View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF9639_low_12 (Length: 352)

Name: NF9639_low_12
Description: NF9639
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF9639_low_12
NF9639_low_12
[»] chr5 (16 HSPs)
chr5 (1-344)||(19038205-19038548)
chr5 (1-344)||(28238775-28239118)
chr5 (1-344)||(30707719-30708062)
chr5 (1-346)||(28879268-28879613)
chr5 (1-344)||(8577581-8577924)
chr5 (45-344)||(8739-9038)
chr5 (4-341)||(38407896-38408226)
chr5 (1-341)||(7760012-7760345)
chr5 (4-341)||(5199442-5199772)
chr5 (4-341)||(511655-511985)
chr5 (7-341)||(42538468-42538802)
chr5 (3-317)||(8699470-8699784)
chr5 (4-341)||(38970716-38971053)
chr5 (5-341)||(42937702-42938019)
chr5 (4-317)||(15939344-15939657)
chr5 (4-65)||(40623050-40623111)
[»] chr2 (19 HSPs)
chr2 (1-344)||(17423138-17423481)
chr2 (1-344)||(30494003-30494346)
chr2 (1-344)||(15833928-15834271)
chr2 (1-344)||(43981193-43981536)
chr2 (1-344)||(5354643-5354986)
chr2 (1-344)||(43536746-43537089)
chr2 (1-344)||(28471200-28471543)
chr2 (1-344)||(45431177-45431520)
chr2 (1-344)||(39950166-39950509)
chr2 (7-344)||(7189485-7189822)
chr2 (1-341)||(29398647-29398987)
chr2 (1-341)||(10825960-10826293)
chr2 (183-344)||(22680191-22680351)
chr2 (4-341)||(36653541-36653878)
chr2 (3-324)||(7416474-7416795)
chr2 (91-341)||(40538214-40538464)
chr2 (4-98)||(20067502-20067596)
chr2 (267-341)||(45292545-45292619)
chr2 (18-53)||(22529914-22529949)
[»] chr3 (32 HSPs)
chr3 (1-344)||(46401377-46401720)
chr3 (1-344)||(42901198-42901541)
chr3 (1-344)||(46698353-46698696)
chr3 (1-344)||(49141556-49141899)
chr3 (1-344)||(50477815-50478158)
chr3 (1-344)||(54388797-54389140)
chr3 (1-344)||(34048097-34048440)
chr3 (1-344)||(2272094-2272437)
chr3 (1-344)||(36130157-36130500)
chr3 (1-344)||(4005449-4005791)
chr3 (1-341)||(47071225-47071558)
chr3 (1-341)||(599550-599882)
chr3 (4-341)||(20353216-20353553)
chr3 (4-306)||(17562384-17562686)
chr3 (1-261)||(9473034-9473294)
chr3 (4-341)||(41614944-41615273)
chr3 (6-341)||(49266412-49266747)
chr3 (7-341)||(16646183-16646504)
chr3 (4-341)||(44232393-44232723)
chr3 (4-341)||(48565551-48565881)
chr3 (4-341)||(42759337-42759667)
chr3 (3-320)||(48891213-48891530)
chr3 (88-320)||(50758795-50759027)
chr3 (218-344)||(52388827-52388953)
chr3 (216-341)||(51807851-51807976)
chr3 (1-185)||(52388636-52388820)
chr3 (1-107)||(2648614-2648720)
chr3 (3-320)||(42805001-42805318)
chr3 (4-231)||(50214208-50214428)
chr3 (272-344)||(3495550-3495622)
chr3 (70-341)||(30253201-30253472)
chr3 (4-158)||(6927989-6928137)
[»] chr6 (15 HSPs)
chr6 (1-340)||(27638424-27638763)
chr6 (1-344)||(6203821-6204164)
chr6 (1-344)||(11690788-11691131)
chr6 (1-344)||(30826660-30827003)
chr6 (1-344)||(22303902-22304245)
chr6 (4-344)||(31770746-31771079)
chr6 (73-344)||(26440113-26440384)
chr6 (8-332)||(26172594-26172925)
chr6 (4-341)||(2406918-2407248)
chr6 (3-320)||(24085858-24086177)
chr6 (3-341)||(32642567-32642904)
chr6 (4-158)||(2406068-2406222)
chr6 (3-320)||(18005483-18005800)
chr6 (4-341)||(3384104-3384440)
chr6 (22-118)||(21603282-21603378)
[»] chr8 (22 HSPs)
chr8 (1-344)||(1055198-1055541)
chr8 (1-344)||(23019329-23019672)
chr8 (1-344)||(26662119-26662462)
chr8 (1-344)||(15033807-15034150)
chr8 (1-344)||(22538-22881)
chr8 (1-344)||(42482548-42482891)
chr8 (1-344)||(486775-487118)
chr8 (1-341)||(34367652-34367992)
chr8 (1-341)||(39603963-39604302)
chr8 (1-344)||(43214075-43214399)
chr8 (5-341)||(20858688-20859024)
chr8 (4-332)||(34819655-34819983)
chr8 (1-341)||(41243126-41243447)
chr8 (4-341)||(39831796-39832125)
chr8 (4-341)||(5301352-5301689)
chr8 (4-341)||(21176358-21176695)
chr8 (4-317)||(45132438-45132751)
chr8 (4-341)||(35554270-35554600)
chr8 (4-317)||(40075745-40076051)
chr8 (5-317)||(5679558-5679872)
chr8 (89-320)||(51778-52009)
chr8 (4-158)||(30761317-30761485)
[»] chr7 (27 HSPs)
chr7 (1-344)||(41883212-41883555)
chr7 (1-344)||(48406030-48406373)
chr7 (1-344)||(9368444-9368787)
chr7 (1-344)||(17460304-17460647)
chr7 (1-344)||(17592567-17592910)
chr7 (1-344)||(35607433-35607776)
chr7 (1-343)||(42504976-42505318)
chr7 (1-344)||(15071325-15071655)
chr7 (1-344)||(17837632-17837968)
chr7 (1-344)||(10521503-10521845)
chr7 (4-341)||(5538596-5538933)
chr7 (4-344)||(13322706-13323046)
chr7 (4-341)||(16680134-16680471)
chr7 (4-341)||(17654370-17654707)
chr7 (4-341)||(27450732-27451069)
chr7 (11-300)||(34741444-34741726)
chr7 (125-341)||(11630427-11630643)
chr7 (137-341)||(11632680-11632884)
chr7 (3-317)||(47670247-47670561)
chr7 (4-274)||(37342992-37343262)
chr7 (4-154)||(47522022-47522172)
chr7 (88-320)||(9491989-9492221)
chr7 (203-320)||(36980256-36980373)
chr7 (4-65)||(11630326-11630387)
chr7 (218-341)||(17747944-17748067)
chr7 (88-158)||(41734630-41734700)
chr7 (4-107)||(16488281-16488385)
[»] chr4 (34 HSPs)
chr4 (1-344)||(6178846-6179189)
chr4 (1-344)||(41796081-41796424)
chr4 (1-344)||(49168183-49168526)
chr4 (1-344)||(31424412-31424755)
chr4 (1-344)||(1306176-1306521)
chr4 (1-344)||(49093093-49093437)
chr4 (1-344)||(21018634-21018977)
chr4 (1-344)||(40355459-40355802)
chr4 (73-344)||(30723877-30724148)
chr4 (2-341)||(44677027-44677366)
chr4 (4-341)||(50277829-50278166)
chr4 (1-341)||(37016639-37016967)
chr4 (4-332)||(8109835-8110163)
chr4 (47-341)||(51685810-51686104)
chr4 (4-317)||(10730039-10730352)
chr4 (4-317)||(10943808-10944121)
chr4 (4-332)||(50904047-50904368)
chr4 (3-329)||(71624-71950)
chr4 (4-338)||(50020743-50021065)
chr4 (70-320)||(13624644-13624894)
chr4 (199-341)||(50196076-50196218)
chr4 (7-341)||(14317284-14317618)
chr4 (91-317)||(41931108-41931334)
chr4 (130-341)||(46438743-46438954)
chr4 (4-263)||(30706657-30706916)
chr4 (2-65)||(30723784-30723847)
chr4 (4-102)||(55278829-55278927)
chr4 (4-118)||(50196224-50196342)
chr4 (192-340)||(21535449-21535597)
chr4 (4-80)||(46438956-46439032)
chr4 (4-95)||(12891833-12891924)
chr4 (223-341)||(12891586-12891703)
chr4 (22-118)||(40886693-40886789)
chr4 (203-341)||(40886874-40887012)
[»] chr1 (23 HSPs)
chr1 (1-344)||(3729385-3729729)
chr1 (1-344)||(13637042-13637385)
chr1 (1-344)||(26878388-26878724)
chr1 (1-344)||(19158692-19159035)
chr1 (1-344)||(95138-95474)
chr1 (1-344)||(31780703-31781039)
chr1 (1-344)||(22526674-22527010)
chr1 (4-341)||(19522323-19522653)
chr1 (6-341)||(47505016-47505350)
chr1 (4-313)||(52804570-52804879)
chr1 (4-341)||(11196537-11196874)
chr1 (4-341)||(47660547-47660884)
chr1 (12-341)||(45828251-45828579)
chr1 (223-341)||(50341407-50341525)
chr1 (3-320)||(49855061-49855377)
chr1 (232-341)||(21143654-21143763)
chr1 (4-118)||(50617938-50618052)
chr1 (4-182)||(21143770-21143941)
chr1 (8-275)||(38120208-38120475)
chr1 (218-320)||(35256520-35256622)
chr1 (250-341)||(23273541-23273632)
chr1 (12-152)||(16269844-16269984)
chr1 (14-93)||(23273427-23273506)
[»] scaffold0155 (1 HSPs)
scaffold0155 (4-341)||(12025-12362)
[»] scaffold0022 (1 HSPs)
scaffold0022 (15-118)||(56476-56579)
[»] scaffold0117 (1 HSPs)
scaffold0117 (12-80)||(22343-22411)


Alignment Details
Target: chr5 (Bit Score: 344; Significance: 0; HSPs: 16)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 344; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 344
Target Start/End: Original strand, 19038205 - 19038548
Alignment:
Q  1 gcaggcctcggaagatctcctggaataggtggcaagatctgagggtgagacaccctagcgtaccacaggacatagccatccgccgcccgccatgtctcct 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19038205 gcaggcctcggaagatctcctggaataggtggcaagatctgagggtgagacaccctagcgtaccacaggacatagccatccgccgcccgccatgtctcct 19038304  T
Q  101 ctcctgcctgctcaccccgggcgtccgccttaagcgtgtgagtgccgaagtcgacgaacatctgcacaatggaaggcggtgggaggtccctaacatcagt 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19038305 ctcctgcctgctcaccccgggcgtccgccttaagcgtgtgagtgccgaagtcgacgaacatctgcacaatggaaggcggtgggaggtccctaacatcagt 19038404  T
Q  201 cggatgtctggggatggtctgcacgtatccgtactgcctcaaaaccctctcgggcaagtgacggtacaccctacggacgccgcacataatccatccagaa 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19038405 cggatgtctggggatggtctgcacgtatccgtactgcctcaaaaccctctcgggcaagtgacggtacaccctacggacgccgcacataatccatccagaa 19038504  T
Q  301 taccagaaaacctcctcgaagtcctggatctctctgtgctcctc 344  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19038505 taccagaaaacctcctcgaagtcctggatctctctgtgctcctc 19038548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 308; E-Value: 1e-173
Query Start/End: Original strand, 1 - 344
Target Start/End: Original strand, 28238775 - 28239118
Alignment:
Q  1 gcaggcctcggaagatctcctggaataggtggcaagatctgagggtgagacaccctagcgtaccacaggacatagccatccgccgcccgccatgtctcct 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  28238775 gcaggcctcggaagatctcctggaataggtggcaagatctgagggtgagacaccctagtgtaccccaggacatagccatccgccacccgccatgtatcct 28238874  T
Q  101 ctcctgcctgctcaccccgggcgtccgccttaagcgtgtgagtgccgaagtcgacgaacatctgcacaatggaaggcggtgggaggtccctaacatcagt 200  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  28238875 ctcctgcctgctcacctcgagcgtccgccttaagcgtgtgagtgcggaagtcgacgaacatctgcacaatggaaggcggggggaggtccctaacatcagt 28238974  T
Q  201 cggatgtctggggatggtctgcacgtatccgtactgcctcaaaaccctctcgggcaagtgacggtacaccctacggacgccgcacataatccatccagaa 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  28238975 cggatgtctggggatggtctgcacgtatccgtactgcctcaaaaccctctcgggcaagtgacggtacaccctacgggcgccgcacataatccatccagaa 28239074  T
Q  301 taccagaaaacctcctcgaagtcctggatctctctgtgctcctc 344  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28239075 taccagaaaacctcctcgaagtcctggatctctctgtgctcctc 28239118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 272; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 1 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 30708062 - 30707719
Alignment:
Q  1 gcaggcctcggaagatctcctggaataggtggcaagatctgagggtgagacaccctagcgtaccacaggacatagccatccgccgcccgccatgtctcct 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  30708062 gcaggcctcggaagatctcctggaataggtggcaagatctgagggtgagacaccctagtgtaccatatgacatagccatccgccacccgccatgtatcct 30707963  T
Q  101 ctcctgcctgctcaccccgggcgtccgccttaagcgtgtgagtgccgaagtcgacgaacatctgcacaatggaaggcggtgggaggtccctaacatcagt 200  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  30707962 ctcctgcctgctcaccccgatcgtccgccttaatcgtgtgagtgcggaagtcaacgaacacctgcataatggaagacggtgggaggtccctaacagcagt 30707863  T
Q  201 cggatgtctggggatggtctgcacgtatccgtactgcctcaaaaccctctcgggcaagtgacggtacaccctacggacgccgcacataatccatccagaa 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||| ||    
T  30707862 cggatgtctggggatggtctgcacgtatccgtactgcctcaaaaccctctcgggcaagtgacggtacaccctacggacaccacacataatccacccataa 30707763  T
Q  301 taccagaaaacctcctcgaagtcctggatctctctgtgctcctc 344  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30707762 taccagaaaacctcctcgaagtcctggatctctctgtgctcctc 30707719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 270; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 1 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 28879613 - 28879268
Alignment:
Q  1 gcaggcctcggaagatctcctggaataggtggcaagatctgagggtgagacaccctagcgtaccacaggacatagccatccgccgcccgccatgtctcct 100  Q
    |||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  28879613 gcaggcctcggaagatctcctgaaagaggtggaaagatctgagggtgagacaccctagtgtaccacaggacatagccatccgccacccgccatgtatcct 28879514  T
Q  101 ctcctgcctgctcaccccgggcgtccgccttaagcgtgtgagtgccgaagtcgacgaacatctgcacaatggaaggcggtgggaggtccctaacatcagt 200  Q
    |||||||||||||| ||||  |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |    
T  28879513 ctcctgcctgctcatcccgatcgtccgccttaatcgtgtgagtgcggaagtcgacgaacacctgcacaatggaagacggtgggaggtccctaacatcaat 28879414  T
Q  201 cggatgtctggggatggtctgcacgtatccgtactgcctcaaaaccctctcgggcaagtgacggtacaccctacggacgccgcacataatccatccagaa 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| || |||    
T  28879413 cggatgtctggggatggtctgcacgtatccgtactgcctcaaaaccctctcgggcaagtgacggtacaccctacggacaccgcacatgatccagcctgaa 28879314  T
Q  301 taccagaaaacctcctcgaagtcctggatctctctgtgctcctcct 346  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28879313 taccagaaaatctcctcgaagtcctggatctctctgtgctcctcct 28879268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 1 - 344
Target Start/End: Original strand, 8577581 - 8577924
Alignment:
Q  1 gcaggcctcggaagatctcctggaataggtggcaagatctgagggtgagacaccctagcgtaccacaggacatagccatccgccgcccgccatgtctcct 100  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  8577581 gcaggcctcagaagatctcctggaagaggtggcaagatctgagggtgagacaccctagtgtaccatatgacatagccatctgccgtccgccatgtctcct 8577680  T
Q  101 ctcctgcctgctcaccccgggcgtccgccttaagcgtgtgagtgccgaagtcgacgaacatctgcacaatggaaggcggtgggaggtccctaacatcagt 200  Q
    |||||||||||| ||||||  |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||  |||||||||| ||||   |||||  ||   |||||| ||    
T  8577681 ctcctgcctgctgaccccgatcgtccgccttaatcgtgtgagtgcggaagtcgacgaacgcctgcacaatgtaagggaatgggatctctacaacatccgt 8577780  T
Q  201 cggatgtctggggatggtctgcacgtatccgtactgcctcaaaaccctctcgggcaagtgacggtacaccctacggacgccgcacataatccatccagaa 300  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  8577781 gggatgtctggggatggtctgcacgtatccgtactgcctcaaaaccctctcgggcaagtgacggtacaccctacggacaccgcacataatccacccagaa 8577880  T
Q  301 taccagaaaacctcctcgaagtcctggatctctctgtgctcctc 344  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8577881 taccagaaaacctcctcgaagtcctggatctctctgtgctcctc 8577924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 228; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 45 - 344
Target Start/End: Original strand, 8739 - 9038
Alignment:
Q  45 gtgagacaccctagcgtaccacaggacatagccatccgccgcccgccatgtctcctctcctgcctgctcaccccgggcgtccgccttaagcgtgtgagtg 144  Q
    |||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||| |  ||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||    
T  8739 gtgagacaccctagtgtaccataggacatagtcatccgtcatccgtcatgtctcctctcctgcctgctcaccccgatcgtctgccttaagcgtgtgagtg 8838  T
Q  145 ccgaagtcgacgaacatctgcacaatggaaggcggtgggaggtccctaacatcagtcggatgtctggggatggtctgcacgtatccgtactgcctcaaaa 244  Q
    | |||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  8839 cggaagtcgacgaacacctgcacaatgggaggcggcgggaggtccctaacatcagtcggatgtctggggatggtctgcacgtatctgtactgcctcaaaa 8938  T
Q  245 ccctctcgggcaagtgacggtacaccctacggacgccgcacataatccatccagaataccagaaaacctcctcgaagtcctggatctctctgtgctcctc 344  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8939 ccctctcgggcaagtgacggtacaccctacggacaccgcacataatccagccaaaataccagaaaacctcctcgaagtcctggatctctctgtgctcctc 9038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 176; E-Value: 9e-95
Query Start/End: Original strand, 4 - 341
Target Start/End: Original strand, 38407896 - 38408226
Alignment:
Q  4 ggcctcggaagatctcctggaataggtggcaagatctgagggtgagacaccctagcgtaccacaggacatagccatccgccgcccgccatgtctcctctc 103  Q
    ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||||       |||||| |||||    
T  38407896 ggcctaggaagatctcctggaagaggtggcaagatctaagggtgagacaccctagtgtaccatagcacatagccatccgcc-------atgtctgctctc 38407988  T
Q  104 ctgcctgctcaccccgggcgtccgccttaagcgtgtgagtgccgaagtcgacgaacatctgcacaatggaaggcggtgggaggtccctaacatcagtcgg 203  Q
    |||||||||||||||   || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||  ||||||||| || ||   |||||| ||  |    
T  38407989 ctgcctgctcaccccaatcggccgccttaagcgtgtgagtgcggaagtcgacgaacgcctgcacaatgtgaggcggtggcagctctacaacatccgttag 38408088  T
Q  204 atgtctggggatggtctgcacgtatccgtactgcctcaaaaccctctcgggcaagtgacggtacaccctacggacgccgcacataatccatccagaatac 303  Q
    |||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||    
T  38408089 atgtatggggacggtctggacgtatccgtactgcctcaaaaccctctcgggcaagtgacggtacaccctacgaacaccgcacataatccagccagaatac 38408188  T
Q  304 cagaaaacctcctcgaagtcctggatctctctgtgctc 341  Q
    |||||||||||||| || || |||||||| ||||||||    
T  38408189 cagaaaacctcctcaaaatcatggatctccctgtgctc 38408226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 175; E-Value: 4e-94
Query Start/End: Original strand, 1 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 7760345 - 7760012
Alignment:
Q  1 gcaggcctcggaagatctcctggaataggtggcaagatctgagggtgagacaccctagcgtaccacaggacatagccatccgccgcccgccatgtctcct 100  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||||       |||||| ||    
T  7760345 gcaggcctcagaagatctcctggaagaggtgacaagatttgagggtgagacaccctagtgtaccatagcacatagccatccgcc-------atgtctgct 7760253  T
Q  101 ctcctgcctgctcaccccgggcgtccgccttaagcgtgtgagtgccgaagtcgacgaacatctgcacaatggaaggcggtgggaggtccctaacatcagt 200  Q
    ||||||||||||||||||   || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||| || ||||||| |||||   |||||| ||    
T  7760252 ctcctgcctgctcaccccaatcggccgccttaagcgtgtgagtgcggaagtcgacgaacgcctgcacaatgtaaagcggtggcaggtctacaacatccgt 7760153  T
Q  201 cggatgtctggggatggtctgcacgtatccgtactgcctcaaaaccctctcgggcaagtgacggtacaccctacggacgccgcacataatccatccagaa 300  Q
      ||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| ||||    
T  7760152 tagatgtctggggatggtctggacgtattcgcactgcctcaaaaccctctcgggcaagtgacggtacaccctacgaacaccgcacataatccatcaagaa 7760053  T
Q  301 taccagaaaacctcctcgaagtcctggatctctctgtgctc 341  Q
    |||||||||||||  || ||||| |||||||| ||||||||    
T  7760052 taccagaaaacctgttcaaagtcttggatctccctgtgctc 7760012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 4 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 5199772 - 5199442
Alignment:
Q  4 ggcctcggaagatctcctggaataggtggcaagatctgagggtgagacaccctagcgtaccacaggacatagccatccgccgcccgccatgtctcctctc 103  Q
    |||||||||||||||||| ||| || |||||| |||||||||||||||||||||| |||||| |  |||||||||||||||       |||||| |||||    
T  5199772 ggcctcggaagatctcctagaagagatggcaaaatctgagggtgagacaccctagtgtaccataacacatagccatccgcc-------atgtctgctctc 5199680  T
Q  104 ctgcctgctcaccccgggcgtccgccttaagcgtgtgagtgccgaagtcgacgaacatctgcacaatggaaggcggtgggaggtccctaacatcagtcgg 203  Q
    ||||||||||||| |   || ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||   || ||||||   ||||||||  || ||   |||||| |||||    
T  5199679 ctgcctgctcacctcaatcggccgccttaaacgtgtgagtgcggaagtcgacgaatgcctacacaatttgaggcggtgacagctctacaacatccgtcgg 5199580  T
Q  204 atgtctggggatggtctgcacgtatccgtactgcctcaaaaccctctcgggcaagtgacggtacaccctacggacgccgcacataatccatccagaatac 303  Q
    |||||| ||||   |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||| || || ||||||    
T  5199579 atgtctagggaccctctggacgtatccgtactgcctcaaaaccctctcgggcaagtgacggtacaccctacgaacatcgcacataattcagcctgaatac 5199480  T
Q  304 cagaaaacctcctcgaagtcctggatctctctgtgctc 341  Q
    ||||||||||| || || ||||||||||| ||||||||    
T  5199479 cagaaaacctcttcaaaatcctggatctccctgtgctc 5199442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 128; E-Value: 4e-66
Query Start/End: Original strand, 4 - 341
Target Start/End: Original strand, 511655 - 511985
Alignment:
Q  4 ggcctcggaagatctcctggaataggtggcaagatctgagggtgagacaccctagcgtaccacaggacatagccatccgccgcccgccatgtctcctctc 103  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||| |  ||||||||||| |||       |||| | ||||     
T  511655 ggcctcggaagatctcctggaagaggtggcaaaatctgagggtgagacaccttagtgtaccataacacatagccatctgcc-------atgtattctctt 511747  T
Q  104 ctgcctgctcaccccgggcgtccgccttaagcgtgtgagtgccgaagtcgacgaacatctgcacaatggaaggcggtgggaggtccctaacatcagtcgg 203  Q
     ||||||||||||||   || ||||||||| ||||||||||| |||||||| |||   ||| |||||   ||||||||| || ||   |||||| ||||     
T  511748 gtgcctgctcaccccaatcggccgccttaaacgtgtgagtgcggaagtcgatgaatgcctgtacaatctgaggcggtggcagctctacaacatccgtcga 511847  T
Q  204 atgtctggggatggtctgcacgtatccgtactgcctcaaaaccctctcgggcaagtgacggtacaccctacggacgccgcacataatccatccagaatac 303  Q
    |||||| |||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |  ||||||    
T  511848 atgtctagggacgctctggacgtatccgtactgcctcaaaaccctctcgggcaagtgacggtacaccctacgaacaccgcacataatccagcatgaatac 511947  T
Q  304 cagaaaacctcctcgaagtcctggatctctctgtgctc 341  Q
    |||||||||||||| || |||| |||||| ||||||||    
T  511948 cagaaaacctcctcaaaatcctagatctccctgtgctc 511985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 111; E-Value: 6e-56
Query Start/End: Original strand, 7 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 42538802 - 42538468
Alignment:
Q  7 ctcggaagatctcctggaataggtggcaagatctgagggtgagacaccctagcgtaccacaggacatagccatccgccgcccgccatgtctcctctcctg 106  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| ||||  ||| |||||| |  |||||||||||| ||  |   ||| ||| ||||  ||    
T  42538802 ctcggaagatctcctggaagaggtggcaaaatctgagggtgaaacactttagtgtaccataacacatagccatccaccatctatcatatctgctcttgtg 42538703  T
Q  107 cctgctcaccccgggcgtccgccttaagcgtgtgagtgccgaagtcgacgaacatctgcacaatggaaggcggtgggaggtccctaacatcagtcggatg 206  Q
    ||||||||||||   ||  |||  ||||||||||||||| ||||||||| ||   |||||||||   ||| ||||| || ||   |||||| ||||||||    
T  42538702 cctgctcaccccaatcggtcgctgtaagcgtgtgagtgcggaagtcgacaaatgcctgcacaatctgaggtggtggcagctctacaacatccgtcggatg 42538603  T
Q  207 tctggggatggtctgcacgtatccgtactgcctcaaaaccctctcgggcaagtgacggtacaccctacggacgccgcacataatccatccagaataccag 306  Q
    ||| |||| | |||| || ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || |||||||||||||| || |||||||||    
T  42538602 tctagggacgctctggacatattcgtactgcctcaaaaccctctcgggcaagtgacggtacaccctatgaacaccgcacataatccagcctgaataccag 42538503  T
Q  307 aaaacctcctcgaagtcctggatctctctgtgctc 341  Q
    ||||||||||| || |||||||||||  |||||||    
T  42538502 aaaacctcctcaaaatcctggatctccatgtgctc 42538468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 99; E-Value: 8e-49
Query Start/End: Original strand, 3 - 317
Target Start/End: Original strand, 8699470 - 8699784
Alignment:
Q  3 aggcctcggaagatctcctggaataggtggcaagatctgagggtgagacaccctagcgtaccacaggacatagccatccgccgcccgccatgtctcctct 102  Q
    ||||||||||| ||||||||||| | ||||||| |||||||||||||||||    | ||||||  | |||||| |||| | |   |||||||||| ||||    
T  8699470 aggcctcggaatatctcctggaagaagtggcaaaatctgagggtgagacacaacggtgtaccatcgtacataggcatctgtcaaacgccatgtctgctct 8699569  T
Q  103 cctgcctgctcaccccgggcgtccgccttaagcgtgtgagtgccgaagtcgacgaacatctgcacaatggaaggcggtgggaggtccctaacatcagtcg 202  Q
    ||||| ||||||||||   || || ||| |||||||||||||| ||||||||||||   |||||||||   || ||| |  || ||   |||||| | ||    
T  8699570 cctgcatgctcaccccaatcggcctcctcaagcgtgtgagtgcggaagtcgacgaaagcctgcacaatctcagccggcgacagctctacaacatccgacg 8699669  T
Q  203 gatgtctggggatggtctgcacgtatccgtactgcctcaaaaccctctcgggcaagtgacggtacaccctacggacgccgcacataatccatccagaata 302  Q
    ||||||| |||  |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||| || |||||    
T  8699670 gatgtctaggggcggtctagacgtatccgtactgcctcaaaaccctctcgggcaagtgacggtacaccctacgatcaccgcacataatccagcctgaata 8699769  T
Q  303 ccagaaaacctcctc 317  Q
    |||||| ||||||||    
T  8699770 ccagaatacctcctc 8699784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 94; E-Value: 8e-46
Query Start/End: Original strand, 4 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 38971053 - 38970716
Alignment:
Q  4 ggcctcggaagatctcctggaataggtggcaagatctgagggtgagacaccctagcgtaccacaggacatagccatccgccgcccgccatgtctcctctc 103  Q
    ||||| |||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||||||| ||| ||||||||  |||||||| |||  |   |||||||||| ||||     
T  38971053 ggcctaggaagatctcctggaagaggtggaaaaatctgagggtgagacaccttagtgtaccacaacacatagccctccctcatacgccatgtctgctctg 38970954  T
Q  104 ctgcctgctcaccccgggcgtccgccttaagcgtgtgagtgccgaagtcgacgaacatctgcacaatggaaggcggtgggaggtccctaacatcagtcgg 203  Q
    ||| |||||||||||   ||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||    ||||||||  |||||||||  || ||   |||||  ||| |    
T  38970953 ctgtctgctcaccccaatcggtcgccttaagcgtgtgagtgcggaagtcgacgaatgcttgcacaatctaaggcggtgtcagctctacaacattcgtcag 38970854  T
Q  204 atgtctggggatggtctgcacgtatccgtactgcctcaaaaccctctcgggcaagtgacggtacaccctacggacgccgcacataatccatccagaatac 303  Q
    |||||  |||||  |||| ||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| || | || | ||| |||||||| || ||||||    
T  38970853 atgtccagggatcttctgtacgtatctgtactgcctcaacaccctctcaggcaagtgacggtacaccttatgaacactgcaaataatccagcctgaatac 38970754  T
Q  304 cagaaaacctcctcgaagtcctggatctctctgtgctc 341  Q
    || || | |||||| ||  |||||||||| ||||||||    
T  38970753 cataatatctcctcaaaaccctggatctccctgtgctc 38970716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 5 - 341
Target Start/End: Original strand, 42937702 - 42938019
Alignment:
Q  5 gcctcggaagatctcctggaataggtggcaagatctgagggtgagacaccctagcgtacc-acaggacatagccatccgccgcccgccatgtctcctctc 103  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| | || |||||||||||||||       ||||||          
T  42937702 gcctgggaagatctcctggaagaggtggcaaaatctgagggtgagacaccctagtgtacccatagcacatagccatccgcc-------atgtct------ 42937788  T
Q  104 ctgcctgctcaccccgggcgtccgccttaagcgtgtgagtgccgaagtcgacgaacatctgcacaatggaaggcggtgggaggtccctaacatcagtcgg 203  Q
          |||||||||   ||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||   ||||||||| || ||   |||||| ||| |    
T  42937789 ------gctcaccccaatcggtcgccttaagcgtgtgagtgcggaagtcgacgaacgcctgcacaatatgaggcggtggaagctctacaacatccgtcag 42937882  T
Q  204 atgtctggggatggtctgcacgtatccgtactgcctcaaaaccctctcgggcaagtgacggtacaccctacggacgccgcacataatccatccagaatac 303  Q
    ||| || ||||  ||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| | |||||||||| || |||||||| ||||| || ||| ||    
T  42937883 atgcctagggacagtctggacgtatctgtactgcctcaaaaccccctcgggcaagtgac-gaacaccctacgaacaccgcacatgatccagcctgaaaac 42937981  T
Q  304 cagaaaacctcctcgaagtcctggatctctctgtgctc 341  Q
    |||||||||||||  || || |||||||| ||||||||    
T  42937982 cagaaaacctcctaaaaatcttggatctccctgtgctc 42938019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 4 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 15939657 - 15939344
Alignment:
Q  4 ggcctcggaagatctcctggaataggtggcaagatctgagggtgagacaccctagcgtaccacaggacatagccatccgccgcccgccatgtctcctctc 103  Q
    ||||||| ||||| |||||||| ||||||||| |||| ||||||||||| | ||| |||||| |  |||||||| |||  |   |||| ||||| ||||     
T  15939657 ggcctcgaaagatatcctggaagaggtggcaaaatctaagggtgagacaacttagtgtaccataacacatagccctccctcatacgccttgtctgctcta 15939558  T
Q  104 ctgcctgctcaccccgggcgtccgccttaagcgtgtgagtgccgaagtcgacgaacatctgcacaatggaaggcggtgggaggtccctaacatcagtcgg 203  Q
    ||||||||||| |||   ||  | |||||||||||||||||| ||||||||| ||   |||||||||   ||||||||| || ||   ||||||| ||||    
T  15939557 ctgcctgctcatcccaatcggtctccttaagcgtgtgagtgcggaagtcgacaaaagcctgcacaatatgaggcggtggcagctcaacaacatcaatcgg 15939458  T
Q  204 atgtctggggatggtctgcacgtatccgtactgcctcaaaaccctctcgggcaagtgacggtacaccctacggacgccgcacataatccatccagaatac 303  Q
    |||||| ||||  ||||| || ||||||||||||||||||| ||||| | |||  |||| |||||| ||||| || || |||||||| ||||| ||||||    
T  15939457 atgtctagggaccgtctggacatatccgtactgcctcaaaatcctcttgagcagatgacagtacactctacgaacaccacacataattcatcctgaatac 15939358  T
Q  304 cagaaaacctcctc 317  Q
     |||||| ||||||    
T  15939357 tagaaaagctcctc 15939344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 4 - 65
Target Start/End: Original strand, 40623050 - 40623111
Alignment:
Q  4 ggcctcggaagatctcctggaataggtggcaagatctgagggtgagacaccctagcgtacca 65  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||| |||| |||| ||| ||||||    
T  40623050 ggcctcggaagatctcttggaagaggtggcaaaatctgaggatgaggcaccttagtgtacca 40623111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 344; Significance: 0; HSPs: 19)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 344; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 17423481 - 17423138
Alignment:
Q  1 gcaggcctcggaagatctcctggaataggtggcaagatctgagggtgagacaccctagcgtaccacaggacatagccatccgccgcccgccatgtctcct 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17423481 gcaggcctcggaagatctcctggaataggtggcaagatctgagggtgagacaccctagcgtaccacaggacatagccatccgccgcccgccatgtctcct 17423382  T
Q  101 ctcctgcctgctcaccccgggcgtccgccttaagcgtgtgagtgccgaagtcgacgaacatctgcacaatggaaggcggtgggaggtccctaacatcagt 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17423381 ctcctgcctgctcaccccgggcgtccgccttaagcgtgtgagtgccgaagtcgacgaacatctgcacaatggaaggcggtgggaggtccctaacatcagt 17423282  T
Q  201 cggatgtctggggatggtctgcacgtatccgtactgcctcaaaaccctctcgggcaagtgacggtacaccctacggacgccgcacataatccatccagaa 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17423281 cggatgtctggggatggtctgcacgtatccgtactgcctcaaaaccctctcgggcaagtgacggtacaccctacggacgccgcacataatccatccagaa 17423182  T
Q  301 taccagaaaacctcctcgaagtcctggatctctctgtgctcctc 344  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17423181 taccagaaaacctcctcgaagtcctggatctctctgtgctcctc 17423138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 320; E-Value: 1e-180
Query Start/End: Original strand, 1 - 344
Target Start/End: Original strand, 30494003 - 30494346
Alignment:
Q  1 gcaggcctcggaagatctcctggaataggtggcaagatctgagggtgagacaccctagcgtaccacaggacatagccatccgccgcccgccatgtctcct 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  30494003 gcaggcctcggaagatctcctggaataggtggcaagatctgagggtgagacaccctagtgtaccacaggacatagccatccgccacccgccatgtatcct 30494102  T
Q  101 ctcctgcctgctcaccccgggcgtccgccttaagcgtgtgagtgccgaagtcgacgaacatctgcacaatggaaggcggtgggaggtccctaacatcagt 200  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  30494103 ctcctgcctgctcaccccgagcgtccgccttaagcgtgtgagtgcggaagtcgacgaacatctgcacaatggaaggcggggggaggtccctaacatcagt 30494202  T
Q  201 cggatgtctggggatggtctgcacgtatccgtactgcctcaaaaccctctcgggcaagtgacggtacaccctacggacgccgcacataatccatccagaa 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30494203 cggatgtctggggatggtctgcacgtatccgtactgcctcaaaaccctctcgggcaagtgacggtacaccctacggacgccgcacataatccatccagaa 30494302  T
Q  301 taccagaaaacctcctcgaagtcctggatctctctgtgctcctc 344  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30494303 taccagaaaacctcctcgaagtcctggatctctctgtgctcctc 30494346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 312; E-Value: 1e-176
Query Start/End: Original strand, 1 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 15834271 - 15833928
Alignment:
Q  1 gcaggcctcggaagatctcctggaataggtggcaagatctgagggtgagacaccctagcgtaccacaggacatagccatccgccgcccgccatgtctcct 100  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  15834271 gcaggcctcagaagatctcctggaataggtggcaagatctgagggtgagacaccctagtgtaccacaggacatagccatccgccacccgccatgtatcct 15834172  T
Q  101 ctcctgcctgctcaccccgggcgtccgccttaagcgtgtgagtgccgaagtcgacgaacatctgcacaatggaaggcggtgggaggtccctaacatcagt 200  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  15834171 ctcctgcctgctcaccccgagcgtccgccttaagcgtgtgagtgcggaagtcgacgaacatctgcacaatggaaggcggggggaggtccctaacatcagt 15834072  T
Q  201 cggatgtctggggatggtctgcacgtatccgtactgcctcaaaaccctctcgggcaagtgacggtacaccctacggacgccgcacataatccatccagaa 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15834071 cggatgtctggggatggtctgcacgtatccgtactgcctcaaaaccctctcggacaagtgacggtacaccctacggacgccgcacataatccatccagaa 15833972  T
Q  301 taccagaaaacctcctcgaagtcctggatctctctgtgctcctc 344  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15833971 taccagaaaacctcctcgaagtcctggatctctctgtgctcctc 15833928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 312; E-Value: 1e-176
Query Start/End: Original strand, 1 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 43981536 - 43981193
Alignment:
Q  1 gcaggcctcggaagatctcctggaataggtggcaagatctgagggtgagacaccctagcgtaccacaggacatagccatccgccgcccgccatgtctcct 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  43981536 gcaggcctcggaagatctcctggaataggtggcaagatctgagggtgagacaccctagtgtaccacaggacatagccatccgcctcccgccatgtatcct 43981437  T
Q  101 ctcctgcctgctcaccccgggcgtccgccttaagcgtgtgagtgccgaagtcgacgaacatctgcacaatggaaggcggtgggaggtccctaacatcagt 200  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  43981436 ctcctgcctgctcaccccgagcgtccgccttaagcgtgtgagtgcggaagtcgatgaacatctgcacaatggaaggcggggggaggtccctaacatcagt 43981337  T
Q  201 cggatgtctggggatggtctgcacgtatccgtactgcctcaaaaccctctcgggcaagtgacggtacaccctacggacgccgcacataatccatccagaa 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43981336 cggatgtctggggatggtctgcacgtatccgtactgcctcaaaaccctctcgggcaagtgacggtacaccctacggacgccgcacataatccatccagaa 43981237  T
Q  301 taccagaaaacctcctcgaagtcctggatctctctgtgctcctc 344  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  43981236 taccagaaaacctcctcgaagtcttggatctctctgtgctcctc 43981193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 308; E-Value: 1e-173
Query Start/End: Original strand, 1 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 5354986 - 5354643
Alignment:
Q  1 gcaggcctcggaagatctcctggaataggtggcaagatctgagggtgagacaccctagcgtaccacaggacatagccatccgccgcccgccatgtctcct 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  5354986 gcaggcctcggaagatctcctggaataggtggcaagatctgagggtgagacaccctagtgtaccacaggacatagccatccgccacccgccatgtatcct 5354887  T
Q  101 ctcctgcctgctcaccccgggcgtccgccttaagcgtgtgagtgccgaagtcgacgaacatctgcacaatggaaggcggtgggaggtccctaacatcagt 200  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  5354886 ctcctgcctgctcaccccgagcgtccgccttaagcgtgtgagtgcggaagtcgatgaacatctgcacaatggaaggcggggggaggtccctaacatcagt 5354787  T
Q  201 cggatgtctggggatggtctgcacgtatccgtactgcctcaaaaccctctcgggcaagtgacggtacaccctacggacgccgcacataatccatccagaa 300  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5354786 cggatgtctggggatggtctacacgtatccgtactgcctcaaaaccctctcgggcaagtgacggtacaccctacggacgccgcacataatccatccagaa 5354687  T
Q  301 taccagaaaacctcctcgaagtcctggatctctctgtgctcctc 344  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  5354686 taccagaaaacctcctcgaagtcctggatctctctatgctcctc 5354643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 300; E-Value: 1e-169
Query Start/End: Original strand, 1 - 344
Target Start/End: Original strand, 43536746 - 43537089
Alignment:
Q  1 gcaggcctcggaagatctcctggaataggtggcaagatctgagggtgagacaccctagcgtaccacaggacatagccatccgccgcccgccatgtctcct 100  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||    
T  43536746 gcaggcctcggaagatctactggaataggtggcaagatctgagggtgagacaccctagtgtaccacaggacatagccatctgccacccgccatgtatcct 43536845  T
Q  101 ctcctgcctgctcaccccgggcgtccgccttaagcgtgtgagtgccgaagtcgacgaacatctgcacaatggaaggcggtgggaggtccctaacatcagt 200  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  43536846 ctcctgcctgctcaccccgagcgtccgccttaagcgtgtgagtgcggaagtcgacgaacatctgcacaatggaaggcggggggaggtccctaacatcagt 43536945  T
Q  201 cggatgtctggggatggtctgcacgtatccgtactgcctcaaaaccctctcgggcaagtgacggtacaccctacggacgccgcacataatccatccagaa 300  Q
    | ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43536946 cagatgtctggggatagtctgcatgtatccgtactgcctcaaaaccctctcgggcaagtgacggtacaccctacggacgccgcacataatccatccagaa 43537045  T
Q  301 taccagaaaacctcctcgaagtcctggatctctctgtgctcctc 344  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43537046 taccagaaaacctcctcgaagtcctggatctctctgtgctcctc 43537089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 268; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 1 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 28471543 - 28471200
Alignment:
Q  1 gcaggcctcggaagatctcctggaataggtggcaagatctgagggtgagacaccctagcgtaccacaggacatagccatccgccgcccgccatgtctcct 100  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  28471543 gcaggtctcggaagatctcctggaagaggtggcaagatctgagggtgagacaccctagtgtaccatatgacatagccatccgccgcccgccatgtatcct 28471444  T
Q  101 ctcctgcctgctcaccccgggcgtccgccttaagcgtgtgagtgccgaagtcgacgaacatctgcacaatggaaggcggtgggaggtccctaacatcagt 200  Q
    ||||| |||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  28471443 ctcctacctgctcaccccgatcgtccgccttaatcgtgtgagtgcggaagtcgacgaacacctgcacaatggaagacggtgggagatccctaacatcagt 28471344  T
Q  201 cggatgtctggggatggtctgcacgtatccgtactgcctcaaaaccctctcgggcaagtgacggtacaccctacggacgccgcacataatccatccagaa 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  28471343 cggatgtctggggatggtctgcacgtatctgtactacctcaaaaccctctcgggcaagtgacggtacaccctacggacaccgcacataatccacccagaa 28471244  T
Q  301 taccagaaaacctcctcgaagtcctggatctctctgtgctcctc 344  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28471243 taccaaaaaacctcctcgaagtcctggatctctctgtgctcctc 28471200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 268; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 1 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 45431520 - 45431177
Alignment:
Q  1 gcaggcctcggaagatctcctggaataggtggcaagatctgagggtgagacaccctagcgtaccacaggacatagccatccgccgcccgccatgtctcct 100  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  45431520 gcaggcctcggaagatctcctagaaaaggtggcaagatctgagggtgagacaccctagtgtaccatatgacatagccatccgccacccgccatgtatcct 45431421  T
Q  101 ctcctgcctgctcaccccgggcgtccgccttaagcgtgtgagtgccgaagtcgacgaacatctgcacaatggaaggcggtgggaggtccctaacatcagt 200  Q
     ||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45431420 ttcctgcctgctcaccccgatcgtccgccttaatcgtgtgagtgcggaagttgacgaacacctgcacaatggaaggcggtgggaggtccctaacatcagt 45431321  T
Q  201 cggatgtctggggatggtctgcacgtatccgtactgcctcaaaaccctctcgggcaagtgacggtacaccctacggacgccgcacataatccatccagaa 300  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||    
T  45431320 aggatgtctggggatggtctgcacgtatccatactgcctcaaaaccctctcgggcaagtgacggtacaccctacggacaccacacataatccagccagaa 45431221  T
Q  301 taccagaaaacctcctcgaagtcctggatctctctgtgctcctc 344  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45431220 taccagaaaacctcctcgaagtcctggatctctctgtgctcctc 45431177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 248; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 1 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 39950509 - 39950166
Alignment:
Q  1 gcaggcctcggaagatctcctggaataggtggcaagatctgagggtgagacaccctagcgtaccacaggacatagccatccgccgcccgccatgtctcct 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||| ||    
T  39950509 gcaggcctcggaagatctcctggaagaggtggcaagatctgagggtgagacaccctagtgtaccataggacatagccatccgccatccgccatgtctgct 39950410  T
Q  101 ctcctgcctgctcaccccgggcgtccgccttaagcgtgtgagtgccgaagtcgacgaacatctgcacaatggaaggcggtgggaggtccctaacatcagt 200  Q
    ||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||| |||||| ||||||||||||||||   |||||||||    
T  39950409 ctcctgcctgctcaccccaatcgtccgccttaagcgtgtgagtgcggaagtcgacgaacgcctgtacaatgtaaggcggtgggaggtctgcaacatcagt 39950310  T
Q  201 cggatgtctggggatggtctgcacgtatccgtactgcctcaaaaccctctcgggcaagtgacggtacaccctacggacgccgcacataatccatccagaa 300  Q
    |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||    
T  39950309 cggatgtctgcggatggtctggacgtatccgtactgcctcaaaaccctctcgggcaagtgacggtacaccctacagacaccgcacataatccagccagaa 39950210  T
Q  301 taccagaaaacctcctcgaagtcctggatctctctgtgctcctc 344  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  39950209 taccagaaaacctcctcaaagtcctggatctccctgtgctcctc 39950166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 7 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 7189822 - 7189485
Alignment:
Q  7 ctcggaagatctcctggaataggtggcaagatctgagggtgagacaccctagcgtaccacaggacatagccatccgccgcccgccatgtctcctctcctg 106  Q
    |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || | ||||||||||| |  | ||||||||| ||||||||    
T  7189822 ctcggaagatctcctgaaagaggtggcaagatctgagggtgagacaccctagtgtaccatagcatatagccatccgtcatcagccatgtctgctctcctg 7189723  T
Q  107 cctgctcaccccgggcgtccgccttaagcgtgtgagtgccgaagtcgacgaacatctgcacaatggaaggcggtgggaggtccctaacatcagtcggatg 206  Q
    ||||||||||||   || ||||||||||||||||||| | |||||||||||||  |||||||||| ||||| ||||||||||   |||||||||||||||    
T  7189722 cctgctcaccccaatcggccgccttaagcgtgtgagtacggaagtcgacgaacgcctgcacaatgtaaggcagtgggaggtctacaacatcagtcggatg 7189623  T
Q  207 tctggggatggtctgcacgtatccgtactgcctcaaaaccctctcgggcaagtgacggtacaccctacggacgccgcacataatccatccagaataccag 306  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||    
T  7189622 tctggggatggtctggacgtatccgtactgcctcaaaaccctctcgggcaagtgacggtacaccctacggacaccgcacataatccagtcagaataccag 7189523  T
Q  307 aaaacctcctcgaagtcctggatctctctgtgctcctc 344  Q
    |||||||| || ||||||||||||||  ||||||||||    
T  7189522 aaaacctcttcaaagtcctggatctccatgtgctcctc 7189485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 1 - 341
Target Start/End: Original strand, 29398647 - 29398987
Alignment:
Q  1 gcaggcctcggaagatctcctggaataggtggcaagatctgagggtgagacaccctagcgtaccacaggacatagccatccgccgcccgccatgtctcct 100  Q
    |||||||| ||||||| |||||||| || || ||| |||||||||||||||||||||| |||||| || |||||| ||||||||  ||||||||||| ||    
T  29398647 gcaggcctaggaagatttcctggaagagatgacaaaatctgagggtgagacaccctagtgtaccatagcacatagtcatccgccatccgccatgtctgct 29398746  T
Q  101 ctcctgcctgctcaccccgggcgtccgccttaagcgtgtgagtgccgaagtcgacgaacatctgcacaatggaaggcggtgggaggtccctaacatcagt 200  Q
    ||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||| |||||||||| | |||   |||||| ||    
T  29398747 ctcctgcctgctcaccccaatcgtccgccttaagcgtgtgagtgcggaagtcgacgaacgcctgcacaatgtaaggcggtggcaagtctacaacatccgt 29398846  T
Q  201 cggatgtctggggatggtctgcacgtatccgtactgcctcaaaaccctctcgggcaagtgacggtacaccctacggacgccgcacataatccatccagaa 300  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||    
T  29398847 cggatgtctggggatggtcaggacgtatccgtactgcctcaaaaccctctcgggcaagtaacggtacaccctacgaacaccgcacataatccagccagaa 29398946  T
Q  301 taccagaaaacctcctcgaagtcctggatctctctgtgctc 341  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  29398947 taccagaaaacctcctcaaagtcctggatctccctgtgctc 29398987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 1 - 341
Target Start/End: Original strand, 10825960 - 10826293
Alignment:
Q  1 gcaggcctcggaagatctcctggaataggtggcaagatctgagggtgagacaccctagcgtaccacaggacatagccatccgccgcccgccatgtctcct 100  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||       ||||||| ||    
T  10825960 gcaggcctcggaatatctcctggaagaggtggcaaaatctgagggtgagacaccctagtgtaccataggacatagccatccgc-------catgtctgct 10826052  T
Q  101 ctcctgcctgctcaccccgggcgtccgccttaagcgtgtgagtgccgaagtcgacgaacatctgcacaatggaaggcggtgggaggtccctaacatcagt 200  Q
     | |||||||||||||||   |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||  |||||||||| |||||||||| |||||   |||||| ||    
T  10826053 attctgcctgctcaccccaatcgtccgccttaagcatgtgagtgcggaagtcgacgaacgcctgcacaatgtaaggcggtggcaggtctacaacatccgt 10826152  T
Q  201 cggatgtctggggatggtctgcacgtatccgtactgcctcaaaaccctctcgggcaagtgacggtacaccctacggacgccgcacataatccatccagaa 300  Q
    |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||    
T  10826153 cggatgtctgcggatggtctggacgtatccgtactgcctcaaaaccctctcgggcaagtgacggtacaccctacgaacaccgcacataatccagccagaa 10826252  T
Q  301 taccagaaaacctcctcgaagtcctggatctctctgtgctc 341  Q
    |||||||||||||| || ||||| |||||||| ||||||||    
T  10826253 taccagaaaacctcatcaaagtcttggatctccctgtgctc 10826293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 146; E-Value: 7e-77
Query Start/End: Original strand, 183 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 22680351 - 22680191
Alignment:
Q  183 gaggtccctaacatcagtcggatgtctggggatggtctgcacgtatccgtactgcctcaaaaccctctcgggcaagtgacggtacaccctacggacgccg 282  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  22680351 gaggtccctaacatcagtcggatgtctggg-atggtctgcacgtatccgtactgcctcaaaaccctctcgggcaagtgacggtacaccctacggacaccg 22680253  T
Q  283 cacataatccatccagaataccagaaaacctcctcgaagtcctggatctctctgtgctcctc 344  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22680252 cacataatccaaccagaataccagaaaacctcctcgaagtcctggatctctctgtgctcctc 22680191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 4 - 341
Target Start/End: Original strand, 36653541 - 36653878
Alignment:
Q  4 ggcctcggaagatctcctggaataggtggcaagatctgagggtgagacaccctagcgtaccacaggacatagccatccgccgcccgccatgtctcctctc 103  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||| ||  ||||| |  ||||||||||||| |  || |||||||| |||||    
T  36653541 ggcctcggaagatctcctggaagaggtggcaaaatctgagggcgagacacccgagtataccataacacatagccatccgtcatccaccatgtctgctctc 36653640  T
Q  104 ctgcctgctcaccccgggcgtccgccttaagcgtgtgagtgccgaagtcgacgaacatctgcacaatggaaggcggtgggaggtccctaacatcagtcgg 203  Q
    ||| |||||||||||   || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||   || |||||    ||||||||  || ||   |||||| |||||    
T  36653641 ctgtctgctcaccccaatcggccgccttaagcgtgtgagtgcggaagtcgacgaatgccttcacaaactgaggcggtgacagctctacaacatcggtcgg 36653740  T
Q  204 atgtctggggatggtctgcacgtatccgtactgcctcaaaaccctctcgggcaagtgacggtacaccctacggacgccgcacataatccatccagaatac 303  Q
    ||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | || |||||||||||||| || ||||||    
T  36653741 atgtctggggacggtctggacgtatctgtactgcctcaaaaccctctcggacaagtgacggtacaccctatgaacaccgcacataatccaacctgaatac 36653840  T
Q  304 cagaaaacctcctcgaagtcctggatctctctgtgctc 341  Q
    || ||||||||||| || || |||||||| ||||||||    
T  36653841 caaaaaacctcctcaaaatcatggatctccctgtgctc 36653878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 94; E-Value: 8e-46
Query Start/End: Original strand, 3 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 7416795 - 7416474
Alignment:
Q  3 aggcctcggaagatctcctggaataggtggcaagatctgagggtgagacaccctagcgtaccacaggacatagccatccgccgcccgccatgtctcctct 102  Q
    ||||||||||| ||||||||||| | ||||||| ||||||| ||||||| |  | ||||||||  | ||||||||||| |||    ||||||||||||||    
T  7416795 aggcctcggaatatctcctggaagaagtggcaaaatctgagagtgagacgcaatggcgtaccatcgtacatagccatctgccatatgccatgtctcctct 7416696  T
Q  103 cctgcctgctcaccccgggcgtccgccttaagcgtgtgagtgccgaagtcgacgaacatctgcacaatggaaggcggtgggaggtccctaacatcagtcg 202  Q
    ||||| |||||||| |   || | ||||||||||||||||||| |||||||| |||  | ||||||||   || |||||  || ||   |||||| | ||    
T  7416695 cctgcatgctcaccgcaatcggctgccttaagcgtgtgagtgcggaagtcgaagaaagtatgcacaatctcagtcggtgacagctctacaacatccgacg 7416596  T
Q  203 gatgtctggggatggtctgcacgtatccgtactgcctcaaaaccctctcgggcaagtgacggtacaccctacggacgccgcacataatccatccagaata 302  Q
    ||||||| |||| |||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||  |   |||||||||||| || |||||    
T  7416595 gatgtctagggacggtctggacatatccgtactgcctcaaaaccctatcgggcaagtgacggtgcaccttacgatcattgcacataatccagcctgaata 7416496  T
Q  303 ccagaaaacctcctcgaagtcc 324  Q
    |||||| ||||||| |||||||    
T  7416495 ccagaatacctcctggaagtcc 7416474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 91 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 40538464 - 40538214
Alignment:
Q  91 catgtctcctctcctgcctgctcaccccgggcgtccgccttaagcgtgtgagtgccgaagtcgacgaacatctgcacaatggaaggcggtgggaggtccc 190  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||   || ||||||||||||||||||||  ||||||||| ||   || ||||||   || |||||  || ||      
T  40538464 catgtctcctctcctgcatgctcaccccaatcggccgccttaagcgtgtgagtgtggaagtcgacaaaagcctacacaatctcagccggtgacagctcta 40538365  T
Q  191 taacatcagtcggatgtctggggatggtctgcacgtatccgtactgcctcaaaaccctctcgggcaagtgacggtacaccctacggacgccgcacataat 290  Q
     ||| ||   | ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||  |  ||||||||||    
T  40538364 caacctccaacagatgtctagggatggtctggacgtatccgtactgcctcaaaaccctctcgggaaagtgacggtgcaccctacgatcatcgcacataat 40538265  T
Q  291 ccatccagaataccagaaaacctcctcgaagtcctggatctctctgtgctc 341  Q
    ||| || |||||||| || |||||||||||  ||||||  || ||||||||    
T  40538264 ccagcctgaataccaaaatacctcctcgaaagcctggaagtccctgtgctc 40538214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 4 - 98
Target Start/End: Original strand, 20067502 - 20067596
Alignment:
Q  4 ggcctcggaagatctcctggaataggtggcaagatctgagggtgagacaccctagcgtaccacaggacatagccatccgccgcccgccatgtctc 98  Q
    |||||||||||||||||| ||| | ||||||| ||| |||||||||||||||||  |||||| |  |||||||||||| ||  ||||||| ||||    
T  20067502 ggcctcggaagatctcctagaagaagtggcaaaatcagagggtgagacaccctaatgtaccatattacatagccatcctccatccgccatttctc 20067596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 267 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 45292619 - 45292545
Alignment:
Q  267 caccctacggacgccgcacataatccatccagaataccagaaaacctcctcgaagtcctggatctctctgtgctc 341  Q
    ||||||||| || | |||||||||||| || |||||| ||||||||||||| || ||| ||||||| ||||||||    
T  45292619 caccctacgaacactgcacataatccagcctgaatactagaaaacctcctcaaaatcccggatctccctgtgctc 45292545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 18 - 53
Target Start/End: Original strand, 22529914 - 22529949
Alignment:
Q  18 tcctggaataggtggcaagatctgagggtgagacac 53  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  22529914 tcctggaataggtggcaaaatctgagggtgagacac 22529949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 340; Significance: 0; HSPs: 32)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 340; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 46401720 - 46401377
Alignment:
Q  1 gcaggcctcggaagatctcctggaataggtggcaagatctgagggtgagacaccctagcgtaccacaggacatagccatccgccgcccgccatgtctcct 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46401720 gcaggcctcggaagatctcctggaataggtggcaagatctgagggtgagacaccctagcgtaccacaggacatagccatccgccgcccgccatgtctcct 46401621  T
Q  101 ctcctgcctgctcaccccgggcgtccgccttaagcgtgtgagtgccgaagtcgacgaacatctgcacaatggaaggcggtgggaggtccctaacatcagt 200  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46401620 ctcctgcctgctcaccccggacgtccgccttaagcgtgtgagtgccgaagtcgacgaacatctgcacaatggaaggcggtgggaggtccctaacatcagt 46401521  T
Q  201 cggatgtctggggatggtctgcacgtatccgtactgcctcaaaaccctctcgggcaagtgacggtacaccctacggacgccgcacataatccatccagaa 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46401520 cggatgtctggggatggtctgcacgtatccgtactgcctcaaaaccctctcgggcaagtgacggtacaccctacggacgccgcacataatccatccagaa 46401421  T
Q  301 taccagaaaacctcctcgaagtcctggatctctctgtgctcctc 344  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46401420 taccagaaaacctcctcgaagtcctggatctctctgtgctcctc 46401377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 320; E-Value: 1e-180
Query Start/End: Original strand, 1 - 344
Target Start/End: Original strand, 42901198 - 42901541
Alignment:
Q  1 gcaggcctcggaagatctcctggaataggtggcaagatctgagggtgagacaccctagcgtaccacaggacatagccatccgccgcccgccatgtctcct 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  42901198 gcaggcctcggaagatctcctggaataggtggcaagatctgagggtgagacaccctagtgtaccacaggacatagccatccgccacccgccatgtatcct 42901297  T
Q  101 ctcctgcctgctcaccccgggcgtccgccttaagcgtgtgagtgccgaagtcgacgaacatctgcacaatggaaggcggtgggaggtccctaacatcagt 200  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  42901298 ctcctgcctgctcaccccgagcgtccgccttaagcgtgtgagtgcggaagtcgacgaacatctgcacaatggaaggcggggggaggtccctaacatcagt 42901397  T
Q  201 cggatgtctggggatggtctgcacgtatccgtactgcctcaaaaccctctcgggcaagtgacggtacaccctacggacgccgcacataatccatccagaa 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42901398 cggatgtctggggatggtctgcacgtatccgtactgcctcaaaaccctctcgggcaagtgacggtacaccctacggacgccgcacataatccatccagaa 42901497  T
Q  301 taccagaaaacctcctcgaagtcctggatctctctgtgctcctc 344  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42901498 taccagaaaacctcctcgaagtcctggatctctctgtgctcctc 42901541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 316; E-Value: 1e-178
Query Start/End: Original strand, 1 - 344
Target Start/End: Original strand, 46698353 - 46698696
Alignment:
Q  1 gcaggcctcggaagatctcctggaataggtggcaagatctgagggtgagacaccctagcgtaccacaggacatagccatccgccgcccgccatgtctcct 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  46698353 gcaggcctcggaagatctcctggaataggtggcaagatctgagggtgagacaccctagtgtaccacaggacatagccatccgccacccgccatgtatcct 46698452  T
Q  101 ctcctgcctgctcaccccgggcgtccgccttaagcgtgtgagtgccgaagtcgacgaacatctgcacaatggaaggcggtgggaggtccctaacatcagt 200  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  46698453 ctcctgcctgctcaccccgagcgtccgtcttaagcgtgtgagtgcggaagtcgacgaacatctgcacaatggaaggcggggggaggtccctaacatcagt 46698552  T
Q  201 cggatgtctggggatggtctgcacgtatccgtactgcctcaaaaccctctcgggcaagtgacggtacaccctacggacgccgcacataatccatccagaa 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46698553 cggatgtctggggatggtctgcacgtatccgtactgcctcaaaaccctctcgggcaagtgacggtacaccctacggacgccgcacataatccatccagaa 46698652  T
Q  301 taccagaaaacctcctcgaagtcctggatctctctgtgctcctc 344  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46698653 taccagaaaacctcctcgaagtcctggatctctctgtgctcctc 46698696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 312; E-Value: 1e-176
Query Start/End: Original strand, 1 - 344
Target Start/End: Original strand, 49141556 - 49141899
Alignment:
Q  1 gcaggcctcggaagatctcctggaataggtggcaagatctgagggtgagacaccctagcgtaccacaggacatagccatccgccgcccgccatgtctcct 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  49141556 gcaggcctcggaagatctcctggaataggtggcaagatctgagggtgagacaccctagtgtaccacaggacatagccatccgccacccgccatgtatcct 49141655  T
Q  101 ctcctgcctgctcaccccgggcgtccgccttaagcgtgtgagtgccgaagtcgacgaacatctgcacaatggaaggcggtgggaggtccctaacatcagt 200  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  49141656 ctcctgcctgctcaccccgagcgtccgccttaagcgtgtgagtgcggaaatcgatgaacatctgcacaatggaaggcggggggaggtccctaacatcagt 49141755  T
Q  201 cggatgtctggggatggtctgcacgtatccgtactgcctcaaaaccctctcgggcaagtgacggtacaccctacggacgccgcacataatccatccagaa 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49141756 cggatgtctggggatggtctgcacgtatccgtactgcctcaaaaccctctcgggcaagtgacggtacaccctacggacgccgcacataatccatccagaa 49141855  T
Q  301 taccagaaaacctcctcgaagtcctggatctctctgtgctcctc 344  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49141856 taccagaaaacctcctcgaagtcctggatctctctgtgctcctc 49141899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 312; E-Value: 1e-176
Query Start/End: Original strand, 1 - 344
Target Start/End: Original strand, 50477815 - 50478158
Alignment:
Q  1 gcaggcctcggaagatctcctggaataggtggcaagatctgagggtgagacaccctagcgtaccacaggacatagccatccgccgcccgccatgtctcct 100  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  50477815 gcaggcctcggaagatctactggaataggtggcaagatctgagggtgagacaccctagtgtaccacaggacatagccatccgccacccgccatgtatcct 50477914  T
Q  101 ctcctgcctgctcaccccgggcgtccgccttaagcgtgtgagtgccgaagtcgacgaacatctgcacaatggaaggcggtgggaggtccctaacatcagt 200  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  50477915 ctcctgcctgctcaccccgagcgtccgccttaagcgtgtgagtgcggaagtcaacgaacatctgcacaatggaaggcggggggaggtccctaacatcagt 50478014  T
Q  201 cggatgtctggggatggtctgcacgtatccgtactgcctcaaaaccctctcgggcaagtgacggtacaccctacggacgccgcacataatccatccagaa 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50478015 cggatgtctggggatggtctgcacgtatccgtactgcctcaaaaccctctcgggcaagtgacggtacaccctacggacgccgcacataatccatccagaa 50478114  T
Q  301 taccagaaaacctcctcgaagtcctggatctctctgtgctcctc 344  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50478115 taccagaaaacctcctcgaagtcctggatctctctgtgctcctc 50478158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 308; E-Value: 1e-173
Query Start/End: Original strand, 1 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 54389140 - 54388797
Alignment:
Q  1 gcaggcctcggaagatctcctggaataggtggcaagatctgagggtgagacaccctagcgtaccacaggacatagccatccgccgcccgccatgtctcct 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  54389140 gcaggcctcggaagatctcctggaataggtggcaagatctgagggtgagacaccctagtgtaccacaggacatagccatccgccacccgccatgtatcct 54389041  T
Q  101 ctcctgcctgctcaccccgggcgtccgccttaagcgtgtgagtgccgaagtcgacgaacatctgcacaatggaaggcggtgggaggtccctaacatcagt 200  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  54389040 ctcctgcctgctcaccccgagcgtccgccttaagcgtgtgagtgcggaagtcgatgaacatctgcacaatggaaggcggggggaggtccctaaaatcagt 54388941  T
Q  201 cggatgtctggggatggtctgcacgtatccgtactgcctcaaaaccctctcgggcaagtgacggtacaccctacggacgccgcacataatccatccagaa 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54388940 cggatgtctggggatggtctgcacgtatccgtactgcctcaaaaccctctcgggcaagtgacggtacgccctacggacgccgcacataatccatccagaa 54388841  T
Q  301 taccagaaaacctcctcgaagtcctggatctctctgtgctcctc 344  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54388840 taccagaaaacctcctcgaagtcctggatctctctgtgctcctc 54388797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 288; E-Value: 1e-161
Query Start/End: Original strand, 1 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 34048440 - 34048097
Alignment:
Q  1 gcaggcctcggaagatctcctggaataggtggcaagatctgagggtgagacaccctagcgtaccacaggacatagccatccgccgcccgccatgtctcct 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  34048440 gcaggcctcggaagatctcctggaataggtggcaagatctgagggtgagacaccctagtgtaccacaggacatagccatccgccacccgccatgtatcct 34048341  T
Q  101 ctcctgcctgctcaccccgggcgtccgccttaagcgtgtgagtgccgaagtcgacgaacatctgcacaatggaaggcggtgggaggtccctaacatcagt 200  Q
    ||||||||||||||||||  ||  |||||||||||||||||||||  || |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  34048340 ctcctgcctgctcaccccaagctaccgccttaagcgtgtgagtgcgaaaatcgatgaacatctgcacaatggaaggcggggggaggtccctaacatcagt 34048241  T
Q  201 cggatgtctggggatggtctgcacgtatccgtactgcctcaaaaccctctcgggcaagtgacggtacaccctacggacgccgcacataatccatccagaa 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  34048240 cggatgtctggggatggtctgcacgtatccgtactgcctcaaaaccctctcgggcaagtgacggtacaccctatggacgccgcacataatccatccagaa 34048141  T
Q  301 taccagaaaacctcctcgaagtcctggatctctctgtgctcctc 344  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  34048140 taccagaaaacctcctcgaagtcctggatctctatgtgctcctc 34048097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 268; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 1 - 344
Target Start/End: Original strand, 2272094 - 2272437
Alignment:
Q  1 gcaggcctcggaagatctcctggaataggtggcaagatctgagggtgagacaccctagcgtaccacaggacatagccatccgccgcccgccatgtctcct 100  Q
    |||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||| ||    
T  2272094 gcaggcctcaaaagatctcctggaagaggtggcaagatctgagggtgagacaccctagtgtaccataggacatagccatccgccatccgccatgtctgct 2272193  T
Q  101 ctcctgcctgctcaccccgggcgtccgccttaagcgtgtgagtgccgaagtcgacgaacatctgcacaatggaaggcggtgggaggtccctaacatcagt 200  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||   |||||||||    
T  2272194 ctcctgcctgctcaccccgatcgtccgccttaagcgtgtgagtgcggaagtcgacgaacgcctgcacaatggaaagcggtgggaggtctgcaacatcagt 2272293  T
Q  201 cggatgtctggggatggtctgcacgtatccgtactgcctcaaaaccctctcgggcaagtgacggtacaccctacggacgccgcacataatccatccagaa 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  2272294 cggatgtctggggatggtctgcacgtatccgtactgcctcaaaaccctctcgggcaagtgacggtacaccctacggacaccgcacataatccagccagaa 2272393  T
Q  301 taccagaaaacctcctcgaagtcctggatctctctgtgctcctc 344  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2272394 taccagaaaacctcctcgaagtcctggatctctctgtgctcctc 2272437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 1 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 36130500 - 36130157
Alignment:
Q  1 gcaggcctcggaagatctcctggaataggtggcaagatctgagggtgagacaccctagcgtaccacaggacatagccatccgccgcccgccatgtctcct 100  Q
    |||||||||||||||||||| || | ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| || | ||||||||| |||  ||||||||| | ||    
T  36130500 gcaggcctcggaagatctccagggagaggtggcaaaatctgagggtgagacaccctagtgtaccatagcatatagccatcagccatccgccatgtatgct 36130401  T
Q  101 ctcctgcctgctcaccccgggcgtccgccttaagcgtgtgagtgccgaagtcgacgaacatctgcacaatggaaggcggtgggaggtccctaacatcagt 200  Q
    ||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||| ||||  ||||||| ||   |||||| ||    
T  36130400 ctcctgcctgctcaccccaatcgtccgccttaagcgtgtgagtgcggaagtcgacgaacgcctgcacaatgtaagggagtgggagctctacaacatccgt 36130301  T
Q  201 cggatgtctggggatggtctgcacgtatccgtactgcctcaaaaccctctcgggcaagtgacggtacaccctacggacgccgcacataatccatccagaa 300  Q
     |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||    
T  36130300 gggatgtctggggatggtctgcacgtatctgtactgcctcaaaaccctctcgggaaagtgacggtacaccctacggacaccacacataatccagccagaa 36130201  T
Q  301 taccagaaaacctcctcgaagtcctggatctctctgtgctcctc 344  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36130200 taccagaaaacctcctcgaagtcctggatctctctgtgctcctc 36130157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 1 - 344
Target Start/End: Original strand, 4005449 - 4005791
Alignment:
Q  1 gcaggcctcggaagatctcctggaataggtggcaagatctgagggtgagacaccctagcgtaccacaggacatagccatccgccgcccgccatgtctcct 100  Q
    |||||||||||||||||||  || | |||||||||  | ||||||||||||||||||| |||||| || | ||||||||| |||  ||||||||||| ||    
T  4005449 gcaggcctcggaagatctctagggagaggtggcaaagtatgagggtgagacaccctagtgtaccatagcatatagccatcagccatccgccatgtctgct 4005548  T
Q  101 ctcctgcctgctcaccccgggcgtccgccttaagcgtgtgagtgccgaagtcgacgaacatctgcacaatggaaggcggtgggaggtccctaacatcagt 200  Q
    ||||||||| ||||||||   || |||| |||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||| ||||  ||||||| ||   |||||| ||    
T  4005549 ctcctgcctactcaccccaatcg-ccgctttaagcgtgtgagtgcggaagtcgacgaacgcctgcacaatgtaagggagtgggagctctacaacatccgt 4005647  T
Q  201 cggatgtctggggatggtctgcacgtatccgtactgcctcaaaaccctctcgggcaagtgacggtacaccctacggacgccgcacataatccatccagaa 300  Q
     |||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  4005648 gggatgtctagggatggtctgcatgtatccgtactgcctcaaaaccctctcgggcaagtgacggtacaccctacggacaccgcacataatccagccagaa 4005747  T
Q  301 taccagaaaacctcctcgaagtcctggatctctctgtgctcctc 344  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4005748 taccagaaaacatcctcgaagtcctggatctctctgtgctcctc 4005791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 183; E-Value: 6e-99
Query Start/End: Original strand, 1 - 341
Target Start/End: Original strand, 47071225 - 47071558
Alignment:
Q  1 gcaggcctcggaagatctcctggaataggtggcaagatctgagggtgagacaccctagcgtaccacaggacatagccatccgccgcccgccatgtctcct 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||  || |||||||||||||| |||||| || |||||||||||||||       |||||| ||    
T  47071225 gcaggcctcggaagatctcctggtaaaggtggcaagatccaagagtgagacaccctagtgtaccatagcacatagccatccgcc-------atgtctgct 47071317  T
Q  101 ctcctgcctgctcaccccgggcgtccgccttaagcgtgtgagtgccgaagtcgacgaacatctgcacaatggaaggcggtgggaggtccctaacatcagt 200  Q
    |||||||||||||||| |   |  ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||  || ||||||| ||||||||||||||||   |||||| ||    
T  47071318 ctcctgcctgctcacctcaatcagccgccttaagcatgtgagtgcggaagtcgacgaacgcctacacaatgtaaggcggtgggaggtctacaacatccgt 47071417  T
Q  201 cggatgtctggggatggtctgcacgtatccgtactgcctcaaaaccctctcgggcaagtgacggtacaccctacggacgccgcacataatccatccagaa 300  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||  |||||    
T  47071418 cggatgtctggggatggtctggacgtatccgtactgcctcaaaatcctctcgggcaagtgacggtacaccctacgaacgccgcatataatccagtcagaa 47071517  T
Q  301 taccagaaaacctcctcgaagtcctggatctctctgtgctc 341  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  47071518 taccagaaaacctcctcaaagtcctggatctccctgtgctc 47071558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 599882 - 599550
Alignment:
Q  1 gcaggcctcggaagatctcctggaataggtggcaagatctgagggtgagacaccctagcgtaccacaggacatagccatccgccgcccgccatgtctcct 100  Q
    |||||||||||||||||||| |||| ||||||| | |||||||||||||||| ||||| |||||| ||   ||||||||| |||  |||||||| || ||    
T  599882 gcaggcctcggaagatctccaggaagaggtggcgaaatctgagggtgagacatcctagtgtaccatagctaatagccatcagccatccgccatgactgct 599783  T
Q  101 ctcctgcctgctcaccccgggcgtccgccttaagcgtgtgagtgccgaagtcgacgaacatctgcacaatggaaggcggtgggaggtccctaacatcagt 200  Q
    ||||||||||||||||||   ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||  ||| || ||   |||||| ||    
T  599782 ctcctgcctgctcaccccaatcgtccaccttaagcgtgtgagtgcagaagtcgacgaacacctgcacaatgtaaggcaatggcagctctacaacatccgt 599683  T
Q  201 cggatgtctggggatggtctgcacgtatccgtactgcctcaaaaccctctcgggcaagtgacggtacaccctacggacgccgcacataatccatccagaa 300  Q
      |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||           
T  599682 gagatgtctgaggatggtctggacgtatccgtactgcctcaaaaccctctcgggcaagtgacggtacaccctacgaacaccacacataatcca------- 599590  T
Q  301 taccagaaaacctcctcgaagtcctggatctctctgtgctc 341  Q
      ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  599589 -gccagaaaacctcctcaaagtcctggatctccctgtgctc 599550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 4 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 20353553 - 20353216
Alignment:
Q  4 ggcctcggaagatctcctggaataggtggcaagatctgagggtgagacaccctagcgtaccacaggacatagccatccgccgcccgccatgtctcctctc 103  Q
    |||||| ||||||||| || || |||||| || |||||||||||||||||||||| |||||| |  |||||||||||||||  | ||||||||| |||||    
T  20353553 ggcctcagaagatctcgtgaaagaggtggaaaaatctgagggtgagacaccctagtgtaccataacacatagccatccgccatcagccatgtctgctctc 20353454  T
Q  104 ctgcctgctcaccccgggcgtccgccttaagcgtgtgagtgccgaagtcgacgaacatctgcacaatggaaggcggtgggaggtccctaacatcagtcgg 203  Q
    |||||||||||||||   || ||||||||||||||||||||  ||||||||||||   ||||||| |   ||||||||| || ||   |||||| |||||    
T  20353453 ctgcctgctcaccccaatcggccgccttaagcgtgtgagtgtggaagtcgacgaatgcctgcacagtctgaggcggtggtagctctacaacatccgtcgg 20353354  T
Q  204 atgtctggggatggtctgcacgtatccgtactgcctcaaaaccctctcgggcaagtgacggtacaccctacggacgccgcacataatccatccagaatac 303  Q
    |||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| || ||||||    
T  20353353 atgtctagggatcgtctggacgtatccgtactgcctcaaacccctctcaggcaagtgacggtacaccctacgaacaccgcacataatccagcctgaatac 20353254  T
Q  304 cagaaaacctcctcgaagtcctggatctctctgtgctc 341  Q
    ||||||| |||||| || ||||||||||| || |||||    
T  20353253 cagaaaatctcctcaaaatcctggatctccctatgctc 20353216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 4 - 306
Target Start/End: Original strand, 17562384 - 17562686
Alignment:
Q  4 ggcctcggaagatctcctggaataggtggcaagatctgagggtgagacaccctagcgtaccacaggacatagccatccgccgcccgccatgtctcctctc 103  Q
    |||||||||||||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||| |||   |||||||||| |||||    
T  17562384 ggcctcggaagatctcctggaagagatggcgagatctgagggtgagacaccctagtgtaccatagcacatagccatctgccatacgccatgtctgctctc 17562483  T
Q  104 ctgcctgctcaccccgggcgtccgccttaagcgtgtgagtgccgaagtcgacgaacatctgcacaatggaaggcggtgggaggtccctaacatcagtcgg 203  Q
    |||||||||||||||   || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||   |||||||||  ||| || ||  || ||   |||||| | | |    
T  17562484 ctgcctgctcaccccaatcggccgccttaagcgtgtgagtgcggaagtcgacgaaagactgcacaatctaagacgatgacagctctacaacatccgacag 17562583  T
Q  204 atgtctggggatggtctgcacgtatccgtactgcctcaaaaccctctcgggcaagtgacggtacaccctacggacgccgcacataatccatccagaatac 303  Q
    |||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| || ||||||    
T  17562584 atgtctagggacggtctggacgtatccgtactgcctcaaaaccctctcgggcaagtgacggtacaccctacgaacaccgcacataatccagcctgaatac 17562683  T
Q  304 cag 306  Q
    |||    
T  17562684 cag 17562686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 1 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 9473294 - 9473034
Alignment:
Q  1 gcaggcctcggaagatctcctggaataggtggcaagatctgagggtgagacaccctagcgtaccacaggacatagccatccgccgcccgccatgtctcct 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||  ||| ||||||||||    
T  9473294 gcaggcctcggaagatctcctggaagaggtggcaagatctgagggtgagacaccctagtgtaccataggacatagccatccgccatccgtcatgtctcct 9473195  T
Q  101 ctcctgcctgctcaccccgggcgtccgccttaagcgtgtgagtgccgaagtcgacgaacatctgcacaatggaaggcggtgggaggtccctaacatcagt 200  Q
    ||||||||||||||||||   || ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||  ||| ||||||  || |||||| || |    ||||||  |    
T  9473194 ctcctgcctgctcaccccaatcggccgccttaagcgtctgagtgcggaagtcgacgaacgcctggacaatgtgagacggtggcagctgtacaacatcgat 9473095  T
Q  201 cggatgtctggggatggtctgcacgtatccgtactgcctcaaaaccctctcgggcaagtga 261  Q
    |||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9473094 cggatgtctggggacggtctggacgtatctgtactgcctcaaaaccctctcgggcaagtga 9473034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 136; E-Value: 7e-71
Query Start/End: Original strand, 4 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 41615273 - 41614944
Alignment:
Q  4 ggcctcggaagatctcctggaataggtggcaagatctgagggtgagacaccctagcgtaccacaggacatagccatccgccgcccgccatgtctcctctc 103  Q
    ||||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| |  |||||||||||||||       |||||| |||||    
T  41615273 ggcctcggaagatctcctgtaagaggtggcaaaatctgagggtgagacaccctagtgtaccataacacatagccatccgcc-------atgtctgctctc 41615181  T
Q  104 ctgcctgctcaccccgggcgtccgccttaagcgtgtgagtgccgaagtcgacgaacatctgcacaatggaaggcggtgggaggtccctaacatcagtcgg 203  Q
    |||||||||||||||   || ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||   |||||||||   ||||||||  || ||   |||||| | | |    
T  41615180 ctgcctgctcaccccat-cggccgccctaagcgtgtgagtgcggaagtcgacgaatgcctgcacaatctgaggcggtgacagctctacaacatccgccag 41615082  T
Q  204 atgtctggggatggtctgcacgtatccgtactgcctcaaaaccctctcgggcaagtgacggtacaccctacggacgccgcacataatccatccagaatac 303  Q
    |||||| ||||   |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||| || ||||||    
T  41615081 atgtctagggaccctctggacgtatccgtactgcctcaaaaccctctcgggcaagtgacgatacaccctacgaacaccgcacataatccagcctgaatac 41614982  T
Q  304 cagaaaacctcctcgaagtcctggatctctctgtgctc 341  Q
    || ||||||||||| || ||||||||||| ||||||||    
T  41614981 cataaaacctcctcaaaatcctggatctccctgtgctc 41614944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 6 - 341
Target Start/End: Original strand, 49266412 - 49266747
Alignment:
Q  6 cctcggaagatctcctggaataggtggcaagatctgagggtgagacaccctagcgtaccacaggacatagccatccgccgcccgccatgtctcctctcct 105  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| |  ||| || |||| |||  ||||||||||| || ||||    
T  49266412 cctcggaagatctcctggaagaggtggcaaaatctgagggtgagacaccctagtgtaccataacacacagtcatctgccatccgccatgtctgctttcct 49266511  T
Q  106 gcctgctcaccccgggcgtccgccttaagcgtgtgagtgccgaagtcgacgaacatctgcacaatggaaggcggtgggaggtccctaacatcagtcggat 205  Q
    ||||||||||||    || || ||||||||||||||||||  |||||||||||   |||||||||   ||||||||  || ||   |||||| ||| |||    
T  49266512 gcctgctcaccctaatcggccaccttaagcgtgtgagtgcgaaagtcgacgaatgcctgcacaatctgaggcggtgacagctctacaacatccgtcagat 49266611  T
Q  206 gtctggggatggtctgcacgtatccgtactgcctcaaaaccctctcgggcaagtgacggtacaccctacggacgccgcacataatccatccagaatacca 305  Q
    || |||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||  | || ||||||||||| ||  |||||||    
T  49266612 gtttggggacggtctggacgtctccgtactgcctcaaaaccctctcgggcaaatgacggtagaccctacgaccacctcacataatccagcctaaatacca 49266711  T
Q  306 gaaaacctcctcgaagtcctggatctctctgtgctc 341  Q
    |||||||||||| || | |||||||||  |||||||    
T  49266712 gaaaacctcctcaaaattctggatctccttgtgctc 49266747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 7 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 16646504 - 16646183
Alignment:
Q  7 ctcggaagatctcctggaataggtggcaagatctgagggtgagacaccctagcgtaccacaggacatagccatccgccgcccgccatgtctcctctcctg 106  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| |||  |||||||||||||||||  ||||| || |||||| ||||||||  ||||||||| |             
T  16646504 ctcggaagatctcctggaagaggtggcaaaatcaaagggtgagacaccctagtttaccatagcacatagtcatccgccatccgccatgtgt--------- 16646414  T
Q  107 cctgctcaccccgggcgtccgccttaagcgtgtgagtgccgaagtcgacgaacatctgcacaatggaaggcggtgggaggtccctaacatcagtcggatg 206  Q
       |||||||||   |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||| |||| |||||||||| |||||   |||||   || ||||    
T  16646413 ---gctcaccccaatcgtctgccttaagcgtgtgagtgcggaagtcgacgaacgcctgcataatgtaaggcggtggcaggtctacaacatacttcagatg 16646317  T
Q  207 tctggggatggtctgcacgtatccgtactgcctcaaaaccctctcgggcaagtgacggtacaccctacggacgccgcacataatccatccagaataccag 306  Q
    ||| ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| || ||||||||||||    
T  16646316 tcttgggatggtctggatgtatccgtactgcctcaaaaccctatcgggaaagtgacggtacaccctacgaacaccgcacataat-cagccagaataccag 16646218  T
Q  307 aaaacctcctcgaagtcctggatctctctgtgctc 341  Q
    || |||| ||| |||||||||||||| ||||||||    
T  16646217 aataccttctcaaagtcctggatctccctgtgctc 16646183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 116; E-Value: 6e-59
Query Start/End: Original strand, 4 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 44232723 - 44232393
Alignment:
Q  4 ggcctcggaagatctcctggaataggtggcaagatctgagggtgagacaccctagcgtaccacaggacatagccatccgccgcccgccatgtctcctctc 103  Q
    ||||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| |  |||| | |||| |||       |||| | |||||    
T  44232723 ggcctcggaagatctcctgaaagaggtggcaaaatctgagggtgagacaccctagtgtaccataacacattgtcatcagcc-------atgtatgctctc 44232631  T
Q  104 ctgcctgctcaccccgggcgtccgccttaagcgtgtgagtgccgaagtcgacgaacatctgcacaatggaaggcggtgggaggtccctaacatcagtcgg 203  Q
     ||||||||||||||   || ||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||| |||   ||||||||| || ||   |||||| ||| |    
T  44232630 ttgcctgctcaccccaatcggccgccttaagcgtgtgagtgcggaagccgacgaatatctgcataatctgaggcggtggcagctctacaacatctgtcag 44232531  T
Q  204 atgtctggggatggtctgcacgtatccgtactgcctcaaaaccctctcgggcaagtgacggtacaccctacggacgccgcacataatccatccagaatac 303  Q
    ||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||   ||||||| |||||||||| | || || ||||||||||| || ||||||    
T  44232530 atgtctggggacggtctggacgtatccgcactgcctcaaaaccctctcgaaaaagtgacagtacaccctatgaacaccacacataatccagcctgaatac 44232431  T
Q  304 cagaaaacctcctcgaagtcctggatctctctgtgctc 341  Q
    |||||||||||||  || |||||||||||  |||||||    
T  44232430 cagaaaacctccttaaaatcctggatctccatgtgctc 44232393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 4 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 48565881 - 48565551
Alignment:
Q  4 ggcctcggaagatctcctggaataggtggcaagatctgagggtgagacaccctagcgtaccacaggacatagccatccgccgcccgccatgtctcctctc 103  Q
    ||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||  || |||||| |  |||||||||||||||       |||||| ||||     
T  48565881 ggcctcggaagatcttctggaagaggtggcaaaatctgagggtgagacacctcagtgtaccataacacatagccatccgcc-------atgtctgctctt 48565789  T
Q  104 ctgcctgctcaccccgggcgtccgccttaagcgtgtgagtgccgaagtcgacgaacatctgcacaatggaaggcggtgggaggtccctaacatcagtcgg 203  Q
     ||||||||||||||   || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||   |||||||||   ||||||||| || ||   |||||| |||||    
T  48565788 gtgcctgctcaccccattcgaccgccttaagcgtgtgagtgcggaagtcgacgaatgcctgcacaatctgaggcggtggcagctctacaacatcggtcgg 48565689  T
Q  204 atgtctggggatggtctgcacgtatccgtactgcctcaaaaccctctcgggcaagtgacggtacaccctacggacgccgcacataatccatccagaatac 303  Q
    ||||||   || | |||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||| || || ||||||||| | || ||| ||    
T  48565688 atgtctaaagacgctctggacgtatctgtactgcctcaaaacccgctcgggtaagtgacagtacaccctacgaacaccacacataatctagcctgaacac 48565589  T
Q  304 cagaaaacctcctcgaagtcctggatctctctgtgctc 341  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||| | ||||||    
T  48565588 cagaaaacctcctcaaaatcctggatctcccagtgctc 48565551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 4 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 42759667 - 42759337
Alignment:
Q  4 ggcctcggaagatctcctggaataggtggcaagatctgagggtgagacaccctagcgtaccacaggacatagccatccgccgcccgccatgtctcctctc 103  Q
    |||||||||||||||| | ||| ||||||||| || ||||||||||||||| ||| |||||| |  |||||||||||||||       |||||| ||||     
T  42759667 ggcctcggaagatctcttagaagaggtggcaaaatttgagggtgagacaccttagtgtaccataaaacatagccatccgcc-------atgtctgctctt 42759575  T
Q  104 ctgcctgctcaccccgggcgtccgccttaagcgtgtgagtgccgaagtcgacgaacatctgcacaatggaaggcggtgggaggtccctaacatcagtcgg 203  Q
     || |||||||||||   || || |||||||||||||||||| ||||||||||||    ||||||||   ||||||||| || ||   |||||  |||||    
T  42759574 gtgtctgctcaccccaatcgaccaccttaagcgtgtgagtgcggaagtcgacgaatgcatgcacaatctgaggcggtggcagctctacaacattcgtcgg 42759475  T
Q  204 atgtctggggatggtctgcacgtatccgtactgcctcaaaaccctctcgggcaagtgacggtacaccctacggacgccgcacataatccatccagaatac 303  Q
    |||||| |||| | |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||| || || ||||||    
T  42759474 atgtctagggacgctctggatgtatccgtactgcctcaaaaccctctcgggcaagtgacgctacaccctacgaacaccgcacataattcagcctgaatac 42759375  T
Q  304 cagaaaacctcctcgaagtcctggatctctctgtgctc 341  Q
    ||||||  |||||| || || |||||||| ||||||||    
T  42759374 cagaaaggctcctcaaaatcttggatctccctgtgctc 42759337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 106; E-Value: 5e-53
Query Start/End: Original strand, 3 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 48891530 - 48891213
Alignment:
Q  3 aggcctcggaagatctcctggaataggtggcaagatctgagggtgagacaccctagcgtaccacaggacatagccatccgccgcccgccatgtctcctct 102  Q
    |||||||| || ||||||||||| | ||||||| |||||||||||||||||    | ||||||  | ||||||||||| |||   ||||||| || ||||    
T  48891530 aggcctcgtaatatctcctggaagaagtggcaaaatctgagggtgagacacaacggtgtaccatcgtacatagccatctgccatacgccatgcctgctct 48891431  T
Q  103 cctgcctgctcaccccgggcgtccgccttaagcgtgtgagtgccgaagtcgacgaacatctgcacaatggaaggcggtgggaggtccctaacatcagtcg 202  Q
    | ||| ||||||| ||   || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||   || || ||  || ||   |||||| | ||    
T  48891430 catgcatgctcactccaatcggccgccttaagcgtgtgagtgcggaagtcgacgaaagtctgcacaatctcagccgatgacagctctacaacatccgacg 48891331  T
Q  203 gatgtctggggatggtctgcacgtatccgtactgcctcaaaaccctctcgggcaagtgacggtacaccctacggacgccgcacataatccatccagaata 302  Q
    ||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || | ||| |||||||| || |||||    
T  48891330 gatgtctagggacggtctggacgtatccgtactgcctcaaaaccctctcgggcaagtgacggtacaccttacgaacactgcatataatccagcctgaata 48891231  T
Q  303 ccagaaaacctcctcgaa 320  Q
    |||||| |||||||||||    
T  48891230 ccagaatacctcctcgaa 48891213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 88 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 50759027 - 50758795
Alignment:
Q  88 cgccatgtctcctctcctgcctgctcaccccgggcgtccgccttaagcgtgtgagtgccgaagtcgacgaacatctgcacaatggaaggcggtgggaggt 187  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||||||   || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||   |||||||||   || |||||  || |    
T  50759027 cgccatgtctgctctcctgcatgctcaccccaatcggccgccttaagcgtgtgagtgcggaagtcgacgaaagcctgcacaatctcagccggtgacagct 50758928  T
Q  188 ccctaacatcagtcggatgtctggggatggtctgcacgtatccgtactgcctcaaaaccctctcgggcaagtgacggtacaccctacggacgccgcacat 287  Q
    |   |||||| | ||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||   | ||||||||    
T  50758927 ctacaacatccggcggatgtctagggacggtctggacgtatccgtactgcctcaaaaccctctcggtcaagtgacggtacaccctacaatcaccgcacat 50758828  T
Q  288 aatccatccagaataccagaaaacctcctcgaa 320  Q
    |||||| || ||||||||||| |||||||||||    
T  50758827 aatccagcctgaataccagaatacctcctcgaa 50758795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 99; E-Value: 8e-49
Query Start/End: Original strand, 218 - 344
Target Start/End: Original strand, 52388827 - 52388953
Alignment:
Q  218 tctgcacgtatccgtactgcctcaaaaccctctcgggcaagtgacggtacaccctacggacgccgcacataatccatccagaataccagaaaacctcctc 317  Q
    ||||||||||||  |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  52388827 tctgcacgtatctatactacctcaaaaccctctcggacaagtgacggtacaccctacggacaccgcacattatccagccagaataccagaaaacctcctc 52388926  T
Q  318 gaagtcctggatctctctgtgctcctc 344  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    
T  52388927 gaagtcctggatctctctgtgctcctc 52388953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 216 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 51807976 - 51807851
Alignment:
Q  216 ggtctgcacgtatccgtactgcctcaaaaccctctcgggcaagtgacggtacaccctacggacgccgcacataatccatccagaataccagaaaacctcc 315  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  51807976 ggtctggacgtatccgtactgcctcaaaaccctctcgggcaagtgacggtacaccctacgaacaccgcacataatccagcctgaataccagaaaacctcc 51807877  T
Q  316 tcgaagtcctggatctctctgtgctc 341  Q
    || || || |||||||| ||||||||    
T  51807876 tcaaaatcttggatctccctgtgctc 51807851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 89; E-Value: 8e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 185
Target Start/End: Original strand, 52388636 - 52388820
Alignment:
Q  1 gcaggcctcggaagatctcctggaataggtggcaagatctgagggtgagacaccctagcgtaccacaggacatagccatccgccgcccgccatgtctcct 100  Q
    ||||||||||||||||||||    | ||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||| || | ||||||||| |||  ||||||||||| ||    
T  52388636 gcaggcctcggaagatctccattgagaggtggcaaaatctgagggtgagacaccctagtctaccatagcatatagccatcagccatccgccatgtctact 52388735  T
Q  101 ctcctgcctgctcaccccgggcgtccgccttaagcgtgtgagtgccgaagtcgacgaacatctgcacaatggaaggcggtgggag 185  Q
    ||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||| ||||  |||||||    
T  52388736 ctcctgcctgctcaccccaatcgtccgccttaagcgtgtgagtgcggaagtcgacgaacgcctgcacaatgtaagggagtgggag 52388820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 1 - 107
Target Start/End: Original strand, 2648614 - 2648720
Alignment:
Q  1 gcaggcctcggaagatctcctggaataggtggcaagatctgagggtgagacaccctagcgtaccacaggacatagccatccgccgcccgccatgtctcct 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  2648614 gcaggcctcggaagatctcctggaataggtggcaagatctgagggtgagacaccctagtgtaccatatgacatagccatccgccacccgccatgtatcct 2648713  T
Q  101 ctcctgc 107  Q
    |||||||    
T  2648714 ctcctgc 2648720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 3 - 320
Target Start/End: Original strand, 42805001 - 42805318
Alignment:
Q  3 aggcctcggaagatctcctggaataggtggcaagatctgagggtgagacaccctagcgtaccacaggacatagccatccgccgcccgccatgtctcctct 102  Q
    ||||||| ||| ||||||||||| | ||||||| |||||||||||||||||  | | ||||||  | ||||||||||| |||   | |||||||||||||    
T  42805001 aggcctcagaatatctcctggaagaagtggcaaaatctgagggtgagacacaatggtgtaccatcgtacatagccatctgccatacaccatgtctcctct 42805100  T
Q  103 cctgcctgctcaccccgggcgtccgccttaagcgtgtgagtgccgaagtcgacgaacatctgcacaatggaaggcggtgggaggtccctaacatcagtcg 202  Q
    | ||| ||||||||||   || |||||||||||||  |||||| ||||||||||||   |||||||||   || ||||   || ||   |||||| | ||    
T  42805101 catgcatgctcaccccaatcgcccgccttaagcgtacgagtgcggaagtcgacgaaagcctgcacaatctgagccggtaacagctctacaacatccgacg 42805200  T
Q  203 gatgtctggggatggtctgcacgtatccgtactgcctcaaaaccctctcgggcaagtgacggtacaccctacggacgccgcacataatccatccagaata 302  Q
    ||||||| |||| |||| | ||||||| |||||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||| || |  | |||||||||||||| || |||||    
T  42805201 gatgtctagggacggtccgaacgtatctgtactgcctcaaaatcctctcgggctagtgacggtgcaccgtatgatcaccgcacataatccagcctgaata 42805300  T
Q  303 ccagaaaacctcctcgaa 320  Q
    |||||| |||||||||||    
T  42805301 ccagaatacctcctcgaa 42805318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 4 - 231
Target Start/End: Original strand, 50214208 - 50214428
Alignment:
Q  4 ggcctcggaagatctcctggaataggtggcaagatctgagggtgagacaccctagcgtaccacaggacatagccatccgccgcccgccatgtctcctctc 103  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||       ||||||||||| |||||    
T  50214208 ggcctcggaatatctcctggaagaggtggcaagatttgagggtgagacaccctagtgtaccatagcacatagccat-------ccgccatgtctgctctc 50214300  T
Q  104 ctgcctgctcaccccgggcgtccgccttaagcgtgtgagtgccgaagtcgacgaacatctgcacaatggaaggcggtgggaggtccctaacatcagtcgg 203  Q
     |  |||||||||||   ||  || ||||||||||||||||  |||||||||||||  || |||||||  ||||||||  || |    || ||| |||||    
T  50214301 ttagctgctcaccccaatcggtcgtcttaagcgtgtgagtgaggaagtcgacgaacgcctacacaatgtgaggcggtgacagctttacaatatccgtcgg 50214400  T
Q  204 atgtctggggatggtctgcacgtatccg 231  Q
    ||||||||||| |||||| |||||||||    
T  50214401 atgtctggggacggtctggacgtatccg 50214428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 272 - 344
Target Start/End: Original strand, 3495550 - 3495622
Alignment:
Q  272 tacggacgccgcacataatccatccagaataccagaaaacctcctcgaagtcctggatctctctgtgctcctc 344  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3495550 tacggacaccgcacataatccacccagaataccagaaaacctcctcgaagtcctggatctctctgtgctcctc 3495622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 70 - 341
Target Start/End: Original strand, 30253201 - 30253472
Alignment:
Q  70 acatagccatccgccgcccgccatgtctcctctcctgcctgctcaccccgggcgtccgccttaagcgtgtgagtgccgaagtcgacgaacatctgcacaa 169  Q
    ||||||||||| |||   |||||||| |  |||| ||| |||||||||| | |  ||||||||||||||||||||| |||||||| ||| | ||||||||    
T  30253201 acatagccatctgccatacgccatgtttgttctcttgcatgctcaccccagtcagccgccttaagcgtgtgagtgcggaagtcgatgaaaacctgcacaa 30253300  T
Q  170 tggaaggcggtgggaggtccctaacatcagtcggatgtctggggatggtctgcacgtatccgtactgcctcaaaaccctctcgggcaagtgacggtacac 269  Q
    |   |||| |||  || ||   |||||| | ||||||||| |||| ||| || | ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||    
T  30253301 tctcaggcagtgacagctctacaacatccgacggatgtctagggacggtttggatgtatctgtactgcctcaaaaccctctcgagcaagtgacggtatac 30253400  T
Q  270 cctacggacgccgcacataatccatccagaataccagaaaacctcctcgaagtcctggatctctctgtgctc 341  Q
    |||  |  | || ||||||||||| || |||||||| || |||||||||||  ||||||  || ||||||||    
T  30253401 cctctgatcaccacacataatccagcctgaataccataatacctcctcgaaagcctggaagtccctgtgctc 30253472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 4 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 6928137 - 6927989
Alignment:
Q  4 ggcctcggaagatctcctggaataggtggcaagatctgagggtgagacaccctagcgtaccacagg-acatagccatccgccgcccgccatgtctcctct 102  Q
    ||||||||||||||||||| || ||||||||| || ||||||||| ||||| ||| |||||| |   |||||||||||||||       |||||| ||||    
T  6928137 ggcctcggaagatctcctgaaagaggtggcaaaatttgagggtgacacaccttagtgtaccataaacacatagccatccgcc-------atgtctgctct 6928045  T
Q  103 cctgcctgctcaccccgggcgtccgccttaagcgtgtgagtgccgaagtcgacgaa 158  Q
       |||||||||||||   || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  6928044 tgcgcctgctcaccccaatcggccgccttaagcgtgtgagtgcggaagtcgacgaa 6927989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 324; Significance: 0; HSPs: 15)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 324; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 27638763 - 27638424
Alignment:
Q  1 gcaggcctcggaagatctcctggaataggtggcaagatctgagggtgagacaccctagcgtaccacaggacatagccatccgccgcccgccatgtctcct 100  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  27638763 gcaggcctcggaagatctcttggaataggtggcaagatctgagggtgagacaccctagcgtaccacaggacatagccatccgccacccgccatgtatcct 27638664  T
Q  101 ctcctgcctgctcaccccgggcgtccgccttaagcgtgtgagtgccgaagtcgacgaacatctgcacaatggaaggcggtgggaggtccctaacatcagt 200  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27638663 ctcctgcctgctcaccccgagcgtccgccttaagcgtgtgagtgccgaagtcgacgaacatctgcacaatggaaggcggtgggaggtccctaacatcagt 27638564  T
Q  201 cggatgtctggggatggtctgcacgtatccgtactgcctcaaaaccctctcgggcaagtgacggtacaccctacggacgccgcacataatccatccagaa 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27638563 cggatgtctggggatggtctgcacgtatccgtactgcctcaaaaccctctcgggcaagtgacggtacaccctacggacgccgcacataatccatccagaa 27638464  T
Q  301 taccagaaaacctcctcgaagtcctggatctctctgtgct 340  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27638463 taccagaaaacctcctcgaagtcctggatctctctgtgct 27638424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 320; E-Value: 1e-180
Query Start/End: Original strand, 1 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 6204164 - 6203821
Alignment:
Q  1 gcaggcctcggaagatctcctggaataggtggcaagatctgagggtgagacaccctagcgtaccacaggacatagccatccgccgcccgccatgtctcct 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  6204164 gcaggcctcggaagatctcctggaataggtggcaagatctgagggtgagacaccctagtgtaccacaggacatagccatccgccacccgccatgtatcct 6204065  T
Q  101 ctcctgcctgctcaccccgggcgtccgccttaagcgtgtgagtgccgaagtcgacgaacatctgcacaatggaaggcggtgggaggtccctaacatcagt 200  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  6204064 ctcctgcctgctcaccccgagcgtccgccttaagcgtgtgagtgcggaagtcgacgaacatctgcacaatggaaggcggggggaggtccctaacatcagt 6203965  T
Q  201 cggatgtctggggatggtctgcacgtatccgtactgcctcaaaaccctctcgggcaagtgacggtacaccctacggacgccgcacataatccatccagaa 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6203964 cggatgtctggggatggtctgcacgtatccgtactgcctcaaaaccctctcgggcaagtgacggtacaccctacggacgccgcacataatccatccagaa 6203865  T
Q  301 taccagaaaacctcctcgaagtcctggatctctctgtgctcctc 344  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6203864 taccagaaaacctcctcgaagtcctggatctctctgtgctcctc 6203821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 320; E-Value: 1e-180
Query Start/End: Original strand, 1 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 11691131 - 11690788
Alignment:
Q  1 gcaggcctcggaagatctcctggaataggtggcaagatctgagggtgagacaccctagcgtaccacaggacatagccatccgccgcccgccatgtctcct 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  11691131 gcaggcctcggaagatctcctggaataggtggcaagatctgagggtgagacaccctagtgtaccacaggacatagccatccgccacccgccatgtatcct 11691032  T
Q  101 ctcctgcctgctcaccccgggcgtccgccttaagcgtgtgagtgccgaagtcgacgaacatctgcacaatggaaggcggtgggaggtccctaacatcagt 200  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  11691031 ctcctgcctgctcaccccgagcgtccgccttaagcgtgtgagtgcggaagtcgacgaacatctgcacaatggaaggcggggggaggtccctaacatcagt 11690932  T
Q  201 cggatgtctggggatggtctgcacgtatccgtactgcctcaaaaccctctcgggcaagtgacggtacaccctacggacgccgcacataatccatccagaa 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11690931 cggatgtctggggatggtctgcacgtatccgtactgcctcaaaaccctctcgggcaagtgacggtacaccctacggacgccgcacataatccatccagaa 11690832  T
Q  301 taccagaaaacctcctcgaagtcctggatctctctgtgctcctc 344  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11690831 taccagaaaacctcctcgaagtcctggatctctctgtgctcctc 11690788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 320; E-Value: 1e-180
Query Start/End: Original strand, 1 - 344
Target Start/End: Original strand, 30826660 - 30827003
Alignment:
Q  1 gcaggcctcggaagatctcctggaataggtggcaagatctgagggtgagacaccctagcgtaccacaggacatagccatccgccgcccgccatgtctcct 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  30826660 gcaggcctcggaagatctcctggaataggtggcaagatctgagggtgagacaccctagtgtaccacaggacatagccatccgccacccgccatgtatcct 30826759  T
Q  101 ctcctgcctgctcaccccgggcgtccgccttaagcgtgtgagtgccgaagtcgacgaacatctgcacaatggaaggcggtgggaggtccctaacatcagt 200  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  30826760 ctcctgcctgctcaccccgagcgtccgccttaagcgtgtgagtgcggaagtcgacgaacatctgcacaatggaaggcggggggaggtccctaacatcagt 30826859  T
Q  201 cggatgtctggggatggtctgcacgtatccgtactgcctcaaaaccctctcgggcaagtgacggtacaccctacggacgccgcacataatccatccagaa 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30826860 cggatgtctggggatggtctgcacgtatccgtactgcctcaaaaccctctcgggcaagtgacggtacaccctacggacgccgcacataatccatccagaa 30826959  T
Q  301 taccagaaaacctcctcgaagtcctggatctctctgtgctcctc 344  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30826960 taccagaaaacctcctcgaagtcctggatctctctgtgctcctc 30827003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 316; E-Value: 1e-178
Query Start/End: Original strand, 1 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 22304245 - 22303902
Alignment:
Q  1 gcaggcctcggaagatctcctggaataggtggcaagatctgagggtgagacaccctagcgtaccacaggacatagccatccgccgcccgccatgtctcct 100  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  22304245 gcaggcctcagaagatctcctggaataggtggcaagatctgagggtgagacaccctagtgtaccacaggacatagccatccgccacccgccatgtatcct 22304146  T
Q  101 ctcctgcctgctcaccccgggcgtccgccttaagcgtgtgagtgccgaagtcgacgaacatctgcacaatggaaggcggtgggaggtccctaacatcagt 200  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  22304145 ctcctgcctgctcaccccgagcgtccgccttaagcgtgtgagtgcggaagtcgacgaacatctgcacaatggaaggcggggggaggtccctaacatcagt 22304046  T
Q  201 cggatgtctggggatggtctgcacgtatccgtactgcctcaaaaccctctcgggcaagtgacggtacaccctacggacgccgcacataatccatccagaa 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22304045 cggatgtctggggatggtctgcacgtatccgtactgcctcaaaaccctctcgggcaagtgacggtacaccctacggacgccgcacataatccatccagaa 22303946  T
Q  301 taccagaaaacctcctcgaagtcctggatctctctgtgctcctc 344  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22303945 taccagaaaacctcctcgaagtcctggatctctctgtgctcctc 22303902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 4 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 31771079 - 31770746
Alignment:
Q  4 ggcctcggaagatctcctggaataggtggcaagatctgagggtgagacaccctagcgtaccacaggacatagccatccgccgcccgccatgtctcctctc 103  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||||       |||||| |||||    
T  31771079 ggcctcggaagatctcctgaaagaggtggcaagatctgagggtgagacaccctagtgtaccatagcacatagccatccgcc-------atgtctgctctc 31770987  T
Q  104 ctgcctgctcaccccgggcgtccgccttaagcgtgtgagtgccgaagtcgacgaacatctgcacaatggaaggcggtgggaggtccctaacatcagtcgg 203  Q
    |||||||||||||||   || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||  || |||||||  ||||||||| || ||   |||||| |||||    
T  31770986 ctgcctgctcaccccaatcggccgccttaagcgtgtgagtgcggaagtcgacgaacgcctacacaatgtgaggcggtggcagctctacaacatccgtcgg 31770887  T
Q  204 atgtctggggatggtctgcacgtatccgtactgcctcaaaaccctctcgggcaagtgacggtacaccctacggacgccgcacataatccatccagaatac 303  Q
    ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||    
T  31770886 atgtctggggacggtctggacgtatccgtactgcctcaaaaccctctcaggcaagtgacggtacaccctacgaacaccgcacataatccagccagaatac 31770787  T
Q  304 cagaaaacctcctcgaagtcctggatctctctgtgctcctc 344  Q
    || ||||||||||| || || ||||||||||||||||||||    
T  31770786 cataaaacctcctcaaaatcatggatctctctgtgctcctc 31770746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 156; E-Value: 8e-83
Query Start/End: Original strand, 73 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 26440384 - 26440113
Alignment:
Q  73 tagccatccgccgcccgccatgtctcctctcctgcctgctcaccccgggcgtccgccttaagcgtgtgagtgccgaagtcgacgaacatctgcacaatgg 172  Q
    ||||||||||||  ||||||||||| |||||||||| |||||||||   |   |||||||||||||||||||| |||||||||||||   |||||||||     
T  26440384 tagccatccgccatccgccatgtctgctctcctgccggctcaccccaatcagtcgccttaagcgtgtgagtgcggaagtcgacgaacgcttgcacaatgt 26440285  T
Q  173 aaggcggtgggaggtccctaacatcagtcggatgtctggggatggtctgcacgtatccgtactgcctcaaaaccctctcgggcaagtgacggtacaccct 272  Q
    ||||| ||||||||||   |||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26440284 aaggcagtgggaggtctacaacatcagtcagatgtctagggatggtctggacgtatccgtattgcctcaaaaccctctcgggcaagtgacggtacaccct 26440185  T
Q  273 acggacgccgcacataatccatccagaataccagaaaacctcctcgaagtcctggatctctctgtgctcctc 344  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||  ||||||||||    
T  26440184 acggacaccgcacataatccaaccagaataccagaaaacctcctcaaagtcatggatctccttgtgctcctc 26440113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 8 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 26172925 - 26172594
Alignment:
Q  8 tcggaagatctcctggaataggtggcaagatctgagggtgagacaccctagcgtaccacaggacatagccatccgccgcccgccatgtctcctctcctgc 107  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||||| || ||||| ||||||||||||| |||||| |  |||||| ||||||||  |||| |||||| |||||||||    
T  26172925 tcggaagatctcctcgaagaggtggcaaaatttgagg-tgagacaccctagtgtaccataacacatagacatccgccatccgcaatgtctgctctcctgc 26172827  T
Q  108 ctgctcaccccgggcgtccgccttaagcgtgtgagtgccgaagtcgacgaacatctgcacaatggaaggcggtgggaggtccctaacatcagt------- 200  Q
    ||||| | |||   || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||   |||||||||   ||||||||| || ||   |||||| ||           
T  26172826 ctgcttatcccaatcggccgccttaagcgtgtgagtgcggaagtcgacgaatgcctgcacaatctgaggcggtggcagctctacaacatccgttcatccg 26172727  T
Q  201 -cggatgtctggggatggtctgcacgtatccgtactgcctcaaaaccctctcgggcaagtgacggtacaccctacggacgccgcacataatccatccaga 299  Q
     |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| || ||    
T  26172726 tcggatgtctggggacggtctggacgtatccgtactgcctcaaaactctctcgggcaagtgacggtacaccctacgaacaccgcacataatccagcctga 26172627  T
Q  300 ataccagaaaacctcctcgaagtcctggatctc 332  Q
    |||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  26172626 ataccagaaaacctcctcaaaatcctggatctc 26172594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 4 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 2407248 - 2406918
Alignment:
Q  4 ggcctcggaagatctcctggaataggtggcaagatctgagggtgagacaccctagcgtaccacaggacatagccatccgccgcccgccatgtctcctctc 103  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||||| |  ||||||||||| |||       || ||| |||||    
T  2407248 ggcctcggaagatctcctggaagaggtggcaaaatccgagggtgagacaccctagtgtaccataacacatagccatctgcc-------atttctgctctc 2407156  T
Q  104 ctgcctgctcaccccgggcgtccgccttaagcgtgtgagtgccgaagtcgacgaacatctgcacaatggaaggcggtgggaggtccctaacatcagtcgg 203  Q
    ||||||| ||||| ||  || ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||  ||||||||||   |||  |||| || ||   |||||| |||||    
T  2407155 ctgcctgttcacctcgatcggccgccttaagcgtgtaagtgcggaagtcgacgaatgtctgcacaatttgaggtagtggcagctctacaacatccgtcgg 2407056  T
Q  204 atgtctggggatggtctgcacgtatccgtactgcctcaaaaccctctcgggcaagtgacggtacaccctacggacgccgcacataatccatccagaatac 303  Q
    |||| | |||| |||||  ||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||| ||| |||||||| || ||||| |||||||| || ||||||    
T  2407055 atgtttagggacggtctagacgtatccgtattgccttaaaaccctctcgagcaagtgacagtagaccctacgtacaccgcatataatccagcctgaatac 2406956  T
Q  304 cagaaaacctcctcgaagtcctggatctctctgtgctc 341  Q
    |||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||    
T  2406955 cagaaaacctactcaaagtcctggatctccctgtgctc 2406918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 3 - 320
Target Start/End: Original strand, 24085858 - 24086177
Alignment:
Q  3 aggcctcggaagatctcctggaataggtggcaagatctgagggtgagacaccctagcgtaccacaggacatagccatccgccgcccgccatgtctcctct 102  Q
    ||||||| ||| |||||||  || | ||||||| |||||||||||||||||    | ||||||  | ||||||||||| |||   ||||||| || ||||    
T  24085858 aggcctccgaatatctcctacaagaagtggcaaaatctgagggtgagacacaacggtgtaccatcgtacatagccatctgccatacgccatgcctgctct 24085957  T
Q  103 cctgcctgctcaccccgggcgtccgccttaagcgtgtgagtgccgaagtcgacgaacatctgcacaatggaaggcggtgggaggtccctaacatcagtcg 202  Q
    ||||| ||||||||||   || |||||||||| |||||||||| |||||||||||| |  ||||||||   || |||||  || ||   |||||| | ||    
T  24085958 cctgcatgctcaccccaatcggccgccttaagtgtgtgagtgcggaagtcgacgaaaacatgcacaatctcagtcggtgacagctctacaacatccgacg 24086057  T
Q  203 gatgtctg-gggatggtctgcacgtatccgtactgcctcaaaaccctctcggg-caagtgacggtacaccctacggacgccgcacataatccatccagaa 300  Q
     ||||||  |||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||| |||    
T  24086058 aatgtctaagggacggtctggacgtatctgtactgcctcaaaaccctctcggggcaagtgacggtacaccctacgatcaccgcacataatccatcctgaa 24086157  T
Q  301 taccagaaaacctcctcgaa 320  Q
    |||||||| |||||||||||    
T  24086158 taccagaatacctcctcgaa 24086177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 3 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 32642904 - 32642567
Alignment:
Q  3 aggcctcggaagatctcctggaataggtggcaagatctgagggtgagacaccctagcgtaccacaggacatagccatccgccgcccgccatgtctcctct 102  Q
    ||||||||||| ||||||||||| | ||||||| || ||||||||||||||    | ||||||  | ||||||||||| | |   |||||||||| | ||    
T  32642904 aggcctcggaatatctcctggaagaagtggcaaaatttgagggtgagacacaacggtgtaccatcgtacatagccatctgtcatacgccatgtctaccct 32642805  T
Q  103 cctgcctgctcaccccgggcgtccgccttaagcgtgtgagtgccgaagtcgacgaacatctgcacaatggaaggcggtgggaggtccctaacatcagtcg 202  Q
    ||| | |||||||||     | ||||||||||||||||||| | ||||||||||||   |||||||||   || |||||  |  ||   |||||| | ||    
T  32642804 cctacatgctcacccaatcag-ccgccttaagcgtgtgagtacggaagtcgacgaaagcctgcacaatctcagccggtgacaactctacaacatccgacg 32642706  T
Q  203 gatgtctggggatggtctgcacgtatccgtactgcctcaaaaccctctcgggcaagtgacggtacaccctacggacgccgcacataatccatccagaata 302  Q
    ||||||| |||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||| || || |||||    
T  32642705 gatgtctagggacggtcaggacgtatccgtactgcctcaaaaccctctcgggcaagtgacggtacaccctacgatcaccgcacataattcagcctgaata 32642606  T
Q  303 ccagaaaacctcctcgaagtcctggatctctctgtgctc 341  Q
    |||||| |||||||||||  ||||||  |||||||||||    
T  32642605 ccagaatacctcctcgaaagcctggaagtctctgtgctc 32642567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 4 - 158
Target Start/End: Original strand, 2406068 - 2406222
Alignment:
Q  4 ggcctcggaagatctcctggaataggtggcaagatctgagggtgagacaccctagcgtaccacaggacatagccatccgccgcccgccatgtctcctctc 103  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| | |||||| |  ||||||||||||| || ||| ||||||| |||||    
T  2406068 ggcctcggaagatctcttggaagaggtggcaaaatctgagggtgagacacccttgtgtaccataacacatagccatccgtcgtccgtcatgtctgctctc 2406167  T
Q  104 ctgcctgctcaccccgggcgtccgccttaagcgtgtgagtgccgaagtcgacgaa 158  Q
    |||||||||||||||   || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  2406168 ctgcctgctcaccccaatcggccgccttaagcgtgtgagtgcggaagtcgacgaa 2406222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 3 - 320
Target Start/End: Original strand, 18005483 - 18005800
Alignment:
Q  3 aggcctcggaagatctcctggaataggtggcaagatctgagggtgagacaccctagcgtaccacaggacatagccatccgccgcccgccatgtctcctct 102  Q
    ||||||||||| ||||||||||| | ||||||| |||||||||||||||||    | |||||   | ||||||||||| |||   | |||||| ||||||    
T  18005483 aggcctcggaaaatctcctggaagaagtggcaaaatctgagggtgagacacaacggtgtaccttcgtacatagccatctgccatacaccatgtttcctct 18005582  T
Q  103 cctgcctgctcaccccgggcgtccgccttaagcgtgtgagtgccgaagtcgacgaacatctgcacaatggaaggcggtgggaggtccctaacatcagtcg 202  Q
     |||| ||||||||||   || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||   |||||||||   || |||||  |  ||   |||| |   |     
T  18005583 gctgcatgctcaccccaatcggccgccttaagcgtgtgagtgcggaagtcgacgaaagcctgcacaatctcagtcggtgacatctctacaacagctaaca 18005682  T
Q  203 gatgtctggggatggtctgcacgtatccgtactgcctcaaaaccctctcgggcaagtgacggtacaccctacggacgccgcacataatccatccagaata 302  Q
    ||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||   | || ||| ||||||| || |||||    
T  18005683 gatgtctagggacggtctggacgtatccgtactgcctcaaaaccctctcgggcaagtgatggtgcaccctacaatcaccacacgtaatccagcctgaata 18005782  T
Q  303 ccagaaaacctcctcgaa 320  Q
    | |||| |||||||||||    
T  18005783 ctagaatacctcctcgaa 18005800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 4 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 3384440 - 3384104
Alignment:
Q  4 ggcctcggaagatctcctggaataggtggcaagatctgagggtgagacaccctagcgtaccacaggacatagccatccgccgcccgccatgtctcctctc 103  Q
    |||||||||||||||| ||||| || |||||| |||||||||||||||| | ||| ||| || |  |||||||| |||  |    ||||||||| ||||     
T  3384440 ggcctcggaagatctc-tggaagagatggcaaaatctgagggtgagacatcttagtgtatcataacacatagccctccctcatatgccatgtctgctctg 3384342  T
Q  104 ctgcctgctcaccccgggcgtccgccttaagcgtgtgagtgccgaagtcgacgaacatctgcacaatggaaggcggtgggaggtccctaacatcagtcgg 203  Q
    ||||||||||||  |   ||  | |||||||||||||| ||   ||||| |||||  ||||||||||   |||| |||  |  ||   |||||| || ||    
T  3384341 ctgcctgctcacttcaatcggtctccttaagcgtgtgaatgtgaaagtctacgaatgtctgcacaatctgaggcagtgtcatctctacaacatccgtagg 3384242  T
Q  204 atgtctggggatggtctgcacgtatccgtactgcctcaaaaccctctcgggcaagtgacggtacaccctacggacgccgcacataatccatccagaatac 303  Q
    |||||| ||||| || || |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||||| || ||||| |||||||| || ||||||    
T  3384241 atgtctagggatcgtatggacgtatccgtactgcctcaacaccctctcaggcaagtgacggtgcaccctacgaacaccgcaaataatccagcctgaatac 3384142  T
Q  304 cagaaaacctcctcgaagtcctggatctctctgtgctc 341  Q
    || || | || ||| ||  |||||||||| ||||||||    
T  3384141 cataatatcttctcaaaaccctggatctccctgtgctc 3384104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 22 - 118
Target Start/End: Complemental strand, 21603378 - 21603282
Alignment:
Q  22 ggaataggtggcaagatctgagggtgagacaccctagcgtaccacaggacatagccatccgccgcccgccatgtctcctctcctgcctgctcacccc 118  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||||| ||| |||||| || | |||||||||  ||  |  ||||||| ||||||||||  |||||||||    
T  21603378 ggaataggtggaaaaatctgagggtgagacaccgtagtgtaccatagtatatagccatcatccatcttccatgtcgcctctcctgctggctcacccc 21603282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 320; Significance: 1e-180; HSPs: 22)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 320; E-Value: 1e-180
Query Start/End: Original strand, 1 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 1055541 - 1055198
Alignment:
Q  1 gcaggcctcggaagatctcctggaataggtggcaagatctgagggtgagacaccctagcgtaccacaggacatagccatccgccgcccgccatgtctcct 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  1055541 gcaggcctcggaagatctcctggaataggtggcaagatctgagggtgagacaccctagtgtaccacaggacatagccatccgccacccgccatgtatcct 1055442  T
Q  101 ctcctgcctgctcaccccgggcgtccgccttaagcgtgtgagtgccgaagtcgacgaacatctgcacaatggaaggcggtgggaggtccctaacatcagt 200  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  1055441 ctcctgcctgctcaccccgagcgtccgccttaagcgtgtgagtgcggaagtcgacgaacatctgcacaatggaaggcggggggaggtccctaacatcagt 1055342  T
Q  201 cggatgtctggggatggtctgcacgtatccgtactgcctcaaaaccctctcgggcaagtgacggtacaccctacggacgccgcacataatccatccagaa 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1055341 cggatgtctggggatggtctgcacgtatccgtactgcctcaaaaccctctcgggcaagtgacggtacaccctacggacgccgcacataatccatccagaa 1055242  T
Q  301 taccagaaaacctcctcgaagtcctggatctctctgtgctcctc 344  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1055241 taccagaaaacctcctcgaagtcctggatctctctgtgctcctc 1055198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 320; E-Value: 1e-180
Query Start/End: Original strand, 1 - 344
Target Start/End: Original strand, 23019329 - 23019672
Alignment:
Q  1 gcaggcctcggaagatctcctggaataggtggcaagatctgagggtgagacaccctagcgtaccacaggacatagccatccgccgcccgccatgtctcct 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  23019329 gcaggcctcggaagatctcctggaataggtggcaagatctgagggtgagacaccctagtgtaccacaggacatagccatccgccacccgccatgtatcct 23019428  T
Q  101 ctcctgcctgctcaccccgggcgtccgccttaagcgtgtgagtgccgaagtcgacgaacatctgcacaatggaaggcggtgggaggtccctaacatcagt 200  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  23019429 ctcctgcctgctcaccccgagcgtccgccttaagcgtgtgagtgcggaagtcgacgaacatctgcacaatggaaggcggggggaggtccctaacatcagt 23019528  T
Q  201 cggatgtctggggatggtctgcacgtatccgtactgcctcaaaaccctctcgggcaagtgacggtacaccctacggacgccgcacataatccatccagaa 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23019529 cggatgtctggggatggtctgcacgtatccgtactgcctcaaaaccctctcgggcaagtgacggtacaccctacggacgccgcacataatccatccagaa 23019628  T
Q  301 taccagaaaacctcctcgaagtcctggatctctctgtgctcctc 344  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23019629 taccagaaaacctcctcgaagtcctggatctctctgtgctcctc 23019672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 320; E-Value: 1e-180
Query Start/End: Original strand, 1 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 26662462 - 26662119
Alignment:
Q  1 gcaggcctcggaagatctcctggaataggtggcaagatctgagggtgagacaccctagcgtaccacaggacatagccatccgccgcccgccatgtctcct 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  26662462 gcaggcctcggaagatctcctggaataggtggcaagatctgagggtgagacaccctagtgtaccacaggacatagccatccgccacccgccatgtatcct 26662363  T
Q  101 ctcctgcctgctcaccccgggcgtccgccttaagcgtgtgagtgccgaagtcgacgaacatctgcacaatggaaggcggtgggaggtccctaacatcagt 200  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  26662362 ctcctgcctgctcaccccgagcgtccgccttaagcgtgtgagtgcggaagtcgacgaacatctgcacaatggaaggcggggggaggtccctaacatcagt 26662263  T
Q  201 cggatgtctggggatggtctgcacgtatccgtactgcctcaaaaccctctcgggcaagtgacggtacaccctacggacgccgcacataatccatccagaa 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26662262 cggatgtctggggatggtctgcacgtatccgtactgcctcaaaaccctctcgggcaagtgacggtacaccctacggacgccgcacataatccatccagaa 26662163  T
Q  301 taccagaaaacctcctcgaagtcctggatctctctgtgctcctc 344  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26662162 taccagaaaacctcctcgaagtcctggatctctctgtgctcctc 26662119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 300; E-Value: 1e-169
Query Start/End: Original strand, 1 - 344
Target Start/End: Original strand, 15033807 - 15034150
Alignment:
Q  1 gcaggcctcggaagatctcctggaataggtggcaagatctgagggtgagacaccctagcgtaccacaggacatagccatccgccgcccgccatgtctcct 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||    
T  15033807 gcaggcctcggaagatctcctggaagaggtggcaagatctgagggtgagacaccctagtgtaccacaggacatagccatccgccatccgccatgtatcct 15033906  T
Q  101 ctcctgcctgctcaccccgggcgtccgccttaagcgtgtgagtgccgaagtcgacgaacatctgcacaatggaaggcggtgggaggtccctaacatcagt 200  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  15033907 ctcctgcctgctcaccccgatcgtccgccttaagcgtgtgagtgcggaagtcgacgaacatctgcacaatggaaggcggtgggaggttcctaacatcagt 15034006  T
Q  201 cggatgtctggggatggtctgcacgtatccgtactgcctcaaaaccctctcgggcaagtgacggtacaccctacggacgccgcacataatccatccagaa 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  15034007 cggatgtctggggatggtctgcacgtatccgtactgcctcaaaaccctctcgggcaagtgacggtacaccctacggacaccgcacataatccacccagaa 15034106  T
Q  301 taccagaaaacctcctcgaagtcctggatctctctgtgctcctc 344  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15034107 taccagaaaacctcctcgaagtcctggatctctctgtgctcctc 15034150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 296; E-Value: 1e-166
Query Start/End: Original strand, 1 - 344
Target Start/End: Original strand, 22538 - 22881
Alignment:
Q  1 gcaggcctcggaagatctcctggaataggtggcaagatctgagggtgagacaccctagcgtaccacaggacatagccatccgccgcccgccatgtctcct 100  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||| |||||||||| ||||    
T  22538 gcaggcctcggaatatctcctggaataggtggcaagatctgagggtgagacaccctagtgtaccacaggacatagtcatctgccacccgccatgtatcct 22637  T
Q  101 ctcctgcctgctcaccccgggcgtccgccttaagcgtgtgagtgccgaagtcgacgaacatctgcacaatggaaggcggtgggaggtccctaacatcagt 200  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  22638 ctcctgcctgctcaccccgagcgtccgccttaagcgtgtgagtgcggaagtcgacgaacatctgcacaatggaaggcggggggaggtccctaacatcagt 22737  T
Q  201 cggatgtctggggatggtctgcacgtatccgtactgcctcaaaaccctctcgggcaagtgacggtacaccctacggacgccgcacataatccatccagaa 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  22738 cggatgtctggggatggtctgcacgtatccgtactgcctcaaaaccctctcgggcaagtgacggtacaccctacggatgccacacataatccatccagaa 22837  T
Q  301 taccagaaaacctcctcgaagtcctggatctctctgtgctcctc 344  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  22838 taccagaaaacctcctcgaagtcctagatctctctgtgctcctc 22881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 296; E-Value: 1e-166
Query Start/End: Original strand, 1 - 344
Target Start/End: Original strand, 42482548 - 42482891
Alignment:
Q  1 gcaggcctcggaagatctcctggaataggtggcaagatctgagggtgagacaccctagcgtaccacaggacatagccatccgccgcccgccatgtctcct 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||| ||||    
T  42482548 gcaggcctcggaagatctcctggaataggtggcaagatctgagggtgagacaccctagtgtaccacaggatatagccatccgccacccaccatgtatcct 42482647  T
Q  101 ctcctgcctgctcaccccgggcgtccgccttaagcgtgtgagtgccgaagtcgacgaacatctgcacaatggaaggcggtgggaggtccctaacatcagt 200  Q
     |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  42482648 ttcctgcctgctcaccccgagcgtccgcctcaagcgtgtgagtgcggaagtcgacgaacatctgcacaatggaaggcggggggaggtccctaacatcagt 42482747  T
Q  201 cggatgtctggggatggtctgcacgtatccgtactgcctcaaaaccctctcgggcaagtgacggtacaccctacggacgccgcacataatccatccagaa 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42482748 cggatgtctggggatggtctgcacgtatccgtactgcctcaaaatcctctcgggcaagtgacggtacaccctacggacgccgcacataatccatccagaa 42482847  T
Q  301 taccagaaaacctcctcgaagtcctggatctctctgtgctcctc 344  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  42482848 taccagaaaacctcctcgaagtcctggatctttctgtgctcctc 42482891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 292; E-Value: 1e-164
Query Start/End: Original strand, 1 - 344
Target Start/End: Original strand, 486775 - 487118
Alignment:
Q  1 gcaggcctcggaagatctcctggaataggtggcaagatctgagggtgagacaccctagcgtaccacaggacatagccatccgccgcccgccatgtctcct 100  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  486775 gcaggcctcgaaagatctcctggaataggtggcaagatctgagggtgagacaccctagtgtaccacaggacatagccatccgccacccgccatgtatcct 486874  T
Q  101 ctcctgcctgctcaccccgggcgtccgccttaagcgtgtgagtgccgaagtcgacgaacatctgcacaatggaaggcggtgggaggtccctaacatcagt 200  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  486875 ctcctgcctgctcaccccgagcgtccgccttaagcgtgtgagtgcggaagtcgataaacatctgcacaatggaaggcggggggaggtccctaacatcagt 486974  T
Q  201 cggatgtctggggatggtctgcacgtatccgtactgcctcaaaaccctctcgggcaagtgacggtacaccctacggacgccgcacataatccatccagaa 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  486975 cggatgtctggggatggtctgcacgtatccgtactgcctcaaaaccctctcgggcaagtgacggtacaccctacagacgccgcacataatccatccagaa 487074  T
Q  301 taccagaaaacctcctcgaagtcctggatctctctgtgctcctc 344  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  487075 taccaggaaacctcctcgaagtcctgaatctctttgtgctcctc 487118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 1 - 341
Target Start/End: Original strand, 34367652 - 34367992
Alignment:
Q  1 gcaggcctcggaagatctcctggaataggtggcaagatctgagggtgagacaccctagcgtaccacaggacatagccatccgccgcccgccatgtctcct 100  Q
    ||||||||| |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| || |||||||||||||||  ||||||||||| ||    
T  34367652 gcaggcctcagaagatctcctgaaagaggtggcaagatctgagggtgagataccctagtgtaccatagcacatagccatccgccatccgccatgtctgct 34367751  T
Q  101 ctcctgcctgctcaccccgggcgtccgccttaagcgtgtgagtgccgaagtcgacgaacatctgcacaatggaaggcggtgggaggtccctaacatcagt 200  Q
    ||||||||||||||||||   || |||||||||||||||||||||  ||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||   |||||||||    
T  34367752 ctcctgcctgctcaccccaatcggccgccttaagcgtgtgagtgcgaaagtcgacgaacgcctgcacaatgtaaggcggtgggaggtctacaacatcagt 34367851  T
Q  201 cggatgtctggggatggtctgcacgtatccgtactgcctcaaaaccctctcgggcaagtgacggtacaccctacggacgccgcacataatccatccagaa 300  Q
    |||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||| |||||||||||||| ||||||    
T  34367852 cggatgtctgaggatggtctggacgtattcgtactgcctcaaaaccctctcgggcaagtgaaggtacaccatacagacaccgcacataatccagccagaa 34367951  T
Q  301 taccagaaaacctcctcgaagtcctggatctctctgtgctc 341  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||    
T  34367952 taccagaaaacctcctcaaagtcctggatctccctatgctc 34367992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 1 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 39604302 - 39603963
Alignment:
Q  1 gcaggcctcggaagatctcctggaataggtggcaagatctgagggtgagacaccctagcgtaccacaggacatagccatccgccgcccgccatgtctcct 100  Q
    ||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||  ||| ||||||| ||    
T  39604302 gcaggcctcagaagatttcctggaagaggtggcaagatctgagggtgagacaccctagtgtaccataggacatagtcatccgccatccgtcatgtctact 39604203  T
Q  101 ctcctgcctgctcaccccgggcgtccgccttaagcgtgtgagtgccgaagtcgacgaacatctgcacaatggaaggcggtgggaggtccctaacatcagt 200  Q
    ||||||| ||||||||||   || || |||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||| |||||||||| |||||   |||||| ||    
T  39604202 ctcctgcatgctcaccccaatcggccaccttaagcgtgtgagtgcggaagtcgacgaacgcctgcacaatgtaaggcggtggcaggtctacaacatccgt 39604103  T
Q  201 cggatgtctggggatggtctgcacgtatccgtactgcctcaaaaccctctcgggcaagtgacggtacaccctacggacgccgcacataatccatccagaa 300  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  39604102 cggatgtct-gggatggtctggacgtattcgtactgcctcaaaaccctcttgggcaagtgacggtacaccctacgaacaccgcacataatccatccagaa 39604004  T
Q  301 taccagaaaacctcctcgaagtcctggatctctctgtgctc 341  Q
    ||| |||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||    
T  39604003 tacgagaaaaccacctcaaagtcctggatctccctgtgctc 39603963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 173; E-Value: 6e-93
Query Start/End: Original strand, 1 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 43214399 - 43214075
Alignment:
Q  1 gcaggcctcggaagatctcctggaataggtggcaagatctgagggtgagacaccctagcgtaccacaggacatagccatccgccgcccgccatgtctcct 100  Q
    |||||||||  || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||       ||||||       
T  43214399 gcaggcctcataatatctcctggaagaggtggcaagatctgagggtgagacaccctagtgtaccataggacatagccatccgcc-------atgtct--- 43214310  T
Q  101 ctcctgcctgctcaccccgggcgtccgccttaagcgtgtgagtgccgaagtcgacgaacatctgcacaatggaaggcggtgggaggtccctaacatcagt 200  Q
             |||||||||   ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||| |||||||| |||||||   |||||||||    
T  43214309 ---------gctcaccccaatcgttcgccttaagcgtgtgagtgcggaagtcgacgaacgcctgcacaatgtaaggcggtcggaggtctgcaacatcagt 43214219  T
Q  201 cggatgtctggggatggtctgcacgtatccgtactgcctcaaaaccctctcgggcaagtgacggtacaccctacggacgccgcacataatccatccagaa 300  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  43214218 cggatgtctggggatggtctggacgtattcgtactgcctcaaaaccctctcgggcaagtgacggtacatcctacggacaccgcacataatccagccagaa 43214119  T
Q  301 taccagaaaacctcctcgaagtcctggatctctctgtgctcctc 344  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||    
T  43214118 taccagaaaacctcctcaaagtcctgcatctccctgtgctcctc 43214075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 141; E-Value: 7e-74
Query Start/End: Original strand, 5 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 20859024 - 20858688
Alignment:
Q  5 gcctcggaagatctcctggaataggtggcaagatctgagggtgagacaccctagcgtaccacaggacatagccatccgccgcccgccatgtctcctctcc 104  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||| || |||||||||||||||||||||| |||||| |  |||||||||||||||  |  |||||| | ||||||    
T  20859024 gcctcgaaagatctcctggaagaggtggaaaaatctgagggtgagacaccctagtgtaccataacacatagccatccgccatcatccatgtatgctctcc 20858925  T
Q  105 tgcctgctcaccccgggcgtccgccttaagcgtgtgagtgccgaagtcgacgaacatctgcacaatggaaggcggtgggaggtccctaacatcagtcgga 204  Q
    ||||||||||| ||    | |||||||||| |||||||||  ||||| ||||||   |||||||||  |||||||||  |  ||   |||||| ||||||    
T  20858924 tgcctgctcactccaataggccgccttaagggtgtgagtgtggaagttgacgaatgcctgcacaatctaaggcggtgacaactctacaacatccgtcgga 20858825  T
Q  205 tgtctggggatggtctgcacgtatccgtactgcctcaaaaccctctcgggcaagtgacggtacaccctacggacgccgcacataatccatccagaatacc 304  Q
    ||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| || |||||||    
T  20858824 tgtttggggacggtctggacgtatccgtactgcctcaaaaccctctcgggcaagtgacggtacaccctacgaacaccgcacataatccagcctgaatacc 20858725  T
Q  305 agaaaacctcctcgaagtcctggatctctctgtgctc 341  Q
    ||||||||||||| || | ||||||||| || |||||    
T  20858724 agaaaacctcctcaaaattctggatctccctatgctc 20858688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 141; E-Value: 7e-74
Query Start/End: Original strand, 4 - 332
Target Start/End: Original strand, 34819655 - 34819983
Alignment:
Q  4 ggcctcggaagatctcctggaataggtggcaagatctgagggtgagacaccctagcgtaccacaggacatagccatccgccgcccgccatgtctcctctc 103  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||| ||||| ||| |||||| |  |||||||||||||||  ||||||||||| |||      
T  34819655 ggcctcggaagatctcctggaagaggtggaaaaatctgagggtgaaacaccttagtgtaccataacacatagccatccgccatccgccatgtctgctcct 34819754  T
Q  104 ctgcctgctcaccccgggcgtccgccttaagcgtgtgagtgccgaagtcgacgaacatctgcacaatggaaggcggtgggaggtccctaacatcagtcgg 203  Q
     ||||||||||||||   || | ||||||||||||||||||| ||||||||||||   || ||||||   ||||||||| || ||   |||||| |||||    
T  34819755 gtgcctgctcaccccaatcggctgccttaagcgtgtgagtgcggaagtcgacgaatgcctacacaatctgaggcggtggcagctctacaacatccgtcgg 34819854  T
Q  204 atgtctggggatggtctgcacgtatccgtactgcctcaaaaccctctcgggcaagtgacggtacaccctacggacgccgcacataatccatccagaatac 303  Q
    |||||| |||| | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |  |||||||||||||| || ||||||    
T  34819855 atgtctagggacgctctggacgtatccgtactgcctcaaaaccctctcgggcaagtgacggtacatcctacgaataccgcacataatccagcctgaatac 34819954  T
Q  304 cagaaaacctcctcgaagtcctggatctc 332  Q
    |||||||||||||| || || ||||||||    
T  34819955 cagaaaacctcctcaaaatcttggatctc 34819983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 1 - 341
Target Start/End: Original strand, 41243126 - 41243447
Alignment:
Q  1 gcaggcctcggaagatctcctggaataggtggcaagatctgagggtgagacaccctagcgtaccacaggacatagccatccgccgcccgccatgtctcct 100  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||| |||                    
T  41243126 gcaggccttggaagatctcctggaagaggtgacaaaatctgagggtgagacaccctagtgtaccatagcacatagccatctgcca--------------- 41243210  T
Q  101 ctcctgcctgctcaccccgggcgtccgccttaagcgtgtgagtgccgaagtcgacgaacatctgcacaatggaaggcggtgggaggtccctaacatcagt 200  Q
        ||||||||||||||   |||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||||  |||||||||| |||||||||| |||||   |||||| ||    
T  41243211 ----tgcctgctcaccccaatcgtctgccttaagcgtgtcagtgcggaagtcgacgaacgcctgcacaatgtaaggcggtggcaggtctacaacatctgt 41243306  T
Q  201 cggatgtctggggatggtctgcacgtatccgtactgcctcaaaaccctctcgggcaagtgacggtacaccctacggacgccgcacataatccatccagaa 300  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||| ||||||    
T  41243307 cggatgtctggggatggtctggacgtatccgtactgcctcaaaacactctctggcaagtgacggtacaccctacgaacagcgcacataatccagccagaa 41243406  T
Q  301 taccagaaaacctcctcgaagtcctggatctctctgtgctc 341  Q
    ||||| |||| |||||| ||||| |||||||| ||||||||    
T  41243407 taccataaaatctcctcaaagtcatggatctccctgtgctc 41243447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 4 - 341
Target Start/End: Original strand, 39831796 - 39832125
Alignment:
Q  4 ggcctcggaagatctcctggaataggtggcaagatctgagggtgagacaccctagcgtaccacaggacatagccatccgccgcccgccatgtctcctctc 103  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||| |  |||||  ||||||||       |||||| |||||    
T  39831796 ggcctcggaagatctcttggaagaggtggcaaaatctgagggtgagacacc-tagtgtaccataacacataatcatccgcc-------atgtctgctctc 39831887  T
Q  104 ctgcctgctcaccccgggcgtccgccttaagcgtgtgagtgccgaagtcgacgaacatctgcacaatggaaggcggtgggaggtccctaacatcagtcgg 203  Q
    |||||||||||||||   || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||   |||||||||   ||||||||  || ||   |||||| |||||    
T  39831888 ctgcctgctcaccccaatcgaccgccttaagcgtgtgagtgcggaagtcgacgaatgcctgcacaatctgaggcggtgacagctctacaacatcggtcgg 39831987  T
Q  204 atgtctggggatggtctgcacgtatccgtactgcctcaaaaccctctcgggcaagtgacggtacaccctacggacgccgcacataatccatccagaatac 303  Q
    |||||||| || |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| || | || |||||||||||||| || ||||||    
T  39831988 atgtctggagacggtctggacgtatccgtactgccttaaaaccctctcgggtaagtgacggtacaccttaggaacaccgcacataatccagcctgaatac 39832087  T
Q  304 cagaaaacctcctcgaagtcctggatctctctgtgctc 341  Q
    || ||||||||||| || ||||||||||| ||||||||    
T  39832088 cacaaaacctcctcaaaatcctggatctccctgtgctc 39832125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 4 - 341
Target Start/End: Original strand, 5301352 - 5301689
Alignment:
Q  4 ggcctcggaagatctcctggaataggtggcaagatctgagggtgagacaccctagcgtaccacaggacatagccatccgccgcccgccatgtctcctctc 103  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| |  |||||| ||||||||  ||  ||||||| |||||    
T  5301352 ggccttggaagatctcctggaagaggtggcaaaatctgagggtgagacaccctagtgtaccataacacatagtcatccgccatccatcatgtctgctctc 5301451  T
Q  104 ctgcctgctcaccccgggcgtccgccttaagcgtgtgagtgccgaagtcgacgaacatctgcacaatggaaggcggtgggaggtccctaacatcagtcgg 203  Q
    |||||||||| || |   || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||   |||||||||   |||  ||||||| ||   |||||| |||||    
T  5301452 ctgcctgctcgcctcaatcggccgccttaagcgtgtgagtgcggaagtcgacgaatgcctgcacaatctgaggtagtgggagctctacaacatccgtcgg 5301551  T
Q  204 atgtctggggatggtctgcacgtatccgtactgcctcaaaaccctctcgggcaagtgacggtacaccctacggacgccgcacataatccatccagaatac 303  Q
    |||||| |||| ||| || ||||||||||||| |||||||| || || || |||||||||||| |||| ||  || |||||||||||||| |  ||||||    
T  5301552 atgtctagggacggtatggacgtatccgtactacctcaaaatccacttggacaagtgacggtagacccaacaaacaccgcacataatccagcttgaatac 5301651  T
Q  304 cagaaaacctcctcgaagtcctggatctctctgtgctc 341  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||  ||||||||    
T  5301652 cagaaaacctcctcaaaatcctggatcttcctgtgctc 5301689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 4 - 341
Target Start/End: Original strand, 21176358 - 21176695
Alignment:
Q  4 ggcctcggaagatctcctggaataggtggcaagatctgagggtgagacaccctagcgtaccacaggacatagccatccgccgcccgccatgtctcctctc 103  Q
    |||||| |||||||| |||||| ||||| ||| ||||||||||| ||||||  || |||||| || |||||| |||||  |   |||||||||| |||||    
T  21176358 ggcctcagaagatcttctggaagaggtgtcaaaatctgagggtgtgacaccgcagtgtaccatagcacatagtcatccctcatacgccatgtctgctctc 21176457  T
Q  104 ctgcctgctcaccccgggcgtccgccttaagcgtgtgagtgccgaagtcgacgaacatctgcacaatggaaggcggtgggaggtccctaacatcagtcgg 203  Q
    |||||||||||||||   ||| | |||||||||||||||||| |||||||| |||   || ||||||   ||||| | | || ||   |||||| |||||    
T  21176458 ctgcctgctcaccccaatcgtgctccttaagcgtgtgagtgcggaagtcgatgaatgcctccacaatctgaggcgatcgcagctctacaacatccgtcgg 21176557  T
Q  204 atgtctggggatggtctgcacgtatccgtactgcctcaaaaccctctcgggcaagtgacggtacaccctacggacgccgcacataatccatccagaatac 303  Q
    |||||| |||||| |||| |||||||| ||||||| ||||||||||||  | ||||||||||||| |||||| || |||||||||||||| || ||||||    
T  21176558 atgtctagggatgctctggacgtatccttactgccgcaaaaccctctcaagaaagtgacggtacatcctacgaacaccgcacataatccagcctgaatac 21176657  T
Q  304 cagaaaacctcctcgaagtcctggatctctctgtgctc 341  Q
    |||||||||||||| ||  |||||||||| ||||||||    
T  21176658 cagaaaacctcctcaaaaccctggatctccctgtgctc 21176695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 4 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 45132751 - 45132438
Alignment:
Q  4 ggcctcggaagatctcctggaataggtggcaagatctgagggtgagacaccctagcgtaccacaggacatagccatccgccgcccgccatgtctcctctc 103  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||| |  |||||||| |||  |   ||||||||||  |||     
T  45132751 ggcctcggaagatctcctggaagaggtggcaaaatctgagggtgagacaccttagtgtaccataacacatagccctccctcatacgccatgtctgatctg 45132652  T
Q  104 ctgcctgctcaccccgggcgtccgccttaagcgtgtgagtgccgaagtcgacgaacatctgcacaatggaaggcggtgggaggtccctaacatcagtcgg 203  Q
    || ||||||||||||   || || |||||||| ||||||||| ||||||||||||    ||||||||   ||||||||| || ||   |||||| |||||    
T  45132651 ctacctgctcaccccaatcggcctccttaagcatgtgagtgcggaagtcgacgaaagcttgcacaatctgaggcggtggcagctcaacaacatccgtcgg 45132552  T
Q  204 atgtctggggatggtctgcacgtatccgtactgcctcaaaaccctctcgggcaagtgacggtacaccctacggacgccgcacataatccatccagaatac 303  Q
    |||||| ||||   |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||  || |||||||| ||||| || ||||||||||||||||| ||||||    
T  45132551 atgtctagggaccatctggacgtatccgtactacctcaaaaccctctcgggcagatgtcggtacactctacgaacaccgcacataatccatcctgaatac 45132452  T
Q  304 cagaaaacctcctc 317  Q
    || |||||||||||    
T  45132451 caaaaaacctcctc 45132438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 4 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 35554600 - 35554270
Alignment:
Q  4 ggcctcggaagatctcctggaataggtggcaagatctgagggtgagacaccctagcgtaccacaggacatagccatccgccgcccgccatgtctcctctc 103  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||| |  |||||||||||||||       |||||| || |     
T  35554600 ggcctcggaagatctcctggaagaggtggcaaaatctgagggtgagacaccttagtgtaccataacacatagccatccgcc-------atgtctgctttt 35554508  T
Q  104 ctgcctgctcaccccgggcgtccgccttaagcgtgtgagtgccgaagtcgacgaacatctgcacaatggaaggcggtgggaggtccctaacatcagtcgg 203  Q
     ||||||||||||||   || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||   |||||||||   ||||||||  || ||   |  ||| |||||    
T  35554507 gtgcctgctcaccccaatcggccgccttaagcgtgtgagtgcggaagtcgacgaattcctgcacaatctgaggcggtgtcagctctacattatccgtcgg 35554408  T
Q  204 atgtctggggatggtctgcacgtatccgtactgcctcaaaaccctctcgggcaagtgacggtacaccctacggacgccgcacataatccatccagaatac 303  Q
    |||||| ||||   |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || || |||||||| || | ||||    
T  35554407 atgtctagggaccctctggacgtatccgtactgcctcaaaaccctctcgggcaagtgacggtacaccctacgaacaccacaaataatccagcctggatac 35554308  T
Q  304 cagaaaacctcctcgaagtcctggatctctctgtgctc 341  Q
    ||||| | |||||  ||  ||||||||||  |||||||    
T  35554307 cagaatatctccttaaaaccctggatctccatgtgctc 35554270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 4 - 317
Target Start/End: Original strand, 40075745 - 40076051
Alignment:
Q  4 ggcctcggaagatctcctggaataggtggcaagatctgagggtgagacaccctagcgtaccacaggacatagccatccgccgcccgccatgtctcctctc 103  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||| |  |||||||||||||||       |||||| ||||     
T  40075745 ggcctcggaagatctcctggaagaggtggcaaaatctgagggtgagacaccttagtgtaccataacacatagccatccgcc-------atgtctgctctt 40075837  T
Q  104 ctgcctgctcaccccgggcgtccgccttaagcgtgtgagtgccgaagtcgacgaacatctgcacaatggaaggcggtgggaggtccctaacatcagtcgg 203  Q
     ||||||||||||||   ||   ||||||||||||||||||| ||||||||||||   |||||||||   ||| ||||  || ||   |||||| ||| |    
T  40075838 gtgcctgctcaccccaatcggttgccttaagcgtgtgagtgcggaagtcgacgaatgcctgcacaatctgaggtggtgtcagctctacaacatccgtctg 40075937  T
Q  204 atgtctggggatggtctgcacgtatccgtactgcctcaaaaccctctcgggcaagtgacggtacaccctacggacgccgcacataatccatccagaatac 303  Q
    |||||| |||||  |||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||| || ||||||    
T  40075938 atgtctagggattctctggatgtatctgtactgcctcaaaaccctctcgggcaagtgacgatacaccctacgaacaccgcacataatccagcctgaatac 40076037  T
Q  304 cagaaaacctcctc 317  Q
     |||||| ||||||    
T  40076038 tagaaaatctcctc 40076051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 5 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 5679872 - 5679558
Alignment:
Q  5 gcctcggaagatctcctggaataggtggcaagatctgagggtgagacaccctagcgtaccacaggacatagccatccgccgcccgccatgtctcctctcc 104  Q
    |||||||||||||| |||||| ||||||||| ||| |||||||||||||| |||  ||||| || ||||||||||||  |   |||||||||| ||||||    
T  5679872 gcctcggaagatctactggaagaggtggcaaaatccgagggtgagacaccgtagtataccatagcacatagccatccctcatacgccatgtctgctctcc 5679773  T
Q  105 tgcctgctcaccccgggcgtccgccttaagcgtgtgagtgccgaagtcgacgaacatctgcacaatggaaggcggtgggaggtccctaacatcagtcgga 204  Q
    ||||||||||||||   ||  | |||||||||||||||||| |||||||| |||   |||||||||   ||||||| |  | ||   |||||| ||  |     
T  5679772 tgcctgctcaccccaatcgggctccttaagcgtgtgagtgcggaagtcgatgaatggctgcacaatctgaggcggtcgccgctctacaacatccgttagt 5679673  T
Q  205 tgtctggggatggtctgcacgtatccgtactgcctcaaaaccctctcgggcaagtgacgg--tacaccctacggacgccgcacataatccatccagaata 302  Q
    ||||| |||| | |||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||  || ||| |||||||||| || |||||    
T  5679672 tgtctagggacgctctggacgtatccgtactgccgcaaaaccctctcaggcaagtgacggtatacaccctacaaacaccgtacataatccagcctgaata 5679573  T
Q  303 ccagaaaacctcctc 317  Q
    |||||||||||||||    
T  5679572 ccagaaaacctcctc 5679558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 84; E-Value: 7e-40
Query Start/End: Original strand, 89 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 52009 - 51778
Alignment:
Q  89 gccatgtctcctctcctgcctgctcaccccgggcgtccgccttaagcgtgtgagtgccgaagtcgacgaacatctgcacaatggaaggcggtgggaggtc 188  Q
    ||||||||| ||||| ||| ||||||||||   || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||   |||||||||   || |||||  || ||    
T  52009 gccatgtctgctctcatgcatgctcaccccaatcgaccgccttaagcgtgtgagtgcggaagtcgacgaaatcctgcacaatctgagtcggtgacagctc 51910  T
Q  189 cctaacatcagtcggatgtctggggatggtctgcacgtatccgtactgcctcaaaaccctctcgggcaagtgacggtacaccctacggacgccgcacata 288  Q
       |||||| | ||||||||| |||| || ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||    
T  51909 tacaacatctgacggatgtctagggacggactggacgtatccgtactgcctcaaaaccctctcgggcaagtgacggtacaccctacgatcaccgcacata 51810  T
Q  289 atccatccagaataccagaaaacctcctcgaa 320  Q
    ||| | |  ||||| ||||| ||| |||||||    
T  51809 atctagcatgaatatcagaataccccctcgaa 51778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 4 - 158
Target Start/End: Original strand, 30761317 - 30761485
Alignment:
Q  4 ggcctcggaagatctcctggaataggtggcaagatctgagggtgagacaccctagcgtaccacaggacatagccatccgccgcccgccat---------- 93  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||| || || ||||||||||||||||||| |||||| |  |||||| ||||||||  |||||||              
T  30761317 ggcctcggaagatctcttggaagaggtggaaaaatttgagggtgagacaccctagtgtaccataacacatagtcatccgccatccgccatctgccatcca 30761416  T
Q  94 ----gtctcctctcctgcctgctcaccccgggcgtccgccttaagcgtgtgagtgccgaagtcgacgaa 158  Q
        |||| ||||||||| ||||||||||   || || |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  30761417 ccatgtctgctctcctgcatgctcaccccaatcggccaccttaagcgtgtgagtgcggaagtcgacgaa 30761485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 320; Significance: 1e-180; HSPs: 27)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 320; E-Value: 1e-180
Query Start/End: Original strand, 1 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 41883555 - 41883212
Alignment:
Q  1 gcaggcctcggaagatctcctggaataggtggcaagatctgagggtgagacaccctagcgtaccacaggacatagccatccgccgcccgccatgtctcct 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  41883555 gcaggcctcggaagatctcctggaataggtggcaagatctgagggtgagacaccctagtgtaccacaggacatagccatccgccacccgccatgtatcct 41883456  T
Q  101 ctcctgcctgctcaccccgggcgtccgccttaagcgtgtgagtgccgaagtcgacgaacatctgcacaatggaaggcggtgggaggtccctaacatcagt 200  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  41883455 ctcctgcctgctcaccccgagcgtccgccttaagcgtgtgagtgcggaagtcgacgaacatctgcacaatggaaggcggggggaggtccctaacatcagt 41883356  T
Q  201 cggatgtctggggatggtctgcacgtatccgtactgcctcaaaaccctctcgggcaagtgacggtacaccctacggacgccgcacataatccatccagaa 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41883355 cggatgtctggggatggtctgcacgtatccgtactgcctcaaaaccctctcgggcaagtgacggtacaccctacggacgccgcacataatccatccagaa 41883256  T
Q  301 taccagaaaacctcctcgaagtcctggatctctctgtgctcctc 344  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41883255 taccagaaaacctcctcgaagtcctggatctctctgtgctcctc 41883212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 320; E-Value: 1e-180
Query Start/End: Original strand, 1 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 48406373 - 48406030
Alignment:
Q  1 gcaggcctcggaagatctcctggaataggtggcaagatctgagggtgagacaccctagcgtaccacaggacatagccatccgccgcccgccatgtctcct 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  48406373 gcaggcctcggaagatctcctggaataggtggcaagatctgagggtgagacaccctagtgtaccacaggacatagccatccgccacccgccatgtatcct 48406274  T
Q  101 ctcctgcctgctcaccccgggcgtccgccttaagcgtgtgagtgccgaagtcgacgaacatctgcacaatggaaggcggtgggaggtccctaacatcagt 200  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  48406273 ctcctgcctgctcaccccgagcgtccgccttaagcgtgtgagtgcggaagtcgacgaacatctgcacaatggaaggcggggggaggtccctaacatcagt 48406174  T
Q  201 cggatgtctggggatggtctgcacgtatccgtactgcctcaaaaccctctcgggcaagtgacggtacaccctacggacgccgcacataatccatccagaa 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48406173 cggatgtctggggatggtctgcacgtatccgtactgcctcaaaaccctctcgggcaagtgacggtacaccctacggacgccgcacataatccatccagaa 48406074  T
Q  301 taccagaaaacctcctcgaagtcctggatctctctgtgctcctc 344  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48406073 taccagaaaacctcctcgaagtcctggatctctctgtgctcctc 48406030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 312; E-Value: 1e-176
Query Start/End: Original strand, 1 - 344
Target Start/End: Original strand, 9368444 - 9368787
Alignment:
Q  1 gcaggcctcggaagatctcctggaataggtggcaagatctgagggtgagacaccctagcgtaccacaggacatagccatccgccgcccgccatgtctcct 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||    
T  9368444 gcaggcctcggaagatctcctggaataggtggcaagatctgagggtgagacaccctagtgtaccacaggacatagccatccgccacccgccgtgtatcct 9368543  T
Q  101 ctcctgcctgctcaccccgggcgtccgccttaagcgtgtgagtgccgaagtcgacgaacatctgcacaatggaaggcggtgggaggtccctaacatcagt 200  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9368544 ctcctgcctgcacaccccgagcgtccgccttaagcgtgtgagtgcggaagtcgatgaacatctgcacaatggaaggcggtgggaggtccctaacatcagt 9368643  T
Q  201 cggatgtctggggatggtctgcacgtatccgtactgcctcaaaaccctctcgggcaagtgacggtacaccctacggacgccgcacataatccatccagaa 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9368644 cggatgtctggggatggtctgcacgtatccgtactgcctcaaaaccctctcgggcaagtgacggtacaccctacggacgccgcacataatccatccagaa 9368743  T
Q  301 taccagaaaacctcctcgaagtcctggatctctctgtgctcctc 344  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9368744 taccagaaaacctcctcgaagtcctggatctctctgtgctcctc 9368787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 308; E-Value: 1e-173
Query Start/End: Original strand, 1 - 344
Target Start/End: Original strand, 17460304 - 17460647
Alignment:
Q  1 gcaggcctcggaagatctcctggaataggtggcaagatctgagggtgagacaccctagcgtaccacaggacatagccatccgccgcccgccatgtctcct 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  17460304 gcaggcctcggaagatctcctggaataggtggcaagatatgagggtgaaacaccctagtgtaccacaggacatagccatccgccacccgccatgtatcct 17460403  T
Q  101 ctcctgcctgctcaccccgggcgtccgccttaagcgtgtgagtgccgaagtcgacgaacatctgcacaatggaaggcggtgggaggtccctaacatcagt 200  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  17460404 ctcctgcctgctcaccccgagcgtccgccttaagcgtgtgagtgcggaagtcgacgaacatctgcacaatggaaggcggggggaggtccctaacatcagt 17460503  T
Q  201 cggatgtctggggatggtctgcacgtatccgtactgcctcaaaaccctctcgggcaagtgacggtacaccctacggacgccgcacataatccatccagaa 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  17460504 cggatgtctggggatggtctgcacgtatccgtactgcctcaaaaccctctcgggcaagtgacggtacaccctacggacgccgcacataatccatcaagaa 17460603  T
Q  301 taccagaaaacctcctcgaagtcctggatctctctgtgctcctc 344  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17460604 taccagaaaacctcctcgaagtcctggatctctctgtgctcctc 17460647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 308; E-Value: 1e-173
Query Start/End: Original strand, 1 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 17592910 - 17592567
Alignment:
Q  1 gcaggcctcggaagatctcctggaataggtggcaagatctgagggtgagacaccctagcgtaccacaggacatagccatccgccgcccgccatgtctcct 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  17592910 gcaggcctcggaagatctcctggaataggtggcaagatatgagggtgaaacaccctagtgtaccacaggacatagccatccgccacccgccatgtatcct 17592811  T
Q  101 ctcctgcctgctcaccccgggcgtccgccttaagcgtgtgagtgccgaagtcgacgaacatctgcacaatggaaggcggtgggaggtccctaacatcagt 200  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  17592810 ctcctgcctgctcaccccgagcgtccgccttaagcgtgtgagtgcggaagtcgacgaacatctgcacaatggaaggcggggggaggtccctaacatcagt 17592711  T
Q  201 cggatgtctggggatggtctgcacgtatccgtactgcctcaaaaccctctcgggcaagtgacggtacaccctacggacgccgcacataatccatccagaa 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  17592710 cggatgtctggggatggtctgcacgtatccgtactgcctcaaaaccctctcgggcaagtgacggtacaccctacggacgccgcacataatccatcaagaa 17592611  T
Q  301 taccagaaaacctcctcgaagtcctggatctctctgtgctcctc 344  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17592610 taccagaaaacctcctcgaagtcctggatctctctgtgctcctc 17592567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 308; E-Value: 1e-173
Query Start/End: Original strand, 1 - 344
Target Start/End: Original strand, 35607433 - 35607776
Alignment:
Q  1 gcaggcctcggaagatctcctggaataggtggcaagatctgagggtgagacaccctagcgtaccacaggacatagccatccgccgcccgccatgtctcct 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||    
T  35607433 gcaggcctcggaagatctcctggaataggtggcaagatctgagggtgagacaccctagtgtaccacaggacatagccatccgccacctgccatgtatcct 35607532  T
Q  101 ctcctgcctgctcaccccgggcgtccgccttaagcgtgtgagtgccgaagtcgacgaacatctgcacaatggaaggcggtgggaggtccctaacatcagt 200  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  35607533 ctcctgcctgctcaccccgagcgtccgccttaagcgtgtgagtgcggaagtcgacgaacatctgcacaatggaaggcggggggaggtccctaacatcagt 35607632  T
Q  201 cggatgtctggggatggtctgcacgtatccgtactgcctcaaaaccctctcgggcaagtgacggtacaccctacggacgccgcacataatccatccagaa 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  35607633 cggatgtctggggatggtctgcacgtatccatactgcctcaaaaccctctcgggcaagtgacggtacaccctacggacgccgcacataatccatctagaa 35607732  T
Q  301 taccagaaaacctcctcgaagtcctggatctctctgtgctcctc 344  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35607733 taccagaaaacctcctcgaagtcctggatctctctgtgctcctc 35607776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 287; E-Value: 1e-161
Query Start/End: Original strand, 1 - 343
Target Start/End: Original strand, 42504976 - 42505318
Alignment:
Q  1 gcaggcctcggaagatctcctggaataggtggcaagatctgagggtgagacaccctagcgtaccacaggacatagccatccgccgcccgccatgtctcct 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  42504976 gcaggcctcggaagatctcctggaataggcagcaagatatgagggtgagacaccctagtgtaccatatgacatagccatccgccacccgccatgtatcct 42505075  T
Q  101 ctcctgcctgctcaccccgggcgtccgccttaagcgtgtgagtgccgaagtcgacgaacatctgcacaatggaaggcggtgggaggtccctaacatcagt 200  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  42505076 ctcctgcctgctcaccccgatcgtccgccttaagcgtgtgagtgcggaagtcgacgaacatctgcacaatgaaaggcggtgggaggtccctaacatcagt 42505175  T
Q  201 cggatgtctggggatggtctgcacgtatccgtactgcctcaaaaccctctcgggcaagtgacggtacaccctacggacgccgcacataatccatccagaa 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  42505176 cggatgtctggggatggtctgcacgtatccgtactgcctcaaaaccctcttgggcaagtgacggtacaccctacggacaccgcacataatccatccagaa 42505275  T
Q  301 taccagaaaacctcctcgaagtcctggatctctctgtgctcct 343  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42505276 taccagaaaacctcctcgaagtcctggatctctctgtgctcct 42505318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 247; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 1 - 344
Target Start/End: Original strand, 15071325 - 15071655
Alignment:
Q  1 gcaggcctcggaagatctcctggaataggtggcaagatctgagggtgagacaccctagcgtaccacaggacatagccatccgccgcccgccatgtctcct 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  15071325 gcaggcctcggaagatctcctggaataggtggcaagatctgagggtgagacaccctagtgtaccatatgacatagccatccgccacccgccatgtatcct 15071424  T
Q  101 ctcctgcctgctcaccccgggcgtccgccttaagcgtgtgagtgccgaagtcgacgaacatctgcacaatggaaggcggtgggaggtccctaacatcagt 200  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15071425 ctcctgcctgctcaccccgatcgtccgccttaagcatgtgagtgcggaagtcgacgaacatctgcacaatggaaggcggtgggaggtccctaacatcagt 15071524  T
Q  201 cggatgtctggggatggtctgcacgtatccgtactgcctcaaaaccctctcgggcaagtgacggtacaccctacggacgccgcacataatccatccagaa 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||          ||   || ||||||||||    
T  15071525 cggatgtctggggatggtctgcacgtatccgtactgcctcaaaaccctctcgggcaagtgatggtacaccct----------ca---aaaccatccagaa 15071611  T
Q  301 taccagaaaacctcctcgaagtcctggatctctctgtgctcctc 344  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  15071612 taccagaaaacctcctcgaagtcctggatctctctatgctcctc 15071655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 1 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 17837968 - 17837632
Alignment:
Q  1 gcaggcctcggaagatctcctggaataggtggcaagatctgagggtgagacaccctagcgtaccacaggacatagccatccgccgcccgccatgtctcct 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||       |||||| ||    
T  17837968 gcaggcctcggaagatctcctggaagaggtggcaagatctgagggtgagacaccctagtgtaccataggacatagccatccgcc-------atgtctgct 17837876  T
Q  101 ctcctgcctgctcaccccgggcgtccgccttaagcgtgtgagtgccgaagtcgacgaacatctgcacaatggaaggcggtgggaggtccctaacatcagt 200  Q
    ||||||| ||||||||||   |||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||   |||||||||    
T  17837875 ctcctgcttgctcaccccaatcgtctgccttaagcgtgtaagtgcggaagtcgacgaacgcctgcacaatggaaggcggtgggaggtctgcaacatcagt 17837776  T
Q  201 cggatgtctggggatggtctgcacgtatccgtactgcctcaaaaccctctcgggcaagtgacggtacaccctacggacgccgcacataatccatccagaa 300  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  17837775 cggatgtctggggatggtctggacgtatccatactgcctcaaaaccatctcgggcaagtgacggtacaccatacggacaccgcacataatccagccagaa 17837676  T
Q  301 taccagaaaacctcctcgaagtcctggatctctctgtgctcctc 344  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  17837675 taccagaaaacctcctcgaagtcctggatctctctatgctcctc 17837632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 208; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 1 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 10521845 - 10521503
Alignment:
Q  1 gcaggcctcggaagatctcctggaataggtggcaagatctgagggtgagacaccctagcgtaccacaggacatagccatccgccgcccgccatgtctcct 100  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||  ||||||||||| ||    
T  10521845 gcaggtctcggaagatctcctggaagaggtggcaagatatgagggtgagacaccctagtgtaccatatgacatagccatccgccatccgccatgtctgct 10521746  T
Q  101 ctcctgcctgctcaccccgggcgtccgccttaagcgtgtgagtgccgaagtcgacgaacatctgcacaatggaaggcggtgggaggtccctaacatcagt 200  Q
    ||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||  ||| ||||||  ||||||| |||||||   |||||||||    
T  10521745 ctcctgcctgctcaccccaatcgtccgccttaagcgtgtgagtgcgaaagtcgacgaacgcctgtacaatgtcaggcggtcggaggtctgcaacatcagt 10521646  T
Q  201 cggatgtctggggatggtctgcacgtatccgtactgcctcaaaaccctctcgggcaagtgacggtacaccctacggacgccgcacataatccatccagaa 300  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  10521645 cggatgtctggggatggtctggacgtatccgtactgcctcaaaa-cctcttgggcaagtgacggtacaccctacggacaccgcacataatccagccagaa 10521547  T
Q  301 taccagaaaacctcctcgaagtcctggatctctctgtgctcctc 344  Q
    ||||||||||||||||| ||||| || |||||  ||||||||||    
T  10521546 taccagaaaacctcctcaaagtcatgcatctccatgtgctcctc 10521503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 178; E-Value: 6e-96
Query Start/End: Original strand, 4 - 341
Target Start/End: Original strand, 5538596 - 5538933
Alignment:
Q  4 ggcctcggaagatctcctggaataggtggcaagatctgagggtgagacaccctagcgtaccacaggacatagccatccgccgcccgccatgtctcctctc 103  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||||  ||||||||||| |||||    
T  5538596 ggcctcgaaagatctcctggaataggtggcaagatctgagggtgagacaccctagtgtaccatagcacatagccatccgccatccgccatgtctgctctc 5538695  T
Q  104 ctgcctgctcaccccgggcgtccgccttaagcgtgtgagtgccgaagtcgacgaacatctgcacaatggaaggcggtgggaggtccctaacatcagtcgg 203  Q
    |||||||||||||||   || |||||||||| |||||||||| |||||||||||||  ||||||||||  ||||| ||| || ||   ||||||  ||||    
T  5538696 ctgcctgctcaccccaatcggccgccttaagtgtgtgagtgcggaagtcgacgaacgcctgcacaatgtgaggcgatggcagctctacaacatccatcgg 5538795  T
Q  204 atgtctggggatggtctgcacgtatccgtactgcctcaaaaccctctcgggcaagtgacggtacaccctacggacgccgcacataatccatccagaatac 303  Q
    |||||| ||| ||||||  | ||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| || |||||||||||||| |||||||||    
T  5538796 atgtctagggttggtctagatgtatttgtactgcctcaaaacccactcgggcaagtgacggtacaccgtacgaacaccgcacataatccaaccagaatac 5538895  T
Q  304 cagaaaacctcctcgaagtcctggatctctctgtgctc 341  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||    
T  5538896 cagaaaacctcctcaaaatcctggatctccctgtgctc 5538933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 4 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 13323046 - 13322706
Alignment:
Q  4 ggcctcggaagatctcctggaataggtggcaagatctgagggtgagacaccctagcgtaccacaggacatagccatccgccgcccgccatgtctcctctc 103  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||| || |||| ||||||||||  ||||||||||| |||||    
T  13323046 ggcctcggaagatctcctggaagaggtggcaatatctgagggtgagacaccatagtgtaccatagaacatcgccatccgccatccgccatgtctgctctc 13322947  T
Q  104 ctgcctgctcaccccgggcgtccgccttaagcgtgtgagtgccgaagtcgacgaacatctgcacaatggaaggcggtgggaggtccctaacatcagtcgg 203  Q
    |||||||||||||||   || || ||||||||||||||||||  ||||||| ||||  ||||||||||  ||| ||||| || ||   ||||||  ||||    
T  13322946 ctgcctgctcaccccaatcggcccccttaagcgtgtgagtgctaaagtcgatgaacgcctgcacaatgtgaggtggtggcagctctacaacatctttcgg 13322847  T
Q  204 atgtctggggatggtctgcacgtatccgtactgcctcaaaaccctctcgggcaagtgacggtacaccctacggacgccgcacataatccatccagaatac 303  Q
    ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || || ||||| ||||| |||||||||    
T  13322846 atgtctggggacggtctggacgtatccgtactgcctcaaaaccctctcgggcaagtgacggtacaccttacgaacaccacacattatccagccagaatac 13322747  T
Q  304 cagaaaacctcctcgaagtcctggatctctctgtgctcctc 344  Q
    || ||||||||||| || |||||||||||||| | ||||||    
T  13322746 cataaaacctcctcaaaatcctggatctctctattctcctc 13322706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 4 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 16680471 - 16680134
Alignment:
Q  4 ggcctcggaagatctcctggaataggtggcaagatctgagggtgagacaccctagcgtaccacaggacatagccatccgccgcccgccatgtctcctctc 103  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||| |  |||||||||||||||  |||||| |||| |||||    
T  16680471 ggcctcggaagatctcatggaacaggtggcaaaatctgagggtgacacaccctagtgtaccataacacatagccatccgccatccgccaagtctgctctc 16680372  T
Q  104 ctgcctgctcaccccgggcgtccgccttaagcgtgtgagtgccgaagtcgacgaacatctgcacaatggaaggcggtgggaggtccctaacatcagtcgg 203  Q
    ||||||||||||||    || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||   |||||||||   ||||||||| || ||   |||||| |||||    
T  16680371 ctgcctgctcaccctaatcggccgccttaagcgtgtgagtgcggaagtcgacgaatgcctgcacaatctgaggcggtggcagctcgacaacatccgtcgg 16680272  T
Q  204 atgtctggggatggtctgcacgtatccgtactgcctcaaaaccctctcgggcaagtgacggtacaccctacggacgccgcacataatccatccagaatac 303  Q
    |||||||||||  | ||| |||||| ||||||||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| || ||||||    
T  16680271 atgtctggggacaggctggacgtattcgtactgcctcaaaaccctattggacaagtgacggtacaccctacgaacaccgcacataatccagcctgaatac 16680172  T
Q  304 cagaaaacctcctcgaagtcctggatctctctgtgctc 341  Q
    || ||||||||||  || ||||||||||| ||||||||    
T  16680171 cataaaacctcctaaaaatcctggatctccctgtgctc 16680134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 4 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 17654707 - 17654370
Alignment:
Q  4 ggcctcggaagatctcctggaataggtggcaagatctgagggtgagacaccctagcgtaccacaggacatagccatccgccgcccgccatgtctcctctc 103  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||| |  |||||||||||||||  |||||| |||| |||||    
T  17654707 ggcctcggaagatctcatggaacaggtggcaaaatctgagggtgacacaccctagtgtaccataacacatagccatccgccatccgccaagtctgctctc 17654608  T
Q  104 ctgcctgctcaccccgggcgtccgccttaagcgtgtgagtgccgaagtcgacgaacatctgcacaatggaaggcggtgggaggtccctaacatcagtcgg 203  Q
    ||||||||||||||    || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||   |||||||||   ||||||||| || ||   |||||| |||||    
T  17654607 ctgcctgctcaccctaatcggccgccttaagcgtgtgagtgcggaagtcgacgaatgcctgcacaatctgaggcggtggcagctcgacaacatccgtcgg 17654508  T
Q  204 atgtctggggatggtctgcacgtatccgtactgcctcaaaaccctctcgggcaagtgacggtacaccctacggacgccgcacataatccatccagaatac 303  Q
    |||||||||||  | ||| |||||| ||||||||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| || ||||||    
T  17654507 atgtctggggacaggctggacgtattcgtactgcctcaaaaccctattggacaagtgacggtacaccctacgaacaccgcacataatccagcctgaatac 17654408  T
Q  304 cagaaaacctcctcgaagtcctggatctctctgtgctc 341  Q
    || ||||||||||  || ||||||||||| ||||||||    
T  17654407 cataaaacctcctaaaaatcctggatctccctgtgctc 17654370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 146; E-Value: 7e-77
Query Start/End: Original strand, 4 - 341
Target Start/End: Original strand, 27450732 - 27451069
Alignment:
Q  4 ggcctcggaagatctcctggaataggtggcaagatctgagggtgagacaccctagcgtaccacaggacatagccatccgccgcccgccatgtctcctctc 103  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| |  ||| |||||||||||  ||||||||||| |||||    
T  27450732 ggcctcggaagatctcttggaagaggtggcaaaatctgagggtgagacaccctagtgtaccataacacacagccatccgccatccgccatgtctgctctc 27450831  T
Q  104 ctgcctgctcaccccgggcgtccgccttaagcgtgtgagtgccgaagtcgacgaacatctgcacaatggaaggcggtgggaggtccctaacatcagtcgg 203  Q
    |||||||||||||||   || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||   |||||||||   ||| ||||  || ||   ||||||  ||||    
T  27450832 ctgcctgctcaccccaatcggccgccttaagcgtgtgagtgcggaagtcgacgaatgcctgcacaatctgaggtggtgacagctctacaacatcgttcgg 27450931  T
Q  204 atgtctggggatggtctgcacgtatccgtactgcctcaaaaccctctcgggcaagtgacggtacaccctacggacgccgcacataatccatccagaatac 303  Q
    || ||||| || ||| || ||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||   || |||||||||||||| || ||||||    
T  27450932 atatctggagacggtttggacgtatccgtactacctcaaaaccctcttgggaaagtgacggtacaccctataaacaccgcacataatccagcctgaatac 27451031  T
Q  304 cagaaaacctcctcgaagtcctggatctctctgtgctc 341  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||    
T  27451032 cagaaaacctcctcaaaatcctggatctccctgtgctc 27451069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 11 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 34741726 - 34741444
Alignment:
Q  11 gaagatctcctggaataggtggcaagatctgagggtgagacaccctagcgtaccacaggacatagccatccgccgcccgccatgtctcctctcctgcctg 110  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||| ||||| |||||| |  |||||||||||||||       |||||| ||||||||||||    
T  34741726 gaagatctcctggaagaggtggcaaaatctgaggttgagacagcctagtgtaccataacacatagccatccgcc-------atgtctgctctcctgcctg 34741634  T
Q  111 ctcaccccgggcgtccgccttaagcgtgtgagtgccgaagtcgacgaacatctgcacaatggaaggcggtgggaggtccctaacatcagtcggatgtctg 210  Q
    ||||||||   || | ||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||  ||||||||| || ||   |||||| ||| ||||||||    
T  34741633 ctcaccccaatcggctgccttaagcgtgtgagtgcggaagtcgacgaacgcctgcacaatgtgaggcggtggcagctctacaacatccgtcagatgtctg 34741534  T
Q  211 gggatggtctgcacgtatccgtactgcctcaaaaccctctcgggcaagtgacggtacaccctacggacgccgcacataatccatccagaa 300  Q
    |||| |||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||  ||||| || |||||||||||||| ||||||    
T  34741533 gggacggtctggacgtatccgtactgcttcaaaaccctatcgggcaagtgacagtacattctacgaacaccgcacataatccagccagaa 34741444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 125 - 341
Target Start/End: Original strand, 11630427 - 11630643
Alignment:
Q  125 ccgccttaagcgtgtgagtgccgaagtcgacgaacatctgcacaatggaaggcggtgggaggtccctaacatcagtcggatgtctggggatggtctgcac 224  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| |||||   |||||||||   ||||||||| || ||   |||||| ||||||||||| |||| |||||  ||    
T  11630427 ccgccttaagcgtgtgagtgcggaagtcaacgaatgcctgcacaatctgaggcggtggcagctctacaacatccgtcggatgtctagggacggtcttgac 11630526  T
Q  225 gtatccgtactgcctcaaaaccctctcgggcaagtgacggtacaccctacggacgccgcacataatccatccagaataccagaaaacctcctcgaagtcc 324  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| |||||||| || |||||||||||||| || |||||||||||||||||||| || |||    
T  11630527 gtatacgtactgcctcaaaaccctctcgggaaagtgatggtagaccctacgaacaccgcacataatccagcctgaataccagaaaacctcctcaaaatcc 11630626  T
Q  325 tggatctctctgtgctc 341  Q
    |||||||| ||||||||    
T  11630627 tggatctccctgtgctc 11630643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 89; E-Value: 8e-43
Query Start/End: Original strand, 137 - 341
Target Start/End: Original strand, 11632680 - 11632884
Alignment:
Q  137 tgtgagtgccgaagtcgacgaacatctgcacaatggaaggcggtgggaggtccctaacatcagtcggatgtctggggatggtctgcacgtatccgtactg 236  Q
    ||||||||| |||||| |||||   |||||||||   ||||||||| || ||   |||||| ||||||||||| |||| |||||  |||||| |||||||    
T  11632680 tgtgagtgcggaagtcaacgaatgcctgcacaatctgaggcggtggcagctctacaacatccgtcggatgtctagggacggtcttgacgtatacgtactg 11632779  T
Q  237 cctcaaaaccctctcgggcaagtgacggtacaccctacggacgccgcacataatccatccagaataccagaaaacctcctcgaagtcctggatctctctg 336  Q
    |||||||||||||||||| |||||| |||| |||||||| || |||||||||||||| || |||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||    
T  11632780 cctcaaaaccctctcgggaaagtgatggtagaccctacgaacaccgcacataatccagcctgaataccagaaaacctcctcaaaatcctggatctccctg 11632879  T
Q  337 tgctc 341  Q
    |||||    
T  11632880 tgctc 11632884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 3 - 317
Target Start/End: Original strand, 47670247 - 47670561
Alignment:
Q  3 aggcctcggaagatctcctggaataggtggcaagatctgagggtgagacaccctagcgtaccacaggacatagccatccgccgcccgccatgtctcctct 102  Q
    |||||||| || ||||||||||| | |||||||  ||||||||||||||||  | ||||||||    ||||||||||  ||    |||||||||||||||    
T  47670247 aggcctcgaaatatctcctggaagaagtggcaaattctgagggtgagacacaatggcgtaccatcatacatagccatatgctatacgccatgtctcctct 47670346  T
Q  103 cctgcctgctcaccccgggcgtccgccttaagcgtgtgagtgccgaagtcgacgaacatctgcacaatggaaggcggtgggaggtccctaacatcagtcg 202  Q
    ||||  ||||||||||   || ||| |||||||| |||||||| ||||| ||||||   |||||||||   || |||||  || ||   ||| || | ||    
T  47670347 cctggatgctcaccccaatcggccgacttaagcgcgtgagtgcggaagttgacgaaagcctgcacaatctcagccggtgacagctctacaacctccgacg 47670446  T
Q  203 gatgtctggggatggtctgcacgtatccgtactgcctcaaaaccctctcgggcaagtgacggtacaccctacggacgccgcacataatccatccagaata 302  Q
    ||||||| || | |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||  | |||||||||||||| || |||||    
T  47670447 gatgtctaggtacggtctggacgtatccgtactgcctcaaaaccctttcgggcaagtgacggtgcaccctacgatcaccgcacataatccagcctgaata 47670546  T
Q  303 ccagaaaacctcctc 317  Q
    |||||| ||||||||    
T  47670547 ccagaatacctcctc 47670561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 4 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 37343262 - 37342992
Alignment:
Q  4 ggcctcggaagatctcctggaataggtggcaagatctgagggtgagacaccctagcgtaccacaggacatagccatccgccgcccgccatgtctcctctc 103  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||| || |||||||||||||||||| ||| |||||| |  |||||||| |||  |    ||||||||| ||||     
T  37343262 ggcctcggaagatctcctgaaagaggtggaaaaatctgagggtgagacaccttagtgtaccataacacatagccctccctcatatgccatgtctgctctg 37343163  T
Q  104 ctgcctgctcaccccgggcgtccgccttaagcgtgtgagtgccgaagtcgacgaacatctgcacaatggaaggcggtgggaggtccctaacatcagtcgg 203  Q
    |||||||||||||||   || || |||||||||||||||||| |||||  |||||  ||||||||||   ||||||||  || ||   |||||| | |||    
T  37343162 ctgcctgctcaccccaatcggcctccttaagcgtgtgagtgcggaagtatacgaatgtctgcacaatctgaggcggtgtcagctctacaacatccgccgg 37343063  T
Q  204 atgtctggggatggtctgcacgtatccgtactgcctcaaaaccctctcgggcaagtgacggtacaccctac 274  Q
    |||||| ||| | ||||| ||||||||||| ||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  37343062 atgtctagggtttgtctggacgtatccgtattgccttaacaccctctcaggcaagtgacggtacaccctac 37342992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 4 - 154
Target Start/End: Original strand, 47522022 - 47522172
Alignment:
Q  4 ggcctcggaagatctcctggaataggtggcaagatctgagggtgagacaccctagcgtaccacaggacatagccatccgccgcccgccatgtctcctctc 103  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| |  |||||| ||||||||  ||||||||||| || ||    
T  47522022 ggcctcggaagatctcctggaataggtggcaaaatctgagggtgagacaccctagtgtaccataacacatagtcatccgccatccgccatgtctgctttc 47522121  T
Q  104 ctgcctgctcaccccgggcgtccgccttaagcgtgtgagtgccgaagtcga 154  Q
    |||||||||||||||   || ||||||||| ||||| ||||| ||||||||    
T  47522122 ctgcctgctcaccccaatcggccgccttaaacgtgtaagtgcggaagtcga 47522172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 88 - 320
Target Start/End: Original strand, 9491989 - 9492221
Alignment:
Q  88 cgccatgtctcctctcctgcctgctcaccccgggcgtccgccttaagcgtgtgagtgccgaagtcgacgaacatctgcacaatggaaggcggtgggaggt 187  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||||||    |  |||||||||||||||||||| ||||||||||||   |||||||||   || |||||  || |    
T  9491989 cgccatgtctcctctcctacatgctcaccccaattggtcgccttaagcgtgtgagtgcggaagtcgacgaaagcctgcacaatctcagccggtgacagct 9492088  T
Q  188 ccctaacatcagtcggatgtctggggatggtctgcacgtatccgtactgcctcaaaaccctctcgggcaagtgacggtacaccctacggacgccgcacat 287  Q
    |   |||||| | ||||||||| |||||||||||   ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||  | || |||||    
T  9492089 ctacaacatccgacggatgtctagggatggtctgggtgtatccgtactgccttaaaaccctctcgggaaagtgacggtacactctacgatcaccacacat 9492188  T
Q  288 aatccatccagaataccagaaaacctcctcgaa 320  Q
    |||| | || |||| | |||| |||| ||||||    
T  9492189 aatcaaacctgaatgctagaataccttctcgaa 9492221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 203 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 36980373 - 36980256
Alignment:
Q  203 gatgtctggggatggtctgcacgtatccgtactgcctcaaaaccctctcgggcaagtgacggtacaccctacggacgccgcacataatccatccagaata 302  Q
    ||||||| ||||  ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||  | || |||||||| || || |||||    
T  36980373 gatgtctagggacagtctggacgtatccgtactgcctcaaaatcctctcgggaaagtgacggtacaccctacgatcaccacacataattcagcctgaata 36980274  T
Q  303 ccagaaaacctcctcgaa 320  Q
    |  ||| |||||||||||    
T  36980273 caggaatacctcctcgaa 36980256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 4 - 65
Target Start/End: Original strand, 11630326 - 11630387
Alignment:
Q  4 ggcctcggaagatctcctggaataggtggcaagatctgagggtgagacaccctagcgtacca 65  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  11630326 ggcctcggaagatctcctggaagaggtggcaaaatctgagggtgagacaccctagtgtacca 11630387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 218 - 341
Target Start/End: Original strand, 17747944 - 17748067
Alignment:
Q  218 tctgcacgtatccgtactgcctcaaaaccctctcgggcaagtgacggtacaccctacggacgccgcacataatccatccagaataccagaaaacctcctc 317  Q
    ||||||||||||||||||||| |  ||| ||||| ||||||||||  |||||| |    || | ||||||||||||  | ||||||||||||| ||||||    
T  17747944 tctgcacgtatccgtactgccgcctaactctctcaggcaagtgacaatacaccttgtcaacactgcacataatccaaactgaataccagaaaatctcctc 17748043  T
Q  318 gaagtcctggatctctctgtgctc 341  Q
     || ||||||||||| ||||||||    
T  17748044 aaaatcctggatctccctgtgctc 17748067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 88 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 41734700 - 41734630
Alignment:
Q  88 cgccatgtctcctctcctgcctgctcaccccgggcgtccgccttaagcgtgtgagtgccgaagtcgacgaa 158  Q
    |||||||||| |||| |||||||||||||||   || || |||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  41734700 cgccatgtctgctctgctgcctgctcaccccaatcggcctccttaagcgtgtgagtgcggaagtctacgaa 41734630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 4 - 107
Target Start/End: Complemental strand, 16488385 - 16488281
Alignment:
Q  4 ggcctcggaagatctcctggaataggtggcaagatctga-gggtgagacaccctagcgtaccacaggacatagccatccgccgcccgccatgtctcctct 102  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||| |||||| ||||| ||| |||||| |  ||||| ||||||     ||||||||||| ||||    
T  16488385 ggcctcggaagatctcctggaagaggtggcacaatctgaggggtgaaacaccttagtgtaccataacacatatccatcccttatccgccatgtctgctct 16488286  T
Q  103 cctgc 107  Q
    |||||    
T  16488285 cctgc 16488281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 320; Significance: 1e-180; HSPs: 34)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 320; E-Value: 1e-180
Query Start/End: Original strand, 1 - 344
Target Start/End: Original strand, 6178846 - 6179189
Alignment:
Q  1 gcaggcctcggaagatctcctggaataggtggcaagatctgagggtgagacaccctagcgtaccacaggacatagccatccgccgcccgccatgtctcct 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  6178846 gcaggcctcggaagatctcctggaataggtggcaagatctgagggtgagacaccctagtgtaccacaggacatagccatccgccacccgccatgtatcct 6178945  T
Q  101 ctcctgcctgctcaccccgggcgtccgccttaagcgtgtgagtgccgaagtcgacgaacatctgcacaatggaaggcggtgggaggtccctaacatcagt 200  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  6178946 ctcctgcctgctcaccccgagcgtccgccttaagcgtgtgagtgcggaagtcgacgaacatctgcacaatggaaggcggggggaggtccctaacatcagt 6179045  T
Q  201 cggatgtctggggatggtctgcacgtatccgtactgcctcaaaaccctctcgggcaagtgacggtacaccctacggacgccgcacataatccatccagaa 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6179046 cggatgtctggggatggtctgcacgtatccgtactgcctcaaaaccctctcgggcaagtgacggtacaccctacggacgccgcacataatccatccagaa 6179145  T
Q  301 taccagaaaacctcctcgaagtcctggatctctctgtgctcctc 344  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6179146 taccagaaaacctcctcgaagtcctggatctctctgtgctcctc 6179189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 320; E-Value: 1e-180
Query Start/End: Original strand, 1 - 344
Target Start/End: Original strand, 41796081 - 41796424
Alignment:
Q  1 gcaggcctcggaagatctcctggaataggtggcaagatctgagggtgagacaccctagcgtaccacaggacatagccatccgccgcccgccatgtctcct 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  41796081 gcaggcctcggaagatctcctggaataggtggcaagatctgagggtgagacaccctagcgtaccacaagacatagccatcccccgcccgccatgtctcct 41796180  T
Q  101 ctcctgcctgctcaccccgggcgtccgccttaagcgtgtgagtgccgaagtcgacgaacatctgcacaatggaaggcggtgggaggtccctaacatcagt 200  Q
    ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41796181 ctcctacctgctcaccccaggcgtccgccttaagcgtgtgagtgccgaagtcgacgaacatctgcacaatggaaggcggtgggaggtccctaacatcagt 41796280  T
Q  201 cggatgtctggggatggtctgcacgtatccgtactgcctcaaaaccctctcgggcaagtgacggtacaccctacggacgccgcacataatccatccagaa 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41796281 cggatgtctggggatggtctgcacgtatccgtattgcctcaaaaccctctcgggcaagtgacagtacaccctacggacgccgcacataatccatccagaa 41796380  T
Q  301 taccagaaaacctcctcgaagtcctggatctctctgtgctcctc 344  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41796381 taccagaaaacctcctcgaagtcctggatctctctgtgctcctc 41796424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 320; E-Value: 1e-180
Query Start/End: Original strand, 1 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 49168526 - 49168183
Alignment:
Q  1 gcaggcctcggaagatctcctggaataggtggcaagatctgagggtgagacaccctagcgtaccacaggacatagccatccgccgcccgccatgtctcct 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  49168526 gcaggcctcggaagatctcctggaataggtggcaagatctgagggtgagacaccctagtgtaccacaggacatagccatccgccacccgccatgtatcct 49168427  T
Q  101 ctcctgcctgctcaccccgggcgtccgccttaagcgtgtgagtgccgaagtcgacgaacatctgcacaatggaaggcggtgggaggtccctaacatcagt 200  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  49168426 ctcctgcctgctcaccccgagcgtccgccttaagcgtgtgagtgcggaagtcgacgaacatctgcacaatggaaggcggggggaggtccctaacatcagt 49168327  T
Q  201 cggatgtctggggatggtctgcacgtatccgtactgcctcaaaaccctctcgggcaagtgacggtacaccctacggacgccgcacataatccatccagaa 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49168326 cggatgtctggggatggtctgcacgtatccgtactgcctcaaaaccctctcgggcaagtgacggtacaccctacggacgccgcacataatccatccagaa 49168227  T
Q  301 taccagaaaacctcctcgaagtcctggatctctctgtgctcctc 344  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49168226 taccagaaaacctcctcgaagtcctggatctctctgtgctcctc 49168183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 308; E-Value: 1e-173
Query Start/End: Original strand, 1 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 31424755 - 31424412
Alignment:
Q  1 gcaggcctcggaagatctcctggaataggtggcaagatctgagggtgagacaccctagcgtaccacaggacatagccatccgccgcccgccatgtctcct 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  31424755 gcaggcctcggaagatctcctggaataggtggcaagatctgagggtgagacaccctagtgtgccacaggacatagccatccgccacccgccatgtatcct 31424656  T
Q  101 ctcctgcctgctcaccccgggcgtccgccttaagcgtgtgagtgccgaagtcgacgaacatctgcacaatggaaggcggtgggaggtccctaacatcagt 200  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  31424655 ctcctgcctgctcaccccgagcgtccgccttaagcgtgtgagtgcggaagtcgacgaacatctgcacaatggaaggcggggggaggtccttaacatcagt 31424556  T
Q  201 cggatgtctggggatggtctgcacgtatccgtactgcctcaaaaccctctcgggcaagtgacggtacaccctacggacgccgcacataatccatccagaa 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31424555 cggatgtctggggatggtctgcacgtatccgtactgcctcaaaaccctctcgggcaagtgacggtacaccctacggacgccgcacataatccatccagaa 31424456  T
Q  301 taccagaaaacctcctcgaagtcctggatctctctgtgctcctc 344  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  31424455 taccagaaaacctcctcgaagtcctgaatctctctgtgctcctc 31424412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 307; E-Value: 1e-173
Query Start/End: Original strand, 1 - 344
Target Start/End: Original strand, 1306176 - 1306521
Alignment:
Q  1 gcaggcctcggaagatctcctggaataggtggcaagatctgagggtgagacaccctagcgtaccacaggacatagccatccgccgcccgc--catgtctc 98  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||| ||    
T  1306176 gcaggcctcggaagatctcctggaataggtggcaagatctgagggtgagacaccctagtgtaccacaggacatagccatccgccacccgcgccatgtatc 1306275  T
Q  99 ctctcctgcctgctcaccccgggcgtccgccttaagcgtgtgagtgccgaagtcgacgaacatctgcacaatggaaggcggtgggaggtccctaacatca 198  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  1306276 ctctcctacctgctcaccccgagcgtccgccttaagcgtgtgagtgcggaagtcgacgaacatctgcacaatggaaggcggggggaggtccctaacatca 1306375  T
Q  199 gtcggatgtctggggatggtctgcacgtatccgtactgcctcaaaaccctctcgggcaagtgacggtacaccctacggacgccgcacataatccatccag 298  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1306376 gtcggatgtctggggatggtctgcacgtatccgtactgcctcaaaaccctctcgggcaagtgacggtacaccctacggacgccgcacataatccatccag 1306475  T
Q  299 aataccagaaaacctcctcgaagtcctggatctctctgtgctcctc 344  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1306476 aataccagaaaacctcctcgaagtcctggatctctctgtgctcctc 1306521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 297; E-Value: 1e-167
Query Start/End: Original strand, 1 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 49093437 - 49093093
Alignment:
Q  1 gcaggcctcggaagatctcctggaataggtggcaagatctgagggtgagacaccctagcgtaccacaggacatagccatccgccgcccgcc-atgtctcc 99  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| |||    
T  49093437 gcaggcctcggaagatctcctggaataggtggcaagatctgagggtgagacaccctagtgtaccacaggacatagccatccgccacccgcccatgtatcc 49093338  T
Q  100 tctcctgcctgctcaccccgggcgtccgccttaagcgtgtgagtgccgaagtcgacgaacatctgcacaatggaaggcggtgggaggtccctaacatcag 199  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  49093337 tctcctgcctgctcaccccgagcgtccgccttaagcatgtgagtgcggaagtcgatgaacatctgcacaatggaaggcggggggaggtccctaacatcag 49093238  T
Q  200 tcggatgtctggggatggtctgcacgtatccgtactgcctcaaaaccctctcgggcaagtgacggtacaccctacggacgccgcacataatccatccaga 299  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  49093237 tcggatgtctagggatggtctgcacgtatccgtactgcctcaaaaccctctcgggcaagtgacggtacaccctacggacaccgcacataatccatccaga 49093138  T
Q  300 ataccagaaaacctcctcgaagtcctggatctctctgtgctcctc 344  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49093137 ataccagaaaacctcctcgaagtcctggatctctctgtgctcctc 49093093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 264; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 1 - 344
Target Start/End: Original strand, 21018634 - 21018977
Alignment:
Q  1 gcaggcctcggaagatctcctggaataggtggcaagatctgagggtgagacaccctagcgtaccacaggacatagccatccgccgcccgccatgtctcct 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  21018634 gcaggcctcggaagatctcctggaagaggtggcaagatcttagggtgagacaccctagtgtaccataggacatagccatccgccatccgccatgtctcct 21018733  T
Q  101 ctcctgcctgctcaccccgggcgtccgccttaagcgtgtgagtgccgaagtcgacgaacatctgcacaatggaaggcggtgggaggtccctaacatcagt 200  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  21018734 ctcctgcctgctcaccccgatcgtccgccttaagcgtgtgagtgcggaagtcgacgaacacctgcataatgaaaggcggtgggaggtccctaacatcagt 21018833  T
Q  201 cggatgtctggggatggtctgcacgtatccgtactgcctcaaaaccctctcgggcaagtgacggtacaccctacggacgccgcacataatccatccagaa 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||| ||||||    
T  21018834 cggatgtctggggatggtctgcacgtatccgtactgcctcaaaaccttctcgggaaagtgacggtacacgctacagacaccgcacataatccagccagaa 21018933  T
Q  301 taccagaaaacctcctcgaagtcctggatctctctgtgctcctc 344  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  21018934 taccagaaaacctcctctaagtcctggatctctctatgctcctc 21018977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 252; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 1 - 344
Target Start/End: Original strand, 40355459 - 40355802
Alignment:
Q  1 gcaggcctcggaagatctcctggaataggtggcaagatctgagggtgagacaccctagcgtaccacaggacatagccatccgccgcccgccatgtctcct 100  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| | ||||| ||||| |||| |||||||||| ||||    
T  40355459 gcaggtctcggaagatctcctggaataggtggcaagatctgagggttagacaccctagtgtaccatatgacattgccattcgccacccgccatgtatcct 40355558  T
Q  101 ctcctgcctgctcaccccgggcgtccgccttaagcgtgtgagtgccgaagtcgacgaacatctgcacaatggaaggcggtgggaggtccctaacatcagt 200  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  40355559 ctcctgcctgctcaccccgatcgtccgccttaatcgtgtgagtgcggaagtcgacgaacacctgcacaatggaagacggtgggaggtccctaacagcagt 40355658  T
Q  201 cggatgtctggggatggtctgcacgtatccgtactgcctcaaaaccctctcgggcaagtgacggtacaccctacggacgccgcacataatccatccagaa 300  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||| ||||||    
T  40355659 cggatgtctagggatggtctggacgtatccgtactgcctcaaaaccctctcgggcaagtgacggtacaccctacggacactacacataatccacccagaa 40355758  T
Q  301 taccagaaaacctcctcgaagtcctggatctctctgtgctcctc 344  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40355759 taccataaaacctcctcgaagtcctggatctctctgtgctcctc 40355802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 244; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 73 - 344
Target Start/End: Original strand, 30723877 - 30724148
Alignment:
Q  73 tagccatccgccgcccgccatgtctcctctcctgcctgctcaccccgggcgtccgccttaagcgtgtgagtgccgaagtcgacgaacatctgcacaatgg 172  Q
    |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |    
T  30723877 tagccatccgccacccgccatgtatcctctcctgcctgctcaccccgatcgtccgccttaagcgtgtgagtgcggaagtcgacgaacatctgcacaattg 30723976  T
Q  173 aaggcggtgggaggtccctaacatcagtcggatgtctggggatggtctgcacgtatccgtactgcctcaaaaccctctcgggcaagtgacggtacaccct 272  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30723977 aaggcggtgggaggtccctaacatcagtcggatgtctggggatggtctgcacgtatccgtactgcctcaaaaccctctcgggcaagtgacggtacaccct 30724076  T
Q  273 acggacgccgcacataatccatccagaataccagaaaacctcctcgaagtcctggatctctctgtgctcctc 344  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30724077 acggacaccgcacataatccatccagaataccagaaaacctcctcgaagtcctggatctctctgtgctcctc 30724148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 2 - 341
Target Start/End: Original strand, 44677027 - 44677366
Alignment:
Q  2 caggcctcggaagatctcctggaataggtggcaagatctgagggtgagacaccctagcgtaccacaggacatagccatccgccgcccgccatgtctcctc 101  Q
    ||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||| |||||||||||    |||||||||  ||    
T  44677027 caggcctcgaaaaatctcctggaagaggtggcaagatctgagggtgagacaccctagtgtaccatagcacacagccatccgccatgtgccatgtctgttc 44677126  T
Q  102 tcctgcctgctcaccccgggcgtccgccttaagcgtgtgagtgccgaagtcgacgaacatctgcacaatggaaggcggtgggaggtccctaacatcagtc 201  Q
    |||||||||||||||||   || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||    ||||||||||    
T  44677127 tcctgcctgctcaccccaatcggccgccttaagcgtgtgagtgcggaagtcgacgaacgcctgcacaatgtaaggcggtgggaggtttacaacatcagtc 44677226  T
Q  202 ggatgtctggggatggtctgcacgtatccgtactgcctcaaaaccctctcgggcaagtgacggtacaccctacggacgccgcacataatccatccagaat 301  Q
     |||| |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  44677227 agatgcctggggatggtctggatgtatccgtactgcctcaaaaccctcttgggcaagtgacggtacaccctacggacaccgcacataatccagccagaat 44677326  T
Q  302 accagaaaacctcctcgaagtcctggatctctctgtgctc 341  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  44677327 accaaaaaacctcctcaaagtcctggatctccctgtgctc 44677366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 4 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 50278166 - 50277829
Alignment:
Q  4 ggcctcggaagatctcctggaataggtggcaagatctgagggtgagacaccctagcgtaccacaggacatagccatccgccgcccgccatgtctcctctc 103  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| ||| || ||||||||||||||||||| || ||| |  |||||||||||||||  ||||||||||| |||||    
T  50278166 ggcctcggaagatctcctggaagaggtgacaaaatatgagggtgagacaccctagtgtgccataacacatagccatccgccatccgccatgtctgctctc 50278067  T
Q  104 ctgcctgctcaccccgggcgtccgccttaagcgtgtgagtgccgaagtcgacgaacatctgcacaatggaaggcggtgggaggtccctaacatcagtcgg 203  Q
    |||||||||||||||   || | ||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||   ||||||||| |  ||   |||||| |||||    
T  50278066 ctgcctgctcaccccaatcggctgccttaagcgtgtgagtgcggaagtcgacgaacgcctgcacaatatgaggcggtggcaactctacaacatccgtcgg 50277967  T
Q  204 atgtctggggatggtctgcacgtatccgtactgcctcaaaaccctctcgggcaagtgacggtacaccctacggacgccgcacataatccatccagaatac 303  Q
    ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||| |||||||||    
T  50277966 atgtctggggacggtctggacgtatccgtactgcctcaaaaccctctcgggcaagtgacggtacaccctacaaacaccgcacataatccagccagaatac 50277867  T
Q  304 cagaaaacctcctcgaagtcctggatctctctgtgctc 341  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  50277866 cagaaaacctcctcaaaatcctggatctctctgtgctc 50277829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 1 - 341
Target Start/End: Original strand, 37016639 - 37016967
Alignment:
Q  1 gcaggcctcggaagatctcctggaataggtggcaagatctgagggtgagacaccctagcgtaccacaggacatagccatccgccgcccgccatgtctcct 100  Q
    |||||||||||||||||| ||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||||  |||||||||||       
T  37016639 gcaggcctcggaagatctactgaaagaggtggcaagatcttagggtgagacaccctagtgtaccatagcacatagccatccgccatccgccatgtct--- 37016735  T
Q  101 ctcctgcctgctcaccccgggcgtccgccttaagcgtgtgagtgccgaagtcgacgaacatctgcacaatggaaggcggtgggaggtccctaacatcagt 200  Q
             |||||||||   ||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||| ||||||||||| |||||| |||||||||   |||||| ||    
T  37016736 ---------gctcaccccaatcgtccgccttaagtgtgtgagtgcggaagtcaacgaacgtctgcacaatgtaaggcgatgggaggtctacaacatccgt 37016826  T
Q  201 cggatgtctggggatggtctgcacgtatccgtactgcctcaaaaccctctcgggcaagtgacggtacaccctacggacgccgcacataatccatccagaa 300  Q
    | ||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||| ||||||    
T  37016827 cagatgtctggggatggtcttgacgtatccgtattgcctcaaaaccctctcgggcaagtgacggtacaccctacgaacaccacacataatccaaccagaa 37016926  T
Q  301 taccagaaaacctcctcgaagtcctggatctctctgtgctc 341  Q
    ||||||||||||||||| |||| ||||||||| || |||||    
T  37016927 taccagaaaacctcctcaaagttctggatctccctatgctc 37016967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 4 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 8110163 - 8109835
Alignment:
Q  4 ggcctcggaagatctcctggaataggtggcaagatctgagggtgagacaccctagcgtaccacaggacatagccatccgccgcccgccatgtctcctctc 103  Q
    |||||||||||||||||||||| | |||| || |||||||||||||||||||||| |||||| |  |||||||||||||||  |  |||||||| |||||    
T  8110163 ggcctcggaagatctcctggaagatgtggaaaaatctgagggtgagacaccctagtgtaccataacacatagccatccgccatcaaccatgtctgctctc 8110064  T
Q  104 ctgcctgctcaccccgggcgtccgccttaagcgtgtgagtgccgaagtcgacgaacatctgcacaatggaaggcggtgggaggtccctaacatcagtcgg 203  Q
     ||||||||||||||   || | ||||||||||| |||||||  |||||||||||   |||||||||   || |||||| || ||   |||||  |||||    
T  8110063 ttgcctgctcaccccaatcggctgccttaagcgtatgagtgcgaaagtcgacgaatgcctgcacaatctgagacggtggcagctctacaacattcgtcgg 8109964  T
Q  204 atgtctggggatggtctgcacgtatccgtactgcctcaaaaccctctcgggcaagtgacggtacaccctacggacgccgcacataatccatccagaatac 303  Q
    ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||| || ||||||    
T  8109963 atgtctggggacggtctggacgtatccgtactgcctcaaaaccctctcgggcaagtgacggtacaccctacgaacaccacacataatccagcctgaatac 8109864  T
Q  304 cagaaaacctcctcgaagtcctggatctc 332  Q
    |||||||||||||| || || ||||||||    
T  8109863 cagaaaacctcctcaaaatcttggatctc 8109835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 47 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 51686104 - 51685810
Alignment:
Q  47 gagacaccctagcgtaccacaggacatagccatccgccgcccgccatgtctcctctcctgcctgctcaccccgggcgtccgccttaagcgtgtgagtgcc 146  Q
    |||||||||||| |||||| |  ||||||||||| | |  |||||||||||  |||||||||||||||||||   || |||||||||||||||||||||     
T  51686104 gagacaccctagtgtaccataacacatagccatctgtcatccgccatgtctgttctcctgcctgctcaccccaatcggccgccttaagcgtgtgagtgca 51686005  T
Q  147 gaagtcgacgaacatctgcacaatggaaggcggtgggaggtccctaacatcagtcggatgtctggggatggtctgcacgtatccgtactgcctcaaaacc 246  Q
    ||||| ||||||   |||||||||   ||||||||| || ||   |||||| ||||||||||| |||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  51686004 gaagttgacgaatgcctgcacaatctgaggcggtggcagctctacaacatccgtcggatgtctagggacggtctggacgtatctgtactgcctcaaaacc 51685905  T
Q  247 ctctcgggcaagtgacggtacaccctacggacgccgcacataatccatccagaataccagaaaacctcctcgaagtcctggatctctctgtgctc 341  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| || ||||| |||||||| || |||||||||||||||||||| || || | |||||||||||||||    
T  51685904 ctctcgggcaagtgacggtagaccctacgaacaccgcatataatccagcctgaataccagaaaacctcctcaaaatcttagatctctctgtgctc 51685810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 4 - 317
Target Start/End: Original strand, 10730039 - 10730352
Alignment:
Q  4 ggcctcggaagatctcctggaataggtggcaagatctgagggtgagacaccctagcgtaccacaggacatagccatccgccgcccgccatgtctcctctc 103  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||| |  |||||||| |||  |   || ||||||| |||||    
T  10730039 ggcctcggaagatctcctggaagaggtggcaaaatctgagggtgagacaccttagtgtaccataacacatagccctccctcatacgtcatgtctgctctc 10730138  T
Q  104 ctgcctgctcaccccgggcgtccgccttaagcgtgtgagtgccgaagtcgacgaacatctgcacaatggaaggcggtgggaggtccctaacatcagtcgg 203  Q
     ||||||||||||||   || || |||| ||||||||||||| ||||||||||||   |||||||||   ||||||| | || ||   |||||| |||||    
T  10730139 gtgcctgctcaccccaatcggcctccttcagcgtgtgagtgcggaagtcgacgaaagcctgcacaatctgaggcggtagcagctcaacaacatccgtcgg 10730238  T
Q  204 atgtctggggatggtctgcacgtatccgtactgcctcaaaaccctctcgggcaagtgacggtacaccctacggacgccgcacataatccatccagaatac 303  Q
    || ||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| || ||||||| |||||| ||  |||||    
T  10730239 atttctagggatggtctggacgtatctgtactgcctcaaaaccctctcaggcaagtgacggtacactctacgaacaccgcacaaaatccagcctaaatac 10730338  T
Q  304 cagaaaacctcctc 317  Q
    ||||||||||||||    
T  10730339 cagaaaacctcctc 10730352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 4 - 317
Target Start/End: Original strand, 10943808 - 10944121
Alignment:
Q  4 ggcctcggaagatctcctggaataggtggcaagatctgagggtgagacaccctagcgtaccacaggacatagccatccgccgcccgccatgtctcctctc 103  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||| |  |||||||| |||  |   || ||||||| |||||    
T  10943808 ggcctcggaagatctcctggaagaggtggcaaaatctgagggtgagacaccttagtgtaccataacacatagccctccctcatacgtcatgtctgctctc 10943907  T
Q  104 ctgcctgctcaccccgggcgtccgccttaagcgtgtgagtgccgaagtcgacgaacatctgcacaatggaaggcggtgggaggtccctaacatcagtcgg 203  Q
     ||||||||||||||   || || |||| ||||||||||||| ||||||||||||   |||||||||   ||||||| | || ||   |||||| |||||    
T  10943908 gtgcctgctcaccccaatcggcctccttcagcgtgtgagtgcggaagtcgacgaaagcctgcacaatctgaggcggtagcagctcaacaacatccgtcgg 10944007  T
Q  204 atgtctggggatggtctgcacgtatccgtactgcctcaaaaccctctcgggcaagtgacggtacaccctacggacgccgcacataatccatccagaatac 303  Q
    || ||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| || ||||||| |||||| ||  |||||    
T  10944008 atttctagggatggtctggacgtatctgtactgcctcaaaaccctctcaggcaagtgacggtacactctacgaacaccgcacaaaatccagcctaaatac 10944107  T
Q  304 cagaaaacctcctc 317  Q
    ||||||||||||||    
T  10944108 cagaaaacctcctc 10944121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 4 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 50904368 - 50904047
Alignment:
Q  4 ggcctcggaagatctcctggaataggtggcaagatctgagggtgagacaccctagcgtaccacaggacatagccatccgccgcccgccatgtctcctctc 103  Q
    ||||| ||||||||| ||| || ||||| ||| |||||||||||||| ||||||| |||||| || |||||||| ||||||       |||||| |||||    
T  50904368 ggcctgggaagatcttctgaaagaggtgacaaaatctgagggtgagataccctagtgtaccatagcacatagccgtccgcc-------atgtctgctctc 50904276  T
Q  104 ctgcctgctcaccccgggcgtccgccttaagcgtgtgagtgccgaagtcgacgaacatctgcacaatggaaggcggtgggaggtccctaacatcagtcgg 203  Q
    || |||||||||| |   || || |||||||||||||||||| ||| |||||||||  |||||||||   ||||||||| || ||   |||||| |||||    
T  50904275 ctacctgctcacctcaatcggccaccttaagcgtgtgagtgcggaaatcgacgaacgcctgcacaatatgaggcggtggaagctctacaacatccgtcgg 50904176  T
Q  204 atgtctggggatggtctgcacgtatccgtactgcctcaaaaccctctcgggcaagtgacggtacaccctacggacgccgcacataatccatccagaatac 303  Q
    ||| ||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| || ||| ||    
T  50904175 atgcctggggacggtctggacgtatctgtactgcctcaaaaccctctcggacaagtgacggtacaccctacgaacaccgcacatgatccaacctgaaaac 50904076  T
Q  304 cagaaaacctcctcgaagtcctggatctc 332  Q
    || ||| ||||||| || |||||||||||    
T  50904075 caaaaaccctcctcaaaatcctggatctc 50904047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 3 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 71950 - 71624
Alignment:
Q  3 aggcctcggaagatctcctggaataggtggcaagatctgagggtgagacaccctagcgtaccacaggacatagccatccgccgcccgccatgtctcctct 102  Q
    ||||||| ||| ||||||| ||| | ||| ||| |||||||||||||||||    | ||||||  | |||||||||||||||   |||||||||| ||||    
T  71950 aggcctcagaatatctcctagaagaagtgacaaaatctgagggtgagacacaacggtgtaccatcgtacatagccatccgccatacgccatgtctgctct 71851  T
Q  103 cctgcctgctcaccccgggcgtccgccttaagcgtgtgagtgccgaagtcgacgaacatctgcacaatggaaggcggtgggaggtccctaacatcagtcg 202  Q
    ||||| ||||||||||   || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||   |||||||||   || || ||  || ||   |||||| | |     
T  71850 cctgcatgctcaccccaatcggccgccttaagcgtgtgagtgcggaagtcgacgaaagcctgcacaatctgagccgatgacagctctacaacatccgaca 71751  T
Q  203 gatgtctggggatggtctgcacgtatccgtactgcctcaaaaccctctcgggcaagtgacggtacaccctacggacgccgcacataatccatccagaata 302  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||  | |||||||||||||| || |||||    
T  71750 gatgtctagggatggtctggacgtatccgtactgcctcaaaaccctctcggccaagtgacggaacaccctacgatcaccgcacataatccagcctgaata 71651  T
Q  303 ccagaaaacctcctcgaagtcctggat 329  Q
    ||| || |||||||||||  |||||||    
T  71650 ccataatacctcctcgaaagcctggat 71624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 4 - 338
Target Start/End: Original strand, 50020743 - 50021065
Alignment:
Q  4 ggcctcggaagatctcctggaataggtggcaagatctgagggtgagacaccctagcgtaccacaggacatagccatccgccgcccgccatgtctcctctc 103  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||| |||||| |  | |||||||||||||  | |||||||||          
T  50020743 ggcctcggaagatctcttggaagaggtggcaaaatttgagggtgagacaccctagtgtaccataacatatagccatccgccatcagccatgtct------ 50020836  T
Q  104 ctgcctgctcaccccgggcgtccgccttaagcgtgtgagtgccgaagtcgacgaacatctgcacaatggaaggcggtgggaggtccctaacatcagtcgg 203  Q
          |||||||||   || || |||| ||| |||||||||   ||| ||||||   |||||||||   || |||||| || ||   |||||| |||||    
T  50020837 ------gctcaccccaatcggcctccttgagcatgtgagtgcgagagttgacgaatgcctgcacaatctgagtcggtggtagctctacaacatccgtcgg 50020930  T
Q  204 atgtctggggatggtctgcacgtatccgtactgcctcaaaaccctctcgggcaagtgacggtacaccctacggacgccgcacataatccatccagaatac 303  Q
    ||||||||||| ||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| || ||||||    
T  50020931 atgtctggggacggtatggacgtacccgtactgcctcaaaaccctctcgggcaagtgacggtacaccctacgaacaccgcacataatccaacctgaatac 50021030  T
Q  304 cagaaaacctcctcgaagtcctggatctctctgtg 338  Q
    |||||||||||||| || || || ||||| |||||    
T  50021031 cagaaaacctcctcaaaatcatgtatctccctgtg 50021065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 70 - 320
Target Start/End: Original strand, 13624644 - 13624894
Alignment:
Q  70 acatagccatccgccgcccgccatgtctcctctcctgcctgctcaccccgggcgtccgccttaagcgtgtgagtgccgaagtcgacgaacatctgcacaa 169  Q
    ||||||||||| |||   |||||||||| ||||| ||| ||||||||||   || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||   ||||||||    
T  13624644 acatagccatctgccatacgccatgtctgctctcttgcatgctcaccccaatcggccgccttaagcgtgtgagtgcggaagtcgacgaaagcctgcacaa 13624743  T
Q  170 tggaaggcggtgggaggtccctaacatcagtcggatgtctggggatggtctgcacgtatccgtactgcctcaaaaccctctcgggcaagtgacggtacac 269  Q
    |   || |||||  || ||   |||||| | ||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |    
T  13624744 tctcagccggtgacagatctacaacatccgacggatgtctagggacggtctggacgtatccgtactgcctcaaaaccctcttgggcaagtgacggtacgc 13624843  T
Q  270 cctacggacgccgcacataatccatccagaataccagaaaacctcctcgaa 320  Q
    ||||||  | |||||||||||||| || ||||||||||| || ||||||||    
T  13624844 cctacgatcaccgcacataatccaacctgaataccagaatacttcctcgaa 13624894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 199 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 50196218 - 50196076
Alignment:
Q  199 gtcggatgtctggggatggtctgcacgtatccgtactgcctcaaaaccctctcgggcaagtgacggtacaccctacggacgccgcacataatccatccag 298  Q
    |||| ||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| || |    
T  50196218 gtcgaatgtctggggacggcctgaacgtatccgtactgcctcaaaaccctctcgggcaagtgacggtacaccctacgaacaccgcacataatccaacctg 50196119  T
Q  299 aataccagaaaacctcctcgaagtcctggatctctctgtgctc 341  Q
    ||||||||||||||||||| || | ||||||||| ||||||||    
T  50196118 aataccagaaaacctcctcaaaattctggatctccctgtgctc 50196076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 7 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 14317618 - 14317284
Alignment:
Q  7 ctcggaagatctcctggaataggtggcaagatctgagggtgagacaccctagcgtaccacaggacatagccatccgccgcccgccatgtctcctctcctg 106  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||| ||| |||||| |  |||||||| |||  |   |||||||| | |||||| |    
T  14317618 ctcggaagatctcctggaagaggtggcaaaatatgagggtgagacaccttagtgtaccataacacatagccctccctcatacgccatgtttgctctcccg 14317519  T
Q  107 cctgctcaccccgggcgtccgccttaagcgtgtgagtgccgaagtcgacgaacatctgcacaatggaaggcggtgggaggtccctaacatcagtcggatg 206  Q
    || |||||||||   |   | |||||||||||||||||| |||||| |  ||    ||||||||   |||  |||| || ||   |||||| ||||||||    
T  14317518 ccggctcaccccattcaggctccttaagcgtgtgagtgcggaagtcaagaaatgcttgcacaatctgaggtagtggcagctctacaacatccgtcggatg 14317419  T
Q  207 tctggggatggtctgcacgtatccgtactgcctcaaaaccctctcgggcaagtgacggtacaccctacggacgccgcacataatccatccagaataccag 306  Q
     || ||||  || || ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| || |||||||||||||| || |||||||||    
T  14317418 actagggacagtttggacgtatctgtaccgcctcaaaaccctctcgggcaagtgatggtataccctacgaacaccgcacataatccagcctgaataccag 14317319  T
Q  307 aaaacctcctcgaagtcctggatctctctgtgctc 341  Q
    ||||||||||| ||  |||| ||||| ||||||||    
T  14317318 aaaacctcctcaaaaccctgaatctccctgtgctc 14317284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 91 - 317
Target Start/End: Original strand, 41931108 - 41931334
Alignment:
Q  91 catgtctcctctcctgcctgctcaccccgggcgtccgccttaagcgtgtgagtgccgaagtcgacgaacatctgcacaatggaaggcggtgggaggtccc 190  Q
    ||||||| |||| |||||||||||||||   || || |||||| | ||||||||| ||||||||||||  ||||||||||   ||||||||| || ||      
T  41931108 catgtctgctctgctgcctgctcaccccaatcggcctccttaatcatgtgagtgcggaagtcgacgaaagtctgcacaatctgaggcggtggcagctcaa 41931207  T
Q  191 taacatcagtcggatgtctggggatggtctgcacgtatccgtactgcctcaaaaccctctcgggcaagtgacggtacaccctacggacgccgcacataat 290  Q
     |||||||||||||||||| ||||  || || |||||||||| ||||||||||||||||| ||| |  | ||||||||| ||||| || |||||||||||    
T  41931208 caacatcagtcggatgtctagggactgtttggacgtatccgtgctgcctcaaaaccctcttgggtagataacggtacactctacgaacaccgcacataat 41931307  T
Q  291 ccatccagaataccagaaaacctcctc 317  Q
    ||||||  |||||||||||||||||||    
T  41931308 ccatccttaataccagaaaacctcctc 41931334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 130 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 46438954 - 46438743
Alignment:
Q  130 ttaagcgtgtgagtgccgaagtcgacgaacatctgcacaatggaaggcggtgggaggtccctaacatcagtcggatgtctggggatggtctgcacgtatc 229  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||   ||||||||  || ||   |||||| ||||||||||| ||||   |||| |||||||    
T  46438954 ttaagcgtgtgagtgcggaagtcgacgaatgtctgcacaatctgaggcggtgtcagctctacaacatccgtcggatgtctagggaccctctggacgtatc 46438855  T
Q  230 cgtactgcctcaaaaccctctcgggcaagtgacggtacaccctacggacgccgcacataatccatccagaataccagaaaacctcctcgaagtcctggat 329  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||| |||||||| || |||||| |||| | |||||| ||  |||||||    
T  46438854 tgtactgcctcaaaaccctctcgggcaagtaacggtacaccctacgaacaccgcaaataatccagcctgaatactagaatatctcctcaaatccctggat 46438755  T
Q  330 ctctctgtgctc 341  Q
    |||  |||||||    
T  46438754 ctccttgtgctc 46438743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 4 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 30706916 - 30706657
Alignment:
Q  4 ggcctcggaagatctcctggaataggtggcaagatctgagggtgagacaccctagcgtaccacaggacatagccatccgccgcccgccatgtctcctctc 103  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||| || |  ||| | |  |||  |   |||||||||| ||||     
T  30706916 ggcctccgaagatctcctggaagaggtggcaaaatctgagggtgagacaccttagtgtatcataacacacaacattccctcatacgccatgtctgctctg 30706817  T
Q  104 ctgcctgctcaccccgggcgtccgccttaagcgtgtgagtgccgaagtcgacgaacatctgcacaatggaaggcggtgggaggtccctaacatcagtcgg 203  Q
    ||||| |||||||||   || || |||||| ||||||||||| |||||| |||||   |||||||||   ||||||||  || ||   |||||| |||||    
T  30706816 ctgccagctcaccccaatcggcctccttaaacgtgtgagtgcagaagtctacgaatgcctgcacaatctgaggcggtgtcagctctacaacatccgtcgg 30706717  T
Q  204 atgtctggggatggtctgcacgtatccgtactgcctcaaaaccctctcgggcaagtgacg 263  Q
    |||||| ||||| ||||  |||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  30706716 atgtctagggatcgtctagacgtattcgtactgcctcaacaccctctcaggcaagtgacg 30706657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 2 - 65
Target Start/End: Original strand, 30723784 - 30723847
Alignment:
Q  2 caggcctcggaagatctcctggaataggtggcaagatctgagggtgagacaccctagcgtacca 65  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  30723784 caggcctcggaagatctcctggaataggtggcaagatctgagggtgagacaccctagtgtacca 30723847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 4 - 102
Target Start/End: Original strand, 55278829 - 55278927
Alignment:
Q  4 ggcctcggaagatctcctggaataggtggcaagatctgagggtgagacaccctagcgtaccacaggacatagccatccgccgcccgccatgtctcctct 102  Q
    ||||||||||||| |||||||| | ||||||| ||| ||||||||| |||||||| |||||| || |||||||||||| ||  ||||||||||||||||    
T  55278829 ggcctcggaagatatcctggaagaagtggcaaaatcagagggtgagtcaccctagtgtaccatagtacatagccatcctccatccgccatgtctcctct 55278927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 4 - 118
Target Start/End: Complemental strand, 50196342 - 50196224
Alignment:
Q  4 ggcctcggaagatctcctggaataggtggcaagatctgagggtgagacaccct----agcgtaccacaggacatagccatccgccgcccgccatgtctcc 99  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||    || |||||| |  |||||||||||| ||  | ||||||||| |    
T  50196342 ggcctcggaagatctcctggaagaggtggcaaaatctgagggtgagacaccctagtgagtgtaccataacacatagccatccaccatcagccatgtctgc 50196243  T
Q  100 tctcctgcctgctcacccc 118  Q
    |||||| ||||| ||||||    
T  50196242 tctcctacctgcacacccc 50196224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 192 - 340
Target Start/End: Original strand, 21535449 - 21535597
Alignment:
Q  192 aacatcagtcggatgtctggggatggtctgcacgtatccgtactgcctcaaaaccctctcgggcaagtgacggtacaccctacggacgccgcacataatc 291  Q
    |||||| ||||||||||| |||| |||||  || ||||||||| ||| |||||| ||||| ||||||||||| |||||||||   || | |||||||| |    
T  21535449 aacatccgtcggatgtctagggacggtctcgacatatccgtacagccgcaaaactctctcaggcaagtgacgatacaccctaataacactgcacataacc 21535548  T
Q  292 catccagaataccagaaaacctcctcgaagtcctggatctctctgtgct 340  Q
     | || ||||| || |||| |||||| ||  |||||||||| |||||||    
T  21535549 tagcctgaataacataaaatctcctcaaaaccctggatctccctgtgct 21535597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 4 - 80
Target Start/End: Complemental strand, 46439032 - 46438956
Alignment:
Q  4 ggcctcggaagatctcctggaataggtggcaagatctgagggtgagacaccctagcgtaccacaggacatagccatc 80  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||||||| || ||||||||||||||| ||| |||||| |  |||||||||||    
T  46439032 ggcctcggaagatctcatggaagaggtggcaaaatttgagggtgagacaccttagtgtaccataacacatagccatc 46438956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 4 - 95
Target Start/End: Complemental strand, 12891924 - 12891833
Alignment:
Q  4 ggcctcggaagatctcctggaataggtggcaagatctgagggtgagacaccctagcgtaccacaggacatagccatccgccgcccgccatgt 95  Q
    ||||||| ||||||||| | || | ||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||| | | |||||||||| ||  |||||||||    
T  12891924 ggcctcgaaagatctcccgaaagaagtggcaaaatctgagggtgatacaccctagtgtaccaccgtatatagccatcctccatccgccatgt 12891833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 223 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 12891703 - 12891586
Alignment:
Q  223 acgtatccgtactgcctcaaaaccctctcgggcaagtgacggtacaccctacggacgccgcacataatccatccagaataccagaaaacctcctcgaagt 322  Q
    |||||||||||||||| |  ||| ||||| ||||||||||| |||||   ||  || |||||||||| ||| || ||||||||||||| |||||| ||      
T  12891703 acgtatccgtactgccgcctaactctctcaggcaagtgacgatacacttaaca-acaccgcacataacccagcctgaataccagaaaatctcctcaaaac 12891605  T
Q  323 cctggatctctctgtgctc 341  Q
    |||||||||| ||||||||    
T  12891604 cctggatctccctgtgctc 12891586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 22 - 118
Target Start/End: Original strand, 40886693 - 40886789
Alignment:
Q  22 ggaataggtggcaagatctgagggtgagacaccctagcgtaccacaggacatagccatccgccgcccgccatgtctcctctcctgcctgctcacccc 118  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| |  | ||| |||||  ||  | |||||||| |||||| |||| |||||||||    
T  40886693 ggaataagtggcaaaatctgagggtgagacaccctagtgtaccataacatataaccatcatccatctgccatgtcacctctcatgccggctcacccc 40886789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 203 - 341
Target Start/End: Original strand, 40886874 - 40887012
Alignment:
Q  203 gatgtctggggatggtctgcacgtatccgtactgcctcaaaaccctctcgggcaagtgacggtacaccctacggacgccgcacataatccatccagaata 302  Q
    ||||||| |||| | ||||||||||||| ||||||| |  ||| |||||  | |||||||| |||||  |    || |||||||||||||| || |||||    
T  40886874 gatgtctagggacgttctgcacgtatccttactgccgcctaactctctcaagaaagtgacgatacacgttgtcaacaccgcacataatccagcctgaata 40886973  T
Q  303 ccagaaaacctcctcgaagtcctggatctctctgtgctc 341  Q
    ||| |||| |||||| || || ||||||||||| |||||    
T  40886974 ccataaaatctcctcaaaatcttggatctctctatgctc 40887012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 297; Significance: 1e-167; HSPs: 23)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 297; E-Value: 1e-167
Query Start/End: Original strand, 1 - 344
Target Start/End: Original strand, 3729385 - 3729729
Alignment:
Q  1 gcaggcctcggaagatctcctggaataggtggcaagatctgagggtgagacaccctagcgtaccacaggacatagccatccgccgcccgccatgtctcct 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||    
T  3729385 gcaggcctcggaagatctcctggaataggtggcaagatctgagggtgagacaccctagtgtaccacaggacatagccatccgtcacccgccatgtatcct 3729484  T
Q  101 ctcctgcctgctcaccccgggcgtccgccttaagcgtgtgagtgccgaagtcgacgaacatctgcacaatggaagg-cggtgggaggtccctaacatcag 199  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  3729485 ctcctgcctactcaccccgagcgtccgccttaagcgtgtgagtgcggaagtcaacgaacatctgcacaatggaagggcggggggaggtccctaacatcag 3729584  T
Q  200 tcggatgtctggggatggtctgcacgtatccgtactgcctcaaaaccctctcgggcaagtgacggtacaccctacggacgccgcacataatccatccaga 299  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3729585 tcggatgtctggggatggtctgcacgtatccgtactgcctcaaaaccctctcgggcaagtgacggtacaccctacggacgccgcacataatccatccaga 3729684  T
Q  300 ataccagaaaacctcctcgaagtcctggatctctctgtgctcctc 344  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  3729685 ataccagaaaacctcctcgaagtcttggatctctctgtgctcctc 3729729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 296; E-Value: 1e-166
Query Start/End: Original strand, 1 - 344
Target Start/End: Original strand, 13637042 - 13637385
Alignment:
Q  1 gcaggcctcggaagatctcctggaataggtggcaagatctgagggtgagacaccctagcgtaccacaggacatagccatccgccgcccgccatgtctcct 100  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  13637042 gcaggcctcagaagatctcctggaataggtggcaagatctgagggtgagacaccctagtgtaccatatgacatagccatccgccacccgccatgtatcct 13637141  T
Q  101 ctcctgcctgctcaccccgggcgtccgccttaagcgtgtgagtgccgaagtcgacgaacatctgcacaatggaaggcggtgggaggtccctaacatcagt 200  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  13637142 ctcctgcctgctcaccccgagcgtccgccttaagcgtgtgagtgcggaagtcgacgaacatctgcacaatggaaggcggggggagctccctaacatcagt 13637241  T
Q  201 cggatgtctggggatggtctgcacgtatccgtactgcctcaaaaccctctcgggcaagtgacggtacaccctacggacgccgcacataatccatccagaa 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13637242 cggatgtctggggatggtctgcacgtatctgtactgcctcaaaaccctctcgggcaagtgatggtacaccctacggacgccgcacataatccatccagaa 13637341  T
Q  301 taccagaaaacctcctcgaagtcctggatctctctgtgctcctc 344  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13637342 taccagaaaacctcctcgaagtcctggatctctctgtgctcctc 13637385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 266; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 1 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 26878724 - 26878388
Alignment:
Q  1 gcaggcctcggaagatctcctggaataggtggcaagatctgagggtgagacaccctagcgtaccacaggacatagccatccgccgcccgccatgtctcct 100  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||       |||| ||||    
T  26878724 gcaggcctcagaagatctactggaataggtggcaagatctgagggtgagacaccccagtgtaccacaggacatagccattcgcc-------atgtatcct 26878632  T
Q  101 ctcctgcctgctcaccccgggcgtccgccttaagcgtgtgagtgccgaagtcgacgaacatctgcacaatggaaggcggtgggaggtccctaacatcagt 200  Q
    ||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  26878631 ctcctgcttgctcaccccgagcttccgccttaagcgtgtgagtgcggaagtcgacgaacatctgcacaatggaaggcggggggaggtccctaacatcagt 26878532  T
Q  201 cggatgtctggggatggtctgcacgtatccgtactgcctcaaaaccctctcgggcaagtgacggtacaccctacggacgccgcacataatccatccagaa 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26878531 cggatgtctggggatggtctgcacgtatccgtactgtctcaaaaccctctcgggcaagtgacggtacaccctacggacgccgcacataatccatccagaa 26878432  T
Q  301 taccagaaaacctcctcgaagtcctggatctctctgtgctcctc 344  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  26878431 taccagaaaacctcctcgaagtcatggatctctctgtgctcctc 26878388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 244; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 1 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 19159035 - 19158692
Alignment:
Q  1 gcaggcctcggaagatctcctggaataggtggcaagatctgagggtgagacaccctagcgtaccacaggacatagccatccgccgcccgccatgtctcct 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  19159035 gcaggcctcggaagatctcctggaagaggtggcaagatctgagggtgagacaccctagtgtaccatatgacatagccatccgccgtccgccatgtctcct 19158936  T
Q  101 ctcctgcctgctcaccccgggcgtccgccttaagcgtgtgagtgccgaagtcgacgaacatctgcacaatggaaggcggtgggaggtccctaacatcagt 200  Q
    |||||||||||| ||||||  |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||  |||||||||| ||||  ||||||| ||   |||||| ||    
T  19158935 ctcctgcctgctgaccccgatcgtccgccttaatcgtgtgagtgcggaagtcgacgaacgcctgcacaatgtaagggagtgggagctctacaacatccgt 19158836  T
Q  201 cggatgtctggggatggtctgcacgtatccgtactgcctcaaaaccctctcgggcaagtgacggtacaccctacggacgccgcacataatccatccagaa 300  Q
     |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  19158835 gggatgtttggggatggtctgcacgtatccgtactgcctcaaaaccctctcgggaaagtgacggtacaccctacggacaccgcacataatccacccagaa 19158736  T
Q  301 taccagaaaacctcctcgaagtcctggatctctctgtgctcctc 344  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19158735 taccagaaaacctcctcgaagtcctggatctctctgtgctcctc 19158692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 1 - 344
Target Start/End: Original strand, 95138 - 95474
Alignment:
Q  1 gcaggcctcggaagatctcctggaataggtggcaagatctgagggtgagacaccctagcgtaccacaggacatagccatccgccgcccgccatgtctcct 100  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||       ||||||| ||    
T  95138 gcaggcctcagaagatctcctggaagaggtggcaagatctgagggtgagacaccctagtgtactataggacatagccatccgc-------catgtctact 95230  T
Q  101 ctcctgcctgctcaccccgggcgtccgccttaagcgtgtgagtgccgaagtcgacgaacatctgcacaatggaaggcggtgggaggtccctaacatcagt 200  Q
    |||||| |||||||||||   | |||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||   |||||||||    
T  95231 ctcctgtctgctcaccccaatcatccgccttaagcgtgtgagtgcggaagtcgacgaacgcctgcacaatgtaaggcggtgggaggtctacaacatcagt 95330  T
Q  201 cggatgtctggggatggtctgcacgtatccgtactgcctcaaaaccctctcgggcaagtgacggtacaccctacggacgccgcacataatccatccagaa 300  Q
    ||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||    
T  95331 cggatgtctggggatggtctggaaatatccgtactgcctcaaaaccctatcgggcaagtgacggtacaccctacggacaccacacataatccagccagaa 95430  T
Q  301 taccagaaaacctcctcgaagtcctggatctctctgtgctcctc 344  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  95431 taccagaaaacctcctcaaagtcctggatctccctgtgctcctc 95474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 1 - 344
Target Start/End: Original strand, 31780703 - 31781039
Alignment:
Q  1 gcaggcctcggaagatctcctggaataggtggcaagatctgagggtgagacaccctagcgtaccacaggacatagccatccgccgcccgccatgtctcct 100  Q
    |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||||       ||||||| ||    
T  31780703 gcaggcctcggaagatctgctggaagaggtggcaagatctgagggtgagacaccctagtgtaccatagcacatagccatccgc-------catgtctgct 31780795  T
Q  101 ctcctgcctgctcaccccgggcgtccgccttaagcgtgtgagtgccgaagtcgacgaacatctgcacaatggaaggcggtgggaggtccctaacatcagt 200  Q
    ||||||||| ||||||||   || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||   |||||||||    
T  31780796 ctcctgcctactcaccccaatcggccgccttaagcgtgtgagtgcggaagtcgacgaacgtctgcacaatgtaaggcggtgggaggtctacaacatcagt 31780895  T
Q  201 cggatgtctggggatggtctgcacgtatccgtactgcctcaaaaccctctcgggcaagtgacggtacaccctacggacgccgcacataatccatccagaa 300  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||    
T  31780896 cggatgtttggggatggtctggacgtatccgtactgcctcataaccctctcgggcaagtgatggtacaccctacagacaccgcacataatccaaccagaa 31780995  T
Q  301 taccagaaaacctcctcgaagtcctggatctctctgtgctcctc 344  Q
    |||||||||| | |||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  31780996 taccagaaaatcccctcaaagtcctggatctccctgtgctcctc 31781039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 1 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 22527010 - 22526674
Alignment:
Q  1 gcaggcctcggaagatctcctggaataggtggcaagatctgagggtgagacaccctagcgtaccacaggacatagccatccgccgcccgccatgtctcct 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||       |||| | ||    
T  22527010 gcaggcctcggaagatctcctggaataggtggcaagatctgagggtgagacaccctagtgtaccataggacatagccatccgcc-------atgtttgct 22526918  T
Q  101 ctcctgcctgctcaccccgggcgtccgccttaagcgtgtgagtgccgaagtcgacgaacatctgcacaatggaaggcggtgggaggtccctaacatcagt 200  Q
    ||||||||||||||||||   || |||||||||||||||||| || |||||||||||||  ||||||||||  ||||||||| || ||   |||||| ||    
T  22526917 ctcctgcctgctcaccccaatcggccgccttaagcgtgtgagggcggaagtcgacgaacgcctgcacaatgtgaggcggtggcagctctacaacatcggt 22526818  T
Q  201 cggatgtctggggatggtctgcacgtatccgtactgcctcaaaaccctctcgggcaagtgacggtacaccctacggacgccgcacataatccatccagaa 300  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||     
T  22526817 cggatgtctggggacggtctggacgtatccgtactgcctcaaaaccctctcgggcaagtgacggtacaccctacggacaccgcacataatccagccagag 22526718  T
Q  301 taccagaaaacctcctcgaagtcctggatctctctgtgctcctc 344  Q
    ||| ||||||||||||| ||||||| ||||||  ||||||||||    
T  22526717 tactagaaaacctcctcaaagtcctagatctccatgtgctcctc 22526674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 4 - 341
Target Start/End: Original strand, 19522323 - 19522653
Alignment:
Q  4 ggcctcggaagatctcctggaataggtggcaagatctgagggtgagacaccctagcgtaccacaggacatagccatccgccgcccgccatgtctcctctc 103  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| |  |||||||||||||||       |||||| |||||    
T  19522323 ggcctcgaaagatctcctggaagaggtggcaaaatctgagggtgagacaccctagtgtaccataacacatagccatccgcc-------atgtctgctctc 19522415  T
Q  104 ctgcctgctcaccccgggcgtccgccttaagcgtgtgagtgccgaagtcgacgaacatctgcacaatggaaggcggtgggaggtccctaacatcagtcgg 203  Q
    |||||||||||||||   || | |||||||||||||||| || ||||| |||||||  ||||||||||  ||||||||| || ||   |||||| ||||     
T  19522416 ctgcctgctcaccccaatcggctgccttaagcgtgtgagggcggaagttgacgaacgcctgcacaatgtgaggcggtggcagctctacaacatccgtcga 19522515  T
Q  204 atgtctggggatggtctgcacgtatccgtactgcctcaaaaccctctcgggcaagtgacggtacaccctacggacgccgcacataatccatccagaatac 303  Q
    ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||    
T  19522516 atgtctggggacggtctggacgtatccgtactgcctcaaaaccctctcgggcaagtgacgatacaccctacgaacaccgcacataatccagccagaatac 19522615  T
Q  304 cagaaaacctcctcgaagtcctggatctctctgtgctc 341  Q
    |||||||||||||| |  ||||| ||||||||||||||    
T  19522616 cagaaaacctcctcaatatcctgtatctctctgtgctc 19522653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 160; E-Value: 3e-85
Query Start/End: Original strand, 6 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 47505350 - 47505016
Alignment:
Q  6 cctcggaagatctcctggaataggtggcaagatctgagggtgagacaccctagcgtaccacaggacatagccatccgccgcccgccatgtctcctctcct 105  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||| |||  ||||||||||| |||||||    
T  47505350 cctcgaaagatctcctggaagaggtggcaagatctgagggtgagacaccctagtgtaccatagcacatagccatctgccatccgccatgtctgctctcct 47505251  T
Q  106 gcctgctcaccccgggcgtccgccttaagcgtgtgagtgccgaagtcgacgaacatctgcacaatggaaggcggtgggaggtccctaacatcagtcggat 205  Q
    |||||||||||||   || |||||||||||||||||| || ||||||||||||   |||||||||   ||||||||   | ||   |||||| |||||||    
T  47505250 gcctgctcaccccaatcggccgccttaagcgtgtgagcgcggaagtcgacgaatgcctgcacaatctgaggcggtgatcgctctacaacatccgtcggat 47505151  T
Q  206 gtctggggatggtctgcacgtatccgtactgcctcaaaaccctctcgggcaagtgacggtacaccctacggacgccgcacataatccatccagaatacca 305  Q
    |||||||||  ||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||||||||||||| || || |||||    
T  47505150 gtctggggacagtctggacgtatttgtactgcctcaaaaccctctcgggcaagtgacggtacaccc-acgaacaccgcacataatccagcctgattacca 47505052  T
Q  306 gaaaacctcctcgaagtcctggatctctctgtgctc 341  Q
    |||||||||||| || ||||||||||| ||||||||    
T  47505051 gaaaacctcctcaaaatcctggatctccctgtgctc 47505016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 158; E-Value: 5e-84
Query Start/End: Original strand, 4 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 52804879 - 52804570
Alignment:
Q  4 ggcctcggaagatctcctggaataggtggcaagatctgagggtgagacaccctagcgtaccacaggacatagccatccgccgcccgccatgtctcctctc 103  Q
    |||||||||| |||| |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||| |  || |||||||| |||||    
T  52804879 ggcctcggaatatctactggaagagctggcaagatctgagggtgagacaccctagtgtaccatagcacatagccatccgtcatcctccatgtctgctctc 52804780  T
Q  104 ctgcctgctcaccccgggcgtccgccttaagcgtgtgagtgccgaagtcgacgaacatctgcacaatggaaggcggtgggaggtccctaacatcagtcgg 203  Q
    |||||||||||||||   |  |||||||||| |||||||||  ||||||||||||| |||||||||||  |||| |||| || ||   |||||| |||||    
T  52804779 ctgcctgctcaccccaatcagccgccttaagtgtgtgagtgtggaagtcgacgaacgtctgcacaatgtgaggcagtggcagctctacaacatccgtcgg 52804680  T
Q  204 atgtctggggatggtctgcacgtatccgtactgcctcaaaaccctctcgggcaagtgacggtacaccctacggacgccgcacataatccatccagaatac 303  Q
    ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||  || |||||    
T  52804679 atgtctggggacggtctggacgtatccgtactgcctcaaaaccctctcgggcaagtgacggtacaccctacgaacacctcacataatccaagcataatac 52804580  T
Q  304 cagaaaacct 313  Q
    ||||||||||    
T  52804579 cagaaaacct 52804570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 114; E-Value: 9e-58
Query Start/End: Original strand, 4 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 11196874 - 11196537
Alignment:
Q  4 ggcctcggaagatctcctggaataggtggcaagatctgagggtgagacaccctagcgtaccacaggacatagccatccgccgcccgccatgtctcctctc 103  Q
    ||||||||||||||||||| || ||||||||| ||  |||||||||||||| ||| |||||| |  |||||||| |||  |   || ||||||| ||||     
T  11196874 ggcctcggaagatctcctgaaagaggtggcaaaatacgagggtgagacaccttagtgtaccataacacatagccctccctcatacgacatgtctgctctg 11196775  T
Q  104 ctgcctgctcaccccgggcgtccgccttaagcgtgtgagtgccgaagtcgacgaacatctgcacaatggaaggcggtgggaggtccctaacatcagtcgg 203  Q
    ||||||||||||||    || ||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||  ||||||||||  |||||||||  || ||   |||||  |||||    
T  11196774 ctgcctgctcaccctaatcggccgccttaagcatgtgagtgcggaaatcgacgaatgtctgcacaatctaaggcggtgtcagctctacaacattcgtcgg 11196675  T
Q  204 atgtctggggatggtctgcacgtatccgtactgcctcaaaaccctctcgggcaagtgacggtacaccctacggacgccgcacataatccatccagaatac 303  Q
    |||||| |||||  |||| |||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||| || ||||||    
T  11196674 atgtctagggatcatctggacgtatccgtactgcctcaacaccctctcagacaagtgacggtacaccctacgaataccgcacataatccagcctgaatac 11196575  T
Q  304 cagaaaacctcctcgaagtcctggatctctctgtgctc 341  Q
    || ||||||||||| || |||||||| ||| |||||||    
T  11196574 caaaaaacctcctcaaaatcctggatttctttgtgctc 11196537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 114; E-Value: 9e-58
Query Start/End: Original strand, 4 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 47660884 - 47660547
Alignment:
Q  4 ggcctcggaagatctcctggaataggtggcaagatctgagggtgagacaccctagcgtaccacaggacatagccatccgccgcccgccatgtctcctctc 103  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||| |  |||||| ||||||||  ||||||||||| |||||    
T  47660884 ggcctcagaagatctcctggaagaggtggcaaaatctgagggtgagacaccttagtgtaccataacacatagtcatccgccatccgccatgtctgctctc 47660785  T
Q  104 ctgcctgctcaccccgggcgtccgccttaagcgtgtgagtgccgaagtcgacgaacatctgcacaatggaaggcggtgggaggtccctaacatcagtcgg 203  Q
     || | |||||||||   || || |||||||||||||||||| ||||||||||||   |||||||||   ||| ||||  || ||   |||||  ||| |    
T  47660784 gtgtcggctcaccccaatcggccaccttaagcgtgtgagtgcagaagtcgacgaatgcctgcacaatctgaggtggtgtcagctctacaacattcgtccg 47660685  T
Q  204 atgtctggggatggtctgcacgtatccgtactgcctcaaaaccctctcgggcaagtgacggtacaccctacggacgccgcacataatccatccagaatac 303  Q
    |||||| ||||   |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  || ||||| |||||||| || ||||||    
T  47660684 atgtctagggaccctctggacgtatccgtacttcctcaaaaccctctcgggtaagtgacggtacaccctacaaacaccgcagataatccagcctgaatac 47660585  T
Q  304 cagaaaacctcctcgaagtcctggatctctctgtgctc 341  Q
    ||||| | |||||| ||  |||||||||| ||||||||    
T  47660584 cagaatatctcctcaaaaccctggatctccctgtgctc 47660547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 12 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 45828579 - 45828251
Alignment:
Q  12 aagatctcctggaataggtggcaagatctgagggtgagacaccctagcgtaccacaggacatagccatccgccgcccgccatgtctcctctcctgcctgc 111  Q
    |||||||| || || ||||||||| |||||||||||| ||||| ||| |||||| |  |||||||||||| ||   |||||||||| ||||  |||||||    
T  45828579 aagatctcatgaaagaggtggcaaaatctgagggtgaaacaccttagtgtaccataacacatagccatcctccattcgccatgtctgctcttgtgcctgc 45828480  T
Q  112 tcaccccgggcgtccgccttaagcgtgtgagtgccgaagtcgacgaacatctgcacaatggaaggcggtgggaggtccctaacatcagtcggatgtctgg 211  Q
    |||||||   || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||   |||||||||   |||| |||| || ||   |||||| || |||||||| |    
T  45828479 tcaccccaatcggccgccttaagcgtgtgagtgcggaagtcgacgaatg-ctgcacaatctgaggcagtggcagctctacaacatctgtaggatgtctag 45828381  T
Q  212 ggatggtctgcacgtatccgtactgcctcaaaaccctctcgggcaagtgacggtacaccctacggacgccgcacataatccatccagaataccagaaaac 311  Q
    ||| | | || ||||||  ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| | || |||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  45828380 ggacgctatgaacgtatttgtactacctcaaaaccctcttgggcaagtgacggtataccctatgaacaccgcacataatccagcctgaataccagaaaac 45828281  T
Q  312 ctcctcgaagtcctggatctctctgtgctc 341  Q
    |||||| || ||||||||||| ||||||||    
T  45828280 ctcctcaaaatcctggatctccctgtgctc 45828251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 223 - 341
Target Start/End: Original strand, 50341407 - 50341525
Alignment:
Q  223 acgtatccgtactgcctcaaaaccctctcgggcaagtgacggtacaccctacggacgccgcacataatccatccagaataccagaaaacctcctcgaagt 322  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| || |||||||||||||||||||| || |    
T  50341407 acgtatccgtactgcctcaaaaccctctcgggcaagtgacggtacaccctacgaacaccgcacataatccagcctgaataccagaaaacctcctctaaat 50341506  T
Q  323 cctggatctctctgtgctc 341  Q
    |||||||||| ||||||||    
T  50341507 cctggatctccctgtgctc 50341525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 3 - 320
Target Start/End: Original strand, 49855061 - 49855377
Alignment:
Q  3 aggcctcggaagatctcctggaataggtggcaagatctgagggtgagacaccctagcgtaccacaggacatagccatccgccgcccgccatgtctcctct 102  Q
    |||||| |||| |||||| | || | ||||||| |||||||||||||||||    | ||||||  | ||||||||||| |||   |||||||||| ||||    
T  49855061 aggccttggaatatctcccgaaagaagtggcaaaatctgagggtgagacacaacggtgtaccatcgtacatagccatctgccatacgccatgtctgctct 49855160  T
Q  103 cctgcctgctcaccccgggcgtccgccttaagcgtgtgagtgccgaagtcgacgaacatctgcacaatggaaggcggtgggaggtccctaacatcagtcg 202  Q
    ||||| ||||||||||   || |||||||||| ||||||||||  |||||||||||  ||||||||||   || |||||  || ||   |||||| | |     
T  49855161 cctgcatgctcaccccaatcggccgccttaagtgtgtgagtgcgcaagtcgacgaaagtctgcacaatttgagccggtgacagctctacaacatccgaca 49855260  T
Q  203 gatgtctggggatggtctgcacgtatccgtactgcctcaaaaccctctcgggcaagtgacggtacaccctacggacgccgcacataatccatccagaata 302  Q
    ||||||| |||| |||||| ||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||  | |||||||||||||| |  |||||    
T  49855261 gatgtctagggacggtctggacgtatctgtagtgcctcaaa-ccctctcgggcaagtcacggtacaccctacgatcaccgcacataatccaacttgaata 49855359  T
Q  303 ccagaaaacctcctcgaa 320  Q
    |||||| ||| |||||||    
T  49855360 ccagaataccccctcgaa 49855377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 232 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 21143763 - 21143654
Alignment:
Q  232 tactgcctcaaaaccctctcgggcaagtgacggtacaccctacggacgccgcacataatccatccagaataccagaaaacctcctcgaagtcctggatct 331  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||| | | || |||| |||||    
T  21143763 tactgcctcaaaaccctctcgggcaagtgacggtacaccctacgaacaccgcacataatccagccagaataccagaaaaccttcacaaaatcctagatct 21143664  T
Q  332 ctctgtgctc 341  Q
    | ||||||||    
T  21143663 ccctgtgctc 21143654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 4 - 118
Target Start/End: Original strand, 50617938 - 50618052
Alignment:
Q  4 ggcctcggaagatctcctggaataggtggcaagatctgagggtgagacaccctagcgtaccacaggacatagccatccgccgcccgccatgtctcctctc 103  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| | |||||| || |||||| |||| |||  ||||||||||| |||||    
T  50617938 ggcctcggaagatctcctggaagaggttgcaagatctgagggtgagacaccctggtgtaccatagcacatagtcatctgccatccgccatgtctgctctc 50618037  T
Q  104 ctgcctgctcacccc 118  Q
    |||||||||||||||    
T  50618038 ctgcctgctcacccc 50618052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 4 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 21143941 - 21143770
Alignment:
Q  4 ggcctcggaagatctcctggaataggtggcaagatctgagggtgagacaccctagcgtaccacaggacatagccatccgccgcccgccatgtctcctctc 103  Q
    |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| || |||||||||||       |||| ||||| ||||     
T  21143941 ggcctcggaagaactcctggaagaggtggcaagatctgagggtgagacacccaagtgtaccatagcacatagccatc-------cgccttgtctgctctt 21143849  T
Q  104 ctgcctgctcaccccgggcgtccgccttaagcgtgtgagtgccgaagtcgacgaacatctgcacaatggaaggcggtgg 182  Q
    |||| ||||||||||   || || ||||||| |||||||||| |||||||||||||  ||||||||||  |||||||||    
T  21143848 ctgcttgctcaccccaatcggccaccttaagtgtgtgagtgcggaagtcgacgaacgcctgcacaatgtgaggcggtgg 21143770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 8 - 275
Target Start/End: Original strand, 38120208 - 38120475
Alignment:
Q  8 tcggaagatctcctggaataggtggcaagatctgagggtgagacaccctagcgtaccacaggacatagccatccgccgcccgccatgtctcctctcctgc 107  Q
    |||||||||||||| ||| |||||| || |||||||| || |  ||| ||| |||||| |  |||||||| |||  |   |||||||||| |||| || |    
T  38120208 tcggaagatctcctagaagaggtggaaaaatctgaggatgggttaccttagtgtaccataacacatagccctccctcatacgccatgtctgctctgctac 38120307  T
Q  108 ctgctcaccccgggcgtccgccttaagcgtgtgagtgccgaagtcgacgaacatctgcacaatggaaggcggtgggaggtccctaacatcagtcggatgt 207  Q
    |||||||||||   || | |||| |||||||||||||  ||||||||||||   |||||||||   |||| |||  || ||   |||||| ||| |||||    
T  38120308 ctgctcaccccaatcggcggcctgaagcgtgtgagtgtggaagtcgacgaatgcctgcacaatctgaggcagtgtcagctctacaacatccgtcagatgt 38120407  T
Q  208 ctggggatggtctgcacgtatccgtactgcctcaaaaccctctcgggcaagtgacggtacaccctacg 275  Q
     | ||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  38120408 ttagggatcgtctggacgtatccgtactgcctcaacaccctctcaggcaagtgacggtacaccctacg 38120475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 218 - 320
Target Start/End: Original strand, 35256520 - 35256622
Alignment:
Q  218 tctgcacgtatccgtactgcctcaaaaccctctcgggcaagtgacggtacaccctacggacgccgcacataatccatccagaataccagaaaacctcctc 317  Q
    |||| |||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||    
T  35256520 tctgaacgtatccgtactgtctcaaaactctctcaggcaagtgacggtacaccctacgatcaccgcacataatccagcctgaataccagaatacctcctc 35256619  T
Q  318 gaa 320  Q
    |||    
T  35256620 gaa 35256622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 250 - 341
Target Start/End: Original strand, 23273541 - 23273632
Alignment:
Q  250 tcgggcaagtgacggtacaccctacggacgccgcacataatccatccagaataccagaaaacctcctcgaagtcctggatctctctgtgctc 341  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| || ||||| |||||||| || |||||||| ||||||||||| || ||||||||||| ||||||||    
T  23273541 tcgggcaagtgacggtagaccctacgaacaccgcatataatccagccggaataccaaaaaacctcctcaaaatcctggatctccctgtgctc 23273632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 12 - 152
Target Start/End: Original strand, 16269844 - 16269984
Alignment:
Q  12 aagatctcctggaataggtggcaagatctgagggtgagacaccctagcgtaccacaggacatagccatccgccgcccgccatgtctcctctcctgcctgc 111  Q
    |||||||||||||| ||||||||  |||| ||||||||||| | ||| |||||| |  ||||||| ||||  |  ||||||||||| |||||||||| ||    
T  16269844 aagatctcctggaagaggtggcacaatctaagggtgagacatcgtagtgtaccataacacatagcgatccctcatccgccatgtctgctctcctgccggc 16269943  T
Q  112 tcaccccgggcgtccgccttaagcgtgtgagtgccgaagtc 152  Q
    |||||||    |  | |||||||||||||||||| ||||||    
T  16269944 tcaccccaattgggctccttaagcgtgtgagtgcggaagtc 16269984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 14 - 93
Target Start/End: Original strand, 23273427 - 23273506
Alignment:
Q  14 gatctcctggaataggtggcaagatctgagggtgagacaccctagcgtaccacaggacatagccatccgccgcccgccat 93  Q
    |||||||| ||| || |||||| |||||||||||||||||||||| |||||| |  |||||||||||||||  |||||||    
T  23273427 gatctcctagaagagatggcaaaatctgagggtgagacaccctagtgtaccataacacatagccatccgccatccgccat 23273506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0155 (Bit Score: 114; Significance: 9e-58; HSPs: 1)
Name: scaffold0155
Description:

Target: scaffold0155; HSP #1
Raw Score: 114; E-Value: 9e-58
Query Start/End: Original strand, 4 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 12362 - 12025
Alignment:
Q  4 ggcctcggaagatctcctggaataggtggcaagatctgagggtgagacaccctagcgtaccacaggacatagccatccgccgcccgccatgtctcctctc 103  Q
    |||||||||| || |||||||| | ||||||| |||||||||||||||||  | | ||||||    |||||||||||||||   |||||||||| |||||    
T  12362 ggcctcggaatatttcctggaagaagtggcaaaatctgagggtgagacacaatggtgtaccatcctacatagccatccgccatacgccatgtctgctctc 12263  T
Q  104 ctgcctgctcaccccgggcgtccgccttaagcgtgtgagtgccgaagtcgacgaacatctgcacaatggaaggcggtgggaggtccctaacatcagtcgg 203  Q
    |||| ||||||||||   || || |||||||||||||||||| ||||||||||||   || ||||||   ||||||||  || ||   |||||| | |||    
T  12262 ctgcatgctcaccccaatcgacctccttaagcgtgtgagtgcggaagtcgacgaaagactacacaatctgaggcggtgacagctctacaacatccgacgg 12163  T
Q  204 atgtctggggatggtctgcacgtatccgtactgcctcaaaaccctctcgggcaagtgacggtacaccctacggacgccgcacataatccatccagaatac 303  Q
    |||||| ||||||||| | |||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||  | |||||||||||||| || ||||||    
T  12162 atgtctagggatggtcaggacgtattcgtactgcctcaaaaccctctcgagcaaatgacggtacaccctacgatcaccgcacataatccagcctgaatac 12063  T
Q  304 cagaaaacctcctcgaagtcctggatctctctgtgctc 341  Q
    ||||| || ||||| ||  |||||||||| ||||||||    
T  12062 cagaatacgtcctcaaaagcctggatctccctgtgctc 12025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022 (Bit Score: 60; Significance: 2e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0022
Description:

Target: scaffold0022; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 15 - 118
Target Start/End: Complemental strand, 56579 - 56476
Alignment:
Q  15 atctcctggaataggtggcaagatctgagggtgagacaccctagcgtaccacaggacatagccatccgccgcccgccatgtctcctctcctgcctgctca 114  Q
    ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| | |||||| || |||||| |||| |||  ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  56579 atctcctggaagaggttgcaagatctgagggtgagacaccctggtgtaccatagcacatagtcatctgccatccgccatgtctgctctcctgcctgctca 56480  T
Q  115 cccc 118  Q
    ||||    
T  56479 cccc 56476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0117 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0117
Description:

Target: scaffold0117; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 12 - 80
Target Start/End: Original strand, 22343 - 22411
Alignment:
Q  12 aagatctcctggaataggtggcaagatctgagggtgagacaccctagcgtaccacaggacatagccatc 80  Q
    |||||||||| ||| | ||||||| ||| |||| ||||||||||||| |||||| || | |||||||||    
T  22343 aagatctcctagaagaagtggcaaaatcagaggttgagacaccctagtgtaccatagtatatagccatc 22411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University