View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF9595A_low_267 (Length: 230)

Name: NF9595A_low_267
Description: NF9595A
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF9595A_low_267
NF9595A_low_267
[»] chr8 (27 HSPs)
chr8 (1-204)||(21382099-21382309)
chr8 (1-204)||(21098794-21099003)
chr8 (1-204)||(21104115-21104324)
chr8 (1-204)||(8314473-8314683)
chr8 (1-204)||(23911447-23911655)
chr8 (1-204)||(8322846-8323056)
chr8 (2-204)||(21843524-21843733)
chr8 (2-204)||(21939996-21940206)
chr8 (2-204)||(20038981-20039189)
chr8 (3-204)||(17620755-17620961)
chr8 (2-204)||(16418620-16418830)
chr8 (3-204)||(23454945-23455154)
chr8 (31-204)||(24034049-24034230)
chr8 (3-193)||(14352181-14352378)
chr8 (148-204)||(11346953-11347009)
chr8 (148-204)||(19767684-19767740)
chr8 (140-204)||(20712585-20712649)
chr8 (148-204)||(22370102-22370158)
chr8 (153-204)||(20002279-20002330)
chr8 (148-204)||(22033555-22033611)
chr8 (148-204)||(22099655-22099711)
chr8 (148-204)||(22102552-22102608)
chr8 (141-204)||(21538702-21538765)
chr8 (153-204)||(21831181-21831232)
chr8 (153-204)||(22817755-22817806)
chr8 (2-71)||(20712470-20712539)
chr8 (155-203)||(18572977-18573025)
[»] scaffold0029 (1 HSPs)
scaffold0029 (1-204)||(123375-123584)
[»] chr7 (36 HSPs)
chr7 (1-204)||(9582899-9583108)
chr7 (1-204)||(16119849-16120058)
chr7 (1-200)||(23515073-23515278)
chr7 (1-204)||(14551104-14551314)
chr7 (1-204)||(8717871-8718080)
chr7 (1-204)||(13673862-13674071)
chr7 (1-204)||(18593352-18593561)
chr7 (1-204)||(18618123-18618332)
chr7 (2-204)||(4312564-4312772)
chr7 (2-204)||(538755-538964)
chr7 (2-204)||(12567020-12567229)
chr7 (3-204)||(12548805-12549012)
chr7 (3-203)||(48801777-48801983)
chr7 (2-204)||(8780936-8781146)
chr7 (2-204)||(20108375-20108584)
chr7 (2-202)||(9003958-9004165)
chr7 (2-204)||(13657873-13658081)
chr7 (2-204)||(11921307-11921512)
chr7 (5-204)||(9264939-9265145)
chr7 (2-204)||(16465616-16465821)
chr7 (2-204)||(16532100-16532311)
chr7 (2-204)||(16633351-16633562)
chr7 (141-204)||(15206584-15206647)
chr7 (148-204)||(825783-825839)
chr7 (148-204)||(4461242-4461298)
chr7 (148-204)||(14221718-14221774)
chr7 (148-204)||(15916776-15916832)
chr7 (148-204)||(18287761-18287817)
chr7 (148-204)||(27291496-27291552)
chr7 (146-204)||(5397273-5397331)
chr7 (155-204)||(15065935-15065984)
chr7 (148-203)||(15348532-15348587)
chr7 (151-204)||(9194544-9194597)
chr7 (148-200)||(6713072-6713124)
chr7 (148-188)||(15522517-15522557)
chr7 (164-203)||(4791383-4791422)
[»] chr6 (29 HSPs)
chr6 (1-204)||(15699561-15699770)
chr6 (1-204)||(22165549-22165758)
chr6 (1-204)||(22243818-22244027)
chr6 (1-204)||(22061503-22061712)
chr6 (2-204)||(24855245-24855453)
chr6 (1-204)||(20170248-20170458)
chr6 (1-204)||(22767116-22767325)
chr6 (2-204)||(18448140-18448349)
chr6 (2-200)||(20107784-20107989)
chr6 (2-204)||(23023093-23023302)
chr6 (2-204)||(21560554-21560762)
chr6 (2-204)||(25625691-25625899)
chr6 (2-204)||(25631269-25631477)
chr6 (5-204)||(2181063-2181269)
chr6 (10-204)||(18854026-18854226)
chr6 (2-204)||(25963248-25963457)
chr6 (2-204)||(25967895-25968104)
chr6 (3-204)||(29595697-29595904)
chr6 (7-204)||(30671807-30672011)
chr6 (2-121)||(19585631-19585750)
chr6 (1-99)||(20016339-20016438)
chr6 (141-204)||(18184874-18184937)
chr6 (147-204)||(35270971-35271028)
chr6 (141-204)||(18731868-18731931)
chr6 (141-204)||(20218981-20219044)
chr6 (141-204)||(22113006-22113069)
chr6 (148-204)||(11204004-11204060)
chr6 (148-200)||(23517835-23517887)
chr6 (148-204)||(29686601-29686657)
[»] chr4 (22 HSPs)
chr4 (1-204)||(11496614-11496823)
chr4 (1-204)||(13822919-13823128)
chr4 (1-204)||(42709731-42709940)
chr4 (1-204)||(15254354-15254563)
chr4 (3-204)||(10630758-10630965)
chr4 (2-204)||(3354646-3354855)
chr4 (3-204)||(18291945-18292153)
chr4 (3-204)||(38426745-38426938)
chr4 (2-204)||(18081459-18081669)
chr4 (2-204)||(45234232-45234441)
chr4 (3-204)||(17484910-17485118)
chr4 (3-204)||(56580539-56580748)
chr4 (5-80)||(8092559-8092634)
chr4 (141-204)||(14653998-14654061)
chr4 (148-202)||(15865647-15865701)
chr4 (148-204)||(10650547-10650603)
chr4 (148-204)||(15260109-15260165)
chr4 (148-204)||(16682913-16682969)
chr4 (153-204)||(15409534-15409585)
chr4 (144-204)||(8092427-8092487)
chr4 (148-204)||(9488878-9488934)
chr4 (155-203)||(17296250-17296298)
[»] chr3 (48 HSPs)
chr3 (1-204)||(10602472-10602681)
chr3 (1-204)||(13504881-13505090)
chr3 (1-204)||(11947413-11947622)
chr3 (1-204)||(16448760-16448969)
chr3 (5-204)||(15556942-15557147)
chr3 (1-204)||(7600361-7600570)
chr3 (1-204)||(9360971-9361180)
chr3 (1-204)||(16373565-16373774)
chr3 (1-204)||(12187076-12187285)
chr3 (1-204)||(37942384-37942593)
chr3 (3-203)||(12193491-12193697)
chr3 (1-200)||(6814874-6815079)
chr3 (1-204)||(10147017-10147226)
chr3 (1-204)||(10160173-10160382)
chr3 (1-204)||(15645007-15645216)
chr3 (1-203)||(13187418-13187626)
chr3 (2-204)||(13097711-13097919)
chr3 (3-203)||(3245589-3245795)
chr3 (3-204)||(2721305-2721511)
chr3 (2-204)||(4382751-4382961)
chr3 (3-204)||(13001425-13001634)
chr3 (2-204)||(13690608-13690816)
chr3 (2-204)||(20156515-20156722)
chr3 (2-204)||(10546936-10547148)
chr3 (2-204)||(1992803-1993011)
chr3 (2-204)||(14348588-14348797)
chr3 (2-204)||(11398215-11398424)
chr3 (1-93)||(16655804-16655897)
chr3 (3-204)||(3279191-3279399)
chr3 (2-204)||(12160207-12160416)
chr3 (5-204)||(22637702-22637908)
chr3 (5-204)||(17387839-17388045)
chr3 (148-204)||(27356728-27356784)
chr3 (147-204)||(13601220-13601277)
chr3 (148-204)||(3339226-3339282)
chr3 (148-204)||(12776534-12776590)
chr3 (148-204)||(13136210-13136266)
chr3 (148-204)||(20584262-20584318)
chr3 (153-204)||(15946773-15946824)
chr3 (141-196)||(17045847-17045902)
chr3 (141-196)||(17048007-17048062)
chr3 (146-204)||(14445768-14445826)
chr3 (148-204)||(15619283-15619339)
chr3 (148-204)||(13195458-13195514)
chr3 (149-204)||(8686387-8686442)
chr3 (141-204)||(20225754-20225817)
chr3 (165-204)||(13068318-13068357)
chr3 (173-204)||(2005499-2005530)
[»] chr2 (32 HSPs)
chr2 (1-204)||(22665068-22665277)
chr2 (1-204)||(117549-117758)
chr2 (1-204)||(22044660-22044869)
chr2 (1-204)||(25357517-25357726)
chr2 (1-204)||(16775657-16775866)
chr2 (2-204)||(11615-11823)
chr2 (1-204)||(24795285-24795494)
chr2 (1-204)||(17590413-17590622)
chr2 (1-204)||(27627586-27627796)
chr2 (2-204)||(25144757-25144966)
chr2 (3-204)||(5500265-5500473)
chr2 (2-204)||(25804267-25804475)
chr2 (4-199)||(25370890-25371091)
chr2 (3-204)||(23798922-23799129)
chr2 (2-85)||(24502168-24502251)
chr2 (46-204)||(23643994-23644160)
chr2 (148-204)||(23159385-23159441)
chr2 (148-204)||(23570642-23570698)
chr2 (148-204)||(27631655-27631711)
chr2 (148-204)||(27768816-27768872)
chr2 (153-204)||(24171510-24171561)
chr2 (141-204)||(24178193-24178256)
chr2 (141-204)||(24506802-24506865)
chr2 (141-204)||(25337651-25337714)
chr2 (148-204)||(23257570-23257625)
chr2 (148-200)||(24321328-24321380)
chr2 (143-185)||(23648123-23648165)
chr2 (157-203)||(25582768-25582814)
chr2 (158-203)||(29955868-29955913)
chr2 (155-187)||(15532917-15532949)
chr2 (159-203)||(19805618-19805662)
chr2 (155-203)||(21512567-21512615)
[»] scaffold0230 (1 HSPs)
scaffold0230 (1-204)||(15684-15893)
[»] chr5 (29 HSPs)
chr5 (1-204)||(20595831-20596040)
chr5 (1-204)||(20602117-20602326)
chr5 (1-204)||(20608408-20608617)
chr5 (1-204)||(15735540-15735749)
chr5 (1-179)||(23710701-23710886)
chr5 (1-204)||(23748057-23748266)
chr5 (2-204)||(24940540-24940749)
chr5 (1-204)||(18072906-18073115)
chr5 (1-204)||(24953174-24953383)
chr5 (3-186)||(20622170-20622359)
chr5 (1-204)||(20790714-20790923)
chr5 (2-204)||(23600636-23600845)
chr5 (2-204)||(24219752-24219961)
chr5 (2-200)||(20444843-20445048)
chr5 (16-204)||(21387410-21387605)
chr5 (2-80)||(22948518-22948596)
chr5 (6-110)||(20916556-20916660)
chr5 (3-123)||(20575510-20575630)
chr5 (148-204)||(22317513-22317569)
chr5 (148-204)||(25006808-25006864)
chr5 (148-204)||(30759655-30759711)
chr5 (141-204)||(18484212-18484275)
chr5 (154-204)||(25116171-25116221)
chr5 (148-204)||(26847803-26847859)
chr5 (159-204)||(25175261-25175306)
chr5 (148-200)||(22855723-22855775)
chr5 (159-203)||(27270563-27270607)
chr5 (146-204)||(20916456-20916514)
chr5 (155-203)||(17412736-17412784)
[»] chr1 (15 HSPs)
chr1 (1-204)||(27046880-27047089)
chr1 (1-204)||(17094601-17094810)
chr1 (1-204)||(21798662-21798872)
chr1 (1-204)||(20237462-20237671)
chr1 (5-200)||(8653126-8653327)
chr1 (2-204)||(52938621-52938830)
chr1 (2-204)||(3989944-3990154)
chr1 (9-204)||(19364043-19364244)
chr1 (131-204)||(14070647-14070720)
chr1 (146-200)||(19875648-19875702)
chr1 (141-204)||(21784472-21784535)
chr1 (141-204)||(4027832-4027895)
chr1 (141-204)||(8947515-8947578)
chr1 (148-201)||(16382578-16382631)
chr1 (3-83)||(21784598-21784677)
[»] scaffold0404 (2 HSPs)
scaffold0404 (1-204)||(1044-1253)
scaffold0404 (141-204)||(3461-3524)
[»] scaffold0215 (1 HSPs)
scaffold0215 (1-204)||(615-825)
[»] scaffold0113 (1 HSPs)
scaffold0113 (2-204)||(220-428)
[»] scaffold0825 (1 HSPs)
scaffold0825 (5-204)||(2852-3058)
[»] scaffold0156 (1 HSPs)
scaffold0156 (2-204)||(831-1041)
[»] scaffold0004 (1 HSPs)
scaffold0004 (2-204)||(251870-252079)
[»] scaffold0026 (1 HSPs)
scaffold0026 (10-204)||(11064-11264)
[»] scaffold0020 (1 HSPs)
scaffold0020 (3-204)||(120954-121162)
[»] scaffold0679 (1 HSPs)
scaffold0679 (2-204)||(7941-8149)
[»] scaffold0506 (1 HSPs)
scaffold0506 (2-204)||(2287-2496)
[»] scaffold0315 (1 HSPs)
scaffold0315 (3-204)||(14662-14869)
[»] scaffold0034 (1 HSPs)
scaffold0034 (2-204)||(58628-58838)
[»] scaffold0974 (1 HSPs)
scaffold0974 (2-204)||(1108-1318)
[»] scaffold0032 (1 HSPs)
scaffold0032 (2-204)||(97726-97936)
[»] scaffold0773 (1 HSPs)
scaffold0773 (5-204)||(482-687)
[»] scaffold0011 (3 HSPs)
scaffold0011 (52-204)||(164403-164562)
scaffold0011 (141-203)||(172254-172316)
scaffold0011 (141-204)||(161995-162058)
[»] scaffold0162 (1 HSPs)
scaffold0162 (55-204)||(35104-35251)
[»] scaffold0328 (1 HSPs)
scaffold0328 (2-204)||(510-718)
[»] scaffold0059 (2 HSPs)
scaffold0059 (141-202)||(12548-12609)
scaffold0059 (49-79)||(12450-12480)
[»] scaffold0013 (1 HSPs)
scaffold0013 (49-202)||(232789-232948)
[»] scaffold0582 (1 HSPs)
scaffold0582 (141-204)||(8806-8869)
[»] scaffold0278 (2 HSPs)
scaffold0278 (141-204)||(13002-13065)
scaffold0278 (5-80)||(13132-13207)
[»] scaffold0420 (1 HSPs)
scaffold0420 (92-204)||(10206-10325)
[»] scaffold0096 (2 HSPs)
scaffold0096 (140-204)||(38508-38572)
scaffold0096 (30-80)||(38625-38675)
[»] scaffold0512 (1 HSPs)
scaffold0512 (141-204)||(5232-5295)
[»] scaffold0056 (1 HSPs)
scaffold0056 (141-204)||(42237-42300)
[»] scaffold0035 (1 HSPs)
scaffold0035 (141-204)||(50506-50569)
[»] scaffold0861 (1 HSPs)
scaffold0861 (146-204)||(912-970)
[»] scaffold0566 (1 HSPs)
scaffold0566 (148-204)||(2762-2818)
[»] scaffold0375 (1 HSPs)
scaffold0375 (153-204)||(12743-12794)
[»] scaffold0258 (1 HSPs)
scaffold0258 (141-200)||(22159-22218)
[»] scaffold0384 (1 HSPs)
scaffold0384 (148-204)||(10720-10776)
[»] scaffold0089 (1 HSPs)
scaffold0089 (148-204)||(54849-54905)
[»] scaffold1225 (1 HSPs)
scaffold1225 (141-204)||(1839-1902)
[»] scaffold1095 (1 HSPs)
scaffold1095 (2-69)||(2859-2926)
[»] scaffold0116 (2 HSPs)
scaffold0116 (141-204)||(37743-37806)
scaffold0116 (3-83)||(37869-37948)
[»] scaffold0094 (1 HSPs)
scaffold0094 (148-203)||(1193-1248)
[»] scaffold0031 (1 HSPs)
scaffold0031 (141-204)||(22756-22818)
[»] scaffold0123 (1 HSPs)
scaffold0123 (159-204)||(18218-18263)
[»] scaffold0117 (1 HSPs)
scaffold0117 (141-204)||(45228-45291)
[»] scaffold0088 (1 HSPs)
scaffold0088 (146-200)||(37868-37922)
[»] scaffold0037 (2 HSPs)
scaffold0037 (154-204)||(72572-72622)
scaffold0037 (154-204)||(84762-84812)
[»] scaffold0001 (1 HSPs)
scaffold0001 (148-188)||(83174-83214)


Alignment Details
Target: chr8 (Bit Score: 169; Significance: 9e-91; HSPs: 27)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 169; E-Value: 9e-91
Query Start/End: Original strand, 1 - 204
Target Start/End: Original strand, 21382099 - 21382309
Alignment:
Q  1 tcacacacacactcacttgaaacttgaccgttgggctgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaagcccttg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21382099 tcacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaagcccttg 21382198  T
Q  101 aggagacatgtgctttaattgaaattgtc-------ataactgttagtgctactatgtttatgccttttacttgaggacaagcaaagattcaagtgtggg 193  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||       ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  21382199 aggagacatgtgctttaattgaaattgtcatttgatataactgttagtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtatggg 21382298  T
Q  194 ggagtttgatg 204  Q
    |||||||||||    
T  21382299 ggagtttgatg 21382309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 1 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 21099003 - 21098794
Alignment:
Q  1 tcacacacacactcacttgaaacttgaccgttgggctgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaagcccttg 100  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| | ||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21099003 tcacacacacactcacttaaaacttgatcattgggttgaataaaaatgacaagaaatgcttgaatttgtgattagtgtacatttgggatttaagcccttg 21098904  T
Q  101 aggagacatgtgctttaattgaaattgtcat-------aactgttagtgctactatgtttatgccttttacttgaggacaagcaaagattcaagtgtggg 193  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||||       || |||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21098903 aggagacatgtgctttaatcg-aattgtcatttgataaaattgtttgtgctaccatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtggg 21098805  T
Q  194 ggagtttgatg 204  Q
    |||||||||||    
T  21098804 ggagtttgatg 21098794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 1 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 21104324 - 21104115
Alignment:
Q  1 tcacacacacactcacttgaaacttgaccgttgggctgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaagcccttg 100  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| | ||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21104324 tcacacacacactcacttaaaacttgatcattgggttgaataaaaatgacaagaaatgcttgaatttgtgattagtgtacatttgggatttaagcccttg 21104225  T
Q  101 aggagacatgtgctttaattgaaattgtcat-------aactgttagtgctactatgtttatgccttttacttgaggacaagcaaagattcaagtgtggg 193  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||||       || |||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21104224 aggagacatgtgctttaatcg-aattgtcatttgataaaattgtttgtgctaccatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtggg 21104126  T
Q  194 ggagtttgatg 204  Q
    |||||||||||    
T  21104125 ggagtttgatg 21104115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 1 - 204
Target Start/End: Original strand, 8314473 - 8314683
Alignment:
Q  1 tcacacacacactcacttgaaacttgaccgttgggctgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaagcccttg 100  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| |||||||  ||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8314473 tcacacacacactcacttaaaacttgatcgttgggtagaataaagatttcaagaaatacttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaagcccttg 8314572  T
Q  101 aggagacatgtgctttaattgaaattgtca-------taactgttagtgctactatgtttatgccttttacttgaggacaagcaaagattcaagtgtggg 193  Q
    |||||||||||||||||| |  ||||||||       ||| ||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  8314573 aggagacatgtgctttaaatttaattgtcatttgatttaaatgttgatgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtatggg 8314672  T
Q  194 ggagtttgatg 204  Q
    |||||||||||    
T  8314673 ggagtttgatg 8314683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 1 - 204
Target Start/End: Original strand, 23911447 - 23911655
Alignment:
Q  1 tcacacacacactcacttgaaacttgaccgttgggctgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaagcccttg 100  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| | ||||| |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  23911447 tcacacacacactcacttgaaatttgatc-ttgggttgaataaaaattacaagaaatgtttaagtttgtgattagtgtacatctgggatttaagcccttg 23911545  T
Q  101 aggagacatgtgctttaattgaaattgtc-------ataactgttagtgctactatgtttatgccttttacttgaggacaagcaaagattcaagtgtggg 193  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||       |||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  23911546 aggagacatgtgctttaatcg-aattgtcatttgatataactattggtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtatggg 23911644  T
Q  194 ggagtttgatg 204  Q
    |||||||||||    
T  23911645 ggagtttgatg 23911655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 118; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 8323056 - 8322846
Alignment:
Q  1 tcacacacacactcacttgaaacttgaccgttgggctgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtaca-tttgggatttaagccctt 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  8323056 tcacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggtagaataaagatttcaagaaatacttgagtttgtgattagtgtacattttgggatttaagccctt 8322957  T
Q  100 gaggagacatgtgctttaattgaaattgtca-------taactgttagtgctactatgtttatgccttttacttgaggacaagcaaagattcaagtgtgg 192  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||||||       |||||||   |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||     
T  8322956 gaggagacatgtgctttaatt-aatttgtcatttgatttaactgtcgatgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtatga 8322858  T
Q  193 gggagtttgatg 204  Q
    ||||||||||||    
T  8322857 gggagtttgatg 8322846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 105; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 2 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 21843733 - 21843524
Alignment:
Q  2 cacacacacactcacttgaaacttgaccgttgggctgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaagcccttga 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||   |||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||  ||||||||||||||    
T  21843733 cacacacacactcacttgaaacttgattgttgggttgaataaggtttacaagaaatgcttgagtttgtgattactgtacgcttgaaatttaagcccttga 21843634  T
Q  102 ggagacatgtgctttaattgaaattgtcata-------actgt-tagtgctactatgtttatgccttttacttgaggacaagcaaagattcaagtgtggg 193  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||||||||       | ||| | ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21843633 ggagacatgtgttttaatt-aaattgtcatatgataatattgtcttgtgctaccatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtggg 21843535  T
Q  194 ggagtttgatg 204  Q
    |||||||||||    
T  21843534 ggagtttgatg 21843524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 82; E-Value: 7e-39
Query Start/End: Original strand, 2 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 21940206 - 21939996
Alignment:
Q  2 cacacacacactcacttgaaacttgaccgttgggctgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtaca-tttgggatttaagcccttg 100  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||  |||||| |||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||  ||  ||||| |||    
T  21940206 cacacacacactcacttcagacttgattgttgggttgaaaaaggattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtactctttgaaatgaaagcctttg 21940107  T
Q  101 aggagacatgtgctttaattgaaattgtcata----actgttagt----gctactatgtttatgccttttacttgaggacaagcaaagattcaagtgtgg 192  Q
    |||||||||||||||||||| || ||||||||    | ||||| |    ||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  21940106 aggagacatgtgctttaatttaa-ttgtcatatgataatgttattttatgctaccatgtttatgccttttgcttgagaacaagcaaagattcaagtgtgg 21940008  T
Q  193 gggagtttgatg 204  Q
    ||||||||||||    
T  21940007 gggagtttgatg 21939996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 77; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 2 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 20039189 - 20038981
Alignment:
Q  2 cacacacacactcacttgaaacttgaccgttgggctgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaagcccttga 101  Q
    |||||||||||||| |||||||||||  |||||| |||| ||  |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||  ||| ||||| ||||    
T  20039189 cacacacacactcatttgaaacttgattgttgggttgaaaaaggattacaagaaatacttgagtttgtgattattgtacatttgaaattaaagcctttga 20039090  T
Q  102 ggagacatgtgctttaattgaaat----tgtcataac--tgttagtgctactatgtttatgccttttacttgaggacaagcaaagattcaagtgtggggg 195  Q
     |||||||||   ||| || ||||    ||| || |   ||||  |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20039089 agagacatgtatcttagttaaaatgtcatgtgatgatcttgtttatgctaccatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtggggg 20038990  T
Q  196 agtttgatg 204  Q
    |||||||||    
T  20038989 agtttgatg 20038981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 3 - 204
Target Start/End: Original strand, 17620755 - 17620961
Alignment:
Q  3 acacacacactcacttgaaacttgaccgttgggctgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaagcccttgag 102  Q
    |||||||||||||||||||||||||  |||||  |||| ||  |||||||  ||||||||||||| ||||||| ||||| |||  ||| ||||| |||||    
T  17620755 acacacacactcacttgaaacttgattgttggt-tgaaaaaggattacaaagaatgcttgagtttatgattagggtacacttgaaattaaagcctttgag 17620853  T
Q  103 gagacatgtgctttaattgaaattgtcataac-------tgttagtgctactatgtttatgccttttacttgaggacaagcaaagattcaagtgtggggg 195  Q
    |||||||||| ||||||| |||||||||| |        ||||  |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  17620854 gagacatgtgttttaatt-aaattgtcatgaagtaatcttgtttatgctaccatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaaaattcaagtgtggggg 17620952  T
Q  196 agtttgatg 204  Q
    |||||||||    
T  17620953 agtttgatg 17620961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 74; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 2 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 16418830 - 16418620
Alignment:
Q  2 cacacacacactcacttgaaacttgaccgttgggctgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtaca-tttgggatttaagcccttg 100  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||  |||||| |||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||  ||  ||||| |||    
T  16418830 cacacacacactcacttaagacttgattgttgggttgaaaaaggattataagaaatgcttgagtttgtgattagtgtactctttgaaataaaagcctttg 16418731  T
Q  101 aggagacatgtgctttaattgaaattgtcata----actgttagt----gctactatgtttatgccttttacttgaggacaagcaaagattcaagtgtgg 192  Q
    |||||||||||| |||||| | ||||||||||    | ||||| |    ||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  16418730 aggagacatgtgttttaat-gtaattgtcatatgataatgttattttatgctaccatgtttatgccttttgcttgagaacaagcaaagattcaagtgtgg 16418632  T
Q  193 gggagtttgatg 204  Q
    ||||||||||||    
T  16418631 gggagtttgatg 16418620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 3 - 204
Target Start/End: Original strand, 23454945 - 23455154
Alignment:
Q  3 acacacacactcacttgaaacttgaccgttgggctgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaagcccttgag 102  Q
    |||||||||||||||||||||||||  |||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||  ||  ||||| |||||    
T  23454945 acacacacactcacttgaaacttgattgttggattgaataaagattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtatgcttgaaatgaaagcctttgag 23455044  T
Q  103 gagacatgtgcttt-aattgaaattgtcata-------actgttagtgctactatgtttatgccttttacttgaggacaagcaaagattcaagtgt-ggg 193  Q
    |||||||    ||| ||||| ||||||||||         ||||  |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| |||    
T  23455045 gagacataaattttcaattg-aattgtcatatgtgagtcttgtttatgctactatgtttatgccttttgctcgaggacaagcaaagattcaagtgtgggg 23455143  T
Q  194 ggagtttgatg 204  Q
    |||||||||||    
T  23455144 ggagtttgatg 23455154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 31 - 204
Target Start/End: Original strand, 24034049 - 24034230
Alignment:
Q  31 ttgggctgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaagcccttgaggagacatgtgcttt-aattgaaattgtc 129  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||  ||| ||||| ||||||||||||  | ||| ||||||| |||||    
T  24034049 ttgggttgaataaagattacaagaaatgcttgagtttgtgatcagtgtacgcttgaaattaaagcctttgaggagacataagttttcaattgaa-ttgtc 24034147  T
Q  130 ataactg--------ttagtgctactatgtttatgccttttacttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 204  Q
    |||  |         ||| |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24034148 atatattaatctcgtttattgctactatgtttatgccttttgcttgtggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 24034230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 3 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 14352378 - 14352181
Alignment:
Q  3 acacacacactcacttgaaacttgaccgttgggctgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaagcccttgag 102  Q
    |||||||||||||||||| ||||||  |||||| |||||||| |||||||  |||||||||||| || ||||||||||  |||  ||  |||||   |||    
T  14352378 acacacacactcacttgagacttgattgttgggttgaataaagattacaaagaatgcttgagttagtaattagtgtacgcttgaaataaaagcctcggag 14352279  T
Q  103 gagacatgtgctttaattgaaattgtcata-------actgttagtgctactatgtttatgccttttacttgaggacaagcaaagattcaagtgtggg 193  Q
    |||||||| | |||||||  ||||||||||         ||||  |||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14352278 gagacatgagttttaattttaattgtcatataattatcttgtttatgctaccatgtttatgtcttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtggg 14352181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 148 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 11347009 - 11346953
Alignment:
Q  148 atgtttatgccttttacttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 204  Q
    |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11347009 atgtctatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 11346953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 148 - 204
Target Start/End: Original strand, 19767684 - 19767740
Alignment:
Q  148 atgtttatgccttttacttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 204  Q
    |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19767684 atgtctatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 19767740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 140 - 204
Target Start/End: Original strand, 20712585 - 20712649
Alignment:
Q  140 gtgctactatgtttatgccttttacttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 204  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  20712585 gtgctaccatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagatttaagtgtaggggagtttgatg 20712649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 148 - 204
Target Start/End: Original strand, 22370102 - 22370158
Alignment:
Q  148 atgtttatgccttttacttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 204  Q
    |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22370102 atgtctatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 22370158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 153 - 204
Target Start/End: Original strand, 20002279 - 20002330
Alignment:
Q  153 tatgccttttacttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 204  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20002279 tatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 20002330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 148 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 22033611 - 22033555
Alignment:
Q  148 atgtttatgccttttacttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 204  Q
    |||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22033611 atgtctatgtcttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 22033555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 148 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 22099711 - 22099655
Alignment:
Q  148 atgtttatgccttttacttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 204  Q
    |||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22099711 atgtctatgtcttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 22099655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 148 - 204
Target Start/End: Original strand, 22102552 - 22102608
Alignment:
Q  148 atgtttatgccttttacttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 204  Q
    |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  22102552 atgtctatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtaggggagtttgatg 22102608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 141 - 204
Target Start/End: Original strand, 21538702 - 21538765
Alignment:
Q  141 tgctactatgtttatgccttttacttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 204  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||    
T  21538702 tgctaccatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaaaatttaagtgtgggggattttgatg 21538765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 153 - 204
Target Start/End: Original strand, 21831181 - 21831232
Alignment:
Q  153 tatgccttttacttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 204  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21831181 tatgtcttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 21831232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 153 - 204
Target Start/End: Original strand, 22817755 - 22817806
Alignment:
Q  153 tatgccttttacttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 204  Q
    |||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22817755 tatgtcttttgcttgaggaaaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 22817806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 2 - 71
Target Start/End: Original strand, 20712470 - 20712539
Alignment:
Q  2 cacacacacactcacttgaaacttgaccgttgggctgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtga 71  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||  |||||| |||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||    
T  20712470 cacacacacactcatttgagacttgattgttgggttgaaaaaagattacaagaaatgattgagtttgtga 20712539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 155 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 18573025 - 18572977
Alignment:
Q  155 tgccttttacttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgat 203  Q
    |||||||| ||| |||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||    
T  18573025 tgccttttgcttaaggacaagaaaaaattcaagtatgggggagtttgat 18572977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029 (Bit Score: 161; Significance: 5e-86; HSPs: 1)
Name: scaffold0029
Description:

Target: scaffold0029; HSP #1
Raw Score: 161; E-Value: 5e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 204
Target Start/End: Original strand, 123375 - 123584
Alignment:
Q  1 tcacacacacactcacttgaaacttgaccgttgggctgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaagcccttg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  123375 tcacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaagcccttg 123474  T
Q  101 aggagacatgtgctttaattgaaattgtc-------ataactgttagtgctactatgtttatgccttttacttgaggacaagcaaagattcaagtgtggg 193  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||       ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  123475 aggagacatgtgctttaattg-aattgtcatttgatataactgttggtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtggg 123573  T
Q  194 ggagtttgatg 204  Q
    |||||||||||    
T  123574 ggagtttgatg 123584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 161; Significance: 5e-86; HSPs: 36)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 161; E-Value: 5e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 204
Target Start/End: Original strand, 9582899 - 9583108
Alignment:
Q  1 tcacacacacactcacttgaaacttgaccgttgggctgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaagcccttg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9582899 tcacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaagcccttg 9582998  T
Q  101 aggagacatgtgctttaattgaaattgtc-------ataactgttagtgctactatgtttatgccttttacttgaggacaagcaaagattcaagtgtggg 193  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||       ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9582999 aggagacatgtgctttaattg-aattgtcatttgatataactgttggtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtggg 9583097  T
Q  194 ggagtttgatg 204  Q
    |||||||||||    
T  9583098 ggagtttgatg 9583108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 153; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 1 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 16120058 - 16119849
Alignment:
Q  1 tcacacacacactcacttgaaacttgaccgttgggctgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaagcccttg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16120058 tcacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaagcccttg 16119959  T
Q  101 aggagacatgtgctttaattgaaattgtc-------ataactgttagtgctactatgtttatgccttttacttgaggacaagcaaagattcaagtgtggg 193  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||       ||||||||| |||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16119958 aggagacatgtgctttaattg-aattgtcatttgatataactgtttgtgctactatgtatatgtcttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtggg 16119860  T
Q  194 ggagtttgatg 204  Q
    |||||||||||    
T  16119859 ggagtttgatg 16119849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 149; E-Value: 8e-79
Query Start/End: Original strand, 1 - 200
Target Start/End: Original strand, 23515073 - 23515278
Alignment:
Q  1 tcacacacacactcacttgaaacttgaccgttgggctgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaagcccttg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23515073 tcacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaagcccttg 23515172  T
Q  101 aggagacatgtgctttaattgaaattgtc-------ataactgttagtgctactatgtttatgccttttacttgaggacaagcaaagattcaagtgtggg 193  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||       |||| |||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23515173 aggagacatgtgctttaattg-aattgtcatttgatataattgtttgtgctaccatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtggg 23515271  T
Q  194 ggagttt 200  Q
    |||||||    
T  23515272 ggagttt 23515278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 146; E-Value: 5e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 204
Target Start/End: Original strand, 14551104 - 14551314
Alignment:
Q  1 tcacacacacactcacttgaaacttgaccgttgggctgaataaaa-attacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaagccctt 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14551104 tcacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaagccctt 14551203  T
Q  100 gaggagacatgtgctttaattgaaattgtc-------ataactgttagtgctactatgtttatgccttttacttgaggacaagcaaagattcaagtgtgg 192  Q
    |||| ||||||||||||||||| |||||||       ||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  14551204 gaggggacatgtgctttaattg-aattgtcatttgatataaccgtttgtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgg 14551302  T
Q  193 gggagtttgatg 204  Q
    ||||||||||||    
T  14551303 gggagtttgatg 14551314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 141; E-Value: 4e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 204
Target Start/End: Original strand, 8717871 - 8718080
Alignment:
Q  1 tcacacacacactcacttgaaacttgaccgttgggctgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaagcccttg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  8717871 tcacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaacacttgagtttgtgattagtgtacacttgggatttaagcccttg 8717970  T
Q  101 aggagacatgtgctttaattgaaattgtc-------ataactgttagtgctactatgtttatgccttttacttgaggacaagcaaagattcaagtgtggg 193  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||       |||||| || |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8717971 aggagacatgtgctttaattg-aattgtcatttgatataactattggtgctactatgtttatgcattttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtggg 8718069  T
Q  194 ggagtttgatg 204  Q
    |||||||||||    
T  8718070 ggagtttgatg 8718080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 1 - 204
Target Start/End: Original strand, 13673862 - 13674071
Alignment:
Q  1 tcacacacacactcacttgaaacttgaccgttgggctgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaagcccttg 100  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| |||||||  ||| ||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13673862 tcacacacacactcacttaaaacttgatcgttgggtagaaaaaagatttcaagaaatacttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaagcccttg 13673961  T
Q  101 aggagacatgtgctttaattgaaattgtca-------taactgttagtgctactatgtttatgccttttacttgaggacaagcaaagattcaagtgtggg 193  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||       ||||||||  |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  13673962 aggagacatgtgctttaatt-aaattgtcatttgatttaactgttgatgctactacgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtatggg 13674060  T
Q  194 ggagtttgatg 204  Q
    |||||||||||    
T  13674061 ggagtttgatg 13674071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 1 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 18593561 - 18593352
Alignment:
Q  1 tcacacacacactcacttgaaacttgaccgttgggctgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaagcccttg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||| ||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  18593561 tcacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggtagaataaagattccaagaaatacttgagtttgtaattagtgtacattttggatttaagcccttg 18593462  T
Q  101 aggagacatgtgctttaattgaaattgtca-------taactgttagtgctactatgtttatgccttttacttgaggacaagcaaagattcaagtgtggg 193  Q
    ||||||||||| ||||||||  ||||||||       ||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  18593461 aggagacatgtactttaatt-taattgtcatttgatttaactgttgatgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtatggg 18593363  T
Q  194 ggagtttgatg 204  Q
    |||||||||||    
T  18593362 ggagtttgatg 18593352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 1 - 204
Target Start/End: Original strand, 18618123 - 18618332
Alignment:
Q  1 tcacacacacactcacttgaaacttgaccgttgggctgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaagcccttg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||| ||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  18618123 tcacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggtagaataaagattccaagaaatacttgagtttgtaattagtgtacattttggatttaagcccttg 18618222  T
Q  101 aggagacatgtgctttaattgaaattgtca-------taactgttagtgctactatgtttatgccttttacttgaggacaagcaaagattcaagtgtggg 193  Q
    ||||||||||| ||||||||  ||||||||       ||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  18618223 aggagacatgtactttaatt-taattgtcatttgatttaactgttgatgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtatggg 18618321  T
Q  194 ggagtttgatg 204  Q
    |||||||||||    
T  18618322 ggagtttgatg 18618332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 2 - 204
Target Start/End: Original strand, 4312564 - 4312772
Alignment:
Q  2 cacacacacactcacttgaaacttgaccgttgggctgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaagcccttga 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||  ||  ||||| ||||    
T  4312564 cacacacacactcacttgaaacttgattgttgggttgaataaagattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacgcttgaaataaaagcctttga 4312663  T
Q  102 ggagacatgtgctttaattgaaattgtcata-------actgttagtgctactatgtttatgccttttacttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggg 194  Q
    ||||||||  | |||||||| ||||||||||         ||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4312664 ggagacataagttttaattg-aattgtcatatgataatcttgtttatgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggg 4312762  T
Q  195 gagtttgatg 204  Q
    ||||||||||    
T  4312763 gagtttgatg 4312772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 97; E-Value: 8e-48
Query Start/End: Original strand, 2 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 538964 - 538755
Alignment:
Q  2 cacacacacactcacttgaaacttgaccgttgggctgaataaaaattacaagaaa-tgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaagcccttg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||  |||  ||| || |||||     
T  538964 cacacacacactcacttgaaacttgattgttgggttgaataaagattacaaaaaaatgcttgagtttgtgattagtgtacgcttgaaattaaaacccttc 538865  T
Q  101 aggagacatgtgctttaattgaaattgtcata-------actgttagtgctactatgtttatgccttttacttgaggacaagcaaagattcaagtgtggg 193  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||||||||       | ||||  |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  538864 aggagacatgtgttttaatt-aaattgtcatatgataatattgtttatgctaccatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtggg 538766  T
Q  194 ggagtttgatg 204  Q
    |||||||||||    
T  538765 ggagtttgatg 538755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 2 - 204
Target Start/End: Original strand, 12567020 - 12567229
Alignment:
Q  2 cacacacacactcacttgaaacttgaccgttgggctgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaagcccttga 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||   |||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||  ||| ||||||||||    
T  12567020 cacacacacactcacttgaaacttgattgttgggttgaataaggtttacaagaaatgtttgagtttgtgattagtgtacgcttgaaattgaagcccttga 12567119  T
Q  102 ggagacatgtgctttaattgaaattgtcata-------actg-ttagtgctactatgtttatgccttttacttgaggacaagcaaagattcaagtgtggg 193  Q
    ||||||||| | ||||||| |||||||||||       | || || || |||| |||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  12567120 ggagacatgagttttaatt-aaattgtcatatgataatattgttttgttctaccatgtttatgcattttgcttgaggacaagcaaaaattcaagtgtggg 12567218  T
Q  194 ggagtttgatg 204  Q
    |||||||||||    
T  12567219 ggagtttgatg 12567229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 3 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 12549012 - 12548805
Alignment:
Q  3 acacacacactcacttgaaacttgaccgttgggctgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaagcccttgag 102  Q
    ||||||||||||||||||| |||||  |||||| |||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||  ||| |||||||||||    
T  12549012 acacacacactcacttgaagcttgattgttgggttgaataaggtttacaagaaatgcttgagtttgtgattagtggacgcttgaaattgaagcccttgag 12548913  T
Q  103 gagacatgtgctttaattgaaattgtcata----actgtta----gtgctactatgtttatgccttttacttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggg 194  Q
    |||||||||  ||||||| |||||||||||    | | |||    ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  12548912 gagacatgt-atttaatt-aaattgtcatatgataatattattttgtgctaccatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgttggg 12548815  T
Q  195 gagtttgatg 204  Q
    ||||||||||    
T  12548814 gagtttgatg 12548805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 82; E-Value: 7e-39
Query Start/End: Original strand, 3 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 48801983 - 48801777
Alignment:
Q  3 acacacacactcacttgaaacttgaccgttgggctgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaagcccttgag 102  Q
    ||||||| ||||||||   ||||||  |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||| ||||| |||||    
T  48801983 acacacatactcactttttacttgattgttgggttgaataaagattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacgtttgaaattaaagcctttgag 48801884  T
Q  103 gagacatgtgctttaattgaaattgtcataact-------gttagtgctactatgtttatgccttttacttgaggacaagcaaagattcaagtgtggggg 195  Q
    |||||||| | ||| |||| ||||||||||  |        ||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  48801883 gagacatgagttttgattg-aattgtcatatataatcttgtttattgctactatgtgtatgccttttgcttgaggacaagaaaagattcaagtgtggggg 48801785  T
Q  196 agtttgat 203  Q
    ||||||||    
T  48801784 agtttgat 48801777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 79; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 2 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 8781146 - 8780936
Alignment:
Q  2 cacacacacactcacttgaaacttgaccgttgggctgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaagcccttga 101  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||  |||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||  ||||| ||||    
T  8781146 cacacacacactaccttgaaacttgattgttgggttgaataaaggttacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacacttgaaataaaagcctttga 8781047  T
Q  102 ggagacat--gtgctttaattgaaattgtcata-------actgttagtgctactatgtttatgccttttacttgaggacaagcaaagattcaagtgtgg 192  Q
    ||||||||  ||  |||||||| ||||||||||         ||||  |||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  8781046 ggagacataagttttttaattg-aattgtcatatgttaatcttgtttatgctgctatgtttatgccttttgtttgaggacaagcaaagattcaagtgtgg 8780948  T
Q  193 gggagtttgatg 204  Q
    ||||||||||||    
T  8780947 gggagtttgatg 8780936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 2 - 204
Target Start/End: Original strand, 20108375 - 20108584
Alignment:
Q  2 cacacacacactcacttgaaacttgaccgttgggctgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaagcccttga 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||  ||  ||||| ||||    
T  20108375 cacacacacactcacttgaaacttgattgttgggttgaataaagattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtatgcttgaaataaaagcctttga 20108474  T
Q  102 ggagacatgtgctttaattgaaat----tgtcataac--tg-ttagtgctactatgtttatgccttttacttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggg 194  Q
    ||||||||  | |||||||||| |    | | |||||  || ||  |||||||||||||||| ||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  20108475 ggagacatcagttttaattgaattctcatatgataaccttgttttatgctactatgtttatgtcttttgcttgaggacaataaaagattcaagtgtgggg 20108574  T
Q  195 gagtttgatg 204  Q
    ||||||||||    
T  20108575 gagtttgatg 20108584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 2 - 202
Target Start/End: Original strand, 9003958 - 9004165
Alignment:
Q  2 cacacacacactcacttgaaacttgaccgttgggctgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaagcccttga 101  Q
    |||||| |||||||||||||||||||  |||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||   |||  ||  ||||| ||||    
T  9003958 cacacatacactcacttgaaacttgattgttgggttgaataaagatcacaagaaatgcttgagtttgtaattagtgtatgcttgaaataaaagcctttga 9004057  T
Q  102 ggagacatgtgctttaattgaaattgtcata------actg--ttagtgctactatgtttatgccttttacttgaggacaagcaaagattcaagtgtggg 193  Q
    ||||||||  | |||||||||| ||||||||      |||   ||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  9004058 ggagacataagttttaattgaa-ttgtcatatgataaacttgttttatgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaaacaaagattcaagtgtggg 9004156  T
Q  194 ggagtttga 202  Q
    |||||||||    
T  9004157 ggagtttga 9004165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 2 - 204
Target Start/End: Original strand, 13657873 - 13658081
Alignment:
Q  2 cacacacacactcacttgaaacttgaccgttgggctgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaagcccttga 101  Q
    |||||||||||||| |||||||||||  ||||||  ||| |   |||||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||  ||| ||||| ||||    
T  13657873 cacacacacactcatttgaaacttgattgttgggtggaaaagggattacaaagaatgcttgagtttgtgattagtgtacacttgaaattaaagcctttga 13657972  T
Q  102 ggagacatgtgctttaattgaaattgtcataac-------tgttagtgctactatgtttatgccttttacttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggg 194  Q
    ||||| ||||| ||||||| |||||||||| |        ||||   ||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13657973 ggagatatgtgttttaatt-aaattgtcatgaagtaatcttgtttacgctaccatgttgatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggg 13658071  T
Q  195 gagtttgatg 204  Q
    ||||||||||    
T  13658072 gagtttgatg 13658081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 2 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 11921512 - 11921307
Alignment:
Q  2 cacacacacactcacttgaaacttgaccgttgggctgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtaca-tttgggatttaagcccttg 100  Q
    |||||||||||||||||   ||| ||  |||||| |||| ||  |||| |||||||||||| |||||||||||||||||  ||||  ||  ||||| |||    
T  11921512 cacacacacactcacttaggactagattgttgggttgaaaaaggattataagaaatgcttgcgtttgtgattagtgtactctttgaaataaaagcctttg 11921413  T
Q  101 aggagacatgtgctttaattgaaattgtcat----aactgttagtgctactatgtttatgccttttacttgaggacaagcaaagattcaagtgtggggga 196  Q
    ||||||| ||||||||||| | |||||||||    || ||||| |||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11921412 aggagacgtgtgctttaat-gtaattgtcatgtgaaaatgtta-tgctaccatgtttatgacttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtggggga 11921315  T
Q  197 gtttgatg 204  Q
    ||||||||    
T  11921314 gtttgatg 11921307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 67; E-Value: 6e-30
Query Start/End: Original strand, 5 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 9265145 - 9264939
Alignment:
Q  5 acacacactcacttgaaacttgaccgttgggctgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaagcccttgagga 104  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||  ||  ||| | |||||||    
T  9265145 acacacactcacttgaaacttgattgttgggttgaataaagattacaagaaatacttgagtttgtgattagtgtacgcttgaaataaaagtctttgagga 9265046  T
Q  105 gacatgtg-ctttaattgaaattgtcataactgtta---------gtgctactatgtttatgccttttacttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggg 194  Q
    |||||  |  ||| |||| ||||||||||  |||||          |||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9265045 gacataagttttttattg-aattgtcata--tgttaatcttgcttatgctgctatgtttatgccttttgtttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggg 9264949  T
Q  195 gagtttgatg 204  Q
    ||||||||||    
T  9264948 gagtttgatg 9264939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 2 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 16465821 - 16465616
Alignment:
Q  2 cacacacacactcacttgaaacttgaccgttgggctgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtaca-tttgggatttaagccctt- 99  Q
    |||||||||||||||||   ||| ||| | |||| |||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||  ||  ||||| ||     
T  16465821 cacacacacactcacttaggactagactgatgggttgaaaaaggattataagaaatgcttgagtttgtgattagtgtactctttgaaataaaagcctttt 16465722  T
Q  100 gaggagacatgtgctttaattgaaattgtcat---aactgttagtgctactatgtttatgccttttacttgaggacaagcaaagattcaagtgtggggga 196  Q
    |||||||| |||| |||||| | | |||||||   || ||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16465721 gaggagacgtgtgttttaat-gtatttgtcatgagaaatgtta-tgctactatgtttatgtcttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtggggga 16465624  T
Q  197 gtttgatg 204  Q
    ||||||||    
T  16465623 gtttgatg 16465616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 55; E-Value: 9e-23
Query Start/End: Original strand, 2 - 204
Target Start/End: Original strand, 16532100 - 16532311
Alignment:
Q  2 cacacacacactcacttgaaacttgaccg-ttgggctgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaa-gccctt 99  Q
    |||||||||||||| || | ||||||  | ||||| |||| |||  ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||  || | | | || ||| ||    
T  16532100 cacacacacactcaattaagacttgattgattgggttgaaaaaaggttataagaaatacttgagtttgtgattagtgtactctttgaaataaatgccttt 16532199  T
Q  100 gaggagacatgtgctttaattgaaattgtcata----actgttagt----gctactatgtttatgccttttacttgaggacaagcaaagattcaagtgtg 191  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||||||||    | ||||| |    ||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||    
T  16532200 gaggagacatgtgctttaat-gtaattgtcatatgaaaatgttattttatgctaccatgtttatgtcttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtatg 16532298  T
Q  192 ggggagtttgatg 204  Q
    |||||||||||||    
T  16532299 ggggagtttgatg 16532311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 55; E-Value: 9e-23
Query Start/End: Original strand, 2 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 16633562 - 16633351
Alignment:
Q  2 cacacacacactcacttgaaacttgaccg-ttgggctgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaa-gccctt 99  Q
    |||||||||||||| || | ||||||  | ||||| |||| |||  ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||  || | | | || ||| ||    
T  16633562 cacacacacactcaattaagacttgattgattgggttgaaaaaaggttataagaaatacttgagtttgtgattagtgtactctttgaaataaatgccttt 16633463  T
Q  100 gaggagacatgtgctttaattgaaattgtcata----actgttagt----gctactatgtttatgccttttacttgaggacaagcaaagattcaagtgtg 191  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||||||||    | ||||| |    ||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||    
T  16633462 gaggagacatgtgctttaat-gtaattgtcatatgaaaatgttattttatgctaccatgtttatgtcttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtatg 16633364  T
Q  192 ggggagtttgatg 204  Q
    |||||||||||||    
T  16633363 ggggagtttgatg 16633351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 141 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 15206647 - 15206584
Alignment:
Q  141 tgctactatgtttatgccttttacttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 204  Q
    |||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15206647 tgctgctatgtctatgcctttttcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 15206584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 148 - 204
Target Start/End: Original strand, 825783 - 825839
Alignment:
Q  148 atgtttatgccttttacttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 204  Q
    |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  825783 atgtctatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 825839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 148 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 4461298 - 4461242
Alignment:
Q  148 atgtttatgccttttacttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 204  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  4461298 atgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtatgggggagtttgatg 4461242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 148 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 14221774 - 14221718
Alignment:
Q  148 atgtttatgccttttacttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 204  Q
    |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14221774 atgtctatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 14221718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 148 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 15916832 - 15916776
Alignment:
Q  148 atgtttatgccttttacttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 204  Q
    |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15916832 atgtctatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 15916776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 148 - 204
Target Start/End: Original strand, 18287761 - 18287817
Alignment:
Q  148 atgtttatgccttttacttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 204  Q
    |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18287761 atgtctatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 18287817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 148 - 204
Target Start/End: Original strand, 27291496 - 27291552
Alignment:
Q  148 atgtttatgccttttacttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 204  Q
    |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27291496 atgtctatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 27291552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 146 - 204
Target Start/End: Original strand, 5397273 - 5397331
Alignment:
Q  146 ctatgtttatgccttttacttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 204  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  5397273 ctatgtctatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtaggggagtttgatg 5397331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 155 - 204
Target Start/End: Original strand, 15065935 - 15065984
Alignment:
Q  155 tgccttttacttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 204  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15065935 tgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 15065984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 148 - 203
Target Start/End: Original strand, 15348532 - 15348587
Alignment:
Q  148 atgtttatgccttttacttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgat 203  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  15348532 atgtttatgccttttacttgaggacaaacaaagattcaagtttggggaagtttgat 15348587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 151 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 9194597 - 9194544
Alignment:
Q  151 tttatgccttttacttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 204  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  9194597 tttatgccttttgcttgaggacaaacaaagattcaagtatgggggagtttgatg 9194544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 148 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 6713124 - 6713072
Alignment:
Q  148 atgtttatgccttttacttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagttt 200  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  6713124 atgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtataggggagttt 6713072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 148 - 188
Target Start/End: Original strand, 15522517 - 15522557
Alignment:
Q  148 atgtttatgccttttacttgaggacaagcaaagattcaagt 188  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15522517 atgtttatgccttttacttgaggacaagcaaagattcaagt 15522557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 164 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 4791422 - 4791383
Alignment:
Q  164 cttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgat 203  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  4791422 cttgaggacaagcaaagattcaagtatgggggagtttgat 4791383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 161; Significance: 5e-86; HSPs: 29)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 161; E-Value: 5e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 204
Target Start/End: Original strand, 15699561 - 15699770
Alignment:
Q  1 tcacacacacactcacttgaaacttgaccgttgggctgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaagcccttg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15699561 tcacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaagcccttg 15699660  T
Q  101 aggagacatgtgctttaattgaaattgtc-------ataactgttagtgctactatgtttatgccttttacttgaggacaagcaaagattcaagtgtggg 193  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||       ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15699661 aggagacatgtgctttaattg-aattgtcatttgatataactgttggtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtggg 15699759  T
Q  194 ggagtttgatg 204  Q
    |||||||||||    
T  15699760 ggagtttgatg 15699770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 161; E-Value: 5e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 22165758 - 22165549
Alignment:
Q  1 tcacacacacactcacttgaaacttgaccgttgggctgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaagcccttg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22165758 tcacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaagcccttg 22165659  T
Q  101 aggagacatgtgctttaattgaaattgtc-------ataactgttagtgctactatgtttatgccttttacttgaggacaagcaaagattcaagtgtggg 193  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||       ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22165658 aggagacatgtgctttaattg-aattgtcatttgatataactgttggtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtggg 22165560  T
Q  194 ggagtttgatg 204  Q
    |||||||||||    
T  22165559 ggagtttgatg 22165549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 161; E-Value: 5e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 204
Target Start/End: Original strand, 22243818 - 22244027
Alignment:
Q  1 tcacacacacactcacttgaaacttgaccgttgggctgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaagcccttg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22243818 tcacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaagcccttg 22243917  T
Q  101 aggagacatgtgctttaattgaaattgtc-------ataactgttagtgctactatgtttatgccttttacttgaggacaagcaaagattcaagtgtggg 193  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||       ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22243918 aggagacatgtgctttaattg-aattgtcatttgatataactgttggtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtggg 22244016  T
Q  194 ggagtttgatg 204  Q
    |||||||||||    
T  22244017 ggagtttgatg 22244027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 22061712 - 22061503
Alignment:
Q  1 tcacacacacactcacttgaaacttgaccgttgggctgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaagcccttg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22061712 tcacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaagcccttg 22061613  T
Q  101 aggagacatgtgctttaattgaaattgtc-------ataactgttagtgctactatgtttatgccttttacttgaggacaagcaaagattcaagtgtggg 193  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||       ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  22061612 aggagacatgtgctttaattg-aattgtcatttgatataactgttggtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtatggg 22061514  T
Q  194 ggagtttgatg 204  Q
    |||||||||||    
T  22061513 ggagtttgatg 22061503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 118; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 2 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 24855453 - 24855245
Alignment:
Q  2 cacacacacactcacttgaaacttgaccgttgggctgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtaca-tttgggatttaagcccttg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  ||||||  ||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  24855453 cacacacacactcacttgaaacttgattgttgggtagaataaagatttcaagaaatacttgagtttgtgattagtgtacattttgggatttaagcccttg 24855354  T
Q  101 aggagacatgtgctttaattgaaattgtca-------taactgttagtgctactatgtttatgccttttacttgaggacaagcaaagattcaagtgtggg 193  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||       ||||| ||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  24855353 aggagacatgtgctttaatt--aattgtcatttgatttaactattgatgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtatggg 24855256  T
Q  194 ggagtttgatg 204  Q
    |||||||||||    
T  24855255 ggagtttgatg 24855245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 117; E-Value: 9e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 204
Target Start/End: Original strand, 20170248 - 20170458
Alignment:
Q  1 tcacacacacactcacttgaaacttgaccgttgggctgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtaca-tttgggatttaagccctt 99  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  ||||||  ||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  20170248 tcacacacacactcacttgaaacttgattgttgggtagaataaagatttcaagaaatacttgagtttgtgattagtgtacattttgggatttaagccctt 20170347  T
Q  100 gaggagacatgtgctttaattgaaattgtcat--------aactgttagtgctactatgtttatgccttttacttgaggacaagcaaagattcaagtgtg 191  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||||        |||| ||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||    
T  20170348 gaggagacatgtgctttaatt--aattgtcatttgatttaaactattgatgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtatg 20170445  T
Q  192 ggggagtttgatg 204  Q
    |||||||||||||    
T  20170446 ggggagtttgatg 20170458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 115; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 22767325 - 22767116
Alignment:
Q  1 tcacacacacactcacttgaaacttgaccgttgggctgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtaca-tttgggatttaagccctt 99  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||  ||||||  ||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  22767325 tcacacacactctcacttgaaacttgattgttgggtagaataaagatttcaagaaatacttgagtttgtgattagtgtacattttgggatttaagccctt 22767226  T
Q  100 gaggagacatgtgctttaattgaaattgtca-------taactgttagtgctactatgtttatgccttttacttgaggacaagcaaagattcaagtgtgg 192  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||||||       ||||||||  || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||    
T  22767225 gaggagacatgtgctttaatt--aattgtcatttgatttaactgttgatgttactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtatgg 22767128  T
Q  193 gggagtttgatg 204  Q
    ||||||||||||    
T  22767127 gggagtttgatg 22767116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 101; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 2 - 204
Target Start/End: Original strand, 18448140 - 18448349
Alignment:
Q  2 cacacacacactcacttgaaacttgaccgttgggctgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaagcccttga 101  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||  ||| ||||||||||    
T  18448140 cacacacacagtcacttgaaacttgactgttgggatgaataaggtttacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacgcttgaaattaaagcccttga 18448239  T
Q  102 ggagacatgtgctttaattgaaattgtcata-------actg-ttagtgctactatgtttatgccttttacttgaggacaagcaaagattcaagtgtggg 193  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||||||||       | || || ||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18448240 ggagacatgtgttttaatt-aaattgtcatatgataatattgttttgtgctaccaagtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtggg 18448338  T
Q  194 ggagtttgatg 204  Q
    |||||||||||    
T  18448339 ggagtttgatg 18448349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 2 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 20107989 - 20107784
Alignment:
Q  2 cacacacacactcacttgaaacttgaccgttgggctgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaagcccttga 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||  ||  ||||| ||||    
T  20107989 cacacacacactcacttgaaacttgattgttgggttgaataaagattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacgcttgaaatgaaagcctttga 20107890  T
Q  102 ggagacatgtgcttt-aattgaaattgtcata-------actgttagtgctactatgtttatgccttttacttgaggacaagcaaagattcaagtgtggg 193  Q
    ||||||||  | ||| ||||| ||||||||||         ||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20107889 ggagacataagttttcaattg-aattgtcatatgtttatcttgtttatgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtggg 20107791  T
Q  194 ggagttt 200  Q
    |||||||    
T  20107790 ggagttt 20107784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 2 - 204
Target Start/End: Original strand, 23023093 - 23023302
Alignment:
Q  2 cacacacacactcacttgaaacttgaccgttgggctgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaagcccttga 101  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||  |||||| |||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||  ||| ||||||||||    
T  23023093 cacacgcacactcacttgaaacttgattgttgggttgaataaggtttacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacgcttgaaattaaagcccttga 23023192  T
Q  102 ggagacatgtgctttaattgaaattgtcata-------actgt-tagtgctactatgtttatgccttttacttgaggacaagcaaagattcaagtgtggg 193  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||||||||       | ||| |  |||||| ||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23023193 ggagacatgtgttttaatt-aaattgtcatatgataatattgtcttatgctaccatgtttaagacttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtggg 23023291  T
Q  194 ggagtttgatg 204  Q
    |||||||||||    
T  23023292 ggagtttgatg 23023302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 2 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 21560762 - 21560554
Alignment:
Q  2 cacacacacactcacttgaaacttgaccgttgggctgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaagcccttga 101  Q
    |||||||||||||| |||||||||||  |||||| |||| ||  |||||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||  ||| ||||| ||||    
T  21560762 cacacacacactcatttgaaacttgattgttgggttgaaaaaggattacaaagaatgcttgagtttgtgattagtgtacacttgaaattaaagcctttga 21560663  T
Q  102 ggagacatgtgctttaattgaaattgtcataa-------ctgttagtgctactatgtttatgccttttacttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggg 194  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||| ||| |        ||||  |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  21560662 ggagacatgtgttttaatt-aaattgacatgaagtaatcttgtttatgctaccatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtatgggg 21560564  T
Q  195 gagtttgatg 204  Q
    ||||||||||    
T  21560563 gagtttgatg 21560554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 2 - 204
Target Start/End: Original strand, 25625691 - 25625899
Alignment:
Q  2 cacacacacactcacttgaaacttgaccgttgggctgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaagcccttga 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||  ||| |||||||| |    
T  25625691 cacacacacactcacttgaaacttgattgttgggttgaataaggtttacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacgcttgaaattaaagcccttaa 25625790  T
Q  102 ggagacatgtgctttaattgaaattgtcata-------actgttagtgctactatgtttatgccttttacttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggg 194  Q
    |||||||| || ||||||| |||||||||||       | ||||  |||||| |||||||  |||||| |||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  25625791 ggagacatatgttttaatt-aaattgtcatatgataatattgtttatgctaccatgtttacaccttttgcttgaggacaagcaaaaattcaagtatgggg 25625889  T
Q  195 gagtttgatg 204  Q
    ||||||||||    
T  25625890 gagtttgatg 25625899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 2 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 25631477 - 25631269
Alignment:
Q  2 cacacacacactcacttgaaacttgaccgttgggctgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaagcccttga 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||  ||| ||||| ||||    
T  25631477 cacacacacactcacttgaaacttgattgttgggttgaataaagattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacgcttgaaattaaagcctttga 25631378  T
Q  102 ggagacatgtgctttaattgaaattgtcataact-------gttagtgctactatgtttatgccttttacttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggg 194  Q
     |||| ||  | |||||||| ||||||||||  |        ||| |||||| |||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  25631377 agagatataagttttaattg-aattgtcatatataatcttgtttattgctaccatgtttatgcatttttcctgaggacaagcaaagattcaagtgtgggg 25631279  T
Q  195 gagtttgatg 204  Q
    ||||||||||    
T  25631278 gagtttgatg 25631269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 82; E-Value: 7e-39
Query Start/End: Original strand, 5 - 204
Target Start/End: Original strand, 2181063 - 2181269
Alignment:
Q  5 acacacactcacttgaaacttgaccgttgggctgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaagcccttgagga 104  Q
    ||||||||||||||||||||||   |||| | |||||||  ||||| |||||||||| |||||||||||| ||| |  | |  |||||||||||||||||    
T  2181063 acacacactcacttgaaacttggttgttgagttgaataaggattacgagaaatgcttaagtttgtgattaatgtgcgctcgaaatttaagcccttgagga 2181162  T
Q  105 gacatgtgctttaattgaaattgtcata-------actgtta-gtgctactatgtttatgccttttacttgaggacaagcaaagattcaagtgtggggga 196  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||||       | ||||  ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2181163 gacatgtgttttaatt-aaattgtcatatgataatattgttttgtgctaccatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtggggga 2181261  T
Q  197 gtttgatg 204  Q
    ||||||||    
T  2181262 gtttgatg 2181269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 10 - 204
Target Start/End: Original strand, 18854026 - 18854226
Alignment:
Q  10 cactcacttgaaacttgaccgttgggctgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaagcccttgaggagacat 109  Q
    ||||||||||||||||||  |||||| |||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |  ||| ||||||||||||||||||    
T  18854026 cactcacttgaaacttgattgttgggttgaataaggtttacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacgctggaaattaaagcccttgaggagacat 18854125  T
Q  110 gtgctttaattgaaattgtcata-------actgttagtgctactatgtttatgccttttacttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttga 202  Q
    |||  |||||| |||||||||||       | ||||  |||||| || |||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  18854126 gtgtattaatt-aaattgtcatatgataatattgtttatgctaccatatttatgccttttgcttgaggacaagaaaagattcaagtatgggggagtttga 18854224  T
Q  203 tg 204  Q
    ||    
T  18854225 tg 18854226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 2 - 204
Target Start/End: Original strand, 25963248 - 25963457
Alignment:
Q  2 cacacacacactcacttgaaacttgaccgttgggctgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaagcccttga 101  Q
    |||||||||||||||||  |||||||  |||||| |||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||   |||  ||  ||||| ||||    
T  25963248 cacacacacactcacttagaacttgattgttgggttgaataaagattaaaggaaatgcttgagtttgtgattagtgtatgcttgaaataaaagcctttga 25963347  T
Q  102 ggagacatgtgctttaattgaaattgtcataactgttag----------tgctactatgtttatgccttttacttgaggacaagcaaagattcaagtgtg 191  Q
    |||||||     |||||||||| ||||||||  |||||           ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  25963348 ggagacacaaattttaattgaa-ttgtcata--tgttaagtcttgcttatgctactatgtctatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtg 25963444  T
Q  192 ggggagtttgatg 204  Q
    |||||||||||||    
T  25963445 ggggagtttgatg 25963457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 2 - 204
Target Start/End: Original strand, 25967895 - 25968104
Alignment:
Q  2 cacacacacactcacttgaaacttgaccgttgggctgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaagcccttga 101  Q
    |||||||||||||||||  |||||||  |||||| |||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||   |||  ||  ||||| ||||    
T  25967895 cacacacacactcacttagaacttgattgttgggttgaataaagattaaaggaaatgcttgagtttgtgattagtgtatgcttgaaataaaagcctttga 25967994  T
Q  102 ggagacatgtgctttaattgaaattgtcataactgttag----------tgctactatgtttatgccttttacttgaggacaagcaaagattcaagtgtg 191  Q
    |||||||     |||||||||| ||||||||  |||||           ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  25967995 ggagacacaaattttaattgaa-ttgtcata--tgttaagtcttgcttatgctactatgtctatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtg 25968091  T
Q  192 ggggagtttgatg 204  Q
    |||||||||||||    
T  25968092 ggggagtttgatg 25968104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 62; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 3 - 204
Target Start/End: Original strand, 29595697 - 29595904
Alignment:
Q  3 acacacacactcacttgaaacttgaccgttgggctgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaagcccttgag 102  Q
    ||||||||| ||| |||||||||||   ||||| |||| ||  ||||||||||||| |||||||| | ||||||||||| |||  ||| ||||||||| |    
T  29595697 acacacacagtcatttgaaacttgattattgggttgaaaaaggattacaagaaatgtttgagttttttattagtgtacacttgaaattaaagcccttggg 29595796  T
Q  103 gagacatgtgctttaattgaaattgtcata----actgttagt---gctactatgtttatgccttttacttgaggacaagcaaagattcaagtgtggggg 195  Q
    |||||||||| ||||||| |||| |||||     | | ||| |   ||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  29595797 gagacatgtgttttaatt-aaatcgtcatgtgataatcttatttatgctaccatgtttatgctttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgaggg 29595895  T
Q  196 agtttgatg 204  Q
    |||||||||    
T  29595896 agtttgatg 29595904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 7 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 30672011 - 30671807
Alignment:
Q  7 acacactcacttgaaacttgaccgttgggctgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaagcccttgaggaga 106  Q
    ||||||||| ||  |||||||  |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||  ||  ||||| ||| ||| |    
T  30672011 acacactcaattagaacttgattgttgggttgaataaagattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacgcttgaaataaaagcctttggggaaa 30671912  T
Q  107 catgtgctttaattgaaattgtcataactgttag----------tgctactatgtttatgccttttacttgaggacaagcaaagattcaagtgtggggga 196  Q
    ||     |||||||||| ||||||||  |||||           ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30671911 cacaaattttaattgaa-ttgtcata--tgttaagtcttgcttatgctactatgtctatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtggggga 30671815  T
Q  197 gtttgatg 204  Q
    ||||||||    
T  30671814 gtttgatg 30671807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 2 - 121
Target Start/End: Complemental strand, 19585750 - 19585631
Alignment:
Q  2 cacacacacactcacttgaaacttgaccgttgggctgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaagcccttga 101  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||  |||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||  ||  ||||| || |    
T  19585750 cacatacacactcacttaaaacttgattgttgggttgaataaagattacaagaaatgcttgtgtttgtgattagtgtacgtttgaaataaaagcctttta 19585651  T
Q  102 ggagacatgtgctttaattg 121  Q
    ||||||||| | ||||||||    
T  19585650 ggagacatgagttttaattg 19585631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 20016438 - 20016339
Alignment:
Q  1 tcacacacacactcacttgaaacttgaccgttgggctgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtaca-tttgggatttaagccctt 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||   ||||||| ||| |||||||| ||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  20016438 tcacacacacactcacttgaaacttgatcgttggatagaataaagatttcaagaaatacttgagtttgcaattagtgtacattttgggatttaagccctt 20016339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 141 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 18184937 - 18184874
Alignment:
Q  141 tgctactatgtttatgccttttacttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 204  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  18184937 tgctaccatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtatgggggagtttgatg 18184874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 147 - 204
Target Start/End: Original strand, 35270971 - 35271028
Alignment:
Q  147 tatgtttatgccttttacttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 204  Q
    ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  35270971 tatgtctatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggtgtttgatg 35271028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 141 - 204
Target Start/End: Original strand, 18731868 - 18731931
Alignment:
Q  141 tgctactatgtttatgccttttacttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 204  Q
    |||| |||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||    
T  18731868 tgctgctatgtctatgccttttgcttgaggacaagctaagattcaagtgtggaggagtttgatg 18731931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 141 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 20219044 - 20218981
Alignment:
Q  141 tgctactatgtttatgccttttacttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 204  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  20219044 tgctgctatgtttatgccttttgcttgaagagaagcaaagattcatgtgtgggggagtttgatg 20218981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 141 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 22113069 - 22113006
Alignment:
Q  141 tgctactatgtttatgccttttacttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 204  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  22113069 tgctgctatgtttatgccttttgcttgaagagaagcaaagattcatgtgtgggggagtttgatg 22113006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 148 - 204
Target Start/End: Original strand, 11204004 - 11204060
Alignment:
Q  148 atgtttatgccttttacttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 204  Q
    |||| |||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  11204004 atgtctatgccttttgcttgaggacaagcaaatatttaagtgtgggggagtttgatg 11204060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 148 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 23517887 - 23517835
Alignment:
Q  148 atgtttatgccttttacttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagttt 200  Q
    |||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  23517887 atgtgtatgccttttgcttgaggataagcaaagattcaagtatgggggagttt 23517835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 148 - 204
Target Start/End: Original strand, 29686601 - 29686657
Alignment:
Q  148 atgtttatgccttttacttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 204  Q
    |||||||||||| || |||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||    
T  29686601 atgtttatgcctcttgcttgaggacaagaaaagattcaagtatgggagagtttgatg 29686657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 161; Significance: 5e-86; HSPs: 22)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 161; E-Value: 5e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 11496823 - 11496614
Alignment:
Q  1 tcacacacacactcacttgaaacttgaccgttgggctgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaagcccttg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11496823 tcacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaagcccttg 11496724  T
Q  101 aggagacatgtgctttaattgaaattgtc-------ataactgttagtgctactatgtttatgccttttacttgaggacaagcaaagattcaagtgtggg 193  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||       ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11496723 aggagacatgtgctttaattg-aattgtcatttgatataactgttggtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtggg 11496625  T
Q  194 ggagtttgatg 204  Q
    |||||||||||    
T  11496624 ggagtttgatg 11496614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 161; E-Value: 5e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 204
Target Start/End: Original strand, 13822919 - 13823128
Alignment:
Q  1 tcacacacacactcacttgaaacttgaccgttgggctgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaagcccttg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13822919 tcacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaagcccttg 13823018  T
Q  101 aggagacatgtgctttaattgaaattgtc-------ataactgttagtgctactatgtttatgccttttacttgaggacaagcaaagattcaagtgtggg 193  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||       ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13823019 aggagacatgtgctttaattg-aattgtcatttgatataactgttggtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtggg 13823117  T
Q  194 ggagtttgatg 204  Q
    |||||||||||    
T  13823118 ggagtttgatg 13823128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 42709940 - 42709731
Alignment:
Q  1 tcacacacacactcacttgaaacttgaccgttgggctgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaagcccttg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  42709940 tcacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgagatttaagcccttg 42709841  T
Q  101 aggagacatgtgctttaattgaaattgtc-------ataactgttagtgctactatgtttatgccttttacttgaggacaagcaaagattcaagtgtggg 193  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||       ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42709840 aggagacatgtgctttaattg-aattgtcatttgatataactgttggtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtggg 42709742  T
Q  194 ggagtttgatg 204  Q
    |||||||||||    
T  42709741 ggagtttgatg 42709731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 1 - 204
Target Start/End: Original strand, 15254354 - 15254563
Alignment:
Q  1 tcacacacacactcacttgaaacttgaccgttgggctgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaagcccttg 100  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||     
T  15254354 tcacacacacactcacttaaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacattttggatttaaaccctta 15254453  T
Q  101 aggagacatgtgctttaattgaaattgtcat-------aactgttagtgctactatgtttatgccttttacttgaggacaagcaaagattcaagtgtggg 193  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||||       || |||| |||| |||| || |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15254454 aggagacatgtgctttaatcg-aattgtcatttgataaaattgtttgtgcaactacgtctatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtggg 15254552  T
Q  194 ggagtttgatg 204  Q
    |||||||||||    
T  15254553 ggagtttgatg 15254563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 110; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 3 - 204
Target Start/End: Original strand, 10630758 - 10630965
Alignment:
Q  3 acacacacactcacttgaaacttgaccgttgggctgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaagcccttgag 102  Q
    |||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||  |||||||||||||||    
T  10630758 acacacacactcacttgaaacttgattgttgggttgaataaggtttacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacgcttgaaatttaagcccttgag 10630857  T
Q  103 gagacatgtgctttaattgaaattgtcata----actgt---tagtgctactatgtttatgccttttacttgaggacaagcaaagattcaagtgtggggg 195  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||    | | |   | ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10630858 gagacatgtgctttaatt-aaattgtcatatgataatatgtcttgtgctaccatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtggggg 10630956  T
Q  196 agtttgatg 204  Q
    |||||||||    
T  10630957 agtttgatg 10630965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 97; E-Value: 8e-48
Query Start/End: Original strand, 2 - 204
Target Start/End: Original strand, 3354646 - 3354855
Alignment:
Q  2 cacacacacactcacttgaaacttgaccgttgggctgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaagcccttga 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||  ||| ||||||||||    
T  3354646 cacacacacactcacttgaaacttgattgttgggttgaataaggtttacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacgcttgaaattgaagcccttga 3354745  T
Q  102 ggagacatgtgctttaattgaaattgtcata-------actg-ttagtgctactatgtttatgccttttacttgaggacaagcaaagattcaagtgtggg 193  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||||||||       | || || ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||    
T  3354746 ggagacatgtgttttaatt-aaattgtcatatgataatattgttttgtgctaccatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaactattcaagtgtggg 3354844  T
Q  194 ggagtttgatg 204  Q
    |||||||||||    
T  3354845 ggagtttgatg 3354855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 3 - 204
Target Start/End: Original strand, 18291945 - 18292153
Alignment:
Q  3 acacacacactcacttgaaacttgaccgttgggctgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaagcccttgag 102  Q
    |||||||| ||||||||||||||||  |||||| |||||||   ||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||  ||| |||||||||||    
T  18291945 acacacacgctcacttgaaacttgattgttgggttgaataaggtttacaagaaatgcttgactttgtgattagtgtacgcttgaaattgaagcccttgag 18292044  T
Q  103 gagacatgtgctttaattgaaattgtcata-------actg-ttagtgctactatgtttatgccttttacttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggg 194  Q
    |||||||||| ||||||| |||||||||||       | || || ||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  18292045 gagacatgtgttttaatt-aaattgtcatatgataatattgttttgtgctaccatgtttatgcctttttcttgtggacaagcaaagattcaagtgtgggg 18292143  T
Q  195 gagtttgatg 204  Q
    ||||||||||    
T  18292144 gagtttgatg 18292153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 3 - 204
Target Start/End: Original strand, 38426745 - 38426938
Alignment:
Q  3 acacacacactcacttgaaacttgaccgttgggctgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaagcccttgag 102  Q
    |||||||||||||||||||||||||  |||||  |||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||  ||| |||||||||||    
T  38426745 acacacacactcacttgaaacttgattgttggcttgaataaggtttacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacgcttgaaattaaagcccttgag 38426844  T
Q  103 gagacatgtgctttaattgaaattgtcataactgttagtgctactatgtttatgccttttacttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttga 202  Q
    |||||||||| ||||||| |||||||||||  || || |  ||     |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38426845 gagacatgtgttttaatt-aaattgtcata--tgataatatta-----tttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttga 38426936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 2 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 18081669 - 18081459
Alignment:
Q  2 cacacacacactcacttgaaacttgaccgttgggctgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtaca-tttgggatttaagcccttg 100  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||  |||||| |||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||  ||  ||||| |||    
T  18081669 cacacacacactcacttaagacttgattgttgggttgaaaaaggattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtactctttgaaataaaagcctttg 18081570  T
Q  101 aggagacatgtgctttaattgaaattgtcata----actgttagt----gctactatgtttatgccttttacttgaggacaagcaaagattcaagtgtgg 192  Q
    |||||||||||||||| ||| || ||||||||    | ||||  |    ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  18081569 aggagacatgtgctttgatttaa-ttgtcatatgataatgttgttctatgctaccatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgg 18081471  T
Q  193 gggagtttgatg 204  Q
    ||||||||||||    
T  18081470 gggagtttgatg 18081459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 77; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 2 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 45234441 - 45234232
Alignment:
Q  2 cacacacacactcacttgaaacttgaccgttgggctgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaagcccttga 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||  ||  ||||| ||||    
T  45234441 cacacacacactcacttgaaacttgatagttgggttgaataaagattacaagaaatgcttgagtttgtgattactgtacgcttgaaataaaagcctttga 45234342  T
Q  102 ggagacatgtgctttaattgaaattgtcata----act----gttagtgctactatgtttatgccttttacttgaggacaagcaaagattcaagtgtggg 193  Q
    ||||||||  | |||||||  ||||||||||    | |     ||  ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  45234341 ggagacattagttttaatt-taattgtcatatgataatcttgttttatgccaccatgtttatgccttttacttgaggacaagcaaagattcaagtctggg 45234243  T
Q  194 ggagtttgatg 204  Q
    |||||||||||    
T  45234242 ggagtttgatg 45234232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 3 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 17485118 - 17484910
Alignment:
Q  3 acacacacactcacttgaaacttgaccgttgggctgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaagcccttgag 102  Q
    |||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||  |||  ||  |||||| ||||    
T  17485118 acacacacactcacttgaaacttgattgttgggttgaataaggattataagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacgcttgaaataaaagcccctgag 17485019  T
Q  103 gagacatgtgctttaattgaaattgtcat------aact--gttagtgctactatgtttatgccttttacttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggg 194  Q
    |||||||  | ||||||| ||||||||||      | ||   ||  |||||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17485018 gagacataagttttaatt-aaattgtcatgtgataatcttgttttatgctaccatatttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggg 17484920  T
Q  195 gagtttgatg 204  Q
    ||||||||||    
T  17484919 gagtttgatg 17484910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 3 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 56580748 - 56580539
Alignment:
Q  3 acacacacactcacttgaaacttgaccgttgggctgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtaca-tttgggatttaagcccttga 101  Q
    |||||||||||||||| | ||||||    |||| |||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||  ||  ||||| ||||    
T  56580748 acacacacactcacttaagacttgatttatgggttgaaaaatgattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtactctttgaaataaaagcctttga 56580649  T
Q  102 ggagacatgtgctttaattgaaattgtcata----actgttagt----gctactatgtttatgccttttacttgaggacaagcaaagattcaagtgtggg 193  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||| |    | ||||| |    ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  56580648 ggagacatgtgctttaatttaa-ttgtcagatgataatgttattttatgctaccatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtggg 56580550  T
Q  194 ggagtttgatg 204  Q
    |||||||||||    
T  56580549 ggagtttgatg 56580539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 5 - 80
Target Start/End: Complemental strand, 8092634 - 8092559
Alignment:
Q  5 acacacactcacttgaaacttgaccgttgggctgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtac 80  Q
    ||||||||||||||  |||||||  |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8092634 acacacactcacttagaacttgattgttgggttgaataaagattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtac 8092559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 141 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 14654061 - 14653998
Alignment:
Q  141 tgctactatgtttatgccttttacttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 204  Q
    |||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14654061 tgctgctatgtctatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 14653998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 148 - 202
Target Start/End: Original strand, 15865647 - 15865701
Alignment:
Q  148 atgtttatgccttttacttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttga 202  Q
    |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15865647 atgtctatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttga 15865701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 148 - 204
Target Start/End: Original strand, 10650547 - 10650603
Alignment:
Q  148 atgtttatgccttttacttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 204  Q
    |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  10650547 atgtctatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtatgggggagtttgatg 10650603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 148 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 15260165 - 15260109
Alignment:
Q  148 atgtttatgccttttacttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 204  Q
    |||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15260165 atgtctatgccttttgcttgaggaaaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 15260109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 148 - 204
Target Start/End: Original strand, 16682913 - 16682969
Alignment:
Q  148 atgtttatgccttttacttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 204  Q
    |||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16682913 atgtctatgccttttgcttgatgacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 16682969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 153 - 204
Target Start/End: Original strand, 15409534 - 15409585
Alignment:
Q  153 tatgccttttacttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 204  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  15409534 tatgccttttgcttgaggacaagcaaagattctagtgtgggggagtttgatg 15409585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 144 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 8092487 - 8092427
Alignment:
Q  144 tactatgtttatgccttttacttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 204  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||    
T  8092487 tactatgtttatgtctttttcttgaggacaagcaaagattcaagtatgggaaagtttgatg 8092427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 148 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 9488934 - 9488878
Alignment:
Q  148 atgtttatgccttttacttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 204  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  9488934 atgttcatgccttttgcttgaggacaagcaaagattgaagtatgggggagtttgatg 9488878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 155 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 17296298 - 17296250
Alignment:
Q  155 tgccttttacttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgat 203  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  17296298 tgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagcatgggggagtttgat 17296250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 161; Significance: 5e-86; HSPs: 48)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 161; E-Value: 5e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 10602681 - 10602472
Alignment:
Q  1 tcacacacacactcacttgaaacttgaccgttgggctgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaagcccttg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10602681 tcacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaagcccttg 10602582  T
Q  101 aggagacatgtgctttaattgaaattgtc-------ataactgttagtgctactatgtttatgccttttacttgaggacaagcaaagattcaagtgtggg 193  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||       ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10602581 aggagacatgtgctttaattg-aattgtcatttgatataactgttggtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtggg 10602483  T
Q  194 ggagtttgatg 204  Q
    |||||||||||    
T  10602482 ggagtttgatg 10602472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 13505090 - 13504881
Alignment:
Q  1 tcacacacacactcacttgaaacttgaccgttgggctgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaagcccttg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13505090 tcacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaagcccttg 13504991  T
Q  101 aggagacatgtgctttaattgaaattgtcat-------aactgttagtgctactatgtttatgccttttacttgaggacaagcaaagattcaagtgtggg 193  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||       || |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13504990 aggagacatgtgctttaattg-aattgtcatttgataaaattgtttgtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtggg 13504892  T
Q  194 ggagtttgatg 204  Q
    |||||||||||    
T  13504891 ggagtttgatg 13504881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 149; E-Value: 8e-79
Query Start/End: Original strand, 1 - 204
Target Start/End: Original strand, 11947413 - 11947622
Alignment:
Q  1 tcacacacacactcacttgaaacttgaccgttgggctgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaagcccttg 100  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11947413 tcacacacacactcatttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaagcccttg 11947512  T
Q  101 aggagacatgtgctttaattgaaattgtcat-------aactgttagtgctactatgtttatgccttttacttgaggacaagcaaagattcaagtgtggg 193  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||       || |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  11947513 aggagacatgtgctttaattg-aattgtcatttgataaaattgtttgtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagtaaagattcaagtgtggg 11947611  T
Q  194 ggagtttgatg 204  Q
    |||||||||||    
T  11947612 ggagtttgatg 11947622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 141; E-Value: 4e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 16448969 - 16448760
Alignment:
Q  1 tcacacacacactcacttgaaacttgaccgttgggctgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaagcccttg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  16448969 tcacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgaatttgtgattagtgtacatttggaatttaagcccttg 16448870  T
Q  101 aggagacatgtgctttaattgaaattgtcat-------aactgttagtgctactatgtttatgccttttacttgaggacaagcaaagattcaagtgtggg 193  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||       || |||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  16448869 aggagacatgtgctttaattg-aattgtcatttgataaaattgtttgtgctaccatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtatggg 16448771  T
Q  194 ggagtttgatg 204  Q
    |||||||||||    
T  16448770 ggagtttgatg 16448760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 5 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 15557147 - 15556942
Alignment:
Q  5 acacacactcacttgaaacttgaccgttgggctgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaagcccttgagga 104  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15557147 acacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaagatttcaagaaatgcttaagtttgtgattagtgtacatttgggatttaagcccttgagga 15557048  T
Q  105 gacatgtgctttaattgaaattgtca-------taactgttagtgctactatgtttatgccttttacttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggag 197  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||       ||||| ||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15557047 gacatgtgctttaattg-aattgtcatttgaattaactattgatgctactatgtttatgcctttttcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggag 15556949  T
Q  198 tttgatg 204  Q
    |||||||    
T  15556948 tttgatg 15556942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 1 - 204
Target Start/End: Original strand, 7600361 - 7600570
Alignment:
Q  1 tcacacacacactcacttgaaacttgaccgttgggctgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaagcccttg 100  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| |||||||  ||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7600361 tcacacacacactcacttaaaacttgatcgttgggtagaataaagatttcaagaaatacttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaagcccttg 7600460  T
Q  101 aggagacatgtgctttaattgaaattgtca-------taactgttagtgctactatgtttatgccttttacttgaggacaagcaaagattcaagtgtggg 193  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||       ||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  7600461 aggagacatgtgctttaatt-aaattgtcatttgatttaactgttgatgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtatggg 7600559  T
Q  194 ggagtttgatg 204  Q
    |||||||||||    
T  7600560 ggagtttgatg 7600570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 129; E-Value: 6e-67
Query Start/End: Original strand, 1 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 9361180 - 9360971
Alignment:
Q  1 tcacacacacactcacttgaaacttgaccgttgggctgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaagcccttg 100  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  9361180 tcacacacacactcacttaaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgaatttgtgattagtgtacatttggaatttaagcccttg 9361081  T
Q  101 aggagacatgtgctttaattgaaattgtcat-------aactgttagtgctactatgtttatgccttttacttgaggacaagcaaagattcaagtgtggg 193  Q
    ||||||||||| ||||||| | |||||||||       || |||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  9361080 aggagacatgtcctttaatcg-aattgtcatttgataaaattgtttgtgctaccatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtatggg 9360982  T
Q  194 ggagtttgatg 204  Q
    |||||||||||    
T  9360981 ggagtttgatg 9360971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 16373774 - 16373565
Alignment:
Q  1 tcacacacacactcacttgaaacttgaccgttgggctgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtaca-tttgggatttaagccctt 99  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  ||||||  ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  16373774 tcacacacacactcacttgaaacttgattgttgggtagaataaagatttcaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacattttgggatttaagccctt 16373675  T
Q  100 gaggagacatgtgctttaattgaaattgtca-------taactgttagtgctactatgtttatgccttttacttgaggacaagcaaagattcaagtgtgg 192  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||||||       ||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||    
T  16373674 gaggagacatgtgctttaatt--aattgtcatttgatttaactgttgatgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtatgg 16373577  T
Q  193 gggagtttgatg 204  Q
    ||||||||||||    
T  16373576 gggagtttgatg 16373565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 123; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 1 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 12187285 - 12187076
Alignment:
Q  1 tcacacacacactcacttgaaacttgaccgttgggctgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtaca-tttgggatttaagccctt 99  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  ||||||  ||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  12187285 tcacacacacactcacttgaaacttgattgttgggtagaataaagatttcaagaaatacttgagtttgtgattagtgtacattttgggatttaagccctt 12187186  T
Q  100 gaggagacatgtgctttaattgaaattgtca-------taactgttagtgctactatgtttatgccttttacttgaggacaagcaaagattcaagtgtgg 192  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||||||       ||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||    
T  12187185 gaggagacatgtgctttaatt--aattgtcatttgatttaactgttgatgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtatgg 12187088  T
Q  193 gggagtttgatg 204  Q
    ||||||||||||    
T  12187087 gggagtttgatg 12187076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 119; E-Value: 6e-61
Query Start/End: Original strand, 1 - 204
Target Start/End: Original strand, 37942384 - 37942593
Alignment:
Q  1 tcacacacacactcacttgaaacttgaccgttgggctgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtaca-tttgggatttaagccctt 99  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  ||||||  ||||||| ||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  37942384 tcacacacacactcacttgaaacttgattgttgggtagaataaagatttcaggaaatacttgagtttgtgattagtgtacattttgggatttaagccctt 37942483  T
Q  100 gaggagacatgtgctttaattgaaattgtca-------taactgttagtgctactatgtttatgccttttacttgaggacaagcaaagattcaagtgtgg 192  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||||||       ||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||    
T  37942484 gaggagacatgtgctttaatt--aattgtcatttgatttaactgttgatgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtatgg 37942581  T
Q  193 gggagtttgatg 204  Q
    ||||||||||||    
T  37942582 gggagtttgatg 37942593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 3 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 12193697 - 12193491
Alignment:
Q  3 acacacacactcacttgaaacttgaccgttgggctgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtaca-tttgggatttaagcccttga 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||  ||||||  ||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  12193697 acacacacactcacttgaaacttgattgttgggtagaataaagatttcaagaaatacttgagtttgtgattagtgtacattttgggatttaagcccttga 12193598  T
Q  102 ggagacatgtgctttaattgaaattgtca-------taactgttagtgctactatgtttatgccttttacttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggg 194  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||       ||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || |||||    
T  12193597 ggagacatgtgctttaatt--aattgtcatttgatttaactgttgatgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaggtatgggg 12193500  T
Q  195 gagtttgat 203  Q
    |||||||||    
T  12193499 gagtttgat 12193491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 200
Target Start/End: Original strand, 6814874 - 6815079
Alignment:
Q  1 tcacacacacactcacttgaaacttgaccgttgggctgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtaca-tttgggatttaagccctt 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  6814874 tcacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggtagaataaagatttcaagaaatacttgagtttgtgattagtgtacattttgggatttatgccctt 6814973  T
Q  100 gaggagacatgtgctttaattgaaattgtca-------taactgttagtgctactatgtttatgccttttacttgaggacaagcaaagattcaagtgtgg 192  Q
    |||||||||||||||||||||  || |||||       ||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||     
T  6814974 gaggagacatgtgctttaatt--aactgtcatttgatttaactgttgatgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtatga 6815071  T
Q  193 gggagttt 200  Q
    ||||||||    
T  6815072 gggagttt 6815079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 204
Target Start/End: Original strand, 10147017 - 10147226
Alignment:
Q  1 tcacacacacactcacttgaaacttgaccgttgggctgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtaca-tttgggatttaagccctt 99  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  ||||||  ||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  10147017 tcacacacacactcacttgaaacttgattgttgggtagaataaagatttcaagaaatacttgagtttgtgattagtgtacattttgggatttaagccctt 10147116  T
Q  100 gaggagacatgtgctttaattgaaattgtca-------taactgttagtgctactatgtttatgccttttacttgaggacaagcaaagattcaagtgtgg 192  Q
    |||||||||||||||||||||  || |||||       ||||| ||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||    
T  10147117 gaggagacatgtgctttaatt--aactgtcatttgatttaactattgatgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagactcaagtatgg 10147214  T
Q  193 gggagtttgatg 204  Q
    ||||||||||||    
T  10147215 gggagtttgatg 10147226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 10160382 - 10160173
Alignment:
Q  1 tcacacacacactcacttgaaacttgaccgttgggctgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtaca-tttgggatttaagccctt 99  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  ||||||  ||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  10160382 tcacacacacactcacttgaaacttgattgttgggtagaataaagatttcaagaaatacttgagtttgtgattagtgtacattttgggattaaagccctt 10160283  T
Q  100 gaggagacatgtgctttaattgaaattgtca-------taactgttagtgctactatgtttatgccttttacttgaggacaagcaaagattcaagtgtgg 192  Q
    |||||||||||||||||||||  || |||||       ||||| ||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||    
T  10160282 gaggagacatgtgctttaatt--aactgtcattcgatttaactattgatgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtatgg 10160185  T
Q  193 gggagtttgatg 204  Q
    ||||||||||||    
T  10160184 gggagtttgatg 10160173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 204
Target Start/End: Original strand, 15645007 - 15645216
Alignment:
Q  1 tcacacacacactcacttgaaacttgaccgttgggctgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtaca-tttgggatttaagccctt 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |  ||||||  ||||||| ||| |||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  15645007 tcacacacacactcacttgaaacttaattgttgggtagaataaagatttcaagaaacacttgagtttgtgattagtgtacattttgggatttaagccctt 15645106  T
Q  100 gaggagacatgtgctttaattgaaattgtca-------taactgttagtgctactatgtttatgccttttacttgaggacaagcaaagattcaagtgtgg 192  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||       ||||| ||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||    
T  15645107 gaggagacatgtgctttaattg--attgtcatttgatttaactattgatgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtatgg 15645204  T
Q  193 gggagtttgatg 204  Q
    ||||||||||||    
T  15645205 gggagtttgatg 15645216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 106; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 1 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 13187626 - 13187418
Alignment:
Q  1 tcacacacacactcacttgaaacttgaccgttgggctgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtaca-tttgggatttaagccctt 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||  ||||||  ||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  13187626 tcacacacacactcacttgaaactcgattgttgggtagaataaagatttcaagaaatacttgagtttgtgattagtgtacattttgggattaaagccctt 13187527  T
Q  100 gaggagacatgtgctttaattgaaattgtca-------taactgttagtgctactatgtttatgccttttacttgaggacaagcaaagattcaagtgtgg 192  Q
    |||||||||||||||||||||  || |||||       ||||| ||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||    
T  13187526 gaggagacatgtgctttaatt--aactgtcatttgatttaactattgatgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtatgg 13187429  T
Q  193 gggagtttgat 203  Q
    |||||||||||    
T  13187428 gggagtttgat 13187418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 2 - 204
Target Start/End: Original strand, 13097711 - 13097919
Alignment:
Q  2 cacacacacactcacttgaaacttgaccgttgggctgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaagcccttga 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||| ||  |||||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||  ||| ||||| ||||    
T  13097711 cacacacacactcacttgaaacttgattgttgggttgaaaaaggattacaaagaatgcttgagtttgtgattagtgtacacttgaaattaaagcctttga 13097810  T
Q  102 ggagacatgtgctttaattgaaattgtcataa-------ctgttagtgctactatgtttatgccttttacttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggg 194  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||||||| |        ||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  13097811 ggagacatgtgttttaatt-aaattgtcatgaagtaatcttgtttatgctaccatgtttatgccttttacttgaggacaagcaaagattcaaatgtgggg 13097909  T
Q  195 gagtttgatg 204  Q
    ||||||||||    
T  13097910 gagtttgatg 13097919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 3 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 3245795 - 3245589
Alignment:
Q  3 acacacacactcacttgaaacttgaccgttgggctgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaagcccttgag 102  Q
    ||||||| |||||||||| ||||||  |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||  ||  ||||| |||||    
T  3245795 acacacatactcacttgagacttgattgttgggttgaataaagattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacgcttgaaataaaagcctttgag 3245696  T
Q  103 gagacatgtgctttaattgaaattgtcataac-------tgttagtgctactatgtttatgccttttacttgaggacaagcaaagattcaagtgtggggg 195  Q
    |||||||  | |||||||||| ||||||||         ||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3245695 gagacataagttttaattgaa-ttgtcatatgataatcttgtttatgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtggggg 3245597  T
Q  196 agtttgat 203  Q
    ||||||||    
T  3245596 agtttgat 3245589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 3 - 204
Target Start/End: Original strand, 2721305 - 2721511
Alignment:
Q  3 acacacacactcacttgaaacttgaccgttgggctgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaagcccttgag 102  Q
    |||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||   |  ||||| |||||    
T  2721305 acacacacactcacttgaaacttgattgttgggttgaataaagattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacgcttgaattaaaagcctttgag 2721404  T
Q  103 gagacatgtgctttaattgaaattgtcata-------actgttagtgctactatgtttatgccttttacttgaggacaagcaaagattcaagtgtggggg 195  Q
    |||||||  | |||||||| ||||||||||         ||||  |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  2721405 gagacataagttttaattg-aattgtcatattataatcttgtttatgctgctatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgt-gggg 2721502  T
Q  196 agtttgatg 204  Q
    |||||||||    
T  2721503 agtttgatg 2721511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 2 - 204
Target Start/End: Original strand, 4382751 - 4382961
Alignment:
Q  2 cacacacacactcacttgaaacttgaccgttgggctgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtaca-tttgggatttaagcccttg 100  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||  |||||| |||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||  ||  ||||| |||    
T  4382751 cacacacacactcacttaagacttgattgttgggttgaaaaaggattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtactctttgaaataaaagcctttg 4382850  T
Q  101 aggagacatgtgctttaattgaaattgtcata----actgttagt----gctactatgtttatgccttttacttgaggacaagcaaagattcaagtgtgg 192  Q
    |||||||||||||||| ||| || ||||||||    | ||||  |    ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  4382851 aggagacatgtgctttgatttaa-ttgtcatatgataatgttgttctatgctaccatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgg 4382949  T
Q  193 gggagtttgatg 204  Q
    ||||||||||||    
T  4382950 gggagtttgatg 4382961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 77; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 3 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 13001634 - 13001425
Alignment:
Q  3 acacacacactcacttgaaacttgaccgttgggctgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtaca-tttgggatttaagcccttga 101  Q
    |||||||||||||||| | ||||||  |||||| |||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||  ||  ||||| ||||    
T  13001634 acacacacactcacttaagacttgattgttgggttgaaaaaggattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtactctttgaaataaaagcctttga 13001535  T
Q  102 ggagacatgtgctttaattgaaattgtcata----actgttagt----gctactatgtttatgccttttacttgaggacaagcaaagattcaagtgtggg 193  Q
    ||||||||||||||| ||| || ||||||||    | ||||  |    ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13001534 ggagacatgtgctttgatttaa-ttgtcatatgataatgttgttttatgctaccatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtggg 13001436  T
Q  194 ggagtttgatg 204  Q
    |||||||||||    
T  13001435 ggagtttgatg 13001425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 2 - 204
Target Start/End: Original strand, 13690608 - 13690816
Alignment:
Q  2 cacacacacactcacttgaaacttgaccgttgggctgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaagcccttga 101  Q
    |||||||||||||| |||||||||||  |||||| |||| ||  |||||||  ||||||||||||||||||||||| ||| |||  ||| ||||| ||||    
T  13690608 cacacacacactcatttgaaacttgattgttgggttgaaaaaggattacaaagaatgcttgagtttgtgattagtggacacttgaaattaaagcctttga 13690707  T
Q  102 ggagacatgtgctttaattgaaattgtcataa-------ctgttagtgctactatgtttatgccttttacttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggg 194  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||||||| |        ||||  |||||| ||||||||||||||| ||||| |||||  ||||||||||||||||||    
T  13690708 ggagacatgtgttttaatt-aaattgtcatgaaataatcttgtttatgctaccatgtttatgccttttgcttgatgacaactaaagattcaagtgtgggg 13690806  T
Q  195 gagtttgatg 204  Q
    ||||||||||    
T  13690807 gagtttgatg 13690816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 2 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 20156722 - 20156515
Alignment:
Q  2 cacacacacactcacttgaaacttgaccgttgggctgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaagcccttga 101  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||  |||||| ||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||| | |||  ||  ||||| ||||    
T  20156722 cacacacacactcacttgagacttgattgttgggttgaataaagtttacaagaaatgcttgagcttgtgattagtgtaaaattgaaataaaagcctttga 20156623  T
Q  102 ggagacatgtgctttaattgaaattgtcata-------actgttagtgctactatgtttatgccttttacttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggg 194  Q
    ||||||||| | |||||||  ||||||||||         ||||  |||||| |||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  20156622 ggagacatgagttttaatt-taattgtcatatgattatcttgtttatgctaccatgtttatgcattttgcttgaggacaagc-aagattcaagtgtgggg 20156525  T
Q  195 gagtttgatg 204  Q
    ||||||||||    
T  20156524 gagtttgatg 20156515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 2 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 10547148 - 10546936
Alignment:
Q  2 cacacacacactcacttgaaacttgaccgttgggctgaataaaa--attacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtaca-tttgggatttaagccct 98  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||  |||||| |||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||  ||  ||||| |    
T  10547148 cacacacacactcacttaagacttgattgttgggttgaaaaaaaggattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtactctttgaaataaaagcctt 10547049  T
Q  99 tgaggagacatgtgctt-----taattg--aaattgtcataactgttagtgctactatgtttatgccttttacttgaggacaagcaaagattcaagtgtg 191  Q
    |||||||||||||||||     ||||||  | ||  | ||| |  ||  |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  10547048 tgaggagacatgtgcttcgaattaattgtcatatgataatatcgttttatgctaccatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtg 10546949  T
Q  192 ggggagtttgatg 204  Q
    |||||||||||||    
T  10546948 ggggagtttgatg 10546936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 2 - 204
Target Start/End: Original strand, 1992803 - 1993011
Alignment:
Q  2 cacacacacactcacttgaaacttgaccgttgggctgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaagcccttga 101  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||  |||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||  ||  ||||| ||||    
T  1992803 cacacacacactcacttgaaatttgattgttgagttgaataaagattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacgcttgaaataaaagcctttga 1992902  T
Q  102 ggagacatgtgctttaattgaaattgtcata-------actgttagtgctactatgtttatgccttttacttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggg 194  Q
    ||||||||  | |||||||  ||||||||||         ||||  |||||||||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||| | |     
T  1992903 ggagacataagttttaatt-taattgtcatatgataatcttgtttatgctactatgtttatgccttttgcttgagcataagcaaagattcaagtgggaga 1993001  T
Q  195 gagtttgatg 204  Q
    ||||||||||    
T  1993002 gagtttgatg 1993011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 67; E-Value: 6e-30
Query Start/End: Original strand, 2 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 14348797 - 14348588
Alignment:
Q  2 cacacacacactcacttgaaacttgaccgttgggctgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaagcccttga 101  Q
    |||||||||||||||||  |||||||  ||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||  ||  ||||| ||||    
T  14348797 cacacacacactcacttagaacttgattgtttggttgaataaagattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacgcttgaaataaaagcctttga 14348698  T
Q  102 ggagacatgtgctttaattgaaattgtcataactgtta----------gtgctactatgtttatgccttttacttgaggacaagcaaagattcaagtgtg 191  Q
    |||||||   | |||||||| ||||||||||  |||||           || ||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  14348697 ggagacacaagttttaattg-aattgtcata--tgttaagtcttgcttatgttaccatgtctatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtg 14348601  T
Q  192 ggggagtttgatg 204  Q
    |||||||||||||    
T  14348600 ggggagtttgatg 14348588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 2 - 204
Target Start/End: Original strand, 11398215 - 11398424
Alignment:
Q  2 cacacacacactcacttgaaacttgaccgttgggctgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaagcccttga 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||   ||  ||||| ||||    
T  11398215 cacacacacactcacttgaaacttgattgttgggttgaataaagattacaagaaatgcttgagtttatgattagtgtacgctttaaataaaagcctttga 11398314  T
Q  102 ggagacatgtgcttt-aattgaaattgtcata-------actgttagtgctactatgtttatgccttttacttgaggacaagcaaagattcaagtgtggg 193  Q
     |||||||  | ||| ||||| ||||||| ||         ||||  |||| |||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  11398315 agagacataagttttcaattg-aattgtcgtatgttaatcttgtttatgctgctatatttatgccttttgcttgaggacaagcaaatattcaagtgtggg 11398413  T
Q  194 ggagtttgatg 204  Q
    |||||||||||    
T  11398414 ggagtttgatg 11398424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 62; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 1 - 93
Target Start/End: Original strand, 16655804 - 16655897
Alignment:
Q  1 tcacacacacactcacttgaaacttgaccgttgggctgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtaca-tttgggatttaa 93  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  16655804 tcacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggtagaataaagatttcaagaaatacttgagtttgtgattagtgtacattttgggatttaa 16655897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 61; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 3 - 204
Target Start/End: Original strand, 3279191 - 3279399
Alignment:
Q  3 acacacacactcacttgaaacttgaccgttgggctgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaagcccttgag 102  Q
    ||||||||||||||||  |||||||  |||||| |||||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||||| |||  ||  ||| | |||||    
T  3279191 acacacacactcacttagaacttgattgttgggttgaataaagattacaagaaatgttcgagtttgtgattagtgtacacttgaaataaaagtctttgag 3279290  T
Q  103 gagacatgtgctttaattgaaattgtcata--------actgttagtgctactatgtttatgccttttacttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggg 194  Q
    ||||||   | |||||||  ||||||||||        | ||||  || | |||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  3279291 gagacacaagttttaatt-taattgtcatatgttaagtattgtttatgttgctatgtctatgccttttgcttgaggacaaacaaagattcaagtgtgggg 3279389  T
Q  195 gagtttgatg 204  Q
    ||||||||||    
T  3279390 gagtttgatg 3279399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 2 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 12160416 - 12160207
Alignment:
Q  2 cacacacacactcacttgaaacttgaccgttgggctgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtaca-tttgggatttaagcccttg 100  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||  |||||| |||| || ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||  ||||  ||  || |  |||    
T  12160416 cacacacacactcacttaagacttgattgttgggttgaa-aagaattacaagaaatgcttgagttttttattagtgtactctttgaaataaaaacatttg 12160318  T
Q  101 aggagacatgtgctttaattgaaattgtcata----actgttagt----gctactatgtttatgccttttacttgaggacaagcaaagattcaagtgtgg 192  Q
    ||||||||||| |||||||| || ||||||||    | ||||| |    || || |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  12160317 aggagacatgttctttaatttaa-ttgtcatatgataatgttattttatgccaccatgtttatgcattttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgg 12160219  T
Q  193 gggagtttgatg 204  Q
    ||||||||||||    
T  12160218 gggagtttgatg 12160207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 5 - 204
Target Start/End: Original strand, 22637702 - 22637908
Alignment:
Q  5 acacacactcacttgaaacttgaccgttgggctgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaagcccttgagga 104  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||  |||  ||  ||| | |||||||    
T  22637702 acacacactcacttgaaacttgattgttgggttgaataaagattacaagaattgcttaagtttgtgattagtgtacgcttgaaataaaagtctttgagga 22637801  T
Q  105 gacatgtgctttaattgaaattgtcata----act----gttagtgctactatgtttatgccttttacttgaggacaagcaaagattcaagtgtggggga 196  Q
    | |||  | |||||||| ||||||||||    | |     ||  |||||| ||||| ||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||| |||||    
T  22637802 ggcataagttttaattg-aattgtcatatgataatcttgttttatgctaccatgttgatgccttttgcttgagcacaagtaaagattcaagtgtagggga 22637900  T
Q  197 gtttgatg 204  Q
    ||||||||    
T  22637901 gtttgatg 22637908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 5 - 204
Target Start/End: Original strand, 17387839 - 17388045
Alignment:
Q  5 acacacactcacttgaaacttgaccgttgggctgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaagcccttgagga 104  Q
    |||||||||||||| ||||||||  |||||| |||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||||    |||  ||  ||||| |||||||    
T  17387839 acacacactcactttaaacttgattgttgggttgaataaagatttcaagaattgcttgagtttgtgattagtgtgtgcttgaaataaaagcctttgagga 17387938  T
Q  105 gacatgtgctttaattgaaattgtca-----taac--tgttag-tgctactatgtttatgccttttacttgaggacaagcaaagattcaagtgtggggga 196  Q
    || ||  | |||||||||| ||||||     |||   ||||   |||||| ||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  17387939 gatataagttttaattgaa-ttgtcacatgataatcttgttttatgctaccatgttgatgccttttgcttaaggacaagcaaagattcaagtgtggggga 17388037  T
Q  197 gtttgatg 204  Q
    ||||||||    
T  17388038 gtttgatg 17388045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 148 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 27356784 - 27356728
Alignment:
Q  148 atgtttatgccttttacttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 204  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27356784 atgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 27356728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 50; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 147 - 204
Target Start/End: Original strand, 13601220 - 13601277
Alignment:
Q  147 tatgtttatgccttttacttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 204  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13601220 tatgtttatgccttttgcttgagaacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 13601277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 148 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 3339282 - 3339226
Alignment:
Q  148 atgtttatgccttttacttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 204  Q
    |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3339282 atgtctatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 3339226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 148 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 12776590 - 12776534
Alignment:
Q  148 atgtttatgccttttacttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 204  Q
    |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12776590 atgtctatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 12776534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 148 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 13136266 - 13136210
Alignment:
Q  148 atgtttatgccttttacttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 204  Q
    |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13136266 atgtctatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 13136210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 148 - 204
Target Start/End: Original strand, 20584262 - 20584318
Alignment:
Q  148 atgtttatgccttttacttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 204  Q
    |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20584262 atgtctatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 20584318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 153 - 204
Target Start/End: Original strand, 15946773 - 15946824
Alignment:
Q  153 tatgccttttacttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 204  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15946773 tatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 15946824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 141 - 196
Target Start/End: Original strand, 17045847 - 17045902
Alignment:
Q  141 tgctactatgtttatgccttttacttgaggacaagcaaagattcaagtgtggggga 196  Q
    ||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17045847 tgctactatttttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtggggga 17045902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 141 - 196
Target Start/End: Original strand, 17048007 - 17048062
Alignment:
Q  141 tgctactatgtttatgccttttacttgaggacaagcaaagattcaagtgtggggga 196  Q
    ||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17048007 tgctactatttttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtggggga 17048062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 146 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 14445826 - 14445768
Alignment:
Q  146 ctatgtttatgccttttacttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 204  Q
    |||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14445826 ctatgtctatgccttttgctttaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 14445768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 148 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 15619339 - 15619283
Alignment:
Q  148 atgtttatgccttttacttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 204  Q
    |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  15619339 atgtctatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtggggcagtttgatg 15619283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 148 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 13195514 - 13195458
Alignment:
Q  148 atgtttatgccttttacttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 204  Q
    |||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  13195514 atgtctatgcattttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgtgggagtttgatg 13195458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 149 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 8686442 - 8686387
Alignment:
Q  149 tgtttatgccttttacttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 204  Q
    ||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  8686442 tgtttatgctttttgtttgaggacaagcaaagattcaagtatgggggagtttgatg 8686387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 141 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 20225817 - 20225754
Alignment:
Q  141 tgctactatgtttatgccttttacttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 204  Q
    |||| ||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||    
T  20225817 tgctgctatgtttatgtcttttgcttgaggacaaacaaagatttaagtatgggggagtttgatg 20225754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 165 - 204
Target Start/End: Original strand, 13068318 - 13068357
Alignment:
Q  165 ttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 204  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  13068318 ttgaggacaagtaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 13068357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 173 - 204
Target Start/End: Original strand, 2005499 - 2005530
Alignment:
Q  173 aagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 204  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2005499 aagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 2005530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 161; Significance: 5e-86; HSPs: 32)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 161; E-Value: 5e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 204
Target Start/End: Original strand, 22665068 - 22665277
Alignment:
Q  1 tcacacacacactcacttgaaacttgaccgttgggctgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaagcccttg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22665068 tcacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaagcccttg 22665167  T
Q  101 aggagacatgtgctttaattgaaattgtc-------ataactgttagtgctactatgtttatgccttttacttgaggacaagcaaagattcaagtgtggg 193  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||       ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22665168 aggagacatgtgctttaattg-aattgtcatttgatataactgttggtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtggg 22665266  T
Q  194 ggagtttgatg 204  Q
    |||||||||||    
T  22665267 ggagtttgatg 22665277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 1 - 204
Target Start/End: Original strand, 117549 - 117758
Alignment:
Q  1 tcacacacacactcacttgaaacttgaccgttgggctgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaagcccttg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  117549 tcacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaagcccttg 117648  T
Q  101 aggagacatgtgctttaattgaaattgtcat-------aactgttagtgctactatgtttatgccttttacttgaggacaagcaaagattcaagtgtggg 193  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||||       || |||| | ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||||||||    
T  117649 aggagacatgtgctttaatcg-aattgtcatttgataaaattgtttgagctactacgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaatatgcaagtgtggg 117747  T
Q  194 ggagtttgatg 204  Q
    |||||||||||    
T  117748 ggagtttgatg 117758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 1 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 22044869 - 22044660
Alignment:
Q  1 tcacacacacactcacttgaaacttgaccgttgggctgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaagcccttg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22044869 tcacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggtagaataaagatttcaagaaatacttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaagcccttg 22044770  T
Q  101 aggagacatgtgctttaattgaaattgtca-------taactgttagtgctactatgtttatgccttttacttgaggacaagcaaagattcaagtgtggg 193  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||       ||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  22044769 aggagacatgtgctttaatt-aaattgtcatttgatttaactgttgatgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtatggg 22044671  T
Q  194 ggagtttgatg 204  Q
    |||||||||||    
T  22044670 ggagtttgatg 22044660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 1 - 204
Target Start/End: Original strand, 25357517 - 25357726
Alignment:
Q  1 tcacacacacactcacttgaaacttgaccgttgggctgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaagcccttg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25357517 tcacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggtagaataaagatttcaagaaatacttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaagcccttg 25357616  T
Q  101 aggagacatgtgctttaattgaaattgtca-------taactgttagtgctactatgtttatgccttttacttgaggacaagcaaagattcaagtgtggg 193  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||       ||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  25357617 aggagacatgtgctttaatt-aaattgtcatttgatttaactgttgatgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtatggg 25357715  T
Q  194 ggagtttgatg 204  Q
    |||||||||||    
T  25357716 ggagtttgatg 25357726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 129; E-Value: 6e-67
Query Start/End: Original strand, 1 - 204
Target Start/End: Original strand, 16775657 - 16775866
Alignment:
Q  1 tcacacacacactcacttgaaacttgaccgttgggctgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaagcccttg 100  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| |||||||  ||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16775657 tcacacacacactcacttaaaacttgatcgttgggtagaataaagatttcaagaaatacttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaagcccttg 16775756  T
Q  101 aggagacatgtgctttaattgaaattgtca-------taactgttagtgctactatgtttatgccttttacttgaggacaagcaaagattcaagtgtggg 193  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||       ||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  16775757 aggagacatgtgctttaatt-taattgtcatttgatttaactgttgatgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtatggg 16775855  T
Q  194 ggagtttgatg 204  Q
    |||||||||||    
T  16775856 ggagtttgatg 16775866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 2 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 11823 - 11615
Alignment:
Q  2 cacacacacactcacttgaaacttgaccgttgggctgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaagcccttga 101  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11823 cacacacacactcacttaaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaagcccttga 11724  T
Q  102 ggagacatgtgctttaattgaaattgtcat-------aactgttagtgctactatgtttatgccttttacttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggg 194  Q
    ||||| |||||||||||| | |||||||||       || |||| | ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  11723 ggagatatgtgctttaatcg-aattgtcatttgataaaattgtttgagctactacgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagaggcaagtgtgggg 11625  T
Q  195 gagtttgatg 204  Q
    ||||||||||    
T  11624 gagtttgatg 11615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 1 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 24795494 - 24795285
Alignment:
Q  1 tcacacacacactcacttgaaacttgaccgttgggctgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaagcccttg 100  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| |||||||  ||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24795494 tcacacacacactcacttaaaacttgatcgttgggtagaataaagatttcaagaaatacttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaagcccttg 24795395  T
Q  101 aggagacatgtgctttaattgaaattgtca-------taactgttagtgctactatgtttatgccttttacttgaggacaagcaaagattcaagtgtggg 193  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||       |||||| |  || ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  24795394 aggagacatgtgctttaatt-aaattgtcatttgatttaactgctgatggtactacgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtatggg 24795296  T
Q  194 ggagtttgatg 204  Q
    |||||||||||    
T  24795295 ggagtttgatg 24795285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 117; E-Value: 9e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 204
Target Start/End: Original strand, 17590413 - 17590622
Alignment:
Q  1 tcacacacacactcacttgaaacttgaccgttgggctgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaagcccttg 100  Q
    ||||| |||||||||||| |||||||| |||||||  ||||| | ||| | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17590413 tcacatacacactcacttaaaacttgatcgttgggtagaatagagatttccagaaatacttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaagcccttg 17590512  T
Q  101 aggagacatgtgctttaattgaaattgtca-------taactgttagtgctactatgtttatgccttttacttgaggacaagcaaagattcaagtgtggg 193  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||       ||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  17590513 aggagacatgtgctttaatt-taattgtcatttgatttaactgttgctgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtatggg 17590611  T
Q  194 ggagtttgatg 204  Q
    |||||||||||    
T  17590612 ggagtttgatg 17590622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 114; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 204
Target Start/End: Original strand, 27627586 - 27627796
Alignment:
Q  1 tcacacacacactcacttgaaacttgaccgttgggctgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtaca-tttgggatttaagccctt 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||    
T  27627586 tcacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggtagaataaagatttcaagaaatacttgagtttgtgattaatgtacattttaggatttaagccctt 27627685  T
Q  100 gaggagacatgtgctttaattgaaattgtcat-------aactgttagtgctactatgtttatgccttttacttgaggacaagcaaagattcaagtgtgg 192  Q
    ||||||||||||||||||||| || |||||||       ||||||   |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||    
T  27627686 gaggagacatgtgctttaatt-aatttgtcatttgattcaactgtcgatgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtatgg 27627784  T
Q  193 gggagtttgatg 204  Q
    ||||||||||||    
T  27627785 gggagtttgatg 27627796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 105; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 2 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 25144966 - 25144757
Alignment:
Q  2 cacacacacactcacttgaaacttgaccgttgggctgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaagcccttga 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||  ||| ||||||||||    
T  25144966 cacacacacactcacttgaaacttgattgttgggttgaataaggtttacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacgcttgaaattgaagcccttga 25144867  T
Q  102 ggagacatgtgctttaattgaaattgtcata-------actg-ttagtgctactatgtttatgccttttacttgaggacaagcaaagattcaagtgtggg 193  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||||||||       | || || ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25144866 ggagacatgtgttttaatt-aaattgtcatatgataatattgttttgtgctaccatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtggg 25144768  T
Q  194 ggagtttgatg 204  Q
    |||||||||||    
T  25144767 ggagtttgatg 25144757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 3 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 5500473 - 5500265
Alignment:
Q  3 acacacacactcacttgaaacttgaccgttgggctgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaagcccttgag 102  Q
    |||||||||||||||||||||||||  |||| | |||||||   ||||  ||||||||||||||||||||||||||||  |||  ||| |||||||||||    
T  5500473 acacacacactcacttgaaacttgattgttgagttgaataaggtttacgtgaaatgcttgagtttgtgattagtgtacgcttgaaattgaagcccttgag 5500374  T
Q  103 gagacatgtgctttaattgaaattgtcata-------actg-ttagtgctactatgtttatgccttttacttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggg 194  Q
    |||||||||| ||||||| |||||||||||       | || || ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5500373 gagacatgtgttttaatt-aaattgtcatatgataatattgttttgtgctaccatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggg 5500275  T
Q  195 gagtttgatg 204  Q
    ||||||||||    
T  5500274 gagtttgatg 5500265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 2 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 25804475 - 25804267
Alignment:
Q  2 cacacacacactcacttgaaacttgaccgttgggctgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaagcccttga 101  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||||  |||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||   |  ||||| ||||    
T  25804475 cacacgcacactcacttgaaatttgattgttgggttgaataaagattacaagaaatgcttgaatttgtgattagtgtacgcttgaattaaaagcctttga 25804376  T
Q  102 ggagacatgtgctttaattgaaattgtcataact-------gttagtgctactatgtttatgccttttacttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggg 194  Q
    ||| ||||  | |||||||||| ||||||||  |       ||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25804375 ggatacataagttttaattgaa-ttgtcatatgttaatcttgtttgtgctgctatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggg 25804277  T
Q  195 gagtttgatg 204  Q
    ||||||||||    
T  25804276 gagtttgatg 25804267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 4 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 25371091 - 25370890
Alignment:
Q  4 cacacacactcacttgaaacttgaccgttgggctgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaagcccttgagg 103  Q
    |||||||||||||||  |||||||  |||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||  |||  ||| ||||| ||||||    
T  25371091 cacacacactcacttagaacttgattgttgggttgaataaagattataagaaatgcttgagtttgtaattagtgtacgcttgaaattaaagcctttgagg 25370992  T
Q  104 agacatgtgctttaattgaaattgtcata------actg-ttagtgctactatgtttatgccttttacttgaggacaagcaaagattcaagtgtggggga 196  Q
    ||||||| | ||| |||| ||||||||||       ||| ||| || ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25370991 agacatgagttttgattg-aattgtcatatataatcctgtttattgttactatgtttatgtcttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtggggga 25370893  T
Q  197 gtt 199  Q
    |||    
T  25370892 gtt 25370890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 3 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 23799129 - 23798922
Alignment:
Q  3 acacacacactcacttgaaacttgaccgttgggctgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaagcccttgag 102  Q
    ||||||||||||||||  |||||||  |||||| ||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||  ||  ||||| |||||    
T  23799129 acacacacactcacttagaacttgattgttgggttgaataaaggatacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacgcttgaaataaaagcctttgag 23799030  T
Q  103 gagacatgtgctttaattgaaattgtcataactg-------ttagtgctactatgtttatgccttttacttgaggacaagcaaagattcaagtgtggggg 195  Q
    |||||||| | ||| |||||| ||||||||  |        ||  |||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  23799029 gagacatgagttttgattgaa-ttgtcatatgtaatcttgttttatgctactatgtttatgccttttgcttgaggataatcaaagattcaagtgtggggg 23798931  T
Q  196 agtttgatg 204  Q
    |||||||||    
T  23798930 agtttgatg 23798922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 2 - 85
Target Start/End: Original strand, 24502168 - 24502251
Alignment:
Q  2 cacacacacactcacttgaaacttgaccgttgggctgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttg 85  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  24502168 cacacacacactcacttgaaacttgattgttgggttgaataaagattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacgtttg 24502251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 46 - 204
Target Start/End: Original strand, 23643994 - 23644160
Alignment:
Q  46 attacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacat-ttgggatttaagcccttgaggagacatgtgctttaattgaaattgtcata----actgttag 140  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||   |||  ||  ||||| ||||||||||| ||||||||||| || ||||||||    | |||||     
T  23643994 attacaggaaatgcttgagtttgtgattagtgtactccttgaaataaaagcctttgaggagacacgtgctttaatttaa-ttgtcatatgataatgttat 23644092  T
Q  141 t----gctactatgtttatgccttttacttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 204  Q
    |    ||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23644093 tttatgctaccatgtttatgtcttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 23644160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 148 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 23159441 - 23159385
Alignment:
Q  148 atgtttatgccttttacttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 204  Q
    |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23159441 atgtctatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 23159385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 148 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 23570698 - 23570642
Alignment:
Q  148 atgtttatgccttttacttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 204  Q
    |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23570698 atgtctatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 23570642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 148 - 204
Target Start/End: Original strand, 27631655 - 27631711
Alignment:
Q  148 atgtttatgccttttacttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 204  Q
    |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27631655 atgtctatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 27631711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 148 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 27768872 - 27768816
Alignment:
Q  148 atgtttatgccttttacttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 204  Q
    |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27768872 atgtctatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 27768816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 153 - 204
Target Start/End: Original strand, 24171510 - 24171561
Alignment:
Q  153 tatgccttttacttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 204  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24171510 tatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 24171561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 141 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 24178256 - 24178193
Alignment:
Q  141 tgctactatgtttatgccttttacttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 204  Q
    |||| |||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24178256 tgctgctatgtttatgccttttgtttgaagacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 24178193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 141 - 204
Target Start/End: Original strand, 24506802 - 24506865
Alignment:
Q  141 tgctactatgtttatgccttttacttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 204  Q
    |||| ||||||||||| ||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  24506802 tgctgctatgtttatgtcttttgcttgaggacaataaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 24506865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 141 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 25337714 - 25337651
Alignment:
Q  141 tgctactatgtttatgccttttacttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 204  Q
    |||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  25337714 tgctgctatatttatgcctttttcttgaggacaagcaaagattcaagtatgggggaatttgatg 25337651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 148 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 23257625 - 23257570
Alignment:
Q  148 atgtttatgccttttacttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 204  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  23257625 atgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtat-ggggagtttgatg 23257570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 148 - 200
Target Start/End: Original strand, 24321328 - 24321380
Alignment:
Q  148 atgtttatgccttttacttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagttt 200  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  24321328 atgtttacgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtatgggggagttt 24321380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 143 - 185
Target Start/End: Original strand, 23648123 - 23648165
Alignment:
Q  143 ctactatgtttatgccttttacttgaggacaagcaaagattca 185  Q
    ||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||    
T  23648123 ctactatgtctatgcattttgcttgaggacaagcaaagattca 23648165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 157 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 25582814 - 25582768
Alignment:
Q  157 ccttttacttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgat 203  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||| ||||||||    
T  25582814 ccttttacttgaggacaagcaaggattcaagcatggggcagtttgat 25582768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 158 - 203
Target Start/End: Original strand, 29955868 - 29955913
Alignment:
Q  158 cttttacttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgat 203  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||    
T  29955868 cttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtatcgggaagtttgat 29955913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 155 - 187
Target Start/End: Original strand, 15532917 - 15532949
Alignment:
Q  155 tgccttttacttgaggacaagcaaagattcaag 187  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  15532917 tgccttttacttgaggacaagcaaatattcaag 15532949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 159 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 19805662 - 19805618
Alignment:
Q  159 ttttacttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgat 203  Q
    |||| ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||    
T  19805662 ttttgcttgaggacaagcaatggttctagtgtgggggagtttgat 19805618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 155 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 21512615 - 21512567
Alignment:
Q  155 tgccttttacttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgat 203  Q
    |||||||| ||||||||||||||| ||||||||  ||||||| ||||||    
T  21512615 tgccttttgcttgaggacaagcaaggattcaagcatgggggaatttgat 21512567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0230 (Bit Score: 157; Significance: 1e-83; HSPs: 1)
Name: scaffold0230
Description:

Target: scaffold0230; HSP #1
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 204
Target Start/End: Original strand, 15684 - 15893
Alignment:
Q  1 tcacacacacactcacttgaaacttgaccgttgggctgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaagcccttg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  15684 tcacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgagatttaagcccttg 15783  T
Q  101 aggagacatgtgctttaattgaaattgtcat-------aactgttagtgctactatgtttatgccttttacttgaggacaagcaaagattcaagtgtggg 193  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||       ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15784 aggagacatgtgctttaattg-aattgtcatttgataaaactgtttgtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtggg 15882  T
Q  194 ggagtttgatg 204  Q
    |||||||||||    
T  15883 ggagtttgatg 15893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 157; Significance: 1e-83; HSPs: 29)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 20596040 - 20595831
Alignment:
Q  1 tcacacacacactcacttgaaacttgaccgttgggctgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaagcccttg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20596040 tcacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaagcccttg 20595941  T
Q  101 aggagacatgtgctttaattgaaattgtc-------ataactgttagtgctactatgtttatgccttttacttgaggacaagcaaagattcaagtgtggg 193  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||       ||||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20595940 aggagacatgtgctttaattg-aattgtcatttgatataaccgtttgtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtggg 20595842  T
Q  194 ggagtttgatg 204  Q
    |||||||||||    
T  20595841 ggagtttgatg 20595831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 20602326 - 20602117
Alignment:
Q  1 tcacacacacactcacttgaaacttgaccgttgggctgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaagcccttg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20602326 tcacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaagcccttg 20602227  T
Q  101 aggagacatgtgctttaattgaaattgtc-------ataactgttagtgctactatgtttatgccttttacttgaggacaagcaaagattcaagtgtggg 193  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||       ||||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20602226 aggagacatgtgctttaattg-aattgtcatttgatataaccgtttgtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtggg 20602128  T
Q  194 ggagtttgatg 204  Q
    |||||||||||    
T  20602127 ggagtttgatg 20602117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 20608617 - 20608408
Alignment:
Q  1 tcacacacacactcacttgaaacttgaccgttgggctgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaagcccttg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20608617 tcacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaagcccttg 20608518  T
Q  101 aggagacatgtgctttaattgaaattgtc-------ataactgttagtgctactatgtttatgccttttacttgaggacaagcaaagattcaagtgtggg 193  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||       ||||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20608517 aggagacatgtgctttaattg-aattgtcatttgatataaccgtttgtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtggg 20608419  T
Q  194 ggagtttgatg 204  Q
    |||||||||||    
T  20608418 ggagtttgatg 20608408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 149; E-Value: 8e-79
Query Start/End: Original strand, 1 - 204
Target Start/End: Original strand, 15735540 - 15735749
Alignment:
Q  1 tcacacacacactcacttgaaacttgaccgttgggctgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaagcccttg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  15735540 tcacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaacacttgagtttgtgattagtgtacacttgggatttaagcccttg 15735639  T
Q  101 aggagacatgtgctttaattgaaattgtc-------ataactgttagtgctactatgtttatgccttttacttgaggacaagcaaagattcaagtgtggg 193  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||       ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15735640 aggagacatgtgctttaattg-aattgtcatttgatataactgttggtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtggg 15735738  T
Q  194 ggagtttgatg 204  Q
    |||||||||||    
T  15735739 ggagtttgatg 15735749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 144; E-Value: 7e-76
Query Start/End: Original strand, 1 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 23710886 - 23710701
Alignment:
Q  1 tcacacacacactcacttgaaacttgaccgttgggctgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaagcccttg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23710886 tcacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttaaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaagcccttg 23710787  T
Q  101 aggagacatgtgctttaattgaaattgtc-------ataactgttagtgctactatgtttatgccttttacttgaggacaagcaaa 179  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||       ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  23710786 aggagacatgtgctttaattgaaattgtcatttgatataactgttagtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaa 23710701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 129; E-Value: 6e-67
Query Start/End: Original strand, 1 - 204
Target Start/End: Original strand, 23748057 - 23748266
Alignment:
Q  1 tcacacacacactcacttgaaacttgaccgttgggctgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaagcccttg 100  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| |||||||  ||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23748057 tcacacacacactcacttaaaacttgatcgttgggtagaataaagatttcaagaaatacttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaagcccttg 23748156  T
Q  101 aggagacatgtgctttaattgaaattgtca-------taactgttagtgctactatgtttatgccttttacttgaggacaagcaaagattcaagtgtggg 193  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||       ||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  23748157 aggagacatgtgctttaatt-taattgtcatttgatttaactgttgatgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtatggg 23748255  T
Q  194 ggagtttgatg 204  Q
    |||||||||||    
T  23748256 ggagtttgatg 23748266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 2 - 204
Target Start/End: Original strand, 24940540 - 24940749
Alignment:
Q  2 cacacacacactcacttgaaacttgaccgttgggctgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtaca-tttgggatttaagcccttg 100  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| |||||||  ||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||    
T  24940540 cacacactcactcacttgaaacttgatcgttgggtagaataaagatttcaagaaatacttgagtttgtgattagtttacattttgggatttaagcccttg 24940639  T
Q  101 aggagacatgtgctttaattgaaattgtca-------taactgttagtgctactatgtttatgccttttacttgaggacaagcaaagattcaagtgtggg 193  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||       ||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  24940640 aggagacatgtgctttaatt-aaattgtcatttgatttaactgttgatgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtatggg 24940738  T
Q  194 ggagtttgatg 204  Q
    |||||||||||    
T  24940739 ggagtttgatg 24940749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 115; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 204
Target Start/End: Original strand, 18072906 - 18073115
Alignment:
Q  1 tcacacacacactcacttgaaacttgaccgttgggctgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtaca-tttgggatttaagccctt 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |  ||||||  ||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  18072906 tcacacacacactcacttgaaacttaattgttgggtagaataaagatttcaagaaatacttgagtttgtgattagtgtacattttgggatttaagccctt 18073005  T
Q  100 gaggagacatgtgctttaattgaaattgtca-------taactgttagtgctactatgtttatgccttttacttgaggacaagcaaagattcaagtgtgg 192  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||       ||||| ||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||    
T  18073006 gaggagacatgtgctttaattg--attgtcatttgatttaactattgatgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtatgg 18073103  T
Q  193 gggagtttgatg 204  Q
    ||||||||||||    
T  18073104 gggagtttgatg 18073115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 115; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 24953383 - 24953174
Alignment:
Q  1 tcacacacacactcacttgaaacttgaccgttgggctgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtaca-tttgggatttaagccctt 99  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  ||||||  ||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  24953383 tcacacacacactcacttgaaacttgattgttgggtagaataaagatttcaagaaatacttgagtttgtgattagtgtacattttgggatttaagccctt 24953284  T
Q  100 gaggagacatgtgctttaattgaaattgtca-------taactgttagtgctactatgtttatgccttttacttgaggacaagcaaagattcaagtgtgg 192  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||||||       ||||| ||  ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||    
T  24953283 gaggagacatgtgctttaatt--aattgtcatttgatttaactattgatgctactatgtttataccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtatgg 24953186  T
Q  193 gggagtttgatg 204  Q
    ||||||||||||    
T  24953185 gggagtttgatg 24953174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 113; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 3 - 186
Target Start/End: Original strand, 20622170 - 20622359
Alignment:
Q  3 acacacacactcacttgaaacttgaccgttgggctgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaagcccttgag 102  Q
    |||||||||||||||| |||||||| |||||||  ||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20622170 acacacacactcacttaaaacttgatcgttgggtagaataaagatttcaagaaatacttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaagcccttgag 20622269  T
Q  103 gagacatgtgctttaattgaaattgtca-------taactgttagtgctactatgtttatgccttttacttgaggacaagcaaagattcaa 186  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||       ||| ||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  20622270 gagacatgtgctttaatt-aaattgtcatttgatttaattgttgatgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaa 20622359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 20790923 - 20790714
Alignment:
Q  1 tcacacacacactcacttgaaacttgaccgttgggctgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtaca-tttgggatttaagccctt 99  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||  ||| ||  ||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  20790923 tcacacacacactcgcttgaaacttgattgttaggtagaataaagatttcaagaaatacttgagtttgtgattagtgtacattttgggattaaagccctt 20790824  T
Q  100 gaggagacatgtgctttaattgaaattgtca-------taactgttagtgctactatgtttatgccttttacttgaggacaagcaaagattcaagtgtgg 192  Q
    |||||||||||||||||||||  || |||||       ||||| ||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||    
T  20790823 gaggagacatgtgctttaatt--aactgtcatttgatttaactattgatgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtatgg 20790726  T
Q  193 gggagtttgatg 204  Q
    ||||||||||||    
T  20790725 gggagtttgatg 20790714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 101; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 2 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 23600845 - 23600636
Alignment:
Q  2 cacacacacactcacttgaaacttgaccgttgggctgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaagcccttga 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||  ||||||||||||||    
T  23600845 cacacacacactcacttgaaacttgattgttgggttgaataaggtttacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacgcttgaaatttaagcccttga 23600746  T
Q  102 ggagacatgtgctttaattgaaattgtcata-------actgt-tagtgctactatgtttatgccttttacttgaggacaagcaaagattcaagtgtggg 193  Q
    ||||||||||| | ||||| |||||||||||       | ||| | ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23600745 ggagacatgtgttctaatt-aaattgtcatatgataatattgtcttgtgctaccatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtggg 23600647  T
Q  194 ggagtttgatg 204  Q
    ||| |||||||    
T  23600646 ggaatttgatg 23600636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 101; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 2 - 204
Target Start/End: Original strand, 24219752 - 24219961
Alignment:
Q  2 cacacacacactcacttgaaacttgaccgttgggctgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaagcccttga 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||  ||| ||||||||||    
T  24219752 cacacacacactcacttgaaacttgattgttgggttgaataaggtttacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacgcttgaaattgaagcccttga 24219851  T
Q  102 ggagacatgtgctttaattgaaattgtcata-------actg-ttagtgctactatgtttatgccttttacttgaggacaagcaaagattcaagtgtggg 193  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||||||||       | || || ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  24219852 ggagacatgtgttttaatt-aaattgtcatatgataatattgttttgtgctaccatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagactcaagtgtggg 24219950  T
Q  194 ggagtttgatg 204  Q
    |||||||||||    
T  24219951 ggagtttgatg 24219961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 97; E-Value: 8e-48
Query Start/End: Original strand, 2 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 20445048 - 20444843
Alignment:
Q  2 cacacacacactcacttgaaacttgaccgttgggctgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaagcccttga 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||  ||| ||||||||||    
T  20445048 cacacacacactcacttgaaacttgattgttgggttgaataaagtttacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacgcttgaaattgaagcccttga 20444949  T
Q  102 ggagacatgtgctttaattgaaattgtcata----actgtta----gtgctactatgtttatgccttttacttgaggacaagcaaagattcaagtgtggg 193  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||||||||    | | |||    ||||||| || |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  20444948 ggagacatgtgttttaatt-aaattgtcatatgataatattattttgtgctaccatatttatgccttttgcttgaggacaatcaaagattcaagtgtggg 20444850  T
Q  194 ggagttt 200  Q
    |||||||    
T  20444849 ggagttt 20444843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 16 - 204
Target Start/End: Original strand, 21387410 - 21387605
Alignment:
Q  16 cttgaaacttgaccgttgggctgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaagcccttgaggagacatgtgctt 115  Q
    ||||||||||||  |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||  ||  ||| | ||||||||||||  | ||    
T  21387410 cttgaaacttgattgttgggttgaataaagattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacgcttgaaatgaaagtctttgaggagacataagttt 21387509  T
Q  116 t-aattgaaattgtcataactgttagt---------gctactatgtttatgccttttacttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 204  Q
    | ||||||| ||||||||  |||||||         ||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21387510 tcaattgaa-ttgtcata--tgttagtcttgtgtgtgctgctatgtttatgcatttttcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 21387605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 2 - 80
Target Start/End: Original strand, 22948518 - 22948596
Alignment:
Q  2 cacacacacactcacttgaaacttgaccgttgggctgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtac 80  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22948518 cacacacacactcacttgaaacttgattgttgggttgaaaaaagattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtac 22948596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 6 - 110
Target Start/End: Complemental strand, 20916660 - 20916556
Alignment:
Q  6 cacacactcacttgaaacttgaccgttgggctgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaagcccttgaggag 105  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||  ||  ||||| ||||||||    
T  20916660 cacacactcacttgaaacttgattgttgggttgaataaagattacaagaaatgcttgagttcgtgattagtgtacggttgaaataaaagcctttgaggag 20916561  T
Q  106 acatg 110  Q
    |||||    
T  20916560 acatg 20916556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 3 - 123
Target Start/End: Original strand, 20575510 - 20575630
Alignment:
Q  3 acacacacactcacttgaaacttgaccgttgggctgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaagcccttgag 102  Q
    |||||| ||||||||||||||||||  || ||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||  ||  ||||| |||||    
T  20575510 acacacgcactcacttgaaacttgattgtcgggttgaataaagactacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacgcttgaaataaaagcctttgag 20575609  T
Q  103 gagacatgtgctttaattgaa 123  Q
    |||||||| | ||| ||||||    
T  20575610 gagacatgagttttgattgaa 20575630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 148 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 22317569 - 22317513
Alignment:
Q  148 atgtttatgccttttacttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 204  Q
    |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22317569 atgtctatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 22317513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 148 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 25006864 - 25006808
Alignment:
Q  148 atgtttatgccttttacttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 204  Q
    |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25006864 atgtctatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 25006808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 148 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 30759711 - 30759655
Alignment:
Q  148 atgtttatgccttttacttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 204  Q
    |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30759711 atgtctatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 30759655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 141 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 18484275 - 18484212
Alignment:
Q  141 tgctactatgtttatgccttttacttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 204  Q
    |||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  18484275 tgctgctatgtctatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgttggggagtttgatg 18484212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 154 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 25116221 - 25116171
Alignment:
Q  154 atgccttttacttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 204  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25116221 atgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 25116171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 148 - 204
Target Start/End: Original strand, 26847803 - 26847859
Alignment:
Q  148 atgtttatgccttttacttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 204  Q
    |||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26847803 atgtctatgccttttggttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 26847859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 159 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 25175306 - 25175261
Alignment:
Q  159 ttttacttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 204  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25175306 ttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 25175261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 148 - 200
Target Start/End: Original strand, 22855723 - 22855775
Alignment:
Q  148 atgtttatgccttttacttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagttt 200  Q
    |||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22855723 atgtctatgtcttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagttt 22855775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 159 - 203
Target Start/End: Original strand, 27270563 - 27270607
Alignment:
Q  159 ttttacttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgat 203  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  27270563 ttttgcttgaggacaagcaatgattcaagtgtgggggagtttgat 27270607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 146 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 20916514 - 20916456
Alignment:
Q  146 ctatgtttatgccttttacttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 204  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||| |||| ||||| |||| |||||||||||||    
T  20916514 ctatgtctatgccttttgcttgaggacaaccaaaaattcatgtgtaggggagtttgatg 20916456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 155 - 203
Target Start/End: Original strand, 17412736 - 17412784
Alignment:
Q  155 tgccttttacttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgat 203  Q
    |||||||| ||||| ||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  17412736 tgccttttgcttgacgacaaacaatgattcaagtatgggggagtttgat 17412784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 157; Significance: 1e-83; HSPs: 15)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 204
Target Start/End: Original strand, 27046880 - 27047089
Alignment:
Q  1 tcacacacacactcacttgaaacttgaccgttgggctgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaagcccttg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27046880 tcacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaagcccttg 27046979  T
Q  101 aggagacatgtgctttaattgaaattgtc-------ataactgttagtgctactatgtttatgccttttacttgaggacaagcaaagattcaagtgtggg 193  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||       ||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27046980 aggagacatgtgctttaattg-aattgtcatttgatataactgttggagctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtggg 27047078  T
Q  194 ggagtttgatg 204  Q
    |||||||||||    
T  27047079 ggagtttgatg 27047089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 141; E-Value: 4e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 17094810 - 17094601
Alignment:
Q  1 tcacacacacactcacttgaaacttgaccgttgggctgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaagcccttg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17094810 tcacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaagatttcaagaaatgcttaagtttgtgattagtgtacatttgggatttaagcccttg 17094711  T
Q  101 aggagacatgtgctttaattgaaattgtca-------taactgttagtgctactatgtttatgccttttacttgaggacaagcaaagattcaagtgtggg 193  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||       ||||| ||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17094710 aggagacatgtgctttaattg-aattgtcatttgaattaactattgatgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtggg 17094612  T
Q  194 ggagtttgatg 204  Q
    |||||||||||    
T  17094611 ggagtttgatg 17094601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 1 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 21798872 - 21798662
Alignment:
Q  1 tcacacacacactcacttgaaacttgaccgttgggctgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaagcccttg 100  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| |||||||  ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21798872 tcacacacacactcacttaaaacttgatcgttgggtagaataaaaatttcaagaaatacttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaagcccttg 21798773  T
Q  101 aggagacatgtgctttaattgaaattgtca-------taactgttagtgctactatgtttatgccttttacttgaggacaagcaaagattcaagtgtggg 193  Q
    |||||||||||||||||| |  ||||||||       ||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  21798772 aggagacatgtgctttaaatttaattgtcatttgatttaactgttgatgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtatggg 21798673  T
Q  194 ggagtttgatg 204  Q
    |||||||||||    
T  21798672 ggagtttgatg 21798662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 1 - 204
Target Start/End: Original strand, 20237462 - 20237671
Alignment:
Q  1 tcacacacacactcacttgaaacttgaccgttgggctgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaagcccttg 100  Q
    ||||||| |||||||||| || ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  20237462 tcacacaaacactcacttaaagcttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtggttagtgtacatttgggatttaagcccttg 20237561  T
Q  101 aggagacatgtgctttaattgaaattgtcat-------aactgttagtgctactatgtttatgccttttacttgaggacaagcaaagattcaagtgtggg 193  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||||       || | || ||||||||   |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20237562 aggagacatgtgctttaatcg-aattgtcatttgataaaattatttgtgctactgcatttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtggg 20237660  T
Q  194 ggagtttgatg 204  Q
    |||||||||||    
T  20237661 ggagtttgatg 20237671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 5 - 200
Target Start/End: Original strand, 8653126 - 8653327
Alignment:
Q  5 acacacactcacttgaaacttgaccgttgggctgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaagcccttgagga 104  Q
    |||||||| |||||  |||||||  |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||  ||| ||||| |||||||    
T  8653126 acacacacacacttagaacttgattgttgggttgaataaagattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacgcttgaaattaaagcctttgagga 8653225  T
Q  105 gacatgtgctttaattgaaattgtcataact-------gttagtgctactatgtttatgccttttacttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggag 197  Q
    |||||| | ||| |||| ||||||||||  |        ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8653226 gacatgagttttgattg-aattgtcatatataatcttgtttattgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggag 8653324  T
Q  198 ttt 200  Q
    |||    
T  8653325 ttt 8653327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 2 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 52938830 - 52938621
Alignment:
Q  2 cacacacacactcacttgaaacttgaccgttgggctgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaagcccttga 101  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||  |||||| |||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||  ||  ||||| ||||    
T  52938830 cacacacacactcacttaagacttgattgttgggttgaaaaaggattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtactcttgaaataaaagcctttga 52938731  T
Q  102 ggagacatgtgctttaattgaaattgtcata----actgttagt----gctactatgtttatgccttttacttgaggacaagcaaagattcaagtgtggg 193  Q
    ||||||||||| ||| ||| || ||||||||    | ||||  |    ||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52938730 ggagacatgtgatttgatttaa-ttgtcatatgataatgttgttttatgctaccatgattatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtggg 52938632  T
Q  194 ggagtttgatg 204  Q
    |||||||||||    
T  52938631 ggagtttgatg 52938621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 62; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 2 - 204
Target Start/End: Original strand, 3989944 - 3990154
Alignment:
Q  2 cacacacacactcacttgaaacttgaccgttgggctgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtaca-tttgggatttaagcccttg 100  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||  |||||| |||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||  ||  ||||| |||    
T  3989944 cacacacacactcacttaagacttgattgttgggttgaaaaaggattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgcactctttgaaataaaagcctttg 3990043  T
Q  101 aggagacatgtgctttaattgaaattgtcata----actgttagt----gctactatgtttatgccttttacttgaggacaagcaaagattcaagtgtgg 192  Q
    | |||||||||||||| ||| || ||||||||    | ||||  |    ||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||    
T  3990044 acgagacatgtgctttgatttaa-ttgtcatatgataatgttgttttatgctaccatgtttatgccttttgcttgaggacaaacaaagattcaagtatgg 3990142  T
Q  193 gggagtttgatg 204  Q
    ||||||||||||    
T  3990143 gggagtttgatg 3990154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 61; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 9 - 204
Target Start/End: Original strand, 19364043 - 19364244
Alignment:
Q  9 acactcacttgaaacttgaccgttgggctgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaagcccttgaggagaca 108  Q
    ||||||||||  |||| ||  |||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||  ||  ||||| |||||||||||    
T  19364043 acactcacttagaactggattgttgggttgaataaagactacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacgcttgaaataaaagcctttgaggagaca 19364142  T
Q  109 tgtgctttaattgaaattgtcataactg-------ttagtgctactatgtttatgccttttacttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttg 201  Q
    || | ||| |||||| ||||||||  |        ||  |||| |||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19364143 tgagttttgattgaa-ttgtcatatgtaatcttgttttatgctgctatgtctatgcattttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttg 19364241  T
Q  202 atg 204  Q
    |||    
T  19364242 atg 19364244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 131 - 204
Target Start/End: Original strand, 14070647 - 14070720
Alignment:
Q  131 taactgttagtgctactatgtttatgccttttacttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 204  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  14070647 taactgttgatgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtatgggggagtttgatg 14070720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 146 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 19875702 - 19875648
Alignment:
Q  146 ctatgtttatgccttttacttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagttt 200  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19875702 ctatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagttt 19875648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 141 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 21784535 - 21784472
Alignment:
Q  141 tgctactatgtttatgccttttacttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 204  Q
    |||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  21784535 tgctgctatgtctatgccttttgcttgaggacaagcaaatattcaagtgtgggggagtttgatg 21784472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 141 - 204
Target Start/End: Original strand, 4027832 - 4027895
Alignment:
Q  141 tgctactatgtttatgccttttacttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 204  Q
    |||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  4027832 tgctgctatgtctatgccttttgcttgaggaaaagcaaagattcaagggtgggggagtttgatg 4027895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 141 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 8947578 - 8947515
Alignment:
Q  141 tgctactatgtttatgccttttacttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 204  Q
    |||| |||||| |||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  8947578 tgctgctatgtctatgtcttttccttgaggacaagtaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 8947515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 148 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 16382631 - 16382578
Alignment:
Q  148 atgtttatgccttttacttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttg 201  Q
    |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  16382631 atgtttattccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtatgggggagtttg 16382578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 3 - 83
Target Start/End: Complemental strand, 21784677 - 21784598
Alignment:
Q  3 acacacacactcacttgaaacttgaccgttgggctgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatt 83  Q
    |||||||||||||||| | |||||   |||||| ||||||||  | ||||||||| |||||  ||||||||||||||||||    
T  21784677 acacacacactcacttaagacttgtt-gttgggttgaataaagttcacaagaaatacttgaagttgtgattagtgtacatt 21784598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0404 (Bit Score: 117; Significance: 9e-60; HSPs: 2)
Name: scaffold0404
Description:

Target: scaffold0404; HSP #1
Raw Score: 117; E-Value: 9e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 204
Target Start/End: Original strand, 1044 - 1253
Alignment:
Q  1 tcacacacacactcacttgaaacttgaccgttgggctgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaagcccttg 100  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||  ||||||  ||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1044 tcacacatacactcacttgaaacttgattgttgggtagaataaagatttcaagaaatacttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaagcccttg 1143  T
Q  101 aggagacatgtgctttaattgaaattgtca-------taactgttagtgctactatgtttatgccttttacttgaggacaagcaaagattcaagtgtggg 193  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||       |||||| |  |||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  1144 aggagacatgtgctttaatt-aaattgtcatttgatttaactgctgatgctactacgtttatgccttttgcttgaggaaaagcaaagattcaagtatggg 1242  T
Q  194 ggagtttgatg 204  Q
    |||||||||||    
T  1243 ggagtttgatg 1253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0404; HSP #2
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 141 - 204
Target Start/End: Original strand, 3461 - 3524
Alignment:
Q  141 tgctactatgtttatgccttttacttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 204  Q
    |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  3461 tgctactacgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtatgggggagtttgatg 3524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0215 (Bit Score: 114; Significance: 6e-58; HSPs: 1)
Name: scaffold0215
Description:

Target: scaffold0215; HSP #1
Raw Score: 114; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 825 - 615
Alignment:
Q  1 tcacacacacactcacttgaaa-cttgaccgttgggctgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaagccctt 99  Q
    |||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  825 tcacacacacactcacttaaaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaatccctt 726  T
Q  100 gaggagacatgtgctttaattgaaattgtcat-------aactgttagtgctactatgtttatgccttttacttgaggacaagcaaagattcaagtgtgg 192  Q
    |||||||| ||||||||||| | |||||| ||       || |||| ||||||| || ||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  725 gaggagacttgtgctttaatcg-aattgtgatttgataaaattgtttgtgctaccatatttatgctttttgctttaggacaagcaaagattcaagtgtgg 627  T
Q  193 gggagtttgatg 204  Q
    ||||||||||||    
T  626 gggagtttgatg 615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0113 (Bit Score: 100; Significance: 1e-49; HSPs: 1)
Name: scaffold0113
Description:

Target: scaffold0113; HSP #1
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 2 - 204
Target Start/End: Original strand, 220 - 428
Alignment:
Q  2 cacacacacactcacttgaaacttgaccgttgggctgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaagcccttga 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||   ||| ||||||||||    
T  220 cacacacacactcacttgaaacttgattgttgggttgaataaagattacaagaaatgcttcagtttgtgattagtgtacgctttaaattaaagcccttga 319  T
Q  102 ggagacatgtgctttaattgaaattgtcata-------actgttagtgctactatgtttatgccttttacttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggg 194  Q
    ||||||||||  ||||||| |||||||||||       | ||||  |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  320 ggagacatgtattttaatt-aaattgtcatacgataatattgtttatgctaccatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtatgggg 418  T
Q  195 gagtttgatg 204  Q
    ||||||||||    
T  419 gagtttgatg 428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0825 (Bit Score: 90; Significance: 1e-43; HSPs: 1)
Name: scaffold0825
Description:

Target: scaffold0825; HSP #1
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 5 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 3058 - 2852
Alignment:
Q  5 acacacactcacttgaaacttgaccgttgggctgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaagcccttgagga 104  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||  ||| |||||||| ||||    
T  3058 acacacactcacttgaaacttgattgttgggttgaataaggtttacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacacatgaaattaaagcccttaagga 2959  T
Q  105 gacatgtgctttaattgaaattgtcata-------actg-ttagtgctactatgtttatgccttttacttgaggacaagcaaagattcaagtgtggggga 196  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||||       | || || ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||    
T  2958 gacatgtgttttaatt-aaattgtcatatgataatattgttttgtgctaccatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtatgtggga 2860  T
Q  197 gtttgatg 204  Q
    ||||||||    
T  2859 gtttgatg 2852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0156 (Bit Score: 86; Significance: 3e-41; HSPs: 1)
Name: scaffold0156
Description:

Target: scaffold0156; HSP #1
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 2 - 204
Target Start/End: Original strand, 831 - 1041
Alignment:
Q  2 cacacacacactcacttgaaacttgaccgttgggctgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtaca-tttgggatttaagcccttg 100  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||  |||||| |||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||  ||  ||||| |||    
T  831 cacacacacactcacttaagacttgattgttgggttgaaaaaggattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtactctttgaaataaaagcctttg 930  T
Q  101 aggagacatgtgctttaattgaaattgtcata----actgttagt----gctactatgtttatgccttttacttgaggacaagcaaagattcaagtgtgg 192  Q
    |||||||||||||||||||| || ||||||||    | ||||| |    ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  931 aggagacatgtgctttaatttaa-ttgtcatatgataatgttaatttatgctaccatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgg 1029  T
Q  193 gggagtttgatg 204  Q
    ||||||||||||    
T  1030 gggagtttgatg 1041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004 (Bit Score: 85; Significance: 1e-40; HSPs: 1)
Name: scaffold0004
Description:

Target: scaffold0004; HSP #1
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 2 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 252079 - 251870
Alignment:
Q  2 cacacacacactcacttgaaacttgaccgttgggctgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaagcccttga 101  Q
    |||||||||||||||||| |||||||  |||||| |||||||   ||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||  ||| ||||||||||    
T  252079 cacacacacactcacttggaacttgattgttgggttgaataaggtttacaagaaatgcttgagtttgtgactagtgtacgcttgaaattaaagcccttga 251980  T
Q  102 ggagacatgtgctttaattgaaattgtcata-------actg-ttagtgctactatgtttatgccttttacttgaggacaagcaaagattcaagtgtggg 193  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||||| |       | || || ||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  251979 ggagacatgtgttttaatt-aaattgtcaaatgataatattgttttgtgctaccatgtttatgccatttgcttgaggacaagtaaagattcaagtgtggg 251881  T
Q  194 ggagtttgatg 204  Q
    |||||||||||    
T  251880 ggagtttgatg 251870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026 (Bit Score: 84; Significance: 5e-40; HSPs: 1)
Name: scaffold0026
Description:

Target: scaffold0026; HSP #1
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 10 - 204
Target Start/End: Original strand, 11064 - 11264
Alignment:
Q  10 cactcacttgaaacttgaccgttgggctgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaagcccttgaggagacat 109  Q
    |||||||||||||||| |   ||||| |||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||   ||| ||||||||||||||||||    
T  11064 cactcacttgaaacttaatttttgggttgaataaggtttacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacgcttaaaattaaagcccttgaggagacat 11163  T
Q  110 gtgctttaattgaaattgtcata-------actgttagtgctactatgtttatgccttttacttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttga 202  Q
    ||| ||||||| |||||||||||       | ||||  |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  11164 gtgttttaatt-aaattgtcatatgataatattgtttatgctaccatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtatgggggagtttga 11262  T
Q  203 tg 204  Q
    ||    
T  11263 tg 11264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0020 (Bit Score: 84; Significance: 5e-40; HSPs: 1)
Name: scaffold0020
Description:

Target: scaffold0020; HSP #1
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 3 - 204
Target Start/End: Original strand, 120954 - 121162
Alignment:
Q  3 acacacacactcacttgaaacttgaccgttgggctgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaagcccttgag 102  Q
    |||||||||| |||||| ||||||   |||||| |||||||   ||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||  ||| |||||||||||    
T  120954 acacacacacacacttggaacttggttgttgggttgaataaggtttacaagaaatacttgagtttgtgattagtgtacgcttgaaattaaagcccttgag 121053  T
Q  103 gagacatgtgctttaattgaaattgtcata----actgtta----gtgctactatgtttatgccttttacttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggg 194  Q
    |||||||||| || |||| |||||||||||    | | |||    ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  121054 gagacatgtgtttcaatt-aaattgtcatataaaaatattattttgtgctaccatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggg 121152  T
Q  195 gagtttgatg 204  Q
    ||||||||||    
T  121153 gagtttgatg 121162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0679 (Bit Score: 81; Significance: 3e-38; HSPs: 1)
Name: scaffold0679
Description:

Target: scaffold0679; HSP #1
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 2 - 204
Target Start/End: Original strand, 7941 - 8149
Alignment:
Q  2 cacacacacactcacttgaaacttgaccgttgggctgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaagcccttga 101  Q
    |||||||||||||| |||||||||||  |||||| |||| ||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||| ||||| ||||    
T  7941 cacacacacactcatttgaaacttgattgttgggttgaaaaaggattacaagaaatgctcgagtttgtgattagtgtacatttgaaattaaagcctttga 8040  T
Q  102 ggagacatgtgctttaattgaaat----tgtcataa--ctgttagtgctactatgtttatgccttttacttgaggacaagcaaagattcaagtgtggggg 195  Q
     |||||||||| |||| || ||||    ||| || |   ||||  ||||||  |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  8041 agagacatgtgttttagttaaaatgtcatgtaatgatcttgtttatgctaccgtgtttatgccttttgcttgaagacaagcaaagattcaagtgtggggg 8140  T
Q  196 agtttgatg 204  Q
    |||||||||    
T  8141 agtttgatg 8149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0506 (Bit Score: 81; Significance: 3e-38; HSPs: 1)
Name: scaffold0506
Description:

Target: scaffold0506; HSP #1
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 2 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 2496 - 2287
Alignment:
Q  2 cacacacacactcacttgaaacttgaccgttgggctgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaagcccttga 101  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||  |||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||  ||  ||||| ||||    
T  2496 cacacacacactcacttaagacttgattgttgggttgaaaaaagattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtactcttgaaataaaagcctttga 2397  T
Q  102 ggagacatgtgctttaattgaaattgtcata----actg----ttagtgctactatgtttatgccttttacttgaggacaagcaaagattcaagtgtggg 193  Q
    ||||||||||||||| |||  ||||||||||    | ||    ||  |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  2396 ggagacatgtgctttgatt-taattgtcatatgataatgttgttttatgctaccatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtatggg 2298  T
Q  194 ggagtttgatg 204  Q
    |||||||||||    
T  2297 ggagtttgatg 2287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0315 (Bit Score: 79; Significance: 4e-37; HSPs: 1)
Name: scaffold0315
Description:

Target: scaffold0315; HSP #1
Raw Score: 79; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 3 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 14869 - 14662
Alignment:
Q  3 acacacacactcacttgaaacttgaccgttgggctgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaagcccttgag 102  Q
    |||||||||||||||||||||||||  |||||| |  ||||   ||||||||||||||||||||| ||| || |||||  |||  ||| |||||||||||    
T  14869 acacacacactcacttgaaacttgattgttgggtttcataaggtttacaagaaatgcttgagtttatgaataatgtacgcttgaaattaaagcccttgag 14770  T
Q  103 gagacatgtgctttaattgaaattgtcata-------actgttagtgctactatgtttatgccttttacttgaggacaagcaaagattcaagtgtggggg 195  Q
    |||||||||| ||||||| ||||| |||||       | ||||  |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  14769 gagacatgtgttttaatt-aaattttcatatgataatattgtttatgctaccatgtttatgcctttttcttgaggacaagcaaagattcaagtatggggg 14671  T
Q  196 agtttgatg 204  Q
    |||||||||    
T  14670 agtttgatg 14662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034 (Bit Score: 78; Significance: 2e-36; HSPs: 1)
Name: scaffold0034
Description:

Target: scaffold0034; HSP #1
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 2 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 58838 - 58628
Alignment:
Q  2 cacacacacactcacttgaaacttgaccgttgggctgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtaca-tttgggatttaagcccttg 100  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||  |||||| |||| ||  |||| |||||||| |||||||||||||||||||||  ||||  ||  ||||  |||    
T  58838 cacacacacactcacttaagacttgattgttgggttgaaaaaggattataagaaatggttgagtttgtgattagtgtactctttgaaataaaagcatttg 58739  T
Q  101 aggagacatgtgctttaattgaaattgtcata----actgttagt----gctactatgtttatgccttttacttgaggacaagcaaagattcaagtgtgg 192  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||||||||    | ||||| |    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  58738 aggagacatgtgctttaat-gtaattgtcatatgataatgttattttatgctaccatgtttatgccttttacttgaggacaagcaaagattcaagtgtgg 58640  T
Q  193 gggagtttgatg 204  Q
    ||||||||||||    
T  58639 gggagtttgatg 58628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0974 (Bit Score: 70; Significance: 1e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0974
Description:

Target: scaffold0974; HSP #1
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 2 - 204
Target Start/End: Original strand, 1108 - 1318
Alignment:
Q  2 cacacacacactcacttgaaacttgaccgttgggctgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtaca-tttgggatttaagcccttg 100  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||  |||||| |||| ||  |||| |||||||||||||||||||||||| |||||  ||||  ||  ||||| |||    
T  1108 cacacacacactcacttaagacttgattgttgggttgaaaaaggattataagaaatgcttgagtttgtgattaatgtactctttgaaataaaagcctttg 1207  T
Q  101 aggagacatgtgctttaattgaaattgtcata----actgttagt----gctactatgtttatgccttttacttgaggacaagcaaagattcaagtgtgg 192  Q
    ||| ||||||||| ||||| | ||||||||||    | ||||| |    ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  1208 aggggacatgtgccttaat-gtaattgtcatatgataatgttattttatgctaccatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgg 1306  T
Q  193 gggagtttgatg 204  Q
    ||||||||||||    
T  1307 gggagtttgatg 1318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0032 (Bit Score: 70; Significance: 1e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0032
Description:

Target: scaffold0032; HSP #1
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 2 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 97936 - 97726
Alignment:
Q  2 cacacacacactcacttgaaacttgaccgttgggctgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtaca-tttgggatttaagcccttg 100  Q
    |||||||| |||||||| | ||||||  |||||| |||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||  ||  ||||  |||    
T  97936 cacacacatactcacttaagacttgattgttgggttgaaaaaggattataagaaatgcttgagtttgtgattagtgtactctttgaaataaaagcatttg 97837  T
Q  101 aggagacatgtgctttaattgaaattgtcata----actgttagt----gctactatgtttatgccttttacttgaggacaagcaaagattcaagtgtgg 192  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||||||||    | ||||| |    ||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  97836 aggagacatgtgctttaat-gtaattgtcatatgataatgttattttatgctaccatgtttatgccttttgctttaggacaagcaaagattcaagtgtgg 97738  T
Q  193 gggagtttgatg 204  Q
    ||||||||||||    
T  97737 gggagtttgatg 97726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0773 (Bit Score: 69; Significance: 4e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0773
Description:

Target: scaffold0773; HSP #1
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 5 - 204
Target Start/End: Original strand, 482 - 687
Alignment:
Q  5 acacacactcacttgaaacttgaccgttgggctgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaagcccttgagga 104  Q
    ||||||||||| |||||||||||  |||||| |||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||  ||  ||||  |||||||    
T  482 acacacactcatttgaaacttgattgttgggttgaataaagattacaaaaaatggttgagtttgtgattagtgtacacttgaaataaaagcttttgagga 581  T
Q  105 gacatgtgctttaattgaaattgtcata-------actgttagtgctactatgtttatgccttttacttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggag 197  Q
    |||||    |||||||| ||||||||||         ||||  |||| |||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  582 gacattaattttaattg-aattgtcatatgataatcttgtttatgctgctatgtttatacattttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggag 680  T
Q  198 tttgatg 204  Q
    |||||||    
T  681 tttgatg 687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011 (Bit Score: 67; Significance: 6e-30; HSPs: 3)
Name: scaffold0011
Description:

Target: scaffold0011; HSP #1
Raw Score: 67; E-Value: 6e-30
Query Start/End: Original strand, 52 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 164562 - 164403
Alignment:
Q  52 agaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaagcccttgaggagacatgtgctttaattgaaattgtcata-------actgtta-gtgc 143  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |  ||   ||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||       | ||||  ||||    
T  164562 agaaatgcttgagtttgtgattagtgtgcgctttaaattgaagcccttgaggagacatgtgttttaatt-aaattgtcatatgataatattgttttgtgc 164464  T
Q  144 tactatgtttatgccttttacttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 204  Q
    ||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  164463 taccatgtttatgccttttgcttgaggataagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 164403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #2
Raw Score: 55; E-Value: 9e-23
Query Start/End: Original strand, 141 - 203
Target Start/End: Original strand, 172254 - 172316
Alignment:
Q  141 tgctactatgtttatgccttttacttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgat 203  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  172254 tgctgctatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgat 172316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #3
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 141 - 204
Target Start/End: Original strand, 161995 - 162058
Alignment:
Q  141 tgctactatgtttatgccttttacttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 204  Q
    |||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  161995 tgctgctatgtctatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 162058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0162 (Bit Score: 66; Significance: 3e-29; HSPs: 1)
Name: scaffold0162
Description:

Target: scaffold0162; HSP #1
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 55 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 35251 - 35104
Alignment:
Q  55 aatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaagcccttgaggagacatgtgctttaattgaaattgtcataactgttagtgctactatgttta 154  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| |||  ||| ||||| |  |||||||||||| |||| ||||| |||||||   ||||  |||||| |||||||    
T  35251 aatgcttgagtttgtgattactgtacacttgaaattaaagccttaaaggagacatgtgttttagttgaa-ttgtcatct-tgtttatgctaccatgttta 35154  T
Q  155 tgccttttacttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 204  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  35153 tgccttttgcttgaggacaaggaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 35104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0328 (Bit Score: 60; Significance: 1e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0328
Description:

Target: scaffold0328; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 2 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 718 - 510
Alignment:
Q  2 cacacacacactcacttgaaacttgaccgttgggctgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaagcccttga 101  Q
    |||||||||||||||||  |||||||  |||||| ||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||  ||  ||||| ||||    
T  718 cacacacacactcacttagaacttgattgttgggttgaataaaggttacaagaaatgtttgagtttgtgattagtgtacgcttgaaataaaagcctttga 619  T
Q  102 ggagacatgtgctttaattgaaattgtcataactg-------ttagtgctactatgtttatgccttttacttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggg 194  Q
    ||||| ||  | ||| |||||| ||||||||  |        ||  ||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  618 ggagatataagttttgattgaa-ttgtcatatgtaatcttgttttatgctactatatttatgccttttgcttgaggacaaacaaagattcaagtatgggg 520  T
Q  195 gagtttgatg 204  Q
    ||||||||||    
T  519 gagtttgatg 510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0059 (Bit Score: 58; Significance: 2e-24; HSPs: 2)
Name: scaffold0059
Description:

Target: scaffold0059; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 141 - 202
Target Start/End: Original strand, 12548 - 12609
Alignment:
Q  141 tgctactatgtttatgccttttacttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttga 202  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12548 tgctactatgtttatgcctttttcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttga 12609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0059; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 49 - 79
Target Start/End: Original strand, 12450 - 12480
Alignment:
Q  49 acaagaaatgcttgagtttgtgattagtgta 79  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12450 acaagaaatgcttgagtttgtgattagtgta 12480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0013 (Bit Score: 58; Significance: 2e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0013
Description:

Target: scaffold0013; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 49 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 232948 - 232789
Alignment:
Q  49 acaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaagcccttgaggagacatgtgctttaattgaaattgtcata------actg-ttagt 141  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||   |||  ||  ||| | |||||||||||||   ||| |||| ||||||||||       ||| ||| |    
T  232948 acaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtatgcttgaaataaaagtctttgaggagacatgaattttgattg-aattgtcatatataatcctgtttatt 232850  T
Q  142 gctactatgtttatgccttttacttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttga 202  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  232849 gctactatgtttatgcctttttcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttga 232789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0582 (Bit Score: 56; Significance: 2e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0582
Description:

Target: scaffold0582; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 141 - 204
Target Start/End: Original strand, 8806 - 8869
Alignment:
Q  141 tgctactatgtttatgccttttacttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 204  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8806 tgctaccatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 8869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0278 (Bit Score: 56; Significance: 2e-23; HSPs: 2)
Name: scaffold0278
Description:

Target: scaffold0278; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 141 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 13065 - 13002
Alignment:
Q  141 tgctactatgtttatgccttttacttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 204  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  13065 tgctactatgtttatgcctcttacttgaggacaagcaaagattcaagtgtggcggagtttgatg 13002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0278; HSP #2
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 5 - 80
Target Start/End: Complemental strand, 13207 - 13132
Alignment:
Q  5 acacacactcacttgaaacttgaccgttgggctgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtac 80  Q
    |||| ||||||||||||||||||   ||||| | |||||| |||||||||||||||||||| ||  ||||||||||    
T  13207 acacgcactcacttgaaacttgattcttgggtttaataaagattacaagaaatgcttgagtatggtattagtgtac 13132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0420 (Bit Score: 55; Significance: 9e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0420
Description:

Target: scaffold0420; HSP #1
Raw Score: 55; E-Value: 9e-23
Query Start/End: Original strand, 92 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 10325 - 10206
Alignment:
Q  92 aagcccttgaggagacatgtgctttaattgaaattgtcata-------actgt-tagtgctactatgtttatgccttttacttgaggacaagcaaagatt 183  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||       | ||| | ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  10325 aagcccttgaggagacatgtgttttaatt-aaattgtcatatgataatattgtcttgtgctaccatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagatt 10227  T
Q  184 caagtgtgggggagtttgatg 204  Q
    ||||| |||||||||||||||    
T  10226 caagtttgggggagtttgatg 10206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0096 (Bit Score: 53; Significance: 1e-21; HSPs: 2)
Name: scaffold0096
Description:

Target: scaffold0096; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 140 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 38572 - 38508
Alignment:
Q  140 gtgctactatgtttatgccttttacttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 204  Q
    ||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38572 gtgctaccatgtttatgctttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 38508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0096; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 30 - 80
Target Start/End: Complemental strand, 38675 - 38625
Alignment:
Q  30 gttgggctgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtac 80  Q
    |||||| |||||||   |||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  38675 gttgggttgaataaggtttacaagaaatgcttgagtttgtgattaatgtac 38625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0512 (Bit Score: 52; Significance: 6e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0512
Description:

Target: scaffold0512; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 141 - 204
Target Start/End: Original strand, 5232 - 5295
Alignment:
Q  141 tgctactatgtttatgccttttacttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 204  Q
    |||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5232 tgctgctatgtctatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 5295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0056 (Bit Score: 52; Significance: 6e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0056
Description:

Target: scaffold0056; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 141 - 204
Target Start/End: Original strand, 42237 - 42300
Alignment:
Q  141 tgctactatgtttatgccttttacttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 204  Q
    |||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42237 tgctgctatgtctatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 42300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0035 (Bit Score: 52; Significance: 6e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0035
Description:

Target: scaffold0035; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 141 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 50569 - 50506
Alignment:
Q  141 tgctactatgtttatgccttttacttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 204  Q
    |||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50569 tgctgctatgtctatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 50506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0861 (Bit Score: 51; Significance: 2e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0861
Description:

Target: scaffold0861; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 146 - 204
Target Start/End: Original strand, 912 - 970
Alignment:
Q  146 ctatgtttatgccttttacttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 204  Q
    |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  912 ctatgtctatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0566 (Bit Score: 49; Significance: 4e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0566
Description:

Target: scaffold0566; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 148 - 204
Target Start/End: Original strand, 2762 - 2818
Alignment:
Q  148 atgtttatgccttttacttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 204  Q
    |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2762 atgtctatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 2818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0375 (Bit Score: 48; Significance: 1e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0375
Description:

Target: scaffold0375; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 153 - 204
Target Start/End: Original strand, 12743 - 12794
Alignment:
Q  153 tatgccttttacttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 204  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12743 tatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 12794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0258 (Bit Score: 48; Significance: 1e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0258
Description:

Target: scaffold0258; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 141 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 22218 - 22159
Alignment:
Q  141 tgctactatgtttatgccttttacttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagttt 200  Q
    |||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22218 tgctgctatgtctatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagttt 22159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0384 (Bit Score: 45; Significance: 9e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0384
Description:

Target: scaffold0384; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 148 - 204
Target Start/End: Original strand, 10720 - 10776
Alignment:
Q  148 atgtttatgccttttacttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 204  Q
    |||| |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  10720 atgtctatgccttttgcttgaggacaagcaaagattaaagtgtgggggagtttgatg 10776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0089 (Bit Score: 45; Significance: 9e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0089
Description:

Target: scaffold0089; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 148 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 54905 - 54849
Alignment:
Q  148 atgtttatgccttttacttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 204  Q
    |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  54905 atgtctatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagcgtgggggagtttgatg 54849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1225 (Bit Score: 44; Significance: 3e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold1225
Description:

Target: scaffold1225; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 141 - 204
Target Start/End: Original strand, 1839 - 1902
Alignment:
Q  141 tgctactatgtttatgccttttacttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 204  Q
    |||| |||| |||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  1839 tgctgctatatttatgccttttgcttgagaacaatcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 1902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1095 (Bit Score: 44; Significance: 3e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold1095
Description:

Target: scaffold1095; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 2 - 69
Target Start/End: Original strand, 2859 - 2926
Alignment:
Q  2 cacacacacactcacttgaaacttgaccgttgggctgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgt 69  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||   |||||||||||||||||||||||    
T  2859 cacacacacactcacttgaaacttgattgttgggttgaataaggtttacaagaaatgcttgagtttgt 2926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0116 (Bit Score: 44; Significance: 3e-16; HSPs: 2)
Name: scaffold0116
Description:

Target: scaffold0116; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 141 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 37806 - 37743
Alignment:
Q  141 tgctactatgtttatgccttttacttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 204  Q
    |||| |||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  37806 tgctgctatgtctattccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggaatttgatg 37743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0116; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 3 - 83
Target Start/End: Complemental strand, 37948 - 37869
Alignment:
Q  3 acacacacactcacttgaaacttgaccgttgggctgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatt 83  Q
    |||||||||||||||| | ||||||  |||||| ||||||||  | ||||| ||| |||||  ||||||||||||||||||    
T  37948 acacacacactcacttaagacttgat-gttgggttgaataaagttcacaaggaatacttgaagttgtgattagtgtacatt 37869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0094 (Bit Score: 44; Significance: 3e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0094
Description:

Target: scaffold0094; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 148 - 203
Target Start/End: Original strand, 1193 - 1248
Alignment:
Q  148 atgtttatgccttttacttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgat 203  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  1193 atgtttatgccttttgcttgtggacaagcaaagattcaagtatgggggagtttgat 1248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031 (Bit Score: 44; Significance: 3e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0031
Description:

Target: scaffold0031; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 141 - 204
Target Start/End: Original strand, 22756 - 22818
Alignment:
Q  141 tgctactatgtttatgccttttacttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 204  Q
    |||| |||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22756 tgctgctatgtctatgcctttg-cttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 22818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0123 (Bit Score: 42; Significance: 0.000000000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0123
Description:

Target: scaffold0123; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 159 - 204
Target Start/End: Original strand, 18218 - 18263
Alignment:
Q  159 ttttacttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 204  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18218 tttttcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 18263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0117 (Bit Score: 40; Significance: 0.00000000000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0117
Description:

Target: scaffold0117; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 141 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 45291 - 45228
Alignment:
Q  141 tgctactatgtttatgccttttacttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 204  Q
    |||| |||||| |||| ||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  45291 tgctgctatgtctatgtcttttgcttgagaacaagcaaagattcaggtgtgggggagtttgatg 45228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0088 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0088
Description:

Target: scaffold0088; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 146 - 200
Target Start/End: Original strand, 37868 - 37922
Alignment:
Q  146 ctatgtttatgccttttacttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagttt 200  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  37868 ctatgtttatggcttttgcttgagggcaagaaaagattcaagtgtgggggagttt 37922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000003; HSPs: 2)
Name: scaffold0037
Description:

Target: scaffold0037; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 154 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 72622 - 72572
Alignment:
Q  154 atgccttttacttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 204  Q
    ||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  72622 atgccttttgcttgaggaaaagtaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 72572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037; HSP #2
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 154 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 84812 - 84762
Alignment:
Q  154 atgccttttacttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 204  Q
    ||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  84812 atgccttttgcttgaggaaaagtaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 84762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0001
Description:

Target: scaffold0001; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 148 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 83214 - 83174
Alignment:
Q  148 atgtttatgccttttacttgaggacaagcaaagattcaagt 188  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  83214 atgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaatattcaagt 83174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University