View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF9628_low_16 (Length: 367)

Name: NF9628_low_16
Description: NF9628
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF9628_low_16
NF9628_low_16
[»] chr5 (34 HSPs)
chr5 (19-366)||(27449249-27449596)
chr5 (19-366)||(37556937-37557284)
chr5 (20-366)||(33790743-33791089)
chr5 (19-366)||(43598159-43598506)
chr5 (19-366)||(43603651-43603998)
chr5 (19-366)||(43609143-43609490)
chr5 (19-366)||(31397305-31397652)
chr5 (19-351)||(24555913-24556245)
chr5 (19-351)||(24596944-24597277)
chr5 (69-366)||(42126712-42127011)
chr5 (47-344)||(5599353-5599650)
chr5 (20-344)||(34842044-34842371)
chr5 (20-340)||(9788653-9788973)
chr5 (20-344)||(534171-534495)
chr5 (20-340)||(26171183-26171503)
chr5 (20-340)||(29720791-29721111)
chr5 (20-340)||(40380532-40380852)
chr5 (20-340)||(15356324-15356644)
chr5 (20-340)||(23665530-23665850)
chr5 (20-340)||(34478894-34479214)
chr5 (20-340)||(16544853-16545176)
chr5 (20-111)||(10750411-10750502)
chr5 (20-183)||(18467325-18467488)
chr5 (20-340)||(31543217-31543537)
chr5 (19-94)||(42427862-42427937)
chr5 (20-126)||(16407965-16408071)
chr5 (20-105)||(6745787-6745872)
chr5 (263-340)||(23792980-23793057)
chr5 (263-333)||(42428105-42428175)
chr5 (263-340)||(10750182-10750259)
chr5 (20-184)||(13694573-13694736)
chr5 (278-345)||(10627731-10627798)
chr5 (23-105)||(658737-658819)
chr5 (47-84)||(31304065-31304102)
[»] chr6 (35 HSPs)
chr6 (19-366)||(14737885-14738232)
chr6 (19-366)||(33330759-33331106)
chr6 (19-351)||(18232287-18232619)
chr6 (20-341)||(9035725-9036046)
chr6 (38-310)||(24078354-24078628)
chr6 (20-340)||(5408501-5408821)
chr6 (20-340)||(5412826-5413146)
chr6 (20-340)||(16553092-16553412)
chr6 (20-340)||(16629648-16629968)
chr6 (20-340)||(34165300-34165620)
chr6 (20-123)||(12936724-12936827)
chr6 (271-342)||(21198602-21198673)
chr6 (20-183)||(25462940-25463103)
chr6 (20-111)||(26067870-26067961)
chr6 (20-111)||(33309602-33309693)
chr6 (258-340)||(16555301-16555383)
chr6 (258-340)||(16631857-16631939)
chr6 (20-126)||(16651566-16651672)
chr6 (263-340)||(16578177-16578254)
chr6 (263-340)||(16617126-16617203)
chr6 (263-340)||(33309374-33309451)
chr6 (40-200)||(12157875-12158035)
chr6 (20-111)||(26932038-26932129)
chr6 (20-344)||(28301309-28301638)
chr6 (149-344)||(28510570-28510764)
chr6 (23-105)||(3395115-3395197)
chr6 (271-345)||(13879111-13879185)
chr6 (44-101)||(30444016-30444073)
chr6 (271-330)||(5165578-5165637)
chr6 (271-345)||(25942041-25942115)
chr6 (263-340)||(26068113-26068190)
chr6 (263-340)||(26932281-26932358)
chr6 (23-105)||(15534080-15534162)
chr6 (271-345)||(17694586-17694660)
chr6 (20-122)||(28510435-28510537)
[»] scaffold0197 (1 HSPs)
scaffold0197 (19-366)||(14622-14969)
[»] chr8 (27 HSPs)
chr8 (19-366)||(10684577-10684924)
chr8 (20-366)||(35744818-35745164)
chr8 (19-366)||(18853476-18853823)
chr8 (23-350)||(23799891-23800217)
chr8 (20-344)||(6813121-6813445)
chr8 (19-187)||(26300765-26300933)
chr8 (20-340)||(34255938-34256258)
chr8 (20-333)||(4732081-4732394)
chr8 (19-163)||(5591478-5591622)
chr8 (40-340)||(43080141-43080441)
chr8 (20-340)||(18811247-18811567)
chr8 (20-173)||(450690-450843)
chr8 (20-200)||(27827664-27827844)
chr8 (20-102)||(15069344-15069426)
chr8 (271-345)||(4823436-4823510)
chr8 (20-106)||(17848299-17848385)
chr8 (271-345)||(28328280-28328354)
chr8 (271-345)||(28891136-28891210)
chr8 (46-340)||(21481035-21481329)
chr8 (271-345)||(16756995-16757069)
chr8 (258-340)||(18105746-18105828)
chr8 (20-98)||(31577768-31577846)
chr8 (263-340)||(15069106-15069183)
chr8 (263-344)||(41383195-41383276)
chr8 (271-345)||(21034240-21034314)
chr8 (263-340)||(27827524-27827601)
chr8 (269-333)||(13985551-13985615)
[»] chr7 (42 HSPs)
chr7 (19-366)||(24261636-24261983)
chr7 (19-366)||(12405764-12406111)
chr7 (19-366)||(16884354-16884701)
chr7 (19-349)||(18413085-18413415)
chr7 (23-366)||(21645456-21645799)
chr7 (19-351)||(9185485-9185817)
chr7 (20-351)||(21988348-21988679)
chr7 (19-351)||(49091104-49091436)
chr7 (20-153)||(5817711-5817844)
chr7 (20-340)||(47675569-47675889)
chr7 (256-344)||(5817603-5817691)
chr7 (20-340)||(6593965-6594285)
chr7 (20-340)||(38394479-38394799)
chr7 (20-340)||(18391603-18391923)
chr7 (20-126)||(48490035-48490141)
chr7 (258-340)||(48489847-48489929)
chr7 (20-200)||(36083-36263)
chr7 (20-111)||(7351126-7351217)
chr7 (20-340)||(22135296-22135616)
chr7 (20-340)||(40550323-40550643)
chr7 (21-126)||(6570617-6570722)
chr7 (20-333)||(1048764-1049077)
chr7 (20-111)||(7093936-7094027)
chr7 (23-105)||(4295419-4295501)
chr7 (23-105)||(7471459-7471541)
chr7 (20-105)||(44725303-44725388)
chr7 (271-345)||(3324522-3324596)
chr7 (271-345)||(7070167-7070241)
chr7 (20-94)||(13289974-13290048)
chr7 (271-345)||(25405786-25405860)
chr7 (20-207)||(6047110-6047297)
chr7 (271-345)||(25351724-25351798)
chr7 (263-340)||(7351369-7351446)
chr7 (20-81)||(26213472-26213533)
chr7 (20-100)||(24749320-24749400)
chr7 (265-344)||(7471701-7471780)
chr7 (23-98)||(20298050-20298125)
chr7 (23-105)||(28486293-28486375)
chr7 (271-345)||(44016400-44016474)
chr7 (52-93)||(3903937-3903978)
chr7 (263-340)||(7094179-7094256)
chr7 (263-340)||(31159406-31159483)
[»] chr4 (38 HSPs)
chr4 (19-354)||(9224729-9225064)
chr4 (19-351)||(16624333-16624665)
chr4 (20-344)||(5872227-5872551)
chr4 (20-340)||(52094794-52095114)
chr4 (20-340)||(5136508-5136828)
chr4 (23-340)||(12743363-12743680)
chr4 (20-340)||(7123124-7123444)
chr4 (40-344)||(16933643-16933947)
chr4 (20-340)||(8393835-8394154)
chr4 (20-340)||(22134092-22134412)
chr4 (20-340)||(22782212-22782532)
chr4 (27-340)||(11008050-11008363)
chr4 (258-340)||(26558125-26558207)
chr4 (20-84)||(4588624-4588688)
chr4 (20-162)||(3578169-3578311)
chr4 (20-98)||(12402571-12402649)
chr4 (258-344)||(46147065-46147151)
chr4 (20-97)||(10113639-10113716)
chr4 (20-112)||(31480974-31481066)
chr4 (20-110)||(22046190-22046280)
chr4 (263-344)||(11435489-11435570)
chr4 (222-344)||(21549153-21549275)
chr4 (23-103)||(36920976-36921056)
chr4 (271-345)||(16631552-16631626)
chr4 (23-173)||(18536982-18537132)
chr4 (263-340)||(9176193-9176270)
chr4 (23-107)||(14788911-14788995)
chr4 (266-333)||(4588375-4588442)
chr4 (265-340)||(18311095-18311170)
chr4 (265-340)||(18409072-18409147)
chr4 (271-345)||(4558680-4558754)
chr4 (44-90)||(5207119-5207165)
chr4 (20-98)||(12395335-12395412)
chr4 (20-98)||(12400297-12400374)
chr4 (40-138)||(26558327-26558425)
chr4 (23-105)||(47563528-47563610)
chr4 (263-340)||(22802455-22802532)
chr4 (263-344)||(36921216-36921297)
[»] chr1 (28 HSPs)
chr1 (19-366)||(41397666-41398013)
chr1 (19-366)||(19359151-19359498)
chr1 (19-351)||(47099147-47099478)
chr1 (20-347)||(17345846-17346173)
chr1 (19-349)||(9024155-9024485)
chr1 (19-333)||(28222852-28223166)
chr1 (19-203)||(3157216-3157400)
chr1 (20-344)||(16226648-16226972)
chr1 (23-333)||(31657627-31657937)
chr1 (20-340)||(51750521-51750841)
chr1 (20-111)||(28841135-28841226)
chr1 (19-203)||(50168781-50168964)
chr1 (20-103)||(27338608-27338691)
chr1 (20-126)||(16456348-16456454)
chr1 (19-64)||(775765-775810)
chr1 (20-105)||(20300850-20300935)
chr1 (20-105)||(28203174-28203259)
chr1 (40-103)||(47178083-47178146)
chr1 (20-111)||(51758247-51758338)
chr1 (271-345)||(9522097-9522171)
chr1 (263-340)||(27338851-27338928)
chr1 (263-340)||(47177846-47177923)
chr1 (71-163)||(13784790-13784882)
chr1 (271-345)||(2400959-2401033)
chr1 (23-105)||(3805616-3805698)
chr1 (23-105)||(6996303-6996385)
chr1 (23-105)||(13127213-13127295)
chr1 (23-105)||(31736954-31737036)
[»] chr3 (58 HSPs)
chr3 (19-366)||(32479767-32480114)
chr3 (19-366)||(8516521-8516868)
chr3 (19-351)||(3323875-3324208)
chr3 (19-349)||(16263790-16264120)
chr3 (19-340)||(22834439-22834759)
chr3 (20-340)||(37407105-37407425)
chr3 (19-340)||(7762683-7763008)
chr3 (20-340)||(10209617-10209937)
chr3 (20-340)||(23199570-23199890)
chr3 (20-340)||(29811285-29811605)
chr3 (20-340)||(32891506-32891826)
chr3 (44-340)||(6716929-6717225)
chr3 (20-333)||(5259754-5260067)
chr3 (20-340)||(9635555-9635875)
chr3 (20-340)||(4600151-4600471)
chr3 (20-340)||(10058883-10059203)
chr3 (20-126)||(23409763-23409869)
chr3 (20-340)||(10056661-10056981)
chr3 (20-340)||(10061105-10061425)
chr3 (20-340)||(10063327-10063647)
chr3 (20-340)||(10065549-10065869)
chr3 (20-340)||(456370-456690)
chr3 (20-105)||(43226775-43226860)
chr3 (20-111)||(6065268-6065359)
chr3 (20-105)||(5898107-5898192)
chr3 (20-105)||(18098646-18098731)
chr3 (20-340)||(5192113-5192433)
chr3 (20-344)||(10957798-10958122)
chr3 (20-111)||(11168793-11168884)
chr3 (20-102)||(1619949-1620031)
chr3 (271-345)||(6303683-6303757)
chr3 (20-98)||(7769260-7769338)
chr3 (258-340)||(25637871-25637953)
chr3 (23-105)||(42990997-42991079)
chr3 (20-105)||(4309985-4310070)
chr3 (40-105)||(43422963-43423028)
chr3 (23-340)||(3315145-3315462)
chr3 (271-345)||(16457838-16457912)
chr3 (262-344)||(23633903-23633985)
chr3 (271-345)||(29913690-29913764)
chr3 (271-345)||(47882623-47882697)
chr3 (263-340)||(6065511-6065588)
chr3 (271-344)||(10099809-10099882)
chr3 (271-344)||(10205426-10205499)
chr3 (263-340)||(10621244-10621321)
chr3 (23-124)||(15830676-15830777)
chr3 (23-102)||(53917152-53917231)
chr3 (263-330)||(53917384-53917451)
chr3 (271-345)||(10612512-10612586)
chr3 (271-345)||(10897377-10897451)
chr3 (266-340)||(11168564-11168638)
chr3 (271-345)||(22625714-22625788)
chr3 (20-98)||(23634150-23634228)
chr3 (266-344)||(43226536-43226614)
chr3 (271-340)||(5886663-5886732)
chr3 (263-340)||(28101726-28101803)
chr3 (263-344)||(42990758-42990839)
chr3 (20-84)||(15822117-15822181)
[»] scaffold0028 (1 HSPs)
scaffold0028 (19-366)||(149268-149615)
[»] chr2 (22 HSPs)
chr2 (20-355)||(19348705-19349040)
chr2 (19-366)||(25403077-25403424)
chr2 (19-366)||(23078778-23079127)
chr2 (19-351)||(10445768-10446100)
chr2 (19-344)||(16387891-16388215)
chr2 (20-340)||(36560616-36560936)
chr2 (71-344)||(3277497-3277771)
chr2 (20-344)||(35217445-35217769)
chr2 (40-340)||(19503831-19504131)
chr2 (258-338)||(30720337-30720417)
chr2 (20-105)||(21520169-21520254)
chr2 (40-105)||(34574653-34574718)
chr2 (152-340)||(723311-723499)
chr2 (271-345)||(2736577-2736651)
chr2 (271-345)||(20054495-20054569)
chr2 (271-345)||(22716968-22717042)
chr2 (271-345)||(39680418-39680492)
chr2 (263-340)||(6263872-6263948)
chr2 (49-105)||(22405434-22405490)
chr2 (255-333)||(42019553-42019631)
chr2 (271-344)||(28458578-28458651)
chr2 (264-340)||(22405649-22405725)
[»] scaffold0188 (1 HSPs)
scaffold0188 (18-366)||(18257-18605)
[»] scaffold0355 (1 HSPs)
scaffold0355 (23-366)||(190-533)
[»] scaffold0006 (1 HSPs)
scaffold0006 (19-351)||(1934-2266)
[»] scaffold0087 (1 HSPs)
scaffold0087 (32-351)||(37155-37474)
[»] scaffold0842 (1 HSPs)
scaffold0842 (19-349)||(3522-3852)
[»] scaffold0184 (1 HSPs)
scaffold0184 (20-344)||(29821-30142)
[»] scaffold0078 (1 HSPs)
scaffold0078 (20-344)||(42702-43023)
[»] scaffold0016 (1 HSPs)
scaffold0016 (20-340)||(115019-115339)
[»] scaffold1991 (1 HSPs)
scaffold1991 (19-78)||(1022-1081)
[»] scaffold0140 (1 HSPs)
scaffold0140 (20-340)||(22610-22930)
[»] scaffold1899 (1 HSPs)
scaffold1899 (20-344)||(104-428)
[»] scaffold0011 (1 HSPs)
scaffold0011 (22-101)||(34273-34352)
[»] scaffold0025 (1 HSPs)
scaffold0025 (20-102)||(72992-73074)
[»] scaffold0491 (1 HSPs)
scaffold0491 (258-340)||(10830-10912)
[»] scaffold0209 (1 HSPs)
scaffold0209 (271-344)||(16770-16843)
[»] scaffold0005 (1 HSPs)
scaffold0005 (23-107)||(50735-50819)
[»] scaffold1674 (1 HSPs)
scaffold1674 (266-340)||(1173-1247)
[»] scaffold0127 (1 HSPs)
scaffold0127 (266-340)||(12596-12670)


Alignment Details
Target: chr5 (Bit Score: 299; Significance: 1e-168; HSPs: 34)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 299; E-Value: 1e-168
Query Start/End: Original strand, 19 - 366
Target Start/End: Original strand, 27449249 - 27449596
Alignment:
Q  19 atagagttgttgcttcaagagttgcctatgagccaaagatttcgtcatatacaatgactccaacttcgcccacatcgatgccgcggtagcttctctcgcg 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27449249 atagagttgttgcttcaagagttgcctatgagctaaagattttgtcatatacaatgactccaacttcgcccacatcgatgccgcggtagcttctctcgcg 27449348  T
Q  119 acatcccttaagaccttatctctgagacataaaacaatggcactctttgccttgtttaccatctcacgcttctcctcttgtgtcaaggttgccggcatcg 218  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27449349 acatccattaagaccttatctccgagacataagacaatggcactctttgccttgtctaccatctcacgcttctcctcttgtgtcaaggttgccggcatcg 27449448  T
Q  219 ccgcttcaccctttaatgcttctacacacnnnnnnngtgtcaaaaccgcttgcatcttaaccttccacaacccgaaatcattacttccggtgaacttctc 318  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||       ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27449449 ccgcttcaccctttaatgcttctacacacttttgttgtgtcaaaaccgcttgcatcttaaccttccacaacccgaaatcattacttccggtgaacttctc 27449548  T
Q  319 gatgtcccactttgaccccatgataccaactatcaataactcctatgc 366  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  27449549 gatgtcccactttgaccccatgataccaactatcaataacgcctatgc 27449596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 275; E-Value: 1e-154
Query Start/End: Original strand, 19 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 37557284 - 37556937
Alignment:
Q  19 atagagttgttgcttcaagagttgcctatgagccaaagatttcgtcatatacaatgactccaacttcgcccacatcgatgccgcggtagcttctctcgcg 118  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  37557284 atagagttgttgcttcaagagttgcctatgagccaaagatttcgtcatatacaatgactccaacttcgcccacatcgatgtcgcggtagcttctctcgcg 37557185  T
Q  119 acatcccttaagaccttatctctgagacataaaacaatggcactctttgccttgtttaccatctcacgcttctcctcttgtgtcaaggttgccggcatcg 218  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37557184 acatcccttaagaccttatctccgagacataagacaatagcactctttgccttgtctaccatctcacgcttctcctcttgtgtcaaggttgccggcatcg 37557085  T
Q  219 ccgcttcaccctttaatgcttctacacacnnnnnnngtgtcaaaaccgcttgcatcttaaccttccacaacccgaaatcattacttccggtgaacttctc 318  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||          ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37557084 ccgcttcacccttcaatgcttctacacatttttgttaagtcaaaaccgcttccatcttaaccttccataacccgaaatcattacttccggtgaacttctc 37556985  T
Q  319 gatgtcccactttgaccccatgataccaactatcaataactcctatgc 366  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  37556984 gatgtcccactttgaccccatgataccaactatcaatcacgcctatgc 37556937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 270; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 20 - 366
Target Start/End: Original strand, 33790743 - 33791089
Alignment:
Q  20 tagagttgttgcttcaagagttgcctatgagccaaagatttcgtcatatacaatgactccaacttcgcccacatcgatgccgcggtagcttctctcgcga 119  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33790743 tagagttgttgcttcaagagttgtctatgagccaaagatttcgtcatatacaatgactccaactttgcccacatcgatgccgcggtagcttctctcgcga 33790842  T
Q  120 catcccttaagaccttatctctgagacataaaacaatggcactctttgccttgtttaccatctcacgcttctcctcttgtgtcaaggttgccggcatcgc 219  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33790843 catcccttaagaccttatctccgagacataagacaatggcactctttgccttgtccaccatctcacgcttctcctcttgtgtcaaggttgccggcatcgc 33790942  T
Q  220 cgcttcaccctttaatgcttctacacacnnnnnnngtgtcaaaaccgcttgcatcttaaccttccacaacccgaaatcattacttccggtgaacttctcg 319  Q
    |||||||||||| |||||||||| ||||       ||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  33790943 cgcttcacccttcaatgcttctagacacttttgttgtgtcaataccgcttgcatcttaactttccataacccgaaatcattgcttccggtgaacttctcg 33791042  T
Q  320 atgtcccactttgaccccatgataccaactatcaataactcctatgc 366  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  33791043 atgtcccactttgaccccatgataccaactatcaatcacgcctatgc 33791089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 269; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 19 - 366
Target Start/End: Original strand, 43598159 - 43598506
Alignment:
Q  19 atagagttgttgcttcaagagttgcctatgagccaaagatttcgtcatatacaatgactccaacttcgcccacatcgatgccgcggtagcttctctcgcg 118  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43598159 atagagttgttgcttcaagagttgcccatgagctaaagatttcgtcatatacaatgactccaacttcgcccacatcgatgccgcggtagcttctctcgcg 43598258  T
Q  119 acatcccttaagaccttatctctgagacataaaacaatggcactctttgccttgt----ttaccatctcacgcttctcctcttgtgtcaaggttgccggc 214  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  43598259 acatcccttaagaccttatctccgagacataagacaatggcactctttgccttgtctacctaccatctcacgcttctcctcttgtgtcaaggttgccgac 43598358  T
Q  215 atcgccgcttcaccctttaatgcttctacacacnnnnnnngtgtcaaaaccgcttgcatcttaaccttccacaacccgaaatcattacttccggtgaact 314  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||       ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43598359 atcgccgcttcaccctttaatgcttctacacacttttgttgtgtcaaaaccgcttgcatcttaaccttccacaacccgaaatcattacttccggtgaact 43598458  T
Q  315 tctcgatgtcccactttgaccccatgataccaactatcaataactcctatgc 366  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    |||||||||||| |||||||    
T  43598459 tctcgatgtcccactttgaccccatgat----actatcaataacgcctatgc 43598506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 269; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 19 - 366
Target Start/End: Original strand, 43603651 - 43603998
Alignment:
Q  19 atagagttgttgcttcaagagttgcctatgagccaaagatttcgtcatatacaatgactccaacttcgcccacatcgatgccgcggtagcttctctcgcg 118  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43603651 atagagttgttgcttcaagagttgcccatgagctaaagatttcgtcatatacaatgactccaacttcgcccacatcgatgccgcggtagcttctctcgcg 43603750  T
Q  119 acatcccttaagaccttatctctgagacataaaacaatggcactctttgccttgt----ttaccatctcacgcttctcctcttgtgtcaaggttgccggc 214  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  43603751 acatcccttaagaccttatctccgagacataagacaatggcactctttgccttgtctacctaccatctcacgcttctcctcttgtgtcaaggttgccgac 43603850  T
Q  215 atcgccgcttcaccctttaatgcttctacacacnnnnnnngtgtcaaaaccgcttgcatcttaaccttccacaacccgaaatcattacttccggtgaact 314  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||       ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43603851 atcgccgcttcaccctttaatgcttctacacacttttgttgtgtcaaaaccgcttgcatcttaaccttccacaacccgaaatcattacttccggtgaact 43603950  T
Q  315 tctcgatgtcccactttgaccccatgataccaactatcaataactcctatgc 366  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    |||||||||||| |||||||    
T  43603951 tctcgatgtcccactttgaccccatgat----actatcaataacgcctatgc 43603998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 269; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 19 - 366
Target Start/End: Original strand, 43609143 - 43609490
Alignment:
Q  19 atagagttgttgcttcaagagttgcctatgagccaaagatttcgtcatatacaatgactccaacttcgcccacatcgatgccgcggtagcttctctcgcg 118  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43609143 atagagttgttgcttcaagagttgcccatgagctaaagatttcgtcatatacaatgactccaacttcgcccacatcgatgccgcggtagcttctctcgcg 43609242  T
Q  119 acatcccttaagaccttatctctgagacataaaacaatggcactctttgccttgt----ttaccatctcacgcttctcctcttgtgtcaaggttgccggc 214  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  43609243 acatcccttaagaccttatctccgagacataagacaatggcactctttgccttgtctacctaccatctcacgcttctcctcttgtgtcaaggttgccgac 43609342  T
Q  215 atcgccgcttcaccctttaatgcttctacacacnnnnnnngtgtcaaaaccgcttgcatcttaaccttccacaacccgaaatcattacttccggtgaact 314  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||       ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43609343 atcgccgcttcaccctttaatgcttctacacacttttgttgtgtcaaaaccgcttgcatcttaaccttccacaacccgaaatcattacttccggtgaact 43609442  T
Q  315 tctcgatgtcccactttgaccccatgataccaactatcaataactcctatgc 366  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    |||||||||||| |||||||    
T  43609443 tctcgatgtcccactttgaccccatgat----actatcaataacgcctatgc 43609490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 243; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 19 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 31397652 - 31397305
Alignment:
Q  19 atagagttgttgcttcaagagttgcctatgagccaaagatttcgtcatatacaatgactccaacttcgcccacatcgatgccgcggtagcttctctcgcg 118  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  31397652 atagagttgttgcttcaagagttgcctatgagccaaagattttgtcatatagaatgactccaacttttcccacattgatgccgcggtagcttccctcgcg 31397553  T
Q  119 acatcccttaagaccttatctctgagacataaaacaatggcactctttgccttgtttaccatctcacgcttctcctcttgtgtcaaggttgccggcatcg 218  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31397552 acatcccttaagactttatctccgagacataagacaatagtactctttgccttgtctaccatctcacgcttctcctcttgtgtcaaggttgccggcatcg 31397453  T
Q  219 ccgcttcaccctttaatgcttctacacacnnnnnnngtgtcaaaaccgcttgcatcttaaccttccacaacccgaaatcattacttccggtgaacttctc 318  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||       ||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  31397452 ccgcttcacccttcaatgcttctacacacttttgttgtgtcaataccacttgcatcttaaccttccataacccgaaatcattacttccagtgaacttctc 31397353  T
Q  319 gatgtcccactttgaccccatgataccaactatcaataactcctatgc 366  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  |||||||| || |||||||    
T  31397352 gatgtcccactttgaccccatgatacctcctatcaatcacgcctatgc 31397305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 19 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 24556245 - 24555913
Alignment:
Q  19 atagagttgttgcttcaagagttgcctatgagccaaagatttcgtcatatacaatgactccaacttcgcccacatcgatgccgcggtagcttctctcgcg 118  Q
    |||||||||||  ||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||  |||||||| | |||||| || |||    
T  24556245 atagagttgttatttcaagagttgtctatgagccaacgatttagtcatgtacaatgactccaacttagcccacagagatgccgcagcagcttcccttgcg 24556146  T
Q  119 acatcccttaagaccttatctctgagacataaaacaatggcactctttgccttgtttaccatctcacgcttctcctcttgtgtcaaggttgccggcatcg 218  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||| ||||||||||  | | ||||||||    
T  24556145 acatcccttaaaaccttatctccgagacataaaacaatggcactcttagccttgtctatcatctcacgcttctccgcttgtgtcaaattcgtcggcatcg 24556046  T
Q  219 ccgcttcaccctttaatgcttctacacacnnnnnnngtgtcaaaaccgcttgcatcttaaccttccacaacccgaaatcattacttccggtgaacttctc 318  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||       ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  24556045 ccgcttcacccttcaatgcttctacacactttttttgtgtcaaaaccgcttacatcttaaccttccacaacccgaaatcatttctttcggtgaacttctc 24555946  T
Q  319 gatgtcccactttgaccccatgataccaactat 351  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  24555945 gatgtcccactttgaacccatgataccaactat 24555913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 19 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 24597277 - 24596944
Alignment:
Q  19 atagagttgttgcttcaagagttgcctatgagccaaagatttcgtcatatacaatgactccaacttcgcccacatcgatgccgcggtagcttctctcgcg 118  Q
    |||||||||||  ||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||  |||||||| | |||||| || |||    
T  24597277 atagagttgttatttcaagagttgtctatgagccaacgatttagtcatgtacaatgactccaacttagcccacagagatgccgcagcagcttcccttgcg 24597178  T
Q  119 acatcccttaagaccttatctctgagacataaaacaatggcactctttgccttgtttaccatctcacgcttctcctcttgtgtcaaggttgccggcatcg 218  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||| ||||||||||  | | ||||||||    
T  24597177 acatcccttaaaaccttatctccgagacataaaacaatggcactcttagccttgtctatcatctcacgcttctccgcttgtgtcaaattcgtcggcatcg 24597078  T
Q  219 ccgcttcaccctttaatgcttctacacac-nnnnnnngtgtcaaaaccgcttgcatcttaaccttccacaacccgaaatcattacttccggtgaacttct 317  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||        ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||    
T  24597077 ccgcttcacccttcaatgcttctacacacttttttttgtgtcaaaaccgcttacatcttaaccttccacaacccgaaatcatttctttcggtgaacttct 24596978  T
Q  318 cgatgtcccactttgaccccatgataccaactat 351  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  24596977 cgatgtcccactttgaacccatgataccaactat 24596944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 176; E-Value: 1e-94
Query Start/End: Original strand, 69 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 42127011 - 42126712
Alignment:
Q  69 acaatgactccaacttcgcccacatcgatgccgcggtagcttctctcgcgacatcccttaagaccttatctctgagacataaaacaatggcactctttgc 168  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||    
T  42127011 acaatgactccaacttagcccatatcgacgtcgcggtagcttctctcgcgacatcccttaagaccttatctccgagacataaaaaaatggcactcttagc 42126912  T
Q  169 cttgtttaccatctcacgcttctcctcttgtgtcaaggttgccggcatcgccgcttcaccctttaatgcttctacacacnnnnnnngtgtcaaaaccgct 268  Q
    ||||| || |||||| ||||||||  ||||||||||  | ||||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||       ||||||||||||||    
T  42126911 cttgtctatcatctctcgcttctctgcttgtgtcaaactcgccggcatcaccgcttcacccttcaatgcttctaaacacttttgttgtgtcaaaaccgct 42126812  T
Q  269 tgcatcttaaccttccacaacccgaaatcattacttccggtgaacttctcgatgtcccactttgaccccatgataccaactat--caataactcctatgc 366  Q
    || |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||| |||||||    
T  42126811 tgtatcttaaccttccacaacccaaaatcattatttccggtgaacttctcgatgtcccactttgaacccatgataccaactataccaataacgcctatgc 42126712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 121; E-Value: 6e-62
Query Start/End: Original strand, 47 - 344
Target Start/End: Original strand, 5599353 - 5599650
Alignment:
Q  47 tgagccaaagatttcgtcatatacaatgactccaacttcgcccacatcgatgccgcggtagcttctctcgcgacatcccttaagaccttatctctgagac 146  Q
    |||| |||||||||  ||||||| |||||||||||||| | ||||||| ||||||| ||||||| ||||| |||||| || || ||||||||| ||||||    
T  5599353 tgagtcaaagattttatcatatataatgactccaacttagtccacatcaatgccgcagtagcttttctcgtgacatctctcaaaaccttatctatgagac 5599452  T
Q  147 ataaaacaatggcactctttgccttgtttaccatctcacgcttctcctcttgtgtcaaggttgccggcatcgccgcttcaccctttaatgcttctacaca 246  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||| || ||||  |||||||||| || |||||||||| |||| ||||  || |||||||||||||||||| | |||    
T  5599453 ataaaacaatgacactctttgctttgtctatcatcctacgcttctccgctagtgtcaaggtagccgacatcatcgattcaccctttaatgcttccaaaca 5599552  T
Q  247 cnnnnnnngtgtcaaaaccgcttgcatcttaaccttccacaacccgaaatcattacttccggtgaacttctcgatgtcccactttgaccccatgatac 344  Q
    |       ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| | |||||| |||||| |||||||||||||||||   ||||||| ||||||||||    
T  5599553 cttttgctgtgtcaaaaccgcttgcatcttaactttccaaaacacaaaatcaatacttctggtgaacttctcgatgtttgactttgaacccatgatac 5599650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 20 - 344
Target Start/End: Original strand, 34842044 - 34842371
Alignment:
Q  20 tagagttgttgcttcaagagttgcctatgagccaaagatttcgtcatatacaatgactccaacttcgcccacatcgatgccgcggtagcttctctcgcga 119  Q
    ||||||||||  ||||| | ||| ||| |||| |||||||| ||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||| | | |||||||  |||||||    
T  34842044 tagagttgttatttcaaaaattgtctacgagctaaagattttgtcatgtacaatggctccaacttagcccacatcgatgtcacagtagctttcctcgcga 34842143  T
Q  120 catcccttaagaccttatctctgagacataaaacaatggcactctttgccttgtttaccatctcacgcttctcctcttgtgtcaaggttgc---cggcat 216  Q
    ||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||  |||| ||||| |||| || ||||| || ||||||| ||||||| ||| | ||   || |      
T  34842144 catcctttaaaaccttatctttgagacataaaacaatatcactatttgctttgtctatcatcttacacttctccgcttgtgttaagttagcttacgtcga 34842243  T
Q  217 cgccgcttcaccctttaatgcttctacacacnnnnnnngtgtcaaaaccgcttgcatcttaaccttccacaacccgaaatcattacttccggtgaacttc 316  Q
    ||| |||||| ||||||||||||  ||||||       ||||||||||||||||||||||||| |||   ||||| ||||||||| ||||| ||||||||    
T  34842244 cgcagcttcatcctttaatgctttaacacacttttattgtgtcaaaaccgcttgcatcttaactttctctaacccaaaatcattaattccgatgaacttc 34842343  T
Q  317 tcgatgtcccactttgaccccatgatac 344  Q
    || ||||| |||||||| ||||||||||    
T  34842344 tcaatgtcacactttgaacccatgatac 34842371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 84; E-Value: 8e-40
Query Start/End: Original strand, 20 - 340
Target Start/End: Original strand, 9788653 - 9788973
Alignment:
Q  20 tagagttgttgcttcaagagttgcctatgagccaaagatttcgtcatatacaatgactccaacttcgcccacatcgatgccgcggtagcttctctcgcga 119  Q
    |||||||||||||| | || |||||||||||||||||| || ||||||||||| || |||||||| | ||| |||||||||||||| | |||  ||||||    
T  9788653 tagagttgttgcttaaggaattgcctatgagccaaagacttggtcatatacaacgattccaactttgaccatatcgatgccgcggttggttccttcgcga 9788752  T
Q  120 catcccttaagaccttatctctgagacataaaacaatggcactctttgccttgtttaccatctcacgcttctcctcttgtgtcaaggttgccggcatcgc 219  Q
    ||||||| || || || || | ||| || || |||||||||||| | |||||||  | ||||||   |||||||||||||| || |||  |||| |  ||    
T  9788753 catccctcaaaactttgtccccgaggcacaagacaatggcactcctagccttgtccatcatctcggtcttctcctcttgtgacatggtgtccggtaaagc 9788852  T
Q  220 cgcttcaccctttaatgcttctacacacnnnnnnngtgtcaaaaccgcttgcatcttaaccttccacaacccgaaatcattacttccggtgaacttctcg 319  Q
      |||||||||| || ||||   |||||       || |||| |||||||||||||| |||||||| ||||| ||||| ||| |||||||||||||||||    
T  9788853 accttcacccttcaaagctttctcacacttttgttgtatcaacaccgcttgcatcttcaccttccataacccaaaatcgttaattccggtgaacttctcg 9788952  T
Q  320 atgtcccactttgaccccatg 340  Q
    || ||||||||||| ||||||    
T  9788953 atatcccactttgaacccatg 9788973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 20 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 534495 - 534171
Alignment:
Q  20 tagagttgttgcttcaagagttgcctatgagccaaagatttcgtcatatacaatgactccaacttcgcccacatcgatgccgcggtagcttctctcgcga 119  Q
    |||||||||||||| | || |||||||| | ||||||| || ||||||||||||||||||||||| | ||||||| | ||||| |||| |||  ||| ||    
T  534495 tagagttgttgcttaaggaattgcctatcaaccaaagacttggtcatatacaatgactccaactttgaccacatcaacgccgccgtaggttccttcggga 534396  T
Q  120 catcccttaagaccttatctctgagacataaaacaatggcactctttgccttgtttaccatctcacgcttctcctcttgtgtcaaggttgccggcatcgc 219  Q
    ||||||| || || || || | ||| || || |||||||||||| | |||||||  ||||||||   ||||||| ||| || || |||   ||| | |||    
T  534395 catccctcaaaactttgtcaccgaggcacaagacaatggcactcctagccttgtccaccatctcggtcttctccgcttctgacatggtgaacggtaacgc 534296  T
Q  220 cgcttcaccctttaatgcttctacacacnnnnnnngtgtcaaaaccgcttgcatcttaaccttccacaacccgaaatcattacttccggtgaacttctcg 319  Q
      |||||||||| || ||||   |||||       || |||| |||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||     
T  534295 accttcacccttcaaagctttctcacacttttgttgtatcaacaccgcttgcatcttcaccttccataacccaaaatcattacttccggtgaacttctca 534196  T
Q  320 atgtcccactttgaccccatgatac 344  Q
    || ||||||||||| ||||||||||    
T  534195 atatcccactttgaacccatgatac 534171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 20 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 26171503 - 26171183
Alignment:
Q  20 tagagttgttgcttcaagagttgcctatgagccaaagatttcgtcatatacaatgactccaacttcgcccacatcgatgccgcggtagcttctctcgcga 119  Q
    |||||||||||||| | || |||||||||||||||||| || ||||||||||| || |||||||| | ||| ||||||||| |||| | |||  ||||||    
T  26171503 tagagttgttgcttaaggaattgcctatgagccaaagacttggtcatatacaacgattccaactttgaccatatcgatgccacggttggttccttcgcga 26171404  T
Q  120 catcccttaagaccttatctctgagacataaaacaatggcactctttgccttgtttaccatctcacgcttctcctcttgtgtcaaggttgccggcatcgc 219  Q
    |||||||||| || || ||   ||| || || |||||||||||| | |||||||  ||||||||   |||||||||||||| || |||  |||| | |||    
T  26171403 catcccttaaaactttgtcctcgaggcacaagacaatggcactcctagccttgtccaccatctcggtcttctcctcttgtgacatggtgaccggtaacgc 26171304  T
Q  220 cgcttcaccctttaatgcttctacacacnnnnnnngtgtcaaaaccgcttgcatcttaaccttccacaacccgaaatcattacttccggtgaacttctcg 319  Q
      |||||||||| || ||||   |||||       || |||| |||||||||||||| |||||||| ||||| ||||| ||| | |||||||||||||||    
T  26171303 accttcacccttcaaagctttctcacacttttgttgtatcaacaccgcttgcatcttcaccttccataacccaaaatcgttaatcccggtgaacttctcg 26171204  T
Q  320 atgtcccactttgaccccatg 340  Q
    || ||||||||| | ||||||    
T  26171203 atatcccactttaaacccatg 26171183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 20 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 29721111 - 29720791
Alignment:
Q  20 tagagttgttgcttcaagagttgcctatgagccaaagatttcgtcatatacaatgactccaacttcgcccacatcgatgccgcggtagcttctctcgcga 119  Q
    |||||||||||||| | || |||||||||||||||||| || ||||||||||| || |||||||| | |||||||||||||||||| | |||  ||||||    
T  29721111 tagagttgttgcttaaggaattgcctatgagccaaagacttggtcatatacaacgattccaactttgaccacatcgatgccgcggttggttccttcgcga 29721012  T
Q  120 catcccttaagaccttatctctgagacataaaacaatggcactctttgccttgtttaccatctcacgcttctcctcttgtgtcaaggttgccggcatcgc 219  Q
    ||||||| || || || || | ||| || || |||||||||||| | |||||||  ||||||||   |||||||||||||| || ||| ||||| | |||    
T  29721011 catccctcaaaactttgtccccgaggcacaagacaatggcactcctagccttgtccaccatctcggtcttctcctcttgtgacatggtagccggtaacgc 29720912  T
Q  220 cgcttcaccctttaatgcttctacacacnnnnnnngtgtcaaaaccgcttgcatcttaaccttccacaacccgaaatcattacttccggtgaacttctcg 319  Q
      ||||||| || |  ||||   |||||       |  |||| |||||||||||||| |||||||| ||||| ||||| |||   ||||||||||||||     
T  29720911 accttcaccattcacggctttctcacacttttgttgaatcaacaccgcttgcatcttcaccttccataacccaaaatcgttaagcccggtgaacttctca 29720812  T
Q  320 atgtcccactttgaccccatg 340  Q
    || ||||||||||| ||||||    
T  29720811 atatcccactttgaacccatg 29720791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 20 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 40380852 - 40380532
Alignment:
Q  20 tagagttgttgcttcaagagttgcctatgagccaaagatttcgtcatatacaatgactccaacttcgcccacatcgatgccgcggtagcttctctcgcga 119  Q
    |||||||||||||| | || ||| ||||||||||| || || ||||||||||| || |||||||| | ||| |||||||||||||| | |||  ||||||    
T  40380852 tagagttgttgcttaaggaattgtctatgagccaacgacttggtcatatacaacgattccaacttagaccatatcgatgccgcggttggttccttcgcga 40380753  T
Q  120 catcccttaagaccttatctctgagacataaaacaatggcactctttgccttgtttaccatctcacgcttctcctcttgtgtcaaggttgccggcatcgc 219  Q
    ||||||| || || || || | ||| || || |||||||| ||| | |||||||  ||||||||   |||||||||||||| || |||  |||||| |||    
T  40380752 catccctcaaaactttgtccccgaggcacaagacaatggcgctcctcgccttgtccaccatctcggtcttctcctcttgtgacatggtgtccggcaacgc 40380653  T
Q  220 cgcttcaccctttaatgcttctacacacnnnnnnngtgtcaaaaccgcttgcatcttaaccttccacaacccgaaatcattacttccggtgaacttctcg 319  Q
      |||||||||| || ||||   |||||       |  |||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||    ||||||||||||||     
T  40380652 accttcacccttcaaagctttctcacacttttgttgaatcaacaccgcttgcatcttcaccttccacaacccaaaatcgttgagcccggtgaacttctca 40380553  T
Q  320 atgtcccactttgaccccatg 340  Q
    || || |||||||| ||||||    
T  40380552 atatctcactttgaacccatg 40380532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 20 - 340
Target Start/End: Original strand, 15356324 - 15356644
Alignment:
Q  20 tagagttgttgcttcaagagttgcctatgagccaaagatttcgtcatatacaatgactccaacttcgcccacatcgatgccgcggtagcttctctcgcga 119  Q
    |||||||||||||| | || ||||| |||||||||||| || ||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||| |||||  | || |    
T  15356324 tagagttgttgctttaggaattgccgatgagccaaagactttgtcatatacaaagattccaactttgcccatatcgatgccgcggttgcttcctttgcta 15356423  T
Q  120 catcccttaagaccttatctctgagacataaaacaatggcactctttgccttgtttaccatctcacgcttctcctcttgtgtcaaggttgccggcatcgc 219  Q
    | || || || || ||||| | ||| || || |||| |||||||   |||||||  ||||||||   ||||||| |||||| || |||  |||| | ||     
T  15356424 cttctctcaaaactttatccccgaggcacaagacaacggcactccgggccttgtccaccatctcggtcttctccgcttgtgacatggtgaccggtaacga 15356523  T
Q  220 cgcttcaccctttaatgcttctacacacnnnnnnngtgtcaaaaccgcttgcatcttaaccttccacaacccgaaatcattacttccggtgaacttctcg 319  Q
      |||||||||| || ||||   |||||       || | || ||||||| |||||| |||||||| ||||||||||| |||  |||||| |||||||||    
T  15356524 accttcacccttcaaagctttctcacacttctgctgtattaacaccgcttccatctttaccttccataacccgaaatcgttatctccggtaaacttctcg 15356623  T
Q  320 atgtcccactttgaccccatg 340  Q
    || ||||||||||| ||||||    
T  15356624 atatcccactttgaacccatg 15356644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 20 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 23665850 - 23665530
Alignment:
Q  20 tagagttgttgcttcaagagttgcctatgagccaaagatttcgtcatatacaatgactccaacttcgcccacatcgatgccgcggtagcttctctcgcga 119  Q
    |||||||||||||| | || ||||| |||||||||||| || ||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||| |||||  | || |    
T  23665850 tagagttgttgctttaggaattgccgatgagccaaagactttgtcatatacaaagattccaactttgcccatatcgatgccgcggttgcttcctttgcta 23665751  T
Q  120 catcccttaagaccttatctctgagacataaaacaatggcactctttgccttgtttaccatctcacgcttctcctcttgtgtcaaggttgccggcatcgc 219  Q
    | || || || || ||||| | ||| || || |||| |||||||   |||||||  ||||||||   ||||||| |||||| || |||  |||| | ||     
T  23665750 cttctctcaaaactttatccccgaggcacaagacaacggcactccgggccttgtccaccatctcggtcttctccgcttgtgacatggtgaccggtaacga 23665651  T
Q  220 cgcttcaccctttaatgcttctacacacnnnnnnngtgtcaaaaccgcttgcatcttaaccttccacaacccgaaatcattacttccggtgaacttctcg 319  Q
      |||||||||| || ||||   |||||       || | || ||||||| |||||| |||||||| ||||||||||| |||  |||||| |||||||||    
T  23665650 accttcacccttcaaagctttctcacacttctgctgtattaacaccgcttccatctttaccttccataacccgaaatcgttatctccggtaaacttctcg 23665551  T
Q  320 atgtcccactttgaccccatg 340  Q
    || ||||||||||| ||||||    
T  23665550 atatcccactttgaacccatg 23665530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 20 - 340
Target Start/End: Original strand, 34478894 - 34479214
Alignment:
Q  20 tagagttgttgcttcaagagttgcctatgagccaaagatttcgtcatatacaatgactccaacttcgcccacatcgatgccgcggtagcttctctcgcga 119  Q
    |||||||||||||| | || ||| | |||||||||||| || ||||||||||| || |||||||| ||||||||||||| |||||| |||||  | || |    
T  34478894 tagagttgttgctttaggaattgtcgatgagccaaagactttgtcatatacaaagattccaactttgcccacatcgatgtcgcggttgcttcctttgcta 34478993  T
Q  120 catcccttaagaccttatctctgagacataaaacaatggcactctttgccttgtttaccatctcacgcttctcctcttgtgtcaaggttgccggcatcgc 219  Q
    | || || || || ||||| | ||| || || |||| ||||||| | |||||||  ||||||||   |||||||||||||| || |||  |||| | ||     
T  34478994 cttctctcaaaactttatccccgaggcacaagacaacggcactcctggccttgtccaccatctcggtcttctcctcttgtgacatggtgaccggtaacga 34479093  T
Q  220 cgcttcaccctttaatgcttctacacacnnnnnnngtgtcaaaaccgcttgcatcttaaccttccacaacccgaaatcattacttccggtgaacttctcg 319  Q
      |||||||||| || ||||   |||||       || | || ||||||| |||||| |||||||| ||||||||||| |||  |||||| | |||||||    
T  34479094 accttcacccttcaaagctttctcacacttttgctgtattaacaccgcttccatctttaccttccataacccgaaatcgttatctccggtaaccttctcg 34479193  T
Q  320 atgtcccactttgaccccatg 340  Q
    || ||||||||||| ||||||    
T  34479194 atatcccactttgaacccatg 34479214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 20 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 16545176 - 16544853
Alignment:
Q  20 tagagttgttgcttcaagagttgcctatgagccaaagatttc---gtcatatacaatgactccaacttcgcccacatcgatgccgcggtagcttctctcg 116  Q
    |||||||||||||| | || ||||||||||||||| || ||    ||||||||||| || |||||||| | ||| |||||||||||||| | |||  |||    
T  16545176 tagagttgttgcttaaggaattgcctatgagccaacgacttgttggtcatatacaacgattccaacttagaccatatcgatgccgcggttggttccttcg 16545077  T
Q  117 cgacatcccttaagaccttatctctgagacataaaacaatggcactctttgccttgtttaccatctcacgcttctcctcttgtgtcaaggttgccggcat 216  Q
    |||||||||| || || || || | ||| || || |||||||| ||| | |||||||  ||||||||   |||||||||||||| || |||  ||||||     
T  16545076 cgacatccctcaaaactttgtccccgaggcacaagacaatggcgctcctcgccttgtccaccatctcggtcttctcctcttgtgacatggtgtccggcaa 16544977  T
Q  217 cgccgcttcaccctttaatgcttctacacacnnnnnnngtgtcaaaaccgcttgcatcttaaccttccacaacccgaaatcattacttccggtgaacttc 316  Q
      |  |||||||||| || ||||   |||||       |  |||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||    ||||||||||||    
T  16544976 accaccttcacccttcaaagctttctcacacttttgttgaatcaacaccgcttgcatcttcaccttccacaacccaaaatcgttgagcccggtgaacttc 16544877  T
Q  317 tcgatgtcccactttgaccccatg 340  Q
    || || ||||||||||| ||||||    
T  16544876 tcaatatcccactttgaacccatg 16544853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 20 - 111
Target Start/End: Complemental strand, 10750502 - 10750411
Alignment:
Q  20 tagagttgttgcttcaagagttgcctatgagccaaagatttcgtcatatacaatgactccaacttcgcccacatcgatgccgcggtagcttc 111  Q
    |||||||||||||| | || ||||| |||||||||||| || ||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  10750502 tagagttgttgctttaggaattgccgatgagccaaagactttgtcatatacaaagattccaactttgcccacatcgatgccgcggttgcttc 10750411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 20 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 18467488 - 18467325
Alignment:
Q  20 tagagttgttgcttcaagagttgcctatgagccaaagatttcgtcatatacaatgactccaacttcgcccacatcgatgccgcggtagcttctctcgcga 119  Q
    |||||||||||||| | || ||||| |||||||||||| || ||||||||||| || |||||||| ||||| ||||||| ||||||   |||  | || |    
T  18467488 tagagttgttgctttaggaattgccgatgagccaaagactttgtcatatacaaagattccaactttgcccatatcgatgtcgcggttcgttcctttgcta 18467389  T
Q  120 catcccttaagaccttatctctgagacataaaacaatggcactctttgccttgtttaccatctc 183  Q
    | || || || || ||||||| |||||| || |||||||||||| | |||||||  ||||||||    
T  18467388 cttctctcaaaactttatctccgagacacaagacaatggcactcctggccttgtccaccatctc 18467325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 20 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 31543537 - 31543217
Alignment:
Q  20 tagagttgttgcttcaagagttgcctatgagccaaagatttcgtcatatacaatgactccaacttcgcccacatcgatgccgcggtagcttctctcgcga 119  Q
    |||||| ||||||| | || ||||| |||||||||||| || ||||||||||| || || ||||| ||||||||||||| |||||| |||||  | || |    
T  31543537 tagagtcgttgctttaggaattgccgatgagccaaagactttgtcatatacaaagattctaactttgcccacatcgatgtcgcggttgcttcctttgcta 31543438  T
Q  120 catcccttaagaccttatctctgagacataaaacaatggcactctttgccttgtttaccatctcacgcttctcctcttgtgtcaaggttgccggcatcgc 219  Q
    | || || || || ||||| | ||| || || |||| ||||||| | |||||||  ||||||||   ||||||| ||| || || |||  |||| | ||     
T  31543437 cttctctcaaaactttatccccgaggcacaagacaacggcactcctggccttgtccaccatctcggtcttctccgcttatgacatggtgaccggtaacga 31543338  T
Q  220 cgcttcaccctttaatgcttctacacacnnnnnnngtgtcaaaaccgcttgcatcttaaccttccacaacccgaaatcattacttccggtgaacttctcg 319  Q
      |||||||||| || ||||   |||||       || | || ||||||| |||||| |||||||| ||||||||||| |||  || ||| |||||||||    
T  31543337 accttcacccttcaaagctttctcacacttttgctgtattaacaccgcttccatctttaccttccataacccgaaatcgttatctctggtaaacttctcg 31543238  T
Q  320 atgtcccactttgaccccatg 340  Q
    || ||||||||||| ||||||    
T  31543237 atatcccactttgaacccatg 31543217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 19 - 94
Target Start/End: Original strand, 42427862 - 42427937
Alignment:
Q  19 atagagttgttgcttcaagagttgcctatgagccaaagatttcgtcatatacaatgactccaacttcgcccacatc 94  Q
    ||||||||||||||| | || |||||||||||||||||| || |||||||||||||||| |||||| | |||||||    
T  42427862 atagagttgttgcttaaggaattgcctatgagccaaagacttggtcatatacaatgactacaactttgaccacatc 42427937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 20 - 126
Target Start/End: Complemental strand, 16408071 - 16407965
Alignment:
Q  20 tagagttgttgcttcaagagttgcctatgagccaaagatttcgtcatatacaatgactccaacttcgcccacatcgatgccgcggtagcttctctcgcga 119  Q
    |||||||||||||| | || |||||||||||||||||| || ||||||||||| || |||||||| |  || |||||| ||||||| | |||  ||||||    
T  16408071 tagagttgttgcttaaggaattgcctatgagccaaagacttggtcatatacaacgattccaactttgatcatatcgattccgcggttggttccttcgcga 16407972  T
Q  120 catccct 126  Q
    |||||||    
T  16407971 catccct 16407965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 20 - 105
Target Start/End: Complemental strand, 6745872 - 6745787
Alignment:
Q  20 tagagttgttgcttcaagagttgcctatgagccaaagatttcgtcatatacaatgactccaacttcgcccacatcgatgccgcggt 105  Q
    |||||||||||||| | || ||||| |||||||||||| || ||||||||||| || | |||||| |||||||| |||||||||||    
T  6745872 tagagttgttgctttaggaattgccgatgagccaaagactttgtcatatacaaagattacaactttgcccacattgatgccgcggt 6745787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 263 - 340
Target Start/End: Original strand, 23792980 - 23793057
Alignment:
Q  263 accgcttgcatcttaaccttccacaacccgaaatcattacttccggtgaacttctcgatgtcccactttgaccccatg 340  Q
    ||||||| |||||| |||||||| ||||||||||| |||  |||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  23792980 accgcttccatctttaccttccataacccgaaatcgttatctccggtaaacttctcgatatcccactttgaacccatg 23793057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 263 - 333
Target Start/End: Original strand, 42428105 - 42428175
Alignment:
Q  263 accgcttgcatcttaaccttccacaacccgaaatcattacttccggtgaacttctcgatgtcccactttga 333  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||||| ||||  |||||| ||||||||||||| || |||||||||||    
T  42428105 accgcttgcatcttcaccttccataacccaaaattgttactttcggtgaacttctcaatatcccactttga 42428175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 263 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 10750259 - 10750182
Alignment:
Q  263 accgcttgcatcttaaccttccacaacccgaaatcattacttccggtgaacttctcgatgtcccactttgaccccatg 340  Q
    ||||||| |||||| |||||||| ||||||||||| |||  ||| || ||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  10750259 accgcttccatctttaccttccataacccgaaatcgttatctccagtaaacttctcgatatcccactttgaacccatg 10750182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 20 - 184
Target Start/End: Original strand, 13694573 - 13694736
Alignment:
Q  20 tagagttgttgcttcaagagttgcctatgagccaaagatttcgtcatatacaatgactccaacttcgcccacatcgatgccgcggtagcttctctcgcga 119  Q
    ||||||||||| |  | || |||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| || | ||||||| ||  |||||||| |||  ||| ||    
T  13694573 tagagttgttgatataggaattgcatatgagccaaagatttggtcatatacaacgactccaaatttgaccacatcaatatcgcggtaggttccttcgtga 13694672  T
Q  120 catcccttaagaccttatctctgagacataaaacaatggcactctttgccttgtttaccatctca 184  Q
     || ||| || || ||||| | ||| || || | ||| |||||| ||||||||| ||||||||||    
T  13694673 tat-cctcaaaactttatccccgaggcacaagaaaatagcactcattgccttgtctaccatctca 13694736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 278 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 10627798 - 10627731
Alignment:
Q  278 accttccacaacccgaaatcattacttccggtgaacttctcgatgtcccactttgaccccatgatacc 345  Q
    ||||||||||||||||| || ||||| ||||| ||||| || || |||||||| || |||||||||||    
T  10627798 accttccacaacccgaagtcgttactaccggtaaacttttcaatatcccacttcgaacccatgatacc 10627731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 23 - 105
Target Start/End: Complemental strand, 658819 - 658737
Alignment:
Q  23 agttgttgcttcaagagttgcctatgagccaaagatttcgtcatatacaatgactccaacttcgcccacatcgatgccgcggt 105  Q
    ||||||||||| | || ||||| |||||||||||| || |||||||||||  | || ||||| | ||||||||||| ||||||    
T  658819 agttgttgctttaggacttgccgatgagccaaagactttgtcatatacaaatattcgaactttgaccacatcgatgtcgcggt 658737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 47 - 84
Target Start/End: Original strand, 31304065 - 31304102
Alignment:
Q  47 tgagccaaagatttcgtcatatacaatgactccaactt 84  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  31304065 tgagccaaagatttcgtcatgtacaatgactccgactt 31304102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 295; Significance: 1e-166; HSPs: 35)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 295; E-Value: 1e-166
Query Start/End: Original strand, 19 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 14738232 - 14737885
Alignment:
Q  19 atagagttgttgcttcaagagttgcctatgagccaaagatttcgtcatatacaatgactccaacttcgcccacatcgatgccgcggtagcttctctcgcg 118  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  14738232 atagagttgttgcttcaagagttgcctatgagccaaagatttcgtcatatacaatgactccaacttcgccaacatcgatgccgcggtagcttctctcgcg 14738133  T
Q  119 acatcccttaagaccttatctctgagacataaaacaatggcactctttgccttgtttaccatctcacgcttctcctcttgtgtcaaggttgccggcatcg 218  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  14738132 acatcccttaagaccttatctccgagacataagacaatggcactctttgccttgtctaccatctcacgcttctcctcttgtgtcaaggttgccggcatct 14738033  T
Q  219 ccgcttcaccctttaatgcttctacacacnnnnnnngtgtcaaaaccgcttgcatcttaaccttccacaacccgaaatcattacttccggtgaacttctc 318  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||       ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14738032 ccgcttcaccctttaatgcttctacacacttttgttgtgtcaaaatcgcttgcatcttaaccttctacaacccgaaatcattacttccggtgaacttctc 14737933  T
Q  319 gatgtcccactttgaccccatgataccaactatcaataactcctatgc 366  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  14737932 gatgtcccactttgaccccatgataccaactatcaataacgcctatgc 14737885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 283; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 19 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 33331106 - 33330759
Alignment:
Q  19 atagagttgttgcttcaagagttgcctatgagccaaagatttcgtcatatacaatgactccaacttcgcccacatcgatgccgcggtagcttctctcgcg 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  33331106 atagagttgttgcttcaagagttgcctatgagccaaagatttcatcatatacaatgactccaactttgcccacatcgatgctgcggtagcttctctcgcg 33331007  T
Q  119 acatcccttaagaccttatctctgagacataaaacaatggcactctttgccttgtttaccatctcacgcttctcctcttgtgtcaaggttgccggcatcg 218  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33331006 acatcccttaagaccttatctccgagacataagacaatggcactctttgccttgtctaccatctcacgcttctcctcttgtgtcaaggttgccggcatcg 33330907  T
Q  219 ccgcttcaccctttaatgcttctacacacnnnnnnngtgtcaaaaccgcttgcatcttaaccttccacaacccgaaatcattacttccggtgaacttctc 318  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||       ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33330906 ccgcttcacccttcaatgcttctacacacttttgttgtgtcaataccgcttgcatcttaaccttccataacccgaaatcattacttccggtgaacttctc 33330807  T
Q  319 gatgtcccactttgaccccatgataccaactatcaataactcctatgc 366  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  33330806 gatgtcccactttgaccccatgataccaactatcaatcacgcctatgc 33330759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 19 - 351
Target Start/End: Original strand, 18232287 - 18232619
Alignment:
Q  19 atagagttgttgcttcaagagttgcctatgagccaaagatttcgtcatatacaatgactccaacttcgcccacatcgatgccgcggtagcttctctcgcg 118  Q
    |||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||| || |||||||| |||||||    
T  18232287 atagagttgttgtttcaagagtttcctatgagccaacgattttgtcatgtacaatgactccaacgtagcccacatcgatgtcgtggtagcttttctcgcg 18232386  T
Q  119 acatcccttaagaccttatctctgagacataaaacaatggcactctttgccttgtttaccatctcacgcttctcctcttgtgtcaaggttgccggcatcg 218  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||| || |||||||||||||||| ||||||||||  | | ||||||||    
T  18232387 acatcccttaagaccttatctccgagacataaaacaatggcacttttagccttgtctatcatctcacgcttctccgcttgtgtcaaattcgtcggcatcg 18232486  T
Q  219 ccgcttcaccctttaatgcttctacacacnnnnnnngtgtcaaaaccgcttgcatcttaaccttccacaacccgaaatcattacttccggtgaacttctc 318  Q
    ||| |||||| || |||||||||||||||       ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  18232487 ccgtttcacctttcaatgcttctacacacttttgttgtgtcaaaaccgcttgcatcttaaccttccacaacccaaaatcattacttccggtgaacttctc 18232586  T
Q  319 gatgtcccactttgaccccatgataccaactat 351  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  18232587 gatgtcccactttgaacccatgataccaactat 18232619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 20 - 341
Target Start/End: Original strand, 9035725 - 9036046
Alignment:
Q  20 tagagttgttgcttcaagagttgcctatgagccaaagatttcgtcatatacaatgactccaacttcgcccacatcgatgccgcggtagcttctctcgcga 119  Q
    ||||||||||| ||||| |||| |||||| |||||||||||| |||| |||||||||| | |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||    
T  9035725 tagagttgttgtttcaacagtttcctatgggccaaagatttcatcatgtacaatgacttcgactttgcccacatcgatgtcgcggtagcttctctcgtga 9035824  T
Q  120 catcccttaagaccttatctctgagacataaaacaatggcactctttgccttgtttaccatctcacgcttctcctcttgtgtcaaggttgccggcatcgc 219  Q
    ||||||| || | |||||||||||||||||| |||||  |||| |||||||| | || ||||  ||| |||||  ||||| |||| || | || |||| |    
T  9035825 catccctcaaaatcttatctctgagacataagacaatatcactttttgccttatctatcatcaaacgtttctctgcttgtttcaaagtagtcgccatctc 9035924  T
Q  220 cgcttcaccctttaatgcttctacacacnnnnnnngtgtcaaaaccgcttgcatcttaaccttccacaacccgaaatcattacttccggtgaacttctcg 319  Q
    |||||||||| |||||||||| ||||||       ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||     
T  9035925 cgcttcacccattaatgcttccacacacttttgtggtgccaaaatcgcttgcatcttaaccttccacaacctgaaatcattacttctagtgaacttctca 9036024  T
Q  320 atgtcccactttgaccccatga 341  Q
    |||||||||||||| |||||||    
T  9036025 atgtcccactttgaacccatga 9036046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 38 - 310
Target Start/End: Original strand, 24078354 - 24078628
Alignment:
Q  38 agttgcctatgagccaaagatttcgtcatatacaatgactccaacttcgcccacatcgatgccgcggtagcttctctcgcgacatcccttaagaccttat 137  Q
    |||| |||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||| || |||||||| |||||| || |||||| ||  |||||||||||||| ||||| |    
T  24078354 agttacctatgagccaaagttttcgtcatgtataatgactccaaattagcccacattgatgccacgatagcttttcctgcgacatcccttaaaaccttgt 24078453  T
Q  138 ctctgagacataaaacaa--tggcactctttgccttgtttaccatctcacgcttctcctcttgtgtcaaggttgccggcatcgccgcttcaccctttaat 235  Q
    |||  | ||||||||  |  ||| |||||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||    
T  24078454 ctccaaaacataaaaataagtggtactctttgccttgtctagcatctcacgcttctccgcttgtgtcaaggtagccgacatcgcagcttcaccctttaat 24078553  T
Q  236 gcttctacacacnnnnnnngtgtcaaaaccgcttgcatcttaaccttccacaacccgaaatcattacttccggtg 310  Q
    ||||| ||||||       ||||||||||| ||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  24078554 gcttccacacacttttgttgtgtcaaaaccactttcatcttaaccttccatagcccgaaatcattacttccggtg 24078628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 20 - 340
Target Start/End: Original strand, 5408501 - 5408821
Alignment:
Q  20 tagagttgttgcttcaagagttgcctatgagccaaagatttcgtcatatacaatgactccaacttcgcccacatcgatgccgcggtagcttctctcgcga 119  Q
    |||||||||||||| | || |||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||| ||||||   |||  ||||||    
T  5408501 tagagttgttgcttaaggaattgcctatgagccaaagactttgtcatatacaacgactccaactttgaccacatcgatgtcgcggttagttccttcgcga 5408600  T
Q  120 catcccttaagaccttatctctgagacataaaacaatggcactctttgccttgtttaccatctcacgcttctcctcttgtgtcaaggttgccggcatcgc 219  Q
    ||||||| || || || || | ||| || || |||||||||||| | |||||||  ||||||||   ||||||| |||||| || |||   | | | | |    
T  5408601 catccctcaaaactttgtccccgaggcacaagacaatggcactcctagccttgtccaccatctcggtcttctccgcttgtgacacggtgatcagtaaccc 5408700  T
Q  220 cgcttcaccctttaatgcttctacacacnnnnnnngtgtcaaaaccgcttgcatcttaaccttccacaacccgaaatcattacttccggtgaacttctcg 319  Q
      |||||||||| || ||||   |||||       || |||| |||||||||||||| |||||||| ||||| ||||| ||| | ||||||||||||||     
T  5408701 accttcacccttcaaagctttctcacacttttgttgtatcaacaccgcttgcatcttcaccttccataacccaaaatcgttaatcccggtgaacttctca 5408800  T
Q  320 atgtcccactttgaccccatg 340  Q
    || ||||||||||| ||||||    
T  5408801 atatcccactttgaacccatg 5408821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 20 - 340
Target Start/End: Original strand, 5412826 - 5413146
Alignment:
Q  20 tagagttgttgcttcaagagttgcctatgagccaaagatttcgtcatatacaatgactccaacttcgcccacatcgatgccgcggtagcttctctcgcga 119  Q
    |||||||||||||| | || |||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||| ||||||   |||  ||||||    
T  5412826 tagagttgttgcttaaggaattgcctatgagccaaagactttgtcatatacaacgactccaactttgaccacatcgatgtcgcggttagttccttcgcga 5412925  T
Q  120 catcccttaagaccttatctctgagacataaaacaatggcactctttgccttgtttaccatctcacgcttctcctcttgtgtcaaggttgccggcatcgc 219  Q
    ||||||| || || || || | ||| || || |||||||||||| | |||||||  ||||||||   ||||||| |||||| || |||   | | | | |    
T  5412926 catccctcaaaactttgtccccgaggcacaagacaatggcactcctagccttgtccaccatctcggtcttctccgcttgtgacacggtgatcagtaaccc 5413025  T
Q  220 cgcttcaccctttaatgcttctacacacnnnnnnngtgtcaaaaccgcttgcatcttaaccttccacaacccgaaatcattacttccggtgaacttctcg 319  Q
      |||||||||| || ||||   |||||       || |||| |||||||||||||| |||||||| ||||| ||||| ||| | ||||||||||||||     
T  5413026 accttcacccttcaaagctttctcacacttttgttgtatcaacaccgcttgcatcttcaccttccataacccaaaatcgttaatcccggtgaacttctca 5413125  T
Q  320 atgtcccactttgaccccatg 340  Q
    || ||||||||||| ||||||    
T  5413126 atatcccactttgaacccatg 5413146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 20 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 16553412 - 16553092
Alignment:
Q  20 tagagttgttgcttcaagagttgcctatgagccaaagatttcgtcatatacaatgactccaacttcgcccacatcgatgccgcggtagcttctctcgcga 119  Q
    |||||||||||||| | || ||| ||||||||||| || || ||||||||||| || |||||||| | ||| |||||||||||||| | |||  ||||||    
T  16553412 tagagttgttgcttaaggaattgtctatgagccaacgacttggtcatatacaacgattccaacttagaccatatcgatgccgcggttggttccttcgcga 16553313  T
Q  120 catcccttaagaccttatctctgagacataaaacaatggcactctttgccttgtttaccatctcacgcttctcctcttgtgtcaaggttgccggcatcgc 219  Q
    ||||||| || || || || | ||| || || |||||||| ||| | |||||||  || |||||   |||||||| ||||| || |||  |||||| |||    
T  16553312 catccctcaaaactttgtccccgaggcacaagacaatggcgctcctcgccttgtccacgatctcggtcttctccttttgtgacatggtgaccggcaacgc 16553213  T
Q  220 cgcttcaccctttaatgcttctacacacnnnnnnngtgtcaaaaccgcttgcatcttaaccttccacaacccgaaatcattacttccggtgaacttctcg 319  Q
      |||||||||| || ||||   |||||       |  |||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||   |||||||||||||      
T  16553212 accttcacccttcaaggctttctcacacttttgttgaatcaacaccgcttgcatcttcaccttccataacccgaaatcgttaagcccggtgaacttctaa 16553113  T
Q  320 atgtcccactttgaccccatg 340  Q
    || ||||||||||| ||||||    
T  16553112 atatcccactttgaacccatg 16553092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 20 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 16629968 - 16629648
Alignment:
Q  20 tagagttgttgcttcaagagttgcctatgagccaaagatttcgtcatatacaatgactccaacttcgcccacatcgatgccgcggtagcttctctcgcga 119  Q
    |||||||||||||| | || ||| ||||||||||| || || ||||||||||| || |||||||| | ||| |||||||||||||| | |||  ||||||    
T  16629968 tagagttgttgcttaaggaattgtctatgagccaacgacttggtcatatacaacgattccaacttagaccatatcgatgccgcggttggttccttcgcga 16629869  T
Q  120 catcccttaagaccttatctctgagacataaaacaatggcactctttgccttgtttaccatctcacgcttctcctcttgtgtcaaggttgccggcatcgc 219  Q
    ||||||| || || || || | ||| || || |||||||| ||| | |||||||  || |||||   |||||||| ||||| || |||  |||||| |||    
T  16629868 catccctcaaaactttgtccccgaggcacaagacaatggcgctcctcgccttgtccacgatctcggtcttctccttttgtgacatggtgaccggcaacgc 16629769  T
Q  220 cgcttcaccctttaatgcttctacacacnnnnnnngtgtcaaaaccgcttgcatcttaaccttccacaacccgaaatcattacttccggtgaacttctcg 319  Q
      |||||||||| || ||||   |||||       |  |||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||   |||||||||||||      
T  16629768 accttcacccttcaaggctttctcacacttttgttgaatcaacaccgcttgcatcttcaccttccataacccgaaatcgttaagcccggtgaacttctaa 16629669  T
Q  320 atgtcccactttgaccccatg 340  Q
    || ||||||||||| ||||||    
T  16629668 atatcccactttgaacccatg 16629648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 20 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 34165620 - 34165300
Alignment:
Q  20 tagagttgttgcttcaagagttgcctatgagccaaagatttcgtcatatacaatgactccaacttcgcccacatcgatgccgcggtagcttctctcgcga 119  Q
    |||||||||||||| | || ||||||||||||||| || || ||||||||||| || |||||||| | ||| ||||||||||| || | |||  ||||||    
T  34165620 tagagttgttgcttaaggaattgcctatgagccaacgacttggtcatatacaacgattccaacttagaccatatcgatgccgcagttggttccttcgcga 34165521  T
Q  120 catcccttaagaccttatctctgagacataaaacaatggcactctttgccttgtttaccatctcacgcttctcctcttgtgtcaaggttgccggcatcgc 219  Q
    ||||||| || || || || | ||| || |  |||||||| ||| | |||||||  ||||||||   |||||||||||||| || |||  ||||||   |    
T  34165520 catccctcaaaactttgtccccgaggcacaggacaatggcgctcctcgccttgtccaccatctcggtcttctcctcttgtgacatggtgtccggcaaacc 34165421  T
Q  220 cgcttcaccctttaatgcttctacacacnnnnnnngtgtcaaaaccgcttgcatcttaaccttccacaacccgaaatcattacttccggtgaacttctcg 319  Q
      |||||||||| || ||||   |||||       |  |||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||    ||||||||||||||     
T  34165420 gccttcacccttcaaagctttctcacacttttgttgaatcaacaccgcttgcatcttcaccttccacaacccaaaatcgttgagcccggtgaacttctca 34165321  T
Q  320 atgtcccactttgaccccatg 340  Q
    || ||||||||||| ||||||    
T  34165320 atatcccactttgaacccatg 34165300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 20 - 123
Target Start/End: Original strand, 12936724 - 12936827
Alignment:
Q  20 tagagttgttgcttcaagagttgcctatgagccaaagatttcgtcatatacaatgactccaacttcgcccacatcgatgccgcggtagcttctctcgcga 119  Q
    |||||||||||||| | || ||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||| |||||| | |||| |||| |    
T  12936724 tagagttgttgctttaggaattgccaatgagccaaagattttgtcatatacaaagactccaactttgaccacatcgatggcgcggttggttctttcgcta 12936823  T
Q  120 catc 123  Q
    ||||    
T  12936824 catc 12936827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 271 - 342
Target Start/End: Original strand, 21198602 - 21198673
Alignment:
Q  271 catcttaaccttccacaacccgaaatcattacttccggtgaacttctcgatgtcccactttgaccccatgat 342  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||    
T  21198602 catcttaactttccataacccgaaatcattacttcaggtgaacttctcgatatcccactttaaacccatgat 21198673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 20 - 183
Target Start/End: Original strand, 25462940 - 25463103
Alignment:
Q  20 tagagttgttgcttcaagagttgcctatgagccaaagatttcgtcatatacaatgactccaacttcgcccacatcgatgccgcggtagcttctctcgcga 119  Q
    |||||||||||||| | || ||||| ||||||| |||| || ||||||||||| ||||  |||||   | |||||||||||||| | | |||| |||| |    
T  25462940 tagagttgttgctttaggaattgccgatgagcctaagactttgtcatatacaaagactataactttaactacatcgatgccgcgtttggttctttcgcta 25463039  T
Q  120 catcccttaagaccttatctctgagacataaaacaatggcactctttgccttgtttaccatctc 183  Q
    |||| || || || ||||| | ||| || || |||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  25463040 catctctcaaaactttatccccgaggcacaagacaatggcactcttggccttgtctaccatctc 25463103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 20 - 111
Target Start/End: Original strand, 26067870 - 26067961
Alignment:
Q  20 tagagttgttgcttcaagagttgcctatgagccaaagatttcgtcatatacaatgactccaacttcgcccacatcgatgccgcggtagcttc 111  Q
    |||||| ||||||| | || ||||  |||||||||||| || ||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  26067870 tagagtcgttgctttaggaattgctgatgagccaaagactttgtcatatacaaagattccaactttgcccacatcgatgccgcggttgcttc 26067961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 20 - 111
Target Start/End: Complemental strand, 33309693 - 33309602
Alignment:
Q  20 tagagttgttgcttcaagagttgcctatgagccaaagatttcgtcatatacaatgactccaacttcgcccacatcgatgccgcggtagcttc 111  Q
    |||||||||||||| | || ||||| |||||||||||| || ||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||| ||||| |||||    
T  33309693 tagagttgttgctttaggaattgccgatgagccaaagactttgtcatatacaaagattccaactttgcccatatcgatgctgcggttgcttc 33309602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 258 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 16555383 - 16555301
Alignment:
Q  258 tcaaaaccgcttgcatcttaaccttccacaacccgaaatcattacttccggtgaacttctcgatgtcccactttgaccccatg 340  Q
    |||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||   |||||||||||||| || ||||||||||| ||||||    
T  16555383 tcaacaccgcttgcatcttcaccttccataacccgaaatcgttaagcccggtgaacttctcaatatcccactttgaacccatg 16555301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 258 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 16631939 - 16631857
Alignment:
Q  258 tcaaaaccgcttgcatcttaaccttccacaacccgaaatcattacttccggtgaacttctcgatgtcccactttgaccccatg 340  Q
    |||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||   |||||||||||||| || ||||||||||| ||||||    
T  16631939 tcaacaccgcttgcatcttcaccttccataacccgaaatcgttaagcccggtgaacttctcaatatcccactttgaacccatg 16631857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 20 - 126
Target Start/End: Complemental strand, 16651672 - 16651566
Alignment:
Q  20 tagagttgttgcttcaagagttgcctatgagccaaagatttcgtcatatacaatgactccaacttcgcccacatcgatgccgcggtagcttctctcgcga 119  Q
    |||||||||||||| | || ||| ||||||||||| || || ||||||||||| || |||||||| | ||| |||||||||||||| | |||  ||||||    
T  16651672 tagagttgttgcttaaggaattgtctatgagccaacgacttggtcatatacaacgattccaacttagaccatatcgatgccgcggttggttccttcgcga 16651573  T
Q  120 catccct 126  Q
    |||||||    
T  16651572 catccct 16651566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 263 - 340
Target Start/End: Original strand, 16578177 - 16578254
Alignment:
Q  263 accgcttgcatcttaaccttccacaacccgaaatcattacttccggtgaacttctcgatgtcccactttgaccccatg 340  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||   |||||||||||||| || ||||||||||| ||||||    
T  16578177 accgcttgcatcttcaccttccataacccgaaatcgttaagcccggtgaacttctcaatatcccactttgaacccatg 16578254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 263 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 16617203 - 16617126
Alignment:
Q  263 accgcttgcatcttaaccttccacaacccgaaatcattacttccggtgaacttctcgatgtcccactttgaccccatg 340  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||   |||||||||||||| || ||||||||||| ||||||    
T  16617203 accgcttgcatcttcaccttccataacccgaaatcgttaagcccggtgaacttctcaatatcccactttgaacccatg 16617126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 263 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 33309451 - 33309374
Alignment:
Q  263 accgcttgcatcttaaccttccacaacccgaaatcattacttccggtgaacttctcgatgtcccactttgaccccatg 340  Q
    ||||||| |||||| |||||||| ||||||||||| |||  |||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  33309451 accgcttccatctttaccttccataacccgaaatcgttatctccggtaaacttctcgatatcccactttgaacccatg 33309374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 40 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 12158035 - 12157875
Alignment:
Q  40 ttgcctatgagccaaagatttcgtcatatacaatgactccaacttcgcccacatcgatgccgcggtagcttctctcgcgacatcccttaagaccttatct 139  Q
    ||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||| | | |||  | ||||||||||  || || || ||     
T  12158035 ttgccaatgagccaaagactttgtcatatacaatgactccaactttgaccacatcgatgtcgcgtttggttccttagcgacatcccccaaaactttttcc 12157936  T
Q  140 ctgagacataaaacaatggcactctttgccttgtttaccatctcacgcttctcctcttgtg 200  Q
    | ||| ||||| |||||| ||||| | |||||||  ||||||||   ||||||| ||||||    
T  12157935 ccgaggcataagacaatgtcactcctagccttgtccaccatctcggtcttctccgcttgtg 12157875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 20 - 111
Target Start/End: Original strand, 26932038 - 26932129
Alignment:
Q  20 tagagttgttgcttcaagagttgcctatgagccaaagatttcgtcatatacaatgactccaacttcgcccacatcgatgccgcggtagcttc 111  Q
    |||||| ||||||| | || ||||| |||||||||||| || ||||||||||| || | |||||| ||||||| |||||||||||| |||||    
T  26932038 tagagtcgttgctttaggaattgccgatgagccaaagactttgtcatatacaaagatttcaactttgcccacaacgatgccgcggttgcttc 26932129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 20 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 28301638 - 28301309
Alignment:
Q  20 tagagttgttgcttcaagagttgcctatgagccaaagatttcgtcatatacaatgactccaacttcgcccacatcgatgccgcggtagcttctctcgcga 119  Q
    ||||| ||||| ||||| |||  ||||| ||||||||||||  |||| || |||||||||||||| ||| |||| | ||||||| ||  ||| |||||||    
T  28301638 tagagatgttgtttcaatagtgtcctattagccaaagatttaatcatgtataatgactccaacttagccaacattggtgccgcgataaattccctcgcga 28301539  T
Q  120 catcccttaagaccttatctc------tgagacataaaacaatggcactctttgccttgtttaccatctcacgcttctcctcttgtgtcaaggttgccgg 213  Q
    |||  || || |||| || ||        ||| | |||||||| |||||||||||||||| || ||||||| | |||||| ||||||||||||| || |     
T  28301538 cataactcaaaacctcatttccaggaagaagaaaaaaaacaat-gcactctttgccttgtatatcatctcaagtttctccacttgtgtcaaggtagctga 28301440  T
Q  214 catcgccgcttcaccctttaatgcttctacacacnnnnnnngtgtcaaaaccgcttgcatctta---accttccacaacccgaaatcattacttccggtg 310  Q
    ||| || |||||||||||| || |||| |||||        ||||||||||   ||||||||||   | ||||||  ||| ||||||||||  || ||||    
T  28301439 cattgcagcttcacccttt-atacttcaacaca--ttttgtgtgtcaaaactatttgcatcttaagtagcttccatcaccagaaatcattaaatctggtg 28301343  T
Q  311 aacttctcgatgtcccactttgaccccatgatac 344  Q
    |||||||||||||||| |||| | ||||||||||    
T  28301342 aacttctcgatgtcccgctttcaacccatgatac 28301309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 149 - 344
Target Start/End: Original strand, 28510570 - 28510764
Alignment:
Q  149 aaaacaatggcactctttgccttgtttaccatctcacgcttctcctcttgtgtcaaggttgccggcatcgccgcttcaccctttaatgcttctacacacn 248  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| || ||||||| | |||||| ||||||||||||| || | ||| || |||||||||||| || |||| |||||      
T  28510570 aaaacaatg-cactctttgccttgtatatcatctcaagtttctccacttgtgtcaaggtagctgacattgcagcttcacccttt-atacttcaacaca-- 28510665  T
Q  249 nnnnnngtgtcaaaaccgcttgcatctta---accttccacaacccgaaatcattacttccggtgaacttctcgatgtcccactttgaccccatgatac 344  Q
          ||||||||||   ||||||||||   | ||||||  ||| ||||||||||  || |||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||    
T  28510666 ttttgtgtgtcaaaactatttgcatcttaagtagcttccatcaccagaaatcattaaatctggtgaacttctcgatgtcccgctttcaacccatgatac 28510764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 23 - 105
Target Start/End: Complemental strand, 3395197 - 3395115
Alignment:
Q  23 agttgttgcttcaagagttgcctatgagccaaagatttcgtcatatacaatgactccaacttcgcccacatcgatgccgcggt 105  Q
    ||||||||||| | || ||||| |||||||||||| || ||||||||||| || |||||||| || ||||||||||| |||||    
T  3395197 agttgttgctttaggaattgccaatgagccaaagactttgtcatatacaaagattccaactttgcacacatcgatgcggcggt 3395115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 271 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 13879185 - 13879111
Alignment:
Q  271 catcttaaccttccacaacccgaaatcattacttccggtgaacttctcgatgtcccactttgaccccatgatacc 345  Q
    |||||| ||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||| || || |||||||| || |||||||||||    
T  13879185 catcttcaccttccacaacccgaagtcgttactaccggtgaacttttcaatatcccacttcgaacccatgatacc 13879111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 44 - 101
Target Start/End: Complemental strand, 30444073 - 30444016
Alignment:
Q  44 ctatgagccaaagatttcgtcatatacaatgactccaacttcgcccacatcgatgccg 101  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||    
T  30444073 ctatgagccaaagacttggtcatatacaacgactccaactttgaccacatcgatgccg 30444016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 271 - 330
Target Start/End: Original strand, 5165578 - 5165637
Alignment:
Q  271 catcttaaccttccacaacccgaaatcattacttccggtgaacttctcgatgtcccactt 330  Q
    |||||| ||||||||||||||||| || ||||| ||||| |||||||| |||||||||||    
T  5165578 catctttaccttccacaacccgaagtcgttactaccggtaaacttctcaatgtcccactt 5165637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 271 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 25942115 - 25942041
Alignment:
Q  271 catcttaaccttccacaacccgaaatcattacttccggtgaacttctcgatgtcccactttgaccccatgatacc 345  Q
    |||||| ||||||||||||||||| || ||||| ||||| ||||| || || |||||||| || |||||||||||    
T  25942115 catctttaccttccacaacccgaagtcgttactaccggtaaacttttcaatatcccacttcgaacccatgatacc 25942041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 263 - 340
Target Start/End: Original strand, 26068113 - 26068190
Alignment:
Q  263 accgcttgcatcttaaccttccacaacccgaaatcattacttccggtgaacttctcgatgtcccactttgaccccatg 340  Q
    ||||||| |||||| |||||||| ||||||||||| |||  |||||| |||||||| || ||| ||||||| ||||||    
T  26068113 accgcttccatctttaccttccataacccgaaatcgttatctccggtaaacttctcaatatcctactttgaacccatg 26068190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 263 - 340
Target Start/End: Original strand, 26932281 - 26932358
Alignment:
Q  263 accgcttgcatcttaaccttccacaacccgaaatcattacttccggtgaacttctcgatgtcccactttgaccccatg 340  Q
    ||| ||| |||||| |||||||| ||||| ||||| |||  |||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  26932281 acctcttccatctttaccttccataaccctaaatcgttatctccggtaaacttctcgatatcccactttgaacccatg 26932358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 23 - 105
Target Start/End: Original strand, 15534080 - 15534162
Alignment:
Q  23 agttgttgcttcaagagttgcctatgagccaaagatttcgtcatatacaatgactccaacttcgcccacatcgatgccgcggt 105  Q
    ||||||||||| | || ||||| |||||||||||| || |||||||||||  | || ||||| | ||||||||||| ||||||    
T  15534080 agttgttgctttaggacttgccaatgagccaaagactttgtcatatacaaatattcgaactttgaccacatcgatgtcgcggt 15534162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 271 - 345
Target Start/End: Original strand, 17694586 - 17694660
Alignment:
Q  271 catcttaaccttccacaacccgaaatcattacttccggtgaacttctcgatgtcccactttgaccccatgatacc 345  Q
    |||||| ||||||||||||| ||| || ||||| ||||| ||||| || || |||||||| || |||||||||||    
T  17694586 catctttaccttccacaacctgaagtcgttactaccggtaaacttttcaatatcccacttcgaacccatgatacc 17694660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 20 - 122
Target Start/End: Original strand, 28510435 - 28510537
Alignment:
Q  20 tagagttgttgcttcaagagttgcctatgagccaaagatttcgtcatatacaatgactccaacttcgcccacatcgatgccgcggtagcttctctcgcga 119  Q
    ||||| ||||| ||||| |||  ||||| ||||||||||||  |||| || |||||||||||||| ||| |||| | ||||||| ||  ||| |||||||    
T  28510435 tagagatgttgtttcaatagtgtcctattagccaaagatttaatcatgtataatgactccaacttagccaacattggtgccgcgataaattccctcgcga 28510534  T
Q  120 cat 122  Q
    |||    
T  28510535 cat 28510537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0197 (Bit Score: 291; Significance: 1e-163; HSPs: 1)
Name: scaffold0197
Description:

Target: scaffold0197; HSP #1
Raw Score: 291; E-Value: 1e-163
Query Start/End: Original strand, 19 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 14969 - 14622
Alignment:
Q  19 atagagttgttgcttcaagagttgcctatgagccaaagatttcgtcatatacaatgactccaacttcgcccacatcgatgccgcggtagcttctctcgcg 118  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14969 atagagttgttgcttcaagagttgcctatgagccaaagatttcgtcatatacaatgactccaactttgcccacatcgatgccgcggtagcttctctcgcg 14870  T
Q  119 acatcccttaagaccttatctctgagacataaaacaatggcactctttgccttgtttaccatctcacgcttctcctcttgtgtcaaggttgccggcatcg 218  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14869 acatcccttaagaccttatctccgagacataagacaatggcactctttgccttgtctaccatctcacgcttctcctcttgtgtcaaggttgccggcatcg 14770  T
Q  219 ccgcttcaccctttaatgcttctacacacnnnnnnngtgtcaaaaccgcttgcatcttaaccttccacaacccgaaatcattacttccggtgaacttctc 318  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||       ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14769 ccgcttcacccttcaatgcttctacacacttttgttgtgtcaataccgcttgcatcttaaccttccataacccgaaatcattacttccggtgaacttctc 14670  T
Q  319 gatgtcccactttgaccccatgataccaactatcaataactcctatgc 366  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  14669 gatgtcccactttgaccccatgataccaactatcaatcacgcctatgc 14622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 291; Significance: 1e-163; HSPs: 27)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 291; E-Value: 1e-163
Query Start/End: Original strand, 19 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 10684924 - 10684577
Alignment:
Q  19 atagagttgttgcttcaagagttgcctatgagccaaagatttcgtcatatacaatgactccaacttcgcccacatcgatgccgcggtagcttctctcgcg 118  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10684924 atagagttgttgcttcaagagttgcctatgagccaaagatttcgtcatatacaatgactccaactttgcccacatcgatgccgcggtagcttctctcgcg 10684825  T
Q  119 acatcccttaagaccttatctctgagacataaaacaatggcactctttgccttgtttaccatctcacgcttctcctcttgtgtcaaggttgccggcatcg 218  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10684824 acatcccttaagaccttatctccgagacataagacaatggcactctttgccttgtctaccatctcacgcttctcctcttgtgtcaaggttgccggcatcg 10684725  T
Q  219 ccgcttcaccctttaatgcttctacacacnnnnnnngtgtcaaaaccgcttgcatcttaaccttccacaacccgaaatcattacttccggtgaacttctc 318  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||       ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10684724 ccgcttcacccttcaatgcttctacacacttttgttgtgtcaataccgcttgcatcttaaccttccataacccgaaatcattacttccggtgaacttctc 10684625  T
Q  319 gatgtcccactttgaccccatgataccaactatcaataactcctatgc 366  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  10684624 gatgtcccactttgaccccatgataccaactatcaatcacgcctatgc 10684577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 270; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 20 - 366
Target Start/End: Original strand, 35744818 - 35745164
Alignment:
Q  20 tagagttgttgcttcaagagttgcctatgagccaaagatttcgtcatatacaatgactccaacttcgcccacatcgatgccgcggtagcttctctcgcga 119  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35744818 tagagttgttgcttcaagagttgtctatgagccaaagatttcgtcatatacaatgactccaactttgcccacatcgatgccgcggtagcttctctcgcga 35744917  T
Q  120 catcccttaagaccttatctctgagacataaaacaatggcactctttgccttgtttaccatctcacgcttctcctcttgtgtcaaggttgccggcatcgc 219  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  35744918 catcccttaagaccttatctccgagacataagacaatggcactctttgccttgtctaccatctcacgcttctcctcttgtgtcaaggttgtcggcatcgc 35745017  T
Q  220 cgcttcaccctttaatgcttctacacacnnnnnnngtgtcaaaaccgcttgcatcttaaccttccacaacccgaaatcattacttccggtgaacttctcg 319  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||       ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||| |||    
T  35745018 cgcttcacccttcaatgcttctacacacttttgttgtgtcaataccgcttgcatcttaaccttccataacctgaaatcattgcttccggtgaacttatcg 35745117  T
Q  320 atgtcccactttgaccccatgataccaactatcaataactcctatgc 366  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  35745118 atgtcccactttgaccccatgataccaactatcaatcacgcctatgc 35745164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 267; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 19 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 18853823 - 18853476
Alignment:
Q  19 atagagttgttgcttcaagagttgcctatgagccaaagatttcgtcatatacaatgactccaacttcgcccacatcgatgccgcggtagcttctctcgcg 118  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  18853823 atagagttgttgtttcaagagttgcctatgagccaaagatttcgtcatatacaatgactccaatttagcccacatcgatgccgcggttgcttctctcgcg 18853724  T
Q  119 acatcccttaagaccttatctctgagacataaaacaatggcactctttgccttgtttaccatctcacgcttctcctcttgtgtcaaggttgccggcatcg 218  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |    
T  18853723 acatcccttaagaccttatctccgagacataaaacaatagcactctttgccttgtctaccatctcacgcttctcctcttgtgtcaaagttgccggcatag 18853624  T
Q  219 ccgcttcaccctttaatgcttctacacacnnnnnnngtgtcaaaaccgcttgcatcttaaccttccacaacccgaaatcattacttccggtgaacttctc 318  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||||       |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  18853623 ccgcttcacccttcaatgcttctaaacactttttttgtgtcaaaaccgcttgcatcttaaccttccacaatccgaaatcattacttccggtgaacttctc 18853524  T
Q  319 gatgtcccactttgaccccatgataccaactatcaataactcctatgc 366  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  18853523 gatgtcccactttgaacccatgataccaactaccaataacgcctatgc 18853476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 23 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 23800217 - 23799891
Alignment:
Q  23 agttgttgcttcaagagttgcctatgagccaaagatttcgtcatatacaatgactccaacttcgcccacatcgatgccgcggtagcttctctcgcgacat 122  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||| || | ||||||||||||||| |||| ||    
T  23800217 agttgttgtttcaagagttgcctatgagccaacgatttcgtcatgtacaatgaatccaacttagcccacatagacgtcgcggtagcttctcttgcgatat 23800118  T
Q  123 cccttaagaccttatctctgagacataaaacaatggcactctttgccttgtttaccatctcacgcttctcctcttgtgtcaaggttgccggcatcgccgc 222  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||| ||||||||||  | ||||| |||||| |    
T  23800117 cccttaagaccttatctccgagacataaaacaatggcactttttgccttgtctatcatctcacgcttctccgcttgtgtcaaactcgccgg-atcgccac 23800019  T
Q  223 ttcaccctttaatgcttctacacacnnnnnnngtgtcaaaaccgcttgcatcttaaccttccacaacccgaaatcattacttccggtgaacttctcgatg 322  Q
    ||||||||| |||||||||||||||       ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23800018 ttcacccttcaatgcttctacacacttttgttgtgtcaaaaccgcttgcatcttaaccttccacaacccaaaatcattacttccggtgaacttctcgatg 23799919  T
Q  323 tcccactttgaccccatgataccaacta 350  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  23799918 tcccactttgaacccatgataccaacta 23799891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 20 - 344
Target Start/End: Original strand, 6813121 - 6813445
Alignment:
Q  20 tagagttgttgcttcaagagttgcctatgagccaaagatttcgtcatatacaatgactccaacttcgcccacatcgatgccgcggtagcttctctcgcga 119  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||| ||| |||||||    
T  6813121 tagagttgttgtttcaagagtttcctatgagccaacgatttcgtcatgtacaatgactccaacttagcccacattgatgtcgcggtagattccctcgcga 6813220  T
Q  120 catcccttaagaccttatctctgagacataaaacaatggcactctttgccttgtttaccatctcacgcttctcctcttgtgtcaaggttgccggcatcgc 219  Q
    |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||    
T  6813221 catcccttaaaatcttatctctgagacataaaacaatggcactctttgccttgtctatcatctcacgcttctccgcttgtgtcaagtttgctggcatcgc 6813320  T
Q  220 cgcttcaccctttaatgcttctacacacnnnnnnngtgtcaaaaccgcttgcatcttaaccttccacaacccgaaatcattacttccggtgaacttctcg 319  Q
    ||||||||| || |||||||||||| |        ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||    
T  6813321 cgcttcacctttcaatgcttctacaaaattttgttgtgtcaaaaccgctttcatcttaaccttccacaacccgaaatcattacttctagttaacttctcg 6813420  T
Q  320 atgtcccactttgaccccatgatac 344  Q
    |||||||||||||| ||||||||||    
T  6813421 atgtcccactttgaacccatgatac 6813445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 19 - 187
Target Start/End: Original strand, 26300765 - 26300933
Alignment:
Q  19 atagagttgttgcttcaagagttgcctatgagccaaagatttcgtcatatacaatgactccaacttcgcccacatcgatgccgcggtagcttctctcgcg 118  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  26300765 atagagttgttgtttcaagagttgtctatgagccaaagattttgtcatgtacaatgactccaacttagcccacatcaatgctgcggtagcttctctcgcg 26300864  T
Q  119 acatcccttaagaccttatctctgagacataaaacaatggcactctttgccttgtttaccatctcacgc 187  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||| || ||||||||||    
T  26300865 acatcccttaagatcttatctccgagacataaaacaatagcactctttaccttgtctatcatctcacgc 26300933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 20 - 340
Target Start/End: Original strand, 34255938 - 34256258
Alignment:
Q  20 tagagttgttgcttcaagagttgcctatgagccaaagatttcgtcatatacaatgactccaacttcgcccacatcgatgccgcggtagcttctctcgcga 119  Q
    |||||||||||||| | || |||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||  ||||| | |||  ||||||    
T  34255938 tagagttgttgcttaaggaattgcctatgagccaaagacttggtcatatacaacgactccaactttgaccacatcgatgttgcggttggttccttcgcga 34256037  T
Q  120 catcccttaagaccttatctctgagacataaaacaatggcactctttgccttgtttaccatctcacgcttctcctcttgtgtcaaggttgccggcatcgc 219  Q
    ||||||| || || || || | ||| || || |||||||||||| | |||||||  ||||||||   ||||||| |||||| || |||  |||| | |||    
T  34256038 catccctcaaaactttgtccccgaggcacaagacaatggcactcatagccttgtccaccatctcggtcttctccgcttgtgacatggtgaccggtaacgc 34256137  T
Q  220 cgcttcaccctttaatgcttctacacacnnnnnnngtgtcaaaaccgcttgcatcttaaccttccacaacccgaaatcattacttccggtgaacttctcg 319  Q
      |||||||||| || ||||   |||||       || |||| |||| ||||||||| |||||||| ||||| ||||| ||| | ||||||||||||||     
T  34256138 accttcacccttcaaagctttctcacacttttgttgtatcaacaccgtttgcatcttcaccttccataacccaaaatcgttaatcccggtgaacttctca 34256237  T
Q  320 atgtcccactttgaccccatg 340  Q
    || ||||||||||| ||||||    
T  34256238 atatcccactttgaacccatg 34256258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 20 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 4732394 - 4732081
Alignment:
Q  20 tagagttgttgcttcaagagttgcctatgagccaaagatttcgtcatatacaatgactccaacttcgcccacatcgatgccgcggtagcttctctcgcga 119  Q
    |||||||||||||| | || |||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||| | ||||||||| ||| |||||| |||  ||||||    
T  4732394 tagagttgttgcttaaggaattgcctatgagccaaagacttggtcatatacaatgtctccaactttgaccacatcgacgccacggtaggttccttcgcga 4732295  T
Q  120 catcccttaagaccttatctctgagacataaaacaatggcactctttgccttgtttaccatctcacgcttctcctcttgtgtcaaggttgccggcatcgc 219  Q
    ||||||| || || || || | ||| || |  |||||| ||||| | |||||||  || |||||   ||||||| ||||||||| |||  |||||| |||    
T  4732294 catccctcaaaactttgtcaccgaggcacatgacaatgacactcctagccttgtccacaatctcggtcttctccgcttgtgtcatggtgaccggcaacgc 4732195  T
Q  220 cgcttcaccctttaatgcttctacacacnnnnnnngtgtcaaaaccgcttgcatcttaaccttccacaacccgaaatcattacttccggtgaacttctcg 319  Q
      |||||||||| || ||||   | |||       || |||| ||| |||||||||| |||||||| ||||| ||||| ||| ||||| ||||||||||     
T  4732194 accttcacccttcaaagctttctcgcacttttgttgtatcaacacctcttgcatcttcaccttccataacccaaaatcgttaattccgatgaacttctca 4732095  T
Q  320 atgtcccactttga 333  Q
    || |||||||||||    
T  4732094 atatcccactttga 4732081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 19 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 5591622 - 5591478
Alignment:
Q  19 atagagttgttgcttcaagagttgcctatgagccaaagatttcgtcatatacaatgactccaacttcgcccacatcgatgccgcggtagcttctctcgcg 118  Q
    ||||||||||||||| | || |||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||| | |||  |||||    
T  5591622 atagagttgttgcttaaggaattgcctatgagccaaagacttgatcatatacaatgactccaactttgaccacatcgacgccgcggttggttccttcgcg 5591523  T
Q  119 acatcccttaagaccttatctctgagacataaaacaatggcactc 163  Q
    |||||||| || || ||||| | ||| || || ||||||||||||    
T  5591522 acatccctcaaaactttatcaccgaggcacaagacaatggcactc 5591478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 40 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 43080441 - 43080141
Alignment:
Q  40 ttgcctatgagccaaagatttcgtcatatacaatgactccaacttcgcccacatcgatgccgcggtagcttctctcgcgacatcccttaagaccttatct 139  Q
    ||||| |||||||||||| || ||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||| |||||  | || || || || || || ||||||    
T  43080441 ttgccgatgagccaaagactttgtcatatacaaagattccaactttgcccacatcgatgccgcggttgcttcctttgctacttctctcaaaactttatct 43080342  T
Q  140 ctgagacataaaacaatggcactctttgccttgtttaccatctcacgcttctcctcttgtgtcaaggttgccggcatcgccgcttcaccctttaatgctt 239  Q
    | ||| || || |||||||||||| | |||||||  ||||||||   ||||||| |||||| || |||  |||  | ||   |||||||||| || ||||    
T  43080341 ccgaggcacaagacaatggcactcctggccttgtccaccatctcggtcttctccgcttgtgacatggtgaccgataacgaaccttcacccttcaaagctt 43080242  T
Q  240 ctacacacnnnnnnngtgtcaaaaccgcttgcatcttaaccttccacaacccgaaatcattacttccggtgaacttctcgatgtcccactttgaccccat 339  Q
       |||||       || | || ||||||| |||||| |||||||| ||||||||||| |||  |||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  43080241 tctcacacttttgttgtattaacaccgcttccatctttaccttccataacccgaaatcgttatctccggtaaacttctcgatatcccactttgaacccat 43080142  T
Q  340 g 340  Q
    |    
T  43080141 g 43080141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 20 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 18811567 - 18811247
Alignment:
Q  20 tagagttgttgcttcaagagttgcctatgagccaaagatttcgtcatatacaatgactccaacttcgcccacatcgatgccgcggtagcttctctcgcga 119  Q
    |||||||||||||| | || ||||| |||||||||||| || ||||||||||| || |||| ||| |||||||||||||||||||| |||||  | || |    
T  18811567 tagagttgttgctttaggaattgccgatgagccaaagactttgtcatatacaaagattccatctttgcccacatcgatgccgcggttgcttcctttgcta 18811468  T
Q  120 catcccttaagaccttatctctgagacataaaacaatggcactctttgccttgtttaccatctcacgcttctcctcttgtgtcaaggttgccggcatcgc 219  Q
    | || || || || ||||| | ||| || || |||||| |||||   |||||||  ||||||||   ||||||| |||||| || |||  |||| | ||     
T  18811467 cttctctcaaaactttatccccgaggcacaagacaatgacactccaggccttgtccaccatctcggtcttctccgcttgtgacatggtgaccggtaacga 18811368  T
Q  220 cgcttcaccctttaatgcttctacacacnnnnnnngtgtcaaaaccgcttgcatcttaaccttccacaacccgaaatcattacttccggtgaacttctcg 319  Q
      |||||||||| || ||||   |||||       || | || |||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||  |||||| ||||||||     
T  18811367 accttcacccttcaaagctttctcacacttttgctgtattaacaccgcttgcatctttaccttccataacccgaaatcgttatctccggtaaacttctca 18811268  T
Q  320 atgtcccactttgaccccatg 340  Q
    || || |||||||| ||||||    
T  18811267 atatctcactttgaacccatg 18811247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 20 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 450843 - 450690
Alignment:
Q  20 tagagttgttgcttcaagagttgcctatgagccaaagatttcgtcatatacaatgactccaacttcgcccacatcgatgccgcggtagcttctctcgcga 119  Q
    ||||||||||| || || ||||  |||||||||||||||||||| || |||||||||||||| || ||| ||||||||    || ||||||| ||   ||    
T  450843 tagagttgttgtttgaaaagttatctatgagccaaagatttcgttatgtacaatgactccaatttagccgacatcgattatacgatagcttccctaatga 450744  T
Q  120 catcccttaagaccttatctctgagacataaaacaatggcactctttgccttgt 173  Q
    |||||||||| |||||||||   ||||||||||| || ||||| ||||||||||    
T  450743 catcccttaaaaccttatcttcaagacataaaactatagcactttttgccttgt 450690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 20 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 27827844 - 27827664
Alignment:
Q  20 tagagttgttgcttcaagagttgcctatgagccaaagatttcgtcatatacaatgactccaacttcgcccacatcgatgccgcggtagcttctctcgcga 119  Q
    |||||| ||||||| | || ||||| |||||||||||| || ||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||| |||||  | || |    
T  27827844 tagagtcgttgctttaggaattgccgatgagccaaagactttgtcatatacaaagattccaactttgcccacatcgatgccgcggttgcttcctttgcta 27827745  T
Q  120 catcccttaagaccttatctctgagacataaaacaatggcactctttgccttgtttaccatctcacgcttctcctcttgtg 200  Q
    | || || || || ||||| | ||| || || |||||||||||| | |||||||  ||||||||   ||||||| ||||||    
T  27827744 cttctctcaaaactttatccccgaggcacaagacaatggcactcctagccttgtccaccatctcggtcttctccacttgtg 27827664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 20 - 102
Target Start/End: Complemental strand, 15069426 - 15069344
Alignment:
Q  20 tagagttgttgcttcaagagttgcctatgagccaaagatttcgtcatatacaatgactccaacttcgcccacatcgatgccgc 102  Q
    |||||||||||||| | || ||||| |||||||||||| || ||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||    
T  15069426 tagagttgttgctttaggaattgccgatgagccaaagactttgtcatatacaaagattccaactttgcccacatcgatgccgc 15069344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 271 - 345
Target Start/End: Original strand, 4823436 - 4823510
Alignment:
Q  271 catcttaaccttccacaacccgaaatcattacttccggtgaacttctcgatgtcccactttgaccccatgatacc 345  Q
    |||||| ||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||| || || |||||||| || |||||||||||    
T  4823436 catcttcaccttccacaacccgaagtcgttactaccggtgaacttttcaatatcccacttcgaacccatgatacc 4823510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 20 - 106
Target Start/End: Complemental strand, 17848385 - 17848299
Alignment:
Q  20 tagagttgttgcttcaagagttgcctatgagccaaagatttcgtcatatacaatgactccaacttcgcccacatcgatgccgcggta 106  Q
    |||||||||||||| | || || || ||||||||||||  | ||||||||||| ||||||||||| | |||||||||| ||||||||    
T  17848385 tagagttgttgctttaggaatttccgatgagccaaagagattgtcatatacaaagactccaactttgaccacatcgattccgcggta 17848299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 271 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 28328354 - 28328280
Alignment:
Q  271 catcttaaccttccacaacccgaaatcattacttccggtgaacttctcgatgtcccactttgaccccatgatacc 345  Q
    |||||| ||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||| || || |||||||| || |||||||||||    
T  28328354 catcttcaccttccacaacccgaagtcgttactaccggtgaacttttcaatatcccacttcgaacccatgatacc 28328280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 271 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 28891210 - 28891136
Alignment:
Q  271 catcttaaccttccacaacccgaaatcattacttccggtgaacttctcgatgtcccactttgaccccatgatacc 345  Q
    |||||| ||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||| || || |||||||| || |||||||||||    
T  28891210 catctttaccttccacaacccgaagtcgttactaccggtgaacttttcaatatcccacttcgaacccatgatacc 28891136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 46 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 21481329 - 21481035
Alignment:
Q  46 atgagccaaagatttcgtcatatacaatgactccaacttcgcccacatcgatgccgcggtagcttctctcgcgacatcccttaagaccttatctctgaga 145  Q
    |||||||||||| || |||||||||||  | || ||||| | |||||| |||| |||||| | |||  |||| || || || || |  ||||||| |||     
T  21481329 atgagccaaagactttgtcatatacaaatattcgaactttgaccacattgatgtcgcggttggttcattcgctacttctctcaaaaatttatctccgagg 21481230  T
Q  146 cataaaacaatggcactctttgccttgtttaccatctcacgcttctcctcttgtgtcaaggttgccggcatcgccgcttcaccctttaatgcttctacac 245  Q
    || ||||||||||||||||| ||||||   ||||||||   ||||||| |||||| || |||  |||| | | |  |||||||||| || ||||   |||    
T  21481229 cacaaaacaatggcactcttggccttgcccaccatctcgatcttctccgcttgtgacatggtgaccggtaacacaccttcacccttcaaagctttctcac 21481130  T
Q  246 acnnnnnnngtgtcaaaaccgcttgcatcttaaccttccacaacccgaaatcattacttccggtgaacttctcgatgtcccactttgaccccatg 340  Q
    ||       || | |||||||||| |||||| |||||||| ||||| ||||| |||  |||||| |||||||| || ||||||||||| ||||||    
T  21481129 acttttgttgtattaaaaccgcttccatctttaccttccataacccaaaatcgttatctccggtaaacttctcaatatcccactttgaacccatg 21481035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 271 - 345
Target Start/End: Original strand, 16756995 - 16757069
Alignment:
Q  271 catcttaaccttccacaacccgaaatcattacttccggtgaacttctcgatgtcccactttgaccccatgatacc 345  Q
    |||||| ||||||||||||| ||| || ||||| ||||||||||| || || |||||||| || |||||||||||    
T  16756995 catcttcaccttccacaacctgaagtcgttactaccggtgaacttttcaatatcccacttcgaacccatgatacc 16757069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 258 - 340
Target Start/End: Original strand, 18105746 - 18105828
Alignment:
Q  258 tcaaaaccgcttgcatcttaaccttccacaacccgaaatcattacttccggtgaacttctcgatgtcccactttgaccccatg 340  Q
    |||| ||||||| |||||| | |||||| ||||  |||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||| | ||||||    
T  18105746 tcaacaccgcttacatcttcatcttccataacctaaaatcattccttccggtgaacttctcaatatcccacttttaacccatg 18105828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 20 - 98
Target Start/End: Original strand, 31577768 - 31577846
Alignment:
Q  20 tagagttgttgcttcaagagttgcctatgagccaaagatttcgtcatatacaatgactccaacttcgcccacatcgatg 98  Q
    |||||||||||||| | || ||||| | |||||||||| || ||||||||||  ||||||||||| | |||||||||||    
T  31577768 tagagttgttgctttaggaattgccgaagagccaaagactttgtcatatacacagactccaactttgaccacatcgatg 31577846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 263 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 15069183 - 15069106
Alignment:
Q  263 accgcttgcatcttaaccttccacaacccgaaatcattacttccggtgaacttctcgatgtcccactttgaccccatg 340  Q
    ||||||| |||||| |||||||| ||||| ||||| |||  |||||| |||||||| || ||||||||||| ||||||    
T  15069183 accgcttccatctttaccttccataacccaaaatcgttatctccggtaaacttctcaatatcccactttgaacccatg 15069106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 263 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 41383276 - 41383195
Alignment:
Q  263 accgcttgcatcttaaccttccacaacccgaaatcattacttccggtgaacttctcgatgtcccactttgaccccatgatac 344  Q
    ||||||| |||||| |||||||| ||| | ||||| |||  |||||| |||||||| || ||||||||||| ||||||||||    
T  41383276 accgcttccatctttaccttccataactcaaaatcgttatctccggtaaacttctcaatatcccactttgaacccatgatac 41383195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 271 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 21034314 - 21034240
Alignment:
Q  271 catcttaaccttccacaacccgaaatcattacttccggtgaacttctcgatgtcccactttgaccccatgatacc 345  Q
    |||||| |||||||||||||| || || ||||| ||||| ||||| || || |||||||| || |||||||||||    
T  21034314 catctttaccttccacaacccaaagtctttactaccggtaaacttttcaatatcccacttcgaacccatgatacc 21034240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 263 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 27827601 - 27827524
Alignment:
Q  263 accgcttgcatcttaaccttccacaacccgaaatcattacttccggtgaacttctcgatgtcccactttgaccccatg 340  Q
    ||||||| |||||| |||||||| || || ||||| |||  |||||| |||||||| || ||||||||||| ||||||    
T  27827601 accgcttccatctttaccttccataatccaaaatcgttatctccggtaaacttctcaatatcccactttgaacccatg 27827524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 269 - 333
Target Start/End: Original strand, 13985551 - 13985615
Alignment:
Q  269 tgcatcttaaccttccacaacccgaaatcattacttccggtgaacttctcgatgtcccactttga 333  Q
    |||||||| || ||||| ||||| ||||  |||||||| ||||||||||| || |||||||||||    
T  13985551 tgcatcttgacattccataacccaaaattgttacttccagtgaacttctcaatatcccactttga 13985615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 291; Significance: 1e-163; HSPs: 42)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 291; E-Value: 1e-163
Query Start/End: Original strand, 19 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 24261983 - 24261636
Alignment:
Q  19 atagagttgttgcttcaagagttgcctatgagccaaagatttcgtcatatacaatgactccaacttcgcccacatcgatgccgcggtagcttctctcgcg 118  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24261983 atagagttgttgcttcaagagttgcctatgagccaaagatttcgtcatatacaatgactccaactttgcccacatcgatgccgcggtagcttctctcgcg 24261884  T
Q  119 acatcccttaagaccttatctctgagacataaaacaatggcactctttgccttgtttaccatctcacgcttctcctcttgtgtcaaggttgccggcatcg 218  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24261883 acatcccttaagaccttatctccgagacataagacaatggcactctttgccttgtctaccatctcacgcttctcctcttgtgtcaaggttgccggcatcg 24261784  T
Q  219 ccgcttcaccctttaatgcttctacacacnnnnnnngtgtcaaaaccgcttgcatcttaaccttccacaacccgaaatcattacttccggtgaacttctc 318  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||       ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24261783 ccgcttcacccttcaatgcttctacacacttttgttgtgtcaataccgcttgcatcttaaccttccataacccgaaatcattacttccggtgaacttctc 24261684  T
Q  319 gatgtcccactttgaccccatgataccaactatcaataactcctatgc 366  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  24261683 gatgtcccactttgaccccatgataccaactatcaatcacgcctatgc 24261636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 279; E-Value: 1e-156
Query Start/End: Original strand, 19 - 366
Target Start/End: Original strand, 12405764 - 12406111
Alignment:
Q  19 atagagttgttgcttcaagagttgcctatgagccaaagatttcgtcatatacaatgactccaacttcgcccacatcgatgccgcggtagcttctctcgcg 118  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  12405764 atagagttgttgcttcaagagttgcctatgagccaaagatttcgtcatatacaatgactccaacttcgcccacatcgatgtcgcggtagcttctctcgcg 12405863  T
Q  119 acatcccttaagaccttatctctgagacataaaacaatggcactctttgccttgtttaccatctcacgcttctcctcttgtgtcaaggttgccggcatcg 218  Q
    ||||||  |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12405864 acatccaataagaccttatctccgagacataacacaatggcactctttgccttgtctaccatctcacgcttctcctcttgtgtcaaggttgccggcatcg 12405963  T
Q  219 ccgcttcaccctttaatgcttctacacacnnnnnnngtgtcaaaaccgcttgcatcttaaccttccacaacccgaaatcattacttccggtgaacttctc 318  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||       |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  12405964 ccgcttcacccttcaatgcttctacacacttttgttgtgtcaaaactgcttgcatcttaaccttccacaactcgaaatcattacttccggtaaacttctc 12406063  T
Q  319 gatgtcccactttgaccccatgataccaactatcaataactcctatgc 366  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  12406064 gatgtcccactttgactccatgataccaactatcaataacgcctatgc 12406111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 279; E-Value: 1e-156
Query Start/End: Original strand, 19 - 366
Target Start/End: Original strand, 16884354 - 16884701
Alignment:
Q  19 atagagttgttgcttcaagagttgcctatgagccaaagatttcgtcatatacaatgactccaacttcgcccacatcgatgccgcggtagcttctctcgcg 118  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  16884354 atagagttgttgcttcaagagttgcctatgagccaaagatttcgtcatatacaatgactccaactttgcccacatcgatgccgcggtagcttccctcgcg 16884453  T
Q  119 acatcccttaagaccttatctctgagacataaaacaatggcactctttgccttgtttaccatctcacgcttctcctcttgtgtcaaggttgccggcatcg 218  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16884454 acatcccttaagaccttatctccgagacataagacaatggcactctttgccttgtctaccatctcacgcttctcctcttgtgtcaaggttgccggcatcg 16884553  T
Q  219 ccgcttcaccctttaatgcttctacacacnnnnnnngtgtcaaaaccgcttgcatcttaaccttccacaacccgaaatcattacttccggtgaacttctc 318  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||       ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16884554 ccgcttcacccttcaatgcttctacacacttttgttgtgtcaataccgcttgcatcttaaccttccataacccgaaatcattacttccggtgaacttctc 16884653  T
Q  319 gatgtcccactttgaccccatgataccaactatcaataactcctatgc 366  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  |||||||| || |||||||    
T  16884654 gatgtcccactttgaccccatgatacctcctatcaatcacgcctatgc 16884701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 250; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 19 - 349
Target Start/End: Original strand, 18413085 - 18413415
Alignment:
Q  19 atagagttgttgcttcaagagttgcctatgagccaaagatttcgtcatatacaatgactccaacttcgcccacatcgatgccgcggtagcttctctcgcg 118  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18413085 atagagttgttgtttcaagagttgcctatgagccaaagatttcgtcatgtacaatgactccaacttagctcacatcgatgccgcggtagcttctctcgcg 18413184  T
Q  119 acatcccttaagaccttatctctgagacataaaacaatggcactctttgccttgtttaccatctcacgcttctcctcttgtgtcaaggttgccggcatcg 218  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| || |||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||| |    
T  18413185 acatcccttaagaccttatctccgagacataaaacaatagcactctttgccttgtctatcatctcccgcttctcttcttgtgtcaaagttgccggcatag 18413284  T
Q  219 ccgcttcaccctttaatgcttctacacacnnnnnnngtgtcaaaaccgcttgcatcttaaccttccacaacccgaaatcattacttccggtgaacttctc 318  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||       |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18413285 ccgcttcacccttcaatgcttctacacacttttgttgtgtcaaaactgcttgcatcttaaccttccacaacccgaaatcattacttccggtgaacttctc 18413384  T
Q  319 gatgtcccactttgaccccatgataccaact 349  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  18413385 gatgtcccactttgaacccatgataccaact 18413415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 23 - 366
Target Start/End: Original strand, 21645456 - 21645799
Alignment:
Q  23 agttgttgcttcaagagttgcctatgagccaaagatttcgtcatatacaatgactccaacttcgcccacatcgatgccgcggtagcttctctcgcgacat 122  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  21645456 agttgttgtttcaagagttgcttatgagctaaagatttcgtcatgtacaataactccaacttagcccacatcgatgtcgcggtagcttctctcgcgacat 21645555  T
Q  123 cccttaagaccttatctctgagacataaaacaatggcactctttgccttgtttaccatctcacgcttctcctcttgtgtcaaggttgccggcatcgccgc 222  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||||   |||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  21645556 cccttaagaccttatctccgagacataaaacaatagcactctttgccttgtctatcatctcctacttctcttcttgtgtcaaagttgccggcatagccgc 21645655  T
Q  223 ttcaccctttaatgcttctacacacnnnnnnngtgtcaaaaccgcttgcatcttaaccttccacaacccgaaatcattacttccggtgaacttctcgatg 322  Q
    ||||||||| |||||||||||||||       |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21645656 ttcacccttcaatgcttctacacactttttatgtgtcaaaaccgcttgcatcttaatcttccacaacccgaaatcattacttccggtgaacttctcgatg 21645755  T
Q  323 tcccactttgaccccatgataccaactatcaataactcctatgc 366  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||| |||||||    
T  21645756 tcccactttgaacccatgatacgaactaccaataacgcctatgc 21645799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 19 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 9185817 - 9185485
Alignment:
Q  19 atagagttgttgcttcaagagttgcctatgagccaaagatttcgtcatatacaatgactccaacttcgcccacatcgatgccgcggtagcttctctcgcg 118  Q
    |||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  9185817 atagagttgttgtttcgagagctgcctatgagccaaagatttcatcacgtacaatgactccaacttagcccacatcgatgccacggtagcttccctcgcg 9185718  T
Q  119 acatcccttaagaccttatctctgagacataaaacaatggcactctttgccttgtttaccatctcacgcttctcctcttgtgtcaaggttgccggcatcg 218  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||| || |||||||||||||||| ||||||||||  | ||||||||||    
T  9185717 acatcccttaagaccttatctccgagacataaaacaatggtactcttagccttgtctatcatctcacgcttctccacttgtgtcaaattcgccggcatcg 9185618  T
Q  219 ccgcttcaccctttaatgcttctacacacnnnnnnngtgtcaaaaccgcttgcatcttaaccttccacaacccgaaatcattacttccggtgaacttctc 318  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||       |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  9185617 ccgcttcacccttcaatgcttctacacacttttgttgtgtcaaaaccgcttgcatcttaaccttccacaacccgaaattattacttctggtgaacttctc 9185518  T
Q  319 gatgtcccactttgaccccatgataccaactat 351  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  9185517 gatgtcccactttgaacccatgataccaactat 9185485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 20 - 351
Target Start/End: Original strand, 21988348 - 21988679
Alignment:
Q  20 tagagttgttgcttcaagagttgcctatgagccaaagatttcgtcatatacaatgactccaacttcgcccacatcgatgccgcggtagcttctctcgcga 119  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||  |||||||||||||||||||||    
T  21988348 tagagttgttgtttcaagagttgcctatgatccaacgatttcgtcatgtacaatgactccaacttagcccacaacgaccccgcggtagcttctctcgcga 21988447  T
Q  120 catcccttaagaccttatctctgagacataaaacaatggcactctttgccttgtttaccatctcacgcttctcctcttgtgtcaaggttgccggcatcgc 219  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||    
T  21988448 catcccttcagaccttatctccgagacataaaaaaatggcactctttgccttgtctatcatctcacgcttctctgcttgtgtcaaagttgccggcatcgc 21988547  T
Q  220 cgcttcaccctttaatgcttctacacacnnnnnnngtgtcaaaaccgcttgcatcttaaccttccacaacccgaaatcattacttccggtgaacttctcg 319  Q
    |||| ||||||| |||||||||||| ||       ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21988548 cgctacacccttcaatgcttctacatacttttgttgtgtcaaaaccgcttgcatcttaactttccagaacccgaaatcattacttccggtgaacttctcg 21988647  T
Q  320 atgtcccactttgaccccatgataccaactat 351  Q
    |||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  21988648 atgtcccactttgagcccatgatactaactat 21988679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 19 - 351
Target Start/End: Original strand, 49091104 - 49091436
Alignment:
Q  19 atagagttgttgcttcaagagttgcctatgagccaaagatttcgtcatatacaatgactccaacttcgcccacatcgatgccgcggtagcttctctcgcg 118  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||| |    
T  49091104 atagaattgttgtttcaagagttgcctatgagccaacgatttcgtcatgtacaatgactccaacttagcccacatcgatgccatggtagcttctctcgtg 49091203  T
Q  119 acatcccttaagaccttatctctgagacataaaacaatggcactctttgccttgtttaccatctcacgcttctcctcttgtgtcaaggttgccggcatcg 218  Q
    ||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||| ||||||||| ||||||||||  | | ||| ||||    
T  49091204 acattgcttaagaccttatctccgagacataaaacaatggcactctttgccttgtctattatctctcgcttctccgcttgtgtcaaactcgtcgggatcg 49091303  T
Q  219 ccgcttcaccctttaatgcttctacacacnnnnnnngtgtcaaaaccgcttgcatcttaaccttccacaacccgaaatcattacttccggtgaacttctc 318  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||       |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  49091304 ccgcttcacccttcaatgcttctacacacttttgttgtgtcaaaaccgcttgcatcttaaccttccacaacccgaaatcattacttctagtgaacttctc 49091403  T
Q  319 gatgtcccactttgaccccatgataccaactat 351  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  49091404 gatgtcccactttgaacccatgataccaactat 49091436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 106; E-Value: 6e-53
Query Start/End: Original strand, 20 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 5817844 - 5817711
Alignment:
Q  20 tagagttgttgcttcaagagttgcctatgagccaaagatttcgtcatatacaatgactccaacttcgcccacatcgatgccgcggtagcttctctcgcga 119  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5817844 tagagttgttgtttcaagagtttcctatgagtcaacgattttgtcatatacaatgactccaacttagcccacatcgatgccgcggtagcttctctcgcga 5817745  T
Q  120 catcccttaagaccttatctctgagacataaaac 153  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  5817744 catcccttaagaccttatctccgagacataaaac 5817711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 20 - 340
Target Start/End: Original strand, 47675569 - 47675889
Alignment:
Q  20 tagagttgttgcttcaagagttgcctatgagccaaagatttcgtcatatacaatgactccaacttcgcccacatcgatgccgcggtagcttctctcgcga 119  Q
    |||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| | ||||||||| |||||||||| |||  | ||||    
T  47675569 tagagttgttgcttaaggaattgcctatgagccaaagatttggtcatatacaatgactcaaactttgaccacatcgacgccgcggtaggttcctttgcga 47675668  T
Q  120 catcccttaagaccttatctctgagacataaaacaatggcactctttgccttgtttaccatctcacgcttctcctcttgtgtcaaggttgccggcatcgc 219  Q
    ||||||| || || || || | ||| || || |||||||||||| | |||||||  ||||||||   ||||| | ||||||||| |||  |||||| |||    
T  47675669 catccctcaaaactttgtcaccgaggcacaatacaatggcactcctagccttgtccaccatctcggtcttctacgcttgtgtcatggtgaccggcaacgc 47675768  T
Q  220 cgcttcaccctttaatgcttctacacacnnnnnnngtgtcaaaaccgcttgcatcttaaccttccacaacccgaaatcattacttccggtgaacttctcg 319  Q
      |||||||||| || ||||   |||||       || |||| |||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||     
T  47675769 accttcacccttcaaagctttctcacacttttgttgtatcaacaccgcttgcatcttcaccttccataacccaaaatcattacttccggtgaacttctca 47675868  T
Q  320 atgtcccactttgaccccatg 340  Q
    || | ||||||||| ||||||    
T  47675869 atataccactttgaacccatg 47675889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 256 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 5817691 - 5817603
Alignment:
Q  256 tgtcaaaaccgcttgcatcttaaccttccacaacccgaaatcattacttccggtgaacttctcgatgtcccactttgaccccatgatac 344  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  5817691 tgtcaaaactgcttgcatcttaaccttccacaactcgaaatcattacttccgatgaacttctcgatgtcccactttgaacccacgatac 5817603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 20 - 340
Target Start/End: Original strand, 6593965 - 6594285
Alignment:
Q  20 tagagttgttgcttcaagagttgcctatgagccaaagatttcgtcatatacaatgactccaacttcgcccacatcgatgccgcggtagcttctctcgcga 119  Q
    |||||||||||||| | || ||||||||||||||| || || ||||||||||| || |||||||| | ||| |||||||||||||| | |||  ||||||    
T  6593965 tagagttgttgcttaaggaattgcctatgagccaacgacttggtcatatacaacgattccaacttagaccatatcgatgccgcggttggttccttcgcga 6594064  T
Q  120 catcccttaagaccttatctctgagacataaaacaatggcactctttgccttgtttaccatctcacgcttctcctcttgtgtcaaggttgccggcatcgc 219  Q
    ||||||| || || || || | ||| || || |||||||| ||| |||||||||  ||||||||   ||||||||||||||  | |||  | |||| |||    
T  6594065 catccctcaaaactttgtccccgaggcacaagacaatggcgctccttgccttgtccaccatctcggtcttctcctcttgtgatatggtgtctggcaacgc 6594164  T
Q  220 cgcttcaccctttaatgcttctacacacnnnnnnngtgtcaaaaccgcttgcatcttaaccttccacaacccgaaatcattacttccggtgaacttctcg 319  Q
      |||||||||| || ||||   |||||       |  |||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||    ||||||||||||||     
T  6594165 accttcacccttcaaagctttctcacacttctgttgaatcaacaccgcttgcatcttcaccttccacaacccaaaatcgttgagcccggtgaacttctca 6594264  T
Q  320 atgtcccactttgaccccatg 340  Q
    || ||||||||||| ||||||    
T  6594265 atatcccactttgaacccatg 6594285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 20 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 38394799 - 38394479
Alignment:
Q  20 tagagttgttgcttcaagagttgcctatgagccaaagatttcgtcatatacaatgactccaacttcgcccacatcgatgccgcggtagcttctctcgcga 119  Q
    |||||||||||||| | || ||||| |||||||||||| || ||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||| |||||  | || |    
T  38394799 tagagttgttgctttaggaattgccgatgagccaaagactttgtcatatacaaagattccaactttgcccacatcgatgccgcggttgcttcctttgcta 38394700  T
Q  120 catcccttaagaccttatctctgagacataaaacaatggcactctttgccttgtttaccatctcacgcttctcctcttgtgtcaaggttgccggcatcgc 219  Q
    | || || || || ||||| | ||| || || |||||||||||| | |||||||  ||||||||   ||||||| |||||| || |||  |||| | ||     
T  38394699 cttctctcaaaactttatccccgaggcacaagacaatggcactcctggccttgtccaccatctcggtcttctccgcttgtgacatggtgaccggtaacga 38394600  T
Q  220 cgcttcaccctttaatgcttctacacacnnnnnnngtgtcaaaaccgcttgcatcttaaccttccacaacccgaaatcattacttccggtgaacttctcg 319  Q
      |||||||||| || ||||   |||||       || | || ||||||| |||||| |||||||| ||||||||||| |||  |||||| |||||||||    
T  38394599 accttcacccttcaaagctttctcacacttttgctgtattaacaccgcttccatctttaccttccataacccgaaatcgttatctccggtaaacttctcg 38394500  T
Q  320 atgtcccactttgaccccatg 340  Q
    || ||||||||||| ||||||    
T  38394499 atatcccactttgaacccatg 38394479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 20 - 340
Target Start/End: Original strand, 18391603 - 18391923
Alignment:
Q  20 tagagttgttgcttcaagagttgcctatgagccaaagatttcgtcatatacaatgactccaacttcgcccacatcgatgccgcggtagcttctctcgcga 119  Q
    |||||||||||||| | || ||||||||||||||| || || ||||||||||| || |||||||| | ||| |||||||||||||| | |||  ||||||    
T  18391603 tagagttgttgcttaaggaattgcctatgagccaacgacttggtcatatacaacgattccaacttagaccatatcgatgccgcggttggttccttcgcga 18391702  T
Q  120 catcccttaagaccttatctctgagacataaaacaatggcactctttgccttgtttaccatctcacgcttctcctcttgtgtcaaggttgccggcatcgc 219  Q
    ||||||| || || ||||| | ||| || || |||||||| ||| | |||||||  ||||||||   |||||||||||||| || |||  ||||||   |    
T  18391703 catccctcaaaactttatccccgaggcacaagacaatggcgctcctcgccttgtccaccatctcggtcttctcctcttgtgacatggtgtccggcaaacc 18391802  T
Q  220 cgcttcaccctttaatgcttctacacacnnnnnnngtgtcaaaaccgcttgcatcttaaccttccacaacccgaaatcattacttccggtgaacttctcg 319  Q
      |||||||||| || ||||   |||||       |  |||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||    ||||||||||||||     
T  18391803 accttcacccttcaaagctttctcacacttttgttgaatcaacaccgcttgcatcttcaccttccacaacccaaaatcgttgagcccggtgaacttctca 18391902  T
Q  320 atgtcccactttgaccccatg 340  Q
    || | ||||||||| ||||||    
T  18391903 atattccactttgaacccatg 18391923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 20 - 126
Target Start/End: Complemental strand, 48490141 - 48490035
Alignment:
Q  20 tagagttgttgcttcaagagttgcctatgagccaaagatttcgtcatatacaatgactccaacttcgcccacatcgatgccgcggtagcttctctcgcga 119  Q
    |||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||| |||| |||  ||||||    
T  48490141 tagagttgttgcttaaggaattgcctatgagccaaagattttgtaatatacaatgactccaactttgaccacatcgacgccgcagtaggttccttcgcga 48490042  T
Q  120 catccct 126  Q
    |||||||    
T  48490041 catccct 48490035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 258 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 48489929 - 48489847
Alignment:
Q  258 tcaaaaccgcttgcatcttaaccttccacaacccgaaatcattacttccggtgaacttctcgatgtcccactttgaccccatg 340  Q
    |||| |||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||    
T  48489929 tcaacaccgcttgcatcttcaccttccataacccaaaatcattacttccggtgaacttctcaatatcccactttgaacccatg 48489847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 20 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 36263 - 36083
Alignment:
Q  20 tagagttgttgcttcaagagttgcctatgagccaaagatttcgtcatatacaatgactccaacttcgcccacatcgatgccgcggtagcttctctcgcga 119  Q
    |||||||||||||| | || ||||| |||||| ||||| || ||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||  | || |    
T  36263 tagagttgttgctttaggaattgccgatgagctaaagactttgtcatatacaaagattccaactttgcccacatcgatgccgcggtagcttcctttgcta 36164  T
Q  120 catcccttaagaccttatctctgagacataaaacaatggcactctttgccttgtttaccatctcacgcttctcctcttgtg 200  Q
    | || || || || ||||| | ||| || || |||||||||||| | |||||||  ||||||||   ||||||| ||||||    
T  36163 cttctctcaaaactttatccccgaggcacaagacaatggcactcctggccttgtccaccatctcggtcttctccgcttgtg 36083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 20 - 111
Target Start/End: Original strand, 7351126 - 7351217
Alignment:
Q  20 tagagttgttgcttcaagagttgcctatgagccaaagatttcgtcatatacaatgactccaacttcgcccacatcgatgccgcggtagcttc 111  Q
    |||||||||||||| | || ||||| |||||||||||| || ||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  7351126 tagagttgttgctttaggaattgccgatgagccaaagactttgtcatatacaaagattccaactttgcccacatcgatgccgcggttgcttc 7351217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 20 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 22135616 - 22135296
Alignment:
Q  20 tagagttgttgcttcaagagttgcctatgagccaaagatttcgtcatatacaatgactccaacttcgcccacatcgatgccgcggtagcttctctcgcga 119  Q
    |||||||||||||| | || ||||| |||||||||||| || ||||||||||| || |||||||| ||||| || ||||||||||| |||||  | || |    
T  22135616 tagagttgttgctttaggaattgccgatgagccaaagactttgtcatatacaaagattccaactttgcccatattgatgccgcggttgcttcctttgcta 22135517  T
Q  120 catcccttaagaccttatctctgagacataaaacaatggcactctttgccttgtttaccatctcacgcttctcctcttgtgtcaaggttgccggcatcgc 219  Q
    | || || || || ||||| | ||| || || |||| |||||||   |||||||  ||||||||   ||||||| |||||| || |||  |||| | ||     
T  22135516 cttctctcaaaactttatccccgaggcacaagacaacggcactccgggccttgtccaccatctcggtcttctccgcttgtgacatggtgaccggtaacga 22135417  T
Q  220 cgcttcaccctttaatgcttctacacacnnnnnnngtgtcaaaaccgcttgcatcttaaccttccacaacccgaaatcattacttccggtgaacttctcg 319  Q
      |||||||||| || ||||   |||||       || | || ||||||| |||||| |||||||| ||||||||||| |||  |||||| |||||||||    
T  22135416 accttcacccttcaaagctttctcacacttctgctgtattaacaccgcttccatctttaccttccataacccgaaatcgttatctccggtaaacttctcg 22135317  T
Q  320 atgtcccactttgaccccatg 340  Q
    || ||||||||||| ||||||    
T  22135316 atatcccactttgaacccatg 22135296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 20 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 40550643 - 40550323
Alignment:
Q  20 tagagttgttgcttcaagagttgcctatgagccaaagatttcgtcatatacaatgactccaacttcgcccacatcgatgccgcggtagcttctctcgcga 119  Q
    |||||||||||||| | || ||||| |||||||||||| || ||||||||||| || |||||||| ||||| || ||||||||||| |||||  | || |    
T  40550643 tagagttgttgctttaggaattgccgatgagccaaagactttgtcatatacaaagattccaactttgcccatattgatgccgcggttgcttcctttgcta 40550544  T
Q  120 catcccttaagaccttatctctgagacataaaacaatggcactctttgccttgtttaccatctcacgcttctcctcttgtgtcaaggttgccggcatcgc 219  Q
    | || || || || ||||| | ||| || || |||| |||||||   |||||||  ||||||||   ||||||| |||||| || |||  |||| | ||     
T  40550543 cttctctcaaaactttatccccgaggcacaagacaacggcactccgggccttgtccaccatctcggtcttctccgcttgtgacatggtgaccggtaacga 40550444  T
Q  220 cgcttcaccctttaatgcttctacacacnnnnnnngtgtcaaaaccgcttgcatcttaaccttccacaacccgaaatcattacttccggtgaacttctcg 319  Q
      |||||||||| || ||||   |||||       || | || ||||||| |||||| |||||||| ||||||||||| |||  |||||| |||||||||    
T  40550443 accttcacccttcaaagctttctcacacttctgctgtattaacaccgcttccatctttaccttccataacccgaaatcgttatctccggtaaacttctcg 40550344  T
Q  320 atgtcccactttgaccccatg 340  Q
    || ||||||||||| ||||||    
T  40550343 atatcccactttgaacccatg 40550323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 21 - 126
Target Start/End: Complemental strand, 6570722 - 6570617
Alignment:
Q  21 agagttgttgcttcaagagttgcctatgagccaaagatttcgtcatatacaatgactccaacttcgcccacatcgatgccgcggtagcttctctcgcgac 120  Q
    ||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| | ||||||||| ||| |  ||| |||  |||||||    
T  6570722 agagttgttgcttaaggaattgcctatgagccaaagatttggtcatatacaatgactgcaactttgaccacatcgacgccacaataggttccttcgcgac 6570623  T
Q  121 atccct 126  Q
    ||||||    
T  6570622 atccct 6570617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 20 - 333
Target Start/End: Original strand, 1048764 - 1049077
Alignment:
Q  20 tagagttgttgcttcaagagttgcctatgagccaaagatttcgtcatatacaatgactccaacttcgcccacatcgatgccgcggtagcttctctcgcga 119  Q
    |||||||||||||| | || ||||| ||| |||||||| || ||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||| |||||  | || |    
T  1048764 tagagttgttgctttaggaattgccgatgcgccaaagactttgtcatatacaaagattccaactttgcccatatcgatgccgcggttgcttcctttgcta 1048863  T
Q  120 catcccttaagaccttatctctgagacataaaacaatggcactctttgccttgtttaccatctcacgcttctcctcttgtgtcaaggttgccggcatcgc 219  Q
    | || || || || ||||| | ||| || || |||||||||||| |  ||||||  ||||||||   ||||||| |||||| || |||  |||| | ||     
T  1048864 cttctctcaaaactttatccccgaggcacaagacaatggcactcctgaccttgtccaccatctcggtcttctccgcttgtgacatggtgaccggtaacga 1048963  T
Q  220 cgcttcaccctttaatgcttctacacacnnnnnnngtgtcaaaaccgcttgcatcttaaccttccacaacccgaaatcattacttccggtgaacttctcg 319  Q
      |||||||||| || ||||   |||||       || | || ||||||| |||||| |||||||| ||||||||||| |||  |||||| ||||||||     
T  1048964 accttcacccttcaaagctttctcacacttttgttgtattaacaccgcttccatctttaccttccataacccgaaatcgttatctccggtaaacttctca 1049063  T
Q  320 atgtcccactttga 333  Q
    || |||||||||||    
T  1049064 atatcccactttga 1049077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 20 - 111
Target Start/End: Original strand, 7093936 - 7094027
Alignment:
Q  20 tagagttgttgcttcaagagttgcctatgagccaaagatttcgtcatatacaatgactccaacttcgcccacatcgatgccgcggtagcttc 111  Q
    |||||||||||||| | || ||| | |||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||    
T  7093936 tagagttgttgctttaggaattgtcgatgagccaaagactttgtcatatacaaagactccaactttgcccacatcgatgtcgcggttgcttc 7094027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 23 - 105
Target Start/End: Original strand, 4295419 - 4295501
Alignment:
Q  23 agttgttgcttcaagagttgcctatgagccaaagatttcgtcatatacaatgactccaacttcgcccacatcgatgccgcggt 105  Q
    ||||||||||| | || ||||| |||||||||||| || ||||||||||| || ||||||||  |||||||||||||||||||    
T  4295419 agttgttgctttaggacttgccgatgagccaaagactttgtcatatacaaagattccaacttttcccacatcgatgccgcggt 4295501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 23 - 105
Target Start/End: Original strand, 7471459 - 7471541
Alignment:
Q  23 agttgttgcttcaagagttgcctatgagccaaagatttcgtcatatacaatgactccaacttcgcccacatcgatgccgcggt 105  Q
    ||||||||||| | || ||||| |||||||||||| || ||||||||||| || |||||||| | ||||||||||||||||||    
T  7471459 agttgttgctttaggacttgccgatgagccaaagactttgtcatatacaaagattccaactttgaccacatcgatgccgcggt 7471541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 20 - 105
Target Start/End: Complemental strand, 44725388 - 44725303
Alignment:
Q  20 tagagttgttgcttcaagagttgcctatgagccaaagatttcgtcatatacaatgactccaacttcgcccacatcgatgccgcggt 105  Q
    |||||||||| ||| | || ||||| |||||||||||| || ||||||||||| || |||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  44725388 tagagttgttactttaggaattgccgatgagccaaagactttgtcatatacaaagattccaactttgcccaaatcgatgccgcggt 44725303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 271 - 345
Target Start/End: Original strand, 3324522 - 3324596
Alignment:
Q  271 catcttaaccttccacaacccgaaatcattacttccggtgaacttctcgatgtcccactttgaccccatgatacc 345  Q
    |||||| ||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||| || || |||||||| || |||||||||||    
T  3324522 catcttcaccttccacaacccgaagtcgttactaccggtgaacttttcaatatcccacttcgaacccatgatacc 3324596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 271 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 7070241 - 7070167
Alignment:
Q  271 catcttaaccttccacaacccgaaatcattacttccggtgaacttctcgatgtcccactttgaccccatgatacc 345  Q
    |||||| ||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||| || || |||||||| || |||||||||||    
T  7070241 catcttcaccttccacaacccgaagtcgttactaccggtgaacttttcaatatcccacttcgaacccatgatacc 7070167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 20 - 94
Target Start/End: Original strand, 13289974 - 13290048
Alignment:
Q  20 tagagttgttgcttcaagagttgcctatgagccaaagatttcgtcatatacaatgactccaacttcgcccacatc 94  Q
    |||||||||||||| | || || || |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  13289974 tagagttgttgctttaggaattaccgatgagccaaagactttgtcatatacaatgactccaactttgaccacatc 13290048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 271 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 25405860 - 25405786
Alignment:
Q  271 catcttaaccttccacaacccgaaatcattacttccggtgaacttctcgatgtcccactttgaccccatgatacc 345  Q
    |||||| ||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||| || || |||||||| || |||||||||||    
T  25405860 catcttcaccttccacaacccgaagtcgttactaccggtgaacttttcaatatcccacttcgaacccatgatacc 25405786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 20 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 6047297 - 6047110
Alignment:
Q  20 tagagttgttgcttcaagagttgcctatgagccaaagatttcgtcatatacaatgactccaacttcgcccacatcgatgccgcggtagcttctctcgcga 119  Q
    |||||||||||||| | || |||| ||||||||||||||||  |||||||||| |||||||| || |  | ||| ||||||||| | | |||  |||| |    
T  6047297 tagagttgttgctttaggaattgcgtatgagccaaagatttgttcatatacaacgactccaaatttgatcgcattgatgccgcgattggttccttcgcaa 6047198  T
Q  120 catcccttaagaccttatctctgagacataaaacaatggcactctttgccttgtttaccatctcacgcttctcctcttgtgtcaaggt 207  Q
    |||| || || |  ||||| |||||||| || |||||||||||  | |||||||  ||||| ||   ||||||| |||||| ||||||    
T  6047197 catctctaaaaaaattatccctgagacacaagacaatggcacttctagccttgtccaccatttcggtcttctccgcttgtgacaaggt 6047110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 271 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 25351798 - 25351724
Alignment:
Q  271 catcttaaccttccacaacccgaaatcattacttccggtgaacttctcgatgtcccactttgaccccatgatacc 345  Q
    |||||| ||||||||||||||||| || ||||| ||||| ||||| || || |||||||| || |||||||||||    
T  25351798 catctttaccttccacaacccgaagtcgttactaccggtaaacttttcaatatcccacttcgaacccatgatacc 25351724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 263 - 340
Target Start/End: Original strand, 7351369 - 7351446
Alignment:
Q  263 accgcttgcatcttaaccttccacaacccgaaatcattacttccggtgaacttctcgatgtcccactttgaccccatg 340  Q
    ||||||| |||||| |||||||| | ||||||||| |||  |||| | ||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  7351369 accgcttccatctttaccttccatagcccgaaatcgttatctccgataaacttctcgatatcccactttgaacccatg 7351446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 20 - 81
Target Start/End: Complemental strand, 26213533 - 26213472
Alignment:
Q  20 tagagttgttgcttcaagagttgcctatgagccaaagatttcgtcatatacaatgactccaa 81  Q
    |||||||||||||| | || ||||  ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  26213533 tagagttgttgctttaggaattgcaaatgagccaaagatttggtcctatacaatgactccaa 26213472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 20 - 100
Target Start/End: Complemental strand, 24749400 - 24749320
Alignment:
Q  20 tagagttgttgcttcaagagttgcctatgagccaaagatttcgtcatatacaatgactccaacttcgcccacatcgatgcc 100  Q
    ||||||| |||||| | || ||||| || ||||||||| || ||||||||||| || | |||||| |||||||||||||||    
T  24749400 tagagttattgctttaggaattgccgatcagccaaagactttgtcatatacaaagatttcaactttgcccacatcgatgcc 24749320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 265 - 344
Target Start/End: Original strand, 7471701 - 7471780
Alignment:
Q  265 cgcttgcatcttaaccttccacaacccgaaatcattacttccggtgaacttctcgatgtcccactttgaccccatgatac 344  Q
    ||||| |||||| |||||||| ||||| ||||| |||  ||| || |||||||| || ||||||||||| ||||||||||    
T  7471701 cgcttccatctttaccttccataacccaaaatcgttatctccagtaaacttctcaatatcccactttgaacccatgatac 7471780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 23 - 98
Target Start/End: Complemental strand, 20298125 - 20298050
Alignment:
Q  23 agttgttgcttcaagagttgcctatgagccaaagatttcgtcatatacaatgactccaacttcgcccacatcgatg 98  Q
    ||||||||||| | || ||| | |||||||||||| || ||||||||||| || ||| |||| |||||||||||||    
T  20298125 agttgttgctttaggacttgtcgatgagccaaagactttgtcatatacaaagattccgactttgcccacatcgatg 20298050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 23 - 105
Target Start/End: Complemental strand, 28486375 - 28486293
Alignment:
Q  23 agttgttgcttcaagagttgcctatgagccaaagatttcgtcatatacaatgactccaacttcgcccacatcgatgccgcggt 105  Q
    ||||||||||| | || || || |||||||||||| || |||||||||||  | || ||||| | ||||||||||||||||||    
T  28486375 agttgttgctttaggactttccgatgagccaaagactttgtcatatacaaatattcgaactttgaccacatcgatgccgcggt 28486293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 271 - 345
Target Start/End: Original strand, 44016400 - 44016474
Alignment:
Q  271 catcttaaccttccacaacccgaaatcattacttccggtgaacttctcgatgtcccactttgaccccatgatacc 345  Q
    |||||| ||||||||||||| ||| || ||||| | ||| ||||| || || |||||||| ||||||||||||||    
T  44016400 catctttaccttccacaaccagaagtcgttactactggtaaacttttcaatatcccacttcgaccccatgatacc 44016474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 52 - 93
Target Start/End: Original strand, 3903937 - 3903978
Alignment:
Q  52 caaagatttcgtcatatacaatgactccaacttcgcccacat 93  Q
    |||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  3903937 caaagacttggtcatatacaatgactccaactttgcccacat 3903978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 263 - 340
Target Start/End: Original strand, 7094179 - 7094256
Alignment:
Q  263 accgcttgcatcttaaccttccacaacccgaaatcattacttccggtgaacttctcgatgtcccactttgaccccatg 340  Q
    ||||||| |||||| |||||||| ||||| ||||| |||  ||| || |||||||| || ||||||||||| ||||||    
T  7094179 accgcttccatctttaccttccataacccaaaatcgttatctccagtaaacttctcaatatcccactttgaacccatg 7094256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 263 - 340
Target Start/End: Original strand, 31159406 - 31159483
Alignment:
Q  263 accgcttgcatcttaaccttccacaacccgaaatcattacttccggtgaacttctcgatgtcccactttgaccccatg 340  Q
    ||||||| |||||| |||||||| ||||| ||||| |||  |||||| ||||| || || ||||||||||| ||||||    
T  31159406 accgcttccatctttaccttccataacccaaaatcgttatctccggtaaacttatcaatatcccactttgaacccatg 31159483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 291; Significance: 1e-163; HSPs: 38)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 291; E-Value: 1e-163
Query Start/End: Original strand, 19 - 354
Target Start/End: Complemental strand, 9225064 - 9224729
Alignment:
Q  19 atagagttgttgcttcaagagttgcctatgagccaaagatttcgtcatatacaatgactccaacttcgcccacatcgatgccgcggtagcttctctcgcg 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9225064 atagagttgttgcttcaagagttgcctatgagccaaagatttcgtcatatacaatgactccaacttcgcccacatcgatgccgcggtagcttctctcgcg 9224965  T
Q  119 acatcccttaagaccttatctctgagacataaaacaatggcactctttgccttgtttaccatctcacgcttctcctcttgtgtcaaggttgccggcatcg 218  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9224964 acatcccttaagaccttatctccgagacataagacaatgacactctttgccttgtctaccatctcacgcttctcctcttgtgtcaaggttgccggcatcg 9224865  T
Q  219 ccgcttcaccctttaatgcttctacacacnnnnnnngtgtcaaaaccgcttgcatcttaaccttccacaacccgaaatcattacttccggtgaacttctc 318  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||       |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  9224864 ccgcttcacccttcaatgcttctacacacttttgttgtgtcaaaaccgcttgcatcttaaccttccacaacccgaaatcattacttccggtgaacttctt 9224765  T
Q  319 gatgtcccactttgaccccatgataccaactatcaa 354  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9224764 gatgtcccactttgaccccatgataccaactatcaa 9224729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 19 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 16624665 - 16624333
Alignment:
Q  19 atagagttgttgcttcaagagttgcctatgagccaaagatttcgtcatatacaatgactccaacttcgcccacatcgatgccgcggtagcttctctcgcg 118  Q
    |||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16624665 atagagttgttgtttcaagagtttcctatgagccaacgatttcgtcatgtacaatgactccaacttagcccacatcgatgccgcggtagcttctctcgcg 16624566  T
Q  119 acatcccttaagaccttatctctgagacataaaacaatggcactctttgccttgtttaccatctcacgcttctcctcttgtgtcaaggttgccggcatcg 218  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||| ||||  |||||| || ||||||||||||||   ||||||||||  | | |||||| |    
T  16624565 acatcccttaagaacttatctccgagacataaaacaatagcaatcttaaccttgtctatcatctcacgcttctaaacttgtgtcaaaatagacggcatag 16624466  T
Q  219 ccgcttcaccctttaatgcttctacacacnnnnnnngtgtcaaaaccgcttgcatcttaaccttccacaacccgaaatcattacttccggtgaacttctc 318  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||       ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16624465 ccgcttcacccttcaatacttctacacacttttgttgtgtcaaaaccgcttgcatcttaaccttccacaacccgaaatcattacttccggtgaacttctc 16624366  T
Q  319 gatgtcccactttgaccccatgataccaactat 351  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  16624365 gatgtcccactttgaacccattataccaactat 16624333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 20 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 5872551 - 5872227
Alignment:
Q  20 tagagttgttgcttcaagagttgcctatgagccaaagatttcgtcatatacaatgactccaacttcgcccacatcgatgccgcggtagcttctctcgcga 119  Q
    |||| ||||||||| | || |||||||||||||||||| || ||||||| ||| ||||||||||| | ||||||||| | |||||| | |||  ||||||    
T  5872551 tagatttgttgcttaaggaattgcctatgagccaaagacttggtcatatgcaacgactccaactttgaccacatcgacggcgcggttggttccttcgcga 5872452  T
Q  120 catcccttaagaccttatctctgagacataaaacaatggcactctttgccttgtttaccatctcacgcttctcctcttgtgtcaaggttgccggcatcgc 219  Q
    | ||||| || || || || | ||| || || |||||||||||| | |||||||  ||||||||   ||||||| ||||||||| |||  |||||| |||    
T  5872451 cctccctcaaaactttgtcaccgaggcacaagacaatggcactcatagccttgtccaccatctcggtcttctccgcttgtgtcatggtgaccggcaacgc 5872352  T
Q  220 cgcttcaccctttaatgcttctacacacnnnnnnngtgtcaaaaccgcttgcatcttaaccttccacaacccgaaatcattacttccggtgaacttctcg 319  Q
      |||||||||| || ||||   |||||       || |||| | ||| |||||||| |||||||| ||||| ||||| |||||| |||||||||||||     
T  5872351 accttcacccttcaaagctttctcacacttttgttgtatcaacatcgcctgcatcttcaccttccataacccaaaatcgttactttcggtgaacttctca 5872252  T
Q  320 atgtcccactttgaccccatgatac 344  Q
    || ||||||||||| ||||||||||    
T  5872251 atatcccactttgaacccatgatac 5872227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 20 - 340
Target Start/End: Original strand, 52094794 - 52095114
Alignment:
Q  20 tagagttgttgcttcaagagttgcctatgagccaaagatttcgtcatatacaatgactccaacttcgcccacatcgatgccgcggtagcttctctcgcga 119  Q
    |||||||||||||| | || |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| |||  ||| ||    
T  52094794 tagagttgttgcttaaggaattgcctatgagccaaagacttggtcatatacaatgactccaactttgaccacatcgatgccgcggtaggttccttcgtga 52094893  T
Q  120 catcccttaagaccttatctctgagacataaaacaatggcactctttgccttgtttaccatctcacgcttctcctcttgtgtcaaggttgccggcatcgc 219  Q
     |||||| || || || || | ||  || || |||||| ||||| | |||||||  ||||||||   ||||||| |||||| || |||  |||  | |||    
T  52094894 aatccctcaaaactttgtcaccgaagcacaagacaatgacactcatagccttgtccaccatctcggtcttctccgcttgtgacatggtgaccgataacgc 52094993  T
Q  220 cgcttcaccctttaatgcttctacacacnnnnnnngtgtcaaaaccgcttgcatcttaaccttccacaacccgaaatcattacttccggtgaacttctcg 319  Q
      |||||||||| || ||||   |||||       || |||| || ||||||||||| |||||||| ||||| ||||| ||| ||||||||||||||||     
T  52094994 accttcacccttcaaagctttctcacacttttgttgtatcaacactgcttgcatcttcaccttccataacccaaaatcgttaattccggtgaacttctca 52095093  T
Q  320 atgtcccactttgaccccatg 340  Q
    || ||||||||||| ||||||    
T  52095094 atatcccactttgaacccatg 52095114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 20 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 5136828 - 5136508
Alignment:
Q  20 tagagttgttgcttcaagagttgcctatgagccaaagatttcgtcatatacaatgactccaacttcgcccacatcgatgccgcggtagcttctctcgcga 119  Q
    |||||||||||||| | || ||||||||||||||| || || ||||||||||| || |||||||| | ||| |||||||||||||| | |||  ||||||    
T  5136828 tagagttgttgcttaaggaattgcctatgagccaacgacttggtcatatacaacgattccaacttagaccatatcgatgccgcggttggttccttcgcga 5136729  T
Q  120 catcccttaagaccttatctctgagacataaaacaatggcactctttgccttgtttaccatctcacgcttctcctcttgtgtcaaggttgccggcatcgc 219  Q
    ||||||| || || || || | ||| || || |||||||||||| | |||||||  ||||||||   |||||||||||||| || |||  ||||||   |    
T  5136728 catccctcaaaactttgtccccgaggcacaagacaatggcactcctcgccttgtccaccatctcggtcttctcctcttgtgacatggtgtccggcaaacc 5136629  T
Q  220 cgcttcaccctttaatgcttctacacacnnnnnnngtgtcaaaaccgcttgcatcttaaccttccacaacccgaaatcattacttccggtgaacttctcg 319  Q
      |||||||||| || ||||   |||||       |  |||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||    ||||||||||||||     
T  5136628 accttcacccttcaaagctttctcacacttttgttgaatcaacaccgcttgcatcttcaccttccacaacccaaaatcgttgagcccggtgaacttctca 5136529  T
Q  320 atgtcccactttgaccccatg 340  Q
    || ||||||||||| ||||||    
T  5136528 atatcccactttgaacccatg 5136508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 23 - 340
Target Start/End: Original strand, 12743363 - 12743680
Alignment:
Q  23 agttgttgcttcaagagttgcctatgagccaaagatttcgtcatatacaatgactccaacttcgcccacatcgatgccgcggtagcttctctcgcgacat 122  Q
    ||||||| ||| | || |||||||| ||||||||| || |||||||||||||| | |||||| | ||||||||| |||||||||| |||  || ||||||    
T  12743363 agttgtttcttaaggaattgcctataagccaaagacttggtcatatacaatgatttcaactttgaccacatcgacgccgcggtaggttccttcacgacat 12743462  T
Q  123 cccttaagaccttatctctgagacataaaacaatggcactctttgccttgtttaccatctcacgcttctcctcttgtgtcaaggttgccggcatcgccgc 222  Q
    |||| || || || || | ||| || |  |||||||||||  | |||||||  ||||||||   ||||||| | ||||||| |||  |||||| |||  |    
T  12743463 ccctcaaaactttgtcaccgaggcacacgacaatggcacttctagccttgtccaccatctcggtcttctccgcatgtgtcatggtgaccggcagcgcacc 12743562  T
Q  223 ttcaccctttaatgcttctacacacnnnnnnngtgtcaaaaccgcttgcatcttaaccttccacaacccgaaatcattacttccggtgaacttctcgatg 322  Q
    ||||||||| || ||||   |||||       || |||| |||||||||||||| |||||||| ||||| ||||| ||| ||||||| |||||||| ||     
T  12743563 ttcacccttaaaagctttctcacacttttgttgtatcaacaccgcttgcatcttcaccttccataacccaaaatcgttaattccggtaaacttctcaata 12743662  T
Q  323 tcccactttgaccccatg 340  Q
    ||||||||||| ||||||    
T  12743663 tcccactttgaacccatg 12743680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 20 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 7123444 - 7123124
Alignment:
Q  20 tagagttgttgcttcaagagttgcctatgagccaaagatttcgtcatatacaatgactccaacttcgcccacatcgatgccgcggtagcttctctcgcga 119  Q
    |||||||||||||| | || ||| ||||||||||| || || ||||||||||| || |||||||| | ||| |||||||||||| | | |||  ||||||    
T  7123444 tagagttgttgcttaaggaattgtctatgagccaacgacttggtcatatacaacgattccaacttagaccatatcgatgccgcgtttggttccttcgcga 7123345  T
Q  120 catcccttaagaccttatctctgagacataaaacaatggcactctttgccttgtttaccatctcacgcttctcctcttgtgtcaaggttgccggcatcgc 219  Q
    ||||||| || || || || | ||| || || |||||||| ||| | |||||||  ||||||||   |||||||||||||| || |||  |||||| |||    
T  7123344 catccctcaaaactttgtccccgaggcacaagacaatggcgctcctcgccttgtccaccatctcggtcttctcctcttgtgacatggtgtccggcaacgc 7123245  T
Q  220 cgcttcaccctttaatgcttctacacacnnnnnnngtgtcaaaaccgcttgcatcttaaccttccacaacccgaaatcattacttccggtgaacttctcg 319  Q
      |||||||||| || ||||   |||||       |  |||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||    ||||||||||||||     
T  7123244 accttcacccttcaaagctttctcacacttttgttgaatcaacaccgcttgcatcttcaccttccacaacccaaaatcgttgagcccggtgaacttctca 7123145  T
Q  320 atgtcccactttgaccccatg 340  Q
    || ||||||||||| ||||||    
T  7123144 atatcccactttgaacccatg 7123124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 40 - 344
Target Start/End: Original strand, 16933643 - 16933947
Alignment:
Q  40 ttgcctatgagccaaagatttcgtcatatacaatgactccaacttcgcccacatcgatgccgcggtagcttctctcgcgacatcccttaagaccttatct 139  Q
    ||||| |||||||||||| || ||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||| |||||  | || || || || || || |||||     
T  16933643 ttgccgatgagccaaagactttgtcatatacaaagattccaactttgcccacatcgatgccgcggttgcttcctttgctacttctctcaaaactttatcc 16933742  T
Q  140 ctgagacataaaacaatggcactctttgccttgtttaccatctcacgcttctcctcttgtgtcaaggttgccggcatcgccgcttcaccctttaatgctt 239  Q
    | ||| || || |||||||||||| | |||||||  ||||||||   ||||||| |||||| || |||  |||| | ||   |||||||||| || ||||    
T  16933743 ccgaggcacaagacaatggcactcctggccttgtccaccatctcggtcttctccgcttgtgacatggtgaccggtaacgaaccttcacccttcaaagctt 16933842  T
Q  240 ctacacacnnnnnnngtgtcaaaaccgcttgcatcttaaccttccacaacccgaaatcattacttccggtgaacttctcgatgtcccactttgaccccat 339  Q
       |||||        | | || ||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||  |||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  16933843 tctcacacttttgctatattaacaccgcttccatctttaccttccataacccgaaatcattatctccggtaaacttctcgatatcccactttgaacccat 16933942  T
Q  340 gatac 344  Q
    |||||    
T  16933943 gatac 16933947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 20 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 8394154 - 8393835
Alignment:
Q  20 tagagttgttgcttcaagagttgcctatgagccaaagatttcgtcatatacaatgactccaacttcgcccacatcgatgccgcggtagcttctctcgcga 119  Q
    |||||||||||||| | || ||| ||||||||||| || || ||||||||||| || |||||||| | ||| |||||||||||||| | |||  ||||||    
T  8394154 tagagttgttgcttgaggaattgtctatgagccaacgacttggtcatatacaacgattccaacttagaccatatcgatgccgcggttggttccttcgcga 8394055  T
Q  120 catcccttaagaccttatctctgagacataaaacaatggcactctttgccttgtttaccatctcacgcttctcctcttgtgtcaaggttgccggcatcgc 219  Q
    ||||||| || |  ||||| | ||| || || |||||||| ||| | |||||||  ||||||||   |||||||||||||| || |||  |||| |   |    
T  8394054 catccctcaa-aatttatccccgaggcacaagacaatggcgctcctcgccttgtccaccatctcggtcttctcctcttgtgacatggtgaccggtaaacc 8393956  T
Q  220 cgcttcaccctttaatgcttctacacacnnnnnnngtgtcaaaaccgcttgcatcttaaccttccacaacccgaaatcattacttccggtgaacttctcg 319  Q
       ||||||||| || ||||   |||||       |  |||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||   ||||||||||||||     
T  8393955 acattcacccttcaaagctttctcacacttttgttgaatcaacaccgcttgcatcttcaccttccataacccgaaatcgttaagcccggtgaacttctca 8393856  T
Q  320 atgtcccactttgaccccatg 340  Q
    || ||||||||||| ||||||    
T  8393855 atatcccactttgaacccatg 8393835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 20 - 340
Target Start/End: Original strand, 22134092 - 22134412
Alignment:
Q  20 tagagttgttgcttcaagagttgcctatgagccaaagatttcgtcatatacaatgactccaacttcgcccacatcgatgccgcggtagcttctctcgcga 119  Q
    |||||||||||||| | || ||||| |||||||||||| || |||||||| || || |||||||| |||||||||||||||||||| |||||  | || |    
T  22134092 tagagttgttgctttaggaattgccgatgagccaaagactttgtcatataaaaagattccaactttgcccacatcgatgccgcggttgcttcctttgcta 22134191  T
Q  120 catcccttaagaccttatctctgagacataaaacaatggcactctttgccttgtttaccatctcacgcttctcctcttgtgtcaaggttgccggcatcgc 219  Q
    | || || || || ||||| | ||| || || |||||||||||| | |||||||  ||||||||    |||||| |||||| || |||  |||| | ||     
T  22134192 cttctctcaaaactttatccccgaggcacaagacaatggcactcctggccttgtccaccatctcggttttctccgcttgtgacatggtgaccggtaacga 22134291  T
Q  220 cgcttcaccctttaatgcttctacacacnnnnnnngtgtcaaaaccgcttgcatcttaaccttccacaacccgaaatcattacttccggtgaacttctcg 319  Q
      |||||||||| || ||||   |||||       || | || ||| ||| |||||| |||||||| ||||||||||| |||  |||||| ||||||||     
T  22134292 accttcacccttcaaagctttctcacacttttgctgtattaacacctcttccatctttaccttccataacccgaaatcgttatctccggtaaacttctca 22134391  T
Q  320 atgtcccactttgaccccatg 340  Q
    || ||||||||||| ||||||    
T  22134392 atatcccactttgaacccatg 22134412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 20 - 340
Target Start/End: Original strand, 22782212 - 22782532
Alignment:
Q  20 tagagttgttgcttcaagagttgcctatgagccaaagatttcgtcatatacaatgactccaacttcgcccacatcgatgccgcggtagcttctctcgcga 119  Q
    |||||||||||||| | || ||| | |||||||||||| || ||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||| |||||  | || |    
T  22782212 tagagttgttgctttaggaattgtcgatgagccaaagactttgtcatatacaaagattccaactttgcccacatcgatgccgcggttgcttcctttgcta 22782311  T
Q  120 catcccttaagaccttatctctgagacataaaacaatggcactctttgccttgtttaccatctcacgcttctcctcttgtgtcaaggttgccggcatcgc 219  Q
    | || || || || ||||| | ||| || || |||| ||||||| | |||||||  ||||||||    |||||| || ||| || |||  |||| | ||     
T  22782312 cttctctcaaaactttatccccgaggcacaagacaacggcactcctggccttgtccaccatctcggttttctccgctcgtgacatggtgaccggtaacga 22782411  T
Q  220 cgcttcaccctttaatgcttctacacacnnnnnnngtgtcaaaaccgcttgcatcttaaccttccacaacccgaaatcattacttccggtgaacttctcg 319  Q
      |||||||||| || ||||   |||||       || | || ||||||| |||||| |||||||| ||||||||||| |||  |||||| |||||||||    
T  22782412 accttcacccttcaaagctttctcacacttctgctgtattaacaccgcttccatctttaccttccataacccgaaatcgttatctccggtaaacttctcg 22782511  T
Q  320 atgtcccactttgaccccatg 340  Q
    || ||||||||||| ||||||    
T  22782512 atatcccactttgaacccatg 22782532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 27 - 340
Target Start/End: Original strand, 11008050 - 11008363
Alignment:
Q  27 gttgcttcaagagttgcctatgagccaaagatttcgtcatatacaatgactccaacttcgcccacatcgatgccgcggtagcttctctcgcgacatccct 126  Q
    ||||||| | || ||||| |||||||||||| || ||||||||||| || |||| |||  ||||||||||||||||||| |||||  | || || || ||    
T  11008050 gttgctttaggaattgccgatgagccaaagactttgtcatatacaaagattccatcttttcccacatcgatgccgcggttgcttcctttgctacttctct 11008149  T
Q  127 taagaccttatctctgagacataaaacaatggcactctttgccttgtttaccatctcacgcttctcctcttgtgtcaaggttgccggcatcgccgcttca 226  Q
     || || ||||||| ||| || || |||| ||||||| | |||||||  |||||||||  ||||||| |||||| || |||  |||| | ||   |||||    
T  11008150 caaaactttatctccgaggcacaagacaacggcactcctggccttgtccaccatctcagtcttctccgcttgtgacatggtgaccggtaacgaaccttca 11008249  T
Q  227 ccctttaatgcttctacacacnnnnnnngtgtcaaaaccgcttgcatcttaaccttccacaacccgaaatcattacttccggtgaacttctcgatgtccc 326  Q
    ||||| || ||||   |||||       || | || ||||||| |||||| |||||||| ||||| ||||| |||  |||||| |||||||| || ||||    
T  11008250 cccttcaaagctttctcacacttttgctgtattaacaccgcttccatctttaccttccataacccaaaatcgttatctccggtaaacttctcaatatccc 11008349  T
Q  327 actttgaccccatg 340  Q
    ||||||| ||||||    
T  11008350 actttgaacccatg 11008363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 258 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 26558207 - 26558125
Alignment:
Q  258 tcaaaaccgcttgcatcttaaccttccacaacccgaaatcattacttccggtgaacttctcgatgtcccactttgaccccatg 340  Q
    |||||| ||||| |||||| |||||||| ||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  26558207 tcaaaatcgctttcatcttgaccttccataacccaaaatcgttacttctggtgaacttctcgatatcccactttgaacccatg 26558125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 20 - 84
Target Start/End: Complemental strand, 4588688 - 4588624
Alignment:
Q  20 tagagttgttgcttcaagagttgcctatgagccaaagatttcgtcatatacaatgactccaactt 84  Q
    |||| ||||||||| | || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  4588688 tagaattgttgcttaaggaattgcctatgagccaaagatttggtcatatacaatgactccaactt 4588624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 20 - 162
Target Start/End: Original strand, 3578169 - 3578311
Alignment:
Q  20 tagagttgttgcttcaagagttgcctatgagccaaagatttcgtcatatacaatgactccaacttcgcccacatcgatgccgcggtagcttctctcgcga 119  Q
    |||||||||||||| || ||||| | |||| ||||||| || |||||||| || ||||||||||| | ||||||||||| |||||| | |||  || | |    
T  3578169 tagagttgttgctttaaaagttggcgatgatccaaagactttgtcatatataaagactccaactttgaccacatcgatgtcgcggttggttccttcacta 3578268  T
Q  120 catcccttaagaccttatctctgagacataaaacaatggcact 162  Q
    |||| || || || ||||||||||| || || |||||||||||    
T  3578269 catctctcaaaactttatctctgaggcacaagacaatggcact 3578311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 20 - 98
Target Start/End: Original strand, 12402571 - 12402649
Alignment:
Q  20 tagagttgttgcttcaagagttgcctatgagccaaagatttcgtcatatacaatgactccaacttcgcccacatcgatg 98  Q
    |||||||||||||| | || ||||| |||||||||||| || ||||||||||| || |||||||| |||||||||||||    
T  12402571 tagagttgttgctttaggaattgccgatgagccaaagactttgtcatatacaaagattccaactttgcccacatcgatg 12402649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 258 - 344
Target Start/End: Original strand, 46147065 - 46147151
Alignment:
Q  258 tcaaaaccgcttgcatcttaaccttccacaacccgaaatcattacttccggtgaacttctcgatgtcccactttgaccccatgatac 344  Q
    |||| |||| ||||||||| |||||||| ||||| |||||||| ||||| ||||||||||| || || |||||||| ||||||||||    
T  46147065 tcaacaccgtttgcatcttcaccttccataacccaaaatcattgcttccagtgaacttctcaatatctcactttgaacccatgatac 46147151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 20 - 97
Target Start/End: Complemental strand, 10113716 - 10113639
Alignment:
Q  20 tagagttgttgcttcaagagttgcctatgagccaaagatttcgtcatatacaatgactccaacttcgcccacatcgat 97  Q
    ||||||||||| || | || |||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  10113716 tagagttgttgatttaggaattgcctgtgagccaaagacttagtcatatacaatgactccaactttgaccacatcgat 10113639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 20 - 112
Target Start/End: Original strand, 31480974 - 31481066
Alignment:
Q  20 tagagttgttgcttcaagagttgcctatgagccaaagatttcgtcatatacaatgactccaacttcgcccacatcgatgccgcggtagcttct 112  Q
    |||| |||||| |||||||| ||||||||||||||| |||| ||||| || |||||||| ||||||  | ||||| ||| |||||||||||||    
T  31480974 tagaattgttgtttcaagagatgcctatgagccaaatattttgtcatgtataatgactcaaacttcaactacatcaatgtcgcggtagcttct 31481066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 20 - 110
Target Start/End: Original strand, 22046190 - 22046280
Alignment:
Q  20 tagagttgttgcttcaagagttgcctatgagccaaagatttcgtcatatacaatgactccaacttcgcccacatcgatgccgcggtagctt 110  Q
    |||||| ||||||| | || ||||| |||||||||||| || ||||||||||| || ||||| || |||||||||||||||| ||| ||||    
T  22046190 tagagtcgttgctttaggaattgccgatgagccaaagactttgtcatatacaaagattccaaatttgcccacatcgatgccgaggttgctt 22046280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 263 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 11435570 - 11435489
Alignment:
Q  263 accgcttgcatcttaaccttccacaacccgaaatcattacttccggtgaacttctcgatgtcccactttgaccccatgatac 344  Q
    ||||||| |||||| |||||||| ||||| ||||| |||| ||| || |||||||| || ||||||||||| ||||||||||    
T  11435570 accgcttccatctttaccttccataacccaaaatcgttacctccagtaaacttctcaatatcccactttgaacccatgatac 11435489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 222 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 21549275 - 21549153
Alignment:
Q  222 cttcaccctttaatgcttctacacacnnnnnnngtgtcaaaaccgcttgcatcttaaccttccacaacccgaaatcattacttccggtgaacttctcgat 321  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||       ||||||| |  |||||||| ||||||||||| ||| | |||| ||| ||||| |||||||| || ||    
T  21549275 cttcaccctttaacgcttcaacacactttcgttgtgtcaacaatgcttgcatattaaccttccataactcaaaataattgcttccagtgaacttttcaat 21549176  T
Q  322 gtcccactttgaccccatgatac 344  Q
    |||||||||||| | ||||||||    
T  21549175 gtcccactttgaacacatgatac 21549153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 23 - 103
Target Start/End: Original strand, 36920976 - 36921056
Alignment:
Q  23 agttgttgcttcaagagttgcctatgagccaaagatttcgtcatatacaatgactccaacttcgcccacatcgatgccgcg 103  Q
    ||||||||||| |||| ||||| |||||||||||| || |||||||||||  | || ||||| | ||||||||||||||||    
T  36920976 agttgttgctttaagacttgccaatgagccaaagactttgtcatatacaaatattcaaactttgaccacatcgatgccgcg 36921056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 271 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 16631626 - 16631552
Alignment:
Q  271 catcttaaccttccacaacccgaaatcattacttccggtgaacttctcgatgtcccactttgaccccatgatacc 345  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||||| | ||| ||||| || || |||||||| ||||| ||||||||    
T  16631626 catctttaccttccacaacccgaagtcattactactggtaaacttttcaatatcccacttcgacccaatgatacc 16631552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 23 - 173
Target Start/End: Original strand, 18536982 - 18537132
Alignment:
Q  23 agttgttgcttcaagagttgcctatgagccaaagatttcgtcatatacaatgactccaacttcgcccacatcgatgccgcggtagcttctctcgcgacat 122  Q
    ||||||||||| | || ||||| |||||||||||| || |||||||||||  |  | ||||| | |||||||||||||||| | | |||  |||| ||||    
T  18536982 agttgttgctttaggaattgccgatgagccaaagactttgtcatatacaaatatacgaactttgaccacatcgatgccgcgattggttccttcgctacat 18537081  T
Q  123 cccttaagaccttatctctgagacataaaacaatggcactctttgccttgt 173  Q
    | ||||| || ||||  | ||| || || |||||||||||||| |||||||    
T  18537082 ctcttaaaactttattcccgaggcacaagacaatggcactcttggccttgt 18537132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 263 - 340
Target Start/End: Original strand, 9176193 - 9176270
Alignment:
Q  263 accgcttgcatcttaaccttccacaacccgaaatcattacttccggtgaacttctcgatgtcccactttgaccccatg 340  Q
    ||||||| |||||| |||||||| ||||||||||| |||  |||||| |||||||| || || |||||||| ||||||    
T  9176193 accgcttccatctttaccttccataacccgaaatcgttatctccggtaaacttctctatatcgcactttgaacccatg 9176270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 23 - 107
Target Start/End: Original strand, 14788911 - 14788995
Alignment:
Q  23 agttgttgcttcaagagttgcctatgagccaaagatttcgtcatatacaatgactccaacttcgcccacatcgatgccgcggtag 107  Q
    ||||||||||| | || ||||| |||||||||||| || |||||||||||  | || | ||| | ||||||||||||||||||||    
T  14788911 agttgttgctttaggacttgccgatgagccaaagactttgtcatatacaaatattcgatctttgaccacatcgatgccgcggtag 14788995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 266 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 4588442 - 4588375
Alignment:
Q  266 gcttgcatcttaaccttccacaacccgaaatcattacttccggtgaacttctcgatgtcccactttga 333  Q
    ||||||||||| ||| || | ||||| || |||||| |||||||||||||||| || |||||||||||    
T  4588442 gcttgcatcttcaccatcaataacccaaattcattatttccggtgaacttctcaatatcccactttga 4588375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 265 - 340
Target Start/End: Original strand, 18311095 - 18311170
Alignment:
Q  265 cgcttgcatcttaaccttccacaacccgaaatcattacttccggtgaacttctcgatgtcccactttgaccccatg 340  Q
    ||||| |||||| |||||||| ||||| ||||| |||  |||||| |||||||| || ||||||||||| ||||||    
T  18311095 cgcttccatctttaccttccataacccaaaatcgttatctccggtaaacttctcaatatcccactttgaacccatg 18311170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 265 - 340
Target Start/End: Original strand, 18409072 - 18409147
Alignment:
Q  265 cgcttgcatcttaaccttccacaacccgaaatcattacttccggtgaacttctcgatgtcccactttgaccccatg 340  Q
    ||||| |||||| |||||||| ||||| ||||| |||  |||||| |||||||| || ||||||||||| ||||||    
T  18409072 cgcttccatctttaccttccataacccaaaatcgttatctccggtaaacttctcaatatcccactttgaacccatg 18409147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 271 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 4558754 - 4558680
Alignment:
Q  271 catcttaaccttccacaacccgaaatcattacttccggtgaacttctcgatgtcccactttgaccccatgatacc 345  Q
    |||||| ||||||||||||| ||| || ||||| ||||| ||||| || || |||||||| || |||||||||||    
T  4558754 catctttaccttccacaacctgaagtcgttactaccggtaaacttttcaatatcccacttcgaacccatgatacc 4558680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 44 - 90
Target Start/End: Original strand, 5207119 - 5207165
Alignment:
Q  44 ctatgagccaaagatttcgtcatatacaatgactccaacttcgccca 90  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  5207119 ctatgagccaaagactttgtcatatacaaagactccaactttgccca 5207165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 20 - 98
Target Start/End: Original strand, 12395335 - 12395412
Alignment:
Q  20 tagagttgttgcttcaagagttgcctatgagccaaagatttcgtcatatacaatgactccaacttcgcccacatcgatg 98  Q
    |||||||||||||| | || ||||| |||||||||||| ||  ||| |||||| || |||||||| |||||||||||||    
T  12395335 tagagttgttgctttaggaattgccgatgagccaaagactttttca-atacaaagattccaactttgcccacatcgatg 12395412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 20 - 98
Target Start/End: Original strand, 12400297 - 12400374
Alignment:
Q  20 tagagttgttgcttcaagagttgcctatgagccaaagatttcgtcatatacaatgactccaacttcgcccacatcgatg 98  Q
    |||||||||||||| | || ||||| |||||||||||| ||  ||| |||||| || |||||||| |||||||||||||    
T  12400297 tagagttgttgctttaggaattgccgatgagccaaagactttttca-atacaaagattccaactttgcccacatcgatg 12400374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 40 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 26558425 - 26558327
Alignment:
Q  40 ttgcctatgagccaaagatttcgtcatatacaatgactccaacttcgcccacatcgatgccgcggtagcttctctcgcgacatcccttaagaccttatc 138  Q
    |||| ||| |||||| ||| | ||||||||||| ||||||||||| | ||| ||| |||||||||| | |||  | |||||||||||||| || |||||    
T  26558425 ttgcatataagccaaggatatggtcatatacaacgactccaactttgaccatatccatgccgcggttggttcctttgcgacatcccttaaaactttatc 26558327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 23 - 105
Target Start/End: Complemental strand, 47563610 - 47563528
Alignment:
Q  23 agttgttgcttcaagagttgcctatgagccaaagatttcgtcatatacaatgactccaacttcgcccacatcgatgccgcggt 105  Q
    ||||||||||| | || ||| | ||||||||| || || ||||||||||| || ||||||||  |||||||||||| ||||||    
T  47563610 agttgttgctttaggaattgtcgatgagccaacgactttgtcatatacaaagattccaacttttcccacatcgatgtcgcggt 47563528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 263 - 340
Target Start/End: Original strand, 22802455 - 22802532
Alignment:
Q  263 accgcttgcatcttaaccttccacaacccgaaatcattacttccggtgaacttctcgatgtcccactttgaccccatg 340  Q
    ||||||| |||||| |||||||| ||||  ||||| |||  |||||| |||||||| || ||||||||||| ||||||    
T  22802455 accgcttccatctttaccttccataacctaaaatcgttatctccggtaaacttctcaatatcccactttgaacccatg 22802532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 263 - 344
Target Start/End: Original strand, 36921216 - 36921297
Alignment:
Q  263 accgcttgcatcttaaccttccacaacccgaaatcattacttccggtgaacttctcgatgtcccactttgaccccatgatac 344  Q
    ||||||| |||||| |||||||| ||||| ||||  |||  |||||| || ||||| || ||||||||||| ||||||||||    
T  36921216 accgcttccatctttaccttccataacccaaaattgttatctccggtaaaattctcaatatcccactttgaacccatgatac 36921297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 287; Significance: 1e-161; HSPs: 28)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 287; E-Value: 1e-161
Query Start/End: Original strand, 19 - 366
Target Start/End: Original strand, 41397666 - 41398013
Alignment:
Q  19 atagagttgttgcttcaagagttgcctatgagccaaagatttcgtcatatacaatgactccaacttcgcccacatcgatgccgcggtagcttctctcgcg 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41397666 atagagttgttgcttcaagagttgcctatgagccaaagatttcgtcatatacaatgactccaacttcgcccacatcgatgccgcggtagcttctctcgcg 41397765  T
Q  119 acatcccttaagaccttatctctgagacataaaacaatggcactctttgccttgtttaccatctcacgcttctcctcttgtgtcaaggttgccggcatcg 218  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41397766 acatcccttaagaccttatctccgagacataagacaatggcactctttgccttgtctaccatctcacgcttctcctcttgtgtcaaggttgccggcatcg 41397865  T
Q  219 ccgcttcaccctttaatgcttctacacacnnnnnnngtgtcaaaaccgcttgcatcttaaccttccacaacccgaaatcattacttccggtgaacttctc 318  Q
    |||||| |||||| |||||||||||||||       ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  41397866 ccgcttgacccttcaatgcttctacacacttttgttgtgtcaataccgcttgcatcttaaccttccacaacccgaaatcattacttctggtgaacttctc 41397965  T
Q  319 gatgtcccactttgaccccatgataccaactatcaataactcctatgc 366  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||    
T  41397966 gatgtcccactttgaccccatgatatcaactatcaatcacgcctatgc 41398013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 247; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 19 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 19359498 - 19359151
Alignment:
Q  19 atagagttgttgcttcaagagttgcctatgagccaaagatttcgtcatatacaatgactccaacttcgcccacatcgatgccgcggtagcttctctcgcg 118  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  19359498 atagagttgttgtttcaagagttgcctatgagccaaagatttcgtcatgtacaatgacttcaacttagcccacatcgatgccgcggtagcttctctcacg 19359399  T
Q  119 acatcccttaagaccttatctctgagacataaaacaatggcactctttgccttgtttaccatctcacgcttctcctcttgtgtcaaggttgccggcatcg 218  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| || |||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||| |    
T  19359398 acatccgttaagaccttatctccgagacataaaacaatagcactctttgccttgtctatcatctcacgcttctctacttgtgtcaaagttgccggcatag 19359299  T
Q  219 ccgcttcaccctttaatgcttctacacacnnnnnnngtgtcaaaaccgcttgcatcttaaccttccacaacccgaaatcattacttccggtgaacttctc 318  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||       ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19359298 ccgcttcacccttcagtgcttctacacacttttgttgtgtcaaaaacgcttgcatcttaaccttccacaacccgaaatcattacttccggtgaacttctc 19359199  T
Q  319 gatgtcccactttgaccccatgataccaactatcaataactcctatgc 366  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  19359198 gatgtcccactttgaacccatgataccaactaccaataacgcctatgc 19359151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 220; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 19 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 47099478 - 47099147
Alignment:
Q  19 atagagttgttgcttcaagagttgcctatgagccaaagatttcgtcatatacaatgactccaacttcgcccacatcgatgccgcggtagcttctctcgcg 118  Q
    |||||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| |    
T  47099478 atagagttgttgtttcacgagttgcctatgagccaacgatttcgtcatgtaaaatgactccaacttagcccacatcgatgccgcggtagcttccctcgtg 47099379  T
Q  119 acatcccttaagaccttatctctgagacataaaacaatggcactctttgccttgtttaccatctcacgcttctcctcttgtgtcaaggttgccggcatcg 218  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||  |||||||||| |||| |||||||    
T  47099378 acatcccttaaaaccttatctccgagacataaaacaatggcactcttagcattgtttatcatctcacgcttctccgtttgtgtcaagtttgctggcatcg 47099279  T
Q  219 ccgcttcaccctttaatgcttctacacacnnnnnnngtgtcaaaaccgcttgcatcttaaccttccacaacccgaaatcattacttccggtgaacttctc 318  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||         ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47099278 ccgcttcacccttcaatgcttctacac-tttttttggtgtcaaaaccgcttgcatcttaaccttccacaacccgaaatcattacttccggtgaacttctc 47099180  T
Q  319 gatgtcccactttgaccccatgataccaactat 351  Q
     |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  47099179 aatgtcccactttgaacccatgataccaactat 47099147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 20 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 17346173 - 17345846
Alignment:
Q  20 tagagttgttgcttcaagagttgcctatgagccaaagatttcgtcatatacaatgactccaacttcgcccacatcgatgccgcggtagcttctctcgcga 119  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| | |||| ||||||||||| |||||||||||||| || |||||||| ||||  ||||||||||| ||| |||    
T  17346173 tagagttgttgtttcaagagttgcctatcaaccaacgatttcgtcatgtacaatgactccaatttagcccacattgatgatgcggtagcttccctcacga 17346074  T
Q  120 catcccttaagaccttatctctgagacataaaacaatggcactctttgccttgtttaccatctcacgcttctcctcttgtgtcaaggttgccggcatcgc 219  Q
    |||||||||| ||||||| |  || ||||||||||| |  ||| ||| |||||| || |||||||||||||||| ||||||||||  ||| | |||||||    
T  17346073 catcccttaaaaccttatattcgatacataaaacaacgatacttttttccttgtctatcatctcacgcttctccacttgtgtcaaatttgtcagcatcgc 17345974  T
Q  220 cgcttcaccctttaatgcttctacacacnnnnnnngtgtcaaaaccgcttgcatcttaaccttccacaacccgaaatcattacttccggtgaacttctcg 319  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||       || ||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| || | || ||||||    
T  17345973 cgcttcacccttcaatgcttctacacacttttgttgtttcaaaactgcttgcattttaaccttccataacccgaaatcattactttcgattaaattctcg 17345874  T
Q  320 atgtcccactttgaccccatgataccaa 347  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||||    
T  17345873 atgtcccacattgaacccatgataccaa 17345846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 19 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 9024485 - 9024155
Alignment:
Q  19 atagagttgttgcttcaagagttgcctatgagccaaagatttcgtcatatacaatgactccaacttcgcccacatcgatgccgcggtagcttctctcgcg 118  Q
    |||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||| ||| |||||||| |||| | || | ||||| ||||||    
T  9024485 atagagttgttgtttcaagagtttcctatgagccaatgatttcgtcatgtacaataactccatcttagcccacattgatgtcacgatggcttccctcgcg 9024386  T
Q  119 acatcccttaagaccttatctctgagacataaaacaatggcactctttgccttgtttaccatctcacgcttctcctcttgtgtcaaggttgccggcatcg 218  Q
    |||| |||||| |||||||||  |||||||||||||||  || | ||| |||||| || |||||||| ||| ||| ||||| ||||  || || |||| |    
T  9024385 acataccttaaaaccttatcttcgagacataaaacaattacattattttccttgtatatcatctcacccttttccgcttgtatcaaattttccagcatgg 9024286  T
Q  219 ccgcttcaccctttaatgcttctacacacnnnnnnngtgtcaaaaccgcttgcatcttaaccttccacaacccgaaatcattacttccggtgaacttctc 318  Q
    | | |||| |||| ||||||| |||||||       || | |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||    
T  9024285 cgggttcatccttcaatgcttgtacacacttttgttgtattaaaaccgcttgcatcttaaccttccacaatacgaaatcattacttccagtgaacttctc 9024186  T
Q  319 gatgtcccactttgaccccatgataccaact 349  Q
    | ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  9024185 ggtgtcccactttgaacccatgataccaact 9024155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 19 - 333
Target Start/End: Original strand, 28222852 - 28223166
Alignment:
Q  19 atagagttgttgcttcaagagttgcctatgagccaaagatttcgtcatatacaatgactccaacttcgcccacatcgatgccgcggtagcttctctcgcg 118  Q
    ||||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||| ||||| | |||  |||||    
T  28222852 atagagttgttgcttaaggaattgcctatgagccaaagatttggtcatatacaatgacaccaactttgaccacatcgatgctgcggttggttccttcgcg 28222951  T
Q  119 acatcccttaagaccttatctctgagacataaaacaatggcactctttgccttgtttaccatctcacgcttctcctcttgtgtcaaggttgccggcatcg 218  Q
    |||||||| || || || || | ||| || || ||||||  | || | |||||||  || |||||   ||||||| ||||||||| |||  |||||| ||    
T  28222952 acatccctcaaaactttgtcaccgaggcacaagacaatgaaattcctagccttgtccactatctcggtcttctccgcttgtgtcatggtgcccggcaacg 28223051  T
Q  219 ccgcttcaccctttaatgcttctacacacnnnnnnngtgtcaaaaccgcttgcatcttaaccttccacaacccgaaatcattacttccggtgaacttctc 318  Q
    |   ||||||||| || ||||   || ||       || |||| |||||||||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||||||||| ||||||||    
T  28223052 cactttcacccttcaaagctttctcatacttttgttgtatcaacaccgcttgcatcttcaccttccataacccaaaatcgttacttccggtaaacttctc 28223151  T
Q  319 gatgtcccactttga 333  Q
     || |||||||||||    
T  28223152 aatatcccactttga 28223166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 19 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 3157400 - 3157216
Alignment:
Q  19 atagagttgttgcttcaagagttgcctatgagccaaagatttcgtcatatacaatgactccaacttcgcccacatcgatgccgcggtagcttctctcgcg 118  Q
    ||||||||||||||| | || ||| |||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||| | ||||||||| |||||||||| |||  |||||    
T  3157400 atagagttgttgcttaaggaattgtctatgagccaaagacttggtcatatagaatgactccaactttgaccacatcgacgccgcggtaggttccttcgcg 3157301  T
Q  119 acatcccttaagaccttatctctgagacataaaacaatggcactctttgccttgtttaccatctcacgcttctcctcttgtgtca 203  Q
    |||||||| || || ||  | | ||| || || |||||||||||| | |||||||  ||||||||   |||||||||||||||||    
T  3157300 acatccctcaaaactttgccaccgaggcacaagacaatggcactcctagccttgtccaccatctcggtcttctcctcttgtgtca 3157216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 20 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 16226972 - 16226648
Alignment:
Q  20 tagagttgttgcttcaagagttgcctatgagccaaagatttcgtcatatacaatgactccaacttcgcccacatcgatgccgcggtagcttctctcgcga 119  Q
    |||||| ||||||| | || ||||| |||||||||||| || ||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||| |||||  | |  |    
T  16226972 tagagtcgttgctttaggaattgccgatgagccaaagactttgtcatatacaaagattccaactttgcccacatcgatgccgcggttgcttcctttgtta 16226873  T
Q  120 catcccttaagaccttatctctgagacataaaacaatggcactctttgccttgtttaccatctcacgcttctcctcttgtgtcaaggttgccggcatcgc 219  Q
    | || ||||| || ||||| | ||| || || |||| ||||||| | |||||||  ||||||||   ||||||| |||||| || |||  |||| | ||     
T  16226872 cttctcttaaaactttatccccgaggcacaagacaacggcactcctggccttgtccaccatctcggtcttctccgcttgtgacatggtgaccggtaacga 16226773  T
Q  220 cgcttcaccctttaatgcttctacacacnnnnnnngtgtcaaaaccgcttgcatcttaaccttccacaacccgaaatcattacttccggtgaacttctcg 319  Q
      |||||||||| || ||||   |||||       || | || ||||||| |||||| |||||||| ||||||||||| |||  |||||| |||||||||    
T  16226772 accttcacccttcaaagctttctcacacttttgttgtattaacaccgcttccatctttaccttccataacccgaaatcgttatctccggtaaacttctcg 16226673  T
Q  320 atgtcccactttgaccccatgatac 344  Q
    || ||||||||||| ||||||||||    
T  16226672 atatcccactttgaacccatgatac 16226648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 23 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 31657937 - 31657627
Alignment:
Q  23 agttgttgcttcaagagttgcctatgagccaaagatttcgtcatatacaatgactccaacttcgcccacatcgatgccgcggtagcttctctcgcgacat 122  Q
    ||||||||||| | || || ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||| | |||  || ||||||    
T  31657937 agttgttgcttaaggaatttcctataagccaaagatttggtcatatacaatgactccaactttgaccacatcgacgccgcggttggttccttcacgacat 31657838  T
Q  123 cccttaagaccttatctctgagacataaaacaatggcactctttgccttgtttaccatctcacgcttctcctcttgtgtcaaggttgccggcatcgccgc 222  Q
    |||| || || || || | ||| || || |||||||||||| | |||||||  ||||||||   ||||||  ||||||||| | |  ||| || |||  |    
T  31657837 ccctcaaaactttgtcaccgaggcacaagacaatggcactcctagccttgtccaccatctcggtcttctctgcttgtgtcatgatgaccgacaacgcacc 31657738  T
Q  223 ttcaccctttaatgcttctacacacnnnnnnngtgtcaaaaccgcttgcatcttaaccttccacaacccgaaatcattacttccggtgaacttctcgatg 322  Q
    ||||||||| || | ||   ||||        || | ||  || |||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||     
T  31657737 ttcacccttcaaagttttctcacagttttgttgtataaacgccacttgcatcttcaccttccataacccaaaatcattacttccggtgaacttctcaata 31657638  T
Q  323 tcccactttga 333  Q
    |||||||||||    
T  31657637 tcccactttga 31657627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 20 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 51750841 - 51750521
Alignment:
Q  20 tagagttgttgcttcaagagttgcctatgagccaaagatttcgtcatatacaatgactccaacttcgcccacatcgatgccgcggtagcttctctcgcga 119  Q
    |||||||||||||| | || ||||| |||||||||||| || ||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||| |||||  | || |    
T  51750841 tagagttgttgctttaggaattgccgatgagccaaagactttgtcatatacaaagattccaactttgcccacatcgatgccgcggttgcttcctttgcta 51750742  T
Q  120 catcccttaagaccttatctctgagacataaaacaatggcactctttgccttgtttaccatctcacgcttctcctcttgtgtcaaggttgccggcatcgc 219  Q
    | || || || || ||||| | ||| || || |||||||||||| | |||||||  ||||||||   ||||||| || ||| || |||  |||| | ||     
T  51750741 cttctctcaaaactttatccccgaggcacaagacaatggcactcctggccttgtccaccatctcggtcttctccgctcgtgacatggtgaccggtaacga 51750642  T
Q  220 cgcttcaccctttaatgcttctacacacnnnnnnngtgtcaaaaccgcttgcatcttaaccttccacaacccgaaatcattacttccggtgaacttctcg 319  Q
      |||||||||| || ||||   |||||       || | || ||||||| |||||| |||||||| ||||| ||||| |||  |||||| ||||||||     
T  51750641 accttcacccttcaaagctttctcacacttttgctgtattaacaccgcttccatctttaccttccataacccaaaatcgttatctccggtaaacttctca 51750542  T
Q  320 atgtcccactttgaccccatg 340  Q
    || ||||||||||| ||||||    
T  51750541 atatcccactttgaacccatg 51750521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 20 - 111
Target Start/End: Complemental strand, 28841226 - 28841135
Alignment:
Q  20 tagagttgttgcttcaagagttgcctatgagccaaagatttcgtcatatacaatgactccaacttcgcccacatcgatgccgcggtagcttc 111  Q
    |||||||||||||| | || ||||| |||||||||||| || ||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  28841226 tagagttgttgctttaggaattgccgatgagccaaagactttgtcatatacaaagattccaactttgcccacatcgatgccgcggttgcttc 28841135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 19 - 203
Target Start/End: Original strand, 50168781 - 50168964
Alignment:
Q  19 atagagttgttgcttcaagagttgcctatgagccaaagatttcgtcatatacaatgactccaacttcgcccacatcgatgccgcggtagcttctctcgcg 118  Q
    ||||||||||||||| | || |||||||||||||||| | || ||||||||||| ||||||||||| | ||| ||||| | || ||| | |||  |||||    
T  50168781 atagagttgttgcttaaggaattgcctatgagccaaaaacttggtcatatacaa-gactccaactttgaccatatcgacgtcgtggttggttccttcgcg 50168879  T
Q  119 acatcccttaagaccttatctctgagacataaaacaatggcactctttgccttgtttaccatctcacgcttctcctcttgtgtca 203  Q
    |||||||| || || || || ||||| || || |||||||||||| | |||||||  ||||||||   ||||||| |||||||||    
T  50168880 acatccctcaaaactttgtcactgaggcacaagacaatggcactcctagccttgtccaccatctcggtcttctccgcttgtgtca 50168964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 20 - 103
Target Start/End: Original strand, 27338608 - 27338691
Alignment:
Q  20 tagagttgttgcttcaagagttgcctatgagccaaagatttcgtcatatacaatgactccaacttcgcccacatcgatgccgcg 103  Q
    |||||||||||||| | || ||||| ||||| |||||| || ||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||    
T  27338608 tagagttgttgctttaggaattgccaatgagtcaaagactttgtcatatacaaagattccaactttgcccacatcgatgccgcg 27338691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 20 - 126
Target Start/End: Complemental strand, 16456454 - 16456348
Alignment:
Q  20 tagagttgttgcttcaagagttgcctatgagccaaagatttcgtcatatacaatgactccaacttcgcccacatcgatgccgcggtagcttctctcgcga 119  Q
    |||||||||||||| | || |||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||| |  |||||| | ||||| || | |||  ||||||    
T  16456454 tagagttgttgctttaggatttgcctatgagccaaagtcttggtcatatacaatgactccaactttgatcacatcaacgccgcagttggttccttcgcga 16456355  T
Q  120 catccct 126  Q
    |||||||    
T  16456354 catccct 16456348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 19 - 64
Target Start/End: Complemental strand, 775810 - 775765
Alignment:
Q  19 atagagttgttgcttcaagagttgcctatgagccaaagatttcgtc 64  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  775810 atagagttgttgtttcaagagttgcctatgagccaacgatttcgtc 775765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 20 - 105
Target Start/End: Complemental strand, 20300935 - 20300850
Alignment:
Q  20 tagagttgttgcttcaagagttgcctatgagccaaagatttcgtcatatacaatgactccaacttcgcccacatcgatgccgcggt 105  Q
    |||||||||||||| | || ||| | |||||||||||| || ||||||||||| || |||||||| ||||| ||||||||| ||||    
T  20300935 tagagttgttgctttaggaattgacgatgagccaaagactttgtcatatacaaagattccaactttgcccatatcgatgccacggt 20300850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 20 - 105
Target Start/End: Original strand, 28203174 - 28203259
Alignment:
Q  20 tagagttgttgcttcaagagttgcctatgagccaaagatttcgtcatatacaatgactccaacttcgcccacatcgatgccgcggt 105  Q
    |||||||||||||| | || ||| | ||||| |||||| || ||| ||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  28203174 tagagttgttgctttaggaattgtcgatgagtcaaagactttgtcttatacaaagattccaactttgcccacatcgatgccgcggt 28203259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 40 - 103
Target Start/End: Complemental strand, 47178146 - 47178083
Alignment:
Q  40 ttgcctatgagccaaagatttcgtcatatacaatgactccaacttcgcccacatcgatgccgcg 103  Q
    ||||| ||||||||| || || ||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||    
T  47178146 ttgccgatgagccaatgactttgtcatatacaaagattccaactttgcccacatcgatgccgcg 47178083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 20 - 111
Target Start/End: Complemental strand, 51758338 - 51758247
Alignment:
Q  20 tagagttgttgcttcaagagttgcctatgagccaaagatttcgtcatatacaatgactccaacttcgcccacatcgatgccgcggtagcttc 111  Q
    |||||||||||||| | || ||| | |||||||||||| || ||| ||||||| || ||||| || ||||||||||||| |||||| |||||    
T  51758338 tagagttgttgctttaggaattgtcgatgagccaaagactttgtcgtatacaaagattccaattttgcccacatcgatgtcgcggttgcttc 51758247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 271 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 9522171 - 9522097
Alignment:
Q  271 catcttaaccttccacaacccgaaatcattacttccggtgaacttctcgatgtcccactttgaccccatgatacc 345  Q
    |||||| ||||||||||||||||| || ||||| ||||| ||||| || || |||||||| || |||||||||||    
T  9522171 catctttaccttccacaacccgaagtcgttactaccggtaaacttttcaatatcccacttcgaacccatgatacc 9522097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 263 - 340
Target Start/End: Original strand, 27338851 - 27338928
Alignment:
Q  263 accgcttgcatcttaaccttccacaacccgaaatcattacttccggtgaacttctcgatgtcccactttgaccccatg 340  Q
    ||||||| |||||| |||||||| ||||| ||||| |||  |||||| |||||||| || ||||||||||| ||||||    
T  27338851 accgcttccatctttaccttccataacccaaaatcgttatctccggtaaacttctcaatatcccactttgaacccatg 27338928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 263 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 47177923 - 47177846
Alignment:
Q  263 accgcttgcatcttaaccttccacaacccgaaatcattacttccggtgaacttctcgatgtcccactttgaccccatg 340  Q
    ||||||| |||||| |||||||| ||||||||||  |||  |||||| |||||||| || ||||||||||| ||||||    
T  47177923 accgcttccatctttaccttccataacccgaaattgttatctccggtaaacttctcaatatcccactttgaacccatg 47177846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 71 - 163
Target Start/End: Original strand, 13784790 - 13784882
Alignment:
Q  71 aatgactccaacttcgcccacatcgatgccgcggtagcttctctcgcgacatcccttaagaccttatctctgagacataaaacaatggcactc 163  Q
    |||||||||||||| | |||||||||||  ||||||| |||  ||||||||||||| || |  ||||||||||| || || |||||| |||||    
T  13784790 aatgactccaactttgaccacatcgatgttgcggtaggttccttcgcgacatccctcaaaattttatctctgaggcacaagacaatgccactc 13784882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 271 - 345
Target Start/End: Original strand, 2400959 - 2401033
Alignment:
Q  271 catcttaaccttccacaacccgaaatcattacttccggtgaacttctcgatgtcccactttgaccccatgatacc 345  Q
    |||||| ||||||||||||||||| || ||||| ||||  ||||| || || |||||||| || |||||||||||    
T  2400959 catctttaccttccacaacccgaagtcgttactaccggaaaacttttcaatatcccacttcgaacccatgatacc 2401033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 23 - 105
Target Start/End: Original strand, 3805616 - 3805698
Alignment:
Q  23 agttgttgcttcaagagttgcctatgagccaaagatttcgtcatatacaatgactccaacttcgcccacatcgatgccgcggt 105  Q
    ||||||||||| | || ||||| ||||||||||||||| |||||| ||||  |||| ||| | | ||||||||||| ||||||    
T  3805616 agttgttgctttaggaattgccaatgagccaaagatttggtcataaacaacaactctaacgttgaccacatcgatgtcgcggt 3805698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 23 - 105
Target Start/End: Complemental strand, 6996385 - 6996303
Alignment:
Q  23 agttgttgcttcaagagttgcctatgagccaaagatttcgtcatatacaatgactccaacttcgcccacatcgatgccgcggt 105  Q
    ||||||||||| | || ||||| |||||||||||| || |||||||||||  | || ||||| | ||||||||||| ||||||    
T  6996385 agttgttgctttaggacttgccgatgagccaaagactttgtcatatacaaatattcgaactttgaccacatcgatgtcgcggt 6996303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 23 - 105
Target Start/End: Original strand, 13127213 - 13127295
Alignment:
Q  23 agttgttgcttcaagagttgcctatgagccaaagatttcgtcatatacaatgactccaacttcgcccacatcgatgccgcggt 105  Q
    ||||||| ||| |||| ||| | |||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||| |   ||||||||| ||||||    
T  13127213 agttgtttctttaagaattgtcgatgagccaaagaatttgtcatatacaaagactccaactttgaagacatcgatgtcgcggt 13127295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 23 - 105
Target Start/End: Original strand, 31736954 - 31737036
Alignment:
Q  23 agttgttgcttcaagagttgcctatgagccaaagatttcgtcatatacaatgactccaacttcgcccacatcgatgccgcggt 105  Q
    ||||||||||| | || || || |||||||||||| || |||||||||||  | || ||||| | ||||||||||||||||||    
T  31736954 agttgttgctttaggactttccgatgagccaaagactttgtcatatacaaatattcgaactttgaccacatcgatgccgcggt 31737036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 275; Significance: 1e-154; HSPs: 58)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 275; E-Value: 1e-154
Query Start/End: Original strand, 19 - 366
Target Start/End: Original strand, 32479767 - 32480114
Alignment:
Q  19 atagagttgttgcttcaagagttgcctatgagccaaagatttcgtcatatacaatgactccaacttcgcccacatcgatgccgcggtagcttctctcgcg 118  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  32479767 atagagttgttgcttcaagagttgcctatgagccaaagatttcgtcatatacaatgactccaactttgcccacatcgatgctgcggtagcttccctcgcg 32479866  T
Q  119 acatcccttaagaccttatctctgagacataaaacaatggcactctttgccttgtttaccatctcacgcttctcctcttgtgtcaaggttgccggcatcg 218  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32479867 acatcccttaagaccttatctccgagacataagacaatggcactctttgccttgtctaccatctcacgcttctcctcttgtgtcaaggttgccggcatcg 32479966  T
Q  219 ccgcttcaccctttaatgcttctacacacnnnnnnngtgtcaaaaccgcttgcatcttaaccttccacaacccgaaatcattacttccggtgaacttctc 318  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||       ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32479967 ccgcttcacccttcaatgcttctacacacttttgttgtgtcaataccgcttgcatcttaaccttccataacccgaaatcattacttccggtgaacttctc 32480066  T
Q  319 gatgtcccactttgaccccatgataccaactatcaataactcctatgc 366  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  |||||||| || |||||||    
T  32480067 gatgtcccactttgaccccatgatacctcctatcaatcacgcctatgc 32480114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 263; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 19 - 366
Target Start/End: Original strand, 8516521 - 8516868
Alignment:
Q  19 atagagttgttgcttcaagagttgcctatgagccaaagatttcgtcatatacaatgactccaacttcgcccacatcgatgccgcggtagcttctctcgcg 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  8516521 atagagttgttgcttcaagagttgcctatgagccaaagatttcgtcatatataatgactctaactttgcccacatcgatgccgcggtagcttccctcgcg 8516620  T
Q  119 acatcccttaagaccttatctctgagacataaaacaatggcactctttgccttgtttaccatctcacgcttctcctcttgtgtcaaggttgccggcatcg 218  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8516621 acatcccttaagaccttatctccgagacataagacaatagcactctttgccttgtctaccatctcacgcttctcctcttgtgtcaaggttgccggcatcg 8516720  T
Q  219 ccgcttcaccctttaatgcttctacacacnnnnnnngtgtcaaaaccgcttgcatcttaaccttccacaacccgaaatcattacttccggtgaacttctc 318  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||       ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8516721 ccgcttcacccttcaatgcttctacacacttttgttgtgtcaataccgcttgcatcttaaccttccataacccgaaatcattacttccggtgaacttctc 8516820  T
Q  319 gatgtcccactttgaccccatgataccaactatcaataactcctatgc 366  Q
    ||||||||||||||||||||||||||   |||||||| || |||||||    
T  8516821 gatgtcccactttgaccccatgatacttcctatcaatcacgcctatgc 8516868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 19 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 3324208 - 3323875
Alignment:
Q  19 atagagttgttgcttcaagagttgcctatgagccaaagattt-cgtcatatacaatgactccaacttcgcccacatcgatgccgcggtagcttctctcgc 117  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||| | ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  3324208 atagagttgttgtttcaagagttgcctatgagccaacgattttcgtcttgtacaatgactccaacttagcccacatcgacgccgcggtagcttccctcgc 3324109  T
Q  118 gacatcccttaagaccttatctctgagacataaaacaatggcactctttgccttgtttaccatctcacgcttctcctcttgtgtcaaggttgccggcatc 217  Q
    |||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||| ||||||| ||||||| || |||||||||||||||| ||||||||||  || |||||||     
T  3324108 gacatcccttaagaacttatttccgagacataaaacaatgacactcttagccttgtctatcatctcacgcttctccgcttgtgtcaaattttccggcatt 3324009  T
Q  218 gccgcttcaccctttaatgcttctacacacnnnnnnngtgtcaaaaccgcttgcatcttaaccttccacaacccgaaatcattacttccggtgaacttct 317  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| ||       |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  3324008 gccgcttcacccttcaatgcttctacaaacttttgttgtgtcaaaaccgcttgcatcttaaccttccacaacccgaaatcattacttctagtgaacttct 3323909  T
Q  318 cgatgtcccactttgaccccatgataccaactat 351  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  3323908 cgatgtcccactttgaacccatgataccaactat 3323875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 19 - 349
Target Start/End: Original strand, 16263790 - 16264120
Alignment:
Q  19 atagagttgttgcttcaagagttgcctatgagccaaagatttcgtcatatacaatgactccaacttcgcccacatcgatgccgcggtagcttctctcgcg 118  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||    
T  16263790 atagagttgttgtttcaagagctgcctatga-ccaaagatttcgtcatgtacaatgactccaacttagcccacattgacgccgcagtagcttctctcgcg 16263888  T
Q  119 acatcccttaagaccttatctctgagacataaaacaatggcactctttgccttgtttaccatctcacgcttctcctcttgtgtcaaggttgccggcatcg 218  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||||| ||||||||||  | ||||||||||    
T  16263889 acatcccttaagaccttatctccgagacataaaacaatggcactcttttccttgtctatcatctcacgcttctccgcttgtgtcaaactcgccggcatcg 16263988  T
Q  219 ccgcttcaccctttaatgcttctacacacnnnnnnngtgtc-aaaaccgcttgcatcttaaccttccacaacccgaaatcattacttccggtgaacttct 317  Q
    || |||||||||| |||||||||||||||       ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |    
T  16263989 ccacttcacccttcaatgcttctacacacttttgttgtgtcaaaaatcgcttgcatcttaaccttccacaacttgaaatcattacttccggtgaacttat 16264088  T
Q  318 cgatgtcccactttgaccccatgataccaact 349  Q
    ||||||| |||||||| |||||||||| ||||    
T  16264089 cgatgtctcactttgaacccatgatacaaact 16264120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 19 - 340
Target Start/End: Original strand, 22834439 - 22834759
Alignment:
Q  19 atagagttgttgcttcaagagttgcctatgagccaaagatttcgtcatatacaatgactccaacttcgcccacatcgatgccgcggtagcttctctcgcg 118  Q
    ||||||||||||||| | || |||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||| | |||  |||||    
T  22834439 atagagttgttgcttaaggaattgcctatgagccaaagacttgatcatatacaatgactccaactttgaccacatcgacgccgcggttggttccttcgcg 22834538  T
Q  119 acatcccttaagaccttatctctgagacataaaacaatggcactctttgccttgtttaccatctcacgcttctcctcttgtgtcaaggttgccggcatcg 218  Q
    |||||||| || || ||||| | ||| || || |||||||||||| | ||| |||  ||||||||   ||||||| ||||||||| |||  |||| | |     
T  22834539 acatccctcaaaactttatcaccgaggcacaagacaatggcactcctagcc-tgtccaccatctcggtcttctccgcttgtgtcatggtgaccggtaaca 22834637  T
Q  219 ccgcttcaccctttaatgcttctacacacnnnnnnngtgtcaaaaccgcttgcatcttaaccttccacaacccgaaatcattacttccggtgaacttctc 318  Q
    |  ||||||| || || ||||   |||||       || |||| |||||||||||||| |||||||| ||||  |||||||||||||| |||||||||||    
T  22834638 caccttcacctttcaaagctttctcacacttttgttgtatcaacaccgcttgcatcttcaccttccataacctaaaatcattacttccagtgaacttctc 22834737  T
Q  319 gatgtcccactttgaccccatg 340  Q
     || ||||||||||| ||||||    
T  22834738 aatatcccactttgaacccatg 22834759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 20 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 37407425 - 37407105
Alignment:
Q  20 tagagttgttgcttcaagagttgcctatgagccaaagatttcgtcatatacaatgactccaacttcgcccacatcgatgccgcggtagcttctctcgcga 119  Q
    |||||||||||||| | || |||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||| | |||||| ||||||||||| | |||  ||||||    
T  37407425 tagagttgttgcttaaggaattgcctatgagccaaagacttggtcatatacaacgactccaactttgaccacattgatgccgcggttggttccttcgcga 37407326  T
Q  120 catcccttaagaccttatctctgagacataaaacaatggcactctttgccttgtttaccatctcacgcttctcctcttgtgtcaaggttgccggcatcgc 219  Q
    ||||||| || || || || | ||| || || |||||||||||| | |||||||  ||||||||   ||||||| |||||| || |||  |||| | |||    
T  37407325 catccctcaaaactttgtccccgaggcacaagacaatggcactcctagccttgtccaccatctcggtcttctccgcttgtgacatggtgaccggtaacgc 37407226  T
Q  220 cgcttcaccctttaatgcttctacacacnnnnnnngtgtcaaaaccgcttgcatcttaaccttccacaacccgaaatcattacttccggtgaacttctcg 319  Q
      |||||||||| || ||||   |||||       || |||| |||||||||||||| |||||||| ||||  ||||| ||| ||||||| ||||||||     
T  37407225 accttcacccttgaaagctttctcacacttttgttgtatcaacaccgcttgcatcttcaccttccataacctaaaatcgttaattccggtaaacttctca 37407126  T
Q  320 atgtcccactttgaccccatg 340  Q
    || ||||||||||| ||||||    
T  37407125 atatcccactttgaacccatg 37407105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 19 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 7763008 - 7762683
Alignment:
Q  19 atagagttgttgcttcaagagttgcctatgagccaaagatttcgtcatatacaatgactccaacttcgcccacatcgatgccgcggtagcttctctcgcg 118  Q
    ||||||||||||||| |||| |||| ||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||| | |||||||||| |||||||   |||  |||||    
T  7763008 atagagttgttgcttaaagaattgcttatgagccaaagacttggtcatatataatgactccaactttgaccacatcgattccgcggttagttccttcgcg 7762909  T
Q  119 acatcccttaagaccttatctctgagacataaaacaatggcactctttgccttgtttaccatctcacgcttctcctcttgtgtcaaggttgccggcatc- 217  Q
    ||||||||||| || || || | ||| || || |||||||||||||| |||||||  ||||||||   ||||||| |||||| || |||  |||| | |     
T  7762908 acatcccttaaaactttgtcaccgaggcacaagacaatggcactcttagccttgtccaccatctcggtcttctccgcttgtgacatggtcaccggtaacg 7762809  T
Q  218 ---gccgcttcaccctttaatgc-ttctacacacnnnnnnngtgtcaaaaccgcttgcatcttaaccttccacaacccgaaatcattacttccggtgaac 313  Q
       ||  |||||||||| || || ||||| ||||       || |||| ||||||||||| || |||||||| ||||| ||||| ||| |||||||||||    
T  7762808 catgcaccttcacccttcaaagctttcta-acacttttgttgtatcaacaccgcttgcattttcaccttccataacccaaaatcgttaattccggtgaac 7762710  T
Q  314 ttctcgatgtcccactttgaccccatg 340  Q
    ||||| || ||||||||||| ||||||    
T  7762709 ttctcaatatcccactttgaacccatg 7762683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 20 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 10209937 - 10209617
Alignment:
Q  20 tagagttgttgcttcaagagttgcctatgagccaaagatttcgtcatatacaatgactccaacttcgcccacatcgatgccgcggtagcttctctcgcga 119  Q
    |||||||||||||| | || ||||||||||||||| || || |||||||||||||| |||||||| | ||| |||||||||||||| | |||  ||||||    
T  10209937 tagagttgttgcttaaggaattgcctatgagccaacgacttggtcatatacaatgattccaacttagaccatatcgatgccgcggttggttccttcgcga 10209838  T
Q  120 catcccttaagaccttatctctgagacataaaacaatggcactctttgccttgtttaccatctcacgcttctcctcttgtgtcaaggttgccggcatcgc 219  Q
    ||||||| || || ||||| | ||| || || |||||||| ||| | |||||||  ||||||||   |||||||||||||| || |||  ||||||   |    
T  10209837 catccctcaaaactttatccccgaggcacaagacaatggcgctcctcgccttgtccaccatctcggtcttctcctcttgtgacatggtgtccggcaaacc 10209738  T
Q  220 cgcttcaccctttaatgcttctacacacnnnnnnngtgtcaaaaccgcttgcatcttaaccttccacaacccgaaatcattacttccggtgaacttctcg 319  Q
      |||||||||| || ||||   |||||       |  |||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||  | ||||||||| ||||     
T  10209737 accttcacccttcaaagctttctcacacttttgttgaatcaacaccgcttgcatcttcaccttccacaacccaaaatcgttgatcccggtgaacatctca 10209638  T
Q  320 atgtcccactttgaccccatg 340  Q
    || ||||||||||| ||||||    
T  10209637 atatcccactttgaacccatg 10209617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 20 - 340
Target Start/End: Original strand, 23199570 - 23199890
Alignment:
Q  20 tagagttgttgcttcaagagttgcctatgagccaaagatttcgtcatatacaatgactccaacttcgcccacatcgatgccgcggtagcttctctcgcga 119  Q
    |||||||||||||| | || |||||||||||||||||| || ||||||||||| || |||||||| | ||| ||||||| |||||| | |||  |||| |    
T  23199570 tagagttgttgcttaaggaattgcctatgagccaaagacttggtcatatacaacgattccaactttgaccatatcgatgtcgcggttggttccttcgcaa 23199669  T
Q  120 catcccttaagaccttatctctgagacataaaacaatggcactctttgccttgtttaccatctcacgcttctcctcttgtgtcaaggttgccggcatcgc 219  Q
    ||||||| || || || || | ||| || || |||||||||||| | |||||||  |||||||    |||||||||||||| || |||  |||| | |||    
T  23199670 catccctcaaaactttgtccccgaggcacaagacaatggcactcctagccttgtccaccatctaggtcttctcctcttgtgacatggtgaccggtaacgc 23199769  T
Q  220 cgcttcaccctttaatgcttctacacacnnnnnnngtgtcaaaaccgcttgcatcttaaccttccacaacccgaaatcattacttccggtgaacttctcg 319  Q
      |||||||||| || ||||   |||||       || |||| |||||||||||||| |||||||| ||||| ||||| ||| | |||||||||||||||    
T  23199770 accttcacccttcaaagctttctcacacttttgttgtatcaacaccgcttgcatcttcaccttccataacccaaaatcgttaatcccggtgaacttctcg 23199869  T
Q  320 atgtcccactttgaccccatg 340  Q
    || || |||||||| ||||||    
T  23199870 atatcacactttgaacccatg 23199890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 20 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 29811605 - 29811285
Alignment:
Q  20 tagagttgttgcttcaagagttgcctatgagccaaagatttcgtcatatacaatgactccaacttcgcccacatcgatgccgcggtagcttctctcgcga 119  Q
    |||||||||||||| | || |||| |||||||||||||  | || |||||||||||||||||||| | |||||| || || ||||||| |||  | ||||    
T  29811605 tagagttgttgcttaaggaattgcttatgagccaaagacctggttatatacaatgactccaactttgaccacatggacgctgcggtaggttccttagcga 29811506  T
Q  120 catcccttaagaccttatctctgagacataaaacaatggcactctttgccttgtttaccatctcacgcttctcctcttgtgtcaaggttgccggcatcgc 219  Q
    ||||||| || || || || | ||| || || |||||||||||| | |||||||  |||||||    ||||||| ||||||||| |||  ||| || |||    
T  29811505 catccctcaaaactttgtcaccgaggcacaagacaatggcactcctagccttgtccaccatcttggtcttctccgcttgtgtcatggtgaccgacaacgc 29811406  T
Q  220 cgcttcaccctttaatgcttctacacacnnnnnnngtgtcaaaaccgcttgcatcttaaccttccacaacccgaaatcattacttccggtgaacttctcg 319  Q
      ||||||| || || | ||   |||||       || |||| |||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||     
T  29811405 accttcaccattcaaagatttctcacacttttgttgtatcaacaccgcttgcatcttcaccttccataacccaaaatcattacttccggtgaacttctca 29811306  T
Q  320 atgtcccactttgaccccatg 340  Q
    || ||||||||||| ||||||    
T  29811305 atatcccactttgaacccatg 29811285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 20 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 32891826 - 32891506
Alignment:
Q  20 tagagttgttgcttcaagagttgcctatgagccaaagatttcgtcatatacaatgactccaacttcgcccacatcgatgccgcggtagcttctctcgcga 119  Q
    |||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||    ||  || || |||  ||||||    
T  32891826 tagagttgttgcttaaggaattgcctatgagccaaagatttggtcatatacaatgactccaactttgaccacatcaccaccatggcaggttccttcgcga 32891727  T
Q  120 catcccttaagaccttatctctgagacataaaacaatggcactctttgccttgtttaccatctcacgcttctcctcttgtgtcaaggttgccggcatcgc 219  Q
    ||||||| ||    ||||| | ||| || || |||| ||||||| | |||||||  ||||||||   | ||||| ||||||||| |||  ||| || |||    
T  32891726 catccctaaaatttttatcaccgaggcacaagacaacggcactcctagccttgtccaccatctcggtcctctccgcttgtgtcatggtgaccgacaacgc 32891627  T
Q  220 cgcttcaccctttaatgcttctacacacnnnnnnngtgtcaaaaccgcttgcatcttaaccttccacaacccgaaatcattacttccggtgaacttctcg 319  Q
      |||||||||| |||||||   |||||       || |||| |||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||     
T  32891626 accttcacccttcaatgctttctcacacttttgttgtatcaacaccgcttgcatcttcaccttccataacccaaaatcattactttcggtgaacttctca 32891527  T
Q  320 atgtcccactttgaccccatg 340  Q
    || || |||||||| ||||||    
T  32891526 atatctcactttgaacccatg 32891506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 44 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 6717225 - 6716929
Alignment:
Q  44 ctatgagccaaagatttcgtcatatacaatgactccaacttcgcccacatcgatgccgcggtagcttctctcgcgacatcccttaagaccttatctctga 143  Q
    ||||||||||| || || ||||||||||| || |||||||| | ||| |||||||||||||| | |||  ||||||||||||| || || ||||| | ||    
T  6717225 ctatgagccaacgacttggtcatatacaacgattccaacttagaccatatcgatgccgcggttggttccttcgcgacatccctcaaaactttatccccga 6717126  T
Q  144 gacataaaacaatggcactctttgccttgtttaccatctcacgcttctcctcttgtgtcaaggttgccggcatcgccgcttcaccctttaatgcttctac 243  Q
    | || || |||||||||||| | |||||||  ||||||||   |||||||||||||| || |||  |||| | |||  |||||||||| || ||||   |    
T  6717125 ggcacaagacaatggcactcctcgccttgtccaccatctcggtcttctcctcttgtgacatggtgaccggtaacgcaccttcacccttcaaagctttctc 6717026  T
Q  244 acacnnnnnnngtgtcaaaaccgcttgcatcttaaccttccacaacccgaaatcattacttccggtgaacttctcgatgtcccactttgaccccatg 340  Q
    ||||       |  |||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||   |||||||||||||| || ||||||||||| ||||||    
T  6717025 acacttttgttgaatcaacaccgcttgcatcttcaccttccataacccgaaatcgttaagcccggtgaacttctcaatatcccactttgaacccatg 6716929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 20 - 333
Target Start/End: Original strand, 5259754 - 5260067
Alignment:
Q  20 tagagttgttgcttcaagagttgcctatgagccaaagatttcgtcatatacaatgactccaacttcgcccacatcgatgccgcggtagcttctctcgcga 119  Q
    |||||||||||||| | || |||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||| | |||||| ||||||||||| | |||  ||||||    
T  5259754 tagagttgttgcttaaggaattgcctatgagccaaagacttggtcatatacaacgactccaactttgaccacatagatgccgcggttggttccttcgcga 5259853  T
Q  120 catcccttaagaccttatctctgagacataaaacaatggcactctttgccttgtttaccatctcacgcttctcctcttgtgtcaaggttgccggcatcgc 219  Q
    |||||||||| || || ||   ||| || || |||||||||||| | ||| |||  ||||||||   ||||||| |||||| || |||  |||| | |||    
T  5259854 catcccttaaaactttttcctcgaggcacaagacaatggcactcctagccatgtccaccatctcggtcttctccacttgtgacatggtgaccggtaacgc 5259953  T
Q  220 cgcttcaccctttaatgcttctacacacnnnnnnngtgtcaaaaccgcttgcatcttaaccttccacaacccgaaatcattacttccggtgaacttctcg 319  Q
      |||||||||| || ||||   |||||       || |||| |||||||||||||| |||||| | ||| | ||||| ||| | ||| ||||||||||     
T  5259954 accttcacccttcaaagctttctcacacttttgttgtatcaacaccgcttgcatcttcaccttctataactcaaaatcgttaatcccgatgaacttctca 5260053  T
Q  320 atgtcccactttga 333  Q
    || |||||||||||    
T  5260054 atatcccactttga 5260067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 20 - 340
Target Start/End: Original strand, 9635555 - 9635875
Alignment:
Q  20 tagagttgttgcttcaagagttgcctatgagccaaagatttcgtcatatacaatgactccaacttcgcccacatcgatgccgcggtagcttctctcgcga 119  Q
    |||| ||||||||| | || |||||||||||||||||| || ||||||||||| | ||||||||| | |||| | ||||||||||| | |||  ||||||    
T  9635555 tagatttgttgcttaaggaattgcctatgagccaaagacttggtcatatacaacggctccaactttgaccacgtagatgccgcggttggttccttcgcga 9635654  T
Q  120 catcccttaagaccttatctctgagacataaaacaatggcactctttgccttgtttaccatctcacgcttctcctcttgtgtcaaggttgccggcatcgc 219  Q
    ||||||| || || || || | ||| ||||| |||||||||||| | |||||||  ||||||||   ||||||| |||||| || |||    || | |||    
T  9635655 catccctcaaaactttgtccccgaggcataagacaatggcactcctagccttgtccaccatctcggtcttctccgcttgtgacatggtgattggtaacgc 9635754  T
Q  220 cgcttcaccctttaatgcttctacacacnnnnnnngtgtcaaaaccgcttgcatcttaaccttccacaacccgaaatcattacttccggtgaacttctcg 319  Q
      |||||||||| || ||||   |||||       || |||| ||||||| |||||| |||||||| ||||| ||||| ||| | ||||||||||||||     
T  9635755 accttcacccttcaaagctttctcacacttttgttgtatcaacaccgcttacatcttcaccttccataacccaaaatcgttaatcccggtgaacttctca 9635854  T
Q  320 atgtcccactttgaccccatg 340  Q
    || ||||||||||| ||||||    
T  9635855 atatcccactttgaacccatg 9635875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 20 - 340
Target Start/End: Original strand, 4600151 - 4600471
Alignment:
Q  20 tagagttgttgcttcaagagttgcctatgagccaaagatttcgtcatatacaatgactccaacttcgcccacatcgatgccgcggtagcttctctcgcga 119  Q
    |||||||||||||| | || ||||||||||||||| || || ||||||||||| || |||||||| | ||| |||||||||||||| | |||  ||||||    
T  4600151 tagagttgttgcttaaggaattgcctatgagccaacgacttggtcatatacaacgattccaacttagaccatatcgatgccgcggttggttccttcgcga 4600250  T
Q  120 catcccttaagaccttatctctgagacataaaacaatggcactctttgccttgtttaccatctcacgcttctcctcttgtgtcaaggttgccggcatcgc 219  Q
    ||||||| || || || || | ||| || || |||||||| ||| | |||||||  ||||||||   |||||||||||||| || |||  ||||||   |    
T  4600251 catccctcaaaactttgtccccgaggcacaagacaatggcgctcctcgccttgtccaccatctcggtcttctcctcttgtgacatggtgtccggcaaacc 4600350  T
Q  220 cgcttcaccctttaatgcttctacacacnnnnnnngtgtcaaaaccgcttgcatcttaaccttccacaacccgaaatcattacttccggtgaacttctcg 319  Q
      |||||||||| || ||||   |||||       |  |||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||    ||||||||||| ||     
T  4600351 accttcacccttcaaagctttctcacacttttgttgaatcaacaccgcttgcatcttcaccttccacaacccaaaatcgttgagcccggtgaacttttca 4600450  T
Q  320 atgtcccactttgaccccatg 340  Q
    || ||||||||||| ||||||    
T  4600451 atatcccactttgaacccatg 4600471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 20 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 10059203 - 10058883
Alignment:
Q  20 tagagttgttgcttcaagagttgcctatgagccaaagatttcgtcatatacaatgactccaacttcgcccacatcgatgccgcggtagcttctctcgcga 119  Q
    |||||||||||||| | || ||||||||||||||| || || ||||||||||| || |||||||| | ||| ||||||||||| || | |||  ||||||    
T  10059203 tagagttgttgcttaaggaattgcctatgagccaacgacttggtcatatacaacgattccaacttagaccatatcgatgccgcagttggttccttcgcga 10059104  T
Q  120 catcccttaagaccttatctctgagacataaaacaatggcactctttgccttgtttaccatctcacgcttctcctcttgtgtcaaggttgccggcatcgc 219  Q
    ||||||| || || || || | ||| || |  |||||||||||| | |||||||  ||||||||   |||||||||||||| || |||  ||||||   |    
T  10059103 catccctcaaaactttgtccccgaggcacaggacaatggcactcctcgccttgtccaccatctcggtcttctcctcttgtgacatggtgtccggcaaacc 10059004  T
Q  220 cgcttcaccctttaatgcttctacacacnnnnnnngtgtcaaaaccgcttgcatcttaaccttccacaacccgaaatcattacttccggtgaacttctcg 319  Q
      |||||||||| || ||||   |||||       |  |||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||    ||||||||||||||     
T  10059003 gccttcacccttcaaagctttctcacacttttgttgaatcaacaccgcttgcatcttcaccttccacaacccaaaatcgttgagcccggtgaacttctca 10058904  T
Q  320 atgtcccactttgaccccatg 340  Q
    || ||||||||||| ||||||    
T  10058903 atatcccactttgaacccatg 10058883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 20 - 126
Target Start/End: Original strand, 23409763 - 23409869
Alignment:
Q  20 tagagttgttgcttcaagagttgcctatgagccaaagatttcgtcatatacaatgactccaacttcgcccacatcgatgccgcggtagcttctctcgcga 119  Q
    |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || || | ||| ||||| |||||||||| |||  ||||||    
T  23409763 tagagttgttgcttaaggagttgcctatgagccaaagatttggtcatatacaatgactcaaaatttgaccatatcgacgccgcggtaggttccttcgcga 23409862  T
Q  120 catccct 126  Q
    |||||||    
T  23409863 catccct 23409869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 20 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 10056981 - 10056661
Alignment:
Q  20 tagagttgttgcttcaagagttgcctatgagccaaagatttcgtcatatacaatgactccaacttcgcccacatcgatgccgcggtagcttctctcgcga 119  Q
    |||||||||||||| | || ||||||||||||||| || || ||||||||||| || |||||||| | ||| ||||||||||| || | |||  ||||||    
T  10056981 tagagttgttgcttaaggaattgcctatgagccaacgacttggtcatatacaacgattccaacttagaccatatcgatgccgcagttggttccttcgcga 10056882  T
Q  120 catcccttaagaccttatctctgagacataaaacaatggcactctttgccttgtttaccatctcacgcttctcctcttgtgtcaaggttgccggcatcgc 219  Q
    ||||||| || || || || | ||| || |  |||||||| ||| | |||||||  ||||||||   |||||||||||||| || |||  ||||||   |    
T  10056881 catccctcaaaactttgtccccgaggcacaggacaatggcgctcctcgccttgtccaccatctcggtcttctcctcttgtgacatggtgtccggcaaacc 10056782  T
Q  220 cgcttcaccctttaatgcttctacacacnnnnnnngtgtcaaaaccgcttgcatcttaaccttccacaacccgaaatcattacttccggtgaacttctcg 319  Q
      |||||||||| || ||||   |||||       |  |||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||    ||||||||||||||     
T  10056781 gccttcacccttcaaagctttctcacacttttgttgaatcaacaccgcttgcatcttcaccttccacaacccaaaatcgttgagcccggtgaacttctca 10056682  T
Q  320 atgtcccactttgaccccatg 340  Q
    || ||||||||||| ||||||    
T  10056681 atatcccactttgaacccatg 10056661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 20 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 10061425 - 10061105
Alignment:
Q  20 tagagttgttgcttcaagagttgcctatgagccaaagatttcgtcatatacaatgactccaacttcgcccacatcgatgccgcggtagcttctctcgcga 119  Q
    |||||||||||||| | || ||||||||||||||| || || ||||||||||| || |||||||| | ||| ||||||||||| || | |||  ||||||    
T  10061425 tagagttgttgcttaaggaattgcctatgagccaacgacttggtcatatacaacgattccaacttagaccatatcgatgccgcagttggttccttcgcga 10061326  T
Q  120 catcccttaagaccttatctctgagacataaaacaatggcactctttgccttgtttaccatctcacgcttctcctcttgtgtcaaggttgccggcatcgc 219  Q
    ||||||| || || || || | ||| || |  |||||||| ||| | |||||||  ||||||||   |||||||||||||| || |||  ||||||   |    
T  10061325 catccctcaaaactttgtccccgaggcacaggacaatggcgctcctcgccttgtccaccatctcggtcttctcctcttgtgacatggtgtccggcaaacc 10061226  T
Q  220 cgcttcaccctttaatgcttctacacacnnnnnnngtgtcaaaaccgcttgcatcttaaccttccacaacccgaaatcattacttccggtgaacttctcg 319  Q
      |||||||||| || ||||   |||||       |  |||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||    ||||||||||||||     
T  10061225 gccttcacccttcaaagctttctcacacttttgttgaatcaacaccgcttgcatcttcaccttccacaacccaaaatcgttgagcccggtgaacttctca 10061126  T
Q  320 atgtcccactttgaccccatg 340  Q
    || ||||||||||| ||||||    
T  10061125 atatcccactttgaacccatg 10061105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 20 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 10063647 - 10063327
Alignment:
Q  20 tagagttgttgcttcaagagttgcctatgagccaaagatttcgtcatatacaatgactccaacttcgcccacatcgatgccgcggtagcttctctcgcga 119  Q
    |||||||||||||| | || ||||||||||||||| || || ||||||||||| || |||||||| | ||| ||||||||||| || | |||  ||||||    
T  10063647 tagagttgttgcttaaggaattgcctatgagccaacgacttggtcatatacaacgattccaacttagaccatatcgatgccgcagttggttccttcgcga 10063548  T
Q  120 catcccttaagaccttatctctgagacataaaacaatggcactctttgccttgtttaccatctcacgcttctcctcttgtgtcaaggttgccggcatcgc 219  Q
    ||||||| || || || || | ||| || |  |||||||| ||| | |||||||  ||||||||   |||||||||||||| || |||  ||||||   |    
T  10063547 catccctcaaaactttgtccccgaggcacaggacaatggcgctcctcgccttgtccaccatctcggtcttctcctcttgtgacatggtgtccggcaaacc 10063448  T
Q  220 cgcttcaccctttaatgcttctacacacnnnnnnngtgtcaaaaccgcttgcatcttaaccttccacaacccgaaatcattacttccggtgaacttctcg 319  Q
      |||||||||| || ||||   |||||       |  |||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||    ||||||||||||||     
T  10063447 gccttcacccttcaaagctttctcacacttttgttgaatcaacaccgcttgcatcttcaccttccacaacccaaaatcgttgagcccggtgaacttctca 10063348  T
Q  320 atgtcccactttgaccccatg 340  Q
    || ||||||||||| ||||||    
T  10063347 atatcccactttgaacccatg 10063327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 20 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 10065869 - 10065549
Alignment:
Q  20 tagagttgttgcttcaagagttgcctatgagccaaagatttcgtcatatacaatgactccaacttcgcccacatcgatgccgcggtagcttctctcgcga 119  Q
    |||||||||||||| | || ||||||||||||||| || || ||||||||||| || |||||||| | ||| ||||||||||| || | |||  ||||||    
T  10065869 tagagttgttgcttaaggaattgcctatgagccaacgacttggtcatatacaacgattccaacttagaccatatcgatgccgcagttggttccttcgcga 10065770  T
Q  120 catcccttaagaccttatctctgagacataaaacaatggcactctttgccttgtttaccatctcacgcttctcctcttgtgtcaaggttgccggcatcgc 219  Q
    ||||||| || || || || | ||| || |  |||||||| ||| | |||||||  ||||||||   |||||||||||||| || |||  ||||||   |    
T  10065769 catccctcaaaactttgtccccgaggcacaggacaatggcgctcctcgccttgtccaccatctcggtcttctcctcttgtgacatggtgtccggcaaacc 10065670  T
Q  220 cgcttcaccctttaatgcttctacacacnnnnnnngtgtcaaaaccgcttgcatcttaaccttccacaacccgaaatcattacttccggtgaacttctcg 319  Q
      |||||||||| || ||||   |||||       |  |||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||    ||||||||||||||     
T  10065669 gccttcacccttcaaagctttctcacacttttgttgaatcaacaccgcttgcatcttcaccttccacaacccaaaatcgttgagcccggtgaacttctca 10065570  T
Q  320 atgtcccactttgaccccatg 340  Q
    || ||||||||||| ||||||    
T  10065569 atatcccactttgaacccatg 10065549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 20 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 456690 - 456370
Alignment:
Q  20 tagagttgttgcttcaagagttgcctatgagccaaagatttcgtcatatacaatgactccaacttcgcccacatcgatgccgcggtagcttctctcgcga 119  Q
    |||||||||||||| | || ||||| |||||||||||| || ||||||||||| || |||||||| ||||||||||||| |||||| |||||  | || |    
T  456690 tagagttgttgctttaggaattgccgatgagccaaagactttgtcatatacaaagattccaactttgcccacatcgatgtcgcggttgcttcctttgcta 456591  T
Q  120 catcccttaagaccttatctctgagacataaaacaatggcactctttgccttgtttaccatctcacgcttctcctcttgtgtcaaggttgccggcatcgc 219  Q
    | || || || || ||||||| ||| || || |||| ||||||| | |||||||  ||||||||   ||||||  || ||| || |||  |||| | ||     
T  456590 cttctctcaaaactttatctccgaggcacaagacaacggcactcctggccttgtccaccatctcggtcttctctgctcgtgacatggtgaccggtaacga 456491  T
Q  220 cgcttcaccctttaatgcttctacacacnnnnnnngtgtcaaaaccgcttgcatcttaaccttccacaacccgaaatcattacttccggtgaacttctcg 319  Q
      |||||||||| || ||||   |||||       || | || ||||||| |||||| |||||||| ||||| ||||| |||  |||||| |||||||||    
T  456490 accttcacccttcaaagctttctcacacttttgctgtattaacaccgcttccatctttaccttccataacccaaaatcgttatctccggtaaacttctcg 456391  T
Q  320 atgtcccactttgaccccatg 340  Q
    || ||||||||||| ||||||    
T  456390 atatcccactttgaacccatg 456370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 20 - 105
Target Start/End: Complemental strand, 43226860 - 43226775
Alignment:
Q  20 tagagttgttgcttcaagagttgcctatgagccaaagatttcgtcatatacaatgactccaacttcgcccacatcgatgccgcggt 105  Q
    |||||||||||||| | || ||||| |||||||||||| || ||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  43226860 tagagttgttgctttaggaattgccgatgagccaaagactttgtcatatacaaagattccaactttgcccacatcgatgccgcggt 43226775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 20 - 111
Target Start/End: Original strand, 6065268 - 6065359
Alignment:
Q  20 tagagttgttgcttcaagagttgcctatgagccaaagatttcgtcatatacaatgactccaacttcgcccacatcgatgccgcggtagcttc 111  Q
    |||||||||||||| | || ||||| |||||||||||| || ||| ||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  6065268 tagagttgttgctttaggaattgccgatgagccaaagactttgtcgtatacaaagattccaactttgcccacatcgatgccgcggttgcttc 6065359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 20 - 105
Target Start/End: Complemental strand, 5898192 - 5898107
Alignment:
Q  20 tagagttgttgcttcaagagttgcctatgagccaaagatttcgtcatatacaatgactccaacttcgcccacatcgatgccgcggt 105  Q
    |||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||| || ||||||||||| || |||||||| ||||| ||||||| ||||||    
T  5898192 tagagttgttgctttaagaattgccgatgagccaaagactttgtcatatacaaagattccaactttgcccatatcgatgtcgcggt 5898107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 20 - 105
Target Start/End: Original strand, 18098646 - 18098731
Alignment:
Q  20 tagagttgttgcttcaagagttgcctatgagccaaagatttcgtcatatacaatgactccaacttcgcccacatcgatgccgcggt 105  Q
    |||||||||||||| | || |||||||||||||||||| || ||||||||||| || |||| ||| |||||||| |||||||||||    
T  18098646 tagagttgttgctttaggaattgcctatgagccaaagactttgtcatatacaaagattccatctttgcccacattgatgccgcggt 18098731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 20 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 5192433 - 5192113
Alignment:
Q  20 tagagttgttgcttcaagagttgcctatgagccaaagatttcgtcatatacaatgactccaacttcgcccacatcgatgccgcggtagcttctctcgcga 119  Q
    |||||| ||||||| | || ||||  |||||||||||| || ||||||||||| || |||||||| ||||||||||||| ||| || |||||  | || |    
T  5192433 tagagtcgttgctttaggaattgctgatgagccaaagactttgtcatatacaaagattccaactttgcccacatcgatgtcgcagttgcttcctttgcta 5192334  T
Q  120 catcccttaagaccttatctctgagacataaaacaatggcactctttgccttgtttaccatctcacgcttctcctcttgtgtcaaggttgccggcatcgc 219  Q
    | || || || || ||||| | ||| || || |||||||||||||| |||||||  ||||||||   ||||||| |||||| ||  ||  |||| | ||     
T  5192333 cttctctcaaaactttatccccgaggcacaagacaatggcactcttggccttgtccaccatctcggtcttctccgcttgtgacattgtgaccggtaacga 5192234  T
Q  220 cgcttcaccctttaatgcttctacacacnnnnnnngtgtcaaaaccgcttgcatcttaaccttccacaacccgaaatcattacttccggtgaacttctcg 319  Q
      |||||||||| || ||||   |||||       || | || ||||||| |||||| |||||||| ||||| ||||| |||  |||||| ||||||||     
T  5192233 accttcacccttcaaagctttctcacacttttgctgtattaacaccgcttccatctttaccttccataacccaaaatcgttatctccggtaaacttctca 5192134  T
Q  320 atgtcccactttgaccccatg 340  Q
    || ||||||||||| ||||||    
T  5192133 atatcccactttgaacccatg 5192113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 20 - 344
Target Start/End: Original strand, 10957798 - 10958122
Alignment:
Q  20 tagagttgttgcttcaagagttgcctatgagccaaagatttcgtcatatacaatgactccaacttcgcccacatcgatgccgcggtagcttctctcgcga 119  Q
    |||||||||||||| | || ||||| |||||||||||| || ||||||||||| || |||||||| ||||| ||||||||| |||| | |||  | || |    
T  10957798 tagagttgttgctttaggaattgccgatgagccaaagactttgtcatatacaaagattccaactttgcccaaatcgatgccacggttggttcctttgcta 10957897  T
Q  120 catcccttaagaccttatctctgagacataaaacaatggcactctttgccttgtttaccatctcacgcttctcctcttgtgtcaaggttgccggcatcgc 219  Q
    | || || || || |||||   ||| || || ||||||| |||| | ||||||| |||||||||   ||||||| || ||| || |||  |||| | ||     
T  10957898 cttctctcaaaactttatcctcgaggcacaagacaatggaactcctggccttgtctaccatctcggtcttctccgctcgtgacatggtgaccggtaacga 10957997  T
Q  220 cgcttcaccctttaatgcttctacacacnnnnnnngtgtcaaaaccgcttgcatcttaaccttccacaacccgaaatcattacttccggtgaacttctcg 319  Q
      |||||||||| || ||||   |||||       || | || ||||||| |||||| |||||||| ||||| ||||| |||  |||||| ||||||||     
T  10957998 accttcacccttcaaagctttctcacacttttgctgtattaacaccgcttccatctttaccttccataacccaaaatcgttatctccggtaaacttctca 10958097  T
Q  320 atgtcccactttgaccccatgatac 344  Q
    || ||||||||||| ||||||||||    
T  10958098 atatcccactttgaacccatgatac 10958122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 20 - 111
Target Start/End: Complemental strand, 11168884 - 11168793
Alignment:
Q  20 tagagttgttgcttcaagagttgcctatgagccaaagatttcgtcatatacaatgactccaacttcgcccacatcgatgccgcggtagcttc 111  Q
    |||||| ||||||| | || ||||| |||||||||||| || ||||||||||| || |||||||| |||||||||||||| ||||| |||||    
T  11168884 tagagtagttgctttaggaattgccgatgagccaaagactttgtcatatacaaagattccaactttgcccacatcgatgctgcggttgcttc 11168793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 20 - 102
Target Start/End: Original strand, 1619949 - 1620031
Alignment:
Q  20 tagagttgttgcttcaagagttgcctatgagccaaagatttcgtcatatacaatgactccaacttcgcccacatcgatgccgc 102  Q
    |||||||||||||| | || || || |||||||||||| || ||||||| ||| ||||||||||| | |||||||||||||||    
T  1619949 tagagttgttgctttaggaattaccaatgagccaaagactttgtcatatgcaaagactccaactttgaccacatcgatgccgc 1620031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 271 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 6303757 - 6303683
Alignment:
Q  271 catcttaaccttccacaacccgaaatcattacttccggtgaacttctcgatgtcccactttgaccccatgatacc 345  Q
    |||||| ||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||| || || |||||||| || |||||||||||    
T  6303757 catcttcaccttccacaacccgaagtcgttactaccggtgaacttttcaatatcccacttggaacccatgatacc 6303683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 20 - 98
Target Start/End: Complemental strand, 7769338 - 7769260
Alignment:
Q  20 tagagttgttgcttcaagagttgcctatgagccaaagatttcgtcatatacaatgactccaacttcgcccacatcgatg 98  Q
    |||||||||| ||| | || ||||| |||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||    
T  7769338 tagagttgtttctttaggaattgccgatgagccaaagactttgtcatatacaaagactccaactttgaccacatcgatg 7769260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 258 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 25637953 - 25637871
Alignment:
Q  258 tcaaaaccgcttgcatcttaaccttccacaacccgaaatcattacttccggtgaacttctcgatgtcccactttgaccccatg 340  Q
    |||| |||||||||||||| || ||||| ||||||||||| |||   |||||||||||||| || ||||||||||| ||||||    
T  25637953 tcaacaccgcttgcatcttcacattccataacccgaaatcgttaagcccggtgaacttctcaatatcccactttgaacccatg 25637871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 23 - 105
Target Start/End: Complemental strand, 42991079 - 42990997
Alignment:
Q  23 agttgttgcttcaagagttgcctatgagccaaagatttcgtcatatacaatgactccaacttcgcccacatcgatgccgcggt 105  Q
    ||||||||||| | || ||||| |||||||||||| || |||||||| || || |||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  42991079 agttgttgctttaggacttgccgatgagccaaagactttgtcatatataaagattccaactttgcccacatcgatgtcgcggt 42990997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 20 - 105
Target Start/End: Original strand, 4309985 - 4310070
Alignment:
Q  20 tagagttgttgcttcaagagttgcctatgagccaaagatttcgtcatatacaatgactccaacttcgcccacatcgatgccgcggt 105  Q
    |||||||||||||| | || ||||| |||||||||||| || ||||||||||| || | |||||| ||||| || |||||||||||    
T  4309985 tagagttgttgctttaggaattgccgatgagccaaagactttgtcatatacaaagatttcaactttgcccatattgatgccgcggt 4310070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 40 - 105
Target Start/End: Original strand, 43422963 - 43423028
Alignment:
Q  40 ttgcctatgagccaaagatttcgtcatatacaatgactccaacttcgcccacatcgatgccgcggt 105  Q
    ||||| |||||||||||| || ||||||||||| || |||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  43422963 ttgccgatgagccaaagactttgtcatatacaaagattccaactttgcccacatcgatgtcgcggt 43423028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 23 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 3315462 - 3315145
Alignment:
Q  23 agttgttgcttcaagagttgcctatgagccaaagatttcgtcatatacaatgactccaacttcgcccacatcgatgccgcggtagcttctctcgcgacat 122  Q
    ||||||||||| | || ||||| |||||||||||| || |||||||||||  | |||||||| || |||||||||| |||||| | |||  | || || |    
T  3315462 agttgttgctttaggaattgccgatgagccaaagactttgtcatatacaaatattccaactttgcacacatcgatgtcgcggttggttcctttgctactt 3315363  T
Q  123 cccttaagaccttatctctgagacataaaacaatggcactctttgccttgtttaccatctcacgcttctcctcttgtgtcaaggttgccggcatcgccgc 222  Q
    | || || || ||||| | ||| || || |||||||||||| | |||||||  ||||||||   ||||||| || ||| || |||  |||| | |||  |    
T  3315362 ctctcaaaactttatccccgaggcacaagacaatggcactcctggccttgtccaccatctcggtcttctccgctcgtgacatggtgaccggtaccgcacc 3315263  T
Q  223 ttcaccctttaatgcttctacacacnnnnnnngtgtcaaaaccgcttgcatcttaaccttccacaacccgaaatcattacttccggtgaacttctcgatg 322  Q
    ||||||||| || ||||   |||||       || | |||||||||| ||| || |||||||| ||||| ||||| |||  |||||| || ||||| ||     
T  3315262 ttcacccttcaaagctttctcacacttctgctgtattaaaaccgcttccatgtttaccttccataacccaaaatcgttatctccggtaaaattctcaata 3315163  T
Q  323 tcccactttgaccccatg 340  Q
    ||||||||||| ||||||    
T  3315162 tcccactttgaacccatg 3315145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 271 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 16457912 - 16457838
Alignment:
Q  271 catcttaaccttccacaacccgaaatcattacttccggtgaacttctcgatgtcccactttgaccccatgatacc 345  Q
    |||||| ||||||||||||||||| || ||||| ||||| ||||| || || |||||||| || |||||||||||    
T  16457912 catctttaccttccacaacccgaagtcgttactaccggtaaacttttcaatatcccacttcgaacccatgatacc 16457838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 262 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 23633985 - 23633903
Alignment:
Q  262 aaccgcttgcatcttaaccttccacaacccgaaatcattacttccggtgaacttctcgatgtcccactttgaccccatgatac 344  Q
    |||||||| |||||| |||||||| ||||| ||||| |||  || ||| |||||||| || ||||||||||| ||||||||||    
T  23633985 aaccgcttccatctttaccttccataaccccaaatctttatctcaggtaaacttctcaatatcccactttgaacccatgatac 23633903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 271 - 345
Target Start/End: Original strand, 29913690 - 29913764
Alignment:
Q  271 catcttaaccttccacaacccgaaatcattacttccggtgaacttctcgatgtcccactttgaccccatgatacc 345  Q
    |||||| ||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||| || || |||||||| || || ||||||||    
T  29913690 catcttcaccttccacaacccgaagtcgttactaccggtgaacttttcaatatcccacttcgaacctatgatacc 29913764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 271 - 345
Target Start/End: Original strand, 47882623 - 47882697
Alignment:
Q  271 catcttaaccttccacaacccgaaatcattacttccggtgaacttctcgatgtcccactttgaccccatgatacc 345  Q
    |||||| ||||||||||||||||| || ||||| ||||| ||||| || || |||||||| || |||||||||||    
T  47882623 catctttaccttccacaacccgaagtcgttactaccggtaaacttttcaatatcccacttcgaacccatgatacc 47882697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 263 - 340
Target Start/End: Original strand, 6065511 - 6065588
Alignment:
Q  263 accgcttgcatcttaaccttccacaacccgaaatcattacttccggtgaacttctcgatgtcccactttgaccccatg 340  Q
    ||||||| |||||| |||||||| ||||||||||| |||  |||||| |||||||| || |||||||| || ||||||    
T  6065511 accgcttccatctttaccttccataacccgaaatcgttatctccggtaaacttctcaatatcccacttcgaacccatg 6065588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 271 - 344
Target Start/End: Original strand, 10099809 - 10099882
Alignment:
Q  271 catcttaaccttccacaacccgaaatcattacttccggtgaacttctcgatgtcccactttgaccccatgatac 344  Q
    |||||| ||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||| || || |||||||| || ||||| ||||    
T  10099809 catcttcaccttccacaacccgaagtcgttactaccggtgaacttttcaatatcccacttcgaacccattatac 10099882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 271 - 344
Target Start/End: Original strand, 10205426 - 10205499
Alignment:
Q  271 catcttaaccttccacaacccgaaatcattacttccggtgaacttctcgatgtcccactttgaccccatgatac 344  Q
    |||||| ||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||| || || |||||||| || ||||| ||||    
T  10205426 catcttcaccttccacaacccgaagtcgttactaccggtgaacttttcaatatcccacttcgaacccattatac 10205499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 263 - 340
Target Start/End: Original strand, 10621244 - 10621321
Alignment:
Q  263 accgcttgcatcttaaccttccacaacccgaaatcattacttccggtgaacttctcgatgtcccactttgaccccatg 340  Q
    ||||||| |||||| |||||||| ||||||||||| |||  |||||| |||||||| || ||||||| ||| ||||||    
T  10621244 accgcttccatctttaccttccataacccgaaatcgttatctccggtaaacttctcaatatcccactctgaacccatg 10621321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 23 - 124
Target Start/End: Original strand, 15830676 - 15830777
Alignment:
Q  23 agttgttgcttcaagagttgcctatgagccaaagatttcgtcatatacaatgactccaacttcgcccacatcgatgccgcggtagcttctctcgcgacat 122  Q
    |||| |||||| | || |||||||||| ||| ||| || |||||||||||| |||||||||| | |||| |||||| || ||||| |||  |||||||||    
T  15830676 agttcttgctttaggaattgcctatgaaccatagacttagtcatatacaataactccaactttgaccacctcgatgtcgtggtaggttccttcgcgacat 15830775  T
Q  123 cc 124  Q
    ||    
T  15830776 cc 15830777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 23 - 102
Target Start/End: Original strand, 53917152 - 53917231
Alignment:
Q  23 agttgttgcttcaagagttgcctatgagccaaagatttcgtcatatacaatgactccaacttcgcccacatcgatgccgc 102  Q
    ||||||||||| | || ||||| |||||||||||| || |||||||||||  | || ||||| | |||||||||||||||    
T  53917152 agttgttgctttaggacttgccgatgagccaaagactttgtcatatacaaatattcgaactttgaccacatcgatgccgc 53917231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 263 - 330
Target Start/End: Original strand, 53917384 - 53917451
Alignment:
Q  263 accgcttgcatcttaaccttccacaacccgaaatcattacttccggtgaacttctcgatgtcccactt 330  Q
    ||||||| |||||| |||||||| ||||||||||| |||  |||||| |||||||| || ||||||||    
T  53917384 accgcttccatctttaccttccataacccgaaatcgttatctccggtaaacttctcaatatcccactt 53917451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 271 - 345
Target Start/End: Original strand, 10612512 - 10612586
Alignment:
Q  271 catcttaaccttccacaacccgaaatcattacttccggtgaacttctcgatgtcccactttgaccccatgatacc 345  Q
    |||||| ||||||||||||||||| || ||||| ||||| || || || || |||||||| || |||||||||||    
T  10612512 catctttaccttccacaacccgaagtcgttactaccggtaaaattttcaatatcccacttcgaacccatgatacc 10612586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 271 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 10897451 - 10897377
Alignment:
Q  271 catcttaaccttccacaacccgaaatcattacttccggtgaacttctcgatgtcccactttgaccccatgatacc 345  Q
    |||||| ||||||||||||| ||| || ||||| ||||| ||||| || || |||||||| || |||||||||||    
T  10897451 catctttaccttccacaacctgaagtcgttactaccggtaaacttttcaatatcccacttcgaacccatgatacc 10897377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 266 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 11168638 - 11168564
Alignment:
Q  266 gcttgcatcttaaccttccacaacccgaaatcattacttccggtgaacttctcgatgtcccactttgaccccatg 340  Q
    |||| |||||| |||||||| ||||| ||||| |||  |||||| |||||||| || ||||||||||| ||||||    
T  11168638 gcttccatctttaccttccataacccaaaatcgttagctccggtaaacttctcaatatcccactttgaacccatg 11168564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 271 - 345
Target Start/End: Original strand, 22625714 - 22625788
Alignment:
Q  271 catcttaaccttccacaacccgaaatcattacttccggtgaacttctcgatgtcccactttgaccccatgatacc 345  Q
    |||||| ||||||||||||||||| || ||||| ||||| || || || || |||||||| || |||||||||||    
T  22625714 catctttaccttccacaacccgaagtcgttactaccggtaaaattttcaatatcccacttcgaacccatgatacc 22625788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 20 - 98
Target Start/End: Complemental strand, 23634228 - 23634150
Alignment:
Q  20 tagagttgttgcttcaagagttgcctatgagccaaagatttcgtcatatacaatgactccaacttcgcccacatcgatg 98  Q
    |||||||||||||| |  | ||||| |||||||||||| || ||||||||||| || |||||||| | || ||||||||    
T  23634228 tagagttgttgctttagaaattgccgatgagccaaagactttgtcatatacaaagattccaactttgacctcatcgatg 23634150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 266 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 43226614 - 43226536
Alignment:
Q  266 gcttgcatcttaaccttccacaacccgaaatcattacttccggtgaacttctcgatgtcccactttgaccccatgatac 344  Q
    |||| |||||| |||||||| ||||  ||||| |||  |||||| |||||||| || ||||||||||| ||||||||||    
T  43226614 gcttccatctttaccttccataaccgaaaatcgttatctccggtaaacttctcaatatcccactttgaacccatgatac 43226536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 271 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 5886732 - 5886663
Alignment:
Q  271 catcttaaccttccacaacccgaaatcattacttccggtgaacttctcgatgtcccactttgaccccatg 340  Q
    |||||| |||||||| ||||| ||||| ||| | ||||| |||||||| || ||||||||||| ||||||    
T  5886732 catctttaccttccataacccaaaatcgttattaccggtaaacttctcaatatcccactttgaacccatg 5886663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 263 - 340
Target Start/End: Original strand, 28101726 - 28101803
Alignment:
Q  263 accgcttgcatcttaaccttccacaacccgaaatcattacttccggtgaacttctcgatgtcccactttgaccccatg 340  Q
    ||||||| |||||| |||||||| ||||| |||||||||  ||| || || ||||| || ||||||||||| ||||||    
T  28101726 accgcttccatctttaccttccataacccaaaatcattatctccagtaaatttctccatatcccactttgaacccatg 28101803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 263 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 42990839 - 42990758
Alignment:
Q  263 accgcttgcatcttaaccttccacaacccgaaatcattacttccggtgaacttctcgatgtcccactttgaccccatgatac 344  Q
    ||||||| |||||| |||||||| ||||| ||||  |||  |||||| |||||| | || ||||||||||| ||||||||||    
T  42990839 accgcttccatctttaccttccataacccaaaattgttatctccggtaaacttcccaatatcccactttgaacccatgatac 42990758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 20 - 84
Target Start/End: Original strand, 15822117 - 15822181
Alignment:
Q  20 tagagttgttgcttcaagagttgcctatgagccaaagatttcgtcatatacaatgactccaactt 84  Q
    |||||||||||||| | || || | ||||||| ||||| || ||||||||||||| |||||||||    
T  15822117 tagagttgttgctttaggaattacatatgagctaaagacttagtcatatacaatgcctccaactt 15822181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028 (Bit Score: 271; Significance: 1e-151; HSPs: 1)
Name: scaffold0028
Description:

Target: scaffold0028; HSP #1
Raw Score: 271; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 19 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 149615 - 149268
Alignment:
Q  19 atagagttgttgcttcaagagttgcctatgagccaaagatttcgtcatatacaatgactccaacttcgcccacatcgatgccgcggtagcttctctcgcg 118  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  149615 atagagttgttgcttcaagagttgcctatgagccaaagatttcgtcatatacaatgactccaactttgcccacattgatgccgcggtagcttccctcgcg 149516  T
Q  119 acatcccttaagaccttatctctgagacataaaacaatggcactctttgccttgtttaccatctcacgcttctcctcttgtgtcaaggttgccggcatcg 218  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  149515 acatcccttaagaccttatctccgagacataagacaatggcactctttgccttgtctaccatctcacgcttctcctcttgtgtcaaggttgccggcatcg 149416  T
Q  219 ccgcttcaccctttaatgcttctacacacnnnnnnngtgtcaaaaccgcttgcatcttaaccttccacaacccgaaatcattacttccggtgaacttctc 318  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||       ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  149415 ccgcttcacccttcaatgcttctacacacttttgttgtgtcaataccgcttgcatcttaaccttccataacccgaaatcattacttccggtgaacttctc 149316  T
Q  319 gatgtcccactttgaccccatgataccaactatcaataactcctatgc 366  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||  |||||||| || |||||||    
T  149315 gatgtcccacttttaccccatgatacctcctatcaatcacgcctatgc 149268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 271; Significance: 1e-151; HSPs: 22)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 271; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 20 - 355
Target Start/End: Original strand, 19348705 - 19349040
Alignment:
Q  20 tagagttgttgcttcaagagttgcctatgagccaaagatttcgtcatatacaatgactccaacttcgcccacatcgatgccgcggtagcttctctcgcga 119  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  19348705 tagagttgttgcttcaagagttgtctatgagccaaagatttcgtcatatacaatgactccaactttgcccacatcgatgtcgcggtagcttctctcgcga 19348804  T
Q  120 catcccttaagaccttatctctgagacataaaacaatggcactctttgccttgtttaccatctcacgcttctcctcttgtgtcaaggttgccggcatcgc 219  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19348805 catcccttaagaccttatctccgagacataagacaatggcactctttgccttgtctaccatctcacgcttctcctcttgtgtcaaggttgccggcatcgc 19348904  T
Q  220 cgcttcaccctttaatgcttctacacacnnnnnnngtgtcaaaaccgcttgcatcttaaccttccacaacccgaaatcattacttccggtgaacttctcg 319  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||       ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||    
T  19348905 cgcttcacccttcaatgcttctacacacttttgttgtgtcaataccgcttgcatcttaaccttccataacccaaaatcattgcttccggtgaacttctcg 19349004  T
Q  320 atgtcccactttgaccccatgataccaactatcaat 355  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19349005 atgtcccactttgaccccatgataccaactatcaat 19349040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 263; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 19 - 366
Target Start/End: Original strand, 25403077 - 25403424
Alignment:
Q  19 atagagttgttgcttcaagagttgcctatgagccaaagatttcgtcatatacaatgactccaacttcgcccacatcgatgccgcggtagcttctctcgcg 118  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25403077 atagagttgttgtttcaagagttgcctatgagccaaagatttcgtcatgtacaatgactccaacttagcccacatcgatgccgcggtagcttctctcgcg 25403176  T
Q  119 acatcccttaagaccttatctctgagacataaaacaatggcactctttgccttgtttaccatctcacgcttctcctcttgtgtcaaggttgccggcatcg 218  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||| || ||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||| |    
T  25403177 acatcccttaagaccttatctccgagacataaaacaatagcattctttgccttgtctatcatctcacgcttcttttcttgtgtcaaagttgccggcatag 25403276  T
Q  219 ccgcttcaccctttaatgcttctacacacnnnnnnngtgtcaaaaccgcttgcatcttaaccttccacaacccgaaatcattacttccggtgaacttctc 318  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||       ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25403277 ccgcttcacccttcaatgcttctacacacttttgttgtgtcaaaaccgcttgcatcttaaccttccacaacccgaaatcattacttccggtgaacttctc 25403376  T
Q  319 gatgtcccactttgaccccatgataccaactatcaataactcctatgc 366  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  25403377 gatgtcccactttgaacccatgataccaactaccaataacgcctatgc 25403424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 258; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 19 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 23079127 - 23078778
Alignment:
Q  19 atagagttgttgcttcaagagttgcctatgagccaaagatttcgtcatatacaatgactccaacttcgcccacatcgatgccgcggtagcttctctcgcg 118  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||    
T  23079127 atagagttgttgtttcaagagttgcctatgagccaaagatttcgtcatgtacaatgactccaacttagcccacatcgatgccgcagtagcttctcttgcg 23079028  T
Q  119 acatcccttaagaccttatctctgagacataaaacaatggcactctttgccttgtttaccatctcacgcttctcctcttgtgtcaaggttgccggcatcg 218  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  23079027 acatcccttaagaccttatctccgagacataaaacaatggtactctttgccttgtctatcatctcacgcttctccgcttgtgtcaaagttgccggcatcg 23078928  T
Q  219 ccgcttcaccctttaatgcttctacacacnnnnnnngtgtcaaaaccgcttgcatcttaaccttccacaacccgaaatcattacttccggtgaacttctc 318  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||       ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23078927 ccgcttcacccttcaatgcttctacacacttttgttgtgtcaaaaccgcttgcatcttaaccttccacaacccgaaatcattacttccggtgaacttctc 23078828  T
Q  319 gatgtcccactttgaccccatgataccaactat--caataactcctatgc 366  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||||||||||  ||||||| |||||||    
T  23078827 gatgttccactttgaacccatgataccaactataccaataacgcctatgc 23078778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 19 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 10446100 - 10445768
Alignment:
Q  19 atagagttgttgcttcaagagttgcctatgagccaaagatttcgtcatatacaatgactccaacttcgcccacatcgatgccgcggtagcttctctcgcg 118  Q
    |||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  10446100 atagagttgttgtttcaagagtttcctatgagccaacgatttcgtcatgtacaatgactccaacttagcccacatcgacgccgcggtagcttctttcgcg 10446001  T
Q  119 acatcccttaagaccttatctctgagacataaaacaatggcactctttgccttgtttaccatctcacgcttctcctcttgtgtcaaggttgccggcatcg 218  Q
    ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||| ||||||||||  | || |||||||    
T  10446000 acatctcttaagaccttatctccgagacataaaacaatggcactcttagccttgtctatcatctcacgcttctccgcttgtgtcaaattcgctggcatcg 10445901  T
Q  219 ccgcttcaccctttaatgcttctacacacnnnnnnngtgtcaaaaccgcttgcatcttaaccttccacaacccgaaatcattacttccggtgaacttctc 318  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||       |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  10445900 ccgcttcacccttcaatgcttctacacacttttgttgtgttaaaaccgcttgcatcttaaccttccacaacccaaaatcattacttccggtgaacttctc 10445801  T
Q  319 gatgtcccactttgaccccatgataccaactat 351  Q
    ||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  10445800 gatgtcccactttgaacacatgataccaactat 10445768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 141; E-Value: 7e-74
Query Start/End: Original strand, 19 - 344
Target Start/End: Original strand, 16387891 - 16388215
Alignment:
Q  19 atagagttgttgcttcaagagttgcctatgagccaaagatttcgtcatatacaatgactccaacttcgcccacatcgatgccgcggtagcttctctcgcg 118  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||  ||||| ||| |||| |||| |||   | |||   |||||    
T  16387891 atagagttgttgtttcaacagttgcctatgagacaaagatttcatcatgtacaatgactataacttggccgacattgatgacgcaacaactttcgtcgcg 16387990  T
Q  119 acatcccttaagaccttatctctgagacataaaacaatggcactctttgccttgtttaccatctcacgcttctcctcttgtgtcaaggttgccggcatcg 218  Q
     |||| || || | ||||||| ||||||||||||  |||||||| ||| | |||| || |||||||||||||||||||||||||||||| | || |||||    
T  16387991 gcatctctcaaaatcttatctttgagacataaaaacatggcactattttc-ttgtctatcatctcacgcttctcctcttgtgtcaaggtagacgacatcg 16388089  T
Q  219 ccgcttcaccctttaatgcttctacacacnnnnnnngtgtcaaaaccgcttgcatcttaaccttccacaacccgaaatcattacttccggtgaacttctc 318  Q
    | |||||||||||||||||||| ||||||       ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  16388090 cagcttcaccctttaatgcttccacacacatttgttgtgtcaaaacctcttgcatcttaaccttccacaacccaaaatcattacttccggtgaacttctc 16388189  T
Q  319 gatgtcccactttgaccccatgatac 344  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||    
T  16388190 gatgtcccactttgaactcatgatac 16388215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 20 - 340
Target Start/End: Original strand, 36560616 - 36560936
Alignment:
Q  20 tagagttgttgcttcaagagttgcctatgagccaaagatttcgtcatatacaatgactccaacttcgcccacatcgatgccgcggtagcttctctcgcga 119  Q
    |||||||||||||| | || ||||| |||||||||||| || ||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||| |||||  | || |    
T  36560616 tagagttgttgctttaggaattgccgatgagccaaagactttgtcatatacaaagattccaactttgcccatatcgatgccgcggttgcttcctttgcta 36560715  T
Q  120 catcccttaagaccttatctctgagacataaaacaatggcactctttgccttgtttaccatctcacgcttctcctcttgtgtcaaggttgccggcatcgc 219  Q
    | || || || || ||||| | ||| || || |||||||||||| | |||||||  ||||||||   ||||||| |||||| || |||  |||| | ||     
T  36560716 cttctctcaaaactttatccccgaggcacaagacaatggcactcctggccttgtccaccatctcggtcttctccgcttgtgacatggtgaccggtaacga 36560815  T
Q  220 cgcttcaccctttaatgcttctacacacnnnnnnngtgtcaaaaccgcttgcatcttaaccttccacaacccgaaatcattacttccggtgaacttctcg 319  Q
      |||||||||| || ||||   |||||       || | || ||||||| |||||| |||||||| ||||||||||| |||  |||||| |||||||||    
T  36560816 accttcacccttcaaagctttctcacacttctgctgtattaacaccgcttccatctttaccttccataacccgaaatcgttatctccggtaaacttctcg 36560915  T
Q  320 atgtcccactttgaccccatg 340  Q
    || ||||||||||| ||||||    
T  36560916 atatcccactttgaacccatg 36560936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 71 - 344
Target Start/End: Original strand, 3277497 - 3277771
Alignment:
Q  71 aatgactccaacttcgcccacatcgatgccgcggtagcttctctcgcgacatcccttaagaccttatctctgagacataaaacaatg--gcactctttgc 168  Q
    |||||||||||||| | |||||| | ||| ||||||||||||||| ||||||  || || ||||||| ||||||||| |||| ||    ||||| ||| |    
T  3277497 aatgactccaacttagtccacattggtgcagcggtagcttctctcacgacatatctcaaaaccttatatctgagacaaaaaaaaaaaaagcactatttac 3277596  T
Q  169 cttgtttaccatctcacgcttctcctcttgtgtcaaggttgccggcatcgccgcttcaccctttaatgcttctacacacnnnnnnngtgtcaaaaccgct 268  Q
    | ||| ||  ||||||  ||||||  ||||||||||||| || |  || ||  ||||||| ||| || |||| ||||||       | |||||||| | |    
T  3277597 cctgtgtataatctcaaacttctcaacttgtgtcaaggtagctgagattgcaacttcacc-tttgatacttcaacacacttttgttgagtcaaaactgtt 3277695  T
Q  269 tgcatcttaaccttccacaacccgaaatcattacttccggtgaacttctcgatgtcccactttgaccccatgatac 344  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||||||| | |||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  3277696 tgcatcttaaccttccataacccaaaatcataatttccagtgaacttctcgatgtcccgctttgaacccatgatac 3277771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 20 - 344
Target Start/End: Original strand, 35217445 - 35217769
Alignment:
Q  20 tagagttgttgcttcaagagttgcctatgagccaaagatttcgtcatatacaatgactccaacttcgcccacatcgatgccgcggtagcttctctcgcga 119  Q
    |||||||||||||| | || ||||| |||||||||||| || |||||||| || || |||||||| |||||||||||||||||||| |||||  | || |    
T  35217445 tagagttgttgctttaggaattgccgatgagccaaagactttgtcatatataaagattccaactttgcccacatcgatgccgcggttgcttcctttgcta 35217544  T
Q  120 catcccttaagaccttatctctgagacataaaacaatggcactctttgccttgtttaccatctcacgcttctcctcttgtgtcaaggttgccggcatcgc 219  Q
    | || || || || ||||| | ||| || || |||| ||||||| | |||||||  |||||||    ||||||| || ||| || |||  |||| | ||     
T  35217545 cttctctcaaaactttatccccgaggcacaagacaacggcactcctggccttgtccaccatcttggtcttctccgctcgtgacatggtgaccggtaacga 35217644  T
Q  220 cgcttcaccctttaatgcttctacacacnnnnnnngtgtcaaaaccgcttgcatcttaaccttccacaacccgaaatcattacttccggtgaacttctcg 319  Q
      |||||||||| || ||||   |||||       || | || ||||||| |||||| |||||||| ||||||||||| |||  |||||| |||||||||    
T  35217645 accttcacccttcaaagctttctcacacttctgctgtattaacaccgcttccatctttaccttccataacccgaaatcgttatctccggtaaacttctcg 35217744  T
Q  320 atgtcccactttgaccccatgatac 344  Q
    || ||||||||||| ||||||||||    
T  35217745 atatcccactttgaacccatgatac 35217769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 40 - 340
Target Start/End: Original strand, 19503831 - 19504131
Alignment:
Q  40 ttgcctatgagccaaagatttcgtcatatacaatgactccaacttcgcccacatcgatgccgcggtagcttctctcgcgacatcccttaagaccttatct 139  Q
    ||||| ||||| |||||| || ||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||| |||||  | || || || || || || |||||     
T  19503831 ttgccgatgaggcaaagactttgtcatatacaaagattccaactttgcccacatcgatgccgcggttgcttcctttgctacttctctcaaaactttatcc 19503930  T
Q  140 ctgagacataaaacaatggcactctttgccttgtttaccatctcacgcttctcctcttgtgtcaaggttgccggcatcgccgcttcaccctttaatgctt 239  Q
    | ||| || || |||||||||||| | |||||||  ||||||||   ||||||| |||||| || |||  |||| | ||   |||||||||| || ||||    
T  19503931 ccgaggcacaagacaatggcactcctggccttgtccaccatctcggtcttctccgcttgtgacatggtgaccggtaacgaaccttcacccttcaaagctt 19504030  T
Q  240 ctacacacnnnnnnngtgtcaaaaccgcttgcatcttaaccttccacaacccgaaatcattacttccggtgaacttctcgatgtcccactttgaccccat 339  Q
       |||||       || | || ||||||| |||||| |||||||| ||||| |||||||||  |||||| |||||||| || ||||||||||| |||||    
T  19504031 tctcacacttttgctgtattaacaccgcttccatctttaccttccataacccaaaatcattatctccggtaaacttctcaatatcccactttgaacccat 19504130  T
Q  340 g 340  Q
    |    
T  19504131 g 19504131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 258 - 338
Target Start/End: Original strand, 30720337 - 30720417
Alignment:
Q  258 tcaaaaccgcttgcatcttaaccttccacaacccgaaatcattacttccggtgaacttctcgatgtcccactttgacccca 338  Q
    ||||||| |||| ||| || |||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  30720337 tcaaaactgcttccattttgaccttccataacccaaaatcattacatccggtgaacttctcgatatcccactttgaaccca 30720417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 20 - 105
Target Start/End: Original strand, 21520169 - 21520254
Alignment:
Q  20 tagagttgttgcttcaagagttgcctatgagccaaagatttcgtcatatacaatgactccaacttcgcccacatcgatgccgcggt 105  Q
    |||||||||||||| | || ||||| |||||||||||| || ||||||||||| || |||||||| | |||||||||||| |||||    
T  21520169 tagagttgttgctttaggaattgccgatgagccaaagactttgtcatatacaaagattccaactttggccacatcgatgctgcggt 21520254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 40 - 105
Target Start/End: Original strand, 34574653 - 34574718
Alignment:
Q  40 ttgcctatgagccaaagatttcgtcatatacaatgactccaacttcgcccacatcgatgccgcggt 105  Q
    |||||||||||||||||  || ||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  34574653 ttgcctatgagccaaaggctttgtcatatacaaagactccaactttgaccacatcgatgccgcggt 34574718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 152 - 340
Target Start/End: Original strand, 723311 - 723499
Alignment:
Q  152 acaatggcactctttgccttgtttaccatctcacgcttctcctcttgtgtcaaggttgccggcatcgccgcttcaccctttaatgcttctacacacnnnn 251  Q
    |||| ||||||| | |||||||  ||||||||   ||||||| ||||||||| |||  |||||| |||  |||||||||| || ||||   |||||        
T  723311 acaaaggcactcctagccttgtccaccatctcggtcttctccgcttgtgtcatggtgaccggcaacgcaccttcacccttcaaagctttctcacactttt 723410  T
Q  252 nnngtgtcaaaaccgcttgcatcttaaccttccacaacccgaaatcattacttccggtgaacttctcgatgtcccactttgaccccatg 340  Q
       || |||| ||| ||||||| || |||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||| || | ||||||||| ||||||    
T  723411 gttgtatcaacaccacttgcattttcaccttccataacccaaaatcgttacttccggtgaacttctcaatattccactttgaacccatg 723499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 271 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 2736651 - 2736577
Alignment:
Q  271 catcttaaccttccacaacccgaaatcattacttccggtgaacttctcgatgtcccactttgaccccatgatacc 345  Q
    |||||| ||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||| || || |||||||| || |||||||||||    
T  2736651 catcttcaccttccacaacccgaagtcgttactaccggtgaacttttcaatatcccacttcgaacccatgatacc 2736577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 271 - 345
Target Start/End: Original strand, 20054495 - 20054569
Alignment:
Q  271 catcttaaccttccacaacccgaaatcattacttccggtgaacttctcgatgtcccactttgaccccatgatacc 345  Q
    |||||| ||||||||||||||||| || ||||| ||||| ||||| || || |||||||| || |||||||||||    
T  20054495 catctttaccttccacaacccgaagtcgttactaccggtaaacttttcaatatcccacttcgaacccatgatacc 20054569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 271 - 345
Target Start/End: Original strand, 22716968 - 22717042
Alignment:
Q  271 catcttaaccttccacaacccgaaatcattacttccggtgaacttctcgatgtcccactttgaccccatgatacc 345  Q
    |||||| ||||||||||||||||| || ||||| ||||| ||||| || || |||||||| || |||||||||||    
T  22716968 catctttaccttccacaacccgaagtcgttactaccggtaaacttttcaatatcccacttcgaacccatgatacc 22717042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 271 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 39680492 - 39680418
Alignment:
Q  271 catcttaaccttccacaacccgaaatcattacttccggtgaacttctcgatgtcccactttgaccccatgatacc 345  Q
    |||||| ||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||| || || ||||||||  | |||||||||||    
T  39680492 catcttcaccttccacaacccgaagtcgttactaccggtgaacttttcaatatcccacttcaaacccatgatacc 39680418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 263 - 340
Target Start/End: Original strand, 6263872 - 6263948
Alignment:
Q  263 accgcttgcatcttaaccttccacaacccgaaatcattacttccggtgaacttctcgatgtcccactttgaccccatg 340  Q
    ||||||| |||||| |||||||| ||||| ||||| |||  ||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||    
T  6263872 accgctttcatctttaccttccataaccc-aaatcgttatctccggtgaacttctcaatatcccactttgaacccatg 6263948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 49 - 105
Target Start/End: Original strand, 22405434 - 22405490
Alignment:
Q  49 agccaaagatttcgtcatatacaatgactccaacttcgcccacatcgatgccgcggt 105  Q
    ||||||||| || ||||||||||| || |||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  22405434 agccaaagactttgtcatatacaaagattccaactttgcccacatcgatgtcgcggt 22405490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 255 - 333
Target Start/End: Original strand, 42019553 - 42019631
Alignment:
Q  255 gtgtcaaaaccgcttgcatcttaaccttccacaacccgaaatcattacttccggtgaacttctcgatgtcccactttga 333  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||||| | ||||| ||||||||| || | ||  | ||| ||||||||||||||||    
T  42019553 gtgtcaaaaccacttgcatctttaccttcaataacccaaaatcattattttcagttcatttcccgatgtcccactttga 42019631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 271 - 344
Target Start/End: Original strand, 28458578 - 28458651
Alignment:
Q  271 catcttaaccttccacaacccgaaatcattacttccggtgaacttctcgatgtcccactttgaccccatgatac 344  Q
    |||||| ||||||||||||| ||| |||||||| ||||| |||||||  || || ||||||||  |||||||||    
T  28458578 catctttaccttccacaacctgaagtcattactaccggtaaacttctaaatatctcactttgaatccatgatac 28458651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 264 - 340
Target Start/End: Original strand, 22405649 - 22405725
Alignment:
Q  264 ccgcttgcatcttaaccttccacaacccgaaatcattacttccggtgaacttctcgatgtcccactttgaccccatg 340  Q
    |||||| |||||| |||||||| ||||||||||  |||  || ||| |||||||| || ||||||||||| ||||||    
T  22405649 ccgcttccatctttaccttccataacccgaaattgttatctctggtaaacttctcaatatcccactttgaacccatg 22405725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0188 (Bit Score: 260; Significance: 1e-145; HSPs: 1)
Name: scaffold0188
Description:

Target: scaffold0188; HSP #1
Raw Score: 260; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 18 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 18605 - 18257
Alignment:
Q  18 catagagttgttgcttcaagagttgcctatgagccaaagatttcgtcatatacaatgactccaacttcgcccacatcgatgccgcggtagcttctctcgc 117  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18605 catagagttgttgtttcaaaagttgcctatgagccaaagatttcgtcatgtacaatgactccaacttagcccacatcgatgccgcggtagcttctctcgc 18506  T
Q  118 gacatcccttaagaccttatctctgagacataaaacaatggcactctttgccttgtttaccatctcacgcttctcctcttgtgtcaaggttgccggcatc 217  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||     
T  18505 gacatcccttaagaccttatctccgagacataaaacaatagcactctttgccttgtctatcatctcacgcttctcttcttgtgtcaaagttgccggcata 18406  T
Q  218 gccgcttcaccctttaatgcttctacacacnnnnnnngtgtcaaaaccgcttgcatcttaaccttccacaacccgaaatcattacttccggtgaacttct 317  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||       |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  18405 gccgcttcacccttcaatacttctacacacttttgttgtgtcaaaaccgcttgcatcttaaccttccacaacccgaaatcattacttccggtgaatttct 18306  T
Q  318 cgatgtcccactttgaccccatgataccaactatcaataactcctatgc 366  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  18305 cgatgtcccactttgaacccatgataccaactaccaataacgcctatgc 18257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0355 (Bit Score: 251; Significance: 1e-139; HSPs: 1)
Name: scaffold0355
Description:

Target: scaffold0355; HSP #1
Raw Score: 251; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 23 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 533 - 190
Alignment:
Q  23 agttgttgcttcaagagttgcctatgagccaaagatttcgtcatatacaatgactccaacttcgcccacatcgatgccgcggtagcttctctcgcgacat 122  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||    
T  533 agttgttgcttcaagagttgcctatgagccaaagatttcgtcatatacaatgactccaactttgcccacatcgatgtcgctgtagcttctctcgtgacat 434  T
Q  123 cccttaagaccttatctctgagacataaaacaatggcactctttgccttgtttaccatctcacgcttctcctcttgtgtcaaggttgccggcatcgccgc 222  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  433 cccttaagaccttatctccgagacataagacaatggcactctttgccttgtctaccatctcacgcttctcctcttgtgtcaaggttgccggcatcgccgc 334  T
Q  223 ttcaccctttaatgcttctacacacnnnnnnngtgtcaaaaccgcttgcatcttaaccttccacaacccgaaatcattacttccggtgaacttctcgatg 322  Q
    ||||||||| ||||||||||||||         |||||| ||| ||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  333 ttcacccttcaatgcttctacacatttttgttttgtcaatacctctttcatcttaaccttccataacctgaaatcattacttccggtgaacttcttgatg 234  T
Q  323 tcccactttgaccccatgataccaactatcaataactcctatgc 366  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  233 tcccactttgaccccatgataccaactatcaatcacgcctatgc 190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006 (Bit Score: 228; Significance: 1e-126; HSPs: 1)
Name: scaffold0006
Description:

Target: scaffold0006; HSP #1
Raw Score: 228; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 19 - 351
Target Start/End: Original strand, 1934 - 2266
Alignment:
Q  19 atagagttgttgcttcaagagttgcctatgagccaaagatttcgtcatatacaatgactccaacttcgcccacatcgatgccgcggtagcttctctcgcg 118  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||   ||||||||| |||||    
T  1934 atagagttgttgtttcaagagttgcctatgagccaacgatttcgtcatgtacaatgactccaacttagcccacatcgacgccattgtagcttctgtcgcg 2033  T
Q  119 acatcccttaagaccttatctctgagacataaaacaatggcactctttgccttgtttaccatctcacgcttctcctcttgtgtcaaggttgccggcatcg 218  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||| ||||||||||  | ||||||||||    
T  2034 acatcccttaaaaccttatctccgagacataaaacaatggcactcttagccttgtctatcatctcacgcttctccgcttgtgtcaaattcgccggcatcg 2133  T
Q  219 ccgcttcaccctttaatgcttctacacacnnnnnnngtgtcaaaaccgcttgcatcttaaccttccacaacccgaaatcattacttccggtgaacttctc 318  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||       || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2134 ccgcttcacccttcaatgcttctacacacttttgttgtatcaaaaccgcttgcatcttaaccttccacaacccgaaatcattacttccggtgaacttctc 2233  T
Q  319 gatgtcccactttgaccccatgataccaactat 351  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  2234 gatgtcccactttgaacccatgataccaactat 2266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0087 (Bit Score: 227; Significance: 1e-125; HSPs: 1)
Name: scaffold0087
Description:

Target: scaffold0087; HSP #1
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 32 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 37474 - 37155
Alignment:
Q  32 ttcaagagttgcctatgagccaaagatttcgtcatatacaatgactccaacttcgcccacatcgatgccgcggtagcttctctcgcgacatcccttaaga 131  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||||| || |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37474 ttcaagagttgcctatgagcagaagatttcgtcatgtaaaatgactccaacttagcccgcatcgatgccgcggtagcttctctcgcgacatcccttaaga 37375  T
Q  132 ccttatctctgagacataaaacaatggcactctttgccttgtttaccatctcacgcttctcctcttgtgtcaaggttgccggcatcgccgcttcaccctt 231  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| |||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  37374 ccttatctccaagacataaaacaatggcactctttgccttgtctatcatctcacgtttctccgcttgtgtcaaagttgccggaatcgccgcttcaccctt 37275  T
Q  232 taatgcttctacacacnnnnnnngtgtcaaaaccgcttgcatcttaaccttccacaacccgaaatcattacttccggtgaacttctcgatgtcccacttt 331  Q
     |||||||||||||||       ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  37274 caatgcttctacacacttttgttgtgtcaaaatcgcttgcatcttaaccttccacaacccgaaatcattacttccggtgaacttatcgatgtcccacttt 37175  T
Q  332 gaccccatgataccaactat 351  Q
    || |||||||||||||||||    
T  37174 gaacccatgataccaactat 37155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0842 (Bit Score: 218; Significance: 1e-120; HSPs: 1)
Name: scaffold0842
Description:

Target: scaffold0842; HSP #1
Raw Score: 218; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 19 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 3852 - 3522
Alignment:
Q  19 atagagttgttgcttcaagagttgcctatgagccaaagatttcgtcatatacaatgactccaacttcgcccacatcgatgccgcggtagcttctctcgcg 118  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||  |||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| |    
T  3852 atagagttgttgtttcaagagttgcctatgagtgaaagttttcgtcatgtacaatgactccaacttagcccacatcgatgccgtggtagcttctctcgtg 3753  T
Q  119 acatcccttaagaccttatctctgagacataaaacaatggcactctttgccttgtttaccatctcacgcttctcctcttgtgtcaaggttgccggcatcg 218  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||||||  || ||||||||     
T  3752 acatcccttaagaccttatctccgagacataaaataatggaactctttgccttgtctatcatctcacgcttctccgcttgtgtcaaattttccggcatca 3653  T
Q  219 ccgcttcaccctttaatgcttctacacacnnnnnnngtgtcaaaaccgcttgcatcttaaccttccacaacccgaaatcattacttccggtgaacttctc 318  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||       ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  3652 ccgcttcacccttcaatgcttctacacacttttgttgtgtcaaaatcacttgcatcttaaccttccacaacccaaaatcattacttccggtgaacttctc 3553  T
Q  319 gatgtcccactttgaccccatgataccaact 349  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  3552 gatgtcccactttgaacccatgataccaact 3522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0184 (Bit Score: 132; Significance: 2e-68; HSPs: 1)
Name: scaffold0184
Description:

Target: scaffold0184; HSP #1
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 20 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 30142 - 29821
Alignment:
Q  20 tagagttgttgcttcaagagttgcctatgagccaaagatttcgtcatatacaatgactccaacttcgcccacatcgatgccgcggtagcttctctcgcga 119  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||  |||||||||| |||||||||||||| || || |||||  |   |||||||||||| |||||||    
T  30142 tagagttgttgtttcaagagttgccaatgagccaacaatttcgtcatgtacaatgactccaagttagctcacattaacatcgcggtagcttccctcgcga 30043  T
Q  120 catcccttaagaccttatctctgagacataaaacaatggcactctttgccttgtttaccatctcacgcttctcctcttgtgtcaaggttgccggcatcgc 219  Q
    |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||  ||| |||||||||| || ||||||| |||||||| ||||||||||  || |||||||  |    
T  30042 catcccttaaaaccttatttctgagacataaaacaatgatactttttgccttgtctatcatctcatgcttctccgcttgtgtcaaatttcccggcatttc 29943  T
Q  220 cgcttcaccctttaatgcttctacacacnnnnnnngtgtcaaaaccgcttgcatcttaaccttccacaacccgaaatcattacttccggtgaacttctcg 319  Q
    || || |||||| ||| ||  ||||||        ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| || ||||||||||||||    
T  29942 cgttttacccttcaattctcttacaca---attttgtgtcaaaaccgcttgcatcttaaccttccataacctgaaatcattattttcggtgaacttctcg 29846  T
Q  320 atgtcccactttgaccccatgatac 344  Q
    |||||| ||||||  ||||||||||    
T  29845 atgtcctactttgtacccatgatac 29821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0078 (Bit Score: 132; Significance: 2e-68; HSPs: 1)
Name: scaffold0078
Description:

Target: scaffold0078; HSP #1
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 20 - 344
Target Start/End: Original strand, 42702 - 43023
Alignment:
Q  20 tagagttgttgcttcaagagttgcctatgagccaaagatttcgtcatatacaatgactccaacttcgcccacatcgatgccgcggtagcttctctcgcga 119  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||  |||||||||| |||||||||||||| || || |||||  |   |||||||||||| |||||||    
T  42702 tagagttgttgtttcaagagttgccaatgagccaacaatttcgtcatgtacaatgactccaagttagctcacattaacatcgcggtagcttccctcgcga 42801  T
Q  120 catcccttaagaccttatctctgagacataaaacaatggcactctttgccttgtttaccatctcacgcttctcctcttgtgtcaaggttgccggcatcgc 219  Q
    |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||  ||| |||||||||| || ||||||| |||||||| ||||||||||  || |||||||  |    
T  42802 catcccttaaaaccttatttctgagacataaaacaatgatactttttgccttgtctatcatctcatgcttctccgcttgtgtcaaatttcccggcatttc 42901  T
Q  220 cgcttcaccctttaatgcttctacacacnnnnnnngtgtcaaaaccgcttgcatcttaaccttccacaacccgaaatcattacttccggtgaacttctcg 319  Q
    || || |||||| ||| ||  ||||||        ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| || ||||||||||||||    
T  42902 cgttttacccttcaattctcttacaca---attttgtgtcaaaaccgcttgcatcttaaccttccataacctgaaatcattattttcggtgaacttctcg 42998  T
Q  320 atgtcccactttgaccccatgatac 344  Q
    |||||| ||||||  ||||||||||    
T  42999 atgtcctactttgtacccatgatac 43023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016 (Bit Score: 80; Significance: 2e-37; HSPs: 1)
Name: scaffold0016
Description:

Target: scaffold0016; HSP #1
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 20 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 115339 - 115019
Alignment:
Q  20 tagagttgttgcttcaagagttgcctatgagccaaagatttcgtcatatacaatgactccaacttcgcccacatcgatgccgcggtagcttctctcgcga 119  Q
    |||||||||||||| | || ||| |||||||||||||| || |||||||||||||||| |||||| | |||| ||||||||||||| | |||  ||||||    
T  115339 tagagttgttgcttaaggaattgtctatgagccaaagacttggtcatatacaatgactacaactttgaccacgtcgatgccgcggttggttccttcgcga 115240  T
Q  120 catcccttaagaccttatctctgagacataaaacaatggcactctttgccttgtttaccatctcacgcttctcctcttgtgtcaaggttgccggcatcgc 219  Q
    |||| || || || || || | ||| || || |||||||||||| | |||||||  |||||||||  ||||| | ||||||||| |||  |||| | |||    
T  115239 catcgctcaaaactttgtcaccgaggcacaagacaatggcactcctagccttgtccaccatctcagtcttcttcgcttgtgtcatggtgaccggtaacgc 115140  T
Q  220 cgcttcaccctttaatgcttctacacacnnnnnnngtgtcaaaaccgcttgcatcttaaccttccacaacccgaaatcattacttccggtgaacttctcg 319  Q
       ||||||||| || ||||   |||||       || |||| |||||||||||||| |||||||| ||||| ||||| ||| ||||||||||||||||     
T  115139 actttcacccttcaaagctttctcacacttttgttgtatcaacaccgcttgcatcttcaccttccataacccaaaatcgttaattccggtgaacttctca 115040  T
Q  320 atgtcccactttgaccccatg 340  Q
    || ||||||||||| ||||||    
T  115039 atatcccactttgaacccatg 115019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1991 (Bit Score: 56; Significance: 4e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold1991
Description:

Target: scaffold1991; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 19 - 78
Target Start/End: Complemental strand, 1081 - 1022
Alignment:
Q  19 atagagttgttgcttcaagagttgcctatgagccaaagatttcgtcatatacaatgactc 78  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1081 atagagttgttgtttcaagagttgcctatgagccaaagatttcgtcatatacaatgactc 1022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0140 (Bit Score: 56; Significance: 4e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0140
Description:

Target: scaffold0140; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 20 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 22930 - 22610
Alignment:
Q  20 tagagttgttgcttcaagagttgcctatgagccaaagatttcgtcatatacaatgactccaacttcgcccacatcgatgccgcggtagcttctctcgcga 119  Q
    |||||||||||||| | || ||||| |||||||||||| || ||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||| |||||  | || |    
T  22930 tagagttgttgctttaggaattgccgatgagccaaagactttgtcatatacaaagattccaactttgcccatatcgatgccgcggttgcttcctttgcta 22831  T
Q  120 catcccttaagaccttatctctgagacataaaacaatggcactctttgccttgtttaccatctcacgcttctcctcttgtgtcaaggttgccggcatcgc 219  Q
    | || || || || ||||| | ||| || || |||| |||||||   |||||||  ||||||||   ||||||| |||||| || |||  |||| | ||     
T  22830 cttctctcaaaactttatccccgaggcacaagacaacggcactccgggccttgtccaccatctcggtcttctccgcttgtgacatggtgaccggtaacga 22731  T
Q  220 cgcttcaccctttaatgcttctacacacnnnnnnngtgtcaaaaccgcttgcatcttaaccttccacaacccgaaatcattacttccggtgaacttctcg 319  Q
      |||||||||| || ||||   |||||       || | || ||||||| |||||| |||||||| ||||||||||| |||  |||||| |||||||||    
T  22730 accttcacccttcaaagctttctcacacttctgctgtattaacaccgcttccatctttaccttccataacccgaaatcgttatctccggtaaacttctcg 22631  T
Q  320 atgtcccactttgaccccatg 340  Q
    || ||||||||||| ||||||    
T  22630 atatcccactttgaacccatg 22610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1899 (Bit Score: 48; Significance: 2e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold1899
Description:

Target: scaffold1899; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 20 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 428 - 104
Alignment:
Q  20 tagagttgttgcttcaagagttgcctatgagccaaagatttcgtcatatacaatgactccaacttcgcccacatcgatgccgcggtagcttctctcgcga 119  Q
    |||||| ||||||| | || ||||| |||||||||||  || ||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||| |||| |||||  | || |    
T  428 tagagtcgttgctttaggaattgccgatgagccaaaggctttgtcatatacaaagattccaactttgcccacatcgatgccacggttgcttcctttgcta 329  T
Q  120 catcccttaagaccttatctctgagacataaaacaatggcactctttgccttgtttaccatctcacgcttctcctcttgtgtcaaggttgccggcatcgc 219  Q
    | || || || || ||||| | ||| || || |||||||||||| | |||||||  ||||||||   ||| ||| |||||| || |||  |||| | ||     
T  328 cttctctcaaaactttatccccgaggcacaagacaatggcactcctggccttgtccaccatctcggtcttttccgcttgtgacatggtgaccggtaacga 229  T
Q  220 cgcttcaccctttaatgcttctacacacnnnnnnngtgtcaaaaccgcttgcatcttaaccttccacaacccgaaatcattacttccggtgaacttctcg 319  Q
      |||||||||| || ||||   |||||       || | || ||||||| |||||| |||||||| ||||| ||||| |||| ||| || ||||||||     
T  228 accttcacccttcaaagctttctcacacttttgctgtattaacaccgcttccatctttaccttccataacccaaaatcgttacctccagtaaacttctca 129  T
Q  320 atgtcccactttgaccccatgatac 344  Q
    || ||||||||||| ||||||||||    
T  128 atatcccactttgaacccatgatac 104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011 (Bit Score: 44; Significance: 6e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0011
Description:

Target: scaffold0011; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 22 - 101
Target Start/End: Complemental strand, 34352 - 34273
Alignment:
Q  22 gagttgttgcttcaagagttgcctatgagccaaagatttcgtcatatacaatgactccaacttcgcccacatcgatgccg 101  Q
    |||||||||||| | || ||||| |||||||||||| || ||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||    
T  34352 gagttgttgctttaggaattgccgatgagccaaagactttgtcatatacaaagattccaactttgcccacatcgatgccg 34273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0025
Description:

Target: scaffold0025; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 20 - 102
Target Start/End: Original strand, 72992 - 73074
Alignment:
Q  20 tagagttgttgcttcaagagttgcctatgagccaaagatttcgtcatatacaatgactccaacttcgcccacatcgatgccgc 102  Q
    |||||||||||||| | || ||||| ||||| ||||||||| ||||||||||| || |||||||| |||||||| ||||||||    
T  72992 tagagttgttgctttaggaattgccgatgagtcaaagattttgtcatatacaaagattccaactttgcccacatagatgccgc 73074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0491 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0491
Description:

Target: scaffold0491; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 258 - 340
Target Start/End: Original strand, 10830 - 10912
Alignment:
Q  258 tcaaaaccgcttgcatcttaaccttccacaacccgaaatcattacttccggtgaacttctcgatgtcccactttgaccccatg 340  Q
    |||| ||| ||| |||||| |||||||| ||||| ||||| ||| | |||||||||||||||||  |||||||||| ||||||    
T  10830 tcaacacctctttcatcttcaccttccataacccaaaatcgttaatcccggtgaacttctcgataccccactttgaacccatg 10912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0209 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0209
Description:

Target: scaffold0209; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 271 - 344
Target Start/End: Original strand, 16770 - 16843
Alignment:
Q  271 catcttaaccttccacaacccgaaatcattacttccggtgaacttctcgatgtcccactttgaccccatgatac 344  Q
    |||||| ||||||||||||||||| || ||||| ||||| ||||| || || |||||||| || ||||||||||    
T  16770 catctttaccttccacaacccgaagtcgttactaccggtaaacttttcaatatcccacttcgaacccatgatac 16843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0005
Description:

Target: scaffold0005; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 23 - 107
Target Start/End: Complemental strand, 50819 - 50735
Alignment:
Q  23 agttgttgcttcaagagttgcctatgagccaaagatttcgtcatatacaatgactccaacttcgcccacatcgatgccgcggtag 107  Q
    ||||||||||| | || ||||| |||||||||||| || |||||||||||  | || | ||| | ||||||||||||||||||||    
T  50819 agttgttgctttaggacttgccgatgagccaaagactttgtcatatacaaatattcgatctttgaccacatcgatgccgcggtag 50735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1674 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000003; HSPs: 1)
Name: scaffold1674
Description:

Target: scaffold1674; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 266 - 340
Target Start/End: Original strand, 1173 - 1247
Alignment:
Q  266 gcttgcatcttaaccttccacaacccgaaatcattacttccggtgaacttctcgatgtcccactttgaccccatg 340  Q
    |||| |||||| |||||||| ||||| ||||| |||  |||||| |||||||| || ||||||||||| ||||||    
T  1173 gcttccatctttaccttccataacccaaaatcgttatctccggtaaacttctcaatatcccactttgaacccatg 1247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0127 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0127
Description:

Target: scaffold0127; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 266 - 340
Target Start/End: Original strand, 12596 - 12670
Alignment:
Q  266 gcttgcatcttaaccttccacaacccgaaatcattacttccggtgaacttctcgatgtcccactttgaccccatg 340  Q
    |||| |||||| |||||||| ||||| ||||| |||  |||||| |||||||| || ||||||||||| ||||||    
T  12596 gcttccatctttaccttccataacccaaaatcgttatctccggtaaacttctcaatatcccactttgaacccatg 12670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University