View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF9609_low_3 (Length: 615)

Name: NF9609_low_3
Description: NF9609
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF9609_low_3
NF9609_low_3
[»] chr8 (25 HSPs)
chr8 (1-603)||(20649784-20650386)
chr8 (1-603)||(16414841-16415438)
chr8 (3-603)||(21193983-21194583)
chr8 (64-603)||(21847829-21848368)
chr8 (93-601)||(23902914-23903421)
chr8 (60-603)||(22437053-22437583)
chr8 (367-603)||(23154838-23155073)
chr8 (363-603)||(24931619-24931855)
chr8 (207-259)||(16268859-16268911)
chr8 (207-259)||(28984005-28984057)
chr8 (207-259)||(28989224-28989276)
chr8 (208-259)||(22375090-22375141)
chr8 (207-252)||(19985281-19985326)
chr8 (207-252)||(21928529-21928574)
chr8 (207-252)||(22027915-22027960)
chr8 (207-251)||(22373971-22374015)
chr8 (182-252)||(22053964-22054034)
chr8 (207-252)||(20391187-20391232)
chr8 (207-252)||(31414167-31414212)
chr8 (207-259)||(17671657-17671709)
chr8 (207-259)||(19115494-19115546)
chr8 (207-259)||(20015898-20015950)
chr8 (207-259)||(22117810-22117862)
chr8 (207-259)||(22126594-22126646)
chr8 (207-259)||(32603239-32603291)
[»] chr3 (46 HSPs)
chr3 (1-588)||(6150078-6150665)
chr3 (5-603)||(8271628-8272226)
chr3 (5-603)||(30149670-30150268)
chr3 (5-603)||(13964584-13965179)
chr3 (70-601)||(17200950-17201482)
chr3 (1-442)||(22149971-22150403)
chr3 (5-329)||(15943824-15944148)
chr3 (325-603)||(15948020-15948297)
chr3 (361-588)||(15612430-15612657)
chr3 (363-603)||(30140119-30140359)
chr3 (391-603)||(12795880-12796092)
chr3 (391-603)||(18915370-18915582)
chr3 (391-567)||(16258822-16258998)
chr3 (371-603)||(3295969-3296201)
chr3 (207-259)||(10408625-10408677)
chr3 (207-259)||(12509903-12509955)
chr3 (207-259)||(28756976-28757028)
chr3 (207-259)||(47126601-47126653)
chr3 (207-252)||(12273002-12273047)
chr3 (207-252)||(16327129-16327174)
chr3 (207-259)||(15399948-15400000)
chr3 (377-499)||(29680805-29680928)
chr3 (182-252)||(13317929-13317999)
chr3 (182-252)||(16831923-16831993)
chr3 (207-252)||(8744810-8744855)
chr3 (207-252)||(11949345-11949390)
chr3 (207-252)||(13944688-13944733)
chr3 (207-252)||(17494311-17494356)
chr3 (207-252)||(24185844-24185889)
chr3 (207-252)||(24189968-24190013)
chr3 (207-252)||(31692605-31692650)
chr3 (207-252)||(31941567-31941612)
chr3 (207-259)||(3688590-3688642)
chr3 (207-259)||(5422361-5422413)
chr3 (207-259)||(10008247-10008299)
chr3 (207-259)||(10908857-10908909)
chr3 (207-259)||(12889356-12889408)
chr3 (207-259)||(13255337-13255389)
chr3 (207-259)||(15345676-15345728)
chr3 (207-259)||(15358730-15358782)
chr3 (207-259)||(15586823-15586875)
chr3 (207-259)||(15713487-15713539)
chr3 (208-252)||(16825702-16825746)
chr3 (207-259)||(26790844-26790896)
chr3 (207-259)||(43165322-43165374)
chr3 (207-259)||(48428094-48428146)
[»] scaffold0021 (4 HSPs)
scaffold0021 (1-603)||(7870-8472)
scaffold0021 (1-603)||(90215-90817)
scaffold0021 (60-578)||(20924-21420)
scaffold0021 (60-578)||(30500-30996)
[»] scaffold0225 (1 HSPs)
scaffold0225 (5-603)||(26109-26707)
[»] chr2 (26 HSPs)
chr2 (3-603)||(22280420-22281020)
chr2 (9-579)||(22739188-22739758)
chr2 (203-603)||(25130924-25131324)
chr2 (232-603)||(24567425-24567796)
chr2 (363-493)||(25878531-25878661)
chr2 (391-603)||(24829105-24829316)
chr2 (391-603)||(12638818-12639030)
chr2 (391-493)||(12644485-12644587)
chr2 (392-493)||(34821575-34821675)
chr2 (342-499)||(27541905-27542067)
chr2 (207-259)||(20848248-20848300)
chr2 (207-252)||(19716749-19716794)
chr2 (207-252)||(19721312-19721357)
chr2 (207-252)||(23113389-23113434)
chr2 (207-252)||(23097750-23097795)
chr2 (207-259)||(9338241-9338293)
chr2 (207-259)||(9486875-9486927)
chr2 (207-259)||(10871509-10871561)
chr2 (207-259)||(16983899-16983951)
chr2 (207-259)||(17001659-17001711)
chr2 (207-259)||(22323074-22323126)
chr2 (207-259)||(24265029-24265081)
chr2 (207-259)||(24712693-24712745)
chr2 (207-259)||(27220675-27220727)
chr2 (207-259)||(27373928-27373980)
chr2 (207-259)||(44383302-44383354)
[»] chr7 (37 HSPs)
chr7 (5-603)||(7826573-7827171)
chr7 (5-603)||(27104773-27105371)
chr7 (5-603)||(27172954-27173552)
chr7 (62-603)||(13458708-13459247)
chr7 (10-603)||(4442600-4443193)
chr7 (394-603)||(17926292-17926501)
chr7 (361-460)||(11284626-11284725)
chr7 (138-319)||(14207278-14207456)
chr7 (138-319)||(14215968-14216146)
chr7 (108-293)||(22034980-22035165)
chr7 (108-284)||(17142404-17142580)
chr7 (172-401)||(17131547-17131776)
chr7 (454-603)||(22034738-22034887)
chr7 (60-132)||(14218206-14218278)
chr7 (207-259)||(13965847-13965899)
chr7 (207-259)||(26091977-26092029)
chr7 (207-259)||(40924996-40925048)
chr7 (207-259)||(49155319-49155371)
chr7 (207-259)||(21755430-21755482)
chr7 (207-259)||(26115769-26115821)
chr7 (207-252)||(12798680-12798725)
chr7 (207-252)||(14261425-14261470)
chr7 (207-252)||(11550303-11550348)
chr7 (207-252)||(14140704-14140749)
chr7 (207-252)||(14957578-14957623)
chr7 (207-252)||(15099782-15099827)
chr7 (207-252)||(15343456-15343501)
chr7 (207-252)||(16947651-16947696)
chr7 (342-499)||(17142638-17142795)
chr7 (207-252)||(18051132-18051177)
chr7 (207-252)||(19150036-19150081)
chr7 (207-252)||(20749435-20749480)
chr7 (207-259)||(8710622-8710674)
chr7 (207-259)||(12459646-12459698)
chr7 (207-259)||(13689058-13689110)
chr7 (207-259)||(14335413-14335465)
chr7 (207-259)||(44788552-44788604)
[»] scaffold0141 (1 HSPs)
scaffold0141 (5-603)||(23676-24274)
[»] scaffold0008 (2 HSPs)
scaffold0008 (1-603)||(26490-27091)
scaffold0008 (5-603)||(131482-132080)
[»] chr6 (32 HSPs)
chr6 (5-603)||(16379508-16380106)
chr6 (5-603)||(16647104-16647702)
chr6 (3-603)||(16100563-16101163)
chr6 (203-603)||(18401193-18401593)
chr6 (299-603)||(1646243-1646547)
chr6 (361-579)||(23025252-23025470)
chr6 (62-242)||(14149316-14149496)
chr6 (361-603)||(16234907-16235148)
chr6 (361-474)||(18578098-18578211)
chr6 (3-160)||(21412659-21412816)
chr6 (391-478)||(18836178-18836265)
chr6 (363-466)||(19985697-19985800)
chr6 (237-423)||(14133824-14133995)
chr6 (419-503)||(14131087-14131171)
chr6 (183-252)||(21474499-21474568)
chr6 (207-259)||(24367292-24367344)
chr6 (182-252)||(19455922-19455992)
chr6 (182-252)||(19466067-19466137)
chr6 (207-252)||(18797589-18797634)
chr6 (207-252)||(19437901-19437946)
chr6 (207-259)||(10466185-10466237)
chr6 (198-259)||(16924968-16925029)
chr6 (207-252)||(19486631-19486676)
chr6 (207-252)||(24515751-24515796)
chr6 (207-259)||(2872139-2872191)
chr6 (559-603)||(14131018-14131062)
chr6 (207-259)||(16574782-16574834)
chr6 (207-259)||(16620546-16620598)
chr6 (208-252)||(18182705-18182749)
chr6 (207-259)||(27190328-27190380)
chr6 (207-259)||(27258860-27258912)
chr6 (207-259)||(29589776-29589828)
[»] chr1 (23 HSPs)
chr1 (5-603)||(20828454-20829052)
chr1 (3-603)||(20527752-20528352)
chr1 (5-603)||(20927753-20928351)
chr1 (3-603)||(41214920-41215516)
chr1 (206-603)||(22133015-22133412)
chr1 (3-212)||(22129499-22129708)
chr1 (163-518)||(20171946-20172302)
chr1 (434-577)||(21200445-21200588)
chr1 (207-259)||(20074973-20075025)
chr1 (207-259)||(20297455-20297507)
chr1 (207-259)||(31537261-31537313)
chr1 (207-259)||(38910090-38910142)
chr1 (207-259)||(48425947-48425999)
chr1 (207-259)||(52988815-52988867)
chr1 (207-259)||(37680123-37680175)
chr1 (208-247)||(21045389-21045428)
chr1 (408-461)||(12200390-12200443)
chr1 (207-252)||(19857355-19857400)
chr1 (207-252)||(21739300-21739345)
chr1 (207-259)||(16347859-16347911)
chr1 (207-259)||(21833345-21833397)
chr1 (207-259)||(33388293-33388345)
chr1 (207-259)||(51330756-51330808)
[»] chr4 (29 HSPs)
chr4 (6-603)||(15290149-15290746)
chr4 (5-602)||(14999331-14999928)
chr4 (60-568)||(12339910-12340420)
chr4 (361-603)||(9292850-9293092)
chr4 (361-603)||(15139016-15139257)
chr4 (207-259)||(3261986-3262038)
chr4 (207-259)||(7357295-7357347)
chr4 (207-259)||(11204424-11204476)
chr4 (207-259)||(29450729-29450781)
chr4 (207-259)||(44659058-44659110)
chr4 (208-259)||(14697129-14697180)
chr4 (207-252)||(20893066-20893111)
chr4 (207-252)||(14683602-14683647)
chr4 (207-252)||(15073394-15073439)
chr4 (207-252)||(16150671-16150716)
chr4 (207-252)||(16154817-16154862)
chr4 (207-252)||(27903420-27903465)
chr4 (207-252)||(51603984-51604029)
chr4 (207-252)||(53750662-53750707)
chr4 (207-259)||(8050555-8050607)
chr4 (207-259)||(8389440-8389492)
chr4 (207-259)||(12479628-12479680)
chr4 (207-259)||(14300911-14300963)
chr4 (207-259)||(16233924-16233976)
chr4 (207-259)||(17092081-17092133)
chr4 (207-259)||(19635164-19635216)
chr4 (207-259)||(19775725-19775777)
chr4 (207-259)||(23958775-23958827)
chr4 (207-259)||(27714364-27714416)
[»] scaffold0011 (5 HSPs)
scaffold0011 (1-603)||(73586-74187)
scaffold0011 (1-603)||(77967-78568)
scaffold0011 (4-372)||(181934-182302)
scaffold0011 (200-601)||(175701-176102)
scaffold0011 (190-252)||(151631-151693)
[»] scaffold0561 (1 HSPs)
scaffold0561 (60-603)||(6052-6596)
[»] scaffold0124 (1 HSPs)
scaffold0124 (5-603)||(4798-5397)
[»] chr5 (27 HSPs)
chr5 (8-603)||(23508282-23508868)
chr5 (5-603)||(24583808-24584397)
chr5 (268-603)||(21934623-21934958)
chr5 (391-574)||(23505202-23505383)
chr5 (207-259)||(14884365-14884417)
chr5 (207-259)||(20345224-20345276)
chr5 (207-259)||(22505621-22505673)
chr5 (182-259)||(25851014-25851091)
chr5 (201-284)||(26056565-26056648)
chr5 (207-252)||(23078279-23078324)
chr5 (208-259)||(21631774-21631825)
chr5 (207-252)||(17266708-17266753)
chr5 (207-252)||(21561399-21561444)
chr5 (207-252)||(21983551-21983596)
chr5 (207-259)||(14997113-14997165)
chr5 (207-259)||(16359462-16359514)
chr5 (207-259)||(19772920-19772972)
chr5 (207-259)||(22330261-22330313)
chr5 (207-259)||(27521366-27521418)
chr5 (207-259)||(27613316-27613368)
chr5 (207-259)||(27665864-27665916)
chr5 (207-259)||(27682774-27682826)
chr5 (207-259)||(29473447-29473499)
chr5 (207-259)||(34569454-34569506)
chr5 (207-259)||(37288870-37288922)
chr5 (207-259)||(40711740-40711792)
chr5 (207-259)||(41773802-41773854)
[»] scaffold0170 (1 HSPs)
scaffold0170 (62-603)||(34798-35339)
[»] scaffold0218 (1 HSPs)
scaffold0218 (1-603)||(940-1543)
[»] scaffold0465 (1 HSPs)
scaffold0465 (5-603)||(12618-13216)
[»] scaffold0467 (2 HSPs)
scaffold0467 (3-572)||(612-1181)
scaffold0467 (3-305)||(13322-13624)
[»] scaffold0302 (1 HSPs)
scaffold0302 (5-603)||(926-1522)
[»] scaffold0120 (1 HSPs)
scaffold0120 (3-550)||(24944-25492)
[»] scaffold0610 (1 HSPs)
scaffold0610 (3-603)||(3894-4493)
[»] scaffold0673 (1 HSPs)
scaffold0673 (84-603)||(5376-5895)
[»] scaffold0266 (1 HSPs)
scaffold0266 (5-552)||(6853-7401)
[»] scaffold0962 (1 HSPs)
scaffold0962 (11-544)||(2346-2876)
[»] scaffold0162 (2 HSPs)
scaffold0162 (60-603)||(15623-16166)
scaffold0162 (391-603)||(10553-10765)
[»] scaffold0112 (1 HSPs)
scaffold0112 (93-512)||(3303-3722)
[»] scaffold0138 (1 HSPs)
scaffold0138 (3-319)||(25691-26008)
[»] scaffold0462 (2 HSPs)
scaffold0462 (3-310)||(2703-3016)
scaffold0462 (346-603)||(2435-2692)
[»] scaffold0342 (1 HSPs)
scaffold0342 (363-603)||(3196-3436)
[»] scaffold0009 (1 HSPs)
scaffold0009 (5-205)||(96637-96838)
[»] scaffold0233 (1 HSPs)
scaffold0233 (92-454)||(20806-21168)
[»] scaffold0058 (1 HSPs)
scaffold0058 (75-511)||(77229-77671)
[»] scaffold0139 (2 HSPs)
scaffold0139 (361-603)||(17697-17938)
scaffold0139 (207-252)||(19164-19209)
[»] scaffold0615 (1 HSPs)
scaffold0615 (62-223)||(9422-9583)
[»] scaffold0092 (1 HSPs)
scaffold0092 (391-588)||(800-997)
[»] scaffold0028 (4 HSPs)
scaffold0028 (363-574)||(93791-94002)
scaffold0028 (207-252)||(18001-18046)
scaffold0028 (207-252)||(11533-11578)
scaffold0028 (207-252)||(55068-55113)
[»] scaffold1488 (1 HSPs)
scaffold1488 (412-602)||(205-395)
[»] scaffold1486 (1 HSPs)
scaffold1486 (368-601)||(222-455)
[»] scaffold0269 (1 HSPs)
scaffold0269 (361-474)||(2320-2433)
[»] scaffold0244 (1 HSPs)
scaffold0244 (361-474)||(24914-25027)
[»] scaffold0023 (2 HSPs)
scaffold0023 (368-601)||(53967-54200)
scaffold0023 (207-252)||(164596-164641)
[»] scaffold0022 (1 HSPs)
scaffold0022 (382-603)||(8196-8417)
[»] scaffold0409 (2 HSPs)
scaffold0409 (391-579)||(3331-3519)
scaffold0409 (391-579)||(11586-11774)
[»] scaffold0102 (2 HSPs)
scaffold0102 (365-573)||(46436-46643)
scaffold0102 (207-252)||(42762-42807)
[»] scaffold0066 (1 HSPs)
scaffold0066 (391-603)||(51554-51766)
[»] scaffold1164 (1 HSPs)
scaffold1164 (324-417)||(2291-2384)
[»] scaffold1424 (1 HSPs)
scaffold1424 (391-552)||(38-198)
[»] scaffold0335 (1 HSPs)
scaffold0335 (391-603)||(10757-10970)
[»] scaffold0088 (1 HSPs)
scaffold0088 (207-259)||(29991-30043)
[»] scaffold0068 (1 HSPs)
scaffold0068 (207-259)||(67303-67355)
[»] scaffold0041 (1 HSPs)
scaffold0041 (207-259)||(41792-41844)
[»] scaffold0010 (1 HSPs)
scaffold0010 (207-259)||(39528-39580)
[»] scaffold0001 (1 HSPs)
scaffold0001 (207-259)||(514548-514600)
[»] scaffold0585 (1 HSPs)
scaffold0585 (207-252)||(4284-4329)
[»] scaffold0443 (1 HSPs)
scaffold0443 (207-259)||(11866-11918)
[»] scaffold0118 (1 HSPs)
scaffold0118 (207-259)||(518-570)
[»] scaffold0040 (2 HSPs)
scaffold0040 (208-259)||(17935-17986)
scaffold0040 (207-259)||(111102-111154)
[»] scaffold1530 (1 HSPs)
scaffold1530 (207-252)||(647-692)
[»] scaffold1433 (1 HSPs)
scaffold1433 (207-252)||(1506-1551)
[»] scaffold1056 (1 HSPs)
scaffold1056 (207-252)||(1785-1830)
[»] scaffold0420 (1 HSPs)
scaffold0420 (207-252)||(8678-8723)
[»] scaffold0405 (1 HSPs)
scaffold0405 (207-252)||(5666-5711)
[»] scaffold0404 (1 HSPs)
scaffold0404 (207-252)||(7808-7853)
[»] scaffold0310 (1 HSPs)
scaffold0310 (207-252)||(11041-11086)
[»] scaffold0309 (1 HSPs)
scaffold0309 (207-252)||(12791-12836)
[»] scaffold0298 (1 HSPs)
scaffold0298 (183-252)||(9398-9467)
[»] scaffold0167 (1 HSPs)
scaffold0167 (207-252)||(1184-1229)
[»] scaffold0156 (1 HSPs)
scaffold0156 (207-252)||(37003-37048)
[»] scaffold0108 (1 HSPs)
scaffold0108 (207-252)||(50169-50214)
[»] scaffold0104 (1 HSPs)
scaffold0104 (207-252)||(43614-43659)
[»] scaffold0020 (2 HSPs)
scaffold0020 (207-252)||(98778-98823)
scaffold0020 (208-252)||(176052-176096)
[»] scaffold0074 (2 HSPs)
scaffold0074 (208-252)||(15187-15231)
scaffold0074 (208-258)||(6171-6221)
[»] scaffold0529 (1 HSPs)
scaffold0529 (208-259)||(5145-5196)
[»] scaffold0293 (1 HSPs)
scaffold0293 (208-259)||(15467-15518)
[»] scaffold0067 (2 HSPs)
scaffold0067 (207-250)||(29690-29733)
scaffold0067 (182-252)||(64772-64842)
[»] scaffold0012 (1 HSPs)
scaffold0012 (208-259)||(216616-216667)
[»] scaffold0412 (1 HSPs)
scaffold0412 (198-252)||(15765-15819)
[»] scaffold1299 (1 HSPs)
scaffold1299 (207-252)||(2043-2088)
[»] scaffold1288 (1 HSPs)
scaffold1288 (207-252)||(50-95)
[»] scaffold0993 (1 HSPs)
scaffold0993 (198-259)||(1039-1100)
[»] scaffold0865 (1 HSPs)
scaffold0865 (207-252)||(1467-1512)
[»] scaffold0765 (1 HSPs)
scaffold0765 (207-252)||(6452-6497)
[»] scaffold0751 (1 HSPs)
scaffold0751 (207-252)||(5245-5290)
[»] scaffold0708 (1 HSPs)
scaffold0708 (207-252)||(5340-5385)
[»] scaffold0664 (1 HSPs)
scaffold0664 (207-252)||(7102-7147)
[»] scaffold0523 (1 HSPs)
scaffold0523 (207-252)||(2935-2980)
[»] scaffold0367 (1 HSPs)
scaffold0367 (207-252)||(9216-9261)
[»] scaffold0259 (1 HSPs)
scaffold0259 (207-252)||(8322-8367)
[»] scaffold0243 (1 HSPs)
scaffold0243 (207-252)||(9967-10012)
[»] scaffold0239 (1 HSPs)
scaffold0239 (207-252)||(9981-10026)
[»] scaffold0222 (1 HSPs)
scaffold0222 (207-252)||(20878-20923)
[»] scaffold0203 (1 HSPs)
scaffold0203 (207-252)||(1049-1094)
[»] scaffold0192 (1 HSPs)
scaffold0192 (207-252)||(29591-29636)
[»] scaffold0165 (1 HSPs)
scaffold0165 (207-252)||(12024-12069)
[»] scaffold0148 (1 HSPs)
scaffold0148 (198-259)||(2056-2117)
[»] scaffold0133 (1 HSPs)
scaffold0133 (207-252)||(28480-28525)
[»] scaffold0106 (1 HSPs)
scaffold0106 (207-252)||(34401-34446)
[»] scaffold0077 (1 HSPs)
scaffold0077 (192-225)||(29941-29974)
[»] scaffold0076 (1 HSPs)
scaffold0076 (207-252)||(53618-53663)
[»] scaffold0056 (1 HSPs)
scaffold0056 (207-252)||(1078-1123)
[»] scaffold0049 (1 HSPs)
scaffold0049 (11-120)||(36171-36280)
[»] scaffold0046 (2 HSPs)
scaffold0046 (207-252)||(60803-60848)
scaffold0046 (207-252)||(70172-70217)
[»] scaffold0034 (1 HSPs)
scaffold0034 (207-252)||(2147-2192)
[»] scaffold0031 (1 HSPs)
scaffold0031 (207-252)||(110674-110719)
[»] scaffold0007 (1 HSPs)
scaffold0007 (207-252)||(48729-48774)
[»] scaffold0005 (1 HSPs)
scaffold0005 (207-252)||(263290-263335)
[»] scaffold0004 (1 HSPs)
scaffold0004 (207-252)||(200663-200708)
[»] scaffold0003 (1 HSPs)
scaffold0003 (207-252)||(203445-203490)
[»] scaffold0423 (1 HSPs)
scaffold0423 (223-259)||(2474-2510)
[»] scaffold0411 (1 HSPs)
scaffold0411 (207-259)||(8467-8519)
[»] scaffold0114 (1 HSPs)
scaffold0114 (207-259)||(40115-40167)
[»] scaffold0055 (1 HSPs)
scaffold0055 (207-259)||(22304-22356)
[»] scaffold0052 (1 HSPs)
scaffold0052 (207-259)||(7293-7345)
[»] scaffold0044 (1 HSPs)
scaffold0044 (207-259)||(3481-3533)
[»] scaffold0026 (1 HSPs)
scaffold0026 (207-251)||(51716-51760)


Alignment Details
Target: chr8 (Bit Score: 403; Significance: 0; HSPs: 25)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 403; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 603
Target Start/End: Original strand, 20649784 - 20650386
Alignment:
Q  1 tcagttgtcacaagtgtgggaaagtgggtcacaagggttatgaatgcaagagtgttgtaaaggagattacttgctacaattgtggagagaaaggtcatat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||| ||| || ||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  20649784 tcagttgtcacaagtgtgggaaagcgggtcacaaggattttgaatgcaagggtgatgcaaaagagattacttgctacaattgtggggagaagggtcatat 20649883  T
Q  101 cagtactaagtgtaccaagccgaagaaggcggcgggaaaggtgtttgctttgaatgcggaagaggtggagcagccggataatcttatccgaggtatgtgt 200  Q
     |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20649884 tagtactaagtgtaccaggccgaagaaggcggcgggaaaggtgtttgctttgaatgcggaggaggtggagcagccggataatcttatccgaggtatgtgt 20649983  T
Q  201 tttatcaatagtactcctttgattgcaattattgatactggtgctactcattcttttatctcagctagttgtgttgaacgtttggatttggttgtaagtc 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||| | |||||||||| ||    
T  20649984 tttatcaatagtactcctttgattgcaattattgatactggtgctactcattcttttatctcggttagttgtgttgagcgtttgaaattggttgtaactc 20650083  T
Q  301 ctttgttgcgtggaatggttattgacaccccggctagcggttcggtgactacttcttttatgtgtgctaagtgtcctgttaattttggtaatgttgattt 400  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20650084 ctttgttgcgggggatggttattgacaccccgaccagcggttcggtgactacttcttttatgtgtgataagtgtcctgttaattttggtaatgttgattt 20650183  T
Q  401 taagttggattttgtgtgtcttccgttgaagcatatggatgtgatttttggtatggattggatgttgtcctttggtgttagcattaactgtttaaccaag 500  Q
    | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  | ||||| ||||||||||| ||||| || |||    
T  20650184 tgagttggatcttgtgtgtcttccgttgaagcatatggatgtgatttttggtatggattggttgttaacttttggggttagcattaattgtttgactaag 20650283  T
Q  501 agtataacattttcgaagtcggtatacgagttaggtgggaagttattgaccgtggaaaaagtgaagaagtctttggacgatgaagctttagtgtttatga 600  Q
    ||| | || ||||||||| ||||| ||||||||| | ||||||| ||||||| |||  |||||||||||||||| || | ||||||||  ||||| ||||    
T  20650284 agtgtgactttttcgaagccggtagacgagttagataggaagttcttgaccgcggagcaagtgaagaagtctttagatggtgaagcttgtgtgttcatga 20650383  T
Q  601 tgt 603  Q
    |||    
T  20650384 tgt 20650386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 363; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 603
Target Start/End: Complemental strand, 16415438 - 16414841
Alignment:
Q  1 tcagttgtcacaagtgtgggaaagtgggtcacaagggttatgaatgcaagagtgttgtaaaggagattacttgctacaattgtggagagaaaggtcatat 100  Q
    |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  16415438 tcagttgtcacaagtgtgagaaagcgggtcacaaggcttatgaatgcaagagtgttgcaaaggagattacttgctacaattatggagagaaaggtcatat 16415339  T
Q  101 cagtactaagtgtaccaagccgaagaaggcggcgggaaaggtgtttgctttgaatgcggaagaggtggagcagccggataatcttatccgaggtatgtgt 200  Q
     |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||    
T  16415338 tagtactaagtgtaccaagccgaagaaggtggtgggaaaggtgtttgccttgaatgcggaggaggtggagcaaccggataaccttatccgaggtatgtgt 16415239  T
Q  201 tttatcaatagtactcctttgattgcaattattgatactggtgctactcattcttttatctcagctagttgtgttgaacgtttggatttggttgtaagtc 300  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| | ||| || | | ||    
T  16415238 tttatcaatagtattccattgattgcaattattgatactggtgctactcattcttttatctcggttagttgtgttgaacgtttgaaattgattttgactc 16415139  T
Q  301 ctttgttgcgtggaatggttattgacaccccggctagcggttcggtgactacttcttttatgtgtgctaagtgtcctgttaattttggtaatgttgattt 400  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16415138 ctttgttgcggggaatggttattgacaccccggctagcggttcggtgactacttcttttatgtgtgctaagtgtcctgttaattttggtaatgttgattt 16415039  T
Q  401 taagttggattttgtgtgtcttccgttgaagcatatggatgtgatttttggtatggattggatgttgtcctttggtgttagcattaactgtttaaccaag 500  Q
    | |||||||| |||||  |      |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  | ||||| ||||||||||| ||||| || |||    
T  16415038 tgagttggatcttgtgatt-----tttgaagcatatggatgtgatttttggtatggattggttgttagcttttggggttagcattaattgtttgactaag 16414944  T
Q  501 agtataacattttcgaagtcggtatacgagttaggtgggaagttattgaccgtggaaaaagtgaagaagtctttggacgatgaagctttagtgtttatga 600  Q
    ||| |||| ||||| ||| ||||| | ||||||| | ||||||| |||| ||||||  |||||||||| ||||| || | ||||||||  ||||| ||||    
T  16414943 agtgtaactttttctaagccggtagaagagttagataggaagttcttgaacgtggagcaagtgaagaaatctttagatggtgaagcttgtgtgttcatga 16414844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 361; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 3 - 603
Target Start/End: Original strand, 21193983 - 21194583
Alignment:
Q  3 agttgtcacaagtgtgggaaagtgggtcacaagggttatgaatgcaagagtgttgtaaaggagattacttgctacaattgtggagagaaaggtcatatca 102  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |  ||||||||||  ||||| || |||  ||||||| ||||||||||||||||| || |||||||    
T  21193983 agttgtcacaagtgtgggaaagcgggtcacaaggctgctgaatgcaaggatgttgcaagggatgttacttgttacaattgtggagagaagggccatatca 21194082  T
Q  103 gtactaagtgtaccaagccgaagaaggcggcgggaaaggtgtttgctttgaatgcggaagaggtggagcagccggataatcttatccgaggtatgtgttt 202  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21194083 gtaccaagtgtaccaagccgaagaaggcggcgggaaaggtgtttgcattgaatgcggaggaggtggagcagccggataatcttatccgaggtatgtgttt 21194182  T
Q  203 tatcaatagtactcctttgattgcaattattgatactggtgctactcattcttttatctcagctagttgtgttgaacgtttggatttggttgtaagtcct 302  Q
     |||||||| |||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||||||| | |||||| | |||||||||| ||||    
T  21194183 catcaatagcactcatttgattggaattattgatattggtgctactcattcttttatctcggttagttgtgttaagcgtttgaaattggttgtaactcct 21194282  T
Q  303 ttgttgcgtggaatggttattgacaccccggctagcggttcggtgactacttcttttatgtgtgctaagtgtcctgttaattttggtaatgttgatttta 402  Q
    |||||||| || |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  21194283 ttgttgcgggggatggttatcgacaccccggctagaggttcggtgactacttcttttatgtgtgctaagtgtcctgttaattttggtaatgttgattttg 21194382  T
Q  403 agttggattttgtgtgtcttccgttgaagcatatggatgtgatttttggtatggattggatgttgtcctttggtgttagcattaactgtttaaccaagag 502  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |  ||||| ||||||||||| ||||| || |||||    
T  21194383 agttggatcttgtgtgtcttccgttgaagcatatggatgtgatttttggtatggattggttgttattttttggggttagcattaattgtttgactaagag 21194482  T
Q  503 tataacattttcgaagtcggtatacgagttaggtgggaagttattgaccgtggaaaaagtgaagaagtctttggacgatgaagctttagtgtttatgatg 602  Q
    | |||| ||||| ||| ||||| |  | |||| | ||||||| ||||||| |||  ||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||| ||||||    
T  21194483 tgtaactttttcaaagccggtagaaaaattagataggaagttcttgaccgcggagcaagtgaagaagtctttggacggtgaagcttgtgtgttcatgatg 21194582  T
Q  603 t 603  Q
    |    
T  21194583 t 21194583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 340; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 64 - 603
Target Start/End: Original strand, 21847829 - 21848368
Alignment:
Q  64 agattacttgctacaattgtggagagaaaggtcatatcagtactaagtgtaccaagccgaagaaggcggcgggaaaggtgtttgctttgaatgcggaaga 163  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||    
T  21847829 agattacttgttacaattgtggagagaagggtcatattagtaccaagtgtaccatgccgaagaaggcggcgggaaaggtgtttgctttgaacgcggagga 21847928  T
Q  164 ggtggagcagccggataatcttatccgaggtatgtgttttatcaatagtactcctttgattgcaattattgatactggtgctactcattcttttatctca 263  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  21847929 ggtggagcagccggataatcttatccgaggtatgtgttttatcaatagtactcttttgattgcaattattgatactggtgctactcattcttttatctcg 21848028  T
Q  264 gctagttgtgttgaacgtttggatttggttgtaagtcctttgttgcgtggaatggttattgacaccccggctagcggttcggtgactacttcttttatgt 363  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  21848029 gctagttgtgttgaacgtttggatttggttgtaactcctttgttgcgtggaatggttattgacaccccggctagtggttcggtgactacttcgtttatgt 21848128  T
Q  364 gtgctaagtgtcctgttaattttggtaatgttgattttaagttggattttgtgtgtcttccgttgaagcatatggatgtgatttttggtatggattggat 463  Q
    |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |    
T  21848129 gtgctaagtgtcctgttaattttgttgatgttgattttgagttggatcttgtttgtcttccgttgaagcatatggatgttatttttggtatggattggtt 21848228  T
Q  464 gttgtcctttggtgttagcattaactgtttaaccaagagtataacattttcgaagtcggtatacgagttaggtgggaagttattgaccgtggaaaaagtg 563  Q
    |||  | ||||| ||||||||||| ||||| || | |||| | || ||||| ||  ||||| |  |||||| | ||||||| |||| || ||   |||||    
T  21848229 gttagcttttggggttagcattaattgtttgactaggagtgtgactttttctaaaccggtagaaaagttagataggaagtttttgaacgcggggcaagtg 21848328  T
Q  564 aagaagtctttggacgatgaagctttagtgtttatgatgt 603  Q
    ||||||||||| || | ||| ||||  |||||||||||||    
T  21848329 aagaagtctttagaaggtgaggcttgtgtgtttatgatgt 21848368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 317; E-Value: 1e-178
Query Start/End: Original strand, 93 - 601
Target Start/End: Complemental strand, 23903421 - 23902914
Alignment:
Q  93 ggtcatatcagtactaagtgtaccaagccgaagaaggcggcgggaaaggtgtttgctttgaatgcggaagaggtggagcagccggataatcttatccgag 192  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||| | |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||    
T  23903421 ggtcatatcagtgctaagtgtaccaagccaaagaaggtggcagaaaaggtgtttgcattgaatgcagaagaggtggagcagccggataatcttatatgag 23903322  T
Q  193 gtatgtgttttatcaatagtactcctttgattgcaattattgatactggtgctactcattcttttatctcagctagttgtgttgaacgtttggatttggt 292  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | |||| |||||||    
T  23903321 gtatatgttttatcaatagtactcctt-gattataattattgatactggtgctactcattcttttatctcggctagttgtgttgagcatttgaatttggt 23903223  T
Q  293 tgtaagtcctttgttgcgtggaatggttattgacaccccggctagcggttcggtgactacttcttttatgtgtgctaagtgtcctgttaattttggtaat 392  Q
    ||||| ||| || | ||| || ||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  23903222 tgtaactccgttatcgcgagggatggtcatcgacaccccggctagtggttcggtgactacttccttagtgtgtgctaagtgtcctgttaattttggaaat 23903123  T
Q  393 gttgattttaagttggattttgtgtgtcttccgttgaagcatatggatgtgatttttggtatggattggatgttgtcctttggtgttagcattaactgtt 492  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |    
T  23903122 gttgattttgagttggatcttgtgtgtcttccgttgaagcatatggatgtgattttttgtatggattggatgttgtcttttggtgttagcattaactgct 23903023  T
Q  493 taaccaagagtataacattttcgaagtcggtatacgagttaggtgggaagttattgaccgtggaaaaagtgaagaagtctttggacgatgaagctttagt 592  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||| ||||| ||||||| |||  ||||||||||||||||||||| ||||||||  ||    
T  23903022 taaccaagagtataacattttcgaagccggtagatgagttaggtggaaagttcttgaccgcggagcaagtgaagaagtctttggacggtgaagcttgtgt 23902923  T
Q  593 gtttatgat 601  Q
    ||| |||||    
T  23902922 gttcatgat 23902914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 288; E-Value: 1e-161
Query Start/End: Original strand, 60 - 603
Target Start/End: Complemental strand, 22437583 - 22437053
Alignment:
Q  60 aaggagattacttgctacaattgtggagagaaaggtcatatcagtactaagtgtaccaagccgaagaaggcggcgggaaaggtgtttgctttgaatgcgg 159  Q
    |||||||| ||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||| ||    
T  22437583 aaggagatcacttgttacaattgtggtgagaagggtcatatcagtactaagtgtaccaagccgaagaaggcggtggaaaaggtgtttgcattgaatgtgg 22437484  T
Q  160 aagaggtggagcagccggataatcttatccgaggtatgtgttttatcaatagtactcctttgattgcaattattgatactggtgctactcattcttttat 259  Q
    | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  22437483 aggaagtggagcagccggataatcttatccgaggtatgtgttttatcaatagtactcctttgattgcgattattgatactgatgttactcattcttttat 22437384  T
Q  260 ctcagctagttgtgttgaacgtttggatttggttgtaagtcctttgttgcgtggaatggttattgacaccccggctagcggttcggtgactacttctttt 359  Q
    ||| | |||||||||||| |||||| | |||||||||| ||| |||||||| || ||||| || ||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||     
T  22437383 ctcggttagttgtgttgagcgtttgaaattggttgtaactccgttgttgcgagggatggtcatcgacaccccgactagtggttcagtgactacttcttta 22437284  T
Q  360 atgtgtgctaagtgtcctgttaattttggtaatgttgattttaagttggattttgtgtgtcttccgttgaagcatatggatgtgatttttggtatggatt 459  Q
     ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||    
T  22437283 gtgtgtgctaagtgtcatgttaattttggtaatgttgattttgagttagatcttgtgtgtcttccattgaatcatatggatgtgattttttgtatggatt 22437184  T
Q  460 ggatgttgtcctttggtgttagcattaactgtttaaccaagagtataacattttcgaagtcggtatacgagttaggtgggaagttattgaccgtggaaaa 559  Q
    | ||||| || ||||| ||||||||||| ||||| ||||| ||| |||||||||||||| |||||             | ||||| ||||||| |||  |    
T  22437183 gaatgttatcttttggggttagcattaattgtttgaccaaaagtgtaacattttcgaagccggta-------------gaaagttcttgaccgcggagca 22437097  T
Q  560 agtgaagaagtctttggacgatgaagctttagtgtttatgatgt 603  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||    
T  22437096 agtgaagaagtctttggacggtgaagcttaagtgttcatgatgt 22437053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 113; E-Value: 6e-57
Query Start/End: Original strand, 367 - 603
Target Start/End: Original strand, 23154838 - 23155073
Alignment:
Q  367 ctaagtgtcctgttaattttggtaatgttgattttaagttggattttgtgtgtcttccgttgaagcatatggatgtgatttttggtatggattggatgtt 466  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||    
T  23154838 ctaagtgtcatgttaattatggtaatgttgattttgagtttgatcttgtgtatcttccgttgaagcatatggatgtgattttggg-atggattggttgtt 23154936  T
Q  467 gtcctttggtgttagcattaactgtttaaccaagagtataacattttcgaagtcggtatacgagttaggtgggaagttattgaccgtggaaaaagtgaag 566  Q
    ||| ||||| ||||||||||||||||| || |||||| |||| |||||||||  |||| | |||||| ||  |||||| ||||||| |||  ||||||||    
T  23154937 gtcttttggggttagcattaactgtttgactaagagtgtaacgttttcgaagctggtagaagagttaagtaagaagttcttgaccgcggagcaagtgaag 23155036  T
Q  567 aagtctttggacgatgaagctttagtgtttatgatgt 603  Q
    ||||||||||||| |||| |||  |||||||||||||    
T  23155037 aagtctttggacggtgaaacttgtgtgtttatgatgt 23155073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 88; E-Value: 5e-42
Query Start/End: Original strand, 363 - 603
Target Start/End: Original strand, 24931619 - 24931855
Alignment:
Q  363 tgtgctaagtgtcctgttaattttggtaatgttgattttaagttggattttgtgtgtcttccgttgaagcatatggatgtgatttttggtatggattgga 462  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| |    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  24931619 tgtgctaagtgtcctgttaattttggtaatgttgattttgagttggatcttgttt----tccgttgaagcatatggatgtgatttttggtatggattggt 24931714  T
Q  463 tgttgtcctttggtgttagcattaactgtttaaccaagagtataacattttcgaagtcggtatacgagttaggtgggaagttattgaccgtggaaaaagt 562  Q
    ||||  | ||||| ||||||||||| ||||| || |||||| | || ||||| ||| ||||| | ||||||| | ||||||| |||| || |||  ||||    
T  24931715 tgttagcttttggggttagcattaattgtttgactaagagtgtgactttttctaagccggtagaagagttagataggaagttcttgatcgcggagcaagt 24931814  T
Q  563 gaagaagtctttggacgatgaagctttagtgtttatgatgt 603  Q
     ||||| ||| | || | ||||||||  |||| ||||||||    
T  24931815 aaagaaatctctagatggtgaagcttgtgtgtctatgatgt 24931855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 207 - 259
Target Start/End: Original strand, 16268859 - 16268911
Alignment:
Q  207 aatagtactcctttgattgcaattattgatactggtgctactcattcttttat 259  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  16268859 aatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttat 16268911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 207 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 28984057 - 28984005
Alignment:
Q  207 aatagtactcctttgattgcaattattgatactggtgctactcattcttttat 259  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  28984057 aatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcactgttttat 28984005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 207 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 28989276 - 28989224
Alignment:
Q  207 aatagtactcctttgattgcaattattgatactggtgctactcattcttttat 259  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  28989276 aatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcactgttttat 28989224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 208 - 259
Target Start/End: Original strand, 22375090 - 22375141
Alignment:
Q  208 atagtactcctttgattgcaattattgatactggtgctactcattcttttat 259  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  22375090 atagtactcctttaattgctattattgatactggtgctacacattgttttat 22375141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 207 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 19985326 - 19985281
Alignment:
Q  207 aatagtactcctttgattgcaattattgatactggtgctactcatt 252  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  19985326 aatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcatt 19985281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 207 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 21928574 - 21928529
Alignment:
Q  207 aatagtactcctttgattgcaattattgatactggtgctactcatt 252  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  21928574 aatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcatt 21928529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 207 - 252
Target Start/End: Original strand, 22027915 - 22027960
Alignment:
Q  207 aatagtactcctttgattgcaattattgatactggtgctactcatt 252  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  22027915 aatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcatt 22027960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 207 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 22374015 - 22373971
Alignment:
Q  207 aatagtactcctttgattgcaattattgatactggtgctactcat 251  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  22374015 aatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcat 22373971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 182 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 22054034 - 22053964
Alignment:
Q  182 tcttatccgaggtatgtgttttatcaatagtactcctttgattgcaattattgatactggtgctactcatt 252  Q
    ||||||| ||||||  |||||  | |||||||||||||| ||||| ||||| || ||||||||||||||||    
T  22054034 tcttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtgctactcatt 22053964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 207 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 20391232 - 20391187
Alignment:
Q  207 aatagtactcctttgattgcaattattgatactggtgctactcatt 252  Q
    |||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||| ||||    
T  20391232 aatagtactcctttaatttctattattgatactggtgctacacatt 20391187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 207 - 252
Target Start/End: Original strand, 31414167 - 31414212
Alignment:
Q  207 aatagtactcctttgattgcaattattgatactggtgctactcatt 252  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| |||| ||||||||||||||    
T  31414167 aatagtactcctttaattgctattatagatattggtgctactcatt 31414212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 207 - 259
Target Start/End: Original strand, 17671657 - 17671709
Alignment:
Q  207 aatagtactcctttgattgcaattattgatactggtgctactcattcttttat 259  Q
    |||| |||||||||  |||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  17671657 aataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttat 17671709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 207 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 19115546 - 19115494
Alignment:
Q  207 aatagtactcctttgattgcaattattgatactggtgctactcattcttttat 259  Q
    |||| |||||||||  |||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  19115546 aataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttat 19115494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 207 - 259
Target Start/End: Original strand, 20015898 - 20015950
Alignment:
Q  207 aatagtactcctttgattgcaattattgatactggtgctactcattcttttat 259  Q
    |||| |||||||||  |||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  20015898 aataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttat 20015950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 207 - 259
Target Start/End: Original strand, 22117810 - 22117862
Alignment:
Q  207 aatagtactcctttgattgcaattattgatactggtgctactcattcttttat 259  Q
    |||| |||||||||  |||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  22117810 aataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttat 22117862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 207 - 259
Target Start/End: Original strand, 22126594 - 22126646
Alignment:
Q  207 aatagtactcctttgattgcaattattgatactggtgctactcattcttttat 259  Q
    |||| |||||||||  |||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  22126594 aataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttat 22126646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 207 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 32603291 - 32603239
Alignment:
Q  207 aatagtactcctttgattgcaattattgatactggtgctactcattcttttat 259  Q
    |||| |||||||||  |||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  32603291 aataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttat 32603239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 396; Significance: 0; HSPs: 46)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 396; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 588
Target Start/End: Original strand, 6150078 - 6150665
Alignment:
Q  1 tcagttgtcacaagtgtgggaaagtgggtcacaagggttatgaatgcaagagtgttgtaaaggagattacttgctacaattgtggagagaaaggtcatat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  6150078 tcagttgtcacaagtgtgggaaagcgggtcacaaggcttatgaatgcaagagtgttgtaaaggagattacttgctacaattgtggagagaagggtcatat 6150177  T
Q  101 cagtactaagtgtaccaagccgaagaaggcggcgggaaaggtgtttgctttgaatgcggaagaggtggagcagccggataatcttatccgaggtatgtgt 200  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  6150178 tagtactaagtgtaccaagccgaagaaggcggtgggaaaggtgtttgctttgaatgcggaggaggtggagcaaccggataatcttatccgaggtatgtgt 6150277  T
Q  201 tttatcaatagtactcctttgattgcaattattgatactggtgctactcattcttttatctcagctagttgtgttgaacgtttggatttggttgtaagtc 300  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || | |||||||||||| |||||| | |||||||||| ||    
T  6150278 tttatcaatagtactcatttgattgcaattattgatattggtgctactcattcttttatatcggttagttgtgttgagcgtttgaaattggttgtaactc 6150377  T
Q  301 ctttgttgcgtggaatggttattgacaccccggctagcggttcggtgactacttcttttatgtgtgctaagtgtcctgttaattttggtaatgttgattt 400  Q
    | |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6150378 ccttgttgcggggaatggttattgacaccccggctagaggttcggttactacttcttttatgtgtgctaagtgtcctgttaattttggtaatgttgattt 6150477  T
Q  401 taagttggattttgtgtgtcttccgttgaagcatatggatgtgatttttggtatggattggatgttgtcctttggtgttagcattaactgtttaaccaag 500  Q
    | |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  | ||||| ||||||||||| ||||| || |||    
T  6150478 tgagttggatcttgtttgtcttccgttgaagcatatggatgtgatttttggtatggattggttgttagcttttggggttagcattaattgtttgactaag 6150577  T
Q  501 agtataacattttcgaagtcggtatacgagttaggtgggaagttattgaccgtggaaaaagtgaagaagtctttggacgatgaagctt 588  Q
    ||| | || ||||||||| ||||| | ||||||| | ||||||| |||| ||| ||  | |||||||||||||| || | ||||||||    
T  6150578 agtgtgactttttcgaagccggtagaagagttagataggaagttcttgatcgtagagcaggtgaagaagtctttagatggtgaagctt 6150665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 375; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 5 - 603
Target Start/End: Original strand, 8271628 - 8272226
Alignment:
Q  5 ttgtcacaagtgtgggaaagtgggtcacaagggttatgaatgcaagagtgttgtaaaggagattacttgctacaattgtggagagaaaggtcatatcagt 104  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||     || ||||   |||||| ||  ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||    
T  8271628 ttgtcacaagtgtgggaaagcgggtcacaaggcggccgattgcagaggtgttgcaagagagattacttgttacaattgtggagagaagggtcatattagt 8271727  T
Q  105 actaagtgtaccaagccgaagaaggcggcgggaaaggtgtttgctttgaatgcggaagaggtggagcagccggataatcttatccgaggtatgtgtttta 204  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8271728 accaagtgtaccaagccgaagaaggcggcgggaaaggtgtttgctttgaatgcggaggaggtggagcagccggataatcttatccgaggtatgtgtttta 8271827  T
Q  205 tcaatagtactcctttgattgcaattattgatactggtgctactcattcttttatctcagctagttgtgttgaacgtttggatttggttgtaagtccttt 304  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  8271828 tcaatagtactcctttgattgcaattattgatactggtgctactcattcttttatctcggctagttgtgttgaacgtttggatttggttgtaactccttt 8271927  T
Q  305 gttgcgtggaatggttattgacaccccggctagcggttcggtgactacttcttttatgtgtgctaagtgtcctgttaattttggtaatgttgattttaag 404  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||    
T  8271928 gttgcgtggaatggttattgacaccccggctagcggttcggtgactacttcttttatgtgtgctaaatgtcctgttaattttggtgatgttgattttgag 8272027  T
Q  405 ttggattttgtgtgtcttccgttgaagcatatggatgtgatttttggtatggattggatgttgtcctttggtgttagcattaactgtttaaccaagagta 504  Q
    |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  | ||||| ||| ||||||| ||||| || | ||||     
T  8272028 ttggatcttgtttgtcttccgttgaagcatatggatgtgatttttggtatggattggttgttagcttttggggttcgcattaattgtttgactaggagtg 8272127  T
Q  505 taacattttcgaagtcggtatacgagttaggtgggaagttattgaccgtggaaaaagtgaagaagtctttggacgatgaagctttagtgtttatgatgt 603  Q
    | || ||||| ||  ||||| | ||||||| | ||||||| ||||||| ||   |||||||||||||||| || | ||| ||||  |||||||||||||    
T  8272128 tgactttttctaaaccggtagaagagttagataggaagtttttgaccgcggggcaagtgaagaagtctttagaaggtgaggcttgtgtgtttatgatgt 8272226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 375; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 5 - 603
Target Start/End: Complemental strand, 30150268 - 30149670
Alignment:
Q  5 ttgtcacaagtgtgggaaagtgggtcacaagggttatgaatgcaagagtgttgtaaaggagattacttgctacaattgtggagagaaaggtcatatcagt 104  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||     || ||||   |||||| ||  |||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||    
T  30150268 ttgtcacaagtgtgggaaagcgggtcacaaggcggtcgattgcagaggtgttgcaagagagactacttgttacaattgtggagagaagggtcatattagt 30150169  T
Q  105 actaagtgtaccaagccgaagaaggcggcgggaaaggtgtttgctttgaatgcggaagaggtggagcagccggataatcttatccgaggtatgtgtttta 204  Q
    || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30150168 accaagtgtaccaagccaaagaaggcggcgggaaaggtgtttgctttgaacgccgaggaggtggagcagccggataatcttatccgaggtatgtgtttta 30150069  T
Q  205 tcaatagtactcctttgattgcaattattgatactggtgctactcattcttttatctcagctagttgtgttgaacgtttggatttggttgtaagtccttt 304  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  30150068 tcaatagtactcctttgattgcaattattgatactggtgctactcattcttttatctcggctagttgtgttgaacgtttggatttggttgtaactccttt 30149969  T
Q  305 gttgcgtggaatggttattgacaccccggctagcggttcggtgactacttcttttatgtgtgctaagtgtcctgttaattttggtaatgttgattttaag 404  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||    
T  30149968 gttgcgtggaatggttattgacaccccggctagcggttcggtgactacttcttttatgtgtgctaagtgtcctgttaattttggtgatgttgattttgag 30149869  T
Q  405 ttggattttgtgtgtcttccgttgaagcatatggatgtgatttttggtatggattggatgttgtcctttggtgttagcattaactgtttaaccaagagta 504  Q
    |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  | ||||| ||||||||||| ||||| || | ||||     
T  30149868 ttggatcttgtttgtcttccgttgaagcatatggatgtgatttttggtatggattggttgttagcttttggggttagcattaattgtttgactaggagtg 30149769  T
Q  505 taacattttcgaagtcggtatacgagttaggtgggaagttattgaccgtggaaaaagtgaagaagtctttggacgatgaagctttagtgtttatgatgt 603  Q
    | || ||||| ||| ||||| | ||||||| | ||||||| ||||||| |||  |||||||||||||||| || | ||| ||||  |||||||||||||    
T  30149768 tgactttttctaagccggtagaagagttagataggaagtttttgaccgcggagcaagtgaagaagtctttagatggtgaggcttgtgtgtttatgatgt 30149670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 361; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 5 - 603
Target Start/End: Original strand, 13964584 - 13965179
Alignment:
Q  5 ttgtcacaagtgtgggaaagtgggtcacaagggttatgaatgcaagagtgttgtaaaggagattacttgctacaattgtggagagaaaggtcatatcagt 104  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||     || ||||   |||||| ||  ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||    
T  13964584 ttgtcacaagtgtgggaaagcgggtcacaaggcggccgattgcagaggtgttgcaagagagattacttgttacaattgtggagagaagggtcatattagt 13964683  T
Q  105 actaagtgtaccaagccgaagaaggcggcgggaaaggtgtttgctttgaatgcggaagaggtggagcagccggataatcttatccgaggtatgtgtttta 204  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13964684 accaagtgtaccaagccgaagaaggcggcgggaaaggtgtttgctttgaatgcggaggaggcggagcagccggataatcttatccgaggtatgtgtttta 13964783  T
Q  205 tcaatagtactcctttgattgcaattattgatactggtgctactcattcttttatctcagctagttgtgttgaacgtttggatttggttgtaagtccttt 304  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| || |||    
T  13964784 tcaatagtactcctttgattgcaattattgatactggtgctactcattcttttatctcggctagttgtgttgaaagtttggatttggttgtaactcgttt 13964883  T
Q  305 gttgcgtggaatggttattgacaccccggctagcggttcggtgactacttcttttatgtgtgctaagtgtcctgttaattttggtaatgttgattttaag 404  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||    
T  13964884 gttgcgtggaatggttattgataccccggctagcggttcggtgacta---cttttatgtgtgctaagtgtcctgttaattttggtgatgttgattttgag 13964980  T
Q  405 ttggattttgtgtgtcttccgttgaagcatatggatgtgatttttggtatggattggatgttgtcctttggtgttagcattaactgtttaaccaagagta 504  Q
    |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  | ||||| ||||||||||| ||||| || | ||||     
T  13964981 ttggatcttgtttgtcttccgttgaagcatatggatgtgatttttggtatggattggttgttagcttttggggttagcattaattgtttgactaggagtg 13965080  T
Q  505 taacattttcgaagtcggtatacgagttaggtgggaagttattgaccgtggaaaaagtgaagaagtctttggacgatgaagctttagtgtttatgatgt 603  Q
    | || ||||| ||| ||||| | ||||||| | ||||||| ||||||||||   |||||||||||||||| || | ||| ||||  |||||||||||||    
T  13965081 tgactttttctaagccggtagaagagttagataggaagtttttgaccgtggggcaagtgaagaagtctttagaaggtgaggcttgtgtgtttatgatgt 13965179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 297; E-Value: 1e-166
Query Start/End: Original strand, 70 - 601
Target Start/End: Complemental strand, 17201482 - 17200950
Alignment:
Q  70 cttgctacaattgtggagagaaaggtcatatcagtactaagtgtaccaagccgaagaaggcggcgggaaaggtgtttgctttgaatgcggaagaggtgga 169  Q
    |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||  ||||    
T  17201482 cttgttacaattgtggagagaagggtcatatcagtactaagtgtaccaagccgaagaaggcggcgggaaaggtgtttgcattgaatgcggaggaaatgga 17201383  T
Q  170 gcagccggataatcttatccgaggtatgtgtttt-atcaatagtactcctttgattgcaattattgatactggtgctactcattcttttatctcagctag 268  Q
    ||| || |||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | |||    
T  17201382 gcatccagataatcttatctgatgtatgtgtttttatcaatagtactccattgattgcaattattgatactagtgctactcattcttttatctcggttag 17201283  T
Q  269 ttgtgttgaacgtttggatttggttgtaagtcctttgttgcgtggaatggttattgacaccccggctagcggttcggtgactacttcttttatgtgtgct 368  Q
    ||||||||| |||||| | |||||||||| |||||||||||| || ||||| || |||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  17201282 ttgtgttgagcgtttgaaattggttgtaactcctttgttgcgagggatggtcatcgacacccgtgctagcggttcggtgactacttcttttgtgtgtgct 17201183  T
Q  369 aagtgtcctgttaattttggtaatgttgattttaagttggattttgtgtgtcttccgttgaagcatatggatgtgatttttggtatggattggatgttgt 468  Q
    || |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |    
T  17201182 aattgtcctgttaatttaggtaatgttgattttgagttggatcttgtgtgtcttccgttgaagcatatggatgtgatttttggtatggattggttgatat 17201083  T
Q  469 cctttggtgttagcattaactgtttaaccaagagtataacattttcgaagtcggtatacgagttaggtgggaagttattgaccgtggaaaaagtgaagaa 568  Q
    | ||||| ||||||||||| || ||||| |||||| ||  |||||| ||  ||||| |||||||| || ||||||| ||||||| | |  ||||||||||    
T  17201082 cttttggggttagcattaattggttaactaagagtgtagtattttcaaaaccggtagacgagttaagtaggaagttcttgaccgcgtagcaagtgaagaa 17200983  T
Q  569 gtctttggacgatgaagctttagtgtttatgat 601  Q
    ||||||| ||| ||| ||||  ||||| |||||    
T  17200982 gtctttgaacggtgaggcttgtgtgttcatgat 17200950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 266; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 1 - 442
Target Start/End: Original strand, 22149971 - 22150403
Alignment:
Q  1 tcagttgtcacaagtgtgggaaagtgggtcacaagggttatgaatgcaagagtgttgtaaaggagattacttgctacaattgtggagagaaaggtcatat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| | ||||||||| || |||||||| | |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||    
T  22149971 tcagttgtcacaagtgtgggaaagcgagtcacaaggcttttgaatgcatgggtgttgcaaaagagattacttgctacaattgtggagagaagggtcacat 22150070  T
Q  101 cagtactaagtgtaccaagccgaagaaggcggcgggaaaggtgtttgctttgaatgcggaagaggtggagcagccggataatcttatccgaggtatgtgt 200  Q
     |||||         |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||| || |||||||||||| |||||||||||    
T  22150071 tagtac---------caagccgaagaaggcggcgggaaaagtgtttgctttgaatgctgaggaggtggagcaaccagataatcttatctgaggtatgtgt 22150161  T
Q  201 tttatcaatagtactcctttgattgcaattattgatactggtgctactcattcttttatctcagctagttgtgttgaacgtttggatttggttgtaagtc 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  | ||| |||||||| |||||| | |||||||||| ||    
T  22150162 tttatcaatagtactcctttgattgcaattattgatactggtgctagtcattcttttatcttggttagctgtgttgagcgtttgaaattggttgtaactc 22150261  T
Q  301 ctttgttgcgtggaatggttattgacaccccggctagcggttcggtgactacttcttttatgtgtgctaagtgtcctgttaattttggtaatgttgattt 400  Q
    |||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||    
T  22150262 ctttgttgcggggaacggttattgataccccggctagcggttcggtgactacttcttttatgtgtgctaagtgtcttgttaattttggttatgttaattt 22150361  T
Q  401 taagttggattttgtgtgtcttccgttgaagcatatggatgt 442  Q
    | |||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  22150362 tgagttgggtcttgtttgtcttccgttgaagcatatggatgt 22150403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 5 - 329
Target Start/End: Original strand, 15943824 - 15944148
Alignment:
Q  5 ttgtcacaagtgtgggaaagtgggtcacaagggttatgaatgcaagagtgttgtaaaggagattacttgctacaattgtggagagaaaggtcatatcagt 104  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||||||    ||| ||||||||||||| ||  ||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||| |||    
T  15943824 ttgtcacaagtgtgggaaaacgggtcacaaggcggctgattgcaagagtgttgcaagagagattacttgttacaattgcggagagaagggtcatattagt 15943923  T
Q  105 actaagtgtaccaagccgaagaaggcggcgggaaaggtgtttgctttgaatgcggaagaggtggagcagccggataatcttatccgaggtatgtgtttta 204  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  15943924 actaagtgtaccaagccgaagaaggcggcgggaaaggtgtttgctttaaatgcggaggaggtggagcagccggataatcttatacgaggtatgtgtttta 15944023  T
Q  205 tcaatagtactcctttgattgcaattattgatactggtgctactcattcttttatctcagctagttgtgttgaacgtttggatttggttgtaagtccttt 304  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||    
T  15944024 tcaatagtactcctttgattgcaattattgatattggtgctactcattcttttatctcggttagttgtgttgaacgtttgaatttggttgtaacttcttt 15944123  T
Q  305 gttgcgtggaatggttattgacacc 329  Q
    |||||  ||||||||||||||||||    
T  15944124 gttgcagggaatggttattgacacc 15944148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 131; E-Value: 1e-67
Query Start/End: Original strand, 325 - 603
Target Start/End: Original strand, 15948020 - 15948297
Alignment:
Q  325 acaccccggctagcggttcggtgactacttcttttatgtgtgctaagtgtcctgttaattttggtaatgttgattttaagttggattttgtgtgtcttcc 424  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||    
T  15948020 acaccccggctagcggttcggtgactacttcttttatgtgtgctaagtgtcctgttaattttggtaatgttgattttgagttggatcttgtttgtcttcc 15948119  T
Q  425 gttgaagcatatggatgtgatttttggtatggattggatgttgtcctttggtgttagcattaactgtttaaccaagagtataacattttcgaagtcggta 524  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  | ||||| ||||||||||| || || || |||||| |||  ||||| ||| |||||    
T  15948120 gtttaagcatatggatgtgatttttggtatggattggttgttagcttttggagttagcattaattg-ttgactaagagtgtaaagttttctaagccggta 15948218  T
Q  525 tacgagttaggtgggaagttattgaccgtggaaaaagtgaagaagtctttggacgatgaagctttagtgtttatgatgt 603  Q
     | ||||||| |  ||  || |||||||  ||  |||||||||||||||| || | ||||||||  ||||| |||||||    
T  15948219 gaagagttagataagagattcttgaccgcagagcaagtgaagaagtctttagatggtgaagcttgtgtgttcatgatgt 15948297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 108; E-Value: 6e-54
Query Start/End: Original strand, 361 - 588
Target Start/End: Complemental strand, 15612657 - 15612430
Alignment:
Q  361 tgtgtgctaagtgtcctgttaattttggtaatgttgattttaagttggattttgtgtgtcttccgttgaagcatatggatgtgatttttggtatggattg 460  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15612657 tgtgtgctaagtgtcctgttaattttggtaatgttgattttgagttggatcttgtttgtcttccgttgaagcatatggatgtgatttttggtatggattg 15612558  T
Q  461 gatgttgtcctttggtgttagcattaactgtttaaccaagagtataacattttcgaagtcggtatacgagttaggtgggaagttattgaccgtggaaaaa 560  Q
    | ||||  | ||||| ||||||||||| ||||| || | |||| | || ||||| ||| ||||| | ||||||| | ||||||| ||||||  ||   ||    
T  15612557 gttgttagcttttggggttagcattaattgtttgactaggagtgtgactttttctaagccggtagaagagttagataggaagtttttgaccacggggcaa 15612458  T
Q  561 gtgaagaagtctttggacgatgaagctt 588  Q
    |||||||||||||| || ||||| ||||    
T  15612457 gtgaagaagtctttagaagatgaggctt 15612430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 101; E-Value: 9e-50
Query Start/End: Original strand, 363 - 603
Target Start/End: Complemental strand, 30140359 - 30140119
Alignment:
Q  363 tgtgctaagtgtcctgttaattttggtaatgttgattttaagttggattttgtgtgtcttccgttgaagcatatggatgtgatttttggtatggattgga 462  Q
    |||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||     
T  30140359 tgtgttaagtgttctgttaattttggtgatgttgattttgagttggatcttgtttgtcttccgttgaagcatatggatgttatttttggtatggattggt 30140260  T
Q  463 tgttgtcctttggtgttagcattaactgtttaaccaagagtataacattttcgaagtcggtatacgagttaggtgggaagttattgaccgtggaaaaagt 562  Q
    ||||  | ||||| ||||||||||| ||||| || | |||| | || ||||| ||| ||||| | ||||||| | ||||||| ||||||| |||  ||||    
T  30140259 tgttagcttttggggttagcattaattgtttgactaggagtgtgactttttctaagccggtagaagagttagataggaagtttttgaccgcggagcaagt 30140160  T
Q  563 gaagaagtctttggacgatgaagctttagtgtttatgatgt 603  Q
    |||||||||||| || | ||| ||||  |||||||||||||    
T  30140159 gaagaagtctttagatggtgaggcttgtgtgtttatgatgt 30140119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 391 - 603
Target Start/End: Complemental strand, 12796092 - 12795880
Alignment:
Q  391 atgttgattttaagttggattttgtgtgtcttccgttgaagcatatggatgtgatttttggtatggattggatgttgtcctttggtgttagcattaactg 490  Q
    ||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  | ||||| ||||||||||| ||    
T  12796092 atgttgattttgagttggatcttgtttgtcttccgttgaagcatatggatgtgatttttggtatggattggttgttagcttttggggttagcattaattg 12795993  T
Q  491 tttaaccaagagtataacattttcgaagtcggtatacgagttaggtgggaagttattgaccgtggaaaaagtgaagaagtctttggacgatgaagcttta 590  Q
    ||| || |||||| |||| ||||| ||| || || | ||||||| | ||||||| |||||||  ||  |||||||||  ||||| || | |||||||| |    
T  12795992 tttgactaagagtgtaactttttctaagccgttagaagagttagataggaagttcttgaccgcagagcaagtgaagagatctttagatggtgaagcttga 12795893  T
Q  591 gtgtttatgatgt 603  Q
    |||||||||||||    
T  12795892 gtgtttatgatgt 12795880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 81; E-Value: 8e-38
Query Start/End: Original strand, 391 - 603
Target Start/End: Complemental strand, 18915582 - 18915370
Alignment:
Q  391 atgttgattttaagttggattttgtgtgtcttccgttgaagcatatggatgtgatttttggtatggattggatgttgtcctttggtgttagcattaactg 490  Q
    ||||||| ||| |||||||| |||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  | |||||||||| |||||| ||    
T  18915582 atgttgactttgagttggatcttgtttggcttccgttgaagcatatggatgtgatttttggtatggattggttgttagcttttggtgttatcattaattg 18915483  T
Q  491 tttaaccaagagtataacattttcgaagtcggtatacgagttaggtgggaagttattgaccgtggaaaaagtgaagaagtctttggacgatgaagcttta 590  Q
    ||| || |||||| |||| ||||| ||||||||| | ||||||| | ||||||| |||||||  ||  |||||||||  ||||| || | ||||||||      
T  18915482 ttttactaagagtgtaacgttttctaagtcggtagaagagttagataggaagttcttgaccgcagagcaagtgaagagatctttagatggtgaagcttgt 18915383  T
Q  591 gtgtttatgatgt 603  Q
    ||||| |||||||    
T  18915382 gtgttcatgatgt 18915370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 391 - 567
Target Start/End: Complemental strand, 16258998 - 16258822
Alignment:
Q  391 atgttgattttaagttggattttgtgtgtcttccgttgaagcatatggatgtgatttttggtatggattggatgttgtcctttggtgttagcattaactg 490  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| ||||  | ||||| ||||||||||| ||    
T  16258998 atgttgattttgagttggatcttgtgtgtcttccgttgaagaatatggatgttatttttggtatggattggttgttagcttttggggttagcattaattg 16258899  T
Q  491 tttaaccaagagtataacattttcgaagtcggtatacgagttaggtgggaagttattgaccgtggaaaaagtgaaga 567  Q
    ||| || |||||| | || ||||||||| ||||| | ||||| | | ||||||| ||||||| |||  |||||||||    
T  16258898 tttgactaagagtgtgactttttcgaagccggtagaagagttggataggaagttcttgaccgcggagcaagtgaaga 16258822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 371 - 603
Target Start/End: Original strand, 3295969 - 3296201
Alignment:
Q  371 gtgtcctgttaattttggtaatgttgattttaagttggattttgtgtgtcttccgttgaagcatatggatgtgatttttggtatggattggatgttgtcc 470  Q
    ||||||| |||||||||| || ||||||||| | |||||||| || ||  | ||||||  ||||||| ||||||| || || ||||| |||||| | ||     
T  3295969 gtgtcctattaattttggcaacgttgattttgaattggatttagtttgcttgccgttggtgcatatgaatgtgatattcggaatggactggatgctatct 3296068  T
Q  471 tttggtgttagcattaactgtttaaccaagagtataacattttcgaagtcggtatacgagttaggtgggaagttattgaccgtggaaaaagtgaagaagt 570  Q
    ||| | |||| |||||||||||||||||| ||||||||||| || | |   ||| | | | ||||||||||||| ||||||| ||| ||| |||||||||    
T  3296069 ttttgggttaacattaactgtttaaccaaaagtataacattctctacgctagtagatgtggtaggtgggaagttcttgaccgcggagaaactgaagaagt 3296168  T
Q  571 ctttggacgatgaagctttagtgtttatgatgt 603  Q
    ||| ||| |  ||||||   |||||||||||||    
T  3296169 cttcggatggcgaagctagtgtgtttatgatgt 3296201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 207 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 10408677 - 10408625
Alignment:
Q  207 aatagtactcctttgattgcaattattgatactggtgctactcattcttttat 259  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  10408677 aatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttat 10408625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 207 - 259
Target Start/End: Original strand, 12509903 - 12509955
Alignment:
Q  207 aatagtactcctttgattgcaattattgatactggtgctactcattcttttat 259  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  12509903 aatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttat 12509955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 207 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 28757028 - 28756976
Alignment:
Q  207 aatagtactcctttgattgcaattattgatactggtgctactcattcttttat 259  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  28757028 aatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttat 28756976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 207 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 47126653 - 47126601
Alignment:
Q  207 aatagtactcctttgattgcaattattgatactggtgctactcattcttttat 259  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  47126653 aatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttat 47126601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 207 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 12273047 - 12273002
Alignment:
Q  207 aatagtactcctttgattgcaattattgatactggtgctactcatt 252  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  12273047 aatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcatt 12273002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 207 - 252
Target Start/End: Original strand, 16327129 - 16327174
Alignment:
Q  207 aatagtactcctttgattgcaattattgatactggtgctactcatt 252  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  16327129 aatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcatt 16327174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 207 - 259
Target Start/End: Original strand, 15399948 - 15400000
Alignment:
Q  207 aatagtactcctttgattgcaattattgatactggtgctactcattcttttat 259  Q
    |||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  15399948 aataatactcctttggttgctattattgatactggtgctacgcattgttttat 15400000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 377 - 499
Target Start/End: Original strand, 29680805 - 29680928
Alignment:
Q  377 tgttaattttggtaatgttgattttaagttggattttgtgtgtcttccgttgaagcatatggatgtgatttttggtatggattggatgttgtccttt-gg 475  Q
    |||||||||||||| ||| |||||| | |||||||| || |   |  | ||| |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| || ||| ||    
T  29680805 tgttaattttggtattgtggattttgaattggatttagtttacttatctttggagcatatggatgtgatttttggaatggattagatgttatcttttggg 29680904  T
Q  476 tgttagcattaactgtttaaccaa 499  Q
     ||||  ||||| |||||||||||    
T  29680905 ggttaatattaattgtttaaccaa 29680928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 182 - 252
Target Start/End: Original strand, 13317929 - 13317999
Alignment:
Q  182 tcttatccgaggtatgtgttttatcaatagtactcctttgattgcaattattgatactggtgctactcatt 252  Q
    ||||||| ||||||  |||||  | |||||||||||||| ||||| ||||| || ||||||||||||||||    
T  13317929 tcttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtgctactcatt 13317999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 182 - 252
Target Start/End: Original strand, 16831923 - 16831993
Alignment:
Q  182 tcttatccgaggtatgtgttttatcaatagtactcctttgattgcaattattgatactggtgctactcatt 252  Q
    ||||||| ||||||  |||||  | |||||||||||||| ||||| ||||| || ||||||||||||||||    
T  16831923 tcttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtgctactcatt 16831993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 207 - 252
Target Start/End: Original strand, 8744810 - 8744855
Alignment:
Q  207 aatagtactcctttgattgcaattattgatactggtgctactcatt 252  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| || ||||||||||||||||    
T  8744810 aatagtactcctttaattgctattatagacactggtgctactcatt 8744855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 207 - 252
Target Start/End: Original strand, 11949345 - 11949390
Alignment:
Q  207 aatagtactcctttgattgcaattattgatactggtgctactcatt 252  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| || ||||||||||||||||    
T  11949345 aatagtactcctttaattgctattatagacactggtgctactcatt 11949390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 207 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 13944733 - 13944688
Alignment:
Q  207 aatagtactcctttgattgcaattattgatactggtgctactcatt 252  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| || ||||||||||||||||    
T  13944733 aatagtactcctttaattgctattatagacactggtgctactcatt 13944688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 207 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 17494356 - 17494311
Alignment:
Q  207 aatagtactcctttgattgcaattattgatactggtgctactcatt 252  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| || ||||||||||||||||    
T  17494356 aatagtactcctttaattgctattatagacactggtgctactcatt 17494311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 207 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 24185889 - 24185844
Alignment:
Q  207 aatagtactcctttgattgcaattattgatactggtgctactcatt 252  Q
    |||| |||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  24185889 aataatactcctttagttgctattattgatactggtgctactcatt 24185844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 207 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 24190013 - 24189968
Alignment:
Q  207 aatagtactcctttgattgcaattattgatactggtgctactcatt 252  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| || ||||||||||||||||    
T  24190013 aatagtactcctttaattgctattatagacactggtgctactcatt 24189968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 207 - 252
Target Start/End: Original strand, 31692605 - 31692650
Alignment:
Q  207 aatagtactcctttgattgcaattattgatactggtgctactcatt 252  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| |||| ||||||||||||||    
T  31692605 aatagtactcctttaattgctattatagatattggtgctactcatt 31692650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 207 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 31941612 - 31941567
Alignment:
Q  207 aatagtactcctttgattgcaattattgatactggtgctactcatt 252  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| ||||||| |||||||||||    
T  31941612 aatagtactcctttaattgctattatagatactgatgctactcatt 31941567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 207 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 3688642 - 3688590
Alignment:
Q  207 aatagtactcctttgattgcaattattgatactggtgctactcattcttttat 259  Q
    |||| |||||||||  |||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  3688642 aataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttat 3688590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 207 - 259
Target Start/End: Original strand, 5422361 - 5422413
Alignment:
Q  207 aatagtactcctttgattgcaattattgatactggtgctactcattcttttat 259  Q
    |||| |||||||||  |||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  5422361 aataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttat 5422413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 207 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 10008299 - 10008247
Alignment:
Q  207 aatagtactcctttgattgcaattattgatactggtgctactcattcttttat 259  Q
    |||| |||||||||  |||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  10008299 aataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttat 10008247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 207 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 10908909 - 10908857
Alignment:
Q  207 aatagtactcctttgattgcaattattgatactggtgctactcattcttttat 259  Q
    |||| |||||||||  |||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  10908909 aataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttat 10908857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 207 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 12889408 - 12889356
Alignment:
Q  207 aatagtactcctttgattgcaattattgatactggtgctactcattcttttat 259  Q
    |||| |||||||||  |||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  12889408 aataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttat 12889356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 207 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 13255389 - 13255337
Alignment:
Q  207 aatagtactcctttgattgcaattattgatactggtgctactcattcttttat 259  Q
    |||| |||||||||  |||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  13255389 aataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttat 13255337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 207 - 259
Target Start/End: Original strand, 15345676 - 15345728
Alignment:
Q  207 aatagtactcctttgattgcaattattgatactggtgctactcattcttttat 259  Q
    |||| |||||||||  |||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  15345676 aataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttat 15345728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 207 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 15358782 - 15358730
Alignment:
Q  207 aatagtactcctttgattgcaattattgatactggtgctactcattcttttat 259  Q
    |||| |||||||||  |||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  15358782 aataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttat 15358730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 207 - 259
Target Start/End: Original strand, 15586823 - 15586875
Alignment:
Q  207 aatagtactcctttgattgcaattattgatactggtgctactcattcttttat 259  Q
    |||| |||||||||  |||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  15586823 aataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttat 15586875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 207 - 259
Target Start/End: Original strand, 15713487 - 15713539
Alignment:
Q  207 aatagtactcctttgattgcaattattgatactggtgctactcattcttttat 259  Q
    |||| |||||||||  |||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  15713487 aataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttat 15713539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 208 - 252
Target Start/End: Original strand, 16825702 - 16825746
Alignment:
Q  208 atagtactcctttgattgcaattattgatactggtgctactcatt 252  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||| |||||| ||||||||||||    
T  16825702 atagtactcctttaattgctattatagatactagtgctactcatt 16825746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 207 - 259
Target Start/End: Original strand, 26790844 - 26790896
Alignment:
Q  207 aatagtactcctttgattgcaattattgatactggtgctactcattcttttat 259  Q
    |||| |||||||||  |||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  26790844 aataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttat 26790896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 207 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 43165374 - 43165322
Alignment:
Q  207 aatagtactcctttgattgcaattattgatactggtgctactcattcttttat 259  Q
    |||| |||||||||  |||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  43165374 aataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttat 43165322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 207 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 48428146 - 48428094
Alignment:
Q  207 aatagtactcctttgattgcaattattgatactggtgctactcattcttttat 259  Q
    |||| |||||||||  |||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  48428146 aataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttat 48428094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021 (Bit Score: 395; Significance: 0; HSPs: 4)
Name: scaffold0021
Description:

Target: scaffold0021; HSP #1
Raw Score: 395; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 603
Target Start/End: Complemental strand, 8472 - 7870
Alignment:
Q  1 tcagttgtcacaagtgtgggaaagtgggtcacaagggttatgaatgcaagagtgttgtaaaggagattacttgctacaattgtggagagaaaggtcatat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| || |||||||| || | |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  8472 tcagttgtcacaagtgtgggaaagcggatcacaaggcttttaaatgcaagggtgttgcaaaggagattacttgctacaattctggagagaagggtcatat 8373  T
Q  101 cagtactaagtgtaccaagccgaagaaggcggcgggaaaggtgtttgctttgaatgcggaagaggtggagcagccggataatcttatccgaggtatgtgt 200  Q
     ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  8372 tagtactaagtgtaccaatccgaagaaggcggcgggaaaggtgtttgctttgaatgcggaagaagtggagcagccgaataatcttatctgaggtatgtgt 8273  T
Q  201 tttatcaatagtactcctttgattgcaattattgatactggtgctactcattcttttatctcagctagttgtgttgaacgtttggatttggttgtaagtc 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||| |  |||||||||  |    
T  8272 tttatcaatagtactcctttgattgcaattattgatactggtgctactcattcttttatctcggttagttgtgttgagcgtttgaaaatggttgtaaccc 8173  T
Q  301 ctttgttgcgtggaatggttattgacaccccggctagcggttcggtgactacttcttttatgtgtgctaagtgtcctgttaattttggtaatgttgattt 400  Q
    ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  8172 ctttgttccggggaatggttattgacaccccggctagcggttcggtgactacttcttttatgtgtgctaagtgtcctgtcaattttggtgatgttgattt 8073  T
Q  401 taagttggattttgtgtgtcttccgttgaagcatatggatgtgatttttggtatggattggatgttgtcctttggtgttagcattaactgtttaaccaag 500  Q
    ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || ||||| ||||||||||| ||||| ||||      
T  8072 taagttgtatcttgtgtgtcttccgttgaagcatatggatgtgatttttggtatggattggttgttctcttttggggttagcattaattgtttgaccaga 7973  T
Q  501 agtataacattttcgaagtcggtatacgagttaggtgggaagttattgaccgtggaaaaagtgaagaagtctttggacgatgaagctttagtgtttatga 600  Q
    ||| |||||||||||||| ||||| | ||||||| | ||||||| |||||||  ||  |||||||||||||||||||||  |||||||  ||||| ||||    
T  7972 agtgtaacattttcgaagccggtagaagagttagataggaagttcttgaccgcagagcaagtgaagaagtctttggacggcgaagcttgtgtgttcatga 7873  T
Q  601 tgt 603  Q
    |||    
T  7872 tgt 7870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #2
Raw Score: 391; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 603
Target Start/End: Complemental strand, 90817 - 90215
Alignment:
Q  1 tcagttgtcacaagtgtgggaaagtgggtcacaagggttatgaatgcaagagtgttgtaaaggagattacttgctacaattgtggagagaaaggtcatat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  90817 tcagttgtcacaagtgtgggaaagcgggtcacaaggcttatgaatgcaagagtgttgaaaaggagattacttgatacaattgtggagagaaaggttatat 90718  T
Q  101 cagtactaagtgtaccaagccgaagaaggcggcgggaaaggtgtttgctttgaatgcggaagaggtggagcagccggataatcttatccgaggtatgtgt 200  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||    
T  90717 tagtactaagtgtaccaagccgaagaaggcggcgggaaaggtgtatgctttgaatgcggaggaggtggagcaaccggataatcttatctgaggtatgtgt 90618  T
Q  201 tttatcaatagtactcctttgattgcaattattgatactggtgctactcattcttttatctcagctagttgtgttgaacgtttggatttggttgtaagtc 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||| | |||||||||| ||    
T  90617 tttatcaatagtactcctttgattgcaattattgatactggtgctactcattcttttatctcggttagttgtgttgagcgtttgaaattggttgtaactc 90518  T
Q  301 ctttgttgcgtggaatggttattgacaccccggctagcggttcggtgactacttcttttatgtgtgctaagtgtcctgttaattttggtaatgttgattt 400  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  90517 ctttgttgcggggaatggttattgacaccccggctggcggttcggtgactacttcttttatgtgtgctaagtgtcctgttaattttggtaatgttgattt 90418  T
Q  401 taagttggattttgtgtgtcttccgttgaagcatatggatgtgatttttggtatggattggatgttgtcctttggtgttagcattaactgtttaaccaag 500  Q
    | |||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||  | ||||| ||||||||||| ||||| || |||    
T  90417 tgagttggatcttgtttgtcttccgttgaagcgtatggatgtgatttttggtatggattggttgttagcttttggggttagcattaattgtttgactaag 90318  T
Q  501 agtataacattttcgaagtcggtatacgagttaggtgggaagttattgaccgtggaaaaagtgaagaagtctttggacgatgaagctttagtgtttatga 600  Q
    ||| |||| ||||| ||| || || | ||||||| | ||||||| |||| || |||  |||| ||||| ||| | || | ||||||||  ||||| ||||    
T  90317 agtgtaactttttctaagccgatagaagagttagataggaagttcttgatcgcggagcaagtaaagaaatctctagatggtgaagcttgtgtgttcatga 90218  T
Q  601 tgt 603  Q
    |||    
T  90217 tgt 90215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #3
Raw Score: 275; E-Value: 1e-153
Query Start/End: Original strand, 60 - 578
Target Start/End: Original strand, 20924 - 21420
Alignment:
Q  60 aaggagattacttgctacaattgtggagagaaaggtcatatcagtactaagtgtaccaagccgaagaaggcggcgggaaaggtgtttgctttgaatgcgg 159  Q
    |||||||||||||| ||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  20924 aaggagattacttgttacaattgttgtgagaaaggacatatcagtactaagtgtaccaagccaaagaaggcggcaggaaaggtgtttgctttgattgcgg 21023  T
Q  160 aagaggtggagcagccggataatcttatccgaggtatgtgttttatcaatagtactcctttgattgcaattattgatactggtgctactcattcttttat 259  Q
    | || |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  21024 aggaagtggagcagccggataatcttatctgaggtatgtgttttatcaatagtactcctttgattgcaattattgatagtggtgctactcattcttttat 21123  T
Q  260 ctcagctagttgtgttgaacgtttggatttggttgtaagtcctttgttgcgtggaatggttattgacaccccggctagcggttcggtgactacttctttt 359  Q
    ||| | |||||||||||| |||||| |  | ||||||| ||  |||||||| || ||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||     
T  21124 ctcggttagttgtgttgaccgtttgaacat-gttgtaactctgttgttgcgagggatggtcatcgacaccccggctagtggttcggtgactacttcttta 21222  T
Q  360 atgtgtgctaagtgtcctgttaattttggtaatgttgattttaagttggattttgtgtgtcttccgttgaagcatatggatgtgatttttggtatggatt 459  Q
     ||||||||||||||||| |||||||||||||                     |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  21223 gtgtgtgctaagtgtcctattaattttggtaa---------------------tgtgtgtcttccgttgaagcatatagatgtgatttttggtatcgatt 21301  T
Q  460 ggatgttgtcctttggtgttagcattaactgtttaaccaagagtataacattttcgaagtcggtatacgagttaggtgggaagttattgaccgtggaaaa 559  Q
    ||||||| || ||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||| ||||||| |||  |    
T  21302 ggatgttatcttttggggttagcattaattgtttgaccaagagtataacattttcgaagccggtaaaagagttaggtgggaagttcttgaccgcggagca 21401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #4
Raw Score: 275; E-Value: 1e-153
Query Start/End: Original strand, 60 - 578
Target Start/End: Original strand, 30500 - 30996
Alignment:
Q  60 aaggagattacttgctacaattgtggagagaaaggtcatatcagtactaagtgtaccaagccgaagaaggcggcgggaaaggtgtttgctttgaatgcgg 159  Q
    |||||||||||||| ||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  30500 aaggagattacttgttacaattgttgtgagaaaggacatatcagtactaagtgtaccaagccaaagaaggcggcaggaaaggtgtttgctttgattgcgg 30599  T
Q  160 aagaggtggagcagccggataatcttatccgaggtatgtgttttatcaatagtactcctttgattgcaattattgatactggtgctactcattcttttat 259  Q
    | || |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  30600 aggaagtggagcagccggataatcttatctgaggtatgtgttttatcaatagtactcctttgattgcaattattgatagtggtgctactcattcttttat 30699  T
Q  260 ctcagctagttgtgttgaacgtttggatttggttgtaagtcctttgttgcgtggaatggttattgacaccccggctagcggttcggtgactacttctttt 359  Q
    ||| | |||||||||||| |||||| |  | ||||||| ||  |||||||| || ||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||     
T  30700 ctcggttagttgtgttgaccgtttgaacat-gttgtaactctgttgttgcgagggatggtcatcgacaccccggctagtggttcggtgactacttcttta 30798  T
Q  360 atgtgtgctaagtgtcctgttaattttggtaatgttgattttaagttggattttgtgtgtcttccgttgaagcatatggatgtgatttttggtatggatt 459  Q
     ||||||||||||||||| |||||||||||||                     |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  30799 gtgtgtgctaagtgtcctattaattttggtaa---------------------tgtgtgtcttccgttgaagcatatagatgtgatttttggtatcgatt 30877  T
Q  460 ggatgttgtcctttggtgttagcattaactgtttaaccaagagtataacattttcgaagtcggtatacgagttaggtgggaagttattgaccgtggaaaa 559  Q
    ||||||| || ||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||| ||||||| |||  |    
T  30878 ggatgttatcttttggggttagcattaattgtttgaccaagagtataacattttcgaagccggtaaaagagttaggtgggaagttcttgaccgcggagca 30977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0225 (Bit Score: 391; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold0225
Description:

Target: scaffold0225; HSP #1
Raw Score: 391; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 5 - 603
Target Start/End: Complemental strand, 26707 - 26109
Alignment:
Q  5 ttgtcacaagtgtgggaaagtgggtcacaagggttatgaatgcaagagtgttgtaaaggagattacttgctacaattgtggagagaaaggtcatatcagt 104  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||    ||| | ||   |||||| ||  ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||    
T  26707 ttgtcacaagtgtgggaaagcgggtcacaaggcggctgatttcagaggtgttgcaagagagattacttgctacaattgtcgagagaagggtcatattagt 26608  T
Q  105 actaagtgtaccaagccgaagaaggcggcgggaaaggtgtttgctttgaatgcggaagaggtggagcagccggataatcttatccgaggtatgtgtttta 204  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26607 accaagtgtaccaagccgaagaaggcggcgggaaaggtgtttgctttgaatgcggaggaggtggagcagccggataatcttatccgaggtatgtgtttta 26508  T
Q  205 tcaatagtactcctttgattgcaattattgatactggtgctactcattcttttatctcagctagttgtgttgaacgtttggatttggttgtaagtccttt 304  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  26507 tcaatagtactcctttgattgcaattattgatactggtgctactcattcttttatctcggctagttgtgttgaacgtttggatttggttgtaactccttt 26408  T
Q  305 gttgcgtggaatggttattgacaccccggctagcggttcggtgactacttcttttatgtgtgctaagtgtcctgttaattttggtaatgttgattttaag 404  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||    
T  26407 gttgcgtggaatggttattgacaccccggctagcggttcggtgactacttcttttatgtgtgctaagtgtcctgttaattttggtgatgttgattttgag 26308  T
Q  405 ttggattttgtgtgtcttccgttgaagcatatggatgtgatttttggtatggattggatgttgtcctttggtgttagcattaactgtttaaccaagagta 504  Q
    |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  | ||||| ||||||||||| ||||| || | ||||     
T  26307 ttggatcttgtttgtcttccgttgaagcatatggatgtgatttttggtatggattggttgttagcttttggggttagcattaattgtttgactaggagtg 26208  T
Q  505 taacattttcgaagtcggtatacgagttaggtgggaagttattgaccgtggaaaaagtgaagaagtctttggacgatgaagctttagtgtttatgatgt 603  Q
    | || ||||| ||| ||||| | ||||||| | ||||||| ||||||| |||  |||||||||||||||| || | ||| ||||  |||||||||||||    
T  26207 tgactttttctaagccggtagaagagttagataggaagtttttgaccgcggagcaagtgaagaagtctttagatggtgaggcttgtgtgtttatgatgt 26109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 385; Significance: 0; HSPs: 26)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 385; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 3 - 603
Target Start/End: Complemental strand, 22281020 - 22280420
Alignment:
Q  3 agttgtcacaagtgtgggaaagtgggtcacaagggttatgaatgcaagagtgttgtaaaggagattacttgctacaattgtggagagaaaggtcatatca 102  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||    ||| ||||||||||||| ||  ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |    
T  22281020 agttgtcacaagtgtgggaaagcgggtcacaaggcggctgattgcaagagtgttgcaagagagattacttgttacaattgtggagagaaatgtcatatta 22280921  T
Q  103 gtactaagtgtaccaagccgaagaaggcggcgggaaaggtgtttgctttgaatgcggaagaggtggagcagccggataatcttatccgaggtatgtgttt 202  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  22280920 gtactaagtgtacaaagccgaagaaggcggcgggaaaggtgtttgctttgaatgcggaggaggtggagcagcaggataatcttatcagaggtatgtgttt 22280821  T
Q  203 tatcaatagtactcctttgattgcaattattgatactggtgctactcattcttttatctcagctagttgtgttgaacgtttggatttggttgtaagtcct 302  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| | ||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||    
T  22280820 tatcaatagtactcctttgattgcaattattgatactggtgctagtcattcatttatctcggttagttgtgttgaacgtttgaaattggttgtaactcct 22280721  T
Q  303 ttgttgcgtggaatggttattgacaccccggctagcggttcggtgactacttcttttatgtgtgctaagtgtcctgttaattttggtaatgttgatttta 402  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||     
T  22280720 ttgttgcggggaatggttattgacaccccggctagcggttcggtgactacttcttttatgtgtgctaagtgtcctgttaatttaggtaatgttgattttg 22280621  T
Q  403 agttggattttgtgtgtcttccgttgaagcatatggatgtgatttttggtatggattggatgttgtcctttggtgttagcattaactgtttaaccaagag 502  Q
    |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  | ||||| ||||||||||| ||||| || |||||    
T  22280620 agttggatcttgtttgtcttccgttgaagcatatggatgtgatttttggtatggattggttgttagcttttggggttagcattaattgtttgactaagag 22280521  T
Q  503 tataacattttcgaagtcggtatacgagttaggtgggaagttattgaccgtggaaaaagtgaagaagtctttggacgatgaagctttagtgtttatgatg 602  Q
    | |||| ||||| ||| ||||| | ||||||| |  |||||| ||||||| |||| |||||||||  ||||| |||| ||||||||  ||||||||||||    
T  22280520 tgtaactttttctaagccggtagaagagttagatatgaagttcttgaccgcggaacaagtgaagagatctttagacggtgaagcttgtgtgtttatgatg 22280421  T
Q  603 t 603  Q
    |    
T  22280420 t 22280420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 339; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 9 - 579
Target Start/End: Original strand, 22739188 - 22739758
Alignment:
Q  9 cacaagtgtgggaaagtgggtcacaagggttatgaatgcaagagtgttgtaaaggagattacttgctacaattgtggagagaaaggtcatatcagtacta 108  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| || |||||| ||| ||||||  |||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  22739188 cacaagtgtgggaaagcgggtcacaaggcttttgaatgtaagggtgttgcgaaggatgttacttgctacaattgtggagagaagggtcatattagtacta 22739287  T
Q  109 agtgtaccaagccgaagaaggcggcgggaaaggtgtttgctttgaatgcggaagaggtggagcagccggataatcttatccgaggtatgtgttttatcaa 208  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||    
T  22739288 agtgtaccaagccgaagaaggcggcaggaaaggtgtttgctttgaatgcggaggaagtggagcagccggataaatttatcagaggtatgtgttttatcaa 22739387  T
Q  209 tagtactcctttgattgcaattattgatactggtgctactcattcttttatctcagctagttgtgttgaacgtttggatttggttgtaagtcctttgttg 308  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||  |||||| | |||||||||| ||||||||||    
T  22739388 tagtactcctttgattgcaattattgatactggtgctactcattcttttatctcggttagttgtgttgtgcgtttgaaattggttgtaactcctttgttg 22739487  T
Q  309 cgtggaatggttattgacaccccggctagcggttcggtgactacttcttttatgtgtgctaagtgtcctgttaattttggtaatgttgattttaagttgg 408  Q
    || || |||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  22739488 cgggggatggttatcgacacctcggctagcggttcggtaactacttcttttatgtgtgctaagtgtcctgttaatttttgtaatgttgattttgagttgg 22739587  T
Q  409 attttgtgtgtcttccgttgaagcatatggatgtgatttttggtatggattggatgttgtcctttggtgttagcattaactgtttaaccaagagtataac 508  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| | ||    ||||| ||||||||||| ||||| || |||||| ||||    
T  22739588 atcttgtgtgtcttccgttgaagcatatggatgtgatttttggcatggaatggttattaatttttggggttagcattaattgtttgactaagagtgtaac 22739687  T
Q  509 attttcgaagtcggtatacgagttaggtgggaagttattgaccgtggaaaaagtgaagaagtctttggacg 579  Q
     ||||||||| ||||  | ||||||| | ||||||| | |||||  ||  |||||||||||||||||||||    
T  22739688 tttttcgaagccggtggaagagttagataggaagttctagaccgcagagcaagtgaagaagtctttggacg 22739758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 203 - 603
Target Start/End: Complemental strand, 25131324 - 25130924
Alignment:
Q  203 tatcaatagtactcctttgattgcaattattgatactggtgctactcattcttttatctcagctagttgtgttgaacgtttggatttggttgtaagtcct 302  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||| ||||| || |||||||||||| |||     
T  25131324 tatcaatagtactcatttgattgcaattattgatactggtgctactcattcttctatctcggttagttgtgtttaacgtctgaatttggttgtaactccg 25131225  T
Q  303 ttgttgcgtggaatggttattgacaccccggctagcggttcggtgactacttcttttatgtgtgctaagtgtcctgttaattttggtaatgttgatttta 402  Q
    |||| ||| || ||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||  ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||     
T  25131224 ttgtcgcgagggatggtcatcgacaccccggctagtggttcggtgactacttccttagtgtgtgctaagtgccctgttaattttggtaatattgattttg 25131125  T
Q  403 agttggattttgtgtgtcttccgttgaagcatatggatgtgatttttggtatggattggatgttgtcctttggtgttagcattaactgtttaaccaagag 502  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  25131124 agttggatcttgtgtgtcttccgttgaagcatatggatgtgatttttggtatggattggatgttatcttttggggttagcattaattgtttaaccaagag 25131025  T
Q  503 tataacattttcgaagtcggtatacgagttaggtgggaagttattgaccgtggaaaaagtgaagaagtctttggacgatgaagctttagtgtttatgatg 602  Q
    |||||| ||||||||| ||||| | ||||||||||||||||| |||||||  ||  ||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||    
T  25131024 tataacgttttcgaagccggtagatgagttaggtgggaagttcttgaccgcagagcaagtgaagaagtctttggacggtgaagcttgtgtgtttatgatg 25130925  T
Q  603 t 603  Q
    |    
T  25130924 t 25130924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 232 - 603
Target Start/End: Original strand, 24567425 - 24567796
Alignment:
Q  232 ttgatactggtgctactcattcttttatctcagctagttgtgttgaacgtttggatttggttgtaagtcctttgttgcgtggaatggttattgacacccc 331  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||| | |||||||||| |||||||||||  |||||| |||||||||||||    
T  24567425 ttgatactagtgctactcattcttttatctcggttagttgtgttgagcgtttgaaattggttgtaactcctttgttgcagggaatgattattgacacccc 24567524  T
Q  332 ggctagcggttcggtgactacttcttttatgtgtgctaagtgtcctgttaattttggtaatgttgattttaagttggattttgtgtgtcttccgttgaag 431  Q
    | ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||| | ||||    
T  24567525 gactagcggttcgatgacaacttcttttatgtgtgctaagtgtcctgttgattttggtactgttgattttgagttggatcttgtgtgtcttccatggaag 24567624  T
Q  432 catatggatgtgatttttggtatggattggatgttgtcctttggtgttagcattaactgtttaaccaagagtataacattttcgaagtcggtatacgagt 531  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||| || ||||| ||||||||||| ||||| || |||||| |||| ||||||||| ||||| | ||||    
T  24567625 catatggatgtgatttttggtatggattggttgttatcttttggggttagcattaattgtttgactaagagtgtaactttttcgaagccggtagaagagt 24567724  T
Q  532 taggtgggaagttattgaccgtggaaaaagtgaagaagtctttggacgatgaagctttagtgtttatgatgt 603  Q
    ||| | ||||||| |||||||  ||  |||||||||||||||| |||| ||||||||  ||||| |||||||    
T  24567725 tagataggaagttcttgaccgcagagcaagtgaagaagtctttagacggtgaagcttgtgtgttcatgatgt 24567796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 91; E-Value: 9e-44
Query Start/End: Original strand, 363 - 493
Target Start/End: Original strand, 25878531 - 25878661
Alignment:
Q  363 tgtgctaagtgtcctgttaattttggtaatgttgattttaagttggattttgtgtgtcttccgttgaagcatatggatgtgatttttggtatggattgga 462  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||     
T  25878531 tgtgttaagtgtcctgttaattttggtaatgttgattttgagttggatcttgtgtgtcttccgttgaagcatatggatgtgatttttggtatgaattggt 25878630  T
Q  463 tgttgtcctttggtgttagcattaactgttt 493  Q
    ||||  | ||||| ||||||||||| |||||    
T  25878631 tgttaacttttggggttagcattaattgttt 25878661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 391 - 603
Target Start/End: Original strand, 24829105 - 24829316
Alignment:
Q  391 atgttgattttaagttggattttgtgtgtcttccgttgaagcatatggatgtgatttttggtatggattggatgttgtcctttggtgttagcattaactg 490  Q
    ||||||||||| |||||||| || | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||  | ||||| ||||||||||| ||    
T  24829105 atgttgattttgagttggatctttt-tgtcttccgttgaagcatatgaatgtgatttttggtatggattggttgttagcttttggggttagcattaattg 24829203  T
Q  491 tttaaccaagagtataacattttcgaagtcggtatacgagttaggtgggaagttattgaccgtggaaaaagtgaagaagtctttggacgatgaagcttta 590  Q
    ||| || |||||| |||| ||||| ||| ||||| | ||||||| | ||||||| ||||||| |||  |||||||||||||||| || | ||| ||||      
T  24829204 tttgactaagagtgtaacgttttctaagccggtagaagagttagataggaagtttttgaccgcggagcaagtgaagaagtctttagatggtgaggcttgt 24829303  T
Q  591 gtgtttatgatgt 603  Q
    |||||||||||||    
T  24829304 gtgtttatgatgt 24829316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 73; E-Value: 5e-33
Query Start/End: Original strand, 391 - 603
Target Start/End: Original strand, 12638818 - 12639030
Alignment:
Q  391 atgttgattttaagttggattttgtgtgtcttccgttgaagcatatggatgtgatttttggtatggattggatgttgtcctttggtgttagcattaactg 490  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||| |||| |||||| ||    
T  12638818 atgttgattttgagttggattttgtttgtcttccgttgaagcatatggatgtgatttttggtatggattggatgttagcttttggggttaccattaattg 12638917  T
Q  491 tttaaccaagagtataacattttcgaagtcggtatacgagttaggtgggaagttattgaccgtggaaaaagtgaagaagtctttggacgatgaagcttta 590  Q
    ||| || | |||| | || ||||  ||  ||||| | ||||||| | ||||||| |||||||  ||  |||||||||  ||||| || | ||||||||      
T  12638918 tttgactaggagtgtgactttttgtaaaccggtagaagagttagataggaagttcttgaccgcagagcaagtgaagagatctttagatggtgaagcttgt 12639017  T
Q  591 gtgtttatgatgt 603  Q
    ||||| |||||||    
T  12639018 gtgttcatgatgt 12639030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 71; E-Value: 7e-32
Query Start/End: Original strand, 391 - 493
Target Start/End: Original strand, 12644485 - 12644587
Alignment:
Q  391 atgttgattttaagttggattttgtgtgtcttccgttgaagcatatggatgtgatttttggtatggattggatgttgtcctttggtgttagcattaactg 490  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||| |||| |||||| ||    
T  12644485 atgttgattttgagttggattttgtttgtcttccgttgaagcatatggatgtgatttttggtatggattggttgttggcttttggggttaccattaattg 12644584  T
Q  491 ttt 493  Q
    |||    
T  12644585 ttt 12644587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 392 - 493
Target Start/End: Complemental strand, 34821675 - 34821575
Alignment:
Q  392 tgttgattttaagttggattttgtgtgtcttccgttgaagcatatggatgtgatttttggtatggattggatgttgtcctttggtgttagcattaactgt 491  Q
    |||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| ||||| | ||||| |||| |||||| |||    
T  34821675 tgttgattttgagttggatcttgtttgtcttccgttgaagcatatggatgcga-ttttggtatggattggttgttggcttttggggttaccattaattgt 34821577  T
Q  492 tt 493  Q
    ||    
T  34821576 tt 34821575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 342 - 499
Target Start/End: Complemental strand, 27542067 - 27541905
Alignment:
Q  342 tcggtgactacttcttttatgtgtgctaagtgtcctgttaattttggtaatgttgattttaagttggattttgtgtgtcttccgttgaagcatatggatg 441  Q
    |||||||| ||||| ||  |||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||||   |||||||| || ||  | || ||| ||||||||||||    
T  27542067 tcggtgacgacttccttggtgtgtgttaagtgtcatgttaattttggtaatgtggattttgcattggatttggtttgcatacctttggagcatatggatg 27541968  T
Q  442 tgattt-----ttggtatggattggatgttgtcctttggtgttagcattaactgtttaaccaa 499  Q
    ||||||     | || ||| ||||||||||||| ||||| |||| |||||| |||||||||||    
T  27541967 tgatttaattttcggaatgaattggatgttgtcttttggggttaacattaattgtttaaccaa 27541905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 207 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 20848300 - 20848248
Alignment:
Q  207 aatagtactcctttgattgcaattattgatactggtgctactcattcttttat 259  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||    
T  20848300 aatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgttttat 20848248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 207 - 252
Target Start/End: Original strand, 19716749 - 19716794
Alignment:
Q  207 aatagtactcctttgattgcaattattgatactggtgctactcatt 252  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  19716749 aatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcatt 19716794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 207 - 252
Target Start/End: Original strand, 19721312 - 19721357
Alignment:
Q  207 aatagtactcctttgattgcaattattgatactggtgctactcatt 252  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  19721312 aatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcatt 19721357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 207 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 23113434 - 23113389
Alignment:
Q  207 aatagtactcctttgattgcaattattgatactggtgctactcatt 252  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  23113434 aatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctacacatt 23113389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 207 - 252
Target Start/End: Original strand, 23097750 - 23097795
Alignment:
Q  207 aatagtactcctttgattgcaattattgatactggtgctactcatt 252  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| || ||||||||||||||||    
T  23097750 aatagtactcctttaattgctattatagacactggtgctactcatt 23097795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 207 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 9338293 - 9338241
Alignment:
Q  207 aatagtactcctttgattgcaattattgatactggtgctactcattcttttat 259  Q
    |||| |||||||||  |||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  9338293 aataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttat 9338241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 207 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 9486927 - 9486875
Alignment:
Q  207 aatagtactcctttgattgcaattattgatactggtgctactcattcttttat 259  Q
    |||| |||||||||  |||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  9486927 aataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttat 9486875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 207 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 10871561 - 10871509
Alignment:
Q  207 aatagtactcctttgattgcaattattgatactggtgctactcattcttttat 259  Q
    |||| |||||||||  |||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  10871561 aataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttat 10871509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 207 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 16983951 - 16983899
Alignment:
Q  207 aatagtactcctttgattgcaattattgatactggtgctactcattcttttat 259  Q
    |||| |||||||||  |||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  16983951 aataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttat 16983899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 207 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 17001711 - 17001659
Alignment:
Q  207 aatagtactcctttgattgcaattattgatactggtgctactcattcttttat 259  Q
    |||| |||||||||  |||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  17001711 aataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttat 17001659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 207 - 259
Target Start/End: Original strand, 22323074 - 22323126
Alignment:
Q  207 aatagtactcctttgattgcaattattgatactggtgctactcattcttttat 259  Q
    |||| |||||||||  |||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  22323074 aataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttat 22323126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 207 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 24265081 - 24265029
Alignment:
Q  207 aatagtactcctttgattgcaattattgatactggtgctactcattcttttat 259  Q
    |||| |||||||||  |||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  24265081 aataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttat 24265029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 207 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 24712745 - 24712693
Alignment:
Q  207 aatagtactcctttgattgcaattattgatactggtgctactcattcttttat 259  Q
    |||| |||||||||  |||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  24712745 aataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttat 24712693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 207 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 27220727 - 27220675
Alignment:
Q  207 aatagtactcctttgattgcaattattgatactggtgctactcattcttttat 259  Q
    |||| |||||||||  |||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  27220727 aataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttat 27220675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 207 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 27373980 - 27373928
Alignment:
Q  207 aatagtactcctttgattgcaattattgatactggtgctactcattcttttat 259  Q
    |||| |||||||||  |||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  27373980 aataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttat 27373928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 207 - 259
Target Start/End: Original strand, 44383302 - 44383354
Alignment:
Q  207 aatagtactcctttgattgcaattattgatactggtgctactcattcttttat 259  Q
    |||| |||||||||  |||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  44383302 aataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttat 44383354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 379; Significance: 0; HSPs: 37)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 379; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 5 - 603
Target Start/End: Complemental strand, 7827171 - 7826573
Alignment:
Q  5 ttgtcacaagtgtgggaaagtgggtcacaagggttatgaatgcaagagtgttgtaaaggagattacttgctacaattgtggagagaaaggtcatatcagt 104  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||     || ||||   |||||| ||  |||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||    
T  7827171 ttgtcacaagtgtgggaaagcgggtcacaaggcggtcgattgcagaggtgttgcaagagagactacttgttacaattgtggagagaagggtcatattagt 7827072  T
Q  105 actaagtgtaccaagccgaagaaggcggcgggaaaggtgtttgctttgaatgcggaagaggtggagcagccggataatcttatccgaggtatgtgtttta 204  Q
    || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7827071 accaagtgtaccaagccaaagaaggcggcgggaaaggtgtttgctttgaacgccgaggaggtggagcagccggataatcttatccgaggtatgtgtttta 7826972  T
Q  205 tcaatagtactcctttgattgcaattattgatactggtgctactcattcttttatctcagctagttgtgttgaacgtttggatttggttgtaagtccttt 304  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  7826971 tcaatagtactcctttgattgcaattattgatactggtgctactcattcttttatctcggctagttgtgttgaacgtttggatttggttgtaactccttt 7826872  T
Q  305 gttgcgtggaatggttattgacaccccggctagcggttcggtgactacttcttttatgtgtgctaagtgtcctgttaattttggtaatgttgattttaag 404  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||    
T  7826871 gttgcgtggaatggttattgacaccccggctagcggttcggtgactacttcttttatgtgtgctaagtgtcctgttaattttggtgatgttgattttgag 7826772  T
Q  405 ttggattttgtgtgtcttccgttgaagcatatggatgtgatttttggtatggattggatgttgtcctttggtgttagcattaactgtttaaccaagagta 504  Q
    |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  | ||||| ||||||||||| ||||| || | ||||     
T  7826771 ttggatcttgtttgtcttccgttgaagcatatggatgtgatttttggtatggattggttgttagcttttggggttagcattaattgtttgactaggagtg 7826672  T
Q  505 taacattttcgaagtcggtatacgagttaggtgggaagttattgaccgtggaaaaagtgaagaagtctttggacgatgaagctttagtgtttatgatgt 603  Q
    | || ||||| ||||||||| | ||||||| | ||||||| ||||||| |||  |||||||||||||||| || | ||| ||||  |||||||||||||    
T  7826671 tgactttttctaagtcggtagaagagttagataggaagtttttgaccgcggagcaagtgaagaagtctttagatggtgaggcttgtgtgtttatgatgt 7826573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 375; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 5 - 603
Target Start/End: Original strand, 27104773 - 27105371
Alignment:
Q  5 ttgtcacaagtgtgggaaagtgggtcacaagggttatgaatgcaagagtgttgtaaaggagattacttgctacaattgtggagagaaaggtcatatcagt 104  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||     || ||||   |||||| ||  |||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||    
T  27104773 ttgtcacaagtgtgggaaagcgggtcacaaggcggtcgattgcagaggtgttgcaagagagactacttgttacaattgtggagagaagggtcatattagt 27104872  T
Q  105 actaagtgtaccaagccgaagaaggcggcgggaaaggtgtttgctttgaatgcggaagaggtggagcagccggataatcttatccgaggtatgtgtttta 204  Q
    || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27104873 accaagtgtaccaagccaaagaaggcggcgggaaaggtgtttgctttgaacgccgaggaggtggagcagccggataatcttatccgaggtatgtgtttta 27104972  T
Q  205 tcaatagtactcctttgattgcaattattgatactggtgctactcattcttttatctcagctagttgtgttgaacgtttggatttggttgtaagtccttt 304  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  27104973 tcaatagtactcctttgattgcaattattgatactggtgctactcattcttttatctcggctagttgtgttgaacgtttggatttggttgtaactccttt 27105072  T
Q  305 gttgcgtggaatggttattgacaccccggctagcggttcggtgactacttcttttatgtgtgctaagtgtcctgttaattttggtaatgttgattttaag 404  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||    
T  27105073 gttgcgtggaatggttattgacaccccggctagcggttcggtgactacttcttttatgtgtgctaagtgtcctgttaattttggtgatgttgattttgag 27105172  T
Q  405 ttggattttgtgtgtcttccgttgaagcatatggatgtgatttttggtatggattggatgttgtcctttggtgttagcattaactgtttaaccaagagta 504  Q
    |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  | ||||| ||||||||||| ||||| || | ||||     
T  27105173 ttggatcttgtttgtcttccgttgaagcatatggatgtgatttttggtatggattggttgttagcttttggggttagcattaattgtttgactaggagtg 27105272  T
Q  505 taacattttcgaagtcggtatacgagttaggtgggaagttattgaccgtggaaaaagtgaagaagtctttggacgatgaagctttagtgtttatgatgt 603  Q
    | || ||||| ||| ||||| | ||||||| | ||||||| ||||||| |||  |||||||||||||||| || | ||| ||||  |||||||||||||    
T  27105273 tgactttttctaagccggtagaagagttagataggaagtttttgaccgcggagcaagtgaagaagtctttagatggtgaggcttgtgtgtttatgatgt 27105371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 375; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 5 - 603
Target Start/End: Complemental strand, 27173552 - 27172954
Alignment:
Q  5 ttgtcacaagtgtgggaaagtgggtcacaagggttatgaatgcaagagtgttgtaaaggagattacttgctacaattgtggagagaaaggtcatatcagt 104  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||     || ||||   |||||| ||  |||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||    
T  27173552 ttgtcacaagtgtgggaaagcgggtcacaaggcggtcgattgcagaggtgttgcaagagagactacttgttacaattgtggagagaagggtcatattagt 27173453  T
Q  105 actaagtgtaccaagccgaagaaggcggcgggaaaggtgtttgctttgaatgcggaagaggtggagcagccggataatcttatccgaggtatgtgtttta 204  Q
    || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27173452 accaagtgtaccaagccaaagaaggcggcgggaaaggtgtttgctttgaacgccgaggaggtggagcagccggataatcttatccgaggtatgtgtttta 27173353  T
Q  205 tcaatagtactcctttgattgcaattattgatactggtgctactcattcttttatctcagctagttgtgttgaacgtttggatttggttgtaagtccttt 304  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  27173352 tcaatagtactcctttgattgcaattattgatactggtgctactcattcttttatctcggctagttgtgttgaacgtttgggtttggttgtaactccttt 27173253  T
Q  305 gttgcgtggaatggttattgacaccccggctagcggttcggtgactacttcttttatgtgtgctaagtgtcctgttaattttggtaatgttgattttaag 404  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  27173252 gttgcggggaatggttattgacaccccggctagcggttcggtgactacttcttttatgtgtgctaagtgtcctgttaattttggtaatgttgattttgag 27173153  T
Q  405 ttggattttgtgtgtcttccgttgaagcatatggatgtgatttttggtatggattggatgttgtcctttggtgttagcattaactgtttaaccaagagta 504  Q
    |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  | ||||| ||||||||||| ||||| || | ||||     
T  27173152 ttggatcttgtttgtcttccgttgaagcatatggatgtgatttttggtatggattggttgttagcttttggggttagcattaattgtttgactaggagtg 27173053  T
Q  505 taacattttcgaagtcggtatacgagttaggtgggaagttattgaccgtggaaaaagtgaagaagtctttggacgatgaagctttagtgtttatgatgt 603  Q
    | || ||||| ||||||||| | ||||||| | ||||||| ||||||| |||  |||||||||||||||| || | ||| ||||  |||||||||||||    
T  27173052 tgactttttctaagtcggtagaagagttagataggaagtttttgaccgcggagcaagtgaagaagtctttagatggtgaggcttgtgtgtttatgatgt 27172954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 367; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 62 - 603
Target Start/End: Complemental strand, 13459247 - 13458708
Alignment:
Q  62 ggagattacttgctacaattgtggagagaaaggtcatatcagtactaagtgtaccaagccgaagaaggcggcgggaaaggtgtttgctttgaatgcggaa 161  Q
    |||| ||| ||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||| | ||||||| |||||||| |||||||||||     
T  13459247 ggagtttagttgttacaattgtggcgagaagggtcatatcagtactaagtgtaccaagttgaagaaggtgacgggaaaagtgtttgcattgaatgcggag 13459148  T
Q  162 gaggtggagcagccggataatcttatccgaggtatgtgttttatcaatagtactcctttgattgcaattattgatactggtgctactcattcttttatct 261  Q
    || ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  13459147 gaagtggagcagacggataatcttctccgaggtatgtgttttatcaatagtactcctttgattgcaattattgatactggtgctactcattcttttattt 13459048  T
Q  262 cagctagttgtgttgaacgtttggatttggttgtaagtcctttgttgcgtggaatggttattgacaccccggctagcggttcggtgactacttcttttat 361  Q
    | | |||||||||||| | |||| |||| ||||||| ||  |||||||| || ||||| ||  ||||||||||||| |||| |||||||||||||||       
T  13459047 cggttagttgtgttgagcatttgaatttagttgtaactctgttgttgcgagggatggtcatcaacaccccggctagtggttaggtgactacttcttta-- 13458950  T
Q  362 gtgtgctaagtgtcctgttaattttggtaatgttgattttaagttggattttgtgtgtcttccgttgaagcatatggatgtgatttttggtatggattgg 461  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13458949 gtgtgctaagtgtcctgttaattttggtaatgttgattttgagttggattttgtgtgtatgccgttgaaccatatggatgtgatttttggtatggattgg 13458850  T
Q  462 atgttgtcctttggtgttagcattaactgtttaaccaagagtataacattttcgaagtcggtatacgagttaggtgggaagttattgaccgtggaaaaag 561  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||  |||    
T  13458849 atgttgtcctttggtgttagcattaactgtttaaccaagagtataacattttcgaagtcggtatacgagttaggtgggaagttattgactgcggagcaag 13458750  T
Q  562 tgaagaagtctttggacgatgaagctttagtgtttatgatgt 603  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13458749 tgaagaagtctttggacgatgaagctttagtgtttatgatgt 13458708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 350; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 10 - 603
Target Start/End: Complemental strand, 4443193 - 4442600
Alignment:
Q  10 acaagtgtgggaaagtgggtcacaagggttatgaatgcaagagtgttgtaaaggagattacttgctacaattgtggagagaaaggtcatatcagtactaa 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || ||| || | || ||| |  |||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  4443193 acaagtgtgggaaagtgggtcacaaggcttttgagtgtacgaatgtcgagaaggaggttacttgttacaattgtggtgagaaaggtcatatcagttctaa 4443094  T
Q  110 gtgtaccaagccgaagaaggcggcgggaaaggtgtttgctttgaatgcggaagaggtggagcagccggataatcttatccgaggtatgtgttttatcaat 209  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4443093 gtgtaccaagccaaagaaggcggcgggaaaggtgtttgctttgtatgtggaggaagtggagcagccggataatcttatccgaggtatgtgttttatcaat 4442994  T
Q  210 agtactcctttgattgcaattattgatactggtgctactcattcttttatctcagctagttgtgttgaacgtttggatttggttgtaagtcctttgttgc 309  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| | |||||||||||| |||||| |||||||||||| ||| |||||||    
T  4442993 agtactcctttgattgcaattattgatactggtgctactcattcttctacctcggttagttgtgttgagcgtttgaatttggttgtaactccgttgttgc 4442894  T
Q  310 gtggaatggttattgacaccccggctagcggttcggtgactacttcttttatgtgtgctaagtgtcctgttaattttggtaatgttgattttaagttgga 409  Q
    | || ||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||  ||||||||| ||||| || ||||||||||||  |||||||| ||||| |    
T  4442893 gagggatggtcattgacaccccggctagtggttcggtaactacttccttagtgtgtgctaggtgtcatgctaattttggtaacattgattttgagttgta 4442794  T
Q  410 ttttgtgtgtcttccgttgaagcatatggatgtgatttttggtatggattggatgttgtcctttggtgttagcattaactgtttaaccaagagtataaca 509  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  4442793 tcttgtgtgtcttccgttgaagcatatggatgtgatttttggtatggatttgatgttatcttttggggttagcattaattgtttgaccaagagtataaca 4442694  T
Q  510 ttttcgaagtcggtatacgagttaggtgggaagttattgaccgtggaaaaagtgaagaagtctttggacgatgaagctttagtgtttatgatgt 603  Q
    |||||||||  |||| | || |||||||||||||| |||| || |||  ||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||    
T  4442693 ttttcgaagctggtagatgacttaggtgggaagttcttgatcgcggagcaagtgaagaagtctttggacgatgaggcttgtgtgtttatgatgt 4442600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 114; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 394 - 603
Target Start/End: Complemental strand, 17926501 - 17926292
Alignment:
Q  394 ttgattttaagttggattttgtgtgtcttccgttgaagcatatggatgtgatttttggtatggattggatgttgtcctttggtgttagcattaactgttt 493  Q
    |||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  17926501 ttgattttgagttggatcctgtgtgtcttccgttgaagcatatggatgtgatctctggtatggattgaatgttgtcttttggtgttagcattaattgttt 17926402  T
Q  494 aaccaagagtataacattttcgaagtcggtatacgagttaggtgggaagttattgaccgtggaaaaagtgaagaagtctttggacgatgaagctttagtg 593  Q
    || |||||||||||||||||||||| |||||   ||| |||| |||||||| ||||||| |||  ||||||||||||| ||||||| |||| |||  |||    
T  17926401 aatcaagagtataacattttcgaagccggtagctgaggtaggagggaagttcttgaccgcggagcaagtgaagaagtccttggacggtgaaacttgtgtg 17926302  T
Q  594 tttatgatgt 603  Q
    ||||||||||    
T  17926301 tttatgatgt 17926292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 361 - 460
Target Start/End: Complemental strand, 11284725 - 11284626
Alignment:
Q  361 tgtgtgctaagtgtcctgttaattttggtaatgttgattttaagttggattttgtgtgtcttccgttgaagcatatggatgtgatttttggtatggattg 460  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11284725 tgtgtgctaagtgtcctgttaattttggtaatgttgattttgagttggattttgtgtgtcttccattgaagcatatggatgtgatttttggtatggattg 11284626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 91; E-Value: 9e-44
Query Start/End: Original strand, 138 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 14207456 - 14207278
Alignment:
Q  138 aaggtgtttgctttgaatgcggaagaggtggagcagccggataatcttatccgaggtatgtgttttatcaatagtactcctttgattgcaattattgata 237  Q
    |||||||| ||||||||||||||  | |||||||||||  ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||    
T  14207456 aaggtgttcgctttgaatgcggagtaagtggagcagccatataatcttatt-gaggtatgtgttttatcaatagtactcctttaattgcaattattaata 14207358  T
Q  238 ctggtgctactcattcttttatctcagctagttgtgttgaacgtttggatttggttgtaagtcctttgttgcgtggaatggt 319  Q
    |||| |||||||||  |||  |||| | ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||| ||||||||||||    
T  14207357 ctggcgctactcat--tttggtctcggttagttgtgttgaacgtttgaatttggttgtaactccgttgtcgcgtggaatggt 14207278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 91; E-Value: 9e-44
Query Start/End: Original strand, 138 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 14216146 - 14215968
Alignment:
Q  138 aaggtgtttgctttgaatgcggaagaggtggagcagccggataatcttatccgaggtatgtgttttatcaatagtactcctttgattgcaattattgata 237  Q
    |||||||| ||||||||||||||  | |||||||||||  ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||    
T  14216146 aaggtgttcgctttgaatgcggagtaagtggagcagccatataatcttatt-gaggtatgtgttttatcaatagtactcctttaattgcaattattaata 14216048  T
Q  238 ctggtgctactcattcttttatctcagctagttgtgttgaacgtttggatttggttgtaagtcctttgttgcgtggaatggt 319  Q
    |||| |||||||||  |||  |||| | ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||| ||||||||||||    
T  14216047 ctggcgctactcat--tttggtctcggttagttgtgttgaacgtttgaatttggttgtaactccgttgtcgcgtggaatggt 14215968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 108 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 22035165 - 22034980
Alignment:
Q  108 aagtgtaccaagccgaagaaggcggcgggaaaggtgtttgctttgaatgcggaagaggtggagcagccggataatcttatccgaggtatgtgttttatca 207  Q
    |||||||||||||||||||||||   |||||  || ||||| |||||||  || || |||||||||||||||||| | ||  ||||||||||||||||||    
T  22035165 aagtgtaccaagccgaagaaggccatgggaagagtttttgcattgaatgttgaggacgtggagcagccggataatttaatatgaggtatgtgttttatca 22035066  T
Q  208 atagtactcctttgattgcaattattgatactggtgctactcattcttttatctcagctagttgtgttgaacgtttggatttggtt 293  Q
    ||||||||| ||||||||||| | |||||||| ||||||| |||||||| |||||   |||||||||||||| |||| ||||||||    
T  22035065 atagtactcatttgattgcaaatgttgatacttgtgctacgcattctttcatctcgcttagttgtgttgaacctttgaatttggtt 22034980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 73; E-Value: 5e-33
Query Start/End: Original strand, 108 - 284
Target Start/End: Original strand, 17142404 - 17142580
Alignment:
Q  108 aagtgtaccaagccgaagaaggcggcgggaaaggtgtttgctttgaatgcggaagaggtggagcagccggataatcttatccgaggtatgtgttttatca 207  Q
    ||||||||||| |||||||||||||  |||||||| ||||| |||||||| ||||||||| ||||| || ||||| | ||  |||| |||||||||||||    
T  17142404 aagtgtaccaaaccgaagaaggcgggaggaaaggtctttgcattgaatgcagaagaggtgaagcagacgaataatttaatttgagggatgtgttttatca 17142503  T
Q  208 atagtactcctttgattgcaattattgatactggtgctactcattcttttatctcagctagttgtgttgaacgtttg 284  Q
      |||| ||  |||||||||||||||||| | ||||||  |||||||||||||||   |||||||||||||||||||    
T  17142504 tcagtattcaattgattgcaattattgattcgggtgcttttcattcttttatctcgcttagttgtgttgaacgtttg 17142580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 172 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 17131776 - 17131547
Alignment:
Q  172 agccggataatcttatccgaggtatgtgttttatcaatagtactcctttgattgcaattattgatactggtgctactcattcttttatctcagctagttg 271  Q
    ||||||||||  | ||| ||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||   ||||||    
T  17131776 agccggataacttgatcagaggtatgtgttttaacaacagtactccattgattgtaattattgatacgggtgctacccattcttttatatcgcttagttg 17131677  T
Q  272 tgttgaacgtttggatttggttgtaagtcctttgttgcgtggaatggttattgacaccccggctagcggttcggtgactacttcttttatgtgtgctaag 371  Q
    ||  ||||||||| || | ||| | | |||  ||||| |  | ||||| || || |||||| | |   | |||||||||||||| ||  | |||| ||||    
T  17131676 tgcggaacgtttgaatattgttatgactccgatgttgagatggatggtcatcgataccccgaccaatagctcggtgactacttccttggtttgtgttaag 17131577  T
Q  372 tgtcctgttaattttggtaatgttgatttt 401  Q
    |||| |||||||||||| ||||| ||||||    
T  17131576 tgtcttgttaattttggaaatgtggatttt 17131547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 454 - 603
Target Start/End: Complemental strand, 22034887 - 22034738
Alignment:
Q  454 tggattggatgttgtcctttggtgttagcattaactgtttaaccaagagtataacat--tttcgaagtcggtatacgagttaggtgggaagttattgacc 551  Q
    |||| |||||||| || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||  |||| | ||  ||||||| ||||| ||||||    
T  22034887 tggactggatgttatcttttggtgttaacattaactgtttaaccaagagtataacattctttagaag--ggtagatgaagtaggtggaaagttcttgacc 22034790  T
Q  552 gtggaaaaagtgaagaagtctttggacgatgaagctttagtgtttatgatgt 603  Q
    | | || ||||||| ||||||||||| | |||| ||  |||||| |||||||    
T  22034789 gcgaaacaagtgaataagtctttggatggtgaatctagagtgttcatgatgt 22034738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 60 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 14218278 - 14218206
Alignment:
Q  60 aaggagattacttgctacaattgtggagagaaaggtcatatcagtactaagtgtaccaagccgaagaaggcgg 132  Q
    ||||| |||||||| | ||| |||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14218278 aaggatattacttgtttcaactgtggagaggcaggccatatcagtactaagtgtaccaagccgaagaaggcgg 14218206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 207 - 259
Target Start/End: Original strand, 13965847 - 13965899
Alignment:
Q  207 aatagtactcctttgattgcaattattgatactggtgctactcattcttttat 259  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  13965847 aatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttat 13965899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 207 - 259
Target Start/End: Original strand, 26091977 - 26092029
Alignment:
Q  207 aatagtactcctttgattgcaattattgatactggtgctactcattcttttat 259  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  26091977 aatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttat 26092029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 207 - 259
Target Start/End: Original strand, 40924996 - 40925048
Alignment:
Q  207 aatagtactcctttgattgcaattattgatactggtgctactcattcttttat 259  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  40924996 aatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttat 40925048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 207 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 49155371 - 49155319
Alignment:
Q  207 aatagtactcctttgattgcaattattgatactggtgctactcattcttttat 259  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  49155371 aatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttat 49155319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 207 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 21755482 - 21755430
Alignment:
Q  207 aatagtactcctttgattgcaattattgatactggtgctactcattcttttat 259  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  21755482 aatagtactcctttaattgctattattgatattggtgctactcattgttttat 21755430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 207 - 259
Target Start/End: Original strand, 26115769 - 26115821
Alignment:
Q  207 aatagtactcctttgattgcaattattgatactggtgctactcattcttttat 259  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  26115769 aatagtactcctttaattgctattattgatattggtgctactcattgttttat 26115821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 207 - 252
Target Start/End: Original strand, 12798680 - 12798725
Alignment:
Q  207 aatagtactcctttgattgcaattattgatactggtgctactcatt 252  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  12798680 aatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcatt 12798725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 207 - 252
Target Start/End: Original strand, 14261425 - 14261470
Alignment:
Q  207 aatagtactcctttgattgcaattattgatactggtgctactcatt 252  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  14261425 aatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcatt 14261470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 207 - 252
Target Start/End: Original strand, 11550303 - 11550348
Alignment:
Q  207 aatagtactcctttgattgcaattattgatactggtgctactcatt 252  Q
    |||| |||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  11550303 aataatactcctttagttgctattattgatactggtgctactcatt 11550348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 207 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 14140749 - 14140704
Alignment:
Q  207 aatagtactcctttgattgcaattattgatactggtgctactcatt 252  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| || ||||||||||||||||    
T  14140749 aatagtactcctttaattgctattatagacactggtgctactcatt 14140704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 207 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 14957623 - 14957578
Alignment:
Q  207 aatagtactcctttgattgcaattattgatactggtgctactcatt 252  Q
    |||| |||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  14957623 aataatactcctttagttgctattattgatactggtgctactcatt 14957578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 207 - 252
Target Start/End: Original strand, 15099782 - 15099827
Alignment:
Q  207 aatagtactcctttgattgcaattattgatactggtgctactcatt 252  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||| ||||||||    
T  15099782 aatagtactcctttaattgctattatagatactggtgatactcatt 15099827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 207 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 15343501 - 15343456
Alignment:
Q  207 aatagtactcctttgattgcaattattgatactggtgctactcatt 252  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| || ||||||||||||||||    
T  15343501 aatagtactcctttaattgctattatagacactggtgctactcatt 15343456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 207 - 252
Target Start/End: Original strand, 16947651 - 16947696
Alignment:
Q  207 aatagtactcctttgattgcaattattgatactggtgctactcatt 252  Q
    |||||||||| ||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  16947651 aatagtactcatttaattgctattatagatactggtgctactcatt 16947696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 342 - 499
Target Start/End: Original strand, 17142638 - 17142795
Alignment:
Q  342 tcggtgactacttcttttatgtgtgctaagtgtcctgttaattttggtaatgttgattttaagttggattttgtgtgtcttccgttgaagcatatggatg 441  Q
    |||||||||||||| ||  || ||| ||||| ||||||||||||| ||||| | ||| || | |||||||| || ||| |||| ||    || |||||||    
T  17142638 tcggtgactacttccttggtgagtgttaagtatcctgttaattttagtaatatggatattgaattggatttggtttgttttcctttagttcacatggatg 17142737  T
Q  442 tgatttttggtatggattggatgttgtcctttggtgttagcattaactgtttaaccaa 499  Q
    ||||||| ||  || |||||||||| || |||||  ||| |||||| |||||| ||||    
T  17142738 tgattttcggagtgtattggatgttatcttttggaattaacattaattgtttatccaa 17142795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 207 - 252
Target Start/End: Original strand, 18051132 - 18051177
Alignment:
Q  207 aatagtactcctttgattgcaattattgatactggtgctactcatt 252  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| || ||||||||||||||||    
T  18051132 aatagtactcctttaattgctattatagacactggtgctactcatt 18051177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 207 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 19150081 - 19150036
Alignment:
Q  207 aatagtactcctttgattgcaattattgatactggtgctactcatt 252  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||| |||||||||    
T  19150081 aatagtactcctttaattgctattatagatactggttctactcatt 19150036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 207 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 20749480 - 20749435
Alignment:
Q  207 aatagtactcctttgattgcaattattgatactggtgctactcatt 252  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||| |||||||||    
T  20749480 aatagtactcctttaattgctattatagatactggttctactcatt 20749435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 207 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 8710674 - 8710622
Alignment:
Q  207 aatagtactcctttgattgcaattattgatactggtgctactcattcttttat 259  Q
    |||| |||||||||  |||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  8710674 aataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttat 8710622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 207 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 12459698 - 12459646
Alignment:
Q  207 aatagtactcctttgattgcaattattgatactggtgctactcattcttttat 259  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| ||||||| ||||||| ||| ||||||    
T  12459698 aatagtactcctttaattgctattatagatactgatgctactaattgttttat 12459646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 207 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 13689110 - 13689058
Alignment:
Q  207 aatagtactcctttgattgcaattattgatactggtgctactcattcttttat 259  Q
    |||| |||||||||  |||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  13689110 aataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttat 13689058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 207 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 14335465 - 14335413
Alignment:
Q  207 aatagtactcctttgattgcaattattgatactggtgctactcattcttttat 259  Q
    |||| |||||||||  |||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  14335465 aataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttat 14335413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 207 - 259
Target Start/End: Original strand, 44788552 - 44788604
Alignment:
Q  207 aatagtactcctttgattgcaattattgatactggtgctactcattcttttat 259  Q
    |||| |||||||||  |||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  44788552 aataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttat 44788604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0141 (Bit Score: 375; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold0141
Description:

Target: scaffold0141; HSP #1
Raw Score: 375; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 5 - 603
Target Start/End: Complemental strand, 24274 - 23676
Alignment:
Q  5 ttgtcacaagtgtgggaaagtgggtcacaagggttatgaatgcaagagtgttgtaaaggagattacttgctacaattgtggagagaaaggtcatatcagt 104  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||     || ||||   |||||| ||  ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||    
T  24274 ttgtcacaagtgtgggaaagcgggtcacaaggcggccgattgcagaggtgttgcaagagagattacttgttacaattgtggagagaagggtcatattagt 24175  T
Q  105 actaagtgtaccaagccgaagaaggcggcgggaaaggtgtttgctttgaatgcggaagaggtggagcagccggataatcttatccgaggtatgtgtttta 204  Q
    || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24174 accaagtgtaccaagccaaagaaggcggcgggaaaggtgtttgctttgaacgcagaggaggtggagcagccggataatcttatccgaggtatgtgtttta 24075  T
Q  205 tcaatagtactcctttgattgcaattattgatactggtgctactcattcttttatctcagctagttgtgttgaacgtttggatttggttgtaagtccttt 304  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  24074 tcaatagtactcctttgattgcaattattgatactggtgctactcattcttttatctcggctagttgtgttgaacgtttggatttggttgtaactccttt 23975  T
Q  305 gttgcgtggaatggttattgacaccccggctagcggttcggtgactacttcttttatgtgtgctaagtgtcctgttaattttggtaatgttgattttaag 404  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||    
T  23974 gttgcgtggaatggttattgacaccccggctagcggttcggtgactacttcttttatgtgtgctaagtgtcctgttaattttggtgatgttgattttgag 23875  T
Q  405 ttggattttgtgtgtcttccgttgaagcatatggatgtgatttttggtatggattggatgttgtcctttggtgttagcattaactgtttaaccaagagta 504  Q
    |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  | ||||| ||||||||||| ||||| || | ||||     
T  23874 ttggatcttgtttgtcttccgttgaagcatatggatgtgatttttggtatggattggttgttagcttttggggttagcattaattgtttgactaggagtg 23775  T
Q  505 taacattttcgaagtcggtatacgagttaggtgggaagttattgaccgtggaaaaagtgaagaagtctttggacgatgaagctttagtgtttatgatgt 603  Q
    | || ||||| ||| ||||| | ||||||| | ||||||| ||||||| | |  |||||||||||||||| || | ||| ||||  |||||||||||||    
T  23774 tgactttttctaagccggtagaagagttagataggaagtttttgaccgcgaagcaagtgaagaagtctttagatggtgaggcttgtgtgtttatgatgt 23676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008 (Bit Score: 375; Significance: 0; HSPs: 2)
Name: scaffold0008
Description:

Target: scaffold0008; HSP #1
Raw Score: 375; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 603
Target Start/End: Complemental strand, 27091 - 26490
Alignment:
Q  1 tcagttgtcacaagtgtgggaaagtgggtcacaagggttatgaatgcaagagtgttgtaaaggagattacttgctacaattgtggagagaaaggtcatat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27091 tcagttgtcacaagtgtgggaaagcgggtcacaaggcttatgaatgtaagagtgttgcaaaggagattacttgctacaattgtggagagaaaggtcatat 26992  T
Q  101 cagtactaagtgtaccaagccgaagaaggcggcgggaaaggtgtttgctttgaatgcggaagaggtggagcagccggataatcttatccgaggtatgtgt 200  Q
     |||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  26991 tagtactaagtttaccaagccgaagaagggggcggaaaaggtgtttgctttgaatgcggaggaagtggagcaaccggataatcttatccgaggtatgtgt 26892  T
Q  201 tttatcaatagtactcctttgattgcaattattgatactggtgctactcattcttttatctcagctagttgtgttgaacgtttggatttggttgtaagtc 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||   |||||||||| |  |||||  ||||||||| | ||    
T  26891 tttatcaatagtactcctttgattgcaattattgatactgttgctacttattcttttatctcttttagttgtgtttattgtttgtttttggttgttactc 26792  T
Q  301 ctttgttgcgtggaatggttattgacaccccggctagcggttcggtgactacttcttttatgtgtgctaagtgtcctgttaattttggtaatgttgattt 400  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||    
T  26791 ctttgttgcgtggtatggttattgacaccccggctagcggttcggtgactacttcttttatgtgtgctaagtgtcctgttaattttggtaatgtt-aatt 26693  T
Q  401 taagttggattttgtgtgtcttccgttgaagcatatggatgtgatttttggtatggattggatgttgtcctttggtgttagcattaactgtttaaccaag 500  Q
    | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||  | ||||| ||||||| ||| ||||| || |||    
T  26692 tgagttggatcttgtgtgtcttccgttgaagcatatggatgtgatttttggtatagattggttgttagcttttggggttagcagtaattgtttgactaag 26593  T
Q  501 agtataacattttcgaagtcggtatacgagttaggtgggaagttattgaccgtggaaaaagtgaagaagtctttggacgatgaagctttagtgtttatga 600  Q
    ||| |||| ||||| ||| ||||| | ||||||| | ||||||| |||||||||||  |||||||||| ||||| || | ||||||||  ||||| ||||    
T  26592 agtgtaactttttctaagccggtagaagagttagataggaagttcttgaccgtggagcaagtgaagaaatctttagatggtgaagcttgtgtgttcatga 26493  T
Q  601 tgt 603  Q
    |||    
T  26492 tgt 26490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008; HSP #2
Raw Score: 363; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 5 - 603
Target Start/End: Original strand, 131482 - 132080
Alignment:
Q  5 ttgtcacaagtgtgggaaagtgggtcacaagggttatgaatgcaagagtgttgtaaaggagattacttgctacaattgtggagagaaaggtcatatcagt 104  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||||     ||| ||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||    
T  131482 ttgtcacaagtgtgggaaaacgggtcacaagtcggctgattgcaagagtgttgcaagagagattacttgctacaattgtggagagaagggtcatattagt 131581  T
Q  105 actaagtgtaccaagccgaagaaggcggcgggaaaggtgtttgctttgaatgcggaagaggtggagcagccggataatcttatccgaggtatgtgtttta 204  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  131582 actaagtgtaccaagccgaagaaggcggcgggaaaggtgtttgctttgaatgcggaggaggtggagcagccggataatcttatccgaggtatgtgtttta 131681  T
Q  205 tcaatagtactcctttgattgcaattattgatactggtgctactcattcttttatctcagctagttgtgttgaacgtttggatttggttgtaagtccttt 304  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| | |||||||||||| |||||| | |||||||||| ||||||    
T  131682 tcaatagaactcctttgattgcaattattgatacttgtgctactcattattttatctcggttagttgtgttgatcgtttgaaattggttgtaactccttt 131781  T
Q  305 gttgcgtggaatggttattgacaccccggctagcggttcggtgactacttcttttatgtgtgctaagtgtcctgttaattttggtaatgttgattttaag 404  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  131782 gttgcggggaatggttattgacaccccggctagcggttcggtgactacttcttttatgtgtgctaaatgtcctattaattttggtaatgttaattttaag 131881  T
Q  405 ttggattttgtgtgtcttccgttgaagcatatggatgtgatttttggtatggattggatgttgtcctttggtgttagcattaactgtttaaccaagagta 504  Q
    |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  | ||||| ||||| || || ||||| || | ||||     
T  131882 ttggatcttgtttgtcttccgttgaagcatatggatgtgatttttggtatggattggttgttagcttttggggttagaataaattgtttgactaggagtg 131981  T
Q  505 taacattttcgaagtcggtatacgagttaggtgggaagttattgaccgtggaaaaagtgaagaagtctttggacgatgaagctttagtgtttatgatgt 603  Q
    | || ||||| ||| ||||| | ||||||| | ||||||| ||||||| |||  |||||||||| ||||| || | ||||||||  |||||||||||||    
T  131982 tgactttttctaagccggtagaagagttagataggaagttcttgaccgcggagcaagtgaagaaatctttagatggtgaagcttgtgtgtttatgatgt 132080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 375; Significance: 0; HSPs: 32)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 375; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 5 - 603
Target Start/End: Original strand, 16379508 - 16380106
Alignment:
Q  5 ttgtcacaagtgtgggaaagtgggtcacaagggttatgaatgcaagagtgttgtaaaggagattacttgctacaattgtggagagaaaggtcatatcagt 104  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||     || ||||   |||||| ||  |||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||    
T  16379508 ttgtcacaagtgtgggaaagcgggtcacaaggcggtcgattgcagaggtgttgcaagagagactacttgttacaattgtggagagaagggtcatattagt 16379607  T
Q  105 actaagtgtaccaagccgaagaaggcggcgggaaaggtgtttgctttgaatgcggaagaggtggagcagccggataatcttatccgaggtatgtgtttta 204  Q
    || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16379608 accaagtgtaccaagccaaagaaggcggcgggaaaggtgtttgctttgaacgccgaggaggtggagcagccggataatcttatccgaggtatgtgtttta 16379707  T
Q  205 tcaatagtactcctttgattgcaattattgatactggtgctactcattcttttatctcagctagttgtgttgaacgtttggatttggttgtaagtccttt 304  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  16379708 tcaatagtactcctttgattgcaattattgatactggtgctactcattcttttatctcggctagttgtgttgaacgtttggatttggttgtaactccttt 16379807  T
Q  305 gttgcgtggaatggttattgacaccccggctagcggttcggtgactacttcttttatgtgtgctaagtgtcctgttaattttggtaatgttgattttaag 404  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||    
T  16379808 gttgcgtggaatggttattgacaccccggctagcggttcggtgactacttcttttatgtgtgctaagtgtcctgttaattttggtgatgttgattttgag 16379907  T
Q  405 ttggattttgtgtgtcttccgttgaagcatatggatgtgatttttggtatggattggatgttgtcctttggtgttagcattaactgtttaaccaagagta 504  Q
    |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  | ||||| ||||||||||| ||||| || | ||||     
T  16379908 ttggatcttgtttgtcttccgttgaagcatatggatgtgatttttggtatggattggttgttagcttttggggttagcattaattgtttgactaggagtg 16380007  T
Q  505 taacattttcgaagtcggtatacgagttaggtgggaagttattgaccgtggaaaaagtgaagaagtctttggacgatgaagctttagtgtttatgatgt 603  Q
    | || ||||| ||| ||||| | ||||||| | ||||||| ||||||| |||  |||||||||||||||| || | ||| ||||  |||||||||||||    
T  16380008 tgactttttctaagccggtagaagagttagataggaagtttttgaccgcggagcaagtgaagaagtctttagatggtgaggcttgtgtgtttatgatgt 16380106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 367; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 5 - 603
Target Start/End: Original strand, 16647104 - 16647702
Alignment:
Q  5 ttgtcacaagtgtgggaaagtgggtcacaagggttatgaatgcaagagtgttgtaaaggagattacttgctacaattgtggagagaaaggtcatatcagt 104  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||     || ||||   |||||| ||  ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||    
T  16647104 ttgtcacaagtgtgggaaagcgggtcacaaggcggccgattgcagaggtgttgcaagagagattacttgttacaattgtggagagaagggtcatattagt 16647203  T
Q  105 actaagtgtaccaagccgaagaaggcggcgggaaaggtgtttgctttgaatgcggaagaggtggagcagccggataatcttatccgaggtatgtgtttta 204  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16647204 accaagtgtaccaagccgaagaaggcggcgggaaaggtgtttgctttgaatgcggaggaggtggagcagccggataatcttatccgaggtatgtgtttta 16647303  T
Q  205 tcaatagtactcctttgattgcaattattgatactggtgctactcattcttttatctcagctagttgtgttgaacgtttggatttggttgtaagtccttt 304  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||    
T  16647304 tcaatagtactcctttgattgcaattattgatactggtgctactcattcttttatctcggctagttgtgttaaacgtttggatttggttgtaactcattt 16647403  T
Q  305 gttgcgtggaatggttattgacaccccggctagcggttcggtgactacttcttttatgtgtgctaagtgtcctgttaattttggtaatgttgattttaag 404  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||    
T  16647404 gttgcgtggaatggttattgacaccccgactagcggttcggtgactacttcttttatgtgtgctaagtgtcctgttaattttggtgatgttgattttgag 16647503  T
Q  405 ttggattttgtgtgtcttccgttgaagcatatggatgtgatttttggtatggattggatgttgtcctttggtgttagcattaactgtttaaccaagagta 504  Q
    |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  | ||||| ||||||||||| ||||| || | ||||     
T  16647504 ttggatcttgtttgtcttccgttgaagcatatggatgtgatttttggtatggattggttgttagcttttggggttagcattaattgtttgactaggagtg 16647603  T
Q  505 taacattttcgaagtcggtatacgagttaggtgggaagttattgaccgtggaaaaagtgaagaagtctttggacgatgaagctttagtgtttatgatgt 603  Q
    | || ||||| ||  ||||| | ||||||| |  |||||| ||||||| ||   |||||||||||||||| || | ||| ||||  |||||||||||||    
T  16647604 tgactttttctaaaccggtagaagagttagatatgaagtttttgaccgcggggcaagtgaagaagtctttagaaggtgaggcttgtgtgtttatgatgt 16647702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 345; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 3 - 603
Target Start/End: Complemental strand, 16101163 - 16100563
Alignment:
Q  3 agttgtcacaagtgtgggaaagtgggtcacaagggttatgaatgcaagagtgttgtaaaggagattacttgctacaattgtggagagaaaggtcatatca 102  Q
    |||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |  |||||||||| |  |||  |  ||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |    
T  16101163 agttgtcataagtgtgggaaagcgggtcacaaggctgttgaatgcaagggaattgcgagagatgttacttgctacaattgtggagagaagggtcatatta 16101064  T
Q  103 gtactaagtgtaccaagccgaagaaggcggcgggaaaggtgtttgctttgaatgcggaagaggtggagcagccggataatcttatccgaggtatgtgttt 202  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||    
T  16101063 gtactaagtgtaccaagccaaagaaggcggcgggaaaggtgtttgctttgaatgcggaagaggtggagcaaccggataatcttatccgaagtatttgttt 16100964  T
Q  203 tatcaatagtactcctttgattgcaattattgatactggtgctactcattcttttatctcagctagttgtgttgaacgtttggatttggttgtaagtcct 302  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||| |||||| | |||||||||| ||||    
T  16100963 tatcaatagtactcctttgattgcaattattgatattggtgctactcatttttttatctcggttagttgtgttgagcgtttgaaattggttgtaactcct 16100864  T
Q  303 ttgttgcgtggaatggttattgacaccccggctagcggttcggtgactacttcttttatgtgtgctaagtgtcctgttaattttggtaatgttgatttta 402  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  16100863 ttgttgcggggaatggttattgacaccccgactagcggttcggtgactacttcttttatgtgtgctaagtgtcctgttaattttggtaatgttgattttg 16100764  T
Q  403 agttggattttgtgtgtcttccgttgaagcatatggatgtgatttttggtatggattggatgttgtcctttggtgttagcattaactgtttaaccaagag 502  Q
    |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||  | ||| | |||| |||||| ||||| || |||||    
T  16100763 agttggatcttgcgtgtcttccgttgaagcatatggatgtgatttttggtatggattagttgttagcttttagggttaccattaattgtttgactaagag 16100664  T
Q  503 tataacattttcgaagtcggtatacgagttaggtgggaagttattgaccgtggaaaaagtgaagaagtctttggacgatgaagctttagtgtttatgatg 602  Q
    | |||| ||||| ||| ||||| | ||||||| |  ||||||  |||||| |||  |||||||||||||||| || | ||||||||  ||||| ||||||    
T  16100663 tgtaactttttctaagccggtagaagagttagatatgaagttcctgaccgcggagcaagtgaagaagtctttagatggtgaagcttgggtgttcatgatg 16100564  T
Q  603 t 603  Q
    |    
T  16100563 t 16100563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 203 - 603
Target Start/End: Complemental strand, 18401593 - 18401193
Alignment:
Q  203 tatcaatagtactcctttgattgcaattattgatactggtgctactcattcttttatctcagctagttgtgttgaacgtttggatttggttgtaagtcct 302  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| || |||||||||| | ||||||||||||||||||| | ||||||| || ||||    
T  18401593 tatcaatagtactcctttgattgcaattattgatattggtgttactgatacttttatctcggttagttgtgttgaacgtttgaaattggttggaactcct 18401494  T
Q  303 ttgttgcgtggaatggttattgacaccccggctagcggttcggtgactacttcttttatgtgtgctaagtgtcctgttaattttggtaatgttgatttta 402  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||     
T  18401493 ttgttgcggggaatggttattgacaccctgactagcggttcagtgactacttcttttatgtgtgctaagtgtcctgttaatttcggtaatgttgattttg 18401394  T
Q  403 agttggattttgtgtgtcttccgttgaagcatatggatgtgatttttggtatggattggatgttgtcctttggtgttagcattaactgtttaaccaagag 502  Q
    |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || ||| | |||| |||||| ||||| || |||||    
T  18401393 agttggatcttgtgtctcttccgttgaagcatatggatgtgatttttggtatggattggttgttatctttttgggttatcattaattgtttgactaagag 18401294  T
Q  503 tataacattttcgaagtcggtatacgagttaggtgggaagttattgaccgtggaaaaagtgaagaagtctttggacgatgaagctttagtgtttatgatg 602  Q
    | |||| |||||  || ||||| | ||||||| | ||||||| ||||||| |||  ||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||| ||||||    
T  18401293 tgtaactttttcttagccggtagaagagttagataggaagttcttgaccgcggagcaagtgaagaagtctttggatgatgaagcttgtgtgttcatgatg 18401194  T
Q  603 t 603  Q
    |    
T  18401193 t 18401193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 165; E-Value: 6e-88
Query Start/End: Original strand, 299 - 603
Target Start/End: Original strand, 1646243 - 1646547
Alignment:
Q  299 tcctttgttgcgtggaatggttattgacaccccggctagcggttcggtgactacttcttttatgtgtgctaagtgtcctgttaattttggtaatgttgat 398  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  1646243 tcctttgttgcggggaatggttattgacaccccggctagcggttcggtgactacttcttttatgtgtgctaagtgtcctgttaattttggtgatgttgat 1646342  T
Q  399 tttaagttggattttgtgtgtcttccgttgaagcatatggatgtgatttttggtatggattggatgttgtcctttggtgttagcattaactgtttaacca 498  Q
    ||| |||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  | ||||| ||||||||||| ||||| || |    
T  1646343 tttgagttggatcttgtttttcttccgttgaagcatatggatgtgatttttggtatggattggttgttagcttttggggttagcattaattgtttgacta 1646442  T
Q  499 agagtataacattttcgaagtcggtatacgagttaggtgggaagttattgaccgtggaaaaagtgaagaagtctttggacgatgaagctttagtgtttat 598  Q
     |||| | || ||||| ||| ||||| | || |||| | ||||||| ||||||| |||  |||||||||||||||| || | ||| ||||  ||||||||    
T  1646443 ggagtgtgactttttctaagccggtagaagaattagataggaagtttttgaccgcggagcaagtgaagaagtctttagatggtgaggcttgtgtgtttat 1646542  T
Q  599 gatgt 603  Q
    |||||    
T  1646543 gatgt 1646547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 139; E-Value: 2e-72
Query Start/End: Original strand, 361 - 579
Target Start/End: Original strand, 23025252 - 23025470
Alignment:
Q  361 tgtgtgctaagtgtcctgttaattttggtaatgttgattttaagttggattttgtgtgtcttccgttgaagcatatggatgtgatttttggtatggattg 460  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23025252 tgtgtgctaagtgtcttgttaattttggtaacattgattttgagttggatcttgtgcgtcttccgttgaagcatatggatgtgatttttggtatggattg 23025351  T
Q  461 gatgttgtcctttggtgttagcattaactgtttaaccaagagtataacattttcgaagtcggtatacgagttaggtgggaagttattgaccgtggaaaaa 560  Q
    |||||| || ||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| | ||||||||||| ||||| ||||||| | |  ||    
T  23025352 gatgttatcttttggggttagcattaattgtttaaccaagagtgtaacattttcgaagccggtagatgagttaggtggaaagttcttgaccgcgaagcaa 23025451  T
Q  561 gtgaagaagtctttggacg 579  Q
    |||||||||||||||||||    
T  23025452 gtgaagaagtctttggacg 23025470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 129; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 62 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 14149496 - 14149316
Alignment:
Q  62 ggagattacttgctacaattgtggagagaaaggtcatatcagtactaagtgtaccaagccgaagaaggcggcgggaaaggtgtttgctttgaatgcggaa 161  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||     
T  14149496 ggagattacttgttacaattgtggtgagaagggtcatatcagtactaattgtaccaagccgaagaaggcggcagggaaggtgtttgcattgaatgcggag 14149397  T
Q  162 gaggtggagcagccggataatcttatccgaggtatgtgttttatcaatagtactcctttgattgcaattattgatactggt 242  Q
    || ||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14149396 gaagtggaacaactggataatcttatccgaggtatgtgttttatcgatagtactcctttgattgcaattattgatactggt 14149316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 95; E-Value: 4e-46
Query Start/End: Original strand, 361 - 603
Target Start/End: Complemental strand, 16235148 - 16234907
Alignment:
Q  361 tgtgtgctaagtgtcctgttaattttggtaatgttgattttaagttggattttgtgtgtcttccgttgaagcatatggatgtgatttttggtatggattg 460  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  16235148 tgtgtgctaagtgtcctgttaattt-ggtaatgttgattttgagttggatcttgtttgtcttccattgaagcatatggatgtgatttttgttttggattg 16235050  T
Q  461 gatgttgtcctttggtgttagcattaactgtttaaccaagagtataacattttcgaagtcggtatacgagttaggtgggaagttattgaccgtggaaaaa 560  Q
    | ||||  | ||||| ||||||||||| ||||| || |||||| | || ||||| ||| ||||| | ||||||| | ||||||| ||||||| |||  ||    
T  16235049 gttgttagcttttggggttagcattaattgtttgactaagagtgtgactttttctaagccggtagaagagttagataggaagttcttgaccgcggagcaa 16234950  T
Q  561 gtgaagaagtctttggacgatgaagctttagtgtttatgatgt 603  Q
    |||||||  ||||| || |  |||||||  |||||||||||||    
T  16234949 gtgaagagatctttagatggcgaagcttgtgtgtttatgatgt 16234907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 361 - 474
Target Start/End: Complemental strand, 18578211 - 18578098
Alignment:
Q  361 tgtgtgctaagtgtcctgttaattttggtaatgttgattttaagttggattttgtgtgtcttccgttgaagcatatggatgtgatttttggtatggattg 460  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18578211 tgtgtgctaagtgtcttgttaattttggtaatgttgattttgagttggatcttgtgtgtcttccgttgaagcatatggatgtgatttttggtatggattg 18578112  T
Q  461 gatgttgtcctttg 474  Q
    | ||||||| ||||    
T  18578111 gttgttgtcttttg 18578098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 3 - 160
Target Start/End: Original strand, 21412659 - 21412816
Alignment:
Q  3 agttgtcacaagtgtgggaaagtgggtcacaagggttatgaatgcaagagtgttgtaaaggagattacttgctacaattgtggagagaaaggtcatatca 102  Q
    |||||||| ||||||||||||| ||||||||||| || |||||| ||| ||||||  |||||  ||||||| ||||||||||||||||| ||| |||| |    
T  21412659 agttgtcataagtgtgggaaagcgggtcacaaggcttttgaatgtaagggtgttgcgaaggatgttacttgatacaattgtggagagaagggttatatta 21412758  T
Q  103 gtactaagtgtaccaagccgaagaaggcggcgggaaaggtgtttgctttgaatgcgga 160  Q
    |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||    
T  21412759 gtactaagtgtatcaagtcgaagaaggcggcgggaacagtgtttgctttgaatacgga 21412816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 391 - 478
Target Start/End: Original strand, 18836178 - 18836265
Alignment:
Q  391 atgttgattttaagttggattttgtgtgtcttccgttgaagcatatggatgtgatttttggtatggattggatgttgtcctttggtgt 478  Q
    ||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  18836178 atgttgattttgagttggatcttgtctgtcttccgttgaagcatatggatgtgatttttggtatggattggatgttgtcttttggtgt 18836265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 68; E-Value: 5e-30
Query Start/End: Original strand, 363 - 466
Target Start/End: Original strand, 19985697 - 19985800
Alignment:
Q  363 tgtgctaagtgtcctgttaattttggtaatgttgattttaagttggattttgtgtgtcttccgttgaagcatatggatgtgatttttggtatggattgga 462  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||     
T  19985697 tgtgttaagtgtcctgttaattttggtaatgttgattttgagttggatcctgtttgtcttccgttgaagcatatagatgtgattttttgtatgaattggt 19985796  T
Q  463 tgtt 466  Q
    ||||    
T  19985797 tgtt 19985800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 237 - 423
Target Start/End: Complemental strand, 14133995 - 14133824
Alignment:
Q  237 actggtgctactcattcttttatctcagctagttgtgttgaacgtttggatttggttgtaagtcctttgttgcgtggaatggttattgacaccccggcta 336  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||| | |||||||||| ||| |||||||| || ||||| |||||||||||         
T  14133995 actggtgctactcattcttttatctcggttagttgtgttgagcgtttgaaattggttgtaactccgttgttgcgagggatggtcattgacacccc----- 14133901  T
Q  337 gcggttcggtgactacttcttttatgtgtgctaagtgtcctgttaattttggtaatgttgattttaagttggattttgtgtgtcttc 423  Q
               |||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||| ||||||||||||    
T  14133900 ----------aactacttccttagtgtgtgctaagtgtcctgttaattttggtaaggttgattttgagctggatcttgtgtgtcttc 14133824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 419 - 503
Target Start/End: Complemental strand, 14131171 - 14131087
Alignment:
Q  419 tcttccgttgaagcatatggatgtgatttttggtatggattggatgttgtcctttggtgttagcattaactgtttaaccaagagt 503  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||| ||| | ||||| ||||| |||||||||    
T  14131171 tcttccattgaaacatatggatgtgatctttggtatggattggatgttatcttttggagtttgtattaattgtttgaccaagagt 14131087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 183 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 21474568 - 21474499
Alignment:
Q  183 cttatccgaggtatgtgttttatcaatagtactcctttgattgcaattattgatactggtgctactcatt 252  Q
    |||||| ||||||| |||||  | |||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  21474568 cttatcagaggtatttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcatt 21474499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 207 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 24367344 - 24367292
Alignment:
Q  207 aatagtactcctttgattgcaattattgatactggtgctactcattcttttat 259  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||    
T  24367344 aatagtactcctttaattgctattattaatactggtgctactcattgttttat 24367292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 182 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 19455992 - 19455922
Alignment:
Q  182 tcttatccgaggtatgtgttttatcaatagtactcctttgattgcaattattgatactggtgctactcatt 252  Q
    ||||||| ||||||  |||||  | |||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  19455992 tcttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcatt 19455922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 182 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 19466137 - 19466067
Alignment:
Q  182 tcttatccgaggtatgtgttttatcaatagtactcctttgattgcaattattgatactggtgctactcatt 252  Q
    ||||||| ||||||  |||||  | |||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  19466137 tcttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcatt 19466067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 207 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 18797634 - 18797589
Alignment:
Q  207 aatagtactcctttgattgcaattattgatactggtgctactcatt 252  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  18797634 aatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcatt 18797589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 207 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 19437946 - 19437901
Alignment:
Q  207 aatagtactcctttgattgcaattattgatactggtgctactcatt 252  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  19437946 aatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcatt 19437901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 207 - 259
Target Start/End: Original strand, 10466185 - 10466237
Alignment:
Q  207 aatagtactcctttgattgcaattattgatactggtgctactcattcttttat 259  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| ||||||| ||||||||||| ||||||    
T  10466185 aatagtactcctttaattgctattatagatactgttgctactcattgttttat 10466237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 198 - 259
Target Start/End: Original strand, 16924968 - 16925029
Alignment:
Q  198 tgttttatcaatagtactcctttgattgcaattattgatactggtgctactcattcttttat 259  Q
    |||| ||| |||| |||||||||  |||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  16924968 tgttatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacacattgttttat 16925029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 207 - 252
Target Start/End: Original strand, 19486631 - 19486676
Alignment:
Q  207 aatagtactcctttgattgcaattattgatactggtgctactcatt 252  Q
    |||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||| ||||    
T  19486631 aatagtactcctttaattgttattattgatactggtgctacacatt 19486676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 207 - 252
Target Start/End: Original strand, 24515751 - 24515796
Alignment:
Q  207 aatagtactcctttgattgcaattattgatactggtgctactcatt 252  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| || ||||||||||||||||    
T  24515751 aatagtactcctttaattgctattatagacactggtgctactcatt 24515796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 207 - 259
Target Start/End: Original strand, 2872139 - 2872191
Alignment:
Q  207 aatagtactcctttgattgcaattattgatactggtgctactcattcttttat 259  Q
    |||| |||||||||  |||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  2872139 aataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttat 2872191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 559 - 603
Target Start/End: Complemental strand, 14131062 - 14131018
Alignment:
Q  559 aagtgaagaagtctttggacgatgaagctttagtgtttatgatgt 603  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||||||  |||||||||||||    
T  14131062 aagtgaagaagtctttcgacggtgaagcttgtgtgtttatgatgt 14131018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 207 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 16574834 - 16574782
Alignment:
Q  207 aatagtactcctttgattgcaattattgatactggtgctactcattcttttat 259  Q
    |||| |||||||||  |||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  16574834 aataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttat 16574782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 207 - 259
Target Start/End: Original strand, 16620546 - 16620598
Alignment:
Q  207 aatagtactcctttgattgcaattattgatactggtgctactcattcttttat 259  Q
    |||| |||||||||  |||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  16620546 aataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttat 16620598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 208 - 252
Target Start/End: Original strand, 18182705 - 18182749
Alignment:
Q  208 atagtactcctttgattgcaattattgatactggtgctactcatt 252  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||| ||||    
T  18182705 atagtactcctttaattgctattattgatattggtgctacacatt 18182749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 207 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 27190380 - 27190328
Alignment:
Q  207 aatagtactcctttgattgcaattattgatactggtgctactcattcttttat 259  Q
    |||| |||||||||  |||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  27190380 aataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttat 27190328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 207 - 259
Target Start/End: Original strand, 27258860 - 27258912
Alignment:
Q  207 aatagtactcctttgattgcaattattgatactggtgctactcattcttttat 259  Q
    |||| |||||||||  |||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  27258860 aataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttat 27258912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 207 - 259
Target Start/End: Original strand, 29589776 - 29589828
Alignment:
Q  207 aatagtactcctttgattgcaattattgatactggtgctactcattcttttat 259  Q
    |||| |||||||||  |||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  29589776 aataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttat 29589828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 375; Significance: 0; HSPs: 23)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 375; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 5 - 603
Target Start/End: Original strand, 20828454 - 20829052
Alignment:
Q  5 ttgtcacaagtgtgggaaagtgggtcacaagggttatgaatgcaagagtgttgtaaaggagattacttgctacaattgtggagagaaaggtcatatcagt 104  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||     || ||||   |||||| ||  |||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||    
T  20828454 ttgtcacaagtgtgggaaagcgggtcacaaggcggtcgattgcagaggtgttgcaagagagactacttgttacaattgtggagagaagggtcatattagt 20828553  T
Q  105 actaagtgtaccaagccgaagaaggcggcgggaaaggtgtttgctttgaatgcggaagaggtggagcagccggataatcttatccgaggtatgtgtttta 204  Q
    || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20828554 accaagtgtaccaagccaaagaaggcggcgggaaaggtgtttgctttgaacgccgaggaggtggagcagccggataatcttatccgaggtatgtgtttta 20828653  T
Q  205 tcaatagtactcctttgattgcaattattgatactggtgctactcattcttttatctcagctagttgtgttgaacgtttggatttggttgtaagtccttt 304  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  20828654 tcaatagtactcctttgattgcaattattgatactggtgctactcattcttttatctcggctagttgtgttgaacgtttggatttggttgtaactccttt 20828753  T
Q  305 gttgcgtggaatggttattgacaccccggctagcggttcggtgactacttcttttatgtgtgctaagtgtcctgttaattttggtaatgttgattttaag 404  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||    
T  20828754 gttgcgtggaatggttattgacaccccggctagcggttcggtgactacttcttttatgtgtgctaagtgtcctgttaattttggtgatgttgattttgag 20828853  T
Q  405 ttggattttgtgtgtcttccgttgaagcatatggatgtgatttttggtatggattggatgttgtcctttggtgttagcattaactgtttaaccaagagta 504  Q
    |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  | ||||| ||||||||||| ||||| || | ||||     
T  20828854 ttggatcttgtttgtcttccgttgaagcatatggatgtgatttttggtatggattggttgttagcttttggggttagcattaattgtttgactaggagtg 20828953  T
Q  505 taacattttcgaagtcggtatacgagttaggtgggaagttattgaccgtggaaaaagtgaagaagtctttggacgatgaagctttagtgtttatgatgt 603  Q
    | || ||||| ||| ||||| | ||||||| | ||||||| ||||||| |||  |||||||||||||||| || | ||| ||||  |||||||||||||    
T  20828954 tgactttttctaagccggtagaagagttagataggaagtttttgaccgcggagcaagtgaagaagtctttagatggtgaggcttgtgtgtttatgatgt 20829052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 361; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 3 - 603
Target Start/End: Complemental strand, 20528352 - 20527752
Alignment:
Q  3 agttgtcacaagtgtgggaaagtgggtcacaagggttatgaatgcaagagtgttgtaaaggagattacttgctacaattgtggagagaaaggtcatatca 102  Q
    |||||||| ||||||||||||| |||||||||||    | | ||||| ||||||| |   ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |    
T  20528352 agttgtcataagtgtgggaaagcgggtcacaaggcgactaattgcaacagtgttgcatgagagattacttgttacaattgtggagagaaaggtcatatta 20528253  T
Q  103 gtactaagtgtaccaagccgaagaaggcggcgggaaaggtgtttgctttgaatgcggaagaggtggagcagccggataatcttatccgaggtatgtgttt 202  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  20528252 gtactaagtgtaccaagccgaagaaggcagcgggaaaggtgtttgctttgaatgcggaggaggtggaacagccgcataatcttatccgaggtatgtgttt 20528153  T
Q  203 tatcaatagtactcctttgattgcaattattgatactggtgctactcattcttttatctcagctagttgtgttgaacgtttggatttggttgtaagtcct 302  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||    
T  20528152 tatcaatagtactcctttgattgcaattattgatcctggtgctactcattcttttatctcggttagttgtgttgaacgtttgaaattggttgtaactcct 20528053  T
Q  303 ttgttgcgtggaatggttattgacaccccggctagcggttcggtgactacttcttttatgtgtgctaagtgtcctgttaattttggtaatgttgatttta 402  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  20528052 ttgttgcggggaatggttattgacaccccgactagaggttcggtgactacttcttttatgtgtgctaagtgtcctgttaattttggtaatgttgattttg 20527953  T
Q  403 agttggattttgtgtgtcttccgttgaagcatatggatgtgatttttggtatggattggatgttgtcctttggtgttagcattaactgtttaaccaagag 502  Q
    |||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||  | ||||| ||||||||||| ||||| || |||||    
T  20527952 agttggatcttgtttgtcttccgttaaagcatatggatgtgatttttgatatggattggttgttagcttttggggttagcattaattgtttgactaagag 20527853  T
Q  503 tataacattttcgaagtcggtatacgagttaggtgggaagttattgaccgtggaaaaagtgaagaagtctttggacgatgaagctttagtgtttatgatg 602  Q
    | | || ||||| ||| ||||| | ||||||| ||||||||| ||||||| | |  |||||||||| ||||| || | ||||||||  ||||||||||||    
T  20527852 tgtgactttttctaagccggtagaagagttagatgggaagttcttgaccgcgaagcaagtgaagaaatctttagatggtgaagcttctgtgtttatgatg 20527753  T
Q  603 t 603  Q
    |    
T  20527752 t 20527752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 347; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 5 - 603
Target Start/End: Complemental strand, 20928351 - 20927753
Alignment:
Q  5 ttgtcacaagtgtgggaaagtgggtcacaagggttatgaatgcaagagtgttgtaaaggagattacttgctacaattgtggagagaaaggtcatatcagt 104  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||||     ||| ||||||||||||| ||  |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| |||    
T  20928351 ttgtcacaagtgtgggaaaacgggtcacaagtcggctgattgcaagagtgttgcaagagagatttcttgttacaattgtggagagaaaggtcatattagt 20928252  T
Q  105 actaagtgtaccaagccgaagaaggcggcgggaaaggtgtttgctttgaatgcggaagaggtggagcagccggataatcttatccgaggtatgtgtttta 204  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  20928251 actaagtgtaccaagccgaagaaggcggcaggaaaggtgtttgctttgaatgcagaggaggtggagcagccggataatcttatttgaggtatgtgtttta 20928152  T
Q  205 tcaatagtactcctttgattgcaattattgatactggtgctactcattcttttatctcagctagttgtgttgaacgtttggatttggttgtaagtccttt 304  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||| | |||||| ||| ||||||    
T  20928151 tcaatagtactcctttgattgcaattattgatactggtgctactcattcttttatctcggttagttgtgttgatcgtttgaaattggttataactccttt 20928052  T
Q  305 gttgcgtggaatggttattgacaccccggctagcggttcggtgactacttcttttatgtgtgctaagtgtcctgttaattttggtaatgttgattttaag 404  Q
    ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  20928051 gttacggggaatggttattgacaccccggctagcggttcggtgactacttcttttatgtgtgctaaatgtcctgttaattttggtaatgttgattttgag 20927952  T
Q  405 ttggattttgtgtgtcttccgttgaagcatatggatgtgatttttggtatggattggatgttgtcctttggtgttagcattaactgtttaaccaagagta 504  Q
    || ||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||  | ||||| ||||||||||| ||||| || ||||||     
T  20927951 ttagatcttgtttgtcttccgttgaagcatatagatgtgatttttggtatggattgtttgttagcttttggggttagcattaattgtttgactaagagtg 20927852  T
Q  505 taacattttcgaagtcggtatacgagttaggtgggaagttattgaccgtggaaaaagtgaagaagtctttggacgatgaagctttagtgtttatgatgt 603  Q
    | |||||||| ||  ||||| | ||||||| | ||||||| ||||||| |||  |||||||||| ||||| || | | ||||||  |||||||||||||    
T  20927851 tgacattttctaaaccggtagaagagttagataggaagttcttgaccgcggagcaagtgaagaaatctttagatggtaaagcttgtgtgtttatgatgt 20927753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 296; E-Value: 1e-166
Query Start/End: Original strand, 3 - 603
Target Start/End: Original strand, 41214920 - 41215516
Alignment:
Q  3 agttgtcacaagtgtgggaaagtgggtcacaagggttatgaatgcaagagtgttgtaaaggagattacttgctacaattgtggagagaaaggtcatatca 102  Q
    ||||| |||||||||||||| |  |||||||||| || ||| || |||| ||||| ||||||  ||||||| ||||||||||| ||   |||||||  ||    
T  41214920 agttgccacaagtgtgggaaggcaggtcacaaggcttttgagtgtaagattgttgcaaaggatgttacttgttacaattgtggtgaagcaggtcattaca 41215019  T
Q  103 gtactaagtgtaccaagccgaagaaggcggcgggaaaggtgtttgctttgaatgcggaagaggtggagcagccggataatcttatccgaggtatgtgttt 202  Q
    ||| || |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||||| || || |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  41215020 gtaatatgtgtaccaagccaaagaaggcgacgggaaaggtgtttgcattgaatgccgaggaagtggagcaaccggataatcttatccgatgtatgtgttt 41215119  T
Q  203 tatcaatagtactcctttgattgcaattattgatactggtgctactcattcttttatctcagctagttgtgttgaacgtttggatttggttgtaagtcct 302  Q
    |||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||| |||||||||||| |||     
T  41215120 tatcagcagtactccttggattgcaattattgatactggtgctactcattcttttatctcggttagttgtgttgagcgtttgaatttggttgtaactccg 41215219  T
Q  303 ttgttgcgtggaatggttattgacaccccggctagcggttcggtgactacttcttttatgtgtgctaagtgtcctgttaattttggtaatgttgatttta 402  Q
    |||||||| || |||||||| ||||||||||||||    |||||||||||||| ||  ||||||||||||||| |||||||||||||||  || |||||     
T  41215220 ttgttgcgagggatggttatcgacaccccggctag----tcggtgactacttccttagtgtgtgctaagtgtcatgttaattttggtaacattaattttg 41215315  T
Q  403 agttggattttgtgtgtcttccgttgaagcatatggatgtgatttttggtatggattggatgttgtcctttggtgttagcattaactgtttaaccaagag 502  Q
    |||||||| |||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||| ||||||||||| |||||||| || ||    
T  41215316 agttggatcttgtttgtcttccgttttagcatatggatgtgatttttggtattgattggatgttatcttttggggttagcattaattgtttaacgaatag 41215415  T
Q  503 tataacattttcgaagtcggtatacgagttaggtgggaagttattgaccgtggaaaaagtgaagaagtctttggacgatgaagctttagtgtttatgatg 602  Q
    |||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||| |||||||  ||  ||||||||||||||||||||| ||| ||||  ||||||||||||    
T  41215416 tataacattttcgaagccggtagatgagttaggtgggaagttcttgaccgcagagcaagtgaagaagtctttggacggtgaggcttgtgtgtttatgatg 41215515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 206 - 603
Target Start/End: Original strand, 22133015 - 22133412
Alignment:
Q  206 caatagtactcctttgattgcaattattgatactggtgctactcattcttttatctcagctagttgtgttgaacgtttggatttggttgtaagtcctttg 305  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||| | |||| | |||||| ||| ||| |||    
T  22133015 caatagtaatcctttgattgcaattattgataccggtgctactcattcttttacctcggttagttgtgttgagcatttgaaattggttctaactccgttg 22133114  T
Q  306 ttgcgtggaatggttattgacaccccggctagcggttcggtgactacttcttttatgtgtgctaagtgtcctgttaattttggtaatgttgattttaagt 405  Q
    ||||| || ||||| || |||||||||||||  |||||||||||||||| |||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  22133115 ttgcgagggatggtcatcgacaccccggctaatggttcggtgactacttgttttgtgtgcgctaagtgtcctattaattttggtaatgttgattttgagt 22133214  T
Q  406 tggattttgtgtgtcttccgttgaagcatatggatgtgatttttggtatggattggatgttgtcctttggtgttagcattaactgtttaaccaagagtat 505  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||| ||||| ||||| || |||||| |    
T  22133215 tggatcttgtgtgtcttccgttgaagcatatggatgtgatttttggtatggattggatgttatcttttggggttagtattaaatgtttgactaagagtgt 22133314  T
Q  506 aacattttcgaagtcggtatacgagttaggtgggaagttattgaccgtggaaaaagtgaagaagtctttggacgatgaagctttagtgtttatgatgt 603  Q
    ||| ||||||||| ||||| | |||||| |||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||| || |||||  |||||||||||||    
T  22133315 aacgttttcgaagccggtagaagagttaagtgggaagttcttgaccgtggagcaagtgaagaagtctttggacggtggagcttgtgtgtttatgatgt 22133412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 130; E-Value: 5e-67
Query Start/End: Original strand, 3 - 212
Target Start/End: Original strand, 22129499 - 22129708
Alignment:
Q  3 agttgtcacaagtgtgggaaagtgggtcacaagggttatgaatgcaagagtgttgtaaaggagattacttgctacaattgtggagagaaaggtcatatca 102  Q
    ||||| |||||||||||||||| |||||||||||  ||||| || |||  |||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |    
T  22129499 agttgccacaagtgtgggaaagcgggtcacaaggcctatgagtgtaaggatgttttgaaggatattacttgctacaattgtggagagaagggtcatatta 22129598  T
Q  103 gtactaagtgtaccaagccgaagaaggcggcgggaaaggtgtttgctttgaatgcggaagaggtggagcagccggataatcttatccgaggtatgtgttt 202  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||    
T  22129599 gtactaagtgtaccaagccgaagaaggcggcaggaaaggtgtttgctttgaatgcagaggaagtggagcagccagataatcttacccgaggtatttgttt 22129698  T
Q  203 tatcaatagt 212  Q
    ||||||||||    
T  22129699 tatcaatagt 22129708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 109; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 163 - 518
Target Start/End: Complemental strand, 20172302 - 20171946
Alignment:
Q  163 aggtggagcagccggataatcttatccgaggtatgtgtttt-atcaatagtactcctttgattgcaattattgatactggtgctactcattcttttatct 261  Q
    |||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||| |||||||| |||||||  ||||||| ||||    
T  20172302 aggtggagcagccggataatctcatttgaggtatgtgtttttatcaatagtactcatttgattgaaattgttgatactagtgctacgtattctttcatct 20172203  T
Q  262 cagctagttgtgttgaacgtttggatttggttgtaagtcctttgttgcgtggaatggttattgacaccccggctagcggttcggtgactacttcttttat 361  Q
    |   |||||||||||||||||||  ||||||| ||| ||  |||||| | |||||| | || || |||||| |    || |||||| | ||||| ||  |    
T  20172202 cgcttagttgtgttgaacgtttgagtttggttttaactctgttgttgagaggaatgttcatcgataccccgaccgatggctcggtggcaacttccttagt 20172103  T
Q  362 gtgtgctaagtgtcctgttaattttggtaatgttgattttaagttggattttgtgtgtcttccgttgaagcatatggatgtgatttttggtatggattgg 461  Q
     ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||| ||  | ||||||  | |||||||||||||||| |||| ||| |||    
T  20172102 ttgtgctaagtgtcctgttaattttggtgatgttgattttgagttggatcttgtttgcttgccgttggtgaatatggatgtgattttcggtaaggactgg 20172003  T
Q  462 atgttgtcctttggtgttagcattaactgtttaaccaagagtataacattttcgaag 518  Q
    |||| ||| ||| |||||  |||||| | ||| ||||| ||||||||||| ||||||    
T  20172002 atgtcgtcttttagtgttgacattaattttttgaccaaaagtataacattctcgaag 20171946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 434 - 577
Target Start/End: Original strand, 21200445 - 21200588
Alignment:
Q  434 tatggatgtgatttttggtatggattggatgttgtcctttggtgttagcattaactgtttaaccaagagtataacattttcgaagtcggtatacgagtta 533  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| ||| | |  ||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||| | || ||| | ||| | ||  ||    
T  21200445 tatgaatgtgatttttggtatggattgaatgctatattttggtgttaatattaactatttaaccaagagtataacaatctctaagccagtaaatgaagta 21200544  T
Q  534 ggtgggaagttattgaccgtggaaaaagtgaagaagtctttgga 577  Q
    | ||||||||| || ||||   || |||||||||||||||||||    
T  21200545 gatgggaagtttttaaccgcacaacaagtgaagaagtctttgga 21200588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 207 - 259
Target Start/End: Original strand, 20074973 - 20075025
Alignment:
Q  207 aatagtactcctttgattgcaattattgatactggtgctactcattcttttat 259  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  20074973 aatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttat 20075025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 207 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 20297507 - 20297455
Alignment:
Q  207 aatagtactcctttgattgcaattattgatactggtgctactcattcttttat 259  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  20297507 aatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttat 20297455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 207 - 259
Target Start/End: Original strand, 31537261 - 31537313
Alignment:
Q  207 aatagtactcctttgattgcaattattgatactggtgctactcattcttttat 259  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  31537261 aatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttat 31537313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 207 - 259
Target Start/End: Original strand, 38910090 - 38910142
Alignment:
Q  207 aatagtactcctttgattgcaattattgatactggtgctactcattcttttat 259  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  38910090 aatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttat 38910142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 207 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 48425999 - 48425947
Alignment:
Q  207 aatagtactcctttgattgcaattattgatactggtgctactcattcttttat 259  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  48425999 aatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttat 48425947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 207 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 52988867 - 52988815
Alignment:
Q  207 aatagtactcctttgattgcaattattgatactggtgctactcattcttttat 259  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  52988867 aatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttat 52988815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 207 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 37680175 - 37680123
Alignment:
Q  207 aatagtactcctttgattgcaattattgatactggtgctactcattcttttat 259  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  37680175 aatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctattcattgttttat 37680123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 208 - 247
Target Start/End: Original strand, 21045389 - 21045428
Alignment:
Q  208 atagtactcctttgattgcaattattgatactggtgctac 247  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  21045389 atagtactcctttaattgctattattgatactggtgctac 21045428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 408 - 461
Target Start/End: Complemental strand, 12200443 - 12200390
Alignment:
Q  408 gattttgtgtgtcttccgttgaagcatatggatgtgatttttggtatggattgg 461  Q
    ||||| |||||||| ||||||| |  |||||||||||||||||||||| |||||    
T  12200443 gatttagtgtgtctgccgttgacgggtatggatgtgatttttggtatgaattgg 12200390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 207 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 19857400 - 19857355
Alignment:
Q  207 aatagtactcctttgattgcaattattgatactggtgctactcatt 252  Q
    |||||||||||||| | ||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  19857400 aatagtactcctttaactgctattatagatactggtgctactcatt 19857355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 207 - 252
Target Start/End: Original strand, 21739300 - 21739345
Alignment:
Q  207 aatagtactcctttgattgcaattattgatactggtgctactcatt 252  Q
    |||||||||||||| ||| | ||||| |||||||||||||||||||    
T  21739300 aatagtactcctttaatttctattatagatactggtgctactcatt 21739345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 207 - 259
Target Start/End: Original strand, 16347859 - 16347911
Alignment:
Q  207 aatagtactcctttgattgcaattattgatactggtgctactcattcttttat 259  Q
    |||| |||||||||  |||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  16347859 aataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttat 16347911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 207 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 21833397 - 21833345
Alignment:
Q  207 aatagtactcctttgattgcaattattgatactggtgctactcattcttttat 259  Q
    |||| |||||||||  |||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  21833397 aataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttat 21833345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 207 - 259
Target Start/End: Original strand, 33388293 - 33388345
Alignment:
Q  207 aatagtactcctttgattgcaattattgatactggtgctactcattcttttat 259  Q
    |||| |||||||||  |||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  33388293 aataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttat 33388345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 207 - 259
Target Start/End: Original strand, 51330756 - 51330808
Alignment:
Q  207 aatagtactcctttgattgcaattattgatactggtgctactcattcttttat 259  Q
    |||| |||||||||  |||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  51330756 aataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttat 51330808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 374; Significance: 0; HSPs: 29)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 374; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 6 - 603
Target Start/End: Original strand, 15290149 - 15290746
Alignment:
Q  6 tgtcacaagtgtgggaaagtgggtcacaagggttatgaatgcaagagtgttgtaaaggagattacttgctacaattgtggagagaaaggtcatatcagta 105  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| || ||  ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||    
T  15290149 tgtcacaagtgtgggaaagtgggtcacaagggttttgaatgcaggagtgctgcaagagagattacttgctacaattatggagagaagggtcatattagta 15290248  T
Q  106 ctaagtgtaccaagccgaagaaggcggcgggaaaggtgtttgctttgaatgcggaagaggtggagcagccggataatcttatccgaggtatgtgttttat 205  Q
    | ||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15290249 ccaagtgtacccaaccgaagaaggcggcgagaaaggtgttttctttgaacgcggaggaagtggagcagccggataatcttatccgaggtatgtgttttat 15290348  T
Q  206 caatagtactcctttgattgcaattattgatactggtgctactcattcttttatctcagctagttgtgttgaacgtttggatttggttgtaagtcctttg 305  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  15290349 caatagtactcctttgattgcaattattgatagtggtgctactcattcttttatctcggctagttgtgttgaacgtttggatttggttgtaactcctttg 15290448  T
Q  306 ttgcgtggaatggttattgacaccccggctagcggttcggtgactacttcttttatgtgtgctaagtgtcctgttaattttggtaatgttgattttaagt 405  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||    
T  15290449 ttgcgtggaatggttattgacaccccggctagcggttcggtgactacttcttttatgtgtgctaagtgtcctgttaattttggtgatgttgattttgagt 15290548  T
Q  406 tggattttgtgtgtcttccgttgaagcatatggatgtgatttttggtatggattggatgttgtcctttggtgttagcattaactgtttaaccaagagtat 505  Q
    ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  | ||||| |||||| |||| ||||| || | |||| |    
T  15290549 tggatcttgtttgtcttccgttgaagcatatggatgtgatttttggtatggattggttgttcgcttttggggttagcgttaattgtttgactaggagtgt 15290648  T
Q  506 aacattttcgaagtcggtatacgagttaggtgggaagttattgaccgtggaaaaagtgaagaagtctttggacgatgaagctttagtgtttatgatgt 603  Q
     || ||||| ||  ||||| | ||||||| | ||||||| ||||||| ||   |||||||||||||||| || | |||  |||  |||||||||||||    
T  15290649 gactttttctaaaccggtagaagagttagataggaagtttttgaccgcggggcaagtgaagaagtctttagaaggtgagacttgtgtgtttatgatgt 15290746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 358; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 5 - 602
Target Start/End: Complemental strand, 14999928 - 14999331
Alignment:
Q  5 ttgtcacaagtgtgggaaagtgggtcacaagggttatgaatgcaagagtgttgtaaaggagattacttgctacaattgtggagagaaaggtcatatcagt 104  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||     || ||||   |||||| ||  ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||    
T  14999928 ttgtcacaagtgtgggaaagcgggtcacaaggcggccgattgcagaggtgttgcaagagagattacttgttacaattgtggagagaagggtcatattagt 14999829  T
Q  105 actaagtgtaccaagccgaagaaggcggcgggaaaggtgtttgctttgaatgcggaagaggtggagcagccggataatcttatccgaggtatgtgtttta 204  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  14999828 accaagtgtaccaagccgaagaaggcggcgggaaaggtgtttgctttgaatgcggaggaggtggagcagccagataatcttatccgaggtatgcgtttta 14999729  T
Q  205 tcaatagtactcctttgattgcaattattgatactggtgctactcattcttttatctcagctagttgtgttgaacgtttggatttggttgtaagtccttt 304  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  14999728 tcaatagtactcctttgattgcaattattgatactggtgctactcattcttttatctcggctagttgtgttgaacgtttggatttggttgtaactccttt 14999629  T
Q  305 gttgcgtggaatggttattgacaccccggctagcggttcggtgactacttcttttatgtgtgctaagtgtcctgttaattttggtaatgttgattttaag 404  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||    
T  14999628 gttgcggggaatggttattgacaccccggctagcggttcggtgactacttcttttatgtgtgctaagtgtcctgttaattttggtgatgttgattttgag 14999529  T
Q  405 ttggattttgtgtgtcttccgttgaagcatatggatgtgatttttggtatggattggatgttgtcctttggtgttagcattaactgtttaaccaagagta 504  Q
    |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||  | ||||| ||||||||||| ||||| || ||||||     
T  14999528 ttggatcttgtttgtcttccgttgaagcatatggatgtgatttttggtatggatttgttattagcttttggggttagcattaattgtttgactaagagtg 14999429  T
Q  505 taacattttcgaagtcggtatacgagttaggtgggaagttattgaccgtggaaaaagtgaagaagtctttggacgatgaagctttagtgtttatgatg 602  Q
    |||| ||||  ||| ||||| | | ||||| |  || ||| ||| ||| |||  |||||||||||||||| || | ||||||||  ||||| ||||||    
T  14999428 taacgttttgtaagccggtagaagggttagataagaggttcttggccgcggagcaagtgaagaagtctttagatggtgaagcttgtgtgttcatgatg 14999331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 232; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 60 - 568
Target Start/End: Original strand, 12339910 - 12340420
Alignment:
Q  60 aaggagattacttgctacaattgtggagagaaaggtcatatcagtactaagtgtaccaagccgaagaaggcggcgggaaaggtgtttgctttgaatgcgg 159  Q
    ||||| |||||||| ||||| || ||||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||    
T  12339910 aaggatattacttgttacaactgcggagagtcaggtcatatcagtactaagtgtaccaaaccgaagaaggcgtcgggtaaggtgtttgatttgaatgcgg 12340009  T
Q  160 aagaggtggagcagccggataatcttatccgaggtatgtgtttt--atcaatagtactcctttgattgcaattattgatactggtgctactcattctttt 257  Q
    | ||||| || || |  |||||||| ||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  12340010 atgaggtcgaacaacaagataatctcatccgaggtatgtattttttatcaatagtactcctttgattgcgattattgatattggtcctactcattctttt 12340109  T
Q  258 atctcagctagttgtgttgaacgtttggatttggttgtaagtcctttgttgcgtggaatggttattgacaccccggctagcggttcggtgactacttctt 357  Q
    ||||| | ||||||||||||||||||| |||||||||| | ||| |||||||| || | ||| || ||||||||| | || ||||||||||||||||| |    
T  12340110 atctcggttagttgtgttgaacgtttgaatttggttgtgactccgttgttgcgagggagggtcatcgacaccccgaccagtggttcggtgactacttcct 12340209  T
Q  358 ttatgtgtgctaagtgtcctgttaattttggtaatgttgattttaagttggattttgtgtgtcttccgttgaagcatatggatgtgatttttggtatgga 457  Q
    |  |||| |||||||||| |||||| | |||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  12340210 tggtgtgcgctaagtgtcatgttaactctggtaatgttgactttgagttggatcttgtgtgtcttccgttgaagcacatggacgtgatttttggtatgga 12340309  T
Q  458 ttggatgttgtcctttggtgttagcattaactgtttaaccaagagtataacattttcgaagtcggtatacgagttaggtgggaagttattgaccgtggaa 557  Q
     | ||||||||| |||||||||| ||| || || |||||||||||||||||||| || ||| |  |  | ||| ||||||||||||| ||||||| |||     
T  12340310 ctagatgttgtcttttggtgttaacatcaattgcttaaccaagagtataacattatctaagccattggaggaggtaggtgggaagttcttgaccgcggag 12340409  T
Q  558 aaagtgaagaa 568  Q
     ||||||||||    
T  12340410 caagtgaagaa 12340420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 361 - 603
Target Start/End: Complemental strand, 9293092 - 9292850
Alignment:
Q  361 tgtgtgctaagtgtcctgttaattttggtaatgttgattttaagttggattttgtgtgtcttccgttgaagcatatggatgtgatttttggtatggattg 460  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9293092 tgtgtgctaagtgtcctgttaattttggtaatgttgattttgagttggattttgtgtgtcttccgttgaagcatatggatgtgatttttggtatggattg 9292993  T
Q  461 gatgttgtcctttggtgttagcattaactgtttaaccaagagtataacattttcgaagtcggtatacgagttaggtgggaagttattgaccgtggaaaaa 560  Q
      ||||  | ||||  ||||||||||| ||||| || |||||| | || ||| |||||  ||||   ||||| | | ||||||| ||||||  |||  ||    
T  9292992 attgttagcttttgaggttagcattaattgtttgactaagagtgtgacttttccgaagctggtaggagagttggataggaagttcttgaccacggagcaa 9292893  T
Q  561 gtgaagaagtctttggacgatgaagctttagtgtttatgatgt 603  Q
    |||||||||| |||||||| |||| |||  ||||| |||||||    
T  9292892 gtgaagaagtttttggacggtgaaacttgtgtgttcatgatgt 9292850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 361 - 603
Target Start/End: Original strand, 15139016 - 15139257
Alignment:
Q  361 tgtgtgctaagtgtcctgttaattttggtaatgttgattttaagttggattttgtgtgtcttccgttgaagcatatggatgtgatttttggtatggattg 460  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  15139016 tgtgtgctaagtgtcctgttaattttggtaatgttgattttgagttggatcttgt-tgtcttccgttgaagcttatggatgtaatttttggtatggattg 15139114  T
Q  461 gatgttgtcctttggtgttagcattaactgtttaaccaagagtataacattttcgaagtcggtatacgagttaggtgggaagttattgaccgtggaaaaa 560  Q
    | ||||  | ||||| ||||||||||| ||||| || | |||| | || |||||  || ||||| | ||||||| | ||||||| ||||||  |||  ||    
T  15139115 gttgttagcttttggagttagcattaattgtttgactaggagtgtgactttttcttagccggtagaagagttagataggaagtttttgaccacggagcaa 15139214  T
Q  561 gtgaagaagtctttggacgatgaagctttagtgtttatgatgt 603  Q
    || ||||||||||| || | ||||||||  |||||||||||||    
T  15139215 gtaaagaagtctttagatggtgaagcttgtgtgtttatgatgt 15139257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 207 - 259
Target Start/End: Original strand, 3261986 - 3262038
Alignment:
Q  207 aatagtactcctttgattgcaattattgatactggtgctactcattcttttat 259  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  3261986 aatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttat 3262038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 207 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 7357347 - 7357295
Alignment:
Q  207 aatagtactcctttgattgcaattattgatactggtgctactcattcttttat 259  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  7357347 aatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttat 7357295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 207 - 259
Target Start/End: Original strand, 11204424 - 11204476
Alignment:
Q  207 aatagtactcctttgattgcaattattgatactggtgctactcattcttttat 259  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  11204424 aatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttat 11204476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 207 - 259
Target Start/End: Original strand, 29450729 - 29450781
Alignment:
Q  207 aatagtactcctttgattgcaattattgatactggtgctactcattcttttat 259  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  29450729 aatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttat 29450781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 207 - 259
Target Start/End: Original strand, 44659058 - 44659110
Alignment:
Q  207 aatagtactcctttgattgcaattattgatactggtgctactcattcttttat 259  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||    
T  44659058 aatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgttttat 44659110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 208 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 14697180 - 14697129
Alignment:
Q  208 atagtactcctttgattgcaattattgatactggtgctactcattcttttat 259  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  14697180 atagtactcctttaattgctattattgatactggtgctacacattgttttat 14697129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 207 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 20893111 - 20893066
Alignment:
Q  207 aatagtactcctttgattgcaattattgatactggtgctactcatt 252  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  20893111 aatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcatt 20893066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 207 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 14683647 - 14683602
Alignment:
Q  207 aatagtactcctttgattgcaattattgatactggtgctactcatt 252  Q
    |||| |||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  14683647 aataatactcctttagttgctattattgatactggtgctactcatt 14683602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 207 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 15073439 - 15073394
Alignment:
Q  207 aatagtactcctttgattgcaattattgatactggtgctactcatt 252  Q
    |||| ||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  15073439 aataatactcctttaattgctattatagatactggtgctactcatt 15073394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 207 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 16150716 - 16150671
Alignment:
Q  207 aatagtactcctttgattgcaattattgatactggtgctactcatt 252  Q
    ||||||||||||||  |||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  16150716 aatagtactcctttagttgctattatagatactggtgctactcatt 16150671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 207 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 16154862 - 16154817
Alignment:
Q  207 aatagtactcctttgattgcaattattgatactggtgctactcatt 252  Q
    ||||||||||||||  |||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  16154862 aatagtactcctttagttgctattatagatactggtgctactcatt 16154817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 207 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 27903465 - 27903420
Alignment:
Q  207 aatagtactcctttgattgcaattattgatactggtgctactcatt 252  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| || ||||||||||||||||    
T  27903465 aatagtactcctttaattgctattatagacactggtgctactcatt 27903420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 207 - 252
Target Start/End: Original strand, 51603984 - 51604029
Alignment:
Q  207 aatagtactcctttgattgcaattattgatactggtgctactcatt 252  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| || ||||||||||||||||    
T  51603984 aatagtactcctttaattgctattatagacactggtgctactcatt 51604029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 207 - 252
Target Start/End: Original strand, 53750662 - 53750707
Alignment:
Q  207 aatagtactcctttgattgcaattattgatactggtgctactcatt 252  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| || ||||||||||||||||    
T  53750662 aatagtactcctttaattgctattatagacactggtgctactcatt 53750707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 207 - 259
Target Start/End: Original strand, 8050555 - 8050607
Alignment:
Q  207 aatagtactcctttgattgcaattattgatactggtgctactcattcttttat 259  Q
    |||| |||||||||  |||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  8050555 aataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttat 8050607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 207 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 8389492 - 8389440
Alignment:
Q  207 aatagtactcctttgattgcaattattgatactggtgctactcattcttttat 259  Q
    |||| |||||||||  |||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  8389492 aataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttat 8389440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 207 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 12479680 - 12479628
Alignment:
Q  207 aatagtactcctttgattgcaattattgatactggtgctactcattcttttat 259  Q
    |||| |||||||||  |||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  12479680 aataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttat 12479628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 207 - 259
Target Start/End: Original strand, 14300911 - 14300963
Alignment:
Q  207 aatagtactcctttgattgcaattattgatactggtgctactcattcttttat 259  Q
    |||| |||||||||  |||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  14300911 aataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttat 14300963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 207 - 259
Target Start/End: Original strand, 16233924 - 16233976
Alignment:
Q  207 aatagtactcctttgattgcaattattgatactggtgctactcattcttttat 259  Q
    |||| |||||||||  |||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  16233924 aataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttat 16233976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 207 - 259
Target Start/End: Original strand, 17092081 - 17092133
Alignment:
Q  207 aatagtactcctttgattgcaattattgatactggtgctactcattcttttat 259  Q
    |||| |||||||||  |||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  17092081 aataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttat 17092133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 207 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 19635216 - 19635164
Alignment:
Q  207 aatagtactcctttgattgcaattattgatactggtgctactcattcttttat 259  Q
    |||| |||||||||  |||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  19635216 aataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttat 19635164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 207 - 259
Target Start/End: Original strand, 19775725 - 19775777
Alignment:
Q  207 aatagtactcctttgattgcaattattgatactggtgctactcattcttttat 259  Q
    |||| |||||||||  |||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  19775725 aataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttat 19775777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 207 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 23958827 - 23958775
Alignment:
Q  207 aatagtactcctttgattgcaattattgatactggtgctactcattcttttat 259  Q
    |||| |||||||||  |||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  23958827 aataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttat 23958775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 207 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 27714416 - 27714364
Alignment:
Q  207 aatagtactcctttgattgcaattattgatactggtgctactcattcttttat 259  Q
    |||| |||||||||  |||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  27714416 aataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttat 27714364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011 (Bit Score: 367; Significance: 0; HSPs: 5)
Name: scaffold0011
Description:

Target: scaffold0011; HSP #1
Raw Score: 367; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 603
Target Start/End: Original strand, 73586 - 74187
Alignment:
Q  1 tcagttgtcacaagtgtgggaaagtgggtcacaagggttatgaatgcaagagtgttgtaaaggagattacttgctacaattgtggagagaaaggtcatat 100  Q
    ||||||||||||||||||| |||| |||||||||  | |||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  73586 tcagttgtcacaagtgtggaaaagcgggtcacaaatgatatgaatgaaagagtgttgcaaaggagattacttgctacaattgcggagagaagggtcatat 73685  T
Q  101 cagtactaagtgtaccaagccgaagaaggcggcgggaaaggtgtttgctttgaatgcggaagaggtggagcagccggataatcttatccgaggtatgtgt 200  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  || ||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||    
T  73686 tagtactaagtgtaccaagccgaagaaggcggtgggaaaggtgtttgctttgaatgtcgaggaggtggagcaaccggataatcttatatgaggtatgtgt 73785  T
Q  201 tttatcaatagtactcctttgattgcaattattgatactggtgctactcattcttttatctcagctagttgtgttgaacgtttggatttggttgtaagtc 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||| | |||||||||| ||    
T  73786 tttatcaatagtactcctttgattgcaattattgatactggtgctactcattgttttatctcggttagttgtgttgaacgtttgaaattggttgtaactc 73885  T
Q  301 ctttgttgcgtggaatggttattgacaccccggctagcggttcggtgactacttcttttatgtgtgctaagtgtcctgttaattttggtaatgttgattt 400  Q
    || | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  73886 ctctattgcggggaatggttattgacaccccggctagcggttcggtgactacttcttttatgtgtgctaagtgtcctgttaattttgttaatgttgattt 73985  T
Q  401 taagttggattttgtgtgtcttccgttgaagcatatggatgtgatttttggtatggattggatgttgtcctttggtgttagcattaactgtttaaccaag 500  Q
    | |||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  | ||||| ||||||||||| ||||| || |||    
T  73986 tgagttcgatcttgtttgtcttccgttgaagcatatggatgtgatttttggtatggattggctgttagcttttggggttagcattaattgtttgactaag 74085  T
Q  501 agtataacattttcgaagtcggtatacgagttaggtgggaagttattgaccgtggaaaaagtgaagaagtctttggacgatgaagctttagtgtttatga 600  Q
    ||| |||| ||||||||| ||||||  || |||| | ||||||| ||||||| |||  |||||||||| ||||| || | || |||||  ||||||||||    
T  74086 agtgtaactttttcgaagccggtatcagaattagataggaagttcttgaccgcggagcaagtgaagaaatctttagatggtg-agcttgtgtgtttatga 74184  T
Q  601 tgt 603  Q
    |||    
T  74185 tgt 74187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #2
Raw Score: 367; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 603
Target Start/End: Original strand, 77967 - 78568
Alignment:
Q  1 tcagttgtcacaagtgtgggaaagtgggtcacaagggttatgaatgcaagagtgttgtaaaggagattacttgctacaattgtggagagaaaggtcatat 100  Q
    ||||||||||||||||||| |||| |||||||||  | |||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  77967 tcagttgtcacaagtgtggaaaagcgggtcacaaatgatatgaatgaaagagtgttgcaaaggagattacttgctacaattgcggagagaagggtcatat 78066  T
Q  101 cagtactaagtgtaccaagccgaagaaggcggcgggaaaggtgtttgctttgaatgcggaagaggtggagcagccggataatcttatccgaggtatgtgt 200  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  || ||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||    
T  78067 tagtactaagtgtaccaagccgaagaaggcggtgggaaaggtgtttgctttgaatgtcgaggaggtggagcaaccggataatcttatatgaggtatgtgt 78166  T
Q  201 tttatcaatagtactcctttgattgcaattattgatactggtgctactcattcttttatctcagctagttgtgttgaacgtttggatttggttgtaagtc 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||| | |||||||||| ||    
T  78167 tttatcaatagtactcctttgattgcaattattgatactggtgctactcattgttttatctcggttagttgtgttgaacgtttgaaattggttgtaactc 78266  T
Q  301 ctttgttgcgtggaatggttattgacaccccggctagcggttcggtgactacttcttttatgtgtgctaagtgtcctgttaattttggtaatgttgattt 400  Q
    || | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  78267 ctctattgcggggaatggttattgacaccccggctagcggttcggtgactacttcttttatgtgtgctaagtgtcctgttaattttgttaatgttgattt 78366  T
Q  401 taagttggattttgtgtgtcttccgttgaagcatatggatgtgatttttggtatggattggatgttgtcctttggtgttagcattaactgtttaaccaag 500  Q
    | |||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  | ||||| ||||||||||| ||||| || |||    
T  78367 tgagttcgatcttgtttgtcttccgttgaagcatatggatgtgatttttggtatggattggctgttagcttttggggttagcattaattgtttgactaag 78466  T
Q  501 agtataacattttcgaagtcggtatacgagttaggtgggaagttattgaccgtggaaaaagtgaagaagtctttggacgatgaagctttagtgtttatga 600  Q
    ||| |||| ||||||||| ||||||  || |||| | ||||||| ||||||| |||  |||||||||| ||||| || | || |||||  ||||||||||    
T  78467 agtgtaactttttcgaagccggtatcagaattagataggaagttcttgaccgcggagcaagtgaagaaatctttagatggtg-agcttgtgtgtttatga 78565  T
Q  601 tgt 603  Q
    |||    
T  78566 tgt 78568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #3
Raw Score: 297; E-Value: 1e-166
Query Start/End: Original strand, 4 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 182302 - 181934
Alignment:
Q  4 gttgtcacaagtgtgggaaagtgggtcacaagggttatgaatgcaagagtgttgtaaaggagattacttgctacaattgtggagagaaaggtcatatcag 103  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||    
T  182302 gttgtcacaagtgtgggaaagtgggtcacaaaggttatgaatgcaagggtgttgcaaaggagattacttgctacaattgtggagagaagggtcagattag 182203  T
Q  104 tactaagtgtaccaagccgaagaaggcggcgggaaaggtgtttgctttgaatgcggaagaggtggagcagccggataatcttatccgaggtatgtgtttt 203  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  182202 tactaagtgtaccaagccgaagaaggcggcgtgaaaggtgtttgctttgaatgcggaggaggtggagcagccggataatcttatccgaggtatgtgtttt 182103  T
Q  204 atcaatagtactcctttgattgcaattattgatactggtgctactcattcttttatctcagctagttgtgttgaacgtttggatttggttgtaagtcctt 303  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| | || ||||||| |||||    
T  182102 atcaatagtactcctttgattgcaattattgatactggtgctactcattcttttatctcggttagttgtgttgaacgtttgaaattcgttgtaactcctt 182003  T
Q  304 tgttgcgtggaatggttattgacaccccggctagcggttcggtgactacttcttttatgtgtgctaagt 372  Q
    | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  182002 ttttgcggggaatggttattgacaccccggctagcggttcggtgactacttcatttatgtctgctaagt 181934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #4
Raw Score: 198; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 200 - 601
Target Start/End: Original strand, 175701 - 176102
Alignment:
Q  200 ttttatcaatagtactcctttgattgcaattattgatactggtgctactcattcttttatctcagctagttgtgttgaacgtttggatttggttgtaagt 299  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||| |||||||| |||||||||| | |    
T  175701 ttttatcaatagtactcctttgattgcaattattgatactggtgctactcattctttcatctccgttagttgtgttaaacgtttgaatttggttgtgact 175800  T
Q  300 cctttgttgcgtggaatggttattgacaccccggctagcggttcggtgactacttcttttatgtgtgctaagtgtcctgttaattttggtaatgttgatt 399  Q
    || || ||| | |||||||| || || |||||| | || ||||||||||||||||| || | |||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  175801 ccgttattgtgaggaatggtcatcgataccccgaccagtggttcggtgactacttccttgaggtgttctaagtgtcccgttaactttggtaatgttgatt 175900  T
Q  400 ttaagttggattttgtgtgtcttccgttgaagcatatggatgtgatttttggtatggattggatgttgtcctttggtgttagcattaactgtttaaccaa 499  Q
    || |||||| | |||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  175901 ttgagttggttcttgtgtttcttccgttaaagcacatggatgtgatttttggtatggactggatgttgtcttttagtgttagcattaattgtttaaccaa 176000  T
Q  500 gagtataacattttcgaagtcggtatacgagttaggtgggaagttattgaccgtggaaaaagtgaagaagtctttggacgatgaagctttagtgtttatg 599  Q
    ||||||||| || || |||   ||| | ||| ||||||||||||| |||||| ||||  ||||||||||||||||||||  |||||||   |||||||||    
T  176001 gagtataactttctctaagctagtagatgaggtaggtgggaagttgttgaccttggagcaagtgaagaagtctttggactgtgaagctagtgtgtttatg 176100  T
Q  600 at 601  Q
    ||    
T  176101 at 176102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #5
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 190 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 151693 - 151631
Alignment:
Q  190 gaggtatgtgttttatcaatagtactcctttgattgcaattattgatactggtgctactcatt 252  Q
    ||||||| |||||  | |||||||||||||| ||||| ||||| |||||| ||||||||||||    
T  151693 gaggtatttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactagtgctactcatt 151631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0561 (Bit Score: 357; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold0561
Description:

Target: scaffold0561; HSP #1
Raw Score: 357; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 60 - 603
Target Start/End: Original strand, 6052 - 6596
Alignment:
Q  60 aaggagattacttgctacaattgtggagagaaaggtcatatcagtactaagtgtaccaagccgaagaaggcggcgggaaaggtgtttgctttgaatgcgg 159  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  6052 aaggagatcacttgttacaattgtggtaagaagggtcatatcagtactaagtgtaccaagccaaagaaggcggcgggaaaggtgtttgcattgaatgcgg 6151  T
Q  160 aagaggtggagcagccggataatcttatccgaggtatgtgttttatcaatagtactcctttgattgcaattattgatactggtgctactcattcttttat 259  Q
    | || |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  6152 aggaagtggagcagccggataatcttatctgaggtatgtgttttatcaatagtactactttgattgcaataattgatactggtgctactcattcttttat 6251  T
Q  260 ctcagctagttgtgttgaacgtttggatttggttgtaagtcctttgttgcgtggaatggttattgacaccccggctagcggttcggtgactacttctttt 359  Q
    ||| | |||||||||||| |||||| |||||||||| | ||| || ||||| |||||||| || |||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||     
T  6252 ctcggttagttgtgttgagcgtttgaatttggttgtgactccgttattgcgaggaatggtcatcgacaccccggctagtggttcagtgactacttcctta 6351  T
Q  360 atgtgtgctaagtgtcctgttaa-ttttggtaatgttgattttaagttggattttgtgtgtcttccgttgaagcatatggatgtgatttttggtatggat 458  Q
     ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6352 gtgtgtgctaagtgccctgttaatttttggtaatgttgattttgagttggatcttgtgtgtgttccgttgaagcatatggatgtgatttttggtatggat 6451  T
Q  459 tggatgttgtcctttggtgttagcattaactgtttaaccaagagtataacattttcgaagtcggtatacgagttaggtgggaagttattgaccgtggaaa 558  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||| |||      
T  6452 tggatgttgtcttttggtgttagcattaactgtttaaccaagagtataacattttcgaagtcggtagatgagttaggtgggaagttcttgaccgcggagc 6551  T
Q  559 aagtgaagaagtctttggacgatgaagctttagtgtttatgatgt 603  Q
    ||||||| |||||||| |||| ||||||||  ||||| |||||||    
T  6552 aagtgaataagtctttagacggtgaagcttgtgtgttcatgatgt 6596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124 (Bit Score: 356; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold0124
Description:

Target: scaffold0124; HSP #1
Raw Score: 356; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 5 - 603
Target Start/End: Original strand, 4798 - 5397
Alignment:
Q  5 ttgtcacaagtgtgggaaagtgggtcacaagggttatgaatgcaagagtgttgtaaaggagattacttgctacaattgtggagagaaaggtcatatcagt 104  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||     || ||||   |||||| ||  ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||    
T  4798 ttgtcacaagtgtgggaaagcgggtcacaaggcggccgattgcagaggtgttgcaagagagattacttgttacaattgtggagagaagggtcatattagt 4897  T
Q  105 actaagtgtaccaagccgaagaaggcggcgggaaaggtgtttgctttgaatgcggaagaggtggagcagccggataatcttatccgaggtatgtgtttta 204  Q
    || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4898 accaagtgtaccaagccaaagaaggcggcgggaaaggtgtttgctttgaacgcagaggaggtggagcagccggataatcttatccgaggtatgtgtttta 4997  T
Q  205 tcaatagtactcctttgattgcaattattgatactggtgctactcattcttttatctcagctagttgtgttgaacgtttggatttggttgtaagtccttt 304  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  4998 tcaataatactcctttgattgcaattatcgatactggtgctactcattcttttatctcggctagttgtgttgaacgtttggatttggttgtaactccttt 5097  T
Q  305 gttgcgtggaatggttattgaca-ccccggctagcggttcggtgactacttcttttatgtgtgctaagtgtcctgttaattttggtaatgttgattttaa 403  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||      
T  5098 gttgcgtggaatggttattgacacccccggctagcggttcggtgactacttcttttatgtgtgctaagtgttctgttaattttggtgatgttgattttgt 5197  T
Q  404 gttggattttgtgtgtcttccgttgaagcatatggatgtgatttttggtatggattggatgttgtcctttggtgttagcattaactgtttaaccaagagt 503  Q
    ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  | ||||| ||||||||||| ||||| || | ||||    
T  5198 gttggatcttgtttgtcttccgttgaagcatatggatgtgatttttggtatggattggttgttagcttttggggttagcattaattgtttgactaggagt 5297  T
Q  504 ataacattttcgaagtcggtatacgagttaggtgggaagttattgaccgtggaaaaagtgaagaagtctttggacgatgaagctttagtgtttatgatgt 603  Q
     | || ||||| ||| ||||| | ||||||| | ||||||| ||||||| |||  |||||||||||||||| || | ||| ||||  |||||||||||||    
T  5298 gtgactttttctaagccggtagaagagttagataggaagtttttgaccgcggagcaagtgaagaagtctttagatggtgaggcttgtgtgtttatgatgt 5397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 352; Significance: 0; HSPs: 27)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 352; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 8 - 603
Target Start/End: Complemental strand, 23508868 - 23508282
Alignment:
Q  8 tcacaagtgtgggaaagtgggtcacaagggttatgaatgcaagagtgttgtaaaggagattacttgctacaattgtggagagaaaggtcatatcagtact 107  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||    
T  23508868 tcacaagtgtgggaaagcgggccacaagggttttgaatgcaggagtgatgcaaaggagattacttgctacaattgtggagagaagagtcatattagtact 23508769  T
Q  108 aagtgtaccaagccgaagaaggcggcgggaaaggtgtttgctttgaatgcggaagaggtggagcagccggataatcttatccgaggtatgtgttttatca 207  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||         |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23508768 aagtgtaccaagccgaagaaggcagcgggaaaggtgtttgctttgaatgcgga---------gcagtcggataatcttatccgaggtatgtgttttatca 23508678  T
Q  208 atagtactcctttgattgcaattattgatactggtgctactcattcttttatctcagctagttgtgttgaacgtttggatttggttgtaagtcctttgtt 307  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| | |||| ||||| |||||||||    
T  23508677 atagtactcctttgattgcaattattgatactggtgctactcattcttttatctcggttagttgtgttgaacgtttgaaattggctgtaactcctttgtt 23508578  T
Q  308 gcgtggaatggttattgacaccccggctagcggttcggtgactacttcttttatgtgtgctaagtgtcctgttaattttggtaatgttgattttaagttg 407  Q
    ||| |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||     
T  23508577 gcggggaatggttattaacaccccggctagcggtttggtgactacttcttttatgtgtgttaagtgtcctgttaattttggtaatgttgattttgagtta 23508478  T
Q  408 gattttgtgtgtcttccgttgaagcatatggatgtgatttttggtatggattggatgttgtcctttggtgttagcattaactgtttaaccaagagtataa 507  Q
    ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  | ||||| ||||||||||| ||||| || | |||| | |    
T  23508477 gatcttgtttgtcttccgttgaagcatatggatgtgatttttggtatggattggttgttagcttttggggttagcattaattgtttgactaggagtgtga 23508378  T
Q  508 cattttcgaagtcggtatacgagttaggtgggaagttattgaccgtggaaaaagtgaagaagtctttggacgatgaagctttagtgtttatgatgt 603  Q
    | ||||| ||| ||||| | ||||||| | ||||||| ||||||| |||  |||||||||||||||| || | ||| ||||  |||||||||||||    
T  23508377 ctttttctaagccggtagaagagttagataggaagtttttgaccgcggagcaagtgaagaagtctttagatggtgaggcttgtgtgtttatgatgt 23508282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 339; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 5 - 603
Target Start/End: Complemental strand, 24584397 - 24583808
Alignment:
Q  5 ttgtcacaagtgtgggaaagtgggtcacaagggttatgaatgcaagagtgttgtaaaggagattacttgctacaattgtggagagaaaggtcatatcagt 104  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||     || ||||   |||||  ||  ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||    
T  24584397 ttgtcacaagtgtgggaaagcgggtcacaaggcggccgattgcagaggtgtttcaagagagattacttgttacaattgtggagagaagggtcatattagt 24584298  T
Q  105 actaagtgtaccaagccgaagaaggcggcgggaaaggtgtttgctttgaatgcggaagaggtggagcagccggataatcttatccgaggtatgtgtttta 204  Q
    ||         ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24584297 ac---------caagccgaagaaggcagcgggaaaggtgtttgctttgaatgcggaggaggtggagcagccggataatcttatccgaggtatgtgtttta 24584207  T
Q  205 tcaatagtactcctttgattgcaattattgatactggtgctactcattcttttatctcagctagttgtgttgaacgtttggatttggttgtaagtccttt 304  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  24584206 tcaatagtactcctttgattgcaattattgatactggtgctactcattcttttatctcggctagttgtgttgaacgtttggatttggttgtaactccttt 24584107  T
Q  305 gttgcgtggaatggttattgacaccccggctagcggttcggtgactacttcttttatgtgtgctaagtgtcctgttaattttggtaatgttgattttaag 404  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||    
T  24584106 gttgcgtggaatggttattgacaccccggctagcggttcggtgactacttcttttatgtgtgctaagtgtcctgttaattttggtgatattgattttgag 24584007  T
Q  405 ttggattttgtgtgtcttccgttgaagcatatggatgtgatttttggtatggattggatgttgtcctttggtgttagcattaactgtttaaccaagagta 504  Q
    |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  | ||||| ||||||||||| ||||| || | ||||     
T  24584006 ttggatcttgtttgtcttccgttgaagcatatggatgtgatttttggtatggattggttgttagcttttggggttagcattaattgtttgactaggagtg 24583907  T
Q  505 taacattttcgaagtcggtatacgagttaggtgggaagttattgaccgtggaaaaagtgaagaagtctttggacgatgaagctttagtgtttatgatgt 603  Q
    | || ||||| ||  ||||| | ||||||| | ||||||| || |||| ||   |||||||||||||||| || | ||| ||||  |||||||||||||    
T  24583906 tgactttttctaaaccggtagaagagttagataggaagtttttaaccgcggggcaagtgaagaagtctttagaaggtgaggcttgtgtgtttatgatgt 24583808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 268 - 603
Target Start/End: Original strand, 21934623 - 21934958
Alignment:
Q  268 gttgtgttgaacgtttggatttggttgtaagtcctttgttgcgtggaatggttattgacaccccggctagcggttcggtgactacttcttttatgtgtgc 367  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21934623 gttgtgttgaacgtttggatttggttgtaactcctttgttgcgtggaatggttattgacaccctggctagcggttcggtgactacttcttttatgtgtgc 21934722  T
Q  368 taagtgtcctgttaattttggtaatgttgattttaagttggattttgtgtgtcttccgttgaagcatatggatgtgatttttggtatggattggatgttg 467  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||     
T  21934723 taagtgtcctgttaattttggtgatgttgattttgagttggatcttgtttgtcttccgttgaagcatatggatgtgatttttggtatggattggttgtta 21934822  T
Q  468 tcctttggtgttagcattaactgtttaaccaagagtataacattttcgaagtcggtatacgagttaggtgggaagttattgaccgtggaaaaagtgaaga 567  Q
     | ||||| ||||||||||| ||||| || | |||| | || ||||| ||| ||||| | ||||||| | ||||||| ||||||| |||  |||||||||    
T  21934823 gcttttggggttagcattaattgtttgactaggagtgtgactttttctaagccggtagaagagttagataggaagtttttgaccgcggagcaagtgaaga 21934922  T
Q  568 agtctttggacgatgaagctttagtgtttatgatgt 603  Q
    ||||||| || | ||| ||||  |||||||||||||    
T  21934923 agtctttagatggtgaggcttgtgtgtttatgatgt 21934958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 391 - 574
Target Start/End: Complemental strand, 23505383 - 23505202
Alignment:
Q  391 atgttgattttaagttggattttgtgtgtcttccgttgaagcatatggatgtgatttttggtatggattggatgttgtcctttggtgttagcattaactg 490  Q
    ||||||||||| |||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||  | ||||| ||||||||||| ||    
T  23505383 atgttgattttgagttggatcttgtttgtcttctgttgaagcatatggatgtgattttt-gtatggattgattgttagcttttggggttagcattaattg 23505285  T
Q  491 tttaaccaagagtataacattttcgaagtcggtatacgagttaggtgggaagttattgaccgtggaaaaagtgaagaagtcttt 574  Q
    ||| || |||||| | || ||||||||||||||| | ||||| | | ||||||| ||||||| |||  ||||||||||||||||    
T  23505284 tttgactaagagtgtgac-ttttcgaagtcggtagaagagttggataggaagttcttgaccgcggagcaagtgaagaagtcttt 23505202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 207 - 259
Target Start/End: Original strand, 14884365 - 14884417
Alignment:
Q  207 aatagtactcctttgattgcaattattgatactggtgctactcattcttttat 259  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  14884365 aatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttat 14884417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 207 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 20345276 - 20345224
Alignment:
Q  207 aatagtactcctttgattgcaattattgatactggtgctactcattcttttat 259  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  20345276 aatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttat 20345224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 207 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 22505673 - 22505621
Alignment:
Q  207 aatagtactcctttgattgcaattattgatactggtgctactcattcttttat 259  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  22505673 aatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttat 22505621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 182 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 25851091 - 25851014
Alignment:
Q  182 tcttatccgaggtatgtgttttatcaatagtactcctttgattgcaattattgatactggtgctactcattcttttat 259  Q
    ||||||| ||||||  |||||  | |||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  25851091 tcttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcatttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttat 25851014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 201 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 26056648 - 26056565
Alignment:
Q  201 tttatcaatagtactcctttgattgcaattattgatactggtgctactcattcttttatctcagctagttgtgttgaacgtttg 284  Q
    ||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||  |||| || ||||||||||| |  | | |||||||||||||||||    
T  26056648 tttatcaaccgtactcctttgattgctattattgatacgagtgcgacacattcttttatttatgttggttgtgttgaacgtttg 26056565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 207 - 252
Target Start/End: Original strand, 23078279 - 23078324
Alignment:
Q  207 aatagtactcctttgattgcaattattgatactggtgctactcatt 252  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  23078279 aatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcatt 23078324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 208 - 259
Target Start/End: Original strand, 21631774 - 21631825
Alignment:
Q  208 atagtactcctttgattgcaattattgatactggtgctactcattcttttat 259  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||| |||| ||||||    
T  21631774 atagtactcctttaattgctattattaatactggtgctacgcattgttttat 21631825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 207 - 252
Target Start/End: Original strand, 17266708 - 17266753
Alignment:
Q  207 aatagtactcctttgattgcaattattgatactggtgctactcatt 252  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| || ||||||||||||||||    
T  17266708 aatagtactcctttaattgctattatagacactggtgctactcatt 17266753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 207 - 252
Target Start/End: Original strand, 21561399 - 21561444
Alignment:
Q  207 aatagtactcctttgattgcaattattgatactggtgctactcatt 252  Q
    ||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  21561399 aatagtacttctttaattgctattattgatactggtgctacacatt 21561444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 207 - 252
Target Start/End: Original strand, 21983551 - 21983596
Alignment:
Q  207 aatagtactcctttgattgcaattattgatactggtgctactcatt 252  Q
    |||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||| ||||    
T  21983551 aatagtactcctttaattactattattgatactggtgctacacatt 21983596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 207 - 259
Target Start/End: Original strand, 14997113 - 14997165
Alignment:
Q  207 aatagtactcctttgattgcaattattgatactggtgctactcattcttttat 259  Q
    |||| |||||||||  |||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  14997113 aataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacacattgttttat 14997165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 207 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 16359514 - 16359462
Alignment:
Q  207 aatagtactcctttgattgcaattattgatactggtgctactcattcttttat 259  Q
    |||| |||||||||  |||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  16359514 aataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttat 16359462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 207 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 19772972 - 19772920
Alignment:
Q  207 aatagtactcctttgattgcaattattgatactggtgctactcattcttttat 259  Q
    |||| |||||||||  |||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  19772972 aataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttat 19772920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 207 - 259
Target Start/End: Original strand, 22330261 - 22330313
Alignment:
Q  207 aatagtactcctttgattgcaattattgatactggtgctactcattcttttat 259  Q
    |||| |||||||||  |||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  22330261 aataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttat 22330313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 207 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 27521418 - 27521366
Alignment:
Q  207 aatagtactcctttgattgcaattattgatactggtgctactcattcttttat 259  Q
    |||| |||||||||  |||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  27521418 aataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttat 27521366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 207 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 27613368 - 27613316
Alignment:
Q  207 aatagtactcctttgattgcaattattgatactggtgctactcattcttttat 259  Q
    |||| |||||||||  |||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  27613368 aataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttat 27613316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 207 - 259
Target Start/End: Original strand, 27665864 - 27665916
Alignment:
Q  207 aatagtactcctttgattgcaattattgatactggtgctactcattcttttat 259  Q
    |||| |||||||||  |||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  27665864 aataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttat 27665916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 207 - 259
Target Start/End: Original strand, 27682774 - 27682826
Alignment:
Q  207 aatagtactcctttgattgcaattattgatactggtgctactcattcttttat 259  Q
    |||| |||||||||  |||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  27682774 aataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttat 27682826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 207 - 259
Target Start/End: Original strand, 29473447 - 29473499
Alignment:
Q  207 aatagtactcctttgattgcaattattgatactggtgctactcattcttttat 259  Q
    |||| |||||||||  |||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  29473447 aataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttat 29473499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 207 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 34569506 - 34569454
Alignment:
Q  207 aatagtactcctttgattgcaattattgatactggtgctactcattcttttat 259  Q
    |||| |||||||||  |||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  34569506 aataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttat 34569454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 207 - 259
Target Start/End: Original strand, 37288870 - 37288922
Alignment:
Q  207 aatagtactcctttgattgcaattattgatactggtgctactcattcttttat 259  Q
    |||| |||||||||  |||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  37288870 aataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacacattgttttat 37288922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 207 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 40711792 - 40711740
Alignment:
Q  207 aatagtactcctttgattgcaattattgatactggtgctactcattcttttat 259  Q
    |||| |||||||||  |||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  40711792 aataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttat 40711740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 207 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 41773854 - 41773802
Alignment:
Q  207 aatagtactcctttgattgcaattattgatactggtgctactcattcttttat 259  Q
    |||| |||||||||  |||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  41773854 aataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttat 41773802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0170 (Bit Score: 350; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold0170
Description:

Target: scaffold0170; HSP #1
Raw Score: 350; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 62 - 603
Target Start/End: Complemental strand, 35339 - 34798
Alignment:
Q  62 ggagattacttgctacaattgtggagagaaaggtcatatcagtactaagtgtaccaagccgaagaaggcggcgggaaaggtgtttgctttgaatgcggaa 161  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||| || ||||||||||| |||||||||| ||| || ||||||||||||||||| |||    
T  35339 ggagatcacttgctataattgtggagagaagggtcatattagtaccaattgtaccaagccaaagaaggcggtggggaaagtgtttgctttgaatgcagaa 35240  T
Q  162 gaggtggagcagccggataatcttatccgaggtatgtgttttatcaatagtactcctttgattgcaattattgatactggtgctactcattcttttatct 261  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35239 gaggtggaacagccggataatcttatccgaggtatgtgttttatcaatagtactcctttgattgcaattattgatactggtgctactcattcttttatct 35140  T
Q  262 cagctagttgtgttgaacgtttggatttggttgtaagtcctttgttgcgtggaatggttattgacaccccggctagcggttcggtgactacttcttttat 361  Q
    | | ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35139 cggttagttgtgttgaacgtttgtatttggttgtaactcctttgttgcgtggaatggttattgacaccccggctagcggttcggtgactacttcttttat 35040  T
Q  362 gtgtgctaagtgtcctgttaattttggtaatgttgattttaagttggattttgtgtgtcttccgttgaagcatatggatgtgatttttggtatggattgg 461  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35039 gtgtgctaaatgtcctgttaattttggtaatgttgattttgagttggatcttgtttgtcttccgttgaagcatatggatgtgatttttggtatggattgg 34940  T
Q  462 atgttgtcctttggtgttagcattaactgtttaaccaagagtataacattttcgaagtcggtatacgagttaggtgggaagttattgaccgtggaaaaag 561  Q
     ||||  | ||||| ||||||||||| ||||| || | |||| | || ||||| ||||||||| | ||||||| | |||| || ||||||| |||  |||    
T  34939 ttgttagcttttggggttagcattaattgtttgactaggagtgtgactttttctaagtcggtagaagagttagataggaaattcttgaccgcggagcaag 34840  T
Q  562 tgaagaagtctttggacgatgaagctttagtgtttatgatgt 603  Q
    ||||||| || ||||| | ||||||||  |||||||||||||    
T  34839 tgaagaaatcattggatggtgaagcttgtgtgtttatgatgt 34798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0218 (Bit Score: 348; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold0218
Description:

Target: scaffold0218; HSP #1
Raw Score: 348; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 603
Target Start/End: Original strand, 940 - 1543
Alignment:
Q  1 tcagttgtcacaagtgtgggaaagtgggtcacaagggttatgaatgcaa-gagtgttgtaaaggagattacttgctacaattgtggagagaaaggtcata 99  Q
    ||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||| | ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |    
T  940 tcagttgtcacaagtgtggaaaagcaggtcacaagggttatgaatgcaaagggtggtgcaaaggagattacttgctacaattgtggagagaagggtcaca 1039  T
Q  100 tcagtactaagtgtaccaagccgaagaaggcggcgggaaaggtgtttgctttgaatgcggaagaggtggagcagccggataatcttatccgaggtatgtg 199  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  1040 ttagtactaagtgtaccaagccgaagaaggcggtgggaaaggtgtttgctttgaatgcggaggaagtggagcagctggataatcttatccgaggtatgtg 1139  T
Q  200 ttttatcaatagtactcctttgattgcaattattgatactggtgctactcattcttttatctcagctagttgtgttgaacgtttggatttggttgtaagt 299  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||| | ||||| |||| |    
T  1140 ttttatcaatagtactcctttgattgcaattatagatactggtgctactcattcttttatctcgattagttgtgttgaacgtttgaaattggtcgtaact 1239  T
Q  300 cctttgttgcgtggaatggttattgacaccccggctagcggttcggtgactacttcttttatgtgtgctaagtgtcctgttaattttggtaatgttgatt 399  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  1240 cctttgttgcggggaatggttatcgacaccttggctagcgtttcggtgactacttcttttatgtgtgctaagtgtcctattaattttggtaatgttgatt 1339  T
Q  400 ttaagttggattttgtgtgtcttccgttgaagcatatggatgtgatttttggtatggattggatgttgtcctttggtgttagcattaactgtttaaccaa 499  Q
    || |||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  | ||||| ||||||||||| ||||| || ||    
T  1340 ttgagttggatcttgtttgtcttctgttgaagcatatggatgtgatttttggtatggattggttgttagcttttggggttagcattaattgtttgactaa 1439  T
Q  500 gagtataacattttcgaagtcggtatacgagttaggtgggaagttattgaccgtggaaaaagtgaagaagtctttggacgatgaagctttagtgtttatg 599  Q
    |||| | || ||| | ||| || || |   ||||| | ||||||| ||||||| |||  |||||||||| ||||| || | ||||||||  |||||||||    
T  1440 gagtgtgacttttcctaagccgatagaacggttagataggaagttcttgaccgcggagcaagtgaagaaatctttagatggtgaagcttgtgtgtttatg 1539  T
Q  600 atgt 603  Q
    ||||    
T  1540 atgt 1543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0465 (Bit Score: 347; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold0465
Description:

Target: scaffold0465; HSP #1
Raw Score: 347; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 5 - 603
Target Start/End: Original strand, 12618 - 13216
Alignment:
Q  5 ttgtcacaagtgtgggaaagtgggtcacaagggttatgaatgcaagagtgttgtaaaggagattacttgctacaattgtggagagaaaggtcatatcagt 104  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||||     ||| ||||||||||||| ||  ||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||| |||    
T  12618 ttgtcacaagtgtgggaaaacgggtcacaagtcggctgattgcaagagtgttgcaagagagattacttgttacaattctggagagaaagttcatattagt 12717  T
Q  105 actaagtgtaccaagccgaagaaggcggcgggaaaggtgtttgctttgaatgcggaagaggtggagcagccggataatcttatccgaggtatgtgtttta 204  Q
    || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12718 accaagtgtaccaagccaaagaaggcggcgggaaaggtgattgctttgaatgcggaggaggtggagcagccggataatcttatccgaggtatgtgtttta 12817  T
Q  205 tcaatagtactcctttgattgcaattattgatactggtgctactcattcttttatctcagctagttgtgttgaacgtttggatttggttgtaagtccttt 304  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||| || |||||||||| | ||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||    
T  12818 tcaatagtactcctttgattgcaattattgataatggagatactaatacttttatctcggttagttgtgttgaacgtttgaaattggttgtaactccttt 12917  T
Q  305 gttgcgtggaatggttattgacaccccggctagcggttcggtgactacttcttttatgtgtgctaagtgtcctgttaattttggtaatgttgattttaag 404  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  12918 gttgcggggaatggttattgacaccccggctagcggtttagtgactacttcttttatgtgtgctaagtgtcctgttaattttggtaatgttgattttgag 13017  T
Q  405 ttggattttgtgtgtcttccgttgaagcatatggatgtgatttttggtatggattggatgttgtcctttggtgttagcattaactgtttaaccaagagta 504  Q
    |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||  | ||||| ||||||||||| ||||| || ||||||     
T  13018 ttggatcttgtttgtcttccgttgaagcatatggatgtgaattttggtatggattggttgttagcttttggggttagcattaattgtttgactaagagtg 13117  T
Q  505 taacattttcgaagtcggtatacgagttaggtgggaagttattgaccgtggaaaaagtgaagaagtctttggacgatgaagctttagtgtttatgatgt 603  Q
    | || ||||| ||| ||||| | ||||||| | ||||||| ||||||| |||  |||||||||| ||||| || | ||||||||  |||||||||||||    
T  13118 tgactttttctaagccggtagaagagttagataggaagtttttgaccgcggagcaagtgaagaaatctttagatggtgaagcttatgtgtttatgatgt 13216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0467 (Bit Score: 346; Significance: 0; HSPs: 2)
Name: scaffold0467
Description:

Target: scaffold0467; HSP #1
Raw Score: 346; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 3 - 572
Target Start/End: Original strand, 612 - 1181
Alignment:
Q  3 agttgtcacaagtgtgggaaagtgggtcacaagggttatgaatgcaagagtgttgtaaaggagattacttgctacaattgtggagagaaaggtcatatca 102  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| ||    ||| ||||||||||||| || |||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||| |    
T  612 agttgtcacaagtgtgggaaagcgggtcacagggcggctgattgcaagagtgttgcaagggagatcacttgttataattgtggagagaaaggtcatatta 711  T
Q  103 gtactaagtgtaccaagccgaagaaggcggcgggaaaggtgtttgctttgaatgcggaagaggtggagcagccggataatcttatccgaggtatgtgttt 202  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  712 gtaccaagtgtaccaaaccgaagaaggcggcgggaaaggtgtttgctttgaatgcggaggaggtggagcagccggataatcttatctgaggtatgtgttt 811  T
Q  203 tatcaatagtactcctttgattgcaattattgatactggtgctactcattcttttatctcagctagttgtgttgaacgtttggatttggttgtaagtcct 302  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||| | |||||||||| ||||    
T  812 tatcaatagtactcctttgattgcaattattgatactggtgctactcattcttttatctcggttagttgtattgaacgtttgaaattggttgtaactcct 911  T
Q  303 ttgttgcgtggaatggttattgacaccccggctagcggttcggtgactacttcttttatgtgtgctaagtgtcctgttaattttggtaatgttgatttta 402  Q
    |||| ||  || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||     
T  912 ttgtcgcaggggatggttattgacaccccggctagtggttcggtgactacttcttttatgtgtgctaagtgtcctgttaattttggtaatactgattttg 1011  T
Q  403 agttggattttgtgtgtcttccgttgaagcatatggatgtgatttttggtatggattggatgttgtcctttggtgttagcattaactgtttaaccaagag 502  Q
    |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  | | ||| ||||||||||| ||||| || |||||    
T  1012 agttggatcttgtttgtcttccgttgaagcatatggatgtgatttttggtatggattggttgttagcttctggggttagcattaattgtttgactaagag 1111  T
Q  503 tataacattttcgaagtcggtatacgagttaggtgggaagttattgaccgtggaaaaagtgaagaagtct 572  Q
    | |||| ||||| ||| ||||| | ||||||| |  || ||| ||||||| |||  ||||||||||||||    
T  1112 tgtaacgttttctaagccggtaaaagagttagataagaggttcttgaccgcggagcaagtgaagaagtct 1181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0467; HSP #2
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 3 - 305
Target Start/End: Original strand, 13322 - 13624
Alignment:
Q  3 agttgtcacaagtgtgggaaagtgggtcacaagggttatgaatgcaagagtgttgtaaaggagattacttgctacaattgtggagagaaaggtcatatca 102  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| ||    ||| ||||||||||||| || |||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||| |    
T  13322 agttgtcacaagtgtgggaaagcgggtcacagggcggctgattgcaagagtgttgcaagggagatcacttgttataattgtggagagaaaggtcatatta 13421  T
Q  103 gtactaagtgtaccaagccgaagaaggcggcgggaaaggtgtttgctttgaatgcggaagaggtggagcagccggataatcttatccgaggtatgtgttt 202  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  13422 gtaccaagtgtaccaaaccgaagaaggcggcgggaaaggtgtttgctttgaatgcggaagaggtggagcagccggataatcttatcagaggtatgtgttt 13521  T
Q  203 tatcaatagtactcctttgattgcaattattgatactggtgctactcattcttttatctcagctagttgtgttgaacgtttggatttggttgtaagtcct 302  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||    
T  13522 tatcaatagtactcctttgattgcaattattgatactggtgctactcattcttttatctcggttagttgtgttgaacgtttgaaattggttgtaactcct 13621  T
Q  303 ttg 305  Q
    |||    
T  13622 ttg 13624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0302 (Bit Score: 340; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold0302
Description:

Target: scaffold0302; HSP #1
Raw Score: 340; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 5 - 603
Target Start/End: Complemental strand, 1522 - 926
Alignment:
Q  5 ttgtcacaagtgtgggaaagtgggtcacaagggttatgaatgcaagagtgttgtaaaggagattacttgctacaattgtggagagaaaggtcatatcagt 104  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||    ||| ||||   |||||| ||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||    
T  1522 ttgtcacaagtgtgggaaagcgggtcacaaggcggctgattgcagaggtgttgcaagagagattacttgttacaattgtggagagaaaggtcatattagt 1423  T
Q  105 actaagtgtaccaagccgaagaaggcggcgggaaaggtgtttgctttgaatgcggaagaggtggagcagccggataatcttatccgaggtatgtgtttta 204  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  1422 actaagtgtaccaagccgaagaaggcagcggcaaaggtgtttgctttgaatgcggaggagctggagcagctggataatcttatccgaggtatgtgtttta 1323  T
Q  205 tcaatagtactcctttgattgcaattattgatactggtgctactcattcttttatctcagctagttgtgttgaacgtttggatttggttgtaagtccttt 304  Q
    |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||    
T  1322 tcaatagtactcttttgatttcaattattgatactggtgctactcattcttttatctcggttagttgtgttgaacgtttgtttttggttgtaactccttt 1223  T
Q  305 gttgcgtggaatggttattgacaccccggctagcggttcggtgactacttcttttatgtgtgctaagtgtcctgttaattttggtaatgttgattttaag 404  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||    
T  1222 gttgcggggaatggttattgacaccccggctagcggttcggtgactacttcttttatgtgtgctaagtgtcttgttaattttggtgatgttgattttgag 1123  T
Q  405 ttggattttgtgtgtcttccgttgaagcatatggatgtgatttttggtatggattggatgttgtcctttggtgttagcattaactgtttaaccaagagta 504  Q
    |||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  | ||||| ||||||||||| ||||| || | ||||     
T  1122 ttggatcttgtttctcttccgttgaagcatatggatgtgatttttggtatggattggttgttagcttttggggttagcattaattgtttgactaggagtg 1023  T
Q  505 taacattttcgaagtcggtatacgagttaggtgggaagttattgaccgtggaaaaagtgaagaagtctttggacgatgaagctttagtgtttatgatgt 603  Q
    | ||  |||| ||| || || | || |||| | ||||||| ||||||| |||  |||||||||| || |||||||  |||||||  |||||||||||||    
T  1022 tgac--tttctaagccgatagaagaattagataggaagttcttgaccgcggagcaagtgaagaaatcattggacggagaagcttgtgtgtttatgatgt 926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120 (Bit Score: 337; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold0120
Description:

Target: scaffold0120; HSP #1
Raw Score: 337; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 3 - 550
Target Start/End: Complemental strand, 25492 - 24944
Alignment:
Q  3 agttgtcacaagtgtgggaaagtgggtcacaagggttatgaatgcaagagtgttgtaaaggagattacttgctacaattgtggagagaaaggtcatatca 102  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |  ||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |    
T  25492 agttgtcacaagtgtgggaaagcgggtcacaaggctgctgagtgcaagagttttgcaaaggagattacttgctacaattgtggagagaagggtcatatta 25393  T
Q  103 gtactaagtgtaccaagccgaagaaggcggcgggaaaggtgtttgctttgaatgcggaagaggtggagcagccggataatcttatccgaggtatgtgttt 202  Q
    ||||||||||||| |||||| ||||||||||  |||||| |||||||||||||||||| ||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  25392 gtactaagtgtacaaagccggagaaggcggcaagaaaggcgtttgctttgaatgcggaggaactggagcaaccggataatcttatccgaggtatgtgttt 25293  T
Q  203 t-atcaatagtactcctttgattgcaattattgatactggtgctactcattcttttatctcagctagttgtgttgaacgtttggatttggttgtaagtcc 301  Q
    | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||| |||||| | |||||||||| |||    
T  25292 ttatcaatagtactcctttaattgcaattattgatactggtgctactcattcttttatctcggttagttatgttgagcgtttgaaattggttgtaactcc 25193  T
Q  302 tttgttgcgtggaatggttattgacaccccggctagcggttcggtgactacttcttttatgtgtgctaagtgtcctgttaattttggtaatgttgatttt 401  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  25192 tttgttgcggggaatggttattgacaccccggctagcggatcggtgactacttcttttatgggtgctaaatgtcctattaattttggtaatgttgatttt 25093  T
Q  402 aagttggattttgtgtgtcttccgttgaagcatatggatgtgatttttggtatggattggatgttgtcctttggtgttagcattaactgtttaaccaaga 501  Q
     |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || ||||| ||||||||||| ||||| || ||||    
T  25092 gagttggatcttgtgtgtcttccgttaaagcatatggatgtgatttttggtatggattggttgttatcttttggggttagcattaattgtttgacgaaga 24993  T
Q  502 gtataacattttcgaagtcggtatacgagttaggtgggaagttattgac 550  Q
    || |||| ||||| ||| ||||  | ||||||| | ||||||| |||||    
T  24992 gtgtaactttttcaaagccggttgaagagttagataggaagttcttgac 24944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0610 (Bit Score: 329; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold0610
Description:

Target: scaffold0610; HSP #1
Raw Score: 329; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 3 - 603
Target Start/End: Original strand, 3894 - 4493
Alignment:
Q  3 agttgtcacaagtgtgggaaagtgggtcacaagggttatgaatgcaagagtgttgtaaaggagattacttgctacaattgtggagagaaaggtcatatca 102  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |  ||| ||||||||| |||  | |||  ||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  3894 agttgtcacaagtgtgggaaagcgggtcacaaggctgctgagtgcaagagtattgcgagggatgttacttgttacaattgtggtgagaagggtcatatca 3993  T
Q  103 gtactaagtgtaccaagccgaagaaggcggcgggaaaggtgtttgctttgaatgcggaagaggtggagcagccggataatcttatccgaggtatgtgttt 202  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||| ||||| ||||||||| |||  |||||||||||| ||| |||||||||    
T  3994 gtactaagtgtaccaagccgaagaaggcggcgggaaaagtgtcttctttgaacgcggaggaggtggagtagctagataatcttatctgagctatgtgttt 4093  T
Q  203 tatcaatagtactcctttgattgcaattattgatactggtgctactcattcttttatctcagctagttgtgttgaacgtttggatttggttgtaagtcct 302  Q
     |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||   || ||||||||| |||||| | |||||||||| ||||    
T  4094 -atcaatagtactccgttgattgcaattatcgatactggtgctactcattcttttatctcgattaattgtgttgagcgtttgaaattggttgtaactcct 4192  T
Q  303 ttgttgcgtggaatggttattgacaccccggctagcggttcggtgactacttcttttatgtgtgctaagtgtcctgttaattttggtaatgttgatttta 402  Q
    |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||     
T  4193 ttgttgcggggaatggttattgataccccggctagcggttcggtgactacttcttttatgtgtgctaaatgccctgttaattttggtaatgttgactttg 4292  T
Q  403 agttggattttgtgtgtcttccgttgaagcatatggatgtgatttttggtatggattggatgttgtcctttggtgttagcattaactgtttaaccaagag 502  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || ||||| ||||||||||| ||||| || |||||    
T  4293 agttggatcttgtgtgtcttccgttgaagcatatggatgtgatttttggtatggattggttgttatcttttggggttagcattaattgtttgactaagag 4392  T
Q  503 tataacattttcgaagtcggtatacgagttaggtgggaagttattgaccgtggaaaaagtgaagaagtctttggacgatgaagctttagtgtttatgatg 602  Q
    | |||| ||||| ||| ||||| | ||||||| | |||||||  ||||||  ||| |||||||||||||||| || | ||||||||  ||||||||||||    
T  4393 tgtaactttttctaagccggtagaggagttagataggaagttcatgaccgctgaacaagtgaagaagtctttagatggtgaagcttgtgtgtttatgatg 4492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0673 (Bit Score: 312; Significance: 1e-175; HSPs: 1)
Name: scaffold0673
Description:

Target: scaffold0673; HSP #1
Raw Score: 312; E-Value: 1e-175
Query Start/End: Original strand, 84 - 603
Target Start/End: Original strand, 5376 - 5895
Alignment:
Q  84 ggagagaaaggtcatatcagtactaagtgtaccaagccgaagaaggcggcgggaaaggtgtttgctttgaatgcggaagaggtggagcagccggataatc 183  Q
    |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||    
T  5376 ggagagaaaggtcaaattagtactaagtgtaccaagccgaagaaggcggcgggaaaagtgtttgctttgaatgcggaggaggcggagcaaccggataatc 5475  T
Q  184 ttatccgaggtatgtgttttatcaatagtactcctttgattgcaattattgatactggtgctactcattcttttatctcagctagttgtgttgaacgttt 283  Q
    |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||| |||||| |||||    
T  5476 ttattcgtggtatgtgttttatcaatagtactcctttgattgcaattattgatactggtgctactcattcttttatcttggttagttatgttgagcgttt 5575  T
Q  284 ggatttggttgtaagtcctttgttgcgtggaatggttattgacaccccggctagcggttcggtgactacttcttttatgtgtgctaagtgtcctgttaat 383  Q
    | | |||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5576 gaaattggttataactcctttgttgcggggaatggttattgacacccctgctagcagttcggtgactacttcttttatgtgtgctaagtgtcctgttaat 5675  T
Q  384 tttggtaatgttgattttaagttggattttgtgtgtcttccgttgaagcatatggatgtgatttttggtatggattggatgttgtcctttggtgttagca 483  Q
    |||||||||||||||||| | || ||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || ||||| |||||||    
T  5676 tttggtaatgttgattttgaatttgatcttgtttgtcttctgttgaagcatatggatgtgatttttggtatggattggttgttatcttttggggttagca 5775  T
Q  484 ttaactgtttaaccaagagtataacattttcgaagtcggtatacgagttaggtgggaagttattgaccgtggaaaaagtgaagaagtctttggacgatga 583  Q
    |||| ||||| || |||||| |||| ||||| ||| ||||| | ||||||| | | ||||| ||||||| |||  |||||||||| ||||| |||| |||    
T  5776 ttaattgtttgactaagagtgtaactttttctaagccggtagaagagttagatagaaagttcttgaccgcggagcaagtgaagaaatctttagacggtga 5875  T
Q  584 agctttagtgtttatgatgt 603  Q
    |||||  ||||| |||||||    
T  5876 agcttgtgtgttcatgatgt 5895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0266 (Bit Score: 311; Significance: 1e-175; HSPs: 1)
Name: scaffold0266
Description:

Target: scaffold0266; HSP #1
Raw Score: 311; E-Value: 1e-175
Query Start/End: Original strand, 5 - 552
Target Start/End: Original strand, 6853 - 7401
Alignment:
Q  5 ttgtcacaagtgtgggaaagtgggtcacaagggttatgaatgcaagagtgttgtaaaggagattacttgctacaattgtggagagaaaggtcatatc--a 102  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||||     ||| ||||||||||||| ||  |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||   |    
T  6853 ttgtcacaagtgtgggaaaacgggtcacaagtcggctgattgcaagagtgttgcaagagagattacttgctataattgtggagagaagggtcatatatta 6952  T
Q  103 gtactaagtgtaccaagccgaagaaggcggcgggaaaggtgtttgctttgaatgcggaagaggtggagcagccggataatcttatccgaggtatgtgttt 202  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6953 gtaccaagtgtaccaagccgaagaaggcggcgggaaaggtgtttactttgaatgtagaggaggtggagcagccggataatcttatccgaggtatgtgttt 7052  T
Q  203 tatcaatagtactcctttgattgcaattattgatactggtgctactcattcttttatctcagctagttgtgttgaacgtttggatttggttgtaagtcct 302  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||| ||||| |||||| | |||||||||| ||||    
T  7053 tatcaatagtactcctttgattgcaattattgatactggtgctacttattcttttatctcggttagttgcgttgatcgtttgaaattggttgtaactcct 7152  T
Q  303 ttgttgcgtggaatggttattgacaccccggctagcggttcggtgactacttcttttatgtgtgctaagtgtcctgttaattttggtaatgttgatttta 402  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||     
T  7153 ttgttgcggggaatggttattgacaccccggctagcggttcagtgactacttc-tttatgtgtgctaaatgtccagttaattttggtgatgttgattttg 7251  T
Q  403 agttggattttgtgtgtcttccgttgaagcatatggatgtgatttttggtatggattggatgttgtcctttggtgttagcattaactgtttaaccaagag 502  Q
    |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||| ||||| ||||| ||||| || | |||    
T  7252 agttggatcttgtttgtcttccgttgaagcatatggatgtgatttttggtatggattggttgttggcttttggggttagtattaattgtttgactaggag 7351  T
Q  503 tataacattttcgaagtcggtatacgagttaggtgggaagttattgaccg 552  Q
    | | || | ||| ||| ||||| | ||||||| | ||||||| |||||||    
T  7352 tgtgacttattctaagccggtagaagagttagataggaagttcttgaccg 7401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0962 (Bit Score: 299; Significance: 1e-168; HSPs: 1)
Name: scaffold0962
Description:

Target: scaffold0962; HSP #1
Raw Score: 299; E-Value: 1e-168
Query Start/End: Original strand, 11 - 544
Target Start/End: Complemental strand, 2876 - 2346
Alignment:
Q  11 caagtgtgggaaagtgggtcacaagggttatgaatgcaagagtgttgtaaaggagattacttgctacaattgtggagagaaaggtcatatcagtactaag 110  Q
    |||||||||||| | |||||||| || || ||| || |||| |||||  |||||  ||||||| ||||||||||| ||   |||||||  ||||| ||||    
T  2876 caagtgtgggaaggcgggtcacacggcttttgagtgtaagaatgttgcgaaggatgttacttgttacaattgtggtgaagcaggtcattacagtaataag 2777  T
Q  111 tgtaccaagccgaagaaggcggcgggaaaggtgtttgctttgaatgcggaagaggtggagcagccggataatcttatccgaggtatgtgttttatcaata 210  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||||| || || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2776 tgtaccaagctgaagaaggcggcgggaaaagtgtttgcattgaatgcagaggaagtggagcagtcggataatcttatccgaggtatgtgttttatcaata 2677  T
Q  211 gtactcctttgattgcaattattgatactggtgctactcattcttttatctcagctagttgtgttgaacgtttggatttggttgtaagtcctttgttgcg 310  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||  |||||| |||||||||||| ||| || |||||    
T  2676 atactcctttgattgcaattattgatactggtgctactcattcttttatctcggttagttgtgttg--cgtttgaatttggttgtaactccgtttttgcg 2579  T
Q  311 tggaatggttattgacaccccggctagcggttcggtgactacttcttttatgtgtgctaagtgtcctgttaattttggtaatgttgattttaagttggat 410  Q
     || ||||| || ||||||||| ||||  |||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  2578 agggatggtcatcgacaccccgactagttgttcggtgactacttccttagtgtgtgctaagtgtcctattaattttggtaattttgattttgagttggat 2479  T
Q  411 tttgtgtgtcttccgttgaagcatatggatgtgatttttggtatggattggatgttgtcctttggtgttagcattaactgtttaaccaagagtataacat 510  Q
     ||||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2478 cttgtgtgtctt-cgttaaagcatatgggtgtgatttttggtatggattggatgttgtcttctggtgttagcattaactgtttaaccaagagtataacat 2380  T
Q  511 tttcgaagtcggtatacgagttaggtgggaagtt 544  Q
    |||||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  2379 tttcgaagtcggtagatgagttaggtgggaagtt 2346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0162 (Bit Score: 288; Significance: 1e-161; HSPs: 2)
Name: scaffold0162
Description:

Target: scaffold0162; HSP #1
Raw Score: 288; E-Value: 1e-161
Query Start/End: Original strand, 60 - 603
Target Start/End: Complemental strand, 16166 - 15623
Alignment:
Q  60 aaggagattacttgctacaattgtggagagaaaggtcatatcagtactaagtgtaccaagccgaagaaggcggcgggaaaggtgtttgctttgaatgcgg 159  Q
    |||||||| ||||| || |||||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||   ||||||| ||||||||||||||| | |    
T  16166 aaggagatcacttgttataattgtggagagaagggccatattagtaccaagtgtaccaagccgaataaggtaacgggaaaagtgtttgctttgaattcag 16067  T
Q  160 aagaggtggagcagccggataatcttatccgaggtatgtgttttatcaatagtactcctttgattgcaattattgatactggtgctactcattcttttat 259  Q
    | ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||    
T  16066 aggaggtggagcaaccgcataatcttatccgaggtatgtgttttatcaatagtactcctttgattgcaattattgatattggtgttacttattcttttat 15967  T
Q  260 ctcagctagttgtgttgaacgtttggatttggttgtaagtcctttgttgcgtggaatggttattgacaccccggctagcggttcggtgactacttctttt 359  Q
    ||| | ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||    
T  15966 ctcggttagttgtgttgaacgtttgtatttggttgtaactcctttgttgtttggaatggttattgacaccctgtctagcggttcggtgactacttctttt 15867  T
Q  360 atgtgtgctaagtgtcctgttaattttggtaatgttgattttaagttggattttgtgtgtcttccgttgaagcatatggatgtgatttttggtatggatt 459  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  15866 atgtgtgctaaatgtcctgttaattttggtaatgctgattttgagttggatcttgtttgccttccgttgaagcatatggatgtgagttttggtatggatt 15767  T
Q  460 ggatgttgtcctttggtgttagcattaactgtttaaccaagagtataacattttcgaagtcggtatacgagttaggtgggaagttattgaccgtggaaaa 559  Q
    || ||||  | ||||| | ||||||||| ||||| || |||||| |||| ||||| ||| ||||| | ||||||| |  || ||| ||||||| |||  |    
T  15766 ggttgttagcttttggggctagcattaattgtttgactaagagtgtaactttttctaagccggtagaagagttagataagaggttcttgaccgcggagca 15667  T
Q  560 agtgaagaagtctttggacgatgaagctttagtgtttatgatgt 603  Q
    ||||||||||||| | || | ||||||||| ||||| |||||||    
T  15666 agtgaagaagtctctagatggtgaagcttttgtgttcatgatgt 15623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0162; HSP #2
Raw Score: 81; E-Value: 8e-38
Query Start/End: Original strand, 391 - 603
Target Start/End: Original strand, 10553 - 10765
Alignment:
Q  391 atgttgattttaagttggattttgtgtgtcttccgttgaagcatatggatgtgatttttggtatggattggatgttgtcctttggtgttagcattaactg 490  Q
    ||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||  ||||  | ||||| ||||||||||| ||    
T  10553 atgttgattttgagttggatcttgtatgtcttccgttgaagaatatggatgtaatttttggtatggattgattgttagcttttggggttagcattaattg 10652  T
Q  491 tttaaccaagagtataacattttcgaagtcggtatacgagttaggtgggaagttattgaccgtggaaaaagtgaagaagtctttggacgatgaagcttta 590  Q
    ||| || |||||| | || ||||| ||| ||||| | ||||||| | ||||||| |||| || |||| |||||||||| | ||| |||| ||||||||      
T  10653 tttgactaagagtgtgactttttctaagccggtagaagagttagataggaagttcttgaacgcggaacaagtgaagaaatttttagacggtgaagcttgt 10752  T
Q  591 gtgtttatgatgt 603  Q
    |||||||||||||    
T  10753 gtgtttatgatgt 10765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0112 (Bit Score: 216; Significance: 1e-118; HSPs: 1)
Name: scaffold0112
Description:

Target: scaffold0112; HSP #1
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 93 - 512
Target Start/End: Complemental strand, 3722 - 3303
Alignment:
Q  93 ggtcatatcagtactaagtgtaccaagccgaagaaggcggcgggaaaggtgtttgctttgaatgcggaagaggtggagcagccggataatcttatccgag 192  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||   ||||||||| || |||||||| || |||||||||||| |||    
T  3722 ggtcatttcagtactaagtgtaccaagccgaagaaggcggaggaaaaagtgtttgcaccgaatgcggatgaagtggagcaaccagataatcttatctgag 3623  T
Q  193 gtatgtgttttatcaatagtactcctttgattgcaattattgatactggtgctactcattcttttatctcagctagttgtgttgaacgtttggatttggt 292  Q
    | |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| | |||||||||| |||||||| ||||| |    
T  3622 gaacatgttttatcaatagtactcctttgattgcaattattgatattggtgctactcattctttcatctcggttagttgtgttcaacgtttgaatttgtt 3523  T
Q  293 tgtaagtcctttgttgcgtggaatggttattgacaccccggctagcggttcggtgactacttcttttatgtgtgctaagtgtcctgttaattttggtaat 392  Q
    || || ||  |||||||| || ||||| || ||||||||| | || || || ||||||||||| ||   |||||||||||||| ||||  |||||||| |    
T  3522 tggaactctgttgttgcgagggatggtcatcgacaccccgaccagtggctcagtgactacttcgttagggtgtgctaagtgtcttgttcgttttggtagt 3423  T
Q  393 gttgattttaagttggattttgtgtgtcttccgttgaagcatatggatgtgatttttggtatggattggatgttgtcctttggtgttagcattaactgtt 492  Q
    ||||||||  |||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |    
T  3422 gttgatttagagttggatcttgtgtgtctttcgttgaagcacatggatgtgatttttggtatggattggatgttgtcttttggtgttagcattaactgct 3323  T
Q  493 taaccaagagtataacattt 512  Q
    ||||||||||||||| ||||    
T  3322 taaccaagagtataatattt 3303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0138 (Bit Score: 194; Significance: 1e-105; HSPs: 1)
Name: scaffold0138
Description:

Target: scaffold0138; HSP #1
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 3 - 319
Target Start/End: Original strand, 25691 - 26008
Alignment:
Q  3 agttgtcacaagtgtgggaaagtgggtcacaagggttatgaatgcaagagtgttgtaaaggagattacttgctacaattgtggagagaaaggtcatatca 102  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |  ||| |||||| |||||| || |||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||| |    
T  25691 agttgtcacaagtgtgggaaagcgggtcacaaggctactgattgcaagggtgttgcaagggatgttacttgttacaattgtggagagaaaggtcatatta 25790  T
Q  103 gtactaagtgtaccaagccgaagaaggcggcgggaaaggtgtttgctttgaatgcggaagaggtggagcagccggataatcttatccgaggtatgtgttt 202  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25791 gtactaagtgtaccaagccgaagaaggcggcgggaaaggtgtttgctttgaaagcagaagaagtggagcagccggataatcttatccgaggtatgtgttt 25890  T
Q  203 tatcaatagtactcctttgattgcaattattgatactggtgctactca-ttcttttatctcagctagttgtgttgaacgtttggatttggttgtaagtcc 301  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||| | |||||||||| || ||||||||| | |||||| ||||| |||||| | ||| |||||| |||    
T  25891 tatcaatagtactcatttgattgcaattattgatattagtgctactcattttttttatctcggttagttgcgttgagcgtttgaaattgattgtaactcc 25990  T
Q  302 tttgttgcgtggaatggt 319  Q
     ||||||||||| |||||    
T  25991 gttgttgcgtgggatggt 26008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0462 (Bit Score: 171; Significance: 2e-91; HSPs: 2)
Name: scaffold0462
Description:

Target: scaffold0462; HSP #1
Raw Score: 171; E-Value: 2e-91
Query Start/End: Original strand, 3 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 3016 - 2703
Alignment:
Q  3 agttgtcacaagtgtgggaaagtgggtcacaagggttatgaatgcaagagtgttgtaaaggagattacttgctacaattgtggagagaaaggtcatatca 102  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||||| |||| |  ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |    
T  3016 agttgtcacaagtgcgggaaagcgggtcataaggctgctgagtgcaagagtgttggaaaggagattacttgctacaattgtggagagaagggtcatatta 2917  T
Q  103 gtactaagtgtaccaagccgaagaaggcggcgggaaaggtgtttgctttgaatgcggaagaggtggagcagccggataatcttatccgaggtatgtgttt 202  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||     
T  2916 gtactaagtgtaccaagccgaagaaggcggcgagaaaggtgtttgctttgaatgcggaggaagtggagcaaccggataatcttatccgaggtctgtgttg 2817  T
Q  203 tatcaatagta------ctcctttgattgcaattattgatactggtgctactcattcttttatctcagctagttgtgttgaacgtttggatttggttgta 296  Q
    |   |||||||        ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| | |||| | |||| ||||    
T  2816 tgcgaatagtagcatagtacctttgattgcaattattgataccggtgctactcattcttttatctcggttagttgtgttgagcttttgaaattggctgta 2717  T
Q  297 agtcctttgttgcg 310  Q
    | ||||||||||||    
T  2716 actcctttgttgcg 2703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0462; HSP #2
Raw Score: 126; E-Value: 1e-64
Query Start/End: Original strand, 346 - 603
Target Start/End: Complemental strand, 2692 - 2435
Alignment:
Q  346 tgactacttcttttatgtgtgctaagtgtcctgttaattttggtaatgttgattttaagttggattttgtgtgtcttccgttgaagcatatggatgtgat 445  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  2692 tgactacttcttttatgtgcgctaagtgtcctgttaattttggtaatgttgattttgagttagatcttgtgtgttttccgttaaagcatatggatgtgat 2593  T
Q  446 ttttggtatggattggatgttgtcctttggtgttagcattaactgtttaaccaagagtataacattttcgaagtcggtatacgagttaggtgggaagtta 545  Q
    |||||||||||||||| ||||  | ||||| ||||||||||| ||||| || |||||| |||| ||||||||| ||||| | ||||||| | | |||||     
T  2592 ttttggtatggattggttgttagcttttggggttagcattaattgtttcactaagagtgtaactttttcgaagccggtagaagagttagatagaaagttc 2493  T
Q  546 ttgaccgtggaaaaagtgaagaagtctttggacgatgaagctttagtgtttatgatgt 603  Q
    |||| || |||  |||||||||||||||| || | ||||||||  ||||| |||||||    
T  2492 ttgatcgcggagcaagtgaagaagtctttagatggtgaagcttgtgtgttcatgatgt 2435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0342 (Bit Score: 133; Significance: 7e-69; HSPs: 1)
Name: scaffold0342
Description:

Target: scaffold0342; HSP #1
Raw Score: 133; E-Value: 7e-69
Query Start/End: Original strand, 363 - 603
Target Start/End: Complemental strand, 3436 - 3196
Alignment:
Q  363 tgtgctaagtgtcctgttaattttggtaatgttgattttaagttggattttgtgtgtcttccgttgaagcatatggatgtgatttttggtatggattgga 462  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  3436 tgtggtaagtgtcctgttaattttggtaatgttgattttgagttggatcttgtgtgtcttccattgaagcatatgaatgtgatttttggtatggattgga 3337  T
Q  463 tgttgtcctttggtgttagcattaactgtttaaccaagagtataacattttcgaagtcggtatacgagttaggtgggaagttattgaccgtggaaaaagt 562  Q
    |||| || ||||| ||||||||||| ||||| ||||||||| |||| ||||||||| ||||| | ||| ||| | ||||||| || |||| |||  ||||    
T  3336 tgttatcttttggggttagcattaattgtttgaccaagagtttaacgttttcgaagccggtagaagagctagataggaagttcttaaccgcggagcaagt 3237  T
Q  563 gaagaagtctttggacgatgaagctttagtgtttatgatgt 603  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||  ||||| |||||||    
T  3236 gaagaagtctttggacggtgaagcttgtgtgttcatgatgt 3196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009 (Bit Score: 130; Significance: 5e-67; HSPs: 1)
Name: scaffold0009
Description:

Target: scaffold0009; HSP #1
Raw Score: 130; E-Value: 5e-67
Query Start/End: Original strand, 5 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 96838 - 96637
Alignment:
Q  5 ttgtcacaagtgtgggaaagtgggtcacaaggg-ttatgaatgcaagagtgttgtaaaggagattacttgctacaattgtggagagaaaggtcatatcag 103  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| || || |||||||||| |||||| ||| ||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  96838 ttgtcacaagtgtgggaaagcgggtcacaaaggcttttgaatgcaagggtgttgcaaatgatgttacttgctacaattgtggagagaagggtcatatcag 96739  T
Q  104 tactaagtgtaccaagccgaagaaggcggcgggaaaggtgtttgctttgaatgcggaagaggtggagcagccggataatcttatccgaggtatgtgtttt 203  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||| |||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  96738 tactaagtgtaccaagccgaagaaggcggcgggaaaaatgttttctttgaatacggaggaagtggagcagccggattatcttatccgaggtatgtgtttt 96639  T
Q  204 at 205  Q
    ||    
T  96638 at 96637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0233 (Bit Score: 119; Significance: 2e-60; HSPs: 1)
Name: scaffold0233
Description:

Target: scaffold0233; HSP #1
Raw Score: 119; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 92 - 454
Target Start/End: Original strand, 20806 - 21168
Alignment:
Q  92 aggtcatatcagtactaagtgtaccaagccgaagaaggcggcgggaaaggtgtttgctttgaatgcggaagaggtggagcagccggataatcttatccga 191  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||| | |  || || || ||||| || || || ||||||  || ||||||||||||||||    
T  20806 aggtcatatcagtaccaagtgaaccaagccgaaaaaggcggcgtggagagttttcgcattgaacgcagaggaagtggagttgctggataatcttatccga 20905  T
Q  192 ggtatgtgttttatcaatagtactcctttgattgcaattattgatactggtgctactcattcttttatctcagctagttgtgttgaacgtttggatttgg 291  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||||||||||| |||| |||||||| || |||||||||||||  ||||  ||||||||||||| |||||| ||||||    
T  20906 ggtatgtgtttcatcaatagtgctcctttgattgtaattgttgatactagttctactcattctttcttctcgactagttgtgttgatcgtttgaatttgg 21005  T
Q  292 ttgtaagtcctttgttgcgtggaatggttattgacaccccggctagcggttcggtgactacttcttttatgtgtgctaagtgtcctgttaattttggtaa 391  Q
    | |||| ||| || |   | || | ||| || || |||||| | |  || |||||||||||||| ||||  |||||||||||||| |||| ||||||||     
T  21006 tagtaactccgttatcaggaggtaaggtcatcgataccccgaccaatgggtcggtgactacttcctttagttgtgctaagtgtcccgttagttttggtag 21105  T
Q  392 tgttgattttaagttggattttgtgtgtcttccgttgaagcatatggatgtgatttttggtat 454  Q
     || |||||| ||||| || |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  21106 cgtcgattttgagttgtatcttgtttgtcttctgttgaagcatatggatgtgattttcggtat 21168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0058 (Bit Score: 116; Significance: 1e-58; HSPs: 1)
Name: scaffold0058
Description:

Target: scaffold0058; HSP #1
Raw Score: 116; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 75 - 511
Target Start/End: Complemental strand, 77671 - 77229
Alignment:
Q  75 tacaattgtggagagaaaggtcatatcagtactaagtgtaccaagccgaagaaggcggcgggaaaggtgtttgctttgaatgcggaagaggtggagcagc 174  Q
    ||||||||||| ||   ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||| | |  || ||||| ||||| || || ||||||||||| |    
T  77671 tacaattgtggggaagcaggtcatatcagtaccaagtgtaccaagctgaagaaagcggcgtggagagtttttgcattgaacgctgaggaggtggagcaac 77572  T
Q  175 cggataatcttatccgaggtatgtgttttatcaatagtactcctttgattgcaattattgatactggtgctactcattcttttatctcagctagttgtgt 274  Q
    | |||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||||| |||||||| |||||   ||||| |||    
T  77571 cagataatctaatccgagatatgtattttatcaatagtactcctttgtttggaattgttgatactggtgctacgcattctttcatctcgcttagttatgt 77472  T
Q  275 tgaacgtttggatttggttgtaagtcctttgttgcgtggaatggttattgacaccccggctagcggttcggtgactacttcttttatgtgtgctaagtgt 374  Q
    |||||||||| |||||||| ||| ||  || ||    || ||||| || |||||||  || |  || | | |||||||||| ||  | |||||||||| |    
T  77471 tgaacgtttgaatttggttttaactctgttttttaaagggatggtcatcgacaccctagccaatggcttgatgactacttccttagtttgtgctaagttt 77372  T
Q  375 cctgttaattttggtaatgttgattttaagttggattttgtgtgtcttccg------ttgaagcatatggatgtgatttttggtatggattggatgttgt 468  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| ||||| || || | |   |  ||      |||  ||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||| |    
T  77371 cctgttaattttggtaacgttgattttgagttgaatgttattttggtaacgttgtcattggtgcaaatggatgttattttcggtatggattggatgttat 77272  T
Q  469 cctttggtgttagcattaactgtttaaccaagagtataacatt 511  Q
    ||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  77271 cctttggagttaacattaactatttaaccaagagtataacatt 77229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0139 (Bit Score: 111; Significance: 1e-55; HSPs: 2)
Name: scaffold0139
Description:

Target: scaffold0139; HSP #1
Raw Score: 111; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 361 - 603
Target Start/End: Original strand, 17697 - 17938
Alignment:
Q  361 tgtgtgctaagtgtcctgttaattttggtaatgttgattttaagttggattttgtgtgtcttccgttgaagcatatggatgtgatttttggtatggattg 460  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17697 tgtgtgctaagtgtcctgttaatttcggtaatgttgatttta-gttgaatcttgtgtgtcttccattgaagcatatggatgtgatttttggtatggattg 17795  T
Q  461 gatgttgtcctttggtgttagcattaactgtttaaccaagagtataacattttcgaagtcggtatacgagttaggtgggaagttattgaccgtggaaaaa 560  Q
    | ||||  | ||||| ||||||||||| ||||| || |||||| | || ||||| ||| ||||| | ||||||| |  |||||| |||||||| ||  ||    
T  17796 gttgttagcttttggggttagcattaattgtttgactaagagtgtgactttttctaagccggtagaagagttagataagaagtttttgaccgtagagcaa 17895  T
Q  561 gtgaagaagtctttggacgatgaagctttagtgtttatgatgt 603  Q
    |||||||||||||| || | ||||||||  |||||||||||||    
T  17896 gtgaagaagtctttagatggtgaagcttgtgtgtttatgatgt 17938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0139; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 207 - 252
Target Start/End: Original strand, 19164 - 19209
Alignment:
Q  207 aatagtactcctttgattgcaattattgatactggtgctactcatt 252  Q
    |||||||||||||| ||| | ||||| |||||||||||||||||||    
T  19164 aatagtactcctttaattactattatagatactggtgctactcatt 19209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0615 (Bit Score: 110; Significance: 4e-55; HSPs: 1)
Name: scaffold0615
Description:

Target: scaffold0615; HSP #1
Raw Score: 110; E-Value: 4e-55
Query Start/End: Original strand, 62 - 223
Target Start/End: Original strand, 9422 - 9583
Alignment:
Q  62 ggagattacttgctacaattgtggagagaaaggtcatatcagtactaagtgtaccaagccgaagaaggcggcgggaaaggtgtttgctttgaatgcggaa 161  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||||| | |||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||   ||    
T  9422 ggagatcacttgctacaattgtggggagaaggatcatattagtaccaattgtaccaagccgaagaaggcggcggggaaggtgtttgctttgaatgaaaaa 9521  T
Q  162 gaggtggagcagccggataatcttatccgaggtatgtgttttatcaatagtactcctttgat 223  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  9522 gaggtggaacagccggataatcttatccgaggtatgtgttttatcaatagtactcatttgat 9583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0092 (Bit Score: 102; Significance: 2e-50; HSPs: 1)
Name: scaffold0092
Description:

Target: scaffold0092; HSP #1
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 391 - 588
Target Start/End: Complemental strand, 997 - 800
Alignment:
Q  391 atgttgattttaagttggattttgtgtgtcttccgttgaagcatatggatgtgatttttggtatggattggatgttgtcctttggtgttagcattaactg 490  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| || ||||| ||||||||||| ||    
T  997 atgttgattttgagttggatcttgtgtgtcttccgttgaagcatatggatgtgatttttggtatggattagttgttatcttttggggttagcattaattg 898  T
Q  491 tttaaccaagagtataacattttcgaagtcggtatacgagttaggtgggaagttattgaccgtggaaaaagtgaagaagtctttggacgatgaagctt 588  Q
    ||| || |||||| |||| |||||||||  |||| | ||||||| | ||||||| ||||||| |||  |||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  897 tttgactaagagtgtaactttttcgaagctggtagaagagttagataggaagttcttgaccgcggagcaagtgaagaagtctttagacgttgaagctt 800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028 (Bit Score: 100; Significance: 4e-49; HSPs: 4)
Name: scaffold0028
Description:

Target: scaffold0028; HSP #1
Raw Score: 100; E-Value: 4e-49
Query Start/End: Original strand, 363 - 574
Target Start/End: Original strand, 93791 - 94002
Alignment:
Q  363 tgtgctaagtgtcctgttaattttggtaatgttgattttaagttggattttgtgtgtcttccgttgaagcatatggatgtgatttttggtatggattgga 462  Q
    |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      
T  93791 tgtgttaagtgtcctgttaatttcggtaatgttgatttggagttggatcttgtttgtcttccgttgaagcatatggatgtgatttttggtatggattgat 93890  T
Q  463 tgttgtcctttggtgttagcattaactgtttaaccaagagtataacattttcgaagtcggtatacgagttaggtgggaagttattgaccgtggaaaaagt 562  Q
    ||||  | ||||| ||||||||||| ||||| || |||||| | || ||||| ||| ||||| | ||||| | | ||||||| |||||||||||  ||||    
T  93891 tgttaacttttggggttagcattaattgtttgactaagagtgtgactttttcaaagccggtagaagagttggataggaagttcttgaccgtggagcaagt 93990  T
Q  563 gaagaagtcttt 574  Q
    ||||||||||||    
T  93991 gaagaagtcttt 94002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #2
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 207 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 18046 - 18001
Alignment:
Q  207 aatagtactcctttgattgcaattattgatactggtgctactcatt 252  Q
    |||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  18046 aataatactcctttaattgctattattgatactggtgctactcatt 18001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #3
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 207 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 11578 - 11533
Alignment:
Q  207 aatagtactcctttgattgcaattattgatactggtgctactcatt 252  Q
    |||| |||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  11578 aataatactcctttagttgctattattgatactggtgctactcatt 11533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #4
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 207 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 55113 - 55068
Alignment:
Q  207 aatagtactcctttgattgcaattattgatactggtgctactcatt 252  Q
    |||| |||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  55113 aataatactcctttagttgctattattgatactggtgctactcatt 55068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1488 (Bit Score: 95; Significance: 4e-46; HSPs: 1)
Name: scaffold1488
Description:

Target: scaffold1488; HSP #1
Raw Score: 95; E-Value: 4e-46
Query Start/End: Original strand, 412 - 602
Target Start/End: Original strand, 205 - 395
Alignment:
Q  412 ttgtgtgtcttccgttgaagcatatggatgtgatttttggtatggattggatgttgtcctttggtgttagcattaactgtttaaccaagagtataacatt 511  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || ||||| ||||||||||| ||||| |  |||||| |||||||    
T  205 ttgtgtgtcttccgttgaagcatatggatgtgatttttggtatggattggttgttatcttttggggttagcattaattgtttgattaagagtgtaacatt 304  T
Q  512 ttcgaagtcggtatacgagttaggtgggaagttattgaccgtggaaaaagtgaagaagtctttggacgatgaagctttagtgtttatgatg 602  Q
    ||||||| ||||| | |||||| ||  |||||| ||||||| |||  |||||||||||||||| ||||  |||||||  ||||||||||||    
T  305 ttcgaagccggtagaagagttaagtaagaagttcttgaccgcggagcaagtgaagaagtctttagacggagaagcttgtgtgtttatgatg 395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1486 (Bit Score: 94; Significance: 1e-45; HSPs: 1)
Name: scaffold1486
Description:

Target: scaffold1486; HSP #1
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 368 - 601
Target Start/End: Complemental strand, 455 - 222
Alignment:
Q  368 taagtgtcctgttaattttggtaatgttgattttaagttggattttgtgtgtcttccgttgaagcatatggatgtgatttttggtatggattggatgttg 467  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||     
T  455 taagtgtcctgttaattttgataatgttgattttaagttggatcttgtttgtcttccgttgaagcatatggatgtgatttttggtatggattggtcgtta 356  T
Q  468 tcctttggtgttagcattaactgtttaaccaagagtataacattttcgaagtcggtatacgagttaggtgggaagttattgaccgtggaaaaagtgaaga 567  Q
       ||||| ||||||||||| ||||| || |||||| | || ||||| ||| || || | ||||||  | ||||||| |||| || |||  |||||||||    
T  355 ggttttggggttagcattaattgtttgactaagagtgtgactttttctaagccgatagaagagttatataggaagttcttgatcgcggagcaagtgaaga 256  T
Q  568 agtctttggacgatgaagctttagtgtttatgat 601  Q
    ||||||| || | ||||||||  ||||| |||||    
T  255 agtctttagatggtgaagcttgtgtgttcatgat 222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0269 (Bit Score: 94; Significance: 1e-45; HSPs: 1)
Name: scaffold0269
Description:

Target: scaffold0269; HSP #1
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 361 - 474
Target Start/End: Complemental strand, 2433 - 2320
Alignment:
Q  361 tgtgtgctaagtgtcctgttaattttggtaatgttgattttaagttggattttgtgtgtcttccgttgaagcatatggatgtgatttttggtatggattg 460  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2433 tgtgtgctaagtgtcttgttaattttggtaatgttgattttgagttggatcttgtgtgtcttccgttgaagcatatggatgtgatttttggtatggattg 2334  T
Q  461 gatgttgtcctttg 474  Q
    | ||||||| ||||    
T  2333 gttgttgtcttttg 2320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0244 (Bit Score: 94; Significance: 1e-45; HSPs: 1)
Name: scaffold0244
Description:

Target: scaffold0244; HSP #1
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 361 - 474
Target Start/End: Original strand, 24914 - 25027
Alignment:
Q  361 tgtgtgctaagtgtcctgttaattttggtaatgttgattttaagttggattttgtgtgtcttccgttgaagcatatggatgtgatttttggtatggattg 460  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24914 tgtgtgctaagtgtcctgttaattttggtaatgttgattttgagttggatcttgtgtgtctcccgttgaagcatatggatgtgatttttggtatggattg 25013  T
Q  461 gatgttgtcctttg 474  Q
    | ||||||| ||||    
T  25014 gttgttgtcttttg 25027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023 (Bit Score: 94; Significance: 1e-45; HSPs: 2)
Name: scaffold0023
Description:

Target: scaffold0023; HSP #1
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 368 - 601
Target Start/End: Original strand, 53967 - 54200
Alignment:
Q  368 taagtgtcctgttaattttggtaatgttgattttaagttggattttgtgtgtcttccgttgaagcatatggatgtgatttttggtatggattggatgttg 467  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||     
T  53967 taagtgtcctgttaattttgataatgttgattttaagttggatcttgtttgtcttccgttgaagcatatggatgtgatttttggtatggattggtcgtta 54066  T
Q  468 tcctttggtgttagcattaactgtttaaccaagagtataacattttcgaagtcggtatacgagttaggtgggaagttattgaccgtggaaaaagtgaaga 567  Q
       ||||| ||||||||||| ||||| || |||||| | || ||||| ||| || || | ||||||  | ||||||| |||| || |||  |||||||||    
T  54067 gtttttggggttagcattaattgtttgactaagagtgtgactttttctaagccgatagaagagttatataggaagttcttgatcgcggagcaagtgaaga 54166  T
Q  568 agtctttggacgatgaagctttagtgtttatgat 601  Q
    ||||||| || | ||||||||  ||||| |||||    
T  54167 agtctttagatggtgaagcttgtgtgttcatgat 54200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 207 - 252
Target Start/End: Original strand, 164596 - 164641
Alignment:
Q  207 aatagtactcctttgattgcaattattgatactggtgctactcatt 252  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| || ||||||||||||||||    
T  164596 aatagtactcctttaattgctattatagacactggtgctactcatt 164641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022 (Bit Score: 86; Significance: 8e-41; HSPs: 1)
Name: scaffold0022
Description:

Target: scaffold0022; HSP #1
Raw Score: 86; E-Value: 8e-41
Query Start/End: Original strand, 382 - 603
Target Start/End: Original strand, 8196 - 8417
Alignment:
Q  382 attttggtaatgttgattttaagttggattttgtgtgtcttccgttgaagcatatggatgtgatttttggtatggattggatgttgtcctttggtgttag 481  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||  | ||||| |||||    
T  8196 attttggtgatgttgattttgagttggatcttgtttgtcttccgttgaagcatatggattttatttttggtatggattggttgttagcttttggggttag 8295  T
Q  482 cattaactgtttaaccaagagtataacattttcgaagtcggtatacgagttaggtgggaagttattgaccgtggaaaaagtgaagaagtctttggacgat 581  Q
    |||||| ||||| || | |||| | || ||||| ||| ||||| | ||||||| | ||||||| ||||||| |||  |||||||||||||||| || | |    
T  8296 cattaattgtttgactaggagtgtgactttttctaagccggtagaagagttagataggaagtttttgaccgcggagcaagtgaagaagtctttagatggt 8395  T
Q  582 gaagctttagtgtttatgatgt 603  Q
    |||||||  ||||| |||||||    
T  8396 gaagcttgtgtgttcatgatgt 8417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0409 (Bit Score: 85; Significance: 3e-40; HSPs: 2)
Name: scaffold0409
Description:

Target: scaffold0409; HSP #1
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 391 - 579
Target Start/End: Original strand, 3331 - 3519
Alignment:
Q  391 atgttgattttaagttggattttgtgtgtcttccgttgaagcatatggatgtgatttttggtatggattggatgttgtcctttggtgttagcattaactg 490  Q
    ||||||||||| |||||||| || ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||| |||||| ||    
T  3331 atgttgattttgagttggatcttttgtgtcttcggttgaagcatatagatgtgatttttggtatggattggatgttatcttttggggttatcattaattg 3430  T
Q  491 tttaaccaagagtataacattttcgaagtcggtatacgagttaggtgggaagttattgaccgtggaaaaagtgaagaagtctttggacg 579  Q
    ||| || |||||| |||  ||||||||| ||||| | |||||| ||  |||||| |||| || |||  |||||||||||||||||||||    
T  3431 tttgactaagagtgtaatgttttcgaagccggtagaagagttaagtaagaagttcttgatcgcggagcaagtgaagaagtctttggacg 3519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0409; HSP #2
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 391 - 579
Target Start/End: Original strand, 11586 - 11774
Alignment:
Q  391 atgttgattttaagttggattttgtgtgtcttccgttgaagcatatggatgtgatttttggtatggattggatgttgtcctttggtgttagcattaactg 490  Q
    ||||||||||| |||||||| || ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||| |||||| ||    
T  11586 atgttgattttgagttggatcttttgtgtcttcggttgaagcatatagatgtgatttttggtatggattggatgttatcttttggggttatcattaattg 11685  T
Q  491 tttaaccaagagtataacattttcgaagtcggtatacgagttaggtgggaagttattgaccgtggaaaaagtgaagaagtctttggacg 579  Q
    ||| || |||||| |||  ||||||||| ||||| | |||||| ||  |||||| |||| || |||  |||||||||||||||||||||    
T  11686 tttgactaagagtgtaatgttttcgaagccggtagaagagttaagtaagaagttcttgatcgcggagcaagtgaagaagtctttggacg 11774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0102 (Bit Score: 85; Significance: 3e-40; HSPs: 2)
Name: scaffold0102
Description:

Target: scaffold0102; HSP #1
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 365 - 573
Target Start/End: Original strand, 46436 - 46643
Alignment:
Q  365 tgctaagtgtcctgttaattttggtaatgttgattttaagttggattttgtgtgtcttccgttgaagcatatggatgtgatttttggtatggattggatg 464  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||    
T  46436 tgctaagtgtcctgtaaatttcggtaatgttgattttgagttggatcttgtttgtcttccgttgaagcatatggatgtga-ttttggtatggattagttg 46534  T
Q  465 ttgtcctttggtgttagcattaactgtttaaccaagagtataacattttcgaagtcggtatacgagttaggtgggaagttattgaccgtggaaaaagtga 564  Q
    ||  | ||||| ||||||||||| | ||| |  |||||| |||| ||||| ||| ||||| | ||||||| | ||||||| |||||||  ||  ||||||    
T  46535 ttagcttttggggttagcattaattttttgaataagagtgtaactttttctaagccggtagaagagttagataggaagttcttgaccgcagagcaagtga 46634  T
Q  565 agaagtctt 573  Q
    |||||||||    
T  46635 agaagtctt 46643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0102; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 207 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 42807 - 42762
Alignment:
Q  207 aatagtactcctttgattgcaattattgatactggtgctactcatt 252  Q
    ||||||||||||||  |||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  42807 aatagtactcctttatttgctattatagatactggtgctactcatt 42762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0066 (Bit Score: 77; Significance: 2e-35; HSPs: 1)
Name: scaffold0066
Description:

Target: scaffold0066; HSP #1
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 391 - 603
Target Start/End: Complemental strand, 51766 - 51554
Alignment:
Q  391 atgttgattttaagttggattttgtgtgtcttccgttgaagcatatggatgtgatttttggtatggattggatgttgtcctttggtgttagcattaactg 490  Q
    ||||||||||| | |||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||  | ||||  ||||||||||| ||    
T  51766 atgttgattttgaattggatcttgtttatcttccgttgaagcatatggatgtgatttttggcatggattggttgttagcttttgtggttagcattaattg 51667  T
Q  491 tttaaccaagagtataacattttcgaagtcggtatacgagttaggtgggaagttattgaccgtggaaaaagtgaagaagtctttggacgatgaagcttta 590  Q
    ||| || |||||| |||| ||||| ||| ||||| | ||||| ||| ||||||| ||||||| |||  |||||||||||||||| || |  |||||||      
T  51666 tttgactaagagtgtaactttttctaagccggtagaagagttgggtaggaagttcttgaccgcggagcaagtgaagaagtctttagatggcgaagcttgt 51567  T
Q  591 gtgtttatgatgt 603  Q
    ||||| |||||||    
T  51566 gtgttcatgatgt 51554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1164 (Bit Score: 74; Significance: 1e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold1164
Description:

Target: scaffold1164; HSP #1
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 324 - 417
Target Start/End: Original strand, 2291 - 2384
Alignment:
Q  324 gacaccccggctagcggttcggtgactacttcttttatgtgtgctaagtgtcctgttaattttggtaatgttgattttaagttggattttgtgt 417  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  2291 gacaccccggctagtggttcggtgactacttcttttgtgtgtgctaagtgtcttgttaattttggtaatgttgattttgagttggatcttgtgt 2384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1424 (Bit Score: 70; Significance: 3e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold1424
Description:

Target: scaffold1424; HSP #1
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 391 - 552
Target Start/End: Complemental strand, 198 - 38
Alignment:
Q  391 atgttgattttaagttggattttgtgtgtcttccgttgaagcatatggatgtgatttttggtatggattggatgttgtcctttggtgttagcattaactg 490  Q
    ||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||  | ||||| ||||||||||| ||    
T  198 atgttgattttgagttggattt-gtttgtcttccgttgaagcatatggatgttatttttggtatggattggttgttagcttttggggttagcattaattg 100  T
Q  491 tttaaccaagagtataacattttcgaagtcggtatacgagttaggtgggaagttattgaccg 552  Q
    ||| || |||| | | || ||||||||| ||||| | ||||||| | ||||||| |||||||    
T  99 tttgactaagattgttactttttcgaagccggtagaagagttagataggaagttcttgaccg 38  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0335 (Bit Score: 70; Significance: 3e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0335
Description:

Target: scaffold0335; HSP #1
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 391 - 603
Target Start/End: Original strand, 10757 - 10970
Alignment:
Q  391 atgttgatttta-agttggattttgtgtgtcttccgttgaagcatatggatgtgatttttggtatggattggatgttgtcctttggtgttagcattaact 489  Q
    |||||||||||  |||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  | ||||| ||||||||||| |    
T  10757 atgttgattttggagttggatcttgtttgtcttccgttaaagcatatggatgtgatttttggtatggattggttgttaacttttggggttagcattaatt 10856  T
Q  490 gtttaaccaagagtataacattttcgaagtcggtatacgagttaggtgggaagttattgaccgtggaaaaagtgaagaagtctttggacgatgaagcttt 589  Q
    |||| || |||||| |||| ||||| ||| ||||| | ||||||| |  || ||| |||||||  ||  |||||||||||||||| || |  |||||||     
T  10857 gtttgactaagagtgtaacgttttctaagccggtagaagagttagataagaggttcttgaccgcagagcaagtgaagaagtctttagatggcgaagcttg 10956  T
Q  590 agtgtttatgatgt 603  Q
     ||||| |||||||    
T  10957 tgtgttcatgatgt 10970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0088 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0088
Description:

Target: scaffold0088; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 207 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 30043 - 29991
Alignment:
Q  207 aatagtactcctttgattgcaattattgatactggtgctactcattcttttat 259  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  30043 aatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttat 29991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0068 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0068
Description:

Target: scaffold0068; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 207 - 259
Target Start/End: Original strand, 67303 - 67355
Alignment:
Q  207 aatagtactcctttgattgcaattattgatactggtgctactcattcttttat 259  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  67303 aatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttat 67355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0041 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0041
Description:

Target: scaffold0041; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 207 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 41844 - 41792
Alignment:
Q  207 aatagtactcctttgattgcaattattgatactggtgctactcattcttttat 259  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  41844 aatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttat 41792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0010
Description:

Target: scaffold0010; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 207 - 259
Target Start/End: Original strand, 39528 - 39580
Alignment:
Q  207 aatagtactcctttgattgcaattattgatactggtgctactcattcttttat 259  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  39528 aatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttat 39580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0001
Description:

Target: scaffold0001; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 207 - 259
Target Start/End: Original strand, 514548 - 514600
Alignment:
Q  207 aatagtactcctttgattgcaattattgatactggtgctactcattcttttat 259  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  514548 aatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttat 514600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0585 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0585
Description:

Target: scaffold0585; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 207 - 252
Target Start/End: Original strand, 4284 - 4329
Alignment:
Q  207 aatagtactcctttgattgcaattattgatactggtgctactcatt 252  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  4284 aatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcatt 4329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0443 (Bit Score: 37; Significance: 0.00000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0443
Description:

Target: scaffold0443; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 207 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 11918 - 11866
Alignment:
Q  207 aatagtactcctttgattgcaattattgatactggtgctactcattcttttat 259  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||    
T  11918 aatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgttttat 11866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0118 (Bit Score: 37; Significance: 0.00000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0118
Description:

Target: scaffold0118; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 207 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 570 - 518
Alignment:
Q  207 aatagtactcctttgattgcaattattgatactggtgctactcattcttttat 259  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  570 aatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctagtcattgttttat 518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0040 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000006; HSPs: 2)
Name: scaffold0040
Description:

Target: scaffold0040; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 208 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 17986 - 17935
Alignment:
Q  208 atagtactcctttgattgcaattattgatactggtgctactcattcttttat 259  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  17986 atagtactcctttaattgctattattgatactggtgctacacattgttttat 17935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0040; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 207 - 259
Target Start/End: Original strand, 111102 - 111154
Alignment:
Q  207 aatagtactcctttgattgcaattattgatactggtgctactcattcttttat 259  Q
    |||||||| |||||  |||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  111102 aatagtacacctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttat 111154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1530 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000009; HSPs: 1)
Name: scaffold1530
Description:

Target: scaffold1530; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 207 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 692 - 647
Alignment:
Q  207 aatagtactcctttgattgcaattattgatactggtgctactcatt 252  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  692 aatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcatt 647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1433 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000009; HSPs: 1)
Name: scaffold1433
Description:

Target: scaffold1433; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 207 - 252
Target Start/End: Original strand, 1506 - 1551
Alignment:
Q  207 aatagtactcctttgattgcaattattgatactggtgctactcatt 252  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  1506 aatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcatt 1551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1056 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000009; HSPs: 1)
Name: scaffold1056
Description:

Target: scaffold1056; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 207 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 1830 - 1785
Alignment:
Q  207 aatagtactcctttgattgcaattattgatactggtgctactcatt 252  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  1830 aatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcatt 1785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0420 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000009; HSPs: 1)
Name: scaffold0420
Description:

Target: scaffold0420; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 207 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 8723 - 8678
Alignment:
Q  207 aatagtactcctttgattgcaattattgatactggtgctactcatt 252  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  8723 aatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcatt 8678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0405 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000009; HSPs: 1)
Name: scaffold0405
Description:

Target: scaffold0405; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 207 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 5711 - 5666
Alignment:
Q  207 aatagtactcctttgattgcaattattgatactggtgctactcatt 252  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  5711 aatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcatt 5666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0404 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000009; HSPs: 1)
Name: scaffold0404
Description:

Target: scaffold0404; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 207 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 7853 - 7808
Alignment:
Q  207 aatagtactcctttgattgcaattattgatactggtgctactcatt 252  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  7853 aatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcatt 7808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0310 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000009; HSPs: 1)
Name: scaffold0310
Description:

Target: scaffold0310; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 207 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 11086 - 11041
Alignment:
Q  207 aatagtactcctttgattgcaattattgatactggtgctactcatt 252  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  11086 aatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcatt 11041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0309 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000009; HSPs: 1)
Name: scaffold0309
Description:

Target: scaffold0309; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 207 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 12836 - 12791
Alignment:
Q  207 aatagtactcctttgattgcaattattgatactggtgctactcatt 252  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  12836 aatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcatt 12791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0298 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000009; HSPs: 1)
Name: scaffold0298
Description:

Target: scaffold0298; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 183 - 252
Target Start/End: Original strand, 9398 - 9467
Alignment:
Q  183 cttatccgaggtatgtgttttatcaatagtactcctttgattgcaattattgatactggtgctactcatt 252  Q
    |||||| ||||||  ||||| || |||||||||||||| ||||| ||||| || ||||||||||||||||    
T  9398 cttatcagaggtacttgtttcattaatagtactcctttaattgctattatagacactggtgctactcatt 9467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0167 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000009; HSPs: 1)
Name: scaffold0167
Description:

Target: scaffold0167; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 207 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 1229 - 1184
Alignment:
Q  207 aatagtactcctttgattgcaattattgatactggtgctactcatt 252  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  1229 aatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcatt 1184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0156 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000009; HSPs: 1)
Name: scaffold0156
Description:

Target: scaffold0156; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 207 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 37048 - 37003
Alignment:
Q  207 aatagtactcctttgattgcaattattgatactggtgctactcatt 252  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  37048 aatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcatt 37003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0108 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000009; HSPs: 1)
Name: scaffold0108
Description:

Target: scaffold0108; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 207 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 50214 - 50169
Alignment:
Q  207 aatagtactcctttgattgcaattattgatactggtgctactcatt 252  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  50214 aatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcatt 50169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0104 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000009; HSPs: 1)
Name: scaffold0104
Description:

Target: scaffold0104; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 207 - 252
Target Start/End: Original strand, 43614 - 43659
Alignment:
Q  207 aatagtactcctttgattgcaattattgatactggtgctactcatt 252  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  43614 aatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcatt 43659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0020 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000009; HSPs: 2)
Name: scaffold0020
Description:

Target: scaffold0020; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 207 - 252
Target Start/End: Original strand, 98778 - 98823
Alignment:
Q  207 aatagtactcctttgattgcaattattgatactggtgctactcatt 252  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  98778 aatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcatt 98823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0020; HSP #2
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 208 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 176096 - 176052
Alignment:
Q  208 atagtactcctttgattgcaattattgatactggtgctactcatt 252  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  176096 atagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcatt 176052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0074 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000004; HSPs: 2)
Name: scaffold0074
Description:

Target: scaffold0074; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 208 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 15231 - 15187
Alignment:
Q  208 atagtactcctttgattgcaattattgatactggtgctactcatt 252  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  15231 atagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcatt 15187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0074; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 208 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 6221 - 6171
Alignment:
Q  208 atagtactcctttgattgcaattattgatactggtgctactcattctttta 258  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||| |||| |||||    
T  6221 atagtactcctttaattgctattattgatactgatgctacgcattgtttta 6171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0529 (Bit Score: 32; Significance: 0.00000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0529
Description:

Target: scaffold0529; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 208 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 5196 - 5145
Alignment:
Q  208 atagtactcctttgattgcaattattgatactggtgctactcattcttttat 259  Q
    ||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  5196 atagtactcttttaattgctattattgatactggtgctacgcattgttttat 5145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0293 (Bit Score: 32; Significance: 0.00000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0293
Description:

Target: scaffold0293; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 208 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 15518 - 15467
Alignment:
Q  208 atagtactcctttgattgcaattattgatactggtgctactcattcttttat 259  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||| |||| ||||||    
T  15518 atagtactcctttaattgctattattgatattggtgctacgcattgttttat 15467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0067 (Bit Score: 32; Significance: 0.00000001; HSPs: 2)
Name: scaffold0067
Description:

Target: scaffold0067; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 207 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 29733 - 29690
Alignment:
Q  207 aatagtactcctttgattgcaattattgatactggtgctactca 250  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  29733 aatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactca 29690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0067; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 182 - 252
Target Start/End: Original strand, 64772 - 64842
Alignment:
Q  182 tcttatccgaggtatgtgttttatcaatagtactcctttgattgcaattattgatactggtgctactcatt 252  Q
    ||||||| ||||||  |||||  | |||||||||||||| ||||| ||||| || ||||||||||||||||    
T  64772 tcttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtgctactcatt 64842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012 (Bit Score: 32; Significance: 0.00000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0012
Description:

Target: scaffold0012; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 208 - 259
Target Start/End: Original strand, 216616 - 216667
Alignment:
Q  208 atagtactcctttgattgcaattattgatactggtgctactcattcttttat 259  Q
    |||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  216616 atagtactactttaattgctattattgatactggtgctacacattgttttat 216667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0412 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0412
Description:

Target: scaffold0412; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 198 - 252
Target Start/End: Original strand, 15765 - 15819
Alignment:
Q  198 tgttttatcaatagtactcctttgattgcaattattgatactggtgctactcatt 252  Q
    |||| ||| |||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  15765 tgttatattaataatactcctttagttgcaattattgatactggtgctacgcatt 15819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1299 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000002; HSPs: 1)
Name: scaffold1299
Description:

Target: scaffold1299; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 207 - 252
Target Start/End: Original strand, 2043 - 2088
Alignment:
Q  207 aatagtactcctttgattgcaattattgatactggtgctactcatt 252  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| || ||||||||||||||||    
T  2043 aatagtactcctttaattgctattatagacactggtgctactcatt 2088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1288 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000002; HSPs: 1)
Name: scaffold1288
Description:

Target: scaffold1288; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 207 - 252
Target Start/End: Original strand, 50 - 95
Alignment:
Q  207 aatagtactcctttgattgcaattattgatactggtgctactcatt 252  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||||||||    
T  50 aatagtactcctttaattgctattatagatacgggtgctactcatt 95  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0993 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0993
Description:

Target: scaffold0993; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 198 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 1100 - 1039
Alignment:
Q  198 tgttttatcaatagtactcctttgattgcaattattgatactggtgctactcattcttttat 259  Q
    |||| ||| |||||||| |||||  |||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  1100 tgttatattaatagtacacctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttat 1039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0865 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0865
Description:

Target: scaffold0865; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 207 - 252
Target Start/End: Original strand, 1467 - 1512
Alignment:
Q  207 aatagtactcctttgattgcaattattgatactggtgctactcatt 252  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| ||||    
T  1467 aatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctacacatt 1512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0765 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0765
Description:

Target: scaffold0765; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 207 - 252
Target Start/End: Original strand, 6452 - 6497
Alignment:
Q  207 aatagtactcctttgattgcaattattgatactggtgctactcatt 252  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| || ||||||||||||||||    
T  6452 aatagtactcctttaattgctattatagacactggtgctactcatt 6497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0751 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0751
Description:

Target: scaffold0751; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 207 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 5290 - 5245
Alignment:
Q  207 aatagtactcctttgattgcaattattgatactggtgctactcatt 252  Q
    |||||||||| ||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  5290 aatagtactcatttaattgctattatagatactggtgctactcatt 5245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0708 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0708
Description:

Target: scaffold0708; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 207 - 252
Target Start/End: Original strand, 5340 - 5385
Alignment:
Q  207 aatagtactcctttgattgcaattattgatactggtgctactcatt 252  Q
    |||||||||| ||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  5340 aatagtactcatttaattgctattatagatactggtgctactcatt 5385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0664 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0664
Description:

Target: scaffold0664; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 207 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 7147 - 7102
Alignment:
Q  207 aatagtactcctttgattgcaattattgatactggtgctactcatt 252  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| || ||||||||||||||||    
T  7147 aatagtactcctttaattgctattatagacactggtgctactcatt 7102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0523 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0523
Description:

Target: scaffold0523; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 207 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 2980 - 2935
Alignment:
Q  207 aatagtactcctttgattgcaattattgatactggtgctactcatt 252  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| |||||||| ||||||||||    
T  2980 aatagtactcctttaattgctattatagatactggggctactcatt 2935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0367 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0367
Description:

Target: scaffold0367; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 207 - 252
Target Start/End: Original strand, 9216 - 9261
Alignment:
Q  207 aatagtactcctttgattgcaattattgatactggtgctactcatt 252  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| || ||||||||||||||||    
T  9216 aatagtactcctttaattgctattatagacactggtgctactcatt 9261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0259 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0259
Description:

Target: scaffold0259; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 207 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 8367 - 8322
Alignment:
Q  207 aatagtactcctttgattgcaattattgatactggtgctactcatt 252  Q
    |||| |||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  8367 aataatactcctttagttgctattattgatactggtgctactcatt 8322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0243 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0243
Description:

Target: scaffold0243; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 207 - 252
Target Start/End: Original strand, 9967 - 10012
Alignment:
Q  207 aatagtactcctttgattgcaattattgatactggtgctactcatt 252  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| || ||||||||||||||||    
T  9967 aatagtactcctttaattgctattatagacactggtgctactcatt 10012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0239 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0239
Description:

Target: scaffold0239; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 207 - 252
Target Start/End: Original strand, 9981 - 10026
Alignment:
Q  207 aatagtactcctttgattgcaattattgatactggtgctactcatt 252  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| || ||||||||||||||||    
T  9981 aatagtactcctttaattgctattatagacactggtgctactcatt 10026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0222 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0222
Description:

Target: scaffold0222; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 207 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 20923 - 20878
Alignment:
Q  207 aatagtactcctttgattgcaattattgatactggtgctactcatt 252  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| || ||||||||||||||||    
T  20923 aatagtactcctttaattgctattatagacactggtgctactcatt 20878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0203 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0203
Description:

Target: scaffold0203; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 207 - 252
Target Start/End: Original strand, 1049 - 1094
Alignment:
Q  207 aatagtactcctttgattgcaattattgatactggtgctactcatt 252  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| || ||||||||||||||||    
T  1049 aatagtactcctttaattgctattatagacactggtgctactcatt 1094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0192 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0192
Description:

Target: scaffold0192; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 207 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 29636 - 29591
Alignment:
Q  207 aatagtactcctttgattgcaattattgatactggtgctactcatt 252  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| |||||| ||||||||||||    
T  29636 aatagtactcctttaattgctattatagatactagtgctactcatt 29591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0165 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0165
Description:

Target: scaffold0165; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 207 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 12069 - 12024
Alignment:
Q  207 aatagtactcctttgattgcaattattgatactggtgctactcatt 252  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| |||||||| ||||||||||    
T  12069 aatagtactcctttaattgctattatagatactggcgctactcatt 12024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0148 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0148
Description:

Target: scaffold0148; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 198 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 2117 - 2056
Alignment:
Q  198 tgttttatcaatagtactcctttgattgcaattattgatactggtgctactcattcttttat 259  Q
    ||||| || |||||||||||||| ||| | ||||| |||||||||||||| |||| ||||||    
T  2117 tgtttcattaatagtactcctttaattactattatagatactggtgctacgcattgttttat 2056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0133 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0133
Description:

Target: scaffold0133; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 207 - 252
Target Start/End: Original strand, 28480 - 28525
Alignment:
Q  207 aatagtactcctttgattgcaattattgatactggtgctactcatt 252  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| ||||    
T  28480 aatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctacacatt 28525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0106
Description:

Target: scaffold0106; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 207 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 34446 - 34401
Alignment:
Q  207 aatagtactcctttgattgcaattattgatactggtgctactcatt 252  Q
    |||||||||||||| | ||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  34446 aatagtactcctttaactgctattatagatactggtgctactcatt 34401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0077 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0077
Description:

Target: scaffold0077; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 192 - 225
Target Start/End: Original strand, 29941 - 29974
Alignment:
Q  192 ggtatgtgttttatcaatagtactcctttgattg 225  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  29941 ggtatgtgttttatcaatagtactcttttgattg 29974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0076 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0076
Description:

Target: scaffold0076; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 207 - 252
Target Start/End: Original strand, 53618 - 53663
Alignment:
Q  207 aatagtactcctttgattgcaattattgatactggtgctactcatt 252  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| || ||||||||||||||||    
T  53618 aatagtactcctttaattgctattatagaaactggtgctactcatt 53663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0056 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0056
Description:

Target: scaffold0056; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 207 - 252
Target Start/End: Original strand, 1078 - 1123
Alignment:
Q  207 aatagtactcctttgattgcaattattgatactggtgctactcatt 252  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| | |||||||||||||||||    
T  1078 aatagtactcctttaattgctattatagctactggtgctactcatt 1123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0049 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0049
Description:

Target: scaffold0049; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 11 - 120
Target Start/End: Original strand, 36171 - 36280
Alignment:
Q  11 caagtgtgggaaagtgggtcacaagggttatgaatgcaagagtgttgtaaaggagattacttgctacaattgtggagagaaaggtcatatcagtactaag 110  Q
    |||||||||||| | ||||||||||| || ||| || |||| |||||  |||||  ||||||| ||||||||||| ||   |||||||  || || ||||    
T  36171 caagtgtgggaaggcgggtcacaaggcttttgagtgtaagaatgttgcgaaggatgttacttgttacaattgtggtgaagcaggtcattacaataataag 36270  T
Q  111 tgtaccaagc 120  Q
    ||||||||||    
T  36271 tgtaccaagc 36280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0046 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000002; HSPs: 2)
Name: scaffold0046
Description:

Target: scaffold0046; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 207 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 60848 - 60803
Alignment:
Q  207 aatagtactcctttgattgcaattattgatactggtgctactcatt 252  Q
    ||||||| |||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  60848 aatagtattcctttaattgctattatagatactggtgctactcatt 60803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0046; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 207 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 70217 - 70172
Alignment:
Q  207 aatagtactcctttgattgcaattattgatactggtgctactcatt 252  Q
    ||||||| |||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  70217 aatagtattcctttaattgctattatagatactggtgctactcatt 70172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0034
Description:

Target: scaffold0034; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 207 - 252
Target Start/End: Original strand, 2147 - 2192
Alignment:
Q  207 aatagtactcctttgattgcaattattgatactggtgctactcatt 252  Q
    ||||||| |||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  2147 aatagtattcctttaattgctattatagatactggtgctactcatt 2192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0031
Description:

Target: scaffold0031; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 207 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 110719 - 110674
Alignment:
Q  207 aatagtactcctttgattgcaattattgatactggtgctactcatt 252  Q
    |||||||||||||| |||||  |||| |||||||||||||||||||    
T  110719 aatagtactcctttaattgctgttatagatactggtgctactcatt 110674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0007 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0007
Description:

Target: scaffold0007; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 207 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 48774 - 48729
Alignment:
Q  207 aatagtactcctttgattgcaattattgatactggtgctactcatt 252  Q
    |||| |||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  48774 aataatactcctttagttgctattattgatactggtgctactcatt 48729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0005
Description:

Target: scaffold0005; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 207 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 263335 - 263290
Alignment:
Q  207 aatagtactcctttgattgcaattattgatactggtgctactcatt 252  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| || ||||||||||||||||    
T  263335 aatagtactcctttaattgctattatagacactggtgctactcatt 263290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0004
Description:

Target: scaffold0004; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 207 - 252
Target Start/End: Original strand, 200663 - 200708
Alignment:
Q  207 aatagtactcctttgattgcaattattgatactggtgctactcatt 252  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||| ||||    
T  200663 aatagtactcctttaattgctattattgatactagtgctacacatt 200708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0003
Description:

Target: scaffold0003; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 207 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 203490 - 203445
Alignment:
Q  207 aatagtactcctttgattgcaattattgatactggtgctactcatt 252  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| || ||||||||||||||||    
T  203490 aatagtactcctttaattgctattatagacactggtgctactcatt 203445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0423 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000009; HSPs: 1)
Name: scaffold0423
Description:

Target: scaffold0423; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 223 - 259
Target Start/End: Original strand, 2474 - 2510
Alignment:
Q  223 ttgcaattattgatactggtgctactcattcttttat 259  Q
    |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  2474 ttgctattattgatactggtgctacgcattcttttat 2510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0411 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000009; HSPs: 1)
Name: scaffold0411
Description:

Target: scaffold0411; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 207 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 8519 - 8467
Alignment:
Q  207 aatagtactcctttgattgcaattattgatactggtgctactcattcttttat 259  Q
    |||| |||||||||  |||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  8519 aataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttat 8467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0114 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000009; HSPs: 1)
Name: scaffold0114
Description:

Target: scaffold0114; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 207 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 40167 - 40115
Alignment:
Q  207 aatagtactcctttgattgcaattattgatactggtgctactcattcttttat 259  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| || || ||||||||||||| ||||||    
T  40167 aatagtactcctttaattgctattatagacacaggtgctactcattgttttat 40115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0055 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000009; HSPs: 1)
Name: scaffold0055
Description:

Target: scaffold0055; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 207 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 22356 - 22304
Alignment:
Q  207 aatagtactcctttgattgcaattattgatactggtgctactcattcttttat 259  Q
    |||| |||||||||  |||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  22356 aataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttat 22304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0052 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000009; HSPs: 1)
Name: scaffold0052
Description:

Target: scaffold0052; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 207 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 7345 - 7293
Alignment:
Q  207 aatagtactcctttgattgcaattattgatactggtgctactcattcttttat 259  Q
    |||| |||||||||  |||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  7345 aataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttat 7293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000009; HSPs: 1)
Name: scaffold0044
Description:

Target: scaffold0044; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 207 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 3533 - 3481
Alignment:
Q  207 aatagtactcctttgattgcaattattgatactggtgctactcattcttttat 259  Q
    |||| |||||||||  |||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  3533 aataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttat 3481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000009; HSPs: 1)
Name: scaffold0026
Description:

Target: scaffold0026; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 207 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 51760 - 51716
Alignment:
Q  207 aatagtactcctttgattgcaattattgatactggtgctactcat 251  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| |||||| |||||||||||    
T  51760 aatagtactcctttaattgctattatagatactcgtgctactcat 51716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University