View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF9640_3 (Length: 612)

Name: NF9640_3
Description: NF9640
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF9640_3
NF9640_3
[»] chr2 (20 HSPs)
chr2 (1-604)||(12539143-12539749)
chr2 (276-596)||(34317480-34317797)
chr2 (7-237)||(28840967-28841219)
chr2 (48-221)||(34318149-34318325)
chr2 (431-601)||(33453190-33453363)
chr2 (445-601)||(19951833-19951992)
chr2 (1-108)||(23866664-23866771)
chr2 (445-604)||(35649659-35649821)
chr2 (450-584)||(22483568-22483705)
chr2 (431-584)||(34526352-34526508)
chr2 (460-532)||(13308745-13308818)
chr2 (431-584)||(22464670-22464826)
chr2 (1-70)||(31708642-31708711)
chr2 (508-584)||(26656360-26656437)
chr2 (494-600)||(7886661-7886767)
chr2 (494-604)||(18425956-18426072)
chr2 (559-604)||(31392927-31392972)
chr2 (543-604)||(13309704-13309765)
chr2 (553-600)||(45261848-45261895)
chr2 (552-585)||(45121356-45121389)
[»] chr5 (18 HSPs)
chr5 (1-604)||(27168802-27169403)
chr5 (174-604)||(8785526-8785958)
chr5 (269-601)||(3055319-3055655)
chr5 (1-237)||(40813408-40813647)
chr5 (303-604)||(11852587-11852891)
chr5 (342-604)||(23244569-23244834)
chr5 (456-604)||(203875-204026)
chr5 (441-604)||(22712898-22713056)
chr5 (435-572)||(1280382-1280522)
chr5 (1-168)||(15731032-15731200)
chr5 (431-584)||(26540674-26540830)
chr5 (486-604)||(2228971-2229091)
chr5 (1-138)||(8785334-8785471)
chr5 (494-575)||(19518970-19519053)
chr5 (450-604)||(22541905-22542062)
chr5 (2-68)||(3055056-3055122)
chr5 (535-585)||(38269409-38269459)
chr5 (552-588)||(28801427-28801463)
[»] scaffold0178 (1 HSPs)
scaffold0178 (1-604)||(17311-17916)
[»] chr1 (28 HSPs)
chr1 (7-604)||(9636675-9637297)
chr1 (7-604)||(48606611-48607217)
chr1 (16-604)||(30559004-30559605)
chr1 (247-604)||(14498714-14499073)
chr1 (1-230)||(40864922-40865154)
chr1 (1-230)||(25017126-25017358)
chr1 (391-604)||(52753819-52754032)
chr1 (416-604)||(40864718-40864909)
chr1 (416-594)||(25017371-25017552)
chr1 (445-601)||(26272931-26273090)
chr1 (274-411)||(30054708-30054845)
chr1 (415-600)||(32379859-32380043)
chr1 (456-604)||(35948977-35949128)
chr1 (431-531)||(17127439-17127540)
chr1 (247-360)||(52754030-52754143)
chr1 (457-604)||(30054847-30054997)
chr1 (1-102)||(52754265-52754366)
chr1 (1-108)||(32380048-32380155)
chr1 (1-104)||(49465611-49465714)
chr1 (503-604)||(17874851-17874954)
chr1 (118-237)||(50682654-50682776)
chr1 (431-577)||(21973814-21973963)
chr1 (552-603)||(11843899-11843950)
chr1 (552-587)||(33489827-33489862)
chr1 (552-587)||(41972267-41972302)
chr1 (535-585)||(28463202-28463252)
chr1 (553-607)||(170445-170500)
chr1 (73-129)||(14498547-14498603)
[»] chr4 (25 HSPs)
chr4 (142-604)||(31944329-31944792)
chr4 (1-297)||(17359023-17359322)
chr4 (1-366)||(24104671-24105032)
chr4 (1-230)||(4325160-4325385)
chr4 (425-604)||(4325406-4325587)
chr4 (431-604)||(12211225-12211401)
chr4 (446-604)||(53693033-53693194)
chr4 (1-108)||(31943781-31943886)
chr4 (431-533)||(27364883-27364986)
chr4 (478-604)||(3074417-3074545)
chr4 (7-108)||(53693280-53693381)
chr4 (431-531)||(55464734-55464835)
chr4 (1-108)||(3074281-3074388)
chr4 (118-230)||(29528246-29528361)
chr4 (494-585)||(8897944-8898037)
chr4 (304-377)||(51379514-51379587)
chr4 (431-532)||(42843707-42843809)
chr4 (348-409)||(24104598-24104659)
chr4 (1-60)||(10984957-10985016)
chr4 (494-585)||(10632662-10632757)
chr4 (515-604)||(1147584-1147675)
chr4 (1-97)||(29528401-29528494)
chr4 (553-604)||(25182878-25182929)
chr4 (552-587)||(48130099-48130134)
chr4 (552-587)||(30110096-30110131)
[»] chr3 (26 HSPs)
chr3 (118-604)||(3856875-3857356)
chr3 (1-598)||(51261557-51262149)
chr3 (1-329)||(55194597-55194947)
chr3 (332-527)||(15667874-15668070)
chr3 (7-197)||(9741167-9741360)
chr3 (431-585)||(43137127-43137283)
chr3 (1-227)||(15667579-15667806)
chr3 (431-603)||(31989029-31989204)
chr3 (431-603)||(24908393-24908568)
chr3 (431-603)||(53710398-53710573)
chr3 (431-601)||(37381871-37382044)
chr3 (9-105)||(22527115-22527211)
chr3 (497-604)||(24988812-24988921)
chr3 (494-604)||(22934798-22934910)
chr3 (1-92)||(24989055-24989146)
chr3 (1-66)||(3858626-3858691)
chr3 (552-603)||(51408609-51408660)
chr3 (1-57)||(3345443-3345499)
chr3 (450-521)||(43585836-43585908)
chr3 (553-604)||(9743393-9743444)
chr3 (271-325)||(9741427-9741480)
chr3 (535-584)||(38282514-38282563)
chr3 (553-587)||(5135410-5135444)
chr3 (312-350)||(9743337-9743374)
chr3 (142-195)||(24988960-24989011)
chr3 (552-584)||(43585933-43585965)
[»] chr6 (14 HSPs)
chr6 (8-603)||(12180525-12181125)
chr6 (189-604)||(11970718-11971135)
chr6 (1-377)||(25340038-25340425)
chr6 (1-230)||(8035797-8036052)
chr6 (1-107)||(30621078-30621184)
chr6 (414-604)||(25340428-25340620)
chr6 (476-588)||(3050909-3051023)
chr6 (431-604)||(24074412-24074588)
chr6 (118-313)||(8035702-8035912)
chr6 (451-604)||(25599172-25599331)
chr6 (484-580)||(30621227-30621324)
chr6 (445-604)||(32441973-32442132)
chr6 (303-375)||(8035479-8035551)
chr6 (477-603)||(1296556-1296684)
[»] chr8 (37 HSPs)
chr8 (247-604)||(13152393-13152753)
chr8 (118-604)||(28846290-28846781)
chr8 (2-586)||(14446404-14446990)
chr8 (247-604)||(27190595-27190947)
chr8 (310-604)||(24333593-24333893)
chr8 (431-604)||(30791457-30791633)
chr8 (394-604)||(9256355-9256565)
chr8 (431-603)||(21958512-21958687)
chr8 (431-585)||(16532649-16532806)
chr8 (247-358)||(9256237-9256348)
chr8 (1-110)||(23448791-23448900)
chr8 (1-108)||(13152872-13152979)
chr8 (494-585)||(32372022-32372115)
chr8 (7-108)||(9256013-9256113)
chr8 (476-604)||(10014434-10014564)
chr8 (453-604)||(10467786-10467927)
chr8 (494-604)||(32342880-32342992)
chr8 (494-604)||(32355367-32355479)
chr8 (147-237)||(30694292-30694383)
chr8 (494-585)||(32359486-32359579)
chr8 (1-108)||(24332804-24332910)
chr8 (496-600)||(34228232-34228338)
chr8 (501-604)||(40146009-40146114)
chr8 (1-86)||(40146258-40146343)
chr8 (1-108)||(30694121-30694228)
chr8 (142-230)||(23448953-23449038)
chr8 (553-604)||(24592336-24592387)
chr8 (39-227)||(27190361-27190563)
chr8 (247-330)||(23449068-23449144)
chr8 (552-604)||(42447049-42447101)
chr8 (180-237)||(24333291-24333348)
chr8 (9-68)||(28841500-28841557)
chr8 (497-535)||(2826373-2826411)
chr8 (552-587)||(3435409-3435444)
chr8 (552-587)||(40470486-40470521)
chr8 (448-520)||(42446935-42447008)
chr8 (7-39)||(42446895-42446927)
[»] chr7 (31 HSPs)
chr7 (247-604)||(9230217-9230577)
chr7 (247-535)||(43727812-43728101)
chr7 (164-604)||(23179885-23180331)
chr7 (17-307)||(25023994-25024288)
chr7 (431-603)||(27387306-27387481)
chr7 (431-604)||(26493713-26493889)
chr7 (415-599)||(8638598-8638786)
chr7 (431-603)||(19399978-19400153)
chr7 (431-603)||(38575289-38575464)
chr7 (431-604)||(45197644-45197819)
chr7 (1-108)||(26786722-26786829)
chr7 (1-103)||(9230038-9230140)
chr7 (303-430)||(25024455-25024582)
chr7 (1-108)||(43727595-43727702)
chr7 (1-231)||(5287151-5287370)
chr7 (313-436)||(24276397-24276521)
chr7 (303-433)||(5287940-5288070)
chr7 (342-471)||(23804633-23804762)
chr7 (1-79)||(24276519-24276597)
chr7 (501-601)||(14088819-14088921)
chr7 (501-601)||(14398837-14398939)
chr7 (501-601)||(25491636-25491738)
chr7 (445-530)||(18375420-18375506)
chr7 (552-600)||(26782317-26782365)
chr7 (503-604)||(25024596-25024699)
chr7 (259-307)||(5287725-5287773)
chr7 (28-108)||(28041647-28041727)
chr7 (553-584)||(9557813-9557844)
chr7 (545-604)||(10224008-10224067)
chr7 (552-587)||(10868467-10868502)
chr7 (99-174)||(28041560-28041637)
[»] scaffold0002 (1 HSPs)
scaffold0002 (344-585)||(435366-435617)
[»] scaffold0019 (1 HSPs)
scaffold0019 (431-604)||(134853-135029)
[»] scaffold0007 (1 HSPs)
scaffold0007 (431-604)||(259918-260094)
[»] scaffold0015 (1 HSPs)
scaffold0015 (431-603)||(214161-214336)
[»] scaffold0726 (3 HSPs)
scaffold0726 (497-604)||(950-1059)
scaffold0726 (1-92)||(725-816)
scaffold0726 (142-195)||(860-911)
[»] scaffold0198 (1 HSPs)
scaffold0198 (465-604)||(1430-1572)
[»] scaffold0168 (1 HSPs)
scaffold0168 (431-584)||(15814-15970)
[»] scaffold0012 (1 HSPs)
scaffold0012 (431-584)||(197105-197261)
[»] scaffold0170 (1 HSPs)
scaffold0170 (515-575)||(9161-9223)


Alignment Details
Target: chr2 (Bit Score: 475; Significance: 0; HSPs: 20)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 475; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 604
Target Start/End: Original strand, 12539143 - 12539749
Alignment:
Q  1 gattattataatcaatttttagaataaaatcttgaagtgacttaactagaataattctccttaactatgaactattataccattcactcaaaccaatcct 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||    
T  12539143 gattattataatcaatttttagaataaaatcttgaagtgacttaactagaataattctccttaactatgaactattatactattcacccaaaccaatact 12539242  T
Q  101 caatactctcctgaattaaaatttatatatactccatttcttttaatttatagtaacaaaatttgaatcactat-cataatagcttattagacaaaatga 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  12539243 caatactctcctgaattaaaatttatatatactccatttcatttaatttatggtaacaaaatttgaatcactattcataatagcttattagacaaaatga 12539342  T
Q  200 cataatatcaagttataacttacaatcacttaatacctnnnnnnncatacaatcatttatacaacaaggcataataaatcagattttatcttctaatttt 299  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||       |||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12539343 cataatatcaagttacaacttacaatcacttcatacctaaaaaaacatataatcacttatacaacacggcataataaatcagattttatcttctaatttt 12539442  T
Q  300 tggatctttaacaatagcgggtgcaccaaagttattaccaacatcaacaaaagttggaagtccaccagttatcaagccttgctaataagctagtaaaaga 399  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  12539443 tggatctttaacaatagcgggtgcaccaaagctattaccaacatcaacaaaagttggaagtccaccagttatcaagccttgccaataagctagtaaaaga 12539542  T
Q  400 atcttataagccagtgagaaataattgttaccaacaagaacaataatgtgtggttcaatgacttgatgatatgttaaccgagcaggagatattcaagtca 499  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  12539543 atcttataagcccgtgagaaagaattgttaccaacaagatcaacaatgcgtggttcaatgacttgatgatatgttaaccgagcataagatattcaagtca 12539642  T
Q  500 tttgatgatgttgatattattcgaacattcaccgc--agaggtcttagaaagatcatttacctcctaattttatttagcacactattgacatgttatgtt 597  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  12539643 cttgatgatgttgatattattcgaacattcaccgcaaagaggtcttggaaagaacatttacctcctaattttatttagcacactattgacacgttatgtt 12539742  T
Q  598 tcatctc 604  Q
    |||||||    
T  12539743 tcatctc 12539749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 178; E-Value: 1e-95
Query Start/End: Original strand, 276 - 596
Target Start/End: Complemental strand, 34317797 - 34317480
Alignment:
Q  276 aatcagattttatcttctaatttttggatctttaacaatagcgggtgcaccaaagttattaccaacatcaacaaaagttggaagtccaccagttatcaag 375  Q
    |||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34317797 aatcagattttaacttctaatttgtggatcttcaacaatagcgggtgaaccaaagctattaccaacatcaacaaaagttggaagtccaccagttatcaag 34317698  T
Q  376 ccttgctaataagctagtaaaagaatcttataagccagtgagaaataattgttaccaacaagaacaataatgtgtggttcaatgacttgatgatatgtta 475  Q
    | |||  ||||||||||||||||||||||||||  |  ||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34317697 ctttgtcaataagctagtaaaagaatcttataaatccatgagaaagaattgttaccaacaagatcaatgatgtgtggttcaatgacttgatgatatgtta 34317598  T
Q  476 -accgagcaggagatattcaagtcatttgatgatgttgatattattcgaacattcaccgc--agaggtcttagaaagatcatttacctcctaattttatt 572  Q
     |||||| | ||||||||||||||| || |||||||||||||| |||      |||||||  |||||||| | ||||| ||||||||||||||||||| |    
T  34317597 caccgagtaagagatattcaagtcacttcatgatgttgatattgttc------tcaccgcaaagaggtctcaaaaagagcatttacctcctaattttaat 34317504  T
Q  573 tagcacactattgacatgttatgt 596  Q
    ||||||||||||| || |||||||    
T  34317503 tagcacactattggcaggttatgt 34317480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 88; E-Value: 5e-42
Query Start/End: Original strand, 7 - 237
Target Start/End: Original strand, 28840967 - 28841219
Alignment:
Q  7 tataatcaatttttagaataaaatcttgaagtgacttaactagaataattctccttaactatgaactattataccattcactcaaacc------------ 94  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||                
T  28840967 tataatcaatttttagaataaattcttgaagtgccttaacaagaataattctccctaactatgaactattataccattcacccaaaccaatattcaatac 28841066  T
Q  95 -------aatcctcaatactctcctgaattaaaatttatatatactccatt--tcttttaatttatagtaacaaaatttgaatcacta-tcataatagct 184  Q
           ||| |||||||||| | | ||| ||||| |||| |||||||| |  || |||||||||| |||| || |||||| |||||| |||||||||||    
T  28841067 ccacataaatactcaatactcacataaatcaaaatctatacatactccactactcatttaatttatggtaataagatttgattcactagtcataatagct 28841166  T
Q  185 tattagacaaaatgacataatatcaagttataacttacaatcacttaatacct 237  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  28841167 tattagacaaaatgacatactatcaagttacaacttacaatcacttcatacct 28841219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 86; E-Value: 8e-41
Query Start/End: Original strand, 48 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 34318325 - 34318149
Alignment:
Q  48 agaataattctccttaactatgaactattataccattcactcaaaccaatcctcaatactctcctgaattaaaatttatatatactccatttct--ttta 145  Q
    ||||||||||||  |||||||| |||||||||| |||||| |||||||||  |||||| ||     |||||||||||||||||| |||||| ||  ||||    
T  34318325 agaataattctctgtaactatggactattatactattcacccaaaccaataatcaatattcaaaaaaattaaaatttatatatagtccattgctcattta 34318226  T
Q  146 atttatagtaacaaaatttgaatcactat-cataatagcttattagacaaaatgacataatatcaagttataactta 221  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  34318225 atttatggtaacaaaatttgaatcactattcataatagcttactagacaaaatgacataatatcaagttacaactta 34318149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 81; E-Value: 8e-38
Query Start/End: Original strand, 431 - 601
Target Start/End: Complemental strand, 33453363 - 33453190
Alignment:
Q  431 caacaagaacaataatgtgtggttcaatgacttgatgatatgttaac--cgagcaggagatattcaagtcatttgatgatgttgatattattcgaacatt 528  Q
    |||||||| |||  ||||||||| ||||||||| || ||||||| ||  ||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  33453363 caacaagatcaacgatgtgtggt-caatgacttcatcatatgtttacaccgagcgggagatatttaagtcacttgatgatgttgatattattcgaacatt 33453265  T
Q  529 caccgc--agaggtcttagaaagatcatttacctcctaattttatttagcacactattgacatgttatgtttcat 601  Q
    ||||||  |||||| | ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||| ||||||    
T  33453264 caccgcaaagaggtatcagaaagagcatttacctcctaattttatttagcagactattggcaagttatatttcat 33453190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 445 - 601
Target Start/End: Complemental strand, 19951992 - 19951833
Alignment:
Q  445 atgtgtggttcaatgacttgatgatatgtta-accgagcaggagatattcaagtcatttgatgatgttgatattattcgaacattcaccgc--agaggtc 541  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||||| | || ||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  19951992 atgtatggttcaatgacttgacgatatgtcacactgagcgagagatattcaagtcacttgatgatgttgatattattcgaacattcaccgcaaagaggtc 19951893  T
Q  542 ttagaaagatcatttacctcctaattttatttagcacactattgacatgttatgtttcat 601  Q
    |   ||||  ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  19951892 tcgaaaagggcatttaccttctaatttaatttagcacactattgacaggttatatttcat 19951833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 1 - 108
Target Start/End: Original strand, 23866664 - 23866771
Alignment:
Q  1 gattattataatcaatttttagaataaaatcttgaagtgacttaactagaataattctccttaactatgaactattataccattcactcaaaccaatcct 100  Q
    ||||| || ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||    
T  23866664 gattactaaaatcaatttttagaataaattgttgaagtgacttaactagaataattctccctgactataaactattataccattcacccaaaccaatact 23866763  T
Q  101 caatactc 108  Q
    ||||||||    
T  23866764 caatactc 23866771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 445 - 604
Target Start/End: Complemental strand, 35649821 - 35649659
Alignment:
Q  445 atgtgtggttcaatgacttgatgatatgtta-accgagcaggagatattcaagtcatttgatgatgttgatattattcgaacattcaccgc--agaggtc 541  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||  |||| ||    
T  35649821 atgtgttgttcaatgacttgatgatatgttacaccgagcgggagatattcaagtcatttgatgatgttgatattattgaaacattcactgcaaagagatc 35649722  T
Q  542 ttagaaagatcatttacctcctaattttatttagcacactattgacatgttatgtttcatctc 604  Q
    |   ||||  ||||||| |||||||||||||||| ||| | |||| | ||||| |||||||||    
T  35649721 tcgaaaaggacatttacttcctaattttatttagtacatttttgataggttatatttcatctc 35649659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 450 - 584
Target Start/End: Original strand, 22483568 - 22483705
Alignment:
Q  450 tggttcaatgacttgatgatatgtta-accgagcaggagatattcaagtcatttgatgatgttgatattattcgaacattcaccgc--agaggtcttaga 546  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||  |||  |||  ||    
T  22483568 tggttaaatgacttgatgatatgttacaccgagcgggagatattcaaatcacttgatgacattgatattattcgaacattcaccgcaaagaaatctcgga 22483667  T
Q  547 aagatcatttacctcctaattttatttagcacactatt 584  Q
    |||  |||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  22483668 aagggcatttacctcctaattttatctagcacgctatt 22483705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 431 - 584
Target Start/End: Original strand, 34526352 - 34526508
Alignment:
Q  431 caacaagaacaataatgtgtggttcaatgacttgatgatatgtta-accgagcaggagatattcaagtcatttgatgatgttgatattattcgaacattc 529  Q
    ||||||||  || |||| |||||| ||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||| |||||||  ||||||||||||||||||||    
T  34526352 caacaagattaacaatgagtggttaaatgatttgatgatatgttacaccgagcgggagatattcaaatcacttgatgacattgatattattcgaacattc 34526451  T
Q  530 accgc--agaggtcttagaaagatcatttacctcctaattttatttagcacactatt 584  Q
    |||||  |||  |||  |||||  |||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  34526452 accgcaaagaaatctcggaaagggcatttacctcctaattttatctagcacgctatt 34526508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 460 - 532
Target Start/End: Original strand, 13308745 - 13308818
Alignment:
Q  460 acttgatgatatgtta-accgagcaggagatattcaagtcatttgatgatgttgatattattcgaacattcacc 532  Q
    |||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13308745 acttgatgatatgttacaccgagcgagagatattcaagtcacttgatgatgttgatattattcgaacattcacc 13308818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 431 - 584
Target Start/End: Original strand, 22464670 - 22464826
Alignment:
Q  431 caacaagaacaataatgtgtggttcaatgacttgatgatatgtta-accgagcaggagatattcaagtcatttgatgatgttgatattattcgaacattc 529  Q
    ||||||||  || |||| |||||| ||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||| |||||||  |||||||||||| |||||||    
T  22464670 caacaagattaacaatgagtggttaaatgatttgatgatatgttacaccgagcgggagatattcaaatcacttgatgacattgatattattcaaacattc 22464769  T
Q  530 accgc--agaggtcttagaaagatcatttacctcctaattttatttagcacactatt 584  Q
    |||||  |||  |||   ||||  |||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  22464770 accgcaaagaaatctcgaaaagggcatttacctcctaattttatctagcacgctatt 22464826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 70
Target Start/End: Complemental strand, 31708711 - 31708642
Alignment:
Q  1 gattattataatcaatttttagaataaaatcttgaagtgacttaactagaataattctccttaactatga 70  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  31708711 gattactataataaatttttagaataaattcttgaagtgacttaactagaataattctacctaactatga 31708642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 508 - 584
Target Start/End: Complemental strand, 26656437 - 26656360
Alignment:
Q  508 tgttgatattattcgaacattcaccgca--gaggtcttagaaagatcatttacctcctaattttatttagcacactatt 584  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  26656437 tgttgatattattcgaacattcaccgcaaagagatcttagaagg-tcatttacctcctaattttatttcgcacactatt 26656360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 494 - 600
Target Start/End: Complemental strand, 7886767 - 7886661
Alignment:
Q  494 aagtcatttgatgatgttgatattattcgaacattcaccgcagag--gtcttagaaagatcatttacctcctaattttatttagcacactattgacatgt 591  Q
    |||||||  ||||||||||||  ||||| ||||||||||||| ||  || | |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  7886767 aagtcatccgatgatgttgat--tattcaaacattcaccgcaaagaagtttcagaaaggtcacttacctcctaattttatttagcacactattgatatgt 7886670  T
Q  592 tatgtttca 600  Q
    ||| |||||    
T  7886669 tatatttca 7886661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 494 - 604
Target Start/End: Complemental strand, 18426072 - 18425956
Alignment:
Q  494 aagtcatttgatgatgttgatattattcgaacattcaccg--cagaggtcttagaaagatcatttacctcctaatttt----atttagcacactattgac 587  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||   |||||||| | |||  | |||||||||||||||||    ||||| ||||||||||||    
T  18426072 aagtcacttgataatgttgatattattcgaacattcaccgtaaagaggtctcaaaaatgttatttacctcctaattttattaatttatcacactattgac 18425973  T
Q  588 atgttatgtttcatctc 604  Q
    | ||||| |||||||||    
T  18425972 aagttatatttcatctc 18425956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 559 - 604
Target Start/End: Original strand, 31392927 - 31392972
Alignment:
Q  559 ctcctaattttatttagcacactattgacatgttatgtttcatctc 604  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  31392927 ctcctaattttatttagcacactattgacaggttatgttacatctc 31392972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 543 - 604
Target Start/End: Original strand, 13309704 - 13309765
Alignment:
Q  543 tagaaagatcatttacctcctaattttatttagcacactattgacatgttatgtttcatctc 604  Q
    |||||||  |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||  |||| |||||||||    
T  13309704 tagaaagggcatttacctcataatattatttagcacactattgacagattatatttcatctc 13309765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 553 - 600
Target Start/End: Complemental strand, 45261895 - 45261848
Alignment:
Q  553 atttacctcctaattttatttagcacactattgacatgttatgtttca 600  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||    
T  45261895 atttaactcctaattttatttagcacactattagaatgttatgtttca 45261848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 552 - 585
Target Start/End: Original strand, 45121356 - 45121389
Alignment:
Q  552 catttacctcctaattttatttagcacactattg 585  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  45121356 catttacctcctaattttatttagaacactattg 45121389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 290; Significance: 1e-162; HSPs: 18)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 290; E-Value: 1e-162
Query Start/End: Original strand, 1 - 604
Target Start/End: Complemental strand, 27169403 - 27168802
Alignment:
Q  1 gattattataatcaatttttagaataaaatcttgaagtgacttaactagaataattctccttaactatgaactattataccattcactcaaaccaatcct 100  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| | | | |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||    
T  27169403 gattactataatcaatttttaaaataaattcttgaagtgacttaactagaataattttacctgactatgaactattataccattcacccaaaccaatact 27169304  T
Q  101 caatactctcctgaattaaaatttatatatactccatttct--tttaatttatagtaacaaaatttgaatcactat-cataatagcttattagacaaaat 197  Q
    |||||||| | | ||| |||||  |||||||||   || ||  |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  27169303 caatactcacataaatcaaaatcaatatatactatgttgctcatttaatttatggtaacaaaatttgaatcactattcataatagcttattagacaaaat 27169204  T
Q  198 gacataatatcaagttataacttacaatcacttaatacctnnnnnnncatacaatcatttatacaacaaggcataataaatcagattttatcttctaatt 297  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||         |||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  27169203 gacataatatcaagttacaacttacaatcacttcataccttaaaaagtttacaatcacttctacaacagggcataataaatcagattttaacttctaatt 27169104  T
Q  298 tttggatctttaacaatagcgggtgcaccaaagttattaccaacatcaacaaaagttggaagtccaccagttatcaagccttgctaataagctagtaaaa 397  Q
    | || ||||| || ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||    
T  27169103 tgtgaatcttcaataatagcgggtgtaccaaagctattaccaacatcaacaaaagatggaagtccaccagttatcaagtcttgtcaataagctagtaaaa 27169004  T
Q  398 gaatcttataagccagtgagaaataattgttaccaacaagaacaataatgtgtggttcaatgacttgatgatatgtta-accgagcaggagatattcaag 496  Q
     |||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||| |||  ||||||||||||        || |||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  27169003 taatcttataagcccatgagaaataattgttacaaacaagatcaacgatgtgtggttca--------ataatatgttacaccgagcgggagatattcaag 27168912  T
Q  497 tcatttgatgatgttgatattattcgaacattcaccgca--gaggtcttagaaagatcatttacctcctaattttatttagcacactattgacatgttat 594  Q
    ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||| | ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||    |||||    
T  27168911 tcacttgataatgttgatattattcgaacattcaccgaaatgaggtctcataaagggcatttacctcctaattttatttagcacactattggatggttat 27168812  T
Q  595 gtttcatctc 604  Q
    ||||||||||    
T  27168811 gtttcatctc 27168802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 174 - 604
Target Start/End: Original strand, 8785526 - 8785958
Alignment:
Q  174 tcataatagcttattagacaaaatgacataatatcaagttataacttacaatcacttaatacctnnnnnnncatacaatcatttatacaacaaggcataa 273  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||| | |||| |       | |||||||| || |||| || | |||||    
T  8785526 tcataatagcttattagacaaaatgacataatatcaaattacaccttacaatcaccttatacttaaaaaaacttacaatcacttctacagcatgtcataa 8785625  T
Q  274 taaatcagattttatcttctaatttttggatctttaacaatagcgggtgcaccaaagttattaccaacatcaacaaaagttggaagtccaccagttatca 373  Q
    |||||||||||| | |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  8785626 taaatcagatttaaacttctaatttgtggatcttcaacaatagcgggtgcaccaaagctattaccaacatcaacaaaagttggaagtccactagttatca 8785725  T
Q  374 agccttgctaataagctagtaaaagaatcttataagccagtgagaaataattgttaccaacaagaacaataatgtgtggttcaatgacttgatgatatgt 473  Q
    | ||  | |||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||| |||| |    
T  8785726 aaccccgttaataagctagtaaaataatcttataag-caatgagaaagaattgttaccaacaagatcaacgatgtgtggttcaatgacttgataatatat 8785824  T
Q  474 ta-accgagcaggagatattcaagtcatttgatgatgttgatattattcgaacattcaccgc--agaggtcttagaaagatcatttacctcctaatttta 570  Q
    || | | ||| |||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||  | ||||||   ||||     ||||||||||||||||    
T  8785825 tacatcaagcgggagatattcaattcagttgatgatattgatattattcgaacattcaccgcaaataggtctcgaaaagggttcttacctcctaatttta 8785924  T
Q  571 tttagcacactattgacatgttatgtttcatctc 604  Q
    ||||||| | |||||||| |||||||||||||||    
T  8785925 tttagcatattattgacaggttatgtttcatctc 8785958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 178; E-Value: 1e-95
Query Start/End: Original strand, 269 - 601
Target Start/End: Original strand, 3055319 - 3055655
Alignment:
Q  269 cataataaatcagattttatcttctaatttttggatctttaacaatagcgggtgcaccaaagttattaccaacatcaacaaaa-gttggaagtccaccag 367  Q
    |||||| ||| |||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||  | | |||||  |||||    
T  3055319 cataattaatgagattttaacttctaatttatggatcttcaacaatagcgggtgcaccaaagctattatcaacatcaacaaattggtagaagtaaaccag 3055418  T
Q  368 ttatcaagccttgctaataagctagtaaaagaatcttataagccagtgagaaataattgttaccaacaagaacaataatgtgtggttcaatgacttgatg 467  Q
    |||||||||| ||  ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| || |||  |||||||||||||||||||||||    
T  3055419 ttatcaagccatgtcaataagctagtaaaataatcttataagcccgtgagaaagaattgttaccaacatgatcaacgatgtgtggttcaatgacttgatg 3055518  T
Q  468 atatgtta-accgagcaggagatattcaagtcatttgatgatgttgatattattcgaacattcaccgca--gaggtcttagaaagatcatttacctccta 564  Q
    |||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||  ||||||| | |||   |||||||||||||    
T  3055519 atatgttacatcgagcgggagatattcaagtcatttgatgatgttgatattattcgaacattccgcgcaatgaggtctcataaatggcatttacctccta 3055618  T
Q  565 attttatttagcacactattgacatgttatgtttcat 601  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  3055619 attttatttagcacactattgacaatttatgtttcat 3055655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 133; E-Value: 7e-69
Query Start/End: Original strand, 1 - 237
Target Start/End: Original strand, 40813408 - 40813647
Alignment:
Q  1 gattattataatcaatttttagaataaaatcttgaagtgacttaactagaataattctccttaactatgaactattataccattcactcaaaccaatcct 100  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||| |||| ||    
T  40813408 gattactataatcaatttttagaataaattcttgaagtgacttaattagaataattctccgtaactatgaactattataccaatcacccaaatcaatact 40813507  T
Q  101 caatactctcctgaattaaaatttatatatactccatt--tcttttaatttatagtaacaaaatttgaatcacta-tcataatagcttattagacaaaat 197  Q
    |||||||| | | ||| |||||||| ||||||||||||  || |||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||    
T  40813508 caatactcgcataaatcaaaatttacatatactccattactcatttaatttatggtaataaaatttgaatcactattcataatagtttatcagacaaaat 40813607  T
Q  198 gacataatatcaagttataacttacaatcacttaatacct 237  Q
    |||||||||||| |||| ||||| ||||||||| ||||||    
T  40813608 gacataatatcaggttacaacttgcaatcacttcatacct 40813647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 130; E-Value: 5e-67
Query Start/End: Original strand, 303 - 604
Target Start/End: Original strand, 11852587 - 11852891
Alignment:
Q  303 atctttaacaatagcgggtgcaccaaagttattaccaacatcaacaaaagttggaagtccaccagttatcaagccttgctaataagctagtaaaagaatc 402  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||||  |||||| |||||||||||||||   || |||| ||||| ||||| | ||  ||||||||||||||| ||||    
T  11852587 atcttcaacaatagtgggtgcaccaaaactattactaacatcaacaaaagtgaaaaatccatcagttgtcaagtcctgtcaataagctagtaaaataatc 11852686  T
Q  403 ttataagccagtgagaaataattgttaccaacaagaacaataatgtgtggttcaatgacttgatgatatgtta-accgagcaggagatattcaagtcatt 501  Q
    ||||||| | |||||||| |||| ||||||||||||  ||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||| || ||| |    
T  11852687 ttataagtccgtgagaaagaattattaccaacaagatgaaagatgtgtggttcaatgacttgatgatatgttacaccgaacgggagatatttaactcact 11852786  T
Q  502 tgatgatgttgatattattcgaacattcaccgc--agaggtcttagaaagatcatttacctcctaattttatttagcacactattgacatgttatgtttc 599  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | | |  |||||||| |||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||    
T  11852787 tgatgatgttgatattattcgaacatttaacacaaagaggtctaagaaagagtatttaccttctaattttatttagcacactattgacaaattatctttc 11852886  T
Q  600 atctc 604  Q
    |||||    
T  11852887 atctc 11852891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 115; E-Value: 4e-58
Query Start/End: Original strand, 342 - 604
Target Start/End: Complemental strand, 23244834 - 23244569
Alignment:
Q  342 atcaacaaaagttggaagtccaccagttatcaagccttgctaataagctagtaaaagaatcttataagccagtgagaaataattgttaccaacaagaaca 441  Q
    ||||||||||||||||| ||||   ||| ||||||| ||  ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||    
T  23244834 atcaacaaaagttggaattccattcgttgtcaagccctgtcaataagctagtaaaataatcttataagccaatgagaaagaattgttaccaacaagatca 23244735  T
Q  442 ataatgtgtggttcaatgacttgatgatatgtta-accgagcaggagatattcaagtcatttgatgatgttgatattattcgaacattcaccgca--gag 538  Q
    |  |||||| ||||||||||||||||||||||||   ||||| | || ||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||  |||    
T  23244734 acgatgtgtcgttcaatgacttgatgatatgttatgtcgagcggaagttattctagtcacttgatgatgttgatattatttgaacattaaccgcaacgag 23244635  T
Q  539 gtcttagaaagatcatttacctcctaattttatttagcacactattgacatgttatgtttcatctc 604  Q
    |||| ||||||  ||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||  |||| |||||||||    
T  23244634 gtctcagaaagggcatgtacctgctaattttatttaccacactattgacagattatatttcatctc 23244569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 93; E-Value: 6e-45
Query Start/End: Original strand, 456 - 604
Target Start/End: Original strand, 203875 - 204026
Alignment:
Q  456 aatgacttgatgatatgtta-accgagcaggagatattcaagtcatttgatgatgttgatattattcgaacattcaccg--cagaggtcttagaaagatc 552  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||  |||||  |    
T  203875 aatgacttgatgatatgttacaccgagcgggagatattcaagtcacttgatgatgttgatattattcgaacattcaccggaaagaggtctcggaaaggac 203974  T
Q  553 atttacctcctaattttatttagcacactattgacatgttatgtttcatctc 604  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||    
T  203975 atttacctcctaattttatttagcacactattgacaaattatatttcatctc 204026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 441 - 604
Target Start/End: Complemental strand, 22713056 - 22712898
Alignment:
Q  441 aataatgtgtggttcaatgacttgatgatatgttaaccgagcaggagatattcaagtcatttgatgatgttgatattattcgaacattcaccgca--gag 538  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||       ||| || |||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||    
T  22713056 aataatgcgtggttcaatgacttgatgatatg-------agcgggggatattcatgtcacttgatgatgttgatattattcaaacattcaccgcaaagag 22712964  T
Q  539 gtcttagaaagatcatttacctcctaattttatttagcacactattgacatgttatgtttcatctc 604  Q
    |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  22712963 gtctcagaaagagcatttacctcctaattttatttagcacactattgtcatgttatgttacatctc 22712898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 435 - 572
Target Start/End: Original strand, 1280382 - 1280522
Alignment:
Q  435 aagaacaataatgtgtggttcaatgacttgatgatatgtta-accgagcaggagatattcaagtcatttgatgatgttgatattattcgaacattcaccg 533  Q
    |||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1280382 aagatcaacaatgtgtggttcaatgatttgatgatatgttacaccgagcgggagatattcaagtcacttgatgatgttgatattattcgaacattcaccg 1280481  T
Q  534 c--agaggtcttagaaagatcatttacctcctaattttatt 572  Q
    |  ||||||||  ||||   |||||||||||||||||||||    
T  1280482 caaagaggtctcggaaaaggcatttacctcctaattttatt 1280522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 1 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 15731200 - 15731032
Alignment:
Q  1 gattattataatcaatttttagaataaaatcttgaagtgacttaactagaataattctccttaactatgaactattataccattcactcaaaccaatcct 100  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||    
T  15731200 gattactataatcaattttttgaataaattcttaaagtgacttaacttgaataattctcct-aactatgaactattatactattcacccaaaccaatact 15731102  T
Q  101 caatactctcctgaattaaaatttatatatactccatt--tcttttaatttatagtaacaaaatttgaat 168  Q
     ||||||||| | ||| ||||| |||||||||| ||||  || |||| ||||| |||| |||||||||||    
T  15731101 taatactctcataaatcaaaatctatatatacttcattgctcatttactttatggtaataaaatttgaat 15731032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 66; E-Value: 7e-29
Query Start/End: Original strand, 431 - 584
Target Start/End: Complemental strand, 26540830 - 26540674
Alignment:
Q  431 caacaagaacaataatgtgtggttcaatgacttgatgatatgtta-accgagcaggagatattcaagtcatttgatgatgttgatattattcgaacattc 529  Q
    ||||||||  || |||| |||||| ||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||| |||||||  ||||||||||||||||||||    
T  26540830 caacaagattaacaatgagtggttaaatgatttgatgatatgttacaccgagcgggagatattcaaatcacttgatgacattgatattattcgaacattc 26540731  T
Q  530 accgc--agaggtcttagaaagatcatttacctcctaattttatttagcacactatt 584  Q
    |||||  |||  ||| ||||||  |||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  26540730 accgcaaagaaatctcagaaagggcatttacctcctaattttatctagcacgctatt 26540674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 486 - 604
Target Start/End: Original strand, 2228971 - 2229091
Alignment:
Q  486 agatattcaagtcatttgatgatgttgatattattcgaacattcaccgc--agaggtcttagaaagatcatttacctcctaattttatttagcacactat 583  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||  ||||||  ||| |||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  2228971 agatatttaagtcatttgatgatgttgatattatttgaacattcatcgcaaagaggttctaggaagggcatttacctcctaattttatttagcacgctat 2229070  T
Q  584 tgacatgttatgtttcatctc 604  Q
    ||  | ||||| |||||||||    
T  2229071 tggtaggttatatttcatctc 2229091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 138
Target Start/End: Original strand, 8785334 - 8785471
Alignment:
Q  1 gattattataatcaatttttagaataaaatcttgaagtgacttaactagaataattctccttaactatgaactattataccattcactcaaaccaatcct 100  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||||| |   |||||||||||||||||| |||||||  ||||||||  |    
T  8785334 gattactataatcaatttttagaatacattcttgaagtgacttaactaaaataattttttctaactatgaactattatatcattcacaaaaaccaatatt 8785433  T
Q  101 caatactctcctgaattaaaatttatatatactccatt 138  Q
    |||||||| |   ||| ||||| |||||||||| ||||    
T  8785434 caatactcacagaaatcaaaatctatatatacttcatt 8785471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 494 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 19519053 - 19518970
Alignment:
Q  494 aagtcatttgatgatgttgatattattcgaacattcaccgc--agaggtcttagaaagatcatttacctcctaattttatttag 575  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| || ||||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  19519053 aagtcacttgatgatgttgatattattcgaacattcaccgcaaagaggtattggaaaggtcatttaccacctaattttatttag 19518970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 450 - 604
Target Start/End: Original strand, 22541905 - 22542062
Alignment:
Q  450 tggttcaatgacttgatgatatgtta-accgagcaggagatattcaagtcatttgatgatgttgatattattcgaacattcac-cg-cagaggtcttaga 546  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| | ||| | | |||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||| | ||  |||||||   ||    
T  22541905 tggttgaatgacttgatgatatgttacatcgaacggaagatattcaagtcactcgatgatgttaatattattcgaacattccctcgaaagaggtcgcgga 22542004  T
Q  547 aagatcatttacctcctaattttatttagcacactattgacatgttatgtttcatctc 604  Q
    |||  |||||||||| |||||||||||||||| |||||| || ||||| |||| ||||    
T  22542005 aagggcatttacctcataattttatttagcacgctattgtcaggttatatttcttctc 22542062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 2 - 68
Target Start/End: Original strand, 3055056 - 3055122
Alignment:
Q  2 attattataatcaatttttagaataaaatcttgaagtgacttaactagaataattctccttaactat 68  Q
    |||| ||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  3055056 attactataatcaacttttagaataaattgttgaagtgacttaactagaataattctccctaactat 3055122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 535 - 585
Target Start/End: Complemental strand, 38269459 - 38269409
Alignment:
Q  535 agaggtcttagaaagatcatttacctcctaattttatttagcacactattg 585  Q
    |||||| |||||||   |||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  38269459 agaggtgttagaaaagacatttacctcctaattttatttggcacactattg 38269409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 552 - 588
Target Start/End: Original strand, 28801427 - 28801463
Alignment:
Q  552 catttacctcctaattttatttagcacactattgaca 588  Q
    |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  28801427 catttaactcctaattttatttagctcactattgaca 28801463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0178 (Bit Score: 276; Significance: 1e-154; HSPs: 1)
Name: scaffold0178
Description:

Target: scaffold0178; HSP #1
Raw Score: 276; E-Value: 1e-154
Query Start/End: Original strand, 1 - 604
Target Start/End: Original strand, 17311 - 17916
Alignment:
Q  1 gattattataatcaatttttagaataaaatcttgaagtgacttaactagaataattctccttaactatgaactattataccattcactcaaaccaatcct 100  Q
    ||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||| |||| ||| |||| || ||| ||||| ||| ||    
T  17311 gattactataatcaatgtttagaataaattcttgaagtgacttaactagaattattctgcctaactttgaagtat-atactatacacccaaactaatact 17409  T
Q  101 caatactctcctgaattaaaatttatatatactccatttctt-ttaatttatagtaacaaaatttgaatcactatcataatagcttattagacaaaatga 199  Q
    ||| |||| |   ||| ||||||||||||||||||||| ||  ||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  17410 caacactcacaaaaatcaaaatttatatatactccattgctcgttaatttatggtaacaaaatttgaatcact-tcctaatagcttattagacaaaatga 17508  T
Q  200 cataatatcaagttataacttacaatcacttaatacctnnnnnnncatacaatcatttatacaacaaggcataataaatcagattttatcttctaatttt 299  Q
    ||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||       | |||||||| || ||||||| ||| ||||||||| ||||||| ||||||||||     
T  17509 cataatatcaagttacaacttacactcacttcatacctaaaaaaacttacaatcacttctacaacatggcgtaataaatccgattttagcttctaatttg 17608  T
Q  300 tggatctttaacaatagcgggtgcaccaaagttattaccaacatcaacaaaagttggaagtccaccagttatcaagccttgctaataagctagtaaaaga 399  Q
    |||||||| ||||| || ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||  ||||||||||||||| |    
T  17609 tggatcttcaacaaaagtgggtgcaccaaaactattaccaacatcaacaaaagttggaagtccaccagttatcaatctctgtcaataagctagtaaaata 17708  T
Q  400 atcttataagccagtgagaaataattgttaccaacaagaacaataatgtgtggttcaatgacttgatgatatgtta-accgagcaggagatattcaagtc 498  Q
    |||||||||||   | |||||||||||||| |||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||| ||||||||| |||||    
T  17709 atcttataagctcattagaaataattgttatcaacaagatcaacgatgtgtggttcaatgacttgatgatacgttacatcgagcgggagatatttaagtc 17808  T
Q  499 atttgatgatgttgatattattcgaacattcaccgc--agaggtcttagaaagatcatttacctcctaattttatttagcacactattgacatgttatgt 596  Q
    | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||  |||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||    
T  17809 acttgctgatgttgatattattcgaacattcaccgcaaagaggtctccgaaaggacatttaactcctaattttatttagcacactattgacagattacgt 17908  T
Q  597 ttcatctc 604  Q
    ||||||||    
T  17909 ttcatctc 17916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 267; Significance: 1e-149; HSPs: 28)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 267; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 7 - 604
Target Start/End: Original strand, 9636675 - 9637297
Alignment:
Q  7 tataatcaatttttagaataaaatcttgaagtgacttaactagaataattctccttaactatgaactattataccattcactcaaaccaa---------- 96  Q
    ||||||||||||||| |||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||  |||||||              
T  9636675 tataatcaatttttaaaataaatttttggagtgacttaactagaataattctccttaaccatgaactatcgtaccattcacctaaaccaataatcaatac 9636774  T
Q  97 ---------tcctcaatactctcctgaattaaaatttatatatactccatttct--tttaatttatagtaacaaaatttgaatcactat-cataatagct 184  Q
             | ||||||| || |   ||| ||||| |||||||||| |||| ||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  9636775 tcacaaaaatactcaataatcacagaaatcaaaatctatatatactgcattgctcatttaatttatagtaataaaatttgaatcactattcataatagct 9636874  T
Q  185 tattagacaaaatgacataatatcaagttataacttacaatcacttaatacctnnnnnnn-catacaatcatttatacaacaaggcataataaatcagat 283  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||        | |||||||| || |||||||||||||| ||||||||||    
T  9636875 tattagacaaaatgacataatatcaagttacaacttacactcacttcatacctaaaaaaaacttacaatcacttctacaacaaggcatagtaaatcagat 9636974  T
Q  284 tttatcttctaatttttggatctttaacaatagcgggtgcaccaaagttattaccaacatcaacaaaagttggaagtccaccagttatcaagccttgcta 383  Q
    |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||| ||| |    
T  9636975 tttaacttctaatttttggatcttcaacaatagcgggtgcaccaaagccattactaacatcaacaaaagttgaaagtccaccggttataaagccctgcca 9637074  T
Q  384 ataagctagtaaaagaatcttataagccagtgagaaataattgttaccaacaagaacaataatgtgtggttcaatgacttgatgatatgtta-accgagc 482  Q
    |||||||||| ||| |||||||||||   |||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  9637075 ataagctagt-aaataatcttataagttcgtgagaaataattgttaccaacaagatcaatgatgcgtggttcaatgacttgatgatatgttacaccgagc 9637173  T
Q  483 aggagatattcaagtcatttgatgatgttgatattattcgaacattcaccgc--agaggtcttagaaagatcatttacctcctaattttatttagcacac 580  Q
     || ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||  |||||  ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  9637174 gggtgatattcaagtcacttgatgatgttgatattatttgaacattcaccgcaaagaggtctcggaaagggcatttacatcctaattttatttagcacac 9637273  T
Q  581 tattgacatgttatgtttcatctc 604  Q
    |||||| | |||||||||||||||    
T  9637274 tattgataggttatgtttcatctc 9637297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 262; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 7 - 604
Target Start/End: Complemental strand, 48607217 - 48606611
Alignment:
Q  7 tataatcaatttttagaataaaatcttgaagtgacttaactagaataattctccttaactatgaactattataccattcactcaaaccaatcctcaatac 106  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||  |||| ||| ||||||||    
T  48607217 tataatcaatttttagaatatattcttgaagtgacttaactagaataattctccccaactatgaactgttataccattcaccaaaactaatactcaatac 48607118  T
Q  107 tctcctgaattaaaatttatatatactccatttct--tttaatttatagtaacaaaatttgaatcactat-cataatagcttattagacaaaatgacata 203  Q
    ||     ||| ||||| |||||||||| |||| ||  |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||| |||||    
T  48607117 tcagagaaatcaaaatctatatatactacattgctcatttaatttatggtaacaaaatttgaatcactattcataatagcttattggagaaaataacata 48607018  T
Q  204 atatcaagttataacttacaatcacttaatacctnnnnnnnca---tacaatcatttatacaacaaggcataataaatcagattttatcttctaattttt 300  Q
    ||||||||||| |||||| |||||||| ||||||        |   |||||||  || ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| |    
T  48607017 atatcaagttacaacttaaaatcactttatacctaaaaaaaaaacctacaatcccttctacaacatggcataataaatcagattttaacttctaatttgt 48606918  T
Q  301 ggatctttaacaatagcgggtgcaccaaagttattaccaacatcaacaaaagttggaagtccaccagttatcaagccttgctaataagctagtaaaagaa 400  Q
    ||||||| |||||||||  ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||  ||||  ||||||||| ||    
T  48606917 ggatcttcaacaatagcaagtgcaccaaagctattaccaaaatcaacaaaagttggaagtccactagttatcaaaccctgtcaatattctagtaaaataa 48606818  T
Q  401 tcttataagccagtgagaaataattgttaccaacaagaacaataatgtgtggttcaatgacttgatgatatgtta-accgagcaggagatattcaagtca 499  Q
    ||||||| |   ||| |||| ||||| ||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |    
T  48606817 tcttatatgttcgtgggaaagaattgctaccaacaagatcaacgatgtgtggttcaatgacttgatgatatgttacaccgagcgggagatattcaagtaa 48606718  T
Q  500 tttgatgatgttgatattattcgaacattcaccgc--agaggtcttagaaagatcatttacctcctaattttatttagcacactattgacatgttatgtt 597  Q
     ||||| ||||||||||||||| |||| |||||||  ||||||||| |||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||  |||||||    
T  48606717 cttgataatgttgatattattcaaacactcaccgcaaagaggtcttcgaaagggcatttacctcataattttatttagcacactattggcagattatgtt 48606618  T
Q  598 tcatctc 604  Q
    |||||||    
T  48606617 tcatctc 48606611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 16 - 604
Target Start/End: Complemental strand, 30559605 - 30559004
Alignment:
Q  16 tttttagaataaaatcttgaagtgacttaactagaataattctccttaactatgaactattataccattcactcaaaccaatcctcaatactctcctgaa 115  Q
    |||||||||| || ||||||| ||| |||||||||||||||| |  || ||||||| |||||||| |||||| ||||||||| |||||||||| |   ||    
T  30559605 tttttagaatgaattcttgaattgagttaactagaataattccc--tatctatgaattattatacaattcacccaaaccaatactcaatactcacaacaa 30559508  T
Q  116 ttaaaatttatatatactccatttct--tttaatttatagtaacaaaatttgaatcactat-cataatagcttattagacaaaatgacataatatcaagt 212  Q
    | |||||  |||||||||||||| ||  |||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  30559507 tcaaaat--atatatactccattgctcatttaatttatggtaacaaaattcgaatcactattcataatggcttattagacaaaatgacatactatcaagt 30559410  T
Q  213 tataacttacaatca------------cttaatacctnnnnnnncatacaatcatttatacaacaaggcataataaatcagattttatcttctaattttt 300  Q
    || ||||||||||||            |||  |||||       | |||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||| |    
T  30559409 tacaacttacaatcatttctacaatcacttcttacctaaaaaa-cttacaatcacttctacaacagggcataataaatcagattttaacttataatttgt 30559311  T
Q  301 ggatctttaacaatagcgggtgcaccaaagttattaccaacatcaacaaaagttggaagtccaccagttatcaagccttgctaataagctagtaaaagaa 400  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||| |||  ||||||||||||||| |     
T  30559310 ggatcttcaacaatagcgggtgcaccaaagctattaccaacatcaacaaaagttgaaagtccaccggttgtcaagctttgtcaataagctagtaaaatat 30559211  T
Q  401 tcttataagccagtgagaaataattgttaccaacaagaacaataatgtgtggttcaatgacttgatgatatgtta-accgagcaggagatattcaagtca 499  Q
    ||||||||||  | |||||| |||||||| |||||||| |||  ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||    
T  30559210 tcttataagctcgcgagaaagaattgttatcaacaagatcaacgatgtgtggttctatgacttgatgatatgttacaccgagcgagagatattcaagtca 30559111  T
Q  500 tttgatgatgttgatattattcgaacattcaccg--cagaggtcttagaaa-gatcatttacctcctaattttatttagcacactattgacatgttatgt 596  Q
     ||||||||| |||||||||||||||||||||||   | || ||| | ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  |  ||||||    
T  30559110 cttgatgatgctgatattattcgaacattcaccgtaaatagatctcataaatgat-atttacctcctaattttatttagcacactattggtagattatgt 30559012  T
Q  597 ttcatctc 604  Q
    ||||||||    
T  30559011 ttcatctc 30559004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 247 - 604
Target Start/End: Original strand, 14498714 - 14499073
Alignment:
Q  247 tacaatcatttatacaacaaggcataataaatcagattttatcttctaatttttggatctttaacaatagcgggtgcaccaaagttattaccaacatcaa 346  Q
    |||||||| || ||||||| |||||||| |||||||||||| ||| |||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||    
T  14498714 tacaatcacttctacaacagggcataattaatcagattttaacttttaatttgtggatcttcaacaatagcgggtgtaccaaagctattatcaacatcaa 14498813  T
Q  347 caaaagttggaagtccaccagttatcaagccttgctaataagctagtaaaagaatcttataagccagtgagaaataattgttaccaacaagaacaataat 446  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||||||| ||  ||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||| | |||||||||||| || |||  ||    
T  14498814 caaaagttggaagtacaccagtcatcaagccatgtcaataagctagtaaaataatcttataagctcgtgagaaagatttgttaccaacatgatcaacgat 14498913  T
Q  447 gtgtggttcaatgacttgatgatatgtta-accgagcaggagatattcaagtcatttgatgatgttgatattattcgaacattcaccgc--agaggtctt 543  Q
     ||||| |||||||||||||||||| ||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||     
T  14498914 ttgtgg-tcaatgacttgatgatatcttacatcgagcgggagatattcaagtcatttgatgatgttgatattattcgaacattcatcgcaaagaggtctc 14499012  T
Q  544 agaaagatcatttacctcctaattttatttagcacactattgacatgttatgtttcatctc 604  Q
    ||||||  |||||||||||||||| ||||||  |||||||||||| |||||||||||||||    
T  14499013 agaaaggacatttacctcctaattatatttaaaacactattgacaagttatgtttcatctc 14499073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 130; E-Value: 5e-67
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 40865154 - 40864922
Alignment:
Q  1 gattattataatcaatttttagaataaaatcttgaagtgacttaactagaataattctccttaactatgaactattataccattcactcaaaccaatcct 100  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||| ||    
T  40865154 gattactataatcaatttttagaataaattcttgcactgacttaactagaataattatccctaactatgaacaattataccattcacccaaacaaatact 40865055  T
Q  101 caatactctcctgaattaaaatttatatatactccatt--tcttttaatttatagtaacaaaatttgaatcacta-tcataatagcttattagacaaaat 197  Q
    |||||||| | | ||| |||||||||||||||||||||  || |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||    
T  40865054 caatactcacataaatcaaaatttatatatactccattgctcatttaatttatggtaacaaaatttgaatcactattcataatagtttattaggcaaaat 40864955  T
Q  198 gacataatatcaagttataacttacaatcactt 230  Q
    || |||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  40864954 gaaataatatcaagttacaacttataatcactt 40864922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 118; E-Value: 7e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Original strand, 25017126 - 25017358
Alignment:
Q  1 gattattataatcaatttttagaataaaatcttgaagtgacttaactagaataattctccttaactatgaactattataccattcactcaaaccaatcct 100  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||  ||||  ||| ||    
T  25017126 gattactataataaatttttagaataaattcttgatgtgatttaactagaataattctccctaactataaacaattataccattcatccaaataaatact 25017225  T
Q  101 caatactctcctgaattaaaatttatatatactccatt--tcttttaatttatagtaacaaaatttgaatcacta-tcataatagcttattagacaaaat 197  Q
    ||||||||     ||| |||||||||||||||||||||  || |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  25017226 caatactcatagaaatcaaaatttatatatactccattgctcatttaatttatggtaacaaaatttgaatcactattcataatagcttattaggcaaaat 25017325  T
Q  198 gacataatatcaagttataacttacaatcactt 230  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  25017326 gacataatatcaagttacaacttataatcactt 25017358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 115; E-Value: 4e-58
Query Start/End: Original strand, 391 - 604
Target Start/End: Complemental strand, 52754032 - 52753819
Alignment:
Q  391 agtaaaagaatcttataagccagtgagaaataattgttaccaacaagaacaataatgtgtggttcaatgacttgatgatatgtta-accgagcaggagat 489  Q
    ||||||| ||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||| || |||  ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| | ||||||    
T  52754032 agtaaaataatcttataagcctgtgagaaagaattattaccaacatgatcaacgatgtgtggttcaatgacttgatgatatgttacatcgaacgggagat 52753933  T
Q  490 attcaagtcatttgatgatgttgatattattcgaacattcaccgcagaggtcttagaaagatcatttacctcctaattttatttagcacactattgacat 589  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |  ||||||||  |||||   ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||     
T  52753932 attcaagtcatttgatgatgttgatattattcgaacattc-gcaaagaggtctcggaaagggtatttacctcctaattttatctagcacactattgacaa 52753834  T
Q  590 gttatgtttcatctc 604  Q
    |||||||||||||||    
T  52753833 gttatgtttcatctc 52753819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 109; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 416 - 604
Target Start/End: Complemental strand, 40864909 - 40864718
Alignment:
Q  416 agaaataattgttaccaacaagaacaataatgtgtggttcaatgacttgatgatatgtta-accgagcaggagatattcaagtcatttgatgatgttgat 514  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| |  | ||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  40864909 agaaataattgttaccaacaagatcaacgatgtgtggttcaatgacttgatgatatcttacaccgaacgagggatattcaagtcacttgataatgttgat 40864810  T
Q  515 attattcgaacattcaccgca--gaggtcttagaaagatcatttacctcctaattttatttagcacactattgacatgttatgtttcatctc 604  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||    
T  40864809 attattcgaacattcaccgcaaagaggttttagaaagggcatttacctcctaattttatttagcacactattaacaggttatgttacatctc 40864718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 103; E-Value: 6e-51
Query Start/End: Original strand, 416 - 594
Target Start/End: Original strand, 25017371 - 25017552
Alignment:
Q  416 agaaataattgttaccaacaagaacaataatgtgtggttcaatgacttgatgatatgtta-accgagcaggagatattcaagtcatttgatgatgttgat 514  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||  ||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  25017371 agaaagaattgttaccaacaagatcaacgatgtgtggttcaatgacttgatgatatcttacaccgagcgagagatattcaaatcacttgatgatgttgat 25017470  T
Q  515 attattcgaacattcaccgc--agaggtcttagaaagatcatttacctcctaattttatttagcacactattgacatgttat 594  Q
    ||||||||||| ||||||||  |||||||| ||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  25017471 attattcgaacgttcaccgcaaagaggtctcagaaagggcatatacctcctaattttatttagcacactattgacaggttat 25017552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 445 - 601
Target Start/End: Complemental strand, 26273090 - 26272931
Alignment:
Q  445 atgtgtggttcaatgacttgatgatatgtta-accgagcaggagatattcaagtcatttgatgatgttgatattattcgaacattcaccgc--agaggtc 541  Q
    |||||| ||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||| |||  | |||||    
T  26273090 atgtgttgttcaatgatttgatgatatgttacatcgagcaggagatattcaagtcacgtgatgatgttaatattattcgaacattcatcgcaaacaggtc 26272991  T
Q  542 ttagaaagatcatttacctcctaattttatttagcacactattgacatgttatgtttcat 601  Q
    |  |||||  || |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  26272990 tcggaaagggcaattacctactaattttatttagcacactattggcatgttatatttcat 26272931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 274 - 411
Target Start/End: Original strand, 30054708 - 30054845
Alignment:
Q  274 taaatcagattttatcttctaatttttggatctttaacaatagcgggtgcaccaaagttattaccaacatcaacaaaagttggaagtccaccagttatca 373  Q
    ||||||||||||||  ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||  |||   ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||    
T  30054708 taaatcagattttaatttctaatttatggatcttcaacaatagcgggtgcattaaaaccattaccaacatcaacaaaagttggaagtccaccggttgtca 30054807  T
Q  374 agccttgctaataagctagtaaaagaatcttataagcc 411  Q
    |||| | | ||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  30054808 agccctaccaataagctagtaaaataatcttacaagcc 30054845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 415 - 600
Target Start/End: Complemental strand, 32380043 - 32379859
Alignment:
Q  415 gagaaataattgttaccaacaagaacaataatgtgtggttcaatgacttgatgatatgtta-accgagcaggagatattcaagtcatttgatgatgttga 513  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||   |||||| ||| | | |||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  32380043 gagaaagaattgttaccaacaagatcaacgatgtgtggttcaatgacttgat---atgttacaccaaacgggagatattcaattcacttgatgatgttga 32379947  T
Q  514 tattattcgaacattcac-cgcagaggtcttagaaagatcatttacctcctaattttatttagcacactattgacatgttatgtttca 600  Q
    ||||||||||||||| || |  |||||| |   |||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  32379946 tattattcgaacatttacgcaaagaggtatcgaaaatgacatttacctcctaattttatttagcacactattgacaggttatgattca 32379859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 73; E-Value: 5e-33
Query Start/End: Original strand, 456 - 604
Target Start/End: Complemental strand, 35949128 - 35948977
Alignment:
Q  456 aatgacttgatgatatgtta-accgagcaggagatattcaagtcatttgatgatgttgatattattcgaacattcaccg--cagaggtcttagaaagatc 552  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||   ||||||||  |||||  |    
T  35949128 aatgacttgatgatatgttacaccgagcgggagatattcaagtcacttgatgatgttgatgttattcgaacattcaccgaaaagaggtctcggaaaggac 35949029  T
Q  553 atttacctcctaattttatttagcacactattgacatgttatgtttcatctc 604  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| |||| || |  |||| |||||||||    
T  35949028 atttacctcctaattttattttgcacgctatagatagattatatttcatctc 35948977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 431 - 531
Target Start/End: Original strand, 17127439 - 17127540
Alignment:
Q  431 caacaagaacaataatgtgtggttcaatgacttgatgatatgtta-accgagcaggagatattcaagtcatttgatgatgttgatattattcgaacattc 529  Q
    |||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  17127439 caacaagatcaacaatgtgtggttgaatgacttgatgatatgttacaccgagcgggagatattcaagtcgcttgatgatgttgatattattcgaacattc 17127538  T
Q  530 ac 531  Q
    ||    
T  17127539 ac 17127540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 247 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 52754143 - 52754030
Alignment:
Q  247 tacaatcatttatacaacaaggcataataaatcagattttatcttctaatttttggatctttaacaatagcgggtgcaccaaagttattaccaacatcaa 346  Q
    |||||||| || ||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||    
T  52754143 tacaatcacttctacaacatggcataattaatcagattttaacttctaatttgtggatcttcaacaatagcgggtgcaccaaagctattatcaacattaa 52754044  T
Q  347 caaaagttggaagt 360  Q
    ||||||||| ||||    
T  52754043 caaaagttgaaagt 52754030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 68; E-Value: 5e-30
Query Start/End: Original strand, 457 - 604
Target Start/End: Original strand, 30054847 - 30054997
Alignment:
Q  457 atgacttgatgatatgtta-accgagcaggagatattcaagtcatttgatgatgttgatattattcgaacattcaccgca--gaggtcttagaaagatca 553  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||| || |||| ||||||||||| ||| |||||  ||||| | | |||   ||    
T  30054847 atgacttaatgatatgttacaccgagcgggagatattcaagtcacttgatcatattgacattattcgaaccttctccgcaaagaggtatcataaatgaca 30054946  T
Q  554 tttacctcctaattttatttagcacactattgacatgttatgtttcatctc 604  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  30054947 tttacctcctaattttatttagcacattattgacacgttatgtttcatctc 30054997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 1 - 102
Target Start/End: Complemental strand, 52754366 - 52754265
Alignment:
Q  1 gattattataatcaatttttagaataaaatcttgaagtgacttaactagaataattctccttaactatgaactattataccattcactcaaaccaatcct 100  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| | || |||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||    
T  52754366 gattactataatcaatttttagaataaattgtttaagtgatttaactagaataattctctctaactatgaactattatactattcacccaaaccaatact 52754267  T
Q  101 ca 102  Q
    ||    
T  52754266 ca 52754265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 108
Target Start/End: Complemental strand, 32380155 - 32380048
Alignment:
Q  1 gattattataatcaatttttagaataaaatcttgaagtgacttaactagaataattctccttaactatgaactattataccattcactcaaaccaatcct 100  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||| |   |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||    
T  32380155 gattactataatcaatttttagaacaaatttttgaagtgacttaactagaataattttttctaactatgaactattatatcattcacccaaaccaatact 32380056  T
Q  101 caatactc 108  Q
     |||||||    
T  32380055 taatactc 32380048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 104
Target Start/End: Complemental strand, 49465714 - 49465611
Alignment:
Q  1 gattattataatcaatttttagaataaaatcttgaagtgacttaactagaataattctccttaactatgaactattataccattcactcaaaccaatcct 100  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||| || |  ||||||||| ||    
T  49465714 gattactataatcaatttttagaataaattgttgaagtgacttaattagaataattcttcctaactatgaactattataccctttatccaaaccaatact 49465615  T
Q  101 caat 104  Q
    ||||    
T  49465614 caat 49465611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 503 - 604
Target Start/End: Original strand, 17874851 - 17874954
Alignment:
Q  503 gatgatgttgatattattcgaacattcaccgca--gaggtcttagaaagatcatttacctcctaattttatttagcacactattgacatgttatgtttca 600  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||   ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||  |||| |||||    
T  17874851 gatgatgttgatattattcaaacattcaccgcaaagaggtctcgaaaagatcatttaccttctaattttatttaccacactattgacagattatatttca 17874950  T
Q  601 tctc 604  Q
    ||||    
T  17874951 tctc 17874954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 56; E-Value: 7e-23
Query Start/End: Original strand, 118 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 50682776 - 50682654
Alignment:
Q  118 aaaatttatatatactccatttct--tttaatttatagtaacaaaatttgaatcactat-cataatagcttattagacaaaatgacataatatcaagtta 214  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||  |||||||||  |||| ||| |||||||||| || ||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  50682776 aaaatttatgtatactccattgctattttaatttacggtaataaattttgaatcaccattcataataacttatcagacaaaatgacatactatcaagtta 50682677  T
Q  215 taacttacaatcacttaatacct 237  Q
     ||||||||||||||| ||||||    
T  50682676 caacttacaatcacttcatacct 50682654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 431 - 577
Target Start/End: Complemental strand, 21973963 - 21973814
Alignment:
Q  431 caacaagaacaataatgtgtggttcaatgacttgatgatatgtta-accgagcaggagatattcaagtcatttgatgatgttgatattattcgaacattc 529  Q
    ||||||||  || |||| |||||| ||||| |||||||||||||| || |||| |||||||||||| ||| |||||||  ||||||||||||||||||||    
T  21973963 caacaagattaacaatgagtggttaaatgatttgatgatatgttacactgagcgggagatattcaaatcacttgatgacattgatattattcgaacattc 21973864  T
Q  530 accgc--agaggtcttagaaagatcatttacctcctaattttatttagca 577  Q
    |||||  |||  |||  |||||  |||||||||||||||||||| |||||    
T  21973863 accgcaaagaaatctcggaaagggcatttacctcctaattttatctagca 21973814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 552 - 603
Target Start/End: Complemental strand, 11843950 - 11843899
Alignment:
Q  552 catttacctcctaattttatttagcacactattgacatgttatgtttcatct 603  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||| ||||||||    
T  11843950 catttacctcctaattttatttagcacactattggtaggttatatttcatct 11843899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 552 - 587
Target Start/End: Original strand, 33489827 - 33489862
Alignment:
Q  552 catttacctcctaattttatttagcacactattgac 587  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33489827 catttacctcctaattttatttagcacactattgac 33489862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 552 - 587
Target Start/End: Complemental strand, 41972302 - 41972267
Alignment:
Q  552 catttacctcctaattttatttagcacactattgac 587  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41972302 catttacctcctaattttatttagcacactattgac 41972267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 535 - 585
Target Start/End: Original strand, 28463202 - 28463252
Alignment:
Q  535 agaggtcttagaaagatcatttacctcctaattttatttagcacactattg 585  Q
    ||||||||| |||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  28463202 agaggtcttggaaagggcattcacctcctaattttatttagcacactattg 28463252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 553 - 607
Target Start/End: Complemental strand, 170500 - 170445
Alignment:
Q  553 atttacctcctaattttatttagcacactattgac-atgttatgtttcatctcact 607  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||| | | ||||| ||||||||||||    
T  170500 atttacctcctaattttatttagcacattattggcaaggttatatttcatctcact 170445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 73 - 129
Target Start/End: Original strand, 14498547 - 14498603
Alignment:
Q  73 tattataccattcactcaaaccaatcctcaatactctcctgaattaaaatttatata 129  Q
    ||||||||||||||| |||| |||| |||||||||| | ||||| ||||| ||||||    
T  14498547 tattataccattcacccaaatcaatactcaatactcacatgaatcaaaatctatata 14498603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 260; Significance: 1e-144; HSPs: 25)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 260; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 142 - 604
Target Start/End: Original strand, 31944329 - 31944792
Alignment:
Q  142 tttaatttatagtaacaaaatttgaatcactat-cataatagcttattagacaaaatgacataatatcaagttataacttacaatcacttaatacctnnn 240  Q
    |||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||       
T  31944329 tttaatttatggtaacagaatttgaatcactattcataatagcttattagacaaa-tgacagaatatcaagttacaacttacaatcacttcatacctaaa 31944427  T
Q  241 nnnncatacaatcatttatacaacaaggcataataaatcagattttatcttctaatttttggatctttaacaatagcgggtgcaccaaagttattaccaa 340  Q
        | |||||||| || |||||   ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||  |||| |||||||||    
T  31944428 aaaacttacaatcacttctacaat--ggcataataaatcagattttaacttctaatttgtggatcttcaacaatagcgggtgcatgaaagctattaccaa 31944525  T
Q  341 catcaacaaaagttggaagtccaccagttatcaagccttgctaataagctagtaaaagaatcttataagccagtgagaaataattgttaccaacaagaac 440  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||| |    
T  31944526 cattaacaaaagttggaagtccaccagttatcaagccctgccaataagctagtaaaataatcttataagctcgtgagaaagaattgttaccaacaagatc 31944625  T
Q  441 aataatgtgtggttcaatgacttgatgatatgtta-accgagcaggagatattcaagtcatttgatgatgttgatattattcgaacattcaccgc--aga 537  Q
    ||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||   ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||    
T  31944626 aacgatgtgtggttcaatgacttgatgatatgttacaccgagtgtgagatattcaagtcacttgatgatgttgatattattcgaacattcaccgcaaaga 31944725  T
Q  538 ggtcttagaaagatcatttacctcctaattttatttagcacactattgacatgttatgtttcatctc 604  Q
    |||||  |||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||    
T  31944726 ggtctcggaaagggcatttacctcctaattttatttagtacactattgacaagttatgtttcatctc 31944792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 168; E-Value: 1e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 297
Target Start/End: Original strand, 17359023 - 17359322
Alignment:
Q  1 gattattataatcaatttttagaataaaatcttgaagtgacttaactagaataattctccttaactatgaactattataccattcactcaaaccaatcct 100  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| | |||||| ||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  17359023 gattactataatcaatttttagaataaatttttgaagcgacttaagtagaataattctccataactttgaactattataccattcactcaaaccaatact 17359122  T
Q  101 caatactctcctgaattaaaatttatatatactccatt--tcttttaatttatagtaacaaaatttgaatcacta-tcataatagcttattagacaaaat 197  Q
    |||||||| | | |||| ||||||||||||||||||||  || ||||| |||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  17359123 caatactcacataaattgaaatttatatatactccattgctcatttaagttatggtaataaaatttgaatcactattcataatagcttattagacaaaat 17359222  T
Q  198 gacataatatcaagttataacttacaatcacttaatacctnnnnnnncatacaatcatttatacaacaaggcataataaatcagattttatcttctaatt 297  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||       | |||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  17359223 gacataatatcaagttacagcttacaatcacttaatacctaaaaaaacttacaatcacttctacaacagggcataataaatcagattttaacttctaatt 17359322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 160; E-Value: 6e-85
Query Start/End: Original strand, 1 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 24105032 - 24104671
Alignment:
Q  1 gattattataatcaatttttagaataaaatcttgaagtgacttaactagaataattctccttaactatgaactattataccattcactcaaaccaatcct 100  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||           
T  24105032 gattactataatcaatttttagaataaatttttgaattgacttaactagaataattctccttaactatgaactattataccattcacccaaac------- 24104940  T
Q  101 caatactctcctgaattaaaatttatatatactccatt--tcttttaatttatagtaacaaaatttgaatcacta-tcataatagcttattagacaaaat 197  Q
    |||||||| |   ||||||||||||| |||||| ||||  || |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  24104939 caatactcacaaaaattaaaatttatgtatacttcattgctcatttaatttatggtaacaaaatttgaatcactattcatattagcttattagacaaaat 24104840  T
Q  198 gacataatatcaagttataacttacaatcacttaatacctnnnnnnncatacaatcatttatacaacaaggcataataaatcagattttatcttctaatt 297  Q
    |||| |||||||||||| || | || ||||||| ||||||       | |||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  24104839 gaca-aatatcaagttacaattcacgatcacttcatacctaaaaaaacttacaattatttctacaacatggcataataaatcagattttaacttctaatt 24104741  T
Q  298 tttggatctttaacaatagc-gggtgcaccaaagttattaccaacatcaacaaaagttggaagtccacca 366  Q
    | ||||| |  ||| ||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  24104740 tgtggatatgcaacgatagcagggtgcaccaaagctatcaccaacatcaacaaaagttgaaagtccacca 24104671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 118; E-Value: 7e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Original strand, 4325160 - 4325385
Alignment:
Q  1 gattattataatcaatttttagaataaaatcttgaagtgacttaactagaataattctccttaactatgaactattataccattcactcaaaccaatcct 100  Q
    ||||| ||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||  ||||||||| ||    
T  4325160 gattactataatcaattat-agaataaattcttgaagtgacttaactagaataattttccctaactataaactattataccattcatccaaaccaatact 4325258  T
Q  101 caatactctcctgaattaaaatttatatatactccatttct-tttaatttatagtaacaaaatttgaatcactatcataatagcttattagacaaaatga 199  Q
    |||||||| |   ||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||| |||||||||||||||    ||||||||||||||||||||||    
T  4325259 caatactcacagaaatcaaaatttatatatactccattgctctttaatttatggtaaccaaatttgaatcacta----aatagcttattagacaaaatga 4325354  T
Q  200 cataatatcaagttataacttacaatcactt 230  Q
    |||||||| |||||| ||||||| |||||||    
T  4325355 cataatattaagttacaacttacgatcactt 4325385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 425 - 604
Target Start/End: Original strand, 4325406 - 4325587
Alignment:
Q  425 tgttaccaacaagaacaataatgtgtggttcaatgacttgatgatatgtta-accgagcaggagatattcaagtcatttgatgatgttgatattattcga 523  Q
    |||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||| ||||  || |||||||||||||||||||| ||    
T  4325406 tgttaccaacaagatcaacgatgtgtggttcaatgacttgatgatatgttacaccgagtgggagataatcaacccacttgatgatgttgatattatttga 4325505  T
Q  524 acattcaccgcagag-gtcttagaaagatcatttacctcctaattttatttagcacactattgacatgttatgtttcatctc 604  Q
    |||||||| |||||  |||| ||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  4325506 acattcacagcagaatgtctcagaaagggcaattacctcctaattttatttagcacactattgacaggttatgttgcatctc 4325587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 431 - 604
Target Start/End: Complemental strand, 12211401 - 12211225
Alignment:
Q  431 caacaagaacaataatgtgtggttcaatgacttgatgatatgtta-accgagcaggagatattcaagtcatttgatgatgttgatattattcgaacattc 529  Q
    |||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12211401 caacaagatcaacgatgtgtggttcaatgacttgatgatatgttacaccgaacaggagatattcaagtcatttgatgatgttgatattattcgaacattc 12211302  T
Q  530 accgca--gaggtcttagaaagatcatttacctcctaattttatttagcacactattgacatgttatgtttcatctc 604  Q
    |   ||  |||||||   |||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||| |||||||||    
T  12211301 atttcaatgaggtctcgaaaatgacatttacctcctaattttatttagcacactattggtaggttatatttcatctc 12211225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 83; E-Value: 5e-39
Query Start/End: Original strand, 446 - 604
Target Start/End: Complemental strand, 53693194 - 53693033
Alignment:
Q  446 tgtgtggttcaatgacttgatgatatgtta-accgagcaggagatattcaagtcatttgatgatgttgatattattcgaacattcaccgc--agaggtct 542  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||    
T  53693194 tgtgtggttcaatgacttgatgatatgttacatcgagcgggagataatcaaggcacttgatgatgttgatattattcgaacattcatcgcaaagaggtct 53693095  T
Q  543 tagaaagatcatttacctcctaattttatttagcacactattgacatgttatgtttcatctc 604  Q
      |||||  |||| ||||| |||||| |||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  53693094 cggaaagggcattcacctcttaatttcatttagcacactattggcaagttatgtttcatctc 53693033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 1 - 108
Target Start/End: Original strand, 31943781 - 31943886
Alignment:
Q  1 gattattataatcaatttttagaataaaatcttgaagtgacttaactagaataattctccttaactatgaactattataccattcactcaaaccaatcct 100  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||    
T  31943781 gattactataatcaatttttagaataaattcttgaagtgacttaactagaataattttccataactatgaactattataccattcacccaaaccaa--ct 31943878  T
Q  101 caatactc 108  Q
    ||||||||    
T  31943879 caatactc 31943886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 431 - 533
Target Start/End: Original strand, 27364883 - 27364986
Alignment:
Q  431 caacaagaacaataatgtgtggttcaatgacttgatgatatgtta-accgagcaggagatattcaagtcatttgatgatgttgatattattcgaacattc 529  Q
    |||||||| ||| | ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  27364883 caacaagatcaacagtgtgtggttaaatgacttgatgatatgttacaccgagcgggagatattcaagtcacttgatgatgttgatattattcgaacattc 27364982  T
Q  530 accg 533  Q
    ||||    
T  27364983 accg 27364986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 478 - 604
Target Start/End: Original strand, 3074417 - 3074545
Alignment:
Q  478 cgagcaggagatattcaagtcatttgatgatgttgatattattcgaacattcaccgca--gaggtcttagaaagatcatttacctcctaattttatttag 575  Q
    ||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||  ||||||| || |||  |||||| |||||||||||||||||    
T  3074417 cgagcgggagataatcaagtcacttgatgatgttgatattatttgaacattcatcgcaaagaggtctcaggaagggcatttatctcctaattttatttag 3074516  T
Q  576 cacactattgacatgttatgtttcatctc 604  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||    
T  3074517 cacactattggcaagttatgtttcatctc 3074545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 7 - 108
Target Start/End: Complemental strand, 53693381 - 53693280
Alignment:
Q  7 tataatcaatttttagaataaaatcttgaagtgacttaactagaataattctccttaactatgaactattataccattcactcaaaccaatcctcaatac 106  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||    
T  53693381 tataatcaatttttagaataaattgttgaaatgatttaactagaataattctccctaactatgaactattataccattcccccaaaccaatactcaatac 53693282  T
Q  107 tc 108  Q
    ||    
T  53693281 tc 53693280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 66; E-Value: 7e-29
Query Start/End: Original strand, 431 - 531
Target Start/End: Complemental strand, 55464835 - 55464734
Alignment:
Q  431 caacaagaacaataatgtgtggttcaatgacttgatgatatgtta-accgagcaggagatattcaagtcatttgatgatgttgatattattcgaacattc 529  Q
    |||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  55464835 caacaagatcaacaatgtgtggttgaatgacttgatgatatgttacaccgagcgggagaaaatcaagtcacttgatgatgttgatattattcgaacattc 55464736  T
Q  530 ac 531  Q
    ||    
T  55464735 ac 55464734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 1 - 108
Target Start/End: Original strand, 3074281 - 3074388
Alignment:
Q  1 gattattataatcaatttttagaataaaatcttgaagtgacttaactagaataattctccttaactatgaactattataccattcactcaaaccaatcct 100  Q
    |||||||| |||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |  ||||||||| ||    
T  3074281 gattattacaatcaatttttaaaataaattgttgaagtgacttaactataataattctccctaactatgaactattataccatttatccaaaccaatact 3074380  T
Q  101 caatactc 108  Q
     |||||||    
T  3074381 aaatactc 3074388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 61; E-Value: 7e-26
Query Start/End: Original strand, 118 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 29528361 - 29528246
Alignment:
Q  118 aaaatttatatatactccatttct--tttaatttatagtaacaaaatttgaatcactat-cataatagcttattagacaaaatgacataatatcaagtta 214  Q
    ||||| |||||||||| |||| ||  |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||   |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  29528361 aaaatctatatatacttcattgctcatttaatttatggtaacaaaatttgaatcactattcataatgatttattagacaaaatgacatactatcaagtta 29528262  T
Q  215 taacttacaatcactt 230  Q
     |||||||||||||||    
T  29528261 caacttacaatcactt 29528246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 494 - 585
Target Start/End: Complemental strand, 8898037 - 8897944
Alignment:
Q  494 aagtcatttgatgatgttgatattattcgaacattcaccgca--gaggtcttagaaagatcatttacctcctaattttatttagcacactattg 585  Q
    |||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  8898037 aagtcactggatgatgttgatattattcgagcattcaccgcaaagaggtctcagaaagactatttacctcctaattttatttagcaaactattg 8897944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 304 - 377
Target Start/End: Original strand, 51379514 - 51379587
Alignment:
Q  304 tctttaacaatagcgggtgcaccaaagttattaccaacatcaacaaaagttggaagtccaccagttatcaagcc 377  Q
    |||| ||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  51379514 tcttcaacaatagcaggtgcaccaaagctattaccaacatcaacaaaagttggaagtccaccggttgtcaagcc 51379587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 51; E-Value: 6e-20
Query Start/End: Original strand, 431 - 532
Target Start/End: Original strand, 42843707 - 42843809
Alignment:
Q  431 caacaagaacaataatgtgtggttcaatgacttgatgatatgtta-accgagcaggagatattcaagtcatttgatgatgttgatattattcgaacattc 529  Q
    |||||||| ||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||| |  |||   ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  42843707 caacaagatcaacaatgtgtggtttaatgagttgatgatatgttatattgagtgagagatattcaagtcacttgatgatgttgatattaatcgaacattc 42843806  T
Q  530 acc 532  Q
    |||    
T  42843807 acc 42843809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 348 - 409
Target Start/End: Complemental strand, 24104659 - 24104598
Alignment:
Q  348 aaaagttggaagtccaccagttatcaagccttgctaataagctagtaaaagaatcttataag 409  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  24104659 aaaagttggaagtccaccagttatcaagctctgccaataagctagtaaaagaatcttataag 24104598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 60
Target Start/End: Complemental strand, 10985016 - 10984957
Alignment:
Q  1 gattattataatcaatttttagaataaaatcttgaagtgacttaactagaataattctcc 60  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10985016 gattactataatcaatttttagaatgaattcttgaagtgacttaactagaataattctcc 10984957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 494 - 585
Target Start/End: Complemental strand, 10632757 - 10632662
Alignment:
Q  494 aagtcatttgatgatgttgatattattcgaacatt--caccgcagag--gtcttagaaagatcatttacctcctaattttatttagcacactattg 585  Q
    |||||| ||||||||||| || |||||||||||||  ||||||| ||  ||||  |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  10632757 aagtcacttgatgatgttaatgttattcgaacattttcaccgcaaagaagtctcggaaatatcatttacctcctaattttattttgcacactattg 10632662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 515 - 604
Target Start/End: Original strand, 1147584 - 1147675
Alignment:
Q  515 attattcgaacattcaccgca--gaggtcttagaaagatcatttacctcctaattttatttagcacactattgacatgttatgtttcatctc 604  Q
    ||||||||||||||||  |||  |||||||  ||||||  ||||||||||||||||| ||||  |||||||||||| |||||||||||||||    
T  1147584 attattcgaacattcattgcaaagaggtctcggaaagagtatttacctcctaattttctttaaaacactattgacaagttatgtttcatctc 1147675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 1 - 97
Target Start/End: Complemental strand, 29528494 - 29528401
Alignment:
Q  1 gattattataatcaatttttagaataaaatcttgaagtgacttaactagaataattctccttaactatgaactattataccattcactcaaaccaat 97  Q
    ||||| ||||||||||||  ||| |||| |||||||| | ||||||  |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  29528494 gattactataatcaattta-agattaaattcttgaagcgtcttaac--gaataattctctctaactatgaactattataccattcacccaaatcaat 29528401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 553 - 604
Target Start/End: Complemental strand, 25182929 - 25182878
Alignment:
Q  553 atttacctcctaattttatttagcacactattgacatgttatgtttcatctc 604  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||    
T  25182929 atttaccttctaattttatttagcacactattgataggttatatttcatctc 25182878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 552 - 587
Target Start/End: Original strand, 48130099 - 48130134
Alignment:
Q  552 catttacctcctaattttatttagcacactattgac 587  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48130099 catttacctcctaattttatttagcacactattgac 48130134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 552 - 587
Target Start/End: Original strand, 30110096 - 30110131
Alignment:
Q  552 catttacctcctaattttatttagcacactattgac 587  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  30110096 catttaccacctaattttatttagcacactattgac 30110131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 246; Significance: 1e-136; HSPs: 26)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 246; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 118 - 604
Target Start/End: Complemental strand, 3857356 - 3856875
Alignment:
Q  118 aaaatttatatatactccatttct--tttaatttatagtaacaaaatttgaatcactatcataatagcttattagacaaaatgacataatatcaagttat 215  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||  |||||||||| ||||||||||||||||          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  3857356 aaaatctatatatactccattgctcatttaatttatggtaacaaaatttgaat----------atagcttattagacaaaatgacataatatcaagttac 3857267  T
Q  216 aacttacaatcacttaatacctnnnnnnncatacaatcatttatacaacaaggcataataaatcagattttatcttctaatttttggatctttaacaata 315  Q
    |||||||| ||| || ||||||       | |||||||| || ||||| ||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| |||||||    
T  3857266 aacttacactcatttcatacctaaaaaaacttacaatcacttctacaataagacataataaatcaaattttaacttctaatttttggatcttcaacaata 3857167  T
Q  316 gcgggtgcaccaaagttattaccaacatcaacaaaagttggaagtccaccagttatcaagccttgctaataagctagtaaaagaatcttataagccagtg 415  Q
    || |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||| ||||||||||||| |||    
T  3857166 gcaggtgcaccaaagctattacgaacatcaacaaaagttggaagtccaccagttatcaagccctgtcaataagctagtaaaataatcttataagcccgtg 3857067  T
Q  416 agaaataattgttaccaacaagaacaataatgtgtggttcaatgacttgatgatatgtta-accgagcaggagatattcaagtcatttgatgatgttgat 514  Q
    ||||||||||||||||| ||||| |||  |||||||||| ||||||||||||| ||||||  | |||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3857066 agaaataattgttaccatcaagatcaacgatgtgtggttaaatgacttgatgacatgttactcagagtgggagatattcaagtcatttgatgatgttgat 3856967  T
Q  515 attattcgaacattcaccgc--agaggtcttagaaagatcatttacctcctaattttatttagcacactattgacatgttatgtttcatctc 604  Q
    ||||||| ||||||||||||  |||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||    
T  3856966 attattcaaacattcaccgcaaagaggtctcagaaagaaaatttacctcctaattttatttagcacattattggcatgtaatgtttcatctc 3856875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 233; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 1 - 598
Target Start/End: Original strand, 51261557 - 51262149
Alignment:
Q  1 gattattataatcaatttttagaataaaatcttgaagtgacttaactagaataattctccttaactatgaactattataccattcactcaaaccaatcct 100  Q
    ||||| ||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||  |    
T  51261557 gattaatataatcaattttgagaataaatttttgaagtgacttaactaaaataattttccctaactatgaactattctaccattcacccaaatcaatatt 51261656  T
Q  101 caatactctcctgaattaaaatttatatatactccatttctt--ttaatttatagtaacaaaatttgaatcactat-cataatagcttattagacaaaat 197  Q
    |||||||| |   ||| ||||| |||||||||||| || | |  ||||||||| |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  51261657 caatactcactgaaatcaaaatctatatatactccgttgcatatttaatttatggtaacaaaatttgaatcactgttcataatagcttattagacaaaat 51261756  T
Q  198 gacataatatcaagttataacttacaatcacttaatacctnnnnnnn-catacaatcatttatacaacaaggcataataaatcagattttatcttctaat 296  Q
     ||||| ||||||| || ||||||||||||||| ||||||        | |||||||| |            ||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  51261757 tacatactatcaagatacaacttacaatcactttatacctaaaaaaaacttacaatcact------------cataataaatcagatcttaacttctaat 51261844  T
Q  297 ttttggatctttaacaatagcgggtgcaccaaagttattaccaacatcaacaaaagttggaagtccaccagttatcaagccttgctaataagctagtaaa 396  Q
    || |||||||| ||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || ||  ||||||||||||||    
T  51261845 ttgtggatcttcaacaatagcaggtgcatcaaagctattaccaacatcaacaaaagttggaagtccaccagttgtcaaaccctgtcaataagctagtaaa 51261944  T
Q  397 agaatcttataagccagtgagaaataattgttaccaacaagaacaataatgtgtggttcaatgacttgatgatatgtta-accgagcaggagatattcaa 495  Q
    | ||| | ||||||  |||| ||| ||||||||||||||||| |||  | ||||||| |||||| |||||||||||||| ||  ||| | ||||||||||    
T  51261945 ataatataataagctcgtgaaaaagaattgttaccaacaagatcaacgaagtgtggtacaatgaattgatgatatgttacactaagcggaagatattcaa 51262044  T
Q  496 gtcatttgatgatgttgatattattcgaacattcaccg--cagaggtcttagaaagatcatttacctcctaattttatttagcacactattgacatgtta 593  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||   |||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  51262045 gtcacttgatgatgttgatattattcgaacattcatcgtaaagaggtcttgaaaagaacatttacctcctaattttatttagcacactattgacaggtta 51262144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 133; E-Value: 7e-69
Query Start/End: Original strand, 1 - 329
Target Start/End: Original strand, 55194597 - 55194947
Alignment:
Q  1 gattattataatcaatttttagaataaaatcttgaagtgacttaactagaataattctccttaactatgaactattataccattcactcaaacc------ 94  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||          
T  55194597 gattactataatcaatttttagaataaattcttgaagtgacttaactagaataattctccctaactatgaactattataccattcacccaaaccaatgct 55194696  T
Q  95 -------------aatcctcaatactctcctgaattaaaatttatatatactccatttct--tttaatttatagtaacaaaatttgaatcact-atcata 178  Q
                 ||| |||||||| | | | ||| ||||| |||||||||| |||| ||  ||||||| |  ||||||||||||||||||||  |||||    
T  55194697 taatactcacggaaatactcaatacccacataaatcaaaatctatatatacttcattgcttatttaattcacggtaacaaaatttgaatcactgttcata 55194796  T
Q  179 atagcttattagacaaaatgacataatatcaagttataacttacaatcacttaatacctnnnnnnncatacaatcatttatacaacaaggcataataaat 278  Q
    |||||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| || ||||||       | |||||||| || ||||||| ||||||||||||    
T  55194797 atagcttattggacaaaattacataatatcaagttacaacttacaatcagttcatacctaaaaaaacttacaatcacttctacaacagggcataataaat 55194896  T
Q  279 cagattttatcttctaatttttggatctttaacaatagcgggtgcaccaaa 329  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  55194897 cagattttaacttctaatttgtggatcttcaacaatagcgggtgcaccaaa 55194947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 121; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 332 - 527
Target Start/End: Original strand, 15667874 - 15668070
Alignment:
Q  332 tattaccaacatcaacaaaagttggaagtccaccagttatcaagccttgctaataagctagtaaaagaatcttataagccagtgagaaataattgttacc 431  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |   ||||||| ||||||| |||||||||| ||  ||||||| ||||||||||    
T  15667874 tattaccaacatcaacaaaagttggaagtccactagttatcaagccctatcaataagcaagtaaaataatcttataaacccatgagaaagaattgttacc 15667973  T
Q  432 aacaagaacaataatgtgtggttcaatgacttgatgatatgtta-accgagcaggagatattcaagtcatttgatgatgttgatattattcgaacat 527  Q
    ||||||| |||  |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  15667974 aacaagatcaaggatgtgtggttcaataacttgatgatatgttataccgagcgggagatattcaagtcacttgatgatgttgatattattcgaacat 15668070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 95; E-Value: 4e-46
Query Start/End: Original strand, 7 - 197
Target Start/End: Original strand, 9741167 - 9741360
Alignment:
Q  7 tataatcaatttttagaataaaatcttgaagtgacttaactagaataattctccttaactatgaactattataccattcactcaaaccaatcctcaatac 106  Q
    |||||| ||||||||||||||| | || |||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||| |  ||||||||| ||||||||    
T  9741167 tataattaatttttagaataaatttttaaagtaacttaactagaataattctcactaactatgaactattatacgatttatgcaaaccaatactcaatac 9741266  T
Q  107 tctcctgaattaaaatttatatatactccatt--tcttttaatttatagtaacaaaatttgaatcacta-tcataatagcttattagacaaaat 197  Q
    || |   ||| |||||||||||||||||||||  ||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  9741267 tcacaaaaatcaaaatttatatatactccattgctctttcaatttatggtaaccaaatttgaatcactattcataatagcttattagacaaaat 9741360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 93; E-Value: 6e-45
Query Start/End: Original strand, 431 - 585
Target Start/End: Original strand, 43137127 - 43137283
Alignment:
Q  431 caacaagaacaataatgtgtggttcaatgacttgatgatatgtta-accgagcaggagatattcaagtcatttgatgatgttgatattattcgaacattc 529  Q
    |||||||| |||  |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  43137127 caacaagatcaacgatgtatggttcaatgacttgatgatatgttacaccgagcgggagatattcaagtcacttgatgatgttgatattattcgaacattc 43137226  T
Q  530 accgc-agaggtcttagaaagatcatttacctcctaattttatttagcacactattg 585  Q
     |||| |||||||| |||||    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43137227 gccgcaagaggtctcagaaaaggtatttacctcctaattttatttagcacactattg 43137283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 91; E-Value: 9e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 227
Target Start/End: Original strand, 15667579 - 15667806
Alignment:
Q  1 gattattataatcaatttttagaataaaatcttgaagtgacttaactagaataattctccttaactatgaactattataccattcactcaaaccaatcct 100  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| ||||  ||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||| ||||||||| | ||||||||| ||    
T  15667579 gattattataatcaattttaagaataaattcttatagtgacttaactaaaataattctcccaaactatgaactatgataccattcgcccaaaccaatact 15667678  T
Q  101 caatactctcctgaattaaaatttatatatactccatt--tcttttaatttatagtaacaaaatttgaatcact-atcataatagcttattagacaaaat 197  Q
    |||||||| |   ||| ||||| | |||||||||  ||  || |||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||| |||||    
T  15667679 caatactcacagaaatcaaaatctctatatactctgttgctcatttaatttatcgtaacaaaatttgaatcactgttcataatagc-tattagataaaat 15667777  T
Q  198 gacataatatcaagttataacttacaatca 227  Q
    |||||| ||| |||||| ||||||||||||    
T  15667778 gacatactat-aagttacaacttacaatca 15667806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 88; E-Value: 5e-42
Query Start/End: Original strand, 431 - 603
Target Start/End: Original strand, 31989029 - 31989204
Alignment:
Q  431 caacaagaacaataatgtgtggttcaatgacttgatgatatgtta-accgagcaggagatattcaagtcatttgatgatgttgatattattcgaacattc 529  Q
    |||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  31989029 caacaagatcaacaatgtgtggttgaatgacttgatgatatgttacaccgagcgggagatattcaagtcacttgatgatgttgatattattcgaacattc 31989128  T
Q  530 ac-cg-cagaggtcttagaaagatcatttacctcctaattttatttagcacactattgacatgttatgtttcatct 603  Q
    || ||  |||||||   |||||  ||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||| ||||| ||||||||    
T  31989129 actcgaaagaggtcgcggaaagggcatttacctcctaattttatttagcacgccattaacaggttatatttcatct 31989204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 431 - 603
Target Start/End: Complemental strand, 24908568 - 24908393
Alignment:
Q  431 caacaagaacaataatgtgtggttcaatgacttgatgatatgtta-accgagcaggagatattcaagtcatttgatgatgttgatattattcgaacattc 529  Q
    |||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  24908568 caacaagatcaacaatgtgtggttgaatgacttgatgatatgttacaccaagcaggagatattcaagtcgcttgaagatgttgatattattcgaacattc 24908469  T
Q  530 ac-cg-cagaggtcttagaaagatcatttacctcctaattttatttagcacactattgacatgttatgtttcatct 603  Q
    || ||  |||||||   |||||   |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||| ||||||||    
T  24908468 actcgaaagaggtcgcggaaagggtatttacctcctaattttatttagcacgctattcacaggttatatttcatct 24908393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 431 - 603
Target Start/End: Original strand, 53710398 - 53710573
Alignment:
Q  431 caacaagaacaataatgtgtggttcaatgacttgatgatatgtta-accgagcaggagatattcaagtcatttgatgatgttgatattattcgaacattc 529  Q
    |||||||| ||| ||||  ||||| |||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  53710398 caacaagatcaacaatggatggttgaatgacttgatgatctgttacaccgagcgggagatattcaagtcacttgatgatgttgatattattcgaacattc 53710497  T
Q  530 ac-cg-cagaggtcttagaaagatcatttacctcctaattttatttagcacactattgacatgttatgtttcatct 603  Q
    || ||  |||||||   |||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||| ||||    
T  53710498 actcgaaagaggtcacggaaagggcatttacctcctaattttatttagcacgctattgacaggttatattttatct 53710573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 431 - 601
Target Start/End: Complemental strand, 37382044 - 37381871
Alignment:
Q  431 caacaagaacaataatgtgtggttcaatgacttgatgatatgtta-accgagcaggagatattcaagtcatttgatgatgttgatattattcgaacattc 529  Q
    |||||||| |||  |||||||||| ||||||| |||||||| ||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  37382044 caacaagatcaacgatgtgtggttaaatgactcgatgatatattacactgagcatgagatattcaagtcatttgatgatgtttatattattcgaacattc 37381945  T
Q  530 accgc--agaggtcttagaaagatcatttacctcctaattttatttagcacactattgacatgttatgtttcat 601  Q
    || ||  ||||||||  ||||   ||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||| ||||||    
T  37381944 actgcaaagaggtctcggaaatgacatttgcctcctaattttattcagcacgctattgacaggttatatttcat 37381871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 9 - 105
Target Start/End: Original strand, 22527115 - 22527211
Alignment:
Q  9 taatcaatttttagaataaaatcttgaagtgacttaactagaataattctccttaactatgaactattataccattcactcaaaccaatcctcaata 105  Q
    |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||    
T  22527115 taatcaatatttagaataaaattttgaagtgacttaactagaataattctccataactgtgaactattatatcattcactcaaaacaatactcaata 22527211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 497 - 604
Target Start/End: Complemental strand, 24988921 - 24988812
Alignment:
Q  497 tcatttgatgatgttgatattattcgaacattcaccgc--agaggtcttagaaagatcatttacctcctaattttatttagcacactattgacatgttat 594  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||  |||||  ||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||    
T  24988921 tcatttgatgatgttgatattattcgaacattcaccgcaaagaggtctcggaaagggcatgtatctcctaattttatttagcacactattgccagattat 24988822  T
Q  595 gtttcatctc 604  Q
    ||||||||||    
T  24988821 gtttcatctc 24988812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 494 - 604
Target Start/End: Complemental strand, 22934910 - 22934798
Alignment:
Q  494 aagtcatttgatgatgttgatattattcgaacattcaccgc--agaggtcttagaaagatcatttacctcctaattttatttagcacactattgacatgt 591  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||  ||||| ||||||||||| ||||||| ||||  |||||||||| || |    
T  22934910 aagtcacttgatgatgttgatattattagaacattcaccgcaaagaggtctcggaaaggtcatttacctcttaattttgtttaagacactattgatatat 22934811  T
Q  592 tatgtttcatctc 604  Q
    ||| |||||||||    
T  22934810 tatatttcatctc 22934798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 1 - 92
Target Start/End: Complemental strand, 24989146 - 24989055
Alignment:
Q  1 gattattataatcaatttttagaataaaatcttgaagtgacttaactagaataattctccttaactatgaactattataccattcactcaaa 92  Q
    ||||| |||||| |||||| |||||||| || |||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  24989146 gattactataattaattttaagaataaattcctgaagtgagttaactaaaataattctccataactatgaattattataccattcacccaaa 24989055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 66
Target Start/End: Complemental strand, 3858691 - 3858626
Alignment:
Q  1 gattattataatcaatttttagaataaaatcttgaagtgacttaactagaataattctccttaact 66  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  3858691 gattactataatcaatttttagaataaattcttaaagtgacttaactagaataattctccctaact 3858626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 552 - 603
Target Start/End: Complemental strand, 51408660 - 51408609
Alignment:
Q  552 catttacctcctaattttatttagcacactattgacatgttatgtttcatct 603  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  51408660 catttacctcctaattttatttagcacgctattgacatgttatatttcatct 51408609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 1 - 57
Target Start/End: Original strand, 3345443 - 3345499
Alignment:
Q  1 gattattataatcaatttttagaataaaatcttgaagtgacttaactagaataattc 57  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  3345443 gattactataatcaatttttaaaataaattcgtgaagtgacttaactagaataattc 3345499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 450 - 521
Target Start/End: Original strand, 43585836 - 43585908
Alignment:
Q  450 tggttcaatgacttgatgatatgtta-accgagcaggagatattcaagtcatttgatgatgttgatattattc 521  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||| | |||| |||||| |||||||||    
T  43585836 tggttgaatgacttgatgatatgttacaccgagcgggagatatccaagttacttgacgatgttaatattattc 43585908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 553 - 604
Target Start/End: Original strand, 9743393 - 9743444
Alignment:
Q  553 atttacctcctaattttatttagcacactattgacatgttatgtttcatctc 604  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||    
T  9743393 atttacctcgtaattttatttagcacactattggtaggttatgtttcatctc 9743444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 271 - 325
Target Start/End: Original strand, 9741427 - 9741480
Alignment:
Q  271 taataaatcagattttatcttctaatttttggatctttaacaatagcgggtgcac 325  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  9741427 taataaatcagattttaactt-taatttgtggatcttcaacaatagcgggtgcac 9741480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 535 - 584
Target Start/End: Original strand, 38282514 - 38282563
Alignment:
Q  535 agaggtcttagaaagatcatttacctcctaattttatttagcacactatt 584  Q
    ||||||||  |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  38282514 agaggtctcggaaagagcatttacctcataattttatttagcacactatt 38282563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 553 - 587
Target Start/End: Original strand, 5135410 - 5135444
Alignment:
Q  553 atttacctcctaattttatttagcacactattgac 587  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  5135410 atttacctcataattttatttagcacactattgac 5135444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 312 - 350
Target Start/End: Original strand, 9743337 - 9743374
Alignment:
Q  312 aatagcgggtgcaccaaagttattaccaacatcaacaaa 350  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  9743337 aatagcgggtgcaccaaagttattacc-acatcaacaaa 9743374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 142 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 24989011 - 24988960
Alignment:
Q  142 tttaatttatagtaacaaaatttgaatcactat-cataatagcttattagacaaa 195  Q
    |||||||||| |||||||   |||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  24989011 tttaatttatggtaacaa---ttgaatcactatacataatagcttattagacaaa 24988960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 552 - 584
Target Start/End: Original strand, 43585933 - 43585965
Alignment:
Q  552 catttacctcctaattttatttagcacactatt 584  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  43585933 catttacctcctaattttatttagcacgctatt 43585965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 244; Significance: 1e-135; HSPs: 14)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 244; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 8 - 603
Target Start/End: Complemental strand, 12181125 - 12180525
Alignment:
Q  8 ataatcaatttttagaataaaatcttgaagtgacttaactagaataattctccttaactatgaactattataccattcactcaaaccaatcctca----- 102  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||         
T  12181125 ataatcaatttttagaataaattcttgaagtggcttaattagaataattctccctaactatgaactattataccattcatccaaaccaatactcacggaa 12181026  T
Q  103 -------atactctcctgaattaaaatttatatatactccatttct--tttaatttatagtaacaaaatttgaatcactatc-ataatagcttattagac 192  Q
           |||||| | | ||| |||||||| |||||||||||| ||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  12181025 atactcaatactcgcataaatcaaaatttacatatactccattgctcatttaatttatggtaacaaaatttgaatcactatttataatagcttattagac 12180926  T
Q  193 aaaatgacataatatcaagttataacttacaatcacttaatacctnnnnnnncatacaatcatttatacaacaaggcataataaatcagattttatcttc 292  Q
    ||||      || |  |||     || ||||||||||| |||||        | ||||||||||| |||| ||| ||||||| |||||||||||| ||||    
T  12180925 aaaa------aaaa--aag-----acatacaatcacttcatacccaaaaaaacttacaatcatttctacatcaaagcataatgaatcagattttaacttc 12180839  T
Q  293 taatttttggatctttaacaatagcgggtgcaccaaagttattaccaacatcaacaaaagttggaagtccaccagttatcaagccttgctaataagctag 392  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||  |||||||| |    
T  12180838 taatttgtggatcttcaacaatagcgggtgcgccaaagttattacaaacatcaacaaaagttgaaagtccatcagttatcaagccctgtcaataagctgg 12180739  T
Q  393 taaaagaatcttataagccagtgagaaataattgttaccaacaagaacaataatgtgtggttcaatgacttgatgatatgtta-accgagcaggagatat 491  Q
    ||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||| ||    
T  12180738 taaaataatcttataagcccgtgagaaaaaattgttaccaacaagatcaacattgtgtggttcaatgacttgatgatatgttacaccgagtgggagaaat 12180639  T
Q  492 tcaagtcatttgatgatgttgatattattcgaacattcaccgc--agaggtcttagaaagatcatttacctcctaattttatttagcacactattgacat 589  Q
    |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||  | |||  ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||     
T  12180638 tcaagtcacttgatgttgttgatattattcgaacattcaccgcaaagaggtctcgggaagggcatttaccttctaattttatttagcacattattgacag 12180539  T
Q  590 gttatgtttcatct 603  Q
    ||||||||||||||    
T  12180538 gttatgtttcatct 12180525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 177; E-Value: 4e-95
Query Start/End: Original strand, 189 - 604
Target Start/End: Original strand, 11970718 - 11971135
Alignment:
Q  189 agacaaaatgacataatatcaagttataacttacaatcacttaatacctnnnnnnncatacaatcatttatacaacaaggcataataaatcagattttat 288  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||| |       | |||||||| || ||||||| |||||||||||||| ||||||     
T  11970718 agacaaaatgacatactatcaagttacaacttacaatcacttcatacataaaaaaacttacaatcacttctacaacagggcataataaatcaaattttaa 11970817  T
Q  289 cttctaatttttggatctttaacaatagcgggtgcaccaaagttattaccaacatcaacaaaagttggaagtccaccagttatcaagccttgctaataag 388  Q
     ||||||||| | |||||| || ||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||  ||||||||| |||| |||| ||      ||||     
T  11970818 tttctaatttctagatcttcaaaaatagcgggtgcagcaaagctattaccaacatcagcaaaagtatgaagtccactagttgtcaaaccccatctataat 11970917  T
Q  389 ctagtaaaagaatcttataagccagtgagaaataattgttaccaacaagaacaataatgtgtggttcaatgacttgatgatatgtta-accgagcaggag 487  Q
    ||||||||| ||| |||||||   |||||||| |||||||||||| |||| |||  |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| | ||    
T  11970918 ctagtaaaataattttataagtatgtgagaaagaattgttaccaataagatcaacgatgtgtggttcaatgacttgatcatatgttacaccgagcggaag 11971017  T
Q  488 atattcaagtcatttgatgatgttgatattattcgaacattcaccgca-gaggtcttagaaagatcatttacctcctaattttatttagcacactattga 586  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||| | ||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11971018 atattcaagtcacttgatgatgttgatattttgcgaacattcaccgaaagaggtctcagaaagggcatttacctcctaattttatttagcacactattga 11971117  T
Q  587 catgttatgtttcatctc 604  Q
    || |||||||||||||||    
T  11971118 caggttatgtttcatctc 11971135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 134; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 1 - 377
Target Start/End: Original strand, 25340038 - 25340425
Alignment:
Q  1 gattattataatcaatttttagaataaaatcttgaagtgacttaactagaataattctccttaactatgaactattataccattcactcaaaccaatcct 100  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| || |||| |||| ||    
T  25340038 gattattgtaatcaatttttagaataaatttttgaagtggcttaactagaataattctccctaactatgaactattatacaatttacccaaatcaatact 25340137  T
Q  101 caatactctcctgaattaaaatttatatatactccatt--tcttttaatttatagtaacaaaatttgaatcacta-tcataatagcttattagacaaaat 197  Q
    |||||||| |   ||| ||||| |||| |||||| |||  || ||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  25340138 caatactcacagaaatcaaaatctatagatactctattgctcattttatttatggtaacaaaatttgaatcactattcataatagtttattagacaaaat 25340237  T
Q  198 gacataatatcaagttataacttacaatcactta------------atacctnnnnnnncatacaatcatttatacaacaaggcataataaatcagattt 285  Q
    |||||| |||||| ||| || |||||||||||||            ||||||         |||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||    
T  25340238 gacatactatcaaattacaatttacaatcacttatacaatcacttcataccttaaaaaaattacaatcacttctacaacaacgcataataaatcagattt 25340337  T
Q  286 tatcttctaatttttggatctttaacaatagcgggtgcaccaaagttattaccaacatcaacaaaagttggaagtccaccagttatcaagcc 377  Q
    || |||||||||  |||||||| |||||    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||| |||||||    
T  25340338 taacttctaattcgtggatcttcaacaa----gggttcaccaaagttattaccaacatcaacaaaagttgaaagtccatcggttgtcaagcc 25340425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 88; E-Value: 5e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 8036052 - 8035797
Alignment:
Q  1 gattattataatcaatttttagaataaaatcttgaagtgacttaactagaataattctccttaactatgaactattataccattcactc----aaaccaa 96  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||    || ||||    
T  8036052 gattactataatcaatttttagaataaattcttgaagtgacttaactagaataattctccctaactatgaactattatatcattcattcaccaaatccaa 8035953  T
Q  97 tcctcaatactc-------tcctgaat-----taaaatt-------tatatatactccatt--tcttttaatttatagtaacaaaatttgaatcacta-t 174  Q
    | ||||||||||       | || |||     |||||||       |||||||||||||||  || |||||||||| ||||||||||||||||||| | |    
T  8035952 tactcaatactcatagaaatactcaatactcataaaattcaaaatctatatatactccattgctcatttaatttatggtaacaaaatttgaatcacgatt 8035853  T
Q  175 cataatagcttattagacaaaatgacataatatcaagttataacttacaatcactt 230  Q
    | ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  8035852 cctaatagcttatcagacaaaatgacatactatcaagttataacttacaatcactt 8035797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 83; E-Value: 5e-39
Query Start/End: Original strand, 1 - 107
Target Start/End: Original strand, 30621078 - 30621184
Alignment:
Q  1 gattattataatcaatttttagaataaaatcttgaagtgacttaactagaataattctccttaactatgaactattataccattcactcaaaccaatcct 100  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  30621078 gattactataatcaatttttagaataaattgttgaagtgacttaattagaataattctccctaactatgaactattataccattcactcaaaccaatact 30621177  T
Q  101 caatact 107  Q
    |||||||    
T  30621178 caatact 30621184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 414 - 604
Target Start/End: Original strand, 25340428 - 25340620
Alignment:
Q  414 tgagaaataattgttaccaacaagaacaataatgtgtggttcaatgacttgatgatatgtta-accgagcaggagatattcaagtcatttgatgatgttg 512  Q
    |||||||||| || ||||||||||| |||| ||||||| || | ||| |||||||||||||| ||| ||  | ||||||| |||||| ||||||||||||    
T  25340428 tgagaaataagtgctaccaacaagatcaatgatgtgtgattaagtgatttgatgatatgttacacccagtggaagatatttaagtcacttgatgatgttg 25340527  T
Q  513 atattattcgaacattcacc--gcagaggtcttagaaagatcatttacctcctaattttatttagcacactattgacatgttatgtttcatctc 604  Q
    ||||||||||||||||||||    |||||||| ||||||  ||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||  ||||||||||||||    
T  25340528 atattattcgaacattcaccataaagaggtctcagaaagtgcatttacctcctaatttta-ttaacacactattggcagattatgtttcatctc 25340620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 476 - 588
Target Start/End: Original strand, 3050909 - 3051023
Alignment:
Q  476 accgagcaggagatattcaagtcatttgatgatgttgatattattcgaacattcaccg--cagaggtcttagaaagatcatttacctcctaattttattt 573  Q
    ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||   ||||||||  |||||| |||||||| |||||||||||||    
T  3050909 accgagcgggagatattcaagtcacttgatgatgttgatattattcaaacattcaccggaaagaggtctcggaaagagcatttaccacctaattttattt 3051008  T
Q  574 agcacactattgaca 588  Q
    |||||||||||||||    
T  3051009 agcacactattgaca 3051023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 71; E-Value: 7e-32
Query Start/End: Original strand, 431 - 604
Target Start/End: Original strand, 24074412 - 24074588
Alignment:
Q  431 caacaagaacaataatgtgtggttcaatgacttgatgatatgtta-accgagcaggagatattcaagtcatttgatgatgttgatattattcgaacattc 529  Q
    |||||||| ||| ||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  24074412 caacaagatcaacaatgtgtggtaaaatgacttgatgatatgttacaccgagggggagatattcaagttacttgatgatgttgatattattcgaacattc 24074511  T
Q  530 -accg--cagaggtcttagaaagatcatttacctcctaattttatttagcacactattgacatgttatgtttcatctc 604  Q
     ||||   ||||||||  ||| || |||||||||||||||||||||||||||  | ||||||  |||| |||||||||    
T  24074512 aaccggaaagaggtctcggaatga-catttacctcctaattttatttagcacgtttttgacagattatatttcatctc 24074588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 66; E-Value: 7e-29
Query Start/End: Original strand, 118 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 8035912 - 8035702
Alignment:
Q  118 aaaatttatatatactccatttct--tttaatttatagtaacaaaatttgaatcactat-cataatagcttattagacaaaatgacataatatcaagtta 214  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||  |||||||||| ||||||||||||||||||| || | ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  8035912 aaaatctatatatactccattgctcatttaatttatggtaacaaaatttgaatcacgattcctaatagcttatcagacaaaatgacatactatcaagtta 8035813  T
Q  215 taacttacaatcactta------------atacctnnnnnnncatacaatcatttatacaacaaggcataataaatcagattttatcttctaatttttgg 302  Q
    ||||||||||||||||             ||||||       | |||||||| || ||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||| |||    
T  8035812 taacttacaatcacttctaaaatcacttcatacctaaaaaaacttacaatcacttctacaacagggcataataaatcatattttaacttctaatttgtgg 8035713  T
Q  303 atctttaacaa 313  Q
    ||||| |||||    
T  8035712 atcttcaacaa 8035702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 451 - 604
Target Start/End: Original strand, 25599172 - 25599331
Alignment:
Q  451 ggttcaatgacttgatgatatgtta-accgagcaggagatattcaagtcatttgatgatgttgatattattcgaacat---tcaccgc--agaggtctta 544  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| | ||||  ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||   ||| |||  ||||||||      
T  25599172 ggttcaatgacttgatggtatgttacatcgagtgggagataatcaagtcacttgatgatgttgatattattcgaacattcatcatcgcaaagaggtctcg 25599271  T
Q  545 gaaagatcatttacctcctaattttatttagcacactattgacatgttatgtttcatctc 604  Q
    |||||  ||||||| ||||||||| ||||| |||||||||| || ||||| |||||||||    
T  25599272 gaaagggcatttacgtcctaatttgatttaacacactattggcaagttatatttcatctc 25599331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 484 - 580
Target Start/End: Original strand, 30621227 - 30621324
Alignment:
Q  484 ggagatattcaagtcatttgatgatgttgatattattcgaacattcaccg-cagaggtcttagaaagatcatttacctcctaattttatttagcacac 580  Q
    ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||  |||||  ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  30621227 ggagataatcaagtcacttgatgatgttgatattattcgaacattcatcgaaagaggtctcggaaaggacatttacctcctaattttatttaacacac 30621324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 445 - 604
Target Start/End: Complemental strand, 32442132 - 32441973
Alignment:
Q  445 atgtgtggttcaatgacttgatgatatgtta-accgagcaggagatattcaagtcatttgatgatgttgatattattcgaacattcaccgca--gaggtc 541  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||| | ||||| | |  ||| |||||||||||||||||||||||||||||| | ||  |||||     
T  32442132 atgtgtggttcaatgactt-atgatatgttacatcgagcggaagataataa--tcacttgatgatgttgatattattcgaacattcatcccaaagaggta 32442036  T
Q  542 ttagaaagatcatttacctcctaattttatttagcacactattgacatgttatgtttcatctc 604  Q
    |  |||||  |||||||||| |||||||||||||||||| |||| || ||||||||| |||||    
T  32442035 tcggaaagggcatttacctcttaattttatttagcacaccattggcaagttatgttttatctc 32441973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 303 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 8035551 - 8035479
Alignment:
Q  303 atctttaacaatagcgggtgcaccaaagttattaccaacatcaacaaaagttggaagtccaccagttatcaag 375  Q
    ||||| |||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  8035551 atcttcaacagtagcaggtgcaccaaagctattaccaacatcaacaaaagttggaagtccacgagttgtcaag 8035479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 477 - 603
Target Start/End: Original strand, 1296556 - 1296684
Alignment:
Q  477 ccgagcaggagatattcaagtcatttgatgatgttgatattattcgaacattcac--cgcagaggtcttagaaagatcatttacctcctaattttattta 574  Q
    |||||| |||||||||||||||| |||||||| || ||||||||| || ||||||     ||||||||  |||||  |||||||||||| ||||||||||    
T  1296556 ccgagcgggagatattcaagtcacttgatgatattaatattattcaaatattcacaataaagaggtctcggaaaggccatttacctccttattttattta 1296655  T
Q  575 gcacactattgacatgttatgtttcatct 603  Q
     |||||||| | || ||||| ||||||||    
T  1296656 ccacactatcggcaggttatatttcatct 1296684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 202; Significance: 1e-110; HSPs: 37)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 247 - 604
Target Start/End: Complemental strand, 13152753 - 13152393
Alignment:
Q  247 tacaatcatttatacaacaaggcataataaatcagattttatcttctaatttttggatctttaacaatagcgggtgcaccaaagttattaccaacatcaa 346  Q
    |||||||| || ||||||  || ||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||| || ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  13152753 tacaatcacttctacaacggggtataataaattagattttaacttctaatttgtggatcttcaataatagagggtgcaccaaagctattaccaacatcaa 13152654  T
Q  347 caaaagttggaagtccaccagttatcaagccttgctaataagctagtaaaagaatcttataagccagtgagaaataattgttaccaacaagaacaataat 446  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||| ||  || |||||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| || |||   |    
T  13152653 caaaagttggaagtacaccagttatcaagccatgtcaaaaagctagtaaaataatcttataagcccgtgagaaagaattgttaccaacatgatcaacgct 13152554  T
Q  447 gtgtggttcaatgacttgatgatatgtta-accgagcaggagatattcaagtcatttgatgatgttgatattattcgaacattcaccgc--agaggtctt 543  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||  ||||||||     
T  13152553 gtgtggttcaatgacttgatgatatgttacatcgagcgggagatattcaagtcatttgatgatgttggtattattccaacattcatcgcaaagaggtctc 13152454  T
Q  544 agaaagatcatttacctcctaattttatttagcacactattgacatgttatgtttcatctc 604  Q
     |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  13152453 ggaaagggcatttacctcctaattttatttagcacactattgacaagttatgtttcatctc 13152393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 118 - 604
Target Start/End: Original strand, 28846290 - 28846781
Alignment:
Q  118 aaaatttatatatactccatttct--tttaatttatagtaacaaaatttgaatcactat-cataatagcttattagacaaaatgacataatatcaagtta 214  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||  |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  28846290 aaaatctatatatactccattgctcatttaatttatggtaacaaaatttgaatcactattcataatagcttattagacaaaatgacatactatcaagtta 28846389  T
Q  215 taact------------tacaatcacttaatacctnnnnnnncat---acaatcatttatacaacaaggcataataaatcagattttatcttctaatttt 299  Q
     ||||            ||||||||||| ||||          ||   |||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||     
T  28846390 caacttactatcacttttacaatcacttcatacaaaaaaaaaaatcttacaatcatttctacaacatgacataataaatcagattttaacttctaatttg 28846489  T
Q  300 tggatctttaacaatagcgggtgcaccaaagttattaccaacatcaacaaaagttggaagtccaccagttatcaagccttgctaataagctagtaaaaga 399  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||  ||| || ||  ||||||||||||||| |    
T  28846490 tggatcttcaacaatatcgggtgcaccaaagctataaccaacatcaacaaaagttgtaagtctaccagttgccaaaccctgtcaataagctagtaaaata 28846589  T
Q  400 atcttataagccagtgagaaataattgttaccaacaagaacaataatgtgtggttcaatgacttgatgatatgttaaccgagcaggagatattcaagtca 499  Q
    |||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||  ||||  | ||||| ||||||||||||||||    
T  28846590 atcttataagtccgtgagaaagaattgttaccaacaagatcaacgatgtgtggttcaatgacttgatg--atgtacatcgagcgggagatattcaagtca 28846687  T
Q  500 tttgatgatgttgatattattcgaacattcaccgcagaggtcttagaaagatcatttacctcctaattttatttagcacactattgacatgttatgtttc 599  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||           ||||  |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||    
T  28846688 cttgatgatgttgatattattcgaacattcaccgc-----------aaagggcatttacctcataattttatttagcacacttttgacagattatgtttc 28846776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 170; E-Value: 6e-91
Query Start/End: Original strand, 2 - 586
Target Start/End: Original strand, 14446404 - 14446990
Alignment:
Q  2 attattataatcaatttttagaataaaatcttgaagtgacttaactagaataattctccttaactatgaactattataccattcactcaaaccaatcctc 101  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||  |||| |||||||||  ||||||||| |||    
T  14446404 attactataatcaatttttagaataaattgttgaagtgacttaactagaataatttttcataactatgatatattgtaccattcatccaaaccaatactc 14446503  T
Q  102 aatactctcctgaattaaaatttatatatactccatt-tcttttaatttatagtaacaaaatttgaatcactat-cataatagcttattagacaaaatga 199  Q
    || |||| |              ||| |||||| ||  || |||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |    
T  14446504 aacactcac--------------atacatactcaatactcgtttaatttatggcaacaaaatttgaatcactattcataataacttattagacaaaataa 14446589  T
Q  200 cataatatcaagttataacttacaatcactta------------atacctnnnnnnncatacaatcatttatacaacaaggcataataaatcagatttta 287  Q
    |||| ||| |||||| ||||| |||||||||             ||||||       | |||||||| || |||||||   |||||||||| ||||||||    
T  14446590 catactataaagttacaacttgcaatcacttctacaatcacctcatacctaaaagaacttacaatcacttctacaacataacataataaattagatttta 14446689  T
Q  288 tcttctaatttttggatctttaacaatagcgggtgcaccaaagttattaccaacatcaacaaaagttggaagtccaccagttatcaagccttgctaataa 387  Q
     |||||||||| ||||  || |||||||  |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| | ||  |||||    
T  14446690 acttctaatttgtggaatttcaacaatattgggtacaccaaagctattaccaacatcaacaaaagttggaagtccaccagtagtcaagtcctgtcaataa 14446789  T
Q  388 gctagtaaaagaatcttataagccagtgagaaataattgttaccaacaagaacaataatgtgtggttcaatgacttgatgatatgtta-accgagcagga 486  Q
    |||||||||| ||||||||||| | | |||||| |||||||||| |||||| |||  || |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||   ||    
T  14446790 gctagtaaaataatcttataagtctgcgagaaagaattgttacc-acaagatcaacgatttgtggttcaatgacttgatgatatgttacaccaagagaga 14446888  T
Q  487 gatattcaagtcatttgatgatgttgatattattcgaacattcaccgc--agaggtcttagaaagatcatttacctcctaattttatttagcacactatt 584  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||  ||||||||  |||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  14446889 gatattcaagtcacttgatgatgttgatattattctaacattcactgcaaagaggtctcggaaaggacattcacctcctaattttatttagcacactatt 14446988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 165; E-Value: 6e-88
Query Start/End: Original strand, 247 - 604
Target Start/End: Original strand, 27190595 - 27190947
Alignment:
Q  247 tacaatcatttatacaacaaggcataataaatcagattttatcttctaatttttggatctttaacaatagcgggtgcaccaaagttattaccaacatcaa 346  Q
    |||||||| || ||||||  | ||||||||||| ||||||| |||||||||| | |||||        |||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  27190595 tacaatcacttctacaactggacataataaatctgattttaacttctaatttgtagatct--------agcgagtgcaccaaagctattaccaacatcaa 27190686  T
Q  347 caaaagttggaagtccaccagttatcaagccttgctaataagctagtaaaagaatcttataagccagtgagaaataattgttaccaacaagaacaataat 446  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||  || |||||||||||| ||||||||||||| | |||||| ||||||||| ||||||| |||  ||    
T  27190687 caaaagttggaagtccaccagttgtcaagccatgtcaacaagctagtaaaataatcttataagcccgcgagaaagaattgttacaaacaagatcaacgat 27190786  T
Q  447 gtgtggttcaatgacttgatgatatgtt-aaccgagcaggagatattcaagtcatttgatgatgttgatattattcgaacattcaccgc--agaggtctt 543  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||||  ||| ||||     
T  27190787 gtgtggttcaatgacttgatgatatgttgcacctagcgggagatattcaagtcacttgatgatgttgatattactcgaatattcaccgcaaagatgtctc 27190886  T
Q  544 agaaagatcatttacctcctaattttatttagcacactattgacatgttatgtttcatctc 604  Q
    ||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||    
T  27190887 agaaaggacatttacctcctaattttatttagtacactattggcaagttatgtttcatctc 27190947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 144; E-Value: 2e-75
Query Start/End: Original strand, 310 - 604
Target Start/End: Original strand, 24333593 - 24333893
Alignment:
Q  310 acaatagcgggtgcaccaaagttattaccaacatcaacaaaagttggaagtccaccagttatcaagccttgctaataagctagtaaaagaatcttataag 409  Q
    |||||||| |||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||| ||||  ||||||||||||||| |||||||||||    
T  24333593 acaatagcaggtgcaccaaaactattaccaacatcaataaaagttggaagtccaccggttgtcaagtcttgtcaataagctagtaaaataatcttataag 24333692  T
Q  410 ccagtgagaaataattgttaccaacaagaacaataatgtgtggttcaatgacttgatgatatgtta-accgagcaggagatattcaagtcatttgatgat 508  Q
    || |||||||| ||||||||||||||||| |||  |||| || ||||||||||| ||||||||||| || |||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  24333693 cccgtgagaaagaattgttaccaacaagatcaacgatgtatgattcaatgactttatgatatgttacactgagcgggagatattcaagtcacttgatgat 24333792  T
Q  509 gttgatattattcgaacatt---caccgca--gaggtcttagaaagatcatttacctcctaattttatttagcacactattgacatgttatgtttcatct 603  Q
    ||| ||||||||||||||||   |||| ||  |||||||  ||||||  ||||||||| | |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  24333793 gttaatattattcgaacattattcaccacaaagaggtctcggaaagagaatttacctcatgattttatttagcacactattgaccggttatgtttcatct 24333892  T
Q  604 c 604  Q
    |    
T  24333893 c 24333893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 98; E-Value: 6e-48
Query Start/End: Original strand, 431 - 604
Target Start/End: Complemental strand, 30791633 - 30791457
Alignment:
Q  431 caacaagaacaataatgtgtggttcaatgacttgatgatatgtta-accgagcaggagatattcaagtcatttgatgatgttgatattattcgaacattc 529  Q
    |||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||    
T  30791633 caacaagatcaagaatgagtggttcaatgacttgatgatatgttacaccgagcgggagatattcaagtcacttgatgacattgatattattcgaacattc 30791534  T
Q  530 accgc--agaggtcttagaaagatcatttacctcctaattttatttagcacactattgacatgttatgtttcatctc 604  Q
    |||||  ||||||||  |||||  |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||    
T  30791533 accgcaaagaggtctcggaaagggcatttaccacctaattttatttagcacgctattgacaggttatatttcatctc 30791457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 394 - 604
Target Start/End: Original strand, 9256355 - 9256565
Alignment:
Q  394 aaaagaatcttataagccagtgagaaataattgttaccaacaagaacaataatgtgtggttcaatgacttgatgatatgtta-accgagcaggagatatt 492  Q
    |||| ||||||||||||  |||||||| ||||   ||||| | || |||| |||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||    
T  9256355 aaaataatcttataagcacgtgagaaagaatt---accaatatgatcaatgatgtgtggtttaatgacttgatgatatgttacatcgagcgggagatatt 9256451  T
Q  493 caagtcatttgatgatgttgatattattcgaacattcaccgc--agaggtcttagaaagatcatttacctcctaattttatttagcacactattgacatg 590  Q
    ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| |||  ||||||||   |||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  9256452 caagtcacttgatgatgttgatataattcgaacattcatcgcaaagaggtctcgcaaatgacatttacctcctaattttatttagcacactattgacaag 9256551  T
Q  591 ttatgtttcatctc 604  Q
    ||||||||||||||    
T  9256552 ttatgtttcatctc 9256565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 431 - 603
Target Start/End: Original strand, 21958512 - 21958687
Alignment:
Q  431 caacaagaacaataatgtgtggttcaatgacttgatgatatgtta-accgagcaggagatattcaagtcatttgatgatgttgatattattcgaacatt- 528  Q
    |||||||| ||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||     
T  21958512 caacaagatcaacaatatgtggttgaatgacttgatgatatgttacaccgagcaggagatattcgagtcacttgatgatgttgatattattcgaacatta 21958611  T
Q  529 -caccgcagaggtcttagaaagatcatttacctcctaattttatttagcacactattgacatgttatgtttcatct 603  Q
     | |   |||||||   |||||   |||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||| ||||||||    
T  21958612 actcaaaagaggtcgcggaaagggaatttacctcctaattttatttagcacgctattggcaggttatatttcatct 21958687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 431 - 585
Target Start/End: Complemental strand, 16532806 - 16532649
Alignment:
Q  431 caacaagaacaataatgtgtggttcaatgacttgatgatatgtta-accgagcaggagatattcaagtcatttgatgatgttgatattattcgaacattc 529  Q
    |||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||   ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  16532806 caacaagatcaacgatgtgtggttcaatgacttgatgatatgttataccaagtgagagatattcaagtcacttgatgatgttgatattattcaaacattc 16532707  T
Q  530 accgc--agaggtcttagaaagatcatttacctcctaattttatttagcacactattg 585  Q
    |||||  |||| | |  |||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  16532706 accgcaaagagatatcggaaagggcatttacctcctaattttatttagcacgctattg 16532649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 247 - 358
Target Start/End: Original strand, 9256237 - 9256348
Alignment:
Q  247 tacaatcatttatacaacaaggcataataaatcagattttatcttctaatttttggatctttaacaatagcgggtgcaccaaagttattaccaacatcaa 346  Q
    |||||||| || | ||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  9256237 tacaatcacttcttcaacatggcataataaatcagattttaacttttaatttgtggatcttcaacgatagcgggtgcaccaaagctattaccaacatcaa 9256336  T
Q  347 caaaagttggaa 358  Q
    ||||||||||||    
T  9256337 caaaagttggaa 9256348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 110
Target Start/End: Original strand, 23448791 - 23448900
Alignment:
Q  1 gattattataatcaatttttagaataaaatcttgaagtgacttaactagaataattctccttaactatgaactattataccattcactcaaaccaatcct 100  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||| ||    
T  23448791 gattactataatcaatttttagaataaatttttgaagtgacttaactagaataattctcactaactatgaactattatatcattcacccaaacaaatact 23448890  T
Q  101 caatactctc 110  Q
    || |||||||    
T  23448891 cattactctc 23448900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 68; E-Value: 5e-30
Query Start/End: Original strand, 1 - 108
Target Start/End: Complemental strand, 13152979 - 13152872
Alignment:
Q  1 gattattataatcaatttttagaataaaatcttgaagtgacttaactagaataattctccttaactatgaactattataccattcactcaaaccaatcct 100  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| | | |||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||    
T  13152979 gattactataatcaatttttagaataaattgtagaagtgacttaaatagaatagttctccctaactatgaactattataccattcactcaaatcaatact 13152880  T
Q  101 caatactc 108  Q
     |||||||    
T  13152879 taatactc 13152872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 494 - 585
Target Start/End: Original strand, 32372022 - 32372115
Alignment:
Q  494 aagtcatttgatgatgttgatattattcgaacattcaccgca--gaggtcttagaaagatcatttacctcctaattttatttagcacactattg 585  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32372022 aagtcacttgatgatgttgatattattcgaacattcaccgcaaagaggtctcaaaaaggtcatttacctcctaattttatttagcacactattg 32372115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 66; E-Value: 7e-29
Query Start/End: Original strand, 7 - 108
Target Start/End: Original strand, 9256013 - 9256113
Alignment:
Q  7 tataatcaatttttagaataaaatcttgaagtgacttaactagaataattctccttaactatgaactattataccattcactcaaaccaatcctcaatac 106  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||    
T  9256013 tataatcaatttttagaataaattgttgaagtgacttaactagaat-attctccctatctatgaactattataccattcacccaaaccaataatcaatac 9256111  T
Q  107 tc 108  Q
    ||    
T  9256112 tc 9256113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 476 - 604
Target Start/End: Complemental strand, 10014564 - 10014434
Alignment:
Q  476 accgagcaggagatattcaagtcatttgatgatgttgatattattcgaacattcaccgca--gaggtcttagaaagatcatttacctcctaattttattt 573  Q
    ||||||| | ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |  ||| | || |||||  ||||||||||||||||||||||    
T  10014564 accgagcggaagatattcatgtcacttgatgatgttgatattattcaaacattcaccggaaagagattttggaaagggcatttacctcctaattttattt 10014465  T
Q  574 agcacactattgacatgttatgtttcatctc 604  Q
    |||||| ||||||||| |||| |||||||||    
T  10014464 agcacattattgacatattatatttcatctc 10014434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 453 - 604
Target Start/End: Original strand, 10467786 - 10467927
Alignment:
Q  453 ttcaatgacttgatgatatgtta-accgagcaggagatattcaagtcatttgatgatgttgatattattcgaacattcaccgcagaggtcttagaaagat 551  Q
    ||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||           |||||      
T  10467786 ttcaatgacttgatgatatgttacatcgagcgggagataatcaagtcatttgatgatgttgatattattcgaacatgcatcg-----------gaaaggg 10467874  T
Q  552 catttacctcctaattttatttagcacactattgacatgttatgtttcatctc 604  Q
     ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  10467875 tatttacctcataattttatttagcacaatattgacaagttatgtttcatctc 10467927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 494 - 604
Target Start/End: Original strand, 32342880 - 32342992
Alignment:
Q  494 aagtcatttgatgatgttgatattattcgaacattcaccgcaga--ggtcttagaaagatcatttacctcctaattttatttagcacactattgacatgt 591  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |  ||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||    
T  32342880 aagtcacttgatgatgttgatattattcgaacattcactgcaaaaaggtctcaaaaaggtcatttacctcctaattttatttagcacaccattggtatgt 32342979  T
Q  592 tatgtttcatctc 604  Q
    ||| |||||||||    
T  32342980 tatatttcatctc 32342992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 494 - 604
Target Start/End: Original strand, 32355367 - 32355479
Alignment:
Q  494 aagtcatttgatgatgttgatattattcgaacattcaccgcaga--ggtcttagaaagatcatttacctcctaattttatttagcacactattgacatgt 591  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |  ||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||    
T  32355367 aagtcacttgatgatgttgatattattcgaacattcactgcaaaaaggtctcaaaaaggtcatttacctcctaattttatttagcacaccattggtatgt 32355466  T
Q  592 tatgtttcatctc 604  Q
    ||| |||||||||    
T  32355467 tatatttcatctc 32355479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 147 - 237
Target Start/End: Original strand, 30694292 - 30694383
Alignment:
Q  147 tttatagtaacaaaatttgaatcactat-cataatagcttattagacaaaatgacataatatcaagttataacttacaatcacttaatacct 237  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||    
T  30694292 tttatggtaacaaaatttgaatcaccattcataatagcttaatagacaaaatgacataatattaagttacaacttacattcacttaatacct 30694383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 494 - 585
Target Start/End: Original strand, 32359486 - 32359579
Alignment:
Q  494 aagtcatttgatgatgttgatattattcgaacattcaccgca--gaggtcttagaaagatcatttacctcctaattttatttagcacactattg 585  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||| | |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32359486 aagtcacttgatgatgttgatattattcgaacattcactgcaaagaggtctcaaaaatgtcatttacctcctaattttatttagcacactattg 32359579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 1 - 108
Target Start/End: Original strand, 24332804 - 24332910
Alignment:
Q  1 gattattataatcaatttttagaataaaatcttgaagtgacttaactagaataattctccttaactatgaactattataccattcactcaaaccaatcct 100  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||||| | ||||| ||||||||||||||||||| | | ||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||| ||    
T  24332804 gattaatataatcaattttta-aataaattattgaattgacttaactagaataattattcctaactttgaactattataccgttcacccaaaccaatact 24332902  T
Q  101 caatactc 108  Q
     |||||||    
T  24332903 aaatactc 24332910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 496 - 600
Target Start/End: Complemental strand, 34228338 - 34228232
Alignment:
Q  496 gtcatttgatgatgttgatattattcgaacattcaccgca--gaggtcttagaaagatcatttacctcctaattttatttagcacactattgacatgtta 593  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||  |||||||| ||||   |||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||    
T  34228338 gtcacttgatgatgttgatattattcgaacatttaccacaaagaggtcttggaaattgcatttacctcctcattttatttatcacattattgacatgtta 34228239  T
Q  594 tgtttca 600  Q
    | |||||    
T  34228238 tatttca 34228232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 51; E-Value: 6e-20
Query Start/End: Original strand, 501 - 604
Target Start/End: Complemental strand, 40146114 - 40146009
Alignment:
Q  501 ttgatgatgttgatattattcgaacattcaccgca--gaggtcttagaaagatcatttacctcctaattttatttagcacactattgacatgttatgttt 598  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  ||  |||||||  ||||   ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||    
T  40146114 ttgatgatgttgatattattcgaacattcacaacaaagaggtctcggaaatggcatctacctcctaattttatttagcacactattggcagattatgttt 40146015  T
Q  599 catctc 604  Q
    ||||||    
T  40146014 catctc 40146009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 86
Target Start/End: Complemental strand, 40146343 - 40146258
Alignment:
Q  1 gattattataatcaatttttagaataaaatcttgaagtgacttaactagaataattctccttaactatgaactattataccattca 86  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||| |  |||||||||||    
T  40146343 gattactataatcaacttttagaataaattcttgaagtgacttaactaaaataattatccctaactatgaatttctataccattca 40146258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 108
Target Start/End: Original strand, 30694121 - 30694228
Alignment:
Q  1 gattattataatcaatttttagaataaaatcttgaagtgacttaactagaataattctccttaactatgaactattataccattcactcaaaccaatcct 100  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||| || ||||||||||| ||| | | ||||||| ||||||| || |||| |||| ||    
T  30694121 gattagtataatcaatttttagaataaattattgaagtggcttaagtataataattctccctaattgtaaactattgtaccattaacccaaatcaatact 30694220  T
Q  101 caatactc 108  Q
    ||||||||    
T  30694221 caatactc 30694228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 142 - 230
Target Start/End: Original strand, 23448953 - 23449038
Alignment:
Q  142 tttaatttatagtaacaaaatttgaatcactatcataatagcttattagacaaaatgacataatatcaagttataacttacaatcactt 230  Q
    ||||||| || ||||||||||| ||||   | |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||    
T  23448953 tttaattcatggtaacaaaattagaat---tttcataatagcttattagacaaaatgacatagtatcaagttacaaattacaatcactt 23449038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 553 - 604
Target Start/End: Complemental strand, 24592387 - 24592336
Alignment:
Q  553 atttacctcctaattttatttagcacactattgacatgttatgtttcatctc 604  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  24592387 atttacctcctaattttatttagcacactattggcaggttatgtttcatctc 24592336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 39 - 227
Target Start/End: Original strand, 27190361 - 27190563
Alignment:
Q  39 gacttaactagaataattctccttaactatgaactat----tataccattcactcaaaccaatcctca-----atactctcctgaattaaaatttatata 129  Q
    |||||||||||||||||| || |||||||| ||||||    |||| ||||||| || | |||| ||||     |||||| | | ||| ||||| ||||||    
T  27190361 gacttaactagaataattttctttaactattaactatatattatatcattcacccatatcaatactcacagaaatactcacataaatcaaaatctatata 27190460  T
Q  130 tactccatttct--tttaatttatagtaacaaaatttgaatcac--tat-cataatagcttattagacaaaatgacataatatcaagttataacttacaa 224  Q
    |||  |||| ||  |||||||||  |||||||||||||||||||  ||| |||||||| ||||  |||||||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  27190461 tacatcattgctcatttaatttacggtaacaaaatttgaatcacactattcataatagtttatcggacaaaatgacatactatcaagttacaacttacaa 27190560  T
Q  225 tca 227  Q
    |||    
T  27190561 tca 27190563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 247 - 330
Target Start/End: Original strand, 23449068 - 23449144
Alignment:
Q  247 tacaatcatttatacaacaaggcataataaatcagattttatcttctaatttttggatctttaacaatagcgggtgcaccaaag 330  Q
    |||||||| || ||||||| |||||||||||||||||||||       |||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23449068 tacaatcacttttacaacagggcataataaatcagatttta-------atttgtggatctttaacaatagcgggtgcaccaaag 23449144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 552 - 604
Target Start/End: Original strand, 42447049 - 42447101
Alignment:
Q  552 catttacctcctaattttatttagcacactattgacatgttatgtttcatctc 604  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||    
T  42447049 catttacctcctaattttatttagcacactaatgacaagttatatttcatctc 42447101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 180 - 237
Target Start/End: Original strand, 24333291 - 24333348
Alignment:
Q  180 tagcttattagacaaaatgacataatatcaagttataacttacaatcacttaatacct 237  Q
    |||||||||||| |||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  24333291 tagcttattagataaaatggcatactatcaagttacaacttacaatcacttcatacct 24333348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 9 - 68
Target Start/End: Original strand, 28841500 - 28841557
Alignment:
Q  9 taatcaatttttagaataaaatcttgaagtgacttaactagaataattctccttaactat 68  Q
    |||||||||||||||||||| |||| |  ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  28841500 taatcaatttttagaataaattcttaa--tgacttaactagaataattctccataactat 28841557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 497 - 535
Target Start/End: Complemental strand, 2826411 - 2826373
Alignment:
Q  497 tcatttgatgatgttgatattattcgaacattcaccgca 535  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  2826411 tcatttgataatgttgatattattcgaacattcaccgca 2826373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 552 - 587
Target Start/End: Original strand, 3435409 - 3435444
Alignment:
Q  552 catttacctcctaattttatttagcacactattgac 587  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  3435409 catttacctcctaactttatttagcacactattgac 3435444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 552 - 587
Target Start/End: Complemental strand, 40470521 - 40470486
Alignment:
Q  552 catttacctcctaattttatttagcacactattgac 587  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  40470521 catttaccttctaattttatttagcacactattgac 40470486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 448 - 520
Target Start/End: Original strand, 42446935 - 42447008
Alignment:
Q  448 tgtggttcaatgacttgatgatatgtta-accgagcaggagatattcaagtcatttgatgatgttgatattatt 520  Q
    ||||||| |||||| |||| |||||||| | ||||| | |||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||    
T  42446935 tgtggttgaatgacgtgattatatgttacatcgagcggaagatattcaagtcacttgatgacgtttatattatt 42447008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 7 - 39
Target Start/End: Complemental strand, 42446927 - 42446895
Alignment:
Q  7 tataatcaatttttagaataaaatcttgaagtg 39  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  42446927 tataatcaatttttagaataaattcttgaagtg 42446895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 174; Significance: 3e-93; HSPs: 31)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 174; E-Value: 3e-93
Query Start/End: Original strand, 247 - 604
Target Start/End: Original strand, 9230217 - 9230577
Alignment:
Q  247 tacaatcatttatacaacaaggcataataaatcagattttatcttctaatttttggatctttaacaatagcgggtgcaccaaagttattaccaacatcaa 346  Q
    |||||||| || ||||||| | |||||| |||||||||||| | ||| |||| | ||| || |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  9230217 tacaatcacttctacaacatgacataattaatcagattttaacatcttatttgtcgatattcaacaatagcgggtgcaccaaagctattatcaacatcaa 9230316  T
Q  347 caaaagttggaagtccaccagttatcaagccttgctaataagctagtaaaagaatcttataagccagtgagaaataattgttaccaacaagaacaataat 446  Q
    |||||||||||| | || ||||||||||||| ||  ||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||| |||||||||||||| |  |||  ||    
T  9230317 caaaagttggaaatacatcagttatcaagccatgtcaataagctagtaaaataatcttataagcccgttagaaaaaattgttaccaacatggtcaacgat 9230416  T
Q  447 gtgtggttcaatgacttgatgatatgtta-accgagcaggagatattcaagtcatttgatgatgttgatattattcgaacattcaccgc--agaggtctt 543  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |  |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||| |     
T  9230417 gtgtggttcaatgacttgatgatatgttacatagagcgggagatactcaagtcatttgatgatgttgatattattcgaacattcatcgcaaagaggtatc 9230516  T
Q  544 agaaagatcatttacctcctaattttatttagcacactattgacatgttatgtttcatctc 604  Q
      ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  9230517 gaaaagggcatttacctcctaattttatttagcacactattgacaaggtatgtttcatctc 9230577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 170; E-Value: 6e-91
Query Start/End: Original strand, 247 - 535
Target Start/End: Original strand, 43727812 - 43728101
Alignment:
Q  247 tacaatcatttatacaacaaggcataataaatcagattttatcttctaatttttggatctttaacaatagcgggtgcaccaaagttattaccaacatcaa 346  Q
    |||||||| || |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  43727812 tacaatcacttctacaacaaggcataataaatcagactttaacttctaattcgtggatcttcaacaatagcgggtgcaccaaagctattaccaacatcaa 43727911  T
Q  347 caaaagttggaagtccaccagttatcaagccttgctaataagctagtaaaagaatcttataagccagtgagaaataattgttaccaacaagaacaataat 446  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||  | ||  ||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||| |||||||||||||| || |||  ||    
T  43727912 caaaagttggaagtacaccagttatcaactcatgtcaataagctagtaaaataatcttataagcctatgagaaagaattgttaccaacatgatcaacgat 43728011  T
Q  447 gtgtggttcaatgacttgatgatatgtta-accgagcaggagatattcaagtcatttgatgatgttgatattattcgaacattcaccgca 535  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | ||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  43728012 gtgtggttcaatgacttgatgatatgttatatcgaacgggagatattcaagtcagttgatgatgttgatattattcaaacattcatcgca 43728101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 160; E-Value: 6e-85
Query Start/End: Original strand, 164 - 604
Target Start/End: Complemental strand, 23180331 - 23179885
Alignment:
Q  164 tgaatcactat-cataatagcttattagacaaaatgacataatatcaagttataacttacaatcacttaatacctnnnnnnncatacaatcatttataca 262  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||| ||| ||       | |||||||| || ||||    
T  23180331 tgaatcactattcataatagcttattaaataaaatgacataat--caagttacaacttacaatcacttcatatctaaaaaaacttacaatcacttctaca 23180234  T
Q  263 acaaggcataataaatcagattttatcttctaatttttggatctt---taacaatagcgggtgcaccaaagttattaccaacatcaacaaaagttggaag 359  Q
    |||  ||||||||||| ||| ||||  || |||||| |||||||    |||||| |  ||||     |||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  23180233 acagagcataataaattagaatttaatttttaatttgtggatctacaataacaaaat-gggtatcttaaagctattaccaacatcaacaaaagttggaag 23180135  T
Q  360 tccacca---gttatcaagccttgctaataagctagtaaaagaatcttataagccagtgagaaataattgttaccaacaagaacaataatgtgtggttca 456  Q
    | | |||   |||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||| ||||    
T  23180134 tactccacgggttatcaagctttgccaataagctagtaaaataatcttataagctcgtgagaaataattgttaccaacaagatcaacgatgtgtgtttca 23180035  T
Q  457 atgacttgatgatatgtta-accgagcaggagatattcaagtcatttgatgatgttgatattattcgaacattcaccgc--agaggtcttagaaagatca 553  Q
    || |||||||||||||||| |||||||  |||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||  ||    
T  23180034 ataacttgatgatatgttacaccgagcgagagatattcaaggcacttgataatgttgatattattcgaacattcaccgcaaagaggtcttggaaagggca 23179935  T
Q  554 tttacctcctaattttatttagcacactattgacatgttatgtttcatctc 604  Q
    |||| |||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  23179934 ttta-ctcctaatttaatttagcacactattgacaagttatgtttcatctc 23179885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 131; E-Value: 1e-67
Query Start/End: Original strand, 17 - 307
Target Start/End: Original strand, 25023994 - 25024288
Alignment:
Q  17 ttttagaataaaatcttgaagtgacttaactagaataattctccttaactatgaactattataccattcactcaaaccaatcctcaatactctcctgaat 116  Q
    |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| | | |||    
T  25023994 ttttagaataaattcttgaagtggcttaactagaataattctccctaactataaactattataccattcacccaaaccaatactcaatactcacataaat 25024093  T
Q  117 taaaatttatatatactccatt--tcttttaatttatagtaacaaaatttgaatcacta-tcataatagcttattagacaaaatgacataatatcaagtt 213  Q
     ||||| |||||||||||||||  || |||||||||| |||||||||||||| | |||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  25024094 caaaatctatatatactccattgctcatttaatttatggtaacaaaatttgatttactattcataatagcttatcagacaaaatgacatactatcaagtt 25024193  T
Q  214 ataacttacaatcacttaatacct-nnnnnnncatacaatcatttatacaacaaggcataataaatcagattttatcttctaatttttggatctt 307  Q
    | || |||||||||||| ||||||        | |||||||| || ||||||||||||| |||||||| ||||||  ||||||||| | ||||||    
T  25024194 acaaattacaatcacttcatacctaaaaataacttacaatcacttctacaacaaggcatgataaatcaaattttaaattctaatttgtagatctt 25024288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 100; E-Value: 4e-49
Query Start/End: Original strand, 431 - 603
Target Start/End: Complemental strand, 27387481 - 27387306
Alignment:
Q  431 caacaagaacaataatgtgtggttcaatgacttgatgatatgtta-accgagcaggagatattcaagtcatttgatgatgttgatattattcgaacattc 529  Q
    |||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  27387481 caacaagatcaacaatgtgtggttgaatgacttgatgatatgttacaccgagcgggagatattcaagtcacttgatgatgttgatattattcgaacattc 27387382  T
Q  530 ac-cg-cagaggtcttagaaagatcatttacctcctaattttatttagcacactattgacatgttatgtttcatct 603  Q
    || ||  |||||||   |||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||    
T  27387381 actcgaaagaggtcgcggaaagagcatttacctcctaattttatttagcacgctattgacaggttatatttcatct 27387306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 98; E-Value: 6e-48
Query Start/End: Original strand, 431 - 604
Target Start/End: Complemental strand, 26493889 - 26493713
Alignment:
Q  431 caacaagaacaataatgtgtggttcaatgacttgatgatatgtta-accgagcaggagatattcaagtcatttgatgatgttgatattattcgaacattc 529  Q
    ||||||||  || ||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  26493889 caacaagatgaacaatgtgtggttaaatgacttgatgatacgttacaccgagcgggagatattcaagtcacttgatgatgttgatattattcgaacattc 26493790  T
Q  530 accg--cagaggtcttagaaagatcatttacctcctaattttatttagcacactattgacatgttatgtttcatctc 604  Q
    ||||   ||||||||  |||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||    
T  26493789 accgtaaagaggtctcggaaagggcatttacctcctaattttatttagcacgctattgacaggttatatttcatctc 26493713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 415 - 599
Target Start/End: Original strand, 8638598 - 8638786
Alignment:
Q  415 gagaaataattgttaccaacaagaacaataatgtgtggttcaatgacttgatgatatgtta-accgagcaggagatattcaagtcatttgatgatgttga 513  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||  | |||||||| ||| |||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||| | ||    
T  8638598 gagaaagaattgttaccaacaagatcaacgacgtgtggtttaattacttgatgatatgttataccgaacaagagatattcaagtcatttgatgatatcga 8638697  T
Q  514 tattattcgaacattcaccgcaga---ggtcttagaaagatcatttacctcctaattttatttagcacactattgacatgttatgtttc 599  Q
    ||||||||||||||||| |||| |   |||||  |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| | || ||||||||||    
T  8638698 tattattcgaacattcaacgcaaagagggtctcggaaagggcatttacctcctaattttatttagcacactatcggcaagttatgtttc 8638786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 431 - 603
Target Start/End: Original strand, 19399978 - 19400153
Alignment:
Q  431 caacaagaacaataatgtgtggttcaatgacttgatgatatgtta-accgagcaggagatattcaagtcatttgatgatgttgatattattcgaacattc 529  Q
    |||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  19399978 caacaagatcaacaatgtgtggttgaatgacttgatgatatgttacaccgagcgggagatattcaagtcgcttgatgatgttgatattattcgaacattc 19400077  T
Q  530 ac-cg-cagaggtcttagaaagatcatttacctcctaattttatttagcacactattgacatgttatgtttcatct 603  Q
    || ||  |||||||   |||||   |||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||| ||||||||    
T  19400078 actcgaaagaggtcgcggaaagggtatttacctcctaattttatttagcacgctattggcaggttatatttcatct 19400153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 431 - 603
Target Start/End: Complemental strand, 38575464 - 38575289
Alignment:
Q  431 caacaagaacaataatgtgtggttcaatgacttgatgatatgtta-accgagcaggagatattcaagtcatttgatgatgttgatattattcgaacattc 529  Q
    |||||| | ||| |||| |||||| || ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  38575464 caacaatatcaacaatgggtggttgaacgacttgatgatatgttacaccgagcgggagatattaaagtcacttgatgatgttgatattattcgaacattc 38575365  T
Q  530 ac-cg-cagaggtcttagaaagatcatttacctcctaattttatttagcacactattgacatgttatgtttcatct 603  Q
    || ||  |||||||   |||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||    
T  38575364 actcgaaagaggtcgcggaaagaacatttacctcctaattttatttagcacgctattgacaggttatatttcatct 38575289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 81; E-Value: 8e-38
Query Start/End: Original strand, 431 - 604
Target Start/End: Original strand, 45197644 - 45197819
Alignment:
Q  431 caacaagaacaataatgtgtggttcaatgacttgatgatatgttaaccgagcaggagatattcaagtcatttgatgatgttgatattattcgaacattca 530  Q
    |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  45197644 caacaagatcaacaatgtgtggttcaatgacttgatgatatattcatcgagcaggagatattcaagtcacttgacgatgttgatattgttcgaacattca 45197743  T
Q  531 ccgc--agaggtcttagaaagatcatttacctcctaattttatttagcacactattgacatgttatgtttcatctc 604  Q
    || |  ||||||||  |  ||  ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||  | ||||| |||||||||    
T  45197744 ccacaaagaggtctcggggagggcatttacatcctaattttatttagcaccctattggtaggttatatttcatctc 45197819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 108
Target Start/End: Complemental strand, 26786829 - 26786722
Alignment:
Q  1 gattattataatcaatttttagaataaaatcttgaagtgacttaactagaataattctccttaactatgaactattataccattcactcaaaccaatcct 100  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |    
T  26786829 gattactataatcaatttttagaataaattgttgaagtgacttaactagaataattctccataactatgaactattataccattcacccaaaccaatatt 26786730  T
Q  101 caatactc 108  Q
    ||||||||    
T  26786729 caatactc 26786722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 1 - 103
Target Start/End: Original strand, 9230038 - 9230140
Alignment:
Q  1 gattattataatcaatttttagaataaaatcttgaagtgacttaactagaataattctccttaactatgaactattataccattcactcaaaccaatcct 100  Q
    ||||| |||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  9230038 gattactatactcaatttttagaataaattgttgaagtgacttaactagaataattctccctaactatgaactattataccattcactcaaaccaatact 9230137  T
Q  101 caa 103  Q
    |||    
T  9230138 caa 9230140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 303 - 430
Target Start/End: Original strand, 25024455 - 25024582
Alignment:
Q  303 atctttaacaatagcgggtgcaccaaagttattaccaacatcaacaaaagttggaagtccaccagttatcaagccttgctaataagctagtaaaagaatc 402  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||| || || |||||||||||||||| ||||    
T  25024455 atcttcaacaatagcggatgcaccaaagctattaccagcatcaacaaaagttggaagtccaccaattgtcaatccatgttaataagctagtaaaataatc 25024554  T
Q  403 ttataagccagtgagaaataattgttac 430  Q
    ||||||||| | |||||  |||||||||    
T  25024555 ttataagccggcgagaaggaattgttac 25024582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 1 - 108
Target Start/End: Original strand, 43727595 - 43727702
Alignment:
Q  1 gattattataatcaatttttagaataaaatcttgaagtgacttaactagaataattctccttaactatgaactattataccattcactcaaaccaatcct 100  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || | |||  ||    
T  43727595 gattactataatcaatttttagaataaattgttgaagtgacttaactagaataattctccctaactatgaactattataccattcacccagatcaaaact 43727694  T
Q  101 caatactc 108  Q
    ||||||||    
T  43727695 caatactc 43727702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Original strand, 5287151 - 5287370
Alignment:
Q  1 gattattataatcaatttttagaataaaatcttgaagtgacttaactagaataattctccttaactatgaactattataccattcactcaaaccaatcct 100  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||  ||||||||||||||||||  ||| ||| |||||||||| ||||||| |||||||         
T  5287151 gattactataatcaatttttagaataatttcttgaagtggtttaactagaataattctcgctaattattaactattatatcattcacccaaacca----- 5287245  T
Q  101 caatactctcctgaattaaaatttatatatactccatt--tcttttaatttatagtaacaaaatttgaatcact-atcataatagcttattagacaaaat 197  Q
             | | ||| ||||| || |||| |||||||  || |||||||||| || ||||||||||||||| |  ||||||||||||||  ||||||||    
T  5287246 ---------cataaatcaaaatctacatattctccattgctcatttaatttatggtgacaaaatttgaatcagtgttcataatagcttatcggacaaaat 5287336  T
Q  198 gacataatatcaagttataacttacaatcactta 231  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  5287337 gacatactatcaagttacaacttacaatcactta 5287370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 61; E-Value: 7e-26
Query Start/End: Original strand, 313 - 436
Target Start/End: Complemental strand, 24276521 - 24276397
Alignment:
Q  313 atagcgggtgcaccaaagttattaccaacatcaacaaaagttggaagtccaccagttatcaagcct-tgctaataagctagtaaaagaatcttataagcc 411  Q
    |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |   ||||||||||||||  |||||||||| |     
T  24276521 atagcgggtgcaccaaagctataaccaacatcaacaaaagttggaagtccaccagttgtcaagactctatcaataagctagtaaattaatcttataacct 24276422  T
Q  412 agtgagaaataattgttaccaacaa 436  Q
     || ||||| |||||||||||||||    
T  24276421 cgttagaaagaattgttaccaacaa 24276397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 303 - 433
Target Start/End: Original strand, 5287940 - 5288070
Alignment:
Q  303 atctttaacaatagcgggtgcaccaaagttattaccaacatcaacaaaagttggaagtccaccagttatcaagccttgctaataagctagtaaaagaatc 402  Q
    ||||| || ||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||  | ||  ||||||||||||||| ||||    
T  5287940 atcttcaaaaatagcgggtgtaccaaagctattaccatcatcaacaaaagttggaagtccaccggttgtcaaatcctgtcaataagctagtaaaataatc 5288039  T
Q  403 ttataagccagtgagaaataattgttaccaa 433  Q
    ||| ||||  |||||||| || |||||||||    
T  5288040 ttacaagctcgtgagaaagaagtgttaccaa 5288070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 342 - 471
Target Start/End: Complemental strand, 23804762 - 23804633
Alignment:
Q  342 atcaacaaaagttggaagtccaccagttatcaagccttgctaataagctagtaaaagaatcttataagccagtgagaaataattgttaccaacaagaaca 441  Q
    ||||||||||||| ||||||| || ||| ||||||  ||  ||||||||||||||| |||||||||||   |||||||| ||| ||||||||||||| ||    
T  23804762 atcaacaaaagttagaagtccccccgttgtcaagctctgtcaataagctagtaaaataatcttataagtttgtgagaaagaatggttaccaacaagatca 23804663  T
Q  442 ataatgtgtggttcaatgacttgatgatat 471  Q
    |  |||||||||||||||||||| ||||||    
T  23804662 acgatgtgtggttcaatgacttgttgatat 23804633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 1 - 79
Target Start/End: Complemental strand, 24276597 - 24276519
Alignment:
Q  1 gattattataatcaatttttagaataaaatcttgaagtgacttaactagaataattctccttaactatgaactattata 79  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||| ||||    
T  24276597 gattactataatcaatttttagaataaattcttgaagtgacttaactagaataattatccctaactataaactaatata 24276519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 501 - 601
Target Start/End: Original strand, 14088819 - 14088921
Alignment:
Q  501 ttgatgatgttgatattattcgaacattcaccgca--gaggtcttagaaagatcatttacctcctaattttatttagcacactattgacatgttatgttt 598  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||| || ||||  |||||||  ||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||    
T  14088819 ttgatgatgctgatattattcaaacatccatcgcaaagaggtctcggaaaaggcatttacctcctaattttatttagcacactattgacaagttatattt 14088918  T
Q  599 cat 601  Q
    |||    
T  14088919 cat 14088921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 501 - 601
Target Start/End: Original strand, 14398837 - 14398939
Alignment:
Q  501 ttgatgatgttgatattattcgaacattcaccgca--gaggtcttagaaagatcatttacctcctaattttatttagcacactattgacatgttatgttt 598  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||| || ||||  |||||||  ||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||    
T  14398837 ttgatgatgctgatattattcaaacatccatcgcaaagaggtctcggaaaaggcatttacctcctaattttatttagcacactattgacaagttatattt 14398936  T
Q  599 cat 601  Q
    |||    
T  14398937 cat 14398939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 501 - 601
Target Start/End: Complemental strand, 25491738 - 25491636
Alignment:
Q  501 ttgatgatgttgatattattcgaacattcaccgca--gaggtcttagaaagatcatttacctcctaattttatttagcacactattgacatgttatgttt 598  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| | |  ||||||| | |||   ||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||||| |||    
T  25491738 ttgatgatgttgatattattcgaacattcactgtaaagaggtctcaaaaaaggcatttacttcctgattttatttatcacactattgacatgttatattt 25491639  T
Q  599 cat 601  Q
    |||    
T  25491638 cat 25491636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 445 - 530
Target Start/End: Original strand, 18375420 - 18375506
Alignment:
Q  445 atgtgtggttcaatgacttgatgatatgtta-accgagcaggagatattcaagtcatttgatgatgttgatattattcgaacattca 530  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||| |  |||| |||||||||||| ||| | ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  18375420 atgtgtggttcaatgacttgatgatatattacatggagcgggagatattcaaatcactagataatgttgatattattcgaacattca 18375506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 552 - 600
Target Start/End: Complemental strand, 26782365 - 26782317
Alignment:
Q  552 catttacctcctaattttatttagcacactattgacatgttatgtttca 600  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  26782365 catttacctcctaattttatttagcacactattgacaagttatgtttca 26782317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 503 - 604
Target Start/End: Original strand, 25024596 - 25024699
Alignment:
Q  503 gatgatgttgatattattcgaacattcaccgca--gaggtcttagaaagatcatttacctcctaattttatttagcacactattgacatgttatgtttca 600  Q
    |||||||||||||   |||| ||||||||| ||  ||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||| ||||   |||||||||||||| |||||    
T  25024596 gatgatgttgataagtttcggacattcaccacaaagaggtctcagaaagggcatttacctcctaattttattaagcatgttattgacatgttatatttca 25024695  T
Q  601 tctc 604  Q
    ||||    
T  25024696 tctc 25024699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 259 - 307
Target Start/End: Original strand, 5287725 - 5287773
Alignment:
Q  259 tacaacaaggcataataaatcagattttatcttctaatttttggatctt 307  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  5287725 tacaacaagacataataaatcagattttaacttctaatttgtggatctt 5287773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 28 - 108
Target Start/End: Complemental strand, 28041727 - 28041647
Alignment:
Q  28 aatcttgaagtgacttaactagaataattctccttaactatgaactattataccattcactcaaaccaatcctcaatactc 108  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||| |||| || |||||||  ||||  ||| ||||||||||    
T  28041727 aatcttgaagtggcttaactagaataattctctctaactatgacctatcatgccattcatccaaataaatactcaatactc 28041647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 553 - 584
Target Start/End: Original strand, 9557813 - 9557844
Alignment:
Q  553 atttacctcctaattttatttagcacactatt 584  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9557813 atttacctcctaattttatttagcacactatt 9557844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 545 - 604
Target Start/End: Original strand, 10224008 - 10224067
Alignment:
Q  545 gaaagatcatttacctcctaattttatttagcacactattgacatgttatgtttcatctc 604  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||  |||| |||||||||    
T  10224008 gaaagaccatttacctcctaattttatttaccacactatcggcagattatatttcatctc 10224067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 552 - 587
Target Start/End: Complemental strand, 10868502 - 10868467
Alignment:
Q  552 catttacctcctaattttatttagcacactattgac 587  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  10868502 catttacctcctaattttatttagcacacttttgac 10868467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 99 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 28041637 - 28041560
Alignment:
Q  99 ctcaatactctcctgaattaaaatttatatatactccatttct--tttaatttatagtaacaaaatttgaatcactat 174  Q
    |||||||||| | | ||| ||||| |||||||||| |||| ||  |||||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  28041637 ctcaatactcacataaatcaaaatgtatatatacttcattgctcatttaatttatggtaacataatttgaatcactat 28041560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0002 (Bit Score: 107; Significance: 2e-53; HSPs: 1)
Name: scaffold0002
Description:

Target: scaffold0002; HSP #1
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 344 - 585
Target Start/End: Complemental strand, 435617 - 435366
Alignment:
Q  344 caacaaaagttggaagtccaccagttatcaagccttgctaataagctagtaaaagaatcttataagccagtgagaaataattgttaccaacaagaacaat 443  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| |||| || ||  |||||| |||||||| ||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  435617 caacaaaagttcgaagtccaccagttgtcaacccatgtcaataagttagtaaaataatcttataagctcgtgagaaaaaattgttaccaacaagatcaat 435518  T
Q  444 aatgtgtggttcaatgacttgatgatatgtta------accgagcaggagatattcaagtcatttgatgatgttgatattattcgaac--attcaccgc- 534  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| ||      ||||||| | |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||  ||| |||||     
T  435517 aatgtgtggctcaatgacttgatgatatgatatgttacaccgagcggaagatattcaagtcacttgattatgttgatattattagaacatattaaccgcg 435418  T
Q  535 -agaggtcttagaaagatcatttacctcctaattttatttagcacactattg 585  Q
     ||||||||   ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  435417 aagaggtctcgaaaaggacatttacctcctaattttatttagcacactattg 435366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0019 (Bit Score: 98; Significance: 6e-48; HSPs: 1)
Name: scaffold0019
Description:

Target: scaffold0019; HSP #1
Raw Score: 98; E-Value: 6e-48
Query Start/End: Original strand, 431 - 604
Target Start/End: Complemental strand, 135029 - 134853
Alignment:
Q  431 caacaagaacaataatgtgtggttcaatgacttgatgatatgtta-accgagcaggagatattcaagtcatttgatgatgttgatattattcgaacattc 529  Q
    ||||||||  || ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  135029 caacaagatgaacaatgtgtggttaaatgacttgatgatatgttacaccgagcgggagatattcaagtcacttgatgatgttgatattattcgaacattc 134930  T
Q  530 accg--cagaggtcttagaaagatcatttacctcctaattttatttagcacactattgacatgttatgtttcatctc 604  Q
    ||||   ||||||||  |||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||| |||||||||    
T  134929 accggaaagaggtctcggaaagggcatttacctcctaattttatttagcacgctattgataggttatatttcatctc 134853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0007 (Bit Score: 82; Significance: 2e-38; HSPs: 1)
Name: scaffold0007
Description:

Target: scaffold0007; HSP #1
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 431 - 604
Target Start/End: Original strand, 259918 - 260094
Alignment:
Q  431 caacaagaacaataatgtgtggttcaatgacttgatgatatgtta-accgagcaggagatattcaagtcatttgatgatgttgatattattcgaacattc 529  Q
    |||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||| |||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||    
T  259918 caacaagatcaacaatgagtggttcaatgacttgatgatatgttacatcgagcgggatatattcaagtcacttgatgacattgatattattcgaacattc 260017  T
Q  530 accgc--agaggtcttagaaagatcatttacctcctaattttatttagcacactattgacatgttatgtttcatctc 604  Q
    |||||  ||||||||  ||||   |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||  |||| |||||||||    
T  260018 accgcaaagaggtctcggaaatggcatttaccacctaattttatttagcacgctattgacagattatatttcatctc 260094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0015 (Bit Score: 77; Significance: 2e-35; HSPs: 1)
Name: scaffold0015
Description:

Target: scaffold0015; HSP #1
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 431 - 603
Target Start/End: Complemental strand, 214336 - 214161
Alignment:
Q  431 caacaagaacaataatgtgtggttcaatgacttgatgatatgtta-accgagcaggagatattcaagtcatttgatgatgttgatattattcgaacatt- 528  Q
    |||||||| ||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||     
T  214336 caacaagatcaacaatatgtggttgaatgacttgatgatatgttacaccgagcaggagatattcgagtcacttgatgatgttgatattattcgaacatta 214237  T
Q  529 -caccgcagaggtcttagaaagatcatttacctcctaattttatttagcacactattgacatgttatgtttcatct 603  Q
     | |   |||||||   |||||   |||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||| ||||||||    
T  214236 actcaaaagaggtcgcggaaagggaatttacctcctaattttatttagcacgctattggcaggttatatttcatct 214161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0726 (Bit Score: 67; Significance: 2e-29; HSPs: 3)
Name: scaffold0726
Description:

Target: scaffold0726; HSP #1
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 497 - 604
Target Start/End: Original strand, 950 - 1059
Alignment:
Q  497 tcatttgatgatgttgatattattcgaacattcaccgc--agaggtcttagaaagatcatttacctcctaattttatttagcacactattgacatgttat 594  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||  |||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||    
T  950 tcatttgatgatgttgatattattcgaacattcaccgcaaagaggtctccgaaagggcatttatctcctaattttatttagcacactattgccagattat 1049  T
Q  595 gtttcatctc 604  Q
    ||||||||||    
T  1050 gtttcatctc 1059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0726; HSP #2
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 1 - 92
Target Start/End: Original strand, 725 - 816
Alignment:
Q  1 gattattataatcaatttttagaataaaatcttgaagtgacttaactagaataattctccttaactatgaactattataccattcactcaaa 92  Q
    ||||| |||||| |||||| |||||||| || |||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  725 gattactataattaattttaagaataaattcctgaagtgagttaactaaaataattctccctaactatgaattattataccattcacccaaa 816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0726; HSP #3
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 142 - 195
Target Start/End: Original strand, 860 - 911
Alignment:
Q  142 tttaatttatagtaacaaaatttgaatcactat-cataatagcttattagacaaa 195  Q
    |||||||||| ||||||   ||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  860 tttaatttatggtaaca---tttgaatcactatacataatagcttattagacaaa 911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0198 (Bit Score: 64; Significance: 1e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold0198
Description:

Target: scaffold0198; HSP #1
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 465 - 604
Target Start/End: Original strand, 1430 - 1572
Alignment:
Q  465 atgatatgtta-accgagcaggagatattcaagtcatttgatgatgttgatattattcgaacattcaccgc--agaggtcttagaaagatcatttacctc 561  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||  ||||||||  ||||   ||||| ||||    
T  1430 atgatatgttacaccgagcgggagatattcaaatcacttgatgatgttgatattattcgaacattcattgcaaagaggtctcggaaatggcatttgcctc 1529  T
Q  562 ctaattttatttagcacactattgacatgttatgtttcatctc 604  Q
    |||||||||||||||| ||||| | |||| |||||||||||||    
T  1530 ctaattttatttagcatactatcggcatgctatgtttcatctc 1572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0168 (Bit Score: 62; Significance: 2e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold0168
Description:

Target: scaffold0168; HSP #1
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 431 - 584
Target Start/End: Original strand, 15814 - 15970
Alignment:
Q  431 caacaagaacaataatgtgtggttcaatgacttgatgatatgtta-accgagcaggagatattcaagtcatttgatgatgttgatattattcgaacattc 529  Q
    ||||||||  || |||| |||||| ||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||| |||||||  ||||||||||||||||||||    
T  15814 caacaagattaacaatgagtggttaaatgatttgatgatatgttacaccgagcgggagatattcaaatcacttgatgacattgatattattcgaacattc 15913  T
Q  530 accgc--agaggtcttagaaagatcatttacctcctaattttatttagcacactatt 584  Q
    |||||  |||  |||  |||||  |||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  15914 accgcaaagaaatctcggaaagggcatttacctcctaattttatctagcacgctatt 15970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012 (Bit Score: 54; Significance: 1e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0012
Description:

Target: scaffold0012; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 431 - 584
Target Start/End: Original strand, 197105 - 197261
Alignment:
Q  431 caacaagaacaataatgtgtggttcaatgacttgatgatatgtta-accgagcaggagatattcaagtcatttgatgatgttgatattattcgaacattc 529  Q
    ||||||||  || |||| |||||| ||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||| |||||||  |||||||||||| |||||||    
T  197105 caacaagattaacaatgagtggttaaatgaattgatgatatgttacaccgagcgggagatattcaaatcacttgatgacattgatattattcaaacattc 197204  T
Q  530 accgc--agaggtcttagaaagatcatttacctcctaattttatttagcacactatt 584  Q
    |||||  |||  |||   ||||  |||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  197205 accgcaaagaaatctcgaaaagggcatttacctcctaattttatctagcacgctatt 197261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0170 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0170
Description:

Target: scaffold0170; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 515 - 575
Target Start/End: Original strand, 9161 - 9223
Alignment:
Q  515 attattcgaacattcac-cgca-gaggtcttagaaagatcatttacctcctaattttatttag 575  Q
    ||||||||||||||||| || | |||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  9161 attattcgaacattcactcgaaagaggtcgtagaaaggacatttacctcctaattttatttag 9223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University