View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF9627_5 (Length: 421)

Name: NF9627_5
Description: NF9627
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF9627_5
NF9627_5
[»] chr6 (44 HSPs)
chr6 (8-411)||(27284177-27284581)
chr6 (8-411)||(29555537-29555941)
chr6 (24-411)||(16755815-16756204)
chr6 (9-411)||(27623522-27623927)
chr6 (24-411)||(27063477-27063864)
chr6 (26-411)||(13518009-13518395)
chr6 (8-411)||(27355926-27356330)
chr6 (8-411)||(22928696-22929102)
chr6 (26-411)||(27491130-27491516)
chr6 (48-411)||(26110226-26110589)
chr6 (41-411)||(28166506-28166878)
chr6 (26-411)||(16680136-16680523)
chr6 (8-411)||(8899514-8899918)
chr6 (57-411)||(4763791-4764146)
chr6 (48-411)||(26772444-26772807)
chr6 (8-411)||(27200165-27200569)
chr6 (8-411)||(27248664-27249068)
chr6 (57-411)||(29507444-29507801)
chr6 (8-411)||(4539573-4539978)
chr6 (8-411)||(34458323-34458725)
chr6 (8-411)||(28213433-28213838)
chr6 (8-411)||(33370246-33370650)
chr6 (25-411)||(4778876-4779264)
chr6 (19-411)||(30551815-30552208)
chr6 (47-411)||(13292766-13293125)
chr6 (32-411)||(29579018-29579397)
chr6 (46-411)||(16937840-16938205)
chr6 (8-411)||(4531267-4531671)
chr6 (24-411)||(26791811-26792199)
chr6 (24-408)||(14139218-14139597)
chr6 (24-408)||(27013728-27014106)
chr6 (24-411)||(26926763-26927135)
chr6 (110-411)||(26666473-26666774)
chr6 (24-411)||(27208899-27209283)
chr6 (24-411)||(27239945-27240329)
chr6 (25-411)||(27031019-27031403)
chr6 (24-411)||(24869705-24870087)
chr6 (47-411)||(27025163-27025524)
chr6 (25-411)||(24299575-24299957)
chr6 (47-411)||(15406348-15406709)
chr6 (47-411)||(15418135-15418496)
chr6 (47-399)||(20174567-20174930)
chr6 (47-399)||(22161061-22161424)
chr6 (8-105)||(23851450-23851547)
[»] chr5 (49 HSPs)
chr5 (47-407)||(11555382-11555742)
chr5 (20-411)||(3795539-3795932)
chr5 (26-411)||(18369300-18369686)
chr5 (25-411)||(30174471-30174859)
chr5 (25-411)||(40467321-40467708)
chr5 (26-411)||(33881133-33881519)
chr5 (24-411)||(28655247-28655636)
chr5 (47-408)||(9544478-9544842)
chr5 (48-411)||(30158063-30158427)
chr5 (46-411)||(6880331-6880697)
chr5 (25-411)||(13318596-13318982)
chr5 (8-411)||(9323466-9323869)
chr5 (8-411)||(12138165-12138568)
chr5 (24-411)||(13436442-13436836)
chr5 (24-411)||(37665254-37665642)
chr5 (8-411)||(22894405-22894808)
chr5 (47-411)||(23631997-23632364)
chr5 (26-411)||(24729977-24730363)
chr5 (8-411)||(32590044-32590447)
chr5 (41-411)||(18494536-18494906)
chr5 (8-411)||(37352412-37352816)
chr5 (8-411)||(2517054-2517459)
chr5 (8-411)||(31820178-31820580)
chr5 (24-411)||(37746090-37746484)
chr5 (25-411)||(34622524-34622912)
chr5 (26-411)||(8659240-8659625)
chr5 (26-411)||(11329644-11330032)
chr5 (24-411)||(15752626-15753008)
chr5 (31-411)||(43084270-43084651)
chr5 (24-388)||(30035431-30035795)
chr5 (25-411)||(13180561-13180944)
chr5 (8-411)||(26486385-26486778)
chr5 (19-411)||(33522382-33522776)
chr5 (24-411)||(37760987-37761376)
chr5 (24-411)||(18122184-18122572)
chr5 (47-411)||(5643828-5644191)
chr5 (8-411)||(33298522-33298930)
chr5 (24-408)||(31437469-31437847)
chr5 (25-411)||(41680710-41681098)
chr5 (8-411)||(28953548-28953952)
chr5 (8-404)||(25206266-25206670)
chr5 (8-404)||(25270422-25270826)
chr5 (24-411)||(22992892-22993272)
chr5 (24-411)||(15652528-15652914)
chr5 (47-411)||(23897902-23898261)
chr5 (24-411)||(33783492-33783875)
chr5 (24-411)||(24608250-24608634)
chr5 (47-411)||(24975877-24976236)
chr5 (25-411)||(30940642-30941023)
[»] chr2 (41 HSPs)
chr2 (47-411)||(12661558-12661922)
chr2 (46-411)||(39896087-39896452)
chr2 (24-411)||(37383673-37384061)
chr2 (25-411)||(9343845-9344232)
chr2 (25-411)||(39045680-39046067)
chr2 (26-411)||(34867681-34868066)
chr2 (46-411)||(22922001-22922369)
chr2 (25-411)||(254510-254897)
chr2 (25-411)||(37945723-37946111)
chr2 (24-411)||(27809697-27810087)
chr2 (57-411)||(27122554-27122907)
chr2 (46-411)||(19410342-19410710)
chr2 (24-411)||(34160840-34161230)
chr2 (25-411)||(16167475-16167862)
chr2 (8-411)||(37679749-37680155)
chr2 (8-411)||(37695014-37695420)
chr2 (24-411)||(12592806-12593198)
chr2 (8-411)||(12710459-12710863)
chr2 (25-411)||(13930402-13930791)
chr2 (8-411)||(11629043-11629446)
chr2 (8-411)||(21671028-21671435)
chr2 (25-411)||(31882284-31882670)
chr2 (24-411)||(3788490-3788877)
chr2 (24-411)||(32055798-32056185)
chr2 (19-411)||(21697031-21697427)
chr2 (25-411)||(37931369-37931763)
chr2 (19-411)||(16823195-16823588)
chr2 (19-411)||(16897892-16898285)
chr2 (8-411)||(40239489-40239892)
chr2 (76-411)||(31868644-31868979)
chr2 (8-411)||(27782212-27782616)
chr2 (24-411)||(34297152-34297533)
chr2 (8-411)||(27396303-27396717)
chr2 (8-411)||(19450276-19450689)
chr2 (24-411)||(34268784-34269167)
chr2 (24-411)||(28888275-28888658)
chr2 (24-407)||(27428315-27428692)
chr2 (25-411)||(23122436-23122818)
chr2 (47-411)||(20843931-20844296)
chr2 (224-411)||(23116993-23117180)
chr2 (25-81)||(31887682-31887738)
[»] scaffold0159 (2 HSPs)
scaffold0159 (8-411)||(3047-3453)
scaffold0159 (172-411)||(17952-18194)
[»] chr3 (57 HSPs)
chr3 (8-411)||(32296574-32296979)
chr3 (25-411)||(4790544-4790932)
chr3 (25-411)||(5727940-5728328)
chr3 (25-411)||(47029415-47029803)
chr3 (25-411)||(5717030-5717418)
chr3 (25-411)||(5764040-5764428)
chr3 (46-411)||(31958366-31958734)
chr3 (24-411)||(10402110-10402497)
chr3 (8-411)||(48471872-48472280)
chr3 (46-411)||(5603224-5603592)
chr3 (46-411)||(24334156-24334524)
chr3 (24-411)||(22381492-22381879)
chr3 (8-411)||(29658879-29659283)
chr3 (8-411)||(28027236-28027638)
chr3 (8-411)||(16422128-16422532)
chr3 (24-411)||(17970777-17971163)
chr3 (25-411)||(10649033-10649420)
chr3 (25-411)||(5019675-5020061)
chr3 (24-411)||(22864759-22865145)
chr3 (24-411)||(22879818-22880204)
chr3 (19-411)||(4340587-4340980)
chr3 (32-411)||(18286266-18286645)
chr3 (32-411)||(18301567-18301946)
chr3 (24-411)||(20071994-20072384)
chr3 (25-411)||(4422880-4423267)
chr3 (57-408)||(5590275-5590627)
chr3 (24-411)||(6536654-6537042)
chr3 (8-411)||(28109862-28110271)
chr3 (46-411)||(28345154-28345519)
chr3 (24-411)||(8217593-8217983)
chr3 (8-411)||(18248683-18249087)
chr3 (8-411)||(16618400-16618808)
chr3 (24-411)||(7079183-7079576)
chr3 (24-411)||(5472949-5473336)
chr3 (41-411)||(11104272-11104644)
chr3 (25-411)||(51787984-51788371)
chr3 (19-411)||(17978861-17979255)
chr3 (8-411)||(29142665-29143072)
chr3 (8-411)||(4629730-4630133)
chr3 (8-411)||(21680646-21681049)
chr3 (25-411)||(18231155-18231542)
chr3 (25-411)||(18057222-18057612)
chr3 (57-411)||(31030156-31030504)
chr3 (26-408)||(18336591-18336968)
chr3 (8-411)||(20570757-20571161)
chr3 (31-411)||(32445122-32445494)
chr3 (8-411)||(19700431-19700847)
chr3 (47-411)||(4727617-4727976)
chr3 (47-411)||(6207884-6208245)
chr3 (25-411)||(15735011-15735393)
chr3 (47-411)||(35886748-35887109)
chr3 (25-411)||(8283369-8283767)
chr3 (25-411)||(4689613-4689994)
chr3 (24-411)||(5658095-5658480)
chr3 (163-411)||(15886652-15886895)
chr3 (24-134)||(15886894-15887006)
chr3 (25-110)||(8002522-8002607)
[»] scaffold0547 (1 HSPs)
scaffold0547 (24-411)||(9510-9897)
[»] chr4 (27 HSPs)
chr4 (8-411)||(39856630-39857032)
chr4 (26-411)||(14104554-14104939)
chr4 (26-411)||(30759775-30760159)
chr4 (26-411)||(33667671-33668055)
chr4 (25-411)||(20332290-20332678)
chr4 (25-411)||(40099504-40099892)
chr4 (25-411)||(27157180-27157569)
chr4 (24-411)||(54839400-54839787)
chr4 (24-411)||(14753362-14753749)
chr4 (24-411)||(5700549-5700937)
chr4 (24-411)||(34182832-34183218)
chr4 (25-411)||(24586229-24586617)
chr4 (8-411)||(5011870-5012275)
chr4 (8-411)||(18794485-18794889)
chr4 (24-407)||(24118672-24119055)
chr4 (8-411)||(1906245-1906654)
chr4 (19-408)||(21975708-21976098)
chr4 (24-411)||(36338394-36338774)
chr4 (47-411)||(31120378-31120744)
chr4 (47-411)||(6575894-6576251)
chr4 (8-411)||(15276497-15276904)
chr4 (8-411)||(15380106-15380510)
chr4 (8-411)||(15233809-15234217)
chr4 (47-411)||(1673892-1674258)
chr4 (105-411)||(36324185-36324484)
chr4 (25-411)||(14671026-14671410)
chr4 (25-411)||(17019062-17019445)
[»] chr8 (24 HSPs)
chr8 (25-411)||(33248365-33248751)
chr8 (24-411)||(18796704-18797093)
chr8 (8-411)||(19680430-19680833)
chr8 (46-411)||(28355780-28356148)
chr8 (46-411)||(31483700-31484068)
chr8 (24-411)||(9360620-9361007)
chr8 (20-411)||(29835317-29835708)
chr8 (25-411)||(31360527-31360914)
chr8 (57-411)||(15773605-15773960)
chr8 (47-411)||(44567002-44567369)
chr8 (24-411)||(18715478-18715868)
chr8 (8-411)||(12086553-12086958)
chr8 (47-411)||(21342000-21342366)
chr8 (8-411)||(19202205-19202598)
chr8 (51-411)||(19910992-19911355)
chr8 (57-374)||(33264762-33265079)
chr8 (8-411)||(22074759-22075164)
chr8 (24-408)||(19655180-19655562)
chr8 (8-411)||(27602744-27603141)
chr8 (24-411)||(22138904-22139286)
chr8 (25-411)||(2131098-2131479)
chr8 (25-411)||(19694094-19694477)
chr8 (8-283)||(16260205-16260480)
chr8 (50-411)||(14569180-14569540)
[»] chr7 (32 HSPs)
chr7 (46-411)||(24586289-24586654)
chr7 (47-411)||(5164402-5164767)
chr7 (25-411)||(26518789-26519174)
chr7 (24-411)||(5154079-5154466)
chr7 (46-411)||(4138999-4139367)
chr7 (8-411)||(4205368-4205772)
chr7 (8-411)||(26313603-26314006)
chr7 (25-411)||(26678858-26679246)
chr7 (48-411)||(45393238-45393602)
chr7 (14-411)||(26441238-26441637)
chr7 (8-411)||(11446867-11447271)
chr7 (24-411)||(45737296-45737686)
chr7 (8-411)||(31084376-31084781)
chr7 (25-411)||(26663666-26664054)
chr7 (8-411)||(16745274-16745679)
chr7 (8-411)||(26268839-26269247)
chr7 (8-411)||(5141088-5141493)
chr7 (47-411)||(11418533-11418898)
chr7 (25-411)||(31558148-31558535)
chr7 (25-411)||(2160566-2160955)
chr7 (8-411)||(16047294-16047695)
chr7 (24-389)||(26509471-26509839)
chr7 (25-411)||(39206893-39207280)
chr7 (22-411)||(16443757-16444148)
chr7 (8-411)||(3451297-3451702)
chr7 (24-408)||(2779247-2779626)
chr7 (24-411)||(31129900-31130282)
chr7 (8-411)||(10847562-10847968)
chr7 (111-411)||(26595750-26596053)
chr7 (47-411)||(10910680-10911039)
chr7 (24-411)||(16512194-16512576)
chr7 (25-110)||(26531926-26532011)
[»] scaffold0418 (1 HSPs)
scaffold0418 (24-411)||(12034-12421)
[»] chr1 (11 HSPs)
chr1 (25-411)||(3647147-3647534)
chr1 (8-411)||(20334283-20334689)
chr1 (26-411)||(28591085-28591470)
chr1 (25-411)||(41787177-41787566)
chr1 (24-411)||(28155726-28156116)
chr1 (57-411)||(10968698-10969054)
chr1 (8-389)||(51644204-51644588)
chr1 (41-411)||(10951108-10951480)
chr1 (8-411)||(16201895-16202307)
chr1 (8-411)||(20466761-20467173)
chr1 (8-411)||(21891630-21892020)
[»] scaffold0792 (1 HSPs)
scaffold0792 (24-411)||(4471-4862)
[»] scaffold0322 (2 HSPs)
scaffold0322 (8-411)||(1639-2043)
scaffold0322 (8-411)||(12028-12443)
[»] scaffold0254 (1 HSPs)
scaffold0254 (25-411)||(18584-18973)
[»] scaffold0237 (1 HSPs)
scaffold0237 (24-411)||(8797-9184)
[»] scaffold0143 (2 HSPs)
scaffold0143 (24-411)||(9912-10299)
scaffold0143 (24-411)||(33295-33680)
[»] scaffold0038 (1 HSPs)
scaffold0038 (8-411)||(13931-14336)
[»] scaffold0336 (1 HSPs)
scaffold0336 (8-411)||(15551-15962)
[»] scaffold0109 (1 HSPs)
scaffold0109 (8-411)||(25097-25509)
[»] scaffold0089 (1 HSPs)
scaffold0089 (25-411)||(6065-6449)
[»] scaffold0240 (1 HSPs)
scaffold0240 (47-411)||(24774-25135)
[»] scaffold0093 (1 HSPs)
scaffold0093 (239-411)||(1-173)
[»] scaffold0288 (1 HSPs)
scaffold0288 (8-189)||(359-540)
[»] scaffold0241 (1 HSPs)
scaffold0241 (8-168)||(26245-26405)
[»] scaffold0099 (2 HSPs)
scaffold0099 (304-411)||(40497-40606)
scaffold0099 (73-164)||(40759-40855)


Alignment Details
Target: chr6 (Bit Score: 369; Significance: 0; HSPs: 44)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 369; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 8 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 27284581 - 27284177
Alignment:
Q  8 tcatcagaagtttctgtgcttgtgaattcagaatttccgggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 107  Q
    ||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27284581 tcatctgaagcttctgtgcttgtgaattcaaaatttccaggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 27284482  T
Q  108 ctttgtgaatccatggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttaaaactctattttt-cttctacttt 206  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  27284481 ctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctattttttcttctacttt 27284382  T
Q  207 caaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaa 306  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27284381 caaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaa 27284282  T
Q  307 acctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagt 406  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  27284281 acctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaaacaggctcttccccaggatagt 27284182  T
Q  407 ctgtg 411  Q
    |||||    
T  27284181 ctgtg 27284177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 321; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 8 - 411
Target Start/End: Original strand, 29555537 - 29555941
Alignment:
Q  8 tcatcagaagtttctgtgcttgtgaattcagaatttccgggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 107  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29555537 tcatcagaagtttctgtgcttgtgaattcaaaatttccaggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 29555636  T
Q  108 ctttgtgaatccatggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttaaaactctatttttcttctactttc 207  Q
    |||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||  || |||||||    
T  29555637 ctttgtaaatccgtggagtcgcgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtctgaaactctgttttctttttactttc 29555736  T
Q  208 aaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttt-gaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaa 306  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  29555737 aaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttagaaaattaaaagctttttgtctattttgaaaagcaa 29555836  T
Q  307 acctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagt 406  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||  | ||||||||||    
T  29555837 acctgaacaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatatgttacaagcaggttcccctccaggatagt 29555936  T
Q  407 ctgtg 411  Q
    |||||    
T  29555937 ctgtg 29555941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 319; E-Value: 1e-180
Query Start/End: Original strand, 24 - 411
Target Start/End: Original strand, 16755815 - 16756204
Alignment:
Q  24 tgcttgtgaattcagaatttccgggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccatgg 123  Q
    |||||| ||||||| | ||||  ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  16755815 tgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtcatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtgg 16755914  T
Q  124 agtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttaaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaa 223  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16755915 agtcacgccttcggctgaccaccgctcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaa 16756014  T
Q  224 cattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaac--attttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacaggg 321  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16756015 cattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatattttgacaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacaggg 16756114  T
Q  322 tacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtg 411  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| | |||||||||||||||    
T  16756115 tacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatatgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtg 16756204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 314; E-Value: 1e-177
Query Start/End: Original strand, 9 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 27623927 - 27623522
Alignment:
Q  9 catcagaagtttctgtgcttgtgaattcagaatttccgggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagc 108  Q
    ||||||||| |||||| |||||||||||| | ||||   ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27623927 catcagaagcttctgtacttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagc 27623828  T
Q  109 tttgtgaatccatggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgttt-aaaactctattttt-cttctacttt 206  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  27623827 tttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctattttttcttctacttt 27623728  T
Q  207 caaagctatatacaaaacatttt-ctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagca 305  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27623727 caaagctatatacaaaacatttttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttaaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagca 27623628  T
Q  306 aacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatag 405  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27623627 aacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatag 27623528  T
Q  406 tctgtg 411  Q
    ||||||    
T  27623527 tctgtg 27623522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 313; E-Value: 1e-176
Query Start/End: Original strand, 24 - 411
Target Start/End: Original strand, 27063477 - 27063864
Alignment:
Q  24 tgcttgtgaattcagaatttccgggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccatgg 123  Q
    |||||||||||||| | |||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||    
T  27063477 tgcttgtgaattcaaagtttctgggaaatgtcatgattactgtgttcaatgtaccaccaactaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtgg 27063576  T
Q  124 agtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttaaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaa 223  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||     
T  27063577 agtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgtttaaaactcta-ttttcttctactttcaaagctatatacaaat 27063675  T
Q  224 cattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaaca-ttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggt 322  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27063676 cattttccttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggt 27063775  T
Q  323 acattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtg 411  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| | |||||||||||||||    
T  27063776 acattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatatgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtg 27063864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 311; E-Value: 1e-175
Query Start/End: Original strand, 26 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 13518395 - 13518009
Alignment:
Q  26 cttgtgaattcagaatttccgggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccatggag 125  Q
    |||| ||||||| | ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  13518395 cttgcgaattcaaagtttccaggaaatgtaatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 13518296  T
Q  126 tcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgttt-aaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaac 224  Q
    ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  13518295 tcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctattttttttccactttcaaagctatatacaaaac 13518196  T
Q  225 attttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtac 324  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13518195 attttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtac 13518096  T
Q  325 attcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtg 411  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| | || ||||||||||||    
T  13518095 attcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatatgttacaagcaggttctcctccgggatagtctgtg 13518009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 305; E-Value: 1e-171
Query Start/End: Original strand, 8 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 27356330 - 27355926
Alignment:
Q  8 tcatcagaagtttctgtgcttgtgaattcagaatttccgggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 107  Q
    |||||| ||| |||||| |||||||||||| | ||||   ||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27356330 tcatcaaaagcttctgtacttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttaccgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 27356231  T
Q  108 ctttgtgaatccatggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttaaaactctatttttcttctactttc 207  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  27356230 ctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaagttgagcctttgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttc 27356131  T
Q  208 aaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaaca-ttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaa 306  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  27356130 aaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttttgaaaattgaaaacctttggtctattttgaaaagcaa 27356031  T
Q  307 acctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagt 406  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||    
T  27356030 acctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggttctcctccaggatagt 27355931  T
Q  407 ctgtg 411  Q
    |||||    
T  27355930 ctgtg 27355926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 304; E-Value: 1e-171
Query Start/End: Original strand, 8 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 22929102 - 22928696
Alignment:
Q  8 tcatcagaagtttctgtgcttgtgaattcagaatttccgggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 107  Q
    ||||| |||| ||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22929102 tcatctgaagcttctgtgcttgcgaattcaaaatttccaggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 22929003  T
Q  108 ctttgtgaatccatggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttaaaactctatttttcttctactttc 207  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | ||||||||||| |||||||| |||  ||||||||||    
T  22929002 ctttgtaaatccatggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaaattgagcctatgcttttgtttgaaactctactttctttctactttc 22928903  T
Q  208 aaagctatatac--aaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattg-aaaactttttgtctattttgaaaagc 304  Q
    |||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||  |||||    
T  22928902 aaagctatgtacaaaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagtttttgtctatttttgaaagc 22928803  T
Q  305 aaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggata 404  Q
    |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22928802 aaacctgagcaatagggtacaatcaaatgaaacatgcatgagcgagtgtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggata 22928703  T
Q  405 gtctgtg 411  Q
    |||||||    
T  22928702 gtctgtg 22928696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 303; E-Value: 1e-170
Query Start/End: Original strand, 26 - 411
Target Start/End: Original strand, 27491130 - 27491516
Alignment:
Q  26 cttgtgaattcagaatttccgggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccatggag 125  Q
    |||||||||||| | ||||   ||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  27491130 cttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttaccgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 27491229  T
Q  126 tcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttaaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaaca 225  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  27491230 tcatgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagctgtatacaaaaca 27491329  T
Q  226 ttttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaaca-ttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtac 324  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27491330 ttttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttttgaaaattgaaaacctttggtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtac 27491429  T
Q  325 attcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtg 411  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||| | |||||||||||||||    
T  27491430 attcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatatgttacaagcaagttctcctccaggatagtctgtg 27491516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 300; E-Value: 1e-168
Query Start/End: Original strand, 48 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 26110589 - 26110226
Alignment:
Q  48 gaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccatggagtcacgccttcggctgaccacca 147  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  26110589 gaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccacca 26110490  T
Q  148 ctcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttaaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatg 247  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26110489 ctcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctgctttctttttactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatg 26110390  T
Q  248 acaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagc 347  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26110389 acaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctgttttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagc 26110290  T
Q  348 gagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtg 411  Q
    ||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||| ||| | ||| |||| ||||||    
T  26110289 gagagtatgttaatgtctatttccatatatgttacaagcaggttctcctccaagataatctgtg 26110226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 298; E-Value: 1e-167
Query Start/End: Original strand, 41 - 411
Target Start/End: Original strand, 28166506 - 28166878
Alignment:
Q  41 tttccgggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccatggagtcacgccttcggctg 140  Q
    ||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  28166506 tttccaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctg 28166605  T
Q  141 accaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttaaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctatttt 240  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||| |||||||||    
T  28166606 accaccactctcatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaatttattttccttctatttt 28166705  T
Q  241 gataatgacaatgcttgaaacaaaca--ttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaaca 338  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28166706 gataatgacaatgcttgaaacaaacattttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaaca 28166805  T
Q  339 tgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtg 411  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| | |||||||||||||||    
T  28166806 tgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatatgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtg 28166878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 296; E-Value: 1e-166
Query Start/End: Original strand, 26 - 411
Target Start/End: Original strand, 16680136 - 16680523
Alignment:
Q  26 cttgtgaattcagaatttccgggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccatggag 125  Q
    |||| ||||||| | ||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||    
T  16680136 cttgcgaattcaaagtttccaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgaaaatccgtggag 16680235  T
Q  126 tcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttaaaactctattttt-cttctactttcaaagctatatacaaaac 224  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||     
T  16680236 tcacgccgtcggctgaccaccactcttatacgtcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctattttttcttctactttcaaagttatatacaaaaa 16680335  T
Q  225 -attttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggta 323  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  16680336 tattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcgacagggta 16680435  T
Q  324 cattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtg 411  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| | |||||||||||||||    
T  16680436 cattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcgggttctcctccaggatagtctgtg 16680523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 290; E-Value: 1e-162
Query Start/End: Original strand, 8 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 8899918 - 8899514
Alignment:
Q  8 tcatcagaagtttctgtgcttgtgaattcagaatttccgggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 107  Q
    ||||| |||| |||||| |||||||||||| | ||||   ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8899918 tcatctgaagcttctgtacttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 8899819  T
Q  108 ctttgtgaatccatggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgttt-aaaactctatttttcttctacttt 206  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  8899818 ctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctatttt-cttctacttt 8899720  T
Q  207 caaagctatatacaaaac-attttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagca 305  Q
    ||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8899719 caaagttatatacaaaaatattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagca 8899620  T
Q  306 aacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatag 405  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||| | |||||||||    
T  8899619 aacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagggtatgttgatgtctatttcaatatatgttacaaacaggttctcctccaggatag 8899520  T
Q  406 tctgtg 411  Q
    ||||||    
T  8899519 tctgtg 8899514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 289; E-Value: 1e-162
Query Start/End: Original strand, 57 - 411
Target Start/End: Original strand, 4763791 - 4764146
Alignment:
Q  57 tgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccatggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatac 156  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4763791 tgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatac 4763890  T
Q  157 atcaatttgagcttgtgcttttgttt-aaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgct 255  Q
    ||| |||||||| | ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  4763891 atctatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctatttt-cttctactttcaaagctatatacaaatcattttccttctattttgataatgacaatgct 4763989  T
Q  256 tgaaacaaacatttt-gaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagta 354  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4763990 tgaaacaaacatttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagta 4764089  T
Q  355 tgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtg 411  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |  ||||||||||||||    
T  4764090 tgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggttctccttcaggatagtctgtg 4764146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 289; E-Value: 1e-162
Query Start/End: Original strand, 48 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 26772807 - 26772444
Alignment:
Q  48 gaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccatggagtcacgccttcggctgaccacca 147  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||    
T  26772807 gaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgcctttggctgaccacca 26772708  T
Q  148 ctcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttaaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatg 247  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26772707 ctcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaattcta-ttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatg 26772609  T
Q  248 acaatgcttgaaacaaaca-ttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgag 346  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  26772608 acaatgcttgaaacaaacatttttgaagattgaaaactttttgtctattttgaaaaacaaacctgagcaacagggtacaatcaaatgaaacatgcatgag 26772509  T
Q  347 cgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtg 411  Q
    |||| ||||||  |||||||||||||||| || |||||||||| ||| | |||||||||||||||    
T  26772508 cgagggtatgtgaatgtctatttcaatatatgctacaagcaggttctcctccaggatagtctgtg 26772444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 287; E-Value: 1e-161
Query Start/End: Original strand, 8 - 411
Target Start/End: Original strand, 27200165 - 27200569
Alignment:
Q  8 tcatcagaagtttctgtgcttgtgaattcagaatttccgggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaa-ttaccattttccaa 106  Q
    |||||| ||| |||||| |||||| ||||| | ||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  27200165 tcatcaaaagcttctgtacttgtggattcaaagtttctaagaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaaattaccattttccaa 27200264  T
Q  107 gctttgtgaatccatggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttaaaactctatttttcttctacttt 206  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  27200265 gctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatctatttgagcttgtgcttttgattaaaactctatttt-cttctacttt 27200363  T
Q  207 caaagctatatacaaaa-cattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatt-ttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagc 304  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27200364 caaagctatgtacaaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattcttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagc 27200463  T
Q  305 aaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggata 404  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||| ||| | ||||| ||    
T  27200464 aaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgaacgagagtatgttgatgtgtatttcaatgtatgttacaagcaggttctcctccagg-ta 27200562  T
Q  405 gtctgtg 411  Q
    |||||||    
T  27200563 gtctgtg 27200569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 287; E-Value: 1e-161
Query Start/End: Original strand, 8 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 27249068 - 27248664
Alignment:
Q  8 tcatcagaagtttctgtgcttgtgaattcagaatttccgggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaa-ttaccattttccaa 106  Q
    |||||| ||| |||||| |||||| ||||| | ||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  27249068 tcatcaaaagcttctgtacttgtggattcaaagtttctaagaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaaattaccattttccaa 27248969  T
Q  107 gctttgtgaatccatggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttaaaactctatttttcttctacttt 206  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  27248968 gctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatctatttgagcttgtgcttttgattaaaactctatttt-cttctacttt 27248870  T
Q  207 caaagctatatacaaaa-cattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatt-ttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagc 304  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27248869 caaagctatgtacaaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattcttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagc 27248770  T
Q  305 aaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggata 404  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||| ||| | ||||| ||    
T  27248769 aaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgaacgagagtatgttgatgtgtatttcaatgtatgttacaagcaggttctcctccagg-ta 27248671  T
Q  405 gtctgtg 411  Q
    |||||||    
T  27248670 gtctgtg 27248664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 287; E-Value: 1e-161
Query Start/End: Original strand, 57 - 411
Target Start/End: Original strand, 29507444 - 29507801
Alignment:
Q  57 tgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccatggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatac 156  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29507444 tgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatac 29507543  T
Q  157 atcaatttgagcttgtgcttttgtttaaaactctatttt--tcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgc 254  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||  | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  29507544 atcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctgctttctttttttactttcaaagctatatacaaaacattttctttctcttttgataatgacaatgc 29507643  T
Q  255 ttgaaacaaacatttt-gaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagt 353  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  29507644 ttgaaacaaacatttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatggaacatgcatgagcgagagt 29507743  T
Q  354 atgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtg 411  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| | |||||||||||||||    
T  29507744 atgttgatgtctatttcaatatatgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtg 29507801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 286; E-Value: 1e-160
Query Start/End: Original strand, 8 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 4539978 - 4539573
Alignment:
Q  8 tcatcagaagtttctgtgcttgtgaattcagaatttccgggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaa-ttaccattttccaa 106  Q
    |||||| ||| |||||| |||||||||||| | ||||   ||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  4539978 tcatcaaaagcttctgtacttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttaccgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaaattaccattttccaa 4539879  T
Q  107 gctttgtgaatccatggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttaaaactctatttttcttct-actt 205  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| | ||||    
T  4539878 gctttgtgaatccgtggagtcatgccttcggctgaccaccactcttatacatcaaattgagcttgtgctgttgtttgaaactctatttttctttttactt 4539779  T
Q  206 tcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagca 305  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  4539778 tcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctgttttgaaaagca 4539679  T
Q  306 aacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatag 405  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| ||| | ||| ||||     
T  4539678 aacctgagcaacagggtacgttcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttaatgtctatttcaatatatgttacaagcaggttctcctccaagataa 4539579  T
Q  406 tctgtg 411  Q
    ||||||    
T  4539578 tctgtg 4539573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 285; E-Value: 1e-159
Query Start/End: Original strand, 8 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 34458725 - 34458323
Alignment:
Q  8 tcatcagaagtttctgtgcttgtgaattcagaatttccgggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 107  Q
    |||||| ||| |||||| |||||||||||| | ||||   ||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34458725 tcatcaaaagcttctgtacttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttaccgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 34458626  T
Q  108 ctttgtgaatccatggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgttt-aaaactctatttttcttctacttt 206  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| | ||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||    
T  34458625 ctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaagttgagcctttgcttttgtttgaaaactctatttt-cttctatttt 34458527  T
Q  207 caaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaa 306  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  34458526 ctaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatggttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttt-gtctattttgaaaagcaa 34458428  T
Q  307 acctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagt 406  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||    
T  34458427 acctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagtgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggttctcctccaggatagt 34458328  T
Q  407 ctgtg 411  Q
    |||||    
T  34458327 ctgtg 34458323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 278; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 8 - 411
Target Start/End: Original strand, 28213433 - 28213838
Alignment:
Q  8 tcatcagaagtttctgtgcttgtgaattcagaatttccgggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaa-ttaccattttccaa 106  Q
    |||||| ||| |||||| |||||||||||| | ||||   ||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  28213433 tcatcaaaagcttctgtacttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttaccgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaaattaccattttccaa 28213532  T
Q  107 gctttgtgaatccatggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttaaaactctatttttcttctacttt 206  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  28213533 gctttgtgaatccgtggagtcatgccttcggctgaccaccactcttatacatcaaattgagcttgtgctgttgtttgaaactctatttttcttctacttt 28213632  T
Q  207 caaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaaca-ttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagca 305  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  28213633 caaagctgtatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttttgaaaattgaaaactttttgtgtgttttgaaaagca 28213732  T
Q  306 aacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatag 405  Q
    | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| ||| | ||| ||||     
T  28213733 agcctgagcaacagggtacgttcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttaatgtctatttcaatatatgttacaagcaggttctcctccaagataa 28213832  T
Q  406 tctgtg 411  Q
    ||||||    
T  28213833 tctgtg 28213838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 278; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 8 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 33370650 - 33370246
Alignment:
Q  8 tcatcagaagtttctgtgcttgtgaattcagaatttccgggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 107  Q
    |||||| ||| |||||| |||||||||||| | ||||   ||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33370650 tcatcaaaagcttctgtacttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttaccgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 33370551  T
Q  108 ctttgtgaatccatggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgttt-aaaactctatttttcttctacttt 206  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| | ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  33370550 ctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaagttgagcctttgcttttgtttgaaaactctatttt-cttctacttt 33370452  T
Q  207 caaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttt-gaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagca 305  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||     
T  33370451 caaagctatatacaaagcattttctttctcttttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttttgaaaattgaaatttttttgtctattttgaaaagcg 33370352  T
Q  306 aacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatag 405  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||    
T  33370351 aacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagtgagagtatgttgatgtctatttcaatatatgttacaagcaggctctcctccaggatag 33370252  T
Q  406 tctgtg 411  Q
    ||||||    
T  33370251 tctgtg 33370246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 274; E-Value: 1e-153
Query Start/End: Original strand, 25 - 411
Target Start/End: Original strand, 4778876 - 4779264
Alignment:
Q  25 gcttgtgaattcagaatttccgggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaa-ttaccattttccaagctttgtgaatccatgg 123  Q
    ||||| ||||||| | ||| | ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  4778876 gcttgcgaattcaaagttttcaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtgg 4778975  T
Q  124 agtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttaaaactctatttttcttctactttc-aaagctatatacaaa 222  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||    
T  4778976 agtcacgcctccggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaaagctgtatacgaa 4779075  T
Q  223 acattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaaca-ttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacaggg 321  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4779076 acattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacaggg 4779175  T
Q  322 tacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtg 411  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||| | ||| |||| ||||||    
T  4779176 tacattcaaatg-aacatgcatgagcgagtgtgtgttggtgtctatttcaatatatgttacaagcaggttctcctccaagataatctgtg 4779264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 274; E-Value: 1e-153
Query Start/End: Original strand, 19 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 30552208 - 30551815
Alignment:
Q  19 ttctgtgcttgtgaattcagaatttccgggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatc 118  Q
    |||||| |||||| ||||| | || || ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30552208 ttctgtacttgtggattcaaagttcccaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatc 30552109  T
Q  119 catggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttaaaactctatttttcttctactttcaaagctatata 218  Q
    | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||| ||||  || ||||||||||||||||||    
T  30552108 cgtggagtcatgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagactgtgcttttgtttgaaactctgttttctttttactttcaaagctatata 30552009  T
Q  219 caaaa-cattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaac 317  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  30552008 caaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaaccttttgtctattttgaaaagcaaacccgagcaac 30551909  T
Q  318 agggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtg 411  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||| || |||||||||| ||| | |||||||||||||||    
T  30551908 agggtacaatcaaatgaaacatgcatgagcgagggtatgtgaatgtctatttcaatatatgctacaagcaggttctcctccaggatagtctgtg 30551815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 273; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 47 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 13293125 - 13292766
Alignment:
Q  47 ggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccatggagtcacgccttcggctgaccacc 146  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  13293125 ggaaatgtaatgattaccgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccacc 13293026  T
Q  147 actcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttaaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataat 246  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13293025 actcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataat 13292926  T
Q  247 gacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgag 346  Q
    || |||||| ||||||||||| ||||||||||||||  ||||     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13292925 gataatgctcgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagtttt-----ttttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgag 13292831  T
Q  347 cgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtg 411  Q
     ||| || ||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||| ||| | |||||||||||||||    
T  13292830 tgagcgtgtgttggtgtctatttcaatatatgttataagcaggttctcctccaggatagtctgtg 13292766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 273; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 32 - 411
Target Start/End: Original strand, 29579018 - 29579397
Alignment:
Q  32 aattcagaatttccgggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccatggagtcacgc 131  Q
    |||||| | ||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||    
T  29579018 aattcaaagtttccaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcatgc 29579117  T
Q  132 cttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttaaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttct 231  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||     
T  29579118 cttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgtttgaaactcta-ttttcttctattttcaaagctatatacaaatcattttcc 29579216  T
Q  232 ttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttg-aaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaa 330  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  29579217 ttctatcttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacaatcaa 29579316  T
Q  331 atgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtg 411  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||| || |||||||||| ||| |  ||||||||||||||    
T  29579317 atgaaacatgcatgagcgagggtatgtgaatgtctatttcaatatatgctacaagcaggttctccttcaggatagtctgtg 29579397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 271; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 46 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 16938205 - 16937840
Alignment:
Q  46 gggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccatggagtcacgccttcggctgaccac 145  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||    
T  16938205 gggaaatgtaatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggccgaccac 16938106  T
Q  146 cactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttaaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataa 245  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||    
T  16938105 cactcttatacatcaaattgagcctgtgcttttgtttaaaactcta-ttttcttctattttcaaagctatatacaaattattttccttctattttgataa 16938007  T
Q  246 tgacaatgcttgaaacaaaca-ttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatg 344  Q
    || |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16938006 tggcaatgcttgaaacaaacatttttgaaaactgaaaactttttgtttattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatg 16937907  T
Q  345 agcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtg 411  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||| ||| | ||| |||| ||||||    
T  16937906 agcgagagtatgttggtgtctatttcaatatatgttaccagcaggttctcctccaagataatctgtg 16937840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 270; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 8 - 411
Target Start/End: Original strand, 4531267 - 4531671
Alignment:
Q  8 tcatcagaagtttctgtgcttgtgaattcagaatttccgggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 107  Q
    |||||| ||| |||||| |||||||||||  | |||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4531267 tcatcaaaagcttctgtacttgtgaattcgaagtttctgggaaatgtcatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 4531366  T
Q  108 ctttgtgaatccatggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttaaaactctatttttcttctactttc 207  Q
    |||||||||||| |||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  4531367 ctttgtgaatccgtggagtcgtgccttcggctgatcaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttc 4531466  T
Q  208 aaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaaca-ttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaa 306  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4531467 aaagctgtatacaaaacattctctttccattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaa 4531566  T
Q  307 acctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctat-ttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatag 405  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||| | ||||||| |||||||| ||||||||||||| ||| | ||| ||||     
T  4531567 acccgagcaacagggtacattcaaatg-aacatgcatgagcgagtgtgtgtgggtgtctatcttcaatatatgttacaagcaggttctcctccaagataa 4531665  T
Q  406 tctgtg 411  Q
    ||||||    
T  4531666 tctgtg 4531671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 270; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 24 - 411
Target Start/End: Original strand, 26791811 - 26792199
Alignment:
Q  24 tgcttgtgaattcagaatttccgggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccatgg 123  Q
    |||||| ||||||| | ||||  ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||    
T  26791811 tgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtcatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtgg 26791910  T
Q  124 agtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgttt-aaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaa 222  Q
    | ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26791911 aatcacgcctttggctgaccaccactcttatacgtcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaaactcta-ttttcttctactttcaaagctatatacaaa 26792009  T
Q  223 acattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaaca-ttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacaggg 321  Q
     ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26792010 tcattttccttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacaggg 26792109  T
Q  322 tacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtg 411  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||| || |||||||||| ||| |  ||||||||||||||    
T  26792110 tacaatcaaatgaaacatgcatgagcgagggtatgtgaatgtctatttcaatatatgctacaagcaggttctccttcaggatagtctgtg 26792199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 261; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 24 - 408
Target Start/End: Complemental strand, 14139597 - 14139218
Alignment:
Q  24 tgcttgtgaattcagaatttccgggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccatgg 123  Q
    |||||| ||||||| | ||||  ||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||    
T  14139597 tgcttgcgaattcaaagtttctaggagatgtcatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtgg 14139498  T
Q  124 agtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttaaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaa 223  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||  |||  || |||||||||||||||||||||||    
T  14139497 agtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatctatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctgctttctttttactttcaaagctatatacaaaa 14139398  T
Q  224 cattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggta 323  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||     ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  14139397 cattttctttctattttgataatgataatgctcgaaacaaacattttgaaaattgaaaaagtttt-----ttttgaaaagcaaacctgagcaacatggta 14139303  T
Q  324 cattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtct 408  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||    
T  14139302 cattcaaatgagacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggttctcctccaggatagtct 14139218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 258; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 24 - 408
Target Start/End: Original strand, 27013728 - 27014106
Alignment:
Q  24 tgcttgtgaattcagaatttccgggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccatgg 123  Q
    |||||| ||||||| | ||||  ||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||    
T  27013728 tgcttgcgaattcaaagtttctaggagatgtcatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtgg 27013827  T
Q  124 agtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttaaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaa 223  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||  |||  || |||||||||||||||||||||||    
T  27013828 agtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatctatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctgctttctttttactttcaaagctatatacaaaa 27013927  T
Q  224 cattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggta 323  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||      ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27013928 cattttctttctattttgataatgataatgctcgaaacaaacattttgaaaattgaaaaagttt------ttttgaaaagcaaacctgagcaacagggta 27014021  T
Q  324 cattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtct 408  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||    
T  27014022 cattcaaatgagacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctattttaatatgtgttacaagcaggttctcctccaggatagtct 27014106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 243; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 24 - 411
Target Start/End: Original strand, 26926763 - 26927135
Alignment:
Q  24 tgcttgtgaattcagaatttccgggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccatgg 123  Q
    |||||| ||||||| | ||||  ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||    
T  26926763 tgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtcatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtgg 26926862  T
Q  124 agtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttaaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaa 223  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||      
T  26926863 agtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaaattgagcctgtgcttttgtttaaaactcta-ttttcttctactttcaaagctatatacaatt 26926961  T
Q  224 cattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaaca-ttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggt 322  Q
     |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26926962 tattttccttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggt 26927061  T
Q  323 acattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtg 411  Q
    ||||||||||               |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| | | |||||||||||||    
T  26927062 acattcaaat---------------gagagtatgttgatgtctatttcaatatatgttacaagcaggttctcctctaggatagtctgtg 26927135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 110 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 26666774 - 26666473
Alignment:
Q  110 ttgtgaatccatggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttaaaactctatttttcttctactttcaa 209  Q
    |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||    
T  26666774 ttgtgaatccgtggagtcacgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaattctatttt-cttctactttcaa 26666676  T
Q  210 agctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttt-gaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaac 308  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  26666675 agctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttttgaagattgaaaactttttgtctattttgaaaaacaaac 26666576  T
Q  309 ctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtct 408  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||| || |||||||||| ||| | ||||||||||||    
T  26666575 ctgagcaacagggtacaatcaaatgaaacatgcatgagcgagggtatgtgaatgtctatttcaatatatgctacaagcaggttctcctccaggatagtct 26666476  T
Q  409 gtg 411  Q
    |||    
T  26666475 gtg 26666473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 24 - 411
Target Start/End: Original strand, 27208899 - 27209283
Alignment:
Q  24 tgcttgtgaattcagaatttccgggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccatgg 123  Q
    |||||| ||||||| | ||||  ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||    
T  27208899 tgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaacccataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtgg 27208998  T
Q  124 agtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttaaaactctatttttcttctactttcaaagctatatac-aaa 222  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||  || ||||||||||| ||| ||| |||    
T  27208999 agtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcgtgtgcttttgtttgaaactctattttctttttactttcaaagttatgtacaaaa 27209098  T
Q  223 acattttctttcta---ttttgataatgac-aatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaaca 318  Q
    |||||||| |||||   |||| |||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||  ||       ||||||||||||||| |||||||||    
T  27209099 acattttccttctatttttttaataatgacaaatgctcgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagtt-------ttttgaaaagcaaacttgagcaaca 27209191  T
Q  319 gggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtg 411  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27209192 gggtacattcaaatg-aacgtgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatatgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtg 27209283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 24 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 27240329 - 27239945
Alignment:
Q  24 tgcttgtgaattcagaatttccgggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccatgg 123  Q
    |||||| ||||||| | ||||  ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||    
T  27240329 tgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaacccataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtgg 27240230  T
Q  124 agtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttaaaactctatttttcttctactttcaaagctatatac-aaa 222  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||  || ||||||||||| ||| ||| |||    
T  27240229 agtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcgtgtgcttttgtttgaaactctattttctttttactttcaaagttatgtacaaaa 27240130  T
Q  223 acattttctttcta---ttttgataatgac-aatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaaca 318  Q
    |||||||| |||||   |||| |||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||  ||       ||||||||||||||| |||||||||    
T  27240129 acattttccttctatttttttaataatgacaaatgctcgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagtt-------ttttgaaaagcaaacttgagcaaca 27240037  T
Q  319 gggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtg 411  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27240036 gggtacattcaaatg-aacgtgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatatgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtg 27239945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 25 - 411
Target Start/End: Original strand, 27031019 - 27031403
Alignment:
Q  25 gcttgtgaattcagaatttccgggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccatgga 124  Q
    ||||||||||||| | ||||  ||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  27031019 gcttgtgaattcaaagtttctaggaaatgtaatgattgctgtattcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtgga 27031118  T
Q  125 gtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttaaaactctatttttcttctactttcaaagctatatac--aaa 222  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||  || ||||||||||| ||| |||  |||    
T  27031119 gtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgtttgaaactctgttttctttttactttcaaagttatgtacaaaaa 27031218  T
Q  223 acattttctttctattttgataatgac-aatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacaggg 321  Q
    |||||||| ||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||  |||    | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  27031219 acattttccttctattttaataatgacaaatgctcgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagttt----ttttttgaaaagcaaacctgagcaacaggg 27031314  T
Q  322 tacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtg 411  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||| | |||||||||||||||    
T  27031315 tacattcaaatg-aacatgcatgagcgagtgtgtgttggtgtctatttcaatatatgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtg 27031403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 24 - 411
Target Start/End: Original strand, 24869705 - 24870087
Alignment:
Q  24 tgcttgtgaattcagaatttccgggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccatgg 123  Q
    |||||| ||||||| | ||||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||    
T  24869705 tgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtcatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtgg 24869804  T
Q  124 agtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttaaaactctatttttcttctactttcaaagctatatac-aaa 222  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||  || ||||||||||| ||| ||| |||    
T  24869805 agtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgtttgaaactctactttctttttactttcaaagttatgtacaaaa 24869904  T
Q  223 acattttctttcta-ttttgataatgac-aatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagg 320  Q
    |||||||| ||||| |||| |||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||  ||       |||||||||||||||||||||||||||    
T  24869905 acattttccttctatttttaataatgacaaatgctcgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagtt-------ttttgaaaagcaaacctgagcaacagg 24869997  T
Q  321 gtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtg 411  Q
    ||||||||||| | |||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||  ||| | |||||||||||||||    
T  24869998 gtacattcaaacg-aacatgcatgagcgagtgtgtgttggtgtctatttcaatatatgttacaagcagtttctcctccaggatagtctgtg 24870087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 47 - 411
Target Start/End: Original strand, 27025163 - 27025524
Alignment:
Q  47 ggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccatggagtcacgccttcggctgaccacc 146  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  27025163 ggaaatgtaatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggagtcacgccttcggctgaccacc 27025262  T
Q  147 actcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttaaaactctatttttcttctactttcaaagctatatac--aaaacattttctttcta-ttttgat 243  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||  |||  || ||||||||||| ||| |||  ||||||||||| ||||| |||| ||    
T  27025263 actcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgtttgaaactctgctttctttttactttcaaagttatgtacaaaaaacattttccttctatttttaat 27025362  T
Q  244 aatgac-aatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgca 342  Q
    |||||| |||||| ||||||| ||| ||||||||||||||  ||       |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  27025363 aatgacaaatgctcgaaacaagcatcttgaaaattgaaaaagtt-------ttttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaacgagacatgca 27025455  T
Q  343 tgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtg 411  Q
    ||||| || || ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||| | |||||||||||||||    
T  27025456 tgagctagtgtgtgttggtgtctatttcaatatatgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtg 27025524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 181; E-Value: 1e-97
Query Start/End: Original strand, 25 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 24299957 - 24299575
Alignment:
Q  25 gcttgtgaattcagaatttccgggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccatgga 124  Q
    ||||| ||||||| | ||||  ||||||||| |||||  ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  24299957 gcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtaatgattgttgtgttcaatgtatcaccaacccataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtgga 24299858  T
Q  125 gtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttaaaactctatttttcttctactttcaaagctatatac-aaaa 223  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||  |||  || |||| |||||| ||| ||| ||||    
T  24299857 gtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgtttgaaactctgctttctttttactctcaaagttatgtacaaaaa 24299758  T
Q  224 cattttctttctattttgataatgac-aatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggt 322  Q
    | ||| | |||| |||| |||||||| |||||| | ||||||||| ||||||||||||||  ||||     |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  24299757 cgtttcccttcttttttaataatgacaaatgctcggaacaaacatcttgaaaattgaaaaagtttt-----ttttgaaaagcaaacctgagtaacagggt 24299663  T
Q  323 acattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtg 411  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||||| || ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||| | |||||||||||||||    
T  24299662 acattcaaatg-aacatgcataagcgagtgtgtgttggtgtctatttcaatatatgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtg 24299575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 174; E-Value: 2e-93
Query Start/End: Original strand, 47 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 15406709 - 15406348
Alignment:
Q  47 ggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaa-ttaccattttccaagctttgtgaatccatggagtcacgccttcggctgaccac 145  Q
    ||||||||  ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  15406709 ggaaatgtcatgattgctgtgttcaatgtatcaccaaccaataaaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggagtcacgccttcggctgaccac 15406610  T
Q  146 cactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttaaaactctatttttcttctactttcaaagctatatac-aaaacattttctttcta-ttttgat 243  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||  |||  || ||||||||||| ||| ||| ||||||||||| ||||| |||| ||    
T  15406609 cactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgtttgaaactctgctttctttttactttcaaagatatgtacaaaaacattttccttctatttttaat 15406510  T
Q  244 aatgac-aatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgca 342  Q
    |||||| |||||| ||||||||||| | |||||||| |||   ||      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  15406509 aatgacaaatgctcgaaacaaacatctggaaaattggaaaaagtt------ttttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaacg-aacatgca 15406417  T
Q  343 tgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtg 411  Q
    |||||||| |||||||| ||||||||||||  | ||||||||||||| ||| | |||||||||||||||    
T  15406416 tgagcgagtgtatgttggtgtctatttcaacgtatgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtg 15406348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 174; E-Value: 2e-93
Query Start/End: Original strand, 47 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 15418496 - 15418135
Alignment:
Q  47 ggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaa-ttaccattttccaagctttgtgaatccatggagtcacgccttcggctgaccac 145  Q
    ||||||||  ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  15418496 ggaaatgtcatgattgctgtgttcaatgtatcaccaaccaataaaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggagtcacgccttcggctgaccac 15418397  T
Q  146 cactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttaaaactctatttttcttctactttcaaagctatatac-aaaacattttctttcta-ttttgat 243  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||  |||  || ||||||||||| ||| ||| ||||||||||| ||||| |||| ||    
T  15418396 cactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgtttgaaactctgctttctttttactttcaaagatatgtacaaaaacattttccttctatttttaat 15418297  T
Q  244 aatgac-aatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgca 342  Q
    |||||| |||||| ||||||||||| | |||||||| |||   ||      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  15418296 aatgacaaatgctcgaaacaaacatctggaaaattggaaaaagtt------ttttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaacg-aacatgca 15418204  T
Q  343 tgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtg 411  Q
    |||||||| |||||||| ||||||||||||  | ||||||||||||| ||| | |||||||||||||||    
T  15418203 tgagcgagtgtatgttggtgtctatttcaacgtatgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtg 15418135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 47 - 399
Target Start/End: Original strand, 20174567 - 20174930
Alignment:
Q  47 ggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccatggagtcacgccttcggctgaccacc 146  Q
    |||||| ||||| ||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||    
T  20174567 ggaaatatagtgtttaccatgctcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccatggagtcccgcctttggctgaccacc 20174666  T
Q  147 actcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttaaaactctatttttcttc--tactttcaaagctatatac-aaaacattttctttctattttgat 243  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||  ||  ||||| ||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  20174667 actcttatacatcaatttgagtctgtgcttttgtttgaaactctattttttctctttacttccaaagttatgtacaaaaacattttctttctattttgat 20174766  T
Q  244 aatgacaatgcttg-aaacaaacattttgaaa------attgaaaactttt-tgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaa 335  Q
     ||||||||||||| ||||||||||| | |||      ||  | || |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||| ||||    
T  20174767 gatgacaatgcttgaaaacaaacattctaaaaaaaaatatcaagaagttttctgtctattttgaaaagcaaaccttagcaacaaggtactttcaagtgaa 20174866  T
Q  336 acatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttcccca 399  Q
    ||||||||||||||| |    |  |||| ||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  20174867 acatgcatgagcgagtgcgcatcaatgtatatctcaatatgtgttacaagcaagcttttcccca 20174930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 47 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 22161424 - 22161061
Alignment:
Q  47 ggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccatggagtcacgccttcggctgaccacc 146  Q
    |||||| ||||| ||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||    
T  22161424 ggaaatatagtgtttaccatgctcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccatggagtcccgcctttggctgaccacc 22161325  T
Q  147 actcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttaaaactctatttttcttc--tactttcaaagctatatac-aaaacattttctttctattttgat 243  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||  ||  ||||| ||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  22161324 actcttatacatcaatttgagtctgtgcttttgtttgaaactctattttttctctttacttccaaagttatgtacaaaaacattttctttctattttgat 22161225  T
Q  244 aatgacaatgcttg-aaacaaacattttgaaa------attgaaaactttt-tgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaa 335  Q
     ||||||||||||| ||||||||||| | |||      ||  | || |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||| ||||    
T  22161224 gatgacaatgcttgaaaacaaacattctaaaaaaaaatatcaagaagttttctgtctattttgaaaagcaaaccttagcaacaaggtactttcaagtgaa 22161125  T
Q  336 acatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttcccca 399  Q
    ||||||||||||||| |    |  |||| ||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  22161124 acatgcatgagcgagtgcgcatcaatgtatatctcaatatgtgttacaagcaagcttttcccca 22161061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 8 - 105
Target Start/End: Complemental strand, 23851547 - 23851450
Alignment:
Q  8 tcatcagaagtttctgtgcttgtgaattcagaatttccgggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttcca 105  Q
    ||||| |||| ||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23851547 tcatctgaagcttctgtgcttgcgaattcaaaatttccaggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttcca 23851450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 333; Significance: 0; HSPs: 49)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 333; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 47 - 407
Target Start/End: Original strand, 11555382 - 11555742
Alignment:
Q  47 ggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccatggagtcacgccttcggctgaccacc 146  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  11555382 ggaaatgtaatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccacc 11555481  T
Q  147 actcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttaaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataat 246  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11555482 actcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataat 11555581  T
Q  247 gacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgag 346  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11555582 gacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaacttcttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgag 11555681  T
Q  347 cgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtc 407  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||    
T  11555682 cgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggttctcctccaggatagtc 11555742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 322; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 20 - 411
Target Start/End: Original strand, 3795539 - 3795932
Alignment:
Q  20 tctgtgcttgtgaattcagaatttccgggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatcc 119  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3795539 tctgtgcttgtgaattcaaaatttccaggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatcc 3795638  T
Q  120 atggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgttt-aaaactctatttt-tcttctactttcaaagctatat 217  Q
     |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  3795639 gtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaattctattttttcttctactttcaaagctatat 3795738  T
Q  218 acaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaac 317  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3795739 acaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaaccttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaac 3795838  T
Q  318 agggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtg 411  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||| | |||||||||||||||    
T  3795839 agggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatatgttataagcaggttctcctccaggatagtctgtg 3795932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 315; E-Value: 1e-177
Query Start/End: Original strand, 26 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 18369686 - 18369300
Alignment:
Q  26 cttgtgaattcagaatttccgggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccatggag 125  Q
    |||| ||||||| | ||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  18369686 cttgcgaattcaaagtttccaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 18369587  T
Q  126 tcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgttt-aaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaac 224  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18369586 tcatgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgaaccttcgcttttgtttgaaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaac 18369487  T
Q  225 attttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtac 324  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18369486 attttctttctattttggtaatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtac 18369387  T
Q  325 attcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtg 411  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||    
T  18369386 attcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtg 18369300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 313; E-Value: 1e-176
Query Start/End: Original strand, 25 - 411
Target Start/End: Original strand, 30174471 - 30174859
Alignment:
Q  25 gcttgtgaattcagaatttccgggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccatgga 124  Q
    ||||| ||||||| | ||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  30174471 gcttgcgaattcaaagtttccaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtgga 30174570  T
Q  125 gtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgttt-aaaactctatttt-tcttctactttcaaagctatatacaaa 222  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  30174571 gtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctattttttcttctactttcaaagctatatacaaa 30174670  T
Q  223 acattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggt 322  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30174671 acattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggt 30174770  T
Q  323 acattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtg 411  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||    
T  30174771 acattcaaatgaaacatgcatgagtgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtg 30174859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 312; E-Value: 1e-176
Query Start/End: Original strand, 25 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 40467708 - 40467321
Alignment:
Q  25 gcttgtgaattcagaatttccgggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccatgga 124  Q
    ||||| ||||||| | ||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||    
T  40467708 gcttgcgaattcaaagtttccaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttataaatccgtgga 40467609  T
Q  125 gtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttaaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaac 224  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  40467608 gtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttaaaactctattttctttctactttcaaagctatatacaaaac 40467509  T
Q  225 attttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaaca-ttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggta 323  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40467508 attttctttccattttaataatgacaatgcttgaaacaaacatttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggta 40467409  T
Q  324 cattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtg 411  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| | |||||||||||||||    
T  40467408 cattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatatgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtg 40467321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 311; E-Value: 1e-175
Query Start/End: Original strand, 26 - 411
Target Start/End: Original strand, 33881133 - 33881519
Alignment:
Q  26 cttgtgaattcagaatttccgggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccatggag 125  Q
    |||| ||||||| | ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  33881133 cttgcgaattcaaagtttccaggaaatgtaatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 33881232  T
Q  126 tcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgttt-aaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaac 224  Q
    ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  33881233 tcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctattttttttccactttcaaagctatatacaaaac 33881332  T
Q  225 attttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtac 324  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33881333 attttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtac 33881432  T
Q  325 attcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtg 411  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| | || ||||||||||||    
T  33881433 attcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatatgttacaagcaggttctcctccgggatagtctgtg 33881519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 304; E-Value: 1e-171
Query Start/End: Original strand, 24 - 411
Target Start/End: Original strand, 28655247 - 28655636
Alignment:
Q  24 tgcttgtgaattcagaatttccgggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccatgg 123  Q
    |||||| ||||||| | ||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  28655247 tgcttgcgaattcaaagttttcaggaaatgtaatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtgg 28655346  T
Q  124 agtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttaaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaa 223  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28655347 agtcacgccttcggctgactaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgtttaaaactcta-ttttcttctactttcaaagctatatacaaaa 28655445  T
Q  224 cattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaaca--ttttgaaaattgaaaac-tttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagg 320  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28655446 cattttctttctattttaataatgacaatgctcgaaacaaacattttttgaaaattgaaaacttttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagg 28655545  T
Q  321 gtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtg 411  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| | |||||||||||||||    
T  28655546 gtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatatgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtg 28655636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 301; E-Value: 1e-169
Query Start/End: Original strand, 47 - 408
Target Start/End: Complemental strand, 9544842 - 9544478
Alignment:
Q  47 ggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccatggagtcacgccttcggctgaccacc 146  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  9544842 ggaaatgtaatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggagtcacgccttcggctgaccacc 9544743  T
Q  147 actcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttaaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataat 246  Q
    ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  9544742 actcttatacatcaaattgagcctgtgcttttgtttaaaactcta-ttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttccttctattttgataat 9544644  T
Q  247 gacaatgcttgaaacaaaca----ttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgca 342  Q
    ||||||||||||||||||||    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9544643 gacaatgcttgaaacaaacattttttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagtaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgca 9544544  T
Q  343 tgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtct 408  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||    
T  9544543 tgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggttctcctccaggatagtct 9544478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 301; E-Value: 1e-169
Query Start/End: Original strand, 48 - 411
Target Start/End: Original strand, 30158063 - 30158427
Alignment:
Q  48 gaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccatggagtcacgccttcggctgaccacca 147  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||    
T  30158063 gaaatgtagtgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgcctttggctgaccacca 30158162  T
Q  148 ctcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttaaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatg 247  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  30158163 ctcttacacatcaatttgagcttgtgcttttgtttaaaactctacctttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttccttctattttgataatg 30158262  T
Q  248 acaatgcttgaaacaaaca-ttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgag 346  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  30158263 acaatgcttgaaacaaacatttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacggggtacattcaaatgaaacatgcatgag 30158362  T
Q  347 cgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtg 411  Q
    ||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| ||| | |||||||||||||||    
T  30158363 cgagaatatgttaatgtctatttcaatatatgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtg 30158427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 299; E-Value: 1e-168
Query Start/End: Original strand, 46 - 411
Target Start/End: Original strand, 6880331 - 6880697
Alignment:
Q  46 gggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccatggagtcacgccttcggctgaccac 145  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  6880331 gggaaatgtaatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccac 6880430  T
Q  146 cactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttaaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataa 245  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  6880431 cactcttatacatcaaattgagcctgtgcttttgtttaagactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttcttcctattttgataa 6880530  T
Q  246 tgacaatgcttgaaacaaaca-ttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatg 344  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6880531 tgacaatgcttgaaacaaacatttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatg 6880630  T
Q  345 agcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtg 411  Q
    |||||| || ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||| | ||| |||| ||||||    
T  6880631 agcgagtgtgtgttggtgtctatttcaatgtgtgttacaagcaggttctcctccaagataatctgtg 6880697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 299; E-Value: 1e-168
Query Start/End: Original strand, 25 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 13318982 - 13318596
Alignment:
Q  25 gcttgtgaattcagaatttccgggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccatgga 124  Q
    ||||| ||||||| | |||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  13318982 gcttgcgaattcaaagtttctgggaaatgttatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtgga 13318883  T
Q  125 gtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttaaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaac 224  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||  || ||||||||||||||||||||||||    
T  13318882 gtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctgctttctttttactttcaaagctatatacaaaac 13318783  T
Q  225 attttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtac 324  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13318782 attttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctgttttgaaaagcaaacctgagcaacagggtac 13318683  T
Q  325 attcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtg 411  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| ||| | ||| |||| ||||||    
T  13318682 attcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttaatgtctatttcaatatatgttacaagcaggttctcctccaagataatctgtg 13318596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 297; E-Value: 1e-167
Query Start/End: Original strand, 8 - 411
Target Start/End: Original strand, 9323466 - 9323869
Alignment:
Q  8 tcatcagaagtttctgtgcttgtgaattcagaatttcc-gggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaa 106  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||||| | |||   |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9323466 tcatctgaagtttctgtacttgtgaattcaaagttttttgggaaatgtaatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaa 9323565  T
Q  107 gctttgtgaatccatggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttaaaactctatttttcttctacttt 206  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||    
T  9323566 gctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaaattgagcctgtgcttttgtttaaaactctatttt-cttctatttt 9323664  T
Q  207 caaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaa 306  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  9323665 caaagctatatacaaatcattttccttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaaccttttgtctattttgaaaagcaa 9323764  T
Q  307 acctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagt 406  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| | ||| |||| |    
T  9323765 acctgagcaacagggtacattcaaacgaaacatgcataagcgagagtatgtcgatgtctatttcaatatatgttacaagcaggttctcctccaagataat 9323864  T
Q  407 ctgtg 411  Q
    |||||    
T  9323865 ctgtg 9323869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 293; E-Value: 1e-164
Query Start/End: Original strand, 8 - 411
Target Start/End: Original strand, 12138165 - 12138568
Alignment:
Q  8 tcatcagaagtttctgtgcttgtgaattcagaatttcc-gggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaa 106  Q
    ||||| ||||||||||| ||| |||||||| | |||   |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12138165 tcatctgaagtttctgtacttatgaattcaaagttttttgggaaatgtaatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaa 12138264  T
Q  107 gctttgtgaatccatggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttaaaactctatttttcttctacttt 206  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||    
T  12138265 gctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaaattgagcctgtgcttttgtttaaaactctatttt-cttctatttt 12138363  T
Q  207 caaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaa 306  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  12138364 caaagctatatacaaatcattttccttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaaccttttgtctattttgaaaagcaa 12138463  T
Q  307 acctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagt 406  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| | ||| |||| |    
T  12138464 acctgagcaacagggtacattcaaacgaaacatgcataagcgagagtatgtcgatgtctatttcaatatatgttacaagcaggttctcctccaagataat 12138563  T
Q  407 ctgtg 411  Q
    |||||    
T  12138564 ctgtg 12138568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 290; E-Value: 1e-162
Query Start/End: Original strand, 24 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 13436836 - 13436442
Alignment:
Q  24 tgcttgtgaattcagaatttccgggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaa-ttaccattttccaagctttgtgaatccatg 122  Q
    |||||| ||||||| | ||| | ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  13436836 tgcttgcgaattcaaagttttcaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtg 13436737  T
Q  123 gagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttaaaactctattttt-cttctactttcaaagctatatacaa 221  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  13436736 gagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctattttttcttctactttcaaagctatatacaa 13436637  T
Q  222 aacatttt-ctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttt----gaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaa 316  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13436636 aacatttttctttctattttgataatggcaacgcttgaaacaaacattttttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaa 13436537  T
Q  317 cagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtg 411  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||| | |||||||||||||||    
T  13436536 cagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatatattacaagcaggttctcctccaggatagtctgtg 13436442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 290; E-Value: 1e-162
Query Start/End: Original strand, 24 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 37665642 - 37665254
Alignment:
Q  24 tgcttgtgaattcagaatttccgggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccatgg 123  Q
    |||||| ||||||| |||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||    
T  37665642 tgcttgcgaattcaaaatttctgggaaatgtcatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtgg 37665543  T
Q  124 agtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttaaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaa 223  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  37665542 agtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagctgtatacaaaa 37665443  T
Q  224 cattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaaca-ttttgaaaattgaaaactttttgtcta-ttttgaaaagcaaacctgagcaacaggg 321  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  37665442 cattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttttgaaaattgaaaaccttttgtctatttttaaaaagcaaacctgagcaacaggg 37665343  T
Q  322 tacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtg 411  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||| |||||||| |||| ||| | |||||||||||||||    
T  37665342 tacattcaaatg-aacatgcatgagcgagtgtgtgttggtgtctatttcaatatatgttacaaacaggttctcctccaggatagtctgtg 37665254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 289; E-Value: 1e-162
Query Start/End: Original strand, 8 - 411
Target Start/End: Original strand, 22894405 - 22894808
Alignment:
Q  8 tcatcagaagtttctgtgcttgtgaattcagaatttccgggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 107  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||| | ||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22894405 tcatcagaagcttctgtgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 22894504  T
Q  108 ctttgtgaatccatggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttaaaactctatttttcttctactttc 207  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||| |||  ||||||||||    
T  22894505 ctttgtaaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaactctactttctttctactttc 22894604  T
Q  208 aaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaa-ctttttgtctattttgaaaagcaa 306  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||    
T  22894605 aaagctatgtacaaaatattttctttctattttgataatgaccatgcttgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaggtttttgtctattttg-aaagcaa 22894703  T
Q  307 acctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagt 406  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  22894704 acctgagcaacagggtacattcaaacgaaacatgcataagcgagtgtatgttgatgtctatttcgatatgtgttacaagcagactcttccccaggatagt 22894803  T
Q  407 ctgtg 411  Q
    |||||    
T  22894804 ctgtg 22894808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 289; E-Value: 1e-162
Query Start/End: Original strand, 47 - 411
Target Start/End: Original strand, 23631997 - 23632364
Alignment:
Q  47 ggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccatggagtcacgccttcggctgaccacc 146  Q
    ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  23631997 ggaaatgtaatgattaccgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagcttcgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccacc 23632096  T
Q  147 actcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttaaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataat 246  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23632097 actcttatgcatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataat 23632196  T
Q  247 gacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaa--ctttttgtcta-ttttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcat 343  Q
    |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23632197 gacaatgcttgaaataaacatcttgaaaattgaaaaagctttttgtctatttttgaaaagcaaacttgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcat 23632296  T
Q  344 gagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtg 411  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| || ||| | |||||||||||||||    
T  23632297 gagcgagtgtatgttgatgtctatttcaatatgtgttataagccggttctcctccaggatagtctgtg 23632364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 285; E-Value: 1e-159
Query Start/End: Original strand, 26 - 411
Target Start/End: Original strand, 24729977 - 24730363
Alignment:
Q  26 cttgtgaattcagaatttccgggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccatggag 125  Q
    |||| ||||||| | ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  24729977 cttgcgaattcaaagtttccaggaaatgtaatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 24730076  T
Q  126 tcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttaaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaaca 225  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  24730077 tcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaaattgagcctgtgcttttgtttgaaattcta-ttttcttctactttcaaagctatatacaaaata 24730175  T
Q  226 ttttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaaca--ttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggta 323  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24730176 ttttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggta 24730275  T
Q  324 cattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtg 411  Q
    || |||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||| || |||||||||| ||| |  ||||||||||||||    
T  24730276 caatcaaatgaaacatgcatgagcgagggtatgtgaatgtctatttcaatatatgctacaagcaggttctccttcaggatagtctgtg 24730363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 285; E-Value: 1e-159
Query Start/End: Original strand, 8 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 32590447 - 32590044
Alignment:
Q  8 tcatcagaagtttctgtgcttgtgaattcagaatttccgggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 107  Q
    |||||| ||| |||||| |||||| ||||| | ||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32590447 tcatcaaaagcttctgtacttgtggattcaaagtttctaagaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 32590348  T
Q  108 ctttgtgaatccatggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttaaaactctatttttcttctactttc 207  Q
    |||||||||| | ||| |||| ||||| ||| ||| |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  32590347 ctttgtgaattcgtggggtcatgcctttggccgactaccactcttatacatcaaattgagcctgtgcttttgtttaaaactctacttt-cttctactttc 32590249  T
Q  208 aaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttt-gaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaa 306  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32590248 aaagctatatacaaatcattttctttctattttgataatgacaatgcctgaaacgaacatttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaa 32590149  T
Q  307 acctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagt 406  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| | ||||||||||    
T  32590148 acctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatatgttacaagcaggttctcctccaggatagt 32590049  T
Q  407 ctgtg 411  Q
    |||||    
T  32590048 ctgtg 32590044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 284; E-Value: 1e-159
Query Start/End: Original strand, 41 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 18494906 - 18494536
Alignment:
Q  41 tttccgggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccatggagtcacgccttcggctg 140  Q
    ||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |    
T  18494906 tttccaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggccg 18494807  T
Q  141 accaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgttt-aaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattt 239  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||   | |||||| ||||||    
T  18494806 accaccactctcatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactccatttt-cttctactttcaaagctatatacaatttactttcttcctattt 18494708  T
Q  240 tgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacat 339  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18494707 tgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacat 18494608  T
Q  340 gcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtg 411  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| | |||||||||||||||    
T  18494607 gcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcgggttctcctccaggatagtctgtg 18494536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 282; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 8 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 37352816 - 37352412
Alignment:
Q  8 tcatcagaagtttctgtgcttgtgaattcagaatttccgggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 107  Q
    |||||| ||| |||||  |||||| ||||| | |||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37352816 tcatcaaaagcttctgcacttgtggattcaaagtttctgggaaatgtcatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 37352717  T
Q  108 ctttgtgaatccatggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgttt-aaaactctatttttcttctacttt 206  Q
    |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  37352716 ctttgtgaatccgtggagtcatgccttcggctgaccaccactcttatacatcaagttgagcctttgcttttgtttgaaaactctatttt-cttctacttt 37352618  T
Q  207 caaagctatatacaaaacattttctttctatttt-gataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagca 305  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  37352617 caaagctatatacaaaacattttccttccatttttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtttattttgaaaagca 37352518  T
Q  306 aacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatag 405  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| ||| | ||||||||     
T  37352517 aacctgagcaacagggtacgttcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttaatgtctatttcaatatatgttacaagcaggttctcctccaggataa 37352418  T
Q  406 tctgtg 411  Q
    ||||||    
T  37352417 tctgtg 37352412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 281; E-Value: 1e-157
Query Start/End: Original strand, 8 - 411
Target Start/End: Original strand, 2517054 - 2517459
Alignment:
Q  8 tcatcagaagtttctgtgcttgtgaattcagaatttccgggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 107  Q
    |||||| ||| |||||| |||||||||||| | ||||   ||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2517054 tcatcaaaagcttctgtacttgtgaattcaaagtttctaagaactgtcatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 2517153  T
Q  108 ctttgtgaatccatggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttaaaactctatttttcttctactttc 207  Q
    |||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | |||| |||||||||||||||    
T  2517154 ctttgtgaatccgtggagtcatgccctcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgagattcta-ttttcttctactttc 2517252  T
Q  208 aaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaaca---ttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagc 304  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2517253 aaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgataatgcttgaaacaaacatttttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagc 2517352  T
Q  305 aaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggata 404  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||| | ||||||||    
T  2517353 aaacctgagcaacagggtacattcaaacgaaacatgcatgaatgagagtatgttgatgtctatttcaacgtgtgttacaagcaggttctcctccaggata 2517452  T
Q  405 gtctgtg 411  Q
    |||||||    
T  2517453 gtctgtg 2517459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 280; E-Value: 1e-156
Query Start/End: Original strand, 8 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 31820580 - 31820178
Alignment:
Q  8 tcatcagaagtttctgtgcttgtgaattcagaatttccgggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 107  Q
    |||||| ||| |||||| |||||||||||| | ||||   ||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31820580 tcatcaaaagcttctgtacttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttaccgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 31820481  T
Q  108 ctttgtgaatccatggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttaaaactctatttttcttctactttc 207  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  31820480 ctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaaattgagcctgtgcttttgtttaaaactctatttt-cttctattttc 31820382  T
Q  208 aaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaa 307  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  31820381 aaagctatatacaaatcattttccttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaaccttttgtctattttgaaaagcaaa 31820282  T
Q  308 cctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtc 407  Q
    ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||| || |||||||||| ||| |  ||||||||||    
T  31820281 cctgagcaacaaggtacaatcaaatgaaacatgcatgagcgagggtatgtgaatgtctatttcaatatatgctacaagcaggttctccttcaggatagtc 31820182  T
Q  408 tgtg 411  Q
    ||||    
T  31820181 tgtg 31820178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 280; E-Value: 1e-156
Query Start/End: Original strand, 24 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 37746484 - 37746090
Alignment:
Q  24 tgcttgtgaattcagaatttccgggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccatgg 123  Q
    |||||| ||||||| | |||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||    
T  37746484 tgcttgcgaattcaaagtttctgggaaatgtcatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtgg 37746385  T
Q  124 agtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgttt-aaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaa 222  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||    
T  37746384 agtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctattttctttttactttcaaagctatatacaaa 37746285  T
Q  223 acattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggt 322  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  37746284 acattttctttctattttgataatgacaatgctcgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctgttttgaaaagcaaacctgagcaacagggt 37746185  T
Q  323 acattcaaatgaaacatgcatgagcgagagta------tgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtg 411  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||      |||| |||||||||||||||| ||||||||||||| ||| | |||||||||||||||    
T  37746184 acattcaaatgaagcatgcatgagcgagagtatgttaatgttaatgtctatttcaatatatgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtg 37746090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 277; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 25 - 411
Target Start/End: Original strand, 34622524 - 34622912
Alignment:
Q  25 gcttgtgaattcagaatttccgggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaa-ttaccattttccaagctttgtgaatccatgg 123  Q
    ||||| ||||||| | ||| | ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||    
T  34622524 gcttgcgaattcaaagttttcaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaaattaccattttccaagttttgtgaatccgtgg 34622623  T
Q  124 agtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttaaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaa 223  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||  || |||||||||||||||||||||||    
T  34622624 agtcacgcctccggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctgctttctttttactttcaaagctatatacaaaa 34622723  T
Q  224 cattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaaca-ttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggt 322  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  34622724 cattttctttctattttgataatgataatgctcgaaacaaacatttttgaaaattaaaaactttttgtctgttttgaaaagcaaacctgagcaacagggt 34622823  T
Q  323 acattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtg 411  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| | |||||||||||||    
T  34622824 acattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatatgttacaagcaggttcttctcaaggatagtctgtg 34622912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 276; E-Value: 1e-154
Query Start/End: Original strand, 26 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 8659625 - 8659240
Alignment:
Q  26 cttgtgaattcagaatttccgggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccatggag 125  Q
    |||||||||||| | |||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||    
T  8659625 cttgtgaattcaaagtttc-gggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattcgccaagctttgtgaatccgtggag 8659527  T
Q  126 tcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgttt-aaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaac 224  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| | || |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  8659526 tcacgcctttggctgaccaccactcttatacatcaagttgagcctttgtttttgtttgaaaactctatttt-cttctactttcaaagctatatacaaaac 8659428  T
Q  225 attttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttt-gaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggta 323  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8659427 attttccttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttttgaaaattgaaaactttttgtttattttgaaaagcaaacctgagcaacagggta 8659328  T
Q  324 cattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtg 411  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| ||| | |||||||||||||||    
T  8659327 caatcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttaatgtctatttcaatatatgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtg 8659240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 275; E-Value: 1e-154
Query Start/End: Original strand, 26 - 411
Target Start/End: Original strand, 11329644 - 11330032
Alignment:
Q  26 cttgtgaattcagaatttccgggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccatggag 125  Q
    |||| ||||||| | ||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  11329644 cttgcgaattcaaagtttccaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 11329743  T
Q  126 tcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgttt-aaaactctatttttcttctactttcaaagcta--tatacaaa 222  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||     
T  11329744 tcacgccttcggctgaccaccactctcatacatcaatttgagcctttgcttttgttttaaaactctatttt-cttctactttcaaagctaaatatacaat 11329842  T
Q  223 acattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaa-ttgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacaggg 321  Q
      |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11329843 ttattttccttctattttgataatgataatgcttgaaacaaacatttttaaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacaggg 11329942  T
Q  322 tacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtg 411  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| | |||||||||||||||    
T  11329943 tacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatatgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtg 11330032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 275; E-Value: 1e-154
Query Start/End: Original strand, 24 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 15753008 - 15752626
Alignment:
Q  24 tgcttgtgaattcagaatttccgggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccatgg 123  Q
    |||||| ||||||| | ||||  ||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  15753008 tgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtcatgattactgtgttcaatgtatcaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtgg 15752909  T
Q  124 agtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttaaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaa 223  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  15752908 agtcacgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaattctatttt-cttctactttcaaagctatatacaaaa 15752810  T
Q  224 cattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggta 323  Q
    ||||||||||||    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15752809 cattttctttct----tgataatgacaatacttgaaacaaacattttgaaaattgaaaaccttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggta 15752714  T
Q  324 cattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtg 411  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||| ||| | ||| |||| ||||||    
T  15752713 cattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttggtgtctatttcaatatatgttaccagcaggttctcctccaagataatctgtg 15752626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 275; E-Value: 1e-154
Query Start/End: Original strand, 31 - 411
Target Start/End: Original strand, 43084270 - 43084651
Alignment:
Q  31 gaattcagaatttccgggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccatggagtcacg 130  Q
    ||||||| | ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |    
T  43084270 gaattcaaagttttcgggaaatgtaatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcatg 43084369  T
Q  131 ccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgttt-aaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaac-attt 228  Q
    |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||  ||||    
T  43084370 cctttggctgaccaccactcttatgcatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctatttt-cttctattttcaaagttatatacaaaaatattt 43084468  T
Q  229 tctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattc 328  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43084469 tctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaagttgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattc 43084568  T
Q  329 aaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtg 411  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | || |||||||||| ||| | |||||||||||||||    
T  43084569 aaatgaaacatgcatgaacgagagtatgttgatgtctatttcaatgtatgctacaagcaggttctcctccaggatagtctgtg 43084651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 274; E-Value: 1e-153
Query Start/End: Original strand, 24 - 388
Target Start/End: Original strand, 30035431 - 30035795
Alignment:
Q  24 tgcttgtgaattcagaatttccgggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccatgg 123  Q
    |||||| ||||||| | ||||  ||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||    
T  30035431 tgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtcatgattactgtgttcaatgtatcaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtgg 30035530  T
Q  124 agtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttaaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaa 223  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30035531 agtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaaattgagcctgtgcttttgtttaaaattcta-ttttcttctactttcaaagctatatacaaaa 30035629  T
Q  224 cattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaaca-ttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggt 322  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30035630 cattttctttctattttgataatggcaatgcttgaaacaaacatttttgaaaactgaaaactttttgtttattttgaaaagcaaacctgagcaacagggt 30035729  T
Q  323 acattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcag 388  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||    
T  30035730 acattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttggtgtctatttcaatatatgttaccagcag 30035795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 273; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 25 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 13180944 - 13180561
Alignment:
Q  25 gcttgtgaattcagaatttccgggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaa-ttaccattttccaagctttgtgaatccatgg 123  Q
    ||||| ||||||| | ||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||    
T  13180944 gcttgcgaattcaaagtttccaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtgg 13180845  T
Q  124 agtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgttt-aaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaa 222  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13180844 agtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactccatttttcttctactttcaaagctatatacaaa 13180745  T
Q  223 acattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggt 322  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||  ||||     |||||||||||||||||||||||||||||    
T  13180744 acattttctttctattttgataatgataatgctcgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagtttt-----ttttgaaaagcaaacctgagcaacagggt 13180650  T
Q  323 acattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtg 411  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  | |||||||||||||||    
T  13180649 acattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggttcccctccaggatagtctgtg 13180561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 271; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 8 - 411
Target Start/End: Original strand, 26486385 - 26486778
Alignment:
Q  8 tcatcagaagtttctgtgcttgtgaattcagaatttcc-gggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaa 106  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||||| | |||   |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26486385 tcatctgaagtttctgtacttgtgaattcaaagttttttgggaaatgtaatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaa 26486484  T
Q  107 gctttgtgaatccatggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttaaaactctatttttcttctacttt 206  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||               
T  26486485 gctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaaattgagcctgtgcttttgtttaaaactctatttt----------- 26486573  T
Q  207 caaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaa 306  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  26486574 caaagctatatacaaatcattttccttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaaccttttgtctattttgaaaagcaa 26486673  T
Q  307 acctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagt 406  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| | ||| |||| |    
T  26486674 acctgagcaacagggtacattcaaacgaaacatgcataagcgagagtatgtcgatgtctatttcaatatatgttacaagcaggttctcctccaagataat 26486773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 271; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 19 - 411
Target Start/End: Original strand, 33522382 - 33522776
Alignment:
Q  19 ttctgtgcttgtgaattcagaatttccgggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatc 118  Q
    |||||| |||||| ||||| | || || ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33522382 ttctgtacttgtggattcaaagttcccaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatc 33522481  T
Q  119 catggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttaaaactctatttt-tcttctactttcaaagctatat 217  Q
    | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||| |||| | || |||||||||||||||||    
T  33522482 cgtggagtcatgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagactgtgcttttgtttgaaactctgttttcttttttactttcaaagctatat 33522581  T
Q  218 acaaaa-cattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaa 316  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  33522582 acaaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaaccttttgtctattttgaaaagcaaacccgagcaa 33522681  T
Q  317 cagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtg 411  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||| || |||||||||| ||| | |||||||||||||||    
T  33522682 cagggtacaatcaaatgaaacatgcatgagcgagggtatgtgaatgtctatttcaatatatgctacaagcaggttctcctccaggatagtctgtg 33522776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 271; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 24 - 411
Target Start/End: Original strand, 37760987 - 37761376
Alignment:
Q  24 tgcttgtgaattcagaatttccgggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccatgg 123  Q
    |||||| ||||||| | ||||  ||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||    
T  37760987 tgcttgcgaattcaaagtttctaggagatgtcatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgcgg 37761086  T
Q  124 agtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgttt-aaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaa 222  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37761087 agtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactcta-ttttcttctactttcaaagctatatacaaa 37761185  T
Q  223 acattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaaca-ttttgaaaattgaaaactttttgtcta-ttttgaaaagcaaacctgagcaacagg 320  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  37761186 acattttctttctattttgataatgataatgcttgaaacaaacatttttgaaaattgaaaactttttgtctatttttgaaaagcaaacctgagcaacagg 37761285  T
Q  321 gtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtg 411  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| | ||||||||| |||||    
T  37761286 gcacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatatgttacaagcaggttctcctccaggatagactgtg 37761376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 270; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 24 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 18122572 - 18122184
Alignment:
Q  24 tgcttgtgaattcagaatttccgggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccatgg 123  Q
    |||||| ||||||| | ||||  ||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||    
T  18122572 tgcttgcgaattcaaagtttctaggagatgtcatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtgg 18122473  T
Q  124 agtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttaaaactctat-ttttcttctactttcaaagctatatacaaa 222  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||     
T  18122472 agtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttaaaactctatttttttttctactttcaaagctatatacaat 18122373  T
Q  223 acattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaaca-ttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacaggg 321  Q
      |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18122372 ttattttccttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttttgaaaattgagaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacaggg 18122273  T
Q  322 tacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtg 411  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||  ||| | |||||||||||||||    
T  18122272 tacattcaaatg-aacatgcatgagcgagtgtgtgttggtgtctatttcaatatatgttacaagcagtttctcctccaggatagtctgtg 18122184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 266; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 47 - 411
Target Start/End: Original strand, 5643828 - 5644191
Alignment:
Q  47 ggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccatggagtcacgccttcggctgaccacc 146  Q
    ||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  5643828 ggaaatgtcatgatcactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagttttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccacc 5643927  T
Q  147 actcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttaaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataat 246  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  5643928 actcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgtttgaaactcta-ttttcttttactttcaaagctatatacaaaacattttccttctattttgataat 5644026  T
Q  247 gacaatgcttgaaacaaaca-ttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatga 345  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  5644027 gacaatgcctgaaacaaacatttttgaaaatcgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatg-aacatgcatga 5644125  T
Q  346 gcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtg 411  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||| | ||| |||| ||||||    
T  5644126 gcgagagtatgtcgatgtctatttcaatatatgttaaaagcaggttctcctccaagataatctgtg 5644191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 266; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 8 - 411
Target Start/End: Original strand, 33298522 - 33298930
Alignment:
Q  8 tcatcagaagtttctgtgcttgtgaattcagaatttccgggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 107  Q
    ||||| |||| |||||| |||||||||||| | ||||   ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33298522 tcatctgaagcttctgtacttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 33298621  T
Q  108 ctttgtgaatccatggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgttt-aaaactcta-tttttcttctactt 205  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||| | ||||| ||||||||    
T  33298622 ctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactccatttttttttctactt 33298721  T
Q  206 tcaaagctatatac-aaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctatttt--gaaaa 302  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||    
T  33298722 tcaaagctatatacaaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctatttttgaaaaa 33298821  T
Q  303 gcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccagga 402  Q
     ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||| | ||||||    
T  33298822 acaaacctgagcaacatggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtgtgtgttggtgtctatttcaatatatgttacaagcaggttctcctccagga 33298921  T
Q  403 tagtctgtg 411  Q
    |||||||||    
T  33298922 tagtctgtg 33298930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 262; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 24 - 408
Target Start/End: Original strand, 31437469 - 31437847
Alignment:
Q  24 tgcttgtgaattcagaatttccgggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccatgg 123  Q
    |||||| ||||||| | ||||  ||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||    
T  31437469 tgcttgcgaattcaaagtttctaggagatgtcatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtgg 31437568  T
Q  124 agtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttaaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaa 223  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||  |||  || |||||||||||||||||||||||    
T  31437569 agtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatctatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctgctttctttttactttcaaagctatatacaaaa 31437668  T
Q  224 cattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggta 323  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||      ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31437669 cattttctttctattttgataatgataatgctcgaaacaaacattttgaaaattgaaaaagttt------ttttgaaaagcaaacctgagcaacagggta 31437762  T
Q  324 cattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtct 408  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||    
T  31437763 cattcaaatgagacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggttctcctccaggatagtct 31437847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 262; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 25 - 411
Target Start/End: Original strand, 41680710 - 41681098
Alignment:
Q  25 gcttgtgaattcagaatttccgggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccatgga 124  Q
    ||||| ||||||| | ||||  ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  41680710 gcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtaatggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtgga 41680809  T
Q  125 gtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgttt-aaaactctatttttcttctactttcaaagctatatac-aaa 222  Q
    |||  ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  41680810 gtcgtgcccttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactccatttttcttctactttcaaagctatatacaaaa 41680909  T
Q  223 acattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtcta-ttttgaaaagcaaacctgagcaacaggg 321  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  41680910 atattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctatttttgaaaagcaaacctgagcaacaggg 41681009  T
Q  322 tacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtg 411  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||| | ||||||||||||| ||| | |||||||||||||||    
T  41681010 tacattcaaatg-aacatgcatgagcgagtgtgtgttggtgtctatttcaatttatgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtg 41681098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 259; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 8 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 28953952 - 28953548
Alignment:
Q  8 tcatcagaagtttctgtgcttgtgaattcagaatttccgggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 107  Q
    ||||| |||| |||||| |||||||||||| | ||||   ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28953952 tcatctgaagcttctgtacttgtgaattcaaagtttctaagagctgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 28953853  T
Q  108 ctttgtgaatccatggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgttt-aaaactctatttttcttctacttt 206  Q
    |||||| ||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  28953852 ctttgtaaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactcta-ttttcttctacttt 28953754  T
Q  207 caaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaaca-ttttgaaaattgaaaactttttgtcta-ttttgaaaagc 304  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  28953753 caaagctatatacaaaacattttccttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttttgggaattgaaaactttttgtctatttttgaaaagc 28953654  T
Q  305 aaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggata 404  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||| | ||||||||||||| ||| | ||||||||    
T  28953653 aaacctgagcaacagggtacattcaaatg-aacatgcatgagcgagtgtgtgttggtgtctatttcaatttatgttacaagcaggttctcctccaggata 28953555  T
Q  405 gtctgtg 411  Q
    |||||||    
T  28953554 gtctgtg 28953548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 243; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 8 - 404
Target Start/End: Original strand, 25206266 - 25206670
Alignment:
Q  8 tcatcagaagtttctgtgcttgtgaattcagaatttccgggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaa-ttaccattttccaa 106  Q
    |||||||||| | || || ||| ||||||||| |||   ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  25206266 tcatcagaagctcctatgtttgcgaattcagagtttataggaaatgtagtgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaaattaccattttccaa 25206365  T
Q  107 gctttgtgaatccatggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttaaaactctatttttcttctacttt 206  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||  || ||||||    
T  25206366 gctttgtaaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgtttgaaactctattttctttttacttt 25206465  T
Q  207 caaagctatatac--aaaacattttctttctattttgataatgac-aatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaa-----ctttttgtctattttg 298  Q
    ||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||      |||||||||||||||    
T  25206466 caaagctatgtacaaaaaacattttctttctattttgataatgacaaatgcttgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagtttttttttgtctattttg 25206565  T
Q  299 aaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttcccc 398  Q
     ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||     
T  25206566 -aaagcaaacctgaacaacagggtacattcaaacgaaacatgcatgagcgagcgtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaaattcttccct 25206664  T
Q  399 aggata 404  Q
    ||||||    
T  25206665 aggata 25206670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 243; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 8 - 404
Target Start/End: Original strand, 25270422 - 25270826
Alignment:
Q  8 tcatcagaagtttctgtgcttgtgaattcagaatttccgggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaa-ttaccattttccaa 106  Q
    |||||||||| | || || ||| ||||||||| |||   ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  25270422 tcatcagaagctcctatgtttgcgaattcagagtttataggaaatgtagtgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaaattaccattttccaa 25270521  T
Q  107 gctttgtgaatccatggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttaaaactctatttttcttctacttt 206  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||  || ||||||    
T  25270522 gctttgtaaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgtttgaaactctattttctttttacttt 25270621  T
Q  207 caaagctatatac--aaaacattttctttctattttgataatgac-aatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaa-----ctttttgtctattttg 298  Q
    ||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||      |||||||||||||||    
T  25270622 caaagctatgtacaaaaaacattttctttctattttgataatgacaaatgcttgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagtttttttttgtctattttg 25270721  T
Q  299 aaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttcccc 398  Q
     ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||     
T  25270722 -aaagcaaacctgaacaacagggtacattcaaacgaaacatgcatgagcgagcgtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaaattcttccct 25270820  T
Q  399 aggata 404  Q
    ||||||    
T  25270821 aggata 25270826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 24 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 22993272 - 22992892
Alignment:
Q  24 tgcttgtgaattcagaatttccgggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccatgg 123  Q
    |||||| ||||||| | ||| | |||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||    
T  22993272 tgcttgcgaattcaaagttttcaggaaatgtatcgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtgg 22993173  T
Q  124 agtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttaaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaa 223  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||  || |||||||||||||||||||||||    
T  22993172 agtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctgctttctttttactttcaaagctatatacaaaa 22993073  T
Q  224 cattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggta 323  Q
    |||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||| ||||||||||||||||||  |||      ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22993072 cattttctttctattttgataatgatgatgctcgaaacaagcattttgaaaattgaaaaagttt------ttttgaaaagcaaacctgagcaacagggta 22992979  T
Q  324 cattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtg 411  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||| | |||||||||||||||    
T  22992978 cattcaaatg-aacatgcatgagcgagtgtgtgttggtgtctatttcaatatatgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtg 22992892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 240; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 24 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 15652914 - 15652528
Alignment:
Q  24 tgcttgtgaattcagaatttccgggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccatgg 123  Q
    |||||| ||||||| | ||||  ||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||    
T  15652914 tgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtcatgattgctgtgttcaatgtaccaccaactaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtgg 15652815  T
Q  124 agtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttaaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaa 223  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||  || |||||||||||||||||||||||    
T  15652814 agtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctgctttctttttactttcaaagctatatacaaaa 15652715  T
Q  224 cattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggta 323  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||| | | |    |||||||||||||||||||||||||    
T  15652714 cattttctttctattttgataatgataatgctcgaaacaaacattttgaaaattgaaaaagttttttttttaaaaaaaagcaaacctgagcaacagggta 15652615  T
Q  324 cattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtg 411  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||| | |||||||||||||||    
T  15652614 cattcaaatg-aacatgcatgagcgagtgtgtgttggtgtctatttcaatatatgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtg 15652528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 230; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 47 - 411
Target Start/End: Original strand, 23897902 - 23898261
Alignment:
Q  47 ggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccatggagtcacgccttcggctgaccacc 146  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  23897902 ggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaattcatggagtcacgccttcggctgaccacc 23898001  T
Q  147 actcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttaaaactctatttttcttctactttcaaagctatatac----aaaacattttctttctattttga 242  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||| |||    ||||||||||||||||||||| |    
T  23898002 actcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttaaaactctattttctttttactttcaaagctatgtacaaaaaaaacattttctttctattttaa 23898101  T
Q  243 taatgac-aatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgc 341  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||          |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  23898102 taatgacaaatgcttgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagttttg----------aaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaacgaaacatgc 23898191  T
Q  342 atgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtg 411  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||  ||||| |||||||||||||||    
T  23898192 atgagcgagtgtatgttggtgtctatttcaatatatgttgcaagcagattcttctccaggatagtctgtg 23898261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 24 - 411
Target Start/End: Original strand, 33783492 - 33783875
Alignment:
Q  24 tgcttgtgaattcagaatttccgggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccatgg 123  Q
    |||||| ||||||| | ||||  ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||    
T  33783492 tgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaacccataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtgg 33783591  T
Q  124 agtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttaaaactctatttttcttctactttcaaagctatatac-aaa 222  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||  || ||||||||||| ||| ||| |||    
T  33783592 agtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgtttgaaactctattttctttttactttcaaagttatgtacaaaa 33783691  T
Q  223 acattttctttcta--ttttgataatgac-aatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacag 319  Q
    |||||||| |||||  |||| |||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||  ||       |||||||||||||||| |||||||||    
T  33783692 acattttccttctattttttaataatgacaaatgctcgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagtt-------ttttgaaaagcaaaccggagcaacag 33783784  T
Q  320 ggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtg 411  Q
    |||||||||||| | |||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||| | |||||||||||||||    
T  33783785 ggtacattcaaacg-aacatgcatgagcgagtgtgtgttggtgtctatttcaatatatgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtg 33783875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 24 - 411
Target Start/End: Original strand, 24608250 - 24608634
Alignment:
Q  24 tgcttgtgaattcagaatttccgggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaa-ttaccattttccaagctttgtgaatccatg 122  Q
    |||||| ||||||| | ||||  ||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||    
T  24608250 tgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtaatgattgttgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtg 24608349  T
Q  123 gagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttaaaactctatttttcttctactttcaaagctatatac-aa 221  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||   |||  || ||||||||||| ||| ||| ||    
T  24608350 gagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcatgtgcttttgtttgaaactccgctttctttttactttcaaagttatgtacaaa 24608449  T
Q  222 aacattttctttcta-ttttgataatgac-aatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacag 319  Q
    ||||||||| ||||| |||| |||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||  ||       ||||||||||||||||||||||||||    
T  24608450 aacattttccttctatttttaataatgacaaatgctcgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagtt-------ttttgaaaagcaaacctgagcaacag 24608542  T
Q  320 ggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtg 411  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||| || || ||||| |||||||||||| || ||||||||||||| ||| | |||||||||||||||    
T  24608543 ggtacattcaaacaaaacatgcatgagcaagtgtgtgttggtgtctatttcaacatatgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtg 24608634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 183; E-Value: 7e-99
Query Start/End: Original strand, 47 - 411
Target Start/End: Original strand, 24975877 - 24976236
Alignment:
Q  47 ggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccatggagtcacgccttcggctgaccacc 146  Q
    ||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  24975877 ggaaatgtaatgattgttgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggagtcacgccttcggctgaccacc 24975976  T
Q  147 actcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttaaaactctatttttcttctactttcaaagctatatac-aaaacattttctttcta-ttttgata 244  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||  |||  || ||||||||||| ||| ||| ||||||||||| ||||| |||| |||    
T  24975977 actcttatacatcaatttgagtctgtgcttttgtttgaaactctgctttctttttactttcaaagttatgtacaaaaacattttccttctatttttaata 24976076  T
Q  245 atgac-aatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcat 343  Q
    ||||| |||||| ||||||||||| |||||||||| |||  |        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  24976077 atgacaaatgctcgaaacaaacatcttgaaaattggaaaagt--------ttttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaacgaaatatgcat 24976168  T
Q  344 gagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtg 411  Q
    ||||||| || ||||| |||||||||||| || ||||||||||||| ||| | |||||||||| ||||    
T  24976169 gagcgagtgtgtgttggtgtctatttcaacatatgttacaagcaggttctcctccaggatagtatgtg 24976236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 182; E-Value: 3e-98
Query Start/End: Original strand, 25 - 411
Target Start/End: Original strand, 30940642 - 30941023
Alignment:
Q  25 gcttgtgaattcagaatttccgggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaa-ttaccattttccaagctttgtgaatccatgg 123  Q
    ||||| ||||||| | ||||  ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||||| |||    
T  30940642 gcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaaattaccattttccaagcttcgtaaatccgtgg 30940741  T
Q  124 agtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttaaaactctatttttcttctactttcaaagctatatac-aaa 222  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||| |||  |||  || ||||||||||| ||| ||| |||    
T  30940742 agtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatctatttgagcctgtgcttttgtttgaaattctgctttctttttactttcaaagttatgtacaaaa 30940841  T
Q  223 acattttctttcta-ttttgataatgac-aatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagg 320  Q
    |||||||| ||||| |||| |||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||  |        |||||||||||||||||||||||||||    
T  30940842 acattttccttctatttttaataatgacaaatgctcgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagt--------ttttgaaaagcaaacctgagcaacagg 30940933  T
Q  321 gtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtg 411  Q
    ||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||| ||||||||||||| ||| | |||||||||||||||    
T  30940934 gtacattcaaaag-aacatgcatgagcgagtgtatgttggtgcctatttcaatatatgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtg 30941023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 333; Significance: 0; HSPs: 41)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 333; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 47 - 411
Target Start/End: Original strand, 12661558 - 12661922
Alignment:
Q  47 ggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccatggagtcacgccttcggctgaccacc 146  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  12661558 ggaaatgtaatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccacc 12661657  T
Q  147 actcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttaaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataat 246  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12661658 actcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataat 12661757  T
Q  247 gacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgag 346  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12661758 gataatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgag 12661857  T
Q  347 cgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtg 411  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| | |||||||||||||||    
T  12661858 cgagagtatgttgatgtctatttcaatatatgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtg 12661922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 330; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 46 - 411
Target Start/End: Original strand, 39896087 - 39896452
Alignment:
Q  46 gggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccatggagtcacgccttcggctgaccac 145  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  39896087 gggaaatgtaatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccgagctttgtgaatccgtggagtcacgcctccggctgaccac 39896186  T
Q  146 cactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttaaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataa 245  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39896187 cactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataa 39896286  T
Q  246 tgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatga 345  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39896287 tgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaaccttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatga 39896386  T
Q  346 gcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtg 411  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||    
T  39896387 gcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtg 39896452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 321; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 24 - 411
Target Start/End: Original strand, 37383673 - 37384061
Alignment:
Q  24 tgcttgtgaattcagaatttccgggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaa-ttaccattttccaagctttgtgaatccatg 122  Q
    |||||| ||||||| | ||| | ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  37383673 tgcttgcgaattcaaagttttcaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtg 37383772  T
Q  123 gagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttaaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaa 222  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37383773 gagtcacgcctccggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaa 37383872  T
Q  223 acattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggt 322  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37383873 acattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaaccttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggt 37383972  T
Q  323 acattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtg 411  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||    
T  37383973 acatccaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtg 37384061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 312; E-Value: 1e-176
Query Start/End: Original strand, 25 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 9344232 - 9343845
Alignment:
Q  25 gcttgtgaattcagaatttccgggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccatgga 124  Q
    ||||| ||||||| | ||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  9344232 gcttgcgaattcaaagtttccaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtgga 9344133  T
Q  125 gtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttaaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaac 224  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  9344132 gtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttaaaactctattttctttctactttcaaagctatatacaaaac 9344033  T
Q  225 attttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaaca-ttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggta 323  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9344032 attttctttccattttaataatgacaatgcttgaaacaaacatttttgaaaattgaaaactttttgtccattttgaaaagcaaacctgagcaacagggta 9343933  T
Q  324 cattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtg 411  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| | |||||||||||||||    
T  9343932 cattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatatgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtg 9343845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 308; E-Value: 1e-173
Query Start/End: Original strand, 25 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 39046067 - 39045680
Alignment:
Q  25 gcttgtgaattcagaatttccgggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccatgga 124  Q
    ||||| ||||||| | ||||| | ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  39046067 gcttgcgaattcaaagtttccagaaaatgtaatgattactgtgttcaatgtaccactaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtgga 39045968  T
Q  125 gtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttaaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaac 224  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  39045967 gtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttaaaactctattttctttctactttcaaagctatatacaaaac 39045868  T
Q  225 attttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaaca-ttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggta 323  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39045867 attttctttccattttaataatgacaatacttgaaacaaacatttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggta 39045768  T
Q  324 cattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtg 411  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| | |||||||||||||||    
T  39045767 cattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatatgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtg 39045680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 307; E-Value: 1e-173
Query Start/End: Original strand, 26 - 411
Target Start/End: Original strand, 34867681 - 34868066
Alignment:
Q  26 cttgtgaattcagaatttccgggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccatggag 125  Q
    |||| ||||||| | ||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||    
T  34867681 cttgcgaattcaaagtttccaggaaatgaaatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtagag 34867780  T
Q  126 tcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttaaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaaca 225  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  34867781 tcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaaattgagcctgtgcttttgtttaaaactcta-ttttcttctattttcaaagctatatacaaaaca 34867879  T
Q  226 ttttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaaca-ttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtac 324  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34867880 ttttccttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtac 34867979  T
Q  325 attcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtg 411  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| | |||||||||||||||    
T  34867980 attcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatatgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtg 34868066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 306; E-Value: 1e-172
Query Start/End: Original strand, 46 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 22922369 - 22922001
Alignment:
Q  46 gggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccatggagtcacgccttcggctgaccac 145  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  22922369 gggaaatgtaatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccac 22922270  T
Q  146 cactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgttt-aaaactctatttt--tcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttga 242  Q
    ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22922269 cactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaattctattttgttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttga 22922170  T
Q  243 taatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgca 342  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  22922169 taatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaaccttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtaccttcaaatgaaacatgca 22922070  T
Q  343 tgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtg 411  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| | |||||||||||||||    
T  22922069 tgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatatgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtg 22922001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 305; E-Value: 1e-171
Query Start/End: Original strand, 25 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 254897 - 254510
Alignment:
Q  25 gcttgtgaattcagaatttccgggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccatgga 124  Q
    ||||| ||||||| | ||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  254897 gcttgcgaattcaaagtttccaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtgga 254798  T
Q  125 gtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgttt-aaaactcta-tttttcttctactttcaaagctatatacaaa 222  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  254797 gtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctattttttcttctactttcaaagctatatacaaa 254698  T
Q  223 acattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggt 322  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  254697 acattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaac-ttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggt 254599  T
Q  323 acattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtg 411  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||    
T  254598 acattcaaatgaaacatgcatgagtgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtg 254510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 305; E-Value: 1e-171
Query Start/End: Original strand, 25 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 37946111 - 37945723
Alignment:
Q  25 gcttgtgaattcagaatttccgggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccatgga 124  Q
    ||||| ||||||| | ||||| ||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  37946111 gcttgcgaattcaaagtttccaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatataccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtgga 37946012  T
Q  125 gtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgttt-aaaactctattttt-cttctactttcaaagctatatacaaa 222  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  37946011 gtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctattttttcttctactttcaaagctatatacaaa 37945912  T
Q  223 acattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggt 322  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37945911 acattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggt 37945812  T
Q  323 acattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtg 411  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||    
T  37945811 acattcaaatgaaacatgcatgagtaagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtg 37945723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 304; E-Value: 1e-171
Query Start/End: Original strand, 24 - 411
Target Start/End: Original strand, 27809697 - 27810087
Alignment:
Q  24 tgcttgtgaattcagaatttccgggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccatgg 123  Q
    |||||| ||||||| | ||||  ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  27809697 tgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtcatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtgg 27809796  T
Q  124 agtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgttt-aaaactctatttt--tcttctactttcaaagctatataca 220  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  27809797 agtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctatttttttcttctactttcaaagctatataca 27809896  T
Q  221 aaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagg 320  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27809897 aaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagg 27809996  T
Q  321 gtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtg 411  Q
     ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||    
T  27809997 ttacattcaaatgaaacatgcatgagtgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtg 27810087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 299; E-Value: 1e-168
Query Start/End: Original strand, 57 - 411
Target Start/End: Original strand, 27122554 - 27122907
Alignment:
Q  57 tgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccatggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatac 156  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  27122554 tgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggagtcacgccttcggctgaccacccctcttatac 27122653  T
Q  157 atcaatttgagcttgtgcttttgtttaaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgctt 256  Q
    ||||| |||||| | |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  27122654 atcaaattgagcctttgcttttgtttaaaactctatttt-cttctactttcaaagctatatacaaaacattttccttctattttgataatgacaatgctt 27122752  T
Q  257 gaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatg 356  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27122753 gaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgagaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatg 27122852  T
Q  357 ttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtg 411  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| | |||||||||||||||    
T  27122853 ttgatgtctatttcaatatatgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtg 27122907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 298; E-Value: 1e-167
Query Start/End: Original strand, 46 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 19410710 - 19410342
Alignment:
Q  46 gggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccatggagtcacgccttcggctgaccac 145  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  19410710 gggaaatgtaatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccac 19410611  T
Q  146 cactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgttt-aaaactctatttt--tcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttga 242  Q
    ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||| ||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  19410610 cactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaattctattttgttcttctactttcaaagctatacacaaaacattttctttctattttga 19410511  T
Q  243 taatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgca 342  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  19410510 taatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaaccttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacaggataccttcaaatgaaacatgca 19410411  T
Q  343 tgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtg 411  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| | |||||||||||||||    
T  19410410 tgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatatgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtg 19410342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 297; E-Value: 1e-167
Query Start/End: Original strand, 24 - 411
Target Start/End: Original strand, 34160840 - 34161230
Alignment:
Q  24 tgcttgtgaattcagaatttccgggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccatgg 123  Q
    |||||| ||||||| | |||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||    
T  34160840 tgcttgcgaattcaaagtttctgggaaatgtcatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtgg 34160939  T
Q  124 agtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttaaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaa 223  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||  || |||||||||||||||||||||||    
T  34160940 agtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctgctttctttttactttcaaagctatatacaaaa 34161039  T
Q  224 cattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaaca---ttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagg 320  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34161040 cattttctttctattttgataatgataatgcttgaaacaaacatttttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagg 34161139  T
Q  321 gtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtg 411  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||| | |||||||||||||||    
T  34161140 gtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatatgtcacaagcaggttctcctccaggatagtctgtg 34161230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 293; E-Value: 1e-164
Query Start/End: Original strand, 25 - 411
Target Start/End: Original strand, 16167475 - 16167862
Alignment:
Q  25 gcttgtgaattcagaatttccgggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccatgga 124  Q
    ||||| ||||||| | ||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  16167475 gcttgcgaattcaaagtttccaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtgga 16167574  T
Q  125 gtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgttt-aaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaa 223  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||    
T  16167575 gtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctatttt-cttctactttcaaagttatatacaaaa 16167673  T
Q  224 c-attttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggt 322  Q
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16167674 atattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggt 16167773  T
Q  323 acattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtg 411  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||    
T  16167774 acattcaaatgaaacatgcatgagtgagggtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtg 16167862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 293; E-Value: 1e-164
Query Start/End: Original strand, 8 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 37680155 - 37679749
Alignment:
Q  8 tcatcagaagtttctgtgcttgtgaattcagaatttccgggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaa-ttaccattttccaa 106  Q
    ||||| |||| |||||| |||||||||||| | ||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  37680155 tcatctgaagcttctgtacttgtgaattcaaagttttcgggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaaattaccattttccaa 37680056  T
Q  107 gctttgtgaatccatggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttaaaactctatttttcttctacttt 206  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  37680055 gctttgtgaatccgtggagtcacgcctttggctgaccaccactcttatacatcaaattgagcctgtgcttttgtttaaaactctatttt-cttctacttt 37679957  T
Q  207 caaagctatatacaaaa-cattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttt--gaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaag 303  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  37679956 caaagctatatacaaaaacattttctttctattttgataaagacaatgcttgaaacaaacattttttgaaaattgaaatttttttgtctattttgaaaag 37679857  T
Q  304 caaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggat 403  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||| | |||||||    
T  37679856 caaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatgtatgttacaagcaggttctcctccaggat 37679757  T
Q  404 agtctgtg 411  Q
    ||||||||    
T  37679756 agtctgtg 37679749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 293; E-Value: 1e-164
Query Start/End: Original strand, 8 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 37695420 - 37695014
Alignment:
Q  8 tcatcagaagtttctgtgcttgtgaattcagaatttccgggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaa-ttaccattttccaa 106  Q
    ||||| |||| |||||| |||||||||||| | ||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  37695420 tcatctgaagcttctgtacttgtgaattcaaagttttcgggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaaattaccattttccaa 37695321  T
Q  107 gctttgtgaatccatggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttaaaactctatttttcttctacttt 206  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  37695320 gctttgtgaatccgtggagtcacgcctttggctgaccaccactcttatacatcaaattgagcctgtgcttttgtttaaaactctatttt-cttctacttt 37695222  T
Q  207 caaagctatatacaaaa-cattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttt--gaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaag 303  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  37695221 caaagctatatacaaaaacattttctttctattttgataaagacaatgcttgaaacaaacattttttgaaaattgaaatttttttgtctattttgaaaag 37695122  T
Q  304 caaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggat 403  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||| | |||||||    
T  37695121 caaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatgtatgttacaagcaggttctcctccaggat 37695022  T
Q  404 agtctgtg 411  Q
    ||||||||    
T  37695021 agtctgtg 37695014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 292; E-Value: 1e-164
Query Start/End: Original strand, 24 - 411
Target Start/End: Original strand, 12592806 - 12593198
Alignment:
Q  24 tgcttgtgaattcagaatttccgggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccatgg 123  Q
    |||||| ||||||| | ||||  ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  12592806 tgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtcatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtgg 12592905  T
Q  124 agtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgttt-aaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaa 222  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12592906 agtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactccatttttcttctactttcaaagctatatacaaa 12593005  T
Q  223 acattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttt----gaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaaca 318  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  12593006 acattttccttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttttttgaaaattgaaaactttttgtctattttggaaagcaaacctgagcaaca 12593105  T
Q  319 gggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtg 411  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||    
T  12593106 gggtacattcaaatgaaacatgcatgagtgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtg 12593198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 291; E-Value: 1e-163
Query Start/End: Original strand, 8 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 12710863 - 12710459
Alignment:
Q  8 tcatcagaagtttctgtgcttgtgaattcagaatttccgggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 107  Q
    ||||| |||| |||||| |||||||||||| | ||||   ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12710863 tcatctgaagcttctgtacttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 12710764  T
Q  108 ctttgtgaatccatggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttaaaactctatttttcttctactttc 207  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||||    
T  12710763 ctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaattcta-ttttcttctactttc 12710665  T
Q  208 aaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaaca--ttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagca 305  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12710664 aaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagca 12710565  T
Q  306 aacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatag 405  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||| || |||||||||| ||| |  ||||||||    
T  12710564 aacctgagcaacagggtacaatcaaatgaaacatgcatgagcgagggtatgtgaatgtctatttcaatatatgctacaagcaggttctccttcaggatag 12710465  T
Q  406 tctgtg 411  Q
    ||||||    
T  12710464 tctgtg 12710459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 290; E-Value: 1e-162
Query Start/End: Original strand, 25 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 13930791 - 13930402
Alignment:
Q  25 gcttgtgaattcagaatttccgggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccatgga 124  Q
    ||||| ||||||| | ||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  13930791 gcttgcgaattcaaagtttccaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtgga 13930692  T
Q  125 gtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgttt-aaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaa 223  Q
    |||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13930691 gtcgtgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactccatttttcttctactttcaaagctatatacaaaa 13930592  T
Q  224 -cattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttt-gaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacaggg 321  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13930591 acattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacaggg 13930492  T
Q  322 tacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtg 411  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||| | ||| |||||||||||    
T  13930491 tacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttaatgtctatttcaatatgtgttacgagcaggttctcctccaagatagtctgtg 13930402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 286; E-Value: 1e-160
Query Start/End: Original strand, 8 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 11629446 - 11629043
Alignment:
Q  8 tcatcagaagtttctgtgcttgtgaattcagaatttccgggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 107  Q
    ||||| |||| |||||| |||||||||||| | |||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11629446 tcatctgaagcttctgtacttgtgaattcaaagtttttgggaaatgtaatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 11629347  T
Q  108 ctttgtgaatccatggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttaaaactctatttttcttctactttc 207  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||    
T  11629346 ctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgtttaaaactcta-ttttcttttattttc 11629248  T
Q  208 aaagctatatac-aaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaaca-ttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagca 305  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||    
T  11629247 aaagctatatacaaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaataaacatttttgaaaattgaaaactctttgtctattttgaaaaaca 11629148  T
Q  306 aacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatag 405  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||| | |||||||||    
T  11629147 aacctgagcaacagggtacattcaaatg-aacatgcatgagcgagtgtgtgttggtgtctatttcaatatatgttacaagcaggttctcctccaggatag 11629049  T
Q  406 tctgtg 411  Q
    ||||||    
T  11629048 tctgtg 11629043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 286; E-Value: 1e-160
Query Start/End: Original strand, 8 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 21671435 - 21671028
Alignment:
Q  8 tcatcagaagtttctgtgcttgtgaattcagaatttccgggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaa-ttaccattttccaa 106  Q
    ||||| |||| |||||| |||||||||||| | ||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  21671435 tcatctgaagcttctgtacttgtgaattcaaagttttcgggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaaattaccattttccaa 21671336  T
Q  107 gctttgtgaatccatggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttaaaactctatttttcttctacttt 206  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  21671335 gctttgtgaatccgtggagtcacgcctttggctgaccaccactcttatacatcaaattgagcctgtgcttttgtttaaaactctatttt-cttctacttt 21671237  T
Q  207 caaagctatatacaaaa-cattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttt--gaaaattgaaaacttttt-gtctattttgaaaa 302  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  21671236 caaagctatatacaaaaacattttctttctattttgataaagacaatgcttgaaacaaacattttttgaaaattgaaattttttttgtctattttgaaaa 21671137  T
Q  303 gcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccagga 402  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||| | ||||||    
T  21671136 gcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatgtatgttacaagcaggttctcctccagga 21671037  T
Q  403 tagtctgtg 411  Q
    |||||||||    
T  21671036 tagtctgtg 21671028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 284; E-Value: 1e-159
Query Start/End: Original strand, 25 - 411
Target Start/End: Original strand, 31882284 - 31882670
Alignment:
Q  25 gcttgtgaattcagaatttccgggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccatgga 124  Q
    ||||| ||||||| | ||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  31882284 gcttgcgaattcaaagtttccaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtatcaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtgga 31882383  T
Q  125 gtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttaaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaac 224  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31882384 gtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaattcta-ttttcttctactttcaaagctatatacaaaac 31882482  T
Q  225 attttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaaca-ttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggta 323  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  31882483 attttctttctattttgataatggcaatgcttgaaacaaacatttttgaaaattaaaaactttttttctattttgaaaagcaaacttgagcaacggggta 31882582  T
Q  324 cattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtg 411  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| ||| | |||||||||||||||    
T  31882583 cattcaaatgaaacatgcatgagcgagaatatgttaatgtctatttcaatatatgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtg 31882670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 281; E-Value: 1e-157
Query Start/End: Original strand, 24 - 411
Target Start/End: Original strand, 3788490 - 3788877
Alignment:
Q  24 tgcttgtgaattcagaatttccgggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccatgg 123  Q
    |||||| ||||||| | ||||  ||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||  ||    
T  3788490 tgcttgcgaattcaaagtttctaggagatgtcatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttataaatccgcgg 3788589  T
Q  124 agtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgttt-aaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaa 222  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  3788590 agtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctatttt-cttctactttcaaagctatatacaaa 3788688  T
Q  223 acattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggt 322  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3788689 acattttctttctattttgataatgataatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggt 3788788  T
Q  323 acattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtg 411  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||| | |||||||||||||||    
T  3788789 acattcaaatgaaacatgcatgaacgagagtatgttgatgtctatttcaatgtatgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtg 3788877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 281; E-Value: 1e-157
Query Start/End: Original strand, 24 - 411
Target Start/End: Original strand, 32055798 - 32056185
Alignment:
Q  24 tgcttgtgaattcagaatttccgggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccatgg 123  Q
    |||||| ||||||| | ||||| ||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||    
T  32055798 tgcttgcgaattcaaagtttccaggaaatgtcatgattactgtgttcaatgtatcaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtgg 32055897  T
Q  124 agtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttaaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaa 223  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32055898 agtcacgccttcggctgactaccactcttatacatcaaattgagcctgtgcttttgtttaaaattcta-ttttcttctactttcaaagctatatacaaaa 32055996  T
Q  224 cattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaaca-ttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggt 322  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32055997 cattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttttgaaaactgaaaactttttgtttattttgaaaagcaaacctgagcaacagggt 32056096  T
Q  323 acattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtg 411  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||| ||| | ||| |||| ||||||    
T  32056097 acattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttggtgtctatttcaatatatgttaccagcaggttctcctccaagataatctgtg 32056185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 280; E-Value: 1e-156
Query Start/End: Original strand, 19 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 21697427 - 21697031
Alignment:
Q  19 ttctgtgcttgtgaattcagaatttccgggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatc 118  Q
    ||||||||||| ||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  21697427 ttctgtgcttgcgaattcaaagtttccaggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatc 21697328  T
Q  119 catggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttaaaactctatttttcttctactttcaaagctatata 218  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| | |  | |||||||||||||||| ||    
T  21697327 cgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgtttgaaactctactatcttcctactttcaaagctatgta 21697228  T
Q  219 c--aaaacattttctttctattttgataatgac-aatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaa--ctttttgtctattttgaaaagcaaacctgag 313  Q
    |  |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||   ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  21697227 caaaaaacattttctttctattttgataatgacaaatgcttgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagttttttgtctattttg-aaagcaaacctgag 21697129  T
Q  314 caacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtg 411  Q
    ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  21697128 caacaaggtacattcaaacgaaacatgcatgagcgagtgtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggttcttccccaggatagtctgtg 21697031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 280; E-Value: 1e-156
Query Start/End: Original strand, 25 - 411
Target Start/End: Original strand, 37931369 - 37931763
Alignment:
Q  25 gcttgtgaattcagaatttccgggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccatgga 124  Q
    ||||| ||||||| | ||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  37931369 gcttgcgaattcaaagtttccaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtgga 37931468  T
Q  125 gtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgttt-aaaactctattttt------cttctactttcaaagctatat 217  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||      |||||||||||||||||||||    
T  37931469 gtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctatttttttttttcttctactttcaaagctatat 37931568  T
Q  218 acaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttt-gaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaa 316  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  37931569 acaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttttgaaaattgaaaactttttgtttattttgaaaagcaaacctgagcaa 37931668  T
Q  317 cagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtg 411  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| ||| | || ||||||||||||    
T  37931669 cagggtacaatcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttaatgtctatttcaatatatgttacaagcaggttctcctccgggatagtctgtg 37931763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 274; E-Value: 1e-153
Query Start/End: Original strand, 19 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 16823588 - 16823195
Alignment:
Q  19 ttctgtgcttgtgaattcagaatttccgggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatc 118  Q
    |||||| |||||| ||||| | || || ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16823588 ttctgtacttgtggattcaaagttcccaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatc 16823489  T
Q  119 catggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttaaaactctatttttcttctactttcaaagctatata 218  Q
    | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||| ||||  || ||||||||||||||||||    
T  16823488 cgtggagtcatgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagactgtgcttttgtttgaaactctgttttctttttactttcaaagctatata 16823389  T
Q  219 caaaa-cattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaac 317  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  16823388 caaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaaccttttgtctattttgaaaagcaaacccgagcaac 16823289  T
Q  318 agggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtg 411  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||| || |||||||||| ||| | |||||||||||||||    
T  16823288 agggtacaatcaaatgaaacatgcatgagcgagggtatgtgaatgtctatttcaatatatgctacaagcaggttctcctccaggatagtctgtg 16823195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 274; E-Value: 1e-153
Query Start/End: Original strand, 19 - 411
Target Start/End: Original strand, 16897892 - 16898285
Alignment:
Q  19 ttctgtgcttgtgaattcagaatttccgggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatc 118  Q
    |||||| |||||| ||||| | || || ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16897892 ttctgtacttgtggattcaaagttcccaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatc 16897991  T
Q  119 catggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttaaaactctatttttcttctactttcaaagctatata 218  Q
    | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||| ||||  || ||||||||||||||||||    
T  16897992 cgtggagtcatgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagactgtgcttttgtttgaaactctgttttctttttactttcaaagctatata 16898091  T
Q  219 caaaa-cattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaac 317  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  16898092 caaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaaccttttgtctattttgaaaagcaaacccgagcaac 16898191  T
Q  318 agggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtg 411  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||| || |||||||||| ||| | |||||||||||||||    
T  16898192 agggtacaatcaaatgaaacatgcatgagcgagggtatgtgaatgtctatttcaatatatgctacaagcaggttctcctccaggatagtctgtg 16898285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 270; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 8 - 411
Target Start/End: Original strand, 40239489 - 40239892
Alignment:
Q  8 tcatcagaagtttctgtgcttgtgaattcagaatttccgggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 107  Q
    ||||| |||| |||||| |||||||||||| | ||||   ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40239489 tcatctgaagcttctgtacttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 40239588  T
Q  108 ctttgtgaatccatggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgttt-aaaactctatttttcttctacttt 206  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  40239589 ctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactcta-ttttcttctacttt 40239687  T
Q  207 caaagctatatac-aaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagca 305  Q
    ||||| ||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40239688 caaagttatatacaaaaatattttctttccattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagca 40239787  T
Q  306 aacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatag 405  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||| |||||||||||| || ||||||||||||| ||| | |||||||||    
T  40239788 aacctgagcaacagggtacattcaaatg-aacatgcatgagcgagtgtgtgttggtgtctatttcaacatatgttacaagcaggttctcctccaggatag 40239886  T
Q  406 tctgtg 411  Q
    ||||||    
T  40239887 tctgtg 40239892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 269; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 76 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 31868979 - 31868644
Alignment:
Q  76 accaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccatggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgct 175  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  31868979 accaccaaccaataaaattaccatttttcaagcattgtaaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaaattgagcctgtgct 31868880  T
Q  176 tttgtttaaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttt-gaaa 274  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  31868879 tttgtttaaaactctatttt-cttctactttcaaagctatatacaaatcattttccttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttttgaaa 31868781  T
Q  275 attgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaata 374  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  31868780 attgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtgtgttgatgtctatttcaata 31868681  T
Q  375 tgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtg 411  Q
    | ||||||||||||| ||| | |||||||||||||||    
T  31868680 tatgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtg 31868644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 262; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 8 - 411
Target Start/End: Original strand, 27782212 - 27782616
Alignment:
Q  8 tcatcagaagtttctgtgcttgtgaattcagaatttccgggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 107  Q
    |||||| ||| |||||| |||||||||||| | ||||   ||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27782212 tcatcaaaagcttctgtacttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttaccgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 27782311  T
Q  108 ctttgtgaatccatggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgttt-aaaactctatttttcttctacttt 206  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||   ||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||    
T  27782312 ctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaagttgagccgttgcttttgtttgaaaactctatttt-cttctatttt 27782410  T
Q  207 caaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttt-gaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagca 305  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  27782411 caaagctatatacaaaacattttccttccattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttttgaaaattgaaaactttttgtttattttgaaaagca 27782510  T
Q  306 aacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatag 405  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||| ||| | |||||||||    
T  27782511 aacctgagcaacagggtacaatcaaatgaaacatgcatgagcgagtgtatgttggtgtctatttcaatatatgttacaaacaggttctcctccaggatag 27782610  T
Q  406 tctgtg 411  Q
    ||||||    
T  27782611 tctgtg 27782616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 261; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 24 - 411
Target Start/End: Original strand, 34297152 - 34297533
Alignment:
Q  24 tgcttgtgaattcagaatttccgggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccatgg 123  Q
    |||||| ||||||| | ||||  ||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||    
T  34297152 tgcttgcgaattcaaagtttctaggagatgtcatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatctgtgg 34297251  T
Q  124 agtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttaaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaa 223  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||  || |||||||||||||||||||||||    
T  34297252 agtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctgctttctttttactttcaaagctatatacaaaa 34297351  T
Q  224 cattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggta 323  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||  |||      ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34297352 cattttctttctattttgataatgataatgctcgaaacaaacatttcgaaaattgaaaaagttt------ttttgaaaagcaaacctgagcaacagggta 34297445  T
Q  324 cattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtg 411  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||| | |||||||||||||||    
T  34297446 cattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatatgttacaagcgggttctcctccaggatagtctgtg 34297533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 246; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 8 - 411
Target Start/End: Original strand, 27396303 - 27396717
Alignment:
Q  8 tcatcagaagtttctgtgcttgtgaattcagaatttccgggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 107  Q
    |||||||||| || |||||||| ||||||| | ||||  |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  27396303 tcatcagaagcttttgtgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtagtggttaccgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattgccattttccaag 27396402  T
Q  108 ctttgtgaatccatggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttaaaactctatttttcttctactttc 207  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||  ||||||||||    
T  27396403 ctttgtaaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgtttgaaactctactttctttctactttc 27396502  T
Q  208 aaagctatatac--aaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaa----------ctttttgtctatt 295  Q
    |||||||| |||  |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||           ||||||||  ||    
T  27396503 aaagctatgtacaaaaaacattttctttctatctttataatgacaatgcttgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaaaaaaaaaagttttttgtccttt 27396602  T
Q  296 ttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttc 395  Q
    ||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27396603 ttg-aaagcaaacctaagcaacaaggtacattcaaacgaaacatgcatgagcgagcgtatgtcgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttc 27396701  T
Q  396 cccaggatagtctgtg 411  Q
    ||||||||||||||||    
T  27396702 cccaggatagtctgtg 27396717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 8 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 19450689 - 19450276
Alignment:
Q  8 tcatcagaagtttctgtgcttgtgaattcagaatttccgggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 107  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||| | ||||  |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  19450689 tcatcagaagcttctgtgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtagtggttaccgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattgccattttccaag 19450590  T
Q  108 ctttgtgaatccatggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttaaaactctatttttcttctactttc 207  Q
    |||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||   |||||||||    
T  19450589 ctttgtaaatccgtggaatcacgccttcggctgaccaccacttttatacatcaattcgagcatgtgcttttgtttgaaactctattttctctctactttc 19450490  T
Q  208 aaagctatatac-----aaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattg------aaaactttttgtctattt 296  Q
    |||| ||| |||     |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||      |||| ||||||||| |||    
T  19450489 aaaggtatgtacaaaaaaaaacattttctttctatcttgataatgacaatgcttgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaaaaaaagtttttgtctgttt 19450390  T
Q  297 tgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttcc 396  Q
    || |||| |||||||||||||| ||||| |||||| ||||  |||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  19450389 tg-aaagtaaacctgagcaacaaggtacgttcaaacgaaatgtgcatgagtgagcgtatgtcgatgtctatttcaatatgtgttataagcaggctcttcc 19450291  T
Q  397 ccaggatagtctgtg 411  Q
    |||||||||||||||    
T  19450290 ccaggatagtctgtg 19450276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 213; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 24 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 34269167 - 34268784
Alignment:
Q  24 tgcttgtgaattcagaatttccgggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccatgg 123  Q
    |||||||||||||| | ||||  ||||||||  |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||    
T  34269167 tgcttgtgaattcaaagtttctaggaaatgtcatgattgttgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattctccaagctttgtaaatccgtgg 34269068  T
Q  124 agtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttaaaactctatttttcttctactttcaaagctatatac-aaa 222  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||| ||| ||| |||    
T  34269067 agtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaaattgagcatgtgcttttgtttaaaactctattttctttttactttcaaagttatgtacaaaa 34268968  T
Q  223 acattttctttcta-ttttgataatgac-aatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagg 320  Q
    |||||||| ||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||||  ||       |||||||||||||||||||||||||||    
T  34268967 acattttccttctatttttaataatgacaaatgcttgaaacaaacatcttaaaaattgaaaaagtt-------ttttgaaaagcaaacctgagcaacagg 34268875  T
Q  321 gtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtg 411  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||  ||||| | |||||||||||||    
T  34268874 gtacattcaaacgaaacatgcatgagcgagtgtatgttggtgtctatttcaatatatgttacaagcagattcttctctaggatagtctgtg 34268784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 24 - 411
Target Start/End: Original strand, 28888275 - 28888658
Alignment:
Q  24 tgcttgtgaattcagaatttccgggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccatgg 123  Q
    |||||| ||||||| | ||||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||    
T  28888275 tgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtcatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtgg 28888374  T
Q  124 agtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttaaaactctatttttcttctactttcaaagctatatac-aaa 222  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||  |||  || ||||||||||| ||| ||| |||    
T  28888375 agtcgcgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgtttgaaactctgctttctttttactttcaaagttatgtacaaaa 28888474  T
Q  223 acattttctttcta-ttttgataatgac-aatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagg 320  Q
    |||||||| ||||| |||| |||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||  |||      |||||||||||||||||||||||||||    
T  28888475 acattttccttctatttttaataatgacaaatgctcgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagttt------ttttgaaaagcaaacctgagcaacagg 28888568  T
Q  321 gtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtg 411  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||| | |||||||||||||||    
T  28888569 gtacattcaaatg-aacatgcatgagcgagtgtgtgttggtgtctatttcaatatatgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtg 28888658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 24 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 27428692 - 27428315
Alignment:
Q  24 tgcttgtgaattcagaatttccgggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccatgg 123  Q
    ||||||||| |||| | ||||  ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||    
T  27428692 tgcttgtgagttcaaagtttctaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtgg 27428593  T
Q  124 agtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttaaaactctatttttcttctactttcaaagctatatac-aaa 222  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||| ||| | | |||    
T  27428592 agtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgtttaaaactctattttctttttactttcaaagttatgtgcaaaa 27428493  T
Q  223 acattttctttcta-ttttgataatgac-aatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagg 320  Q
    |||||||| ||||| |||| |||||||| |||| | ||||||||||| |||||||||| |||  |        |||||||||||||||||||||||||||    
T  27428492 acattttccttctatttttaataatgacaaatgttcgaaacaaacatcttgaaaattgcaaaagt--------ttttgaaaagcaaacctgagcaacagg 27428401  T
Q  321 gtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtc 407  Q
    ||||||||||| | ||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  27428400 gtacattcaaacg-aacgtgcatgagcgagtgtatgttggtgtctatttcaatatatgttacaagcaggttctcccccaggatagtc 27428315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 25 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 23122818 - 23122436
Alignment:
Q  25 gcttgtgaattcagaatttccgggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaa-ttaccattttccaagctttgtgaatccatgg 123  Q
    ||||| ||||||| | ||||  ||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||| |||    
T  23122818 gcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtatcaccaaccaataaaaattaccattttccaagctttgcaaatccgtgg 23122719  T
Q  124 agtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttaaaactctatttttcttctactttcaaagctatatac-aaa 222  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||  || ||||||||||| ||| ||| |||    
T  23122718 agtcacaccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgtttgaaactctgttttctttttactttcaaagttatgtacaaaa 23122619  T
Q  223 acattttctttctattttgataatgac-aatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacaggg 321  Q
    |||||||| ||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||  |||      ||||||||||||||||||||||||||||    
T  23122618 acattttccttctattttaataatgacaaatgctcgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagttt------ttttgaaaagcaaacctgagcaacaggg 23122525  T
Q  322 tacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtg 411  Q
    |||||||||| | |||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||| || |||||||||| ||| | |||||||||||||||    
T  23122524 tacattcaaacg-aacatgcatgagcgagtgtgtgttggtgtctatttcaatatatgctacaagcaggttctcctccaggatagtctgtg 23122436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 180; E-Value: 5e-97
Query Start/End: Original strand, 47 - 411
Target Start/End: Original strand, 20843931 - 20844296
Alignment:
Q  47 ggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaa-ttaccattttccaagctttgtgaatccatggagtcacgccttcggctgaccac 145  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||  |||    
T  20843931 ggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggagtcacgccttcggctggacac 20844030  T
Q  146 cactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttaaaactctatttttcttctactttc-aaagctatat--acaaaacattttctttcta-ttttg 241  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||  || ||| ||| |||| ||| |  | ||||||||||| ||||| ||||     
T  20844031 cactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgtttgaaactctactttctttttaccttcaaaagttatgttcaaaaaacattttccttctattttta 20844130  T
Q  242 ataatgac-aatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatg 340  Q
    |||||||| |||||| ||||||| ||| ||||||||||||||  ||||     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  20844131 ataatgacaaatgctcgaaacaagcatcttgaaaattgaaaaagtttt-----ttttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaacaaaacatg 20844225  T
Q  341 catgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtg 411  Q
    |||||||||| || ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||| | |||||||||||||||    
T  20844226 catgagcgagcgtgtgttggtgtctatttcaatatatgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtg 20844296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 224 - 411
Target Start/End: Original strand, 23116993 - 23117180
Alignment:
Q  224 cattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggta 323  Q
    ||||||| | |||| || || |||||||||||||||  ||   ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  23116993 cattttcctcctatcttcatcatgacaatgcttgaactaacgtttttgaccattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgggcaacagggta 23117092  T
Q  324 cattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtg 411  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||    
T  23117093 cattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtg 23117180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 25 - 81
Target Start/End: Complemental strand, 31887738 - 31887682
Alignment:
Q  25 gcttgtgaattcagaatttccgggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccacc 81  Q
    ||||| ||||||| | ||||  ||||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  31887738 gcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtcatgattactgtgttcaatgtaccacc 31887682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0159 (Bit Score: 332; Significance: 0; HSPs: 2)
Name: scaffold0159
Description:

Target: scaffold0159; HSP #1
Raw Score: 332; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 8 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 3453 - 3047
Alignment:
Q  8 tcatcagaagtttctgtgcttgtgaattcagaatttccgggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 107  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3453 tcatcagaagtttctgtgcttgtgaattcaaaatttccaggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 3354  T
Q  108 ctttgtgaatccatggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgttt-aaaactctatttt--tcttctact 204  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||| ||||||||  |||||||||    
T  3353 ctttgtaaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaattctattttgttcttctact 3254  T
Q  205 ttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagc 304  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  3253 ttcaaagctatatacaaaacattctctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaaccttttgtctattttgaaaagc 3154  T
Q  305 aaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggata 404  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| | ||||||||    
T  3153 aaacctgagcaacagggtaccttcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatatgttacaagcaggttctcctccaggata 3054  T
Q  405 gtctgtg 411  Q
    |||||||    
T  3053 gtctgtg 3047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0159; HSP #2
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 172 - 411
Target Start/End: Original strand, 17952 - 18194
Alignment:
Q  172 tgcttttgttt-aaaactctatttt--tcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatt 268  Q
    ||||||||||| |||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17952 tgcttttgtttgaaaattctattttgttcttctactttcaaagctatatacaaaacattctctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatt 18051  T
Q  269 ttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatt 368  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18052 ttgaaaattgaaaaccttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtaccttcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatt 18151  T
Q  369 tcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtg 411  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||| | |||||||||||||||    
T  18152 tcaatatatgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtg 18194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 330; Significance: 0; HSPs: 57)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 330; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 8 - 411
Target Start/End: Original strand, 32296574 - 32296979
Alignment:
Q  8 tcatcagaagtttctgtgcttgtgaattcagaatttccgggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 107  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32296574 tcatcagaagtttctgcgcttgtgaattcaaaatttccaggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 32296673  T
Q  108 ctttgtgaatccatggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgttt-aaaactctatttt-tcttctactt 205  Q
    |||||||||||| |||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||    
T  32296674 ctttgtgaatccgtggagtcgtgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaattctattttttcttctactt 32296773  T
Q  206 tcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagca 305  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32296774 tcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagca 32296873  T
Q  306 aacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatag 405  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||    
T  32296874 aacctgagcaacagggtacattcaaacgaaacatgcatgagtgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggttctcctccaggatag 32296973  T
Q  406 tctgtg 411  Q
    ||||||    
T  32296974 tctgtg 32296979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 317; E-Value: 1e-179
Query Start/End: Original strand, 25 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 4790932 - 4790544
Alignment:
Q  25 gcttgtgaattcagaatttccgggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaa-ttaccattttccaagctttgtgaatccatgg 123  Q
    ||||| ||||||| | ||| | ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||    
T  4790932 gcttgcgaattcaaagttttcaggaaatgtaatgattaccgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtgg 4790833  T
Q  124 agtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttaaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaa 223  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4790832 attcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaa 4790733  T
Q  224 -cattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggt 322  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4790732 acattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggt 4790633  T
Q  323 acattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtg 411  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||    
T  4790632 acattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtg 4790544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 313; E-Value: 1e-176
Query Start/End: Original strand, 25 - 411
Target Start/End: Original strand, 5727940 - 5728328
Alignment:
Q  25 gcttgtgaattcagaatttccgggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccatgga 124  Q
    ||||| ||||||| | ||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  5727940 gcttgcgaattcaaagtttccaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtgga 5728039  T
Q  125 gtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgttt-aaaactctatttt-tcttctactttcaaagctatatacaaa 222  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  5728040 gtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctattttttcttctactttcaaagctatatacaaa 5728139  T
Q  223 acattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggt 322  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5728140 acattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggt 5728239  T
Q  323 acattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtg 411  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||    
T  5728240 acattcaaatgaaacatgcatgagtgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtg 5728328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 313; E-Value: 1e-176
Query Start/End: Original strand, 25 - 411
Target Start/End: Original strand, 47029415 - 47029803
Alignment:
Q  25 gcttgtgaattcagaatttccgggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccatgga 124  Q
    ||||| ||||||| | ||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  47029415 gcttgcgaattcaaagtttccaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtgga 47029514  T
Q  125 gtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgttt-aaaactctatttt-tcttctactttcaaagctatatacaaa 222  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  47029515 gtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctattttttcttctactttcaaagctatatacaaa 47029614  T
Q  223 acattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggt 322  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47029615 acattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggt 47029714  T
Q  323 acattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtg 411  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||    
T  47029715 acattcaaatgaaacatgcatgagtgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtg 47029803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 309; E-Value: 1e-174
Query Start/End: Original strand, 25 - 411
Target Start/End: Original strand, 5717030 - 5717418
Alignment:
Q  25 gcttgtgaattcagaatttccgggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccatgga 124  Q
    ||||| ||||||| | ||| | ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  5717030 gcttgcgaattcaaagttttcaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtgga 5717129  T
Q  125 gtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgttt-aaaactctatttt-tcttctactttcaaagctatatacaaa 222  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  5717130 gtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctattttttcttctactttcaaagctatatacaaa 5717229  T
Q  223 acattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggt 322  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5717230 acattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggt 5717329  T
Q  323 acattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtg 411  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||    
T  5717330 acattcaaatgaaacatgcatgagtgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtg 5717418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 309; E-Value: 1e-174
Query Start/End: Original strand, 25 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 5764428 - 5764040
Alignment:
Q  25 gcttgtgaattcagaatttccgggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccatgga 124  Q
    ||||| ||||||| | ||| | ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  5764428 gcttgcgaattcaaagttttcaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtgga 5764329  T
Q  125 gtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgttt-aaaactctattttt-cttctactttcaaagctatatacaaa 222  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  5764328 gtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctattttttcttctactttcaaagctatatacaaa 5764229  T
Q  223 acattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggt 322  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5764228 acattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggt 5764129  T
Q  323 acattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtg 411  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||    
T  5764128 acattcaaatgaaacatgcatgagtgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtg 5764040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 306; E-Value: 1e-172
Query Start/End: Original strand, 46 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 31958734 - 31958366
Alignment:
Q  46 gggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccatggagtcacgccttcggctgaccac 145  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  31958734 gggaaatgtaatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccac 31958635  T
Q  146 cactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgttt-aaaactctatttt--tcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttga 242  Q
    ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31958634 cactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaattctattttgttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttga 31958535  T
Q  243 taatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgca 342  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  31958534 taatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaaccttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtaccttcaaatgaaacatgca 31958435  T
Q  343 tgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtg 411  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| | |||||||||||||||    
T  31958434 tgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatatgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtg 31958366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 305; E-Value: 1e-171
Query Start/End: Original strand, 24 - 411
Target Start/End: Original strand, 10402110 - 10402497
Alignment:
Q  24 tgcttgtgaattcagaatttccgggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccatgg 123  Q
    |||||| ||||||| | ||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||    
T  10402110 tgcttgcgaattcaaagttttcaggaaatgtaatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtgg 10402209  T
Q  124 agtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttaaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaa 223  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  10402210 agtcacaccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgattaaaattctattttt-ttctactttcaaagctatatacaaaa 10402308  T
Q  224 cattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttt-gaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggt 322  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10402309 cattttctttctattttgataatgacaatgctcgaaacaaacatttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggt 10402408  T
Q  323 acattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtg 411  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| | |||||||||||||||    
T  10402409 acattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatatgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtg 10402497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 305; E-Value: 1e-171
Query Start/End: Original strand, 8 - 411
Target Start/End: Original strand, 48471872 - 48472280
Alignment:
Q  8 tcatcagaagtttctgtgcttgtgaattcagaatttccgggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 107  Q
    |||||| ||||| ||  ||||| ||||||| | ||||| ||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48471872 tcatcaaaagttcctacgcttgcgaattcaaagtttccaggaaatgtaatgattgatgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 48471971  T
Q  108 ctttgtgaatccatggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttaaaactctatttttcttctactttc 207  Q
    |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  48471972 ctttgtaaatccatggagtcacgccctcggctgaccaccactctcatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttc 48472071  T
Q  208 aaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttg-----aaaattgaaaactttttgtctattttgaaaa 302  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  48472072 aaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttttttttaaaaattgaaaactttctgtctattttgaaaa 48472171  T
Q  303 gcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccagga 402  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| | ||||||    
T  48472172 gcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatatgttacaagcaggttctcctccagga 48472271  T
Q  403 tagtctgtg 411  Q
    |||||||||    
T  48472272 tagtctgtg 48472280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 302; E-Value: 1e-170
Query Start/End: Original strand, 46 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 5603592 - 5603224
Alignment:
Q  46 gggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccatggagtcacgccttcggctgaccac 145  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  5603592 gggaaatgtaatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccac 5603493  T
Q  146 cactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgttt-aaaactctatttt--tcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttga 242  Q
    ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5603492 cactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaattctattttgttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttga 5603393  T
Q  243 taatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgca 342  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  5603392 taatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaaccttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtaccttcaaataaaacatgca 5603293  T
Q  343 tgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtg 411  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| | |||||||||||||||    
T  5603292 tgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatatgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtg 5603224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 302; E-Value: 1e-170
Query Start/End: Original strand, 46 - 411
Target Start/End: Original strand, 24334156 - 24334524
Alignment:
Q  46 gggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccatggagtcacgccttcggctgaccac 145  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  24334156 gggaaatgtaatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccac 24334255  T
Q  146 cactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgttt-aaaactctatttt--tcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttga 242  Q
    ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||| ||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  24334256 cactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaattctattttgttcttctactttcaaagctatacacaaaacattttctttctattttga 24334355  T
Q  243 taatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgca 342  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  24334356 taatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaaccttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtaccttcaaatgaaacatgca 24334455  T
Q  343 tgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtg 411  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| | |||||||||||||||    
T  24334456 tgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatatgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtg 24334524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 301; E-Value: 1e-169
Query Start/End: Original strand, 24 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 22381879 - 22381492
Alignment:
Q  24 tgcttgtgaattcagaatttccgggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccatgg 123  Q
    |||||| ||||||| | ||||  ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  22381879 tgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtcatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtgg 22381780  T
Q  124 agtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttaaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaa 223  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22381779 agtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaa 22381680  T
Q  224 cattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaaca-ttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggt 322  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||    
T  22381679 cattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcgacagtgt 22381580  T
Q  323 acattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtg 411  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||| | |||||||||||||||    
T  22381579 acattcaaatg-aacatgcatgagcgagtgtgtgttggtgtctatttcaatatatgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtg 22381492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 301; E-Value: 1e-169
Query Start/End: Original strand, 8 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 29659283 - 29658879
Alignment:
Q  8 tcatcagaagtttctgtgcttgtgaattcagaatttccgggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 107  Q
    |||||| ||| |||||| |||||||||||| | ||||   ||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29659283 tcatcaaaagcttctgtacttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttaccgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 29659184  T
Q  108 ctttgtgaatccatggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttaaaactctatttttcttctactttc 207  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  29659183 ctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaagttgagcctttgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttc 29659084  T
Q  208 aaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaaca-ttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaa 306  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  29659083 aaagttatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttttgaaaattgaaaacctttggtctattttgaaaagcaa 29658984  T
Q  307 acctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagt 406  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||    
T  29658983 acctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggttctcctccaggatagt 29658884  T
Q  407 ctgtg 411  Q
    |||||    
T  29658883 ctgtg 29658879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 300; E-Value: 1e-168
Query Start/End: Original strand, 8 - 411
Target Start/End: Original strand, 28027236 - 28027638
Alignment:
Q  8 tcatcagaagtttctgtgcttgtgaattcagaatttccgggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 107  Q
    |||||| ||| |||||| |||||| ||||| | ||||   ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28027236 tcatcaaaagcttctgtacttgtggattcaaagtttctaagaactgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 28027335  T
Q  108 ctttgtgaatccatggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttaaaactctatttttcttctactttc 207  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  28027336 ctttgtgaatccgtggagtcaggcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttaaaattctatttt-cttctactttc 28027434  T
Q  208 aaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaa 307  Q
    ||||||||||||||   |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28027435 aaagctatatacaatttattttccttctattttgataatgataatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaa 28027534  T
Q  308 cctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtc 407  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||| | |||||||||||    
T  28027535 cctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatgtatgttacaagcaggttctcctccaggatagtc 28027634  T
Q  408 tgtg 411  Q
    ||||    
T  28027635 tgtg 28027638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 296; E-Value: 1e-166
Query Start/End: Original strand, 8 - 411
Target Start/End: Original strand, 16422128 - 16422532
Alignment:
Q  8 tcatcagaagtttctgtgcttgtgaattcagaatttccgggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 107  Q
    ||||| |||| ||||||||||| ||||||| | ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16422128 tcatctgaagcttctgtgcttgcgaattcaaagtttccgg-aaatgtaatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 16422226  T
Q  108 ctttgtgaatccatggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttaaaactctatttttcttctactttc 207  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||| |||  ||||||||||    
T  16422227 ctttgtaaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaactctactttctttctactttc 16422326  T
Q  208 aaagctatatac--aaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattg-aaaactttttgtctattttgaaaagc 304  Q
    |||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||| ||||||| |||||    
T  16422327 aaagctatgtacaaaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagtttttgtgtattttg-aaagc 16422425  T
Q  305 aaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggata 404  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16422426 aaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtgtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggata 16422525  T
Q  405 gtctgtg 411  Q
    |||||||    
T  16422526 gtctgtg 16422532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 296; E-Value: 1e-166
Query Start/End: Original strand, 24 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 17971163 - 17970777
Alignment:
Q  24 tgcttgtgaattcagaatttccgggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccatgg 123  Q
    |||||| ||||||| | ||||  ||||||||  ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  17971163 tgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtcatgattgctgtgttcaacgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtgg 17971064  T
Q  124 agtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttaaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaa 223  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||      
T  17971063 agtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaaattgagcctgtgcttttgtttaaaactctatttt-cttctattttcaaagctatatacaatt 17970965  T
Q  224 cattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggta 323  Q
     |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17970964 tattttccttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggta 17970865  T
Q  324 cattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtg 411  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| | |||||||||||||||    
T  17970864 cattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgcgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtg 17970777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 293; E-Value: 1e-164
Query Start/End: Original strand, 25 - 411
Target Start/End: Original strand, 10649033 - 10649420
Alignment:
Q  25 gcttgtgaattcagaatttccgggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccatgga 124  Q
    ||||| ||||||| | ||||| |||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  10649033 gcttgcgaattcaaagtttccaggaagtgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtgga 10649132  T
Q  125 gtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgttt-aaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaa 223  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||    
T  10649133 gtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctatttt-cttctactttcaaagttatatacaaaa 10649231  T
Q  224 c-attttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggt 322  Q
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10649232 atattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggt 10649331  T
Q  323 acattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtg 411  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||    
T  10649332 acattcaaatgaaacatgcatgagtgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtg 10649420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 292; E-Value: 1e-164
Query Start/End: Original strand, 25 - 411
Target Start/End: Original strand, 5019675 - 5020061
Alignment:
Q  25 gcttgtgaattcagaatttccgggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccatgga 124  Q
    ||||| ||||||| | ||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  5019675 gcttgcgaattcaaagtttccaggaaatgtcatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtgga 5019774  T
Q  125 gtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttaaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaac 224  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  5019775 gtcacgcctttggctgaccaccactcttacacatcaatttgagcttgtgcttttgtttaaaactcta-ctttcttctactttcaaagctatatacaaatc 5019873  T
Q  225 attttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaaca-ttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggta 323  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5019874 attttccttctattttgataatgacaatgcctgaaacgaacatttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggta 5019973  T
Q  324 cattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtg 411  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| | || ||||||||||||    
T  5019974 cattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatatgttacaagcaggttctcctccgggatagtctgtg 5020061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 292; E-Value: 1e-164
Query Start/End: Original strand, 24 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 22865145 - 22864759
Alignment:
Q  24 tgcttgtgaattcagaatttccgggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccatgg 123  Q
    |||||| ||||||| | |||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||    
T  22865145 tgcttgcgaattcaaagtttctgggaaatgtcatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtgg 22865046  T
Q  124 agtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttaaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaa 223  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |  ||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  22865045 agtcacgccttcggctgatcaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactatgcttt-cttctactttcaaagctgtatacaaaa 22864947  T
Q  224 cattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggta 323  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22864946 cattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctgttttgaaaagcaaacctgagcaacagggta 22864847  T
Q  324 cattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtg 411  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| || ||| | ||||| |||||||||    
T  22864846 cattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttaatgtctatttcaatatatgttacaagcgggttctcctccagggtagtctgtg 22864759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 292; E-Value: 1e-164
Query Start/End: Original strand, 24 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 22880204 - 22879818
Alignment:
Q  24 tgcttgtgaattcagaatttccgggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccatgg 123  Q
    |||||| ||||||| | |||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||    
T  22880204 tgcttgcgaattcaaagtttctgggaaatgtcatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtgg 22880105  T
Q  124 agtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttaaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaa 223  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |  ||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  22880104 agtcacgccttcggctgatcaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactatgcttt-cttctactttcaaagctgtatacaaaa 22880006  T
Q  224 cattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggta 323  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22880005 cattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctgttttgaaaagcaaacctgagcaacagggta 22879906  T
Q  324 cattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtg 411  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| || ||| | ||||| |||||||||    
T  22879905 cattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttaatgtctatttcaatatatgttacaagcgggttctcctccagggtagtctgtg 22879818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 291; E-Value: 1e-163
Query Start/End: Original strand, 19 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 4340980 - 4340587
Alignment:
Q  19 ttctgtgcttgtgaattcagaatttccgggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatc 118  Q
    |||||| |||||| ||||| | ||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4340980 ttctgtacttgtggattcaaagtttctaagaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatc 4340881  T
Q  119 catggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgttt-aaaactctatttttcttctactttcaaagctatat 217  Q
    | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  4340880 cgtggagtcatgccttcggctgaccaccactcttatacatcaagttgagcctttgcttttgtttgaaaactctatttt-cttctactttcaaagctatat 4340782  T
Q  218 acaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttt-gaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaa 316  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  4340781 acaaaacattttccttccattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttttgaaaattgaaaactttttgtttattttgaaaagcaaacctgagcaa 4340682  T
Q  317 cagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtg 411  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| | |||||||||||||||    
T  4340681 cagggtacaatcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatatgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtg 4340587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 291; E-Value: 1e-163
Query Start/End: Original strand, 32 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 18286645 - 18286266
Alignment:
Q  32 aattcagaatttccgggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccatggagtcacgc 131  Q
    |||||| | |||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  18286645 aattcaaagtttctgggaaatgtcatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggagtcacgc 18286546  T
Q  132 cttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttaaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttct 231  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18286545 cttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgattaaaactcta-ttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttct 18286447  T
Q  232 ttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaaca--ttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattca 329  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  18286446 ttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaatctgagcaacagggtacattca 18286347  T
Q  330 aatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtg 411  Q
    |||| |||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||    
T  18286346 aatg-aacatgcatgagcgagtgtgtgttggtgtctatttcaatatgtgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtg 18286266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 291; E-Value: 1e-163
Query Start/End: Original strand, 32 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 18301946 - 18301567
Alignment:
Q  32 aattcagaatttccgggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccatggagtcacgc 131  Q
    |||||| | |||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  18301946 aattcaaagtttctgggaaatgtcatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggagtcacgc 18301847  T
Q  132 cttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttaaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttct 231  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18301846 cttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgattaaaactcta-ttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttct 18301748  T
Q  232 ttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaaca--ttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattca 329  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  18301747 ttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaatctgagcaacagggtacattca 18301648  T
Q  330 aatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtg 411  Q
    |||| |||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||    
T  18301647 aatg-aacatgcatgagcgagtgtgtgttggtgtctatttcaatatgtgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtg 18301567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 291; E-Value: 1e-163
Query Start/End: Original strand, 24 - 411
Target Start/End: Original strand, 20071994 - 20072384
Alignment:
Q  24 tgcttgtgaattcagaatttccgggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccatgg 123  Q
    |||||| ||||||| | ||||  ||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||    
T  20071994 tgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtcatgatcactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtgg 20072093  T
Q  124 agtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttaaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaa 223  Q
    |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  20072094 agtcacaccttcggctgaccacccctcttatacatcaaattgagcctgtgcttttgtttaaaactctatttt-cttctactttcaaagctatatacaaaa 20072192  T
Q  224 cattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttt----gaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacag 319  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20072193 cattttccttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacag 20072292  T
Q  320 ggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtg 411  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| | |||||||||||||||    
T  20072293 ggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatatgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtg 20072384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 289; E-Value: 1e-162
Query Start/End: Original strand, 25 - 411
Target Start/End: Original strand, 4422880 - 4423267
Alignment:
Q  25 gcttgtgaattcagaatttccgggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccatgga 124  Q
    ||||| ||||||| | ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  4422880 gcttgcgaattcaaagtttccaggaaatgtaatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtgga 4422979  T
Q  125 gtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgttt-aaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaa 223  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| | ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||     
T  4422980 gtcacgccttcggctgaccaccacttttatacatcaagttgagcctttgcttttgtttgaaaactctatttt-cttctactttcaaagctatatacaaat 4423078  T
Q  224 cattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttt-gaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggt 322  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4423079 cattttccttctattttgataatgacaatgcttgaaataaacatttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggt 4423178  T
Q  323 acattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtg 411  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |  ||||||||||||||    
T  4423179 acattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatatgttacaagcaggttctccttcaggatagtctgtg 4423267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 289; E-Value: 1e-162
Query Start/End: Original strand, 57 - 408
Target Start/End: Complemental strand, 5590627 - 5590275
Alignment:
Q  57 tgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccatggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatac 156  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5590627 tgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatac 5590528  T
Q  157 atcaatttgagcttgtgcttttgtttaaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaa-cattttctttctattttgataatgacaatgct 255  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||  || ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5590527 atcaatttgagcctgtgcttttgtttgaaactctgttttctttttactttcaaagctatgtacaaaaacattttctttctattttgataatgacaatgct 5590428  T
Q  256 tgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtat 355  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  5590427 tgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagtgagagtat 5590328  T
Q  356 gttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtct 408  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| | ||||||||||||    
T  5590327 gttgatgtctatttcaataggtgttacaagcaggttctcctccaggatagtct 5590275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 289; E-Value: 1e-162
Query Start/End: Original strand, 24 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 6537042 - 6536654
Alignment:
Q  24 tgcttgtgaattcagaatttccgggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccatgg 123  Q
    |||||| ||||||| | |||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||    
T  6537042 tgcttgcgaattcaaagtttctgggaaatgtcatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtgg 6536943  T
Q  124 agtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttaaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaa 223  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||  || |||||||||||||||||||||||    
T  6536942 agtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctgctttctttttactttcaaagctatatacaaaa 6536843  T
Q  224 cattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaaca-ttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggt 322  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  6536842 cattttctttctattttgataatgataatgctcgaaacaaacatttttgaaaattaaaaactttttgtctgttttgaaaagcaaacctgagcaacagggt 6536743  T
Q  323 acattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtg 411  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| | |||||||||||||    
T  6536742 acattcaaatgaagcatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatatgttacaagcaggttcttctcaaggatagtctgtg 6536654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 289; E-Value: 1e-162
Query Start/End: Original strand, 8 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 28110271 - 28109862
Alignment:
Q  8 tcatcagaagtttctgtgcttgtgaattcagaatttcc-gggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaa 106  Q
    ||||| |||| |||||| |||||||||||| | |||   |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28110271 tcatctgaagcttctgtacttgtgaattcaaagttttttgggaaatgtaatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaa 28110172  T
Q  107 gctttgtgaatccatggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgttt-aaaactctatttttcttctactt 205  Q
    ||||| ||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  28110171 gctttatgaatccgtggagtcatgccttgggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactccatttttcttctactt 28110072  T
Q  206 tcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaac----attttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaa 301  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28110071 tcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacgttttttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaa 28109972  T
Q  302 agcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccagg 401  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||| |    
T  28109971 agcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttggtgtctatttcaatatgtgttacaagcaggttctcctccaag 28109872  T
Q  402 atagtctgtg 411  Q
    ||| ||||||    
T  28109871 ataatctgtg 28109862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 287; E-Value: 1e-161
Query Start/End: Original strand, 46 - 411
Target Start/End: Original strand, 28345154 - 28345519
Alignment:
Q  46 gggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccatggagtcacgccttcggctgaccac 145  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  28345154 gggaaatgtaatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccac 28345253  T
Q  146 cactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttaaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataa 245  Q
    |||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  28345254 cactcttatacatcaaattgagcctatgcttttgtttaaaactcta-ttttcttctattttcaaagctatatacaaatcattttccttctattttgataa 28345352  T
Q  246 tgacaatgcttgaaacaaacattttg-aaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatg 344  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28345353 tgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaaattgaaaaccttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatg 28345452  T
Q  345 agcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtg 411  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||| |||| ||||||    
T  28345453 agcgagggtatgttggtgtctatttcaatatgtgttacaagcaggttctcctccaagataatctgtg 28345519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 285; E-Value: 1e-159
Query Start/End: Original strand, 24 - 411
Target Start/End: Original strand, 8217593 - 8217983
Alignment:
Q  24 tgcttgtgaattcagaatttccgggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccatgg 123  Q
    |||||| ||||||| | ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||    
T  8217593 tgcttgcgaattcaaagttttcaggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtggatccgtgg 8217692  T
Q  124 agtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgttt-aaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaa 222  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  8217693 agtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctatttt-cttctactttcaaagttatatacaaa 8217791  T
Q  223 ac-attttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttt--gaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacag 319  Q
    |  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8217792 aatattttctttctattttgataatgacaatgctcgaaacaaacattttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacag 8217891  T
Q  320 ggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtg 411  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| | |||||||||||||||    
T  8217892 ggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatatgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtg 8217983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 285; E-Value: 1e-159
Query Start/End: Original strand, 8 - 411
Target Start/End: Original strand, 18248683 - 18249087
Alignment:
Q  8 tcatcagaagtttctgtgcttgtgaattcagaatttccgggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 107  Q
    |||||| ||| |||||| |||||||||||| | ||||   ||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  18248683 tcatcaaaagcttctgtacttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttaccgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccgag 18248782  T
Q  108 ctttgtgaatccatggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttaaaactctatttttcttctactttc 207  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||| | |||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  18248783 ctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccatcactcttatacatcaagttgagcctttgcttttgtttggaactctatttttcttctactttc 18248882  T
Q  208 aaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaaca-ttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaa 306  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  18248883 aaagctacatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttttgaaaattgaaaacctttggtctattttgaaaagcaa 18248982  T
Q  307 acctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagt 406  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| | ||||||||||    
T  18248983 acctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatatgttacaagcaggttctcctccaggatagt 18249082  T
Q  407 ctgtg 411  Q
    |||||    
T  18249083 ctgtg 18249087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 282; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 8 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 16618808 - 16618400
Alignment:
Q  8 tcatcagaagtttctgtgcttgtgaattcagaatttccgggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 107  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||| | ||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16618808 tcatcagaagcttctgtgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 16618709  T
Q  108 ctttgtgaatccatggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttaaaactctatttttcttctactttc 207  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||  ||||||||||    
T  16618708 ctttgtaaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgtttgaaactctactttctttctactttc 16618609  T
Q  208 aaagctatatac---aaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattg---aaaactttttgtctattttgaaa 301  Q
    |||||||| |||   |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||   |||| |||||||| |||||| ||    
T  16618608 aaagctatgtacaaaaaaacattttctttctatcttgataatgacaatgcttgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaaaagtttttgtccattttg-aa 16618510  T
Q  302 agcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccagg 401  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  16618509 agcaaacctgagcaacagggtacattcaaacgaaacatgcatgagcgagcgtatgtcgatgtctatttcaatatgtgttacaaggaggctcttccccagg 16618410  T
Q  402 atagtctgtg 411  Q
    ||||||||||    
T  16618409 atagtctgtg 16618400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 281; E-Value: 1e-157
Query Start/End: Original strand, 24 - 411
Target Start/End: Original strand, 7079183 - 7079576
Alignment:
Q  24 tgcttgtgaattcagaatttccgggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccatgg 123  Q
    |||||| ||||||| | ||||  ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||    
T  7079183 tgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtcatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtgg 7079282  T
Q  124 agtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttaaaactctatttttcttctactttcaaagc----tatatac 219  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||  || ||||||||||||    |||||||    
T  7079283 agtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtctgaaactctgttttctttttactttcaaagctatatatatac 7079382  T
Q  220 aaaacattttctttctatt-ttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaatt-gaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaac 317  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7079383 aaaacattttctttctattcttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattaaaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaac 7079482  T
Q  318 agggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtg 411  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| | |||||||||||||||    
T  7079483 agggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatatgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtg 7079576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 278; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 24 - 411
Target Start/End: Original strand, 5472949 - 5473336
Alignment:
Q  24 tgcttgtgaattcagaatttccgggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccatgg 123  Q
    |||||| ||||||| | ||||  ||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  5472949 tgcttgcgaattcaaagtttctaggagatgtcatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtgg 5473048  T
Q  124 agtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgttt-aaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaa 222  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| | ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  5473049 agtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaagttgagcctttgcttttgtttgaaaactctatttt-cttctactttcaaagctatatacaaa 5473147  T
Q  223 acattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttt-gaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacaggg 321  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5473148 acattttccttccattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttttgaaaattgaaaactttt-gtctattttgaaaagcaaacctgagcaacaggg 5473246  T
Q  322 tacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtg 411  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| | |||||||||||||||    
T  5473247 tacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatatgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtg 5473336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 278; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 41 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 11104644 - 11104272
Alignment:
Q  41 tttccgggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccatggagtcacgccttcggctg 140  Q
    ||||| |||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  11104644 tttccaggaagtgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagccacgccttcggctg 11104545  T
Q  141 accaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttaaaactctatttttcttctactttcaaagcta--tatacaaaacattttctttctatt 238  Q
    || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||  || ||||||||||||||  |||||||   |||||| |||||||    
T  11104544 actaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgtttgaaactctattttctttttactttcaaagctaaatatacaatttattttccttctatt 11104445  T
Q  239 ttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaaca 338  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11104444 ttgataatgataatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaaca 11104345  T
Q  339 tgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtg 411  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| | |||||||||||||||    
T  11104344 tgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatatgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtg 11104272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 277; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 25 - 411
Target Start/End: Original strand, 51787984 - 51788371
Alignment:
Q  25 gcttgtgaattcagaatttccgggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccatgga 124  Q
    ||||| ||||||| | ||||| |||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  51787984 gcttgcgaattcaaagtttccaggaagtgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccgataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtgga 51788083  T
Q  125 gtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgttt-aaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaa 223  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| | ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  51788084 gtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaagttgagcctttgcttttgtttgaaaactctatttt-cttctactttcaaagctatatacaaaa 51788182  T
Q  224 cattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttt-gaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggt 322  Q
     |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51788183 tattttccttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttttgaaaattgaaaactttttgtttattttgaaaagcaaacctgagcaacagggt 51788282  T
Q  323 acattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtg 411  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| ||| | |||||||||||||||    
T  51788283 acattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttaatgtctatttcaatatatgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtg 51788371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 275; E-Value: 1e-154
Query Start/End: Original strand, 19 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 17979255 - 17978861
Alignment:
Q  19 ttctgtgcttgtgaattcagaatttccgggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatc 118  Q
    |||||| |||||| ||||| | || || ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17979255 ttctgtacttgtggattcaaagttcccaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatc 17979156  T
Q  119 catggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttaaaactctatttttcttctactttcaaagctatata 218  Q
    | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||| ||||  || ||||||||||||||||||    
T  17979155 cgtggagtcatgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagactgtgcttttgtttgaaactctgttttctttttactttcaaagctatata 17979056  T
Q  219 c-aaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttg-aaaagcaaacctgagcaa 316  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  17979055 caaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaaagcaaacctgagcaa 17978956  T
Q  317 cagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtg 411  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| | ||| |||| ||||||    
T  17978955 cagggtacattcaaaggaaatatgcatgagcgagggtatgttgatgtctatttcaatatatgttacaagcaggttctcctccaagataatctgtg 17978861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 273; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 8 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 29143072 - 29142665
Alignment:
Q  8 tcatcagaagtttctgtgcttgtgaattcagaatttccgggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 107  Q
    ||||| |||| |||||| |||||||||||| | ||||   ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29143072 tcatctgaagcttctgtacttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 29142973  T
Q  108 ctttgtgaatccatggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgttt-aaaactctatttttcttctacttt 206  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||    
T  29142972 ctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactccattttttttctacttt 29142873  T
Q  207 caaagctatatac-aaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctatttt--gaaaag 303  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||     
T  29142872 caaagctatatacaaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctatttttgaaaaaa 29142773  T
Q  304 caaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggat 403  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||| | |||||||    
T  29142772 caaacctgagcaacatggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtgtgtgttggtgtctatttcaatatatgttacaagcaggttctcctccaggat 29142673  T
Q  404 agtctgtg 411  Q
    ||||||||    
T  29142672 agtctgtg 29142665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 270; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 8 - 411
Target Start/End: Original strand, 4629730 - 4630133
Alignment:
Q  8 tcatcagaagtttctgtgcttgtgaattcagaatttccgggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 107  Q
    ||||| |||| |||||| |||||||||||| | ||||   ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4629730 tcatctgaagcttctgtacttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 4629829  T
Q  108 ctttgtgaatccatggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgttt-aaaactctatttttcttctacttt 206  Q
    |||||| ||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  4629830 ctttgttaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctatttt-cttctacttt 4629928  T
Q  207 caaagctatatacaaaac-attttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagca 305  Q
    ||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4629929 caaagttatatacaaaaatattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagca 4630028  T
Q  306 aacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatag 405  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||| |||||||||||| || ||||||||||||| ||| | |||||||||    
T  4630029 aacctgagcaacagggtacattcaaatg-aacatgcatgagcgagtgtgtgttggtgtctatttcaacatatgttacaagcaggttctcctccaggatag 4630127  T
Q  406 tctgtg 411  Q
    ||||||    
T  4630128 tctgtg 4630133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 270; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 8 - 411
Target Start/End: Original strand, 21680646 - 21681049
Alignment:
Q  8 tcatcagaagtttctgtgcttgtgaattcagaatttccgggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 107  Q
    ||||| |||| |||||| |||||||||||| | ||||   ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21680646 tcatctgaagcttctgtacttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 21680745  T
Q  108 ctttgtgaatccatggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgttt-aaaactctatttttcttctacttt 206  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  21680746 ctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactcta-ttttcttctacttt 21680844  T
Q  207 caaagctatatac-aaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagca 305  Q
    ||||| ||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21680845 caaagttatatacaaaaatattttctttccattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagca 21680944  T
Q  306 aacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatag 405  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||| |||||||||||| || ||||||||||||| ||| | |||||||||    
T  21680945 aacctgagcaacagggtacattcaaatg-aacatgcatgagcgagtgtgtgttggtgtctatttcaacatatgttacaagcaggttctcctccaggatag 21681043  T
Q  406 tctgtg 411  Q
    ||||||    
T  21681044 tctgtg 21681049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 268; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 25 - 411
Target Start/End: Original strand, 18231155 - 18231542
Alignment:
Q  25 gcttgtgaattcagaatttccgggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccatgga 124  Q
    ||||| ||||||| | ||| | ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||    
T  18231155 gcttgcgaattcaaagttttcaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagatttgcgaatccgtgga 18231254  T
Q  125 gtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttaaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaac 224  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  18231255 gtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttaaaactctgttttctttctactttcaaagctatatacaaaac 18231354  T
Q  225 attttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaaca-ttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggta 323  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  18231355 attttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttttgaaaattgaaaaccttttgtctattttgaaaagcaaacccgagcaacagggta 18231454  T
Q  324 cattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtg 411  Q
    || |||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||| || |||||||||| ||| | |||||||||||||||    
T  18231455 cagtcaaatgaaacatgcatgagcgagggtatgtgaatgtctatttcaatatatgctacaagcaggttctcctccaggatagtctgtg 18231542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 259; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 25 - 411
Target Start/End: Original strand, 18057222 - 18057612
Alignment:
Q  25 gcttgtgaattcagaatttccgggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaa-ttaccattttccaagctttgtgaatccatgg 123  Q
    ||||| ||||||| | ||||  ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||    
T  18057222 gcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtgg 18057321  T
Q  124 agtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttaaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaa 223  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||  |||  || ||||||||||| ||| |||||||    
T  18057322 agtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcccgtgcttttgtttgaaactctgctttctttttactttcaaagttatgtacaaaa 18057421  T
Q  224 -cattttctttctatttt-gataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaac-tttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagg 320  Q
     ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  18057422 acattttccttctatttttgataatgacaatgcttgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagtttttgtctatttttgaaagcaaacctgagcaacagg 18057521  T
Q  321 gtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtg 411  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18057522 gtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtgtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtg 18057612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 259; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 57 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 31030504 - 31030156
Alignment:
Q  57 tgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccatggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatac 156  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31030504 tgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatac 31030405  T
Q  157 atcaatttgagcttgtgcttttgtttaaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgctt 256  Q
     ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||     
T  31030404 gtcaatttgagcctgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgataatgctc 31030305  T
Q  257 gaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatg 356  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  ||||     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||    
T  31030304 gaaacaaacattttgaaaattgaaaaagtttt-----ttttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatg-aacatgcatgagcgagtgtgtg 31030211  T
Q  357 ttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtg 411  Q
    ||| |||||||||||| || ||||||||||||| ||| | |||||||||||||||    
T  31030210 ttggtgtctatttcaagatatgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtg 31030156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 256; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 26 - 408
Target Start/End: Original strand, 18336591 - 18336968
Alignment:
Q  26 cttgtgaattcagaatttccgggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaa-ttaccattttccaagctttgtgaatccatgga 124  Q
    |||| ||||||| | ||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  18336591 cttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtaatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtgga 18336690  T
Q  125 gtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttaaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaac 224  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18336691 gtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcgatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaac 18336790  T
Q  225 attttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtac 324  Q
    |||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||  ||||     |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18336791 attttctttctattatgataatgataatgctcgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagtttt-----ttttgaaaagcaaacctgagcaacagggtac 18336885  T
Q  325 attcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtct 408  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||| | ||||||||||||    
T  18336886 attcaaatg-aacatgcatgagcgagtgtgtgttggtgtctatttcaatatatgttacaagcaggttctcctccaggatagtct 18336968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 254; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 8 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 20571161 - 20570757
Alignment:
Q  8 tcatcagaagtttctgtgcttgtgaattcagaatttccgggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 107  Q
    |||||| ||| |||||| |||||||||||| | ||||   ||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20571161 tcatcaaaagcttctgtacttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttaccgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 20571062  T
Q  108 ctttgtgaatccatggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgttt-aaaactctatttttcttctacttt 206  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||   ||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||    
T  20571061 ctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaagttgagccgttgcttttgtttgaaaactctatttt-cttctatttt 20570963  T
Q  207 caaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttt-gaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagca 305  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  20570962 caaagctatatacaaaacattttccttccattttgataatgacaatgcttgaaataaacatttttgaaaattgaaaactttttgtttattttgaaaagca 20570863  T
Q  306 aacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatag 405  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||| ||| | |||||||||    
T  20570862 aacctgagcaacagggtacaatcaaatgaaacatgcatgagcaagtgtatgttggtgtctatttcaatatatgttacaaacaggttctcctccaggatag 20570763  T
Q  406 tctgtg 411  Q
    ||||||    
T  20570762 tctgtg 20570757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 243; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 31 - 411
Target Start/End: Original strand, 32445122 - 32445494
Alignment:
Q  31 gaattcagaatttccgggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccatggagtcacg 130  Q
    ||||||| | |||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  32445122 gaattcaaagtttctgggaaatgtcatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggagtcacg 32445221  T
Q  131 ccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttaaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttc 230  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||  || ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  32445222 ccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctgctttctttttactttcaaagttatatacaaaacattttc 32445321  T
Q  231 tttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaa 330  Q
    ||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||       |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32445322 tttctgttttgataatgataatgctcgaaacaaacattttgaaaattgaaaaagtt-------ttttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaa 32445414  T
Q  331 atgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtg 411  Q
    ||| |||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||| | |||||||||||||||    
T  32445415 atg-aacatgcatgagcgagtgtgtgttggtgtctatttcaatatatgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtg 32445494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 8 - 411
Target Start/End: Original strand, 19700431 - 19700847
Alignment:
Q  8 tcatcagaagtttctgtgcttgtgaattcagaatttccgggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 107  Q
    |||||||||| | || || ||| ||||||| | ||||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19700431 tcatcagaagctcctatgtttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtatcaccaaccaataaaattaccattttccaag 19700530  T
Q  108 ctttgtgaatccatggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttaaaactctatttttcttctactttc 207  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||| ||||||||||||  || |||||||    
T  19700531 ctttgtaaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaagttaagcctgtgcttttgtttgaaactctattttctttttactttc 19700630  T
Q  208 aaagctatatac-----------aaaacattttctttctattttgataatgac-aatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaa--ctttttgtcta 293  Q
    |||||||| |||           |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||   ||||||||||    
T  19700631 aaagctatgtacaaaaaaaaaaaaaaacattttctttctattttgataatgacaaatgcttgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagttttttgtcta 19700730  T
Q  294 ttttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctct 393  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||  |||    
T  19700731 ttttg-aaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaacgaaacatgcatgagcgagtgtatgttggtgtctatttcaatatgtgttacgagcagattct 19700829  T
Q  394 tccccaggatagtctgtg 411  Q
    ||||||||||||||||||    
T  19700830 tccccaggatagtctgtg 19700847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 240; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 47 - 411
Target Start/End: Original strand, 4727617 - 4727976
Alignment:
Q  47 ggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccatggagtcacgccttcggctgaccacc 146  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  4727617 ggaaatgtgatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggagtcacgccttcggctgaccacc 4727716  T
Q  147 actcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttaaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttcta-ttttgataa 245  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  4727717 actcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctgctttctttttactttcaaagctatatacaaaacattttctttctatttttaataa 4727816  T
Q  246 tgac-aatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatg 344  Q
    |||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||  |||      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  4727817 tgacaaatgctcgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagttt------ttttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatg-aacatgcatg 4727909  T
Q  345 agcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtg 411  Q
    |||||| || ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  4727910 agcgagtgtgtgttggtgtctatttcaatatatgttacaagcaggctcttccccaggatggtctgtg 4727976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 47 - 411
Target Start/End: Original strand, 6207884 - 6208245
Alignment:
Q  47 ggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaa-ttaccattttccaagctttgtgaatccatggagtcacgccttcggctgaccac 145  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  6207884 ggaaatgtaatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggagtcacgccttcggctgaccac 6207983  T
Q  146 cactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgttt-aaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttcta-ttttgat 243  Q
    ||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||    
T  6207984 cactcttatacgtcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttccttctatttttaat 6208083  T
Q  244 aatgac-aatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgca 342  Q
    |||||| || ||| ||||||||||| ||||||||||||||  |||      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  6208084 aatgacaaaggctcgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagttt------ttttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatg-aacatgca 6208176  T
Q  343 tgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtg 411  Q
    |||||||| || ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  6208177 tgagcgagtgtgtgttggtgtctatttcaatatatgttacaagcaggctcttccccaggatggtctgtg 6208245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 25 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 15735393 - 15735011
Alignment:
Q  25 gcttgtgaattcagaatttccgggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccatgga 124  Q
    ||||| ||||||| | ||||  ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  15735393 gcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtgga 15735294  T
Q  125 gtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttaaaactctatttttcttctactttcaaagctatatac-aaaa 223  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||   |||||| ||||||||||| ||| ||| ||||    
T  15735293 gtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgtttgaaactct-gctttcttttactttcaaagttatgtacaaaaa 15735195  T
Q  224 cattttctttcta-ttttgataatgac-aatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacaggg 321  Q
    ||||| | ||||| |||| |||||||| |||||| ||||||| ||| ||||||||||||||  ||||     ||||||||||||||||||||||||||||    
T  15735194 catttcccttctatttttaataatgacaaatgctcgaaacaagcatcttgaaaattgaaaaagtttt-----ttttgaaaagcaaacctgagcaacaggg 15735100  T
Q  322 tacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtg 411  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||| | |||||||||||||||    
T  15735099 tacattcaaatg-aacatgcatgagcgagtgtgtgttggtgtctatttcaatatatgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtg 15735011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 47 - 411
Target Start/End: Original strand, 35886748 - 35887109
Alignment:
Q  47 ggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaa-ttaccattttccaagctttgtgaatccatggagtcacgccttcggctgaccac 145  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  35886748 ggaaatgtaatgattactgtgttcaatgtatcaccaaccaataaaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggagtcacgccttcggctgaccac 35886847  T
Q  146 cactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttaaaactctatttttcttctactttcaaagctatatac-aaaacattttctttcta-ttttgat 243  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||  |||  || ||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| |||| ||    
T  35886848 cactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgtttgaaactctgctttctttttactttcaaagctatgtacaaaaacattttccttctatttttaat 35886947  T
Q  244 aatgac-aatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgca 342  Q
    |||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||  |||      |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| | ||||| ||    
T  35886948 aatgacaaatgctcgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagttt------ttttgaaaagcaaacctgtgtaacagggtacattcaaacg-aacataca 35887040  T
Q  343 tgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtg 411  Q
    |||||||| || ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||| | |||||||||||||||    
T  35887041 tgagcgagtgtgtgttggtgtctatttcaatatatgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtg 35887109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 25 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 8283767 - 8283369
Alignment:
Q  25 gcttgtgaattcagaatttccgggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccatgga 124  Q
    ||||| ||||||| | ||||  ||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  8283767 gcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtaatgattgatgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtgga 8283668  T
Q  125 gtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttaaaactctatttttcttctactttcaaagctatatac-aaaa 223  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||   |||  || ||||||||||| ||| ||| ||||    
T  8283667 gtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcatgtgtttttgtttgaaactccgctttctttttactttcaaagttatgtacaaaaa 8283568  T
Q  224 cattttctttcta-ttttgataatgac-aatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaa---------ctttttgtctattttgaaaagcaaacctga 312  Q
    ||||||| ||||| |||| |||||||| |||||| ||||||| ||| ||||||||||||||          ||||| | | ||||| |||||||||||||    
T  8283567 cattttccttctatttttaataatgacaaatgctcgaaacaagcatcttgaaaattgaaaaagttttttttttttttttttttttggaaagcaaacctga 8283468  T
Q  313 gcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtg 411  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||| | |||||||||||||||    
T  8283467 gcaacagggtacattcaaacaaaacatgcatgagcgagcgtgtgttggtgtctatttcaatatatgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtg 8283369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 181; E-Value: 1e-97
Query Start/End: Original strand, 25 - 411
Target Start/End: Original strand, 4689613 - 4689994
Alignment:
Q  25 gcttgtgaattcagaatttccgggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaa-ttaccattttccaagctttgtgaatccatgg 123  Q
    ||||| ||||||| | ||||  ||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||||| |||    
T  4689613 gcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtaatgattgctgcgttcaatgtaccaccaaccaataaaaattaccattttccaagcttcgtaaatccgtgg 4689712  T
Q  124 agtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttaaaactctatttttcttctactttcaaagctatatac-aaa 222  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||   |||||| ||||||| ||| ||| ||| |||    
T  4689713 agtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgtttgaaactct-gctttcttttactttctaagttatgtacaaaa 4689811  T
Q  223 acattttctttcta-ttttgataatgac-aatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagg 320  Q
    |||||||| ||||| |||| |||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||  ||       |||||||||||||||||||||||||||    
T  4689812 acattttccttctatttttaataatgacaaatgctcgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagtt-------ttttgaaaagcaaacctgagcaacagg 4689904  T
Q  321 gtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtg 411  Q
    ||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||| ||||||||||||  ||| | |||||||||||||||    
T  4689905 gtacattcaaacg-aacatgcatgagcgagtgtatgttggtgcctatttcaatatatgttacaagcagattctcctccaggatagtctgtg 4689994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 175; E-Value: 4e-94
Query Start/End: Original strand, 24 - 411
Target Start/End: Original strand, 5658095 - 5658480
Alignment:
Q  24 tgcttgtgaattcagaatttccgggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccatgg 123  Q
    |||||| ||||||| | ||||  ||||||||  ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||    
T  5658095 tgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtcatgattgctgtgttcaacgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtgg 5658194  T
Q  124 agtcacgccttcggctgaccaccactcttatac--atcaatttgagcttgtgcttttgtttaaaactctatttttcttctactttcaaagctatatac-a 220  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||| | ||| ||| |    
T  5658195 agtcaggccttcggctgaccaccactcttatacatatcattttgagcctgtgcttttgtttgaaactctattttccttttactttcaacgttatgtacaa 5658294  T
Q  221 aaacattttctttcta-ttttgataatgac-aatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaaca 318  Q
    |||||||||| ||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||||  |||      ||||||||||||||||| |||||||    
T  5658295 aaacattttccttctatttttaataatgacaaatgcttgaaacaaacatcttaaaaattgaaaaagttt------ttttgaaaagcaaacctaagcaaca 5658388  T
Q  319 gggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtg 411  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||    ||||||||||||| ||| | | |||||||||||||    
T  5658389 gggtacattcaaacg-aacatgcatgagcgagtgtatgttggtgtctatttcaacgcatgttacaagcaggttctcctcaaggatagtctgtg 5658480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 163 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 15886895 - 15886652
Alignment:
Q  163 ttgagcttgtgcttttgtttaaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaac-attttctttctattttga-taatgacaa-tgcttgaa 259  Q
    |||||| |||| |||||||| ||||||| ||||  || ||||||||||| ||| |||||||  | |||| ||||||||| | ||||||||| |||| |||    
T  15886895 ttgagcctgtgtttttgtttgaaactctgttttctttttactttcaaagttatgtacaaaaatactttccttctatttttaataatgacaaatgctcgaa 15886796  T
Q  260 acaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttg 359  Q
     ||||||| ||||||||||||||  ||||       |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||    
T  15886795 gcaaacatcttgaaaattgaaaaagtttt-------ttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaacgaa-catgcatgagcgagtgtatgttg 15886704  T
Q  360 atgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtg 411  Q
     ||||||||||||||| ||||||||||||| ||| | || ||||||||||||    
T  15886703 gtgtctatttcaatatatgttacaagcaggttctcctcccggatagtctgtg 15886652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 24 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 15887006 - 15886894
Alignment:
Q  24 tgcttgtgaattcagaatttccgggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaat-aaaattaccattttccaagctttgt-gaatccat 121  Q
    |||||| ||||||| | ||||  ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||| |    
T  15887006 tgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaaattaccattttccaagctttgtaaaatccgt 15886907  T
Q  122 ggagtcacgcctt 134  Q
    |||||||||||||    
T  15886906 ggagtcacgcctt 15886894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 25 - 110
Target Start/End: Original strand, 8002522 - 8002607
Alignment:
Q  25 gcttgtgaattcagaatttccgggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctt 110  Q
    ||||| ||||||| | ||||| |||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8002522 gcttgcgaattcaaagtttccaggaagtgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctt 8002607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0547 (Bit Score: 324; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold0547
Description:

Target: scaffold0547; HSP #1
Raw Score: 324; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 24 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 9897 - 9510
Alignment:
Q  24 tgcttgtgaattcagaatttccgggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccatgg 123  Q
    |||||| ||||||| | ||||  ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||    
T  9897 tgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtaatgattactgtgttcaatgtatcaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtgg 9798  T
Q  124 agtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttaaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaa 223  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9797 agtcacgctttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaa 9698  T
Q  224 cattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggta 323  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9697 cattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggta 9598  T
Q  324 cattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtg 411  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||| | |||||||||||||||    
T  9597 cattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatatgttataagcaggttctcctccaggatagtctgtg 9510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 324; Significance: 0; HSPs: 27)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 324; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 8 - 411
Target Start/End: Original strand, 39856630 - 39857032
Alignment:
Q  8 tcatcagaagtttctgtgcttgtgaattcagaatttccgggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 107  Q
    ||||| |||| |||||| |||||||||||| | ||||   ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39856630 tcatctgaagcttctgtacttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 39856729  T
Q  108 ctttgtgaatccatggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttaaaactctatttttcttctactttc 207  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  39856730 ctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttaaaactct-tttttcttctactttc 39856828  T
Q  208 aaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaa 307  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39856829 aaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaa 39856928  T
Q  308 cctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtc 407  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||    
T  39856929 cctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggttctcctccaggatagtc 39857028  T
Q  408 tgtg 411  Q
    ||||    
T  39857029 tgtg 39857032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 322; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 26 - 411
Target Start/End: Original strand, 14104554 - 14104939
Alignment:
Q  26 cttgtgaattcagaatttccgggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccatggag 125  Q
    |||| ||||||| | ||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  14104554 cttgcgaattcaaagtttccaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 14104653  T
Q  126 tcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttaaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaaca 225  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  14104654 tcatgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttaaaactctgttttctttctactttcaaagctatatacaaaaca 14104753  T
Q  226 ttttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtaca 325  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14104754 ttttctttctattttggtaatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtaca 14104853  T
Q  326 ttcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtg 411  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||    
T  14104854 ttcaaatgaaacatgcatgagtgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtg 14104939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 310; E-Value: 1e-174
Query Start/End: Original strand, 26 - 411
Target Start/End: Original strand, 30759775 - 30760159
Alignment:
Q  26 cttgtgaattcagaatttccgggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccatggag 125  Q
    |||| ||||||| | ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  30759775 cttgcgaattcaaagtttccaggaaatgtaatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 30759874  T
Q  126 tcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttaaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaaca 225  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||    
T  30759875 tcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaaattgagcctgtgcttttgtttaaaactctatttt-cttctattttcaaagctatatacaaatca 30759973  T
Q  226 ttttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtaca 325  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  30759974 ttttccttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaaccttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtact 30760073  T
Q  326 ttcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtg 411  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| | |||||||||||||||    
T  30760074 ttcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatatgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtg 30760159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 310; E-Value: 1e-174
Query Start/End: Original strand, 26 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 33668055 - 33667671
Alignment:
Q  26 cttgtgaattcagaatttccgggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccatggag 125  Q
    |||| ||||||| | ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  33668055 cttgcgaattcaaagtttccaggaaatgtaatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 33667956  T
Q  126 tcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttaaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaaca 225  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||    
T  33667955 tcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaaattgagcctgtgcttttgtttaaaactctatttt-cttctattttcaaagctatatacaaatca 33667857  T
Q  226 ttttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtaca 325  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  33667856 ttttccttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaaccttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtact 33667757  T
Q  326 ttcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtg 411  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| | |||||||||||||||    
T  33667756 ttcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatatgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtg 33667671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 309; E-Value: 1e-174
Query Start/End: Original strand, 25 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 20332678 - 20332290
Alignment:
Q  25 gcttgtgaattcagaatttccgggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccatgga 124  Q
    ||||| ||||||| | ||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  20332678 gcttgcgaattcaaagtttccaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtgga 20332579  T
Q  125 gtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgttt-aaaactctattttt-cttctactttcaaagctatatacaaa 222  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  20332578 gtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctattttttcttctactttcaaagctatatacaaa 20332479  T
Q  223 acattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggt 322  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20332478 atattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggt 20332379  T
Q  323 acattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtg 411  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||    
T  20332378 acattcaaatgaaacatgcatgagtgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtg 20332290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 309; E-Value: 1e-174
Query Start/End: Original strand, 25 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 40099892 - 40099504
Alignment:
Q  25 gcttgtgaattcagaatttccgggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccatgga 124  Q
    ||||| ||||||| | ||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  40099892 gcttgcgaattcaaagtttccaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtgga 40099793  T
Q  125 gtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgttt-aaaactctattttt-cttctactttcaaagctatatacaaa 222  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  40099792 gtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttacttttgtttgaaaactctattttttcttctactttcaaagctatatacaaa 40099693  T
Q  223 acattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggt 322  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40099692 acattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggt 40099593  T
Q  323 acattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtg 411  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||    
T  40099592 acattcaaatgaaacatgcatgagtgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtg 40099504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 302; E-Value: 1e-170
Query Start/End: Original strand, 25 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 27157569 - 27157180
Alignment:
Q  25 gcttgtgaattcagaatttccgggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccatgga 124  Q
    ||||| ||||||| | ||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  27157569 gcttgcgaattcaaagtttccaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtgga 27157470  T
Q  125 gtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgttt-aaaactctattttt-cttctactttcaaagctatatacaaa 222  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  27157469 gtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctattttttcttctactttcaaagctatatacaaa 27157370  T
Q  223 ac-attttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacaggg 321  Q
    |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27157369 aatattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacaggg 27157270  T
Q  322 tacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtg 411  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||    
T  27157269 tacattcaaatgaaacatgcatgagtgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtg 27157180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 297; E-Value: 1e-167
Query Start/End: Original strand, 24 - 411
Target Start/End: Original strand, 54839400 - 54839787
Alignment:
Q  24 tgcttgtgaattcagaatttccgggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccatgg 123  Q
    |||||| ||||||| | ||||  ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||    
T  54839400 tgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtcatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtgg 54839499  T
Q  124 agtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttaaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaa 223  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||     
T  54839500 agtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgcttgaaactctatttt-cttctactttcaaagctatatacaaat 54839598  T
Q  224 cattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttt-gaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggt 322  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  54839599 cattttccttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacttgagcaacagggt 54839698  T
Q  323 acattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtg 411  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| | |||||||||||||||    
T  54839699 acattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatatgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtg 54839787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 295; E-Value: 1e-165
Query Start/End: Original strand, 24 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 14753749 - 14753362
Alignment:
Q  24 tgcttgtgaattcagaatttccgggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccatgg 123  Q
    |||||| ||||||| | |||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||    
T  14753749 tgcttgcgaattcaaagtttctgggaaatgtcatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtgg 14753650  T
Q  124 agtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttaaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaa 223  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14753649 agtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgattaaaactcta-ttttcttctactttcaaagctatatacaaaa 14753551  T
Q  224 cattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaaca--ttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacaggg 321  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  14753550 cattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaatctgagcaacaggg 14753451  T
Q  322 tacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtg 411  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||    
T  14753450 tacattcaaatg-aacatgcatgagcgagtgtgtgttggtgtctatttcaatatgtgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtg 14753362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 294; E-Value: 1e-165
Query Start/End: Original strand, 24 - 411
Target Start/End: Original strand, 5700549 - 5700937
Alignment:
Q  24 tgcttgtgaattcagaatttccgggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaa-ttaccattttccaagctttgtgaatccatg 122  Q
    |||||| ||||||| | |||  |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  5700549 tgcttgcgaattcaaagtttttgggaaatgtcatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtg 5700648  T
Q  123 gagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttaaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaa 222  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  5700649 gagtcacgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaattctatttt-cttctactttcaaagctatatacaaa 5700747  T
Q  223 acattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttt-gaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacaggg 321  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  5700748 acattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacgaacatttttgaaaattaaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacttgagcaacaggg 5700847  T
Q  322 tacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtg 411  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| | |||||||||||||||    
T  5700848 tacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatatgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtg 5700937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 293; E-Value: 1e-164
Query Start/End: Original strand, 24 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 34183218 - 34182832
Alignment:
Q  24 tgcttgtgaattcagaatttccgggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccatgg 123  Q
    |||||| ||||||| | |||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||    
T  34183218 tgcttgcgaattcaaagtttctgggaaatgtcatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtgg 34183119  T
Q  124 agtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttaaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaa 223  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34183118 agtcacgccttcggctgaccaccgctcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaa 34183019  T
Q  224 cattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaaca-ttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggt 322  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34183018 cattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttttgaaaattgaaaac-ttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggt 34182920  T
Q  323 acattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtg 411  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||| | |||||||| ||||||    
T  34182919 acattcaaatg-aacatgcatgagcgagtgtgtgttggtgtctatttcaatatatgttacaagcaggttctcctccaggataatctgtg 34182832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 289; E-Value: 1e-162
Query Start/End: Original strand, 25 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 24586617 - 24586229
Alignment:
Q  25 gcttgtgaattcagaatttccgggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaa-ttaccattttccaagctttgtgaatccatgg 123  Q
    ||||| ||||||| | ||||  ||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  24586617 gcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtaatgattgatgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtgg 24586518  T
Q  124 agtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgttt-aaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaa 222  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24586517 agtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactccatttttcttctactttcaaagctatatacaaa 24586418  T
Q  223 acattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggt 322  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  24586417 acattttctttctattttgataaggacaatgctcgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaatagggt 24586318  T
Q  323 acattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtg 411  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| | |||||||||||||||    
T  24586317 acattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatatgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtg 24586229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 286; E-Value: 1e-160
Query Start/End: Original strand, 8 - 411
Target Start/End: Original strand, 5011870 - 5012275
Alignment:
Q  8 tcatcagaagtttctgtgcttgtgaattcagaatttccgggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaa-ttaccattttccaa 106  Q
    ||||| |||| |||||| |||||||||||| | |||  |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  5011870 tcatctgaagcttctgtacttgtgaattcaaagtttttgggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaaattaccattttccaa 5011969  T
Q  107 gctttgtgaatccatggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttaaaactctatttttcttctacttt 206  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  5011970 gctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaaattgagcctgtgcttttgtttaaaactctacttttcttctacttt 5012069  T
Q  207 caaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaaca-ttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagca 305  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  5012070 caaagctatatacaaatcattttctttctacttggataatggcaatgcttgaaacaaacatttttgaaaattaaaaactttttgtctattttgaaaagca 5012169  T
Q  306 aacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatag 405  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| | |||||||||    
T  5012170 aacctgagcaacagggcacattcaaacgaaacatgcataagcgagagtatgtcgatgtctatttcaatatatgttacaagcaggttctcctccaggatag 5012269  T
Q  406 tctgtg 411  Q
    ||||||    
T  5012270 tctgtg 5012275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 274; E-Value: 1e-153
Query Start/End: Original strand, 8 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 18794889 - 18794485
Alignment:
Q  8 tcatcagaagtttctgtgcttgtgaattcagaatttccgggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 107  Q
    |||||| ||| |||||| |||||||||||| | ||||    || ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18794889 tcatcaaaagcttctgtacttgtgaattcaaagtttctaaaaactgtagtggttaccgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 18794790  T
Q  108 ctttgtgaatccatggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgttt-aaaactctatttttcttctacttt 206  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| | ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  18794789 ctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaaattgagcctttgcttttgtttgaaaactctatttt-cttctacttt 18794691  T
Q  207 caaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatt-ttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagca 305  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  18794690 caaagctatatacaaaacattttccttccattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattcttgaaaattgaaaactttttgtttattttgaaaagca 18794591  T
Q  306 aacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatag 405  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| ||| | |||||||||    
T  18794590 aacctgagcaacagggtacaatcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttaatgtctatttcaatatatgttacaagcaggttctcctccaggatag 18794491  T
Q  406 tctgtg 411  Q
    ||||||    
T  18794490 tctgtg 18794485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 269; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 24 - 407
Target Start/End: Original strand, 24118672 - 24119055
Alignment:
Q  24 tgcttgtgaattcagaatttccgggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccatgg 123  Q
    |||||| ||||||| | |||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||    
T  24118672 tgcttgcgaattcaaagtttctgggaaatgtcatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtgg 24118771  T
Q  124 agtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttaaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaa 223  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||  || |||||||||||||||||||||||    
T  24118772 agtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtctgaaactctgttttctttttactttcaaagctatatacaaaa 24118871  T
Q  224 cattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaaca-ttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggt 322  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  24118872 cattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttttgaaaattaaaaactttttgtctattttgaaaagcaaaccggagcaacagggt 24118971  T
Q  323 acattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtc 407  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| || || || |||||||||||| || ||||||||||||| ||| | |||||||||||    
T  24118972 acattcaaatg-aacatgcatgagcgagtgtgtgctggtgtctatttcaacatatgttacaagcaggttctcctccaggatagtc 24119055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 267; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 8 - 411
Target Start/End: Original strand, 1906245 - 1906654
Alignment:
Q  8 tcatcagaagtttctgtgcttgtgaattcagaatttccgggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 107  Q
    |||||||||| |  |||||||| ||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1906245 tcatcagaagctcatgtgcttgcgaattcaaagtttccaggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 1906344  T
Q  108 ctttgtgaatccatggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttaaaactctatttttcttctactttc 207  Q
    ||||||  |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||| | |  ||||||||||    
T  1906345 ctttgtatatctgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagtctgtgcttttgtttgaaactctactatctttctactttc 1906444  T
Q  208 aaagctatataca----aaacattttctttctattttgataatgac-aatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaa--ctttttgtctattttgaa 300  Q
    ||||| || ||||    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||   ||||||||||||||| |    
T  1906445 aaagccatgtacaaaagaaacattttctttctattttgataatgacaaatgcttgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagttttttgtctattttg-a 1906543  T
Q  301 aagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccag 400  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  1906544 aagcaaacctgagcaacagggtacattcaaacgaaacatgcatgagcgagtgtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggttcttccccag 1906643  T
Q  401 gatagtctgtg 411  Q
    |||||||||||    
T  1906644 gatagtctgtg 1906654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 267; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 19 - 408
Target Start/End: Original strand, 21975708 - 21976098
Alignment:
Q  19 ttctgtgcttgtgaattcagaatttccgggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatc 118  Q
    |||||| |||||| ||||| | || || ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21975708 ttctgtacttgtggattcaaagttcccaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatc 21975807  T
Q  119 catggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttaaaactctatttttcttctactttcaaagctatata 218  Q
    | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||| ||||||| ||||  || ||||||||||||||||||    
T  21975808 cgtggagtcatgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagactgcgcttttgtttgaaactctgttttctttttactttcaaagctatata 21975907  T
Q  219 caaaa-cattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaac 317  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  21975908 caaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaaccttttgtctattttgaaaagcaaacccgagcaac 21976007  T
Q  318 agggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtct 408  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||| || |||||||||| ||| | ||||||||||||    
T  21976008 agggtacaatcaaatgaaacatgcatgagcgagggtatgtgaatgtctatttcaatatatgctacaagcaggttctcctccaggatagtct 21976098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 265; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 24 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 36338774 - 36338394
Alignment:
Q  24 tgcttgtgaattcagaatttccgggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccatgg 123  Q
    |||||| ||||||| | ||||  ||| ||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  36338774 tgcttgcgaattcaaagtttctaggagatgtcatgattactgtgttcaatgtaccgccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtgg 36338675  T
Q  124 agtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttaaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaa 223  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36338674 agtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaa 36338575  T
Q  224 cattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggta 323  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||      ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36338574 cattttctttctattttgataatgataatgctcgaaacaaacattttgaaaattgaaaaagttt------ttttgaaaagcaaacctgagcaacagggta 36338481  T
Q  324 cattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtg 411  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||| |||||||||| || ||| | |||||||||||||||    
T  36338480 cattcaaatg-aacatgcatgagcgagtgtgtgttggtgtctatttcaatatatgttacaagcgggttctcctccaggatagtctgtg 36338394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 259; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 47 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 31120744 - 31120378
Alignment:
Q  47 ggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccatggagtcacgccttcggctgaccacc 146  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  31120744 ggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccatttttcaagctttgtgaatccgtggagtcatgccttcggctgaccacc 31120645  T
Q  147 actcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttaaaactctatttttcttctactttcaaagctatatac-aaaacattttctttctattttgataa 245  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||| ||||  || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  31120644 actcttatacatcaatttgagactgtgcttttgtttgaaactctgttttctttttactttcaaagctatatacaaaaacattttctttctattttgataa 31120545  T
Q  246 tgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtcta-ttttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatg 344  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  31120544 tgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaaccttttgtctatttttgaaaagcaaacccgagcaacagggtacaatcaaatgaaacatgcatg 31120445  T
Q  345 agcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtg 411  Q
    |||||| ||||||  |||||||||||||||| || |||||||||| ||| | |||||||||||||||    
T  31120444 agcgagggtatgtgaatgtctatttcaatatatgctacaagcaggttctcctccaggatagtctgtg 31120378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 250; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 47 - 411
Target Start/End: Original strand, 6575894 - 6576251
Alignment:
Q  47 ggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccatggagtcacgccttcggctgaccacc 146  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  6575894 ggaaatgtgatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggagtcacgccttcggctgaccacc 6575993  T
Q  147 actcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttaaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataat 246  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6575994 actcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctgctttctttttactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataat 6576093  T
Q  247 gacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgag 346  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||       ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  6576094 gataatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaaagttt------ctttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatg-aacatgcatgag 6576186  T
Q  347 cgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtg 411  Q
    |||| || ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||| | |||||||||||||||    
T  6576187 cgagtgtgtgttggtgtctatttcaatatatgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtg 6576251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 248; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 8 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 15276904 - 15276497
Alignment:
Q  8 tcatcagaagtttctgtgcttgtgaattcagaatttccgggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 107  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||| | ||||  |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  15276904 tcatcagaagcttctgtgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtagtggttaccgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattgccattttccaag 15276805  T
Q  108 ctttgtgaatccatggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttaaaactctatttttcttctactttc 207  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||   |||||||||    
T  15276804 ctttgtaaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaattcgagcctgtgcttttgtttgaaactctattttctctctactttc 15276705  T
Q  208 aaagctatatac--aaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattg---aaaactttttgtctattttgaaaa 302  Q
    |||||||| |||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||   |||| ||||||||| ||||| |||    
T  15276704 aaagctatgtacaaaaaacattttctttctatcttgataatgacaatgcttgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaaaagtttttgtctgttttg-aaa 15276606  T
Q  303 gcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccagga 402  Q
    | |||| ||||||||| ||||| |||||| ||||| |||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  15276605 gtaaacttgagcaacaaggtacgttcaaacgaaacgtgcatgagtgagcgtatgtcgatgtctatttcaatatgtgttacaaacaggctcttccccagga 15276506  T
Q  403 tagtctgtg 411  Q
    |||||||||    
T  15276505 tagtctgtg 15276497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 247; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 8 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 15380510 - 15380106
Alignment:
Q  8 tcatcagaagtttctgtgcttgtgaattcagaatttccgggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 107  Q
    ||||| |||| || |||||||| ||||||| | ||||  |||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  15380510 tcatccgaagcttttgtgcttgcgaattcaaagtttcaaggaaatgtagtggttatcgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattgccattttccaag 15380411  T
Q  108 ctttgtgaatccatggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttaaaactctatttttcttctactttc 207  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||| |||  ||||||||||    
T  15380410 ctttgtaaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaattcgagcctgtgcttttgtttgaaactctactttctttctactttc 15380311  T
Q  208 aaagctatatac--aaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagca 305  Q
    |||||||| |||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |  |||| ||||||||| ||||| ||||||    
T  15380310 aaagctatgtacaaaaaacattttctttctatcttgataatgacaatgcttgaaacaaacatcttgaaattaaaaaagtttttgtctgttttg-aaagca 15380212  T
Q  306 aacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatag 405  Q
    | ||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15380211 agcctgagcaacaaggtacattcaaacgaaacgtgcatgagcgagcgtatgtcgatgtctttttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatag 15380112  T
Q  406 tctgtg 411  Q
    ||||||    
T  15380111 tctgtg 15380106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 239; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 8 - 411
Target Start/End: Original strand, 15233809 - 15234217
Alignment:
Q  8 tcatcagaagtttctgtgcttgtgaattcagaatttccgggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 107  Q
    |||||| ||| || |||||||| ||||||| | |||   |||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15233809 tcatcataagcttttgtgcttgcgaattcaaagtttataggaaatgtagtggttactatgtccaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 15233908  T
Q  108 ctttgtgaatccatggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttaaaactctatttttcttctactttc 207  Q
    |||||| ||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||| |||  ||||||||||    
T  15233909 ctttgtaaatccgtagagtcacgccttcggctaaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaactctactttctttctactttc 15234008  T
Q  208 aaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaa------ctttttgtctattttgaaa 301  Q
    |||||||| ||||||| | ||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||       ||||||||||||||| ||    
T  15234009 aaagctatgtacaaaaaaatttctttttatcttgataatgacaatgcttgaagcaaacatcttgaaacttgaaaaagttttttttttgtctattttg-aa 15234107  T
Q  302 agcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccagg 401  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  15234108 agcaaacctgggcaacagggtacattcaaacgaaacatgcatgagcgagtgtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggttcttccccagg 15234207  T
Q  402 atagtctgtg 411  Q
    ||||||||||    
T  15234208 atagtctgtg 15234217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 47 - 411
Target Start/End: Original strand, 1673892 - 1674258
Alignment:
Q  47 ggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccatggagtcacgccttcggctgaccacc 146  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||| ||||||||||||||||    
T  1673892 ggaaatgtagtggttactgtgttcaatataccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggtgtcactccttcggctgaccacc 1673991  T
Q  147 actcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttaaaactctatttttcttctactttcaaagctatatac--aaaacattttctttctattttgata 244  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| | |  ||||||||||||||| || |||  |||| ||||||||||||||||||||    
T  1673992 actcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgtttgaaactctactatctttctactttcaaagccatgtacaaaaaatattttctttctattttgata 1674091  T
Q  245 atgac-aatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaa--ctttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgc 341  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||   ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  1674092 atgacaaatgcttgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagttttttgtctattttg-aaagcaaacttgagcaacagggtacattcaaacgaaacatgc 1674190  T
Q  342 atgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtg 411  Q
    ||||||||| || |||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  1674191 atgagcgagtgtgtgttgatgtctatttca--atgtgttacaagcaggttcttccctaggatagtctgtg 1674258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 220; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 105 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 36324484 - 36324185
Alignment:
Q  105 aagctttgtgaatccatggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttaaaactctatttttcttctact 204  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  36324484 aagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctact 36324385  T
Q  205 ttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagc 304  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||      |||||||||||    
T  36324384 ttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgataatgctcgaaacaaacattttgaaaattgaaaaagttt------ttttgaaaagc 36324291  T
Q  305 aaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggata 404  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||| |||||||||| || ||| | ||||||||    
T  36324290 aaacctgagcaacagggtacattcaaatg-aacatgcatgagcgagtgtgtgttggtgtctatttcaatatatgttacaagcgggttctcctccaggata 36324192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 25 - 411
Target Start/End: Original strand, 14671026 - 14671410
Alignment:
Q  25 gcttgtgaattcagaatttccgggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaa-ttaccattttccaagctttgtgaatccatgg 123  Q
    ||||||||||||| | ||||  ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||    
T  14671026 gcttgtgaattcaaagtttctaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtgg 14671125  T
Q  124 agtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttaaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaa-a 222  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||  |||  || ||||||||||| ||| ||||| |    
T  14671126 agttacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcccgtgcttttgtttgaaactctgctttctttttactttcaaagttatgtacaaga 14671225  T
Q  223 acattttctttcta-ttttgataatgac-aatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagg 320  Q
    |||||||| ||||| |||| |||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||  |||      |||||||||||||||||||||||||||    
T  14671226 acattttccttctatttttaataatgacaaatgctcgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagttt------ttttgaaaagcaaacctgagcaacagg 14671319  T
Q  321 gtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtg 411  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||| | | |||||||||||||    
T  14671320 gtacattcaaacgaaacatgcatgagcgagtgtgtgttggtgtctatttcaatatatgttacaagcaggttctcctctaggatagtctgtg 14671410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 25 - 411
Target Start/End: Original strand, 17019062 - 17019445
Alignment:
Q  25 gcttgtgaattcagaatttccgggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaa-ttaccattttccaagctttgtgaatccatgg 123  Q
    ||||| ||||||| | ||||  ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||    
T  17019062 gcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtaatgattactgtgttcaatgtatcaccaaccaataaaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtgg 17019161  T
Q  124 agtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttaaaactctatttttcttctactttc-aaagctatatac-aa 221  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||  |||  || ||||||| |||||||| ||| ||    
T  17019162 agtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctatgcttttgtttgaaactctgctttctttttactttcaaaagctatgtacaaa 17019261  T
Q  222 aacattttctttctattttgataatgac-aatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagg 320  Q
    ||||||||| ||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||| |||| |||||||||  |||      |||||||||||||||||||||||||||    
T  17019262 aacattttccttctattttaataatgacaaatgctcgaaacaaacatcttgagaattgaaaaagttt------ttttgaaaagcaaacctgagcaacagg 17019355  T
Q  321 gtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtg 411  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||| | |||||||||||||||    
T  17019356 gtacattcaaatg-aacatgcatgagcgagtgtgtgttggtgtctatttcaatatatgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtg 17019445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 323; Significance: 0; HSPs: 24)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 323; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 25 - 411
Target Start/End: Original strand, 33248365 - 33248751
Alignment:
Q  25 gcttgtgaattcagaatttccgggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccatgga 124  Q
    ||||| ||||||| | ||||  ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  33248365 gcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtgga 33248464  T
Q  125 gtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttaaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaac 224  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33248465 gtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttaaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaac 33248564  T
Q  225 attttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtac 324  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33248565 attttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtac 33248664  T
Q  325 attcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtg 411  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||| ||| | |||||||||||||||    
T  33248665 attcaaatgaaacatgcatgagcgagcgtgtgttggtgtctatttcaatatatgttataagcaggttctcctccaggatagtctgtg 33248751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 318; E-Value: 1e-179
Query Start/End: Original strand, 24 - 411
Target Start/End: Original strand, 18796704 - 18797093
Alignment:
Q  24 tgcttgtgaattcagaatttccgggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaa-ttaccattttccaagctttgtgaatccatg 122  Q
    |||||| ||||||| | ||| | ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||| ||    
T  18796704 tgcttgcgaattcaaagttttcaggaaatgtaatgattaccgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaaattaccattttccaagctttataaatccgtg 18796803  T
Q  123 gagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttaaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaa 222  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18796804 gagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaa 18796903  T
Q  223 a-cattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacaggg 321  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18796904 aacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacaggg 18797003  T
Q  322 tacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtg 411  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||    
T  18797004 tacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtg 18797093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 309; E-Value: 1e-174
Query Start/End: Original strand, 8 - 411
Target Start/End: Original strand, 19680430 - 19680833
Alignment:
Q  8 tcatcagaagtttctgtgcttgtgaattcagaatttcc-gggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaa 106  Q
    ||||| |||| |||||| |||||||||||| | |||   |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19680430 tcatctgaagcttctgtacttgtgaattcaaagttttttgggaaatgtaatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaa 19680529  T
Q  107 gctttgtgaatccatggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttaaaactctatttttcttctacttt 206  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||    
T  19680530 gctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaaattgagcctgtgcttttgtttaaaactctatttt-cttctatttt 19680628  T
Q  207 caaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaa 306  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  19680629 caaagctatatacaaatcattttccttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaaccttttgtctattttgaaaagcaa 19680728  T
Q  307 acctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagt 406  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| | ||||||||||    
T  19680729 acctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcacgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatatgttacaagcaggttctcctccaggatagt 19680828  T
Q  407 ctgtg 411  Q
    |||||    
T  19680829 ctgtg 19680833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 306; E-Value: 1e-172
Query Start/End: Original strand, 46 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 28356148 - 28355780
Alignment:
Q  46 gggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccatggagtcacgccttcggctgaccac 145  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||    
T  28356148 gggaaatgtaatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccac 28356049  T
Q  146 cactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgttt-aaaactctattttt--cttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttga 242  Q
    ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28356048 cactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaattctatttttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttga 28355949  T
Q  243 taatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgca 342  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28355948 taatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgca 28355849  T
Q  343 tgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtg 411  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||    
T  28355848 tgagtgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtg 28355780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 298; E-Value: 1e-167
Query Start/End: Original strand, 46 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 31484068 - 31483700
Alignment:
Q  46 gggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccatggagtcacgccttcggctgaccac 145  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  31484068 gggaaatgtaatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccac 31483969  T
Q  146 cactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgttt-aaaactctatttt--tcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttga 242  Q
    ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31483968 cactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaattctattttgttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttga 31483869  T
Q  243 taatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgca 342  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  31483868 taatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaaccttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacaaggtaccttcaaatgaaacatgca 31483769  T
Q  343 tgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtg 411  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||| | |||||||||||||||    
T  31483768 tgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatatgttacgagcaggttctcctccaggatagtctgtg 31483700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 297; E-Value: 1e-167
Query Start/End: Original strand, 24 - 411
Target Start/End: Original strand, 9360620 - 9361007
Alignment:
Q  24 tgcttgtgaattcagaatttccgggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccatgg 123  Q
    |||||| ||||||| | ||||  ||| ||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  9360620 tgcttgcgaattcaaagtttctaggagatgtcatgattactgtgtccaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtgg 9360719  T
Q  124 agtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgttt-aaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaa 222  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| | ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  9360720 agtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaagttgagcctttgcttttgtttgaaaactctatttt-cttctactttcaaagctatatacaaa 9360818  T
Q  223 acattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggt 322  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9360819 acattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggt 9360918  T
Q  323 acattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtg 411  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| | |||||||||||||||    
T  9360919 acattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatatgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtg 9361007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 293; E-Value: 1e-164
Query Start/End: Original strand, 20 - 411
Target Start/End: Original strand, 29835317 - 29835708
Alignment:
Q  20 tctgtgcttgtgaattcagaatttccgggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatcc 119  Q
    ||||| |||||||||||| | ||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  29835317 tctgtacttgtgaattcaaagttttcgggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatcc 29835416  T
Q  120 atggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgttt-aaaactctatttttcttctactttcaaagctatata 218  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  29835417 gtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaaattgagcctgtgcttttgtttgaaaactccatttt-cttctactttcaaagctatata 29835515  T
Q  219 caaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaaca 318  Q
    |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29835516 caaatcattttccttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaaccttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaaca 29835615  T
Q  319 gggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtg 411  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||| | ||| |||| ||||||    
T  29835616 gggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttggtgtctatttcaatatgtgttacgagcaggttctcctccaagataatctgtg 29835708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 293; E-Value: 1e-164
Query Start/End: Original strand, 25 - 411
Target Start/End: Original strand, 31360527 - 31360914
Alignment:
Q  25 gcttgtgaattcagaatttccgggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccatgga 124  Q
    ||||| ||||||| | ||||| |||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  31360527 gcttgcgaattcaaagtttccaggaagtgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtgga 31360626  T
Q  125 gtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgttt-aaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaa 223  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||    
T  31360627 gtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctatttt-cttctactttcaaagttatatacaaaa 31360725  T
Q  224 c-attttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggt 322  Q
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31360726 atattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggt 31360825  T
Q  323 acattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtg 411  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||    
T  31360826 acattcaaatgaaacatgcatgagtgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtg 31360914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 288; E-Value: 1e-161
Query Start/End: Original strand, 57 - 411
Target Start/End: Original strand, 15773605 - 15773960
Alignment:
Q  57 tgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccatggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatac 156  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15773605 tgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatac 15773704  T
Q  157 atcaatttgagcttgtgcttttgtttaaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgctt 256  Q
     ||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||  || |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  15773705 gtcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctgctttctttttactttcagagctatatacaaaacattttctttctcttttgataatgacaatgctt 15773804  T
Q  257 gaaacaaaca-ttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtat 355  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15773805 gaaacaaacatttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtat 15773904  T
Q  356 gttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtg 411  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| | |||||||||||||||    
T  15773905 gttgatgtctatttcaatatatgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtg 15773960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 288; E-Value: 1e-161
Query Start/End: Original strand, 47 - 411
Target Start/End: Original strand, 44567002 - 44567369
Alignment:
Q  47 ggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccatggagtcacgccttcggctgaccacc 146  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  44567002 ggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggagtcacgccttcggctgaccacc 44567101  T
Q  147 actcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttaaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataat 246  Q
    ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  44567102 actctcatacatcaatttgagcctgtgcttttgtttaaaactcta-ttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttccttctattttgataat 44567200  T
Q  247 gacaatgcttgaaacaaaca----ttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgca 342  Q
    ||||||||||||||||||||    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44567201 gacaatgcttgaaacaaacattttttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgca 44567300  T
Q  343 tgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtg 411  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| | ||| |||| ||||||    
T  44567301 taagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatatgttacaagcaggttctcctccaagataatctgtg 44567369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 283; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 24 - 411
Target Start/End: Original strand, 18715478 - 18715868
Alignment:
Q  24 tgcttgtgaattcagaatttccgggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccatgg 123  Q
    |||||| ||||||| | ||||  ||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||    
T  18715478 tgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtcatgatcactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtgg 18715577  T
Q  124 agtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttaaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaa 223  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18715578 agtcacgccttcggctgaccacccctcttatacatcaaattgagcctgtgcttttgtttaaaactcta-ttttcttctactttcaaagctatatacaaaa 18715676  T
Q  224 cattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttt----gaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacag 319  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18715677 cattttccttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttttttgaaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacag 18715776  T
Q  320 ggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtg 411  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| || ||| | |||||||||||||||    
T  18715777 ggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgactatttcaatatatgttacaagcgggttctcctccaggatagtctgtg 18715868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 282; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 8 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 12086958 - 12086553
Alignment:
Q  8 tcatcagaagtttctgtgcttgtgaattcagaatttccgggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaa-ttaccattttccaa 106  Q
    |||||| ||| |||||| |||||||||||| | ||||   ||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  12086958 tcatcaaaagcttctgtacttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttaccgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaaattaccattttccaa 12086859  T
Q  107 gctttgtgaatccatggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttaaaactctatttttcttctacttt 206  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  12086858 gctttgtgaatccgtggagtcatgccttcggctgaccaccactcttatacatcaaattgagcttgtgctgttgtttgaaactctatttttcttctacttt 12086759  T
Q  207 caaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaaca-ttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagca 305  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  12086758 caaagctgtatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttttgaaaattgaaaactttttgtctgttttgaaaagca 12086659  T
Q  306 aacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatag 405  Q
    | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| ||| | ||| ||||     
T  12086658 agcctgagcaacagggtacgttcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttaatgtctatttcaatatatgttacaagcaggttctcctccaagataa 12086559  T
Q  406 tctgtg 411  Q
    ||||||    
T  12086558 tctgtg 12086553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 279; E-Value: 1e-156
Query Start/End: Original strand, 47 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 21342366 - 21342000
Alignment:
Q  47 ggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaa-ttaccattttccaagctttgtgaatccatggagtcacgccttcggctgaccac 145  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  21342366 ggaaatgtaatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggagtcacgccttcggctgaccac 21342267  T
Q  146 cactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttaaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataa 245  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||| |||||||  |||  || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  21342266 cactcttatacatcgatttgagcctgtgcttctgtttgaaactctgctttctttttactttcaaagctatatacaaaacattttccttctattttgataa 21342167  T
Q  246 tgacaatgcttgaaacaaaca-ttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatg 344  Q
    |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21342166 tgacaatgcttgaaacaagcatttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatg 21342067  T
Q  345 agcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtg 411  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||| ||||||||||    
T  21342066 agcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggttctcctccagaatagtctgtg 21342000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 267; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 8 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 19202598 - 19202205
Alignment:
Q  8 tcatcagaagtttctgtgcttgtgaattcagaat-ttccgggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaa 106  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||||| | | ||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19202598 tcatctgaagtttctgtacttgtgaattcaaagtcttttgggaaatgtaatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaa 19202499  T
Q  107 gctttgtgaatccatggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttaaaactctatttttcttctacttt 206  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||               
T  19202498 gctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaaattgagcctgtgcttttgtttaaaactctatttt----------- 19202410  T
Q  207 caaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaa 306  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  19202409 caaagctatatacaaatcattttccttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaaccttttgtctattttgaaaagcaa 19202310  T
Q  307 acctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagt 406  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||| | ||| |||| |    
T  19202309 acctgagcaacagggtacattcaaacgaaacatgcataagcgagagtatgtcgatgtctgtttcaatatatgttacaagcaggttctcctccaagataat 19202210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 265; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 51 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 19911355 - 19910992
Alignment:
Q  51 atgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccatggagtcacgccttcggctgaccaccactc 150  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19911355 atgtaatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattacctttttccaagctttgtaaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactc 19911256  T
Q  151 ttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttaaaactctatttttcttctactttcaaagctatatac--aaaacattttctttctattttgataatga 248  Q
    ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||   || ||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  19911255 ttatacatcaaattgagcctgtgcttttgtttaaaactctatttcctttttactttcaaagctatgtacaaaaaacattttctttctattttgataatga 19911156  T
Q  249 caatgcttgaaacaaacattttgaaaattg-aaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagc 347  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19911155 caatgcttgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagtttttgtctatttttgaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagc 19911056  T
Q  348 gagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtg 411  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||| |||||||||||    
T  19911055 gagtgtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggttctcctccaagatagtctgtg 19910992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 263; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 57 - 374
Target Start/End: Original strand, 33264762 - 33265079
Alignment:
Q  57 tgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccatggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatac 156  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  33264762 tgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggagtcacgcctttggctgaccaccactcttatac 33264861  T
Q  157 atcaatttgagcttgtgcttttgtttaaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgctt 256  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33264862 atcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaattcta-ttttcttctactttcaaagctatatacgaaacattttctttctattttgataatgacaatgctt 33264960  T
Q  257 gaaacaaaca-ttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtat 355  Q
    ||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33264961 gaaacgaacatttttgaaaattaaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtat 33265060  T
Q  356 gttgatgtctatttcaata 374  Q
    ||  |||||||||||||||    
T  33265061 gtcaatgtctatttcaata 33265079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 8 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 22075164 - 22074759
Alignment:
Q  8 tcatcagaagtttctgtgcttgtgaattcagaatttccgggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 107  Q
    |||||||||| || |||| ||| ||||||| | ||||  |||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  22075164 tcatcagaagcttttgtgtttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtagtggttgccgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattgccattttccaag 22075065  T
Q  108 ctttgtgaatccatggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttaaaactctatttttcttctactttc 207  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |  |||||||||| |||||||| |||  ||||||||||    
T  22075064 ctttgtaaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaattcgagcctaggcttttgtttgaaactctactttctttctactttc 22074965  T
Q  208 aaagctatatac---aaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagc 304  Q
    |||||||| |||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||  |||| ||||||||| ||||| |||||    
T  22074964 aaagctatgtacaaaaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacttcttgaaaataaaaaagtttttgtctgttttg-aaagc 22074866  T
Q  305 aaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggata 404  Q
    || | ||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  22074865 aagcatgagcaacaaggtacattcaaacgaaacgtgcatgagcgagcgtatgtcgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccctaggata 22074766  T
Q  405 gtctgtg 411  Q
    |||||||    
T  22074765 gtctgtg 22074759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 208; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 24 - 408
Target Start/End: Complemental strand, 19655562 - 19655180
Alignment:
Q  24 tgcttgtgaattcagaatttccgggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaa--ttaccattttccaagctttgtgaatccat 121  Q
    |||||| ||||||| | ||||  ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||| |    
T  19655562 tgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaaaattaccattttccaagctttgtaaatccgt 19655463  T
Q  122 ggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttaaaactctatttttcttctactttcaaagctatatac-a 220  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||  || ||||||||||| ||| ||| |    
T  19655462 ggagtctcgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgtttgaaactctactttctttttactttcaaagttatgtacaa 19655363  T
Q  221 aaacattttctttcta-ttttgataatgac-aatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaaca 318  Q
    |||||||||| ||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||      ||||| |||||||||||||||||||    
T  19655362 aaacattttccttctatttttaataatgacaaatgcttgaaacaaacatcttgaaaattgaaaagtttt------ttttg-aaagcaaacctgagcaaca 19655270  T
Q  319 gggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtct 408  Q
    |||||||||||||  |||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  19655269 gggtacattcaaacaaaacgtgcatgagcgagtgtatgttggtgtctatttcaatatatgttacaagcagactcttccccaggatagtct 19655180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 8 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 27603141 - 27602744
Alignment:
Q  8 tcatcagaagtttctgtgcttgtgaattcagaatttccgggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 107  Q
    ||||| |||| |||||| |||||||||||| | ||||   ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27603141 tcatctgaagcttctgtacttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 27603042  T
Q  108 ctttgtgaatccatggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttaaaactctatttttcttctactttc 207  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||  |||  || |||||||    
T  27603041 ctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttagacatcaatttgagcctgtgcttttgtttgaaactctgctttctttttactttc 27602942  T
Q  208 aaagctatatac-aaaacattttctttcta-ttttgataatgac-aatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagc 304  Q
    |||||||| ||| ||||||||||| ||||| |||| |||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||        |||||||||||    
T  27602941 aaagctatgtacaaaaacattttccttctatttttaataatgacaaatgctcgaaacaaacatcttgaaaattgaaaagtt--------ttttgaaaagc 27602850  T
Q  305 aaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggata 404  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||    
T  27602849 aaacctgtgcaacagggtacattcaaacg-aacatgcatgagcgagtgtgtgttggtgtctatttcaatatgtgttacaagcaggttctcctccaggata 27602751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 24 - 411
Target Start/End: Original strand, 22138904 - 22139286
Alignment:
Q  24 tgcttgtgaattcagaatttccgggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaa-ttaccattttccaagctttgtgaatccatg 122  Q
    |||||| ||||||| | ||||  ||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||    
T  22138904 tgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtaatgattgttgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtg 22139003  T
Q  123 gagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttaaaactctatttttcttctactttcaaagctatatac-aa 221  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  || ||||||||||| ||| ||| ||    
T  22139004 gagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctattttctttttactttcaaagttatgtacaaa 22139103  T
Q  222 aacattttctttcta-ttttgataatgac-aatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacag 319  Q
    ||||||||| ||||| |||| |||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||  |        ||||| ||||||||| ||||||||||    
T  22139104 aacattttccttctatttttaataatgacaaatgcttgaaacaaacgtcttgaaaattgaaaaagt--------ttttg-aaagcaaacttgagcaacag 22139194  T
Q  320 ggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtg 411  Q
    |||||||| ||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||| | |||||||||||||||    
T  22139195 ggtacattgaaatgaaacgtgcatgagcgagtgtatgttggtgtctatttcaatatatgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtg 22139286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 25 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 2131479 - 2131098
Alignment:
Q  25 gcttgtgaattcagaatttccgggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccatgga 124  Q
    ||||| ||||||| | ||||  ||||||||| |||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  2131479 gcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtaatgattgatgtgttcaatgtatcaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtgga 2131380  T
Q  125 gtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttaaaactctatttttcttctactttcaaagctatatac-aaaa 223  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||  || ||||||||||| ||| ||| ||||    
T  2131379 gtcgcgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgtttgaaactctactttctttttactttcaaagttatgtacaaaaa 2131280  T
Q  224 cattttctttcta-ttttgataatgac-aatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacaggg 321  Q
    ||||||| ||||| |||| |||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||  ||        |||||||||||||||||||||||||||    
T  2131279 cattttccttctatttttaataatgacaaatgctcgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagtt-------ctttgaaaagcaaacctgagcaacaggg 2131187  T
Q  322 tacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtg 411  Q
    |||||||||| | |||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||| | |||||||||||||||    
T  2131186 tacattcaaacg-aacatgcatgagcgagtgtgtgttggtgtctatttcaatatatgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtg 2131098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 25 - 411
Target Start/End: Original strand, 19694094 - 19694477
Alignment:
Q  25 gcttgtgaattcagaatttccgggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaa-ttaccattttccaagctttgtgaatccatgg 123  Q
    ||||| ||||||| | ||||  ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||    
T  19694094 gcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtgg 19694193  T
Q  124 agtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttaaaactctatttttcttctactttcaaagctatatac-aaa 222  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||   |||  || ||||||||||| ||| ||| |||    
T  19694194 agtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgtttaaaactccgctttctttttactttcaaagttatgtacaaaa 19694293  T
Q  223 acattttctttcta-ttttgataatgac-aatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagg 320  Q
    |||||||| ||||| |||| |||||||| |||||| ||||||| ||| ||||||||||||||  |||      |||||||||||||||||||||||||||    
T  19694294 acattttccttctatttttaataatgacaaatgctcgaaacaagcatcttgaaaattgaaaaagttt------ttttgaaaagcaaacctgagcaacagg 19694387  T
Q  321 gtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtg 411  Q
    ||||||||||| | |||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||| ||||||||||| | ||| | |||||||||||||||    
T  19694388 gtacattcaaacg-aacatgcatgagcgagtgtgtgttggtgtctatttcaatatatgttacaagcaagttctcctccaggatagtctgtg 19694477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 8 - 283
Target Start/End: Original strand, 16260205 - 16260480
Alignment:
Q  8 tcatcagaagtttctgtgcttgtgaattcagaatttccgggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 107  Q
    |||||| ||| |||||| |||||| ||||| | ||||   |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16260205 tcatcaaaagcttctgtacttgtggattcaaagtttctaagaaatgtagtgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 16260304  T
Q  108 ctttgtgaatccatggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgttt-aaaactctatttttcttctacttt 206  Q
    |||||| |||||  ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  16260305 ctttgtaaatccgcggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactcta-ttttcttctacttt 16260403  T
Q  207 caaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaac 283  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  16260404 caaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgataatgcttgaaacaaacattttgaaaatcgaaaac 16260480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 167; E-Value: 3e-89
Query Start/End: Original strand, 50 - 411
Target Start/End: Original strand, 14569180 - 14569540
Alignment:
Q  50 aatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccatggagtcacgccttcggctgaccaccact 149  Q
    |||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  14569180 aatgtaatgattgttgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccact 14569279  T
Q  150 cttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttaaaactctatttttcttctactttcaaagctat-----atacaaaacattttctttcta-ttttgat 243  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||  |||  || ||||||||||| |||     | | ||||||||||| ||||| |||| ||    
T  14569280 cttatacatcaatttgagcctgtgcttttgtttgaaactctgctttctttttactttcaaagttatgttcaaaaaaaaacattttccttctatttttaat 14569379  T
Q  244 aatgac-aatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgca 342  Q
    |||||| |||||| ||||||| ||| ||||||||||||||  ||       ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  14569380 aatgacaaatgctcgaaacaagcatcttgaaaattgaaaaagtt-------ttttgaaagacaaacctgagcaacagggtacattcaaacg-aacatgca 14569471  T
Q  343 tgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtg 411  Q
    |||||||| || ||||| ||||||||||||||  ||||||||||||| ||| | |||||||| ||||||    
T  14569472 tgagcgagtgtgtgttggtgtctatttcaatacatgttacaagcaggttctcctccaggatattctgtg 14569540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 322; Significance: 0; HSPs: 32)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 322; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 46 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 24586654 - 24586289
Alignment:
Q  46 gggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccatggagtcacgccttcggctgaccac 145  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  24586654 gggaaatgtaatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccac 24586555  T
Q  146 cactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttaaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataa 245  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  24586554 cactcttatacatcaaattgagcctgtgctttcgtttaagactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttcttcctattttgataa 24586455  T
Q  246 tgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatga 345  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24586454 tgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatga 24586355  T
Q  346 gcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtg 411  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||    
T  24586354 gtgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtg 24586289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 318; E-Value: 1e-179
Query Start/End: Original strand, 47 - 411
Target Start/End: Original strand, 5164402 - 5164767
Alignment:
Q  47 ggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccatggagtcacgccttcggctgaccacc 146  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  5164402 ggaaatgtaatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgctttcggctgaccacc 5164501  T
Q  147 actcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttaaaactctatttttcttctactttcaaagc-tatatacaaaacattttctttctattttgataa 245  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5164502 actcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagcctatatacaaaacattttctttctattttgataa 5164601  T
Q  246 tgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatga 345  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  5164602 taacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaaccttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacatccaaatgaaacatgcatga 5164701  T
Q  346 gcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtg 411  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||    
T  5164702 gcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtg 5164767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 311; E-Value: 1e-175
Query Start/End: Original strand, 25 - 411
Target Start/End: Original strand, 26518789 - 26519174
Alignment:
Q  25 gcttgtgaattcagaatttccgggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccatgga 124  Q
    ||||| ||||||| | ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  26518789 gcttgcgaattcaaagtttccaggaaatgtaatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtgga 26518888  T
Q  125 gtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttaaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaac 224  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| |    
T  26518889 gtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaaattgagcctgtgcttttgtttaaaactctatttt-cttctattttcaaagctatatacaaatc 26518987  T
Q  225 attttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtac 324  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26518988 attttccttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaaccttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtac 26519087  T
Q  325 attcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtg 411  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| | |||||||||||||||    
T  26519088 attcaaatgaaacatgcacgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatatgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtg 26519174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 308; E-Value: 1e-173
Query Start/End: Original strand, 24 - 411
Target Start/End: Original strand, 5154079 - 5154466
Alignment:
Q  24 tgcttgtgaattcagaatttccgggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccatgg 123  Q
    |||||| ||||||| | ||||  ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||    
T  5154079 tgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtcatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtgg 5154178  T
Q  124 agtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttaaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaa 223  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||  || |||||||||||||||||||||||    
T  5154179 agtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctgctttctttttactttcaaagctatatacaaaa 5154278  T
Q  224 cattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggta 323  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5154279 cattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaaccttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggta 5154378  T
Q  324 cattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtg 411  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||    
T  5154379 catccaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtg 5154466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 302; E-Value: 1e-170
Query Start/End: Original strand, 46 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 4139367 - 4138999
Alignment:
Q  46 gggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccatggagtcacgccttcggctgaccac 145  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  4139367 gggaaatgtaatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccac 4139268  T
Q  146 cactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgttt-aaaactctatttt--tcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttga 242  Q
    ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4139267 cactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaattctattttgttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttga 4139168  T
Q  243 taatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgca 342  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4139167 taatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgca 4139068  T
Q  343 tgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtg 411  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| | ||| |||| ||||||    
T  4139067 tgagtgagagtatgttgatgtctatttcaatatatgttacaagcaggttctcctccaagataatctgtg 4138999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 298; E-Value: 1e-167
Query Start/End: Original strand, 8 - 411
Target Start/End: Original strand, 4205368 - 4205772
Alignment:
Q  8 tcatcagaagtttctgtgcttgtgaattcagaatttcc-gggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaa 106  Q
    ||||| |||| |||||| |||||||||||| | |||   |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4205368 tcatctgaagcttctgtacttgtgaattcaaagttttttgggaaatgtaatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaa 4205467  T
Q  107 gctttgtgaatccatggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttaaaactctatttttcttctacttt 206  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||    
T  4205468 gctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaaattgagcctgtgcttttgtttaaaactcta-ttttcttctatttt 4205566  T
Q  207 caaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttg-aaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagca 305  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  4205567 caaagctatatacaaatcattttccttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaaattgaaaaccttttgtctattttgaaaagca 4205666  T
Q  306 aacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatag 405  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||| ||||     
T  4205667 aacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttggtgtctatttcaatatgtgttacaagcaggttctcctccaagataa 4205766  T
Q  406 tctgtg 411  Q
    ||||||    
T  4205767 tctgtg 4205772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 293; E-Value: 1e-164
Query Start/End: Original strand, 8 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 26314006 - 26313603
Alignment:
Q  8 tcatcagaagtttctgtgcttgtgaattcagaatttcc-gggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaa 106  Q
    ||||| ||||||||||| ||| |||||||| | |||   |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26314006 tcatctgaagtttctgtacttatgaattcaaagttttttgggaaatgtaatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaa 26313907  T
Q  107 gctttgtgaatccatggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttaaaactctatttttcttctacttt 206  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||    
T  26313906 gctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaaattgagcctgtgcttttgtttaaaactctatttt-cttctatttt 26313808  T
Q  207 caaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaa 306  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  26313807 caaagctatatacaaatcattttccttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaaccttttgtctattttgaaaagcaa 26313708  T
Q  307 acctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagt 406  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| | ||| |||| |    
T  26313707 acctgagcaacagggtacattcaaacgaaacatgcataagcgagagtatgtcgatgtctatttcaatatatgttacaagcaggttctcctccaagataat 26313608  T
Q  407 ctgtg 411  Q
    |||||    
T  26313607 ctgtg 26313603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 293; E-Value: 1e-164
Query Start/End: Original strand, 25 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 26679246 - 26678858
Alignment:
Q  25 gcttgtgaattcagaatttccgggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccatgga 124  Q
    ||||| ||||||| | ||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  26679246 gcttgcgaattcaaagtttccaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtgga 26679147  T
Q  125 gtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgttt-aaaactctattttt-cttctactttcaaagctatatacaaa 222  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  26679146 gtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttacttttgtttgaaaactctattttttcttctactttcaaagctatatacaaa 26679047  T
Q  223 acattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggt 322  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  26679046 acattttctttatattttgataacgacaatgctcgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacggggt 26678947  T
Q  323 acattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtg 411  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||    
T  26678946 acattcaaatgaaacatgcatgagtgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtg 26678858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 293; E-Value: 1e-164
Query Start/End: Original strand, 48 - 411
Target Start/End: Original strand, 45393238 - 45393602
Alignment:
Q  48 gaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccatggagtcacgccttcggctgaccacca 147  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||    
T  45393238 gaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgcctttggctgaccacca 45393337  T
Q  148 ctcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttaaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatg 247  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  45393338 ctcttacacatcaatttgagcttgtgcttttgtttaaaactctacttttcttctactttcaaagctatacacaaatcattttccttctattttgataatg 45393437  T
Q  248 acaatgcttgaaacaaaca-ttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgag 346  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45393438 acaatgcctgaaacaaacatttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgag 45393537  T
Q  347 cgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtg 411  Q
    |||||||||| ||||||| |||||| ||| ||||||||||||| ||| |  ||||||||||||||    
T  45393538 cgagagtatggtgatgtccatttcagtatatgttacaagcaggttctccttcaggatagtctgtg 45393602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 292; E-Value: 1e-164
Query Start/End: Original strand, 14 - 411
Target Start/End: Original strand, 26441238 - 26441637
Alignment:
Q  14 gaagtttctgtgcttgtgaattcagaatttccgggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgt 113  Q
    |||| |||||| |||||||||||| | ||||   ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26441238 gaagcttctgtacttgtgaattcaaagtttctatgaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgt 26441337  T
Q  114 gaatccatggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttaaaa-ctctattttt-cttctactttcaaag 211  Q
    |||||| |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||| |||||| ||| |||||||||||    
T  26441338 gaatccgtggagtcatgcctttggctgaccgccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttaaaaactccattttttcttttactttcaaag 26441437  T
Q  212 ctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctg 311  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26441438 ctatatacaaaacattttccttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctg 26441537  T
Q  312 agcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtg 411  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| | |||||||||||||||    
T  26441538 agcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtgtgttgatgtctatttcaatatatgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtg 26441637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 291; E-Value: 1e-163
Query Start/End: Original strand, 8 - 411
Target Start/End: Original strand, 11446867 - 11447271
Alignment:
Q  8 tcatcagaagtttctgtgcttgtgaattcagaatttccgggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 107  Q
    |||||| ||| |||||| |||||||||||| | ||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11446867 tcatcaaaagcttctgtacttgtgaattcaaagtttctaagaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 11446966  T
Q  108 ctttgtgaatccatggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttaaaactctatttttcttctactttc 207  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||||    
T  11446967 ctttgtgaatccgtggagtcacgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaattcta-ttttcttctactttc 11447065  T
Q  208 aaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttt--gaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagca 305  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11447066 aaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttttgaaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagca 11447165  T
Q  306 aacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatag 405  Q
    |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||| || |||||||||| ||| |  ||||||||    
T  11447166 aacctgagcaacagggtacaatcaagtgaaacatgcatgagcgagggtatgtgaatgtctatttcaatatatgctacaagcaggttctccttcaggatag 11447265  T
Q  406 tctgtg 411  Q
    ||||||    
T  11447266 tctgtg 11447271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 291; E-Value: 1e-163
Query Start/End: Original strand, 24 - 411
Target Start/End: Original strand, 45737296 - 45737686
Alignment:
Q  24 tgcttgtgaattcagaatttccgggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccatgg 123  Q
    |||||| ||||||| | ||||  ||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||    
T  45737296 tgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtcatgatcactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtgg 45737395  T
Q  124 agtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttaaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaa 223  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  45737396 agtcacgccttcggctgaccacccctcttatacatcaaattgagcctgtgcttttgtttaaaactctatttt-cttctactttcaaagctatatacaaaa 45737494  T
Q  224 cattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttt----gaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacag 319  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45737495 cattttccttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacag 45737594  T
Q  320 ggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtg 411  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||| | |||||||||||||||    
T  45737595 ggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatatctatttcaatatatgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtg 45737686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 290; E-Value: 1e-162
Query Start/End: Original strand, 8 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 31084781 - 31084376
Alignment:
Q  8 tcatcagaagtttctgtgcttgtgaattcagaatttccgggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaa-ttaccattttccaa 106  Q
    ||||| |||| |||||| |||||||||||| | |||  |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  31084781 tcatctgaagcttctgtacttgtgaattcaaagtttttgggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaaattaccattttccaa 31084682  T
Q  107 gctttgtgaatccatggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttaaaactctatttttcttctacttt 206  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  31084681 gctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggttgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaattctatttttcttctacttt 31084582  T
Q  207 caaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaaca-ttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagca 305  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  31084581 caaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatggcaatgcttgaaacaaacatttttgaaaattgaaatttttttgtctattttgaaaagca 31084482  T
Q  306 aacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatag 405  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| | ||| ||||     
T  31084481 aacctgagcaacagggtacattcaaacgaaacatgcataagcgagagtatgtcgatgtctatttcaatatatgttacaagcaggttctcctccaagataa 31084382  T
Q  406 tctgtg 411  Q
    ||||||    
T  31084381 tctgtg 31084376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 289; E-Value: 1e-162
Query Start/End: Original strand, 25 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 26664054 - 26663666
Alignment:
Q  25 gcttgtgaattcagaatttccgggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccatgga 124  Q
    ||||| ||||||| | ||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  26664054 gcttgcgaattcaaagtttccaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtgga 26663955  T
Q  125 gtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgttt-aaaactctattttt-cttctactttcaaagctatatacaaa 222  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  26663954 gtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttacttttgtttgaaaactctattttttcttctactttcaaagctatatacaaa 26663855  T
Q  223 acattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggt 322  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  26663854 acattttctttatattttgataacgacaatgctcgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacggggt 26663755  T
Q  323 acattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtg 411  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  | |||||||||||||||    
T  26663754 acattcaaatgaaacatgcatgagtgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggttcccctccaggatagtctgtg 26663666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 288; E-Value: 1e-161
Query Start/End: Original strand, 8 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 16745679 - 16745274
Alignment:
Q  8 tcatcagaagtttctgtgcttgtgaattcagaatttccgggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 107  Q
    ||||| |||| ||||||||||| ||||||| | |||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16745679 tcatctgaagcttctgtgcttgcgaattcaaagtttttgggaaatgtaatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 16745580  T
Q  108 ctttgtgaatccatggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgttt-aaaactctatttttcttctacttt 206  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| | ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  16745579 ctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaagttgagcctttgcttttgtttgaaaactcta-ttttcttctacttt 16745481  T
Q  207 caaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaaca--ttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagc 304  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16745480 caaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagc 16745381  T
Q  305 aaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggata 404  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| |  |||||||    
T  16745380 aaacctgagcaacagggtatattcaaacgaaacatgcatgaatgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaagttctccttcaggata 16745281  T
Q  405 gtctgtg 411  Q
    |||||||    
T  16745280 gtctgtg 16745274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 288; E-Value: 1e-161
Query Start/End: Original strand, 8 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 26269247 - 26268839
Alignment:
Q  8 tcatcagaagtttctgtgcttgtgaattcagaatttccgggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 107  Q
    |||||| ||| |||||| |||||||||||| | ||||   ||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26269247 tcatcaaaagcttctgtacttgtgaattcaaagtttctaagaactgtcatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 26269148  T
Q  108 ctttgtgaatccatggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttaaaactctatttttcttctactttc 207  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||  || |||||||    
T  26269147 ctttgtaaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgtttgaaactctgttttctttttactttc 26269048  T
Q  208 aaagctatatac-aaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaaca----ttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaa 302  Q
    |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26269047 aaagctatgtacaaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaa 26268948  T
Q  303 gcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccagga 402  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| | ||||||    
T  26268947 gcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatatgttacaagcaggttctcctccagga 26268848  T
Q  403 tagtctgtg 411  Q
    |||||||||    
T  26268847 tagtctgtg 26268839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 287; E-Value: 1e-161
Query Start/End: Original strand, 8 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 5141493 - 5141088
Alignment:
Q  8 tcatcagaagtttctgtgcttgtgaattcagaatttccgggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 107  Q
    ||||| |||| |||||| |||||||||||| | ||||   ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5141493 tcatctgaagcttctgtacttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 5141394  T
Q  108 ctttgtgaatccatggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgttt-aaaactctatttttcttctacttt 206  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  5141393 ctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactcta-ttttcttctacttt 5141295  T
Q  207 caaagctatatac-aaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttg-aaaagc 304  Q
    ||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  5141294 caaagttatatacaaaaatattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaaagc 5141195  T
Q  305 aaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggata 404  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| | ||||||||    
T  5141194 aaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagggtatgttgatgtctatttcaatatatgttacaagcaggttctcctccaggata 5141095  T
Q  405 gtctgtg 411  Q
    |||||||    
T  5141094 gtctgtg 5141088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 286; E-Value: 1e-160
Query Start/End: Original strand, 47 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 11418898 - 11418533
Alignment:
Q  47 ggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccatggagtcacgccttcggctgaccacc 146  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  11418898 ggaaatgtaatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggagtcacgccttcggctgaccacc 11418799  T
Q  147 actcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttaaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataat 246  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| |||||||| |||  || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  11418798 actcttatacatcgatttgagcctgtgcttttgtttgaaactctactttctttttactttcaaagctatatacaaaacattttccttctattttgataat 11418699  T
Q  247 gacaatgcttgaaacaaaca-ttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatga 345  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  11418698 gacaatgcttgaaacaaacatttttgaaaattgaaaactttctgtctgttttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcacga 11418599  T
Q  346 gcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtg 411  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || | |||||||||||||||    
T  11418598 gcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggtcctcctccaggatagtctgtg 11418533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 285; E-Value: 1e-159
Query Start/End: Original strand, 25 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 31558535 - 31558148
Alignment:
Q  25 gcttgtgaattcagaatttccgggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccatgga 124  Q
    ||||| ||||||| | ||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  31558535 gcttgcgaattcaaagtttccaggaaatgtaatgatcactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtgga 31558436  T
Q  125 gtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgttt-aaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaa 223  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| | ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||     
T  31558435 gtcacgccttcggctgaccaccacttttatacatcaagttgagcctttgcttttgtttgaaaactctatttt-cttctactttcaaagctatatacaaat 31558337  T
Q  224 cattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttt-gaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggt 322  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31558336 cattttccttctattttgataatgacaatacttgaaacaaacatttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggt 31558237  T
Q  323 acattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtg 411  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |  ||||||||||||||    
T  31558236 acattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatatgttacaagcaggttctccttcaggatagtctgtg 31558148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 283; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 25 - 411
Target Start/End: Original strand, 2160566 - 2160955
Alignment:
Q  25 gcttgtgaattcagaatttccgggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccatgga 124  Q
    ||||| ||||||| | ||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  2160566 gcttgcgaattcaaagtttccaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtatcaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtgga 2160665  T
Q  125 gtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttaaaactctatttttcttctactttcaaagctatatac--aaa 222  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||   || ||||||||||||||| |||  |||    
T  2160666 gtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaaattgagcctgtgcttttgtttaaaactctatttcctttttactttcaaagctatgtacaaaaa 2160765  T
Q  223 acattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattg-aaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacaggg 321  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||    
T  2160766 acattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagtttttgtctatttttgaaagcaaatctgagcaacaggg 2160865  T
Q  322 tacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtg 411  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2160866 tacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtgtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtg 2160955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 280; E-Value: 1e-156
Query Start/End: Original strand, 8 - 411
Target Start/End: Original strand, 16047294 - 16047695
Alignment:
Q  8 tcatcagaagtttctgtgcttgtgaattcagaatttccgggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 107  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||| | ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16047294 tcatcagaagcttctgtgcttgcgaattcaaagtttccaggaaatgtagtgattactatgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 16047393  T
Q  108 ctttgtgaatccatggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttaaaactctatttttcttctactttc 207  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||| |||  ||||||| ||    
T  16047394 ctttgtaaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaactctactttctttctactgtc 16047493  T
Q  208 aaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaa 307  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||     
T  16047494 aaagctatgtacaaaa-attttctttctatcttgataatgacaatgcttgaaacaaacatcctgaaaattgaaaagtttttgtctattttg-aaagcaag 16047591  T
Q  308 cctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtc 407  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  16047592 cctgagcaacaggatacattcaaacgaaacatgcatgagcgagcgtatgtcgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggttcttccccgggatagtc 16047691  T
Q  408 tgtg 411  Q
    ||||    
T  16047692 tgtg 16047695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 277; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 24 - 389
Target Start/End: Complemental strand, 26509839 - 26509471
Alignment:
Q  24 tgcttgtgaattcagaatttccgggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaa-ttaccattttccaagctttgtgaatccatg 122  Q
    |||||| ||||||| | ||||  ||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||    
T  26509839 tgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtcatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtg 26509740  T
Q  123 gagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgttt-aaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaa 221  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26509739 gagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgtttgaaaactccatttttcttctactttcaaagctatatacaa 26509640  T
Q  222 aacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaa-ctttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagg 320  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26509639 aacattttctttctattttgataatgacaatgctcgaaacaaacattttgaaaattgaaaacctttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagg 26509540  T
Q  321 gtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcagg 389  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||    
T  26509539 gtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtgtatgttgatgtctatttcaatacatgtcacaagcagg 26509471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 277; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 25 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 39207280 - 39206893
Alignment:
Q  25 gcttgtgaattcagaatttccgggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccatgga 124  Q
    ||||| ||||||| | ||||| |||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  39207280 gcttgcgaattcaaagtttccaggaagtgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccgataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtgga 39207181  T
Q  125 gtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgttt-aaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaa 223  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| | ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  39207180 gtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaagttgagcctttgcttttgtttgaaaactctatttt-cttctactttcaaagctatatacaaaa 39207082  T
Q  224 cattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttt-gaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggt 322  Q
     |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39207081 tattttccttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttttgaaaattgaaaactttttgtttattttgaaaagcaaacctgagcaacagggt 39206982  T
Q  323 acattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtg 411  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| ||| | |||||||||||||||    
T  39206981 acattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttaatgtctatttcaatatatgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtg 39206893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 274; E-Value: 1e-153
Query Start/End: Original strand, 22 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 16444148 - 16443757
Alignment:
Q  22 tgtgcttgtgaattcagaatttccgggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccat 121  Q
    |||||||| ||||||| | ||||   ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |    
T  16444148 tgtgcttgcgaattcaaagtttctaagaaatgtagtcgttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgt 16444049  T
Q  122 ggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttaaaactctatttttcttctactttcaaagctatatac-- 219  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||| |||      
T  16444048 ggagtcacgccttcgcctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttaaaactctactttctttctactttcaaagctatgtacaa 16443949  T
Q  220 aaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattg-aaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaaca 318  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  16443948 aaaacattttctttctatcttgataatgacaatgcttgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagtttttgtctattttg-aaagcaaacctgagcaaca 16443850  T
Q  319 gggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtg 411  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16443849 gggtacattcaaacgaaacatgcatgagcgagcatatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtg 16443757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 273; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 8 - 411
Target Start/End: Original strand, 3451297 - 3451702
Alignment:
Q  8 tcatcagaagtttctgtgcttgtgaattcagaatttccgggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 107  Q
    ||||| |||| |||||| |||||||||||| | ||||   ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3451297 tcatctgaagcttctgtacttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtgatcactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 3451396  T
Q  108 ctttgtgaatccatggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttaaaactctatttttcttctactttc 207  Q
     ||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||| |||||||||||||||    
T  3451397 ttttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagctggtgcttttgtttgaaattcta-ttttcttctactttc 3451495  T
Q  208 aaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaaca---ttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagc 304  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3451496 aaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagc 3451595  T
Q  305 aaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggata 404  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||  ||||||||| |||||| ||||||||||||| ||| | ||||||||    
T  3451596 aaacctgagcaacagggtacaatcaaatggaacatgcatgagcgagggtatgtgaatgtctattccaatatatgttacaagcaggttctcctccaggata 3451695  T
Q  405 gtctgtg 411  Q
    || ||||    
T  3451696 gtatgtg 3451702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 265; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 24 - 408
Target Start/End: Original strand, 2779247 - 2779626
Alignment:
Q  24 tgcttgtgaattcagaatttccgggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccatgg 123  Q
    |||||| ||||||| | ||||  ||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||    
T  2779247 tgcttgcgaattcaaagtttctaggagatgtcatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtgg 2779346  T
Q  124 agtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttaaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaa 223  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||  |||  || |||||||||||||||||||||||    
T  2779347 agtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatctatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctgctttctttttactttcaaagctatatacaaaa 2779446  T
Q  224 cattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggta 323  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||     ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2779447 cattttctttctattttgataatgataatgctcgaaacaaacattttgaaaattgaaaaagtttt-----ttttgaaaagcaaacctgagcaacagggta 2779541  T
Q  324 cattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtct 408  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||    
T  2779542 cattcaaatgagacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggttctcctccaggatagtct 2779626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 260; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 24 - 411
Target Start/End: Original strand, 31129900 - 31130282
Alignment:
Q  24 tgcttgtgaattcagaatttccgggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccatgg 123  Q
    |||||| ||||||| | ||||  ||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||    
T  31129900 tgcttgcgaattcaaagtttctaggagatgtcatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtgg 31129999  T
Q  124 agtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttaaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaa 223  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||  |||  || |||||||||||||||||||||||    
T  31130000 agtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatctatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctgctttctttttactttcaaagctatatacaaaa 31130099  T
Q  224 cattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggta 323  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||     ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31130100 cattttctttctattttgataatgataatgctcgaaacaaacattttgaaaattgaaaaagtttt-----ttttgaaaagcaaacctgagcaacagggta 31130194  T
Q  324 cattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtg 411  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| | |||||||| ||||||    
T  31130195 cattcaaatgagacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatatgttacaagcaggttctcctccaggataatctgtg 31130282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 243; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 8 - 411
Target Start/End: Original strand, 10847562 - 10847968
Alignment:
Q  8 tcatcagaagtttctgtgcttgtgaattcagaatttccgggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 107  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||| | ||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  10847562 tcatcagaagcttctgtgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtagtggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattgccattttccaag 10847661  T
Q  108 ctttgtgaatccatggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttaaaactctatttttcttctactttc 207  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| | ||||||||||||   |||||||||    
T  10847662 ctttgtaaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaattcgagcctgtgcttttgtctgaaactctattttctctctactttc 10847761  T
Q  208 aaagctatatac---aaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaa---ctttttgtctattttgaaa 301  Q
    |||||||| |||   |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    ||||||||| ||||| ||    
T  10847762 aaagctatgtacaaaaaaacattttctttctatcttgataatgacaatgcttgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaaagttttttgtctgttttg-aa 10847860  T
Q  302 agcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccagg 401  Q
    || |||||||||||||| ||||| |||||| ||||| |||||||| ||| |||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  10847861 agtaaacctgagcaacaaggtacgttcaaacgaaacgtgcatgagtgagcgtatgtcgatgtctatttca--atgtgttacaagcaggctcttccccagg 10847958  T
Q  402 atagtctgtg 411  Q
    ||||||||||    
T  10847959 atagtctgtg 10847968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 111 - 411
Target Start/End: Original strand, 26595750 - 26596053
Alignment:
Q  111 tgtgaatccatggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgttt-aaaactctattttt-cttctactttca 208  Q
    ||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||    
T  26595750 tgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctattttttcttctactttca 26595849  T
Q  209 aagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttt-gaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaa 307  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26595850 aagctatatacaacacattttctttttattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaa 26595949  T
Q  308 cctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtc 407  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||    
T  26595950 cctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagtgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggttctcctccaggatagtc 26596049  T
Q  408 tgtg 411  Q
    ||||    
T  26596050 tgtg 26596053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 47 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 10911039 - 10910680
Alignment:
Q  47 ggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccatggagtcacgccttcggctgaccacc 146  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  10911039 ggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtatcactaacccataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggagtcacgccttcggctgaccacc 10910940  T
Q  147 actcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttaaaactctatttttcttctactttcaaagctatatac-aaaacattttctttcta-ttttgata 244  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||  || ||||||||||| ||| ||| ||||||||||| ||||| |||| |||    
T  10910939 actcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgtttgaaactctattttctttttactttcaaagttatgtacaaaaacattttccttctatttttaata 10910840  T
Q  245 atgac-aatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcat 343  Q
    ||||| |||||| ||||||| ||| ||||||||||||||  ||       ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | |||||||||    
T  10910839 atgacaaatgctcgaaacaagcatcttgaaaattgaaaaagtt-------ttttgaaaagcaaacctgagcaacatggtacattcaaacg-aacatgcat 10910748  T
Q  344 gagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtg 411  Q
    ||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||| | |||||||||||||||    
T  10910747 gagcgagtgtatgttggtgtctatttcaatatatgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtg 10910680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 24 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 16512576 - 16512194
Alignment:
Q  24 tgcttgtgaattcagaatttccgggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccatgg 123  Q
    |||||| ||||||| | ||||  ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||    
T  16512576 tgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtgg 16512477  T
Q  124 agtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttaaaactctatttttcttctactttcaaagctatatac-aaa 222  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||  |||  || ||||||||||| ||| ||| |||    
T  16512476 agtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttaagcctgtgcttttgtttgaaactctgctttctttttactttcaaagttatgtacaaaa 16512377  T
Q  223 acattttctttcta-ttttgataatgac-aatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagg 320  Q
    |||||||| ||||| |||| |||||||| |||||| ||||||||||| |||| ||||| |||  |        |||||||||||||||||||||||||||    
T  16512376 acattttccttctatttttaataatgacaaatgctcgaaacaaacatcttgataattggaaaagt--------ttttgaaaagcaaacctgagcaacagg 16512285  T
Q  321 gtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtg 411  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||| |||||||||||| || ||||||||||||| ||| | |||||||||||||||    
T  16512284 gtacattcaaatgaaatatgcatgagcgagtgtgtgttggtgtctatttcaacatatgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtg 16512194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 25 - 110
Target Start/End: Complemental strand, 26532011 - 26531926
Alignment:
Q  25 gcttgtgaattcagaatttccgggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctt 110  Q
    ||||| ||||||| | ||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26532011 gcttgcgaattcaaagtttccaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctt 26531926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0418 (Bit Score: 321; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold0418
Description:

Target: scaffold0418; HSP #1
Raw Score: 321; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 24 - 411
Target Start/End: Original strand, 12034 - 12421
Alignment:
Q  24 tgcttgtgaattcagaatttccgggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccatgg 123  Q
    |||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  12034 tgcttgcgaattcaaaatttccaggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtgg 12133  T
Q  124 agtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgttt-aaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaa 222  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||    
T  12134 agtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctatttt-cttctactttcaaagctatatataaa 12232  T
Q  223 acattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggt 322  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12233 acattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggt 12332  T
Q  323 acattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtg 411  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| | |||||||||||||||    
T  12333 acattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatatgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtg 12421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 312; Significance: 1e-176; HSPs: 11)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 312; E-Value: 1e-176
Query Start/End: Original strand, 25 - 411
Target Start/End: Original strand, 3647147 - 3647534
Alignment:
Q  25 gcttgtgaattcagaatttccgggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccatgga 124  Q
    ||||| ||||||| | ||||  ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  3647147 gcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtaatggttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtgga 3647246  T
Q  125 gtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgttt-aaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaa 223  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3647247 gtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactccatttttcttctactttcaaagctatatacaaaa 3647346  T
Q  224 cattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggta 323  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3647347 cattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggta 3647446  T
Q  324 cattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtg 411  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||| | |||||||||||||||    
T  3647447 cattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatatgctacaagcaggttctcctccaggatagtctgtg 3647534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 306; E-Value: 1e-172
Query Start/End: Original strand, 8 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 20334689 - 20334283
Alignment:
Q  8 tcatcagaagtttctgtgcttgtgaattcagaatttccgggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 107  Q
    ||||| |||| ||||||||||| ||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20334689 tcatctgaagcttctgtgcttgcgaattcaaagtttccaggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 20334590  T
Q  108 ctttgtgaatccatggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttaaaactctatttttcttctactttc 207  Q
    | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||| |||  ||||||||||    
T  20334589 ccttgtaaatccatggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgaaattgtgcttttgtttgaaactctactttctttctactttc 20334490  T
Q  208 aaagctatatac---aaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattg-aaaactttttgtctattttgaaaag 303  Q
    |||||||| |||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||    
T  20334489 aaagctatgtacaaaaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagtttttgtctattttg-aaag 20334391  T
Q  304 caaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggat 403  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20334390 caaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtgtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggat 20334291  T
Q  404 agtctgtg 411  Q
    ||||||||    
T  20334290 agtctgtg 20334283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 306; E-Value: 1e-172
Query Start/End: Original strand, 26 - 411
Target Start/End: Original strand, 28591085 - 28591470
Alignment:
Q  26 cttgtgaattcagaatttccgggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccatggag 125  Q
    |||| ||||||| | ||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  28591085 cttgcgaattcaaagtttccaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggag 28591184  T
Q  126 tcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttaaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaaca 225  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||  || |||||||||||||||||||||||||    
T  28591185 tcatgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctgctttctttttactttcaaagctatatacaaaaca 28591284  T
Q  226 ttttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtaca 325  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28591285 ttctctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtaca 28591384  T
Q  326 ttcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtg 411  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| | |||||||||||||||    
T  28591385 ttcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgtcgatgtctatttcaatatatgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtg 28591470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 305; E-Value: 1e-171
Query Start/End: Original strand, 25 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 41787566 - 41787177
Alignment:
Q  25 gcttgtgaattcagaatttccgggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaa-ttaccattttccaagctttgtgaatccatgg 123  Q
    ||||| ||||||| | ||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  41787566 gcttgcgaattcaaagtttccaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtgg 41787467  T
Q  124 agtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttaaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaa 223  Q
     ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  41787466 ggtcacgcctccggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttaaaactctatttt-cttctactttcaaagctatatacaaaa 41787368  T
Q  224 cattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttt---gaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagg 320  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41787367 cattttctttctattttgataatgacaatgctcgaaacaaacatttttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagg 41787268  T
Q  321 gtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtg 411  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| | |||||||||||||||    
T  41787267 gtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatatgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtg 41787177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 295; E-Value: 1e-165
Query Start/End: Original strand, 24 - 411
Target Start/End: Original strand, 28155726 - 28156116
Alignment:
Q  24 tgcttgtgaattcagaatttccgggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccatgg 123  Q
    |||||| ||||||| | ||||  ||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||    
T  28155726 tgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtcatgatcactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtgg 28155825  T
Q  124 agtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttaaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaa 223  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  28155826 agtcacgccttcggctgaccacccctcttatacatcaaattgagcctgtgcttttgtttaaaactctatttt-cttctactttcaaagctatatacaaaa 28155924  T
Q  224 cattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttt----gaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacag 319  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28155925 cattttccttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacag 28156024  T
Q  320 ggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtg 411  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| | |||||||||||||||    
T  28156025 ggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatatgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtg 28156116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 293; E-Value: 1e-164
Query Start/End: Original strand, 57 - 411
Target Start/End: Original strand, 10968698 - 10969054
Alignment:
Q  57 tgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccatggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatac 156  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  10968698 tgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatac 10968797  T
Q  157 atcaatttgagcttgtgcttttgttt-aaaactctatttt-tcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgc 254  Q
    |||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10968798 atcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctattttttcttctactttcaaagctatatacaaaatattttctttctattttgataatgacaatgc 10968897  T
Q  255 ttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagta 354  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10968898 ttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagta 10968997  T
Q  355 tgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtg 411  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||| | ||||||| |||||||    
T  10968998 tgttgatgtctatttcaatatatgttacaaacaggttctcctccaggatggtctgtg 10969054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 281; E-Value: 1e-157
Query Start/End: Original strand, 8 - 389
Target Start/End: Original strand, 51644204 - 51644588
Alignment:
Q  8 tcatcagaagtttctgtgcttgtgaattcagaatttccgggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 107  Q
    |||||| ||| |||||| |||||||||||| | ||||   ||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51644204 tcatcaaaagcttctgtacttgtgaattcaaagtttctaagaactgtcatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 51644303  T
Q  108 ctttgtgaatccatggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgttt-aaaactcta-tttttcttctactt 205  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  51644304 ctttgtaaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttacacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctattttttcttctactt 51644403  T
Q  206 tcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaac-tttttgtctattttgaaaagc 304  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  51644404 tcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaacttttttgtctattttgaaaagc 51644503  T
Q  305 aaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcagg 389  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  51644504 aaacctgagcaacagggtacattcaaacgaaacatgcataagcgagagtatgtcgatgtctatttcaatatatgttacaagcagg 51644588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 277; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 41 - 411
Target Start/End: Original strand, 10951108 - 10951480
Alignment:
Q  41 tttccgggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccatggagtcacgccttcggctg 140  Q
    ||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||| |||||    
T  10951108 tttccaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatctgtggagtcatgcctttggctg 10951207  T
Q  141 accaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgttt-aaaactctatttt-tcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctatt 238  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  10951208 accaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctattttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttttatt 10951307  T
Q  239 ttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaaca 338  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  10951308 ttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagtaaacctgagcaacagggtacattcaaacgaaaca 10951407  T
Q  339 tgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtg 411  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| | ||| |||| ||||||    
T  10951408 tgcataagcgagagtatgtcgatgtctatttcaatatatgttacaagcaggttctcctccaagataatctgtg 10951480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 256; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 8 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 16202307 - 16201895
Alignment:
Q  8 tcatcagaagtttctgtgcttgtgaattcagaatttccgggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 107  Q
    |||||||||| | ||||||||| ||||||| | ||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16202307 tcatcagaagctcctgtgcttgcgaattcaaagtttccaggacatgtagtaattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 16202208  T
Q  108 ctttgtgaatccatggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttaaaactctatttttcttctactttc 207  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||  || |||||||    
T  16202207 ctttgtaaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgtttgaaactctattttctttttactttc 16202108  T
Q  208 aaagctatatac-----aaaacattttctttcta-ttttgataatgac-aatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaa---ctttttgtctatttt 297  Q
    ||||| || |||     ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||    |||| |||||||||    
T  16202107 aaagccatgtacaaaaaaaaacattttctttctatttttgataatgacaaatgcttgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagttttttcgtctatttt 16202008  T
Q  298 gaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccc 397  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |    
T  16202007 g-aaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaacgaaacatgcatgagcgagcgtatgttgatgtctatttcaatatatgttacaagcaggttcttctc 16201909  T
Q  398 caggatagtctgtg 411  Q
    ||||||||||||||    
T  16201908 caggatagtctgtg 16201895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 238; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 8 - 411
Target Start/End: Original strand, 20466761 - 20467173
Alignment:
Q  8 tcatcagaagtttctgtgcttgtgaattcagaatttccgggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 107  Q
    |||||||||| |||| ||||||  |||||| | ||||  |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20466761 tcatcagaagcttctatgcttgcaaattcaaagtttctaggaaatgtagtcgttactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 20466860  T
Q  108 ctttgtgaatccatggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttaaaactctatttttcttctactttc 207  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||  ||| ||||||    
T  20466861 ctttgtaaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgtttgaaactctactttctttccactttc 20466960  T
Q  208 aaagctatatacaaaa--cattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaatt--------gaaaactttttgtctatttt 297  Q
    |||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||||||         |||| ||  ||||||||||    
T  20466961 aaagctatgtacaaaaaccattttctttctattttgataatgataatgcttgaaacaaacatcttcaaaattagaaaaaaaaaaagttcctgtctatttt 20467060  T
Q  298 gaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccc 397  Q
    | |||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20467061 g-aaagcaaacctgagcagcaaggtacattcaaacgaaacatgcgtgagcgagtgtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccc 20467159  T
Q  398 caggatagtctgtg 411  Q
    || |||||||||||    
T  20467160 catgatagtctgtg 20467173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 8 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 21892020 - 21891630
Alignment:
Q  8 tcatcagaagtttctgtgcttgtgaattcagaatttccgggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 107  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21892020 tcatcagaagcttctgtgcttgtgaattcaaagtttccaggaaatgtagtgattactatgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 21891921  T
Q  108 ctttgtgaatccatggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttaaaactcta-tttttcttctacttt 206  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||| | || ||  ||    
T  21891920 ctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgtttgaaactctactttcttttttatgtt 21891821  T
Q  207 caaagctatatacaaaacattttctttcta-ttttgataatgac-aatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagc 304  Q
    ||           ||||||||||| ||||| |||| |||||||| |||||| ||||||| ||| ||||||||||||||      || | |||||||||||    
T  21891820 ca-----------aaaacattttccttctatttttaataatgacaaatgctcgaaacaagcatcttgaaaattgaaaa----aagttttttttgaaaagc 21891736  T
Q  305 aaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggata 404  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| | ||||||||    
T  21891735 aaacctgagcaacagggtacattcaaacg-aacatgcatgagcgagtgtgtgtcgatgtctatttcaatatatgttacaagcaggttctcctccaggata 21891637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0792 (Bit Score: 308; Significance: 1e-173; HSPs: 1)
Name: scaffold0792
Description:

Target: scaffold0792; HSP #1
Raw Score: 308; E-Value: 1e-173
Query Start/End: Original strand, 24 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 4862 - 4471
Alignment:
Q  24 tgcttgtgaattcagaatttccgggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaa-ccaataaaa-ttaccattttccaagctttgtgaatccat 121  Q
    |||||| ||||||| | ||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |    
T  4862 tgcttgcgaattcaaagttttcaggaaatgtaatgattactgtgttcaatgtaccaccaaaccaataaaaattaccattttccaagctttgtgaatccgt 4763  T
Q  122 ggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttaaaactctatttttcttctactttcaaagctatatac-a 220  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  4762 ggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaa 4663  T
Q  221 aaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattg-aaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacag 319  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  4662 aaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagtttttgtctatttttgaaagcaaacctgagcaacag 4563  T
Q  320 ggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtg 411  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4562 ggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtgtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtg 4471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0322 (Bit Score: 306; Significance: 1e-172; HSPs: 2)
Name: scaffold0322
Description:

Target: scaffold0322; HSP #1
Raw Score: 306; E-Value: 1e-172
Query Start/End: Original strand, 8 - 411
Target Start/End: Original strand, 1639 - 2043
Alignment:
Q  8 tcatcagaagtttctgtgcttgtgaattcagaatttccgggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaa-ttaccattttccaa 106  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  1639 tcatcagaagtttctgtgcttatgaattcaaaatttccaggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaaattaccattttccaa 1738  T
Q  107 gctttgtgaatccatggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttaaaactctatttttcttctacttt 206  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  1739 gctttgtaaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgtttgaaactctatttt-cttctacttt 1837  T
Q  207 caaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttt-gaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagca 305  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  1838 caaagctatatacaaaacattttccttccattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttttgaaaattgaaaactttttgtttactttgaaaagca 1937  T
Q  306 aacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatag 405  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| ||| | || ||||||    
T  1938 aacctgagcaacagggtacgatcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttaatgtctatttcaatatatgttacaagcaggttctcctccgggatag 2037  T
Q  406 tctgtg 411  Q
    ||||||    
T  2038 tctgtg 2043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0322; HSP #2
Raw Score: 263; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 8 - 411
Target Start/End: Original strand, 12028 - 12443
Alignment:
Q  8 tcatcagaagtttctgtgcttgtgaattcagaatttccgggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 107  Q
    |||||||||| |||||| |||| ||| ||| | ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12028 tcatcagaagcttctgtacttgcgaactcaaagtttccaggaaatgtagtgattactatgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 12127  T
Q  108 ctttgtgaatccatggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaattt-gagcttgtgcttttgtttaaaactctatttttcttctacttt 206  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||| | |  |||||||||    
T  12128 ctttgtaaatccatggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaattttgagcctgtgcttttgtttgaaactctactatctttctacttt 12227  T
Q  207 caaagctatatacaaaa-----------cattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaac-tttttgtctat 294  Q
    ||||||||| || ||||           ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||    
T  12228 caaagctatgtaaaaaaaaaaaaaaaaacatttgctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagtttttgtctat 12327  T
Q  295 tttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctctt 394  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12328 tttgaaa-gcaaacctgagcaacagggtacattcaaacgaaacatgcatgagcgagggtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctctt 12426  T
Q  395 ccccaggatagtctgtg 411  Q
    | |||||||||||||||    
T  12427 ctccaggatagtctgtg 12443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0254 (Bit Score: 305; Significance: 1e-171; HSPs: 1)
Name: scaffold0254
Description:

Target: scaffold0254; HSP #1
Raw Score: 305; E-Value: 1e-171
Query Start/End: Original strand, 25 - 411
Target Start/End: Original strand, 18584 - 18973
Alignment:
Q  25 gcttgtgaattcagaatttccgggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaa-ttaccattttccaagctttgtgaatccatgg 123  Q
    ||||| ||||||| | ||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  18584 gcttgcgaattcaaagtttccaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtgg 18683  T
Q  124 agtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttaaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaa 223  Q
     ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  18684 ggtcacgcctccggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttaaaactctatttt-cttctactttcaaagctatatacaaaa 18782  T
Q  224 cattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttt---gaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagg 320  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18783 cattttctttctattttgataatgacaatgctcgaaacaaacatttttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagg 18882  T
Q  321 gtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtg 411  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| | |||||||||||||||    
T  18883 gtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatatgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtg 18973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0237 (Bit Score: 301; Significance: 1e-169; HSPs: 1)
Name: scaffold0237
Description:

Target: scaffold0237; HSP #1
Raw Score: 301; E-Value: 1e-169
Query Start/End: Original strand, 24 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 9184 - 8797
Alignment:
Q  24 tgcttgtgaattcagaatttccgggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccatgg 123  Q
    |||||| ||||||| | |||  |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  9184 tgcttgcgaattcaaagtttttgggaaatgtcatgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtgg 9085  T
Q  124 agtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttaaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaa 223  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9084 agtcacgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaattcta-ttttcttctactttcaaagctatatacaaaa 8986  T
Q  224 cattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaaca-ttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggt 322  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  8985 cattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacgaacatttttgaaaattaaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacttgagcaacagggt 8886  T
Q  323 acattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtg 411  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| | |||||||||||||||    
T  8885 acattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatatgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtg 8797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0143 (Bit Score: 301; Significance: 1e-169; HSPs: 2)
Name: scaffold0143
Description:

Target: scaffold0143; HSP #1
Raw Score: 301; E-Value: 1e-169
Query Start/End: Original strand, 24 - 411
Target Start/End: Original strand, 9912 - 10299
Alignment:
Q  24 tgcttgtgaattcagaatttccgggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccatgg 123  Q
    |||||| ||||||| | ||||  ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  9912 tgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtaatgattactgtgttcaatgtatcaccaaccaataaaattaccattttccaagctttgtgaatccatga 10011  T
Q  124 agtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttaaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaa 223  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  10012 agtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaaattgagcctgtgcttttgtttaaaactcta-ttttcttctattttcaaagctatatacaaaa 10110  T
Q  224 cattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaaca-ttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggt 322  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10111 cattttccttctattttgataatgacaatgtttgaaacaaacatttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggt 10210  T
Q  323 acattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtg 411  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| | |||||||||||||||    
T  10211 acattcaaatgaaacatgcataagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatatgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtg 10299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0143; HSP #2
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 24 - 411
Target Start/End: Original strand, 33295 - 33680
Alignment:
Q  24 tgcttgtgaattcagaatttccgggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaa-ttaccattttccaagctttgtgaatccatg 122  Q
    |||||| ||||||| | ||||  ||||||||| |||||  ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||    
T  33295 tgcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtaatgattgttgtgttcaatgtatcaccaaccaataaaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtg 33394  T
Q  123 gagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttaaaactctatttttcttctactttcaaagctatatac-aa 221  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||  || ||||||||||| ||| ||| ||    
T  33395 gagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgtttgaaactctgttttctttttactttcaaagttatgtacaaa 33494  T
Q  222 aacattttctttctattttgataatgac-aatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttg-aaaagcaaacctgagcaacag 319  Q
    ||||||||| ||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||  ||||     ||||| |||||||||||||||||||||    
T  33495 aacattttccttctattttaataatgacaaatgctcgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagtttt-----ttttgtaaaagcaaacctgagcaacag 33589  T
Q  320 ggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtg 411  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||| | |||||||||||||||    
T  33590 ggtacattcaaatg-aacatgcatgagcgagtgtgtgttggtgtctatttcaatatatgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtg 33680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0038 (Bit Score: 278; Significance: 1e-155; HSPs: 1)
Name: scaffold0038
Description:

Target: scaffold0038; HSP #1
Raw Score: 278; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 8 - 411
Target Start/End: Original strand, 13931 - 14336
Alignment:
Q  8 tcatcagaagtttctgtgcttgtgaattcagaatttccgggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaa-ttaccattttccaa 106  Q
    |||||| ||| |||||| |||||||||||| | ||||   ||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  13931 tcatcaaaagcttctgtacttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttaccgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaaattaccattttccaa 14030  T
Q  107 gctttgtgaatccatggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttaaaactctatttttcttctacttt 206  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  14031 gctttgtgaatccgtggagtcatgccttcggctgaccaccactcttatacatcaaattgagcttgtgctgttgtttgaaactctatttttcttctacttt 14130  T
Q  207 caaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaaca-ttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagca 305  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  14131 caaagctgtatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttttgaaaattgaaaactttttgtgtgttttgaaaagca 14230  T
Q  306 aacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatag 405  Q
    | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| ||| | ||| ||||     
T  14231 agcctgagcaacagggtacgttcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttaatgtctatttcaatatatgttacaagcaggttctcctccaagataa 14330  T
Q  406 tctgtg 411  Q
    ||||||    
T  14331 tctgtg 14336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0336 (Bit Score: 254; Significance: 1e-141; HSPs: 1)
Name: scaffold0336
Description:

Target: scaffold0336; HSP #1
Raw Score: 254; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 8 - 411
Target Start/End: Original strand, 15551 - 15962
Alignment:
Q  8 tcatcagaagtttctgtgcttgtgaattcagaatttccgggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 107  Q
    |||||| ||| |||||| |||||||||||| | ||||   ||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15551 tcatcaaaagcttctgtacttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttaccgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 15650  T
Q  108 ctttgtgaatccatggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgttt-aaaactctatttttcttctacttt 206  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| | ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  15651 ctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaagttgagcctttgcttttgtttgaaaactcta-ttttcttctacttt 15749  T
Q  207 caaagctatatacaaaacattttctttctatttt-gataatgacaatgcttgaaacaaaca------ttttgaaaattgaaaactttttgtctattttg- 298  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||  |  ||||||||||| ||||||||||      ||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  15750 caaagctatatacaaaacattttccttctattttaaacgatgacaatgctcgaaacaaacattttttttttgaaaattgaaaactttttgtctattttga 15849  T
Q  299 aaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttcccc 398  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| | ||    
T  15850 aaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatatgttacaagcaggttctcctcc 15949  T
Q  399 aggatagtctgtg 411  Q
    |||||||||||||    
T  15950 aggatagtctgtg 15962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109 (Bit Score: 250; Significance: 1e-139; HSPs: 1)
Name: scaffold0109
Description:

Target: scaffold0109; HSP #1
Raw Score: 250; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 8 - 411
Target Start/End: Original strand, 25097 - 25509
Alignment:
Q  8 tcatcagaagtttctgtgcttgtgaattcagaatttccgggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 107  Q
    |||||||||| |||||||||||  |||||| | ||||  |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  25097 tcatcagaagcttctgtgcttgcaaattcaaagtttctaggaaatgtagtggttaccgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattgccattttccaag 25196  T
Q  108 ctttgtgaatccatggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttaaaactctatttttcttctactttc 207  Q
    |||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||||||| |||  ||||||||||    
T  25197 ctttgtaaatccgtggagtcacaccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgcgcttttgtttgaaactctactttctttctactttc 25296  T
Q  208 aaagctatatac---aaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaa-------ctttttgtctatttt 297  Q
    |||||||| |||   |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||        ||||||||| ||||    
T  25297 aaagctatgtacgaaaaaacattatctttctatcttgataatgacaatgcttgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaaaaaaagttttttgtctgtttt 25396  T
Q  298 gaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccc 397  Q
    | ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25397 g-aaagcaaacctgagcaacaaggtacattcaaacgaaacatgcatgagcgagcgtatgtcgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccc 25495  T
Q  398 caggatagtctgtg 411  Q
    ||||||||||||||    
T  25496 caggatagtctgtg 25509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0089 (Bit Score: 199; Significance: 1e-108; HSPs: 1)
Name: scaffold0089
Description:

Target: scaffold0089; HSP #1
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 25 - 411
Target Start/End: Original strand, 6065 - 6449
Alignment:
Q  25 gcttgtgaattcagaatttccgggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaa-ttaccattttccaagctttgtgaatccatgg 123  Q
    ||||| ||||||| | ||||  ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||    
T  6065 gcttgcgaattcaaagtttctaggaaatgtaatgattgctgtgttcaatgtaccaccaaccagtaaaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtgg 6164  T
Q  124 agtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttaaaactctatttttcttctactttcaaagctatat--acaa 221  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||| |||||||| |||  || ||||||||||| ||| |  | ||    
T  6165 agtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcatattgagcctgtgcttttgtttgaaactctactttctttttactttcaaagttatgttcaaaa 6264  T
Q  222 aacattttctttcta-ttttgataatgac-aatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacag 319  Q
    ||||||||| ||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||       ||||||||||||||||||||||||||    
T  6265 aacattttccttctatttttaataatgacaaatgcttgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagtt-------ttttgaaaagcaaacctgagcaacag 6357  T
Q  320 ggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtg 411  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||| | |||||||||||||||    
T  6358 ggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtgtgtgttggtgtctatttcaatatatgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtg 6449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0240 (Bit Score: 190; Significance: 1e-103; HSPs: 1)
Name: scaffold0240
Description:

Target: scaffold0240; HSP #1
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 47 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 25135 - 24774
Alignment:
Q  47 ggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaa-ttaccattttccaagctttgtgaatccatggagtcacgccttcggctgaccac 145  Q
    ||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  25135 ggaaatgtaatgattgctgggttcaatgtaccaccaaccaataaaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggagtcacgccttcggctgaccac 25036  T
Q  146 cactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttaaaactctatttttcttctactttcaaagctatatac-aaaacattttctttcta-ttttgat 243  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||  |||  || ||||||||||| ||| ||| ||||||||||| ||||| |||| ||    
T  25035 cactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgtttgaaactctgctttctttttactttcaaagttatgtacaaaaacattttccttctatttttaat 24936  T
Q  244 aatgac-aatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgca 342  Q
    |||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||      |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  24935 aatgacaaatgctcgaaacaaacatcttgaaaattgaaaattttt------ttttgaaaagaaaacctgagcaacagggtacattcaaacg-aacatgca 24843  T
Q  343 tgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtg 411  Q
    |||||||| || ||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||| ||| | |||||||||||||||    
T  24842 tgagcgagtgtgtgttggtgtctgtttcaatatatgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtg 24774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0093 (Bit Score: 130; Significance: 3e-67; HSPs: 1)
Name: scaffold0093
Description:

Target: scaffold0093; HSP #1
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 239 - 411
Target Start/End: Original strand, 1 - 173
Alignment:
Q  239 ttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaac-tttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaac 337  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  1 ttgataatgacaatgcttgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagtttttgtctattttgaaa-gcaaacctgagcaacagggtacattcaaacgaaac 99  T
Q  338 atgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtg 411  Q
    |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  100 atgcatgagcaagtgtatgttgatgtctatttcaatatgtgctacaagcaggctcttccctaggatagtctgtg 173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0288 (Bit Score: 126; Significance: 8e-65; HSPs: 1)
Name: scaffold0288
Description:

Target: scaffold0288; HSP #1
Raw Score: 126; E-Value: 8e-65
Query Start/End: Original strand, 8 - 189
Target Start/End: Original strand, 359 - 540
Alignment:
Q  8 tcatcagaagtttctgtgcttgtgaattcagaatttccgggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 107  Q
    |||||| ||| |||||| |||||||||||| | ||||   ||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  359 tcatcaaaagcttctgtacttgtgaattcaaagtttctaagaactgtagtggttaccgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 458  T
Q  108 ctttgtgaatccatggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttaaaactc 189  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  459 ctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactctcatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaactc 540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0241 (Bit Score: 89; Significance: 9e-43; HSPs: 1)
Name: scaffold0241
Description:

Target: scaffold0241; HSP #1
Raw Score: 89; E-Value: 9e-43
Query Start/End: Original strand, 8 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 26405 - 26245
Alignment:
Q  8 tcatcagaagtttctgtgcttgtgaattcagaatttccgggaaatgtagtgattactgtgttcaatgtaccaccaaccaataaaattaccattttccaag 107  Q
    |||||||||| |||||||||||  |||||| | ||||  |||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||    
T  26405 tcatcagaagcttctgtgcttgctaattcaaagtttctaggaaatgtagtggttaccgtgctcaatgtaccaccaacaaataaaatttccatttttcaag 26306  T
Q  108 ctttgtgaatccatggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagc 168  Q
    |||||| ||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  26305 ctttgtaaatctgtgaagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaattcgagc 26245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0099 (Bit Score: 50; Significance: 2e-19; HSPs: 2)
Name: scaffold0099
Description:

Target: scaffold0099; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 304 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 40606 - 40497
Alignment:
Q  304 caaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaa-catgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatat-gtgttacaagcaggctcttccccagg 401  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||| || ||||| |||||||||||| ||  ||||||||||||| ||| | |||||    
T  40606 caaacctgagcaacagggtacattcaaacgaaataatgcatgagcgagtgtgtgttggtgtctatttcaacataatgttacaagcaggttctcctccagg 40507  T
Q  402 atagtctgtg 411  Q
    ||||| ||||    
T  40506 atagtatgtg 40497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0099; HSP #2
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 73 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 40855 - 40759
Alignment:
Q  73 tgtaccaccaaccaataaaa-ttaccatttt-ccaagcttt-gtgaatccat-ggagtcacgccttcggct-gaccaccactcttatacatcaattt 164  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| || ||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  40855 tgtaccaccaaccaataaaaattaccatttttccaagcttttgtaaatccgttggagtcacgccttcggcttgaccaccactcttatacatcaattt 40759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University