttttatttatctttcccatgtaatttattaaggacaattttgtaaaacaactcataatatattttttccacacaatattaattacatttcttaatatgtg |
12659247 |
T |
 |
| Q |
422 |
tgaaatgcccaaaacgtcatacaattt |
448 |
Q |
| |
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| T |
12659248 |
tgaaatgcccaaaacgtcatacaattt |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #58
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Query Start/End: Original strand, 189 - 463
Target Start/End: Complemental strand, 8042636 - 8042358
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 |
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ctattataaccttaactatttattactctctcttctttcaagtcttttatttatctttttcat-----------aggacaattttgtaaaacaactcata |
377 |
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| |
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T |
 |
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atatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatatgtgtgaaatgcccaaaacgtcatacaatttaggatgaagggagta |
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| |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #59
Raw Score: 120; E-Value: 4e-61
Query Start/End: Original strand, 245 - 448
Target Start/End: Original strand, 6923068 - 6923276
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| |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #60
Raw Score: 120; E-Value: 4e-61
Query Start/End: Original strand, 182 - 448
Target Start/End: Original strand, 9201121 - 9201398
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282 |
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370 |
Q |
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T |
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371 |
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448 |
Q |
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| T |
9201321 |
attctttatatctctttctcacacaatattaattacatttcttaatatgtgtgaaatacctaaaacatcatacaattt |
9201398 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #61
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332 |
Q |
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T |
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333 |
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432 |
Q |
| |
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23991854 |
tttcatttatatttt--------caattttataaaagaactcataatatcttttttccacacaatattaattgcatttcttaatatgtgtgaaatgtcca |
23991945 |
T |
 |
| Q |
433 |
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445 |
Q |
| |
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||||||||||||| |
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|
| T |
23991946 |
aaacgtcatacaa |
23991958 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #62
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Target Start/End: Original strand, 28377677 - 28377919
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230 |
tatttgtcccaaattgtatgtcactttacaataccaatgaaacattaatgttatttttcctattataaccttaactatttattactctctcttctttcaa |
329 |
Q |
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tatttgtcccaaattgtatgtcactttacgataccaatgaaacattaatgttatttttcatattatattcttaattatttattactttttttt--ttcaa |
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T |
 |
| Q |
330 |
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418 |
Q |
| |
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||||| |||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| |
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|
| T |
28377775 |
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28377874 |
T |
 |
| Q |
419 |
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463 |
Q |
| |
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| T |
28377875 |
gtgtgaaatgcccaaaacgtcatacaatttgggacggagggagta |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #63
Raw Score: 120; E-Value: 4e-61
Query Start/End: Original strand, 190 - 464
Target Start/End: Complemental strand, 29619499 - 29619213
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190 |
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289 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |
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| T |
29619499 |
tactccctccgtcccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattatatgtcgttttacaataccaatgaaaaattaatgttacttttca |
29619400 |
T |
 |
| Q |
290 |
tattataaccttaactatttattactctctcttctttcaagtcttttatttatctttt-----tcat------aggacaattttgtaaaacaactcataa |
378 |
Q |
| |
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|
| T |
29619399 |
tattatatccttaactatttattactttctcttttttcaattccttcatttatctttcccttatcatttattgaggacaattttgtaaaacaactcataa |
29619300 |
T |
 |
| Q |
379 |
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464 |
Q |
| |
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|||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||| |
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|
| T |
29619299 |
tatctcatttccacataatattaattacatttcttaatatatgtgaaaatgcccaaaacgtcttacaatttgggatagagggagtaa |
29619213 |
T |
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Back To:
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Target: chr5; HSP #64
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Query Start/End: Original strand, 234 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 34381608 - 34381383
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333 |
Q |
| |
|
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T |
 |
| Q |
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422 |
Q |
| |
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| T |
34381508 |
ttcatttatcttttccataacatttattaaggatcgttttgtaaaacaactcataatatatctttcccacacaatattaattacatttcttaatatgtgt |
34381409 |
T |
 |
| Q |
423 |
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448 |
Q |
| |
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|
| T |
34381408 |
gatatgcccaaaacgtcatacaattt |
34381383 |
T |
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Back To:
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Target: chr5; HSP #65
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Query Start/End: Original strand, 232 - 463
Target Start/End: Original strand, 937834 - 938080
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331 |
Q |
| |
|
||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||| |||| |||||| | |
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| T |
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tttgttccaaattatatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattgtaaccttagttatttattactctatctt-tttcaatt |
937932 |
T |
 |
| Q |
332 |
cttttatttatctttttcata----------------ggacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaatattaattacatttcttaa |
415 |
Q |
| |
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| T |
937933 |
ctttcatttatctttcccatattatattatttattaaggacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccgcacaatattaattacatttcttaa |
938032 |
T |
 |
| Q |
416 |
tatgtgtgaaatgcccaaaacgtcatacaatttaggatgaagggagta |
463 |
Q |
| |
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| T |
938033 |
tatgtgtgaaatgcctaaaacgtcatacaatttaggacggagggagta |
938080 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #66
Raw Score: 119; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 231 - 448
Target Start/End: Original strand, 9246066 - 9246294
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| Q |
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330 |
Q |
| |
|
||||||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| | |||||||||||||||| |||||||||| || |
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| T |
9246066 |
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9246165 |
T |
 |
| Q |
331 |
tcttttatttatctttttcata-----------ggacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatatg |
419 |
Q |
| |
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| ||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | |
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|
| T |
9246166 |
tttttcatttatctttctcatatcatttattaaggacaattttgtaaaacaattcataatatctcttttccgcacaatattaattacatttcttaatacg |
9246265 |
T |
 |
| Q |
420 |
tgtgaaatgcccaaaacgtcatacaattt |
448 |
Q |
| |
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| T |
9246266 |
tgtgaaatgcccaaaacgttatataattt |
9246294 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #67
Raw Score: 119; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 231 - 448
Target Start/End: Original strand, 40555110 - 40555338
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| Q |
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atttgtcccaaattgtatgtcactttacaataccaatgaaacattaatgttatttttcctattataaccttaactatttattactctctcttctttcaag |
330 |
Q |
| |
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| T |
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T |
 |
| Q |
331 |
tcttttatttatctttttcat-----------aggacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatatg |
419 |
Q |
| |
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| T |
40555210 |
tatttcatttatcttttccataccatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttcctcacacaatattaattacatttcttaatacg |
40555309 |
T |
 |
| Q |
420 |
tgtgaaatgcccaaaacgtcatacaattt |
448 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
40555310 |
tgtgaaatggccaaaacgtcatacaattt |
40555338 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #68
Raw Score: 117; E-Value: 3e-59
Query Start/End: Original strand, 233 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 34900239 - 34900013
Alignment:
| Q |
233 |
ttgtcccaaattgtatgtcactttacaataccaatgaaacattaatgttatttttcctattataaccttaactatttattactctctcttctttcaagtc |
332 |
Q |
| |
|
|||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| | |
|
|
| T |
34900239 |
ttgtcccaaattatatgtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcctattatatccttaactattaattactctctcttctttcaatta |
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T |
 |
| Q |
333 |
ttttatttatctttttcat-----------aggacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatatgtg |
421 |
Q |
| |
|
||| ||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |
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| T |
34900139 |
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34900040 |
T |
 |
| Q |
422 |
tgaaatgcccaaaacgtcatacaattt |
448 |
Q |
| |
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||||||| |||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
34900039 |
tgaaatgaccaatacgtcatacaattt |
34900013 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #69
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Query Start/End: Original strand, 235 - 463
Target Start/End: Complemental strand, 9577709 - 9577471
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Q |
| |
|
|||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||| || ||||||||| | || |
|
|
| T |
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gtcccaaattatatgtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcctattatatccttaactattaattactccctattctttcaattatt |
9577610 |
T |
 |
| Q |
335 |
ttatttatctttttcata----------ggacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatatgtgtga |
424 |
Q |
| |
|
| ||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
9577609 |
tcatttatcttttccatacatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaatattaattacatttcttaatacgtgtga |
9577510 |
T |
 |
| Q |
425 |
aatgcccaaaacgtcatacaatttaggatgaagggagta |
463 |
Q |
| |
|
|||| |||||||||||||||||| ||| | |||||||| |
|
|
| T |
9577509 |
aatggtcaaaacgtcatacaatttgggacggagggagta |
9577471 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #70
Raw Score: 116; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 230 - 448
Target Start/End: Original strand, 15856341 - 15856570
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| Q |
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tatttgtcccaaattgtatgtcactttacaataccaatgaaacattaatgttatttttcctattataaccttaactatttattactctctcttctttcaa |
329 |
Q |
| |
|
|||||||| |||||| |||||| ||||||||| |||| ||| |||||||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
15856341 |
tatttgtctcaaattatatgtcgttttacaatatcaataaaaaattaatgttacttttcctattatatctttaactatttattactctctattctttcaa |
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T |
 |
| Q |
330 |
gtcttttatttatctttttcata-----------ggacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatat |
418 |
Q |
| |
|
|| || |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
15856441 |
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15856540 |
T |
 |
| Q |
419 |
gtgtgaaatgcccaaaacgtcatacaattt |
448 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
15856541 |
gtgtgaaatgtccaaaacttcatacaattt |
15856570 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #71
Raw Score: 116; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 190 - 463
Target Start/End: Complemental strand, 18473266 - 18472984
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Q |
| |
|
|||||| || |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
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18473167 |
T |
 |
| Q |
290 |
tattataaccttaactatttattactctctcttctttcaagtcttttatttatctttttcat-----------aggacaattttgtaaaacaactcataa |
378 |
Q |
| |
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|| |||| ||||||||||| ||||| | ||||||||||| ||||| |||||||||| |||| |||| ||||||||||| |||||||||| |
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|
| T |
18473166 |
tactatatccttaactatt--ttactttttcttctttcaattctttcatttatctttctcatatcatttattaaggataattttgtaaagcaactcataa |
18473069 |
T |
 |
| Q |
379 |
tatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatatgtgtgaaatgcccaaaacgtcatacaatttaggatgaagggagta |
463 |
Q |
| |
|
||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||| ||| | |||||||| |
|
|
| T |
18473068 |
tatttgtttctcacacaatattaattacatttcttaatatgtgtgaaaagcccaaaacctcgtacaatttgggacggagggagta |
18472984 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #72
Raw Score: 116; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 190 - 448
Target Start/End: Original strand, 22510400 - 22510669
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190 |
tactccatccgtcctaaattgtatgtcattttnnnnnnnntatttgtcccaaattgtatgtcactttacaataccaatgaaacattaatgttatttttcc |
289 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||| |||||||||| ||||| |
|
|
| T |
22510400 |
tactccctccgtcccaaattgtatgtcgttttggaaaaaaaatttgtcccaaattatatgtcgctttacaatatcaatgaaatattaatgttacttttca |
22510499 |
T |
 |
| Q |
290 |
tattataaccttaactatttattactctctcttctttcaagtcttttatttatctttttcata-----------ggacaattttgtaaaacaactcataa |
378 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||| | ||| ||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||| |
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|
| T |
22510500 |
tattatatccttaactattaattactccctcttctttcaattatttcatttatcttttccataccatttattaaggataattttgtaaaacaactcataa |
22510599 |
T |
 |
| Q |
379 |
tatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatatgtgtgaaatgcccaaaacgtcatacaattt |
448 |
Q |
| |
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| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| |
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|
| T |
22510600 |
tttctcttccccacacaatattaattacatttcttaatacgtgtgaaatggccaaaacgtcatacaattt |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #73
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Query Start/End: Original strand, 233 - 448
Target Start/End: Original strand, 6334994 - 6335211
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ttgtcccaaattgtatgtcactttacaataccaatgaaacattaatgttatttttcctattataaccttaactatttattactctctcttctttcaagtc |
332 |
Q |
| |
|
|||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||| |||||||||| | |||||||||| | |
|
|
| T |
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ttgtcccaaattatatgttactttacaataccaatgaaacattaatattacttttcctattatatccttaattatttattaccccttcttctttcattta |
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T |
 |
| Q |
333 |
ttttatttatctttttcat--aggacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatatgtgtgaaatgcc |
430 |
Q |
| |
|
| || | || | || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |
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|
| T |
6335094 |
tctttctcatatcatttattaaggacaattttgtaaaacaactcataatatctctttcccacgcaatattaattacatttcttaatacgtgtgaaatgcc |
6335193 |
T |
 |
| Q |
431 |
caaaacgtcatacaattt |
448 |
Q |
| |
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|||||||||||||||||| |
|
|
| T |
6335194 |
caaaacgtcatacaattt |
6335211 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #74
Raw Score: 115; E-Value: 4e-58
Query Start/End: Original strand, 231 - 466
Target Start/End: Original strand, 8035784 - 8036027
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330 |
Q |
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T |
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419 |
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T |
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466 |
Q |
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8036027 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #75
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Target Start/End: Original strand, 11312986 - 11313214
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Q |
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T |
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| Q |
331 |
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419 |
Q |
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| T |
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T |
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Q |
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| T |
11313186 |
tgtgaaatgcccaaaacgtcatacaattt |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #76
Raw Score: 115; E-Value: 4e-58
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Target Start/End: Original strand, 12503886 - 12504110
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Q |
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T |
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Q |
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T |
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446 |
Q |
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| T |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #77
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T |
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| Q |
331 |
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419 |
Q |
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| T |
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T |
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448 |
Q |
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| T |
15268314 |
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15268286 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #78
Raw Score: 115; E-Value: 4e-58
Query Start/End: Original strand, 231 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 22635778 - 22635550
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330 |
Q |
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T |
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| Q |
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419 |
Q |
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| T |
22635678 |
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22635579 |
T |
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| Q |
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448 |
Q |
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| T |
22635578 |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #79
Raw Score: 115; E-Value: 4e-58
Query Start/End: Original strand, 231 - 448
Target Start/End: Original strand, 32292494 - 32292722
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330 |
Q |
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T |
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| Q |
331 |
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419 |
Q |
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| T |
32292594 |
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32292693 |
T |
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| Q |
420 |
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448 |
Q |
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| T |
32292694 |
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T |
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Back To:
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Target: chr5; HSP #80
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Target Start/End: Original strand, 9248978 - 9249197
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Q |
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| Q |
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428 |
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| T |
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9249177 |
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| Q |
429 |
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448 |
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| T |
9249178 |
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9249197 |
T |
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Back To:
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Target: chr5; HSP #81
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Target Start/End: Original strand, 36487324 - 36487567
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330 |
Q |
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T |
 |
| Q |
331 |
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419 |
Q |
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| T |
36487424 |
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36487523 |
T |
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| Q |
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463 |
Q |
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| T |
36487524 |
tgtgaaatgctcaaaacgtcatacaatttgggacggagggagta |
36487567 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #82
Raw Score: 113; E-Value: 7e-57
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Target Start/End: Original strand, 3633969 - 3634207
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335 |
Q |
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| Q |
336 |
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424 |
Q |
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| T |
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3634168 |
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463 |
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| T |
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T |
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Back To:
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Target: chr5; HSP #83
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Q |
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 |
| Q |
332 |
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420 |
Q |
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| T |
21195176 |
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21195077 |
T |
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| Q |
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463 |
Q |
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| T |
21195076 |
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T |
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Back To:
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Target: chr5; HSP #84
Raw Score: 113; E-Value: 7e-57
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T |
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| Q |
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| T |
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41348775 |
T |
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| Q |
429 |
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448 |
Q |
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| T |
41348774 |
tctaaaacgtcatacaattt |
41348755 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #85
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332 |
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7458718 |
T |
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| Q |
333 |
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421 |
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| T |
7458719 |
tttcatttatctttcccataccatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttatcttccccacacaatattaattacatttcttaatatgtg |
7458818 |
T |
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422 |
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463 |
Q |
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| T |
7458819 |
tgaaatgaccaaaacgtcatacaatttaggacggagggagta |
7458860 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #86
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Target Start/End: Original strand, 14341793 - 14342027
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atttgtcccaaattgtatgtcactttacaataccaatgaaacattaatgttatttttcctattataaccttaactatttattactctctcttctttcaag |
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Q |
| |
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atttgtctcaaattatatgtcgctttacaatatcaatgaaacactaatgttatttttcctattatatccttaactatttattactctttcttctttcatt |
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T |
 |
| Q |
331 |
tcttttatttatctttttcat--aggacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatatgtgtgaaatg |
428 |
Q |
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| T |
14341893 |
tatatttcccatattatttattaaggacaattttgtaaaacaactcataatatttatgtcccacacaacattaattatatttcttaatacgtgtgaaatg |
14341992 |
T |
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| Q |
429 |
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463 |
Q |
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| T |
14341993 |
cccaaaacgtcatacaatttgggatagagggagta |
14342027 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #87
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ttgtcccaaattatatgtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcctattatatccttaactattaattactctctcttctttcaatta |
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T |
 |
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333 |
ttttatttatctttttcata-----------ggacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatatgtg |
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| T |
24781103 |
tttcatttatcttttccataccatttattagggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccgcacaatattaattaaatttcttaatacatg |
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T |
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422 |
tgaaatgcccaaaacgtcatacaatttaggatgaagggagta |
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| T |
24781003 |
tgaaattgccaaaacgtcatacaatttgggacggagggagta |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #88
Raw Score: 112; E-Value: 3e-56
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| T |
39932853 |
ttgtcccaaattatatgtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttatttttcctattatatccttgactattaattactctctcttctttcaatta |
39932952 |
T |
 |
| Q |
333 |
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421 |
Q |
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| T |
39932953 |
tttcatttatctttctcataccatttattaaggataattttgtaaaataactcataatttctcttccccacacaatattaattatatttcttaatacgtg |
39933052 |
T |
 |
| Q |
422 |
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463 |
Q |
| |
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| T |
39933053 |
tgaaatgatcaaaacgtcatacattttacgacggagggagta |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #89
Raw Score: 111; E-Value: 1e-55
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Target Start/End: Original strand, 9641060 - 9641288
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330 |
Q |
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atttgtcccaaattataagtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcctattatatctttaactattaattactccctcttctttcaat |
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T |
 |
| Q |
331 |
tcttttatttatctttttcat-----------aggacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatatg |
419 |
Q |
| |
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| T |
9641160 |
tatttcatttatcttttccataccatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttcacttccccacacaatattaattacatttcttaatacg |
9641259 |
T |
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| Q |
420 |
tgtgaaatgcccaaaacgtcatacaattt |
448 |
Q |
| |
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||||||||| ||||||||||||||||||| |
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| T |
9641260 |
tgtgaaatggccaaaacgtcatacaattt |
9641288 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #90
Raw Score: 110; E-Value: 4e-55
Query Start/End: Original strand, 197 - 448
Target Start/End: Original strand, 8225615 - 8225882
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296 |
Q |
| |
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tccgtcccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattatatgtcgctttacaataccaatgaataattaatgttacttttcctattata |
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T |
 |
| Q |
297 |
accttaactatttattactctctcttctttcaag-----tcttttatttatctttttcata-----------ggacaattttgtaaaacaactcataata |
380 |
Q |
| |
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| T |
8225715 |
tccttaacaatttattactctctcttctttcaatataatttcttcatttatctttctcatatcatttattgaggacaattttgtaaaacaactcataata |
8225814 |
T |
 |
| Q |
381 |
tctcttttccacacaatattaattacatttcttaatatgtgtgaaatgcccaaaacgtcatacaattt |
448 |
Q |
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| | ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |
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| T |
8225815 |
tttttttcctacacaatattaattacatttcttaatatgtgtgaaatgcccaaaacatcatacaattt |
8225882 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #91
Raw Score: 110; E-Value: 4e-55
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Target Start/End: Original strand, 9591395 - 9591602
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atttgtcccaaattgtatgtcactttacaataccaatgaaacattaatgttatttttcctattataaccttaactatttattactctctcttctttcaag |
330 |
Q |
| |
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atttgtctcaaattgtatgtcgctttacaatatcaatgcaactttaatgttatttttcctattataaccttaactatttattactctctcttatttcaat |
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T |
 |
| Q |
331 |
tcttttatttatctttttcat-----------aggacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatatg |
419 |
Q |
| |
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| T |
9591495 |
tctttcatttatttttcccatattatttattaaggacagttttgtaaaacaactcacaatatctcttttccacacaatattaattgcattttttaatatg |
9591594 |
T |
 |
| Q |
420 |
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427 |
Q |
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| T |
9591595 |
tgtgaaat |
9591602 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #92
Raw Score: 110; E-Value: 4e-55
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Target Start/End: Original strand, 32833614 - 32833837
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339 |
Q |
| |
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| T |
32833614 |
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32833713 |
T |
 |
| Q |
340 |
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428 |
Q |
| |
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| T |
32833714 |
tatcttttccataccatttattagggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaatattaattacattttttaatatgtgtgaaatg |
32833813 |
T |
 |
| Q |
429 |
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452 |
Q |
| |
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| T |
32833814 |
gccaaaatatcatacaatttagga |
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T |
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Target: chr5; HSP #93
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Query Start/End: Original strand, 233 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 440083 - 439857
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332 |
Q |
| |
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|
| T |
440083 |
ttgtcccaaattatatgtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcctattatatctttaactattaattactctctcttctttcaatta |
439984 |
T |
 |
| Q |
333 |
ttttatttatctttttcata-----------ggacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatatgtg |
421 |
Q |
| |
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| T |
439983 |
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439884 |
T |
 |
| Q |
422 |
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448 |
Q |
| |
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| T |
439883 |
tgaaatggccaaaatgtcatacaattt |
439857 |
T |
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Back To:
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Target: chr5; HSP #94
Raw Score: 109; E-Value: 2e-54
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Target Start/End: Complemental strand, 10602074 - 10601826
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326 |
Q |
| |
|
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|
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| T |
10602074 |
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10601975 |
T |
 |
| Q |
327 |
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415 |
Q |
| |
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| T |
10601974 |
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10601875 |
T |
 |
| Q |
416 |
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464 |
Q |
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| T |
10601874 |
tatgtgtgaaatagccaaaacgtcatacaatttaggacggagggagtaa |
10601826 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #95
Raw Score: 109; E-Value: 2e-54
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Target Start/End: Complemental strand, 18026182 - 18025912
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288 |
Q |
| |
|
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| T |
18026182 |
ttactccctccgtcccaaattgtatgtcgctttggaaaaaatatttgtcccaaattatatgtcgctttacaatatcaatgaaatatttatgttacttttc |
18026083 |
T |
 |
| Q |
289 |
ctattataaccttaactatttattactctctcttctttcaagtcttttatttatctttttcata-----------ggacaattttgtaaaacaactcata |
377 |
Q |
| |
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||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||| |
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| T |
18026082 |
ctattctatccttaactattaattactctctcttctttcaattatttcatttatcttttacataccatttattagggataattttgtaaaacaactcata |
18025983 |
T |
 |
| Q |
378 |
atatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatatgtgtgaaatgcccaaaacgtcatacaattt |
448 |
Q |
| |
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|
| T |
18025982 |
atttctcttccccacgcaatattaattacatttcttaatacgtgtgaaatggccaaaacgtcttacaattt |
18025912 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #96
Raw Score: 109; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 233 - 464
Target Start/End: Complemental strand, 40365530 - 40365288
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| Q |
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332 |
Q |
| |
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|
| T |
40365530 |
ttgtcccaaattatatgtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttatttttcatattatatccttaattattaattactctctcttcttttaatta |
40365431 |
T |
 |
| Q |
333 |
ttttatttatctttttcata-----------ggacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatatgtg |
421 |
Q |
| |
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||| ||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |
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| T |
40365430 |
tttcatttatcttttccataccatttattagggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccatacaatattaattacatttcttaatatgtg |
40365331 |
T |
 |
| Q |
422 |
tgaaatgcccaaaacgtcatacaatttaggatgaagggagtaa |
464 |
Q |
| |
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| T |
40365330 |
tgaaatagccaaaacttcttacaatttgggacggagggagtaa |
40365288 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #97
Raw Score: 107; E-Value: 3e-53
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334 |
Q |
| |
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gtcccaaattatatgtcgttttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcctattatatcattaactattaattactccctcttctttcaattatt |
10934890 |
T |
 |
| Q |
335 |
ttatttatctttttcata-----------ggacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatatgtgtg |
423 |
Q |
| |
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| |||||| |||| |||| ||| |||||||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
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| T |
10934889 |
tcatttattttttccatatcatttattagggataattttgtaatacaactcataatttctcttccccacacaatattaattacatttcttaatatgtgtg |
10934790 |
T |
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| Q |
424 |
aaatgcccaaaacgtcatacaatttaggatgaagggagtaa |
464 |
Q |
| |
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||||| |||||||||| |||||||| ||| | ||||||||| |
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| T |
10934789 |
aaatggccaaaacgtcgtacaatttgggacggagggagtaa |
10934749 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #98
Raw Score: 107; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 233 - 463
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| Q |
233 |
ttgtcccaaattgtatgtcactttacaataccaatgaaacattaatgttatttttcctattataaccttaactatttattactctctcttctttcaagtc |
332 |
Q |
| |
|
||||| |||||| ||||| ||||| ||||| ||| || ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |
|
|
| T |
30077373 |
ttgtctcaaattatatgttgctttataatactaatacaatattaatgttgtttttcctattataaccctaactatttattactctctcttctttcaattc |
30077274 |
T |
 |
| Q |
333 |
ttttatttatctttttcatag----------gacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatatgtgt |
422 |
Q |
| |
|
||| |||||| ||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |
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| T |
30077273 |
tttcatttatttttctcatattatttatcaagataattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacagaatattaattacatttctta--atgtgt |
30077176 |
T |
 |
| Q |
423 |
gaaatgcccaaaacgtcatacaatttaggatgaagggagta |
463 |
Q |
| |
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||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||| |
|
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| T |
30077175 |
gaaatacccaaaacgtcatacaatttgagacgaagggagta |
30077135 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #99
Raw Score: 107; E-Value: 3e-53
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Q |
| |
|
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|
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gtcctaaattgtatgtcactttagaaaaaatatctgttccaaattgtatgtcactttagaatactaatgaaacattaatgttacttttcctattatatca |
39410590 |
T |
 |
| Q |
300 |
ttaactatttattactctctcttctttcaagtcttttatttatctt-----tttcat------aggacaattttgtaaaacaactcataatatctctttt |
388 |
Q |
| |
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| T |
39410589 |
ttaactatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccgtatcatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatatctttttc |
39410490 |
T |
 |
| Q |
389 |
ccacacaatattaattacatttcttaatatgtgtgaaatgcccaaa |
434 |
Q |
| |
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| T |
39410489 |
ccacacaatattaattatattttttaatatgtgtgaaatgcccaaa |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #100
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Target Start/End: Original strand, 11247960 - 11248203
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330 |
Q |
| |
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11247960 |
atttgtcccaaattatatgtcgctttacaataccaatgaaatatttatgttacttttcctattatatccttaactattaattaccctctcttctttcaat |
11248059 |
T |
 |
| Q |
331 |
tcttttatttatctttttcata-----------ggacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatatg |
419 |
Q |
| |
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| ||| ||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||||| | |
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| T |
11248060 |
tatttcatttatcttttccataccatttattagggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacgcaatattaattacatttcttaatacg |
11248159 |
T |
 |
| Q |
420 |
tgtgaaatgcccaaaacgtcatacaatttaggatgaagggagta |
463 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||||||| |||||||| ||| | |||||||| |
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| T |
11248160 |
tgtgaaattgtcaaaacgtcttacaatttgggacggagggagta |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #101
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Query Start/End: Original strand, 231 - 463
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| |
|
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|
| T |
4744745 |
atttgtcccaaattatatgtcgctttacaataccaatgaaatattaatgatacttttcctattatatctttaactattaattactctctcttctttcaat |
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T |
 |
| Q |
331 |
tcttttatttatcttt---------ttcat--aggacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatatg |
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Q |
| |
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| ||| |||||||||| || || |||| ||||||||||||||||||||||| | | || ||||||||||||||| ||||||||||||||| |
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| T |
4744845 |
tatttcatttatctttcctataccatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttattttccccacacaatattaatgacatttcttaatatg |
4744944 |
T |
 |
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420 |
tgtgaaatgcccaaaacgtcatacaatttaggatgaagggagta |
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Q |
| |
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| T |
4744945 |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #102
Raw Score: 105; E-Value: 4e-52
Query Start/End: Original strand, 190 - 420
Target Start/End: Original strand, 10370547 - 10370789
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289 |
Q |
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10370547 |
tactccctccgtcccaaattgtatgtcattttagaaaaaatatttgtcccaaattatatgtcgctttacaatattaataaaaaattaatgttacttttcc |
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T |
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tattataaccttaactatttattactctctcttctttcaagtcttttatttatctt------tttcat------aggacaattttgtaaaacaactcata |
377 |
Q |
| |
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| T |
10370647 |
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10370746 |
T |
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| Q |
378 |
atatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatatgt |
420 |
Q |
| |
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|||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |
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|
| T |
10370747 |
atatctctttcccacacaatattaattacatttcttaatatgt |
10370789 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #103
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Q |
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T |
 |
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336 |
tatttatctttttcat-----------aggacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatatgtgtga |
424 |
Q |
| |
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22801822 |
catttatctttctcatatcatttattaaggataattttataaaataactcataatatctttttccaacac-atattaattacatttcttaatatgtgtga |
22801724 |
T |
 |
| Q |
425 |
aatgcccaaaacgtcatacaatttaggatgaagggagta |
463 |
Q |
| |
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|||||||||||| ||||||||||||| | ||||| |||| |
|
|
| T |
22801723 |
aatgcccaaaacatcatacaatttagaacgaaggaagta |
22801685 |
T |
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Back To:
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Target: chr5; HSP #104
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Q |
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T |
 |
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358 |
attttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatatgtgtgaaatgcccaaaacgtcatacaatttaggat |
453 |
Q |
| |
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|
| T |
26630551 |
attttgtaaaacaactaataatatcttttttccacacgatattaattgcattttttaatatgtgtgaaatgtccaaaacgtaatacaatttgggat |
26630646 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #105
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Target Start/End: Complemental strand, 33629970 - 33629739
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327 |
Q |
| |
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T |
 |
| Q |
328 |
aagtcttttatttatctttttcata-----------ggacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaatattaattacatttcttaat |
416 |
Q |
| |
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| T |
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T |
 |
| Q |
417 |
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Q |
| |
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| |||||||||| ||||||||||||||||||| |
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|
| T |
33629770 |
acgtgtgaaatgaccaaaacgtcatacaattt |
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T |
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Target: chr5; HSP #106
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330 |
Q |
| |
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| T |
5070820 |
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T |
 |
| Q |
331 |
tcttttatttatctttttcat---------------aggacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaatattaattacatttcttaa |
415 |
Q |
| |
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| ||| ||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| |
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| T |
5070920 |
tatttaatttatcttttccataccatttatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaatattaattacatttcttaa |
5071019 |
T |
 |
| Q |
416 |
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439 |
Q |
| |
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| T |
5071020 |
tacgtgtgaaatagccaaaacgtc |
5071043 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #107
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 233 - 464
Target Start/End: Complemental strand, 35584952 - 35584705
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327 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
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T |
 |
| Q |
328 |
aagtcttttatttatctttttcata-----------ggacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaatattaattacatttcttaat |
416 |
Q |
| |
|
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| T |
35584852 |
aattatttcatttatctttttcataccatttattagggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacgcaatattaattacatttcttaat |
35584753 |
T |
 |
| Q |
417 |
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464 |
Q |
| |
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| T |
35584752 |
acgtgtgaaatggccaaaacgtcttacaatttgggacggagggagtaa |
35584705 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #108
Raw Score: 101; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 233 - 424
Target Start/End: Original strand, 10164719 - 10164921
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332 |
Q |
| |
|
||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||| ||||||| | |
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|
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T |
 |
| Q |
333 |
ttttatttatctttttcat-----------aggacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatatgtg |
421 |
Q |
| |
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| T |
10164819 |
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10164918 |
T |
 |
| Q |
422 |
tga |
424 |
Q |
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||| |
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|
| T |
10164919 |
tga |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #109
Raw Score: 100; E-Value: 4e-49
Query Start/End: Original strand, 236 - 463
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335 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
8883244 |
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8883341 |
T |
 |
| Q |
336 |
tatttatctttt-----tcat------aggacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaatattaattacatttcttaata--tgtgt |
422 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
8883342 |
catttatctttccaatatcatttattgaggacaattttgtaaaacaactcataatatctctttcctacacaatattaattatatttcttaatatgtgtgt |
8883441 |
T |
 |
| Q |
423 |
gaaatgcccaaaacgtcatacaatttaggatgaagggagta |
463 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||| |
|
|
| T |
8883442 |
gaaatgcccaaaacgtcatacaatttgggacggagggagta |
8883482 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #110
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Query Start/End: Original strand, 265 - 459
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Q |
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|
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aatgaaacattaattttacttttcttattatatccttaactatttattactttttcttcttttaattctttcatttatctttctcatatcatttattaag |
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T |
 |
| Q |
354 |
gacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatatgtgtgaaatgcccaaaacgtcatacaatttaggat |
453 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
37410808 |
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37410907 |
T |
 |
| Q |
454 |
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459 |
Q |
| |
|
| |||| |
|
|
| T |
37410908 |
ggaggg |
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T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #111
Raw Score: 99; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 190 - 463
Target Start/End: Complemental strand, 31196335 - 31196051
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| Q |
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289 |
Q |
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|
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|
|
| T |
31196335 |
tactccctccgtcccaaattgtatgtcactttggaaattttttttgtcccaaattgtatgtcgctttacaataccaataaatcattaatgttacttttcc |
31196236 |
T |
 |
| Q |
290 |
tattataaccttaactatttattactctctcttctttcaagtcttttatttatctttttcata-----------ggacaattttgtaaaacaactcataa |
378 |
Q |
| |
|
||||||| |||| |||||||||| ||||| ||| |||||| || |||||||||| ||||| |||||||||||||||| || |||||| |
|
|
| T |
31196235 |
tattatatccttcactatttattgtcttctctacttccaagtcattcatttatctttctcatatcatttattaaggacaattttgtaaaataattcataa |
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T |
 |
| Q |
379 |
tatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatatgtgtgaaatgcccaaaacgtcatacaatttaggatgaagggagta |
463 |
Q |
| |
|
||||| ||| ||||| || ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||| | |||||||| |
|
|
| T |
31196135 |
tatctatttcccacataaaattaattacattttttaatacgtgtgaaatgcccaaaacgtcgtacaatttgggacggagggagta |
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T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #112
Raw Score: 98; E-Value: 6e-48
Query Start/End: Original strand, 189 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 5847087 - 5846819
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288 |
Q |
| |
|
||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||| |||||| |||| ||||| ||||||| |||||||||| ||||| |
|
|
| T |
5847087 |
ttactccctccgtcctaaattgtatgtcgctttggaaaaaaaatttgtcctaaattatatgtcgttttataatactaatgaaatattaatgttacttttc |
5846988 |
T |
 |
| Q |
289 |
ctattataaccttaactatttattactctctcttctttcaagtcttttatttatctttttcata-----------ggacaattttgtaaaacaactcata |
377 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||| | ||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
5846987 |
ctattatatccttaactattaattactctct--tctttcaattattttatttatcttttccataccatttattaaggataattttgtaaaacaactcata |
5846890 |
T |
 |
| Q |
378 |
atatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatatgtgtgaaatgcccaaaacgtcatacaattt |
448 |
Q |
| |
|
|| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
5846889 |
atttctcttccccacacaatattaattacatttcttaatacgtgtgaaatcggcaaaacgtcatacaattt |
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T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #113
Raw Score: 98; E-Value: 6e-48
Query Start/End: Original strand, 231 - 463
Target Start/End: Complemental strand, 27535054 - 27534811
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330 |
Q |
| |
|
||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||| || |
|
|
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27535054 |
atttgtcttaaattatatgtcgctttacaataccaatgaaatatttatgttatttttcctattatatcattaactattaattactctctcttcttttaat |
27534955 |
T |
 |
| Q |
331 |
tcttttatttatctttttcata-----------ggacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatatg |
419 |
Q |
| |
|
| ||| ||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||| |||||||| | |
|
|
| T |
27534954 |
tatttcatttatcttttccataccatttattagggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacgcaatattaattacatctcttaatacg |
27534855 |
T |
 |
| Q |
420 |
tgtgaaatgcccaaaacgtcatacaatttaggatgaagggagta |
463 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||||||| |||||||| ||| | |||||||| |
|
|
| T |
27534854 |
tgtgaaatggtcaaaacgtcttacaatttgggacggagggagta |
27534811 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #114
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Query Start/End: Original strand, 232 - 447
Target Start/End: Complemental strand, 33894 - 33668
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tttgtcccaaattgtatgtcactttacaataccaatgaaacattaatgttatttttcctattataaccttaactatttattactctctcttctttcaagt |
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Q |
| |
|
||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||| | |||| |||| |||||||| |||||||| || | |
|
|
| T |
33894 |
tttgtcccaaattatatgtcgctttgcaataccaatgaaacaataatgttttttttcctactatatcattaaatattcattactctatcttcttttaatt |
33795 |
T |
 |
| Q |
332 |
cttttatttatctttttcata-----------ggacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatatgt |
420 |
Q |
| |
|
|||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| |||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
33794 |
ctttcatttatctttcccatatcatttattaaggacaattttgtaaaacaactcataatatctttttcccacacaaaattaattatatttcttaatatgt |
33695 |
T |
 |
| Q |
421 |
gtgaaatgcccaaaacgtcatacaatt |
447 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
33694 |
atgaaatgaccaaaacgttatacaatt |
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T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #115
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Query Start/End: Original strand, 231 - 463
Target Start/End: Complemental strand, 13090108 - 13089865
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atttgtcccaaattgtatgtcactttacaataccaatgaaacattaatgttatttttcctattataaccttaactatttattactctctcttctttcaag |
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Q |
| |
|
|||||||| ||||| || ||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||| |||| |
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|
| T |
13090108 |
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T |
 |
| Q |
331 |
tcttttatttatctttt-----tcat------aggacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatatg |
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Q |
| |
|
|| || |||||| ||| |||| ||||||||||| |||||||| |||||||||| |||| | |||||| |||||||||||||||||||| | |
|
|
| T |
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tcattcatttatttttcctatatcatttactaaggacaattttataaaacaattcataatatccctttccaacacaaaattaattacatttcttaatacg |
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T |
 |
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| |
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||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |
|
|
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #116
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Query Start/End: Original strand, 233 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 40275419 - 40275193
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332 |
Q |
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T |
 |
| Q |
333 |
ttttatttatctttttcata-----------ggacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatatgtg |
421 |
Q |
| |
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|
|
| T |
40275319 |
attcatttatctttcccatatcatttattaaggacaattttgtaaaacaactcataatatctctttctcacacaaaattaattacatttcttaatgcgtg |
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T |
 |
| Q |
422 |
tgaaatgcccaaaacgtcatacaattt |
448 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||||||| |||||||| |
|
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| T |
40275219 |
tgaaatacccaaaacgtcgtacaattt |
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T |
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Target: chr5; HSP #117
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Q |
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T |
 |
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330 |
gtcttttatttatctttttcat-----------aggacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatat |
418 |
Q |
| |
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||||| |||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||| | ||||||| |
|
|
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T |
 |
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419 |
gtgtgaaatgcccaaaacgtcatacaattt |
448 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
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T |
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Target: chr5; HSP #118
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332 |
Q |
| |
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| T |
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2620181 |
T |
 |
| Q |
333 |
ttttatttatctttttcata------------ggacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatatgt |
420 |
Q |
| |
|
||| ||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |
|
|
| T |
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tttcatttatcttttccataccatttattaaaggataattttgtaaaacaactcataatttctctaccccacacaatattaattacatttcttaatacgt |
2620081 |
T |
 |
| Q |
421 |
gtgaaatgcccaaaacgtcatacaatttaggatgaagggagta |
463 |
Q |
| |
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||| |||| ||||||||||||||||||| ||| | |||||||| |
|
|
| T |
2620080 |
gtgtaatggccaaaacgtcatacaatttgggacggagggagta |
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T |
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Target: chr5; HSP #119
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Target Start/End: Complemental strand, 14640237 - 14639998
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332 |
Q |
| |
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| T |
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14640140 |
T |
 |
| Q |
333 |
ttttatttatctttttcata-----------ggacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatatgtg |
421 |
Q |
| |
|
||| | ||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |
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| T |
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tttcacttatcttttccataccatttattagggataattttgtaaaacaactcataatttctcttctccacgcaatattaattacatttcttaatacgtg |
14640040 |
T |
 |
| Q |
422 |
tgaaatgcccaaaacgtcatacaatttaggatgaagggagta |
463 |
Q |
| |
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|||||| |||||||||| |||||||| ||| | |||||||| |
|
|
| T |
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tgaaattgccaaaacgtcttacaatttgggacggagggagta |
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T |
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Target: chr5; HSP #120
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Q |
| |
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T |
 |
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331 |
tcttttatttatctttttcat-----------aggacaattttgt-aaaacaactcataatatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatat |
418 |
Q |
| |
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| ||| |||||||||| ||| |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| |
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| T |
19282584 |
tatttcatttatctttcccatattatttattaaggataattttgtaaaaacaactcataatatctcttttccacataatattaattgcatttcttaatat |
19282485 |
T |
 |
| Q |
419 |
gtgtga |
424 |
Q |
| |
|
|||||| |
|
|
| T |
19282484 |
gtgtga |
19282479 |
T |
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Target: chr5; HSP #121
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Query Start/End: Original strand, 231 - 466
Target Start/End: Original strand, 39630554 - 39630799
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330 |
Q |
| |
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| T |
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T |
 |
| Q |
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tcttttatttatctttttcata-----------ggacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatatg |
419 |
Q |
| |
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| T |
39630654 |
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T |
 |
| Q |
420 |
tgtgaaatgcccaaaacgtcatacaatttaggatgaagggagtaatt |
466 |
Q |
| |
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|
|
| T |
39630753 |
tgtgaaatagccaaaacgtcatacaatttgggacagagggagtaatt |
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T |
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Back To:
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Target: chr5; HSP #122
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Target Start/End: Original strand, 18652260 - 18652489
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345 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
18652260 |
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18652359 |
T |
 |
| Q |
346 |
tttcata-----------ggacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatatgtgtgaaatgcccaaa |
434 |
Q |
| |
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| ||||| ||| |||||||||||||||||||| || |||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||| |
|
|
| T |
18652360 |
tctcataccatttattaaggataattttgtaaaacaactcatgatttctcttccccatacaatattaattatatttcttaatacgtgtgaaatggccaaa |
18652459 |
T |
 |
| Q |
435 |
acgtcatacaatttaggatgaagggagtaa |
464 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||| ||| | ||||||||| |
|
|
| T |
18652460 |
acgtcatacattttgggacggagggagtaa |
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T |
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Target: chr5; HSP #123
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Query Start/End: Original strand, 231 - 449
Target Start/End: Original strand, 2881861 - 2882086
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Q |
| |
|
|||| ||||||||| |||||| ||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| |
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|
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2881861 |
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T |
 |
| Q |
331 |
tcttttatttatctttttcat-----------aggacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatatg |
419 |
Q |
| |
|
||||| |||||| |||| ||| ||||||||||| |||||||| ||||||||| | |||||||| ||| ||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
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tctttcatttatattttccatattatttattaaggacaattttataaaacaattcataatatattttttccac---ataataattgcatttcttaatatg |
2882057 |
T |
 |
| Q |
420 |
tgtgaaatgcccaaaacgtcatacaattta |
449 |
Q |
| |
|
| ||||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
2882058 |
tctgaaatg-ccaaaacgtcatacaattta |
2882086 |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #124
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Query Start/End: Original strand, 230 - 416
Target Start/End: Complemental strand, 43403475 - 43403280
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| Q |
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329 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||| |||||| | ||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
43403475 |
tatttgttccaaattatatgtcgcattacaataccaatgaaaaattaatattacttttcctattatatccttaactatttattact--ctcttctttcaa |
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T |
 |
| Q |
330 |
gtcttttatttatctttttcat-----------aggacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaatattaattacatttcttaat |
416 |
Q |
| |
|
|| || |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
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ttccttcatttatctttctcatatcatttattgaggacaattttgtaaaacaactcataatatctttttcccacacaattttaattacatttcttaat |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #125
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Query Start/End: Original strand, 230 - 397
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Q |
| |
|
||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
20656500 |
tatttgtcctaaattatatgtcgctttacaataccaatgaaaaattaatgttacttttcctattatatccttaactatttattacactctcttctttcaa |
20656401 |
T |
 |
| Q |
330 |
gtcttttatttatctt-----tttcat------aggacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaat |
397 |
Q |
| |
|
|| |||||||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| |
|
|
| T |
20656400 |
ttcctttatttatctttccaatatcatttattgaggacaattttgtaaaacaactcataatatctttttcccacacaat |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #126
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352 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| | |||| |||| ||||||| |||||||||||| | ||| ||||||||||| |||| |
|
|
| T |
21582735 |
tttacaataccaatgaaatattaatgttattttttctattatatcattaattattaattactccctcttctttcaattatttcatttatcttttccatac |
21582636 |
T |
 |
| Q |
353 |
----------ggacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatatgtgtgaaatgcccaaaacgtcata |
442 |
Q |
| |
|
| | |||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
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catttattaagcataattttgtaaaacaactcctaatttctcttccccacacaatattaattatatttcttaatacgtgtgaaatgaccaaaacgtcatt |
21582536 |
T |
 |
| Q |
443 |
caatttaggatgaagggagtaa |
464 |
Q |
| |
|
|||||| ||| | ||||||||| |
|
|
| T |
21582535 |
caatttgggacggagggagtaa |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #127
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Target Start/End: Original strand, 28024605 - 28024856
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Q |
| |
|
||||| |||||| |||||| |||| |||||||||| |||||||||| || |||| |||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||| || |
|
|
| T |
28024605 |
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T |
 |
| Q |
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ttttatttatcttt--------ttcat--aggacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccac---------acaatattaattacatttctt |
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Q |
| |
|
||| |||||| ||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
28024705 |
tttcatttatttttccatataatttattaaggacaattttgtaaaacaactcataatatctattttccacacaatattaacaatattaattgtatttctt |
28024804 |
T |
 |
| Q |
414 |
aatatgtgtgaaatgcccaaaacgtcatacaatttaggatgaagggagtaat |
465 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| | |||||||||| |
|
|
| T |
28024805 |
aatatgtgtgaaatacccaaaacgtcatacaatttgggacggagggagtaat |
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T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #128
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Q |
| |
|
|||||||||||| |||||| ||||| ||||||||| || |||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||| | ||||| ||||||| |
|
|
| T |
16626287 |
ttgtcccaaattatatgtcgctttataataccaataaatattattaatgttactttttctattatatccttaactatttattattttctctcatttcaag |
16626386 |
T |
 |
| Q |
331 |
tcttttatttatctttttcat----------aggacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatatgt |
420 |
Q |
| |
|
|| || ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || |
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|
| T |
16626387 |
tcattcatttatctttttcatgtctttattaaggacaattttgtaaaacaactcataatatctctttcccacacaaaattaattacatttcttaatacgt |
16626486 |
T |
 |
| Q |
421 |
gt |
422 |
Q |
| |
|
|| |
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|
| T |
16626487 |
gt |
16626488 |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #129
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 246 - 448
Target Start/End: Original strand, 21486686 - 21486899
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345 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| |||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |
|
|
| T |
21486686 |
tatgtcgctttacaataccaataaaacattaatgttactttttctgttatatccttaactatttattactctctcttctttcaattctttaatttatctt |
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T |
 |
| Q |
346 |
tttcat-----------aggacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatatgtgtgaaatgcccaaa |
434 |
Q |
| |
|
|| ||| |||| |||||||||||||| || | |||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||| || | |||||| ||| |
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|
| T |
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ttccataacatttattaaggaaaattttgtaaaacagcttacaatatctcttccccatacaaaattaattacatttcttaatgcgtataaaatgctgaaa |
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T |
 |
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435 |
acgtcatacaattt |
448 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |
|
|
| T |
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acgtcatacaattt |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #130
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Query Start/End: Original strand, 231 - 347
Target Start/End: Original strand, 1313245 - 1313361
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| |
|
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|
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T |
 |
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331 |
tcttttatttatctttt |
347 |
Q |
| |
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||| | |||||| |||| |
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|
| T |
1313345 |
tctctaatttatgtttt |
1313361 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #131
Raw Score: 81; E-Value: 8e-38
Query Start/End: Original strand, 352 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 4890056 - 4889960
Alignment:
| Q |
352 |
aggacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatatgtgtgaaatgcccaaaacgtcatacaattt |
448 |
Q |
| |
|
|||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
4890056 |
aggataattttgtaaaacaactcataatatctctttcctacacaatattaattacatttcttaatatatgtgaaatgcccaaaacgtcatacaattt |
4889960 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #132
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 307 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 10832760 - 10832608
Alignment:
| Q |
307 |
tttattactctctcttctttcaagtcttttatttatctttttcata-----------ggacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacaca |
395 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |
|
|
| T |
10832760 |
tttattactctctcttctttcaattttttcatttatcttttccatattatttataatggacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacata |
10832661 |
T |
 |
| Q |
396 |
atattaattacatttcttaatatgtgtgaaatgcccaaaacgtcatacaattt |
448 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
10832660 |
atattaattgtatttcttaatatgtgtgaaatatccaaaacgtcatacaattt |
10832608 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #133
Raw Score: 78; E-Value: 5e-36
Query Start/End: Original strand, 254 - 410
Target Start/End: Complemental strand, 2123889 - 2123722
Alignment:
| Q |
254 |
tttacaataccaatgaaacattaatgttatttttcctattataaccttaactatttattactctctcttctttcaagtcttttatttatctttttcat-- |
351 |
Q |
| |
|
||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||| | |||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||| |||| |
|
|
| T |
2123889 |
tttacaataccgatgaaacattaatattatttttcttattatatcattaactatttattattctctcttctttcatttctttaatttatctttctcatac |
2123790 |
T |
 |
| Q |
352 |
---------aggacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaatattaattacattt |
410 |
Q |
| |
|
|||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| |
|
|
| T |
2123789 |
catttattaaggataattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaaaattaattatattt |
2123722 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #134
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 233 - 410
Target Start/End: Complemental strand, 24520613 - 24520422
Alignment:
| Q |
233 |
ttgtcccaaattgtatgtcactttacaataccaatgaaacattaatgttatttttcctattataaccttaactatttattactctctcttctttcaagtc |
332 |
Q |
| |
|
|||||| ||||| |||||| ||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||| | |
|
|
| T |
24520613 |
ttgtcctaaattatatgtcgctttataataccaattaaatattaatgttatttttcctattatatccttaactattaattactctcccttctttcaatta |
24520514 |
T |
 |
| Q |
333 |
tttt---atttatctttttcat-----------aggacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaatattaattacattt |
410 |
Q |
| |
|
|||| ||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
24520513 |
ttttttcatttatcttttccataccatttattaaggataattttgtaaaacaacttataatttctcttccccacacaatattaattacattt |
24520422 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #135
Raw Score: 71; E-Value: 8e-32
Query Start/End: Original strand, 354 - 436
Target Start/End: Original strand, 16745463 - 16745545
Alignment:
| Q |
354 |
gacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatatgtgtgaaatgcccaaaac |
436 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
16745463 |
gacaattttgtaaaacaactcataatatttcttttccaaacaatattaattacatttcttaatatgtgtgaaatacccaaaac |
16745545 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #136
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 240 - 352
Target Start/End: Complemental strand, 3099268 - 3099156
Alignment:
| Q |
240 |
aaattgtatgtcactttacaataccaatgaaacattaatgttatttttcctattataaccttaactatttattactctctcttctttcaagtcttttatt |
339 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||| |
|
|
| T |
3099268 |
aaattgtatgtcactttacgataccaattaaacattaatgttactttttctattatatccttaactatttattactcattcttctttcaattctttcatt |
3099169 |
T |
 |
| Q |
340 |
tatctttttcata |
352 |
Q |
| |
|
||| ||| ||||| |
|
|
| T |
3099168 |
tatttttctcata |
3099156 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #137
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 352 - 448
Target Start/End: Original strand, 13033192 - 13033288
Alignment:
| Q |
352 |
aggacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatatgtgtgaaatgcccaaaacgtcatacaattt |
448 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
13033192 |
aggacaattttgtaaatcaattcataatatctcttttgcacacaatattaattgtgtttcttaatatgtgtgaaatgcccaaaacgtcatgcaattt |
13033288 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #138
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 352 - 448
Target Start/End: Original strand, 13103165 - 13103261
Alignment:
| Q |
352 |
aggacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatatgtgtgaaatgcccaaaacgtcatacaattt |
448 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
13103165 |
aggacaattttgtaaatcaattcataatatctcttttgcacacaatattaattgtgtttcttaatatgtgtgaaatgcccaaaacgtcatgcaattt |
13103261 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #139
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 231 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 15251365 - 15251250
Alignment:
| Q |
231 |
atttgtcccaaattgtatgtcactttacaataccaatgaaacattaatgttatttttcctattataaccttaactatttattactctctcttctttcaag |
330 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
15251365 |
atttgtcccaaattataagttgctttacaataccaatgaaacattgatgttatttttccttttat-accataactatttattactctcttttctttcaat |
15251267 |
T |
 |
| Q |
331 |
tcttttatttatctttt |
347 |
Q |
| |
|
||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
15251266 |
tctttaatttatctttt |
15251250 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #140
Raw Score: 66; E-Value: 7e-29
Query Start/End: Original strand, 352 - 445
Target Start/End: Complemental strand, 3098307 - 3098214
Alignment:
| Q |
352 |
aggacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatatgtgtgaaatgcccaaaacgtcatacaa |
445 |
Q |
| |
|
|||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| |
|
|
| T |
3098307 |
aggataattttgtaaaacaactcataatatctctttcctatacagtattaattacatttcttaatatgtgtgaaatgcccaaagcatcatacaa |
3098214 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #141
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 352 - 448
Target Start/End: Original strand, 1122555 - 1122651
Alignment:
| Q |
352 |
aggacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatatgtgtgaaatgcccaaaacgtcatacaattt |
448 |
Q |
| |
|
|||| |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| || |||||||| |
|
|
| T |
1122555 |
aggataattttataaaacaactcataatatctctttcccacacaatattaattacatttattaatatgtgtgaaatgcctaaaatatcgtacaattt |
1122651 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #142
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 231 - 335
Target Start/End: Original strand, 5288887 - 5288991
Alignment:
| Q |
231 |
atttgtcccaaattgtatgtcactttacaataccaatgaaacattaatgttatttttcctattataaccttaactatttattactctctcttctttcaag |
330 |
Q |
| |
|
||||||| |||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
5288887 |
atttgtctcaaattatatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttattttttctattataattttaattatttattactatctcttctttcaat |
5288986 |
T |
 |
| Q |
331 |
tcttt |
335 |
Q |
| |
|
||||| |
|
|
| T |
5288987 |
tcttt |
5288991 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #143
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 352 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 16284922 - 16284827
Alignment:
| Q |
352 |
aggacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatatgtgtgaaatgcccaaaacgtcatacaattt |
448 |
Q |
| |
|
|||| ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
16284922 |
aggataattttgtaaaacaactcataatatattttttccacacaatattaattgtatttcttaatatgtgtg-aatgcccaaaacatcatacaattt |
16284827 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #144
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 254 - 352
Target Start/End: Original strand, 15251413 - 15251510
Alignment:
| Q |
254 |
tttacaataccaatgaaacattaatgttatttttcctattataaccttaactatttattactctctcttctttcaagtcttttatttatctttttcata |
352 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| | | |||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
15251413 |
tttacaataccaatgaaacattaatgttacttttcctactataccataaactgtttattactctctcttctttcaattc-tttatttatctttctcata |
15251510 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #145
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 352 - 420
Target Start/End: Complemental strand, 86699 - 86631
Alignment:
| Q |
352 |
aggacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatatgt |
420 |
Q |
| |
|
|||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
86699 |
aggagaattttgtaaaacaactcataatatctctttcccacacaaaattaattacatttcttaatatgt |
86631 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #146
Raw Score: 56; E-Value: 7e-23
Query Start/End: Original strand, 190 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 4890220 - 4890113
Alignment:
| Q |
190 |
tactccatccgtcctaaattgtatgtcattttnnnnnnnnta-tttgtcccaaattgtatgtcactttacaataccaatgaaacattaatgttatttttc |
288 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
4890220 |
tactccatccgtcctaaattgtatgtcactttagaaaaaaaaatttgttctaaattgtatgtcactttacaataccaatgaaacattaatgttacttttc |
4890121 |
T |
 |
| Q |
289 |
ctattata |
296 |
Q |
| |
|
|||||||| |
|
|
| T |
4890120 |
ctattata |
4890113 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #147
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 253 - 448
Target Start/End: Original strand, 24806816 - 24807022
Alignment:
| Q |
253 |
ctttacaataccaatgaaacattaatgttatttttcctattataaccttaactatttattactctctcttctttcaagtcttttatttatctttttcata |
352 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||||| |||||||||| |||| |||| || | |||||||||||||| ||| || |||| || ||||| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
24806816 |
ctttacaatatcaatgaaaaattaatgttaatttttctatgatgtctttaactatttattattcttcctccttttaattctttcatttatctttttcata |
24806915 |
T |
 |
| Q |
353 |
g---------gacaattttgtaaaacaactcat---aatatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatatgtgtgaaatgcccaaaacgtca |
440 |
Q |
| |
|
|| |||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||| | ||||||||| |
|
|
| T |
24806916 |
tcttattaaagataattttgtaaaacaactcatgataatatctttttgtcacacaaaattaattatatttcttaatacgtgtgaaatg-ctaaaacgtca |
24807014 |
T |
 |
| Q |
441 |
tacaattt |
448 |
Q |
| |
|
|| ||||| |
|
|
| T |
24807015 |
tataattt |
24807022 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #148
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 264 - 352
Target Start/End: Complemental strand, 37148227 - 37148139
Alignment:
| Q |
264 |
caatgaaacattaatgttatttttcctattataaccttaactatttattactctctcttctttcaagtcttttatttatctttttcata |
352 |
Q |
| |
|
|||| |||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||| ||||| |
|
|
| T |
37148227 |
caataaaacattaatgttatttttctttttatatccttaactatttattactctctcttctttcacttctttaatttatttttctcata |
37148139 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #149
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 254 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 28119088 - 28119014
Alignment:
| Q |
254 |
tttacaataccaatgaaacattaatgttatttttcctattataaccttaactatttattactctctcttctttcaa |
329 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
28119088 |
tttacaataccaatgaaacattaatgttacttttcctatta-caccttaactgtttattactctctattctttcaa |
28119014 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #150
Raw Score: 51; E-Value: 7e-20
Query Start/End: Original strand, 366 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 39914376 - 39914295
Alignment:
| Q |
366 |
aaacaactcataatatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatatgtgtgaaatgcccaaaacgtcatacaattt |
448 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| || || ||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
39914376 |
aaacaactcgtaatatctcttttccacacaaaattaattacatttcttaatacgtgtaaagtg-ccaaaacgtcatataattt |
39914295 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #151
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 273 - 346
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| Q |
273 |
attaatgttatttttcctattataaccttaactatttattactctctcttctttcaagtcttttatttatcttt |
346 |
Q |
| |
|
|||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| |||||||||| |
|
|
| T |
13032973 |
attaatgttattctttctattataaccttaactatttattaatctttcttctttcaattctttcatttatcttt |
13033046 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #152
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 273 - 346
Target Start/End: Original strand, 13102946 - 13103019
Alignment:
| Q |
273 |
attaatgttatttttcctattataaccttaactatttattactctctcttctttcaagtcttttatttatcttt |
346 |
Q |
| |
|
|||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| |||||||||| |
|
|
| T |
13102946 |
attaatgttattctttctattataaccttaactatttattaatctttcttctttcaattctttcatttatcttt |
13103019 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #153
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 352 - 436
Target Start/End: Complemental strand, 26091810 - 26091726
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| Q |
352 |
aggacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatatgtgtgaaatgcccaaaac |
436 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||| ||| |||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||| |
|
|
| T |
26091810 |
aggacaattttgtaaaacacctcataatatctttttcccattcaaaattaattacatttcttaatacgtgtaaaatgtccaaaac |
26091726 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #154
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 268 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 2993259 - 2993202
Alignment:
| Q |
268 |
gaaacattaatgttatttttcctattataaccttaactatttattactctctcttctt |
325 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
2993259 |
gaaacattaatgttatttttcctattatatcattaactatttattactctatcttctt |
2993202 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #155
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 401 - 465
Target Start/End: Complemental strand, 590235 - 590171
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| Q |
401 |
aattacatttcttaatatgtgtgaaatgcccaaaacgtcatacaatttaggatgaagggagtaat |
465 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||| |
|
|
| T |
590235 |
aattacatttcttaatatatgtgaaatgtccaaaacatcatacaatttgggacgaagggagtaat |
590171 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #156
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 397 - 465
Target Start/End: Complemental strand, 20655049 - 20654981
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| Q |
397 |
tattaattacatttcttaatatgtgtgaaatgcccaaaacgtcatacaatttaggatgaagggagtaat |
465 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| | | |||||||| |
|
|
| T |
20655049 |
tattaattacatttcttaatatgtgtgaaatatccaaaacgtcatacaatttgggacggaaggagtaat |
20654981 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #157
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Target Start/End: Complemental strand, 9375306 - 9375233
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| Q |
239 |
caaattgtatgtcactttacaataccaatgaaacattaatgttatttttcctattataaccttaactatttatt |
312 |
Q |
| |
|
|||||| |||||| |||||||||| ||||||| |||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
9375306 |
caaattatatgtcgttttacaatacaaatgaaatattaatgttaattttgctattatatccttaactatttatt |
9375233 |
T |
 |
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Target: chr5; HSP #158
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| Q |
356 |
caattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatatgtgtgaaatg |
428 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| ||||||||| |||| || | || |||||||||||||||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
4745609 |
caattttgtaaaacaacttataatatctatttttcatataaaattaattacatttcttaatacatgtgaaatg |
4745681 |
T |
 |
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| Q |
233 |
ttgtcccaaattgtatgtcactttacaataccaatgaaacattaatgttatttttcctattataaccttaactatttattactctctcttctttca |
328 |
Q |
| |
|
|||||||||||| |||||| |||| ||| ||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||| | |||||||||| |
|
|
| T |
590377 |
ttgtcccaaattatatgtcgttttagaatcccaatacaactttaatgttacttttcctattataacctt-actatctattactatttcttctttca |
590283 |
T |
 |
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| Q |
412 |
ttaatatgtgtgaaatgcccaaaacgtcatacaatttaggatgaagggagta |
463 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||||| |
|
|
| T |
10371449 |
ttaatatgtgtgaaattcccaaaacgtcatacaatttaggacggagggagta |
10371500 |
T |
 |
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| Q |
273 |
attaatgttatttttcctattataaccttaactatttattactctctcttctttcaagtcttttatttatctttttcata |
352 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||| | ||||| |||||| |||| |||| |
|
|
| T |
31747854 |
attaatgttacttttcctgttatatccttaattatttattactctctattctttcgattctttaatttatattttccata |
31747933 |
T |
 |
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| Q |
265 |
aatgaaacattaatgttatttttcctattataaccttaactatttattactctctcttctttcaagtcttttatttatctttttcata |
352 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| ||| ||||| ||||||| ||||| ||||||||||| | |||||||| || ||||| |||||||||| ||||| |
|
|
| T |
37410447 |
aatgaaacattaattttacttttcttattatatccttagctatttattaccttttcttcttttaattctttcatttatctttctcata |
37410534 |
T |
 |
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Target: chr5; HSP #163
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| Q |
190 |
tactccatccgtcctaaattgtatgtcattttnnnnnnnntatttgtcccaaattgtatgtcactttacaataccaatgaaacattaatgt |
280 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||| ||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
4060856 |
tactccctccgtcccaaattgtatgtcactttggaaattttttttgtcccaaattgtatgtcgttttacaataccaatgaatcattaatgt |
4060766 |
T |
 |
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| Q |
254 |
tttacaataccaatgaaacattaatgttatttttcctattataaccttaactatttatt |
312 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||| ||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
6436142 |
tttacaatactaattaaatattaatgttattttttctattatacccttaactatttatt |
6436084 |
T |
 |
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Target: chr5; HSP #165
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| Q |
399 |
ttaattacatttcttaatatgtgtgaaatgcccaaaacgtcatacaatttaggatgaagggagtaat |
465 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||| ||||| | |||||||| |
|
|
| T |
28118960 |
ttaattacatttcttaatatgtgtgaaatgttcaaaacgtcttataatttgggatggaaggagtaat |
28118894 |
T |
 |
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Target: chr5; HSP #166
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| Q |
254 |
tttacaataccaatgaaac-attaatgttatttttcctattataaccttaactatttattactctctcttctttcaagtcttttatttatctttt |
347 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| | |||| ||||||||| ||||| ||||||||| | ||| |||||| |||| |
|
|
| T |
42550858 |
tttacaataccaatgaaattattaatgtcatttttcctattatacctttaaatatttatta-tctcttttctttcaattatttaatttatttttt |
42550765 |
T |
 |
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Target: chr5; HSP #167
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| Q |
231 |
atttgtcccaaattgtatgtcactttacaataccaatgaaacatt-aatgttatttttcctattataaccttaactatttattactctctcttctttcaa |
329 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| || ||||| ||||||||| ||||| |||| |||| || |||||||| |||| ||| ||||||||| || |||||||||||||| |
|
|
| T |
13510621 |
atttgtcccaaattataagtcacactacaataccgatgaagcattaaatgctacttttcctactataccctcaactatttacta--ctctcttctttcaa |
13510524 |
T |
 |
| Q |
330 |
gtcttttatttat |
342 |
Q |
| |
|
||||| |||||| |
|
|
| T |
13510523 |
ttctttaatttat |
13510511 |
T |
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| Q |
369 |
caactcataatatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatatgtgtgaaatg |
428 |
Q |
| |
|
||||||||||||| ||||||| | |||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
39612924 |
caactcataatatttcttttcaatacaaaattaattacattttttaatatgtatgaaatg |
39612983 |
T |
 |
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Target: chr5; HSP #169
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| Q |
254 |
tttacaataccaatgaaacattaatgttatttttcctattataaccttaactattt |
309 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
40485053 |
tttacaatatcaatgaaacattattgttattttttatattatagccttaactattt |
40485108 |
T |
 |
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Target: chr5; HSP #170
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| Q |
233 |
ttgtcccaaattgtatgtcactttacaataccaatgaaacattaatgttatttttcctattataaccttaactatttattact |
315 |
Q |
| |
|
||||| |||||| || ||| |||||||||| | ||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
26332222 |
ttgtctcaaattataagtcgttttacaatactagtgaaatattaatgttatttttcttattatactcttaactgtttattact |
26332140 |
T |
 |
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| Q |
414 |
aatatgtgtgaaatgcccaaaacgtcatacaattt |
448 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
43402423 |
aatatgtgtgaaatgcccaaaacgtcatacaattt |
43402389 |
T |
 |
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Target: chr5; HSP #172
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| Q |
230 |
tatttgtcccaaattgtatgtcactttacaataccaatgaaacatt |
275 |
Q |
| |
|
||||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| |
|
|
| T |
1108228 |
tatttgttccaaattgtatgtcactttagaatatcaatgaaacatt |
1108273 |
T |
 |
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Target: chr5; HSP #173
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| Q |
254 |
tttacaataccaatgaaacattaatgttatttttcctatta-taaccttaactatttattactctctcttctttcaagtcttttatttatctttttcata |
352 |
Q |
| |
|
|||| |||| |||| | ||||||| ||||||||| |||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||| | ||| |||||| ||| ||||| |
|
|
| T |
4911612 |
tttataatatcaataatacattaacgttattttttctattactataattaactatttattattctctcttctttcaattgtttaatttatatttatcata |
4911513 |
T |
 |
| Q |
353 |
g |
353 |
Q |
| |
|
| |
|
|
| T |
4911512 |
g |
4911512 |
T |
 |
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Target: chr5; HSP #174
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| Q |
352 |
aggacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatatgtgtgaaatg |
428 |
Q |
| |
|
|||| |||||||||||| || ||||| || | || ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
13510490 |
aggataattttgtaaaatgacctataatttcacgttcccatacaatattaattacatttcttaatttgtgtgaaatg |
13510414 |
T |
 |
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Target: chr5; HSP #175
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| Q |
364 |
taaaacaactcataatatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatatgtgtgaaatgcccaaaa |
435 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||||||| |||||| | | || ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
26678239 |
taaaacaacttataatattacttttcaatataaaattaattacattt-ttaatatgtgtgaaatgctcaaaa |
26678309 |
T |
 |
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Target: chr5; HSP #176
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| Q |
364 |
taaaacaactcataatatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatatgtgtgaaatgcccaaaa |
435 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||||||| |||||| | | || ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
26949849 |
taaaacaacttataatattacttttcaatataaaattaattacattt-ttaatatgtgtgaaatgctcaaaa |
26949919 |
T |
 |
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| Q |
370 |
aactcataatatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatatgtgtgaaatg |
428 |
Q |
| |
|
|||||||||| | ||||| || |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
7196803 |
aactcataatttttctttatcatacaaaattaattacatttcttaatttgtgtgaaatg |
7196861 |
T |
 |
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240 |
aaattgtatgtcactttacaataccaatgaaacattaatgttatttttcctattataaccttaactatttattactctctcttcttt |
326 |
Q |
| |
|
|||||||| ||| ||||||||| |||| ||| ||||||||||||||| |||||||| | || | | ||||||||||| | |||||| |
|
|
| T |
8077283 |
aaattgtaagtcgttttacaatatcaataaaatattaatgttattttttctattatatcttttattgtttattactcttttttcttt |
8077369 |
T |
 |
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| Q |
240 |
aaattgtatgtcactttacaataccaatgaaacattaatgtta |
282 |
Q |
| |
|
||||| |||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
16745349 |
aaattatatgtcgctttacaataccaatgaaatattaatgtta |
16745391 |
T |
 |
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| Q |
230 |
tatttgtcccaaattgtatgtcactttacaataccaatg |
268 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
32238073 |
tatttgtctcaaattgtatgtcactttagaataccaatg |
32238035 |
T |
 |
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| Q |
354 |
gacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatatgtgtgaaatgcccaaaa |
435 |
Q |
| |
|
|||||||| |||||||||||| ||||||||||||| || | || |||||||| |||| || ||| || | |||||| ||||| |
|
|
| T |
20145723 |
gacaatttggtaaaacaactcgtaatatctctttttcatataaaattaattatattttttgatacgtataaaatgctcaaaa |
20145804 |
T |
 |
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| Q |
231 |
atttgtcccaaattgtatgtcactttacaataccaatgaaacatt-aatgttatttttcctattataaccttaactatttattactctctcttctttcaa |
329 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| || ||| | ||||||||| ||||| |||| |||| || |||||||| |||| ||| ||||||||| | |||||||||||||| |
|
|
| T |
21780570 |
atttgtcccaaattataagtcgcactacaataccgatgaagcattaaatgctacttttcctactataccctcaactatttacaa--ctctcttctttcaa |
21780667 |
T |
 |
| Q |
330 |
gtcttttatttat |
342 |
Q |
| |
|
||||| |||||| |
|
|
| T |
21780668 |
ttctttaatttat |
21780680 |
T |
 |
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| Q |
352 |
aggacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaatattaattacatttcttaata |
417 |
Q |
| |
|
|||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||| ||||||| |||| |||||| |
|
|
| T |
40871438 |
aggataattttgtaaaacaactaataatatctttttctcacacaacattaattctattttttaata |
40871503 |
T |
 |
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| Q |
238 |
ccaaattgtatgtcactttacaataccaatgaaacattaatgttatttttcctattataaccttaactatttattact |
315 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||||||||||||| ||| ||| |||| | ||| |||||||||||| || | ||||||||||||| |
|
|
| T |
41954731 |
ccaaattatatgtcactttacaataacaaggaatcattgacgtttattttcctattatgccccttactatttattact |
41954654 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
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| Q |
355 |
acaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatatgtgtgaaatgcccaaaacgtcatacaatttaggatg |
454 |
Q |
| |
|
||||| || ||||| || ||||||||| ||||| || ||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||| || ||| ||||| || | |
|
|
| T |
2993161 |
acaatcttataaaataagtcataatatttctttctcatacaatattaattaaatttcttaatacacatgaaatgtccaaaatgttatataatttgagacg |
2993062 |
T |
 |
| Q |
455 |
aagggagta |
463 |
Q |
| |
|
||||||||| |
|
|
| T |
2993061 |
aagggagta |
2993053 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #186
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 255 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 4911403 - 4911347
Alignment:
| Q |
255 |
ttacaataccaatgaaacattaatgttat-ttttcctattataaccttaactattta |
310 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
4911403 |
ttacaatacaaatgaaatattaatgttatttttttctattatatccttaagtattta |
4911347 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #187
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 352 - 428
Target Start/End: Original strand, 21780701 - 21780777
Alignment:
| Q |
352 |
aggacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatatgtgtgaaatg |
428 |
Q |
| |
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|
|
| T |
21780701 |
aggataattttgtaaaatgacttataatttcatgttcccatacaatattaattacacttcttaatttgtgtgaaatg |
21780777 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #188
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 360 - 396
Target Start/End: Complemental strand, 31196004 - 31195968
Alignment:
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360 |
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396 |
Q |
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|
|
| T |
31196004 |
tttgtaaaacaactcataatatctatttcccacacaa |
31195968 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4 (Bit Score: 202; Significance: 1e-110; HSPs: 244)
Name: chr4
Description:
Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 191 - 448
Target Start/End: Original strand, 6920604 - 6920861
Alignment:
| Q |
191 |
actccatccgtcctaaattgtatgtcattttnnnnnnnntatttgtcccaaattgtatgtcactttacaataccaatgaaacattaatgttatttttcct |
290 |
Q |
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||||| ||||||| ||||||||||||| ||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
6920604 |
actccctccgtcccaaattgtatgtcactttataaaaaatatttatcctaaattgtatgtcactttacaataccaatgaaacattaatgttacttttcct |
6920703 |
T |
 |
| Q |
291 |
attataaccttaactatttattactctctcttctttcaagtcttttatttatctttttcataggacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttcc |
390 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
6920704 |
attataaccttaactatttattactctctcttctttcaagtcttttatttatcttttccataggacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttcc |
6920803 |
T |
 |
| Q |
391 |
acacaatattaattacatttcttaatatgtgtgaaatgcccaaaacgtcatacaattt |
448 |
Q |
| |
|
||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
6920804 |
acacaatatcaattacatttcttaatatgtgtgaaatgcccaaaacgtcatacaattt |
6920861 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 193; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 188 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 42179732 - 42179472
Alignment:
| Q |
188 |
attactccatccgtcctaaattgtatgtcattttnnnnnnnntatttgtcccaaattgtatgtcactttacaataccaatgaaacattaatgttattttt |
287 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| |
|
|
| T |
42179732 |
attactccctccgtcccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttacaataccaatgaaacattgatgttactttt |
42179633 |
T |
 |
| Q |
288 |
cctattataaccttaactatttattactctctcttctttcaagtcttttatttatctttttcataggacaattttgtaaaacaactcataatatctcttt |
387 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
42179632 |
cctattataaccttaactattcattactctctcttctttcaagtcttttatttatctttcccatagaacaattttgtaaaacaactcataatatctcttt |
42179533 |
T |
 |
| Q |
388 |
tccacacaatattaattacatttcttaatatgtgtgaaatgcccaaaacgtcatacaattt |
448 |
Q |
| |
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|| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
42179532 |
tctacacaatattaattacatttcttaatacgtgtgaaatgcccaaaacgtcatacaattt |
42179472 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 179; E-Value: 3e-96
Query Start/End: Original strand, 230 - 463
Target Start/End: Original strand, 51624885 - 51625121
Alignment:
| Q |
230 |
tatttgtcccaaattgtatgtcactttaca---ataccaatgaaacattaatgttatttttcctattataaccttaactatttattactctctcttcttt |
326 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
51624885 |
tatttgtttcaaattgtatgtcactttatactaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattataactttaactatttattactctcttttcttt |
51624984 |
T |
 |
| Q |
327 |
caagtcttttatttatctttttcataggacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatatgtgtgaaa |
426 |
Q |
| |
|
|| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
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| T |
51624985 |
caggtcttttatttatcttttccataggacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatatgtgtgaaa |
51625084 |
T |
 |
| Q |
427 |
tgcccaaaacgtcatacaatttaggatgaagggagta |
463 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| ||| | |||||||| |
|
|
| T |
51625085 |
tgcccaaaacgtcatacaatttgggacggagggagta |
51625121 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 171; E-Value: 2e-91
Query Start/End: Original strand, 230 - 463
Target Start/End: Complemental strand, 27383675 - 27383432
Alignment:
| Q |
230 |
tatttgtcccaaattgtatgtcactttacaataccaatgaaacattaatgttatttttcctattataaccttaactatttattactctctcttctttcaa |
329 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
27383675 |
tatttgtctcaaattgtatgtcactttacaataccaataaaacattaatgttatttttcctattataaccttaactatttattactctctcttctttcaa |
27383576 |
T |
 |
| Q |
330 |
gtcttttatttatctttttcat-----------aggacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatat |
418 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
27383575 |
gtcttttatttatcttttccatattatttattaaggacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaatattaattacattt-ttaatat |
27383477 |
T |
 |
| Q |
419 |
gtgtgaaatgcccaaaacgtcatacaatttaggatgaagggagta |
463 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||||||||||||||||||| ||| | |||||||| |
|
|
| T |
27383476 |
gtgtgaaatgtccaaaacgtcatacaatttgggacggagggagta |
27383432 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 166; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 230 - 463
Target Start/End: Complemental strand, 25367485 - 25367241
Alignment:
| Q |
230 |
tatttgtcccaaattgtatgtcactttacaataccaatgaaacattaatgttatttttcctattataaccttaactatttattactctctcttctttcaa |
329 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
25367485 |
tatttgtcccaaattgtatgtcactttacaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattataaccttaactatttattactctctcttctttcaa |
25367386 |
T |
 |
| Q |
330 |
gtcttttatttatcttt---------ttcat--aggacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatat |
418 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
25367385 |
gtcttttatttatctttcctatattatttattaaggacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttctacataatattaattacatttcttaatat |
25367286 |
T |
 |
| Q |
419 |
gtgtgaaatgcccaaaacgtcatacaatttaggatgaagggagta |
463 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||||||||||||||| ||| | |||||||| |
|
|
| T |
25367285 |
gtgtgaaatgttcaaaacgtcatacaatttgggacggagggagta |
25367241 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 163; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 190 - 463
Target Start/End: Original strand, 45250070 - 45250354
Alignment:
| Q |
190 |
tactccatccgtcctaaattgtatgtcattttnnnnnnnntatttgtcccaaattgtatgtcactttacaataccaatgaaacattaatgttatttttcc |
289 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |
|
|
| T |
45250070 |
tactccctccgtcccaaattgtatgtcattttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcgctttacaataccaatgaaaaattaatgttacttttcc |
45250169 |
T |
 |
| Q |
290 |
tattataaccttaactatttattactctctcttctttcaagtcttttatttatctttttcata-----------ggacaattttgtaaaacaactcataa |
378 |
Q |
| |
|
||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
45250170 |
tattatatccttaactatttattactctctcttctttcaattcattcatttatctttcccatatcatttattgaggacaattttgtaaaacaactcataa |
45250269 |
T |
 |
| Q |
379 |
tatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatatgtgtgaaatgcccaaaacgtcatacaatttaggatgaagggagta |
463 |
Q |
| |
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||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||| |
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|
| T |
45250270 |
tatctctttcccacacaatattaattacatttcttaatatgtgtgaaatgcccaaaacgtcatacaatttgggacggagggagta |
45250354 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 159; E-Value: 2e-84
Query Start/End: Original strand, 190 - 463
Target Start/End: Original strand, 48380573 - 48380857
Alignment:
| Q |
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tactccatccgtcctaaattgtatgtcattttnnnnnnnntatttgtcccaaattgtatgtcactttacaataccaatgaaacattaatgttatttttcc |
289 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
48380573 |
tactccctccgtcccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttatttttcc |
48380672 |
T |
 |
| Q |
290 |
tattataaccttaactatttattactctctcttctttcaagtcttttatttatctttttcata-----------ggacaattttgtaaaacaactcataa |
378 |
Q |
| |
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||||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||| |||||| |||| |||| ||| |||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
48380673 |
tattatatccttaactatttattactctttcttttttcaattctttcatttattttttccatatcatttattaaggataattttgtaaaacaactcataa |
48380772 |
T |
 |
| Q |
379 |
tatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatatgtgtgaaatgcccaaaacgtcatacaatttaggatgaagggagta |
463 |
Q |
| |
|
||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||| |
|
|
| T |
48380773 |
tatctctttcccacacaatattaattacatttcttaatatgtgtgaaatgcccaaaacgtcatacaatttgggacggagggagta |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 155; E-Value: 6e-82
Query Start/End: Original strand, 190 - 463
Target Start/End: Complemental strand, 4294210 - 4293926
Alignment:
| Q |
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tactccatccgtcctaaattgtatgtcattttnnnnnnnntatttgtcccaaattgtatgtcactttacaataccaatgaaacattaatgttatttttcc |
289 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
4294210 |
tactccctccgtcccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattatatgtcgctttacaataccaatgaaacattaatgttatttttcc |
4294111 |
T |
 |
| Q |
290 |
tattataaccttaactatttattactctctcttctttcaagtcttttatttatctttttcata-----------ggacaattttgtaaaacaactcataa |
378 |
Q |
| |
|
||||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
4294110 |
tattatatccttaactatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccatatcatttattaaggacaattttgtaaaacatctcataa |
4294011 |
T |
 |
| Q |
379 |
tatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatatgtgtgaaatgcccaaaacgtcatacaatttaggatgaagggagta |
463 |
Q |
| |
|
||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||| |
|
|
| T |
4294010 |
tatctctttcccacacaatattaattacatttcttaatatgtgtgaaatgcccaaaacgtcatacaatttgggacggagggagta |
4293926 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 154; E-Value: 2e-81
Query Start/End: Original strand, 239 - 448
Target Start/End: Original strand, 35836101 - 35836321
Alignment:
| Q |
239 |
caaattgtatgtcactttacaataccaatgaaacattaatgttatttttcctattataaccttaactatttattactctctcttctttcaagtcttttat |
338 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
35836101 |
caaattgtatgtcactttacaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattataactttaactatttattattctctcttctttcaaatcttttat |
35836200 |
T |
 |
| Q |
339 |
ttatcttt---------ttcat--aggacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatatgtgtgaaat |
427 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
35836201 |
ttatctttccaatattatttattaaggacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatatatgtgaaat |
35836300 |
T |
 |
| Q |
428 |
gcccaaaacgtcatacaattt |
448 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
35836301 |
gcccaaaacgtcatacaattt |
35836321 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 151; E-Value: 1e-79
Query Start/End: Original strand, 230 - 463
Target Start/End: Complemental strand, 11248989 - 11248745
Alignment:
| Q |
230 |
tatttgtcccaaattgtatgtcactttacaataccaatgaaacattaatgttatttttcctattataaccttaactatttattactctctcttctttcaa |
329 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||| |
|
|
| T |
11248989 |
tatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatccttaactatttattactctttcttttttcaa |
11248890 |
T |
 |
| Q |
330 |
gtcttttatttatctttttcata-----------ggacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatat |
418 |
Q |
| |
|
||||| |||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
11248889 |
ttctttcatttatctttcccatatcatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatatctctttcccacacaatattaattacatttcttaatat |
11248790 |
T |
 |
| Q |
419 |
gtgtgaaatgcccaaaacgtcatacaatttaggatgaagggagta |
463 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||| |
|
|
| T |
11248789 |
gtgtgaaatgcccaaaacgtcatacaatttgggacggagggagta |
11248745 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 149; E-Value: 2e-78
Query Start/End: Original strand, 188 - 467
Target Start/End: Complemental strand, 25771261 - 25770971
Alignment:
| Q |
188 |
attactccatccgtcctaaattgtatgtcattttnnnnnnnntatttgtcccaaattgtatgtcactttacaataccaatgaaacattaatgttattttt |
287 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||| |
|
|
| T |
25771261 |
attactccctccgtcccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacatcaatgttactttt |
25771162 |
T |
 |
| Q |
288 |
cctattataaccttaactatttattactctctcttctttcaagtcttttatttatctttttcat-----------aggacaattttgtaaaacaactcat |
376 |
Q |
| |
|
||||||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||| |||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
25771161 |
cctattatatccttaactatttattactctttcttttttcaattctttcatttatttttttcatattatttattaaggataattttgtaaaacaactcat |
25771062 |
T |
 |
| Q |
377 |
aatatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatatgtgtgaaatgcccaaaacgtcatacaatttaggatgaagggagtaattt |
467 |
Q |
| |
|
||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||| |
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|
| T |
25771061 |
aatatttctttcccacacaatattaattacatttcttaatatgtgtgaaatgcccaaaacgtcgtacaatttgggacagagggagtaattt |
25770971 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 148; E-Value: 9e-78
Query Start/End: Original strand, 190 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 49236040 - 49235771
Alignment:
| Q |
190 |
tactccatccgtcctaaattgtatgtcattttnnnnnnnntatttgtcccaaattgtatgtcactttacaataccaatgaaacattaatgttatttttcc |
289 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
49236040 |
tactccctccgtcccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattctatgtcgctttacaataccaatgaaaaattaatgttatttttcc |
49235941 |
T |
 |
| Q |
290 |
tattataaccttaactatttattactctctcttctttcaagtcttttatttatctttttcat-----------aggacaattttgtaaaacaactcataa |
378 |
Q |
| |
|
||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
49235940 |
tattatatccttaactatttattactctctcttctttcaattcattcatttatctttctcatatcatttattgaggacaattttgtaaaacaactcataa |
49235841 |
T |
 |
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379 |
tatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatatgtgtgaaatgcccaaaacgtcatacaattt |
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Q |
| |
|
||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |
|
|
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49235840 |
tatctattttccacacaatattaattatattttttaatatgtgtgaaatgcccaaaacatcatacaattt |
49235771 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 148; E-Value: 9e-78
Query Start/End: Original strand, 186 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 56038701 - 56038428
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Q |
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aaattactccctccgtcccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcgctttacaatatcaatgaaaaattaatgttattt |
56038602 |
T |
 |
| Q |
286 |
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374 |
Q |
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| T |
56038601 |
ttcctattatatccttaactatttattactctctcttctttcaattccttcatttatctttcccatatcatttattgaggacaattttataaaacaactc |
56038502 |
T |
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| Q |
375 |
ataatatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatatgtgtgaaatgcccaaaacgtcatacaattt |
448 |
Q |
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|
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| T |
56038501 |
ataatatctctttcccacataatattaattacatttcttaatatgtgtgaaatgcccaaaacgtcatataattt |
56038428 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 147; E-Value: 3e-77
Query Start/End: Original strand, 230 - 463
Target Start/End: Complemental strand, 29495004 - 29494760
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329 |
Q |
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T |
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| Q |
330 |
gtcttttatttatctttttcata-----------ggacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatat |
418 |
Q |
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| T |
29494904 |
taccttcatttatctttcccatatcatttattgaggacaattttgtaaaacaactcataatatctctttcccacacaatattaattacatttcttaatat |
29494805 |
T |
 |
| Q |
419 |
gtgtgaaatgcccaaaacgtcatacaatttaggatgaagggagta |
463 |
Q |
| |
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| T |
29494804 |
gtgtgaaatgcccaaaacgtcatacaatttgggacggagggagta |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 147; E-Value: 3e-77
Query Start/End: Original strand, 190 - 463
Target Start/End: Complemental strand, 30088879 - 30088595
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T |
 |
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290 |
tattataaccttaactatttattactctctcttctttcaagtcttttatttatctttttcata-----------ggacaattttgtaaaacaactcataa |
378 |
Q |
| |
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| T |
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tattatatccttaactatttattactctctcttctttcaatttcttcatttatctttcccatatcatttattgaggacaattttgtaaaacaactcataa |
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T |
 |
| Q |
379 |
tatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatatgtgtgaaatgcccaaaacgtcatacaatttaggatgaagggagta |
463 |
Q |
| |
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tatatctttcccacacaatattaattacatttcttaatacgtgtgaaatgcccaaaacgtcatacaatttgggacggagggagta |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 147; E-Value: 3e-77
Query Start/End: Original strand, 187 - 464
Target Start/End: Original strand, 42168274 - 42168562
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286 |
Q |
| |
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42168274 |
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T |
 |
| Q |
287 |
tcctattataaccttaactatttattactctctcttctttcaagtcttttatttatctttttcata-----------ggacaattttgtaaaacaactca |
375 |
Q |
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| T |
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tcctattatatctttaactatttattactctttcttttttcaaatctttcatttatctttcccatatcatttattaaggataattttgtaaaacaactca |
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T |
 |
| Q |
376 |
taatatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatatgtgtgaaatgcccaaaacgtcatacaatttaggatgaagggagtaa |
464 |
Q |
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taatatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatatgtgtgaaatgcccaaaacatcatacaatttgggacggagggagtaa |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 146; E-Value: 1e-76
Query Start/End: Original strand, 231 - 463
Target Start/End: Original strand, 2409783 - 2410026
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330 |
Q |
| |
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T |
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| Q |
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419 |
Q |
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| T |
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tctttcatttatctttcccatattatttattaaggacaattttgtaaaataaatcataatatatcttttccacacaatattaattacatttcttaatatg |
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T |
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463 |
Q |
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2410026 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #18
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Query Start/End: Original strand, 189 - 465
Target Start/End: Original strand, 22019089 - 22019376
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| Q |
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288 |
Q |
| |
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| T |
22019089 |
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22019188 |
T |
 |
| Q |
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ctattataaccttaactatttattactctctcttctttcaagtcttttatttatctttttcata-----------ggacaattttgtaaaacaactcata |
377 |
Q |
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| T |
22019189 |
ttattatatccttaactatttattactctctcttttttcaattccttcatttatctttcccatatcatttattgaggacaattttgtaaaacaattcata |
22019288 |
T |
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| Q |
378 |
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465 |
Q |
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| T |
22019289 |
atatctctttcccacacaatattaattacatttcttaatatgtgtgaaatgtccaaaacgtcatacaattttggacggagggagtaat |
22019376 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 146; E-Value: 1e-76
Query Start/End: Original strand, 234 - 463
Target Start/End: Original strand, 23137729 - 23137969
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| Q |
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333 |
Q |
| |
|
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| T |
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tgtcccaaattgtaggtcgttttacaataccaatgaaaaattaatgttacttttcctattatatccttaactatttattactctctcttctttcaattcc |
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T |
 |
| Q |
334 |
tttatttatctttt-----tcat------aggacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatatgtgt |
422 |
Q |
| |
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| T |
23137829 |
ttcatttatctttccaatatcatttattgaggacaattttgtaaaacaactcataatatctctttcccacacaatattaattacatttcttaatatgtgt |
23137928 |
T |
 |
| Q |
423 |
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463 |
Q |
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| T |
23137929 |
gaaatgcccaaaacgtcatacaatttgggacgaagggagta |
23137969 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 145; E-Value: 5e-76
Query Start/End: Original strand, 230 - 465
Target Start/End: Complemental strand, 42629823 - 42629577
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| Q |
230 |
tatttgtcccaaattgtatgtcactttacaataccaatgaaacattaatgttatttttcctattataaccttaactatttattactctctcttctttcaa |
329 |
Q |
| |
|
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| T |
42629823 |
tatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatctttaactatttattactctttcttttttcaa |
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T |
 |
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gtcttttatttatctttttcata-----------ggacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatat |
418 |
Q |
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| T |
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ttctttcatttatctttcccatataatttattaaggataattttgtaaaacaatccataatatctctttcccacacaatattaattacatttcttaatat |
42629624 |
T |
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| Q |
419 |
gtgtgaaatgcccaaaacgtcatacaatttaggatgaagggagtaat |
465 |
Q |
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| T |
42629623 |
gtgtgaaatgcccaaaacgtcatacaatttgggatggagggagtaat |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #21
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Query Start/End: Original strand, 190 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 42507817 - 42507548
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| Q |
190 |
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289 |
Q |
| |
|
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| T |
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tactccctccgtcccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatatcactttagaataccaatgaaacattaatgttactttttc |
42507718 |
T |
 |
| Q |
290 |
tattataaccttaactatttattactctctcttctttcaagtcttttatttatctttttcata-----------ggacaattttgtaaaacaactcataa |
378 |
Q |
| |
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| T |
42507717 |
tattatatccttaactatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttctcatatcatttattaaggataattttgtaaaacaactcataa |
42507618 |
T |
 |
| Q |
379 |
tatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatatgtgtgaaatgcccaaaacgtcatacaattt |
448 |
Q |
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|
|
| T |
42507617 |
tatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatatgtgtgaaatgccaaaaacatcatacaattt |
42507548 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #22
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Query Start/End: Original strand, 230 - 448
Target Start/End: Original strand, 43587705 - 43587934
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tatttgtcccaaattgtatgtcactttacaataccaatgaaacattaatgttatttttcctattataaccttaactatttattactctctcttctttcaa |
329 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
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tatttgtcccaaattgtatgtcactttagaatacaaatgaaacattaatgttatttttcctattatatccttaactatttattactctttcttttttcaa |
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T |
 |
| Q |
330 |
gtcttttatttatctttttcat-----------aggacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatat |
418 |
Q |
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| T |
43587805 |
ttcttttatttatctttctcatatcatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatatctctttcccaaacaatattaactacatttcttaatat |
43587904 |
T |
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| Q |
419 |
gtgtgaaatgcccaaaacgtcatacaattt |
448 |
Q |
| |
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| T |
43587905 |
gtgtgaaatgcccaaaacgtcatataattt |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #23
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Query Start/End: Original strand, 231 - 452
Target Start/End: Original strand, 26799385 - 26799617
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| Q |
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atttgtcccaaattgtatgtcactttacaataccaatgaaacattaatgttatttttcctattataaccttaactatttattactctctcttctttcaag |
330 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
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atttgtcccaaattatatgtcattttacaatacccatgcaacattaatgttacttttccaattataaccttaattatttattactccctcttctttcaat |
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T |
 |
| Q |
331 |
tcttttatttatctttttcata-----------ggacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatatg |
419 |
Q |
| |
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| T |
26799485 |
tctttcatttatctttctcatattatttattaaggacaattttgtaaaacaactcataatatttattttccacacaatattaattacatttcttaatatg |
26799584 |
T |
 |
| Q |
420 |
tgtgaaatgcccaaaacgtcatacaatttagga |
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Q |
| |
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| T |
26799585 |
tgtgaaatgcccaaaacgtcatacaatttagga |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #24
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Query Start/End: Original strand, 235 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 41608861 - 41608637
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T |
 |
| Q |
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ttatttatctttttcata-----------ggacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatatgtgtg |
423 |
Q |
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| T |
41608761 |
tcatttatttttctcatattatttattaaggacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaatattaattgcatttcttaatatgtgtg |
41608662 |
T |
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| Q |
424 |
aaatgcccaaaacgtcatacaattt |
448 |
Q |
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41608661 |
aaatgcccaaaacgtcatacaattt |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #25
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Query Start/End: Original strand, 235 - 463
Target Start/End: Original strand, 26882768 - 26883007
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Q |
| |
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|
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gtcccaaattgtatgtcactttacaataccaatgaaacattaatgttatttttccaattatatccttaagtatttattactctttattccttcaattctt |
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T |
 |
| Q |
335 |
ttatttatctttttcata-----------ggacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatatgtgtg |
423 |
Q |
| |
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| T |
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tcatttatctttcccatatcatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatatctctttcccacacaatattaattacatttcttaatatgtgtg |
26882967 |
T |
 |
| Q |
424 |
aaatgcccaaaacgtcatacaatttaggatgaagggagta |
463 |
Q |
| |
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|
| T |
26882968 |
aaatgcccaaaacgtcatacaatttgggacggagggagta |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 141; E-Value: 1e-73
Query Start/End: Original strand, 185 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 26483273 - 26482999
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| |
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taaattactccctccgtcttaaattgtatgtcattttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcgctttataataccaatgaaaaattaatgttacc |
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 |
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tttcctattataaccttaactatttattactctctcttctttcaagtcttttatttatctttttcata-----------ggacaattttgtaaaacaact |
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26483074 |
T |
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| Q |
374 |
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448 |
Q |
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| T |
26483073 |
cataatatctcttttccacacagtattaattacatttcttaacatgtgtgaaatgcccaaaacatcatacaattt |
26482999 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #27
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Query Start/End: Original strand, 190 - 448
Target Start/End: Original strand, 5388158 - 5388427
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T |
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378 |
Q |
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5388357 |
T |
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| Q |
379 |
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448 |
Q |
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| T |
5388358 |
tatctctttcccacacaatattagttacatttcttaatatgtgtgaaatgcccaaaacgtcatacaattt |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 140; E-Value: 5e-73
Query Start/End: Original strand, 193 - 463
Target Start/End: Complemental strand, 41988241 - 41987960
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Q |
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41988142 |
T |
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| Q |
293 |
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381 |
Q |
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| T |
41988141 |
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41988042 |
T |
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| Q |
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463 |
Q |
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| T |
41988041 |
ctctttcccacacaatattaattacatttcttaatatgtgtgaaatgcccaaaacgtcatacaatttgggacggagggagta |
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 139; E-Value: 2e-72
Query Start/End: Original strand, 230 - 463
Target Start/End: Complemental strand, 33245010 - 33244766
Alignment:
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329 |
Q |
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T |
 |
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330 |
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418 |
Q |
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33244811 |
T |
 |
| Q |
419 |
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463 |
Q |
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gtgtgaaatgtccaaaacgtcatacaatttgggacggagggagta |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 139; E-Value: 2e-72
Query Start/End: Original strand, 190 - 463
Target Start/End: Original strand, 55968541 - 55968825
Alignment:
| Q |
190 |
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289 |
Q |
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tactccctccgtcccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtctcaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcc |
55968640 |
T |
 |
| Q |
290 |
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378 |
Q |
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| T |
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55968740 |
T |
 |
| Q |
379 |
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463 |
Q |
| |
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|
| T |
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tatctctttcccacacaatattaattacacttcttaatatgtgtgaaatgcccaaaacgtcatacaatttgggacggagggagta |
55968825 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 138; E-Value: 8e-72
Query Start/End: Original strand, 190 - 446
Target Start/End: Complemental strand, 10555377 - 10555110
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| Q |
190 |
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289 |
Q |
| |
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| T |
10555377 |
tactccctccgtcccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttacaatatcaatgaaacattaatgttacttttcc |
10555278 |
T |
 |
| Q |
290 |
tattataaccttaactatttattactctctcttctttcaagtcttttatttatctttttcat-----------aggacaattttgtaaaacaactcataa |
378 |
Q |
| |
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| T |
10555277 |
tattatatctttaactatttattactttttcttctttcaattctttcatttatctttcccatatcatttattaaggacaattttgtaaaataactcataa |
10555178 |
T |
 |
| Q |
379 |
tatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatatgtgtgaaatgcccaaaacgtcatacaat |
446 |
Q |
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| T |
10555177 |
tatctttttcccacacaatattaattacatttcttaatatgtgtgaaatgtccaaaacgtcatacaat |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 138; E-Value: 8e-72
Query Start/End: Original strand, 233 - 449
Target Start/End: Original strand, 13494146 - 13494373
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332 |
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T |
 |
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421 |
Q |
| |
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tttcatttatctttctcatatcatttattaaggacaattttataaaacaactcataatatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatatgtg |
13494345 |
T |
 |
| Q |
422 |
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449 |
Q |
| |
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| T |
13494346 |
tgaaatacccaaaacattatacaattta |
13494373 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 137; E-Value: 3e-71
Query Start/End: Original strand, 189 - 448
Target Start/End: Original strand, 13880450 - 13880720
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| Q |
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288 |
Q |
| |
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T |
 |
| Q |
289 |
ctattataaccttaactatttattactctctcttctttcaagtcttttatttatctttttcat-----------aggacaattttgtaaaacaactcata |
377 |
Q |
| |
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| T |
13880550 |
ctattatatccttaactatttattactctcttttctttcaattccttcatttatctttcccatatcaattattgaggataattttgtaaaacaactcata |
13880649 |
T |
 |
| Q |
378 |
atatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatatgtgtgaaatgcccaaaacgtcatacaattt |
448 |
Q |
| |
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| T |
13880650 |
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13880720 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 137; E-Value: 3e-71
Query Start/End: Original strand, 231 - 463
Target Start/End: Original strand, 23237041 - 23237284
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T |
 |
| Q |
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419 |
Q |
| |
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| T |
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T |
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420 |
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23237284 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 137; E-Value: 3e-71
Query Start/End: Original strand, 233 - 463
Target Start/End: Original strand, 32402722 - 32402964
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| Q |
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ttgtcccaaattgtatgtcactttacaataccaatgaaacattaatgttatttttcctattataaccttaactatttattactctctcttctttcaagtc |
332 |
Q |
| |
|
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|
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T |
 |
| Q |
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420 |
Q |
| |
|
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| T |
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tttcatttatctttcccatgttatttattaaggacaattttgtaaaacaactcataatatctttttttccacacaatattaattgcatttcttaatatgt |
32402921 |
T |
 |
| Q |
421 |
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463 |
Q |
| |
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| T |
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gtgaaatgcccaaaacgtcatacaatttgggacggagggagta |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 136; E-Value: 1e-70
Query Start/End: Original strand, 230 - 448
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Q |
| |
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||||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |
|
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T |
 |
| Q |
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gtcttttatttatctttttcat-----------aggacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatat |
418 |
Q |
| |
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| T |
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gtcttttatttatctttcccatattatttattaatgacaattttgtaaaacaactcataatatctctttttcatataatattaattacatttttaaatat |
3506249 |
T |
 |
| Q |
419 |
gtgtgaaatgcccaaaacgtcatacaattt |
448 |
Q |
| |
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| T |
3506250 |
gtgtgaaatgcccaaaacgtcatacaattt |
3506279 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 136; E-Value: 1e-70
Query Start/End: Original strand, 190 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 31648615 - 31648346
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| |
|
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|
|
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T |
 |
| Q |
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tattataaccttaactatttattactctctcttctttcaagtcttttatttatctttttcata-----------ggacaattttgtaaaacaactcataa |
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Q |
| |
|
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|
| T |
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T |
 |
| Q |
379 |
tatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatatgtgtgaaatgcccaaaacgtcatacaattt |
448 |
Q |
| |
|
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|
|
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31648415 |
tatctttttcccacacaatattaattacatttcttaatatgagtgaaatgcccaaaacgtcatacaattt |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #38
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Query Start/End: Original strand, 230 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 47869282 - 47869053
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tatttgtcccaaattgtatgtcactttacaataccaatgaaacattaatgttatttttcctattataaccttaactatttattactctctcttctttcaa |
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| |
|
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|
|
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 |
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gtcttttatttatctttttcata-----------ggacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatat |
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| |
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|
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T |
 |
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gtgtgaaatgcccaaaacgtcatacaattt |
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Q |
| |
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|||||||||| ||||||||||||||||||| |
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|
| T |
47869082 |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #39
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|
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 |
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accttaactatttattactctctcttctttcaagtcttttatttatctttttcat-----------aggacaattttgtaaaacaactcata----atat |
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Q |
| |
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| |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #40
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Target Start/End: Complemental strand, 20540529 - 20540265
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Q |
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T |
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383 |
Q |
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T |
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Q |
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T |
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Target: chr4; HSP #41
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T |
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Q |
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T |
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Q |
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Target: chr4; HSP #42
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T |
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Q |
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T |
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Q |
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Target: chr4; HSP #43
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T |
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Q |
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T |
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Target: chr4; HSP #44
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Target Start/End: Original strand, 20180407 - 20180653
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20180407 |
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T |
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418 |
Q |
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| T |
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20180606 |
T |
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Target: chr4; HSP #45
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Target Start/End: Complemental strand, 23511369 - 23511083
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T |
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Q |
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Q |
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Target: chr4; HSP #46
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T |
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Q |
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T |
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Q |
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T |
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448 |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #48
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #49
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Target Start/End: Complemental strand, 55984395 - 55984126
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| |
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Q |
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Back To:
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T |
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17609018 |
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Back To:
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419 |
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Q |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #52
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| |
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|
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #53
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Query Start/End: Original strand, 231 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 47477213 - 47476985
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T |
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448 |
Q |
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47477013 |
tgtgaaatgcccaaaacgtcttacaattt |
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T |
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Target: chr4; HSP #54
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Target Start/End: Original strand, 6628910 - 6629157
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329 |
Q |
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T |
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418 |
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T |
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Q |
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6629110 |
gtgtgaaatgcccaaaacgtcatacaatttgggacggagggagtaatt |
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T |
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Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 130; E-Value: 5e-67
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330 |
Q |
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T |
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419 |
Q |
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T |
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420 |
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463 |
Q |
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tgtgaaatggccaaaacgtcatacaatttgggacggagggagta |
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T |
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Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 130; E-Value: 5e-67
Query Start/End: Original strand, 231 - 448
Target Start/End: Original strand, 37912488 - 37912712
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Q |
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T |
 |
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419 |
Q |
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| T |
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37912683 |
T |
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| Q |
420 |
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448 |
Q |
| |
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| |||||||| |||||||||||||||||| |
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tatgaaatgctcaaaacgtcatacaattt |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 129; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 190 - 463
Target Start/End: Original strand, 34447632 - 34447915
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Q |
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34447731 |
T |
 |
| Q |
290 |
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378 |
Q |
| |
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| T |
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T |
 |
| Q |
379 |
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463 |
Q |
| |
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tatctctttcccacaccaatattaattacatttctta--atgtgtgaaatgcccaaaacgtcatacaatttgggacggagggagta |
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T |
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Target: chr4; HSP #58
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Query Start/End: Original strand, 233 - 463
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Q |
| |
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T |
 |
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333 |
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421 |
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tttcatttatttttcccatattatttattaaggacaattttgtaaaacaactcataatatctctttcccacacaatattaattacatttcttaatacgtg |
2401466 |
T |
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| Q |
422 |
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463 |
Q |
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| T |
2401467 |
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T |
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Back To:
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Target: chr4; HSP #59
Raw Score: 128; E-Value: 7e-66
Query Start/End: Original strand, 189 - 463
Target Start/End: Complemental strand, 33600066 - 33599781
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| Q |
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| |
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T |
 |
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377 |
Q |
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T |
 |
| Q |
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463 |
Q |
| |
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|
| T |
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atatctttttccaacacaatattaattacattttttaatatgtgtgaaatgctcaaaacgtcatacaatttgggacggagggagta |
33599781 |
T |
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Back To:
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Target: chr4; HSP #60
Raw Score: 128; E-Value: 7e-66
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Target Start/End: Complemental strand, 35877126 - 35876861
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Q |
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T |
 |
| Q |
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Q |
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T |
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| Q |
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Q |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #61
Raw Score: 128; E-Value: 7e-66
Query Start/End: Original strand, 230 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 52920825 - 52920596
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T |
 |
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T |
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| Q |
419 |
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448 |
Q |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #62
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Q |
| |
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T |
 |
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330 |
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418 |
Q |
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| T |
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T |
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| Q |
419 |
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463 |
Q |
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3086096 |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #63
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T |
 |
| Q |
290 |
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Q |
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T |
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| Q |
379 |
tatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatatgtgtgaaatgcccaaaacgtcatacaatttaggatgaagggagta |
463 |
Q |
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7257990 |
tatctctttccgacactgtattaattatatttcttaatatgtgtgaaatgcccaaaacgtcgtacaatttgggacggagggagta |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #64
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| |
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|
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T |
 |
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tcttttatttatctttttcat-----------aggacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatatg |
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| |
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| T |
23222612 |
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23222711 |
T |
 |
| Q |
420 |
tgtgaaatgcccaaaacgtcatacaattt |
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Q |
| |
|
||| |||||| ||||||||| |||||||| |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #65
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 |
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 |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #66
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Query Start/End: Original strand, 190 - 463
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| |
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 |
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tattataaccttaactatttattactctctcttctttcaagtcttttatttatctttttcataggacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttc |
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| |
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tattatatccttaatcatttattactctcttttctttcaattccttcatttctctttcccaaa----aattttgtaaaataactcataatatctttttcc |
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cacacaatattaattacatttcttaatatgtgtgaaatgcccaaaacgtcatacaatttaggatgaagggagta |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #67
Raw Score: 125; E-Value: 5e-64
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Target Start/End: Complemental strand, 29290393 - 29290123
Alignment:
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189 |
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288 |
Q |
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| T |
29290393 |
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29290294 |
T |
 |
| Q |
289 |
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377 |
Q |
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| T |
29290293 |
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29290194 |
T |
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| Q |
378 |
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448 |
Q |
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| T |
29290193 |
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29290123 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #68
Raw Score: 125; E-Value: 5e-64
Query Start/End: Original strand, 230 - 469
Target Start/End: Original strand, 36937238 - 36937488
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329 |
Q |
| |
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T |
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330 |
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418 |
Q |
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36937338 |
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36937437 |
T |
 |
| Q |
419 |
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469 |
Q |
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| T |
36937438 |
gtgtgaaatgcccaaaacgtcatacaatttgggacggagggagtagtttaa |
36937488 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #69
Raw Score: 125; E-Value: 5e-64
Query Start/End: Original strand, 230 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 41458934 - 41458707
Alignment:
| Q |
230 |
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329 |
Q |
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41458934 |
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41458837 |
T |
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| Q |
330 |
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418 |
Q |
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| T |
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41458737 |
T |
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| Q |
419 |
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448 |
Q |
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| T |
41458736 |
gtgtgaaatacccaaaacgtcatacaattt |
41458707 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #70
Raw Score: 124; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 230 - 464
Target Start/End: Complemental strand, 13252398 - 13252163
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| Q |
230 |
tatttgtcccaaattgtatgtcactttacaataccaatgaaacattaatgttatttttcctattataaccttaactatttattactctctcttctttcaa |
329 |
Q |
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13252398 |
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13252299 |
T |
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| Q |
330 |
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428 |
Q |
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| T |
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13252199 |
T |
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| Q |
429 |
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464 |
Q |
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| T |
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cctaaaacgtcatataatttgggacggagggagtaa |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #71
Raw Score: 124; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 233 - 463
Target Start/End: Original strand, 22100958 - 22101199
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332 |
Q |
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22100958 |
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T |
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333 |
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421 |
Q |
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22101058 |
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22101157 |
T |
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422 |
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463 |
Q |
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| T |
22101158 |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #72
Raw Score: 124; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 233 - 463
Target Start/End: Original strand, 34246798 - 34247039
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233 |
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332 |
Q |
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34246798 |
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T |
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333 |
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421 |
Q |
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T |
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| Q |
422 |
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463 |
Q |
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34246998 |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #73
Raw Score: 124; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 197 - 463
Target Start/End: Complemental strand, 34491957 - 34491680
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197 |
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T |
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| Q |
297 |
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385 |
Q |
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| T |
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34491758 |
T |
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| Q |
386 |
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463 |
Q |
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| T |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #74
Raw Score: 124; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 233 - 463
Target Start/End: Original strand, 53690281 - 53690522
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233 |
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332 |
Q |
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53690281 |
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T |
 |
| Q |
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421 |
Q |
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| T |
53690381 |
tttcatttatcttttccataccatttattatggataattttgtaaaacaattcataatttctcttccccacacaatattaattacatttcttaatacgtg |
53690480 |
T |
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| Q |
422 |
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463 |
Q |
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53690481 |
tgaaatgaccaaaacgtcatacaatttgggacggagggagta |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #75
Raw Score: 123; E-Value: 7e-63
Query Start/End: Original strand, 239 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 19807059 - 19806839
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338 |
Q |
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|
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T |
 |
| Q |
339 |
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Q |
| |
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| T |
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19806860 |
T |
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| Q |
428 |
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448 |
Q |
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| T |
19806859 |
gcccaaaacgtcattcaattt |
19806839 |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #76
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Query Start/End: Original strand, 235 - 463
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|
|
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T |
 |
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335 |
ttatttatctttttcat-----------aggacaattttgt-aaaacaactcataatatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatatgtgt |
422 |
Q |
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tcatttatctttcccatattatttattaaggataattttgtaaaaacaactcataatatctcttttccacataatattaattgtatttcttaatatgtat |
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T |
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| Q |
423 |
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463 |
Q |
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| T |
52809063 |
gaaatgtccaaaacgtcatacaatttgggacggagggagta |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #77
Raw Score: 122; E-Value: 3e-62
Query Start/End: Original strand, 231 - 463
Target Start/End: Complemental strand, 25063850 - 25063607
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Q |
| |
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|
|
| T |
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atttgttccaaattatatgtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttatttttcctattatatccttaactattaattactctctcttctttcaat |
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T |
 |
| Q |
331 |
tcttttatttatctttttcata-----------ggacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatatg |
419 |
Q |
| |
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| T |
25063750 |
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25063651 |
T |
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| Q |
420 |
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463 |
Q |
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| T |
25063650 |
tgtgaaattgccaaaacgtcttacaatttgggacggagggagta |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #78
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Query Start/End: Original strand, 233 - 465
Target Start/End: Original strand, 34735962 - 34736205
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Q |
| |
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|
| T |
34735962 |
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T |
 |
| Q |
333 |
ttttatttatctttttcata-----------ggacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatatgtg |
421 |
Q |
| |
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| T |
34736062 |
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34736161 |
T |
 |
| Q |
422 |
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465 |
Q |
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| T |
34736162 |
tgaaatgctcaaaacgtcttacaatttgggacggagggagtaat |
34736205 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #79
Raw Score: 122; E-Value: 3e-62
Query Start/End: Original strand, 231 - 463
Target Start/End: Original strand, 56235190 - 56235433
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231 |
atttgtcccaaattgtatgtcactttacaataccaatgaaacattaatgttatttttcctattataaccttaactatttattactctctcttctttcaag |
330 |
Q |
| |
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|
| T |
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atttgtcccaaattataagtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcctattatatccttaactattaattactctctcttctttcaat |
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T |
 |
| Q |
331 |
tcttttatttatctttttcat-----------aggacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatatg |
419 |
Q |
| |
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| T |
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tatttcatttatcttttccataccatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttcacttccccacacaatattaattacatttcttaatacg |
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T |
 |
| Q |
420 |
tgtgaaatgcccaaaacgtcatacaatttaggatgaagggagta |
463 |
Q |
| |
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|
| T |
56235390 |
tgtgaaatggccaaaacgtcatacaatttgagatggagggagta |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #80
Raw Score: 121; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 233 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 1607029 - 1606803
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Q |
| |
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|
|
| T |
1607029 |
ttgtcccaaattatatgtcgttttacaataccaatgcaacattaatgttatttttcctattgtaaccttaacgatttattactctcttttttttcaatta |
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T |
 |
| Q |
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ttttatttatctttttca-----------taggacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatatgtg |
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Q |
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|
| T |
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tttcatttatctttttcatattatttatttaggacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacgatattaattgaatttcttaatatgtt |
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T |
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422 |
tgaaatgcccaaaacgtcatacaattt |
448 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
1606829 |
tgaaatgctcaaaacgtcgtacaattt |
1606803 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #81
Raw Score: 121; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 240 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 50690649 - 50690430
Alignment:
| Q |
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339 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||| ||| |
|
|
| T |
50690649 |
aaattgtatgtcactttaaaataccaatgaaacattaatgttatttttcctattatatccttaactatttattactctttcttttttcaattctttcatt |
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T |
 |
| Q |
340 |
t-atctttttcata----------ggacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatatgtgtgaaatg |
428 |
Q |
| |
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| ||| || |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |
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| T |
50690549 |
ttatcattcccataacatttataaggataattttgtaaaacaactcataatatctctttcccacacaatattacttacatttcttaatatgtgtgaaatg |
50690450 |
T |
 |
| Q |
429 |
cccaaaacgtcatacaattt |
448 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||||||| |
|
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| T |
50690449 |
tccaaaacatcatacaattt |
50690430 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #82
Raw Score: 120; E-Value: 4e-61
Query Start/End: Original strand, 233 - 463
Target Start/End: Original strand, 288387 - 288628
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| Q |
233 |
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332 |
Q |
| |
|
|||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||| | |
|
|
| T |
288387 |
ttgtcccaaattatatgtcgctttacaataccaatgaaatattattgttacttttcctattatatcattaactattaattactctctcttctttcaatta |
288486 |
T |
 |
| Q |
333 |
ttttatttatctttttcata-----------ggacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatatgtg |
421 |
Q |
| |
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||| ||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |
|
|
| T |
288487 |
tttcatttatcttttccataccatttattagggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaatattaattacatttcttaatacgtg |
288586 |
T |
 |
| Q |
422 |
tgaaatgcccaaaacgtcatacaatttaggatgaagggagta |
463 |
Q |
| |
|
||||||| |||||||||||||||||||||| | |||||||| |
|
|
| T |
288587 |
tgaaatgggcaaaacgtcatacaatttaggacggagggagta |
288628 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #83
Raw Score: 120; E-Value: 4e-61
Query Start/End: Original strand, 197 - 463
Target Start/End: Original strand, 21634576 - 21634852
Alignment:
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197 |
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296 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||||||||| ||| ||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
21634576 |
tccgtcccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttttcccaaattatatgtcgctttacaataccaatgaaaaatta-tgttacttttcctattata |
21634674 |
T |
 |
| Q |
297 |
accttaactatttattactctctcttctttcaagtcttttatttatctttttcata-----------ggacaattttgtaaaacaactcataatatctct |
385 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||||||| ||||||||||| || || |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | |
|
|
| T |
21634675 |
tccttaatcatttattactctatcttctttcaattcattcatttatctttcccatatcatttattgaggacaattttgtaaaacaactcataatatcttt |
21634774 |
T |
 |
| Q |
386 |
tttccacacaatattaattacatttcttaatatgtgtgaaatgcccaaaacgtcatacaatttaggatgaagggagta |
463 |
Q |
| |
|
|| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||| |
|
|
| T |
21634775 |
ttcctacacaatattaattacatttcttaatatgtgtgaaatgcccaaaacgtcatacaatttgggacggagggagta |
21634852 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #84
Raw Score: 120; E-Value: 4e-61
Query Start/End: Original strand, 186 - 463
Target Start/End: Complemental strand, 38852923 - 38852634
Alignment:
| Q |
186 |
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284 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||| | |
|
|
| T |
38852923 |
aaattactccctccgtcctaaattgtatgtcgttttagaaaaaaaaatttgtcccaaattatatgtcgctttacaataccaatgaaatatttatgttact |
38852824 |
T |
 |
| Q |
285 |
tttcctattataaccttaactatttattactctctcttctttcaagtcttttatttatctttttcata-----------ggacaattttgtaaaacaact |
373 |
Q |
| |
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|||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||| |
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|
| T |
38852823 |
tttcttattatatccttaactattaattactctctcttctttcaattatttcatttatcttttccataccatttattagggataattttgtaaaacaact |
38852724 |
T |
 |
| Q |
374 |
cataatatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatatgtgtgaaatgcccaaaacgtcatacaatttaggatgaagggagta |
463 |
Q |
| |
|
|||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||| | |||||||| |
|
|
| T |
38852723 |
cataatttctcttccccacacaatattaattacatttcttaatacgtgtgaaattgccaaaacgtcttacaatttaggacggagggagta |
38852634 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #85
Raw Score: 119; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 231 - 448
Target Start/End: Original strand, 13800372 - 13800599
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| Q |
231 |
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330 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
13800372 |
atttgtcccaaatt-tatgtcgctttacgataccaatgaaatattaatgttacttttcctattatatccttaactattaattactctctcttctttcaat |
13800470 |
T |
 |
| Q |
331 |
tcttttatttatctttttcat-----------aggacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatatg |
419 |
Q |
| |
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| ||| ||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |
|
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| T |
13800471 |
tatttcatttatcttttccataccatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaatattaattacatttcttaatacg |
13800570 |
T |
 |
| Q |
420 |
tgtgaaatgcccaaaacgtcatacaattt |
448 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||||||||||||||||| |
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|
| T |
13800571 |
tgtgaaatggccaaaacgtcatacaattt |
13800599 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #86
Raw Score: 119; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 235 - 463
Target Start/End: Original strand, 33501366 - 33501622
Alignment:
| Q |
235 |
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334 |
Q |
| |
|
||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
33501366 |
gtcccaaattggatgtcactttacaatatcaatgaaacattaatgttactttttctattataaccttaactatttattactctctcttatttcaagtctt |
33501465 |
T |
 |
| Q |
335 |
ttatttatctttttcat-----------aggacaattttgtaaaacaactcataatatctc-----------------ttttccacacaatattaattac |
406 |
Q |
| |
|
|||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |
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|
| T |
33501466 |
ttatttatctttcccatattatttattaaggacaattttgtaaaacaactcataatatctctttttcacacatattaatttttcacacaatattaattac |
33501565 |
T |
 |
| Q |
407 |
atttcttaatatgtgtgaaatgcccaaaacgtcatacaatttaggatgaagggagta |
463 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
33501566 |
atttcttaatatgtgtgaaatgcccaaaacgtcatacaatttgggacggagggagta |
33501622 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #87
Raw Score: 119; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 254 - 463
Target Start/End: Complemental strand, 36871466 - 36871246
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| Q |
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tttacaataccaatgaaacattaatgttatttttcctattataaccttaactatttattactctctcttctttcaagtcttttatttatctttttcata- |
352 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||| ||||| |
|
|
| T |
36871466 |
tttacaataccaatgaaaaattaatgttacttttcttattatatccttaactatttattactctctcttctttcagttccttcatttatctttctcatat |
36871367 |
T |
 |
| Q |
353 |
----------ggacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatatgtgtgaaatgcccaaaacgtcata |
442 |
Q |
| |
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||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |
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|
| T |
36871366 |
catttattgaggataattttgtaaaacaactcataatatttctttcccacacaatattaattacatttcttaatatgcgtgaaatgcccaaaacgtcata |
36871267 |
T |
 |
| Q |
443 |
caatttaggatgaagggagta |
463 |
Q |
| |
|
|||||| ||| | |||||||| |
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|
| T |
36871266 |
caatttgggacggagggagta |
36871246 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #88
Raw Score: 119; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 231 - 452
Target Start/End: Original strand, 43050206 - 43050438
Alignment:
| Q |
231 |
atttgtcccaaattgtatgtcactttacaataccaatgaaacattaatgttatttttcctattataaccttaactatttattactctctcttctttcaag |
330 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||| || |
|
|
| T |
43050206 |
atttgttccaaattatatgtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttactttttctattatatccttaactattaattactccctcttcttttaat |
43050305 |
T |
 |
| Q |
331 |
tcttttatttatctttttcata-----------ggacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatatg |
419 |
Q |
| |
|
| ||| ||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |
|
|
| T |
43050306 |
tatttcatttatcttttccataccatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctctttcccacacaatattaattacatttcttaatacg |
43050405 |
T |
 |
| Q |
420 |
tgtgaaatgcccaaaacgtcatacaatttagga |
452 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
43050406 |
tgtgaaatggccaaaacgtcatacaatttagga |
43050438 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #89
Raw Score: 118; E-Value: 7e-60
Query Start/End: Original strand, 249 - 452
Target Start/End: Complemental strand, 38794041 - 38793829
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| Q |
249 |
gtcactttacaataccaatgaaacattaatgttatttttcctattataaccttaactatttattactctctcttctttcaagtcttttatttatcttttt |
348 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||| |||||||||| |
|
|
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38794041 |
gtcactttagaataccaatgaaacattaatgttatgtttcctattatatccttaactatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcc |
38793942 |
T |
 |
| Q |
349 |
catag-----------gacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatatgtgtgaaatgcccaaaacg |
437 |
Q |
| |
|
|||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
38793941 |
catatcatttattaaagataattttgtaaaacaactcataatatctctttcccacac--tattaattacatttcttaatatgtgtgaaatgcccaaaacg |
38793844 |
T |
 |
| Q |
438 |
tcatacaatttagga |
452 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| |
|
|
| T |
38793843 |
tcatacaatttagga |
38793829 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #90
Raw Score: 117; E-Value: 3e-59
Query Start/End: Original strand, 230 - 465
Target Start/End: Original strand, 30049507 - 30049753
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| Q |
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329 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
30049507 |
tatttgtcccaaattatatgttgctttacaatatcaatgaaatattaatgttatttttcctattatatccttaactattaattactctctcttctttcaa |
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T |
 |
| Q |
330 |
gtcttttatttatctttttcat-----------aggacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatat |
418 |
Q |
| |
|
| ||| ||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
30049607 |
ttatttcatttatcttttccatgctatttattaaggataattttgtaaaacaacttataatttctcttccccacacaatattaattacatttcttaatac |
30049706 |
T |
 |
| Q |
419 |
gtgtgaaatgcccaaaacgtcatacaatttaggatgaagggagtaat |
465 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||||||||| |||||||| ||| | |||||||||| |
|
|
| T |
30049707 |
gtgtgaaatggtcaaaacgtcttacaatttgggacggagggagtaat |
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T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #91
Raw Score: 117; E-Value: 3e-59
Query Start/End: Original strand, 230 - 461
Target Start/End: Original strand, 56299725 - 56299967
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| Q |
230 |
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329 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||| |||||| |||||||||| ||||||| |||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
56299725 |
tatttgttccaaattatatgtcgttttacaatacaaatgaaaaattaatgttactttttctattatatccttaactatttattaatctctcttctttcaa |
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T |
 |
| Q |
330 |
gtcttttatttatctttttcata-----------ggacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatat |
418 |
Q |
| |
|
| || |||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
56299825 |
tttcttcatttatctttctcatatcatttattgaggataattttgtaaaacaactcataatatttttttcccacataatattaattacatttcttaatat |
56299924 |
T |
 |
| Q |
419 |
gtgtgaaatgcccaaaacgtcatacaatttaggatgaagggag |
461 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| |
|
|
| T |
56299925 |
gtgtgaaatgcccaaaacgtcatacaatttaggacggagggag |
56299967 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #92
Raw Score: 116; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 190 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 33924993 - 33924724
Alignment:
| Q |
190 |
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289 |
Q |
| |
|
||||||||| |||| ||||||||||||| ||| |||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
33924993 |
tactccatctgtcccaaattgtatgtcactttagaaaaataatttgtcccagattatatgtcactttacaattccaataaaacattaatgttacttttcc |
33924894 |
T |
 |
| Q |
290 |
tattataaccttaactatttattactctctcttctttcaagtcttttatttatctttttcata-----------ggacaattttgtaaaacaactcataa |
378 |
Q |
| |
|
||||||| | |||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
33924893 |
tattatatctttaattatttattactctttcttctttcaattcttttatttatttttcccatatcatttattaaggacaattttgtaaaacaactcataa |
33924794 |
T |
 |
| Q |
379 |
tatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatatgtgtgaaatgcccaaaacgtcatacaattt |
448 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
33924793 |
tatctctttctcacataatattaattacatttcctaatatgtgtgaaatgcccaaatcgtcgtacaattt |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #93
Raw Score: 116; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 233 - 448
Target Start/End: Original strand, 44197291 - 44197519
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233 |
ttgtcccaaattgtatgtcactttacaataccaatgaaacattaatgttatttttcctattataaccttaactatttattactctctcttctttcaagtc |
332 |
Q |
| |
|
|||||| ||||| || ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || |
|
|
| T |
44197291 |
ttgtcctaaattatacgtcgttttacaataccaatgcaacattaatgttatttttcttattataaccttaactatttattactatctcttctttcaattc |
44197390 |
T |
 |
| Q |
333 |
ttttatttatctttttcat-----------aggacaattttgtaaaacaactcata--atatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatatg |
419 |
Q |
| |
|
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|
| T |
44197391 |
tttcatttatctttcccatattatttattaaggaaaattttgtaaaacaactcataatatattttttttccacacaatattaattacatttcttaatatg |
44197490 |
T |
 |
| Q |
420 |
tgtgaaatgcccaaaacgtcatacaattt |
448 |
Q |
| |
|
||| ||||||||||||||||||||||||| |
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|
| T |
44197491 |
tgttaaatgcccaaaacgtcatacaattt |
44197519 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #94
Raw Score: 116; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 230 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 51234953 - 51234724
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| |
|
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| T |
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tatttgtcccaaattgtacgtcattttagaatatcaatgaaatattaatgttacttttcctattatattcttaactatttattactctttcttttttcaa |
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T |
 |
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gtcttttatttatctttttcata-----------ggacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatat |
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Q |
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51234754 |
T |
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448 |
Q |
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| T |
51234753 |
gtgtgaaatgcccaaaacgtcgtataattt |
51234724 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #95
Raw Score: 114; E-Value: 2e-57
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Target Start/End: Original strand, 16032331 - 16032574
Alignment:
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Q |
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T |
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331 |
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419 |
Q |
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| T |
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T |
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Q |
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tgtgaaatgaccaaaacgtcatacaatttgggacggagggagta |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #96
Raw Score: 114; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 231 - 463
Target Start/End: Original strand, 27851208 - 27851451
Alignment:
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330 |
Q |
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T |
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| Q |
331 |
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419 |
Q |
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| T |
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27851407 |
T |
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| Q |
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463 |
Q |
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| T |
27851408 |
tgtgaaatggccaaaacgtcatacaatttagaacggagggagta |
27851451 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #97
Raw Score: 114; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 246 - 463
Target Start/End: Complemental strand, 42133785 - 42133555
Alignment:
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343 |
Q |
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T |
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| Q |
344 |
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432 |
Q |
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| T |
42133685 |
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T |
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| Q |
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463 |
Q |
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| T |
42133585 |
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42133555 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #98
Raw Score: 113; E-Value: 7e-57
Query Start/End: Original strand, 233 - 448
Target Start/End: Original strand, 388086 - 388312
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332 |
Q |
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T |
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| Q |
333 |
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421 |
Q |
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| T |
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T |
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| Q |
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448 |
Q |
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| T |
388286 |
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388312 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #99
Raw Score: 113; E-Value: 7e-57
Query Start/End: Original strand, 238 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 46481652 - 46481453
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337 |
Q |
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| T |
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46481553 |
T |
 |
| Q |
338 |
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437 |
Q |
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| T |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #100
Raw Score: 113; E-Value: 7e-57
Query Start/End: Original strand, 233 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 49651087 - 49650861
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Q |
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T |
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Q |
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| T |
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49650888 |
T |
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448 |
Q |
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| T |
49650887 |
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49650861 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #101
Raw Score: 113; E-Value: 7e-57
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Target Start/End: Complemental strand, 51487785 - 51487543
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332 |
Q |
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| T |
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T |
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| Q |
333 |
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422 |
Q |
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| T |
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466 |
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| T |
51487586 |
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51487543 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #102
Raw Score: 113; E-Value: 7e-57
Query Start/End: Original strand, 233 - 448
Target Start/End: Original strand, 55925704 - 55925930
Alignment:
| Q |
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ttgtcccaaattgtatgtcactttacaataccaatgaaacattaatgttatttttcctattataaccttaactatttattactctctcttctttcaagtc |
332 |
Q |
| |
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| T |
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55925803 |
T |
 |
| Q |
333 |
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421 |
Q |
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| T |
55925804 |
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55925903 |
T |
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| Q |
422 |
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448 |
Q |
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| T |
55925904 |
tgaaatgaccaaaacgtcatacaattt |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #103
Raw Score: 112; E-Value: 3e-56
Query Start/End: Original strand, 239 - 448
Target Start/End: Original strand, 17678575 - 17678795
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337 |
Q |
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| T |
17678675 |
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17678773 |
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448 |
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| T |
17678774 |
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17678795 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #104
Raw Score: 111; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 246 - 463
Target Start/End: Complemental strand, 26707391 - 26707163
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tatgtcactttacaataccaatgaaacattaatgttatttttcctattataaccttaactatttattactctctcttctttcaagtcttttatttatctt |
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Q |
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T |
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| Q |
346 |
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434 |
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| T |
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26707192 |
T |
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| Q |
435 |
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463 |
Q |
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| T |
26707191 |
acgtcgtacaatttgggatggagagagta |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #105
Raw Score: 110; E-Value: 4e-55
Query Start/End: Original strand, 231 - 463
Target Start/End: Original strand, 22842946 - 22843189
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| |
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T |
 |
| Q |
331 |
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419 |
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| T |
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22843145 |
T |
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| Q |
420 |
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463 |
Q |
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| T |
22843146 |
tgtgaaattgtcaaaacgtcttacaatttgggacggagggagta |
22843189 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #106
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Q |
| |
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| T |
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ttgtcccaaattgtatgtcgctttacaataccaatgcaactttaatgttactttttctattataaccttaactatttattactctct--tatttcaattc |
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T |
 |
| Q |
333 |
ttttatttatctttttcata-----------ggacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatatgtg |
421 |
Q |
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| T |
43566137 |
tttcatttatttttcacatattatttattaaggacaattttgtagaacaattcataatatctcttttccacacaaaattaattgcatttcttaatacgtg |
43566236 |
T |
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| Q |
422 |
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448 |
Q |
| |
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| T |
43566237 |
tgaaatgtccaaaacgtcatacaattt |
43566263 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #107
Raw Score: 110; E-Value: 4e-55
Query Start/End: Original strand, 231 - 463
Target Start/End: Complemental strand, 56513695 - 56513452
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atttgtcccaaattgtatgtcactttacaataccaatgaaacattaatgttatttttcctattataaccttaactatttattactctctcttctttcaag |
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| |
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| T |
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T |
 |
| Q |
331 |
tcttttatttatctttttcat-----------aggacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatatg |
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Q |
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| T |
56513595 |
tatttcgtttatcttttccataccatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttcacttccccgcacaatattaattacatttcttaatacg |
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T |
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| Q |
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tgtgaaatgcccaaaacgtcatacaatttaggatgaagggagta |
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Q |
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| T |
56513495 |
tgtgaaatggccaaaacgtcatacaatttgggacggagggagta |
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 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #108
Raw Score: 109; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 230 - 465
Target Start/End: Original strand, 19877793 - 19878039
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tatttgtcccaaattgtatgtcactttacaataccaatgaaacattaatgttatttttcctattataaccttaactatttattactctctcttctttcaa |
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19877793 |
tatttgtcccaaattatatgtcgctttacaataccaatgaaacattaaagttacttttctcattatatccttaactatttattactctctattctttcaa |
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T |
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gtcttttatttatctttttcat-----------aggacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatat |
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Q |
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| T |
19877893 |
ttatttaatttatctttcccatacaacttattaaggacaattttgtaaaataactcataatatctatttcccacacaaaattaattatatttcttaatac |
19877992 |
T |
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419 |
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465 |
Q |
| |
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| T |
19877993 |
gtgtgaaatgcctaaaacgtcatataatttgggacggagggggtaat |
19878039 |
T |
 |
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Target: chr4; HSP #109
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332 |
Q |
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T |
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Q |
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T |
 |
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422 |
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Q |
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23138278 |
tgaaatggccaaaac |
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T |
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Target: chr4; HSP #110
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332 |
Q |
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T |
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ttttatttatctttttcata-----------ggacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatatgtg |
421 |
Q |
| |
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T |
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tgaaatgcccaaaacgtcatacaattt |
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Q |
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T |
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Target: chr4; HSP #111
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T |
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ttttatttatctttttcata-----------ggacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatatgtg |
421 |
Q |
| |
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T |
 |
| Q |
422 |
tgaaatgcccaaaacgtcatacaatttaggatgaagggagtaattta |
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Q |
| |
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| T |
39418042 |
tgaaatggccaaaatgtcgtacaatttgggacggagggagtagttta |
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #112
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T |
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Q |
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T |
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| Q |
422 |
tgaaatgcccaaaacgtcatacaattt |
448 |
Q |
| |
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| T |
47170723 |
tgaaatggccaaaacgtcatacaattt |
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T |
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Target: chr4; HSP #113
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332 |
Q |
| |
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T |
 |
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333 |
ttttatttatctttttcat-----------aggacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatatgtg |
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Q |
| |
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T |
 |
| Q |
422 |
tgaaatgcccaaaacgtcatacaatttaggatgaagggagta |
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Q |
| |
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| T |
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T |
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Target: chr4; HSP #114
Raw Score: 108; E-Value: 6e-54
Query Start/End: Original strand, 233 - 463
Target Start/End: Original strand, 54315096 - 54315337
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233 |
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332 |
Q |
| |
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T |
 |
| Q |
333 |
ttttatttatctttttcata-----------ggacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatatgtg |
421 |
Q |
| |
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|
| T |
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attcatttatttttctcatattatttattaaggacaattttgtaaaacaactcataatatctctttcccacacaaaattaattatatttcttaatacgtg |
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T |
 |
| Q |
422 |
tgaaatgcccaaaacgtcatacaatttaggatgaagggagta |
463 |
Q |
| |
|
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|
| T |
54315296 |
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T |
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Target: chr4; HSP #115
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Q |
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T |
 |
| Q |
353 |
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442 |
Q |
| |
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T |
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| Q |
443 |
caatt |
447 |
Q |
| |
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||||| |
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|
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596167 |
caatt |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #116
Raw Score: 107; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 231 - 448
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330 |
Q |
| |
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|||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||| ||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
36878681 |
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T |
 |
| Q |
331 |
tcttttatttatctttttcat-----------aggacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatatg |
419 |
Q |
| |
|
||||| |||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||| |||| |||||||| |
|
|
| T |
36878581 |
tctttcatttatttttcccatattatttattaaggacaattttgtaaaacaactcataatatccctttttcatacaatattaattgtattttttaatatg |
36878482 |
T |
 |
| Q |
420 |
tgtgaaatgcccaaaacgtcatacaattt |
448 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||||||||| |||||||| |
|
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| T |
36878481 |
tgtgaaatgctcaaaacgtcttacaattt |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #117
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Query Start/End: Original strand, 231 - 447
Target Start/End: Original strand, 22320570 - 22320797
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330 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
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atttgtcccaaattatatgtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcctattatatccttaactattaattactctctcttctttcaat |
22320669 |
T |
 |
| Q |
331 |
tcttttatttatctttttcata-----------ggacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatatg |
419 |
Q |
| |
|
| ||| ||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||| | |
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|
| T |
22320670 |
tatttcatttatcttttccataccatttattatggataattttgtaaaacaattcataatttctcttccccacacaatattaattacattttttaatacg |
22320769 |
T |
 |
| Q |
420 |
tgtgaaatgcccaaaacgtcatacaatt |
447 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||| || |||||||| |
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|
| T |
22320770 |
tgtgaaatggtcaaaatgttatacaatt |
22320797 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #118
Raw Score: 106; E-Value: 1e-52
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332 |
Q |
| |
|
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|
| T |
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ttgtcccaaattgtatgtcactttacaatactaatgaaatattaatgttacttttcctaatatatcattaattatttattactctttcttctttcaattc |
23662668 |
T |
 |
| Q |
333 |
ttttatttatctt----tttcat------aggacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatatgtgt |
422 |
Q |
| |
|
||| |||||| || | |||| |||||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||| |||||||||||| | |
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|
| T |
23662669 |
tttcatttatttttccatatcatttattaaggacaattttgtaaaacaactcataatatttatttcccacacaatattaattatatttcttaatataaat |
23662768 |
T |
 |
| Q |
423 |
gaaatgcccaaaacgtcatacaattt |
448 |
Q |
| |
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|||||| ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
23662769 |
gaaatgtccaaaacgtcatacaattt |
23662794 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #119
Raw Score: 106; E-Value: 1e-52
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Target Start/End: Complemental strand, 37175410 - 37175167
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231 |
atttgtcccaaattgtatgtcactttacaataccaatgaaacattaatgttatttttcctattataaccttaactatttattactctctcttctttcaag |
330 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
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atttgtcccaaattatatgtcgctttacaataccaatgaaatatttatgttacttttcctattatatccttaactattaattactctctcttctttcaat |
37175311 |
T |
 |
| Q |
331 |
tcttttatttatctttttcata-----------ggacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatatg |
419 |
Q |
| |
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| ||| ||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||||| | |
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|
| T |
37175310 |
tatttcatttatcttttccataccatttattagggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacgcaatattaattacatttcttaatacg |
37175211 |
T |
 |
| Q |
420 |
tgtgaaatgcccaaaacgtcatacaatttaggatgaagggagta |
463 |
Q |
| |
|
|| ||||| ||||||||| |||||||| ||| | |||||||| |
|
|
| T |
37175210 |
tgcaaaatggtcaaaacgtcttacaatttgggacggagggagta |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #120
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Target Start/End: Complemental strand, 29753195 - 29752953
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Q |
| |
|
||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| |||| |||||||| ||||||||||| | |
|
|
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T |
 |
| Q |
332 |
cttttatttatctttttcata-----------ggacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatatgt |
420 |
Q |
| |
|
||| ||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||||| || |
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|
| T |
29753095 |
atttcatttatcttttccatacaatttattatggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacgcaatattaattacatttcttaatacgt |
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T |
 |
| Q |
421 |
gtgaaatgcccaaaacgtcatacaatttaggatgaagggagta |
463 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||||| |||||||| ||| | |||||||| |
|
|
| T |
29752995 |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #121
Raw Score: 105; E-Value: 4e-52
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232 |
tttgtcccaaattgtatgtcactttacaataccaatgaaacattaatgttatttttcctattataaccttaactatttattactctctcttctttcaagt |
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Q |
| |
|
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|
|
| T |
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T |
 |
| Q |
332 |
cttttatttatctttttcat-----------aggacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatatgt |
420 |
Q |
| |
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||| ||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| || |
|
|
| T |
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atttcatttatcttttccataccatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttcctcacacaatattaattacatttcttaatacgt |
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T |
 |
| Q |
421 |
gtgaaatgcccaaaacgtcatacaatttaggatgaagggagta |
463 |
Q |
| |
|
|||||||| |||||||||| || ||||| ||| | |||||||| |
|
|
| T |
52184097 |
gtgaaatggccaaaacgtcgtataatttgggacggagggagta |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #122
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Query Start/End: Original strand, 269 - 467
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| |
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T |
 |
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attttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatatgtgtgaaatgcccaaaacgtcatacaatttaggatgaag |
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Q |
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| T |
26855498 |
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26855597 |
T |
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| Q |
458 |
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467 |
Q |
| |
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| T |
26855598 |
ggagtaattt |
26855607 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #123
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Target Start/End: Complemental strand, 49226610 - 49226413
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352 |
Q |
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| T |
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49226513 |
T |
 |
| Q |
353 |
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448 |
Q |
| |
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| T |
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ttaaggacaattttataaaacaactcataatatctcttttccacacaatattaattgcttttcttaatatgtgtgaaatgcccaaaacgtcatacaattt |
49226413 |
T |
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Target: chr4; HSP #124
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Target Start/End: Original strand, 43609306 - 43609530
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332 |
Q |
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43609306 |
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T |
 |
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333 |
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425 |
Q |
| |
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| T |
43609406 |
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43609505 |
T |
 |
| Q |
426 |
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450 |
Q |
| |
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| T |
43609506 |
atacccaaaacgtcatacaatttag |
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T |
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Target: chr4; HSP #125
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Target Start/End: Complemental strand, 22496699 - 22496473
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ttgtcccaaattgtatgtcactttacaataccaatgaaacattaatgttatttttcctattataaccttaactatttattactctctcttctttcaagtc |
332 |
Q |
| |
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| T |
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ttgtcccaaattgtatgtgtctttacaataccaatgaatcattaatgttacttttcctattatatccttcgctatttattgcattctctacttccaagtc |
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T |
 |
| Q |
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ttttatttatctttttcata-----------ggacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatatgtg |
421 |
Q |
| |
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||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||| || |||||||||||||||||||| ||| |
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| T |
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atttatttatctttcccatatcatttattaaggacaattttgtaaaacgactcataatatatctttcccacataaaattaattacatttcttaatacgtg |
22496500 |
T |
 |
| Q |
422 |
tgaaatgcccaaaacgtcatacaattt |
448 |
Q |
| |
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| ||||||||||||||||||||||||| |
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| T |
22496499 |
taaaatgcccaaaacgtcatacaattt |
22496473 |
T |
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Target: chr4; HSP #126
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339 |
Q |
| |
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37390545 |
aaattgtatgtcgctttaggaaaaaaatgaaacattaatgttattttttctattatatccttaactatttattactctttcttctttcaattctttcttt |
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T |
 |
| Q |
340 |
tatctttttcata-----------ggacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatatgtgtgaaatg |
428 |
Q |
| |
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| T |
37390645 |
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37390744 |
T |
 |
| Q |
429 |
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463 |
Q |
| |
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| T |
37390745 |
ttcaaaacgtcatacaatttgggacggagggagta |
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T |
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Target: chr4; HSP #127
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Target Start/End: Original strand, 39915773 - 39916051
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Q |
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|
| T |
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T |
 |
| Q |
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tataaccttaactatttattactctctcttctttcaagtcttttatttatctttttcat-----------aggacaattttgtaaaacaactcataatat |
381 |
Q |
| |
|
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|
| T |
39915873 |
tatatccttaactatttattactttctcttctttcaattctttcatttatctttctcatattatttattaagatcaattttataaaacaactcataatat |
39915972 |
T |
 |
| Q |
382 |
ctcttttccacacaatattaattacatttcttaatatgtgtgaaatgcccaaaacgtcatacaatttaggatgaagggagtaat |
465 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
39915973 |
ctcattttcacacaaaatatattacatttcttaatatatgt----tgcctaaaacatcatacaattt-ggacggagggagtaat |
39916051 |
T |
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Target: chr4; HSP #128
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Target Start/End: Complemental strand, 48510874 - 48510648
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332 |
Q |
| |
|
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| T |
48510874 |
ttgtcccaaattatatgtcgttttacattaccaatgcaacattaatgttacttttccaattgtaaccttaactatttatttttatctcttctttcaattc |
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T |
 |
| Q |
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ttttatttatctttttcata-----------ggacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatatgtg |
421 |
Q |
| |
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| T |
48510774 |
tttcatttatctttcccatattatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatattttttttccacacaatattaattgtatttcttaatatgtg |
48510675 |
T |
 |
| Q |
422 |
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448 |
Q |
| |
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|
| T |
48510674 |
tgaaatgtccaaaacatcatacaattt |
48510648 |
T |
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Target: chr4; HSP #129
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334 |
Q |
| |
|
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|
|
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T |
 |
| Q |
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423 |
Q |
| |
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| ||||| ||||| ||| || ||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| |
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| T |
9542501 |
tcatttaacttttccatatcatttattaagaacaatttagtaaaacaactcataatatctatttcccacacaatatcaattatatttcttaatacgtgtg |
9542402 |
T |
 |
| Q |
424 |
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441 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||||||| |
|
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| T |
9542401 |
aaatgctcaaaacgtcat |
9542384 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #130
Raw Score: 100; E-Value: 4e-49
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Target Start/End: Original strand, 14965337 - 14965610
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Q |
| |
|
|||||| ||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
14965337 |
tactccctccgtcccaaattgtatgtcgttttggaaaaaaaatttgtcccaaattgtatgtcgctttgcaatactaatgaagcattaatgttatttttcc |
14965436 |
T |
 |
| Q |
290 |
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378 |
Q |
| |
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||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||| |||||| || |||||||||| ||| | || ||||||||||||||| ||| || |
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| T |
14965437 |
tattatatccttaactatttactactttctcttcttccaagtcattcatttatctttcccatatcatttactaaagataattttgtaaaacaattcaaaa |
14965536 |
T |
 |
| Q |
379 |
tatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatatgtgtgaaatgcccaaaacgtcatacaatttagga |
452 |
Q |
| |
|
|||| |||||||| ||| |||||||| ||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
14965537 |
tatccattttccacgcaaaattaattatatttcttaatacgtatgaaatgctcaaaacgtcatacaatttagga |
14965610 |
T |
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Target: chr4; HSP #131
Raw Score: 100; E-Value: 4e-49
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Target Start/End: Complemental strand, 20788376 - 20788179
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330 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
20788376 |
atttgtcccaaattatatgtcgctttacaatatcaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttaattatttattactctatcttctttcaat |
20788277 |
T |
 |
| Q |
331 |
tcttttatttatctttttcat-----------aggacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaatattaattacatttcttaata |
417 |
Q |
| |
|
| ||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
20788276 |
tatttcatttatcttttccatattatttattaaggacaattttgtaaaacaactcataatatttcatttcctcacaatattaattgcatttcttaata |
20788179 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #132
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Query Start/End: Original strand, 231 - 437
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atttgtcccaaattgtatgtcactttacaataccaatgaaacattaatgttatttttcctattataaccttaactatttattactctctcttctttcaag |
330 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
28002555 |
atttgtcccaaattatatgtcgttttacaataccaatgaaatatttatgttacttttcctattatatccttaactattaattactctctcttctttcaat |
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T |
 |
| Q |
331 |
tcttttatttatctttttcata-----------ggacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatatg |
419 |
Q |
| |
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| T |
28002655 |
tatttcatttatcttttccatactatttattagggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacgcagtattaattacatttcttaatacg |
28002754 |
T |
 |
| Q |
420 |
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437 |
Q |
| |
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| T |
28002755 |
tgtgaaatggccaaaacg |
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #133
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334 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||| | || |
|
|
| T |
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gtcccaaattatatgtcgctttagaataccaatgaaatattaatgttacttttcctattatatccttaactattaattagtctctcttctttcaattatt |
30418848 |
T |
 |
| Q |
335 |
ttatttatctttttcat-----------aggacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatatgtgtg |
423 |
Q |
| |
|
| ||||||||||| ||| |||| |||||| |||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||||||||| ||||| |
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| T |
30418849 |
tcatttatcttttccataccatttattaaggataattttataaaacaactcataatttctcttccacccacaatattaattacatttcttaatacgtgtg |
30418948 |
T |
 |
| Q |
424 |
aaatgcccaaaacgtcatacaatttaggatgaagggagtaat |
465 |
Q |
| |
|
||||| |||||||| ||||||||| ||| | |||||||||| |
|
|
| T |
30418949 |
aaatggtcaaaacgttatacaatttgggacggagggagtaat |
30418990 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #134
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atttgtcccaaattgtatgtcactttacaataccaatgaaacattaatgtt-atttttcctattataaccttaactatttattactctctcttctttcaa |
329 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||| |||| |||||||||| | ||||| || |||| |
|
|
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atttgtcctaaattgtatgtcactttacaataccaatgaataattaatgtttacttttcctattatatccttcactatttattgccttctctactctcaa |
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T |
 |
| Q |
330 |
gtcttttatttatctttttcata-----------ggacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatat |
418 |
Q |
| |
|
||| || |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| |||||||||||||||||||| |
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|
| T |
41947705 |
gtcattcatttatctttcccatatcatttattaaggacaattttgtaaaacaactcataatatctctttccaacacaaaattaattacatttcttaatac |
41947606 |
T |
 |
| Q |
419 |
gtgtgaaatgcccaaaacgtcatacaattt |
448 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||||||||| |||||||| |
|
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| T |
41947605 |
gtgtgaaatacccaaaacgtcttacaattt |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #135
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Target Start/End: Original strand, 22128784 - 22128989
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tttacaataccaatgaaacattaatgttatttttcctattataaccttaactatttattactctctcttctttcaagtcttttatttatctttt-----t |
348 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
22128784 |
tttacaataccaatgaaacattaatgttatcttttctattatatcattaactatttattactctattttcttttaattctttcatttatctttccggtat |
22128883 |
T |
 |
| Q |
349 |
cat------aggacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatatgtgtgaaatgcccaaaacgtcata |
442 |
Q |
| |
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||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |
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| T |
22128884 |
catttattaaggacaattttgtaaaacaagtcataatttctcttttccatacaatattaattatatttcttaatacgtgtgaaatgctcaaaacgtcata |
22128983 |
T |
 |
| Q |
443 |
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448 |
Q |
| |
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| T |
22128984 |
caattt |
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T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #136
Raw Score: 99; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 233 - 452
Target Start/End: Complemental strand, 30035536 - 30035304
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Q |
| |
|
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|
| T |
30035536 |
ttgtctcaaattatatgttactttacaataccaatgcaacattaatattaatttctctattataaccttaactatttattactatctcttctttcaattc |
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T |
 |
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ttttatttatcttt--------ttcat--aggacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatatgtgt |
422 |
Q |
| |
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| T |
30035436 |
tttcatttatttttccatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatattttttccacacaatattaattgtattttttaatatgtgt |
30035337 |
T |
 |
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423 |
g---aaatgcccaaaacgtcatacaatttagga |
452 |
Q |
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30035336 |
gatcaaatgcctaaaacgtcatacaatttagga |
30035304 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #137
Raw Score: 99; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 233 - 465
Target Start/End: Complemental strand, 41414305 - 41414061
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233 |
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332 |
Q |
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41414305 |
ttgtctcaaattatatgtcgttttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcctattatatccttaattattaattactctctcttctttcaatta |
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T |
 |
| Q |
333 |
ttttatttatctttttcat-----------aggacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacac-aatattaattacatttcttaatatgt |
420 |
Q |
| |
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| T |
41414205 |
tttcatttatctttttcataccatttattaaggataattttgtaaaataactcataatttctcttccccacacgaatattaattacatttcttaatacgt |
41414106 |
T |
 |
| Q |
421 |
gtgaaatgcccaaaacgtcatacaatttaggatgaagggagtaat |
465 |
Q |
| |
|
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|
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| T |
41414105 |
gtgaaatggtcaaaatgtcatacaatttgagacggagggagtaat |
41414061 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #138
Raw Score: 98; E-Value: 6e-48
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Target Start/End: Original strand, 30609280 - 30609499
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339 |
Q |
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aaattatatgtcgctttacaataccaatgaaatatttatgttacttttcctgttatatccttaactattaattactctctcttctttcaattatttcatt |
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T |
 |
| Q |
340 |
tatctttttcata-----------ggacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatatgtgtgaaatg |
428 |
Q |
| |
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| T |
30609380 |
tatcttttccataccatttattagggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacgcaatattaattacatttcttaatacgtgcgaaatg |
30609479 |
T |
 |
| Q |
429 |
cccaaaacgtcatacaattt |
448 |
Q |
| |
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| ||||||||| |||||||| |
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| T |
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ctcaaaacgtcttacaattt |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #139
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 256 - 463
Target Start/End: Complemental strand, 8591904 - 8591686
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353 |
Q |
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T |
 |
| Q |
354 |
---------gacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatatgtgtgaaatgcccaaaacgtcataca |
444 |
Q |
| |
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| T |
8591804 |
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8591705 |
T |
 |
| Q |
445 |
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463 |
Q |
| |
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|||| | | |||||||||| |
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| T |
8591704 |
atttggaacgaagggagta |
8591686 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #140
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 233 - 463
Target Start/End: Complemental strand, 30649825 - 30649583
Alignment:
| Q |
233 |
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331 |
Q |
| |
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|||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||| || |||| |||| || ||| ||| || ||||||||| | |
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| T |
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T |
 |
| Q |
332 |
cttttatttatctttttcata-----------ggacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatatgt |
420 |
Q |
| |
|
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| T |
30649725 |
attttatttatcttttccataccatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaatattaattacatttcttaatacgt |
30649626 |
T |
 |
| Q |
421 |
gtgaaatgcccaaaacgtcatacaatttaggatgaagggagta |
463 |
Q |
| |
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| T |
30649625 |
gtgaaatagccaaaacgtcatacaatttgggacggagggagta |
30649583 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #141
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 269 - 448
Target Start/End: Original strand, 34018750 - 34018940
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357 |
Q |
| |
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| T |
34018750 |
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34018849 |
T |
 |
| Q |
358 |
attttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatatgtgtgaaatgcccaaaacgtcatacaattt |
448 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |
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|
| T |
34018850 |
attttgtaaaacaactcataatatctttttttcacacaatattaactacatttcttaatatgtgtgaaatgcccaaaacatcatacaattt |
34018940 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #142
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 233 - 448
Target Start/End: Original strand, 50098214 - 50098440
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| Q |
233 |
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332 |
Q |
| |
|
|||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| | |
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| T |
50098214 |
ttgttccaaattatatgtcgctttacaataccaatgaaatatttatgttacttttcctattatatccttaactattaattactctctcttctttcaatta |
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T |
 |
| Q |
333 |
ttttatttatctttttcata-----------ggacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatatgtg |
421 |
Q |
| |
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| T |
50098314 |
tttcatttatcttttccataccatttattagggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccctatgcaatattaataacatttcttaatacgtg |
50098413 |
T |
 |
| Q |
422 |
tgaaatgcccaaaacgtcatacaattt |
448 |
Q |
| |
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||||||| |||||||||| |||||||| |
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| T |
50098414 |
tgaaatgaccaaaacgtcttacaattt |
50098440 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #143
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 233 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 52397930 - 52397704
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| Q |
233 |
ttgtcccaaattgtatgtcactttacaataccaatgaaacattaatgttatttttcctattataaccttaactatttattactctctcttctttcaagtc |
332 |
Q |
| |
|
|||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||| | ||||||||| |||||| ||||||||||||| | |
|
|
| T |
52397930 |
ttgtcctaaattatatgtcgctttacaataccaatgaaatatttatgttatttttcttattatatcattaactattaattactttctcttctttcaatta |
52397831 |
T |
 |
| Q |
333 |
ttttatttatctttttcat-----------aggacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatatgtg |
421 |
Q |
| |
|
||| ||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||| |||||| ||| |
|
|
| T |
52397830 |
tttcatttatcattttcataccatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacgcaatattaattacattttttaatacgtg |
52397731 |
T |
 |
| Q |
422 |
tgaaatgcccaaaacgtcatacaattt |
448 |
Q |
| |
|
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| T |
52397730 |
tgaaatgaccaaaacgtcttacaattt |
52397704 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #144
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 233 - 448
Target Start/End: Original strand, 54270812 - 54271038
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| Q |
233 |
ttgtcccaaattgtatgtcactttacaataccaatgaaacattaatgttatttttcctattataaccttaactatttattactctctcttctttcaagtc |
332 |
Q |
| |
|
|||||| ||||| ||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||| | |
|
|
| T |
54270812 |
ttgtcctaaattatatttcgctttacaataccaatgaaatattaatgttattttttctattatatccttaactattaattactttctcttctttcaatta |
54270911 |
T |
 |
| Q |
333 |
ttttatttatctttttcat-----------aggacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatatgtg |
421 |
Q |
| |
|
||| ||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||| | |||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |
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|
| T |
54270912 |
tttcatttatcttttccataccttatattaaggataattttgtaaaacaactcataatttatcttccccacagaatattaattacatttcttaatacgtg |
54271011 |
T |
 |
| Q |
422 |
tgaaatgcccaaaacgtcatacaattt |
448 |
Q |
| |
|
||||||| |||| || ||||||||||| |
|
|
| T |
54271012 |
tgaaatggccaatacatcatacaattt |
54271038 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #145
Raw Score: 96; E-Value: 9e-47
Query Start/End: Original strand, 273 - 463
Target Start/End: Original strand, 23138300 - 23138501
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attaatgttatttttcctattataaccttaactatttattactctctcttctttcaagtcttttatttatctttttcata-----------ggacaattt |
361 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||| | ||| ||||||||||| |||| ||| ||||| |
|
|
| T |
23138300 |
attaatgttacttttcatattatatccttaactattaattactccctcttctttcaattatttcatttatcttttccataccatttattaaggataattt |
23138399 |
T |
 |
| Q |
362 |
tgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatatgtgtgaaatgcccaaaacgtcatacaatttaggatgaagggag |
461 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
23138400 |
tgtaaaacaactcataatttctcttctccacacaatattaattacatttcttaatacgtgtgaaatggccaaaacgtcatacaatttgggacggagggag |
23138499 |
T |
 |
| Q |
462 |
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463 |
Q |
| |
|
|| |
|
|
| T |
23138500 |
ta |
23138501 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #146
Raw Score: 96; E-Value: 9e-47
Query Start/End: Original strand, 246 - 448
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tatgtcactttacaataccaatgaaacattaatgttatttttcctattataaccttaactatttattactctctcttctttcaagtcttttatttatctt |
345 |
Q |
| |
|
|||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||| || |||| | ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||| |
|
|
| T |
23153711 |
tatgtcactttataataccaatgaaatattaatgttactttttctgttatgtcattaactatttattactctctcgtctttcaattctttaatttatctt |
23153810 |
T |
 |
| Q |
346 |
tttcata-----------ggacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatatgtgtgaaatgcccaaa |
434 |
Q |
| |
|
| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| || || |
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|
| T |
23153811 |
tctcatactatttactaaggacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttttacacaaaattaattatatttcttaatatgtgtgaaatgtcc-aa |
23153909 |
T |
 |
| Q |
435 |
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448 |
Q |
| |
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|
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| T |
23153910 |
acttcatacaattt |
23153923 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #147
Raw Score: 96; E-Value: 9e-47
Query Start/End: Original strand, 231 - 464
Target Start/End: Original strand, 37787918 - 37788160
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atttgtcccaaattgtatgtcactttacaataccaatgaaacattaatgttatttttcctattataaccttaactatttattactctctcttctttcaag |
330 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||| ||| || ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||| |||| |||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
37787918 |
atttgtcctaaattatatatcgctttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcctattatatccttaattattaattactctct--tctttcaat |
37788015 |
T |
 |
| Q |
331 |
tcttttatttatctttttcata-----------ggacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatatg |
419 |
Q |
| |
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| ||| ||||||| ||| |||| ||| |||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| | |
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|
| T |
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tatttcatttatcctttccataccatttattagggataattttgtaaaataactcataatttctctttcccacacaatattaattatatttcttaatacg |
37788115 |
T |
 |
| Q |
420 |
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464 |
Q |
| |
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||||||||| ||||||||||||| ||||| ||| | ||||||||| |
|
|
| T |
37788116 |
tgtgaaatggccaaaacgtcatataatttgggacggagggagtaa |
37788160 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #148
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Query Start/End: Original strand, 235 - 448
Target Start/End: Original strand, 6284026 - 6284250
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Q |
| |
|
|||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
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gtcccaaattatatgtcgttttacaatatcaatgaaacattaatgttacttttcatattatgtccttaactatttattattatctcttctttcaattctt |
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T |
 |
| Q |
335 |
ttatttatctttttcat-----------aggacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatatgtgtg |
423 |
Q |
| |
|
| ||||||||||| ||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||| | | || |||| |||||||||||||||||||| ||||| |
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|
| T |
6284126 |
taatttatcttttccatatcatttattaaggataattttgtaaagcaactcataatatctatgtctcatacaaaattaattacatttcttaatacgtgtg |
6284225 |
T |
 |
| Q |
424 |
aaatgcccaaaacgtcatacaattt |
448 |
Q |
| |
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||||||| ||||||||||||||||| |
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|
| T |
6284226 |
aaatgcctaaaacgtcatacaattt |
6284250 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #149
Raw Score: 95; E-Value: 4e-46
Query Start/End: Original strand, 262 - 463
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262 |
accaatgaaacattaatgttatttttcctattataaccttaactatttattactctctcttctttcaagtcttttatttatctttttcata--------- |
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Q |
| |
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15986483 |
T |
 |
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--ggacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatatgtgtgaaatgcccaaaacgtcatacaatttag |
450 |
Q |
| |
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| T |
15986482 |
aaggataattttgtaaaacaactcataatatctttcttccacacaatattaattgcatttcttaatatgtgtgaaatgcccaaaacgtcatacaatttgg |
15986383 |
T |
 |
| Q |
451 |
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463 |
Q |
| |
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| T |
15986382 |
gacggagggagta |
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T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #150
Raw Score: 95; E-Value: 4e-46
Query Start/End: Original strand, 241 - 446
Target Start/End: Complemental strand, 32397500 - 32397284
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| |
|
|||| |||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
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T |
 |
| Q |
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atctttttcat-----------aggacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatatgtgtgaaatgc |
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Q |
| |
|
|| ||| ||| ||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||| |
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|
| T |
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atttttcccatattatttattaaggacaattttttaaaacatttcataatatttcttttccacacaatattaattatatttcttaatgtgtgtaaaatgc |
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T |
 |
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ccaaaacgtcatacaat |
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Q |
| |
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| |||| || ||||||| |
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|
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #151
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 268 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 32385562 - 32385372
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Q |
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| T |
32385562 |
gaaacattaatgttatttttcctattatatccttaactatttatta-tctctcttctttcaattctttaatttatctttctcataccatttattaaggaa |
32385464 |
T |
 |
| Q |
357 |
aattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatatgtgtgaaatgcccaaaacgtcatacaattt |
448 |
Q |
| |
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|||||||||||| || ||||||||||| ||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |
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|
| T |
32385463 |
aattttgtaaaataattcataatatctatttcccacacaaaattaattatatttcttaatatgtgtgaaatgtctaaaacgtcatacaattt |
32385372 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #152
Raw Score: 93; E-Value: 6e-45
Query Start/End: Original strand, 197 - 448
Target Start/End: Original strand, 51779540 - 51779802
Alignment:
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296 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||| ||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |
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| T |
51779540 |
tccgtcccaaattgtatgtcactttataaaaaatatttgtcctaaattatatatcgttttacaataccaatgaaacattaatgttactttttctattata |
51779639 |
T |
 |
| Q |
297 |
accttaactatttattactctctcttctttcaagtcttttatttatctttttcat-----------aggacaattttgtaaaacaactcataatatctct |
385 |
Q |
| |
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|
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| T |
51779640 |
tccttaactatttattattctctcttcttttaattccttcatttaattttctcatatcatttattaaggacgattttgtaaaacaactcataatatcttt |
51779739 |
T |
 |
| Q |
386 |
tttccacacaatattaattacatttcttaatatgtgtgaaatgcccaaaacgtcatacaattt |
448 |
Q |
| |
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|| | |||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||| |||||||| ||||||||| |
|
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| T |
51779740 |
ttcctacacaatattaattgcatttcttaacatgtgtaaaatgctcaaaacgtaatacaattt |
51779802 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #153
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Query Start/End: Original strand, 230 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 1788835 - 1788607
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| Q |
230 |
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329 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
1788835 |
tatttgtcccaaattatatgtcgctttacaataccgataaaacattaatgttacttttcctattatatcgttaattatctattactctctcttctttcaa |
1788736 |
T |
 |
| Q |
330 |
gtcttttatttatctttttcat-----------aggacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatat |
418 |
Q |
| |
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||||| |||||||| | |||| || |||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||| |||||||||| ||||||||| |
|
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| T |
1788735 |
ttctttcatttatctatctcatatcatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatcactttccagcacaaaattaattaca-ttcttaatac |
1788637 |
T |
 |
| Q |
419 |
gtgtgaaatgcccaaaacgtcatacaattt |
448 |
Q |
| |
|
||| |||||| ||||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
1788636 |
gtgcgaaatgaccaaaacatcatacaattt |
1788607 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #154
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 230 - 448
Target Start/End: Original strand, 7770493 - 7770723
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| Q |
230 |
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327 |
Q |
| |
|
|||||||| |||||| |||||||||||||||||| || |||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||||||||| |
|
|
| T |
7770493 |
tatttgtctcaaattatatgtcactttacaatac-aaggaaaaattaatgttacttttcctattatatccttaactatttactgttctctctcttctttc |
7770591 |
T |
 |
| Q |
328 |
aagtcttttatttatctttttcata-----------ggacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaatattaattacatttcttaat |
416 |
Q |
| |
|
|| || || |||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||| |
|
|
| T |
7770592 |
aattccttcatttatctttcccatatcatttattgagaacaattttgtaaaacaactcataatatctctttcccacacaatattaattaca-tccttaat |
7770690 |
T |
 |
| Q |
417 |
atgt-gtgaaatgcccaaaacgtcatacaattt |
448 |
Q |
| |
|
|||| ||||||||||||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
7770691 |
atgtggtgaaatgcccaaaacgtcgtacaattt |
7770723 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #155
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 231 - 463
Target Start/End: Complemental strand, 44622457 - 44622215
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| Q |
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330 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| | ||||||||| |||||||||| || ||||| |
|
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| T |
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atttgtccaaaattatatgtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcctattatatctttaactattaattactctctttt--ttcaat |
44622360 |
T |
 |
| Q |
331 |
tcttttatttatctttttc----------at--aggacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatat |
418 |
Q |
| |
|
| ||| |||||| |||||| || || | ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |
|
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| T |
44622359 |
tatttcatttatttttttccataccatttattaagaataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaatattaattacatttcttaatac |
44622260 |
T |
 |
| Q |
419 |
gtgtgaaatgcccaaaacgtcatacaatttaggatgaagggagta |
463 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||||||||||||||||| ||| | |||||||| |
|
|
| T |
44622259 |
atgtgaaatggccaaaacgtcatacaatttgggacggagggagta |
44622215 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #156
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 231 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 53334097 - 53333916
Alignment:
| Q |
231 |
atttgtcccaaattgtatgtcactttacaataccaatgaaacattaatgttatttttcctattataaccttaactatttattactctctcttctttcaag |
330 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||| |||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
53334097 |
atttgtcccaaattatatgtcgctttacaatatcaatgcaacattgatgttactttttctattataaccttaactatttattactatctcttctttcaat |
53333998 |
T |
 |
| Q |
331 |
tcttttatttatctttttcat-----------aggacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaatatta |
401 |
Q |
| |
|
||||| |||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
53333997 |
tctttcatttatatttctcatattatttattaaggacaattttgtaaaacaactcataatatcttttttccacacaatatta |
53333916 |
T |
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Target: chr4; HSP #157
Raw Score: 90; E-Value: 4e-43
Query Start/End: Original strand, 190 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 51817225 - 51817001
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| Q |
190 |
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289 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| | |
|
|
| T |
51817225 |
tactccctccgtcccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaatatcaatgaaacattaatgttattttttc |
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T |
 |
| Q |
290 |
tattataaccttaactatttattactctctcttctttcaagtcttttatttatcttt-----ttcat------aggacaattttgtaaaacaactcataa |
378 |
Q |
| |
|
||||||| | |||||||||||||||||| | || |||||| |||||||||||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
51817125 |
tattatatcattaactatttattactcttttttttttcaattcttttatttatctttcccagatcatttataaaggataattttgtaaaacaactcataa |
51817026 |
T |
 |
| Q |
379 |
tatctcttttccacacaatattaat |
403 |
Q |
| |
|
||||||||| || ||||||||||| |
|
|
| T |
51817025 |
tatctctttctcatacaatattaat |
51817001 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #158
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 189 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 32860901 - 32860755
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| Q |
189 |
ttactccatccgtcctaaattgtatgtcattttnnnnnnnntatttgtcccaaattgtatgtcactttacaataccaatgaaacattaatgttatttttc |
288 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
32860901 |
ttactccctccgtcccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttacaataccaatgaaacattaatgttacttttc |
32860802 |
T |
 |
| Q |
289 |
ctattataaccttaactatttattactctctcttctttcaagtcttt |
335 |
Q |
| |
|
|||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
32860801 |
ctattatatttttaactatttattactctttcttctttcaattcttt |
32860755 |
T |
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Target: chr4; HSP #159
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Query Start/End: Original strand, 230 - 352
Target Start/End: Original strand, 32882161 - 32882283
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329 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||| ||| || ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
32882161 |
tatttgttccaaattatatatcgctttataataccaatgcaacattaatgttatttttcctattataaccttaactatttattactctatcttctttcaa |
32882260 |
T |
 |
| Q |
330 |
gtcttttatttatctttttcata |
352 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
32882261 |
ttcttttatttatctttctcata |
32882283 |
T |
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Target: chr4; HSP #160
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Query Start/End: Original strand, 284 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 27956017 - 27955842
Alignment:
| Q |
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ttttcctattataaccttaactatttattactctctcttctttcaagtcttttatttatctttttcata-----------ggacaattttgtaaaacaac |
372 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||| ||||| |||||||||| |||| | |||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
27956017 |
ttttcctattataaccttaattatttattactctattttctttcaattctttcatttatctttcccatattatttattaagaacaaatttgtaaaacaac |
27955918 |
T |
 |
| Q |
373 |
tcataatatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatatgtgtgaaatgcccaaaacgtcatacaattt |
448 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
27955917 |
tcataatatcccttttccacacaatattaattgcatttcttaatatgtgtgaaatgtccaaaacatcatacaattt |
27955842 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #161
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 233 - 464
Target Start/End: Complemental strand, 16833842 - 16833600
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| Q |
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332 |
Q |
| |
|
||||| |||||| |||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||| | || |
|
|
| T |
16833842 |
ttgtctcaaattatatgtcgctttacaataccaataaaatattaatgttacttttcctattacataattaactattaattactctctcttctttctattc |
16833743 |
T |
 |
| Q |
333 |
ttttatttatctttttcata-----------ggacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatatgtg |
421 |
Q |
| |
|
|| |||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||||| |||||| ||| |
|
|
| T |
16833742 |
attcatttatttttctcatatcatttattaaggacaattttgtaaaacaactcataatatctctttctcaaataatattaattacattttttaatacgtg |
16833643 |
T |
 |
| Q |
422 |
tgaaatgcccaaaacgtcatacaatttaggatgaagggagtaa |
464 |
Q |
| |
|
||||||| ||||| ||||||||||| ||| | ||||||||| |
|
|
| T |
16833642 |
tgaaatgtccaaacaatcatacaatttgggacggagggagtaa |
16833600 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #162
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Target Start/End: Original strand, 50534238 - 50534352
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451 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
50534238 |
aggacaattttgtaatacaactcataatatat-ttttccacacaatattaattacatttcttaatatgtgtgaaatgcccaaaacgttatacaatttagg |
50534336 |
T |
 |
| Q |
452 |
atgaagggagtaattt |
467 |
Q |
| |
|
| | | |||||||||| |
|
|
| T |
50534337 |
acggaaggagtaattt |
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T |
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Target: chr4; HSP #163
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Query Start/End: Original strand, 230 - 435
Target Start/End: Original strand, 46674900 - 46675116
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329 |
Q |
| |
|
|||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
46674900 |
tatttgtctcaaattttatgtcactttacaataccaatgaaacattaatattatttttcctattatatccttaactatctattactctttcttctttcaa |
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T |
 |
| Q |
330 |
gtcttt-tatttatctttttcatagga----------caattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatat |
418 |
Q |
| |
|
| ||| |||||| ||| ||||| | ||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||| ||||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
46675000 |
ttttttccatttatatttctcatatcatttattaatgtaattttgtaaaacaattcataatatctttttcttacacggtattaattatatttcttaatat |
46675099 |
T |
 |
| Q |
419 |
gtgtgaaatgcccaaaa |
435 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
46675100 |
gtgtgaaatacccaaaa |
46675116 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #164
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332 |
Q |
| |
|
|||||||| ||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||| |||||| || |
|
|
| T |
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T |
 |
| Q |
333 |
ttttatttatctttttcat-----------aggacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatatgtg |
421 |
Q |
| |
|
||| |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | | || | |||||||||||||||||||| ||| |
|
|
| T |
8178103 |
tttcatttatctttcccatataatttattgaggacaattttgtaaaacaacttataatatctctttcctatactacattaattacatttcttaatacgtg |
8178004 |
T |
 |
| Q |
422 |
tgaaatgcccaaaacgtcatacaattt |
448 |
Q |
| |
|
| ||| | ||||| || ||||||||| |
|
|
| T |
8178003 |
tacaatactcaaaaagtgatacaattt |
8177977 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #165
Raw Score: 81; E-Value: 8e-38
Query Start/End: Original strand, 233 - 452
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ttgtcccaaattgtatgtcactttacaataccaatgaaacattaatgttatttttcctattataaccttaactatttattactctctcttctttcaagtc |
332 |
Q |
| |
|
|||||||||||| |||||| ||||| |||||||||| |||||| || | |||||||||||||||||||| |||||| | || ||||||||||| || |
|
|
| T |
29977132 |
ttgtcccaaattatatgtcgctttaaaataccaatgcaacattgat---acttttcctattataaccttaattattta---ccctttcttctttcaattc |
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T |
 |
| Q |
333 |
ttttatttatctttttcata-----------ggacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatatgtg |
421 |
Q |
| |
|
||| ||||| ||| ||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| || |
|
|
| T |
29977038 |
tttcatttaattttctcatatcatttattaaggataattttgtaaaacaacttataatatctcttttccatacaatattaattgtatttcttaatatatg |
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T |
 |
| Q |
422 |
tgaaatgcccaaaacgtcatacaatttagga |
452 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
29976938 |
tgaaatgcccaaaacatcatacaatttagga |
29976908 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #166
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| |
|
|||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
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ttaactatttattactctttcttctttcaattctttcatttatctttcctatatcatttattaaggattattttgtaaaacaactcataatatctctttc |
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 |
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ccacacaatattaattacatttcttaatatgtgtgaaatgcccaaaacgtcatacaatttaggatgaagggagta |
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Q |
| |
|
||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||| | |||||||| |
|
|
| T |
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ccacacagtattaattacatttcttaatatgtgtgaaatgtccaaaacgtcataaaatttgggacggagggagta |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #167
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Target Start/End: Original strand, 34498250 - 34498358
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456 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || | | |
|
|
| T |
34498250 |
aattttgtaaaacaactcataatatctctttcccatataatattaattacatttcttaatatatgtgaaatgcccaaaacgtcatacaatttgagacgga |
34498349 |
T |
 |
| Q |
457 |
gggagtaat |
465 |
Q |
| |
|
||||||||| |
|
|
| T |
34498350 |
gggagtaat |
34498358 |
T |
 |
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332 |
Q |
| |
|
|||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||| | |
|
|
| T |
44570836 |
ttgtcccaaattatatgtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcctattatatccttaactattaattactatctcttctttcaatta |
44570935 |
T |
 |
| Q |
333 |
ttttatttatctttt |
347 |
Q |
| |
|
||| ||||||||||| |
|
|
| T |
44570936 |
tttcatttatctttt |
44570950 |
T |
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Target: chr4; HSP #169
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352 |
aggacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatatgtgtgaaatgcccaaaacgtcatacaattt |
448 |
Q |
| |
|
|||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
32859889 |
aggataattttgtaaaacaactcataatatctattttctacataatattaattacatttcttaatatatgtgaaatgctcaaaacgtcatacaattt |
32859793 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #170
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
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| Q |
233 |
ttgtcccaaattgtatgtcactttacaataccaatgaaacattaatgttatttttcctattataaccttaactatttattactctctcttctttcaagtc |
332 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||| || |||||| |
|
|
| T |
36507563 |
ttgtcccaaattgtattttgctttacaataccaatgaaacattaattttatttttcctattatatatttaactatttattactttatctcattccaagtc |
36507464 |
T |
 |
| Q |
333 |
ttttatttatctttttcat-----------aggacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaatattaatta |
405 |
Q |
| |
|
|| ||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||| |
|
|
| T |
36507463 |
attcatttatcttttccatatcatttattaatgacaattttgtaaaacaactcataatatctctttcccaaacaaaattaatta |
36507380 |
T |
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Target: chr4; HSP #171
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Target Start/End: Original strand, 50533809 - 50533885
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| Q |
230 |
tatttgtcccaaattgtatgtcactttacaataccaatgaaacattaatgttatttttcctattataaccttaacta |
306 |
Q |
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|
||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
50533809 |
tatttgtcccaaattatatgtcgctttacaataccaatgaaaaattaatgttatttttcctattatatccttaacta |
50533885 |
T |
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Target: chr4; HSP #172
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| Q |
298 |
ccttaactatttattactctctcttctttcaagtcttttatttatctttttcataggacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaat |
397 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||||| | | ||||||||||| ||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||| |
|
|
| T |
38052464 |
ccttaattatttattattttatcttctttcaattctttaatttatcatttattaaggacaattttgtaaaacaactcataatatgtattttccatgcaaa |
38052365 |
T |
 |
| Q |
398 |
attaattacatttcttaatatgtgtgaaatgcccaaaacgtcatacaatttaggatgaagggagtaat |
465 |
Q |
| |
|
||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||| ||||| | | |||| ||||||| |
|
|
| T |
38052364 |
attaactacatttcttaatagatgtgaaatgtccaaaatatcatataatttggaacgaagagagtaat |
38052297 |
T |
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Target: chr4; HSP #173
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| Q |
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attaatgttatttttcctattataaccttaactatttattactctctcttctttcaagtcttttatttatctttttcat-----------aggacaattt |
361 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| || || |||||||||| |||| | |||||||| |
|
|
| T |
13394531 |
attaatgttacttttcctattatatccttaactatttattgctctctcttctttcaattccttcatttatctttctcatatcatttattgaagacaattt |
13394432 |
T |
 |
| Q |
362 |
tgtaaaacaactcataatatctcttttccacac |
394 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
13394431 |
tgtaaaacaactcataatatctctttcccacac |
13394399 |
T |
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Target: chr4; HSP #174
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Query Start/End: Original strand, 273 - 394
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| Q |
273 |
attaatgttatttttcctattataaccttaactatttattactctctcttctttcaagtcttttatttatctttttcat-----------aggacaattt |
361 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| || || |||||||||| |||| | |||||||| |
|
|
| T |
13397670 |
attaatgttacttttcctattatatccttaactatttattgctctctcttctttcaattccttcatttatctttctcatatcatttattgaagacaattt |
13397571 |
T |
 |
| Q |
362 |
tgtaaaacaactcataatatctcttttccacac |
394 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
13397570 |
tgtaaaacaactcataatatctctttcccacac |
13397538 |
T |
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Target: chr4; HSP #175
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Target Start/End: Original strand, 14604248 - 14604443
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| Q |
239 |
caaattgtatgtcactttacaataccaatgaaacattaatgttatttttcctattataaccttaactatttattactctctcttctttcaagtcttttat |
338 |
Q |
| |
|
|||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||| |||||| |||| |||||||| | ||||| || |
|
|
| T |
14604248 |
caaattatatgtcgctttacaataccaacgaaacattaatgtaacttttcctattataactttaactagttattattctcgcttctttccattctttaat |
14604347 |
T |
 |
| Q |
339 |
ttatctttttcat-----------aggacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatatgtgtgaaat |
427 |
Q |
| |
|
||||| || |||| |||| |||||||||||| ||| ||||||||| ||||| | |||||||||| |||||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
14604348 |
ttatcattctcataccatttattaaggataattttgtaaaataacacataatatcacttttac-----atattaattatatttcttaatatatgtgaaat |
14604442 |
T |
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Back To:
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Target: chr4; HSP #176
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Query Start/End: Original strand, 239 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 18872445 - 18872355
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| Q |
239 |
caaattgtatgtcactttacaataccaatgaaacattaatgttatttttcctattataaccttaactatttattactctctcttctttcaa |
329 |
Q |
| |
|
|||||| |||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||| |
|
|
| T |
18872445 |
caaattatatgtcgttttataataccaataaaacattaatgttatttttcctattatatccttaactatttattactttatcttctttcaa |
18872355 |
T |
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Target: chr4; HSP #177
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282 |
Q |
| |
|
||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
29832428 |
aataagttactccctccgtcccaaattgtatgtcatttaaaaaaaaaaaattgtcccaaattgtatgtcactttacaatatcaatgaaacattaatgtta |
29832527 |
T |
 |
| Q |
283 |
tttttcctattata |
296 |
Q |
| |
|
||||||||||||| |
|
|
| T |
29832528 |
cttttcctattata |
29832541 |
T |
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acaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatatgtgtgaaatgcccaaaa |
435 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||| |||| ||||| |||||| |
|
|
| T |
31372470 |
acaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccatacaaaattaattacatatcttaatacgtgtaaaatgaccaaaa |
31372390 |
T |
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| Q |
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aattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatatgtgtgaaatgcccaaaacgtcatacaattt |
448 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| | || |||||||||||||| |
|
|
| T |
30152933 |
aattttgtaaaacaattcacaatatctcttttccacacaatattaattgtatttcttaatatgtaggaaatgtctaatacgtcatacaattt |
30152842 |
T |
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Back To:
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Target: chr4; HSP #180
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| Q |
239 |
caaattgtatgtcactttacaataccaatgaaacattaatgttatttttcctattataaccttaactatttattactctctcttctttcaagtcttttat |
338 |
Q |
| |
|
|||||| |||||| ||||| | || ||||||||||||||| | |||||| |||||| ||||||||||||||| |||||| || |||||| | |||||| |
|
|
| T |
26478180 |
caaattatatgtcgctttatattatcaatgaaacattaat---acttttccgattatatccttaactatttattgctctcttttttttcaattattttat |
26478084 |
T |
 |
| Q |
339 |
ttatctttt-----tcat------aggacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacaca-------atattaattacattt-cttaatatg |
419 |
Q |
| |
|
|||| ||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||| | |
|
|
| T |
26478083 |
ttatttttccaatatcatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatctctttctcacacagtacacaatattaattacattttcttaatacg |
26477984 |
T |
 |
| Q |
420 |
tgtgaaatgcccaaaacgtcatacaatttaggatgaagggagtaat |
465 |
Q |
| |
|
||||||||| | ||| ||||||||||||| ||| | |||||||||| |
|
|
| T |
26477983 |
tgtgaaatggctaaagcgtcatacaatttgggacggagggagtaat |
26477938 |
T |
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Target: chr4; HSP #181
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aatgaaacattaatgttatttttcctattataaccttaactatttattactctctcttctttcaagtcttttatttatcttt |
346 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| || || ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||| |
|
|
| T |
11116547 |
aatgaaacattaatgttacttgtcttattatacccttaactatttattactatctcttctttcaattctttgatttatcttt |
11116466 |
T |
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caaattgtatgtcactttacaataccaatgaaacattaatgttatttttcctat----tataaccttaactatttattactctctcttctttcaagtctt |
334 |
Q |
| |
|
|||||| |||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||| || | || |
|
|
| T |
23949769 |
caaattatatgtcgctttacaatataaatgcaacattaatgttattttttctattatatataaccttaactatttatcactctcttttcttttaattatt |
23949670 |
T |
 |
| Q |
335 |
ttatttatctttttcat-----------aggacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatatgtgtg |
423 |
Q |
| |
|
| ||||||||| | || || |||||||| ||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||| |||||||||||| |||| |
|
|
| T |
23949669 |
tcttttatctttctaatattatttattaagaacaattttttaaaacaactcatgatatctctttttaaaacaatattaattgcatttcttaatagatgtg |
23949570 |
T |
 |
| Q |
424 |
aaatgcccaaaacgtcataca |
444 |
Q |
| |
|
|| ||| ||| || ||||||| |
|
|
| T |
23949569 |
aagtgctcaagacatcataca |
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Target: chr4; HSP #183
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351 |
Q |
| |
|
|||| |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||| |
|
|
| T |
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tttaaaataccaatgaagaattaatgttatttttttctattataccattaattatttattactctctcttctttcaattctttaatttatctttcgcata |
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T |
 |
| Q |
352 |
----------aggacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatatgtgtgaaatg |
428 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||| |||| |||| ||| | || |||||| |||||||||| |
|
|
| T |
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gtatttattaaggacaattttgtaaaataattcataatatttcttttccatacaaaattatttatagtt-ttaatacgtgtgaaatg |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
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351 |
Q |
| |
|
|||| |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||| |
|
|
| T |
10913193 |
tttaaaataccaatgaagaattaatgttatttttttctattataccattaattatttattactctctcttctttcaattctttaatttatctttcgcata |
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T |
 |
| Q |
352 |
----------aggacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatatgtgtgaaatg |
428 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||| |||| |||| ||| | || |||||| |||||||||| |
|
|
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T |
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351 |
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| |
|
|||| |||||||||||| |||||||||| |||| |||||||| | ||||||| | |||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||| ||| |
|
|
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tttaaaataccaatgaagaattaatgttactttttctattatacctttaactaatcattactctctattctttcaattctttaatttatctttcgcatgg |
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T |
 |
| Q |
352 |
---------aggacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatatgtgtgaaatg |
428 |
Q |
| |
|
|||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||| |||||||| | || |||||| |||||||||| |
|
|
| T |
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tatttattaaggaaaattttgtaaaacaattcataatatttcttttccatacaaaattaattataatt-ttaatacgtgtgaaatg |
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| |
|
|||| |||||||||||| |||||||||| |||| |||||||| | ||||||| | |||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||| ||| |
|
|
| T |
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tttaaaataccaatgaagaattaatgttactttttctattatacctttaactaatcattactctctattctttcaattctttaatttatctttcgcatgg |
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T |
 |
| Q |
352 |
---------aggacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatatgtgtgaaatg |
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Q |
| |
|
|||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||| |||||||| | || |||||| |||||||||| |
|
|
| T |
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tatttattaaggaaaattttgtaaaacaattcataatatttcttttccatacaaaattaattataatt-ttaatacgtgtgaaatg |
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| |
|
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35340662 |
tttacaataccaatgaaacattaataatattttttctattatacccttgacaaattattattttatcttctttcaattctttaatttatctttcttatac |
35340761 |
T |
 |
| Q |
352 |
---------aggacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatatgtgtgaaatg |
428 |
Q |
| |
|
|| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||| |||||||||| ||||| ||| |||||||||| |
|
|
| T |
35340762 |
catttatcaagaacaattttgtaaaacaattcataatatctctttcatatacaaaattaattacaattctttatacgtgtgaaatg |
35340847 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #188
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Target Start/End: Complemental strand, 9583786 - 9583570
Alignment:
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339 |
Q |
| |
|
||||| |||||| |||||| |||| ||| ||| |||| ||||| |||||| |||||| | ||||||||||| |||||||| |||||||| | ||||||| |
|
|
| T |
9583786 |
aaattatatgtcgctttacgatactaataaaatattagtgttacttttcccattatatctttaactatttagtactctct--tctttcaatttttttatt |
9583689 |
T |
 |
| Q |
340 |
tatctttttcata-----------ggacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatatgtgtgaaatg |
428 |
Q |
| |
|
||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||| | ||||||||||| |||||| ||||||||| |
|
|
| T |
9583688 |
tatctttcccatatcatttattaaggacaattttgtaaaacaactaataatatccctttcccacacataagtaattacattt-ttaatacgtgtgaaata |
9583590 |
T |
 |
| Q |
429 |
cccaaaacgtcatacaattt |
448 |
Q |
| |
|
|||||| ||| ||| |||| |
|
|
| T |
9583589 |
tccaaaatgtcgtacgattt |
9583570 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #189
Raw Score: 51; E-Value: 7e-20
Query Start/End: Original strand, 240 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 9589481 - 9589265
Alignment:
| Q |
240 |
aaattgtatgtcactttacaataccaatgaaacattaatgttatttttcctattataaccttaactatttattactctctcttctttcaagtcttttatt |
339 |
Q |
| |
|
||||| |||||| |||||| |||| ||| ||| |||| ||||| |||||| |||||| | ||||||||||| |||||||| |||||||| | ||||||| |
|
|
| T |
9589481 |
aaattatatgtcgctttacgatactaataaaatattagtgttacttttcccattatatctttaactatttagtactctct--tctttcaatttttttatt |
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T |
 |
| Q |
340 |
tatctttttcata-----------ggacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatatgtgtgaaatg |
428 |
Q |
| |
|
||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||| | ||||||||||| |||||| ||||||||| |
|
|
| T |
9589383 |
tatctttcccatatcatttattaaggacaattttgtaaaacaactaataatatccctttcccacacataagtaattacattt-ttaatacgtgtgaaata |
9589285 |
T |
 |
| Q |
429 |
cccaaaacgtcatacaattt |
448 |
Q |
| |
|
|||||| ||| ||| |||| |
|
|
| T |
9589284 |
tccaaaatgtcgtacgattt |
9589265 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #190
Raw Score: 51; E-Value: 7e-20
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Target Start/End: Complemental strand, 19721332 - 19721196
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379 |
Q |
| |
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|||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| | || ||||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
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attatatccttaactatttattactctctcttctttcaattctttaatttatctttcttataccatttattaaggacaaatttgtaaaacaactcataat |
19721233 |
T |
 |
| Q |
380 |
atctcttttccacacaatattaattacatttcttaat |
416 |
Q |
| |
|
|| | ||| ||||||| |||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
19721232 |
atttatttctcacacaaaattaattacacttcttaat |
19721196 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #191
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
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Target Start/End: Complemental strand, 19625211 - 19625035
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| Q |
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387 |
Q |
| |
|
||||||||||||| ||| ||||||||||||| | |||| ||||||||| |||| | ||||| |||||||||||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
19625211 |
cttaactatttatcactttctcttctttcaattattttttttatctttctcatatcatttattaaagacaaatttgtaaaacaattcataatatctcttt |
19625112 |
T |
 |
| Q |
388 |
tccacacaatattaattacatttcttaatatgtgtgaaatgcccaaaacgtcatacaatttaggatgaagggagtaatt |
466 |
Q |
| |
|
|||| || |||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||| ||| ||||| ||| |||||||||||| |
|
|
| T |
19625111 |
ctcacaaaaaattaattatatttctta--atgtgtgaaatgcctaaaacgtaatataatttgggacaaagggagtaatt |
19625035 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #192
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279 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
34016767 |
tactccctccgtcccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatg |
34016856 |
T |
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Target: chr4; HSP #193
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Target Start/End: Complemental strand, 5907839 - 5907763
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| Q |
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435 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||| | || ||||| |||||| |
|
|
| T |
5907839 |
ttttgtaaaacaactcataatatatcttttacacacaaaattaattacatttcttaatacgcgtaaaatgaccaaaa |
5907763 |
T |
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Target: chr4; HSP #194
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 253 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 6154198 - 6154107
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| Q |
253 |
ctttacaataccaatgaaacattaatgttatttttcctattataaccttaactattta--ttactctctcttctttcaagtcttttatttat |
342 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||| ||||||| ||||||||||| | ||| |||||| |
|
|
| T |
6154198 |
ctttacaatatcaatgaaacattaatgttaattttcctattataccattaactatttacgttactctttcttctttcaattttttaatttat |
6154107 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #195
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
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| Q |
355 |
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442 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||| |||||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
5483963 |
acaattttgtaaaacaactcgtaatatctattttccatacaaaattaattatgcttcttaatatgtctgaaatatccaaaacgtcata |
5484050 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #196
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 254 - 454
Target Start/End: Original strand, 33517384 - 33517596
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| Q |
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351 |
Q |
| |
|
||||||||| |||||| | ||||||||| ||||| |||||||| | ||||||| |||||||||| ||||||| || ||||| ||||||| |||||||| |
|
|
| T |
33517384 |
tttacaatatcaatgagatattaatgttgttttttctattatatcattaactagttattactctaacttcttttaattctttaatttatcttttttcata |
33517483 |
T |
 |
| Q |
352 |
----------aggacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatatgtgtgaaatgcccaaaacgtcat |
441 |
Q |
| |
|
| || ||||||||||||||||||||||||| || |||| ||| || |||||| | |||| |||||| || ||||||| ||||||||| | |
|
|
| T |
33517484 |
cattttattaaagagaattttgtaaaacaactcataatatttcatttctacataaaattaatcatattttttaatacgtatgaaatgttcaaaacgtcgt |
33517583 |
T |
 |
| Q |
442 |
acaatttaggatg |
454 |
Q |
| |
|
| |||||| |||| |
|
|
| T |
33517584 |
ataatttaagatg |
33517596 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #197
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 253 - 435
Target Start/End: Original strand, 6328220 - 6328414
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| Q |
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ctttacaataccaatgaaacattaatgttatttttcctattataaccttaactatttattactctctcttctttcaagtctttta-tttatctttttcat |
351 |
Q |
| |
|
||||||||||| |||||| |||||||| ||||||| ||||||| | |||||||||||||||| || ||||||||| || ||||| ||||||||| |||| |
|
|
| T |
6328220 |
ctttacaatac-aatgaatcattaatgctattttttatattataccattaactatttattactttcccttctttca-gttttttactttatctttctcat |
6328317 |
T |
 |
| Q |
352 |
a-------------ggacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatatgtgtgaaatgcccaaaa |
435 |
Q |
| |
|
| |||||||||| ||||| ||||||||||||||| || || |||| ||||||||||||| |||||| |||||||| | |||||| |
|
|
| T |
6328318 |
accatttattaagaggacaattttataaaataactcataatatctcattctcatacaaaattaattacattttttaatacgtgtgaaaggaccaaaa |
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #198
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| Q |
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329 |
Q |
| |
|
||||| |||||| | |||| |||||| ||| |||||| |||||||||||||||| ||||||| | ||||||| |||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
25200170 |
ttgtctcaaattatttgtcgttttacagtactaatgaatcattaatgttattttttatattatatcattaactagttattactctctcttctttcaa |
25200266 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #199
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| Q |
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339 |
Q |
| |
|
||||| || ||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||| | ||| |||||| | ||| ||| |
|
|
| T |
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aaattataagtctctttacaataccaatgaaac-ttaatgttacttttcctat-atacccttaactatttattactttaacttttttcaattttttaatt |
29462642 |
T |
 |
| Q |
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tatctt-----tttcat------aggacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatatgtgtgaaatg |
428 |
Q |
| |
|
|||||| | |||| | |||||||||||| || |||||||||||||||||| || | || |||||||| ||||||||||| ||| |||| |
|
|
| T |
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tatctttcctatatcatttattaaagacaattttgtagaataactcataatatctctttctcatagaaaattaattagatttcttaatacatgttaaata |
29462542 |
T |
 |
| Q |
429 |
cccaaaac |
436 |
Q |
| |
|
|||||||| |
|
|
| T |
29462541 |
cccaaaac |
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T |
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Target: chr4; HSP #200
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taatatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatatgtgtgaaatgcccaaaacgtcatacaatttaggatgaagggagta |
463 |
Q |
| |
|
|||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||| || || ||| |||| ||||| |
|
|
| T |
9036721 |
taatatctctttcttacacaatattaattacatttcttaatacgtgtgaaatgctcaaaatgtcatataacttgggacgaagcgagta |
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T |
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335 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||| | ||||||| ||||||||||||| | ||||||||| ||||| |
|
|
| T |
13967728 |
tttacaataccaatgaaacatcaatgttacttttcttattacataccttaagtatttattactctttattctttcaattcttt |
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T |
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Q |
| |
|
|||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||| |
|
|
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18316832 |
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T |
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Q |
| |
|
||||| |||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |
|
|
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aaattatatgtcgttttacaataccaataaaaaattaatgttatttttcctattat-tctttaactatttattactct |
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Q |
| |
|
||||||||| ||| |||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||| |||| |
|
|
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tttgtcccagattatatgtcgctttacaataccactgaagcattaatgttacttttcctattatgccctcaactattcatta |
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T |
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428 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||| |||| |||||||| | || |||||| |||||||||| |
|
|
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
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| Q |
352 |
aggacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatatgtgtgaaatg |
428 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||| |||| |||||||| | || |||||| |||||||||| |
|
|
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Q |
| |
|
|||||||||||||||||| |||| |||||| ||||| ||||||||||||||| |||| | |||||| ||||||||||||||||| ||||| |
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|
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20978197 |
T |
 |
| Q |
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tccacacaatattaattacatttcttaatatgtgtgaaatgcccaaaacgtcatacaatttaggatgaagggagtaatt |
466 |
Q |
| |
|
|||| || |||||||||||||||||||| || ||| || |||| |||| || ||||| ||| | ||||||||||| |
|
|
| T |
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ctcacataaaattaattacatttcttaatacgtatgatatattcaaatcgtcgtataattttggacggagggagtaatt |
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| |
|
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|
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T |
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Q |
| |
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|
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Back To:
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Target: chr4; HSP #210
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Query Start/End: Original strand, 359 - 426
Target Start/End: Original strand, 7555237 - 7555304
Alignment:
| Q |
359 |
ttttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatatgtgtgaaa |
426 |
Q |
| |
|
|||| ||||||||||||| || ||||||||||| |||| |||||||| |||||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
7555237 |
ttttataaaacaactcatcatttctcttttccatacaaaattaattatatttcttaatttgtgtgaaa |
7555304 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #211
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Query Start/End: Original strand, 264 - 386
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| Q |
264 |
caatgaaacattaatgttatttttcctattataaccttaactatttattactctctcttctttcaagtcttttatttatctttttcat-----------a |
352 |
Q |
| |
|
||||| ||||||||||||| |||| |||||||| | ||| ||||||||||| || ||| || ||| ||||| ||||||||||||||| | |
|
|
| T |
9033593 |
caatggaacattaatgttactttttctattatagtcataaatatttattactttccctttttacaattctttcatttatctttttcatataatttattaa |
9033692 |
T |
 |
| Q |
353 |
ggacaattttgtaaaacaactcataatatctctt |
386 |
Q |
| |
|
||| |||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
9033693 |
ggataattttgtaaaacaactcataatatctctt |
9033726 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #212
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| Q |
284 |
ttttcctattataaccttaactatttattactctctcttctttcaagtcttttatttatctttttcat-----------aggacaattttgtaaaacaac |
372 |
Q |
| |
|
||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||| | ||| |||||||||| ||| |||||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
39603436 |
ttttcctattatacccttaactatttattactttttcttctttcaattttttaatttatctttcccataccatttattaaggacaattttgtaaagcaac |
39603337 |
T |
 |
| Q |
373 |
tcataatatctcttttccacacaatattaattacattt |
410 |
Q |
| |
|
||| ||||||||||| || ||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
39603336 |
tcagaatatctctttcgcatgcaaaattaattacattt |
39603299 |
T |
 |
Back To:
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Target: chr4; HSP #213
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Target Start/End: Original strand, 45219720 - 45219791
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| Q |
354 |
gacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatatgtgtgaa |
425 |
Q |
| |
|
||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| | |||| |||||| | ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
45219720 |
gacaattttgttaaacaactcataatatcatttttcaagacaagattaatgatatttcttaatatgtgtgaa |
45219791 |
T |
 |
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Target: chr4; HSP #214
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Target Start/End: Original strand, 50174402 - 50174609
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| Q |
231 |
atttgtcccaaattgtatgtcactttacaataccaatgaaacattaa-tgttatttttcctattataaccttaactatttattactctctcttctttcaa |
329 |
Q |
| |
|
|||| ||||||||| || || |||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||| |||| ||| |||||||||||| || ||||||||||| |
|
|
| T |
50174402 |
atttatcccaaattataattcgctttacaataccaatgaagtattaaatgttacttttcctactataccctcaactatttatta--ctgtcttctttcaa |
50174499 |
T |
 |
| Q |
330 |
gtcttttatttatcttt---------ttcat--aggacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatat |
418 |
Q |
| |
|
| ||| |||||||||| || || |||| |||||||||||| ||| ||||| ||||||| ||| ||| |||||||||| |||||||| | |
|
|
| T |
50174500 |
ttatttaatttatctttcctataccgttaatgaaggataattttgtaaaatgacttataatttctctttcccatgcaacattaattacacttcttaattt |
50174599 |
T |
 |
| Q |
419 |
gtgtgaaatg |
428 |
Q |
| |
|
|||||||||| |
|
|
| T |
50174600 |
gtgtgaaatg |
50174609 |
T |
 |
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Target: chr4; HSP #215
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| Q |
249 |
gtcactttacaataccaatgaaacattaatgttat-ttttcctattataaccttaactatttattactct |
317 |
Q |
| |
|
|||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||| | ||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
3727192 |
gtcattttacaataccaattaaacattaatgttatttttttctattatatctttacctatttattactct |
3727123 |
T |
 |
Back To:
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Target: chr4; HSP #216
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Alignment:
| Q |
259 |
aataccaatgaaacattaatgttatttttcctattataaccttaactatttattactctctcttctttcaagtcttttatttatctttttcata |
352 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||| || ||| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
53988255 |
aataccaataaaacattaatgttctttttgctattatacatttaactatttattaccctctctt-tttaaatattttaatttatctttttcata |
53988347 |
T |
 |
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Target Start/End: Original strand, 39717496 - 39717571
Alignment:
| Q |
352 |
aggacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatatgtgtgaaatg |
428 |
Q |
| |
|
||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| || |||| |||||||| |||| ||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
39717496 |
aggacaattttttaaaacaactcataatatcactttcacatacaaaattaatta-attttttaatatgtctgaaatg |
39717571 |
T |
 |
Back To:
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Target: chr4; HSP #218
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Target Start/End: Complemental strand, 42885169 - 42885096
Alignment:
| Q |
254 |
tttacaataccaatgaaacattaatgttatttttcctattataaccttaa-ctatttattactctctcttctttcaag |
330 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||||||||| | || ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
42885169 |
tttacagtaccaatgaaacat----gctacttttcctattatatccttaaactatttattactctctcttctttcaag |
42885096 |
T |
 |
Back To:
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Target: chr4; HSP #219
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Query Start/End: Original strand, 259 - 306
Target Start/End: Original strand, 3761807 - 3761854
Alignment:
| Q |
259 |
aataccaatgaaacattaatgttatttttcctattataaccttaacta |
306 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
3761807 |
aataccaatgaaacattaatgttattttttctattatgtccttaacta |
3761854 |
T |
 |
Back To:
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Target: chr4; HSP #220
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 239 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 36609896 - 36609821
Alignment:
| Q |
239 |
caaattgtatgtcactttacaataccaatgaaacattaatgttatttttcctattataaccttaactatttattac |
314 |
Q |
| |
|
|||||| || ||| |||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
36609896 |
caaattataagtcgctttacaatagtaatgaaaaattaatgttgtttttcctattatactgttaactatttattac |
36609821 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #221
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 362 - 420
Target Start/End: Complemental strand, 5163890 - 5163832
Alignment:
| Q |
362 |
tgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatatgt |
420 |
Q |
| |
|
|||||||| ||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
5163890 |
tgtaaaactactgataatatctctttcatatacaatattaattacatttcttaatatgt |
5163832 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #222
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 366 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 11116462 - 11116400
Alignment:
| Q |
366 |
aaacaactcataatatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatatgtgtgaaatg |
428 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| | | |||| ||||||||||||| | |||| |||||||||| |
|
|
| T |
11116462 |
aaacaactcataatatctctttcctatacaaaattaattacatttttgaatacgtgtgaaatg |
11116400 |
T |
 |
Back To:
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Target: chr4; HSP #223
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Query Start/End: Original strand, 395 - 448
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Alignment:
| Q |
395 |
aatattaattacatttctt-aatatgtgtgaaatgcccaaaacgtcatacaattt |
448 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| || |||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
32882637 |
aatattaattacatttttttaatatgtgtgaaatgctcaaaacgtcatataattt |
32882691 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #224
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 398 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 39603283 - 39603246
Alignment:
| Q |
398 |
attaattacatttcttaatatgtgtgaaatgcccaaaa |
435 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
39603283 |
attaattacatttcttaatatgtgtgaaatggccaaaa |
39603246 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #225
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 254 - 303
Target Start/End: Original strand, 41855052 - 41855101
Alignment:
| Q |
254 |
tttacaataccaatgaaacattaatgttatttttcctattataaccttaa |
303 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| |
|
|
| T |
41855052 |
tttacaatataaatgaaacattaatgttattttttctattataacattaa |
41855101 |
T |
 |
Back To:
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Target: chr4; HSP #226
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 257 - 322
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Alignment:
| Q |
257 |
acaataccaatgaaacattaatgttatttttcctattataaccttaactatttattactctctctt |
322 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||||| | ||||||| |||||| || ||||| |
|
|
| T |
51747581 |
acaatatcaatgaaacattaatattatttttcttattatacctttaactacttattattcactctt |
51747516 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #227
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 354 - 442
Target Start/End: Original strand, 13968065 - 13968153
Alignment:
| Q |
354 |
gacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatatgtgtgaaatgcccaaaacgtcata |
442 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| || |||||||| || | || |||| |||||| |||||| |||||| ||| ||| || |||||||||||| |
|
|
| T |
13968065 |
gacaattttgtaaaacaattcgtaatatctattctacatacaaaattaatcacattttttaatacgtgcgaagtggtcaaaacgtcata |
13968153 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #228
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Query Start/End: Original strand, 352 - 420
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Alignment:
| Q |
352 |
aggacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatatgt |
420 |
Q |
| |
|
|||| |||||| |||||||||||| ||||||||||| || | || |||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
22493785 |
aggataattttataaaacaactcacaatatctctttgtcataaaaatttaattacatttcttaatatgt |
22493717 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #229
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Query Start/End: Original strand, 273 - 335
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Alignment:
| Q |
273 |
attaatgttatttttc-ctattataaccttaactatttattactctctcttctttcaagtcttt |
335 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| |||||||| | |||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
10672763 |
attaatgttatttttttctattataccattaattatttattattctctcttctttcaattcttt |
10672826 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #230
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Query Start/End: Original strand, 273 - 335
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Alignment:
| Q |
273 |
attaatgttatttttc-ctattataaccttaactatttattactctctcttctttcaagtcttt |
335 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| |||||||| | |||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
10886403 |
attaatgttatttttttctattataccattaattatttattattctctcttctttcaattcttt |
10886466 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #231
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Alignment:
| Q |
419 |
gtgtgaaatgcccaaaacgtcatacaatttaggatgaagggagt |
462 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||| |
|
|
| T |
13394398 |
gtgtgaaatgcccaaaacgtcgtacaatttgggacgaagggagt |
13394355 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #232
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| Q |
419 |
gtgtgaaatgcccaaaacgtcatacaatttaggatgaagggagt |
462 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||| |
|
|
| T |
13397537 |
gtgtgaaatgcccaaaacgtcgtacaatttgggacgaagggagt |
13397494 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #233
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Alignment:
| Q |
230 |
tatttgtcccaaattgtatgtcactttacaataccaatgaaacattaa |
277 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
13398027 |
tatttgtcccaaattatatgtcgttttacaataccaatgaaaaattaa |
13397980 |
T |
 |
Back To:
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| Q |
233 |
ttgtcccaaattgtatgtcactttacaataccaatgaaacattaatgttatttttcctattat |
295 |
Q |
| |
|
|||||||||||| || ||| | |||||||| ||||| ||||||||||||| ||||| |||||| |
|
|
| T |
32295403 |
ttgtcccaaattatacgtcgccttacaatatcaatgcaacattaatgttacttttcttattat |
32295341 |
T |
 |
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| Q |
354 |
gacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatatgtgtgaaatgcccaaaac |
436 |
Q |
| |
|
||||||||| |||||||||||| ||||| | |||| | |||| |||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
41855178 |
gacaattttataaaacaactcacaatatttatttttaatacaaaattaattatattt-ttaatatgtgtgaaacacccaaaac |
41855259 |
T |
 |
Back To:
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| Q |
254 |
tttacaataccaatgaaacattaatgttatttttcctattataaccttaactatttattactctctcttctttcaagtcttttatttatctttttcata |
352 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||||| |||||||||| |||| |||||||| | ||||||||||||| | ||| ||||| || | ||| |||||||||| ||||| |
|
|
| T |
49877666 |
tttacaatatcaatgaagtattaatgttaatttttctattatacacataactatttattattgtctattcttcgaattttttaatttatctttctcata |
49877764 |
T |
 |
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| Q |
233 |
ttgtcccaaattgtatgtcactttacaataccaatgaaacattaatgttatttttcctattataaccttaactatttattactctctcttcttt |
326 |
Q |
| |
|
|||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||| ||| ||||| |||| ||||||| |||| ||||||||||||| | |||||| |
|
|
| T |
13529650 |
ttgtcccaaattatatgtggctttacaatactaatgaaaacttattgttactttttgtattatatgtttaaatatttattactctattttcttt |
13529743 |
T |
 |
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attaatgttatttttcctattataaccttaactatttattactctctcttctttcaagtcttttatttatcttt |
346 |
Q |
| |
|
||||||||| |||||| ||||||| | ||||||||||||||| | ||||||||||| |||| |||||||||| |
|
|
| T |
22395970 |
attaatgttgtttttc-tattatactcataactatttattactttatcttctttcaatcctttaatttatcttt |
22395898 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #239
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 232 - 340
Target Start/End: Original strand, 22508041 - 22508147
Alignment:
| Q |
232 |
tttgtcccaaattgtatgtcactttacaataccaatgaaacattaatgttatttttcctattataaccttaactatttattactctctcttctttcaagt |
331 |
Q |
| |
|
||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||| ||||||| | |||||||||||| || | ||||||||||||| |||| || ||| | |
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|
| T |
22508041 |
tttgtcccaaatt--atgtcattttacaatatcaatgaactattaatgcttattttcctattatgccccttactatttattacttgatctttttccaatt |
22508138 |
T |
 |
| Q |
332 |
cttttattt |
340 |
Q |
| |
|
||||||||| |
|
|
| T |
22508139 |
cttttattt |
22508147 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #240
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 232 - 281
Target Start/End: Complemental strand, 55852220 - 55852171
Alignment:
| Q |
232 |
tttgtcccaaattgtatgtcactttacaataccaatgaaacattaatgtt |
281 |
Q |
| |
|
||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||| || ||||||||| |
|
|
| T |
55852220 |
tttgtcccaaattatatgtcgctttataataccaatgcaaaattaatgtt |
55852171 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #241
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 360 - 428
Target Start/End: Original strand, 7118256 - 7118324
Alignment:
| Q |
360 |
tttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatatgtgtgaaatg |
428 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||||| || |||||||| | || | ||||||||||||||||||| ||||| ||||| |
|
|
| T |
7118256 |
tttgtaaaataactcattatttctcttttatataccaaattaattacatttcttaatttgtgtaaaatg |
7118324 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #242
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 254 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 22824243 - 22824163
Alignment:
| Q |
254 |
tttacaataccaatgaaacattaatgttatttttcctattataaccttaactatttattactctctcttctttcaagtctt |
334 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| | |||| || ||||||||||||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
22824243 |
tttacaataccaatgtgtcattaatgtttcttttcctatcacgccctttaccttttattactctctcttctttcaattctt |
22824163 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #243
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 254 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 29890285 - 29890217
Alignment:
| Q |
254 |
tttacaataccaatgaaacattaatgttatttttcctattataaccttaactatttattactctctctt |
322 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||||| |||||||||||||||| || || | |||||| ||| |||||||| ||||| |
|
|
| T |
29890285 |
tttacaatatcaatgaagcattaatgttattttttctgttttgtccttaattatatattactccctctt |
29890217 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #244
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 359 - 427
Target Start/End: Original strand, 31063672 - 31063740
Alignment:
| Q |
359 |
ttttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatatgtgtgaaat |
427 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||||||| || ||||| | ||| ||||||| ||||||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
31063672 |
ttttgtaaaataactcataattgcttttttctatccaaaattaattgcatttcttaatatatgtgaaat |
31063740 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3 (Bit Score: 194; Significance: 1e-105; HSPs: 231)
Name: chr3
Description:
Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 235 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 54103985 - 54103772
Alignment:
| Q |
235 |
gtcccaaattgtatgtcactttacaataccaatgaaacattaatgttatttttcctattataaccttaactatttattactctctcttctttcaagtctt |
334 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
54103985 |
gtcccaaattgtatgtcactttacaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattataaccttaactatttattactctctcttctttcaagtctt |
54103886 |
T |
 |
| Q |
335 |
ttatttatctttttcataggacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatatgtgtgaaatgcccaaa |
434 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |
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|
| T |
54103885 |
ttatttatctttttcataggacaattttataaaacaactcataatatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatatatgtgaaatgttcaaa |
54103786 |
T |
 |
| Q |
435 |
acgtcatacaattt |
448 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
54103785 |
acgtcatacaattt |
54103772 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 193; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 239 - 463
Target Start/End: Complemental strand, 27039114 - 27038890
Alignment:
| Q |
239 |
caaattgtatgtcactttacaataccaatgaaacattaatgttatttttcctattataaccttaactatttattactctctcttctttcaagtcttttat |
338 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
27039114 |
caaattgtatgtcactttacaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattataactttaactatttattactctctcttctttcaagtcttttat |
27039015 |
T |
 |
| Q |
339 |
ttatctttttcataggacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatatgtgtgaaatgcccaaaacgt |
438 |
Q |
| |
|
|||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
27039014 |
ttatctttctcataggacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccatacaatattaattacatttcttaaaatgtgtgaaatgtccaaaacgt |
27038915 |
T |
 |
| Q |
439 |
catacaatttaggatgaagggagta |
463 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| | |||||||| |
|
|
| T |
27038914 |
catacaatttaggacggagggagta |
27038890 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 163; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 188 - 465
Target Start/End: Original strand, 47241160 - 47241448
Alignment:
| Q |
188 |
attactccatccgtcctaaattgtatgtcattttnnnnnnnntatttgtcccaaattgtatgtcactttacaataccaatgaaacattaatgttattttt |
287 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
47241160 |
attactccctccgtcctaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgccactttacaatatcaatgaaacattaatgttattttt |
47241259 |
T |
 |
| Q |
288 |
cctattataaccttaactatttattactctctcttctttcaagtcttttatttatctttttcat-----------aggacaattttgtaaaacaactcat |
376 |
Q |
| |
|
||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||| |||| |||| ||||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
47241260 |
cctattatatctttaactatttattactctttcttctttcaattctttcatttatctttctcatatcatttattaaggataattttgtaaaacaattcat |
47241359 |
T |
 |
| Q |
377 |
aatatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatatgtgtgaaatgcccaaaacgtcatacaatttaggatgaagggagtaat |
465 |
Q |
| |
|
||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||| |
|
|
| T |
47241360 |
aatatctctttcccacacaatattaattacatttcttaatatgtgtgaaatgcctaaaacgtcatacaatttaggacggagggagtaat |
47241448 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 155; E-Value: 6e-82
Query Start/End: Original strand, 190 - 463
Target Start/End: Complemental strand, 19961107 - 19960823
Alignment:
| Q |
190 |
tactccatccgtcctaaattgtatgtcattttnnnnnnnntatttgtcccaaattgtatgtcactttacaataccaatgaaacattaatgttatttttcc |
289 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||| ||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
19961107 |
tactccctccgtcccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcacaaattgtatgtcgttttacaataccaatgaaaaattaatgttatttttcc |
19961008 |
T |
 |
| Q |
290 |
tattataaccttaactatttattactctctcttctttcaagtcttttatttatctttttcata-----------ggacaattttgtaaaacaactcataa |
378 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || || || |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
19961007 |
tattatatccttaactatttattactctctcttcttttaattccttcatttatctttctcatatcatttactaaggacaattttgtaaaacaactcataa |
19960908 |
T |
 |
| Q |
379 |
tatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatatgtgtgaaatgcccaaaacgtcatacaatttaggatgaagggagta |
463 |
Q |
| |
|
||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||| |
|
|
| T |
19960907 |
tatctctttcccacacaatattaattacatttcttaatatgtgtgaaatgcccaaaacgtcatacaatttgggacggagggagta |
19960823 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 152; E-Value: 4e-80
Query Start/End: Original strand, 230 - 448
Target Start/End: Original strand, 19602211 - 19602440
Alignment:
| Q |
230 |
tatttgtcccaaattgtatgtcactttacaataccaatgaaacattaatgttatttttcctattataaccttaactatttattactctctcttctttcaa |
329 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
19602211 |
tatttgtcctaaattgtatatcactttacaataccaataaaacattaatgttacttttcctattataaccttaactatttattactctctcttctttcaa |
19602310 |
T |
 |
| Q |
330 |
gtcttttatttatctttttcat-----------aggacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatat |
418 |
Q |
| |
|
||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
19602311 |
gtcttttatttattttttccatattatttattaaggacaattttgtaaaacaactcataacatctcttttccacacaatattaattacattttttaatat |
19602410 |
T |
 |
| Q |
419 |
gtgtgaaatgcccaaaacgtcatacaattt |
448 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
19602411 |
gtgtgaaatgtccaatacgtcatacaattt |
19602440 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 152; E-Value: 4e-80
Query Start/End: Original strand, 189 - 463
Target Start/End: Original strand, 47053995 - 47054280
Alignment:
| Q |
189 |
ttactccatccgtcctaaattgtatgtcattttnnnnnnnntatttgtcccaaattgtatgtcactttacaataccaatgaaacattaatgttatttttc |
288 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||| ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |
|
|
| T |
47053995 |
ttactccctccgtcccaaattgtatgtcacattagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcgctttacaataccaatgaaaaattaatgttacttttc |
47054094 |
T |
 |
| Q |
289 |
ctattataaccttaactatttattactctctcttctttcaagtcttttatttatctttttcata-----------ggacaattttgtaaaacaactcata |
377 |
Q |
| |
|
|||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||| || || |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
47054095 |
ctattatatccttaactatttattactttatcttctttcaattccttcatttatctttctcatatcatttattgaggacaattttgtaaaacaactcata |
47054194 |
T |
 |
| Q |
378 |
atatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatatgtgtgaaatgcccaaaacgtcatacaatttaggatgaagggagta |
463 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||| |
|
|
| T |
47054195 |
atatctctttcccacacaatattaattacatttcttaatatgtgtgaaatgcccaaaacgtcatacaatttgggacggagggagta |
47054280 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 151; E-Value: 1e-79
Query Start/End: Original strand, 230 - 463
Target Start/End: Original strand, 17378211 - 17378455
Alignment:
| Q |
230 |
tatttgtcccaaattgtatgtcactttacaataccaatgaaacattaatgttatttttcctattataaccttaactatttattactctctcttctttcaa |
329 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
17378211 |
tatttgtcgcaaattgtatgtcgctttacaataccaatgaaaaattaatgttacttttcatattatatccttaactatttattactctctcttctttcaa |
17378310 |
T |
 |
| Q |
330 |
gtcttttatttatctttttcata-----------ggacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatat |
418 |
Q |
| |
|
|| || |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
17378311 |
ttccttcatttatctttcccatatcatttattgaggacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatat |
17378410 |
T |
 |
| Q |
419 |
gtgtgaaatgcccaaaacgtcatacaatttaggatgaagggagta |
463 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||| |
|
|
| T |
17378411 |
gtgtgaaatgcccaaaacgtcatacaatttgggacggagggagta |
17378455 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 151; E-Value: 1e-79
Query Start/End: Original strand, 230 - 468
Target Start/End: Complemental strand, 23609475 - 23609226
Alignment:
| Q |
230 |
tatttgtcccaaattgtatgtcactttacaataccaatgaaacattaatgttatttttcctattataaccttaactatttattactctctcttctttcaa |
329 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
23609475 |
tatttgtcccaaattgtatgtcgctttacaataccaatgaaaaattaatgttacttttcctattatatctttaactatttattactctctcttctttcaa |
23609376 |
T |
 |
| Q |
330 |
gtcttttatttatctttt-----tcat------aggacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatat |
418 |
Q |
| |
|
|| || |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
23609375 |
ttccttcatttatctttcctatatcatttattgaggacaattttgtaaaacaactcataatatctctttcccacacaatattaattacatttcttaatat |
23609276 |
T |
 |
| Q |
419 |
gtgtgaaatgcccaaaacgtcatacaatttaggatgaagggagtaattta |
468 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
23609275 |
gtgtgaaatgcccaaaacgtcatacaatttgggacggagggagtatttta |
23609226 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 151; E-Value: 1e-79
Query Start/End: Original strand, 230 - 463
Target Start/End: Original strand, 29343242 - 29343486
Alignment:
| Q |
230 |
tatttgtcccaaattgtatgtcactttacaataccaatgaaacattaatgttatttttcctattataaccttaactatttattactctctcttctttcaa |
329 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
29343242 |
tatttgtcccaaattgtatgtcgctttataataccaatgaaaaattaatgttatttttcctattatatctttaactatttattactctctcttctttcaa |
29343341 |
T |
 |
| Q |
330 |
gtcttttatttatctttttcata-----------ggacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatat |
418 |
Q |
| |
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|| || |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
29343342 |
ttccttcatttatctttctcatatcatttattgaggacaattttgtaaaacaactcataatatctctttcccacacaatattaattacatttcttaatat |
29343441 |
T |
 |
| Q |
419 |
gtgtgaaatgcccaaaacgtcatacaatttaggatgaagggagta |
463 |
Q |
| |
|
||||||||||| |||||||||||||||||| ||| | |||||||| |
|
|
| T |
29343442 |
gtgtgaaatgcgcaaaacgtcatacaatttgggacggagggagta |
29343486 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 151; E-Value: 1e-79
Query Start/End: Original strand, 230 - 463
Target Start/End: Original strand, 30744892 - 30745136
Alignment:
| Q |
230 |
tatttgtcccaaattgtatgtcactttacaataccaatgaaacattaatgttatttttcctattataaccttaactatttattactctctcttctttcaa |
329 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
30744892 |
tatttgtcccaaattgtatgtcactttacaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatcattaactatttattactctttcttctttcaa |
30744991 |
T |
 |
| Q |
330 |
gtcttttatttatctttttcat-----------aggacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatat |
418 |
Q |
| |
|
||||| |||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
30744992 |
ttctttcatttatctttctcatatcatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatatctctttcctacacaatattaattacatttcttaatat |
30745091 |
T |
 |
| Q |
419 |
gtgtgaaatgcccaaaacgtcatacaatttaggatgaagggagta |
463 |
Q |
| |
|
||||||||||| |||||||||||||||||| ||| | |||||||| |
|
|
| T |
30745092 |
gtgtgaaatgctcaaaacgtcatacaatttgggacggagggagta |
30745136 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 151; E-Value: 1e-79
Query Start/End: Original strand, 190 - 448
Target Start/End: Original strand, 31786795 - 31787064
Alignment:
| Q |
190 |
tactccatccgtcctaaattgtatgtcattttnnnnnnnntatttgtcccaaattgtatgtcactttacaataccaatgaaacattaatgttatttttcc |
289 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| ||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
31786795 |
tactccatccgtcccaaattatatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttacaataccaatgaaacattaatgttacttttcc |
31786894 |
T |
 |
| Q |
290 |
tattataaccttaactatttattactctctcttctttcaagtcttttatttatcttt---------ttcat--aggacaattttgtaaaacaactcataa |
378 |
Q |
| |
|
||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||| || || |||| |||||||||||||||||||||| |
|
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| T |
31786895 |
tattatatcgttaactatttattactctttcttctttcaattctttcatttatctttcctatattatttattaaggataattttgtaaaacaactcataa |
31786994 |
T |
 |
| Q |
379 |
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448 |
Q |
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| T |
31786995 |
tatctctttcccacacagtattaattacatttcttaatatgtgtgaaatgcccaaaacgtcatacaattt |
31787064 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 149; E-Value: 2e-78
Query Start/End: Original strand, 187 - 450
Target Start/End: Original strand, 28226968 - 28227242
Alignment:
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Q |
| |
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| T |
28226968 |
aattactccctccgtcccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttaggataccaatgaaacattaatgttatttt |
28227067 |
T |
 |
| Q |
287 |
tcctattataaccttaactatttattactctctcttctttcaagtcttttatttatctttttcata-----------ggacaattttgtaaaacaactca |
375 |
Q |
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| T |
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tcctattatatctttaactatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcacatatcatttattaaggataattttgtaaaacaactca |
28227167 |
T |
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| Q |
376 |
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450 |
Q |
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| T |
28227168 |
taatatctctttcccacacaatattaattacatttcttaatatgtctgaaatgcccaaaacgtcatacaatttag |
28227242 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 147; E-Value: 3e-77
Query Start/End: Original strand, 190 - 463
Target Start/End: Original strand, 30190323 - 30190607
Alignment:
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289 |
Q |
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| T |
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tactccatccgtctcaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattatatgtcgttttacaataccaatgaaaaattaatgttacttttcc |
30190422 |
T |
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290 |
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378 |
Q |
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| T |
30190423 |
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30190522 |
T |
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| Q |
379 |
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463 |
Q |
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| T |
30190523 |
tatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatatgtgtgaaatgcccaaaacgtcatacaatttgggacggagggagta |
30190607 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 147; E-Value: 3e-77
Query Start/End: Original strand, 190 - 463
Target Start/End: Original strand, 41751101 - 41751385
Alignment:
| Q |
190 |
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289 |
Q |
| |
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| T |
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tactccctccgtcccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattatatgtcgttttacaataccaatgaaaaattaatgttacttttct |
41751200 |
T |
 |
| Q |
290 |
tattataaccttaactatttattactctctcttctttcaagtcttttatttatctttttcata-----------ggacaattttgtaaaacaactcataa |
378 |
Q |
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| T |
41751201 |
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41751300 |
T |
 |
| Q |
379 |
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463 |
Q |
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| T |
41751301 |
tatctctttcccacacaatattaattacatttcttaatatgtgtgaaatggccaaaacgtcatacaatttgggacggagggagta |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 144; E-Value: 2e-75
Query Start/End: Original strand, 187 - 453
Target Start/End: Complemental strand, 29227455 - 29227178
Alignment:
| Q |
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aattactccatccgtcctaaattgtatgtcattttnnnnnnnntatttgtcccaaattgtatgtcactttacaataccaatgaaacattaatgttatttt |
286 |
Q |
| |
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| T |
29227455 |
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29227356 |
T |
 |
| Q |
287 |
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375 |
Q |
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| T |
29227355 |
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29227256 |
T |
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| Q |
376 |
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453 |
Q |
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| T |
29227255 |
taatatctctttcccatacaatattaattacatttcttaatatatgtgaaatgcccaaaacgtcatacaatttaggat |
29227178 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 144; E-Value: 2e-75
Query Start/End: Original strand, 197 - 463
Target Start/End: Original strand, 52915030 - 52915307
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296 |
Q |
| |
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| T |
52915030 |
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52915129 |
T |
 |
| Q |
297 |
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385 |
Q |
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| T |
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tccttaactatttattactctctcttctttcaattccttcatttatctttctcatatcatttattgaggacaattttgtaaaataactcataatatctct |
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T |
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| Q |
386 |
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463 |
Q |
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| T |
52915230 |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 143; E-Value: 8e-75
Query Start/End: Original strand, 230 - 467
Target Start/End: Complemental strand, 4047320 - 4047072
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329 |
Q |
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T |
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418 |
Q |
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| T |
4047220 |
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4047121 |
T |
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| Q |
419 |
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467 |
Q |
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| T |
4047120 |
gtgtgaaatgctcaaaacgtcatacaatttgggacggagggagtaattt |
4047072 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 143; E-Value: 8e-75
Query Start/End: Original strand, 230 - 463
Target Start/End: Original strand, 8108475 - 8108719
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329 |
Q |
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tatttgtcccaaattgtatgtcgctttacaataccaatgaaaagttaatgttacctttcctattatatccctaactatttattactctctcttctttcaa |
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T |
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| Q |
330 |
gtcttttatttatctttttcata-----------ggacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatat |
418 |
Q |
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| T |
8108575 |
ttccttcatttatctttctcatatcatttattgaggacaattttgtaaaacaattcataatatctctttcccacacaatattaattacatttcttaatat |
8108674 |
T |
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| Q |
419 |
gtgtgaaatgcccaaaacgtcatacaatttaggatgaagggagta |
463 |
Q |
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| T |
8108675 |
gtgtgaaatgcccaaaacgtcatacaatttgggacggagggagta |
8108719 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 143; E-Value: 8e-75
Query Start/End: Original strand, 190 - 463
Target Start/End: Original strand, 38096029 - 38096313
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289 |
Q |
| |
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| T |
38096029 |
tactccatccgttccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttatcctaaattgtatgtcgttttacaataccaatgaaaaattaatgttacattttc |
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T |
 |
| Q |
290 |
tattataaccttaactatttattactctctcttctttcaagtcttttatttatctttttcatag-----------gacaattttgtaaaacaactcataa |
378 |
Q |
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| T |
38096129 |
tattatatccttaactatttattactctctcttatttcaattctttcatttatctttctcatatcatttattgatgacaattttgtaaaacaactcataa |
38096228 |
T |
 |
| Q |
379 |
tatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatatgtgtgaaatgcccaaaacgtcatacaatttaggatgaagggagta |
463 |
Q |
| |
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|
| T |
38096229 |
tatctctttcccacacaatattaattacatttcttaatatgtgtgaaatgcccaaaacgtcatacaatttaggacggagggagta |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 143; E-Value: 8e-75
Query Start/End: Original strand, 190 - 463
Target Start/End: Complemental strand, 38783723 - 38783439
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| Q |
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289 |
Q |
| |
|
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| T |
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tactccctccgtcccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattatatgtcgctttacaataccaatgaaaaattaatgttacttttcc |
38783624 |
T |
 |
| Q |
290 |
tattataaccttaactatttattactctctcttctttcaagtcttttatttatctttttcata-----------ggacaattttgtaaaacaactcataa |
378 |
Q |
| |
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|
| T |
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tattatatccttaactatttattactctctcttctttcaattccttcatttatctttcccatatcatttattgagaacaattttgtaaaacaactcataa |
38783524 |
T |
 |
| Q |
379 |
tatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatatgtgtgaaatgcccaaaacgtcatacaatttaggatgaagggagta |
463 |
Q |
| |
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|
| T |
38783523 |
tatctttttcccacacaatattaattacatttcttaatatgtgtgaaatgtccaaaacgtcatacaatttgggacggagggagta |
38783439 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 143; E-Value: 8e-75
Query Start/End: Original strand, 190 - 463
Target Start/End: Complemental strand, 52060553 - 52060269
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| Q |
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tactccatccgtcctaaattgtatgtcattttnnnnnnnntatttgtcccaaattgtatgtcactttacaataccaatgaaacattaatgttatttttcc |
289 |
Q |
| |
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| T |
52060553 |
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T |
 |
| Q |
290 |
tattataaccttaactatttattactctctcttctttcaagtcttttatttatctttttcata-----------ggacaattttgtaaaacaactcataa |
378 |
Q |
| |
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| T |
52060453 |
tattatatccttaactatttattactccctcttctttcaattctttcatttatctttcccatatcatttattgaggataattttgtaaaacaactcataa |
52060354 |
T |
 |
| Q |
379 |
tatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatatgtgtgaaatgcccaaaacgtcatacaatttaggatgaagggagta |
463 |
Q |
| |
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|
| T |
52060353 |
tatctctttcccacacaatattaattacatttcttaatatgtgtgaaatgcccaaaacgtcatacaatttgggacggagggagta |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 141; E-Value: 1e-73
Query Start/End: Original strand, 190 - 448
Target Start/End: Original strand, 44048098 - 44048368
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Q |
| |
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T |
 |
| Q |
289 |
ctattataaccttaactatttattactctctcttctttcaagtcttttatttatctttttcat-----------aggacaattttgtaaaacaactcata |
377 |
Q |
| |
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|
| T |
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ctattatatccttaactatttattactctctcttctttcaattccttcatttatctttctcatatcatttattgaggacaattttgtaaaacaactcata |
44048297 |
T |
 |
| Q |
378 |
atatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatatgtgtgaaatgcccaaaacgtcatacaattt |
448 |
Q |
| |
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|
| T |
44048298 |
atatatctttcccacataatattaattacatttcttaatatgtgtgaaatgctcaaaacgtcatacaattt |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #23
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Query Start/End: Original strand, 230 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 2510267 - 2510038
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tatttgtcccaaattgtatgtcactttacaataccaatgaaacattaatgttatttttcctattataaccttaactatttattactctctcttctttcaa |
329 |
Q |
| |
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| T |
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tatttgtcccaaattatatgtcgctttacaataccaatgaaaaattaatgttacttttcctattatattcttaactatttattactttctcttctttcaa |
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T |
 |
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330 |
gtcttttatttatctttttcata-----------ggacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatat |
418 |
Q |
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| T |
2510167 |
ttccttcatttatctttctcatatcatttattgaggacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatat |
2510068 |
T |
 |
| Q |
419 |
gtgtgaaatgcccaaaacgtcatacaattt |
448 |
Q |
| |
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|||||||||||||||||||| |||||||| |
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| T |
2510067 |
ctgtgaaatgcccaaaacgtcttacaattt |
2510038 |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 140; E-Value: 5e-73
Query Start/End: Original strand, 189 - 463
Target Start/End: Original strand, 24089327 - 24089612
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288 |
Q |
| |
|
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| T |
24089327 |
ttactccctccgtcccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtccgaaattatatgtcgctttacaataccaatgaaaaattaatgttacttttc |
24089426 |
T |
 |
| Q |
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ctattataaccttaactatttattactctctcttctttcaagtcttttatttatctttttcat-----------aggacaattttgtaaaacaactcata |
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| |
|
|||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||| |||| |||| |||||| |||||||||||||| |
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| T |
24089427 |
ctattatatccttaactatttattactctctcttctttcaattccttcatttatctttctcatatcatttattgaggataattttttaaaacaactcata |
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T |
 |
| Q |
378 |
atatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatatgtgtgaaatgcccaaaacgtcatacaatttaggatgaagggagta |
463 |
Q |
| |
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| T |
24089527 |
atatctctttcccacacaatattaattacatttcttaatatacgtgaaatgcccaaaacgtcatacaatttaagacggagggagta |
24089612 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #25
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Target Start/End: Complemental strand, 27848922 - 27848697
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334 |
Q |
| |
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27848922 |
gtcccaaattgtatgtcactttagaataccaataaaacattaatgttacttttcctattatatccttaactatttattactctttcttttttcaattctt |
27848823 |
T |
 |
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335 |
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423 |
Q |
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| T |
27848822 |
tcatttatctttctcatatcatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatatctctttcccacacaatattaattacatttcttaatatgtgtg |
27848723 |
T |
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| Q |
424 |
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449 |
Q |
| |
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||||| |||||||||||||||||||| |
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| T |
27848722 |
aaatgtccaaaacgtcatacaattta |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 140; E-Value: 5e-73
Query Start/End: Original strand, 190 - 452
Target Start/End: Original strand, 36669148 - 36669421
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289 |
Q |
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T |
 |
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290 |
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378 |
Q |
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| T |
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T |
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| Q |
379 |
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452 |
Q |
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 139; E-Value: 2e-72
Query Start/End: Original strand, 190 - 463
Target Start/End: Complemental strand, 3645987 - 3645703
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289 |
Q |
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T |
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| Q |
290 |
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378 |
Q |
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| T |
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T |
 |
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463 |
Q |
| |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 139; E-Value: 2e-72
Query Start/End: Original strand, 190 - 463
Target Start/End: Complemental strand, 25904190 - 25903906
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| Q |
190 |
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289 |
Q |
| |
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25904091 |
T |
 |
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290 |
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378 |
Q |
| |
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tgttatatccttaactatttattactctctcttctttcaattccttcatttatctttctcatatcatttattgaggacaattttgtaaaacaactcataa |
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T |
 |
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379 |
tatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatatgtgtgaaatgcccaaaacgtcatacaatttaggatgaagggagta |
463 |
Q |
| |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 139; E-Value: 2e-72
Query Start/End: Original strand, 230 - 463
Target Start/End: Complemental strand, 40710754 - 40710510
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Q |
| |
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T |
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418 |
Q |
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40710654 |
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40710555 |
T |
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| Q |
419 |
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463 |
Q |
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| T |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 138; E-Value: 8e-72
Query Start/End: Original strand, 230 - 450
Target Start/End: Complemental strand, 2929931 - 2929700
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329 |
Q |
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T |
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418 |
Q |
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| T |
2929831 |
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2929732 |
T |
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| Q |
419 |
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450 |
Q |
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2929731 |
gtgtgaaatgcccaaaacgtcatacaatttag |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 138; E-Value: 8e-72
Query Start/End: Original strand, 231 - 463
Target Start/End: Complemental strand, 33610331 - 33610088
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330 |
Q |
| |
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T |
 |
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419 |
Q |
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T |
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| Q |
420 |
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463 |
Q |
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| T |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 137; E-Value: 3e-71
Query Start/End: Original strand, 230 - 452
Target Start/End: Original strand, 30358758 - 30358989
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tatttgtcccaaattgtatgtcactttacaataccaatgaaacattaatgttatttttcctattataaccttaactatttattactctctcttctttcaa |
329 |
Q |
| |
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T |
 |
| Q |
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gtcttttatttatctttttcata-----------ggacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatat |
418 |
Q |
| |
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T |
 |
| Q |
419 |
gtgtgaaatgcccaaaacgtcatacaatttagga |
452 |
Q |
| |
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| T |
30358956 |
gtgtgaaatgtccaaaacgtcatacaatttagga |
30358989 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 137; E-Value: 3e-71
Query Start/End: Original strand, 190 - 465
Target Start/End: Complemental strand, 53655248 - 53654962
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| Q |
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|
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T |
 |
| Q |
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tattataaccttaactatttattactctctcttctttcaagtcttttatttatctttttcata-----------ggacaattttgtaaaacaactcataa |
378 |
Q |
| |
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|
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| T |
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tattatattcttaactatttattaccctctcttctttcaattccttcatttatctttcccatatcatttattgaggacaattttataaaacaactcataa |
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T |
 |
| Q |
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tatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatatgtgtgaaatgcccaaaacgtcatacaatttaggatgaagggagtaat |
465 |
Q |
| |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #34
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Query Start/End: Original strand, 197 - 463
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T |
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accttaactatttattactctctcttctttcaagtcttttatttatctttttcata-----------ggacaattttgtaaaacaactcataatatctct |
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Q |
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tccttaactatttattactatctcttctttcaattctttcatttatctttctcatatcatttattgaggtcaattttgtaaaacaactcataatatcttt |
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T |
 |
| Q |
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Q |
| |
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15019985 |
ttcccacacaatattaattacatttcttaatatgtgtgaaatgcccaaaacatcatacaatttgggacggagggagta |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 136; E-Value: 1e-70
Query Start/End: Original strand, 190 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 38483614 - 38483345
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| |
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|
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T |
 |
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tattataaccttaactatttattactctctcttctttcaagtcttttatttatctttttcat-----------aggacaattttgtaaaacaactcataa |
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Q |
| |
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| T |
38483514 |
tattatatccttaactatttattgctctctcttctttcaattccttcatttatcttttccatatcatttattgaggacaattttgtaaaacaactcataa |
38483415 |
T |
 |
| Q |
379 |
tatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatatgtgtgaaatgcccaaaacgtcatacaattt |
448 |
Q |
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| T |
38483414 |
tatctatttcccacacaatattaattacatttcttaatatgtgtgaaatgcctaaaacatcatataattt |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #36
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Query Start/End: Original strand, 197 - 463
Target Start/End: Complemental strand, 4392606 - 4392325
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Q |
| |
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 |
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accttaactatttattactctctcttctttcaagtcttttatttatctttttcat-----------aggacaattttgtaaaacaactcata----atat |
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Q |
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tccttaactatttattactctctcttctttcaattccttcatttatctttcccatatcatttattgaggacaattttgtaaaacaactcataatatatat |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #37
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| |
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21216849 |
T |
 |
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tattataaccttaactatttattactctctcttctttcaagtcttttatttatctttttcata-----------ggacaattttgtaaaacaactcataa |
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Q |
| |
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 |
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tatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatatgtgtgaaatgcccaaaacgtcatacaatttaggatgaagggagta |
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| |
|
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tatctatttcccatacaatattaattacatttcttaatatgtgtgaaatgcccaaaacgtcatacaatttgggacggagggagta |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 135; E-Value: 5e-70
Query Start/End: Original strand, 234 - 463
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29756559 |
gaaatgcccaaaatgtcatacaatttgggacggagggagta |
29756519 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 135; E-Value: 5e-70
Query Start/End: Original strand, 230 - 463
Target Start/End: Original strand, 32048034 - 32048277
Alignment:
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Q |
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T |
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| Q |
330 |
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418 |
Q |
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| T |
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32048232 |
T |
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Q |
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32048233 |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 135; E-Value: 5e-70
Query Start/End: Original strand, 190 - 463
Target Start/End: Original strand, 43175734 - 43176018
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Q |
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T |
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378 |
Q |
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43175834 |
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43175933 |
T |
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| Q |
379 |
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463 |
Q |
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| T |
43175934 |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 135; E-Value: 5e-70
Query Start/End: Original strand, 190 - 463
Target Start/End: Complemental strand, 45824167 - 45823884
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| Q |
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289 |
Q |
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T |
 |
| Q |
290 |
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378 |
Q |
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| T |
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T |
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| Q |
379 |
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463 |
Q |
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| T |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 135; E-Value: 5e-70
Query Start/End: Original strand, 197 - 463
Target Start/End: Complemental strand, 46195902 - 46195625
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| Q |
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296 |
Q |
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| Q |
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385 |
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463 |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 135; E-Value: 5e-70
Query Start/End: Original strand, 238 - 463
Target Start/End: Complemental strand, 51166516 - 51166280
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337 |
Q |
| |
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51166516 |
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| Q |
338 |
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426 |
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| T |
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51166317 |
T |
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| Q |
427 |
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463 |
Q |
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| T |
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T |
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Back To:
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Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 135; E-Value: 5e-70
Query Start/End: Original strand, 230 - 463
Target Start/End: Complemental strand, 52040491 - 52040247
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329 |
Q |
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T |
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418 |
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| T |
52040391 |
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52040292 |
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463 |
Q |
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gtgtgaaatgcccaaaacgtcatacaatttgggacggagggagta |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 134; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 188 - 463
Target Start/End: Complemental strand, 27942298 - 27942030
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T |
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| Q |
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387 |
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27942198 |
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27942106 |
T |
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| Q |
388 |
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463 |
Q |
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| T |
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27942030 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 134; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 197 - 465
Target Start/End: Complemental strand, 49384527 - 49384249
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Q |
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tccgtcccaaattgtatgtcattttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcg-tttacaataccaatgaaatattattgttacttttcctattata |
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T |
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385 |
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T |
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| Q |
386 |
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465 |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 134; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 191 - 463
Target Start/End: Complemental strand, 54080391 - 54080108
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Q |
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T |
 |
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379 |
Q |
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| T |
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54080192 |
T |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 133; E-Value: 8e-69
Query Start/End: Original strand, 233 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 29361567 - 29361341
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T |
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333 |
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421 |
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| T |
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T |
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422 |
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448 |
Q |
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tgaaatgctcaaaacgtcatacaattt |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 133; E-Value: 8e-69
Query Start/End: Original strand, 188 - 463
Target Start/End: Complemental strand, 32100365 - 32100079
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287 |
Q |
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 |
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cctattataaccttaactatttattactctctcttctttcaagtcttttatttatctttttcat-----------aggacaattttgtaaaacaactcat |
376 |
Q |
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cctattatatccttaactatttattactctttcgtttttcaattctttcatttatctttcccatatcatttattaaggataattttgtaaaacaactcat |
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T |
 |
| Q |
377 |
aatatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatatgtgtgaaatgcccaaaacgtcatacaatttaggatgaagggagta |
463 |
Q |
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| T |
32100165 |
aatatctctttctcacacaatattaattacatttcttaatttgtgtgaaatgctcaaaacgtcatacaatttgggacggagggagta |
32100079 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 133; E-Value: 8e-69
Query Start/End: Original strand, 197 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 42939850 - 42939588
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296 |
Q |
| |
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 |
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accttaactatttattactctctcttctttcaagtcttttatttatctttttcat-----------aggacaattttgtaaaacaactcataatatctct |
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Q |
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| T |
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tccttaactatttattactctttcttctttcaattctttcatttatctttcccatatcatttattaaggataattttgtaaaacaattcataatatctct |
42939651 |
T |
 |
| Q |
386 |
tttccacacaatattaattacatttcttaatatgtgtgaaatgcccaaaacgtcatacaattt |
448 |
Q |
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| T |
42939650 |
ttcccacacaatattaattatatttcttaatatgtatgaaatgcccaaaacgtcatacaattt |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 133; E-Value: 8e-69
Query Start/End: Original strand, 233 - 463
Target Start/End: Original strand, 52262267 - 52262508
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333 |
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420 |
Q |
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| T |
52262367 |
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52262465 |
T |
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| Q |
421 |
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463 |
Q |
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| T |
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gtgaaatgcccaaaacgtcatacaatttgggacggagggagta |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 132; E-Value: 3e-68
Query Start/End: Original strand, 233 - 463
Target Start/End: Original strand, 10659243 - 10659484
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332 |
Q |
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T |
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| Q |
333 |
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421 |
Q |
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| T |
10659343 |
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10659442 |
T |
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| Q |
422 |
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463 |
Q |
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| T |
10659443 |
tgaaatgcccaaaacaacatacaatttgggacggagggagta |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 132; E-Value: 3e-68
Query Start/End: Original strand, 190 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 35084619 - 35084350
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Q |
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T |
 |
| Q |
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378 |
Q |
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| T |
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35084420 |
T |
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| Q |
379 |
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448 |
Q |
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| T |
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tatctattccccacacaatattaattacatttcttaatatgtgtgaaatgcccaaaacgtcttacaattt |
35084350 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 131; E-Value: 1e-67
Query Start/End: Original strand, 230 - 463
Target Start/End: Complemental strand, 13759880 - 13759636
Alignment:
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Q |
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T |
 |
| Q |
330 |
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418 |
Q |
| |
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| T |
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ttctttcatttatctttctcatgttatttattaaggacaattttgtaaaacaactcataatatctattttctacacaatattaattgcatttcttaatat |
13759681 |
T |
 |
| Q |
419 |
gtgtgaaatgcccaaaacgtcatacaatttaggatgaagggagta |
463 |
Q |
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| T |
13759680 |
gtatgaaatgcccaaaacgtcatacaatttgggacggagggagta |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 131; E-Value: 1e-67
Query Start/End: Original strand, 190 - 463
Target Start/End: Original strand, 29674859 - 29675143
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Q |
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| T |
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tactccttccgtcccaaattgtatgtcgttttaaaaaaaaaatttgtcccaaattatatgtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttatttttcc |
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T |
 |
| Q |
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378 |
Q |
| |
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| T |
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tattatatccttatctattaattactctctcttctttcaattatttcatttatcttttccataccatttattatggataattttgtaaaacaactcataa |
29675058 |
T |
 |
| Q |
379 |
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463 |
Q |
| |
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| T |
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tttctcttccccacacaatattaattacatttcttaatacgtgtgaaatgaccaaaacgtcatacaatttgggacggagggagta |
29675143 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 131; E-Value: 1e-67
Query Start/End: Original strand, 190 - 463
Target Start/End: Original strand, 43599570 - 43599853
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| Q |
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289 |
Q |
| |
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|||||| ||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| |||| | ||| |||||| |
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| T |
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T |
 |
| Q |
290 |
tattataaccttaactatttattactctctcttctttcaagtcttttatttatctttttcata-----------ggacaattttgtaaaacaactcataa |
378 |
Q |
| |
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| T |
43599669 |
tattatatccttaaccatttattactctctcttctttcaattccttcatttatctttcacatatcatttattgaggacaattttgtaaaacaactcataa |
43599768 |
T |
 |
| Q |
379 |
tatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatatgtgtgaaatgcccaaaacgtcatacaatttaggatgaagggagta |
463 |
Q |
| |
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|
| T |
43599769 |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 131; E-Value: 1e-67
Query Start/End: Original strand, 191 - 463
Target Start/End: Complemental strand, 48584165 - 48583881
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| Q |
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290 |
Q |
| |
|
||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
48584165 |
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48584066 |
T |
 |
| Q |
291 |
attataaccttaactatttattactctctcttctttcaagtcttttatttatctttttcat-----------aggacaattttgt-aaaacaactcataa |
378 |
Q |
| |
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|
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| T |
48584065 |
attatatccttaactatttattactctctcttctttcaattccttcatttatctttcccatatcatttattaaggacaattttgtaaaaataactcataa |
48583966 |
T |
 |
| Q |
379 |
tatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatatgtgtgaaatgcccaaaacgtcatacaatttaggatgaagggagta |
463 |
Q |
| |
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|
|
| T |
48583965 |
tatatctttcccatacaatattaattacatttcttaacatgtgtgaaatggccaaaacgtcatacaatttgggacggagggagta |
48583881 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 131; E-Value: 1e-67
Query Start/End: Original strand, 190 - 463
Target Start/End: Original strand, 51865689 - 51865973
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| Q |
190 |
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289 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||| ||||||||||||| ||| ||||| | | ||||| || ||| ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |
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51865689 |
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51865788 |
T |
 |
| Q |
290 |
tattataaccttaactatttattactctctcttctttcaagtcttttatttatctttttcata-----------ggacaattttgtaaaacaactcataa |
378 |
Q |
| |
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| T |
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tattatatccttaactatttattactctctcttctttcaattccttcatttatctttcccatatcatttattgaggacaattttgtaaaacaactcacaa |
51865888 |
T |
 |
| Q |
379 |
tatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatatgtgtgaaatgcccaaaacgtcatacaatttaggatgaagggagta |
463 |
Q |
| |
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|
| T |
51865889 |
tatctctttcccacacaatattaattacatttcttaatatgtgtgaaatgtccaaaacgtcatacaatttgggacggagggagta |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 129; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 197 - 448
Target Start/End: Original strand, 23782072 - 23782334
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Q |
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|
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tccgtcccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtctcaaattgtatatcactttacattaccaatgaaacattaatgttacttttcctattata |
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T |
 |
| Q |
297 |
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385 |
Q |
| |
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|
| T |
23782172 |
tccttaattatttattactctttcttcttttaattctttcatttatctttctcatatcatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatatctat |
23782271 |
T |
 |
| Q |
386 |
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448 |
Q |
| |
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| T |
23782272 |
ttcccatacaatattaattacatttcttaatatatgtgaaatgcccaaaacgtcatacaattt |
23782334 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #60
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Query Start/End: Original strand, 190 - 463
Target Start/End: Complemental strand, 33840082 - 33839796
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190 |
tactccatccgtcctaaattgtatgtcattttnnnnnnnntatttgtcccaaattgtatgtcactttacaataccaatgaaacattaatgttatttttcc |
289 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |
|
|
| T |
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tactccatccatcccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcgctttacaataccaatgaaaaattaatgttacttttcc |
33839983 |
T |
 |
| Q |
290 |
tattataaccttaactatttattactctctcttcttt--caagtcttttatttatctttt-----tcat------aggacaattttgtaaaacaactcat |
376 |
Q |
| |
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| T |
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tattatatccttaactatttattactcttttttttttttcaattccttcatttatctttcctatatcatttattgaggacaattttgtaaaacaactcat |
33839883 |
T |
 |
| Q |
377 |
aatatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatatgtgtgaaatgcccaaaacgtcatacaatttaggatgaagggagta |
463 |
Q |
| |
|
||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||| |
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|
| T |
33839882 |
aatatatatttcccacacaatattaattacatttcttaatatgtgtgaaatgcccaaaacgtcatataatttgggatggagggagta |
33839796 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 129; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 231 - 450
Target Start/End: Original strand, 39259299 - 39259529
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Q |
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|
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atttgtcccaaattatatgtcgctttacaatatcaatgcaacattaatgttatttttcctattataaccttagctatttattactctcttttctttcaat |
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T |
 |
| Q |
331 |
tcttttatttatctttttca-----------taggacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatatg |
419 |
Q |
| |
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| T |
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tctttcatttatctttcccaagttatttgttaaggacaattttgtaaaacaacttataatatctcttttatacacaatattaattgcatttcttaatatg |
39259498 |
T |
 |
| Q |
420 |
tgtgaaatgcccaaaacgtcatacaatttag |
450 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
39259499 |
tgtgaaatgtccaaaacgtcatacaatttag |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #62
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tatttgtcccaaattgtatgtcactttacaataccaatgaaacattaatgttatttttcctattataaccttaactatttattactctctcttctttcaa |
329 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||| ||||||||||||| |||| |||||| |
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|
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tatttgtcccaaattgtatgtcactttagaatatcaatgaaacattaatgttattttttctattatatcattaattatttattactctttcttttttcaa |
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T |
 |
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gtcttttatttatctttttcat-----------aggacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatat |
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Q |
| |
|
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| T |
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atctttcatttatctttctcatatcatttattaaggataattttgtaaaacaacttataatatctctttcccatacaatattaattacatttcttaatat |
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T |
 |
| Q |
419 |
gtgtgaaatgcccaaaacgtcatacaattt |
448 |
Q |
| |
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|||||||||||| ||||||||||||||||| |
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| T |
38999684 |
gtgtgaaatgcctaaaacgtcatacaattt |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #63
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339 |
Q |
| |
|
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| T |
47142251 |
aaattatatttcattttacaataccaatgcaacattaacgttactttttctattataaccttaactatttattactctattttctttcaattctttcatt |
47142350 |
T |
 |
| Q |
340 |
tatctttttcata-----------ggacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatatgtgtgaaatg |
428 |
Q |
| |
|
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| T |
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tatctttctcatattatttattaaggataattttgtaaaacaaatcataatatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatatgtgtgaaatg |
47142450 |
T |
 |
| Q |
429 |
cccaaaacgtcatacaatttag |
450 |
Q |
| |
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|
| T |
47142451 |
cccaaaacgtcatacaatttag |
47142472 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 128; E-Value: 7e-66
Query Start/End: Original strand, 231 - 448
Target Start/End: Original strand, 51571793 - 51572022
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231 |
atttgtcccaaattgtatgtcactttacaataccaatgaaacattaatgttatttttcctattataaccttaactatttattactctctcttctttcaag |
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Q |
| |
|
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|
| T |
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atttgtcccaaattatatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatggtacttttcctattataaccttaactatttattactatctcttctttcaat |
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T |
 |
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tcttttatttatctttttcat-----------aggacaattttgtaaaacaactcataatatc-tcttttccacacaatattaattacatttcttaatat |
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Q |
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| T |
51571893 |
tatttcatttatctttcccatgttatttattaaggacaattttgtaaaacaactcataatatctttttttccacacaatattaattgcatttcttaatat |
51571992 |
T |
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419 |
gtgtgaaatgcccaaaacgtcatacaattt |
448 |
Q |
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| T |
51571993 |
gtgtgaaatgcccaaaacgtcgtacaattt |
51572022 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 128; E-Value: 7e-66
Query Start/End: Original strand, 230 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 52679829 - 52679600
Alignment:
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329 |
Q |
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| T |
52679829 |
tatttgttccaaattgtatgtcactttacaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattatatctttaattatttattactcttttttctttcaa |
52679730 |
T |
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330 |
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418 |
Q |
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| T |
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52679630 |
T |
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| Q |
419 |
gtgtgaaatgcccaaaacgtcatacaattt |
448 |
Q |
| |
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| T |
52679629 |
atgtgaaatgctcaaaacgtcatacaattt |
52679600 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 127; E-Value: 3e-65
Query Start/End: Original strand, 230 - 463
Target Start/End: Complemental strand, 240715 - 240471
Alignment:
| Q |
230 |
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329 |
Q |
| |
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| T |
240715 |
tatttgtcccaaattgtatgtcactttacaatactaatgaaacattaatatcattttttctattataaccttaactatttattactctcttttctttcaa |
240616 |
T |
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| Q |
330 |
gtcttttatttatctttttcat-----------aggacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatat |
418 |
Q |
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| T |
240615 |
gtcttttatttatctttcccatattatttattaaggacaattttgtaaaacaattcataatatatcttttccatacaatattaattatattttttaatat |
240516 |
T |
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| Q |
419 |
gtgtgaaatgcccaaaacgtcatacaatttaggatgaagggagta |
463 |
Q |
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| T |
240515 |
ctgtgacatgtccaaaatgtcatataatttgggacggagggagta |
240471 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 127; E-Value: 3e-65
Query Start/End: Original strand, 190 - 463
Target Start/End: Original strand, 34663430 - 34663714
Alignment:
| Q |
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289 |
Q |
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T |
 |
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290 |
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378 |
Q |
| |
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| T |
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34663629 |
T |
 |
| Q |
379 |
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463 |
Q |
| |
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| T |
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tatttctttcccacacaatattaattacatttcttaatatgtgtgaaatgctcaaaacgtcatacaatttgggacggagggagta |
34663714 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 127; E-Value: 3e-65
Query Start/End: Original strand, 231 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 47109303 - 47109075
Alignment:
| Q |
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330 |
Q |
| |
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T |
 |
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331 |
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419 |
Q |
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| T |
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T |
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| Q |
420 |
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448 |
Q |
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| T |
47109103 |
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47109075 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 127; E-Value: 3e-65
Query Start/End: Original strand, 231 - 448
Target Start/End: Original strand, 49818319 - 49818547
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| Q |
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330 |
Q |
| |
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T |
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| Q |
331 |
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419 |
Q |
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| T |
49818419 |
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49818518 |
T |
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| Q |
420 |
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448 |
Q |
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| T |
49818519 |
tgtgaaatgcccaaaacgtcatacaattt |
49818547 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #70
Raw Score: 126; E-Value: 1e-64
Query Start/End: Original strand, 238 - 465
Target Start/End: Original strand, 5925347 - 5925583
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337 |
Q |
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 |
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426 |
Q |
| |
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5925544 |
T |
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| Q |
427 |
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465 |
Q |
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| T |
5925545 |
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5925583 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #71
Raw Score: 126; E-Value: 1e-64
Query Start/End: Original strand, 232 - 448
Target Start/End: Original strand, 54677656 - 54677883
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| Q |
232 |
tttgtcccaaattgtatgtcactttacaataccaatgaaacattaatgttatttttcctattataaccttaactatttattactctctcttctttcaagt |
331 |
Q |
| |
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T |
 |
| Q |
332 |
cttttatttatctttttcata-----------ggacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatatgt |
420 |
Q |
| |
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| T |
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54677855 |
T |
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| Q |
421 |
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448 |
Q |
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| T |
54677856 |
gtgaaatgctcaaaacgtcatacaattt |
54677883 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #72
Raw Score: 125; E-Value: 5e-64
Query Start/End: Original strand, 197 - 448
Target Start/End: Original strand, 31725629 - 31725891
Alignment:
| Q |
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Q |
| |
|
||||| ||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||| ||| || |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| |
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tccgttctaaattgtatgtcactttagaaaatatatttgttccaaattatatttcgttttacaataccaatgaaaaattaatgttacttttcctattata |
31725728 |
T |
 |
| Q |
297 |
accttaactatttattactctctcttctttcaagtcttttatttatctttttcata-----------ggacaattttgtaaaacaactcataatatctct |
385 |
Q |
| |
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tccttaactatttattattctctcttctttcaattccttcatttatctttcccatatcatttattgaggacaattttgtaaaacaactcataatatctct |
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T |
 |
| Q |
386 |
tttccacacaatattaattacatttcttaatatgtgtgaaatgcccaaaacgtcatacaattt |
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Q |
| |
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| T |
31725829 |
ttcccacacaatattaattacatttcttaatacgtgtgaaatgtccaaaacgtcatacaattt |
31725891 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #73
Raw Score: 124; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 230 - 436
Target Start/End: Complemental strand, 1672939 - 1672722
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329 |
Q |
| |
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|
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T |
 |
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418 |
Q |
| |
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| T |
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T |
 |
| Q |
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436 |
Q |
| |
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| T |
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gtgtgaaatgcccaaaac |
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T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #74
Raw Score: 124; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 189 - 448
Target Start/End: Original strand, 40643315 - 40643585
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| Q |
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288 |
Q |
| |
|
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|
| T |
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ttactccctccgtcccaaattgtatgtcattttaaaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaataaaacattaatgttacttttc |
40643414 |
T |
 |
| Q |
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ctattataaccttaactatttattactctctcttctttcaagtcttttatttatctt-----tttcat------aggacaattttgtaaaacaactcata |
377 |
Q |
| |
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ctattatatccttaactatttattactctttattttttcaattttttcatttatctttccgatatcatttattaaagataattttgtaaaacaactcata |
40643514 |
T |
 |
| Q |
378 |
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448 |
Q |
| |
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| T |
40643515 |
atatatctttcatacacaatattaattacatttcttaatatgtgtgaaatgctcaaaacgtcatacaattt |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #75
Raw Score: 124; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 231 - 465
Target Start/End: Original strand, 44035183 - 44035428
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| |
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T |
 |
| Q |
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419 |
Q |
| |
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tctttcatttatctttctcatattatttattaaggacaattttgtaaaacaactcataatatctattttccacacaatattaattacattttttaatatg |
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T |
 |
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Q |
| |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #76
Raw Score: 124; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 183 - 465
Target Start/End: Complemental strand, 47498193 - 47497900
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Q |
| |
|
|||||| |||||| ||||||| |||||||||||| |||| | |||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||| |||||||||| |
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|
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T |
 |
| Q |
283 |
tttttcctattataaccttaactatttattactctctcttctttcaagtcttttatttatctttttcata-----------ggacaattttgtaaaacaa |
371 |
Q |
| |
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cttttcctattatatccttaattattaattactctctcttctttcaattatttcatttatcttttccataccatttattaaggataattttgtaaaacag |
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T |
 |
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372 |
ctcataatatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatatgtgtgaaatgcccaaaacgtcatacaatttaggatgaagggagtaat |
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Q |
| |
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| T |
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ctcataatttctcttccccacacaatattaattacatttcttaatacgtgtgaaatgaccaaaacgtcatacaatttaggacggagggagtaat |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #77
Raw Score: 124; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 190 - 463
Target Start/End: Original strand, 48333710 - 48333992
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Q |
| |
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tactccctccgtcccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattatatgttgctttacaataccaatgaaaaattaatgttacttttcc |
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T |
 |
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tattataaccttaactatttattactctctcttctttcaagtcttttatttatctttttcata-----------ggacaattttgtaaaacaactcataa |
378 |
Q |
| |
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| T |
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T |
 |
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tatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatatgtgtgaaatgcccaaaacgtcatacaatttaggatgaagggagta |
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Q |
| |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #78
Raw Score: 123; E-Value: 7e-63
Query Start/End: Original strand, 231 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 28686403 - 28686175
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tcttttatttatctttttcata-----------ggacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatatg |
419 |
Q |
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28686204 |
T |
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| Q |
420 |
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448 |
Q |
| |
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||||||||||||||||||||||||||||| |
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| T |
28686203 |
tgtgaaatgcccaaaacgtcatacaattt |
28686175 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #79
Raw Score: 123; E-Value: 7e-63
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Target Start/End: Complemental strand, 37331422 - 37331186
Alignment:
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337 |
Q |
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T |
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| Q |
338 |
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426 |
Q |
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| T |
37331322 |
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37331223 |
T |
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| Q |
427 |
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463 |
Q |
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37331222 |
tgcccaagacgtcatacaatttgggatggaaggagta |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #80
Raw Score: 123; E-Value: 7e-63
Query Start/End: Original strand, 231 - 464
Target Start/End: Original strand, 43185385 - 43185629
Alignment:
| Q |
231 |
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330 |
Q |
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T |
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| Q |
331 |
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419 |
Q |
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| T |
43185485 |
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43185584 |
T |
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| Q |
420 |
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464 |
Q |
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43185585 |
tgtgaaatgaccaaaacgtcatacaatttgggacggagggagtaa |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #81
Raw Score: 123; E-Value: 7e-63
Query Start/End: Original strand, 233 - 463
Target Start/End: Complemental strand, 43190728 - 43190487
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| Q |
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332 |
Q |
| |
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43190728 |
ttgtcccaaattgtatgtcgctttacaatatcaatgaagcattaatgttatttttcatattatatcattaactatttactactttctcttcttccaagtc |
43190629 |
T |
 |
| Q |
333 |
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421 |
Q |
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| T |
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43190529 |
T |
 |
| Q |
422 |
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463 |
Q |
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| T |
43190528 |
tgaaatgcccaaaacgtcatacaatttaggacggagggagta |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #82
Raw Score: 121; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 231 - 450
Target Start/End: Complemental strand, 33593192 - 33592962
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| Q |
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330 |
Q |
| |
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T |
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| Q |
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Q |
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| T |
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T |
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| Q |
420 |
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450 |
Q |
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| T |
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tgtgaaatgtccaaaatgtcatacaatttag |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #83
Raw Score: 121; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 231 - 450
Target Start/End: Complemental strand, 33600323 - 33600093
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| Q |
231 |
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330 |
Q |
| |
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| T |
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T |
 |
| Q |
331 |
tcttttatttatctttttcatag-----------gacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatatg |
419 |
Q |
| |
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| T |
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T |
 |
| Q |
420 |
tgtgaaatgcccaaaacgtcatacaatttag |
450 |
Q |
| |
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| T |
33600123 |
tgtgaaatgtccaaaatgtcatacaatttag |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #84
Raw Score: 121; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 189 - 464
Target Start/End: Complemental strand, 50622784 - 50622498
Alignment:
| Q |
189 |
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288 |
Q |
| |
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| T |
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T |
 |
| Q |
289 |
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377 |
Q |
| |
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| T |
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ctattatatccttaactatttattactctctcttctttcaatttctttatttatctttcccatatcatttattgaggacaattttgtaaaacaactcata |
50622585 |
T |
 |
| Q |
378 |
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464 |
Q |
| |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #85
Raw Score: 120; E-Value: 4e-61
Query Start/End: Original strand, 230 - 452
Target Start/End: Complemental strand, 335933 - 335700
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Q |
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T |
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418 |
Q |
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| T |
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ttctttcatttatctttcccatataatttatcgaggacaattttgtaaaacaattcataatatctttttcccacacaatattaattgcatttcttaatat |
335734 |
T |
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| Q |
419 |
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452 |
Q |
| |
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| T |
335733 |
gtgtgaaatggtcaaaacgtcatacaatttagga |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #86
Raw Score: 120; E-Value: 4e-61
Query Start/End: Original strand, 230 - 463
Target Start/End: Complemental strand, 33193203 - 33192961
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| Q |
230 |
tatttgtcccaaattgtatgtcactttacaataccaatgaaacattaatgttatttttcctattataaccttaactatttattactctctcttctttcaa |
329 |
Q |
| |
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| T |
33193203 |
tatttgttccaaattatatgtcgctttacaataccaatgaaaaattaatgttacctttcatattatatctttaactatttattactctct--tctttcaa |
33193106 |
T |
 |
| Q |
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418 |
Q |
| |
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| T |
33193105 |
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33193006 |
T |
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| Q |
419 |
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463 |
Q |
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| T |
33193005 |
gtgtgaaatgcccaaaacatcatacaatttaggacggagggagta |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #87
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Query Start/End: Original strand, 231 - 448
Target Start/End: Original strand, 41979916 - 41980143
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| |
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T |
 |
| Q |
331 |
tcttttatttatctttttcata-----------ggacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatatg |
419 |
Q |
| |
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| T |
41980015 |
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41980114 |
T |
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| Q |
420 |
tgtgaaatgcccaaaacgtcatacaattt |
448 |
Q |
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| T |
41980115 |
tgtgaaatgctcaaaacgtcatacaattt |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #88
Raw Score: 119; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 231 - 452
Target Start/End: Original strand, 43109633 - 43109865
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| Q |
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330 |
Q |
| |
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T |
 |
| Q |
331 |
tcttttatttatctttttcata-----------ggacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatatg |
419 |
Q |
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| T |
43109733 |
tatttcatttatcttttccataccatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaatattaattacatttcttaatacg |
43109832 |
T |
 |
| Q |
420 |
tgtgaaatgcccaaaacgtcatacaatttagga |
452 |
Q |
| |
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| T |
43109833 |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #89
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Query Start/End: Original strand, 230 - 463
Target Start/End: Original strand, 43408307 - 43408543
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Q |
| |
|
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|
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T |
 |
| Q |
330 |
gtcttttatttatctttttcat-----------aggacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatat |
418 |
Q |
| |
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ttatttcatttatctttcccatattatttattgaggacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttctacacaatattaattgcatt--------t |
43408498 |
T |
 |
| Q |
419 |
gtgtgaaatgcccaaaacgtcatacaatttaggatgaagggagta |
463 |
Q |
| |
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gtgtgaaatgcccaaaacgtcatacaatttgggacggagggagta |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #90
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289 |
Q |
| |
|
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|
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tactccatccgtcccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtctcaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttatttttcc |
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T |
 |
| Q |
290 |
tattataaccttaactatttattactctctcttctttcaagtcttttatttatctttttcat-----------aggacaattttgtaaaacaactcataa |
378 |
Q |
| |
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tattatatccttaactatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttctcatatcatttattaaggataattttgtaaaacaactcataa |
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T |
 |
| Q |
379 |
tatctcttttccacacaatattaatta |
405 |
Q |
| |
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| T |
8104430 |
tatctctttcccacacaatattaatta |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #91
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Query Start/End: Original strand, 233 - 464
Target Start/End: Original strand, 41935951 - 41936193
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ttgtcccaaattgtatgtcactttacaataccaatgaaacattaatgttatttttcctattataaccttaactatttattactctctcttctttcaagtc |
332 |
Q |
| |
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| T |
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ttgtcccaaattatatgtcgctttacaataccaatgaatcattaatgttaattttcctattatatccttcactatttattgccttctctactctcaagtc |
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T |
 |
| Q |
333 |
ttttatttatctttttcata-----------ggacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatatgtg |
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| |
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| T |
41936051 |
attcatttatcttttccatataatttattaaggacaattttgtaaaacaactcataatatctctttcccacacaaaattaattacatttcttaatgcgtg |
41936150 |
T |
 |
| Q |
422 |
tgaaatgcccaaaacgtcatacaatttaggatgaagggagtaa |
464 |
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| |
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| T |
41936151 |
tgaaatacccaaaacgtcatacaatttgggacggagggagtaa |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #92
Raw Score: 116; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 230 - 464
Target Start/End: Complemental strand, 4822921 - 4822677
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Q |
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| T |
4822921 |
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4822823 |
T |
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418 |
Q |
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4822723 |
T |
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464 |
Q |
| |
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|
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| T |
4822722 |
gtgtgaaatgcccaaaacatcatacaatttgggacggagggagtaa |
4822677 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #93
Raw Score: 116; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 233 - 463
Target Start/End: Complemental strand, 34817143 - 34816902
Alignment:
| Q |
233 |
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332 |
Q |
| |
|
|||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| |||||||||| || |||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||| | |
|
|
| T |
34817143 |
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34817044 |
T |
 |
| Q |
333 |
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421 |
Q |
| |
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|
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| T |
34817043 |
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34816944 |
T |
 |
| Q |
422 |
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463 |
Q |
| |
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||||||| ||||||||||||||||||| ||| | |||||||| |
|
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| T |
34816943 |
tgaaatggccaaaacgtcatacaatttgggacggagggagta |
34816902 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #94
Raw Score: 116; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 190 - 438
Target Start/End: Original strand, 45218717 - 45218973
Alignment:
| Q |
190 |
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289 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
45218717 |
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45218816 |
T |
 |
| Q |
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379 |
Q |
| |
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||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| || || ||||||||| | |||| | |||||||||||||||||||| ||||| |
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| T |
45218817 |
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45218914 |
T |
 |
| Q |
380 |
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438 |
Q |
| |
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|||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
45218915 |
atctttttcccacacaatattaattacatttcttaatatgtgtgaaatgtccaaaacgt |
45218973 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #95
Raw Score: 116; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 197 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 48910614 - 48910350
Alignment:
| Q |
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Q |
| |
|
||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
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48910515 |
T |
 |
| Q |
297 |
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383 |
Q |
| |
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| ||||||||||||||||| ||| || |||||| | ||| |||||||||| ||| |||| ||||||||||| ||||||||||||| | |
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| T |
48910514 |
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48910415 |
T |
 |
| Q |
384 |
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448 |
Q |
| |
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|
| T |
48910414 |
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48910350 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #96
Raw Score: 116; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 181 - 463
Target Start/End: Complemental strand, 54241116 - 54240823
Alignment:
| Q |
181 |
aaaataaattactccatccgtcctaaattgtatgtcattttnnnnnnnntatttgtcccaaattgtatgtcactttacaataccaatgaaacattaatgt |
280 |
Q |
| |
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|||| ||| |||||| ||||||| | ||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||| || ||||| |
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| T |
54241116 |
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54241017 |
T |
 |
| Q |
281 |
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369 |
Q |
| |
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| T |
54241016 |
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54240917 |
T |
 |
| Q |
370 |
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463 |
Q |
| |
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|
| T |
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54240823 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #97
Raw Score: 115; E-Value: 4e-58
Query Start/End: Original strand, 230 - 463
Target Start/End: Complemental strand, 15999060 - 15998817
Alignment:
| Q |
230 |
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329 |
Q |
| |
|
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|
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| T |
15999060 |
tatttgtcccaaattatatgtcgctttacaataccaatgaaaaatta-tgctacttttcctattatatccttaatcatttattactctctcttctttcaa |
15998962 |
T |
 |
| Q |
330 |
gtcttttatttatctttttcata-----------ggacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatat |
418 |
Q |
| |
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|
| T |
15998961 |
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15998862 |
T |
 |
| Q |
419 |
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463 |
Q |
| |
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|
| T |
15998861 |
atgtgaaatgctcaaaacgtgatacaatttaggacaaagggagta |
15998817 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #98
Raw Score: 115; E-Value: 4e-58
Query Start/End: Original strand, 254 - 463
Target Start/End: Complemental strand, 31289301 - 31289081
Alignment:
| Q |
254 |
tttacaataccaatgaaacattaatgttatttttcctattataaccttaactatttattactctctcttctttcaagtcttttatttatctttttcata- |
352 |
Q |
| |
|
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| T |
31289301 |
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31289202 |
T |
 |
| Q |
353 |
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442 |
Q |
| |
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| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| |
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| T |
31289201 |
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31289102 |
T |
 |
| Q |
443 |
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463 |
Q |
| |
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| T |
31289101 |
caatttaggacggagggagta |
31289081 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #99
Raw Score: 115; E-Value: 4e-58
Query Start/End: Original strand, 233 - 463
Target Start/End: Complemental strand, 41637122 - 41636879
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| Q |
233 |
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330 |
Q |
| |
|
|||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| | | || ||||||| |
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| T |
41637122 |
ttgtcccaaattatatgtcgctttacaataccaataaaatattaatgttacttttcctattatgtccttaactatttattacttttttttttctttcaat |
41637023 |
T |
 |
| Q |
331 |
tcttttatttatctttttcata-----------ggacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatatg |
419 |
Q |
| |
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| T |
41637022 |
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41636923 |
T |
 |
| Q |
420 |
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463 |
Q |
| |
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| ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| |
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|
| T |
41636922 |
tttgaaatgcccaaaacgtcatacaatttaggacggagggagta |
41636879 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #100
Raw Score: 114; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 233 - 463
Target Start/End: Complemental strand, 8096843 - 8096611
Alignment:
| Q |
233 |
ttgtcccaaattgtatgtcactttacaataccaatgaaacattaatgttatttttcctattataaccttaactatttattactctctcttctttcaagt- |
331 |
Q |
| |
|
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|
| T |
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ttgtcccaaattatatgtcgttttacaatagcaatgaaacattaatgttacttttcctattatatccttaactatttattactctttcttctttcattta |
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T |
 |
| Q |
332 |
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430 |
Q |
| |
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| T |
8096743 |
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8096644 |
T |
 |
| Q |
431 |
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463 |
Q |
| |
|
||||| |||||||||||||| | | |||||||| |
|
|
| T |
8096643 |
caaaatgtcatacaatttagaacggagggagta |
8096611 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #101
Raw Score: 114; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 231 - 463
Target Start/End: Original strand, 12569333 - 12569575
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| Q |
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atttgtcccaaattgtatgtcactttacaataccaatgaaacattaatgttatttttcctattataaccttaactatttattactctctcttctttcaag |
330 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
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atttgtcccaaattatatgtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttaattttcctattatatccttaactattaattactctctcttctttcaat |
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T |
 |
| Q |
331 |
tcttttatttatctttttcat-----------aggacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatatg |
419 |
Q |
| |
|
| ||| ||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||| |||||| |
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| T |
12569433 |
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12569531 |
T |
 |
| Q |
420 |
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463 |
Q |
| |
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|
| T |
12569532 |
tgtgaaatgaccaaaacgtcatacaatttgggacggagggagta |
12569575 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #102
Raw Score: 114; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 231 - 463
Target Start/End: Original strand, 13545797 - 13546039
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| Q |
231 |
atttgtcccaaattgtatgtcactttacaataccaatgaaacattaatgttatttttcctattataaccttaactatttattactctctcttctttcaag |
330 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
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atttgtcccaaattatatgtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttaattttcctattatatccttaactattaattactctctcttctttcaat |
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T |
 |
| Q |
331 |
tcttttatttatctttttcat-----------aggacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatatg |
419 |
Q |
| |
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| ||| ||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||| |||||| |
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| T |
13545897 |
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13545995 |
T |
 |
| Q |
420 |
tgtgaaatgcccaaaacgtcatacaatttaggatgaagggagta |
463 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||||||||||||||||| ||| | |||||||| |
|
|
| T |
13545996 |
tgtgaaatgaccaaaacgtcatacaatttgggacggagggagta |
13546039 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #103
Raw Score: 114; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 233 - 468
Target Start/End: Original strand, 37056659 - 37056903
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233 |
ttgtcccaaattgtatgtcactttacaataccaatgaaacattaatgttatttttcctattataaccttaactatttattactctctcttctttcaagtc |
332 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||| || |
|
|
| T |
37056659 |
ttgtccaaaattgtatgtcgctttacaataccaatacaactttaatgttatttttcctattataaccttaactatttattagtctct--tatttcaattc |
37056756 |
T |
 |
| Q |
333 |
ttttatttatctttttcata-----------ggacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatatgtg |
421 |
Q |
| |
|
||| |||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |
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|
| T |
37056757 |
tttcatttatttttcccatattatttattaaggacaattttgtaaaacaactcataatatatattttccacacaatattaattgcatttcttgatatgtg |
37056856 |
T |
 |
| Q |
422 |
tgaaatgcccaaaacgtcatacaatttaggatgaagggagtaattta |
468 |
Q |
| |
|
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|
| T |
37056857 |
tgaaatgccaaaaacgtcatacaatttgggacggagggagtatttta |
37056903 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #104
Raw Score: 114; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 231 - 463
Target Start/End: Original strand, 41265552 - 41265795
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atttgtcccaaattgtatgtcactttacaataccaatgaaacattaatgttatttttcctattataaccttaactatttattactctctcttctttcaag |
330 |
Q |
| |
|
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|
| T |
41265552 |
atttgtcccaaattatatgttgttttacaataccaataaaatattaatgttatttttcctattatatccttaactattaattactccatcttctttcaat |
41265651 |
T |
 |
| Q |
331 |
tcttttatttatctttttcata-----------ggacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatatg |
419 |
Q |
| |
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| ||| ||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |
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| T |
41265652 |
tatttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaatattaattacatttcttaatacg |
41265751 |
T |
 |
| Q |
420 |
tgtgaaatgcccaaaacgtcatacaatttaggatgaagggagta |
463 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||||||||||||||||| ||| | |||||||| |
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|
| T |
41265752 |
tgtgaaatggccaaaacgtcatacaatttgggacggagggagta |
41265795 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #105
Raw Score: 114; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 231 - 463
Target Start/End: Complemental strand, 49610187 - 49609944
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231 |
atttgtcccaaattgtatgtcactttacaataccaatgaaacattaatgttatttttcctattataaccttaactatttattactctctcttctttcaag |
330 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||| |
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|
| T |
49610187 |
atttgtcccagattatatgtcgctttacaataccaatgaaatatttatgttacttttcctattatatccttaactattaattaccctctcttctttcaat |
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T |
 |
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331 |
tcttttatttatctttttcata-----------ggacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatatg |
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Q |
| |
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| ||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||||| | |
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T |
 |
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420 |
tgtgaaatgcccaaaacgtcatacaatttaggatgaagggagta |
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Q |
| |
|
||||||||| |||||||||| |||||||| ||| | |||||||| |
|
|
| T |
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tgtgaaatggccaaaacgtcttacaatttgggacggagggagta |
49609944 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #106
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Query Start/End: Original strand, 231 - 463
Target Start/End: Original strand, 21272669 - 21272912
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330 |
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T |
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419 |
Q |
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| T |
21272769 |
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21272868 |
T |
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463 |
Q |
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21272869 |
tgtgaaatgtccaaaacgtcttacaatttgggacggagggagta |
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Target: chr3; HSP #107
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T |
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Q |
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T |
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Q |
| |
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T |
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Target: chr3; HSP #108
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332 |
Q |
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T |
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421 |
Q |
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T |
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422 |
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463 |
Q |
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tgaaatgttcaaaacgtcatacaatttgggacggagggagta |
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #109
Raw Score: 112; E-Value: 3e-56
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Q |
| |
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T |
 |
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418 |
Q |
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T |
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Q |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #110
Raw Score: 112; E-Value: 3e-56
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Target Start/End: Complemental strand, 45347241 - 45347008
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Q |
| |
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T |
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418 |
Q |
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45347141 |
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45347042 |
T |
 |
| Q |
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Q |
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| T |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #111
Raw Score: 112; E-Value: 3e-56
Query Start/End: Original strand, 231 - 465
Target Start/End: Complemental strand, 52870678 - 52870433
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| Q |
231 |
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330 |
Q |
| |
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52870678 |
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T |
 |
| Q |
331 |
tcttttatttatctttttcata-----------ggacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatatg |
419 |
Q |
| |
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52870578 |
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T |
 |
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Q |
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52870478 |
tgtgaaatggccaaaacgtcatacaatttgggacggagggagtaat |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #112
Raw Score: 111; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 235 - 463
Target Start/End: Original strand, 46336741 - 46336974
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T |
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| Q |
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ttatttatctttttcata-----------ggacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatatgtgtg |
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Q |
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tcatttatctttcccatattatttattaaggacaattttgtaaaacaacttataatatctttttttcacacaatattaattgcatttcttaatatatgtg |
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T |
 |
| Q |
424 |
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463 |
Q |
| |
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aaatgcccaaaacgtcatacaatttgggacggagggagta |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #113
Raw Score: 111; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 243 - 448
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| |
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48574672 |
T |
 |
| Q |
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448 |
Q |
| |
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||||| ||||||||||| |
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48574671 |
aaaacatcatacaattt |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #114
Raw Score: 111; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 230 - 467
Target Start/End: Complemental strand, 52804926 - 52804678
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T |
 |
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gtcttttatttatctttttcata-----------ggacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatat |
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Q |
| |
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ttccttcatttatttttcccatataatttattaaggacaattttgtaaaataattcataatatctttttcaaacacaatattaattacatatcttaatat |
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T |
 |
| Q |
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gtgtgaaatgcccaaaacgtcatacaatttaggatgaagggagtaattt |
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Q |
| |
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|
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52804726 |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #115
Raw Score: 110; E-Value: 4e-55
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Target Start/End: Original strand, 24978829 - 24979085
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T |
 |
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tattataaccttaactatttattactctctcttctttcaagtcttttatttatctt-----tttcat------aggacaattttgtaaaacaactcataa |
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Q |
| |
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|
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tattatatccttaactatttattactcttttttttttcaattctttcatttatctttcctatatcatttattaagaataattttgtagaacaactcataa |
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T |
 |
| Q |
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tatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatatgtgtgaaatgcccaaaa |
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Q |
| |
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|
| T |
24979029 |
tatctctttctcacacaatattaattatatttcttaatatttgtgaaatacccaaaa |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #116
Raw Score: 110; E-Value: 4e-55
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Target Start/End: Complemental strand, 42662699 - 42662456
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| |
|
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|
|
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T |
 |
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tcttttatttatctttttcata-----------ggacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatatg |
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Q |
| |
|
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|
|
| T |
42662599 |
tcattcatttatctttcacatatcatttattaaggacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaaaattaattacatttcttaatacg |
42662500 |
T |
 |
| Q |
420 |
tgtgaaatgcccaaaacgtcatacaatttaggatgaagggagta |
463 |
Q |
| |
|
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|
|
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #117
Raw Score: 108; E-Value: 6e-54
Query Start/End: Original strand, 236 - 463
Target Start/End: Original strand, 11363095 - 11363329
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| |
|
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|
|
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 |
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tatttatctttttcata-----------ggacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatatgtgtga |
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Q |
| |
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|
| T |
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catttatctttctcatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacagaatattaattgcatttcttaatatgtgcgg |
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T |
 |
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Q |
| |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #118
Raw Score: 108; E-Value: 6e-54
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Target Start/End: Complemental strand, 20394274 - 20393989
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| |
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 |
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| |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #119
Raw Score: 107; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 190 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 3671662 - 3671393
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| T |
3671562 |
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3671463 |
T |
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| Q |
379 |
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448 |
Q |
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| T |
3671462 |
tatctctttcccacacaatattaattacatttcttaatatgtgtgaaatgcccaaaacatcatacaattt |
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T |
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Target: chr3; HSP #120
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Target Start/End: Complemental strand, 9508745 - 9508501
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T |
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Q |
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9508546 |
T |
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463 |
Q |
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9508545 |
tgtgaaatgcccaaaaacatcatataatttgggacggagggagta |
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T |
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Target: chr3; HSP #121
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Query Start/End: Original strand, 231 - 463
Target Start/End: Complemental strand, 9516720 - 9516476
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330 |
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T |
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419 |
Q |
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| T |
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T |
 |
| Q |
420 |
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463 |
Q |
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| T |
9516520 |
tgtgaaatgcccaaaaacatcatataatttgggacggagggagta |
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T |
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Target: chr3; HSP #122
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Target Start/End: Original strand, 43600909 - 43601136
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330 |
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T |
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Q |
| |
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43601108 |
T |
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| Q |
420 |
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447 |
Q |
| |
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| T |
43601109 |
tgtgaaattcctaaaacgtcgtacaatt |
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T |
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Target: chr3; HSP #123
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Q |
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T |
 |
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450 |
Q |
| |
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ttttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaatattaattgcatttcttaatatgtgtgaaatgcctaaaatgtcatacaatttag |
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Target: chr3; HSP #124
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Target Start/End: Original strand, 38550917 - 38551143
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Q |
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T |
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Q |
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| T |
38551017 |
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38551116 |
T |
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| Q |
422 |
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448 |
Q |
| |
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| T |
38551117 |
tgaaatgcccaaaacgtcatgcaattt |
38551143 |
T |
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Target: chr3; HSP #125
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332 |
Q |
| |
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| T |
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T |
 |
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333 |
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420 |
Q |
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| T |
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T |
 |
| Q |
421 |
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463 |
Q |
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| T |
53722399 |
gtgaaacgcccaaaacgtcatacaatttgggacggagggagta |
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T |
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Target: chr3; HSP #126
Raw Score: 105; E-Value: 4e-52
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Target Start/End: Complemental strand, 54747989 - 54747722
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| |
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| T |
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T |
 |
| Q |
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378 |
Q |
| |
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| T |
54747889 |
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54747792 |
T |
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| Q |
379 |
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448 |
Q |
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| T |
54747791 |
tatctctttctcacacaatattaattatattttttaatatgtgtgaaatgctcaaaatatcatacaattt |
54747722 |
T |
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Target: chr3; HSP #127
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Query Start/End: Original strand, 233 - 463
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332 |
Q |
| |
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T |
 |
| Q |
333 |
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421 |
Q |
| |
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| T |
22926179 |
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22926278 |
T |
 |
| Q |
422 |
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463 |
Q |
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| T |
22926279 |
tgaaattgccaaaacgtcatacaatttgggacggagggagta |
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T |
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Target: chr3; HSP #128
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Q |
| |
|
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|
|
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tatttgtcctaaattatatgtcgctttacaataccaatgaaacattaatgttatttttctcattatatccttaactatttattactctatcttctttcaa |
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T |
 |
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429 |
Q |
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| T |
39290676 |
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39290772 |
T |
 |
| Q |
430 |
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463 |
Q |
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| T |
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ttaaaacattatacaatttaggacggagggagta |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #129
Raw Score: 103; E-Value: 6e-51
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331 |
Q |
| |
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| T |
23513131 |
tttgtctcaaattatatgtcgttttataacacccatgcaacattaatgttgctttttcaattataaccttaattatttattactctctcttctttcaatt |
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T |
 |
| Q |
332 |
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420 |
Q |
| |
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| T |
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ctttcatttatctttcccatattatttattaaggacaattttgtaa--caactcataatatctattttccacacaatattaattgcatttcttaatatgt |
23512934 |
T |
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| Q |
421 |
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448 |
Q |
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| T |
23512933 |
gtgaaatgcccaaaacgtcatacaattt |
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #130
Raw Score: 103; E-Value: 6e-51
Query Start/End: Original strand, 190 - 448
Target Start/End: Original strand, 29651993 - 29652267
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Q |
| |
|
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| T |
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tactccctccgtcccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgttccaaattatatgtcgctttacaatatcaatgaaacattaatgttatttttct |
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T |
 |
| Q |
289 |
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372 |
Q |
| |
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| T |
29652093 |
tattactattatatccttaactatttattattctttcttttttcaattctttcatttatctttcacatatcatttattaaggacaattt-gtaaaacaac |
29652191 |
T |
 |
| Q |
373 |
tcataatatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatatgtgtgaaatgcccaaaacgtcatacaattt |
448 |
Q |
| |
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| T |
29652192 |
tcataatatttcttttccgtacaatattaattacatttcttaatatgtgtaaaatgcccaaaacatcatacaattt |
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #131
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Target Start/End: Complemental strand, 39144638 - 39144422
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Q |
| |
|
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aaattatatgtcgttttacaataccaatgaaacattaatgttatttttcctattatatcattaactatttattactctctcttatttcaattctttaatt |
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T |
 |
| Q |
340 |
tatctttttcat-----------aggacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatatgtgtgaaatg |
428 |
Q |
| |
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| T |
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tatctttctcatatcacttatcaaggacaattttgtaaaacaactctaaatatctctttctcatacaaaattaattatattttttaatacgtgtgaaatg |
39144439 |
T |
 |
| Q |
429 |
cccaaaacgtcatacaa |
445 |
Q |
| |
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| T |
39144438 |
cccaaaacctcatacaa |
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #132
Raw Score: 101; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 233 - 448
Target Start/End: Original strand, 38808130 - 38808356
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Q |
| |
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ttgtcccaaattatatgtcgttttacaataccaatgaaatattaatgttatttttcctattatatccttaactattaatcactctctcttctttcaatta |
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T |
 |
| Q |
333 |
ttttatttatctttttcat-----------aggacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatatgtg |
421 |
Q |
| |
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| T |
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tttcatttatcttttccataccatttattaaggataattttgtaaaataactaataatttttcttccccacacaatattaattatatttcttaatacgtg |
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T |
 |
| Q |
422 |
tgaaatgcccaaaacgtcatacaattt |
448 |
Q |
| |
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| T |
38808330 |
tgaaatgaccaaaacgtcatgcaattt |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #133
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Query Start/End: Original strand, 231 - 405
Target Start/End: Complemental strand, 5137712 - 5137527
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| |
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atttgttccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttatttttcctattatatccttaactatttattactctttcttttttcaat |
5137613 |
T |
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| Q |
331 |
tcttttatttatctttttcat-----------aggacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaatattaatta |
405 |
Q |
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| T |
5137612 |
tctttcatttatctttcccatattatttattaaggataattttgtaaaacaacttataatatctctttcccacacaatattaatta |
5137527 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #134
Raw Score: 100; E-Value: 4e-49
Query Start/End: Original strand, 230 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 16661511 - 16661282
Alignment:
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329 |
Q |
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tatttgtctcaaattgtatgtcactttacaataccaatgaaacatttattttactttttctattatatctttaactatttattaccttttcttcttttaa |
16661412 |
T |
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330 |
gtcttttatttatctttttcata-----------ggacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatat |
418 |
Q |
| |
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| T |
16661411 |
ttctttcatttatttttcccatatcatttattaaggacaattttgtaaaataattcataatatcttttttccacacaatattaattacatttcttaatac |
16661312 |
T |
 |
| Q |
419 |
gtgtgaaatgcccaaaacgtcatacaattt |
448 |
Q |
| |
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| T |
16661311 |
gtttgaaatatccaaaacgtcatacaattt |
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #135
Raw Score: 100; E-Value: 4e-49
Query Start/End: Original strand, 233 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 29517452 - 29517231
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332 |
Q |
| |
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ttgttccaaattatatgtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcctattatatccttaattattaattactctctcttctttcaatta |
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T |
 |
| Q |
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ttttatttatctttttcat-----------aggacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatatgtg |
421 |
Q |
| |
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tttcatttatctttcccataccatttattaaggataattttgtaaaacaacttataatttctcttccccgcacaatattaattacatttcttaatacgtg |
29517253 |
T |
 |
| Q |
422 |
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443 |
Q |
| |
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| T |
29517252 |
tgaaatggccaaaacgtcatac |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #136
Raw Score: 100; E-Value: 4e-49
Query Start/End: Original strand, 233 - 447
Target Start/End: Complemental strand, 46741183 - 46740958
Alignment:
| Q |
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ttgtcccaaattgtatgtcactttacaataccaatgaaacattaatgttatttttcctattataaccttaactatttattactctctcttctttcaagtc |
332 |
Q |
| |
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ttgtcccaaattatatgtcgctttacaatactaatgaaatattaatgttatttttcctattatatccttaactattaattaccctctcttctttcaatta |
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T |
 |
| Q |
333 |
ttttatttatctttttcat-----------aggacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatatgtg |
421 |
Q |
| |
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| T |
46741083 |
tttcatttatctttcccataccatttattaacgataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaatattaattacattttttaatacgtg |
46740984 |
T |
 |
| Q |
422 |
tgaaatgcccaaaacgtcatacaatt |
447 |
Q |
| |
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| T |
46740983 |
tgaaatggccaaaatatcatacaatt |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #137
Raw Score: 99; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 298 - 463
Target Start/End: Complemental strand, 6466507 - 6466331
Alignment:
| Q |
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386 |
Q |
| |
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| T |
6466507 |
ccttaactatttattgctctctcttctttcaattctttcatttatcttttccatatcatttattgaggacaattttgtaaaacaactcataatatctttt |
6466408 |
T |
 |
| Q |
387 |
ttccacacaatattaattacatttcttaatatgtgtgaaatgcccaaaacgtcatacaatttaggatgaagggagta |
463 |
Q |
| |
|
| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||| |
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|
| T |
6466407 |
tcccacacaatattaattatatttcttaatatgtgtgaaatgcccaaaacgtcatacaatttgggacggagggagta |
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #138
Raw Score: 99; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 231 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 48962809 - 48962581
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330 |
Q |
| |
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| T |
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atttgtcataaattatatgtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcctattatatccttcactattaattactctatcttctttcaat |
48962710 |
T |
 |
| Q |
331 |
tcttttatttatctttttcat-----------aggacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatatg |
419 |
Q |
| |
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| ||| ||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |
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| T |
48962709 |
tatttcatttatcttttccatacaatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttatcttccccacacaatattaattacatttcttaatacg |
48962610 |
T |
 |
| Q |
420 |
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448 |
Q |
| |
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| T |
48962609 |
tgtgaaatagccaaaacgtaatacaattt |
48962581 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #139
Raw Score: 98; E-Value: 6e-48
Query Start/End: Original strand, 231 - 463
Target Start/End: Complemental strand, 49780467 - 49780224
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| Q |
231 |
atttgtcccaaattgtatgtcactttacaataccaatgaaacattaatgttatttttcctattataaccttaactatttattactctctcttctttcaag |
330 |
Q |
| |
|
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|
| T |
49780467 |
atttgtcccaaattatatgccgctttacaaaaccaatgaaatattaatgttaattttcctattatattcttaactattaattactccctcttctttcaat |
49780368 |
T |
 |
| Q |
331 |
tcttttatttatctttttcat-----------aggacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatatg |
419 |
Q |
| |
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| ||| ||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |
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| T |
49780367 |
tatttcatttatcttttctataccatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttatcttccccacacaatattaattacatttcttaatacg |
49780268 |
T |
 |
| Q |
420 |
tgtgaaatgcccaaaacgtcatacaatttaggatgaagggagta |
463 |
Q |
| |
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| T |
49780267 |
tgtgaaatagctaaaacgtcatacaatttgggacggagggagta |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #140
Raw Score: 96; E-Value: 9e-47
Query Start/End: Original strand, 240 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 9151415 - 9151191
Alignment:
| Q |
240 |
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339 |
Q |
| |
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||||| ||||||| ||||||||| ||||| ||||| |||| || |||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |
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| T |
9151415 |
aaattatatgtcattttacaatatcaatgcaacatcaatgatacttttactattataatcttagttatttattactctctcttctttcaattctttaatt |
9151316 |
T |
 |
| Q |
340 |
tatctttttcat----------------aggacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatatgtgtg |
423 |
Q |
| |
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|
| T |
9151315 |
tatctttctcatggtgtattatttattaaggacaattttataaaacaactcataatatatcttttccacacaatattaagtgcatttcttaatatgtgtg |
9151216 |
T |
 |
| Q |
424 |
aaatgcccaaaacgtcatacaattt |
448 |
Q |
| |
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||||||||||||||||||| ||||| |
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|
| T |
9151215 |
aaatgcccaaaacgtcatataattt |
9151191 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #141
Raw Score: 95; E-Value: 4e-46
Query Start/End: Original strand, 190 - 463
Target Start/End: Original strand, 8724279 - 8724563
Alignment:
| Q |
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289 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||| |||| | |
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|
| T |
8724279 |
tactccctccgtcccaaattgtatgtcgttttggaaaaaaaatttgtcccaaattatatgtcgctttacaataccaatgaaatatttatgttactttttc |
8724378 |
T |
 |
| Q |
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tattataaccttaactatttattactctctcttctttcaagtcttttatttatctttttcata-----------ggacaattttgtaaaacaactcataa |
378 |
Q |
| |
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| T |
8724379 |
tattatatccttaactattaattactctctcttctttcaattatttcatttatcttttccataccatttattagggataattttataaaataactcataa |
8724478 |
T |
 |
| Q |
379 |
tatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatatgtgtgaaatgcccaaaacgtcatacaatttaggatgaagggagta |
463 |
Q |
| |
|
| | |||| |||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||| ||| | |||||||| |
|
|
| T |
8724479 |
tttatcttccccacgcaatattaattatatttcttaatacgtgtgaaatggtcaaaacgtcttacaatttgggacggagggagta |
8724563 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #142
Raw Score: 95; E-Value: 4e-46
Query Start/End: Original strand, 190 - 463
Target Start/End: Original strand, 9076166 - 9076450
Alignment:
| Q |
190 |
tactccatccgtcctaaattgtatgtcattttnnnnnnnntatttgtcccaaattgtatgtcactttacaataccaatgaaacattaatgttatttttcc |
289 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||| |||| | |
|
|
| T |
9076166 |
tactccctccgtcccaaattgtatgtcgttttggaaaaaaaatttgtcccaaattatatgtcgctttacaataccaatgaaatatttatgttactttttc |
9076265 |
T |
 |
| Q |
290 |
tattataaccttaactatttattactctctcttctttcaagtcttttatttatctttttcata-----------ggacaattttgtaaaacaactcataa |
378 |
Q |
| |
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||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||| |||| ||| |||||| ||||| ||||||||| |
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|
| T |
9076266 |
tattatatccttaactattaattactctctcttctttcaattatttcatttatcttttccataccatttattagggataattttataaaataactcataa |
9076365 |
T |
 |
| Q |
379 |
tatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatatgtgtgaaatgcccaaaacgtcatacaatttaggatgaagggagta |
463 |
Q |
| |
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| | |||| |||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||| ||| | |||||||| |
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|
| T |
9076366 |
tttatcttccccacgcaatattaattatatttcttaatacgtgtgaaatggtcaaaacgtcttacaatttgggacggagggagta |
9076450 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #143
Raw Score: 93; E-Value: 6e-45
Query Start/End: Original strand, 254 - 461
Target Start/End: Complemental strand, 8333659 - 8333441
Alignment:
| Q |
254 |
tttacaataccaatgaaacattaatgttatttttcctattataaccttaactatttattactctctcttctttcaagtcttttatttatctttttcata- |
352 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||| ||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||| ||| |||| |
|
|
| T |
8333659 |
tttacaatactaatgcaacattaatattactttttctattataaccttaactatttattactctctcttcttttaattctttcatttatttttcccatat |
8333560 |
T |
 |
| Q |
353 |
----------ggacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatatgtgtgaaatgcccaaaacgtcata |
442 |
Q |
| |
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| T |
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8333460 |
T |
 |
| Q |
443 |
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461 |
Q |
| |
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| T |
8333459 |
caatataggacgaatggag |
8333441 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #144
Raw Score: 93; E-Value: 6e-45
Query Start/End: Original strand, 276 - 463
Target Start/End: Original strand, 14780979 - 14781177
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276 |
aatgttatttttcctattataaccttaactatttattactctctcttctttcaagtcttttatttatctttttcata-----------ggacaattttgt |
364 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||| |||| ||| |||||||| |
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| T |
14780979 |
aatgttacttttcctattatatctttaactattaattactctctcttctttcaattatttcatttatcttttccataccatttattaaggataattttgt |
14781078 |
T |
 |
| Q |
365 |
aaaacaactcataatatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatatgtgtgaaatgcccaaaacgtcatacaatttaggatgaagggagta |
463 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
14781079 |
aaaacaactcataatttctcttccccacacaatattaattacatttcttaatatgtgtgaaatggtcaaaacgtcatacaatttgggacggagggagta |
14781177 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #145
Raw Score: 93; E-Value: 6e-45
Query Start/End: Original strand, 233 - 448
Target Start/End: Original strand, 32758511 - 32758737
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| Q |
233 |
ttgtcccaaattgtatgtcactttacaataccaatgaaacattaatgttatttttcctattataaccttaactatttattactctctcttctttcaagtc |
332 |
Q |
| |
|
|||| ||||||| |||||| |||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||| | ||||||||| || |
|
|
| T |
32758511 |
ttgttccaaattatatgtcgctttacaatatcaatgaaatattaatgttacttttcctattatatcattaactatttattactctttattctttcaattc |
32758610 |
T |
 |
| Q |
333 |
ttttatttatctttttcat-----------aggacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatatgtg |
421 |
Q |
| |
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| T |
32758611 |
atttatttatctttctaatatcatttattaaagataattttgtaaaacaactcataatatctctttcccacataatattaattacatttcttaataagtg |
32758710 |
T |
 |
| Q |
422 |
tgaaatgcccaaaacgtcatacaattt |
448 |
Q |
| |
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| T |
32758711 |
tgaaatatccaaaatatcataaaattt |
32758737 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #146
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 231 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 390769 - 390540
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| Q |
231 |
atttgtcccaaattgtatgtcactttacaatacc-aatgaaacattaatgttatttttcctattataaccttaactatttattactctctcttctttcaa |
329 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||||||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||| |||| |||||||| |||| |||||||||| ||||| ||||||| |
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|
| T |
390769 |
atttgttccaaattgtatgtcgctttacaatacccaatgaatcattaatgttactttttctattatatccttcactatttattgtcttctctactttcaa |
390670 |
T |
 |
| Q |
330 |
gtcttttatttatctttttcatag-----------gacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatat |
418 |
Q |
| |
|
||| || |||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |
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|
| T |
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gtcattcatttatctttcacatatcatttattaaagacaattttataaaacaactcataatatctcttctccacacaaaattaattacatttcttaatac |
390570 |
T |
 |
| Q |
419 |
gtgtgaaatgcccaaaacgtcatacaattt |
448 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||| ||| ||||| |
|
|
| T |
390569 |
gtgtgaaatgcccaaaacgttatataattt |
390540 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #147
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 352 - 463
Target Start/End: Original strand, 3835388 - 3835499
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451 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
3835388 |
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3835487 |
T |
 |
| Q |
452 |
atgaagggagta |
463 |
Q |
| |
|
| | |||||||| |
|
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| T |
3835488 |
acggagggagta |
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T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #148
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 352 - 463
Target Start/End: Complemental strand, 45674228 - 45674117
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| Q |
352 |
aggacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatatgtgtgaaatgcccaaaacgtcatacaatttagg |
451 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
45674228 |
aggacaattttgtaaaacaacttataatatctctttcccacacaatattaattacatttcttaatatgtgtgaaatgcccaaaacgtcatacaatttggg |
45674129 |
T |
 |
| Q |
452 |
atgaagggagta |
463 |
Q |
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|
| T |
45674128 |
acggagggagta |
45674117 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #149
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 233 - 463
Target Start/End: Original strand, 49102476 - 49102717
Alignment:
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233 |
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332 |
Q |
| |
|
|||||||||||| ||| || ||||||||| |||||||| |||||||||| |||| |||||||| ||||||||||| |||||||| |||| |||||| | |
|
|
| T |
49102476 |
ttgtcccaaattatatatcgttttacaatatcaatgaaatattaatgttactttttctattatatccttaactattaattactctatcttttttcaatta |
49102575 |
T |
 |
| Q |
333 |
ttttatttatctttttcat-----------aggacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatatgtg |
421 |
Q |
| |
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||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||| | ||| ||||||||||||||||||||||| || |
|
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| T |
49102576 |
tttcatttatctttttcataccatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccctacataatattaattacatttcttaataggta |
49102675 |
T |
 |
| Q |
422 |
tgaaatgcccaaaacgtcatacaatttaggatgaagggagta |
463 |
Q |
| |
|
||||||| |||||||||||||||||| ||| | |||||||| |
|
|
| T |
49102676 |
tgaaatggtcaaaacgtcatacaatttgggacggagggagta |
49102717 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #150
Raw Score: 90; E-Value: 4e-43
Query Start/End: Original strand, 232 - 450
Target Start/End: Original strand, 4756351 - 4756579
Alignment:
| Q |
232 |
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331 |
Q |
| |
|
|||||| |||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||| | |
|
|
| T |
4756351 |
tttgtctcaaattatatgtcgctttaagataccaatgaaacattaatattatttttcctattatatccttaactatttattactctttcttttttcaatt |
4756450 |
T |
 |
| Q |
332 |
cttttatttatctttttcat----------aggacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatatgtg |
421 |
Q |
| |
|
|||| ||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||| || || | |||||||||||||||||||| || |
|
|
| T |
4756451 |
ctttaatttatcttttcaatttatttaataaggacaattttgtaaaataactcgtaatatctttttttcatactaaattaattacatttcttaatacatg |
4756550 |
T |
 |
| Q |
422 |
tgaaatgcccaaaacgtcatacaatttag |
450 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
4756551 |
tgaaattgtcaaaacgtcatataatttag |
4756579 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #151
Raw Score: 90; E-Value: 4e-43
Query Start/End: Original strand, 238 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 18019683 - 18019471
Alignment:
| Q |
238 |
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337 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||||||||||||||| || |||||| ||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| || ||||| | | || |
|
|
| T |
18019683 |
ccaaattgtatgtcgctttacaataccaatgcaaaattaattttacttttcctattacaaccttaaccatttattactctctattttttcatttatcttt |
18019584 |
T |
 |
| Q |
338 |
tttatctttttcat--aggacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatatgtgtgaaatgcccaaaa |
435 |
Q |
| |
|
|| || || || ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
18019583 |
cccatattatttattaaggacaattttgttaaataactcataatatctcttttccacacaatattaattgcatttttcaatatgtgtaaaatgcccaaag |
18019484 |
T |
 |
| Q |
436 |
cgtcatacaattt |
448 |
Q |
| |
|
|||| |||||||| |
|
|
| T |
18019483 |
cgtcgtacaattt |
18019471 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #152
Raw Score: 90; E-Value: 4e-43
Query Start/End: Original strand, 231 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 51380265 - 51380045
Alignment:
| Q |
231 |
atttgtcccaaattgtatgtcactttacaataccaatgaaacattaatgttatttttcctattataaccttaactatttattactctctcttctttcaag |
330 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||| |||||||||| |||| |||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
51380265 |
atttgtcccaaattatatgtcgctttacaata----tgaaatattaatgttactttttctattatatccttgactattaattactctctcttctttcaat |
51380170 |
T |
 |
| Q |
331 |
tcttttatttatctttttcata-----------ggacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatatg |
419 |
Q |
| |
|
| ||| |||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| | |
|
|
| T |
51380169 |
tatttcatttatctttcccataccatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaatattaattatatttcttaatacg |
51380070 |
T |
 |
| Q |
420 |
tgtgaaatgcccaaaacgtcataca |
444 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
51380069 |
tgtgaaatggccaaaacgtcataca |
51380045 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #153
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 273 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 9783238 - 9783052
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| Q |
273 |
attaatgttatttttcctattataaccttaactatttattactctctcttctttcaagtcttttatttatctttttcata-----------ggacaattt |
361 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| || || |||||||||| |||| | ||||||| |
|
|
| T |
9783238 |
attaatgttacttttcctaatatatccttaactatttattattctctcttctttcaattccttcctttatcttttccatatcatttattgagaacaattt |
9783139 |
T |
 |
| Q |
362 |
tgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatatgtgtgaaatgcccaaaacgtcatacaattt |
448 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
9783138 |
tgtaaaacaactcataatatctctttcccgcacaatattagttacatttcttaatatgtgtgaaatacccaagacgtcatacaattt |
9783052 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #154
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 354 - 466
Target Start/End: Complemental strand, 21815893 - 21815781
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| Q |
354 |
gacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatatgtgtgaaatgcccaaaacgtcatacaatttaggat |
453 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
21815893 |
gacaattttgtaaaacaactcataatatctctttcccacacaatattaattatatttcttaatatgtgtgaaatgccaaaaatatcatacaatttaggat |
21815794 |
T |
 |
| Q |
454 |
gaagggagtaatt |
466 |
Q |
| |
|
| ||||||||||| |
|
|
| T |
21815793 |
ggagggagtaatt |
21815781 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #155
Raw Score: 88; E-Value: 6e-42
Query Start/End: Original strand, 233 - 463
Target Start/End: Original strand, 31170427 - 31170668
Alignment:
| Q |
233 |
ttgtcccaaattgtatgtcactttacaataccaatgaaacattaatgttatttttcctattataaccttaactatttattactctctcttctttcaagtc |
332 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||| | |||||||| | ||||| ||| |||||| |
|
|
| T |
31170427 |
ttgtcccaaattgtatgtcgctttacaataccaatgaatcattaatgttacttttcctattatatccttcattatttattgccttctctacttccaagtc |
31170526 |
T |
 |
| Q |
333 |
ttttatttatctttttcat-----------aggacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatatgtg |
421 |
Q |
| |
|
|| |||||| ||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||| || ||||||||||| ||| |
|
|
| T |
31170527 |
attcatttatttttctcatattatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatatatctttcccacacaaaattaagtatatttcttaatacgtg |
31170626 |
T |
 |
| Q |
422 |
tgaaatgcccaaaacgtcatacaatttaggatgaagggagta |
463 |
Q |
| |
|
| ||||| | ||||||||||| ||||| ||| ||||| |||| |
|
|
| T |
31170627 |
ttaaatgtctaaaacgtcatataatttgggacgaaggaagta |
31170668 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #156
Raw Score: 86; E-Value: 9e-41
Query Start/End: Original strand, 240 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 31171621 - 31171402
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| Q |
240 |
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339 |
Q |
| |
|
||||| |||||| ||||||||| |||||||| |||||||||| |||| |||||||| | ||||||||| |||||||| ||||||||||| | ||| ||| |
|
|
| T |
31171621 |
aaattatatgtcgttttacaatatcaatgaaatattaatgttactttttctattatatcattaactattaattactctatcttctttcaattatttcatt |
31171522 |
T |
 |
| Q |
340 |
tatctttttcata-----------ggacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatatgtgtgaaatg |
428 |
Q |
| |
|
|||||||| |||| ||| ||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
31171521 |
tatcttttccatactatttattaaggataattttgtaaaacaactaataatttctcttccccacacaatattaattacatttcttaatacgtgtgaaatt |
31171422 |
T |
 |
| Q |
429 |
cccaaaacgtcatacaattt |
448 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
31171421 |
gccaaaacgtcttacaattt |
31171402 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #157
Raw Score: 86; E-Value: 9e-41
Query Start/End: Original strand, 197 - 346
Target Start/End: Original strand, 42490048 - 42490197
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| Q |
197 |
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296 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |
|
|
| T |
42490048 |
tccgtcccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcttattata |
42490147 |
T |
 |
| Q |
297 |
accttaactatttattactctctcttctttcaagtcttttatttatcttt |
346 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||| |||||||||| |
|
|
| T |
42490148 |
tccttaactatttattactctttcttttttcaattctttcatttatcttt |
42490197 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #158
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 233 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 7674145 - 7673919
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| Q |
233 |
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332 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||||| || ||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||| | || |||||||||| ||||| ||| |||||| |
|
|
| T |
7674145 |
ttgtcctaaattgtatttcgttttacaatatcaatgaatcattaatgttgcttttcctattatatcattcactatttattgtcttctctacttccaagtc |
7674046 |
T |
 |
| Q |
333 |
ttttatttatctttttcatag-----------gacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatatgtg |
421 |
Q |
| |
|
|| |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||| |
|
|
| T |
7674045 |
attcatttatctttctcatattatttattaaagacaattttgtaaaacaactcataatatctatttcccacacaaaattaattacatttcttaatacgtg |
7673946 |
T |
 |
| Q |
422 |
tgaaatgcccaaaacgtcatacaattt |
448 |
Q |
| |
|
|||||||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
7673945 |
tgaaatgctcaaaacgtcatacaattt |
7673919 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #159
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 352 - 448
Target Start/End: Original strand, 42490469 - 42490565
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| Q |
352 |
aggacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatatgtgtgaaatgcccaaaacgtcatacaattt |
448 |
Q |
| |
|
|||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
42490469 |
aggataattttgtaaaacgactcataatatctctttcccacacaatattaattacatttcttaatatgtgtgaaatgcccaaaacgtcatacaattt |
42490565 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #160
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 233 - 453
Target Start/End: Complemental strand, 3429083 - 3428853
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| Q |
233 |
ttgtcccaaattgtatgtcactttacaataccaatgaaacattaatgttatttttcctattataaccttaactatttattactctctcttctttcaagtc |
332 |
Q |
| |
|
||||| |||||| | |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||| || |
|
|
| T |
3429083 |
ttgtctcaaattatttgtcgttttacaataccaatgaagtattaatgttatttttcttattatatcct-aattatttattactctctcttctttcaattc |
3428985 |
T |
 |
| Q |
333 |
ttttatttatctttttcat-----------aggacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatatgtg |
421 |
Q |
| |
|
||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||| |||||||| |||| |||||| ||| |
|
|
| T |
3428984 |
tttaatttatcattttcataccatttattaaggacaattttgtaaaacaacttataatatctctttctcatgcaaaattaattaaatttattaatacgtg |
3428885 |
T |
 |
| Q |
422 |
tgaaatgcccaaaacgtcatacaatttaggat |
453 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| ||||| ||||| |||| |
|
|
| T |
3428884 |
tgaaatgcccaaaatatcatataatttgggat |
3428853 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #161
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 352 - 465
Target Start/End: Complemental strand, 40164151 - 40164039
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| Q |
352 |
aggacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatatgtgtgaaatgcccaaaacgtcatacaatttagg |
451 |
Q |
| |
|
|||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||| || |
|
|
| T |
40164151 |
aggataattttgtaaaacaactcataatatctctttttcacacaatattaattacatttcttaatatgtgtgaaatggcaaaaacatcatacaattt-gg |
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T |
 |
| Q |
452 |
atgaagggagtaat |
465 |
Q |
| |
|
| |||||||||||| |
|
|
| T |
40164052 |
acgaagggagtaat |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #162
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Query Start/End: Original strand, 230 - 346
Target Start/End: Original strand, 23781944 - 23782060
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| Q |
230 |
tatttgtcccaaattgtatgtcactttacaataccaatgaaacattaatgttatttttcctattataaccttaactatttattactctctcttctttcaa |
329 |
Q |
| |
|
||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
23781944 |
tatttgtcccagattgtatgtcgctttacaataccaatgaaaaattaattttatttttcctattatatctttaactatttattactctatcttctttcaa |
23782043 |
T |
 |
| Q |
330 |
gtcttttatttatcttt |
346 |
Q |
| |
|
|| ||||||||||||| |
|
|
| T |
23782044 |
ttcctttatttatcttt |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #163
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Query Start/End: Original strand, 275 - 463
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taatgttatttttcctattataaccttaactatttattactctctcttctttcaagtcttttatttatctttttcata---------------ggacaat |
359 |
Q |
| |
|
||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| | ||| |||||||||| ||||| ||| ||| |
|
|
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T |
 |
| Q |
360 |
tttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatatgtgtgaaatgcccaaaacgtcatacaatttaggatgaaggg |
459 |
Q |
| |
|
|||| |||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||| |||| || | |||| |
|
|
| T |
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tttgaaaaacaactcataatatctctttttcagataatattaattacatttcttaatatgtgtgaaatgtccaaaacatcgtacagtttaagacggaggg |
40500842 |
T |
 |
| Q |
460 |
agta |
463 |
Q |
| |
|
|||| |
|
|
| T |
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agta |
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #164
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 352 - 448
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352 |
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448 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
23782360 |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #165
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 352 - 448
Target Start/End: Original strand, 35846986 - 35847082
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Q |
| |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #166
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Target Start/End: Complemental strand, 47916053 - 47915834
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339 |
Q |
| |
|
||||| |||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||| ||| |
|
|
| T |
47916053 |
aaattatatgtcgttttataataccaatgaaatattaatgttattttttctattatatccttaactatttattactctcttttctttcaattatttaatt |
47915954 |
T |
 |
| Q |
340 |
tatctttttcat-----------aggacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatatgtgtgaaatg |
428 |
Q |
| |
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||||||| |||| |||| |||||| |||||||||| ||||||| | |||| ||||||| |||||||| |||||| ||||| |||||||| |
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| T |
47915953 |
tatctttctcatacaatttattaaggataattttataaaacaactaataatatatatttttcacacaaaattaattatatttctcaatatatgtgaaata |
47915854 |
T |
 |
| Q |
429 |
cccaaaacgtcatacaattt |
448 |
Q |
| |
|
||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
47915853 |
taaaaaacatcatacaattt |
47915834 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #167
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361 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||| | || ||||| |
|
|
| T |
23656314 |
attaatgttacttttcctattataaccataattatttattactctctcttctttcaattctttcatttatctttctcatattatttattaaagataattt |
23656413 |
T |
 |
| Q |
362 |
tgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatatgtgtgaaatgcccaaaacgtcatacaattt |
448 |
Q |
| |
|
||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||| |||||| |||| |||||||||||| |
|
|
| T |
23656414 |
tgtaagacaactcataatatctcttttccacacattattaattgtattttttaatatgtatgaaatatttaaaatgtcatacaattt |
23656500 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #168
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Target Start/End: Original strand, 44976350 - 44976528
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| Q |
239 |
caaattgtatgtcactttacaataccaatgaaacattaatgttatttttcctattataaccttaactatttattactctctcttctttcaagtcttttat |
338 |
Q |
| |
|
|||||| ||||| | |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||| | ||| || |
|
|
| T |
44976350 |
caaattatatgttattttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcctattatatccttaactattaattacattctcttctttcaattatttcat |
44976449 |
T |
 |
| Q |
339 |
ttatctttttcat-----------aggacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaatattaattac |
406 |
Q |
| |
|
||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
44976450 |
ttatcttttccataccatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaatattaattac |
44976528 |
T |
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Target: chr3; HSP #169
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240 |
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339 |
Q |
| |
|
||||| |||||||||||| |||| ||||||| ||||||| ||| | |||||| |||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| ||| |
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|
| T |
48897267 |
aaattatatgtcactttataatattaatgaaa----aatgttaatttgctcattatatccttaactatttattactct-tcatctttcaattctttcatt |
48897173 |
T |
 |
| Q |
340 |
tatctttttcata-----------ggacaattttgtaaaa-caactcataatatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatatgtgtgaaat |
427 |
Q |
| |
|
||||||| ||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| |
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|
| T |
48897172 |
tatctttctcatatcatttattaaggacaatttcgtaaaaacaactcataatatctatttctcacacaatattaattacatttcttaatatgtataaaat |
48897073 |
T |
 |
| Q |
428 |
gcccaaaacgtcatacaatttaggatgaagggagtaa |
464 |
Q |
| |
|
| |||||||||||||||||| ||| | ||||||||| |
|
|
| T |
48897072 |
gttcaaaacgtcatacaatttgggacggagggagtaa |
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T |
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Target: chr3; HSP #170
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360 |
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448 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||| | ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
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tttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaatattaattgcatttcttaataagtgtaaaatgtctaaaacgtcatacaattt |
50106020 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #171
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Query Start/End: Original strand, 233 - 410
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| Q |
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332 |
Q |
| |
|
|||||| ||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||| | |||||||||||||| || |
|
|
| T |
50106292 |
ttgtcctaaattatacgtcactttacaatatcaatgaaacattaatgttattttttctattttatccttaactatttat--cactctcttctttcaattc |
50106195 |
T |
 |
| Q |
333 |
ttttatttatctttttcat-----------aggacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaatattaattacattt |
410 |
Q |
| |
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||| |||||||||| ||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||| |||||||| |||| |
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| T |
50106194 |
tttaatttatctttcccataccatttattaaggataattttgtaaaacaattcataatatctatttcccacacaaaattaattatattt |
50106106 |
T |
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Target: chr3; HSP #172
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331 |
Q |
| |
|
||||| ||||| || ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||| | | || |||||| | |
|
|
| T |
32852205 |
tgtcctaaattataagtcgctttacaataccaatgaaacattaatgttacttttccaattatgcccttaactatttattactctattttttttttcaatt |
32852106 |
T |
 |
| Q |
332 |
cttttatttatctttttcat-----------aggacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatatgt |
420 |
Q |
| |
|
||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||| |||| |||| ||||||||||||||| || |
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| T |
32852105 |
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32852007 |
T |
 |
| Q |
421 |
gtgaaatgcccaaaacgtcatacaattt |
448 |
Q |
| |
|
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|
| T |
32852006 |
gtgaaatggccaaaacatcatataattt |
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T |
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Target: chr3; HSP #173
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| Q |
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338 |
Q |
| |
|
|||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| | |
|
|
| T |
21817575 |
caaattatatgtcgttttaccataccaatgaaacattaatgttatttttcccgttatattcttaactatttattactctctcttccttcaattctttctt |
21817476 |
T |
 |
| Q |
339 |
ttatctttttcat |
351 |
Q |
| |
|
||||||||||||| |
|
|
| T |
21817475 |
ttatctttttcat |
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T |
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Target: chr3; HSP #174
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| Q |
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451 |
Q |
| |
|
|||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||| || |
|
|
| T |
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aggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacataatattaattacatttcttaatacgtgtgaaattgccaaaacgtcgtacaatttggg |
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T |
 |
| Q |
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463 |
Q |
| |
|
| | |||||||| |
|
|
| T |
9795426 |
acggagggagta |
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T |
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| Q |
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332 |
Q |
| |
|
|||||| ||||| |||||| ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| | ||||||||||| || |
|
|
| T |
49384130 |
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T |
 |
| Q |
333 |
ttttatttatctttttcata |
352 |
Q |
| |
|
||| |||||| ||| ||||| |
|
|
| T |
49384230 |
tttcatttatttttctcata |
49384249 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #176
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 355 - 442
Target Start/End: Original strand, 49384545 - 49384632
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| Q |
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442 |
Q |
| |
|
|||||||| |||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
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T |
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330 |
Q |
| |
|
||||||| |||||| ||| ||| ||||||||| || ||||||||||| ||||||||| |||||||| | ||||||| |||||||| | |||||||| | |
|
|
| T |
43190991 |
atttgtctcaaattatatatcattttacaatatcagtgaaacattaacgttattttttctattatatcattaactacttattactttatcttcttttcat |
43190892 |
T |
 |
| Q |
331 |
tcttttatttatctttttcat-----------aggacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatatg |
419 |
Q |
| |
|
||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| ||||||| | ||| ||||| || ||||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
43190891 |
tctttaatttatctttctcataccatttacaaaggacaattttgtaaaacaacttataatatatatttcccacataaacttaattatatttcttaatact |
43190792 |
T |
 |
| Q |
420 |
tgtgaaatgcccaaaacgtcatac |
443 |
Q |
| |
|
|| |||||||| ||||| |||||| |
|
|
| T |
43190791 |
tgggaaatgcctaaaacatcatac |
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T |
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Target: chr3; HSP #178
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Q |
| |
|
|||||||||||||||| ||||||||||||| | || || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
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T |
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Target: chr3; HSP #179
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298 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| ||| ||||||| | ||||| |||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||| | |
|
|
| T |
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cgtcctaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgttctaaattatatgtcgctttacaataccaatgaaaaattaatgttactttttctattatatc |
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T |
 |
| Q |
299 |
cttaactatttattactctctctt |
322 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
3835359 |
cttaactatttattactttctctt |
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T |
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Target: chr3; HSP #180
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338 |
Q |
| |
|
||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||| || ||||| || |
|
|
| T |
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caaattgtatgtcg-tttacaatattaataaaacattaatgttatttttcctatcatatccttaattatttattactctctcttcttttaattctttcat |
27834442 |
T |
 |
| Q |
339 |
ttatct |
344 |
Q |
| |
|
|||||| |
|
|
| T |
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ttatct |
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329 |
Q |
| |
|
||||| |||||| || ||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| | | |||||| ||||||||| |||| |||||| |
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|
| T |
3442861 |
ttgtctcaaattatacgtcgctttacaataccaatgaaaaaatattaatgttatttttcctattatatcatcaactatctattactctatcttatttcaa |
3442762 |
T |
 |
| Q |
330 |
gtcttttatttatcttttt-----cat------aggacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatat |
418 |
Q |
| |
|
|| || |||||||||| | ||| ||||| ||||| ||||||||| |||||||| | ||| ||||||||||||||| ||||||||||| | |
|
|
| T |
3442761 |
ttcattcatttatctttctaacaccatttattaaggaccattttataaaacaacacataatatatttttcccacacaatattaataacatttcttaacgt |
3442662 |
T |
 |
| Q |
419 |
gtgtgaaatgcccaaaacgtcatacaatttagga |
452 |
Q |
| |
|
||| |||||| |||||||| || ||||||||| |
|
|
| T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
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|
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|
|
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
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| |
|
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|
|
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Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| || |||||||| |||| |||||| |||||||| ||||||| |||||||||||| |
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|
| T |
27549896 |
gacaattttgtaaaacaactcataatatctatttttcacataaaattaattatattttttaatacatgtgaaatacccaaaatttcatacaattta |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #185
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| |
|
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|
|
| T |
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aaattatatgtcattttacaatacatataaaacattaatggtattttttctattatagcattaaatacttactactttatcttatttcaattatttaatt |
54769102 |
T |
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340 |
tatctttttcata-----------ggacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatatgtgtgaaatg |
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Q |
| |
|
||||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||| || | ||||||| |||| |||||||| ||||||| || |||||||||| |
|
|
| T |
54769101 |
tatctttcgtataccatttattatggacaattttgtaaaacaactcgtaacattt-ttttccatacaaaattaattatatttctttatgcgtgtgaaatg |
54769003 |
T |
 |
| Q |
429 |
cccaaaacgtcatacaatttaggatgaagggagtaat |
465 |
Q |
| |
|
| ||||||||| || ||||||| ||||| |||||||| |
|
|
| T |
54769002 |
ctcaaaacgtcttataatttagaatgaaaggagtaat |
54768966 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #186
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 352 - 417
Target Start/End: Complemental strand, 14343870 - 14343805
Alignment:
| Q |
352 |
aggacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaatattaattacatttcttaata |
417 |
Q |
| |
|
|||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
14343870 |
aggacaatattgtaaaacaactcataatatctctttttcatacaaaattaattacatttcttaata |
14343805 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #187
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 284 - 427
Target Start/End: Complemental strand, 7554638 - 7554484
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| Q |
284 |
ttttcctattataaccttaactatttattactctctcttctttcaagtcttttatttatctttttcata-----------ggacaattttgtaaaacaac |
372 |
Q |
| |
|
|||| |||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||| || ||||| |||||| ||| ||||| ||| |||| ||||||||||| |
|
|
| T |
7554638 |
tttttctattatactcttaactatttattactttctgttcttttaattctttaatttatttttctcataccatttattaaggataattatgtaaaacaac |
7554539 |
T |
 |
| Q |
373 |
tcataatatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatatgtgtgaaat |
427 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
7554538 |
tcataatatatcttttccatacaaaattaattacatctcttaatatttgtgaaat |
7554484 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #188
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 232 - 442
Target Start/End: Original strand, 42938006 - 42938226
Alignment:
| Q |
232 |
tttgtcccaaattgtatgtcactttacaataccaatgaaacattaatgttatttttcctattataaccttaactatttattactctctcttctttcaagt |
331 |
Q |
| |
|
||||||| ||||| ||||| ||| ||||||| || |||||||||||||||||||| | |||||| | || ||||||| |||||||||| |||||||| | |
|
|
| T |
42938006 |
tttgtcctaaattatatgttgcttcacaatac-aacgaaacattaatgttattttttccattatatcattgactatttgttactctctcatctttcaatt |
42938104 |
T |
 |
| Q |
332 |
cttttatttatctttt------tcat------aggacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatatg |
419 |
Q |
| |
|
|||| ||||| ||||| |||| |||| |||||| ||||||||||||||| |||| ||| |||||| |||||||| |||| |||||| | |
|
|
| T |
42938105 |
ctttcattta-cttttcacatatcatttattaaggataattttataaaacaactcataacatctatttctcacacacgattaattatattttttaatacg |
42938203 |
T |
 |
| Q |
420 |
tgtgaaatgcccaaaacgtcata |
442 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||| ||||| |
|
|
| T |
42938204 |
tgtgaaatgctcaaaacatcata |
42938226 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #189
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 355 - 427
Target Start/End: Complemental strand, 44697258 - 44697186
Alignment:
| Q |
355 |
acaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatatgtgtgaaat |
427 |
Q |
| |
|
||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||| |||| |
|
|
| T |
44697258 |
acaattttgaaaaacaactcataaaatctctttcccacacaaaattaattacatttcttaatacgtgtaaaat |
44697186 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #190
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 239 - 342
Target Start/End: Original strand, 23005742 - 23005845
Alignment:
| Q |
239 |
caaattgtatgtcactttacaataccaatgaaacattaatgttatttttcctattataaccttaactatttattactctctcttctttcaagtcttttat |
338 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||| |||||||||| |||||| |||| || ||| |||||| |||| | | |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| || |
|
|
| T |
23005742 |
caaattatatgtcattttacaatactaatgaagcattgatattacttttccaattacatctttaactattttttactctctcttctttcaattctttcat |
23005841 |
T |
 |
| Q |
339 |
ttat |
342 |
Q |
| |
|
|||| |
|
|
| T |
23005842 |
ttat |
23005845 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #191
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Query Start/End: Original strand, 357 - 463
Target Start/End: Original strand, 4561796 - 4561902
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| Q |
357 |
aattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatatgtgtgaaatgcccaaaacgtcatacaatttaggatgaa |
456 |
Q |
| |
|
||||||||||| ||| ||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||| | | | ||||||| ||||||||||||| ||||| ||| ||| |
|
|
| T |
4561796 |
aattttgtaaatttacttataatttctcttttccatacaacattaattacatttcttattttatatgaaatgaccaaaacgtcataaaatttgggacgaa |
4561895 |
T |
 |
| Q |
457 |
gggagta |
463 |
Q |
| |
|
||||||| |
|
|
| T |
4561896 |
gggagta |
4561902 |
T |
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Target: chr3; HSP #192
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 351 - 452
Target Start/End: Complemental strand, 31229649 - 31229548
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| Q |
351 |
taggacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatatgtgtgaaatgcccaaaacgtcatacaatttag |
450 |
Q |
| |
|
||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||| |||| |||||| |||| |||| ||||||||| || ||||||| |
|
|
| T |
31229649 |
taggataattttgtaaaacaacttataatatctctttctcacacaaaattaattaaatttgttaatacgtgtaaaatattcaaaacgtcgtataatttag |
31229550 |
T |
 |
| Q |
451 |
ga |
452 |
Q |
| |
|
|| |
|
|
| T |
31229549 |
ga |
31229548 |
T |
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Target: chr3; HSP #193
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Query Start/End: Original strand, 232 - 381
Target Start/End: Complemental strand, 35958090 - 35957933
Alignment:
| Q |
232 |
tttgtcccaaattgtatgtcactttacaataccaatgaaacattaatgttatttttcctattataaccttaactatttattactctctcttctttcaagt |
331 |
Q |
| |
|
||||||||||||| || || ||||| |||||| ||| |||||||| || ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||||| | |
|
|
| T |
35958090 |
tttgtcccaaattataagtagctttaaaatacc---gaagcattaatgctacttttcctattatacccttaactatttattactttctcttttttcaatt |
35957994 |
T |
 |
| Q |
332 |
cttttatttatctttttcat-----------aggacaattttgtaaaacaactcataatat |
381 |
Q |
| |
|
||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
35957993 |
ttttattttatctttctcatatcatttattaaggacaattttgtaaaacaactcataatat |
35957933 |
T |
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Target: chr3; HSP #194
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Target Start/End: Original strand, 47895181 - 47895256
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| Q |
240 |
aaattgtatgtcactttacaataccaatgaaacattaatgttatttttcctattataaccttaactatttattact |
315 |
Q |
| |
|
|||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
47895181 |
aaattgtatgtcgttttacaatatcaatgaataattaatgttactttttctattatatccttaactatttattact |
47895256 |
T |
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Target: chr3; HSP #195
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
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Target Start/End: Complemental strand, 30767796 - 30767698
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| Q |
354 |
gacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatatgtgtgaaatgcccaaaacgtcatacaatttagga |
452 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||| ||| || || || ||| || ||||| ||||| ||||||||| |
|
|
| T |
30767796 |
gacaattttgtaaaattactcataatatctctttcctacacaaaattaattacattttttattacgtttggaatacctaaaacatcatataatttagga |
30767698 |
T |
 |
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Target: chr3; HSP #196
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Target Start/End: Complemental strand, 4493414 - 4493353
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| Q |
253 |
ctttacaataccaatgaaacattaatgttatttttcctattataaccttaactatttattac |
314 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||| |
|
|
| T |
4493414 |
ctttacaatattaatgaaacattaatgttacttttcctattatacccttaactatgtattac |
4493353 |
T |
 |
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Target: chr3; HSP #197
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| Q |
233 |
ttgtcccaaattgtatgtcactttacaataccaatgaaacattaatgttatttttcctattata--accttaactatttattactctctcttctttcaag |
330 |
Q |
| |
|
||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| | | || |||||| | | ||||||||||||||||||| |||||||| || |
|
|
| T |
19538457 |
ttgtcacaaattatatgtccatttacaataccaatgaaacattaatgtcactctttctattacaccatcttaactatttattactctttcttcttttaat |
19538556 |
T |
 |
| Q |
331 |
tcttt |
335 |
Q |
| |
|
||||| |
|
|
| T |
19538557 |
tcttt |
19538561 |
T |
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Target: chr3; HSP #198
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| Q |
231 |
atttgtcccaaattgtatgtcactttacaataccaatgaaacattaatgttatttttcctatta---taaccttaactatttattactctctcttctttc |
327 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| || ||| ||||| |||| |||| || ||||||||| | ||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
19562764 |
atttgtcccaaattatacgtctctttaaaatatcaataaagcattaatgtcaattttcctattacaccatccttaactatttattacttactcttctttt |
19562863 |
T |
 |
| Q |
328 |
aagtcttttatttatcttt |
346 |
Q |
| |
|
|| ||||| |||||||||| |
|
|
| T |
19562864 |
aactctttaatttatcttt |
19562882 |
T |
 |
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Target: chr3; HSP #199
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Target Start/End: Complemental strand, 5136979 - 5136925
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| Q |
397 |
tattaattacatttcttaatatgtgtgaaatgcccaaaacgtcatacaatttagga |
452 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
5136979 |
tattaattatatttcttaatatgtgtgaaatgctcaaaacgtcata-aatttagga |
5136925 |
T |
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Target: chr3; HSP #200
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Query Start/End: Original strand, 273 - 352
Target Start/End: Complemental strand, 32151403 - 32151324
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| Q |
273 |
attaatgttatttttcctattataaccttaactatttattactctctcttctttcaagtcttttatttatctttttcata |
352 |
Q |
| |
|
||||||| |||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||| |||| |||| |
|
|
| T |
32151403 |
attaatgacatttttcctattatttcattaactatttattactctttcttctttcaattctttaatttattttttccata |
32151324 |
T |
 |
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Target: chr3; HSP #201
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Target Start/End: Complemental strand, 45637709 - 45637650
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| Q |
389 |
ccacacaatattaattacatttcttaatatgtgtgaaatgcccaaaacgtcatacaattt |
448 |
Q |
| |
|
||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
45637709 |
ccacacaatattatttacatttcttaatacgtgcgaaatggtcaaaacgtcatacaattt |
45637650 |
T |
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Target: chr3; HSP #202
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| Q |
365 |
aaaacaactcataatatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatatgtgtgaaatgcccaaaacgtcatacaattt |
448 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| | ||| |||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||| |||||| ||||| |
|
|
| T |
49615483 |
aaaacaactcataatatctttcttc-acacaaaattaattacattttttaatacgtgtgaaatctccaaaatgtcatataattt |
49615565 |
T |
 |
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| Q |
233 |
ttgtcccaaattgtatgtcactttacaataccaatgaaacattaatgttatttttcctattataa---ccttaactatttattactctctcttctttcaa |
329 |
Q |
| |
|
||||||| |||| || ||| |||||||||| |||| || |||| |||| | ||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||| || |
|
|
| T |
18480074 |
ttgtccctaattatacgtctctttacaatatcaataaagcattcatgtcaattttcctattacacaatccttaactatttattactttctcttcttttaa |
18479975 |
T |
 |
| Q |
330 |
gtcttttatttatcttt |
346 |
Q |
| |
|
||||| |||||||||| |
|
|
| T |
18479974 |
ctctttaatttatcttt |
18479958 |
T |
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Target: chr3; HSP #204
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| Q |
355 |
acaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatatgtgtgaaatgcccaaaac |
436 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| | ||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
9196830 |
acaattttgtaaaacaactcataatatattttttccatttataattaattacatttctaaatacttgtgaaatgtccaaaac |
9196911 |
T |
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237 |
cccaaattgtatgtcactttacaataccaatgaaacattaatgttatttttcctattataaccttaactatttattactctctcttctttcaagtctttt |
336 |
Q |
| |
|
|||||||| || ||| |||||||||| ||||||| |||||| |||| |||| |||||| | ||||||||||||||| |||||| |||||| | |||| |
|
|
| T |
29040469 |
cccaaattatacgtcgctttacaatagcaatgaagcattaacgttacttttt-tattatgtctttaactatttattaccatctcttttttcaattttttt |
29040567 |
T |
 |
| Q |
337 |
atttatcttt |
346 |
Q |
| |
|
|||||||||| |
|
|
| T |
29040568 |
atttatcttt |
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T |
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ttaatatgtgtgaaatgcccaaaacgtcatacaattt |
448 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
4276972 |
ttaatatgtgtgaaatgcccaaaacgtcatacaattt |
4276936 |
T |
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| Q |
356 |
caattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatatgtgtgaaatgcccaaaacgtcatacaattt |
448 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||||| |||||||||| ||| | ||| |||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||| || ||||| |
|
|
| T |
4610858 |
caatttggtaaaacaacacataatatctatttcatatacataattaattatatttcttaatatgtatgaaatgtccaaaacgtcgtataattt |
4610766 |
T |
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253 |
ctttacaataccaatgaaacattaatgttatttttcctattataaccttaactatttattactctctcttctttcaagtctttta |
337 |
Q |
| |
|
||||||||||| ||| || |||||||||||||||| ||| ||| ||||||| ||||| ||||||| ||| |||||| ||||||| |
|
|
| T |
21653252 |
ctttacaatactaataaatcattaatgttattttttttatcatacccttaacgatttaatactctcgcttatttcaattctttta |
21653336 |
T |
 |
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Target: chr3; HSP #209
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265 |
aatgaaacattaatgttatttttcctattataaccttaactatttattactctctcttctttcaagtcttttatttatctttttcat----------agg |
354 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||| | |||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||| |||| || |
|
|
| T |
25134775 |
aatgaagcattaatatgatttttt-tattatatctttaactatttattactctctcttcttttaattctttattttatctttctcatacatttattaaga |
25134677 |
T |
 |
| Q |
355 |
acaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaatattaattacatttcttaata |
417 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||| ||||| ||||| || |||| |||||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
25134676 |
acaattttgtaaaacaactc--aatatttctttctcatacaaaattaattaaatttcttaata |
25134616 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #210
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 256 - 352
Target Start/End: Complemental strand, 30744074 - 30743978
Alignment:
| Q |
256 |
tacaataccaatgaaacattaatgttatttttcctattataaccttaactatttattactctctcttctttcaagtcttttatttatctttttcata |
352 |
Q |
| |
|
||||||| |||||||| |||||| ||| ||||| ||||||| |||| |||||||||||||| | ||||||| | ||||| |||||| ||| ||||| |
|
|
| T |
30744074 |
tacaatatcaatgaaatattaattttacttttcttattatactcttagctatttattactctatattctttcgattctttaatttatttttctcata |
30743978 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #211
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 265 - 317
Target Start/End: Original strand, 49615375 - 49615426
Alignment:
| Q |
265 |
aatgaaacattaatgttatttttcctattataaccttaactatttattactct |
317 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
49615375 |
aatgaaacattaatgttacttt-cctattatatccttaactatttattactct |
49615426 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #212
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 305 - 449
Target Start/End: Original strand, 4540533 - 4540679
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| Q |
305 |
tatttattactctctcttctttcaagtcttttatttatctttttcat--aggacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaatattaa |
402 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| ||||||| || ||||| |||||||||| || || | |||||||||||| ||| ||||| ||| ||| || ||| ||||| |
|
|
| T |
4540533 |
tatttattactctcacttcttttaattctttaatttatctttcctatgaagaataattttgtaaaattacttataatttctttttctcatacatcattaa |
4540632 |
T |
 |
| Q |
403 |
ttacatttcttaatatgtgtgaaatgcccaaaacgtcatacaattta |
449 |
Q |
| |
|
|||||||||||| | ||||||||||| | ||||| ||||| |||||| |
|
|
| T |
4540633 |
ttacatttcttactttgtgtgaaatgacgaaaacatcatataattta |
4540679 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #213
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 236 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 29852164 - 29852106
Alignment:
| Q |
236 |
tcccaaattgtatgtcactttacaataccaatgaaacattaatgttatttttcctatta |
294 |
Q |
| |
|
||||||||| || ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
29852164 |
tcccaaattataagtcgctttacaaatacaatgaaacattaatgttatttttcctatta |
29852106 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #214
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 365 - 439
Target Start/End: Complemental strand, 26367271 - 26367194
Alignment:
| Q |
365 |
aaaacaactcataatatctcttttccacacaatattaattac---atttcttaatatgtgtgaaatgcccaaaacgtc |
439 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
26367271 |
aaaacaactcataatatctctttcatgtacaatattaactacattatttcttaatatgtgtgaaatgttcaaaacgtc |
26367194 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #215
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 233 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 33272869 - 33272814
Alignment:
| Q |
233 |
ttgtcccaaattgtatgtcactttacaataccaatgaaacattaatgttatttttc |
288 |
Q |
| |
|
||||| |||||| || ||||||||| | ||||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
33272869 |
ttgtctcaaattataagtcactttatattaccaataaaacattaatgttatttttc |
33272814 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #216
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 359 - 425
Target Start/End: Original strand, 118818 - 118884
Alignment:
| Q |
359 |
ttttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatatgtgtgaa |
425 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||||||| |||||||| | |||| | ||||| ||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
118818 |
ttttgtaaaataactcataattactcttttctatacaaaaataattccatttcttaatatatgtgaa |
118884 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #217
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 383 - 437
Target Start/End: Complemental strand, 1118838 - 1118784
Alignment:
| Q |
383 |
tcttttccacacaatattaattacatttcttaatatgtgtgaaatgcccaaaacg |
437 |
Q |
| |
|
||||||||| |||| ||||||||||||||||||| | ||||||||| | |||||| |
|
|
| T |
1118838 |
tcttttccatacaaaattaattacatttcttaatttatgtgaaatgtctaaaacg |
1118784 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #218
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 254 - 296
Target Start/End: Original strand, 8176421 - 8176463
Alignment:
| Q |
254 |
tttacaataccaatgaaacattaatgttatttttcctattata |
296 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||| |
|
|
| T |
8176421 |
tttacaatatcaatgaaacattaattttattttttctattata |
8176463 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #219
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 360 - 426
Target Start/End: Complemental strand, 12064850 - 12064784
Alignment:
| Q |
360 |
tttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatatgtgtgaaa |
426 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||||||| | ||||||| | |||| ||||| ||||||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
12064850 |
tttgtaaaatcactcataatttatcttttcaatacaaaattaactacattttttaatatgtgtgaaa |
12064784 |
T |
 |
Back To:
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Target: chr3; HSP #220
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 239 - 352
Target Start/End: Complemental strand, 1214919 - 1214806
Alignment:
| Q |
239 |
caaattgtatgtcactttacaataccaatgaaacattaatgttatttttcctattataaccttaactatttattactctctcttctttcaagtcttttat |
338 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||||||||||||| ||| ||| |||| | ||| |||||||||||| || | ||||||||||||| | |||| || || ||||| || |
|
|
| T |
1214919 |
caaattatatgtcactttacaataacaaggaatcattgacgtttattttcctattatgccccttactatttattactttatctttttcgaattctttaat |
1214820 |
T |
 |
| Q |
339 |
ttatctttttcata |
352 |
Q |
| |
|
|||| |||| |||| |
|
|
| T |
1214819 |
ttatgttttccata |
1214806 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #221
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 402 - 463
Target Start/End: Complemental strand, 4255367 - 4255306
Alignment:
| Q |
402 |
attacatttcttaatatgtgtgaaatgcccaaaacgtcatacaatttaggatgaagggagta |
463 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||| ||||||||||| ||||| |||||| ||||| ||||| |||||||| |
|
|
| T |
4255367 |
attacacttcttaatttgtgtgaaatgatcaaaatgtcatataatttgggatggagggagta |
4255306 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #222
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 233 - 346
Target Start/End: Original strand, 19547157 - 19547270
Alignment:
| Q |
233 |
ttgtcccaaattgtatgtcactttacaataccaatgaaacattaatgttatttttcctattataac--cttaactatttattactctctcttctttcaag |
330 |
Q |
| |
|
|||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||| || |||| | |||| |||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||| || |
|
|
| T |
19547157 |
ttgtcccaaattatatgtatatttacaatatcaatgaagcactaattacactttttctattatatcatcttaactatttatta--ctctcttcttttaat |
19547254 |
T |
 |
| Q |
331 |
tcttttatttatcttt |
346 |
Q |
| |
|
||||| |||||||||| |
|
|
| T |
19547255 |
tctttaatttatcttt |
19547270 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #223
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 352 - 381
Target Start/End: Original strand, 30696526 - 30696555
Alignment:
| Q |
352 |
aggacaattttgtaaaacaactcataatat |
381 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
30696526 |
aggacaattttgtaaaacaactcataatat |
30696555 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #224
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 254 - 287
Target Start/End: Original strand, 33975557 - 33975590
Alignment:
| Q |
254 |
tttacaataccaatgaaacattaatgttattttt |
287 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
33975557 |
tttacaatactaatgaaacattaatgttattttt |
33975590 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #225
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 352 - 417
Target Start/End: Original strand, 50700511 - 50700576
Alignment:
| Q |
352 |
aggacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaatattaattacatttcttaata |
417 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||| |||||||||| ||| | | | || |||||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
50700511 |
aggacaattttgtaaaacaattcataatatcattttacaatataaaattaattatatttcttaata |
50700576 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #226
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 237 - 293
Target Start/End: Original strand, 1384416 - 1384472
Alignment:
| Q |
237 |
cccaaattgtatgtcactttacaataccaatgaaacattaatgttatttttcctatt |
293 |
Q |
| |
|
|||||| | |||||||||| |||||| |||| || ||||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
1384416 |
cccaaagtatatgtcacttgacaataacaattaagcattaatgttacttttcctatt |
1384472 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #227
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 231 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 3349023 - 3348967
Alignment:
| Q |
231 |
atttgtcccaaattgtatgtcactttacaataccaatgaaacattaatgttattttt |
287 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||| || ||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
3349023 |
atttgtcctaaattataagtcgttttacaatatcaatgaaatattaatgttattttt |
3348967 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #228
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 360 - 452
Target Start/End: Complemental strand, 5355470 - 5355378
Alignment:
| Q |
360 |
tttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatatgtgtgaaatgcccaaaacgtcatacaatttagga |
452 |
Q |
| |
|
||||| |||||||||||||||||||||| | | | || |||||||| |||| |||| || | ||||| ||||||||| |||| || |||||| |
|
|
| T |
5355470 |
tttgttaaacaactcataatatctctttgcaatataaaattaattaaattttttaacatataggaaatacccaaaacgccatataagttagga |
5355378 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #229
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 352 - 396
Target Start/End: Original strand, 27834467 - 27834511
Alignment:
| Q |
352 |
aggacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaa |
396 |
Q |
| |
|
|||| |||||||||||||||||||||||||| |||| | |||||| |
|
|
| T |
27834467 |
aggataattttgtaaaacaactcataatatcactttccaacacaa |
27834511 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #230
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 300 - 352
Target Start/End: Complemental strand, 30767861 - 30767809
Alignment:
| Q |
300 |
ttaactatttattactctctcttctttcaagtcttttatttatctttttcata |
352 |
Q |
| |
|
|||| ||||||||||| | ||||||||||| ||||| |||||||||| ||||| |
|
|
| T |
30767861 |
ttaattatttattactttttcttctttcaattctttcatttatctttctcata |
30767809 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #231
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 399 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 49903600 - 49903564
Alignment:
| Q |
399 |
ttaattacatttcttaatatgtgtgaaatgcccaaaa |
435 |
Q |
| |
|
|||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
49903600 |
ttaattacattttttaatacgtgtgaaatgcccaaaa |
49903564 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1 (Bit Score: 189; Significance: 1e-102; HSPs: 252)
Name: chr1
Description:
Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 188 - 448
Target Start/End: Original strand, 4226237 - 4226497
Alignment:
| Q |
188 |
attactccatccgtcctaaattgtatgtcattttnnnnnnnntatttgtcccaaattgtatgtcactttacaataccaatgaaacattaatgttattttt |
287 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
4226237 |
attactccctccgtcccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattatatgtcactttacaatatcaatgaaacattaatgttactttt |
4226336 |
T |
 |
| Q |
288 |
cctattataaccttaactatttattactctctcttctttcaagtcttttatttatctttttcataggacaattttgtaaaacaactcataatatctcttt |
387 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |
|
|
| T |
4226337 |
cctattataaccttaactatttattactctctcttctttcaaatcttttatttatctttctcataggacaattttgtaaaacagctcataatatcttttt |
4226436 |
T |
 |
| Q |
388 |
tccacacaatattaattacatttcttaatatgtgtgaaatgcccaaaacgtcatacaattt |
448 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
4226437 |
tccacacaatattaattacatttcttaatatgtgtgaaatatccaaaacgtcatacaattt |
4226497 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 180; E-Value: 7e-97
Query Start/End: Original strand, 235 - 466
Target Start/End: Original strand, 23827375 - 23827606
Alignment:
| Q |
235 |
gtcccaaattgtatgtcactttacaataccaatgaaacattaatgttatttttcctattataaccttaactatttattactctctcttctttcaagtctt |
334 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
23827375 |
gtcccaaattgtatgtcactttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcctattatatccttaactatttattactctctcttctttcaagtctt |
23827474 |
T |
 |
| Q |
335 |
ttatttatctttttcataggacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatatgtgtgaaatgcccaaa |
434 |
Q |
| |
|
|||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |
|
|
| T |
23827475 |
ttatttatctttcccatatgacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatatgtgtgaaatgcctaaa |
23827574 |
T |
 |
| Q |
435 |
acgtcatacaatttaggatgaagggagtaatt |
466 |
Q |
| |
|
|||| |||||||| ||| ||||||||||| |
|
|
| T |
23827575 |
acgtattacaatttgggacagagggagtaatt |
23827606 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 171; E-Value: 2e-91
Query Start/End: Original strand, 190 - 463
Target Start/End: Complemental strand, 4750481 - 4750197
Alignment:
| Q |
190 |
tactccatccgtcctaaattgtatgtcattttnnnnnnnntatttgtcccaaattgtatgtcactttacaataccaatgaaacattaatgttatttttcc |
289 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
4750481 |
tactccctccgtcccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttacaataccaatgaaacattaatgttacttttcc |
4750382 |
T |
 |
| Q |
290 |
tattataaccttaactatttattactctctcttctttcaagtcttttatttatctttttcat-----------aggacaattttgtaaaacaactcataa |
378 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
4750381 |
tattataaccttaactatttattactctttcttctttcaagtcttttatttatctttcccatattatttattaaggacaattttgtaaaacaactcataa |
4750282 |
T |
 |
| Q |
379 |
tatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatatgtgtgaaatgcccaaaacgtcatacaatttaggatgaagggagta |
463 |
Q |
| |
|
||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||| | |||||||| |
|
|
| T |
4750281 |
tatctcttttccatacaatattaattacatttcttaatatgcgtgaaatgtccaaaacgtcatacaatttgggacggagggagta |
4750197 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 171; E-Value: 2e-91
Query Start/End: Original strand, 230 - 463
Target Start/End: Complemental strand, 15824357 - 15824113
Alignment:
| Q |
230 |
tatttgtcccaaattgtatgtcactttacaataccaatgaaacattaatgttatttttcctattataaccttaactatttattactctctcttctttcaa |
329 |
Q |
| |
|
||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
15824357 |
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15824258 |
T |
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418 |
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T |
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419 |
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463 |
Q |
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| T |
15824157 |
gtgtgaaatgcccaaaacttcatacaatttgggacggagggagta |
15824113 |
T |
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Target Start/End: Complemental strand, 29361525 - 29361241
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Q |
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T |
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| Q |
290 |
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378 |
Q |
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| T |
29361425 |
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T |
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| Q |
379 |
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463 |
Q |
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| T |
29361325 |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 155; E-Value: 6e-82
Query Start/End: Original strand, 230 - 463
Target Start/End: Complemental strand, 44343885 - 44343641
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329 |
Q |
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T |
 |
| Q |
330 |
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418 |
Q |
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| T |
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44343686 |
T |
 |
| Q |
419 |
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463 |
Q |
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| T |
44343685 |
gtgtgaaatgcccaaaacgtcatacaatttgggacggagggagta |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 151; E-Value: 1e-79
Query Start/End: Original strand, 190 - 463
Target Start/End: Original strand, 38816848 - 38817132
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Q |
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T |
 |
| Q |
290 |
tattataaccttaactatttattactctctcttctttcaagtcttttatttatctttttcata-----------ggacaattttgtaaaacaactcataa |
378 |
Q |
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| T |
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tattatatccttaactatttattactctctcttctttcaatttctttatttatctttctcatatcatttattgaggacaattttgtaaaacaactcataa |
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T |
 |
| Q |
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tatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatatgtgtgaaatgcccaaaacgtcatacaatttaggatgaagggagta |
463 |
Q |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #8
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Query Start/End: Original strand, 179 - 463
Target Start/End: Complemental strand, 8712172 - 8711875
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T |
 |
| Q |
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365 |
Q |
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| T |
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T |
 |
| Q |
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463 |
Q |
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| T |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 149; E-Value: 2e-78
Query Start/End: Original strand, 197 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 26541296 - 26541034
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26541197 |
T |
 |
| Q |
297 |
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385 |
Q |
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| T |
26541196 |
tccttaactatttattactctctcttctttcaattccttcatttatctttcccatatcatttattgaggacaattttgtaaaacaactcataatatctct |
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T |
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| Q |
386 |
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ttcccacacaatattaattacatttcttaatatgtgtgaaatgcccaaaacgtcatacaattt |
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Back To:
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Target: chr1; HSP #10
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Query Start/End: Original strand, 233 - 463
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T |
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Q |
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T |
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| Q |
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463 |
Q |
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8330383 |
tgaaatgctcaaaacgtcatacaatttgggacggagggagta |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #11
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| |
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T |
 |
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gtcttttatttatctttttcat-----------aggacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatat |
418 |
Q |
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| T |
25984515 |
ttctttcatttatctttctcatataatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatatctctttcccacacaatattaattacatttcttaatat |
25984614 |
T |
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| Q |
419 |
gtgtgaaatgcccaaaacgtcatacaattt |
448 |
Q |
| |
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| T |
25984615 |
gtgtgaaatgtccaaaacgtcatacaattt |
25984644 |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 148; E-Value: 9e-78
Query Start/End: Original strand, 233 - 463
Target Start/End: Original strand, 31787112 - 31787353
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| Q |
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ttgtcccaaattgtatgtcactttacaataccaatgaaacattaatgttatttttcctattataaccttaactatttattactctctcttctttcaagtc |
332 |
Q |
| |
|
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31787112 |
ttgtcccaaattatatgtcgctttaaaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttaattatttattactctctcttctttcaattc |
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T |
 |
| Q |
333 |
ttttatttatctttttcata-----------ggacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatatgtg |
421 |
Q |
| |
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| T |
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tttcatttatctttcccatattatttattaaggacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaatattaattgcatttcttaatatgtg |
31787311 |
T |
 |
| Q |
422 |
tgaaatgcccaaaacgtcatacaatttaggatgaagggagta |
463 |
Q |
| |
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| T |
31787312 |
tgaaatgcccaaaacgtcatacaatttgggacggagggagta |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 147; E-Value: 3e-77
Query Start/End: Original strand, 190 - 463
Target Start/End: Original strand, 16010916 - 16011200
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|
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T |
 |
| Q |
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tattataaccttaactatttattactctctcttctttcaagtcttttatttatctttttcat-----------aggacaattttgtaaaacaactcataa |
378 |
Q |
| |
|
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| T |
16011016 |
tattatatccttaactatttattactctctcttctttcaattccttcatttatctttcccatatcatttattgaggacaattttgtaaaacaactcataa |
16011115 |
T |
 |
| Q |
379 |
tatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatatgtgtgaaatgcccaaaacgtcatacaatttaggatgaagggagta |
463 |
Q |
| |
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| T |
16011116 |
tatctctttcctacacaatattaattacatttcttaatacgtgtgaaatgccaaaaacgtcgtacaatttgggacggagggagta |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 147; E-Value: 3e-77
Query Start/End: Original strand, 190 - 463
Target Start/End: Complemental strand, 47393663 - 47393379
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Q |
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|
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|
|
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T |
 |
| Q |
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tattataaccttaactatttattactctctcttctttcaagtcttttatttatctttttcat-----------aggacaattttgtaaaacaactcataa |
378 |
Q |
| |
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|
|
| T |
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tattatatccttaactatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccatatcatttattaaacataattttgtaaaacaactcataa |
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T |
 |
| Q |
379 |
tatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatatgtgtgaaatgcccaaaacgtcatacaatttaggatgaagggagta |
463 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
47393463 |
tatctctttcccacacaatattaattacatttcttaatatgtgtgaaatctccaaaacgtcatacaatttgggacggagggagta |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #15
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Query Start/End: Original strand, 190 - 464
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| |
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tactccctccgtcccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattatatgtcgctttacaataccaataaaaaattaatgttatttttcc |
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T |
 |
| Q |
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tattataaccttaactatttattactctctcttctttcaagtcttttattta-tctttttcata-----------ggacaattttgtaaaacaactcata |
377 |
Q |
| |
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| T |
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tattatatccttaactatttattactctctcttcttttaattccttcatttaatctttctcatatcatttattaaggataattttgtaaaacaactcata |
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T |
 |
| Q |
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atatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatatgtgtgaaatgcccaaaacgtcatacaatttaggatgaagggagtaa |
464 |
Q |
| |
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|
| T |
18127534 |
atatctctttcccacacaatattaattacatttcttaatatgtgtgaaatgcccaaaacgtcatacaatttgggacggagggagtaa |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #16
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Query Start/End: Original strand, 197 - 448
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296 |
Q |
| |
|
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|
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34347278 |
tccgtcccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattatatgtcgctttacaataccaatgaaaaattaatattatttttcctattata |
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T |
 |
| Q |
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accttaactatttattactctctcttctttcaagtcttttatttatctttttcata-----------ggacaattttgtaaaacaactcataatatctct |
385 |
Q |
| |
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| T |
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tccttaactatttattactctctcttctttcaattccttcatttatctttcttatatcatttattgaggataattttgtaaaacaactcataatatctct |
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T |
 |
| Q |
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tttccacacaatattaattacatttcttaatatgtgtgaaatgcccaaaacgtcatacaattt |
448 |
Q |
| |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #17
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Query Start/End: Original strand, 190 - 467
Target Start/End: Complemental strand, 6921011 - 6920725
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| |
|
|||||| ||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |
|
|
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6921011 |
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6920912 |
T |
 |
| Q |
290 |
tattataaccttaactatttattactctctcttctttcaagtcttttatttatctttttcata-----------ggacaattttgtaaaacaactcataa |
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Q |
| |
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6920814 |
T |
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| Q |
379 |
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467 |
Q |
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| T |
6920813 |
tatctctttcctacacaatattaattacatttcttaatatgtgtgaaatgcccaaaacgtcatacaatttgggacgaatggagtaattt |
6920725 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #18
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Target Start/End: Original strand, 21362486 - 21362715
Alignment:
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Q |
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T |
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Q |
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T |
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419 |
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Q |
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| T |
21362686 |
gtgtgaaatgcccaaaacgtcatacaattt |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 144; E-Value: 2e-75
Query Start/End: Original strand, 230 - 464
Target Start/End: Complemental strand, 26333525 - 26333280
Alignment:
| Q |
230 |
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329 |
Q |
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T |
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330 |
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418 |
Q |
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T |
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| Q |
419 |
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464 |
Q |
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gtgtgaaatgcccaaaacatcatacaatttgggacggagggagtaa |
26333280 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 143; E-Value: 8e-75
Query Start/End: Original strand, 230 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 16011603 - 16011374
Alignment:
| Q |
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329 |
Q |
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T |
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gtcttttatttatctttt-----tcat------aggacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatat |
418 |
Q |
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16011404 |
T |
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| Q |
419 |
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448 |
Q |
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| T |
16011403 |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 143; E-Value: 8e-75
Query Start/End: Original strand, 230 - 463
Target Start/End: Complemental strand, 31045584 - 31045340
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| Q |
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329 |
Q |
| |
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T |
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| Q |
330 |
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418 |
Q |
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| T |
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31045385 |
T |
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| Q |
419 |
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463 |
Q |
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| T |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 143; E-Value: 8e-75
Query Start/End: Original strand, 230 - 463
Target Start/End: Complemental strand, 31925308 - 31925064
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| Q |
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Q |
| |
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T |
 |
| Q |
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gtcttttatttatctttttcata-----------ggacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatat |
418 |
Q |
| |
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| T |
31925208 |
ttccttcatttatctttcccatatcatttattgaggataattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatat |
31925109 |
T |
 |
| Q |
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463 |
Q |
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| T |
31925108 |
gtgtgaaatgtccaaaacgtcatacaatttaggacggagggagta |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 143; E-Value: 8e-75
Query Start/End: Original strand, 230 - 463
Target Start/End: Complemental strand, 34967572 - 34967328
Alignment:
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230 |
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329 |
Q |
| |
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T |
 |
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gtcttttatttatctttttcata-----------ggacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatat |
418 |
Q |
| |
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| T |
34967472 |
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34967373 |
T |
 |
| Q |
419 |
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463 |
Q |
| |
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| T |
34967372 |
gtgtgaaatgtccaaaacgtcatacaatttgggacggagggagta |
34967328 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 143; E-Value: 8e-75
Query Start/End: Original strand, 190 - 463
Target Start/End: Original strand, 39282532 - 39282816
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T |
 |
| Q |
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tattataaccttaactatttattactctctcttctttcaagtcttttatttatctttttcat-----------aggacaattttgtaaaacaactcataa |
378 |
Q |
| |
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| T |
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tattatatccttaactatttattactgtttcttttttcaaatctttcatttatctttcccatatcatttattaaggataattttgtaaaacaaatcataa |
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T |
 |
| Q |
379 |
tatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatatgtgtgaaatgcccaaaacgtcatacaatttaggatgaagggagta |
463 |
Q |
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| T |
39282732 |
tatctctttcccacacaatattaattacatttcttaatatgtgtgaaatgctcaaaacgtcatacaatttgggacggagggagta |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 143; E-Value: 8e-75
Query Start/End: Original strand, 231 - 468
Target Start/End: Original strand, 42787897 - 42788145
Alignment:
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Q |
| |
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T |
 |
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419 |
Q |
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| T |
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T |
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| Q |
420 |
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468 |
Q |
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| T |
42788097 |
tgtgaaatgcctaaaacatcatacaatttaggacggagggagtacttta |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 142; E-Value: 3e-74
Query Start/End: Original strand, 235 - 463
Target Start/End: Original strand, 32557942 - 32558181
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T |
 |
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ttatttatctttttcata-----------ggacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatatgtgtg |
423 |
Q |
| |
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| |||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |
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tcatttatctttcccatatcatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatatctattttccacacaatattaattacattttttaatatgtgtg |
32558141 |
T |
 |
| Q |
424 |
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463 |
Q |
| |
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| T |
32558142 |
aaatgcccaaaacgtcatacaatttgggacggagggagta |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 141; E-Value: 1e-73
Query Start/End: Original strand, 190 - 448
Target Start/End: Original strand, 24589498 - 24589768
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T |
 |
| Q |
290 |
tattataaccttaactatttattactctctcttctttcaagtcttttatttatctttttcat-----------aggacaattttgtaaaacaactcataa |
378 |
Q |
| |
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| T |
24589598 |
tattatatccttaactatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccatatcatttattaaggataattttgtaaaataactcataa |
24589697 |
T |
 |
| Q |
379 |
tatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatatgtgtg-aaatgcccaaaacgtcatacaattt |
448 |
Q |
| |
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|
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tatctctttcccacacaatattaattacatttcttaatatgtgtgaaaatgcccaaaacgtcatacaattt |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 140; E-Value: 5e-73
Query Start/End: Original strand, 191 - 465
Target Start/End: Complemental strand, 5653768 - 5653483
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|
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T |
 |
| Q |
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attataaccttaactatttattactctctcttctttcaagtcttttatttatctttttcata-----------ggacaattttgtaaaacaactcataat |
379 |
Q |
| |
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| T |
5653668 |
attatatctttaactatttattactctcttttcttttaattttttcatttatctttctcatatcatttattgaggacaattttgtaaaacaactcataat |
5653569 |
T |
 |
| Q |
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atctcttttccacacaatattaattacatttcttaatatgtgtgaaatgcccaaaacgtcatacaatttaggatgaagggagtaat |
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Q |
| |
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| T |
5653568 |
atctctttcccacacaatattaattacatttcttaatatgtgtgaaatgtcaaaaacgtcatacaattttggacggagggggtaat |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 140; E-Value: 5e-73
Query Start/End: Original strand, 190 - 467
Target Start/End: Original strand, 38238866 - 38239152
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| Q |
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289 |
Q |
| |
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|
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38238866 |
tactccctccgtcccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattatatgtcgctttacaataccaatgaaaaattaatattaattttcc |
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T |
 |
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290 |
tattataaccttaactatttattactctctcttctttcaagtcttttatttatctttttcata-----------ggacaattttgtaaaacaactcataa |
378 |
Q |
| |
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| T |
38238966 |
tattatatccttaactatttattactctctc--ctttcaattccttcatttatctttcacatatcatttattgaggataattttgtaaaacaactcataa |
38239063 |
T |
 |
| Q |
379 |
tatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatatgtgtgaaatgcccaaaacgtcatacaatttaggatgaagggagtaattt |
467 |
Q |
| |
|
||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||| |
|
|
| T |
38239064 |
tatctctttcccacacaatattaattacatttcttaatatgtgtgaaatgcccaaaacgtcatacaatttgggacgaaaggagtaattt |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #30
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Query Start/End: Original strand, 230 - 463
Target Start/End: Original strand, 26834868 - 26835112
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| |
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T |
 |
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gtgtgaaatgcccaaaacgtcatacaatttaggatgaagggagta |
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| |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 139; E-Value: 2e-72
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Target Start/End: Original strand, 29672303 - 29672586
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190 |
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29672586 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 139; E-Value: 2e-72
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Target Start/End: Original strand, 48355791 - 48356035
Alignment:
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230 |
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329 |
Q |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 138; E-Value: 8e-72
Query Start/End: Original strand, 231 - 463
Target Start/End: Complemental strand, 43555062 - 43554819
Alignment:
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330 |
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463 |
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43554819 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 138; E-Value: 8e-72
Query Start/End: Original strand, 235 - 463
Target Start/End: Original strand, 49872544 - 49872783
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| T |
49872744 |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 137; E-Value: 3e-71
Query Start/End: Original strand, 188 - 463
Target Start/End: Original strand, 16705292 - 16705578
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| Q |
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Q |
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463 |
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16705578 |
T |
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Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 137; E-Value: 3e-71
Query Start/End: Original strand, 232 - 463
Target Start/End: Original strand, 48747276 - 48747518
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332 |
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420 |
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| T |
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48747475 |
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| T |
48747476 |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 137; E-Value: 3e-71
Query Start/End: Original strand, 197 - 448
Target Start/End: Original strand, 52833606 - 52833868
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Q |
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385 |
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52833805 |
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448 |
Q |
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| T |
52833806 |
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52833868 |
T |
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Back To:
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Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 136; E-Value: 1e-70
Query Start/End: Original strand, 230 - 460
Target Start/End: Complemental strand, 40403938 - 40403697
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230 |
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329 |
Q |
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418 |
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40403739 |
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460 |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 136; E-Value: 1e-70
Query Start/End: Original strand, 230 - 452
Target Start/End: Complemental strand, 42334499 - 42334266
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| Q |
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tatttgtcccaaattgtatgtcactttacaataccaatgaaacattaatgttatttttcctattataaccttaactatttattactctctcttctttcaa |
329 |
Q |
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418 |
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42334300 |
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| T |
42334299 |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 136; E-Value: 1e-70
Query Start/End: Original strand, 205 - 463
Target Start/End: Original strand, 42379206 - 42379475
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aaattgtatgtcattttnnnnnnnntatttgtcccaaattgtatgtcactttacaataccaatgaaacattaatgttatttttcctattataaccttaac |
304 |
Q |
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393 |
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463 |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 135; E-Value: 5e-70
Query Start/End: Original strand, 190 - 463
Target Start/End: Complemental strand, 3552841 - 3552557
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| Q |
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289 |
Q |
| |
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| T |
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tactccctccgtcccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttactttttc |
3552742 |
T |
 |
| Q |
290 |
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378 |
Q |
| |
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| T |
3552741 |
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3552642 |
T |
 |
| Q |
379 |
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463 |
Q |
| |
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| T |
3552641 |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 135; E-Value: 5e-70
Query Start/End: Original strand, 183 - 448
Target Start/End: Original strand, 4227739 - 4228015
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Q |
| |
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4227838 |
T |
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283 |
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4227938 |
T |
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372 |
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448 |
Q |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 135; E-Value: 5e-70
Query Start/End: Original strand, 230 - 448
Target Start/End: Original strand, 8307826 - 8308055
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Q |
| |
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418 |
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419 |
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448 |
Q |
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| T |
8308026 |
gtgtgaaatgcccaaaacgtcatacaattt |
8308055 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 135; E-Value: 5e-70
Query Start/End: Original strand, 230 - 463
Target Start/End: Original strand, 14202972 - 14203216
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tatttgtcccaaattgtatgtcactttacaataccaatgaaacattaatgttatttttcctattataaccttaactatttattactctctcttctttcaa |
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Q |
| |
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| T |
14202972 |
tatttgtcccaaattgtatgtcactttagaatatcaatgaaacattaatgttatttttcctattatatccttaactatttattactctttctttttccaa |
14203071 |
T |
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gtcttttatttatctttttcat-----------aggacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatat |
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| T |
14203072 |
ttctttcatttatctttctcatatcatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatatctctttcccaaacaatattaattatatttcttaatat |
14203171 |
T |
 |
| Q |
419 |
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463 |
Q |
| |
|
|||||| ||||| ||||||||||||||||| ||| | |||||||| |
|
|
| T |
14203172 |
gtgtgagatgcctaaaacgtcatacaatttgggacggagggagta |
14203216 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 134; E-Value: 2e-69
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Target Start/End: Original strand, 2994185 - 2994404
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339 |
Q |
| |
|
|||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| | || ||| |
|
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| T |
2994185 |
aaattgtatgtcgctttacaataccaatgaaaaattaatgttatttttcctattatatccttaactatttattactcactcttctttcaatttattcatt |
2994284 |
T |
 |
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340 |
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428 |
Q |
| |
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2994285 |
tatcttttccatatcatttattgaggacaattttgtaaaccaactcacaatatctctttcccacacaatattaattacatttcttaatatgtgtgaaatg |
2994384 |
T |
 |
| Q |
429 |
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448 |
Q |
| |
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|||||||||||||||||||| |
|
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| T |
2994385 |
cccaaaacgtcatacaattt |
2994404 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 134; E-Value: 2e-69
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Target Start/End: Original strand, 28011108 - 28011351
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231 |
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330 |
Q |
| |
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||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |
|
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28011108 |
atttgtcccaaattgtatgtcgctttacaataccaatgcaactttaatgttacttttcctattataaccttaactacttattactctctcttatttcaat |
28011207 |
T |
 |
| Q |
331 |
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419 |
Q |
| |
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| T |
28011208 |
tctttcatttatttttcccatattatttattacggacaattttgtaaaacaactcataatatcccttttccacacaatattaattgtatttcttaatatg |
28011307 |
T |
 |
| Q |
420 |
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463 |
Q |
| |
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|||||||||||||||||||| |||||||| ||| | |||||||| |
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| T |
28011308 |
tgtgaaatgcccaaaacgtcttacaatttgggacggagggagta |
28011351 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 133; E-Value: 8e-69
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Target Start/End: Complemental strand, 13985552 - 13985266
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Q |
| |
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ttactccatacgtcccaaattgtacgtcactttagaaaaaatatttgtctcaaattatatgttgatttacaataccaatgaaacattaatgttatttttc |
13985453 |
T |
 |
| Q |
289 |
ctattataaccttaact-atttattactctctcttctttcaagtcttttatttatctttttcata-----------ggacaattttgtaaaacaactcat |
376 |
Q |
| |
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13985452 |
ctattatatccttaacttatttattactctctcttctttcaattccttcatttatttttctcatatcatttattaaggacaattttgtaaaacaactcat |
13985353 |
T |
 |
| Q |
377 |
aatatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatatgtgtgaaatgcccaaaacgtcatacaatttaggatgaagggagta |
463 |
Q |
| |
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||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||| |
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|
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13985352 |
aatatctctttcccacacaatattaattacattttttaatatgcgtgaaatgcccaaaacgtcatacaatttgggatggagagagta |
13985266 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 133; E-Value: 8e-69
Query Start/End: Original strand, 233 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 15575102 - 15574876
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| Q |
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332 |
Q |
| |
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15575003 |
T |
 |
| Q |
333 |
ttttatttatctttttcata-----------ggacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatatgtg |
421 |
Q |
| |
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| T |
15575002 |
tttcatttatcttttccatatcatttattaaggacaattttgtaaaacaactcataatatctctttcccacacaatattaattacatttcttaatatgtg |
15574903 |
T |
 |
| Q |
422 |
tgaaatgcccaaaacgtcatacaattt |
448 |
Q |
| |
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| T |
15574902 |
tgaaatgctcaaaacgtcatacaattt |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #49
Raw Score: 132; E-Value: 3e-68
Query Start/End: Original strand, 192 - 447
Target Start/End: Original strand, 42643110 - 42643376
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Q |
| |
|
|||| ||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |
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42643110 |
ctccctccgtcccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcctaaattatatgtcgctttacaataccaatgaaaaattaatgttatttttccta |
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T |
 |
| Q |
292 |
ttataaccttaactatttattactctctcttctttcaagtcttttatttatctt-----tttcat------aggacaattttgtaaaacaactcataata |
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Q |
| |
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ttatatccttaactatttattactctctcttctttcaatttcttcatttatctttcctatatcatttattgaggataattttgtaaaacaactcataata |
42643309 |
T |
 |
| Q |
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tctcttttccacacaatattaattacatttcttaatatgtgtgaaatgcccaaaacgtcatacaatt |
447 |
Q |
| |
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| T |
42643310 |
tctctttcccacacaatattaattatatttcttaatatgtgttaaatgcccaaaacgtcatacaatt |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #50
Raw Score: 132; E-Value: 3e-68
Query Start/End: Original strand, 201 - 463
Target Start/End: Complemental strand, 49980537 - 49980264
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300 |
Q |
| |
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49980537 |
tcctaaattgtatgtcactttagaaaatatatttatcccaaattgtatgtcgctttacaataccaatgaaaaattaatgttatttttcctattatatcct |
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T |
 |
| Q |
301 |
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Q |
| |
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| T |
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taattatttattactctatcttctttcaattccttcatttatctttcccatatcatttattgaggacaattttgtaaaacaactcataatatatttttcc |
49980338 |
T |
 |
| Q |
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463 |
Q |
| |
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|
| T |
49980337 |
cacacaatattaattacatttcttaatatgtgtaaaatgtccaaaacgtcatacaatttgggacggagggagta |
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T |
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Back To:
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Target: chr1; HSP #51
Raw Score: 132; E-Value: 3e-68
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Target Start/End: Original strand, 50942661 - 50942890
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Q |
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|
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|
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T |
 |
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gtcttttatttatctttttcat-----------aggacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatat |
418 |
Q |
| |
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|
| T |
50942761 |
ttctttcatttatttttctcattttatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaatattaattacattttttgatat |
50942860 |
T |
 |
| Q |
419 |
gtgtgaaatgcccaaaacgtcatacaattt |
448 |
Q |
| |
|
|||||||||| | ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
50942861 |
gtgtgaaatgtctaaaacgtcatacaattt |
50942890 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #52
Raw Score: 131; E-Value: 1e-67
Query Start/End: Original strand, 230 - 463
Target Start/End: Complemental strand, 8462522 - 8462278
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| Q |
230 |
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Q |
| |
|
|||||||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
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8462522 |
tatttgtctcaaattatatgtcgttttacaataccaatgaaacattaatgttattttttctattatatccttaactatttattactctctcttctttcaa |
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T |
 |
| Q |
330 |
gtcttttatttatctttttcata-----------ggacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatat |
418 |
Q |
| |
|
|| || |||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
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ttccttcatttattattctcatatcatttattaaggacaattttgtaaaacaactcataatatctctttcccacataatattaattacatttcttaatat |
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T |
 |
| Q |
419 |
gtgtgaaatgcccaaaacgtcatacaatttaggatgaagggagta |
463 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||||||| ||||||||||| ||| | |||||||| |
|
|
| T |
8462322 |
gtgtgaaatgtccaaaacatcatacaatttgggacggagggagta |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #53
Raw Score: 131; E-Value: 1e-67
Query Start/End: Original strand, 230 - 463
Target Start/End: Complemental strand, 13896605 - 13896361
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| Q |
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329 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||| |||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
13896605 |
tatttgtcctaaattatatgtcgttttacaataccattgcaacattaatgttatttttcctattataaccttaactagttattactctttcttctttcaa |
13896506 |
T |
 |
| Q |
330 |
gtcttttatttatctttttcata-----------ggacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatat |
418 |
Q |
| |
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||||| |||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
13896505 |
ttctttcatttatttttctcatattatttattaaggacaattttgtaaaacaacttataatatctctttttcacacaatattaattgcatttcttaatat |
13896406 |
T |
 |
| Q |
419 |
gtgtgaaatgcccaaaacgtcatacaatttaggatgaagggagta |
463 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||| |||||| |
|
|
| T |
13896405 |
gtgtgaaatgtccaaaacgtcatacaatttgggacgaaaggagta |
13896361 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #54
Raw Score: 131; E-Value: 1e-67
Query Start/End: Original strand, 230 - 463
Target Start/End: Complemental strand, 32162452 - 32162209
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| Q |
230 |
tatttgtcccaaattgtatgtcactttacaataccaatgaaacattaatgttatttttcctattataaccttaactatttattactctctcttctttcaa |
329 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
32162452 |
tatttgtctcaaattatatatcgctttacaataccaatgaaaaattaat-ttacttttcctattatatccttaactatttattactctctcttctttcaa |
32162354 |
T |
 |
| Q |
330 |
gtcttttatttatctttttcata-----------ggacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatat |
418 |
Q |
| |
|
|| || |||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
32162353 |
ttccttcatttatctttctcatatcatttattgaggataattttgtaaaacaactcataatatctctttcccacacaatattaattacatttcttaatat |
32162254 |
T |
 |
| Q |
419 |
gtgtgaaatgcccaaaacgtcatacaatttaggatgaagggagta |
463 |
Q |
| |
|
|| ||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||| |
|
|
| T |
32162253 |
gtatgaaatgcccaaaacatcatacaatttaggacggagggagta |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #55
Raw Score: 131; E-Value: 1e-67
Query Start/End: Original strand, 190 - 464
Target Start/End: Original strand, 41529109 - 41529394
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289 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||| ||||||||||||| ||| ||||||| | ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |
|
|
| T |
41529109 |
tactccctccgtcccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgttcgaaattatatgtcgctttacaataccaatgaaacattaatgttattttttc |
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T |
 |
| Q |
290 |
tattataaccttaactatttattactctctcttctttcaagtcttttatttatcttt---------ttcat--aggacaattttgtaaaacaactcataa |
378 |
Q |
| |
|
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| T |
41529209 |
tattatatccttaactatttattactttttcttttttcaattctttcatttatatttcctatatcattcattaaggacaattttgtaaaataactcataa |
41529308 |
T |
 |
| Q |
379 |
tatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatatgtgtgaaatgcccaaaacgtcatacaatttaggatgaagggagtaa |
464 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
41529309 |
tatctctttcccacacaatgttaattacatttcttaatatgtgtgaaatgcccaaaacgtcgtacaatttggaatggagggagtaa |
41529394 |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #56
Raw Score: 131; E-Value: 1e-67
Query Start/End: Original strand, 231 - 448
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330 |
Q |
| |
|
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|
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T |
 |
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331 |
tcttttatttatctttttcat-----------aggacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatatg |
419 |
Q |
| |
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| ||| |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |
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tatttcatttatctttcacatgttatttattaaggacaattttgtaaaacaactcataatattttttttccacacaatattaattgcatttcttaatatg |
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T |
 |
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420 |
tgtgaaatgcccaaaacgtcatacaattt |
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Q |
| |
|
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| T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #57
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332 |
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| |
|
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|
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ttgtcctaaattatatgtcgctttacaatatcaatgcaacattaatgttatttttcctattataactttaactatttattactatctcttctttcaattc |
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T |
 |
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333 |
ttttatttatctttttcat-----------aggacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatatgtg |
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Q |
| |
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|
|
| T |
16128682 |
tttcatttatctttctcatgttatttattaaggacaattttgtaaaacaactcataatat-tttttttcacacaatattaattgcatttcttaatatgtg |
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T |
 |
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tgaaatgcccaaaacgtcatacaatttaggatgaagggagtaat |
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| |
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|||||||| |||||||||||||||||| ||| | |||||||||| |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #58
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T |
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Target: chr1; HSP #59
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Target Start/End: Original strand, 27952649 - 27952891
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T |
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Target: chr1; HSP #60
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Target Start/End: Original strand, 38665054 - 38665327
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T |
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Target: chr1; HSP #61
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Target Start/End: Original strand, 9066361 - 9066590
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Q |
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9066561 |
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T |
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Target: chr1; HSP #62
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Target Start/End: Original strand, 39655395 - 39655639
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #63
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Target Start/End: Original strand, 42728217 - 42728486
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Back To:
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Target: chr1; HSP #64
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Query Start/End: Original strand, 230 - 463
Target Start/End: Original strand, 13352491 - 13352735
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #65
Raw Score: 127; E-Value: 3e-65
Query Start/End: Original strand, 190 - 463
Target Start/End: Complemental strand, 51984041 - 51983754
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463 |
Q |
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51983841 |
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Target: chr1; HSP #66
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Target Start/End: Original strand, 52666854 - 52667094
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Target: chr1; HSP #67
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Query Start/End: Original strand, 231 - 463
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atttgtcccaaattgtatgtcactttacaataccaatgaaacattaatgttatttttcctattataaccttaactatttattactctctcttctttcaag |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #68
Raw Score: 125; E-Value: 5e-64
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Target Start/End: Original strand, 30679272 - 30679542
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377 |
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30679471 |
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448 |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #69
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gtcttttatttatctttttcat---------aggacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatatgt |
420 |
Q |
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| T |
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ttctttcatttatctttctcatattatattaaggacaattttgtaaaacaactcataatattttttttccagacaatattaattgtatttcttaatatgt |
9264827 |
T |
 |
| Q |
421 |
gtgaaatgcccaaaacgtcatacaatttagga |
452 |
Q |
| |
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9264826 |
gtgaaatgtccaaaacgtcatataatctagga |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #70
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Target Start/End: Original strand, 29095254 - 29095531
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T |
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T |
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386 |
tttccacacaatattaattacatttcttaatatgtgtgaaatgcccaaaacgtcatacaatttaggatgaagggagta |
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Q |
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29095454 |
ttcctgcacaatattaattacatttcttaatatgtgtgaaatgctcaaaacgtcatacaatttgggacggagggagta |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #71
Raw Score: 124; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 190 - 448
Target Start/End: Original strand, 32145353 - 32145622
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tactccatccgtcctaaattgtatgtcattttnnnnnnnntatttgtcccaaattgtatgtcactttacaataccaatgaaacattaatgttatttttcc |
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tactccctccgtcccaaattgtatgtcactttggaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcgctttacaataccaataaaaaattaatattacttttcc |
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tattataaccttaactatttattactctctcttctttcaagtcttttatttatctttttcat-----------aggacaattttgtaaaacaactcataa |
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379 |
tatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatatgtgtgaaatgcccaaaacgtcatacaattt |
448 |
Q |
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|||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||| |
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|
| T |
32145553 |
tatcattttcccacacaatattaattacatttcttaataagtgtgaaatgtccaaaacatcatacaattt |
32145622 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #72
Raw Score: 124; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 190 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 42219868 - 42219599
Alignment:
| Q |
190 |
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Q |
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|
|
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tactccctccgtcctaaattgtatgtcgctttggaaaaaaaatttgtcccaaattatatgtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcc |
42219769 |
T |
 |
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378 |
Q |
| |
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| T |
42219768 |
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42219669 |
T |
 |
| Q |
379 |
tatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatatgtgtgaaatgcccaaaacgtcatacaattt |
448 |
Q |
| |
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| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| |
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| T |
42219668 |
tttctcttccccacacaatattaattacatttcttaatacgtgtgaaatggccaaaacgtcatacaattt |
42219599 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #73
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Target Start/End: Original strand, 42709716 - 42709944
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T |
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gtcttttatttatctttttcata-----------ggacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatat |
418 |
Q |
| |
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42709914 |
T |
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| Q |
419 |
gtgtgaaatgcccaaaacgtcatacaattt |
448 |
Q |
| |
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| T |
42709915 |
atgtgaaatgcccaaaacatcatacaattt |
42709944 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #74
Raw Score: 124; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 230 - 464
Target Start/End: Original strand, 51560786 - 51561031
Alignment:
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329 |
Q |
| |
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51560786 |
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T |
 |
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330 |
gtcttttatttatctttttcata-----------ggacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatat |
418 |
Q |
| |
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| T |
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ttcattcatttatctttcccatatcatttattgaggacaattttgtaaaacaactcataatatctatttctcacacaatattaattacatttcttaatat |
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T |
 |
| Q |
419 |
gtgtgaaatgcccaaaacgtcatacaatttaggatgaagggagtaa |
464 |
Q |
| |
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| T |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #75
Raw Score: 123; E-Value: 7e-63
Query Start/End: Original strand, 233 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 12959535 - 12959306
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332 |
Q |
| |
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T |
 |
| Q |
333 |
ttttatttatctttttcata--------------ggacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatat |
418 |
Q |
| |
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| T |
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tttcatttatctttcccatattatttattattaaggacaattttgtaaaataactcataatatctctttttcacacaatattaattgcatttcttaatat |
12959336 |
T |
 |
| Q |
419 |
gtgtgaaatgcccaaaacgtcatacaattt |
448 |
Q |
| |
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| T |
12959335 |
gtgtgaaatacccaaaacgtcatacaattt |
12959306 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #76
Raw Score: 123; E-Value: 7e-63
Query Start/End: Original strand, 239 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 40052379 - 40052159
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338 |
Q |
| |
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caaattatatgtcgctttacaataccaataaaacattaatgttatttttcctattatatctttaactatttattactcttttttctttcaattattttat |
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T |
 |
| Q |
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ttatctttttcata-----------ggacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatatgtgtgaaat |
427 |
Q |
| |
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| T |
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ttatctttcccatatcatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatatttatttcccacacaatattaattacatttcttaatatgtgtgaaat |
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T |
 |
| Q |
428 |
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448 |
Q |
| |
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| T |
40052179 |
gcccaaaacgtcatacaattt |
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #77
Raw Score: 122; E-Value: 3e-62
Query Start/End: Original strand, 230 - 465
Target Start/End: Original strand, 3550028 - 3550275
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329 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| || || |||||||||||||||||||| | || |||||| |
|
|
| T |
3550028 |
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T |
 |
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gtcttttatttatctttttcat-----------aggacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaatatt-aattacatttcttaata |
417 |
Q |
| |
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||||| |||||||||| ||| |||| |||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |
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|
| T |
3550128 |
ttctttcatttatctttcccatatcatttattaaggataattttgtaaaataacttataatatctctttcccacacaatattaaattacatttcttaata |
3550227 |
T |
 |
| Q |
418 |
tgtgtgaaatgcccaaaacgtcatacaatttaggatgaagggagtaat |
465 |
Q |
| |
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||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| | |||||||||| |
|
|
| T |
3550228 |
tgtgtgaaatgtccaaaacgtcatacaatttgggacggagggagtaat |
3550275 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #78
Raw Score: 122; E-Value: 3e-62
Query Start/End: Original strand, 231 - 463
Target Start/End: Original strand, 17180713 - 17180956
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330 |
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|
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|
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T |
 |
| Q |
331 |
tcttttatttatctttttcat-----------aggacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatatg |
419 |
Q |
| |
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|
| T |
17180813 |
tctttcgtttatctttcccatattatttattaagaacaattttgtaaaacaacttataatatctcttttccacacaatattaattgcatttcttaatatg |
17180912 |
T |
 |
| Q |
420 |
tgtgaaatgcccaaaacgtcatacaatttaggatgaagggagta |
463 |
Q |
| |
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|
| T |
17180913 |
tgtgaaatgtctaaaacgttatataatttgggacggagggagta |
17180956 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #79
Raw Score: 122; E-Value: 3e-62
Query Start/End: Original strand, 189 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 22172711 - 22172443
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288 |
Q |
| |
|
||||||| ||| ||| ||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||| |
|
|
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22172711 |
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T |
 |
| Q |
289 |
ctattataaccttaactatttattactctctcttctttcaagtcttttatttatctttttcata-----------ggacaattttgtaaaacaactcata |
377 |
Q |
| |
|
|||||||| |||||||||||||||||| ||| || ||||| ||||| |||| ||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||| |
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|
| T |
22172611 |
ctattatatccttaactatttattactttctttt--ttcaattctttcatttttctttcacatatcatttattaaggataattttgtaaaacaactcata |
22172514 |
T |
 |
| Q |
378 |
atatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatatgtgtgaaatgcccaaaacgtcatacaattt |
448 |
Q |
| |
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|||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
22172513 |
atatctttttcccacacaatattaattacatttcttaatatgtgtgaaatgcccaaaacgtcatacaattt |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #80
Raw Score: 121; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 233 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 35379752 - 35379526
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332 |
Q |
| |
|
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|
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T |
 |
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ttttatttatctttttcata-----------ggacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatatgtg |
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Q |
| |
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|
|
| T |
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tttcatttatcttttccataccatttattagggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaatattaattacatttcttaatacgtg |
35379553 |
T |
 |
| Q |
422 |
tgaaatgcccaaaacgtcatacaattt |
448 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
35379552 |
tgaaatggccaaaacgtcatacaattt |
35379526 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #81
Raw Score: 121; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 233 - 448
Target Start/End: Original strand, 52688181 - 52688407
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332 |
Q |
| |
|
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|
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T |
 |
| Q |
333 |
ttttatttatctttttcat-----------aggacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatatgtg |
421 |
Q |
| |
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|
|
| T |
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tttcatttatcttttccataccatttattaaggataattttgtaaaacagctcataatttctcttccccacacaatattaattacatttcttaatatgtg |
52688380 |
T |
 |
| Q |
422 |
tgaaatgcccaaaacgtcatacaattt |
448 |
Q |
| |
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||||||| ||||||||||||||||||| |
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| T |
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tgaaatggccaaaacgtcatacaattt |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #82
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Query Start/End: Original strand, 233 - 463
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| |
|
|||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| | |
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|
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T |
 |
| Q |
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ttttatttatctttttcat-----------aggacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatatgtg |
421 |
Q |
| |
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||| ||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||| |
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|
| T |
2458631 |
tttcatttatcttttccataccatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaaaattaattacatttcttaatacgtg |
2458730 |
T |
 |
| Q |
422 |
tgaaatgcccaaaacgtcatacaatttaggatgaagggagta |
463 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||||||||||||||| ||| | |||||||| |
|
|
| T |
2458731 |
tgaaatggccaaaacgtcatacaatttgggacggagggagta |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #83
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330 |
Q |
| |
|
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|
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T |
 |
| Q |
331 |
tcttttatttatctttttcata-----------ggacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatatg |
419 |
Q |
| |
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| T |
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tctttcatttatctttcccatattatttattaaggacaattttgtaaaacaactcataatatctattttccacacaatattaattgcatttcttaatatg |
3163413 |
T |
 |
| Q |
420 |
tgtgaaatgcccaaaacgtcatacaatttaggatgaagggagta |
463 |
Q |
| |
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|
| T |
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tgtgaaatgcccaaaacgtcatacaatttgggacggagggagta |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #84
Raw Score: 120; E-Value: 4e-61
Query Start/End: Original strand, 233 - 463
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| |
|
||||| |||||| |||||| ||||| |||| ||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || |
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 |
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ttttatttatctttttcata-----------ggacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatatgtg |
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Q |
| |
|
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|
| T |
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tttcatttatttttcccatattatttattaaggacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaatattaattgtatttcttaatatgtg |
8879004 |
T |
 |
| Q |
422 |
tgaaatgcccaaaacgtcatacaatttaggatgaagggagta |
463 |
Q |
| |
|
|||||||| |||||| ||||||||||| ||| | |||||||| |
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|
| T |
8879005 |
tgaaatgctcaaaacatcatacaatttgggacggagggagta |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #85
Raw Score: 120; E-Value: 4e-61
Query Start/End: Original strand, 230 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 16630095 - 16629886
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| |
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|
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gtcttttatttatctttttcat-----------aggacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatat |
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| T |
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T |
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419 |
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428 |
Q |
| |
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|||||||||| |
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| T |
16629895 |
gtgtgaaatg |
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #86
Raw Score: 120; E-Value: 4e-61
Query Start/End: Original strand, 230 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 49419602 - 49419374
Alignment:
| Q |
230 |
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329 |
Q |
| |
|
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| T |
49419602 |
tatttgtcctaaattatatgtcgctttacaataccaatgaaaaattaatgttacttttcctattatatccttaactatttattgctctctcttctttcaa |
49419503 |
T |
 |
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330 |
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418 |
Q |
| |
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| T |
49419502 |
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49419404 |
T |
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| Q |
419 |
gtgtgaaatgcccaaaacgtcatacaattt |
448 |
Q |
| |
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| T |
49419403 |
gtgtgaaatgtccaaaatatcatacaattt |
49419374 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #87
Raw Score: 119; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 230 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 1037702 - 1037471
Alignment:
| Q |
230 |
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327 |
Q |
| |
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T |
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| Q |
328 |
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416 |
Q |
| |
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| T |
1037602 |
aatttctttatttatctttcccatatcatttattgaggacaattttataaaacaactcataatatctcttttccatattatattaattacatttcttaat |
1037503 |
T |
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| Q |
417 |
atgtgtgaaatgcccaaaacgtcatacaattt |
448 |
Q |
| |
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| T |
1037502 |
atgtgtgaaatgtccaaaacatcatacaattt |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #88
Raw Score: 119; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 230 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 1044608 - 1044377
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230 |
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327 |
Q |
| |
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| T |
1044608 |
tatttgttccaaattgtatgtcgctttacaataccaatgaaaaattaatgttacttttcctattatatccttaactatttattactctctctcttctttc |
1044509 |
T |
 |
| Q |
328 |
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416 |
Q |
| |
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| T |
1044508 |
aatttctttatttatctttcccatatcatttattgaggacaattttataaaacaactcataatatctcttttccatattatattaattacatttcttaat |
1044409 |
T |
 |
| Q |
417 |
atgtgtgaaatgcccaaaacgtcatacaattt |
448 |
Q |
| |
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| T |
1044408 |
atgtgtgaaatgtccaaaacatcatacaattt |
1044377 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #89
Raw Score: 119; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 230 - 463
Target Start/End: Complemental strand, 45467297 - 45467053
Alignment:
| Q |
230 |
tatttgtcccaaattgtatgtcactttacaataccaatgaaacattaatgttatttttcctattataaccttaactatttattactctctcttctttcaa |
329 |
Q |
| |
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| T |
45467297 |
tatttgtcccaaattgtatgttactttacaatatcaatgaaacattaatgctatttttcctattatatccttaattatttattactctttcttctttcaa |
45467198 |
T |
 |
| Q |
330 |
gtcttttatttatctttttcat-----------aggacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatat |
418 |
Q |
| |
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| T |
45467197 |
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45467098 |
T |
 |
| Q |
419 |
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463 |
Q |
| |
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| T |
45467097 |
atgtgaaatgcccaaaacgtcatacaatttgggacggagggagta |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #90
Raw Score: 118; E-Value: 7e-60
Query Start/End: Original strand, 188 - 463
Target Start/End: Original strand, 19010775 - 19011058
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Q |
| |
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| T |
19010775 |
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19010874 |
T |
 |
| Q |
288 |
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376 |
Q |
| |
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| T |
19010875 |
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19010972 |
T |
 |
| Q |
377 |
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463 |
Q |
| |
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| T |
19010973 |
aatatctcattcccacacaatattaattacatttcttaatatgtgtgaaatgctcaaaacgtcata-aatttgggacggagggagta |
19011058 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #91
Raw Score: 118; E-Value: 7e-60
Query Start/End: Original strand, 240 - 448
Target Start/End: Original strand, 35096662 - 35096881
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| Q |
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Q |
| |
|
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35096662 |
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35096761 |
T |
 |
| Q |
340 |
tatctttttcat-----------aggacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatatgtgtgaaatg |
428 |
Q |
| |
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| T |
35096762 |
tatctttcccatataatttattaaggataattttgtaaaacaacttataatatctctttcccacacaatattaattacaattcttaatatgtgtgaaata |
35096861 |
T |
 |
| Q |
429 |
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448 |
Q |
| |
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| T |
35096862 |
cccaaaacgtcattcaattt |
35096881 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #92
Raw Score: 118; E-Value: 7e-60
Query Start/End: Original strand, 233 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 46436521 - 46436294
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332 |
Q |
| |
|
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ttgtcccaaattatatgtcgttttataataccaatgaaatattaatgttatttttcctattatatccttaactattgattactctctcttctttcaatta |
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T |
 |
| Q |
333 |
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420 |
Q |
| |
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| T |
46436421 |
ttttcatttatcttttccataccatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaatattaattatatttcttaatatgt |
46436322 |
T |
 |
| Q |
421 |
gtgaaatgcccaaaacgtcatacaattt |
448 |
Q |
| |
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| T |
46436321 |
gtgaaatggccaaaacgtcatacaattt |
46436294 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #93
Raw Score: 117; E-Value: 3e-59
Query Start/End: Original strand, 233 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 6540702 - 6540476
Alignment:
| Q |
233 |
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332 |
Q |
| |
|
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| T |
6540702 |
ttgtcccaaattatatgtcgctttacaatatcaatgaaatattaatgttatttttcctattatatccttaactattaattactccctcttctttcaattg |
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T |
 |
| Q |
333 |
ttttatttatctttttcat-----------aggacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatatgtg |
421 |
Q |
| |
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| T |
6540602 |
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6540503 |
T |
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| Q |
422 |
tgaaatgcccaaaacgtcatacaattt |
448 |
Q |
| |
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|
| T |
6540502 |
tgaaatgatcaaaacgtcatacaattt |
6540476 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #94
Raw Score: 117; E-Value: 3e-59
Query Start/End: Original strand, 231 - 463
Target Start/End: Original strand, 10085752 - 10085995
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Q |
| |
|
||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| || |||| |
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|
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T |
 |
| Q |
331 |
tcttttatttatctttt-----tcat------aggacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatatg |
419 |
Q |
| |
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|
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| T |
10085852 |
tcattcatttattttttcaatgtcatttattaaatacaattttgtaaaataactcataatatctctttcccacacaaaattaattacatttcttaatacg |
10085951 |
T |
 |
| Q |
420 |
tgtgaaatgcccaaaacgtcatacaatttaggatgaagggagta |
463 |
Q |
| |
|
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|
| T |
10085952 |
tgtgaaatgcccaaaacgtcatacaatttgggacggagggagta |
10085995 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #95
Raw Score: 117; E-Value: 3e-59
Query Start/End: Original strand, 234 - 461
Target Start/End: Original strand, 12966942 - 12967180
Alignment:
| Q |
234 |
tgtcccaaattgtatgtcactttacaataccaatgaaacattaatgttatttttcctattataaccttaactatttattactctctcttctttcaagtct |
333 |
Q |
| |
|
|||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||| | ||||||||||| ||| |
|
|
| T |
12966942 |
tgtctcaaattgtatgtcactttacaatatcaatgaaatattaatgttacttttcctattatatctttaactatttattactttttcttctttcaattct |
12967041 |
T |
 |
| Q |
334 |
tttatttatctttttcata-----------ggacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatatgtgt |
422 |
Q |
| |
|
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| T |
12967042 |
ttcatttatctttcccatatcatttattaaggacaattttgtaaaacaactcataatatctatttcccacataatattaattatatttcttgatatatgt |
12967141 |
T |
 |
| Q |
423 |
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461 |
Q |
| |
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|
|
| T |
12967142 |
gaaatgcccaaaacgtcatacaatttgggacggagggag |
12967180 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #96
Raw Score: 116; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 233 - 463
Target Start/End: Complemental strand, 26061900 - 26061659
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| Q |
233 |
ttgtcccaaattgtatgtcactttacaataccaatgaaacattaatgttatttttcctattataaccttaactatttattactctctcttctttcaagtc |
332 |
Q |
| |
|
|||||||||||| |||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||| || |
|
|
| T |
26061900 |
ttgtcccaaattatatgtcgttttacaatatcaatgcaacattaatgttacttttcatattataaccttaactatttattactatatcttttttcaattc |
26061801 |
T |
 |
| Q |
333 |
ttttatttatctttttcatag-----------gacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatatgtg |
421 |
Q |
| |
|
||| |||||| |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |
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|
| T |
26061800 |
tttcatttatattttccatattatttattaaagacaattttgtaaaacaactcataatatcttttttccacacaatattaattgcatttcttaatatgtg |
26061701 |
T |
 |
| Q |
422 |
tgaaatgcccaaaacgtcatacaatttaggatgaagggagta |
463 |
Q |
| |
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| T |
26061700 |
tgaaatgtccaaaacgtcatataatttgggacggagggagta |
26061659 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #97
Raw Score: 116; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 233 - 463
Target Start/End: Complemental strand, 38680122 - 38679881
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| Q |
233 |
ttgtcccaaattgtatgtcactttacaataccaatgaaacattaatgttatttttcctattataaccttaactatttattactctctcttctttcaagtc |
332 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||| || |
|
|
| T |
38680122 |
ttgtcctaaattgtatgtcactttacaataccaatgaaatattaatgttatttttcctattatattcttaactatttattactctttcttttttcaattc |
38680023 |
T |
 |
| Q |
333 |
ttttatttatctttttcat-----------aggacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatatgtg |
421 |
Q |
| |
|
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| T |
38680022 |
ctttatttatctttctcatatcgtttattgaggataattttgtaaaacaactcataatatctatttcccacacaatattaattacatttcttaatacaag |
38679923 |
T |
 |
| Q |
422 |
tgaaatgcccaaaacgtcatacaatttaggatgaagggagta |
463 |
Q |
| |
|
||||||| | ||||| ||||||| ||| ||| | |||||||| |
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| T |
38679922 |
tgaaatgtctaaaacatcatacagtttgggacggagggagta |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #98
Raw Score: 115; E-Value: 4e-58
Query Start/End: Original strand, 231 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 2619586 - 2619358
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Q |
| |
|
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|
|
| T |
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atttgtcttaaattatatgtcgattaacaatatcaatgcaacattaatgttatttttcctattataaccttaactatttattactccctcttctttcaat |
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T |
 |
| Q |
331 |
tcttttatttatctttttcat-----------aggacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatatg |
419 |
Q |
| |
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|
|
| T |
2619486 |
tctttaatttatctttctcatattatttattaaggatcattttgtaaaacatctcataatatcttttttccacacaatattaattgtatttcttaatatg |
2619387 |
T |
 |
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420 |
tgtgaaatgcccaaaacgtcatacaattt |
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Q |
| |
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|||||||||||||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
2619386 |
tgtgaaatgcccaaaacgtcgtacaattt |
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T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #99
Raw Score: 115; E-Value: 4e-58
Query Start/End: Original strand, 231 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 8768689 - 8768461
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| |
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8768689 |
atttgtcctaaattatatgtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttattttttctattatatccttatctattaattactctctcttctttcaat |
8768590 |
T |
 |
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tcttttatttatctttttcata-----------ggacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatatg |
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T |
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| Q |
420 |
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448 |
Q |
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| T |
8768489 |
tgtgaaatggccaaaacgtcatacaattt |
8768461 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #100
Raw Score: 115; E-Value: 4e-58
Query Start/End: Original strand, 230 - 463
Target Start/End: Complemental strand, 47038553 - 47038309
Alignment:
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329 |
Q |
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T |
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330 |
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418 |
Q |
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| T |
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47038354 |
T |
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| Q |
419 |
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463 |
Q |
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47038353 |
gtatgaaatgcccaaaacatcgtacaatttagaacggagggagta |
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #101
Raw Score: 114; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 231 - 463
Target Start/End: Complemental strand, 7318817 - 7318574
Alignment:
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330 |
Q |
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T |
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331 |
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419 |
Q |
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| T |
7318717 |
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7318618 |
T |
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| Q |
420 |
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463 |
Q |
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| T |
7318617 |
tgtgaaatagccaaaacgtcatacaatttgggacggagggagta |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #102
Raw Score: 114; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 235 - 463
Target Start/End: Complemental strand, 10656808 - 10656569
Alignment:
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334 |
Q |
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10656709 |
T |
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335 |
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423 |
Q |
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| T |
10656708 |
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10656609 |
T |
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| Q |
424 |
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463 |
Q |
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| T |
10656608 |
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10656569 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #103
Raw Score: 114; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 230 - 464
Target Start/End: Original strand, 46160378 - 46160616
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| Q |
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329 |
Q |
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| T |
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46160477 |
T |
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| Q |
330 |
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418 |
Q |
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| T |
46160478 |
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46160570 |
T |
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| Q |
419 |
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464 |
Q |
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| T |
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gtgtgaaatgcccaaaacgtcatacaatttgggacggagggagtaa |
46160616 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #104
Raw Score: 113; E-Value: 7e-57
Query Start/End: Original strand, 233 - 464
Target Start/End: Complemental strand, 39673736 - 39673494
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Q |
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T |
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| Q |
333 |
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Q |
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| T |
39673636 |
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T |
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| Q |
422 |
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464 |
Q |
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| T |
39673536 |
tgaaatggccaaaacgtcatacaatttgggacggagggagtaa |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #105
Raw Score: 113; E-Value: 7e-57
Query Start/End: Original strand, 233 - 452
Target Start/End: Original strand, 52703412 - 52703642
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332 |
Q |
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T |
 |
| Q |
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421 |
Q |
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| T |
52703512 |
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52703611 |
T |
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| Q |
422 |
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452 |
Q |
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| T |
52703612 |
tgaaatacccaaaacgtcatacaatttagga |
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #106
Raw Score: 112; E-Value: 3e-56
Query Start/End: Original strand, 230 - 460
Target Start/End: Complemental strand, 32049574 - 32049335
Alignment:
| Q |
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Q |
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T |
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| Q |
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418 |
Q |
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| T |
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ttctttcatttatctttcccatatcatttattaaggataattttgtaaaataacttataatatctcttttccacacaatattaa-tacattttttaatat |
32049377 |
T |
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| Q |
419 |
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460 |
Q |
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| T |
32049376 |
gtgtgaaatatctaaaacgtcatacaatttaggacgaaggga |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #107
Raw Score: 111; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 230 - 463
Target Start/End: Original strand, 28646189 - 28646433
Alignment:
| Q |
230 |
tatttgtcccaaattgtatgtcactttacaataccaatgaaacattaatgttatttttcctattataaccttaactatttattactctctcttctttcaa |
329 |
Q |
| |
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| T |
28646189 |
tatttgtcttaaattatatgttgctttacaatatcaatgcaacattaatgttacttttcctattataactttagctatttattactctcttttctttcaa |
28646288 |
T |
 |
| Q |
330 |
gtcttttatttatctttttcat-----------aggacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatat |
418 |
Q |
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| T |
28646289 |
ttctttcatttatctttcccatgttatttgttaaggacaattttgtaaaacaacttataatatctcttttctacacaatattaattgcatttcttaatat |
28646388 |
T |
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| Q |
419 |
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463 |
Q |
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| T |
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atgtgaaatgcctaaaacgtcgtacaatttgggacggagggagta |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #108
Raw Score: 111; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 231 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 33488142 - 33487914
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330 |
Q |
| |
|
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|
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| T |
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T |
 |
| Q |
331 |
tcttttatttatctttttcata-----------ggacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatatg |
419 |
Q |
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| T |
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tatttcatttatcttttccatacaatttattagggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacgcaatattaattacatttcttaatacg |
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T |
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| Q |
420 |
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448 |
Q |
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| T |
33487942 |
tgtgaaatggccaaaacgtcttacaattt |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #109
Raw Score: 111; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 233 - 463
Target Start/End: Complemental strand, 35369632 - 35369389
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| Q |
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ttgtcccaaattgtatgtcactttacaataccaatgaaacattaatgttatttttcctattataaccttaactatttattactctctcttctttcaagtc |
332 |
Q |
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T |
 |
| Q |
333 |
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419 |
Q |
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| T |
35369532 |
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35369433 |
T |
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| Q |
420 |
tgtgaaatgcccaaaacgtcatacaatttaggatgaagggagta |
463 |
Q |
| |
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| T |
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tgtgaaatggccgaaacgtcatacaatttgggacggagggagta |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #110
Raw Score: 111; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 231 - 464
Target Start/End: Original strand, 46398640 - 46398884
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330 |
Q |
| |
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| T |
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T |
 |
| Q |
331 |
tcttttatttatctttttcata-----------ggacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatatg |
419 |
Q |
| |
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| T |
46398740 |
tctttcatttatctttcccatattatttattaaggacaattttgtaaaacaactcataatatctattttccacacaatattaattgcatttcttaatatg |
46398839 |
T |
 |
| Q |
420 |
tgtgaaatgcccaaaacgtcatacaatttaggatgaagggagtaa |
464 |
Q |
| |
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| T |
46398840 |
tgtgaaatgcccaaaacgtcatacaatttgggacggagggagtaa |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #111
Raw Score: 110; E-Value: 4e-55
Query Start/End: Original strand, 231 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 17179507 - 17179279
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atttgtcccaaattgtatgtcactttacaataccaatgaaacattaatgttatttttcctattataaccttaactatttattactctctcttctttcaag |
330 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
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T |
 |
| Q |
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tcttttatttatctt-----tttcat------aggacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatatg |
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Q |
| |
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| T |
17179407 |
tcattcatttatctttcatatatcatttactaaggacaattttgtaaaacaattcataatatccttttcccacacaaaattaattacatttcttaatacg |
17179308 |
T |
 |
| Q |
420 |
tgtgaaatgcccaaaacgtcatacaattt |
448 |
Q |
| |
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|
| T |
17179307 |
tgtgaaatgcccaaaatatcatacaattt |
17179279 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #112
Raw Score: 110; E-Value: 4e-55
Query Start/End: Original strand, 238 - 463
Target Start/End: Original strand, 45430053 - 45430289
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ccaaattgtatgtcactttacaataccaatgaaacattaatgttatttttcctattataaccttaactatttattactctctcttctttcaagtctttta |
337 |
Q |
| |
|
||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| | |
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ccaaattatatgtcgttttacaataccaatgcaacattaatgttactttttctattgtatccttagttatttattactctctcttctttcaattctttca |
45430152 |
T |
 |
| Q |
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tttatcttt---------ttcat--aggacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatatgtgtgaaa |
426 |
Q |
| |
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| T |
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tttatctttcctatattatttattaaggacaaatttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaatattaattgtatttcttaatatgtgtgaaa |
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T |
 |
| Q |
427 |
tgcccaaaacgtcatacaatttaggatgaagggagta |
463 |
Q |
| |
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| T |
45430253 |
tggctaaaacgtcatacaatttgggacggagggagta |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #113
Raw Score: 108; E-Value: 6e-54
Query Start/End: Original strand, 190 - 464
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Q |
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| T |
28121255 |
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28121353 |
T |
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378 |
Q |
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T |
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464 |
Q |
| |
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| T |
28121454 |
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28121539 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #114
Raw Score: 108; E-Value: 6e-54
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Target Start/End: Complemental strand, 31023828 - 31023587
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332 |
Q |
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T |
 |
| Q |
333 |
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421 |
Q |
| |
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31023629 |
T |
 |
| Q |
422 |
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463 |
Q |
| |
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| T |
31023628 |
tgaaatgcccaaaacgtcatacaatttgggacggagggagta |
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T |
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Target: chr1; HSP #115
Raw Score: 108; E-Value: 6e-54
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Q |
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T |
 |
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418 |
Q |
| |
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39501823 |
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39501922 |
T |
 |
| Q |
419 |
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448 |
Q |
| |
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| T |
39501923 |
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #116
Raw Score: 108; E-Value: 6e-54
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Target Start/End: Original strand, 50776227 - 50776445
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T |
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442 |
Q |
| |
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| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| |
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T |
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463 |
Q |
| |
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|||||| ||||| |||||||| |
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|
| T |
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caatttgggatggagggagta |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #117
Raw Score: 107; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 239 - 448
Target Start/End: Original strand, 11353609 - 11353829
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Q |
| |
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T |
 |
| Q |
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Q |
| |
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| T |
11353709 |
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11353808 |
T |
 |
| Q |
428 |
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448 |
Q |
| |
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| T |
11353809 |
gttcaaaacgtcgtacaattt |
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T |
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Back To:
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Target: chr1; HSP #118
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339 |
Q |
| |
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T |
 |
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429 |
Q |
| |
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| T |
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tatctttcccatttaattattaaggacaattttgtaaaacaactcataatatctctttcctacacaatattaattacatttcttaatatgtgtgaaatgt |
14794951 |
T |
 |
| Q |
430 |
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463 |
Q |
| |
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|
| T |
14794950 |
ccaaaacgtcatacaatttgggacggagggagta |
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T |
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Back To:
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Target: chr1; HSP #119
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| |
|
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T |
 |
| Q |
347 |
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435 |
Q |
| |
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| T |
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10426768 |
T |
 |
| Q |
436 |
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463 |
Q |
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10426769 |
cgtcatacaatttgggacggagggagta |
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #120
Raw Score: 105; E-Value: 4e-52
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352 |
Q |
| |
|
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T |
 |
| Q |
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441 |
Q |
| |
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| T |
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T |
 |
| Q |
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Q |
| |
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||||||| |
|
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28359662 |
acaattt |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #121
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Q |
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|
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|
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T |
 |
| Q |
333 |
ttttatttatctttttcata-----------ggacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatatgtg |
421 |
Q |
| |
|
||| |||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
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tttaatttatctttcccatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatttcttttccacacaatattaattgtatttcttaatatgta |
39674259 |
T |
 |
| Q |
422 |
tgaaatgcccaaaacgtcatacaattt |
448 |
Q |
| |
|
| |||||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
39674260 |
tcaaatgcccaagacgtcatacaattt |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #122
Raw Score: 105; E-Value: 4e-52
Query Start/End: Original strand, 233 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 49367477 - 49367251
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|
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T |
 |
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ttttatttatctttttcata-----------ggacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatatgtg |
421 |
Q |
| |
|
|| |||||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
49367377 |
attcatttatcttttttatatcatttattaaggtcaattttgtaaaacaactcataatatctctttcccacacaaaattaattacatttcttaatatgtg |
49367278 |
T |
 |
| Q |
422 |
tgaaatgcccaaaacgtcatacaattt |
448 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
49367277 |
tgaaatgctcaaaatatcatacaattt |
49367251 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #123
Raw Score: 104; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 230 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 5467136 - 5466907
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|
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T |
 |
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gtcttttatttatctttttcat-----------aggacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatat |
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Q |
| |
|
||||| ||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||| |||||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
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5466937 |
T |
 |
| Q |
419 |
gtgtgaaatgcccaaaacgtcatacaattt |
448 |
Q |
| |
|
|||||||||| | ||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
5466936 |
gtgtgaaatgtctaaaacgtcatataattt |
5466907 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #124
Raw Score: 104; E-Value: 2e-51
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Q |
| |
|
||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||| |
|
|
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24322760 |
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T |
 |
| Q |
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gtcttttatttatctttttcat-----------aggacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaatattaattacatttcttaat |
416 |
Q |
| |
|
||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |
|
|
| T |
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ttctttcatttatctttcccatataatttattaaggacaattttgtaaaacaacttataatatctcttttccacacaatattaattgcattttttaat |
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #125
Raw Score: 103; E-Value: 6e-51
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Q |
| |
|
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|
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T |
 |
| Q |
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tcttttatttatctttttcat-----------aggacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatatg |
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Q |
| |
|
||||| |||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
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30469752 |
T |
 |
| Q |
420 |
tgtgaaatgcccaaaacgtcatacaatttaggatgaagggagta |
463 |
Q |
| |
|
|| |||||| ||| |||||||| ||||| ||| | |||||||| |
|
|
| T |
30469753 |
tgcaaaatgctcaatacgtcatataatttgggacggagggagta |
30469796 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #126
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 236 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 41457939 - 41457716
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335 |
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| |
|
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|
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T |
 |
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336 |
tatttatctttttcat-----------aggacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatatgtgtga |
424 |
Q |
| |
|
||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||| | ||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |
|
|
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catttatcttttccataccatttattaaggataattttgtaaaacaatttataatttctgttctccacacaatattaattacatttcttaatacgtgtga |
41457740 |
T |
 |
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aatgcccaaaacgtcatacaattt |
448 |
Q |
| |
|
|||| |||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
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aatggccaaaacgtcgtacaattt |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #127
Raw Score: 101; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 240 - 463
Target Start/End: Original strand, 48509747 - 48509979
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340 |
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428 |
Q |
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| T |
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48509944 |
T |
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429 |
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463 |
Q |
| |
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| T |
48509945 |
cccaaaacgtcatacaatttaggacggagggagta |
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T |
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Target: chr1; HSP #128
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T |
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378 |
Q |
| |
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T |
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Q |
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T |
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Target: chr1; HSP #129
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Target Start/End: Original strand, 44789268 - 44789536
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289 |
Q |
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44789268 |
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44789367 |
T |
 |
| Q |
290 |
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378 |
Q |
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T |
 |
| Q |
379 |
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447 |
Q |
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44789468 |
tatctctttctcacacaatattaattacatttcttaatatatgtgaaatgtctaaaacgtcatacaatt |
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T |
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Target: chr1; HSP #130
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Q |
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T |
 |
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336 |
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424 |
Q |
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| T |
3788193 |
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3788292 |
T |
 |
| Q |
425 |
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452 |
Q |
| |
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|||| ||||||||||||||||||||||| |
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| T |
3788293 |
aatggccaaaacgtcatacaatttagga |
3788320 |
T |
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Target: chr1; HSP #131
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Q |
| |
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T |
 |
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331 |
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419 |
Q |
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| T |
13387666 |
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13387765 |
T |
 |
| Q |
420 |
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463 |
Q |
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| T |
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tgtgaaatggacaaaacgtcttacaatttagaacggagggagta |
13387809 |
T |
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Target: chr1; HSP #132
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Query Start/End: Original strand, 231 - 463
Target Start/End: Complemental strand, 23549444 - 23549201
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330 |
Q |
| |
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| T |
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T |
 |
| Q |
331 |
tcttttatttatctttttcata-----------ggacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatatg |
419 |
Q |
| |
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| T |
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tatttcatttatcttttccataccatttattagggataattttgtaaaacaactcataatttcttttcctcatgcaatattaattacatttcttaatacg |
23549245 |
T |
 |
| Q |
420 |
tgtgaaatgcccaaaacgtcatacaatttaggatgaagggagta |
463 |
Q |
| |
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| T |
23549244 |
tgtgaaatggccaaaacgtcttacaatttgggacggagggagta |
23549201 |
T |
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Target: chr1; HSP #133
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Query Start/End: Original strand, 233 - 464
Target Start/End: Complemental strand, 31583327 - 31583084
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332 |
Q |
| |
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T |
 |
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333 |
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420 |
Q |
| |
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| T |
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tttcatttatcttttccataccatttattagggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacgcaatattaattacattttcttaatacgt |
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T |
 |
| Q |
421 |
gtgaaatgcccaaaacgtcatacaatttaggatgaagggagtaa |
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Q |
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gcgaaatggccaaaacgtcttacaatttgggacggagggagtaa |
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T |
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Target: chr1; HSP #134
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| |
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||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||| |||||| ||||||||||||||| |||||||| | || |
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T |
 |
| Q |
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tatttatctttttcata-----------ggacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatatgtgtga |
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Q |
| |
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| T |
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catttatctttctcatatcatttattaaggataattttgtaaaataactcataatatttcttttccacataatattaattacgtttcttaacatatgtga |
40100728 |
T |
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| Q |
425 |
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447 |
Q |
| |
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| T |
40100729 |
aatgtccaaaacgtcatacaatt |
40100751 |
T |
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Back To:
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Target: chr1; HSP #135
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Query Start/End: Original strand, 233 - 448
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332 |
Q |
| |
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T |
 |
| Q |
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421 |
Q |
| |
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| T |
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16436298 |
T |
 |
| Q |
422 |
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448 |
Q |
| |
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|
| T |
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tgaaatgaccaaaacgtcatacaattt |
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T |
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Back To:
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Target: chr1; HSP #136
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Q |
| |
|
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T |
 |
| Q |
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Q |
| |
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| T |
31500665 |
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31500566 |
T |
 |
| Q |
422 |
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448 |
Q |
| |
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| T |
31500565 |
ttaaatgaccaaaacgtcttacaattt |
31500539 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #137
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 233 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 31681772 - 31681554
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233 |
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332 |
Q |
| |
|
|||| |||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |
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| T |
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T |
 |
| Q |
333 |
ttttatttatctttttcat-----------aggacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatatgtg |
421 |
Q |
| |
|
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| T |
31681672 |
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31681573 |
T |
 |
| Q |
422 |
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440 |
Q |
| |
|
||| ||||||||||||||| |
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|
| T |
31681572 |
tgagatgcccaaaacgtca |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #138
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| |
|
||||| |||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||||||| ||||||||| |
|
|
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27999770 |
T |
 |
| Q |
340 |
tatctttttcat----------aggacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatatgtgtgaaatgc |
429 |
Q |
| |
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| T |
27999771 |
tatctttcccatattatttttaaggacaattttgttaagctacttataatatctctttcgcacacaatattaattgcatttcttaatatgtatgaaatgt |
27999870 |
T |
 |
| Q |
430 |
ccaaaacgtcatacaattt |
448 |
Q |
| |
|
| ||||||||| ||||||| |
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| T |
27999871 |
caaaaacgtcacacaattt |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #139
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Q |
| |
|
|||||| ||||||||| | | | | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| || || |
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|
| T |
32871505 |
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T |
 |
| Q |
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ttttatttatctt-----tttcat------aggacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatatgtg |
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Q |
| |
|
||| ||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
32871405 |
tttcatttatctttcctgtatcatttattaaggacaattttgtaaaacaactcataaaatctc--tcacacacaatattaattacatttcttaatatgta |
32871308 |
T |
 |
| Q |
422 |
tgaaatgcccaaaacgtcatacaatttaggatgaagggagta |
463 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||||| |||||||| ||| | |||||||| |
|
|
| T |
32871307 |
tgaaatgttcaaaacgtcgtacaatttgggacggagggagta |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #140
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| |
|
|||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||| ||||||||| |
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|
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T |
 |
| Q |
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tttcata-----------ggacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatatgtgtgaaatgcccaaa |
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Q |
| |
|
|| |||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |
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| T |
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ttccataccatttatttgggataattttgtaaaacaactcataatttctcttcgccacgcaatattaattacatttcttaatacgtgtgaaatgaccaaa |
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T |
 |
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435 |
acgtcatacaattt |
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Q |
| |
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| || |||||||| |
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| T |
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atatcttacaattt |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #141
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Query Start/End: Original strand, 231 - 448
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1395720 |
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1395819 |
T |
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331 |
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419 |
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| T |
1395820 |
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1395918 |
T |
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420 |
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448 |
Q |
| |
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||||||||| ||||||||||||||||||| |
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| T |
1395919 |
tgtgaaatggccaaaacgtcatacaattt |
1395947 |
T |
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Target: chr1; HSP #142
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Target Start/End: Complemental strand, 26551710 - 26551466
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Q |
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T |
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333 |
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421 |
Q |
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26551610 |
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26551511 |
T |
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| Q |
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466 |
Q |
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26551510 |
ttaaatgttcaaaacgtcatacaatttgggacggagggagtaatt |
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #143
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
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Target Start/End: Complemental strand, 45269180 - 45268985
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352 |
Q |
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45269081 |
T |
 |
| Q |
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448 |
Q |
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| T |
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T |
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Target: chr1; HSP #144
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Query Start/End: Original strand, 254 - 450
Target Start/End: Complemental strand, 46272962 - 46272755
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352 |
Q |
| |
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T |
 |
| Q |
353 |
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442 |
Q |
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| T |
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T |
 |
| Q |
443 |
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450 |
Q |
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| T |
46272762 |
caatttag |
46272755 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #145
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Query Start/End: Original strand, 233 - 452
Target Start/End: Complemental strand, 50309943 - 50309714
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331 |
Q |
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| T |
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T |
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| Q |
332 |
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420 |
Q |
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| T |
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T |
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| Q |
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452 |
Q |
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| T |
50309745 |
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T |
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Target: chr1; HSP #146
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
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Target Start/End: Complemental strand, 51905837 - 51905594
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330 |
Q |
| |
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| T |
51905837 |
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51905738 |
T |
 |
| Q |
331 |
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419 |
Q |
| |
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| T |
51905737 |
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51905638 |
T |
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| Q |
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463 |
Q |
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| |||||| |||||||||||||||||| ||| | |||||||| |
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| T |
51905637 |
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51905594 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #147
Raw Score: 93; E-Value: 6e-45
Query Start/End: Original strand, 189 - 448
Target Start/End: Original strand, 52177782 - 52178052
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Q |
| |
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| T |
52177782 |
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T |
 |
| Q |
289 |
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377 |
Q |
| |
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| T |
52177882 |
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52177981 |
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| Q |
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448 |
Q |
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| T |
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T |
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Target: chr1; HSP #148
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 233 - 463
Target Start/End: Original strand, 2733884 - 2734125
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332 |
Q |
| |
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2733884 |
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T |
 |
| Q |
333 |
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421 |
Q |
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| T |
2733984 |
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2734083 |
T |
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| Q |
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463 |
Q |
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| T |
2734084 |
tgaaatggtcaaaacatcatacaatttgggacggagggagta |
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T |
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Target: chr1; HSP #149
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Target Start/End: Original strand, 25792206 - 25792431
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Q |
| |
|
||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| || |||||||| ||||| | | | ||| |
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 |
| Q |
340 |
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435 |
Q |
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| T |
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25792403 |
T |
 |
| Q |
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463 |
Q |
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| T |
25792404 |
cgtcatataatttaggatggagggagta |
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T |
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Target: chr1; HSP #150
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 234 - 448
Target Start/End: Original strand, 31809514 - 31809739
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333 |
Q |
| |
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| T |
31809514 |
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31809613 |
T |
 |
| Q |
334 |
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422 |
Q |
| |
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| T |
31809614 |
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31809713 |
T |
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| Q |
423 |
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448 |
Q |
| |
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| T |
31809714 |
gaaatggccaaaacgtcattcaattt |
31809739 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #151
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 190 - 404
Target Start/End: Complemental strand, 49251846 - 49251621
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Q |
| |
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| T |
49251846 |
tactccctccgtcccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaaatgtatctcactttacaatatcaatgaaacattaatgttacttttcc |
49251747 |
T |
 |
| Q |
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378 |
Q |
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| T |
49251746 |
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49251647 |
T |
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| Q |
379 |
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404 |
Q |
| |
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||||| ||| |||||||||||||||| |
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|
| T |
49251646 |
tatctttttcccacacaatattaatt |
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #152
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Q |
| |
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tttattactctctcttctttcaagtcttttatttatttttcccatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacaca |
8012514 |
T |
 |
| Q |
396 |
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448 |
Q |
| |
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| T |
8012513 |
atattaattacatttcttaatatatgtgaaatgctcaaaacgtcatacaattt |
8012461 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #153
Raw Score: 91; E-Value: 9e-44
Query Start/End: Original strand, 231 - 448
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330 |
Q |
| |
|
|||| ||||||||| |||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||| |
|
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atttatcccaaattatatgtcgttttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcctattatatccttaactattaattactctcttttctttcaat |
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T |
 |
| Q |
331 |
tcttttatttatctttttcata-----------ggacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatatg |
419 |
Q |
| |
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| T |
51417507 |
tattttatttatcttttccataccatttattagggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacataatattaattatatttcttaatacc |
51417408 |
T |
 |
| Q |
420 |
tgtgaaatgcccaaaacgtcatacaattt |
448 |
Q |
| |
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| | |||| ||||||| ||||||||||| |
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| T |
51417407 |
tctaaaatagccaaaacatcatacaattt |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #154
Raw Score: 88; E-Value: 6e-42
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452 |
Q |
| |
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aattttgtaaaacaactcataatatctctttcccacacaatattaattacatttcttaatatgtgtgaaatacccaaaacgtcatacaatttagga |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #155
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Target Start/End: Complemental strand, 19316624 - 19316404
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aaattgtatgtcactttacaataccaatgaaacattaatgttatttttcctattataaccttaactatttattactctctcttctttcaagtcttttatt |
339 |
Q |
| |
|
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| T |
19316624 |
aaattgtatgtcattttacaatatcaataaaataataaagttattttttctattatatccttcattatttattactctttcttctttcaattctttcatt |
19316525 |
T |
 |
| Q |
340 |
tatctttttcata-----------ggacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatatgtgtgaaat- |
427 |
Q |
| |
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| T |
19316524 |
catcttttccatattatttattaaggacaattttgtaaaacaacttataatatatatttcccacacaatattaattacatttcttaatatgtgttaaatg |
19316425 |
T |
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| Q |
428 |
gcccaaaacgtcatacaattt |
448 |
Q |
| |
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| T |
19316424 |
gccaaaaacgtcgtacaattt |
19316404 |
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Target: chr1; HSP #156
Raw Score: 86; E-Value: 9e-41
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atttgtcccaaattgtatgtcactttacaataccaatgaaacattaatgttatttttcctattataaccttaactatttattactctctcttctttcaag |
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Q |
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| T |
15170305 |
atttgtcccaaattatatttcgctttacaataccaatgaaatattaatgttactttttctattatatccttaactattaattactctatcttctttcaat |
15170206 |
T |
 |
| Q |
331 |
tcttttatttatct--ttttcat-----------aggacaattttgtaaaacaactcataatatctctt-ttccacacaatattaattacatttcttaat |
416 |
Q |
| |
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| ||| |||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |
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| T |
15170205 |
tatttcatttatctttttttcataccatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttcccccacacaatattaattatatttcttaat |
15170106 |
T |
 |
| Q |
417 |
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463 |
Q |
| |
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| T |
15170105 |
acgt-taaaatggccaaaacatcatacaatttgggacggagggagta |
15170060 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #157
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 233 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 46569159 - 46568936
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332 |
Q |
| |
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|||| ||||||| |||||| |||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||| | |
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| T |
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ttgtaccaaattatatgtcgttttataatac-aattaaacattaatgttatttttcctattatatccttaattatttattactctttcttctttcaatac |
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T |
 |
| Q |
333 |
ttttatttatcttt---ttcat------aggacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatatgtgtg |
423 |
Q |
| |
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| T |
46569060 |
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46568961 |
T |
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| Q |
424 |
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448 |
Q |
| |
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|||| || ||||||| |||||||| |
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| T |
46568960 |
aaatacctaaaacgttgtacaattt |
46568936 |
T |
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Target: chr1; HSP #158
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 352 - 464
Target Start/End: Original strand, 24583957 - 24584070
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352 |
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450 |
Q |
| |
|
|||| |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | |
|
|
| T |
24583957 |
aggataattttgtaaaataactcataatatctctttcccacacaatattaattacatttcttaatatgtgtgaaaatgcccaaaacgtcatacaatttgg |
24584056 |
T |
 |
| Q |
451 |
gatgaagggagtaa |
464 |
Q |
| |
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|| | ||||||||| |
|
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| T |
24584057 |
gacggagggagtaa |
24584070 |
T |
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Target: chr1; HSP #159
Raw Score: 81; E-Value: 8e-38
Query Start/End: Original strand, 352 - 464
Target Start/End: Complemental strand, 7038079 - 7037967
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| Q |
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aggacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatatgtgtgaaatgcccaaaacgtcatacaatttagg |
451 |
Q |
| |
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|
| T |
7038079 |
aggacaatattgtaaaacaattcttaatatctcttttccatacaatattaattacatttcttaatacgtgtgaaatgcccaaaatgtcatacaatttggg |
7037980 |
T |
 |
| Q |
452 |
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464 |
Q |
| |
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| ||||||||||| |
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acgaagggagtaa |
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #160
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Target Start/End: Original strand, 50324826 - 50325047
Alignment:
| Q |
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288 |
Q |
| |
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| T |
50324826 |
ttactccctccgtcccaaaatgtatgtcactttagaaaaaatatttgttccaaattgtatgtcgctttacaataccaatgaaaaattaatgttagttttc |
50324925 |
T |
 |
| Q |
289 |
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377 |
Q |
| |
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|
| T |
50324926 |
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50325025 |
T |
 |
| Q |
378 |
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399 |
Q |
| |
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| T |
50325026 |
atatctatttcccacacaatat |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #161
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 231 - 396
Target Start/End: Complemental strand, 23825242 - 23825066
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| Q |
231 |
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330 |
Q |
| |
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| T |
23825242 |
atttgtcccaaattatatgtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcttattatatccttaactattaattactctctcttctttcaat |
23825143 |
T |
 |
| Q |
331 |
tcttttatttatctttttcata-----------ggacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaa |
396 |
Q |
| |
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| ||| ||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |
|
|
| T |
23825142 |
tatttcatttatcttttccataccatttattagggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaa |
23825066 |
T |
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Target: chr1; HSP #162
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 230 - 463
Target Start/End: Complemental strand, 26448268 - 26448023
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| Q |
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328 |
Q |
| |
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|
| T |
26448268 |
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26448169 |
T |
 |
| Q |
329 |
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417 |
Q |
| |
|
| ||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||| | || |||||||||||||||||||| |
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| T |
26448168 |
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26448069 |
T |
 |
| Q |
418 |
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463 |
Q |
| |
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| T |
26448068 |
catgtaaattgaccaaaacatcatatagtttaggataaagggagta |
26448023 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #163
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 233 - 418
Target Start/End: Original strand, 40132270 - 40132466
Alignment:
| Q |
233 |
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332 |
Q |
| |
|
||||| |||||| | |||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| | |
|
|
| T |
40132270 |
ttgtcacaaattatttgtcgctttacgatatcaatgaaacattaatgttatttttcctattatatctttaactatttattactctctcttctttcaattt |
40132369 |
T |
 |
| Q |
333 |
ttttatttatctttttcat-----------aggacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatat |
418 |
Q |
| |
|
||| |||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||| |||| ||| |||| ||||||| |
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| T |
40132370 |
tttaatttatctttctcataccatatattaaggataattttgtaaaacaactcataatatatttttcccacacaaaattatttatattttttaatat |
40132466 |
T |
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Target: chr1; HSP #164
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Query Start/End: Original strand, 352 - 465
Target Start/End: Complemental strand, 36633138 - 36633025
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451 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
36633138 |
aggacaattttgtaaaacaactcataatatctttttcccacacaatatgaattacatttcttaatatgtgtgaaatgctcaaaacgtcatataatttggg |
36633039 |
T |
 |
| Q |
452 |
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465 |
Q |
| |
|
| | || ||||||| |
|
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| T |
36633038 |
acggagagagtaat |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #165
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 231 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 7572545 - 7572343
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| Q |
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330 |
Q |
| |
|
||||||| |||||| | |||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||| || ||||||||||||||||||||| ||||||| || |
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|
| T |
7572545 |
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7572446 |
T |
 |
| Q |
331 |
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419 |
Q |
| |
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| ||| |||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||| |||||| | |
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| T |
7572445 |
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7572346 |
T |
 |
| Q |
420 |
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422 |
Q |
| |
|
||| |
|
|
| T |
7572345 |
tgt |
7572343 |
T |
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Target: chr1; HSP #166
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Query Start/End: Original strand, 233 - 464
Target Start/End: Original strand, 20793380 - 20793621
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| Q |
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ttgtcccaaattgtatgtcactttacaataccaatgaaacattaatgttatttttcctattataaccttaactatttattactctctcttctttcaagtc |
332 |
Q |
| |
|
|||||| ||||| || ||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||| |||||| |||| |||||||| ||||||||||| | |
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|
| T |
20793380 |
ttgtcctaaattatacgtcgctttacaataccaatgaaatatttatgttattttttttattatatccttaattattaattactctatcttctttcaatta |
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T |
 |
| Q |
333 |
ttttatttatctttttcat-----------aggacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatatgtg |
421 |
Q |
| |
|
||| |||||| |||||||| |||| |||||||||||| |||||||||| |||||| || || ||||||||||||||||| |||||| || |
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| T |
20793480 |
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20793578 |
T |
 |
| Q |
422 |
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464 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||||| |||||||| ||| | ||||||||| |
|
|
| T |
20793579 |
tgaaatggtcaaaacgtcttacaatttgggacggagggagtaa |
20793621 |
T |
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Back To:
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Target: chr1; HSP #167
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 240 - 444
Target Start/End: Original strand, 39782464 - 39782678
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Q |
| |
|
||||| |||||| ||||||||| ||||| |||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |
|
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39782464 |
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39782563 |
T |
 |
| Q |
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tatctttttcat-----------aggacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatatgtgtgaaatg |
428 |
Q |
| |
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||| ||| |||| | ||||||||||||||||| ||||||||| | |||| || |||||||||||||||||||||||||| | ||||||| |
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| T |
39782564 |
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39782662 |
T |
 |
| Q |
429 |
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444 |
Q |
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|
| |||||||| |||| |
|
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| T |
39782663 |
cataaaacgtcgtaca |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #168
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Query Start/End: Original strand, 190 - 308
Target Start/End: Original strand, 24583829 - 24583947
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Q |
| |
|
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|
|
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tactccctccgtcccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcc |
24583928 |
T |
 |
| Q |
290 |
tattataaccttaactatt |
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Q |
| |
|
||||||| ||||||||||| |
|
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| T |
24583929 |
tattatatccttaactatt |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #169
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Query Start/End: Original strand, 354 - 448
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gacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatatgtgtgaaatgcccaaaacgtcatacaattt |
448 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||| |
|
|
| T |
31181350 |
gacaattttgtaaaacaactcataacatctctttcccacacaaaattaattacatttcttaatacgtgtgaaatgcccaaaatgtcatataattt |
31181444 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #170
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Q |
| |
|
|||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| | |||||||| |
|
|
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52701881 |
acaactcataatttatctttcccacacaatattaattacatttcttaatatgtgtgaaatgaccaaaacgtcatacaatttgggacggagggagta |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #171
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Query Start/End: Original strand, 231 - 352
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330 |
Q |
| |
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|||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||| |
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290512 |
atttgtcccaaattatatgccgctttacaataccaatgaaatatttatgttacttttcctattatatccttaactattaattactatctcttctttcaat |
290413 |
T |
 |
| Q |
331 |
tcttttatttatctttttcata |
352 |
Q |
| |
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| || ||||||||||| |||| |
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| T |
290412 |
tattccatttatcttttccata |
290391 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #172
Raw Score: 66; E-Value: 7e-29
Query Start/End: Original strand, 233 - 399
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ttgtcccaaattgtatgtcactttacaataccaatgaaacattaatgttatttttcctattataaccttaactatttattactctctcttctttcaagtc |
332 |
Q |
| |
|
|||||||||||| || ||| |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||| | |
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| T |
46762159 |
ttgtcccaaattatacgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcttattataaccttaactatttattactatattttctttcaatta |
46762258 |
T |
 |
| Q |
333 |
ttttatttatctttttcat--aggacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaatat |
399 |
Q |
| |
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| || || || || || || ||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||| |
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| T |
46762259 |
tctttcccatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatgttttttttccacacaatat |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #173
Raw Score: 66; E-Value: 7e-29
Query Start/End: Original strand, 231 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 48110898 - 48110680
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atttgtcccaaattgtatgtcactttacaataccaatgaaacattaatgttatttttcctattataaccttaactatttattactctctcttctttcaag |
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Q |
| |
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| T |
48110898 |
atttgtctcaaattatatgtcgttttacaatatgaatgaaacattaacgttgcatttc-tattatatcattaactatttaatactctatcttctttcatt |
48110800 |
T |
 |
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t--cttttatttatctttt-tcataggacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatatgtgtgaaat |
427 |
Q |
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| T |
48110799 |
tatctttcccatatcatttatca-aggacaattttgtaaaacaactcataatatattttttctagacaaaattaattacatttcttaatacgtatgaaat |
48110701 |
T |
 |
| Q |
428 |
gcccaaaacgtcatacaattt |
448 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
48110700 |
tcccaaaacgtcatataattt |
48110680 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #174
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
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Target Start/End: Original strand, 39739449 - 39739638
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| Q |
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353 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||| || |||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||| ||| || |
|
|
| T |
39739449 |
aatgaaatattaatgctactttttctattatatccttaattatttattactctctcttttttcaattctttaatttatcttttccataccatttattaag |
39739548 |
T |
 |
| Q |
354 |
gacaattttgtaaaacaactcat-aatatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatatgtgtgaaatgcccaaaacgtcata |
442 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||| || ||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| | | ||||||||| |
|
|
| T |
39739549 |
aacaattttgtaaaataacttataaatatctttttcccacacaaaattaattacatttcttaatacgtgtgaaatgtctataacgtcata |
39739638 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #175
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Target Start/End: Complemental strand, 10977893 - 10977801
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| Q |
254 |
tttacaataccaatgaaacattaatgttatttttcctattataaccttaactatttattactctctcttctttcaagtcttttatttatcttt |
346 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| | | ||| |||||||||| |
|
|
| T |
10977893 |
tttacaataccaatgaaaaattaatgttacttttcctattatacccttaactatttattattctctcttctttcgattttttaatttatcttt |
10977801 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #176
Raw Score: 61; E-Value: 7e-26
Query Start/End: Original strand, 230 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 36633306 - 36633191
Alignment:
| Q |
230 |
tatttgtcccaaattgtatgtcactttacaataccaatgaaacattaatgttatttttcctattataaccttaactatttattactctctcttctttcaa |
329 |
Q |
| |
|
|||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
36633306 |
tatttgtctcaaattatatgttgctttacaataccaatgaaaaatta-tgttacttttcatattatatccttaaccatttattactctctcttctttcaa |
36633208 |
T |
 |
| Q |
330 |
gtcttttatttatcttt |
346 |
Q |
| |
|
|| || |||||||||| |
|
|
| T |
36633207 |
ttccttcatttatcttt |
36633191 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #177
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 239 - 350
Target Start/End: Original strand, 17772950 - 17773061
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| Q |
239 |
caaattgtatgtcactttacaataccaatgaaacattaatgttatttttcctattataaccttaactatttattactctctcttctttcaagtcttttat |
338 |
Q |
| |
|
|||||| || |||| || ||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||| | ||| || |
|
|
| T |
17772950 |
caaattataagtcatttcacaatacaaataaaacattaatgttatttttcttattatacccttaactatttattactctctcatttttcaattttttaat |
17773049 |
T |
 |
| Q |
339 |
ttatctttttca |
350 |
Q |
| |
|
|||||||||||| |
|
|
| T |
17773050 |
ttatctttttca |
17773061 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #178
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
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Target Start/End: Original strand, 39640311 - 39640430
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| Q |
233 |
ttgtcccaaattgtatgtcactttacaataccaatgaaacattaatgttatttttcctattataaccttaactatttattactctctcttctttcaagtc |
332 |
Q |
| |
|
|||||| ||||| || ||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||| |||| |||||| ||||||||||||| | |
|
|
| T |
39640311 |
ttgtcctaaattatacgtcgcttaacaataccaatgaaatattaatgttattttttctattatatccttaattattaattactatctcttctttcaatta |
39640410 |
T |
 |
| Q |
333 |
ttttatttatctttttcata |
352 |
Q |
| |
|
||| ||||||||||| |||| |
|
|
| T |
39640411 |
tttcatttatcttttccata |
39640430 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #179
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Query Start/End: Original strand, 354 - 468
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| Q |
354 |
gacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatatgtgtgaaatgcccaaaacgtcatacaatttaggat |
453 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || |||||||| | ||||||| | ||||||||||| |
|
|
| T |
35610608 |
gacaattttgtaaaacagctcataatatctctttctcacacaatattaattacatttcttagtacacgtgaaatgtcgaaaacgttaaacaatttaggac |
35610707 |
T |
 |
| Q |
454 |
gaagggagtaattta |
468 |
Q |
| |
|
| |||||||| |||| |
|
|
| T |
35610708 |
ggagggagtagttta |
35610722 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #180
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 254 - 352
Target Start/End: Complemental strand, 52551816 - 52551718
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| Q |
254 |
tttacaataccaatgaaacattaatgttatttttcctattataaccttaactatttattactctctcttctttcaagtcttttatttatctttttcata |
352 |
Q |
| |
|
||||||||| |||||| ||||||| ||||||||| ||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
52551816 |
tttacaatatcaatgattcattaatattatttttcttattacatccttaactatttaatactctctcttctttcaattctttcatttatctttttcata |
52551718 |
T |
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Target: chr1; HSP #181
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Query Start/End: Original strand, 276 - 463
Target Start/End: Complemental strand, 52551701 - 52551503
Alignment:
| Q |
276 |
aatgttatttttcctattataaccttaactatttattactctctcttctttcaagtcttttatttatctttttcata-----------ggacaattttgt |
364 |
Q |
| |
|
||||||||||||| || || | ||||||||||| | |||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||| | |||||||||| |
|
|
| T |
52551701 |
aatgttatttttcttactacatccttaactattaaatactctatcttctttcaattcttatatttatctttttcatatcatttatcaagaacaattttgt |
52551602 |
T |
 |
| Q |
365 |
aaaacaactcataatatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatatgtgtgaaatgcccaaaacgtcatacaatttaggatgaagggagta |
463 |
Q |
| |
|
||||||||| ||| ||| || || ||||||| |||||||| ||||||||||| | ||||||| |||||||||||| ||||||||||| || ||||| |
|
|
| T |
52551601 |
aaaacaacttatagtatttccttctcacacaaaattaattatatttcttaataaatatgaaatgttcaaaacgtcatataatttaggatggagagagta |
52551503 |
T |
 |
Back To:
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Target: chr1; HSP #182
Raw Score: 56; E-Value: 7e-23
Query Start/End: Original strand, 259 - 450
Target Start/End: Complemental strand, 28979803 - 28979599
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| Q |
259 |
aataccaatgaaacattaatgttatttttcctattataaccttaactatttattactctctcttctttcaagtcttttatttatctttttcat------- |
351 |
Q |
| |
|
|||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||| | |||||| |||||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||| |
|
|
| T |
28979803 |
aatatcaataaaacattaatgttacttttcctattatatctttaactgtttattgctctctcttctttcaattctattatttatctttctcatactattt |
28979704 |
T |
 |
| Q |
352 |
----aggacaattttgt--aaaacaactcataatatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatatgtgtgaaatgcccaaaacgtcatacaa |
445 |
Q |
| |
|
|||| |||||| | |||| |||||||||||| |||||| | |||| |||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||| || |
|
|
| T |
28979703 |
atcaaggataattttataaaaaaaaactcataatatatcttttttatacaaacttaattacatttattaatgtgtgtgaaatagtcaaaacgtcatataa |
28979604 |
T |
 |
| Q |
446 |
tttag |
450 |
Q |
| |
|
||||| |
|
|
| T |
28979603 |
tttag |
28979599 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #183
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 233 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 83145 - 83063
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| Q |
233 |
ttgtcccaaattgtatgtcactttacaataccaatgaaacattaatgttatttttcctattataaccttaactatttattact |
315 |
Q |
| |
|
||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
83145 |
ttgtctcaaattatatgtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcctattatatccttaactattaattact |
83063 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #184
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 235 - 452
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| Q |
235 |
gtcccaaattgtatgtcactttacaataccaatgaaacattaatgttatttttcctattataaccttaactatttattactctctcttctttcaagtctt |
334 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| || | || |
|
|
| T |
6049742 |
gtcccaaattatatgtcgttttacaataccaatgaagaattaatattatttttc-tattattttcttaactatttattactctctcttcttttaattatt |
6049840 |
T |
 |
| Q |
335 |
ttatttatctt-----tttcat------aggacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatatgtgtg |
423 |
Q |
| |
|
| ||||||||| | |||| || |||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||| |||| |
|
|
| T |
6049841 |
taatttatctttcatatatcatctattaagaacaattttataaaacaaatcataatatctcttt------caaaattaatcgcatttcttaataattgtg |
6049934 |
T |
 |
| Q |
424 |
aaatgcccaaaacgtcatacaatttagga |
452 |
Q |
| |
|
||||| |||||||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
6049935 |
aaatgttcaaaacgtcatataatttagga |
6049963 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #185
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 352 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 9410989 - 9410893
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| Q |
352 |
aggacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatatgtgtgaaatgcccaaaacgtcatacaattt |
448 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||| ||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||| || ||||| |
|
|
| T |
9410989 |
aggacaattttgtaaaataacttataatatatctttcccaaacaatattaattttattttttaatatgtgtgaaatgtccaaaacgtcgtataattt |
9410893 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #186
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 246 - 442
Target Start/End: Original strand, 16966706 - 16966907
Alignment:
| Q |
246 |
tatgtcactttacaataccaatgaaacattaatgttatttttcctattataaccttaactatttattactctctcttctttcaa---gtcttttatttat |
342 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||||| | ||| |||||||||||||| ||||||| || ||||| ||| |
|
|
| T |
16966706 |
tatgtcgctttacaataacaatgaaacattaatattatttttcatattatatctttacatatttattactctcacttcttttaatttatctttctcatat |
16966805 |
T |
 |
| Q |
343 |
ctttttcataggacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccac--acaatattaattacatttcttaatatgtgtgaaatgcccaaaacgtca |
440 |
Q |
| |
|
| ||| || |||||||||||||| ||||||||| ||||||||| || |||| |||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||| ||| |
|
|
| T |
16966806 |
catttattaagaacaattttgtaaaataactcataagatctcttttttaccaacaaaattaattacatttcttaatacatgtaaaatggccaaaacatca |
16966905 |
T |
 |
| Q |
441 |
ta |
442 |
Q |
| |
|
|| |
|
|
| T |
16966906 |
ta |
16966907 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #187
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 254 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 26060717 - 26060629
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| Q |
254 |
tttacaataccaatgaaacattaatgttatttttcctattataaccttaactatttattactctctcttctttcaagtcttttatttat |
342 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||| | | |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||| |
|
|
| T |
26060717 |
tttacaatatcaatgaagcattaatgttatttttcatattacacctttaactatttattactatctcttctttcaattctttaatttat |
26060629 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #188
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 233 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 38606216 - 38606129
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| Q |
233 |
ttgtcccaaattgtatgtcactttacaataccaatgaaacattaatgttatttttcctattataaccttaactatttattactctctct |
321 |
Q |
| |
|
|||||| ||||| || ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
38606216 |
ttgtcctaaattatacgtcgctttacaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattat-attttaactatttattactctctct |
38606129 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #189
Raw Score: 51; E-Value: 7e-20
Query Start/End: Original strand, 236 - 346
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| Q |
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tcccaaattgtatgtcactttacaataccaatgaaacattaatgttatttttcctattataaccttaactatttattactctctcttctttcaagtcttt |
335 |
Q |
| |
|
||||||||| || ||| |||||||||| |||||| |||||||||| ||||| ||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||| | ||| |
|
|
| T |
11030084 |
tcccaaattataagtcgttttacaatacgtatgaaaaattaatgttacttttcttattatacccttgactatttattattctctcttctttcaatttttt |
11030183 |
T |
 |
| Q |
336 |
tatttatcttt |
346 |
Q |
| |
|
|||||||||| |
|
|
| T |
11030184 |
aatttatcttt |
11030194 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #190
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| Q |
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gtcccaaattgtatgtcactttacaataccaatgaaacattaatgttatttttcctattata |
296 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
5432400 |
gtcccaaattgtatgtcactttagaataccaattaaacattaatgttacttttcctattata |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #191
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
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aggacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatatgtgtgaaatgcccaaaacgtcatacaatttagg |
451 |
Q |
| |
|
||||||||||| ||| | |||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||| ||| || |
|
|
| T |
16108530 |
aggacaattttataatataactcataatatatcttttccacataatattaattgcatttattaataggtgtgaaatgtttaaaacgtcatacattttggg |
16108629 |
T |
 |
| Q |
452 |
atgaagggag |
461 |
Q |
| |
|
| | |||||| |
|
|
| T |
16108630 |
acggagggag |
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #192
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448 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| | ||||| ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
33086798 |
tatctcttttccacacaatattaattgcatttcttaacatgtattaaatgtccaaaacgtcatacaattt |
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T |
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Target: chr1; HSP #193
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360 |
tttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatatgtgtgaaatgcccaaaacgtcatacaattt |
448 |
Q |
| |
|
||||||||| |||||||||||||||||| || |||| |||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||| || ||||| |
|
|
| T |
3280961 |
tttgtaaaataactcataatatctctttctcagacaaaattaattatatttcttaatacgtgtgaaatgtccaaaacgtcgtataattt |
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T |
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Target: chr1; HSP #194
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tttacaataccaatgaaacattaatgttatttttcctattataaccttaactatttattactctctcttctttcaagtcttttatttatctttttcat-- |
351 |
Q |
| |
|
||||| ||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||| | |||| | |||||||| ||||||||||||| | ||| |||||||||| |||| |
|
|
| T |
35150232 |
tttacgatatcaatgaaactttaatgttattttttctattatacctttaattgcttattactttctcttctttcaattatttaatttatctttctcatat |
35150133 |
T |
 |
| Q |
352 |
---------aggacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaatattaattacatttcttaata |
417 |
Q |
| |
|
|||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||| |||| |||||| |
|
|
| T |
35150132 |
aatttattaaggataattttataaaacaactcataatatctctttttcatgcaaaattaattaaattttttaata |
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T |
 |
Back To:
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Target: chr1; HSP #195
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254 |
tttacaataccaatgaaacattaatgttatttttcctattataaccttaactatttattactctctcttctttcaagtcttttatttatcttt |
346 |
Q |
| |
|
|||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||| | | ||||||||| ||||| |||||||||| |
|
|
| T |
41617637 |
tttacaataccagtgaaacattaatgttactttttctattatacttttaactatttattactattttttctttcaattctttaatttatcttt |
41617545 |
T |
 |
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Target: chr1; HSP #196
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aattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatatgtgtgaaatgcccaaaacgtcatacaattt |
448 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| | |||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||| |||||||| |
|
|
| T |
290358 |
aattttgtaaaacaactcataatttttcttccccatgcaatattaattacatttcttaatacgtgtgaaatggtcaaaaagtcttacaattt |
290267 |
T |
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352 |
Q |
| |
|
||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||| | ||| ||| |||||| ||||| |
|
|
| T |
4953589 |
acaataccaatcaaacattaatgttgttttttctattatatccttaacta-ttattactctttcttctttcaattatttcattcatctttctcata |
4953683 |
T |
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347 |
Q |
| |
|
|||| |||||| |||| || ||||||||||||||| |||| |||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||| |
|
|
| T |
6596905 |
tgtcgctttacgatactaaagaaacattaatgttaatttttctattatattcttaac-atttattactatctcttctttcgcttctttaatttatctttc |
6597003 |
T |
 |
| Q |
348 |
tcat-----------aggacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatatgtgtgaaatgcccaaaac |
436 |
Q |
| |
|
||| ||||||||||||||||||| | ||||| ||| |||||||| |||||||| ||||||||||| |||| ||||||| |||| |
|
|
| T |
6597004 |
ccataccatttattaaggacaattttgtaaaaca------attatctatttcccacacaaaattaattatatttcttaatacgtgtaaaatgcctaaaat |
6597097 |
T |
 |
| Q |
437 |
gtcatacaatttaggatgaagggagtaat |
465 |
Q |
| |
|
||||||||||| ||||| || ||||||| |
|
|
| T |
6597098 |
atcatacaatttgggatggagagagtaat |
6597126 |
T |
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Target: chr1; HSP #199
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caatgaaacattaatgttatttttcct-attataaccttaactatttattactctctcttctttcaagtcttttatttatctttttcata |
352 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| ||||| | |||||||| |||| ||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||| ||||||||| |
|
|
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40332502 |
caatgaaacattaatgttttttttttttattataacattaattatttattactctatcttttttcaattcttttatttatttttttcata |
40332591 |
T |
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| Q |
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tttacaataccaatgaaacattaatgttatttttcctattataaccttaactatttattactctctcttctttcaagtcttttatttatctttttcata |
352 |
Q |
| |
|
||||| |||| ||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||| || ||| || |||||| ||||| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
17633654 |
tttacgatacgaatgaaacattaatgttatattt---attatacccttaactatttatttctgtcttttttttcaattctttaatttatctttttcata |
17633749 |
T |
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aattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatatgtgtgaaatgcccaaaacgtcatacaattt |
448 |
Q |
| |
|
|||||||||||| ||| ||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||| | ||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
3533420 |
aattttgtaaaattacttataatttcttttttccatacaatattaattacatttcttaatttgtatgaaattactaaaacgtcatataattt |
3533511 |
T |
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aaaacaactcataatatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatatgtgtgaaatgcccaaaacgtcatacaattt |
448 |
Q |
| |
|
|||| |||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||| ||||| |
|
|
| T |
14149298 |
aaaaaaactcataatatctctttcccatgcaaaattaattacatttcttaatatatgtgaaatgttcaaatcgtcatataattt |
14149215 |
T |
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| Q |
254 |
tttacaataccaatgaaacattaatgttatttttcctattataaccttaactatttattactct---ctcttctttcaagtcttttatttatctttt--- |
347 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||| |||| | |||||||||||||| | | |||||||||||| | ||| ||||||||||| |
|
|
| T |
32472763 |
tttacaataacaatgaaacattaatgt-acttttcctaatatacctttaactatttattattattatctcttctttcaattatttaatttatcttttcat |
32472861 |
T |
 |
| Q |
348 |
-----tcat--aggacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatatgtgtgaaa |
426 |
Q |
| |
|
| || ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| || |||| |||||||||||||||| || |||||||| |
|
|
| T |
32472862 |
ataatttattaaggacaattttgtaaaataactcaaaatatctctttctcatacaaaattaattacatttctttatgcgtgtgaaa |
32472947 |
T |
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ctttacaataccaatgaaacattaatgttatttttcctattataaccttaactatttattactctctcttctttcaagtcttttatttatctttttcata |
352 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||| ||| ||||||||| |||| ||| || | ||| |||||| ||| ||||| |
|
|
| T |
34186478 |
ctttacaatatcaatgaaacattaatattactttttctattataaccttaattatgtattactctatctttttttaattttttaatttatatttctcata |
34186379 |
T |
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ataccaatgaaacattaatgttatttttcctattataaccttaactatttattactctctcttctttcaagtcttttatttatctttttcata------- |
352 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| || | || |||||| ||||||||| | || |||||||||| || || |
|
|
| T |
487530 |
ataccaatgaaacattaatgtttttttt--tattataaccttaaccatctcttcctctcttttctttcaatttttaaatttatctttatcgtataattta |
487627 |
T |
 |
| Q |
353 |
----ggacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatatgtgtgaaatgcccaaaac |
436 |
Q |
| |
|
||| ||||||||||||| |||| || ||| ||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||| |
|
|
| T |
487628 |
ttaaggaaaattttgtaaaacgtgtcatgatttcttttttccacataaaattaattacatttcttaatacgtgtgaaattctcaaaac |
487715 |
T |
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tacaataccaatgaaacattaatgttatttttcctattataaccttaactatttattactctc |
318 |
Q |
| |
|
||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
4321142 |
tacaatatcaataaaacattaatgttatttttcttattatatcattaactatttattactctc |
4321080 |
T |
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aataccaatgaaacattaatgttatttttcctattataaccttaactatttattactctctcttctttcaagtcttttatttatcttttt |
348 |
Q |
| |
|
||||||||||||| ||||||| || ||||| ||||||| | |||||||| ||||||| ||||||| ||||| | ||| |||||||||||| |
|
|
| T |
30455424 |
aataccaatgaaatattaatgataattttcttattatatcattaactatatattactttctcttcattcaattatttaatttatcttttt |
30455335 |
T |
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aggacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatatgtgtgaaatgcccaaaacgtcatacaattt |
448 |
Q |
| |
|
||||||||||| ||||||||| |||||||| | |||| ||||| ||||| |||| ||||||||||| ||||||||||| ||| | ||||| ||||| |
|
|
| T |
39387642 |
aggacaattttctaaaacaacccataatatatatttttcacacgatattgattagatttcttaatacatgtgaaatgcctaaatcatcatataattt |
39387738 |
T |
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tttacaataccaatgaaacattaatgttatttttcc-tattataaccttaactatttattactct |
317 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| |||||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||||||| |
|
|
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48070512 |
tttacaataccaatgaaattttaatgttattttttcatattatgaccttaactatttattactct |
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T |
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attaatgttatttttcctattataaccttaactatttattactctctcttctttcaagtcttttatttatctttttcata |
352 |
Q |
| |
|
|||||| ||| |||||| |||||| |||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
3875720 |
attaatattacttttccaattatactattaactatttattactttatcttctttcaattcttttatttatctttctcata |
3875799 |
T |
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425 |
Q |
| |
|
|||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
36317759 |
aggataattttgtaaaaacaactcataatatctctttttcaca--atattaattatatttcttaatatatgtgaa |
36317831 |
T |
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aattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatatgtgtgaaatgcccaaaacgtcatacaattt |
448 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| | ||||||||||||| |||| || |||||||||||||||||||| | |||||| | ||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
49927945 |
aattttgtaaaacaattgataatatctctttcacacataaaattaattacatttcttaatacatttgaaatatctaaaacgtcatataattt |
49927854 |
T |
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acaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatatgtgtgaaatgcccaaaacgtcatacaattta |
449 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||| | ||||| | |||||| |||| |||||||||||||||| ||| || ||||||| | |||| ||||| |||||| |
|
|
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T |
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316 |
Q |
| |
|
||||| ||| ||||| || |||| |||||||||||||| |||||||||| ||| |||| ||||||| |||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
35691748 |
tatttatcctaaattataagtcattttacaataccaataaaacattaattttactttttatattatacccttaattatttattactc |
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T |
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atgaaacattaatgttatttttcctattataaccttaactatttattactctctcttctttcaagtcttttatttatctttttc |
349 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||| || ||||||||||| ||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
25163224 |
atgaaacattaatgttacatttcctattatactcttgactatttatta--ctttcttctttcaattctttagtttatctttttc |
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T |
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tttacaataccaatgaaacattaatgttatttttcctattataaccttaactattta |
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Q |
| |
|
|||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||| |
|
|
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46529980 |
tttataataccaataaaacattaacgttatttttcctattatatcattaactattta |
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T |
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aggacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaatattaattacattt |
410 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||| ||| ||||||||| |
|
|
| T |
16689278 |
aggacaattttgtaaaacaa-tcataatatctctttcccatacaaaatttattacattt |
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T |
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tttacaataccaatgaaacattaatgttattttt |
287 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
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tttacaataccaatgaaacattaatgttattttt |
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T |
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453 |
Q |
| |
|
|||| ||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||| |||||||| ||| |||| |||| |||||| | ||| |||||||||| |
|
|
| T |
9875996 |
gacacttttgtaaaacaactcataatatctctttcttacgtaaaattaatttcatttcttgatacgtgtaaaatatccaaaatggcatttaatttaggat |
9876095 |
T |
 |
| Q |
454 |
g |
454 |
Q |
| |
|
| |
|
|
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9876096 |
g |
9876096 |
T |
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| |
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|
|
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tttataatatcaataagacattaatgttatttttc-tattatactcttaactatttattgctctctctt |
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| |
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|
|
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Alignment:
| Q |
304 |
ctatttattactctctcttctttcaagtcttttatttatctttttcata |
352 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||| |||||| ||||| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
14795249 |
ctatttattactctatcttttttcaattctttaatttatctttttcata |
14795201 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #223
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 355 - 416
Target Start/End: Original strand, 16967040 - 16967103
Alignment:
| Q |
355 |
acaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccac--acaatattaattacatttcttaat |
416 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| ||||||||| ||||||||| || |||| ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
16967040 |
acaattttgtaaaataactcataagatctcttttttaccaacaaaattaattacatttcttaat |
16967103 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #224
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
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Alignment:
| Q |
239 |
caaattgtatgtcactttacaataccaatgaaacattaa-tgttatttttcctattataaccttaactatttattactctctcttctttcaagtctttta |
337 |
Q |
| |
|
|||||| || |||| |||| ||||||||| ||||||||| |||||||||| | | |||| ||| |||||||| ||||| | | ||||||| | ||||| | |
|
|
| T |
27675988 |
caaattataagtcattttataataccaataaaacattaaatgttattttttccactataccctcaactattttttactttatattctttcgaatctttaa |
27675889 |
T |
 |
| Q |
338 |
tttatcttt |
346 |
Q |
| |
|
||||||||| |
|
|
| T |
27675888 |
tttatcttt |
27675880 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #225
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 352 - 428
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Alignment:
| Q |
352 |
aggacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatatgtgtgaaatg |
428 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||||||||||||||||||| | ||| || |||| |||| |||||| ||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
30093753 |
aggacaatattgtaaaacaactcataatatatttttctcatacaaagttaactacattccttaatacgtgtgaaatg |
30093677 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #226
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 352 - 428
Target Start/End: Original strand, 46288106 - 46288182
Alignment:
| Q |
352 |
aggacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatatgtgtgaaatg |
428 |
Q |
| |
|
|||| |||||| |||||||||||||||||| |||||| | |||| ||||||| |||| |||||| |||||||||| |
|
|
| T |
46288106 |
aggataattttataaaacaactcataatatatctttttaatacaaaattaattgtattttttaatacgtgtgaaatg |
46288182 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #227
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
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Target Start/End: Original strand, 4953735 - 4953770
Alignment:
| Q |
417 |
atgtgtgaaatgcccaaaacgtcatacaatttagga |
452 |
Q |
| |
|
|||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
4953735 |
atgtgtgaaatgaccaaaacgtcatacaatttagga |
4953770 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #228
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 285 - 352
Target Start/End: Complemental strand, 6519761 - 6519694
Alignment:
| Q |
285 |
tttcctattataaccttaactatttattactctctcttctttcaagtcttttatttatctttttcata |
352 |
Q |
| |
|
|||||||||||| | | |||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||| ||| ||||| |
|
|
| T |
6519761 |
tttcctattatatcatgaactatttattactcttccttctttcaattctttaatttatttttctcata |
6519694 |
T |
 |
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Target: chr1; HSP #229
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
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Target Start/End: Complemental strand, 20711103 - 20711003
Alignment:
| Q |
254 |
tttacaataccaatgaaacattaatgttatttttcctattataaccttaac---tatttattactctctcttctttcaagtcttttatttatctttttca |
350 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||| || ||| ||||||||| |||||| |||||||| | ||| |||||| |||| || |
|
|
| T |
20711103 |
tttacaataccaatgaaacattaatattactttt-ctattatactctcaactagtatttattattctctcgtctttcaattatttaatttattttttcca |
20711005 |
T |
 |
| Q |
351 |
ta |
352 |
Q |
| |
|
|| |
|
|
| T |
20711004 |
ta |
20711003 |
T |
 |
Back To:
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Target: chr1; HSP #230
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 232 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 34022411 - 34022356
Alignment:
| Q |
232 |
tttgtcccaaattgtatgtcactttacaataccaatgaaacattaatgttattttt |
287 |
Q |
| |
|
||||||| ||||| |||||| |||||||||| ||||| ||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
34022411 |
tttgtcctaaattatatgtcgctttacaatatcaatgcaacattaatgtcattttt |
34022356 |
T |
 |
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Target: chr1; HSP #231
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Query Start/End: Original strand, 240 - 347
Target Start/End: Original strand, 35370340 - 35370447
Alignment:
| Q |
240 |
aaattgtatgtcactttacaataccaatgaaacattaatgttatttttcctattataaccttaactatttattactctctcttctttcaagtcttttatt |
339 |
Q |
| |
|
||||| || |||||||||||| | || |||||||||||| |||||||| ||||| | |||| | | ||||| | ||||| ||||||||| ||||| ||| |
|
|
| T |
35370340 |
aaattataagtcactttacaacatcagtgaaacattaatattattttttatattaaatccttgattgtttatcattctcttttctttcaattctttaatt |
35370439 |
T |
 |
| Q |
340 |
tatctttt |
347 |
Q |
| |
|
||| |||| |
|
|
| T |
35370440 |
tatatttt |
35370447 |
T |
 |
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Target: chr1; HSP #232
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Query Start/End: Original strand, 255 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 3281077 - 3281003
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| Q |
255 |
ttacaataccaatgaaacattaatgttatttttcctattataaccttaactatttattactctctcttctttcaa |
329 |
Q |
| |
|
|||||||| |||||| ||||||| || |||||| ||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
3281077 |
ttacaatattaatgaaccattaatactacttttccatttataacattacctatttattaccctctcttctttcaa |
3281003 |
T |
 |
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Target: chr1; HSP #233
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 358 - 396
Target Start/End: Complemental strand, 10758729 - 10758691
Alignment:
| Q |
358 |
attttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaa |
396 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |
|
|
| T |
10758729 |
attttgtaaaacaactcataatatttctttcccacacaa |
10758691 |
T |
 |
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Target: chr1; HSP #234
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Query Start/End: Original strand, 300 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 14149373 - 14149327
Alignment:
| Q |
300 |
ttaactatttattactctctcttctttcaagtcttttatttatcttt |
346 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| | ||||||||||||| ||||| |||||||||| |
|
|
| T |
14149373 |
ttaactatttattaatatctcttctttcaattctttaatttatcttt |
14149327 |
T |
 |
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Target: chr1; HSP #235
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Query Start/End: Original strand, 284 - 346
Target Start/End: Original strand, 21041093 - 21041153
Alignment:
| Q |
284 |
ttttcctattataaccttaactatttattactctctcttctttcaagtcttttatttatcttt |
346 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||| |||||| ||||| |||||||||| |
|
|
| T |
21041093 |
ttttcctattataaccttcattatttattactctttctt-tttcaa-tctttaatttatcttt |
21041153 |
T |
 |
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Target: chr1; HSP #236
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 355 - 436
Target Start/End: Complemental strand, 25279402 - 25279320
Alignment:
| Q |
355 |
acaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaatattaattaca-tttcttaatatgtgtgaaatgcccaaaac |
436 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||||||||||| |||| ||| || | |||||||||| ||| |||||| ||||||||| || ||||| |
|
|
| T |
25279402 |
acaattttgtaaaataactcataatattcctttaccatactaaattaattacatttttttaatacgtgtgaaattccaaaaac |
25279320 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #237
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 374 - 428
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Alignment:
| Q |
374 |
cataatatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatatgtgtgaaatg |
428 |
Q |
| |
|
|||||| ||| ||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
28782640 |
cataatttcttttttccatacacaattgattacatttcttaatatgtgtgaaatg |
28782586 |
T |
 |
Back To:
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Target: chr1; HSP #238
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 283 - 337
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Alignment:
| Q |
283 |
tttttcctattataaccttaactatttattactctctcttctttcaagtctttta |
337 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||| |||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
29086643 |
tttttcctatcataccctttactatttattgttctctcttctttcaattctttta |
29086589 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #239
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 398 - 448
Target Start/End: Original strand, 50326229 - 50326279
Alignment:
| Q |
398 |
attaattacatttcttaatatgtgtgaaatgcccaaaacgtcatacaattt |
448 |
Q |
| |
|
||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||| ||||| ||||| |
|
|
| T |
50326229 |
attaattacattttttaatatgtgtgaaatgtctaaaacatcatataattt |
50326279 |
T |
 |
Back To:
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Target: chr1; HSP #240
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Query Start/End: Original strand, 276 - 329
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| Q |
276 |
aatgttatttttcctattataaccttaactatttattactctctcttctttcaa |
329 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||| ||| |||||| |||| |
|
|
| T |
1938664 |
aatgttacttttcctattatacccttaactgtttattattctttcttctctcaa |
1938717 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #241
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 230 - 273
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| Q |
230 |
tatttgtcccaaattgtatgtcactttacaataccaatgaaaca |
273 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
8012656 |
tatttgtcccaaat---atgtcactttacaataccaatgaaaca |
8012616 |
T |
 |
Back To:
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Target: chr1; HSP #242
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Query Start/End: Original strand, 240 - 281
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| Q |
240 |
aaattgtatgtcactttacaataccaatgaaacattaatgtt |
281 |
Q |
| |
|
||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
9001628 |
aaattatatgtcactttacaatatcaatgaatcattaatgtt |
9001669 |
T |
 |
Back To:
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Target: chr1; HSP #243
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Query Start/End: Original strand, 352 - 437
Target Start/End: Original strand, 29091801 - 29091886
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| Q |
352 |
aggacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatatgtgtgaaatgcccaaaacg |
437 |
Q |
| |
|
||||||||||| || || |||||||||||| | |||| | |||| |||||||||||| ||||||||| | ||||| |||||||| |
|
|
| T |
29091801 |
aggacaattttatagaaaaactcataatatattttttatatacaaatttaattacattttttaatatgtataaaatgtccaaaacg |
29091886 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #244
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 231 - 296
Target Start/End: Original strand, 39387507 - 39387572
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| Q |
231 |
atttgtcccaaattgtatgtcactttacaataccaatgaaacattaatgttatttttcctattata |
296 |
Q |
| |
|
||||||||||| || |||| | |||| |||||||||| ||| |||||||||| |||| |||||||| |
|
|
| T |
39387507 |
atttgtcccaatttatatgacgctttgcaataccaataaaatattaatgttactttttctattata |
39387572 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #245
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| Q |
240 |
aaattgtatgtcactttacaataccaatgaaacattaatgttatttttcctattataaccttaactatttattactctctcttctttcaa |
329 |
Q |
| |
|
||||| ||| ||| ||||||||| | | ||| ||||||||||||||| ||||||| |||||| || |||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
42334561 |
aaattatatatcattttacaatatcgacgaagtattaatgttattttttttattatatccttaatta-ttattactatctcttctttcaa |
42334649 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
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| Q |
254 |
tttacaataccaatgaaacattaatgttatttttcctattataaccttaactatttattactctct |
319 |
Q |
| |
|
|||| |||||||||| || |||||| ||| |||| |||||||||||||||||||| ||| ||||| |
|
|
| T |
43901433 |
tttataataccaatgtaatattaatattacttttaatattataaccttaactattttttaatctct |
43901498 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
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| Q |
357 |
aattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaatatta |
401 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||| |
|
|
| T |
6519678 |
aattttgtaaaacaactcataatatttctttctcacacaaaatta |
6519634 |
T |
 |
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| Q |
276 |
aatgttatttttcctattataaccttaactatttattactctctcttctttcaagtcttttatttatct |
344 |
Q |
| |
|
||||||||||||| || |||| | | |||||||||||||||| |||||||||| | ||| |||||||| |
|
|
| T |
9414333 |
aatgttatttttcttactatatcatcaactatttattactcttacttctttcaattatttaatttatct |
9414265 |
T |
 |
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| Q |
265 |
aatgaaacattaatgttatttttcctattataaccttaactatttattactct |
317 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||| ||||||| ||||| || ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
16689374 |
aatgaagcattaatgctattttttctattgtattcttaactatttattactct |
16689322 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
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| Q |
352 |
aggacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaatattaattacatttcttaat |
416 |
Q |
| |
|
||||||||||| |||||||| || |||||||| ||| ||||||| |||||||| |||| ||||| |
|
|
| T |
47945928 |
aggacaattttataaaacaattcgtaatatctttttctcacacaaaattaattatattttttaat |
47945992 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #251
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| Q |
266 |
atgaaacattaatgttatttttcctattataaccttaactatttattactctctcttctttcaa |
329 |
Q |
| |
|
|||||| |||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||| |
|
|
| T |
49325028 |
atgaaatattaatattattttt--tattatactcttaactatttattattatctcttctttcaa |
49325089 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #252
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 352 - 416
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| Q |
352 |
aggacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaatattaattacatttcttaat |
416 |
Q |
| |
|
|||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||| |||| | |||| ||||| |
|
|
| T |
51690960 |
aggataattttgtaaaatcactcataatttctcttttccatacaatactaataatattttttaat |
51690896 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6 (Bit Score: 171; Significance: 2e-91; HSPs: 151)
Name: chr6
Description:
Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 171; E-Value: 2e-91
Query Start/End: Original strand, 190 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 690541 - 690284
Alignment:
| Q |
190 |
tactccatccgtcctaaattgtatgtcattttnnnnnnnntatttgtcccaaattgtatgtcactttacaataccaatgaaacattaatgttatttttcc |
289 |
Q |
| |
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|
|
| T |
690541 |
tactccctccatcctaaattgtatgtcattttagaaaaaatatttgtcccaaattatatgttactttataataccaatgaaacattaatgttacttttc- |
690443 |
T |
 |
| Q |
290 |
tattataaccttaactatttattactctctcttctttcaagtcttttatttatctttttcataggacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttc |
389 |
Q |
| |
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|
|
| T |
690442 |
tattataaccttaactatttattactctcttttctttcaagttttttatttatctttttaataggacaattttgtaaaacaacttataatatctcttttc |
690343 |
T |
 |
| Q |
390 |
cacacaatattaattacatttcttaatatgtgtgaaatgcccaaaacgtcatacaattt |
448 |
Q |
| |
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|
|
| T |
690342 |
cacacaatattaattatatttcttaatatgtgtgaaatgcttaaaacatcatacaattt |
690284 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 159; E-Value: 2e-84
Query Start/End: Original strand, 190 - 463
Target Start/End: Complemental strand, 8415285 - 8415001
Alignment:
| Q |
190 |
tactccatccgtcctaaattgtatgtcattttnnnnnnnntatttgtcccaaattgtatgtcactttacaataccaatgaaacattaatgttatttttcc |
289 |
Q |
| |
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|
|
| T |
8415285 |
tactccatccgtcccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccatattgtatgtcgctttacaataccaatgaaaaattaatgttacttttcc |
8415186 |
T |
 |
| Q |
290 |
tattataaccttaactatttattactctctcttctttcaagtcttttatttatctttttcata-----------ggacaattttgtaaaacaactcataa |
378 |
Q |
| |
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|
|
| T |
8415185 |
tattatatccttaactatttattactctctcttctttcaattccttcatttatcttttccatatcatttattaaggacaattttgtaaaacaactcataa |
8415086 |
T |
 |
| Q |
379 |
tatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatatgtgtgaaatgcccaaaacgtcatacaatttaggatgaagggagta |
463 |
Q |
| |
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|
| T |
8415085 |
tatctctttcccacacaatattaattgcatttcttaatatgtgtgaaatgcccaaaacgtcatacaatttgggacggagggagta |
8415001 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 158; E-Value: 9e-84
Query Start/End: Original strand, 188 - 464
Target Start/End: Original strand, 11172883 - 11173170
Alignment:
| Q |
188 |
attactccatccgtcctaaattgtatgtcattttnnnnnnnntatttgtcccaaattgtatgtcactttacaataccaatgaaacattaatgttattttt |
287 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| |||| |
|
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| T |
11172883 |
attactccctccgtcccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcgctttacaataccaatgaaaaattaatgttactttt |
11172982 |
T |
 |
| Q |
288 |
cctattataaccttaactatttattactctctcttctttcaagtcttttatttatctttttcat-----------aggacaattttgtaaaacaactcat |
376 |
Q |
| |
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|
|
| T |
11172983 |
cctattatatccttaactatttattactctctcttctttcaattccttcatttatctttctcatatcatttattgaggataattttgtaaaacaactcat |
11173082 |
T |
 |
| Q |
377 |
aatatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatatgtgtgaaatgcccaaaacgtcatacaatttaggatgaagggagtaa |
464 |
Q |
| |
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|
|
| T |
11173083 |
aatatctctttcccacacaatattaattacatttcttaatatgtgtgaaatgcccaaaacgtcatgcaatttgggacggagggagtaa |
11173170 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 155; E-Value: 6e-82
Query Start/End: Original strand, 190 - 463
Target Start/End: Complemental strand, 14311048 - 14310764
Alignment:
| Q |
190 |
tactccatccgtcctaaattgtatgtcattttnnnnnnnntatttgtcccaaattgtatgtcactttacaataccaatgaaacattaatgttatttttcc |
289 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
14311048 |
tactccctccgtccgaaattgtatgtcattttaaaaaaaatatttgtcctaaattgtatgtcactttagaatatcaatgaaacattaatgttatttttcc |
14310949 |
T |
 |
| Q |
290 |
tattataaccttaactatttattactctctcttctttcaagtcttttatttatctttttcata-----------ggacaattttgtaaaacaactcataa |
378 |
Q |
| |
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|
| T |
14310948 |
tattatatccttaactatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttctcatatcatttattaaggataattttgtaaaacaactcataa |
14310849 |
T |
 |
| Q |
379 |
tatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatatgtgtgaaatgcccaaaacgtcatacaatttaggatgaagggagta |
463 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||| |
|
|
| T |
14310848 |
tatctctttcccacacaatattaattatatttcttaatatgtgtgaaatgctcaaaacgtcatacaatttgggacgaagggagta |
14310764 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 154; E-Value: 2e-81
Query Start/End: Original strand, 197 - 465
Target Start/End: Complemental strand, 9660500 - 9660221
Alignment:
| Q |
197 |
tccgtcctaaattgtatgtcattttnnnnnnnntatttgtcccaaattgtatgtcactttacaataccaatgaaacattaatgttatttttcctattata |
296 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
9660500 |
tccgtcccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattatatgtcgctttacaataccaatgaaacattaatgttatttttcttattata |
9660401 |
T |
 |
| Q |
297 |
accttaactatttattactctctcttctttcaagtcttttatttatctttttcata-----------ggacaattttgtaaaacaactcataatatctct |
385 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
9660400 |
tccttaactatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccatatcatttattaaggacaattttgtaaaacaactcataatatctct |
9660301 |
T |
 |
| Q |
386 |
tttccacacaatattaattacatttcttaatatgtgtgaaatgcccaaaacgtcatacaatttaggatgaagggagtaat |
465 |
Q |
| |
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|
|
| T |
9660300 |
ttcccacacaatattaattacatttcttaatatgtgtgaaatgcccaaaacgtcatacaatttgggacggagggagtaat |
9660221 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 153; E-Value: 9e-81
Query Start/End: Original strand, 190 - 465
Target Start/End: Original strand, 6835712 - 6835998
Alignment:
| Q |
190 |
tactccatccgtcctaaattgtatgtcattttnnnnnnnntatttgtcccaaattgtatgtcactttacaataccaatgaaacattaatgttatttttcc |
289 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
6835712 |
tactccctccgtcccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaatattaatgttatttttcc |
6835811 |
T |
 |
| Q |
290 |
tattataaccttaactatttattactctctcttctttcaagtcttttatttatctttttcata-----------ggacaattttgtaaaacaactcataa |
378 |
Q |
| |
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|
|
| T |
6835812 |
tattatatccttaactatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccatatcatttattaaggataattttgtaaaacaactcataa |
6835911 |
T |
 |
| Q |
379 |
tatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatatgtgtgaaatgcccaaaacgtcatacaatttaggatgaagggagtaat |
465 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
6835912 |
tatctctttcccacacaatatcaattacatttcttaatatgtgtgaaatgcccaaaacgtcatacaatttgggacggagggagtaat |
6835998 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 151; E-Value: 1e-79
Query Start/End: Original strand, 190 - 463
Target Start/End: Original strand, 3787092 - 3787376
Alignment:
| Q |
190 |
tactccatccgtcctaaattgtatgtcattttnnnnnnnntatttgtcccaaattgtatgtcactttacaataccaatgaaacattaatgttatttttcc |
289 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |
|
|
| T |
3787092 |
tactccctccgtcccaaattgtatgtcactttaaaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttattttttc |
3787191 |
T |
 |
| Q |
290 |
tattataaccttaactatttattactctctcttctttcaagtcttttatttatctttttcat-----------aggacaattttgtaaaacaactcataa |
378 |
Q |
| |
|
||||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||| |||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
3787192 |
tattatatccttaactatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccatatcatttattaaggataattttgtaaaacaactcataa |
3787291 |
T |
 |
| Q |
379 |
tatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatatgtgtgaaatgcccaaaacgtcatacaatttaggatgaagggagta |
463 |
Q |
| |
|
||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| | |||||||| |
|
|
| T |
3787292 |
tatctctttcccacacaatattaattacatttcttaatatgtgtgaaatgcccaaaacatcatacaatttgggacggagggagta |
3787376 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 151; E-Value: 1e-79
Query Start/End: Original strand, 197 - 466
Target Start/End: Complemental strand, 30739426 - 30739146
Alignment:
| Q |
197 |
tccgtcctaaattgtatgtcattttnnnnnnnntatttgtcccaaattgtatgtcactttacaataccaatgaaacattaatgttatttttcctattata |
296 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
30739426 |
tccgtcccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgatacattaatattatttttcctattata |
30739327 |
T |
 |
| Q |
297 |
accttaactatttattactctctcttctttcaagtcttttatttatctttttcata-----------ggacaattttgtaaaacaactcataatatctct |
385 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
30739326 |
ttcttaactatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttctcatatcatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatatctct |
30739227 |
T |
 |
| Q |
386 |
tttccacacaatattaattacatttcttaatatgtgtgaaatgcccaaaacgtcatacaatttaggatgaagggagtaatt |
466 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
30739226 |
ttcccacacaatattaattacatttcttaatatgtgtgaaatgcccaaaacgtcatacaatttgggatggagggaataatt |
30739146 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 149; E-Value: 2e-78
Query Start/End: Original strand, 185 - 464
Target Start/End: Original strand, 31492875 - 31493165
Alignment:
| Q |
185 |
taaattactccatccgtcctaaattgtatgtcattttnnnnnnnntatttgtcccaaattgtatgtcactttacaataccaatgaaacattaatgttatt |
284 |
Q |
| |
|
|||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | |
|
|
| T |
31492875 |
taaaataccccatccgtcttaaattgtatgtcattttaggaaaaaaaattgtcccaaattgtatgtcactttacaataccaatgaaatattaatgttact |
31492974 |
T |
 |
| Q |
285 |
tttcctattataaccttaactatttattactctctcttctttcaagtcttttatttatctttttcata-----------ggacaattttgtaaaacaact |
373 |
Q |
| |
|
|||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
31492975 |
tttcctattatatccttaattatttattactctttcttctttcaattctttcatttatctttcccatatcatttattaaggacaattttgtaaaacaact |
31493074 |
T |
 |
| Q |
374 |
cataatatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatatgtgtgaaatgcccaaaacgtcatacaatttaggatgaagggagtaa |
464 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||| |
|
|
| T |
31493075 |
cataatatctatttcccacacaatattaattacatttcttaatatgtgttaaatgcccaaaacgtcatgcaatttgggatggagggagtaa |
31493165 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 149; E-Value: 2e-78
Query Start/End: Original strand, 185 - 464
Target Start/End: Original strand, 31498264 - 31498554
Alignment:
| Q |
185 |
taaattactccatccgtcctaaattgtatgtcattttnnnnnnnntatttgtcccaaattgtatgtcactttacaataccaatgaaacattaatgttatt |
284 |
Q |
| |
|
|||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | |
|
|
| T |
31498264 |
taaaataccccatccgtcttaaattgtatgtcattttaggaaaaaaaattgtcccaaattgtatgtcactttacaataccaatgaaatattaatgttact |
31498363 |
T |
 |
| Q |
285 |
tttcctattataaccttaactatttattactctctcttctttcaagtcttttatttatctttttcata-----------ggacaattttgtaaaacaact |
373 |
Q |
| |
|
|||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
31498364 |
tttcctattatatccttaattatttattactctttcttctttcaattctttcatttatctttcccatatcatttattaaggacaattttgtaaaacaact |
31498463 |
T |
 |
| Q |
374 |
cataatatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatatgtgtgaaatgcccaaaacgtcatacaatttaggatgaagggagtaa |
464 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||| |
|
|
| T |
31498464 |
cataatatctatttcccacacaatattaattacatttcttaatatgtgttaaatgcccaaaacgtcatgcaatttgggatggagggagtaa |
31498554 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 148; E-Value: 9e-78
Query Start/End: Original strand, 230 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 25526894 - 25526665
Alignment:
| Q |
230 |
tatttgtcccaaattgtatgtcactttacaataccaatgaaacattaatgttatttttcctattataaccttaactatttattactctctcttctttcaa |
329 |
Q |
| |
|
||||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
25526894 |
tatttgtcctaaattgtatgtcgctttacaatatcaatgaaaaattaatgttatttttcctattatatccttaactatttattactctctcttctttcaa |
25526795 |
T |
 |
| Q |
330 |
gtcttttatttatctttttcata-----------ggacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatat |
418 |
Q |
| |
|
|| || |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
25526794 |
ttccttcatttatctttctcatatcatttattgaggacaattttgtaaaacaactcataatatctttttcccacacaatattaattacatttcttaatat |
25526695 |
T |
 |
| Q |
419 |
gtgtgaaatgcccaaaacgtcatacaattt |
448 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
25526694 |
gtgtgaaatgcccaaaacgtcatacaattt |
25526665 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 148; E-Value: 9e-78
Query Start/End: Original strand, 231 - 464
Target Start/End: Original strand, 29344017 - 29344260
Alignment:
| Q |
231 |
atttgtcccaaattgtatgtcactttacaataccaatgaaacattaatgttatttttcctattataaccttaactatttattactctctcttctttcaag |
330 |
Q |
| |
|
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|
| T |
29344017 |
atttgtcccaaattatatgtcgctttaaaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttaattatttattactttctcttctttcaat |
29344116 |
T |
 |
| Q |
331 |
tcttttatttatcttt--------ttcat--aggacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatatgt |
420 |
Q |
| |
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||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |
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|
| T |
29344117 |
tctttcatttatctttcccaattattcattaaggacaattttgtaaaacaactcataatatcttttttccacacaatattaattgcatttcttaatatgt |
29344216 |
T |
 |
| Q |
421 |
gtgaaatgcccaaaacgtcatacaatttaggatgaagggagtaa |
464 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||| |
|
|
| T |
29344217 |
gtgaaatgcccaaaacatcatacaatttaggacggagggagtaa |
29344260 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 147; E-Value: 3e-77
Query Start/End: Original strand, 230 - 463
Target Start/End: Complemental strand, 13631304 - 13631060
Alignment:
| Q |
230 |
tatttgtcccaaattgtatgtcactttacaataccaatgaaacattaatgttatttttcctattataaccttaactatttattactctctcttctttcaa |
329 |
Q |
| |
|
|||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
13631304 |
tatttgtctcaaattatatgtcgctttacaataccaatgaaaaattaatgttacttttcctattatatccttaactatttattgctctctcttctttcaa |
13631205 |
T |
 |
| Q |
330 |
gtcttttatttatctttttcata-----------ggacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatat |
418 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
13631204 |
ttccttcatttatctttctcatatcatttattgaggacaattttgtaaaacaactcataatatctctttcccacacaatattaattacatttcttaatat |
13631105 |
T |
 |
| Q |
419 |
gtgtgaaatgcccaaaacgtcatacaatttaggatgaagggagta |
463 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||| |
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| T |
13631104 |
gtgtgaaatgcccaaaacgtcatacaatttgggacggagggagta |
13631060 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 145; E-Value: 5e-76
Query Start/End: Original strand, 230 - 465
Target Start/End: Complemental strand, 8493639 - 8493393
Alignment:
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230 |
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T |
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Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 145; E-Value: 5e-76
Query Start/End: Original strand, 230 - 465
Target Start/End: Original strand, 26409087 - 26409333
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329 |
Q |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 144; E-Value: 2e-75
Query Start/End: Original strand, 230 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 31949382 - 31949153
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329 |
Q |
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T |
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Q |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 143; E-Value: 8e-75
Query Start/End: Original strand, 190 - 463
Target Start/End: Complemental strand, 12499752 - 12499468
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Q |
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463 |
Q |
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T |
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Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 143; E-Value: 8e-75
Query Start/End: Original strand, 190 - 463
Target Start/End: Original strand, 12509149 - 12509433
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289 |
Q |
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| T |
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T |
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T |
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Target: chr6; HSP #19
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Query Start/End: Original strand, 230 - 463
Target Start/End: Original strand, 11615392 - 11615637
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| T |
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T |
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T |
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Q |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 140; E-Value: 5e-73
Query Start/End: Original strand, 190 - 468
Target Start/End: Original strand, 17360599 - 17360888
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| T |
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17360798 |
T |
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468 |
Q |
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17360888 |
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Target: chr6; HSP #21
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Query Start/End: Original strand, 230 - 464
Target Start/End: Original strand, 6612414 - 6612660
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T |
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T |
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tgtgtgaaatgtccaaaacgtcatacaatttgggacggagggagtaa |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 136; E-Value: 1e-70
Query Start/End: Original strand, 190 - 448
Target Start/End: Original strand, 1352471 - 1352740
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T |
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378 |
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448 |
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| T |
1352671 |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 136; E-Value: 1e-70
Query Start/End: Original strand, 190 - 448
Target Start/End: Original strand, 1778823 - 1779091
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Q |
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| T |
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tactccatccgtcccaaattgtatgtcactctagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcgttttacaataccaatgaaaaattaatgttatttt-cc |
1778921 |
T |
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290 |
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| T |
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T |
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379 |
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| T |
1779022 |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 136; E-Value: 1e-70
Query Start/End: Original strand, 190 - 452
Target Start/End: Complemental strand, 15989870 - 15989597
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289 |
Q |
| |
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| T |
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tactccctccgtcccaaattgtatgtcattttaaaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcattttacaataccaatgaaacattaatgttacttttcc |
15989771 |
T |
 |
| Q |
290 |
tattataaccttaactatttattactctctcttctttcaagtcttttatttatctttttcat-----------aggacaattttgtaaaacaactcataa |
378 |
Q |
| |
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| T |
15989770 |
tattatatccttaactatttattaatctttcttatttcaattctttcatttatctttctcatatcatttattaaggataattttgtaaaacaactcataa |
15989671 |
T |
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| Q |
379 |
tatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatatgtgtgaaatgcccaaaacgtcatacaatttagga |
452 |
Q |
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| T |
15989670 |
tatctctttcctacatagtattaattacatttcttaatatgtgtgaaatattcaaaacgtcatacaatttagga |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 136; E-Value: 1e-70
Query Start/End: Original strand, 230 - 452
Target Start/End: Original strand, 20605609 - 20605842
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230 |
tatttgtcccaaattgtatgtcactttacaataccaatgaaacattaatgttatttttcctattataaccttaactatttattactctctcttctttcaa |
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Q |
| |
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tatttgtcctaaattatatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttaactatttattaatctcttttctttcaa |
20605708 |
T |
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418 |
Q |
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| T |
20605709 |
ttctttcatttatctttcccatgttatttattaaggataattttataaaacaactcataatatctcttttctacacaatattaattgcatttcttaatat |
20605808 |
T |
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| Q |
419 |
gtgtgaaatgcccaaaacgtcatacaatttagga |
452 |
Q |
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| T |
20605809 |
gtgtgaaatgcccaaaacgtcatacaatttagga |
20605842 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 135; E-Value: 5e-70
Query Start/End: Original strand, 238 - 463
Target Start/End: Original strand, 21858574 - 21858810
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ccaaattgtatgtcactttacaataccaatgaaacattaatgttatttttcctattataaccttaactatttattactctctcttctttcaagtctttta |
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Q |
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ccaaaatgtacgtccctttacaataccaatgaaaaattaatgttacttttcctattatatccttaactatttattactctctattctttcaattccttca |
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T |
 |
| Q |
338 |
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426 |
Q |
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| T |
21858674 |
tttatctttcccatatcatttattgaggacaattttgtaaaacaactcataatatctctttcccacacaatattaattacatttcttaatatgtgtgaaa |
21858773 |
T |
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427 |
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463 |
Q |
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| T |
21858774 |
tgcccaaaacgtcatacaatttgggacggagggagta |
21858810 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 135; E-Value: 5e-70
Query Start/End: Original strand, 231 - 448
Target Start/End: Original strand, 24430190 - 24430418
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atttgtcccaaattgtatgtcactttacaataccaatgaaacattaatgttatttttcctattataaccttaactatttattactctctcttctttcaag |
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| |
|
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| T |
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atttgtcccaaattatatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacatttcctattataaccttaactatttattactatctcttctttcaat |
24430289 |
T |
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331 |
tcttttatttatctttttcat-----------aggacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatatg |
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Q |
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| T |
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tctttcatttatctttcccatgttatttattaaggacaattttgtaaaacaactcataatatcttttttccacacaatattaattgcatttcttaatatg |
24430389 |
T |
 |
| Q |
420 |
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448 |
Q |
| |
|
||| |||||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
24430390 |
tgtaaaatgctcaaaacgtcatacaattt |
24430418 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #28
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Target Start/End: Original strand, 3337421 - 3337657
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329 |
Q |
| |
|
|||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
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tatttgtctcaaattgtatgtcactttacaatatcaatgaaacattaatgttacttttcctattatatccttaactatttattactctttcttctttcat |
3337520 |
T |
 |
| Q |
330 |
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427 |
Q |
| |
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| |||| |||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| |
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3337521 |
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T |
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| Q |
428 |
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464 |
Q |
| |
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||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||| |
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| T |
3337621 |
gcccaaaacatcatacaatttaggacggagggagtaa |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #29
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Target Start/End: Original strand, 4130893 - 4131120
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330 |
Q |
| |
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|
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T |
 |
| Q |
331 |
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419 |
Q |
| |
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| T |
4130993 |
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4131092 |
T |
 |
| Q |
420 |
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447 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||| |
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| T |
4131093 |
tgtgaaatgcccaaaacgtcatacaatt |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 134; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 197 - 465
Target Start/End: Original strand, 14499115 - 14499394
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Q |
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|
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T |
 |
| Q |
297 |
accttaactatttattactctctcttctttcaagtcttttatttatctttttcata-----------ggacaattttgtaaaacaactcataatatctct |
385 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
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14499314 |
T |
 |
| Q |
386 |
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465 |
Q |
| |
|
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|
| T |
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ttcccacacaatattaattacatttcttaatatgtgtgaaatgcttaaaacgtcataaaatttaggacggagagagtaat |
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T |
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Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 132; E-Value: 3e-68
Query Start/End: Original strand, 233 - 463
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332 |
Q |
| |
|
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|
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| T |
6850053 |
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T |
 |
| Q |
333 |
ttttatttatctttttcatag-----------gacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatatgtg |
421 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
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tttcatttatctttctcatattatttattaaagacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacaaaatattaattgcatttcttaatatgtg |
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T |
 |
| Q |
422 |
tgaaatgcccaaaacgtcatacaatttaggatgaagggagta |
463 |
Q |
| |
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|
| T |
6850253 |
tgaaatgcctaaaacgtcatacattttgggatggagggagta |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 131; E-Value: 1e-67
Query Start/End: Original strand, 190 - 463
Target Start/End: Complemental strand, 2603677 - 2603393
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289 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||| ||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | |||| | |
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|
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2603677 |
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T |
 |
| Q |
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378 |
Q |
| |
|
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|
| T |
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tattatatccttaactatttattattcttttttttttcaattcttacatttatcttttccatatcatttattaaggataattttgtaaaacaactcataa |
2603478 |
T |
 |
| Q |
379 |
tatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatatgtgtgaaatgcccaaaacgtcatacaatttaggatgaagggagta |
463 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
2603477 |
tatctctttcccacacaatattaattatatttcttaatatgtgtgaaatgcccaaaacgtcatacaatttgggacggagggagta |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 129; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 190 - 465
Target Start/End: Original strand, 1228395 - 1228681
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| Q |
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289 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
1228395 |
tactccctccgtcttaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtttcaaattgtatgtcactttacaatatcaataaaacattaatgttatttttcc |
1228494 |
T |
 |
| Q |
290 |
tattataaccttaactatttattactctctcttctttcaagtcttttatttatctttttcata-----------ggacaattttgtaaaacaactcataa |
378 |
Q |
| |
|
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|
| T |
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gattatatccttaagtatttattactctttcttccttcaattctttcatttatctttctcatatcatttattaaggataattttgtaaaacaactcataa |
1228594 |
T |
 |
| Q |
379 |
tatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatatgtgtgaaatgcccaaaacgtcatacaatttaggatgaagggagtaat |
465 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
1228595 |
catctctttcccacacaatattaattacatttcttaatatgtgtaaaatgcccaaaacgttatacaatttgggacggatggagtaat |
1228681 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 129; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 232 - 463
Target Start/End: Complemental strand, 2010308 - 2010066
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232 |
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331 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
2010308 |
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2010209 |
T |
 |
| Q |
332 |
cttttatttatctttttcat-----------aggacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatatgt |
420 |
Q |
| |
|
|||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||| | |
|
|
| T |
2010208 |
ctttcatttatctttcccatatcatttattaaggacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaaaatatattacattttttaatatat |
2010109 |
T |
 |
| Q |
421 |
gtgaaatgcccaaaacgtcatacaatttaggatgaagggagta |
463 |
Q |
| |
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|
| T |
2010108 |
gtgaaatgtctaaaacgtcatacaatttgggacggagggagta |
2010066 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 128; E-Value: 7e-66
Query Start/End: Original strand, 190 - 448
Target Start/End: Original strand, 8201460 - 8201729
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| Q |
190 |
tactccatccgtcctaaattgtatgtcattttnnnnnnnntatttgtcccaaattgtatgtcactttacaataccaatgaaacattaatgttatttttcc |
289 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||| ||||||||||||| ||| |||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |
|
|
| T |
8201460 |
tactccctccgtcccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtctcaaattatatgtcgctttacaataccaatgaaaaattaatgttacttttct |
8201559 |
T |
 |
| Q |
290 |
tattataaccttaactatttattactctctcttctttcaagtcttttatttatctttttcata-----------ggacaattttgtaaaacaactcataa |
378 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||| || || |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
8201560 |
tattatatccttaacaatttattactttctcttctttcaattccttcatttatctttctcatatcatttattgaggacaattttgtaaaacaactcataa |
8201659 |
T |
 |
| Q |
379 |
tatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatatgtgtgaaatgcccaaaacgtcatacaattt |
448 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
8201660 |
tatctctttcccacacaatattaattatatttcttaatatgtgtaaaatgtccaaaacgtcatacaattt |
8201729 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #36
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Target Start/End: Complemental strand, 9038488 - 9038260
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329 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
9038488 |
tatttgtcccaaattatatgtcgctttataataccaatgaaaaatta-tgttacttttcctattatatccttaaccatttattactctctcttctttcaa |
9038390 |
T |
 |
| Q |
330 |
gtcttttatttatctttttcata-----------ggacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatat |
418 |
Q |
| |
|
|| || |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
9038389 |
ttccttcatttatctttttcatataatttattgaggacaattttgtaaaacaactcataatatctttttcccacacaatattaattacatttcttaatat |
9038290 |
T |
 |
| Q |
419 |
gtgtgaaatgcccaaaacgtcatacaattt |
448 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
9038289 |
gtgtgaaatgtccaaaatgtcatacaattt |
9038260 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 128; E-Value: 7e-66
Query Start/End: Original strand, 230 - 448
Target Start/End: Original strand, 14304386 - 14304615
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| Q |
230 |
tatttgtcccaaattgtatgtcactttacaataccaatgaaacattaatgttatttttcctattataaccttaactatttattactctctcttctttcaa |
329 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
14304386 |
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T |
 |
| Q |
330 |
gtcttttatttatctttttcata-----------ggacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatat |
418 |
Q |
| |
|
|| || |||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
14304486 |
ttccttcatttatctttctcatatcatttattgaggataattttgtaaaacaactcataatatctctttcccacacaatattaattacatttcttaatat |
14304585 |
T |
 |
| Q |
419 |
gtgtgaaatgcccaaaacgtcatacaattt |
448 |
Q |
| |
|
|||| ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
14304586 |
gtgttaaatgcccaaaacgtcatacaattt |
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T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #38
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Query Start/End: Original strand, 230 - 448
Target Start/End: Original strand, 17941648 - 17941876
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230 |
tatttgtcccaaattgtatgtcactttacaataccaatgaaacattaatgttatttttcctattataaccttaactatttattactctctcttctttcaa |
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Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
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T |
 |
| Q |
330 |
gtcttttatttatctttttcata-----------ggacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatat |
418 |
Q |
| |
|
|| || |||||||||| |||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
17941747 |
ttccttcatttatctttcccatatcatttgttaaggacaattttataaaacaattcataatatctctttcccacacaatattaattacatttcttaatat |
17941846 |
T |
 |
| Q |
419 |
gtgtgaaatgcccaaaacgtcatacaattt |
448 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
17941847 |
gtgtgaaatgcccaaaacgtcatacaattt |
17941876 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #39
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337 |
Q |
| |
|
||||||| |||||| |||||||||||| ||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
28075253 |
ccaaattatatgtcgctttacaatacctatgcaacattaatattacttttcctattataaccttaaatatttattactctctcttctttcaattctttta |
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T |
 |
| Q |
338 |
tttatctttttcata-----------ggacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatatgtgtgaaa |
426 |
Q |
| |
|
|| ||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |
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|
| T |
28075153 |
ttgatcttttccatattatttattaagaacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaatatttattgcatttcttaatatgtgtgaaa |
28075054 |
T |
 |
| Q |
427 |
tgcccaaaacgtcatacaattt |
448 |
Q |
| |
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||| |||||||||||||||||| |
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|
| T |
28075053 |
tgctcaaaacgtcatacaattt |
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T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 128; E-Value: 7e-66
Query Start/End: Original strand, 232 - 463
Target Start/End: Complemental strand, 30510994 - 30510752
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tttgtcccaaattgtatgtcactttacaataccaatgaaacattaatgttatttttcctattataaccttaactatttattactctctcttctttcaagt |
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| |
|
|||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||||| | ||||| ||| ||||| |
|
|
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T |
 |
| Q |
332 |
cttttatttatcttt-----ttcat------aggacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatatgt |
420 |
Q |
| |
|
| || |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
30510894 |
cattcatttatctttcccatttcatttattaaggacaattttgtaaaacaactcataatatctctttcccatacaaaattaattacatttcttaatatgt |
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T |
 |
| Q |
421 |
gtgaaatgcccaaaacgtcatacaatttaggatgaagggagta |
463 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||| |
|
|
| T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 127; E-Value: 3e-65
Query Start/End: Original strand, 231 - 448
Target Start/End: Original strand, 3888603 - 3888831
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| |
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|
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T |
 |
| Q |
331 |
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419 |
Q |
| |
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3888703 |
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3888802 |
T |
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| Q |
420 |
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448 |
Q |
| |
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||||| ||||||||||||||||||||||| |
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|
| T |
3888803 |
tgtgacatgcccaaaacgtcatacaattt |
3888831 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 127; E-Value: 3e-65
Query Start/End: Original strand, 190 - 463
Target Start/End: Complemental strand, 12507081 - 12506797
Alignment:
| Q |
190 |
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289 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |
|
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| T |
12507081 |
tactccctccgtcctaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgttccaaattatatgtcgttttacaataccaatgaaaaattaatgttacttttcc |
12506982 |
T |
 |
| Q |
290 |
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378 |
Q |
| |
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| T |
12506981 |
tattatatccttaactatttatttctttttcttttttcaattccttcatttatctttctcatatcatttattgaggacaattttgtaaaacaactcataa |
12506882 |
T |
 |
| Q |
379 |
tatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatatgtgtgaaatgcccaaaacgtcatacaatttaggatgaagggagta |
463 |
Q |
| |
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| T |
12506881 |
tatctctttcccacacaatattaattacatttcttaatatgtgttaaatgttcaaaacgtcatacaatttgggacggagggagta |
12506797 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 126; E-Value: 1e-64
Query Start/End: Original strand, 231 - 463
Target Start/End: Complemental strand, 16524758 - 16524515
Alignment:
| Q |
231 |
atttgtcccaaattgtatgtcactttacaataccaatgaaacattaatgttatttttcctattataaccttaactatttattactctctcttctttcaag |
330 |
Q |
| |
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| T |
16524758 |
atttgtcccaaattatatgtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcctattatatccttaactattaattactctctattctttcaat |
16524659 |
T |
 |
| Q |
331 |
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419 |
Q |
| |
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| ||| ||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |
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| T |
16524658 |
tatttcatttatcttttccataccatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaatattaattacatttcttaatacg |
16524559 |
T |
 |
| Q |
420 |
tgtgaaatgcccaaaacgtcatacaatttaggatgaagggagta |
463 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||||||||||||||||| ||| | |||||||| |
|
|
| T |
16524558 |
tgtgaaatggccaaaacgtcatacaatttgggacggagggagta |
16524515 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 125; E-Value: 5e-64
Query Start/End: Original strand, 188 - 448
Target Start/End: Original strand, 9961313 - 9961584
Alignment:
| Q |
188 |
attactccatccgtcctaaattgtatgtcattttnnnnnnnntatttgtcccaaattgtatgtcactttacaataccaatgaaacattaatgttattttt |
287 |
Q |
| |
|
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|
| T |
9961313 |
attactccctccgtcccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattatatgtcgttttacaataccaatgaaaaattaatgttactttt |
9961412 |
T |
 |
| Q |
288 |
cctattataaccttaactatttattactctctcttctttcaagtcttttatttatctt-----tttcat------aggacaattttgtaaaacaactcat |
376 |
Q |
| |
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|
|
| T |
9961413 |
cctattatatccttaactatttattactctctcttctttcaattccttcatttatctttcctatatcatttattaaggataattttgtaaaacaactcat |
9961512 |
T |
 |
| Q |
377 |
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448 |
Q |
| |
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|
| T |
9961513 |
aatatctctttcccacacaatattaattacatttcttaatatatgcgaaatatccaaaacttcatacaattt |
9961584 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 124; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 231 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 6792014 - 6791785
Alignment:
| Q |
231 |
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330 |
Q |
| |
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| T |
6792014 |
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T |
 |
| Q |
331 |
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418 |
Q |
| |
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| T |
6791914 |
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6791815 |
T |
 |
| Q |
419 |
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448 |
Q |
| |
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|
| T |
6791814 |
gtgtgaaatgtccaaaacgtcatacaattt |
6791785 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 123; E-Value: 7e-63
Query Start/End: Original strand, 235 - 463
Target Start/End: Complemental strand, 6335181 - 6334944
Alignment:
| Q |
235 |
gtcccaaattgtatgtcactttacaataccaatgaaacattaatgttatttttcctattataaccttaactatttattactctctcttctttcaagtctt |
334 |
Q |
| |
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| T |
6335181 |
gtcccaaattgtatgtcgctttacaataccaatgcaactttaatgttacttttcctattataaccttaactatttattactctct--tatttcaattctt |
6335084 |
T |
 |
| Q |
335 |
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423 |
Q |
| |
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| |||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |
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| T |
6335083 |
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6334984 |
T |
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| Q |
424 |
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463 |
Q |
| |
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| T |
6334983 |
aaatgcccaaaacgtcttacaatttgggacggagggagta |
6334944 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 123; E-Value: 7e-63
Query Start/End: Original strand, 231 - 448
Target Start/End: Original strand, 24178268 - 24178496
Alignment:
| Q |
231 |
atttgtcccaaattgtatgtcactttacaataccaatgaaacattaatgttatttttcctattataaccttaactatttattactctctcttctttcaag |
330 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
24178268 |
atttatcccaaattatatgtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcctattatatccttaactattaattactctctcttctttcaat |
24178367 |
T |
 |
| Q |
331 |
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419 |
Q |
| |
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| T |
24178368 |
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24178467 |
T |
 |
| Q |
420 |
tgtgaaatgcccaaaacgtcatacaattt |
448 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||||||||||||||||| |
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|
| T |
24178468 |
tgtgaaatggccaaaacgtcatacaattt |
24178496 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 122; E-Value: 3e-62
Query Start/End: Original strand, 233 - 465
Target Start/End: Original strand, 32609835 - 32610078
Alignment:
| Q |
233 |
ttgtcccaaattgtatgtcactttacaataccaatgaaacattaatgttatttttcctattataaccttaactatttattactctctcttctttcaagtc |
332 |
Q |
| |
|
|||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || |
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| T |
32609835 |
ttgtcccaaattatatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttaactatttattactatctcttctttcaattc |
32609934 |
T |
 |
| Q |
333 |
ttttatttatctttttcat-----------aggacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatatgtg |
421 |
Q |
| |
|
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|
| T |
32609935 |
tttcatttatctttcccatgttatttattaaggacaattttgtaaaaaaactcataatatcttttttccacacaatattaattgcatttcttaatatgta |
32610034 |
T |
 |
| Q |
422 |
tgaaatgcccaaaacgtcatacaatttaggatgaagggagtaat |
465 |
Q |
| |
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| T |
32610035 |
tgaaatattcaaaacgacatacaatttggaacggagggagtaat |
32610078 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 119; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 230 - 463
Target Start/End: Original strand, 9461614 - 9461858
Alignment:
| Q |
230 |
tatttgtcccaaattgtatgtcactttacaataccaatgaaacattaatgttatttttcctattataaccttaactatttattactctctcttctttcaa |
329 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||| |||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
9461614 |
tatttgtcccaaattatatgtcgctttacaataacaatgaaaaattaatattacttttcctattatatccttaactatttattactctctcttctttcaa |
9461713 |
T |
 |
| Q |
330 |
gtcttttatttatctttttcat-----------aggacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatat |
418 |
Q |
| |
|
| ||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
9461714 |
tttatttatttatctttcccatatcatttattgaggataattttgtaaaacaactaataatatatctttctcacacaatattaattatatttcttaatat |
9461813 |
T |
 |
| Q |
419 |
gtgtgaaatgcccaaaacgtcatacaatttaggatgaagggagta |
463 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||| |||||||||||||||||| | |||||||| |
|
|
| T |
9461814 |
gtgtgaaatgaccaagacgtcatacaatttaggacggagggagta |
9461858 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #50
Raw Score: 119; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 231 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 10629557 - 10629329
Alignment:
| Q |
231 |
atttgtcccaaattgtatgtcactttacaataccaatgaaacattaatgttatttttcctattataaccttaactatttattactctctcttctttcaag |
330 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||| ||||||||||| |||||| | ||||||||||| |
|
|
| T |
10629557 |
atttgtcccaaattatatgtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttactttttctattatatccttaactattaattactttatcttctttcaat |
10629458 |
T |
 |
| Q |
331 |
tcttttatttatctttttcat-----------aggacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatatg |
419 |
Q |
| |
|
| ||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |
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|
| T |
10629457 |
tatttcatttatctttttcatactatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaatattaattacatttcttaatacg |
10629358 |
T |
 |
| Q |
420 |
tgtgaaatgcccaaaacgtcatacaattt |
448 |
Q |
| |
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|
|
| T |
10629357 |
tgtgaaatgaccaaaacgtcatacaattt |
10629329 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #51
Raw Score: 119; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 231 - 465
Target Start/End: Original strand, 32588717 - 32588962
Alignment:
| Q |
231 |
atttgtcccaaattgtatgtcactttacaataccaatgaaacattaatgttatttttcctattataaccttaactatttattactctctcttctttcaag |
330 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||| |||| |
|
|
| T |
32588717 |
atttgtcccaaattgtatgtcgctttacaataccaatgaagctttaatgttattttttctattatatccttaactatttactactttctcttcttccaag |
32588816 |
T |
 |
| Q |
331 |
tcttttatttatctt-----tttcat------aggacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatatg |
419 |
Q |
| |
|
|| || ||||||||| | |||| | |||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||| | |
|
|
| T |
32588817 |
tcattcatttatctttcctatatcatttactaatgacaattttgtaaaacaattcataatatccctttcccacacaaaattaattacatttcttaatacg |
32588916 |
T |
 |
| Q |
420 |
tgtgaaatgcccaaaacgtcatacaatttaggatgaagggagtaat |
465 |
Q |
| |
|
| ||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||| |
|
|
| T |
32588917 |
tatgaaatgcccaaaacgtcatacaatttgggacggagggagtaat |
32588962 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #52
Raw Score: 118; E-Value: 7e-60
Query Start/End: Original strand, 259 - 463
Target Start/End: Complemental strand, 78387 - 78172
Alignment:
| Q |
259 |
aataccaatgaaacattaatgttatttttcctattataaccttaactatttattactctctcttctttcaagtcttttatttatctttttcata------ |
352 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||| |||| |
|
|
| T |
78387 |
aataccaatgcaacattaatgtcacttttccgattataaccttaactatttattactatctcttctttcaattctttcatttatctttcccatattattt |
78288 |
T |
 |
| Q |
353 |
-----ggacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatatgtgtgaaatgcccaaaacgtcatacaatt |
447 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
78287 |
attaaggacaattttgtaaaacaacccataatatcttttttccacacaatattaattgcatttcttaatatgtgtgaaatgcacaaaacgtcatacaatt |
78188 |
T |
 |
| Q |
448 |
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463 |
Q |
| |
|
| ||||| |||||||| |
|
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| T |
78187 |
tgggatggagggagta |
78172 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #53
Raw Score: 117; E-Value: 3e-59
Query Start/End: Original strand, 241 - 448
Target Start/End: Original strand, 5489633 - 5489851
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241 |
aattgtatgtcactttacaataccaatgaaacattaatgttatttttcctattataaccttaactatttattactctctcttctttcaagtcttttattt |
340 |
Q |
| |
|
|||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| | ||| |||| |
|
|
| T |
5489633 |
aattatatgtcgttttacaataccaatgcaacattaatgttactttttctattataaccttaactatttattactttatcttctttcaattatttcattt |
5489732 |
T |
 |
| Q |
341 |
atctttttcata-----------ggacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatatgtgtgaaatgc |
429 |
Q |
| |
|
|||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |
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|
| T |
5489733 |
atctttctcatattatttattaaggacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacaaaatattaattgcatttcttaatatgtgtgaaatgt |
5489832 |
T |
 |
| Q |
430 |
ccaaaacgtcatacaattt |
448 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
5489833 |
ccaaaacgtcgtacaattt |
5489851 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #54
Raw Score: 116; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 230 - 463
Target Start/End: Original strand, 12058609 - 12058851
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329 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
12058609 |
tatttgtcccaaattatatgtcgctttacaataccaataaaacattaatgttacttttcctattatatccttaattatttatt--tctctcttctttcaa |
12058706 |
T |
 |
| Q |
330 |
gtcttttatttatctttttcat-----------aggacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatat |
418 |
Q |
| |
|
||||| |||||||| | |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| | |||||| |||||||||||||||||||| |
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| T |
12058707 |
ttctttcatttatctatctcatatcatttattaaggacaactttgtaaaacaactcataatatcactttccaacacaaaattaattacatttcttaatac |
12058806 |
T |
 |
| Q |
419 |
gtgtgaaatgcccaaaacgtcatacaatttaggatgaagggagta |
463 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||||||||||||||||||| ||| | |||||||| |
|
|
| T |
12058807 |
gtgtgaaatggccaaaacgtcatacaatttgggacggagggagta |
12058851 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #55
Raw Score: 116; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 230 - 448
Target Start/End: Original strand, 19098559 - 19098787
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| Q |
230 |
tatttgtcccaaattgtatgtcactttacaataccaatgaaacattaatgttatttttcctattataaccttaactatttattactctctcttctttcaa |
329 |
Q |
| |
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| T |
19098559 |
tatttgttccaaattatatgtcgctttataataccaatgaaaaattaatgttactttttctattatatccttaactatttattgctctctcttcattcaa |
19098658 |
T |
 |
| Q |
330 |
gtcttttatttatctttttcata-----------ggacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatat |
418 |
Q |
| |
|
|| || |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
19098659 |
ttccttcatttatctttctcatatcatttattgaggacaattttgtaaaacaac-cataatatctctttcccatacaatattaattacatttcttaatat |
19098757 |
T |
 |
| Q |
419 |
gtgtgaaatgcccaaaacgtcatacaattt |
448 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
19098758 |
gtgtgaaatgtccaaaacgtcatacaattt |
19098787 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #56
Raw Score: 116; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 233 - 463
Target Start/End: Original strand, 29818226 - 29818467
Alignment:
| Q |
233 |
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332 |
Q |
| |
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| T |
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T |
 |
| Q |
333 |
ttttatttatctttttcat-----------aggacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatatgtg |
421 |
Q |
| |
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|
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| T |
29818326 |
tttcatttatttttcccatgttatttattaaggacaattttgtaaaacaattcataatatctcttttccatacaatattaattgcatttcttaatatgcg |
29818425 |
T |
 |
| Q |
422 |
tgaaatgcccaaaacgtcatacaatttaggatgaagggagta |
463 |
Q |
| |
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|||| |||||||||||||||||||||| ||| | |||||||| |
|
|
| T |
29818426 |
tgaactgcccaaaacgtcatacaatttgggacggagggagta |
29818467 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #57
Raw Score: 116; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 233 - 463
Target Start/End: Complemental strand, 35040073 - 35039832
Alignment:
| Q |
233 |
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332 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||| | ||||| ||| |||||| |
|
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| T |
35040073 |
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T |
 |
| Q |
333 |
ttttatttatctttttcata-----------ggacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatatgtg |
421 |
Q |
| |
|
|| |||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| |
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|
| T |
35039973 |
attcatttatctttcacatatcatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatatttctttcccacacaaaattaattacatttcttaatatgtg |
35039874 |
T |
 |
| Q |
422 |
tgaaatgcccaaaacgtcatacaatttaggatgaagggagta |
463 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||| |
|
|
| T |
35039873 |
tgaaatgcccaaaacgtcatacaatttgggacggagggagta |
35039832 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #58
Raw Score: 115; E-Value: 4e-58
Query Start/End: Original strand, 233 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 9225650 - 9225425
Alignment:
| Q |
233 |
ttgtcccaaattgtatgtcactttacaataccaatgaaacattaatgttatttttcctattataaccttaactatttattactctctcttctttcaagtc |
332 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||| |||||| |
|
|
| T |
9225650 |
ttgtcccaaattgtgtgtcgctttacaataccaatgaagcattaatgttatttttcatattatatccttaactatttactactttctcttcttccaagtc |
9225551 |
T |
 |
| Q |
333 |
ttttatttatctttttcat----------aggacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatatgtgt |
422 |
Q |
| |
|
|| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |
|
|
| T |
9225550 |
attaatttatctttctcatatcaattctaaggacaattttgtaaaacagttcataatatccattttccacacaaaattaattacatttcttaatacatgt |
9225451 |
T |
 |
| Q |
423 |
gaaatgcccaaaacgtcatacaattt |
448 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||||||||||||||| |
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|
| T |
9225450 |
gaaatgtccaaaacgtcatacaattt |
9225425 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #59
Raw Score: 114; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 268 - 468
Target Start/End: Original strand, 200118 - 200329
Alignment:
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268 |
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356 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||| |||||| ||||| ||| |||||| ||||| ||| |
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|
| T |
200118 |
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200217 |
T |
 |
| Q |
357 |
aattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatatgtgtgaaatgcccaaaacgtcatacaatttaggatgaa |
456 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| | | |
|
|
| T |
200218 |
aattttgtaaaacaactcataatatctctttcccacacaatattaattacatttcttaatatgtgtgaaatgcctaaaacgtcatacaatttgggacgga |
200317 |
T |
 |
| Q |
457 |
gggagtaattta |
468 |
Q |
| |
|
|||||||||||| |
|
|
| T |
200318 |
gggagtaattta |
200329 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #60
Raw Score: 114; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 231 - 463
Target Start/End: Original strand, 34283384 - 34283627
Alignment:
| Q |
231 |
atttgtcccaaattgtatgtcactttacaataccaatgaaacattaatgttatttttcctattataaccttaactatttattactctctcttctttcaag |
330 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
34283384 |
atttgtcccaaattataagtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcctattatatccttaactattaattactccctcttctttcaat |
34283483 |
T |
 |
| Q |
331 |
tcttttatttatctttttcat-----------aggacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatatg |
419 |
Q |
| |
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| ||| ||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |
|
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| T |
34283484 |
tatttcatttatcttttccataccatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttcacttccccacacaatattaattacatttcttaatacg |
34283583 |
T |
 |
| Q |
420 |
tgtgaaatgcccaaaacgtcatacaatttaggatgaagggagta |
463 |
Q |
| |
|
||||||||| |||||||||| |||||||| ||| | |||||||| |
|
|
| T |
34283584 |
tgtgaaatgaccaaaacgtcttacaatttgggacggagggagta |
34283627 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #61
Raw Score: 113; E-Value: 7e-57
Query Start/End: Original strand, 187 - 448
Target Start/End: Original strand, 29455349 - 29455611
Alignment:
| Q |
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Q |
| |
|
||||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||| |||||| ||||| |||||||||| | ||||||||||| ||| |
|
|
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29455349 |
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29455447 |
T |
 |
| Q |
287 |
tcctattataaccttaactatttattactctctcttctttcaagtcttttatttatctttttcat--aggacaattttgtaaaacaactcataatatctc |
384 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| | | || || || || || |||||||||||||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
29455448 |
tcctattataaccttaattatttattactttctcttctttcatttatctttcccatattatttattaaggacaattttgtaaaactactcataatatctc |
29455547 |
T |
 |
| Q |
385 |
ttttccacacaatattaattacatttcttaatatgtgtgaaatgcccaaaacgtcatacaattt |
448 |
Q |
| |
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|
|
| T |
29455548 |
tttttcacacaatattaattgcatttcttaatatgtgtgaaatgtccaaaacgtcgtacaattt |
29455611 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #62
Raw Score: 112; E-Value: 3e-56
Query Start/End: Original strand, 233 - 463
Target Start/End: Complemental strand, 16466400 - 16466159
Alignment:
| Q |
233 |
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332 |
Q |
| |
|
|||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||| | |
|
|
| T |
16466400 |
ttgtcccaaattataagtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcctattatatccttaactattaattactccctcttctttcaatta |
16466301 |
T |
 |
| Q |
333 |
ttttatttatctttttcat-----------aggacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatatgtg |
421 |
Q |
| |
|
||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |
|
|
| T |
16466300 |
tttcatttatctttttcataccatttatcaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaatattaattacatttcttaatacgta |
16466201 |
T |
 |
| Q |
422 |
tgaaatgcccaaaacgtcatacaatttaggatgaagggagta |
463 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||||| |||||||| ||| | |||||||| |
|
|
| T |
16466200 |
tgaaatggtcaaaacgtcgtacaatttgggacggagggagta |
16466159 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #63
Raw Score: 112; E-Value: 3e-56
Query Start/End: Original strand, 190 - 424
Target Start/End: Original strand, 32142375 - 32142619
Alignment:
| Q |
190 |
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289 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
32142375 |
tactccctccgtcccaaattgtatgtcattttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcgctttacaataccaatgaaaaattaatgttatttttcc |
32142474 |
T |
 |
| Q |
290 |
tattataaccttaactatttattactctctcttctttcaagtcttttatttatctttttcat-----------aggacaattttgtaaaacaactcataa |
378 |
Q |
| |
|
||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||| || || |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
32142475 |
tattatatccttaactatttattactctatctt-tttcatttccttcatttatctttcccatatcatttattgaggacaattttgtaaaacaactcataa |
32142573 |
T |
 |
| Q |
379 |
tatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatatgtgtga |
424 |
Q |
| |
|
||| | ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
32142574 |
tatatttttcccacacaatattaattacattttttaatatgtgtga |
32142619 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #64
Raw Score: 111; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 230 - 463
Target Start/End: Original strand, 31003944 - 31004188
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| Q |
230 |
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329 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||| | |||||| | |||| ||||||||||||| ||||| ||||| |
|
|
| T |
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tatttgtcccaaattatatgtcattttacaatagcaatgaaacattaatgttactttttcgattatatcattaagtatttattactctttcttccttcaa |
31004043 |
T |
 |
| Q |
330 |
gtcttttatttatctttttcata-----------ggacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatat |
418 |
Q |
| |
|
||||| |||||||||| |||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
31004044 |
ttctttcatttatctttcccatatcatttattaaggataattttgtaaaacaattcataatatctctttctcacacaatattaattacatttcttaatat |
31004143 |
T |
 |
| Q |
419 |
gtgtgaaatgcccaaaacgtcatacaatttaggatgaagggagta |
463 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
31004144 |
gtgtgaaatgcccaaaacgttatacactttgggacggagggagta |
31004188 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #65
Raw Score: 109; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 233 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 4981375 - 4981149
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| Q |
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332 |
Q |
| |
|
||||| |||||| |||||| ||||||||||| ||| ||| |||||||||| |||| ||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||| || |
|
|
| T |
4981375 |
ttgtcgcaaattatatgtcgctttacaatactaataaaatattaatgttactttttctattatgtctttaactatttattactctcttttctttcaattc |
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T |
 |
| Q |
333 |
ttttatttatctttttcata-----------ggacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatatgtg |
421 |
Q |
| |
|
|| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |
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|
| T |
4981275 |
attcatttatctttctcatataatttattaaggacaattttgtaaaacaactcataatatctctttctcacacaatattaattacatttcttaatatgtg |
4981176 |
T |
 |
| Q |
422 |
tgaaatgcccaaaacgtcatacaattt |
448 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
4981175 |
tgaaatgtccaaaacgttatacaattt |
4981149 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #66
Raw Score: 108; E-Value: 6e-54
Query Start/End: Original strand, 233 - 463
Target Start/End: Original strand, 30240249 - 30240490
Alignment:
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233 |
ttgtcccaaattgtatgtcactttacaataccaatgaaacattaatgttatttttcctattataaccttaactatttattactctctcttctttcaagtc |
332 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||| ||||| || ||||||| |
|
|
| T |
30240249 |
ttgtcctaaattgtatgtcgctttacaataccaatgaatcattaatgttacttttcctattatttccttcactatttattaccttctctactctcaagtc |
30240348 |
T |
 |
| Q |
333 |
ttttatttatctttttcata-----------ggacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatatgtg |
421 |
Q |
| |
|
|| |||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||| |
|
|
| T |
30240349 |
attcatttatctttctcatatcatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatatctctttcccacacaaaattaattacatttcttaatacgtg |
30240448 |
T |
 |
| Q |
422 |
tgaaatgcccaaaacgtcatacaatttaggatgaagggagta |
463 |
Q |
| |
|
||| || |||||||| ||||||||||| ||| | |||||||| |
|
|
| T |
30240449 |
tgatatacccaaaacatcatacaatttgggacggagggagta |
30240490 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #67
Raw Score: 107; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 231 - 448
Target Start/End: Original strand, 29901236 - 29901464
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atttgtcccaaattgtatgtcactttacaataccaatgaaacattaatgttatttttcctattataaccttaactatttattactctctcttctttcaag |
330 |
Q |
| |
|
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|
| T |
29901236 |
atttgtcccaaattatatgtcgctttacaatacccatgcaacattattgttactttttcaattataaccttaattatttattactctctcttctttcaat |
29901335 |
T |
 |
| Q |
331 |
tcttttatttatctttttcat-----------aggacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatatg |
419 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
29901336 |
tctttcatttatctttcccatattatttattaaggataattttgtaaaacaatgcataatatctattttccacacaatattaattgcatttcttaatatg |
29901435 |
T |
 |
| Q |
420 |
tgtgaaatgcccaaaacgtcatacaattt |
448 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||| |||||||||||| |
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|
| T |
29901436 |
tgtgaaatgcttaaaatgtcatacaattt |
29901464 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #68
Raw Score: 107; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 231 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 31022627 - 31022399
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231 |
atttgtcccaaattgtatgtcactttacaataccaatgaaacattaatgttatttttcctattataaccttaactatttattactctctcttctttcaag |
330 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
31022627 |
atttgtcctaaattatatgtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttatttttcctattatatccttaactattaattactctctcttctttcaat |
31022528 |
T |
 |
| Q |
331 |
tcttttatttatctttttcat-----------aggacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatatg |
419 |
Q |
| |
|
| ||| ||||||||||| ||| | || ||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||| ||||||||||| | |
|
|
| T |
31022527 |
tatttcatttatcttttccataccatttattaatgataattttgtaaaacaactcataatttctattccccacacaatattaattatatttcttaatacg |
31022428 |
T |
 |
| Q |
420 |
tgtgaaatgcccaaaacgtcatacaattt |
448 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
31022427 |
tgtgaaatagccaaaacatcatacaattt |
31022399 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #69
Raw Score: 107; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 234 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 32393701 - 32393472
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234 |
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333 |
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32393602 |
T |
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418 |
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32393502 |
T |
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448 |
Q |
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| T |
32393501 |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #70
Raw Score: 107; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 230 - 463
Target Start/End: Original strand, 33254374 - 33254618
Alignment:
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T |
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330 |
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418 |
Q |
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| T |
33254474 |
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33254573 |
T |
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| Q |
419 |
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463 |
Q |
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33254574 |
gtgtgaaattgctaatacgtcatacaatttgggacggagggagta |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #71
Raw Score: 106; E-Value: 1e-52
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Target Start/End: Complemental strand, 14600672 - 14600430
Alignment:
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Q |
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T |
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Q |
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T |
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465 |
Q |
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tgaaatgaccaaaacatcatacaatttaggacggagggagtaat |
14600430 |
T |
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Back To:
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Target: chr6; HSP #72
Raw Score: 105; E-Value: 4e-52
Query Start/End: Original strand, 233 - 448
Target Start/End: Original strand, 3819645 - 3819871
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Q |
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T |
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421 |
Q |
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| T |
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3819844 |
T |
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| Q |
422 |
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448 |
Q |
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| T |
3819845 |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #73
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Query Start/End: Original strand, 231 - 448
Target Start/End: Original strand, 8550209 - 8550438
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| Q |
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329 |
Q |
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T |
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418 |
Q |
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| T |
8550309 |
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8550408 |
T |
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| Q |
419 |
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448 |
Q |
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| T |
8550409 |
gtgtgaaatgcccaaaacgtcatacaattt |
8550438 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #74
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428 |
Q |
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| T |
17275376 |
tatgtttcccatataatttattaaggacaagtttgtaaaacaactaataatatctattttccacacaatattaattgtatttcttaatatgtgtgaaatg |
17275277 |
T |
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| Q |
429 |
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448 |
Q |
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17275276 |
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17275257 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #75
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Target Start/End: Original strand, 4657877 - 4658071
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Q |
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T |
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448 |
Q |
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ggacaattttgtaaaacaactcataatatctttttcccacacaatattaattacatttcttaatatgtgtgaaatgctcaaaatgtcatacaattt |
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #76
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T |
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| Q |
345 |
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Q |
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T |
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| Q |
434 |
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448 |
Q |
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| T |
6334747 |
aacgtcatacaattt |
6334733 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #77
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Query Start/End: Original strand, 233 - 452
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T |
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421 |
Q |
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30238952 |
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T |
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422 |
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452 |
Q |
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30239052 |
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30239082 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #78
Raw Score: 100; E-Value: 4e-49
Query Start/End: Original strand, 233 - 463
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Q |
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T |
 |
| Q |
333 |
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421 |
Q |
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| T |
27080472 |
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27080373 |
T |
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| Q |
422 |
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463 |
Q |
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| T |
27080372 |
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27080331 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #79
Raw Score: 99; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 239 - 463
Target Start/End: Complemental strand, 7245924 - 7245692
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338 |
Q |
| |
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caaattatatgtcgctttacaataccaatgaaaaattaatcttatttttcctattatatctttaactatttattgctctct--tctttcaattcattcat |
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T |
 |
| Q |
339 |
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427 |
Q |
| |
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| T |
7245826 |
ttatctttcccatatcatttattgaggataattttgtaaaacaacttataatatctcttatc-acacaatattaattacatttcttaatatgcgtgaaat |
7245728 |
T |
 |
| Q |
428 |
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463 |
Q |
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| T |
7245727 |
gtccaaaacgtcatataatttaggacggagggagta |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #80
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339 |
Q |
| |
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T |
 |
| Q |
340 |
tatctttttcata-----------ggacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatatgtgtgaaatg |
428 |
Q |
| |
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| T |
10133823 |
tatctttcttatatcatttattaaggacaattttgtaaaacaattcataatatttctttcccacacaatatcaattacatttcttaatatgtgtgtaatg |
10133922 |
T |
 |
| Q |
429 |
cccaaaacgtcatacaatttagga |
452 |
Q |
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| T |
10133923 |
ctcaaaacatcgtacaatttagga |
10133946 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #81
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Query Start/End: Original strand, 232 - 444
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tttgtcccaaattgtatgtcactttacaataccaatgaaacattaatgttatttttcctattataaccttaactatttattactctctcttctttcaagt |
331 |
Q |
| |
|
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| T |
16465858 |
tttgtctcaaattatatgtcgttttacaataccaatgcaatattaatgttattttttctattataaccttagtaatttattactctatcttctttcaatt |
16465957 |
T |
 |
| Q |
332 |
cttttatttatctttttcatag--------gacaattttgtaaaacaactcataa-tatctcttttccacacaatattaattacatttc---ttaatatg |
419 |
Q |
| |
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| T |
16465958 |
ctttcatttattttttctatatttattaaagacaattttataaaacaactcataagtatctcttttccacacaatattaattacatttctaattaatatg |
16466057 |
T |
 |
| Q |
420 |
tgtgaaatgcccaaaacgtcataca |
444 |
Q |
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| T |
16466058 |
tgtaaaatgcccaaaacgtcataca |
16466082 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #82
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 233 - 463
Target Start/End: Original strand, 11000411 - 11000650
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| Q |
233 |
ttgtcccaaattgtatgtcactttacaataccaatgaaacattaatgttatttttcctattataaccttaactatttattactctctcttctttcaagtc |
332 |
Q |
| |
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|
| T |
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T |
 |
| Q |
333 |
ttttatttatctttttcata-----------ggacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatatgtg |
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Q |
| |
|
||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
11000511 |
tttcatttatctttcccatattatttattaaggacaattttgtaaaacatctcataatatct--tttccacacaatattaattgcatttcttaatatgtg |
11000608 |
T |
 |
| Q |
422 |
tgaaatgcccaaaacgtcatacaatttaggatgaagggagta |
463 |
Q |
| |
|
| ||||| | |||| || ||||||||||||| | |||||||| |
|
|
| T |
11000609 |
taaaatgtctaaaatgttatacaatttaggacggagggagta |
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T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #83
Raw Score: 96; E-Value: 9e-47
Query Start/End: Original strand, 246 - 448
Target Start/End: Original strand, 290394 - 290606
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246 |
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Q |
| |
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| T |
290394 |
tatgtcgctttacaataccaatgaa-cattaattttattttttatattatatctttaactatttattactctctcttctttcaactctttaatttttctt |
290492 |
T |
 |
| Q |
346 |
tttcat-----------aggacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatatgtgtgaaatgcccaaa |
434 |
Q |
| |
|
|||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||| |||||||| |||||||||||||| |||||||| ||| |
|
|
| T |
290493 |
tttcataccatttattaaggacgattttgtaaaacaactcataatatctattttctactcaaaattaattatatttcttaatatgtatgaaatgcttaaa |
290592 |
T |
 |
| Q |
435 |
acgtcatacaattt |
448 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |
|
|
| T |
290593 |
acgtcatacaattt |
290606 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #84
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Query Start/End: Original strand, 266 - 448
Target Start/End: Original strand, 31503923 - 31504116
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354 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||| |||| || |
|
|
| T |
31503923 |
atgaaatattaatgttacttttcctattatatccttaattatttattactctttcttctttcaattctttcatttatctttcccatatcatttattaagg |
31504022 |
T |
 |
| Q |
355 |
acaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatatgtgtgaaatgcccaaaacgtcatacaattt |
448 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||| |
|
|
| T |
31504023 |
acaattttgtaaaacaactcataatatctatttcccacacaatattaattatatttcttaatatgtgtgaaatgtccaaaacgccgtacaattt |
31504116 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #85
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Query Start/End: Original strand, 233 - 418
Target Start/End: Original strand, 11130157 - 11130353
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332 |
Q |
| |
|
|||||||||||| || ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| || |
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|
| T |
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T |
 |
| Q |
333 |
ttttatttatctttttcat-----------aggacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatat |
418 |
Q |
| |
|
||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
11130257 |
tttcatttatctttctcatattatttattaaggacaattttgtaaaacaacttttaatatcttttttccacgcaatattaattgcatttcttaatat |
11130353 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #86
Raw Score: 95; E-Value: 4e-46
Query Start/End: Original strand, 190 - 463
Target Start/End: Original strand, 18105625 - 18105907
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289 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||| ||| ||| | || ||| ||||||||||| | ||||| ||||||| ||||||| | |
|
|
| T |
18105625 |
tactccatccatcctaaattgtatgttattttaaaaaaaatatttatcctaaagtatacgtcgctttacaatacta-tgaaatattaatgatattttttc |
18105723 |
T |
 |
| Q |
290 |
tattataaccttaactatttattactctctcttctttcaagtcttttatttatctttttcata-----------ggacaattttgtaaaacaactcataa |
378 |
Q |
| |
|
||||||| |||| ||||||||||||||| | || |||||| || | |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
18105724 |
tattatatccttcactatttattactctttttt-tttcaattccatcatttatctttcccatattatttattaaggacaattttgtaaaacaactcataa |
18105822 |
T |
 |
| Q |
379 |
tatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatatgtgtgaaatgcccaaaacgtcatacaatttaggatgaagggagta |
463 |
Q |
| |
|
||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| | |||||||| |
|
|
| T |
18105823 |
tatctctttcccacacaatattaaatacatttcttaatatgtgtgaaatgtccaaaacgtcatacaatttgggacggagggagta |
18105907 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #87
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Target Start/End: Original strand, 7358515 - 7358737
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338 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||| ||||||| ||||| ||||||||||| | ||||||||||| ||||| || |
|
|
| T |
7358515 |
caaattatatgtcactttacaatatcaatcaaacattaatgttactttttttattatattcttaattatttattactttttcttctttcaattctttcat |
7358614 |
T |
 |
| Q |
339 |
ttatctttttcata-----------ggacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatatgtgtgaaat |
427 |
Q |
| |
|
|||| ||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||| |
|
|
| T |
7358615 |
ttatttttcccatatcatttattaaggaaaattttgtaaaacaactcataatatctctttcccacacaatataaattacatttcttaatacgtatgaaat |
7358714 |
T |
 |
| Q |
428 |
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450 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
7358715 |
gcccaaaatatcatacaatttag |
7358737 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #88
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Query Start/End: Original strand, 231 - 448
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330 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||| ||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
7897010 |
atttgttccaaattatatgtg-ctttgcaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttaactatttattactatctcttctttcatt |
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T |
 |
| Q |
331 |
tcttttatttatctttttcat--aggacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatatgtgtgaaatg |
428 |
Q |
| |
|
| | || | || || || || |||| |||||||||||||||| |||||||| | ||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||| |
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|
| T |
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tatatttctcatattatttattaaggaaaattttgtaaaacaacccataatatattttttccacataatattaattgaattttttaatatgtgtgaaatg |
7896812 |
T |
 |
| Q |
429 |
cccaaaacgtcatacaattt |
448 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
7896811 |
tccaaaacgttatacaattt |
7896792 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #89
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Query Start/End: Original strand, 279 - 465
Target Start/End: Original strand, 11173321 - 11173518
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Q |
| |
|
|||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||| |||||| ||| ||||| | |||| |||||||| |
|
|
| T |
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gttactttttctattataaccttaactatttattactctatcttatttcaattcttacatttatttttctcatattatttattaagtacaagtttgtaaa |
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T |
 |
| Q |
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acaactcataatatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatatgtgtgaaatgcccaaaacgtcatacaatttaggatgaagggagtaat |
465 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||| |
|
|
| T |
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acaactcataatatctcttttccacacaaaattaattatatttcttaatatatgtgaaatgcccaaaacgtcatacaatttgggacggagggagtaat |
11173518 |
T |
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Target: chr6; HSP #90
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Target Start/End: Original strand, 15497841 - 15498078
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288 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |
|
|
| T |
15497841 |
tactccctccgtcccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaaattatatgtcgctttacaataccaatgaaaaattaatgttacttttc |
15497940 |
T |
 |
| Q |
289 |
ctattataaccttaactatttattactctctcttctttcaagtcttttatttatctttttcat-----------aggacaattttgtaaaacaactcata |
377 |
Q |
| |
|
|||||||| || ||||||||||| |||||||||| ||||| | || ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
15497941 |
ctattatatccggaactatttattgctctctcttcattcaatttcttcatttatcttttccatatcatttattgaggacaattttgtaaaacaactcata |
15498040 |
T |
 |
| Q |
378 |
atatctcttttccacacaatattaattacatttcttaa |
415 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
15498041 |
atatctctttctcacacaatattaattacatttcttaa |
15498078 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #91
Raw Score: 91; E-Value: 9e-44
Query Start/End: Original strand, 190 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 1228283 - 1228055
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| Q |
190 |
tactccatccgtcctaaattgtatgtcattttnnnnnnnntatttgtcccaaattgtatgtcactttacaataccaatgaaacattaatgttatttttcc |
289 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||| |||| | |
|
|
| T |
1228283 |
tactccctccgtcctaaattgtatgtcactttagaagaaatatttgtcccaaattatatgtcgctttaaaataccaatgaaaaattaatgttactttttc |
1228184 |
T |
 |
| Q |
290 |
tattataaccttaactatttattactctctcttctttcaagtcttttatttatctttttcat-----------aggacaattttgtaaaacaactcataa |
378 |
Q |
| |
|
||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||| || || |||||||||| |||| |||| |||||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
1228183 |
tattatatctttaactatttattactatctcttctttcaattccttcatttatctttctcatattatttattgaggataattttataaaacaactcataa |
1228084 |
T |
 |
| Q |
379 |
tatctcttttccacacaatattaattaca |
407 |
Q |
| |
|
||| ||||| ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
1228083 |
tatatctttcccacacaatattaattaca |
1228055 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #92
Raw Score: 90; E-Value: 4e-43
Query Start/End: Original strand, 236 - 463
Target Start/End: Complemental strand, 21139987 - 21139751
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| Q |
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335 |
Q |
| |
|
||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||| | ||| |
|
|
| T |
21139987 |
tcccaaattatatgtcgctttacaataccaatgaaatatttatgttacttttcctattatatccttaactattaatta--ctctcttctttcaattattt |
21139890 |
T |
 |
| Q |
336 |
tatttatctttttcata-----------ggacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatatgtgtga |
424 |
Q |
| |
|
||||||||||| |||| ||| |||||||||||| |||||||||| |||||| |||| |||||||||||| ||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
21139889 |
catttatcttttccataccatttattagggataattttgtaaaataactcataatttctcttccccacgcaatattaattagatttcttaatacgtgtga |
21139790 |
T |
 |
| Q |
425 |
aatgcccaaaacgtcatacaatttaggatgaagggagta |
463 |
Q |
| |
|
||| |||||||||| |||||||| ||| | |||||||| |
|
|
| T |
21139789 |
aattgccaaaacgtcttacaatttgggacggagggagta |
21139751 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #93
Raw Score: 90; E-Value: 4e-43
Query Start/End: Original strand, 236 - 463
Target Start/End: Complemental strand, 24053181 - 24052949
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| Q |
236 |
tcccaaattgtatgtcactttacaataccaatgaaacattaatgttatttttcctattataaccttaactatttattactctctcttctttcaagtcttt |
335 |
Q |
| |
|
||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| | ||||||||||||| | ||| |
|
|
| T |
24053181 |
tcccaaattatatgtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttatttttcctattatatccttaactattaattattatctcttctttcaattattt |
24053082 |
T |
 |
| Q |
336 |
tatttatctttttcata-----------ggacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatatgtgtga |
424 |
Q |
| |
|
||||||||||| |||| ||| |||||||||||| |||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||| || |||||| |
|
|
| T |
24053081 |
catttatcttttccataccatttattatggataattttgtaaaaaaactcataatttatcttccccacacaatattaattacatt------tacgtgtga |
24052988 |
T |
 |
| Q |
425 |
aatgcccaaaacgtcatacaatttaggatgaagggagta |
463 |
Q |
| |
|
|||| ||||||||||||||||||| ||| | |||||||| |
|
|
| T |
24052987 |
aatggccaaaacgtcatacaatttgggacggagggagta |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #94
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Query Start/End: Original strand, 230 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 10364711 - 10364592
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329 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||| |
|
|
| T |
10364711 |
tatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttactttttctattatatccttaactatttattactctttcttttttcaa |
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T |
 |
| Q |
330 |
gtcttttatttatctttttc |
349 |
Q |
| |
|
||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
10364611 |
ttctttcatttatctttttc |
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
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Target Start/End: Original strand, 16970461 - 16970642
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333 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |
|
|
| T |
16970461 |
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16970560 |
T |
 |
| Q |
334 |
tttatttatctttttcat-----------aggacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaatattaatt |
404 |
Q |
| |
|
|| |||||||||| |||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
16970561 |
ttcatttatctttctcatattatttattaaggataattttgtaaaccaactcataatatctcttttccacacaatattaatt |
16970642 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #96
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ttgtcccaaattgtatgtcactttacaataccaatgaaacattaatgttatttttcctattataaccttaactatttattactctctcttctttcaagtc |
332 |
Q |
| |
|
||||| |||||| |||||| ||||||| || |||||| |||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||||| ||| |||||| || |
|
|
| T |
5609522 |
ttgtctcaaattatatgtcgttttacaa--cccatgaaatattaatgttagttttcctattatatcattaactatttattactctcacttttttcaaatc |
5609425 |
T |
 |
| Q |
333 |
ttttatttatctttttcata-----------ggacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatatgtg |
421 |
Q |
| |
|
||| |||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||| || ||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
5609424 |
tttcatttatttttcccatataatttattaaggacaattttgtaaaacaacttataatatcattttcccacataaatttaattacatttcttaatatgtg |
5609325 |
T |
 |
| Q |
422 |
tgaaatgcccaaaacgtcatacaatttaggatgaagggagtaa |
464 |
Q |
| |
|
||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||| |
|
|
| T |
5609324 |
tgaaatggtcaaaacgtcatacaatttgggatgaatggagtaa |
5609282 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #97
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Target Start/End: Complemental strand, 10364561 - 10364448
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451 |
Q |
| |
|
|||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || |
|
|
| T |
10364561 |
aggataattttgtaaaacaattcataatatctctttcccacacaatattaattacatttcttaatatgtgtaaaatgcccaaaacgtcatacaatttggg |
10364462 |
T |
 |
| Q |
452 |
atgaagggagtaat |
465 |
Q |
| |
|
| | |||||||||| |
|
|
| T |
10364461 |
acggagggagtaat |
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #98
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Q |
| |
|
|||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
17441979 |
aggacaattttgtaaaacaattcataatatctctttcccacacaatattaattatatttcttaatatgtgtgaaatgtccaaaacgtcatacaatttagg |
17442078 |
T |
 |
| Q |
452 |
a |
452 |
Q |
| |
|
| |
|
|
| T |
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a |
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Target: chr6; HSP #99
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231 |
atttgtcccaaattgtatgtcactttacaataccaatgaaacattaatgttatttttcctattataaccttaactatttattactctctcttctttcaag |
330 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
29017068 |
atttgtcccaaattatatgtcgctttacaatactaatgaaatattaatgttatttttcctactatatccttaactattaattactctctcttctttcaat |
29017167 |
T |
 |
| Q |
331 |
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402 |
Q |
| |
|
| ||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||| |
|
|
| T |
29017168 |
tatttcatttatctttttcataccatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccatacaatattaa |
29017250 |
T |
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Target: chr6; HSP #100
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233 |
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332 |
Q |
| |
|
|||||||||||| |||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || |
|
|
| T |
4148309 |
ttgtcccaaattatatgtcgctttacaatacgaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttaactatttattact--ctcttctttcaattc |
4148212 |
T |
 |
| Q |
333 |
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352 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
4148211 |
ttttatttatcttttccata |
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T |
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Target: chr6; HSP #101
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345 |
Q |
| |
|
||||||| ||| ||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||| || || ||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||| |
|
|
| T |
21047474 |
tatgtcattttgcaataccaatgaagaattaatattattttttctattatatccgtagctatttattactctcacttctttcaaatctttaatttatctt |
21047375 |
T |
 |
| Q |
346 |
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434 |
Q |
| |
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| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||| ||||| |||| |||| |||| |
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| T |
21047374 |
tctcataccatttattaaggacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttttatgcaaaattaattacatttcgtaatacgtgtcaaatagtcaaa |
21047275 |
T |
 |
| Q |
435 |
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452 |
Q |
| |
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|||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
21047274 |
acgtcatataatttagga |
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T |
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Target Start/End: Complemental strand, 1114555 - 1114433
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329 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| || ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
1114555 |
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1114456 |
T |
 |
| Q |
330 |
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352 |
Q |
| |
|
|| || |||||| ||| ||||| |
|
|
| T |
1114455 |
ttccttcatttatttttctcata |
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T |
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450 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
4147920 |
aggacaattttgtaaaaaaaactcataatatctcttttccacacaatattaattgcatttcttaatatgtgtgaaatgcctaaaacgccatacaatttat |
4147821 |
T |
 |
| Q |
451 |
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465 |
Q |
| |
|
|| | |||||||||| |
|
|
| T |
4147820 |
gacggagggagtaat |
4147806 |
T |
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Target: chr6; HSP #104
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383 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||| |||| | | ||||||||||||||| ||||||||| | |
|
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| T |
10027871 |
taaccttaactatttattactctctcttctttcgattctttcatttatcttttccatattatttattaagaataattttgtaaaacaattcataatattt |
10027970 |
T |
 |
| Q |
384 |
cttttccacacaatattaattacatttcttaatatgtgtgaaatgcccaaaacgtcatacaattt |
448 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
10027971 |
tttttccacacaatattaattgtatttcttaatatgtgtgaaatgcccaaaacgtcgtacaattt |
10028035 |
T |
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330 |
Q |
| |
|
||||||| |||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| |
|
|
| T |
6833787 |
atttgtctcaaattatatgtcgctttacaataccaatgtaacattaatgttacttttcctattataaccttaactatttattattatctcttctttcaat |
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T |
 |
| Q |
331 |
tcttttatttatctttt |
347 |
Q |
| |
|
| ||| ||||||||||| |
|
|
| T |
6833887 |
tatttcatttatctttt |
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T |
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Target: chr6; HSP #106
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451 |
Q |
| |
|
|||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||||||| || |
|
|
| T |
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aggataattttgtaaaacaactcataatatctttttccaacacaatattaattacatttcttaataagcgtgaaaggcccaaaacgtcatacaatttggg |
19687740 |
T |
 |
| Q |
452 |
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466 |
Q |
| |
|
| | ||||||||||| |
|
|
| T |
19687739 |
acggagggagtaatt |
19687725 |
T |
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349 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| ||||||| |||||| | |||||||| |||||||||||||||||| | ||| |||||| || || |||||||||| || |
|
|
| T |
34219127 |
tttacaataccaatgaatcattaatattatttcttctattatatccttaactatttattactttatctcctttcatgtgattcatttatctttccatatc |
34219028 |
T |
 |
| Q |
350 |
at------aggacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatatgtgtgaaatgcccaaaa |
435 |
Q |
| |
|
|| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |
|
|
| T |
34219027 |
atttattaaggacaattttgtaaaacaacttataatatctctttctcacacaaaagtaattacatttcttaataggtgtgaaatgtccaaaa |
34218936 |
T |
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Target: chr6; HSP #108
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aggacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatatgtgtgaaatgcccaaaacgtcatacaatttagg |
451 |
Q |
| |
|
|||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||| || |||||||| || |
|
|
| T |
14386636 |
aggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaatattaattacatttcttaatacgtatgaaatgaccaaaacatcgtacaatttggg |
14386735 |
T |
 |
| Q |
452 |
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463 |
Q |
| |
|
||| |||||||| |
|
|
| T |
14386736 |
atggagggagta |
14386747 |
T |
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Target: chr6; HSP #109
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ctcataatatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatatgtgtgaaatgcccaaaacgtcatacaattt |
448 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
1114438 |
ctcataatatctctttcccacacaatattaattacatttcttaatatgtgtgaaatgtccaaaatgtcatacaattt |
1114362 |
T |
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Target: chr6; HSP #110
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tttacaataccaatgaaacattaatgttatttttcctattataaccttaactatttattactctctcttctttcaagtcttttatttatctttttcat-- |
351 |
Q |
| |
|
||||||||| ||| |||||||||||||| |||| |||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||| | || |
|
|
| T |
7885318 |
tttacaataataataaaacattaatgttactttttctattatatcattagctatttattactctctcttctttcaattatttaatttatctttcttatac |
7885219 |
T |
 |
| Q |
352 |
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417 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||| || ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
7885218 |
tatttattaaggacaattttgtaaaataactaataatatctcttttccatacaaaatgaattacatttcttaata |
7885144 |
T |
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Target: chr6; HSP #111
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ttgtcccaaattgtatgtcactttacaataccaatgaaacattaatgttatttttcctattataaccttaactatttattactctctcttctttcaagtc |
332 |
Q |
| |
|
|||||| |||| ||||||| ||| ||||||||||||| |||||| ||| |||| |||||||| || || |||||||||||||||||||||||||| || |
|
|
| T |
21072207 |
ttgtcctaaatcatatgtcattttgcaataccaatgaagaattaatattactttttctattatatccgtagctatttattactctctcttctttcaaatc |
21072108 |
T |
 |
| Q |
333 |
ttttatttatctttttcat-----------aggacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatatgtg |
421 |
Q |
| |
|
||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||| |||| ||||||| ||||| ||| |
|
|
| T |
21072107 |
tttaatttatctttctcataccatttattaaggacaattttgtaaaacaactcataatatcacttttttatgcaaaattatatacattttgtaatacgtg |
21072008 |
T |
 |
| Q |
422 |
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452 |
Q |
| |
|
| |||| |||||||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
21072007 |
tcaaatagtcaaaacgtcatataatttagga |
21071977 |
T |
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Target: chr6; HSP #112
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338 |
Q |
| |
|
|||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||| || |
|
|
| T |
11213617 |
caaattatatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttactttttctattataactttagttatttattactctcttttctttcaattctttcat |
11213518 |
T |
 |
| Q |
339 |
ttatcttt |
346 |
Q |
| |
|
|||||||| |
|
|
| T |
11213517 |
ttatcttt |
11213510 |
T |
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Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||| || ||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
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ggacaattttgtaaaacaactcataatatctttttcccatacaatattaagtatatttcttaatacgtatgaaatgcctaaaacgtcatacaattt |
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T |
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331 |
Q |
| |
|
||||||||||||| || ||||||||||| |||| ||||| | ||||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||| ||| | ||||||| | |
|
|
| T |
13587102 |
tttgtcccaaattataaatcactttacaaaaccagtgaaatagtaatgttgatttttctattataacctaaactatttattactttctatcctttcaaat |
13587003 |
T |
 |
| Q |
332 |
cttttatttatctttttcat-----------aggacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatatgt |
420 |
Q |
| |
|
|||| |||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||| |||||||| |||| ||||| || |
|
|
| T |
13587002 |
ctttaatttatctttctcataatatttattaaagacaattttgtaaaacaactcataatatctatttttcatacaaaattaattatgtttcctaatacgt |
13586903 |
T |
 |
| Q |
421 |
gtgaaatgcccaaaa |
435 |
Q |
| |
|
| ||||| |||||| |
|
|
| T |
13586902 |
ttaaaatgtccaaaa |
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T |
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Q |
| |
|
|||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
12278980 |
aattgtatctcactttacaataccaatgaaacattaattttacttttcctattatatctttaactatttattactc |
12278905 |
T |
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333 |
Q |
| |
|
||||| ||||| ||||||||||||||||| |||| |||||| |||||| ||||| |||||||| | | || ||||||||| | | ||||||||||| ||| |
|
|
| T |
7595903 |
tgtcctaaattatatgtcactttacaatatcaataaaacatcaatgtt-ttttttctattatatcttgaattatttattattatatcttctttcaattct |
7596001 |
T |
 |
| Q |
334 |
tttatttatcttt---------ttcat--aggacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatatgtgt |
422 |
Q |
| |
|
|| |||||||||| || || |||| |||| |||||||||||||||||||| ||||| || |||| ||||||||||||| |||||| |||| |
|
|
| T |
7596002 |
ttaatttatctttccgacaccatttattaaggaaaattgtgtaaaacaactcataatatttctttatcatacaaaattaattacattttttaatacgtgt |
7596101 |
T |
 |
| Q |
423 |
gaaatg |
428 |
Q |
| |
|
|||||| |
|
|
| T |
7596102 |
gaaatg |
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T |
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Q |
| |
|
|||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||| |
|
|
| T |
17441698 |
tttgtctcaaattatatgtcactttacaataccaataaaacattaatgttacttttcctattatattcttaattatttatt |
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| |
|
||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||| | ||||| ||||| ||||| |
|
|
| T |
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T |
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Q |
| |
|
|||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| ||||| | |||||| | ||||||||| |||| |||||||| |
|
|
| T |
24915689 |
acaattcataatatctcttttccacataatattaattgcatttcttaatatgtgcgaaatactcaaaacattatacaatttgagatggagggagta |
24915594 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #120
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 253 - 352
Target Start/End: Complemental strand, 31872799 - 31872700
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| Q |
253 |
ctttacaataccaatgaaacattaatgttatttttcctattataaccttaactatttattactctctcttctttcaagtcttttatttatctttttcata |
352 |
Q |
| |
|
||||| |||| ||||||| |||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||| |||| |||||||||||| | |||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
31872799 |
ctttaaaatatcaatgaagcattaatgctatttttcttattatattcttaactatttataactcactcttctttcaatttttttatttatctttctcata |
31872700 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #121
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 233 - 322
Target Start/End: Original strand, 24718320 - 24718409
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| Q |
233 |
ttgtcccaaattgtatgtcactttacaataccaatgaaacattaatgttatttttcctattataaccttaactatttattactctctctt |
322 |
Q |
| |
|
|||||| ||||| ||||||| ||||||||| |||| |||||||| ||||| ||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
24718320 |
ttgtcctaaattatatgtcattttacaatatcaataaaacattattgttacttttcttattatacccttaactatttactactctctctt |
24718409 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #122
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Query Start/End: Original strand, 354 - 442
Target Start/End: Complemental strand, 3401518 - 3401430
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| Q |
354 |
gacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatatgtgtgaaatgcccaaaacgtcata |
442 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||| |||| ||||||||||||| |||||| || ||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
3401518 |
gacaattttgtaaaataactcataatacatattttccatacaaaattaattacattttttaatacgtatgaaatgtccaaaacgtcata |
3401430 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #123
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 232 - 352
Target Start/End: Original strand, 31858246 - 31858366
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| Q |
232 |
tttgtcccaaattgtatgtcactttacaataccaatgaaacattaatgttatttttcctattataaccttaactatttattactctctcttctttcaagt |
331 |
Q |
| |
|
||||||||||||| ||| || ||| |||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||| | |
|
|
| T |
31858246 |
tttgtcccaaattatatatcgtattaaaatatcaatgaaatattaatgttattttttttattatatccttaactatttattactacctcttcattcaatt |
31858345 |
T |
 |
| Q |
332 |
cttttatttatctttttcata |
352 |
Q |
| |
|
||| |||||||||| ||||| |
|
|
| T |
31858346 |
atttaatttatctttctcata |
31858366 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #124
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 360 - 452
Target Start/End: Original strand, 3331906 - 3332000
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| Q |
360 |
tttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaatattaattacatttct--taatatgtgtgaaatgcccaaaacgtcatacaatttagga |
452 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||| ||| || ||||||||| ||||| |||||| ||||||||| |
|
|
| T |
3331906 |
tttgtaaaacaactcataatatctattttccatacaaaattaattacatttcttataaaatatgtgaaatgatcaaaatgtcatataatttagga |
3332000 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #125
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 254 - 344
Target Start/End: Original strand, 35030409 - 35030499
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| Q |
254 |
tttacaataccaatgaaacattaatgttatttttcctattataaccttaactatttattactctctcttctttcaagtcttttatttatct |
344 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||||||| || ||||||| ||||||||||||| | |||| ||||||||||||||| | ||||||| ||||| |||||||| |
|
|
| T |
35030409 |
tttacaattccaatgaaatatcaatgttacttttcctattataccattaattatttattactctctttactttcaattctttaatttatct |
35030499 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #126
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 352 - 421
Target Start/End: Original strand, 33841408 - 33841477
Alignment:
| Q |
352 |
aggacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatatgtg |
421 |
Q |
| |
|
|||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
33841408 |
aggataattttgtaaaacaacttataatatttctttcccacacaaaattaattatatttcttaatatgtg |
33841477 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #127
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 239 - 428
Target Start/End: Original strand, 32614634 - 32614835
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| Q |
239 |
caaattgtatgtcactttacaataccaatgaaacattaatgttatttttcctattataaccttaactatttattactctctcttctttcaagtcttttat |
338 |
Q |
| |
|
|||||| || |||| ||||||||||| |||||| | ||||| ||||||| | ||| | |||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||| || |
|
|
| T |
32614634 |
caaattataagtcattttacaataccgatgaaatactaatgatattttttttcttacacccttaactttttattaatctctcttctttcaattctttaat |
32614733 |
T |
 |
| Q |
339 |
ttatctttttcatag-----------gacaattttgtaaaacaactcataa-tatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatatgtgtgaaa |
426 |
Q |
| |
|
|||||||| || || ||||||||||||||||||||||||| | | | |||| || |||| |||| ||||||||||||| | |||||||| |
|
|
| T |
32614734 |
ttatctttctcttatcatttattaaagacaattttgtaaaacaactcataattttttttttttcatacaacattagttacatttcttaaaacgtgtgaaa |
32614833 |
T |
 |
| Q |
427 |
tg |
428 |
Q |
| |
|
|| |
|
|
| T |
32614834 |
tg |
32614835 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #128
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Target Start/End: Complemental strand, 6087111 - 6087026
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| Q |
352 |
aggacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatatgtgtgaaatgcccaaaacgt |
438 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||| | ||| || |||| |||||||| |||||||||||||| |||||||| | |||||| |
|
|
| T |
6087111 |
aggacaattttgtaaaacaactcataatatatttttctcatacaaaattaattatatttcttaatatgt-tgaaatgctctaaacgt |
6087026 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #129
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Query Start/End: Original strand, 359 - 465
Target Start/End: Original strand, 24660265 - 24660371
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| Q |
359 |
ttttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatatgtgtgaaatgcccaaaacgtcatacaatttaggatgaagg |
458 |
Q |
| |
|
||||||||||||| ||| ||||||||||| || |||| |||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||| | |||| |||| || |
|
|
| T |
24660265 |
ttttgtaaaacaattcagaatatctctttaacatacaaaattacttacatttcttaatacgtgtgaaatagccaaaacatcatatattttaagatggaga |
24660364 |
T |
 |
| Q |
459 |
gagtaat |
465 |
Q |
| |
|
||||||| |
|
|
| T |
24660365 |
gagtaat |
24660371 |
T |
 |
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Target: chr6; HSP #130
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 185 - 271
Target Start/End: Original strand, 31503651 - 31503737
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| Q |
185 |
taaattactccatccgtcctaaattgtatgtcattttnnnnnnnntatttgtcccaaattgtatgtcactttacaataccaatgaaa |
271 |
Q |
| |
|
|||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
31503651 |
taaaataccccatccgtcttaaattgtatgtcattttaggaaaaaaaattgtcccaaattgtatgtcactttacaataccaatgaaa |
31503737 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #131
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 359 - 450
Target Start/End: Complemental strand, 31712616 - 31712525
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| Q |
359 |
ttttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatatgtgtgaaatgcccaaaacgtcatacaatttag |
450 |
Q |
| |
|
|||||||||||| ||||||||||||||| || | | ||||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||| ||||| ||||||| |
|
|
| T |
31712616 |
ttttgtaaaacatttcataatatctctttctcatatacaattaattacatttcttaatatatgttaaatgtccaaaacatcatataatttag |
31712525 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #132
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
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Target Start/End: Original strand, 18023743 - 18023837
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| Q |
356 |
caattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatatgtgtgaaatgcccaaaacgtcatacaatttag |
450 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| ||||| ||||| ||| || |||| |||||||| ||||||||||| |||| |||| | ||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
18023743 |
caattttgtaaaacaaatcatattatctatttctcatacaaaattaattatatttcttaatacgtgtaaaataactaaaacctcatacaatttag |
18023837 |
T |
 |
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Target: chr6; HSP #133
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
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Target Start/End: Original strand, 32243328 - 32243424
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| Q |
352 |
aggacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatatgtgtgaaatgcccaaaacgtcatacaattt |
448 |
Q |
| |
|
|||| |||||||||||| | | ||||| |||||||| || |||| ||||||||||||| ||||| ||||| ||||| | ||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
32243328 |
aggataattttgtaaaattatttataatttctctttttcatacaacattaattacattttttaatttgtgtaaaatgactaaaacgtcatataattt |
32243424 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #134
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 355 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 32655075 - 32654996
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| Q |
355 |
acaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatatgtgtgaaatgcccaaaa |
435 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| || ||||||||||||| | |||| ||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
32655075 |
acaattttgtaaaacacctaataatatctctttctcgtacaaaattaatttcatttctt-atacgtgtgaaatgcccaaaa |
32654996 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #135
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 355 - 450
Target Start/End: Complemental strand, 22816205 - 22816110
Alignment:
| Q |
355 |
acaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatatgtgtgaaatgcccaaaacgtcatacaatttag |
450 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||| ||||| ||||| || | || | ||||||||||| |||||| | |||||| ||||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
22816205 |
acaattttgtaaaacaactcacaatatatctttctcaaataaaagtaattacattttttaatacgcatgaaataaccaaaacgtcatataatttag |
22816110 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #136
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Query Start/End: Original strand, 354 - 392
Target Start/End: Original strand, 2309515 - 2309553
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| Q |
354 |
gacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccac |
392 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
2309515 |
gacaattttgtaaaacaactcataatatctctttcccac |
2309553 |
T |
 |
Back To:
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Target: chr6; HSP #137
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 352 - 410
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| Q |
352 |
aggacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaatattaattacattt |
410 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||| || ||||| || |||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
25509904 |
aggacaattttgtaaaacaactcataacatgtctttctcatacaaaattaattacattt |
25509846 |
T |
 |
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Target: chr6; HSP #138
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Query Start/End: Original strand, 352 - 410
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| Q |
352 |
aggacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaatattaattacattt |
410 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||| || ||||| || |||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
26046299 |
aggacaattttgtaaaacaactcataacatgtctttctcatacaaaattaattacattt |
26046241 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #139
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
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| Q |
264 |
caatgaaacattaatgttatttttcctattataaccttaactatttattactctctcttcttt |
326 |
Q |
| |
|
||||||||| | || |||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
30662491 |
caatgaaacttaaaagttatttttcctatcatatctttaactatttattactctctcctcttt |
30662429 |
T |
 |
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Target: chr6; HSP #140
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Query Start/End: Original strand, 239 - 315
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| Q |
239 |
caaattgtatgtcactttacaataccaatgaaacattaatgttatttttcctattataaccttaactatttattact |
315 |
Q |
| |
|
|||||| ||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||| ||||||| |||| ||||||||||| |
|
|
| T |
290737 |
caaattatatgtttctttacaatatcaatgaagcattaatgttacttttcatattatataattaattatttattact |
290813 |
T |
 |
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| Q |
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ttaatgttatttttcctattataaccttaactatttattactctctcttctttcaagtcttttatttatcttt |
346 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||| |||||||| ||| |||||||||| |
|
|
| T |
10218268 |
ttaatgttatttttcctatgatacccttaactatttatt-tactctctaatttcaagtttttaatttatcttt |
10218339 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #142
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| Q |
246 |
tatgtcactttacaataccaatgaaacattaatgttatttttcctattataaccttaactatttattactctctcttctttcaagtctttta |
337 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||| ||||||| | ||| ||||| ||| ||| |||| | ||||||||||| |||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
25149537 |
tatgtcactttacaataccaacgaaacatcaccgtttcttttcttatcataccctttattatttattact--ctcttctttcaattctttta |
25149448 |
T |
 |
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| Q |
357 |
aattttgtaaaacaactcataatatctcttttccac |
392 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
2311624 |
aattttgtaaaacaactcataatatctctttaccac |
2311659 |
T |
 |
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| Q |
352 |
aggacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaatattaattacatttcttaa |
415 |
Q |
| |
|
|||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||| |||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
30662390 |
aggataattttgtaaaacaactcataatatatctttctcatgcaaaattaattatatttcttaa |
30662327 |
T |
 |
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253 |
ctttacaataccaatgaaacattaatgttatttttcctattataaccttaactatttattactctctcttctttcaagtcttttatttatcttttt |
348 |
Q |
| |
|
||||| |||| ||||| ||||||||| ||| |||| || ||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||| || ||||| |
|
|
| T |
31712734 |
ctttaaaatatcaatggaacattaattttactttttctcttatacttttagctatttattactctatcttctttcaattctttaattcattttttt |
31712639 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
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aggacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaatattaattacattt |
410 |
Q |
| |
|
|||| |||||||||||||||||| |||||| | ||| ||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
290838 |
aggataattttgtaaaacaactcgtaatatatttttctcacacaaaattaattacattt |
290896 |
T |
 |
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291 |
attataaccttaactatttattactctctcttctttcaagtctttt--atttatcttt |
346 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||| |||||||||| |
|
|
| T |
24660184 |
attatatccttaactatttattaatttctcttctttcaattctttttaatttatcttt |
24660241 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #148
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 352 - 414
Target Start/End: Complemental strand, 31560381 - 31560319
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| Q |
352 |
aggacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaatattaattacatttctta |
414 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||||||||| ||||||| | |||||||||||| |||||||| || ||||| |
|
|
| T |
31560381 |
aggacaaatttgtaaaacaacgtataatatattttttccacacaaaattaattaaatatctta |
31560319 |
T |
 |
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Target: chr6; HSP #149
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Query Start/End: Original strand, 233 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 78566 - 78525
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233 |
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274 |
Q |
| |
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|||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||| |
|
|
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78566 |
ttgtcccaaattatatgtcgctttacaataccaatgcaacat |
78525 |
T |
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Target: chr6; HSP #150
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Target Start/End: Complemental strand, 30668527 - 30668462
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| Q |
254 |
tttacaataccaatgaaacattaatgttatttttcctattataaccttaactatttattactctct |
319 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||| ||||||||||||| ||||| ||||| | | || ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
30668527 |
tttacaatacaaataaaacattaatgtttttttttctattgcaccatttactatttattactctct |
30668462 |
T |
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Target: chr6; HSP #151
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Target Start/End: Original strand, 22530018 - 22530101
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| Q |
352 |
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438 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| || ||||||| | ||||||| |||| || ||| |||||||||| || ||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
22530018 |
aggacaattttgtaaaacaccttataatatgttttttccatacaacat---ttagatttcttaatgcgtatgaaatgtccaaaacgt |
22530101 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0160 (Bit Score: 159; Significance: 2e-84; HSPs: 1)
Name: scaffold0160
Description:
Target: scaffold0160; HSP #1
Raw Score: 159; E-Value: 2e-84
Query Start/End: Original strand, 190 - 463
Target Start/End: Complemental strand, 26042 - 25758
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289 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
26042 |
tactccctccgtcccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttatttttcc |
25943 |
T |
 |
| Q |
290 |
tattataaccttaactatttattactctctcttctttcaagtcttttatttatctttttcat-----------aggacaattttgtaaaacaactcataa |
378 |
Q |
| |
|
||||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||| |||||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
25942 |
tattatatccttaactatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttctcatatcatttattaaggataattttgtaaaacaactcataa |
25843 |
T |
 |
| Q |
379 |
tatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatatgtgtgaaatgcccaaaacgtcatacaatttaggatgaagggagta |
463 |
Q |
| |
|
||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| | |||||||| |
|
|
| T |
25842 |
tatctctttcccacacaatattaattacatttcttaatatgtgtgaaatgtccaaaacgtcatacaatttgggacggagggagta |
25758 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0037 (Bit Score: 156; Significance: 1e-82; HSPs: 1)
Name: scaffold0037
Description:
Target: scaffold0037; HSP #1
Raw Score: 156; E-Value: 1e-82
Query Start/End: Original strand, 190 - 448
Target Start/End: Original strand, 98862 - 99131
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| Q |
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289 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
98862 |
tactccctccgtcccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattatatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcc |
98961 |
T |
 |
| Q |
290 |
tattataaccttaactatttattactctctcttctttcaagtcttttatttatctttttcata-----------ggacaattttgtaaaacaactcataa |
378 |
Q |
| |
|
||||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
98962 |
tattatatccttaactatttattactctttcttttttcaattcttttatttatctttcccatatcatttattaaggataattttgtaaaacaactcataa |
99061 |
T |
 |
| Q |
379 |
tatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatatgtgtgaaatgcccaaaacgtcatacaattt |
448 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
99062 |
tatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatatgtgtgaaatgcccaaaacgtcatacaattt |
99131 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0239 (Bit Score: 145; Significance: 5e-76; HSPs: 3)
Name: scaffold0239
Description:
Target: scaffold0239; HSP #1
Raw Score: 145; E-Value: 5e-76
Query Start/End: Original strand, 233 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 1474 - 1248
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| Q |
233 |
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332 |
Q |
| |
|
||||||||| || |||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |
|
|
| T |
1474 |
ttgtcccaacttatatgtcgctttacaatatcaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttaactatttattactctctcttctttcaattc |
1375 |
T |
 |
| Q |
333 |
ttttatttatctttttcata-----------ggacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatatgtg |
421 |
Q |
| |
|
||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
1374 |
tttcatttatctttctcatattatttattaaggacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaatattaattgtatttcttaatatgtg |
1275 |
T |
 |
| Q |
422 |
tgaaatgcccaaaacgtcatacaattt |
448 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
1274 |
tgaaatgcccaaaacgtcatacaattt |
1248 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0239; HSP #2
Raw Score: 105; E-Value: 4e-52
Query Start/End: Original strand, 231 - 402
Target Start/End: Complemental strand, 15971 - 15789
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231 |
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330 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
15971 |
atttgtcccaaattatatgtcgctttacaatatcaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttaattatttattactctctcttctttcaat |
15872 |
T |
 |
| Q |
331 |
tcttttatttatctttttcat-----------aggacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaatattaa |
402 |
Q |
| |
|
||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
15871 |
tctttcatttatctttctcatattatttattaaggacaattttgtaaaacaactcataatatcttttttccacacaatattaa |
15789 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0239; HSP #3
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 394 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 15379 - 15325
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| Q |
394 |
caatattaattacatttcttaatatgtgtgaaatgcccaaaacgtcatacaattt |
448 |
Q |
| |
|
||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
15379 |
caatagtaattgtatttcttaatatgtgtgaaatgcccaaaacgtcatacaattt |
15325 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0011 (Bit Score: 145; Significance: 5e-76; HSPs: 3)
Name: scaffold0011
Description:
Target: scaffold0011; HSP #1
Raw Score: 145; E-Value: 5e-76
Query Start/End: Original strand, 190 - 465
Target Start/End: Original strand, 63344 - 63630
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190 |
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289 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
63344 |
tactccctccgtcccaaaatgtatgtcattttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcgctttacaataccaatgaaaaattaatgttatttttcc |
63443 |
T |
 |
| Q |
290 |
tattataaccttaactatttattactctctcttctttcaagtcttttatttatctttttcat-----------aggacaattttgtaaaacaactcataa |
378 |
Q |
| |
|
||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
63444 |
tattatatccttaactatttattactctctcttctttcaattccttcatttatctttcccatatcatttattgaggacagttttgtaaaacaactcataa |
63543 |
T |
 |
| Q |
379 |
tatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatatgtgtgaaatgcccaaaacgtcatacaatttaggatgaagggagtaat |
465 |
Q |
| |
|
||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||||| || | |||||||||| |
|
|
| T |
63544 |
tatctctttcccacacaatattaattacattttttaatatgtgtgaaatgcccaatacatcatacaatttgagacggagggagtaat |
63630 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0011; HSP #2
Raw Score: 117; E-Value: 3e-59
Query Start/End: Original strand, 233 - 448
Target Start/End: Original strand, 1285 - 1511
Alignment:
| Q |
233 |
ttgtcccaaattgtatgtcactttacaataccaatgaaacattaatgttatttttcctattataaccttaactatttattactctctcttctttcaagtc |
332 |
Q |
| |
|
||||||||| || ||| || ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| | |
|
|
| T |
1285 |
ttgtcccaagttatatatcgctttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcctattatatccttaactattgattactctctcttctttcaaata |
1384 |
T |
 |
| Q |
333 |
ttttatttatctttttcata-----------ggacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatatgtg |
421 |
Q |
| |
|
||| ||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |
|
|
| T |
1385 |
tttcatttatcttttccataccatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaatattaattacatttcttaatacgtg |
1484 |
T |
 |
| Q |
422 |
tgaaatgcccaaaacgtcatacaattt |
448 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
1485 |
tgaaatggccaaaacgtcatacaattt |
1511 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0011; HSP #3
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 233 - 463
Target Start/End: Complemental strand, 13914 - 13673
Alignment:
| Q |
233 |
ttgtcccaaattgtatgtcactttacaataccaatgaaacattaatgttatttttcctattataaccttaactatttattactctctcttctttcaagtc |
332 |
Q |
| |
|
|||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||| | ||||||||| | |
|
|
| T |
13914 |
ttgtcctaaattatatgtcgttttacaataccaatgaaataataatgttacttttcctattatatccttaactattaattactccccattctttcaatta |
13815 |
T |
 |
| Q |
333 |
ttttatttatctttttcata-----------ggacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatatgtg |
421 |
Q |
| |
|
||| ||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||| |||||||| ||||||||||| || |
|
|
| T |
13814 |
tttcatttatcttttccatactatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccctacacaaaattaattatatttcttaatacgta |
13715 |
T |
 |
| Q |
422 |
tgaaatgcccaaaacgtcatacaatttaggatgaagggagta |
463 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||||||||||||||||| | | |||||||| |
|
|
| T |
13714 |
tgaaatagccaaaacgtcatacaatttagaacggagggagta |
13673 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0427 (Bit Score: 140; Significance: 5e-73; HSPs: 1)
Name: scaffold0427
Description:
Target: scaffold0427; HSP #1
Raw Score: 140; E-Value: 5e-73
Query Start/End: Original strand, 197 - 463
Target Start/End: Original strand, 5238 - 5515
Alignment:
| Q |
197 |
tccgtcctaaattgtatgtcattttnnnnnnnntatttgtcccaaattgtatgtcactttacaataccaatgaaacattaatgttatttttcctattata |
296 |
Q |
| |
|
||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
5238 |
tccgtcctaaattatatgtcactttagaaaaaatatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacattaatgttacttttcctattata |
5337 |
T |
 |
| Q |
297 |
accttaactatttattactctctcttctttcaagtcttttatttatctttttcat-----------aggacaattttgtaaaacaactcataatatctct |
385 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||| |||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
5338 |
tccttaactatttattactctttcttttttcaattctttcatttatctttcccatatcatttattaaggataattttgtaaaacaacttataatatctct |
5437 |
T |
 |
| Q |
386 |
tttccacacaatattaattacatttcttaatatgtgtgaaatgcccaaaacgtcatacaatttaggatgaagggagta |
463 |
Q |
| |
|
|| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| | |||||||| |
|
|
| T |
5438 |
ttcccacacaatattaattatatttcttaatatgtgtgaaatgcctaaaacgtcatacaatttgggacggagggagta |
5515 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0264 (Bit Score: 138; Significance: 8e-72; HSPs: 1)
Name: scaffold0264
Description:
Target: scaffold0264; HSP #1
Raw Score: 138; E-Value: 8e-72
Query Start/End: Original strand, 231 - 463
Target Start/End: Complemental strand, 18919 - 18676
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| Q |
231 |
atttgtcccaaattgtatgtcactttacaataccaatgaaacattaatgttatttttcctattataaccttaactatttattactctctcttctttcaag |
330 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| |
|
|
| T |
18919 |
atttgtcccaaattgtatgtctctttacaataccaatgcaactttaatgttacttttcctattataaccttaactatttattactttctcttatttcaat |
18820 |
T |
 |
| Q |
331 |
tcttttatttatctttttcata-----------ggacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatatg |
419 |
Q |
| |
|
||||| |||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
18819 |
tctttcatttatttttcccatattatttattaaggacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaatattaattgcatttcttaatatg |
18720 |
T |
 |
| Q |
420 |
tgtgaaatgcccaaaacgtcatacaatttaggatgaagggagta |
463 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| |||||||| ||| | |||||||| |
|
|
| T |
18719 |
tgtgaaatgcccaaaacgttttacaatttgggacggagggagta |
18676 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0380 (Bit Score: 134; Significance: 2e-69; HSPs: 1)
Name: scaffold0380
Description:
Target: scaffold0380; HSP #1
Raw Score: 134; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 240 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 16234 - 16015
Alignment:
| Q |
240 |
aaattgtatgtcactttacaataccaatgaaacattaatgttatttttcctattataaccttaactatttattactctctcttctttcaagtcttttatt |
339 |
Q |
| |
|
||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||| |
|
|
| T |
16234 |
aaattatatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataaccttatctatttattactctcttttctttcaattctttcatt |
16135 |
T |
 |
| Q |
340 |
tatctttttcat-----------aggacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatatgtgtgaaatg |
428 |
Q |
| |
|
||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
16134 |
tatctttcccatgttatttattaaggacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttctacacaatattaattgcatttcttaatatgtgtgaaatg |
16035 |
T |
 |
| Q |
429 |
cccaaaacgtcatacaattt |
448 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
16034 |
cccaaaacgtcatacaattt |
16015 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0154 (Bit Score: 134; Significance: 2e-69; HSPs: 2)
Name: scaffold0154
Description:
Target: scaffold0154; HSP #1
Raw Score: 134; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 239 - 451
Target Start/End: Complemental strand, 4212 - 3989
Alignment:
| Q |
239 |
caaattgtatgtcactttacaataccaatgaaacattaatgttatttttcctattataaccttaactatttattactctctcttctttcaagtcttttat |
338 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| || |
|
|
| T |
4212 |
caaattgtatgtcactttacaatatcaatgaaacattaatgttactttttctattatattcttaactatttattactctttcttctttcaattctttcat |
4113 |
T |
 |
| Q |
339 |
ttatctttttcata-----------ggacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatatgtgtgaaat |
427 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
4112 |
ttatctttgtcatatcatttattaaggacaattttgtaaaacaactcataatatctattttccacacaatattaattatatttcttaatatatgtgaaat |
4013 |
T |
 |
| Q |
428 |
gcccaaaacgtcatacaatttagg |
451 |
Q |
| |
|
|||||||||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
4012 |
gcccaaaacgtcgtacaatttagg |
3989 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0154; HSP #2
Raw Score: 108; E-Value: 6e-54
Query Start/End: Original strand, 238 - 448
Target Start/End: Original strand, 6614 - 6835
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| Q |
238 |
ccaaattgtatgtcactttacaataccaatgaaacattaatgttatttttcctattataaccttaactatttattactctctcttctttcaagtctttta |
337 |
Q |
| |
|
||||||| |||||| ||||| |||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||| | |
|
|
| T |
6614 |
ccaaattatatgtcgctttataataccaatgcaacattaatgctacttttcctattataaccttagctatttattactctctcttatttcaattctttca |
6713 |
T |
 |
| Q |
338 |
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426 |
Q |
| |
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| T |
6714 |
tttatctttcccatattatttattaaggacaattttataaaacaactcataatatctcttttccacacaatattaattgcattttttaatatgtgtgaaa |
6813 |
T |
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| Q |
427 |
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448 |
Q |
| |
|
| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
6814 |
aagctaaaacgtcatacaattt |
6835 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold1335 (Bit Score: 127; Significance: 3e-65; HSPs: 1)
Name: scaffold1335
Description:
Target: scaffold1335; HSP #1
Raw Score: 127; E-Value: 3e-65
Query Start/End: Original strand, 230 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 1410 - 1181
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329 |
Q |
| |
|
|||||| || ||||| |||||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |
|
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| T |
1410 |
tatttgacctaaattatatgtcgctttacaataccaatgtaactttaatgttatttttcctattataaccttaactatttattactctctcttcttccaa |
1311 |
T |
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| Q |
330 |
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418 |
Q |
| |
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||||| |||||||||| || || |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |
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| T |
1310 |
ttctttcatttatctttcctatattatttattaaggacaattttgtaaaacaacttataatatctcttttccacacaatattaattgcatttcttaatat |
1211 |
T |
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| Q |
419 |
gtgtgaaatgcccaaaacgtcatacaattt |
448 |
Q |
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| T |
1210 |
atgtgaaatgcccaaaacgccatagaattt |
1181 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold1515 (Bit Score: 126; Significance: 1e-64; HSPs: 1)
Name: scaffold1515
Description:
Target: scaffold1515; HSP #1
Raw Score: 126; E-Value: 1e-64
Query Start/End: Original strand, 197 - 445
Target Start/End: Original strand, 1452 - 1711
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197 |
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296 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
1452 |
tccgtcccaaattgtatgtcactttagaaaaaatatttgtcctaaattatatgtcgttttacaataccaatgaaaaattaatgttaattttcctattata |
1551 |
T |
 |
| Q |
297 |
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385 |
Q |
| |
|
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|
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| T |
1552 |
ttcttaactatttattactttgtcttctttcaattccttcatttatctttcccatattatttattgaggacaattttgtaaaacaactcataatatctct |
1651 |
T |
 |
| Q |
386 |
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445 |
Q |
| |
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|||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
1652 |
tttccacataatattaattacatttcttaatatgtgtgaaatgcccaaaacgtcatacaa |
1711 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0768 (Bit Score: 123; Significance: 7e-63; HSPs: 1)
Name: scaffold0768
Description:
Target: scaffold0768; HSP #1
Raw Score: 123; E-Value: 7e-63
Query Start/End: Original strand, 231 - 463
Target Start/End: Complemental strand, 6141 - 5897
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330 |
Q |
| |
|
||||||| |||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| |
|
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| T |
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atttgtctcaaattatatgtcgctttacaataccaatgtaacattaatgttacttttcctattataaccttaactatttattattatctcttctttcaat |
6042 |
T |
 |
| Q |
331 |
tcttttatttatctttttcat-----------aggacaattttgtaaaacaactcataatatc-tcttttccacacaatattaattacatttcttaatat |
418 |
Q |
| |
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| ||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |
|
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| T |
6041 |
tatttcatttatcttttccatgttatttattaaggacaattttgtaaaacaactcataatatctttttttccacacaatattaattgcatttcttaatat |
5942 |
T |
 |
| Q |
419 |
gtgtgaaatgcccaaaacgtcatacaatttaggatgaagggagta |
463 |
Q |
| |
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|| ||||||||| ||||||||||| ||||| ||| | |||||||| |
|
|
| T |
5941 |
gtatgaaatgccgaaaacgtcataaaatttgggacggagggagta |
5897 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0060 (Bit Score: 123; Significance: 7e-63; HSPs: 3)
Name: scaffold0060
Description:
Target: scaffold0060; HSP #1
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329 |
Q |
| |
|
||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
21668 |
tatttatcctaaattgtatgtcactttacaatatcaatgaaatattaatgttatttttcctattatatccttaactattttttactctttcttctttcaa |
21569 |
T |
 |
| Q |
330 |
gtcttttatttatctt-----tttcat------aggacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatat |
418 |
Q |
| |
|
||||| |||||| || | |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
21568 |
ttctttcatttattttccccatatcatttattaaggacaattttgtaaaacaactcataatttcttttttccacacaatattaattacattttttaatat |
21469 |
T |
 |
| Q |
419 |
gtgtgaaatgcccaaaacgtcatacaattt |
448 |
Q |
| |
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|
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| T |
21468 |
gtgtgaaatgtacaaaacgtcatacaattt |
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T |
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Back To:
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Target: scaffold0060; HSP #2
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421 |
Q |
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|
||||||||||||||| ||||||||||||||||| || | |||| ||||||||||||| ||||| |||| |
|
|
| T |
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aggacaattttgtaagacaactcataatatctcattctcgtacaaaattaattacattttttaatgtgtg |
27906 |
T |
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Target: scaffold0060; HSP #3
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 352 - 421
Target Start/End: Complemental strand, 71791 - 71722
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| Q |
352 |
aggacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatatgtg |
421 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| ||||||||||||||||| || | |||| ||||||||||||| ||||| |||| |
|
|
| T |
71791 |
aggacaattttgtaagacaactcataatatctcattctcgtacaaaattaattacattttttaatgtgtg |
71722 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0018 (Bit Score: 123; Significance: 7e-63; HSPs: 1)
Name: scaffold0018
Description:
Target: scaffold0018; HSP #1
Raw Score: 123; E-Value: 7e-63
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Target Start/End: Original strand, 151680 - 151924
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329 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
151680 |
tatttgtcccaaattatatgtcgctttacaatatcaatgcaacattaatgttacttttcttattataaccttaagcatttattactccatcttctttcaa |
151779 |
T |
 |
| Q |
330 |
gtcttttatttatctttttcata-----------ggacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatat |
418 |
Q |
| |
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| ||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |
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| T |
151780 |
ttatttcatttatctttcccatattatttattaaggacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaatattaattgtatttcttaatat |
151879 |
T |
 |
| Q |
419 |
gtgtgaaatgcccaaaacgtcatacaatttaggatgaagggagta |
463 |
Q |
| |
|
||| |||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||| |
|
|
| T |
151880 |
gtgcgaaatgcccaaaacgtcatacaatttgggacggagggagta |
151924 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0983 (Bit Score: 122; Significance: 3e-62; HSPs: 1)
Name: scaffold0983
Description:
Target: scaffold0983; HSP #1
Raw Score: 122; E-Value: 3e-62
Query Start/End: Original strand, 231 - 463
Target Start/End: Complemental strand, 1310 - 1067
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330 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||||| ||| |||||| ||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |
|
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| T |
1310 |
atttgtcccaaattatatgtcgcttcacaatatcaatgcaacattaatattacttttcctattataaccttaactatttattactatctcttctttcaat |
1211 |
T |
 |
| Q |
331 |
tcttttatttatctttttcata-----------ggacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatatg |
419 |
Q |
| |
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| T |
1210 |
tctttcatttatatttcccatattatttattaaggacaattttgtaaaacaactcataatatcttttttcgacacaatattaattgcatttcttaatatg |
1111 |
T |
 |
| Q |
420 |
tgtgaaatgcccaaaacgtcatacaatttaggatgaagggagta |
463 |
Q |
| |
|
||||||||| |||||| ||||||||||||| || | |||||||| |
|
|
| T |
1110 |
tgtgaaatgtccaaaatgtcatacaatttaagacggagggagta |
1067 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0444 (Bit Score: 122; Significance: 3e-62; HSPs: 1)
Name: scaffold0444
Description:
Target: scaffold0444; HSP #1
Raw Score: 122; E-Value: 3e-62
Query Start/End: Original strand, 233 - 473
Target Start/End: Original strand, 7638 - 7889
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332 |
Q |
| |
|
|||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| | |
|
|
| T |
7638 |
ttgtcccaaattataagtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcctattatatccttaactattaattactctctcttctttcaatta |
7737 |
T |
 |
| Q |
333 |
ttttatttatctttttcat-----------aggacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatatgtg |
421 |
Q |
| |
|
||| ||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |
|
|
| T |
7738 |
tttcatttatcttttccataccatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttttcttccccacacaatattaattacatttcttaatacgtg |
7837 |
T |
 |
| Q |
422 |
tgaaatgcccaaaacgtcatacaatttaggatgaagggagtaatttaaatat |
473 |
Q |
| |
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|
|
| T |
7838 |
tgaaatggccaaaacgtcatacaatttgggacggagggagtagttttaatat |
7889 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0330 (Bit Score: 121; Significance: 1e-61; HSPs: 1)
Name: scaffold0330
Description:
Target: scaffold0330; HSP #1
Raw Score: 121; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 230 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 13941 - 13714
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329 |
Q |
| |
|
||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
13941 |
tatttgtcctaaattgtatgtcactttacaatacaaatgaaacgttaatgttacttttcctattatatccttaactattt--tactctttcttctttcaa |
13844 |
T |
 |
| Q |
330 |
gtcttttatttatctttttcata-----------ggacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatat |
418 |
Q |
| |
|
||||| |||||||||| |||| ||| ||||||||||| |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
13843 |
ttctttcatttatctttcccatatcatttattaaggataattttgtaaagcaactcataatatcactttcccacacaatattaattacatttcttaatat |
13744 |
T |
 |
| Q |
419 |
gtgtgaaatgcccaaaacgtcatacaattt |
448 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
13743 |
atgtgaaatgcccaaaacgtcatacaattt |
13714 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0262 (Bit Score: 119; Significance: 2e-60; HSPs: 1)
Name: scaffold0262
Description:
Target: scaffold0262; HSP #1
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Query Start/End: Original strand, 240 - 465
Target Start/End: Original strand, 3808 - 4044
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339 |
Q |
| |
|
||||| |||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| | | | ||| |
|
|
| T |
3808 |
aaattatatgtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcctattatatccttaactattaattactctctcttctttcaattatatcatt |
3907 |
T |
 |
| Q |
340 |
tatctttttcata-----------ggacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatatgtgtgaaatg |
428 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
3908 |
tatcttttccataccatttattaaggataattttgtataacaactgataatttctcttccccacacaatattaattacatttcttaatacgtgtgaaatg |
4007 |
T |
 |
| Q |
429 |
cccaaaacgtcatacaatttaggatgaagggagtaat |
465 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
4008 |
gccaaaacgtcatacaatttaggatggagggagtaat |
4044 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0009 (Bit Score: 118; Significance: 7e-60; HSPs: 1)
Name: scaffold0009
Description:
Target: scaffold0009; HSP #1
Raw Score: 118; E-Value: 7e-60
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Target Start/End: Original strand, 8477 - 8720
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330 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
8477 |
atttgtcccaaattatatgtcgctttacaataccaatgaaatattaattttatttttcctattatatccttaactattaattattctctcttctttcaat |
8576 |
T |
 |
| Q |
331 |
tcttttatttatctttttcat-----------aggacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatatg |
419 |
Q |
| |
|
| ||| |||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| | |
|
|
| T |
8577 |
tatttcatttatctttcccataccatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccacacacaatattaattacatttcttaatacg |
8676 |
T |
 |
| Q |
420 |
tgtgaaatgcccaaaacgtcatacaatttaggatgaagggagta |
463 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||||| ||||||||||| ||| |||||||||| |
|
|
| T |
8677 |
tgtgaaatgaccaaaacatcatacaatttgggacgaagggagta |
8720 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0734 (Bit Score: 117; Significance: 3e-59; HSPs: 1)
Name: scaffold0734
Description:
Target: scaffold0734; HSP #1
Raw Score: 117; E-Value: 3e-59
Query Start/End: Original strand, 230 - 449
Target Start/End: Original strand, 6307 - 6537
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230 |
tatttgtcccaaattgtatgtcactttacaataccaatgaaacattaatgttatttttcctattataaccttaactatttattactctctcttctttcaa |
329 |
Q |
| |
|
|||||||| ||| || |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
6307 |
tatttgtctcaatttatatgtcgctttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataactttagctatttattactctcttttctttcaa |
6406 |
T |
 |
| Q |
330 |
gtcttttatttatctttttcata-----------ggacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatat |
418 |
Q |
| |
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||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
6407 |
ttctttcatttatctttcccatattatttattaaggacaattttgtaaaacaactcataatatatcaattccacacaatattaattgcatttcttaatat |
6506 |
T |
 |
| Q |
419 |
gtgtgaaatgcccaaaacgtcatacaattta |
449 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
6507 |
gtgtgaaatgtccaaaacatcatacaattta |
6537 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0789 (Bit Score: 116; Significance: 1e-58; HSPs: 1)
Name: scaffold0789
Description:
Target: scaffold0789; HSP #1
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Target Start/End: Original strand, 3354 - 3595
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Q |
| |
|
|||||||||||| |||||| |||| |||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || |
|
|
| T |
3354 |
ttgtcccaaattatatgtcgttttaaaataccaatgcaacattaatgatacttttcctattataaccttaattatttattactctctcttctttcaattc |
3453 |
T |
 |
| Q |
333 |
ttttatttatctttttcata-----------ggacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatatgtg |
421 |
Q |
| |
|
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|
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| T |
3454 |
tttcatttatttttcccatatcatttactaaggacaattttgtaaaacaactcataatatctattttccacacaatattaattgtatttcttaatatgta |
3553 |
T |
 |
| Q |
422 |
tgaaatgcccaaaacgtcatacaatttaggatgaagggagta |
463 |
Q |
| |
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||||||| ||||||||||||| ||||| ||| | |||||||| |
|
|
| T |
3554 |
tgaaatgaccaaaacgtcatataatttgggacggagggagta |
3595 |
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 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0027 (Bit Score: 116; Significance: 1e-58; HSPs: 1)
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Description:
Target: scaffold0027; HSP #1
Raw Score: 116; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 190 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 11275 - 11006
Alignment:
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190 |
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289 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
11275 |
tactccctccgtcctaaattgtatgtcgttttgaaatttttttttgtcccaaattgtatgtcgctttacaatatcaatgaatcattaatgttacttttcc |
11176 |
T |
 |
| Q |
290 |
tattataaccttaactatttattactctctcttctttcaagtcttttatttatctttttcata-----------ggacaattttgtaaaacaactcataa |
378 |
Q |
| |
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|
|
| T |
11175 |
tattatatccttcactatttattgtcttctctacttccaagtcattcatttatctttcccatatcatttattaaggacaattttgtaaaacaactcataa |
11076 |
T |
 |
| Q |
379 |
tatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatatgtgtgaaatgcccaaaacgtcatacaattt |
448 |
Q |
| |
|
||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
11075 |
tatctctttcccacacaaaattaattacaattcttaatacgtgtgaaatgcccaaaacgtcatacaattt |
11006 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0654 (Bit Score: 114; Significance: 2e-57; HSPs: 1)
Name: scaffold0654
Description:
Target: scaffold0654; HSP #1
Raw Score: 114; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 231 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 3069 - 2841
Alignment:
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231 |
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327 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| || | |||||| || |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
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3069 |
atttgtcccaaattatatgtcgctttacaataccaatgcaataatattaatgctactttttccattataaccttaactatttattactctctcttctttc |
2970 |
T |
 |
| Q |
328 |
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416 |
Q |
| |
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|| ||||| |||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
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aattctttcatttatctttcccatattatttactaaggactattttgtaaaacaactcataatatctctt---cacacaatattaattacatttcttaat |
2873 |
T |
 |
| Q |
417 |
atgtgtgaaatgcccaaaacgtcatacaattt |
448 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
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atgtgtgaaatgcccaaaacgtcatacaattt |
2841 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0172 (Bit Score: 113; Significance: 7e-57; HSPs: 1)
Name: scaffold0172
Description:
Target: scaffold0172; HSP #1
Raw Score: 113; E-Value: 7e-57
Query Start/End: Original strand, 230 - 465
Target Start/End: Complemental strand, 18434 - 18188
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329 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||| |
|
|
| T |
18434 |
tatttgtcccaaattatatgtcgctttacaatatcaatgaaaaattaatgttacttttcctattatatccttaactatttattaccctcttttctttcaa |
18335 |
T |
 |
| Q |
330 |
gtcttttatttatctttttcat-----------aggacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatat |
418 |
Q |
| |
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|
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| T |
18334 |
ttccttcatttatcttttccatatcatttattgaggataattttgtaaaacaacgaataatatcactttcccacacaatattaattacatttcttaatat |
18235 |
T |
 |
| Q |
419 |
gtgtgaaatgcccaaaacgtcatacaatttaggatgaagggagtaat |
465 |
Q |
| |
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|||||||||| ||||||| | ||||||||| | | | |||||||||| |
|
|
| T |
18234 |
gtgtgaaatgtccaaaacattatacaatttggaacggagggagtaat |
18188 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0459 (Bit Score: 112; Significance: 3e-56; HSPs: 1)
Name: scaffold0459
Description:
Target: scaffold0459; HSP #1
Raw Score: 112; E-Value: 3e-56
Query Start/End: Original strand, 233 - 463
Target Start/End: Complemental strand, 11734 - 11493
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332 |
Q |
| |
|
|||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| | |
|
|
| T |
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ttgtcccaaattatatgtcgctttacaataccaatgaaatatttatgttacttttcctattatatccttaactattaattactctctcttctttcaatta |
11635 |
T |
 |
| Q |
333 |
ttttatttatctttttcata-----------ggacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatatgtg |
421 |
Q |
| |
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| T |
11634 |
tttcatttatcttttccataccatttattagggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacgcaatattaattacatttcttaatacatg |
11535 |
T |
 |
| Q |
422 |
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463 |
Q |
| |
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|
| T |
11534 |
tgaaatggccaaaacgtcttacaatttagaacggagggagta |
11493 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0366 (Bit Score: 112; Significance: 3e-56; HSPs: 2)
Name: scaffold0366
Description:
Target: scaffold0366; HSP #1
Raw Score: 112; E-Value: 3e-56
Query Start/End: Original strand, 233 - 463
Target Start/End: Complemental strand, 13041 - 12800
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332 |
Q |
| |
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|
|
| T |
13041 |
ttgtcccaaattatatgtcgctttacaataccaatgaaatatttatgttacttttcctattatatccttaactattaattactctctcttctttcaatta |
12942 |
T |
 |
| Q |
333 |
ttttatttatctttttcata-----------ggacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatatgtg |
421 |
Q |
| |
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|
|
| T |
12941 |
tttcatttatcttttccataccatttattagggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacgcaatattaattacatttcttaatacatg |
12842 |
T |
 |
| Q |
422 |
tgaaatgcccaaaacgtcatacaatttaggatgaagggagta |
463 |
Q |
| |
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|
|
| T |
12841 |
tgaaatggccaaaacgtcttacaatttagaacggagggagta |
12800 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0366; HSP #2
Raw Score: 107; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 233 - 463
Target Start/End: Complemental strand, 292 - 49
Alignment:
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233 |
ttgtcccaaattgtatgtcactttacaataccaatgaaacattaatgttatttttcctattataaccttaactatttattactctctcttctttcaagtc |
332 |
Q |
| |
|
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| T |
292 |
ttgtcccaaattatatgtcgttttacagtaccaatgcaacattaatgttacttttccaattgtaaccttaactatttattattatctcttctttcaattc |
193 |
T |
 |
| Q |
333 |
ttttatttatctttttcata-----------ggacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttc--cacacaatattaattacatttcttaatatg |
419 |
Q |
| |
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|
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| T |
192 |
tttcatttatctttcccatattatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatatctttttttttcacgcaatattaattgcatttcttaatatg |
93 |
T |
 |
| Q |
420 |
tgtgaaatgcccaaaacgtcatacaatttaggatgaagggagta |
463 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
92 |
tgtgaaatgcccaaaacgtcatacaatttgggacggagggagta |
49 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0166 (Bit Score: 112; Significance: 3e-56; HSPs: 1)
Name: scaffold0166
Description:
Target: scaffold0166; HSP #1
Raw Score: 112; E-Value: 3e-56
Query Start/End: Original strand, 233 - 463
Target Start/End: Complemental strand, 23586 - 23345
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| Q |
233 |
ttgtcccaaattgtatgtcactttacaataccaatgaaacattaatgttatttttcctattataaccttaactatttattactctctcttctttcaagtc |
332 |
Q |
| |
|
|||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| | |
|
|
| T |
23586 |
ttgtcccaaattatatgtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcctattatatccttaactattaattactctctcttctttcaatta |
23487 |
T |
 |
| Q |
333 |
ttttatttatctttttcata-----------ggacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatatgtg |
421 |
Q |
| |
|
||| ||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||| ||||||||||| || |
|
|
| T |
23486 |
tttcatttatcttttccataccatttattagggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccgcacaatattaattaaatttcttaatacatg |
23387 |
T |
 |
| Q |
422 |
tgaaatgcccaaaacgtcatacaatttaggatgaagggagta |
463 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||||||||||||||| ||| | |||||||| |
|
|
| T |
23386 |
tgaaattgccaaaacgtcatacaatttgggacggagggagta |
23345 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0130 (Bit Score: 109; Significance: 2e-54; HSPs: 1)
Name: scaffold0130
Description:
Target: scaffold0130; HSP #1
Raw Score: 109; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 231 - 466
Target Start/End: Complemental strand, 23118 - 22872
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| Q |
231 |
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330 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||| || ||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||||| | |||| |||||||| |||||| |
|
|
| T |
23118 |
atttgttccaaattataagtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttacttttcctattatatccttaactactaattattctctcttgtttcaat |
23019 |
T |
 |
| Q |
331 |
tcttttatttatctttttcata-----------ggacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatatg |
419 |
Q |
| |
|
| ||| ||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |
|
|
| T |
23018 |
tatttcatttatcttttccataccatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttacccacacaatattaattacatttcttaatacg |
22919 |
T |
 |
| Q |
420 |
tgtgaaatgcccaaaacgtcatacaatttaggatgaagggagtaatt |
466 |
Q |
| |
|
||||||||| |||||||||| |||||||| ||| | ||||||||||| |
|
|
| T |
22918 |
tgtgaaatggccaaaacgtcgtacaatttgggacggagggagtaatt |
22872 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0189 (Bit Score: 108; Significance: 6e-54; HSPs: 1)
Name: scaffold0189
Description:
Target: scaffold0189; HSP #1
Raw Score: 108; E-Value: 6e-54
Query Start/End: Original strand, 239 - 448
Target Start/End: Original strand, 13359 - 13577
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338 |
Q |
| |
|
|||||| |||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| || | ||| || |
|
|
| T |
13359 |
caaattatatgtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttatttttcctattata--cttaactattaattactctctcttcttttaattatttcat |
13456 |
T |
 |
| Q |
339 |
ttatctttttcata-----------ggacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatatgtgtgaaat |
427 |
Q |
| |
|
||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |
|
|
| T |
13457 |
ttatcttttccataccatttattagggataattttgtaaaacaactcataatttctcttccccacacaatattaattacattttttaatacgtgtgaaat |
13556 |
T |
 |
| Q |
428 |
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448 |
Q |
| |
|
| ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
13557 |
gaccaaaacgtcatacaattt |
13577 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0140 (Bit Score: 107; Significance: 3e-53; HSPs: 1)
Name: scaffold0140
Description:
Target: scaffold0140; HSP #1
Raw Score: 107; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 231 - 463
Target Start/End: Complemental strand, 18365 - 18120
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328 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||| |||||| |||||||| |||| |||| ||| | |
|
|
| T |
18365 |
atttgtctcaaattgtatgtcactttataataccaatgaaatattaatgtttattttttctattatatccttaattatttatttctctttctttttttta |
18266 |
T |
 |
| Q |
329 |
agtcttttatttatctttt-----tcat------aggacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaatattaattacatttcttaata |
417 |
Q |
| |
|
| |||||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
18265 |
attcttttatttatttttcctatatcatttattaaggacaattttgtaaaacaactcataatatctatttcccacacaatattaattacatttcttaata |
18166 |
T |
 |
| Q |
418 |
tgtgtgaaatgcccaaaacgtcatacaatttaggatgaagggagta |
463 |
Q |
| |
|
||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||| |
|
|
| T |
18165 |
tgtgtaaaatatccaaaacgtcatacaatttagaatggagggagta |
18120 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0533 (Bit Score: 105; Significance: 4e-52; HSPs: 1)
Name: scaffold0533
Description:
Target: scaffold0533; HSP #1
Raw Score: 105; E-Value: 4e-52
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Target Start/End: Original strand, 7250 - 7476
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332 |
Q |
| |
|
|||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||| | | |
|
|
| T |
7250 |
ttgtcctaaattatatgtcgttttacaataccaatgaaatattaatgttatttttcctattatatcattaactattaattactctctcttctttctatta |
7349 |
T |
 |
| Q |
333 |
ttttatttatctttttcata-----------ggacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatatgtg |
421 |
Q |
| |
|
||| ||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |
|
|
| T |
7350 |
tttcatttatcttttccataccatttattagggataattttgtaaaacaaatcataatttctcttccccacacagtattaattacatttcttaatacgtg |
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T |
 |
| Q |
422 |
tgaaatgcccaaaacgtcatacaattt |
448 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
7450 |
tgaaatggccaaaacgtcatacaattt |
7476 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0308 (Bit Score: 103; Significance: 6e-51; HSPs: 1)
Name: scaffold0308
Description:
Target: scaffold0308; HSP #1
Raw Score: 103; E-Value: 6e-51
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Q |
| |
|
|||||||||||| |||||| ||||| |||||||||| || ||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |
|
|
| T |
20711 |
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20810 |
T |
 |
| Q |
333 |
ttttatttatctttttcata-----------ggacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatatgtg |
421 |
Q |
| |
|
||| | |||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
20811 |
tttcagttatctttcccatattatttactaaggacgattttgtaaaacaactcataatatctctt---caaacaatattaattacatttcttaatatgtg |
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T |
 |
| Q |
422 |
tgaaatgcccaaaacgtcatacaattt |
448 |
Q |
| |
|
||||||| |||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
20908 |
tgaaatgtccaaaatgtcatacaattt |
20934 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0074 (Bit Score: 99; Significance: 2e-48; HSPs: 4)
Name: scaffold0074
Description:
Target: scaffold0074; HSP #1
Raw Score: 99; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 231 - 468
Target Start/End: Original strand, 17499 - 17747
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231 |
atttgtcccaaattgtatgtcactttacaataccaatgaaacattaatgttatttttcctattataaccttaactatttattactctctcttctttcaag |
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Q |
| |
|
|||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
17499 |
atttgtcccaaattataagtcgctttacaataccaatgaaatattaatgttactttccctattatatccttaactattaattactccatcttctttcaat |
17598 |
T |
 |
| Q |
331 |
tcttttatttatctttttcat-----------aggacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatatg |
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Q |
| |
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| ||| ||||||||||| ||| |||| ||||| ||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |
|
|
| T |
17599 |
tatttcatttatcttttccataccatttattaaggataatttggtaaaacaactcataatttcacttccccacacaatattaattacatttcttaatacg |
17698 |
T |
 |
| Q |
420 |
tgtgaaatgcccaaaacgtcatacaatttaggatgaagggagtaattta |
468 |
Q |
| |
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||||||||| ||||||| || |||||||| ||| | |||||||| |||| |
|
|
| T |
17699 |
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17747 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0074; HSP #2
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 352 - 448
Target Start/End: Original strand, 45872 - 45968
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|
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|
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T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0074; HSP #3
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 233 - 315
Target Start/End: Original strand, 45624 - 45706
Alignment:
| Q |
233 |
ttgtcccaaattgtatgtcactttacaataccaatgaaacattaatgttatttttcctattataaccttaactatttattact |
315 |
Q |
| |
|
|||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
45624 |
ttgtcccaaattatatgtcgtgttacaataccaatgcaacattaatgttacttttcctattataacattaactatttattact |
45706 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0074; HSP #4
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 306 - 346
Target Start/End: Original strand, 45815 - 45855
Alignment:
| Q |
306 |
atttattactctctcttctttcaagtcttttatttatcttt |
346 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||| |
|
|
| T |
45815 |
atttattactctctcttctttcaattatttcatttatcttt |
45855 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0007 (Bit Score: 92; Significance: 2e-44; HSPs: 1)
Name: scaffold0007
Description:
Target: scaffold0007; HSP #1
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 231 - 448
Target Start/End: Original strand, 2965 - 3191
Alignment:
| Q |
231 |
atttgtcccaaattgtatgtcactttacaataccaatgaaacattaatgttatttttcctattataaccttaactatttattactctctcttctttcaag |
330 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||||| |||||||||||| || |||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
2965 |
atttgtcccaaattatatgtcgttttacaataccattgcaacaat--tgttacttttcctattataaccttaactatttattactctctctcctttcaat |
3062 |
T |
 |
| Q |
331 |
tcttttatttatctttttcata-----------ggacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatatg |
419 |
Q |
| |
|
||||| ||||| ||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||| |||| ||||||| |
|
|
| T |
3063 |
tctttcgtttatttttcccatattatttattaaggacaattttataaaacaactcataatatctattttgcactcaatattaattgtattttttaatata |
3162 |
T |
 |
| Q |
420 |
tgtgaaatgcccaaaacgtcatacaattt |
448 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
3163 |
tgtgaaatgcccaaaacgtcatacaattt |
3191 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0236 (Bit Score: 89; Significance: 1e-42; HSPs: 1)
Name: scaffold0236
Description:
Target: scaffold0236; HSP #1
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 236 - 443
Target Start/End: Original strand, 20318 - 20535
Alignment:
| Q |
236 |
tcccaaattgtatgtcactttacaataccaatgaaacattaatgttatttttcctattataaccttaactatttattactctctcttctttcaagtcttt |
335 |
Q |
| |
|
||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||| |||| |||||||| ||||| ||||| | |||||||| ||||||||| | ||| |
|
|
| T |
20318 |
tcccaaattatatgtcgctttacaataccaataaaatattaatgttactttttctattatatcctta-ctattaactactctcttttctttcaattattt |
20416 |
T |
 |
| Q |
336 |
tatttatctttttcata-----------ggacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatatgtgtga |
424 |
Q |
| |
|
||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
20417 |
catttatcttttccataccatttattaaggataattttgtaaaacaactcataatttctcttcctcacacaatattaattacatttcttaatacgtgtga |
20516 |
T |
 |
| Q |
425 |
aatgcccaaaacgtcatac |
443 |
Q |
| |
|
|||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
20517 |
aatggccaaaacgtcatac |
20535 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0015 (Bit Score: 88; Significance: 6e-42; HSPs: 1)
Name: scaffold0015
Description:
Target: scaffold0015; HSP #1
Raw Score: 88; E-Value: 6e-42
Query Start/End: Original strand, 233 - 463
Target Start/End: Original strand, 20500 - 20740
Alignment:
| Q |
233 |
ttgtcccaaattgtatgtcactttacaataccaatgaaacattaatgttatttttcctattataaccttaactatttattactctctcttctttcaagtc |
332 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||| | ||| |||||||||||| ||||||||| ||| || |
|
|
| T |
20500 |
ttgtcctaaattgtatgtcgttttacaataccaatgaattattaatgttaccttttctattatatcttta-ctatttattactttctcttcttccaattc |
20598 |
T |
 |
| Q |
333 |
ttttatttatctttttcata-----------ggacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatatgtg |
421 |
Q |
| |
|
|| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||| || |
|
|
| T |
20599 |
attcatttatctttctcatatcatttattaaggacaattttgtaaaacaacttataatatctctttcccaaacaaaattaattacatttcttaatacgta |
20698 |
T |
 |
| Q |
422 |
tgaaatgcccaaaacgtcatacaatttaggatgaagggagta |
463 |
Q |
| |
|
|||||| || ||||||||||||||||| ||| | |||||||| |
|
|
| T |
20699 |
tgaaatacctaaaacgtcatacaatttgggacggagggagta |
20740 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0496 (Bit Score: 81; Significance: 8e-38; HSPs: 1)
Name: scaffold0496
Description:
Target: scaffold0496; HSP #1
Raw Score: 81; E-Value: 8e-38
Query Start/End: Original strand, 352 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 12748 - 12652
Alignment:
| Q |
352 |
aggacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatatgtgtgaaatgcccaaaacgtcatacaattt |
448 |
Q |
| |
|
|||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
12748 |
aggataattttgtaaaacaactcataatatttctttcccacacaatattaattacatttcttaatatgtgtgaaatgcccaaaacatcatacaattt |
12652 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0475 (Bit Score: 78; Significance: 5e-36; HSPs: 1)
Name: scaffold0475
Description:
Target: scaffold0475; HSP #1
Raw Score: 78; E-Value: 5e-36
Query Start/End: Original strand, 264 - 448
Target Start/End: Original strand, 5173 - 5366
Alignment:
| Q |
264 |
caatgaaacattaatgttatttttcctattataaccttaactatttattactctctcttctttcaagtcttttatttat-cttt---------ttcat-- |
351 |
Q |
| |
|
|||| ||||||||| |||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||| |||||| |||| || || |
|
|
| T |
5173 |
caataaaacattaacgttacttt-cctattatatccttaactatttattactctttcttctt-caattctttcatttattctttctatatctatttatta |
5270 |
T |
 |
| Q |
352 |
aggacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatatgtgtgaaatgcccaaaacgtcatacaattt |
448 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
5271 |
aggacaattttgtaaaacaactcataatatct-tttcccacacaatattaattacatttcttaatatgtgtgaaatgctcaaaatgtcatacaattt |
5366 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0006 (Bit Score: 78; Significance: 5e-36; HSPs: 2)
Name: scaffold0006
Description:
Target: scaffold0006; HSP #1
Raw Score: 78; E-Value: 5e-36
Query Start/End: Original strand, 233 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 188827 - 188718
Alignment:
| Q |
233 |
ttgtcccaaattgtatgtcactttacaataccaatgaaacattaatgttatttttcctattataaccttaactatttattactctctcttctttcaagtc |
332 |
Q |
| |
|
|||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || |
|
|
| T |
188827 |
ttgtcccaaattatatgtcgatttacaataccaatgcaacattaatattatttttcctattataaccttaactatttattactgtctcttctttcaattc |
188728 |
T |
 |
| Q |
333 |
ttttatttat |
342 |
Q |
| |
|
||| |||||| |
|
|
| T |
188727 |
tttcatttat |
188718 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0006; HSP #2
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 410 - 452
Target Start/End: Complemental strand, 187572 - 187530
Alignment:
| Q |
410 |
tcttaatatgtgtgaaatgcccaaaacgtcatacaatttagga |
452 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
187572 |
tcttaatatgtgtgaaatgttcaaaacgtcatacaatttagga |
187530 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0001 (Bit Score: 69; Significance: 1e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold0001
Description:
Target: scaffold0001; HSP #1
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 230 - 314
Target Start/End: Original strand, 524331 - 524415
Alignment:
| Q |
230 |
tatttgtcccaaattgtatgtcactttacaataccaatgaaacattaatgttatttttcctattataaccttaactatttattac |
314 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
524331 |
tatttgtcccaaattgtatgtcactttagaataccaatgaaacaataatgttacttttcctattatatccttaactatttattac |
524415 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0005 (Bit Score: 59; Significance: 1e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0005
Description:
Target: scaffold0005; HSP #1
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 239 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 213130 - 212935
Alignment:
| Q |
239 |
caaattgtatgtcactttacaataccaatgaaacattaatgttatttttcctattataaccttaactatttattactctctcttctttcaagtcttttat |
338 |
Q |
| |
|
|||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||| |||||| |||| |||||||| | ||||| || |
|
|
| T |
213130 |
caaattatatgtcgctttacaataccaacgaaacattaatgtaacttttcctattataactttaactagttattattctcgcttctttccattctttaat |
213031 |
T |
 |
| Q |
339 |
ttatctttttcat-----------aggacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatatgtgtgaaat |
427 |
Q |
| |
|
||||| || |||| |||| |||||||||||| ||| ||||||||| ||||| | |||||||||| |||||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
213030 |
ttatcattctcataccatttattaaggataattttgtaaaataacacataatatcacttttac-----atattaattatatttcttaatatatgtgaaat |
212936 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0187 (Bit Score: 54; Significance: 1e-21; HSPs: 2)
Name: scaffold0187
Description:
Target: scaffold0187; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 253 - 430
Target Start/End: Complemental strand, 10511 - 10321
Alignment:
| Q |
253 |
ctttacaataccaatgaaacattaatgttatttttcctattataaccttaactattt--attactctctcttctttcaagtcttttatttatctttttca |
350 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||| ||| |||||||||| |||| ||||||||| |||| ||| | ||||||||||||||| |||| ||||| ||||||| || ||| |
|
|
| T |
10511 |
ctttacaatatcaataaaatattaatgttactttttctattataatcttagttatctctattactctctcttctatcaattctttaatttatcattctca |
10412 |
T |
 |
| Q |
351 |
ta-----------ggacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatatgtgtgaaatgcc |
430 |
Q |
| |
|
|| || |||||||||||||||||||||||||||| ||||| | | || |||||||| ||||||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
10411 |
taccatttattaagggcaattttgtaaaacaactcataatatctattttctatataaaattaattatatttcttaatacgtgtgaaatgcc |
10321 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0187; HSP #2
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 253 - 430
Target Start/End: Complemental strand, 20839 - 20649
Alignment:
| Q |
253 |
ctttacaataccaatgaaacattaatgttatttttcctattataaccttaactattt--attactctctcttctttcaagtcttttatttatctttttca |
350 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||| ||| |||||||||| |||| ||||||||| |||| ||| | ||||||||||||||| |||| ||||| ||||||| || ||| |
|
|
| T |
20839 |
ctttacaatatcaataaaatattaatgttactttttctattataatcttagttatctctattactctctcttctatcaattctttaatttatcattctca |
20740 |
T |
 |
| Q |
351 |
ta-----------ggacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatatgtgtgaaatgcc |
430 |
Q |
| |
|
|| || |||||||||||||||||||||||||||| ||||| | | || |||||||| ||||||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
20739 |
taccatttattaagggcaattttgtaaaacaactcataatatctattttctatataaaattaattatatttcttaatacgtgtgaaatgcc |
20649 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0024 (Bit Score: 54; Significance: 1e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0024
Description:
Target: scaffold0024; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 355 - 448
Target Start/End: Original strand, 42712 - 42805
Alignment:
| Q |
355 |
acaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatatgtgtgaaatgcccaaaacgtcatacaattt |
448 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||| || | || |||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||| ||| ||||| |
|
|
| T |
42712 |
acaattttgtaaaacaactcataatatctcttttacatataaaattaattacatttcttaatacgtttgaaatgttcaaaacgttatataattt |
42805 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0057 (Bit Score: 53; Significance: 4e-21; HSPs: 2)
Name: scaffold0057
Description:
Target: scaffold0057; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 352 - 436
Target Start/End: Original strand, 39942 - 40026
Alignment:
| Q |
352 |
aggacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatatgtgtgaaatgcccaaaac |
436 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||| ||||| |||| ||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
39942 |
aggacaattttgtaaaacaattcatagcatctttttaccatacaaaattaattacatttcttaatatgtgtgaaatgtccaaaac |
40026 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0057; HSP #2
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 253 - 315
Target Start/End: Original strand, 39827 - 39889
Alignment:
| Q |
253 |
ctttacaataccaatgaaacattaatgttatttttcctattataaccttaactatttattact |
315 |
Q |
| |
|
||||| |||| |||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
39827 |
ctttataatatcaatgaaacattaatgttattttttctgttatacttttaactatttattact |
39889 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0010 (Bit Score: 49; Significance: 1e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0010
Description:
Target: scaffold0010; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 254 - 460
Target Start/End: Original strand, 133913 - 134131
Alignment:
| Q |
254 |
tttacaataccaatgaaacattaatgttatttttc-ctattataaccttaactatttattactctctcttctttcaagtcttttatttatctttttcata |
352 |
Q |
| |
|
||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||| ||| | || | |||||||||||||| || |||||| ||||| |||||||||| || || |
|
|
| T |
133913 |
tttacaatagcaatgaaatattaatgttatttttttctatcataccatttattatttattactctcactaatttcaattctttaatttatctttctcgta |
134012 |
T |
 |
| Q |
353 |
-----------ggacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatatgtgtgaaatgcccaaaacgtcat |
441 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||||| |||||||||||||| ||| || |||| |||||||| |||||| |||| ||||||||| | ||||||||| | |
|
|
| T |
134013 |
caatttattaaggacaaatttgtaaaataactcataatatctttttctcatacaaaattaattatatttctaaatacgtgtgaaatactcaaaacgtcgt |
134112 |
T |
 |
| Q |
442 |
acaatttaggatgaaggga |
460 |
Q |
| |
|
| ||||| | ||||||||| |
|
|
| T |
134113 |
ataatttggaatgaaggga |
134131 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0939 (Bit Score: 42; Significance: 0.00000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0939
Description:
Target: scaffold0939; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 376 - 464
Target Start/End: Original strand, 827 - 918
Alignment:
| Q |
376 |
taatatctcttttccacacaatatt---aattacatttcttaatatgtgtgaaatgcccaaaacgtcatacaatttaggatgaagggagtaa |
464 |
Q |
| |
|
|||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||| |||||| ||||||||||| ||| | ||||||||| |
|
|
| T |
827 |
taatatctctttcccacacaatattattaattacatttcttagtatatgtgaaatgatcaaaacttcatacaatttgggacggagggagtaa |
918 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0268 (Bit Score: 42; Significance: 0.00000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0268
Description:
Target: scaffold0268; HSP #1
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Target Start/End: Original strand, 20374 - 20439
Alignment:
| Q |
231 |
atttgtcccaaattgtatgtcactttacaataccaatgaaacattaatgttatttttcctattata |
296 |
Q |
| |
|
|||||| | ||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
20374 |
atttgttctaaattatatgttactttacaatatcaatgaaacataaatgttatttttcctattata |
20439 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0263 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0263
Description:
Target: scaffold0263; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
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Target Start/End: Original strand, 14103 - 14198
Alignment:
| Q |
354 |
gacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatatgtgtgaaatgcccaaaacgtcatacaattta |
449 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| || |||||||||||| || || | ||| |||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||| ||| |||||| |
|
|
| T |
14103 |
gacaattttgtaaaacagcttataatatctcttcaacatactaaatttattacatttcttaatacgtgtaaaatgaccaaaacgttatataattta |
14198 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold1989 (Bit Score: 37; Significance: 0.00000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold1989
Description:
Target: scaffold1989; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
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| Q |
407 |
atttcttaatatgtgtgaaatgcccaaaacgtcatacaatttaggatgaagggagta |
463 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| || ||||| |
|
|
| T |
828 |
atttcttaatgtgtgtgaaatgctcaaaacatcatacaatttaggatggagagagta |
884 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0047 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0047
Description:
Target: scaffold0047; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 354 - 436
Target Start/End: Complemental strand, 18733 - 18651
Alignment:
| Q |
354 |
gacaattttgtaaaacaactcataatatctcttttccacacaatattaattacatttcttaatatgtgtgaaatgcccaaaac |
436 |
Q |
| |
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||||||||| ||||||||||| ||||| || ||| || ||| ||||||||||||| |||||| |||| ||||| ||||||| |
|
|
| T |
18733 |
gacaattttataaaacaactcgtaataaatcgttttcatccaaaattaattacattttttaatacgtgtaaaatgtccaaaac |
18651 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0034 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000009; HSPs: 1)
Name: scaffold0034
Description:
Target: scaffold0034; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 274 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 96189 - 96141
Alignment:
| Q |
274 |
ttaatgttatttttcctattataaccttaactatttattactctctctt |
322 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| ||||| || | |||||||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
96189 |
ttaatgttattttttctattgtacctttaactatttattactctatctt |
96141 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
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