View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF9628_low_49 (Length: 225)

Name: NF9628_low_49
Description: NF9628
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF9628_low_49
NF9628_low_49
[»] chr1 (54 HSPs)
chr1 (10-225)||(28492274-28492489)
chr1 (10-220)||(33256226-33256436)
chr1 (10-220)||(33276398-33276608)
chr1 (10-221)||(22600056-22600267)
chr1 (10-220)||(22153852-22154062)
chr1 (10-220)||(10757416-10757627)
chr1 (10-220)||(1577862-1578072)
chr1 (10-221)||(20954347-20954558)
chr1 (10-217)||(22201614-22201821)
chr1 (10-220)||(19717519-19717729)
chr1 (10-220)||(48704199-48704409)
chr1 (10-221)||(1900340-1900551)
chr1 (14-225)||(32785808-32786018)
chr1 (10-221)||(38282562-38282772)
chr1 (10-220)||(12284418-12284628)
chr1 (13-220)||(2267087-2267292)
chr1 (10-220)||(22427234-22427442)
chr1 (10-217)||(36134185-36134391)
chr1 (10-220)||(2268526-2268733)
chr1 (27-217)||(35401821-35402011)
chr1 (10-218)||(29215792-29215998)
chr1 (10-220)||(39200869-39201077)
chr1 (13-220)||(30893090-30893298)
chr1 (10-209)||(16235182-16235381)
chr1 (10-220)||(22464685-22464894)
chr1 (10-220)||(25448443-25448651)
chr1 (10-202)||(21028788-21028980)
chr1 (27-217)||(23036405-23036595)
chr1 (13-198)||(21191763-21191947)
chr1 (10-220)||(2834684-2834893)
chr1 (10-200)||(35040161-35040351)
chr1 (10-220)||(2327316-2327525)
chr1 (10-198)||(12613713-12613899)
chr1 (26-217)||(7309830-7310020)
chr1 (10-220)||(26702004-26702214)
chr1 (10-223)||(44821419-44821630)
chr1 (10-225)||(30572192-30572404)
chr1 (10-223)||(48570106-48570316)
chr1 (10-220)||(21702809-21703016)
chr1 (21-175)||(14263371-14263525)
chr1 (30-139)||(17024920-17025029)
chr1 (10-220)||(46088984-46089183)
chr1 (13-220)||(10250984-10251179)
chr1 (27-155)||(18896537-18896665)
chr1 (26-220)||(7744967-7745159)
chr1 (10-78)||(19215607-19215675)
chr1 (10-102)||(21121057-21121149)
chr1 (10-102)||(21135153-21135245)
chr1 (10-78)||(23024783-23024851)
chr1 (21-102)||(21204916-21204997)
chr1 (29-102)||(42284642-42284715)
chr1 (26-102)||(21984607-21984683)
chr1 (10-78)||(37642243-37642311)
chr1 (15-58)||(17371042-17371085)
[»] chr3 (67 HSPs)
chr3 (10-225)||(49642711-49642926)
chr3 (10-222)||(37467328-37467540)
chr3 (10-214)||(31303381-31303585)
chr3 (10-221)||(2561183-2561394)
chr3 (10-225)||(12963034-12963249)
chr3 (10-220)||(14392958-14393168)
chr3 (10-195)||(41494994-41495179)
chr3 (13-217)||(13948334-13948538)
chr3 (13-212)||(17238884-17239083)
chr3 (10-220)||(6090727-6090937)
chr3 (13-215)||(15903196-15903399)
chr3 (26-221)||(38177596-38177791)
chr3 (12-218)||(28582103-28582309)
chr3 (29-221)||(14969341-14969533)
chr3 (10-183)||(13780575-13780748)
chr3 (10-225)||(20646149-20646365)
chr3 (10-221)||(18121575-18121786)
chr3 (10-220)||(29951392-29951602)
chr3 (10-220)||(30000546-30000756)
chr3 (38-209)||(13824092-13824263)
chr3 (10-221)||(18142705-18142916)
chr3 (10-220)||(47405377-47405585)
chr3 (10-225)||(16658567-16658782)
chr3 (10-220)||(49553443-49553653)
chr3 (10-220)||(47207701-47207910)
chr3 (10-225)||(12726179-12726394)
chr3 (10-220)||(19888898-19889107)
chr3 (12-220)||(52920403-52920610)
chr3 (10-197)||(40799869-40800056)
chr3 (10-217)||(16032520-16032726)
chr3 (10-220)||(11223559-11223766)
chr3 (10-225)||(20627382-20627595)
chr3 (10-220)||(24775490-24775698)
chr3 (26-225)||(2785075-2785273)
chr3 (10-149)||(22804048-22804187)
chr3 (27-225)||(46349795-46349991)
chr3 (10-220)||(53056683-53056891)
chr3 (21-225)||(14955433-14955635)
chr3 (11-202)||(12388845-12389035)
chr3 (28-202)||(19249385-19249558)
chr3 (26-225)||(33583240-33583439)
chr3 (10-134)||(25398295-25398419)
chr3 (21-223)||(5213583-5213782)
chr3 (10-220)||(22140759-22140967)
chr3 (21-198)||(20725093-20725269)
chr3 (10-220)||(29855404-29855613)
chr3 (84-220)||(11869137-11869271)
chr3 (28-155)||(23538185-23538312)
chr3 (21-155)||(12968312-12968446)
chr3 (13-225)||(21640865-21641074)
chr3 (38-162)||(50300246-50300370)
chr3 (10-78)||(11868264-11868332)
chr3 (10-220)||(46796333-46796531)
chr3 (10-220)||(49666371-49666569)
chr3 (10-102)||(21605726-21605818)
chr3 (21-155)||(26417698-26417832)
chr3 (27-119)||(11909079-11909171)
chr3 (10-102)||(21636742-21636834)
chr3 (157-209)||(25398238-25398290)
chr3 (10-78)||(30054313-30054381)
chr3 (10-60)||(1728129-1728179)
chr3 (10-78)||(9700132-9700200)
chr3 (48-119)||(45858804-45858875)
chr3 (15-60)||(37412605-37412650)
chr3 (15-119)||(51341011-51341107)
chr3 (21-53)||(13557777-13557809)
chr3 (38-102)||(40850991-40851055)
[»] chr2 (67 HSPs)
chr2 (10-225)||(30666979-30667194)
chr2 (10-220)||(25829124-25829334)
chr2 (10-225)||(25037154-25037369)
chr2 (10-225)||(25041261-25041476)
chr2 (10-223)||(20568647-20568860)
chr2 (10-220)||(9015270-9015478)
chr2 (10-221)||(13963877-13964088)
chr2 (10-221)||(23234997-23235208)
chr2 (14-225)||(30621210-30621421)
chr2 (14-225)||(30623831-30624042)
chr2 (10-225)||(22187997-22188212)
chr2 (10-220)||(19540406-19540616)
chr2 (10-220)||(21537148-21537358)
chr2 (10-220)||(24576025-24576236)
chr2 (10-202)||(18376824-18377016)
chr2 (10-220)||(10009649-10009860)
chr2 (10-220)||(24377091-24377301)
chr2 (10-216)||(24850569-24850776)
chr2 (10-217)||(38781388-38781596)
chr2 (10-220)||(28140519-28140729)
chr2 (10-218)||(40782467-40782669)
chr2 (21-225)||(6574019-6574223)
chr2 (38-217)||(20151939-20152117)
chr2 (10-218)||(22317583-22317792)
chr2 (10-202)||(24779333-24779525)
chr2 (46-217)||(22260432-22260603)
chr2 (10-154)||(31800853-31800997)
chr2 (10-220)||(39037542-39037752)
chr2 (10-217)||(23595473-23595677)
chr2 (10-200)||(28711618-28711808)
chr2 (10-198)||(41121642-41121829)
chr2 (10-220)||(22454890-22455100)
chr2 (21-195)||(26619027-26619200)
chr2 (13-202)||(25189391-25189579)
chr2 (10-225)||(33074216-33074429)
chr2 (10-199)||(6392624-6392814)
chr2 (38-220)||(45087084-45087266)
chr2 (10-220)||(22802451-22802658)
chr2 (10-220)||(28701131-28701339)
chr2 (10-220)||(31327867-31328075)
chr2 (10-220)||(31334588-31334796)
chr2 (10-223)||(35743901-35744110)
chr2 (26-223)||(34321835-34322030)
chr2 (98-220)||(7609039-7609162)
chr2 (26-220)||(30557221-30557415)
chr2 (26-155)||(44881173-44881302)
chr2 (26-217)||(19115089-19115279)
chr2 (10-152)||(23184276-23184414)
chr2 (27-191)||(22272139-22272303)
chr2 (10-154)||(28550893-28551028)
chr2 (10-105)||(44840424-44840519)
chr2 (10-154)||(31968018-31968153)
chr2 (10-105)||(22776303-22776398)
chr2 (10-105)||(22781681-22781776)
chr2 (10-105)||(1587048-1587142)
chr2 (10-105)||(14581505-14581600)
chr2 (26-217)||(18430844-18431034)
chr2 (10-105)||(40332077-40332172)
chr2 (27-106)||(3277037-3277116)
chr2 (10-50)||(22258191-22258231)
chr2 (26-217)||(18702744-18702934)
chr2 (26-105)||(22785670-22785749)
chr2 (15-53)||(19498010-19498048)
chr2 (179-223)||(22776197-22776239)
chr2 (179-223)||(22781575-22781617)
chr2 (38-78)||(23392710-23392750)
chr2 (26-58)||(24814645-24814677)
[»] chr8 (60 HSPs)
chr8 (10-225)||(39693523-39693738)
chr8 (13-221)||(12757715-12757923)
chr8 (10-221)||(16207294-16207505)
chr8 (10-225)||(19156184-19156399)
chr8 (10-225)||(17914447-17914662)
chr8 (10-220)||(602673-602883)
chr8 (13-223)||(17525678-17525889)
chr8 (10-220)||(16681256-16681466)
chr8 (10-220)||(16188972-16189182)
chr8 (13-220)||(18321112-18321319)
chr8 (10-221)||(24646326-24646537)
chr8 (10-225)||(29693303-29693518)
chr8 (38-220)||(33082873-33083055)
chr8 (13-221)||(17441760-17441967)
chr8 (21-220)||(19943234-19943435)
chr8 (10-220)||(23185181-23185389)
chr8 (10-218)||(21932871-21933079)
chr8 (10-220)||(17701733-17701943)
chr8 (9-218)||(18679802-18680011)
chr8 (11-220)||(20382347-20382556)
chr8 (11-220)||(17267463-17267671)
chr8 (10-220)||(18718989-18719199)
chr8 (10-221)||(18121061-18121269)
chr8 (28-220)||(23263564-23263757)
chr8 (10-217)||(17797410-17797615)
chr8 (11-220)||(30421383-30421591)
chr8 (10-220)||(45538394-45538602)
chr8 (10-223)||(15336040-15336251)
chr8 (10-223)||(15425105-15425316)
chr8 (10-223)||(15516409-15516620)
chr8 (10-221)||(40845342-40845550)
chr8 (10-200)||(1237625-1237815)
chr8 (80-209)||(20255529-20255658)
chr8 (13-220)||(24551265-24551470)
chr8 (13-217)||(19707497-19707700)
chr8 (10-196)||(43644884-43645069)
chr8 (21-217)||(18685353-18685549)
chr8 (21-217)||(18722602-18722798)
chr8 (21-217)||(18730947-18731143)
chr8 (10-220)||(9320557-9320766)
chr8 (10-225)||(22673766-22673979)
chr8 (10-221)||(36105183-36105392)
chr8 (13-225)||(22663107-22663317)
chr8 (129-221)||(22745594-22745686)
chr8 (28-195)||(22461617-22461783)
chr8 (10-86)||(25164058-25164134)
chr8 (10-220)||(6407714-6407912)
chr8 (11-140)||(19956374-19956502)
chr8 (10-106)||(14989518-14989614)
chr8 (26-220)||(24833011-24833204)
chr8 (10-106)||(18151713-18151809)
chr8 (15-119)||(45567955-45568059)
chr8 (10-102)||(13430699-13430791)
chr8 (144-225)||(3598296-3598375)
chr8 (21-56)||(43639782-43639817)
chr8 (15-53)||(7018416-7018454)
chr8 (15-53)||(20259652-20259690)
chr8 (15-53)||(21046282-21046320)
chr8 (26-110)||(18772624-18772707)
chr8 (26-78)||(21301026-21301078)
[»] scaffold0084 (3 HSPs)
scaffold0084 (10-225)||(49328-49543)
scaffold0084 (10-224)||(32481-32695)
scaffold0084 (15-119)||(351-455)
[»] scaffold0337 (1 HSPs)
scaffold0337 (10-217)||(14644-14851)
[»] scaffold0004 (4 HSPs)
scaffold0004 (10-221)||(377463-377674)
scaffold0004 (10-220)||(220234-220443)
scaffold0004 (19-153)||(244256-244390)
scaffold0004 (10-223)||(211394-211605)
[»] chr5 (46 HSPs)
chr5 (10-225)||(6512361-6512573)
chr5 (10-225)||(41566364-41566579)
chr5 (10-218)||(17814960-17815168)
chr5 (10-225)||(89352-89567)
chr5 (10-220)||(21910548-21910758)
chr5 (10-220)||(23412909-23413119)
chr5 (10-216)||(7745632-7745838)
chr5 (10-220)||(21072176-21072385)
chr5 (10-220)||(20550887-20551097)
chr5 (10-220)||(33022656-33022864)
chr5 (10-220)||(19536235-19536446)
chr5 (10-221)||(13545454-13545657)
chr5 (10-223)||(26784346-26784559)
chr5 (10-225)||(30742973-30743185)
chr5 (10-220)||(31117869-31118078)
chr5 (10-220)||(4887014-4887222)
chr5 (10-223)||(42243673-42243884)
chr5 (10-223)||(11993880-11994091)
chr5 (10-202)||(6499231-6499423)
chr5 (10-225)||(15516962-15517174)
chr5 (10-225)||(29138340-29138551)
chr5 (10-220)||(23881059-23881268)
chr5 (10-220)||(21198940-21199148)
chr5 (10-220)||(642643-642849)
chr5 (10-182)||(12352768-12352940)
chr5 (10-220)||(21099640-21099849)
chr5 (10-225)||(33933259-33933476)
chr5 (11-202)||(25096777-25096969)
chr5 (11-202)||(25154747-25154939)
chr5 (10-220)||(14086474-14086684)
chr5 (26-225)||(26759157-26759354)
chr5 (10-108)||(9398781-9398879)
chr5 (13-220)||(3245379-3245583)
chr5 (21-154)||(26765501-26765634)
chr5 (10-149)||(28139599-28139738)
chr5 (10-129)||(30115863-30115982)
chr5 (10-106)||(9088961-9089057)
chr5 (15-131)||(32160763-32160879)
chr5 (13-105)||(28464389-28464481)
chr5 (10-218)||(25930104-25930301)
chr5 (10-105)||(10848765-10848860)
chr5 (10-102)||(35932059-35932151)
chr5 (15-130)||(11208011-11208125)
chr5 (26-110)||(16607520-16607603)
chr5 (120-220)||(5429985-5430084)
chr5 (21-78)||(23391680-23391737)
[»] chr7 (74 HSPs)
chr7 (10-214)||(2500030-2500234)
chr7 (10-221)||(13137850-13138061)
chr7 (11-218)||(15088513-15088720)
chr7 (10-223)||(10883126-10883339)
chr7 (10-223)||(13302802-13303015)
chr7 (10-225)||(16316508-16316723)
chr7 (10-220)||(44467056-44467267)
chr7 (10-223)||(2913561-2913774)
chr7 (13-225)||(11319400-11319612)
chr7 (10-220)||(21695393-21695603)
chr7 (10-220)||(22577977-22578187)
chr7 (10-221)||(13880096-13880307)
chr7 (13-220)||(28409034-28409241)
chr7 (10-220)||(21692279-21692489)
chr7 (12-213)||(13730638-13730839)
chr7 (13-225)||(21283324-21283536)
chr7 (10-217)||(13648721-13648928)
chr7 (10-220)||(12366704-12366914)
chr7 (10-218)||(9069554-9069762)
chr7 (10-220)||(11792899-11793109)
chr7 (21-225)||(23279910-23280113)
chr7 (10-220)||(30944281-30944489)
chr7 (10-221)||(33691667-33691878)
chr7 (10-221)||(30025897-30026108)
chr7 (26-221)||(15467924-15468119)
chr7 (13-220)||(24788136-24788343)
chr7 (14-220)||(30945314-30945518)
chr7 (10-220)||(29935315-29935524)
chr7 (10-220)||(28622314-28622522)
chr7 (13-209)||(5000788-5000985)
chr7 (10-220)||(9709760-9709968)
chr7 (10-220)||(48236860-48237068)
chr7 (13-220)||(14426542-14426747)
chr7 (15-198)||(19237022-19237204)
chr7 (10-220)||(33605677-33605886)
chr7 (13-217)||(39284524-39284727)
chr7 (10-216)||(331637-331842)
chr7 (39-217)||(13692372-13692541)
chr7 (10-200)||(16111860-16112050)
chr7 (13-225)||(35952640-35952851)
chr7 (10-202)||(13018479-13018671)
chr7 (10-122)||(16309961-16310073)
chr7 (10-220)||(13260579-13260781)
chr7 (11-217)||(13893958-13894162)
chr7 (12-147)||(14193108-14193243)
chr7 (10-220)||(41842230-41842439)
chr7 (38-198)||(13880608-13880768)
chr7 (10-220)||(4821466-4821673)
chr7 (38-162)||(12174354-12174479)
chr7 (44-220)||(16542978-16543152)
chr7 (44-220)||(16622510-16622684)
chr7 (35-202)||(13032046-13032213)
chr7 (10-220)||(8182922-8183129)
chr7 (146-220)||(4494634-4494708)
chr7 (21-225)||(2265472-2265674)
chr7 (63-225)||(15704452-15704612)
chr7 (38-139)||(9098283-9098384)
chr7 (13-130)||(19711059-19711176)
chr7 (93-200)||(13472555-13472663)
chr7 (13-154)||(1293025-1293157)
chr7 (15-220)||(14425444-14425637)
chr7 (10-105)||(48062891-48062986)
chr7 (10-78)||(27871710-27871778)
chr7 (63-150)||(16556664-16556751)
chr7 (63-150)||(16608911-16608998)
chr7 (26-102)||(19339324-19339400)
chr7 (10-78)||(24794813-24794881)
chr7 (10-69)||(4494569-4494628)
chr7 (157-220)||(7339832-7339893)
chr7 (186-221)||(14193242-14193277)
chr7 (26-105)||(16412000-16412078)
chr7 (16-53)||(14745750-14745787)
chr7 (10-102)||(32264791-32264884)
chr7 (10-78)||(48805977-48806045)
[»] chr4 (59 HSPs)
chr4 (10-218)||(37985525-37985733)
chr4 (10-213)||(29680462-29680665)
chr4 (10-220)||(16632430-16632640)
chr4 (10-221)||(12811088-12811296)
chr4 (10-215)||(19666362-19666567)
chr4 (10-221)||(3395580-3395791)
chr4 (10-221)||(45833384-45833595)
chr4 (10-223)||(19884692-19884904)
chr4 (10-220)||(55380280-55380490)
chr4 (10-220)||(37435446-37435656)
chr4 (18-210)||(12601099-12601291)
chr4 (10-205)||(9140902-9141097)
chr4 (10-220)||(19620972-19621182)
chr4 (10-218)||(14604819-14605028)
chr4 (10-225)||(14904262-14904477)
chr4 (10-222)||(10072925-10073136)
chr4 (13-220)||(56034567-56034774)
chr4 (10-225)||(19911786-19912002)
chr4 (21-220)||(22675433-22675630)
chr4 (10-223)||(10692841-10693052)
chr4 (10-223)||(10906607-10906818)
chr4 (26-220)||(413008-413200)
chr4 (38-221)||(3483739-3483922)
chr4 (10-220)||(13576027-13576235)
chr4 (73-225)||(14833449-14833601)
chr4 (21-220)||(17247245-17247441)
chr4 (21-220)||(54679931-54680126)
chr4 (12-200)||(29121362-29121550)
chr4 (10-218)||(6641674-6641881)
chr4 (10-220)||(40846089-40846299)
chr4 (10-225)||(6517475-6517688)
chr4 (10-220)||(23750512-23750720)
chr4 (10-200)||(8105628-8105819)
chr4 (10-220)||(3105333-3105540)
chr4 (10-162)||(56533030-56533182)
chr4 (117-220)||(23123528-23123631)
chr4 (10-189)||(25651046-25651224)
chr4 (21-155)||(11915701-11915835)
chr4 (30-177)||(16940026-16940172)
chr4 (10-219)||(17398598-17398795)
chr4 (80-220)||(15139287-15139427)
chr4 (10-119)||(16853493-16853602)
chr4 (84-220)||(55731844-55731977)
chr4 (21-155)||(17540396-17540530)
chr4 (26-195)||(41114707-41114875)
chr4 (10-102)||(38513868-38513960)
chr4 (10-78)||(20977447-20977515)
chr4 (10-78)||(22190836-22190904)
chr4 (26-65)||(8685509-8685548)
chr4 (29-155)||(11901196-11901322)
chr4 (26-110)||(17788067-17788152)
chr4 (10-78)||(39419787-39419855)
chr4 (10-102)||(40860657-40860749)
chr4 (26-76)||(1672395-1672445)
chr4 (26-76)||(1674870-1674920)
chr4 (10-60)||(14154065-14154115)
chr4 (38-78)||(3499705-3499745)
chr4 (10-78)||(9751593-9751661)
chr4 (21-78)||(27188691-27188748)
[»] scaffold0065 (1 HSPs)
scaffold0065 (10-217)||(1686-1893)
[»] chr6 (47 HSPs)
chr6 (10-221)||(13602168-13602379)
chr6 (10-221)||(32544261-32544472)
chr6 (10-218)||(26972173-26972379)
chr6 (14-220)||(23284564-23284770)
chr6 (12-221)||(9717841-9718050)
chr6 (11-220)||(20112642-20112852)
chr6 (10-225)||(12715357-12715573)
chr6 (10-217)||(15302196-15302403)
chr6 (26-220)||(13435544-13435738)
chr6 (10-220)||(14100383-14100592)
chr6 (10-196)||(18378310-18378496)
chr6 (13-217)||(15987232-15987437)
chr6 (10-223)||(29918013-29918225)
chr6 (10-225)||(15531562-15531777)
chr6 (10-220)||(19623975-19624185)
chr6 (10-220)||(24116824-24117035)
chr6 (27-217)||(21625114-21625303)
chr6 (10-225)||(22802137-22802350)
chr6 (10-221)||(18435552-18435763)
chr6 (38-220)||(19688790-19688970)
chr6 (10-220)||(19086154-19086354)
chr6 (14-220)||(20730649-20730853)
chr6 (44-221)||(34451610-34451787)
chr6 (10-197)||(16265116-16265303)
chr6 (10-225)||(16336123-16336336)
chr6 (92-225)||(25597557-25597690)
chr6 (10-225)||(16877209-16877422)
chr6 (13-223)||(15954702-15954910)
chr6 (10-223)||(22076349-22076560)
chr6 (21-223)||(21618251-21618451)
chr6 (10-180)||(26943572-26943741)
chr6 (10-225)||(20487857-20488071)
chr6 (27-198)||(10640384-10640555)
chr6 (8-223)||(19832974-19833187)
chr6 (16-220)||(12348995-12349196)
chr6 (14-182)||(12423261-12423428)
chr6 (27-195)||(19470683-19470850)
chr6 (10-101)||(25594064-25594155)
chr6 (26-220)||(21235137-21235317)
chr6 (10-152)||(33351939-33352079)
chr6 (10-92)||(17381517-17381599)
chr6 (10-102)||(19066079-19066171)
chr6 (13-78)||(19482751-19482816)
chr6 (10-78)||(17316610-17316678)
chr6 (26-110)||(25930485-25930568)
chr6 (15-120)||(14051425-14051529)
chr6 (10-78)||(26589595-26589664)
[»] scaffold0290 (1 HSPs)
scaffold0290 (12-220)||(18526-18734)
[»] scaffold0411 (1 HSPs)
scaffold0411 (10-221)||(12205-12416)
[»] scaffold0083 (2 HSPs)
scaffold0083 (13-217)||(25883-26087)
scaffold0083 (47-177)||(44652-44782)
[»] scaffold0359 (1 HSPs)
scaffold0359 (10-220)||(5595-5805)
[»] scaffold0026 (3 HSPs)
scaffold0026 (10-220)||(60012-60222)
scaffold0026 (10-220)||(7922-8132)
scaffold0026 (165-202)||(151794-151831)
[»] scaffold0227 (1 HSPs)
scaffold0227 (10-223)||(22672-22885)
[»] scaffold0771 (1 HSPs)
scaffold0771 (13-217)||(474-678)
[»] scaffold0035 (2 HSPs)
scaffold0035 (13-225)||(19372-19584)
scaffold0035 (10-225)||(99110-99320)
[»] scaffold0146 (1 HSPs)
scaffold0146 (13-212)||(15116-15315)
[»] scaffold0426 (1 HSPs)
scaffold0426 (10-182)||(13567-13739)
[»] scaffold0161 (2 HSPs)
scaffold0161 (13-220)||(10012-10220)
scaffold0161 (13-78)||(14819-14884)
[»] scaffold0171 (1 HSPs)
scaffold0171 (10-220)||(27334-27544)
[»] scaffold0251 (1 HSPs)
scaffold0251 (19-218)||(7708-7907)
[»] scaffold0210 (1 HSPs)
scaffold0210 (10-220)||(1656-1866)
[»] scaffold0116 (1 HSPs)
scaffold0116 (10-225)||(20871-21086)
[»] scaffold0861 (1 HSPs)
scaffold0861 (32-221)||(4851-5040)
[»] scaffold0005 (2 HSPs)
scaffold0005 (10-218)||(212350-212559)
scaffold0005 (73-225)||(6098-6250)
[»] scaffold0479 (1 HSPs)
scaffold0479 (10-225)||(9965-10180)
[»] scaffold0120 (2 HSPs)
scaffold0120 (10-220)||(36680-36890)
scaffold0120 (10-220)||(42115-42325)
[»] scaffold0193 (1 HSPs)
scaffold0193 (10-220)||(15789-16001)
[»] scaffold0023 (1 HSPs)
scaffold0023 (27-220)||(103585-103778)
[»] scaffold0217 (3 HSPs)
scaffold0217 (10-218)||(19027-19235)
scaffold0217 (13-220)||(9559-9763)
scaffold0217 (10-225)||(22033-22246)
[»] scaffold0003 (2 HSPs)
scaffold0003 (10-220)||(89962-90170)
scaffold0003 (26-105)||(712-790)
[»] scaffold0047 (2 HSPs)
scaffold0047 (73-225)||(30283-30435)
scaffold0047 (10-220)||(9899-10108)
[»] scaffold0439 (1 HSPs)
scaffold0439 (10-223)||(6644-6855)
[»] scaffold1359 (2 HSPs)
scaffold1359 (13-220)||(562-767)
scaffold1359 (15-220)||(1672-1865)
[»] scaffold0364 (1 HSPs)
scaffold0364 (10-225)||(6003-6217)
[»] scaffold0012 (1 HSPs)
scaffold0012 (10-220)||(215404-215612)
[»] scaffold0015 (1 HSPs)
scaffold0015 (13-225)||(60802-61012)
[»] scaffold0324 (1 HSPs)
scaffold0324 (10-220)||(9952-10162)
[»] scaffold0043 (1 HSPs)
scaffold0043 (10-223)||(78270-78481)
[»] scaffold0028 (1 HSPs)
scaffold0028 (10-219)||(5510-5717)
[»] scaffold1434 (1 HSPs)
scaffold1434 (80-220)||(691-831)
[»] scaffold1331 (1 HSPs)
scaffold1331 (10-220)||(1606-1814)
[»] scaffold0334 (2 HSPs)
scaffold0334 (44-220)||(9825-10001)
scaffold0334 (13-48)||(7823-7858)
[»] scaffold0007 (1 HSPs)
scaffold0007 (10-218)||(143093-143292)
[»] scaffold0022 (5 HSPs)
scaffold0022 (83-221)||(39494-39632)
scaffold0022 (83-221)||(137554-137692)
scaffold0022 (10-202)||(159051-159242)
scaffold0022 (10-75)||(37398-37463)
scaffold0022 (10-75)||(135458-135523)
[»] scaffold0176 (1 HSPs)
scaffold0176 (10-225)||(9151-9363)
[»] scaffold0471 (1 HSPs)
scaffold0471 (10-221)||(3300-3509)
[»] scaffold0056 (3 HSPs)
scaffold0056 (28-195)||(36115-36281)
scaffold0056 (13-102)||(25688-25777)
scaffold0056 (10-102)||(34827-34919)
[»] scaffold0040 (1 HSPs)
scaffold0040 (27-155)||(1491-1619)
[»] scaffold0243 (1 HSPs)
scaffold0243 (130-218)||(4900-4988)
[»] scaffold0414 (1 HSPs)
scaffold0414 (21-223)||(7060-7260)
[»] scaffold0064 (1 HSPs)
scaffold0064 (11-217)||(43828-44032)
[»] scaffold0273 (1 HSPs)
scaffold0273 (21-217)||(5634-5828)
[»] scaffold0081 (1 HSPs)
scaffold0081 (15-157)||(40638-40780)
[»] scaffold0011 (3 HSPs)
scaffold0011 (15-131)||(164940-165056)
scaffold0011 (68-220)||(65336-65485)
scaffold0011 (68-220)||(144381-144530)
[»] scaffold0530 (1 HSPs)
scaffold0530 (30-91)||(2029-2090)
[»] scaffold0247 (3 HSPs)
scaffold0247 (10-131)||(25393-25514)
scaffold0247 (10-53)||(15811-15854)
scaffold0247 (138-220)||(23470-23549)
[»] scaffold0025 (1 HSPs)
scaffold0025 (10-115)||(74577-74682)
[»] scaffold0280 (1 HSPs)
scaffold0280 (10-154)||(2702-2845)
[»] scaffold1747 (1 HSPs)
scaffold1747 (21-107)||(1324-1410)
[»] scaffold1745 (1 HSPs)
scaffold1745 (21-107)||(1-87)
[»] scaffold0527 (1 HSPs)
scaffold0527 (45-220)||(7963-8135)
[»] scaffold0211 (1 HSPs)
scaffold0211 (15-119)||(15628-15732)
[»] scaffold0261 (1 HSPs)
scaffold0261 (130-220)||(5844-5935)
[»] scaffold0249 (1 HSPs)
scaffold0249 (10-105)||(17785-17880)
[»] scaffold0132 (1 HSPs)
scaffold0132 (21-124)||(38086-38189)
[»] scaffold0220 (1 HSPs)
scaffold0220 (27-119)||(1803-1895)
[»] scaffold0473 (1 HSPs)
scaffold0473 (10-79)||(2737-2806)
[»] scaffold0387 (1 HSPs)
scaffold0387 (10-78)||(7377-7445)
[»] scaffold0045 (1 HSPs)
scaffold0045 (10-78)||(87647-87715)
[»] scaffold0352 (1 HSPs)
scaffold0352 (10-100)||(846-935)
[»] scaffold0908 (1 HSPs)
scaffold0908 (21-78)||(3942-3999)
[»] scaffold0607 (1 HSPs)
scaffold0607 (10-51)||(6002-6043)
[»] scaffold0269 (1 HSPs)
scaffold0269 (21-75)||(7292-7346)
[»] scaffold0078 (1 HSPs)
scaffold0078 (21-102)||(31808-31888)
[»] scaffold0016 (1 HSPs)
scaffold0016 (21-78)||(731-788)
[»] scaffold0018 (1 HSPs)
scaffold0018 (26-58)||(6589-6621)


Alignment Details
Target: chr1 (Bit Score: 196; Significance: 1e-107; HSPs: 54)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 196; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 10 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 28492489 - 28492274
Alignment:
Q  10 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaa 109  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  28492489 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaagcatccaatgccttcaaa 28492390  T
Q  110 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatct 209  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  28492389 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttctagtcttctgcaatgcttagacgatattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatct 28492290  T
Q  210 cctgatgaactacaac 225  Q
    ||||||||||||||||    
T  28492289 cctgatgaactacaac 28492274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 179; E-Value: 9e-97
Query Start/End: Original strand, 10 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 33256436 - 33256226
Alignment:
Q  10 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaa 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  33256436 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgcccttcaaagaacaagcatccaatgccttcaaa 33256337  T
Q  110 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatct 209  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  33256336 tccttttaaaatagtcgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatct 33256237  T
Q  210 cctgatgaact 220  Q
    |||| ||||||    
T  33256236 cctgttgaact 33256226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 179; E-Value: 9e-97
Query Start/End: Original strand, 10 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 33276608 - 33276398
Alignment:
Q  10 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaa 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  33276608 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgcccttcaaagaacaagcatccaatgccttcaaa 33276509  T
Q  110 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatct 209  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  33276508 tccttttaaaatagtcgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatct 33276409  T
Q  210 cctgatgaact 220  Q
    |||| ||||||    
T  33276408 cctggtgaact 33276398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 168; E-Value: 3e-90
Query Start/End: Original strand, 10 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 22600267 - 22600056
Alignment:
Q  10 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaa 109  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||| |||||||||||||||||    
T  22600267 agcagagacaaaaacagagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaacaagcatccaatgccttcaaa 22600168  T
Q  110 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatct 209  Q
    ||||||||||||||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  22600167 tcctttcaaaatagtcgttgttttactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacagcctttgaagctttaagtcttgcatct 22600068  T
Q  210 cctgatgaacta 221  Q
    ||||||||||||    
T  22600067 cctgatgaacta 22600056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 163; E-Value: 3e-87
Query Start/End: Original strand, 10 - 220
Target Start/End: Original strand, 22153852 - 22154062
Alignment:
Q  10 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaa 109  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  22153852 agcagagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaatcatccaatgctttcaaa 22153951  T
Q  110 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatct 209  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  22153952 tcctttcaaattagttgttgcttcactattctagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacagcctttgaagctttaagtcttgcatct 22154051  T
Q  210 cctgatgaact 220  Q
    |||||||||||    
T  22154052 cctgatgaact 22154062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 160; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 10 - 220
Target Start/End: Original strand, 10757416 - 10757627
Alignment:
Q  10 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaa 109  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  10757416 agcagagacacaaactgagtagtgaagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaatgctcttcaaagaacaatcatccaatgctttcaaa 10757515  T
Q  110 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaa-catttgaagctttaagtcttgcatc 208  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||   | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  10757516 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttctgattttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaaccttttgaagctttaagtcttgcatc 10757615  T
Q  209 tcctgatgaact 220  Q
    ||||||||||||    
T  10757616 tcctgatgaact 10757627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 159; E-Value: 8e-85
Query Start/End: Original strand, 10 - 220
Target Start/End: Original strand, 1577862 - 1578072
Alignment:
Q  10 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaa 109  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||| ||||||    
T  1577862 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttagtacaattatactttgtcaacgctcttaaaagaacaagcatccaatgctttcaaa 1577961  T
Q  110 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatct 209  Q
    | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  1577962 ttctttcaaaatagtcgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatctattgaacaacctttgaagctctaagtcttgcatct 1578061  T
Q  210 cctgatgaact 220  Q
    |||||| ||||    
T  1578062 cctgataaact 1578072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 156; E-Value: 5e-83
Query Start/End: Original strand, 10 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 20954558 - 20954347
Alignment:
Q  10 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaa 109  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| || | |||||||| ||||||    
T  20954558 agcagagaaacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttggtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaataagcctccaatgctttcaaa 20954459  T
Q  110 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatct 209  Q
    |||||||||||| |   ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  20954458 tcctttcaaaatggccattgcttcactcttcctgtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatct 20954359  T
Q  210 cctgatgaacta 221  Q
    ||||||||||||    
T  20954358 cctgatgaacta 20954347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 156; E-Value: 5e-83
Query Start/End: Original strand, 10 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 22201821 - 22201614
Alignment:
Q  10 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaa 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  22201821 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcatagaacaagcatccaatgccttcaaa 22201722  T
Q  110 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatct 209  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| || | ||||  ||||||||||||||||||    
T  22201721 tcctttcaaaatagttgttgctttactttttcagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatgcattgagcagcctttgtcgctttaagtcttgcatct 22201622  T
Q  210 cctgatga 217  Q
    ||||||||    
T  22201621 cctgatga 22201614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 155; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 10 - 220
Target Start/End: Original strand, 19717519 - 19717729
Alignment:
Q  10 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaa 109  Q
    |||||||||||||||||| | |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  19717519 agcagagacacaaactgatttgtggagttagttgttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatccgatgccttcaaa 19717618  T
Q  110 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatct 209  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  19717619 tcctttcaaaatagtcgttgcttcactcttccagtcctctgcaatgcttcgacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatct 19717718  T
Q  210 cctgatgaact 220  Q
    ||  |||||||    
T  19717719 ccatatgaact 19717729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 155; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 10 - 220
Target Start/End: Original strand, 48704199 - 48704409
Alignment:
Q  10 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaa 109  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  48704199 agcagagacataaattgagtagtggagacattggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgttcttcaaagaacaagcatccagtgccttcaaa 48704298  T
Q  110 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatct 209  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  48704299 tcctttcaaaatagttgttgtttcactcttccagtcttctgcattgcttaaacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatct 48704398  T
Q  210 cctgatgaact 220  Q
     ||||||||||    
T  48704399 tctgatgaact 48704409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 152; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 10 - 221
Target Start/End: Original strand, 1900340 - 1900551
Alignment:
Q  10 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaa 109  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||  |||||||| ||| ||||||||| |||    
T  1900340 agcagagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcttacaactgtactttgtcaacgctctttgaagaacaagcattcaatgcctttaaa 1900439  T
Q  110 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatct 209  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  1900440 tcctttcaaaatagtcgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaataacctttgaagctttaagtcttgcatct 1900539  T
Q  210 cctgatgaacta 221  Q
    ||||||||||||    
T  1900540 cctgatgaacta 1900551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 152; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 14 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 32786018 - 32785808
Alignment:
Q  14 gagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaatcct 113  Q
    |||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  32786018 gagacaaaaacatagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttttaagaacaagcatccaatgccttcaaatcct 32785919  T
Q  114 ttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatctcctg 213  Q
    |||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||    
T  32785918 ttcaaactagtcgttgcttcacttttccagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatcca-tgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcatg 32785820  T
Q  214 atgaactacaac 225  Q
    ||||||||||||    
T  32785819 atgaactacaac 32785808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 148; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 10 - 221
Target Start/End: Original strand, 38282562 - 38282772
Alignment:
Q  10 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaa 109  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||| ||| ||||||||| |||    
T  38282562 agcagagacaaaaacagagtagtggagatagtggttgta-acttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaacaagcattcaatgcctttaaa 38282660  T
Q  110 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatct 209  Q
    |||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  38282661 tcctttcaaaatacccgttgcttcactcttccagtcttctgcgatgcttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatct 38282760  T
Q  210 cctgatgaacta 221  Q
    ||||||||||||    
T  38282761 cctgatgaacta 38282772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 143; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 10 - 220
Target Start/End: Original strand, 12284418 - 12284628
Alignment:
Q  10 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaa 109  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  12284418 agcagagacacaaactgattagtggagatagtgtttgtacacttcgtacaattgtactatgtcaacgctcttcaaagaacaagcatccaatgctttcaaa 12284517  T
Q  110 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatct 209  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| ||  ||||| |||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  12284518 tcctttcaaaatagtcgttgcttcactcctctggtcttttgcaatgcttggacgagattgaatccattgaacaacctttgaagctctaagtcttgcatct 12284617  T
Q  210 cctgatgaact 220  Q
     ||||||||||    
T  12284618 tctgatgaact 12284628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 13 - 220
Target Start/End: Original strand, 2267087 - 2267292
Alignment:
Q  13 agagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaatcc 112  Q
    ||||||| ||||  |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||| |    
T  2267087 agagacaaaaacatagtagtggaggtagtggttgtacacttcatacaattgcactttgacaacgctctttgaagaacaaacatccaatgccttcaaattc 2267186  T
Q  113 tttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatctcct 212  Q
    ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||  | |||||||||||    
T  2267187 tttcaaactagttgttgcttcacttttccagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagcttta--tgttgcatctcct 2267284  T
Q  213 gatgaact 220  Q
    ||||||||    
T  2267285 gatgaact 2267292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 10 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 22427442 - 22427234
Alignment:
Q  10 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaa 109  Q
    |||||||||| ||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||| |||||||||||||||||    
T  22427442 agcagagacaaaaacaaagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgcttttttaagaacaagcatccaatgccttcaaa 22427343  T
Q  110 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatct 209  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||   ||||||||||||  | ||||||||    
T  22427342 tcctttcaaactagtcgttgcttcacttttccagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatctattgaacagtctttgaagcttta--tgttgcatct 22427245  T
Q  210 cctgatgaact 220  Q
    |||||||||||    
T  22427244 cctgatgaact 22427234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 10 - 217
Target Start/End: Original strand, 36134185 - 36134391
Alignment:
Q  10 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaa 109  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||| |||||||||| ||||||    
T  36134185 agcagagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaacaagcatccaatgc-ttcaaa 36134283  T
Q  110 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatct 209  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| || |||||  ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||    
T  36134284 tcctttcaaaatagttgttgctccacttttccagtcttctgcattgtttagatgagattaaatccattgaacaacctttgaaactttaagtcttgtatct 36134383  T
Q  210 cctgatga 217  Q
     |||||||    
T  36134384 tctgatga 36134391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 10 - 220
Target Start/End: Original strand, 2268526 - 2268733
Alignment:
Q  10 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaa 109  Q
    |||||||||| |||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  | |||||| ||| |||||||||||||    
T  2268526 agcagagacaaaaacagagtagtcgaggtagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgacgaacaagcattcaatgccttcaaa 2268625  T
Q  110 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatct 209  Q
    || ||||||||||   ||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  2268626 tcatttcaaaata---gttgcttaactcttccagtcttctacaatgattagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagccttaagtcttgcatct 2268722  T
Q  210 cctgatgaact 220  Q
    ||| |||||||    
T  2268723 cctaatgaact 2268733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 123; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 27 - 217
Target Start/End: Original strand, 35401821 - 35402011
Alignment:
Q  27 agtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaatcctttcaaaatagttg 126  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  35401821 agtagtggaggtagtggttgtacactttgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaacaagcatccaatgccttcaaatcctttcaaaatagtcg 35401920  T
Q  127 ttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatctcctgatga 217  Q
    |||||||||| ||||||||||||| | || ||| || |||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  35401921 ttgcttcacttttccagtcttctgtattgtttaaacgagattaaatccattgaacagtctttgaagctttaagtcttgcatcttctgatga 35402011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 10 - 218
Target Start/End: Original strand, 29215792 - 29215998
Alignment:
Q  10 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaa 109  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||  |||||||| |||||||||||||||||    
T  29215792 agcagagacaaaaacagagtagtggagctagtgattgtacacttcgtacaattgtactttgttatcgctctttgaagaacaagcatccaatgccttcaaa 29215891  T
Q  110 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatct 209  Q
    |||||||||| |||  ||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||  ||||||||    
T  29215892 tcctttcaaactagccgttgcttcacttttctagtcttttgcaatgcttagacgagattaaatccattaaacaacctttgaagctttaag--ttgcatct 29215989  T
Q  210 cctgatgaa 218  Q
    |||||||||    
T  29215990 cctgatgaa 29215998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 120; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 10 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 39201077 - 39200869
Alignment:
Q  10 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaa 109  Q
    |||||| ||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||| ||||||||| |||||||    
T  39201077 agcagaaacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaacaagcatccaatgtcttcaaa 39200978  T
Q  110 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatct 209  Q
    |||||||||| |||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||| | ||||||||||||  | ||||||||    
T  39200977 tcctttcaaactagccgttgcttcactctttcagtcttctgcaatgcttacatgagattaaatccattgaacagcttttgaagcttta--tgttgcatct 39200880  T
Q  210 cctgatgaact 220  Q
    ||| |||||||    
T  39200879 cctaatgaact 39200869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 117; E-Value: 9e-60
Query Start/End: Original strand, 13 - 220
Target Start/End: Original strand, 30893090 - 30893298
Alignment:
Q  13 agagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaatcc 112  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||| | ||| |||||||||    
T  30893090 agagacacaaacttagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactatgtcagcgctattcaaagaacaagcatctagtgctttcaaatcc 30893189  T
Q  113 tttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaa-catttgaagctttaagtcttgcatctcc 211  Q
    |||||||||||   ||||||||||| ||   |||| |||||||||| ||| ||||| |||||| ||||||| | |||||| |||||||||||||||||||    
T  30893190 tttcaaaatagcctttgcttcactcctctgatcttttgcaatgcttggacgagattgaatccaatgaacaaccttttgaaactttaagtcttgcatctcc 30893289  T
Q  212 tgatgaact 220  Q
    |||||||||    
T  30893290 tgatgaact 30893298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 10 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 16235381 - 16235182
Alignment:
Q  10 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaa 109  Q
    |||||||||| |||  ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||   ||||||| ||| |||||||||||||    
T  16235381 agcagagacaaaaaaggagtagtggaggtagttgttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacactctttggagaacaagcattcaatgccttcaaa 16235282  T
Q  110 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatct 209  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| || |||||| |||||||||| |||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||    
T  16235281 tcctttcaaaatagtcgttgcttcacttttccagtcttctgcattgtttagacgagattaaatcaattgaacaacctttgaagttttaaatcttgcatct 16235182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 113; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 10 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 22464894 - 22464685
Alignment:
Q  10 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaa 109  Q
    |||||||||| |||  ||||||||||| |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||  |||||||| |||||||||||||||||    
T  22464894 agcagagacaaaaatagagtagtggaggtagtggatgtacacttcgtacacttgtactttgtcaacgctctttgaagaacaagcatccaatgccttcaaa 22464795  T
Q  110 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaa-catttgaagctttaagtcttgcatc 208  Q
    || ||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||| | ||||||||||||  | || ||||    
T  22464794 tcatttcaaattagtcgttgcttcacttttccagtcttctgcaatgcttagatgagattaaatccgttgaacaaccttttgaagcttta--tgttacatc 22464697  T
Q  209 tcctgatgaact 220  Q
    ||||||||||||    
T  22464696 tcctgatgaact 22464685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 10 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 25448651 - 25448443
Alignment:
Q  10 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaa 109  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||  ||||| || |||||||||||||||||    
T  25448651 agcagagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaaacgtactttgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgccttcaaa 25448552  T
Q  110 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatct 209  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||  |||||| || || ||||| || |||| | ||||||||||||||  ||||||||    
T  25448551 tcctttcaaaatagtcgctgcttcacttttccagtcttctgcaatctttagacgagtttgaatccgttaaacagcttttgaagctttaag--ttgcatct 25448454  T
Q  210 cctgatgaact 220  Q
     ||||||||||    
T  25448453 tctgatgaact 25448443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 105; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 10 - 202
Target Start/End: Original strand, 21028788 - 21028980
Alignment:
Q  10 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaa 109  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||| | ||| ||||||||||||||||     
T  21028788 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggctgtacacttcatacaattgtactttgtcagcgctcttcaaaaagcaagcatccaatgccttcaac 21028887  T
Q  110 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtct 202  Q
    | | ||  || |||| ||||||||||||||   |||||||||||||||| ||  ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  21028888 ttcatttgaattagtcgttgcttcactcttatggtcttctgcaatgcttggatgagattaaattcattgaacaacatatgaagctttaagtct 21028980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 27 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 23036595 - 23036405
Alignment:
Q  27 agtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaatcctttcaaaatagttg 126  Q
    ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||| ||  |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  23036595 agtagaggaggtagtggttgtacacttcgtacaattgttctttgttgacgctctttgaagaacaagcatccaatgtcttcaaatcctttcaaaatagttg 23036496  T
Q  127 ttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatctcctgatga 217  Q
    ||| |||||| ||  ||||||||||| |  |||||| ||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  23036495 ttgtttcacttttttagtcttctgcattatttagacgagattaaatccattgaatagcctttgaagctttaagtcttgcatcttctgatga 23036405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 102; E-Value: 8e-51
Query Start/End: Original strand, 13 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 21191947 - 21191763
Alignment:
Q  13 agagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaatcc 112  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  21191947 agagacacaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgccaacgctcttcaaagaacaagcatccaatgccttcaaatcc 21191848  T
Q  113 tttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaa 198  Q
    |||  || ||| ||||||||||||||||  ||||||||||||| || |    |||||||| | ||||||||| |||||||||||||    
T  21191847 ttttgaattagctgttgcttcactcttctggtcttctgcaatg-ttgggtgtgattaaatactttgaacaacctttgaagctttaa 21191763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 101; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 10 - 220
Target Start/End: Original strand, 2834684 - 2834893
Alignment:
Q  10 agcagagacaca-aactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaa 108  Q
    |||||||||| | ||| |||||||||||  |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| | ||  |||||||| ||||||||||||||||    
T  2834684 agcagagacaaagaacagagtagtggaggcagtggttgtacaattcgtacaatcgtactttgtcaacgttctttgaagaacaagcatccaatgccttcaa 2834783  T
Q  109 atcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatc 208  Q
    ||||||||||| |||  ||||||||||| || ||||||||  |||||||||||| ||||| ||||||||||||||| || |||||||||||  |||||||    
T  2834784 atcctttcaaattagccgttgcttcactttttcagtcttcaacaatgcttagacgagattgaatccattgaacaactttggaagctttaag--ttgcatc 2834881  T
Q  209 tcctgatgaact 220  Q
    ||| ||||||||    
T  2834882 tcccgatgaact 2834893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 10 - 200
Target Start/End: Original strand, 35040161 - 35040351
Alignment:
Q  10 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaa 109  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||  |||| ||| |||||||||| ||||||    
T  35040161 agcagagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaaacgtactttgtcaacgctctttgaagatcaagcatccaatgctttcaaa 35040260  T
Q  110 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagt 200  Q
    ||||||||||||||| ||||||| ||| ||| |||||||||||||  |||||| || ||  ||||||| |||||| |||||||| ||||||    
T  35040261 tcctttcaaaatagtcgttgctttacttttctagtcttctgcaatctttagacgaggttggatccattaaacaacttttgaagccttaagt 35040351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 10 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 2327525 - 2327316
Alignment:
Q  10 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgct-attcaaagaacaaacatccaatgccttcaa 108  Q
    |||||||||| || | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||  ||  | |||||| |||||||||| ||| |    
T  2327525 agcagagacaaaaccagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaaacgtactttgtcaatgctcttttgaggaacaagcatccaatgcgttcga 2327426  T
Q  109 atcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatc 208  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| || ||||| ||||||||  |||||| || || |||| ||| |||||| ||||||||||||||  |||||||    
T  2327425 atcctttcaaaatagtttttgcttcactttttcagtcatctgcaatctttagacgagtttgaatctattaaacaacttttgaagctttaag--ttgcatc 2327328  T
Q  209 tcctgatgaact 220  Q
    ||||||||||||    
T  2327327 tcctgatgaact 2327316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 10 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 12613899 - 12613713
Alignment:
Q  10 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaa 109  Q
    ||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| || ||||||| ||||||    
T  12613899 agcagagacacaaacagagtagtgaaggtagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgccaacgctcttcaaagaacaagcaaccaatgctttcaaa 12613800  T
Q  110 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaa 198  Q
    | ||||  || |||  |||||||||||||||  |||||||||||||| ||| |  |||||||||  ||||||||| |||||||||||||    
T  12613799 t-cttttgaattagccgttgcttcactcttctggtcttctgcaatgc-taggcgtgattaaatcttttgaacaacctttgaagctttaa 12613713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 26 - 217
Target Start/End: Original strand, 7309830 - 7310020
Alignment:
Q  26 gagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaatcctttcaaaatagtt 125  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||| || || |||| | |||||||||||||||||||| | ||||||        
T  7309830 gagtattggaggtagtggttgtacacttcgtacaattgtactacgttaacgcttttgaa-gaacgagcatccaatgccttcaaatccctacaaaatgacc 7309928  T
Q  126 gttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatctcctgatga 217  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||| | | | ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7309929 gttgcttcactcttatagtcttctgcaatccttagacgacactgaatccattgaacagcttttgaagctttaagtcttgcatctcctgatga 7310020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 87; E-Value: 7e-42
Query Start/End: Original strand, 10 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 26702214 - 26702004
Alignment:
Q  10 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaa 109  Q
    |||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || |||||| | |||  |||||||||||||||     
T  26702214 agcagagacacatactaagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcatcactcttcaaaaagcaagaatccaatgccttcaac 26702115  T
Q  110 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatct 209  Q
    | | ||  || || ||||||||||||||| |  ||||||||||||||| | || ||||| |||||||  |||| | |||||||||||||||||  |||||    
T  26702114 ttcatttgaattaattgttgcttcactctcctggtcttctgcaatgctcaaacgagattgaatccatataacagcctttgaagctttaagtctcccatct 26702015  T
Q  210 cctgatgaact 220  Q
     ||||||||||    
T  26702014 tctgatgaact 26702004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 87; E-Value: 7e-42
Query Start/End: Original strand, 10 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 44821630 - 44821419
Alignment:
Q  10 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaa 109  Q
    |||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||| ||||||| || ||  ||||| || ||| ||| |||||||||    
T  44821630 agcagagacaaaaacagagtagtggagatagtagttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacactctttgaagaataagcatacaaagccttcaaa 44821531  T
Q  110 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatct 209  Q
    ||||| ||||||||| ||||||  ||| || ||||||||| |||  ||||||| || || ||||| || |||||| ||||||||||||||  ||||||||    
T  44821530 tccttccaaaatagtcgttgctatactttttcagtcttctacaaaccttagacgagtttgaatcctttaaacaacttttgaagctttaag--ttgcatct 44821433  T
Q  210 cctgatgaactaca 223  Q
    ||||||||||||||    
T  44821432 cctgatgaactaca 44821419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 10 - 225
Target Start/End: Original strand, 30572192 - 30572404
Alignment:
Q  10 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaa 109  Q
    |||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||| ||||| ||||||||||||| ||  ||    
T  30572192 agcagaaacaaaaacagagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaatcgtactatgtcaacgctcttctaagaataaacatccaatgcttttcaa 30572291  T
Q  110 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatct 209  Q
    ||||||||||||||  ||||||  ||| ||||||||||||||||| || |||| || || ||||| |  |||| |  |||||||||||||  ||| ||||    
T  30572292 tcctttcaaaatagccgttgctatacttttccagtcttctgcaat-ctcagacgagtttgaatccttgaaacagctattgaagctttaag--ttgtatct 30572388  T
Q  210 cctgatgaactacaac 225  Q
    ||||||||||| ||||    
T  30572389 cctgatgaactgcaac 30572404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 10 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 48570316 - 48570106
Alignment:
Q  10 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaa 109  Q
    |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||| ||  ||||| || |||||||||||||  ||    
T  48570316 agcagagacaaaaacagagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgccttttaa 48570217  T
Q  110 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatct 209  Q
    ||||| ||||||||| |||| |  ||| ||| ||||||||||||| ||||||| || || ||||| || |||| | |||||| |||||||  ||||||||    
T  48570216 tccttccaaaatagtcgttgttatacttttctagtcttctgcaat-cttagacgagtttgaatccgttaaacagcttttgaaactttaag--ttgcatct 48570120  T
Q  210 cctgatgaactaca 223  Q
    ||||||||| ||||    
T  48570119 cctgatgaattaca 48570106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 10 - 220
Target Start/End: Original strand, 21702809 - 21703016
Alignment:
Q  10 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaa 109  Q
    |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||| ||  ||||| || ||| ||||||| |  ||    
T  21702809 agcagagacaaaaacagagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcattcaatgcccttcaa 21702908  T
Q  110 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatct 209  Q
    ||||||||||||||  ||||||  ||| ||| ||||||||||||| ||||||| || || ||||| |  |||||  ||||||||||||||  ||||||||    
T  21702909 tcctttcaaaatagccgttgctatacttttcaagtcttctgcaat-cttagacgagtttgaatccttgaaacaaattttgaagctttaag--ttgcatct 21703005  T
Q  210 cctgatgaact 220  Q
    |||||||||||    
T  21703006 cctgatgaact 21703016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 67; E-Value: 6e-30
Query Start/End: Original strand, 21 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 14263525 - 14263371
Alignment:
Q  21 aaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaatcctttcaaaa 120  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||  || ||||| ||||||| ||  | ||||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  14263525 aaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaaacgtgctttgccaacgctctttgaggaacaagtatccaatgccttcaaatcctttcaaaa 14263426  T
Q  121 tagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatcca 175  Q
    |||| |||| ||  ||  |||||||||||||||| |||||||  |||| ||||||    
T  14263425 tagtcgttgttttgcttctccagtcttctgcaatccttagacgggatttaatcca 14263371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 66; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 30 - 139
Target Start/End: Complemental strand, 17025029 - 17024920
Alignment:
Q  30 agtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaatcctttcaaaatagttgttg 129  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||||  || |||| ||||    
T  17025029 agtggaggtagtggttgtacacttcgtacaattgtcatttttcaacgctctttaaagaacaagcatccaatgccttcaaatccttttgaattagtcgttg 17024930  T
Q  130 cttcactctt 139  Q
    ||||||||||    
T  17024929 cttcactctt 17024920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 60; E-Value: 9e-26
Query Start/End: Original strand, 10 - 220
Target Start/End: Original strand, 46088984 - 46089183
Alignment:
Q  10 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaa 109  Q
    |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||| ||  ||||| || |||||||||            
T  46088984 agcagagacaaaaacagagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatg-------- 46089075  T
Q  110 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatct 209  Q
     |||||||||||||| |||||   ||| |||||||||||||||||  |||| | || || ||||| |  |||| | ||||||||||||||  ||||||||    
T  46089076 -cctttcaaaatagtcgttgccatacttttccagtcttctgcaatttttaggcgagtttgaatccttgaaacagcttttgaagctttaag--ttgcatct 46089172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 13 - 220
Target Start/End: Original strand, 10250984 - 10251179
Alignment:
Q  13 agagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaatcc 112  Q
    ||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||| ||||||  || ||  ||||| || ||||||||||||||          
T  10250984 agagacaaaaacagagtagtggagataatggttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaaaactctttgaagaataagcatccaatgccttc------ 10251077  T
Q  113 tttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatctcct 212  Q
       |||| |||  |||| |  ||| ||||||||||||||||| ||||||| || || ||||| || |||||| ||||||||||||||  |||||||||||    
T  10251078 ---caaattagccgttgttatacttttccagtcttctgcaat-cttagacgagtttgaatcctttaaacaacttttgaagctttaag--ttgcatctcct 10251171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 45; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 27 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 18896665 - 18896537
Alignment:
Q  27 agtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaatcctttcaaaatagttg 126  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||||  ||||| | | ||||||  || |||||||||||||||||| ||||  || |||  |    
T  18896665 agtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaactgtccttttccaacgttctccaaagactaagcatccaatgccttcaaattcttttgaattagccg 18896566  T
Q  127 ttgcttcactcttccagtcttctgcaatg 155  Q
    |||||||   |||| ||||||||||||||    
T  18896565 ttgcttcttgcttctagtcttctgcaatg 18896537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 26 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 7745159 - 7744967
Alignment:
Q  26 gagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaatcctttcaaaatagtt 125  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||  |||||||||||||||| ||  ||| | || |||| ||||| |||||||||||||||| ||  |    
T  7745159 gagtagtggaggtagtggttgtacactttgtataaacgtactttgtcaacgctctttgaaggataagcatcaaatgcattcaaatcctttcaaattaact 7745060  T
Q  126 gttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaact 220  Q
    |||||| | ||  | ||||||| |||| |  |||||  || || |||||||| |||||| |||||| || || |  |||||||| ||||||||||    
T  7745059 gttgctactcttcttcagtcttatgcactctttagatgagtttgaatccattaaacaacttttgaaactgtagg--ttgcatcttctgatgaact 7744967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 10 - 78
Target Start/End: Original strand, 19215607 - 19215675
Alignment:
Q  10 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgct 78  Q
    |||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||   ||| ||||||||||    
T  19215607 agcagagacaaaaacagagtagtgcagatagtggttgtacacttcgtacaatcacactatgtcaacgct 19215675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 10 - 102
Target Start/End: Complemental strand, 21121149 - 21121057
Alignment:
Q  10 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgc 102  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||  |||||||||||||| ||||||||  ||||| |||||||||| ||  ||||| || ||||||||||    
T  21121149 agcagagacaaaaacagagtagtggaagtagtggttgtacacgtcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgc 21121057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 10 - 102
Target Start/End: Complemental strand, 21135245 - 21135153
Alignment:
Q  10 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgc 102  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||| || ||  ||||| || ||||||||||    
T  21135245 agcagagacaaaaacagagtagtggatttagtggttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacactctttgaagaataagcatccaatgc 21135153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #49
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 10 - 78
Target Start/End: Original strand, 23024783 - 23024851
Alignment:
Q  10 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgct 78  Q
    |||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||  | ||| ||||||||||    
T  23024783 agcagagacaaaaacagagtagtgcagatagtggttgtacacttcgtacaaacgcactatgtcaacgct 23024851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #50
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 21 - 102
Target Start/End: Complemental strand, 21204997 - 21204916
Alignment:
Q  21 aaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgc 102  Q
    |||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||| ||  |||||  ||||||||||||    
T  21204997 aaacagagtagtggaagtagtggttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaattaacatccaatgc 21204916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #51
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 29 - 102
Target Start/End: Original strand, 42284642 - 42284715
Alignment:
Q  29 tagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgc 102  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||| ||  ||||| || ||||||||||    
T  42284642 tagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaaaaagcatccaatgc 42284715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #52
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 26 - 102
Target Start/End: Original strand, 21984607 - 21984683
Alignment:
Q  26 gagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgc 102  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||| ||  ||||| || ||||||||||    
T  21984607 gagtagtggaagtagtggttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgc 21984683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #53
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 10 - 78
Target Start/End: Original strand, 37642243 - 37642311
Alignment:
Q  10 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgct 78  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||  |||||||||||||||||||| ||  ||||| ||||||||||    
T  37642243 agcagagacaaaaacagagtagtggaagtagtggttgtacacttcgtataaacgtactatgtcaacgct 37642311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #54
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 15 - 58
Target Start/End: Original strand, 17371042 - 17371085
Alignment:
Q  15 agacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtac 58  Q
    ||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  17371042 agacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtac 17371085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 184; Significance: 1e-99; HSPs: 67)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 10 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 49642926 - 49642711
Alignment:
Q  10 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaa 109  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||    
T  49642926 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacactttgtacaattgtactttgtcaacgctcttaaaagaacaatcatccaatgccttcaaa 49642827  T
Q  110 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatct 209  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  49642826 tcctttcaaaatagtcgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatctattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatct 49642727  T
Q  210 cctgatgaactacaac 225  Q
    ||||||||||||||||    
T  49642726 cctgatgaactacaac 49642711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 169; E-Value: 9e-91
Query Start/End: Original strand, 10 - 222
Target Start/End: Original strand, 37467328 - 37467540
Alignment:
Q  10 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaa 109  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  37467328 agcagagacacaaactgggtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatccaatgccttcaaa 37467427  T
Q  110 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatct 209  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||| ||||||||    
T  37467428 tcctttcaaaatagtcgttgcttcactcttccagtcttctacaatgcttagatgagattaaatccattgaacaagctttgaagatttaagttttgcatct 37467527  T
Q  210 cctgatgaactac 222  Q
    |||||||||||||    
T  37467528 cctgatgaactac 37467540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 161; E-Value: 5e-86
Query Start/End: Original strand, 10 - 214
Target Start/End: Original strand, 31303381 - 31303585
Alignment:
Q  10 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaa 109  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  31303381 agcagagacacaaactgagtagtggagatagttgttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaaacatcaaatgtcttcaaa 31303480  T
Q  110 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatct 209  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||    
T  31303481 tcctttcaaaatagttgttccttcactctttcagtcttctgcaatgcttagacgagattaaattcattgaacaacctttaaagctttaagtctttcatct 31303580  T
Q  210 cctga 214  Q
    |||||    
T  31303581 cctga 31303585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 160; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 10 - 221
Target Start/End: Original strand, 2561183 - 2561394
Alignment:
Q  10 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaa 109  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||  |||||||| ||||||||  |||||||    
T  2561183 agcagagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacacttgtactttgtcaacgatctttgaagaacaagcatccaatttcttcaaa 2561282  T
Q  110 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatct 209  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  2561283 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatct 2561382  T
Q  210 cctgatgaacta 221  Q
    ||||||||||||    
T  2561383 cctgatgaacta 2561394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 160; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 10 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 12963249 - 12963034
Alignment:
Q  10 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaa 109  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  12963249 agcagagacacatactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactatgtcaacactcttcaaagaacaagcatccaatgctttcaaa 12963150  T
Q  110 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatct 209  Q
     ||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  12963149 accttctaaaatagttgttgcttcactctcccagtcttctgcattgcttagacaagattaaatcccttgaacaacccttgaagctttaagtcttgcatct 12963050  T
Q  210 cctgatgaactacaac 225  Q
    ||||||||||||||||    
T  12963049 cctgatgaactacaac 12963034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 159; E-Value: 8e-85
Query Start/End: Original strand, 10 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 14393168 - 14392958
Alignment:
Q  10 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaa 109  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  14393168 agcagagacacaaactaagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatccaatgctttcaaa 14393069  T
Q  110 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatct 209  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||    
T  14393068 tcctttcaaaatagtcgttgtttcactcttctggtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaaactttaagtcttgtatct 14392969  T
Q  210 cctgatgaact 220  Q
    ||| |||||||    
T  14392968 cctaatgaact 14392958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 154; E-Value: 8e-82
Query Start/End: Original strand, 10 - 195
Target Start/End: Original strand, 41494994 - 41495179
Alignment:
Q  10 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaa 109  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  41494994 agcagatacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatccaatgccttcaaa 41495093  T
Q  110 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctt 195  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  41495094 tcctttcaaaatagtcgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgtttagacgagattaaatccattgaacagcctttgaagctt 41495179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 153; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 13 - 217
Target Start/End: Original strand, 13948334 - 13948538
Alignment:
Q  13 agagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaatcc 112  Q
    |||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  13948334 agagacacaacctgagtaatggagataatggttgtacacttcgtacaattgtactatgtcaacgctcttcaaagaacaagcatccaatgccttcaaatcc 13948433  T
Q  113 tttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatctcct 212  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||    
T  13948434 tttcaaaatagtcgttgcttcactattccagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatcaattgaacatcctttgacgctttaagtcttgcatctcct 13948533  T
Q  213 gatga 217  Q
    |||||    
T  13948534 gatga 13948538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 152; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 13 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 17239083 - 17238884
Alignment:
Q  13 agagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaatcc 112  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  17239083 agagatacaaactaagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaatcatccaatgctttcaaatcc 17238984  T
Q  113 tttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatctcct 212  Q
    |||||||||||| | |||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||    
T  17238983 tttcaaaatagtcgatgcttcactcttctggtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgatcagcctttgaagctttaagtcttgcatctcct 17238884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 151; E-Value: 5e-80
Query Start/End: Original strand, 10 - 220
Target Start/End: Original strand, 6090727 - 6090937
Alignment:
Q  10 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaa 109  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||| ||| |||||||||||||    
T  6090727 agcagagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaaagctttttaaagaacaagcattcaatgccttcaaa 6090826  T
Q  110 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatct 209  Q
    |||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  6090827 tcctttcaaattagatgttgcttcactcttctagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgagcaacctttgaagttttaagtcttgcatct 6090926  T
Q  210 cctgatgaact 220  Q
    |||||||||||    
T  6090927 cctgatgaact 6090937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 148; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 13 - 215
Target Start/End: Original strand, 15903196 - 15903399
Alignment:
Q  13 agagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaa-catccaatgccttcaaatc 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||| |||||| ||||||||    
T  15903196 agagacacaaactgagtagtggagatagttgttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaatgctcttcaaagaacaaagcatgcaatgctttcaaatc 15903295  T
Q  112 ctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatctcc 211  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||    
T  15903296 ctttcaaaatagtcgttgcttcactcttctagtcttctgtaatgcttagacgagattgaatccattgaacagcgtttgaagctttaagtcttgcatctcc 15903395  T
Q  212 tgat 215  Q
    ||||    
T  15903396 tgat 15903399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 148; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 26 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 38177791 - 38177596
Alignment:
Q  26 gagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaatcctttcaaaatagtt 125  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38177791 gagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttaaagaacaagcatccaatgccttcaaatcctttcaaaatagtt 38177692  T
Q  126 gttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaacta 221  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  38177691 gttgcttcactcttccaatcttctgcattgctcagacgagattaaattcattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctaataaacta 38177596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 12 - 218
Target Start/End: Original strand, 28582103 - 28582309
Alignment:
Q  12 cagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaatc 111  Q
    |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||  |||||||| ||||||||||| | |||||    
T  28582103 cagagacaaaaactgagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaattgtattttgtcaacgctctttgaagaacaagcatccaatgccattaaatc 28582202  T
Q  112 ctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatctcc 211  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||    
T  28582203 ctttcaaaatagtcgttgcttcactcttccaatcttctgcaatgcatagacgagattaaatccattgaacagcctttgaagctttaagtcttgcatctcc 28582302  T
Q  212 tgatgaa 218  Q
    |||||||    
T  28582303 tgatgaa 28582309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 29 - 221
Target Start/End: Original strand, 14969341 - 14969533
Alignment:
Q  29 tagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaatcctttcaaaatagttgtt 128  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||  ||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  14969341 tagtggagatagtggttgtacacttcgtaaaaatgtactttgtcaacgctatttgaagaataagcatccaatgccatcaaatcctttcaaaatagttgtt 14969440  T
Q  129 gcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaacta 221  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  14969441 gctttactcttccagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatatcctcatgaacta 14969533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 10 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 13780748 - 13780575
Alignment:
Q  10 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaa 109  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  13780748 agcagagacacaaactgagtcgtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaataacaagcatccaatgccttcaaa 13780649  T
Q  110 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaa 183  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  13780648 tcctttcaaaatagtcgttgcttcactctttcagtcttctgcaatgcttagacgagattaaattcattgaacaa 13780575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 141; E-Value: 4e-74
Query Start/End: Original strand, 10 - 225
Target Start/End: Original strand, 20646149 - 20646365
Alignment:
Q  10 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaa 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  20646149 agcagagacacaaactgagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaattgtactatgtcaacgctcttcaaagaacaagcatccaatgctttcaaa 20646248  T
Q  110 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaaca-acatttgaagctttaagtcttgcatc 208  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||||||  ||||||| |||||||| ||| |||| |||| |||||||||  | ||| |||||||||||||||||||    
T  20646249 tcctttcaaaatagacgttgcttcactcttctggtcttctacaatgcttggacgagatgaaatacattgaacagccttttaaagctttaagtcttgcatc 20646348  T
Q  209 tcctgatgaactacaac 225  Q
    |||||||||||||||||    
T  20646349 tcctgatgaactacaac 20646365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 10 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 18121786 - 18121575
Alignment:
Q  10 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaa 109  Q
    |||||||||| | || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||  ||||| || ||| ||||||||| |||    
T  18121786 agcagagacaaacacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtaaacgctctttgaagaaaaagcattcaatgcctttaaa 18121687  T
Q  110 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatct 209  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  18121686 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgctcaaacgagattgaatccattgaacaacctttgaagctttaaatcttgcatct 18121587  T
Q  210 cctgatgaacta 221  Q
    ||||||||||||    
T  18121586 cctgatgaacta 18121575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 139; E-Value: 7e-73
Query Start/End: Original strand, 10 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 29951602 - 29951392
Alignment:
Q  10 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaa 109  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| || |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  29951602 agcagagactcaaactgagtggtggagatagtggttgtacactttgtacaattgtactttgttaactctcttcaaagaacaagcatccaatgccttcaaa 29951503  T
Q  110 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatct 209  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||  | |||    
T  29951502 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcctctggtcttctacaatgcttagacgagattaaatccattgaaaaacctttgaagctttaagtctctcgtct 29951403  T
Q  210 cctgatgaact 220  Q
     ||||||||||    
T  29951402 tctgatgaact 29951392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 139; E-Value: 7e-73
Query Start/End: Original strand, 10 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 30000756 - 30000546
Alignment:
Q  10 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaa 109  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| || |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  30000756 agcagagactcaaactgagtggtggagatagtggttgtacactttgtacaattgtactttgttaactctcttcaaagaacaagcatccaatgccttcaaa 30000657  T
Q  110 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatct 209  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||  | |||    
T  30000656 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcctctggtcttctacaatgcttagacgagattaaatccattgaaaaacctttgaagctttaagtctctcgtct 30000557  T
Q  210 cctgatgaact 220  Q
     ||||||||||    
T  30000556 tctgatgaact 30000546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 136; E-Value: 4e-71
Query Start/End: Original strand, 38 - 209
Target Start/End: Original strand, 13824092 - 13824263
Alignment:
Q  38 tagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaatcctttcaaaatagttgttgcttcactc 137  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  13824092 tagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaacaaacatccaatgccttcaaatcatttcaaaatagttgttgcttcactc 13824191  T
Q  138 ttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatct 209  Q
    |||||||||||| || || |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  13824192 ttccagtcttcttcattgtttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatct 13824263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 10 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 18142916 - 18142705
Alignment:
Q  10 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaa 109  Q
    |||||||||| | || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||  ||||| || ||| ||||||||| |||    
T  18142916 agcagagacaaacacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtaaacgctctttgaagaaaaagcattcaatgcctttaaa 18142817  T
Q  110 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatct 209  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || ||||| ||||||||||| | | ||||||||||||| ||||||||||    
T  18142816 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgctcaaacgagattgaatccattgaatagcctttgaagctttaaatcttgcatct 18142717  T
Q  210 cctgatgaacta 221  Q
    ||||||||||||    
T  18142716 cctgatgaacta 18142705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 10 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 47405585 - 47405377
Alignment:
Q  10 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaa 109  Q
    |||||||||| ||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||  ||||||||||||| ||||||||||||    
T  47405585 agcagagacaaaaacatagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacactctttgaagaacaaacatcaaatgccttcaaa 47405486  T
Q  110 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatct 209  Q
    |||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||||  | ||||||||    
T  47405485 tcctttcaaactagttgttgcttcatttttccagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacagcctttgaagcttta--tgttgcatct 47405388  T
Q  210 cctgatgaact 220  Q
    | |||||||||    
T  47405387 cgtgatgaact 47405377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 10 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 16658782 - 16658567
Alignment:
Q  10 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaa 109  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||| || |||||||||| ||||||    
T  16658782 agcagagacacaaactaagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaattgtattatgtcaacgctcttcaaagaataagcatccaatgctttcaaa 16658683  T
Q  110 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatct 209  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||  ||  ||||| || ||||||| ||| ||||| |||| |||||||||| ||||||| || |||||||||||||    
T  16658682 tcctttcaaaatagtcgttgcttcactgctctggtcttttgtaatgcttggacgagattgaatcaattgaacaacctttgaagtttcaagtcttgcatct 16658583  T
Q  210 cctgatgaactacaac 225  Q
    ||||||||||||||||    
T  16658582 cctgatgaactacaac 16658567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 10 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 49553653 - 49553443
Alignment:
Q  10 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaa 109  Q
    |||||||||| |||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |   ||||||||||||||||||||||||||    
T  49553653 agcagagacaaaaatagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctctgaagaacaaacatccaatgccttcaaa 49553554  T
Q  110 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatct 209  Q
    |||||||||||||||   |||||||||||| || ||||||||||||||||||| |  ||||||| ||| |||| | |||||| |||||||||||||||||    
T  49553553 tcctttcaaaatagtcactgcttcactctttcaatcttctgcaatgcttagacgatgttaaatctattaaacagcctttgaaactttaagtcttgcatct 49553454  T
Q  210 cctgatgaact 220  Q
    |||||||||||    
T  49553453 cctgatgaact 49553443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 10 - 220
Target Start/End: Original strand, 47207701 - 47207910
Alignment:
Q  10 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaa 109  Q
    |||| ||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||| |||||||||||||||||    
T  47207701 agcaaagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaacaagcatccaatgccttcaaa 47207800  T
Q  110 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgc-ttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatc 208  Q
    || ||||||| |||  ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||  | |||||||    
T  47207801 tcatttcaaactagccgttgcttcacttttccagtcttctgcaatgctttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagtttta--tgttgcatc 47207898  T
Q  209 tcctgatgaact 220  Q
    ||||||||||||    
T  47207899 tcctgatgaact 47207910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 124; E-Value: 6e-64
Query Start/End: Original strand, 10 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 12726394 - 12726179
Alignment:
Q  10 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaa 109  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| || || |||||  || |||||||||| ||||||    
T  12726394 agcagagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactttgtacaattgtactttgttaactctctttaaagagtaagcatccaatgctttcaaa 12726295  T
Q  110 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatct 209  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| | | ||||||||||||||||||| ||||    
T  12726294 tcctttcaaaatagtcgttacttcactcttctagtcttctgcaaagcttagacgagattgaatccattgaatagcctttgaagctttaagtcttgaatct 12726195  T
Q  210 cctgatgaactacaac 225  Q
    ||||||||||| ||||    
T  12726194 cctgatgaacttcaac 12726179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 10 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 19889107 - 19888898
Alignment:
Q  10 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaa 109  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||  ||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  19889107 agcagagacacaaactgag--gtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtaatatgtcaatcctattcaaagaacaagcatccaatgctttcaaa 19889010  T
Q  110 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaaca-acatttgaagctttaagtcttgcatc 208  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| ||  ||||| |||||||||| ||| ||||| |||||||||||||  | ||| |||||||||||||||||||    
T  19889009 tcctttcaaaatagtcgttgcttcactcatctggtcttttgcaatgcttggacgagattgaatccattgaacagtctttttaagctttaagtcttgcatc 19888910  T
Q  209 tcctgatgaact 220  Q
    || |||||||||    
T  19888909 tcttgatgaact 19888898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 12 - 220
Target Start/End: Original strand, 52920403 - 52920610
Alignment:
Q  12 cagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaatc 111  Q
    |||||||| |||| | ||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||| || |||||||||||| || ||||||||| |||| |||||||||||||     
T  52920403 cagagacaaaaacagggtagtagaggtagtggttgtatacttcgtacaattttaatttgtcaacgctctttaaagaacaagcatcaaatgccttcaaata 52920502  T
Q  112 ctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatctcc 211  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || | |||||| |||||||||||||||||||    
T  52920503 cttt-aaattagttgttgcttcactcttctagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgagcagcctttgaaactttaagtcttgcatctcc 52920601  T
Q  212 tgatgaact 220  Q
    |||||||||    
T  52920602 tgatgaact 52920610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 120; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 10 - 197
Target Start/End: Original strand, 40799869 - 40800056
Alignment:
Q  10 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaa 109  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||  ||||||| ||||||||    
T  40799869 agcagagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaacaagtatccaattccttcaaa 40799968  T
Q  110 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagcttta 197  Q
    | |||||||| |||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  40799969 tactttcaaactagtcgttgcttcgcttttccagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacagcctttgaagcttta 40800056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 10 - 217
Target Start/End: Original strand, 16032520 - 16032726
Alignment:
Q  10 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaa 109  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  16032520 agcagagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaatgctcttcaaagaacaagcatccaatgccttcaaa 16032619  T
Q  110 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatct 209  Q
    ||||||||||||||| |||| | |||||| |  |||||||||| ||  ||| || |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||  |||||    
T  16032620 tcctttcaaaatagtcgttgatacactctcctggtcttctgcagtg-ataggcatgattaaatcctttgaacaacctttgaagctttaagtctctcatct 16032718  T
Q  210 cctgatga 217  Q
     |||||||    
T  16032719 tctgatga 16032726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 112; E-Value: 9e-57
Query Start/End: Original strand, 10 - 220
Target Start/End: Original strand, 11223559 - 11223766
Alignment:
Q  10 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaa 109  Q
    |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||| ||  |||||||| |||||||||||||||||    
T  11223559 agcagagaca-aaacagagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaaacatactttgtcaacgctctttgaagaacaagcatccaatgccttcaaa 11223657  T
Q  110 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatct 209  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||| ||||| ||||| || |||||||||| | |||||||||  |||  ||| ||||    
T  11223658 tcctttcaaaatagtcgttgcttcactttttcagtcttctgcaatgcatagacgagattgaacccattgaacagcttttgaagctcaaag--ttgtatct 11223755  T
Q  210 cctgatgaact 220  Q
    |||||||||||    
T  11223756 cctgatgaact 11223766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 109; E-Value: 5e-55
Query Start/End: Original strand, 10 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 20627595 - 20627382
Alignment:
Q  10 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaa 109  Q
    |||||||| | ||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||  |  ||||| |||||||||||||||||    
T  20627595 agcagagataaaaacaaagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaaacgtactttgtcaacgctctttgataaacaagcatccaatgccttcaaa 20627496  T
Q  110 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatct 209  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||| || || |||||||| |||| | ||||||||||||||  ||||||||    
T  20627495 tccattcaaaatagttgttgcttcacttttccagtcttctgcaatcattagacgagtttgaatccattaaacatcttttgaagctttaag--ttgcatct 20627398  T
Q  210 cctgatgaactacaac 225  Q
    ||||||||||| ||||    
T  20627397 cctgatgaactgcaac 20627382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 10 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 24775698 - 24775490
Alignment:
Q  10 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaa 109  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||| ||  ||||| || ||| |||||||||||||    
T  24775698 agcagagacaaaaacagagtagtggatgtagtggttgtacacttcgtacaaacgtactttgtcaaagctctttgaagaataagcattcaatgccttcaaa 24775599  T
Q  110 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatct 209  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||| || || ||||| || |||| | ||||||||||||||  ||||||||    
T  24775598 tcctttcaaaatagttgttgcttcacttttccagtcttctgcaatctttagacgagtttgaatccgttaaacagcttttgaagctttaag--ttgcatct 24775501  T
Q  210 cctgatgaact 220  Q
    |||||||||||    
T  24775500 cctgatgaact 24775490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 106; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 26 - 225
Target Start/End: Original strand, 2785075 - 2785273
Alignment:
Q  26 gagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgct-attcaaagaacaaacatccaatgccttcaaatcctttcaaaatagt 124  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||  ||  | |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  2785075 gagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctcttttgaggaacaagcatccaatgcgttcaaatcctttcaaaatagt 2785174  T
Q  125 tgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaactacaa 224  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||  |||||| || || ||||| || |||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  2785175 tgttgcttcacttttccagtcttctgcaatctttagacgagtttgaatccgttaaacaacttttgaagctttaag--ttgcatctcctgatgaactacaa 2785272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 10 - 149
Target Start/End: Complemental strand, 22804187 - 22804048
Alignment:
Q  10 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaa 109  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||     
T  22804187 agcagagacacaaattgagtagtggagatagtggttttacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaatcatcgaatgccttcaag 22804088  T
Q  110 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttct 149  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||||||  |||||||    
T  22804087 tcctttcaaaatagccgttgcttcactcttctggtcttct 22804048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 27 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 46349991 - 46349795
Alignment:
Q  27 agtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaatcctttcaaaatagttg 126  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | | |   |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| |    
T  46349991 agtagtggaggcagtggttgtacacttcgtacaatcgtactttgtcaatgttctctgaagaacaagcatccaatgccttcaaatcctttcaaattagtcg 46349892  T
Q  127 ttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaactacaac 225  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||  ||| |||||||||| |||||||  |||||  |||| |||||||||||||| ||||    
T  46349891 ttgcttcacttttccagtcttctgcaatgcttagacgagattggatcaattgaacaacttttgaagtcttaag--ttgcttctcctgatgaactgcaac 46349795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 10 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 53056891 - 53056683
Alignment:
Q  10 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaa 109  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||| ||  |||||||| |||||||||||||||||    
T  53056891 agcagagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaaacgtactttgtaaacgctctttgaagaacaagcatccaatgccttcaaa 53056792  T
Q  110 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatct 209  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||  |||||| |  || |||||||| |||| | |||||| | |||||  |||||||     
T  53056791 tcctttcaaaatagtcgttgcttcacttttccagtcttctgcaatctttagacgatgttgaatccattaaacagcttttgaaaccttaag--ttgcatcc 53056694  T
Q  210 cctgatgaact 220  Q
    | |||||||||    
T  53056693 catgatgaact 53056683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 21 - 225
Target Start/End: Original strand, 14955433 - 14955635
Alignment:
Q  21 aaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaatcctttcaaaa 120  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||  ||||| || |||||||||||||||||| |||||||||    
T  14955433 aaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaaacgtactttgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgccttcaaatactttcaaaa 14955532  T
Q  121 tagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaact 220  Q
    |||||||||||| ||  |||||||||||||||||  |||||| || || |||||||| |||| | ||||||||||| ||  || ||||||||||||||||    
T  14955533 tagttgttgctttacctttccagtcttctgcaatctttagacgagtttgaatccattaaacagcttttgaagctttgag--ttacatctcctgatgaact 14955630  T
Q  221 acaac 225  Q
     ||||    
T  14955631 gcaac 14955635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 11 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 12389035 - 12388845
Alignment:
Q  11 gcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaat 110  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||| || ||||||||||||| ||||    
T  12389035 gcagagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaattgtcctttgccaacgctcttcaaagaagaagcatccaatgccttaaaat 12388936  T
Q  111 cctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtct 202  Q
     ||||  || |||| || |||||||| |||   ||||||||||| | |||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  12388935 tcttttgaattagtcgtagcttcactgttctgatcttctgcaattc-tagacatgattaaatcctttgaacaacctttgaagctttaagtct 12388845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 28 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 19249558 - 19249385
Alignment:
Q  28 gtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaatcctttcaaaatagttgt 127  Q
    |||||||||  |||||||||||||||||||||||||| || | ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||| |||    
T  19249558 gtagtggagtaagtggttgtacacttcgtacaattgtcctatttcagcgctcttcaaagaacaaacatccaatgccttcaaatccttttgaattagctgt 19249459  T
Q  128 tgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtct 202  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||| ||| |  |||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||    
T  19249458 tgcttcactcttctggtcttctgcaatgc-taggcgtgattaaatcgtttgaacaacctttgaagctttaagtct 19249385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 26 - 225
Target Start/End: Original strand, 33583240 - 33583439
Alignment:
Q  26 gagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgct-attcaaagaacaaacatccaatgccttcaaatcctttcaaaatagt 124  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||  ||  | |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||     
T  33583240 gagtattggaggtagtggttgtacacttcgtacaaacgtactttgtcaacgctcttttgaggaacaagcatccaatgcgttcaaatcctttcaaaatagc 33583339  T
Q  125 tgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaat-ccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaactaca 223  Q
     ||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||| || ||| ||||  |||||| |||||||| |||||  |||||||  |||||||||||||    
T  33583340 cgttgcttcacttttccagtcttctacaatccttagacaaggttgaatcccataaaacaacttttgaagccttaag--ttgcatcctctgatgaactaca 33583437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 10 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 25398419 - 25398295
Alignment:
Q  10 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaa 109  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||  |||| |||| || |||||||||||||    
T  25398419 agcagagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaattgtgctttgtcaacgctctttgaagagcaaatatgcaatgccttcaaa 25398320  T
Q  110 tcctttcaaaatagttgttgcttca 134  Q
    ||||||||||||||| |||||||||    
T  25398319 tcctttcaaaatagtcgttgcttca 25398295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 21 - 223
Target Start/End: Original strand, 5213583 - 5213782
Alignment:
Q  21 aaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaatcctttcaaaa 120  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||  ||||||||| || ||  || || |||| ||||||||||||||||| |||||    
T  5213583 aaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaaacgtactacgtcaacgcttttgaat-aataagcatctaatgccttcaaatccttccaaaa 5213681  T
Q  121 tagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaact 220  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||||||||  ||| || || || ||||| || |||| | ||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  5213682 tagttgttgctatacttttccagtcttctgcaatctttatacgagtttgaatccgttaaacagcttttgaagctttaag--ttgcatctcctgatgaact 5213779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 10 - 220
Target Start/End: Original strand, 22140759 - 22140967
Alignment:
Q  10 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaa 109  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||   ||||| |||||||||| ||  |||||||| |||||||||  ||||||    
T  22140759 agcagagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttatacacttcgtacatacgtactatgtcaacgctctttgaagaacaagcatccaatgttttcaaa 22140858  T
Q  110 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatct 209  Q
     || ||||||||||| |||| ||||||  || ||||||||||||| ||||| | || || ||||| ||||||| | |||||| |||||||  ||||||||    
T  22140859 acccttcaaaatagtcgttggttcacttatctagtcttctgcaatccttaggcgagtttgaatccgttgaacagcttttgaaactttaag--ttgcatct 22140956  T
Q  210 cctgatgaact 220  Q
    |||||||||||    
T  22140957 cctgatgaact 22140967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 21 - 198
Target Start/End: Original strand, 20725093 - 20725269
Alignment:
Q  21 aaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaatcctttcaaaa 120  Q
    |||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||  ||||| ||||||||| |||||||||||||  ||     
T  20725093 aaacagagtagtggagatagttattgtacacttcgtacaattgtcctttttcaacgctcttcaagaaacaagcatccaatgtcttcaaatccttttgaat 20725192  T
Q  121 tagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaa 198  Q
    |||| |||||||||||||||  |||||||||||||| |||||  ||||| |||  ||||||| | |||||||||||||    
T  20725193 tagtcgttgcttcactcttctggtcttctgcaatgc-tagacgtgattagatcttttgaacagcctttgaagctttaa 20725269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 10 - 220
Target Start/End: Original strand, 29855404 - 29855613
Alignment:
Q  10 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaa 109  Q
    |||||||| | |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||| ||  |||||||| |||||||||||||||||    
T  29855404 agcagagataaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaaacgtactctgtcaacgctttttgaagaacaagcatccaatgccttcaaa 29855503  T
Q  110 tcctttcaaaatagttgttgcttcac-tcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatc 208  Q
    | |||||||| |||  |||||||||| | ||  |||||||||||||  |||||| || || |||||||| |||| | |||||||  |||||  |||||||    
T  29855504 ttctttcaaactagccgttgcttcactttttttagtcttctgcaatctttagacgaggttgaatccattaaacagcttttgaagtcttaag--ttgcatc 29855601  T
Q  209 tcctgatgaact 220  Q
     | |||||||||    
T  29855602 ccatgatgaact 29855613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 62; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 84 - 220
Target Start/End: Original strand, 11869137 - 11869271
Alignment:
Q  84 aagaacaaacatccaatgccttcaaatcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaa 183  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||| ||||||||||||| | | ||||||| ||||| ||| |||| |||||    
T  11869137 aagaacaagcatccaatgccttcaaatcctttcaaactagacgttgcttcacttttccagtcttctgtatttcttagacgagattgaattcattaaacaa 11869236  T
Q  184 catttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaact 220  Q
      |||||||| |||||  ||||||| |||||||||||    
T  11869237 attttgaagccttaag--ttgcatcccctgatgaact 11869271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 60; E-Value: 9e-26
Query Start/End: Original strand, 28 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 23538312 - 23538185
Alignment:
Q  28 gtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaatcctttcaaaatagttgt 127  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| | |  |||||| || ||| |||||||||||||| ||||  |||||   ||    
T  23538312 gtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtcctttttcaacgttctctaaagaataagcattcaatgccttcaaattcttttgaaataaccgt 23538213  T
Q  128 tgcttcactcttccagtcttctgcaatg 155  Q
    || |||| ||||||||||||||||||||    
T  23538212 tgtttcattcttccagtcttctgcaatg 23538185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 21 - 155
Target Start/End: Original strand, 12968312 - 12968446
Alignment:
Q  21 aaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaatcctttcaaaa 120  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||  ||||| | ||||||||| ||  ||||||||||||||||| ||||  ||     
T  12968312 aaacagagtagtggagatagtggttgtacacttcgtataattgtccttttccaacgttcttcaaagaataagtatccaatgccttcaaattcttttgaat 12968411  T
Q  121 tagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatg 155  Q
    |||| ||| |||||  |||| ||||||||||||||    
T  12968412 tagtcgttacttcatgcttctagtcttctgcaatg 12968446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 58; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 13 - 225
Target Start/End: Original strand, 21640865 - 21641074
Alignment:
Q  13 agagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaatcc 112  Q
    ||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||| |||||||||| ||  || || || |||||||||| ||  |||||    
T  21640865 agagacaaaaatagagtagtggagatagtggttgtacacttcgtaaaaacgtactatgtcaacgctctttgaaaaataagcatccaatgcttttcaatcc 21640964  T
Q  113 tttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatctcct 212  Q
    || ||||||||  ||||||  ||| |||||||||||| |||| ||||| | || || ||||| |  |||| | ||||| ||||||||  |||||||||||    
T  21640965 ttccaaaatagccgttgctatacttttccagtcttctacaat-cttaggcgagtttgaatccttgaaacagcttttgaggctttaag--ttgcatctcct 21641061  T
Q  213 gatgaactacaac 225  Q
    |||||||| ||||    
T  21641062 gatgaactgcaac 21641074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 58; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 38 - 162
Target Start/End: Original strand, 50300246 - 50300370
Alignment:
Q  38 tagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgct-attcaaagaacaaacatccaatgccttcaaatcctttcaaaatagttgttgcttcact 136  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||  ||  | ||||| ||||||||||| ||||||||| ||| ||||||  |||||||||||    
T  50300246 tagtggttgtacacttcgtacaaacgtactttgtcaacgctcttttgaggaacatacatccaatgcgttcaaatcccttc-aaatagcagttgcttcact 50300344  T
Q  137 cttccagtcttctgcaatgcttagac 162  Q
     ||||||||||||||||| |||||||    
T  50300345 tttccagtcttctgcaatccttagac 50300370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 10 - 78
Target Start/End: Original strand, 11868264 - 11868332
Alignment:
Q  10 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgct 78  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  11868264 agcagagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaatcgtactttgtcaacgct 11868332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 10 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 46796531 - 46796333
Alignment:
Q  10 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaa 109  Q
    |||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||| ||  ||||| ||  ||| ||||            
T  46796531 agcagagacaaaaacaaagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagtatctaatg-------- 46796440  T
Q  110 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatct 209  Q
     ||||||||| |||  ||||    ||| ||||||||||||||||| ||||||| || || ||||| || |||||| ||||||||||||||  ||||||||    
T  46796439 -cctttcaaattagccgttgtaatacttttccagtcttctgcaat-cttagacgagtttgaatcctttaaacaacttttgaagctttaag--ttgcatct 46796344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 10 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 49666569 - 49666371
Alignment:
Q  10 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaa 109  Q
    |||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| | |||||| ||| ||  ||||| |         || |||  ||    
T  49666569 agcagagacagaatcagagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaaacgtaatatgtcaatgctctttgaagaata---------tgtctttcaa 49666479  T
Q  110 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatct 209  Q
    ||||||||||||||| |||| |  ||| ||||||||||||||||| ||||||| || || ||||| |  |||||| ||||||||||||||  ||||||||    
T  49666478 tcctttcaaaatagtcgttgttatacttttccagtcttctgcaat-cttagacgagtttgaatccttgaaacaacttttgaagctttaag--ttgcatct 49666382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 49; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 10 - 102
Target Start/End: Complemental strand, 21605818 - 21605726
Alignment:
Q  10 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgc 102  Q
    |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| | |||||||||| ||  ||||| || ||||||||||    
T  21605818 agcagagacaaaaacagagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaaacgtattatgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgc 21605726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 47; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 21 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 26417832 - 26417698
Alignment:
Q  21 aaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaatcctttcaaaa 120  Q
    |||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||  |||  ||||| | | |||||||  | |||||||||||||||||| ||||  ||     
T  26417832 aaacagagtagtgaagatagtggttgtacactttgtacaattgtcattttccaacgttctccaaagaatgagcatccaatgccttcaaattcttttgaat 26417733  T
Q  121 tagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatg 155  Q
    |||  ||||||||| ||||| ||||||||| ||||    
T  26417732 tagccgttgcttcattcttctagtcttctggaatg 26417698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 45; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 27 - 119
Target Start/End: Complemental strand, 11909171 - 11909079
Alignment:
Q  27 agtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaatcctttcaaa 119  Q
    |||||||||| ||||||| |||||||||||| |   |||||||||||||||| ||  ||| | || |||||||||||||||||||||||||||    
T  11909171 agtagtggaggtagtggtcgtacacttcgtaaagacgtactttgtcaacgctctttgaaggataagcatccaatgccttcaaatcctttcaaa 11909079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 45; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 10 - 102
Target Start/End: Complemental strand, 21636834 - 21636742
Alignment:
Q  10 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgc 102  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||| ||  ||||| || ||||||||||    
T  21636834 agcagagacaaaaacagagtagtggaagtagtggttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgc 21636742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 157 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 25398290 - 25398238
Alignment:
Q  157 ttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatct 209  Q
    |||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  25398290 ttagacgagattaaattcattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatct 25398238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 10 - 78
Target Start/End: Complemental strand, 30054381 - 30054313
Alignment:
Q  10 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgct 78  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||  ||||| ||||||||||    
T  30054381 agcagagacaaaaacagagtagtggagttagtggttgtacatttcgtacaaacgtactatgtcaacgct 30054313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 10 - 60
Target Start/End: Complemental strand, 1728179 - 1728129
Alignment:
Q  10 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaa 60  Q
    |||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  1728179 agcagagacaaaaacagagtagtgcagatagtggttgtacacttcgtacaa 1728129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 10 - 78
Target Start/End: Complemental strand, 9700200 - 9700132
Alignment:
Q  10 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgct 78  Q
    |||||||||| |||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||  | ||| ||||||||||    
T  9700200 agcagagacaaaaacagagtagtgcagatagtggttatacacttcgtacaaacgcactatgtcaacgct 9700132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 48 - 119
Target Start/End: Complemental strand, 45858875 - 45858804
Alignment:
Q  48 acacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaatcctttcaaa 119  Q
    ||||||||||||   |||||||||||||||| ||  ||| | || |||||||||||||||||||||||||||    
T  45858875 acacttcgtacagacgtactttgtcaacgctctttgaaggataagcatccaatgccttcaaatcctttcaaa 45858804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 15 - 60
Target Start/End: Original strand, 37412605 - 37412650
Alignment:
Q  15 agacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaa 60  Q
    ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  37412605 agacagaaacagagtagtggagatagtggttgtacatttcgtacaa 37412650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 15 - 119
Target Start/End: Original strand, 51341011 - 51341107
Alignment:
Q  15 agacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaatcctt 114  Q
    ||||| |||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||        |||||||||||| ||  ||| | || |||||||||||||||| |||||    
T  51341011 agacaaaaacagagtagtggaggtagtggtcgtacacttcgtac--------tttgtcaacgctctttgaaggataagcatccaatgccttcaattcctt 51341102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 21 - 53
Target Start/End: Original strand, 13557777 - 13557809
Alignment:
Q  21 aaactgagtagtggagatagtggttgtacactt 53  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  13557777 aaacagagtagtggagatagtggttgtacactt 13557809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 38 - 102
Target Start/End: Original strand, 40850991 - 40851055
Alignment:
Q  38 tagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgc 102  Q
    |||||||||||||||||||||||   |||| |||||||||| ||  ||||| || ||||||||||    
T  40850991 tagtggttgtacacttcgtacaaacatactatgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgc 40851055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 184; Significance: 1e-99; HSPs: 67)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 10 - 225
Target Start/End: Original strand, 30666979 - 30667194
Alignment:
Q  10 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaa 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  30666979 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagatcaagcatccaatgccttcaaa 30667078  T
Q  110 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatct 209  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  30667079 tcctttcaaaatagtcgttgcttcattcttccagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaattcttgcatct 30667178  T
Q  210 cctgatgaactacaac 225  Q
    ||||||||||||||||    
T  30667179 cctgatgaactacaac 30667194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 179; E-Value: 9e-97
Query Start/End: Original strand, 10 - 220
Target Start/End: Original strand, 25829124 - 25829334
Alignment:
Q  10 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaa 109  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  25829124 agcagagacacaaaatgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatccaatgccttcaaa 25829223  T
Q  110 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatct 209  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||    
T  25829224 tcctttcaaaatagtcgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacatcctttgaagctctaagtcttgcatct 25829323  T
Q  210 cctgatgaact 220  Q
    |||||||||||    
T  25829324 cctgatgaact 25829334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 176; E-Value: 6e-95
Query Start/End: Original strand, 10 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 25037369 - 25037154
Alignment:
Q  10 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaa 109  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  25037369 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgaacaattgtactttgtcaacgcttttcaaagaacaaacatccaatgctttcaaa 25037270  T
Q  110 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatct 209  Q
    |||||||||| |||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  25037269 tcctttcaaattagtcgttacatcactcttccagtcttctgcaatgcttcgacaagattgaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatct 25037170  T
Q  210 cctgatgaactacaac 225  Q
    ||||||||||||||||    
T  25037169 cctgatgaactacaac 25037154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 176; E-Value: 6e-95
Query Start/End: Original strand, 10 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 25041476 - 25041261
Alignment:
Q  10 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaa 109  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  25041476 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgaacaattgtactttgtcaacgcttttcaaagaacaaacatccaatgctttcaaa 25041377  T
Q  110 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatct 209  Q
    |||||||||| |||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  25041376 tcctttcaaattagtcgttacatcactcttccagtcttctgcaatgcttcgacaagattgaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatct 25041277  T
Q  210 cctgatgaactacaac 225  Q
    ||||||||||||||||    
T  25041276 cctgatgaactacaac 25041261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 174; E-Value: 9e-94
Query Start/End: Original strand, 10 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 20568860 - 20568647
Alignment:
Q  10 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaa 109  Q
    |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  20568860 agcagatacacaaactgagtagtggggatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatccaatgccttcaaa 20568761  T
Q  110 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatct 209  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| | ||| ||||||||||||||||||||    
T  20568760 tcctttcaaaattgttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccatggaacagcctttaaagctttaagtcttgcatct 20568661  T
Q  210 cctgatgaactaca 223  Q
    ||||||||||||||    
T  20568660 cctgatgaactaca 20568647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 172; E-Value: 1e-92
Query Start/End: Original strand, 10 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 9015478 - 9015270
Alignment:
Q  10 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaa 109  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||| ||||||    
T  9015478 agcagagatacaaactgagtagtggagatagtggttgtacac--cgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaataagcatccaatgctttcaaa 9015381  T
Q  110 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatct 209  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  9015380 tcctttcaaaatagttgttgtttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatct 9015281  T
Q  210 cctgatgaact 220  Q
    |||||||||||    
T  9015280 cctgatgaact 9015270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 172; E-Value: 1e-92
Query Start/End: Original strand, 10 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 13964088 - 13963877
Alignment:
Q  10 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaa 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  13964088 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatccaatgccttcaaa 13963989  T
Q  110 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatct 209  Q
    | ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  13963988 ttctttcaaaatagtcgttgcttcactctttcagtcttctacaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaaatcttgcatct 13963889  T
Q  210 cctgatgaacta 221  Q
     |||||||||||    
T  13963888 actgatgaacta 13963877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 168; E-Value: 3e-90
Query Start/End: Original strand, 10 - 221
Target Start/End: Original strand, 23234997 - 23235208
Alignment:
Q  10 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaa 109  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| || |||||||||||||||||    
T  23234997 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacactcttcaaagaataagcatccaatgccttcaaa 23235096  T
Q  110 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatct 209  Q
    | ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  23235097 ttctttcaaaatagtcgttgctttactcttccagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacagcctttgaagctttaagtcttgcatct 23235196  T
Q  210 cctgatgaacta 221  Q
    | ||||||||||    
T  23235197 catgatgaacta 23235208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 168; E-Value: 3e-90
Query Start/End: Original strand, 14 - 225
Target Start/End: Original strand, 30621210 - 30621421
Alignment:
Q  14 gagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaatcct 113  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  30621210 gagacacaaactgagtagtggagatagtggttttacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagatcaaacatccaatgccttcaaatcct 30621309  T
Q  114 ttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatctcctg 213  Q
    ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||    
T  30621310 ttcaaaatagtcgctgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttacacgagattaaatccattgaacaacctttgaacctttaattcttgcatctcctg 30621409  T
Q  214 atgaactacaac 225  Q
    ||| ||||||||    
T  30621410 atgcactacaac 30621421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 168; E-Value: 3e-90
Query Start/End: Original strand, 14 - 225
Target Start/End: Original strand, 30623831 - 30624042
Alignment:
Q  14 gagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaatcct 113  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  30623831 gagacacaaactgagtagtggagatagtggttttacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagatcaaacatccaatgccttcaaatcct 30623930  T
Q  114 ttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatctcctg 213  Q
    ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||    
T  30623931 ttcaaaatagtcgctgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttacacgagattaaatccattgaacaacctttgaacctttaattcttgcatctcctg 30624030  T
Q  214 atgaactacaac 225  Q
    ||| ||||||||    
T  30624031 atgcactacaac 30624042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 164; E-Value: 8e-88
Query Start/End: Original strand, 10 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 22188212 - 22187997
Alignment:
Q  10 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaa 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  22188212 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattatactttgttaacgctcttcaaagaacaagcatccaatgccttcaaa 22188113  T
Q  110 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatct 209  Q
    ||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| |    
T  22188112 tctattcaaaatagttgttgcttcactctttcagtcttctgcaatacttagacgagattaaatccattgaacagcctttgaagctttaagtcttgcatgt 22188013  T
Q  210 cctgatgaactacaac 225  Q
    ||||||||||| ||||    
T  22188012 cctgatgaacttcaac 22187997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 155; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 10 - 220
Target Start/End: Original strand, 19540406 - 19540616
Alignment:
Q  10 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaa 109  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||| |||||||| ||||||||    
T  19540406 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactatgtcaacgctctttaaagaacaagcatccaataccttcaaa 19540505  T
Q  110 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatct 209  Q
     |||||| ||||||  ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19540506 acctttcgaaatagccgttgcttcactctcctagtcttctgcaatgcttagatgagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatct 19540605  T
Q  210 cctgatgaact 220  Q
    | |||||||||    
T  19540606 catgatgaact 19540616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 155; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 10 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 21537358 - 21537148
Alignment:
Q  10 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaa 109  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | ||| |||||||||||| ||||    
T  21537358 agcaaagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaaaagcaagcatccaatgcctccaaa 21537259  T
Q  110 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatct 209  Q
     |||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  21537258 acctttcaaaatagtcgttgcttcactcttctggtcttctgcaatgtttaaacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatct 21537159  T
Q  210 cctgatgaact 220  Q
    |||||||||||    
T  21537158 cctgatgaact 21537148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 152; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 10 - 220
Target Start/End: Original strand, 24576025 - 24576236
Alignment:
Q  10 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaa 109  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||| |||||||||| |||    
T  24576025 agcagagacacaaactaagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaactctcttcaacgaacaaacaaccaatgcctttaaa 24576124  T
Q  110 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaaga-ttaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatc 208  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  24576125 tcctttcaaaatagttgttgcttcacttttccagtcttctgcaatgcttagatgagatttaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtattgcatc 24576224  T
Q  209 tcctgatgaact 220  Q
    |||| |||||||    
T  24576225 tcctaatgaact 24576236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 149; E-Value: 7e-79
Query Start/End: Original strand, 10 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 18377016 - 18376824
Alignment:
Q  10 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaa 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  18377016 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatccaatgccttcaaa 18376917  T
Q  110 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtct 202  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||| ||  | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  18376916 tcctttcaaaatagtagttgattcactattaaaatcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacagcctttgaagctttaagtct 18376824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 10 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 10009860 - 10009649
Alignment:
Q  10 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaa 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  10009860 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacatttcgtacaattgtactatgtcaacgttcttcaaagaacaagcatccaatgctttcaaa 10009761  T
Q  110 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttc-cagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatc 208  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||   ||||| |||||||||| ||| ||||| ||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||    
T  10009760 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcctcttggtcttttgcaatgcttggacgagattgaatccattgaacagcccttgaagctttaagtcttgcatc 10009661  T
Q  209 tcctgatgaact 220  Q
    ||||||||||||    
T  10009660 tcctgatgaact 10009649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 10 - 220
Target Start/End: Original strand, 24377091 - 24377301
Alignment:
Q  10 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaa 109  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||||  |||||    
T  24377091 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactatgtcaacgctcttcaaagaacaagcatccaatgctctcaaa 24377190  T
Q  110 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaa-catttgaagctttaagtcttgcatc 208  Q
     |||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||| ||| |  ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  24377191 acctttcaaaatagtcgttgcttcactcttctggtcttctgcaatgc-taggcgtgattaaatccattgaacaaccttttgaagctttaagtcttgcatc 24377289  T
Q  209 tcctgatgaact 220  Q
    || |||||||||    
T  24377290 tcttgatgaact 24377301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 10 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 24850776 - 24850569
Alignment:
Q  10 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaa 109  Q
    |||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| || |||    
T  24850776 agcagagacacacactgagtagtggatgtagtggttgtacatttcgtacacttgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatccaatgctttgaaa 24850677  T
Q  110 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaa-catttgaagctttaagtcttgcatc 208  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||||  |||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  24850676 tcctttcaaaatattcgttgcttcactcttctggtcttcagcaatgcgtagacgagattaaatccattgaacaaccttttgaagctttaagtcttgcatc 24850577  T
Q  209 tcctgatg 216  Q
    ||||||||    
T  24850576 tcctgatg 24850569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 129; E-Value: 6e-67
Query Start/End: Original strand, 10 - 217
Target Start/End: Original strand, 38781388 - 38781596
Alignment:
Q  10 agcagagacacaaact-gagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaa 108  Q
    |||||||||| ||| | ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||| ||| ||||||||||||    
T  38781388 agcagagacaaaaaatagagtagtggatgtagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaacaatcattcaatgccttcaa 38781487  T
Q  109 atcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatc 208  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || || |||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  38781488 atcctttcaaaatagttgttgcttcacttttccagtcttctacattgtttagacgagattaaatcaattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatc 38781587  T
Q  209 tcctgatga 217  Q
      |||||||    
T  38781588 ctctgatga 38781596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 10 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 28140729 - 28140519
Alignment:
Q  10 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaa 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||  ||||||    
T  28140729 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtgatggtacactttgtacaattgtactatgtcaacgctcttcaaagaacaagcatccaatgttttcaaa 28140630  T
Q  110 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatct 209  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||      |||| |||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  28140629 tcctttcaaaatagttgttgcttcactccaatgatcttttgcaatgcttggacgagattgaatccattgaacaacctttgaagttttaagtcttgcatct 28140530  T
Q  210 cctgatgaact 220  Q
    || ||||||||    
T  28140529 cccgatgaact 28140519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 10 - 218
Target Start/End: Original strand, 40782467 - 40782669
Alignment:
Q  10 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaa 109  Q
    |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  40782467 agcagagacacaaactaagtattggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactatgtcaacgctcttcaaagaacaaacatccaatgctttcaaa 40782566  T
Q  110 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatct 209  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| ||  ||||| |||||||||| ||| ||||| |||||||||||    ||||  |||| ||||||||||||||    
T  40782567 tcctttcaaaatagtcgttgcttcactcctctggtcttttgcaatgcttggacgagattgaatccattgaa----attt--agctctaagtcttgcatct 40782660  T
Q  210 cctgatgaa 218  Q
    |||||||||    
T  40782661 cctgatgaa 40782669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 124; E-Value: 6e-64
Query Start/End: Original strand, 21 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 6574223 - 6574019
Alignment:
Q  21 aaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaatt-gtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaatcctttcaaa 119  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6574223 aaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaatttgtactttgtcaacgctctttgaagaacaaacatccaatgccttcaaatcctttcaaa 6574124  T
Q  120 atagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgc-ttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaa 218  Q
     |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||||  | |||||||| ||||||||    
T  6574123 ctagtcgttgcttcacttttccagtcttctgcaatgcattagacgagattaaatcaattgaacaacctttgaagcttta--tgttgcatcttctgatgaa 6574026  T
Q  219 ctacaac 225  Q
    || ||||    
T  6574025 ctgcaac 6574019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 124; E-Value: 6e-64
Query Start/End: Original strand, 38 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 20152117 - 20151939
Alignment:
Q  38 tagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaatcctttcaaaatagttgttgcttcactc 137  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||   |||||||||||     
T  20152117 tagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaacaagcatccaatgccttcaaatcctttcaaactaaccgttgcttcactt 20152018  T
Q  138 ttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatctcctgatga 217  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  20152017 ttccagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacttttgaagctttaa-tgttgcatctcctgatga 20151939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 10 - 218
Target Start/End: Original strand, 22317583 - 22317792
Alignment:
Q  10 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaa 109  Q
    |||||||| | ||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||| ||||||||||||| |||    
T  22317583 agcagagataaaaactgaatagtggaggtagtggttgtatacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaacaagcatccaatgcctttaaa 22317682  T
Q  110 tcctttc-aaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatc 208  Q
    ||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||  |||||||||||| |||| | | |||||||||||||||||||||||    
T  22317683 tcctttcaaaaatagtcgttgcttcactcttctagtcttatgcaatgcttagatgagattaaatccaatgaaaagcctttgaagctttaagtcttgcatc 22317782  T
Q  209 tcctgatgaa 218  Q
    || |||||||    
T  22317783 tcttgatgaa 22317792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 10 - 202
Target Start/End: Original strand, 24779333 - 24779525
Alignment:
Q  10 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaa 109  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  24779333 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttatacacttcatacaattgtactatgtcaacactcttcaaagaacaaacatccgatgctttcaaa 24779432  T
Q  110 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtct 202  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| ||  ||||| | |||||||| ||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  24779433 tcctttcaaaatagtcgttgcttcactcctctggtctttttcaatgcttggacgagattgaatccattgaacaacctttgaagcttcaagtct 24779525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 120; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 46 - 217
Target Start/End: Original strand, 22260432 - 22260603
Alignment:
Q  46 gtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaatcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtc 145  Q
    ||||||||| |||||||||||| |||||| ||| |||||||||||| |||||| | ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  22260432 gtacacttcttacaattgtactatgtcaaagctcttcaaagaacaagcatccagttccttcaaatccttccaaaatatttgttgcttcacttttccagtc 22260531  T
Q  146 ttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatctcctgatga 217  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  22260532 ttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacttttgacgctttaagtcttgcatctcctgatga 22260603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 105; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 10 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 31800997 - 31800853
Alignment:
Q  10 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaa 109  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||  |||| |||||||||||||| ||||||    
T  31800997 agcagagacaaaaacagagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaaatgtactttgtcaacgctctttgaagatcaaacatccaatgctttcaaa 31800898  T
Q  110 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaat 154  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  31800897 tcctttcaaaatagttgttgtttcacttttccagtcttctgcaat 31800853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 10 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 39037752 - 39037542
Alignment:
Q  10 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaa 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | ||| |||| |||||||||||     
T  39037752 agcagagacacaaactgagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaaaagcaagcatctaatgccttcaac 39037653  T
Q  110 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatct 209  Q
    | | ||  || |||  ||||||||||| | | | ||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||||||| ||||||| |||||||||  |||||    
T  39037652 ttcatttgaattagccgttgcttcactttcctaatcttctgcaatgcttagacgagatcaaatccaatgaacaacctttgaagttttaagtctctcatct 39037553  T
Q  210 cctgatgaact 220  Q
     ||||| ||||    
T  39037552 tctgatcaact 39037542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 97; E-Value: 8e-48
Query Start/End: Original strand, 10 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 23595677 - 23595473
Alignment:
Q  10 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaa 109  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||  ||||||||||||||||    
T  23595677 agcagagacacaaactgagtagaggaggtagtggttctacacttcgtacaattgtactttgtcaacgc--ttcagagaacaagaatccaatgccttcaaa 23595580  T
Q  110 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatct 209  Q
    | | ||  || |||| |||||||||||||||  |||||||||||||| |||    |||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||| |||||    
T  23595579 ttcatttgaattagtcgttgcttcactcttctggtcttctgcaatgc-taggtgtgattaaatcctttgaacaacctttgaagctttaattctttcatct 23595481  T
Q  210 cctgatga 217  Q
     |||||||    
T  23595480 tctgatga 23595473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 10 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 28711808 - 28711618
Alignment:
Q  10 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaa 109  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||| ||  |||||||| |||||||||||||||||    
T  28711808 agcagagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaaacgtactttttcaacgctctttgaagaacaagcatccaatgccttcaaa 28711709  T
Q  110 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagt 200  Q
    | | ||| ||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||  ||||||||| || |||||||| |||| | |||||||| ||||||    
T  28711708 ttcattcgaaatagtcgttgctttacttttccagtcttctgcaatctttagacaaggttgaatccattaaacagcttttgaagccttaagt 28711618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 10 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 41121829 - 41121642
Alignment:
Q  10 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaa 109  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||| |||||||| |||  ||||||||||||||||    
T  41121829 agcagagacacaaacagagtagtggaggtagtggttgtacatttcgcacaattgtactttgtcaatgctcttcaaagagcaataatccaatgccttcaaa 41121730  T
Q  110 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaa 198  Q
    ||||||  || ||||  ||||||||||| |||| ||||||||||||| ||| |  |||||||||| ||||||| | |||||||||||||    
T  41121729 tccttttgaattagtctttgcttcactcatccaatcttctgcaatgc-taggcgtgattaaatcctttgaacagcctttgaagctttaa 41121642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 10 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 22455100 - 22454890
Alignment:
Q  10 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaa 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | ||| ||||||||||||||||     
T  22455100 agcagagacacaaactgagtagtggaggtactggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgcttttcaaaaagcaagcatccaatgccttcaac 22455001  T
Q  110 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaaca-acatttgaagctttaagtcttgcatc 208  Q
    | | ||  || ||  ||||||||||||||||  ||||||||||||| || | |  ||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||  ||||    
T  22455000 ttcatttgaattaactgttgcttcactcttctggtcttctgcaatg-ttgggcgtgattaaatccattgaacacccttttgaagctttaagtctctcatc 22454902  T
Q  209 tcctgatgaact 220  Q
    | |||| |||||    
T  22454901 ttctgaagaact 22454890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 87; E-Value: 7e-42
Query Start/End: Original strand, 21 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 26619200 - 26619027
Alignment:
Q  21 aaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaatcctttcaaaa 120  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| | | ||||||| || ||| |||||||||||||| ||||  |||    
T  26619200 aaacagagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtcctttttcaacgttctccaaagaataagcattcaatgccttcaaattcttttgaaa 26619101  T
Q  121 tagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctt 195  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||| |  |||||||||  ||||||||| ||||||||||    
T  26619100 tagttgttgcttcattcttccagtcttctgcaatg-ataggcgtgattaaatcatttgaacaacctttgaagctt 26619027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 13 - 202
Target Start/End: Original strand, 25189391 - 25189579
Alignment:
Q  13 agagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaatcc 112  Q
    ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||  ||||||||||||||| | |    
T  25189391 agagacacaaattgagtagtggaggtagtggttgtacatttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaaaagcaagaatccaatgccttcaacttc 25189490  T
Q  113 tttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtct 202  Q
     ||  || ||||  |||||||||||| |  |||||||||||||| |||    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  25189491 atttgaattagtcattgcttcactctcctggtcttctgcaatgc-taggtgtgattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtct 25189579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 10 - 225
Target Start/End: Original strand, 33074216 - 33074429
Alignment:
Q  10 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaa 109  Q
    |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||| | ||  ||||| || |||| ||||||||| ||    
T  33074216 agcagagacaaaaacagagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaatcgtattatgtcaacgttttttgaagaataagcatctaatgccttccaa 33074315  T
Q  110 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatct 209  Q
    ||  | ||||||||| ||||||  ||| |||||||||||||||||  |||||| || || ||||| || |||| | ||||||| ||||||  ||||||||    
T  33074316 tctgtccaaaatagtcgttgctatacttttccagtcttctgcaatctttagacgagtttgaatcctttaaacagcttttgaagttttaag--ttgcatct 33074413  T
Q  210 cctgatgaactacaac 225  Q
    ||||||||||||||||    
T  33074414 cctgatgaactacaac 33074429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 10 - 199
Target Start/End: Original strand, 6392624 - 6392814
Alignment:
Q  10 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgct-attcaaagaacaaacatccaatgccttcaa 108  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||  ||||||||||||  ||||||||||||||||  ||  | |||||| |||||||||| |||||    
T  6392624 agcagagaca-aaacagagtagtggaggtagtggttgcgcacttcgtacaaacgtactttgtcaacgctcttttgaggaacaagcatccaatgcgttcaa 6392722  T
Q  109 atcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatc-cattgaacaacatttgaagctttaag 199  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| || || |||| |||| |||| | |||||||| |||||    
T  6392723 atcctttcaaaatagtcgttgcttcacttttccagtcttctgcaatccttagacgaggttgaatcacattaaacagcttttgaagccttaag 6392814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 38 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 45087266 - 45087084
Alignment:
Q  38 tagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaatcctttcaaaatagttgttgcttcactc 137  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||   |||| || |||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||     
T  45087266 tagtggttgtacacttcgtacaaacgtactttgtcaacgctcttttgagaataagcatctaatgcattcaaatcctttcaaaatagtcgttgcttcactt 45087167  T
Q  138 ttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaat-ccattgaacaac-atttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaact 220  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| || || ||| ||||| ||||||  ||||||||||||||  |||||||  ||||||||||    
T  45087166 ttccagtcttctgcaatccttagacgaggttgaatcccattaaacaactttttgaagctttaag--ttgcatcctctgatgaact 45087084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 10 - 220
Target Start/End: Original strand, 22802451 - 22802658
Alignment:
Q  10 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaa 109  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| || ||  ||||| || ||||  |||||||||||    
T  22802451 agcagagaca-aaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaaacgtactttgtcaactctctttgaagaataagcatcatatgccttcaaa 22802549  T
Q  110 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatct 209  Q
    ||||||||||||||   |||||| ||  ||| |||||||||||||  |||||| || || |||||||| || | | |||||| |||||||  ||||||||    
T  22802550 tcctttcaaaatagccattgctttacctttctagtcttctgcaatctttagacgagtttgaatccattaaatagcttttgaatctttaag--ttgcatct 22802647  T
Q  210 cctgatgaact 220  Q
    |||||||||||    
T  22802648 cctgatgaact 22802658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 10 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 28701339 - 28701131
Alignment:
Q  10 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaa 109  Q
    ||||| |||| ||||  |||||||||| || ||||||||||||||||||||   ||||||||||||||  ||  |||||||| |||||||||||||||||    
T  28701339 agcagggacaaaaacaaagtagtggaggtaatggttgtacacttcgtacaaacttactttgtcaacgccctttgaagaacaagcatccaatgccttcaaa 28701240  T
Q  110 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatct 209  Q
    |||||||||||||  |||||||| ||| |||||||||||||||||  | |||| || || |||| ||| |||| | |||||||| |||||  |||||||     
T  28701239 tcctttcaaaatatctgttgctttacttttccagtcttctgcaatcttaagacgaggttgaatctattaaacagcttttgaagccttaag--ttgcatcc 28701142  T
Q  210 cctgatgaact 220  Q
    | |||||||||    
T  28701141 catgatgaact 28701131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 10 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 31328075 - 31327867
Alignment:
Q  10 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaa 109  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| | |   ||||||||||||||| ||  |||||||| |||||||||| ||||||    
T  31328075 agcagagaca-aaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgttcgaacatactttgtcaacgctctttgaagaacaagcatccaatgctttcaaa 31327977  T
Q  110 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaac-atttgaagctttaagtcttgcatc 208  Q
     || | ||||||||| |||||||||||  || |||||||||||||  |||| | || || ||||| |||||||||  |||||| |||||||  |||||||    
T  31327976 accctccaaaatagtcgttgcttcacttctctagtcttctgcaatctttaggcgagtttgaatccgttgaacaactttttgaaactttaag--ttgcatc 31327879  T
Q  209 tcctgatgaact 220  Q
    ||||||||||||    
T  31327878 tcctgatgaact 31327867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 10 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 31334796 - 31334588
Alignment:
Q  10 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaa 109  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| | |   ||||||||||||||| ||  |||||||| |||||||||| ||||||    
T  31334796 agcagagaca-aaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgttcgaacatactttgtcaacgctctttgaagaacaagcatccaatgctttcaaa 31334698  T
Q  110 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaac-atttgaagctttaagtcttgcatc 208  Q
     || | ||||||||| |||||||||||  || |||||||||||||  |||| | || || ||||| |||||||||  |||||| |||||||  |||||||    
T  31334697 accctccaaaatagtcgttgcttcacttctctagtcttctgcaatctttaggcgagtttgaatccgttgaacaactttttgaaactttaag--ttgcatc 31334600  T
Q  209 tcctgatgaact 220  Q
    ||||||||||||    
T  31334599 tcctgatgaact 31334588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 10 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 35744110 - 35743901
Alignment:
Q  10 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaa 109  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||  ||||| |||||||||| ||  |||||  | ||| |||||||||||||    
T  35744110 agcagagacaaaaactgagtagtggagatagtagttgtacatttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaattagcattcaatgccttcaaa 35744011  T
Q  110 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatct 209  Q
    ||||| ||||||||| ||||||  ||| ||||| | |||||||||  ||||||  | || | ||  || |||||| ||||| ||||||||  ||||||||    
T  35744010 tccttccaaaatagtcgttgctatacttttccaatattctgcaatctttagac--gtttgagtctgttaaacaacttttgacgctttaag--ttgcatct 35743915  T
Q  210 cctgatgaactaca 223  Q
    ||||||||||||||    
T  35743914 cctgatgaactaca 35743901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 26 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 34322030 - 34321835
Alignment:
Q  26 gagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaatcctttcaaaatagtt 125  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| |||||  ||||| |||||||||| ||  ||||| ||  ||||||||||||  |||||||||||||||||     
T  34322030 gagtagtgaagatagtggttgtacacttcatacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagaatccaatgcctttcaatcctttcaaaatagtc 34321931  T
Q  126 gttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaactaca 223  Q
    ||||||  ||| |||||| ||||||||||  |||||| || || ||||| || |||| | ||||| ||||||||  ||||||||||||||||| ||||    
T  34321930 gttgctatacttttccaggcttctgcaatctttagacgagtttgaatcctttaaacagcttttgaggctttaag--ttgcatctcctgatgaattaca 34321835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 98 - 220
Target Start/End: Original strand, 7609039 - 7609162
Alignment:
Q  98 aatgccttcaaatcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccag-tcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagcttt 196  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||  | |||| || ||||||| ||| ||||| ||||||||||||| |  ||||||||||    
T  7609039 aatgccttcaaatcctttcaaaataggtgttgcttcactcctcttggtcttttgtaatgcttggacgagattgaatccattgaacagcccttgaagcttt 7609138  T
Q  197 aagtcttgcatctcctgatgaact 220  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  7609139 aagtcttgcatctcctgatgaact 7609162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 66; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 26 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 30557415 - 30557221
Alignment:
Q  26 gagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgct-attcaaagaacaaacatccaatgccttcaaatcctttcaaaatagt 124  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||  ||  | |||||| |||||||||  ||||||| |||||||||||||    
T  30557415 gagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaaacgtactttgtcaacgctcttttgaggaacaagcatccaatgtgttcaaattctttcaaaatagt 30557316  T
Q  125 tgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaat-ccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaact 220  Q
     | ||||||||| || ||||| |||||||| ||||||| || || ||| ||||| |||||  |||||||| |||||  |||||||  ||||||||||    
T  30557315 cgatgcttcactttttcagtcctctgcaatccttagacgaggttgaatcccattaaacaatttttgaagccttaag--ttgcatcctctgatgaact 30557221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 66; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 26 - 155
Target Start/End: Original strand, 44881173 - 44881302
Alignment:
Q  26 gagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaatcctttcaaaatagtt 125  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| || | |||  || |||||||||||||||||||| || ||  || ||| |    
T  44881173 gagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtcctttttcaactctctccaacaaaaaaacatccaatgccttcaaacccatttgaattagct 44881272  T
Q  126 gttgcttcactcttccagtcttctgcaatg 155  Q
    | ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  44881273 gctgcttcattcttccagtcttctgcaatg 44881302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 26 - 217
Target Start/End: Original strand, 19115089 - 19115279
Alignment:
Q  26 gagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaatcctttcaaaatagtt 125  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| || | ||| ||| |  |||||| || ||||| |||| |   || |||||    
T  19115089 gagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtcctttttcaacactctccaacgaataggcatccactggcttcacatccatctgaattagtt 19115188  T
Q  126 gttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatctcctgatga 217  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||   ||| | ||||||||| | ||||||||| |||||||||| || |||| || || |||||||    
T  19115189 gttgcttcattcttccagtcttctgcaat-agtaggcgagattaaattctttgaacaacctttgaagcttcaattctttcagcttctgatga 19115279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 10 - 152
Target Start/End: Complemental strand, 23184414 - 23184276
Alignment:
Q  10 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaa 109  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||| | ||||||||||||||||    
T  23184414 agcagagacacaaactgagtagaggaggtagtggttctacacttcgtacaattgtactttgtcaacgc--ttcagagaacaga-atccaatgccttcaaa 23184318  T
Q  110 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgca 152  Q
    | | ||  || |||| | |||||||||||||  ||||||||||    
T  23184317 ttcatttgaattagtcg-tgcttcactcttctggtcttctgca 23184276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #49
Raw Score: 62; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 27 - 191
Target Start/End: Original strand, 22272139 - 22272303
Alignment:
Q  27 agtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaa-catccaatgccttcaaatcctttcaaaatagtt 125  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | |||| ||||| || | ||| ||| ||| |||||||||||||||||||| ||  || ||||     
T  22272139 agtagtggagatagtggttgtacacttcttacaattttcctttttcaactctctccaacgaaaaaagcatccaatgccttcaaatccatttgaattagtc 22272238  T
Q  126 gttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaa 191  Q
     |||||||| ||||||||||||||||||||  |||||  |||||||||  ||||||||| ||||||    
T  22272239 attgcttcattcttccagtcttctgcaatg-atagacgtgattaaatcatttgaacaacctttgaa 22272303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #50
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 10 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 28551028 - 28550893
Alignment:
Q  10 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaa 109  Q
    |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||| ||  ||||| || |||||||||            
T  28551028 agcagagacaaaaacagagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatg-------- 28550937  T
Q  110 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaat 154  Q
     |||||||||||||||||| ||  ||| |||||||||||||||||    
T  28550936 -cctttcaaaatagttgtttctatacttttccagtcttctgcaat 28550893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #51
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 10 - 105
Target Start/End: Original strand, 44840424 - 44840519
Alignment:
Q  10 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgcctt 105  Q
    |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||| ||  ||||| || |||||||||||||    
T  44840424 agcagagacaaaaacagagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgcctt 44840519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #52
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 10 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 31968153 - 31968018
Alignment:
Q  10 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaa 109  Q
    |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| | |||||||||| ||  ||||| || |||||||||            
T  31968153 agcagagacaaaaacagagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaaacgtattatgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatg-------- 31968062  T
Q  110 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaat 154  Q
     | |||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||    
T  31968061 -catttcaaaatagttgttgctatacttttccagtcttctgcaat 31968018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #53
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 10 - 105
Target Start/End: Complemental strand, 22776398 - 22776303
Alignment:
Q  10 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgcctt 105  Q
    |||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||| ||  ||||| || |||||||||||||    
T  22776398 agcagagacaaaaacagagtactggagatagtggttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgcctt 22776303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #54
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 10 - 105
Target Start/End: Complemental strand, 22781776 - 22781681
Alignment:
Q  10 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgcctt 105  Q
    |||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||| ||  ||||| || |||||||||||||    
T  22781776 agcagagacaaaaacagagtactggagatagtggttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgcctt 22781681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #55
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 10 - 105
Target Start/End: Complemental strand, 1587142 - 1587048
Alignment:
Q  10 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgcctt 105  Q
    |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||| ||  |||||  | |||||||||||||    
T  1587142 agcagagaca-aaacagagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaattagcatccaatgcctt 1587048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #56
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 10 - 105
Target Start/End: Original strand, 14581505 - 14581600
Alignment:
Q  10 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgcctt 105  Q
    |||||||||| || | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||| ||  ||||| || |||||||||||||    
T  14581505 agcagagacaaaatcagagaagtggagatagtggttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgcctt 14581600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #57
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 26 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 18431034 - 18430844
Alignment:
Q  26 gagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaatcctttcaaaatagtt 125  Q
    ||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||  |||  ||||| | | ||||||| || ||| |||||||||||||| ||||  || |||      
T  18431034 gagtagtggaggtcgtggttgtacacttcgtactattgtcgttttccaacgttttccaaagaataagcattcaatgccttcaaattcttttgaattagcc 18430935  T
Q  126 gttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatctcctgatga 217  Q
    |||||||||  |||| ||||||||||||||  ||| |  ||||||| |  ||||||||| ||||||||||||| |||| || || |||||||    
T  18430934 gttgcttcatgcttctagtcttctgcaatg-ataggcgtgattaaaacatttgaacaacctttgaagctttaattctttcagcttctgatga 18430844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #58
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 10 - 105
Target Start/End: Original strand, 40332077 - 40332172
Alignment:
Q  10 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgcctt 105  Q
    |||||||||| |||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||| ||  ||||| || |||||||||||||    
T  40332077 agcagagacaaaaacagagtaatggagttagtggttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgcctt 40332172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #59
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 27 - 106
Target Start/End: Original strand, 3277037 - 3277116
Alignment:
Q  27 agtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttc 106  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| | |||||||| ||  ||||| || ||||||||||||||    
T  3277037 agtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaaacgtactatatcaacgctctttgaagaataagcatccaatgccttc 3277116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #60
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 10 - 50
Target Start/End: Original strand, 22258191 - 22258231
Alignment:
Q  10 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtaca 50  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22258191 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtaca 22258231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #61
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 26 - 217
Target Start/End: Original strand, 18702744 - 18702934
Alignment:
Q  26 gagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaatcctttcaaaatagtt 125  Q
    |||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||| ||||  ||||| | | ||||||  || |||| ||||||||||||| ||||  || |||      
T  18702744 gagtagtggagatagttgttgcatacttcgtacaattgtccttttccaacgttctccaaagagtaagcatctaatgccttcaaattcttttgaattagcc 18702843  T
Q  126 gttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatctcctgatga 217  Q
    ||| |||||  |||| ||||||||| ||||  |||||  ||||||| |  ||||||||| |||||||||| || |||| || || |||||||    
T  18702844 gttacttcatgcttctagtcttctgtaatg-atagacgtgattaaaacatttgaacaacctttgaagcttcaattctttcagcttctgatga 18702934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #62
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 26 - 105
Target Start/End: Complemental strand, 22785749 - 22785670
Alignment:
Q  26 gagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgcctt 105  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||  ||||| |||||||||| ||  ||||| || |||||||||||||    
T  22785749 gagtagtggagatagtggttatacactttgtacaaaagtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgcctt 22785670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #63
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 15 - 53
Target Start/End: Complemental strand, 19498048 - 19498010
Alignment:
Q  15 agacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacactt 53  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  19498048 agacacaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 19498010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #64
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 179 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 22776239 - 22776197
Alignment:
Q  179 aacaacatttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaactaca 223  Q
    |||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  22776239 aacaacttttgaagctttaagt--tgcatctcctgatgaactaca 22776197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #65
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 179 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 22781617 - 22781575
Alignment:
Q  179 aacaacatttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaactaca 223  Q
    |||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  22781617 aacaacttttgaagctttaagt--tgcatctcctgatgaactaca 22781575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #66
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 38 - 78
Target Start/End: Complemental strand, 23392750 - 23392710
Alignment:
Q  38 tagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgct 78  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||    
T  23392750 tagtggttgtacacttcgtacagttgtactaggtcaacgct 23392710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #67
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 26 - 58
Target Start/End: Complemental strand, 24814677 - 24814645
Alignment:
Q  26 gagtagtggagatagtggttgtacacttcgtac 58  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  24814677 gagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtac 24814645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 180; Significance: 2e-97; HSPs: 60)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 180; E-Value: 2e-97
Query Start/End: Original strand, 10 - 225
Target Start/End: Original strand, 39693523 - 39693738
Alignment:
Q  10 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaa 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  39693523 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatccaatgctttcaaa 39693622  T
Q  110 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatct 209  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  39693623 tcctttcaaaatagtcattgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacgagattgaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatct 39693722  T
Q  210 cctgatgaactacaac 225  Q
    |||||||| |||||||    
T  39693723 cctgatgagctacaac 39693738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 177; E-Value: 1e-95
Query Start/End: Original strand, 13 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 12757923 - 12757715
Alignment:
Q  13 agagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaatcc 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  12757923 agagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatccaatgccttcaaatcc 12757824  T
Q  113 tttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatctcct 212  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||| ||| |||||||||||||||||||    
T  12757823 tttcaaaatagttgttgcttcactctttcagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacatcctttaaagttttaagtcttgcatctcct 12757724  T
Q  213 gatgaacta 221  Q
    |||||||||    
T  12757723 gatgaacta 12757715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 168; E-Value: 3e-90
Query Start/End: Original strand, 10 - 221
Target Start/End: Original strand, 16207294 - 16207505
Alignment:
Q  10 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaa 109  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||| |||||||||||||||||    
T  16207294 agcagagacaaaaacagagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaacaagcatccaatgccttcaaa 16207393  T
Q  110 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatct 209  Q
    ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  16207394 tcctttcaaaatagtagttgctttactcttccagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacagcgtttgaagctttaagtcttgcatct 16207493  T
Q  210 cctgatgaacta 221  Q
    ||||||||||||    
T  16207494 cctgatgaacta 16207505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 168; E-Value: 3e-90
Query Start/End: Original strand, 10 - 225
Target Start/End: Original strand, 19156184 - 19156399
Alignment:
Q  10 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaa 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  19156184 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacatttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatccaatgccttcaaa 19156283  T
Q  110 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatct 209  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||    
T  19156284 tcctttcaaattagtcgttgcttcactcttctagtcttctgcaatgcatagacgagattaaatccattgaacagcctttgaagctttaattcttgcatct 19156383  T
Q  210 cctgatgaactacaac 225  Q
    | ||||||||||||||    
T  19156384 cttgatgaactacaac 19156399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 164; E-Value: 8e-88
Query Start/End: Original strand, 10 - 225
Target Start/End: Original strand, 17914447 - 17914662
Alignment:
Q  10 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaa 109  Q
    |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  17914447 agcagagaaacaaattgagtagtggagatagtggttatacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatctaatgccttcaaa 17914546  T
Q  110 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatct 209  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||    
T  17914547 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttacagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacttttgaagctttaactcttgcaact 17914646  T
Q  210 cctgatgaactacaac 225  Q
    ||| |||| |||||||    
T  17914647 cctaatgagctacaac 17914662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 163; E-Value: 3e-87
Query Start/End: Original strand, 10 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 602883 - 602673
Alignment:
Q  10 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaa 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  602883 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatccaatgctttcaaa 602784  T
Q  110 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatct 209  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||| |    
T  602783 tcctttcaaaatagtcattgcttcactcttcaagtcttctgcaatgcttagacgagattgaatccaatgaacaacctttgaagttttaagtcttgcattt 602684  T
Q  210 cctgatgaact 220  Q
    |||||||||||    
T  602683 cctgatgaact 602673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 160; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 13 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 17525889 - 17525678
Alignment:
Q  13 agagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaatcc 112  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  17525889 agagacacaaactgagtagtgaagatagtggttgtacactttgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatccaatgctttcaaatcc 17525790  T
Q  113 tttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaa-catttgaagctttaagtcttgcatctcc 211  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||    
T  17525789 tttcaaaatagttgttgtttcactcttccagtcttctgcagtgcttagacgatattaaatccattgaacaaccttttgaagatttaagtcttgcatctcc 17525690  T
Q  212 tgatgaactaca 223  Q
    ||||||||||||    
T  17525689 tgatgaactaca 17525678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 159; E-Value: 8e-85
Query Start/End: Original strand, 10 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 16681466 - 16681256
Alignment:
Q  10 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaa 109  Q
    ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  16681466 agcagagacacaaactgagtactagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactatgtcaacgctcttcaaagaacaagcatctaatgccttcaaa 16681367  T
Q  110 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatct 209  Q
    |||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||    
T  16681366 tcctttcaaactagacgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacagcctttgaagctctaagtcttgcatct 16681267  T
Q  210 cctgatgaact 220  Q
    |||||||||||    
T  16681266 cctgatgaact 16681256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 155; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 10 - 220
Target Start/End: Original strand, 16188972 - 16189182
Alignment:
Q  10 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaa 109  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||| || |||||||||||||||||    
T  16188972 agcagagacacatactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttagaagaataagcatccaatgccttcaaa 16189071  T
Q  110 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatct 209  Q
    || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  16189072 tcatttcaaaatagtcgttgcttcactcttccagtcttctgcaatggttggacgagattaaatccattaaacaacctttgaagctttaagtcttgcatct 16189171  T
Q  210 cctgatgaact 220  Q
    ||| |||||||    
T  16189172 cctaatgaact 16189182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 152; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 13 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 18321319 - 18321112
Alignment:
Q  13 agagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaatcc 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  18321319 agagacacaaactgagtagtggagataatggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgcccttcaaagaacaagcatccaatgccctcaaatcc 18321220  T
Q  113 tttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatctcct 212  Q
    ||| ||||||| |||||||||||||||   ||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  18321219 tttgaaaatagctgttgcttcactcttttggtctcatgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcct 18321120  T
Q  213 gatgaact 220  Q
    ||||||||    
T  18321119 gatgaact 18321112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 152; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 10 - 221
Target Start/End: Original strand, 24646326 - 24646537
Alignment:
Q  10 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaa 109  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| || |||||||||||| ||||    
T  24646326 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacactcttcaaagaataagcatccaatgcctgcaaa 24646425  T
Q  110 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatct 209  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||||||  |||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  24646426 tcctttcaaaatagctgttgctacactcttttagtcttatgcaatgcttagacgagattaaatcaattgaacaacctttgaagctttaactcttgcatct 24646525  T
Q  210 cctgatgaacta 221  Q
    | ||||||||||    
T  24646526 cttgatgaacta 24646537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 152; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 10 - 225
Target Start/End: Original strand, 29693303 - 29693518
Alignment:
Q  10 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaa 109  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||| |||||| ||||||    
T  29693303 agcagagacacaaactgagtagtggagataatggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaaagctcttcaaagaacaagcatacaatgctttcaaa 29693402  T
Q  110 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatct 209  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||   |||| |||||||||||||||||||    
T  29693403 tcctttcaaaatagtggttgcttcactctttcagtcttctgcaatgcttagacgagattaaattcattaaacagtctttggagctttaagtcttgcatct 29693502  T
Q  210 cctgatgaactacaac 225  Q
    ||| ||||||||||||    
T  29693503 cctaatgaactacaac 29693518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 151; E-Value: 5e-80
Query Start/End: Original strand, 38 - 220
Target Start/End: Original strand, 33082873 - 33083055
Alignment:
Q  38 tagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaatcctttcaaaatagttgttgcttcactc 137  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  33082873 tagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatccaatgccttcaaatcctttcaaaatagtcgttgcttcactc 33082972  T
Q  138 ttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaact 220  Q
    |||   ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33082973 ttctgatcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaact 33083055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 149; E-Value: 7e-79
Query Start/End: Original strand, 13 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 17441967 - 17441760
Alignment:
Q  13 agagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaatcc 112  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||| |||||||||    
T  17441967 agagacacaaaatgagtagtggagatagtggttgtacacttagtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaataagcatccaatgc-ttcaaatcc 17441869  T
Q  113 tttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatctcct 212  Q
    |||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  17441868 tttcaaaatagtcgttgctttagtcttccagtcttctgcaatgcttagaggagattaagtccattgaacaacctttaaagctttaagtcttgcatctcct 17441769  T
Q  213 gatgaacta 221  Q
    |||||||||    
T  17441768 gatgaacta 17441760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 146; E-Value: 5e-77
Query Start/End: Original strand, 21 - 220
Target Start/End: Original strand, 19943234 - 19943435
Alignment:
Q  21 aaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaag-aacaaacatccaatgccttcaaatcctttcaaa 119  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  19943234 aaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaattttactttgtcaacgctttttaaaggaacaagcatccaatgccttcaaatcctttcaaa 19943333  T
Q  120 atagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaaca-acatttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaa 218  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |  | |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19943334 atagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaatagccttttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaa 19943433  T
Q  219 ct 220  Q
    ||    
T  19943434 ct 19943435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 10 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 23185389 - 23185181
Alignment:
Q  10 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaa 109  Q
    |||||||||| |||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||| || |||||||||||||||||    
T  23185389 agcagagacaaaaacagagcagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgccttcaaa 23185290  T
Q  110 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatct 209  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||  | ||||||||    
T  23185289 tcctttcaaactagtcgttgcttcacttttccagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagcttta--tgttgcatct 23185192  T
Q  210 cctgatgaact 220  Q
    |||||||||||    
T  23185191 cctgatgaact 23185181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 10 - 218
Target Start/End: Original strand, 21932871 - 21933079
Alignment:
Q  10 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaa 109  Q
    |||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||  || ||||| ||| ||||||||| |||    
T  21932871 agcagagacaaacactgagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaattttactttgtcaacgctctttgaaaaacaagcatacaatgcctttaaa 21932970  T
Q  110 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatct 209  Q
    ||||||||||||||  |||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  21932971 tcctttcaaaatagccgttgtttcactctttcagtcttatgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatct 21933070  T
Q  210 cctgatgaa 218  Q
    |||||||||    
T  21933071 cctgatgaa 21933079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 10 - 220
Target Start/End: Original strand, 17701733 - 17701943
Alignment:
Q  10 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaa 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||| || || |||  | |||||||||||||||||    
T  17701733 agcagagacacaaactgagtagtggaggtagtggttgtaaacttcgtacaattatactttgccaacgctcttaaaggaattagcatccaatgccttcaaa 17701832  T
Q  110 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatct 209  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||  |||||    
T  17701833 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttctgatcttctgcaatgcttagacgagattaaattcattgaacaacctttgaagctttaagtctctcatct 17701932  T
Q  210 cctgatgaact 220  Q
     ||||||||||    
T  17701933 tctgatgaact 17701943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 134; E-Value: 7e-70
Query Start/End: Original strand, 9 - 218
Target Start/End: Original strand, 18679802 - 18680011
Alignment:
Q  9 aagcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaa 108  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||    
T  18679802 aagcagagacacaaactgagtagtagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactatgtcaacgctcttcaaagaacaagcatccaatgctttcaa 18679901  T
Q  109 atcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatc 208  Q
    ||||| |||||||||| ||||||| |||| ||  ||||| |||||||||||||| ||||| |||||| ||||| || ||||||||| |||||||||||||    
T  18679902 atcctatcaaaatagtcgttgctttactcctctggtcttttgcaatgcttagacgagattgaatccactgaactacctttgaagctctaagtcttgcatc 18680001  T
Q  209 tcctgatgaa 218  Q
    | ||||||||    
T  18680002 ttctgatgaa 18680011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 134; E-Value: 7e-70
Query Start/End: Original strand, 11 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 20382556 - 20382347
Alignment:
Q  11 gcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaat 110  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| | | |||||||    
T  20382556 gcagagacacaaactgattagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactatgtcaacgctcttcaaagaacaaacatccactactttcaaat 20382457  T
Q  111 cctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatctc 210  Q
    ||||||| |||||  |||||||||||| || |||||| |||||||| | ||| ||||| ||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||    
T  20382456 cctttcagaatagccgttgcttcactcctctagtcttttgcaatgcatggacgagattgaatccattgaacagcctttgaagctttaagacttgcatctc 20382357  T
Q  211 ctgatgaact 220  Q
    ||||||||||    
T  20382356 ctgatgaact 20382347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 11 - 220
Target Start/End: Original strand, 17267463 - 17267671
Alignment:
Q  11 gcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaat 110  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||| |||| ||||| |||||||    
T  17267463 gcagagacaaaaactgagtagtggagatagtggttgtacaattcgtacaattgtactatgtcaatgctcttcaaagaacaagcatctaatgctttcaaat 17267562  T
Q  111 cctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatctc 210  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| | | ||||| |||||||||| ||| ||||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  17267563 cctttcaaaatagctgttgcttcactcctgcggtcttttgcaatgcttggacgagattgaa-ccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctc 17267661  T
Q  211 ctgatgaact 220  Q
     |||||||||    
T  17267662 ttgatgaact 17267671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 10 - 220
Target Start/End: Original strand, 18718989 - 18719199
Alignment:
Q  10 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaa 109  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  18718989 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactatgacaacgctcttcaaagaacaagcatccaatgctttcaaa 18719088  T
Q  110 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatct 209  Q
    |||| |||||||||| |||||||||||| ||  ||||| ||||||||||  || ||||| |||||| |||||| | ||||||||| ||||||||||||||    
T  18719089 tcctatcaaaatagtcgttgcttcactcctctggtcttttgcaatgcttgaacgagattgaatccactgaacagcctttgaagctctaagtcttgcatct 18719188  T
Q  210 cctgatgaact 220  Q
     |||| |||||    
T  18719189 tctgaagaact 18719199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 126; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 10 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 18121269 - 18121061
Alignment:
Q  10 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaa 109  Q
    |||||||||| |||| ||||||| ||| |||||||   |||||||||||||||||||||||| || ||| ||  |||||||| ||||||||||||| |||    
T  18121269 agcagagacagaaacagagtagttgaggtagtggt---acacttcgtacaattgtactttgttaatgctctttgaagaacaagcatccaatgcctttaaa 18121173  T
Q  110 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatct 209  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||| |||||||||||||||||    
T  18121172 tcctttcaaaatagcagttgcttcactcttctagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacagcctttgaaactttaagtcttgcatct 18121073  T
Q  210 cctgatgaacta 221  Q
    ||||||||||||    
T  18121072 cctgatgaacta 18121061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 28 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 23263757 - 23263564
Alignment:
Q  28 gtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaatcctttcaaaatagttgt 127  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |    
T  23263757 gtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaactgtactttgtcaacgctctttgaagaacaaacatccaatgccttcaaatcctttcaaaatagtcat 23263658  T
Q  128 tgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagct-ttaagtcttgcatctcctgatgaact 220  Q
    || |||||||||| ||||||||||| || |||||| |||||||||| |||||||||| ||||||| | |||||| |||||||||||||||||||    
T  23263657 tgtttcactcttctagtcttctgcattgtttagacgagattaaatctattgaacaacctttgaagttcttaagttttgcatctcctgatgaact 23263564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 10 - 217
Target Start/End: Original strand, 17797410 - 17797615
Alignment:
Q  10 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaa 109  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||| ||||||||||||||||     
T  17797410 agcagagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaacaagcatccaatgccttcaat 17797509  T
Q  110 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatct 209  Q
    |||||||||| |||  ||||| ||||| ||||||||||||| |||| |||||| ||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||  ||||||||    
T  17797510 tcctttcaaactagccgttgcatcacttttccagtcttctgtaatggttagacgagattgaatccattgaacaacttttgaggctttaag--ttgcatct 17797607  T
Q  210 cctgatga 217  Q
    ||||||||    
T  17797608 cctgatga 17797615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 118; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 11 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 30421591 - 30421383
Alignment:
Q  11 gcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattc--aaagaacaaacatccaatgccttcaa 108  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||   ||||||||| ||||||||||||||||    
T  30421591 gcagagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtaaacttcgtacaat-gtactttgtcaacgctctttgaaaagaacaagcatccaatgccttcaa 30421493  T
Q  109 atcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatc 208  Q
    |||| |||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||||  | |||||||    
T  30421492 atccattcaaactagtcgttgcttcacttttccagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacagcctttgaagcttta--tgttgcatc 30421395  T
Q  209 tcctgatgaact 220  Q
    | ||||||||||    
T  30421394 ttctgatgaact 30421383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 10 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 45538602 - 45538394
Alignment:
Q  10 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaa 109  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||  |||||||||||| ||  |||||||| ||||||||| |||||||    
T  45538602 agcagagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaaacgtgatttgtcaacgctctttgaagaacaagcatccaatgtcttcaaa 45538503  T
Q  110 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatct 209  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||| || || |||||||| |||||| |||||||| |||||  |||||||     
T  45538502 tcctttcaaaatagttgttgcttcacttttccagtcttctgcaatctttagacgaggttgaatccattaaacaacttttgaagccttaag--ttgcatcc 45538405  T
Q  210 cctgatgaact 220  Q
    | |||||||||    
T  45538404 catgatgaact 45538394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 107; E-Value: 9e-54
Query Start/End: Original strand, 10 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 15336251 - 15336040
Alignment:
Q  10 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaa 109  Q
    |||| ||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||  | ||| || |||||||||||||||||    
T  15336251 agcaaagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaaacgtactttgtcaacgctctttgacgaataagcatccaatgccttcaaa 15336152  T
Q  110 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatct 209  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| |  ||||||||||||||  |||||| || || | |||||| |||||| ||||||||||||||  ||||||||    
T  15336151 tcctttcaaaatagtcgttgcttcactttctcagtcttctgcaatctttagacgagtttgattccattaaacaacttttgaagctttaag--ttgcatct 15336054  T
Q  210 cctgatgaactaca 223  Q
    ||||||||||||||    
T  15336053 cctgatgaactaca 15336040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 107; E-Value: 9e-54
Query Start/End: Original strand, 10 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 15425316 - 15425105
Alignment:
Q  10 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaa 109  Q
    |||| ||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||  | ||| || |||||||||||||||||    
T  15425316 agcaaagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaaacgtactttgtcaacgctctttgacgaataagcatccaatgccttcaaa 15425217  T
Q  110 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatct 209  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| |  ||||||||||||||  |||||| || || | |||||| |||||| ||||||||||||||  ||||||||    
T  15425216 tcctttcaaaatagtcgttgcttcactttctcagtcttctgcaatctttagacgagtttgattccattaaacaacttttgaagctttaag--ttgcatct 15425119  T
Q  210 cctgatgaactaca 223  Q
    ||||||||||||||    
T  15425118 cctgatgaactaca 15425105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 107; E-Value: 9e-54
Query Start/End: Original strand, 10 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 15516620 - 15516409
Alignment:
Q  10 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaa 109  Q
    |||| ||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||  | ||| || |||||||||||||||||    
T  15516620 agcaaagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaaacgtactttgtcaacgctctttgacgaataagcatccaatgccttcaaa 15516521  T
Q  110 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatct 209  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| |  ||||||||||||||  |||||| || || | |||||| |||||| ||||||||||||||  ||||||||    
T  15516520 tcctttcaaaatagtcgttgcttcactttctcagtcttctgcaatctttagacgagtttgattccattaaacaacttttgaagctttaag--ttgcatct 15516423  T
Q  210 cctgatgaactaca 223  Q
    ||||||||||||||    
T  15516422 cctgatgaactaca 15516409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 101; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 10 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 40845550 - 40845342
Alignment:
Q  10 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaa 109  Q
    |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||  ||||| || |||||||||||||| ||    
T  40845550 agcagagacaaaaacagagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaatcgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgccttccaa 40845451  T
Q  110 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatct 209  Q
    ||||| ||||||||| ||||||  ||| |||||||||||||||||  |||||| || || ||||| || |||||| ||||||||||||||   |||||||    
T  40845450 tccttccaaaatagtcgttgctatacttttccagtcttctgcaatctttagacgagtttgaatcc-ttaaacaacttttgaagctttaag--ctgcatct 40845354  T
Q  210 cctgatgaacta 221  Q
    ||||||||||||    
T  40845353 cctgatgaacta 40845342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 99; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 10 - 200
Target Start/End: Original strand, 1237625 - 1237815
Alignment:
Q  10 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaa 109  Q
    ||||||||||  ||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||| ||  ||||||||| ||||||||||||||||    
T  1237625 agcagagacaacaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgcacaaaagtactttgtcaacgctctttgaagaacaaatatccaatgccttcaaa 1237724  T
Q  110 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagt 200  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||  |||||| || || |||||||| |||| | |||||||| ||||||    
T  1237725 tcctttcaaaatagtcgttgcttcacttttccggtcttctgcaatctttagacgaggttgaatccattaaacagcttttgaagccttaagt 1237815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 80 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 20255658 - 20255529
Alignment:
Q  80 ttcaaagaacaaacatccaatgccttcaaatcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattga 179  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  20255658 ttcaaagaacaagcatccaatgccttcaaatcctttcaaaatagtcgttgcttcacttttccagtcttctgtaatgcttagacgagattaaatccattga 20255559  T
Q  180 acaacatttgaagctttaagtcttgcatct 209  Q
    ||| | ||||| ||||||||||||||||||    
T  20255558 acagcctttgacgctttaagtcttgcatct 20255529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 97; E-Value: 8e-48
Query Start/End: Original strand, 13 - 220
Target Start/End: Original strand, 24551265 - 24551470
Alignment:
Q  13 agagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaatcc 112  Q
    ||||||| ||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||| ||| |||||| ||  |||||||| |||||||||||||||||||     
T  24551265 agagacaaaaacaaagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaaacgtactatgttaacgctctttgaagaacaagcatccaatgccttcaaatct 24551364  T
Q  113 tttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatctcct 212  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||  |||||| || || |||||||| |||||| |||||||| |||||  ||||||| | |    
T  24551365 tttcaaaatagtcgttgcttcacttttccagtcttctgcaatctttagacgaggttgaatccattaaacaacttttgaagccttaag--ttgcatcccat 24551462  T
Q  213 gatgaact 220  Q
    ||||||||    
T  24551463 gatgaact 24551470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 13 - 217
Target Start/End: Original strand, 19707497 - 19707700
Alignment:
Q  13 agagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaatcc 112  Q
    ||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||| |||||||||||||| |    
T  19707497 agagacacaaactgagtagaggatgtagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgttcttcaaagaacaaccattcaatgccttcaaattc 19707596  T
Q  113 tttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatctcct 212  Q
     ||  || |||  |||||||||||||||  ||||||||||||| ||||  | |||||| ||| ||||||| | ||||||||||||| |||| ||||| ||    
T  19707597 atttgaattagccgttgcttcactcttctggtcttctgcaatg-ttaggaatgattaagtcctttgaacagcctttgaagctttaattctttcatcttct 19707695  T
Q  213 gatga 217  Q
    |||||    
T  19707696 gatga 19707700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 10 - 196
Target Start/End: Original strand, 43644884 - 43645069
Alignment:
Q  10 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaa 109  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  43644884 agcagagacacaaaccgagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaattgtactttattaacgctcttcaaagaacaagcatccaatgccttcaaa 43644983  T
Q  110 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagcttt 196  Q
    | | ||  || |||  ||| |||||||||||  |||||||||||||| ||| |  |||||||||  ||||||||| |||||||||||    
T  43644984 ttcatttgaattagccgtttcttcactcttctggtcttctgcaatgc-taggcgtgattaaatcatttgaacaacctttgaagcttt 43645069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 21 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 18685549 - 18685353
Alignment:
Q  21 aaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaatcctttcaaaa 120  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| |||||| || || |||| ||||||||||||| |||||||||    
T  18685549 aaacagagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtagtttttcaacgctcttcaaaaaataagcatctaatgccttcaaattctttcaaaa 18685450  T
Q  121 tagttgttgcttcactcttccagtcttc-tgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatctcctgatga 217  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||| |||||||| |||||  ||||| |||| |||||||   |||||||| |||| ||||  |||| |||||||    
T  18685449 tagttgttgcttcactcttctggtcttcttgcaatgc-tagacgtgattatatcctttgaacagtctttgaagcattaactcttttatcttctgatga 18685353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 21 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 18722798 - 18722602
Alignment:
Q  21 aaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaatcctttcaaaa 120  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| |||||| || || |||| ||||||||||||| |||||||||    
T  18722798 aaacagagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtagtttttcaacgctcttcaaaaaataagcatctaatgccttcaaattctttcaaaa 18722699  T
Q  121 tagttgttgcttcactcttccagtcttc-tgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatctcctgatga 217  Q
    |||| |||||||||||||||  |||||| |||||||| ||| |  |||||||||| |||||||   |||||||| |||| |||| ||||| |||||||    
T  18722698 tagtcgttgcttcactcttcttgtcttcttgcaatgc-tagccgtgattaaatcctttgaacagtctttgaagcattaactctttcatcttctgatga 18722602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 21 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 18731143 - 18730947
Alignment:
Q  21 aaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaatcctttcaaaa 120  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| |||||| || || |||| ||||||||||||| |||||||||    
T  18731143 aaacagagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtagtttttcaacgctcttcaaaaaataagcatctaatgccttcaaattctttcaaaa 18731044  T
Q  121 tagttgttgcttcactcttccagtcttc-tgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatctcctgatga 217  Q
    |||| |||||||||||||||  |||||| |||||||| ||| |  |||||||||| |||||||   |||||||| |||| |||| ||||| |||||||    
T  18731043 tagtcgttgcttcactcttcttgtcttcttgcaatgc-tagccgtgattaaatcctttgaacagtctttgaagcattaactctttcatcttctgatga 18730947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 10 - 220
Target Start/End: Original strand, 9320557 - 9320766
Alignment:
Q  10 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattca-aagaacaaacatccaatgccttcaa 108  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||   ||||| || |||||||||| |||||    
T  9320557 agcagagaca-aaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaaatatactttgtcaacgctcttttgaagaataagcatccaatgcgttcaa 9320655  T
Q  109 atcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatcc-attgaacaacatttgaagctttaagtcttgcat 207  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||| || || ||||| ||| |||| | |||||||| |||||  ||||||    
T  9320656 atcctttcaaaataattgttgcttcacttttccagtcttctgcaatctttagacgaggttgaatccaattaaacagcttttgaagccttaag--ttgcat 9320753  T
Q  208 ctcctgatgaact 220  Q
    |  ||||||||||    
T  9320754 cctctgatgaact 9320766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 10 - 225
Target Start/End: Original strand, 22673766 - 22673979
Alignment:
Q  10 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaa 109  Q
    |||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||| ||  ||||| || ||||||||| |||| ||    
T  22673766 agcagagacaaaaacaaagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgtcttctaa 22673865  T
Q  110 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatct 209  Q
    ||||| |||||||| |||||||  ||| ||| |||||||||||||    |||| || || ||||| || |||||| ||||||||||||||  ||||||||    
T  22673866 tccttccaaaatagatgttgctatacttttctagtcttctgcaatctccagacgagtttgaatccgttaaacaacttttgaagctttaag--ttgcatct 22673963  T
Q  210 cctgatgaactacaac 225  Q
    || |||||||||||||    
T  22673964 ccggatgaactacaac 22673979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 10 - 221
Target Start/End: Original strand, 36105183 - 36105392
Alignment:
Q  10 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaa 109  Q
    |||||||||| |||| ||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||  ||||| | |||||||| ||  ||||| ||||||||||||||||||||    
T  36105183 agcagagacaaaaacagagcagtggaggtagtggttgtacactttgtacaaacgtactatatcaacgctctttgaagaataaacatccaatgccttcaaa 36105282  T
Q  110 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatct 209  Q
    ||||| ||||||||  |||| |  ||| ||||| |||||||||||  |||||| || || ||||| || |||| | ||||||||||||||  ||||||||    
T  36105283 tccttccaaaatagccgttgttatacttttccaatcttctgcaatctttagacgagtttgaatccgttaaacagcttttgaagctttaag--ttgcatct 36105380  T
Q  210 cctgatgaacta 221  Q
    ||||||||||||    
T  36105381 cctgatgaacta 36105392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 13 - 225
Target Start/End: Original strand, 22663107 - 22663317
Alignment:
Q  13 agagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaatcc 112  Q
    ||||||| |||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||| ||  ||||| || ||||||||| |||| ||||     
T  22663107 agagacaaaaatagagtagtggagatattggttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgtcttctaatct 22663206  T
Q  113 tttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatctcct 212  Q
    || ||||||||||||||||  | | |||||||||||||||||  | |||| || || ||||| || |||| | ||||||||||||||  |||||||||||    
T  22663207 ttccaaaatagttgttgctatatttttccagtcttctgcaatcttcagacgagtttgaatccgttaaacagcttttgaagctttaag--ttgcatctcct 22663304  T
Q  213 gatgaactacaac 225  Q
     ||||||||||||    
T  22663305 aatgaactacaac 22663317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 77; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 129 - 221
Target Start/End: Original strand, 22745594 - 22745686
Alignment:
Q  129 gcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaacta 221  Q
    ||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22745594 gcttcacacttccagtcttctacaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaacta 22745686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 28 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 22461783 - 22461617
Alignment:
Q  28 gtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaatcctttcaaaatagttgt 127  Q
    |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| |||| ||||| || | ||| ||| || |||||||||||||||||||| ||  || |||| ||    
T  22461783 gtagtggagatagtggttgtgcactccgtacaattgtcctttttcaactctctccaacgaataagcatccaatgccttcaaatccatttgaattagtcgt 22461684  T
Q  128 tgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctt 195  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||||||  ||  | ||||||||||| | ||||||| ||||||||||    
T  22461683 tgcttcattcttctagtcttctgcaatg-atatgctagattaaatccttcgaacaacctttgaagctt 22461617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 10 - 86
Target Start/End: Original strand, 25164058 - 25164134
Alignment:
Q  10 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaag 86  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| || |||||||    
T  25164058 agcagagacacaaattgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactatgacaacactcttcaaag 25164134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 10 - 220
Target Start/End: Original strand, 6407714 - 6407912
Alignment:
Q  10 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaa 109  Q
    |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||| |||||||||| ||  |||||  | ||||||||||||||       
T  6407714 agcagagacaaaaacagagtagtggagatagtggttgtacacttcgtagaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaattagcatccaatgccttc--- 6407810  T
Q  110 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatct 209  Q
          ||||||||  ||||    ||| ||||||||||||||||| ||||||| || || ||||| || |||| | ||||||||||||||  ||||||||    
T  6407811 ------caaaatagccgttgtaatacttttccagtcttctgcaat-cttagacgagtttgaatcctttaaacagcttttgaagctttaag--ttgcatct 6407901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 11 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 19956502 - 19956374
Alignment:
Q  11 gcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaat 110  Q
    ||||||||| |||| | ||| ||||| ||||||||||||| || |||||||||| |||| |||||||| ||||| ||| ||  |||||||||||||||||    
T  19956502 gcagagaca-aaacagggtattggaggtagtggttgtacaattagtacaattgtcctttttcaacgctcttcaatgaaaaagtatccaatgccttcaaat 19956404  T
Q  111 cctttcaaaatagttgttgcttcactcttc 140  Q
    |||||  || |||| |||||||||||||||    
T  19956403 cctttagaattagtcgttgcttcactcttc 19956374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 10 - 106
Target Start/End: Complemental strand, 14989614 - 14989518
Alignment:
Q  10 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttc 106  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||| |||||||||| ||  ||||| || ||||||||||||||    
T  14989614 agcagagacaaaaacagagtagtggagatagtggttgtacaattcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgccttc 14989518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 50; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 26 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 24833204 - 24833011
Alignment:
Q  26 gagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgct-attcaaagaacaaacatccaatgccttcaaatcctttcaaaatagt 124  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||  ||||  ||||||||||  ||  | |||||| |||||||||| ||||||||| |||||| |||     
T  24833204 gagtaatggaggtagtggttgtacacttcgtacaaacgtaccatgtcaacgctcttttgaggaacaagcatccaatgcgttcaaatcccttcaaagtagc 24833105  T
Q  125 tgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaat-ccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaact 220  Q
      |||||||||| || |||||||||||||| ||||||| || || ||| ||||| |||| | |||||||| |||||  |||||||  ||||||||||    
T  24833104 cattgcttcact-tttcagtcttctgcaatccttagacgaggttgaatcccattaaacagcttttgaagccttaag--ttgcatcctctgatgaact 24833011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #51
Raw Score: 49; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 10 - 106
Target Start/End: Complemental strand, 18151809 - 18151713
Alignment:
Q  10 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttc 106  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||| |||||| ||| ||  ||||| || ||||||||||||||    
T  18151809 agcagagacaaaaacagagtagtggagatagtggttgtacaattcgtacaaacgtactatgtcaatgctctttgaagaataagcatccaatgccttc 18151713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #52
Raw Score: 49; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 15 - 119
Target Start/End: Complemental strand, 45568059 - 45567955
Alignment:
Q  15 agacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaatcctt 114  Q
    ||||| |||| |||||||| || ||||||| ||||||||||||||   |||||||||||||||| ||  ||| | || ||||||||||||||||||||||    
T  45568059 agacataaacagagtagtgaaggtagtggtcgtacacttcgtacagaagtactttgtcaacgctctttgaaggataatcatccaatgccttcaaatcctt 45567960  T
Q  115 tcaaa 119  Q
    |||||    
T  45567959 tcaaa 45567955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #53
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 10 - 102
Target Start/End: Complemental strand, 13430791 - 13430699
Alignment:
Q  10 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgc 102  Q
    ||||| |||| |||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||| || ||  ||||| || ||||||||||    
T  13430791 agcagggacaaaaacagagtagtggaagtagtggttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacactctttgaagaataagcatccaatgc 13430699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #54
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 144 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 3598375 - 3598296
Alignment:
Q  144 tcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaactacaac 225  Q
    |||||||||||  |||||| || || ||||  || |||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  3598375 tcttctgcaatctttagacgagtttgaatctgttaaacaacttttgaagctttaagt--tgcatctcctgatgaactacaac 3598296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #55
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 21 - 56
Target Start/End: Original strand, 43639782 - 43639817
Alignment:
Q  21 aaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgt 56  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43639782 aaacagagtagtggagatagtggttgtacacttcgt 43639817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #56
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 15 - 53
Target Start/End: Complemental strand, 7018454 - 7018416
Alignment:
Q  15 agacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacactt 53  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  7018454 agacacaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 7018416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #57
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 15 - 53
Target Start/End: Complemental strand, 20259690 - 20259652
Alignment:
Q  15 agacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacactt 53  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  20259690 agacacaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 20259652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #58
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 15 - 53
Target Start/End: Complemental strand, 21046320 - 21046282
Alignment:
Q  15 agacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacactt 53  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  21046320 agacacaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt 21046282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #59
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 26 - 110
Target Start/End: Original strand, 18772624 - 18772707
Alignment:
Q  26 gagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaat 110  Q
    ||||||||||| || |||||||||| || |||| ||||| ||||  ||||| | | ||||||| || ||||||||||||||||||    
T  18772624 gagtagtggaggtaatggttgtacattt-gtactattgtccttttccaacgttctccaaagaataagcatccaatgccttcaaat 18772707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #60
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 26 - 78
Target Start/End: Original strand, 21301026 - 21301078
Alignment:
Q  26 gagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgct 78  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||| ||||||  ||||| ||||||||||    
T  21301026 gagtagtggaagtagtggttgtacactttgtacaaacgtactatgtcaacgct 21301078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0084 (Bit Score: 176; Significance: 6e-95; HSPs: 3)
Name: scaffold0084
Description:

Target: scaffold0084; HSP #1
Raw Score: 176; E-Value: 6e-95
Query Start/End: Original strand, 10 - 225
Target Start/End: Original strand, 49328 - 49543
Alignment:
Q  10 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaa 109  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  49328 agcagagacacaaactgagtagtggagatagttgttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatccaatgccttcaaa 49427  T
Q  110 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatct 209  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||    
T  49428 tcctttcaaaatagtagttgcttcactcttcaaatcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaaactttgaagctttaagacttgcatct 49527  T
Q  210 cctgatgaactacaac 225  Q
    ||||||||||||||||    
T  49528 cctgatgaactacaac 49543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0084; HSP #2
Raw Score: 175; E-Value: 2e-94
Query Start/End: Original strand, 10 - 224
Target Start/End: Original strand, 32481 - 32695
Alignment:
Q  10 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaa 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||| ||||||    
T  32481 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatcaaatgcattcaaa 32580  T
Q  110 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatct 209  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||    
T  32581 tcctttcaaaatagtcgttacttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacagtctttgaagctttaagtcttgcatct 32680  T
Q  210 cctgatgaactacaa 224  Q
    |||||||||||||||    
T  32681 cctgatgaactacaa 32695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0084; HSP #3
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 15 - 119
Target Start/End: Complemental strand, 455 - 351
Alignment:
Q  15 agacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaatcctt 114  Q
    ||||| |||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||   |||||||||||||||| ||  ||| | || ||||||||||||||||||||||    
T  455 agacataaacagagtagtggaggtagtggtcgtacacttcgtacagacgtactttgtcaacgctctttgaaggataagcatccaatgccttcaaatcctt 356  T
Q  115 tcaaa 119  Q
    |||||    
T  355 tcaaa 351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0337 (Bit Score: 172; Significance: 1e-92; HSPs: 1)
Name: scaffold0337
Description:

Target: scaffold0337; HSP #1
Raw Score: 172; E-Value: 1e-92
Query Start/End: Original strand, 10 - 217
Target Start/End: Original strand, 14644 - 14851
Alignment:
Q  10 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaa 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  14644 agcagagacacaaactgagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtaaaattgtactttgtcaacgctcttcaaagtacaagcatccaatgccttcaaa 14743  T
Q  110 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatct 209  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |    
T  14744 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcattt 14843  T
Q  210 cctgatga 217  Q
    ||| ||||    
T  14844 cctaatga 14851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004 (Bit Score: 172; Significance: 1e-92; HSPs: 4)
Name: scaffold0004
Description:

Target: scaffold0004; HSP #1
Raw Score: 172; E-Value: 1e-92
Query Start/End: Original strand, 10 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 377674 - 377463
Alignment:
Q  10 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaa 109  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  377674 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttggtacaattgtactttgtcaatgctcttcaaagaacaagcatccaatgccttcaaa 377575  T
Q  110 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatct 209  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  377574 tcctttcaatatagtcgttgcttcactcttccggtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattcaacaacatttgaagttttaagtcttgcatct 377475  T
Q  210 cctgatgaacta 221  Q
    ||||||||||||    
T  377474 cctgatgaacta 377463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #2
Raw Score: 111; E-Value: 3e-56
Query Start/End: Original strand, 10 - 220
Target Start/End: Original strand, 220234 - 220443
Alignment:
Q  10 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaa 109  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||| |||||||    
T  220234 agcagaggcacaaactgagtagtggaggtagtggttatacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaataacaagcatccaatg-cttcaaa 220332  T
Q  110 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatct 209  Q
    | | ||  || |||  ||||||||||||| |  |||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||| | |||||||||||||||||  |||||    
T  220333 ttcatttgaattagccgttgcttcactctcctggtcttctgcaatgcttagacgagattaaaaccaatgaacagcctttgaagctttaagtctctcatct 220432  T
Q  210 cctgatgaact 220  Q
    |||||||||||    
T  220433 cctgatgaact 220443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #3
Raw Score: 87; E-Value: 7e-42
Query Start/End: Original strand, 19 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 244390 - 244256
Alignment:
Q  19 acaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaatcctttcaa 118  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||  |    
T  244390 acaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaattgtcctttttcaacgctcttcaaagaacaagcatccaatgtcttcaaatccttttga 244291  T
Q  119 aatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaa 153  Q
    | ||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  244290 attagttgttgcttcactcttctggtcttctgcaa 244256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #4
Raw Score: 79; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 10 - 223
Target Start/End: Original strand, 211394 - 211605
Alignment:
Q  10 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaa 109  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||| |||| |||||| |||||||||||  ||||| |||||||||| ||  ||||| || |||| ||||| || |||    
T  211394 agcagagacaaaaacagagtagtggaggtagtagttgtatacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatcaaatgcattaaaa 211493  T
Q  110 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatct 209  Q
    ||||| ||||||||| ||||||  ||| |||||||||||||||||  |||||| || || ||||| || |||||| ||||||||||||||   |||||||    
T  211494 tccttacaaaatagtcgttgctatacttttccagtcttctgcaatctttagacgagtttgaatccgttaaacaacttttgaagctttaag--ctgcatct 211591  T
Q  210 cctgatgaactaca 223  Q
    |||||||| |||||    
T  211592 cctgatgagctaca 211605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 170; Significance: 2e-91; HSPs: 46)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 170; E-Value: 2e-91
Query Start/End: Original strand, 10 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 6512573 - 6512361
Alignment:
Q  10 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaa 109  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |   |||||||||||||    
T  6512573 agcagagacacaaactgagtagtgaagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagc---caatgccttcaaa 6512477  T
Q  110 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatct 209  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  6512476 tcctttcaaaatagtcgttgcttcactcttccagtcttcagcaatgcttagacgagattaaatccactgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatct 6512377  T
Q  210 cctgatgaactacaac 225  Q
    ||||||||||||||||    
T  6512376 cctgatgaactacaac 6512361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 168; E-Value: 3e-90
Query Start/End: Original strand, 10 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 41566579 - 41566364
Alignment:
Q  10 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaa 109  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  41566579 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactatatcaacgctcttcaaagaataaacatccaatgccttcaaa 41566480  T
Q  110 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatct 209  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||    
T  41566479 tcctttcaaaatagacgttgcttcacttttctagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaatagcttttgaagctttaagtcttgcatct 41566380  T
Q  210 cctgatgaactacaac 225  Q
    ||||||||||||||||    
T  41566379 cctgatgaactacaac 41566364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 165; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 10 - 218
Target Start/End: Original strand, 17814960 - 17815168
Alignment:
Q  10 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaa 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||| ||||||    
T  17814960 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacactccgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatctaatgctttcaaa 17815059  T
Q  110 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatct 209  Q
    |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  17815060 tcctttcagaatagtcgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacagcctttgaagctttaagtcttgcatct 17815159  T
Q  210 cctgatgaa 218  Q
    | |||||||    
T  17815160 cttgatgaa 17815168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 160; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 10 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 89567 - 89352
Alignment:
Q  10 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaa 109  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||| ||| |||||| ||||||    
T  89567 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactatgtcaatgctcttcaaagaacaagcatgcaatgctttcaaa 89468  T
Q  110 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatct 209  Q
    | ||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  89467 ttctttcaaaatagtcgttgcttcactcttctggtcttctgcaattcttagacgagattaaatccattgaacaacttttgaagctttaagttttgcatct 89368  T
Q  210 cctgatgaactacaac 225  Q
    ||||||||||||||||    
T  89367 cctgatgaactacaac 89352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 159; E-Value: 8e-85
Query Start/End: Original strand, 10 - 220
Target Start/End: Original strand, 21910548 - 21910758
Alignment:
Q  10 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaa 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  21910548 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatccaatgccttcaaa 21910647  T
Q  110 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatct 209  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||| || ||||||||||| |||||||||| ||| |||| | ||||| ||||||||||||||||||    
T  21910648 tcctttcaaaataatcgttgcttcacttttccagtcttttgtaatgcttagacgagattaaatcaattcaacagcctttgacgctttaagtcttgcatct 21910747  T
Q  210 cctgatgaact 220  Q
    |||||||||||    
T  21910748 cctgatgaact 21910758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 159; E-Value: 8e-85
Query Start/End: Original strand, 10 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 23413119 - 23412909
Alignment:
Q  10 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaa 109  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||| |||||||||| ||||||    
T  23413119 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactatgtcaacgctcttcaaaaaacaagcatccaatgctttcaaa 23413020  T
Q  110 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatct 209  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||||  |||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  23413019 tcctttcaaaataatcgttgcttcactcttctggtcttctgcaatgcttggatgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatct 23412920  T
Q  210 cctgatgaact 220  Q
    |||||||||||    
T  23412919 cctgatgaact 23412909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 10 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 7745838 - 7745632
Alignment:
Q  10 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaa 109  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||| |||||||||||||||||    
T  7745838 agcagagacaaaaaccgagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaacaagcatccaatgccttcaaa 7745739  T
Q  110 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatct 209  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||   |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  7745738 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttctagtcttctccaatgcttggatgcgattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttacatct 7745639  T
Q  210 cctgatg 216  Q
    |||||||    
T  7745638 cctgatg 7745632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 10 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 21072385 - 21072176
Alignment:
Q  10 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaa 109  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  21072385 agcagagacacaaactgagtagtagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactatgtcaacgctcttcaaagaacaagcatccaatgctttcaaa 21072286  T
Q  110 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatct 209  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||  ||   |||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  21072285 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttctggtcttctgcaatgctgtga-gtgattaaatccatagaacaaccttttaagctttaagtcttgcatct 21072187  T
Q  210 cctgatgaact 220  Q
    |||||||||||    
T  21072186 cctgatgaact 21072176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 144; E-Value: 7e-76
Query Start/End: Original strand, 10 - 220
Target Start/End: Original strand, 20550887 - 20551097
Alignment:
Q  10 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaa 109  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||    
T  20550887 agcagagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaattgta-tttgtcaacgctctttaaagaacaagcatccaatgccttcaaa 20550985  T
Q  110 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaa-catttgaagctttaagtcttgcatc 208  Q
    || |||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  20550986 tcttttcaaaatagtcgttgcttcactcttctagttttctgcaatgcttagacgagattaaaaccattgaacaaccttttgaagctttaagtcttgcatc 20551085  T
Q  209 tcctgatgaact 220  Q
    ||||||||||||    
T  20551086 tcctgatgaact 20551097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 10 - 220
Target Start/End: Original strand, 33022656 - 33022864
Alignment:
Q  10 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaa 109  Q
    |||||||||| ||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  33022656 agcagagacaaaaacatagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaacaaacatccaatgccttcaaa 33022755  T
Q  110 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatct 209  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| | ||||||||||||  | ||||||||    
T  33022756 tcctttcaaactagtcgttgcttcacttttccagtcttctgcaatgcttagatgagattaaatccattgaacagcctttgaagcttta--tgttgcatct 33022853  T
Q  210 cctgatgaact 220  Q
    |||||||||||    
T  33022854 cctgatgaact 33022864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 136; E-Value: 4e-71
Query Start/End: Original strand, 10 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 19536446 - 19536235
Alignment:
Q  10 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaa 109  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  19536446 agcagagacacaaactaagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactatgtcaacgctcttcaaagaacaaacatccaatgctttcaaa 19536347  T
Q  110 tcctttcaaaatagttgttgcttcact-cttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatc 208  Q
    ||| ||||||| ||| ||||||||||| |||   ||||| |||||||||| ||| ||||| ||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||    
T  19536346 tccattcaaaaaagtcgttgcttcactccttttggtcttttgcaatgcttggacgagattgaatccattgaacagcccttgaagctttaagtcttgcatc 19536247  T
Q  209 tcctgatgaact 220  Q
    ||||||||||||    
T  19536246 tcctgatgaact 19536235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 10 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 13545657 - 13545454
Alignment:
Q  10 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaa 109  Q
    |||||||||| |||  ||||||||||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||  |||||||| |||||||||||||||||    
T  13545657 agcagagacaaaaatagagtagtggaggtggtggttgtacacttcgtacacttgtactttgtcaacgctctttgaagaacaagcatccaatgccttcaaa 13545558  T
Q  110 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatct 209  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||        |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  13545557 tcctttcaaagtagttgttgcttcact--------cttctgcaatgcttagacgagattaagtccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatct 13545466  T
Q  210 cctgatgaacta 221  Q
    ||||||||||||    
T  13545465 cctgatgaacta 13545454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 118; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 10 - 223
Target Start/End: Original strand, 26784346 - 26784559
Alignment:
Q  10 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaa 109  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| || |||||| | | | ||||    
T  26784346 agcagacacacaaactgagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaattgtactatgtcaacgctcttcaaagaataagcatccagttcttccaaa 26784445  T
Q  110 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatct 209  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||  ||  ||||| |||||||||| ||| ||||| ||||||||||||| | ||| ||||||||| ||||||||||    
T  26784446 tcctttcaaaatagtcgttgcttcactgctctggtcttttgcaatgcttggacgagattgaatccattgaacagcctttaaagctttaaatcttgcatct 26784545  T
Q  210 cctgatgaactaca 223  Q
    |||| |||||||||    
T  26784546 cctgctgaactaca 26784559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 109; E-Value: 5e-55
Query Start/End: Original strand, 10 - 225
Target Start/End: Original strand, 30742973 - 30743185
Alignment:
Q  10 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaa 109  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||  ||||| ||||||||||||||||||||    
T  30742973 agcagagaca-aaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaaacgtactttgtcaacgctctttgaagaataaacatccaatgccttcaaa 30743071  T
Q  110 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatct 209  Q
    ||||||||||||| | |||||||  |  |||||||||||||||||  |||||| || || |||||||| |||||| ||||||||||||||  ||||||||    
T  30743072 tcctttcaaaataatcgttgctttgcctttccagtcttctgcaatctttagacgagtttgaatccattaaacaacttttgaagctttaag--ttgcatct 30743169  T
Q  210 cctgatgaactacaac 225  Q
    ||||||||||| ||||    
T  30743170 cctgatgaactgcaac 30743185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 109; E-Value: 5e-55
Query Start/End: Original strand, 10 - 220
Target Start/End: Original strand, 31117869 - 31118078
Alignment:
Q  10 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaa 109  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||  |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| || ||  |||||||| |||||||||||||||||    
T  31117869 agcagagacaaaaacagagtagtggaagtagtggatgtacacttcgtacatttgtactttgtcaacactctttgaagaacaagcatccaatgccttcaaa 31117968  T
Q  110 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaa-catttgaagctttaagtcttgcatc 208  Q
    | |||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || |||||||| || ||||| | ||||||||||||  | |||||||    
T  31117969 ttctttcaaattagtcgttgcttcacttttccagtcttctgcaatgcttagacgagtttaaatccgttaaacaaccttttgaagcttta--tgttgcatc 31118066  T
Q  209 tcctgatgaact 220  Q
    ||||||||||||    
T  31118067 tcctgatgaact 31118078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 10 - 220
Target Start/End: Original strand, 4887014 - 4887222
Alignment:
Q  10 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaa 109  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||| ||  |||||||| |||||||||||||||||    
T  4887014 agcagagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacacacgtactttgtcaacgctctttgaagaacaagcatccaatgccttcaaa 4887113  T
Q  110 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatct 209  Q
    || |||||||||||| ||||||  ||| |||||||||| ||||||  | ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||| |    
T  4887114 tcttttcaaaatagtcgttgctatacttttccagtcttttgcaatcttaagacaagtttaaatccattgaacaacttttgaagctttaag--ttgcatat 4887211  T
Q  210 cctgatgaact 220  Q
    | |||||||||    
T  4887212 cttgatgaact 4887222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 10 - 223
Target Start/End: Original strand, 42243673 - 42243884
Alignment:
Q  10 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaag-aacaaacatccaatgccttcaa 108  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||| ||  ||| |||||||||| |||| ||||||    
T  42243673 agcagagaca-aaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaaacgtattttgtcaacgctcttttaaggaacaaacatcaaatgtcttcaa 42243771  T
Q  109 atcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatc 208  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||| || || ||||| || |||| | ||||||||||||||  |||||||    
T  42243772 atcctttcaaaatagttgttgcttcacttttccagtcttctgcaatttttagacgagtttgaatccgttaaacagcttttgaagctttaag--ttgcatc 42243869  T
Q  209 tcctgatgaactaca 223  Q
    |||||||||||||||    
T  42243870 tcctgatgaactaca 42243884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 10 - 223
Target Start/End: Original strand, 11993880 - 11994091
Alignment:
Q  10 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaa 109  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||| ||  |||||||| |||||||||| ||||||    
T  11993880 agcagagacaaaaacagagtagtggaagtagtggttgtacacttcgtacatacgtactttgtcaacgctctttgaagaacaagcatccaatgctttcaaa 11993979  T
Q  110 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatct 209  Q
    ||| |||||| |||  ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| || || ||||| ||||||| | |||||| |||||||  ||||||||    
T  11993980 tcccttcaaattagccgttgcttcactattccagtcttctgcaatccttagacgagtttgaatccgttgaacatcttttgaaactttaag--ttgcatct 11994077  T
Q  210 cctgatgaactaca 223  Q
    ||||||||||||||    
T  11994078 cctgatgaactaca 11994091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 10 - 202
Target Start/End: Original strand, 6499231 - 6499423
Alignment:
Q  10 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaa 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | ||| ||||| ||||||||||     
T  6499231 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaaaagcaagcatccgatgccttcaac 6499330  T
Q  110 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaa-catttgaagctttaagtct 202  Q
    | | ||  |||||| |||||||||||||| |  |||||||||||| | | |    ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  6499331 ttcatttgaaatagatgttgcttcactctcctggtcttctgcaatac-tgggtgtgattaaatccattgaacaaccttttgaagctttaagtct 6499423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 10 - 225
Target Start/End: Original strand, 15516962 - 15517174
Alignment:
Q  10 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaa 109  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||| || |||| || ||  ||||| || |||||||||||||||||    
T  15516962 agcagagaca-aaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaaaagtactatgccaacactctttgaagaataagcatccaatgccttcaaa 15517060  T
Q  110 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatct 209  Q
    ||||| ||||||||  ||||||  ||| |||||||||||||||||  |||||| || || ||||| ||||||||| ||||||||||||||  ||||||||    
T  15517061 tccttccaaaatagccgttgctatacttttccagtcttctgcaatctttagacgagtttgaatccgttgaacaacttttgaagctttaag--ttgcatct 15517158  T
Q  210 cctgatgaactacaac 225  Q
     |||||||||||||||    
T  15517159 tctgatgaactacaac 15517174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 10 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 29138551 - 29138340
Alignment:
Q  10 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaa 109  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| || ||||||| ||  ||||| || |||||||||||||| ||    
T  29138551 agcagagacacaaacagagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaaacgtactatgacaacgctctttgaagaataagcatccaatgccttctaa 29138452  T
Q  110 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatct 209  Q
    ||||| ||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||| ||||||| |  || ||||  || |||| | |||||| |||||||  ||||||||    
T  29138451 tccttccaaaatagttgttgctatact-ttccagtcttctgcaat-cttagacgattttgaatctgttaaacagcttttgaaactttaag--ttgcatct 29138356  T
Q  210 cctgatgaactacaac 225  Q
    ||||||||||||||||    
T  29138355 cctgatgaactacaac 29138340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 10 - 220
Target Start/End: Original strand, 23881059 - 23881268
Alignment:
Q  10 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaa 109  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| | ||| ||||||||||||||||     
T  23881059 agcagagacacaaactaagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgcactttgtcaacgctcttcaaaaagcaagcatccaatgccttcaac 23881158  T
Q  110 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaa-catttgaagctttaagtcttgcatc 208  Q
    | | ||  || |||| ||||||||||||| |  |||||||||||||| ||| |  ||||||||||||| ||||| | ||||||||||| |||||  ||||    
T  23881159 ttcatttgaattagtcgttgcttcactctcctggtcttctgcaatgc-taggcgtgattaaatccattaaacaaccttttgaagcttt-agtctctcatc 23881256  T
Q  209 tcctgatgaact 220  Q
    | ||||||||||    
T  23881257 ttctgatgaact 23881268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 87; E-Value: 7e-42
Query Start/End: Original strand, 10 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 21199148 - 21198940
Alignment:
Q  10 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaa 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| | |||||||||||||||||    
T  21199148 agcagagacacaaactgagtagtggaggtagtgattgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctttccaaagaacgagcatccaatgccttcaaa 21199049  T
Q  110 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatct 209  Q
    | | ||  || |||  ||||| ||| | |||  |||||||||| | | ||| |  |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||  |||||    
T  21199048 ttcatttgaattagccgttgc-tcatttttctggtcttctgcagtac-taggcgtgattaaatcctttgaacaacctttgaagctttaagtctctcatct 21198951  T
Q  210 cctgatgaact 220  Q
     ||||||||||    
T  21198950 tctgatgaact 21198940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 10 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 642849 - 642643
Alignment:
Q  10 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaa 109  Q
    |||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||     
T  642849 agcagagacacaa---gagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaaaaacaagcatccaatgccttcaac 642753  T
Q  110 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatct 209  Q
    |   ||  || |||  |||| |||||||| |   ||||||| ||||| |||    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||    
T  642752 tttatttgaattagccgttgtttcactctcctgatcttctgtaatgc-taggtgtgattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtctctcatct 642654  T
Q  210 cctgatgaact 220  Q
     ||||||||||    
T  642653 tctgatgaact 642643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 10 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 12352940 - 12352768
Alignment:
Q  10 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaa 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||   ||| ||||||||||||| ||     
T  12352940 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaaatgcaagcatccaatgcctttaac 12352841  T
Q  110 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaaca 182  Q
    | | ||  || |||   ||||||||| || |   |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  12352840 ttcatttgaattagccattgcttcaccctcctgatcttctgcaatgcttagacaagatcaaatccaatgaaca 12352768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 10 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 21099849 - 21099640
Alignment:
Q  10 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaa 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||   ||| |||||||||||||||      
T  21099849 agcagagacacaaactgagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtaaacgttcttcaaaaggcaagcatccaatgccttcagc 21099750  T
Q  110 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatct 209  Q
    | | ||  || ||||||||||||||||||    ||||| || ||||| ||| || ||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||   ||||    
T  21099749 ttcatttgaattagttgttgcttcactctcttggtcttttgtaatgc-taggcatgattaaatccatttaacagcctttgaagctttaagtctctgatct 21099651  T
Q  210 cctgatgaact 220  Q
     ||||||||||    
T  21099650 tctgatgaact 21099640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 82; E-Value: 7e-39
Query Start/End: Original strand, 10 - 225
Target Start/End: Original strand, 33933259 - 33933476
Alignment:
Q  10 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgct-attcaaagaacaaacatccaatgccttcaa 108  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||| | ||||||||  ||  | |||||| |||||||||| || ||    
T  33933259 agcagagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaaacgtactatatcaacgctcttttgaggaacaagcatccaatgcgtttaa 33933358  T
Q  109 atcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaat-ccattgaacaac--atttgaagctttaagtcttgc 205  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||| || || ||| ||||| ||||||   ||||||||||||||  ||||    
T  33933359 atcctttcaaaatagttgttgcttcacttttccagtcttttgcaatccttagacgaggttgaatcccattaaacaacttttttgaagctttaag--ttgc 33933456  T
Q  206 atctcctgatgaactacaac 225  Q
    |||  |||||||||| ||||    
T  33933457 atcctctgatgaactgcaac 33933476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 11 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 25096969 - 25096777
Alignment:
Q  11 gcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgt---caacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttca 107  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| |   ||||||| || ||||||||| ||||||||| |||||    
T  25096969 gcagagaca-aaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaattgtccttttttttcaacgctctttaaagaacaagcatccaatgtcttca 25096871  T
Q  108 aatcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtct 202  Q
    ||||||||  || || | |||||||||||||||  ||||||||||||||| || |   ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  25096870 aatccttttgaattaatcgttgcttcactcttctggtcttctgcaatgct-aggcgtaattaaatcctttgaacaacctttgaagctttaagtct 25096777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 11 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 25154939 - 25154747
Alignment:
Q  11 gcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgt---caacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttca 107  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| |   ||||||| || ||||||||| ||||||||| |||||    
T  25154939 gcagagaca-aaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaattgtccttttttttcaacgctctttaaagaacaagcatccaatgtcttca 25154841  T
Q  108 aatcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtct 202  Q
    ||||||||  || || | |||||||||||||||  ||||||||||||||| || |   ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  25154840 aatccttttgaattaatcgttgcttcactcttctggtcttctgcaatgct-aggcgtaattaaatcctttgaacaacctttgaagctttaagtct 25154747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 10 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 14086684 - 14086474
Alignment:
Q  10 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgct-attcaaagaacaaacatccaatgccttcaa 108  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||  ||  | |||||| |||||||||| |||||    
T  14086684 agcagagacaaaaacagagtagtggaggtagcggttgtacacttcgtacaaacgtactttgtcaacgctcttttgaggaacaagcatccaatgcattcaa 14086585  T
Q  109 atcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaat-ccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcat 207  Q
    |||  ||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| || || ||| ||||| |||| | |||||||| |||||  ||||||    
T  14086584 atcacttcaaaatagccgttgcttcacttttccagtcttctgcaatccttagacgaggttgaatcccattaaacagcttttgaagccttaag--ttgcat 14086487  T
Q  208 ctcctgatgaact 220  Q
    |  ||||||||||    
T  14086486 cctctgatgaact 14086474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 77; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 26 - 225
Target Start/End: Original strand, 26759157 - 26759354
Alignment:
Q  26 gagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaatcctttcaaaatagtt 125  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||   |||| | ||| |||| ||  ||||| || |||||||||||||||||||||| |||||||||     
T  26759157 gagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaaacttactatttcagcgctctttgaagaataagcatccaatgccttcaaatccttccaaaatagtc 26759256  T
Q  126 gttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaactacaac 225  Q
    |||| |  ||| |||||||||||||||||  |||| | |  || ||||| || |||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  26759257 gttgttatacttttccagtcttctgcaatctttaggcgaatttgaatccgttaaacaacttttgaagctttaag--ttgcatctcctgatgaactacaac 26759354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 10 - 108
Target Start/End: Complemental strand, 9398879 - 9398781
Alignment:
Q  10 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaa 108  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |  || ||| ||||||||||||    
T  9398879 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttatacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaaaagtaagcattcaatgccttcaa 9398781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 13 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 3245583 - 3245379
Alignment:
Q  13 agagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaatcc 112  Q
    ||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||| ||  ||||| || |||| ||||||||  ||| |    
T  3245583 agagacaaaaacagagtactggagatagtggttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatcaaatgcctttcaattc 3245484  T
Q  113 tttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatctcct 212  Q
    |||||||||||  ||||||  ||| ||||||||||||||||| ||||||| || || ||||| |  ||||   || |||||||||||  |||||||||||    
T  3245483 tttcaaaatagccgttgctatacttttccagtcttctgcaat-cttagacgagtttgaatccttgaaacagttttggaagctttaag--ttgcatctcct 3245387  T
Q  213 gatgaact 220  Q
    ||||||||    
T  3245386 gatgaact 3245379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 66; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 21 - 154
Target Start/End: Original strand, 26765501 - 26765634
Alignment:
Q  21 aaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaatcctttcaaaa 120  Q
    |||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||  ||||| | ||| |||| ||  ||||| || |||||||||||||||||||||| |||||    
T  26765501 aaacagagtagtggaggcagtggttgtacacttcgtacaaacgtactatttcagcgctctttgaagaataagcatccaatgccttcaaatccttccaaaa 26765600  T
Q  121 tagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaat 154  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||||||||    
T  26765601 tagttgttgctatacttttccagtcttctgcaat 26765634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 60; E-Value: 9e-26
Query Start/End: Original strand, 10 - 149
Target Start/End: Original strand, 28139599 - 28139738
Alignment:
Q  10 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaa 109  Q
    |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||| |||||||||| |   ||||| || ||||||||| |||  ||    
T  28139599 agcagagacaaaaacagagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaaacatactatgtcaacgctctatgaagaataagcatccaatgtctttcaa 28139698  T
Q  110 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttct 149  Q
    ||||||||||||||| ||||||  ||| || |||||||||    
T  28139699 tcctttcaaaatagtcgttgctatactttttcagtcttct 28139738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 10 - 129
Target Start/End: Complemental strand, 30115982 - 30115863
Alignment:
Q  10 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaa 109  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||| |||||||||| ||  ||||| || |||| |||||| |  ||    
T  30115982 agcagagacaaaaacagagtagtggagatagtggttgtacatttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatcaaatgcccttcaa 30115883  T
Q  110 tcctttcaaaatagttgttg 129  Q
    ||||||||||||||| ||||    
T  30115882 tcctttcaaaatagtcgttg 30115863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 10 - 106
Target Start/End: Original strand, 9088961 - 9089057
Alignment:
Q  10 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttc 106  Q
    |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||| ||  |||||  | ||||||||||||||    
T  9088961 agcagagacaaaaacagagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaattagcatccaatgccttc 9089057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 15 - 131
Target Start/End: Original strand, 32160763 - 32160879
Alignment:
Q  15 agacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaatcctt 114  Q
    ||||| |||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||   || ||||||||||||| ||  ||| | || ||||||||||||||||||||||    
T  32160763 agacataaacagagtagtggaggtagtggtcgtacacttcgtacatacgttctttgtcaacgctctttgaaggataagcatccaatgccttcaaatcctt 32160862  T
Q  115 tcaaaatagttgttgct 131  Q
    ||||| ||| |||||||    
T  32160863 tcaaattagctgttgct 32160879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 49; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 13 - 105
Target Start/End: Complemental strand, 28464481 - 28464389
Alignment:
Q  13 agagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgcctt 105  Q
    ||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||| ||  ||||| || |||||||||||||    
T  28464481 agagacaaaaacagagtagtagagatagtggttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgcctt 28464389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 10 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 25930301 - 25930104
Alignment:
Q  10 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaa 109  Q
    |||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||  ||||| |||||||||| ||  || || || ||||||||||||||       
T  25930301 agcagagacaaaaacagagtagtagagatagtggttgtacaattcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaaaaataagcatccaatgccttc--- 25930205  T
Q  110 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatct 209  Q
           ||| |||  |||| |  ||| |||||||||| ||||||  |||||| || || ||||| || |||||| ||||||||||||||  ||||||||    
T  25930204 ------taaattagccgttgttatacttttccagtcttatgcaatctttagacgagtttgaatcctttaaacaacttttgaagctttaag--ttgcatct 25930113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 10 - 105
Target Start/End: Original strand, 10848765 - 10848860
Alignment:
Q  10 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgcctt 105  Q
    |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||| | |||||||||| ||  ||||| || |||| ||||||||    
T  10848765 agcagagacaaaaacagagtagtggagatagtggttgtacactttgtacaaacgtattatgtcaacgctctttgaagaataagcatctaatgcctt 10848860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 10 - 102
Target Start/End: Complemental strand, 35932151 - 35932059
Alignment:
Q  10 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgc 102  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||| || ||  ||||| || ||||||||||    
T  35932151 agcagagacaaaaacagagtagtggaagtagtggttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacactctttgaagaataagcatccaatgc 35932059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 15 - 130
Target Start/End: Complemental strand, 11208125 - 11208011
Alignment:
Q  15 agacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaatcctt 114  Q
    ||||| |||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||| || |||||||||||||||| ||  |||    | |||||||||| ||||||||  |    
T  11208125 agacaaaaacagagtagtggaggtagtggttatacacttcgtac-atagtactttgtcaacgctctttgaaggctgagcatccaatgcattcaaatctct 11208027  T
Q  115 tcaaaatagttgttgc 130  Q
    |||||||||| |||||    
T  11208026 tcaaaatagtcgttgc 11208011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 26 - 110
Target Start/End: Original strand, 16607520 - 16607603
Alignment:
Q  26 gagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaat 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||  ||||| | | ||||||| || | ||||||||||||||||    
T  16607520 gagtagtggagatagtggttgtacactt-gtactattgtccttttccaacgttctccaaagaataagcttccaatgccttcaaat 16607603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 120 - 220
Target Start/End: Original strand, 5429985 - 5430084
Alignment:
Q  120 atagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaat-ccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaa 218  Q
    |||| |||||||||||| || |||||||||||||| |||| || || || ||| ||||  |||| | |||||||| |||||  |||||||||||||||||    
T  5429985 atagctgttgcttcactttttcagtcttctgcaatccttaaacgaggttgaatcccataaaacagcttttgaagccttaag--ttgcatctcctgatgaa 5430082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 21 - 78
Target Start/End: Complemental strand, 23391737 - 23391680
Alignment:
Q  21 aaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgct 78  Q
    |||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||  | ||| ||||||||||    
T  23391737 aaacagagtagtgcagatagtgattgtacacttcgtacaaacgaactatgtcaacgct 23391680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 169; Significance: 9e-91; HSPs: 74)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 169; E-Value: 9e-91
Query Start/End: Original strand, 10 - 214
Target Start/End: Original strand, 2500030 - 2500234
Alignment:
Q  10 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaa 109  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||| | || |||||||||| ||||||    
T  2500030 agcagagacacaaactgagtagtggagaaagtggttgtacactttgtacaattgtactttgtcaactctcttcaaaggataagcatccaatgctttcaaa 2500129  T
Q  110 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatct 209  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2500130 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatct 2500229  T
Q  210 cctga 214  Q
    |||||    
T  2500230 cctga 2500234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 168; E-Value: 3e-90
Query Start/End: Original strand, 10 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 13138061 - 13137850
Alignment:
Q  10 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaa 109  Q
    |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  13138061 agcagagacataaactgagtaatggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatccaatgccttcaaa 13137962  T
Q  110 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatct 209  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  13137961 tcttttcaaaatagttgttgcttcactctttcagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgattaacctttgaagctttaagtcttgcatct 13137862  T
Q  210 cctgatgaacta 221  Q
    ||| ||||||||    
T  13137861 ccttatgaacta 13137850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 168; E-Value: 3e-90
Query Start/End: Original strand, 11 - 218
Target Start/End: Original strand, 15088513 - 15088720
Alignment:
Q  11 gcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaat 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  15088513 gcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttaaaagaacaagcatccaatgtcttcaaat 15088612  T
Q  111 cctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatctc 210  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||    
T  15088613 cctttcaaaatagtcgttgcttcactctttcagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacagcctttgaagctttacgtcttgcatctc 15088712  T
Q  211 ctgatgaa 218  Q
    ||||||||    
T  15088713 ctgatgaa 15088720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 166; E-Value: 5e-89
Query Start/End: Original strand, 10 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 10883339 - 10883126
Alignment:
Q  10 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaa 109  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||    
T  10883339 agcagagacgcaaactgagtagtggaggtagtgattgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaggcatccaatgccttcaaa 10883240  T
Q  110 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatct 209  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  10883239 tcctttcaaaatagtcgttgcttcactcttccagtcttctgaaatgattagacgagattaaatccattgaacaacctttgaaactttaagtcttgcatct 10883140  T
Q  210 cctgatgaactaca 223  Q
    ||||||||||||||    
T  10883139 cctgatgaactaca 10883126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 166; E-Value: 5e-89
Query Start/End: Original strand, 10 - 223
Target Start/End: Original strand, 13302802 - 13303015
Alignment:
Q  10 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaa 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  13302802 agcagagacacaaactgagtagtggtgatagtggttgtacactttgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatctaatgccttcaaa 13302901  T
Q  110 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatct 209  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  13302902 tcctttcaaaatagtcgttgcttcactcttctagtcttctacaatgcttagacgatattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatct 13303001  T
Q  210 cctgatgaactaca 223  Q
    ||| ||||||||||    
T  13303002 cctaatgaactaca 13303015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 160; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 10 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 16316723 - 16316508
Alignment:
Q  10 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaa 109  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  16316723 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactatttcaacgctcttcaaagaacaagcatccaatggcttcaaa 16316624  T
Q  110 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatct 209  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||     
T  16316623 tcctttcaaaatagctgttgcttcactcttctggtcttctgcaattcttagacgtgattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatcc 16316524  T
Q  210 cctgatgaactacaac 225  Q
    ||||||||||| ||||    
T  16316523 cctgatgaacttcaac 16316508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 160; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 10 - 220
Target Start/End: Original strand, 44467056 - 44467267
Alignment:
Q  10 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaa 109  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||| |||||||||||||||||    
T  44467056 agcagagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacactctttaaagaacaagcatccaatgccttcaaa 44467155  T
Q  110 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaa-catttgaagctttaagtcttgcatc 208  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  44467156 tcctttcaaaatagtcgttgcttcactcttctagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaaccttttgaagctttaagtcttgcatc 44467255  T
Q  209 tcctgatgaact 220  Q
    ||||||||||||    
T  44467256 tcctgatgaact 44467267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 158; E-Value: 3e-84
Query Start/End: Original strand, 10 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 2913774 - 2913561
Alignment:
Q  10 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaa 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  2913774 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatccaatgccttcaaa 2913675  T
Q  110 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatct 209  Q
    ||||||||||||||| |||||| |||| ||| ||||||||||| || |||||  ||||||||| ||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||    
T  2913674 tcctttcaaaatagtcgttgctccacttttctagtcttctgcattgtttagatgagattaaattcattgaacagcctttgaagatttaagtcttgcatct 2913575  T
Q  210 cctgatgaactaca 223  Q
    ||||||||||||||    
T  2913574 cctgatgaactaca 2913561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 13 - 225
Target Start/End: Original strand, 11319400 - 11319612
Alignment:
Q  13 agagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaatcc 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||| ||||  |||||||||| |||||||||    
T  11319400 agagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtgcaattgtaatttgtcaacgctcttcaaaaaacacgcatccaatgcattcaaatcc 11319499  T
Q  113 tttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatctcct 212  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| |||||||||||||| |    
T  11319500 tttcaaaatagttgttacttcactctttcagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacatcctttgaagcttgaagtcttgcatctctt 11319599  T
Q  213 gatgaactacaac 225  Q
    ||||| |||||||    
T  11319600 gatgacctacaac 11319612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 155; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 10 - 220
Target Start/End: Original strand, 21695393 - 21695603
Alignment:
Q  10 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaa 109  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  21695393 agcagagacacaaactgagtagttgaggtactggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatccaatgccttcaaa 21695492  T
Q  110 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatct 209  Q
    || |||  ||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  21695493 tcattttgaaatagtcgttgcttcactcttctggtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacttttgaagctttaagtcttgcatct 21695592  T
Q  210 cctgatgaact 220  Q
    | |||||||||    
T  21695593 cttgatgaact 21695603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 155; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 10 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 22578187 - 22577977
Alignment:
Q  10 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaa 109  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||| ||| |||||||||||||    
T  22578187 agcagagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttttaagaacaatcattcaatgccttcaaa 22578088  T
Q  110 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatct 209  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  22578087 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttacagtcttctgcaatgcttaaacgagattaaatctattgaacaccctttgaagctttaagtcttgcatct 22577988  T
Q  210 cctgatgaact 220  Q
    |||||||||||    
T  22577987 cctgatgaact 22577977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 152; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 10 - 221
Target Start/End: Original strand, 13880096 - 13880307
Alignment:
Q  10 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaa 109  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||| ||||||||||||    
T  13880096 agcagagacacaaagtgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaataagcatctaatgccttcaaa 13880195  T
Q  110 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatct 209  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| | |||||||||||| ||||||||  |    
T  13880196 tcctttcaaaatagtcgttgcttcactcgtcgagtcttctgcaatgcttagacgagattaagtccattgaacagcctttgaagctttatgtcttgcaatt 13880295  T
Q  210 cctgatgaacta 221  Q
    ||||||||||||    
T  13880296 cctgatgaacta 13880307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 152; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 13 - 220
Target Start/End: Original strand, 28409034 - 28409241
Alignment:
Q  13 agagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaatcc 112  Q
    ||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  28409034 agagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaacaaacatccaatgccttcaaatcc 28409133  T
Q  113 tttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatctcct 212  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||| |    
T  28409134 tttcaaaataattgttgcttcactcttctagtcttctgcaatgtttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagccttatgtcttgcatctctt 28409233  T
Q  213 gatgaact 220  Q
    ||||||||    
T  28409234 gatgaact 28409241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 151; E-Value: 5e-80
Query Start/End: Original strand, 10 - 220
Target Start/End: Original strand, 21692279 - 21692489
Alignment:
Q  10 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaa 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  21692279 agcagagacacaaactgagtagtggaggtagtggttgtacacttcatacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatccaatgccttcaaa 21692378  T
Q  110 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatct 209  Q
    ||||||||||| ||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||||  ||||||||  ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  21692379 tcctttcaaaacagtcgttgcttcactcttctggtcttctgcaatgcttagaagagattaaaatcattgaataacttttgaagctttaagtcttgcatct 21692478  T
Q  210 cctgatgaact 220  Q
    ||| |||||||    
T  21692479 cctaatgaact 21692489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 12 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 13730839 - 13730638
Alignment:
Q  12 cagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaatc 111  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  13730839 cagagacacaaactgagtagtggagataatggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatccaatgcattcaaatc 13730740  T
Q  112 ctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatctcc 211  Q
     |||||||||||  ||||||||||||||  |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  13730739 ttttcaaaatagccgttgcttcactcttttagtcttatgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagccttgcatctcc 13730640  T
Q  212 tg 213  Q
    ||    
T  13730639 tg 13730638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 149; E-Value: 7e-79
Query Start/End: Original strand, 13 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 21283536 - 21283324
Alignment:
Q  13 agagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaatcc 112  Q
    ||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  || ||||| ||||||||||||||||||||    
T  21283536 agagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaataacaagcatccaatgccttcaaatcc 21283437  T
Q  113 tttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatctcct 212  Q
    ||||||||| |  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  21283436 tttcaaaatggacgttgctttactcttccagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatatcct 21283337  T
Q  213 gatgaactacaac 225  Q
    |||||||| ||||    
T  21283336 gatgaacttcaac 21283324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 148; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 10 - 217
Target Start/End: Original strand, 13648721 - 13648928
Alignment:
Q  10 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaa 109  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||| ||||||||| ||| |||    
T  13648721 agcagagacacaaattgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactatgtcaacgctcttcaaagatcaagcatccaatgtctttaaa 13648820  T
Q  110 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatct 209  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||    
T  13648821 tcctttcaaaatagccgttgcttcactctttcagtcttctgcaatgcttagacgcgattaaatccattgaacatcttttgaagctttaagtctcgcatct 13648920  T
Q  210 cctgatga 217  Q
    ||||||||    
T  13648921 cctgatga 13648928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 10 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 12366914 - 12366704
Alignment:
Q  10 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaa 109  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  12366914 agcagagacacagactgattagtggaggtagtggttgtatacttcgtacaattgtactatgtcaacgctcttcaaagaacagacatccaatgctttcaaa 12366815  T
Q  110 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatct 209  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| |  |||||||||||||| ||||| ||    
T  12366814 tcctttcaaaatagttgttgcttcactctcccagtcttctgcaatgcttaaacgagattaaatccattgaacagcccttgaagctttaagttttgcacct 12366715  T
Q  210 cctgatgaact 220  Q
    |||||||||||    
T  12366714 cctgatgaact 12366704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 10 - 218
Target Start/End: Original strand, 9069554 - 9069762
Alignment:
Q  10 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaa 109  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |  |||||||| ||| ||||||||| |||    
T  9069554 agcagagacaaaaactgagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaatgctccttgaagaacaagcatacaatgcctttaaa 9069653  T
Q  110 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatct 209  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  9069654 tcctttcaaaatagtcgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacgatattaaatcccttgaacaacctttgaagctttaagttttgcatct 9069753  T
Q  210 cctgatgaa 218  Q
    |||||||||    
T  9069754 cctgatgaa 9069762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 143; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 10 - 220
Target Start/End: Original strand, 11792899 - 11793109
Alignment:
Q  10 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaa 109  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||| ||||||    
T  11792899 agcagagacacaaactaagtggtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatcaaatgctttcaaa 11792998  T
Q  110 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatct 209  Q
    | ||||||||||||| ||||||||||||||   |||||  ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  11792999 tgctttcaaaatagtcgttgcttcactcttatggtctttcgcaatgcttagacgagattaagtccattgaacaacctttaaagctttaagtcttgcatct 11793098  T
Q  210 cctgatgaact 220  Q
    |||||||||||    
T  11793099 cctgatgaact 11793109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 141; E-Value: 4e-74
Query Start/End: Original strand, 21 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 23280113 - 23279910
Alignment:
Q  21 aaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaatcctttcaaaa 120  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||     
T  23280113 aaacagagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaacaagcatccaatgccttcaaatcctttcaaac 23280014  T
Q  121 tagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaact 220  Q
    |||  |||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23280013 tagccgttgctccacttttccagtcttctacaatgcttagacaagattaaatcca-tgaatagcctttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaact 23279915  T
Q  221 acaac 225  Q
    |||||    
T  23279914 acaac 23279910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 10 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 30944489 - 30944281
Alignment:
Q  10 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaa 109  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||  ||||| || |||||||||||||||||    
T  30944489 agcagagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaattgtattttgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgccttcaaa 30944390  T
Q  110 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatct 209  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||  ||||||||    
T  30944389 tcctttcaaaatagttgttgcttcacttttccaatcttctgcaatacttagacgagattaaatccgttgaacaacctttgaagctttaag--ttgcatct 30944292  T
Q  210 cctgatgaact 220  Q
    |||||||||||    
T  30944291 cctgatgaact 30944281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 10 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 33691878 - 33691667
Alignment:
Q  10 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaa 109  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||| |||| || ||||| |||    
T  33691878 agcagagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttatacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaacaagcatctaacgcctttaaa 33691779  T
Q  110 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatct 209  Q
    | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| | |||||||||||| |||||||||||    
T  33691778 ttctttcaaaatagtcgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccatttaacagcctttgaagctttatgtcttgcatct 33691679  T
Q  210 cctgatgaacta 221  Q
    ||||||||||||    
T  33691678 cctgatgaacta 33691667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 136; E-Value: 4e-71
Query Start/End: Original strand, 10 - 221
Target Start/End: Original strand, 30025897 - 30026108
Alignment:
Q  10 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaa 109  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| |||| |||||||||||     
T  30025897 agcagagacacaaactgagtagtagagatattggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttaaaagaacaagcatcgaatgccttcaat 30025996  T
Q  110 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatct 209  Q
    || |||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||| ||||||| || ||| |||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||    
T  30025997 tcttttcaaaatagccgttgcttcactctttcagtcttctgcgatgcttatacgagactaaatccattgaccagcgtttgaagctttaagtcttgcatct 30026096  T
Q  210 cctgatgaacta 221  Q
    | ||||||||||    
T  30026097 cttgatgaacta 30026108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 26 - 221
Target Start/End: Original strand, 15467924 - 15468119
Alignment:
Q  26 gagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaatcctttcaaaatagtt 125  Q
    ||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||     
T  15467924 gagtagtggaggtaatggttgtacacctcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaacaagcatccaatgccttcaaatccttttaaaatagtc 15468023  T
Q  126 gttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaacta 221  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15468024 gttgattcactcttccagtcttctgcattgcctagacgagattaaatctattgaacaccctttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaacta 15468119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 13 - 220
Target Start/End: Original strand, 24788136 - 24788343
Alignment:
Q  13 agagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaatcc 112  Q
    ||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||  |||||||| || |||||||||||||||||    
T  24788136 agagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaattctctttgaagaacaagcacccaatgccttcaaatcc 24788235  T
Q  113 tttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatctcct 212  Q
    |||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  | |||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  24788236 tttcaaaatattcgttgcttcactcttctagtcttctgcaatgcttagatgatattaaatctattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcct 24788335  T
Q  213 gatgaact 220  Q
     |||||||    
T  24788336 aatgaact 24788343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 14 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 30945518 - 30945314
Alignment:
Q  14 gagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaatcct 113  Q
    |||||| ||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  | |||||| |||||||||||||||||||||    
T  30945518 gagacaaaaacaaagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaggaacaagcatccaatgccttcaaatcct 30945419  T
Q  114 ttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatctcctg 213  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||| ||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||    
T  30945418 ttcaaaatagttgttgcttcacttttccaatcttctacaatacttagacgagattaaatccgttgaacaacctttgaagctttaag--ttgcatctcctg 30945321  T
Q  214 atgaact 220  Q
    |||||||    
T  30945320 atgaact 30945314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 10 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 29935524 - 29935315
Alignment:
Q  10 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaa 109  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||| |||||||||| ||||||    
T  29935524 agcagagacacaaactaagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactatgtcaacgctctttaaagaacaagcatccaatgctttcaaa 29935425  T
Q  110 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatct 209  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||| |||     ||||||||  |||||||||| ||||||  ||||||||||||||||    
T  29935424 tcctttcaaaatagtcgttgcttcactcttctggtcttctgcaatg-ttaagtgtgattaaatatattgaacaacctttgaaattttaagtcttgcatct 29935326  T
Q  210 cctgatgaact 220  Q
    |||||||||||    
T  29935325 cctgatgaact 29935315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 120; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 10 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 28622522 - 28622314
Alignment:
Q  10 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaa 109  Q
    |||||||||| |||| ||| ||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||  || |||||||||||||||||||||||    
T  28622522 agcagagacaaaaacagagaagtagaggtagtggttgtacacctcgtacaattgtactttgtcaacgccctttgaaaaacaaacatccaatgccttcaaa 28622423  T
Q  110 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatct 209  Q
    |||||||||| |||  ||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||    
T  28622422 tcctttcaaattagccgttgcttcacttttctagtattctgcaatgcttagacgagattgaatccattgaacaacttttgaagctttaag--ttgcatct 28622325  T
Q  210 cctgatgaact 220  Q
    |||||||||||    
T  28622324 cctgatgaact 28622314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 118; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 13 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 5000985 - 5000788
Alignment:
Q  13 agagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaatcc 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||| ||| |||||| |||||||||    
T  5000985 agagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactatgtcaacgttcttcaaagaacaagcattcaatgctttcaaatcc 5000886  T
Q  113 tttcaaaatagttgttgcttcac-tcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatct 209  Q
    |||||||||||| |||||||||| |||    ||||| |||||||||| | | ||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  5000885 tttcaaaatagtcgttgcttcacttctcttggtcttttgcaatgcttgggcgagattgaatccattgaacaacctttgaagctctaagtcttgcatct 5000788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 10 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 9709968 - 9709760
Alignment:
Q  10 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaa 109  Q
    |||||||||| |||| ||| ||||||  |||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||  |||||||| |||| ||||||||||||    
T  9709968 agcagagacaaaaacagagcagtggatgtagtggttttacacttcgtacagttgtactatgtcaacgctctttgaagaacaagcatctaatgccttcaaa 9709869  T
Q  110 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatct 209  Q
    |||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||   ||||||||||||  | ||||||||    
T  9709868 tcctttcaaactaggcgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaggctttgaagcttta--tgttgcatct 9709771  T
Q  210 cctgatgaact 220  Q
    |||||||||||    
T  9709770 cctgatgaact 9709760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 10 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 48237068 - 48236860
Alignment:
Q  10 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaa 109  Q
    |||||||||| ||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||| || ||||  |||||||||||    
T  48237068 agcagagacaaaaacaaagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaataagcatctgatgccttcaaa 48236969  T
Q  110 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatct 209  Q
    |||||||||| | || ||||||||||  || ||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||    
T  48236968 tcctttcaaacttgtcgttgcttcaccttttcagtcttatgcaatgcttagacgagattgaatccattgaacaacttttgaagctttaag--ttgcatct 48236871  T
Q  210 cctgatgaact 220  Q
    |||||||||||    
T  48236870 cctgatgaact 48236860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 109; E-Value: 5e-55
Query Start/End: Original strand, 13 - 220
Target Start/End: Original strand, 14426542 - 14426747
Alignment:
Q  13 agagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaatcc 112  Q
    ||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||| ||  |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  14426542 agagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttagtacaaacgtactttgtcaacgctctttgaagaacaagcatccaatgccttcaaatcc 14426641  T
Q  113 tttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatctcct 212  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||  |||||  || || |||||||| |||| | | ||||||||||||  |||||||||||    
T  14426642 tttcaaaatagtcgttgcttcacttttccagtcttctgcaatctttagatgagtttgaatccattaaacagcttctgaagctttaag--ttgcatctcct 14426739  T
Q  213 gatgaact 220  Q
    ||||||||    
T  14426740 gatgaact 14426747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 15 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 19237204 - 19237022
Alignment:
Q  15 agacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaatcctt 114  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||  |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  19237204 agacacaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtataattgtagtttgtcaacgctctttgaagaacaagcatccaatgccttcaaatcctt 19237105  T
Q  115 tcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaa 198  Q
    ||||| |||  |||||||||||||||  |||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||| | |||||||||||||    
T  19237104 tcaaagtagccgttgcttcactcttctggtcttctgcaatgc-tagacgagattaaatcctttgaacagcctttgaagctttaa 19237022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 105; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 10 - 220
Target Start/End: Original strand, 33605677 - 33605886
Alignment:
Q  10 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaa 109  Q
    |||||||||| ||||  ||||||| || |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||  |||||||| |||||||||||||||||    
T  33605677 agcagagacaaaaacatagtagtgaaggtagtggttgtacacttcgtacaatcgtactttgtcaacgctctttgaagaacaagcatccaatgccttcaaa 33605776  T
Q  110 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaaca-acatttgaagctttaagtcttgcatc 208  Q
    |||||||||||||||  |||||||| | |||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||| ||||| |  | ||||||||||||  | |||||||    
T  33605777 tcctttcaaaatagtcattgcttcaattttccagtcatctgcattgcttagacgagattaaatccgttgaaaagccttttgaagcttta--tgttgcatc 33605874  T
Q  209 tcctgatgaact 220  Q
    ||||||||||||    
T  33605875 tcctgatgaact 33605886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 105; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 13 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 39284727 - 39284524
Alignment:
Q  13 agagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaatcc 112  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  39284727 agagacacaaactgagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaaacatccaatgccttcaaattc 39284628  T
Q  113 tttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatctcct 212  Q
     ||  || |||| |||| ||||||||||  |||||| ||||||| ||| |  |||||||||| ||||||| | ||||||||||| | |||  ||||| ||    
T  39284627 atttgaattagtcgttgtttcactcttctggtcttcagcaatgc-taggcgtgattaaatcctttgaacagcctttgaagctttgattctctcatcttct 39284529  T
Q  213 gatga 217  Q
    |||||    
T  39284528 gatga 39284524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 104; E-Value: 5e-52
Query Start/End: Original strand, 10 - 216
Target Start/End: Original strand, 331637 - 331842
Alignment:
Q  10 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaa 109  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || |   || || ||||||||||||||| |    
T  331637 agcagagacacaaactgtgtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacatttgtactttgtcaacgcttttgagc-aataagcatccaatgccttcaga 331735  T
Q  110 tcctttcaaaa-tagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatc 208  Q
    ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |  || |||||||  |||||| ||||||||||||||||  |||||    
T  331736 tcctttcaaaaatagctgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttggacgaccttgaatccataaaacaacctttgaagctttaagtc-cgcatc 331834  T
Q  209 tcctgatg 216  Q
    ||||||||    
T  331835 tcctgatg 331842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 99; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 39 - 217
Target Start/End: Original strand, 13692372 - 13692541
Alignment:
Q  39 agtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaatcctttcaaaatagttgttgcttcactct 138  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |  ||||| ||| ||||||||| |||         ||||||||||||||||||||||||    
T  13692372 agtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacactctataaagatcaagcatccaatgtctt---------tcaaaatagttgttgcttcactct 13692462  T
Q  139 tccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatctcctgatga 217  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  13692463 tccagtcttctgcaatgcttatacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttacatcttctgatga 13692541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 99; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 10 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 16112050 - 16111860
Alignment:
Q  10 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaa 109  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||| ||||||||||||||||     
T  16112050 agcagagacaaaaacagagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaacaagcatccaatgccttcaat 16111951  T
Q  110 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagt 200  Q
    | ||| ||||| ||| ||||||||||| || | |||||||||| |  |||||| || || |||||||  |||||| |||||||||||||||    
T  16111950 ttcttccaaaaaagtcgttgcttcactttttccgtcttctgcactctttagacgaggttgaatccataaaacaacttttgaagctttaagt 16111860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 99; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 13 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 35952851 - 35952640
Alignment:
Q  13 agagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaatcc 112  Q
    ||||||| |||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||  | |||||||||||||||||||||||||||    
T  35952851 agagacaaaaacagagtaatggaggtagtggttgtacacttcgtacaaacgtactttgtcaacgctctttgatgaacaaacatccaatgccttcaaatcc 35952752  T
Q  113 tttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaat-ccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatctcc 211  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||| || || ||| ||||| |||| | |||||||| |||||  |||||||  |    
T  35952751 tttcaaaatagtcgttgcttcacttttccagtcttcttcaatccttagacgaggttgaatcccattaaacagcttttgaagccttaag--ttgcatcctc 35952654  T
Q  212 tgatgaactacaac 225  Q
    ||||||||| ||||    
T  35952653 tgatgaactgcaac 35952640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 10 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 13018671 - 13018479
Alignment:
Q  10 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaa 109  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | | | ||||||||||||||||     
T  13018671 agcacagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaaaatccagcatccaatgccttcaac 13018572  T
Q  110 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaaca-acatttgaagctttaagtct 202  Q
    | | || |||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||| | | | |  ||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||    
T  13018571 ttcatttaaaatagtcgttgcttcactctcctagtcttctgcaatac-tgggcgtgattaaatccattgaacagccttttgaagctttaagtct 13018479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 97; E-Value: 8e-48
Query Start/End: Original strand, 10 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 16310073 - 16309961
Alignment:
Q  10 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaa 109  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  16310073 agcagagacacaaactgagtagtgtagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactatgtcaacgctcttcaaagaacaagcatccaatgccttcaaa 16309974  T
Q  110 tcctttcaaaata 122  Q
    |||||||||||||    
T  16309973 tcctttcaaaata 16309961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 10 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 13260781 - 13260579
Alignment:
Q  10 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaa 109  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||| ||| |||||||| |||||||||| ||||      
T  13260781 agcagagacacaaactgggtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactatctcaatgctcttccaagaacaagcatccaatgctttca-- 13260684  T
Q  110 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatct 209  Q
         | | |||||||||||||| |||| ||  |||||| ||||||||| ||| |||||||||||||| ||||   |||| |||||||||||||||||||    
T  13260683 -----taagaatagttgttgctttactcctctggtcttccgcaatgcttggacgagattaaatccatt-aacagtctttggagctttaagtcttgcatct 13260590  T
Q  210 cctgatgaact 220  Q
    |||||||||||    
T  13260589 cctgatgaact 13260579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 11 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 13894162 - 13893958
Alignment:
Q  11 gcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaat 110  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||| | |||||||||| |||| |||| ||| || ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  13894162 gcagagaca-aaacagagtagtggaggtagtggttgtacacgttgtacaattgtcctttttcaatgctttttaaagaacaaacattcaatgccttcaaat 13894064  T
Q  111 cctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatctc 210  Q
    |||||  || |||  |||||||||||||||  |||||||||||||| ||| |  |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| || |||||     
T  13894063 ccttttgaattagccgttgcttcactcttctggtcttctgcaatgc-taggcgtgattaaatcctttgaacaacctttgaagctttaagtatttcatctt 13893965  T
Q  211 ctgatga 217  Q
    |||||||    
T  13893964 ctgatga 13893958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 12 - 147
Target Start/End: Original strand, 14193108 - 14193243
Alignment:
Q  12 cagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaatc 111  Q
    |||||||| |||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||  |||||||| ||| |||||||||||||||    
T  14193108 cagagacaaaaacagagtagtagaggtagtggttgtacacttcgtacacttgtactttgttaacgctctttgaagaacaagcattcaatgccttcaaatc 14193207  T
Q  112 ctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtctt 147  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  14193208 ctttcaaaatagtcgttgcttcactcttccagtctt 14193243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 79; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 10 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 41842439 - 41842230
Alignment:
Q  10 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaa 109  Q
    |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  || ||| |||||  |||||||| ||||||     
T  41842439 agcagagacacaaactgagtagtgcaggtagtggttgtacacttcgtacaattgtactctgtcaacgcactttaaaaaacaagtatccaatgtcttcaac 41842340  T
Q  110 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatct 209  Q
    | | ||  || |||| ||||||||||||| |   |||| |||| ||||||||| |||| ||||| | |||||||| |||||||| ||||||||  |||||    
T  41842339 ttcatttgaattagtcgttgcttcactctcctgatcttatgcagtgcttagacgagatcaaatcaaatgaacaacctttgaagc-ttaagtctctcatct 41842241  T
Q  210 cctgatgaact 220  Q
     ||||||||||    
T  41842240 tctgatgaact 41842230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 38 - 198
Target Start/End: Original strand, 13880608 - 13880768
Alignment:
Q  38 tagtggttgtac-acttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaatcctttcaaaatagttgttgcttcact 136  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||  || |||| |||||||||||    
T  13880608 tagtggttgtaccacttcgtacaattgtcctttttcaacgctcttcaaagaacaagcatccagtgccttcaaatccttttgaattagtcgttgcttcact 13880707  T
Q  137 cttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaa 198  Q
    |||| ||||||||||||||| ||| |  |||||||||  ||||||| | |||||||||||||    
T  13880708 cttctagtcttctgcaatgc-taggcgtgattaaatcttttgaacagcctttgaagctttaa 13880768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 10 - 220
Target Start/End: Original strand, 4821466 - 4821673
Alignment:
Q  10 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaa 109  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||| ||  |||||||| |||||||||||||||||    
T  4821466 agcagagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaaacgtactttttcaacgctctttgaagaacaagcatccaatgccttcaaa 4821565  T
Q  110 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatct 209  Q
    | ||||||||||||  |||||| |||| ||| ||||||||| |||  |||||| || || |||   || |||| | ||||||||||||||  ||| ||||    
T  4821566 t-ctttcaaaatagccgttgctccacttttctagtcttctgtaatctttagacgagtttgaatttgttaaacagcttttgaagctttaag--ttgtatct 4821662  T
Q  210 cctgatgaact 220  Q
    || ||||||||    
T  4821663 ccggatgaact 4821673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 74; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 38 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 12174479 - 12174354
Alignment:
Q  38 tagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgct-attcaaagaacaaacatccaatgccttcaaatcctttcaaaatagttgttgcttcact 136  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||  ||  | |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  12174479 tagtggttgtacacttcgtacaaacgtactttgtcaacgctcttttgaggaacaagcatccaatgcgttcaaatcctttcaaaatagtcgttgcttcact 12174380  T
Q  137 cttccagtcttctgcaatgcttagac 162  Q
     ||||||||||||||||| |||||||    
T  12174379 tttccagtcttctgcaatccttagac 12174354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 74; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 44 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 16543152 - 16542978
Alignment:
Q  44 ttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaatcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccag 143  Q
    |||||||| ||||||||  |||||||||||  ||| ||  |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  16543152 ttgtacacatcgtacaaacgtactttgtcagagctctttgaagaacaagcatccaatgccttcaaatcatttcaaaatagtcgttgcttcacttttccag 16543053  T
Q  144 tcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaact 220  Q
    |||||||||||  ||| || || || |||||||| |||| | |||||||| |||  | |||||||||||||||||||    
T  16543052 tcttctgcaatcattaaacgagtttgaatccattaaacagcttttgaagcatta--tgttgcatctcctgatgaact 16542978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 74; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 44 - 220
Target Start/End: Original strand, 16622510 - 16622684
Alignment:
Q  44 ttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaatcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccag 143  Q
    |||||||| ||||||||  |||||||||||  ||| ||  |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  16622510 ttgtacacatcgtacaaacgtactttgtcagagctctttgaagaacaagcatccaatgccttcaaatcatttcaaaatagtcgttgcttcacttttccag 16622609  T
Q  144 tcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaact 220  Q
    |||||||||||  ||| || || || |||||||| |||| | |||||||| |||  | |||||||||||||||||||    
T  16622610 tcttctgcaatcattaaacgagtttgaatccattaaacagcttttgaagcatta--tgttgcatctcctgatgaact 16622684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 35 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 13032213 - 13032046
Alignment:
Q  35 agatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaatcctttcaaaatagttgttgcttca 134  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| | | | |||| |||| |||||| | | ||  |||||||||||||||||    
T  13032213 agatagtggttgtacacttcgtacaattatactttgtcaacgctcttcaaaaagccagcatctaatgtcttcaacttcatttgaaatagttgttgcttca 13032114  T
Q  135 ctcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaa-catttgaagctttaagtct 202  Q
    |||| |  |||||||||||| | ||| |  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  13032113 ctctcctggtcttctgcaatac-taggcgtgattaaatccattgaacaaccatttgaagctttaagtct 13032046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 10 - 220
Target Start/End: Original strand, 8182922 - 8183129
Alignment:
Q  10 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaa 109  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||| | |||||||||| ||  ||||| || |||| | || |||  ||    
T  8182922 agcagagacaaaaacagagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacagacgtattatgtcaacgctctttgaagaataagcatcaagtgtctttcaa 8183021  T
Q  110 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatct 209  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||| ||||||| || || || |  ||  ||||| ||| ||||||| ||  ||||||||    
T  8183022 tcctttcaaaatagttgttgctatacttttccagtcttctgcaat-cttagacgagtttgaaacttttatacaactttttaagctttgag--ttgcatct 8183118  T
Q  210 cctgatgaact 220  Q
    |||||||||||    
T  8183119 cctgatgaact 8183129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 67; E-Value: 6e-30
Query Start/End: Original strand, 146 - 220
Target Start/End: Original strand, 4494634 - 4494708
Alignment:
Q  146 ttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaact 220  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4494634 ttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaact 4494708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 66; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 21 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 2265674 - 2265472
Alignment:
Q  21 aaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaatcctttcaaaa 120  Q
    |||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||| ||  ||||| || |||  ||| ||||||||||||| |||||    
T  2265674 aaacagagcagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcattaaataccttcaaatccttccaaaa 2265575  T
Q  121 tagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaact 220  Q
    |||  ||||||  ||| || ||||||||||||||  |||||| || || ||||  || |||| | ||| ||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  2265574 tagccgttgctatactttttcagtcttctgcaatctttagacgagtttgaatctgttaaacagcttttaaagctttaag--ttgcatctcctgatgaact 2265477  T
Q  221 acaac 225  Q
    |||||    
T  2265476 acaac 2265472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 63 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 15704612 - 15704452
Alignment:
Q  63 gtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaatcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagac 162  Q
    ||||| |||||||||| ||  ||||| || |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||  ||| |||||||||||||||||  ||||||    
T  15704612 gtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgccttcaaatccttccaaaatagtcgttgctatacttttccagtcttctgcaatctttagac 15704513  T
Q  163 aagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaactacaac 225  Q
     || || ||||| || |||| | ||||||||||||||  || ||||| |||||||||||||||    
T  15704512 gagtttgaatccgttaaacagcttttgaagctttaag--tttcatcttctgatgaactacaac 15704452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 62; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 38 - 139
Target Start/End: Complemental strand, 9098384 - 9098283
Alignment:
Q  38 tagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaatcctttcaaaatagttgttgcttcactc 137  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||  || |||  ||||||||||||    
T  9098384 tagtggttgtacacttcgtacaattgtcctttttcaacgctcttcaaagaacaaacatctaatgcattcaaatccttttgaattagccgttgcttcactc 9098285  T
Q  138 tt 139  Q
    ||    
T  9098284 tt 9098283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 62; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 13 - 130
Target Start/End: Complemental strand, 19711176 - 19711059
Alignment:
Q  13 agagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaatcc 112  Q
    ||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||| ||  ||| | || ||||||||||||||||||||    
T  19711176 agagacaaaaacagagtagtggaaatagtggttgtacacttcgtacaaacgtactttgtcaatgctctttgaaggataagcatccaatgccttcaaatcc 19711077  T
Q  113 tttcaaaatagttgttgc 130  Q
    ||||||| |||| |||||    
T  19711076 tttcaaattagtcgttgc 19711059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #59
Raw Score: 61; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 93 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 13472663 - 13472555
Alignment:
Q  93 catccaatgccttcaaatcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaa-catttgaa 191  Q
    |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    |||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||| ||    
T  13472663 catcaaatgccatcaaatcctttcaaaatagttgttgcttcactcttatgatcttctacaatgcttagacgagattaaatccattgaacaaccttttaaa 13472564  T
Q  192 gctttaagt 200  Q
    |||||||||    
T  13472563 gctttaagt 13472555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #60
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 13 - 154
Target Start/End: Original strand, 1293025 - 1293157
Alignment:
Q  13 agagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaatcc 112  Q
    ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||| ||  ||||| || |||||||||         ||    
T  1293025 agagacaaaaacagagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatg---------cc 1293115  T
Q  113 tttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaat 154  Q
    |||||||||||||||||||  ||| |||||||||| ||||||    
T  1293116 tttcaaaatagttgttgctatacttttccagtcttttgcaat 1293157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #61
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 15 - 220
Target Start/End: Original strand, 14425444 - 14425637
Alignment:
Q  15 agacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaatcctt 114  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| | |||||||||| ||  ||||| || |||||||||         | ||    
T  14425444 agacaaaaacagagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaaacgtaatatgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatg---------catt 14425534  T
Q  115 tcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatctcctga 214  Q
    |||||||||  |||||   |||  ||||||||||||||||| |||| | || || ||||| |  |||||| ||||||||||||||  |||||||||||||    
T  14425535 tcaaaatagccgttgccatacttntccagtcttctgcaatg-ttaggcgagtttgaatccttgaaacaacttttgaagctttaag--ttgcatctcctga 14425631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #62
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 10 - 105
Target Start/End: Complemental strand, 48062986 - 48062891
Alignment:
Q  10 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgcctt 105  Q
    |||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||  ||||| |||||||||| ||  ||||| || |||||||||||||    
T  48062986 agcagagacagaaacagagtaatggagatagtggttgtacgcttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgcctt 48062891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #63
Raw Score: 45; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 10 - 78
Target Start/End: Original strand, 27871710 - 27871778
Alignment:
Q  10 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgct 78  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||    
T  27871710 agcagagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgct 27871778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #64
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 63 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 16556751 - 16556664
Alignment:
Q  63 gtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaatcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctg 150  Q
    ||||||| |||||||| ||  |||||||| ||  ||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||    
T  16556751 gtactttttcaacgctctttgaagaacaagcaatcaatgccttaaaatcctttcaaaatagccgttgcttcacttttccagtcttctg 16556664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #65
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 63 - 150
Target Start/End: Original strand, 16608911 - 16608998
Alignment:
Q  63 gtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaatcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctg 150  Q
    ||||||| |||||||| ||  |||||||| ||  ||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||    
T  16608911 gtactttttcaacgctctttgaagaacaagcaatcaatgccttaaaatcctttcaaaatagccgttgcttcacttttccagtcttctg 16608998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #66
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 26 - 102
Target Start/End: Complemental strand, 19339400 - 19339324
Alignment:
Q  26 gagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgc 102  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||| ||  ||||| || ||||||||||    
T  19339400 gagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgc 19339324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #67
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 10 - 78
Target Start/End: Complemental strand, 24794881 - 24794813
Alignment:
Q  10 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgct 78  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||    
T  24794881 agcagagacaaaaacagagtagtggaagtagtggttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgct 24794813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #68
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 10 - 69
Target Start/End: Original strand, 4494569 - 4494628
Alignment:
Q  10 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtacttt 69  Q
    |||||||||| |||  ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  4494569 agcagagacaaaaagagagtagtggaggtagcggttgtacacttcgtacaattgtacttt 4494628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #69
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 157 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 7339893 - 7339832
Alignment:
Q  157 ttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaact 220  Q
    |||||| || ||||||||||| |||||  ||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  7339893 ttagacgagtttaaatccattaaacaatttttgaagctttaag--ttgcatctcctgatgaact 7339832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #70
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 186 - 221
Target Start/End: Original strand, 14193242 - 14193277
Alignment:
Q  186 tttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaacta 221  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  14193242 tttgaagctttaagtcttgcatctcttgatgaacta 14193277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #71
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 26 - 105
Target Start/End: Original strand, 16412000 - 16412078
Alignment:
Q  26 gagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgcctt 105  Q
    |||||||||||||| |||||||||| || |||| ||||| ||||   |||||| ||||||||| || |||||||||||||    
T  16412000 gagtagtggagataatggttgtacaatt-gtactattgtccttttcgaacgctcttcaaagaataagcatccaatgcctt 16412078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #72
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 16 - 53
Target Start/End: Complemental strand, 14745787 - 14745750
Alignment:
Q  16 gacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacactt 53  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  14745787 gacaaaaacagagtagtggagatagtggttgtacactt 14745750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #73
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 10 - 102
Target Start/End: Complemental strand, 32264884 - 32264791
Alignment:
Q  10 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgc-tattcaaagaacaaacatccaatgc 102  Q
    |||||||||| |||| ||| ||||||| || ||||||||||||  ||||||  ||||| ||||||||| | ||  ||||| |||||||||||||    
T  32264884 agcagagacaaaaacagagcagtggaggtactggttgtacactctgtacaaacgtactatgtcaacgcttctttgaagaataaacatccaatgc 32264791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #74
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 10 - 78
Target Start/End: Complemental strand, 48806045 - 48805977
Alignment:
Q  10 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgct 78  Q
    |||||||||| || | ||||||||||  |||||||||||||||| |||| |  ||||| ||||||||||    
T  48806045 agcagagacaaaatcagagtagtggaagtagtggttgtacactttgtacgaacgtactatgtcaacgct 48805977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 169; Significance: 9e-91; HSPs: 59)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 169; E-Value: 9e-91
Query Start/End: Original strand, 10 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 37985733 - 37985525
Alignment:
Q  10 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaa 109  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  37985733 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactatgtcaacgctcttcaaagaacaagcatccaatgccttcaaa 37985634  T
Q  110 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatct 209  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  37985633 tcctttcaaaatagttgttgcttcactttttcagtcttctgcgatgcttagatgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatct 37985534  T
Q  210 cctgatgaa 218  Q
    | |||||||    
T  37985533 catgatgaa 37985525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 168; E-Value: 3e-90
Query Start/End: Original strand, 10 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 29680665 - 29680462
Alignment:
Q  10 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaa 109  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  29680665 agcagagacacatactgagtagtggagataatgattgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatccaatgctttcaaa 29680566  T
Q  110 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatct 209  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||    
T  29680565 tcctttcaaaatagtcgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacctttggagctttaagtcttgcatct 29680466  T
Q  210 cctg 213  Q
    ||||    
T  29680465 cctg 29680462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 163; E-Value: 3e-87
Query Start/End: Original strand, 10 - 220
Target Start/End: Original strand, 16632430 - 16632640
Alignment:
Q  10 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaa 109  Q
    |||||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  16632430 agcagagacacaaactgattggtggaggtagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagaatccaatgccttcaaa 16632529  T
Q  110 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatct 209  Q
    || |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  16632530 tcttttcaaaatagtcgttgattcactcttccagtcttctgcaatgcttatacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatct 16632629  T
Q  210 cctgatgaact 220  Q
    |||||||||||    
T  16632630 cctgatgaact 16632640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 162; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 10 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 12811296 - 12811088
Alignment:
Q  10 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaa 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||   ||||||| |||||||||||||||||    
T  12811296 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattttactttgtcaacgctatt---agaacaagcatccaatgccttcaaa 12811200  T
Q  110 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatct 209  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  12811199 tcctttcaaaatagtcgttgcttcactctttcagtcttctgcaatgcttagacgaaactaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatct 12811100  T
Q  210 cctgatgaacta 221  Q
    ||| ||||||||    
T  12811099 cctaatgaacta 12811088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 162; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 10 - 215
Target Start/End: Original strand, 19666362 - 19666567
Alignment:
Q  10 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaa 109  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||  || |||||| ||||||    
T  19666362 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaactctcttcaaagaacaagtattcaatgctttcaaa 19666461  T
Q  110 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatct 209  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  19666462 tcctttcaaaatagtcgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaataacctttcaagctttaagtcttgcatct 19666561  T
Q  210 cctgat 215  Q
    ||||||    
T  19666562 cctgat 19666567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 156; E-Value: 5e-83
Query Start/End: Original strand, 10 - 221
Target Start/End: Original strand, 3395580 - 3395791
Alignment:
Q  10 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaa 109  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| | |||||||||| ||||||    
T  3395580 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactatgtcaacgctcttcaaagaactagcatccaatgctttcaaa 3395679  T
Q  110 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatct 209  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| || |||| ||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  3395680 tcctttcaaaatagtcgttgcttcactttttcagttttctgcaatgcttagacgatatttaatccattgaacaacttttgaagatttaagtcttgcatct 3395779  T
Q  210 cctgatgaacta 221  Q
    ||||||||||||    
T  3395780 cctgatgaacta 3395791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 156; E-Value: 5e-83
Query Start/End: Original strand, 10 - 221
Target Start/End: Original strand, 45833384 - 45833595
Alignment:
Q  10 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaa 109  Q
    |||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| || |||||||||| ||||||    
T  45833384 agcagagaccaaaacagagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttaaaagaaaaagcatccaatgcattcaaa 45833483  T
Q  110 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatct 209  Q
    | ||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  45833484 tactttcaaaatagaagttgcttaactcttccagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatct 45833583  T
Q  210 cctgatgaacta 221  Q
    ||||||||||||    
T  45833584 cctgatgaacta 45833595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 154; E-Value: 8e-82
Query Start/End: Original strand, 10 - 223
Target Start/End: Original strand, 19884692 - 19884904
Alignment:
Q  10 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaa 109  Q
    |||||||||| |||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||| |||||||||||||||||    
T  19884692 agcagagacaaaaacagattagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaacaagcatccaatgccttcaaa 19884791  T
Q  110 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatct 209  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  19884792 tcctttcaaactagtcgttgcttcacttttccagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatcca-tgaacatcctttgaagctttaagtcttgcatct 19884890  T
Q  210 cctgatgaactaca 223  Q
    ||||||||||||||    
T  19884891 cctgatgaactaca 19884904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 152; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 10 - 220
Target Start/End: Original strand, 55380280 - 55380490
Alignment:
Q  10 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaa 109  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  55380280 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactatgtcaacgctcttcaaagaacaagcatccaatgctttcaaa 55380379  T
Q  110 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaaca-acatttgaagctttaagtcttgcatc 208  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||| || ||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||    
T  55380380 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttctggtcttctgcaatg-ttaggcatgattaaatccattgaacagccttttgaagctttaagtcttgcatc 55380478  T
Q  209 tcctgatgaact 220  Q
    |||| |||||||    
T  55380479 tcctaatgaact 55380490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 151; E-Value: 5e-80
Query Start/End: Original strand, 10 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 37435656 - 37435446
Alignment:
Q  10 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaa 109  Q
    |||||||||| ||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||  |||||||| |||||||||||||||||    
T  37435656 agcagagacaaaaacaaagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaatagtactatgtcaacgctctttgaagaacaagcatccaatgccttcaaa 37435557  T
Q  110 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatct 209  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  37435556 tcctttcaaaatagtcgttgcttcactcttccaatcttctgcaatgcttggacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatct 37435457  T
Q  210 cctgatgaact 220  Q
    |||||||||||    
T  37435456 cctgatgaact 37435446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 149; E-Value: 7e-79
Query Start/End: Original strand, 18 - 210
Target Start/End: Original strand, 12601099 - 12601291
Alignment:
Q  18 cacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaatcctttca 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  12601099 cacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactatgtcaacgctcttcaaagaacaagcatccaatgccttcaaatcctttca 12601198  T
Q  118 aaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatctc 210  Q
    ||||||| |||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||    
T  12601199 aaatagtcgttgattcactattcaagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacagcctttgacgctttaagtcttgcatctc 12601291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 148; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 10 - 205
Target Start/End: Original strand, 9140902 - 9141097
Alignment:
Q  10 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaa 109  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  9140902 agcagagacacaaactgagtagtgaagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactatgtcaacgctcttcaaagaacaagcatccaatgccttcaaa 9141001  T
Q  110 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgc 205  Q
    ||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  9141002 tcctttcaaaatagtcgttgctttacttttccagtcttctacaatgcttagacgagattgaatccattgaacaacccttgaagctttaagtcttgc 9141097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 143; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 10 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 19621182 - 19620972
Alignment:
Q  10 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaa 109  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||| |||||||||| ||||||    
T  19621182 agcagagacacaaactgaatagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactatgtcaacgctcttcatagaacaagcatccaatgctttcaaa 19621083  T
Q  110 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatct 209  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||  ||  ||||| |||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  19621082 tcctttcaaaatagtcgttgcttcacttctctggtcttttgcaatgcttggacgagattgaatccattgaacaacctttgaagctttaactcttgcatct 19620983  T
Q  210 cctgatgaact 220  Q
    |||||||||||    
T  19620982 cctgatgaact 19620972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 10 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 14605028 - 14604819
Alignment:
Q  10 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaa 109  Q
    |||| ||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  14605028 agcatagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatccaatgctttcaaa 14604929  T
Q  110 tcc-tttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatc 208  Q
    ||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||| | | ||||||||||||||||||| |||    
T  14604928 tccttttaaaaatagttgttgcttcactcttctagtcttctgcaatgcttagacgagattgaatccatagaatagcctttgaagctttaagtcttggatc 14604829  T
Q  209 tcctgatgaa 218  Q
    ||||||||||    
T  14604828 tcctgatgaa 14604819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 136; E-Value: 4e-71
Query Start/End: Original strand, 10 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 14904477 - 14904262
Alignment:
Q  10 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaa 109  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||  |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| || ||||||||| |||||||    
T  14904477 agcagagacacaaactgagtggtggagataatggttgtttacttcgtacaattgtactatgtcaacgctcttcaaagaataagcatccaatgtcttcaaa 14904378  T
Q  110 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatct 209  Q
    |||||||||||| |  ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| | | |||||||||||| |||||||||||    
T  14904377 tcctttcaaaatggacgttgcttcacttttccagtcttctgcaatgcctagacgagattaaatcctttgaatagcttttgaagctttaggtcttgcatct 14904278  T
Q  210 cctgatgaactacaac 225  Q
    ||||||||||||||||    
T  14904277 cctgatgaactacaac 14904262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 10 - 222
Target Start/End: Original strand, 10072925 - 10073136
Alignment:
Q  10 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaa 109  Q
    |||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||  || ||||| | |||||||||||||||    
T  10072925 agcagagacaaaaacatagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacatttgtactttgtcaacgctctttgaataacaagcctccaatgccttcaaa 10073024  T
Q  110 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatct 209  Q
    |||||||||| |||  ||||||||||| |||||||||||||| ||||||| || |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  10073025 tcctttcaaactagcagttgcttcacttttccagtcttctgctatgcttaaacgagattaaatcca-tgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatct 10073123  T
Q  210 cctgatgaactac 222  Q
    |||||||||||||    
T  10073124 cctgatgaactac 10073136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 13 - 220
Target Start/End: Original strand, 56034567 - 56034774
Alignment:
Q  13 agagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaatcc 112  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||| ||   |||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||      
T  56034567 agagacacatattgagtagtggagatagtagttgtacattttagacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaacaaacatccaatgccttcaaatta 56034666  T
Q  113 tttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatctcct 212  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||| ||    
T  56034667 tttcaaaatagtcgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttggacgagattaaatccattgaacagtctttgaagctttaagtcttgcatcttct 56034766  T
Q  213 gatgaact 220  Q
    ||||||||    
T  56034767 gatgaact 56034774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 10 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 19912002 - 19911786
Alignment:
Q  10 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctatt-caaagaacaaacatccaatgccttcaa 108  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||| || ||||||| || |||||||||| |||||    
T  19912002 agcagaggcacaaactgagtagtggaggtagtggttgtacactttgtacaattatactatgtcaacgctctttcaaagaataagcatccaatgctttcaa 19911903  T
Q  109 atcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatc 208  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||  ||  ||||| |||||||||| ||| ||||| |||| |||||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  19911902 atcctttcaaaatagtcgttgcttcactgctctggtcttttgcaatgcttggacgagattgaatctattgaacaacctttaaagctttaagtcttgcatc 19911803  T
Q  209 tcctgatgaactacaac 225  Q
    |||||||||||||||||    
T  19911802 tcctgatgaactacaac 19911786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 21 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 22675630 - 22675433
Alignment:
Q  21 aaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaatcctttcaaaa 120  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||  |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||     
T  22675630 aaactgagtagtggaggtagtggttgtacactttgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaacaagcatcaaatgccttcaaatcctttcaaac 22675531  T
Q  121 tagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaact 220  Q
    |||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||||  | ||||||||||| |||||||    
T  22675530 tagtcgttgcttcacttttctagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacagcctttgaagcttta--tgttgcatctcctaatgaact 22675433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 123; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 10 - 223
Target Start/End: Original strand, 10692841 - 10693052
Alignment:
Q  10 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaa 109  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||  ||||||||| |||||| ||  |||||||| |||||||||||||||||    
T  10692841 agcagagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcatacaaacgtactttgtaaacgctctttgaagaacaagcatccaatgccttcaaa 10692940  T
Q  110 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatct 209  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||| || || ||||| || |||||| ||||||||||||||  ||||||||    
T  10692941 tcctttcaaaatagttgttgcttcacttttccagtcttctgcaatctttagacgagtttgaatccgttaaacaacttttgaagctttaag--ttgcatct 10693038  T
Q  210 cctgatgaactaca 223  Q
    ||||||||||||||    
T  10693039 cctgatgaactaca 10693052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 123; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 10 - 223
Target Start/End: Original strand, 10906607 - 10906818
Alignment:
Q  10 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaa 109  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||  ||||||||| |||||| ||  |||||||| |||||||||||||||||    
T  10906607 agcagagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcatacaaacgtactttgtaaacgctctttgaagaacaagcatccaatgccttcaaa 10906706  T
Q  110 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatct 209  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||| || || ||||| || |||||| ||||||||||||||  ||||||||    
T  10906707 tcctttcaaaatagttgttgcttcacttttccagtcttctgcaatctttagacgagtttgaatccgttaaacaacttttgaagctttaag--ttgcatct 10906804  T
Q  210 cctgatgaactaca 223  Q
    ||||||||||||||    
T  10906805 cctgatgaactaca 10906818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 120; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 26 - 220
Target Start/End: Original strand, 413008 - 413200
Alignment:
Q  26 gagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaatcctttcaaaatagtt 125  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||      
T  413008 gagtagtggaggcagtggttgtacacttcgtacaatcgtactttgtcaacgctctttgaagaacaaacattcaatgccttcaaatcctttcaaattagcc 413107  T
Q  126 gttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaact 220  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||  ||| |||||||||||||||    
T  413108 gttgcttcacttttcgagtcttctgcaatgcttagacgagattgaatccattgaacaacttttgaagctttaag--ttgaatctcctgatgaact 413200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 120; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 38 - 221
Target Start/End: Original strand, 3483739 - 3483922
Alignment:
Q  38 tagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaatcctttcaaaatagttgttgcttcactc 137  Q
    |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||     
T  3483739 tagtggttgtgcgcttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgccttcaaatcctttcaaaatagtcgttgcttcactt 3483838  T
Q  138 ttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaacta 221  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |   ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  3483839 ttccagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaatagtttttgaagctttaagtcttgcatctcttaatgaacta 3483922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 10 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 13576235 - 13576027
Alignment:
Q  10 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaa 109  Q
    |||||||||| |||| ||| ||||||  |||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||  |||||||| |||| ||||||||||||    
T  13576235 agcagagacaaaaacagagcagtggatgtagtggttttacacttcgtacagttgtactatgtcaacgctctttgaagaacaagcatctaatgccttcaaa 13576136  T
Q  110 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatct 209  Q
    |||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||   ||||||||||||  | ||||||||    
T  13576135 tcctttcaaactaggcgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaggctttgaagcttta--tgttgcatct 13576038  T
Q  210 cctgatgaact 220  Q
    |||||||||||    
T  13576037 cctgatgaact 13576027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 113; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 73 - 225
Target Start/End: Original strand, 14833449 - 14833601
Alignment:
Q  73 aacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaatcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaat 172  Q
    |||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||    
T  14833449 aacgctcttcaaagaacaagcatccaatgctttcaaatcctttcaaaatagtcgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacgagattgaat 14833548  T
Q  173 ccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaactacaac 225  Q
    | |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  14833549 ctattgaacatcctttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaattacaac 14833601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 113; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 21 - 220
Target Start/End: Original strand, 17247245 - 17247441
Alignment:
Q  21 aaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaatcctttcaaaa 120  Q
    |||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||     
T  17247245 aaacagagtagtggaggcagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaatgttctttgaagaacaaacattcaatgccttcaaatcctttcaaat 17247344  T
Q  121 tagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaact 220  Q
    |||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||   | ||||||||||||||||    
T  17247345 tagtcgttgcttcact-ttccaatcttctgcaatgcttagacgagattgaatccattgaacaacttttgaagctttaag--attcatctcctgatgaact 17247441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 110; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 21 - 220
Target Start/End: Original strand, 54679931 - 54680126
Alignment:
Q  21 aaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaatcctttcaaaa 120  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54679931 aaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaaacgtactttgtcaatgctctttgaagaacaaacatccaatgccttcaaatcctttcaaaa 54680030  T
Q  121 tagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaact 220  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||| || || |  ||||| |||| | ||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  54680031 tagttgttgcttcacttttccagtcttctgcaatcattagacgagtttga--ccattaaacagcttttgaagctttaag--ttgcatctcctgatgaact 54680126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 105; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 12 - 200
Target Start/End: Original strand, 29121362 - 29121550
Alignment:
Q  12 cagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaatc 111  Q
    |||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| || ||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  29121362 cagagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaaacgtactttgtcaacgctctttaaagaacaagcatccagtgccttcaaatc 29121461  T
Q  112 ctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagt 200  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||  |||||| || || |||||||| |||| | |||||||| ||||||    
T  29121462 ctttcaaaatagtcgttgcttcactttttcagtcttctgcaatctttagacgaggttgaatccattaaacagcttttgaagccttaagt 29121550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 101; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 10 - 218
Target Start/End: Original strand, 6641674 - 6641881
Alignment:
Q  10 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaa 109  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||| ||||||||||||    
T  6641674 agcagagacataaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagtatcaaatgccttcaaa 6641773  T
Q  110 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatct 209  Q
    ||||||  || |||  |||| ||||||||||   |||||| |||||| ||| || |||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||  |||||    
T  6641774 tccttttgaattagccgttgtttcactcttctgatcttctacaatgc-taggcatgattaaatcctttgaacaacctttgaagctttaaatctctcatct 6641872  T
Q  210 cctgatgaa 218  Q
     ||||||||    
T  6641873 tctgatgaa 6641881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 10 - 220
Target Start/End: Original strand, 40846089 - 40846299
Alignment:
Q  10 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaa 109  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | ||| |||||||||| |||||     
T  40846089 agcagagatacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaaaagcaagcatccaatgctttcaac 40846188  T
Q  110 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaaca-acatttgaagctttaagtcttgcatc 208  Q
    | | ||  || |||| ||||||||||| | |  |||||||||||||| ||| |  ||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||  ||||    
T  40846189 ttcatttgaattagtcgttgcttcactttcctggtcttctgcaatgc-taggcgtgattaaatccattgaacagccttttgaagctttaagtctctcatc 40846287  T
Q  209 tcctgatgaact 220  Q
    | ||||||||||    
T  40846288 ttctgatgaact 40846299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 10 - 225
Target Start/End: Original strand, 6517475 - 6517688
Alignment:
Q  10 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaa 109  Q
    |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||| ||  ||||| || ||||  |||| ||| ||    
T  6517475 agcagagacaaaaacagagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatctcatgctttccaa 6517574  T
Q  110 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatct 209  Q
    ||||| ||||||||| ||||||  ||| |||||||||||||||||  |||||| || || ||||| || || ||| ||||||||||||||  ||||||||    
T  6517575 tccttccaaaatagtcgttgctatacttttccagtcttctgcaatctttagacgagtttgaatcctttaaataacttttgaagctttaag--ttgcatct 6517672  T
Q  210 cctgatgaactacaac 225  Q
    ||||||||||||||||    
T  6517673 cctgatgaactacaac 6517688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 10 - 220
Target Start/End: Original strand, 23750512 - 23750720
Alignment:
Q  10 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattca-aagaacaaacatccaatgccttcaa 108  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||   ||||  |||| || ||||| |||| |||||||| ||    
T  23750512 agcagagacacaaactgagtagtggagataatggttgtacacttcgtacaattgtactttg---acgcacttcataaaaacaagcatcaaatgcctttaa 23750608  T
Q  109 atcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaa-catttgaagctttaagtcttgcat 207  Q
     | | ||  ||  ||| ||||||||||||| |  |||||||||| ||| ||| |  ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  23750609 cttcatttgaagcagtcgttgcttcactctcctggtcttctgcagtgc-taggcgtgattaaatccattgaacaaccttttgaagctttaagtcttgcat 23750707  T
Q  208 ctcctgatgaact 220  Q
    |||||||||||||    
T  23750708 ctcctgatgaact 23750720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 77; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 10 - 200
Target Start/End: Original strand, 8105628 - 8105819
Alignment:
Q  10 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgct-attcaaagaacaaacatccaatgccttcaa 108  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||  ||  | |||||| |||||||||| |||||    
T  8105628 agcagagaca-aaacagagtagtggaggtagtggttgtacatttcgtacaaacgtactttgtcaacgctcttttgaggaacaagcatccaatgcgttcaa 8105726  T
Q  109 atcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagac-aagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagt 200  Q
    |||||||||||||||  ||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||| ||| | ||  ||||| |||||| |||||||| ||||||    
T  8105727 atcctttcaaaatagccgttgcttcaattttccagtcttctgcaatccttagacgaagttgaatcccattaaacaacttttgaagccttaagt 8105819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 10 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 3105540 - 3105333
Alignment:
Q  10 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaa 109  Q
    |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||| |||||||||| ||  ||||| || |||||||| | ||  ||    
T  3105540 agcagagacaaaaacagagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaaacatactatgtcaacgctctttgaagaataaccatccaatacttttcaa 3105441  T
Q  110 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatct 209  Q
    ||||||||||||||  ||||    ||| ||||||||||||||||| ||||||| || || ||||| |  |||| | ||||||||||||||  ||||||||    
T  3105440 tcctttcaaaatagccgttggaatacttttccagtcttctgcaat-cttagacgagtttgaatccttgaaacagcttttgaagctttaag--ttgcatct 3105344  T
Q  210 cctgatgaact 220  Q
    |||||||||||    
T  3105343 cctgatgaact 3105333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 10 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 56533182 - 56533030
Alignment:
Q  10 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgct-attcaaagaacaaacatccaatgccttcaa 108  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||  ||  | ||||||||||| ||||| |||||    
T  56533182 agcagagaca-aaacagagtagtggaagtagtggttgtacacttcgtacaaacgtactttgtcaacgctcttttgaggaacaaacatctaatgcattcaa 56533084  T
Q  109 atcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagac 162  Q
    |||||||||||||||  ||||||||| | || |||||||||||||| |||||||    
T  56533083 atcctttcaaaatagccgttgcttcattttttcagtcttctgcaatccttagac 56533030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 117 - 220
Target Start/End: Original strand, 23123528 - 23123631
Alignment:
Q  117 aaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatctcctgatg 216  Q
    ||||||||  ||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||| ||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23123528 aaaatagtcattgcttcactctttcagtcttctacaatacttagacgagattaaattcattgaacaatctttgaagctttaagtcttgcatctcctgatg 23123627  T
Q  217 aact 220  Q
    ||||    
T  23123628 aact 23123631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 10 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 25651224 - 25651046
Alignment:
Q  10 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaa 109  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||  |||||  ||||||||| ||  ||||| || ||| |||||||||||||    
T  25651224 agcagagaca-aaacagagtagtggaggtagtggttgtacactttgtacaaacgtactacgtcaacgctctttgaagaataagcattcaatgccttcaaa 25651126  T
Q  110 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttg 189  Q
    ||||| ||||||||  ||||||||||| ||| |||||||||| ||  ||||||||| || ||||| || |||||| ||||    
T  25651125 tccttccaaaatagccgttgcttcacttttcaagtcttctgcgatctttagacaagtttgaatccgttaaacaacttttg 25651046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 67; E-Value: 6e-30
Query Start/End: Original strand, 21 - 155
Target Start/End: Original strand, 11915701 - 11915835
Alignment:
Q  21 aaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaatcctttcaaaa 120  Q
    |||| |||||||||||   |||||||||||||| |||||||||| ||||  ||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||||| ||  |||    
T  11915701 aaacagagtagtggaggcggtggttgtacactttgtacaattgtccttttccaacgctcttcaaagaataagcatccaatgccttcaaatccatttgaaa 11915800  T
Q  121 tagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatg 155  Q
    |||| ||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  11915801 tagtcgttgcttcactcttttagtcttctgcaatg 11915835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 30 - 177
Target Start/End: Original strand, 16940026 - 16940172
Alignment:
Q  30 agtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaatcctttcaaaatagttgttg 129  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||  |  ||||| || ||| |||||||||  ||||||||||||||||| ||||    
T  16940026 agtggagatagtggttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctccttgaagaataagcattcaatgcctttcaatcctttcaaaatagtcgttg 16940125  T
Q  130 cttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccatt 177  Q
    ||  ||| ||||||||||||||||| ||||||| || || ||||||||    
T  16940126 ctatacttttccagtcttctgcaat-cttagacgagtttgaatccatt 16940172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 10 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 17398795 - 17398598
Alignment:
Q  10 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaa 109  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||| ||  ||||| || |||||||||            
T  17398795 agcagagacaaaaacagagtagtggagttagtggttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatg-------- 17398704  T
Q  110 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatct 209  Q
     |||||||||||||| ||||||  ||| |||||||||||||||||  |||| | || || ||||| |  |||||| ||||||||||||||  ||||||||    
T  17398703 -cctttcaaaatagtcgttgctatacttttccagtcttctgcaat-tttaggcgagtttgaatccttgaaacaacttttgaagctttaag--ttgcatct 17398608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 61; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 80 - 220
Target Start/End: Original strand, 15139287 - 15139427
Alignment:
Q  80 ttcaaagaacaaacatccaatgccttcaaatcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattga 179  Q
    |||||| | ||| |||||||||||||||| | | ||  || |||| ||||||||||||| |  ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  15139287 ttcaaaaagcaagcatccaatgccttcaacttcatttgaattagtcgttgcttcactctcctggtcttctgcaatgcttaaacgagattaaatccattga 15139386  T
Q  180 acaacatttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaact 220  Q
    ||||| |||||| ||||||||||  ||||| ||||||||||    
T  15139387 acaacctttgaatctttaagtctatcatcttctgatgaact 15139427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 58; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 10 - 119
Target Start/End: Original strand, 16853493 - 16853602
Alignment:
Q  10 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaa 109  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||| ||  | |||||| |||||||||| ||||||    
T  16853493 agcagagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcatacagatgtactttgtcaacgctctttgaggaacaagcatccaatgctttcaaa 16853592  T
Q  110 tcctttcaaa 119  Q
    ||| ||||||    
T  16853593 tcccttcaaa 16853602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 50; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 84 - 220
Target Start/End: Original strand, 55731844 - 55731977
Alignment:
Q  84 aagaacaaacatccaatgccttcaaatcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaa 183  Q
    ||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| || ||   ||||||||| ||||||  |||||| || || |||||||| |||||    
T  55731844 aagaataagcatccaat-ccttcaaatcctttcaaaatagtcgttgatttacctctccagtcttttgcaattgttagacgagtttgaatccattaaacaa 55731942  T
Q  184 catttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaact 220  Q
    | ||||||| ||||||  |||||||||||||||||||    
T  55731943 cttttgaagttttaag--ttgcatctcctgatgaact 55731977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 47; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 21 - 155
Target Start/End: Original strand, 17540396 - 17540530
Alignment:
Q  21 aaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaatcctttcaaaa 120  Q
    |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||| || | ||| ||| |  |||||| || ||||| |||| |   ||     
T  17540396 aaacagagtagtggagataatggttgtacacttcgtacaattgtcctttttcaacactctccaacgaataggcatccactggcttcacatccatctgaat 17540495  T
Q  121 tagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatg 155  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||| |||||||    
T  17540496 tagttgttgcttcattctttcagtcttttgcaatg 17540530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 26 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 41114875 - 41114707
Alignment:
Q  26 gagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaatcctttcaaaatagtt 125  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||  ||||||||||| |||| ||||| || | |||  || || |||||||||||||||||| | ||  ||||||      
T  41114875 gagtggtggaaatagtggttgtacacgacgtacaattgtcctttttcaactctctccaacaaaaaagcatccaatgccttcaaattcatttgaaatagcc 41114776  T
Q  126 gttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctt 195  Q
    ||||||||| ||||| |||||| |||||||   || |  ||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  41114775 gttgcttcattcttctagtcttttgcaatg-acaggcttgattaaatcaattgaacaacctttgaagctt 41114707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 45; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 10 - 102
Target Start/End: Original strand, 38513868 - 38513960
Alignment:
Q  10 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgc 102  Q
    |||||||||| |||| |||||||| |  |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||  |||||  ||||||||||||    
T  38513868 agcagagacaaaaacagagtagtgaaagtagtggttgtacacttcgtacaatcgtactatgtcaacgctctttgaagaattaacatccaatgc 38513960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 10 - 78
Target Start/End: Original strand, 20977447 - 20977515
Alignment:
Q  10 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgct 78  Q
    |||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||  | ||| ||||||||||    
T  20977447 agcagagacaaaaacagagtagtgcagatagtggttgtacacttcgtacaaacgcactatgtcaacgct 20977515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 10 - 78
Target Start/End: Original strand, 22190836 - 22190904
Alignment:
Q  10 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgct 78  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||    
T  22190836 agcagagacaaaaacagagtagtggaagtagtggttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgct 22190904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 26 - 65
Target Start/End: Complemental strand, 8685548 - 8685509
Alignment:
Q  26 gagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgta 65  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8685548 gagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgta 8685509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 29 - 155
Target Start/End: Original strand, 11901196 - 11901322
Alignment:
Q  29 tagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaatcctttcaaaatagttgtt 128  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||   |||| | | || |||| || |||||||||||||||||  ||||  || |||| |||    
T  11901196 tagtgtagatagtgattgtacacttcgtacaattgtccttttctaacgttctccagagaataagcatccaatgccttcaaaatcttttgaattagtcgtt 11901295  T
Q  129 gcttcactcttccagtcttctgcaatg 155  Q
    ||||||   ||| ||||||||||||||    
T  11901296 gcttcatgtttctagtcttctgcaatg 11901322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 26 - 110
Target Start/End: Complemental strand, 17788152 - 17788067
Alignment:
Q  26 gagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgt-caacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaat 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| | ||||| | | ||||||| || |||| |||||||| ||||    
T  17788152 gagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattgtcctttttccaacgttctccaaagaataagcatctaatgcctttaaat 17788067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 10 - 78
Target Start/End: Complemental strand, 39419855 - 39419787
Alignment:
Q  10 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgct 78  Q
    |||||||||| |||| ||||| ||||  |||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||    
T  39419855 agcagagacaaaaacagagtaatggaagtagtggttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgct 39419787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 10 - 102
Target Start/End: Original strand, 40860657 - 40860749
Alignment:
Q  10 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgc 102  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||  |||||||||||||| || |||||  ||||| |||||||||| ||  ||||| || ||||||||||    
T  40860657 agcagagacaaaaacagagtagtggaagtagtggttgtacacatcatacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgc 40860749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 26 - 76
Target Start/End: Original strand, 1672395 - 1672445
Alignment:
Q  26 gagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacg 76  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||    
T  1672395 gagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaaacgtattttgtcaacg 1672445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 26 - 76
Target Start/End: Original strand, 1674870 - 1674920
Alignment:
Q  26 gagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacg 76  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||    
T  1674870 gagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaaacgtattttgtcaacg 1674920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 10 - 60
Target Start/End: Complemental strand, 14154115 - 14154065
Alignment:
Q  10 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaa 60  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  14154115 agcagagacaaaaacagagtagtggagaaggtggttgtacacttcgtacaa 14154065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 38 - 78
Target Start/End: Complemental strand, 3499745 - 3499705
Alignment:
Q  38 tagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgct 78  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  3499745 tagtggttgtacacttcgtacaaatgtactatgtcaacgct 3499705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 10 - 78
Target Start/End: Complemental strand, 9751661 - 9751593
Alignment:
Q  10 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgct 78  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||  ||||||||||||||||||| |||   |||| ||||||||||    
T  9751661 agcagagacaaaaacagagtagtggaagtagtggttgtacacttcgtgcaaacatactatgtcaacgct 9751593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #59
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 21 - 78
Target Start/End: Complemental strand, 27188748 - 27188691
Alignment:
Q  21 aaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgct 78  Q
    |||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||  | ||| ||||||||||    
T  27188748 aaacagagtagtgcagatagtggttatacacttcgtacaaacgcactatgtcaacgct 27188691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0065 (Bit Score: 168; Significance: 3e-90; HSPs: 1)
Name: scaffold0065
Description:

Target: scaffold0065; HSP #1
Raw Score: 168; E-Value: 3e-90
Query Start/End: Original strand, 10 - 217
Target Start/End: Original strand, 1686 - 1893
Alignment:
Q  10 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaa 109  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  1686 agcagagacacaaactaagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagtacaagcatccaatgccttcaaa 1785  T
Q  110 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatct 209  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |    
T  1786 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcctccagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcattt 1885  T
Q  210 cctgatga 217  Q
    ||| ||||    
T  1886 cctaatga 1893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 168; Significance: 3e-90; HSPs: 47)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 168; E-Value: 3e-90
Query Start/End: Original strand, 10 - 221
Target Start/End: Original strand, 13602168 - 13602379
Alignment:
Q  10 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaa 109  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||||| | ||||||||| || ||||||||||||||||     
T  13602168 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttatacacttcttacaattgtattttgtcaacgttcttcaaagaataagcatccaatgccttcaat 13602267  T
Q  110 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatct 209  Q
    || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  13602268 tcatttcaaaatagtggttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatct 13602367  T
Q  210 cctgatgaacta 221  Q
    ||||||||||||    
T  13602368 cctgatgaacta 13602379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 164; E-Value: 8e-88
Query Start/End: Original strand, 10 - 221
Target Start/End: Original strand, 32544261 - 32544472
Alignment:
Q  10 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaa 109  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||| |||||||||||||||| |||    
T  32544261 agcagagacagaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaataaacatccaatgcctttaaa 32544360  T
Q  110 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatct 209  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  32544361 tcctttcaaaatagacgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatct 32544460  T
Q  210 cctgatgaacta 221  Q
    ||||||||||||    
T  32544461 cctgatgaacta 32544472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 162; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 10 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 26972379 - 26972173
Alignment:
Q  10 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaa 109  Q
    |||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||| |||    
T  26972379 agcagagacaaatactgagtagtggaggtagtggttgtacacttcg--caattgtactttgtcaacgctctttgaagaacaaacatccaatgcctttaaa 26972282  T
Q  110 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatct 209  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26972281 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttcaagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatct 26972182  T
Q  210 cctgatgaa 218  Q
    |||||||||    
T  26972181 cctgatgaa 26972173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 159; E-Value: 8e-85
Query Start/End: Original strand, 14 - 220
Target Start/End: Original strand, 23284564 - 23284770
Alignment:
Q  14 gagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaatcct 113  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||| |||||||||||||||||    
T  23284564 gagacacaaactgagtagtggagataatggttatacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaggaacaagcattcaatgccttcaaatcct 23284663  T
Q  114 ttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatctcctg 213  Q
    ||||||||||  ||||||||||| |||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23284664 ttcaaaataggcgttgcttcacttttctggtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatctcctg 23284763  T
Q  214 atgaact 220  Q
    |||||||    
T  23284764 atgaact 23284770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 158; E-Value: 3e-84
Query Start/End: Original strand, 12 - 221
Target Start/End: Original strand, 9717841 - 9718050
Alignment:
Q  12 cagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaatc 111  Q
    |||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||| |||| |||||||| |||||    
T  9717841 cagagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaacaagcatcaaatgcctttaaatc 9717940  T
Q  112 ctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatctcc 211  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  9717941 ctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctacaatgtttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcc 9718040  T
Q  212 tgatgaacta 221  Q
    ||||||||||    
T  9718041 tgatgaacta 9718050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 155; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 11 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 20112852 - 20112642
Alignment:
Q  11 gcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaat 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  20112852 gcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacatttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatccaatgctttcaaat 20112753  T
Q  111 cctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaa-catttgaagctttaagtcttgcatct 209  Q
    |||||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||    
T  20112752 cctttcaaaatagtcgttgcttcattcttccggtcttctgcaatgcttagaagagattaaatccattgaacaacctttttaagctttaagtcttgcatct 20112653  T
Q  210 cctgatgaact 220  Q
    | |||||||||    
T  20112652 cttgatgaact 20112642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 153; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 10 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 12715573 - 12715357
Alignment:
Q  10 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaa 109  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |  ||| |||||| ||||||    
T  12715573 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttctacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaataggcatacaatgctttcaaa 12715474  T
Q  110 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaaca-acatttgaagctttaagtcttgcatc 208  Q
    || |||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||    
T  12715473 tcatttcaaaatagtcgttgcttcactctttcaatcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacagccttttgaagctttaagtcttgcatc 12715374  T
Q  209 tcctgatgaactacaac 225  Q
    |||||||||||||||||    
T  12715373 tcctgatgaactacaac 12715357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 148; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 10 - 217
Target Start/End: Original strand, 15302196 - 15302403
Alignment:
Q  10 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaa 109  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||    
T  15302196 agcagagacactaactgagtagtggagatagtggttgtacactttgtacaattgtacaatgtcaacgctcttcaaagaacaagcatccaatgcctttaaa 15302295  T
Q  110 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatct 209  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  15302296 tcctttcaaaatagccgttgcttcacttttccagtcttctgcaatgtttagacgagattaaatccattgaacaacctttgacgctttaagtcttgcatct 15302395  T
Q  210 cctgatga 217  Q
    ||| ||||    
T  15302396 cctaatga 15302403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 26 - 220
Target Start/End: Original strand, 13435544 - 13435738
Alignment:
Q  26 gagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaatcctttcaaaatagtt 125  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||     
T  13435544 gagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgcttttcaaagaacaatcattcaatgctttcaaatcctttcaaaatagtc 13435643  T
Q  126 gttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaact 220  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13435644 gttgcttcactcttccaatcttctgcaatgcttaaacgagattaaatccattgaaaatcctttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaact 13435738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 10 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 14100592 - 14100383
Alignment:
Q  10 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaa 109  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||| || |||||||||||||||||    
T  14100592 agcagagaca-aaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtataattgtactttgtcaacgctctttaaagaagaagcatccaatgccttcaaa 14100494  T
Q  110 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatct 209  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||| | |||||| |||||||||||||||||    
T  14100493 tcctttcaaaatagttgtttcttcactcttccagtcttctacaatgcttagatgagattaaatccattgaacatcctttgaaactttaagtcttgcatct 14100394  T
Q  210 cctgatgaact 220  Q
    |||||||||||    
T  14100393 cctgatgaact 14100383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 143; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 10 - 196
Target Start/End: Original strand, 18378310 - 18378496
Alignment:
Q  10 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaa 109  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||    
T  18378310 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttatcaacgctcttcaaagaacatgcatccaatgccttcaaa 18378409  T
Q  110 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagcttt 196  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||  ||||||||||    
T  18378410 tcctttcaaaatagttgttgcttgactcttccagtcttttgcaatacttagacgagatttaatccattgaacaaccgttgaagcttt 18378496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 13 - 217
Target Start/End: Original strand, 15987232 - 15987437
Alignment:
Q  13 agagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaat-c 111  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| |    
T  15987232 agagacacaaactgagtaatggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatccaatgccttcaaatcc 15987331  T
Q  112 ctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatctcc 211  Q
    |||| ||||||||  ||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||  ||||| |    
T  15987332 cttttaaaatagtcattgcttcactcttctggtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacatcctttgaagctctaagtctctcatcttc 15987431  T
Q  212 tgatga 217  Q
    ||||||    
T  15987432 tgatga 15987437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 10 - 223
Target Start/End: Original strand, 29918013 - 29918225
Alignment:
Q  10 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaa 109  Q
    |||| ||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||| ||||  |||||||||||    
T  29918013 agcatagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaacaagcatctgatgccttcaaa 29918112  T
Q  110 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatct 209  Q
    || ||||||| |||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  29918113 tcttttcaaactagtcgttgcttcacttttccaatcttctgcaatgcttagacgagattaaatcca-tgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatct 29918211  T
Q  210 cctgatgaactaca 223  Q
    ||||||||||||||    
T  29918212 cctgatgaactaca 29918225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 136; E-Value: 4e-71
Query Start/End: Original strand, 10 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 15531777 - 15531562
Alignment:
Q  10 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaa 109  Q
    |||||||||| | || ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||| |||||||||||||||||    
T  15531777 agcagagacaaagacagagtagtggaggtagtggttgtacgcttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaacaagcatccaatgccttcaaa 15531678  T
Q  110 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatct 209  Q
    |||||||||||||   |||| || ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  15531677 tcctttcaaaataaccgttgttttactcttctagtcttctgcaatgcttagacgagattaaattcattgaacaacctttcaagctttaagtcttgcatct 15531578  T
Q  210 cctgatgaactacaac 225  Q
     |||||||||||||||    
T  15531577 tctgatgaactacaac 15531562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 10 - 220
Target Start/End: Original strand, 19623975 - 19624185
Alignment:
Q  10 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactt-tgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaa 108  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||| | |||||||||| |||||||||| |||||    
T  19623975 agcaaagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactagtgt-aacgctctccaaagaacaatcatccaatgctttcaa 19624073  T
Q  109 atcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatc 208  Q
    ||||||||| |||||| |||||||||||| ||  ||||| |||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  19624074 atcctttcagaatagtcgttgcttcactcctctggtcttttgcaatgcttggacgagattgaatccattgaacaacctttgaagctttaagacttgcatc 19624173  T
Q  209 tcctgatgaact 220  Q
    ||||||||||||    
T  19624174 tcctgatgaact 19624185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 10 - 220
Target Start/End: Original strand, 24116824 - 24117035
Alignment:
Q  10 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaa 109  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  24116824 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactatgtcaacgctcttcaaagaacaagcatccaatgctttcaaa 24116923  T
Q  110 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaaca-acatttgaagctttaagtcttgcatc 208  Q
    |||||||||||||   | | |||||||| ||  ||||| |||||||||| ||| ||||| |||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||    
T  24116924 tcctttcaaaataaccgctacttcactcctctggtcttttgcaatgcttggacgagattgaatccattgaacagccttttgaagctttaagtcttgcatc 24117023  T
Q  209 tcctgatgaact 220  Q
    | ||||||||||    
T  24117024 ttctgatgaact 24117035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 27 - 217
Target Start/End: Original strand, 21625114 - 21625303
Alignment:
Q  27 agtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaatcctttcaaaatagttg 126  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||  |||||||| ||| |||||||||||||| |||||||| |||  |    
T  21625114 agtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgttaacgctctttgaagaacaagcatgcaatgccttcaaatgctttcaaa-tagccg 21625212  T
Q  127 ttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatctcctgatga 217  Q
    |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  21625213 ttgctttactcttccaatcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctgtaagtcttgcatctcctgatga 21625303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 10 - 225
Target Start/End: Original strand, 22802137 - 22802350
Alignment:
Q  10 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaa 109  Q
    |||||||||| |||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||  |||||||| ||||||||||||| |||    
T  22802137 agcagagacaaaaatagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgttaacgctctttgaagaacaagcatccaatgcctttaaa 22802236  T
Q  110 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatct 209  Q
    | |||||||| | || |||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||  | ||||||||    
T  22802237 ttctttcaaacttgtcgttgtttcacttttccagtcgtctgcaatgcttagacaatattaaatccattgaacaacctttgaagcttta--tgttgcatct 22802334  T
Q  210 cctgatgaactacaac 225  Q
    ||||||||||||||||    
T  22802335 cctgatgaactacaac 22802350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 124; E-Value: 6e-64
Query Start/End: Original strand, 10 - 221
Target Start/End: Original strand, 18435552 - 18435763
Alignment:
Q  10 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaa 109  Q
    |||||||||| |||| | ||| ||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||  |||||||| |||||||||||||||||    
T  18435552 agcagagacaaaaacagtgtactggaggtagtggttgtacactttgtacacttgtactttgtcaacgctctttgaagaacaagcatccaatgccttcaaa 18435651  T
Q  110 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatct 209  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||| || ||| ||||||| ||||||||||||||||| ||| ||  ||||||||||||||||||||    
T  18435652 tcctttcaaaatagtcgttgcttcacttttctagtcttttgaaattcttagacgagattaaatccattgaataaccttcaaagctttaagtcttgcatct 18435751  T
Q  210 cctgatgaacta 221  Q
    ||||||||||||    
T  18435752 cctgatgaacta 18435763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 124; E-Value: 6e-64
Query Start/End: Original strand, 38 - 220
Target Start/End: Original strand, 19688790 - 19688970
Alignment:
Q  38 tagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaatcctttcaaaatagttgttgcttcactc 137  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  19688790 tagtggttatacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaacaaacatccaatgccttcaaatcctttcaaaatagtccttgcttcactc 19688889  T
Q  138 ttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaact 220  Q
    ||||||| |||| |||||||| ||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  19688890 ttccagttttctacaatgcttggacgagaataaatccattgaacaacctttgaagctttaagtc--gcatctcctgatgaact 19688970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 10 - 220
Target Start/End: Original strand, 19086154 - 19086354
Alignment:
Q  10 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaa 109  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||            
T  19086154 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactatgtcaacgctcttcaaagaacaagcatccaatg-------- 19086245  T
Q  110 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaa-caacatttgaagctttaagtcttgcatc 208  Q
      ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| || |  ||| ||||||||||||||||||    
T  19086246 --ctttcaaaatagtcgttgcttcactctcccagtcttctgcaatacttagacgagattaaatccattgaatcagcccttg-agctttaagtcttgcatc 19086342  T
Q  209 tcctgatgaact 220  Q
    ||||||||||||    
T  19086343 tcctgatgaact 19086354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 14 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 20730853 - 20730649
Alignment:
Q  14 gagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaatcct 113  Q
    |||||| |||| ||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20730853 gagacaaaaacagagcagtggaggtagtggttgtacactttgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaacaaacatccaatgccttcaaatcct 20730754  T
Q  114 ttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatctcctg 213  Q
    |||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||| ||||||| | |||||||||||   | || |||||||||    
T  20730753 ttcaaactagtcgttgcttcacttttccagtcttctgcaatacttagatgagattaaatcccttgaacagcctttgaagcttt--ttgttacatctcctg 20730656  T
Q  214 atgaact 220  Q
    |||||||    
T  20730655 atgaact 20730649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 106; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 44 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 34451787 - 34451610
Alignment:
Q  44 ttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaatcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccag 143  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |  ||| |||||| |||||||||| ||||| |||| |||||||||||||| |||    
T  34451787 ttgtacactttgtacaattgtactttgtcaacgcttttcaaagaataggcatacaatgctttcaaatcctctcaaattagtcgttgcttcactctttcag 34451688  T
Q  144 tcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaacta 221  Q
    ||||||||||||||||||| | | | ||||||||||||| | |||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  34451687 tcttctgcaatgcttagacgatactgaatccattgaacagcctttgaatctttaagtcttgcatctcctgatgaacta 34451610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 104; E-Value: 5e-52
Query Start/End: Original strand, 10 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 16265303 - 16265116
Alignment:
Q  10 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaa 109  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||  |||||||| |||||||||| ||||||    
T  16265303 agcagagacacaaacagagtagtggaggtagtggttgcacacttcgtacaattgtactttctcaacgctctttgaagaacaagcatccaatgcattcaaa 16265204  T
Q  110 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagcttta 197  Q
     ||||||||  || | ||||||||||| |||||||| | |||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  16265203 acctttcaatctactcgttgcttcacttttccagtcctgtgcaatgcttagatgagattaaatccattgaacaacctttcaagcttta 16265116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 101; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 10 - 225
Target Start/End: Original strand, 16336123 - 16336336
Alignment:
Q  10 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaa 109  Q
    |||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||  ||||| || ||| |||||||||| ||    
T  16336123 agcagagacaaaaacagagtagtgtagatagtggttgtacacttcgtacaatcgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcattcaatgccttctaa 16336222  T
Q  110 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatct 209  Q
    ||||| ||||||||| ||||||  ||| |||||||||||||||||| |||||| || || ||||| || |||||| |||||||||| |||  ||||||||    
T  16336223 tccttccaaaatagtcgttgctatacttttccagtcttctgcaatgtttagacgagtttgaatcctttaaacaacttttgaagcttcaag--ttgcatct 16336320  T
Q  210 cctgatgaactacaac 225  Q
    |||||||| |||||||    
T  16336321 cctgatgatctacaac 16336336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 92 - 225
Target Start/End: Original strand, 25597557 - 25597690
Alignment:
Q  92 acatccaatgccttcaaatcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaa 191  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||  || ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||    
T  25597557 acatccaatgccttcaaatcctttcgaaatagccgtcgcttcactcttccagtcttctacaatgcttagacgagattaaatccattgaacatcctttgaa 25597656  T
Q  192 gctttaagtcttgcatctcctgatgaactacaac 225  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  25597657 gctttaagtcttgcatgtcctgatgaactacaac 25597690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 97; E-Value: 8e-48
Query Start/End: Original strand, 10 - 225
Target Start/End: Original strand, 16877209 - 16877422
Alignment:
Q  10 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaa 109  Q
    ||||||| || |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||  | |||  | |||||||| ||||||||    
T  16877209 agcagaggcaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaaacgtactttgtcaacgctctttgaggaattagcatccaattccttcaaa 16877308  T
Q  110 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatct 209  Q
    |||||| || ||||| ||||||||||| |  ||||||||||||||  |||||| || || |||||||| |||||| ||||||||||||||  ||||||||    
T  16877309 tccttttaagatagtcgttgcttcactttctcagtcttctgcaatctttagacgagtttgaatccattaaacaacttttgaagctttaag--ttgcatct 16877406  T
Q  210 cctgatgaactacaac 225  Q
    ||||||||||||||||    
T  16877407 cctgatgaactacaac 16877422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 13 - 223
Target Start/End: Original strand, 15954702 - 15954910
Alignment:
Q  13 agagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaatcc 112  Q
    ||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||  || ||||| ||| ||||||||||||||||    
T  15954702 agagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaaacgtactttgtcaacgctctttgaataacaagcattcaatgccttcaaatcc 15954801  T
Q  113 tttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatctcct 212  Q
    ||||||| |||| ||||||||| | |||||||||||||||||  |||||  || || ||||| || |||| | ||||||||||||||  ||||||||| |    
T  15954802 tttcaaattagtcgttgcttcatttttccagtcttctgcaatctttagaagagtttgaatccgttaaacagcttttgaagctttaag--ttgcatctctt 15954899  T
Q  213 gatgaactaca 223  Q
    |||||||||||    
T  15954900 gatgaactaca 15954910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 10 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 22076560 - 22076349
Alignment:
Q  10 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaa 109  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||  ||||| || |||| ||||| ||| ||    
T  22076560 agcagagacaaaaacagagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaaatgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatcaaatgctttccaa 22076461  T
Q  110 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatct 209  Q
    ||||| ||||||||| ||||||  ||| ||| |||||||||||||  |||||| || |||||||| || |||| | ||| ||||||||||  ||||||||    
T  22076460 tccttccaaaatagtcgttgctatacttttcgagtcttctgcaatctttagacgagtttaaatcctttaaacagcttttaaagctttaag--ttgcatct 22076363  T
Q  210 cctgatgaactaca 223  Q
    ||||||||||||||    
T  22076362 cctgatgaactaca 22076349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 21 - 223
Target Start/End: Original strand, 21618251 - 21618451
Alignment:
Q  21 aaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaatcctttcaaaa 120  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||| ||  ||||| || |||||||||||||||||||||| |||||    
T  21618251 aaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgccttcaaatccttccaaaa 21618350  T
Q  121 tagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaact 220  Q
    |||| ||||||| ||| |||||||||||| ||||  |||||  || || ||||| || |||||| ||||||||||||||  |||||||| ||||||||||    
T  21618351 tagtcgttgctttacttttccagtcttctacaatctttagaagagtttgaatccgttaaacaacttttgaagctttaag--ttgcatcttctgatgaact 21618448  T
Q  221 aca 223  Q
    |||    
T  21618449 aca 21618451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 10 - 180
Target Start/End: Original strand, 26943572 - 26943741
Alignment:
Q  10 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaa 109  Q
    |||| ||||| |||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||    
T  26943572 agcaaagacaaaaacagagtagtggaagtagtggttgtacacttcgtacaattgtacttcgccaacgctcttcaaagaacaagcatccaatgccttctaa 26943671  T
Q  110 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaa 180  Q
    |||| |  ||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||    
T  26943672 tcctattgaaatagcggttgcttcactcttctagtcttctgcaatgc-tagacatgattaaatcctttgaa 26943741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 10 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 20488071 - 20487857
Alignment:
Q  10 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaa 109  Q
    |||||| ||| |||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||| ||  |||||||| |||||||||||||||||    
T  20488071 agcagatacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtaaacttcgtacaaacgtactttgtcaacgctctttgaagaacaagcatccaatgccttcaaa 20487972  T
Q  110 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagatt-aaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatc 208  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||| || ||||||||||||||  |||||| || || ||  ||||| |||||| |||||||| |||||  |||||||    
T  20487971 tcctttcaaaatagccgttgcttcacttttacagtcttctgcaatctttagacgaggttgaaccccattaaacaacttttgaagccttaag--ttgcatc 20487874  T
Q  209 tcctgatgaactacaac 225  Q
      |||||||||| ||||    
T  20487873 ctctgatgaactgcaac 20487857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 27 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 10640555 - 10640384
Alignment:
Q  27 agtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgt-caacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaatcctttcaaaatagtt 125  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||  || ||||     
T  10640555 agtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaattgtccttttttcaacgctcttcaaagaacaagcatctaatgccttcaaatccttttgaattagtc 10640456  T
Q  126 gttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaa 198  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||| ||| |  |||||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  10640455 gttgcttcactcttctggtcttctgcaatgc-taggcgtgattaaatcctttgaacaacctttgaagctttaa 10640384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 8 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 19833187 - 19832974
Alignment:
Q  8 gaagcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgct-attcaaagaacaaacatccaatgccttc 106  Q
    |||||||| ||| |||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||  ||||| ||||||||||  ||  | |||||| |||||||||| |||    
T  19833187 gaagcagacaca-aaacagagtagtggaggtagtgcttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctcttttgaggaacaagcatccaatgcgttc 19833089  T
Q  107 aaatcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgca 206  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||  |||||  || || ||||| || |||| | ||| ||||||||||  |||||    
T  19833088 aaatcctttcaaaatagtcgttgcttcacttttccagtcttctgcaatctttagatgagtttgaatccgttaaacagcttttaaagctttaag--ttgca 19832991  T
Q  207 tctcctgatgaactaca 223  Q
    |||||||||||||||||    
T  19832990 tctcctgatgaactaca 19832974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 82; E-Value: 7e-39
Query Start/End: Original strand, 16 - 220
Target Start/End: Original strand, 12348995 - 12349196
Alignment:
Q  16 gacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaatccttt 115  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||| |||||||||| ||  ||||| || |||||||||||||  ||||||||    
T  12348995 gacaaaaacagagtagtggagatagtggttgtacactttgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgcctttcaatccttt 12349094  T
Q  116 caaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatctcctgat 215  Q
    ||||||||| ||||||  ||| ||||||||||||||||| ||||||| || || ||||| |  |||| | ||||||||| ||||  ||||||||||||||    
T  12349095 caaaatagtcgttgctatacttttccagtcttctgcaat-cttagacgagtttgaatccttgaaacagcttttgaagctctaag--ttgcatctcctgat 12349191  T
Q  216 gaact 220  Q
    |||||    
T  12349192 gaact 12349196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 77; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 14 - 182
Target Start/End: Original strand, 12423261 - 12423428
Alignment:
Q  14 gagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaatcct 113  Q
    |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||| ||  ||||| || ||| |||||||||| ||||||    
T  12423261 gagacaaaaacagagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaaaggtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatacaatgccttccaatcct 12423360  T
Q  114 ttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaaca 182  Q
    ||||||||||| ||||||  ||| |||||||||||||| || ||||||| || || |||||||| ||||    
T  12423361 ttcaaaatagtcgttgctatacttttccagtcttctgc-attcttagacgagtttgaatccattaaaca 12423428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 27 - 195
Target Start/End: Original strand, 19470683 - 19470850
Alignment:
Q  27 agtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaatcctttcaaaatagttg 126  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||| || ||||| | |||||||||| |||||||||||||||||||||||  || |||| |    
T  19470683 agtagtggaggtagtggttgtaaacttcgtacaattgtcctttttccacgctctgcaaagaacaagcatccaatgccttcaaatccttttgaattagtcg 19470782  T
Q  127 ttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctt 195  Q
    |||||||| |||||  ||||| |||||||| ||| |  |||||||||  ||||||||| ||||||||||    
T  19470783 ttgcttcattcttctggtcttgtgcaatgc-taggcgtgattaaatctgttgaacaacctttgaagctt 19470850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 10 - 101
Target Start/End: Original strand, 25594064 - 25594155
Alignment:
Q  10 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatg 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||    
T  25594064 agcagagacacaaactgagtagtggaggtagtggttgtacatttcgtacaattgtactttgtcaacgcgcttcaaagaacaagcatccaatg 25594155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 62; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 26 - 220
Target Start/End: Original strand, 21235137 - 21235317
Alignment:
Q  26 gagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaatcctttcaaaatagtt 125  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||  |||||||| |||| ||||||||||||| |||||||           
T  21235137 gagtagtggaggtagtggttgtacacttcatacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaacaagcatcgaatgccttcaaatgctttcaa------- 21235229  T
Q  126 gttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaact 220  Q
    ||   || |      ||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||  | |||||||||||||||||||    
T  21235230 gtccattga-----acagccttttgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacctttaaagcttta--tgttgcatctcctgatgaact 21235317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 55; E-Value: 9e-23
Query Start/End: Original strand, 10 - 152
Target Start/End: Complemental strand, 33352079 - 33351939
Alignment:
Q  10 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaa 109  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||| |||||||||| ||  ||||| ||||||||||||  ||  ||    
T  33352079 agcagagacaaaaacagagtagtggagatagtgattgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctt-gaagaataaacatccaatgtttttcaa 33351981  T
Q  110 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgca 152  Q
    ||||||||||||||   |||||  ||| |||||||||||||||    
T  33351980 tcctttcaaaatag-ccttgctatacttttccagtcttctgca 33351939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 10 - 92
Target Start/End: Original strand, 17381517 - 17381599
Alignment:
Q  10 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaa 92  Q
    |||||||||| |||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||  |||||||||    
T  17381517 agcagagacaaaaacagaatagtggaggtagtgattgtacacttcgtacaaacgtactttgtcaacgctctttgaagaacaaa 17381599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 10 - 102
Target Start/End: Complemental strand, 19066171 - 19066079
Alignment:
Q  10 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgc 102  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||   |||| |||||||||| ||  ||||| || ||||||||||    
T  19066171 agcagagacaaaaacagagtagtggaagtagtggttgtacacttcgtacaaacatactatgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgc 19066079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 13 - 78
Target Start/End: Original strand, 19482751 - 19482816
Alignment:
Q  13 agagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgct 78  Q
    ||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||  | ||| ||||||||||    
T  19482751 agagacaaaaacagagtagtgcagatagtggttgtacacttcgtacaaacgcactatgtcaacgct 19482816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 10 - 78
Target Start/End: Complemental strand, 17316678 - 17316610
Alignment:
Q  10 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgct 78  Q
    |||||||||| ||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||  | ||| ||||||||||    
T  17316678 agcagagacaaaaacatagtagtgcagatagtggttgtacacttcgtacaaacgcactatgtcaacgct 17316610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 26 - 110
Target Start/End: Original strand, 25930485 - 25930568
Alignment:
Q  26 gagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaat 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || |||| ||| | ||||  ||||||| ||||| ||| || ||||||||| ||||||||    
T  25930485 gagtagtggagatagtggttgtacaatt-gtactattatccttttccaacgctcttcaaggaataagcatccaatgacttcaaat 25930568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 15 - 120
Target Start/End: Complemental strand, 14051529 - 14051425
Alignment:
Q  15 agacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaatcctt 114  Q
    ||||| |||| |||||||||||  ||||| ||||| |||||||||| ||||||||||| || || ||  ||| | || ||||||||| |||||||| | |    
T  14051529 agacaaaaacagagtagtggaggaagtggctgtacgcttcgtacaa-tgtactttgtcgactctctttgaaggataagcatccaatgacttcaaattcct 14051431  T
Q  115 tcaaaa 120  Q
    ||||||    
T  14051430 tcaaaa 14051425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 10 - 78
Target Start/End: Original strand, 26589595 - 26589664
Alignment:
Q  10 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacac-ttcgtacaattgtactttgtcaacgct 78  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||  |||||||||||||| ||||||||   ||||| ||||||||||    
T  26589595 agcagagacagaaacagagtagtggaagtagtggttgtacactttcgtacagacgtactatgtcaacgct 26589664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0290 (Bit Score: 165; Significance: 2e-88; HSPs: 1)
Name: scaffold0290
Description:

Target: scaffold0290; HSP #1
Raw Score: 165; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 12 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 18734 - 18526
Alignment:
Q  12 cagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaatc 111  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  18734 cagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtaaaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagtatccaatgccttcaaatc 18635  T
Q  112 ctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatctcc 211  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||  |||||    
T  18634 ctttcaaaatagtcgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacagcctttgaagctttaaatcttgtgtctcc 18535  T
Q  212 tgatgaact 220  Q
    |||||||||    
T  18534 tgatgaact 18526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0411 (Bit Score: 164; Significance: 8e-88; HSPs: 1)
Name: scaffold0411
Description:

Target: scaffold0411; HSP #1
Raw Score: 164; E-Value: 8e-88
Query Start/End: Original strand, 10 - 221
Target Start/End: Original strand, 12205 - 12416
Alignment:
Q  10 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaa 109  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||| ||||||    
T  12205 agcagagacacaatctgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaataagcatccaatgctttcaaa 12304  T
Q  110 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatct 209  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||  |||    
T  12305 ttctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacgagattaaattcattgaacagcctttgaagctttaagtcttgtgtct 12404  T
Q  210 cctgatgaacta 221  Q
    ||||||||||||    
T  12405 cctgatgaacta 12416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0083 (Bit Score: 157; Significance: 1e-83; HSPs: 2)
Name: scaffold0083
Description:

Target: scaffold0083; HSP #1
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 13 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 26087 - 25883
Alignment:
Q  13 agagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaatcc 112  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  26087 agagacacaaactgagtagtcgagatagtggttgtacacttcatacaattgtactatgtcaaccctcttcaaagaacaagcatccaatgccttcaaatcc 25988  T
Q  113 tttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatctcct 212  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  25987 tttcaaaatagtcgttgcttcacttttccagtcttttgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacctttgacgctttaagtcttgcatctcct 25888  T
Q  213 gatga 217  Q
    |||||    
T  25887 gatga 25883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0083; HSP #2
Raw Score: 87; E-Value: 7e-42
Query Start/End: Original strand, 47 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 44782 - 44652
Alignment:
Q  47 tacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaatcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtct 146  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||    
T  44782 tacacttcgtacaattgtattatgtcaacgctcttcaaagaacaagcatctaatgccttcaaatcctttcaaaatagacgttgcttcacttttccagtct 44683  T
Q  147 tctgcaatgcttagacaagattaaatccatt 177  Q
    ||| |||| ||||||| ||||||||||||||    
T  44682 tctacaatacttagacgagattaaatccatt 44652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0359 (Bit Score: 155; Significance: 2e-82; HSPs: 1)
Name: scaffold0359
Description:

Target: scaffold0359; HSP #1
Raw Score: 155; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 10 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 5805 - 5595
Alignment:
Q  10 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaa 109  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||| |    
T  5805 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtagttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttaaaagaacaagcatccaatgccttcata 5706  T
Q  110 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatct 209  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||| |||| ||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  5705 tcctttcaaaatagatgttgctccactcttccaatcttctacaatacttggacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctctaagtcttgcatct 5606  T
Q  210 cctgatgaact 220  Q
    |||||||||||    
T  5605 cctgatgaact 5595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026 (Bit Score: 155; Significance: 2e-82; HSPs: 3)
Name: scaffold0026
Description:

Target: scaffold0026; HSP #1
Raw Score: 155; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 10 - 220
Target Start/End: Original strand, 60012 - 60222
Alignment:
Q  10 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaa 109  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  60012 agcagagacacaaactgagtagaagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactatgtcaacgctcttcaaagaacaagcatccaatggcttcaaa 60111  T
Q  110 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatct 209  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  60112 tcctttcaaaatagtcgttgcttcacttttccagtcttctgcaattcttggacgagattaaatccattgaacatcctttgaagctttaagtcttgcatct 60211  T
Q  210 cctgatgaact 220  Q
     ||||||||||    
T  60212 tctgatgaact 60222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026; HSP #2
Raw Score: 151; E-Value: 5e-80
Query Start/End: Original strand, 10 - 220
Target Start/End: Original strand, 7922 - 8132
Alignment:
Q  10 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaa 109  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||  ||||||    
T  7922 agcagagacacaaacttcgtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactatgtcaacgctcttcaaagaacaagcatccaatgaattcaaa 8021  T
Q  110 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatct 209  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  8022 tcctttcaaaatagtcgttgcttcacttttacagtcttctacaatgcttggacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagttttgcatct 8121  T
Q  210 cctgatgaact 220  Q
    |||||||||||    
T  8122 cctgatgaact 8132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026; HSP #3
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 165 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 151831 - 151794
Alignment:
Q  165 gattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtct 202  Q
    |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  151831 gattaaatcctttgaacaacctttgaagctttaagtct 151794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0227 (Bit Score: 154; Significance: 8e-82; HSPs: 1)
Name: scaffold0227
Description:

Target: scaffold0227; HSP #1
Raw Score: 154; E-Value: 8e-82
Query Start/End: Original strand, 10 - 223
Target Start/End: Original strand, 22672 - 22885
Alignment:
Q  10 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaa 109  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| || ||  ||||| || |||||||||||||||||    
T  22672 agcagagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacgcttcatacaattgtactttgtcaacactctttgaagaataagcatccaatgccttcaaa 22771  T
Q  110 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatct 209  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  22772 tcctttcaaaatagtcgttgcttcacttttccagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatct 22871  T
Q  210 cctgatgaactaca 223  Q
    ||||||||||||||    
T  22872 cctgatgaactaca 22885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0771 (Bit Score: 153; Significance: 3e-81; HSPs: 1)
Name: scaffold0771
Description:

Target: scaffold0771; HSP #1
Raw Score: 153; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 13 - 217
Target Start/End: Original strand, 474 - 678
Alignment:
Q  13 agagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaatcc 112  Q
    |||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  474 agagacacaacctgagtaatggagataatggttgtacacttcgtacaattgtactatgtcaacgctcttcaaagaacaagcatccaatgccttcaaatcc 573  T
Q  113 tttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatctcct 212  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||    
T  574 tttcaaaatagtcgttgcttcactattccagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatcaattgaacatcctttgacgctttaagtcttgcatctcct 673  T
Q  213 gatga 217  Q
    |||||    
T  674 gatga 678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0035 (Bit Score: 153; Significance: 3e-81; HSPs: 2)
Name: scaffold0035
Description:

Target: scaffold0035; HSP #1
Raw Score: 153; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 13 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 19584 - 19372
Alignment:
Q  13 agagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaatcc 112  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| |||||||||||| |||||||||| || ||||||    
T  19584 agagacacaaactgagtagtgaatatagtggttgtacacttcgtacaattgtattatgtcaacgctcttcaaagaacaagcatccaatgcttttaaatcc 19485  T
Q  113 tttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatctcct 212  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| | | ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  19484 tttcaaaatagttgttgcttcactcttctagtcttctgcaattcttaggcgaaattaaatccattgaacaacttttgaagctttaagtcttgcatctcct 19385  T
Q  213 gatgaactacaac 225  Q
     ||||||||||||    
T  19384 catgaactacaac 19372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0035; HSP #2
Raw Score: 66; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 10 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 99320 - 99110
Alignment:
Q  10 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaa 109  Q
    |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||| |||  ||  ||||| || |||||||||||||  ||    
T  99320 agcagagacaaaaacagagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcagcgc--tttgaagaataagcatccaatgccttgtaa 99223  T
Q  110 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatct 209  Q
    ||||| ||||||||| ||||||  ||| |||| ||| |||||||   |||||| || || ||||| || |||| | ||||||||||||||  |||||  |    
T  99222 tccttccaaaatagtcgttgctatacttttccggtcatctgcaa-ctttagacgagtttgaatccgttaaacagcttttgaagctttaag--ttgcactt 99126  T
Q  210 cctgatgaactacaac 225  Q
    ||||||||||||||||    
T  99125 cctgatgaactacaac 99110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0146 (Bit Score: 152; Significance: 1e-80; HSPs: 1)
Name: scaffold0146
Description:

Target: scaffold0146; HSP #1
Raw Score: 152; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 13 - 212
Target Start/End: Original strand, 15116 - 15315
Alignment:
Q  13 agagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaatcc 112  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  15116 agagatacaaactaagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaatcatccaatgctttcaaatcc 15215  T
Q  113 tttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatctcct 212  Q
    |||||||||||| | |||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||    
T  15216 tttcaaaatagtcgatgcttcactcttctggtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgatcagcctttgaagctttaagtcttgcatctcct 15315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0426 (Bit Score: 149; Significance: 7e-79; HSPs: 1)
Name: scaffold0426
Description:

Target: scaffold0426; HSP #1
Raw Score: 149; E-Value: 7e-79
Query Start/End: Original strand, 10 - 182
Target Start/End: Original strand, 13567 - 13739
Alignment:
Q  10 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaa 109  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13567 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacactttgtacaattgtactatgtcaacgctcttcaaagaacaaacatccaatgccttcaaa 13666  T
Q  110 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaaca 182  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  13667 tcctttcaaaatagttgttgcttcactattccaatcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaaca 13739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0161 (Bit Score: 149; Significance: 7e-79; HSPs: 2)
Name: scaffold0161
Description:

Target: scaffold0161; HSP #1
Raw Score: 149; E-Value: 7e-79
Query Start/End: Original strand, 13 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 10220 - 10012
Alignment:
Q  13 agagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaatcc 112  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  10220 agagacacaaacagagtagtggaggtagtggtcgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttaaaaaacaagcatccaatgccttcaaatcc 10121  T
Q  113 tttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaa-catttgaagctttaagtcttgcatctcc 211  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||    
T  10120 tttcaaaatagtcgttgcttcactcttctagtcttctgcaaagcttagatgagattaaatccattgaacaaccttttgaagctttaagtcttgcatctcc 10021  T
Q  212 tgatgaact 220  Q
    |||||||||    
T  10020 tgatgaact 10012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0161; HSP #2
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 13 - 78
Target Start/End: Complemental strand, 14884 - 14819
Alignment:
Q  13 agagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgct 78  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14884 agagacacaaacagagtagtggaggtagtggtcgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgct 14819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0171 (Bit Score: 147; Significance: 1e-77; HSPs: 1)
Name: scaffold0171
Description:

Target: scaffold0171; HSP #1
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 10 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 27544 - 27334
Alignment:
Q  10 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaa 109  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||  |||| ||| |||||||||||||| ||    
T  27544 agcagagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaatggtactttgtcaacgctctttgaagagcaagcatccaatgccttcgaa 27445  T
Q  110 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatct 209  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  27444 tcctatcaaaatagctgttgcttcactctttcagtcttctgcaatgcttagacgagattaaattcattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatct 27345  T
Q  210 cctgatgaact 220  Q
    |||||||||||    
T  27344 cctgatgaact 27334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0251 (Bit Score: 144; Significance: 7e-76; HSPs: 1)
Name: scaffold0251
Description:

Target: scaffold0251; HSP #1
Raw Score: 144; E-Value: 7e-76
Query Start/End: Original strand, 19 - 218
Target Start/End: Original strand, 7708 - 7907
Alignment:
Q  19 acaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaatcctttcaa 118  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||| |||||| ||||||||| |||||||| |||    
T  7708 acaaactgagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaataaacatacaatgcctttaaatccttccaa 7807  T
Q  119 aatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaa 218  Q
    |||||| || ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7808 aatagtcgtggcttcactcttccagtcttttgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacagcctttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaa 7907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0210 (Bit Score: 143; Significance: 3e-75; HSPs: 1)
Name: scaffold0210
Description:

Target: scaffold0210; HSP #1
Raw Score: 143; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 10 - 220
Target Start/End: Original strand, 1656 - 1866
Alignment:
Q  10 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaa 109  Q
    |||||||||| ||||  |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||  || |||||||||| ||||||    
T  1656 agcagagacaaaaacaaagtagtggaggtagtggttgtacacttcctacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagagtaagcatccaatgctttcaaa 1755  T
Q  110 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatct 209  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  1756 tcctttcaaaatagtcgttgtttcactcttctagtcttctgcaaagcttagacgagattgaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatct 1855  T
Q  210 cctgatgaact 220  Q
    |||||||||||    
T  1856 cctgatgaact 1866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0116 (Bit Score: 140; Significance: 2e-73; HSPs: 1)
Name: scaffold0116
Description:

Target: scaffold0116; HSP #1
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 10 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 21086 - 20871
Alignment:
Q  10 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaa 109  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| ||  ||||| || |||||||||||||||||    
T  21086 agcagagacaaaaacagagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtacttggtcgacgctctttgaagaataagcatccaatgccttcaaa 20987  T
Q  110 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatct 209  Q
    ||||||||||||    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  20986 tcctttcaaaatgaccgttgcttcactcttctagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatcaattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatct 20887  T
Q  210 cctgatgaactacaac 225  Q
    | ||||||||| ||||    
T  20886 cttgatgaacttcaac 20871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0861 (Bit Score: 138; Significance: 3e-72; HSPs: 1)
Name: scaffold0861
Description:

Target: scaffold0861; HSP #1
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 32 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 5040 - 4851
Alignment:
Q  32 tggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaatcctttcaaaatagttgttgct 131  Q
    ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||    
T  5040 tggaggtagtggttgtacacttcatacaattgtactttgtcaacgctctataaagaacaaacatccaatgccttcaaatcctttcaaaatagtcgtcgct 4941  T
Q  132 tcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaacta 221  Q
    |||||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  4940 tcactctttcagtcttctacaatgcttagacgagattaaatccattgaacagcctttgaagctttaagtcttgcatcttctgatgaacta 4851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005 (Bit Score: 138; Significance: 3e-72; HSPs: 2)
Name: scaffold0005
Description:

Target: scaffold0005; HSP #1
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 10 - 218
Target Start/End: Original strand, 212350 - 212559
Alignment:
Q  10 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaa 109  Q
    |||| ||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  212350 agcatagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatccaatgctttcaaa 212449  T
Q  110 tcc-tttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatc 208  Q
    ||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||| | | ||||||||||||||||||| |||    
T  212450 tccttttaaaaatagttgttgcttcactcttctagtcttctgcaatgcttagacgagattgaatccatagaatagcctttgaagctttaagtcttggatc 212549  T
Q  209 tcctgatgaa 218  Q
    ||||||||||    
T  212550 tcctgatgaa 212559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005; HSP #2
Raw Score: 113; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 73 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 6250 - 6098
Alignment:
Q  73 aacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaatcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaat 172  Q
    |||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||    
T  6250 aacgctcttcaaagaacaagcatccaatgctttcaaatcctttcaaaatagtcgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacgagattgaat 6151  T
Q  173 ccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaactacaac 225  Q
    | |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  6150 ctattgaacatcctttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaattacaac 6098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0479 (Bit Score: 136; Significance: 4e-71; HSPs: 1)
Name: scaffold0479
Description:

Target: scaffold0479; HSP #1
Raw Score: 136; E-Value: 4e-71
Query Start/End: Original strand, 10 - 225
Target Start/End: Original strand, 9965 - 10180
Alignment:
Q  10 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaa 109  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||  || |||||||||| ||||||    
T  9965 agcagagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactttgtacaattgtactttgtgaacgctcttcaaagagtaagcatccaatgctttcaaa 10064  T
Q  110 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatct 209  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||    
T  10065 tcctttcaaaatagtcgttacttcactcttctagtcttctgcaaagcttagacgagattgaatccattgaatagcctttgaagctttaagtcttgcatct 10164  T
Q  210 cctgatgaactacaac 225  Q
    ||||||||||| ||||    
T  10165 cctgatgaacttcaac 10180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120 (Bit Score: 131; Significance: 4e-68; HSPs: 2)
Name: scaffold0120
Description:

Target: scaffold0120; HSP #1
Raw Score: 131; E-Value: 4e-68
Query Start/End: Original strand, 10 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 36890 - 36680
Alignment:
Q  10 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaa 109  Q
    |||||||||| |||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || || ||||||||| |||||||||||||||||    
T  36890 agcagagacaaaaacagagtagtagaggtagtggttgtacacttcgtacaattgttctttgtcaacactctttaaagaacaagcatccaatgccttcaaa 36791  T
Q  110 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatct 209  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||| ||| |||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||| || | ||||||||||||||||||||||||    
T  36790 tcctttcaaattagtcgttgcttcacttttctagtcatctgcaatgcttagacgagattaaattcattgagcagcctttgaagctttaagtcttgcatct 36691  T
Q  210 cctgatgaact 220  Q
    | |||||||||    
T  36690 cttgatgaact 36680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120; HSP #2
Raw Score: 131; E-Value: 4e-68
Query Start/End: Original strand, 10 - 220
Target Start/End: Original strand, 42115 - 42325
Alignment:
Q  10 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaa 109  Q
    |||||||||| |||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || || ||||||||| |||||||||||||||||    
T  42115 agcagagacaaaaacagagtagtagaggtagtggttgtacacttcgtacaattgttctttgtcaacactctttaaagaacaagcatccaatgccttcaaa 42214  T
Q  110 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatct 209  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||| ||| |||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||| || | ||||||||||||||||||||||||    
T  42215 tcctttcaaattagtcgttgcttcacttttctagtcatctgcaatgcttagacgagattaaattcattgagcagcctttgaagctttaagtcttgcatct 42314  T
Q  210 cctgatgaact 220  Q
    | |||||||||    
T  42315 cttgatgaact 42325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0193 (Bit Score: 129; Significance: 6e-67; HSPs: 1)
Name: scaffold0193
Description:

Target: scaffold0193; HSP #1
Raw Score: 129; E-Value: 6e-67
Query Start/End: Original strand, 10 - 220
Target Start/End: Original strand, 15789 - 16001
Alignment:
Q  10 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaatt-gtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaa 108  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  15789 agcagagacacaaactgagtagtagagatggtggttgtacacttcgtacaatttgtactatgtcaacgctcttcaaagaacaagcatccaatgccttcaa 15888  T
Q  109 atcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaa-catttgaagctttaagtcttgcat 207  Q
     ||||||||||||| ||| |||||||||| ||  ||||| |||||| ||| ||| ||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  15889 gtcctttcaaaataattggtgcttcactcctctggtcttttgcaattcttggacgagattgaatccattgaacaatcttttgaagctttaagtcttgcat 15988  T
Q  208 ctcctgatgaact 220  Q
    |||||||||||||    
T  15989 ctcctgatgaact 16001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023 (Bit Score: 126; Significance: 4e-65; HSPs: 1)
Name: scaffold0023
Description:

Target: scaffold0023; HSP #1
Raw Score: 126; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 27 - 220
Target Start/End: Original strand, 103585 - 103778
Alignment:
Q  27 agtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaatcctttcaaaatagttg 126  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||| ||||||||||||| | ||| |||||||||||  |    
T  103585 agtagtggaggtagtggttgcacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaacaagcatccaatgccttaatatcatttcaaaatagccg 103684  T
Q  127 ttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaact 220  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  103685 ttgcttcactcttccagtcttctgcaatgtttagacaaaattaaattcatttaacaacctttcaagctttaagtcttgcatctcctgatgaact 103778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0217 (Bit Score: 125; Significance: 2e-64; HSPs: 3)
Name: scaffold0217
Description:

Target: scaffold0217; HSP #1
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 10 - 218
Target Start/End: Original strand, 19027 - 19235
Alignment:
Q  10 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaa 109  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||| ||  |||||||| |||| |||||||| |||    
T  19027 agcagagacaaaaactgagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacacttgtacttttccaacgctctttgaagaacaagcatcaaatgcctttaaa 19126  T
Q  110 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatct 209  Q
    ||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||| |||     
T  19127 tccttccaaaatagccgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgctttgacgagattaaatccattgaacagcctttcaagctttaagtcttgtatca 19226  T
Q  210 cctgatgaa 218  Q
    |||||||||    
T  19227 cctgatgaa 19235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0217; HSP #2
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 13 - 220
Target Start/End: Original strand, 9559 - 9763
Alignment:
Q  13 agagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaatcc 112  Q
    ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||| ||   |||| || ||||||||||| |  |||||    
T  9559 agagacaaaaacagagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacagtcgtactatgtcaacgctgtttgtagaataagcatccaatgcccttcaatcc 9658  T
Q  113 tttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatctcct 212  Q
    |||||||||||| ||||||  ||| | ||||||||||||||| |||||||||| || ||||| |  |||||| ||||||||||||||  |||||||||||    
T  9659 tttcaaaatagtcgttgctatactttcccagtcttctgcaat-cttagacaagtttgaatccttgaaacaacttttgaagctttaag--ttgcatctcct 9755  T
Q  213 gatgaact 220  Q
    ||||||||    
T  9756 gatgaact 9763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0217; HSP #3
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 10 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 22246 - 22033
Alignment:
Q  10 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaa 109  Q
    |||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||| | ||||||||||  |  ||||| || |||||||||||||| ||    
T  22246 agcagagacaaaaacagagtactggagatagtggttgtacacttcgtacaaacgtattatgtcaacgctcattgaagaataagcatccaatgccttccaa 22147  T
Q  110 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatct 209  Q
    |||||  || ||||| ||||||  |||  ||||||||||||||||  |||||| || || ||||| || |||||| |||||| |||||||  ||||||||    
T  22146 tccttcaaagatagtcgttgctatacttctccagtcttctgcaatctttagacgagttttaatcctttaaacaacttttgaacctttaag--ttgcatct 22049  T
Q  210 cctgatgaactacaac 225  Q
     || ||||||||||||    
T  22048 tctaatgaactacaac 22033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003 (Bit Score: 124; Significance: 6e-64; HSPs: 2)
Name: scaffold0003
Description:

Target: scaffold0003; HSP #1
Raw Score: 124; E-Value: 6e-64
Query Start/End: Original strand, 10 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 90170 - 89962
Alignment:
Q  10 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaa 109  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||  |||||||| |||||||||||||||||    
T  90170 agcagagacaaaaacagagtagtggaggtaggggttgtacacttcgtacacttgtattttgtcaacgctctttgaagaacaagcatccaatgccttcaaa 90071  T
Q  110 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatct 209  Q
    ||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||  ||||||||    
T  90070 tcctttcaaaatagccgttggttcactcttccagtcttctgtaatacttagacgagattaaatacattgatcaacctttgaagctttaag--ttgcatct 89973  T
Q  210 cctgatgaact 220  Q
    |||||||||||    
T  89972 cctgatgaact 89962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 26 - 105
Target Start/End: Original strand, 712 - 790
Alignment:
Q  26 gagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgcctt 105  Q
    |||||||||||||| |||||||||| || |||| ||||| ||||   |||||| ||||||||| || |||||||||||||    
T  712 gagtagtggagataatggttgtacaatt-gtactattgtccttttcgaacgctcttcaaagaataagcatccaatgcctt 790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0047 (Bit Score: 113; Significance: 2e-57; HSPs: 2)
Name: scaffold0047
Description:

Target: scaffold0047; HSP #1
Raw Score: 113; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 73 - 225
Target Start/End: Original strand, 30283 - 30435
Alignment:
Q  73 aacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaatcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaat 172  Q
    |||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||    
T  30283 aacgctcttcaaagaacaagcatccaatgctttcaaatcctttcaaaatagtcgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacgagattgaat 30382  T
Q  173 ccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaactacaac 225  Q
    | |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  30383 ctattgaacatcctttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaattacaac 30435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0047; HSP #2
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 10 - 220
Target Start/End: Original strand, 9899 - 10108
Alignment:
Q  10 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaa 109  Q
    |||||||||||||||  |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  9899 agcagagacacaaacatagtagtggaggtagtggttttacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatctaatgccttcaaa 9998  T
Q  110 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatct 209  Q
    | | ||  || |||| |||| | ||||||||   ||||||||||||| |||||  |||||||||| | ||||| | ||||||||||||||| |  |||||    
T  9999 ttcatttgaattagtcgttgttgcactcttctgatcttctgcaatgc-tagacgtgattaaatccttagaacagcctttgaagctttaagtttctcatct 10097  T
Q  210 cctgatgaact 220  Q
     ||||||||||    
T  10098 tctgatgaact 10108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0439 (Bit Score: 111; Significance: 3e-56; HSPs: 1)
Name: scaffold0439
Description:

Target: scaffold0439; HSP #1
Raw Score: 111; E-Value: 3e-56
Query Start/End: Original strand, 10 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 6855 - 6644
Alignment:
Q  10 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaa 109  Q
    |||||||||| |||  ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||| ||  |||||||| |||||||||||||||||    
T  6855 agcagagacaaaaatagagtactggaggtagtggttgtacacttcgtacaaacgtactttgtcaatgctctttgaagaacaagcatccaatgccttcaaa 6756  T
Q  110 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatct 209  Q
    || |||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| || ||||| || |||| | ||||||||||||||  ||||||||    
T  6755 tcttttcaaaatagtcggtgcttcacttttccagtcttctgcaatccttagacaagtttgaatccgttaaacagcttttgaagctttaag--ttgcatct 6658  T
Q  210 cctgatgaactaca 223  Q
    ||||||||||||||    
T  6657 cctgatgaactaca 6644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1359 (Bit Score: 109; Significance: 5e-55; HSPs: 2)
Name: scaffold1359
Description:

Target: scaffold1359; HSP #1
Raw Score: 109; E-Value: 5e-55
Query Start/End: Original strand, 13 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 767 - 562
Alignment:
Q  13 agagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaatcc 112  Q
    ||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||| ||  |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  767 agagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttagtacaaacgtactttgtcaacgctctttgaagaacaagcatccaatgccttcaaatcc 668  T
Q  113 tttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatctcct 212  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||  |||||| || || |||||||  |||| | | ||||||||||||  |||||||||||    
T  667 tttcaaaatagtcgttgcttcacttttccagtcttctgcaatctttagacgagtttgaatccatcaaacagcttctgaagctttaag--ttgcatctcct 570  T
Q  213 gatgaact 220  Q
    ||||||||    
T  569 gatgaact 562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1359; HSP #2
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 15 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 1865 - 1672
Alignment:
Q  15 agacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaatcctt 114  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| | |||||||||| ||  ||||| || |||||||||         | ||    
T  1865 agacaaaaacagagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaaacgtaatatgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatg---------catt 1775  T
Q  115 tcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatctcctga 214  Q
    |||||||||  |||||   ||| |||||||||||||||||| |||| | || || ||||| |  |||||| ||||||||||||||  |||||||||||||    
T  1774 tcaaaatagccgttgccatacttttccagtcttctgcaatg-ttaggcgagtttgaatccttgaaacaacttttgaagctttaag--ttgcatctcctga 1678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0364 (Bit Score: 104; Significance: 5e-52; HSPs: 1)
Name: scaffold0364
Description:

Target: scaffold0364; HSP #1
Raw Score: 104; E-Value: 5e-52
Query Start/End: Original strand, 10 - 225
Target Start/End: Original strand, 6003 - 6217
Alignment:
Q  10 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaa 109  Q
    ||||||||||||||  ||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  6003 agcagagacacaaatagagtagtagaggtagtggttgtacactttgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatccaatgccttcaaa 6102  T
Q  110 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatct 209  Q
    ||||||  || |||||||||||||  |||||  |||||||||||||| ||| |  |||||||||| |||||||   ||||||||||||| |||  |||||    
T  6103 tccttttgaattagttgttgcttcggtcttctggtcttctgcaatgc-taggcgtgattaaatcctttgaacagtctttgaagctttaaatctctcatct 6201  T
Q  210 cctgatgaactacaac 225  Q
     |||||||||| ||||    
T  6202 tctgatgaacttcaac 6217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012 (Bit Score: 104; Significance: 5e-52; HSPs: 1)
Name: scaffold0012
Description:

Target: scaffold0012; HSP #1
Raw Score: 104; E-Value: 5e-52
Query Start/End: Original strand, 10 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 215612 - 215404
Alignment:
Q  10 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaa 109  Q
    |||||||||  |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||  |||||||| |||||||||||||||||    
T  215612 agcagagacgaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaaacgtactttgtcaacgctctttgaagaacaagcatccaatgccttcaaa 215513  T
Q  110 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatct 209  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||| ||| |||||||||||||  |||||| || || |||||||| |||| | ||||||| ||||||  ||||||||    
T  215512 tcctttcaaaatagccgttgcttcacttttctagtcttctgcaatctttagacgagtttgaatccattaaacagcttttgaagttttaag--ttgcatct 215415  T
Q  210 cctgatgaact 220  Q
    |||||| ||||    
T  215414 cctgataaact 215404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0015 (Bit Score: 102; Significance: 8e-51; HSPs: 1)
Name: scaffold0015
Description:

Target: scaffold0015; HSP #1
Raw Score: 102; E-Value: 8e-51
Query Start/End: Original strand, 13 - 225
Target Start/End: Original strand, 60802 - 61012
Alignment:
Q  13 agagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaatcc 112  Q
    ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||| ||  |||||||| ||| |||||||||| |||||    
T  60802 agagacaaaaacagagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaacaagcattcaatgccttccaatcc 60901  T
Q  113 tttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatctcct 212  Q
    || ||||||||  ||||||  ||| |||||||||||||||||  |||||| || |||||||| || |||||| ||||||| ||||||  |||||||||||    
T  60902 ttccaaaatagccgttgctatacttttccagtcttctgcaatttttagacgagtttaaatcctttaaacaacttttgaagttttaag--ttgcatctcct 60999  T
Q  213 gatgaactacaac 225  Q
    |||||||||||||    
T  61000 gatgaactacaac 61012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0324 (Bit Score: 100; Significance: 1e-49; HSPs: 1)
Name: scaffold0324
Description:

Target: scaffold0324; HSP #1
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 10 - 220
Target Start/End: Original strand, 9952 - 10162
Alignment:
Q  10 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaa 109  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  9952 agcagcgacacaaactgagtagtggaggtagtggttgtacactttgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatcgaatgccttcaaa 10051  T
Q  110 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaaca-acatttgaagctttaagtcttgcatc 208  Q
    | | ||  || |||  ||||||||||||||   |||||||||||||| ||| |  ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||   |||    
T  10052 ttcatttgaattagccgttgcttcactcttatggtcttctgcaatgc-taggcgtgattaaatccattgaacagccatttgaagctttaagtctcttatc 10150  T
Q  209 tcctgatgaact 220  Q
    | ||||||||||    
T  10151 ttctgatgaact 10162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0043 (Bit Score: 99; Significance: 5e-49; HSPs: 1)
Name: scaffold0043
Description:

Target: scaffold0043; HSP #1
Raw Score: 99; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 10 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 78481 - 78270
Alignment:
Q  10 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaa 109  Q
    |||||||||| ||||  ||||||| || |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| || |||||| || |||||||||||||||||    
T  78481 agcagagacaaaaacatagtagtgtaggtagtggttgtacacttcgtacaaacgtactttgtcaacgctctttaaagaataagcatccaatgccttcaaa 78382  T
Q  110 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatct 209  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||  |||||| || || |||||  | || | | ||||||||||||||   |||||||    
T  78381 tcctttcaaaatagtcgttgcttcacttttccagtcttctgcaatctttagacgagtttgaatccgataaatagcttttgaagctttaag--ctgcatct 78284  T
Q  210 cctgatgaactaca 223  Q
    | ||||||||||||    
T  78283 catgatgaactaca 78270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028 (Bit Score: 99; Significance: 5e-49; HSPs: 1)
Name: scaffold0028
Description:

Target: scaffold0028; HSP #1
Raw Score: 99; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 10 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 5717 - 5510
Alignment:
Q  10 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaa 109  Q
    |||||||||| ||||  |||||||||| ||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||| ||  ||||| || |||| ||||||||||||    
T  5717 agcagagacaaaaacatagtagtggaggtagtggttgtacacttcatataaatgtactttgtcaacgctctttgaagaataagcatcaaatgccttcaaa 5618  T
Q  110 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatct 209  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||  |||||| || || |||||||| |||||| |||||| ||||||   ||||||||    
T  5617 tcctttcaaaatagttgttgctttacttttccagtcttctgcaatctttagacgagtttgaatccattaaacaacttttgaatctttaa--attgcatct 5520  T
Q  210 cctgatgaac 219  Q
     |||||||||    
T  5519 tctgatgaac 5510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1434 (Bit Score: 97; Significance: 8e-48; HSPs: 1)
Name: scaffold1434
Description:

Target: scaffold1434; HSP #1
Raw Score: 97; E-Value: 8e-48
Query Start/End: Original strand, 80 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 831 - 691
Alignment:
Q  80 ttcaaagaacaaacatccaatgccttcaaatcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattga 179  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  831 ttcaaagaacaagcatccaatgccttcaaatcctttcaaaatagtcagtgcttcactattccagtcttctgcaatgcttagacgagattaaattcattga 732  T
Q  180 acaacatttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaact 220  Q
    |||   ||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  731 acagtctttgaagttttaagtcttgcatctcctgatgaact 691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1331 (Bit Score: 96; Significance: 3e-47; HSPs: 1)
Name: scaffold1331
Description:

Target: scaffold1331; HSP #1
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 10 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 1814 - 1606
Alignment:
Q  10 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaa 109  Q
    |||||||||| |||| ||| |||| || |||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||| ||  |||||||| |||||| ||||||||||    
T  1814 agcagagacaaaaacagagcagtgaaggtagtggttgtacacttcgtaaaaacgtactttgtcaacgctctttgaagaacaatcatccagtgccttcaaa 1715  T
Q  110 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatct 209  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||  ||| || || || |||||||| |||| | ||||||||||| ||  ||||||||    
T  1714 tcctttcaaaatagtcgttgcttcacttttcaagtcttctgcaatatttaaacgagtttgaatccattaaacagcttttgaagctttgag--ttgcatct 1617  T
Q  210 cctgatgaact 220  Q
    |||||||||||    
T  1616 cctgatgaact 1606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0334 (Bit Score: 93; Significance: 2e-45; HSPs: 2)
Name: scaffold0334
Description:

Target: scaffold0334; HSP #1
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 44 - 220
Target Start/End: Original strand, 9825 - 10001
Alignment:
Q  44 ttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaatcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccag 143  Q
    |||||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||   |    
T  9825 ttgtacactttgtacaattgtactatgtcaacgctcttcaaagcacaagcatccaatgctttcaagtcctttcaaaatagtcgttacttcactcttttgg 9924  T
Q  144 tcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaact 220  Q
    ||||||  ||||||||||| |||||||||||||| |||||   |||||||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  9925 tcttctataatgcttagacgagattaaatccattaaacaaaccttgaagctttaaatcttgcatctccagatgaact 10001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0334; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 13 - 48
Target Start/End: Original strand, 7823 - 7858
Alignment:
Q  13 agagacacaaactgagtagtggagatagtggttgta 48  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  7823 agagacacaaactgagtagaggagatagtggttgta 7858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0007 (Bit Score: 93; Significance: 2e-45; HSPs: 1)
Name: scaffold0007
Description:

Target: scaffold0007; HSP #1
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 10 - 218
Target Start/End: Original strand, 143093 - 143292
Alignment:
Q  10 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaa 109  Q
    |||| ||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||         |||||||  ||||||| ||  |||||||| ||||||||||||| |||    
T  143093 agcatagacaaaaactaagtagtggaggtagtggttgtacactt---------gtacttttccaacgctctttgaagaacaagcatccaatgcctttaaa 143183  T
Q  110 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatct 209  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| | | ||| ||||||| ||||||||||||    
T  143184 tccttccaaaatagtcgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgctttgacgagattaaatccattgaatagcctttcaagctttgagtcttgcatct 143283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022 (Bit Score: 91; Significance: 3e-44; HSPs: 5)
Name: scaffold0022
Description:

Target: scaffold0022; HSP #1
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 83 - 221
Target Start/End: Original strand, 39494 - 39632
Alignment:
Q  83 aaagaacaaacatccaatgccttcaaatcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaaca 182  Q
    ||||||||  |||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| || ||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  39494 aaagaacatgcatctaatgccttcaaatcctttcaaattagttgttgcttcactcttctagtcttttgtaatgcctagacgagattaaatccattgaaca 39593  T
Q  183 acatttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaacta 221  Q
     | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  39594 gcctttgaagctttaaatcttgcatctcctgatgaacta 39632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #2
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 83 - 221
Target Start/End: Original strand, 137554 - 137692
Alignment:
Q  83 aaagaacaaacatccaatgccttcaaatcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaaca 182  Q
    ||||||||  |||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| || ||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  137554 aaagaacatgcatctaatgccttcaaatcctttcaaattagttgttgcttcactcttctagtcttttgtaatgcctagacgagattaaatccattgaaca 137653  T
Q  183 acatttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaacta 221  Q
     | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  137654 gcctttgaagctttaaatcttgcatctcctgatgaacta 137692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #3
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 10 - 202
Target Start/End: Original strand, 159051 - 159242
Alignment:
Q  10 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaa 109  Q
    |||||||||||||||  |||||| ||| |||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||  ||||||||||||    
T  159051 agcagagacacaaacaaagtagtagaggtagtggttttacacttcatacaattgtcctttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatataatgccttcaaa 159150  T
Q  110 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtct 202  Q
    | | ||  || |||  |||||||||||||||   |||| ||||||| ||||||  |||||||||| ||||||| | ||||||||| |||||||    
T  159151 ttcatttgaattagccgttgcttcactcttctgatcttttgcaatg-ttagacgtgattaaatcctttgaacatcctttgaagctctaagtct 159242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #4
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 10 - 75
Target Start/End: Original strand, 37398 - 37463
Alignment:
Q  10 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaac 75  Q
    |||||||||| |||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  37398 agcagagacaaaaatagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgccaac 37463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #5
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 10 - 75
Target Start/End: Original strand, 135458 - 135523
Alignment:
Q  10 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaac 75  Q
    |||||||||| |||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  135458 agcagagacaaaaatagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgccaac 135523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0176 (Bit Score: 85; Significance: 1e-40; HSPs: 1)
Name: scaffold0176
Description:

Target: scaffold0176; HSP #1
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 10 - 225
Target Start/End: Original strand, 9151 - 9363
Alignment:
Q  10 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaa 109  Q
    |||| ||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||| ||  ||||| || |||||||||||||| ||    
T  9151 agcatagacaaaaacacagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgccttctaa 9250  T
Q  110 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatct 209  Q
    ||||| ||||||||| ||||||  ||| ||||| ||||||||||| ||| ||  || || ||||| || |||| | ||||||||||||||  ||||||||    
T  9251 tccttccaaaatagtcgttgctatacttttccaatcttctgcaat-ctttgatgagtttgaatccgttaaacagcttttgaagctttaag--ttgcatct 9347  T
Q  210 cctgatgaactacaac 225  Q
    ||||||||||||||||    
T  9348 cctgatgaactacaac 9363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0471 (Bit Score: 81; Significance: 3e-38; HSPs: 1)
Name: scaffold0471
Description:

Target: scaffold0471; HSP #1
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 10 - 221
Target Start/End: Original strand, 3300 - 3509
Alignment:
Q  10 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaa 109  Q
    |||||||||| |||| ||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||  ||||| | |||||||| ||  ||||| ||||||||||||||||||||    
T  3300 agcagagacaaaaacagagcagtggaggtagtggttgtacactttgtacaaacgtactatatcaacgctctttgaagaataaacatccaatgccttcaaa 3399  T
Q  110 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatct 209  Q
    ||||| ||||||||  |||| |  ||| ||||| |||||||||||  |||||| || || ||||| || |||| | ||||||||||||||  ||||||||    
T  3400 tccttccaaaatagccgttgttatacttttccaatcttctgcaatctttagacgagtttgaatccgttaaacagcttttgaagctttaag--ttgcatct 3497  T
Q  210 cctgatgaacta 221  Q
    ||||||||||||    
T  3498 cctgatgaacta 3509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0056 (Bit Score: 80; Significance: 1e-37; HSPs: 3)
Name: scaffold0056
Description:

Target: scaffold0056; HSP #1
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 28 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 36281 - 36115
Alignment:
Q  28 gtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaatcctttcaaaatagttgt 127  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || ||||| || | ||| ||| || ||||||||||||| ||| || ||  ||||||||||    
T  36281 gtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtccattttcaactctctccaacgaaaaagcatccaatgcctttaaaaccatttgaaatagttgt 36182  T
Q  128 tgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctt 195  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||  |||||  ||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  36181 tgcttcattcttccagtcttctgcaatg-atagacgtgattaaatcaattgaacaacctttgaagctt 36115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0056; HSP #2
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 13 - 102
Target Start/End: Complemental strand, 25777 - 25688
Alignment:
Q  13 agagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgc 102  Q
    ||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||| ||  ||||| || ||||||||||    
T  25777 agagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctttttgaagaataagcatccaatgc 25688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0056; HSP #3
Raw Score: 45; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 10 - 102
Target Start/End: Complemental strand, 34919 - 34827
Alignment:
Q  10 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgc 102  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||  ||||| |||||||||| ||  ||||| || ||||||||||    
T  34919 agcagagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcatacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgc 34827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0040 (Bit Score: 77; Significance: 7e-36; HSPs: 1)
Name: scaffold0040
Description:

Target: scaffold0040; HSP #1
Raw Score: 77; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 27 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 1619 - 1491
Alignment:
Q  27 agtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaatcctttcaaaatagttg 126  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||| | ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||  ||||||| |    
T  1619 agtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtccttttccaacgttcttcaaagaataaacgtccaatgccttcaaatccttttgaaatagtcg 1520  T
Q  127 ttgcttcactcttccagtcttctgcaatg 155  Q
    ||||||||||| |  ||||||||||||||    
T  1519 ttgcttcactcctatagtcttctgcaatg 1491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0243 (Bit Score: 73; Significance: 2e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold0243
Description:

Target: scaffold0243; HSP #1
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 130 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 4988 - 4900
Alignment:
Q  130 cttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaa 218  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  4988 cttcactctttcagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcttgatgaa 4900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0414 (Bit Score: 72; Significance: 7e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold0414
Description:

Target: scaffold0414; HSP #1
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 21 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 7260 - 7060
Alignment:
Q  21 aaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaatcctttcaaaa 120  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||  |||||||| | ||  ||||| || |||||||||| ||| ||||||| |||||    
T  7260 aaacagagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaaacgtaccatgtcaacgttgtttgaagaataagcatccaatgctttccaatccttccaaaa 7161  T
Q  121 tagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaact 220  Q
    |||| ||||||  ||| |||||||||||||||||  | ||||  | || ||||| |  |||| | ||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  7160 tagtcgttgctatacttttccagtcttctgcaatcttcagacgggtttgaatccttcaaacagcttttgaagctttaag--ttgcatctcctgatgaact 7063  T
Q  221 aca 223  Q
    |||    
T  7062 aca 7060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0064 (Bit Score: 71; Significance: 3e-32; HSPs: 1)
Name: scaffold0064
Description:

Target: scaffold0064; HSP #1
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 11 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 44032 - 43828
Alignment:
Q  11 gcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaat 110  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||| |||||||| ||||| |||||  ||||||||||||||||||    
T  44032 gcagagaca-aaacagagtagtggagatagtggttgtacaattcgtacaaatgtcctttttcaacgctcttcaaggaacaggcatccaatgccttcaaat 43934  T
Q  111 cctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatctc 210  Q
    | |||  || |||   ||||||||||||||   |||||||||||| |||| |  |||||||||  ||||||| | ||||||| |||||||||  |||||     
T  43933 ctttttgaattagcctttgcttcactcttctgatcttctgcaatg-ttaggcgtgattaaatcttttgaacagcctttgaagttttaagtctctcatctt 43835  T
Q  211 ctgatga 217  Q
    |||||||    
T  43834 ctgatga 43828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0273 (Bit Score: 65; Significance: 1e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0273
Description:

Target: scaffold0273; HSP #1
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 21 - 217
Target Start/End: Original strand, 5634 - 5828
Alignment:
Q  21 aaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaatcctttcaaaa 120  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||| | | ||||||| || |||||||||||||||||| | ||  |||    
T  5634 aaactgagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaattgta-ttttccaacgttctccaaagaataagcatccaatgccttcaaattcatttgaaa 5732  T
Q  121 tagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatctcctgatga 217  Q
    |||| ||||||||| ||||| ||||||||| ||||  ||| || ||||||| |  ||||||| | |||||||||| || |||| || || |||||||    
T  5733 tagtcgttgcttcattcttctagtcttctggaatg-ataggcatgattaaaacatttgaacagcctttgaagcttcaattctttcagcttctgatga 5828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0081 (Bit Score: 63; Significance: 2e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold0081
Description:

Target: scaffold0081; HSP #1
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 15 - 157
Target Start/End: Original strand, 40638 - 40780
Alignment:
Q  15 agacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaatcctt 114  Q
    ||||| |||| |||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||| |||||||||| | ||||  |||||||||||| |||    
T  40638 agacataaacagagtagtgaaggtagtggttgtacacttcttacaattgttctttttcaacgctcttcaaagaaccaccatcatatgccttcaaattctt 40737  T
Q  115 tcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgct 157  Q
    |  || |||  |||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  40738 ttgaattagccgttgcttcactcttctggtcttctgcaatgct 40780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011 (Bit Score: 61; Significance: 2e-26; HSPs: 3)
Name: scaffold0011
Description:

Target: scaffold0011; HSP #1
Raw Score: 61; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 15 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 165056 - 164940
Alignment:
Q  15 agacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaatcctt 114  Q
    ||||| |||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||   |||||||||||||||| ||  ||| | || ||||||||||||||||||||||    
T  165056 agacataaacagagtagtggaggtagtggtcgtacacttcgtacagacgtactttgtcaacgctctttgaaggataagcatccaatgccttcaaatcctt 164957  T
Q  115 tcaaaatagttgttgct 131  Q
    ||||| |||||||||||    
T  164956 tcaaattagttgttgct 164940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #2
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 68 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 65485 - 65336
Alignment:
Q  68 ttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaatcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagat 167  Q
    ||||||||||| ||  ||||| || ||||||||||| |  ||||||||||||||||| ||| ||  ||| ||||||||||||||||| ||||||| || |    
T  65485 ttgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgccctttaatcctttcaaaatagtcgtttctatacttttccagtcttctgcaat-cttagacgagtt 65387  T
Q  168 taaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaact 220  Q
    | ||||| |  || | | ||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  65386 tgaatccttgaaatagcttttgaagctttaag--ttgcatctcctgatgaact 65336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #3
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 68 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 144530 - 144381
Alignment:
Q  68 ttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaatcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagat 167  Q
    ||||||||||| ||  ||||| || ||||||||||| |  ||||||||||||| ||| ||||||  ||| ||||||||||||||||| ||||||| || |    
T  144530 ttgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgccctttaatcctttcaaaacagtcgttgctatacttttccagtcttctgcaat-cttagacgagtt 144432  T
Q  168 taaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaact 220  Q
    | ||||| |  || | | ||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  144431 tgaatccttgaaatagcttttgaagctttaag--ttgcatctcctgatgaact 144381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0530 (Bit Score: 58; Significance: 1e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0530
Description:

Target: scaffold0530; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 30 - 91
Target Start/End: Complemental strand, 2090 - 2029
Alignment:
Q  30 agtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaa 91  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  2090 agtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaa 2029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0247 (Bit Score: 58; Significance: 1e-24; HSPs: 3)
Name: scaffold0247
Description:

Target: scaffold0247; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 10 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 25514 - 25393
Alignment:
Q  10 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaa 109  Q
    |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||| || ||  ||||| ||  |||||||||| |  ||    
T  25514 agcagagacaaaaacagagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacactctttgaagaataactatccaatgcccttcaa 25415  T
Q  110 tcctttcaaaatagttgttgct 131  Q
    ||||||||||||||| ||||||    
T  25414 tcctttcaaaatagtcgttgct 25393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0247; HSP #2
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 10 - 53
Target Start/End: Complemental strand, 15854 - 15811
Alignment:
Q  10 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacactt 53  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  15854 agcagagacaaaaacagagtagtggagatagtggttgtacactt 15811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0247; HSP #3
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 138 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 23549 - 23470
Alignment:
Q  138 ttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaact 220  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| || || ||||| |  |||| | |||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  23549 ttccagtcttctgcaat-cttagacgagtttgaatccttgaaacagcttttgaagctttaagt--tgcatctcctgatgaact 23470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025 (Bit Score: 58; Significance: 1e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0025
Description:

Target: scaffold0025; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 10 - 115
Target Start/End: Original strand, 74577 - 74682
Alignment:
Q  10 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaa 109  Q
    |||||||| ||||||  |||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||| |||| ||| ||||||||    
T  74577 agcagagatacaaacaaagtagtagaggtagtggttgtacacttcatacaattgtactttgtcaatgcttttcaaagagcaagcatctaattccttcaaa 74676  T
Q  110 tccttt 115  Q
    ||||||    
T  74677 tccttt 74682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0280 (Bit Score: 57; Significance: 6e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0280
Description:

Target: scaffold0280; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 10 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 2845 - 2702
Alignment:
Q  10 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaa 109  Q
    |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||| || ||  ||||| |  |||||||||| ||| ||    
T  2845 agcagagacaaaaacagagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacactctttgaagaatacgcatccaatgctttccaa 2746  T
Q  110 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaat 154  Q
     |||| ||||||||| |||||   ||| |||||||||||||||||    
T  2745 -ccttccaaaatagtcgttgcaatacttttccagtcttctgcaat 2702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1747 (Bit Score: 55; Significance: 9e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold1747
Description:

Target: scaffold1747; HSP #1
Raw Score: 55; E-Value: 9e-23
Query Start/End: Original strand, 21 - 107
Target Start/End: Original strand, 1324 - 1410
Alignment:
Q  21 aaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttca 107  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| |||||| || || |||| ||||||||||    
T  1324 aaacagagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtagtttttcaacgctcttcaaaaaataagcatctaatgccttca 1410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1745 (Bit Score: 55; Significance: 9e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold1745
Description:

Target: scaffold1745; HSP #1
Raw Score: 55; E-Value: 9e-23
Query Start/End: Original strand, 21 - 107
Target Start/End: Complemental strand, 87 - 1
Alignment:
Q  21 aaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttca 107  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| |||||| || || |||| ||||||||||    
T  87 aaacagagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtagtttttcaacgctcttcaaaaaataagcatctaatgccttca 1  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0527 (Bit Score: 49; Significance: 3e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0527
Description:

Target: scaffold0527; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 45 - 220
Target Start/End: Original strand, 7963 - 8135
Alignment:
Q  45 tgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaatcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagt 144  Q
    ||||||||||||||||  ||||| |||||||||| ||  ||||| || |||| |||||  |  ||||||||||||||||| ||||||  ||| |||||||    
T  7963 tgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatcgaatgcaattcaatcctttcaaaatagtcgttgctatacttttccagt 8062  T
Q  145 cttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaact 220  Q
    |||||||||| ||||||| || || ||||| |  |||| | ||||||||||||||  || ||||| ||||||||||    
T  8063 cttctgcaat-cttagacgagtttgaatccttgaaacagcttttgaagctttaag--ttacatcttctgatgaact 8135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0211 (Bit Score: 49; Significance: 3e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0211
Description:

Target: scaffold0211; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 15 - 119
Target Start/End: Complemental strand, 15732 - 15628
Alignment:
Q  15 agacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaatcctt 114  Q
    ||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||   |||||||||||| ||| ||  ||  | || ||||||||||||||||||||||    
T  15732 agacataaacagagtagtggagatagtggtcgtacacttcgtacagacgtactttgtcaatgctctttgaaagataagcatccaatgccttcaaatcctt 15633  T
Q  115 tcaaa 119  Q
    |||||    
T  15632 tcaaa 15628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0261 (Bit Score: 48; Significance: 1e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0261
Description:

Target: scaffold0261; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 130 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 5935 - 5844
Alignment:
Q  130 cttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacattt-gaagctttaagtcttgcatctcctgatgaact 220  Q
    ||||||||||   ||||||||||||||||| || |||| |||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  5935 cttcactcttatggtcttctgcaatgcttaaacgagatgaaatccattgaacatccttttgaagctttaagtcttgcatctcctaatgaact 5844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0249 (Bit Score: 48; Significance: 1e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0249
Description:

Target: scaffold0249; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 10 - 105
Target Start/End: Complemental strand, 17880 - 17785
Alignment:
Q  10 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgcctt 105  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||| |||||||||| ||  ||| | || |||||||||||||    
T  17880 agcagagacaaaaacagagtagtggagatagtggttgtacacttcatacaaacgtactatgtcaacgctctttgaaggataagcatccaatgcctt 17785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0132 (Bit Score: 48; Significance: 1e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0132
Description:

Target: scaffold0132; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 21 - 124
Target Start/End: Complemental strand, 38189 - 38086
Alignment:
Q  21 aaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaatcctttcaaaa 120  Q
    |||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||    |||||||||||||||| ||  ||| | || |||||||||||||||||||||||||||     
T  38189 aaacagagtagtggaggtagtggtcgtacacttcgtacggacgtactttgtcaacgctctttgaaggataagcatccaatgccttcaaatcctttcaaat 38090  T
Q  121 tagt 124  Q
    ||||    
T  38089 tagt 38086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0220 (Bit Score: 45; Significance: 8e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0220
Description:

Target: scaffold0220; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 27 - 119
Target Start/End: Complemental strand, 1895 - 1803
Alignment:
Q  27 agtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgccttcaaatcctttcaaa 119  Q
    |||||||||| ||||||| |||||||||||| |   |||||||||||||||| ||  ||| | || |||||||||||||||||||||||||||    
T  1895 agtagtggaggtagtggtcgtacacttcgtatagacgtactttgtcaacgctctttgaaggataagcatccaatgccttcaaatcctttcaaa 1803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0473 (Bit Score: 42; Significance: 0.000000000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0473
Description:

Target: scaffold0473; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 10 - 79
Target Start/End: Complemental strand, 2806 - 2737
Alignment:
Q  10 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgcta 79  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||  ||||| |||||||||||    
T  2806 agcagagacaaaaacagagtagtggagttagtggttgtacacttcatacaaacgtactatgtcaacgcta 2737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0387 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0387
Description:

Target: scaffold0387; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 10 - 78
Target Start/End: Original strand, 7377 - 7445
Alignment:
Q  10 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgct 78  Q
    ||||| |||| |||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  7377 agcagggacaaaaacagagtagtggaagtagtggttgtacacttcgtacaaatgtactatgtcaacgct 7445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0045 (Bit Score: 37; Significance: 0.000000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0045
Description:

Target: scaffold0045; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 10 - 78
Target Start/End: Complemental strand, 87715 - 87647
Alignment:
Q  10 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgct 78  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||   ||||| ||||||||||    
T  87715 agcagagacagaaacagagtagtggaagtagtggttgtacacttcgtacagacgtactatgtcaacgct 87647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0352 (Bit Score: 35; Significance: 0.00000000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0352
Description:

Target: scaffold0352; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 10 - 100
Target Start/End: Complemental strand, 935 - 846
Alignment:
Q  10 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaat 100  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||  ||| | |||||||||| ||  ||||| || ||||||||    
T  935 agcagagaca-aaacagagtagtggaagtagtggttgtacacttcgtacaaacgtattatgtcaacgctctttgaagaataagcatccaat 846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0908 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0908
Description:

Target: scaffold0908; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 21 - 78
Target Start/End: Complemental strand, 3999 - 3942
Alignment:
Q  21 aaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgct 78  Q
    |||| ||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  3999 aaacagagaagtggaggtagtggtcgtacacttcgtacagatgtactttgtcaacgct 3942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0607 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0607
Description:

Target: scaffold0607; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 10 - 51
Target Start/End: Original strand, 6002 - 6043
Alignment:
Q  10 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacac 51  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  6002 agcagagacaaaaacagagtagtggagatagtggttgtacac 6043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0269 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0269
Description:

Target: scaffold0269; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 21 - 75
Target Start/End: Original strand, 7292 - 7346
Alignment:
Q  21 aaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaac 75  Q
    |||| ||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  7292 aaacagagaagtggaggtagtggtcgtacacttcgtacatatgtactttgtcaac 7346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0078 (Bit Score: 30; Significance: 0.00000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0078
Description:

Target: scaffold0078; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 21 - 102
Target Start/End: Complemental strand, 31888 - 31808
Alignment:
Q  21 aaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaaacatccaatgc 102  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||| ||||  ||||| | | ||||||| || ||||||||||    
T  31888 aaacagagtagtggaggtagtggttgtacactt-gtactattgtccttttccaacgttctccaaagaataagcatccaatgc 31808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016 (Bit Score: 30; Significance: 0.00000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0016
Description:

Target: scaffold0016; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 21 - 78
Target Start/End: Original strand, 731 - 788
Alignment:
Q  21 aaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgct 78  Q
    |||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||  | ||| ||||||||||    
T  731 aaacagagtagtgcagatagtgattgtacacttcgtacaaacgaactatgtcaacgct 788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0018 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0018
Description:

Target: scaffold0018; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 26 - 58
Target Start/End: Complemental strand, 6621 - 6589
Alignment:
Q  26 gagtagtggagatagtggttgtacacttcgtac 58  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  6621 gagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtac 6589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University