View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF9590_1 (Length: 774)

Name: NF9590_1
Description: NF9590
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF9590_1
NF9590_1
[»] chr1 (50 HSPs)
chr1 (1-774)||(13212257-13213020)
chr1 (59-531)||(18514147-18514617)
chr1 (578-774)||(21346965-21347161)
chr1 (578-774)||(21342100-21342296)
chr1 (601-774)||(15859994-15860167)
chr1 (598-774)||(13988870-13989045)
chr1 (598-774)||(21923274-21923449)
chr1 (598-774)||(29776692-29776867)
chr1 (598-774)||(21475070-21475245)
chr1 (598-774)||(21840771-21840946)
chr1 (598-774)||(16275346-16275522)
chr1 (603-774)||(40389158-40389329)
chr1 (598-774)||(16361921-16362097)
chr1 (598-774)||(23593717-23593893)
chr1 (566-774)||(433016-433222)
chr1 (598-774)||(29298141-29298315)
chr1 (598-774)||(31612317-31612492)
chr1 (571-774)||(21707171-21707373)
chr1 (571-774)||(21711713-21711915)
chr1 (598-774)||(22123050-22123226)
chr1 (595-762)||(45574822-45574989)
chr1 (575-774)||(50210128-50210327)
chr1 (671-774)||(34509787-34509891)
chr1 (575-774)||(27250644-27250843)
chr1 (572-774)||(22532276-22532478)
chr1 (595-762)||(21896190-21896358)
chr1 (566-762)||(35260986-35261180)
chr1 (595-762)||(21861504-21861672)
chr1 (615-774)||(22468651-22468810)
chr1 (566-644)||(21477653-21477732)
chr1 (566-766)||(16758664-16758866)
chr1 (680-774)||(20847173-20847268)
chr1 (724-774)||(20454617-20454667)
chr1 (575-765)||(21026696-21026886)
chr1 (595-766)||(33681022-33681193)
chr1 (619-766)||(22237642-22237788)
chr1 (617-774)||(20135194-20135351)
chr1 (728-767)||(21754059-21754098)
chr1 (728-774)||(21714549-21714595)
chr1 (728-766)||(52928038-52928076)
chr1 (728-765)||(20918620-20918657)
chr1 (598-761)||(14295493-14295652)
chr1 (595-762)||(41049970-41050138)
chr1 (566-605)||(21473120-21473159)
chr1 (728-767)||(22921937-22921976)
chr1 (728-767)||(20248293-20248332)
chr1 (595-648)||(16368221-16368275)
chr1 (595-648)||(22124417-22124471)
chr1 (482-523)||(40389326-40389367)
chr1 (1-62)||(40390126-40390181)
[»] scaffold0247 (2 HSPs)
scaffold0247 (566-770)||(2079-2283)
scaffold0247 (566-763)||(17932-18130)
[»] scaffold0001 (3 HSPs)
scaffold0001 (566-774)||(85530-85738)
scaffold0001 (598-774)||(501088-501263)
scaffold0001 (676-767)||(160698-160790)
[»] scaffold0007 (2 HSPs)
scaffold0007 (566-774)||(161040-161248)
scaffold0007 (566-699)||(164541-164674)
[»] chr3 (80 HSPs)
chr3 (574-774)||(12119683-12119883)
chr3 (574-774)||(17672630-17672829)
chr3 (566-762)||(53070604-53070799)
chr3 (598-774)||(8499522-8499699)
chr3 (598-774)||(9707590-9707765)
chr3 (598-774)||(17463182-17463357)
chr3 (598-774)||(45606890-45607065)
chr3 (595-774)||(8899098-8899276)
chr3 (598-774)||(7781330-7781505)
chr3 (598-774)||(12567564-12567739)
chr3 (598-774)||(13544029-13544204)
chr3 (598-774)||(34159330-34159505)
chr3 (598-770)||(38961874-38962045)
chr3 (598-774)||(55476495-55476670)
chr3 (595-770)||(50242830-50243004)
chr3 (598-774)||(15412433-15412610)
chr3 (598-774)||(29172565-29172741)
chr3 (598-774)||(6469117-6469292)
chr3 (598-774)||(10247706-10247881)
chr3 (598-774)||(16282794-16282969)
chr3 (598-774)||(16454264-16454439)
chr3 (598-774)||(28848594-28848769)
chr3 (598-774)||(41123894-41124066)
chr3 (598-774)||(13151773-13151949)
chr3 (598-774)||(13154238-13154414)
chr3 (598-774)||(17446638-17446812)
chr3 (595-762)||(43550458-43550625)
chr3 (650-774)||(15977519-15977642)
chr3 (566-763)||(24340628-24340826)
chr3 (575-774)||(40213636-40213834)
chr3 (659-774)||(10556989-10557104)
chr3 (671-774)||(36166602-36166704)
chr3 (566-763)||(42386428-42386626)
chr3 (671-774)||(55500946-55501049)
chr3 (575-774)||(14972861-14973060)
chr3 (679-774)||(44494813-44494908)
chr3 (575-774)||(13442281-13442480)
chr3 (671-768)||(21618459-21618555)
chr3 (566-661)||(17248192-17248287)
chr3 (575-774)||(17487863-17488062)
chr3 (615-774)||(17499345-17499504)
chr3 (566-763)||(23274705-23274903)
chr3 (615-774)||(25476340-25476499)
chr3 (575-773)||(43840940-43841138)
chr3 (598-774)||(27165254-27165431)
chr3 (609-774)||(53301499-53301665)
chr3 (575-766)||(26686902-26687093)
chr3 (671-774)||(18438541-18438645)
chr3 (566-763)||(37642170-37642368)
chr3 (575-774)||(24153124-24153322)
chr3 (671-774)||(12399216-12399320)
chr3 (615-774)||(20698391-20698549)
chr3 (671-774)||(23083371-23083475)
chr3 (680-774)||(17737240-17737337)
chr3 (575-767)||(14576748-14576939)
chr3 (566-707)||(22147431-22147571)
chr3 (575-774)||(11424678-11424873)
chr3 (566-762)||(52523633-52523831)
chr3 (682-767)||(14572603-14572688)
chr3 (566-700)||(2051105-2051238)
chr3 (725-774)||(45577947-45577996)
chr3 (728-774)||(28194697-28194743)
chr3 (619-766)||(15470939-15471085)
chr3 (595-767)||(16097342-16097514)
chr3 (595-767)||(16103794-16103965)
chr3 (672-774)||(14234494-14234597)
chr3 (595-762)||(37251102-37251270)
chr3 (671-774)||(46822272-46822376)
chr3 (728-767)||(12174327-12174366)
chr3 (728-767)||(32307691-32307730)
chr3 (728-774)||(13210395-13210441)
chr3 (671-774)||(12511064-12511168)
chr3 (728-767)||(49668144-49668183)
chr3 (596-647)||(15207070-15207122)
chr3 (596-647)||(15246152-15246204)
chr3 (596-647)||(15265273-15265325)
chr3 (728-767)||(9512934-9512973)
chr3 (728-767)||(9520909-9520948)
chr3 (595-648)||(23318650-23318704)
chr3 (595-648)||(28194824-28194878)
[»] scaffold0142 (1 HSPs)
scaffold0142 (566-774)||(16788-16995)
[»] chr7 (74 HSPs)
chr7 (566-774)||(38898327-38898535)
chr7 (566-774)||(44116513-44116720)
chr7 (598-774)||(24702242-24702417)
chr7 (598-774)||(456325-456500)
chr7 (598-774)||(11393270-11393445)
chr7 (598-774)||(11972500-11972675)
chr7 (598-774)||(15376696-15376871)
chr7 (598-774)||(16232524-16232699)
chr7 (598-774)||(20385106-20385281)
chr7 (598-774)||(21189578-21189753)
chr7 (598-774)||(32125495-32125670)
chr7 (598-774)||(41522921-41523096)
chr7 (598-774)||(41525383-41525558)
chr7 (572-774)||(17061872-17062073)
chr7 (598-774)||(14949105-14949280)
chr7 (598-774)||(18640276-18640451)
chr7 (598-774)||(27216864-27217039)
chr7 (566-762)||(12756622-12756817)
chr7 (598-774)||(16213688-16213863)
chr7 (598-774)||(24704692-24704864)
chr7 (598-774)||(13869350-13869527)
chr7 (598-774)||(16410063-16410238)
chr7 (598-774)||(18430716-18430891)
chr7 (599-774)||(3386337-3386511)
chr7 (595-762)||(13647344-13647511)
chr7 (628-774)||(24275175-24275320)
chr7 (600-774)||(20110560-20110723)
chr7 (598-774)||(26355966-26356152)
chr7 (598-774)||(26358418-26358604)
chr7 (651-774)||(13831377-13831499)
chr7 (615-774)||(3564319-3564478)
chr7 (658-774)||(48273396-48273512)
chr7 (595-685)||(15081929-15082019)
chr7 (575-774)||(18456328-18456526)
chr7 (571-766)||(2280029-2280225)
chr7 (575-774)||(12698838-12699038)
chr7 (575-774)||(9509196-9509395)
chr7 (566-763)||(19486649-19486847)
chr7 (615-774)||(38227488-38227646)
chr7 (671-765)||(10589055-10589150)
chr7 (575-765)||(26212012-26212202)
chr7 (578-763)||(10063740-10063921)
chr7 (575-766)||(15143952-15144143)
chr7 (728-774)||(67752-67798)
chr7 (682-774)||(16386268-16386362)
chr7 (728-774)||(47831814-47831860)
chr7 (566-648)||(15008404-15008487)
chr7 (671-774)||(22072920-22073025)
chr7 (566-766)||(1867901-1868101)
chr7 (728-767)||(811199-811238)
chr7 (566-759)||(12255697-12255892)
chr7 (728-767)||(18005660-18005699)
chr7 (728-767)||(44014192-44014231)
chr7 (585-694)||(15113031-15113138)
chr7 (619-766)||(16056343-16056488)
chr7 (728-774)||(28505366-28505412)
chr7 (728-774)||(34200793-34200839)
chr7 (598-762)||(16495421-16495581)
chr7 (585-648)||(20220115-20220178)
chr7 (682-762)||(40443410-40443490)
chr7 (598-632)||(13841157-13841191)
chr7 (728-774)||(14932802-14932848)
chr7 (728-774)||(15356237-15356283)
chr7 (728-774)||(15360351-15360397)
chr7 (728-774)||(15754955-15755001)
chr7 (728-766)||(16219785-16219823)
chr7 (728-774)||(18154909-18154955)
chr7 (609-694)||(15116568-15116651)
chr7 (735-766)||(14044761-14044792)
chr7 (735-766)||(14354791-14354822)
chr7 (728-774)||(11996095-11996141)
chr7 (595-648)||(20619513-20619567)
chr7 (596-648)||(9033281-9033334)
chr7 (566-650)||(9177571-9177656)
[»] chr4 (61 HSPs)
chr4 (566-763)||(15367708-15367905)
chr4 (566-763)||(15402721-15402918)
chr4 (598-774)||(15355307-15355483)
chr4 (566-763)||(15371220-15371417)
chr4 (566-763)||(15373501-15373698)
chr4 (566-763)||(15370036-15370232)
chr4 (566-774)||(44102218-44102425)
chr4 (566-763)||(16223550-16223747)
chr4 (595-774)||(18215254-18215432)
chr4 (566-774)||(44928829-44929038)
chr4 (598-774)||(44773070-44773245)
chr4 (598-774)||(15118335-15118510)
chr4 (598-774)||(52312514-52312689)
chr4 (602-774)||(12294-12465)
chr4 (598-774)||(19618155-19618330)
chr4 (595-774)||(51463848-51464026)
chr4 (598-774)||(3515011-3515186)
chr4 (598-774)||(44615292-44615467)
chr4 (609-774)||(19242703-19242867)
chr4 (598-774)||(1837492-1837667)
chr4 (598-774)||(18239402-18239577)
chr4 (566-762)||(21815536-21815731)
chr4 (598-774)||(50222322-50222497)
chr4 (603-774)||(20149833-20150004)
chr4 (595-774)||(23803245-23803423)
chr4 (598-770)||(14970690-14970861)
chr4 (595-774)||(12610954-12611125)
chr4 (598-774)||(7641175-7641340)
chr4 (566-762)||(22353852-22354048)
chr4 (671-774)||(14280320-14280423)
chr4 (575-774)||(14038655-14038854)
chr4 (671-774)||(54798764-54798868)
chr4 (575-773)||(16377438-16377634)
chr4 (600-774)||(7798781-7798956)
chr4 (679-774)||(8574887-8574981)
chr4 (615-774)||(7088884-7089043)
chr4 (671-774)||(52873377-52873481)
chr4 (595-762)||(13785-13953)
chr4 (575-774)||(12902764-12902963)
chr4 (615-774)||(22636442-22636601)
chr4 (566-766)||(52243099-52243302)
chr4 (671-774)||(7893710-7893814)
chr4 (575-774)||(16270151-16270349)
chr4 (595-766)||(43198487-43198661)
chr4 (575-774)||(44052836-44053035)
chr4 (671-774)||(6899898-6900001)
chr4 (671-774)||(16239980-16240083)
chr4 (671-774)||(23374369-23374473)
chr4 (696-774)||(3096300-3096379)
chr4 (566-700)||(15464836-15464970)
chr4 (728-774)||(39706356-39706402)
chr4 (728-767)||(12774021-12774060)
chr4 (728-766)||(12288278-12288316)
chr4 (728-774)||(15551824-15551870)
chr4 (728-762)||(17046506-17046540)
chr4 (728-767)||(8846370-8846409)
chr4 (594-648)||(16043144-16043199)
chr4 (595-762)||(53082086-53082254)
chr4 (682-762)||(6190481-6190563)
chr4 (595-648)||(15791906-15791960)
chr4 (482-523)||(20150001-20150042)
[»] chr8 (66 HSPs)
chr8 (566-774)||(41598192-41598399)
chr8 (598-774)||(14409427-14409602)
chr8 (598-774)||(1484406-1484581)
chr8 (598-774)||(5853275-5853450)
chr8 (598-774)||(16413299-16413474)
chr8 (598-774)||(20046178-20046353)
chr8 (598-774)||(20403231-20403406)
chr8 (598-774)||(19936988-19937164)
chr8 (598-774)||(22001757-22001932)
chr8 (598-774)||(45290677-45290853)
chr8 (598-774)||(15203214-15203389)
chr8 (598-774)||(4483285-4483459)
chr8 (598-774)||(19896269-19896447)
chr8 (598-774)||(4542356-4542531)
chr8 (566-762)||(19801333-19801527)
chr8 (598-765)||(15070571-15070739)
chr8 (598-774)||(14823778-14823952)
chr8 (598-774)||(26223923-26224098)
chr8 (595-774)||(25484255-25484426)
chr8 (575-774)||(6759265-6759462)
chr8 (615-774)||(16092297-16092456)
chr8 (575-774)||(22875072-22875271)
chr8 (575-774)||(18818324-18818523)
chr8 (566-763)||(13507990-13508188)
chr8 (566-763)||(13597522-13597720)
chr8 (671-774)||(23406386-23406490)
chr8 (671-774)||(26219721-26219823)
chr8 (578-774)||(28648962-28649158)
chr8 (671-774)||(7372785-7372889)
chr8 (566-763)||(17612018-17612213)
chr8 (671-774)||(26225303-26225405)
chr8 (615-774)||(20536215-20536374)
chr8 (671-774)||(21923938-21924042)
chr8 (615-774)||(21918955-21919114)
chr8 (671-774)||(22626743-22626846)
chr8 (682-774)||(31971264-31971356)
chr8 (598-664)||(24486027-24486093)
chr8 (698-774)||(18879268-18879345)
chr8 (595-762)||(20498581-20498749)
chr8 (619-774)||(38855212-38855365)
chr8 (672-774)||(6520375-6520478)
chr8 (683-774)||(23648560-23648652)
chr8 (598-654)||(32810054-32810110)
chr8 (671-772)||(21285606-21285708)
chr8 (682-762)||(45131019-45131098)
chr8 (682-762)||(16199666-16199746)
chr8 (585-762)||(37116366-37116544)
chr8 (728-766)||(983474-983512)
chr8 (728-774)||(17140923-17140969)
chr8 (728-774)||(18678170-18678216)
chr8 (728-774)||(21491002-21491048)
chr8 (728-766)||(23760912-23760950)
chr8 (731-774)||(21249391-21249434)
chr8 (731-774)||(21255229-21255272)
chr8 (728-767)||(26355766-26355805)
chr8 (728-762)||(5866342-5866376)
chr8 (728-762)||(21389518-21389552)
chr8 (728-762)||(21396048-21396082)
chr8 (728-762)||(21778844-21778878)
chr8 (728-762)||(21790541-21790575)
chr8 (728-774)||(32121739-32121785)
chr8 (566-700)||(17439411-17439544)
chr8 (728-767)||(21673718-21673757)
chr8 (595-648)||(17438151-17438205)
chr8 (1-62)||(22966786-22966841)
chr8 (596-648)||(37515837-37515890)
[»] chr5 (59 HSPs)
chr5 (566-774)||(31061072-31061280)
chr5 (566-774)||(36154734-36154938)
chr5 (577-774)||(18318995-18319192)
chr5 (566-774)||(11581151-11581357)
chr5 (593-774)||(10775654-10775834)
chr5 (598-774)||(29329938-29330113)
chr5 (598-774)||(264751-264926)
chr5 (603-774)||(24067111-24067282)
chr5 (598-774)||(39363388-39363563)
chr5 (591-774)||(20901984-20902168)
chr5 (591-774)||(2154589-2154772)
chr5 (598-774)||(10732923-10733098)
chr5 (598-774)||(20909016-20909191)
chr5 (598-774)||(29345984-29346159)
chr5 (598-774)||(39245140-39245315)
chr5 (598-774)||(42245348-42245523)
chr5 (598-774)||(29348457-29348632)
chr5 (598-774)||(29350930-29351105)
chr5 (598-774)||(23064515-23064692)
chr5 (598-774)||(38619438-38619615)
chr5 (598-774)||(32027397-32027572)
chr5 (598-774)||(20917935-20918106)
chr5 (575-774)||(23390411-23390610)
chr5 (674-774)||(21997547-21997648)
chr5 (575-774)||(25421539-25421738)
chr5 (615-774)||(1096474-1096633)
chr5 (566-774)||(24529227-24529435)
chr5 (575-774)||(9077959-9078158)
chr5 (385-574)||(24067353-24067542)
chr5 (575-761)||(25431414-25431600)
chr5 (566-669)||(40725965-40726069)
chr5 (578-774)||(8286760-8286957)
chr5 (671-774)||(21729074-21729178)
chr5 (671-774)||(21808399-21808503)
chr5 (566-762)||(22144068-22144265)
chr5 (575-774)||(24493576-24493774)
chr5 (671-774)||(22412191-22412294)
chr5 (671-765)||(22075035-22075130)
chr5 (671-774)||(13025318-13025421)
chr5 (671-774)||(13095502-13095605)
chr5 (719-774)||(20806845-20806900)
chr5 (595-767)||(21565556-21565728)
chr5 (728-774)||(21329565-21329611)
chr5 (735-774)||(21502231-21502270)
chr5 (728-767)||(22959600-22959639)
chr5 (728-774)||(19660903-19660949)
chr5 (671-762)||(20026949-20027043)
chr5 (682-762)||(21292992-21293071)
chr5 (683-771)||(18418590-18418678)
chr5 (671-722)||(20766130-20766180)
chr5 (728-774)||(17517269-17517315)
chr5 (728-774)||(26704078-26704124)
chr5 (728-774)||(26973811-26973857)
chr5 (728-762)||(36314596-36314630)
chr5 (632-762)||(37723922-37724050)
chr5 (679-766)||(26012053-26012141)
chr5 (728-767)||(19668912-19668951)
chr5 (724-762)||(26740709-26740747)
chr5 (724-765)||(26732896-26732937)
[»] chr6 (62 HSPs)
chr6 (566-762)||(18456735-18456930)
chr6 (603-774)||(16448514-16448685)
chr6 (595-774)||(22782231-22782409)
chr6 (598-774)||(2291163-2291338)
chr6 (598-774)||(12742321-12742496)
chr6 (598-774)||(19005050-19005225)
chr6 (598-774)||(19858902-19859077)
chr6 (598-774)||(24422551-24422726)
chr6 (598-774)||(33861798-33861973)
chr6 (598-774)||(33864282-33864457)
chr6 (598-774)||(8055033-8055208)
chr6 (598-774)||(18334575-18334750)
chr6 (598-774)||(30676693-30676868)
chr6 (595-774)||(25754813-25754991)
chr6 (598-774)||(26924623-26924798)
chr6 (598-774)||(34963377-34963552)
chr6 (598-774)||(1540894-1541069)
chr6 (598-774)||(1595553-1595728)
chr6 (595-774)||(20556874-20557050)
chr6 (598-774)||(25656633-25656808)
chr6 (599-774)||(3852001-3852175)
chr6 (598-773)||(25688507-25688681)
chr6 (625-762)||(18461895-18462031)
chr6 (566-766)||(25644335-25644537)
chr6 (578-774)||(18409745-18409941)
chr6 (575-774)||(29060547-29060746)
chr6 (575-774)||(25629270-25629469)
chr6 (575-774)||(20593780-20593979)
chr6 (575-774)||(19303456-19303654)
chr6 (591-774)||(19847925-19848109)
chr6 (671-774)||(17287806-17287910)
chr6 (566-774)||(8227416-8227625)
chr6 (615-767)||(20360915-20361067)
chr6 (676-774)||(20638298-20638397)
chr6 (671-774)||(16496251-16496355)
chr6 (671-774)||(20076707-20076810)
chr6 (682-762)||(18821866-18821946)
chr6 (600-766)||(20109153-20109322)
chr6 (575-774)||(22780142-22780341)
chr6 (724-774)||(25714424-25714474)
chr6 (728-774)||(27333286-27333332)
chr6 (728-774)||(27394026-27394072)
chr6 (619-762)||(23019425-23019567)
chr6 (728-766)||(9098582-9098620)
chr6 (734-774)||(22080799-22080839)
chr6 (728-764)||(28496539-28496575)
chr6 (728-764)||(29808950-29808986)
chr6 (682-762)||(35245605-35245684)
chr6 (728-767)||(19652209-19652248)
chr6 (728-774)||(1561310-1561356)
chr6 (728-762)||(11185524-11185558)
chr6 (595-648)||(18177606-18177660)
chr6 (595-648)||(18199350-18199404)
chr6 (595-648)||(18204211-18204265)
chr6 (571-648)||(18706437-18706515)
chr6 (728-766)||(19668386-19668424)
chr6 (728-774)||(23992434-23992480)
chr6 (728-760)||(22831524-22831556)
chr6 (594-648)||(23076864-23076919)
chr6 (728-758)||(16920698-16920728)
chr6 (571-648)||(18696619-18696697)
chr6 (595-648)||(28103833-28103887)
[»] scaffold0761 (1 HSPs)
scaffold0761 (571-774)||(4301-4503)
[»] scaffold0819 (1 HSPs)
scaffold0819 (593-774)||(4218-4398)
[»] scaffold0031 (2 HSPs)
scaffold0031 (566-762)||(20331-20524)
scaffold0031 (671-774)||(128758-128861)
[»] scaffold0716 (1 HSPs)
scaffold0716 (598-774)||(4698-4873)
[»] scaffold0254 (1 HSPs)
scaffold0254 (598-774)||(20751-20926)
[»] scaffold0134 (1 HSPs)
scaffold0134 (598-774)||(37825-38000)
[»] scaffold0023 (8 HSPs)
scaffold0023 (598-774)||(94415-94590)
scaffold0023 (598-774)||(17423-17598)
scaffold0023 (618-774)||(44458-44614)
scaffold0023 (619-767)||(100388-100534)
scaffold0023 (728-774)||(119882-119928)
scaffold0023 (731-767)||(40245-40281)
scaffold0023 (728-767)||(101513-101552)
scaffold0023 (566-648)||(105212-105294)
[»] scaffold0003 (2 HSPs)
scaffold0003 (598-774)||(158433-158608)
scaffold0003 (575-766)||(339865-340053)
[»] chr2 (62 HSPs)
chr2 (598-774)||(18808947-18809122)
chr2 (598-774)||(23709515-23709690)
chr2 (598-774)||(23711996-23712171)
chr2 (598-774)||(39682317-39682492)
chr2 (598-774)||(571401-571576)
chr2 (598-774)||(6725999-6726174)
chr2 (598-774)||(21155043-21155218)
chr2 (598-774)||(23130866-23131041)
chr2 (598-774)||(23133333-23133508)
chr2 (598-770)||(24367782-24367953)
chr2 (598-774)||(26505383-26505558)
chr2 (598-774)||(26507861-26508036)
chr2 (598-774)||(32214904-32215079)
chr2 (598-774)||(34402505-34402680)
chr2 (595-774)||(32039478-32039656)
chr2 (598-774)||(23135594-23135769)
chr2 (599-774)||(43137303-43137477)
chr2 (598-774)||(24898178-24898354)
chr2 (598-774)||(24900661-24900837)
chr2 (598-774)||(24903138-24903314)
chr2 (598-774)||(24905615-24905791)
chr2 (598-774)||(24908090-24908266)
chr2 (598-774)||(28577103-28577278)
chr2 (598-774)||(38967378-38967553)
chr2 (598-774)||(45029837-45030012)
chr2 (598-774)||(22105416-22105592)
chr2 (591-774)||(24529504-24529687)
chr2 (566-763)||(19671848-19672043)
chr2 (578-774)||(23060520-23060716)
chr2 (595-693)||(24642836-24642933)
chr2 (615-774)||(22337122-22337281)
chr2 (566-766)||(23708524-23708725)
chr2 (575-774)||(23076449-23076648)
chr2 (575-774)||(22731149-22731348)
chr2 (575-774)||(22738095-22738293)
chr2 (702-774)||(24643036-24643108)
chr2 (575-774)||(23285872-23286067)
chr2 (682-774)||(38136-38228)
chr2 (671-774)||(298824-298929)
chr2 (595-762)||(7667-7835)
chr2 (573-638)||(29601478-29601543)
chr2 (615-774)||(23654341-23654500)
chr2 (615-774)||(23660030-23660188)
chr2 (595-654)||(22173809-22173868)
chr2 (724-774)||(23040253-23040303)
chr2 (652-762)||(23103389-23103497)
chr2 (728-774)||(7679592-7679638)
chr2 (705-774)||(8946664-8946734)
chr2 (671-767)||(28405990-28406088)
chr2 (575-650)||(22413050-22413126)
chr2 (595-762)||(23207296-23207464)
chr2 (458-529)||(27505142-27505213)
chr2 (728-766)||(18786971-18787009)
chr2 (609-686)||(22459511-22459587)
chr2 (566-762)||(20520098-20520295)
chr2 (728-762)||(20309127-20309161)
chr2 (595-700)||(23791357-23791461)
chr2 (728-774)||(25616192-25616238)
chr2 (724-760)||(22134270-22134306)
chr2 (730-774)||(23072019-23072063)
chr2 (566-700)||(24697512-24697644)
chr2 (728-767)||(25175864-25175903)
[»] scaffold0454 (1 HSPs)
scaffold0454 (598-774)||(10777-10952)
[»] scaffold0230 (1 HSPs)
scaffold0230 (598-774)||(13951-14126)
[»] scaffold0056 (2 HSPs)
scaffold0056 (566-762)||(79235-79430)
scaffold0056 (615-774)||(17170-17331)
[»] scaffold0101 (1 HSPs)
scaffold0101 (595-774)||(1260-1439)
[»] scaffold0444 (1 HSPs)
scaffold0444 (598-774)||(13396-13571)
[»] scaffold0028 (6 HSPs)
scaffold0028 (598-774)||(136684-136859)
scaffold0028 (598-774)||(139153-139328)
scaffold0028 (598-774)||(144091-144266)
scaffold0028 (598-774)||(134215-134390)
scaffold0028 (598-774)||(141622-141797)
scaffold0028 (728-767)||(132672-132711)
[»] scaffold1439 (1 HSPs)
scaffold1439 (595-774)||(110-288)
[»] scaffold0037 (2 HSPs)
scaffold0037 (595-774)||(82076-82254)
scaffold0037 (600-766)||(22610-22776)
[»] scaffold0363 (1 HSPs)
scaffold0363 (598-774)||(9246-9421)
[»] scaffold0145 (3 HSPs)
scaffold0145 (591-774)||(9753-9936)
scaffold0145 (575-774)||(32949-33147)
scaffold0145 (575-774)||(38768-38966)
[»] scaffold0149 (1 HSPs)
scaffold0149 (591-764)||(29946-30118)
[»] scaffold0494 (1 HSPs)
scaffold0494 (598-774)||(12232-12407)
[»] scaffold0044 (1 HSPs)
scaffold0044 (598-774)||(40404-40579)
[»] scaffold0029 (1 HSPs)
scaffold0029 (598-774)||(11292-11467)
[»] scaffold0394 (1 HSPs)
scaffold0394 (595-774)||(12068-12240)
[»] scaffold0231 (1 HSPs)
scaffold0231 (575-774)||(22890-23088)
[»] scaffold0540 (1 HSPs)
scaffold0540 (577-774)||(3068-3264)
[»] scaffold0016 (1 HSPs)
scaffold0016 (575-774)||(1858-2057)
[»] scaffold0122 (2 HSPs)
scaffold0122 (671-774)||(44717-44821)
scaffold0122 (575-774)||(25980-26179)
[»] scaffold0022 (3 HSPs)
scaffold0022 (671-774)||(116434-116536)
scaffold0022 (585-762)||(128895-129072)
scaffold0022 (595-648)||(78454-78508)
[»] scaffold0228 (3 HSPs)
scaffold0228 (575-767)||(4522-4713)
scaffold0228 (575-767)||(12104-12295)
scaffold0228 (575-767)||(22056-22247)
[»] scaffold0193 (1 HSPs)
scaffold0193 (578-774)||(13218-13414)
[»] scaffold0011 (2 HSPs)
scaffold0011 (575-774)||(51920-52119)
scaffold0011 (615-774)||(167934-168092)
[»] scaffold0217 (1 HSPs)
scaffold0217 (615-774)||(16555-16714)
[»] scaffold0908 (1 HSPs)
scaffold0908 (577-774)||(3103-3300)
[»] scaffold0141 (1 HSPs)
scaffold0141 (575-772)||(39486-39682)
[»] scaffold0074 (1 HSPs)
scaffold0074 (598-774)||(38639-38816)
[»] scaffold0049 (1 HSPs)
scaffold0049 (575-772)||(75130-75326)
[»] scaffold0461 (1 HSPs)
scaffold0461 (566-763)||(11482-11680)
[»] scaffold0046 (4 HSPs)
scaffold0046 (671-774)||(28421-28525)
scaffold0046 (728-774)||(2004-2050)
scaffold0046 (728-774)||(4559-4605)
scaffold0046 (728-774)||(11299-11345)
[»] scaffold0503 (2 HSPs)
scaffold0503 (575-669)||(12041-12135)
scaffold0503 (700-762)||(11982-12044)
[»] scaffold0357 (2 HSPs)
scaffold0357 (571-766)||(16010-16206)
scaffold0357 (571-762)||(13147-13340)
[»] scaffold0165 (2 HSPs)
scaffold0165 (571-766)||(27659-27855)
scaffold0165 (571-626)||(27577-27633)
[»] scaffold1842 (1 HSPs)
scaffold1842 (615-774)||(1004-1162)
[»] scaffold0026 (2 HSPs)
scaffold0026 (575-773)||(25904-26101)
scaffold0026 (578-774)||(39865-40060)
[»] scaffold0075 (1 HSPs)
scaffold0075 (595-762)||(53483-53651)
[»] scaffold0621 (2 HSPs)
scaffold0621 (595-766)||(8481-8655)
scaffold0621 (619-767)||(6549-6695)
[»] scaffold0490 (1 HSPs)
scaffold0490 (630-762)||(1971-2103)
[»] scaffold0403 (1 HSPs)
scaffold0403 (575-774)||(4856-5055)
[»] scaffold0292 (2 HSPs)
scaffold0292 (575-774)||(3477-3676)
scaffold0292 (671-774)||(350-453)
[»] scaffold0120 (5 HSPs)
scaffold0120 (671-774)||(32967-33070)
scaffold0120 (671-774)||(45935-46038)
scaffold0120 (616-774)||(16120-16278)
scaffold0120 (719-774)||(17388-17443)
scaffold0120 (1-62)||(29287-29342)
[»] scaffold0012 (1 HSPs)
scaffold0012 (572-707)||(225482-225616)
[»] scaffold0327 (1 HSPs)
scaffold0327 (575-717)||(3444-3586)
[»] scaffold0121 (1 HSPs)
scaffold0121 (575-774)||(8448-8643)
[»] scaffold0080 (1 HSPs)
scaffold0080 (670-774)||(39920-40024)
[»] scaffold0042 (1 HSPs)
scaffold0042 (575-763)||(24216-24406)
[»] scaffold0639 (1 HSPs)
scaffold0639 (671-774)||(8486-8590)
[»] scaffold0647 (1 HSPs)
scaffold0647 (578-774)||(6039-6238)
[»] scaffold0124 (1 HSPs)
scaffold0124 (566-763)||(38159-38359)
[»] scaffold0235 (1 HSPs)
scaffold0235 (682-774)||(11464-11557)
[»] scaffold0427 (1 HSPs)
scaffold0427 (682-765)||(13513-13596)
[»] scaffold0113 (1 HSPs)
scaffold0113 (682-774)||(32074-32165)
[»] scaffold0114 (1 HSPs)
scaffold0114 (682-774)||(15485-15577)
[»] scaffold0358 (1 HSPs)
scaffold0358 (691-774)||(4719-4803)
[»] scaffold0555 (1 HSPs)
scaffold0555 (595-766)||(10476-10647)
[»] scaffold0183 (1 HSPs)
scaffold0183 (620-694)||(13092-13165)
[»] scaffold0413 (2 HSPs)
scaffold0413 (598-762)||(12587-12751)
scaffold0413 (566-611)||(15521-15566)
[»] scaffold0010 (2 HSPs)
scaffold0010 (595-767)||(129919-130091)
scaffold0010 (566-762)||(60620-60818)
[»] scaffold0530 (1 HSPs)
scaffold0530 (728-774)||(1102-1148)
[»] scaffold0333 (2 HSPs)
scaffold0333 (728-774)||(6618-6664)
scaffold0333 (728-774)||(13998-14044)
[»] scaffold0243 (1 HSPs)
scaffold0243 (728-774)||(6191-6237)
[»] scaffold0020 (3 HSPs)
scaffold0020 (728-774)||(15845-15891)
scaffold0020 (728-774)||(178901-178947)
scaffold0020 (595-648)||(142714-142768)
[»] scaffold0261 (1 HSPs)
scaffold0261 (679-774)||(15668-15764)
[»] scaffold1765 (1 HSPs)
scaffold1765 (728-772)||(1091-1135)
[»] scaffold0021 (2 HSPs)
scaffold0021 (726-774)||(121773-121821)
scaffold0021 (632-762)||(174785-174913)
[»] scaffold0175 (3 HSPs)
scaffold0175 (575-717)||(13157-13298)
scaffold0175 (725-773)||(281-329)
scaffold0175 (728-774)||(34130-34176)
[»] scaffold0125 (1 HSPs)
scaffold0125 (595-767)||(45727-45899)
[»] scaffold0123 (2 HSPs)
scaffold0123 (566-766)||(25121-25321)
scaffold0123 (571-648)||(669-747)
[»] scaffold0102 (1 HSPs)
scaffold0102 (619-767)||(19278-19424)
[»] scaffold0106 (3 HSPs)
scaffold0106 (728-774)||(15306-15352)
scaffold0106 (728-762)||(1308-1342)
scaffold0106 (728-762)||(7285-7319)
[»] scaffold0088 (1 HSPs)
scaffold0088 (671-763)||(20928-21022)
[»] scaffold0130 (1 HSPs)
scaffold0130 (615-700)||(27912-27996)
[»] scaffold0695 (1 HSPs)
scaffold0695 (598-654)||(6070-6126)
[»] scaffold0034 (1 HSPs)
scaffold0034 (676-766)||(32551-32642)
[»] scaffold0278 (1 HSPs)
scaffold0278 (619-767)||(5657-5803)
[»] scaffold0207 (1 HSPs)
scaffold0207 (728-767)||(2713-2752)
[»] scaffold0628 (1 HSPs)
scaffold0628 (671-767)||(2816-2913)
[»] scaffold0507 (2 HSPs)
scaffold0507 (595-700)||(7993-8098)
scaffold0507 (595-648)||(2605-2659)
[»] scaffold0395 (1 HSPs)
scaffold0395 (724-774)||(4897-4947)
[»] scaffold0198 (1 HSPs)
scaffold0198 (728-774)||(23846-23892)
[»] scaffold0131 (1 HSPs)
scaffold0131 (728-774)||(36457-36503)
[»] scaffold0184 (1 HSPs)
scaffold0184 (598-762)||(1011-1171)
[»] scaffold2014 (1 HSPs)
scaffold2014 (680-762)||(1051-1134)
[»] scaffold0456 (1 HSPs)
scaffold0456 (682-774)||(10446-10537)
[»] scaffold1984 (1 HSPs)
scaffold1984 (595-767)||(143-315)
[»] scaffold0476 (1 HSPs)
scaffold0476 (728-767)||(12780-12819)
[»] scaffold0420 (1 HSPs)
scaffold0420 (595-762)||(6217-6386)
[»] scaffold0008 (1 HSPs)
scaffold0008 (728-767)||(14765-14804)
[»] scaffold0006 (2 HSPs)
scaffold0006 (594-700)||(97089-97194)
scaffold0006 (594-700)||(106367-106472)
[»] scaffold0718 (1 HSPs)
scaffold0718 (728-762)||(5196-5230)
[»] scaffold0351 (1 HSPs)
scaffold0351 (680-762)||(16301-16382)
[»] scaffold0211 (1 HSPs)
scaffold0211 (729-767)||(28839-28877)
[»] scaffold0100 (1 HSPs)
scaffold0100 (728-766)||(23951-23989)
[»] scaffold0032 (1 HSPs)
scaffold0032 (728-762)||(51601-51635)
[»] scaffold1419 (2 HSPs)
scaffold1419 (594-638)||(165-210)
scaffold1419 (594-634)||(1-42)
[»] scaffold0556 (1 HSPs)
scaffold0556 (728-767)||(6826-6865)
[»] scaffold0309 (1 HSPs)
scaffold0309 (630-717)||(6675-6761)
[»] scaffold0218 (1 HSPs)
scaffold0218 (735-766)||(8149-8180)
[»] scaffold0150 (1 HSPs)
scaffold0150 (728-767)||(32112-32151)
[»] scaffold1539 (1 HSPs)
scaffold1539 (595-648)||(1071-1125)
[»] scaffold0290 (1 HSPs)
scaffold0290 (571-648)||(291-369)
[»] scaffold0205 (1 HSPs)
scaffold0205 (728-774)||(29561-29607)
[»] scaffold0170 (1 HSPs)
scaffold0170 (595-648)||(3089-3143)
[»] scaffold0138 (1 HSPs)
scaffold0138 (728-766)||(12954-12992)
[»] scaffold0111 (2 HSPs)
scaffold0111 (595-648)||(7562-7616)
scaffold0111 (595-648)||(14681-14735)
[»] scaffold0078 (1 HSPs)
scaffold0078 (728-766)||(10542-10580)
[»] scaffold0070 (1 HSPs)
scaffold0070 (726-760)||(4545-4579)
[»] scaffold0064 (1 HSPs)
scaffold0064 (728-762)||(47014-47048)
[»] scaffold0013 (1 HSPs)
scaffold0013 (595-648)||(30464-30518)
[»] scaffold0072 (1 HSPs)
scaffold0072 (598-650)||(57946-57999)


Alignment Details
Target: chr1 (Bit Score: 687; Significance: 0; HSPs: 50)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 687; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 774
Target Start/End: Original strand, 13212257 - 13213020
Alignment:
Q  1 aagtgtaggattggttttagagaatagaatttgaaaaaaggtttaacctttgtagttgttaaaaatcaagtttttaattaagtgtatatgtcatgattat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  13212257 aagtgtaggattggttttagagaatagaatttgaaaaaaggtttaaactttgtagttgttaaaaatcaagtttttaattaagagtatatgtcatgattat 13212356  T
Q  101 ttacatggttagttacctggaatatttcaaagagtatgcatcgaattttgtttgatttcaatttcgtctaggaatccgtcaattattgatcaatgaattt 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  13212357 ttacatggttagttacctggaatatttcaaagagtatgcatcgaattttgtttgatttcaatttcgtttaggaatccgtcaattattgattaatgaattt 13212456  T
Q  201 agctttttcagccgtagctgtgtatcatgacaatcgtcactcatgcgctaatattaggagtactttctgttgcttgatttattaacgtcaattaaagatt 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13212457 agctttttcagccgtagctgtgtatcatgacaaccgtcactcatgcgctaatattaggagtactttctgttgcttgatttattaacgtcaattaaagatt 13212556  T
Q  301 cttgaagcatgatattagccactagttttgaaatagaaaagaggaatagggaacgtgatatttttctaaatagattatagatatgtgctacttttgaaga 400  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13212557 cttgaagcatgatattagccactagttttgaaatagaaaagaggaatagggaacgtgatatttttctaaatagattatagatatgtgctacttttgaaga 13212656  T
Q  401 tccaaaataatcatgtaataagttattctctttgaaacatgtttgtaaggccacacatcttaatttaattgactgaggatgactagtttatttagctatt 500  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  13212657 tccaaaataatcaagtaataagttattctctttgaaacatgtttgtaaggccacacatcttaatttaattgactgaggatgactagtttacttagctatt 13212756  T
Q  501 ttaattcgcttaaataattatgtgttattatgtgttaatggatgatgtgtaattgtctagtcattttaacgatgatctgtgaagctgatttatgatgatt 600  Q
    |||||| |||||||||          ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  13212757 ttaattggcttaaata----------attatgtgttaatgggtgatgtgtaattgtcgagtcattttaacgatgatctgtgaagttgatttatgatgatt 13212846  T
Q  601 tgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattaattgaattatttgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatg 700  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13212847 tgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattaattgaattatttgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatg 13212946  T
Q  701 ttgtttttgtatactgctgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 774  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13212947 ttgtttttgtatactgttgcgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 13213020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 367; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 59 - 531
Target Start/End: Original strand, 18514147 - 18514617
Alignment:
Q  59 ttaaaaatcaagtttttaattaagtgtatatgtcatgattatttacatggttagttacctggaatatttcaaagagtatgcatcgaattttgtttgattt 158  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  18514147 ttaaaaatcaagtttttaattaagagtatatgtcatgattatttacatggttagttaccttgaatatttcaaagagtatgcatcaaattttgtttgattt 18514246  T
Q  159 caatttcgtctaggaatccgtcaattattgatcaatgaatttagctttttcagccgtagctgtgtatcatgacaatcgtcactcatgcgctaatattagg 258  Q
    ||| ||    | | |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  18514247 caagtt----ttgaaatctgtcaattattgattaatgaatttagctttttcagccgtagttgtgtatcataacaatcgtcactcatgcgctaatattagg 18514342  T
Q  259 agtactttctgttgcttgatttattaacgtcaattaaagattcttgaagcatgatattagccactagttttgaaatagaaaagaggaatagggaacgtga 358  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  18514343 agtactttctgttgcttgatttattaacgacaattaaagattcttgaagcatgatattagccactagttttgaaatagaaaagagaaataggaaacgtga 18514442  T
Q  359 --tatttttctaaatagattatagatatgtgctacttttgaagatccaaaataatcatgtaataagttattctctttgaaacatgtttgtaaggccacac 456  Q
      | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  18514443 tttttttttctaaatagattatagatatgtgctacttttgaagatccaaaataatcatgtaataagttattttctttgaaacatgtttgtaaggccacac 18514542  T
Q  457 atcttaatttaattgactgaggatgactagtttatttagctattttaattcgcttaaataattatgtgttattat 531  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  18514543 atcttaatttaattggccgaggatgactagtttatttagttattttaattggcataaataattatgtgttattat 18514617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 578 - 774
Target Start/End: Complemental strand, 21347161 - 21346965
Alignment:
Q  578 tgtgaagctgatttatgatgatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattaattgaattatttgtgaataattgagacgttgattgactt 677  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21347161 tgtgaagctgatttatgatgatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattaattgaattatttgtgaataattgagacgttgattgactt 21347062  T
Q  678 gcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgctgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 774  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21347061 gcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgctgtgtctttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 21346965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 578 - 774
Target Start/End: Complemental strand, 21342296 - 21342100
Alignment:
Q  578 tgtgaagctgatttatgatgatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattaattgaattatttgtgaataattgagacgttgattgactt 677  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21342296 tgtgaagctgatttatgatgatttgatgttgttatattgtgatgtaattgtatatgcattaattgaattatttgtgaataattgagacgttgattgactt 21342197  T
Q  678 gcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgctgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 774  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21342196 gcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgctgtgtctttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 21342100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 150; E-Value: 7e-79
Query Start/End: Original strand, 601 - 774
Target Start/End: Original strand, 15859994 - 15860167
Alignment:
Q  601 tgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattaattgaattatttgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatg 700  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  15859994 tgatgttgttatattgtgatataattgtatgtgcattgattgaattatttgtgagtaattaagacgttgattgacttgcatttaatattattatgtcatg 15860093  T
Q  701 ttgtttttgtatactgctgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 774  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  15860094 ttgtttttgtatactgctgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtccaagttgattaagatg 15860167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 149; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 598 - 774
Target Start/End: Complemental strand, 13989045 - 13988870
Alignment:
Q  598 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattaattgaattatttgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtc 697  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  13989045 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtc 13988947  T
Q  698 atgttgtttttgtatactgctgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 774  Q
    ||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13988946 atgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 13988870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 149; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 598 - 774
Target Start/End: Original strand, 21923274 - 21923449
Alignment:
Q  598 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattaattgaattatttgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtc 697  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  21923274 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtc 21923372  T
Q  698 atgttgtttttgtatactgctgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 774  Q
    ||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21923373 atgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 21923449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 149; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 598 - 774
Target Start/End: Complemental strand, 29776867 - 29776692
Alignment:
Q  598 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattaattgaattatttgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtc 697  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  29776867 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtc 29776769  T
Q  698 atgttgtttttgtatactgctgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 774  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29776768 atgttatttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 29776692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 145; E-Value: 7e-76
Query Start/End: Original strand, 598 - 774
Target Start/End: Original strand, 21475070 - 21475245
Alignment:
Q  598 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattaattgaattatttgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtc 697  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  21475070 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtc 21475168  T
Q  698 atgttgtttttgtatactgctgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 774  Q
    ||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  21475169 atgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgattaagatg 21475245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 145; E-Value: 7e-76
Query Start/End: Original strand, 598 - 774
Target Start/End: Complemental strand, 21840946 - 21840771
Alignment:
Q  598 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattaattgaattatttgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtc 697  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  21840946 atttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttaaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtc 21840848  T
Q  698 atgttgtttttgtatactgctgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 774  Q
    ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21840847 atgatgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 21840771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 141; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 598 - 774
Target Start/End: Original strand, 16275346 - 16275522
Alignment:
Q  598 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattaattgaattatttgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtc 697  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  16275346 atttgatgttgttatattgtgatataatggtatatgcattaattgaattttatgtgaataattgagacgttgattgacttgcaattgatattattatgtc 16275445  T
Q  698 atgttgtttttgtatactgctgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 774  Q
    ||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||    
T  16275446 atgctgtttttgtatactgctatgtcgttgttgttatttaactaagttgtatgagtcggtctaagttgattaagatg 16275522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 140; E-Value: 6e-73
Query Start/End: Original strand, 603 - 774
Target Start/End: Complemental strand, 40389329 - 40389158
Alignment:
Q  603 atgttgttatattgtgatataattgtatatgcattaattgaattatttgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgtt 702  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  40389329 atgttgttatattgtgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtgaataattgagacgatgattgacttgcatttgatattattatgtcatgct 40389230  T
Q  703 gtttttgtatactgctgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 774  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  40389229 gtttttgtatactgatgtgtcgctgttgttatttaaccaagttgcatgagtcagtctaggttgattaagatg 40389158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 138; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 598 - 774
Target Start/End: Complemental strand, 16362097 - 16361921
Alignment:
Q  598 atttgatgttgtt-atattgtgatataattgtatatgcattaattgaattatttgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgt 696  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  16362097 atttgatgttgtttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatttgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgt 16361999  T
Q  697 catgttgtttttgtatactgctgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 774  Q
    |||||||||||| ||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16361998 catgttgtttttatatactgttgtgttgctgtcgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 16361921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 138; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 598 - 774
Target Start/End: Original strand, 23593717 - 23593893
Alignment:
Q  598 atttgatgttgtt-atattgtgatataattgtatatgcattaattgaattatttgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgt 696  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  23593717 atttgatgttgtttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgt 23593815  T
Q  697 catgttgtttttgtatactgctgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 774  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23593816 catgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 23593893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 137; E-Value: 4e-71
Query Start/End: Original strand, 566 - 774
Target Start/End: Complemental strand, 433222 - 433016
Alignment:
Q  566 ttaacgatgatctgtgaagctgatttatgatgatttgatgttgtt-atattgtgatataattgtatatgcattaattgaattatttgtgaataattgaga 664  Q
    |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  433222 ttaatgatgatctgtaaagctgatttatgatgatttgatgttgtttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgaga 433123  T
Q  665 cgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactg-ctgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagt 763  Q
     |||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||   ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  433122 tgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtcttgatgtttttgtatactgcctgtgt---tgccgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagt 433027  T
Q  764 tgattaagatg 774  Q
    |||||||||||    
T  433026 tgattaagatg 433016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 137; E-Value: 4e-71
Query Start/End: Original strand, 598 - 774
Target Start/End: Complemental strand, 29298315 - 29298141
Alignment:
Q  598 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattaattgaattatttgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtc 697  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||    
T  29298315 atttgatgttattatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattat-tc 29298218  T
Q  698 atgttgtttttgtatactgctgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 774  Q
    ||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29298217 atgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 29298141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 137; E-Value: 4e-71
Query Start/End: Original strand, 598 - 774
Target Start/End: Complemental strand, 31612492 - 31612317
Alignment:
Q  598 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattaattgaattatttgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtc 697  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  31612492 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataactgagatgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtc 31612394  T
Q  698 atgttgtttttgtatactgctgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 774  Q
    ||| ||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31612393 atgctgtttttgtatactattgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 31612317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 136; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 571 - 774
Target Start/End: Complemental strand, 21707373 - 21707171
Alignment:
Q  571 gatgatctgtgaagctgatttatgatgatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattaattgaattatttgtgaataattgagacgttga 670  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||| |||| ||||||||||||||||||||     
T  21707373 gatgatctgtgaatctgatttctgatgatttgatgatgttatattgtgatataattgtataggcattacatgatttatatgtgaataattgagacgttg- 21707275  T
Q  671 ttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgctgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaa 770  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||  ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21707274 ttgacttgcatttgatattattctgtcatgctttttttgtatactattgtgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaa 21707175  T
Q  771 gatg 774  Q
    ||||    
T  21707174 gatg 21707171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 136; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 571 - 774
Target Start/End: Complemental strand, 21711915 - 21711713
Alignment:
Q  571 gatgatctgtgaagctgatttatgatgatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattaattgaattatttgtgaataattgagacgttga 670  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||| |||| ||||||||||||||||||||     
T  21711915 gatgatctgtgaatctgatttctgatgatttgatgatgttatattgtgatataattgtataggcattacatgatttatatgtgaataattgagacgttg- 21711817  T
Q  671 ttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgctgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaa 770  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||  ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21711816 ttgacttgcatttgatattattctgtcatgctttttttgtatactattgtgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaa 21711717  T
Q  771 gatg 774  Q
    ||||    
T  21711716 gatg 21711713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 122; E-Value: 3e-62
Query Start/End: Original strand, 598 - 774
Target Start/End: Original strand, 22123050 - 22123226
Alignment:
Q  598 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattaattgaattatttgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtc 697  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  22123050 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattaaatgtgaataattgagacattg-ttgacttgcatttgatattattatgtc 22123148  T
Q  698 atgttgtttttgtatactgctgtgtcgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 774  Q
    ||| | ||||||||||||| ||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  22123149 atgctatttttgtatactgttgtgttgctgtttgctatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtagattaagatg 22123226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 117; E-Value: 3e-59
Query Start/End: Original strand, 595 - 762
Target Start/End: Original strand, 45574822 - 45574989
Alignment:
Q  595 atgatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattaattgaattatttgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattat 694  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  45574822 atgatttgatgttcttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgttaataattgagacgttg-ttgacttgcatttggtattattat 45574920  T
Q  695 gtcatgttgtttttgtatactg-ctgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 762  Q
    |||||| |||||||| |||||| || ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45574921 gtcatgctgtttttgcatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 45574989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 94; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 575 - 774
Target Start/End: Original strand, 50210128 - 50210327
Alignment:
Q  575 atctgtgaagctgatttatgatgatttgatgttg-ttatattgtgatataattgtatatgcattaattgaattatttgtgaataattgagacgttgattg 673  Q
    ||||||||||||| |||| ||||  ||||||||| ||||  |||||||||||  || | |||||| |||||||||   || ||| |||||| |||| |||    
T  50210128 atctgtgaagctg-tttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttaaacgcattacttgaattatgaatgtatacttgagatgttg-ttg 50210225  T
Q  674 acttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactg-ctgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaaga 772  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  50210226 acttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaaga 50210325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 671 - 774
Target Start/End: Complemental strand, 34509891 - 34509787
Alignment:
Q  671 ttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgc-tgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatta 769  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  34509891 ttgacttgcatttgatatcattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatga 34509792  T
Q  770 agatg 774  Q
    |||||    
T  34509791 agatg 34509787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 74; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 575 - 774
Target Start/End: Original strand, 27250644 - 27250843
Alignment:
Q  575 atctgtgaagctgatttatgatgatttgatgttg-ttatattgtgatataattgtatatgcattaattgaattatttgtgaataattgagacgttgattg 673  Q
    ||||||||||||| |||| ||||  ||| ||||| ||||  |||||||||||  | ||||||||| |||||| || | |||||| || ||| |||||| |    
T  27250644 atctgtgaagctg-tttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgttttatgcattacttgaataatatttgaatatttaagatgttgat-g 27250741  T
Q  674 acttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgc-tgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaaga 772  Q
    | ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||    
T  27250742 aattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctattgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaaga 27250841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 572 - 774
Target Start/End: Complemental strand, 22532478 - 22532276
Alignment:
Q  572 atgatctgtgaagctgatttatgatgatttgatgttg-ttatattgtgatataattgtatatgcattaattgaattatttgtgaataattgagacgttga 670  Q
    |||| ||||||||||| |||| ||||  ||||||||| ||||  |||||||||||  ||| ||||||| |||||||||   |||||| || ||| ||||     
T  22532478 atgaactgtgaagctg-tttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaattatgaatgaatatttaagatgttg- 22532381  T
Q  671 ttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgc-tgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatta 769  Q
    |||| ||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||| |    
T  22532380 ttgaattgcaatggatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaaattgcatgagttggtctaagttgatga 22532281  T
Q  770 agatg 774  Q
    |||||    
T  22532280 agatg 22532276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 63; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 595 - 762
Target Start/End: Original strand, 21896190 - 21896358
Alignment:
Q  595 atgatttgatgttgtt-atattgtgatataattgtatatgcattaattgaattatttgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattatta 693  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||||  |||||||| | |||||  |||||| ||||| |||||||||||||||||| |||    
T  21896190 atgatttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatacattacatgaattatatatgaatgtttgagatgttga-tgacttgcatttgatattgtta 21896288  T
Q  694 tgtcatgttgtttttgtatactg-ctgtgtcgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 762  Q
    | ||||| || |||||||||||| || ||| |||| |||||  ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  21896289 tatcatgctg-ttttgtatactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagttgcatgagtcggtctaag 21896358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 63; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 566 - 762
Target Start/End: Original strand, 35260986 - 35261180
Alignment:
Q  566 ttaacgatgatctgtgaagctgatttatgatgatttgatgttgtta-tattgtgatataattgtatatgcattaattgaattatttgtgaataattgaga 664  Q
    |||||||| || ||||||| || | || |||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||| ||||||||| | |||||  ||||||    
T  35260986 ttaacgataatatgtgaagttgttataagatgatttgatgttgttaataatgtgatgtaattgtatatgcattacttgaattatgtatgaatgtttgaga 35261085  T
Q  665 cgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactg-ctgtgtcgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 762  Q
     ||||||    |||||||||||||| |||| ||||| || ||||| |||||| || ||| |||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  35261086 tgttgat----ttgcatttgatattgttatatcatgctg-ttttgcatactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaag 35261180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 595 - 762
Target Start/End: Original strand, 21861504 - 21861672
Alignment:
Q  595 atgatttgatgttgtt-atattgtgatataattgtatatgcattaattgaattatttgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattatta 693  Q
    ||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||| | |||||  |||||| ||||| |||||||||||||||||| |||    
T  21861504 atgatatgatgttgtttataatgtgatataattgtatatacattacttgaattatatatgaatgtttgagatgttga-tgacttgcatttgatattgtta 21861602  T
Q  694 tgtcatgttgtttttgtatactg-ctgtgtcgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 762  Q
    | ||||| || ||||| |||||| || ||| |||| |||||  ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  21861603 tatcatgctg-ttttgcatactgcctatgttgctgtttgtttattagctaagctgcatgagtcggtctaag 21861672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 615 - 774
Target Start/End: Original strand, 22468651 - 22468810
Alignment:
Q  615 tgtgatataattgtatatgcattaattgaattatttgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatac 714  Q
    |||||||||||  ||| ||||||| ||||  ||||  ||||||||| ||| |||| |||| ||||| |||||||||| |||||||| |||| |||||  |    
T  22468651 tgtgatataatgttatgtgcattacttgagatattattgaataattaagatgttg-ttgaattgcaattgatattatgatgtcatgctgttgttgtaatc 22468749  T
Q  715 tgc-tgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 774  Q
    ||| | ||| ||| |||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  22468750 tgcctatgttgctattgttatttaactaagttgcatgagtcagtctaagttgattaagatg 22468810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 56; E-Value: 8e-23
Query Start/End: Original strand, 566 - 644
Target Start/End: Complemental strand, 21477732 - 21477653
Alignment:
Q  566 ttaacgatgatctgtgaagctgatttatgatgatttgatgttg-ttatattgtgatataattgtatatgcattaattgaa 644  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  21477732 ttaatgatgatctgtgaagctgatttatgatgatttgatgttgtttataatgtgatataattgtatacgcattacttgaa 21477653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 53; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 566 - 766
Target Start/End: Complemental strand, 16758866 - 16758664
Alignment:
Q  566 ttaacgatgatctgtgaagctgatttatgatgatttgatgttgtt-atattgtgatataattgtatatgcattaattgaattatttgtgaataattgaga 664  Q
    |||| ||||||||||||||||| | ||  |||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||  ||| ||    
T  16758866 ttaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttgttgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatatgaat-gttgtga 16758768  T
Q  665 cgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgttgt-ttttgtatactg-ctgtgtcgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 761  Q
     |||| |||  ||| |||||||||| |||| |||||   |  |||| |||||| || ||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  16758767 tgttg-ttgtattgtatttgatattgttatatcatgaactggtttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaa 16758669  T
Q  762 gttga 766  Q
    |||||    
T  16758668 gttga 16758664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 680 - 774
Target Start/End: Original strand, 20847173 - 20847268
Alignment:
Q  680 atttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgc-tgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 774  Q
    |||||||||  |||||||||| || |||||| |||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  20847173 atttgatatatttatgtcatgctgattttgtgtactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatg 20847268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 51; E-Value: 8e-20
Query Start/End: Original strand, 724 - 774
Target Start/End: Original strand, 20454617 - 20454667
Alignment:
Q  724 gctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 774  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20454617 gctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 20454667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 575 - 765
Target Start/End: Complemental strand, 21026886 - 21026696
Alignment:
Q  575 atctgtgaagctgatttatgatgatttgatgttg-ttatattgtgatataattgtatatgcattaattga--attatttgtgaataattgagacgttgat 671  Q
    ||||||||||||| |||| ||||  ||| ||||| ||||  |||||||||||  | ||||||||| ||||  ||||||||  |||| || ||| |||| |    
T  21026886 atctgtgaagctg-tttaagatgtgttgctgttgattatgatgtgatataatgttttatgcattacttgagaattatttg--aatatttaagatgttg-t 21026791  T
Q  672 tgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgc-tgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 765  Q
    ||| ||||| |||||||  ||| |||||| || ||||||||||||| | | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21026790 tgaattgcaattgatatatttacgtcatgctgattttgtatactgcctatattgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 21026696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 595 - 766
Target Start/End: Complemental strand, 33681193 - 33681022
Alignment:
Q  595 atgatttgatgttgtt-atattgtgatataattgtatatgcattaattgaattatttgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattatta 693  Q
    |||| ||||||||||| ||| ||| |||||||||||||| |||||  |||||||| | ||| || |||||| |||||  |||||||||| |||||| |||    
T  33681193 atgaattgatgttgtttataatgttatataattgtatatacattacatgaattatgtttga-tatttgagatgttgac-gacttgcattcgatattgtta 33681096  T
Q  694 tgtcatgttgtttttgtatactgc-tgtgtcgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 766  Q
    | ||||| || ||| | ||||||| | ||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  33681095 tatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttga 33681022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 46; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 619 - 766
Target Start/End: Complemental strand, 22237788 - 22237642
Alignment:
Q  619 atataattgtatatgcattaattgaattatttgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgc- 717  Q
    |||||||||||||| |||||  |||||||| | ||| || |||||| |||||| |||||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||| |||     
T  22237788 atataattgtatatacattacatgaattatgtttga-tatttgagatgttgat-gacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcataatgcc 22237692  T
Q  718 tgtgtcgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 766  Q
    | |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  22237691 tatgtcgctgtttgttatttaactaagcttcatgagtcggtctaagttga 22237642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 617 - 774
Target Start/End: Complemental strand, 20135351 - 20135194
Alignment:
Q  617 tgatataattgtatatgcattaattgaattatttgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactg 716  Q
    |||||||||  | ||||||||| ||||| | ||  |||||| || ||| |||| |||| |||||  |||||||||||||||||| |||| |||||  |||    
T  20135351 tgatataatgttgtatgcattacttgaagttttattgaatacttaagatgttg-ttgaattgcacatgatattattatgtcatgatgttgttgtaatctg 20135253  T
Q  717 c-tgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 774  Q
    | | ||  ||| ||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  20135252 cctatgctgctattgttgtttaactaagttgcatgagtcagtctaagttgattaagatg 20135194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 728 - 767
Target Start/End: Complemental strand, 21754098 - 21754059
Alignment:
Q  728 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 767  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21754098 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 21754059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 728 - 774
Target Start/End: Complemental strand, 21714595 - 21714549
Alignment:
Q  728 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 774  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  21714595 ttgttatttaaccaagctgcatgagtcggtctaagttgatcaagatg 21714549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 728 - 766
Target Start/End: Original strand, 52928038 - 52928076
Alignment:
Q  728 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 766  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52928038 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 52928076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 728 - 765
Target Start/End: Complemental strand, 20918657 - 20918620
Alignment:
Q  728 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 765  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20918657 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 20918620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 598 - 761
Target Start/End: Original strand, 14295493 - 14295652
Alignment:
Q  598 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattaattgaattatttgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtc 697  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||  ||| |||  | ||| ||||||||  ||||||| ||    ||| ||||||||||| ||    
T  14295493 atttgatgttgttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtctga-taattgagttgttgatttac----attcgatattattatatc 14295587  T
Q  698 atgttgtttttgtatactgc-tgtgtcgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 761  Q
    ||| || ||| | ||||| | | ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14295588 atgatggttt-gcatactacctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 14295652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 595 - 762
Target Start/End: Original strand, 41049970 - 41050138
Alignment:
Q  595 atgatttgatgttgtta-tattgtgatataattgtatatgcattaattgaattatttgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattatta 693  Q
    ||||||||| ||||||| || ||||||||| |||||||||||||| ||||||||| | |||    |||||| |||| |||| |||||||||||||| |||    
T  41049970 atgatttgacgttgttaataatgtgatatatttgtatatgcattacttgaattatatatga--tgttgagatgttg-ttgatttgcatttgatattgtta 41050066  T
Q  694 tgtcatgttgt-ttttgtatactg-ctgtgtcgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 762  Q
    | |||||   | |||| ||||||| || ||| |||||| |||   |||||||||||||||||||||||||||    
T  41050067 tatcatgaactattttatatactgcctatgttgctgttcgtttagtaactaagctgcatgagtcggtctaag 41050138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 566 - 605
Target Start/End: Complemental strand, 21473159 - 21473120
Alignment:
Q  566 ttaacgatgatctgtgaagctgatttatgatgatttgatg 605  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21473159 ttaatgatgatctgtgaagctgatttatgatgatttgatg 21473120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 728 - 767
Target Start/End: Original strand, 22921937 - 22921976
Alignment:
Q  728 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 767  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  22921937 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgat 22921976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 728 - 767
Target Start/End: Complemental strand, 20248332 - 20248293
Alignment:
Q  728 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 767  Q
    ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  20248332 ttgttttttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgat 20248293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 595 - 648
Target Start/End: Original strand, 16368221 - 16368275
Alignment:
Q  595 atgatttgatgttgtta-tattgtgatataattgtatatgcattaattgaattat 648  Q
    ||||||||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||  ||||||||    
T  16368221 atgatttgatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattat 16368275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 595 - 648
Target Start/End: Complemental strand, 22124471 - 22124417
Alignment:
Q  595 atgatttgatgttgtta-tattgtgatataattgtatatgcattaattgaattat 648  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||  ||||||||    
T  22124471 atgatttgatgttgttagtaatgtgatatagttgtatatgcattatgtgaattat 22124417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #49
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 482 - 523
Target Start/End: Complemental strand, 40389367 - 40389326
Alignment:
Q  482 actagtttatttagctattttaattcgcttaaataattatgt 523  Q
    |||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  40389367 actaatttaattagctattttaattggcttaaataattatgt 40389326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #50
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 62
Target Start/End: Complemental strand, 40390181 - 40390126
Alignment:
Q  1 aagtgtaggattggttttagagaatagaatttgaaaaaaggtttaacctttgtagttgttaa 62  Q
    |||||||||||||||||||||     |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  40390181 aagtgtaggattggttttaga-----gaatttgaaaaagggtttaacc-ttgtagttgttaa 40390126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0247 (Bit Score: 193; Significance: 1e-104; HSPs: 2)
Name: scaffold0247
Description:

Target: scaffold0247; HSP #1
Raw Score: 193; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 566 - 770
Target Start/End: Original strand, 2079 - 2283
Alignment:
Q  566 ttaacgatgatctgtgaagctgatttatgatgatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattaattgaattatttgtgaataattgagac 665  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2079 ttaacgatgatctgtgaagctgatttatgatgatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattaattgaattatttgtgaataattgagac 2178  T
Q  666 gttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgctgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 765  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  2179 gttaattgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgttgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcaagagtcggtctaagttg 2278  T
Q  766 attaa 770  Q
    |||||    
T  2279 attaa 2283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0247; HSP #2
Raw Score: 89; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 566 - 763
Target Start/End: Original strand, 17932 - 18130
Alignment:
Q  566 ttaacgatgatctgtgaagctgatttatgatgatttgatgttg-ttatattgtgatataattgtatatgcattaattgaattatttgtgaataattgaga 664  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||    
T  17932 ttaatgatgatctgtgaagctgatttatgatgatttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaatatttgaga 18031  T
Q  665 cgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgc-tgtgtcgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 762  Q
     |||| || |||||| || ||||||||||| ||||| || || || ||| ||| | ||| |||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||||    
T  18032 tgttg-tttacttgcgttcgatattattatatcatgatg-ttgtgcataatgcatatgttgctgattgttaattaactaagctgcatgagtcagtctaag 18129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001 (Bit Score: 193; Significance: 1e-104; HSPs: 3)
Name: scaffold0001
Description:

Target: scaffold0001; HSP #1
Raw Score: 193; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 566 - 774
Target Start/End: Original strand, 85530 - 85738
Alignment:
Q  566 ttaacgatgatctgtgaagctgatttatgatgatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattaattgaattatttgtgaataattgagac 665  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  85530 ttaacgatgatctgtgaagctgatttatgatgatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattaattgaattatttgtgaataattcagac 85629  T
Q  666 gttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgctgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 765  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  85630 gttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 85729  T
Q  766 attaagatg 774  Q
    |||||||||    
T  85730 attaagatg 85738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #2
Raw Score: 149; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 598 - 774
Target Start/End: Complemental strand, 501263 - 501088
Alignment:
Q  598 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattaattgaattatttgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtc 697  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  501263 atttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtc 501165  T
Q  698 atgttgtttttgtatactgctgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 774  Q
    |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  501164 atgttgtttttgtatattgctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 501088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #3
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 676 - 767
Target Start/End: Complemental strand, 160790 - 160698
Alignment:
Q  676 ttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgc-tgtgtcgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 767  Q
    |||||||||||||| |||| ||||| || ||| | ||||||| | ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  160790 ttgcatttgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgattgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 160698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0007 (Bit Score: 185; Significance: 1e-100; HSPs: 2)
Name: scaffold0007
Description:

Target: scaffold0007; HSP #1
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 566 - 774
Target Start/End: Original strand, 161040 - 161248
Alignment:
Q  566 ttaacgatgatctgtgaagctgatttatgatgatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattaattgaattatttgtgaataattgagac 665  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  161040 ttaacgatgatctgtgaagctgatttatgatgatttgatattgttatattgtgatataattgtatatgcattaattgaattatttgtgaataattgagat 161139  T
Q  666 gttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgctgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 765  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  161140 gttgattgacttgcatttgatattattatgtcattatgtttttgtatactgctgtgtcgctgttgatatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 161239  T
Q  766 attaagatg 774  Q
     ||||||||    
T  161240 gttaagatg 161248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0007; HSP #2
Raw Score: 130; E-Value: 6e-67
Query Start/End: Original strand, 566 - 699
Target Start/End: Original strand, 164541 - 164674
Alignment:
Q  566 ttaacgatgatctgtgaagctgatttatgatgatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattaattgaattatttgtgaataattgagac 665  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  164541 ttaacgatgatctgtgaagctgatttatgatgatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattaattgaattatttgtgaataattgagat 164640  T
Q  666 gttgattgacttgcatttgatattattatgtcat 699  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  164641 gttgattgacttgcatttgatattattatgtcat 164674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 181; Significance: 2e-97; HSPs: 80)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 181; E-Value: 2e-97
Query Start/End: Original strand, 574 - 774
Target Start/End: Original strand, 12119683 - 12119883
Alignment:
Q  574 gatctgtgaagctgatttatgatgatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattaattgaattatttgtgaataattgagacgttgattg 673  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  12119683 gatctgtgaagctgatttatgatgatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattaattagattatctgtgaataattgagacgttgattg 12119782  T
Q  674 acttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgctgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagat 773  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12119783 acttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgtcgctgttgttatttaacaaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagat 12119882  T
Q  774 g 774  Q
    |    
T  12119883 g 12119883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 153; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 574 - 774
Target Start/End: Complemental strand, 17672829 - 17672630
Alignment:
Q  574 gatctgtgaagctgatttatgatgatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattaattgaattatttgtgaataattgagacgttgattg 673  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  17672829 gatctgtgaagcttatttatgatgatttgatgatgttatattgtgatataattatatatgcattatttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttg 17672731  T
Q  674 acttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgctgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagat 773  Q
    | ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17672730 atttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagat 17672631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 153; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 566 - 762
Target Start/End: Original strand, 53070604 - 53070799
Alignment:
Q  566 ttaacgatgatctgtgaagctgatttatgatgatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattaattgaattatttgtgaataattgagac 665  Q
    |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  53070604 ttaatgatgatttgtgaagctgatttatgatgatttgatgttgttagattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagac 53070703  T
Q  666 gttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgctgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 762  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  53070704 gttg-ttgacttgcatttgatattattatgtcttgttgtttttgtatactgttatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 53070799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 150; E-Value: 7e-79
Query Start/End: Original strand, 598 - 774
Target Start/End: Complemental strand, 8499699 - 8499522
Alignment:
Q  598 atttgatgttgtt-atattgtgatataattgtatatgcattaattgaattatttgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgt 696  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8499699 atttgatgttgtttatattgtgatataattgtatatgcattaattagattatctgtgaataattgagacattgattgacttgcatttgatattattatgt 8499600  T
Q  697 catgttgtttttgtatactgctgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 774  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8499599 catgttgtttttgtatactactgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 8499522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 149; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 598 - 774
Target Start/End: Original strand, 9707590 - 9707765
Alignment:
Q  598 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattaattgaattatttgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtc 697  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||    
T  9707590 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgtatttgatattattatgtc 9707688  T
Q  698 atgttgtttttgtatactgctgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 774  Q
    ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9707689 atgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 9707765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 149; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 598 - 774
Target Start/End: Complemental strand, 17463357 - 17463182
Alignment:
Q  598 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattaattgaattatttgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtc 697  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  17463357 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtc 17463259  T
Q  698 atgttgtttttgtatactgctgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 774  Q
    ||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17463258 atgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 17463182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 149; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 598 - 774
Target Start/End: Original strand, 45606890 - 45607065
Alignment:
Q  598 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattaattgaattatttgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtc 697  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  45606890 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtc 45606988  T
Q  698 atgttgtttttgtatactgctgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 774  Q
    ||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45606989 atgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 45607065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 148; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 595 - 774
Target Start/End: Complemental strand, 8899276 - 8899098
Alignment:
Q  595 atgatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattaattgaattatttgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattat 694  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  8899276 atgatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattat 8899178  T
Q  695 gtcatgttgtttttgtatactgctgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 774  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  8899177 gtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaaattgattaagatg 8899098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 145; E-Value: 7e-76
Query Start/End: Original strand, 598 - 774
Target Start/End: Original strand, 7781330 - 7781505
Alignment:
Q  598 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattaattgaattatttgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtc 697  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||    
T  7781330 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgatttgcatttgatattattatgtc 7781428  T
Q  698 atgttgtttttgtatactgctgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 774  Q
    ||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7781429 atgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 7781505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 145; E-Value: 7e-76
Query Start/End: Original strand, 598 - 774
Target Start/End: Complemental strand, 12567739 - 12567564
Alignment:
Q  598 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattaattgaattatttgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtc 697  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  12567739 atttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtc 12567641  T
Q  698 atgttgtttttgtatactgctgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 774  Q
    ||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12567640 atgatgtttttgtatattgctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 12567564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 145; E-Value: 7e-76
Query Start/End: Original strand, 598 - 774
Target Start/End: Complemental strand, 13544204 - 13544029
Alignment:
Q  598 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattaattgaattatttgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtc 697  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  13544204 atttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtc 13544106  T
Q  698 atgttgtttttgtatactgctgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 774  Q
    ||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13544105 atgatgtttttgtatattgctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 13544029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 145; E-Value: 7e-76
Query Start/End: Original strand, 598 - 774
Target Start/End: Complemental strand, 34159505 - 34159330
Alignment:
Q  598 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattaattgaattatttgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtc 697  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  34159505 atttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtc 34159407  T
Q  698 atgttgtttttgtatactgctgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 774  Q
    ||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34159406 atgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 34159330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 145; E-Value: 7e-76
Query Start/End: Original strand, 598 - 770
Target Start/End: Original strand, 38961874 - 38962045
Alignment:
Q  598 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattaattgaattatttgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtc 697  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  38961874 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtc 38961972  T
Q  698 atgttgtttttgtatactgctgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaa 770  Q
    ||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38961973 atgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaa 38962045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 145; E-Value: 7e-76
Query Start/End: Original strand, 598 - 774
Target Start/End: Complemental strand, 55476670 - 55476495
Alignment:
Q  598 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattaattgaattatttgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtc 697  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  55476670 atttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtc 55476572  T
Q  698 atgttgtttttgtatactgctgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 774  Q
    ||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  55476571 atgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 55476495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 144; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 595 - 770
Target Start/End: Complemental strand, 50243004 - 50242830
Alignment:
Q  595 atgatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattaattgaattatttgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattat 694  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||    
T  50243004 atgatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgatttgcatttgatattattat 50242906  T
Q  695 gtcatgttgtttttgtatactgctgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaa 770  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50242905 gtcatgttgtttttgtatactactgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaa 50242830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 142; E-Value: 4e-74
Query Start/End: Original strand, 598 - 774
Target Start/End: Complemental strand, 15412610 - 15412433
Alignment:
Q  598 atttgatgttgtt-atattgtgatataattgtatatgcattaattgaattatttgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgt 696  Q
    ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15412610 atttgatgttgtttatattgggatataattgtatatgcatcaattagattatctgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgt 15412511  T
Q  697 catgttgtttttgtatactgctgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 774  Q
    |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15412510 catgctgtttttgtatactactgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 15412433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 142; E-Value: 4e-74
Query Start/End: Original strand, 598 - 774
Target Start/End: Original strand, 29172565 - 29172741
Alignment:
Q  598 atttgatgttgtta-tattgtgatataattgtatatgcattaattgaattatttgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgt 696  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  29172565 atttgatgttgatagtattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgt 29172663  T
Q  697 catgttgtttttgtatactgctgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 774  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29172664 catgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 29172741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 141; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 598 - 774
Target Start/End: Original strand, 6469117 - 6469292
Alignment:
Q  598 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattaattgaattatttgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtc 697  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  6469117 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttcaattatatgtgactaattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtc 6469215  T
Q  698 atgttgtttttgtatactgctgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 774  Q
    ||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6469216 atgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 6469292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 141; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 598 - 774
Target Start/End: Original strand, 10247706 - 10247881
Alignment:
Q  598 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattaattgaattatttgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtc 697  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  10247706 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtc 10247804  T
Q  698 atgttgtttttgtatactgctgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 774  Q
    ||| ||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  10247805 atgctgtttttgtatactgttgtgctgctgttgttatttaactaagctgtatgagtcggtctaagttgattaagatg 10247881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 141; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 598 - 774
Target Start/End: Original strand, 16282794 - 16282969
Alignment:
Q  598 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattaattgaattatttgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtc 697  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||    
T  16282794 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcattcaatattattatgtc 16282892  T
Q  698 atgttgtttttgtatactgctgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 774  Q
    ||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16282893 atgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 16282969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 141; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 598 - 774
Target Start/End: Original strand, 16454264 - 16454439
Alignment:
Q  598 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattaattgaattatttgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtc 697  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  16454264 atttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtc 16454362  T
Q  698 atgttgtttttgtatactgctgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 774  Q
    ||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16454363 atgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 16454439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 141; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 598 - 774
Target Start/End: Original strand, 28848594 - 28848769
Alignment:
Q  598 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattaattgaattatttgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtc 697  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  28848594 atttgatgttgttatactgtgatgtaattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtc 28848692  T
Q  698 atgttgtttttgtatactgctgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 774  Q
    ||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28848693 atgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 28848769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 139; E-Value: 2e-72
Query Start/End: Original strand, 598 - 774
Target Start/End: Complemental strand, 41124066 - 41123894
Alignment:
Q  598 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattaattgaattatttgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtc 697  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  41124066 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtc 41123968  T
Q  698 atgttgtttttgtatactgctgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 774  Q
    ||| ||||||||||||||| |||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41123967 atgctgtttttgtatactgttgtgt---tgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 41123894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 138; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 598 - 774
Target Start/End: Original strand, 13151773 - 13151949
Alignment:
Q  598 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattaattgaattatttgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtc 697  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  13151773 atttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtc 13151871  T
Q  698 atgttgtttttgtatactgctgtgtcgctgttgttatttaact-aagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 774  Q
    ||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13151872 atgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 13151949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 138; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 598 - 774
Target Start/End: Original strand, 13154238 - 13154414
Alignment:
Q  598 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattaattgaattatttgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtc 697  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  13154238 atttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtc 13154336  T
Q  698 atgttgtttttgtatactgctgtgtcgctgttgttatttaact-aagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 774  Q
    ||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13154337 atgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 13154414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 137; E-Value: 4e-71
Query Start/End: Original strand, 598 - 774
Target Start/End: Original strand, 17446638 - 17446812
Alignment:
Q  598 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattaattgaattatttgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtc 697  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  17446638 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaatgatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtc 17446736  T
Q  698 atgttgtttttgtatactgctgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 774  Q
    ||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  17446737 atgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtc-gtctaagttgattaagatg 17446812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 121; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 595 - 762
Target Start/End: Original strand, 43550458 - 43550625
Alignment:
Q  595 atgatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattaattgaattatttgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattat 694  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  43550458 atgatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatacattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattat 43550556  T
Q  695 gtcatgttgtttttgtatactgc-tgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 762  Q
    ||||||||||||||| ||||||| | ||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43550557 gtcatgttgtttttgcatactgcatatgttgctgtcattatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 43550625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 105; E-Value: 5e-52
Query Start/End: Original strand, 650 - 774
Target Start/End: Complemental strand, 15977642 - 15977519
Alignment:
Q  650 tgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgctgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcat 749  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  15977642 tgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactattgtgttgctgttgttatttaactaagctgcat 15977544  T
Q  750 gagtcggtctaagttgattaagatg 774  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  15977543 gagtcggtctaagttgattaagatg 15977519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 93; E-Value: 7e-45
Query Start/End: Original strand, 566 - 763
Target Start/End: Original strand, 24340628 - 24340826
Alignment:
Q  566 ttaacgatgatctgtgaagctgatttatgatgatttgatgttgtt-atattgtgatataattgtatatgcattaattgaattatttgtgaataattgaga 664  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||    
T  24340628 ttaatgatgatctgtgaagctgatttatgatgatttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaatatttgaga 24340727  T
Q  665 cgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgc-tgtgtcgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 762  Q
     |||| || |||||| || ||||||||||| ||||| |||| | | ||||||| | ||| |||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||||    
T  24340728 tgttgttt-acttgcgttcgatattattatatcatgatgttgt-gcatactgcatatgttgctgattgttaattaactaagctgcatgagtcagtctaag 24340825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 93; E-Value: 7e-45
Query Start/End: Original strand, 575 - 774
Target Start/End: Original strand, 40213636 - 40213834
Alignment:
Q  575 atctgtgaagctgatttatgatgatttgatgttg-ttatattgtgatataattgtatatgcattaattgaattatttgtgaataattgagacgttgattg 673  Q
    |||||| |||||| |||| ||||  ||||||||| ||||  |||||||||||  |||| |||||| ||| |||||   || |||||||||| |||| |||    
T  40213636 atctgtaaagctg-tttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttggattatgaatgtataattgagatgttg-ttg 40213733  T
Q  674 acttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgctgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagat 773  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  40213734 acttgcatttgatattattatgtcatgatgtttatgtatactgctgtgttgatgttgttatttaactaagctacatgagtcggtctaagttgattaagat 40213833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 92; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 659 - 774
Target Start/End: Complemental strand, 10557104 - 10556989
Alignment:
Q  659 ttgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgctgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 758  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10557104 ttgagatgttgattggcttgcatttgatattattatgtcatgccgtttttgtatgctgatgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 10557005  T
Q  759 taagttgattaagatg 774  Q
    ||||||||||||||||    
T  10557004 taagttgattaagatg 10556989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 92; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 671 - 774
Target Start/End: Complemental strand, 36166704 - 36166602
Alignment:
Q  671 ttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgctgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaa 770  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36166704 ttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttt-gtatactgctgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaa 36166606  T
Q  771 gatg 774  Q
    ||||    
T  36166605 gatg 36166602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 92; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 566 - 763
Target Start/End: Complemental strand, 42386626 - 42386428
Alignment:
Q  566 ttaacgatgatctgtgaagctgatttatgatgatttgatgttg-ttatattgtgatataattgtatatgcattaattgaattatttgtgaataattgaga 664  Q
    |||| ||| ||||||||||||| |||| |||| |||||||||| ||||  |||||||||||  ||||||||||  |||||||||   |||||| ||||||    
T  42386626 ttaatgataatctgtgaagctgttttaagatgttttgatgttgattatgatgtgatataatgttatatgcattgcttgaattatgaatgaatatttgaga 42386527  T
Q  665 cgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactg-ctgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagt 763  Q
     |||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  42386526 tgttg-ttgacttgcatttgatattgttatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaaactgcatgagtcggtctaagt 42386428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 92; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 671 - 774
Target Start/End: Complemental strand, 55501049 - 55500946
Alignment:
Q  671 ttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgctgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaa 770  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  55501049 ttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaa 55500950  T
Q  771 gatg 774  Q
    ||||    
T  55500949 gatg 55500946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 90; E-Value: 4e-43
Query Start/End: Original strand, 575 - 774
Target Start/End: Complemental strand, 14973060 - 14972861
Alignment:
Q  575 atctgtgaagctgatttatgatgatttgatgttg-ttatattgtgatataattgtatatgcattaattgaattatttgtgaataattgagacgttgattg 673  Q
    |||| |||||||| |||| ||||  ||||||||| ||||  |||||||||||  ||||||||||| |||||||||   || |||  ||||| |||| |||    
T  14973060 atctatgaagctg-tttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatatgcattacttgaattatgaatgtatatatgagatgttg-ttg 14972963  T
Q  674 acttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgc-tgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaaga 772  Q
    | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  14972962 atttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaaga 14972863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 84; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 679 - 774
Target Start/End: Complemental strand, 44494908 - 44494813
Alignment:
Q  679 catttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgctgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 774  Q
    |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  44494908 catttgatattattatgttatgctgtttttgtatactgctgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcgatctaagttgattaagatg 44494813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 82; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 575 - 774
Target Start/End: Complemental strand, 13442480 - 13442281
Alignment:
Q  575 atctgtgaagctgatttatgatgatttgatgttg-ttatattgtgatataattgtatatgcattaattgaattatttgtgaataattgagacgttgattg 673  Q
    ||||||||||||| |||| ||||  ||||||||| ||||  |||||||||||  ||| ||||||| |||||  || | |||||| || ||| |||||| |    
T  13442480 atctgtgaagctg-tttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgat-g 13442383  T
Q  674 acttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgc-tgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaaga 772  Q
    | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  13442382 aattgcaattgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgcctatgttgccgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaaga 13442283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 82; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 671 - 768
Target Start/End: Complemental strand, 21618555 - 21618459
Alignment:
Q  671 ttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgctgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatt 768  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21618555 ttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttt-gtatactgttgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatt 21618459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 80; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 566 - 661
Target Start/End: Original strand, 17248192 - 17248287
Alignment:
Q  566 ttaacgatgatctgtgaagctgatttatgatgatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattaattgaattatttgtgaataattg 661  Q
    |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  17248192 ttaaagatgatctgtgaagatgatttatgatgatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattatttgaattatatgtgaataattg 17248287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 78; E-Value: 6e-36
Query Start/End: Original strand, 575 - 774
Target Start/End: Complemental strand, 17488062 - 17487863
Alignment:
Q  575 atctgtgaagctgatttatgatgatttgatgttg-ttatattgtgatataattgtatatgcattaattgaattatttgtgaataattgagacgttgattg 673  Q
    ||||||||| ||| |||| ||||  ||||||||| ||||  |||||||||||  ||||||||||| |||||  || | |||||| || ||| |||||| |    
T  17488062 atctgtgaatctg-tttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgat-g 17487965  T
Q  674 acttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactg-ctgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaaga 772  Q
    | ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  17487964 aattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgtctattttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaaga 17487865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 615 - 774
Target Start/End: Complemental strand, 17499504 - 17499345
Alignment:
Q  615 tgtgatataattgtatatgcattaattgaattatttgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatac 714  Q
    |||||||||||  ||||||||||| |||||  || | |||||| || ||| |||||| || ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  17499504 tgtgatataatgttatatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgat-gaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatac 17499406  T
Q  715 tg-ctgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 774  Q
    || || | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  17499405 tgtctattttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatg 17499345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 566 - 763
Target Start/End: Complemental strand, 23274903 - 23274705
Alignment:
Q  566 ttaacgatgatctgtgaagctgatttatgatgatttgatgttg-ttatattgtgatataattgtatatgcattaattgaattatttgtgaataattgaga 664  Q
    |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||| | ||| ||||||||| |||||||| ||||||    
T  23274903 ttaatgatgatctgtgaagctgaattatgatgatttgatgttgtttataatgtgatgtaattgtatattctttacttgaattatatgtgaatatttgaga 23274804  T
Q  665 cgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactg-ctgtgtcgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 762  Q
     |||| || |||||| || ||||||||||| ||||| || ||||| |||||| || ||| |||| |||||| ||||||||| |||||||||| |||||||    
T  23274803 tgttg-tttacttgcgttcgatattattatatcatgatg-ttttgcatactgcctatgttgctgattgttaattaactaagttgcatgagtcagtctaag 23274706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 615 - 774
Target Start/End: Original strand, 25476340 - 25476499
Alignment:
Q  615 tgtgatataattgtatatgcattaattgaattatttgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatac 714  Q
    |||||||||||  |||  |||||| |||||||||   || ||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  25476340 tgtgatataatgttatgcgcattacttgaattatgaatgtatacttgagatgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatac 25476438  T
Q  715 tgc-tgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 774  Q
    | | ||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  25476439 tacctgtgttgctgttgttttttaactaagctacatgagtcggtctaagttgatgaagatg 25476499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 575 - 773
Target Start/End: Complemental strand, 43841138 - 43840940
Alignment:
Q  575 atctgtgaagctgatttatgatgatttgatgttg-ttatattgtgatataattgtatatgcattaattgaattatttgtgaataattgagacgttgattg 673  Q
    ||||||||||||| |||| ||||  ||||||||| |||| ||||||||||||  ||| ||||||| ||||| |||   |||||| || ||| | || |||    
T  43841138 atctgtgaagctg-tttaagatgtgttgatgttgattatgttgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgatg-ttg 43841041  T
Q  674 acttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactg-ctgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaaga 772  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  43841040 acttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgtctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtttaagttgatgaaga 43840941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 76; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 598 - 774
Target Start/End: Complemental strand, 27165431 - 27165254
Alignment:
Q  598 atttgatgttgtt-atattgtgatataattgtatatgcattaattgaattatttgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgt 696  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| || || |||||| | |||||| ||||||  ||||| |||||||||||||||||  ||| |    
T  27165431 atttgatgttgtttatattgtgatataattgtatacgcaatacttaaattatatatgaatatttgagatattgat-gacttgcatttgatattggtatat 27165333  T
Q  697 catgttgtttttgtatactg-ctgtgtcgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 774  Q
    ||||||||||| | |||||| || | | |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27165332 catgttgtttt-gcatactgtctatattgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 27165254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 76; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 609 - 774
Target Start/End: Original strand, 53301499 - 53301665
Alignment:
Q  609 ttatattgtgatataattgtatatgcattaattgaattatttgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgttgttttt 708  Q
    ||||||||||||||||||||||| | | || ||||||||| | |||||| ||||||  |||| |||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||    
T  53301499 ttatattgtgatataattgtatacgtaatacttgaattatatatgaatatttgagatattgaatgacttgcatttgatattgttatatcatgttg-tttt 53301597  T
Q  709 gtatactg-ctgtgtcgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 774  Q
    | |||||| || ||| |||| |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||    
T  53301598 gcatactgtctatgttgctgtttgttatttaactaagttgtatgagtcggtctaagttgattaagatg 53301665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 74; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 575 - 766
Target Start/End: Complemental strand, 26687093 - 26686902
Alignment:
Q  575 atctgtgaagctgatttatgatgatttgatgttg-ttatattgtgatataattgtatatgcattaattgaattatttgtgaataattgagacgttgattg 673  Q
    ||||||||||||| |||| ||||  ||||||||| |||| ||||||||||||  ||| ||||||| ||||| |||    ||||| || ||| | || |||    
T  26687093 atctgtgaagctg-tttaagatgtgttgatgttgattatgttgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataatggaatatttaagatgatg-ttg 26686996  T
Q  674 acttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgc-tgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 766  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26686995 acttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 26686902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 73; E-Value: 6e-33
Query Start/End: Original strand, 671 - 774
Target Start/End: Complemental strand, 18438645 - 18438541
Alignment:
Q  671 ttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgc-tgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatta 769  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |    
T  18438645 ttgacttgcatttgatattattatatcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctacatgagtcggtctaagttgatga 18438546  T
Q  770 agatg 774  Q
    |||||    
T  18438545 agatg 18438541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 73; E-Value: 6e-33
Query Start/End: Original strand, 566 - 763
Target Start/End: Original strand, 37642170 - 37642368
Alignment:
Q  566 ttaacgatgatctgtgaagctgatttatgatgatttgatgttg-ttatattgtgatataattgtatatgcattaattgaattatttgtgaataattgaga 664  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| || ||||||    
T  37642170 ttaatgatgatctgtgaagctgatttatgatgatttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgattatttgaga 37642269  T
Q  665 cgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactg-ctgtgtcgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 762  Q
     |||| || |||| | |  ||||||||||| ||||| || ||||| |||||| || ||| |||| |  |||  ||||||||||||||||||||||| |||    
T  37642270 tgttg-tttacttacgtgcgatattattatatcatgatg-ttttgcatactgcctatgttgctgatcattaactaactaagctgcatgagtcggtccaag 37642367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 70; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 575 - 774
Target Start/End: Original strand, 24153124 - 24153322
Alignment:
Q  575 atctgtgaagctgatttatgatgatttgatgttg-ttatattgtgatataattgtatatgcattaattgaattatttgtgaataattgagacgttgattg 673  Q
    ||||||||||||| |||| ||||  ||||||||| ||||  |||||||| ||  ||| ||||||| ||||| |||   |||||| || ||| |||| |||    
T  24153124 atctgtgaagctg-tttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatattatgttatgtgcattatttgaagtataattgaatatttaagatgttg-ttg 24153221  T
Q  674 acttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgc-tgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaaga 772  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| | | ||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24153222 acttgcatttgatattattatgtcatgctgtttt-gtatactacctatgttgctatcgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaaga 24153320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 671 - 774
Target Start/End: Complemental strand, 12399320 - 12399216
Alignment:
Q  671 ttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgc-tgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatta 769  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |    
T  12399320 ttgaattgcatttgatattattatgtcatgctgattttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttga 12399221  T
Q  770 agatg 774  Q
    |||||    
T  12399220 agatg 12399216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 615 - 774
Target Start/End: Original strand, 20698391 - 20698549
Alignment:
Q  615 tgtgatataattgtatatgcattaattgaattatttgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatac 714  Q
    ||||||||||| || ||||||||| |||||  || | ||||||  | ||| |||||| || ||||| |||||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  20698391 tgtgatataat-gtttatgcattacttgaagaatatttgaatatataagatgttgat-gaattgcaattgatattattacgtcatgctgtttttgtatac 20698488  T
Q  715 tgc-tgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 774  Q
    ||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  20698489 tgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatg 20698549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 671 - 774
Target Start/End: Original strand, 23083371 - 23083475
Alignment:
Q  671 ttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgc-tgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatta 769  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||| | ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  23083371 ttgacttgcaattgatattattatgtcattctgtttttgtatactgcctatgttgctattgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatga 23083470  T
Q  770 agatg 774  Q
    |||||    
T  23083471 agatg 23083475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 68; E-Value: 6e-30
Query Start/End: Original strand, 680 - 774
Target Start/End: Complemental strand, 17737337 - 17737240
Alignment:
Q  680 atttgatattattatgtcatgttgtttttgta---tactgctgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 774  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| |||||   || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17737337 atttgatattattatgtcatgctgttgttgtagtatattgctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 17737240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 63; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 575 - 767
Target Start/End: Original strand, 14576748 - 14576939
Alignment:
Q  575 atctgtgaagctgatttatgatgatttgatgttg-ttatattgtgatataattgtatatgcattaattgaattatttgtgaataattgagacgttgattg 673  Q
    |||||||||| || |||| ||||  ||||||||| ||||  |||||||||||  ||||||||||| ||||| |||   |||||| || ||| |||| |||    
T  14576748 atctgtgaagttg-tttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatatgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttg-ttg 14576845  T
Q  674 acttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactg-ctgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 767  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| |||| || ||||||| || ||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  14576846 acttgcaattgatattattatgtcatgctgttgtt-tatactgtctatgttgctgttgttatttaactaagttgaatgagtcggtctaagttgat 14576939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 63; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 566 - 707
Target Start/End: Original strand, 22147431 - 22147571
Alignment:
Q  566 ttaacgatgatctgtgaagctgatttatgatgatttgatgttgtt-atattgtgatataattgtatatgcattaattgaattatttgtgaataattgaga 664  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| || ||||||    
T  22147431 ttaatgatgatctgtgaagctgatttatgatgattt-atgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgattatttgaga 22147529  T
Q  665 cgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttt 707  Q
     |||| || |||| | |  ||||||||||| ||||| ||||||    
T  22147530 tgttg-tttacttacgtgcgatattattatatcatgatgtttt 22147571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 61; E-Value: 9e-26
Query Start/End: Original strand, 575 - 774
Target Start/End: Original strand, 11424678 - 11424873
Alignment:
Q  575 atctgtgaagctgatttatgatgatttgatgttgtt-atattgtgatataattgtatatgcattaattgaattatttgtgaataattgagacgttgattg 673  Q
    ||||||||||||| |||| ||||  |||| |||||| ||  |||||||||||  |||| |||||| |||||||||   || |||||||||| |||||||     
T  11424678 atctgtgaagctg-tttaagatgtgttgaagttgtttatgatgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgcataattgagatgttgatt- 11424775  T
Q  674 acttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgc-tgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaaga 772  Q
       |||  |||||||| |||||||||| |||||| ||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  11424776 ---tgctattgatattgttatgtcatgctgtttt-gtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaaga 11424871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 61; E-Value: 9e-26
Query Start/End: Original strand, 566 - 762
Target Start/End: Original strand, 52523633 - 52523831
Alignment:
Q  566 ttaacgatgatctgtgaagctgatttatgatgatttgatgttgtt-atattgtgatataattgtatatgcattaattgaattatttgtgaataattgaga 664  Q
    |||| ||||||||| ||||||| | || ||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||  ||||||    
T  52523633 ttaatgatgatctgagaagctgttataagatgatt-gatgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatatgaatgtttgaga 52523731  T
Q  665 cgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgttgt-ttttgtatactg-ctgtgtcgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 761  Q
     |||| |||| ||||||| |||||| |||| |||||   | ||||| |||||| || ||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52523732 tgttg-ttgatttgcattcgatattgttatatcatgaactgttttgcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 52523830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 682 - 767
Target Start/End: Complemental strand, 14572688 - 14572603
Alignment:
Q  682 ttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactg-ctgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 767  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| |||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14572688 ttgatattattatgtcatgctgtttt-gtatactgtctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 14572603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 566 - 700
Target Start/End: Original strand, 2051105 - 2051238
Alignment:
Q  566 ttaacgatgatctgtgaagctgatttatgatgatttgatgttgtt-atattgtgatataattgtatatgcattaattgaattatttgtgaataattgaga 664  Q
    |||| |||||| |||||||||| | || ||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||  ||||||    
T  2051105 ttaatgatgatttgtgaagctgctataagatgatt-gatgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatatgaatgtttgaga 2051203  T
Q  665 cgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatg 700  Q
     |||| |||| |||||||||||||| |||| |||||    
T  2051204 tgttg-ttgatttgcatttgatattgttatatcatg 2051238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 725 - 774
Target Start/End: Original strand, 45577947 - 45577996
Alignment:
Q  725 ctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 774  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45577947 ctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 45577996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 728 - 774
Target Start/End: Complemental strand, 28194743 - 28194697
Alignment:
Q  728 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 774  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28194743 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 28194697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 46; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 619 - 766
Target Start/End: Complemental strand, 15471085 - 15470939
Alignment:
Q  619 atataattgtatatgcattaattgaattatttgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgc- 717  Q
    |||||||||||||| |||||  |||||||| | ||| |  |||||| |||||| |||||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | |||||||     
T  15471085 atataattgtatatacattacatgaattatgtttga-tgtttgagatgttgat-gacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcc 15470989  T
Q  718 tgtgtcgctgt-tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 766  Q
    | ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15470988 tatgttgctgtctgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 15470939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 595 - 767
Target Start/End: Complemental strand, 16097514 - 16097342
Alignment:
Q  595 atgatttgatgttgtt-atattgtgatataattgtatatgcattaattgaattatttgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattatta 693  Q
    |||| ||||||||||| ||| ||| |||||||||||||| |||||  |||||||| | ||| || |||||| |||||| |||||||||| |||||| |||    
T  16097514 atgaattgatgttgtttataatgttatataattgtatatacattacatgaattatgtttga-tatttgagatgttgat-gacttgcattcgatattgtta 16097417  T
Q  694 tgtcatgttgtttttgtatactgc-tgtgtcgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 767  Q
    | | ||| || ||| | ||| ||| | ||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16097416 tatgatgatgattt-gcatattgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 16097342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 595 - 767
Target Start/End: Complemental strand, 16103965 - 16103794
Alignment:
Q  595 atgatttgatgttgtt-atattgtgatataattgtatatgcattaattgaattatttgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattatta 693  Q
    |||| ||||||||||| ||| ||| |||||||| ||||| |||||| |||||||| | ||| || |||||| |||| |||| ||||||| |||||| |||    
T  16103965 atgaattgatgttgtttataatgttatataattttatatacattaaatgaattatgtttga-tatttgagatgttg-ttga-ttgcattcgatattgtta 16103869  T
Q  694 tgtcatgttgtttttgtatactgc-tgtgtcgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 767  Q
    | ||||| || ||| | ||||||| | ||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16103868 tatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgttcgttgtttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 16103794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 672 - 774
Target Start/End: Complemental strand, 14234597 - 14234494
Alignment:
Q  672 tgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgc-tgtgtcgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatta 769  Q
    ||||||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||| | ||| |||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  14234597 tgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgcttgttatttaactaagctgcatgaatcagtctaagttgatta 14234499  T
Q  770 agatg 774  Q
    |||||    
T  14234498 agatg 14234494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 595 - 762
Target Start/End: Original strand, 37251102 - 37251270
Alignment:
Q  595 atgatttgatgttgtta-tattgtgatataattgtatatgcattaattgaattatttgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattatta 693  Q
    ||||||||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||  |||||||||| |||    |||||| |||| |||| |||||||||||||| |||    
T  37251102 atgatttgatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatttatga--tgttgagatgttg-ttgatttgcatttgatattgtta 37251198  T
Q  694 tgtcatgttgt-ttttgtatactg-ctgtgtcgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 762  Q
    | |||||   | |||| ||||||| || ||| |||| |||||  ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  37251199 tatcatgaactgttttatatactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgactcggtctaag 37251270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 671 - 774
Target Start/End: Complemental strand, 46822376 - 46822272
Alignment:
Q  671 ttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgc-tgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatta 769  Q
    |||| ||||| |||||||| ||||||| |||||||  ||||  |||| | ||  ||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  46822376 ttgaattgcaattgatatttttatgtcttgttgttgatgtaatctgcctatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagtcagtctaagttgatta 46822277  T
Q  770 agatg 774  Q
    |||||    
T  46822276 agatg 46822272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 728 - 767
Target Start/End: Original strand, 12174327 - 12174366
Alignment:
Q  728 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 767  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12174327 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 12174366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #70
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 728 - 767
Target Start/End: Complemental strand, 32307730 - 32307691
Alignment:
Q  728 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 767  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32307730 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 32307691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #71
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 728 - 774
Target Start/End: Original strand, 13210395 - 13210441
Alignment:
Q  728 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 774  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  13210395 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatg 13210441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #72
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 671 - 774
Target Start/End: Complemental strand, 12511168 - 12511064
Alignment:
Q  671 ttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgc-tgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatta 769  Q
    |||| ||||| |||||||| ||||||| |||||||  ||||  |||| | ||  ||| |||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||    
T  12511168 ttgaattgcaattgatatttttatgtcttgttgttgatgtaatctgcctatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagtcattctaagttgatta 12511069  T
Q  770 agatg 774  Q
    |||||    
T  12511068 agatg 12511064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #73
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 728 - 767
Target Start/End: Original strand, 49668144 - 49668183
Alignment:
Q  728 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 767  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  49668144 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgat 49668183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #74
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 596 - 647
Target Start/End: Complemental strand, 15207122 - 15207070
Alignment:
Q  596 tgatttgatgttgttat-attgtgatataattgtatatgcattaattgaatta 647  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  15207122 tgatttgatgttgttattaatgtgatataattgtatatgcattatgtgaatta 15207070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #75
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 596 - 647
Target Start/End: Complemental strand, 15246204 - 15246152
Alignment:
Q  596 tgatttgatgttgttat-attgtgatataattgtatatgcattaattgaatta 647  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  15246204 tgatttgatgttgttattaatgtgatataattgtatatgcattatgtgaatta 15246152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #76
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 596 - 647
Target Start/End: Complemental strand, 15265325 - 15265273
Alignment:
Q  596 tgatttgatgttgttat-attgtgatataattgtatatgcattaattgaatta 647  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  15265325 tgatttgatgttgttattaatgtgatataattgtatatgcattatgtgaatta 15265273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #77
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 728 - 767
Target Start/End: Complemental strand, 9512973 - 9512934
Alignment:
Q  728 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 767  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  9512973 ttgttgtttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgat 9512934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #78
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 728 - 767
Target Start/End: Complemental strand, 9520948 - 9520909
Alignment:
Q  728 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 767  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  9520948 ttgttgtttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgat 9520909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #79
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 595 - 648
Target Start/End: Original strand, 23318650 - 23318704
Alignment:
Q  595 atgatttgatgttgtta-tattgtgatataattgtatatgcattaattgaattat 648  Q
    ||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  23318650 atgatttaatgttgttagtaatgtgatataattgtatatgcattatgtgaattat 23318704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #80
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 595 - 648
Target Start/End: Complemental strand, 28194878 - 28194824
Alignment:
Q  595 atgatttgatgttgtta-tattgtgatataattgtatatgcattaattgaattat 648  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||  ||||||||    
T  28194878 atgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattat 28194824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0142 (Bit Score: 173; Significance: 1e-92; HSPs: 1)
Name: scaffold0142
Description:

Target: scaffold0142; HSP #1
Raw Score: 173; E-Value: 1e-92
Query Start/End: Original strand, 566 - 774
Target Start/End: Complemental strand, 16995 - 16788
Alignment:
Q  566 ttaacgatgatctgtgaagctgatttatgatgatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattaattgaattatttgtgaataattgagac 665  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||    
T  16995 ttaatgatgatctgtgaagctgatttatgatgatttgatgatgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtaaataattgagac 16896  T
Q  666 gttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgctgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 765  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16895 gttg-ttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactactgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 16797  T
Q  766 attaagatg 774  Q
    |||||||||    
T  16796 attaagatg 16788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 173; Significance: 1e-92; HSPs: 74)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 173; E-Value: 1e-92
Query Start/End: Original strand, 566 - 774
Target Start/End: Original strand, 38898327 - 38898535
Alignment:
Q  566 ttaacgatgatctgtgaagctgatttatgatgatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattaattgaattatttgtgaataattgagac 665  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  38898327 ttaatgatgatctgcgaagctgatttatgatgatttgacgttgttatactgtgatataattgtatatgcattaattgaattatttgtgaataattgagat 38898426  T
Q  666 gttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgctgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 765  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  38898427 gttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttatatactgctgtgtcgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtttaagttg 38898526  T
Q  766 attaagatg 774  Q
    |||||||||    
T  38898527 attaagatg 38898535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 169; E-Value: 3e-90
Query Start/End: Original strand, 566 - 774
Target Start/End: Complemental strand, 44116720 - 44116513
Alignment:
Q  566 ttaacgatgatctgtgaagctgatttatgatgatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattaattgaattatttgtgaataattgagac 665  Q
    |||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||    
T  44116720 ttaatgatgatatgtgaaactgatttatgatgatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattgcttgaattatatgtgaataattgagac 44116621  T
Q  666 gttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgctgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 765  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  44116620 gttg-ttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaaccaagctgcatgagtcggtctaagttg 44116522  T
Q  766 attaagatg 774  Q
    |||||||||    
T  44116521 attaagatg 44116513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 153; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 598 - 774
Target Start/End: Complemental strand, 24702417 - 24702242
Alignment:
Q  598 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattaattgaattatttgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtc 697  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  24702417 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtc 24702319  T
Q  698 atgttgtttttgtatactgctgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 774  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24702318 atgttgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 24702242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 149; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 598 - 774
Target Start/End: Complemental strand, 456500 - 456325
Alignment:
Q  598 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattaattgaattatttgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtc 697  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  456500 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtc 456402  T
Q  698 atgttgtttttgtatactgctgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 774  Q
    ||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  456401 atgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 456325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 149; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 598 - 774
Target Start/End: Original strand, 11393270 - 11393445
Alignment:
Q  598 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattaattgaattatttgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtc 697  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  11393270 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtc 11393368  T
Q  698 atgttgtttttgtatactgctgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 774  Q
    ||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11393369 atgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 11393445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 149; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 598 - 774
Target Start/End: Complemental strand, 11972675 - 11972500
Alignment:
Q  598 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattaattgaattatttgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtc 697  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  11972675 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtc 11972577  T
Q  698 atgttgtttttgtatactgctgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 774  Q
    ||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11972576 atgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 11972500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 149; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 598 - 774
Target Start/End: Original strand, 15376696 - 15376871
Alignment:
Q  598 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattaattgaattatttgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtc 697  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  15376696 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtc 15376794  T
Q  698 atgttgtttttgtatactgctgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 774  Q
    ||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15376795 atgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 15376871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 149; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 598 - 774
Target Start/End: Complemental strand, 16232699 - 16232524
Alignment:
Q  598 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattaattgaattatttgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtc 697  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  16232699 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtc 16232601  T
Q  698 atgttgtttttgtatactgctgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 774  Q
    ||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16232600 atgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 16232524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 149; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 598 - 774
Target Start/End: Original strand, 20385106 - 20385281
Alignment:
Q  598 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattaattgaattatttgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtc 697  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  20385106 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtc 20385204  T
Q  698 atgttgtttttgtatactgctgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 774  Q
    ||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20385205 atgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 20385281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 149; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 598 - 774
Target Start/End: Original strand, 21189578 - 21189753
Alignment:
Q  598 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattaattgaattatttgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtc 697  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  21189578 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtc 21189676  T
Q  698 atgttgtttttgtatactgctgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 774  Q
    ||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21189677 atgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 21189753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 149; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 598 - 774
Target Start/End: Complemental strand, 32125670 - 32125495
Alignment:
Q  598 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattaattgaattatttgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtc 697  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  32125670 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtc 32125572  T
Q  698 atgttgtttttgtatactgctgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 774  Q
    ||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32125571 atgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 32125495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 149; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 598 - 774
Target Start/End: Complemental strand, 41523096 - 41522921
Alignment:
Q  598 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattaattgaattatttgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtc 697  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  41523096 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtc 41522998  T
Q  698 atgttgtttttgtatactgctgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 774  Q
    ||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41522997 atgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 41522921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 149; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 598 - 774
Target Start/End: Complemental strand, 41525558 - 41525383
Alignment:
Q  598 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattaattgaattatttgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtc 697  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  41525558 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtc 41525460  T
Q  698 atgttgtttttgtatactgctgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 774  Q
    ||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41525459 atgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 41525383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 148; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 572 - 774
Target Start/End: Original strand, 17061872 - 17062073
Alignment:
Q  572 atgatctgtgaagctgatttatgatgatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattaattgaattatttgtgaataattgagacgttgat 671  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||      
T  17061872 atgatctgtgaagctgatttatgatgatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgttaataattgagacgttg-c 17061970  T
Q  672 tgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgctgtgtcgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaa 770  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17061971 tgacttgcatttgatattattatgtcatgct-attttgtatactgctgagttgctgattgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaa 17062069  T
Q  771 gatg 774  Q
    ||||    
T  17062070 gatg 17062073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 145; E-Value: 7e-76
Query Start/End: Original strand, 598 - 774
Target Start/End: Original strand, 14949105 - 14949280
Alignment:
Q  598 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattaattgaattatttgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtc 697  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  14949105 atttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtc 14949203  T
Q  698 atgttgtttttgtatactgctgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 774  Q
    ||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14949204 atgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 14949280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 145; E-Value: 7e-76
Query Start/End: Original strand, 598 - 774
Target Start/End: Complemental strand, 18640451 - 18640276
Alignment:
Q  598 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattaattgaattatttgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtc 697  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  18640451 attttatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtc 18640353  T
Q  698 atgttgtttttgtatactgctgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 774  Q
    ||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18640352 atgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 18640276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 145; E-Value: 7e-76
Query Start/End: Original strand, 598 - 774
Target Start/End: Complemental strand, 27217039 - 27216864
Alignment:
Q  598 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattaattgaattatttgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtc 697  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  27217039 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtc 27216941  T
Q  698 atgttgtttttgtatactgctgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 774  Q
    ||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  27216940 atgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgattaagatg 27216864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 141; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 566 - 762
Target Start/End: Original strand, 12756622 - 12756817
Alignment:
Q  566 ttaacgatgatctgtgaagctgatttatgatgatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattaattgaattatttgtgaataattgagac 665  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||    
T  12756622 ttaatgatgatctgtgatgctgatttatgatgatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattttatgtgaataattgagac 12756721  T
Q  666 gttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgctgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 762  Q
    |||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||    
T  12756722 gttg-tttacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatattgttgtgttgctgttgttatttaactaaactgctcgagtcggtctaag 12756817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 141; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 598 - 774
Target Start/End: Complemental strand, 16213863 - 16213688
Alignment:
Q  598 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattaattgaattatttgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtc 697  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||    
T  16213863 atttgatgttgttatgttgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattaagacgttg-ttgacttggatttgatattattatgtc 16213765  T
Q  698 atgttgtttttgtatactgctgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 774  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16213764 atgttgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 16213688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 139; E-Value: 2e-72
Query Start/End: Original strand, 598 - 774
Target Start/End: Complemental strand, 24704864 - 24704692
Alignment:
Q  598 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattaattgaattatttgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtc 697  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  24704864 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtc 24704766  T
Q  698 atgttgtttttgtatactgctgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 774  Q
       |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24704765 ---ttgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 24704692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 138; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 598 - 774
Target Start/End: Complemental strand, 13869527 - 13869350
Alignment:
Q  598 atttgatgttgtt-atattgtgatataattgtatatgcattaattgaattatttgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgt 696  Q
    ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||  ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13869527 atttgatgttgtttatattgggatataattgtatatgcatcaattagattatctttgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgt 13869428  T
Q  697 catgttgtttttgtatactgctgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 774  Q
    |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13869427 catgctgtttttgtatactactgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 13869350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 137; E-Value: 4e-71
Query Start/End: Original strand, 598 - 774
Target Start/End: Complemental strand, 16410238 - 16410063
Alignment:
Q  598 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattaattgaattatttgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtc 697  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  16410238 atttgatgttgttatactatgatataattgtatatgtattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtc 16410140  T
Q  698 atgttgtttttgtatactgctgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 774  Q
    ||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16410139 atgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 16410063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 137; E-Value: 4e-71
Query Start/End: Original strand, 598 - 774
Target Start/End: Complemental strand, 18430891 - 18430716
Alignment:
Q  598 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattaattgaattatttgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtc 697  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  18430891 atttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagatgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtc 18430793  T
Q  698 atgttgtttttgtatactgctgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 774  Q
    ||| ||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18430792 atgatgtttttatatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 18430716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 132; E-Value: 4e-68
Query Start/End: Original strand, 599 - 774
Target Start/End: Complemental strand, 3386511 - 3386337
Alignment:
Q  599 tttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattaattgaattatttgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtca 698  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  3386511 tttgatgatgttatattgtgatataattgtatatgtattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattatcatgtca 3386413  T
Q  699 tgttgtttttgtatactgctgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 774  Q
    || ||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3386412 tgctgtttttgtatactattgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 3386337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 129; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 595 - 762
Target Start/End: Complemental strand, 13647511 - 13647344
Alignment:
Q  595 atgatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattaattgaattatttgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattat 694  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  13647511 atgatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattat 13647413  T
Q  695 gtcatgttgtttttgtatactg-ctgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 762  Q
    |||||| |||||||| |||||| || ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13647412 gtcatgctgtttttgcatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 13647344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 123; E-Value: 9e-63
Query Start/End: Original strand, 628 - 774
Target Start/End: Complemental strand, 24275320 - 24275175
Alignment:
Q  628 tatatgcattaattgaattatttgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgctgtgtcgctg 727  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  24275320 tatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctg 24275222  T
Q  728 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 774  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24275221 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 24275175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 120; E-Value: 5e-61
Query Start/End: Original strand, 600 - 774
Target Start/End: Complemental strand, 20110723 - 20110560
Alignment:
Q  600 ttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattaattgaattatttgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtcat 699  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20110723 ttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgtt-attgacttgcatttgatattattatgtcat 20110625  T
Q  700 gttgtttttgtatactgctgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 774  Q
    | ||||||||||||          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20110624 gctgtttttgtata----------gctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 20110560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 94; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 598 - 774
Target Start/End: Original strand, 26355966 - 26356152
Alignment:
Q  598 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattaattgaattatttgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtc 697  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||     
T  26355966 atttaatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtt 26356064  T
Q  698 atgttgtttttgtatac-----------tgctgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 774  Q
    ||| |||||||||||||           || ||||| | |||||||||||||||  |||||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  26356065 atgctgtttttgtatactgttgtgtttatgttgtgttgttgttgttatttaactttgctgcatgagtcagtctaaattgattaagatg 26356152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 94; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 598 - 774
Target Start/End: Original strand, 26358418 - 26358604
Alignment:
Q  598 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattaattgaattatttgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtc 697  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||     
T  26358418 atttaatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtt 26358516  T
Q  698 atgttgtttttgtatac-----------tgctgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 774  Q
    ||| |||||||||||||           || ||||| | |||||||||||||||  |||||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  26358517 atgctgtttttgtatactgttgtgtttatgttgtgttgttgttgttatttaactttgctgcatgagtcagtctaaattgattaagatg 26358604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 92; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 651 - 774
Target Start/End: Complemental strand, 13831499 - 13831377
Alignment:
Q  651 gtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgctgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatg 750  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  13831499 gtgaataattgagacgttg-ttgacttgcattttatattattatgtcatgttgtttttgtatactaccgtgttgttgttgttatttaactaagctgcatg 13831401  T
Q  751 agtcggtctaagttgattaagatg 774  Q
    ||||||||||| ||||||||||||    
T  13831400 agtcggtctaaattgattaagatg 13831377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 89; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 615 - 774
Target Start/End: Original strand, 3564319 - 3564478
Alignment:
Q  615 tgtgatataattgtatatgcattaattgaattatttgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatac 714  Q
    |||||| ||||  |||| |||||| |||||||||   || |||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3564319 tgtgatctaatgttatacgcattacttgaattatgaatgtataattgagatgttg-ttgacttacatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatac 3564417  T
Q  715 tgc-tgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 774  Q
    ||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  3564418 tgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatg 3564478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 86; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 658 - 774
Target Start/End: Complemental strand, 48273512 - 48273396
Alignment:
Q  658 attgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgc-tgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcgg 756  Q
    ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  48273512 attgagatgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcataagtcgg 48273414  T
Q  757 tctaagttgattaagatg 774  Q
    ||||||||||||||||||    
T  48273413 tctaagttgattaagatg 48273396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 83; E-Value: 7e-39
Query Start/End: Original strand, 595 - 685
Target Start/End: Original strand, 15081929 - 15082019
Alignment:
Q  595 atgatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattaattgaattatttgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttga 685  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  15081929 atgatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtgaataattgagacattgattgacttgcatttga 15082019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 82; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 575 - 774
Target Start/End: Original strand, 18456328 - 18456526
Alignment:
Q  575 atctgtgaagctgatttatgatgatttgatgttg-ttatattgtgatataattgtatatgcattaattgaattatttgtgaataattgagacgttgattg 673  Q
    ||||||||||||| |||| ||||  ||||||||| ||||  |||||||||||  ||| ||||||| ||||| |||   |||||| || ||| |||| |||    
T  18456328 atctgtgaagctg-tttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttg-ttg 18456425  T
Q  674 acttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgc-tgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaaga 772  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18456426 acttgcatttgatattattatgtcatgttgtttt-gtatactgcctatgttgctatcgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaaga 18456524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 79; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 571 - 766
Target Start/End: Original strand, 2280029 - 2280225
Alignment:
Q  571 gatgatctgtgaagctgatttatgatgatttgatgttgtt-atattgtgatataattgtatatgcattaattgaattatttgtgaataattgagacgttg 669  Q
    ||||||||||||||||| | || ||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||| |||| ||||||||| | |||||| |||||| ||||    
T  2280029 gatgatctgtgaagctgttataagatgatttgatgttgtttataatgtgatataattttatatgtattatttgaattatatatgaatatttgagatgttg 2280128  T
Q  670 attgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactg-ctgtgtcgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 766  Q
     |||| ||||||||||||||||||| ||||| || ||||| |||||| || ||| | || |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2280129 -ttgatttgcatttgatattattatatcatgctg-ttttgcatactgcctatgttgttgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 2280225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 75; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 575 - 774
Target Start/End: Complemental strand, 12699038 - 12698838
Alignment:
Q  575 atctgtgaagctgatttatgatgatttgatgttg-ttatattgtgatataattgtatatgcattaattgaattatttgtgaataattgagacgttgattg 673  Q
    ||||||||||||| |||| ||||  ||||||||| ||||  |||||||||||  ||| ||||||| |||||  || | |||||| || ||| |||||| |    
T  12699038 atctgtgaagctg-tttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgat-g 12698941  T
Q  674 acttgcatttgatattattatgtcatgttgt-ttttgtatactgc-tgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaag 771  Q
    | ||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  12698940 aattgcaattgatattattatgtcatgctgtgttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaag 12698841  T
Q  772 atg 774  Q
    |||    
T  12698840 atg 12698838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 70; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 575 - 774
Target Start/End: Complemental strand, 9509395 - 9509196
Alignment:
Q  575 atctgtgaagctgatttatgatgatttgatgttg-ttatattgtgatataattgtatatgcattaattgaattatttgtgaataattgagacgttgattg 673  Q
    ||||||||||||| |||| ||||  ||||||||| ||||  ||||||||| |  ||| ||||||| |||||  || | |||||| || ||| |||||| |    
T  9509395 atctgtgaagctg-tttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatatagtgttatgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgat-g 9509298  T
Q  674 acttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgc-tgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaaga 772  Q
    | ||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| | |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  9509297 aattgcaattgatattattatgtcatgctgttattgtatactgcctatgttactgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaaga 9509198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 566 - 763
Target Start/End: Original strand, 19486649 - 19486847
Alignment:
Q  566 ttaacgatgatctgtgaagctgatttatgatgatttgatgttg-ttatattgtgatataattgtatatgcattaattgaattatttgtgaataattgaga 664  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||| || ||||||    
T  19486649 ttaatgatgatctgtgaagctgatttatgatgatttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatgcataacttgaattatatgtgattatttgaga 19486748  T
Q  665 cgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactg-ctgtgtcgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 762  Q
     |||| || |||| | |  ||||||||||| ||||| || ||||| |||||| || ||| |||| |  |||  ||||||||||||||||||||||| |||    
T  19486749 tgttg-tttacttacgtgcgatattattatatcatgatg-ttttgcatactgcctatgttgctgatcattaactaactaagctgcatgagtcggtccaag 19486846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 615 - 774
Target Start/End: Complemental strand, 38227646 - 38227488
Alignment:
Q  615 tgtgatataattgtatatgcattaattgaattatttgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatac 714  Q
    |||||||||||  ||| | ||||||||||| |||   |||||| || ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  38227646 tgtgatataatgatatgtacattaattgaagtataattgaatatttaagatgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttt-gtatac 38227549  T
Q  715 tgc-tgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 774  Q
    ||| | ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  38227548 tgcctatgttgctattgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtagatgaagatg 38227488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 671 - 765
Target Start/End: Complemental strand, 10589150 - 10589055
Alignment:
Q  671 ttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgc-tgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 765  Q
    |||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  10589150 ttgaattgcaattgatatgattatgtcatgttgtttttgtatactgcatatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcgatctaagttg 10589055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 61; E-Value: 9e-26
Query Start/End: Original strand, 575 - 765
Target Start/End: Complemental strand, 26212202 - 26212012
Alignment:
Q  575 atctgtgaagctgatttatgatgatttgatgttg-ttatattgtgatataattgtatatgcattaattga--attatttgtgaataattgagacgttgat 671  Q
    ||||||||||||| |||| ||||  ||| ||||| ||||| |||||||||||  | ||||||||| ||||  ||||||||  |||| || ||| |||| |    
T  26212202 atctgtgaagctg-tttaagatgtgttgttgttgattataatgtgatataatgttttatgcattacttgagaattatttg--aatatttaagatgttg-t 26212107  T
Q  672 tgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgc-tgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 765  Q
    ||| ||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  26212106 tgaattgcaattgatattattatgtcatgctgattttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagttgtatgagtcggtctaagttg 26212012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 53; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 578 - 763
Target Start/End: Original strand, 10063740 - 10063921
Alignment:
Q  578 tgtgaagctgatttatgatgatttgatgttg-ttatattgtgatataattgtatatgcattaattgaattatttgtgaataattgagacgttgattgact 676  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||      ||||||||| |||||||| |||||| |||| || |||    
T  10063740 tgtgaagctgatttatgatgatttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatg-----tttgaattatatgtgaatatttgagatgttg-tttact 10063833  T
Q  677 tgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactg-ctgtgtcgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagt 763  Q
    ||  || ||||||||||| ||||| || || || |||| | || ||| |||| |||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  10063834 tgtgttcgatattattatatcatgatg-ttgtgcataccgcctatgttgctgattgttaattaactaagttgcatgagtcagtctaagt 10063921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 53; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 575 - 766
Target Start/End: Original strand, 15143952 - 15144143
Alignment:
Q  575 atctgtgaagctgatttatgatgatttgatgttg-ttatattgtgatataattgtatatgcattaattgaattatttgtgaataattgagacgttgattg 673  Q
    |||||| |||||| |||| |||| |||||  ||| ||||  |||||||| ||  |||| |||||| || ||||||   || ||| |||||| |||| |||    
T  15143952 atctgtcaagctgttttaagatgttttgacattgattatgatgtgatatgatgttatacgcattacttaaattatgaatgtatacttgagatgttg-ttg 15144050  T
Q  674 acttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgctgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 766  Q
     ||||||||||||||||| || || || |||| ||| ||||||   ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15144051 gcttgcatttgatattatgatatcttgctgttattgcatactgagatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 15144143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 728 - 774
Target Start/End: Complemental strand, 67798 - 67752
Alignment:
Q  728 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 774  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  67798 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 67752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 682 - 774
Target Start/End: Original strand, 16386268 - 16386362
Alignment:
Q  682 ttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgc-tgtgtcgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 774  Q
    |||||||  |||||||||| || ||||||||||||| | ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  16386268 ttgatatatttatgtcatgctgattttgtatactgcctatgtcgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatg 16386362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 728 - 774
Target Start/End: Complemental strand, 47831860 - 47831814
Alignment:
Q  728 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 774  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47831860 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 47831814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 566 - 648
Target Start/End: Original strand, 15008404 - 15008487
Alignment:
Q  566 ttaacgatgatctgtgaagctgatttatgatgatttgatgttgtt-atattgtgatataattgtatatgcattaattgaattat 648  Q
    |||| ||| ||||||||||||| | || ||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  15008404 ttaatgataatctgtgaagctgttataagatgatttgatgttgttaataatgtgatatatttgtatatgcattacttgaattat 15008487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 671 - 774
Target Start/End: Complemental strand, 22073025 - 22072920
Alignment:
Q  671 ttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactg-ctgtgtcgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatt 768  Q
    ||||||| ||||||||||| |||| ||||| || ||||| ||| || || ||| | || ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  22073025 ttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatagtgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgggtcagtctaagttgatt 22072926  T
Q  769 aagatg 774  Q
    ||||||    
T  22072925 aagatg 22072920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 566 - 766
Target Start/End: Original strand, 1867901 - 1868101
Alignment:
Q  566 ttaacgatgatctgtgaagctgatttatgatgatttgatgttgtta-tattgtgatataattgtatatgcattaattgaattatttgtgaataattgaga 664  Q
    |||| ||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||  |||||||| | || ||  ||||||    
T  1867901 ttaatgatgatctgtgaagctt-tttaagatgatttgatgttgttaataatgtgatatatttgtatatgcattacatgaattatatatg-atgtttgaga 1867998  T
Q  665 cgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgttgt-ttttgtatactg-ctgtgtcgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 761  Q
     |||| || | ||||| |||||||| |||| |||||   | |||| ||||||| || ||| | |||| |||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  1867999 tgttg-ttcatttgca-ttgatattgttatatcatgagctgttttatatactgcctatgttgttgttagtttattaactaagctgcatgagtcggtctaa 1868096  T
Q  762 gttga 766  Q
    |||||    
T  1868097 gttga 1868101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 728 - 767
Target Start/End: Original strand, 811199 - 811238
Alignment:
Q  728 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 767  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  811199 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 811238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 566 - 759
Target Start/End: Original strand, 12255697 - 12255892
Alignment:
Q  566 ttaacgatgatctgtgaagctgatttatgatgatttgatgttgtt-atattgtgatataattgtatatgcattaattgaattatttgtgaataattgaga 664  Q
    |||| |||||||| ||||| || | || ||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||| | |||||  ||||||    
T  12255697 ttaatgatgatctatgaagttgttataagatgatt-gatgttgtttataatgtgatataattgtatatgtattacttgaattatatatgaatgtttgaga 12255795  T
Q  665 cgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatg--ttgtttttgtatactg-ctgtgtcgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtct 759  Q
     |||| | || || ||||||||||| |||| |||||  |||  |||| |||||| || ||| | || ||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  12255796 tgttg-tagaatttcatttgatattgttatatcatgaattg-atttgcatactgactatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtctgtct 12255892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 728 - 767
Target Start/End: Complemental strand, 18005699 - 18005660
Alignment:
Q  728 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 767  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18005699 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 18005660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 728 - 767
Target Start/End: Complemental strand, 44014231 - 44014192
Alignment:
Q  728 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 767  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44014231 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 44014192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 585 - 694
Target Start/End: Complemental strand, 15113138 - 15113031
Alignment:
Q  585 ctgatttatgatgatttgatgttg-ttatattgtgatataattgtatatgcattaattgaattatttgtgaataattgagacgttgattgacttgcattt 683  Q
    ||||||||| |||| ||||||||  ||||| ||||||||||||||||||  |||| |||| |||| ||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||    
T  15113138 ctgatttat-atgagttgatgttaattataatgtgatataattgtatatatattacttgagttatatgtgaat-attgagatgttga-tgacttgcattt 15113042  T
Q  684 gatattattat 694  Q
    |||||| ||||    
T  15113041 gatattgttat 15113031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 619 - 766
Target Start/End: Complemental strand, 16056488 - 16056343
Alignment:
Q  619 atataattgtatatgcattaattgaattatttgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactg-c 717  Q
    |||||||||||||| |||||  |||||||| | ||| |  |||||| |||| |||| |||||||||||||| |||| |||||||||||  | ||| || |    
T  16056488 atataattgtatatacattacatgaattatgtttga-tgtttgagatgttg-ttgatttgcatttgatattgttatatcatgttgttt--gcataatgtc 16056393  T
Q  718 tgtgtcgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 766  Q
    | ||| |||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  16056392 tatgttgctgtttgttatttaactaaggtgcatcagtcggtctaagttga 16056343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 728 - 774
Target Start/End: Original strand, 28505366 - 28505412
Alignment:
Q  728 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 774  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  28505366 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgatgaagatg 28505412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 728 - 774
Target Start/End: Complemental strand, 34200839 - 34200793
Alignment:
Q  728 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 774  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  34200839 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatg 34200793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 598 - 762
Target Start/End: Complemental strand, 16495581 - 16495421
Alignment:
Q  598 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattaattgaattatttgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtc 697  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||  ||| |||  | ||| ||||||||  ||||||| ||    ||| ||||||||||| ||    
T  16495581 atttgatgttgttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtctga-taattgagttgttgatttac----attcgatattattatatc 16495487  T
Q  698 atgttgtttttgtatactgc-tgtgtcgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 762  Q
    ||| || ||| | ||||||| | ||| | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16495486 atgatggttt-gcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 16495421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #59
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 585 - 648
Target Start/End: Original strand, 20220115 - 20220178
Alignment:
Q  585 ctgatttatgatgatttgatgttgtta-tattgtgatataattgtatatgcattaattgaattat 648  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  20220115 ctgattta-gatgatttgatgttgttaataatgtgatataattgtatatgcattacatgaattat 20220178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #60
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 682 - 762
Target Start/End: Complemental strand, 40443490 - 40443410
Alignment:
Q  682 ttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgc-tgtgtcgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 762  Q
    ||||||||||||||||||| |||||  || |||||| | ||| |||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  40443490 ttgatattattatgtcatgctgttt--gtttactgcgtatgttgctgtttgttatttaactaagctgcacgagtcggtctaag 40443410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #61
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 598 - 632
Target Start/End: Complemental strand, 13841191 - 13841157
Alignment:
Q  598 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatat 632  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13841191 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatat 13841157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #62
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 728 - 774
Target Start/End: Original strand, 14932802 - 14932848
Alignment:
Q  728 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 774  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  14932802 ttgttatttaactaagtcgcatgagtcagtctaagttgattaagatg 14932848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #63
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 728 - 774
Target Start/End: Original strand, 15356237 - 15356283
Alignment:
Q  728 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 774  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  15356237 ttgttatttaactaagtcgcatgagtcagtctaagttgattaagatg 15356283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #64
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 728 - 774
Target Start/End: Original strand, 15360351 - 15360397
Alignment:
Q  728 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 774  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  15360351 ttgttatttaactaagtcgcatgagtcagtctaagttgattaagatg 15360397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #65
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 728 - 774
Target Start/End: Original strand, 15754955 - 15755001
Alignment:
Q  728 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 774  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||    
T  15754955 ttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgttgaagatg 15755001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #66
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 728 - 766
Target Start/End: Original strand, 16219785 - 16219823
Alignment:
Q  728 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 766  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  16219785 ttgttatttaactaagctacatgagtcggtctaagttga 16219823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #67
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 728 - 774
Target Start/End: Original strand, 18154909 - 18154955
Alignment:
Q  728 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 774  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  18154909 ttgttatttaaccaagctgcatgagtcggtctaagtcgatcaagatg 18154955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #68
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 609 - 694
Target Start/End: Complemental strand, 15116651 - 15116568
Alignment:
Q  609 ttatattgtgatataattgtatatgcattaattgaattatttgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattat 694  Q
    ||||| ||||||||||||||||||  |||| |||| |||| ||||||| ||||||| ||||| ||||||||| |||||||| ||||    
T  15116651 ttataatgtgatataattgtatatatattacttgagttatatgtgaat-attgagatgttga-tgacttgcaattgatattgttat 15116568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #69
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 735 - 766
Target Start/End: Complemental strand, 14044792 - 14044761
Alignment:
Q  735 ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 766  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14044792 ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 14044761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #70
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 735 - 766
Target Start/End: Complemental strand, 14354822 - 14354791
Alignment:
Q  735 ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 766  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14354822 ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 14354791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #71
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 728 - 774
Target Start/End: Original strand, 11996095 - 11996141
Alignment:
Q  728 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 774  Q
    |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  11996095 ttgttaattaactaagatgcatgagtcggtctaagttgttgaagatg 11996141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #72
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 595 - 648
Target Start/End: Complemental strand, 20619567 - 20619513
Alignment:
Q  595 atgatttgatgttgtta-tattgtgatataattgtatatgcattaattgaattat 648  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||  ||||||||    
T  20619567 atgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattat 20619513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #73
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 596 - 648
Target Start/End: Original strand, 9033281 - 9033334
Alignment:
Q  596 tgatttgatgttgtta-tattgtgatataattgtatatgcattaattgaattat 648  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||  ||||||||    
T  9033281 tgatttgatgttgttaataatgtgatatagttgtatatgcattatgtgaattat 9033334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #74
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 566 - 650
Target Start/End: Original strand, 9177571 - 9177656
Alignment:
Q  566 ttaacgatgatctgtgaagctgatttatgatgatttgatgttgtta-tattgtgatataattgtatatgcattaattgaattattt 650  Q
    |||| |||||| |||||||||| ||||  ||||||| |||||| || || ||| ||||| ||||||||||||||  ||||||||||    
T  9177571 ttaatgatgatatgtgaagctgttttaacatgatttaatgttgatagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattattt 9177656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 170; Significance: 8e-91; HSPs: 61)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 170; E-Value: 8e-91
Query Start/End: Original strand, 566 - 763
Target Start/End: Complemental strand, 15367905 - 15367708
Alignment:
Q  566 ttaacgatgatctgtgaagctgatttatgatgatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattaattgaattatttgtgaataattgagac 665  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  15367905 ttaatgatgatctgtgaagctgatttatgatgatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcgttagttgaattatatgtgaataattgagac 15367806  T
Q  666 gttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgctgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagt 763  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  15367805 gttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagt 15367708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 170; E-Value: 8e-91
Query Start/End: Original strand, 566 - 763
Target Start/End: Complemental strand, 15402918 - 15402721
Alignment:
Q  566 ttaacgatgatctgtgaagctgatttatgatgatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattaattgaattatttgtgaataattgagac 665  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  15402918 ttaatgatgatctgtgaagctgatttatgatgatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcgttagttgaattatatgtgaataattgagac 15402819  T
Q  666 gttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgctgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagt 763  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  15402818 gttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagt 15402721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 169; E-Value: 3e-90
Query Start/End: Original strand, 598 - 774
Target Start/End: Original strand, 15355307 - 15355483
Alignment:
Q  598 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattaattgaattatttgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtc 697  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15355307 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtc 15355406  T
Q  698 atgttgtttttgtatactgctgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 774  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15355407 atgctgtttttgtatactgctgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 15355483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 166; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 566 - 763
Target Start/End: Complemental strand, 15371417 - 15371220
Alignment:
Q  566 ttaacgatgatctgtgaagctgatttatgatgatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattaattgaattatttgtgaataattgagac 665  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  15371417 ttaatgatgatctgtgaagctgatttatgatgatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcgttagttgaattatatgtgaataattgagac 15371318  T
Q  666 gttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgctgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagt 763  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  15371317 attgattgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagt 15371220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 166; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 566 - 763
Target Start/End: Complemental strand, 15373698 - 15373501
Alignment:
Q  566 ttaacgatgatctgtgaagctgatttatgatgatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattaattgaattatttgtgaataattgagac 665  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  15373698 ttaatgatgatctgtgaagctgatttatgatgatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcgttagttgaattatatgtgaataattgagac 15373599  T
Q  666 gttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgctgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagt 763  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  15373598 attgattgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagt 15373501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 162; E-Value: 5e-86
Query Start/End: Original strand, 566 - 763
Target Start/End: Complemental strand, 15370232 - 15370036
Alignment:
Q  566 ttaacgatgatctgtgaagctgatttatgatgatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattaattgaattatttgtgaataattgagac 665  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||| ||||||||||||||||    
T  15370232 ttaatgatgatctgtgaagctgatttatgatgatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcgt-agttgaattatatgtgaataattgagac 15370134  T
Q  666 gttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgctgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagt 763  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  15370133 gttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagt 15370036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 161; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 566 - 774
Target Start/End: Complemental strand, 44102425 - 44102218
Alignment:
Q  566 ttaacgatgatctgtgaagctgatttatgatgatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattaattgaattatttgtgaataattgagac 665  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  44102425 ttaatgatgatctgtgaagctgatttatgatgatttgatgatgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagac 44102326  T
Q  666 gttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgctgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 765  Q
    |||| || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44102325 gttg-tttacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactactgtgttattgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 44102227  T
Q  766 attaagatg 774  Q
    |||||||||    
T  44102226 attaagatg 44102218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 158; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 566 - 763
Target Start/End: Complemental strand, 16223747 - 16223550
Alignment:
Q  566 ttaacgatgatctgtgaagctgatttatgatgatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattaattgaattatttgtgaataattgagac 665  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  16223747 ttaatgatgatctgtgaagctgatttatgatgatgtgatgttgttatattgtgatataattgtatatgggttagttgaattatatgtgaataattgagac 16223648  T
Q  666 gttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgctgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagt 763  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  16223647 gttgattgacttgcattagatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagt 16223550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 156; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 595 - 774
Target Start/End: Original strand, 18215254 - 18215432
Alignment:
Q  595 atgatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattaattgaattatttgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattat 694  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  18215254 atgatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattat 18215352  T
Q  695 gtcatgttgtttttgtatactgctgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 774  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18215353 gtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 18215432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 155; E-Value: 7e-82
Query Start/End: Original strand, 566 - 774
Target Start/End: Original strand, 44928829 - 44929038
Alignment:
Q  566 ttaacgatgatctgtgaagctgatttatgatgatttgatgttgtt-atattgtgatataattgtatatgcattaattgaattatttgtgaataattgaga 664  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  44928829 ttaatgatgatctgtgaagctgatttatgatgattttatgttgtttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgaga 44928928  T
Q  665 cgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgct-gtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagt 763  Q
     ||| |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44928929 tgtt-attgacttgcatttgacattattatgtcatgctgtttttgtatactgcttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagt 44929027  T
Q  764 tgattaagatg 774  Q
    |||||||||||    
T  44929028 tgattaagatg 44929038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 153; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 598 - 774
Target Start/End: Original strand, 44773070 - 44773245
Alignment:
Q  598 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattaattgaattatttgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtc 697  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  44773070 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatttgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtc 44773168  T
Q  698 atgttgtttttgtatactgctgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 774  Q
    ||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44773169 atgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 44773245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 149; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 598 - 774
Target Start/End: Original strand, 15118335 - 15118510
Alignment:
Q  598 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattaattgaattatttgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtc 697  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  15118335 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtc 15118433  T
Q  698 atgttgtttttgtatactgctgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 774  Q
    ||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15118434 atgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 15118510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 149; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 598 - 774
Target Start/End: Complemental strand, 52312689 - 52312514
Alignment:
Q  598 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattaattgaattatttgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtc 697  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  52312689 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtc 52312591  T
Q  698 atgttgtttttgtatactgctgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 774  Q
    ||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52312590 atgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 52312514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 145; E-Value: 7e-76
Query Start/End: Original strand, 602 - 774
Target Start/End: Original strand, 12294 - 12465
Alignment:
Q  602 gatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattaattgaattatttgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgt 701  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||     
T  12294 gatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtcatgc 12392  T
Q  702 tgtttttgtatactgctgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 774  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12393 tgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 12465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 145; E-Value: 7e-76
Query Start/End: Original strand, 598 - 774
Target Start/End: Original strand, 19618155 - 19618330
Alignment:
Q  598 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattaattgaattatttgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtc 697  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  19618155 atttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattataggtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtc 19618253  T
Q  698 atgttgtttttgtatactgctgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 774  Q
    ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19618254 atgatgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 19618330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 144; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 595 - 774
Target Start/End: Original strand, 51463848 - 51464026
Alignment:
Q  595 atgatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattaattgaattatttgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattat 694  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||    
T  51463848 atgatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattatttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgatttgcatttgatattattat 51463946  T
Q  695 gtcatgttgtttttgtatactgctgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 774  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51463947 gtcatgctgtttttgtatactactgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 51464026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 141; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 598 - 774
Target Start/End: Complemental strand, 3515186 - 3515011
Alignment:
Q  598 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattaattgaattatttgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtc 697  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  3515186 atttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtc 3515088  T
Q  698 atgttgtttttgtatactgctgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 774  Q
     || ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3515087 ttgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttttttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 3515011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 141; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 598 - 774
Target Start/End: Complemental strand, 44615467 - 44615292
Alignment:
Q  598 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattaattgaattatttgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtc 697  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  44615467 atttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtc 44615369  T
Q  698 atgttgtttttgtatactgctgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 774  Q
    ||| ||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44615368 atgctgtatttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 44615292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 138; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 609 - 774
Target Start/End: Complemental strand, 19242867 - 19242703
Alignment:
Q  609 ttatattgtgatataattgtatatgcattaattgaattatttgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgttgttttt 708  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  19242867 ttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttt 19242769  T
Q  709 gtatactgctgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 774  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19242768 gtatactgttgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 19242703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 137; E-Value: 4e-71
Query Start/End: Original strand, 598 - 774
Target Start/End: Original strand, 1837492 - 1837667
Alignment:
Q  598 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattaattgaattatttgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtc 697  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||    
T  1837492 atttgatgttgttataatgtgatataatcgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttggtattattatgtc 1837590  T
Q  698 atgttgtttttgtatactgctgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 774  Q
    ||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1837591 atgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 1837667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 137; E-Value: 4e-71
Query Start/End: Original strand, 598 - 774
Target Start/End: Original strand, 18239402 - 18239577
Alignment:
Q  598 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattaattgaattatttgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtc 697  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  18239402 atttgatgttgttatactgtgatgtaattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtc 18239500  T
Q  698 atgttgtttttgtatactgctgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 774  Q
    ||| ||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18239501 atgctgtttttgtatactgttgtgctgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 18239577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 137; E-Value: 4e-71
Query Start/End: Original strand, 566 - 762
Target Start/End: Original strand, 21815536 - 21815731
Alignment:
Q  566 ttaacgatgatctgtgaagctgatttatgatgatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattaattgaattatttgtgaataattgagac 665  Q
    |||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  21815536 ttaatgatgatatgtgaagctgatttatggtgatttgatgttgttatattatgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagac 21815635  T
Q  666 gttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgctgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 762  Q
    |||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  21815636 gttg-ttgacttgcattttatattattatgtcatgctgtttttgtatacagttgtgttgctgtcgttatttaactaagctgcacgagtcggtctaag 21815731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 137; E-Value: 4e-71
Query Start/End: Original strand, 598 - 774
Target Start/End: Original strand, 50222322 - 50222497
Alignment:
Q  598 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattaattgaattatttgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtc 697  Q
    ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  50222322 atttgatattgttatactgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtc 50222420  T
Q  698 atgttgtttttgtatactgctgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 774  Q
    ||| |||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50222421 atgctgtttttgtataatgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 50222497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 136; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 603 - 774
Target Start/End: Complemental strand, 20150004 - 20149833
Alignment:
Q  603 atgttgttatattgtgatataattgtatatgcattaattgaattatttgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgtt 702  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  20150004 atgttgttatattgtgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtgaataattgagacgatgattgacttgcatttgatattattatgtcatgct 20149905  T
Q  703 gtttttgtatactgctgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 774  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |  ||| |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  20149904 gtttttgtatactgatgtgtcgctgttgttattttatcaagttgcatgagtcagtctaagttgattaagatg 20149833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 136; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 595 - 774
Target Start/End: Original strand, 23803245 - 23803423
Alignment:
Q  595 atgatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattaattgaattatttgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattat 694  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||    
T  23803245 atgattttatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataatttagacgttg-ttgatttgcatttgatattattat 23803343  T
Q  695 gtcatgttgtttttgtatactgctgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 774  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23803344 gtcatgctgtttttgtatactactgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 23803423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 129; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 598 - 770
Target Start/End: Original strand, 14970690 - 14970861
Alignment:
Q  598 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattaattgaattatttgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtc 697  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  14970690 atttgatgttgttatattgtgatataattatatatgtattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtc 14970788  T
Q  698 atgttgtttttgtatactgctgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaa 770  Q
    ||| |||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  14970789 atgctgtttttgtatattgctgttttgctgttgttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgattaa 14970861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 122; E-Value: 3e-62
Query Start/End: Original strand, 595 - 774
Target Start/End: Complemental strand, 12611125 - 12610954
Alignment:
Q  595 atgatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattaattgaattatttgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattat 694  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||    
T  12611125 atgatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgatttgcatttgatattattat 12611027  T
Q  695 gtcatgttgtttttgtatactgctgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 774  Q
    |||||| |||||||||       ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12611026 gtcatgctgtttttgt-------tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 12610954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 118; E-Value: 8e-60
Query Start/End: Original strand, 598 - 774
Target Start/End: Original strand, 7641175 - 7641340
Alignment:
Q  598 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattaattgaattatttgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtc 697  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  7641175 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtaaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtc 7641273  T
Q  698 atgttgtttttgtatactgctgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 774  Q
    ||||||||||          ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7641274 atgttgtttt----------tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 7641340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 102; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 566 - 762
Target Start/End: Complemental strand, 22354048 - 22353852
Alignment:
Q  566 ttaacgatgatctgtgaagctgatttatgatgatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattaattgaattatttgtgaataattgagac 665  Q
    |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  22354048 ttaatgatgatctgtgaaactgatttatgatgatttattgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagac 22353949  T
Q  666 gttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactg-ctgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 762  Q
    |||| |||| ||| | |||||||| |||||||||||||||  |  |  ||| || ||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  22353948 gttg-ttgaattgtaattgatattgttatgtcatgttgttgctacaatctgcctatgctgctgttgttatttacctaagctgcatgagtcggtctaag 22353852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 96; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 671 - 774
Target Start/End: Complemental strand, 14280423 - 14280320
Alignment:
Q  671 ttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgctgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaa 770  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14280423 ttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgccgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaa 14280324  T
Q  771 gatg 774  Q
    ||||    
T  14280323 gatg 14280320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 90; E-Value: 4e-43
Query Start/End: Original strand, 575 - 774
Target Start/End: Complemental strand, 14038854 - 14038655
Alignment:
Q  575 atctgtgaagctgatttatgatgatttgatgttg-ttatattgtgatataattgtatatgcattaattgaattatttgtgaataattgagacgttgattg 673  Q
    ||||||||||||| ||||  |||  ||||||||| ||||  |||||||||||  ||| ||||||| ||||| |||   || |||||||||| |||| |||    
T  14038854 atctgtgaagctg-tttaacatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaaatatgaatgtataattgagatgttg-ttg 14038757  T
Q  674 acttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgc-tgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaaga 772  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  14038756 acttgcatttgatattattatgccatgttgtttttgtatactgcatgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaaga 14038657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 85; E-Value: 4e-40
Query Start/End: Original strand, 671 - 774
Target Start/End: Original strand, 54798764 - 54798868
Alignment:
Q  671 ttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgct-gtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatta 769  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54798764 ttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcttgtgttgctgttgttattcaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatta 54798863  T
Q  770 agatg 774  Q
    |||||    
T  54798864 agatg 54798868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 82; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 575 - 773
Target Start/End: Original strand, 16377438 - 16377634
Alignment:
Q  575 atctgtgaagctgatttatgatgatttgatgttg-ttatattgtgatataattgtatatgcattaattgaattatttgtgaataattgagacgttgattg 673  Q
    ||||||| ||||| |||| ||||  ||||||||| ||||  |||||||||||  |||| |||||| |||||||||   || |||||||||| |||| |||    
T  16377438 atctgtggagctg-tttaagatgcgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtataattgagatgttg-ttg 16377535  T
Q  674 acttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgc-tgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaaga 772  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  16377536 acttgcatttgatattattatgtcatgctgttt--gtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaaga 16377633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 81; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 600 - 774
Target Start/End: Complemental strand, 7798956 - 7798781
Alignment:
Q  600 ttgatgttg-ttatattgtgatataattgtatatgcattaattgaattatttgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtca 698  Q
    ||||||||| |||| |||||||| |||  ||| ||||||| ||||| |||   |||||| || ||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  7798956 ttgatgttgattatgttgtgatacaatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgat-gacttgcaattgatattattatgtca 7798858  T
Q  699 tgttgtttttgtatactgc-tgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 774  Q
    || |||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  7798857 tgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatg 7798781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 80; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 679 - 774
Target Start/End: Original strand, 8574887 - 8574981
Alignment:
Q  679 catttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgctgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 774  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  8574887 catttgatattattatgtcatgttgtttt-gtatactgttgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttaattaagatg 8574981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 615 - 774
Target Start/End: Complemental strand, 7089043 - 7088884
Alignment:
Q  615 tgtgatataattgtatatgcattaattgaattatttgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatac 714  Q
    |||||||||||  | ||||||||| |||||| || | ||||||  | ||| |||||| || ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  7089043 tgtgatataatgttttatgcattacttgaataatatttgaatatgtaagatgttgat-gaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatac 7088945  T
Q  715 tgc-tgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 774  Q
    ||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  7088944 tgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatg 7088884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 671 - 774
Target Start/End: Original strand, 52873377 - 52873481
Alignment:
Q  671 ttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgc-tgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatta 769  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  52873377 ttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatga 52873476  T
Q  770 agatg 774  Q
    |||||    
T  52873477 agatg 52873481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 75; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 595 - 762
Target Start/End: Original strand, 13785 - 13953
Alignment:
Q  595 atgatttgatgttgtt-atattgtgatataattgtatatgcattaattgaattatttgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattatta 693  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||| | |||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||| |||    
T  13785 atgatttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatacattacttgaattatatatgaatatttgagatgttga-tgacttgcatttgatattgtta 13883  T
Q  694 tgtcatgttgtttttgtatactg-ctgtgtcgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 762  Q
    | |||||||| ||||| |||||| || ||| |||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  13884 tatcatgttg-ttttgcatactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaag 13953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 74; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 575 - 774
Target Start/End: Complemental strand, 12902963 - 12902764
Alignment:
Q  575 atctgtgaagctgatttatgatgatttgatgttg-ttatattgtgatataattgtatatgcattaattgaattatttgtgaataattgagacgttgattg 673  Q
    ||||||||||||| |||| ||||  ||| ||||| ||||  |||||||||||  | ||||||||| |||||| || | |||||| || ||| |||||| |    
T  12902963 atctgtgaagctg-tttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgttttatgcattacttgaataatatttgaatatttaagatgttgat-g 12902866  T
Q  674 acttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgc-tgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaaga 772  Q
    | || || ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||    
T  12902865 aattacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaaga 12902766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 73; E-Value: 6e-33
Query Start/End: Original strand, 615 - 774
Target Start/End: Complemental strand, 22636601 - 22636442
Alignment:
Q  615 tgtgatataattgtatatgcattaattgaattatttgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatac 714  Q
    |||||||||||  ||||||||||| |||||  || | |||||| || ||| |||||| || ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||    
T  22636601 tgtgatataatgttatatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgat-gaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtaaac 22636503  T
Q  715 tg-ctgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 774  Q
    || || ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  22636502 tgtctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatg 22636442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 73; E-Value: 6e-33
Query Start/End: Original strand, 566 - 766
Target Start/End: Original strand, 52243099 - 52243302
Alignment:
Q  566 ttaacgatgatctgtgaagctgatttatgatgatttgatgttg-ttatattgtgatataattgtatatgcattaattgaattatttgtgaataattgaga 664  Q
    |||| ||||||||||||||||| | || ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||| | |||||  ||||||    
T  52243099 ttaatgatgatctgtgaagctgttataagatgatttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattacttggattatatatgaatgtttgaga 52243198  T
Q  665 cgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgttgt-ttttgtatactg-ctgtgtcgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 761  Q
     |||| |||| || ||||||||||| |||| |||||   |  |||| |||||| || ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52243199 tgttg-ttgaatttcatttgatattgttatatcatgaactgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 52243297  T
Q  762 gttga 766  Q
    |||||    
T  52243298 gttga 52243302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 671 - 774
Target Start/End: Complemental strand, 7893814 - 7893710
Alignment:
Q  671 ttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgc-tgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatta 769  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |    
T  7893814 ttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctattgttatttaactaagctgcatgaatcggtctaagttgatga 7893715  T
Q  770 agatg 774  Q
    |||||    
T  7893714 agatg 7893710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 66; E-Value: 9e-29
Query Start/End: Original strand, 575 - 774
Target Start/End: Original strand, 16270151 - 16270349
Alignment:
Q  575 atctgtgaagctgatttatgatgatttgatgttg-ttatattgtgatataattgtatatgcattaattgaattatttgtgaataattgagacgttgattg 673  Q
    ||||||||||||| |||| ||||  ||||||||| ||||  |||||||||||  ||| ||||||| ||||| |||   |||||| || ||| |||| ||     
T  16270151 atctgtgaagctg-tttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttg-tta 16270248  T
Q  674 acttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgc-tgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaaga 772  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| | ||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  16270249 acttgcatttgatattattatgtcatgctgtttt-gtatactgcctatgttgctattgttatttaattaagctgcatgagtcggtctaacttgatgaaga 16270347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 595 - 766
Target Start/End: Original strand, 43198487 - 43198661
Alignment:
Q  595 atgatttgatgttgtt-atattgtgatataattgtatatgcattaattgaattatttgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattatta 693  Q
    |||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||| | |||||| ||||||  |||| |||||||||||||||||  |||    
T  43198487 atgaattgatgttgtttataatgtgatataattgtatatacattacttgaattatatatgaatatttgagatattga-tgacttgcatttgatatggtta 43198585  T
Q  694 tgtcatg--ttgtttttgtatactg-ctgtgtcgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 766  Q
    | |||||  ||| ||||| ||| || || ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43198586 tatcatgaattg-ttttgcatattgtctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 43198661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 575 - 774
Target Start/End: Complemental strand, 44053035 - 44052836
Alignment:
Q  575 atctgtgaagctgatttatgatgatttgatgttg-ttatattgtgatataattgtatatgcattaattgaattatttgtgaataattgagacgttgattg 673  Q
    ||||||||||||| |||| ||||   |||||||| ||||  |||||||||||  |||  |||||| |||||  || | |||||| || ||| |||||| |    
T  44053035 atctgtgaagctg-tttaagatgtgctgatgttgattatgatgtgatataatgttatgagcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgat-g 44052938  T
Q  674 acttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgc-tgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaaga 772  Q
    | ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  44052937 aattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgatgttgttatttaactgagctgcatgagtcggcctaagttgatgaaga 44052838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 61; E-Value: 9e-26
Query Start/End: Original strand, 671 - 774
Target Start/End: Complemental strand, 6900001 - 6899898
Alignment:
Q  671 ttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgc-tgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatta 769  Q
    |||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||| | ||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |    
T  6900001 ttgacttgcatttgatattattatgctatgttgtttt-gtatactgcctatgttgctattgttatttaactaagatgcatgagtcggtctaagttgatga 6899903  T
Q  770 agatg 774  Q
    |||||    
T  6899902 agatg 6899898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 53; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 671 - 774
Target Start/End: Original strand, 16239980 - 16240083
Alignment:
Q  671 ttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactg-ctgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatta 769  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| || | | ||| ||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||| |    
T  16239980 ttgacttgcatttgatattattatgtcatgctg-ttttgtatactgcctattttgctattgttatttaattaagttgcatgagttggtctaagttgatga 16240078  T
Q  770 agatg 774  Q
    |||||    
T  16240079 agatg 16240083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 53; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 671 - 774
Target Start/End: Original strand, 23374369 - 23374473
Alignment:
Q  671 ttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgc-tgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatta 769  Q
    |||| ||||| |||||||  |||||||||| || ||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | |    
T  23374369 ttgaattgcaattgatatatttatgtcatgctgattttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcgttctaagttgttga 23374468  T
Q  770 agatg 774  Q
    |||||    
T  23374469 agatg 23374473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 696 - 774
Target Start/End: Complemental strand, 3096379 - 3096300
Alignment:
Q  696 tcatgttgtttttgtatactgc-tgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 774  Q
    ||||| |||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  3096379 tcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatg 3096300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 566 - 700
Target Start/End: Original strand, 15464836 - 15464970
Alignment:
Q  566 ttaacgatgatctgtgaagctgatttatgatgatttgatgttg-ttatattgtgatataattgtatatgcattaattgaattatttgtgaataattgaga 664  Q
    |||| |||||| |||||||||||| |||||||||||||||| | ||| | | ||||||||||||||||||| || ||||||||| | |||||  ||||||    
T  15464836 ttaatgatgatttgtgaagctgatatatgatgatttgatgtcgtttaaaatttgatataattgtatatgcaatacttgaattatatatgaatgtttgaga 15464935  T
Q  665 cgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatg 700  Q
     |||| |||| |||||||||||||| |||| |||||    
T  15464936 tgttg-ttgatttgcatttgatattgttatatcatg 15464970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 728 - 774
Target Start/End: Original strand, 39706356 - 39706402
Alignment:
Q  728 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 774  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39706356 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 39706402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 728 - 767
Target Start/End: Complemental strand, 12774060 - 12774021
Alignment:
Q  728 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 767  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12774060 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 12774021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 728 - 766
Target Start/End: Original strand, 12288278 - 12288316
Alignment:
Q  728 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 766  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12288278 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 12288316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 728 - 774
Target Start/End: Complemental strand, 15551870 - 15551824
Alignment:
Q  728 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 774  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  15551870 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatg 15551824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 728 - 762
Target Start/End: Complemental strand, 17046540 - 17046506
Alignment:
Q  728 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 762  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17046540 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 17046506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 728 - 767
Target Start/End: Complemental strand, 8846409 - 8846370
Alignment:
Q  728 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 767  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  8846409 ttgttatttaactaagctgaataagtcggtctaagttgat 8846370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 594 - 648
Target Start/End: Complemental strand, 16043199 - 16043144
Alignment:
Q  594 gatgatttgatgttgtta-tattgtgatataattgtatatgcattaattgaattat 648  Q
    |||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||  ||||||||    
T  16043199 gatgatttgatgttgttagtaatgtgatatagttgtatatgcattatgtgaattat 16043144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 595 - 762
Target Start/End: Original strand, 53082086 - 53082254
Alignment:
Q  595 atgatttgatgttgtta-tattgtgatataattgtatatgcattaattgaattatttgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattatta 693  Q
    ||||||||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||  |||||||| | || ||  |||||| ||| ||||| |||| ||||||||| |||    
T  53082086 atgatttgatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatg-atgtttgagatgtt-attgatttgc-tttgatattgtta 53082182  T
Q  694 tgtcatgttgt-ttttgtatactgc-tgtgtcgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 762  Q
    | |||||   | |||| | |||||| | ||| |||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  53082183 tatcatgaactgttttatgtactgcttatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaag 53082254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #59
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 682 - 762
Target Start/End: Complemental strand, 6190563 - 6190481
Alignment:
Q  682 ttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgc-tgtgtcgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 762  Q
    |||||||| |||||||||| | |||||| || |||| | ||| |||||| | | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  6190563 ttgatattgttatgtcatgctatttttgaatgctgcctatgttgctgtttgatgtttaactaagctgcatgagtcggtctaag 6190481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #60
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 595 - 648
Target Start/End: Complemental strand, 15791960 - 15791906
Alignment:
Q  595 atgatttgatgttgtta-tattgtgatataattgtatatgcattaattgaattat 648  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||  ||||||||    
T  15791960 atgatttgatgttgttaataatgtgatatagttgtatatgcattatgtgaattat 15791906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #61
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 482 - 523
Target Start/End: Complemental strand, 20150042 - 20150001
Alignment:
Q  482 actagtttatttagctattttaattcgcttaaataattatgt 523  Q
    |||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  20150042 actaatttaattagctattttaattggcttaaataattatgt 20150001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 169; Significance: 3e-90; HSPs: 66)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 169; E-Value: 3e-90
Query Start/End: Original strand, 566 - 774
Target Start/End: Complemental strand, 41598399 - 41598192
Alignment:
Q  566 ttaacgatgatctgtgaagctgatttatgatgatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattaattgaattatttgtgaataattgagac 665  Q
    |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  41598399 ttaatgatgatctgtgaaactgatttatgatgatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagac 41598300  T
Q  666 gttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgctgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 765  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  41598299 gttg-ttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactactgtgttgctgttgttattcaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 41598201  T
Q  766 attaagatg 774  Q
    |||||||||    
T  41598200 attaagatg 41598192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 153; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 598 - 774
Target Start/End: Original strand, 14409427 - 14409602
Alignment:
Q  598 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattaattgaattatttgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtc 697  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  14409427 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtc 14409525  T
Q  698 atgttgtttttgtatactgctgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 774  Q
    ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14409526 atgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 14409602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 149; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 598 - 774
Target Start/End: Complemental strand, 1484581 - 1484406
Alignment:
Q  598 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattaattgaattatttgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtc 697  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  1484581 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtc 1484483  T
Q  698 atgttgtttttgtatactgctgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 774  Q
    ||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1484482 atgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 1484406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 149; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 598 - 774
Target Start/End: Original strand, 5853275 - 5853450
Alignment:
Q  598 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattaattgaattatttgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtc 697  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  5853275 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtc 5853373  T
Q  698 atgttgtttttgtatactgctgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 774  Q
    ||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5853374 atgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 5853450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 149; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 598 - 774
Target Start/End: Original strand, 16413299 - 16413474
Alignment:
Q  598 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattaattgaattatttgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtc 697  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  16413299 atttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtc 16413397  T
Q  698 atgttgtttttgtatactgctgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 774  Q
    ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16413398 atgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 16413474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 149; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 598 - 774
Target Start/End: Original strand, 20046178 - 20046353
Alignment:
Q  598 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattaattgaattatttgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtc 697  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  20046178 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtaaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtc 20046276  T
Q  698 atgttgtttttgtatactgctgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 774  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20046277 atgttgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 20046353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 149; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 598 - 774
Target Start/End: Complemental strand, 20403406 - 20403231
Alignment:
Q  598 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattaattgaattatttgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtc 697  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  20403406 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtc 20403308  T
Q  698 atgttgtttttgtatactgctgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 774  Q
    ||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20403307 atgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 20403231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 145; E-Value: 7e-76
Query Start/End: Original strand, 598 - 774
Target Start/End: Original strand, 19936988 - 19937164
Alignment:
Q  598 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattaattgaattatttgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtc 697  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  19936988 atttgatgttgttatattgtgatataactgtatgtgcattgattgaattatttgtgagtaattgagacgttgattgacttgcatttgatcttattatgtc 19937087  T
Q  698 atgttgtttttgtatactgctgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 774  Q
    ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  19937088 atgctgtttttgtatactgttgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtccaagttgattaagatg 19937164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 145; E-Value: 7e-76
Query Start/End: Original strand, 598 - 774
Target Start/End: Complemental strand, 22001932 - 22001757
Alignment:
Q  598 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattaattgaattatttgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtc 697  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  22001932 atttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtc 22001834  T
Q  698 atgttgtttttgtatactgctgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 774  Q
    ||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22001833 atgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 22001757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 145; E-Value: 7e-76
Query Start/End: Original strand, 598 - 774
Target Start/End: Original strand, 45290677 - 45290853
Alignment:
Q  598 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattaattgaattatttgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtc 697  Q
    |||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  45290677 atttgacgttgttatactgtgatataattgtatctgcattaattgaattatatgtgaataattgagacgttgattggcttacatttgatattattatgtc 45290776  T
Q  698 atgttgtttttgtatactgctgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 774  Q
    ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45290777 atgctgtttttgtatactgttgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 45290853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 141; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 598 - 774
Target Start/End: Original strand, 15203214 - 15203389
Alignment:
Q  598 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattaattgaattatttgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtc 697  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  15203214 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttacatttgatattattatgtc 15203312  T
Q  698 atgttgtttttgtatactgctgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 774  Q
    ||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  15203313 atgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcgctctaagttgattaagatg 15203389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 137; E-Value: 4e-71
Query Start/End: Original strand, 598 - 774
Target Start/End: Complemental strand, 4483459 - 4483285
Alignment:
Q  598 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattaattgaattatttgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtc 697  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  4483459 atttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtc 4483361  T
Q  698 atgttgtttttgtatactgctgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 774  Q
    ||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4483360 atgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgtta-ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 4483285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 134; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 598 - 774
Target Start/End: Complemental strand, 19896447 - 19896269
Alignment:
Q  598 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattaattgaattatttgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattat--- 694  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||       
T  19896447 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattattat 19896349  T
Q  695 gtcatgttgtttttgtatactgctgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 774  Q
    |||||| ||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19896348 gtcatgctgtttttgtataccgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 19896269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 133; E-Value: 9e-69
Query Start/End: Original strand, 598 - 774
Target Start/End: Original strand, 4542356 - 4542531
Alignment:
Q  598 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattaattgaattatttgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtc 697  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  4542356 atttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacttgaactatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtc 4542454  T
Q  698 atgttgtttttgtatactgctgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 774  Q
    ||| |||||||||||  || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4542455 atgctgtttttgtatcttgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 4542531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 133; E-Value: 9e-69
Query Start/End: Original strand, 566 - 762
Target Start/End: Original strand, 19801333 - 19801527
Alignment:
Q  566 ttaacgatgatctgtgaagctgatttatgatgatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattaattgaattatttgtgaataattgagac 665  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  19801333 ttaatgatgatctgtgaagctgatttacgatgacttgatgttgttatattgtgttataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagac 19801432  T
Q  666 gttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgctgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 762  Q
    |||| ||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  19801433 gttg-ttgacttgcgtttgatattattatgtcatgctg-ttttgtatactgttgtgttgctattgttatttaactaagctgcatgagccggtctaag 19801527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 129; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 598 - 765
Target Start/End: Complemental strand, 15070739 - 15070571
Alignment:
Q  598 atttgatgttgtt-atattgtgatataattgtatatgcattaattgaattatttgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgt 696  Q
    ||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||| ||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15070739 atttgatgttgtttatattcagatataattgtatatgcatcaattagattatctgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgt 15070640  T
Q  697 catgttgtttttgtatactgctgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 765  Q
    |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15070639 catgctgtttttgtatactactgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 15070571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 121; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 598 - 774
Target Start/End: Complemental strand, 14823952 - 14823778
Alignment:
Q  598 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattaattgaattatttgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtc 697  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  14823952 atttaatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtc 14823854  T
Q  698 atgttgtttttgtatactgctgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 774  Q
    ||| ||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||  ||||||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  14823853 atgctgtttttgtatactgttgtgttgttgttgttatttaactttgctgcatgagt-ggtctaaattgattaagatg 14823778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 121; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 598 - 774
Target Start/End: Complemental strand, 26224098 - 26223923
Alignment:
Q  598 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattaattgaattatttgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtc 697  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  26224098 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattaattaaattatatgtgaataattgagatgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtc 26224000  T
Q  698 atgttgtttttgtatactgctgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 774  Q
    ||| | |||||||||| |||| | | ||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  26223999 atgctatttttgtatattgctttattgctgttgttatttaattaagctgcatgggtcgatctaagttgattaagatg 26223923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 114; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 595 - 774
Target Start/End: Original strand, 25484255 - 25484426
Alignment:
Q  595 atgatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattaattgaattatttgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattat 694  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||    
T  25484255 atgatttgatgttattatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgatttgcatttgatattattat 25484353  T
Q  695 gtcatgttgtttttgtatactgctgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 774  Q
    |||||| |||||||||||||       | ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  25484354 gtcatgctgtttttgtatac-------tagctgttgttatttaactaagctgcacgagttggtctaagttgattaagatg 25484426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 109; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 575 - 774
Target Start/End: Complemental strand, 6759462 - 6759265
Alignment:
Q  575 atctgtgaagctgatttatgatgatttgatgttg-ttatattgtgatataattgtatatgcattaattgaattatttgtgaataattgagacgttgattg 673  Q
    ||||||||||||| |||| ||||  ||||||||| ||||  |||||||||||  |||| ||||||||||||||||  ||| |||||||||| |||||       
T  6759462 atctgtgaagctgttttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattaattgaattatgagtgtataattgagatgttga--- 6759366  T
Q  674 acttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgc-tgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaaga 772  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  6759365 -cttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgcctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaaga 6759267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 89; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 615 - 774
Target Start/End: Original strand, 16092297 - 16092456
Alignment:
Q  615 tgtgatataattgtatatgcattaattgaattatttgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatac 714  Q
    |||||||||||  |||| |||||| || ||||||   || ||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  16092297 tgtgatataatgttatacgcattacttaaattatgaatgtatatttgagatgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatac 16092395  T
Q  715 tgc-tgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 774  Q
    ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  16092396 tgcctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatg 16092456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 86; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 575 - 774
Target Start/End: Complemental strand, 22875271 - 22875072
Alignment:
Q  575 atctgtgaagctgatttatgatgatttgatgttg-ttatattgtgatataattgtatatgcattaattgaattatttgtgaataattgagacgttgattg 673  Q
    ||||||||||||| |||| ||||  ||||||||| ||||  |||||||||||  |||| |||||| |||||||||   || ||| |||||| |||| |||    
T  22875271 atctgtgaagctgttttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttg-ttg 22875173  T
Q  674 acttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgc-tgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaaga 772  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||| || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  22875172 acttgcatttgatattattatgtcatgttgtttt-gtatactgcctgtgttgctgctgctatttaactaagctgcatgagtcggtctaaattgatgaaga 22875074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 82; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 575 - 774
Target Start/End: Original strand, 18818324 - 18818523
Alignment:
Q  575 atctgtgaagctgatttatgatgatttgatgttg-ttatattgtgatataattgtatatgcattaattgaattatttgtgaataattgagacgttgattg 673  Q
    ||||||||||||| |||| ||||  ||||||||| |||| ||||||||||||  ||| ||||||| ||||| |||   |||||| || ||| | || |||    
T  18818324 atctgtgaagctg-tttaagatgtgttgatgttgattatgttgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgatg-ttg 18818421  T
Q  674 acttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgc-tgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaaga 772  Q
    |||| || ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  18818422 acttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaaga 18818521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 81; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 566 - 763
Target Start/End: Original strand, 13507990 - 13508188
Alignment:
Q  566 ttaacgatgatctgtgaagctgatttatgatgatttgatgttgtt-atattgtgatataattgtatatgcattaattgaattatttgtgaataattgaga 664  Q
    |||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||    
T  13507990 ttaatgatgatctgtgaaactgaattatgatgatttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaatatttgaga 13508089  T
Q  665 cgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactg-ctgtgtcgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 762  Q
     |||| || |||||| || ||||||||||| ||||| || || || ||| || || ||| |||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||||    
T  13508090 tgttg-tttacttgcgttcgatattattatatcatgatg-ttgtgcatattgcctatgttgctgattgttaattaactaagctgcatgagtcagtctaag 13508187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 81; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 566 - 763
Target Start/End: Original strand, 13597522 - 13597720
Alignment:
Q  566 ttaacgatgatctgtgaagctgatttatgatgatttgatgttgtt-atattgtgatataattgtatatgcattaattgaattatttgtgaataattgaga 664  Q
    |||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||| ||    
T  13597522 ttaatgatgatctgtgaaactgaattatgatgatttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaatatttggga 13597621  T
Q  665 cgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgctg-tgtcgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 762  Q
     |||| || |||||| || ||||||||||| ||||| |||||| | || |||||  ||| |||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||||    
T  13597622 tgttgttt-acttgcgttcgatattattatatcatgatgtttt-gcattctgcttatgttgctgattgttaattaactaagctgcatgagtcagtctaag 13597719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 81; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 671 - 774
Target Start/End: Complemental strand, 23406490 - 23406386
Alignment:
Q  671 ttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgc-tgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatta 769  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  23406490 ttgacttgcaattgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatga 23406391  T
Q  770 agatg 774  Q
    |||||    
T  23406390 agatg 23406386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 80; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 671 - 774
Target Start/End: Complemental strand, 26219823 - 26219721
Alignment:
Q  671 ttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgctgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaa 770  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  26219823 ttgacttgcatttgatattattatgtcatactatttt-gtatactgctgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattat 26219725  T
Q  771 gatg 774  Q
    ||||    
T  26219724 gatg 26219721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 79; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 578 - 774
Target Start/End: Original strand, 28648962 - 28649158
Alignment:
Q  578 tgtgaagctgatttatgatgatttgatgttg-ttatattgtgatataattgtatatgcattaattgaattatttgtgaataattgagacgttgattgact 676  Q
    |||||||||| |||| ||||  ||||||||| ||||  |||||||||||  ||||  ||||| |||||||||   || |||||| ||| |||| ||||||    
T  28648962 tgtgaagctg-tttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatacacattacttgaattatgaatgtataattaagatgttg-ttgact 28649059  T
Q  677 tgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgc-tgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 774  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| | ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  28649060 tgcatttgatattattatgtcatgctgttttcgtatactgcctatgttgcttttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatg 28649158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 671 - 774
Target Start/End: Complemental strand, 7372889 - 7372785
Alignment:
Q  671 ttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgc-tgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatta 769  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  7372889 ttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatga 7372790  T
Q  770 agatg 774  Q
    |||||    
T  7372789 agatg 7372785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 566 - 763
Target Start/End: Original strand, 17612018 - 17612213
Alignment:
Q  566 ttaacgatgatctgtgaagctgatttatgatgatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattaattgaattatttgtgaataattgagac 665  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| || ||||||     
T  17612018 ttaatgatgatctgtgaagctgatttatgatgatttgatgt--ttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgattatttgagat 17612115  T
Q  666 gttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactg-ctgtgtcgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagt 763  Q
    |||| || |||| | |  ||||||||||| ||||| || ||||| |||||| || ||| | || |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  17612116 gttg-tttacttacgtgcgatattattatatcatgatg-ttttgcatactgcctatgttgttgattgttaattaactaagctgcatgagtcagtctaagt 17612213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 76; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 671 - 774
Target Start/End: Original strand, 26225303 - 26225405
Alignment:
Q  671 ttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgctgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaa 770  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||  |||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26225303 ttgacttgtatttgatattattatgtcatactgtttt-gtatattgttgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaa 26225401  T
Q  771 gatg 774  Q
    ||||    
T  26225402 gatg 26225405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 73; E-Value: 6e-33
Query Start/End: Original strand, 615 - 774
Target Start/End: Complemental strand, 20536374 - 20536215
Alignment:
Q  615 tgtgatataattgtatatgcattaattgaattatttgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatac 714  Q
    |||||||||||  ||| ||||||| |||||  || | |||||| || ||| |||||| || ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  20536374 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgat-gaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatac 20536276  T
Q  715 tgc-tgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 774  Q
    ||| | |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  20536275 tgcctatgtttctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatg 20536215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 73; E-Value: 6e-33
Query Start/End: Original strand, 671 - 774
Target Start/End: Original strand, 21923938 - 21924042
Alignment:
Q  671 ttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgc-tgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatta 769  Q
    |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  21923938 ttgacttgcaattgatattatcatgtcatgttgtttttgtagactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatga 21924037  T
Q  770 agatg 774  Q
    |||||    
T  21924038 agatg 21924042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 70; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 615 - 774
Target Start/End: Original strand, 21918955 - 21919114
Alignment:
Q  615 tgtgatataattgtatatgcattaattgaattatt-tgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtata 713  Q
    ||||||||||| || ||||||||| |||||  ||| | |||||| || ||| |||| |||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  21918955 tgtgatataat-gtttatgcattacttgaagaattatttgaatatttaagatgttg-ttgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtata 21919052  T
Q  714 ctgc-tgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 774  Q
    |||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  21919053 ctgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatg 21919114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 671 - 774
Target Start/End: Complemental strand, 22626846 - 22626743
Alignment:
Q  671 ttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgc-tgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatta 769  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  22626846 ttgatttgtatttgatattattatgtcatgttgtttt-gtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatga 22626748  T
Q  770 agatg 774  Q
    |||||    
T  22626747 agatg 22626743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 682 - 774
Target Start/End: Complemental strand, 31971356 - 31971264
Alignment:
Q  682 ttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgc-tgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 774  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  31971356 ttgatattattatgtcatgttgtttt-gtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatg 31971264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 598 - 664
Target Start/End: Original strand, 24486027 - 24486093
Alignment:
Q  598 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattaattgaattatttgtgaataattgaga 664  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  24486027 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgaga 24486093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 58; E-Value: 5e-24
Query Start/End: Original strand, 698 - 774
Target Start/End: Original strand, 18879268 - 18879345
Alignment:
Q  698 atgttgtttttgtatactgc-tgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 774  Q
    |||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  18879268 atgttgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatg 18879345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 595 - 762
Target Start/End: Complemental strand, 20498749 - 20498581
Alignment:
Q  595 atgatttgatgttgtt-atattgtgatataattgtatatgcattaattgaattatttgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattatta 693  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||| | |||||  |||||| ||||| |||||||||||||||||| |||    
T  20498749 atgatttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatacattacttgaattatatatgaatgtttgagatgttga-tgacttgcatttgatattgtta 20498651  T
Q  694 tgtcatgttgtttttgtatactg-ctgtgtcgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 762  Q
    | ||||| |  ||||  |||||| || ||| |||| |||||  ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  20498650 tatcatgct-attttacatactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagttgcatgagtcggtctaag 20498581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 51; E-Value: 8e-20
Query Start/End: Original strand, 619 - 774
Target Start/End: Original strand, 38855212 - 38855365
Alignment:
Q  619 atataattgtatatgcattaattgaattatttgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgc- 717  Q
    |||||||||||||| |||||  ||||||||  ||  ||| |||||| |||| |||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | |||||||     
T  38855212 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttg-ttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcc 38855307  T
Q  718 tgtgtcgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 774  Q
    | ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38855308 tatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 38855365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 672 - 774
Target Start/End: Complemental strand, 6520478 - 6520375
Alignment:
Q  672 tgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgc-tgtgtcgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatta 769  Q
    ||||||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||| | ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6520478 tgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatta 6520380  T
Q  770 agatg 774  Q
    |||||    
T  6520379 agatg 6520375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 683 - 774
Target Start/End: Complemental strand, 23648652 - 23648560
Alignment:
Q  683 tgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgc-tgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 774  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||  |||| | ||| ||| |||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  23648652 tgatattattatgtcatgttgttgttgtaatctgcctatgttgctattgttaattaactaagttgcatgagtcagtctaagttgattaagatg 23648560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 598 - 654
Target Start/End: Complemental strand, 32810110 - 32810054
Alignment:
Q  598 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattaattgaattatttgtga 654  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  32810110 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtga 32810054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 48; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 671 - 772
Target Start/End: Complemental strand, 21285708 - 21285606
Alignment:
Q  671 ttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgc-tgtgtcgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatt 768  Q
    |||| |||||||||||||| |||| |||||||||||| | ||||||| | ||| | |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  21285708 ttgatttgcatttgatattgttatatcatgttgtttt-gcatactgcctatgttgttgtttgttatttaacaaagctgcatgagtcggtctaagttgatt 21285610  T
Q  769 aaga 772  Q
    ||||    
T  21285609 aaga 21285606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 682 - 762
Target Start/End: Original strand, 45131019 - 45131098
Alignment:
Q  682 ttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgc-tgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 762  Q
    ||||||||||||||||||| |||||  || |||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45131019 ttgatattattatgtcatgctgttt--gtttactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 45131098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 682 - 762
Target Start/End: Original strand, 16199666 - 16199746
Alignment:
Q  682 ttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactg-ctgtgtcgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 762  Q
    |||||||||||||||||||||||||  | |||||| || ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16199666 ttgatattattatgtcatgttgttt--gaatactgtctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 16199746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 585 - 762
Target Start/End: Complemental strand, 37116544 - 37116366
Alignment:
Q  585 ctgatttatgatgatttgatgttgtta-tattgtgatataattgtatatgcattaattgaattatttgtgaataattgagacgttgattgacttgcattt 683  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||  |||||||| | || ||  |||||| |||| |||| ||||||||    
T  37116544 ctgattta-gatgatttgatgttgttaataatgtgatatatttgtatatgcattacatgaattatatatg-atgtttgagatgttg-ttgatttgcattt 37116448  T
Q  684 gatattattatgtcatgttgt-ttttgtatactg-ctgtgtcgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 762  Q
    |||||| |||| |||||   | |||| | ||||| || ||| |||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  37116447 gatattgttatatcatgaactgttttatgtactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaag 37116366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 728 - 766
Target Start/End: Original strand, 983474 - 983512
Alignment:
Q  728 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 766  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  983474 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 983512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 728 - 774
Target Start/End: Complemental strand, 17140969 - 17140923
Alignment:
Q  728 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 774  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  17140969 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatg 17140923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 728 - 774
Target Start/End: Original strand, 18678170 - 18678216
Alignment:
Q  728 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 774  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  18678170 ttgttatttaactaagttgcatgagtcagtctaagttgattaagatg 18678216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #51
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 728 - 774
Target Start/End: Complemental strand, 21491048 - 21491002
Alignment:
Q  728 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 774  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  21491048 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatg 21491002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #52
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 728 - 766
Target Start/End: Original strand, 23760912 - 23760950
Alignment:
Q  728 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 766  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23760912 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 23760950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #53
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 731 - 774
Target Start/End: Complemental strand, 21249434 - 21249391
Alignment:
Q  731 ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 774  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  21249434 ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatg 21249391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #54
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 731 - 774
Target Start/End: Complemental strand, 21255272 - 21255229
Alignment:
Q  731 ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 774  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  21255272 ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatg 21255229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #55
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 728 - 767
Target Start/End: Original strand, 26355766 - 26355805
Alignment:
Q  728 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 767  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26355766 ttgttgtttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 26355805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #56
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 728 - 762
Target Start/End: Original strand, 5866342 - 5866376
Alignment:
Q  728 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 762  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5866342 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 5866376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #57
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 728 - 762
Target Start/End: Original strand, 21389518 - 21389552
Alignment:
Q  728 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 762  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21389518 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 21389552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #58
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 728 - 762
Target Start/End: Original strand, 21396048 - 21396082
Alignment:
Q  728 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 762  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21396048 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 21396082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #59
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 728 - 762
Target Start/End: Original strand, 21778844 - 21778878
Alignment:
Q  728 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 762  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21778844 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 21778878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #60
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 728 - 762
Target Start/End: Original strand, 21790541 - 21790575
Alignment:
Q  728 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 762  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21790541 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 21790575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #61
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 728 - 774
Target Start/End: Complemental strand, 32121785 - 32121739
Alignment:
Q  728 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 774  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  32121785 ttgttatttaactaagttgcatgagtcattctaagttgattaagatg 32121739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #62
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 566 - 700
Target Start/End: Original strand, 17439411 - 17439544
Alignment:
Q  566 ttaacgatgatctgtgaagctgatttatgatgatttgatgttgtta-tattgtgatataattgtatatgcattaattgaattatttgtgaataattgaga 664  Q
    |||| |||||| |||||||||| | ||  ||||||| |||||| || || ||||||||| ||||||||||||||  |||||||| | || ||  ||||||    
T  17439411 ttaatgatgatatgtgaagctgttataatatgatttaatgttgataataatgtgatatatttgtatatgcattacatgaattatatatg-atgtttgaga 17439509  T
Q  665 cgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatg 700  Q
     |||| |||| |||||||||||||| |||| |||||    
T  17439510 tgttg-ttgatttgcatttgatattgttatatcatg 17439544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #63
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 728 - 767
Target Start/End: Complemental strand, 21673757 - 21673718
Alignment:
Q  728 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 767  Q
    |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  21673757 ttgttatttaactatgatgcatgagtcggtctaagttgat 21673718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #64
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 595 - 648
Target Start/End: Original strand, 17438151 - 17438205
Alignment:
Q  595 atgatttgatgttgtta-tattgtgatataattgtatatgcattaattgaattat 648  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||  ||||||||    
T  17438151 atgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattat 17438205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #65
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 62
Target Start/End: Complemental strand, 22966841 - 22966786
Alignment:
Q  1 aagtgtaggattggttttagagaatagaatttgaaaaaaggtttaacctttgtagttgttaa 62  Q
    |||||||||||||||||||||     |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  22966841 aagtgtaggattggttttaga-----gaatttgaaaaagggtttaacc-ttgtagttgttaa 22966786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #66
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 596 - 648
Target Start/End: Complemental strand, 37515890 - 37515837
Alignment:
Q  596 tgatttgatgttgtta-tattgtgatataattgtatatgcattaattgaattat 648  Q
    |||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  37515890 tgatttaatgttgttagtaatgtgatataattgtatatgcattatgtgaattat 37515837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 169; Significance: 3e-90; HSPs: 59)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 169; E-Value: 3e-90
Query Start/End: Original strand, 566 - 774
Target Start/End: Complemental strand, 31061280 - 31061072
Alignment:
Q  566 ttaacgatgatctgtgaagctgatttatgatgatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattaattgaattatttgtgaataattgagac 665  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||    
T  31061280 ttaacgatgatctgcgaagctgatttatggtgatttgatgttgttatattgtgatataattttatatgcattaattaaattatttgtgaataattgatac 31061181  T
Q  666 gttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgctgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 765  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  31061180 gttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactactgttttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttg 31061081  T
Q  766 attaagatg 774  Q
    |||||||||    
T  31061080 attaagatg 31061072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 163; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 566 - 774
Target Start/End: Original strand, 36154734 - 36154938
Alignment:
Q  566 ttaacgatgatctgtgaagctgatttatgatgatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattaattgaattatttgtgaataattgagac 665  Q
    |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  36154734 ttaatgatgatatgtgaagctgatttatgatgatttgatgatgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagac 36154833  T
Q  666 gttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgctgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 765  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36154834 gttg-ttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgt---tgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 36154929  T
Q  766 attaagatg 774  Q
    |||||||||    
T  36154930 attaagatg 36154938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 162; E-Value: 5e-86
Query Start/End: Original strand, 577 - 774
Target Start/End: Original strand, 18318995 - 18319192
Alignment:
Q  577 ctgtgaagctgatttatgatgatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattaattgaattatttgtgaataattgagacgttgattgact 676  Q
    ||||||||||| | ||  ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  18318995 ctgtgaagctgttataacatgattcaatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtgaataattgagacgttgattgact 18319094  T
Q  677 tgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgctgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 774  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  18319095 tgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtttaagttgattaagatg 18319192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 157; E-Value: 5e-83
Query Start/End: Original strand, 566 - 774
Target Start/End: Original strand, 11581151 - 11581357
Alignment:
Q  566 ttaacgatgatctgtgaagctgatttatgatgatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattaattgaattatttgtgaataattgagac 665  Q
    |||| ||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||  |||||||||||||||    
T  11581151 ttaatgataatctgtgaagttgatttatgatgatt-gatgttgttatattgtgatataattgtatatacattacttgaattatacgtgaataattgagac 11581249  T
Q  666 gttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgctgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 765  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11581250 gtt-attgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 11581348  T
Q  766 attaagatg 774  Q
    |||||||||    
T  11581349 attaagatg 11581357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 154; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 593 - 774
Target Start/End: Original strand, 10775654 - 10775834
Alignment:
Q  593 tgatgatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattaattgaattatttgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattatt 692  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10775654 tgatgatttgatgttgt-atattgtgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattatt 10775752  T
Q  693 atgtcatgttgtttttgtatactgctgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 774  Q
    |||||||| || |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10775753 atgtcatgctggttttatatactgctgtgtcgctgtcgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 10775834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 153; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 598 - 774
Target Start/End: Complemental strand, 29330113 - 29329938
Alignment:
Q  598 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattaattgaattatttgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtc 697  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  29330113 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtc 29330015  T
Q  698 atgttgtttttgtatactgctgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 774  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29330014 atgttgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 29329938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 149; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 598 - 774
Target Start/End: Original strand, 264751 - 264926
Alignment:
Q  598 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattaattgaattatttgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtc 697  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  264751 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtc 264849  T
Q  698 atgttgtttttgtatactgctgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 774  Q
    ||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  264850 atgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 264926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 148; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 603 - 774
Target Start/End: Complemental strand, 24067282 - 24067111
Alignment:
Q  603 atgttgttatattgtgatataattgtatatgcattaattgaattatttgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgtt 702  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24067282 atgttgttatattgtgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtgaataattgagacgatgattgacttgcatttgatattattatgtcatgtt 24067183  T
Q  703 gtttttgtatactgctgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 774  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  24067182 gtttttgtatactgttgtgtcgctgttgttatttaaccaagctgcattggtcggtctaagttgattaagatg 24067111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 145; E-Value: 7e-76
Query Start/End: Original strand, 598 - 774
Target Start/End: Complemental strand, 39363563 - 39363388
Alignment:
Q  598 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattaattgaattatttgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtc 697  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  39363563 atttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtc 39363465  T
Q  698 atgttgtttttgtatactgctgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 774  Q
    ||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39363464 atgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 39363388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 142; E-Value: 4e-74
Query Start/End: Original strand, 591 - 774
Target Start/End: Original strand, 20901984 - 20902168
Alignment:
Q  591 tatgatgatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattaattgaattatttgtgaa-taattgagacgttgattgacttgcatttgatatt 689  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  20901984 tatgatgatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattatttgaattatatgtgaaataattgagacgttg-ttgacttgcacttgatatt 20902082  T
Q  690 attatgtcatgttgtttttgtatactgctgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg-attaagatg 774  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  20902083 attatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgaattaagatg 20902168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 141; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 591 - 774
Target Start/End: Original strand, 2154589 - 2154772
Alignment:
Q  591 tatgatgatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattaattgaattatttgtgaa-taattgagacgttgattgacttgcatttgatatt 689  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  2154589 tatgatgatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattatttgaattatatgtgaaataattgagacgttg-ttgacttgcagttgatatt 2154687  T
Q  690 attatgtcatgttgtttttgtatactgctgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 774  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2154688 attatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctattgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 2154772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 141; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 598 - 774
Target Start/End: Original strand, 10732923 - 10733098
Alignment:
Q  598 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattaattgaattatttgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtc 697  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  10732923 atttgatgttgttatacggtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtc 10733021  T
Q  698 atgttgtttttgtatactgctgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 774  Q
    ||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10733022 atgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 10733098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 141; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 598 - 774
Target Start/End: Complemental strand, 20909191 - 20909016
Alignment:
Q  598 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattaattgaattatttgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtc 697  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  20909191 atttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtc 20909093  T
Q  698 atgttgtttttgtatactgctgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 774  Q
    ||| ||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20909092 atgctgtttttgtatactgttgtgttgcttttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 20909016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 141; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 598 - 774
Target Start/End: Complemental strand, 29346159 - 29345984
Alignment:
Q  598 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattaattgaattatttgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtc 697  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  29346159 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtc 29346061  T
Q  698 atgttgtttttgtatactgctgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 774  Q
    ||| ||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  29346060 atgctgtttttgtatactgttgtgatgctgttgttatttaactaagctgtatgagtcggtctaagttgattaagatg 29345984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 141; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 598 - 774
Target Start/End: Complemental strand, 39245315 - 39245140
Alignment:
Q  598 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattaattgaattatttgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtc 697  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  39245315 atttgatgttgttatattgtgatgtaattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgggacgtt-attgacttgcatttgatattattatgtc 39245217  T
Q  698 atgttgtttttgtatactgctgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 774  Q
    ||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39245216 atgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 39245140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 141; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 598 - 774
Target Start/End: Original strand, 42245348 - 42245523
Alignment:
Q  598 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattaattgaattatttgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtc 697  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  42245348 atttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtc 42245446  T
Q  698 atgttgtttttgtatactgctgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 774  Q
    ||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42245447 atgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 42245523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 137; E-Value: 4e-71
Query Start/End: Original strand, 598 - 774
Target Start/End: Complemental strand, 29348632 - 29348457
Alignment:
Q  598 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattaattgaattatttgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtc 697  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  29348632 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtc 29348534  T
Q  698 atgttgtttttgtatactgctgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 774  Q
    ||| ||||||||||||||| ||||  |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  29348533 atgctgtttttgtatactgttgtgatgctgttcttatttaactaagctgtatgagtcggtctaagttgattaagatg 29348457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 137; E-Value: 4e-71
Query Start/End: Original strand, 598 - 774
Target Start/End: Complemental strand, 29351105 - 29350930
Alignment:
Q  598 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattaattgaattatttgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtc 697  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  29351105 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtc 29351007  T
Q  698 atgttgtttttgtatactgctgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 774  Q
    ||| ||||||||||||||| ||||  |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  29351006 atgctgtttttgtatactgttgtgatgctgttcttatttaactaagctgtatgagtcggtctaagttgattaagatg 29350930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 134; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 598 - 774
Target Start/End: Complemental strand, 23064692 - 23064515
Alignment:
Q  598 atttgatgttgtt-atattgtgatataattgtatatgcattaattgaattatttgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgt 696  Q
    ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  23064692 atttgatgttgtttatattgggatataattgtatatgcatcaattagattatctgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattaggt 23064593  T
Q  697 catgttgtttttgtatactgctgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 774  Q
    |||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23064592 catgctgtttttgtatactactgtgtcgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 23064515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 134; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 598 - 774
Target Start/End: Complemental strand, 38619615 - 38619438
Alignment:
Q  598 atttgatgttgtt-atattgtgatataattgtatatgcattaattgaattatttgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgt 696  Q
    ||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||| ||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38619615 atttgatgttgtttatattggaatataattgtatatgcatcaattagattatctgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgt 38619516  T
Q  697 catgttgtttttgtatactgctgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 774  Q
    |||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38619515 catgctgtttttgtatactactgtgtcgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 38619438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 133; E-Value: 9e-69
Query Start/End: Original strand, 598 - 774
Target Start/End: Complemental strand, 32027572 - 32027397
Alignment:
Q  598 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattaattgaattatttgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtc 697  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||    
T  32027572 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttggatttgatattattatgtc 32027474  T
Q  698 atgttgtttttgtatactgctgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 774  Q
    ||| ||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||    
T  32027473 atgctgtttttgtatactgttgtgttgttgttgttatttaactaagttgtatgagtcggtctaagttgattaagatg 32027397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 112; E-Value: 3e-56
Query Start/End: Original strand, 598 - 774
Target Start/End: Original strand, 20917935 - 20918106
Alignment:
Q  598 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattaattgaattatttgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtc 697  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||    || |||||||| ||||    
T  20917935 atttgatgttgttatattgtgatataattatatatgctttacttgaattagatgtgaataattgagacgttg-ttgactt----tttatattattttgtc 20918029  T
Q  698 atgttgtttttgtatactgctgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 774  Q
    ||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20918030 atgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 20918106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 86; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 575 - 774
Target Start/End: Original strand, 23390411 - 23390610
Alignment:
Q  575 atctgtgaagctgatttatgatgatttgatgttg-ttatattgtgatataattgtatatgcattaattgaattatttgtgaataattgagacgttgattg 673  Q
    |||||||||||| ||||| ||||  ||||||||| ||||  |||||||||||  ||| ||||||| |||||  || | |||||| || ||| |||||| |    
T  23390411 atctgtgaagct-atttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgat-g 23390508  T
Q  674 acttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactg-ctgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaaga 772  Q
    | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  23390509 aattgcaattgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgtctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaaga 23390608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 82; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 674 - 774
Target Start/End: Original strand, 21997547 - 21997648
Alignment:
Q  674 acttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgc-tgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaaga 772  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  21997547 acttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaaga 21997646  T
Q  773 tg 774  Q
    ||    
T  21997647 tg 21997648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 82; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 575 - 774
Target Start/End: Complemental strand, 25421738 - 25421539
Alignment:
Q  575 atctgtgaagctgatttatgatgatttgatgttg-ttatattgtgatataattgtatatgcattaattgaattatttgtgaataattgagacgttgattg 673  Q
    ||||||||||||| |||| ||||  ||||||||| ||||  |||||||||||  ||| ||||||| ||||| |||   |||||| || ||| | || |||    
T  25421738 atctgtgaagctg-tttaagatgcgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgctg-ttg 25421641  T
Q  674 acttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgc-tgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaaga 772  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  25421640 acttgcaattgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgcctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaaga 25421541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 81; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 615 - 774
Target Start/End: Complemental strand, 1096633 - 1096474
Alignment:
Q  615 tgtgatataattgtatatgcattaattgaattatttgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatac 714  Q
    |||||||||||  ||||||||||| |||||||||   || |||  ||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  1096633 tgtgatataatgttatatgcattacttgaattatgaatgtatatgtgagatgttg-ttgatttgcatttgatattattatgttatgttgtttttgcatac 1096535  T
Q  715 tgc-tgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 774  Q
    | | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  1096534 tacctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatg 1096474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 79; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 566 - 774
Target Start/End: Complemental strand, 24529435 - 24529227
Alignment:
Q  566 ttaacgatgatctgtgaagctgatttatgatgatttgatgttgt-tatattgtgatataattgtatatgcattaattgaattatttgtgaataattgaga 664  Q
    ||||| || ||||||||||||| |||| ||||  |||||||||  |||  |||||||||||  |||| |||||| ||||  |||   || |||||| |||    
T  24529435 ttaactataatctgtgaagctg-tttaagatgtgttgatgttgaatatgatgtgatataatgttataagcattacttgagatatgaatgtataattaaga 24529337  T
Q  665 cgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgc-tgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagt 763  Q
     |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24529336 tgttg-ttgacttgcatttgatatcattatgtcatgttgtttttgtatactgcctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagt 24529238  T
Q  764 tgattaagatg 774  Q
    |||| ||||||    
T  24529237 tgatgaagatg 24529227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 78; E-Value: 6e-36
Query Start/End: Original strand, 575 - 774
Target Start/End: Complemental strand, 9078158 - 9077959
Alignment:
Q  575 atctgtgaagctgatttatgatgatttgatgttg-ttatattgtgatataattgtatatgcattaattgaattatttgtgaataattgagacgttgattg 673  Q
    ||||||||||||| |||| ||||  ||||||||| ||||  |||||||||||  |||| |||||| |||| ||||   || |||||||||| |||| |||    
T  9078158 atctgtgaagctg-tttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttgagttatgaatgtataattgagatgttg-ttg 9078061  T
Q  674 acttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgc-tgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaaga 772  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||    
T  9078060 acttgcacttgatattattatgtcatgctgttttcgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgggtcagtctaagttgatgaaga 9077961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 75; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 385 - 574
Target Start/End: Complemental strand, 24067542 - 24067353
Alignment:
Q  385 gtgctacttttgaagatccaaaataatcatgtaataagttattctctttgaaacatgtttgtaaggccacacatcttaatttaatt-gactgaggatgac 483  Q
    ||||||||||||||||   |||||| | | || |||| ||||| |||||  |||||||||||   ||||  |||||||||| |||  ||| ||| || ||    
T  24067542 gtgctacttttgaagaaataaaatagtaacgtgataatttattttcttttgaacatgtttgttgagccagccatcttaattgaataagac-gagaataac 24067444  T
Q  484 tagtttatttagctattttaattcgcttaaataattatgtgttattatgtgttaatggatgatgtgtaattgtctagtcattttaacgatg 574  Q
    || |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  24067443 taatttaattagctattttaattggcttaaataattatgtgttattatgtgttaatgggtgatgtgtaattgtcgagtcattttaacgatg 24067353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 73; E-Value: 6e-33
Query Start/End: Original strand, 575 - 761
Target Start/End: Complemental strand, 25431600 - 25431414
Alignment:
Q  575 atctgtgaagctgatttatgatgatttgatgttg-ttatattgtgatataattgtatatgcattaattgaattatttgtgaataattgagacgttgattg 673  Q
    ||||||||||||| |||| ||||  ||||||||| ||||  |||||||||||  ||| ||||||| ||||| |||   |||| | || ||| |||| |||    
T  25431600 atctgtgaagctg-tttaagatgcgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaacatttaagatgttg-ttg 25431503  T
Q  674 acttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactg-ctgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 761  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  25431502 acttgcaattgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagatgcatgagtcggtctaa 25431414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 566 - 669
Target Start/End: Complemental strand, 40726069 - 40725965
Alignment:
Q  566 ttaacgatgatctgtgaagctgatttatgatgatttgatgttg-ttatattgtgatataattgtatatgcattaattgaattatttgtgaataattgaga 664  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| || ||||||    
T  40726069 ttaatgatgatctgtgaagctgatttatgatgatttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgattatttgaga 40725970  T
Q  665 cgttg 669  Q
     ||||    
T  40725969 tgttg 40725965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 68; E-Value: 6e-30
Query Start/End: Original strand, 578 - 774
Target Start/End: Original strand, 8286760 - 8286957
Alignment:
Q  578 tgtgaagctgatttatgatgatttgatgttg-ttatattgtgatataattgtatatgcattaattgaattatttgtgaataattgagacgttgattgact 676  Q
    |||||||||| |||| ||||  ||||||||| ||||  |||||||||||  ||| ||||||| |||||  || | ||| || || ||| |||||| || |    
T  8286760 tgtgaagctg-tttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatgtttgattatttaagatgttgat-gaat 8286857  T
Q  677 tgcatttgatattattatgtcatgttgttttt-gtatactgc-tgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 774  Q
    |||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  8286858 tgcaattgatattattatgtcatgctgttttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatg 8286957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 65; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 671 - 774
Target Start/End: Original strand, 21729074 - 21729178
Alignment:
Q  671 ttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgc-tgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatta 769  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |    
T  21729074 ttgaattgcaattgatattattatgtcatgctgattttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttga 21729173  T
Q  770 agatg 774  Q
    |||||    
T  21729174 agatg 21729178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 65; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 671 - 774
Target Start/End: Original strand, 21808399 - 21808503
Alignment:
Q  671 ttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgc-tgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatta 769  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |    
T  21808399 ttgaattgcaattgatattattatgtcatgctgattttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttga 21808498  T
Q  770 agatg 774  Q
    |||||    
T  21808499 agatg 21808503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 566 - 762
Target Start/End: Complemental strand, 22144265 - 22144068
Alignment:
Q  566 ttaacgatgatctgtgaagctgatttatgatgatttgatgttgtt-atattgtgatataattgtatatgcattaattgaattatttgtgaataattgaga 664  Q
    |||| ||||| |||||||| || | || ||||| ||||||||||| | | |||||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||  ||||||    
T  22144265 ttaatgatgacctgtgaagttgttataagatgaattgatgttgtttacaatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatatgaatgtttgaga 22144166  T
Q  665 cgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatact-gctgtgtcgctgt-tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 762  Q
     |||| |||| ||||| |||||||| |||| |||||||| ||||| |||||  || ||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22144165 tgttg-ttgatttgcaattgatattgttatatcatgttg-ttttgcatactacctatgttgatgtctgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 22144068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 575 - 774
Target Start/End: Complemental strand, 24493774 - 24493576
Alignment:
Q  575 atctgtgaagctgatttatgatgatttgatgttg-ttatattgtgatataattgtatatgcattaattgaattatttgtgaataattgagacgttgattg 673  Q
    |||||||||||| ||||| |||   ||||||||| ||||  |||||||||||  ||| ||||| | ||||| |||   |||||| || ||| |||| |||    
T  24493774 atctgtgaagct-atttaagatatgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcatcacttgaagtataattgaatatttaagatgttg-ttg 24493677  T
Q  674 acttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgc-tgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaaga 772  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| | ||| ||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  24493676 acttgcatttgatattattatgtcatgctgtttt-gtatactgcctatgttgctattgttacttaaccaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaaga 24493578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 61; E-Value: 9e-26
Query Start/End: Original strand, 671 - 774
Target Start/End: Complemental strand, 22412294 - 22412191
Alignment:
Q  671 ttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgc-tgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatta 769  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| | ||| | | | |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  22412294 ttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttt-gtatactgcctatgttgttatcgttatttaactaagctacatgagtcggtctaagttgatta 22412196  T
Q  770 agatg 774  Q
    |||||    
T  22412195 agatg 22412191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 671 - 765
Target Start/End: Complemental strand, 22075130 - 22075035
Alignment:
Q  671 ttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgc-tgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 765  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| | | ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  22075130 ttgaattgcaattgatattattatgtcatgttgattttgtatacttcctatgttgctgttgttatttaactaagctgaatgagtcggtctaagttg 22075035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 671 - 774
Target Start/End: Complemental strand, 13025421 - 13025318
Alignment:
Q  671 ttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgc-tgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatta 769  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||||| |||||| ||||||||| | ||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |    
T  13025421 ttgacttgcatttgatatcaatatgtcatgctgtttt-gtatactgcctatgttgctattgttatttaactatgctgcatgagtcggtctaagttgatga 13025323  T
Q  770 agatg 774  Q
    |||||    
T  13025322 agatg 13025318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 671 - 774
Target Start/End: Complemental strand, 13095605 - 13095502
Alignment:
Q  671 ttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgc-tgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatta 769  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||||| |||||| ||||||||| | ||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |    
T  13095605 ttgacttgcatttgatatcaatatgtcatgctgtttt-gtatactgcctatgttgctattgttatttaactatgctgcatgagtcggtctaagttgatga 13095507  T
Q  770 agatg 774  Q
    |||||    
T  13095506 agatg 13095502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 48; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 719 - 774
Target Start/End: Original strand, 20806845 - 20806900
Alignment:
Q  719 gtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 774  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  20806845 gtgtcgctgttgttatttaattaagctgcatgagtcggtctatgttgattaagatg 20806900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 48; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 595 - 767
Target Start/End: Complemental strand, 21565728 - 21565556
Alignment:
Q  595 atgatttgatgttgtt-atattgtgatataattgtatatgcattaattgaattatttgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattatta 693  Q
    |||| ||||||||||| ||| ||| |||||||||||||| |||||  |||||||| | ||| || |||| | |||||| |||||||||| |||||| |||    
T  21565728 atgaattgatgttgtttataatgttatataattgtatatacattacatgaattatgtttga-tatttgaaatgttgat-gacttgcattcgatattgtta 21565631  T
Q  694 tgtcatgttgtttttgtatactgc-tgtgtcgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 767  Q
    | ||||| || ||| | ||||||| | ||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21565630 tatcatgatgatttgg-atactgcctatgttgctatttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 21565556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 728 - 774
Target Start/End: Original strand, 21329565 - 21329611
Alignment:
Q  728 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 774  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21329565 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 21329611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 735 - 774
Target Start/End: Original strand, 21502231 - 21502270
Alignment:
Q  735 ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 774  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21502231 ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 21502270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 728 - 767
Target Start/End: Original strand, 22959600 - 22959639
Alignment:
Q  728 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 767  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22959600 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 22959639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 728 - 774
Target Start/End: Original strand, 19660903 - 19660949
Alignment:
Q  728 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 774  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  19660903 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatg 19660949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 671 - 762
Target Start/End: Original strand, 20026949 - 20027043
Alignment:
Q  671 ttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgt-ttttgtatactgc-tgtgtcgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 762  Q
    |||| ||||||||||||||||||| |||||   | ||||| ||||||| | ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20026949 ttgaattgcatttgatattattatatcatgaactgttttggatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 20027043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 682 - 762
Target Start/End: Original strand, 21292992 - 21293071
Alignment:
Q  682 ttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgc-tgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 762  Q
    ||||||||||||||||||  |||||  || |||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  21292992 ttgatattattatgtcatactgttt--gtttactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgaatcggtctaag 21293071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 683 - 771
Target Start/End: Complemental strand, 18418678 - 18418590
Alignment:
Q  683 tgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgc-tgtgtcgctgttgttattt-aactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaag 771  Q
    |||||||||||||||||| |||||  ||||||||| | ||| | ||||||||||| ||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||    
T  18418678 tgatattattatgtcatgctgttt--gtatactgcctatgttgatgttgttattttaactaagttgcacgagtcagtctaagttgattaag 18418590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 671 - 722
Target Start/End: Original strand, 20766130 - 20766180
Alignment:
Q  671 ttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgctgtgt 722  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| |||||    
T  20766130 ttgacttgcatttgatattattatgtcatgctg-ttttgtatactgttgtgt 20766180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 728 - 774
Target Start/End: Original strand, 17517269 - 17517315
Alignment:
Q  728 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 774  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  17517269 ttgttattaaactaagttgcatgagtcagtctaagttgattaagatg 17517315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 728 - 774
Target Start/End: Complemental strand, 26704124 - 26704078
Alignment:
Q  728 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 774  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  26704124 ttgttatttaaccaagctgcatgagtcggtctaagtcgatcaagatg 26704078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 728 - 774
Target Start/End: Complemental strand, 26973857 - 26973811
Alignment:
Q  728 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 774  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  26973857 ttgttatttaaccaagctgcatgagtcggtctaagtcgatcaagatg 26973811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 728 - 762
Target Start/End: Complemental strand, 36314630 - 36314596
Alignment:
Q  728 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 762  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36314630 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 36314596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #55
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 632 - 762
Target Start/End: Complemental strand, 37724050 - 37723922
Alignment:
Q  632 tgcattaattgaattatttgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgc-tgtgtcgctgt-t 729  Q
    ||||||| |||||||||   ||||| ||||||| |||||| || ||  ||||||||| || |||||||| ||||   ||||||||| | ||| ||||| |    
T  37724050 tgcattacttgaattatgaatgaatgattgagatgttgat-gaatttaatttgatataatcatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtct 37723955  T
Q  730 gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 762  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  37723954 gttatttaactaagctgcatgagtcagtctaag 37723922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #56
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 679 - 766
Target Start/End: Original strand, 26012053 - 26012141
Alignment:
Q  679 catttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgc-tgtgtcgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 766  Q
    ||||||||||| |||| |||||||| ||| | ||||||| | ||| |||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26012053 catttgatattgttatatcatgttgcttt-gcatactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 26012141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #57
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 728 - 767
Target Start/End: Complemental strand, 19668951 - 19668912
Alignment:
Q  728 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 767  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  19668951 ttgttatttaactgagctgcaagagtcggtctaagttgat 19668912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #58
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 724 - 762
Target Start/End: Original strand, 26740709 - 26740747
Alignment:
Q  724 gctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 762  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  26740709 gctgttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaag 26740747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #59
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 724 - 765
Target Start/End: Original strand, 26732896 - 26732937
Alignment:
Q  724 gctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 765  Q
    |||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  26732896 gctgttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctatgttg 26732937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 161; Significance: 2e-85; HSPs: 62)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 161; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 566 - 762
Target Start/End: Complemental strand, 18456930 - 18456735
Alignment:
Q  566 ttaacgatgatctgtgaagctgatttatgatgatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattaattgaattatttgtgaataattgagac 665  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  18456930 ttaatgatgatctgtgaagctgatttatgatgatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagac 18456831  T
Q  666 gttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgctgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 762  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18456830 gttg-ttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactattgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 18456735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 160; E-Value: 7e-85
Query Start/End: Original strand, 603 - 774
Target Start/End: Original strand, 16448514 - 16448685
Alignment:
Q  603 atgttgttatattgtgatataattgtatatgcattaattgaattatttgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgtt 702  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  16448514 atgttgttatattgtgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgct 16448613  T
Q  703 gtttttgtatactgctgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 774  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  16448614 gtttttgtatactgctgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtttaagttgattaagatg 16448685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 156; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 595 - 774
Target Start/End: Complemental strand, 22782409 - 22782231
Alignment:
Q  595 atgatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattaattgaattatttgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattat 694  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  22782409 atgatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatgtgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattat 22782311  T
Q  695 gtcatgttgtttttgtatactgctgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 774  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22782310 gtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 22782231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 149; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 598 - 774
Target Start/End: Original strand, 2291163 - 2291338
Alignment:
Q  598 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattaattgaattatttgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtc 697  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  2291163 atttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtc 2291261  T
Q  698 atgttgtttttgtatactgctgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 774  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2291262 atgttgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 2291338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 149; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 598 - 774
Target Start/End: Complemental strand, 12742496 - 12742321
Alignment:
Q  598 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattaattgaattatttgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtc 697  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  12742496 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtc 12742398  T
Q  698 atgttgtttttgtatactgctgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 774  Q
    ||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12742397 atgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 12742321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 149; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 598 - 774
Target Start/End: Complemental strand, 19005225 - 19005050
Alignment:
Q  598 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattaattgaattatttgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtc 697  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  19005225 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtc 19005127  T
Q  698 atgttgtttttgtatactgctgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 774  Q
    ||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19005126 atgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 19005050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 149; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 598 - 774
Target Start/End: Original strand, 19858902 - 19859077
Alignment:
Q  598 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattaattgaattatttgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtc 697  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  19858902 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtc 19859000  T
Q  698 atgttgtttttgtatactgctgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 774  Q
    ||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19859001 atgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 19859077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 149; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 598 - 774
Target Start/End: Complemental strand, 24422726 - 24422551
Alignment:
Q  598 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattaattgaattatttgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtc 697  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  24422726 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtc 24422628  T
Q  698 atgttgtttttgtatactgctgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 774  Q
    ||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24422627 atgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 24422551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 149; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 598 - 774
Target Start/End: Complemental strand, 33861973 - 33861798
Alignment:
Q  598 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattaattgaattatttgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtc 697  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  33861973 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtc 33861875  T
Q  698 atgttgtttttgtatactgctgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 774  Q
    ||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33861874 atgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 33861798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 149; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 598 - 774
Target Start/End: Complemental strand, 33864457 - 33864282
Alignment:
Q  598 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattaattgaattatttgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtc 697  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  33864457 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtc 33864359  T
Q  698 atgttgtttttgtatactgctgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 774  Q
    ||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33864358 atgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 33864282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 145; E-Value: 7e-76
Query Start/End: Original strand, 598 - 774
Target Start/End: Complemental strand, 8055208 - 8055033
Alignment:
Q  598 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattaattgaattatttgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtc 697  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  8055208 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtc 8055110  T
Q  698 atgttgtttttgtatactgctgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 774  Q
    ||| ||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8055109 atgctgtttttgtatacttttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 8055033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 145; E-Value: 7e-76
Query Start/End: Original strand, 598 - 774
Target Start/End: Original strand, 18334575 - 18334750
Alignment:
Q  598 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattaattgaattatttgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtc 697  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  18334575 atttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtc 18334673  T
Q  698 atgttgtttttgtatactgctgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 774  Q
    ||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18334674 atgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 18334750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 145; E-Value: 7e-76
Query Start/End: Original strand, 598 - 774
Target Start/End: Original strand, 30676693 - 30676868
Alignment:
Q  598 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattaattgaattatttgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtc 697  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||    
T  30676693 atttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattatatc 30676791  T
Q  698 atgttgtttttgtatactgctgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 774  Q
    ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30676792 atgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 30676868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 144; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 595 - 774
Target Start/End: Complemental strand, 25754991 - 25754813
Alignment:
Q  595 atgatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattaattgaattatttgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattat 694  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||    
T  25754991 atgatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgatttgcatttgatattattat 25754893  T
Q  695 gtcatgttgtttttgtatactgctgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 774  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25754892 gtcatgctgtttttgtatactactgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 25754813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 141; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 598 - 774
Target Start/End: Original strand, 26924623 - 26924798
Alignment:
Q  598 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattaattgaattatttgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtc 697  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  26924623 atttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtc 26924721  T
Q  698 atgttgtttttgtatactgctgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 774  Q
    ||| ||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26924722 atgctgtttttgtatactattgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 26924798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 141; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 598 - 774
Target Start/End: Complemental strand, 34963552 - 34963377
Alignment:
Q  598 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattaattgaattatttgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtc 697  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  34963552 atttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtc 34963454  T
Q  698 atgttgtttttgtatactgctgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 774  Q
    ||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34963453 atgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 34963377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 137; E-Value: 4e-71
Query Start/End: Original strand, 598 - 774
Target Start/End: Original strand, 1540894 - 1541069
Alignment:
Q  598 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattaattgaattatttgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtc 697  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  1540894 atttgatgttgttatattgtgatgtaattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtc 1540992  T
Q  698 atgttgtttttgtatactgctgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 774  Q
    ||  ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  1540993 atactgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcgatctaagttgattaagatg 1541069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 137; E-Value: 4e-71
Query Start/End: Original strand, 598 - 774
Target Start/End: Complemental strand, 1595728 - 1595553
Alignment:
Q  598 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattaattgaattatttgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtc 697  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||    
T  1595728 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatccattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgaattgcatttgatattattatgtc 1595630  T
Q  698 atgttgtttttgtatactgctgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 774  Q
    ||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  1595629 atgttgtttttgtatactgttatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgattaagatg 1595553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 133; E-Value: 9e-69
Query Start/End: Original strand, 595 - 774
Target Start/End: Original strand, 20556874 - 20557050
Alignment:
Q  595 atgatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattaattgaattatttgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattat 694  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  20556874 atgatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaa--attgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattat 20556970  T
Q  695 gtcatgttgtttttgtatactgctgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 774  Q
    | |||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  20556971 gccatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgattaagatg 20557050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 133; E-Value: 9e-69
Query Start/End: Original strand, 598 - 774
Target Start/End: Complemental strand, 25656808 - 25656633
Alignment:
Q  598 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattaattgaattatttgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtc 697  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  25656808 atttgatgtttttatattgtgatataattatatatgtattagttgaattatatgtgaataattgagacgtt-attaacttgcatttgatattattatgtc 25656710  T
Q  698 atgttgtttttgtatactgctgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 774  Q
    ||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25656709 atgctgtttttgtatactgctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 25656633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 128; E-Value: 9e-66
Query Start/End: Original strand, 599 - 774
Target Start/End: Original strand, 3852001 - 3852175
Alignment:
Q  599 tttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattaattgaattatttgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtca 698  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  3852001 tttgatgatgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcattttatattatcatgtca 3852099  T
Q  699 tgttgtttttgtatactgctgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 774  Q
    || ||||||||||||||  ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3852100 tgctgtttttgtatactattgtgttgctgttgttattaaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 3852175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 120; E-Value: 5e-61
Query Start/End: Original strand, 598 - 773
Target Start/End: Complemental strand, 25688681 - 25688507
Alignment:
Q  598 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattaattgaattatttgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtc 697  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  25688681 atttggtgttgttatattgtgatatgattatatatgtattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcagttgatattattatgtc 25688583  T
Q  698 atgttgtttttgtatactgctgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagat 773  Q
    ||| ||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  25688582 atgctgtttttgtatactgttatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcgatctaagttgattaagat 25688507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 106; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 625 - 762
Target Start/End: Complemental strand, 18462031 - 18461895
Alignment:
Q  625 ttgtatatgcattaattgaattatttgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgctgtgtcg 724  Q
    |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||| |    
T  18462031 ttgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactattgtgttg 18461933  T
Q  725 ctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 762  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18461932 ctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 18461895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 92; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 566 - 766
Target Start/End: Complemental strand, 25644537 - 25644335
Alignment:
Q  566 ttaacgatgatctgtgaagctgatttatgatgatttgatgttgttatat-tgtgatataattgtatatgcattaattgaattatttgtgaataattgaga 664  Q
    |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |   ||||||||||||||||| |||||| ||||||||| | |||||  ||||||    
T  25644537 ttaatgatgatctgtgaagctgatatatgatgatttgatgttgtttttgatgtgatataattgtatacgcattacttgaattatatatgaatgtttgaga 25644438  T
Q  665 cgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgc-tgtgtcgctgt-tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 762  Q
     |||||| ||||| ||||||||||| |||| ||| | |||||||| ||||||| | ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25644437 tgttgat-gacttacatttgatattgttatatcacgctgtttttgcatactgcctatgttgctgtctgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 25644339  T
Q  763 ttga 766  Q
    ||||    
T  25644338 ttga 25644335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 91; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 578 - 774
Target Start/End: Original strand, 18409745 - 18409941
Alignment:
Q  578 tgtgaagctgatttatgatgatttgatgttg-ttatattgtgatataattgtatatgcattaattgaattatttgtgaataattgagacgttgattgact 676  Q
    |||||||||| |||| ||||  ||||||||| ||||  |||||||||||  |||||| |||| |||||||||   || || ||||||| |||| ||||||    
T  18409745 tgtgaagctg-tttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatatgtattatttgaattatgaatggatgattgagatgttg-ttgact 18409842  T
Q  677 tgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgc-tgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 774  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  18409843 tgcatttgatattattatgtcatgttgttttcgtatactgcctgtgttgctgttgttatttaactgagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatg 18409941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 90; E-Value: 4e-43
Query Start/End: Original strand, 575 - 774
Target Start/End: Complemental strand, 29060746 - 29060547
Alignment:
Q  575 atctgtgaagctgatttatgatgatttgatgttg-ttatattgtgatataattgtatatgcattaattgaattatttgtgaataattgagacgttgattg 673  Q
    ||||||||||||| |||| ||||  ||||||||| ||||  || ||||||||  ||| ||||||| |||||||||   || ||| |||||| |||| |||    
T  29060746 atctgtgaagctg-tttaagatgtgttgatgttgattatgatgagatataatgttatgtgcattacttgaattatgaatgtatacttgagatgttg-ttg 29060649  T
Q  674 acttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactg-ctgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaaga 772  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  29060648 acttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagctgatgaaga 29060549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 86; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 575 - 774
Target Start/End: Original strand, 25629270 - 25629469
Alignment:
Q  575 atctgtgaagctgatttatgatgatttgatgttg-ttatattgtgatataattgtatatgcattaattgaattatttgtgaataattgagacgttgattg 673  Q
    ||||||||||||| |||| ||||  ||||||||| ||||  |||||||||||  |||| |||||| |||||||||   || |||||||||| |||| |||    
T  25629270 atctgtgaagctg-tttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtataattgagatgttg-ttg 25629367  T
Q  674 acttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgc-tgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaaga 772  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||| |||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  25629368 acttgcatttgatattgttatgtcatgctgttttcgtatactgcatgtgttcctgttgtaatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaaga 25629467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 78; E-Value: 6e-36
Query Start/End: Original strand, 575 - 774
Target Start/End: Complemental strand, 20593979 - 20593780
Alignment:
Q  575 atctgtgaagctgatttatgatgatttgatgttg-ttatattgtgatataattgtatatgcattaattgaattatttgtgaataattgagacgttgattg 673  Q
    ||||||||||||| |||| ||||  ||||||||| ||||  ||||||||| |  |||| |||||| |||| ||||   || |||||||||| |||| |||    
T  20593979 atctgtgaagctg-tttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatatattgttatacgcattacttgatttatgattgtataattgagatgttg-ttg 20593882  T
Q  674 acttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgc-tgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaaga 772  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||| |||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  20593881 acttgcatttgatattattatgtcatgctgttttcgtatactgcatgtgttgctgtttttatttaactgagctgcatgattcggtctaagttgatgaaga 20593782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 74; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 575 - 774
Target Start/End: Original strand, 19303456 - 19303654
Alignment:
Q  575 atctgtgaagctgatttatgatgatttgatgttg-ttatattgtgatataattgtatatgcattaattgaattatttgtgaataattgagacgttgattg 673  Q
    ||||||||||||| || | ||||  ||||||||| ||||  |||||||||||  ||| | ||||| ||||| |||   || |||||||||| |||| |||    
T  19303456 atctgtgaagctg-ttgaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtacattacttgaaatatgaatgtataattgagatgttg-ttg 19303553  T
Q  674 acttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgc-tgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaaga 772  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  19303554 acttgcatttgatattattatgtcatgttgtttt-gtatacttcctgtgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgatgaaga 19303652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 74; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 591 - 774
Target Start/End: Original strand, 19847925 - 19848109
Alignment:
Q  591 tatgatgatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattaattgaattatttgtg-aataattgagacgttgattgacttgcatttgatatt 689  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||| || |||  ||| |||| ||||| ||||||||    
T  19847925 tatgatgatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattatttgaattatatgtgaaatatttaagatattg-ttgaattgcaattgatatt 19848023  T
Q  690 attatgtcatgttgtttttgtatactg-ctgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 774  Q
     ||||||  || ||||  ||||  ||| || ||  ||| |||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  19848024 tttatgtgttgctgttgatgtaatctgcctatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagtcagtctaagttgattaagatg 19848109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 73; E-Value: 6e-33
Query Start/End: Original strand, 671 - 774
Target Start/End: Original strand, 17287806 - 17287910
Alignment:
Q  671 ttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgc-tgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatta 769  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||| | | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17287806 ttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtgtttgtatactacctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatta 17287905  T
Q  770 agatg 774  Q
    |||||    
T  17287906 agatg 17287910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 566 - 774
Target Start/End: Original strand, 8227416 - 8227625
Alignment:
Q  566 ttaacgatgatctgtgaagctgatttatgatgatttgatgttg-ttatattgtgatataattgtatatgcattaattgaattatttgtgaataattgaga 664  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| || ||||||    
T  8227416 ttaatgatgatctgtgaagctgatttatgatgatttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgattatttgaga 8227515  T
Q  665 cgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactg-ctgtgtcgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 762  Q
     |||| || |||| | |  ||||||||||| ||||| || ||||| |||||| ||  || |||| |  |||  ||||||||||||||||||||||| |||    
T  8227516 tgttg-tttacttacgtgcgatattattatatcatgatg-ttttgcatactgcctacgttgctgatcattaactaactaagctgcatgagtcggtccaag 8227613  T
Q  763 ttgattaagatg 774  Q
    ||| | ||||||    
T  8227614 ttgttgaagatg 8227625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 70; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 615 - 767
Target Start/End: Original strand, 20360915 - 20361067
Alignment:
Q  615 tgtgatataattgtatatgcattaattgaattatttgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatac 714  Q
    |||||||||||  ||||||||||| |||||  || | |||||| || ||| |||||| || ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| |    
T  20360915 tgtgatataatgttatatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgat-gaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatgc 20361013  T
Q  715 tgc-tgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 767  Q
    ||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  20361014 tgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcgatctaagttgat 20361067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 68; E-Value: 6e-30
Query Start/End: Original strand, 676 - 774
Target Start/End: Original strand, 20638298 - 20638397
Alignment:
Q  676 ttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgc-tgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 774  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  20638298 ttgcaattgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgcctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgaagatg 20638397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 65; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 671 - 774
Target Start/End: Complemental strand, 16496355 - 16496251
Alignment:
Q  671 ttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgc-tgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatta 769  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |    
T  16496355 ttgaattgcaattgatattattatgtcatgctgattttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttga 16496256  T
Q  770 agatg 774  Q
    |||||    
T  16496255 agatg 16496251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 65; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 671 - 774
Target Start/End: Complemental strand, 20076810 - 20076707
Alignment:
Q  671 ttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgc-tgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatta 769  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| || |||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  20076810 ttgatttgcatttgatattattatgtcatgctgtttt-gtttactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatga 20076712  T
Q  770 agatg 774  Q
    |||||    
T  20076711 agatg 20076707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 61; E-Value: 9e-26
Query Start/End: Original strand, 682 - 762
Target Start/End: Original strand, 18821866 - 18821946
Alignment:
Q  682 ttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgctgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 762  Q
    |||||||| ||||| |||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18821866 ttgatattgttatggcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 18821946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 61; E-Value: 9e-26
Query Start/End: Original strand, 600 - 766
Target Start/End: Complemental strand, 20109322 - 20109153
Alignment:
Q  600 ttgatgttgtt-atattgtgatataat--tgtatatgcattaattgaattatttgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgt 696  Q
    ||||||||||| ||| |||||||||||  ||||||| ||||| ||||||||| | |||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||| |||| |    
T  20109322 ttgatgttgtttataatgtgatataatattgtatatacattacttgaattatatatgaatatttgagatgttgat-gacttgcatttgatattgttatat 20109224  T
Q  697 catgttgtttttgtatactgc-tgtgtcgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 766  Q
     |||||||||| | ||||||| | ||| |||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20109223 tatgttgtttt-gcatactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 20109153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 58; E-Value: 5e-24
Query Start/End: Original strand, 575 - 774
Target Start/End: Original strand, 22780142 - 22780341
Alignment:
Q  575 atctgtgaagctgatttatgatgatttgatgttg-ttatattgtgatataattgtatatgcattaattgaattatttgtgaataattgagacgttgattg 673  Q
    ||||||||||||| |||| ||||  ||||||||| |||| ||||||||||||  |   ||||||| ||||| |||   |||||| || ||| | || |||    
T  22780142 atctgtgaagctg-tttaagatgtgttgatgttgattatgttgtgatataatgttgcgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgatg-ttg 22780239  T
Q  674 acttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgc-tgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaaga 772  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||| ||| | |||   ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  22780240 acttgcaattgatattattatgtcaagctgtttttgtatattgcctatgtttttgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaaga 22780339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 51; E-Value: 8e-20
Query Start/End: Original strand, 724 - 774
Target Start/End: Complemental strand, 25714474 - 25714424
Alignment:
Q  724 gctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 774  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25714474 gctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 25714424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 728 - 774
Target Start/End: Original strand, 27333286 - 27333332
Alignment:
Q  728 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 774  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27333286 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 27333332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 728 - 774
Target Start/End: Original strand, 27394026 - 27394072
Alignment:
Q  728 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 774  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27394026 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 27394072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 619 - 762
Target Start/End: Complemental strand, 23019567 - 23019425
Alignment:
Q  619 atataattgtatatgcattaattgaattatttgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgc- 717  Q
    |||||||||||||| |||||  |||||||| | ||| |  |||||| |||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||| |||||||     
T  23019567 atataattgtatatacattacatgaattatgtttga-tgtttgagatgttg-ttgacttgcatttgatattgttatatcatgttg-ttttgcatactgct 23019471  T
Q  718 tgtgtcgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 762  Q
    | ||| |||| |||||  ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  23019470 tatgttgctgtttgtttattaactaagctgcataagtcggtctaag 23019425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 728 - 766
Target Start/End: Original strand, 9098582 - 9098620
Alignment:
Q  728 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 766  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9098582 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 9098620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 734 - 774
Target Start/End: Original strand, 22080799 - 22080839
Alignment:
Q  734 tttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 774  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  22080799 tttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgattaagatg 22080839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 728 - 764
Target Start/End: Original strand, 28496539 - 28496575
Alignment:
Q  728 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 764  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28496539 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 28496575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 728 - 764
Target Start/End: Original strand, 29808950 - 29808986
Alignment:
Q  728 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 764  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29808950 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 29808986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 682 - 762
Target Start/End: Complemental strand, 35245684 - 35245605
Alignment:
Q  682 ttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgc-tgtgtcgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 762  Q
    ||||||||||||||||||||||||   ||||||||| | ||| | |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  35245684 ttgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttggtgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaag 35245605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 728 - 767
Target Start/End: Complemental strand, 19652248 - 19652209
Alignment:
Q  728 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 767  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19652248 ttgttgtttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 19652209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #50
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 728 - 774
Target Start/End: Complemental strand, 1561356 - 1561310
Alignment:
Q  728 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 774  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||    
T  1561356 ttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgttgaagatg 1561310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #51
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 728 - 762
Target Start/End: Complemental strand, 11185558 - 11185524
Alignment:
Q  728 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 762  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11185558 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 11185524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #52
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 595 - 648
Target Start/End: Original strand, 18177606 - 18177660
Alignment:
Q  595 atgatttgatgttgtta-tattgtgatataattgtatatgcattaattgaattat 648  Q
    ||||||||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  18177606 atgatttgatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattaagtgaattat 18177660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #53
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 595 - 648
Target Start/End: Original strand, 18199350 - 18199404
Alignment:
Q  595 atgatttgatgttgtta-tattgtgatataattgtatatgcattaattgaattat 648  Q
    ||||||||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  18199350 atgatttgatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattaagtgaattat 18199404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #54
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 595 - 648
Target Start/End: Complemental strand, 18204265 - 18204211
Alignment:
Q  595 atgatttgatgttgtta-tattgtgatataattgtatatgcattaattgaattat 648  Q
    ||||||||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  18204265 atgatttgatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattaagtgaattat 18204211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #55
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 571 - 648
Target Start/End: Complemental strand, 18706515 - 18706437
Alignment:
Q  571 gatgatctgtgaagctgatttatgatgatttgatgttgtt-atattgtgatataattgtatatgcattaattgaattat 648  Q
    ||||||||||||||||| | ||  |||||||||||||||| ||| ||| |||||| |||||||||||||  ||||||||    
T  18706515 gatgatctgtgaagctgttataatatgatttgatgttgttaataatgtcatataaatgtatatgcattacatgaattat 18706437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #56
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 728 - 766
Target Start/End: Complemental strand, 19668424 - 19668386
Alignment:
Q  728 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 766  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19668424 ttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 19668386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #57
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 728 - 774
Target Start/End: Complemental strand, 23992480 - 23992434
Alignment:
Q  728 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 774  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  23992480 ttgttatttagctaagttgcatgagtcagtctaagttgattaagatg 23992434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #58
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 728 - 760
Target Start/End: Complemental strand, 22831556 - 22831524
Alignment:
Q  728 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 760  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22831556 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 22831524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #59
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 594 - 648
Target Start/End: Complemental strand, 23076919 - 23076864
Alignment:
Q  594 gatgatttgatgttgtta-tattgtgatataattgtatatgcattaattgaattat 648  Q
    |||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||  ||||||||    
T  23076919 gatgatttgatgttgttaataatgtgatatatttgtatatgcattacatgaattat 23076864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #60
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 728 - 758
Target Start/End: Original strand, 16920698 - 16920728
Alignment:
Q  728 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 758  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16920698 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 16920728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #61
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 571 - 648
Target Start/End: Complemental strand, 18696697 - 18696619
Alignment:
Q  571 gatgatctgtgaagctgatttatgatgatttgatgttgtta-tattgtgatataattgtatatgcattaattgaattat 648  Q
    ||||||||||||||||| | |   ||||||| ||||||||| || |||||||||| |||||||||||||  ||||||||    
T  18696697 gatgatctgtgaagctgttatcatatgatttaatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattat 18696619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #62
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 595 - 648
Target Start/End: Original strand, 28103833 - 28103887
Alignment:
Q  595 atgatttgatgttgtta-tattgtgatataattgtatatgcattaattgaattat 648  Q
    ||||||||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||  ||||||||    
T  28103833 atgatttgatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattatgtgaattat 28103887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0761 (Bit Score: 156; Significance: 2e-82; HSPs: 1)
Name: scaffold0761
Description:

Target: scaffold0761; HSP #1
Raw Score: 156; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 571 - 774
Target Start/End: Complemental strand, 4503 - 4301
Alignment:
Q  571 gatgatctgtgaagctgatttatgatgatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattaattgaattatttgtgaataattgagacgttga 670  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||     
T  4503 gatgatctgtgaagctgatttctgatgatttgatgatgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgattaattgagacgttg- 4405  T
Q  671 ttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgctgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaa 770  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4404 ttgatttgcaattgatattattatgtcatgttgtttttgtatactactgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaa 4305  T
Q  771 gatg 774  Q
    ||||    
T  4304 gatg 4301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0819 (Bit Score: 154; Significance: 3e-81; HSPs: 1)
Name: scaffold0819
Description:

Target: scaffold0819; HSP #1
Raw Score: 154; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 593 - 774
Target Start/End: Complemental strand, 4398 - 4218
Alignment:
Q  593 tgatgatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattaattgaattatttgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattatt 692  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4398 tgatgatttgatgttgt-atattgtgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattatt 4300  T
Q  693 atgtcatgttgtttttgtatactgctgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 774  Q
    |||||||| || |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4299 atgtcatgctggttttgtatactgctgtgtcgctgtcgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 4218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031 (Bit Score: 153; Significance: 1e-80; HSPs: 2)
Name: scaffold0031
Description:

Target: scaffold0031; HSP #1
Raw Score: 153; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 566 - 762
Target Start/End: Original strand, 20331 - 20524
Alignment:
Q  566 ttaacgatgatctgtgaagctgatttatgatgatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattaattgaattatttgtgaataattgagac 665  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  20331 ttaatgatgatctgtgaagctgatttatgatgatttgatgtt-ttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagac 20429  T
Q  666 gttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgctgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 762  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20430 gttg-ttgacttgcatttgatattattatgtcatgttg-ttttgtatactgatgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 20524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031; HSP #2
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 671 - 774
Target Start/End: Complemental strand, 128861 - 128758
Alignment:
Q  671 ttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgctgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaa 770  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | |  |  | ||| ||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||    
T  128861 ttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttttttttttttttgttgcttttgttatttaactaagttgcatgagttggtctaatttgattaa 128762  T
Q  771 gatg 774  Q
    ||||    
T  128761 gatg 128758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0716 (Bit Score: 149; Significance: 3e-78; HSPs: 1)
Name: scaffold0716
Description:

Target: scaffold0716; HSP #1
Raw Score: 149; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 598 - 774
Target Start/End: Complemental strand, 4873 - 4698
Alignment:
Q  598 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattaattgaattatttgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtc 697  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  4873 atttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtc 4775  T
Q  698 atgttgtttttgtatactgctgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 774  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  4774 atgttgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaggatg 4698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0254 (Bit Score: 149; Significance: 3e-78; HSPs: 1)
Name: scaffold0254
Description:

Target: scaffold0254; HSP #1
Raw Score: 149; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 598 - 774
Target Start/End: Complemental strand, 20926 - 20751
Alignment:
Q  598 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattaattgaattatttgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtc 697  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  20926 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtc 20828  T
Q  698 atgttgtttttgtatactgctgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 774  Q
    ||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20827 atgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 20751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0134 (Bit Score: 149; Significance: 3e-78; HSPs: 1)
Name: scaffold0134
Description:

Target: scaffold0134; HSP #1
Raw Score: 149; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 598 - 774
Target Start/End: Complemental strand, 38000 - 37825
Alignment:
Q  598 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattaattgaattatttgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtc 697  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  38000 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtc 37902  T
Q  698 atgttgtttttgtatactgctgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 774  Q
    ||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37901 atgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 37825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023 (Bit Score: 149; Significance: 3e-78; HSPs: 8)
Name: scaffold0023
Description:

Target: scaffold0023; HSP #1
Raw Score: 149; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 598 - 774
Target Start/End: Complemental strand, 94590 - 94415
Alignment:
Q  598 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattaattgaattatttgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtc 697  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  94590 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtc 94492  T
Q  698 atgttgtttttgtatactgctgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 774  Q
    ||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  94491 atgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 94415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #2
Raw Score: 141; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 598 - 774
Target Start/End: Original strand, 17423 - 17598
Alignment:
Q  598 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattaattgaattatttgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtc 697  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  17423 atttgatgttgttatactgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtc 17521  T
Q  698 atgttgtttttgtatactgctgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 774  Q
    ||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17522 atgctgtttttgtatactgctgtgttgctattgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 17598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #3
Raw Score: 114; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 618 - 774
Target Start/End: Complemental strand, 44614 - 44458
Alignment:
Q  618 gatataattgtatatgcattaattgaattatttgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgttgttttt-gtatactg 716  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  44614 gatataattctatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagatgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttttgtatactg 44516  T
Q  717 ctgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 774  Q
     ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44515 ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 44458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #4
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 619 - 767
Target Start/End: Complemental strand, 100534 - 100388
Alignment:
Q  619 atataattgtatatgcattaattgaattatttgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgc- 717  Q
    |||||||||||||| |||||  ||||||||  || |||| |||||| |||| |||| ||||||| ||||||||||| ||||| || ||| | |||||||     
T  100534 atataattgtatatacattatatgaattat--gttaatatttgagatgttg-ttgatttgcattcgatattattatatcatgatgattt-gcatactgcc 100439  T
Q  718 tgtgtcgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 767  Q
    | ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  100438 tatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 100388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #5
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 728 - 774
Target Start/End: Complemental strand, 119928 - 119882
Alignment:
Q  728 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 774  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  119928 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatg 119882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #6
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 731 - 767
Target Start/End: Original strand, 40245 - 40281
Alignment:
Q  731 ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 767  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  40245 ttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgat 40281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #7
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 728 - 767
Target Start/End: Complemental strand, 101552 - 101513
Alignment:
Q  728 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 767  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  101552 ttgttgtttaactaagctgcatgaatcggtctaagttgat 101513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #8
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 566 - 648
Target Start/End: Complemental strand, 105294 - 105212
Alignment:
Q  566 ttaacgatgatctgtgaagctgatttatgatgatttgatgttgtta-tattgtgatataattgtatatgcattaattgaattat 648  Q
    |||| |||||||| ||||||||  | || ||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||  |||||||||    
T  105294 ttaatgatgatctatgaagctgtataat-atgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattttttgaattat 105212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003 (Bit Score: 149; Significance: 3e-78; HSPs: 2)
Name: scaffold0003
Description:

Target: scaffold0003; HSP #1
Raw Score: 149; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 598 - 774
Target Start/End: Original strand, 158433 - 158608
Alignment:
Q  598 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattaattgaattatttgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtc 697  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  158433 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtc 158531  T
Q  698 atgttgtttttgtatactgctgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 774  Q
    ||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  158532 atgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 158608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003; HSP #2
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 575 - 766
Target Start/End: Original strand, 339865 - 340053
Alignment:
Q  575 atctgtgaagctgatttatgatgatttgatgttg-ttatattgtgatataattgtatatgcattaattgaattatttgtgaataattgagacgttgattg 673  Q
    ||||||||||||| |||| ||||  ||||||||| ||||  |||||||||||  ||||  ||||| |||||||||   || ||| |||||| |||| |||    
T  339865 atctgtgaagctg-tttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatacacattacttgaattatgaatgtatacttgagatgttg-ttg 339962  T
Q  674 acttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgc-tgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 766  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  339963 acttg-atttgatattattatgtcatgttgtttt-gtatactgcctatgttgttgt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 340053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 149; Significance: 3e-78; HSPs: 62)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 149; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 598 - 774
Target Start/End: Complemental strand, 18809122 - 18808947
Alignment:
Q  598 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattaattgaattatttgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtc 697  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  18809122 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtc 18809024  T
Q  698 atgttgtttttgtatactgctgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 774  Q
    ||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18809023 atgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 18808947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 149; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 598 - 774
Target Start/End: Original strand, 23709515 - 23709690
Alignment:
Q  598 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattaattgaattatttgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtc 697  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  23709515 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtc 23709613  T
Q  698 atgttgtttttgtatactgctgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 774  Q
    ||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23709614 atgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 23709690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 149; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 598 - 774
Target Start/End: Original strand, 23711996 - 23712171
Alignment:
Q  598 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattaattgaattatttgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtc 697  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  23711996 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtc 23712094  T
Q  698 atgttgtttttgtatactgctgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 774  Q
    ||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23712095 atgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 23712171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 149; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 598 - 774
Target Start/End: Complemental strand, 39682492 - 39682317
Alignment:
Q  598 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattaattgaattatttgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtc 697  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  39682492 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtc 39682394  T
Q  698 atgttgtttttgtatactgctgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 774  Q
    ||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39682393 atgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 39682317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 145; E-Value: 7e-76
Query Start/End: Original strand, 598 - 774
Target Start/End: Complemental strand, 571576 - 571401
Alignment:
Q  598 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattaattgaattatttgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtc 697  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  571576 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaacaattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtc 571478  T
Q  698 atgttgtttttgtatactgctgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 774  Q
    ||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  571477 atgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 571401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 145; E-Value: 7e-76
Query Start/End: Original strand, 598 - 774
Target Start/End: Complemental strand, 6726174 - 6725999
Alignment:
Q  598 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattaattgaattatttgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtc 697  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  6726174 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttacatttgatattattatgtc 6726076  T
Q  698 atgttgtttttgtatactgctgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 774  Q
    ||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6726075 atgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 6725999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 145; E-Value: 7e-76
Query Start/End: Original strand, 598 - 774
Target Start/End: Original strand, 21155043 - 21155218
Alignment:
Q  598 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattaattgaattatttgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtc 697  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  21155043 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcaattgatattattatgtc 21155141  T
Q  698 atgttgtttttgtatactgctgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 774  Q
    ||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21155142 atgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 21155218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 145; E-Value: 7e-76
Query Start/End: Original strand, 598 - 774
Target Start/End: Complemental strand, 23131041 - 23130866
Alignment:
Q  598 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattaattgaattatttgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtc 697  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  23131041 atttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtc 23130943  T
Q  698 atgttgtttttgtatactgctgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 774  Q
    ||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23130942 atgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 23130866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 145; E-Value: 7e-76
Query Start/End: Original strand, 598 - 774
Target Start/End: Complemental strand, 23133508 - 23133333
Alignment:
Q  598 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattaattgaattatttgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtc 697  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  23133508 atttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtc 23133410  T
Q  698 atgttgtttttgtatactgctgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 774  Q
    ||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23133409 atgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 23133333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 145; E-Value: 7e-76
Query Start/End: Original strand, 598 - 770
Target Start/End: Complemental strand, 24367953 - 24367782
Alignment:
Q  598 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattaattgaattatttgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtc 697  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  24367953 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtc 24367855  T
Q  698 atgttgtttttgtatactgctgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaa 770  Q
    ||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24367854 atgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaa 24367782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 145; E-Value: 7e-76
Query Start/End: Original strand, 598 - 774
Target Start/End: Complemental strand, 26505558 - 26505383
Alignment:
Q  598 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattaattgaattatttgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtc 697  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  26505558 atttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtc 26505460  T
Q  698 atgttgtttttgtatactgctgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 774  Q
    ||| | ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26505459 atgctatttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 26505383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 145; E-Value: 7e-76
Query Start/End: Original strand, 598 - 774
Target Start/End: Complemental strand, 26508036 - 26507861
Alignment:
Q  598 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattaattgaattatttgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtc 697  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  26508036 atttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtc 26507938  T
Q  698 atgttgtttttgtatactgctgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 774  Q
    ||| | ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26507937 atgctatttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 26507861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 145; E-Value: 7e-76
Query Start/End: Original strand, 598 - 774
Target Start/End: Original strand, 32214904 - 32215079
Alignment:
Q  598 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattaattgaattatttgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtc 697  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  32214904 atttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtc 32215002  T
Q  698 atgttgtttttgtatactgctgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 774  Q
    ||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32215003 atgctgtttttgtatactgctgtgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 32215079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 145; E-Value: 7e-76
Query Start/End: Original strand, 598 - 774
Target Start/End: Original strand, 34402505 - 34402680
Alignment:
Q  598 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattaattgaattatttgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtc 697  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  34402505 atttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtc 34402603  T
Q  698 atgttgtttttgtatactgctgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 774  Q
    ||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34402604 atgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 34402680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 144; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 595 - 774
Target Start/End: Original strand, 32039478 - 32039656
Alignment:
Q  595 atgatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattaattgaattatttgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattat 694  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  32039478 atgatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattat 32039576  T
Q  695 gtcatgttgtttttgtatactgctgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 774  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  32039577 gtcatgctgtttttgtatactgttgtgttactgttgttatttaactaagctgcatgagccggtctaagttgattaagatg 32039656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 141; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 598 - 774
Target Start/End: Complemental strand, 23135769 - 23135594
Alignment:
Q  598 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattaattgaattatttgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtc 697  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  23135769 atttgatgttgttatactgtgatgtaattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtc 23135671  T
Q  698 atgttgtttttgtatactgctgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 774  Q
    ||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23135670 atgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 23135594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 140; E-Value: 6e-73
Query Start/End: Original strand, 599 - 774
Target Start/End: Complemental strand, 43137477 - 43137303
Alignment:
Q  599 tttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattaattgaattatttgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtca 698  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  43137477 tttgatgatgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaacaattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtca 43137379  T
Q  699 tgttgtttttgtatactgctgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 774  Q
    ||||||||||||||| | |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43137378 tgttgtttttgtatattactgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 43137303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 138; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 598 - 774
Target Start/End: Original strand, 24898178 - 24898354
Alignment:
Q  598 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattaattgaattatttgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtc 697  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  24898178 atttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtc 24898276  T
Q  698 atgttgtttttgtatactgctgtgtcgctgttgttatttaact-aagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 774  Q
    ||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24898277 atgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 24898354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 138; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 598 - 774
Target Start/End: Original strand, 24900661 - 24900837
Alignment:
Q  598 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattaattgaattatttgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtc 697  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  24900661 atttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtc 24900759  T
Q  698 atgttgtttttgtatactgctgtgtcgctgttgttatttaact-aagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 774  Q
    ||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24900760 atgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 24900837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 138; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 598 - 774
Target Start/End: Original strand, 24903138 - 24903314
Alignment:
Q  598 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattaattgaattatttgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtc 697  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  24903138 atttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtc 24903236  T
Q  698 atgttgtttttgtatactgctgtgtcgctgttgttatttaact-aagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 774  Q
    ||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24903237 atgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 24903314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 138; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 598 - 774
Target Start/End: Original strand, 24905615 - 24905791
Alignment:
Q  598 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattaattgaattatttgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtc 697  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  24905615 atttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtc 24905713  T
Q  698 atgttgtttttgtatactgctgtgtcgctgttgttatttaact-aagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 774  Q
    ||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24905714 atgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 24905791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 138; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 598 - 774
Target Start/End: Original strand, 24908090 - 24908266
Alignment:
Q  598 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattaattgaattatttgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtc 697  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  24908090 atttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtc 24908188  T
Q  698 atgttgtttttgtatactgctgtgtcgctgttgttatttaact-aagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 774  Q
    ||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24908189 atgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 24908266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 137; E-Value: 4e-71
Query Start/End: Original strand, 598 - 774
Target Start/End: Complemental strand, 28577278 - 28577103
Alignment:
Q  598 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattaattgaattatttgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtc 697  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||    
T  28577278 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttggcttgcatttgatattattatatc 28577180  T
Q  698 atgttgtttttgtatactgctgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 774  Q
    ||| ||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28577179 atgctgtttttgtatactgttgcgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 28577103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 137; E-Value: 4e-71
Query Start/End: Original strand, 598 - 774
Target Start/End: Complemental strand, 38967553 - 38967378
Alignment:
Q  598 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattaattgaattatttgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtc 697  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  38967553 atttgatgttgt-atattgtgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtgaataattgagatgttgattgacttgcatttgatattattatttc 38967455  T
Q  698 atgttgtttttgtatactgctgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 774  Q
    ||| | |||||||||| || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38967454 atgctatttttgtatattgttgtgtcgatgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 38967378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 137; E-Value: 4e-71
Query Start/End: Original strand, 598 - 774
Target Start/End: Original strand, 45029837 - 45030012
Alignment:
Q  598 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattaattgaattatttgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtc 697  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  45029837 atttcatgttgttatattgtgatataaatgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtc 45029935  T
Q  698 atgttgtttttgtatactgctgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 774  Q
    |||||||||||||||| || ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45029936 atgttgtttttgtatattgttgtgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 45030012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 134; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 598 - 774
Target Start/End: Complemental strand, 22105592 - 22105416
Alignment:
Q  598 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattaattgaattatttgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtc 697  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  22105592 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagaagttg-ttgacttgcatttgatattattatgtc 22105494  T
Q  698 atgttgtttttgtatactg-ctgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 774  Q
    ||| |||||||| |||||| || ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22105493 atgctgtttttgcatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 22105416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 129; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 591 - 774
Target Start/End: Original strand, 24529504 - 24529687
Alignment:
Q  591 tatgatgatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattaattgaattatttgtgaa-taattgagacgttgattgacttgcatttgatatt 689  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||| |||||||||||||| || ||||||| ||||||||    
T  24529504 tatgatgatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattatttgaattatatatgaaataattgagacgttg-ttaacttgcacttgatatt 24529602  T
Q  690 attatgtcatgttgtttttgtatactgctgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 774  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24529603 attatgtcatgctgtttttgtatactgatgtgttgttgttgttatttaactatgctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 24529687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 84; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 566 - 763
Target Start/End: Complemental strand, 19672043 - 19671848
Alignment:
Q  566 ttaacgatgatctgtgaagctgatttatgatgatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattaattgaattatttgtgaataattgagac 665  Q
    |||| ||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||     
T  19672043 ttaatgataatctgtgaagctgatctatgatgatt-gatgttgttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaat-attgagat 19671946  T
Q  666 gttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactg-ctgtgtcgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagt 763  Q
    |||| || |||||| || ||||||||||| ||||| || ||||| |||||| || ||| |||| |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  19671945 gttg-tttacttgcgttcgatattattatatcatgatg-ttttgcatactgcctatgttgctgattgttaattaactaagctgcatgagtcagtctaagt 19671848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 83; E-Value: 7e-39
Query Start/End: Original strand, 578 - 774
Target Start/End: Complemental strand, 23060716 - 23060520
Alignment:
Q  578 tgtgaagctgatttatgatgatttgatgttg-ttatattgtgatataattgtatatgcattaattgaattatttgtgaataattgagacgttgattgact 676  Q
    |||||||||| |||| ||||  ||||||||| ||||  |||||||||||  ||| ||||||| ||||| |||   | |||| || ||| |||| ||||||    
T  23060716 tgtgaagctg-tttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataatttaatatttaagatgttg-ttgact 23060619  T
Q  677 tgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgc-tgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 774  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  23060618 tgcaattgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatg 23060520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 83; E-Value: 7e-39
Query Start/End: Original strand, 595 - 693
Target Start/End: Original strand, 24642836 - 24642933
Alignment:
Q  595 atgatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattaattgaattatttgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattatta 693  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  24642836 atgatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattatta 24642933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 81; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 615 - 774
Target Start/End: Complemental strand, 22337281 - 22337122
Alignment:
Q  615 tgtgatataattgtatatgcattaattgaattatttgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatac 714  Q
    |||||||||||  |||| |||||| |||||||||   || ||| |||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  22337281 tgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttg-ttgtcttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttatatac 22337183  T
Q  715 tgc-tgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 774  Q
     || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  22337182 agcctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatg 22337122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 76; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 566 - 766
Target Start/End: Original strand, 23708524 - 23708725
Alignment:
Q  566 ttaacgatgatctgtgaagctgatttatgatgatttgatgttgtt-atattgtgatataattgtatatgcattaattgaattatttgtgaataattgaga 664  Q
    |||| ||||||||||||||||| | || ||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||  ||||||    
T  23708524 ttaatgatgatctgtgaagctgttataagatgaattgatgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatttgaatgtttgaga 23708623  T
Q  665 cgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgc-tgtgtcgctgt-tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 762  Q
     || ||| || ||||| |||||||| |||| |||||||||||| | ||||||| | ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  23708624 tgtcgat-gatttgcaattgatattgttatatcatgttgtttt-gcatactgcctatgttgctatctgttatttaactaagctgcttgagtcggtctaag 23708721  T
Q  763 ttga 766  Q
    ||||    
T  23708722 ttga 23708725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 74; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 575 - 774
Target Start/End: Complemental strand, 23076648 - 23076449
Alignment:
Q  575 atctgtgaagctgatttatgatgatttgatgttg-ttatattgtgatataattgtatatgcattaattgaattatttgtgaataattgagacgttgattg 673  Q
    ||||||||||||| |||| | ||  ||||||||| ||||  |||||||||||  ||| ||||||| ||||| |||   |||||| || |||  ||| |||    
T  23076648 atctgtgaagctg-tttaagctgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatattg-ttg 23076551  T
Q  674 acttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgc-tgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaaga 772  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  23076550 acttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtggatgaaga 23076451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 70; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 575 - 774
Target Start/End: Original strand, 22731149 - 22731348
Alignment:
Q  575 atctgtgaagctgatttatgatgatttgatgttg-ttatattgtgatataattgtatatgcattaattgaattatttgtgaataattgagacgttgattg 673  Q
    ||||||||||||| |||| ||||  ||||||||| ||||  |||||||||||  ||| ||||||| |||||  || | |||||| || | | |||||| |    
T  22731149 atctgtgaagctg-tttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaatatgttgat-g 22731246  T
Q  674 acttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgc-tgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaaga 772  Q
    | ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  22731247 aattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaacttgatgaaga 22731346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 65; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 575 - 774
Target Start/End: Original strand, 22738095 - 22738293
Alignment:
Q  575 atctgtgaagctgatttatgatgatttgatgttg-ttatattgtgatataattgtatatgcattaattgaattatttgtgaataattgagacgttgattg 673  Q
    ||||||||||||| |||| ||||  ||||||||| ||||  |||||||||||  ||| ||||||| |||||  || | |||||| || ||| |||||| |    
T  22738095 atctgtgaagctg-tttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgat-g 22738192  T
Q  674 acttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgctgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagat 773  Q
    | ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||    |   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  22738193 aattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtaaactgcctatttaatgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatcaagat 22738292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 65; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 702 - 774
Target Start/End: Original strand, 24643036 - 24643108
Alignment:
Q  702 tgtttttgtatactgctgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 774  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24643036 tgtttttgtatactgatgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 24643108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 61; E-Value: 9e-26
Query Start/End: Original strand, 575 - 774
Target Start/End: Complemental strand, 23286067 - 23285872
Alignment:
Q  575 atctgtgaagctgatttatgatgatttgatgttg-ttatattgtgatataattgtatatgcattaattgaattatttgtgaataattgagacgttgattg 673  Q
    ||||||||||||| |||| ||||  ||| ||||| ||||  |||||||||||  | ||||||||| |||||  |  | |||||| || ||| |||||| |    
T  23286067 atctgtgaagctg-tttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgttttatgcattacttgaagaacatttgaatatttaagatgttgat-g 23285970  T
Q  674 acttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgc-tgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaaga 772  Q
    | ||||| ||||||||||||||||    |||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  23285969 aattgcaattgatattattatgtc----tgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaaga 23285874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 58; E-Value: 5e-24
Query Start/End: Original strand, 682 - 774
Target Start/End: Original strand, 38136 - 38228
Alignment:
Q  682 ttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgc-tgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 774  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  38136 ttgatattattatgtcatgctgtttt-gtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatg 38228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 58; E-Value: 5e-24
Query Start/End: Original strand, 671 - 774
Target Start/End: Original strand, 298824 - 298929
Alignment:
Q  671 ttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgc-tgtgtcgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatt 768  Q
    |||| ||||| |||||||  |||||||||| || ||||||||||||| | ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  298824 ttgaattgcaattgatatatttatgtcatgctgattttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatt 298923  T
Q  769 aagatg 774  Q
    ||||||    
T  298924 aagatg 298929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 595 - 762
Target Start/End: Original strand, 7667 - 7835
Alignment:
Q  595 atgatttgatgttgttat-attgtgatataattgtatatgcattaattgaattatttgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattatta 693  Q
    ||||||| |||||||| | | |||||||||||||||||| ||||| ||||||||| | |||||  |||||| ||||| |||||||||||||||||| |||    
T  7667 atgatttaatgttgttgttaatgtgatataattgtatatacattacttgaattatatatgaatgtttgagatgttga-tgacttgcatttgatattgtta 7765  T
Q  694 tgtcatgttgtttttgtatactg-ctgtgtcgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 762  Q
    | |||||||| ||||| |||||| || ||| |||| |||||  ||||||||||||||||| || |||||||    
T  7766 tatcatgttg-ttttgcatactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgattcagtctaag 7835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 573 - 638
Target Start/End: Complemental strand, 29601543 - 29601478
Alignment:
Q  573 tgatctgtgaagctgatttatgatgatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcatta 638  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  29601543 tgatccgtgaagcttatttatgatgatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcatta 29601478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 53; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 615 - 774
Target Start/End: Original strand, 23654341 - 23654500
Alignment:
Q  615 tgtgatataattgtatatgcattaattgaattatttgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatac 714  Q
    |||||||||||  | ||||||||| |||| | ||   |||||| || ||| |||||| || ||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||| |    
T  23654341 tgtgatataatgttttatgcattacttgagtaatacttgaatatttaagatgttgat-gaattgcaattgatattattatgtcatgatgtatttgtatgc 23654439  T
Q  715 tgc-tgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 774  Q
    ||| | ||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  23654440 tgcctatgctgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatg 23654500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 53; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 615 - 774
Target Start/End: Complemental strand, 23660188 - 23660030
Alignment:
Q  615 tgtgatataattgtatatgcattaattgaattatttgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatac 714  Q
    |||||||||||  |||| |||||| |||| ||||   |||||| || ||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||||  |||||  ||||||    
T  23660188 tgtgatataatgttatacgcattacttgagttatgattgaatatttaagatgttg-ttgatttgcatttgatattattatgtcatcctgtttc-gtatac 23660091  T
Q  715 tgc-tgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 774  Q
    ||| | ||| ||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  23660090 tgcctatgttgctgttgttgtttaactaagatacatgagtcggtctaagttgatgaagatg 23660030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 595 - 654
Target Start/End: Original strand, 22173809 - 22173868
Alignment:
Q  595 atgatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattaattgaattatttgtga 654  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  22173809 atgatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtga 22173868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 724 - 774
Target Start/End: Original strand, 23040253 - 23040303
Alignment:
Q  724 gctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 774  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  23040253 gctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatg 23040303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 652 - 762
Target Start/End: Original strand, 23103389 - 23103497
Alignment:
Q  652 tgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgc-tgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatg 750  Q
    ||||| ||||||| |||||| || ||| ||||||||| || |||||||| |||||  ||||||||| | ||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  23103389 tgaatgattgagatgttgat-gaattgaatttgatataatcatgtcatgctgttt--gtatactgcctatgttgctgtttttatttaactaagctgcatg 23103485  T
Q  751 agtcggtctaag 762  Q
    ||||||||||||    
T  23103486 agtcggtctaag 23103497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 728 - 774
Target Start/End: Complemental strand, 7679638 - 7679592
Alignment:
Q  728 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 774  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  7679638 ttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgattaagatg 7679592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 705 - 774
Target Start/End: Complemental strand, 8946734 - 8946664
Alignment:
Q  705 ttttgtatactgc-tgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 774  Q
    ||||||||||||| | ||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  8946734 ttttgtatactgcctatgttgctattgttatctaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatg 8946664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #49
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 671 - 767
Target Start/End: Complemental strand, 28406088 - 28405990
Alignment:
Q  671 ttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgc-tgtgtcgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 767  Q
    |||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||||| ||||||| | ||| |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  28406088 ttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgattttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgat 28405990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #50
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 575 - 650
Target Start/End: Original strand, 22413050 - 22413126
Alignment:
Q  575 atctgtgaagctgatttatgatgatttgatgttgtt-atattgtgatataattgtatatgcattaattgaattattt 650  Q
    ||||||||||||| | || ||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||  ||||||||||    
T  22413050 atctgtgaagctgttataagatgatttgatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattattt 22413126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #51
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 595 - 762
Target Start/End: Complemental strand, 23207464 - 23207296
Alignment:
Q  595 atgatttgatgttgtta-tattgtgatataattgtatatgcattaattgaattatttgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattatta 693  Q
    ||||||||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||  |||||||||| | |||  |||||| || | |||| |||||||||||||| |||    
T  23207464 atgatttgatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatttat-aat-gttgagatgtcg-ttgatttgcatttgatattgtta 23207368  T
Q  694 tgtcatgttgt-ttttgtatactg-ctgtgtcgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 762  Q
    | |||||   | |||| ||||||| || ||| |||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  23207367 tatcatgaactgttttatatactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaag 23207296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #52
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 458 - 529
Target Start/End: Original strand, 27505142 - 27505213
Alignment:
Q  458 tcttaatttaattgactgaggatgactagtttatttagctattttaattcgcttaaataattatgtgttatt 529  Q
    |||||||||||||||  ||| |||||||||||| |||| |||||||||| || |||||||||| ||||||||    
T  27505142 tcttaatttaattgaacgagaatgactagtttagttagttattttaattggcataaataattacgtgttatt 27505213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #53
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 728 - 766
Target Start/End: Original strand, 18786971 - 18787009
Alignment:
Q  728 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 766  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18786971 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 18787009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #54
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 609 - 686
Target Start/End: Original strand, 22459511 - 22459587
Alignment:
Q  609 ttatattgtgatataattgtatatgcattaattgaattatttgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgat 686  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||| |||| |||| |||||||| |||||| ||||| |||||| ||||||||    
T  22459511 ttataatgtgatataattgtatatacattacttgagttatatgtgaatatttgagatgttga-tgactttcatttgat 22459587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #55
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 566 - 762
Target Start/End: Original strand, 20520098 - 20520295
Alignment:
Q  566 ttaacgatgatctgtgaagctgatttatgatgatttgatgttgtta-tattgtgatataattgtatatgcattaattgaattatttgtgaataattgaga 664  Q
    |||| ||| |||||||||| || | || ||||||||||||| |||| || ||||||||| |||||||||||||| ||||||||| | || ||  ||||||    
T  20520098 ttaatgataatctgtgaagttgttataagatgatttgatgtcgttaataatgtgatatatttgtatatgcattacttgaattatatatg-atgtttgaga 20520196  T
Q  665 cgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgttgt-ttttgtatactgc-tgtgtcgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 761  Q
     |||| |||| ||||| |||||||| |||| |||||   | |||| | |||||| | ||| |||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  20520197 tgttg-ttgatttgca-ttgatattgttatatcatgaactgttttatgtactgcatatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaa 20520294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #56
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 728 - 762
Target Start/End: Complemental strand, 20309161 - 20309127
Alignment:
Q  728 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 762  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20309161 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 20309127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #57
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 595 - 700
Target Start/End: Complemental strand, 23791461 - 23791357
Alignment:
Q  595 atgatttgatgttgtta-tattgtgatataattgtatatgcattaattgaattatttgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattatta 693  Q
    ||||||||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||  |||||||| | | |||  |||||| |||| |||| |||||||||||||| |||    
T  23791461 atgatttgatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatat-aatgtttgagatgttg-ttgatttgcatttgatattttta 23791364  T
Q  694 tgtcatg 700  Q
    | |||||    
T  23791363 tatcatg 23791357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #58
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 728 - 774
Target Start/End: Complemental strand, 25616238 - 25616192
Alignment:
Q  728 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 774  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  25616238 ttgtaatttaactaagttgcatgagtcagtctaagttgattaagatg 25616192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #59
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 724 - 760
Target Start/End: Original strand, 22134270 - 22134306
Alignment:
Q  724 gctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 760  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  22134270 gctgttgatatttaactaagctgcatgagtcggtcta 22134306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #60
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 730 - 774
Target Start/End: Original strand, 23072019 - 23072063
Alignment:
Q  730 gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 774  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||    
T  23072019 gttatttaactaagctgcatgagtcggactaagttgttgaagatg 23072063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #61
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 566 - 700
Target Start/End: Original strand, 24697512 - 24697644
Alignment:
Q  566 ttaacgatgatctgtgaagctgatttatgatgatttgatgttgtta-tattgtgatataattgtatatgcattaattgaattatttgtgaataattgaga 664  Q
    |||| |||||||||||||||||  | || ||||||| ||||||||| || |||||||||| |||||||||||||  |||||| | | ||||   ||||||    
T  24697512 ttaatgatgatctgtgaagctgtataat-atgattttatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattgtatatgaa-gtttgaga 24697609  T
Q  665 cgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatg 700  Q
     |||| |||| |||||||||||||| |||| |||||    
T  24697610 tgttg-ttgaattgcatttgatattgttatatcatg 24697644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #62
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 728 - 767
Target Start/End: Complemental strand, 25175903 - 25175864
Alignment:
Q  728 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 767  Q
    |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  25175903 ttgttatttaactaagctgcatgaatctgtctaagttgat 25175864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0454 (Bit Score: 145; Significance: 7e-76; HSPs: 1)
Name: scaffold0454
Description:

Target: scaffold0454; HSP #1
Raw Score: 145; E-Value: 7e-76
Query Start/End: Original strand, 598 - 774
Target Start/End: Complemental strand, 10952 - 10777
Alignment:
Q  598 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattaattgaattatttgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtc 697  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  10952 atttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttaaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtc 10854  T
Q  698 atgttgtttttgtatactgctgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 774  Q
    ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10853 atgatgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 10777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0230 (Bit Score: 145; Significance: 7e-76; HSPs: 1)
Name: scaffold0230
Description:

Target: scaffold0230; HSP #1
Raw Score: 145; E-Value: 7e-76
Query Start/End: Original strand, 598 - 774
Target Start/End: Complemental strand, 14126 - 13951
Alignment:
Q  598 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattaattgaattatttgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtc 697  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  14126 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtc 14028  T
Q  698 atgttgtttttgtatactgctgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 774  Q
    ||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14027 atgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttatctaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 13951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0056 (Bit Score: 145; Significance: 7e-76; HSPs: 2)
Name: scaffold0056
Description:

Target: scaffold0056; HSP #1
Raw Score: 145; E-Value: 7e-76
Query Start/End: Original strand, 566 - 762
Target Start/End: Original strand, 79235 - 79430
Alignment:
Q  566 ttaacgatgatctgtgaagctgatttatgatgatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattaattgaattatttgtgaataattgagac 665  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  79235 ttaatgatgatcagtgaagctgatttatgatgatttgatgttgttatattgtgatatacttgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagac 79334  T
Q  666 gttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgctgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 762  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  79335 gttg-ttgacttgcatttgaaattattatgtcatgctgtttttatatactgtcgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 79430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0056; HSP #2
Raw Score: 76; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 615 - 774
Target Start/End: Original strand, 17170 - 17331
Alignment:
Q  615 tgtgatataattgtatatgcattaattgaattatttgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgttgttttt--gtat 712  Q
    |||||||||||  || | |||||| |||||||||   || ||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||    
T  17170 tgtgatataatgttaaacgcattacttgaattatgaatgtatacttgagatgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttttgtat 17268  T
Q  713 actgc-tgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 774  Q
    ||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  17269 actgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatg 17331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0101 (Bit Score: 144; Significance: 3e-75; HSPs: 1)
Name: scaffold0101
Description:

Target: scaffold0101; HSP #1
Raw Score: 144; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 595 - 774
Target Start/End: Original strand, 1260 - 1439
Alignment:
Q  595 atgatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattaattgaattatttgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattat 694  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  1260 atgatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtgaataattgagacgatgattgacttgcatttgatattattat 1359  T
Q  695 gtcatgttgtttttgtatactgctgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 774  Q
    |||||| ||||||||||||||  |||||   |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1360 gtcatgctgtttttgtatactcatgtgttattgttgttatttaaccaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 1439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0444 (Bit Score: 141; Significance: 2e-73; HSPs: 1)
Name: scaffold0444
Description:

Target: scaffold0444; HSP #1
Raw Score: 141; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 598 - 774
Target Start/End: Complemental strand, 13571 - 13396
Alignment:
Q  598 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattaattgaattatttgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtc 697  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  13571 atttgatgttgttatactgtgatgtaattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtc 13473  T
Q  698 atgttgtttttgtatactgctgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 774  Q
    ||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13472 atgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 13396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028 (Bit Score: 141; Significance: 2e-73; HSPs: 6)
Name: scaffold0028
Description:

Target: scaffold0028; HSP #1
Raw Score: 141; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 598 - 774
Target Start/End: Complemental strand, 136859 - 136684
Alignment:
Q  598 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattaattgaattatttgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtc 697  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  136859 atttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtc 136761  T
Q  698 atgttgtttttgtatactgctgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 774  Q
    ||| ||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  136760 atgctgtatttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 136684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #2
Raw Score: 141; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 598 - 774
Target Start/End: Complemental strand, 139328 - 139153
Alignment:
Q  598 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattaattgaattatttgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtc 697  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  139328 atttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtc 139230  T
Q  698 atgttgtttttgtatactgctgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 774  Q
    ||| ||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  139229 atgctgtatttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 139153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #3
Raw Score: 141; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 598 - 774
Target Start/End: Complemental strand, 144266 - 144091
Alignment:
Q  598 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattaattgaattatttgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtc 697  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  144266 atttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtc 144168  T
Q  698 atgttgtttttgtatactgctgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 774  Q
    ||| ||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  144167 atgctgtatttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 144091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #4
Raw Score: 137; E-Value: 4e-71
Query Start/End: Original strand, 598 - 774
Target Start/End: Complemental strand, 134390 - 134215
Alignment:
Q  598 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattaattgaattatttgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtc 697  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  134390 atttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtc 134292  T
Q  698 atgttgtttttgtatactgctgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 774  Q
    ||| ||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  134291 atgctgtatttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctatgttgattaagatg 134215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #5
Raw Score: 137; E-Value: 4e-71
Query Start/End: Original strand, 598 - 774
Target Start/End: Complemental strand, 141797 - 141622
Alignment:
Q  598 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattaattgaattatttgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtc 697  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  141797 atttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtc 141699  T
Q  698 atgttgtttttgtatactgctgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 774  Q
    ||| ||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  141698 atgctgtatttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctacatgagtcggtctaagttgattaagatg 141622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #6
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 728 - 767
Target Start/End: Complemental strand, 132711 - 132672
Alignment:
Q  728 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 767  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||    
T  132711 ttgttatttatctaagctgcatgagtcggtctaagatgat 132672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1439 (Bit Score: 140; Significance: 6e-73; HSPs: 1)
Name: scaffold1439
Description:

Target: scaffold1439; HSP #1
Raw Score: 140; E-Value: 6e-73
Query Start/End: Original strand, 595 - 774
Target Start/End: Complemental strand, 288 - 110
Alignment:
Q  595 atgatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattaattgaattatttgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattat 694  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||    
T  288 atgatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgatttgcatttgatattattat 190  T
Q  695 gtcatgttgtttttgtatactgctgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 774  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  189 gtcatgttgtttttgtatactattgtgttgctgttgttatttaactaagctgcataagtcggtctaagttgattaagatg 110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037 (Bit Score: 140; Significance: 6e-73; HSPs: 2)
Name: scaffold0037
Description:

Target: scaffold0037; HSP #1
Raw Score: 140; E-Value: 6e-73
Query Start/End: Original strand, 595 - 774
Target Start/End: Complemental strand, 82254 - 82076
Alignment:
Q  595 atgatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattaattgaattatttgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattat 694  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||    
T  82254 atgatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgatttgcatttgatattattat 82156  T
Q  695 gtcatgttgtttttgtatactgctgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 774  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  82155 gtcatgctgtttttgtatactactgtgttgctgttgttatttaactaagcttcatgagtcggtctaagttgattaagatg 82076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037; HSP #2
Raw Score: 58; E-Value: 5e-24
Query Start/End: Original strand, 600 - 766
Target Start/End: Original strand, 22610 - 22776
Alignment:
Q  600 ttgatgttgtt-atattgtgatataattgtatatgcattaattgaattatttgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtca 698  Q
    ||||||||||| ||| ||| |||||||||||||| |||||  |||||||| | ||| || |||||| |||||| |||||||||| |||||| |||| |||    
T  22610 ttgatgttgtttataatgttatataattgtatatacattacatgaattatgtttga-tatttgagatgttgat-gacttgcattcgatattgttatatca 22707  T
Q  699 tgttgtttttgtatactg-ctgtgtcgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 766  Q
    || || ||| | |||||| || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22708 tgatgattt-gcatactgtctatgtcgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 22776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0363 (Bit Score: 137; Significance: 4e-71; HSPs: 1)
Name: scaffold0363
Description:

Target: scaffold0363; HSP #1
Raw Score: 137; E-Value: 4e-71
Query Start/End: Original strand, 598 - 774
Target Start/End: Complemental strand, 9421 - 9246
Alignment:
Q  598 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattaattgaattatttgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtc 697  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  9421 atttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttaaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtc 9323  T
Q  698 atgttgtttttgtatactgctgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 774  Q
    ||| ||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9322 atgatgtttttatatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 9246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0145 (Bit Score: 137; Significance: 4e-71; HSPs: 3)
Name: scaffold0145
Description:

Target: scaffold0145; HSP #1
Raw Score: 137; E-Value: 4e-71
Query Start/End: Original strand, 591 - 774
Target Start/End: Complemental strand, 9936 - 9753
Alignment:
Q  591 tatgatgatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattaattgaattatttgtgaa-taattgagacgttgattgacttgcatttgatatt 689  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  9936 tatgacgatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattatttgaattatatgtgaaataattgagacgttg-ttgacttgcacttgatatt 9838  T
Q  690 attatgtcatgttgtttttgtatactgctgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 774  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9837 attatgtcattctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 9753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0145; HSP #2
Raw Score: 66; E-Value: 9e-29
Query Start/End: Original strand, 575 - 774
Target Start/End: Complemental strand, 33147 - 32949
Alignment:
Q  575 atctgtgaagctgatttatgatgatttgatgttg-ttatattgtgatataattgtatatgcattaattgaattatttgtgaataattgagacgttgattg 673  Q
    ||||||||||||| |||| ||||  ||||||||| ||||  |||||||||||  ||| ||||||| ||||| |||   |||||| || ||| |||| ||     
T  33147 atctgtgaagctg-tttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttg-tta 33050  T
Q  674 acttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgc-tgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaaga 772  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| | ||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  33049 acttgcatttgatattattatgtcatgctgtttt-gtatactgcctatgttgctattgttatttaattaagctgcatgagtcggtctaacttgatgaaga 32951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0145; HSP #3
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 575 - 774
Target Start/End: Complemental strand, 38966 - 38768
Alignment:
Q  575 atctgtgaagctgatttatgatgatttgatgttg-ttatattgtgatataattgtatatgcattaattgaattatttgtgaataattgagacgttgattg 673  Q
    ||||||||||||| |||| ||||  ||||||||| ||||  |||||||||||  ||| ||||||| ||||| |||   |||||| || ||| |||| ||     
T  38966 atctgtgaagctg-tttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttt- 38869  T
Q  674 acttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgc-tgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaaga 772  Q
    | ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| | ||| ||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  38868 atttgcatttgatattattatgtcatgctgtttt-gtatactgcctatgttgctattgttatttaattaagctgcatgactcggtctaagttgatgaaga 38770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0149 (Bit Score: 134; Significance: 2e-69; HSPs: 1)
Name: scaffold0149
Description:

Target: scaffold0149; HSP #1
Raw Score: 134; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 591 - 764
Target Start/End: Complemental strand, 30118 - 29946
Alignment:
Q  591 tatgatgatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattaattgaattatttgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatatta 690  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||    
T  30118 tatgatgatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgaattatttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttacacttgatatta 30020  T
Q  691 ttatgtcatgttgtttttgtatactgctgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 764  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30019 ttatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 29946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0494 (Bit Score: 133; Significance: 9e-69; HSPs: 1)
Name: scaffold0494
Description:

Target: scaffold0494; HSP #1
Raw Score: 133; E-Value: 9e-69
Query Start/End: Original strand, 598 - 774
Target Start/End: Original strand, 12232 - 12407
Alignment:
Q  598 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattaattgaattatttgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtc 697  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  12232 atttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattaaatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattttgtc 12330  T
Q  698 atgttgtttttgtatactgctgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 774  Q
    ||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  12331 atgctgtttttgtattctgctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcataagtcggtctaagttgattaagatg 12407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044 (Bit Score: 133; Significance: 9e-69; HSPs: 1)
Name: scaffold0044
Description:

Target: scaffold0044; HSP #1
Raw Score: 133; E-Value: 9e-69
Query Start/End: Original strand, 598 - 774
Target Start/End: Complemental strand, 40579 - 40404
Alignment:
Q  598 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattaattgaattatttgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtc 697  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  40579 atttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgcattacttgaattttatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtc 40481  T
Q  698 atgttgtttttgtatactgctgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 774  Q
    ||  ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  40480 atcctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcacgagtcggtctaagttgattaagatg 40404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029 (Bit Score: 133; Significance: 9e-69; HSPs: 1)
Name: scaffold0029
Description:

Target: scaffold0029; HSP #1
Raw Score: 133; E-Value: 9e-69
Query Start/End: Original strand, 598 - 774
Target Start/End: Complemental strand, 11467 - 11292
Alignment:
Q  598 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattaattgaattatttgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtc 697  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  11467 atttgattttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtc 11369  T
Q  698 atgttgtttttgtatactgctgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 774  Q
    ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  11368 atgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaatttgattaagatg 11292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0394 (Bit Score: 129; Significance: 2e-66; HSPs: 1)
Name: scaffold0394
Description:

Target: scaffold0394; HSP #1
Raw Score: 129; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 595 - 774
Target Start/End: Complemental strand, 12240 - 12068
Alignment:
Q  595 atgatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattaattgaattatttgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattat 694  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  12240 atgatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattat 12142  T
Q  695 gtcatgttgtttttgtatactgctgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 774  Q
    |||||| |||||| |||||||||||||| ||||      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12141 gtcatgctgttttagtatactgctgtgttgctg------tttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 12068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0231 (Bit Score: 97; Significance: 3e-47; HSPs: 1)
Name: scaffold0231
Description:

Target: scaffold0231; HSP #1
Raw Score: 97; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 575 - 774
Target Start/End: Complemental strand, 23088 - 22890
Alignment:
Q  575 atctgtgaagctgatttatgatgatttgatgttg-ttatattgtgatataattgtatatgcattaattgaattatttgtgaataattgagacgttgattg 673  Q
    ||||||||||||| |||| ||||  ||||||||| |||   |||||||||||  ||| ||||||| ||||| |||   |||||| || ||| |||| |||    
T  23088 atctgtgaagctg-tttaagatgtgttgatgttgattacgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttg-ttg 22991  T
Q  674 acttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgctgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagat 773  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22990 acttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactggtgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagat 22891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0540 (Bit Score: 92; Significance: 3e-44; HSPs: 1)
Name: scaffold0540
Description:

Target: scaffold0540; HSP #1
Raw Score: 92; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 577 - 774
Target Start/End: Original strand, 3068 - 3264
Alignment:
Q  577 ctgtgaagctgatttatgatgatttgatgttg-ttatattgtgatataattgtatatgcattaattgaattatttgtgaataattgagacgttgattgac 675  Q
    ||||||||||| |||| ||||  ||||||||| ||||  |||||||||||  ||||||||||| |||||||||   || ||| |||||| |||| |||||    
T  3068 ctgtgaagctg-tttaagatgcgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatatgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttg-ttgac 3165  T
Q  676 ttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgc-tgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 774  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  3166 ttgcatttgatattattatgtcatgttgtttt-gtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatg 3264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016 (Bit Score: 86; Significance: 1e-40; HSPs: 1)
Name: scaffold0016
Description:

Target: scaffold0016; HSP #1
Raw Score: 86; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 575 - 774
Target Start/End: Complemental strand, 2057 - 1858
Alignment:
Q  575 atctgtgaagctgatttatgatgatttgatgttg-ttatattgtgatataattgtatatgcattaattgaattatttgtgaataattgagacgttgattg 673  Q
    |||||||||||| ||||| ||||  ||||||||| ||||  |||||||||||  ||| ||||||| |||||  || | |||||| || ||| |||||| |    
T  2057 atctgtgaagct-atttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgat-g 1960  T
Q  674 acttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactg-ctgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaaga 772  Q
    | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  1959 aattgcaattgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgtctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaaga 1860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0122 (Bit Score: 85; Significance: 4e-40; HSPs: 2)
Name: scaffold0122
Description:

Target: scaffold0122; HSP #1
Raw Score: 85; E-Value: 4e-40
Query Start/End: Original strand, 671 - 774
Target Start/End: Original strand, 44717 - 44821
Alignment:
Q  671 ttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgc-tgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatta 769  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  44717 ttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatta 44816  T
Q  770 agatg 774  Q
    |||||    
T  44817 agatg 44821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0122; HSP #2
Raw Score: 82; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 575 - 774
Target Start/End: Original strand, 25980 - 26179
Alignment:
Q  575 atctgtgaagctgatttatgatgatttgatgttg-ttatattgtgatataattgtatatgcattaattgaattatttgtgaataattgagacgttgattg 673  Q
    |||| |||||||| |||| ||||  ||||||||| ||||  |||||||||||  || | |||||| |||||||||   || ||| ||||||||||| |||    
T  25980 atctatgaagctg-tttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttaaacgcattacttgaattatgaatgtatacttgagacgttg-ttg 26077  T
Q  674 acttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgc-tgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaaga 772  Q
    | || |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  26078 aattacatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaaga 26177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022 (Bit Score: 84; Significance: 2e-39; HSPs: 3)
Name: scaffold0022
Description:

Target: scaffold0022; HSP #1
Raw Score: 84; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 671 - 774
Target Start/End: Complemental strand, 116536 - 116434
Alignment:
Q  671 ttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgctgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaa 770  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  116536 ttgacttgcatttgatatgattatgtcatgctgtttt-gtatactgttgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaa 116438  T
Q  771 gatg 774  Q
    ||||    
T  116437 gatg 116434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #2
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 585 - 762
Target Start/End: Original strand, 128895 - 129072
Alignment:
Q  585 ctgatttatgatgatttgatgttgtt-atattgtgatataattgtatatgcattaattgaattatttgtgaataattgagacgttgattgacttgcattt 683  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||||||| |||||  |||||||| | || ||  |||||| |||| |||| ||||||||    
T  128895 ctgattta-gatgatttgatgttgttaataatgtgatatatttgtatatccattacatgaattatatatg-atgtttgagatgttg-ttgatttgcattt 128991  T
Q  684 gatattattatgtcatg--ttgtttttgtatactg-ctgtgtcgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 762  Q
    |||||| |||| |||||  ||| |||| | ||||| || ||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  128992 gatattgttatatcatgaattg-ttttatgtactgcctatgttgctgtttgtta-ttaactaagctgcatgagtcggtctaag 129072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #3
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 595 - 648
Target Start/End: Complemental strand, 78508 - 78454
Alignment:
Q  595 atgatttgatgttgtta-tattgtgatataattgtatatgcattaattgaattat 648  Q
    ||||||||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||  ||||||||    
T  78508 atgatttgatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattat 78454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0228 (Bit Score: 83; Significance: 7e-39; HSPs: 3)
Name: scaffold0228
Description:

Target: scaffold0228; HSP #1
Raw Score: 83; E-Value: 7e-39
Query Start/End: Original strand, 575 - 767
Target Start/End: Complemental strand, 4713 - 4522
Alignment:
Q  575 atctgtgaagctgatttatgatgatttgatgttg-ttatattgtgatataattgtatatgcattaattgaattatttgtgaataattgagacgttgattg 673  Q
    ||||||||||||| |||| ||||  ||||||||| ||||  |||||||||||  |||| |||||| |||||||||   || ||| |||||| |||| |||    
T  4713 atctgtgaagctg-tttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttg-ttg 4616  T
Q  674 acttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgc-tgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 767  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  4615 acttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttatatactgcttgtgttgctgttgttatttaactaagc-gcatgagtcggtctaagttgat 4522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0228; HSP #2
Raw Score: 83; E-Value: 7e-39
Query Start/End: Original strand, 575 - 767
Target Start/End: Complemental strand, 12295 - 12104
Alignment:
Q  575 atctgtgaagctgatttatgatgatttgatgttg-ttatattgtgatataattgtatatgcattaattgaattatttgtgaataattgagacgttgattg 673  Q
    ||||||||||||| |||| ||||  ||||||||| ||||  |||||||||||  |||| |||||| |||||||||   || ||| |||||| |||| |||    
T  12295 atctgtgaagctg-tttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttg-ttg 12198  T
Q  674 acttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgc-tgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 767  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  12197 acttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttatatactgcttgtgttgctgttgttatttaactaagc-gcatgagtcggtctaagttgat 12104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0228; HSP #3
Raw Score: 83; E-Value: 7e-39
Query Start/End: Original strand, 575 - 767
Target Start/End: Complemental strand, 22247 - 22056
Alignment:
Q  575 atctgtgaagctgatttatgatgatttgatgttg-ttatattgtgatataattgtatatgcattaattgaattatttgtgaataattgagacgttgattg 673  Q
    ||||||||||||| |||| ||||  ||||||||| ||||  |||||||||||  |||| |||||| |||||||||   || ||| |||||| |||| |||    
T  22247 atctgtgaagctg-tttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttg-ttg 22150  T
Q  674 acttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgc-tgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 767  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  22149 acttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttatatactgcttgtgttgctgttgttatttaactaagc-gcatgagtcggtctaagttgat 22056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0193 (Bit Score: 79; Significance: 2e-36; HSPs: 1)
Name: scaffold0193
Description:

Target: scaffold0193; HSP #1
Raw Score: 79; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 578 - 774
Target Start/End: Complemental strand, 13414 - 13218
Alignment:
Q  578 tgtgaagctgatttatgatgatttgatgttg-ttatattgtgatataattgtatatgcattaattgaattatttgtgaataattgagacgttgattgact 676  Q
    |||||||||| |||| ||||  ||||||||| ||||  |||||||||||  ||||||||||| |||||  || | |||||| || ||| |||||| || |    
T  13414 tgtgaagctg-tttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgat-gaat 13317  T
Q  677 tgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgc-tgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 774  Q
    |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||    
T  13316 tgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatg 13218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011 (Bit Score: 78; Significance: 6e-36; HSPs: 2)
Name: scaffold0011
Description:

Target: scaffold0011; HSP #1
Raw Score: 78; E-Value: 6e-36
Query Start/End: Original strand, 575 - 774
Target Start/End: Complemental strand, 52119 - 51920
Alignment:
Q  575 atctgtgaagctgatttatgatgatttgatgttg-ttatattgtgatataattgtatatgcattaattgaattatttgtgaataattgagacgttgattg 673  Q
    ||||||||||||| |||| ||||  ||||||| | |||| ||||||||||||  ||| ||||||| ||||| |||   |||||| || ||| | || |||    
T  52119 atctgtgaagctg-tttaagatgtgttgatgtagattatgttgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgatg-ttg 52022  T
Q  674 acttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgc-tgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaaga 772  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  52021 acttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatattgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaaga 51922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #2
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 615 - 774
Target Start/End: Original strand, 167934 - 168092
Alignment:
Q  615 tgtgatataattgtatatgcattaattgaattatttgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatac 714  Q
    ||||||||||| || ||||||||| |||||| || | |||||| || ||| |||||| || ||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  167934 tgtgatataat-gtttatgcattacttgaataatatttgaatatttaagatgttgat-gaattgcaattgatattattatgtcatgctatttttgtatac 168031  T
Q  715 tgc-tgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 774  Q
    ||| | ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  168032 tgcctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatg 168092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0217 (Bit Score: 77; Significance: 2e-35; HSPs: 1)
Name: scaffold0217
Description:

Target: scaffold0217; HSP #1
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 615 - 774
Target Start/End: Original strand, 16555 - 16714
Alignment:
Q  615 tgtgatataattgtatatgcattaattgaattatttgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatac 714  Q
    |||||||||||  |||| |||||| |||||||||   || ||| |||||| | || ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  16555 tgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtatacttgagatgctg-ttgacttccatttgatattattatgtcatgctgttttcgtatac 16653  T
Q  715 tgct-gtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 774  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  16654 tgcttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaaattgatgaagatg 16714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0908 (Bit Score: 76; Significance: 1e-34; HSPs: 1)
Name: scaffold0908
Description:

Target: scaffold0908; HSP #1
Raw Score: 76; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 577 - 774
Target Start/End: Original strand, 3103 - 3300
Alignment:
Q  577 ctgtgaagctgatttatgatgatttgatgttg-ttatattgtgatataattgtatatgcattaattgaattatttgtgaataattgagacgttgattgac 675  Q
    ||||||||||| |||| ||||  ||||||||| ||||  |||||||||||  || | |||||| |||||||||   || ||| |||||| |||| ||||     
T  3103 ctgtgaagctg-tttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttaaacgcattacttgaattatgaatgtatacttgagatgttg-ttgaa 3200  T
Q  676 ttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgc-tgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 774  Q
    || |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  3201 ttacatttgatattattatatcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatg 3300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0141 (Bit Score: 76; Significance: 1e-34; HSPs: 1)
Name: scaffold0141
Description:

Target: scaffold0141; HSP #1
Raw Score: 76; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 575 - 772
Target Start/End: Complemental strand, 39682 - 39486
Alignment:
Q  575 atctgtgaagctgatttatgatgatttgatgttg-ttatattgtgatataattgtatatgcattaattgaattatttgtgaataattgagacgttgattg 673  Q
    |||| |||||||| |||| ||||  ||||||||| ||||  |||||||||||  ||| ||||||| |||||||||   || ||| |||||| |||| |||    
T  39682 atctatgaagctg-tttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttg-ttg 39585  T
Q  674 acttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgc-tgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaaga 772  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| | ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  39584 acttgcatttgatattattatgtcatgctgtttt-gtatactgcctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaaga 39486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0074 (Bit Score: 76; Significance: 1e-34; HSPs: 1)
Name: scaffold0074
Description:

Target: scaffold0074; HSP #1
Raw Score: 76; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 598 - 774
Target Start/End: Original strand, 38639 - 38816
Alignment:
Q  598 atttgatgttgtt-atattgtgatataattgtatatgcattaattgaattatttgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgt 696  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||| | | |||| ||||||  ||||| ||||||||||||||||| |||| |    
T  38639 atttgatgttgtttatattgtgatataattgtatacgcaatacttgaattatatataaatatttgagatattgat-gacttgcatttgatattgttatat 38737  T
Q  697 catgttgtttttgtatactg-ctgtgtcgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 774  Q
    ||||||||||| | |||||| || ||| |||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  38738 catgttgtttt-gcatactgtctatgttgctgtttgttatttaactaaggtgcatgagtaggtctaagttgattaagatg 38816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0049 (Bit Score: 76; Significance: 1e-34; HSPs: 1)
Name: scaffold0049
Description:

Target: scaffold0049; HSP #1
Raw Score: 76; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 575 - 772
Target Start/End: Original strand, 75130 - 75326
Alignment:
Q  575 atctgtgaagctgatttatgatgatttgatgttg-ttatattgtgatataattgtatatgcattaattgaattatttgtgaataattgagacgttgattg 673  Q
    |||| |||||||| |||| ||||  ||||||||| ||||  |||||||||||  ||| ||||||| |||||||||   || ||| |||||| |||| |||    
T  75130 atctatgaagctg-tttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttg-ttg 75227  T
Q  674 acttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgc-tgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaaga 772  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| | ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  75228 acttgcatttgatattattatgtcatgctgtttt-gtatactgcctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaaga 75326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0461 (Bit Score: 73; Significance: 6e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold0461
Description:

Target: scaffold0461; HSP #1
Raw Score: 73; E-Value: 6e-33
Query Start/End: Original strand, 566 - 763
Target Start/End: Complemental strand, 11680 - 11482
Alignment:
Q  566 ttaacgatgatctgtgaagctgatttatgatgatttgatgttgtt-atattgtgatataattgtatatgcattaattgaattatttgtgaataattgaga 664  Q
    |||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| || ||||||    
T  11680 ttaatgatgatctgtgaagctgagtgatgatgatttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgattatttgaga 11581  T
Q  665 cgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactg-ctgtgtcgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 762  Q
     |||| || |||| | |  ||||||||||| ||||| || ||||| |||||| || ||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||  ||||||    
T  11580 tgttg-tttacttacgtgcgatattattatatcatgatg-ttttgcatactgcctatgttgctgattgttaattaactaagctgcatgagtcaatctaag 11483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0046 (Bit Score: 73; Significance: 6e-33; HSPs: 4)
Name: scaffold0046
Description:

Target: scaffold0046; HSP #1
Raw Score: 73; E-Value: 6e-33
Query Start/End: Original strand, 671 - 774
Target Start/End: Complemental strand, 28525 - 28421
Alignment:
Q  671 ttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgc-tgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatta 769  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  28525 ttgaattgcaattgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgcctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatga 28426  T
Q  770 agatg 774  Q
    |||||    
T  28425 agatg 28421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0046; HSP #2
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 728 - 774
Target Start/End: Complemental strand, 2050 - 2004
Alignment:
Q  728 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 774  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  2050 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatg 2004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0046; HSP #3
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 728 - 774
Target Start/End: Complemental strand, 4605 - 4559
Alignment:
Q  728 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 774  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  4605 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatg 4559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0046; HSP #4
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 728 - 774
Target Start/End: Complemental strand, 11345 - 11299
Alignment:
Q  728 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 774  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  11345 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatg 11299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0503 (Bit Score: 71; Significance: 9e-32; HSPs: 2)
Name: scaffold0503
Description:

Target: scaffold0503; HSP #1
Raw Score: 71; E-Value: 9e-32
Query Start/End: Original strand, 575 - 669
Target Start/End: Complemental strand, 12135 - 12041
Alignment:
Q  575 atctgtgaagctgatttatgatgatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattaattgaattatttgtgaataattgagacgttg 669  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  12135 atctgtgaagctgatttatgatgatttgatactgttatattgtgatataattgtatatgcattgcttgaattatatgtgaataattgaggcgttg 12041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0503; HSP #2
Raw Score: 51; E-Value: 8e-20
Query Start/End: Original strand, 700 - 762
Target Start/End: Complemental strand, 12044 - 11982
Alignment:
Q  700 gttgtttttgtatactgctgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 762  Q
    |||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12044 gttgttttggtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 11982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0357 (Bit Score: 71; Significance: 9e-32; HSPs: 2)
Name: scaffold0357
Description:

Target: scaffold0357; HSP #1
Raw Score: 71; E-Value: 9e-32
Query Start/End: Original strand, 571 - 766
Target Start/End: Original strand, 16010 - 16206
Alignment:
Q  571 gatgatctgtgaagctgatttatgatgatttgatgttg-ttatattgtgatataattgtatatgcattaattgaattatttgtgaataattgagacgttg 669  Q
    ||||||||||||||||| | || ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |  ||||  |||||| ||||    
T  16010 gatgatctgtgaagctgttataagatgatttgatgttggttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatataagaatgtttgagatgttg 16109  T
Q  670 attgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatact-gctgtgtcgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 766  Q
     |||| || ||||||||||| |||| |||||||| ||||| |||||  || ||| | || |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16110 -ttgatttacatttgatattgttatatcatgttg-ttttgcatactacctatgttgttgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 16206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0357; HSP #2
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 571 - 762
Target Start/End: Complemental strand, 13340 - 13147
Alignment:
Q  571 gatgatctgtgaagctgatttatgatgatttgatgttg-ttatattgtgatataattgtatatgcattaattgaattatttgtgaat-aattgagacgtt 668  Q
    ||||||||||||||||| | || ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||   || ||| |||    
T  13340 gatgatctgtgaagctgttataagatgatttgatgttggttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatatgaatggtttcagatgtt 13241  T
Q  669 gattgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactg-ctgtgtcgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 762  Q
    | |||| |||||||||||||| |||| ||||| || ||||| |||||| || ||| | || |||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  13240 g-ttgatttgcatttgatattgttatatcatgctg-ttttgcatactgcctatgttgttgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaag 13147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0165 (Bit Score: 71; Significance: 9e-32; HSPs: 2)
Name: scaffold0165
Description:

Target: scaffold0165; HSP #1
Raw Score: 71; E-Value: 9e-32
Query Start/End: Original strand, 571 - 766
Target Start/End: Original strand, 27659 - 27855
Alignment:
Q  571 gatgatctgtgaagctgatttatgatgatttgatgttg-ttatattgtgatataattgtatatgcattaattgaattatttgtgaataattgagacgttg 669  Q
    ||||||||||||||||| | || ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||||| |||||||  |||||| ||||    
T  27659 gatgatctgtgaagctgttataagatgatttgatgttggttataatgtgatataattgtatatgcattactagaattatatgtgaatgtttgagatgttg 27758  T
Q  670 attgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatact-gctgtgtcgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 766  Q
     |||| || ||||||||||| |||| ||||| || ||||| |||||  || ||| | || |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27759 -ttgatttacatttgatattgttatatcatgctg-ttttgcatactacctatgttgttgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 27855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0165; HSP #2
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 571 - 626
Target Start/End: Original strand, 27577 - 27633
Alignment:
Q  571 gatgatctgtgaagctgatttatgatgatttgatgtt-gttatattgtgatataatt 626  Q
    ||||||||||||||||| | || |||||||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  27577 gatgatctgtgaagctgttataagatgatttgatgttggttataatgtgatataatt 27633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1842 (Bit Score: 69; Significance: 1e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold1842
Description:

Target: scaffold1842; HSP #1
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 615 - 774
Target Start/End: Original strand, 1004 - 1162
Alignment:
Q  615 tgtgatataattgtatatgcattaattgaattatttgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatac 714  Q
    ||||||||||| || ||||||||| |||||| || | |||||| || ||| |||||| || ||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  1004 tgtgatataat-gtttatgcattacttgaataatatttgaatatttaagatgttgat-gaattgcaattgatattattatgtcatgctatttttgtatac 1101  T
Q  715 tgc-tgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 774  Q
    ||| | ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  1102 tgcctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatg 1162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026 (Bit Score: 69; Significance: 1e-30; HSPs: 2)
Name: scaffold0026
Description:

Target: scaffold0026; HSP #1
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 575 - 773
Target Start/End: Complemental strand, 26101 - 25904
Alignment:
Q  575 atctgtgaagctgatttatgatgatttgatgttg-ttatattgtgatataattgtatatgcattaattgaattatttgtgaataattgagacgttgattg 673  Q
    ||||||||||||| |||| ||||  ||||||||| ||||  |||||||||||  || |||||||| ||||| |||   |||||| |||||| |||| ||     
T  26101 atctgtgaagctg-tttaagatgcgttgatgttgattatgatgtgatataatgttaaatgcattacttgaagtataattgaatatttgagatgttgttt- 26004  T
Q  674 acttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgc-tgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaaga 772  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||| | ||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  26003 acttgcatttgatattattatgtcatgatatttt-gtatactgcctatgttgctattgttatttaactaagcttcatgagtcggtctaagttgatgaaga 25905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026; HSP #2
Raw Score: 63; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 578 - 774
Target Start/End: Complemental strand, 40060 - 39865
Alignment:
Q  578 tgtgaagctgatttatgatgatttgatgttg-ttatattgtgatataattgtatatgcattaattgaattatttgtgaataattgagacgttgattgact 676  Q
    |||||||||| |||| ||||  ||||||||| ||||  |||||||||||  || |||||||| ||||| |||   |||||| |||||| |||| || |||    
T  40060 tgtgaagctg-tttaagatgcgttgatgttgattatgatgtgatataatgttaaatgcattacttgaagtataattgaatatttgagatgttgttt-act 39963  T
Q  677 tgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgc-tgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 774  Q
    |||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||| | ||| ||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  39962 tgcatttgatattattatgtcatgatatttt-gtatactgcctatgttgctattgttatttaactaagcttcatgagttggtctaagttgatgaagatg 39865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0075 (Bit Score: 67; Significance: 2e-29; HSPs: 1)
Name: scaffold0075
Description:

Target: scaffold0075; HSP #1
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 595 - 762
Target Start/End: Original strand, 53483 - 53651
Alignment:
Q  595 atgatttgatgttgtt-atattgtgatataattgtatatgcattaattgaattatttgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattatta 693  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||| | |||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||| |||    
T  53483 atgatttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatacattacttgaattatatatgaatatttgagatgttga-tgacttgcatttgatattgtta 53581  T
Q  694 tgtcatgttgtttttgtatactg-ctgtgtcgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 762  Q
    | |||||||| ||||| |||||| || ||| |||| |||||  ||||||||||||||||| || |||||||    
T  53582 tatcatgttg-ttttgcatactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgaatcagtctaag 53651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0621 (Bit Score: 66; Significance: 9e-29; HSPs: 2)
Name: scaffold0621
Description:

Target: scaffold0621; HSP #1
Raw Score: 66; E-Value: 9e-29
Query Start/End: Original strand, 595 - 766
Target Start/End: Complemental strand, 8655 - 8481
Alignment:
Q  595 atgatttgatgttgtt-atattgtgatataat--tgtatatgcattaattgaattatttgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattat 691  Q
    |||| ||||||||||| ||| |||||||||||  ||||||| ||||| ||||||||| | |||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||| |    
T  8655 atgaattgatgttgtttataatgtgatataatattgtatatacattacttgaattatatatgaatatttgagatgttgat-gacttgcatttgatattgt 8557  T
Q  692 tatgtcatgttgtttttgtatactgc-tgtgtcgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 766  Q
    ||| ||||| |||||| | ||||||| | ||| | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8556 tatatcatgctgtttt-gcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 8481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0621; HSP #2
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 619 - 767
Target Start/End: Complemental strand, 6695 - 6549
Alignment:
Q  619 atataattgtatatgcattaattgaattatttgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgc- 717  Q
    |||||||||||||| |||||  ||||||||  ||  ||| |||||| |||| |||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | |||||||     
T  6695 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttg-ttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcc 6600  T
Q  718 tgtgtcgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 767  Q
    | ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6599 tatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 6549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0490 (Bit Score: 66; Significance: 9e-29; HSPs: 1)
Name: scaffold0490
Description:

Target: scaffold0490; HSP #1
Raw Score: 66; E-Value: 9e-29
Query Start/End: Original strand, 630 - 762
Target Start/End: Complemental strand, 2103 - 1971
Alignment:
Q  630 tatgcattaattgaattatttgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgc-tgtgtcgctgt 728  Q
    ||||||||| |||||| || | |||||| || ||| |||| |||| ||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||||    
T  2103 tatgcattacttgaataatgtttgaatatttaagatgttg-ttgaattgcaattgatatcattatgtcatgttgattttgtatactgcctatgtcgctgt 2005  T
Q  729 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 762  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  2004 tgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaag 1971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0403 (Bit Score: 66; Significance: 9e-29; HSPs: 1)
Name: scaffold0403
Description:

Target: scaffold0403; HSP #1
Raw Score: 66; E-Value: 9e-29
Query Start/End: Original strand, 575 - 774
Target Start/End: Complemental strand, 5055 - 4856
Alignment:
Q  575 atctgtgaagctgatttatgatgatttgatgttg-ttatattgtgatataattgtatatgcattaattga--attatttgtgaataattgagacgttgat 671  Q
    ||||||||||||| |||| ||||  ||| ||||| ||||  |||||||||||  | ||||||||| ||||  ||||||||  |||| || ||| |||| |    
T  5055 atctgtgaagctg-tttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgttttatgcattacttgagaattatttg--aatacttaagatgttg-t 4960  T
Q  672 tgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgc-tgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaa 770  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||    
T  4959 tgaattgcatttgatattattatgtcatgctgattttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaatctgcatgagtcggtctaagttgttgaa 4860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0292 (Bit Score: 66; Significance: 9e-29; HSPs: 2)
Name: scaffold0292
Description:

Target: scaffold0292; HSP #1
Raw Score: 66; E-Value: 9e-29
Query Start/End: Original strand, 575 - 774
Target Start/End: Complemental strand, 3676 - 3477
Alignment:
Q  575 atctgtgaagctgatttatgatgatttgatgttg-ttatattgtgatataattgtatatgcattaattgaattatttgtgaataattgagacgttgattg 673  Q
    |||| |||||||| |||| ||||  ||||||||| ||||  |||||||||||  ||| ||||||| |||||  || | |||||| || ||| |||||| |    
T  3676 atctatgaagctg-tttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatttgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgat-g 3579  T
Q  674 acttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgc-tgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaaga 772  Q
    | ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||| ||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  3578 aattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctttagttatttaactaagctacatgagtcggtctaagttgatgaaga 3479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0292; HSP #2
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 671 - 774
Target Start/End: Complemental strand, 453 - 350
Alignment:
Q  671 ttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgc-tgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatta 769  Q
    ||||||| || |||||||||||| |||||| | |||| ||||||||| | |||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |    
T  453 ttgacttccaattgatattattacgtcatgctatttt-gtatactgcctatgttattgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgataa 355  T
Q  770 agatg 774  Q
    |||||    
T  354 agatg 350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120 (Bit Score: 65; Significance: 4e-28; HSPs: 5)
Name: scaffold0120
Description:

Target: scaffold0120; HSP #1
Raw Score: 65; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 671 - 774
Target Start/End: Original strand, 32967 - 33070
Alignment:
Q  671 ttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgc-tgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatta 769  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  32967 ttgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttt-gtatactgcctgtgttgctgttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatga 33065  T
Q  770 agatg 774  Q
    |||||    
T  33066 agatg 33070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120; HSP #2
Raw Score: 65; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 671 - 774
Target Start/End: Complemental strand, 46038 - 45935
Alignment:
Q  671 ttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgc-tgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatta 769  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  46038 ttgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttt-gtatactgcctgtgttgctgttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatga 45940  T
Q  770 agatg 774  Q
    |||||    
T  45939 agatg 45935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120; HSP #3
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 616 - 774
Target Start/End: Complemental strand, 16278 - 16120
Alignment:
Q  616 gtgatataattgtatatgcattaattgaattatttgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatact 715  Q
    ||||||||||  ||||||||||| |||| ||||   || ||| |||||| | || ||| ||||||||||||||||| || || || ||||||||||||||    
T  16278 gtgatataatgttatatgcattacttgagttatgaatgtatacttgagatgatg-ttggcttgcatttgatattatgatatcttgctgtttttgtatact 16180  T
Q  716 gc-tgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 774  Q
    || | ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  16179 gcctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatg 16120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120; HSP #4
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 719 - 774
Target Start/End: Original strand, 17388 - 17443
Alignment:
Q  719 gtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 774  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  17388 gtgttgctgttgttatttaactaagctacatgagtcggtctaagttgatgaagatg 17443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120; HSP #5
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 62
Target Start/End: Complemental strand, 29342 - 29287
Alignment:
Q  1 aagtgtaggattggttttagagaatagaatttgaaaaaaggtttaacctttgtagttgttaa 62  Q
    |||||||||||||||||||||     |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  29342 aagtgtaggattggttttaga-----gaatttgaaaaagggtttaacc-ttgtagttgttaa 29287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012 (Bit Score: 65; Significance: 4e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0012
Description:

Target: scaffold0012; HSP #1
Raw Score: 65; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 572 - 707
Target Start/End: Complemental strand, 225616 - 225482
Alignment:
Q  572 atgatctgtgaagctgatttatgatgatttgatgttgtt-atattgtgatataattgtatatgcattaattgaattatttgtgaataattgagacgttga 670  Q
    |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||  |||||| ||||     
T  225616 atgaactgtgaagctgatatatgatgatttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatatgaatgtttgagatgttg- 225518  T
Q  671 ttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttt 707  Q
    |||| ||||||||||||||||||| ||| | ||||||    
T  225517 ttga-ttgcatttgatattattatatcacgctgtttt 225482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0327 (Bit Score: 64; Significance: 1e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold0327
Description:

Target: scaffold0327; HSP #1
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 575 - 717
Target Start/End: Original strand, 3444 - 3586
Alignment:
Q  575 atctgtgaagctgatttatgatgatttgatgttg-ttatattgtgatataattgtatatgcattaattgaattatttgtgaataattgagacgttgattg 673  Q
    |||| |||||||| |||| ||||  ||||||||| ||||  |||||||||||  |||| |||||| |||||||||  ||| |||||||||| |||| |||    
T  3444 atctatgaagctgttttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgagtgtataattgagatgttg-ttg 3542  T
Q  674 acttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgc 717  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  3543 acttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc 3586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0121 (Bit Score: 64; Significance: 1e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold0121
Description:

Target: scaffold0121; HSP #1
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 575 - 774
Target Start/End: Original strand, 8448 - 8643
Alignment:
Q  575 atctgtgaagctgatttatgatgatttgatgttg-ttatattgtgatataattgtatatgcattaattgaattatttgtgaataattgagacgttgattg 673  Q
    ||||||||||||| |||| ||||  ||||||||| |||| ||||||||||||  ||| ||||||| ||||| |||   |||||| || ||| | || |||    
T  8448 atctgtgaagctg-tttaagatgtgttgatgttgattatgttgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgatg-ttg 8545  T
Q  674 acttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactg-ctgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaaga 772  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||||| || |||   || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  8546 acttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttg-atactgcctatgt---tgctgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaaga 8641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080 (Bit Score: 62; Significance: 2e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold0080
Description:

Target: scaffold0080; HSP #1
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 670 - 774
Target Start/End: Complemental strand, 40024 - 39920
Alignment:
Q  670 attgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgc-tgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatt 768  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||| ||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||     
T  40024 attgacatgcatttgatattattatgtcatgttgtttt-gtatactgcctatgttgctattgttatttaattaagctgcatgagttggtctaagttgatg 39926  T
Q  769 aagatg 774  Q
    ||||||    
T  39925 aagatg 39920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0042 (Bit Score: 62; Significance: 2e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold0042
Description:

Target: scaffold0042; HSP #1
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 575 - 763
Target Start/End: Original strand, 24216 - 24406
Alignment:
Q  575 atctgtgaagctgatttatgatgatttgatgttg--ttatattgtgatataattgtatatgcattaattgaattatttgtgaataattgagacgttgatt 672  Q
    ||||||||||||| |||| ||||  |||||||||  ||||  |||||||||||  ||| ||||||| |||||  || | |||||| || ||| ||||||     
T  24216 atctgtgaagctg-tttaagatgtgttgatgttgaattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgat- 24313  T
Q  673 gacttgcatttgatattattatgtcatgttgt-ttttgtatactgc-tgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagt 763  Q
    || ||||| |||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24314 gaattgcaattgatatttttatgtcatgctgtgttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagt 24406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0639 (Bit Score: 61; Significance: 9e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold0639
Description:

Target: scaffold0639; HSP #1
Raw Score: 61; E-Value: 9e-26
Query Start/End: Original strand, 671 - 774
Target Start/End: Complemental strand, 8590 - 8486
Alignment:
Q  671 ttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgc-tgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatta 769  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||| | | ||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |    
T  8590 ttgacttgcaattgatattattatgtcatactgtttttgtatactacctatgttgctattgttatttaaccaagctgcatgagtcggtctaagttgatga 8491  T
Q  770 agatg 774  Q
    |||||    
T  8490 agatg 8486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0647 (Bit Score: 60; Significance: 3e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0647
Description:

Target: scaffold0647; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 578 - 774
Target Start/End: Original strand, 6039 - 6238
Alignment:
Q  578 tgtgaagctgatttatgatgatttgatgttg-ttatattgtgatataattgtatatgcattaattgaattatttgtgaataattgagacgttgattgact 676  Q
    |||||||||| |||| ||||  ||||||||| ||||  |||||||||||  ||| ||||||| |||||  || | |||||| || ||| |||||| || |    
T  6039 tgtgaagctg-tttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgat-gaat 6136  T
Q  677 tgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgc---tgt-gtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaaga 772  Q
    |||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||| |   ||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  6137 tgcaattgatattatcatgtcatgctgtttttgtatactacctatgttgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaaga 6236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124 (Bit Score: 60; Significance: 3e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0124
Description:

Target: scaffold0124; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 566 - 763
Target Start/End: Original strand, 38159 - 38359
Alignment:
Q  566 ttaacgatgatctgtgaagc--tgatttatgatgatttgatgttgtt-atattgtgatataattgtatatgcattaattgaattatttgtgaataattga 662  Q
    |||| ||||||||||||||   ||| | ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| || ||||    
T  38159 ttaatgatgatctgtgaagtcttgagtgatgatgatttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgattatttga 38258  T
Q  663 gacgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactg-ctgtgtcgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 760  Q
    || |||| || |||| | |  ||||||||||| ||||| || ||||| |||||| || ||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||  ||||    
T  38259 gatgttg-tttacttacgtgcgatattattatatcatgatg-ttttgcatactgcctatgttgctgattgttaattaactaagctgcatgagtcaatcta 38356  T
Q  761 agt 763  Q
    |||    
T  38357 agt 38359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0235 (Bit Score: 58; Significance: 5e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0235
Description:

Target: scaffold0235; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 5e-24
Query Start/End: Original strand, 682 - 774
Target Start/End: Original strand, 11464 - 11557
Alignment:
Q  682 ttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgc-tgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 774  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||    
T  11464 ttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactacctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtttaagttgttgaagatg 11557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0427 (Bit Score: 57; Significance: 2e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0427
Description:

Target: scaffold0427; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 682 - 765
Target Start/End: Complemental strand, 13596 - 13513
Alignment:
Q  682 ttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgc-tgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 765  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13596 ttgatattatcatgtcatgttgtttt-gtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 13513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0113 (Bit Score: 55; Significance: 3e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0113
Description:

Target: scaffold0113; HSP #1
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 682 - 774
Target Start/End: Complemental strand, 32165 - 32074
Alignment:
Q  682 ttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgc-tgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 774  Q
    |||||||||||||||||||||||||  || |||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  32165 ttgatattattatgtcatgttgttt--gtttactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatg 32074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0114 (Bit Score: 54; Significance: 1e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0114
Description:

Target: scaffold0114; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 682 - 774
Target Start/End: Original strand, 15485 - 15577
Alignment:
Q  682 ttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgc-tgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 774  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||    
T  15485 ttgatattattatgtcatgttgtttt-gtatactgcctatgttgctcttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgttgaagatg 15577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0358 (Bit Score: 53; Significance: 5e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0358
Description:

Target: scaffold0358; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 691 - 774
Target Start/End: Complemental strand, 4803 - 4719
Alignment:
Q  691 ttatgtcatgttgtttttgtatactgc-tgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 774  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| | ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  4803 ttatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatg 4719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0555 (Bit Score: 51; Significance: 8e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0555
Description:

Target: scaffold0555; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 8e-20
Query Start/End: Original strand, 595 - 766
Target Start/End: Original strand, 10476 - 10647
Alignment:
Q  595 atgatttgatgttgtt-atattgtgatataattgtatatgcattaattgaattatttgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattatta 693  Q
    |||| ||||||||||| ||| ||| |||||||||||||| |||||  |||||||| | ||| || |||||| |||||| |||||||||| |||||| |||    
T  10476 atgaattgatgttgtttataatgttatataattgtatatacattacatgaattatgtttga-tatttgagatgttgat-gacttgcattcgatattgtta 10573  T
Q  694 tgtcatgttgtttttgtatactgc-tgtgtcgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 766  Q
    | ||||| || ||| | ||||||| | ||| |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  10574 tatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcataagtcggtctaagttga 10647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0183 (Bit Score: 51; Significance: 8e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0183
Description:

Target: scaffold0183; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 8e-20
Query Start/End: Original strand, 620 - 694
Target Start/End: Complemental strand, 13165 - 13092
Alignment:
Q  620 tataattgtatatgcattaattgaattatttgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattat 694  Q
    ||||||| ||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  13165 tataattatatatgcattacttcaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattat 13092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0413 (Bit Score: 48; Significance: 5e-18; HSPs: 2)
Name: scaffold0413
Description:

Target: scaffold0413; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 598 - 762
Target Start/End: Complemental strand, 12751 - 12587
Alignment:
Q  598 atttgatgttgtt-atattgtgatataattgtatatgcattaattgaattatttgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgt 696  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||| | ||||||| | | | || |||||| |||||| ||||||||||||||||| |||| |    
T  12751 atttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatacattact-gaattatatataagtatttgagatgttgat-gacttgcatttgatattgttatat 12654  T
Q  697 catgttgtttttgtatactgc-tgtgtcgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 762  Q
    |||| |||||| | ||||||| | ||| |||||| |||  ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  12653 catgctgtttt-gcatactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctacatgagtcggtctaag 12587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0413; HSP #2
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 566 - 611
Target Start/End: Original strand, 15521 - 15566
Alignment:
Q  566 ttaacgatgatctgtgaagctgatttatgatgatttgatgttgtta 611  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  15521 ttaatgatgatctgtgaagctgatttgtgatgatttgatgttgtta 15566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010 (Bit Score: 48; Significance: 5e-18; HSPs: 2)
Name: scaffold0010
Description:

Target: scaffold0010; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 595 - 767
Target Start/End: Complemental strand, 130091 - 129919
Alignment:
Q  595 atgatttgatgttgtt-atattgtgatataattgtatatgcattaattgaattatttgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattatta 693  Q
    |||| ||||||||||| | | ||| |||||||||||||| |||||  |||||||| | ||| || |||||| |||||| |||||||||| |||||| |||    
T  130091 atgaattgatgttgtttacaatgttatataattgtatatacattacatgaattatgtttga-tatttgagatgttgat-gacttgcattcgatattgtta 129994  T
Q  694 tgtcatgttgtttttgtatactgc-tgtgtcgctgt-tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 767  Q
    | ||||| || ||| | ||||||| | ||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  129993 tatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtgtgttatttaactaagatgcatgagtcggtctaagttgat 129919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010; HSP #2
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 566 - 762
Target Start/End: Original strand, 60620 - 60818
Alignment:
Q  566 ttaacgatgatctgtgaagctgatttatgatgatttgatgttgttatat-tgtgatataattgtatatgcattaattgaattatttgtgaataattgaga 664  Q
    |||| ||| ||||||||||||| | ||  |||||||||||||||||  | ||||||||| |||||||||||||| ||||||||| | |||||  ||||||    
T  60620 ttaatgataatctgtgaagctgttataaaatgatttgatgttgttaattatgtgatatatttgtatatgcattacttgaattatatatgaatgtttgaga 60719  T
Q  665 cgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgttgt-ttttgtatactg-ctgtgtcgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 761  Q
     |||| |||| ||||| ||||||||  ||| |||||   | |||||||||||| || ||| |||| |||||  ||||||||||||||||||||||| |||    
T  60720 tgttg-ttgatttgca-ttgatattggtatatcatgagctgttttgtatactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtttaa 60817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0530 (Bit Score: 47; Significance: 2e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0530
Description:

Target: scaffold0530; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 728 - 774
Target Start/End: Original strand, 1102 - 1148
Alignment:
Q  728 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 774  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1102 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 1148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0333 (Bit Score: 47; Significance: 2e-17; HSPs: 2)
Name: scaffold0333
Description:

Target: scaffold0333; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 728 - 774
Target Start/End: Complemental strand, 6664 - 6618
Alignment:
Q  728 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 774  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6664 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 6618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0333; HSP #2
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 728 - 774
Target Start/End: Complemental strand, 14044 - 13998
Alignment:
Q  728 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 774  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14044 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 13998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0243 (Bit Score: 47; Significance: 2e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0243
Description:

Target: scaffold0243; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 728 - 774
Target Start/End: Original strand, 6191 - 6237
Alignment:
Q  728 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 774  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6191 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 6237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0020 (Bit Score: 47; Significance: 2e-17; HSPs: 3)
Name: scaffold0020
Description:

Target: scaffold0020; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 728 - 774
Target Start/End: Original strand, 15845 - 15891
Alignment:
Q  728 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 774  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15845 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 15891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0020; HSP #2
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 728 - 774
Target Start/End: Complemental strand, 178947 - 178901
Alignment:
Q  728 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 774  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  178947 ttgttatttaaccaagctgcatgagtcggtctaagtcgatcaagatg 178901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0020; HSP #3
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 595 - 648
Target Start/End: Complemental strand, 142768 - 142714
Alignment:
Q  595 atgatttgatgttgtta-tattgtgatataattgtatatgcattaattgaattat 648  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||  ||||||||    
T  142768 atgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattat 142714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0261 (Bit Score: 46; Significance: 8e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0261
Description:

Target: scaffold0261; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 679 - 774
Target Start/End: Complemental strand, 15764 - 15668
Alignment:
Q  679 catttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgc-tgtgtcgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 774  Q
    |||| ||||||||||| ||||| || ||| ||||||||| | ||| |||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  15764 cattcgatattattatatcatgatggttt-gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcacgagtcggtctaagttgattaagatg 15668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1765 (Bit Score: 45; Significance: 3e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold1765
Description:

Target: scaffold1765; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 728 - 772
Target Start/End: Complemental strand, 1135 - 1091
Alignment:
Q  728 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaaga 772  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1135 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaaga 1091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021 (Bit Score: 45; Significance: 3e-16; HSPs: 2)
Name: scaffold0021
Description:

Target: scaffold0021; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 726 - 774
Target Start/End: Complemental strand, 121821 - 121773
Alignment:
Q  726 tgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 774  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  121821 tgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatg 121773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #2
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 632 - 762
Target Start/End: Complemental strand, 174913 - 174785
Alignment:
Q  632 tgcattaattgaattatttgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgc-tgtgtcgctgtt- 729  Q
    ||||||| |||||||||   ||||| ||||||| |||| |||| ||| ||||||||| || |||||||| ||||   ||||||||| | ||| ||||||     
T  174913 tgcattacttgaattatgaatgaatgattgagatgttg-ttgaattgaatttgatataatcatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgttt 174818  T
Q  730 gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 762  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  174817 gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 174785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0175 (Bit Score: 44; Significance: 0.000000000000001; HSPs: 3)
Name: scaffold0175
Description:

Target: scaffold0175; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 575 - 717
Target Start/End: Complemental strand, 13298 - 13157
Alignment:
Q  575 atctgtgaagctgatttatgatgatttgatgttg-ttatattgtgatataattgtatatgcattaattgaattatttgtgaataattgagacgttgattg 673  Q
    ||||||||| ||| |||| ||||  ||||||||| |||| ||||||||||||  ||| ||||||| ||||| |||   |||||| || ||| | || |||    
T  13298 atctgtgaaactg-tttaagatgtgttgatgttgattatgttgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgatg-ttg 13201  T
Q  674 acttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgc 717  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  13200 acttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc 13157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0175; HSP #2
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 725 - 773
Target Start/End: Complemental strand, 329 - 281
Alignment:
Q  725 ctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagat 773  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  329 ctgttgttatttaactaagctgcatgaatcggtctaagttgatgaagat 281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0175; HSP #3
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 728 - 774
Target Start/End: Complemental strand, 34176 - 34130
Alignment:
Q  728 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 774  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||    
T  34176 ttgttatttaactaagctgtatgagtcggtctaagttgttgaagatg 34130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0125 (Bit Score: 44; Significance: 0.000000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0125
Description:

Target: scaffold0125; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 595 - 767
Target Start/End: Original strand, 45727 - 45899
Alignment:
Q  595 atgatttgatgttgtt-atattgtgatataattgtatatgcattaattgaattatttgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattatta 693  Q
    |||| ||||||||||| ||| ||| |||||||||||||| ||| |  |||||||| | ||| ||||||||| |||||| ||||| |||| |||||| |||    
T  45727 atgaattgatgttgtttataatgttatataattgtatatacatcacatgaattatgtttga-taattgagatgttgat-gacttacattcgatattgtta 45824  T
Q  694 tgtcatgttgtttttgtatactgc-tgtgtcgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 767  Q
    | ||||| || ||| | ||||||| | | |  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45825 tatcatgatgattt-gcatactgcctatttttctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 45899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0123 (Bit Score: 44; Significance: 0.000000000000001; HSPs: 2)
Name: scaffold0123
Description:

Target: scaffold0123; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 566 - 766
Target Start/End: Complemental strand, 25321 - 25121
Alignment:
Q  566 ttaacgatgatctgtgaagctgatttatgatgatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattaattgaattatttgtgaataattgagac 665  Q
    |||| ||||||||||||||||| | || || ||||||||||||| ||| ||||||||| |||||||| |||||  |||||||| | || ||  ||||||     
T  25321 ttaatgatgatctgtgaagctgttataagacgatttgatgttgtaataatgtgatatatttgtatatacattacatgaattatatatg-atgtttgagat 25223  T
Q  666 gttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgttgt-ttttgtatactg-ctgtgtcgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 762  Q
    |||| |||| ||||| |||||||  |||| |||||   | |||| ||||||| || ||| |||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  25222 gttg-ttgatttgca-ttgatatcgttatatcatgagctgttttatatactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaag 25125  T
Q  763 ttga 766  Q
    ||||    
T  25124 ttga 25121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0123; HSP #2
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 571 - 648
Target Start/End: Complemental strand, 747 - 669
Alignment:
Q  571 gatgatctgtgaagctgatttatgatgatttgatgttgtt-atattgtgatataattgtatatgcattaattgaattat 648  Q
    ||||||||||||||||| | ||  |||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||  ||||||||    
T  747 gatgatctgtgaagctgttataatatgatttgatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattat 669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0102 (Bit Score: 44; Significance: 0.000000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0102
Description:

Target: scaffold0102; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 619 - 767
Target Start/End: Complemental strand, 19424 - 19278
Alignment:
Q  619 atataattgtatatgcattaattgaattatttgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgc- 717  Q
    |||||||||||||| |||||  ||||||||  ||  ||| |||||| |||| |||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | |||||||     
T  19424 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttg-ttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcc 19329  T
Q  718 tgtgtcgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 767  Q
    | ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19328 tatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 19278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000005; HSPs: 3)
Name: scaffold0106
Description:

Target: scaffold0106; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 728 - 774
Target Start/End: Original strand, 15306 - 15352
Alignment:
Q  728 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 774  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  15306 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctacgttgattaagatg 15352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106; HSP #2
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 728 - 762
Target Start/End: Complemental strand, 1342 - 1308
Alignment:
Q  728 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 762  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1342 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 1308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106; HSP #3
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 728 - 762
Target Start/End: Complemental strand, 7319 - 7285
Alignment:
Q  728 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 762  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7319 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 7285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0088 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0088
Description:

Target: scaffold0088; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 671 - 763
Target Start/End: Complemental strand, 21022 - 20928
Alignment:
Q  671 ttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactg-ctgtgtcgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagt 763  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| || || ||| |||| |||||| |||||||||||  ||||||||||||||||    
T  21022 ttgaattgcaattgatattattatgtcatgttgtttttgcatattgcctatgttgctgattgttaattaactaagctttatgagtcggtctaagt 20928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0130 (Bit Score: 42; Significance: 0.00000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0130
Description:

Target: scaffold0130; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 615 - 700
Target Start/End: Complemental strand, 27996 - 27912
Alignment:
Q  615 tgtgatataattgtatatgcattaattgaattatttgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatg 700  Q
    |||||||||||  ||||||||||| |||||||||   || ||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27996 tgtgatataatgttatatgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtcatg 27912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0695 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0695
Description:

Target: scaffold0695; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 598 - 654
Target Start/End: Complemental strand, 6126 - 6070
Alignment:
Q  598 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattaattgaattatttgtga 654  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||| |||||    
T  6126 atttgatgttgttatattgtgatttaattgcatatgcattacttgaattatatgtga 6070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0034
Description:

Target: scaffold0034; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 676 - 766
Target Start/End: Complemental strand, 32642 - 32551
Alignment:
Q  676 ttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgc-tgtgtcgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 766  Q
    |||||||||||||| |||| |||||||||||| | ||||||| | ||| |||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32642 ttgcatttgatattgttatatcatgttgtttt-gcatactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 32551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0278 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0278
Description:

Target: scaffold0278; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 619 - 767
Target Start/End: Complemental strand, 5803 - 5657
Alignment:
Q  619 atataattgtatatgcattaattgaattatttgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgc- 717  Q
    |||||||||||||| |||||  ||||||||  ||  ||| |||||| |||| |||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||||  |||||||     
T  5803 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttg-ttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgattttc-atactgcc 5708  T
Q  718 tgtgtcgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 767  Q
    | ||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5707 tatgttgctgtttgttattttactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 5657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0207 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0207
Description:

Target: scaffold0207; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 728 - 767
Target Start/End: Original strand, 2713 - 2752
Alignment:
Q  728 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 767  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2713 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 2752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0628 (Bit Score: 39; Significance: 0.000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0628
Description:

Target: scaffold0628; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 671 - 767
Target Start/End: Original strand, 2816 - 2913
Alignment:
Q  671 ttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgc-tgtgtcgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 767  Q
    |||| |||||||||||||| |||| ||||| || ||| | ||||||| | ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  2816 ttgatttgcatttgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgtagctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgat 2913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0507 (Bit Score: 39; Significance: 0.000000000001; HSPs: 2)
Name: scaffold0507
Description:

Target: scaffold0507; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 595 - 700
Target Start/End: Original strand, 7993 - 8098
Alignment:
Q  595 atgatttgatgttgtt-atattgtgatataattgtatatgcattaattgaattatttgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattatta 693  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||| ||||| ||||||||| | |||||  || ||| |||| |||| || |||||||||||||||    
T  7993 atgatttgatgttgtttataatgtgatataattttatatacattacttgaattatatatgaatgtttaagatgttg-ttgaatttcatttgatattatta 8091  T
Q  694 tgtcatg 700  Q
    | |||||    
T  8092 tatcatg 8098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0507; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 595 - 648
Target Start/End: Original strand, 2605 - 2659
Alignment:
Q  595 atgatttgatgttgtta-tattgtgatataattgtatatgcattaattgaattat 648  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||  ||||||||    
T  2605 atgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattat 2659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0395 (Bit Score: 39; Significance: 0.000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0395
Description:

Target: scaffold0395; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 724 - 774
Target Start/End: Original strand, 4897 - 4947
Alignment:
Q  724 gctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 774  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  4897 gctgttgttatttaactaagttgcatgagttggtctaagttgatgaagatg 4947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0198 (Bit Score: 39; Significance: 0.000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0198
Description:

Target: scaffold0198; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 728 - 774
Target Start/End: Complemental strand, 23892 - 23846
Alignment:
Q  728 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 774  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  23892 ttgttatttaaccaagctgcatgagtcggtctaagttgatcaagatg 23846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0131 (Bit Score: 39; Significance: 0.000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0131
Description:

Target: scaffold0131; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 728 - 774
Target Start/End: Complemental strand, 36503 - 36457
Alignment:
Q  728 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 774  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  36503 ttgttatttaaccaagctgcatgagtcggtctaagttgatcaagatg 36457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0184 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0184
Description:

Target: scaffold0184; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 598 - 762
Target Start/End: Original strand, 1011 - 1171
Alignment:
Q  598 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattaattgaattatttgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtc 697  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||  ||| |||  | ||| ||||||||  ||||||| ||    ||| ||||||||||| ||    
T  1011 atttgatgttgttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtctga-taattgagttgttgatttac----attcgatattattatatc 1105  T
Q  698 atgttgtttttgtatactgc-tgtgtcgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 762  Q
    ||| || ||| | ||||||| | ||| | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1106 atgatggttt-gcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 1171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold2014 (Bit Score: 37; Significance: 0.00000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold2014
Description:

Target: scaffold2014; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 680 - 762
Target Start/End: Complemental strand, 1134 - 1051
Alignment:
Q  680 atttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgc-tgtgtcgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 762  Q
    |||||||||| |||| ||||| |||||| | ||||||| | ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1134 atttgatattgttatatcatgctgtttt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 1051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0456 (Bit Score: 37; Significance: 0.00000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0456
Description:

Target: scaffold0456; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 682 - 774
Target Start/End: Original strand, 10446 - 10537
Alignment:
Q  682 ttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgc-tgtgtcgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 774  Q
    ||||||||||||||||||| ||||   ||||||||| | ||| |||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  10446 ttgatattattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactatgctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatg 10537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1984 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000007; HSPs: 1)
Name: scaffold1984
Description:

Target: scaffold1984; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 595 - 767
Target Start/End: Complemental strand, 315 - 143
Alignment:
Q  595 atgatttgatgttgtt-atattgtgatataattgtatatgcattaattgaattatttgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattatta 693  Q
    |||| ||||||||||| ||| | | |||||||||||||| |||||  |||||||| | ||| || |||||| |||| |||| ||||||| |||||| |||    
T  315 atgaattgatgttgtttataatattatataattgtatatacattacatgaattatgtttga-tatttgagatgttg-ttgatttgcattcgatattgtta 218  T
Q  694 tgtcatgttgtttttgtatactgc-tgtgtcgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 767  Q
    | ||||| || ||| | ||||||| | ||| | |||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  217 tatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgttgtttgttgtttaactaagctgcatgaatcggtctaagttgat 143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0476 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0476
Description:

Target: scaffold0476; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 728 - 767
Target Start/End: Complemental strand, 12819 - 12780
Alignment:
Q  728 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 767  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  12819 ttgttatttagctaagctgcatgagtcggtctaagttgat 12780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0420 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0420
Description:

Target: scaffold0420; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 595 - 762
Target Start/End: Original strand, 6217 - 6386
Alignment:
Q  595 atgatttgatgttgttat-attgtgatataattgtatatgcattaattgaattatttgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattatta 693  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||||| |||||||||||||  |||||||| | || ||  |||||| |||| |||| |||||||||||||| | |    
T  6217 atgatttgatgttgttattaatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatg-atgtttgagatgttg-ttgatttgcatttgatattgtca 6314  T
Q  694 tgtcatgttgt-ttttgtatactg-ctgtgtcgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 762  Q
    | |||||   | |||| ||||||| || ||| |||| |||||  ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  6315 tatcatgagctgttttatatactgcctatgttgctgtttgttcattaactaagttgcatgagtcggtctaag 6386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0008
Description:

Target: scaffold0008; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 728 - 767
Target Start/End: Original strand, 14765 - 14804
Alignment:
Q  728 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 767  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14765 ttgttagttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 14804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000007; HSPs: 2)
Name: scaffold0006
Description:

Target: scaffold0006; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 594 - 700
Target Start/End: Complemental strand, 97194 - 97089
Alignment:
Q  594 gatgatttgatgttgtta-tattgtgatataattgtatatgcattaattgaattatttgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattatt 692  Q
    |||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||  |||||||| | || ||  |||||| |||| |||| |||||||||||||| ||    
T  97194 gatgatttgatgttgttaataatgtgatatatttgtatatgcattacatgaattatatatg-atgtttgagatgttg-ttgatttgcatttgatattgtt 97097  T
Q  693 atgtcatg 700  Q
    || |||||    
T  97096 atatcatg 97089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006; HSP #2
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 594 - 700
Target Start/End: Complemental strand, 106472 - 106367
Alignment:
Q  594 gatgatttgatgttgtta-tattgtgatataattgtatatgcattaattgaattatttgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattatt 692  Q
    |||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||  |||||||| | || ||  |||||| |||| |||| |||||||||||||| ||    
T  106472 gatgatttgatgttgttaataatgtgatatatttgtatatgcattacatgaattatatatg-atgtttgagatgttg-ttgatttgcatttgatattgtt 106375  T
Q  693 atgtcatg 700  Q
    || |||||    
T  106374 atatcatg 106367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0718 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0718
Description:

Target: scaffold0718; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 728 - 762
Target Start/End: Original strand, 5196 - 5230
Alignment:
Q  728 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 762  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5196 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 5230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0351 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0351
Description:

Target: scaffold0351; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 680 - 762
Target Start/End: Complemental strand, 16382 - 16301
Alignment:
Q  680 atttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgc-tgtgtcgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 762  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||   ||||||||| | ||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16382 atttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttcttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 16301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0211 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0211
Description:

Target: scaffold0211; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 729 - 767
Target Start/End: Original strand, 28839 - 28877
Alignment:
Q  729 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 767  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28839 tgttgtttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 28877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0100 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0100
Description:

Target: scaffold0100; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 728 - 766
Target Start/End: Original strand, 23951 - 23989
Alignment:
Q  728 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 766  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  23951 ttgttatttaactaagctacatgagtcggtctaagttga 23989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0032 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0032
Description:

Target: scaffold0032; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 728 - 762
Target Start/End: Complemental strand, 51635 - 51601
Alignment:
Q  728 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 762  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51635 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 51601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1419 (Bit Score: 34; Significance: 0.000000001; HSPs: 2)
Name: scaffold1419
Description:

Target: scaffold1419; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 594 - 638
Target Start/End: Complemental strand, 210 - 165
Alignment:
Q  594 gatgatttgatgttgtta-tattgtgatataattgtatatgcatta 638  Q
    |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  210 gatgatttgatgttgttaataatgtgatataattgtatatgcatta 165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1419; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 594 - 634
Target Start/End: Complemental strand, 42 - 1
Alignment:
Q  594 gatgatttgatgttgtta-tattgtgatataattgtatatgc 634  Q
    |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  42 gatgatttgatgttgttaataatgtgatataattgtatatgc 1  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0556 (Bit Score: 32; Significance: 0.00000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0556
Description:

Target: scaffold0556; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 728 - 767
Target Start/End: Complemental strand, 6865 - 6826
Alignment:
Q  728 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 767  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  6865 ttgttatttaactgagctgcatgagtcggtctaagatgat 6826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0309 (Bit Score: 32; Significance: 0.00000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0309
Description:

Target: scaffold0309; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 630 - 717
Target Start/End: Complemental strand, 6761 - 6675
Alignment:
Q  630 tatgcattaattgaattatttgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgc 717  Q
    ||||||||| |||||| || | |||||| || ||| |||| |||| ||||  ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  6761 tatgcattacttgaataatgtttgaatatttaagatgttg-ttgaattgctattgatatcattatgtcatgttgattttgtatactgc 6675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0218 (Bit Score: 32; Significance: 0.00000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0218
Description:

Target: scaffold0218; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 735 - 766
Target Start/End: Original strand, 8149 - 8180
Alignment:
Q  735 ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 766  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8149 ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 8180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0150 (Bit Score: 32; Significance: 0.00000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0150
Description:

Target: scaffold0150; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 728 - 767
Target Start/End: Complemental strand, 32151 - 32112
Alignment:
Q  728 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 767  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||    
T  32151 ttgttatttatctaagctgcatgagtcggtctaagatgat 32112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1539 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000007; HSPs: 1)
Name: scaffold1539
Description:

Target: scaffold1539; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 595 - 648
Target Start/End: Complemental strand, 1125 - 1071
Alignment:
Q  595 atgatttgatgttgtta-tattgtgatataattgtatatgcattaattgaattat 648  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||  ||||||||    
T  1125 atgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattat 1071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0290 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0290
Description:

Target: scaffold0290; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 571 - 648
Target Start/End: Complemental strand, 369 - 291
Alignment:
Q  571 gatgatctgtgaagctgatttatgatgatttgatgttgtta-tattgtgatataattgtatatgcattaattgaattat 648  Q
    ||||||||||||||||| | ||  ||||||| |||||| || || ||| ||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  369 gatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagtaatgtaatatatttgtatatgcattatttgaattat 291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0205 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0205
Description:

Target: scaffold0205; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 728 - 774
Target Start/End: Complemental strand, 29607 - 29561
Alignment:
Q  728 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 774  Q
    ||||||||||||||||   |||||||| |||||||||||||||||||    
T  29607 ttgttatttaactaagtcacatgagtcagtctaagttgattaagatg 29561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0170 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0170
Description:

Target: scaffold0170; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 595 - 648
Target Start/End: Complemental strand, 3143 - 3089
Alignment:
Q  595 atgatttgatgttgtta-tattgtgatataattgtatatgcattaattgaattat 648  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||  ||||||||    
T  3143 atgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattat 3089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0138 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0138
Description:

Target: scaffold0138; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 728 - 766
Target Start/End: Complemental strand, 12992 - 12954
Alignment:
Q  728 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 766  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  12992 ttgttatttaactgagcagcatgagtcggtctaagttga 12954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0111 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000007; HSPs: 2)
Name: scaffold0111
Description:

Target: scaffold0111; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 595 - 648
Target Start/End: Complemental strand, 7616 - 7562
Alignment:
Q  595 atgatttgatgttgtta-tattgtgatataattgtatatgcattaattgaattat 648  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||  ||||||||    
T  7616 atgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattat 7562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0111; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 595 - 648
Target Start/End: Complemental strand, 14735 - 14681
Alignment:
Q  595 atgatttgatgttgtta-tattgtgatataattgtatatgcattaattgaattat 648  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||  ||||||||    
T  14735 atgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattat 14681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0078 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0078
Description:

Target: scaffold0078; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 728 - 766
Target Start/End: Complemental strand, 10580 - 10542
Alignment:
Q  728 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 766  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  10580 ttgttatttaaaaaagctgcatgagtcggtctaagttga 10542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0070 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0070
Description:

Target: scaffold0070; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 726 - 760
Target Start/End: Complemental strand, 4579 - 4545
Alignment:
Q  726 tgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 760  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  4579 tgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtcta 4545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0064 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0064
Description:

Target: scaffold0064; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 728 - 762
Target Start/End: Complemental strand, 47048 - 47014
Alignment:
Q  728 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 762  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  47048 ttgttatttaactaagctacatgagtcggtctaag 47014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0013 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0013
Description:

Target: scaffold0013; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 595 - 648
Target Start/End: Complemental strand, 30518 - 30464
Alignment:
Q  595 atgatttgatgttgtta-tattgtgatataattgtatatgcattaattgaattat 648  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||  ||||||||    
T  30518 atgatttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattat 30464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0072 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0072
Description:

Target: scaffold0072; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 598 - 650
Target Start/End: Complemental strand, 57999 - 57946
Alignment:
Q  598 atttgatgttgtta-tattgtgatataattgtatatgcattaattgaattattt 650  Q
    |||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  57999 atttaatgttgttagtaatgtgatataattgtatatgcattatgtgaattattt 57946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University