View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF9595A_low_199 (Length: 246)

Name: NF9595A_low_199
Description: NF9595A
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF9595A_low_199
NF9595A_low_199
[»] chr6 (13 HSPs)
chr6 (16-228)||(20524126-20524338)
chr6 (16-228)||(7372156-7372367)
chr6 (16-228)||(7050498-7050710)
chr6 (52-228)||(11355948-11356124)
chr6 (16-228)||(32438253-32438465)
chr6 (16-209)||(18644031-18644224)
chr6 (45-228)||(10569141-10569322)
chr6 (16-166)||(32517672-32517822)
chr6 (112-228)||(6900225-6900341)
chr6 (45-127)||(33268073-33268155)
chr6 (16-118)||(6901999-6902101)
chr6 (30-117)||(32455038-32455125)
chr6 (74-158)||(24431587-24431671)
[»] chr4 (21 HSPs)
chr4 (16-228)||(41760900-41761112)
chr4 (16-228)||(42981359-42981571)
chr4 (16-228)||(35402841-35403053)
chr4 (16-227)||(43520178-43520389)
chr4 (16-228)||(49523871-49524083)
chr4 (31-228)||(11255118-11255315)
chr4 (16-228)||(51012666-51012878)
chr4 (30-228)||(41782261-41782459)
chr4 (16-228)||(48645920-48646130)
chr4 (47-228)||(54386880-54387061)
chr4 (30-202)||(319849-320021)
chr4 (30-202)||(4172689-4172861)
chr4 (30-202)||(33265350-33265522)
chr4 (45-228)||(2692488-2692671)
chr4 (30-202)||(43507993-43508165)
chr4 (75-228)||(11602416-11602569)
chr4 (50-179)||(11640838-11640967)
chr4 (16-191)||(834228-834402)
chr4 (89-178)||(52867414-52867503)
chr4 (16-191)||(5438561-5438731)
chr4 (74-158)||(7150221-7150305)
[»] chr3 (31 HSPs)
chr3 (16-228)||(30599380-30599592)
chr3 (16-228)||(2377755-2377967)
chr3 (16-228)||(43765880-43766092)
chr3 (16-228)||(21349453-21349665)
chr3 (16-228)||(23292342-23292554)
chr3 (16-228)||(27898287-27898499)
chr3 (16-228)||(44275389-44275601)
chr3 (16-228)||(44794958-44795170)
chr3 (30-228)||(2225359-2225555)
chr3 (17-228)||(2660973-2661184)
chr3 (16-228)||(17516069-17516280)
chr3 (44-228)||(41978487-41978671)
chr3 (16-228)||(35904898-35905113)
chr3 (44-228)||(7884094-7884278)
chr3 (16-228)||(46198479-46198690)
chr3 (16-228)||(48829997-48830209)
chr3 (16-228)||(46113226-46113438)
chr3 (30-202)||(46609725-46609897)
chr3 (30-200)||(38192460-38192630)
chr3 (16-228)||(42280246-42280459)
chr3 (16-228)||(51685350-51685562)
chr3 (30-202)||(53093200-53093372)
chr3 (30-170)||(54899250-54899390)
chr3 (32-202)||(46309776-46309946)
chr3 (16-228)||(610353-610565)
chr3 (102-228)||(53190118-53190247)
chr3 (74-180)||(24845668-24845776)
chr3 (16-106)||(53188873-53188963)
chr3 (170-228)||(54899172-54899230)
chr3 (74-158)||(35862691-35862775)
chr3 (74-163)||(22219218-22219308)
[»] chr8 (25 HSPs)
chr8 (16-228)||(27691905-27692117)
chr8 (16-228)||(41041757-41041969)
chr8 (16-228)||(33707983-33708195)
chr8 (16-228)||(42942533-42942745)
chr8 (16-228)||(22272998-22273210)
chr8 (16-228)||(40338853-40339065)
chr8 (44-228)||(8609008-8609192)
chr8 (44-228)||(38547966-38548150)
chr8 (44-228)||(13107574-13107758)
chr8 (44-228)||(13283135-13283314)
chr8 (16-168)||(5037235-5037387)
chr8 (45-209)||(26239644-26239808)
chr8 (16-199)||(9672348-9672531)
chr8 (16-228)||(7744304-7744516)
chr8 (34-202)||(35510181-35510349)
chr8 (16-202)||(29237959-29238145)
chr8 (30-202)||(33761646-33761818)
chr8 (30-202)||(600812-600984)
chr8 (45-209)||(41824873-41825037)
chr8 (16-202)||(15307058-15307243)
chr8 (16-202)||(15487427-15487612)
chr8 (16-202)||(27405316-27405501)
chr8 (81-228)||(13485351-13485493)
chr8 (16-167)||(3152712-3152863)
chr8 (74-163)||(11720608-11720697)
[»] chr5 (16 HSPs)
chr5 (16-228)||(28821119-28821331)
chr5 (16-232)||(32135007-32135223)
chr5 (16-228)||(8540410-8540622)
chr5 (16-228)||(30464810-30465022)
chr5 (16-228)||(2180514-2180725)
chr5 (16-228)||(2853441-2853653)
chr5 (16-228)||(21841740-21841952)
chr5 (44-228)||(7268584-7268768)
chr5 (16-228)||(12737844-12738056)
chr5 (16-228)||(12800667-12800879)
chr5 (77-228)||(24540425-24540576)
chr5 (16-202)||(42472656-42472841)
chr5 (45-142)||(41494644-41494741)
chr5 (16-127)||(40781430-40781541)
chr5 (44-127)||(29620941-29621024)
chr5 (74-158)||(27076733-27076817)
[»] chr2 (16 HSPs)
chr2 (16-228)||(14388275-14388487)
chr2 (16-233)||(40560978-40561195)
chr2 (16-228)||(6798264-6798476)
chr2 (16-209)||(2767691-2767884)
chr2 (16-228)||(19907452-19907664)
chr2 (16-228)||(16763704-16763916)
chr2 (16-228)||(17696965-17697177)
chr2 (56-228)||(39663994-39664166)
chr2 (16-228)||(39455918-39456129)
chr2 (82-228)||(44708996-44709142)
chr2 (16-202)||(24206712-24206900)
chr2 (16-202)||(6784461-6784648)
chr2 (134-228)||(42518524-42518618)
chr2 (16-127)||(37021388-37021499)
chr2 (119-164)||(37646238-37646283)
chr2 (74-158)||(161216-161300)
[»] chr7 (26 HSPs)
chr7 (16-228)||(37114701-37114913)
chr7 (16-228)||(6604264-6604476)
chr7 (16-228)||(38473297-38473508)
chr7 (17-228)||(23905426-23905637)
chr7 (17-228)||(27665220-27665431)
chr7 (16-228)||(22154639-22154851)
chr7 (16-228)||(22210554-22210766)
chr7 (16-228)||(45360076-45360288)
chr7 (16-228)||(29995689-29995901)
chr7 (16-228)||(35692523-35692735)
chr7 (16-228)||(39858415-39858627)
chr7 (16-228)||(13168822-13169034)
chr7 (16-228)||(46438683-46438895)
chr7 (17-228)||(34776135-34776346)
chr7 (16-228)||(24227594-24227806)
chr7 (16-223)||(38550443-38550650)
chr7 (45-228)||(37792236-37792419)
chr7 (46-202)||(35402563-35402719)
chr7 (48-228)||(48851529-48851708)
chr7 (16-209)||(47385388-47385576)
chr7 (34-136)||(69032-69134)
chr7 (132-202)||(66845-66915)
chr7 (16-127)||(20478921-20479032)
chr7 (65-180)||(48310750-48310867)
chr7 (74-158)||(13035621-13035705)
chr7 (182-228)||(30939748-30939794)
[»] chr1 (22 HSPs)
chr1 (16-228)||(3012626-3012838)
chr1 (16-228)||(31237679-31237891)
chr1 (16-228)||(26224726-26224938)
chr1 (16-228)||(2870338-2870550)
chr1 (16-228)||(6817889-6818101)
chr1 (16-228)||(46582761-46582973)
chr1 (16-228)||(51895338-51895550)
chr1 (16-228)||(27088026-27088239)
chr1 (44-228)||(34777338-34777522)
chr1 (44-228)||(4855167-4855351)
chr1 (16-228)||(50555275-50555488)
chr1 (16-202)||(33600325-33600511)
chr1 (16-166)||(25277548-25277698)
chr1 (16-228)||(15105185-15105397)
chr1 (30-202)||(8168518-8168690)
chr1 (16-166)||(37345137-37345287)
chr1 (16-166)||(45045676-45045826)
chr1 (45-190)||(52642838-52642981)
chr1 (16-127)||(9120815-9120926)
chr1 (16-127)||(1443400-1443511)
chr1 (16-127)||(47012215-47012326)
chr1 (74-158)||(3370338-3370422)
[»] scaffold0564 (1 HSPs)
scaffold0564 (16-228)||(9008-9220)
[»] scaffold0058 (2 HSPs)
scaffold0058 (16-228)||(4043-4255)
scaffold0058 (16-228)||(5215-5427)
[»] scaffold0345 (1 HSPs)
scaffold0345 (52-228)||(301-477)
[»] scaffold0004 (1 HSPs)
scaffold0004 (45-228)||(107787-107970)


Alignment Details
Target: chr6 (Bit Score: 177; Significance: 2e-95; HSPs: 13)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 16 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 20524338 - 20524126
Alignment:
Q  16 caatcaaatttgtacttgaattatatatatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaataggtccttgaattttcacaacagatat 115  Q
    |||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20524338 caatcaaattggtccttgaattatatatgtatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaataggtccttgaattttcacaacagatat 20524239  T
Q  116 cactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacaaacactttgattataaaaagacaggcatttgcatatcatcagaggtc 215  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| | |||    
T  20524238 cactatgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacagacactttgattataaaaagacagacatttgcataccatcataagtc 20524139  T
Q  216 atatatttgatgt 228  Q
    |||||||||||||    
T  20524138 atatatttgatgt 20524126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 153; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 16 - 228
Target Start/End: Original strand, 7372156 - 7372367
Alignment:
Q  16 caatcaaatttgtacttgaattatatatatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaataggtccttgaattttcacaacagatat 115  Q
    |||||||||| || ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||    
T  7372156 caatcaaattggtccttgaattatatacatattcatcatatcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaataggtccttgaattttcacaatcga-at 7372254  T
Q  116 cactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacaaacactttgattataaaaagacaggcatttgcatatcatcagaggtc 215  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||| | |||    
T  7372255 cactgtgatccttggtgcatacatttgttgaacaaagtaaaaagtaaaagacagacactttgattataaaaagacagacattttcataccatcataagtc 7372354  T
Q  216 atatatttgatgt 228  Q
    |||||||||||||    
T  7372355 atatatttgatgt 7372367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 149; E-Value: 8e-79
Query Start/End: Original strand, 16 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 7050710 - 7050498
Alignment:
Q  16 caatcaaatttgtacttgaattatatatatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaataggtccttgaattttcacaacagatat 115  Q
    |||||||||| || |||  ||| ||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||    
T  7050710 caatcaaattggtccttctattgtatgtctatccatcatatcgatccccaaattagtgaaaataccatcaaataagtcattgaattttcacaacatatat 7050611  T
Q  116 cactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacaaacactttgattataaaaagacaggcatttgcatatcatcagaggtc 215  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||| | |||    
T  7050610 cactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacaaacactttgattgtaaaaagacagacatttgcataccatcataagtc 7050511  T
Q  216 atatatttgatgt 228  Q
    |||||||||||||    
T  7050510 atatatttgatgt 7050498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 149; E-Value: 8e-79
Query Start/End: Original strand, 52 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 11356124 - 11355948
Alignment:
Q  52 catatcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaa 151  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11356124 catatcgatcctcaaattagtaaaaataccatcaaacaggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaa 11356025  T
Q  152 gtaaaaagtaaaagacaaacactttgattataaaaagacaggcatttgcatatcatcagaggtcatatatttgatgt 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||   ||||||||||||||||    
T  11356024 gtaaaaagtaaaagacaaacactttgattataaaaagacagacatttgcataccatcattagtcatatatttgatgt 11355948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 149; E-Value: 8e-79
Query Start/End: Original strand, 16 - 228
Target Start/End: Original strand, 32438253 - 32438465
Alignment:
Q  16 caatcaaatttgtacttgaattatatatatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaataggtccttgaattttcacaacagatat 115  Q
    |||||| ||| || ||| ||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  32438253 caatcatattggtcctttaattatatgcatatccatcatttcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaataggtccttgaattttcacaatagatat 32438352  T
Q  116 cactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacaaacactttgattataaaaagacaggcatttgcatatcatcagaggtc 215  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||| | |||    
T  32438353 cactatgatccttggtccatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacagacactttgattataaaaagacacacatttgcataccatcataagtc 32438452  T
Q  216 atatatttgatgt 228  Q
    |||||||||||||    
T  32438453 atatatttgatgt 32438465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 146; E-Value: 5e-77
Query Start/End: Original strand, 16 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 18644224 - 18644031
Alignment:
Q  16 caatcaaatttgtacttgaattatatatatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaataggtccttgaattttcacaacagatat 115  Q
    |||||| ||| || ||||||||||||  |||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18644224 caatcacattggtccttgaattatatgcatatccattatttcgatcatcaaattagtgaaaataccatcaaataggtccttgaattttcacaacagatat 18644125  T
Q  116 cactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacaaacactttgattataaaaagacaggcatttgcatatcatca 209  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||    
T  18644124 cactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacagacactttgattataaaaagacacacatttgcataccatca 18644031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 45 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 10569322 - 10569141
Alignment:
Q  45 tatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgatccttggtgcatacatttgct 144  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  10569322 tatccatcatatcgatccccaaattagtgaaaataccatcaaataagtccttgaattttca--acatatatcattgtgatccttggtgcatacatttgct 10569225  T
Q  145 gaacaaagtaaaaagtaaaagacaaacactttgattataaaaagacaggcatttgcatatcatcagaggtcatatatttgatgt 228  Q
     ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  10569224 aaacaaagtaaaaagtaaaaaacagacactttgattgtaaaaagatagacatttgcatatcatcataagtcatatatttgatgt 10569141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 119; E-Value: 6e-61
Query Start/End: Original strand, 16 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 32517822 - 32517672
Alignment:
Q  16 caatcaaatttgtacttgaattatatatatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaataggtccttgaattttcacaacagatat 115  Q
    |||||||||| || ||| ||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||    
T  32517822 caatcaaattggtccttcaattatatgcatatccatcataccgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaatagttccttgaattttcacaacagacat 32517723  T
Q  116 cactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaaga 166  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32517722 cactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaaga 32517672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 77; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 112 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 6900341 - 6900225
Alignment:
Q  112 atatcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacaaacactttgattataaaaagacaggcatttgcatatcatcaga 211  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||| |||||||||| ||| | |    
T  6900341 atatcactgtgatccttggttcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacatacactttgattgtaaaaggacagacatttgcataccattata 6900242  T
Q  212 ggtcatatatttgatgt 228  Q
     |||||| |||||||||    
T  6900241 agtcatacatttgatgt 6900225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 45 - 127
Target Start/End: Original strand, 33268073 - 33268155
Alignment:
Q  45 tatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgatcct 127  Q
    ||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  33268073 tatccatcatatcgatccctaaattattgaaaataccatcaaataagtccttgaattttcacaacatatatcaatgtgatcct 33268155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 16 - 118
Target Start/End: Complemental strand, 6902101 - 6901999
Alignment:
Q  16 caatcaaatttgtacttgaattatatatatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaataggtccttgaattttcacaacagatat 115  Q
    |||||||||| || |||  ||| ||| | ||||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  6902101 caatcaaattggtccttctattgtatgtctatccatcatatcaatccccaaattagtgaaaatatcatcaaataagtccttgaattttcacaacatatat 6902002  T
Q  116 cac 118  Q
    |||    
T  6902001 cac 6901999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 30 - 117
Target Start/End: Original strand, 32455038 - 32455125
Alignment:
Q  30 cttgaattatatatatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaataggtccttgaattttcacaacagatatca 117  Q
    |||||||||||   ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||| ||||    
T  32455038 cttgaattataatcatatccatcatttcgatcctcaaattaatgaaaataccatcaaattggtccttgaattatcataacagagatca 32455125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 74 - 158
Target Start/End: Original strand, 24431587 - 24431671
Alignment:
Q  74 aaaataccatcaaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaa 158  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| |   |||| || |||  ||||||||||||||||| || ||| |||  |||||||||    
T  24431587 aaaataccatcaaataagtccttgaattatttaaacaaatgtcaacgtgatccttggtgcatatatgtgcagaattaagtaaaaa 24431671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 173; Significance: 4e-93; HSPs: 21)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 173; E-Value: 4e-93
Query Start/End: Original strand, 16 - 228
Target Start/End: Original strand, 41760900 - 41761112
Alignment:
Q  16 caatcaaatttgtacttgaattatatatatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaataggtccttgaattttcacaacagatat 115  Q
    |||||||||| || ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  41760900 caatcaaattggtccttgaattatatacatattcatcatatcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaataggtccttgaattttcataccagatat 41760999  T
Q  116 cactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacaaacactttgattataaaaagacaggcatttgcatatcatcagaggtc 215  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| | |||    
T  41761000 cactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacaaacactttgattataaaaagacagacatttgcataccatcataagtc 41761099  T
Q  216 atatatttgatgt 228  Q
    |||||||||||||    
T  41761100 atatatttgatgt 41761112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 169; E-Value: 9e-91
Query Start/End: Original strand, 16 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 42981571 - 42981359
Alignment:
Q  16 caatcaaatttgtacttgaattatatatatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaataggtccttgaattttcacaacagatat 115  Q
    |||||||||| || ||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  42981571 caatcaaattggtccttgaattatatacatatctatcatatcgatccttaaattagtgaaaataccatcaaataggtccttgaattttcacaacaggtat 42981472  T
Q  116 cactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacaaacactttgattataaaaagacaggcatttgcatatcatcagaggtc 215  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| | |||    
T  42981471 cactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacagacactttgattataaaaagacagacatttgcataccatcataagtc 42981372  T
Q  216 atatatttgatgt 228  Q
    |||||||||||||    
T  42981371 atatatttgatgt 42981359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 165; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 16 - 228
Target Start/End: Original strand, 35402841 - 35403053
Alignment:
Q  16 caatcaaatttgtacttgaattatatatatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaataggtccttgaattttcacaacagatat 115  Q
    |||||||||| || ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35402841 caatcaaattggttcttgaattatatgcatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaatatcatcaaataggtccttgaattttcacaacagatat 35402940  T
Q  116 cactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacaaacactttgattataaaaagacaggcatttgcatatcatcagaggtc 215  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||| | |||    
T  35402941 cactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaacgacagacactttgattataaaaagacaaacatttgcataccatcataagtc 35403040  T
Q  216 atatatttgatgt 228  Q
    |||||||||||||    
T  35403041 atatatttgatgt 35403053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 164; E-Value: 9e-88
Query Start/End: Original strand, 16 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 43520389 - 43520178
Alignment:
Q  16 caatcaaatttgtacttgaattatatatatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaataggtccttgaattttcacaacagatat 115  Q
    |||||||||| || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  43520389 caatcaaattggtccttgaattatatacatatccatcatatcgatcctcaaattagtttaaataccatcaaatagatccttgaattttcacaacagatat 43520290  T
Q  116 cactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacaaacactttgattataaaaagacaggcatttgcatatcatcagaggtc 215  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||| | |||    
T  43520289 cactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacagacactttgattataaaaagacagacattttcataccatcataagtc 43520190  T
Q  216 atatatttgatg 227  Q
    ||||||||||||    
T  43520189 atatatttgatg 43520178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 161; E-Value: 6e-86
Query Start/End: Original strand, 16 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 49524083 - 49523871
Alignment:
Q  16 caatcaaatttgtacttgaattatatatatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaataggtccttgaattttcacaacagatat 115  Q
    |||||||||| ||  |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  49524083 caatcaaattggtcattgaattatatgcatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaataggtccttgaattttcacaacaaatat 49523984  T
Q  116 cactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacaaacactttgattataaaaagacaggcatttgcatatcatcagaggtc 215  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||| | |||    
T  49523983 aactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacagacactttgattataaaaacacagacatttgcataccatcataagtc 49523884  T
Q  216 atatatttgatgt 228  Q
    |||||||||||||    
T  49523883 atatatttgatgt 49523871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 158; E-Value: 3e-84
Query Start/End: Original strand, 31 - 228
Target Start/End: Original strand, 11255118 - 11255315
Alignment:
Q  31 ttgaattatatatatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgatccttgg 130  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |    
T  11255118 ttgaattatatacatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgatcattag 11255217  T
Q  131 tgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacaaacactttgattataaaaagacaggcatttgcatatcatcagaggtcatatatttgatgt 228  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||| | ||||||||||||||||    
T  11255218 tgcatacatttgctgagcaaagtaaaaagtaaaagacagacactttgattataaaaagacagatatttgcataccatcataagtcatatatttgatgt 11255315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 149; E-Value: 8e-79
Query Start/End: Original strand, 16 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 51012878 - 51012666
Alignment:
Q  16 caatcaaatttgtacttgaattatatatatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaataggtccttgaattttcacaacagatat 115  Q
    |||||| ||| || ||||||||||||  ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  51012878 caatcacattggtccttgaattatatgcatatccatcatttcaatcctcaaattagtgaaaataccatcaaataggtccttaaattttcacaacagatat 51012779  T
Q  116 cactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacaaacactttgattataaaaagacaggcatttgcatatcatcagaggtc 215  Q
     |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||| | |||    
T  51012778 tactgcgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacagacactttgattataaaaagacacacatttgcataccatcataagtc 51012679  T
Q  216 atatatttgatgt 228  Q
    |||||||||||||    
T  51012678 atatatttgatgt 51012666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 30 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 41782459 - 41782261
Alignment:
Q  30 cttgaattatatatatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgatccttg 129  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  41782459 cttgaattatatgcatatccatcatatcaatcctcaaattagtgaaaatatcatcaaattggtccttgatttttcacaacagatatcaccgtgatccttg 41782360  T
Q  130 gtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacaaacactttgattataaaaagacaggcatttgcatatcatcagaggtcatatatttgatgt 228  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||| |  |||| | ||||||||||||||||    
T  41782359 gtgcatacatttgctaaacaaagtaaaaagtaaaagacagacactttgattataaaaagacagacatatgcacactatcataagtcatatatttgatgt 41782261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 134; E-Value: 7e-70
Query Start/End: Original strand, 16 - 228
Target Start/End: Original strand, 48645920 - 48646130
Alignment:
Q  16 caatcaaatttgtacttgaattatatatatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaataggtccttgaattttcacaacagatat 115  Q
    |||||||||| || |||  ||| ||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  48645920 caatcaaattggtccttctattgtatgtctatccatcatatcgatccccaaattagtgaaaataccatcaaataagtccttgaattttcacaacatatat 48646019  T
Q  116 cactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacaaacactttgattataaaaagacaggcatttgcatatcatcagaggtc 215  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||  || |||||||||| ||||| | |||    
T  48646020 cactgtgatccttggtgcatacatttgctgaataaagtaaaaagtaaaagacaaatactttgattgtaaaaag--agacatttgcataccatcataagtc 48646117  T
Q  216 atatatttgatgt 228  Q
    |||||||||||||    
T  48646118 atatatttgatgt 48646130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 47 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 54387061 - 54386880
Alignment:
Q  47 tccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgatccttggtgcatacatttgctga 146  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||  || |||||||||||||||||||||    
T  54387061 tccatcatatcgatccccaaattagtgaaaataccatcaaataagtccttgaattttcacaacatatatcactgcaattcttggtgcatacatttgctga 54386962  T
Q  147 acaaagtaaaaagtaaaagacaaacactttgattataaaaagacaggcatttgcatatcatcagaggtcatatatttgatgt 228  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||| | |||||| |||||||||    
T  54386961 acaaagtaaaaagtaaaagacatacactttgattgtaaaaagacagacatttgcataccatcataagtcatacatttgatgt 54386880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 129; E-Value: 7e-67
Query Start/End: Original strand, 30 - 202
Target Start/End: Original strand, 319849 - 320021
Alignment:
Q  30 cttgaattatatatatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgatccttg 129  Q
    ||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||     
T  319849 cttgaattatattcatatccatcatttcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaattggtccttgaattatcataacagatatcaatgtgatccttt 319948  T
Q  130 gtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacaaacactttgattataaaaagacaggcatttgcat 202  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  319949 gtgcatacatttgctgaacaaagtaaaatgtaaaagacaaacactttgattataaaaagacaaacatttgcat 320021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 129; E-Value: 7e-67
Query Start/End: Original strand, 30 - 202
Target Start/End: Original strand, 4172689 - 4172861
Alignment:
Q  30 cttgaattatatatatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgatccttg 129  Q
    ||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||     
T  4172689 cttgaattatattcatatccatcatttcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaattggtccttgaattatcataacagatatcaatgtgatccttt 4172788  T
Q  130 gtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacaaacactttgattataaaaagacaggcatttgcat 202  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  4172789 gtgcatacatttgctgaacaaagtaaaatgtaaaagacaaacactttgattataaaaagacaaacatttgcat 4172861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 129; E-Value: 7e-67
Query Start/End: Original strand, 30 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 33265522 - 33265350
Alignment:
Q  30 cttgaattatatatatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgatccttg 129  Q
    ||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||     
T  33265522 cttgaattatattcatatccatcatttcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaattggtccttgaattatcataacagatatcaatgtgatccttt 33265423  T
Q  130 gtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacaaacactttgattataaaaagacaggcatttgcat 202  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  33265422 gtgcatacatttgctgaacaaagtaaaatgtaaaagacaaacactttgattataaaaagacaaacatttgcat 33265350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 45 - 228
Target Start/End: Original strand, 2692488 - 2692671
Alignment:
Q  45 tatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgatccttggtgcatacatttgct 144  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||||| |    
T  2692488 tatccatcatatcgatccccaaattagtgaaaatatcatcaaataagtccttgaattttcacaacatatatcattgtgatccttggttcatacatttgtt 2692587  T
Q  145 gaacaaagtaaaaagtaaaagacaaacactttgattataaaaagacaggcatttgcatatcatcagaggtcatatatttgatgt 228  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||| | |||||| |||||||||    
T  2692588 gaacaaagtaaaaagtaaaagacagacactttgattgtaaaaagacagacatttgcataccatcataagtcatacatttgatgt 2692671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 30 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 43508165 - 43507993
Alignment:
Q  30 cttgaattatatatatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgatccttg 129  Q
    ||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| ||| |||| |||||| ||||||||||     
T  43508165 cttgaattatattcatatccatcatttcgatcctcaaattagtgaagataccatcaaattggtccttgaattatcataacaaatatcaatgtgatccttt 43508066  T
Q  130 gtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacaaacactttgattataaaaagacaggcatttgcat 202  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  43508065 gtgcatacatttgctgaacaaagtaaaatgtaaaagacaaacactttgattataaaaagacaaacatttgcat 43507993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 75 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 11602569 - 11602416
Alignment:
Q  75 aaataccatcaaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacaaacact 174  Q
    |||||| |||||||| ||| || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  11602569 aaatacaatcaaataagtcgttcaattttcacaacatatatcactgtgatccttggtgcatacatctgctaaacaaagtaaaaagtaaaagacatacact 11602470  T
Q  175 ttgattataaaaagacaggcatttgcatatcatcagaggtcatatatttgatgt 228  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||||| ||||| | |||| | |||||||||    
T  11602469 ttgattgtaaaaagacagacatttgcataccatcataagtcacacatttgatgt 11602416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 50 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 11640967 - 11640838
Alignment:
Q  50 atcatatcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaaca 149  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||| ||| || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  11640967 atcatatcgatctccaaattagtgaaaatacaatcaaataagtcgttcaattttcacaacatatatcactgtgatccttggtgcatacatctgctgaaca 11640868  T
Q  150 aagtaaaaagtaaaagacaaacactttgat 179  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  11640867 aagtaaaaagtaaaaaacatacactttgat 11640838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 16 - 191
Target Start/End: Original strand, 834228 - 834402
Alignment:
Q  16 caatcaaatttgtacttgaattatatatatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaataggtccttgaattttcacaacagatat 115  Q
    |||||| ||| || ||||||||||||  ||||||||||| |||||||| |||||||| |||| | |||||||| |||||||||||| ||| |||||| ||    
T  834228 caatcacattggtccttgaattatattcatatccatcatttcgatccttaaattagtaaaaaaaacatcaaattggtccttgaattatcataacagaaat 834327  T
Q  116 cactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacaaacactttgattataaaaagaca 191  Q
    || | |||||||| |  |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  834328 caatttgatcctttggacatacatttgctgaacaaag-aaaaaataaaagacaaacactttgaatataaaaagaca 834402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 82; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 89 - 178
Target Start/End: Original strand, 52867414 - 52867503
Alignment:
Q  89 aggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacaaacactttga 178  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  52867414 aggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtagaagacagacactttga 52867503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 16 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 5438731 - 5438561
Alignment:
Q  16 caatcaaatttgtacttgaattatatatatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaataggtccttgaattttcacaacagatat 115  Q
    |||||| ||| || ||||||||||||  ||||||||||| |||||||| |||||||| |||| | |||||||    |||||||||| ||| |||||| ||    
T  5438731 caatcacattggtccttgaattatattcatatccatcatttcgatccttaaattagtaaaaaaaacatcaaa----tccttgaattatcataacagaaat 5438636  T
Q  116 cactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacaaacactttgattataaaaagaca 191  Q
    || | |||||||| |  |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  5438635 caatttgatcctttggacatacatttgctgaacaaag-aaaaaataaaagacaaacactttgaatataaaaagaca 5438561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 74 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 7150305 - 7150221
Alignment:
Q  74 aaaataccatcaaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaa 158  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||| |   ||||||| ||| |||||||||||| ||||| || ||  ||||||||||||||    
T  7150305 aaaataccatcaaataagtcctttaattatttaaacagatgtcaatgtgatccttggcgcatatatgtgtagaacaaagtaaaaa 7150221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 173; Significance: 4e-93; HSPs: 31)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 173; E-Value: 4e-93
Query Start/End: Original strand, 16 - 228
Target Start/End: Original strand, 30599380 - 30599592
Alignment:
Q  16 caatcaaatttgtacttgaattatatatatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaataggtccttgaattttcacaacagatat 115  Q
    |||||||||| || ||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30599380 caatcaaattggtccttgaattatatacatattcatcatattgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaataggtccttgaattttcacaacagatat 30599479  T
Q  116 cactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacaaacactttgattataaaaagacaggcatttgcatatcatcagaggtc 215  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| | |||    
T  30599480 cactgtgatccttggtgcatacatttgcagaacaaagtaaaaagtaaaagacaaacactttgattataaaaagacagacatttgcataccatcataagtc 30599579  T
Q  216 atatatttgatgt 228  Q
    |||||||||||||    
T  30599580 atatatttgatgt 30599592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 165; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 16 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 2377967 - 2377755
Alignment:
Q  16 caatcaaatttgtacttgaattatatatatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaataggtccttgaattttcacaacagatat 115  Q
    |||||||||| || ||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2377967 caatcaaattggtccttgaattatatgcatatccatcataacgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaataggtccttgaattttcacaacagatat 2377868  T
Q  116 cactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacaaacactttgattataaaaagacaggcatttgcatatcatcagaggtc 215  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||| |  ||    
T  2377867 cactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaactaaaagacaaacactttgattataaaaagacaaatatttgcatatcatcataaatc 2377768  T
Q  216 atatatttgatgt 228  Q
    |||||||||||||    
T  2377767 atatatttgatgt 2377755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 165; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 16 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 43766092 - 43765880
Alignment:
Q  16 caatcaaatttgtacttgaattatatatatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaataggtccttgaattttcacaacagatat 115  Q
    |||||||||| || ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  43766092 caatcaaattggtccttgaattatatacatatccatcatatcgatcatcaaattagtgaaaatactatcaaatatgtccttgaattttcacaacagatat 43765993  T
Q  116 cactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacaaacactttgattataaaaagacaggcatttgcatatcatcagaggtc 215  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |  ||    
T  43765992 cactatgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacaaacactttgattataaaaagacagacatttgcataccatcataaatc 43765893  T
Q  216 atatatttgatgt 228  Q
    |||||||||||||    
T  43765892 atatatttgatgt 43765880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 161; E-Value: 6e-86
Query Start/End: Original strand, 16 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 21349665 - 21349453
Alignment:
Q  16 caatcaaatttgtacttgaattatatatatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaataggtccttgaattttcacaacagatat 115  Q
    |||||||||| ||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||    
T  21349665 caatcaaattggtcattgaattatatacatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaataggtccttgaattttcacaacaattat 21349566  T
Q  116 cactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacaaacactttgattataaaaagacaggcatttgcatatcatcagaggtc 215  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||  |||| | |||    
T  21349565 cactgtggtccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacaaacactttgattataaaaagatagacatttgcatactatcataagtc 21349466  T
Q  216 atatatttgatgt 228  Q
    |||||||||||||    
T  21349465 atatatttgatgt 21349453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 161; E-Value: 6e-86
Query Start/End: Original strand, 16 - 228
Target Start/End: Original strand, 23292342 - 23292554
Alignment:
Q  16 caatcaaatttgtacttgaattatatatatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaataggtccttgaattttcacaacagatat 115  Q
    ||||||||||  | ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23292342 caatcaaattgatccttgaattatatgcatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaatatcatcaaataggtccttgaattttcacaacagatat 23292441  T
Q  116 cactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacaaacactttgattataaaaagacaggcatttgcatatcatcagaggtc 215  Q
    || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| | |||    
T  23292442 cattgtgatccttggtgcataaatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacatacactttgattataaaaagacagacatttgcataccatcataagtc 23292541  T
Q  216 atatatttgatgt 228  Q
    |||||||||||||    
T  23292542 atatatttgatgt 23292554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 161; E-Value: 6e-86
Query Start/End: Original strand, 16 - 228
Target Start/End: Original strand, 27898287 - 27898499
Alignment:
Q  16 caatcaaatttgtacttgaattatatatatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaataggtccttgaattttcacaacagatat 115  Q
    ||||||| || || ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27898287 caatcaagttggtccttgaattatatgcatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaataggtccttgaattttcacaacagatat 27898386  T
Q  116 cactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacaaacactttgattataaaaagacaggcatttgcatatcatcagaggtc 215  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |  ||    
T  27898387 cactgtgatccctggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaactaaaagacagacactttgattataaaaagacagacatttgcataccatcataaatc 27898486  T
Q  216 atatatttgatgt 228  Q
    |||||||||||||    
T  27898487 atatatttgatgt 27898499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 161; E-Value: 6e-86
Query Start/End: Original strand, 16 - 228
Target Start/End: Original strand, 44275389 - 44275601
Alignment:
Q  16 caatcaaatttgtacttgaattatatatatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaataggtccttgaattttcacaacagatat 115  Q
    |||||||||| || ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  44275389 caatcaaattggtccttgaattatacacatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaataggttcttgaattttcacaatagatat 44275488  T
Q  116 cactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacaaacactttgattataaaaagacaggcatttgcatatcatcagaggtc 215  Q
    || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| | |||    
T  44275489 cattgtgatccttgatgcatacatttgctgaacaaagtaaaaattaaaagacaaacactttgattataaaaagacagtcatttgcataccatcataagtc 44275588  T
Q  216 atatatttgatgt 228  Q
    |||||||||||||    
T  44275589 atatatttgatgt 44275601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 161; E-Value: 6e-86
Query Start/End: Original strand, 16 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 44795170 - 44794958
Alignment:
Q  16 caatcaaatttgtacttgaattatatatatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaataggtccttgaattttcacaacagatat 115  Q
    |||||||||| || ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44795170 caatcaaattggttcttgaattatatccatatccatcatatcgatcctcaaattagtttaaataccatcaaataggtccttgaattttcacaacagatat 44795071  T
Q  116 cactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacaaacactttgattataaaaagacaggcatttgcatatcatcagaggtc 215  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||| |||| ||||| | |||    
T  44795070 cactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacagacactttgattataaaaagacggacattttcataccatcataagtc 44794971  T
Q  216 atatatttgatgt 228  Q
    |||||||||||||    
T  44794970 atatatttgatgt 44794958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 160; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 30 - 228
Target Start/End: Original strand, 2225359 - 2225555
Alignment:
Q  30 cttgaattatatatatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgatccttg 129  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2225359 cttgaattatatacatatccatcatttcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgatccttg 2225458  T
Q  130 gtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacaaacactttgattataaaaagacaggcatttgcatatcatcagaggtcatatatttgatgt 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||  | ||||||||||||||||    
T  2225459 gtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacagacactttgattataaaaagacacacatttgcataccatc--aagtcatatatttgatgt 2225555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 160; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 17 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 2661184 - 2660973
Alignment:
Q  17 aatcaaatttgtacttgaattatatatatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaataggtccttgaattttcacaacagatatc 116  Q
    ||||||||| || ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2661184 aatcaaattggtccttgaattatatacatattcatcatatcgatcctcaaattggtttaaataccatcaaataggtccttgaattttcacaacagatatc 2661085  T
Q  117 actgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacaaacactttgattataaaaagacaggcatttgcatatcatcagaggtca 216  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||| | ||||    
T  2661084 actgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacagacactttgattataaaaagacagacattttcataccatcataagtca 2660985  T
Q  217 tatatttgatgt 228  Q
    ||||||||||||    
T  2660984 tatatttgatgt 2660973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 16 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 17516280 - 17516069
Alignment:
Q  16 caatcaaatttgtacttgaattatatatatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaataggtccttgaattttcacaacagatat 115  Q
    |||||||||| || ||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17516280 caatcaaattggtccttgaattatatc-atatccatcatatcgatactcaaattagtaaaaataccatcaaataggtccttgaattttcacaacagatat 17516182  T
Q  116 cactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacaaacactttgattataaaaagacaggcatttgcatatcatcagaggtc 215  Q
    || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | |||    
T  17516181 cattgtgatccttggtgcatacatttgcttaacaaagtaaaaagtaaaagacagatactttgattataaaaagacagacatttgcatatcatcataagtc 17516082  T
Q  216 atatatttgatgt 228  Q
    |||||||||||||    
T  17516081 atatatttgatgt 17516069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 44 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 41978671 - 41978487
Alignment:
Q  44 atatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgatccttggtgcatacatttgc 143  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41978671 atatccatcatttcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgatccttggtgcatacatttgc 41978572  T
Q  144 tgaacaaagtaaaaagtaaaagacaaacactttgattataaaaagacaggcatttgcatatcatcagaggtcatatatttgatgt 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||| | ||||||||||||||||    
T  41978571 tgaacaaagtaaaaagtaaaagacagacactttgattataaaaagacacacatttgcataccatcataagtcatatatttgatgt 41978487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 146; E-Value: 5e-77
Query Start/End: Original strand, 16 - 228
Target Start/End: Original strand, 35904898 - 35905113
Alignment:
Q  16 caatcaaatttgtacttgaattatatatatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaataggtccttgaattttcacaacagatat 115  Q
    |||||| ||| || ||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  35904898 caatcacattggtccttgaattatatgcatatccatcatttcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaataggtcattgaattttcacaacagatat 35904997  T
Q  116 cactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacaaacactttgattataaaaagacaggcatt---tgcatatcatcagag 212  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||   || ||| ||||| |     
T  35904998 cactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacagacactttgattataaaaagacacacatttgatgaataccatcataa 35905097  T
Q  213 gtcatatatttgatgt 228  Q
    ||||||||||||||||    
T  35905098 gtcatatatttgatgt 35905113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 141; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 44 - 228
Target Start/End: Original strand, 7884094 - 7884278
Alignment:
Q  44 atatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgatccttggtgcatacatttgc 143  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7884094 atatccatcatttcaatcctcaaattagtgaaaataccatcaaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgatccttggtgcatacatttgc 7884193  T
Q  144 tgaacaaagtaaaaagtaaaagacaaacactttgattataaaaagacaggcatttgcatatcatcagaggtcatatatttgatgt 228  Q
    ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||  ||||||| || ||||| | ||||||||||| ||||    
T  7884194 tgaacaaagtaaaaagtaaaagatagacactttgattataaaaagacacacatttgcctaccatcataagtcatatatttaatgt 7884278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 141; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 16 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 46198690 - 46198479
Alignment:
Q  16 caatcaaatttgtacttgaattatatatatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaataggtccttgaattttcacaacagatat 115  Q
    |||||||||| || ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || |||| |||||||||||    
T  46198690 caatcaaattggtccttgaattatatacatatctatcatatcgatcctcaaattagtaaaaataccatcaaataggtcctggattttt-acaacagatat 46198592  T
Q  116 cactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacaaacactttgattataaaaagacaggcatttgcatatcatcagaggtc 215  Q
    || ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||| | |||    
T  46198591 cattgtgatctttgatgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacagacactttgattataaaaaaacagacatttgcataccatcataagtc 46198492  T
Q  216 atatatttgatgt 228  Q
    |||||||||||||    
T  46198491 atatatttgatgt 46198479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 16 - 228
Target Start/End: Original strand, 48829997 - 48830209
Alignment:
Q  16 caatcaaatttgtacttgaattatatatatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaataggtccttgaattttcacaacagatat 115  Q
    |||||||||| || |||  ||| ||| | |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||    
T  48829997 caatcaaattggtccttctattgtatgtctatccatcatatcgatctccaaattagtgaaaataccatcaaacaagtccttgaattttcacaacatatat 48830096  T
Q  116 cactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacaaacactttgattataaaaagacaggcatttgcatatcatcagaggtc 215  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||| | |||    
T  48830097 cactgtgatccttagtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacatatactttgattgtaaaaagacagacatttgtatatcatcataagtc 48830196  T
Q  216 atatatttgatgt 228  Q
    |||||||||||||    
T  48830197 atatatttgatgt 48830209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 129; E-Value: 7e-67
Query Start/End: Original strand, 16 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 46113438 - 46113226
Alignment:
Q  16 caatcaaatttgtacttgaattatatatatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaataggtccttgaattttcacaacagatat 115  Q
    |||||||||| || |||  ||| ||| | ||||||||| ||| ||||  ||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||||| | ||    
T  46113438 caatcaaattggtccttctattgtatgtttatccatcacatcaatccctaaattagtgaagataccatcaaacaagtccttgaattttcacaacataaat 46113339  T
Q  116 cactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacaaacactttgattataaaaagacaggcatttgcatatcatcagaggtc 215  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| | |||    
T  46113338 cactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacaaacactttgattgtaaaaagacagacatttgcatatcatcataagtc 46113239  T
Q  216 atatatttgatgt 228  Q
    ||| |||||||||    
T  46113238 atacatttgatgt 46113226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 129; E-Value: 7e-67
Query Start/End: Original strand, 30 - 202
Target Start/End: Original strand, 46609725 - 46609897
Alignment:
Q  30 cttgaattatatatatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgatccttg 129  Q
    ||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||     
T  46609725 cttgaattatattcatatccatcatttcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaattggtccttgaattatcataacagatatcaatgtgatccttt 46609824  T
Q  130 gtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacaaacactttgattataaaaagacaggcatttgcat 202  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  46609825 gtgcatacatttgctgaacaaagtaaaatgtaaaagacaaacactttgattataaaaagacaaacatttgcat 46609897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 30 - 200
Target Start/End: Original strand, 38192460 - 38192630
Alignment:
Q  30 cttgaattatatatatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgatccttg 129  Q
    ||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||     
T  38192460 cttgaattatattcatatccatcatttcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaattggtccttgaattatcataacagatatcaatgtgatccttt 38192559  T
Q  130 gtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacaaacactttgattataaaaagacaggcatttgc 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  38192560 gtgcatacatttgctgaacaaagtaaaatgtaaaagacaaacactttgattataaaaagacaaacatttgc 38192630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 126; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 16 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 42280459 - 42280246
Alignment:
Q  16 caatcaaatttgtacttgaattatatatatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaataggtccttgaattttcacaacagatat 115  Q
    |||||||||| || |||  ||| ||| | ||||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  42280459 caatcaaattggtccttctattgtatgtctatccatcatatcaatccccaaattagtgaaaatatcatcaaataagtccttgaattttcacaacatatat 42280360  T
Q  116 cactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagta-aaaagtaaaagacaaacactttgattataaaaagacaggcatttgcatatcatcagaggt 214  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||| | ||    
T  42280359 cattgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaaagtaaaagacatacactttgattgtaaaaagacagacatttgcataccatcataagt 42280260  T
Q  215 catatatttgatgt 228  Q
    |||| |||||||||    
T  42280259 catacatttgatgt 42280246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 16 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 51685562 - 51685350
Alignment:
Q  16 caatcaaatttgtacttgaattatatatatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaataggtccttgaattttcacaacagatat 115  Q
    |||||||||| || |||  ||| ||| | |||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  51685562 caatcaaattggtccttctattgtatgtctatcgatcatatcaatccccaaattagtgaaaataccatcaaataagtccttgaattttcacaacatatat 51685463  T
Q  116 cactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacaaacactttgattataaaaagacaggcatttgcatatcatcagaggtc 215  Q
    |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||| | ||||| | |||    
T  51685462 cactgtgatcgttggtgcatatatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacaaacactttgattgtaaaaagacggacatttgcaaaccatcataagtc 51685363  T
Q  216 atatatttgatgt 228  Q
    ||| |||||||||    
T  51685362 atacatttgatgt 51685350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 30 - 202
Target Start/End: Original strand, 53093200 - 53093372
Alignment:
Q  30 cttgaattatatatatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgatccttg 129  Q
    ||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||     
T  53093200 cttgaattatattcatatccatcatttcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaattggtccttgaattatcataacagatatcaatgtgatccttt 53093299  T
Q  130 gtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacaaacactttgattataaaaagacaggcatttgcat 202  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  53093300 gtgcatacatttgctgaacaaagtaaaatgtaaaagacaaatactttgattataaaaagacaaacatttgcat 53093372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 30 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 54899390 - 54899250
Alignment:
Q  30 cttgaattatatatatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgatccttg 129  Q
    ||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  54899390 cttgaattatatgcatatccatcatttcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaataggtccttgaattttcacaacatatatcactgtgatccttg 54899291  T
Q  130 gtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacaaa 170  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54899290 gtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacaaa 54899250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 32 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 46309946 - 46309776
Alignment:
Q  32 tgaattatatatatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgatccttggt 131  Q
    ||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||| || ||    
T  46309946 tgaattatattcatatccatcatttcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaattggtccttgaattatcataacagatatcaatgtgatcatttgt 46309847  T
Q  132 gcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacaaacactttgattataaaaagacaggcatttgcat 202  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  46309846 gcatacatttgctgaacaaagtaaaatgtaaaagacaaacactttgattataaaaagacaaacatttgcat 46309776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 16 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 610565 - 610353
Alignment:
Q  16 caatcaaatttgtacttgaattatatatatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaataggtccttgaattttcacaacagatat 115  Q
    |||||||||| || |||  ||| ||| | ||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||    
T  610565 caatcaaattggtccttctattgtatgtctatccatcgcatcgatccccaaattagtgaaaataccatcaaataagtccttgaattttcacaacataaat 610466  T
Q  116 cactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacaaacactttgattataaaaagacaggcatttgcatatcatcagaggtc 215  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||  ||| ||||||||||| |||| | |||    
T  610465 cactatgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacagacactttgattgtaaaaaagcagacatttgcatataatcataagtc 610366  T
Q  216 atatatttgatgt 228  Q
    ||| |||||||||    
T  610365 atacatttgatgt 610353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 102 - 228
Target Start/End: Original strand, 53190118 - 53190247
Alignment:
Q  102 ttcacaacagatatcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaa---agtaaaaagtaaaagacaaacactttgattataaaaagacaggcattt 198  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||   ||||    
T  53190118 ttcacaacagatatcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaattattaaaaagtaaaagacagacactttgattataaaaagacacatattt 53190217  T
Q  199 gcatatcatcagaggtcatatatttgatgt 228  Q
    ||||| ||||| | ||||||||||||||||    
T  53190218 gcataccatcataagtcatatatttgatgt 53190247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 74 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 24845776 - 24845668
Alignment:
Q  74 aaaataccatcaaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagt--aaaagacaaac 171  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||    
T  24845776 aaaataccatcaaataagtctttgaattatcacaacatatatcaatgtgatctttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaaaagacatac 24845677  T
Q  172 actttgatt 180  Q
    |||||||||    
T  24845676 actttgatt 24845668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 16 - 106
Target Start/End: Original strand, 53188873 - 53188963
Alignment:
Q  16 caatcaaatttgtacttgaattatatatatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaataggtccttgaattttcac 106  Q
    |||||| ||| || ||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||    
T  53188873 caatcacattggtccttgaattatatgcatatccatcatttcgatcctcaaattagtgaaaatgtcatcaaataggtcattgaattttcac 53188963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 170 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 54899230 - 54899172
Alignment:
Q  170 acactttgattataaaaagacaggcatttgcatatcatcagaggtcatatatttgatgt 228  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||||||  |||| | ||||||||||||||||    
T  54899230 acactttgattataaaaagacacacatttgcatactatcataagtcatatatttgatgt 54899172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 74 - 158
Target Start/End: Original strand, 35862691 - 35862775
Alignment:
Q  74 aaaataccatcaaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaa 158  Q
    ||||||| |||| ||| ||||||||||| |   ||||||| ||| ||||||||||| |||||| || ||| ||||||||||||||    
T  35862691 aaaatacaatcagataagtccttgaattatttaaacagatgtcaatgtgatccttgttgcatatatgtgcagaacaaagtaaaaa 35862775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 74 - 163
Target Start/End: Original strand, 22219218 - 22219308
Alignment:
Q  74 aaaataccatcaaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagta-aaaagtaaa 163  Q
    |||||| |||||||||  |||||||||| |   ||||||| ||| || ||||||||||||||| || ||| |||||||||| |||||||||    
T  22219218 aaaatatcatcaaataaatccttgaattatttaaacagatgtcaatgcgatccttggtgcatatatgtgcagaacaaagtacaaaagtaaa 22219308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 169; Significance: 9e-91; HSPs: 25)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 169; E-Value: 9e-91
Query Start/End: Original strand, 16 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 27692117 - 27691905
Alignment:
Q  16 caatcaaatttgtacttgaattatatatatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaataggtccttgaattttcacaacagatat 115  Q
    |||||||||| || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27692117 caatcaaattggtccttgaattatatacatatccatcatatcgatcctcaaattagtttaaataccatcaaataggtccttgaattttcacaacagatat 27692018  T
Q  116 cactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacaaacactttgattataaaaagacaggcatttgcatatcatcagaggtc 215  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||| | |||    
T  27692017 cactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacatacactttgattataaaaagacagacattttcataccatcataagtc 27691918  T
Q  216 atatatttgatgt 228  Q
    |||||||||||||    
T  27691917 atatatttgatgt 27691905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 165; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 16 - 228
Target Start/End: Original strand, 41041757 - 41041969
Alignment:
Q  16 caatcaaatttgtacttgaattatatatatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaataggtccttgaattttcacaacagatat 115  Q
    |||||||||| || ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  41041757 caatcaaattggtccttgaattatatacatattcatcatatcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaataggtccttgaattttcacaacagatac 41041856  T
Q  116 cactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacaaacactttgattataaaaagacaggcatttgcatatcatcagaggtc 215  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| | |||    
T  41041857 cattgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacagacactttgattataaaaagacagacatttgcataccatcataagtc 41041956  T
Q  216 atatatttgatgt 228  Q
    |||||| ||||||    
T  41041957 atatatctgatgt 41041969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 161; E-Value: 6e-86
Query Start/End: Original strand, 16 - 228
Target Start/End: Original strand, 33707983 - 33708195
Alignment:
Q  16 caatcaaatttgtacttgaattatatatatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaataggtccttgaattttcacaacagatat 115  Q
    |||||||||| ||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33707983 caatcaaattggtcattgaattatatacatatccatcatatcgatcctcaaattagtttaaataccatcaaataggtccttgaattttcacaacagatat 33708082  T
Q  116 cactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacaaacactttgattataaaaagacaggcatttgcatatcatcagaggtc 215  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| | |||    
T  33708083 cactgtgttccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagatagacactttgattataaaaagacagacattttcatatcatcataagtc 33708182  T
Q  216 atatatttgatgt 228  Q
    |||||||||||||    
T  33708183 atatatttgatgt 33708195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 161; E-Value: 6e-86
Query Start/End: Original strand, 16 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 42942745 - 42942533
Alignment:
Q  16 caatcaaatttgtacttgaattatatatatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaataggtccttgaattttcacaacagatat 115  Q
    |||||||||| || ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42942745 caatcaaattggtccttgaattatatgcatatccatcatatcgatcctcaaattattgaaaataccatcaaataggtccttgaattttcacaacagatat 42942646  T
Q  116 cactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacaaacactttgattataaaaagacaggcatttgcatatcatcagaggtc 215  Q
    || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||| | |||    
T  42942645 cattgtgatccttggtgcatacatttgttgaacaaagtaaaaagtaaaagacatacactttgattatcaaaagacagacatttgcataccatcataagtc 42942546  T
Q  216 atatatttgatgt 228  Q
    |||||||||||||    
T  42942545 atatatttgatgt 42942533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 16 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 22273210 - 22272998
Alignment:
Q  16 caatcaaatttgtacttgaattatatatatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaataggtccttgaattttcacaacagatat 115  Q
    |||||||||| || ||||||||||||  ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22273210 caatcaaattggtccttgaattatatgcatatccatcgtatcgatcatcaaattagtgaaaataccatcaaataggtccttgaattttcacaacagatat 22273111  T
Q  116 cactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacaaacactttgattataaaaagacaggcatttgcatatcatcagaggtc 215  Q
    || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||| | |||    
T  22273110 cattgtgatctttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacatacactttgattataaagagacaggcaattgcataccatcataagtc 22273011  T
Q  216 atatatttgatgt 228  Q
    |||||||||||||    
T  22273010 atatatttgatgt 22272998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 16 - 228
Target Start/End: Original strand, 40338853 - 40339065
Alignment:
Q  16 caatcaaatttgtacttgaattatatatatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaataggtccttgaattttcacaacagatat 115  Q
    |||||||||| || ||||||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40338853 caatcaaattggtccttgaattatatacatattcatcgtatcgatcctcaaattagtgaaaatacaatcaaataggtccttgaattttcacaacagatat 40338952  T
Q  116 cactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacaaacactttgattataaaaagacaggcatttgcatatcatcagaggtc 215  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||| |  ||    
T  40338953 cactgtgatccttgttgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacagacactttgattataaaaagacatacatttgcataccatcataactc 40339052  T
Q  216 atatatttgatgt 228  Q
    |||||||||||||    
T  40339053 atatatttgatgt 40339065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 153; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 44 - 228
Target Start/End: Original strand, 8609008 - 8609192
Alignment:
Q  44 atatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgatccttggtgcatacatttgc 143  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8609008 atatccatcatttcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgatccttggtgcatacatttgc 8609107  T
Q  144 tgaacaaagtaaaaagtaaaagacaaacactttgattataaaaagacaggcatttgcatatcatcagaggtcatatatttgatgt 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||| | ||||| ||||||||||    
T  8609108 tgaacaaagtaaaaagtaaaagacagacactttgattataaaaagacacacatttgcataccatcataagtcatctatttgatgt 8609192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 153; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 44 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 38548150 - 38547966
Alignment:
Q  44 atatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgatccttggtgcatacatttgc 143  Q
    ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38548150 atatccatcattttgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgatccttggtgcatacatttgc 38548051  T
Q  144 tgaacaaagtaaaaagtaaaagacaaacactttgattataaaaagacaggcatttgcatatcatcagaggtcatatatttgatgt 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||| | ||||||||||||||||    
T  38548050 tgaacaaagtaaaaagtaaaagacatacactttgattataaaaagacacacatttgcataccatcataagtcatatatttgatgt 38547966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 149; E-Value: 8e-79
Query Start/End: Original strand, 44 - 228
Target Start/End: Original strand, 13107574 - 13107758
Alignment:
Q  44 atatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgatccttggtgcatacatttgc 143  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13107574 atatccatcatttcgattctcaaattagtgaaaataccatcaaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgatccttggtgcatacatttgc 13107673  T
Q  144 tgaacaaagtaaaaagtaaaagacaaacactttgattataaaaagacaggcatttgcatatcatcagaggtcatatatttgatgt 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||| || ||||| | ||||||||||||||||    
T  13107674 tgaacaaagtaaaaagtaaaagacagacactttgattataaaaagacacacatttgcctaccatcataagtcatatatttgatgt 13107758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 44 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 13283314 - 13283135
Alignment:
Q  44 atatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgatccttggtgcatacatttgc 143  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||     |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13283314 atatccatcatttcgatcctcaaattagtgaaaatacgatcaaataggtccttgaattttcaca-----tatcactgtgatccttggtgcatacatttgc 13283220  T
Q  144 tgaacaaagtaaaaagtaaaagacaaacactttgattataaaaagacaggcatttgcatatcatcagaggtcatatatttgatgt 228  Q
    | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  13283219 tcaacaaagtaaaaagtaaaagacagacactttgattataaaaagacacacatttgcatatcatcataagtcatatatttgatgt 13283135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 16 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 5037387 - 5037235
Alignment:
Q  16 caatcaaatttgtacttgaattatatatatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaataggtccttgaattttcacaacagatat 115  Q
    |||||||||| || ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5037387 caatcaaattggtccttgaattatatgcatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaatatcatcaaataggtccttgaattttcacaacagatat 5037288  T
Q  116 cactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagaca 168  Q
    || |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  5037287 cattgtgatccttggtgcatacatttgttgaacaaagtaaaaagtaaaagaca 5037235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 45 - 209
Target Start/End: Original strand, 26239644 - 26239808
Alignment:
Q  45 tatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgatccttggtgcatacatttgct 144  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26239644 tatccatcatatcgatccccaaattagtgaaaataccatcaaataagtcattgaattttcacaacatatatcactgtgatccttggtgcatacatttgct 26239743  T
Q  145 gaacaaagtaaaaagtaaaagacaaacactttgattataaaaagacaggcatttgcatatcatca 209  Q
     ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| || |||||||||| |||||    
T  26239744 caacaaagtaaaaagtaaaagacatacactttgattgtaaaaagaaagacatttgcataccatca 26239808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 124; E-Value: 7e-64
Query Start/End: Original strand, 16 - 199
Target Start/End: Original strand, 9672348 - 9672531
Alignment:
Q  16 caatcaaatttgtacttgaattatatatatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaataggtccttgaattttcacaacagatat 115  Q
    |||||||||| || |||  ||| ||| | |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  9672348 caatcaaattggtccttctattgtatgtctatccatcgtatcgatccccaaattagtgaaaataccatcaaataagtccttgaattttcacaacatatat 9672447  T
Q  116 cactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacaaacactttgattataaaaagacaggcatttg 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  9672448 cactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaactaaaaagtaaaagacagacactttgattgtaaaaagacagacatttg 9672531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 16 - 228
Target Start/End: Original strand, 7744304 - 7744516
Alignment:
Q  16 caatcaaatttgtacttgaattatatatatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaataggtccttgaattttcacaacagatat 115  Q
    |||||||||| || |||  ||| ||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| || || |    
T  7744304 caatcaaattggttcttctattgtatgtctatccatcatatcgatccccaaattagtgaaaacaccatcaaataagtccttgaattttcacatcatattt 7744403  T
Q  116 cactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacaaacactttgattataaaaagacaggcatttgcatatcatcagaggtc 215  Q
    |||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||| | |||    
T  7744404 cacttttattcttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacatacactttgattgtaaaaagacagacatttgcataccatcataagtc 7744503  T
Q  216 atatatttgatgt 228  Q
    ||| |||||||||    
T  7744504 atacatttgatgt 7744516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 34 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 35510349 - 35510181
Alignment:
Q  34 aattatatatatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgatccttggtgc 133  Q
    ||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||| |||| ||||| ||||    
T  35510349 aattatattcatatccatcatttcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaattggtccttgaattatcataacagatatcaatgtggtcctttgtgc 35510250  T
Q  134 atacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacaaacactttgattataaaaagacaggcatttgcat 202  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  35510249 atacatttgctgaacaaagtaaaatgtaaaagacaaacactttgattataaaaagacaaacatttgcat 35510181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 119; E-Value: 6e-61
Query Start/End: Original strand, 16 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 29238145 - 29237959
Alignment:
Q  16 caatcaaatttgtacttgaattatatatatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaataggtccttgaattttcacaacagatat 115  Q
    |||||| ||| || ||||||||||||  |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||| ||    
T  29238145 caatcacattggtccttgaattatattcatatccgtcatttcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaattggtccttgaattatcataacagaaat 29238046  T
Q  116 cactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacaaacactttgattataaaaagacaggcatttgcat 202  Q
    || | ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  29238045 caatttgatcatttgtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacaaacactttgattataaaaagacaaacatttgcat 29237959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 30 - 202
Target Start/End: Original strand, 33761646 - 33761818
Alignment:
Q  30 cttgaattatatatatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgatccttg 129  Q
    ||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||     
T  33761646 cttgaattatattcatatccatcatttcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaattggtcattgaattatcataacagatatcaatgtgatccttt 33761745  T
Q  130 gtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacaaacactttgattataaaaagacaggcatttgcat 202  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||    
T  33761746 gtgcatacatttgctaaacaaagtaaaatgtaaaagacaaacactttgattataaaaggacaaacatttgcat 33761818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 113; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 30 - 202
Target Start/End: Original strand, 600812 - 600984
Alignment:
Q  30 cttgaattatatatatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgatccttg 129  Q
    ||||||||||||  |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||| |||| | ||||||||     
T  600812 cttgaattatattcatatccgtcatttcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaattggtccttgaattatcataacagaaatcaatttgatccttt 600911  T
Q  130 gtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacaaacactttgattataaaaagacaggcatttgcat 202  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  600912 gtgcatacatttgctgaataaagtaaaaagtaaaagagaaacactttgattataaaaagacaaacatttgcat 600984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 109; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 45 - 209
Target Start/End: Original strand, 41824873 - 41825037
Alignment:
Q  45 tatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgatccttggtgcatacatttgct 144  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  41824873 tatccatcatattgatccccaaattagtgaaaatatcatcaaataagtccttgaattttcacaacatatatcaccgtgatgcttggtgcatacatttgct 41824972  T
Q  145 gaacaaagtaaaaagtaaaagacaaacactttgattataaaaagacaggcatttgcatatcatca 209  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||||| ||||| ||||||| ||| |||||||||| |||||    
T  41824973 gaacaaagtaaaaagtaaaagatatacactgtgattgtaaaaagccagacatttgcataccatca 41825037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 16 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 15307243 - 15307058
Alignment:
Q  16 caatcaaatttgtacttgaattatatatatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaataggtccttgaattttcacaacagatat 115  Q
    |||||| ||| || ||||||||||||  ||||||||||| |||||||| |||||||| |||| |||||||||| |||||||||||| ||| |||||| ||    
T  15307243 caatcacattggtccttgaattatattcatatccatcatttcgatccttaaattagtaaaaaaaccatcaaattggtccttgaattatcataacagaaat 15307144  T
Q  116 cactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacaaacactttgattataaaaagacaggcatttgcat 202  Q
    || | ||||| || || |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  15307143 caatttgatcatttgtacatatatttgctgaacaaagt-aaaagtaaaagacaaacactttgattataaaaagacaaacatttgcat 15307058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 16 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 15487612 - 15487427
Alignment:
Q  16 caatcaaatttgtacttgaattatatatatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaataggtccttgaattttcacaacagatat 115  Q
    |||||| ||| || ||||||||||||  ||||||||||| |||||||| |||||||| |||| |||||||||| |||||||||||| ||| |||||| ||    
T  15487612 caatcacattggtccttgaattatattcatatccatcatttcgatccttaaattagtaaaaaaaccatcaaattggtccttgaattatcataacagaaat 15487513  T
Q  116 cactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacaaacactttgattataaaaagacaggcatttgcat 202  Q
    || | ||||| || || |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  15487512 caatttgatcatttgtacatatatttgctgaacaaagt-aaaagtaaaagacaaacactttgattataaaaagacaaacatttgcat 15487427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 16 - 202
Target Start/End: Original strand, 27405316 - 27405501
Alignment:
Q  16 caatcaaatttgtacttgaattatatatatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaataggtccttgaattttcacaacagatat 115  Q
    |||||| ||| || ||||||||||||  ||||||||||| |||||||| |||||||| |||| | |||||||| |||||||||||| ||| |||||| ||    
T  27405316 caatcacattggtccttgaattatattcatatccatcatttcgatccttaaattagtaaaaaaaacatcaaattggtccttgaattatcataacagaaat 27405415  T
Q  116 cactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacaaacactttgattataaaaagacaggcatttgcat 202  Q
    || | |||||||| |  |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  27405416 caatttgatcctttggacatacatttgctgaacaaag-aaaaaataaaagacaaacactttgattataaaaagacaaacatttgcat 27405501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 87; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 81 - 228
Target Start/End: Original strand, 13485351 - 13485493
Alignment:
Q  81 catcaaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacaaacactttgatt 180  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||    |||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  13485351 catcaaataggtccttcaattttcacaacagatatcactgtgatccttgaggcatacatttgctg----aagtaaaaagtagaagacaaacactttgatt 13485446  T
Q  181 ataaaaagacaggcatttgcatatcatcagaggtcatatatttgatgt 228  Q
    ||||||| |||| |||||||||| ||||| |  |||||||||||||||    
T  13485447 ataaaaa-acagacatttgcataccatcataaatcatatatttgatgt 13485493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 16 - 167
Target Start/End: Original strand, 3152712 - 3152863
Alignment:
Q  16 caatcaaatttgtacttgaattatatatatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaataggtccttgaattttcacaacagatat 115  Q
    |||||||||| || |||  ||| ||| | ||||||||| ||  |||| ||||||||||||| |||||||||||  || ||||||||||||||||| | ||    
T  3152712 caatcaaattggttcttctattgtatgtctatccatcacattcatccccaaattagtgaaattaccatcaaatcagttcttgaattttcacaacataaat 3152811  T
Q  116 cactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagac 167  Q
    || ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  3152812 caatgtgatccttggtgcatacatctactgaacaaagtaaaaagtaaaagac 3152863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 74 - 163
Target Start/End: Original strand, 11720608 - 11720697
Alignment:
Q  74 aaaataccatcaaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaa 163  Q
    |||||| ||||||||| ||||||||| |||   || | ||  || |||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||    
T  11720608 aaaatatcatcaaataagtccttgaagtttttaaaaatatgacaatgtgatccttggtgcatatatgtgttgaacaaagtaaaaagtaaa 11720697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 169; Significance: 9e-91; HSPs: 16)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 169; E-Value: 9e-91
Query Start/End: Original strand, 16 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 28821331 - 28821119
Alignment:
Q  16 caatcaaatttgtacttgaattatatatatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaataggtccttgaattttcacaacagatat 115  Q
    |||||||||| || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28821331 caatcaaattggtccttgaattatatacatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaataacatcaaataggtccttgaattttcacaacagatat 28821232  T
Q  116 cactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacaaacactttgattataaaaagacaggcatttgcatatcatcagaggtc 215  Q
    |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||||| | |||    
T  28821231 cactgtgatctttgatgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacaaacattttgattataaaaagacagatatttgcatatcatcataagtc 28821132  T
Q  216 atatatttgatgt 228  Q
    |||||||||||||    
T  28821131 atatatttgatgt 28821119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 169; E-Value: 9e-91
Query Start/End: Original strand, 16 - 232
Target Start/End: Original strand, 32135007 - 32135223
Alignment:
Q  16 caatcaaatttgtacttgaattatatatatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaataggtccttgaattttcacaacagatat 115  Q
    |||||||||| || ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||    
T  32135007 caatcaaattggtccttgaattatatgcatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaataggtccttgaattttcacaacggagat 32135106  T
Q  116 cactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacaaacactttgattataaaaagacaggcatttgcatatcatcagaggtc 215  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||  | |||    
T  32135107 cactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacatacactttgattataaaaagacagacatttgcataacatcctaagtc 32135206  T
Q  216 atatatttgatgtccat 232  Q
    |||||||||||||||||    
T  32135207 atatatttgatgtccat 32135223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 161; E-Value: 6e-86
Query Start/End: Original strand, 16 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 8540622 - 8540410
Alignment:
Q  16 caatcaaatttgtacttgaattatatatatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaataggtccttgaattttcacaacagatat 115  Q
    ||||||||||  | ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8540622 caatcaaattgatccttgaattatatgcatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaatatcatcaaataggtccttgaattttcacaacagatat 8540523  T
Q  116 cactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacaaacactttgattataaaaagacaggcatttgcatatcatcagaggtc 215  Q
    || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| | |||    
T  8540522 cattgtgatccttggtgcataaatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacatacactttgattataaaaagacagacatttgcataccatcataagtc 8540423  T
Q  216 atatatttgatgt 228  Q
    |||||||||||||    
T  8540422 atatatttgatgt 8540410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 16 - 228
Target Start/End: Original strand, 30464810 - 30465022
Alignment:
Q  16 caatcaaatttgtacttgaattatatatatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaataggtccttgaattttcacaacagatat 115  Q
    |||||||||| || ||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30464810 caatcaaattggtccttgaattatatgcatatccatcatatcgatcctaaaattagtgataataccatcaaataggtccttgaattttcacaacagatat 30464909  T
Q  116 cactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacaaacactttgattataaaaagacaggcatttgcatatcatcagaggtc 215  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||| | |||    
T  30464910 cactgtgatccttggtgcatatatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacatgcactttgactataaaaagacagacatttgcataccatcataagtc 30465009  T
Q  216 atatatttgatgt 228  Q
    |||||||||||||    
T  30465010 atatatttgatgt 30465022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 153; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 16 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 2180725 - 2180514
Alignment:
Q  16 caatcaaatttgtacttgaattatatatatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaataggtccttgaattttcacaacagatat 115  Q
    |||||||||| || ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2180725 caatcaaattggtccttgaattatatgcatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaataggtccttgaattttcacaacagatat 2180626  T
Q  116 cactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacaaacactttgattataaaaagacaggcatttgcatatcatcagaggtc 215  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||| |  ||    
T  2180625 cactgtgatccttgatgcatacatttgctgaacaaagtaaaaactaaaagacagacactttgattataaaaagacagac-tttgcataccatcataaatc 2180527  T
Q  216 atatatttgatgt 228  Q
    |||| ||||||||    
T  2180526 atatctttgatgt 2180514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 153; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 16 - 228
Target Start/End: Original strand, 2853441 - 2853653
Alignment:
Q  16 caatcaaatttgtacttgaattatatatatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaataggtccttgaattttcacaacagatat 115  Q
    |||| ||||| || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  2853441 caatgaaattggtccttgaattatatacatatccatcatatcgatcctcaaattagtttaaatatcatcaaataggtctttgaattttcacaacagatat 2853540  T
Q  116 cactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacaaacactttgattataaaaagacaggcatttgcatatcatcagaggtc 215  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||| | |||    
T  2853541 cactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacatgcactttgattataaaaagacagacattttcatattatcataagtc 2853640  T
Q  216 atatatttgatgt 228  Q
    |||||||||||||    
T  2853641 atatatttgatgt 2853653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 153; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 16 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 21841952 - 21841740
Alignment:
Q  16 caatcaaatttgtacttgaattatatatatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaataggtccttgaattttcacaacagatat 115  Q
    |||||| ||| || ||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  21841952 caatcacattggtccttgaattatatgcatatccatcatttcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaataggtccttgaattttcacaatagatat 21841853  T
Q  116 cactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacaaacactttgattataaaaagacaggcatttgcatatcatcagaggtc 215  Q
    ||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| | |||    
T  21841852 cactgtgattcttagtgcatacatttgctgaagaaagtaaaaagtaaaagacagacactttgattataaaaagacacacatttgcatatcatcataagtc 21841753  T
Q  216 atatatttgatgt 228  Q
    |||||||||||||    
T  21841752 atatatttgatgt 21841740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 149; E-Value: 8e-79
Query Start/End: Original strand, 44 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 7268768 - 7268584
Alignment:
Q  44 atatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgatccttggtgcatacatttgc 143  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7268768 atatccatcatttcgatcctcaaattagtgaaaataacatcaaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgatccttggtgcatacatttgc 7268669  T
Q  144 tgaacaaagtaaaaagtaaaagacaaacactttgattataaaaagacaggcatttgcatatcatcagaggtcatatatttgatgt 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||| |||| ||||| | ||||||||||||||||    
T  7268668 tgaacaaagtaaaaagtaaaagacagacactttgattataaaaagacacacatttacataccatcataagtcatatatttgatgt 7268584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 149; E-Value: 8e-79
Query Start/End: Original strand, 16 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 12738056 - 12737844
Alignment:
Q  16 caatcaaatttgtacttgaattatatatatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaataggtccttgaattttcacaacagatat 115  Q
    |||||||||| || ||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  12738056 caatcaaattggtccttgaattatatgcatatccatcatatcgatcatcaaattagtgaaaataccaccaaataggtcattgaattttcacaacagatat 12737957  T
Q  116 cactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacaaacactttgattataaaaagacaggcatttgcatatcatcagaggtc 215  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||| | |  ||    
T  12737956 cactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaactaaaagacagacactttaattataaaaagacagacatttgcataccattataaatc 12737857  T
Q  216 atatatttgatgt 228  Q
    |||||||||||||    
T  12737856 atatatttgatgt 12737844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 149; E-Value: 8e-79
Query Start/End: Original strand, 16 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 12800879 - 12800667
Alignment:
Q  16 caatcaaatttgtacttgaattatatatatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaataggtccttgaattttcacaacagatat 115  Q
    |||||||||| || ||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  12800879 caatcaaattggtccttgaattatatgcatatccatcatatcgatcatcaaattagtgaaaataccaccaaataggtcattgaattttcacaacagatat 12800780  T
Q  116 cactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacaaacactttgattataaaaagacaggcatttgcatatcatcagaggtc 215  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||| | |  ||    
T  12800779 cactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaactaaaagacagacactttaattataaaaagacagacatttgcataccattataaatc 12800680  T
Q  216 atatatttgatgt 228  Q
    |||||||||||||    
T  12800679 atatatttgatgt 12800667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 77 - 228
Target Start/End: Original strand, 24540425 - 24540576
Alignment:
Q  77 ataccatcaaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacaaacacttt 176  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  24540425 ataccatcaaataggtccttgaattttcacaacatatatcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacagacacttt 24540524  T
Q  177 gattataaaaagacaggcatttgcatatcatcagaggtcatatatttgatgt 228  Q
    |||||||||||||||  ||||| |||| ||||| | ||||||||||||||||    
T  24540525 gattataaaaagacatacattttcataccatcataagtcatatatttgatgt 24540576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 16 - 202
Target Start/End: Original strand, 42472656 - 42472841
Alignment:
Q  16 caatcaaatttgtacttgaattatatatatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaataggtccttgaattttcacaacagatat 115  Q
    |||||| ||| || ||||||||||||  ||||||||||| |||||||| |||||||| |||| | |||||||| |||||||||||| ||| |||||| ||    
T  42472656 caatcacattggtccttgaattatattcatatccatcatttcgatccttaaattagtaaaaaaaacatcaaattggtccttgaattatcataacagaaat 42472755  T
Q  116 cactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacaaacactttgattataaaaagacaggcatttgcat 202  Q
    || | |||||||| |  |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  42472756 caatttgatcctttggacatacatttgctgaacaaag-aaaaaataaaagacaaacactttgattataaaaagacaaacatttgcat 42472841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 45 - 142
Target Start/End: Original strand, 41494644 - 41494741
Alignment:
Q  45 tatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgatccttggtgcatacatttg 142  Q
    |||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||| |||||    
T  41494644 tatccatcatattgatccccaaatttgtgaaaataccatcaaataattccttgaattttcacaacatatatcactgtaatccttagtgcatatatttg 41494741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 16 - 127
Target Start/End: Complemental strand, 40781541 - 40781430
Alignment:
Q  16 caatcaaatttgtacttgaattatatatatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaataggtccttgaattttcacaacagatat 115  Q
    |||||| ||| || |||||||||||   ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||| ||    
T  40781541 caatcacattggtccttgaattataatcatatccatcatttcgatcctcaaattaatgaaaataccatcaaattggtccttgaattatcataacagagat 40781442  T
Q  116 cactgtgatcct 127  Q
    || |||||||||    
T  40781441 caatgtgatcct 40781430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 44 - 127
Target Start/End: Original strand, 29620941 - 29621024
Alignment:
Q  44 atatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgatcct 127  Q
    ||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||| |||| |||||||||    
T  29620941 atatccatcattttgatcctcaaattaatgaaaataccatcaaattggtccttgaattatcataacagagatcaatgtgatcct 29621024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 74 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 27076817 - 27076733
Alignment:
Q  74 aaaataccatcaaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaa 158  Q
    ||||||||||||||||  || ||||||| |   ||||||| ||| |||||||||||||||| | || ||| ||| ||||||||||    
T  27076817 aaaataccatcaaataaatcattgaattatttaaacagatgtcaatgtgatccttggtgcaaatatgtgcagaataaagtaaaaa 27076733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 169; Significance: 9e-91; HSPs: 16)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 169; E-Value: 9e-91
Query Start/End: Original strand, 16 - 228
Target Start/End: Original strand, 14388275 - 14388487
Alignment:
Q  16 caatcaaatttgtacttgaattatatatatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaataggtccttgaattttcacaacagatat 115  Q
    |||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14388275 caatcaaattggtccttgaattatatacatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaatactatcaaataggtccttgaattttcacaacagatat 14388374  T
Q  116 cactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacaaacactttgattataaaaagacaggcatttgcatatcatcagaggtc 215  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||| | |||    
T  14388375 cactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagatagacactttgattataaaaaaacagacatttgcataccatcataagtc 14388474  T
Q  216 atatatttgatgt 228  Q
    |||||||||||||    
T  14388475 atatatttgatgt 14388487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 158; E-Value: 3e-84
Query Start/End: Original strand, 16 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 40561195 - 40560978
Alignment:
Q  16 caatcaaatttgtacttgaattatatatatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaataggtccttgaattttcacaacagatat 115  Q
    |||| ||||| || ||| ||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40561195 caattaaattggtccttaaattatatgcacatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaataggtccttgaattttcacaacagatat 40561096  T
Q  116 cactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacaaacactttgattataaaaagacaggcatttgcatatcatcagaggtc 215  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |  ||    
T  40561095 caatgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagccatacactttgattataaaaagacagacatttgcatatcatcataaatc 40560996  T
Q  216 atatatttgatgtccatc 233  Q
    ||||||||||||| ||||    
T  40560995 atatatttgatgttcatc 40560978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 16 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 6798476 - 6798264
Alignment:
Q  16 caatcaaatttgtacttgaattatatatatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaataggtccttgaattttcacaacagatat 115  Q
    |||||||||| || ||| |||| |||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  6798476 caatcaaattggtccttcaattgtatacatattcatcaaatcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaatatgtccttgaattttcacaacagatat 6798377  T
Q  116 cactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacaaacactttgattataaaaagacaggcatttgcatatcatcagaggtc 215  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||     
T  6798376 cactgtgatccttggtgcatacatttgatgaacaaagtaaaaagtaaaagacagacactttgattataaaaagacagacatttgcatatcatcataagtt 6798277  T
Q  216 atatatttgatgt 228  Q
    |||||||||||||    
T  6798276 atatatttgatgt 6798264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 154; E-Value: 8e-82
Query Start/End: Original strand, 16 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 2767884 - 2767691
Alignment:
Q  16 caatcaaatttgtacttgaattatatatatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaataggtccttgaattttcacaacagatat 115  Q
    |||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||    
T  2767884 caatcaaattggtccttgaattatatacatatccatcatatcgatcctcaatttagtgaaaataccatcaaattggtccttgaattttcacaatagatat 2767785  T
Q  116 cactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacaaacactttgattataaaaagacaggcatttgcatatcatca 209  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  2767784 cactgtgatccttggtgcatacattttctgaacaaagtaaaaagtaaaagacaaactctttgattataaaaagacagacatttgcataccatca 2767691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 153; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 16 - 228
Target Start/End: Original strand, 19907452 - 19907664
Alignment:
Q  16 caatcaaatttgtacttgaattatatatatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaataggtccttgaattttcacaacagatat 115  Q
    |||||||||| || ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19907452 caatcaaattggtccttgaattatatgcatatccatcatatcgatcctcaaatgagtgaaaataccatgaaataggtccttgaattttcacaacagatat 19907551  T
Q  116 cactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacaaacactttgattataaaaagacaggcatttgcatatcatcagaggtc 215  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| | |  ||    
T  19907552 cactgtgatcattggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaactaaaagacagacactttgattataaaaagacagacatttgcataccattataaatc 19907651  T
Q  216 atatatttgatgt 228  Q
    |||||||||||||    
T  19907652 atatatttgatgt 19907664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 16 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 16763916 - 16763704
Alignment:
Q  16 caatcaaatttgtacttgaattatatatatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaataggtccttgaattttcacaacagatat 115  Q
    |||||| ||| || ||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  16763916 caatcacattggtccttgaattatatgcatatccatcatttcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaataggtcattgaatttacacaacagatat 16763817  T
Q  116 cactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacaaacactttgattataaaaagacaggcatttgcatatcatcagaggtc 215  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||  ||||||||||  |||| | |||    
T  16763816 cactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacagagtaaaaagtaaaagatagacactttgattataaaaagacacacatttgcatactatcataagtc 16763717  T
Q  216 atatatttgatgt 228  Q
    |||||||||||||    
T  16763716 atatatttgatgt 16763704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 141; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 16 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 17697177 - 17696965
Alignment:
Q  16 caatcaaatttgtacttgaattatatatatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaataggtccttgaattttcacaacagatat 115  Q
    |||||||| | || ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||    
T  17697177 caatcaaactggtccttgaattatatacatatccatcatatcgatcctaaaattggtgaaaataccatcaaataggtccttgaattttcacaacatacat 17697078  T
Q  116 cactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacaaacactttgattataaaaagacaggcatttgcatatcatcagaggtc 215  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||| | |||    
T  17697077 cactatgatccttggtggatacatttgttgaacaaagtaaaaagtagaagacagacactttgattataaaaagacagatatttgcataccatcataagtc 17696978  T
Q  216 atatatttgatgt 228  Q
    |||||||||||||    
T  17696977 atatatttgatgt 17696965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 56 - 228
Target Start/End: Original strand, 39663994 - 39664166
Alignment:
Q  56 tcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaa 155  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39663994 tcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaataggtccttgaattttcacaacatatatcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaa 39664093  T
Q  156 aaagtaaaagacaaacactttgattataaaaagacaggcatttgcatatcatcagaggtcatatatttgatgt 228  Q
    ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||| |  |||||||||||||||    
T  39664094 aaactaaaagacagacactttgattataaaaagacagacatctgcataccatcataaatcatatatttgatgt 39664166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 129; E-Value: 7e-67
Query Start/End: Original strand, 16 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 39456129 - 39455918
Alignment:
Q  16 caatcaaatttgtacttgaattatatatatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaataggtccttgaattttcacaacagatat 115  Q
    |||||||||| ||  |||||||||||  |||| |||||||| ||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  39456129 caatcaaattggtcattgaattatatgcatattcatcatattgattctcaaatgagtgaaaatatcatcaaataggtccttaaattttcacaacagatat 39456030  T
Q  116 cactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacaaacactttgattataaaaagacaggcatttgcatatcatcagaggtc 215  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||| | |||    
T  39456029 cactatgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacaga-actttgattataaaaagacagacatttgtataccatcataagtc 39455931  T
Q  216 atatatttgatgt 228  Q
    ||||| |||||||    
T  39455930 atatacttgatgt 39455918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 107; E-Value: 9e-54
Query Start/End: Original strand, 82 - 228
Target Start/End: Original strand, 44708996 - 44709142
Alignment:
Q  82 atcaaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacaaacactttgatta 181  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  44708996 atcaaattggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtcaaagacagacactttgatta 44709095  T
Q  182 taaaaagacaggcatttgcatatcatcagaggtcatatatttgatgt 228  Q
    ||||||  ||| |||||||||| ||||| | | ||||||||||||||    
T  44709096 taaaaatgcagacatttgcataccatcataagacatatatttgatgt 44709142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 16 - 202
Target Start/End: Original strand, 24206712 - 24206900
Alignment:
Q  16 caatcaaatttgtacttgaattatatatatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaatac--catcaaataggtccttgaattttcacaacagat 113  Q
    |||||| ||| || ||||||||||||  ||||||||||| |||||||| |||||||| |||| |   |||||||| |||||||||||| | | ||||||     
T  24206712 caatcacattggtccttgaattatattcatatccatcatttcgatccttaaattagtaaaaaaaaatcatcaaattggtccttgaattattataacagaa 24206811  T
Q  114 atcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacaaacactttgattataaaaagacaggcatttgcat 202  Q
    |||| | |||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||    
T  24206812 atcaatttgatcctttggacatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacaaacaatttgattataaaaagacaaacatttgcat 24206900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 16 - 202
Target Start/End: Original strand, 6784461 - 6784648
Alignment:
Q  16 caatcaaatttgtacttgaattatatatatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaatac-catcaaataggtccttgaattttcacaacagata 114  Q
    |||||| ||| || ||||||||||||  ||||||||||| |||||| | |||||||| |||| |  |||||||| |||||||||||| ||| |||||| |    
T  6784461 caatcacattggtccttgaattatattcatatccatcatttcgatctttaaattagtaaaaaaaaacatcaaattggtccttgaattatcataacagaaa 6784560  T
Q  115 tcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacaaacactttgattataaaaagacaggcatttgcat 202  Q
    ||| |  ||||||| |  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  6784561 tcaattggatcctttggacatacatttgctgaacaaagtcaaaagtaaaagacaaacactttgattataaaaagacaaacatttgcat 6784648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 134 - 228
Target Start/End: Original strand, 42518524 - 42518618
Alignment:
Q  134 atacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacaaacactttgattataaaaagacaggcatttgcatatcatcagaggtcatatatttgatgt 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||    
T  42518524 atacatttgctgaacaaagtaaaaaataaaagacaaacactttgattataaaaagacaggcatttgcataccatcataagtcatatatttgatgt 42518618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 16 - 127
Target Start/End: Complemental strand, 37021499 - 37021388
Alignment:
Q  16 caatcaaatttgtacttgaattatatatatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaataggtccttgaattttcacaacagatat 115  Q
    |||||| ||| || |||||||||||   ||||||||||| | ||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||    
T  37021499 caatcacattggtccttgaattataatcatatccatcattttgatcctcaaattaatgaaaaaaccatcaaattggtccttgaattatcataacagatat 37021400  T
Q  116 cactgtgatcct 127  Q
    || |||||||||    
T  37021399 caatgtgatcct 37021388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 119 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 37646283 - 37646238
Alignment:
Q  119 tgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaa 164  Q
    ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  37646283 tgtgatctttggtgcatatatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaa 37646238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 74 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 161300 - 161216
Alignment:
Q  74 aaaataccatcaaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaa 158  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| |   ||||||| |||  ||||||||||||||||| || |||  |||||||||||||    
T  161300 aaaataccatcaaataagtccttgaattatttaaacagatgtcaacgtgatccttggtgcatatatgtgcataacaaagtaaaaa 161216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 165; Significance: 2e-88; HSPs: 26)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 165; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 16 - 228
Target Start/End: Original strand, 37114701 - 37114913
Alignment:
Q  16 caatcaaatttgtacttgaattatatatatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaataggtccttgaattttcacaacagatat 115  Q
    |||||||||| || ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37114701 caatcaaattggtccttgaattatatgcatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaataggtccttgaattttcacaacagatat 37114800  T
Q  116 cactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacaaacactttgattataaaaagacaggcatttgcatatcatcagaggtc 215  Q
    || ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| | |||    
T  37114801 cattgtaatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagaaatacactttgattataaaaagacagacatttgcataccatcataagtc 37114900  T
Q  216 atatatttgatgt 228  Q
    |||||||||||||    
T  37114901 atatatttgatgt 37114913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 161; E-Value: 6e-86
Query Start/End: Original strand, 16 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 6604476 - 6604264
Alignment:
Q  16 caatcaaatttgtacttgaattatatatatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaataggtccttgaattttcacaacagatat 115  Q
    |||||||||| || ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  6604476 caatcaaattggtccttgaattatatgcatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaataggtccttgacttttcacaacatatat 6604377  T
Q  116 cactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacaaacactttgattataaaaagacaggcatttgcatatcatcagaggtc 215  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| | |||    
T  6604376 cactgtgatcattggtgcatacatttactgaacaaagtaaaaagtaaaagacagacactttgattataaaaagacagacatttgcataccatcataagtc 6604277  T
Q  216 atatatttgatgt 228  Q
    |||||||||||||    
T  6604276 atatatttgatgt 6604264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 161; E-Value: 6e-86
Query Start/End: Original strand, 16 - 228
Target Start/End: Original strand, 38473297 - 38473508
Alignment:
Q  16 caatcaaatttgtacttgaattatatatatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaataggtccttgaattttcacaacagatat 115  Q
    |||||||||| || ||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38473297 caatcaaattggtccttgaattatatacatactcatcatatcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaataggtccttgaattttcacaacagatat 38473396  T
Q  116 cactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacaaacactttgattataaaaagacaggcatttgcatatcatcagaggtc 215  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| | |||    
T  38473397 cactgtgatccttggtgcatacatttgctaaacaaagtaaaaagtaaaa-acatacactttgattataaaaagacagacatttgcataccatcataagtc 38473495  T
Q  216 atatatttgatgt 228  Q
    |||||||||||||    
T  38473496 atatatttgatgt 38473508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 160; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 17 - 228
Target Start/End: Original strand, 23905426 - 23905637
Alignment:
Q  17 aatcaaatttgtacttgaattatatatatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaataggtccttgaattttcacaacagatatc 116  Q
    ||||||||| ||  |||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23905426 aatcaaattggtcattgaattatatgcatatcaatcatatcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaataggtccttgaattttcacaacagatatc 23905525  T
Q  117 actgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacaaacactttgattataaaaagacaggcatttgcatatcatcagaggtca 216  Q
    | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| | ||||    
T  23905526 attgtgatctttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagaaaaacactttgattataaaaagacagacatttgcataccatcataagtca 23905625  T
Q  217 tatatttgatgt 228  Q
    ||||||||||||    
T  23905626 tatatttgatgt 23905637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 160; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 17 - 228
Target Start/End: Original strand, 27665220 - 27665431
Alignment:
Q  17 aatcaaatttgtacttgaattatatatatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaataggtccttgaattttcacaacagatatc 116  Q
    ||||||||| || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  27665220 aatcaaattggtccttgaattatatacatatccatcatatcgatcctcaaattagtttaaataccatcaaatatgtccttgaattttcacaacagatatc 27665319  T
Q  117 actgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacaaacactttgattataaaaagacaggcatttgcatatcatcagaggtca 216  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||| |||| ||||| | ||||    
T  27665320 actgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacagacactttgattataaaaaggcagacattttcataccatcataagtca 27665419  T
Q  217 tatatttgatgt 228  Q
    ||||||||||||    
T  27665420 tatatttgatgt 27665431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 16 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 22154851 - 22154639
Alignment:
Q  16 caatcaaatttgtacttgaattatatatatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaataggtccttgaattttcacaacagatat 115  Q
    |||||||||| || ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22154851 caatcaaattggtccttgaattatatgcatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaataggtccttgaattttcacaacagatat 22154752  T
Q  116 cactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacaaacactttgattataaaaagacaggcatttgcatatcatcagaggtc 215  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||  |||||||||| ||||| | |||    
T  22154751 cactgtgatccatggtgcatatatttgctaaacaaagtaaaaagtaaaagacagactctttgattataaaaagacaaacatttgcataccatcataagtc 22154652  T
Q  216 atatatttgatgt 228  Q
    |||||||||||||    
T  22154651 atatatttgatgt 22154639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 16 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 22210766 - 22210554
Alignment:
Q  16 caatcaaatttgtacttgaattatatatatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaataggtccttgaattttcacaacagatat 115  Q
    |||||||||| || ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22210766 caatcaaattggtccttgaattatatgcatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaataggtccttgaattttcacaacagatat 22210667  T
Q  116 cactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacaaacactttgattataaaaagacaggcatttgcatatcatcagaggtc 215  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||  |||||||||| ||||| | |||    
T  22210666 cactgtgatccatggtgcatatatttgctaaacaaagtaaaaagtaaaagacagactctttgattataaaaagacaaacatttgcataccatcataagtc 22210567  T
Q  216 atatatttgatgt 228  Q
    |||||||||||||    
T  22210566 atatatttgatgt 22210554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 16 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 45360288 - 45360076
Alignment:
Q  16 caatcaaatttgtacttgaattatatatatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaataggtccttgaattttcacaacagatat 115  Q
    |||||||||| || ||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  45360288 caatcaaattggtccttgaattatatgcatatccatcatatcgatcctaaaattagtgaaaataccatcaaataggtctttgaattttcacaacatatat 45360189  T
Q  116 cactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacaaacactttgattataaaaagacaggcatttgcatatcatcagaggtc 215  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |  ||    
T  45360188 cactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaactaaaagataaacactttgattataaaaagacagacatttgcataccatcataaatc 45360089  T
Q  216 atatatttgatgt 228  Q
    |||||||||||||    
T  45360088 atatatttgatgt 45360076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 153; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 16 - 228
Target Start/End: Original strand, 29995689 - 29995901
Alignment:
Q  16 caatcaaatttgtacttgaattatatatatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaataggtccttgaattttcacaacagatat 115  Q
    ||||||||||  | ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  29995689 caatcaaattgatccttaaattatatacatatccatcatatcgatcctcaaattagtttaaataccatgaaataggtccttgaattttcacaacaaatat 29995788  T
Q  116 cactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacaaacactttgattataaaaagacaggcatttgcatatcatcagaggtc 215  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||| | |||    
T  29995789 cactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacagacactttgattataaaaagacagacattttcataccatcataagtc 29995888  T
Q  216 atatatttgatgt 228  Q
    |||||||||||||    
T  29995889 atatatttgatgt 29995901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 153; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 16 - 228
Target Start/End: Original strand, 35692523 - 35692735
Alignment:
Q  16 caatcaaatttgtacttgaattatatatatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaataggtccttgaattttcacaacagatat 115  Q
    |||||||||| || ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  35692523 caatcaaattggtccttgaattatatgcatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaataggtcattgaattttcacaacagatat 35692622  T
Q  116 cactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacaaacactttgattataaaaagacaggcatttgcatatcatcagaggtc 215  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||| | |||    
T  35692623 cactgtgatccttggtgcatatatttgccgaacgaagtaaaaagcaaaagacagacactttgattataaaaagacaaacatttgcataccatcataagtc 35692722  T
Q  216 atatatttgatgt 228  Q
    |||||||||||||    
T  35692723 atatatttgatgt 35692735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 153; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 16 - 228
Target Start/End: Original strand, 39858415 - 39858627
Alignment:
Q  16 caatcaaatttgtacttgaattatatatatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaataggtccttgaattttcacaacagatat 115  Q
    |||||||||| || ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39858415 caatcaaattggtccttgaattatatgcatatccatcatatcgatcctcaaatgagtgaaaataccatgaaataggtccttgaattttcacaacagatat 39858514  T
Q  116 cactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacaaacactttgattataaaaagacaggcatttgcatatcatcagaggtc 215  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| | |  ||    
T  39858515 cactgtgatcattggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaactaaaagacagacactttgattataaaaagacagacatttgcataccattataaatc 39858614  T
Q  216 atatatttgatgt 228  Q
    |||||||||||||    
T  39858615 atatatttgatgt 39858627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 149; E-Value: 8e-79
Query Start/End: Original strand, 16 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 13169034 - 13168822
Alignment:
Q  16 caatcaaatttgtacttgaattatatatatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaataggtccttgaattttcacaacagatat 115  Q
    |||||||||| || ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13169034 caatcaaattggtccttgaattatatgcatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaacataccatcaaataggtccttgaattttcacaacagatat 13168935  T
Q  116 cactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacaaacactttgattataaaaagacaggcatttgcatatcatcagaggtc 215  Q
    || |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| | |  ||    
T  13168934 caatgtgatccttggtgcatacattcgctgaacaaaataaaaactaaaagacagacactttgattataaaaatacagacatttgcatatcattataaatc 13168835  T
Q  216 atatatttgatgt 228  Q
    |||||||||||||    
T  13168834 atatatttgatgt 13168822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 16 - 228
Target Start/End: Original strand, 46438683 - 46438895
Alignment:
Q  16 caatcaaatttgtacttgaattatatatatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaataggtccttgaattttcacaacagatat 115  Q
    |||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  46438683 caatcaaattggtccttgaattatatacatatccatcatatcgatcctcaaataagtgaaaataccatcaaataggtcattgaattttcacaacagatat 46438782  T
Q  116 cactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacaaacactttgattataaaaagacaggcatttgcatatcatcagaggtc 215  Q
    |||| |||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||| ||||| | |||    
T  46438783 cactttgatccttggtggatacatttgctgaatagagtaaaaagtagaagacaaacactttgattatagaaagacggacatttgcataccatcataagtc 46438882  T
Q  216 atatatttgatgt 228  Q
    |||||||| ||||    
T  46438883 atatatttaatgt 46438895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 144; E-Value: 8e-76
Query Start/End: Original strand, 17 - 228
Target Start/End: Original strand, 34776135 - 34776346
Alignment:
Q  17 aatcaaatttgtacttgaattatatatatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaataggtccttgaattttcacaacagatatc 116  Q
    ||||||||| || ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  34776135 aatcaaattggtccttgaattatatgcatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaatagatctttgaattttcacaacagatatc 34776234  T
Q  117 actgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacaaacactttgattataaaaagacaggcatttgcatatcatcagaggtca 216  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||  |||||||||||||||  |||||||||| ||||| |  |||    
T  34776235 actgtgatccttggtgcatacatttgctaaacaaagtaaaaactaaaagacagacactcagattataaaaagacaaacatttgcataccatcataaatca 34776334  T
Q  217 tatatttgatgt 228  Q
    ||||||||||||    
T  34776335 tatatttgatgt 34776346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 16 - 228
Target Start/End: Original strand, 24227594 - 24227806
Alignment:
Q  16 caatcaaatttgtacttgaattatatatatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaataggtccttgaattttcacaacagatat 115  Q
    ||||||||| ||| ||| ||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | || ||||||||||||||||||    
T  24227594 caatcaaatatgtccttaaattatatacacatccatcatatcaatcctcaaattagtgaaaataccatcaaataggacatttaattttcacaacagatat 24227693  T
Q  116 cactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacaaacactttgattataaaaagacaggcatttgcatatcatcagaggtc 215  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||| ||| ||||| |  ||    
T  24227694 cactgtgatcattggtacatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacagacactttgattacaaaaagacagacatttgtataccatcataaatc 24227793  T
Q  216 atatatttgatgt 228  Q
    |||||||||||||    
T  24227794 atatatttgatgt 24227806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 16 - 223
Target Start/End: Original strand, 38550443 - 38550650
Alignment:
Q  16 caatcaaatttgtacttgaattatatatatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaataggtccttgaattttcacaacagatat 115  Q
    |||||||||| || |||  ||| ||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||    
T  38550443 caatcaaattagtccttctattgtatgtctatccatcatatcgatccccaaattagtgaaaataccatcaaataagtccttgaatttttacaacatatat 38550542  T
Q  116 cactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacaaacactttgattataaaaagacaggcatttgcatatcatcagaggtc 215  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||| | |||    
T  38550543 cactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaaataaaaagtaaaagacatacactttgattgtaaaaagacagacatttgcataccatcataagtc 38550642  T
Q  216 atatattt 223  Q
    ||| ||||    
T  38550643 atacattt 38550650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 45 - 228
Target Start/End: Original strand, 37792236 - 37792419
Alignment:
Q  45 tatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgatccttggtgcatacatttgct 144  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||| |    
T  37792236 tatccatcatattgatccccaaattagtgaaaataccatcaaataagtccttgaattttcacaccatatatcactgtgatcattggtgcatacatttgtt 37792335  T
Q  145 gaacaaagtaaaaagtaaaagacaaacactttgattataaaaagacaggcatttgcatatcatcagaggtcatatatttgatgt 228  Q
    | ||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||| ||||||| || ||||| | |||||| |||||||||    
T  37792336 gtacaaagtaaaaagtaaaagtcaaagactttgattgtaaaaagacagacatttgcttaccatcatatgtcatacatttgatgt 37792419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 105; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 46 - 202
Target Start/End: Original strand, 35402563 - 35402719
Alignment:
Q  46 atccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgatccttggtgcatacatttgctg 145  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||| | ||||| ||||||||    
T  35402563 atccatcatttcgatcctcaaattagtgaaaatatcatcaaattggtccttgaattatcataacagatatcaatgtgatcctttgagcatatatttgctg 35402662  T
Q  146 aacaaagtaaaaagtaaaagacaaacactttgattataaaaagacaggcatttgcat 202  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  35402663 aacaaagtaaaatgtaaaagataaacactttgattataaaaagacaaacatttgcat 35402719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 105; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 48 - 228
Target Start/End: Original strand, 48851529 - 48851708
Alignment:
Q  48 ccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaa 147  Q
    ||||||||| |||||  ||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| |||||||||||||||     
T  48851529 ccatcatattgatcca-aaattagtgaaaatctcatcaaataagtccttgaattttcacaacatatatcattgtgatccttggggcatacatttgctgac 48851627  T
Q  148 caaagtaaaaagtaaaagacaaacactttgattataaaaagacaggcatttgcatatcatcagaggtcatatatttgatgt 228  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||  |||||||||| ||||||| || ||| |||||||||    
T  48851628 caaagtaaaaagtaaaagacagacactttgattgtaaaaagacatacatttgcataccatcagaagttatacatttgatgt 48851708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 97; E-Value: 9e-48
Query Start/End: Original strand, 16 - 209
Target Start/End: Original strand, 47385388 - 47385576
Alignment:
Q  16 caatcaaatttgtacttgaattatatatatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaataggtccttgaattttcacaacagatat 115  Q
    |||||||||| || |||  ||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||    
T  47385388 caatcaaattggtccttctattatatgtctatccatcatatcgatccccaaattagtgaaattaccatcaaataagtccttgaattttcacaacatacat 47385487  T
Q  116 cactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacaaacactttgattataaaaagacaggcatttgcatatcatca 209  Q
    || |||||||     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||| ||||| |||| |||||    
T  47385488 ca-tgtgatc----atgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacagacacattgattgtaaaaagacagacatttacataccatca 47385576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 34 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 69134 - 69032
Alignment:
Q  34 aattatatatatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgatccttggtgc 133  Q
    ||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  69134 aattatatgcatatccatcatttcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaataggtccttgaattatcataacagatatcaatgtgatccttggtgc 69035  T
Q  134 ata 136  Q
    |||    
T  69034 ata 69032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 132 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 66915 - 66845
Alignment:
Q  132 gcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacaaacactttgattataaaaagacaggcatttgcat 202  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  66915 gcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacagacactttgattataaaaagaaaggcatttgcat 66845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 16 - 127
Target Start/End: Complemental strand, 20479032 - 20478921
Alignment:
Q  16 caatcaaatttgtacttgaattatatatatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaataggtccttgaattttcacaacagatat 115  Q
    |||||| ||| || |||||||||||   ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||| ||    
T  20479032 caatcacattggtccttgaattataatcatatccatcatttcgatcctcaaattaatgaaaataccatcaaattggtccttgaattatcataacagagat 20478933  T
Q  116 cactgtgatcct 127  Q
    || |||||||||    
T  20478932 caatgtgatcct 20478921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 65 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 48310867 - 48310750
Alignment:
Q  65 aaattagtgaaaa-taccatcaaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagta-aaaagtaa 162  Q
    ||||||||||||| || ||||||||| ||| ||||||| |||||||| |||||| | ||||| ||| | |||| ||||||||||||||||| ||||  ||    
T  48310867 aaattagtgaaaaatatcatcaaataagtcattgaattatcacaacatatatcaatatgatctttgctacatatatttgctgaacaaagtagaaaataaa 48310768  T
Q  163 aagacaaacactttgatt 180  Q
    |||||| |||||||||||    
T  48310767 aagacagacactttgatt 48310750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 74 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 13035705 - 13035621
Alignment:
Q  74 aaaataccatcaaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaa 158  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| |   ||||||| ||| |||||||||||||||||| || |||  |||||||||||||    
T  13035705 aaaataccatcaaataagtccttgaattatttaaacagatgtcaatgtgatccttggtgcatatatgtgcaaaacaaagtaaaaa 13035621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 182 - 228
Target Start/End: Original strand, 30939748 - 30939794
Alignment:
Q  182 taaaaagacaggcatttgcatatcatcagaggtcatatatttgatgt 228  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  30939748 taaaaagacagacatttgcatatcatcataagtcatatatttgatgt 30939794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 165; Significance: 2e-88; HSPs: 22)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 165; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 16 - 228
Target Start/End: Original strand, 3012626 - 3012838
Alignment:
Q  16 caatcaaatttgtacttgaattatatatatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaataggtccttgaattttcacaacagatat 115  Q
    |||||||||| || ||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  3012626 caatcaaattggtccttgaattatatgcatatccatcatattgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaataggtccttggattttcacaacagatat 3012725  T
Q  116 cactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacaaacactttgattataaaaagacaggcatttgcatatcatcagaggtc 215  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| | |||    
T  3012726 cattgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacatacactttgattataaaaagacagacatttgcataccatcataagtc 3012825  T
Q  216 atatatttgatgt 228  Q
    |||||||||||||    
T  3012826 atatatttgatgt 3012838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 165; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 16 - 228
Target Start/End: Original strand, 31237679 - 31237891
Alignment:
Q  16 caatcaaatttgtacttgaattatatatatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaataggtccttgaattttcacaacagatat 115  Q
    |||||||||| || ||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31237679 caatcaaattggtccttgaattatatgcatatccattatatcgatcctcaaattagtgataataccatcaaataggtccttgaattttcacaacagatat 31237778  T
Q  116 cactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacaaacactttgattataaaaagacaggcatttgcatatcatcagaggtc 215  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| | |||    
T  31237779 cactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacattcactttgactataaaaagacagacatttgcatatcatcataagtc 31237878  T
Q  216 atatatttgatgt 228  Q
    |||||||||||||    
T  31237879 atatatttgatgt 31237891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 161; E-Value: 6e-86
Query Start/End: Original strand, 16 - 228
Target Start/End: Original strand, 26224726 - 26224938
Alignment:
Q  16 caatcaaatttgtacttgaattatatatatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaataggtccttgaattttcacaacagatat 115  Q
    |||||| ||| || ||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  26224726 caatcacattggtccttgaattatatgcatatccatcatttcgatcctcaaattagtgaaaagaccatcaaataggtccttgaattttcacaacaaatat 26224825  T
Q  116 cactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacaaacactttgattataaaaagacaggcatttgcatatcatcagaggtc 215  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| | |||    
T  26224826 cactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacagacactttgattataaaaagacacacatttgcatatcatcataagtc 26224925  T
Q  216 atatatttgatgt 228  Q
    |||||||||||||    
T  26224926 atatatttgatgt 26224938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 16 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 2870550 - 2870338
Alignment:
Q  16 caatcaaatttgtacttgaattatatatatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaataggtccttgaattttcacaacagatat 115  Q
    |||||||||| || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2870550 caatcaaattggtccttgaattatatacatatccatcatatcgatcctcaaattagtttaaatatcatcaaataggtccttgaattttcacaacagatat 2870451  T
Q  116 cactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacaaacactttgattataaaaagacaggcatttgcatatcatcagaggtc 215  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||| | |||    
T  2870450 cattgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacatgcactttgattataaaaagacagacattttcataccatcataagtc 2870351  T
Q  216 atatatttgatgt 228  Q
    |||||||||||||    
T  2870350 atatatttgatgt 2870338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 16 - 228
Target Start/End: Original strand, 6817889 - 6818101
Alignment:
Q  16 caatcaaatttgtacttgaattatatatatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaataggtccttgaattttcacaacagatat 115  Q
    |||||||||| || ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||    
T  6817889 caatcaaattggtccttgaattatatgcatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaataggtccttggtttttcacaacatatat 6817988  T
Q  116 cactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacaaacactttgattataaaaagacaggcatttgcatatcatcagaggtc 215  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||| | |||    
T  6817989 cactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtgaaagacagacactttgattataaaaagacagacatgtgcataccatcataagtc 6818088  T
Q  216 atatatttgatgt 228  Q
    |||||||||||||    
T  6818089 atatatttgatgt 6818101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 16 - 228
Target Start/End: Original strand, 46582761 - 46582973
Alignment:
Q  16 caatcaaatttgtacttgaattatatatatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaataggtccttgaattttcacaacagatat 115  Q
    |||||||||| || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46582761 caatcaaattggtccttgaattatatacatatccatcatatcgatcctcaaattagtttaaataccatcaaataggtccttgaattttcacaacagatat 46582860  T
Q  116 cactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacaaacactttgattataaaaagacaggcatttgcatatcatcagaggtc 215  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||| |||| ||||| | ||     
T  46582861 cactgtgatccttggtgcatacatctgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacaaacactttgattataaaaagactgatattttcataccatcataagta 46582960  T
Q  216 atatatttgatgt 228  Q
    |||||||||||||    
T  46582961 atatatttgatgt 46582973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 16 - 228
Target Start/End: Original strand, 51895338 - 51895550
Alignment:
Q  16 caatcaaatttgtacttgaattatatatatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaataggtccttgaattttcacaacagatat 115  Q
    |||||||||| |  ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51895338 caatcaaattggcccttgaattatatgcatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaatatcatcaaataggtccttgaattttcacaacagatat 51895437  T
Q  116 cactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacaaacactttgattataaaaagacaggcatttgcatatcatcagaggtc 215  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| | |||    
T  51895438 cattgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagaaatacactttgattataaaaagacagacatttgcataccatcataagtc 51895537  T
Q  216 atatatttgatgt 228  Q
    |||||||| ||||    
T  51895538 atatattttatgt 51895550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 154; E-Value: 8e-82
Query Start/End: Original strand, 16 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 27088239 - 27088026
Alignment:
Q  16 caatcaaatttgtacttgaattatatatatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaataggtccttgaattttcacaacagatat 115  Q
    |||||| ||| || ||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  27088239 caatcacattggtccttgaattatatgcatatccatcatttcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaataggtccttgacttttcacaacagatat 27088140  T
Q  116 cactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacaaacactttgattata-aaaagacaggcatttgcatatcatcagaggt 214  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||   ||||||||||||||| | ||    
T  27088139 cactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacagacactttgattataaaaaagacacatatttgcatatcatcataagt 27088040  T
Q  215 catatatttgatgt 228  Q
    ||||||||||||||    
T  27088039 catatatttgatgt 27088026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 153; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 44 - 228
Target Start/End: Original strand, 34777338 - 34777522
Alignment:
Q  44 atatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgatccttggtgcatacatttgc 143  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34777338 atatccatcatttcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaataggtccttgaattttcataacagatatcactgtgatccttggtgcatacatttgc 34777437  T
Q  144 tgaacaaagtaaaaagtaaaagacaaacactttgattataaaaagacaggcatttgcatatcatcagaggtcatatatttgatgt 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||| | ||||||||||||||||    
T  34777438 tgaacaaagtaaaaagtaaaagacagacactttgattataaaaagacacacatttgcataccatcataagtcatatatttgatgt 34777522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 149; E-Value: 8e-79
Query Start/End: Original strand, 44 - 228
Target Start/End: Original strand, 4855167 - 4855351
Alignment:
Q  44 atatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgatccttggtgcatacatttgc 143  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  4855167 atatccatcatttcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtaatccttggtgcatacatttgc 4855266  T
Q  144 tgaacaaagtaaaaagtaaaagacaaacactttgattataaaaagacaggcatttgcatatcatcagaggtcatatatttgatgt 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||  |||||||||| ||||| | ||||||||||||||||    
T  4855267 tgaacaaagtaaaaagtaaaagacagacaatttgattataaaaagacacacatttgcataccatcataagtcatatatttgatgt 4855351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 16 - 228
Target Start/End: Original strand, 50555275 - 50555488
Alignment:
Q  16 caatcaaatttgtacttgaattatatatatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaataggtccttgaattttcacaacagatat 115  Q
    |||||||||| || ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50555275 caatcaaattggtccttgaattatatgcatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaatatcatcaaataggtccttgaattttcacaacagatat 50555374  T
Q  116 cactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagt-aaaaagtaaaagacaaacactttgattataaaaagacaggcatttgcatatcatcagaggt 214  Q
    || ||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||| |  |    
T  50555375 cattgtgatccttggtgcatacatttactgaacaaggtaaaaaactaaaagacagacactttgattataaaaagacagacatttgcatgccatcataaat 50555474  T
Q  215 catatatttgatgt 228  Q
    ||||||||||||||    
T  50555475 catatatttgatgt 50555488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 16 - 202
Target Start/End: Original strand, 33600325 - 33600511
Alignment:
Q  16 caatcaaatttgtacttgaattatatatatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaataggtccttgaattttcacaacagatat 115  Q
    |||||||||  || ||||||||||||  ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  33600325 caatcaaatcggtccttgaattatatgcatatccatcctttcgatcctcaaattagtgaaaatactatcaaatatgtccttgaattttcacaacagatat 33600424  T
Q  116 cactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacaaacactttgattataaaaagacaggcatttgcat 202  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  33600425 caatgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacaaacaatttgattgtaaaaagacagacatttgcat 33600511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 16 - 166
Target Start/End: Original strand, 25277548 - 25277698
Alignment:
Q  16 caatcaaatttgtacttgaattatatatatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaataggtccttgaattttcacaacagatat 115  Q
    |||||||||| || ||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  25277548 caatcaaattggtccttcaattatatgcatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaataggtccttgaattttcacaacagacat 25277647  T
Q  116 cactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaaga 166  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25277648 cactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaaga 25277698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 16 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 15105397 - 15105185
Alignment:
Q  16 caatcaaatttgtacttgaattatatatatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaataggtccttgaattttcacaacagatat 115  Q
    |||||||||| || |||  ||| ||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||    
T  15105397 caatcaaattggtccttctattgtatgtctatccatcatatcgatccccaaattagtgaaaataccatcaaataagtccttgaattttcacaacataaat 15105298  T
Q  116 cactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacaaacactttgattataaaaagacaggcatttgcatatcatcagaggtc 215  Q
    || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||| |||| ||||| |||||   |||    
T  15105297 cattgtgatctttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacatacactttgattgcaaaaagacagacattcgcataccatcatgagtc 15105198  T
Q  216 atatatttgatgt 228  Q
    |||||||||||||    
T  15105197 atatatttgatgt 15105185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 30 - 202
Target Start/End: Original strand, 8168518 - 8168690
Alignment:
Q  30 cttgaattatatatatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgatccttg 129  Q
    ||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||     
T  8168518 cttgaattatattcatatccatcatttcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaattggtcattgaattatcataacagatatcaatgtgatccttt 8168617  T
Q  130 gtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacaaacactttgattataaaaagacaggcatttgcat 202  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  8168618 gtgcatacatttgctaaacaaagtaaaatgtaaaagacaaacactttgattataaaaagacaaacatttgcat 8168690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 119; E-Value: 6e-61
Query Start/End: Original strand, 16 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 37345287 - 37345137
Alignment:
Q  16 caatcaaatttgtacttgaattatatatatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaataggtccttgaattttcacaacagatat 115  Q
    |||||||||| || ||| ||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||    
T  37345287 caatcaaattggtccttcaattatatgcatatccatcataccgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaatagttccttgaattttcacaacagacat 37345188  T
Q  116 cactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaaga 166  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37345187 cactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaaga 37345137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 16 - 166
Target Start/End: Original strand, 45045676 - 45045826
Alignment:
Q  16 caatcaaatttgtacttgaattatatatatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaataggtccttgaattttcacaacagatat 115  Q
    |||||||||| || ||| ||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  45045676 caatcaaattggtccttcaattatatgcatatccatcatatcgatcttcaaattagtgaaaatatcatcaaataggtccttgaattttcacaatagatat 45045775  T
Q  116 cactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaaga 166  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  45045776 cactgtgatccttggtgcatacatttgttgaacaaagtaaaaagtaaaaga 45045826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 45 - 190
Target Start/End: Original strand, 52642838 - 52642981
Alignment:
Q  45 tatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgatccttggtgcatacatttgct 144  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  52642838 tatccatcatatcgatccctaaattagtgaaaataccatcaaataagtccttgaattttcacaacatatatcactgtgatccttggtgcatatatttgct 52642937  T
Q  145 gaacaaagtaaaaagtaaaagacaaacactttgattataaaaagac 190  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||    
T  52642938 gaacaaagtaaaaagtaaaagac--acactttgattgtaaaaagac 52642981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 16 - 127
Target Start/End: Original strand, 9120815 - 9120926
Alignment:
Q  16 caatcaaatttgtacttgaattatatatatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaataggtccttgaattttcacaacagatat 115  Q
    |||||| ||| || |||||||||||   ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||| ||    
T  9120815 caatcacattggtccttgaattataatcatatccatcatttcgatcctcaaattaatgaaaataccatcaaattggtccttgaattatcataacagagat 9120914  T
Q  116 cactgtgatcct 127  Q
    || |||||||||    
T  9120915 caatgtgatcct 9120926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 16 - 127
Target Start/End: Complemental strand, 1443511 - 1443400
Alignment:
Q  16 caatcaaatttgtacttgaattatatatatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaataggtccttgaattttcacaacagatat 115  Q
    |||||| ||| || |||||||||||   ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||| ||    
T  1443511 caatcacattggtccttgaattataatcatatccatcatttcgatcctcaaattaatgaaaataccatcaaattggtccttgaattatcataacagagat 1443412  T
Q  116 cactgtgatcct 127  Q
    || ||| |||||    
T  1443411 caatgtaatcct 1443400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 16 - 127
Target Start/End: Original strand, 47012215 - 47012326
Alignment:
Q  16 caatcaaatttgtacttgaattatatatatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaataggtccttgaattttcacaacagatat 115  Q
    |||||| ||| || |||||||||||   ||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||| ||    
T  47012215 caatcacattggtccttgaattataatcatatcaatcatttcgatcctcaaattaatgaaaataccatcaaattggtccttgaattatcataacagagat 47012314  T
Q  116 cactgtgatcct 127  Q
    || |||||||||    
T  47012315 caatgtgatcct 47012326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 74 - 158
Target Start/End: Original strand, 3370338 - 3370422
Alignment:
Q  74 aaaataccatcaaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaa 158  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||||| |   ||||||| ||| |||||||||||||||||| || |||  || ||||||||||    
T  3370338 aaaataccatcaaataagtctttgaattatttaaacagatgtcaatgtgatccttggtgcatatatgtgcataataaagtaaaaa 3370422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0564 (Bit Score: 161; Significance: 6e-86; HSPs: 1)
Name: scaffold0564
Description:

Target: scaffold0564; HSP #1
Raw Score: 161; E-Value: 6e-86
Query Start/End: Original strand, 16 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 9220 - 9008
Alignment:
Q  16 caatcaaatttgtacttgaattatatatatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaataggtccttgaattttcacaacagatat 115  Q
    |||||||||| || ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  9220 caatcaaattagtccttgaattatatgcatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaataggtccttgaattttcacaatagatat 9121  T
Q  116 cactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacaaacactttgattataaaaagacaggcatttgcatatcatcagaggtc 215  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||| | |||    
T  9120 cactgtgatccttggtgcatacatctgccgaacaaagtaaaaagtaaaagacagacactttgattataaaaagacagacatttgcatactatcataagtc 9021  T
Q  216 atatatttgatgt 228  Q
    |||||||||||||    
T  9020 atatatttgatgt 9008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0058 (Bit Score: 153; Significance: 3e-81; HSPs: 2)
Name: scaffold0058
Description:

Target: scaffold0058; HSP #1
Raw Score: 153; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 16 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 4255 - 4043
Alignment:
Q  16 caatcaaatttgtacttgaattatatatatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaataggtccttgaattttcacaacagatat 115  Q
    |||||||||| || ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4255 caatcaaattggtccttgaattatatacatattcatcatatcgatcctcaaattagtttaaatatcatcaaataggtccttgaattttcacaacagatat 4156  T
Q  116 cactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacaaacactttgattataaaaagacaggcatttgcatatcatcagaggtc 215  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||  ||| ||||| | |||    
T  4155 cactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacagacactttgattatcaaaagacagacatttttataccatcataagtc 4056  T
Q  216 atatatttgatgt 228  Q
    |||||||||||||    
T  4055 atatatttgatgt 4043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0058; HSP #2
Raw Score: 153; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 16 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 5427 - 5215
Alignment:
Q  16 caatcaaatttgtacttgaattatatatatatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaataggtccttgaattttcacaacagatat 115  Q
    |||||||||| || ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5427 caatcaaattggtccttgaattatatacatattcatcatatcgatcctcaaattagtttaaatatcatcaaataggtccttgaattttcacaacagatat 5328  T
Q  116 cactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacaaacactttgattataaaaagacaggcatttgcatatcatcagaggtc 215  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||  ||| ||||| | |||    
T  5327 cactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaagtaaaaagtaaaagacagacactttgattatcaaaagacagacatttttataccatcataagtc 5228  T
Q  216 atatatttgatgt 228  Q
    |||||||||||||    
T  5227 atatatttgatgt 5215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0345 (Bit Score: 149; Significance: 8e-79; HSPs: 1)
Name: scaffold0345
Description:

Target: scaffold0345; HSP #1
Raw Score: 149; E-Value: 8e-79
Query Start/End: Original strand, 52 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 477 - 301
Alignment:
Q  52 catatcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgatccttggtgcatacatttgctgaacaaa 151  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  477 catatcgatcctcaaattagtaaaaataccatcaaacaggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgatccttggtgcatacatttgccgaacaaa 378  T
Q  152 gtaaaaagtaaaagacaaacactttgattataaaaagacaggcatttgcatatcatcagaggtcatatatttgatgt 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||  ||||||||||||||||    
T  377 gtaaaaagtaaaagacaaacactttgattataaaaagacagacatttgcataccatcaggagtcatatatttgatgt 301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004 (Bit Score: 128; Significance: 3e-66; HSPs: 1)
Name: scaffold0004
Description:

Target: scaffold0004; HSP #1
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 45 - 228
Target Start/End: Original strand, 107787 - 107970
Alignment:
Q  45 tatccatcatatcgatcctcaaattagtgaaaataccatcaaataggtccttgaattttcacaacagatatcactgtgatccttggtgcatacatttgct 144  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| | | |||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  107787 tatccatcatatcgatccctaaattagtgaaaataccatcaaataagtccttaaattttcacaatataaatcactgtgatcattggtgcatacatttgct 107886  T
Q  145 gaacaaagtaaaaagtaaaagacaaacactttgattataaaaagacaggcatttgcatatcatcagaggtcatatatttgatgt 228  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| | |||||| |||||||||    
T  107887 gaacaaagtaaaaagtaaaagacagacactttgattataaaaagacagacatttgcataccatcataagtcatacatttgatgt 107970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University