View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF9595A_low_34 (Length: 392)

Name: NF9595A_low_34
Description: NF9595A
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF9595A_low_34
NF9595A_low_34
[»] chr3 (13 HSPs)
chr3 (1-385)||(55218675-55219060)
chr3 (1-385)||(51191901-51192286)
chr3 (1-248)||(39133522-39133768)
chr3 (1-385)||(43018384-43018769)
chr3 (1-351)||(8457656-8458007)
chr3 (1-382)||(21689467-21689847)
chr3 (1-321)||(51951725-51952046)
chr3 (8-260)||(13443968-13444221)
chr3 (1-335)||(26399951-26400286)
chr3 (1-158)||(39383404-39383562)
chr3 (167-290)||(39371317-39371440)
chr3 (79-251)||(23487916-23488089)
chr3 (1-90)||(7622657-7622745)
[»] chr8 (11 HSPs)
chr8 (1-385)||(5839490-5839875)
chr8 (1-385)||(32577762-32578161)
chr8 (1-255)||(25663360-25663615)
chr8 (1-370)||(36530876-36531246)
chr8 (1-133)||(11503098-11503230)
chr8 (1-118)||(32282872-32282989)
chr8 (267-385)||(32283061-32283179)
chr8 (22-158)||(14219846-14219983)
chr8 (1-105)||(40395245-40395349)
chr8 (1-118)||(10342355-10342475)
chr8 (163-220)||(32282996-32283053)
[»] chr7 (23 HSPs)
chr7 (1-385)||(30466393-30466778)
chr7 (1-385)||(23362014-23362399)
chr7 (1-385)||(3962323-3962708)
chr7 (1-385)||(25611392-25611777)
chr7 (1-385)||(9360467-9360852)
chr7 (1-385)||(4595059-4595444)
chr7 (1-385)||(42851690-42852075)
chr7 (1-385)||(40187083-40187469)
chr7 (22-374)||(24267772-24268125)
chr7 (1-216)||(14160358-14160574)
chr7 (3-165)||(28423910-28424073)
chr7 (1-373)||(5865969-5866327)
chr7 (1-158)||(9026516-9026674)
chr7 (267-382)||(27566307-27566422)
chr7 (1-152)||(8150884-8151036)
chr7 (7-374)||(35827303-35827671)
chr7 (1-86)||(6596171-6596256)
chr7 (218-334)||(33336221-33336337)
chr7 (73-200)||(12152600-12152727)
chr7 (46-115)||(33336091-33336160)
chr7 (166-216)||(21947084-21947134)
chr7 (152-248)||(2241556-2241652)
chr7 (65-105)||(21947010-21947050)
[»] chr6 (11 HSPs)
chr6 (1-385)||(32957163-32957548)
chr6 (4-339)||(7597331-7597667)
chr6 (1-236)||(7435645-7435881)
chr6 (65-385)||(12523336-12523657)
chr6 (145-385)||(7607613-7607853)
chr6 (1-113)||(6192541-6192653)
chr6 (1-125)||(7608464-7608588)
chr6 (4-374)||(13405854-13406225)
chr6 (137-202)||(6192479-6192544)
chr6 (3-85)||(34183152-34183234)
chr6 (66-236)||(31798070-31798241)
[»] chr5 (9 HSPs)
chr5 (1-385)||(9609531-9609916)
chr5 (1-385)||(30796827-30797212)
chr5 (1-385)||(29242137-29242522)
chr5 (1-374)||(1721707-1722081)
chr5 (88-385)||(27452586-27452883)
chr5 (1-113)||(39860924-39861036)
chr5 (173-335)||(39860728-39860889)
chr5 (1-88)||(36978727-36978817)
chr5 (65-131)||(4052843-4052909)
[»] scaffold0577 (1 HSPs)
scaffold0577 (1-385)||(2228-2613)
[»] chr4 (18 HSPs)
chr4 (1-385)||(35852884-35853269)
chr4 (1-385)||(26429221-26429606)
chr4 (1-385)||(17423851-17424236)
chr4 (1-377)||(48446379-48446756)
chr4 (1-385)||(33846033-33846418)
chr4 (1-385)||(9034623-9034995)
chr4 (1-385)||(26006114-26006499)
chr4 (21-385)||(54552331-54552695)
chr4 (1-262)||(52759156-52759418)
chr4 (1-275)||(2537008-2537283)
chr4 (1-351)||(12273939-12274290)
chr4 (65-338)||(791717-791991)
chr4 (1-336)||(8169353-8169689)
chr4 (1-204)||(25058333-25058537)
chr4 (1-385)||(22359270-22359653)
chr4 (1-204)||(19396195-19396399)
chr4 (196-259)||(23860120-23860183)
chr4 (3-101)||(23860023-23860121)
[»] scaffold0016 (1 HSPs)
scaffold0016 (1-385)||(186851-187236)
[»] chr2 (13 HSPs)
chr2 (1-385)||(23769804-23770189)
chr2 (1-339)||(24477505-24477844)
chr2 (1-385)||(10213543-10213928)
chr2 (9-385)||(38451729-38452106)
chr2 (1-385)||(23407778-23408161)
chr2 (1-290)||(45086014-45086304)
chr2 (5-193)||(22605835-22606024)
chr2 (7-338)||(40074065-40074394)
chr2 (1-245)||(27177589-27177834)
chr2 (26-245)||(1604721-1604941)
chr2 (1-81)||(11616661-11616741)
chr2 (1-90)||(31411394-31411483)
chr2 (5-95)||(32025536-32025626)
[»] scaffold0279 (1 HSPs)
scaffold0279 (1-259)||(6564-6823)
[»] scaffold0200 (1 HSPs)
scaffold0200 (1-385)||(26967-27352)
[»] scaffold0450 (1 HSPs)
scaffold0450 (1-245)||(5156-5401)
[»] scaffold0004 (1 HSPs)
scaffold0004 (1-351)||(216221-216572)
[»] scaffold0011 (1 HSPs)
scaffold0011 (1-385)||(58124-58510)
[»] chr1 (7 HSPs)
chr1 (65-385)||(25070898-25071219)
chr1 (1-114)||(48522161-48522274)
chr1 (123-316)||(48518855-48519049)
chr1 (65-335)||(19956308-19956582)
chr1 (5-248)||(11079803-11080047)
chr1 (1-104)||(26347349-26347452)
chr1 (123-192)||(15393654-15393725)
[»] scaffold1351 (1 HSPs)
scaffold1351 (310-385)||(1739-1814)
[»] scaffold0201 (1 HSPs)
scaffold0201 (82-335)||(20433-20686)
[»] scaffold0161 (1 HSPs)
scaffold0161 (149-224)||(9098-9173)


Alignment Details
Target: chr3 (Bit Score: 294; Significance: 1e-165; HSPs: 13)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 294; E-Value: 1e-165
Query Start/End: Original strand, 1 - 385
Target Start/End: Original strand, 55218675 - 55219060
Alignment:
Q  1 aatagtagagatacaatattgaatcctaatatgaatatggaaattagcatgacgcagagccactctagcaaagctatgagcgacttcgttggcttgtctc 100  Q
    |||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  55218675 aatagtagaggtacaagatggaatcctaatatgaatatggaaactagcatgacgcaaagccactctagcaaagctatgagcgacttcgttggcttgtctc 55218774  T
Q  101 cgaatgaacctaatatcaaatgttactaaatca-aagctaacagacgtctacaatcattaataactacgctaaaattagagacgccacttttactaccat 199  Q
    ||||||||||||| |||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  55218775 cgaatgaacctaacatcagaggttactaaatcagaagctaacagacgtctacaatcattaataaatgcgctaaaattagatacgccacttttactaccat 55218874  T
Q  200 aaagaatgtctaccacagttttggagtcaaactcaaaatccacaatacctagttgcagatcgcagaaccagtacattgctgataataaacccaaagcttc 299  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  55218875 aaagactgtctaccacagttttggagtcaaactcaaagttcacaatacctagttgcagatcacagacccagtacattgctgataataaactcaaagcctc 55218974  T
Q  300 acccaaatccacatcaaggagtggagtcatccattcagtcatggctaaaacaaagcgaccttcttcatctcgaatgcaaacaccaa 385  Q
    ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  55218975 acccaaaaccacatcaaggagcggagtcatccattcagtcttggctaaaacaaagcgaccttcttcatctcgaatgcaaacaccaa 55219060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 1 - 385
Target Start/End: Original strand, 51191901 - 51192286
Alignment:
Q  1 aatagtagagatacaatattgaatcctaatatgaatatggaaattagcatgacgcagagccactctagcaaagctatgagcgacttcgttggcttgtctc 100  Q
    ||||||| |||||||| ||  |||| ||||||||||||||||| |||||||||||| || || |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  51191901 aatagtacagatacaagatgaaatcataatatgaatatggaaactagcatgacgcaaagtcaatctagcaaagctatgaacgacttcgttggcttgtctc 51192000  T
Q  101 cgaatgaacctaatatcaaatgttactaaatca-aagctaacagacgtctacaatcattaataactacgctaaaattagagacgccacttttactaccat 199  Q
     |||| ||||||| |||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  51192001 tgaataaacctaacatcagaggttactaaatcataagctaacagacgtctacagtcattgattactacactaaaattagagacgccacttttactgccat 51192100  T
Q  200 aaagaatgtctaccacagttttggagtcaaactcaaaatccacaatacctagttgcagatcgcagaaccagtacattgctgataataaacccaaagcttc 299  Q
    ||||| | ||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||  | |||||||||  |||||||||| || ||||| ||    
T  51192101 aaagactatctaccacagttttggaatcaagctcaaagtccacaatacctagctgcagatcgcgaacccagtacatgactgataataagcctaaagcctc 51192200  T
Q  300 acccaaatccacatcaaggagtggagtcatccattcagtcatggctaaaacaaagcgaccttcttcatctcgaatgcaaacaccaa 385  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||| |||| |||||| | |||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  51192201 acccaaatccacatcaaagagcggagacatccattcagtcttggccaaaacataacgaccttcatcatctcgaatgcacacaccaa 51192286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 178; E-Value: 7e-96
Query Start/End: Original strand, 1 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 39133768 - 39133522
Alignment:
Q  1 aatagtagagatacaatattgaatcctaatatgaatatggaaattagcatgacgcagagccactctagcaaagctatgagcgacttcgttggcttgtctc 100  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39133768 aatagtagagatacaagattgaatcctaatatgaatatggaaactagcatgacgcaaagtcactctagcaaagctatgagcgacttcgttggcttgtctc 39133669  T
Q  101 cgaatgaacctaatatcaaatgttactaaatca-aagctaacagacgtctacaatcattaataactacgctaaaattagagacgccacttttactaccat 199  Q
    ||||||||||||| |||| | |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  39133668 cgaatgaacctaacatcagaggttactaaatcagaagctaacaaacgtctacaatcattaattac--cgctaaaattagagacgtcacttttactaccat 39133571  T
Q  200 aaagaatgtctaccacagttttggagtcaaactcaaaatccacaatacc 248  Q
    ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  39133570 aaagattatctaccacagttttggagtcaaactcaaagtccacaatacc 39133522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 178; E-Value: 7e-96
Query Start/End: Original strand, 1 - 385
Target Start/End: Original strand, 43018384 - 43018769
Alignment:
Q  1 aatagtagagatacaatattgaatcctaatatgaatatggaaattagcatgacgcagagccactctagcaaagctatgagcgacttcgttggcttgtctc 100  Q
    |||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||| ||||||| |||||||| |||| |||||||||||||    
T  43018384 aatagtagagatacaagatggaatcataatatgaatatggaaactagcatgacgcaaaaccactatagcaaaactatgagcaactttgttggcttgtctc 43018483  T
Q  101 cgaatgaacctaatatcaaatgttactaaatca-aagctaacagacgtctacaatcattaataactacgctaaaattagagacgccacttttactaccat 199  Q
    ||||| ||||||| |||| | |||||||||||| |||||||||  |||||| | || || || ||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  43018484 cgaataaacctaacatcagaggttactaaatcagaagctaacatgcgtctatagtctttgattactgcgctaaaattagagacgtcacttttaataccat 43018583  T
Q  200 aaagaatgtctaccacagttttggagtcaaactcaaaatccacaatacctagttgcagatcgcagaaccagtacattgctgataataaacccaaagcttc 299  Q
    ||||| | |||||||| |||||| | ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||   | ||| ||||| |||||||||||||| ||||  ||    
T  43018584 aaagactatctaccacggttttgaaatcaaactcaaagtccacaatatctagttgcagatcgtgaatccaatacatggctgataataaacctaaagtctc 43018683  T
Q  300 acccaaatccacatcaaggagtggagtcatccattcagtcatggctaaaacaaagcgaccttcttcatctcgaatgcaaacaccaa 385  Q
    ||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| | ||||||||| | |||||||| ||||||||||| || |||||||    
T  43018684 acctaaatccacatcaaggagcggagacatccattcagtcttagctaaaacataacgaccttcatcatctcgaatacacacaccaa 43018769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 1 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 8458007 - 8457656
Alignment:
Q  1 aatagtagagatacaatattgaatcctaatatgaatatggaaattagcatgacgcagagccactctagcaaagctatgagcgacttcgttggcttgtctc 100  Q
    |||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||| | |||||||||||| ||||||||| |||||||||||     
T  8458007 aatagtagagatacaagatgaaatcctaatatgaatatgaaaactagcatgacgcaaagccattatagcaaagctataagcgacttcattggcttgtctt 8457908  T
Q  101 cgaatgaacctaatatcaaatgttactaaatcaaa-gctaacagacgtctacaatcattaataactacgctaaaattagagacgccacttttactaccat 199  Q
    ||||| ||||||| |||| | |||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||| |||||||||| ||||    
T  8457907 cgaataaacctaacatcagaggttactaaatcaaaagctaacaggtgtctacaatcattgataactgcgctgaaattagagacgtcacttttactgccat 8457808  T
Q  200 aaagaatgtctaccacagttttggagtcaaactcaaaatccacaatacctagttgcagatcgcagaaccagtacattgctgataataaacccaaagcttc 299  Q
    ||||  | ||||||| | ||||||| |||| | |||| |||||||| ||||| ||||||||||  | ||||||||| |||||||||||||| ||||| ||    
T  8457807 aaaggctatctaccataattttggaatcaagcacaaagtccacaattcctagctgcagatcgcgaacccagtacatggctgataataaacctaaagcctc 8457708  T
Q  300 acccaaatccacatcaaggagtggagtcatccattcagtcatggctaaaaca 351  Q
    |||||| |||||||||||||| |||| |||||||| |||| |||| ||||||    
T  8457707 acccaactccacatcaaggagaggagacatccatttagtcttggccaaaaca 8457656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 160; E-Value: 4e-85
Query Start/End: Original strand, 1 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 21689847 - 21689467
Alignment:
Q  1 aatagtagagatacaatattgaatcctaatatgaatatggaaattagcatgacgcagagccactctagcaaagctatgagcgacttcgttggcttgtctc 100  Q
    |||||||||||||||| ||  |||| ||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||  ||| |||||||||| ||||||||    
T  21689847 aatagtagagatacaagatgaaatcataatatgaatatggaaactaacatgacgcaaagccactctagcaaagct--gagtgacttcgttgacttgtctc 21689750  T
Q  101 cgaatgaacctaatatcaaatgttactaaatca-aagctaacagacgtctacaatcattaataactacgctaaaattagagacgccacttttactaccat 199  Q
     |||| ||||||| |||| | ||||||| || | |||||||||  |||||||| ||||| || ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  21689749 tgaataaacctaacatcagaggttactagattagaagctaacaagcgtctacattcattgattactgcgctaaaattagagacgtcacttttactaccat 21689650  T
Q  200 aaagaatgtctaccacagttttggagtcaaactcaaaatccacaatacctagttgcagatcgcagaaccagtacattgctgataataaacccaaagcttc 299  Q
    ||| | | ||||||||||||||| | |||| |||||| | ||||||||| || ||||||||||  | ||| | ||||  |||||||||||| | ||| ||    
T  21689649 aaaaactatctaccacagttttgaaatcaagctcaaagttcacaatacccagctgcagatcgcgaacccaatgcattattgataataaacctacagcctc 21689550  T
Q  300 acccaaatccacatcaaggagtggagtcatccattcagtcatggctaaaacaaagcgaccttcttcatctcgaatgcaaacac 382  Q
     |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||| | |||||||| |||||||||||||| ||||    
T  21689549 ccccaaatccacatcaaggagcggagtcatccattcaatcttggctaaaacatatcgaccttcatcatctcgaatgcacacac 21689467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 51952046 - 51951725
Alignment:
Q  1 aatagtagagatacaatattgaatcctaatatgaatatggaaattagcatgacgcagagccactctagcaaagctatgagcgacttcgttggcttgtctc 100  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||| |||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||     
T  51952046 aatagtagagatacaagatggaatcctaatatgaatatgaaaactagcatgacgtaaagccactctagcaaaactatgagcgaattcattggcttgtctt 51951947  T
Q  101 cgaatgaacctaatatcaaatgttactaaatca-aagctaacagacgtctacaatcattaataactacgctaaaattagagacgccacttttactaccat 199  Q
    ||||| ||||||| |||| | |||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||| || ||| ||| |||||||||||| |||||||| ||  |||    
T  51951946 cgaataaacctaacatcagaggttactaaatcagaagctaacaggcgtctacagtcattgattactgcgcaaaaattagagaccccacttttcctgtcat 51951847  T
Q  200 aaagaatgtctaccacagttttggagtcaaactcaaaatccacaatacctagttgcagatcgcagaacc-agtacattgctgataataaacccaaagctt 298  Q
    ||||| | || |||||| |||| || |||| |||||| |||||||||||||| | |||||| | ||||| | ||||| | |||||||||||| ||||| |    
T  51951846 aaagactatccaccacacttttagaatcaagctcaaagtccacaatacctagctacagatcac-gaacctaatacatggttgataataaacctaaagcct 51951748  T
Q  299 cacccaaatccacatcaaggagt 321  Q
    |||| ||||||||||||||||||    
T  51951747 cacctaaatccacatcaaggagt 51951725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 8 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 13444221 - 13443968
Alignment:
Q  8 gagatacaatattgaatcctaatatgaatatggaaattagcatgacgcagagccactctagcaaagctatgagcgacttcgttggcttgtctccgaatga 107  Q
    |||||| || || ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||   |||||  | || |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |    
T  13444221 gagataaaagatggaatcctaatatgaatatggaaactagaatgacgtgaagccaaccgaggaaagctatgagcgacttcgttgacttgtctccgaataa 13444122  T
Q  108 acctaatatcaaatgttactaaatca-aagctaacagacgtctacaatcattaataactacgctaaaattagagacgccacttttactaccataaagaat 206  Q
    |||||| ||||   ||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |    
T  13444121 acctaacatcagtggttgctaaatcagaagctaacagacgtctacagtcattaattactgcgctaaaattagagacgccacttttactaccataaggact 13444022  T
Q  207 gtctaccacagttttggagtcaaactcaaaatccacaatacctagttgcagatc 260  Q
     || |||||| ||||||| | || |||||| ||||||||||| ||||| |||||    
T  13444021 atccaccacaattttggaattaagctcaaagtccacaatacccagttgtagatc 13443968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 96; E-Value: 6e-47
Query Start/End: Original strand, 1 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 26400286 - 26399951
Alignment:
Q  1 aatagtagagatacaatattgaatcctaatatgaatatggaaattagcatgacgcagagccactctagcaaagctatgagcgacttcgttggcttgtctc 100  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||  | |    |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||     
T  26400286 aatagtagagatacaatatggaatcataatatgaatatggaaactagcatgacgcgaaactttcctagcaaaactatgagcgactttgttggcttgtcta 26400187  T
Q  101 cgaatgaacctaatatcaaatgttactaaatc-aaagctaacagacgtctacaatcattaataactacgctaaaattagagacgccacttttactaccat 199  Q
     |||| ||||||| |||| | ||| ||||||| |||| ||| ||  ||||||  ||||| || | | | ||| ||||||||| | |||||||||||||||    
T  26400186 tgaataaacctaacatcagaggtttctaaatctaaaggtaagaggtgtctaccgtcattgatcaatgcactataattagagatgtcacttttactaccat 26400087  T
Q  200 aaagaatgtctaccacagttttggagtcaaactcaaaatccacaatacctagttgcagatcgcagaaccagtacattgctgataataaacccaaagcttc 299  Q
    ||||| | || || |||  |||||| |||| ||||||||||| |||||| |  |||| ||| ||   | | || ||||||||||||||||| ||||  ||    
T  26400086 aaagattatcaactacatgtttggaatcaagctcaaaatccataatacccaactgcaaatcacaccccaaatatattgctgataataaacctaaaggctc 26399987  T
Q  300 acccaaatccacatcaaggagtggagtcatccattc 335  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  26399986 acccaaatccacatcaaggagaggagtcattcattc 26399951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 79; E-Value: 8e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 39383562 - 39383404
Alignment:
Q  1 aatagtagagatacaatattgaatcctaatatgaatatggaaattagcatgacgcagagccactctagcaaagctatgagcgacttcgttggcttgtctc 100  Q
    |||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  39383562 aatagtagagatacaaaatggaatcataatatgaatatggaaattaacatgacgcaaaaccactcgagcaaagctatgaacgacttcgttgacttgtctc 39383463  T
Q  101 cgaatgaacctaatatcaaatgttactaaatca-aagctaacagacgtctacaatcatt 158  Q
    ||||| ||||||| |||| | |||| ||||| | ||||||| || | ||||||||||||    
T  39383462 cgaataaacctaacatcagaggttattaaattagaagctaataggcatctacaatcatt 39383404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 167 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 39371440 - 39371317
Alignment:
Q  167 cgctaaaattagagacgccacttttactaccataaagaatgtctaccacagttttggagtcaaactcaaaatccacaatacctagttgcagatcgcagaa 266  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | | || |||| ||||||| |||| |||||| ||||||||||||   | ||||||||  |     
T  39371440 cgctaaaattagagacgccacttttactgccataaagactatttatcacaattttggaatcaatctcaaagtccacaatacctgactccagatcgcgaac 39371341  T
Q  267 ccagtacattgctgataataaacc 290  Q
    ||||||||| | ||||||||||||    
T  39371340 ccagtacatggttgataataaacc 39371317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 79 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 23488089 - 23487916
Alignment:
Q  79 agcgacttcgttggcttgtctccgaatgaacctaatatcaaatgttactaaatca-aagctaacagacgtctacaatcattaataactacgctaaaatta 177  Q
    ||||||||||| |||||||||| || | ||||||| ||||    || |||||||| |||||||||  |||||||||||| | |||||| | ||| |||||    
T  23488089 agcgacttcgtaggcttgtctctgattaaacctaacatcatcaattgctaaatcacaagctaacatgcgtctacaatcaattataactgcactataatta 23487990  T
Q  178 gagacgccacttttactaccataaagaatgtctaccacagttttggagtcaaactcaaaatccacaatacctag 251  Q
    |  |||  |||||| |||||||| ||| | || |||||| ||||||| ||||   |||||||||||||||||||    
T  23487989 gtaacgttactttttctaccatagagactatccaccacatttttggaatcaaggccaaaatccacaatacctag 23487916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 1 - 90
Target Start/End: Complemental strand, 7622745 - 7622657
Alignment:
Q  1 aatagtagagatacaatattgaatcctaatatgaatatggaaattagcatgacgcagagccactctagcaaagctatgagcgacttcgtt 90  Q
    |||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||| ||| |||||| ||||  ||||||  ||||||| |||| ||||| ||||||    
T  7622745 aatagtagagatacaagatgaaatcctaatatgaatatgaaaactagcat-acgcgaagccaccttagcaaatctataagcgatttcgtt 7622657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 282; Significance: 1e-158; HSPs: 11)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 282; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 1 - 385
Target Start/End: Complemental strand, 5839875 - 5839490
Alignment:
Q  1 aatagtagagatacaatattgaatcctaatatgaatatggaaattagcatgacgcagagccactctagcaaagctatgagcgacttcgttggcttgtctc 100  Q
    |||||||||||||||| ||  ||| ||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5839875 aatagtagagatacaagatgaaattctaatattaatatggaaactagcatgacgcaaagccactctagcaaagctatgagcgacttcgttggcttgtctc 5839776  T
Q  101 cgaatgaacctaatatcaaatgttactaaatca-aagctaacagacgtctacaatcattaataactacgctaaaattagagacgccacttttactaccat 199  Q
    | ||||||||||| |||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5839775 caaatgaacctaacatcagaggttactaaatcagaagctaacagacgtctacaatcattaataactgcgctaaaattagagacgccacttttactaccat 5839676  T
Q  200 aaagaatgtctaccacagttttggagtcaaactcaaaatccacaatacctagttgcagatcgcagaaccagtacattgctgataataaacccaaagcttc 299  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| || |||||  ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  5839675 aaagactgtctaccacagttttggagttaagctcaatgtccacaatacctagttgcagatcgcggacccagtacattgctgataataaatccaaagcctc 5839576  T
Q  300 acccaaatccacatcaaggagtggagtcatccattcagtcatggctaaaacaaagcgaccttcttcatctcgaatgcaaacaccaa 385  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5839575 acccaaatccacatcaaggagcggagtcatccattccgtcttggctaaaacaaagcgaccttcttcatctcgaatgcaaacaccaa 5839490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 1 - 385
Target Start/End: Complemental strand, 32578161 - 32577762
Alignment:
Q  1 aatagtagagatacaatattgaatcctaatatgaatatggaaattagcatgacgcagagcca--------------ctctagcaaagctatgagcgactt 86  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||              ||||||||||||||||||| ||||    
T  32578161 aatagtagagatacaagatggaatcctaatatgaatatggaaactagcatgacgcaaagccattctagcaaagccactctagcaaagctatgagcaactt 32578062  T
Q  87 cgttggcttgtctccgaatgaacctaatatcaaatgttactaaatca-aagctaacagacgtctacaatcattaataactacgctaaaattagagacgcc 185  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  32578061 cgttggcttgtctccgaatgaacctaacatcagaggttactaaatcagaagctaacagacgtctacattcattaataactgcactaaaattagagacgcc 32577962  T
Q  186 acttttactaccataaagaatgtctaccacagttttggagtcaaactcaaaatccacaatacctagttgcagatcgcagaaccagtacattgctgataat 285  Q
    |||  |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |  | ||||| ||||||||||||     
T  32577961 actagtactaccataaagactgtctaccacacttttggagtcaagctcaaagtccacaatacctagttgcagatcacgaacccagtgcattgctgataac 32577862  T
Q  286 aaacccaaagcttcacccaaatccacatcaaggagtggagtcatccattcagtcatggctaaaacaaagcgaccttcttcatctcgaatgcaaacaccaa 385  Q
    ||||||||||| |||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  32577861 aaacccaaagcctcacccaactcgacatcaaggagcggagtcatccattcagtcttggctaaaacaaaacgaccttcttcatcgcgaatacaaacaccaa 32577762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 180; E-Value: 4e-97
Query Start/End: Original strand, 1 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 25663615 - 25663360
Alignment:
Q  1 aatagtagagatacaatattgaatcctaatatgaatatggaaattagcatgacgcagagccactctagcaaagctatgagcgacttcgttggcttgtctc 100  Q
    ||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25663615 aataggagagatacaagatggaatcctaatatgaatatggaaaatagcatgacgcaaatccactctagcaaagctatgagcgacttcgttggcttgtctc 25663516  T
Q  101 cgaatgaacctaatatcaaatgttactaaatca-aagctaacagacgtctacaatcattaataactacgctaaaattagagacgccacttttactaccat 199  Q
    ||||||||||||| |||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  25663515 cgaatgaacctaacatcagaggttactaaatcagaagctaacagacgtctacaatcattaataactgcgctaaaattagagacgccactagtactaccat 25663416  T
Q  200 aaagaatgtctaccacagttttggagtcaaactcaaaatccacaatacctagttgc 255  Q
    ||||| ||||||||||| |||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  25663415 aaagactgtctaccacaattttagagtcaagctcaaagtccacaatacctagttgc 25663360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 133; E-Value: 5e-69
Query Start/End: Original strand, 1 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 36531246 - 36530876
Alignment:
Q  1 aatagtagagatacaatattgaatcctaatatgaatatggaaattagcatgacgcagagccactctagcaaagctatgagcgacttcgttggcttgtctc 100  Q
    ||||||||||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | | | ||||||||| |||| |||||||||||| |||||||||    
T  36531246 aatagtagagaaacaagatggaatcctaatatgaatatggaaattagcatgacacaaaactattctagcaaaactataagcgacttcgtttgcttgtctc 36531147  T
Q  101 cgaatgaacctaatatcaaatgttactaaatcaaag--ctaacagacgtctacaatcattaataactacgctaaaattagagacgccacttttactacca 198  Q
    ||||| ||||||| |||| | ||| |||||| |||   |||| | || ||| || ||||| || |||  ||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  36531146 cgaataaacctaacatcagaggtttctaaataaaaaaactaa-atacatctgcagtcattgattactgtgctaaaattagagataccacttttactacca 36531048  T
Q  199 taaagaatgtctaccacagttttggagtcaaactcaaaatccacaatacctagttgcagatcgcagaaccagtacattgctgataataaacccaaagctt 298  Q
    |||||| | ||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||| ||||||    | ||| |||||  |||||| |||||| ||||  |    
T  36531047 taaagactatctaccacagttttggaatcaagctcaaagtccacaatacctagttccagatcatgaacccaatacatgactgatagtaaacctaaagtct 36530948  T
Q  299 cacccaaatccacatcaaggagtggagtcatccattcagtcatggctaaaacaaagcgaccttcttcatctc 370  Q
    |||| || |||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||| | | |||||| |||||||    
T  36530947 cacctaagtccacatcaaggagcggagacatccattcagtcttggctaaaacataacaaccttcatcatctc 36530876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 101; E-Value: 6e-50
Query Start/End: Original strand, 1 - 133
Target Start/End: Original strand, 11503098 - 11503230
Alignment:
Q  1 aatagtagagatacaatattgaatcctaatatgaatatggaaattagcatgacgcagagccactctagcaaagctatgagcgacttcgttggcttgtctc 100  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11503098 aatagtagagatacaagatggaatcctaatatgaatatggaaactagcatgacgcaaagccactctagcgaagctatgagcgacttcgttggcttgtctc 11503197  T
Q  101 cgaatgaacctaatatcaaatgttactaaatca 133  Q
    ||||||||||||| |||| | ||||||||||||    
T  11503198 cgaatgaacctaacatcagaggttactaaatca 11503230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 1 - 118
Target Start/End: Original strand, 32282872 - 32282989
Alignment:
Q  1 aatagtagagatacaatattgaatcctaatatgaatatggaaattagcatgacgcagagccactctagcaaagctatgagcgacttcgttggcttgtctc 100  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  32282872 aatagtagagatacaagatggaatcctaatatgaatatggaaactagcatgatgcaaagtcactctagcaaagctatgagcgacttcgttggtttgtctc 32282971  T
Q  101 cgaatgaacctaatatca 118  Q
    ||||| ||||||| ||||    
T  32282972 cgaataaacctaacatca 32282989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 267 - 385
Target Start/End: Original strand, 32283061 - 32283179
Alignment:
Q  267 ccagtacattgctgataataaacccaaagcttcacccaaatccacatcaaggagtggagtcatccattcagtcatggctaaaacaaagcgaccttcttca 366  Q
    ||||||||| ||||||||||| |  ||||| |||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||| |||| |||||| | ||| |||| |||    
T  32283061 ccagtacatggctgataataagcttaaagcctcacccaaatccacatcaaggagcagagacatccattcagtcttggccaaaacataacgaacttcatca 32283160  T
Q  367 tctcgaatgcaaacaccaa 385  Q
    ||||||||||| |||||||    
T  32283161 tctcgaatgcacacaccaa 32283179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 22 - 158
Target Start/End: Original strand, 14219846 - 14219983
Alignment:
Q  22 aatcctaatatgaatatggaaattagcatgacgcagagccactctagcaaagctatgagcgacttcgttggcttgtctccgaatgaacctaatatcaaat 121  Q
    |||| ||||||||||||||||| || |||||| | ||| |||||| || ||  ||||| |||||| ||||| |||||||| ||| ||||||| |||| ||    
T  14219846 aatcttaatatgaatatggaaactaacatgacacggagtcactctggcgaaattatgaccgactttgttggtttgtctcctaataaacctaacatcagat 14219945  T
Q  122 gttactaaatc-aaagctaacagacgtctacaatcatt 158  Q
     |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  14219946 attactaaatcaaaagctaacagacgtctacaatcatt 14219983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 105
Target Start/End: Complemental strand, 40395349 - 40395245
Alignment:
Q  1 aatagtagagatacaatattgaatcctaatatgaatatggaaattagcatgacgcagagccactctagcaaagctatgagcgacttcgttggcttgtctc 100  Q
    |||||||||||||||| ||  ||| |||||||||||||||||| || ||||||||  | ||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||    
T  40395349 aatagtagagatacaagataaaattctaatatgaatatggaaactaacatgacgcgaatccactctagcaaagctatgagtgacttagttgacttgtctc 40395250  T
Q  101 cgaat 105  Q
    |||||    
T  40395249 cgaat 40395245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 1 - 118
Target Start/End: Complemental strand, 10342475 - 10342355
Alignment:
Q  1 aatagtagagatacaatattgaatcctaata---tgaatatggaaattagcatgacgcagagccactctagcaaagctatgagcgacttcgttggcttgt 97  Q
    ||||||||||||| || || |||||||||||   |||||||| ||| ||||||||| || ||||| | |||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  10342475 aatagtagagatataagatggaatcctaataatatgaatatgaaaactagcatgacacaaagccattttagcaaagctatgagcgatttcgttggtttgt 10342376  T
Q  98 ctccgaatgaacctaatatca 118  Q
    |||| ||| ||||||| ||||    
T  10342375 ctccaaataaacctaacatca 10342355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 163 - 220
Target Start/End: Original strand, 32282996 - 32283053
Alignment:
Q  163 actacgctaaaattagagacgccacttttactaccataaagaatgtctaccacagttt 220  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||    
T  32282996 actacactaaaattagagacgccacttttactgccataaagactatctaccacagttt 32283053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 274; Significance: 1e-153; HSPs: 23)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 274; E-Value: 1e-153
Query Start/End: Original strand, 1 - 385
Target Start/End: Complemental strand, 30466778 - 30466393
Alignment:
Q  1 aatagtagagatacaatattgaatcctaatatgaatatggaaattagcatgacgcagagccactctagcaaagctatgagcgacttcgttggcttgtctc 100  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  30466778 aatagtagagatacaagatggaatcctaatatgaatatggaaactagcataacgcaaagccactctagcaaaactatgagcgacttcgttggcttgtctc 30466679  T
Q  101 cgaatgaacctaatatcaaatgttactaaatca-aagctaacagacgtctacaatcattaataactacgctaaaattagagacgccacttttactaccat 199  Q
    |||||||||||||  ||| | ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  30466678 cgaatgaacctaacttcagaggttactatatcagaagctaacagacgtctacaatcattaataactgcgctaaaattagagacgccacttttactatcat 30466579  T
Q  200 aaagaatgtctaccacagttttggagtcaaactcaaaatccacaatacctagttgcagatcgcagaaccagtacattgctgataataaacccaaagcttc 299  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||  | ||||| |||||||||||||||||||||||| ||    
T  30466578 aaagactgtctaccacagttttggagtcaagctcaaagtccacaatacctagttgcagatcgcgaacccagtgcattgctgataataaacccaaagcctc 30466479  T
Q  300 acccaaatccacatcaaggagtggagtcatccattcagtcatggctaaaacaaagcgaccttcttcatctcgaatgcaaacaccaa 385  Q
    |||||||| | |||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30466478 acccaaattcgcatcaaggagcggagtcatctattcagtcttggctaaaacaaagcgaccttcttcatctcgaatgcaaacaccaa 30466393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 270; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 1 - 385
Target Start/End: Complemental strand, 23362399 - 23362014
Alignment:
Q  1 aatagtagagatacaatattgaatcctaatatgaatatggaaattagcatgacgcagagccactctagcaaagctatgagcgacttcgttggcttgtctc 100  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  23362399 aatagtagagatacaagatggaatcctaatatgaatatggaaactagcatgacgcaaagccactctagcaaagctatgagcgactttgttggcttgtctc 23362300  T
Q  101 cgaatgaacctaatatcaaatgttactaaatca-aagctaacagacgtctacaatcattaataactacgctaaaattagagacgccacttttactaccat 199  Q
    ||||||||||| | |||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  23362299 cgaatgaaccttacatcagaggttactaaatcagaagctaacagacgtctacaatcattaataactgcgctaaaattagagacaccacttttcctaccat 23362200  T
Q  200 aaagaatgtctaccacagttttggagtcaaactcaaaatccacaatacctagttgcagatcgcagaaccagtacattgctgataataaacccaaagcttc 299  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |  | ||||| ||||| |||||| ||||||||||| ||    
T  23362199 aaagactgtctaccacagttttggagtcaatctcaaagtccacaatacctagttgcagatcacgaacccagtgcattgttgataacaaacccaaagcctc 23362100  T
Q  300 acccaaatccacatcaaggagtggagtcatccattcagtcatggctaaaacaaagcgaccttcttcatctcgaatgcaaacaccaa 385  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23362099 acccaaatcgacatcaaggagcggagtcatccattcagtcttggctaaaacaaaacgaccttcttcatctcgaatgcaaacaccaa 23362014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 262; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 1 - 385
Target Start/End: Original strand, 3962323 - 3962708
Alignment:
Q  1 aatagtagagatacaatattgaatcctaatatgaatatggaaattagcatgacgcagagccactctagcaaagctatgagcgacttcgttggcttgtctc 100  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  3962323 aatagtagagatacaagatggaatcctaatacgaatatggaaactagcatgacgcaaagccactctagcaaagctatgagcaacttcgttggcttgtctc 3962422  T
Q  101 cgaatgaacctaatatcaaatgttactaaatca-aagctaacagacgtctacaatcattaataactacgctaaaattagagacgccacttttactaccat 199  Q
    ||||||||||||| |||| | |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  3962423 cgaatgaacctaacatcagaggttactaaatcagaagctaacagacatctacaatcattaataactgcgctaaaattagagacgccactattactaccat 3962522  T
Q  200 aaagaatgtctaccacagttttggagtcaaactcaaaatccacaatacctagttgcagatcgcagaaccagtacattgctgataataaacccaaagcttc 299  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||| | |||||| ||||||||||||||||||||||| |  | ||||| |||||||||||| ||||||||||| ||    
T  3962523 aaagactgtctaccacaattttggagtcgagctcaaagtccacaatacctagttgcagatcacgaacccagtgcattgctgataacaaacccaaagcctc 3962622  T
Q  300 acccaaatccacatcaaggagtggagtcatccattcagtcatggctaaaacaaagcgaccttcttcatctcgaatgcaaacaccaa 385  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  3962623 acccaaatcgacatcaaggagcggagtcatccattcagtcttggctaaaacaaaacgaccttcttcatctcgaatacaaacaccaa 3962708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 262; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 1 - 385
Target Start/End: Original strand, 25611392 - 25611777
Alignment:
Q  1 aatagtagagatacaatattgaatcctaatatgaatatggaaattagcatgacgcagagccactctagcaaagctatgagcgacttcgttggcttgtctc 100  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25611392 aatagtagagatacaagatggaatcctaatatgaatatggaaactagcatgacgcaaagccactctagcaaagctatgagcgacttcgttggcttgtctc 25611491  T
Q  101 cgaatgaacctaatatcaaatgttactaaatca-aagctaacagacgtctacaatcattaataactacgctaaaattagagacgccacttttactaccat 199  Q
    ||||||||||||| |||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  25611492 cgaatgaacctaacatcagaggttactaaatcagaagctaacagacgtctacattcattaataactgcgctaaaattagagacgccactagtactaccat 25611591  T
Q  200 aaagaatgtctaccacagttttggagtcaaactcaaaatccacaatacctagttgcagatcgcagaaccagtacattgctgataataaacccaaagcttc 299  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |  | ||||| |||||||||||| ||||||||||| ||    
T  25611592 aaagactgtctaccacacttttggagtcaagctcaaagtccacaatacctagttgcagatcacgaacccagtgcattgctgataacaaacccaaagcctc 25611691  T
Q  300 acccaaatccacatcaaggagtggagtcatccattcagtcatggctaaaacaaagcgaccttcttcatctcgaatgcaaacaccaa 385  Q
    |||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  25611692 acccaactcgacatcaaggagcggagtcatccattcagtcttggctaaaacaaaacgaccttcttcatcgcgaatacaaacaccaa 25611777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 174; E-Value: 2e-93
Query Start/End: Original strand, 1 - 385
Target Start/End: Complemental strand, 9360852 - 9360467
Alignment:
Q  1 aatagtagagatacaatattgaatcctaatatgaatatggaaattagcatgacgcagagccactctagcaaagctatgagcgacttcgttggcttgtctc 100  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | | ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  9360852 aatagtagagatacaagatggaatcctaatatgaatatggaaactagcatgacgcaaaactactctagcaaaactatgatcgacttcgttggcttgtctc 9360753  T
Q  101 cgaatgaacctaatatcaaatgttactaaatca-aagctaacagacgtctacaatcattaataactacgctaaaattagagacgccacttttactaccat 199  Q
    ||||| ||||||| |||| | ||||||||| || |||||||||| |||||||| ||||| || ||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  9360752 cgaataaacctaacatcagaggttactaaaacagaagctaacaggcgtctacagtcattgattactgcgctaaaattagaaacgccacttttactgccat 9360653  T
Q  200 aaagaatgtctaccacagttttggagtcaaactcaaaatccacaatacctagttgcagatcgcagaaccagtacattgctgataataaacccaaagcttc 299  Q
    ||||| | |||| |||| ||||||| |||| |||||| |||||||||||||  || |||||||  | ||| ||||| |||||||||||||| ||||  ||    
T  9360652 aaagactatctatcacatttttggaatcaagctcaaagtccacaatacctaactggagatcgcgaacccaatacatggctgataataaacctaaagtctc 9360553  T
Q  300 acccaaatccacatcaaggagtggagtcatccattcagtcatggctaaaacaaagcgaccttcttcatctcgaatgcaaacaccaa 385  Q
    ||||||||||||||||||||  |||| ||||||||| ||  ||||  ||||| | |||||||| |||||||||||| | |||||||    
T  9360552 acccaaatccacatcaaggatcggagacatccattccgttttggccgaaacataacgaccttcatcatctcgaatgtacacaccaa 9360467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 171; E-Value: 1e-91
Query Start/End: Original strand, 1 - 385
Target Start/End: Original strand, 4595059 - 4595444
Alignment:
Q  1 aatagtagagatacaatattgaatcctaatatgaatatggaaattagcatgacgcagagccactctagcaaagctatgagcgacttcgttggcttgtctc 100  Q
    |||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||| |||||||||  | | ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||    
T  4595059 aatagtagagatacaagatgaaatcctaatatgaatatggaaactagcatgacagaaaaccactctagcaaaactatgagcgacttcgttggtttgtctc 4595158  T
Q  101 cgaatgaacctaatatcaaatgttactaaatca-aagctaacagacgtctacaatcattaataactacgctaaaattagagacgccacttttactaccat 199  Q
    ||||  ||||||| |||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| || | | |||| |||||||||||||||| ||| || ||||    
T  4595159 cgaacaaacctaacatcagaggttactaaatcagaagctaacagacgtctacagtcattgattattgcgcttaaattagagacgccacattttctgccat 4595258  T
Q  200 aaagaatgtctaccacagttttggagtcaaactcaaaatccacaatacctagttgcagatcgcagaac-cagtacattgctgataataaacccaaagctt 298  Q
    ||||| | | ||||||| ||||||| |||| || ||| |||| |||||||||||||||||||| |||| |||||||| | |||||||||||| ||||| |    
T  4595259 aaagactatataccacaattttggaatcaagcttaaagtccaaaatacctagttgcagatcgc-gaactcagtacatggttgataataaacctaaagcct 4595357  T
Q  299 cacccaaatccacatcaaggagtggagtcatccattcagtcatggctaaaacaaagcgaccttcttcatctcgaatgcaaacaccaa 385  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||| |||||| |  || |||| |||||| ||||||| |||||||    
T  4595358 cacccaaatccacatcaaggagcggaggcatccattcagtcttggccaaaacataatgatcttcatcatcttgaatgcacacaccaa 4595444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 170; E-Value: 4e-91
Query Start/End: Original strand, 1 - 385
Target Start/End: Complemental strand, 42852075 - 42851690
Alignment:
Q  1 aatagtagagatacaatattgaatcctaatatgaatatggaaattagcatgacgcagagccactctagcaaagctatgagcgacttcgttggcttgtctc 100  Q
    |||| |||||||| || || ||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||  ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||    
T  42852075 aataatagagatataagatggaatcctaatatgaatatggaaactaacatgacgcaaagccacgttagcaaaactatgagcgacttcgttggattgtctc 42851976  T
Q  101 cgaatgaacctaatatcaaatgttactaaatca-aagctaacagacgtctacaatcattaataactacgctaaaattagagacgccacttttactaccat 199  Q
    ||||| ||||||| |||| | |||||||| ||| |||||||||  |||||||| ||||| || ||| | ||||||||||| |||||||||||| ||||||    
T  42851975 cgaataaacctaacatcagaggttactaagtcagaagctaacacgcgtctacagtcattgattactgcactaaaattagatacgccacttttaataccat 42851876  T
Q  200 aaagaatgtctaccacagttttggagtcaaactcaaaatccacaatacctagttgcagatcgcagaaccagtacattgctgataataaacccaaagcttc 299  Q
    ||||| | |||||||| |||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||  | ||| |||||  ||||||||||||| ||||| ||    
T  42851875 aaagactatctaccacggttttggaatcaagctcaaagtccacaatacctagttgcagatcgcgaacccaatacatgactgataataaacctaaagcctc 42851776  T
Q  300 acccaaatccacatcaaggagtggagtcatccattcagtcatggctaaaacaaagcgaccttcttcatctcgaatgcaaacaccaa 385  Q
    ||| |||||||||||||||||   || ||| |||| |||| ||||||||||| | |||||||| ||||||||||| || |||||||    
T  42851775 acctaaatccacatcaaggagcaaagacattcatttagtcttggctaaaacacaacgaccttcatcatctcgaatacacacaccaa 42851690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 1 - 385
Target Start/End: Complemental strand, 40187469 - 40187083
Alignment:
Q  1 aatagtagagatacaatattgaatcctaatatgaatatggaaattagcatgacgcagagccactctagcaaag-ctatgagcgacttcgttggcttgtct 99  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||| | |||||||| ||||  ||||||| |  |||||||||||||||    
T  40187469 aatagtagagatacaagatggaatcctaatatgaatatgaaaactagcaagacgcaaaaccactctaacaaaaactatgagtgttttcgttggcttgtct 40187370  T
Q  100 ccgaatgaacctaatatcaaatgttactaaatca-aagctaacagacgtctacaatcattaataactacgctaaaattagagacgccacttttactacca 198  Q
    || ||| ||||||| |||||| |||||||||||| ||| |||||  |||||||| ||||| || ||| |||||||||||||||||||||||||| | |||    
T  40187369 ccaaataaacctaacatcaaaggttactaaatcagaagttaacaagcgtctacagtcattgattactgcgctaaaattagagacgccacttttattgcca 40187270  T
Q  199 taaagaatgtctaccacagttttggagtcaaactcaaaatccacaatacctagttgcagatcgcagaaccagtacattgctgataataaacccaaagctt 298  Q
    |||||| | ||||||||| ||||||| |||| |||||| |||||| ||||||| ||||||||||  | ||| || || ||||||||||| || ||||| |    
T  40187269 taaagactatctaccacaattttggaatcaagctcaaagtccacactacctagctgcagatcgcgaacccattaaatggctgataataagcctaaagcct 40187170  T
Q  299 cacccaaatccacatcaaggagtggagtcatccattcagtcatggctaaaacaaagcgaccttcttcatctcgaatgcaaacaccaa 385  Q
    ||||||||| |||||||||||| |||| |||||||| |||| |||| |||||| | |||||||| ||||||| |||||| |||||||    
T  40187169 cacccaaattcacatcaaggagcggagacatccatttagtcttggccaaaacataacgaccttcatcatctcaaatgcacacaccaa 40187083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 22 - 374
Target Start/End: Original strand, 24267772 - 24268125
Alignment:
Q  22 aatcctaatatgaatatggaaattagcatgacgcagagccactctagcaaagctatgagcgacttcgttggcttgtctccgaatgaacctaatatcaaat 121  Q
    |||||||| || |||||||||| || ||||||||| || ||  |||||||| |||||||||||||| ||| |||||||| |||| ||||||| || | |     
T  24267772 aatcctaacataaatatggaaactaacatgacgcaaagtcatcctagcaaaactatgagcgacttcattgacttgtctctgaataaacctaacattagag 24267871  T
Q  122 gttactaaatca-aagctaacagacgtctacaatcattaataactacgctaaaattagagacgccacttttactaccataaagaatgtctaccacagttt 220  Q
    |||||||||||| || ||||||  ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | || |||||| |||    
T  24267872 gttactaaatcagaaactaacaagcgtctacaatcattaattactgcgctaaaattagagacgccacttttaccaccataaagactatccaccacaattt 24267971  T
Q  221 tggagtcaaactcaaaatccacaatacctagttgcagatcgcagaaccagtacattgctgataataaacccaaagcttcacccaaatccacatcaaggag 320  Q
    |||| |||| | |||| |||||||||||||||||||||||    | ||| ||||||||||||| |||||| || || |||| |||||||||||||| |||    
T  24267972 tggaatcaagcacaaagtccacaatacctagttgcagatcatgaacccaatacattgctgatagtaaacctaaggcctcactcaaatccacatcaatgag 24268071  T
Q  321 tggagtcatccattcagtcatggctaaaacaaagcgaccttcttcatctcgaat 374  Q
    |||||||||||||||| |  ||||||||||||| |||| ||| |||||||||||    
T  24268072 tggagtcatccattcaattttggctaaaacaaaacgacattcatcatctcgaat 24268125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 1 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 14160574 - 14160358
Alignment:
Q  1 aatagtagagatacaatattgaatcctaatatgaatatggaaattagcatgacgcagagccactctagcaaagctatgagcgacttcgttggcttgtctc 100  Q
    |||||||||||||||| |  ||||||||||||||||| | ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14160574 aatagtagagatacaagaaggaatcctaatatgaatacgcaaactagcatgacgcaaagccactctagcaaagctatgagcgacttcgttggcttgtctc 14160475  T
Q  101 cgaatgaacctaatatcaaatgttactaaatca-aagctaacagacgtctacaatcattaataactacgctaaaattagagacgccacttttactaccat 199  Q
    ||||||||||||| |||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  14160474 cgaatgaacctaacatcagaggttactaaatcagaagctaacagacgtctacaatcattaataattgcgctaaaattagagacgccactagtactaccat 14160375  T
Q  200 aaagaatgtctaccaca 216  Q
    ||||| |||||||||||    
T  14160374 aaagactgtctaccaca 14160358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 104; E-Value: 9e-52
Query Start/End: Original strand, 3 - 165
Target Start/End: Original strand, 28423910 - 28424073
Alignment:
Q  3 tagtagagatacaatattgaatcctaatatgaatatggaaattagcatgacgcagagccactctagcaaagctatgagcgacttcgttggcttgtctccg 102  Q
    |||| ||||||||| || |||| || ||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28423910 tagttgagatacaagatggaattctgatatgaatatggaaactagcatgatgcaaagccactctagcgaagctatgagcgacttcgttggcttgtctccg 28424009  T
Q  103 aatgaacctaatatcaaatgttactaaatca-aagctaacagacgtctacaatcattaataact 165  Q
    ||||||||||| |||| | |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  28424010 aatgaacctaacatcagaggttactaaatcagaagctaacagaagtctacaatcattaataact 28424073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 5866327 - 5865969
Alignment:
Q  1 aatagtagagatacaatattgaatcctaatatgaatatggaaattagcatgacgcagagccactctagcaaagctatgagcgacttcgttggcttgtctc 100  Q
    |||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||| |||||| |  ||||||||||| |||||||||||| | || ||| |||||||||    
T  5866327 aatagtagagatacaagatgaaatcctaatatgaatatggaaattaacatgacacgaagccactctaggaaagctatgagcaattttgtttgcttgtctc 5866228  T
Q  101 cgaatgaacctaatatcaaatgttactaaatcaaagctaacagacgtctacaatcattaataactacgctaaaattagagacgccacttttactaccata 200  Q
    ||||| ||||||| |||| |              ||||||||  |||||| | ||||| || | | |  |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  5866227 cgaataaacctaacatcaga--------------agctaacatgcgtctatagtcattgatcattgcagtaaaattagagacgccacatttactaccata 5866142  T
Q  201 aagaatgtctaccacagttttggagtcaaactcaaaatccacaatacctagttgcagatcgcagaacc-agtacattgctgataataaacccaaagcttc 299  Q
    |||| | ||||||||| |||| || |||| |||||| |||||||||||||| |||||||||| ||||| | |||| | ||||||||||||| ||||| ||    
T  5866141 aagattatctaccacaattttagaatcaagctcaaagtccacaatacctagctgcagatcgc-gaacctaatacactactgataataaacctaaagcctc 5866043  T
Q  300 acccaaatccacatcaaggagtggagtcatccattcagtcatggctaaaacaaagcgaccttcttcatctcgaa 373  Q
    | |||| |||| |||||||||  ||||||||||||| ||  ||||||| | | | |||||||| ||||||||||    
T  5866042 atccaattccatatcaaggagcagagtcatccattctgttttggctaacaaataacgaccttcatcatctcgaa 5865969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 9026674 - 9026516
Alignment:
Q  1 aatagtagagatacaatattgaatcctaatatgaatatggaaattagcatgacgcagagccactctagcaaagctatgagcgacttcgttggcttgtctc 100  Q
    |||| ||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||    
T  9026674 aataatagagatacaagatggaatcttaatatgaatatggaaattagcatgacgcaaatccactctagcaaaactatgagcgacttcgttgacttgtctc 9026575  T
Q  101 cgaatgaacctaatatcaaatgttactaaatca-aagctaacagacgtctacaatcatt 158  Q
     |||| ||||||| |||| | |||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||    
T  9026574 tgaataaacctaacatcataagttactaaatcagaagctaaccggcgtctacaatcatt 9026516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 267 - 382
Target Start/End: Original strand, 27566307 - 27566422
Alignment:
Q  267 ccagtacattgctgataataaacccaaagcttcacccaaatccacatcaaggagtggagtcatccattcagtcatggctaaaacaaagcgaccttcttca 366  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  27566307 ccagtgcattgttgataataaacccaaagccttacccaaattcacatcaaggagcggagtcatccattcagtcttggctaaaacaaagcgaccttcttca 27566406  T
Q  367 tctcgaatgcaaacac 382  Q
    ||||||||||||||||    
T  27566407 tctcgaatgcaaacac 27566422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 1 - 152
Target Start/End: Original strand, 8150884 - 8151036
Alignment:
Q  1 aatagtagagatacaatattgaatcctaatatgaatatggaaattagcatgacgcagagccactctagcaaagctatgagcgacttcgttggcttgtctc 100  Q
    |||||||||||||||| || |||||||||||||||| |||||| ||| |||||||| || ||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  8150884 aatagtagagatacaagatggaatcctaatatgaatttggaaactagtatgacgcaaagtcacgctagcaaaactatgagcgacttcgtttgcttgtctc 8150983  T
Q  101 cgaatgaacctaatatcaaatgttactaaatca-aagctaacagacgtctaca 152  Q
    ||||| ||||||| |||| | |||||||||||| |||||||||  ||||||||    
T  8150984 cgaataaacctaacatcagaggttactaaatcagaagctaacatgcgtctaca 8151036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 7 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 35827671 - 35827303
Alignment:
Q  7 agagatacaatattgaatcctaatatgaatatggaaattagcatgacgcagagccactctagcaaagctatgagcgacttcgttggcttgtctccgaatg 106  Q
    |||||||||| ||  |||| |||||||||||||||||||||||||||    | ||| |||||||||||||||||| |||| || |||||||||| ||||     
T  35827671 agagatacaagatgaaatcttaatatgaatatggaaattagcatgacatgaatccattctagcaaagctatgagcaactttgtaggcttgtctcagaata 35827572  T
Q  107 aacctaatatcaaatgttactaaatca-aagctaacagacgtctacaatcattaataactacgctaaaattagagacgccacttttactaccataaagaa 205  Q
    ||||||| || | |  ||  || |||| || ||||||  ||| || ||||||| || ||| | ||| ||||||| || |||||||| |||| ||| |||     
T  35827571 aacctaacataagagattgttagatcataaactaacatgcgtttataatcattgatcactgcactataattagaaacaccacttttgctactatagagac 35827472  T
Q  206 tgtctaccacagttttggagtcaaactcaaaatccacaatacctagttgcagatcgcagaaccagtacattgctgataataaacccaaagcttcacccaa 305  Q
    | || |||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||  |  ||||| || | ||| ||   || |||||||||||| ||||| || |||||    
T  35827471 tatccaccacaattttggaatcaagctcaaaatccacaatacctaactatagatcacacatccaatagtgtgttgataataaacctaaagcctcccccaa 35827372  T
Q  306 atccacatcaaggagtggagtcatccattcagtcatggctaaaacaaagcgaccttcttcatctcgaat 374  Q
    ||||||||||||||||| ||||| |||||| ||  | ||||| ||||| ||||| |  |||||||||||    
T  35827371 atccacatcaaggagtgcagtcaaccattcggttttagctaacacaaaacgacccttatcatctcgaat 35827303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 86
Target Start/End: Complemental strand, 6596256 - 6596171
Alignment:
Q  1 aatagtagagatacaatattgaatcctaatatgaatatggaaattagcatgacgcagagccactctagcaaagctatgagcgactt 86  Q
    ||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | |||||||| |||| ||||||| |||||    
T  6596256 aatagtagatatacaagatggaatcctaatatgaatatggaaactagcatgacgcaaaaccactctaacaaaactatgagtgactt 6596171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 218 - 334
Target Start/End: Original strand, 33336221 - 33336337
Alignment:
Q  218 ttttggagtcaaactcaaaatccacaatacctagttgcagatcgcagaaccagtacattgctgataataaacccaaagcttcacccaaatccacatcaag 317  Q
    ||||||| |||| |||||||||||||||||| |  ||||||||    | ||| ||||||| |||||||||||| ||||  ||| | ||||||||||||||    
T  33336221 ttttggaatcaagctcaaaatccacaatacccaactgcagatcatgcacccaatacattgttgataataaacctaaagtctcatcgaaatccacatcaag 33336320  T
Q  318 gagtggagtcatccatt 334  Q
    ||| |||||||||||||    
T  33336321 gagcggagtcatccatt 33336337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 73 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 12152727 - 12152600
Alignment:
Q  73 gctatgagcgacttcgttggcttgtctccgaatgaacctaatatcaaatgttactaaatcaaagctaacagacgtctacaatcattaataactacgctaa 172  Q
    |||||||||||||| ||| | ||| |||||||| ||||||| | || |||||||||| ||||| |||||    |||||||||||| ||| ||||| |||     
T  12152727 gctatgagcgactttgtttgtttgcctccgaataaacctaacagcagatgttactaattcaaatctaacttgtgtctacaatcatcaatcactacactat 12152628  T
Q  173 aattagagacgccacttttactaccata 200  Q
    ||||||| | |||| |||||| ||||||    
T  12152627 aattagaaaagccagttttaccaccata 12152600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 46 - 115
Target Start/End: Original strand, 33336091 - 33336160
Alignment:
Q  46 agcatgacgcagagccactctagcaaagctatgagcgacttcgttggcttgtctccgaatgaacctaata 115  Q
    ||||||||||  |||||| ||||||||  ||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  33336091 agcatgacgcgaagccaccctagcaaacttatgagcaacttcgttggcttgtctctgaataaacctaata 33336160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 166 - 216
Target Start/End: Original strand, 21947084 - 21947134
Alignment:
Q  166 acgctaaaattagagacgccacttttactaccataaagaatgtctaccaca 216  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| | |||||||||    
T  21947084 acgctaaaattagagacgtcacttttactatcataaagactatctaccaca 21947134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 152 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 2241652 - 2241556
Alignment:
Q  152 aatcattaataactacgctaaaattagagacgccacttttactaccataaagaatgtctaccacagttttggagtcaaactcaaaatccacaatacc 248  Q
    |||||||||| ||| | ||| ||||||| ||||||| |||||||||||| ||| | || |||||||||||||  || | |||||| |||| ||||||    
T  2241652 aatcattaatcactgcactataattagaaacgccacatttactaccatagagactatccaccacagttttggcatcgatctcaaagtccataatacc 2241556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 65 - 105
Target Start/End: Original strand, 21947010 - 21947050
Alignment:
Q  65 ctagcaaagctatgagcgacttcgttggcttgtctccgaat 105  Q
    |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  21947010 ctagcaaaactatgagcgactttgttggcttgtctccgaat 21947050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 274; Significance: 1e-153; HSPs: 11)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 274; E-Value: 1e-153
Query Start/End: Original strand, 1 - 385
Target Start/End: Complemental strand, 32957548 - 32957163
Alignment:
Q  1 aatagtagagatacaatattgaatcctaatatgaatatggaaattagcatgacgcagagccactctagcaaagctatgagcgacttcgttggcttgtctc 100  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32957548 aatagtagagatacaagatggaatcctaatatgaatatggaaactagcatgacgcaaagccactctagcaaagctatgagcgacttcgttggcttgtctc 32957449  T
Q  101 cgaatgaacctaatatcaaatgttactaaatca-aagctaacagacgtctacaatcattaataactacgctaaaattagagacgccacttttactaccat 199  Q
    ||||||||||||| |||| | |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32957448 cgaatgaacctaacatcagaggttactaaatcagaagctaatagacgtctacaatcattaataactgcgctaaaattagagacgccacttttactaccat 32957349  T
Q  200 aaagaatgtctaccacagttttggagtcaaactcaaaatccacaatacctagttgcagatcgcagaaccagtacattgctgataataaacccaaagcttc 299  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||||    | ||||| |||||||||||| |||| |||||| ||    
T  32957348 aaagactgtctaccacagttttggaatcaatctcaaagtccacaatacctagttgcagatcatgaacccagtgcattgctgataacaaactcaaagcctc 32957249  T
Q  300 acccaaatccacatcaaggagtggagtcatccattcagtcatggctaaaacaaagcgaccttcttcatctcgaatgcaaacaccaa 385  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32957248 acccaaatcgacatcaaggagcggagtcatccattcagtcttggctaaaacaaaacgaccttcttcatctcgaatgcaaacaccaa 32957163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 173; E-Value: 6e-93
Query Start/End: Original strand, 4 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 7597667 - 7597331
Alignment:
Q  4 agtagagatacaatattgaatcctaatatgaatatggaaattagcatgacgcagagccactctagcaaagctatgagcgacttcgttggcttgtctccga 103  Q
    |||||||||| || || ||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  7597667 agtagagatataagatggaatcctaatatgaatatgaaaactagcatcacgcaaagccactctagcaaagctatgagcgactttggtggcttgtctccga 7597568  T
Q  104 atgaacctaatatcaaatgttactaaatcaaag-ctaacagacgtctacaatcattaataactacgctaaaattagagacgccacttttactaccataaa 202  Q
    || ||||||| |||| | |||||||||| |||  |||||| ||||||||| ||||| || ||| |||||||  ||||||||||||||||||| |||||||    
T  7597567 ataaacctaacatcagaggttactaaataaaaaactaacatacgtctacagtcattgattactgcgctaaatctagagacgccacttttactgccataaa 7597468  T
Q  203 gaatgtctaccacagttttggagtcaaactcaaaatccacaatacctagttgcagatcgcagaaccagtacattgctgataataaacccaaagcttcacc 302  Q
    || | ||||||||| ||||| | ||||||||||| |||||||||||||| |||||||| || | ||||||||| | |||||||||||| ||||| |||||    
T  7597467 gactctctaccacaattttgaaatcaaactcaaagtccacaatacctagctgcagatcacaaacccagtacatggttgataataaacctaaagcctcacc 7597368  T
Q  303 caaatccacatcaaggagtggagtcatccattcagtc 339  Q
    |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  7597367 caaatccacatcaaggagcggagacatccattcagtc 7597331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 141; E-Value: 8e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 236
Target Start/End: Original strand, 7435645 - 7435881
Alignment:
Q  1 aatagtagagatacaatattgaatcctaatatgaatatggaaattagcatgacgcagagccactctagcaaagctatgagcgacttcgttggcttgtctc 100  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  7435645 aatagtagagatacaagatggaatcctaatatgaatatggaaactagcatgacgcaaagccactctagcaaagctattagcgacttcgttgacttgtctc 7435744  T
Q  101 cgaatgaacctaatatcaaatgttactaaatca-aagctaacagacgtctacaatcattaataactacgctaaaattagagacgccacttttactaccat 199  Q
    ||||| ||||||| |||| | |||||||||||| ||| |||||| |||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||    
T  7435745 cgaataaacctaacatcagaggttactaaatcagaagttaacaggcgtctacagtcattgattactacgctaaaattagagacgctaattttactgccat 7435844  T
Q  200 aaagaatgtctaccacagttttggagtcaaactcaaa 236  Q
    ||||| | ||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  7435845 aaagactatctaccacagttttggaatcaagctcaaa 7435881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 65 - 385
Target Start/End: Complemental strand, 12523657 - 12523336
Alignment:
Q  65 ctagcaaagctatgagcgacttcgttggcttgtctccgaatgaacctaatatcaaatgttactaaatca-aagctaacagacgtctacaatcattaataa 163  Q
    |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| || ||  ||||| | |||||||||| |||||| | ||||| || |    
T  12523657 ctagcaaaactatgagcaacttcgttggcttgtctccgaataaacctaacatcagattttgttaaattagaagctaacaggcgtctatagtcattgatca 12523558  T
Q  164 ctacgctaaaattagagacgccacttttactaccataaagaatgtctaccacagttttggagtcaaactcaaaatccacaatacctagttgcagatcgca 263  Q
    || |||||||||||||||| ||||  ||||||||||| ||| | ||||||||||||||||| |||| |||||| |||| |||||  || ||||||||||     
T  12523557 ctgcgctaaaattagagacaccacaattactaccatatagactatctaccacagttttggaatcaagctcaaagtccataatactcagctgcagatcgcg 12523458  T
Q  264 gaaccagtacattgctgataataaacccaaagcttcacccaaatccacatcaaggagtggagtcatccattcagtcatggctaaaacaaagcgaccttct 363  Q
     | ||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||   ||||||||||||||||  | ||||| | | | |||| |||     
T  12523457 aacccaatacattgctgataataaacctaaagcctcacccaaattcacatcaaggaacagagtcatccattcagttctagctaacaaataacgacattca 12523358  T
Q  364 tcatctcgaatgcaaacaccaa 385  Q
    ||||||||||| || |||||||    
T  12523357 tcatctcgaatacacacaccaa 12523336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 145 - 385
Target Start/End: Complemental strand, 7607853 - 7607613
Alignment:
Q  145 cgtctacaatcattaataactacgctaaaattagagacgccacttttactaccataaagaatgtctaccacagttttggagtcaaactcaaaatccacaa 244  Q
    |||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||| ||||| | |||| |||||| |||||||    
T  7607853 cgtctacagtcattgattactacgctaaaattagagacgccacttttactacaataaagactatctaccacaattttgaaatcaagctcaaagtccacaa 7607754  T
Q  245 tacctagttgcagatcgcagaaccagtacattgctgataataaacccaaagcttcacccaaatccacatcaaggagtggagtcatccattcagtcatggc 344  Q
    ||||||| |||||| | |  | ||||  ||| ||||||||||| || ||||| ||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  7607753 tacctagctgcagaccacgaacccagcccatggctgataataagcctaaagcctcacccaaatatacatcaaggagtggagacatccattcagtcttggc 7607654  T
Q  345 taaaacaaagcgaccttcttcatctcgaatgcaaacaccaa 385  Q
     |||||| | |||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  7607653 caaaacataacgaccttcatcatctcgaatgcacacaccaa 7607613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 1 - 113
Target Start/End: Complemental strand, 6192653 - 6192541
Alignment:
Q  1 aatagtagagatacaatattgaatcctaatatgaatatggaaattagcatgacgcagagccactctagcaaagctatgagcgacttcgttggcttgtctc 100  Q
    ||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||||||    
T  6192653 aatagtagaaatacaagatggaatcctaatatgaatatggaaactagcataacgtagagccactctagcaaagatatgagtgatttcgttggcttgtctc 6192554  T
Q  101 cgaatgaacctaa 113  Q
    |||||||||||||    
T  6192553 cgaatgaacctaa 6192541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 1 - 125
Target Start/End: Complemental strand, 7608588 - 7608464
Alignment:
Q  1 aatagtagagatacaatattgaatcctaatatgaatatggaaattagcatgacgcagagccactctagcaaagctatgagcgacttcgttggcttgtctc 100  Q
    |||||||||||||||| || ||||  ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||     
T  7608588 aatagtagagatacaagatggaattataatatgaatatggaaactagcatgacgcaaagccactatagcaaagctatgagtgacttcgttggcttgtctt 7608489  T
Q  101 cgaatgaacctaatatcaaatgtta 125  Q
    ||||| ||||||| |||||| ||||    
T  7608488 cgaataaacctaacatcaaaggtta 7608464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 4 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 13406225 - 13405854
Alignment:
Q  4 agtagagatacaatattgaatcctaatatgaatatggaaattagcatgacgcagagccactctagcaaagctatgagcgacttcgttggcttgtctccga 103  Q
    ||||||||||||  || ||||| |||||||| |||||||| ||||||||| |  || ||  |||||||| ||||||| |||||  |||||||||||||||    
T  13406225 agtagagatacacgatcgaatcttaatatgattatggaaactagcatgactcgaagtcatcctagcaaaactatgagtgacttaattggcttgtctccga 13406126  T
Q  104 atgaacctaatatcaaatgttactaaatca-aagctaacagacgtctacaatcattaataactacgctaaaattagagacgccacttttactaccataaa 202  Q
    || ||| ||| |||| | ||| |||||||| ||||||||| |||| ||| |||||| |  | |   ||| ||||||| | | ||||||||| ||||||||    
T  13406125 ataaacataacatcagaggttgctaaatcagaagctaacatacgtttactatcattgagcattgtactataattagaaatggcacttttaccaccataaa 13406026  T
Q  203 gaatgtctaccacagttttggagtcaaactcaaaatccacaatacctagttgcagatcgcagaaccagtacattgctgataataaacccaaagcttcacc 302  Q
    || | || |||||||||||| |||||| || |||||| ||| |||| |  |||||||| || | ||| |  | || ||||||||| || | ||| || ||    
T  13406025 gactatcaaccacagttttgaagtcaagctgaaaatctacattacccaaatgcagatcacacatccattgaagtgttgataataagcctagagcctcccc 13405926  T
Q  303 caaatccacatcaaggagtggagtcatccattcagtcatggctaaaacaaagcgaccttcttcatctcgaat 374  Q
     ||||||||||| || ||| | |||| |||||||||  |||| |  ||||| |||||||| |||||||||||    
T  13405925 aaaatccacatcgagaagttgtgtcagccattcagttttggcaagcacaaaacgaccttcatcatctcgaat 13405854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 137 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 6192544 - 6192479
Alignment:
Q  137 ctaacagacgtctacaatcattaataactacgctaaaattagagacgccacttttactaccataaa 202  Q
    |||||||| ||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6192544 ctaacagatgtccacaatcattattaactgcgctaaaattagagacgccacttttactaccataaa 6192479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 3 - 85
Target Start/End: Original strand, 34183152 - 34183234
Alignment:
Q  3 tagtagagatacaatattgaatcctaatatgaatatggaaattagcatgacgcagagccactctagcaaagctatgagcgact 85  Q
    |||||||||||||| ||  ||||| ||||| |||||| ||| || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  34183152 tagtagagatacaagatgaaatcccaatataaatatgaaaactaacatgacgcaaagccactctagcaaagctatgagcgact 34183234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 66 - 236
Target Start/End: Original strand, 31798070 - 31798241
Alignment:
Q  66 tagcaaagctatgagcgacttcgttggcttgtctccgaatgaacctaatatcaaatgttactaaatcaaa-gctaacagacgtctacaatcattaataac 164  Q
    |||||||  ||||||  |||||||| |||||||| | ||| ||||||| |||| | ||||||| |||||| ||||||| | ||||||| || | ||| ||    
T  31798070 tagcaaatttatgagtaacttcgttagcttgtcttcaaataaacctaacatcagaggttactagatcaaaagctaacatatgtctacagtcttgaatcac 31798169  T
Q  165 tacgctaaaattagagacgccacttttactaccataaagaatgtctaccacagttttggagtcaaactcaaa 236  Q
    | | ||||||||||||| | ||| ||||| |||||||||| | || || ||||||||  | |||||||||||    
T  31798170 tgcactaaaattagagatgtcacatttaccaccataaagactatccactacagtttttaaatcaaactcaaa 31798241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 270; Significance: 1e-151; HSPs: 9)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 270; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 1 - 385
Target Start/End: Original strand, 9609531 - 9609916
Alignment:
Q  1 aatagtagagatacaatattgaatcctaatatgaatatggaaattagcatgacgcagagccactctagcaaagctatgagcgacttcgttggcttgtctc 100  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9609531 aatagtagagatacaagatggaatcctaatatgaatatggaaactagcatgatgcaaagccactctagcgaagctatgagcgacttcgttggcttgtctc 9609630  T
Q  101 cgaatgaacctaatatcaaatgttactaaatca-aagctaacagacgtctacaatcattaataactacgctaaaattagagacgccacttttactaccat 199  Q
    ||||||||||||| |||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  9609631 cgaatgaacctaacatcagaggttactaaatcagaagctaacagacgtctacaatcattaataactgcgctaaaattagagacgccactagtactaccat 9609730  T
Q  200 aaagaatgtctaccacagttttggagtcaaactcaaaatccacaatacctagttgcagatcgcagaaccagtacattgctgataataaacccaaagcttc 299  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |  | ||||| |||||||||||| ||||||||||| ||    
T  9609731 aaagactgtctaccacaattttggagtcaagctcaaagtccacaatacctagttgcagatcacgaacccagtgcattgctgataacaaacccaaagcctc 9609830  T
Q  300 acccaaatccacatcaaggagtggagtcatccattcagtcatggctaaaacaaagcgaccttcttcatctcgaatgcaaacaccaa 385  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9609831 acccaaatcgacatcaaggagcggagtcatccattcagtcttggctaaaacaaaacgaccttcttcatctcgaatgcaaacaccaa 9609916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 258; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 1 - 385
Target Start/End: Original strand, 30796827 - 30797212
Alignment:
Q  1 aatagtagagatacaatattgaatcctaatatgaatatggaaattagcatgacgcagagccactctagcaaagctatgagcgacttcgttggcttgtctc 100  Q
    |||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30796827 aatagtagagatgcaagatggaatcctaatatgaatatggaaactagcaagacgcaaagccactctagcaaagctatgagcgacttcgttggcttgtctc 30796926  T
Q  101 cgaatgaacctaatatcaaatgttactaaatca-aagctaacagacgtctacaatcattaataactacgctaaaattagagacgccacttttactaccat 199  Q
    ||||||||||||| |||| | |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  30796927 cgaatgaacctaacatcagaggttactaaatcataagctaatagacgtctacaatcattaataactgcgctaaaattagagacgccactagtactaccat 30797026  T
Q  200 aaagaatgtctaccacagttttggagtcaaactcaaaatccacaatacctagttgcagatcgcagaaccagtacattgctgataataaacccaaagcttc 299  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||| |  | ||| | |||||||||||| ||||||||||| ||    
T  30797027 aaagactgtctaccacaattttggagtcaagctcaaagtccacaatacctagttgcaaatcacgaacccactgcattgctgataacaaacccaaagcctc 30797126  T
Q  300 acccaaatccacatcaaggagtggagtcatccattcagtcatggctaaaacaaagcgaccttcttcatctcgaatgcaaacaccaa 385  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30797127 acccaaatcgacatcaaggagcggagtcatccattcagtcttggctaaaacaaaacgaccttcttcatctcgaatgcaaacaccaa 30797212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 254; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 1 - 385
Target Start/End: Original strand, 29242137 - 29242522
Alignment:
Q  1 aatagtagagatacaatattgaatcctaatatgaatatggaaattagcatgacgcagagccactctagcaaagctatgagcgacttcgttggcttgtctc 100  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||| | | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  29242137 aatagtagagatacaatatggaatcctaatataaatatggaaactagcatgatgtaaagccactctagcaaagctatgagcgacttcattggcttgtctc 29242236  T
Q  101 cgaatgaacctaatatcaaatgttactaaatca-aagctaacagacgtctacaatcattaataactacgctaaaattagagacgccacttttactaccat 199  Q
    ||||||||||||| |||| | |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29242237 cgaatgaacctaacatcagaggttactaagtcagaagctaacagacgtctacaatcattaatatctgcgctaaaattagagacgccacttttactaccat 29242336  T
Q  200 aaagaatgtctaccacagttttggagtcaaactcaaaatccacaatacctagttgcagatcgcagaaccagtacattgctgataataaacccaaagcttc 299  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |  | ||| | |||||||||||| ||||||||||  ||    
T  29242337 aaagactgtctaccatagttttggagtcaatctcaaagtccacaatacctagttgcagatcacgaacccaatgcattgctgataacaaacccaaagtctc 29242436  T
Q  300 acccaaatccacatcaaggagtggagtcatccattcagtcatggctaaaacaaagcgaccttcttcatctcgaatgcaaacaccaa 385  Q
    | ||||||| |||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29242437 atccaaatcgacatcaagaagcggagtcatccattcagtcttggctaaaacaaagcgaccttcttcatctcgaatgcaaacaccaa 29242522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 163; E-Value: 6e-87
Query Start/End: Original strand, 1 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 1722081 - 1721707
Alignment:
Q  1 aatagtagagatacaatattgaatcctaatatgaatatggaaattagcatgacgcagagccactctagcaaagctatgagcgacttcgttggcttgtctc 100  Q
    |||| ||||||||||| ||  |||  ||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||    
T  1722081 aataatagagatacaagatgaaattttaatatgaatatggaaactagcatgacgcgaagccactctagccaaactatgagcgacttcgttggcttgtctc 1721982  T
Q  101 cgaatgaacctaatatcaaatgttactaaatca-aagctaacagacgtctacaatcattaataactacgctaaaattagagacgccacttttactaccat 199  Q
    | ||| ||||||| |||| | |||||||||||| ||| |||||| ||| |||||||||| || ||| ||||||||||| ||||||||| |||  ||||||    
T  1721981 caaataaacctaacatcagaggttactaaatcataagttaacaggcgtttacaatcattgatcactgcgctaaaattaaagacgccacatttcttaccat 1721882  T
Q  200 aaagaatgtctaccacagttttggagtcaaactcaaaatccacaatacctagttgcagatcgcagaaccagtacattgctgataataaacccaaagcttc 299  Q
    ||||| | ||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||  || |||||||||   |  || |||||||||||||||||||| ||||| ||    
T  1721881 aaagactatctaccacagtcttggaatcaagctcaaaatccacaatacacagctgcagatcgtgaattcaatacattgctgataataaacctaaagcctc 1721782  T
Q  300 acccaaatccacatcaaggagtggagtcatccattcagtcatggctaaaacaaagcgaccttcttcatctcgaat 374  Q
    |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||| ||| | | |||||| |||||||||||    
T  1721781 acccaattccacatcaaggattggagtcatccattcagttttggctaacacataacaaccttcatcatctcgaat 1721707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 88 - 385
Target Start/End: Original strand, 27452586 - 27452883
Alignment:
Q  88 gttggcttgtctccgaatgaacctaatatcaaatgttactaaatca-aagctaacagacgtctacaatcattaataactacgctaaaattagagacgcca 186  Q
    |||||||| ||||||||| ||||||| |||| | |||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||| || | | ||||||||||||||||||||    
T  27452586 gttggcttatctccgaataaacctaacatcagaggttactaaatcataagctaacagt-gtctacaatcattgattattgcgctaaaattagagacgcca 27452684  T
Q  187 cttttactaccataaagaatgtctaccacagttttggagtcaaactcaaaatccacaatacctagttgcagatcgcagaaccagtacattgctgataata 286  Q
    ||| |||| ||||||||| | || ||||||| |||||| |||| |||||  |||||||||||||| || |||||||  | || |||||| | ||||||||    
T  27452685 cttctactgccataaagactatccaccacaggtttggaatcaagctcaatgtccacaatacctagctgaagatcgcgaatccggtacatggatgataata 27452784  T
Q  287 aacccaaagcttcacccaaatccacatcaaggagtggagtcatccattcagtcatggctaaaacaaagcgaccttcttcatctcgaatgcaaacaccaa 385  Q
    |||| ||||  |||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||| |||| |||||| | |||||||| ||||||| |||||| |||||||    
T  27452785 aacctaaagtctcacccaaattcacatcaaggagcggagacatccattcagtcttggccaaaacataacgaccttcatcatctcaaatgcacacaccaa 27452883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 113
Target Start/End: Complemental strand, 39861036 - 39860924
Alignment:
Q  1 aatagtagagatacaatattgaatcctaatatgaatatggaaattagcatgacgcagagccactctagcaaagctatgagcgacttcgttggcttgtctc 100  Q
    |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||  |||||| ||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||    
T  39861036 aatagtagagatacaagattgaatcataatatgaatatggaaactagcatgacgcgaagccaccctagcaaaattatgagcgacttccttggcttgtctc 39860937  T
Q  101 cgaatgaacctaa 113  Q
    ||||| |||||||    
T  39860936 cgaataaacctaa 39860924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 173 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 39860889 - 39860728
Alignment:
Q  173 aattagagacgccacttttactaccataaagaatgtctaccacagttttggagtcaaactcaaaatccacaatacctagttgcagatcgcagaaccagta 272  Q
    ||||| |||||  ||||||||||| | ||||| | ||||||||||| ||||| |||| ||||||||||| |||||| || |||||||| |  | ||| ||    
T  39860889 aattaaagacgatacttttactac-acaaagactatctaccacagtattggaatcaagctcaaaatccataatacccagctgcagatcacgcacccaata 39860791  T
Q  273 cattgctgataataaacccaaagcttcacccaaatccacatcaaggagtggagtcatccattc 335  Q
    |||||||||||||||||| ||||| |  ||||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  39860790 cattgctgataataaacctaaagccttgcccaaatccacatcaagaagcggagtcatccattc 39860728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 1 - 88
Target Start/End: Complemental strand, 36978817 - 36978727
Alignment:
Q  1 aatagtagagatacaatattgaatcctaatatgaatatggaaattagcatgacgcagagccact---ctagcaaagctatgagcgacttcg 88  Q
    |||||||||||||||| || |||||||||||| |||||| ||| |||||||||||  | |||||    || ||||||||||||||||||||    
T  36978817 aatagtagagatacaagatggaatcctaatataaatatgaaaactagcatgacgcgaaaccacttaattaacaaagctatgagcgacttcg 36978727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 65 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 4052909 - 4052843
Alignment:
Q  65 ctagcaaagctatgagcgacttcgttggcttgtctccgaatgaacctaatatcaaatgttactaaat 131  Q
    |||||||| |||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||| |||| | ||| ||||||    
T  4052909 ctagcaaaactatgagcaacttcgttggtttgtctccgaataaacctaacatcagaggttgctaaat 4052843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0577 (Bit Score: 267; Significance: 1e-149; HSPs: 1)
Name: scaffold0577
Description:

Target: scaffold0577; HSP #1
Raw Score: 267; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 1 - 385
Target Start/End: Original strand, 2228 - 2613
Alignment:
Q  1 aatagtagagatacaatattgaatcctaatatgaatatggaaattagcatgacgcagagccactctagcaaagctatgagcgacttcgttggcttgtctc 100  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  2228 aatagtagagatacaagatagaatcctaatatgaatatggaaactagcatgacgcaaagtcactctagcaaagctatgagcgacttcgttggcttgtctg 2327  T
Q  101 cgaatgaacctaatatcaaatgttactaaatca-aagctaacagacgtctacaatcattaataactacgctaaaattagagacgccacttttactaccat 199  Q
    ||||||||||||| |||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  2328 cgaatgaacctaacatcagaggttactaaatcagaagctaacagacgtctacaatcattaataaccgtgctaaaattagagacgccatttttactaccat 2427  T
Q  200 aaagaatgtctaccacagttttggagtcaaactcaaaatccacaatacctagttgcagatcgcagaacc-agtacattgctgataataaacccaaagctt 298  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| |    
T  2428 aaagattgtctaccacagttttggagtcaagctcaaagtccacaatacctagttgcagatcgc-gaaccgagtacattgctgataataaacccaaagcct 2526  T
Q  299 cacccaaatccacatcaaggagtggagtcatccattcagtcatggctaaaacaaagcgaccttcttcatctcgaatgcaaacaccaa 385  Q
    ||||||||||||||||||| || | |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||    
T  2527 cacccaaatccacatcaagaagcgaagtcatccattcagtcttggctaaaacaaagtgaccttcatcgtctcgaatgcaaacaccaa 2613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 259; Significance: 1e-144; HSPs: 18)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 259; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 1 - 385
Target Start/End: Complemental strand, 35853269 - 35852884
Alignment:
Q  1 aatagtagagatacaatattgaatcctaatatgaatatggaaattagcatgacgcagagccactctagcaaagctatgagcgacttcgttggcttgtctc 100  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||    
T  35853269 aatagtagagatacaagatggaatcctaatatgaatatggaaactagcatgacgcaaagccactctagcaaaactatgagcgacttcgttgacttgtctc 35853170  T
Q  101 cgaatgaacctaatatcaaatgttactaaatca-aagctaacagacgtctacaatcattaataactacgctaaaattagagacgccacttttactaccat 199  Q
    ||||||||||||| |||| | |||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  35853169 cgaatgaacctaacatcagaggttattaaatcagaagctaacagaagtctacaatcactaataactgcgctaaaattagagatgccacttttactaccat 35853070  T
Q  200 aaagaatgtctaccacagttttggagtcaaactcaaaatccacaatacctagttgcagatcgcagaac-cagtacattgctgataataaacccaaagctt 298  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||||||  |    
T  35853069 aaagactgtctaccacagttttggagtcaaactcaaagtccacaatacctagttgcagatcgc-gaacacagtgcattgctgataataaacccaaagact 35852971  T
Q  299 cacccaaatccacatcaaggagtggagtcatccattcagtcatggctaaaacaaagcgaccttcttcatctcgaatgcaaacaccaa 385  Q
    || |||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  35852970 caaccaaattcacatcaatgagcggagtcatccattcagtcttggctaaaacaaagcgatctttttcatctcgaatgcaaacaccaa 35852884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 254; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 1 - 385
Target Start/End: Original strand, 26429221 - 26429606
Alignment:
Q  1 aatagtagagatacaatattgaatcctaatatgaatatggaaattagcatgacgcagagccactctagcaaagctatgagcgacttcgttggcttgtctc 100  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  26429221 aatagtagagatacaagatggaatcctaatatgaatatggaaactagcatgacgcaaagccactctagcaaagctatgagcgactttgttggcttgtctc 26429320  T
Q  101 cgaatgaacctaatatcaaatgttactaaatca-aagctaacagacgtctacaatcattaataactacgctaaaattagagacgccacttttactaccat 199  Q
    ||||||||||||| |||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||  |||||||||    
T  26429321 cgaatgaacctaacatcagaggttactaaatcagaagctaacagacgtctacaatcattaataactgcgctaaaattaaagacgccactagtactaccat 26429420  T
Q  200 aaagaatgtctaccacagttttggagtcaaactcaaaatccacaatacctagttgcagatcgcagaaccagtacattgctgataataaacccaaagcttc 299  Q
    ||||| ||| ||||| | |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||| |  | ||||| |||||||||||| ||||||||||| ||    
T  26429421 aaagactgtttaccataattttggagtcaagctcaaagtccacaatacctagttggagatcacgaacccagtgcattgctgataacaaacccaaagcctc 26429520  T
Q  300 acccaaatccacatcaaggagtggagtcatccattcagtcatggctaaaacaaagcgaccttcttcatctcgaatgcaaacaccaa 385  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  26429521 acccaaatcgacatcaaggagcggagtcatccattcagtcttggctaaaacaaaacgaccttcttcatcttgaatgcaaacaccaa 26429606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 1 - 385
Target Start/End: Original strand, 17423851 - 17424236
Alignment:
Q  1 aatagtagagatacaatattgaatcctaatatgaatatggaaattagcatgacgcagagccactctagcaaagctatgagcgacttcgttggcttgtctc 100  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  17423851 aatagtagagatacaagatggaatcctaatatgaatatggaaactagcatgactcgaagccactctagcaaagctatgagcaacttcgttggcttgtctc 17423950  T
Q  101 cgaatgaacctaatatcaaatgttactaaatca-aagctaacagacgtctacaatcattaataactacgctaaaattagagacgccacttttactaccat 199  Q
    ||||| ||||||| |||| | ||| | |||||| |||||||||  |||||||| ||||| || ||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  17423951 cgaataaacctaacatcataggttgccaaatcagaagctaacatgcgtctacagtcattgatcactgcgctaaaattagagacgccacaattactaccat 17424050  T
Q  200 aaagaatgtctaccacagttttggagtcaaactcaaaatccacaatacctagttgcagatcgcagaaccagtacattgctgataataaacccaaagcttc 299  Q
    | ||| | ||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||| || |||||||| | ||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||    
T  17424051 agagactatctaccacagttttggaatcaagctcaaagtccacaatacctagctgtagatcgcaaacccaatacattgcagataataaacctaaagcctc 17424150  T
Q  300 acccaaatccacatcaaggagtggagtcatccattcagtcatggctaaaacaaagcgaccttcttcatctcgaatgcaaacaccaa 385  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||| | ||| | ||||||||||||||| |||| || |||||||    
T  17424151 acccaactccacatcaaggagcggagtcatccattcagttttggctgacacatatcgaccttcttcatcttgaatacacacaccaa 17424236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 1 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 48446756 - 48446379
Alignment:
Q  1 aatagtagagatacaatattgaatcctaatatgaatatggaaattagcatgacgcagagccactctagcaaagctatgagcgacttcgttggcttgtctc 100  Q
    ||||||||||||| || || ||| | ||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  48446756 aatagtagagatataagatggaaccataatatgaatatggaaactagcatgacgcaaagtcactctagcaaagctatgagcaacttcgttggcttgtctc 48446657  T
Q  101 cgaatgaacctaatatcaaatgttactaaatca-aagctaacagacgtctacaatcattaataactacgctaaaattagagacgccacttttactaccat 199  Q
    ||||| ||||||| |||| | |||||||||||  ||||||||||||||||||  ||||| || ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  48446656 cgaataaacctaacatcagaggttactaaatctgaagctaacagacgtctaccgtcattgattactgcgctaaaattagagacgccacttttactgccat 48446557  T
Q  200 aaagaatgtctaccacagttttggagtcaaactcaaaatccacaatacctagttgcagatcgcagaaccagtacattgctgataataaacccaaagcttc 299  Q
    ||||| | ||||||||||||||| | ||||  ||||| |||||||||||||||||||| ||||  | ||| ||||| |||||||||||||| ||||  ||    
T  48446556 aaagactatctaccacagttttgaaatcaagttcaaagtccacaatacctagttgcaggtcgcgaacccaatacatggctgataataaacctaaagtctc 48446457  T
Q  300 acccaaatccacatcaaggagtggagtcatccattcagtcatggctaaaacaaagcgaccttcttcatctcgaatgca 377  Q
    ||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||| || |||| |||||| | |||||||| ||||||||||||||    
T  48446456 accaaaatccacatcaaggagaggagacatccattcaatcttggccaaaacataacgaccttcatcatctcgaatgca 48446379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 1 - 385
Target Start/End: Complemental strand, 33846418 - 33846033
Alignment:
Q  1 aatagtagagatacaatattgaatcctaatatgaatatggaaattagcatgacgcagagccactctagcaaagctatgagcgacttcgttggcttgtctc 100  Q
    ||||||||| |||||| || |||||||||| |||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33846418 aatagtagaaatacaagatggaatcctaatgtgaatatggaaactagcatgacgcaaagccactctagcaaagctatgagcgacttcgttggcttgtctc 33846319  T
Q  101 cgaatgaacctaatatcaaatgttactaaatca-aagctaacagacgtctacaatcattaataactacgctaaaattagagacgccacttttactaccat 199  Q
    ||||| ||||||| | || | ||||| |||||| ||||||||| ||||||| | ||||| || ||| ||||||||||||| | |||||||||||| ||||    
T  33846318 cgaataaacctaacaccagaggttaccaaatcagaagctaacaaacgtctatagtcattgattactgcgctaaaattagatatgccacttttactgccat 33846219  T
Q  200 aaagaatgtctaccacagttttggagtcaaactcaaaatccacaatacctagttgcagatcgcagaaccagtacattgctgataataaacccaaagcttc 299  Q
    ||||| | ||||||| | ||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||| ||||| |  | ||||||||| ||||||||||| || ||||| ||    
T  33846218 aaagactatctaccaaaattttggaatcaagctcaaagtccacaatacctagttgtagatcacgaacccagtacatggctgataataagcctaaagcctc 33846119  T
Q  300 acccaaatccacatcaaggagtggagtcatccattcagtcatggctaaaacaaagcgaccttcttcatctcgaatgcaaacaccaa 385  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| || |||| |||||| | |||| ||| |||||| ||||||| |||||||    
T  33846118 acccaaatccacatcaaggagcggagacatccattcaatcttggccaaaacataacgacattcatcatcttgaatgcacacaccaa 33846033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 182; E-Value: 3e-98
Query Start/End: Original strand, 1 - 385
Target Start/End: Complemental strand, 9034995 - 9034623
Alignment:
Q  1 aatagtagagatacaatattgaatcctaatatgaatatggaaattagcatgacgcagagccactctagcaaagctatgagcgacttcgttggcttgtctc 100  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||             || ||||||||||||||||||||    
T  9034995 aatagtagagatacaagatggaatcctaatatgaatatggaaactagcatgacgcaaagccact-------------gaccgacttcgttggcttgtctc 9034909  T
Q  101 cgaatgaacctaatatcaaatgttactaaatca-aagctaacagacgtctacaatcattaataactacgctaaaattagagacgccacttttactaccat 199  Q
    ||||| ||||||| |||| | |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| | ||||||||||    
T  9034908 cgaataaacctaacatcagaggttactaaatcagaagctaacagacatctacaatcattaataactgcgctaaaattagaaacgccaatattactaccat 9034809  T
Q  200 aaagaatgtctaccacagttttggagtcaaactcaaaatccacaatacctagttgcagatcgcagaaccagtacattgctgataataaacccaaagcttc 299  Q
    ||||| | ||||||||| ||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||  | ||| ||||| |||||||||||||| ||||| ||    
T  9034808 aaagactatctaccacaattttggaatcaagctcaaagtccacaatacctagttgcagattgcgaacccaatacatggctgataataaacctaaagcctc 9034709  T
Q  300 acccaaatccacatcaaggagtggagtcatccattcagtcatggctaaaacaaagcgaccttcttcatctcgaatgcaaacaccaa 385  Q
    ||| ||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||| |||| |||||| | |||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  9034708 acctaaatccacatcaaagagcggagacatccattcagtcttggccaaaacataacgaccttcctcatctcgaatgcacacaccaa 9034623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 166; E-Value: 1e-88
Query Start/End: Original strand, 1 - 385
Target Start/End: Original strand, 26006114 - 26006499
Alignment:
Q  1 aatagtagagatacaatattgaatcctaatatgaatatggaaattagcatgacgcagagccactctagcaaagctatgagcgacttcgttggcttgtctc 100  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  26006114 aatagtagagatacaagatggaatcctaatatgaatatggaaactagcatgacgcaaagccactcaagcaaaactatgagcgacttcgttggcttgtctc 26006213  T
Q  101 cgaatgaacctaatatcaaatgttactaaatca-aagctaacagacgtctacaatcattaataactacgctaaaattagagacgccacttttactaccat 199  Q
     |||| ||||||| |||| | ||||||| |||| ||||||||||  ||||||| ||||| || |||  | ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  26006214 tgaataaacctaacatcagaagttactacatcagaagctaacaggggtctacagtcattgattactgtgataaaattagagacgccacttttactgccat 26006313  T
Q  200 aaagaatgtctaccacagttttggagtcaaactcaaaatccacaatacctagttgcagatcgcagaaccagtacattgctgataataaacccaaagcttc 299  Q
    ||||| | ||||||||| ||||| | |||| |||||| |||||||||||||| || | ||| |  | ||||||||| |||||||||||||| ||||  ||    
T  26006314 aaagactatctaccacatttttgaaatcaagctcaaattccacaatacctagctggacatcacgaacccagtacatagctgataataaacctaaagtctc 26006413  T
Q  300 acccaaatccacatcaaggagtggagtcatccattcagtcatggctaaaacaaagcgaccttcttcatctcgaatgcaaacaccaa 385  Q
    |||||||||||||||||| |   ||| |||||||| |||| || | |||||| | | |||||| |||||||||||||| |||||||    
T  26006414 acccaaatccacatcaagaatcagagacatccattaagtcttgtccaaaacataacaaccttcatcatctcgaatgcacacaccaa 26006499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 21 - 385
Target Start/End: Complemental strand, 54552695 - 54552331
Alignment:
Q  21 gaatcctaatatgaatatggaaattagcatgacgcagagccactctagcaaagctatgagcgacttcgttggcttgtctccgaatgaacctaatatcaaa 120  Q
    ||||||| ||||||||||| ||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||| ||||||| |||| |    
T  54552695 gaatcctgatatgaatatgaaatctagcatgacgcaaagccactctagcaaagctatgaccgacttcgttagcttgtatccgaataaacctaacatcaga 54552596  T
Q  121 tgttactaaatca-aagctaacagacgtctacaatcattaataactacgctaaaattagagacgccacttttactaccataaagaatgtctaccacagtt 219  Q
     |||||||||||| ||| ||| || ||| |||||||||| || ||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||| | ||||| ||| ||    
T  54552595 ggttactaaatcagaagttaataggcgtatacaatcatttattactacgctaaaat-agagatgccatttttactaccataaagactatctacgacaatt 54552497  T
Q  220 ttggagtcaaactcaaaatccacaatacctagttgcagatcgcagaaccagtacattgctgataataaacccaaagcttcacccaaatccacatcaagga 319  Q
    ||| | |||| |||||| |||| |||||| || |||||||| |  | ||||||||| |||||||||||||| | ||| |||||||||||||||| |||||    
T  54552496 ttgaaatcaagctcaaagtccataatacccagctgcagatcacgaacccagtacatagctgataataaacctagagcctcacccaaatccacattaagga 54552397  T
Q  320 gtggagtcatccattcagtcatggctaaaacaaagcgaccttcttcatctcgaatgcaaacaccaa 385  Q
    | ||||| |||||||||||| | ||||| ||| | |||||||| ||||||||||| || |||||||    
T  54552396 gcggagttatccattcagtcttcgctaacacataacgaccttcatcatctcgaatacacacaccaa 54552331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 143; E-Value: 5e-75
Query Start/End: Original strand, 1 - 262
Target Start/End: Original strand, 52759156 - 52759418
Alignment:
Q  1 aatagtagagatacaatattgaatcctaatatgaatatggaaattagcatgacgcagagccactctagcaaagctatgagcgacttcgttggcttgtctc 100  Q
    ||||||| |||||||  || ||||| ||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  52759156 aatagtatagatacacgatggaatcataatatgaatatggaaactagcatgacacaaagccactctaacaaaactatgagcgacttcgttggcttgtctc 52759255  T
Q  101 cgaatgaacctaatatcaaatgttactaaatca-aagctaacagacgtctacaatcattaataactacgctaaaattagagacgccacttttactaccat 199  Q
    ||||| ||||||| |||| | |||||||||||| |||||||||  |||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  52759256 cgaataaacctaacatcagaggttactaaatcataagctaacatgcgtctacaatcattgattactgcgctaaaattagagacgccagttttaataccat 52759355  T
Q  200 aaagaatgtctaccacagttttggagtcaaactcaaaatccacaatacctagttgcagatcgc 262  Q
    ||||| | |||| ||| |||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  52759356 aaagactatctatcacggttttggaatcaaactcaaagttcacaatacctagttgcagatcgc 52759418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 1 - 275
Target Start/End: Original strand, 2537008 - 2537283
Alignment:
Q  1 aatagtagagatacaatattgaatcctaatatgaatatggaaattagcatgacgcagagccactctagcaaagctatgagcgacttcgttggcttgtctc 100  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||| ||| || |||||||||||||||||||    
T  2537008 aatagtagagatacaagatggaatcctaacatgaatatggaaactagcatgacgcaaagtcactctagcaaagttataagagacttcgttggcttgtctc 2537107  T
Q  101 cgaatgaacctaatatcaaatgttactaaatca-aagctaacagacgtctacaatcattaataactacgctaaaattagagacgccacttttactaccat 199  Q
    ||||| ||||||| |||| | |||||||||||| |||||||||  |||||||| ||||| || ||| | |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  2537108 cgaataaacctaacatcagaggttactaaatcagaagctaacatgcgtctacagtcattgattactgcactaaaattagagacgccacttttactgccat 2537207  T
Q  200 aaagaatgtctaccacagttttggagtcaaactcaaaatccacaatacctagttgcagatcgcagaaccagtacat 275  Q
    ||||| | ||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||  || |||||||  | |||||||||    
T  2537208 aaagactatctaccacagttttggaatcaagctcaaagtccacaatacctatatgtagatcgcgaacccagtacat 2537283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 1 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 12274290 - 12273939
Alignment:
Q  1 aatagtagagatacaatattgaatcctaatatgaatatggaaattagcatgacgcagagccactctagcaaagctatgagcgacttcgttggcttgtctc 100  Q
    |||||||||||||||| || |||||||||||| ||||| |||| || |||||| || ||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  12274290 aatagtagagatacaagatggaatcctaatataaatatagaaactaacatgacacaaagttactctagcaaagctaagagcgacttcgttggcttatctc 12274191  T
Q  101 cgaatgaacctaatatcaaatgttactaaatca-aagctaacagacgtctacaatcattaataactacgctaaaattagagacgccacttttactaccat 199  Q
    ||||| ||||||| |||| | |||||||||||| |||||||||  | |||||| ||||| || ||| |||| |||||||||  |||||||||||||||||    
T  12274190 cgaataaacctaacatcagaggttactaaatcagaagctaacaagcatctacagtcattgattactgcgctgaaattagaggtgccacttttactaccat 12274091  T
Q  200 aaagaatgtctaccacagttttggagtcaaactcaaaatccacaatacctagttgcagatcgcagaaccagtacattgctgataataaacccaaagcttc 299  Q
    ||||| | ||  ||||||||||||| |||| |||||| | ||||||||||| ||| | ||||| || |||||||||  || |||||||||| ||||  ||    
T  12274090 aaagactatcagccacagttttggaatcaagctcaaagttcacaatacctaattgtatatcgcggacccagtacatcactaataataaacctaaagtctc 12273991  T
Q  300 acccaaatccacatcaaggagtggagtcatccattcagtcatggctaaaaca 351  Q
    || |||||||||||||||||| |||| ||| |||||| || |||||||||||    
T  12273990 actcaaatccacatcaaggagcggagacattcattcaatcttggctaaaaca 12273939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 65 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 791991 - 791717
Alignment:
Q  65 ctagcaaagctatgagcgacttcgttggcttgtctccgaatgaacctaatatcaaatgttactaaatca-aagctaacagacgtctacaatcattaataa 163  Q
    |||||||| |||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||| |||| | ||| |||||| | ||||||||||||||||||||||||| || |    
T  791991 ctagcaaaactatgagcaacttcgttggtttgtctccgaataaacctaacatcagaggttgctaaattagaagctaacagacgtctacaatcattgatca 791892  T
Q  164 ctacgctaaaattagagacgccacttttactaccataaagaatgtctaccacagttttggagtcaaactcaaaatccacaatacctagttgcagatcgca 263  Q
    || |||||||||||||||| ||||  ||||||||||| ||| | ||||||||||||||||| |||| |||||| |||| |||||  |||||||||||||     
T  791891 ctgcgctaaaattagagacaccacaattactaccatatagactatctaccacagttttggaatcaagctcaaagtccagaatactcagttgcagatcgcg 791792  T
Q  264 gaaccagtacattgctgataataaacccaaagcttcacccaaatccacatcaaggagtggagtcatccattcagt 338  Q
     | ||| |||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  791791 aacccaatacattgctgataataaacctaaagcctcactcaaatccacatcaaggagcggagtcatccattcagt 791717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 1 - 336
Target Start/End: Original strand, 8169353 - 8169689
Alignment:
Q  1 aatagtagagatacaatattgaatcctaatatgaatatggaaattagcatgacgcagagccactctagcaaagctatgagcgacttcgttggcttgtctc 100  Q
    ||||||||||||| ||  | |||| ||||||||||||  |||| |||||||||||  |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8169353 aatagtagagatataaggtggaattctaatatgaataatgaaactagcatgacgcgaagccatcctagcaaagctatgagcgacttcgttggcttgtctc 8169452  T
Q  101 cgaatgaacctaatatcaaatgttactaaatca-aagctaacagacgtctacaatcattaataactacgctaaaattagagacgccacttttactaccat 199  Q
    ||||| ||||||| |||| | |||||||||||| |||||||||  | ||||||||||||||| | | ||||||||| | |||| ||||||||||||||||    
T  8169453 cgaataaacctaacatcagaggttactaaatcagaagctaacatgcatctacaatcattaattaatgcgctaaaataaaagacaccacttttactaccat 8169552  T
Q  200 aaagaatgtctaccacagttttggagtcaaactcaaaatccacaatacctagttgcagatcgcagaaccagtacattgctgataataaacccaaagcttc 299  Q
    ||||| | ||  ||||||||||| | ||||||||||| |||| |||| | || |||||||| |  | ||| || ||| | ||||||||||| || || ||    
T  8169553 aaagattatccgccacagttttgaaatcaaactcaaagtccataatatccagctgcagatcacgaacccaataaattacagataataaacctaaggcctc 8169652  T
Q  300 acccaaatccacatcaaggagtggagtcatccattca 336  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||| |||||| ||||    
T  8169653 acccaaatccacatcaatgagcggaatcatcctttca 8169689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 121; E-Value: 7e-62
Query Start/End: Original strand, 1 - 204
Target Start/End: Original strand, 25058333 - 25058537
Alignment:
Q  1 aatagtagagatacaatattgaatcctaatatgaatatggaaattagcatgacgcagagccactctagcaaagctatgagcgacttcgttggcttgtctc 100  Q
    |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||  ||||| |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  25058333 aatagtagagatacaagattgaatcttaatatgaatatggaaactaacatgacgcgaagccagtctaacaaaactatgagcgacttcgttggcttgtctc 25058432  T
Q  101 cgaatgaacctaatatcaaatgttactaaatca-aagctaacagacgtctacaatcattaataactacgctaaaattagagacgccacttttactaccat 199  Q
    | ||| ||||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| | |  ||||||||||||||    
T  25058433 caaataaacctaacatcagatgttactaaatcagaagctaacagacgtctacaatcattaattactgcgctaaaattagatatgttacttttactaccat 25058532  T
Q  200 aaaga 204  Q
    |||||    
T  25058533 aaaga 25058537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 385
Target Start/End: Original strand, 22359270 - 22359653
Alignment:
Q  1 aatagtagagatacaatattgaatcctaatatgaatatggaaattagcatgacgcagagccactctagcaaagctatgagcgacttcgttggcttgtctc 100  Q
    |||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||  |||||| ||||||| |||||||||||||||| |     
T  22359270 aatagtagagatacaagatggaatcttaatatgaatatggaaactagcatgacacaaagccactaaagcaaaactatgagtgacttcgttggcttgtatt 22359369  T
Q  101 cgaatgaacctaatatcaaatgttactaaatca-aagctaacagacgtctacaatcattaataactacgctaaaattagagacgccacttttactaccat 199  Q
    ||||| |||  || |||| |  ||||||||||| |||||||||| | || ||||| ||| || |||  |||||||||||||||| ||||||||||   ||    
T  22359370 cgaataaaca-aacatcagagattactaaatcagaagctaacaggcatcgacaataattgattactgtgctaaaattagagacgtcacttttactgttat 22359468  T
Q  200 aaagaatgtctaccacagttttggagtcaaactcaaaatccacaatacctagttgcagatcgcagaaccagtacattgctgataataaacccaaagcttc 299  Q
    ||||| | | ||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||| || ||| |  | ||||||||| |||||||||||||| ||||  ||    
T  22359469 aaagactatataccacagttttgaaatcaaactcaaagtccacaatacctagttacaaatcacgaatccagtacatggctgataataaacctaaagtctc 22359568  T
Q  300 acccaaatccacatcaaggagtggagtcatccattcagtcatggctaaaacaaagcgaccttcttcatctcgaatgcaaacaccaa 385  Q
    ||||| | |||||| ||||||  ||| |||||||||| || |||| |||||| | | | |||  |||||||||||||| |||||||    
T  22359569 acccagacccacataaaggag-cgagacatccattcattcttggccaaaacataacaatctttatcatctcgaatgcacacaccaa 22359653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 1 - 204
Target Start/End: Original strand, 19396195 - 19396399
Alignment:
Q  1 aatagtagagatacaatattgaatcctaatatgaatatggaaattagcatgacgcagagccactctagcaaagctatgagcgacttcgttggcttgtctc 100  Q
    |||||||||||||||| ||  |||| |||||||||| || ||| ||| |||||||| ||||||  ||||||| |||| ||||||||  ||||||||||||    
T  19396195 aatagtagagatacaagatacaatcttaatatgaatgtgaaaactagtatgacgcaaagccaccatagcaaaactataagcgactttattggcttgtctc 19396294  T
Q  101 cgaatgaacctaatatcaaatgttactaaatca-aagctaacagacgtctacaatcattaataactacgctaaaattagagacgccacttttactaccat 199  Q
    ||||| ||||||| |||||| |||||||||||| ||||||||| || | |||||| ||| || | | | ||| ||||||||||| ||||||||| |||||    
T  19396295 cgaataaacctaacatcaaaggttactaaatcagaagctaacaaacatttacaattatttattattgcactataattagagacgacacttttacaaccat 19396394  T
Q  200 aaaga 204  Q
    |||||    
T  19396395 aaaga 19396399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 196 - 259
Target Start/End: Original strand, 23860120 - 23860183
Alignment:
Q  196 ccataaagaatgtctaccacagttttggagtcaaactcaaaatccacaatacctagttgcagat 259  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  23860120 ccataaagactgtctactacagttttggagtcaagttcaaagtccacaatacctagttgcagat 23860183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 3 - 101
Target Start/End: Original strand, 23860023 - 23860121
Alignment:
Q  3 tagtagagatacaatattgaatcctaatatgaatatggaaattagcatgacgcagagccactctagcaaagctatgagcgacttcgttggcttgtctcc 101  Q
    |||||||||||| | ||  |||| ||||||||||||| ||||||  |||| ||| |  |||||||| |||||||||||||| ||||||| ||| |||||    
T  23860023 tagtagagatacgagatgaaatcgtaatatgaatatgaaaattattatgatgcaaaatcactctagtaaagctatgagcgatttcgttgacttatctcc 23860121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016 (Bit Score: 254; Significance: 1e-141; HSPs: 1)
Name: scaffold0016
Description:

Target: scaffold0016; HSP #1
Raw Score: 254; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 1 - 385
Target Start/End: Complemental strand, 187236 - 186851
Alignment:
Q  1 aatagtagagatacaatattgaatcctaatatgaatatggaaattagcatgacgcagagccactctagcaaagctatgagcgacttcgttggcttgtctc 100  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  187236 aatagtagagatacaagatggaatcctaatatgaatatggaaactagcatgacgcaaagccactatagcaaagctatgagcgaattcgttggcttgtctc 187137  T
Q  101 cgaatgaacctaatatcaaatgttactaaatca-aagctaacagacgtctacaatcattaataactacgctaaaattagagacgccacttttactaccat 199  Q
    ||||||||||||| || | | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  187136 cgaatgaacctaacattagaggttactaaatcagaagctaacagacgtctacaatcattaataattgcgctaaaattagagacgccactagtactaccat 187037  T
Q  200 aaagaatgtctaccacagttttggagtcaaactcaaaatccacaatacctagttgcagatcgcagaaccagtacattgctgataataaacccaaagcttc 299  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |  | ||||| |||||||||||| ||||||||||| ||    
T  187036 aaagactgtctaccacacttttggagtcaagctcaaagtccacaatacctagttgcagatcacgaacccagtgcattgctgataacaaacccaaagcctc 186937  T
Q  300 acccaaatccacatcaaggagtggagtcatccattcagtcatggctaaaacaaagcgaccttcttcatctcgaatgcaaacaccaa 385  Q
    |||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  186936 acccaactcgacatcaaggagcggagtcatccattcagtcttggctaaaacaaaacaaccttcttcatctcgaatgcaaacaccaa 186851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 210; Significance: 1e-115; HSPs: 13)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 1 - 385
Target Start/End: Original strand, 23769804 - 23770189
Alignment:
Q  1 aatagtagagatacaatattgaatcctaatatgaatatggaaattagcatgacgcagagccactctagcaaagctatgagcgacttcgttggcttgtctc 100  Q
    |||||||||||||||| || |||| |||||||||||||||||| |||||||   || ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23769804 aatagtagagatacaagatagaattctaatatgaatatggaaactagcatgtaacaaagctactctagcaaagctatgagcgacttcgttggcttgtctc 23769903  T
Q  101 cgaatgaacctaatatcaaatgttactaaatca-aagctaacagacgtctacaatcattaataactacgctaaaattagagacgccacttttactaccat 199  Q
    ||||| ||||||| |||| | |||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  23769904 cgaataaacctaacatcagaggttactaattctgaagctaacagacgtctacaatcattgattactgcgctaaaattagagacgccacttttactgccat 23770003  T
Q  200 aaagaatgtctaccacagttttggagtcaaactcaaaatccacaatacctagttgcagatcgcagaaccagtacattgctgataataaacccaaagcttc 299  Q
    ||||| | ||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||  | ||||||||| |||||||||||||| ||||  ||    
T  23770004 aaagactatctaccacagttttggaatcaagctcaaagtccacaatacctagctgcagatcgcgaacccagtacatggctgataataaacctaaagtctc 23770103  T
Q  300 acccaaatccacatcaaggagtggagtcatccattcagtcatggctaaaacaaagcgaccttcttcatctcgaatgcaaacaccaa 385  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||| |||| |||||| | | |||||| |||||||||||||| |||||||    
T  23770104 acccaaatctacatcaaggagtggagacattcattcagtcttggccaaaacataacaaccttcatcatctcgaatgcacacaccaa 23770189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 184; E-Value: 2e-99
Query Start/End: Original strand, 1 - 339
Target Start/End: Original strand, 24477505 - 24477844
Alignment:
Q  1 aatagtagagatacaatattgaatcctaatatgaatatggaaattagcatgacgcagagccactctagcaaagctatgagcgacttcgttggcttgtctc 100  Q
    ||||||||||||| || || ||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||    
T  24477505 aatagtagagatataagatggaatcctaatatgaatatgaaaactagcataacgcaaagccactctagcaaaactatgagcgacttcgttggtttatctc 24477604  T
Q  101 cgaatgaacctaatatcaaatgttactaaatca-aagctaacagacgtctacaatcattaataactacgctaaaattagagacgccacttttactaccat 199  Q
    ||||| ||||||| |||| | |||||||||||| |||||||||  | |||||| ||||| || ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24477605 cgaataaacctaacatcagaggttactaaatcagaagctaacatgcatctacagtcattcattactgcgctaaaattagagacgccacttttactaccat 24477704  T
Q  200 aaagaatgtctaccacagttttggagtcaaactcaaaatccacaatacctagttgcagatcgcagaaccagtacattgctgataataaacccaaagcttc 299  Q
    ||||| | ||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||  | ||| ||||| |||||||||||||| ||||| ||    
T  24477705 aaagactatctaccacagttttggaatcaagctcaaagtccacaatacctaattgcagatcgcgaacccaatacatggctgataataaacctaaagcctc 24477804  T
Q  300 acccaaatccacatcaaggagtggagtcatccattcagtc 339  Q
    ||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  24477805 acctaaatccacatcaaggagcggagacatccattcagtc 24477844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 178; E-Value: 7e-96
Query Start/End: Original strand, 1 - 385
Target Start/End: Complemental strand, 10213928 - 10213543
Alignment:
Q  1 aatagtagagatacaatattgaatcctaatatgaatatggaaattagcatgacgcagagccactctagcaaagctatgagcgacttcgttggcttgtctc 100  Q
    |||||||||||||||| ||  |||| ||||||||||||||||| |||||||||||  |||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||    
T  10213928 aatagtagagatacaagatgaaatcttaatatgaatatggaaactagcatgacgcgaagccaccctagcaaaactatgagcgacttcgttggtttgtctc 10213829  T
Q  101 cgaatgaacctaatatcaaatgttactaaatca-aagctaacagacgtctacaatcattaataactacgctaaaattagagacgccacttttactaccat 199  Q
    ||||| ||||||| |||| | |||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  10213828 cgaataaacctaacatcagaggttactaaatcagaagctaacaagcgtctacaatcattagttactgcgctaaaattagatacgccacttttactaccat 10213729  T
Q  200 aaagaatgtctaccacagttttggagtcaaactcaaaatccacaatacctagttgcagatcgcagaaccagtacattgctgataataaacccaaagcttc 299  Q
    ||||| | || |||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||| || |||||||| | || ||| |||| ||||||||||||||| |  || ||    
T  10213728 aaagactatccaccacagttttggaatcaagctcaaagtccacaatacccagctgcagatcacggacccaatacagtgctgataataaacctagggcctc 10213629  T
Q  300 acccaaatccacatcaaggagtggagtcatccattcagtcatggctaaaacaaagcgaccttcttcatctcgaatgcaaacaccaa 385  Q
    ||||| ||||||||||| |||   |||||||||||||||  ||||||||||||| | |||||| |||||||| || || |||||||    
T  10213628 acccagatccacatcaatgagataagtcatccattcagttttggctaaaacaaaacaaccttcatcatctcggatacacacaccaa 10213543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 170; E-Value: 4e-91
Query Start/End: Original strand, 9 - 385
Target Start/End: Original strand, 38451729 - 38452106
Alignment:
Q  9 agatacaatattgaatcctaatatgaatatggaaattagcatgacgcagagccactctagcaaagctatgagcgacttcgttggcttgtctccgaatgaa 108  Q
    |||||||| ||  ||| |||||||||||||||||| |||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||    
T  38451729 agatacaagatgaaattctaatatgaatatggaaactagcatggtgcaaagccactctagcaaagctatgagcgatttcgttggcttgtctccgaaaaaa 38451828  T
Q  109 cctaatatcaaatgttactaaatca-aagctaacagacgtctacaatcattaataactacgctaaaattagagacgccacttttactaccataaagaatg 207  Q
    ||||| || | | |||| ||||||| |||||||||| |||||||| ||||| || | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |     
T  38451829 cctaacattagaggttaataaatcagaagctaacaggcgtctacagtcattgattattgcgctaaaattagagacgccacttttactaccataaaggcta 38451928  T
Q  208 tctaccacagttttggagtcaaactcaaaatccacaatacctagttgcagatcgcagaaccagtacattgctgataataaacccaaagcttcacccaaat 307  Q
    || | ||| |||||||| |||| |||||| ||||||||||||||  | |||||||  | ||||||||| |||||||||||||| ||||  ||||| ||||    
T  38451929 tccatcacggttttggaatcaagctcaaagtccacaatacctagccgaagatcgcgaacccagtacatggctgataataaacctaaagtctcacctaaat 38452028  T
Q  308 ccacatcaaggagtggagtcatccattcagtcatggctaaaacaaagcgaccttcttcatctcgaatgcaaacaccaa 385  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| |||| |||| |||||| | |||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  38452029 ccacatcaaggagtggagacatccatttagtcttggccaaaacataacgaccttcatcatctcgaatgcacacaccaa 38452106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 385
Target Start/End: Original strand, 23407778 - 23408161
Alignment:
Q  1 aatagtagagatacaatattgaatcctaatatgaatatggaaattagcatgacgcagagccactctagcaaagctatgagcgacttcgttggcttgtctc 100  Q
    ||||||||||||| || || ||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||  || ||  ||| |||| ||||||||||||| ||| |||||||||    
T  23407778 aatagtagagatataagatggaatcttaatatgaatatggaaactagcatgatgcgaagacatcctaacaaaactatgagcgactttgtttgcttgtctc 23407877  T
Q  101 cgaatgaacctaatatcaaatgttactaaatca-aagctaacagacgtctacaatcattaataactacgctaaaattagagacgccacttttactaccat 199  Q
    ||||| ||||||| || | | |||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||| ||||||||||| |||    
T  23407878 cgaataaacctaacattagaggttactaaatcagaagctaacatgcgtctacaatcattaattactaaactaaaattagagacgtcacttttactatcat 23407977  T
Q  200 aaagaatgtctaccacagttttggagtcaaactcaaaatccacaatacctagttgcagatcgcagaac-cagtacattgctgataataaacccaaagctt 298  Q
    ||||| | || ||||||||||| || |||| |||||| ||||||||||| || |||| ||| | |||| || |||||||| |||| |||||| || || |    
T  23407978 aaagactatccaccacagttttagaatcaagctcaaagtccacaatacccagctgca-atcac-gaactcaatacattgc-gatagtaaacctaaggcct 23408074  T
Q  299 cacccaaatccacatcaaggagtggagtcatccattcagtcatggctaaaacaaagcgaccttcttcatctcgaatgcaaacaccaa 385  Q
    |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || |||||||    
T  23408075 cacccaaatccacatcaatgagcggagtcatccattcagttttggctaaaacaaaacgaccttcatcatctcgaatacacacaccaa 23408161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 143; E-Value: 5e-75
Query Start/End: Original strand, 1 - 290
Target Start/End: Original strand, 45086014 - 45086304
Alignment:
Q  1 aatagtagagatacaatattgaatcctaatatgaatatggaaattagcatgacgcagagccactctagcaaagctatgagcgacttcgttggcttgtctc 100  Q
    ||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  45086014 aatagtagagatataagatggaatcctaatatgaatatggaaactagcatgacgcgaagccactctagccaagctatgagcgactttgttggcttgtctc 45086113  T
Q  101 cgaatgaacctaatatcaaatgttactaaatca-aagctaacagacgtctacaatcattaataactacgctaaaattagagacgccacttttactaccat 199  Q
    ||||| ||||||| |||| | |||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||| || ||  ||||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  45086114 cgaataaacctaacatcagaggttactaaatcataagctaacagtcgtttacaatcattgatcacggcgctaaaattagagacgccacatttgctaccat 45086213  T
Q  200 aaagaatgtctaccacagttttggagtcaaactcaaaatccacaatacctagttgcagatcgcagaaccagtacattgctgataataaacc 290  Q
    ||||| | ||||||||| | ||||| |||| |||||| | ||||||||| |  ||||||||||  | ||| ||||||||||||||||||||    
T  45086214 aaagactatctaccacattcttggaatcaagctcaaagttcacaatacccaactgcagatcgcgaacccaatacattgctgataataaacc 45086304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 5 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 22606024 - 22605835
Alignment:
Q  5 gtagagatacaatattgaatcctaatatgaatatggaaattagcatgacgcagagccactctagcaaagctatgagcgacttcgttggcttgtctccgaa 104  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| | ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||     
T  22606024 gtagagatacaagatggaatcctaatatgaatatgaaaactagcatgacgcaaaaccactctcgcaaagctatgagcgactccgttggcttgtctctgat 22605925  T
Q  105 tgaacctaatatcaaatgttactaaatca-aagctaacagacgtctacaatcattaataactacgctaaaattagagacgccacttttac 193  Q
    ||||||||| |||| | |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  22605924 tgaacctaacatcagaggttactaaatcagaagctaacagacgactacaatcattaataactacgcaaaaattagagacgccacttttac 22605835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 7 - 338
Target Start/End: Original strand, 40074065 - 40074394
Alignment:
Q  7 agagatacaatattgaatcctaatatgaatatggaaattagcatgacgcagagccactctagcaaagctatgagcgacttcgttggcttgtctccgaatg 106  Q
    |||||||||| || ||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||  ||||| | ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||  |||     
T  40074065 agagatacaagatggaatcttaatatgaatatgaaaactagcatgacgcgaagccatt-tagcaaaactatgagcgactttgttggcttgtctct-aata 40074162  T
Q  107 aacctaatatcaaatgttactaaatca-aagctaacagacgtctacaatcattaataactacgctaaaattagagacgccacttttactaccataaagaa 205  Q
    ||||||| || | | ||| |||||||| |||| ||||||||| ||||  |||| ||| || | ||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||     
T  40074163 aacctaacattagaggttgctaaatcagaagcaaacagacgtttacagccattgata-ctgcactataattagaaacgccgcttttactaccataaagac 40074261  T
Q  206 tgtctaccacagttttggagtcaaactcaaaatccacaatacctagttgcagatcgcagaaccagtacattgctgataataaacccaaagcttcacccaa 305  Q
    | || ||||||||||||||   ||||||||||||||||||||| | ||| ||||| |  | ||| |||||||||||||||||||| ||||| || |||||    
T  40074262 tatccaccacagttttggaacaaaactcaaaatccacaatacccaattgtagatcacgcacccaatacattgctgataataaacctaaagcctcgcccaa 40074361  T
Q  306 atccacatcaaggagtggagtcatccattcagt 338  Q
    |||||| |||| |||||||||||||||||||||    
T  40074362 atccacttcaatgagtggagtcatccattcagt 40074394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 74; E-Value: 8e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 27177834 - 27177589
Alignment:
Q  1 aatagtagagatacaatattgaatcctaatatgaatatggaaattagcatgacgcagagccactctagcaaagctatgagcgacttcgttggcttgtctc 100  Q
    |||||||||||||||  |  ||||| |||||||||||||||||  || ||||| || ||||   ||||  || |||||||| ||||||||||||||||||    
T  27177834 aatagtagagatacacaacggaatcttaatatgaatatggaaacaagaatgacacaaagccgtcctagtgaaactatgagctacttcgttggcttgtctc 27177735  T
Q  101 cgaatgaacctaatatcaaatgttactaaatcaa-agctaacagacgtctacaatcattaataactacgctaaaattagagacgccacttttactaccat 199  Q
      ||| ||||| | |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||| ||| | ||| ||||| | || ||| |||||| |||||    
T  27177734 ataataaacctgacatcaaaggttactaaatcaagagctaatagacgtctacaatcatcaatcactgcactataattaaaaacaccatttttaccaccat 27177635  T
Q  200 aaagaatgtctaccacagttttggagtcaaactcaaaatccacaat 245  Q
    | ||| | || |||||||||||||| ||||||| |||||| |||||    
T  27177634 agagactatcgaccacagttttggaatcaaactgaaaatctacaat 27177589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 26 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 1604941 - 1604721
Alignment:
Q  26 ctaatatgaatatggaaattagcatgacgcagagccactctagcaaagctatgagcgacttcgttggcttgtctccgaatgaacctaatatcaaatgtta 125  Q
    |||||||||||| | ||| || |||||| |  | |||||||||| || |||||| |||||| ||||  |||||||| ||| |||||||||||| ||||||    
T  1604941 ctaatatgaatacgaaaactaacatgacactaatccactctagcgaaactatgaacgactttgttgatttgtctcctaataaacctaatatcagatgtta 1604842  T
Q  126 ctaaatca-aagctaacagacgtctacaatcattaataactacgctaaaattagagacgccacttttactaccataaagaatgtctaccacagttttgga 224  Q
    |||||||| |||||| || || || ||||||||| || | | | ||  ||||||||||  |||| |||| |||||||| | | ||||||| ||||||| |    
T  1604841 ctaaatcagaagctagcacacatcaacaatcattgatcaatgcactttaattagagacatcactcttaccaccataaatactatctaccatagttttgta 1604742  T
Q  225 gtcaaactcaaaatccacaat 245  Q
     ||||||||||||||||||||    
T  1604741 atcaaactcaaaatccacaat 1604721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 81
Target Start/End: Complemental strand, 11616741 - 11616661
Alignment:
Q  1 aatagtagagatacaatattgaatcctaatatgaatatggaaattagcatgacgcagagccactctagcaaagctatgagc 81  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||| | || |||||||||||||||||||||    
T  11616741 aatagtagagatacaagatagaatcctaatatgaatatggaaactagcatgacgtaaagtcactctagcaaagctatgagc 11616661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 90
Target Start/End: Original strand, 31411394 - 31411483
Alignment:
Q  1 aatagtagagatacaatattgaatcctaatatgaatatggaaattagcatgacgcagagccactctagcaaagctatgagcgacttcgtt 90  Q
    |||| |||| |||||| ||  |||||||||||||||||||||| ||| ||||| || || ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  31411394 aataatagatatacaagatgaaatcctaatatgaatatggaaactagaatgacacaaagtcactctagcaaagctatgaacgacttcgtt 31411483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 5 - 95
Target Start/End: Complemental strand, 32025626 - 32025536
Alignment:
Q  5 gtagagatacaatattgaatcctaatatgaatatggaaattagcatgacgcagagccactctagcaaagctatgagcgacttcgttggctt 95  Q
    ||||||||| || ||  ||| ||||||| |||||||||| |||||||||    || ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  32025626 gtagagatataacatgaaattctaatataaatatggaaactagcatgacatgaagtcactctagcaaagctatgagcaacttcattggctt 32025536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0279 (Bit Score: 188; Significance: 1e-102; HSPs: 1)
Name: scaffold0279
Description:

Target: scaffold0279; HSP #1
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 1 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 6823 - 6564
Alignment:
Q  1 aatagtagagatacaatattgaatcctaatatgaatatggaaattagcatgacgcagagccactctagcaaagctatgagcgacttcgttggcttgtctc 100  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  6823 aatagtagagatacaagatggaatcctaatatgaatatggaaactagcatgacgcaaagccgctctagcaaagctatgagcgacttcgttgtcttgtctc 6724  T
Q  101 cgaatgaacctaatatcaaatgttactaaatca-aagctaacagacgtctacaatcattaataactacgctaaaattagagacgccacttttactaccat 199  Q
    ||||||||||||| |||| | |||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  6723 cgaatgaacctaacatcagaggttactaaatcagaagctaatagacgtttacaatcattaataactgcgctaaaattagagacgccatttttactaccat 6624  T
Q  200 aaagaatgtctaccacagttttggagtcaaactcaaaatccacaatacctagttgcagat 259  Q
    ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  6623 aaaggctgtctaccacagttttggagtcaaactcaaagtccacaatacctagttgcagat 6564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0200 (Bit Score: 186; Significance: 1e-100; HSPs: 1)
Name: scaffold0200
Description:

Target: scaffold0200; HSP #1
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 1 - 385
Target Start/End: Original strand, 26967 - 27352
Alignment:
Q  1 aatagtagagatacaatattgaatcctaatatgaatatggaaattagcatgacgcagagccactctagcaaagctatgagcgacttcgttggcttgtctc 100  Q
    ||||| |||||||||| ||  ||| |||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26967 aatagcagagatacaagatgaaattctaatatgaatatgaaaactagcatgacgcaaagccactctagcaaagctatgagcgacttcgttggcttgtctc 27066  T
Q  101 cgaatgaacctaatatcaaatgttactaaatca-aagctaacagacgtctacaatcattaataactacgctaaaattagagacgccacttttactaccat 199  Q
    ||||| ||||||| |||| | ||||| |||||| ||| |||||| |||||||||||||| || ||| | |||||||||||||| ||| || |||| ||||    
T  27067 cgaataaacctaaaatcagaggttacgaaatcagaagataacaggcgtctacaatcattgattactgcactaaaattagagacaccatttatactgccat 27166  T
Q  200 aaagaatgtctaccacagttttggagtcaaactcaaaatccacaatacctagttgcagatcgcagaaccagtacattgctgataataaacccaaagcttc 299  Q
    ||||| | ||||||| ||||||||| |||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||  | ||| ||||| |||||||||||||| ||||| ||    
T  27167 aaagactatctaccatagttttggaatcaagctcaaagtccacaatacctagctgcagatcgcgaacccaatacatggctgataataaacctaaagcctc 27266  T
Q  300 acccaaatccacatcaaggagtggagtcatccattcagtcatggctaaaacaaagcgaccttcttcatctcgaatgcaaacaccaa 385  Q
    |||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||| |||| |||||| | |||| ||| | |||||||||||| |||||||    
T  27267 acccaaatccacatcaaggagtggaaacatccatccagtcttggccaaaacataacgacattcattatctcgaatgcacacaccaa 27352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0450 (Bit Score: 162; Significance: 2e-86; HSPs: 1)
Name: scaffold0450
Description:

Target: scaffold0450; HSP #1
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 5401 - 5156
Alignment:
Q  1 aatagtagagatacaatattgaatcctaatatgaatatggaaattagcatgacgcagagccactctagcaaagctatgagcgacttcgttggcttgtctc 100  Q
    |||||||||||||||| || ||||  |||||||||||||||||||||||||| ||| || |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  5401 aatagtagagatacaagatggaattttaatatgaatatggaaattagcatgatgcaaagtcactatagcaaagttatgagcgacttcgttggcttgtctc 5302  T
Q  101 cgaatgaacctaatatcaaatgttactaaatc-aaagctaacagacgtctacaatcattaataactacgctaaaattagagacgccacttttactaccat 199  Q
    ||||||||||||| |||| | ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  5301 cgaatgaacctaacatcagaggttactaaatcaaaagctaacaggcgtctacaatcattaataactgcgttaaaattagagacgctacttttactaccat 5202  T
Q  200 aaagaatgtctaccacagttttggagtcaaactcaaaatccacaat 245  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  5201 aaagactgtctaccacagttttggagtcaagctcaaagtccacaat 5156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004 (Bit Score: 160; Significance: 4e-85; HSPs: 1)
Name: scaffold0004
Description:

Target: scaffold0004; HSP #1
Raw Score: 160; E-Value: 4e-85
Query Start/End: Original strand, 1 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 216572 - 216221
Alignment:
Q  1 aatagtagagatacaatattgaatcctaatatgaatatggaaattagcatgacgcagagccactctagcaaagctatgagcgacttcgttggcttgtctc 100  Q
    |||||||||||||  | || ||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  216572 aatagtagagatattagatggaatcctaatatgaatatgaaaactagcatggcgcaaagccactctagcaaaggaatgagcgacttcgttggcttgtctc 216473  T
Q  101 cgaatgaacctaatatcaaatgttactaaatca-aagctaacagacgtctacaatcattaataactacgctaaaattagagacgccacttttactaccat 199  Q
    ||||| ||||||| |||||| |||||||||||| || ||||||  |||||||| ||||| || | | ||||||||||| ||| |||| ||||||| ||||    
T  216472 cgaataaacctaacatcaaaggttactaaatcagaatctaacatgcgtctacagtcattgattattgcgctaaaattaaagatgccatttttactgccat 216373  T
Q  200 aaagaatgtctaccacagttttggagtcaaactcaaaatccacaatacctagttgcagatcgcagaaccagtacattgctgataataaacccaaagcttc 299  Q
    ||||| | ||||||||| |||| || |||| |||||| |||||||||||||| || |||||||  | ||||||||| || ||||||||||| ||||| ||    
T  216372 aaagactatctaccacaattttagaatcaagctcaaagtccacaatacctagctgtagatcgcgaacccagtacatggcagataataaacctaaagcctc 216273  T
Q  300 acccaaatccacatcaaggagtggagtcatccattcagtcatggctaaaaca 351  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||| |||| ||||||    
T  216272 acccaaatccacatcaaggagcggagacatccattgagtcttggccaaaaca 216221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011 (Bit Score: 139; Significance: 1e-72; HSPs: 1)
Name: scaffold0011
Description:

Target: scaffold0011; HSP #1
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 1 - 385
Target Start/End: Complemental strand, 58510 - 58124
Alignment:
Q  1 aatagtagagatacaatattgaatcctaatatgaatatggaaattagcatgacgcagagccactctagcaaagctatgagcgacttcgttggcttgtctc 100  Q
    |||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||| |||||||||  | |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||     
T  58510 aatagtagagatacaagatggaaccctaatatgaatatggaaactagcatgacataaagccactcgagcaaagctatgagagacttcgttggcttgtctt 58411  T
Q  101 cgaatgaacctaatatcaaatgttactaaatca-aagctaacagacgtctacaatcattaataactacgctaaaattagagacgcca-cttttactacca 198  Q
    | ||| ||||||| |||| | |||| ||||||| ||||||| || |||||||| ||||| || |||||||||||||||||||| | |  ||||||| |||    
T  58410 ccaataaacctaacatcagaggttattaaatcagaagctaataggcgtctacagtcatttattactacgctaaaattagagacacgattttttactgcca 58311  T
Q  199 taaagaatgtctaccacagttttggagtcaaactcaaaatccacaatacctagttgcagatcgcagaaccagtacattgctgataataaacccaaagctt 298  Q
    |||||| | ||||||||| ||||||| ||||  ||||| ||||   ||||||| | || |||||  | ||||||||| || ||||||||||| ||||  |    
T  58310 taaagactatctaccacaattttggaatcaatatcaaagtccaacgtacctagctacaaatcgcgaacccagtacatggcagataataaacctaaaggct 58211  T
Q  299 cacccaaatccacatcaaggagtggagtcatccattcagtcatggctaaaacaaagcgaccttcttcatctcgaatgcaaacaccaa 385  Q
    ||||| |||||| ||||| ||| |||| ||||||||||||| ||||||||||| |  ||||||  |||||||||||||| |||||||    
T  58210 cacccgaatccatatcaacgagcggagacatccattcagtcttggctaaaacataatgacctttatcatctcgaatgcacacaccaa 58124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 115; Significance: 3e-58; HSPs: 7)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 65 - 385
Target Start/End: Original strand, 25070898 - 25071219
Alignment:
Q  65 ctagcaaagctatgagcgacttcgttggcttgtctccgaatgaacctaatatcaaatgttactaaatca-aagctaacagacgtctacaatcattaataa 163  Q
    |||||||| |||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||| |||| | ||| |||||| | |||||||||  |||||||| ||||| || |    
T  25070898 ctagcaaaactatgagcaacttcgttggtttgtctccgaataaacctaacatcagaggttgctaaattagaagctaacatgcgtctacagtcattgatca 25070997  T
Q  164 ctacgctaaaattagagacgccacttttactaccataaagaatgtctaccacagttttggagtcaaactcaaaatccacaatacctagttgcagatcgca 263  Q
    || |||||||||||||||| ||||  | ||||||||| |||   ||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||  || |||||||||      
T  25070998 ctgcgctaaaattagagacaccacaataactaccatatagaccatctaccacaattttggaatcaaactcaaagtccacaatactcagctgcagatcgt- 25071096  T
Q  264 gaac-cagtacattgctgataataaacccaaagcttcacccaaatccacatcaaggagtggagtcatccattcagtcatggctaaaacaaagcgaccttc 362  Q
    |||| || |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |  | ||||| | | | |||| |||    
T  25071097 gaacgcaatacattgctgataataaacctaaagcctcacccaaatccacatcaaggagcggagtcatccattcaattttagctaacaaataacgacattc 25071196  T
Q  363 ttcatctcgaatgcaaacaccaa 385  Q
     ||||||||||| || |||||||    
T  25071197 atcatctcgaatacacacaccaa 25071219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 1 - 114
Target Start/End: Complemental strand, 48522274 - 48522161
Alignment:
Q  1 aatagtagagatacaatattgaatcctaatatgaatatggaaattagcatgacgcagagccactctagcaaagctatgagcgacttcgttggcttgtctc 100  Q
    ||||||||||||| || || ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  48522274 aatagtagagatataagatggaatcttaatatgaatatggaaactagcatgacgcaaagccactctagcaaagctatgagcgacttcgttgacttgtctc 48522175  T
Q  101 cgaatgaacctaat 114  Q
    ||||| ||||||||    
T  48522174 cgaataaacctaat 48522161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 123 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 48519049 - 48518855
Alignment:
Q  123 ttactaaatca-aagctaacagacgtctacaatcattaataactacgctaaaattagagacgccacttttactaccataaagaatgtctaccacagtttt 221  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||| || | | ||||||||| ||||||| |||||||||| ||  ||||||| ||||||||  ||||    
T  48519049 ttactaaatcagaagctaacagacgtctatagtcattgattattgcgctaaaatcagagacgtcacttttactgccgcaaagaatatctaccacgatttt 48518950  T
Q  222 ggagtcaaactcaaaatccacaatacctagttgcagatcgcagaaccagtacattgctgataataaacccaaagcttcacccaaatccacatcaa 316  Q
    ||| ||||  ||||| |||||||||||||  ||||||||||  | |||||||||  ||||||||||||| ||| | ||||| |||||||||||||    
T  48518949 ggaatcaagttcaaagtccacaatacctaactgcagatcgcgaacccagtacatgactgataataaacctaaaacctcaccaaaatccacatcaa 48518855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 65 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 19956582 - 19956308
Alignment:
Q  65 ctagcaaagctatgagcgacttcgttggcttgtctccgaatgaacctaatatcaaatgttactaaatca-aagctaacagacgtctacaatcattaataa 163  Q
    |||||||| |||| |||||||||||||| |||||||| ||| ||| ||| || | | ||| |||||| | || |||||| || |||| ||||||| || |    
T  19956582 ctagcaaaactataagcgacttcgttggtttgtctccaaataaacttaaaataagaggttgctaaattagaaactaacaaacatctaaaatcattgatca 19956483  T
Q  164 ctacgctaaaattagag---acgccacttttactaccataaagaatgtctaccacagttttggagtcaaactcaaaatccacaatacctagttgcagatc 260  Q
    || | ||| |||||||    || || ||||| |||||||||||| | || |||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||| |    ||||||    
T  19956482 ctgcactataattagacgacacaccgcttttgctaccataaagactatccaccacaattttggaatcaagctcaaaatccacaatacccaaaatcagatc 19956383  T
Q  261 gcagaaccagtacattgctgataataaacccaaagcttcacccaaatccacatcaaggagtggagtcatccattc 335  Q
     |  | ||| |||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||| ||||||||| |   |||||||||||||    
T  19956382 acgcacccaatacattgctgataataaacctaaagcctcactcaaattcacatcaagaaacagagtcatccattc 19956308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 5 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 11080047 - 11079803
Alignment:
Q  5 gtagagatacaatattgaatcctaatatgaatatggaaattagcatgacgcagagccactctagcaaagctatgagcgacttcgttggcttgtctccgaa 104  Q
    |||||||||||| || ||||||| |||||||||  |||| |||| |||| | ||| | | || || || |||| || ||||||||||| |||||||| ||    
T  11080047 gtagagatacaagatggaatcctgatatgaatacagaaactagcctgacacggagtcgcccttgctaaactataagagacttcgttggtttgtctcctaa 11079948  T
Q  105 tgaacctaatatcaaatgttactaaatca-aagctaacagacgtctacaatcattaataactacgctaaaattagagacgccacttttactaccataaag 203  Q
    ||||||||| || | |||||| |||||   |||||||||   |||||||||| ||||| ||| | ||| ||||||| || |||| |||||||||||| ||    
T  11079947 tgaacctaacataagatgttattaaatttgaagctaacatgtgtctacaatcgttaatcacttcactataattagaaacaccacatttactaccatatag 11079848  T
Q  204 aatgtctaccacagttttggagtcaaactcaaaatccacaatacc 248  Q
    | | || |||||| |||| || | ||  ||||| |||||||||||    
T  11079847 actatccaccacaattttagaattaatatcaaagtccacaatacc 11079803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 104
Target Start/End: Complemental strand, 26347452 - 26347349
Alignment:
Q  1 aatagtagagatacaatattgaatcctaatatgaatatggaaattagcatgacgcagagccactctagcaaagctatgagcgacttcgttggcttgtctc 100  Q
    |||||||||||||||| || ||||| |||||| ||||| |||||||| |||| | | ||||||||||  || | ||||||||||||| |||  |||||||    
T  26347452 aatagtagagatacaagatggaatcataatataaatatagaaattagtatgatgtaaagccactctaataaggttatgagcgacttcattgatttgtctc 26347353  T
Q  101 cgaa 104  Q
    ||||    
T  26347352 cgaa 26347349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 123 - 192
Target Start/End: Original strand, 15393654 - 15393725
Alignment:
Q  123 ttactaaatcaaa--gctaacagacgtctacaatcattaataactacgctaaaattagagacgccactttta 192  Q
    |||||||||||||  ||||| | || ||||||||||||||| ||||  ||||||||||| ||| ||||||||    
T  15393654 ttactaaatcaaaaagctaataaacatctacaatcattaatcactatactaaaattagaaacgtcactttta 15393725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1351 (Bit Score: 52; Significance: 1e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold1351
Description:

Target: scaffold1351; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 310 - 385
Target Start/End: Original strand, 1739 - 1814
Alignment:
Q  310 acatcaaggagtggagtcatccattcagtcatggctaaaacaaagcgaccttcttcatctcgaatgcaaacaccaa 385  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||| |||||    
T  1739 acatcaaggagcggagtcatccattcagtcttggctaaaacaaaacgaccttcttcatctagaatacaaaaaccaa 1814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0201 (Bit Score: 47; Significance: 1e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0201
Description:

Target: scaffold0201; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 82 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 20686 - 20433
Alignment:
Q  82 gacttcgttggcttgtctccgaatgaacctaatatcaaatgttactaaatca-aagctaacagacgtctacaatcattaataactacgctaaaattagag 180  Q
    ||||||||||||||||||| || | ||||||| ||||    || |||||||| |||||||||  |||||||||||| | |||| | | ||| ||||||      
T  20686 gacttcgttggcttgtctctgattaaacctaacatcatcaattgctaaatcacaagctaacatgcgtctacaatcaattataattgcactataattagta 20587  T
Q  181 acgccacttttactaccataaagaatgtctaccacagttttggagtcaaactcaaaatccacaatacctagttgcagatcgcagaaccagtacattgctg 280  Q
    ||   |||||| |||||||| ||| | || |||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||| |  ||||| |  | ||| |||| || |     
T  20586 acattactttttctaccatagagactatccaccacagttttggaatcaaggtcaaaatccacaatacctagctatagatcacgcacccaatacaatgttt 20487  T
Q  281 ataataaacccaaagcttcacccaaatccacatcaaggagtggagtcatccattc 335  Q
    |||||||||| ||||| |||  ||| |||||||||||||  ||||||| ||||||    
T  20486 ataataaacctaaagcctca-tcaagtccacatcaaggaccggagtcaaccattc 20433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0161 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0161
Description:

Target: scaffold0161; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 149 - 224
Target Start/End: Original strand, 9098 - 9173
Alignment:
Q  149 tacaatcattaataactacgctaaaattagagacgccacttttactaccataaagaatgtctaccacagttttgga 224  Q
    ||||||||||||| |||||  || ||||||| ||| || ||||||||||||||||| | || ||||||||||||||    
T  9098 tacaatcattaattactacattataattagaaacgtcatttttactaccataaagactatccaccacagttttgga 9173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University