View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF9654_low_2 (Length: 502)

Name: NF9654_low_2
Description: NF9654
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF9654_low_2
NF9654_low_2
[»] chr3 (119 HSPs)
chr3 (11-483)||(25191297-25191769)
chr3 (15-376)||(21995-22357)
chr3 (11-375)||(52138718-52139084)
chr3 (15-376)||(5168750-5169117)
chr3 (16-373)||(47233596-47233955)
chr3 (11-375)||(28245355-28245721)
chr3 (81-373)||(35033136-35033428)
chr3 (18-376)||(53519511-53519865)
chr3 (11-376)||(54278938-54279304)
chr3 (11-376)||(51447714-51448073)
chr3 (11-374)||(54128296-54128662)
chr3 (11-274)||(33272122-33272392)
chr3 (124-376)||(48508268-48508520)
chr3 (13-376)||(43694768-43695127)
chr3 (94-373)||(38850123-38850403)
chr3 (208-376)||(12096702-12096870)
chr3 (11-265)||(45728064-45728324)
chr3 (245-376)||(53262295-53262426)
chr3 (81-373)||(45289091-45289385)
chr3 (81-239)||(38060421-38060579)
chr3 (98-338)||(48953454-48953697)
chr3 (229-376)||(52156081-52156228)
chr3 (57-373)||(54424959-54425289)
chr3 (91-375)||(19676079-19676362)
chr3 (15-372)||(26490239-26490596)
chr3 (260-376)||(311306-311422)
chr3 (33-296)||(3186709-3186973)
chr3 (27-373)||(48734147-48734481)
chr3 (245-373)||(49042090-49042219)
chr3 (33-376)||(49503565-49503896)
chr3 (235-373)||(38060858-38060996)
chr3 (11-160)||(27917490-27917639)
chr3 (107-338)||(39235154-39235384)
chr3 (15-363)||(19736918-19737255)
chr3 (20-363)||(19757826-19758158)
chr3 (25-168)||(36820166-36820309)
chr3 (269-376)||(47555329-47555436)
chr3 (266-376)||(2133609-2133719)
chr3 (40-371)||(39600683-39601016)
chr3 (95-376)||(42510013-42510292)
chr3 (91-374)||(50960636-50960915)
chr3 (78-373)||(54364976-54365271)
chr3 (252-373)||(48712075-48712196)
chr3 (245-373)||(15296061-15296189)
chr3 (11-87)||(38850012-38850088)
chr3 (274-373)||(40106620-40106719)
chr3 (291-373)||(31566161-31566243)
chr3 (291-376)||(40273202-40273287)
chr3 (284-376)||(7895877-7895969)
chr3 (93-309)||(38430850-38431066)
chr3 (292-374)||(31454224-31454306)
chr3 (259-376)||(29601060-29601177)
chr3 (289-374)||(45486848-45486933)
chr3 (285-376)||(48532151-48532243)
chr3 (285-376)||(52927845-52927936)
chr3 (288-370)||(32170602-32170684)
chr3 (274-376)||(39208791-39208893)
chr3 (250-373)||(54422837-54422966)
chr3 (34-112)||(33307087-33307165)
chr3 (259-373)||(36304134-36304248)
chr3 (283-376)||(45374474-45374567)
chr3 (308-376)||(45834597-45834665)
chr3 (81-160)||(3987037-3987116)
chr3 (302-373)||(7278675-7278746)
chr3 (274-373)||(14415260-14415358)
chr3 (289-376)||(20208196-20208283)
chr3 (81-199)||(21200540-21200656)
chr3 (94-371)||(30294125-30294403)
chr3 (278-373)||(30797822-30797917)
chr3 (284-375)||(33271908-33271999)
chr3 (95-294)||(52678929-52679124)
chr3 (15-126)||(2340961-2341074)
chr3 (175-296)||(19162664-19162785)
chr3 (33-133)||(31337766-31337866)
chr3 (305-370)||(41529975-41530040)
chr3 (261-334)||(41842562-41842635)
chr3 (11-56)||(47542031-47542076)
chr3 (245-370)||(49841770-49841895)
chr3 (296-376)||(27893294-27893374)
chr3 (116-160)||(38181042-38181086)
chr3 (298-373)||(24778609-24778684)
chr3 (274-373)||(40991614-40991713)
chr3 (295-374)||(46148232-46148311)
chr3 (318-372)||(21862742-21862796)
chr3 (284-362)||(24541343-24541421)
chr3 (275-373)||(31337560-31337658)
chr3 (261-363)||(40116348-40116450)
chr3 (92-198)||(41842686-41842792)
chr3 (260-373)||(11284157-11284270)
chr3 (245-338)||(17022707-17022800)
chr3 (325-374)||(39512777-39512826)
chr3 (320-376)||(344769-344825)
chr3 (40-133)||(344951-345046)
chr3 (292-376)||(3987535-3987619)
chr3 (320-376)||(31146928-31146984)
chr3 (69-132)||(31454467-31454531)
chr3 (290-350)||(37351606-37351666)
chr3 (259-315)||(37779045-37779101)
chr3 (91-159)||(44134044-44134112)
chr3 (23-87)||(45236786-45236850)
chr3 (300-371)||(659734-659805)
chr3 (300-375)||(31260965-31261039)
chr3 (71-160)||(31453151-31453242)
chr3 (274-373)||(42026536-42026635)
chr3 (321-376)||(50249607-50249662)
chr3 (320-374)||(37083291-37083345)
chr3 (300-370)||(46367390-46367460)
chr3 (297-375)||(50631879-50631957)
chr3 (40-113)||(37227877-37227950)
chr3 (11-168)||(46140352-46140509)
chr3 (320-373)||(52882662-52882715)
chr3 (92-160)||(11581445-11581513)
chr3 (300-376)||(30332557-30332633)
chr3 (292-376)||(31452958-31453042)
chr3 (245-309)||(40116532-40116596)
chr3 (294-374)||(40672366-40672446)
chr3 (263-307)||(44571599-44571643)
chr3 (11-87)||(46568034-46568110)
chr3 (15-75)||(48953696-48953756)
[»] chr7 (141 HSPs)
chr7 (17-376)||(43281600-43281959)
chr7 (11-376)||(12841272-12841639)
chr7 (15-376)||(45836479-45836840)
chr7 (11-376)||(11593878-11594245)
chr7 (11-375)||(37617862-37618229)
chr7 (14-373)||(34869341-34869702)
chr7 (58-376)||(29650349-29650669)
chr7 (11-376)||(33349803-33350170)
chr7 (11-375)||(49029194-49029559)
chr7 (11-366)||(35906208-35906565)
chr7 (15-376)||(39906369-39906730)
chr7 (11-376)||(44855171-44855536)
chr7 (15-376)||(38606927-38607277)
chr7 (13-376)||(36651914-36652277)
chr7 (23-371)||(46355858-46356208)
chr7 (11-314)||(13859067-13859372)
chr7 (16-372)||(35558994-35559353)
chr7 (82-376)||(2885719-2886013)
chr7 (58-376)||(6374833-6375153)
chr7 (11-296)||(31005141-31005428)
chr7 (92-376)||(31682599-31682883)
chr7 (11-239)||(33072872-33073100)
chr7 (15-376)||(43491230-43491593)
chr7 (94-376)||(22349623-22349905)
chr7 (130-376)||(32631615-32631849)
chr7 (90-376)||(36869234-36869527)
chr7 (149-376)||(24598185-24598411)
chr7 (101-376)||(15682184-15682459)
chr7 (208-373)||(40979928-40980093)
chr7 (18-314)||(23404343-23404640)
chr7 (208-376)||(38900074-38900241)
chr7 (145-374)||(7273154-7273383)
chr7 (248-374)||(27648937-27649063)
chr7 (164-371)||(31681022-31681226)
chr7 (24-373)||(36136695-36137046)
chr7 (15-198)||(7272961-7273146)
chr7 (234-373)||(48919255-48919394)
chr7 (15-133)||(32630517-32630636)
chr7 (236-374)||(21078062-21078200)
chr7 (11-156)||(36514424-36514569)
chr7 (213-376)||(9210701-9210864)
chr7 (278-376)||(28208325-28208423)
chr7 (81-195)||(46014359-46014472)
chr7 (263-372)||(34035155-34035264)
chr7 (94-370)||(28627936-28628212)
chr7 (267-374)||(33073105-33073212)
chr7 (259-376)||(36101774-36101891)
chr7 (214-370)||(45601599-45601755)
chr7 (28-333)||(8492276-8492580)
chr7 (259-376)||(27893560-27893677)
chr7 (274-373)||(33732017-33732114)
chr7 (11-87)||(36869577-36869653)
chr7 (245-381)||(44951309-44951445)
chr7 (245-372)||(14057632-14057759)
chr7 (245-372)||(14367660-14367787)
chr7 (300-371)||(24777170-24777241)
chr7 (295-374)||(31869101-31869180)
chr7 (18-160)||(43282330-43282477)
chr7 (40-198)||(19262609-19262766)
chr7 (15-330)||(47848596-47848912)
chr7 (263-376)||(42969870-42969983)
chr7 (11-159)||(5335840-5335988)
chr7 (245-376)||(42187595-42187726)
chr7 (266-374)||(47652722-47652830)
chr7 (211-374)||(1011167-1011329)
chr7 (94-376)||(12966025-12966301)
chr7 (213-330)||(35922376-35922492)
chr7 (15-198)||(25579252-25579431)
chr7 (254-373)||(8519046-8519165)
chr7 (285-372)||(24177628-24177714)
chr7 (92-376)||(26741891-26742177)
chr7 (11-161)||(30200175-30200323)
chr7 (253-373)||(40415169-40415295)
chr7 (318-376)||(31005432-31005490)
chr7 (82-168)||(40169640-40169726)
chr7 (11-161)||(14593679-14593835)
chr7 (235-372)||(34745891-34746028)
chr7 (248-375)||(28355322-28355450)
chr7 (320-376)||(29318792-29318848)
chr7 (245-336)||(36239833-36239924)
chr7 (245-376)||(38135210-38135341)
chr7 (309-376)||(40630652-40630719)
chr7 (300-374)||(7220965-7221039)
chr7 (289-375)||(25891086-25891172)
chr7 (81-159)||(27021906-27021984)
chr7 (259-373)||(37976403-37976517)
chr7 (288-373)||(20158671-20158756)
chr7 (12-81)||(24598440-24598509)
chr7 (259-376)||(33103094-33103211)
chr7 (18-87)||(39811882-39811951)
chr7 (269-370)||(47852265-47852366)
chr7 (311-371)||(6263479-6263539)
chr7 (81-157)||(7189442-7189518)
chr7 (292-376)||(14593953-14594037)
chr7 (292-376)||(16013476-16013560)
chr7 (320-376)||(28708610-28708666)
chr7 (320-376)||(29312218-29312274)
chr7 (303-375)||(31840442-31840514)
chr7 (15-168)||(42187393-42187547)
chr7 (211-314)||(1531420-1531523)
chr7 (24-87)||(27021994-27022057)
chr7 (259-373)||(28541943-28542058)
chr7 (278-373)||(30814125-30814220)
chr7 (262-333)||(31859046-31859117)
chr7 (18-198)||(48736074-48736256)
chr7 (292-374)||(19119423-19119505)
chr7 (318-376)||(30144982-30145040)
chr7 (80-134)||(45558351-45558405)
chr7 (320-377)||(5418303-5418360)
chr7 (11-161)||(16013202-16013358)
chr7 (291-376)||(33281087-33281171)
chr7 (292-373)||(45558531-45558611)
chr7 (304-376)||(1523856-1523928)
chr7 (320-376)||(20525049-20525105)
chr7 (245-336)||(44401164-44401253)
chr7 (24-87)||(1523747-1523810)
chr7 (143-202)||(33139206-33139265)
chr7 (274-373)||(34341395-34341494)
chr7 (277-348)||(34926547-34926618)
chr7 (328-374)||(21244282-21244328)
chr7 (245-327)||(21517426-21517508)
chr7 (33-87)||(25731641-25731695)
chr7 (288-338)||(26332908-26332958)
chr7 (12-159)||(28020883-28021032)
chr7 (302-380)||(28021146-28021224)
chr7 (290-376)||(48515370-48515456)
chr7 (295-376)||(4604751-4604832)
chr7 (299-372)||(34029677-34029750)
chr7 (11-161)||(36101977-36102129)
chr7 (91-156)||(38920794-38920859)
chr7 (300-373)||(40138948-40139021)
chr7 (273-370)||(40149016-40149112)
chr7 (318-375)||(41483714-41483771)
chr7 (92-160)||(18605359-18605427)
chr7 (92-160)||(18637563-18637631)
chr7 (92-160)||(18650997-18651065)
chr7 (56-152)||(27893769-27893865)
chr7 (25-85)||(29653844-29653904)
chr7 (292-373)||(38921086-38921169)
chr7 (320-376)||(47700053-47700108)
chr7 (304-376)||(48735898-48735970)
[»] chr1 (147 HSPs)
chr1 (15-375)||(696191-696554)
chr1 (16-376)||(4001452-4001814)
chr1 (11-376)||(1210663-1211030)
chr1 (11-376)||(30202127-30202494)
chr1 (11-375)||(34792347-34792713)
chr1 (11-376)||(8671838-8672203)
chr1 (11-373)||(49347393-49347757)
chr1 (11-375)||(9592652-9593018)
chr1 (11-376)||(22090012-22090381)
chr1 (15-376)||(15085856-15086207)
chr1 (18-376)||(51601983-51602341)
chr1 (15-376)||(32082753-32083105)
chr1 (11-374)||(51440764-51441129)
chr1 (15-349)||(8391694-8392030)
chr1 (11-372)||(43240380-43240745)
chr1 (14-330)||(32230997-32231315)
chr1 (81-376)||(38807668-38807963)
chr1 (81-376)||(4029112-4029407)
chr1 (109-376)||(25979228-25979495)
chr1 (173-376)||(37311752-37311955)
chr1 (206-373)||(52921195-52921362)
chr1 (154-376)||(39318193-39318413)
chr1 (15-371)||(37462878-37463231)
chr1 (11-338)||(9509236-9509565)
chr1 (211-375)||(4415469-4415633)
chr1 (15-373)||(18469082-18469440)
chr1 (11-335)||(9599432-9599758)
chr1 (41-370)||(39140468-39140794)
chr1 (92-375)||(32404525-32404807)
chr1 (121-372)||(52561590-52561841)
chr1 (255-373)||(46423216-46423331)
chr1 (245-374)||(32079176-32079303)
chr1 (255-376)||(4707218-4707338)
chr1 (81-373)||(2544589-2544875)
chr1 (253-376)||(10200303-10200426)
chr1 (24-376)||(27847797-27848155)
chr1 (245-376)||(41560383-41560514)
chr1 (263-376)||(24020264-24020377)
chr1 (259-375)||(43375596-43375712)
chr1 (91-376)||(48431396-48431688)
chr1 (284-375)||(44941774-44941865)
chr1 (305-375)||(3777258-3777328)
chr1 (283-373)||(21769711-21769801)
chr1 (245-334)||(16142019-16142108)
chr1 (283-376)||(28090691-28090784)
chr1 (284-373)||(42337749-42337838)
chr1 (248-376)||(19936617-19936745)
chr1 (284-376)||(44751677-44751769)
chr1 (300-375)||(29577461-29577536)
chr1 (245-375)||(52532614-52532744)
chr1 (258-375)||(6025772-6025889)
chr1 (18-160)||(18793201-18793345)
chr1 (300-373)||(28533676-28533749)
chr1 (272-373)||(40568410-40568511)
chr1 (245-372)||(29128937-29129065)
chr1 (288-374)||(8796406-8796492)
chr1 (274-376)||(34444539-34444641)
chr1 (295-376)||(51584948-51585029)
chr1 (81-373)||(36339804-36340095)
chr1 (245-376)||(3818853-3818984)
chr1 (23-160)||(43423647-43423788)
chr1 (288-375)||(50846759-50846846)
chr1 (274-376)||(6084158-6084260)
chr1 (33-155)||(14226047-14226169)
chr1 (287-372)||(22175341-22175426)
chr1 (288-373)||(25715326-25715411)
chr1 (275-376)||(31274398-31274499)
chr1 (245-374)||(36623884-36624012)
chr1 (290-375)||(38869081-38869166)
chr1 (36-134)||(52561850-52561950)
chr1 (81-161)||(1661420-1661500)
chr1 (300-376)||(5113952-5114028)
chr1 (260-370)||(15438800-15438906)
chr1 (301-373)||(38877343-38877415)
chr1 (320-376)||(43481795-43481851)
chr1 (288-376)||(50636278-50636366)
chr1 (321-376)||(37430417-37430472)
chr1 (246-325)||(44905404-44905483)
chr1 (57-376)||(52832011-52832330)
chr1 (285-371)||(1290033-1290119)
chr1 (318-376)||(4318842-4318900)
chr1 (148-334)||(27520246-27520428)
chr1 (318-376)||(41165509-41165567)
chr1 (259-376)||(5338881-5338998)
chr1 (245-314)||(7762496-7762565)
chr1 (11-161)||(26016355-26016507)
chr1 (259-336)||(48865744-48865821)
chr1 (288-373)||(50257767-50257852)
chr1 (300-376)||(1704836-1704912)
chr1 (300-376)||(10569068-10569144)
chr1 (73-161)||(13827929-13828017)
chr1 (264-368)||(19908040-19908144)
chr1 (288-356)||(29808053-29808121)
chr1 (94-198)||(35828725-35828829)
chr1 (321-376)||(2914120-2914175)
chr1 (253-376)||(11941577-11941700)
chr1 (81-168)||(40416361-40416448)
chr1 (211-309)||(8628150-8628248)
chr1 (291-377)||(16272818-16272903)
chr1 (326-376)||(38758017-38758067)
chr1 (289-375)||(45510831-45510917)
chr1 (288-369)||(27072491-27072572)
chr1 (304-373)||(33560858-33560927)
chr1 (15-87)||(4379927-4379999)
chr1 (320-372)||(4590533-4590585)
chr1 (320-376)||(7133299-7133355)
chr1 (276-376)||(12930308-12930408)
chr1 (295-371)||(15437130-15437206)
chr1 (320-376)||(26299297-26299353)
chr1 (300-376)||(32111986-32112062)
chr1 (11-160)||(40419557-40419708)
chr1 (321-373)||(43898439-43898491)
chr1 (15-71)||(46226586-46226642)
chr1 (286-362)||(48801625-48801700)
chr1 (292-375)||(14224286-14224368)
chr1 (93-160)||(27637846-27637913)
chr1 (290-361)||(30445304-30445375)
chr1 (274-373)||(35828562-35828661)
chr1 (288-379)||(52633166-52633257)
chr1 (321-376)||(52814291-52814346)
chr1 (43-112)||(854052-854119)
chr1 (245-338)||(8676897-8676993)
chr1 (300-370)||(16943364-16943434)
chr1 (292-350)||(28528556-28528614)
chr1 (259-369)||(29577147-29577256)
chr1 (91-157)||(37263331-37263397)
chr1 (91-160)||(52073675-52073745)
chr1 (92-161)||(10272260-10272329)
chr1 (245-330)||(11331247-11331332)
chr1 (245-330)||(11489268-11489353)
chr1 (33-94)||(16142165-16142226)
chr1 (343-376)||(22930645-22930678)
chr1 (291-356)||(26113456-26113521)
chr1 (320-377)||(42539208-42539265)
chr1 (319-372)||(44008806-44008859)
chr1 (288-373)||(50806864-50806949)
chr1 (91-159)||(4380013-4380081)
chr1 (94-198)||(5338727-5338831)
chr1 (322-374)||(8194721-8194773)
chr1 (325-373)||(12231592-12231640)
chr1 (89-197)||(13827746-13827854)
chr1 (24-64)||(17275137-17275177)
chr1 (81-157)||(51812515-51812591)
chr1 (259-307)||(51812677-51812725)
chr1 (320-372)||(52292268-52292320)
chr1 (11-87)||(52442792-52442868)
chr1 (261-333)||(52900682-52900754)
[»] chr2 (123 HSPs)
chr2 (15-376)||(38429806-38430168)
chr2 (11-376)||(3865990-3866357)
chr2 (15-376)||(45367622-45367984)
chr2 (15-376)||(41197224-41197588)
chr2 (15-373)||(11992108-11992466)
chr2 (15-376)||(12734623-12734985)
chr2 (15-373)||(41763043-41763401)
chr2 (11-372)||(3243654-3244015)
chr2 (11-380)||(36183369-36183740)
chr2 (11-371)||(8180698-8181060)
chr2 (11-373)||(38452686-38453053)
chr2 (11-376)||(4807510-4807880)
chr2 (81-376)||(25834671-25834963)
chr2 (34-373)||(18424378-18424716)
chr2 (81-377)||(2610578-2610874)
chr2 (15-347)||(23997539-23997858)
chr2 (112-376)||(451645-451909)
chr2 (145-376)||(7326157-7326388)
chr2 (148-376)||(39029638-39029872)
chr2 (162-374)||(28508749-28508961)
chr2 (98-374)||(24583630-24583907)
chr2 (208-376)||(35643065-35643233)
chr2 (23-376)||(6237750-6238106)
chr2 (205-373)||(31959635-31959803)
chr2 (249-376)||(30306190-30306317)
chr2 (271-376)||(3635320-3635425)
chr2 (15-167)||(16097192-16097350)
chr2 (262-376)||(227360-227474)
chr2 (211-372)||(45543074-45543234)
chr2 (15-373)||(38434873-38435234)
chr2 (91-376)||(12141544-12141829)
chr2 (259-376)||(9496034-9496151)
chr2 (245-373)||(9996623-9996754)
chr2 (252-376)||(38328367-38328489)
chr2 (245-376)||(12882042-12882173)
chr2 (81-376)||(43751944-43752239)
chr2 (295-376)||(15025698-15025779)
chr2 (215-376)||(43573127-43573287)
chr2 (259-370)||(19336896-19337007)
chr2 (248-374)||(30743686-30743812)
chr2 (11-160)||(4598775-4598928)
chr2 (23-376)||(9556366-9556720)
chr2 (91-372)||(18958907-18959192)
chr2 (89-161)||(43238305-43238377)
chr2 (285-376)||(9531597-9531688)
chr2 (89-376)||(44437718-44438005)
chr2 (23-161)||(9578915-9579053)
chr2 (289-375)||(12520060-12520146)
chr2 (300-373)||(12474927-12475000)
chr2 (303-376)||(17670680-17670753)
chr2 (289-374)||(19863432-19863517)
chr2 (289-374)||(19867764-19867849)
chr2 (289-374)||(19872665-19872750)
chr2 (11-160)||(23714474-23714622)
chr2 (11-160)||(24102146-24102294)
chr2 (219-376)||(33287549-33287706)
chr2 (246-376)||(35755242-35755376)
chr2 (11-87)||(2610446-2610522)
chr2 (219-371)||(13149460-13149612)
chr2 (276-372)||(39709202-39709298)
chr2 (245-357)||(41545559-41545671)
chr2 (245-376)||(8197538-8197669)
chr2 (245-376)||(8202298-8202429)
chr2 (11-158)||(42092437-42092584)
chr2 (302-376)||(43832309-43832383)
chr2 (235-376)||(12489799-12489940)
chr2 (300-373)||(17429259-17429332)
chr2 (303-376)||(17626284-17626357)
chr2 (15-127)||(19337096-19337209)
chr2 (11-75)||(24583906-24583970)
chr2 (11-168)||(9647814-9647969)
chr2 (259-370)||(45077895-45078008)
chr2 (252-376)||(6219126-6219250)
chr2 (11-66)||(451931-451986)
chr2 (248-373)||(11412865-11412992)
chr2 (292-338)||(19334187-19334233)
chr2 (295-376)||(15015149-15015230)
chr2 (15-137)||(30743545-30743668)
chr2 (288-369)||(33504421-33504502)
chr2 (290-371)||(34931631-34931712)
chr2 (288-376)||(3481351-3481439)
chr2 (286-374)||(13443907-13443995)
chr2 (259-335)||(36650610-36650686)
chr2 (296-376)||(42543440-42543520)
chr2 (81-128)||(227312-227359)
chr2 (293-376)||(42549834-42549917)
chr2 (302-376)||(25384680-25384754)
chr2 (311-373)||(36993755-36993816)
chr2 (295-372)||(624687-624764)
chr2 (297-366)||(4598569-4598638)
chr2 (292-373)||(5758995-5759076)
chr2 (327-376)||(8560803-8560852)
chr2 (320-373)||(10516749-10516802)
chr2 (320-373)||(16521007-16521060)
chr2 (275-380)||(17581643-17581748)
chr2 (11-87)||(7825276-7825352)
chr2 (292-376)||(12470894-12470978)
chr2 (320-376)||(15775842-15775898)
chr2 (290-374)||(28960210-28960294)
chr2 (258-374)||(32402667-32402783)
chr2 (300-376)||(33393319-33393394)
chr2 (217-378)||(37470124-37470289)
chr2 (275-370)||(186135-186230)
chr2 (81-198)||(3481134-3481248)
chr2 (45-152)||(7615251-7615358)
chr2 (321-376)||(14444899-14444954)
chr2 (299-372)||(887065-887139)
chr2 (259-297)||(4682253-4682291)
chr2 (301-375)||(14197205-14197279)
chr2 (292-373)||(33594272-33594354)
chr2 (259-313)||(36616856-36616910)
chr2 (83-161)||(38860165-38860243)
chr2 (78-155)||(6218954-6219031)
chr2 (81-134)||(11412711-11412764)
chr2 (343-376)||(14530532-14530565)
chr2 (300-349)||(19224990-19225039)
chr2 (320-373)||(32706472-32706525)
chr2 (320-369)||(45482989-45483038)
chr2 (307-371)||(522445-522509)
chr2 (94-134)||(786833-786873)
chr2 (278-350)||(3720438-3720510)
chr2 (306-350)||(9078792-9078836)
chr2 (104-160)||(41858744-41858800)
[»] chr4 (168 HSPs)
chr4 (15-373)||(27450180-27450533)
chr4 (11-376)||(436147-436514)
chr4 (11-373)||(48622543-48622905)
chr4 (11-373)||(31959814-31960178)
chr4 (11-376)||(33227127-33227494)
chr4 (11-376)||(48174090-48174457)
chr4 (11-376)||(52569512-52569879)
chr4 (11-374)||(1777016-1777379)
chr4 (11-375)||(33190846-33191212)
chr4 (11-376)||(4440773-4441138)
chr4 (11-374)||(56375208-56375573)
chr4 (11-376)||(53707712-53708079)
chr4 (15-376)||(39100533-39100893)
chr4 (11-376)||(43433836-43434209)
chr4 (15-374)||(27983122-27983476)
chr4 (24-376)||(37797783-37798136)
chr4 (110-374)||(32479057-32479321)
chr4 (11-373)||(23906297-23906665)
chr4 (11-378)||(28236103-28236469)
chr4 (14-338)||(37773486-37773811)
chr4 (11-375)||(47265193-47265566)
chr4 (11-376)||(46582823-46583188)
chr4 (11-347)||(50286889-50287217)
chr4 (115-376)||(8286455-8286724)
chr4 (81-372)||(26037506-26037797)
chr4 (82-366)||(39708424-39708708)
chr4 (83-370)||(20192025-20192311)
chr4 (27-374)||(51421666-51422013)
chr4 (219-376)||(21528416-21528573)
chr4 (15-370)||(1793382-1793741)
chr4 (186-376)||(21236953-21237143)
chr4 (219-376)||(6957726-6957883)
chr4 (18-309)||(41009414-41009707)
chr4 (15-376)||(45204837-45205208)
chr4 (13-326)||(20591353-20591662)
chr4 (219-376)||(12494791-12494948)
chr4 (18-356)||(20601669-20602003)
chr4 (11-135)||(12494668-12494794)
chr4 (18-376)||(1211389-1211747)
chr4 (20-330)||(16002854-16003165)
chr4 (209-373)||(51811280-51811442)
chr4 (219-368)||(7947065-7947214)
chr4 (175-323)||(50679588-50679736)
chr4 (209-372)||(4548140-4548303)
chr4 (11-159)||(31458946-31459098)
chr4 (125-376)||(20821001-20821255)
chr4 (263-376)||(19154860-19154973)
chr4 (268-376)||(19969358-19969466)
chr4 (211-376)||(35690391-35690556)
chr4 (259-376)||(55007914-55008031)
chr4 (245-373)||(28550455-28550583)
chr4 (245-376)||(31043226-31043357)
chr4 (149-374)||(28351617-28351842)
chr4 (11-159)||(33709837-33709992)
chr4 (285-376)||(883357-883448)
chr4 (245-376)||(31961263-31961394)
chr4 (291-376)||(19061932-19062017)
chr4 (33-198)||(25257756-25257921)
chr4 (15-113)||(35690226-35690326)
chr4 (11-376)||(56224983-56225353)
chr4 (298-374)||(49939733-49939809)
chr4 (212-298)||(50862764-50862851)
chr4 (213-372)||(53518325-53518483)
chr4 (274-376)||(2589255-2589357)
chr4 (11-130)||(10775665-10775786)
chr4 (259-376)||(25574992-25575109)
chr4 (43-160)||(51252674-51252791)
chr4 (14-160)||(54470128-54470276)
chr4 (288-376)||(13805262-13805350)
chr4 (248-376)||(31459151-31459279)
chr4 (264-376)||(34208266-34208378)
chr4 (23-168)||(41192764-41192913)
chr4 (288-375)||(12443292-12443379)
chr4 (297-376)||(32633403-32633482)
chr4 (309-376)||(50238612-50238679)
chr4 (309-376)||(50238698-50238765)
chr4 (292-370)||(13262413-13262491)
chr4 (235-377)||(26024846-26024988)
chr4 (11-112)||(43070029-43070128)
chr4 (11-134)||(49987346-49987471)
chr4 (33-161)||(10208978-10209104)
chr4 (11-161)||(17900398-17900550)
chr4 (92-161)||(35555859-35555928)
chr4 (245-370)||(37042667-37042792)
chr4 (292-377)||(50869876-50869961)
chr4 (288-376)||(6958236-6958323)
chr4 (296-376)||(7066496-7066575)
chr4 (11-128)||(7092465-7092583)
chr4 (320-376)||(30634103-30634159)
chr4 (288-376)||(51438642-51438730)
chr4 (259-371)||(55388213-55388325)
chr4 (245-376)||(37488245-37488376)
chr4 (81-168)||(44047553-44047640)
chr4 (321-376)||(45209202-45209257)
chr4 (302-373)||(47372915-47372986)
chr4 (274-376)||(5306479-5306581)
chr4 (15-85)||(20105761-20105831)
chr4 (16-157)||(45423542-45423681)
chr4 (91-373)||(46372024-46372306)
chr4 (214-376)||(53540413-53540575)
chr4 (323-376)||(46153940-46153993)
chr4 (320-376)||(1328611-1328667)
chr4 (23-87)||(25967555-25967619)
chr4 (288-376)||(29399001-29399089)
chr4 (292-376)||(35622673-35622757)
chr4 (321-373)||(38017319-38017371)
chr4 (292-376)||(42285700-42285784)
chr4 (294-374)||(44360289-44360369)
chr4 (325-377)||(56130404-56130456)
chr4 (259-374)||(41192229-41192344)
chr4 (321-376)||(44719358-44719413)
chr4 (215-302)||(55809061-55809148)
chr4 (91-157)||(2588991-2589056)
chr4 (320-374)||(15665330-15665384)
chr4 (98-160)||(26356626-26356688)
chr4 (272-314)||(41729509-41729551)
chr4 (101-191)||(42285882-42285972)
chr4 (222-376)||(42293262-42293416)
chr4 (34-195)||(50662330-50662492)
chr4 (290-376)||(54935348-54935434)
chr4 (295-372)||(3979124-3979201)
chr4 (274-371)||(22873601-22873698)
chr4 (11-113)||(31403276-31403384)
chr4 (292-373)||(31897428-31897509)
chr4 (15-113)||(34233291-34233393)
chr4 (44-161)||(50471479-50471596)
chr4 (320-376)||(4879106-4879162)
chr4 (320-376)||(15661869-15661925)
chr4 (288-376)||(20105515-20105603)
chr4 (91-159)||(30621418-30621486)
chr4 (300-376)||(32339768-32339844)
chr4 (274-366)||(34233031-34233123)
chr4 (245-309)||(41009283-41009347)
chr4 (92-160)||(42639233-42639301)
chr4 (321-373)||(49738550-49738602)
chr4 (320-368)||(50862860-50862908)
chr4 (288-371)||(1095642-1095725)
chr4 (321-372)||(4136744-4136795)
chr4 (300-371)||(34585691-34585762)
chr4 (290-373)||(36799657-36799740)
chr4 (81-160)||(44360077-44360155)
chr4 (253-335)||(36198977-36199059)
chr4 (98-195)||(50680746-50680844)
chr4 (320-374)||(50967027-50967081)
chr4 (91-157)||(55768717-55768783)
chr4 (91-157)||(55832973-55833039)
chr4 (17-82)||(2588905-2588970)
chr4 (343-376)||(3601416-3601449)
chr4 (300-373)||(8284348-8284421)
chr4 (292-376)||(10209237-10209319)
chr4 (292-376)||(10775468-10775550)
chr4 (261-314)||(26510558-26510611)
chr4 (81-198)||(28497480-28497596)
chr4 (81-134)||(36557268-36557321)
chr4 (91-168)||(49738809-49738886)
chr4 (320-376)||(7544528-7544584)
chr4 (321-373)||(28348287-28348339)
chr4 (259-335)||(28486089-28486165)
chr4 (245-333)||(30621241-30621329)
chr4 (310-374)||(30662042-30662106)
chr4 (292-376)||(35555647-35555731)
chr4 (292-376)||(36556757-36556841)
chr4 (300-376)||(40932921-40932997)
chr4 (292-376)||(45184130-45184214)
chr4 (321-373)||(46236719-46236771)
chr4 (321-373)||(50471757-50471809)
chr4 (288-376)||(54963648-54963735)
chr4 (259-355)||(55579200-55579295)
[»] chr8 (129 HSPs)
chr8 (15-376)||(42854001-42854364)
chr8 (11-376)||(36545065-36545434)
chr8 (11-375)||(36565239-36565605)
chr8 (11-376)||(40813240-40813609)
chr8 (11-372)||(36394949-36395314)
chr8 (59-376)||(11523720-11524040)
chr8 (11-325)||(39946775-39947091)
chr8 (15-374)||(18125097-18125454)
chr8 (93-370)||(12491141-12491418)
chr8 (11-356)||(2796473-2796818)
chr8 (43-370)||(8932653-8932982)
chr8 (165-376)||(42469724-42469935)
chr8 (122-376)||(21121177-21121430)
chr8 (10-373)||(45419156-45419517)
chr8 (15-253)||(18751996-18752233)
chr8 (15-373)||(8879446-8879800)
chr8 (218-376)||(14742079-14742234)
chr8 (15-376)||(37077687-37078034)
chr8 (111-330)||(26904950-26905168)
chr8 (192-376)||(2027631-2027815)
chr8 (149-369)||(12025847-12026058)
chr8 (252-376)||(15215409-15215533)
chr8 (245-374)||(25473402-25473531)
chr8 (261-373)||(44529395-44529507)
chr8 (11-101)||(12492116-12492206)
chr8 (264-376)||(44047529-44047641)
chr8 (245-372)||(25288918-25289045)
chr8 (245-372)||(25300253-25300380)
chr8 (259-376)||(490503-490620)
chr8 (245-373)||(29520803-29520931)
chr8 (17-184)||(6510617-6510784)
chr8 (62-179)||(12796894-12797011)
chr8 (25-376)||(32043522-32043872)
chr8 (214-376)||(35643605-35643765)
chr8 (245-374)||(45041315-45041443)
chr8 (245-376)||(30559847-30559983)
chr8 (100-376)||(32930970-32931245)
chr8 (11-374)||(39953263-39953628)
chr8 (34-132)||(25985462-25985560)
chr8 (58-338)||(43904700-43904984)
chr8 (15-133)||(13986416-13986536)
chr8 (214-373)||(2216411-2216568)
chr8 (9-87)||(15215559-15215637)
chr8 (321-375)||(39967497-39967551)
chr8 (11-168)||(30748377-30748534)
chr8 (259-376)||(42584527-42584643)
chr8 (300-376)||(27556299-27556375)
chr8 (295-379)||(30689939-30690023)
chr8 (245-373)||(35914601-35914729)
chr8 (288-376)||(41031417-41031505)
chr8 (288-376)||(41031523-41031611)
chr8 (284-376)||(8255528-8255622)
chr8 (213-376)||(28169514-28169676)
chr8 (301-375)||(1928585-1928659)
chr8 (301-375)||(10668495-10668569)
chr8 (259-376)||(21425214-21425331)
chr8 (274-375)||(23492217-23492318)
chr8 (11-105)||(25288820-25288916)
chr8 (11-105)||(25300155-25300251)
chr8 (294-379)||(36042401-36042486)
chr8 (245-372)||(14459049-14459177)
chr8 (263-376)||(31715992-31716107)
chr8 (300-376)||(32276894-32276970)
chr8 (300-376)||(32569707-32569783)
chr8 (288-372)||(36143538-36143622)
chr8 (292-375)||(30812814-30812897)
chr8 (33-161)||(44681251-44681381)
chr8 (44-191)||(7046285-7046434)
chr8 (45-168)||(9695583-9695708)
chr8 (290-372)||(18473973-18474055)
chr8 (13-127)||(13171895-13172011)
chr8 (292-376)||(7531641-7531725)
chr8 (321-373)||(12611727-12611779)
chr8 (321-369)||(26055651-26055699)
chr8 (15-128)||(30113442-30113557)
chr8 (311-375)||(35323993-35324057)
chr8 (220-372)||(35362651-35362803)
chr8 (11-198)||(36143287-36143472)
chr8 (256-376)||(41444336-41444456)
chr8 (295-375)||(43733410-43733490)
chr8 (274-370)||(44699649-44699745)
chr8 (89-168)||(2776434-2776513)
chr8 (288-375)||(10824187-10824274)
chr8 (292-367)||(16351578-16351653)
chr8 (258-373)||(26363655-26363768)
chr8 (274-377)||(30198262-30198365)
chr8 (57-124)||(33666748-33666814)
chr8 (11-114)||(42493565-42493668)
chr8 (326-376)||(1064955-1065005)
chr8 (91-133)||(25985839-25985881)
chr8 (291-369)||(39702154-39702232)
chr8 (294-377)||(41212064-41212149)
chr8 (278-371)||(2518400-2518493)
chr8 (323-376)||(16921451-16921504)
chr8 (300-373)||(35646930-35647003)
chr8 (292-377)||(38901815-38901900)
chr8 (95-147)||(7103274-7103326)
chr8 (16-161)||(10080119-10080264)
chr8 (15-112)||(16351312-16351411)
chr8 (332-376)||(32978115-32978159)
chr8 (24-128)||(2518637-2518742)
chr8 (260-371)||(16917352-16917462)
chr8 (40-108)||(21121105-21121175)
chr8 (23-105)||(25439397-25439477)
chr8 (245-296)||(25439479-25439530)
chr8 (16-87)||(29520583-29520654)
chr8 (220-347)||(38391919-38392046)
chr8 (320-375)||(39651026-39651081)
chr8 (300-370)||(1313773-1313843)
chr8 (321-375)||(11129951-11130004)
chr8 (259-338)||(12966347-12966428)
chr8 (274-376)||(14903744-14903846)
chr8 (278-356)||(16035744-16035822)
chr8 (11-114)||(39760683-39760788)
chr8 (11-133)||(30456452-30456575)
chr8 (263-372)||(36069774-36069883)
chr8 (91-152)||(41444547-41444608)
chr8 (322-374)||(4558207-4558259)
chr8 (245-373)||(4955345-4955473)
chr8 (33-157)||(11129797-11129921)
chr8 (320-376)||(12985919-12985975)
chr8 (321-373)||(16971772-16971824)
chr8 (290-338)||(30456329-30456377)
chr8 (214-338)||(30783077-30783201)
chr8 (324-376)||(35085134-35085186)
chr8 (320-376)||(40982893-40982949)
chr8 (289-377)||(42493426-42493514)
chr8 (214-309)||(45512558-45512654)
chr8 (91-159)||(45512709-45512777)
[»] chr5 (114 HSPs)
chr5 (23-373)||(3301774-3302126)
chr5 (11-374)||(24178428-24178793)
chr5 (23-376)||(4496312-4496669)
chr5 (11-376)||(28976856-28977221)
chr5 (11-376)||(12492381-12492751)
chr5 (58-366)||(38684932-38685242)
chr5 (11-374)||(1287578-1287953)
chr5 (15-373)||(16347380-16347738)
chr5 (11-376)||(1275183-1275549)
chr5 (11-371)||(2075475-2075838)
chr5 (11-376)||(10639215-10639587)
chr5 (41-376)||(14665658-14665997)
chr5 (94-372)||(20456776-20457054)
chr5 (180-375)||(13561384-13561579)
chr5 (149-376)||(2915493-2915719)
chr5 (11-375)||(34272940-34273297)
chr5 (186-376)||(14911267-14911457)
chr5 (24-376)||(26884686-26885040)
chr5 (222-376)||(29816513-29816667)
chr5 (235-373)||(16913882-16914021)
chr5 (15-342)||(32516480-32516806)
chr5 (11-333)||(36215418-36215730)
chr5 (264-374)||(5558314-5558424)
chr5 (252-376)||(2393038-2393161)
chr5 (11-164)||(31636129-31636278)
chr5 (81-326)||(14749297-14749542)
chr5 (271-376)||(30213755-30213860)
chr5 (211-374)||(28002-28165)
chr5 (131-369)||(38501422-38501660)
chr5 (11-151)||(11002645-11002785)
chr5 (245-376)||(28276392-28276523)
chr5 (283-374)||(18855799-18855890)
chr5 (253-376)||(39040918-39041041)
chr5 (254-376)||(418031-418153)
chr5 (57-168)||(15168756-15168869)
chr5 (274-376)||(32442123-32442224)
chr5 (69-161)||(33667194-33667286)
chr5 (259-373)||(43557833-43557947)
chr5 (302-375)||(408492-408565)
chr5 (259-376)||(14667939-14668056)
chr5 (245-361)||(9235201-9235316)
chr5 (35-160)||(10082952-10083079)
chr5 (292-371)||(3442873-3442952)
chr5 (245-375)||(11675683-11675814)
chr5 (254-373)||(31220546-31220664)
chr5 (42-124)||(418236-418318)
chr5 (288-370)||(7640510-7640592)
chr5 (274-376)||(20367076-20367178)
chr5 (81-198)||(79503-79620)
chr5 (253-374)||(2090575-2090696)
chr5 (265-374)||(36551320-36551429)
chr5 (262-327)||(42504293-42504358)
chr5 (98-373)||(1525651-1525923)
chr5 (288-376)||(6859578-6859666)
chr5 (214-374)||(7678601-7678760)
chr5 (300-376)||(28411885-28411961)
chr5 (320-376)||(42576239-42576295)
chr5 (301-368)||(2713146-2713213)
chr5 (274-369)||(8081967-8082059)
chr5 (295-370)||(11002424-11002499)
chr5 (13-88)||(28186955-28187030)
chr5 (81-199)||(42199278-42199394)
chr5 (288-374)||(2645187-2645273)
chr5 (300-374)||(38132545-38132619)
chr5 (296-373)||(9121078-9121155)
chr5 (81-134)||(14667753-14667806)
chr5 (92-161)||(28676596-28676665)
chr5 (259-356)||(30588615-30588712)
chr5 (42-161)||(2712897-2713014)
chr5 (288-376)||(21193649-21193737)
chr5 (95-159)||(37065533-37065597)
chr5 (292-375)||(5860035-5860118)
chr5 (93-375)||(7359259-7359539)
chr5 (300-375)||(32366187-32366262)
chr5 (245-311)||(2552936-2553002)
chr5 (311-373)||(9234106-9234168)
chr5 (259-309)||(17340500-17340550)
chr5 (91-168)||(18351112-18351190)
chr5 (11-85)||(20318905-20318974)
chr5 (24-159)||(31906592-31906729)
chr5 (248-376)||(14725675-14725803)
chr5 (274-379)||(23980127-23980232)
chr5 (320-373)||(27386569-27386622)
chr5 (299-376)||(27800036-27800113)
chr5 (301-374)||(42272687-42272760)
chr5 (11-124)||(219702-219817)
chr5 (23-87)||(5305546-5305610)
chr5 (274-338)||(18350937-18351001)
chr5 (98-158)||(21952364-21952424)
chr5 (300-376)||(41200343-41200419)
chr5 (11-86)||(9234987-9235062)
chr5 (288-375)||(9400708-9400795)
chr5 (293-368)||(28985285-28985360)
chr5 (16-87)||(34039960-34040031)
chr5 (259-374)||(38684648-38684763)
chr5 (274-349)||(41808105-41808180)
chr5 (254-376)||(41894229-41894358)
chr5 (33-160)||(6888933-6889062)
chr5 (245-335)||(6889147-6889237)
chr5 (13-55)||(27998343-27998385)
chr5 (320-373)||(3000968-3001021)
chr5 (315-376)||(4653476-4653537)
chr5 (325-374)||(5303681-5303730)
chr5 (300-375)||(9917458-9917530)
chr5 (259-372)||(12576861-12576974)
chr5 (300-373)||(28186782-28186855)
chr5 (248-297)||(36200886-36200935)
chr5 (325-373)||(7367172-7367220)
chr5 (260-364)||(15588399-15588503)
chr5 (321-377)||(36123178-36123234)
chr5 (292-375)||(37065677-37065761)
chr5 (320-356)||(39322096-39322132)
chr5 (214-314)||(43035104-43035204)
chr5 (94-198)||(43475243-43475347)
[»] chr6 (67 HSPs)
chr6 (11-376)||(28085294-28085661)
chr6 (24-376)||(5258145-5258501)
chr6 (15-373)||(35043441-35043801)
chr6 (15-372)||(608081-608442)
chr6 (15-373)||(9706698-9707052)
chr6 (11-376)||(32755837-32756206)
chr6 (27-338)||(21351872-21352183)
chr6 (15-370)||(30031178-30031535)
chr6 (15-376)||(20427633-20427996)
chr6 (16-333)||(5631741-5632064)
chr6 (11-376)||(14030724-14031080)
chr6 (68-376)||(12890559-12890860)
chr6 (15-239)||(10099993-10100217)
chr6 (102-375)||(30679417-30679680)
chr6 (15-374)||(9593709-9594072)
chr6 (214-376)||(34143762-34143924)
chr6 (214-376)||(34156378-34156540)
chr6 (93-330)||(33496963-33497198)
chr6 (254-376)||(3206456-3206578)
chr6 (11-304)||(28026896-28027189)
chr6 (264-376)||(31819004-31819116)
chr6 (262-373)||(34934830-34934941)
chr6 (156-334)||(5080905-5081083)
chr6 (145-268)||(7133800-7133923)
chr6 (145-268)||(7136723-7136846)
chr6 (97-373)||(2689646-2689915)
chr6 (213-373)||(5095956-5096116)
chr6 (292-376)||(30789071-30789155)
chr6 (15-124)||(5080777-5080888)
chr6 (245-376)||(10098893-10099022)
chr6 (214-376)||(34502-34664)
chr6 (23-113)||(6056032-6056122)
chr6 (288-376)||(4245869-4245957)
chr6 (253-375)||(5897619-5897741)
chr6 (245-373)||(31818685-31818813)
chr6 (245-338)||(24665965-24666058)
chr6 (11-161)||(33083976-33084128)
chr6 (211-338)||(6055806-6055933)
chr6 (252-371)||(7492550-7492669)
chr6 (287-373)||(12119642-12119729)
chr6 (300-373)||(1615223-1615296)
chr6 (23-137)||(9568590-9568708)
chr6 (99-168)||(24665818-24665887)
chr6 (288-376)||(579615-579703)
chr6 (11-87)||(33998292-33998368)
chr6 (302-374)||(12133901-12133973)
chr6 (300-375)||(9109507-9109582)
chr6 (274-376)||(6293389-6293491)
chr6 (259-332)||(14389202-14389275)
chr6 (301-370)||(21886314-21886383)
chr6 (320-373)||(33730194-33730247)
chr6 (296-376)||(38976-39056)
chr6 (214-374)||(8364679-8364839)
chr6 (41-124)||(21870322-21870403)
chr6 (92-159)||(2079341-2079408)
chr6 (36-128)||(5095816-5095910)
chr6 (322-381)||(6906819-6906878)
chr6 (40-154)||(8364523-8364635)
chr6 (78-161)||(14389380-14389462)
chr6 (300-370)||(21089606-21089676)
chr6 (343-376)||(3127273-3127306)
chr6 (343-376)||(4878294-4878327)
chr6 (91-132)||(6641650-6641691)
chr6 (15-83)||(2065048-2065116)
chr6 (11-87)||(7150606-7150682)
chr6 (276-376)||(9568884-9568983)
chr6 (320-376)||(30642998-30643054)
[»] scaffold0018 (2 HSPs)
scaffold0018 (11-376)||(31386-31753)
scaffold0018 (91-161)||(44080-44150)
[»] scaffold0570 (1 HSPs)
scaffold0570 (50-376)||(945-1271)
[»] scaffold0024 (1 HSPs)
scaffold0024 (15-373)||(82643-83000)
[»] scaffold0036 (1 HSPs)
scaffold0036 (13-376)||(4277-4634)
[»] scaffold0041 (1 HSPs)
scaffold0041 (205-373)||(16692-16860)
[»] scaffold0045 (1 HSPs)
scaffold0045 (15-376)||(86606-86967)
[»] scaffold0692 (1 HSPs)
scaffold0692 (161-376)||(4706-4921)
[»] scaffold0157 (2 HSPs)
scaffold0157 (219-376)||(25529-25686)
scaffold0157 (11-135)||(25683-25809)
[»] scaffold0113 (2 HSPs)
scaffold0113 (11-159)||(11810-11962)
scaffold0113 (133-376)||(11546-11787)
[»] scaffold1318 (1 HSPs)
scaffold1318 (245-374)||(485-614)
[»] scaffold0199 (1 HSPs)
scaffold0199 (245-376)||(14737-14868)
[»] scaffold0168 (1 HSPs)
scaffold0168 (283-376)||(28886-28979)
[»] scaffold0050 (1 HSPs)
scaffold0050 (214-376)||(58223-58385)
[»] scaffold0171 (1 HSPs)
scaffold0171 (231-371)||(7580-7720)
[»] scaffold1259 (1 HSPs)
scaffold1259 (245-376)||(1519-1647)
[»] scaffold0010 (1 HSPs)
scaffold0010 (245-372)||(160325-160452)
[»] scaffold0245 (1 HSPs)
scaffold0245 (285-371)||(16438-16524)
[»] scaffold0392 (1 HSPs)
scaffold0392 (288-374)||(6771-6857)
[»] scaffold0221 (1 HSPs)
scaffold0221 (323-376)||(19149-19202)
[»] scaffold0025 (1 HSPs)
scaffold0025 (253-309)||(39481-39537)


Alignment Details
Target: chr3 (Bit Score: 393; Significance: 0; HSPs: 119)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 393; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 483
Target Start/End: Original strand, 25191297 - 25191769
Alignment:
Q  11 agcagagatgatgatgttgcgctggatgagtggtaagactagacatgataggattaagaatgacatcattagagagaatgggggtagcacctatagtaga 110  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25191297 agcagagatgaggatgttgcgctggatgagtggtaagactagacatgatatgattaagaatgacatcattagagagaatgggggtagcacctatagtaga 25191396  T
Q  111 aaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaatggagaagaaccaggtt 210  Q
    ||| |||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||    
T  25191397 aaaattggaagaaaatagacttagatggtttggacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaatggaggagagcccggtt 25191496  T
Q  211 aaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacac 310  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  25191497 aaaagaggtagaggaagaactaagaaaatcatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgaattagatcaaaatatggtttttgatagaacac 25191596  T
Q  311 tatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgtcgtctttgtcactaaccctaaaagcgcttgatag 410  Q
    |||| | |||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25191597 tatggcgtcatttgatccatgtagctgatcccacttagtgggataatgcttggttgttgttgtcgttgtctttgtcactaaccctaaaagcgcttgatag 25191696  T
Q  411 cgagataatttaatattttattttaagtaaattttactatataagtacataaataattatcctaaaaaacagt 483  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25191697 cgagataatttaatatttgattttaagtaaattttactatataagtacataaataattatcctaaaaaacagt 25191769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 15 - 376
Target Start/End: Original strand, 21995 - 22357
Alignment:
Q  15 gagatgatgatgttgcgctggatgagtggtaagactagacatgataggattaagaatgacatcattagagagaa--tgggggtagcacctatagtagaaa 112  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||   ||||||||||||||||||||||||    
T  21995 gagatgaggatgttgcgctggatgagtggtaagactagacatgataggattaggaatgtcaccattagagagagagtgggggtagcacctatagtagaaa 22094  T
Q  113 agttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaatggagaagaaccaggttaa 212  Q
    |||||||||||| ||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||| |||  | ||||||    
T  22095 agttggtagaaa-taggcttagatggtttggacatgtagagagaagacccgtagatgccgttgtaagaagagtagattaaatggaggagagtcgggttaa 22193  T
Q  213 aagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacacta 312  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22194 aagaggtagaggaagacttaagaaaaccattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttttgatagaacacta 22293  T
Q  313 tgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 376  Q
    || | |||||||||| |||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  22294 tggcgtcatttgatctatgtagccgaccccacttagtgggataaagcttggttgttgttgttgt 22357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 220; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 11 - 375
Target Start/End: Original strand, 52138718 - 52139084
Alignment:
Q  11 agcagagatgatgatgttgcgctggatgagtggtaagactagacatgataggattaagaatgacatcattagagagaa--tgggggtagcacctatagta 108  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||   ||||||||||||||||||||    
T  52138718 agcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagactagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgggggtagcacctatagta 52138817  T
Q  109 gaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaatggagaagaaccagg 208  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| ||| | ||||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||  |||| |||||||| |||  || |    
T  52138818 gaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacctgtagatgccgtggtaagaagaatagattaaatggaggagagtcaag 52138917  T
Q  209 ttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaac 308  Q
    |||||||||||||||||||| ||| |||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||| | |||||||||    
T  52138918 ttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaac 52139017  T
Q  309 actatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttg 375  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  52139018 actatgacgttatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 52139084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 15 - 376
Target Start/End: Original strand, 5168750 - 5169117
Alignment:
Q  15 gagatgatgatgttgcgctggatgagtggtaagactagacatgataggattaagaatgacatcattagagagaa------tgggggtagcacctatagta 108  Q
    ||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||       |||||||||||||||| |||    
T  5168750 gagatgaggatgttgcgctggatgataggtaagactagacaggataggattaggaatgacaccattagagagagagagagtgggggtagcacctatggta 5168849  T
Q  109 gaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaatggagaagaaccagg 208  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||| |||  |  |    
T  5168850 gaaaagttggtagaaaatacgcttagatggtttgaacatgtagagagaagacccgtagatgccgttgttagaagagtagatcaaatggaggagagtctag 5168949  T
Q  209 ttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaac 308  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  5168950 ttaaaagaggtagaggaagacctaagaaaaccattagagaaaccattagaaaggatttataggtcaatgagttggatccaaatatggtttttgatagaac 5169049  T
Q  309 actatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 376  Q
    |||||| | ||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  5169050 actatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttgt 5169117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 213; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 16 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 47233955 - 47233596
Alignment:
Q  16 agatgatgatgttgcgctggatgagtggtaagactagacatgataggattaagaatgacatcattagagaga--atgggggtagcacctatagtagaaaa 113  Q
    |||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||| |||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||    
T  47233955 agatgaggatattgcgttggatgagtggtaagactagacatgataagattagaaatgacaccattagagagagaatggaggtagcacctatagtagaaaa 47233856  T
Q  114 gttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaa 213  Q
    ||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||| |||  |||||||||    
T  47233855 gttggtagaaaataggcttagatggtttggacatgtagagagaagacccgtagatgccgttgttagaagagtagatcaaatggaggagagtcaggttaaa 47233756  T
Q  214 agaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactat 313  Q
    ||| || || ||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47233755 agatgttgaagaagacctaagaaaactattagagaaaccattagaaaggaattagaggtcaatgaattagatccaaatatggtttttgatagaacactat 47233656  T
Q  314 gacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgt 373  Q
    | | ||||||||| ||||||||||| || | |||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  47233655 ggcgtcatttgattcatgtagccgaccccagttagtgggataaggcttggttgttgttgt 47233596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 11 - 375
Target Start/End: Original strand, 28245355 - 28245721
Alignment:
Q  11 agcagagatgatgatgttgcgctggatgagtggtaagactagacatgataggattaagaatgacatcattagagagaa--tgggggtagcacctatagta 108  Q
    |||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |  |||||||||| ||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||    
T  28245355 agcaaagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagactagcctggataggattaggaatgacatcattagagagagagtgggggtagcacctatagta 28245454  T
Q  109 gaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaatggagaagaaccagg 208  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||| | ||||||||||| |||  || |    
T  28245455 gaaaagttggtagaaaatagacttagatggtttgggcatgtagagagaaaacccgtagatgccgtggtaagaagagtatatcaaatggaggagagtcaag 28245554  T
Q  209 ttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaac 308  Q
    |||||||||||||| ||||| ||| |||||| ||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||| | | |||||||    
T  28245555 ttaaaagaggtagatgaagacctaggaaaactattagagaaacgattagaaatgatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtataatagaac 28245654  T
Q  309 actatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttg 375  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||| ||| ||||||||    
T  28245655 actatgacgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgagataaggcttgattgctgttgttg 28245721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 193; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 81 - 373
Target Start/End: Original strand, 35033136 - 35033428
Alignment:
Q  81 agagagaatgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaaga 180  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  35033136 agagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttatatggtttggacatgtagagagaagacccgtagatgccattgtaaga 35033235  T
Q  181 agagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagt 280  Q
    |||| | ||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35033236 agagtaaatcaaatggaggagagtcaggttaaaagaggtagaggaagacctaagaaaaccattcgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagt 35033335  T
Q  281 tagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgt 373  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||| |  |  ||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  35033336 tggatccaaatatggtttttgatagaacactatggcgttatttgatccatgtagccgacctcatctagtgggataaggcttggttgttgttgt 35033428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 184; E-Value: 2e-99
Query Start/End: Original strand, 18 - 376
Target Start/End: Original strand, 53519511 - 53519865
Alignment:
Q  18 atgatgatgttgcgctggatgagtggtaagactagacatgataggattaagaatgacatcattaga--gagaatgggggtagcacctata------gtag 109  Q
    |||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||  |||| |||||||||||||||||      ||||    
T  53519511 atgaggatgttgcgttggatgagtggtaatactagacaggataggattaagaatgacaccattagacagagagtgggggtagcacctatatatatagtag 53519610  T
Q  110 aaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaatggagaagaaccaggt 209  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||| | |||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| |||  || ||    
T  53519611 aaaagttggtagaaaataggcttagatgttttggacatgaatagagaagaaccgtagatgccgttgtaagaagagtagatcaaatggaggagagtcatgt 53519710  T
Q  210 taaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaaca 309  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||            | |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  53519711 taaaagaggtagaggaagacctaagaaaaccatt------------aaaaaagatttagaggtcaatgagttggatccaaataaggtttttgatagaaca 53519798  T
Q  310 ctatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 376  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  53519799 ctatgacgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgagataaggcttggttgttgttgttgt 53519865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 181; E-Value: 1e-97
Query Start/End: Original strand, 11 - 376
Target Start/End: Original strand, 54278938 - 54279304
Alignment:
Q  11 agcagagatgatgatgttgcgctggatgagtggtaagactagacatgataggattaagaatgacatcattagagagaatg--ggggtagcacctatagta 108  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| |||| |||||||| |||||||||||  |  ||||||||||||||||||    
T  54278938 agcagagatgaggatgttgcgttggataagtggtaagactagacaagatagaattaggaatgacaccattagagagagagtaggggtagcacctatagta 54279037  T
Q  109 gaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaatggagaagaaccagg 208  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| | ||| | || ||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||| ||||||||||||| |||  || |    
T  54279038 gaaaagttggtagaaaataggcttagacggtttgggcacgtagagagaagacccgtagatgccgtggtaaaaagagtagatcaaatggaggagagtcaag 54279137  T
Q  209 ttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaac 308  Q
    |||||||||||||| ||||| ||| |||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||| | |||||||||    
T  54279138 ttaaaagaggtagaagaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaac 54279237  T
Q  309 actatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 376  Q
    |||||| | |||||||||| ||||||||||||| ||||| |  |||||  ||||||| ||||||||||    
T  54279238 actatggcgtcatttgatcaatgtagccgatcccacttaataagataagacttggtt-ttgttgttgt 54279304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 177; E-Value: 3e-95
Query Start/End: Original strand, 11 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 51448073 - 51447714
Alignment:
Q  11 agcagagatgatgatgttgcgctggatgagtggtaagactagacatgataggattaagaatgacatcattagagagaatgg-gggtagcacctatagtag 109  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||  |  ||||||||||||||||||    
T  51448073 agcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagactagacaggataggattaggaatgacaccattagagagagagtagggtagcacctatagtag 51447974  T
Q  110 aaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaatggagaagaaccaggt 209  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||  ||| | ||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||| |||  || ||    
T  51447973 aaaagttggtagaaaataggcttagatagtttgggcatgtagagagaagatccgtagatgccgtggtaagaagagtagatcaaatggaggagagtcaagt 51447874  T
Q  210 taaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaaca 309  Q
    |||||||       ||||| ||| |||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||| | ||||||||||    
T  51447873 taaaaga-------gaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaaca 51447781  T
Q  310 ctatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 376  Q
    ||||| | ||||||||| ||||||||||  || | |||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  51447780 ctatggcgtcatttgattcatgtagccggccccatttagtgggataaggcttggttgttgttgttgt 51447714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 136; E-Value: 1e-70
Query Start/End: Original strand, 11 - 374
Target Start/End: Original strand, 54128296 - 54128662
Alignment:
Q  11 agcagagatgatgatgttgcgctggatgagtggtaagactagacatgataggattaagaatgacatcattagagagaatg--ggggtagcacctatagta 108  Q
    ||||||||||| ||||||||| | |||||||||||| |||||||  |||||||||| |||||||| ||||||||||| ||  ||||||||||||||||||    
T  54128296 agcagagatgaggatgttgcgtttgatgagtggtaaaactagacgcgataggattatgaatgacaccattagagagagtgttggggtagcacctatagta 54128395  T
Q  109 gaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaatggagaagaaccagg 208  Q
    |||||| ||||||||||||| ||||| || ||| | |||||||||| |||||| ||||||   |  ||| | |||| |||||| ||||||   |  |||     
T  54128396 gaaaagatggtagaaaataggcttaggtggtttgggcatgtagagaaaagacctgtagatgatgcagtacgtagagtagatcagatggaggttagtcaga 54128495  T
Q  209 ttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatt-tgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaa 307  Q
    |  ||||||||||||||||| |||  ||||| |||  ||||||| || || ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||    
T  54128496 tcgaaagaggtagaggaagacctagaaaaactattaagagaaactataaggaaagatttagaggtcaatgagttggacccaaatatggtttatgatagaa 54128595  T
Q  308 cactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgtt 374  Q
    || |||| ||| ||||||||||||||| ||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  54128596 cattatggcataatttgatccatgtaggcgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgtt 54128662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 134; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 11 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 33272392 - 33272122
Alignment:
Q  11 agcagagatgatgatgttgcgctggatgagtggtaagactagacatgataggattaagaatgacatcattagagagaa----tgggggtagcacctata- 105  Q
    ||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||     |||||||||||||||||     
T  33272392 agcagagatgaggatgttgcattggatgagtggtaagactagacatgataggattaagaatgacaccattagagagagagagtgggggtagcacctatat 33272293  T
Q  106 ---gtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaatggagaaga 202  Q
       ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| | ||||||||||||||||  |||||| |||| |||||||| | | ||||||||||| |||    
T  33272292 atagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagact-gtagatgccgtggtaagaagtgtatatcaaatggaggaga 33272194  T
Q  203 accaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtca 274  Q
      || ||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  33272193 gtcaagttaaaagaggtagaggaagacctacgaaaactattagagaaaccattagaaatgatttagaggtca 33272122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 133; E-Value: 6e-69
Query Start/End: Original strand, 124 - 376
Target Start/End: Original strand, 48508268 - 48508520
Alignment:
Q  124 aatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagag 223  Q
    ||||| |||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||   || |||||||||| |||||| |||||| |||  ||||| |||||||||||||    
T  48508268 aataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacccgtagatgttgtcgtaagaagagtagatcagatggaggagagtcaggtcaaaagaggtagag 48508367  T
Q  224 gaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcattt 323  Q
    ||||| ||| |||||| ||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||| | | ||||    
T  48508368 gaagacctaggaaaactataagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggattcaaatatggtttatgatagaacactatggcgtaattt 48508467  T
Q  324 gatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 376  Q
    ||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  48508468 gatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttgt 48508520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 13 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 43695127 - 43694768
Alignment:
Q  13 cagagatgatgatgttgcgctggatgagtggtaagactagacatga-----taggattaagaatgacatcattagagagaatggggg-tagcacctatag 106  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||     |||||||| ||||||||     ||||||| |||||| ||||||||||||    
T  43695127 cagagatgaggatgttgcgttggatgaatggtaagaccagacatgacatgataggattaggaatgacag----agagagagtggggggtagcacctatag 43695032  T
Q  107 tagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaatggagaagaacca 206  Q
    ||||||||||||||||||||   |||||||| ||| | ||||||||||||||||| ||||||  ||| |||||||||  |||||||||| ||  |||       
T  43695031 tagaaaagttggtagaaaatttgcttagatggtttgggcatgtagagagaagacctgtagatgtcgtcgtaagaagattagatcaaatgaag--gaa--- 43694937  T
Q  207 ggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgataga 306  Q
     ||||||||||||||||||| | ||| |||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||  || |||| |||   ||||| |||||||    
T  43694936 -gttaaaagaggtagaggaaaatctaggaaaactattagagaaaccattaaaaaagatttagaggtcaatggattggatctaaactaggtttatgataga 43694838  T
Q  307 acactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 376  Q
    ||| || ||| |||||||||| |||||| ||| || | |||||| ||||| ||| |||||||||||||||    
T  43694837 acaatacgacgtcatttgatctatgtagtcgaccccatttagtgggataaagctgggttgttgttgttgt 43694768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 113; E-Value: 5e-57
Query Start/End: Original strand, 94 - 373
Target Start/End: Original strand, 38850123 - 38850403
Alignment:
Q  94 gtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaa 193  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||| | |||||   ||| |||||||||| ||||| ||    
T  38850123 gtagcacatatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatggtttgggcatgtagagagaagatcagtagaggtcgtcgtaagaagagtagatcgaa 38850222  T
Q  194 tggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaa-gatttagaggtcaatgagttagatccaaata 292  Q
    ||||| |||  || |||| |||||||||||||||| ||| |||||  ||| || |||||||||||||| ||| |||| |||||||| ||  || |||||     
T  38850223 tggaggagagtcaagttagaagaggtagaggaagacctaggaaaattattagataaaccattagaaaaggatctagaagtcaatgaattgaattcaaatt 38850322  T
Q  293 tggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgt 373  Q
    |||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| || |||||||  |||||  ||| |||||||||||    
T  38850323 tggtttatgatagaacactatgacgtaatttgatccatgtagccgaccccacttagtaggataaaacttagttgttgttgt 38850403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 105; E-Value: 3e-52
Query Start/End: Original strand, 208 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 12096870 - 12096702
Alignment:
Q  208 gttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaa 307  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||| || ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||| | ||||||||    
T  12096870 gttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagaaaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaa 12096771  T
Q  308 cactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 376  Q
    ||||||| | ||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  12096770 cactatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttgt 12096702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 11 - 265
Target Start/End: Original strand, 45728064 - 45728324
Alignment:
Q  11 agcagagatgatgatgttgcgctggatgagtggtaagactagacatgataggattaagaatgacatcatt---agagagaatgggggtagcacctatagt 107  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||   |||||||||  ||||||||||||   ||||||| |||||||||||| ||||||    
T  45728064 agcagagatgaggatgttgcgctggatgagtggtaagacgagacgaaataggattagaaatgacatcatttagagagagagtgggggtagcacatatagt 45728163  T
Q  108 agaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagag-aagacccgtagataccgttgtaagaagag--aagatcaaatggagaagaac 204  Q
    ||||||||||||||||| |||  | ||||| ||| ||||||||||||| || |||| |||||  ||||||||||||||   | ||||||||||| |||      
T  45728164 agaaaagttggtagaaagtaggatcagatggttttgacatgtagagagaaaaacccatagatgtcgttgtaagaagagtatatatcaaatggaggagagt 45728263  T
Q  205 caggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatt 265  Q
    || |||||||||| |||||||||| ||| |||||| ||| |||||||||||||||| ||||    
T  45728264 catgttaaaagagatagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatt 45728324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 96; E-Value: 7e-47
Query Start/End: Original strand, 245 - 376
Target Start/End: Original strand, 53262295 - 53262426
Alignment:
Q  245 gagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaac 344  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| |||||||||| || ||    
T  53262295 gagaaaccattagaagagatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttttgatagaacactatggcgtcatttgatctatgtagccgaccccac 53262394  T
Q  345 ttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 376  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  53262395 ttagtgggataaggcttggttgttgttgttgt 53262426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 81 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 45289385 - 45289091
Alignment:
Q  81 agagagaatgggggtagcacctat--agtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaa 178  Q
    ||||||| | ||||||||||||||  |||||||||| |||| |||||||| ||||| || ||| | || |||||||||| ||  ||||||   || ||||    
T  45289385 agagagagttggggtagcacctattcagtagaaaagatggtggaaaataggcttaggtggtttgggcacgtagagagaacacttgtagattttgtagtaa 45289286  T
Q  179 gaagagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatga 278  Q
    |||||| |||||| |||||| | |   || ||| ||||| |||||||||| ||| |||||| ||  ||||||| ||||| |||||||||||| | |||||    
T  45289285 gaagagtagatcagatggaggatagttagattacaagagatagaggaagatctatgaaaactataagagaaactattaggaaagatttagagattaatga 45289186  T
Q  279 gttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgt 373  Q
    ||| |||||||||||||||| |||||||||| |||  ||| ||||||||||||| ||| | || |||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  45289185 gttggatccaaatatggtttatgatagaacattatagcataatttgatccatgtcgccaaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 45289091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 91; E-Value: 7e-44
Query Start/End: Original strand, 81 - 239
Target Start/End: Original strand, 38060421 - 38060579
Alignment:
Q  81 agagagaatgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaaga 180  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||    
T  38060421 agagagagtgggggtagcacctataatagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttggacatgtagagagaagacctgtagatgccgtcgtaaga 38060520  T
Q  181 agagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaac 239  Q
    |||| |||| |||||||| |||  |||||||||| ||||||||| ||| ||| ||||||    
T  38060521 agagtagattaaatggaggagagtcaggttaaaaaaggtagagggagacctaggaaaac 38060579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 91; E-Value: 7e-44
Query Start/End: Original strand, 98 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 48953697 - 48953454
Alignment:
Q  98 cacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaa-gacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaatgg 196  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||| |||||| |||||| ||||   || |||||||||| |||||| ||||    
T  48953697 cacctatagtagaaaagttggtagaaaataaacttagatgatttgggcatgtaaagagaaagacccgcagatgttgtcgtaagaagagtagatcagatgg 48953598  T
Q  197 agaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaaga---tttagaggtcaatgagttagatccaaatat 293  Q
    || |||  | ||| |||||| ||||||||||| ||| |||||| ||  |||||| ||||| ||||||   | || ||||||||||||| |||||||||||    
T  48953597 aggagagtcgggtcaaaagaagtagaggaagacctaggaaaactataagagaaatcatta-aaaagaacttataaaggtcaatgagttggatccaaatat 48953499  T
Q  294 ggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccga 338  Q
    | ||| ||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||    
T  48953498 gatttatgatagaacactatgacgtaatttaatccatgtagccga 48953454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 229 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 52156228 - 52156081
Alignment:
Q  229 actaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatcc 328  Q
    |||| |||||| ||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||| ||||||    
T  52156228 actaggaaaactattagagaaatcattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttatgatagaacactatggcgtcatctgatcc 52156129  T
Q  329 atgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 376  Q
    |||||||||| || |||||||| ||||| ||| |||||||||||||||    
T  52156128 atgtagccgaccccacttagtgggataaggctcggttgttgttgttgt 52156081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 57 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 54425289 - 54424959
Alignment:
Q  57 gataggattaagaatgacatcattag--agagaatgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagaga 154  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||  ||||| || || || || ||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||  |||||||| ||    
T  54425289 gataggattatgaatgacaccattaggaagagagtgagg-tatcatctataatagaaaagtttgtagaaaatagacttagaagatttgaacatgtaggga 54425191  T
Q  155 gaagacccgtagataccgttgtaagaag-------agaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgag 247  Q
    ||||||| | |||| |||||||||| ||       || |||||| |||||| |||  ||||| |||||||||||||||||| |||||||| | ||  |||    
T  54425190 gaagacctgcagatgccgttgtaagtaggatttagagtagatcagatggaggagattcaggtcaaaagaggtagaggaagacctaagaaagctataagag 54425091  T
Q  248 aaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacat------catttgatccatgtagccgatcc 341  Q
      ||||||| ||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| | |||||| ||||||||||       ||||||||||| |||| || ||    
T  54425090 ggaccattaaaaaggatttagaggtcaatgggttggatccaaatatggtttattatagaaaactatgacataatttcaatttgatccatctagctgaccc 54424991  T
Q  342 aacttagtgtgataatgcttggttgttgttgt 373  Q
     |||||||| ||| ||||||| || |||||||    
T  54424990 cacttagtgggatgatgcttgattattgttgt 54424959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 81; E-Value: 7e-38
Query Start/End: Original strand, 91 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 19676362 - 19676079
Alignment:
Q  91 ggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatc 190  Q
    |||||||||||||||||| ||||| || |||||||| | ||||| || | | | ||||||||||||||||| |||||| | || |||  |||||||||||    
T  19676362 ggggtagcacctatagtacaaaagatgatagaaaattggcttaggtggtattggcatgtagagagaagacctgtagatgctgtagtacaaagagaagatc 19676263  T
Q  191 aaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaa 290  Q
    | || ||| |||  ||| | |||||||||| ||||||| |||  |||||  |  ||||||| ||||| ||| |||||||||| |||||||| ||||||||    
T  19676262 agatagaggagagtcagatcaaaagaggta-aggaagacctagaaaaactgtaagagaaactattaggaaaaatttagaggttaatgagttggatccaaa 19676164  T
Q  291 tatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttg 375  Q
    |||| | | ||||||| || |||| | | |||||||||||||||| || || |||||||| ||||| ||||||||||| ||||||    
T  19676163 tatgctgtatgatagagcattatggcgtgatttgatccatgtagctgaccccacttagtgggataaggcttggttgttattgttg 19676079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 15 - 372
Target Start/End: Original strand, 26490239 - 26490596
Alignment:
Q  15 gagatgatgatgttgcgctggatgagtggtaagactagacatgataggattaagaatgacatcattagagagaatgggggtagcacctatagtagaaaag 114  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||  |||| |||||  |||||| |||||||| ||| | | ||||||||||||||||||||||    
T  26490239 gagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagacaagacgggatatgattagcaatgacgtcattagacagagttgaggtagcacctatagtagaaaag 26490338  T
Q  115 ttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaa 214  Q
     ||||||||||||| ||||| || ||| |||||||||| | ||||||  | |||   || ||| |||||| |||||| || ||| |||| ||  ||| |     
T  26490339 atggtagaaaataggcttaggtggtttggacatgtagataaaagaccgttggatgttgtagtacgaagagtagatcagatagaggagaatcatattagat 26490438  T
Q  215 gaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatg 314  Q
    |||| || ||||||  ||  ||||| |   ||||||| ||||||||||||||||||   |||||||| ||||||||| || |||   |||||| | ||||    
T  26490439 gaggcagtggaagatatagaaaaactagaagagaaactattagaaaagatttagagactaatgagtttgatccaaatgtgatttcatatagaatattatg 26490538  T
Q  315 acatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttg 372  Q
     | | ||||||||||| ||| |||||| |||||||  |||||  |||| |||||||||    
T  26490539 gcgtaatttgatccatatagtcgatcccacttagtaagataagacttgattgttgttg 26490596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 260 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 311422 - 311306
Alignment:
Q  260 aagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgc 359  Q
    ||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||| || |||||||| ||||| ||    
T  311422 aagatttagaggtcaattagttggatccagatatggtttttgatagaacactatggcgtcatttgatacatgtagccgaccccacttagtgggataaggc 311323  T
Q  360 ttggttgttgttgttgt 376  Q
    |||||||||||||||||    
T  311322 ttggttgttgttgttgt 311306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 33 - 296
Target Start/End: Original strand, 3186709 - 3186973
Alignment:
Q  33 tggatgagtggtaagactagacatgataggattaagaatgacatcatta--gagagaatgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagac 130  Q
    |||||||| ||||||||| | |  |||| ||||| |||||||| |||||  || ||| ||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |    
T  3186709 tggatgagcggtaagacttggcgggataagattaggaatgacaccattatggaaagagtggtggtagcacctatagtgggaaagttggtagaaaataggc 3186808  T
Q  131 ttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaac 230  Q
    | ||||||||| | |||||||||||||||   ||||||  | ||||||||| |  |||||| || ||||| |  ||||| ||||||||| ||| || | |    
T  3186809 t-agatgatttgggcatgtagagagaagatttgtagatgtcattgtaagaaaaatagatcagattgagaaaagtcaggtcaaaagaggtggagaaatacc 3186907  T
Q  231 taagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggt 296  Q
    ||||||||| ||  || ||| |||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  3186908 taagaaaactataagaaaaatcattagaaagaatttaaaggtcaatgagttagatccaaatatggt 3186973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 27 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 48734481 - 48734147
Alignment:
Q  27 ttgcgctggatgagtggtaagactagacatgataggattaagaatgacatcattagagagaatgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaat 126  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||| |  |||| ||||| |||||||| ||||||||||  | |||||||| | |||||||||| || |||||||||||    
T  48734481 ttgcgttggatgagtggtaaaactaggcgggataagattatgaatgacaccattagagagtgttggggtagcgcgtatagtagaacagatggtagaaaat 48734382  T
Q  127 agacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaa 226  Q
    || ||||| || ||| | ||||||||||||||| | |||||  | || ||| |||||| |||||| |||||||  |   || | ||||||||||||||||    
T  48734381 aggcttaggtggtttgggcatgtagagagaagaactgtagaggctgtagtacgaagagtagatcagatggagattagttagatcaaaagaggtagaggaa 48734282  T
Q  227 gaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgat 326  Q
    |  |            |||| |||| |||||| |||||||| ||||||| ||||| | |||||| ||||||| |||||||||| |||| | | | |||||    
T  48734281 ggcc------------ttgaaaaactattagagaagatttaaaggtcaacgagttgggtccaaacatggtttatgatagaacattatggcgtaagttgat 48734194  T
Q  327 ccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgt 373  Q
    ||||||||| || || |||||||| ||||| ||||| ||||||||||    
T  48734193 ccatgtagctgaccccacttagtgggataaggcttgattgttgttgt 48734147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 245 - 373
Target Start/End: Original strand, 49042090 - 49042219
Alignment:
Q  245 gagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttt-tgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaa 343  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||| || |    
T  49042090 gagaaactattaggaaagatttagaggttaatgagttggatccaaatatggttttatgatagaacactatggcgtaatttgatccatgtagccgacccca 49042189  T
Q  344 cttagtgtgataatgcttggttgttgttgt 373  Q
    ||| ||| ||||| ||||||||||||||||    
T  49042190 cttggtgagataaggcttggttgttgttgt 49042219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 33 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 49503896 - 49503565
Alignment:
Q  33 tggatgagtggtaagactagacatgataggattaagaatgacatcattagagagaatggg--ggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagac 130  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||  |||||||| |||||||||||  |    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |    
T  49503896 tggatgagtggtaagactagacgagataggattgggaatgacaccattagagagagagttcaggtagcacctatagtagaaaagatggtagaaaataggc 49503797  T
Q  131 ttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaac 230  Q
    |||| || ||| | |||||||||||||||||  |||||   ||  ||  || || |||||| ||||||  ||  | | ||| |||| ||||||||||| |    
T  49503796 ttaggtggtttgggcatgtagagagaagaccaatagatgttgtaatacaaacagtagatcagatggaggggagtctgattagaagatgtagaggaagacc 49503697  T
Q  231 taagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccat 330  Q
    |              |||||| ||||| |||||||||  ||| |||||||| | ||||||||||||||| |||| || | |||| | | |||||||||||    
T  49503696 t--------------agaaactattaggaaagatttaacggttaatgagttgggtccaaatatggttttggatataatattatggcgtaatttgatccat 49503611  T
Q  331 gtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 376  Q
    |||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  49503610 gtagccgaccctacttagtgggataaggcttggttgttgttgttgt 49503565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 71; E-Value: 6e-32
Query Start/End: Original strand, 235 - 373
Target Start/End: Original strand, 38060858 - 38060996
Alignment:
Q  235 aaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtag 334  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||| | |||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||| | | |||||||||||||||    
T  38060858 aaaactattagagaaaccattagaaaggttttagaagtcaatgagttggatccaaatatggtttatgatagaacaccatggcgtaatttgatccatgtag 38060957  T
Q  335 ccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgt 373  Q
    |||| || |||||||| |||||   ||||||||||||||    
T  38060958 ccgaccccacttagtgggataagaattggttgttgttgt 38060996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 11 - 160
Target Start/End: Original strand, 27917490 - 27917639
Alignment:
Q  11 agcagagatgatgatgttgcgctggatgagtggtaagactagacatgataggattaagaatgacatcattagagagaatgggggtagcacctatagtaga 110  Q
    ||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||| ||||||  |||  ||||| |||||||  ||||||||| | | ||||||||||||||||||||    
T  27917490 agcagagatgaggatgttgtgttggatgagtggtaagcctagacgagatttgattaggaatgaccccattagagaaagttggggtagcacctatagtaga 27917589  T
Q  111 aaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagac 160  Q
    |||| |||||| |||||| |||||||| ||| |||||||||| |||||||    
T  27917590 aaagatggtaggaaataggcttagatggtttggacatgtagaaagaagac 27917639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 107 - 338
Target Start/End: Original strand, 39235154 - 39235384
Alignment:
Q  107 tagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaatggagaagaacca 206  Q
    |||||||| ||||||||||||| ||||| || ||| | ||||||||||||||||| ||||||   || ||| |||||| |||||| |||||| | |  ||    
T  39235154 tagaaaagatggtagaaaataggcttaggtggtttgggcatgtagagagaagacctgtagatgttgtagtacgaagagtagatcagatggaggaaagtca 39235253  T
Q  207 ggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgataga 306  Q
    | | |||||||||||||||||| | || ||||| ||  || |||| ||||| ||||||||||| || |||||||| |||| |||||||||||  ||||||    
T  39235254 gatcaaaagaggtagaggaagacccaaaaaaactataggataaactattaggaaagatttagaagttaatgagttggatctaaatatggtttacgataga 39235353  T
Q  307 acactatgacatcatttgatccatgtagccga 338  Q
    ||| |||| | | | |||||||||||||||||    
T  39235354 acattatgtcgtga-ttgatccatgtagccga 39235384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 15 - 363
Target Start/End: Original strand, 19736918 - 19737255
Alignment:
Q  15 gagatgatgatgttgcgctggatgagtggtaagactagacatgataggattaagaatgacatcattagagagaa---tgggggtagcacctatagtagaa 111  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||  |||| |||||  | ||| |||||||||||||    |||||| ||||||||||||||||    
T  19736918 gagatgatgatgttgtgttggatgagtggtaagactagacgggatacgattagaagtgaaatcattagagagagagttgggggcagcacctatagtagaa 19737017  T
Q  112 aagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaatggagaagaaccaggtta 211  Q
    ||| |||||||||||||  |||| || |||   |||| |||||||||||| ||||||   || |||||||||| |||||| |||||| |||   || | |    
T  19737018 aagatggtagaaaataggtttaggtggtttgagcatgcagagagaagacctgtagatgttgtagtaagaagagtagatcagatggaggagagttagatca 19737117  T
Q  212 aaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacact 311  Q
    ||| |||| |||||||| |||            || |||| ||||| ||| |||||||| | |||||||| ||||  |||||||||| ||||| |||| |    
T  19737118 aaa-aggttgaggaagaccta------------gaaaaactattaggaaatatttagagattaatgagttggatctcaatatggtttatgataaaacatt 19737204  T
Q  312 atgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttgg 363  Q
    |||  || ||||||||||||||| ||| || |||||||| ||||| ||||||    
T  19737205 atggtataatttgatccatgtag-cgaccccacttagtgggataaggcttgg 19737255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 64; E-Value: 9e-28
Query Start/End: Original strand, 20 - 363
Target Start/End: Original strand, 19757826 - 19758158
Alignment:
Q  20 gatgatgttgcgctggatgagtggtaagactagacatgataggattaagaatgacatcattagagagaa---tgggggtagcacctatagtagaaaagtt 116  Q
    |||||||||| | ||||||||||||||||||| ||  |||| |||||  | ||| |||||||||||||    |||||| ||||||||||||||||||| |    
T  19757826 gatgatgttgtgttggatgagtggtaagactacacgagatacgattagaagtgaaatcattagagagagagttgggggcagcacctatagtagaaaagat 19757925  T
Q  117 ggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaaga 216  Q
    ||||||||||||  |||| || |||   |||| |||||||||||| ||||||   || |||||||||| |||||| |||||| |||   || | |||| |    
T  19757926 ggtagaaaataggtttaggtggtttgagcatgcagagagaagacctgtagatgttgtagtaagaagagtagatcagatggaggagagttagatcaaaa-a 19758024  T
Q  217 ggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgac 316  Q
    |||||||||||| |||            || |||| ||||| ||| |||||||| | |||||||| ||||  |||||||||| |||||||||| ||||      
T  19758025 ggtagaggaagaccta------------gaaaaactattaggaaatatttagagattaatgagttggatctcaatatggtttatgatagaacattatggt 19758112  T
Q  317 atcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttgg 363  Q
    || ||||||||||||||| ||| || |||||||| ||||| ||||||    
T  19758113 ataatttgatccatgtag-cgaccccacttagtgggataaggcttgg 19758158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 64; E-Value: 9e-28
Query Start/End: Original strand, 25 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 36820309 - 36820166
Alignment:
Q  25 tgttgcgctggatgagtggtaagactagacatgataggattaagaatgacatcattagagagaatgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaa 124  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||||||  ||||||||||  ||||||  ||||||||||| | ||||||||||||||| ||| |||| |||| ||||    
T  36820309 tgttgcgttggatgtgtggtaagactagacgagataggattagaaatgacgacattagagagagttggggtagcacctatattagcaaagatggtggaaa 36820210  T
Q  125 atagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagat 168  Q
     ||| ||||| || |||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  36820209 ctaggcttaggtggtttagacatgtaaagagaagacccatagat 36820166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 64; E-Value: 9e-28
Query Start/End: Original strand, 269 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 47555436 - 47555329
Alignment:
Q  269 aggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgtt 368  Q
    ||||||||||||| ||||||||| |||| | ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| | || |||||||| ||||| |||||||||||    
T  47555436 aggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccaaccccacttagtgggataaggcttggttgtt 47555337  T
Q  369 gttgttgt 376  Q
    ||||||||    
T  47555336 gttgttgt 47555329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 59; E-Value: 9e-25
Query Start/End: Original strand, 266 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 2133719 - 2133609
Alignment:
Q  266 tagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggtt 365  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||| |||| ||||||||||||||| | | ||||||||||||||  ||| || |||||||| ||||| ||||||||    
T  2133719 tagaggtcaatgagttgaatccaaatatagtttatgatagaacactatggcgtgatttgatccatgtactcgaccccacttagtgggataaggcttggtt 2133620  T
Q  366 gttgttgttgt 376  Q
    |||||||||||    
T  2133619 gttgttgttgt 2133609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 59; E-Value: 9e-25
Query Start/End: Original strand, 40 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 39601016 - 39600683
Alignment:
Q  40 gtggtaagactagacatgataggattaagaatgacatcattagagagaatg--ggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatg 137  Q
    ||||||||||||||   |||| |||||  ||||||| |||||||||||  |  ||||||| |||||||||||||||| |||| ||||| |  ||||| ||    
T  39601016 gtggtaagactagatgggataagattagaaatgacaacattagagagagagttggggtagtacctatagtagaaaagatggtggaaaacaagcttaggtg 39600917  T
Q  138 atttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaa 237  Q
     ||| | |||||| |||||||||| |||||| | || |  || |||| |||||| || ||| | |  ||| ||  |||||||||||||||| |||  |||    
T  39600916 gttttggcatgtaaagagaagacctgtagattctgtagcgaggagagtagatcagatcgaggatagtcagattgcaagaggtagaggaagacctagaaaa 39600817  T
Q  238 accatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccg 337  Q
    || ||  ||||||| ||||  |||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||  ||||||||| ||||   | ||||||||||| || ||     
T  39600816 actataagagaaactattaagaaagatttagaggttaatgagttggatccaaatctggtttacgatagaacattatggtgtaatttgatccatctaacca 39600717  T
Q  338 atccaacttagtgtgataatgcttggttgttgtt 371  Q
    | || |||| ||| |||||  ||||||| |||||    
T  39600716 accccactttgtgggataagacttggtttttgtt 39600683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 59; E-Value: 9e-25
Query Start/End: Original strand, 95 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 42510292 - 42510013
Alignment:
Q  95 tagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaat 194  Q
    |||||||||||||||||||| | || |||||||| ||||| || ||| ||||||||||||  |||||  |||||   || ||||| |||| |||||| ||    
T  42510292 tagcacctatagtagaaaagatagtggaaaataggcttaggtggtttggacatgtagaga--agacctatagattttgtggtaaggagagtagatcagat 42510195  T
Q  195 ggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatg 294  Q
    |||| | |  ||| | |  ||||| | ||||||| |||  ||||| ||  ||||||||||||| |||||||| ||  | |||||||| || | |||||||    
T  42510194 ggaggatagtcagatcactagaggcaaaggaagacctagaaaaactatcagagaaaccattaggaaagatttggaaataaatgagttggaccaaaatatg 42510095  T
Q  295 gtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 376  Q
    |||| |||| ||||| |||| | | ||||||||||||||||||| || |||||| | || || |||||| ||||||||||||    
T  42510094 gtttatgattgaacattatggcgtaatttgatccatgtagccgaccccacttagagggaaaaggcttggctgttgttgttgt 42510013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 59; E-Value: 9e-25
Query Start/End: Original strand, 91 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 50960915 - 50960636
Alignment:
Q  91 ggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatc 190  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| || ||| | |||||||||||||||||     ||   || | |||||||| |||||    
T  50960915 ggggtagcacctatagtagaaaagatggtagaaaataggcttaggtggtttgggcatgtagagagaagacc----tatgttgtagaaagaagagtagatc 50960820  T
Q  191 aaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaa 290  Q
    | |||||| |||  | | |  ||||||| ||||||||| |||  ||||   |  ||||||| ||||| |||| ||||||| | |||||||| ||||||||    
T  50960819 agatggaggagagtcggatcgaaagagggagaggaagacctagaaaaaatttaagagaaactattaggaaaggtttagagattaatgagttggatccaaa 50960720  T
Q  291 tatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgtt 374  Q
    |||||| | | ||||| || ||||   | ||||||||||| ||||| | || |||||||| ||||| |||||||||||| ||||    
T  50960719 tatggtgtatcatagaccattatggtgtaatttgatccatttagccaaccccacttagtgggataaggcttggttgttgctgtt 50960636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 59; E-Value: 9e-25
Query Start/End: Original strand, 78 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 54365271 - 54364976
Alignment:
Q  78 attagagagaatgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagaga--agacccgtagataccgttg 175  Q
    |||||||||| | |||||||||||||||||||||||  |||  |||||||| ||||| || ||| | ||||||||||||  | ||| |||||| |  ||     
T  54365271 attagagagagttggggtagcacctatagtagaaaatatggcggaaaatag-cttaggtggtttgggcatgtagagagagaatacctgtagattctatta 54365173  T
Q  176 taagaagagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaa 275  Q
    |||| |||| |||||||||| || | |  |||   |  ||||| ||||||||| |||  ||||| ||  ||||||| ||||| ||||| || ||| | ||    
T  54365172 taaggagagtagatcaaatgaaggatagtcagaccacgagaggcagaggaagacctagaaaaactataagagaaactattaggaaagacttggagattaa 54365073  T
Q  276 tgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgt 373  Q
    || |||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||   ||||| ||||| |||||| |||||||||    
T  54365072 tgtgttagaccaaaatatggtttatgatagaacactatgacgtaatttgatccatgtagccga-ccacactagtgggataaggcttggctgttgttgt 54364976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 252 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 48712196 - 48712075
Alignment:
Q  252 cattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgt 351  Q
    |||||| |||||||||||  |  ||||||| ||| |||||||||||| ||||| |||| |||||||| |||| ||||||||||  ||||| ||||||||     
T  48712196 cattaggaaagatttagatattgatgagttggattcaaatatggtttatgatataacattatgacattatttcatccatgtagttgatcccacttagtgg 48712097  T
Q  352 gataatgcttggttgttgttgt 373  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  48712096 gataatgcttggttgttgttgt 48712075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 245 - 373
Target Start/End: Original strand, 15296061 - 15296189
Alignment:
Q  245 gagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaac 344  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| || |||||||||||| |||  ||||||||| ||||   | ||||||||||||| ||||| || ||    
T  15296061 gagaaactattaggaaagatttagaggttaatgaattggatccaaatatgatttcggatagaacattatggtgtaatttgatccatgtggccgaccccac 15296160  T
Q  345 ttagtgtgataatgcttggttgttgttgt 373  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  15296161 ttagtgggataaggcttggttgttgttgt 15296189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 11 - 87
Target Start/End: Original strand, 38850012 - 38850088
Alignment:
Q  11 agcagagatgatgatgttgcgctggatgagtggtaagactagacatgataggattaagaatgacatcattagagaga 87  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||    
T  38850012 agcagagatgaggatgttgcgctggatgagtagtaagactagacatgatatgattaggaatgacatcatgagagaga 38850088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 274 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 40106719 - 40106620
Alignment:
Q  274 aatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgt 373  Q
    |||||||| |||||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||| ||||||  || || |||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  40106719 aatgagttggatccaaatatggtttatgatagaacattatgacataatttgatcaatgtagtggaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 40106620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 291 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 31566243 - 31566161
Alignment:
Q  291 tatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgt 373  Q
    ||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  31566243 tatggtttttgatagaacactatggtgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 31566161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 54; E-Value: 8e-22
Query Start/End: Original strand, 291 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 40273287 - 40273202
Alignment:
Q  291 tatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 376  Q
    |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| || |||||||| || || | |||||||||||||||||    
T  40273287 tatggtttttgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggaaaaggtttggttgttgttgttgt 40273202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 284 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 7895969 - 7895877
Alignment:
Q  284 atccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 376  Q
    |||||||| |||| | ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| || ||||| || ||||| |||||||||||||||||||    
T  7895969 atccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttaatgggataaggcttggttgttgttgttgt 7895877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 93 - 309
Target Start/End: Original strand, 38430850 - 38431066
Alignment:
Q  93 ggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaa 192  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |   || | |||||||||||| |||| | ||||   || ||| |||||| ||||||     
T  38430850 ggtagcacctatagtagaaaagatggtagaaaataggcttaggttgattgggcatgtagagagacgacctgcagatgttgtagtatgaagagtagatcag 38430949  T
Q  193 atggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaata 292  Q
    |||||| |||  ||  | ||||||||||||||||||  ||  ||||| |   ||||||| |||    ||| ||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  38430950 atggaggagagtcaaatcaaaagaggtagaggaagacttagaaaaactacaagagaaactattgtggaaggtttagaggttaatgagttggatccaaata 38431049  T
Q  293 tggtttttgatagaaca 309  Q
    |||||| ||||||||||    
T  38431050 tggtttatgatagaaca 38431066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 292 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 31454306 - 31454224
Alignment:
Q  292 atggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgtt 374  Q
    ||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||| ||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  31454306 atggtttttgatagaacactatggcgtcatttgattcatttagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgtt 31454224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 259 - 376
Target Start/End: Original strand, 29601060 - 29601177
Alignment:
Q  259 aaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatg 358  Q
    |||||||||||| | |||||||| ||| ||||||| |||| |||||||||| |||||  | |||||||||||||||| || || |||||||| ||||  |    
T  29601060 aaagatttagagattaatgagttggattcaaatatagtttatgatagaacattatgatgtaatttgatccatgtagctgaccccacttagtgggatacgg 29601159  T
Q  359 cttggttgttgttgttgt 376  Q
    ||||||| ||||||||||    
T  29601160 cttggttcttgttgttgt 29601177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 289 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 45486933 - 45486848
Alignment:
Q  289 aatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgtt 374  Q
    |||||||||| |||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||  || |||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  45486933 aatatggtttatgatagaacattatggcataatttgatccatgtagccggccccacttagtgggataaagcttggttgttgttgtt 45486848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 285 - 376
Target Start/End: Original strand, 48532151 - 48532243
Alignment:
Q  285 tccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatcca-tgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 376  Q
    ||||||| | |||| ||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  48532151 tccaaattttgtttatgatagaacactatggcgtcatttgatccaatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttgt 48532243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 285 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 52927936 - 52927845
Alignment:
Q  285 tccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 376  Q
    ||||||||||||||  || |||||| |||| ||| ||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||| ||||||    
T  52927936 tccaaatatggtttacgacagaacattatggcataatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgatgttgt 52927845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 288 - 370
Target Start/End: Original strand, 32170602 - 32170684
Alignment:
Q  288 aaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgt 370  Q
    ||||||||| | ||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||    
T  32170602 aaatatggtctatgatataacattatgacataatttgatccatgtagccgaccccacttagtgagataaagcttggttgttgt 32170684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 274 - 376
Target Start/End: Original strand, 39208791 - 39208893
Alignment:
Q  274 aatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgt 373  Q
    |||||||  |||||||||||||||| |||||||||| |||||| | |||||||||||||||  || || | |||||| ||||  ||||||||||||||||    
T  39208791 aatgagtaggatccaaatatggtttatgatagaacattatgacgtaatttgatccatgtagaggaccccagttagtgggatatggcttggttgttgttgt 39208890  T
Q  374 tgt 376  Q
    |||    
T  39208891 tgt 39208893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 250 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 54422966 - 54422837
Alignment:
Q  250 accattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacat------catttgatccatgtagccgatccaa 343  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | |||||| ||||||||||       ||||||||||| |||| || || |    
T  54422966 accattaaaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttattatagaaaactatgacataatttcaatttgatccatctagctgacccca 54422867  T
Q  344 cttagtgtgataatgcttggttgttgttgt 373  Q
    ||||||| ||| ||||||| || |||||||    
T  54422866 cttagtgggatgatgcttgattattgttgt 54422837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 34 - 112
Target Start/End: Original strand, 33307087 - 33307165
Alignment:
Q  34 ggatgagtggtaagactagacatgataggattaagaatgacatcattagagagaatgggggtagcacctatagtagaaa 112  Q
    ||||| |||||||||||| |||||||| |||||  || |||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  33307087 ggatgtgtggtaagactaaacatgataagattagaaacgacaacattagagagagttggggtagcacctatagtagaaa 33307165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 259 - 373
Target Start/End: Original strand, 36304134 - 36304248
Alignment:
Q  259 aaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatg 358  Q
    |||||| ||||| | |||||||| |||| ||||||||||| |||||| ||| |||| | | ||||||||||||||||||| || ||| | ||||| || |    
T  36304134 aaagatctagagattaatgagttggatcaaaatatggtttatgataggacattatggcgtaatttgatccatgtagccgaccccactcaatgtgacaagg 36304233  T
Q  359 cttggttgttgttgt 373  Q
    || ||||||||||||    
T  36304234 ctcggttgttgttgt 36304248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 283 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 45374567 - 45374474
Alignment:
Q  283 gatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 376  Q
    ||||||| ||||||||  ||||||||| |||| | | |||| ||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  45374567 gatccaactatggtttcggatagaacattatggcgtaatttaatccatgtagctgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttgt 45374474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 308 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 45834665 - 45834597
Alignment:
Q  308 cactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 376  Q
    ||||||| | ||||||||||||||||||| | || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  45834665 cactatggcgtcatttgatccatgtagccaaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttgt 45834597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 81 - 160
Target Start/End: Original strand, 3987037 - 3987116
Alignment:
Q  81 agagagaatgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagac 160  Q
    ||||||| | |||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| || ||| |  |||||||||||||||    
T  3987037 agagagagttggggtatcacctatagtagaaaagatggtagaaactagacttaggtggtttgggaatgtagagagaagac 3987116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 302 - 373
Target Start/End: Original strand, 7278675 - 7278746
Alignment:
Q  302 atagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgt 373  Q
    |||||||| ||| || ||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||| |||||||||||    
T  7278675 atagaacattataacgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaagcttagttgttgttgt 7278746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 274 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 14415358 - 14415260
Alignment:
Q  274 aatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgt 373  Q
    |||||||| || ||| ||||||||| ||||| |||| |||| ||| |||||||| |||||||||| || |||||||| |||||  |||||||||||||||    
T  14415358 aatgagttggacccacatatggtttatgatataacattatggcataatttgatc-atgtagccgaccccacttagtgggataagacttggttgttgttgt 14415260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 289 - 376
Target Start/End: Original strand, 20208196 - 20208283
Alignment:
Q  289 aatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 376  Q
    |||||||  |||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||| || | |||||| ||||| ||||||||  |||||||||    
T  20208196 aatatggcatttgatagaactttatggcatcatttgatccatgtagccgaccccatttagtgggataacgcttggttaatgttgttgt 20208283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 81 - 199
Target Start/End: Original strand, 21200540 - 21200656
Alignment:
Q  81 agagagaatgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaaga 180  Q
    ||||||||| |||||||||||||  ||||||||| |||| |||| ||||||||| || ||| | ||||||||||||||||  |||||| | |  |||||     
T  21200540 agagagaattggggtagcaccta--gtagaaaagatggtggaaactagacttaggtggtttgggcatgtagagagaagacatgtagattctgcagtaagg 21200637  T
Q  181 agagaagatcaaatggaga 199  Q
    |||| |||||| |||||||    
T  21200638 agagtagatcacatggaga 21200656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 94 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 30294403 - 30294125
Alignment:
Q  94 gtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacat---gtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatc 190  Q
    ||||||| |||| || |||||||||||||||||||  ||||||| |||   |||   |||||||||||||  |||||| ||   |||||||||| | ||     
T  30294403 gtagcacatatactaaaaaagttggtagaaaataggtttagatggtttgagcatattgtagagagaagacttgtagatgccaccgtaagaagagtaaatt 30294304  T
Q  191 aaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaa 290  Q
    | ||  || |||  | ||| |||||||||||||||||| |||  | ||| ||  || |||| |||| |||||||||| ||||||||||||| |||| ||     
T  30294303 agattaaggagagtcgggtcaaaagaggtagaggaagacctagaagaactataagataaactattaaaaaagatttataggtcaatgagttggatctaag 30294204  T
Q  291 tatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgtt 371  Q
    |||| ||| ||||| ||||||||| ||  ||||| || ||||| || | |  |||||||| |||||  |||||||||||||    
T  30294203 tatgatttatgataaaacactatggca--atttgttctatgtaaccaaccttacttagtgggataaaacttggttgttgtt 30294125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 278 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 30797917 - 30797822
Alignment:
Q  278 agttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgt 373  Q
    |||| ||||||||| | |||| |||||||||| |||||| | |||||||| ||||| |||| || ||||||||  |||| ||||||||||||||||    
T  30797917 agttggatccaaatttagtttatgatagaacattatgacgtaatttgatctatgtaaccgaccccacttagtggaataaggcttggttgttgttgt 30797822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #70
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 284 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 33271999 - 33271908
Alignment:
Q  284 atccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttg 375  Q
    |||||||| |||| | ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| | || ||||| |  ||||| |||| |||||||||||||    
T  33271999 atccaaatttggtgtatgatagaacactatgacgtcatttgatctatgtagccaaccccacttaataagataaagcttagttgttgttgttg 33271908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #71
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 95 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 52679124 - 52678929
Alignment:
Q  95 tagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgtt-gtaagaagagaagatcaaa 193  Q
    ||||| |||||| ||||||||||| ||||||||| ||  | |||||| ||||||||||||||||||  ||||||   ||| ||||||| |  |||||  |    
T  52679124 tagcatctatagcagaaaagttggaagaaaataggctctggtgatttggacatgtagagagaagacttgtagat---gttggtaagaaaaatagatcgga 52679028  T
Q  194 tggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatat 293  Q
    ||||| |||  | |||||||||| ||||| ||||| ||| ||||||  |  ||||||| ||||  |||||||||||||| ||||||||  || |||||||    
T  52679027 tggaggagagtcgggttaaaagatgtagaagaagacctaggaaaac--taagagaaactattatgaaagatttagaggttaatgagttgaattcaaatat 52678930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #72
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 15 - 126
Target Start/End: Complemental strand, 2341074 - 2340961
Alignment:
Q  15 gagatgatgatgttgcgctggatgagtggtaagactagacatgataggattaagaatgacatcattagagagaatg--ggggtagcacctatagtagaaa 112  Q
    ||||||| ||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||| ||||  ||||| | ||||||||||  ||  |||||||||||  | |||||||    
T  2341074 gagatgaggatgttgcattggatgtgtggtaagactagacatgatagaattagaaatgaaaacattagagagggtgttggggtagcaccattcgtagaaa 2340975  T
Q  113 agttggtagaaaat 126  Q
    || |||| ||||||    
T  2340974 agatggtggaaaat 2340961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #73
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 175 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 19162785 - 19162664
Alignment:
Q  175 gtaagaagagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtca 274  Q
    |||||||||| |||||| ||| || |||  ||||| ||||||| |||||||||| ||| |||| | ||  ||||||| ||||| |||||||||||| | |    
T  19162785 gtaagaagagtagatcagatgaaggagagtcaggtcaaaagagttagaggaagacctaggaaatctataagagaaactattaggaaagatttagagatta 19162686  T
Q  275 atgagttagatccaaatatggt 296  Q
    ||||||| ||| ||| ||||||    
T  19162685 atgagttggatgcaagtatggt 19162664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #74
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 33 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 31337866 - 31337766
Alignment:
Q  33 tggatgagtggtaagactagacatgataggattaagaatgacatcattagagagaatgg-gggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagact 131  Q
    |||||| ||| ||||||||||   ||||||||||| ||||||| |||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||| ||    
T  31337866 tggatgtgtgataagactagatgggataggattaa-aatgacagcattagagagaaagttgggtagcacctatagtagaaaagatggttgaaactaggct 31337768  T
Q  132 ta 133  Q
    ||    
T  31337767 ta 31337766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #75
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 305 - 370
Target Start/End: Original strand, 41529975 - 41530040
Alignment:
Q  305 gaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgt 370  Q
    |||||||||| | | ||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||    
T  41529975 gaacactatggcgtaatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgt 41530040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #76
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 261 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 41842635 - 41842562
Alignment:
Q  261 agatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtag 334  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||   | |||||||||||||||    
T  41842635 agatctagaggttaatgagttagattgaaatatggtttttgatagaacattatggtgtaatttgatccatgtag 41842562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #77
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 11 - 56
Target Start/End: Complemental strand, 47542076 - 47542031
Alignment:
Q  11 agcagagatgatgatgttgcgctggatgagtggtaagactagacat 56  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  47542076 agcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagactagacat 47542031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #78
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 245 - 370
Target Start/End: Original strand, 49841770 - 49841895
Alignment:
Q  245 gagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaac 344  Q
    ||||||| ||||  |||||| || || | |||||||| |||| ||||||||| | |||||||||| |||| ||| |||||||||||||||| || || ||    
T  49841770 gagaaactattaacaaagatctaaagattaatgagttggatcgaaatatggtatatgatagaacattatggcataatttgatccatgtagctgaccccac 49841869  T
Q  345 ttagtgtgataatgcttggttgttgt 370  Q
     ||| | | ||| |||||||||||||    
T  49841870 atagcgaggtaaggcttggttgttgt 49841895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #79
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 296 - 376
Target Start/End: Original strand, 27893294 - 27893374
Alignment:
Q  296 tttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 376  Q
    ||||||| ||||||||||| |||  |||||| |||||||||||||| |||||||| ||||| |||| |||| || ||||||    
T  27893294 tttttgaaagaacactatggcattgtttgattcatgtagccgatcccacttagtgggataaggctttgttgatgctgttgt 27893374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #80
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 116 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 38181086 - 38181042
Alignment:
Q  116 tggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagac 160  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  38181086 tggtagaaattagacttagatgatttagacatgttgagagaagac 38181042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #81
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 298 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 24778684 - 24778609
Alignment:
Q  298 tttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgt 373  Q
    |||||||||||| ||||   | ||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||| |||||||||    
T  24778684 tttgatagaacattatggtgtaatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggctgttgttgt 24778609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #82
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 274 - 373
Target Start/End: Original strand, 40991614 - 40991713
Alignment:
Q  274 aatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgt 373  Q
    |||||||| || | ||||||||||| |||||||||| ||||   | |||||||||||||||| || || |||||||| |||||  ||||| |||||||||    
T  40991614 aatgagttggaccaaaatatggtttatgatagaacattatggtgtaatttgatccatgtagctgaccccacttagtgagataagacttggctgttgttgt 40991713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #83
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 295 - 374
Target Start/End: Original strand, 46148232 - 46148311
Alignment:
Q  295 gtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgtt 374  Q
    |||| |||||||||| |||| | | ||||||||||||||||||| || |||||||| |  || |||||||||||||||||    
T  46148232 gtttatgatagaacattatggcgtaatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggtcaaggcttggttgttgttgtt 46148311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #84
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 318 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 21862796 - 21862742
Alignment:
Q  318 tcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttg 372  Q
    ||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| ||||| |||||||||    
T  21862796 tcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgagataaggcttgcttgttgttg 21862742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #85
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 284 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 24541421 - 24541343
Alignment:
Q  284 atccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttg 362  Q
    |||||||||||||||  ||||||||| |||| | | |||||||||||||| |||| || |||||||| ||||| |||||    
T  24541421 atccaaatatggtttaggatagaacattatggcgtaatttgatccatgtacccgaccccacttagtgggataaggcttg 24541343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #86
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 275 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 31337658 - 31337560
Alignment:
Q  275 atgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgt 373  Q
    ||||||| |||  ||||||||| |||||||||||| ||||||||  ||||||| || || |||| |  ||||||||  |||| ||||||||||||||||    
T  31337658 atgagttggatagaaatatggtatttgatagaacattatgacattgtttgatctatttaaccgacctcacttagtggtataaagcttggttgttgttgt 31337560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #87
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 261 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 40116450 - 40116348
Alignment:
Q  261 agatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgct 360  Q
    |||||||||| | |||||||| || | ||||||||||| |||||||||| |||| | | |||||||||| |||||||| |   ||||||| ||||| |||    
T  40116450 agatttagagattaatgagttggaccgaaatatggtttatgatagaacattatggcgtaatttgatccacgtagccgacctcgcttagtgggataaggct 40116351  T
Q  361 tgg 363  Q
    |||    
T  40116350 tgg 40116348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #88
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 92 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 41842792 - 41842686
Alignment:
Q  92 gggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatca 191  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| ||||  || ||||| || ||| |  |||||||||||||| | |||||| | || ||||  |||| ||||||    
T  41842792 gggtagcacctatagtagaaaagatggtggaaaccagtcttaggtggtttgggtatgtagagagaagagcggtagattctgtagtaatgagagtagatca 41842693  T
Q  192 aatggag 198  Q
    |||||||    
T  41842692 aatggag 41842686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #89
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 260 - 373
Target Start/End: Original strand, 11284157 - 11284270
Alignment:
Q  260 aagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgc 359  Q
    ||||| ||||| | |||||||| |||  ||||||||| | |||| ||||| |||  |||| |||||||||||||||| | ||  ||||||| ||||| ||    
T  11284157 aagatgtagagattaatgagttggatataaatatggtatatgattgaacattattgcatcgtttgatccatgtagccaaccccgcttagtgagataaggc 11284256  T
Q  360 ttggttgttgttgt 373  Q
    ||| ||||||||||    
T  11284257 ttgcttgttgttgt 11284270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #90
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 245 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 17022800 - 17022707
Alignment:
Q  245 gagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccga 338  Q
    |||||||||||| ||| || ||||||||||||||||| ||||||| | | |||| |||||||| | ||||   |||||| || |||||||||||    
T  17022800 gagaaaccattaaaaaggaattagaggtcaatgagttggatccaattttagtttatgatagaatattatggtgtcatttaattcatgtagccga 17022707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #91
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 325 - 374
Target Start/End: Original strand, 39512777 - 39512826
Alignment:
Q  325 atccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgtt 374  Q
    |||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  39512777 atccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgtt 39512826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #92
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 320 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 344825 - 344769
Alignment:
Q  320 atttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 376  Q
    |||| ||| |||||||||| ||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||    
T  344825 atttcatcgatgtagccgacccaacttagtaggataaggcttggttgttgttgttgt 344769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #93
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 40 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 345046 - 344951
Alignment:
Q  40 gtggtaagactagacatgataggattaagaatgacatcattagagagaatg--ggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagactta 133  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||  |||||   |||||||||||  |  |||||||||| ||||||||||||| || |||||||||| ||||    
T  345046 gtggtaagactagacgagataggattagaaatgatgacattagagagagagttggggtagcacttatagtagaaaagatgttagaaaataggctta 344951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #94
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 292 - 376
Target Start/End: Original strand, 3987535 - 3987619
Alignment:
Q  292 atggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 376  Q
    |||||||||||||| |||||||| | |  |||||| |||||| |||| || |||| ||| |||||  ||||||||||||||||||    
T  3987535 atggtttttgataggacactatggcgttgtttgattcatgtacccgaccccactttgtgggataagacttggttgttgttgttgt 3987619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #95
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 320 - 376
Target Start/End: Original strand, 31146928 - 31146984
Alignment:
Q  320 atttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 376  Q
    |||||||||||||||||||  | |||||||| ||||| ||| |||||||||||||||    
T  31146928 atttgatccatgtagccgactccacttagtgggataaggctcggttgttgttgttgt 31146984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #96
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 69 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 31454531 - 31454467
Alignment:
Q  69 aatgacatcattagagagaatgggggt-agcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagactt 132  Q
    ||||||| ||||||||||| ||  ||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  31454531 aatgacaacattagagagagtgttggttagcacctatagtagaaaagatggtagaaactagactt 31454467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #97
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 290 - 350
Target Start/End: Original strand, 37351606 - 37351666
Alignment:
Q  290 atatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtg 350  Q
    |||||||||||| |||||||||| ||| || |||||| ||||||||||| || ||||||||    
T  37351606 atatggtttttgttagaacactacgacgtcgtttgattcatgtagccgaccccacttagtg 37351666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #98
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 259 - 315
Target Start/End: Original strand, 37779045 - 37779101
Alignment:
Q  259 aaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatga 315  Q
    |||||||||||| | |||||| ||||||| |||||||||| |||||||||| |||||    
T  37779045 aaagatttagagattaatgagctagatccgaatatggtttatgatagaacattatga 37779101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #99
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 91 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 44134112 - 44134044
Alignment:
Q  91 ggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaaga 159  Q
    |||||||| ||| ||||||||||| |||| |||||||||||||| || ||| ||||| |||| ||||||    
T  44134112 ggggtagcgcctctagtagaaaagatggtggaaaatagacttaggtggtttggacatctagatagaaga 44134044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #100
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 23 - 87
Target Start/End: Original strand, 45236786 - 45236850
Alignment:
Q  23 gatgttgcgctggatgagtggtaagactagacatgataggattaagaatgacatcattagagaga 87  Q
    ||||||||| |||||| |||||||||||||||  |||| |||||  ||||||| |||||||||||    
T  45236786 gatgttgcgttggatgtgtggtaagactagactggatatgattagaaatgacaccattagagaga 45236850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #101
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 300 - 371
Target Start/End: Original strand, 659734 - 659805
Alignment:
Q  300 tgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgtt 371  Q
    |||||||||| |||| ||   |||||||||||||||||| || |||||||| | ||| ||||||||||||||    
T  659734 tgatagaacattatggcagtgtttgatccatgtagccgaccccacttagtggggtaaggcttggttgttgtt 659805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #102
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 300 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 31261039 - 31260965
Alignment:
Q  300 tgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttg 375  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| ||||  ||||| ||  ||||||| ||||| ||||||||||| ||||||    
T  31261039 tgatagaacactgtgacatcatttgattcatg-cgccgaccccgcttagtgggataaggcttggttgtttttgttg 31260965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #103
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 71 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 31453242 - 31453151
Alignment:
Q  71 tgacatcattaga-gagaatgggggtagcacctatagta-gaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagac 160  Q
    ||||| ||||||| |||| | |||| ||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||| |  ||| | ||||||||||||||||    
T  31453242 tgacaacattagaagagagttggggcagcacctatagtaagaaaagatggtagaaactagacttaggttgttttggcatgtagagagaagac 31453151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #104
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 274 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 42026635 - 42026536
Alignment:
Q  274 aatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgt 373  Q
    ||||||||||||  ||||||||| | |||||||||| |||| | | ||||||| ||| ||||||| || || || ||||||||  ||||||| |||||||    
T  42026635 aatgagttagatagaaatatggtatatgatagaacattatggcgttatttgattcatttagccgaccccacatactgtgataagacttggttcttgttgt 42026536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #105
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 321 - 376
Target Start/End: Original strand, 50249607 - 50249662
Alignment:
Q  321 tttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 376  Q
    |||||||||||||| ||| || |||||||| ||||  |||||||||||||||||||    
T  50249607 tttgatccatgtagtcgaccccacttagtgggatacggcttggttgttgttgttgt 50249662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #106
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 320 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 37083345 - 37083291
Alignment:
Q  320 atttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgtt 374  Q
    ||||| ||| ||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  37083345 atttggtccttgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgtt 37083291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #107
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 300 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 46367460 - 46367390
Alignment:
Q  300 tgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgt 370  Q
    |||||||||| |||||| || |||||||||||||||| | || ||||| |  ||||| |||||||||||||    
T  46367460 tgatagaacattatgacgtcgtttgatccatgtagcctaccccacttaattggataaagcttggttgttgt 46367390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #108
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 297 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 50631957 - 50631879
Alignment:
Q  297 ttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttg 375  Q
    ||||||||||||| |||| |||  |||||| |||| |||| | || |||||||| ||||| | ||||||||||||||||    
T  50631957 ttttgatagaacattatgccattgtttgattcatgcagccaaccccacttagtgggataaagattggttgttgttgttg 50631879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #109
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 40 - 113
Target Start/End: Original strand, 37227877 - 37227950
Alignment:
Q  40 gtggtaagactagacatgataggattaagaatgacatcattagagagaatgggggtagcacctatagtagaaaa 113  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||  ||||||  ||||||||||| | || |||||| |||| ||||||||    
T  37227877 gtggtaagactagacaatataggattagaaatgaccacattagagagagttggagtagcagctatcgtagaaaa 37227950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #110
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 11 - 168
Target Start/End: Original strand, 46140352 - 46140509
Alignment:
Q  11 agcagagatgatgatgttgcgctggatgagtggtaagactagacatgataggattaagaatgacatcattagagagaatgggggtagcacctatagtaga 110  Q
    ||||||||||||||||||||  || |||  | ||||||||||||   ||| |||||  | |||||  ||||| |||| | ||||||  || | |||||||    
T  46140352 agcagagatgatgatgttgctttgaatgtattgtaagactagacggtatatgattagaattgacaatattagtgagagttggggtaatacatgtagtaga 46140451  T
Q  111 aaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagat 168  Q
    ||||  ||| |||| |||||| || || ||| ||||| ||||||||||||| ||||||    
T  46140452 aaagacggtggaaactagactcaggtggtttggacatatagagagaagacctgtagat 46140509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #111
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 320 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 52882715 - 52882662
Alignment:
Q  320 atttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgt 373  Q
    ||||||||||||||||| | || |||||||| || || ||||||||||||||||    
T  52882715 atttgatccatgtagccaaccccacttagtgggagaaggcttggttgttgttgt 52882662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #112
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 92 - 160
Target Start/End: Original strand, 11581445 - 11581513
Alignment:
Q  92 gggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagac 160  Q
    |||||| ||||| | |||||||| ||||||||| ||||||||| || ||| |  |||||||||||||||    
T  11581445 gggtagaacctacaatagaaaagatggtagaaactagacttaggtggtttgggtatgtagagagaagac 11581513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #113
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 300 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 30332633 - 30332557
Alignment:
Q  300 tgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 376  Q
    |||||||||| |||| ||| |||||||||| | |||| | || || ||||| ||||  |||||||||||||||||||    
T  30332633 tgatagaacattatggcataatttgatccaggcagcctaccccacctagtgggatacggcttggttgttgttgttgt 30332557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #114
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 292 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 31453042 - 31452958
Alignment:
Q  292 atggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 376  Q
    ||||||||||| | || |||||| | || |||||| |||||||| || || ||||||||  |||| |||||||||||||| ||||    
T  31453042 atggtttttgacataatactatggcgtcgtttgattcatgtagcagaccccacttagtggaataaggcttggttgttgtttttgt 31452958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #115
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 245 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 40116596 - 40116532
Alignment:
Q  245 gagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaaca 309  Q
    ||||||| ||||| | |||||||||| | |||||||| || | ||||||||||| ||||||||||    
T  40116596 gagaaactattaggatagatttagagattaatgagttggaccgaaatatggtttatgatagaaca 40116532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #116
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 294 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 40672446 - 40672366
Alignment:
Q  294 ggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgtt 374  Q
    ||||||||||||  || |||| ||| |||||||||||||||| || |  |||||||| ||||| |||||||| | ||||||    
T  40672446 ggtttttgataggtcattatggcataatttgatccatgtagctgacctcacttagtgggataaggcttggttatagttgtt 40672366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #117
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 263 - 307
Target Start/End: Original strand, 44571599 - 44571643
Alignment:
Q  263 atttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaa 307  Q
    |||||||| | |||||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  44571599 atttagagattaatgagttggatccaaatatggtttatgatagaa 44571643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #118
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 11 - 87
Target Start/End: Original strand, 46568034 - 46568110
Alignment:
Q  11 agcagagatgatgatgttgcgctggatgagtggtaagactagacatgataggattaagaatgacatcattagagaga 87  Q
    ||||||||||| ||||||| | |||||| ||| |||||||||||  ||| | ||||  ||||||| |||||||||||    
T  46568034 agcagagatgaggatgttgtgttggatgtgtgttaagactagaccagattgaattagaaatgacaacattagagaga 46568110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #119
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 15 - 75
Target Start/End: Complemental strand, 48953756 - 48953696
Alignment:
Q  15 gagatgatgatgttgcgctggatgagtggtaagactagacatgataggattaagaatgaca 75  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||| ||||||| | ||   |||||||||||||||||||    
T  48953756 gagatgaggatgttgcgttggatgagcggtaagattggatgagataggattaagaatgaca 48953696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 264; Significance: 1e-147; HSPs: 141)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 264; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 17 - 376
Target Start/End: Original strand, 43281600 - 43281959
Alignment:
Q  17 gatgatgatgttgcgctggatgagtggtaagactagacatgataggattaagaatgacatcattagagagaatgggggtagcacctatagtagaaaagtt 116  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  43281600 gatgaggatgttgcgctggatgagtggtaagactagacaatataggattaggaatgacaccattagagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagtt 43281699  T
Q  117 ggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaaga 216  Q
    |||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| |||  ||||||||||||    
T  43281700 ggtagaaaataggcttagatggtttggacatgtagagagaagacccgtagatgccgttgtaagaagagtagatcaaatggaggagagtcaggttaaaaga 43281799  T
Q  217 ggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgac 316  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  43281800 ggtagaggaagacctaagaaaaccattcgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttttgatagaacactatggc 43281899  T
Q  317 atcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 376  Q
     ||||||||||||||||||||| || |||||||| || || |||||||||||||||||||    
T  43281900 gtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggacaaggcttggttgttgttgttgt 43281959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 11 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 12841639 - 12841272
Alignment:
Q  11 agcagagatgatgatgttgcgctggatgagtggtaagactagacatgataggattaagaatgacatcattagagagaa--tgggggtagcacctatagta 108  Q
    ||||||||||| ||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||   ||| ||||||||||||||||    
T  12841639 agcagagatgaggatgttgtgttggatgagtggtaaaactagacatgataggattaggaatgaccccattagagagagagtggaggtagcacctatagta 12841540  T
Q  109 gaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaatggagaagaaccagg 208  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||| |||  || |    
T  12841539 gaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacccgtagatgccgtggtaagaagagtagatcaaatggaggagagtcaag 12841440  T
Q  209 ttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaac 308  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||| |||||| |||||||||    
T  12841439 ttaaaagaggtagaggaagacctaagaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttgtatccaaatttggtttatgatagaac 12841340  T
Q  309 actatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 376  Q
    |||||| | ||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  12841339 actatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttgt 12841272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 15 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 45836840 - 45836479
Alignment:
Q  15 gagatgatgatgttgcgctggatgagtggtaagactagacatgataggattaagaatgacatcattagagagaa--tgggggtagcacctatagtagaaa 112  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||   ||||||||||||||||||||||||    
T  45836840 gagatgaggatgttgcgctggatgagtggtaagagtagacaagataggattaggaatgacaccattagagagagagtgggggtagcacctatagtagaaa 45836741  T
Q  113 agttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaatggagaagaaccaggttaa 212  Q
    |||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| |||   ||||||     
T  45836740 agttggtagaaaataggcttagatggtttggacatgtagagagaagacccgtagatgccgttgtaagaagagtagatcaaatggaggagagttaggttat 45836641  T
Q  213 aagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacacta 312  Q
      |||||||||| ||| ||| || ||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  45836640 --gaggtagagggagacctaggacaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttatgatagaacacta 45836543  T
Q  313 tgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 376  Q
    || | ||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| ||| |||||||||||||||    
T  45836542 tggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggctcggttgttgttgttgt 45836479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 213; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 11 - 376
Target Start/End: Original strand, 11593878 - 11594245
Alignment:
Q  11 agcagagatgatgatgttgcgctggatgagtggtaagactagacatgataggattaagaatgacatcatt--agagagaatgggggtagcacctatagta 108  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||| ||||  ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  11593878 agcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagactagacaggataagattaggaatgacaccatttgagagagagtgggggtagcacctatagta 11593977  T
Q  109 gaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaatggagaagaaccagg 208  Q
    |||||||||||||||||||   ||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||| || | |||||||||| ||||||||||||| |||  || |    
T  11593978 gaaaagttggtagaaaatacggttagatggtttgggcatgtagagagaagacccgtagatgccatggtaagaagagtagatcaaatggaggagagtcaag 11594077  T
Q  209 ttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaac 308  Q
    |||||||||||||||||||| ||| |||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||| | |||||||||    
T  11594078 ttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaac 11594177  T
Q  309 actatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 376  Q
    |||||| | ||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  11594178 actatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttgt 11594245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 213; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 11 - 375
Target Start/End: Original strand, 37617862 - 37618229
Alignment:
Q  11 agcagagatgatgatgttgcgctggatgagtggtaagactagacatgataggattaagaatgacatcattagagagaa--tgggggtagcacctatagta 108  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||   ||||||||||||||||||||    
T  37617862 agcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagactagacaagataggattaggaatgacaccattagagagagagtgggggtagcacctatagta 37617961  T
Q  109 gaaaagttggtagaaaa-tagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaatggagaagaaccag 207  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||| |||  ||     
T  37617962 gaaaagttggtagaaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacccgtagatgccgtggtaagaagagtagatcaaatggaggagagtcaa 37618061  T
Q  208 gttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaa 307  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||| |||| | ||||||||    
T  37618062 gttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaataagttggatccaaatttggtgtatgatagaa 37618161  T
Q  308 cactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttg 375  Q
    |||||||   ||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  37618162 cactatggtgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 37618229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 14 - 373
Target Start/End: Original strand, 34869341 - 34869702
Alignment:
Q  14 agagatgatgatgttgcgctggatgagtggtaagactagacatgataggattaagaatgacatcattagagagaa--tgggggtagcacctatagtagaa 111  Q
    |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||   |||||||||||||||||||||||    
T  34869341 agagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagactagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgggggtagcacctatagtagaa 34869440  T
Q  112 aagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaatggagaagaaccaggtta 211  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| ||| | ||||||||||||||||||||| || |||| |||||||||| ||||| ||||| | |||  || ||||    
T  34869441 aagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacccgtaaatgccgtggtaagaagagtagatccaatggtggagagtcaagtta 34869540  T
Q  212 aaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacact 311  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||| | ||||||||||||    
T  34869541 aaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacact 34869640  T
Q  312 atgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgt 373  Q
    ||| | ||||||||||||||||||||| || | |||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  34869641 atggcgtcatttgatccatgtagccgaccctaattagtgggataaggcttggttgttgttgt 34869702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 58 - 376
Target Start/End: Original strand, 29650349 - 29650669
Alignment:
Q  58 ataggattaagaatgacatcatt--agagagaatgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagag 155  Q
    ||||||||| |||||||| ||||  ||||||| |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||    
T  29650349 ataggattaggaatgacaccattcgagagagagtgggggcagcacctatagtagaaaaattggtagaaaataggcttagatggtttggacatgtagagag 29650448  T
Q  156 aagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccatt 255  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| |||  |||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||| |||||||||||    
T  29650449 aagacccgtagatgccgttgtaagaagagtagatcaaatggaggagagtcaggttaaaagaggtaaaggaaaacctaagaaaaccattcgagaaaccatt 29650548  T
Q  256 agaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgata 355  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||    
T  29650549 agaaaagatttagaggtcaatgagtttgatccaaatatggtttttgatagaacactaaggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggata 29650648  T
Q  356 atgcttggttgttgttgttgt 376  Q
    | |||||||||||||||||||    
T  29650649 aggcttggttgttgttgttgt 29650669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 11 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 33350170 - 33349803
Alignment:
Q  11 agcagagatgatgatgttgcgctggatgagtggtaagactagacatgataggattaagaatgacatcattagagagaa--tgggggtagcacctatagta 108  Q
    ||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||   ||||||| ||||||||||||    
T  33350170 agcagagatgaggatgttgccttggatgagtggtaagactagacatgataggattaagaatgacaccattagagagagagtgggggttgcacctatagta 33350071  T
Q  109 gaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaatggagaagaaccagg 208  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||| |||  || |    
T  33350070 gaaaagttgctagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacccgtagatgccgtggtaagaagagtagatcaaatggaggagagtcaag 33349971  T
Q  209 ttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaac 308  Q
    |||||||||||||||||||| ||| |||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||| | |  ||||||    
T  33349970 ttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaatgatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatagtagaac 33349871  T
Q  309 actatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 376  Q
    |||||  | ||||||||||||||||||||| |  ||||| || ||||| |||||||||||||||||||    
T  33349870 actatagcgtcatttgatccatgtagccgacctcacttaatgggataaggcttggttgttgttgttgt 33349803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 11 - 375
Target Start/End: Original strand, 49029194 - 49029559
Alignment:
Q  11 agcagagatgatgatgttgcgctggatgagtggtaagactagacatgataggattaagaatgacatcattagagagaa--tgggggtagcacctatagta 108  Q
    ||||||||||| |||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||   ||||||||||||||||||||    
T  49029194 agcagagatgaggatgttacgttggatgagtggtaagactagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgggggtagcacctatagta 49029293  T
Q  109 gaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaatggagaagaaccagg 208  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||  ||||||||||||| |||  || |    
T  49029294 gaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacccgtagatgccgtggtaagacgaatagatcaaatggaggagagtcaag 49029393  T
Q  209 ttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaac 308  Q
    |||||||||||||||||||| ||| |||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||| | |||||||||    
T  49029394 ttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaac 49029493  T
Q  309 actatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttg 375  Q
    |||||| | ||||||||||||||||||| | || |||||||| ||||  || |||||||||||||||    
T  49029494 actatggcgtcatttgatccatgtagccaaccccacttagtgggatacggc-tggttgttgttgttg 49029559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 203; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 11 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 35906565 - 35906208
Alignment:
Q  11 agcagagatgatgatgttgcgctggatgagtggtaagactagacatgataggattaagaatgacatcattagagagaa--tgggggtagcacctatagta 108  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||   ||| ||||||||||||||||    
T  35906565 agcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagactagacaggataggattaggaatgacaccattagagagagagtggaggtagcacctatagta 35906466  T
Q  109 gaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaatggagaagaaccagg 208  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| | |||| |||||| |||  || |    
T  35906465 gaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacccgtagatgccgtggtaagaagagtatatcatatggaggagagtcaag 35906366  T
Q  209 ttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaac 308  Q
    |||||||||||||||||||| ||| |||||| ||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||| |||| | |||||||||    
T  35906365 ttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttcgaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaac 35906266  T
Q  309 actatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttg 366  Q
    |||||| | ||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||    
T  35906265 actatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttg 35906208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 15 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 39906730 - 39906369
Alignment:
Q  15 gagatgatgatgttgcgctggatgagtggtaagactagacatgataggattaagaatgacatcattagagagaa--tgggggtagcacctatagtagaaa 112  Q
    ||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||   || |||||||||||||||||||||    
T  39906730 gagatgaggatgctgcgttggatgagtggtaagactagacaggataggattaggaatgacaccattagagagagagtgagggtagcacctatagtagaaa 39906631  T
Q  113 agttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaatggagaagaaccaggttaa 212  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||  ||| |||||||||| ||||||||||||| ||   || |||||    
T  39906630 agttggtagaaaataggcttagatgatttgggcatgtagagagaagacccatagatgtcgtggtaagaagagtagatcaaatggaggagt--caagttaa 39906533  T
Q  213 aagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacacta 312  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||| |||| | |||||||||||||    
T  39906532 aagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgacttggatccaaatttggtgtatgatagaacacta 39906433  T
Q  313 tgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 376  Q
    || | ||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  39906432 tggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttgt 39906369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 11 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 44855536 - 44855171
Alignment:
Q  11 agcagagatgatgatgttgcgctggatgagtggtaagactagacatgataggattaagaatgacatcattagagagaa--tgggggtagcacctatagta 108  Q
    ||||||||| | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||   ||||| ||| ||||||||||    
T  44855536 agcagagatcaggatgttgtgctggatgagtggtaagactagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtggggatagtacctatagta 44855437  T
Q  109 gaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaatggagaagaaccagg 208  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||| ||||||||||||| |||  || |    
T  44855436 gaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacccgtagatgccgtcataagaagagtagatcaaatggaggagagtcaag 44855337  T
Q  209 ttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaac 308  Q
    |||||||| ||||||||||| ||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||  |||    
T  44855336 ttaaaagaagtagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtttatgat--aac 44855239  T
Q  309 actatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 376  Q
    |||||| | | ||||| ||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  44855238 actatggcgtaatttggtccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttgt 44855171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 198; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 15 - 376
Target Start/End: Original strand, 38606927 - 38607277
Alignment:
Q  15 gagatgatgatgttgcgctggatgagtggtaagactagacatgataggattaagaatgacatcatta-gagagaatgggggtagcacctatagtagaaaa 113  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||     
T  38606927 gagatgataatgttgcgctggatgagtggtaagactagacatgataggattaggaatgacaacattaagagagagtgggggtagcacctatagtagaaag 38607026  T
Q  114 gttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaa 213  Q
    ||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||| |||  || |||| |    
T  38607027 gttggtagaaaataggcttagatggtttggacatgtagagagaagacccgtagatgccgttgttagaagagtagatcaaatggaggagagtcacgttaga 38607126  T
Q  214 agaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactat 313  Q
    ||||| ||||||||| ||||||            ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38607127 agagggagaggaagacctaaga------------aaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttttgatagaacactat 38607214  T
Q  314 gacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 376  Q
    | | || ||||||||||||||||||  | |||||||| | ||| |||||||||||||||||||    
T  38607215 ggcgtcgtttgatccatgtagccgactccacttagtgggttaaggcttggttgttgttgttgt 38607277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 13 - 376
Target Start/End: Original strand, 36651914 - 36652277
Alignment:
Q  13 cagagatgatgatgttgcgctggatgagtggtaagactagacatgataggattaagaatgacatcattagagagaatgggggtagcacctatagtagaaa 112  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||  | ||||| ||| | ||||||||||    
T  36651914 cagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagactagacaggataggattaggaatgacaccattagagagggtaggggtggcatccatagtagaaa 36652013  T
Q  113 agttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaatggagaagaaccaggttaa 212  Q
    |||||||||||||||| |||||||| |||   |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||| ||| | |  || |||||    
T  36652014 agttggtagaaaataggcttagatggtttcagcatgtagagagaagacccgtagatgccgtggtaagaagagtagatcaaatagaggatagtcaagttaa 36652113  T
Q  213 aagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacacta 312  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||  |||||||| |||| | |||||||||||||    
T  36652114 aagaggtagaggaagacctaagaaaactattagagaaaccattagaaaggattcagaggtcaatgagttgaatccaaatttggtgtatgatagaacacta 36652213  T
Q  313 tgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 376  Q
    || | ||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| ||| ||||| |||||||||    
T  36652214 tggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggctcggttgctgttgttgt 36652277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 23 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 46356208 - 46355858
Alignment:
Q  23 gatgttgcgctggatgagtggtaagactagacatgataggattaagaatgacatcattagagaga--atgggggtagcacctatagtagaaaagttggta 120  Q
    ||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46356208 gatgttgcgttgaatgagtggtaagactagacaggataggattaggaatgacaccatcagagagagaatgggggtagcacctatagtagaaaagttggta 46356109  T
Q  121 gaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggta 220  Q
    ||||||||  ||||||| ||| | |||||||||||||||| |||||||   || |||||||||| ||||||||||||| |||  || |||||||||||||    
T  46356108 gaaaataggtttagatggtttgggcatgtagagagaagacacgtagatgttgtggtaagaagagtagatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggta 46356009  T
Q  221 gaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatca 320  Q
    |||||| | ||| |||||| |||  ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||| |||| | ||||||||||||||| |||||    
T  46356008 gaggaaaacctaggaaaactattaaagaaaccattagaaaggatttaaaggtcaatgagttggatccaaatctggtgtatgatagaacactatgccatca 46355909  T
Q  321 tttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgtt 371  Q
    |||||||||||||||||| || |||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  46355908 tttgatccatgtagccgaccccacttagtgagataaggcttggttgttgtt 46355858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 183; E-Value: 9e-99
Query Start/End: Original strand, 11 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 13859372 - 13859067
Alignment:
Q  11 agcagagatgatgatgttgcgctggatgagtggtaagactagacatgataggattaagaatgacatcattagagagaa--tgggggtagcacctatagta 108  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||   ||||||||||||||||||||    
T  13859372 agcagagatgaggatgttgcgttggacgagtggtaagactagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgggggtagcacctatagta 13859273  T
Q  109 gaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaatggagaagaaccagg 208  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||| | || |||||||||| ||||||||||||| |||  || |    
T  13859272 gaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacccgtagatgctgtcgtaagaagagtagatcaaatggaggagagtcaag 13859173  T
Q  209 ttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaac 308  Q
    ||| |||||||||||||||| ||| |||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||    
T  13859172 ttagaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggccaatgagttggatccaaatttggtttatgatagaac 13859073  T
Q  309 actatg 314  Q
    ||||||    
T  13859072 actatg 13859067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 169; E-Value: 2e-90
Query Start/End: Original strand, 16 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 35559353 - 35558994
Alignment:
Q  16 agatgatgatgttgcgctggatgagtggtaagactagacatgataggattaagaatgacatcatt--agagagaatgggggtagcacct-atagtagaaa 112  Q
    |||||| ||||||||| ||||||||||||||||  |||  ||||||||||| |||||||| ||||  ||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  35559353 agatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagatcagatttgataggattaggaatgacaccatttgagagagagtgggggtagcaccttatagtagaaa 35559254  T
Q  113 agttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaatggagaagaaccaggttaa 212  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||| |||||||||| |||||  ||| |||||||||| ||||||||||||| |||  || |||||    
T  35559253 agttggtagaaaataggcttagatgatttggacatttagtgagaagacccctagatgtcgtggtaagaagagtagatcaaatggaggagagtcaagttaa 35559154  T
Q  213 aagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacacta 312  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||| || ||||||| ||    
T  35559153 aagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttggatccaaatttagtttatggtagaacatta 35559054  T
Q  313 tgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttg 372  Q
    |  |||||||||||||||||||| || |  | |||||  ||||| |||| ||||||||||    
T  35559053 tagcatcatttgatccatgtagcggacctcatttagtaagataaggcttagttgttgttg 35558994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 163; E-Value: 8e-87
Query Start/End: Original strand, 82 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 2886013 - 2885719
Alignment:
Q  82 gagagaatgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaa 181  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| | ||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||    
T  2886013 gagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagatccgtagatgccgttgtacgaa 2885914  T
Q  182 gagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagtt 281  Q
    ||| |||||| |||||| |||  ||||| |||||||||||| ||||| ||| |||||| ||  |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  2885913 gagtagatcagatggaggagagtcaggtcaaaagaggtagaagaagacctaggaaaactataagagaaaccattagaaatgatttagtggtcaatgagtt 2885814  T
Q  282 agatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 376  Q
     || ||||||||||||| |||||||||||||||   | ||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  2885813 ggacccaaatatggtttatgatagaacactatggtgtaatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttgt 2885719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 162; E-Value: 3e-86
Query Start/End: Original strand, 58 - 376
Target Start/End: Original strand, 6374833 - 6375153
Alignment:
Q  58 ataggattaagaatgacatcattagagagaa--tgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagag 155  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||   |||||||||||    
T  6374833 ataggattaggaatgacaccattagagagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgagcatgtagagag 6374932  T
Q  156 aagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccatt 255  Q
    |||||| |||||| | || |||||||| | |||||||||| || |||| || ||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||| |||||||||||    
T  6374933 aagaccagtagatgctgtggtaagaagggtagatcaaatgtaggagaatcaagttaaaagaggtagaggaagatctaggaaaactattagagaaaccatt 6375032  T
Q  256 agaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgata 355  Q
    |||||  |||||||||||| |||||| ||||||||| | || | ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||    
T  6375033 agaaagaatttagaggtcagtgagttggatccaaatttagtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggata 6375132  T
Q  356 atgcttggttgttgttgttgt 376  Q
    | ||||||||||||| |||||    
T  6375133 aggcttggttgttgtcgttgt 6375153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 161; E-Value: 1e-85
Query Start/End: Original strand, 11 - 296
Target Start/End: Original strand, 31005141 - 31005428
Alignment:
Q  11 agcagagatgatgatgttgcgctggatgagtggtaagactagacatgataggattaagaatgacatcattagagagaa--tgggggtagcacctatagta 108  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||| |||||||||||   ||||||||||||||||||||    
T  31005141 agcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagactagacaggataggattaggaataacaccattagagagagagtgggggtagcacctatagta 31005240  T
Q  109 gaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaatggagaagaaccagg 208  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||| |||  || |    
T  31005241 gaaaagttggtagaaaataggtttagatggtttgggcatgtagagagaagacccgtagatgccgtggtaagaagagtagatcaaatggaggagagtcaag 31005340  T
Q  209 ttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggt 296  Q
    |||||||||||||||||||| ||| |||||| ||| ||||||||||| |||| |||| |||| |||||||||| ||||||||| ||||    
T  31005341 ttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccatttgaaaggattcagagatcaatgagttggatccaaatttggt 31005428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 161; E-Value: 1e-85
Query Start/End: Original strand, 92 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 31682883 - 31682599
Alignment:
Q  92 gggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatca 191  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |  ||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||| ||||||    
T  31682883 gggtagcacatatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggtatgtagagagaagacccgtagatgccgtcataagaagagtagatca 31682784  T
Q  192 aatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaat 291  Q
    ||||||| |||  || |||| |||||||||||||||| ||| |||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||| ||    
T  31682783 aatggaggagagtcaagttagaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgaattggatccatat 31682684  T
Q  292 atggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 376  Q
     |||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  31682683 ttggtttatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttgt 31682599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 161; E-Value: 1e-85
Query Start/End: Original strand, 11 - 239
Target Start/End: Original strand, 33072872 - 33073100
Alignment:
Q  11 agcagagatgatgatgttgcgctggatgagtggtaagactagacatgataggattaagaatgacatcattagagagaatgggggtagcacctatagtaga 110  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  33072872 agcagagatgatgatgttgcgttggatgagtggtaagactagacaagataggattaggaatgacaccattagagagagtgggggtagcacctatagtaga 33072971  T
Q  111 aaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaatggagaagaaccaggtt 210  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||| |||||||||||||||||  || |||    
T  33072972 aaagttggtagaaaataggcttagatgatttgggcatgtagagagaagacccgtagatgtcgtggtaagaagagtagatcaaatggagaagagtcaagtt 33073071  T
Q  211 aaaagaggtagaggaagaactaagaaaac 239  Q
    |||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  33073072 aaaagaggtagaggaagacctaggaaaac 33073100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 157; E-Value: 3e-83
Query Start/End: Original strand, 15 - 376
Target Start/End: Original strand, 43491230 - 43491593
Alignment:
Q  15 gagatgatgatgttgcgctggatgagtggtaagactagacatgataggattaagaatgacatcattag--agagaatgggggtagcacctatagtagaaa 112  Q
    ||||||| ||||||| |||||||||| ||||||| ||||   |||| ||||| |||||||| |||| |  ||||| | |||||| ||||||||||| |||    
T  43491230 gagatgaggatgttgtgctggatgagcggtaagattagatgggatatgattaggaatgacaccattggggagagagtaggggtaacacctatagtataaa 43491329  T
Q  113 agttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaatggagaagaaccaggttaa 212  Q
    | |||||||||||||| |||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||  ||||| |||||| |||  ||||| ||    
T  43491330 aattggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacccgtagatgccgtcgtaagaagagttgatcagatggaggagagtcaggtcaa 43491429  T
Q  213 aagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacacta 312  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||  ||  ||||||||||||||||  |||||||||||||| |||| |||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  43491430 aagaggtagaggaagacctaggaaaattataagagaaaccattagaaagaatttagaggtcaataagttggatccaaatatgatttatgatagaacacta 43491529  T
Q  313 tgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 376  Q
    |||  | |||| |||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  43491530 tgatgtaatttcatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttgt 43491593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 143; E-Value: 7e-75
Query Start/End: Original strand, 94 - 376
Target Start/End: Original strand, 22349623 - 22349905
Alignment:
Q  94 gtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaa 193  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| | |||||||||||||||||||||  |  | | |||||||||| ||||||||    
T  22349623 gtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggttttggcatgtagagagaagacccgtaattgtcatggtaagaagagtagatcaaa 22349722  T
Q  194 tggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatat 293  Q
    ||||| |||  || ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||| ||| |||||| |||||||| |||| ||||||||| |    
T  22349723 tggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagaactaggaaaactattagagaaaccattaaaaaggatttaaaggtcaataagttggatccaaattt 22349822  T
Q  294 ggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 376  Q
    ||| | |||||||| |||||| | ||||||||||||||||| ||| || |||||||| ||||| ||||| |||||||||||||    
T  22349823 ggtatatgatagaatactatggcgtcatttgatccatgtagtcgaccccacttagtgggataaggcttgattgttgttgttgt 22349905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 126; E-Value: 9e-65
Query Start/End: Original strand, 130 - 376
Target Start/End: Original strand, 32631615 - 32631849
Alignment:
Q  130 cttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaa 229  Q
    |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||  |||||||||||| | |  ||||||||||||||||||||||||     
T  32631615 cttagatggtttggacatgtagagagaagacccgtagatgccgttgttagaagagtggatcaaatggaggatagtcaggttaaaagaggtagaggaagac 32631714  T
Q  230 ctaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatcca 329  Q
    ||||||||||            |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||| |    
T  32631715 ctaagaaaac------------cattagaaaagatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttttgatagaacgctatggcgtcatttgatcta 32631802  T
Q  330 tgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 376  Q
    ||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  32631803 tgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttgt 32631849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 90 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 36869527 - 36869234
Alignment:
Q  90 gggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagat 189  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||| | ||   |||||||| ||||    
T  36869527 gggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggtttagatggtttggtcatgtagagagaagacccgtagatgctgtcagaagaagagtagat 36869428  T
Q  190 caaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaa 289  Q
    ||||||||| |||  || |||| || ||||||||||||| ||  |||||| |||  ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||    
T  36869427 caaatggaggagagtcaagttagaataggtagaggaagacctgggaaaactattaaagaaaccattagaaaggatttagatgtcaatgagttagattcaa 36869328  T
Q  290 atatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatc-------catgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 376  Q
    || || ||| ||||||||||||||| | ||||||||||       ||||||||||| || ||||| || ||||| |||||||||||||||||||    
T  36869327 atttgatttatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgatccatgtagccgaccccacttaatgggataaggcttggttgttgttgttgt 36869234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 149 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 24598411 - 24598185
Alignment:
Q  149 tagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgaga 248  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||  ||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||    
T  24598411 tagagagcagacccgtagatgccgttgtaagaagagtagatcaaatgaaggtgagtcaggttaaaagaggtagaggaagacctaagaaaatcattcgaga 24598312  T
Q  249 aaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttag 348  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||| | | || ||||||||||||||||||||||| |  | |||     
T  24598311 aaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttgaatccaaatatgatttttgatagaatattttggcatcatttgatccatgtagccga-ctcatttaa 24598213  T
Q  349 tgtgataatgcttggttgttgttgttgt 376  Q
    || |||||  ||||||||||||||||||    
T  24598212 tgggataagacttggttgttgttgttgt 24598185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 101 - 376
Target Start/End: Original strand, 15682184 - 15682459
Alignment:
Q  101 ctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaatggagaa 200  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||| || |||||||||||| || ||||| |||| |||||||||| ||||||||| ||| |    
T  15682184 ctatagtagaaaagttggtaggaaataggcttagatggtttaggcaggtagagagaagatccatagatgccgtcgtaagaagagtagatcaaattgagga 15682283  T
Q  201 gaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggttttt 300  Q
     |  || || ||||||||| ||| || | ||| |||||| ||  |||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||| |    
T  15682284 aagtcaagtcaaaagaggtggagaaaaacctaggaaaactataagagaaatcattagaaaggatttagaggtcaataagttggatccaaatatgatttat 15682383  T
Q  301 gatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 376  Q
    |||||||||||||| | |  |||||||||||||||| | || |||||||| ||||| ||||||| |||||||||||    
T  15682384 gatagaacactatggcgtactttgatccatgtagccaaccccacttagtgagataaagcttggtagttgttgttgt 15682459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 106; E-Value: 8e-53
Query Start/End: Original strand, 208 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 40980093 - 40979928
Alignment:
Q  208 gttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaa 307  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  40980093 gttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactataagagaaactattagaaaagatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttatgatagaa 40979994  T
Q  308 cactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgt 373  Q
    ||||||| | | ||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  40979993 cactatggcgtaatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 40979928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 18 - 314
Target Start/End: Original strand, 23404343 - 23404640
Alignment:
Q  18 atgatgatgttgcgctggatgagtggtaagactagacatgataggattaagaatgacatcatta--gagagaatgggggtagcacctatagtagaaaagt 115  Q
    |||| |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||  |||||| |||||||| ||| ||||||||||||||    
T  23404343 atgaggatgttgcgctggatgagcggtaagactatacatgataggattaggaatgacaccattagggagagagtgggggtaacacttatagtagaaaagt 23404442  T
Q  116 tggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaag 215  Q
    ||| ||||||||| ||||||  | || | ||||||||  |||||| |||||||  |||  ||||||||| ||||||||||||| |||  ||||| |||||    
T  23404443 tgggagaaaataggcttaga-cagtttggcatgtagattgaagactcgtagatgtcgtcataagaagagtagatcaaatggaggagagtcaggtcaaaag 23404541  T
Q  216 aggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatg 314  Q
    ||||||| ||||| ||| |||||  ||   ||||||||||| ||   ||||| || |||||||||| |||||||||||||| | |||||||||| ||||    
T  23404542 aggtagaagaagacctaggaaaattataaaagaaaccattacaattaatttatagatcaatgagtttgatccaaatatggtgtatgatagaacattatg 23404640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 101; E-Value: 8e-50
Query Start/End: Original strand, 208 - 376
Target Start/End: Original strand, 38900074 - 38900241
Alignment:
Q  208 gttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaa 307  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||| | |||| |||    
T  38900074 gttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgattgaa 38900173  T
Q  308 cactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 376  Q
    ||||||| | ||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  38900174 cactatggcgtcatttgatccatgtagccga-cccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttgt 38900241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 98; E-Value: 5e-48
Query Start/End: Original strand, 145 - 374
Target Start/End: Original strand, 7273154 - 7273383
Alignment:
Q  145 catgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccattt 244  Q
    ||||||||||||||| |||||| | |||| ||| | |||| ||||   |||||| |||  ||||| |||||||||||||||||| ||| |||||| ||      
T  7273154 catgtagagagaagatccgtaggtgccgtcgtatgtagagtagattggatggaggagagtcaggtcaaaagaggtagaggaagacctatgaaaactataa 7273253  T
Q  245 gagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaac 344  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||| | ||||||||| | ||||||||||||||||||| || ||    
T  7273254 gagaaaccattagaaaatattcagaggtcaatgagttggattcaaatatggtttatgatatagcactatgacgtaatttgatccatgtagccgaccccac 7273353  T
Q  345 ttagtgtgataatgcttggttgttgttgtt 374  Q
    |||||| ||||| ||||| |||||||||||    
T  7273354 ttagtgggataaggcttgattgttgttgtt 7273383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 248 - 374
Target Start/End: Original strand, 27648937 - 27649063
Alignment:
Q  248 aaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaactta 347  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||| || | | ||||||||||||||||||| || |||||    
T  27648937 aaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtttatgatagaacactgtggcgtaatttgatccatgtagccgaccccactta 27649036  T
Q  348 gtgtgataatgcttggttgttgttgtt 374  Q
    ||| ||||| |||||||||||||||||    
T  27649037 gtgggataaggcttggttgttgttgtt 27649063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 164 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 31681226 - 31681022
Alignment:
Q  164 tagataccgttgtaagaagagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaaga 263  Q
    ||||| |||| ||||||||||  |||||||||||  |||  ||| |||||| ||||||||| ||| ||| |||||   || |||||||||||||||| ||    
T  31681226 tagatgccgtcgtaagaagagttgatcaaatggaagagagtcagtttaaaacaggtagagggagacctaggaaaa---ttagagaaaccattagaaagga 31681130  T
Q  264 tttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttgg 363  Q
    ||||  |||||||||||| ||||||||||||| || |||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||| || |||||||| || || ||||||    
T  31681129 tttaagggtcaatgagttggatccaaatatggcttatgatagaatactatgacgtaatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggaaaaggcttgg 31681030  T
Q  364 ttgttgtt 371  Q
    ||||||||    
T  31681029 ttgttgtt 31681022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 81; E-Value: 7e-38
Query Start/End: Original strand, 24 - 373
Target Start/End: Original strand, 36136695 - 36137046
Alignment:
Q  24 atgttgcgctggatgagtggtaagactagacatgataggattaagaatgacatcattagagagaatg--ggggtagcacctatagtagaaaagttggtag 121  Q
    |||||| | |||||| ||||||||||||||   |||||| ||| |||||||| |||||||||||  |  |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  36136695 atgttgtgttggatgggtggtaagactagaagggataggtttaggaatgacaccattagagagagagttggggtagcacctatagtagaaaagatggtag 36136794  T
Q  122 aaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtag 221  Q
    ||||||| ||||| |  ||| | ||| ||||||||| |||  |||||   || ||| |||||| |||||| |||||| |||  ||| | | |||| ||||    
T  36136795 aaaatagtcttaggttgtttgggcatatagagagaatacctatagatgttgtagtacgaagagcagatcagatggaggagagtcagatcagaagaagtag 36136894  T
Q  222 aggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcat 321  Q
    ||||||| |||  ||||| ||  ||||||| ||| | ||||||||||| || ||||| || |||||||||||||||| |||||||||| |||    | ||    
T  36136895 aggaagacctagaaaaactataagagaaactatttggaaagatttagatgttaatgaattggatccaaatatggtttatgatagaacattatagggtaat 36136994  T
Q  322 ttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgt 373  Q
    |||||  || || ||||||   ||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  36136995 ttgatttatttaaccgatcgcgcttagtgggataaggcttggttgttgttgt 36137046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 15 - 198
Target Start/End: Original strand, 7272961 - 7273146
Alignment:
Q  15 gagatgatgatgttgcgctggatgagtggtaagactagacatgataggattaagaatgacatcattag--agagaatgggggtagcacctatagtagaaa 112  Q
    ||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||| ||  |||||||||| |||||||| | ||||  |||||| ||| ||| |||||||||||||||    
T  7272961 gagatgaggatgttgtgctggatgagcggtaagactacacgggataggattaggaatgacacctttagggagagaacgggagtatcacctatagtagaaa 7273060  T
Q  113 agttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaatggag 198  Q
    |||||||||||||||| |||||||| ||| | |||||| |||||||||| |||||| |||  ||| |||||| |||||| ||||||    
T  7273061 agttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtacagagaagacctgtagatgccgccgtatgaagagtagatcagatggag 7273146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 76; E-Value: 6e-35
Query Start/End: Original strand, 234 - 373
Target Start/End: Original strand, 48919255 - 48919394
Alignment:
Q  234 gaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgta 333  Q
    |||||| ||| || ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| | ||||||| | ||||||||||||||||    
T  48919255 gaaaactattagaaaaaccattagaaatgatttagaggtcaatgagtttgatccaaatatggtttatgataaaccactatggcgtcatttgatccatgta 48919354  T
Q  334 gccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgt 373  Q
    | ||| || ||||| || ||||| ||||||||||||||||    
T  48919355 gtcgaccccacttaatgggataaggcttggttgttgttgt 48919394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 15 - 133
Target Start/End: Original strand, 32630517 - 32630636
Alignment:
Q  15 gagatgatgatgttgcgctggatgagtggtaagactagacatgataggattaagaatgacatcatt--agagagaatgggggtagcacctatagtagaaa 112  Q
    ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| | ||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  32630517 gagatgaggatgttgagctggatgagtggtaagactagacatgataggattagga-tgataccattggagagagagtgggggtagcacctatagtagaaa 32630615  T
Q  113 agttggtagaaaatagactta 133  Q
    |||||||||||||||| ||||    
T  32630616 agttggtagaaaataggctta 32630636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 71; E-Value: 6e-32
Query Start/End: Original strand, 236 - 374
Target Start/End: Original strand, 21078062 - 21078200
Alignment:
Q  236 aaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagc 335  Q
    ||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| | |||||||||| |||| | ||||||||||||||||||    
T  21078062 aaaccgttagagaaaccattagtaaagatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacattatggcgtcatttgatccatgtagc 21078161  T
Q  336 cgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgtt 374  Q
    |||    | |||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  21078162 cgacttcatttagtgggataaggcttggttgttgttgtt 21078200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 11 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 36514569 - 36514424
Alignment:
Q  11 agcagagatgatgatgttgcgctggatgagtggtaagactagacatgataggattaagaatgacatcattagagagaatgggggtagcacctatagtaga 110  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||| ||  ||||| ||||  || |||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  36514569 agcagagatgaggatgttgcgttggatgtgtggtaagactaaacgggatagaattagaaaggacaacattagagagagttggggtagcacctatagtaga 36514470  T
Q  111 aaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagaga 156  Q
    |||| ||||||||| ||||||||| || ||| | ||||||||||||    
T  36514469 aaagatggtagaaactagacttaggtggtttgggcatgtagagaga 36514424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 213 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 9210864 - 9210701
Alignment:
Q  213 aagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacacta 312  Q
    ||||||| |||||||| ||| |||||| ||  |||||||  |||| ||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||| |||| ||    
T  9210864 aagaggttgaggaagacctaggaaaactataagagaaacttttaggaaaaatttagaggttaatgagttggatccaaatatggtttatgatacaacatta 9210765  T
Q  313 tgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 376  Q
    || | | |||||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||| ||||||||||||||    
T  9210764 tggcgtaatttgatccatgtagctgaccccacttagtgggataaggcttcgttgttgttgttgt 9210701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 278 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 28208423 - 28208325
Alignment:
Q  278 agttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 376  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  28208423 agttggatccaaatatggtttatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttgt 28208325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 81 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 46014472 - 46014359
Alignment:
Q  81 agagagaatgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaaga 180  Q
    ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  || |||||||||||||||||||| ||||| ||||  |||||    
T  46014472 agagagagtgggggttgcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatg-gttggacatgtagagagaagacccatagatgccgtcctaaga 46014374  T
Q  181 agagaagatcaaatg 195  Q
    |||| ||||||||||    
T  46014373 agagtagatcaaatg 46014359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 66; E-Value: 6e-29
Query Start/End: Original strand, 263 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 34035264 - 34035155
Alignment:
Q  263 atttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttg 362  Q
    |||||||| |||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| || |||||||| ||| | |||||    
T  34035264 atttagagatcaatgagttggatccaaatatggttcatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggattaggcttg 34035165  T
Q  363 gttgttgttg 372  Q
    ||||||||||    
T  34035164 gttgttgttg 34035155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 94 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 28628212 - 28627936
Alignment:
Q  94 gtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaa 193  Q
    |||||||||| |||||||| | |||| |||||| | ||||| || ||| | |||||| |||||| ||| ||||||   || ||||| |||| |||||  |    
T  28628212 gtagcacctagagtagaaatgatggtggaaaattggcttaggtggtttgggcatgtaaagagaaaacctgtagattatgtagtaaggagagtagatccga 28628113  T
Q  194 tggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatat 293  Q
    ||||| | |  ||  | | |||||||||||||||| |||  ||||| ||  ||||||| ||||| |||||||||||| | |||||||| ||| ||||| |    
T  28628112 tggaggatagtcaaatcacaagaggtagaggaagacctagaaaaactataagagaaactattaggaaagatttagagattaatgagttggatgcaaatgt 28628013  T
Q  294 ggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgt 370  Q
    ||||| |||||||||| |||| | | |||||||||||||||||||  | |||||||| ||||| |||| ||||||||    
T  28628012 ggtttatgatagaacattatggcgtaatttgatccatgtagccgactccacttagtgggataaggcttagttgttgt 28627936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 267 - 374
Target Start/End: Original strand, 33073105 - 33073212
Alignment:
Q  267 agaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttg 366  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| |||| | | ||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||    
T  33073105 agaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtataataaaacaatatgacgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttg 33073204  T
Q  367 ttgttgtt 374  Q
    || |||||    
T  33073205 ttattgtt 33073212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 259 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 36101891 - 36101774
Alignment:
Q  259 aaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatg 358  Q
    ||||||||| || | |||||||| |||| ||||||||||| |||||||||| |||||| | |||||||||||||||  || || |||||||| ||||| |    
T  36101891 aaagatttatagattaatgagttggatcaaaatatggtttatgatagaacattatgacgtaatttgatccatgtagttgaccccacttagtgggataagg 36101792  T
Q  359 cttggttgttgttgttgt 376  Q
    ||||||||||||||||||    
T  36101791 cttggttgttgttgttgt 36101774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 214 - 370
Target Start/End: Original strand, 45601599 - 45601755
Alignment:
Q  214 agaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactat 313  Q
    ||||||||||||||| |||  ||||| ||  ||||||||||||  |||||| ||||| | |||||||| |||| ||||||| ||| ||||||||||||||    
T  45601599 agaggtagaggaagacctagaaaaactataagagaaaccattaagaaagatctagagattaatgagttggatcaaaatatgatttatgatagaacactat 45601698  T
Q  314 gacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgt 370  Q
    |   | |||||||||||||||| || |  |||||||| ||||| |||||||||||||    
T  45601699 ggtgtaatttgatccatgtagctgaactcacttagtgggataaggcttggttgttgt 45601755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 54; E-Value: 8e-22
Query Start/End: Original strand, 28 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 8492580 - 8492276
Alignment:
Q  28 tgcgctggatgagtggtaagactagacatgataggattaagaatgacatcatta--gagagaatgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaa 125  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||  |||||||||| |||||||| |||||  |||||| | |||||| ||||||||||| ||| | ||||||||||    
T  8492580 tgcgttggatgagtggcaagactagacgggataggattacgaatgacaccattagggagagatttggggtaacacctatagtaaaaatgatggtagaaaa 8492481  T
Q  126 tagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagagga 225  Q
    ||| || || || |||  || |||||||| |||||  ||||||   || |||  ||||| |||||| |||||| ||    || ||| ||||||||||| |    
T  8492480 taggctaaggtggtttgaacttgtagagaaaagacttgtagatgttgtagtacaaagagtagatcagatggaggagggtgagattagaagaggtagagaa 8492381  T
Q  226 agaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttga 325  Q
    || || | |||||  |||  |  |||  |||| |||||||||||||| || ||||| |||||| ||||||||| |||||||| |||||| ||| ||||||    
T  8492380 ag-accacgaaaa--attataataactgttaggaaagatttagaggttaacgagttggatccatatatggtttatgatagaaaactatggcataatttga 8492284  T
Q  326 tccatgta 333  Q
    || |||||    
T  8492283 tcaatgta 8492276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 54; E-Value: 8e-22
Query Start/End: Original strand, 259 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 27893677 - 27893560
Alignment:
Q  259 aaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatg 358  Q
    |||||||||||| | |||||| | || | ||||||| ||| |||||||||| |||| ||| ||||||| ||||||||||| || |||||||| ||||| |    
T  27893677 aaagatttagagattaatgagctggaccgaaatatgttttatgatagaacattatggcataatttgattcatgtagccgaccctacttagtgcgataagg 27893578  T
Q  359 cttggttgttgttgttgt 376  Q
    ||||||||||||||||||    
T  27893577 cttggttgttgttgttgt 27893560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 274 - 373
Target Start/End: Original strand, 33732017 - 33732114
Alignment:
Q  274 aatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgt 373  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||| |||| ||  |||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  33732017 aatgagtgagatcgaaatatggtttatgatagaacattatggca--atttgatccatgtagccggtcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 33732114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 11 - 87
Target Start/End: Complemental strand, 36869653 - 36869577
Alignment:
Q  11 agcagagatgatgatgttgcgctggatgagtggtaagactagacatgataggattaagaatgacatcattagagaga 87  Q
    ||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  36869653 agcagagatgaggatgttgtgttggatgagtggtaagactggacatgataggattaggaatgacaccattagagaga 36869577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 245 - 381
Target Start/End: Original strand, 44951309 - 44951445
Alignment:
Q  245 gagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaac 344  Q
    |||||||| |||||||| ||||| | |||||| | |||||| |||||||  ||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||    ||    
T  44951309 gagaaacctttagaaaatatttaaaagtcaattacttagattcaaatattatttatgatagaacactatgacgtaatttgatccatgtagccgacaatac 44951408  T
Q  345 ttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgtcgtct 381  Q
    ||||||  |||| | ||||||||||||||||| ||||    
T  44951409 ttagtggtataaggtttggttgttgttgttgtagtct 44951445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 245 - 372
Target Start/End: Original strand, 14057632 - 14057759
Alignment:
Q  245 gagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaac 344  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||||| |||| ||| ||| |||||||||||| |||||||||| ||||   | ||||||||||||||||| | || ||    
T  14057632 gagaaactattaggaaagatttagaggttaatgcgttcgattcaaatatggtttatgatagaacattatggggtaatttgatccatgtagccaaccccac 14057731  T
Q  345 ttagtgtgataatgcttggttgttgttg 372  Q
    |||||  ||||| |||| ||||||||||    
T  14057732 ttagtaggataaggcttagttgttgttg 14057759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 245 - 372
Target Start/End: Original strand, 14367660 - 14367787
Alignment:
Q  245 gagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaac 344  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||||| |||| ||| ||| |||||||||||| |||||||||| ||||   | ||||||||||||||||| | || ||    
T  14367660 gagaaactattaggaaagatttagaggttaatgcgttcgattcaaatatggtttatgatagaacattatggggtaatttgatccatgtagccaaccccac 14367759  T
Q  345 ttagtgtgataatgcttggttgttgttg 372  Q
    |||||  ||||| |||| ||||||||||    
T  14367760 ttagtaggataaggcttagttgttgttg 14367787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 300 - 371
Target Start/End: Original strand, 24777170 - 24777241
Alignment:
Q  300 tgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgtt 371  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  24777170 tgatagaacactatgacgtcatttgattcatgtagccgatcctacttagtgggataaagcttggttgttgtt 24777241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 295 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 31869180 - 31869101
Alignment:
Q  295 gtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgtt 374  Q
    ||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  31869180 gtttttgatagaacactctggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgtt 31869101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 18 - 160
Target Start/End: Original strand, 43282330 - 43282477
Alignment:
Q  18 atgatgatgttgcgctggatgagtggtaagactagacatgataggattaagaatgacatcatt-----agagagaatgggggtagcacctatagtagaaa 112  Q
    |||| ||||||||| | |||| |||||||| |||||||||||| |||||  ||||||| ||||     ||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  43282330 atgaggatgttgcgttagatgtgtggtaagtctagacatgatatgattagaaatgacaacatttagagagagagagttggggtagcacctatagtagaaa 43282429  T
Q  113 agttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagac 160  Q
    ||| ||| |||| ||| ||||| ||| || | ||||||||||||||||    
T  43282430 agtcggtggaaactaggcttaggtgaattgggcatgtagagagaagac 43282477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #59
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 40 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 19262766 - 19262609
Alignment:
Q  40 gtggtaagactagacatgataggattaagaatgacatcattagagagaatgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgat 139  Q
    ||||||| ||||||||||||||  |||  |||||||  |||||||||| | |||||||||||||| ||||||||| ||||||||| | | ||||| || |    
T  19262766 gtggtaatactagacatgatagagttagaaatgacaatattagagagagttggggtagcacctattgtagaaaagatggtagaaacttggcttaggtggt 19262667  T
Q  140 ttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaatggag 198  Q
    ||   ||||||||||||||||| ||||||   || |||||||||| |||||| ||||||    
T  19262666 ttgagcatgtagagagaagacctgtagat-ttgtagtaagaagagtagatcagatggag 19262609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #60
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 15 - 330
Target Start/End: Original strand, 47848596 - 47848912
Alignment:
Q  15 gagatgatgatgttgcgctggatgagtggtaagactagacatgataggattaagaatgacatcattagagagaatg--ggggtagcacctatagtagaaa 112  Q
    ||||||| ||||||| | |||||| |||||||||||||||  |||||||| |  | ||| | |||||||||||  |  |||||||| |||||||||||||    
T  47848596 gagatgaggatgttgtgttggatgtgtggtaagactagacgggataggatcagaagtgataacattagagagagagttggggtagcgcctatagtagaaa 47848695  T
Q  113 agttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaatggagaagaaccaggttaa 212  Q
    || |||| |||||||| ||||| || ||| | ||||| ||||||||||  ||| || | ||  |||| |||| |||||| |||||| | |  | | | |     
T  47848696 agatggtggaaaataggcttaggtggtttgggcatgtcgagagaagacttgtaaattctgtactaaggagagtagatcagatggaggatagtctgatcac 47848795  T
Q  213 aagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacacta 312  Q
     ||||| |||||||||||||  ||||| ||  ||||||| ||| |||| ||||| | | | |||||| | |||||||||||||||| |||||||||| ||    
T  47848796 tagaggcagaggaagaactagaaaaactataagagaaactattggaaa-gatttggggattaatgagctggatccaaatatggtttatgatagaacatta 47848894  T
Q  313 tgacatcatttgatccat 330  Q
    ||   | |||||||||||    
T  47848895 tggtttaatttgatccat 47848912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #61
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 263 - 376
Target Start/End: Original strand, 42969870 - 42969983
Alignment:
Q  263 atttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttg 362  Q
    |||||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||| ||||| |||   || ||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| ||||     
T  42969870 atttagaggttaatgagttggatccaaatatggtttatgattgaacattatcgtataatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttt 42969969  T
Q  363 gttgttgttgttgt 376  Q
    ||| ||| ||||||    
T  42969970 gttattgatgttgt 42969983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #62
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 11 - 159
Target Start/End: Original strand, 5335840 - 5335988
Alignment:
Q  11 agcagagatgatgatgttgcgctggatgagtggtaagactagacatgataggattaagaatgacatcattagagagaatgggggtagcacctatagtaga 110  Q
    ||||||||||| ||||||||| || ||| ||||||||||||||||  ||   ||||  ||||| | ||||||||||| | ||||||||| |||||||||     
T  5335840 agcagagatgaggatgttgcgttgaatgtgtggtaagactagacagaatgcaattagaaatgataacattagagagagttggggtagcatctatagtagg 5335939  T
Q  111 aaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaaga 159  Q
    |||| |||| |||| ||||||||| || ||| | ||| |||||||||||    
T  5335940 aaagatggtcgaaactagacttaggtggtttgggcatatagagagaaga 5335988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #63
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 245 - 376
Target Start/End: Original strand, 42187595 - 42187726
Alignment:
Q  245 gagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacact-atgacatcatttgatccatgtagccgatccaa 343  Q
    ||||||| ||||| ||| |||||||| | ||| |||| ||||||||| |||||| |||||||||| | ||| | | ||||||||||||||||||| || |    
T  42187595 gagaaactattaggaaatatttagagattaattagttggatccaaat-tggtttatgatagaacatttatggcgtaatttgatccatgtagccgacccca 42187693  T
Q  344 cttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 376  Q
    ||||||| ||||| |||| ||||||||||||||    
T  42187694 cttagtgggataaggctttgttgttgttgttgt 42187726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #64
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 266 - 374
Target Start/End: Original strand, 47652722 - 47652830
Alignment:
Q  266 tagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggtt 365  Q
    ||||||| ||| |||| ||||||||||||||||  ||||||||| |||| | | | ||||||| ||||||||| || |||||||| ||||| ||||||||    
T  47652722 tagaggttaataagtttgatccaaatatggtttcggatagaacattatggcgtaacttgatccctgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggtt 47652821  T
Q  366 gttgttgtt 374  Q
    |||||||||    
T  47652822 gttgttgtt 47652830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #65
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 211 - 374
Target Start/End: Original strand, 1011167 - 1011329
Alignment:
Q  211 aaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacac 310  Q
    |||||||||||||||||| |||  ||||  ||  ||||||  ||||| ||| ||||| |||| ||||| || ||||||| ||||||||  |||||||||     
T  1011167 aaaagaggtagaggaagacctagaaaaattatgagagaaattattaggaaatatttaaaggttaatgatttggatccaa-tatggtttaggatagaacat 1011265  T
Q  311 tatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgtt 374  Q
    ||||   | |||||||| |||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  1011266 tatggtgtaatttgatctatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgtt 1011329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #66
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 94 - 376
Target Start/End: Original strand, 12966025 - 12966301
Alignment:
Q  94 gtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaa 193  Q
    ||||||||||||| ||||||| |||| |||| ||  ||||| || ||| | ||||||||||||||||||||| || | || ||||| |||| |||||||     
T  12966025 gtagcacctatagaagaaaagatggtggaaactatgcttaggtggtttgggcatgtagagagaagacccgtaaattctgtagtaaggagagtagatcaag 12966124  T
Q  194 tggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatat 293  Q
    || |||  |     || |||  |  |||||||||| |||  ||||| ||  ||||||| ||||  ||| |||||||| | ||||| || |||  ||||||    
T  12966125 tgaagacta-----gtcaaatcac-tagaggaagacctagaaaaactataagagaaactattaagaaatatttagagattaatgatttggatagaaatat 12966218  T
Q  294 ggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 376  Q
    ||| | ||||| | || |||| |||  |||||| |||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  12966219 ggtatatgataaatcattatgccattgtttgattcatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttgt 12966301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #67
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 213 - 330
Target Start/End: Original strand, 35922376 - 35922492
Alignment:
Q  213 aagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacacta 312  Q
    ||||||||||||||||  ||| |||| | |||||||||| ||||  |||||||||||||| ||||||||  ||| ||||||| ||| |||||||||| ||    
T  35922376 aagaggtagaggaagacttaaaaaaaac-tttgagaaactattaagaaagatttagaggttaatgagttgaatctaaatatgatttatgatagaacatta 35922474  T
Q  313 tgacatcatttgatccat 330  Q
    |||| | |||||||||||    
T  35922475 tgacctaatttgatccat 35922492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #68
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 15 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 25579431 - 25579252
Alignment:
Q  15 gagatgatgatgttgcgctggatgagtggtaagactagacatgataggattaagaatgacatcattagagagaatgggg-gtagcacctatagtagaaaa 113  Q
    ||||||| ||||||||| |||||| ||||||| ||||||     ||||||||  ||||||  ||||||||||| ||||| |||||||| |||| ||||||    
T  25579431 gagatgaggatgttgcgttggatgtgtggtaatactaga-----taggattagaaatgaccacattagagagagtggggagtagcacccatagcagaaaa 25579337  T
Q  114 gttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaatggag 198  Q
      |||| |||||||| ||||| || ||| |  |||||||||||||||  |||||| | || |||||||||| |||| | ||||||    
T  25579336 aatggtggaaaataggcttaggtggtttggggatgtagagagaagacatgtagattctgtggtaagaagagtagattagatggag 25579252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #69
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 254 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 8519165 - 8519046
Alignment:
Q  254 ttagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtga 353  Q
    |||| |||||||||||||| || ||||| |||||| ||||||||| |||||||| |||||| ||| |||||||| ||||| |  | || |||||||| ||    
T  8519165 ttaggaaagatttagaggttaacgagttggatccatatatggtttatgatagaaaactatggcataatttgatcaatgtaactaaccccacttagtgaga 8519066  T
Q  354 taatgcttggttgttgttgt 373  Q
    ||| ||| | ||||||||||    
T  8519065 taaggctcgattgttgttgt 8519046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #70
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 285 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 24177714 - 24177628
Alignment:
Q  285 tccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttg 372  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||| | || |||||||  ||||| |||||||||||||||    
T  24177714 tccaaatatggtttatgatagaacactatggcgtcatt-gatccatgtagccaaccccacttagtaggataaagcttggttgttgttg 24177628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #71
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 92 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 26742177 - 26741891
Alignment:
Q  92 gggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatca 191  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||  |||| || |||  ||||||||||| | ||||  |||||   || ||||| |||| ||||||    
T  26742177 gggtagcacctatagtagaaaagatggtggaaaataggattaggtggtttgaacatgtagagaaacgacctatagattttgtggtaaggagagtagatca 26742078  T
Q  192 aatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgaga--aaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaa 289  Q
     || ||||| |  ||| | |  ||||| |||||||||  ||  ||||| ||   |||  ||| ||||| ||| |||| ||  | |||||||| || | ||    
T  26742077 gatagagaatagtcagatcactagaggcagaggaagacgtagaaaaactatcaaagataaactattaggaaatatttggaaataaatgagttggaccgaa 26741978  T
Q  290 atatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 376  Q
    ||||||||| |||||||||| |||| | | |||||||| ||||| || |||| ||||||||  | ||||||||||||||||||||||    
T  26741977 atatggtttatgatagaacattatggcgtaatttgatcaatgtaaccaatcccacttagtgcaaaaatgcttggttgttgttgttgt 26741891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #72
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 11 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 30200323 - 30200175
Alignment:
Q  11 agcagagatgatgatgttgcgctggatgagtggtaagactagacatgataggattaagaatgacatcattagagagaatgggggtagcacctatagtaga 110  Q
    ||||||||||| ||||||| | |||||| ||||||||| ||||   |||| |||||  ||||||| ||||||||||  |  ||||| |||||||||||||    
T  30200323 agcagagatgaggatgttgtgttggatgtgtggtaagattagatgggatatgattagaaatgacaacattagagag--ttagggtaacacctatagtaga 30200226  T
Q  111 aaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacc 161  Q
    |||| |||| |||| ||| ||||| |||||| | |||||| | ||||||||    
T  30200225 aaagatggtggaaactaggcttaggtgattttggcatgtaaatagaagacc 30200175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #73
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 253 - 373
Target Start/End: Original strand, 40415169 - 40415295
Alignment:
Q  253 attagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatcc------aactt 346  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||| |||| |||| ||||  | | ||||||||||||||||||| ||       ||||    
T  40415169 attaggaaagatttagaggttaatgagtttgatccaaatatgttttatgattgaaccctatagcttaatttgatccatgtagccgaccccacttatactt 40415268  T
Q  347 agtgtgataatgcttggttgttgttgt 373  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||    
T  40415269 agtgggataaggcttggttgttgttgt 40415295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #74
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 318 - 376
Target Start/End: Original strand, 31005432 - 31005490
Alignment:
Q  318 tcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 376  Q
    ||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  31005432 tcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttgt 31005490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #75
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 82 - 168
Target Start/End: Original strand, 40169640 - 40169726
Alignment:
Q  82 gagagaatgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagat 168  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||| ||||| || ||| | |||||||||| ||||| |||||||    
T  40169640 gagagaattggggtagcacttatagtagaaaagatggtggaaaataggcttaggtggtttgggcatgtagagataagacacgtagat 40169726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #76
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 11 - 161
Target Start/End: Original strand, 14593679 - 14593835
Alignment:
Q  11 agcagagatgatgatgttgcgctggatgagtggtaagactagacatgataggattaagaatgacatcattagagagaatg------ggggtagcacctat 104  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||||   |  | ||||  ||||||| |||||||||||  |      |||||  |||||||    
T  14593679 agcagagatgaggatgttgcgttggatgtgtggtaagactagacggaaccgaattagaaatgacaacattagagagagagtgagctggggtgacacctat 14593778  T
Q  105 agtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacc 161  Q
    |||||||||  ||||||||| ||||||||| |||||| | ||||||| |||||||||    
T  14593779 agtagaaaaaatggtagaaactagacttaggtgatttgggcatgtagtgagaagacc 14593835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #77
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 235 - 372
Target Start/End: Original strand, 34745891 - 34746028
Alignment:
Q  235 aaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtag 334  Q
    ||||||||  ||||||| ||||| || ||| || || | |||||||| ||   ||| ||||||||||||||||| ||||| | |  |||||| |||||||    
T  34745891 aaaaccataagagaaactattaggaaggatctaaagataaatgagttggagaaaaacatggtttttgatagaacgctatggcgttgtttgattcatgtag 34745990  T
Q  335 ccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttg 372  Q
    |||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  34745991 ccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttg 34746028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #78
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 248 - 375
Target Start/End: Original strand, 28355322 - 28355450
Alignment:
Q  248 aaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtag-ccgatccaactt 346  Q
    |||| ||||| ||||||||| |||| |||||| | |||| ||||||||||| ||||| |||| |||| |   |||||||||| |||| | || || ||||    
T  28355322 aaactattaggaaagatttataggttaatgaggtggatcaaaatatggtttatgataaaacattatggcggaatttgatccacgtagtctgaccccactt 28355421  T
Q  347 agtgtgataatgcttggttgttgttgttg 375  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  28355422 agtgggataaggcttggttgttgttgttg 28355450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #79
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 320 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 29318848 - 29318792
Alignment:
Q  320 atttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 376  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  29318848 atttgatccatgtagccgacccagcttagtgggataaggcttggttgttgttgttgt 29318792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #80
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 245 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 36239924 - 36239833
Alignment:
Q  245 gagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagcc 336  Q
    ||||||| ||||| ||| |||||||| | || ||||| |||||||||||| ||| |||||||||| |||| | | |||||||||||||||||    
T  36239924 gagaaactattaggaaaaatttagagattaacgagttggatccaaatatgctttatgatagaacattatggcgtaatttgatccatgtagcc 36239833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #81
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 245 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 38135341 - 38135210
Alignment:
Q  245 gagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaac 344  Q
    ||||||| |||| ||||||||||||| | |||||||| || | |||||||| || |||||||| | |||| | | ||||||||||| |||| || || ||    
T  38135341 gagaaactattaaaaaagatttagagattaatgagttggaccgaaatatgggttatgatagaatattatggcgtaatttgatccatctagctgaccccac 38135242  T
Q  345 ttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 376  Q
    || ||| || || ||||||||||| |||||||    
T  38135241 ttggtgggacaaggcttggttgttattgttgt 38135210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #82
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 309 - 376
Target Start/End: Original strand, 40630652 - 40630719
Alignment:
Q  309 actatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 376  Q
    |||||| | ||||||||||||||||||||| || |||||||| || || |||||||||||||||||||    
T  40630652 actatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggaaaaggcttggttgttgttgttgt 40630719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #83
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 300 - 374
Target Start/End: Original strand, 7220965 - 7221039
Alignment:
Q  300 tgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgtt 374  Q
    |||||||| | |||||||||||||||||||||||||| | || ||||||||   ||| |||||||||||||||||    
T  7220965 tgatagaaaattatgacatcatttgatccatgtagccaaccccacttagtggtgtaaggcttggttgttgttgtt 7221039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #84
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 289 - 375
Target Start/End: Original strand, 25891086 - 25891172
Alignment:
Q  289 aatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttg 375  Q
    |||||||||| | |||||||| ||||   | ||||||||||||||||||| || |||||||  ||||| ||||||||||||||||||    
T  25891086 aatatggtttataatagaacattatggtgtaatttgatccatgtagccgaccccacttagtacgataaggcttggttgttgttgttg 25891172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #85
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 81 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 27021984 - 27021906
Alignment:
Q  81 agagagaatgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaaga 159  Q
    ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||| ||||| || ||| | |||||||||||||||    
T  27021984 agagagagttggggtagcacctatagtagaaaagttggtgaaaactaggcttaggtggtttgggcatgtagagagaaga 27021906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #86
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 259 - 373
Target Start/End: Original strand, 37976403 - 37976517
Alignment:
Q  259 aaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatg 358  Q
    |||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||| |||||||||| |||| |   ||| ||||||||||||| | ||  |||||   ||||| |    
T  37976403 aaagatttagagattaatgagttggatccaaatatggtttatgatagaacattatggctaaattagatccatgtagccaaccccgcttagcaagataagg 37976502  T
Q  359 cttggttgttgttgt 373  Q
     ||||||||||||||    
T  37976503 tttggttgttgttgt 37976517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #87
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 288 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 20158756 - 20158671
Alignment:
Q  288 aaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgt 373  Q
    |||||| ||||  ||||||||||||| |  | |||||||||||||||| || || |||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  20158756 aaatattgtttaagatagaacactatcaagtaatttgatccatgtagctgaccctacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 20158671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #88
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 12 - 81
Target Start/End: Complemental strand, 24598509 - 24598440
Alignment:
Q  12 gcagagatgatgatgttgcgctggatgagtggtaagactagacatgataggattaagaatgacatcatta 81  Q
    ||||||| || ||||||| | |||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  24598509 gcagagacgaggatgttgtgttggatgagtggtaagtttagacatgataggattaggaatgacaccatta 24598440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #89
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 259 - 376
Target Start/End: Original strand, 33103094 - 33103211
Alignment:
Q  259 aaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatg 358  Q
    ||||| |||||| | ||||||||  |||  |||||||||| ||||||||||| ||  | | ||||||||||||||||||| || |||||||  ||||| |    
T  33103094 aaagacttagagattaatgagttgaatcggaatatggtttatgatagaacaccatagcgtaatttgatccatgtagccgaccccacttagtaggataagg 33103193  T
Q  359 cttggttgttgttgttgt 376  Q
    ||||| || |||||||||    
T  33103194 cttggctgatgttgttgt 33103211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #90
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 18 - 87
Target Start/End: Original strand, 39811882 - 39811951
Alignment:
Q  18 atgatgatgttgcgctggatgagtggtaagactagacatgataggattaagaatgacatcattagagaga 87  Q
    |||| ||||||||  |||||| ||||||||||||||| |||||||||||  ||||||| |||||||||||    
T  39811882 atgaggatgttgctttggatgtgtggtaagactagacgtgataggattagaaatgacaacattagagaga 39811951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #91
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 269 - 370
Target Start/End: Original strand, 47852265 - 47852366
Alignment:
Q  269 aggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgtt 368  Q
    |||| |||||||| ||||||||| |||| | | |||||||| |||| | | ||||||||||||||||||| || |||||| | ||||| |||||| ||||    
T  47852265 aggttaatgagttggatccaaatgtggtgtatcatagaacattatggcgtaatttgatccatgtagccgaccccacttagggggataaggcttggctgtt 47852364  T
Q  369 gt 370  Q
    ||    
T  47852365 gt 47852366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #92
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 311 - 371
Target Start/End: Original strand, 6263479 - 6263539
Alignment:
Q  311 tatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgtt 371  Q
    |||| ||| ||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  6263479 tatggcataatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgtt 6263539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #93
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 81 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 7189518 - 7189442
Alignment:
Q  81 agagagaatgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaa 157  Q
    ||||||| | ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||| || ||| | |||||||||||||    
T  7189518 agagagagttggggtcgcacctatagtagaaaagatggtagaaaataagcttaggtggtttgggcatgtagagagaa 7189442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #94
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 292 - 376
Target Start/End: Original strand, 14593953 - 14594037
Alignment:
Q  292 atggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 376  Q
    ||||||||||||||||||||| |   || | | || ||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  14593953 atggtttttgatagaacactacggtgtcgtataattcatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttgt 14594037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #95
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 292 - 376
Target Start/End: Original strand, 16013476 - 16013560
Alignment:
Q  292 atggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 376  Q
    ||||||||||||||||||||| |   || | | || ||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  16013476 atggtttttgatagaacactacggtgtcgtataattcatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttgt 16013560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #96
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 320 - 376
Target Start/End: Original strand, 28708610 - 28708666
Alignment:
Q  320 atttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 376  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| ||||||||| |||||||||    
T  28708610 atttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgatgttgttgt 28708666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #97
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 320 - 376
Target Start/End: Original strand, 29312218 - 29312274
Alignment:
Q  320 atttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 376  Q
    |||||||||||| |||||| ||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  29312218 atttgatccatgaagccgacccagcttagtgggataaggcttggttgttgttgttgt 29312274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #98
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 303 - 375
Target Start/End: Original strand, 31840442 - 31840514
Alignment:
Q  303 tagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttg 375  Q
    |||||||||||| | || |||||| ||||||||| | || |||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  31840442 tagaacactatggcgtcgtttgattcatgtagcctaccctacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 31840514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #99
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 15 - 168
Target Start/End: Original strand, 42187393 - 42187547
Alignment:
Q  15 gagatgatgatgttgcgctggatgagtggtaagactagacatgataggattaagaatgacatcattaga--gagaatgggggtagcacctatagtagaaa 112  Q
    ||||||| ||||||| | |||||| || ||||||||||||  ||||  ||||  |||| || |||||||  |||| | ||||||||||||||| ||||||    
T  42187393 gagatgaggatgttgtgttggatgtgtagtaagactagacgggatat-attagaaatggcagcattagaaagagagtcggggtagcacctataatagaaa 42187491  T
Q  113 agttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagat 168  Q
    || |||| |||||||| ||||| || ||| | |||||| ||||||| || ||||||    
T  42187492 agatggtggaaaataggcttaggtggtttgggcatgtaaagagaaggcctgtagat 42187547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #100
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 211 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 1531523 - 1531420
Alignment:
Q  211 aaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacac 310  Q
    |||||||||||||||||| |||| ||||| ||  |  |||  ||||| ||| |||||||||| |||||||| || |||||||||||||  |||||||||     
T  1531523 aaaagaggtagaggaagacctaaaaaaactataagcaaaattattaggaaaaatttagaggttaatgagttggacccaaatatggtttgggatagaacat 1531424  T
Q  311 tatg 314  Q
    ||||    
T  1531423 tatg 1531420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #101
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 24 - 87
Target Start/End: Complemental strand, 27022057 - 27021994
Alignment:
Q  24 atgttgcgctggatgagtggtaagactagacatgataggattaagaatgacatcattagagaga 87  Q
    |||||||  |||||| ||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  27022057 atgttgcattggatgtgtgataagactagacaggataggattaaaaatgacaacattagagaga 27021994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #102
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 259 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 28542058 - 28541943
Alignment:
Q  259 aaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccga-tccaacttagtgtgataat 357  Q
    |||||||||||| | |||||||| |||  || |||||||| ||||||||||  ||| |||  |||||||| |||||||||  || |||||||  |||||     
T  28542058 aaagatttagagattaatgagttggattgaactatggtttatgatagaacatcatggcatagtttgatccgtgtagccgacccccacttagttggataag 28541959  T
Q  358 gcttggttgttgttgt 373  Q
    ||||||||||||||||    
T  28541958 gcttggttgttgttgt 28541943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #103
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 278 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 30814220 - 30814125
Alignment:
Q  278 agttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgt 373  Q
    |||| |||| ||||||| ||| |||||||||| ||| || | ||||||||||||||||||| || |||||||| ||  | ||||||| ||||||||    
T  30814220 agttggatcgaaatatgttttatgatagaacattatcacgtaatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggaagaggcttggtagttgttgt 30814125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #104
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 262 - 333
Target Start/End: Original strand, 31859046 - 31859117
Alignment:
Q  262 gatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgta 333  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||||||| |  ||| | ||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  31859046 gatttagaagtcaatgagttggatccaaatttaatttataatagaacactatgacataatttgattcatgta 31859117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #105
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 18 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 48736256 - 48736074
Alignment:
Q  18 atgatgatgttgcgctggatgagtggtaagactagacatgataggattaagaatgacatcatta--gagagaatgggggtagcacctatagtagaaaagt 115  Q
    |||| ||||||||| || ||| ||||||||||||||   ||||  ||||  ||||||  |||||  |||||| | ||||||||||||| ||||||||||     
T  48736256 atgaggatgttgcgttgaatgtgtggtaagactagatgagataaaattagaaatgacgacattatagagagagttggggtagcacctacagtagaaaaga 48736157  T
Q  116 tggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaatggag 198  Q
    ||| ||||| ||||||||| || |||   ||||||||| ||||||| || |||   || || || |||| |||||||||||||    
T  48736156 tgggagaaactagacttaggtggtttgctcatgtagagcgaagacctgtggattatgtagttaggagagtagatcaaatggag 48736074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #106
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 292 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 19119505 - 19119423
Alignment:
Q  292 atggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgtt 374  Q
    |||| |||||||| ||||||||||| || |||||| ||||||||||| || |||||||| |||||   || ||||||||||||    
T  19119505 atggcttttgatacaacactatgacgtcgtttgattcatgtagccgaccccacttagtgggataaaaatttgttgttgttgtt 19119423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #107
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 318 - 376
Target Start/End: Original strand, 30144982 - 30145040
Alignment:
Q  318 tcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 376  Q
    |||||||||||||| |||| |||| |||||||||||||| ||||||||| |||| ||||    
T  30144982 tcatttgatccatgcagccaatcccacttagtgtgataaggcttggttgctgtttttgt 30145040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #108
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 80 - 134
Target Start/End: Original strand, 45558351 - 45558405
Alignment:
Q  80 tagagagaatgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttag 134  Q
    |||||||| | |||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  45558351 tagagagagttggggtaccacctatagtagaaaagttggtagaaactcgacttag 45558405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #109
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 320 - 377
Target Start/End: Original strand, 5418303 - 5418360
Alignment:
Q  320 atttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgtc 377  Q
    ||||||||||||||| ||| || | |||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  5418303 atttgatccatgtagtcgaccccatttagtgggataaggcttggttgttgttgttgtc 5418360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #110
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 11 - 161
Target Start/End: Original strand, 16013202 - 16013358
Alignment:
Q  11 agcagagatgatgatgttgcgctggatgagtggtaagactagacatgataggattaagaatgacatcattagagagaatg------ggggtagcacctat 104  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||||   |    ||||  ||||||| |||||||||||  |      |||||  |||||||    
T  16013202 agcagagatgaggatgttgcgttggatgtgtggtaagactagacggaaccaaattagaaatgacaacattagagagagagtgagctggggtgacacctat 16013301  T
Q  105 agtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacc 161  Q
    |||| ||||  ||||||||| ||||||||| |||||| | ||||||| |||||||||    
T  16013302 agtacaaaaaatggtagaaactagacttaggtgatttgggcatgtagtgagaagacc 16013358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #111
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 291 - 376
Target Start/End: Original strand, 33281087 - 33281171
Alignment:
Q  291 tatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 376  Q
    ||||||||  ||||||||| ||||   | ||||||||||||||||||  ||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  33281087 tatggtttcagatagaacattatggtgtaatttgatccatgtagccggacca-cttagtgggataaggcttggttgttgttgttgt 33281171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #112
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 292 - 373
Target Start/End: Original strand, 45558531 - 45558611
Alignment:
Q  292 atggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgt 373  Q
    ||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||  || ||  ||||||| ||||| | ||||||||||||||    
T  45558531 atggtttttgatagaacactatggcgtcatttgattcatgtagttgaccccgcttagtg-gataaggtttggttgttgttgt 45558611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #113
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 304 - 376
Target Start/End: Original strand, 1523856 - 1523928
Alignment:
Q  304 agaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 376  Q
    ||||||||||||| | ||||||| ||||||||| | |  |||||| | ||||| |||||||||||||||||||    
T  1523856 agaacactatgacgtaatttgattcatgtagccaacctcacttagggagataaggcttggttgttgttgttgt 1523928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #114
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 320 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 20525105 - 20525049
Alignment:
Q  320 atttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 376  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||| | ||||| ||| |||||||||||||||    
T  20525105 atttgatccatgtagccgaccccacttagcgggataaggctcggttgttgttgttgt 20525049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #115
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 245 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 44401253 - 44401164
Alignment:
Q  245 gagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagcc 336  Q
    ||||||| ||||  |||||||||||| | || ||||||  || ||||||| ||| |||||||||| |||||| | |||||||||||||||||    
T  44401253 gagaaactattaagaaagatttagagattaacgagtta--tcaaaatatgttttatgatagaacattatgacgtaatttgatccatgtagcc 44401164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #116
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 24 - 87
Target Start/End: Original strand, 1523747 - 1523810
Alignment:
Q  24 atgttgcgctggatgagtggtaagactagacatgataggattaagaatgacatcattagagaga 87  Q
    |||||||| || |||||||  |||||||||| |||||||||||  ||||||| |||||||||||    
T  1523747 atgttgcgttgcatgagtgacaagactagacgtgataggattattaatgacaccattagagaga 1523810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #117
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 143 - 202
Target Start/End: Original strand, 33139206 - 33139265
Alignment:
Q  143 gacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaatggagaaga 202  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| || | | || ||||||||||    
T  33139206 gacatgtagagagaagacccgcagatgccgttgtaagaaaagtataacagatggagaaga 33139265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #118
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 274 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 34341494 - 34341395
Alignment:
Q  274 aatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgt 373  Q
    |||||||| |||  ||||||||||| |||||||||| |||| | | |||||| | |||||||||| || | ||||||  |||| ||||| ||||||||||    
T  34341494 aatgagttggattgaaatatggtttatgatagaacattatggcgtaatttgaccaatgtagccgaccccatttagtggaataaggcttgtttgttgttgt 34341395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #119
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 277 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 34926618 - 34926547
Alignment:
Q  277 gagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttag 348  Q
    ||||| |||| ||||||||||| |||||||||   ||| | | |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  34926618 gagttggatcgaaatatggtttatgatagaacttaatggcgtaatttgatccatgtagccgatcccacttag 34926547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #120
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 328 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 21244328 - 21244282
Alignment:
Q  328 catgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgtt 374  Q
    ||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  21244328 catgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgtt 21244282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #121
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 245 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 21517508 - 21517426
Alignment:
Q  245 gagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatc 327  Q
    ||||||| |||| |||| |||||||| | ||| |||| |||||||||||| ||| ||||| |||| |||||| | ||||||||    
T  21517508 gagaaactattaaaaaatatttagagattaataagttggatccaaatatgatttatgatataacattatgacgtaatttgatc 21517426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #122
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 33 - 87
Target Start/End: Complemental strand, 25731695 - 25731641
Alignment:
Q  33 tggatgagtggtaagactagacatgataggattaagaatgacatcattagagaga 87  Q
    ||||||| ||||||||||||||  || |||||||||||||||| | |||||||||    
T  25731695 tggatgaatggtaagactagacgagaaaggattaagaatgacacctttagagaga 25731641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #123
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 288 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 26332958 - 26332908
Alignment:
Q  288 aaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccga 338  Q
    ||||||||||| |||||||| | |||||| | |||||||||||||||||||    
T  26332958 aaatatggtttatgatagaatattatgacgtaatttgatccatgtagccga 26332908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #124
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 12 - 159
Target Start/End: Original strand, 28020883 - 28021032
Alignment:
Q  12 gcagagatgatgatgttgcgctggatgagtggtaagactagacatgataggattaagaatgacatcattagaga--gaatgggggtagcacctatagtag 109  Q
    ||||||| || ||||||||  | |||| ||| ||||||| ||||||||| ||||   ||||| | |||||||||  || | |||||||||| ||| ||||    
T  28020883 gcagagaggaagatgttgcattagatgtgtgataagactggacatgatatgattcgaaatgataacattagagaaagagttggggtagcacttatcgtag 28020982  T
Q  110 aaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaaga 159  Q
    ||||| |||| |||| | | ||||| || ||| | |||||||||||||||    
T  28020983 aaaagatggtggaaacttggcttaggtggtttgggcatgtagagagaaga 28021032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #125
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 302 - 380
Target Start/End: Original strand, 28021146 - 28021224
Alignment:
Q  302 atagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgtcgtc 380  Q
    |||||||| |||||  || ||||| |||||||||| |  | |||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  28021146 atagaacattatgaggtcgtttgacccatgtagcctactccacttggtgggataaggcttggttgttgttgttgtcgtc 28021224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #126
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 290 - 376
Target Start/End: Original strand, 48515370 - 48515456
Alignment:
Q  290 atatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 376  Q
    ||||||||| |||||||||| |||| | | |||| || ||||||||||  ||||||||||| ||||| ||| ||| ||| |||||||    
T  48515370 atatggtttatgatagaacattatggcgtaattttattcatgtagccgccccaacttagtgggataaggctcggtggttattgttgt 48515456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #127
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 295 - 376
Target Start/End: Original strand, 4604751 - 4604832
Alignment:
Q  295 gtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 376  Q
    |||| |||||||||| |||| | |  |||||||||||||||| | || |||||||| |||||  ||||||| ||||||||||    
T  4604751 gtttatgatagaacattatggcgtactttgatccatgtagccaaccccacttagtgggataagacttggttcttgttgttgt 4604832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #128
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 299 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 34029750 - 34029677
Alignment:
Q  299 ttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttg 372  Q
    ||||||||||| |||| | | ||||||||||||||||| | || ||  |||| ||||| |||||||||||||||    
T  34029750 ttgatagaacattatggcgtaatttgatccatgtagccaaccccaccaagtgggataaggcttggttgttgttg 34029677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #129
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 11 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 36102129 - 36101977
Alignment:
Q  11 agcagagatgatgatgttgcgctggatgagtggtaagactagacatgataggattaagaatgacatcattagag--agaatgggggtagcacctatagta 108  Q
    |||||||||||  |||||| | | |||| ||||||||||||||   |||  |||||  ||||||| |||| |||  ||| ||  ||||||||||||| ||    
T  36102129 agcagagatgaaaatgttgagttcgatgtgtggtaagactagatgggatgagattagaaatgacaacatttgaggaagagtgaaggtagcacctataata 36102030  T
Q  109 gaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacc 161  Q
    |||||| || | |||||||| ||||| || ||| |  ||||||||||||||||    
T  36102029 gaaaagatgttggaaaataggcttaggtggtttggggatgtagagagaagacc 36101977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #130
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 91 - 156
Target Start/End: Original strand, 38920794 - 38920859
Alignment:
Q  91 ggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagaga 156  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||| ||||  || ||| | ||||||||||||    
T  38920794 ggggtagcacctatagtagaaaagatggtggaaactaggcttaagtggtttgggcatgtagagaga 38920859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #131
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 300 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 40139021 - 40138948
Alignment:
Q  300 tgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgt 373  Q
    |||||||| | |||||| |||||||||||||||||| || || |||||||| |||||  ||||| |||| ||||    
T  40139021 tgatagaatattatgacgtcatttgatccatgtagcagaccccacttagtgcgataagacttggctgttattgt 40138948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #132
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 273 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 40149112 - 40149016
Alignment:
Q  273 caatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgt 370  Q
    ||||||||| || | |||||||||| | ||||||||| |||| |   |||||||| ||||||||||  | |||||||| ||||| |||||||||||||    
T  40149112 caatgagttggaccaaaatatggttat-gatagaacattatggcgcaatttgatctatgtagccgaatccacttagtgggataaggcttggttgttgt 40149016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #133
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 318 - 375
Target Start/End: Original strand, 41483714 - 41483771
Alignment:
Q  318 tcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttg 375  Q
    |||| |||||||||||||||| || |||||||| |||||   ||||||||||||||||    
T  41483714 tcatatgatccatgtagccgaccccacttagtgggataagatttggttgttgttgttg 41483771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #134
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 92 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 18605427 - 18605359
Alignment:
Q  92 gggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagac 160  Q
    |||||||||||||| || ||||| ||||||||| || |||||| || |||   ||||||||||||||||    
T  18605427 gggtagcacctatattataaaagatggtagaaactaaacttaggtggtttgagcatgtagagagaagac 18605359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #135
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 92 - 160
Target Start/End: Original strand, 18637563 - 18637631
Alignment:
Q  92 gggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagac 160  Q
    |||||||||||||| || ||||| ||||||||| || |||||| || |||   ||||||||||||||||    
T  18637563 gggtagcacctatattataaaagatggtagaaactaaacttaggtggtttgagcatgtagagagaagac 18637631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #136
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 92 - 160
Target Start/End: Original strand, 18650997 - 18651065
Alignment:
Q  92 gggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagac 160  Q
    |||||||||||||| || ||||| ||||||||| || |||||| || |||   ||||||||||||||||    
T  18650997 gggtagcacctatattataaaagatggtagaaactaaacttaggtggtttgagcatgtagagagaagac 18651065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #137
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 56 - 152
Target Start/End: Complemental strand, 27893865 - 27893769
Alignment:
Q  56 tgataggattaagaatgacatcattagagagaatgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtaga 152  Q
    |||||||||||  || ||||  |||||||||| | | |||| |||||||||||||| || |||| |||||||| ||||| || |||  |||||||||    
T  27893865 tgataggattagaaacgacaatattagagagagttgaggtaacacctatagtagaatagatggtggaaaataggcttaggtggtttgaacatgtaga 27893769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #138
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 25 - 85
Target Start/End: Complemental strand, 29653904 - 29653844
Alignment:
Q  25 tgttgcgctggatgagtggtaagactagacatgataggattaagaatgacatcattagaga 85  Q
    ||||||| |||||| ||||||| |||||||  ||||| ||||  |||||||||||||||||    
T  29653904 tgttgcgttggatgtgtggtaacactagacgggatagaattagaaatgacatcattagaga 29653844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #139
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 292 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 38921169 - 38921086
Alignment:
Q  292 atggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtag--ccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgt 373  Q
    ||||||||||||||||  ||||| | ||||||||| |||||||  |||| || |||||| | || || ||||||||||||||||    
T  38921169 atggtttttgatagaaggctatggcgtcatttgattcatgtaggaccgaccccacttagggggaaaaggcttggttgttgttgt 38921086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #140
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 320 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 47700108 - 47700053
Alignment:
Q  320 atttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 376  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||| ||| || || |||||||||||||||||||    
T  47700108 atttgatccatgtagccgaccca-cttggtgggaaaaggcttggttgttgttgttgt 47700053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #141
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 304 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 48735970 - 48735898
Alignment:
Q  304 agaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 376  Q
    |||| |||||| | || |||||| ||||||||| | || |||||||| ||||| | |||||||||||||||||    
T  48735970 agaatactatggcgtcgtttgattcatgtagccaaccccacttagtgggataaggtttggttgttgttgttgt 48735898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 245; Significance: 1e-136; HSPs: 147)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 245; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 15 - 375
Target Start/End: Original strand, 696191 - 696554
Alignment:
Q  15 gagatgatgatgttgcgctggatgagtggtaagactagacatgataggattaagaatgacatcattagagagaa--tgggggtagcacctatagtagaaa 112  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||   ||||||||||||||||||||||||    
T  696191 gagatgaggatgttgcgctggatgagtggtaagactagacaggataggattaggaatgacaccattagagagagagtgggggtagcacctatagtagaaa 696290  T
Q  113 agttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaatggagaagaaccaggttaa 212  Q
    |||||||||||||||| ||||||||  || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||| |||  ||||||||    
T  696291 agttggtagaaaataggcttagatggcttggacatgtagagagaagacccgtagatgccgttgtaagaagagtagatcatatggaggagagtcaggttaa 696390  T
Q  213 aagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacacta 312  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  696391 aagaggtagaggaagacctaagaaaaccattcgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagtttgatccaaatatggtttttgatagaacacta 696490  T
Q  313 -tgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttg 375  Q
     || | |||||||||| |||||||||| || |||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  696491 ttggcgtcatttgatcaatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 696554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 244; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 16 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 4001814 - 4001452
Alignment:
Q  16 agatgatgatgttgcgctggatgagtggtaagactagacatgataggattaagaatgacatcattagagagaa--tgggggtagcacctatagtagaaaa 113  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||| |||||||||||   |||||||||||||||||||||||||    
T  4001814 agatgaggatgttgcgctagatgagtggtaagactagacaaaataggattaggaatgacaccattagagagagagtgggggtagcacctatagtagaaaa 4001715  T
Q  114 gttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaa 213  Q
    ||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| |||  |||||||||    
T  4001714 gttggtagaaaataggcttagatggtttggacatgtagagaggagacccgtagatgccgttgtaagaagagtagatcaaatggaggagagtcaggttaaa 4001615  T
Q  214 agaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactat 313  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  4001614 agaggtagaggaagacctaagaaaaccattcgagaaaccattaaaaaagatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttttgatagaaccctat 4001515  T
Q  314 gacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 376  Q
    ||||||||||||||||||||||| | || |||||||| || || |||||||||||||||||||    
T  4001514 gacatcatttgatccatgtagccaaccccacttagtgggaaaaggcttggttgttgttgttgt 4001452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 11 - 376
Target Start/End: Original strand, 1210663 - 1211030
Alignment:
Q  11 agcagagatgatgatgttgcgctggatgagtggtaagactagacatgataggattaagaatgacatcattagagagaa--tgggggtagcacctatagta 108  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||   ||||||||||||||||||||    
T  1210663 agcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagactagacaggataggattaggaatgacaccattagagagagagtgggggtagcacctatagta 1210762  T
Q  109 gaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaatggagaagaaccagg 208  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||| |||  || |    
T  1210763 gaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacccgtagatgccgtggtaagaagagtagatcaaatggaggagagtcaag 1210862  T
Q  209 ttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaac 308  Q
    |||||||||||||||||||| ||| |||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||| | |||||||||    
T  1210863 ttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaac 1210962  T
Q  309 actatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 376  Q
    |||||| | ||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  1210963 actatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttgt 1211030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 11 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 30202494 - 30202127
Alignment:
Q  11 agcagagatgatgatgttgcgctggatgagtggtaagactagacatgataggattaagaatgacatcattagagagaa--tgggggtagcacctatagta 108  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||   ||||||||||||||||||||    
T  30202494 agcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagactagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgggggtagcacctatagta 30202395  T
Q  109 gaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaatggagaagaaccagg 208  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||  |||  || |    
T  30202394 gaaaggttggtagaaaataggcttagatggtttggtcatgtagagagaagacccgtagatgccgtggtaagaagagtagatcaaatggacgagagtcaag 30202295  T
Q  209 ttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaac 308  Q
    |||||||||||||||||||| ||| |||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||| | |||||||||    
T  30202294 ttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaac 30202195  T
Q  309 actatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 376  Q
    |||||| | ||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  30202194 actatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttgt 30202127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 11 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 34792713 - 34792347
Alignment:
Q  11 agcagagatgatgatgttgcgctggatgagtggtaagactagacatgataggattaagaatgacatcattagagagaa--tgggggtagcacctatagta 108  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||   ||||||||||||||||||||    
T  34792713 agcagagatgaggatgttgcgctggatgagtggtaagactagacatgataggattaggaatgaaaccattagagagagagtgggggtagcacctatagta 34792614  T
Q  109 gaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaatggagaagaaccagg 208  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||| |||  || |    
T  34792613 gaaaagttggtagaaagtaggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacccgtagatgccgtggtaagaagagtagatcaaatggaggagagtcaag 34792514  T
Q  209 ttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaac 308  Q
    |||||||||||||||||||| ||| |||||| ||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||    
T  34792513 ttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttaaaggtcaatgagttggatccaaatttggtttatgatagaac 34792414  T
Q  309 actatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttg 375  Q
    |||||| | ||||||||||||||||||||| || ||||| || ||||| ||||||||||||||||||    
T  34792413 actatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttaatgggataaggcttggttgttgttgttg 34792347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 218; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 11 - 376
Target Start/End: Original strand, 8671838 - 8672203
Alignment:
Q  11 agcagagatgatgatgttgcgctggatgagtggtaagactagacatgataggattaagaatgacatcattagagagaatgggggtagcacctatagtaga 110  Q
    ||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  8671838 agcagagataaggatgttgcgttggatgagtggtaagactagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagtgggggtagcacctatagtaga 8671937  T
Q  111 aaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaatggagaagaaccaggtt 210  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| ||| | ||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||| |||  || |||    
T  8671938 aaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagatccgtagatgccgtggtaagaagagtagatcaaatggaggagagtcaagtt 8672037  T
Q  211 aaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacac 310  Q
    |||||||||||||||||| ||| |||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||| | |||||||||||    
T  8672038 aaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacac 8672137  T
Q  311 tatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 376  Q
    |||  | ||||||||||||| ||||| | || |||||||  ||||| |||||||||||||||||||    
T  8672138 tatagcgtcatttgatccatatagccaaccccacttagtaggataaggcttggttgttgttgttgt 8672203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 11 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 49347757 - 49347393
Alignment:
Q  11 agcagagatgatgatgttgcgctggatgagtggtaagactagacatgataggattaagaatgacatcatt--agagagaatgggggtagcacctatagta 108  Q
    |||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||  ||||||| | ||||||||| ||||||||    
T  49347757 agcaaagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagactagacaggataggattaggaatgacaccattggagagagagtaggggtagcatctatagta 49347658  T
Q  109 gaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaatggagaagaaccagg 208  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| ||| | |||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||| |||  || |    
T  49347657 gaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttggtcatgcagagagaagacccgtagatgccgtggtaagaagagtagatcaaatggaggagagtcaag 49347558  T
Q  209 ttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaac 308  Q
    |||||||||||||||||||| ||| |||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||| | |||||||||    
T  49347557 ttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaac 49347458  T
Q  309 actatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgt 373  Q
    |||||| | ||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  49347457 actatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 49347393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 208; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 11 - 375
Target Start/End: Original strand, 9592652 - 9593018
Alignment:
Q  11 agcagagatgatgatgttgcgctggatgagtggtaagactagacatgataggattaagaatgacatcattagagagaa--tgggggtagcacctatagta 108  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||   ||||||||||||||||||||    
T  9592652 agcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagactagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgggggtagcacctatagta 9592751  T
Q  109 gaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaatggagaagaaccagg 208  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||||||  || | |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||| |||  || |    
T  9592752 gaaaagtttgtagaaaataggcttagatgggttgggcatgtagagagaagacccgtagatgccgtggtaagaagagtagatcaaatggaggagagtcaag 9592851  T
Q  209 ttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaac 308  Q
    |||||||||||||||||||| ||| |||| | ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||| |||| | |||||||||    
T  9592852 ttaaaagaggtagaggaagacctaggaaacctattagagaaaccattagaaatgatttagaggtcaatgagttagatttaaatttggtgtatgatagaac 9592951  T
Q  309 actatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttg 375  Q
    |||||  | ||||||||||||||||||||| || ||||| || ||||| ||||||||||||||||||    
T  9592952 actatagcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttaatgggataaggcttggttgttgttgttg 9593018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 11 - 376
Target Start/End: Original strand, 22090012 - 22090381
Alignment:
Q  11 agcagagatgatgatgttgcgctggatgagtggtaagactagacatgataggattaagaatgacatcattagagagaa----tgggggtagcacctatag 106  Q
    ||||||||||| |||| || | ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||     ||||||||||||||||||    
T  22090012 agcagagatgaggatgctgtgttggatgagtggtaagactagacaggataggattatgaatgacaccattagagagagagagtgggggtagcacctatag 22090111  T
Q  107 tagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaatggagaagaacca 206  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| ||| | ||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||| || ||||||||||||| |||  ||    
T  22090112 tagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagggagaagacccgtagatgccgtggtaagaaaagtagatcaaatggaggagagtca 22090211  T
Q  207 ggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgataga 306  Q
     |||||||| |||||||||||| ||| |||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||| | |||||||    
T  22090212 agttaaaaggggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgataga 22090311  T
Q  307 acactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 376  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||| |||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  22090312 acactatgacgtcatttgatccatgtagccgaccccactaagtgggataaggcttggttgttgttgttgt 22090381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 15 - 376
Target Start/End: Original strand, 15085856 - 15086207
Alignment:
Q  15 gagatgatgatgttgcgctggatgagtggtaagactagacatgataggattaagaatgacatcattagagagaa--tgggggtagcacctatagtagaaa 112  Q
    ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||| |||||||| |||||||||||   ||||||||||||||||||||||||    
T  15085856 gagatgaggatgttgcgctggacgagtggtaagactagataggataggattaggaatgacaccattagagagagagtgggggtagcacctatagtagaaa 15085955  T
Q  113 agttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaatggagaagaaccaggttaa 212  Q
    |||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||| |||  ||| ||||    
T  15085956 agttggtagaaaataggcttagatggtttggacatgtagagagaagacccgtagatgccgttgttagaagagtagatcaaatggaggagagtcagattaa 15086055  T
Q  213 aagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacacta 312  Q
    |||||||||||||||| ||||||            ||||||||||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  15086056 aagaggtagaggaagacctaaga------------aaaccattagataggatttagaggtcaatgagttggatccaaatatgatttttgatagaacacta 15086143  T
Q  313 tgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 376  Q
    |||| ||||||||||||||||||| | || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  15086144 tgacgtcatttgatccatgtagccaaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttgt 15086207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 18 - 376
Target Start/End: Original strand, 51601983 - 51602341
Alignment:
Q  18 atgatgatgttgcgctggatgagtggtaagactagacatgataggattaagaatgacatcattagagagaatgggggtagcacctatagtagaaaagttg 117  Q
    |||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||    
T  51601983 atgaggatgttgcgttagatgagtggtaagactagacatgatatgattaggaatgacaccattagagagagtgagggtagcacctatagtagaaaagttg 51602082  T
Q  118 gtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagag 217  Q
    ||||||||||| |||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||| ||||||||||||| |||  || ||||||||||    
T  51602083 gtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacccgtagatgtcgtggtaagaagagtagatcaaatggaggagagtcaagttaaaagag 51602182  T
Q  218 gtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgaca 317  Q
    ||||||||||| ||| |||||| ||| || ||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||| |||| | ||||||||||  ||| |     
T  51602183 gtagaggaagacctaggaaaactattagaaaaaccattagaagggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacatcatggcg 51602282  T
Q  318 tcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 376  Q
    ||||||||||||||||||| | || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  51602283 tcatttgatccatgtagccaaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttgt 51602341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 193; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 15 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 32083105 - 32082753
Alignment:
Q  15 gagatgatgatgttgcgctggatgagtggtaagactagacatgataggattaagaatgacatcattagagagaa--tgggggtagcacctatagtagaaa 112  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||| |||||||||||   ||||||||||||||||||||||||    
T  32083105 gagatgaggatgttgcgctggatgagtggtaagactagacagggtaggattaggaatgacaccattagagagagagtgggggtagcacctatagtagaaa 32083006  T
Q  113 agttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaatggagaagaaccaggttaa 212  Q
    |||||||||||||||| |||||||| ||| |||||| |||||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| |||  ||||||||    
T  32083005 agttggtagaaaataggcttagatggtttggacatgcagagaggagacccgtagatgccgttgtaagaagagtagatcaaatggaggagagtcaggttaa 32082906  T
Q  213 aagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacacta 312  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||            |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  32082905 aagaggtagaggaagacctaagaaaac------------cattagaaaagatttagaggtcaatgagttggattcaaatatggtttttgatagaacacta 32082818  T
Q  313 tgaca-tcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 376  Q
     | || ||||||||||||||||||||| || |||||||| || || |||| ||| ||||||||||    
T  32082817 cggcagtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggaaaaggcttagtttttgttgttgt 32082753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 11 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 51441129 - 51440764
Alignment:
Q  11 agcagagatgatgatgttgcgctggatgagtggtaagactagacatgataggattaagaatgacatcattagagagaa--tgggggtagcacctatagta 108  Q
    ||||||||||| ||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||   |||||||| |||||||||||    
T  51441129 agcagagatgaggatgttgcattggacgagtggtaagactagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgggggtaacacctatagta 51441030  T
Q  109 gaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaatggagaagaaccagg 208  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| ||| | ||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||| ||| ||||||||| |||  || |    
T  51441029 gaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacccggagatgccgtggtaagaagagtagagcaaatggaggagagtcaag 51440930  T
Q  209 ttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaac 308  Q
    ||||| |||||||||||||| ||| |||||| ||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||| |||| | |||||||||    
T  51440929 ttaaaggaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttataggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaac 51440830  T
Q  309 actatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgtt 374  Q
    |||| | | ||||||||| |||||| |||| || |||||||| |||||  ||||||||||||||||    
T  51440829 actacggcgtcatttgattcatgtaaccgaccccacttagtgggataagacttggttgttgttgtt 51440764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 182; E-Value: 3e-98
Query Start/End: Original strand, 15 - 349
Target Start/End: Original strand, 8391694 - 8392030
Alignment:
Q  15 gagatgatgatgttgcgctggatgagtggtaagactagacatgataggattaagaatgacatcattagagagaa--tgggggtagcacctatagtagaaa 112  Q
    ||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||| |||||||||||   ||||||||||||||||||||||||    
T  8391694 gagatgaagatgttgtgttggatgagtggtaagactacacaagataggattaggaatgacaccattagagagagagtgggggtagcacctatagtagaaa 8391793  T
Q  113 agttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaatggagaagaaccaggttaa 212  Q
    ||||||||||||||||  ||||||  ||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| || |||  || |||||    
T  8391794 agttggtagaaaataggtttagattgtttggacatgtagagaggagacccgtagatgccgttgtaagaagagtagatcaaatgaaggagagtcatgttaa 8391893  T
Q  213 aagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacacta 312  Q
    | |||||| | ||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  8391894 aggaggtatatgaagacctaagaaaaccattcgagaaatcattagaaaagatttagaggtcaataagttggatccaaatatgatttttgatagaatacta 8391993  T
Q  313 tgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagt 349  Q
    || | ||||||||||||||||||| | || |||||||    
T  8391994 tggcgtcatttgatccatgtagccaaccccacttagt 8392030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 169; E-Value: 2e-90
Query Start/End: Original strand, 11 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 43240745 - 43240380
Alignment:
Q  11 agcagagatgatgatgttgcgctggatgagtggtaagactagacatgataggattaagaatgacatcattagagagaa----tgggggtagcacctatag 106  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||     ||||||||||||||||||    
T  43240745 agcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagactagacatgataggattatgaatgacgccattagagagagagagtgggggtagcacctatag 43240646  T
Q  107 tagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaatggagaagaacca 206  Q
    ||||||| ||| |||||||||| |||||||  |||   ||||||||||||||||||||||||   || |||||||||| ||||||||||||| |||   |    
T  43240645 tagaaaaattgatagaaaataggcttagatagtttgagcatgtagagagaagacccgtagatgttgtggtaagaagagtagatcaaatggaggagagtta 43240546  T
Q  207 ggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgataga 306  Q
     ||||||| ||||||||||||| ||| |||||| ||| |||||||||||||||| |||||| | ||||||||||| ||||||||| |||| | |||||||    
T  43240545 agttaaaaaaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaatgatttatatgtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgataga 43240446  T
Q  307 acactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttg 372  Q
    |||||||| | ||||||||| ||||||||||| |  |||||||| ||||| |||| ||||||||||    
T  43240445 acactatggcgtcatttgattcatgtagccgacctcacttagtgggataaggcttagttgttgttg 43240380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 168; E-Value: 8e-90
Query Start/End: Original strand, 14 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 32231315 - 32230997
Alignment:
Q  14 agagatgatgatgttgcgctggatgagtggtaagactagacatgataggattaagaatgacatcattagagagaa--tgggggtagcacctatagtagaa 111  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||   |||||||||||||||||||||||    
T  32231315 agagatgaggatgttgcgctagatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgggggtagcacctatagtagaa 32231216  T
Q  112 aagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaatggagaagaaccaggtta 211  Q
    || |||||||||||||| |||||||| ||| | ||||||||||||||||  |||||| ||||  ||||||||| ||||||||||||| |||  || ||||    
T  32231215 aaattggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacttgtagatgccgtcataagaagagtagatcaaatggaggagagtcaagtta 32231116  T
Q  212 aaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacact 311  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||  |||| | ||||||||||||    
T  32231115 aaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaagttggtctatgatagaacact 32231016  T
Q  312 atgacatcatttgatccat 330  Q
    |||   | |||||||||||    
T  32231015 atggtgtaatttgatccat 32230997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 168; E-Value: 8e-90
Query Start/End: Original strand, 81 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 38807963 - 38807668
Alignment:
Q  81 agagagaatgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaaga 180  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||| ||||| |||| ||||||    
T  38807963 agagagaatgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatggtttaggcatgtaaagagaagacccttagatgccgtcgtaaga 38807864  T
Q  181 agagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagt 280  Q
    |||| ||| || |||||| |||  ||| | ||||||| ||| |||||| |||||||||| ||  |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  38807863 agagtagaccagatggaggagagtcagatcaaaagagctaggggaagacctaagaaaactataagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaacgagt 38807764  T
Q  281 tagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 376  Q
    | |||||||||||||||| ||||||||||||||| | | ||||| ||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  38807763 tggatccaaatatggtttatgatagaacactatggcgtaatttgttccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttgt 38807668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 160; E-Value: 5e-85
Query Start/End: Original strand, 81 - 376
Target Start/End: Original strand, 4029112 - 4029407
Alignment:
Q  81 agagagaatgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaaga 180  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  4029112 agagagagtgggggtagcacctagagtagacaagttggtagaaaataggcttagaaggtttggacatgtagagagaagacccgtagatgccgtggtaaga 4029211  T
Q  181 agagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagt 280  Q
    |||  ||||||||||||| |||  || ||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  4029212 agaatagatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttaaaggtcaatgagt 4029311  T
Q  281 tagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 376  Q
    | ||||||||| |||| | ||||| ||||||||| |  |||||||||||||||||||| || |||||||| |||||  ||||||||||||||||||    
T  4029312 tggatccaaatttggtgtatgatataacactatggcgacatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataagacttggttgttgttgttgt 4029407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 160; E-Value: 5e-85
Query Start/End: Original strand, 109 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 25979495 - 25979228
Alignment:
Q  109 gaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaatggagaagaaccagg 208  Q
    |||||||| ||||||| ||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||||| |||| ||||| ||||||| |||  ||||    
T  25979495 gaaaagttagtagaaactaggcttagatggtttggacatgtagagagaagacccgtagatgctgttgtaaggagagtagatcgaatggaggagagtcagg 25979396  T
Q  209 ttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaac 308  Q
    |||||||||||||||||||| | | |||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  25979395 ttaaaagaggtagaggaagacccatgaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttatgatagaac 25979296  T
Q  309 actatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 376  Q
    |||||| | ||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  25979295 actatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttgt 25979228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 144; E-Value: 2e-75
Query Start/End: Original strand, 173 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 37311955 - 37311752
Alignment:
Q  173 ttgtaagaagagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggt 272  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37311955 ttgtaagaagagtagatcaaatggaggagagtcaggttaaaagaggtagaggtagacctaggaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggt 37311856  T
Q  273 caatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttg 372  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| || |||||||| || || |||||||||||||||    
T  37311855 caatgagttggatccaaatatggtttttgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggaaaaggcttggttgttgttg 37311756  T
Q  373 ttgt 376  Q
    ||||    
T  37311755 ttgt 37311752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 108; E-Value: 5e-54
Query Start/End: Original strand, 206 - 373
Target Start/End: Original strand, 52921195 - 52921362
Alignment:
Q  206 aggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatag 305  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||    
T  52921195 aggttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgaattggatccaaatatggtttatgatag 52921294  T
Q  306 aacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgt 373  Q
    ||||||||  | ||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  52921295 aacactattgcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 52921362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 154 - 376
Target Start/End: Original strand, 39318193 - 39318413
Alignment:
Q  154 agaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaacca 253  Q
    ||||||||||||||| | || |||||||||| |||||| |||||| |||  | ||| |||||||||||||||||| ||| |||||| ||  |||||||||    
T  39318193 agaagacccgtagatgc-gtcgtaagaagagcagatcagatggaggagagtcgggtcaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactataagagaaacca 39318291  T
Q  254 ttagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtga 353  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||| ||  ||||||| ||    
T  39318292 ttagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttatgatagaacactatggcgtaatttgatccatgtagccga-cccgcttagtggga 39318390  T
Q  354 taatgcttggttgttgttgttgt 376  Q
    ||| ||||| |||||||||||||    
T  39318391 taaggcttgtttgttgttgttgt 39318413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 15 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 37463231 - 37462878
Alignment:
Q  15 gagatgatgatgttgcgctggatgagtggtaagactagacatgataggattaagaatgacatcattagagagaatgggggtagcacctatagtagaaaag 114  Q
    ||||||| |||||| |  ||||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  37463231 gagatgaggatgtttcattggatgagtggtaagactagacaggttaggattaggaatgacaccattagagagagttggggtagcacctatagtagaaaag 37463132  T
Q  115 ttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaatggagaagaaccaggt-taaa 213  Q
       ||||||||||| ||||| || ||| | |   || |||| ||||  |||||| |||| ||| |||||| |||||| |||||| |||  | | |  |||    
T  37463131 acagtagaaaataggcttaggtggtttgggc---tatagagtagacatgtagatgccgtagtacgaagagtagatcagatggaggagagtcggatcaaaa 37463035  T
Q  214 agaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactat 313  Q
    ||||||||||||  | |||  ||||| ||  ||||||| || || || ||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||| | |||||||| |||    
T  37463034 agaggtagaggattacctagaaaaactataagagaaacgatcaggaatgatttagaggttaatgagtttgat-caaatatggtttatcatagaacattat 37462936  T
Q  314 gacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgtt 371  Q
    | | | ||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  37462935 ggcgtaatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgtt 37462878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 91; E-Value: 7e-44
Query Start/End: Original strand, 11 - 338
Target Start/End: Original strand, 9509236 - 9509565
Alignment:
Q  11 agcagagatgatgatgttgcgctggatgagtggtaagactagacatgataggattaagaatgacatcatt--agagagaatgggggtagcacctatagta 108  Q
    ||||||||||| ||||||| | |||||||||| |||||||||||| |||| |||||  ||||||| ||||  ||||||| | ||||||||||||||||||    
T  9509236 agcagagatgaggatgttgtgttggatgagtgataagactagacaggatatgattagaaatgacaccattagagagagagttggggtagcacctatagta 9509335  T
Q  109 gaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaatggagaagaaccagg 208  Q
    |||||| ||||| ||||||| ||||| |  ||| | ||||||||||||||||| ||| || |  | |||   |||| |||||| |||||| |||  ||      
T  9509336 gaaaagatggtaaaaaataggcttaggtagtttgggcatgtagagagaagaccggtatatgctttagtacttagagtagatcagatggaggagagtcata 9509435  T
Q  209 ttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaac 308  Q
    ||| |||||||||||||||| |||  ||||| ||  || |||| ||||| ||||||||| ||   ||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||    
T  9509436 ttagaagaggtagaggaagacctagaaaaactataagataaactattaggaaagatttacagcctaatgagttagagccaaatatggtttatgattgaac 9509535  T
Q  309 actatgacatcatttgatccatgtagccga 338  Q
    | |||| | | ||| |||||||||||||||    
T  9509536 attatggcgtaattcgatccatgtagccga 9509565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 211 - 375
Target Start/End: Original strand, 4415469 - 4415633
Alignment:
Q  211 aaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacac 310  Q
    |||| ||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||| ||||||||     
T  4415469 aaaaaaggtagaggaaaacctaagaaaaccattcgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttggatctaaatatgattttttatagaacat 4415568  T
Q  311 tatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttg 375  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||  | | ||||||  | ||  |||||||||||||||||    
T  4415569 tatggcatcatttgatccatgtagccgactccatttagtggaaaaagacttggttgttgttgttg 4415633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 15 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 18469440 - 18469082
Alignment:
Q  15 gagatgatgatgttgcgctggatgagtggtaagactagacatgataggattaagaatgacatcattagagagaatgggggtagcacctatagtagaaaag 114  Q
    ||||||| |||| |||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||  |||||||||| | |||||| ||||||||||||| |||    
T  18469440 gagatgacgatgctgcgttgtatgagtggtaagactagacatgatatgattaggaatgacacaattagagagagttggggtaacacctatagtagagaag 18469341  T
Q  115 ttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaa 214  Q
     || ||||||||||  |||| |  ||| ||||| ||| ||||||||  ||||||   || ||| |||||| | |||| ||||||||||  | | | ||||    
T  18469340 atgatagaaaataggattaggtagtttggacatatagtgagaagactggtagatgttgtagtacgaagagtaaatcagatggagaagagtcggatcaaaa 18469241  T
Q  215 gaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatg 314  Q
    |||||||| |||||  ||  ||||  ||  |||||||  |||| ||| ||| ||||||||||||||| ||| ||||||| |||| |||| ||||| ||||    
T  18469240 gaggtagatgaagacttagaaaaattataagagaaacttttaggaaatattaagaggtcaatgagttggatacaaatatagtttatgatcgaacattatg 18469141  T
Q  315 acatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgt 373  Q
       | ||||| | ||||||| ||| || |||||||| |||||||||| | |||||||||    
T  18469140 gtgtaatttggttcatgtagacgaccccacttagtgggataatgctttgatgttgttgt 18469082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 11 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 9599758 - 9599432
Alignment:
Q  11 agcagagatgatgatgttgcgctggatgagtggtaagactagacatgataggattaagaatgacatcattaga--gagaatgggggtagcacctatagta 108  Q
    ||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||  |||| ||||| ||||||||||||||||  |||| | || ||| |||||||||||    
T  9599758 agcagagatgaggatgttgtgttggatgagtggtaagactagacgggatatgattaggaatgacatcattagagagagagttggagtaacacctatagta 9599659  T
Q  109 gaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaatggagaagaaccagg 208  Q
    |||||| ||||||||||||| ||||| || ||  | ||| || | ||| |||| | ||||    | |||  ||||| |||||| |||||| |||  |||     
T  9599658 gaaaagatggtagaaaataggcttaggtggttcgggcatataaatagatgacctgcagatgttatagtacaaagagtagatcagatggaggagagtcaga 9599559  T
Q  209 ttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaac 308  Q
    | | |||||||||||||||| |||  ||||| |   ||||||| ||||| ||| |||||||| | |||||||| |||||| ||||||||| |||||||||    
T  9599558 tcataagaggtagaggaagacctagaaaaactacaagagaaactattaggaaatatttagagtttaatgagtttgatccagatatggtttatgatagaac 9599459  T
Q  309 actatgacatcatttgatccatgtagc 335  Q
      |||| | | ||||||||||||||||    
T  9599458 gttatggcgtaatttgatccatgtagc 9599432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 41 - 370
Target Start/End: Original strand, 39140468 - 39140794
Alignment:
Q  41 tggtaagactagacatgataggattaagaatgacatcatta--gagagaatgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatga 138  Q
    |||||||||||||   |||||||||| |||||| | |||||  |||||| | || ||||||||||||||||||||| ||| | ||||| | ||||| ||     
T  39140468 tggtaagactagatgagataggattaggaatgaaaccattacagagagagttggcgtagcacctatagtagaaaagatggcaaaaaattggcttaggtgg 39140567  T
Q  139 tttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaa 238  Q
    ||| | |||||||||||||||||  || ||   || ||| |||||| |||||| |||||  |||  ||| ||| ||||||||||||||   |||| |||     
T  39140568 tttgggcatgtagagagaagaccgatacatgttgtagtacgaagagtagatcagatggatgagagtcagattagaagaggtagaggaa---ctaaaaaag 39140664  T
Q  239 ccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccga 338  Q
      ||  ||||||| ||||| ||| |||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||  ||||||||| |||| | | ||||||| |||||||||||    
T  39140665 ttat--gagaaactattaggaaaaatttagaggttaattagttggatccaaatatggtttcagatagaacattatggcgtaatttgattcatgtagccga 39140762  T
Q  339 tccaacttagtgtgataatgcttggttgttgt 370  Q
     || |||||||| |||||||||||||||||||    
T  39140763 ccccacttagtgggataatgcttggttgttgt 39140794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 76; E-Value: 6e-35
Query Start/End: Original strand, 92 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 32404807 - 32404525
Alignment:
Q  92 gggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatca 191  Q
    ||||| ||||||||||| ||||| |||| |||||||| ||||| || ||| || |||||||||||||||| |||||| |  | ||||| |||| |||  |    
T  32404807 gggtaacacctatagtaaaaaagatggtggaaaataggcttaggtggtttggatatgtagagagaagacctgtagattctatagtaaggagagtagagaa 32404708  T
Q  192 aatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaat 291  Q
     |||||| | |  ||  | | |||||||||||||||| |||  ||||| ||  ||||||| ||||| |||||||||||| | ||||||||| |||||||     
T  32404707 gatggaggatagtcatatcacaagaggtagaggaagacctacaaaaactataagagaaactattaggaaagatttagagattaatgagttaaatccaaac 32404608  T
Q  292 atggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttg 375  Q
    ||||||| ||||| ||||  ||| | | ||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| || |||||||||||||||    
T  32404607 atggtttatgatataacataatggcgtaatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggc-tggttgttgttgttg 32404525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 121 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 52561841 - 52561590
Alignment:
Q  121 gaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggta 220  Q
    |||||||| ||||| || ||| | |||||||||||||||||  |||||   |  ||| |||||| |||||| |||||| |||   || ||| ||||||||    
T  52561841 gaaaataggcttaggtggtttcggcatgtagagagaagaccgatagatgttgcagtacgaagagtagatcagatggaggagagttagattagaagaggta 52561742  T
Q  221 gaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatca 320  Q
    ||||||||  ||  ||||| ||  |||||||  |||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||  | ||||||| |||| |   |    
T  52561741 gaggaagacttagaaaaactataagagaaactgttaggaaagatttagaggttaatgagttggatccaaatatggtttcgggtagaacattatggcgaaa 52561642  T
Q  321 tttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttg 372  Q
    |||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  52561641 tttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttg 52561590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 69; E-Value: 9e-31
Query Start/End: Original strand, 255 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 46423331 - 46423216
Alignment:
Q  255 tagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgat 354  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||   ||| | ||||||||||||||||||||| || |||||||| |||    
T  46423331 tagaaaagatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttttgattgaac---atggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggat 46423235  T
Q  355 aatgcttggttgttgttgt 373  Q
    || ||| ||||||||||||    
T  46423234 aaggctcggttgttgttgt 46423216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 245 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 32079303 - 32079176
Alignment:
Q  245 gagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaac 344  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||  || | |||||||||| |||||||||| || ||    
T  32079303 gagaaaccatcagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatctggtttatgatagaacac--tggcgtcatttgatcgatgtagccgaccccac 32079206  T
Q  345 ttagtgtgataatgcttggttgttgttgtt 374  Q
    || ||| ||||| |||||||||||||||||    
T  32079205 ttggtgggataaggcttggttgttgttgtt 32079176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 66; E-Value: 6e-29
Query Start/End: Original strand, 255 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 4707338 - 4707218
Alignment:
Q  255 tagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgat 354  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||| | | ||||||| ||||||||||| || |||||||| |||    
T  4707338 tagaaaggatttagaggttaatgagttggatccaaatttggtttatgatagaacactatggcgtaatttgat-catgtagccgaccccacttagtgggat 4707240  T
Q  355 aatgcttggttgttgttgttgt 376  Q
    || |||||||||||||||||||    
T  4707239 aaggcttggttgttgttgttgt 4707218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 81 - 373
Target Start/End: Original strand, 2544589 - 2544875
Alignment:
Q  81 agagagaatgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaaga 180  Q
    ||||||| | |||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||| || ||| |||||||||||||||||||  ||||| |  | |||||     
T  2544589 agagagagttggggtagcacctatagtagaaaagatggtggaaaacagacttaggtggtttggacatgtagagagaagacctatagattctatagtaagg 2544688  T
Q  181 agagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagt 280  Q
    |||| |||||| |||||| | |  ||    |  ||||||||||||||| |||  ||||| ||  ||||||| ||     ||||||| ||  |||||||||    
T  2544689 agagtagatcagatggaggatagtca-aacactagaggtagaggaagacctagaaaaactatcagagaaactat-----aagatttggaaatcaatgagt 2544782  T
Q  281 tagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgt 373  Q
    | || | ||||||||||| | |||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||| || ||||||||  | || ||||||||||||||||    
T  2544783 tggagcgaaatatggtttataatagaacattatggcataatttgatccatgtagccgaccccacttagtggtaaaaggcttggttgttgttgt 2544875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 64; E-Value: 9e-28
Query Start/End: Original strand, 253 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 10200426 - 10200303
Alignment:
Q  253 attagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtg 352  Q
    |||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||  |||   | ||||||||||||||||||| |  ||||| || |    
T  10200426 attagaaaagatttagagatcgatgagttggatccaaatatggtttatgatagaacatcatggtgtaatttgatccatgtagccgacctcacttaatggg 10200327  T
Q  353 ataatgcttggttgttgttgttgt 376  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  10200326 ataatgcttggttgttgttgttgt 10200303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 64; E-Value: 9e-28
Query Start/End: Original strand, 24 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 27848155 - 27847797
Alignment:
Q  24 atgttgcgctggatgagtggtaagactagacatgataggattaagaatgacatcattagagagaatg--ggggtagcacctatagtagaaaagttggtag 121  Q
    |||||| | ||||||||||||||||||||||  |||||||| | |||| ||| |||||||||||  |  | |||||||||| | ||||||||| ||||||    
T  27848155 atgttgtgttggatgagtggtaagactagacgggataggat-aggaataacaccattagagagagagttgtggtagcacctgtggtagaaaagatggtag 27848057  T
Q  122 aaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtag 221  Q
    ||||||  ||||| || ||| | |||| |||||||||||| |||||| | || ||| |||||| | |||| |||||| |||  ||| | | |||||||||    
T  27848056 aaaataagcttaggtggtttgggcatgcagagagaagacctgtagatgctgtagtatgaagagtatatcagatggaggagagtcagctcagaagaggtag 27847957  T
Q  222 aggaagaactaag-aaaaccatttgagaaaccattagaaa----agatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgac 316  Q
    ||||||| ||  | ||||  ||  ||||||| | ||  ||    |||||||||||| |||||||| | |  ||||||||||| |||| ||||| |||| |    
T  27847956 aggaagacctttgaaaaattataagagaaactactaccaaagatagatttagaggttaatgagtttggttgaaatatggtttatgatggaacattatgcc 27847857  T
Q  317 atcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 376  Q
     | |||| ||||||||||||||||  |||||||| ||||| |||||||  ||||||||||    
T  27847856 gtaattttatccatgtagccgatctcacttagtgggataaggcttggtcattgttgttgt 27847797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 64; E-Value: 9e-28
Query Start/End: Original strand, 245 - 376
Target Start/End: Original strand, 41560383 - 41560514
Alignment:
Q  245 gagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaac 344  Q
    ||||||| ||||| | | |||||||| | |||||||| ||||||||||||| || |||||||||| |||| | | ||||||||||||||||||| || ||    
T  41560383 gagaaactattaggatacatttagagattaatgagttggatccaaatatgggttatgatagaacattatggcgtaatttgatccatgtagccgaccccac 41560482  T
Q  345 ttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 376  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  41560483 ttagtgggataaggcttggttgttgttgttgt 41560514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 263 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 24020377 - 24020264
Alignment:
Q  263 atttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttg 362  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| || ||| ||||||||||||||| | |||||||||||||| |||| | || |||| ||| ||||| |||||    
T  24020377 atttagaggtcaatgagttggatccaaatttgatttatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgcagccaaccccactttgtgggataaggcttg 24020278  T
Q  363 gttgttgttgttgt 376  Q
    ||||||||||||||    
T  24020277 gttgttgttgttgt 24020264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 259 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 43375712 - 43375596
Alignment:
Q  259 aaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatg 358  Q
    |||||||||||| | |||||||| || | ||||||||||  |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||| |    
T  43375712 aaagatttagagattaatgagttggaccgaaatatggttcatgatagaacattatgacataatttgatccatgtagccaatcccacttagtgggataaag 43375613  T
Q  359 cttggttgttgttgttg 375  Q
     ||||||||||||||||    
T  43375612 attggttgttgttgttg 43375596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 59; E-Value: 9e-25
Query Start/End: Original strand, 91 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 48431688 - 48431396
Alignment:
Q  91 ggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatc 190  Q
    |||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||| ||||| || ||| | ||||||||||||||||  ||||||   || ||||  ||||  ||||    
T  48431688 ggggtagcccctatagtagaaaagatggtggaaaataggcttaggtggtttgggcatgtagagagaagacttgtagattttgtagtaaagagagttgatc 48431589  T
Q  191 aaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtc-------aatgagttag 283  Q
    | |||||| | |  | | ||| |||||||||||||||| | || ||||| ||  ||||||| ||||  |||||||||||| |        |||||||| |    
T  48431588 agatggaggatagtcggattacaagaggtagaggaagacccaaaaaaactataagagaaactattaagaaagatttagagatttatgaataatgagttgg 48431489  T
Q  284 atccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 376  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||  ||| | | ||||||||| |||||| || || |||||||  ||||| |||||||||||||||||||    
T  48431488 atccaaatatggtttgtgataaaacatcatggcttaatttgatccttgtagctgaccccacttagtaggataaggcttggttgttgttgttgt 48431396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 284 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 44941865 - 44941774
Alignment:
Q  284 atccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttg 375  Q
    |||||||| |||||| ||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  44941865 atccaaatttggtttatgatagaacactatggcgtaatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 44941774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 305 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 3777328 - 3777258
Alignment:
Q  305 gaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttg 375  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  3777328 gaacactatgacgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtaggataatgcttggttgttgttgttg 3777258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 283 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 21769801 - 21769711
Alignment:
Q  283 gatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgt 373  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||| |||| | | ||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  21769801 gatctaaatatggtttgtgatagaacattatggcgtaatttgatccatgtagccgaccccacttagtgtgataaggcttggttgttgttgt 21769711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 54; E-Value: 8e-22
Query Start/End: Original strand, 245 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 16142108 - 16142019
Alignment:
Q  245 gagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtag 334  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||| |||||||| |||| ||||| |||||| | |||||||||||||||    
T  16142108 gagaaaccattagaaaagatttagagtttaataagttagatccaattatggtttatgatcgaacaatatgacgtaatttgatccatgtag 16142019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 54; E-Value: 8e-22
Query Start/End: Original strand, 283 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 28090784 - 28090691
Alignment:
Q  283 gatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 376  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| |||| | | ||||||||||||||||||| || |||||||| |||||  ||||||||||||||||||    
T  28090784 gatccaaatatggtttatgatagaacattatggcgtaatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataagacttggttgttgttgttgt 28090691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 54; E-Value: 8e-22
Query Start/End: Original strand, 284 - 373
Target Start/End: Original strand, 42337749 - 42337838
Alignment:
Q  284 atccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgt 373  Q
    |||||||| |||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | || |||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  42337749 atccaaatttggtgtatgatagaacactatggcatcatttgatccatgtagccaaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 42337838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 248 - 376
Target Start/End: Original strand, 19936617 - 19936745
Alignment:
Q  248 aaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaactta 347  Q
    |||| ||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||  |||||||||| || | | | |||||||||||||||||||  |  ||||    
T  19936617 aaactattaggaaagatttagatgttaatgagttagatccaaatatggttaatgatagaacattacggcgtaatttgatccatgtagccgactccgctta 19936716  T
Q  348 gtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 376  Q
    ||| |||||  |||| |||||||||||||    
T  19936717 gtgggataagacttgattgttgttgttgt 19936745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 284 - 376
Target Start/End: Original strand, 44751677 - 44751769
Alignment:
Q  284 atccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 376  Q
    |||||||| |||| | ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |  |||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  44751677 atccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgacctcacttagtgggataaggcttggttgttgttgttgt 44751769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #49
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 300 - 375
Target Start/End: Original strand, 29577461 - 29577536
Alignment:
Q  300 tgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttg 375  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  29577461 tgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 29577536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #50
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 245 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 52532744 - 52532614
Alignment:
Q  245 gagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaac 344  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||  | |||||||| || | ||||||||||| |||||||||| |||| | | ||||||| ||||||||||| || ||    
T  52532744 gagaaactattaggaaagatttagaaattaatgagttggaacaaaatatggtttatgatagaacattatggcgtaatttgattcatgtagccgaccccac 52532645  T
Q  345 ttagtgtgataatgcttggttgttgttgttg 375  Q
    |||||| || || ||||||||||||| ||||    
T  52532644 ttagtgggaaaaggcttggttgttgtggttg 52532614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #51
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 258 - 375
Target Start/End: Original strand, 6025772 - 6025889
Alignment:
Q  258 aaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataat 357  Q
    ||||||| ||||| | |||||||| |||  ||||||||| | ||||||||||  ||| | |||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||    
T  6025772 aaaagatctagagattaatgagttggatagaaatatggtatctgatagaacatgatggcgtcatttgatccatgtagccgattccacttagtgggataat 6025871  T
Q  358 gcttggttgttgttgttg 375  Q
     |||||||||| ||||||    
T  6025872 acttggttgtttttgttg 6025889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #52
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 18 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 18793345 - 18793201
Alignment:
Q  18 atgatgatgttgcgctggatgagtggtaagactagacatgataggattaagaatgacatcattagagagaatg--ggggtagcacctatagtagaaaagt 115  Q
    |||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||| ||||| | ||| ||||||  ||||| |||||  |  ||||||| || ||| |||||||||     
T  18793345 atgatgatgttgcgttggatgtgtggaaagactagacaggatagaactaaaaatgacgacattaaagagagggttggggtaggacttattgtagaaaaga 18793246  T
Q  116 tggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagac 160  Q
    ||||||||| ||||||||| |||||| | |||| |||||||||||    
T  18793245 tggtagaaactagacttagttgattttggcatgcagagagaagac 18793201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #53
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 300 - 373
Target Start/End: Original strand, 28533676 - 28533749
Alignment:
Q  300 tgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgt 373  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||  |||||||||||||||    
T  28533676 tgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataagacttggttgttgttgt 28533749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #54
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 272 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 40568511 - 40568410
Alignment:
Q  272 tcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgtt 371  Q
    |||||||||| || | ||||||||||| |||||||| |||||| | | ||||||||||||||||| | || |||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  40568511 tcaatgagttggaccaaaatatggtttatgatagaaaactatggcgtaatttgatccatgtagccaaccccacttagtgggataaggcttggttgttgtt 40568412  T
Q  372 gt 373  Q
    ||    
T  40568411 gt 40568410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #55
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 245 - 372
Target Start/End: Original strand, 29128937 - 29129065
Alignment:
Q  245 gagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgat-ccatgtagccgatccaa 343  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||||| ||  |||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||   | || |||| |||||||||||| || |    
T  29128937 gagaaactattaggaaagatttagaggttaacaagttggatccaaatatggtttatgatagaacattatggtgtaatatgatcccatgtagccgacccca 29129036  T
Q  344 cttagtgtgataatgcttggttgttgttg 372  Q
    ||||||| ||||| |||||||| ||||||    
T  29129037 cttagtgagataaggcttggtttttgttg 29129065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #56
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 288 - 374
Target Start/End: Original strand, 8796406 - 8796492
Alignment:
Q  288 aaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgtt 374  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||| | | |||| |||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  8796406 aaatatggtttatgatagaacattatggcgtaatttaatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgtt 8796492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #57
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 274 - 376
Target Start/End: Original strand, 34444539 - 34444641
Alignment:
Q  274 aatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgt 373  Q
    |||||||| |||||||||||||||| | ||| |||| ||||   | |||||||| |||||||||| || |||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  34444539 aatgagttggatccaaatatggtttataataaaacattatggtgtaatttgatctatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 34444638  T
Q  374 tgt 376  Q
    |||    
T  34444639 tgt 34444641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #58
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 295 - 376
Target Start/End: Original strand, 51584948 - 51585029
Alignment:
Q  295 gtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 376  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||| || || |||||||  ||||| |||||||||||||||||||    
T  51584948 gtttttgatagaacactatgacattgtttgattcatgtagcagaccccacttagtaggataaggcttggttgttgttgttgt 51585029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #59
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 81 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 36340095 - 36339804
Alignment:
Q  81 agagagaatgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaaga 180  Q
    ||||||| | || |||||||||||| |||||||| |||| ||||||||  |||| || |||||||||| ||||||||||||  |||||   || |||||     
T  36340095 agagagagttggtgtagcacctatattagaaaagatggtggaaaataggtttaggtggtttagacatggagagagaagacctatagattttgtagtaagg 36339996  T
Q  181 agagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagt 280  Q
     | |  ||||| |||||| | | | || | |  ||||||||||||||| |||  ||||| ||  ||||||| ||||| |||||||| ||  | |||||||    
T  36339995 cgggttgatcagatggaggatacctagatcactagaggtagaggaagacctagaaaaactatcagagaaactattaggaaagattt-gaaattaatgagt 36339897  T
Q  281 tagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgt 373  Q
    | ||   ||| ||||||  ||||| |||| |||||  | |||||||||||||||| ||  | |||||||| || |||||||||||||||||||    
T  36339896 tggacagaaacatggttaatgataaaacattatgaagtaatttgatccatgtagctgactccacttagtgggaaaatgcttggttgttgttgt 36339804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #60
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 245 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 3818984 - 3818853
Alignment:
Q  245 gagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaac 344  Q
    ||||||| ||||  |||||||||||| | ||||||||  ||  ||||||||||| |||| ||||| |||| |  ||||||||||||||||||||    ||    
T  3818984 gagaaactattaagaaagatttagagattaatgagttgaatagaaatatggtttatgatggaacattatgtcgccatttgatccatgtagccgactgcac 3818885  T
Q  345 ttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 376  Q
    |||||| ||||| ||||||| |||||||||||    
T  3818884 ttagtgggataaggcttggtcgttgttgttgt 3818853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #61
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 23 - 160
Target Start/End: Original strand, 43423647 - 43423788
Alignment:
Q  23 gatgttgcgctggatgagtggt--aagactagacatgataggattaagaatgacatcattagagagaatg--ggggtagcacctatagtagaaaagttgg 118  Q
    ||||||||| |||||| ||||   ||||||||||| ||||||||||  ||||||  |||||||||||  |  |||||| ||||||||||||||||| |||    
T  43423647 gatgttgcgttggatgtgtgggggaagactagacaggataggattagaaatgaccacattagagagagagttggggtaacacctatagtagaaaagatgg 43423746  T
Q  119 tagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagac 160  Q
    | |||| ||| ||||| || ||| | ||||||||||||||||    
T  43423747 tggaaactaggcttaggtggtttggccatgtagagagaagac 43423788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #62
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 288 - 375
Target Start/End: Original strand, 50846759 - 50846846
Alignment:
Q  288 aaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttg 375  Q
    |||||| |||| |||||||||| |||| ||| |||||||| ||||||||||  | |||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  50846759 aaatatagtttatgatagaacattatggcataatttgatctatgtagccgacaccacttagtgggaaaatgcttggttgttgttgttg 50846846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #63
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 274 - 376
Target Start/End: Original strand, 6084158 - 6084260
Alignment:
Q  274 aatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgt 373  Q
    |||||||| |||| ||||||||||| |||||||||| |||| | | ||||||||||||||   ||||  |||||||| ||||| ||||||||||| ||||    
T  6084158 aatgagttggatcaaaatatggtttatgatagaacaatatggcgtaatttgatccatgtatttgatctcacttagtgggataaggcttggttgttattgt 6084257  T
Q  374 tgt 376  Q
    |||    
T  6084258 tgt 6084260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #64
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 33 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 14226169 - 14226047
Alignment:
Q  33 tggatgagtggtaagactagacatgataggattaagaatgacatcattagagagaatgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagactt 132  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||||||||||  |||| || |||| |||||| | |  |||||||||||  |||||||| |||| |||||||| |||    
T  14226169 tggatgtgtggtaaggctagacatgataggattagaaatggcaacattggagagagttgcagtagcacctatcatagaaaagatggtggaaaataggctt 14226070  T
Q  133 agatgatttagacatgtagagag 155  Q
    || || ||| | |||||||||||    
T  14226069 aggtggtttgggcatgtagagag 14226047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #65
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 287 - 372
Target Start/End: Original strand, 22175341 - 22175426
Alignment:
Q  287 caaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttg 372  Q
    |||||||||||| |||||||||| ||||  |  ||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| ||||||||| |||||    
T  22175341 caaatatggtttatgatagaacattatggtagaatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttggtgttg 22175426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #66
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 288 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 25715411 - 25715326
Alignment:
Q  288 aaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgt 373  Q
    ||||||||||| |||||||| | |||| | | ||||||||||||||||||| |  |||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  25715411 aaatatggtttatgatagaatattatggcgtaatttgatccatgtagccgacctcacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 25715326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #67
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 275 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 31274499 - 31274398
Alignment:
Q  275 atgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgtt 374  Q
    |||||||||||  ||||||||||| ||||| |||  |||| | | ||||||||  |||||| || || |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  31274499 atgagttagattgaaatatggtttatgatataacgttatggcgtaatttgatctgtgtagctgaccccacttagtgggataatgcttggttgttgttgtt 31274400  T
Q  375 gt 376  Q
    ||    
T  31274399 gt 31274398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #68
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 245 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 36624012 - 36623884
Alignment:
Q  245 gagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaac 344  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||  ||| ||||| |||| | |    |||||||||||| ||| || ||    
T  36624012 gagaaactattagaaaagatttagaggctaatgagttggatccaaatatggtttaggatcgaacattatggc-tgtaatgatccatgtagtcgaccctac 36623914  T
Q  345 ttagtgtgataatgcttggttgttgttgtt 374  Q
    |||||| ||||| |||| ||||| ||||||    
T  36623913 ttagtgggataaggctttgttgtcgttgtt 36623884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #69
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 290 - 375
Target Start/End: Original strand, 38869081 - 38869166
Alignment:
Q  290 atatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttg 375  Q
    ||||||| | |||||||||| |||| | || |||||||||||||||||| || |||||||| || |||||||||||| ||||||||    
T  38869081 atatggtatatgatagaacattatggcgtcgtttgatccatgtagccgaccccacttagtgggaaaatgcttggttgctgttgttg 38869166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #70
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 36 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 52561950 - 52561850
Alignment:
Q  36 atgagtggtaagactagacatgataggattaagaatgacatcattaga--gagaatgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagactta 133  Q
    |||||||||||||||||||  |||| ||||| |||||||| |||||||  |||| | |||||||||||| ||||||||| | || |||||||||| ||||    
T  52561950 atgagtggtaagactagacgggatatgattaggaatgacaccattagagagagagttggggtagcacctttagtagaaatgatgatagaaaataggctta 52561851  T
Q  134 g 134  Q
    |    
T  52561850 g 52561850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #71
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 81 - 161
Target Start/End: Original strand, 1661420 - 1661500
Alignment:
Q  81 agagagaatgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacc 161  Q
    ||||||| | |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| || ||||| |||   |||||||||||||||||    
T  1661420 agagagagttggggtagcacctatagtagaaaagatggtggaaaataggctcagatggtttgagcatgtagagagaagacc 1661500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #72
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 300 - 376
Target Start/End: Original strand, 5113952 - 5114028
Alignment:
Q  300 tgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 376  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |  | |||||| ||||| | |||||||||||||||||    
T  5113952 tgatagaacactatgacgtcatttgattcatgtagccgacctcaattagtgggataacgtttggttgttgttgttgt 5114028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #73
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 260 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 15438906 - 15438800
Alignment:
Q  260 aagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgc 359  Q
    ||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||    ||||| | ||||||| ||||||||||| || |||||||  ||||| ||    
T  15438906 aagatttagagattaatgagttagatcaaaatatggtttatgatagaa---aatgacgttatttgatgcatgtagccgaccccacttagt-agataaggc 15438811  T
Q  360 ttggttgttgt 370  Q
    |||||||||||    
T  15438810 ttggttgttgt 15438800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #74
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 301 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 38877415 - 38877343
Alignment:
Q  301 gatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgt 373  Q
    ||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||| |||||    
T  38877415 gatagaacattatggcgtcatttgatccatgtagccgaacccacttagtgggataaggcttggttgtggttgt 38877343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #75
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 320 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 43481851 - 43481795
Alignment:
Q  320 atttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 376  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  43481851 atttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttgt 43481795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #76
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 288 - 376
Target Start/End: Original strand, 50636278 - 50636366
Alignment:
Q  288 aaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 376  Q
    ||||||||| | ||||||| || ||||||||||||||||| |||||| |||| | |||||| | ||||| ||||| |||||||||||||    
T  50636278 aaatatggtatatgatagagcattatgacatcatttgatcaatgtagtcgattctacttagcgggataaggcttgattgttgttgttgt 50636366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #77
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 321 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 37430472 - 37430417
Alignment:
Q  321 tttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 376  Q
    |||||||||| |||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  37430472 tttgatccatatagccgatcccacttagtgagataaggcttggttgttgttgttgt 37430417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #78
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 246 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 44905483 - 44905404
Alignment:
Q  246 agaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttga 325  Q
    |||||| || ||||| |||||| |||| |||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||| ||| ||||||    
T  44905483 agaaactataagaaatgatttataggttaatgagtttgatccaaatatggtttatcatagaacactatggcataatttga 44905404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #79
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 57 - 376
Target Start/End: Original strand, 52832011 - 52832330
Alignment:
Q  57 gataggattaagaatgacatcattagagagaatgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagaga 156  Q
    ||||||||| | || |||||||||| ||||| | ||||||| | ||| |||||||||| || || |||||| | |||| || ||| | |||||  |||||    
T  52832011 gataggattcaaaaagacatcattaaagagagttggggtagtagctacagtagaaaagatgatacaaaataaatttaggtggtttgggcatgttaagaga 52832110  T
Q  157 agacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccatta 256  Q
    |||||  |||||   ||||||   |||| |||| | |||||| |||  |   ||| || ||||||||||| | |||  |||||||   ||||||  ||||    
T  52832111 agaccgatagatgttgttgtacagagagtagataagatggaggagagtcgtattagaataggtagaggaatacctagaaaaaccaaaagagaaagtatta 52832210  T
Q  257 gaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataa 356  Q
    ||||||||||||||||  || ||||  || ||||||| ||||  ||||||||| |||||| | ||||||||||| |||  ||| ||| |||||  |||||    
T  52832211 gaaaagatttagaggttgataagttgaatacaaatattgtttcagatagaacattatgacgtaatttgatccatatagttgattcaatttagtaggataa 52832310  T
Q  357 tgcttggttgttgttgttgt 376  Q
       |||||||||||||||||    
T  52832311 gatttggttgttgttgttgt 52832330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #80
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 285 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 1290119 - 1290033
Alignment:
Q  285 tccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgtt 371  Q
    |||||||||||||| |||||||||| |||| ||| ||||||||||||| ||||| || ||| |||  ||||| |||| |||||||||    
T  1290119 tccaaatatggtttatgatagaacattatggcataatttgatccatgtggccgaccccactcagttggataaggcttagttgttgtt 1290033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #81
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 318 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 4318900 - 4318842
Alignment:
Q  318 tcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 376  Q
    ||||||||||||||||||||| || |||||||| || || |||||||||||||||||||    
T  4318900 tcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggaaaaggcttggttgttgttgttgt 4318842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #82
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 148 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 27520428 - 27520246
Alignment:
Q  148 gtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaacta--agaaaaccatttg 245  Q
    |||||||||||||  ||||||  |||||||||||||| ||||||      ||| || || || |||||||||| |||||||  ||  | ||||| ||  |    
T  27520428 gtagagagaagacatgtagatgtcgttgtaagaagagtagatca------gaaaaatcaagtcaaaagaggtaaaggaagacatataaaaaaactataag 27520335  T
Q  246 agaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtag 334  Q
    |||||| ||||||||| |||||||| | |||||| | |||||||||||| ||| |||||||||| |||||  | ||||||| |||||||    
T  27520334 agaaactattagaaaaaatttagagattaatgagctggatccaaatatgatttatgatagaacattatgatgtaatttgattcatgtag 27520246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #83
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 318 - 376
Target Start/End: Original strand, 41165509 - 41165567
Alignment:
Q  318 tcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 376  Q
    ||||||||||||||||||||| || |||||||| || || |||||||||||||||||||    
T  41165509 tcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggaaaaggcttggttgttgttgttgt 41165567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #84
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 259 - 376
Target Start/End: Original strand, 5338881 - 5338998
Alignment:
Q  259 aaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatg 358  Q
    |||||| ||||| | |||||||| |||| |||| || ||| | |||||||| |||| | | ||||||||||||||||| | |  |||||||| ||||| |    
T  5338881 aaagatctagagattaatgagttggatcgaaatgtgatttattatagaacattatggcgtaatttgatccatgtagccaacctcacttagtgagataagg 5338980  T
Q  359 cttggttgttgttgttgt 376  Q
    || |||||||||||||||    
T  5338981 ctcggttgttgttgttgt 5338998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #85
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 245 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 7762565 - 7762496
Alignment:
Q  245 gagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatg 314  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| || |||||||| |||| ||||||||||| | |||||||| ||||    
T  7762565 gagaaactattagaaaagatttagatgttaatgagttggatctaaatatggtttataatagaacattatg 7762496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #86
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 11 - 161
Target Start/End: Original strand, 26016355 - 26016507
Alignment:
Q  11 agcagagatgatgatgttgcgctggatgagtggtaagactagacatgataggattaagaatgacatcatt--agagagaatgggggtagcacctatagta 108  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||  ||||  ||| |   ||||  ||||||| | |||||| ||||||||  |    
T  26016355 agcagagatgaggatgttgcgttggatgtgtggtaagactagacaggatataattataaataatggcattagagagagagttggggtaacacctatatga 26016454  T
Q  109 gaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacc 161  Q
    |||||| ||||||||| |||| |||| || ||| |  ||||||| ||||||||    
T  26016455 gaaaagatggtagaaactagatttaggtggtttgggtatgtagaaagaagacc 26016507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #87
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 259 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 48865821 - 48865744
Alignment:
Q  259 aaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagcc 336  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||| |||||||| | ||||   | |||||||||||||||||    
T  48865821 aaagatttagaggttaatgaattagatccagatatggtttatgatagaatattatggtgtaatttgatccatgtagcc 48865744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #88
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 288 - 373
Target Start/End: Original strand, 50257767 - 50257852
Alignment:
Q  288 aaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgt 373  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||   | ||||||||||||||||| | || |||||||| ||||| |||| |||||||||||    
T  50257767 aaatatggtttatgatagaacattatggtgtaatttgatccatgtagccaaccccacttagtgagataaggcttcgttgttgttgt 50257852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #89
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 300 - 376
Target Start/End: Original strand, 1704836 - 1704912
Alignment:
Q  300 tgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 376  Q
    ||||||||||  ||| ||| ||||||||||||| || || || ||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  1704836 tgatagaacatcatggcataatttgatccatgttgctgaccccacttagtgtgataagacttggttgttgttgttgt 1704912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #90
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 300 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 10569144 - 10569068
Alignment:
Q  300 tgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 376  Q
    |||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||| | | |||||  | ||||| |||||||||||||||||||    
T  10569144 tgatagaacattataatatcatttgatccatgtagccggttccacttaaagggataaggcttggttgttgttgttgt 10569068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #91
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 73 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 13828017 - 13827929
Alignment:
Q  73 acatcattagagagaatgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacc 161  Q
    |||| |||||||||| | |||| ||||||||||||||||||| |||| |||| |||  |||| || |||  ||||||||||||||||||    
T  13828017 acattattagagagatttggggcagcacctatagtagaaaagatggtggaaactagggttaggtggtttgaacatgtagagagaagacc 13827929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #92
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 264 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 19908144 - 19908040
Alignment:
Q  264 tttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttgg 363  Q
    ||||||| | |||||||| ||| |||||||||||| |||| ||||| |||  | | |||| |||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||     
T  19908144 tttagagattaatgagttggattcaaatatggtttatgattgaacattattgcgtaattttatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttga 19908045  T
Q  364 ttgtt 368  Q
    |||||    
T  19908044 ttgtt 19908040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #93
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 288 - 356
Target Start/End: Original strand, 29808053 - 29808121
Alignment:
Q  288 aaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataa 356  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| |  |||||||| |||||||||||| | |||||||| |||||    
T  29808053 aaatatggtttttgataaaacactatggcgacatttgattcatgtagccgattccacttagtgggataa 29808121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #94
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 94 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 35828829 - 35828725
Alignment:
Q  94 gtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaa 193  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||  |||| || ||| ||| |||||||||||||||  |||||   || ||||| ||||||||||| |    
T  35828829 gtagcacctatggtagaaaagatggtggaaaatagggttaggtggtttggacgtgtagagagaagacctatagattatgtagtaaggagagaagatcata 35828730  T
Q  194 tggag 198  Q
    |||||    
T  35828729 tggag 35828725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #95
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 321 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 2914175 - 2914120
Alignment:
Q  321 tttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 376  Q
    |||||||||||||||| | || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  2914175 tttgatccatgtagccaaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttgt 2914120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #96
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 253 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 11941700 - 11941577
Alignment:
Q  253 attagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtg 352  Q
    |||||||||||||||||| | | |||||| ||||  | |||||||| ||||| |||| |||| | |  |||||||||||||| ||  |  |||||||| |    
T  11941700 attagaaaagatttagagattattgagttggatcggagtatggtttatgataaaacattatggcgtattttgatccatgtagtcggcctcacttagtggg 11941601  T
Q  353 ataatgcttggttgttgttgttgt 376  Q
    |||  |||||||||||||||||||    
T  11941600 atacggcttggttgttgttgttgt 11941577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #97
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 81 - 168
Target Start/End: Original strand, 40416361 - 40416448
Alignment:
Q  81 agagagaatgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagat 168  Q
    ||||||| | || ||||||||||||||||||||| |||| ||||  || ||||| || ||||| ||||||||||||||| | ||||||    
T  40416361 agagagagttggagtagcacctatagtagaaaagatggtggaaacgaggcttaggtggtttaggcatgtagagagaagaactgtagat 40416448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #98
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 211 - 309
Target Start/End: Original strand, 8628150 - 8628248
Alignment:
Q  211 aaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaaca 309  Q
    |||||||||||||||||| |||  ||||| ||   |||||| ||||| |||||||||||||| ||||| || |||| |||||| ||||  |||||||||    
T  8628150 aaaagaggtagaggaagacctagaaaaactataacagaaactattaggaaagatttagaggttaatgaatttgatcaaaatatagtttacgatagaaca 8628248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #99
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 291 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 16272903 - 16272818
Alignment:
Q  291 tatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgtc 377  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||||  |||||||||||||  | |||| |||||||| |||||||  ||| |||||||||||||    
T  16272903 tatggtttatgatagaacaatatgacatattttgatccatgtaatcaatcc-acttagtgggataatgtctggatgttgttgttgtc 16272818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #100
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 326 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 38758067 - 38758017
Alignment:
Q  326 tccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 376  Q
    ||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  38758067 tccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttgt 38758017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #101
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 289 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 45510917 - 45510831
Alignment:
Q  289 aatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttg 375  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||  | | |||| |||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||| || ||||||||    
T  45510917 aatatggtttatgatagaacaccatagcgtaatttaatccatgtagccgaccccacttagtgggataaagcttggctgatgttgttg 45510831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #102
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 288 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 27072572 - 27072491
Alignment:
Q  288 aaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttg 369  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||| | | ||||||||||||||||||| |   ||||||| || || ||||||||||||    
T  27072572 aaatatggtttatgatagaacattatggcgtaatttgatccatgtagccgaccatgcttagtgggaaaaggcttggttgttg 27072491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #103
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 304 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 33560927 - 33560858
Alignment:
Q  304 agaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgt 373  Q
    |||||| ||||||||  |||||||||||||||| | || |||||||| ||||| |||||| |||||||||    
T  33560927 agaacattatgacattgtttgatccatgtagccaaccctacttagtgggataaggcttggctgttgttgt 33560858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #104
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 15 - 87
Target Start/End: Original strand, 4379927 - 4379999
Alignment:
Q  15 gagatgatgatgttgcgctggatgagtggtaagactagacatgataggattaagaatgacatcattagagaga 87  Q
    ||||||| ||||||| | |||||| |||||||||||||| | |||| |||||  ||||||| |||||||||||    
T  4379927 gagatgaggatgttgtgttggatgtgtggtaagactagaaaagatatgattagaaatgacaacattagagaga 4379999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #105
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 320 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 4590585 - 4590533
Alignment:
Q  320 atttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttg 372  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| | |||||||||||||    
T  4590585 atttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggtttggttgttgttg 4590533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #106
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 320 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 7133355 - 7133299
Alignment:
Q  320 atttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 376  Q
    |||||||||||||||| || || |||||||| || || |||||||||||||||||||    
T  7133355 atttgatccatgtagctgaccccacttagtgggaaaaggcttggttgttgttgttgt 7133299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #107
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 276 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 12930408 - 12930308
Alignment:
Q  276 tgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttg 375  Q
    |||||| |||||||||||| ||| |||||||| | |||||| | ||||||||| ||||||| | || ||||||    |||| | ||||||||||||||||    
T  12930408 tgagttggatccaaatatgatttatgatagaagattatgacgtaatttgatccgtgtagccaaccccacttagcaaaataaggattggttgttgttgttg 12930309  T
Q  376 t 376  Q
    |    
T  12930308 t 12930308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #108
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 295 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 15437206 - 15437130
Alignment:
Q  295 gtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgtt 371  Q
    ||||||||||||||||||||   || |||||| ||||||||| | || || ||||| ||||| ||||||||||||||    
T  15437206 gtttttgatagaacactatggtgtcgtttgattcatgtagccaaccccacatagtgggataaggcttggttgttgtt 15437130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #109
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 320 - 376
Target Start/End: Original strand, 26299297 - 26299353
Alignment:
Q  320 atttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 376  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||| |||||  |||||||| |||||||||    
T  26299297 atttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataagacttggttgctgttgttgt 26299353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #110
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 300 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 32112062 - 32111986
Alignment:
Q  300 tgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 376  Q
    |||||||||| |||| | | |||||||| |||||||||| || |||||||  || || |||||||||||||||||||    
T  32112062 tgatagaacattatggcgtaatttgatcaatgtagccgaacccacttagttggaaaaggcttggttgttgttgttgt 32111986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #111
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 11 - 160
Target Start/End: Original strand, 40419557 - 40419708
Alignment:
Q  11 agcagagatgatgatgttgcgctggatgagtggtaagactagacatgataggattaagaatgacatcattagagagaatg--ggggtagcacctatagta 108  Q
    ||||||||||| |||| |||| || |||  |||||| ||||||   ||||| ||||  ||||||| |||||||||||  |  ||||||| || |||||||    
T  40419557 agcagagatgaggatggtgcgttgaatgtatggtaaaactagatgagatagaattagaaatgacaacattagagagagagttggggtagaacttatagta 40419656  T
Q  109 gaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagac 160  Q
    ||| || |||||| || ||||||||  || ||| | ||||||||||||||||    
T  40419657 gaatagatggtagtaactagacttaagtggtttgggcatgtagagagaagac 40419708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #112
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 321 - 373
Target Start/End: Original strand, 43898439 - 43898491
Alignment:
Q  321 tttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgt 373  Q
    |||||| ||||||||| | || |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  43898439 tttgattcatgtagccaaccccacttagtgggataatgcttggttgttgttgt 43898491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #113
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 15 - 71
Target Start/End: Complemental strand, 46226642 - 46226586
Alignment:
Q  15 gagatgatgatgttgcgctggatgagtggtaagactagacatgataggattaagaat 71  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| | |||| ||| |||||    
T  46226642 gagatgatgatgttgcgttggatgagtggtgagactagacgtaatagaattgagaat 46226586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #114
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 286 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 48801700 - 48801625
Alignment:
Q  286 ccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttg 362  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||  |||| |||||||||||||||| ||||| |||||| | || ||||||||    
T  48801700 ccaaatatggtttatgatagaacattac-acataatttgatccatgtagctgatcccacttagcgggaaaatgcttg 48801625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #115
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 292 - 375
Target Start/End: Original strand, 14224286 - 14224368
Alignment:
Q  292 atggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttg 375  Q
    ||||||||||||||| ||||||| | |||||| || |||| |||||| || |||||||| || || | ||||||||||||||||    
T  14224286 atggtttttgatagaccactatggcgtcattt-attcatgcagccgaccctacttagtgggacaaggattggttgttgttgttg 14224368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #116
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 93 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 27637913 - 27637846
Alignment:
Q  93 ggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagac 160  Q
    |||||||||||||| ||||||| || |||||| ||||||||| || ||| | |||||||||| |||||    
T  27637913 ggtagcacctatagcagaaaagatgatagaaactagacttaggtgttttgggcatgtagagaaaagac 27637846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #117
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 290 - 361
Target Start/End: Original strand, 30445304 - 30445375
Alignment:
Q  290 atatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgctt 361  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| || |||||| ||||||||| |  | |||||||| ||||| ||||    
T  30445304 atatggtttttgatagaacaccatgacgtcgtttgattcatgtagccaactccacttagtgggataaagctt 30445375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #118
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 274 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 35828661 - 35828562
Alignment:
Q  274 aatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgt 373  Q
    |||||||| |||  |||||||||||  ||||||||| |||| ||  |||||||||||||| |||| ||  ||||||| || ||  |||||||||||||||    
T  35828661 aatgagttggatggaaatatggtttacgatagaacattatggcaatatttgatccatgtaaccgaccccgcttagtgggaaaagacttggttgttgttgt 35828562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #119
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 288 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 52633257 - 52633166
Alignment:
Q  288 aaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgtcgt 379  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||||||  |||| ||||||||| | | |   ||||||| |||  || ||||||||||||||||||||    
T  52633257 aaatatggtttatgatagaacaatatgacatattttggtccatgtagtcaacctcgcttagtgggatggtgtttggttgttgttgttgtcgt 52633166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #120
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 321 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 52814346 - 52814291
Alignment:
Q  321 tttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 376  Q
    |||||||||||||||| |||| |||||||| | ||| ||||||||||| |||||||    
T  52814346 tttgatccatgtagcctatcccacttagtgggttaaggcttggttgtttttgttgt 52814291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #121
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 43 - 112
Target Start/End: Complemental strand, 854119 - 854052
Alignment:
Q  43 gtaagactagacatgataggattaagaatgacatcattagagagaatgggggtagcacctatagtagaaa 112  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||| |||||  | |||||||| ||||| |||||||    
T  854119 gtaagactagacatgatagaattaaaaatgacattatttgagag--ttggggtagctcctatcgtagaaa 854052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #122
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 245 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 8676993 - 8676897
Alignment:
Q  245 gagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttt---tgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccga 338  Q
    ||||||| |||| ||||||||||||| | |||||||| || | |||||||||  |   |||||||| | |||| ||| |||||||||||||||||||    
T  8676993 gagaaactattaaaaaagatttagagattaatgagttggaccgaaatatggtggtctatgatagaatattatggcataatttgatccatgtagccga 8676897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #123
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 300 - 370
Target Start/End: Original strand, 16943364 - 16943434
Alignment:
Q  300 tgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgt 370  Q
    |||||||||| |||| |  | |||||||||||||| ||| || || ||||| |||||||||||||||||||    
T  16943364 tgatagaacattatggcggcgtttgatccatgtagtcgaccccacctagtgagataatgcttggttgttgt 16943434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #124
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 292 - 350
Target Start/End: Original strand, 28528556 - 28528614
Alignment:
Q  292 atggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtg 350  Q
    ||||||||||||||| ||||||| | || |||||| ||||||||||| || ||||||||    
T  28528556 atggtttttgatagaccactatggcgtcgtttgattcatgtagccgaccccacttagtg 28528614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #125
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 259 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 29577256 - 29577147
Alignment:
Q  259 aaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatg 358  Q
    |||||| ||||| | |||||| | |||| |||||||||| | ||||||||| |||| ||| ||||  | ||||||||| | || |||||||| |||| ||    
T  29577256 aaagatctagagattaatgagctggatcaaaatatggttat-gatagaacattatggcataatttatttcatgtagccaaccccacttagtgggatagtg 29577158  T
Q  359 cttggttgttg 369  Q
    |||||||||||    
T  29577157 cttggttgttg 29577147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #126
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 91 - 157
Target Start/End: Original strand, 37263331 - 37263397
Alignment:
Q  91 ggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaa 157  Q
    |||||||||||||||||||||||| | ||||||| |||||||   || ||| | |||||||||||||    
T  37263331 ggggtagcacctatagtagaaaagatagtagaaactagacttcagtggtttgggcatgtagagagaa 37263397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #127
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 91 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 52073745 - 52073675
Alignment:
Q  91 ggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaa-tagacttagatgatttagacatgtagagagaagac 160  Q
    |||||||||||||| ||||||||| ||||| |||| | | ||||| || ||| ||||||||||||||||||    
T  52073745 ggggtagcacctattgtagaaaagatggtaaaaaactcggcttaggtggtttggacatgtagagagaagac 52073675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #128
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 92 - 161
Target Start/End: Original strand, 10272260 - 10272329
Alignment:
Q  92 gggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacc 161  Q
    |||| |||||| ||||||||||| ||||||||| |||||| |  || ||| | |||||||||||||||||    
T  10272260 gggttgcacctgtagtagaaaagatggtagaaactagactaaagtggttttggcatgtagagagaagacc 10272329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #129
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 245 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 11331332 - 11331247
Alignment:
Q  245 gagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccat 330  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||||| ||| |||| |||  ||||||||||| ||||  |||| |||||  | |||||||||||    
T  11331332 gagaaactatttgaaaagatttagaggttaataagttggatttaaatatggtttatgatgaaacattatgatgtaatttgatccat 11331247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #130
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 245 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 11489353 - 11489268
Alignment:
Q  245 gagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccat 330  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||||| ||| |||| |||  ||||||||||| ||||  |||| |||||  | |||||||||||    
T  11489353 gagaaactatttgaaaagatttagaggttaataagttggatttaaatatggtttatgatgaaacattatgatgtaatttgatccat 11489268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #131
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 33 - 94
Target Start/End: Complemental strand, 16142226 - 16142165
Alignment:
Q  33 tggatgagtggtaagactagacatgataggattaagaatgacatcattagagagaatggggg 94  Q
    |||||| |||||||||||||||  |||||||| | ||||| || ||||||||||||| ||||    
T  16142226 tggatgtgtggtaagactagacgggataggatcaggaatgccaccattagagagaattgggg 16142165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #132
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 343 - 376
Target Start/End: Original strand, 22930645 - 22930678
Alignment:
Q  343 acttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 376  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  22930645 acttagtgggataatgcttggttgttgttgttgt 22930678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #133
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 291 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 26113521 - 26113456
Alignment:
Q  291 tatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataa 356  Q
    |||||||| |||||||||| |||| | | ||||||||||||||||||| |  |||||||| |||||    
T  26113521 tatggtttatgatagaacattatggcttaatttgatccatgtagccgagctcacttagtgggataa 26113456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #134
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 320 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 42539265 - 42539208
Alignment:
Q  320 atttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgtc 377  Q
    ||||||||||||||| ||| || |||||||| || || |||||||| |||||||||||    
T  42539265 atttgatccatgtagacgaccccacttagtgggaaaaggcttggttattgttgttgtc 42539208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #135
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 319 - 372
Target Start/End: Original strand, 44008806 - 44008859
Alignment:
Q  319 catttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttg 372  Q
    |||||||||||| ||||||| || |||||||| ||||  |||||||||||||||    
T  44008806 catttgatccatttagccgaacctacttagtgagatacggcttggttgttgttg 44008859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #136
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 288 - 373
Target Start/End: Original strand, 50806864 - 50806949
Alignment:
Q  288 aaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgt 373  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||| | |  |||||| |||||| |||| || | ||||||  |||| ||||||||||||||||    
T  50806864 aaatatggtttatgataaaacactatggcgttgtttgattcatgtaaccgaccccatttagtggaataaggcttggttgttgttgt 50806949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #137
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 91 - 159
Target Start/End: Original strand, 4380013 - 4380081
Alignment:
Q  91 ggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaaga 159  Q
    ||||||||| |||||||||||||| |||| |||| ||   |||| || |||| ||||||||||||||||    
T  4380013 ggggtagcaactatagtagaaaagatggtggaaactaaggttaggtggtttatacatgtagagagaaga 4380081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #138
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 94 - 198
Target Start/End: Original strand, 5338727 - 5338831
Alignment:
Q  94 gtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaa 193  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| |||| |   ||||| || ||| | |||| |||||||||||| |||||| |  | ||||| |||| |||||| |    
T  5338727 gtagcacctatagtagaaaagatggtggaaactgagcttaggtggtttgggcatgcagagagaagacctgtagatgctttagtaaggagagtagatcaga 5338826  T
Q  194 tggag 198  Q
    |||||    
T  5338827 tggag 5338831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #139
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 322 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 8194773 - 8194721
Alignment:
Q  322 ttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgtt 374  Q
    |||||| ||||||||| ||| |||| || |||||||| |||||||||||||||    
T  8194773 ttgatctatgtagccggtcctactttgtatgataatgtttggttgttgttgtt 8194721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #140
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 325 - 373
Target Start/End: Original strand, 12231592 - 12231640
Alignment:
Q  325 atccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgt 373  Q
    |||||||||||||| || |||||||  ||||| ||||||||||||||||    
T  12231592 atccatgtagccgaccccacttagtaggataaggcttggttgttgttgt 12231640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #141
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 89 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 13827854 - 13827746
Alignment:
Q  89 tgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaaga 188  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||  ||| |||| |||  | || || ||| |||||||||||||||||   |||||| | || ||||| |||| |||    
T  13827854 tgggggtagtacctatagtagaaaagacggtggaaactagggtaaggtggtttggacatgtagagagaagaagtgtagattctgtagtaaggagagtaga 13827755  T
Q  189 tcaaatgga 197  Q
    ||| |||||    
T  13827754 tcatatgga 13827746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #142
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 24 - 64
Target Start/End: Original strand, 17275137 - 17275177
Alignment:
Q  24 atgttgcgctggatgagtggtaagactagacatgataggat 64  Q
    |||||||| |||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  17275137 atgttgcgttggatgtgtggtaagactacacatgataggat 17275177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #143
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 81 - 157
Target Start/End: Original strand, 51812515 - 51812591
Alignment:
Q  81 agagagaatgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaa 157  Q
    ||||||| | |||||| || |||||||||||||| |||| |||| ||| ||||  |||||| | |||||||||||||    
T  51812515 agagagagttggggtaacaactatagtagaaaagatggtggaaactaggcttatgtgatttgggcatgtagagagaa 51812591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #144
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 259 - 307
Target Start/End: Original strand, 51812677 - 51812725
Alignment:
Q  259 aaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaa 307  Q
    |||||| |||| || ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  51812677 aaagatctagatgttaatgagttagatcgaaatatggtttatgatagaa 51812725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #145
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 320 - 372
Target Start/End: Original strand, 52292268 - 52292320
Alignment:
Q  320 atttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttg 372  Q
    |||||||||||||| || | || |||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  52292268 atttgatccatgtaaccaaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttg 52292320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #146
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 11 - 87
Target Start/End: Complemental strand, 52442868 - 52442792
Alignment:
Q  11 agcagagatgatgatgttgcgctggatgagtggtaagactagacatgataggattaagaatgacatcattagagaga 87  Q
    |||||| |||| ||||||| | |||||| |||||||||||||||| |||| |||||  ||||| | |||| ||||||    
T  52442868 agcagacatgaggatgttgtgttggatgtgtggtaagactagacaagataagattagaaatgagaacattggagaga 52442792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #147
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 261 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 52900754 - 52900682
Alignment:
Q  261 agatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgta 333  Q
    |||||||||| | |||||||| ||   ||||||||||| ||||||||||||||| |   ||||||||||||||    
T  52900754 agatttagagattaatgagttggactgaaatatggtttatgatagaacactatggcggaatttgatccatgta 52900682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 241; Significance: 1e-133; HSPs: 123)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 15 - 376
Target Start/End: Original strand, 38429806 - 38430168
Alignment:
Q  15 gagatgatgatgttgcgctggatgagtggtaagactagacatgataggattaagaatgacatcattagagagaa--tgggggtagcacctatagtagaaa 112  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||   |||||| |||||||||||||||||    
T  38429806 gagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagactagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgggggcagcacctatagtagaaa 38429905  T
Q  113 agttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaatggagaagaaccaggttaa 212  Q
    |||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||||||||| |||  ||||||||    
T  38429906 agttggtagaaaataggcttagatggtttggacatgtaaagagaagacccgtatatgccgttgtaagaagagtagatcaaatggaggagagtcaggttaa 38430005  T
Q  213 aagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacacta 312  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38430006 aagaagtagaggaagacctaagaaaaccattcgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttttgatagaacacta 38430105  T
Q  313 tgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 376  Q
    || | ||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||| ||||||||||||    
T  38430106 tggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgagataaggcttgg-tgttgttgttgt 38430168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 11 - 376
Target Start/End: Original strand, 3865990 - 3866357
Alignment:
Q  11 agcagagatgatgatgttgcgctggatgagtggtaagactagacatgataggattaagaatgacatcatt--agagagaatgggggtagcacctatagta 108  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||  ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  3865990 agcagagatgatgatgttgcgttggatgagtggtaagactagacatgataggattaggaatgacaccattggagagagagtgggggtagcacctatagta 3866089  T
Q  109 gaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaatggagaagaaccagg 208  Q
     ||||||||||||||||||| |||||||| |||   ||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||| ||||||||||||| |||  ||      
T  3866090 aaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgtgcatgtagagagaagacccgtagatgtcgtggtaagaagagtagatcaaatggaggagagacaaa 3866189  T
Q  209 ttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaac 308  Q
    |||||||||||||||||| | ||| |||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||| | |||||||||    
T  3866190 ttaaaagaggtagaggaaaacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaac 3866289  T
Q  309 actatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 376  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||  ||||| |||||||||||||||||||    
T  3866290 actatgacatcatttgatccatgtagccgaccccacttagtaggataaggcttggttgttgttgttgt 3866357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 15 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 45367984 - 45367622
Alignment:
Q  15 gagatgatgatgttgcgctggatgagtggtaagactagacatgataggattaagaatgacatcattagagagaatggggg-tagcacctatagtagaaaa 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  45367984 gagatgatgatgttgcgctggatgaatggtaagactagacaagataggattaagaatgacaccattagagagagtggggggtagcacctatagtagaaaa 45367885  T
Q  114 gttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaa 213  Q
    ||||||||||||||  |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| | ||||||||||||| |||  |  ||||||    
T  45367884 gttggtagaaaataaccttagatggtttggacatgtagagagaagacccgtagatgccgttgttagaagggtagatcaaatggaggagagtctagttaaa 45367785  T
Q  214 agaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactat 313  Q
    |||||||||||||||   |||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  45367784 agaggtagaggaagactcaagaaaaccattagagaaatcattagaaaggatttagaggtaaatgagttggatccaaatatgatttttgatagaacactat 45367685  T
Q  314 gacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 376  Q
    ||| ||||||||||||||| ||||| || |||||||| |||||  |||| |||||||||||||    
T  45367684 gacgtcatttgatccatgtcgccgaccccacttagtgggataaaacttgtttgttgttgttgt 45367622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 15 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 41197588 - 41197224
Alignment:
Q  15 gagatgatgatgttgcgctggatgagtggtaagactagacatgataggattaagaatgacatcattagaga--gaatgggggtagcacctatagtagaaa 112  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||  || || |||||||||||||| ||||||    
T  41197588 gagatgaggatgttgcgctagatgagtggtaagactagacatgataggattaggaatgacaccattagagatagagtgagggtagcacctataatagaaa 41197489  T
Q  113 agttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaatggagaagaaccaggttaa 212  Q
    |||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| |||  ||||||||    
T  41197488 agttggtagaaaataggcttagatggtttggacatgtagagagaagatccgtagatgccgttgtaagaagagtagatcaaatggaggagagtcaggttaa 41197389  T
Q  213 aaga-ggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacact 311  Q
    || | ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |    
T  41197388 aaaaaggtagagaaagacctaagaaaaccatttgagaaaccattataaaagatttagaggtcaacgagttggatcccaatatggtttttgatagaacatt 41197289  T
Q  312 atgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 376  Q
    ||| | ||||||||||||||||| ||| || ||||  || ||||| |||||||||||||||||||    
T  41197288 atggcgtcatttgatccatgtagtcgaccccacttgatgggataaggcttggttgttgttgttgt 41197224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 15 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 11992466 - 11992108
Alignment:
Q  15 gagatgatgatgttgcgctggatgagtggtaagactagacatgataggattaagaatgacatcattagagagaatgggggtagcacctatagtagaaaag 114  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  11992466 gagatgaggatgttgcgctggatgagtggtaatactagacatgataagattaggaatgacaccattagagagagtgagggtagcacctatagtagaaaag 11992367  T
Q  115 ttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaa 214  Q
    |||||||||||||  |||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||  |||||||||||| |||  | ||||||||    
T  11992366 ttggtagaaaataagcttagatggtttggacatatagagagaagacccgtagatgccgttgttagaagagtggatcaaatggaggagagtcgggttaaaa 11992267  T
Q  215 gaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatg 314  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||||| | |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  11992266 gaggtaaaggaagacctaagaaaaccattagggaaatcattagaaaggatttagaggtcaatgagttagatccaaatatgatttttgatagaacattatg 11992167  T
Q  315 acatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgt 373  Q
     | | |||||||||||||||| || || ||||||||  |||| ||||||||||||||||    
T  11992166 gcgttatttgatccatgtagctgaccccacttagtggaataaggcttggttgttgttgt 11992108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 15 - 376
Target Start/End: Original strand, 12734623 - 12734985
Alignment:
Q  15 gagatgatgatgttgcgctggatgagtggtaagactagacatgataggattaagaatgacatcattagagagaatgggggtagcacctatagtagaaaag 114  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||  ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||     
T  12734623 gagatgaggatgttgtgctggatgagtggtaagactagacgggataggattagaaatgacaccattagagagagtgggggtagcacctatagtagaaaaa 12734722  T
Q  115 ttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaa 214  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||| |||  ||||||||||    
T  12734723 ttggtagaaaataggcttagatggtttggacatgtaaagagaagacccgtagatgccgtggtaagaagagtagatcaaatggaggagagtcaggttaaaa 12734822  T
Q  215 ga-ggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactat 313  Q
    || |||||||| ||| ||| |||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  12734823 gagggtagagggagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttatgatagaacactat 12734922  T
Q  314 gacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 376  Q
    |   | ||||||||||||||| ||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  12734923 ggtgtaatttgatccatgtagtcgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttgt 12734985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 15 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 41763401 - 41763043
Alignment:
Q  15 gagatgatgatgttgcgctggatgagtggtaagactagacatgataggattaagaatgacatcattagagagaatg-ggggtagcacctatagtagaaaa 113  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||  | |||||| ||||||||||||||||    
T  41763401 gagatgaggatgttgcgatggatgagtggtaagactagacaagataggattaggaatgacaccattagagagagagtggggtaacacctatagtagaaaa 41763302  T
Q  114 gttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaa 213  Q
    ||||||||||||||| ||||| || ||| |||||| |||||||||||| |||||| |||||||||||| || ||||||||||||| |||  |||||||||    
T  41763301 gttggtagaaaataggcttaggtggtttggacatgcagagagaagacctgtagatgccgttgtaagaaaagtagatcaaatggaggagagtcaggttaaa 41763202  T
Q  214 agaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactat 313  Q
    | ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||||       
T  41763201 aaaggtagaggaagacctaagaaaaccattcgagaaaccattagaaaaaattta-aggtcaattagttggatccaaatatgttttttgatagaacacccg 41763103  T
Q  314 gacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgt 373  Q
    | | ||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  41763102 ggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 41763043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 11 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 3244015 - 3243654
Alignment:
Q  11 agcagagatgatgatgttgcgctggatgagtggtaagactagacatgataggattaagaatgacatcattagagagaatgggggtagcacctatagtaga 110  Q
    ||||||||| | ||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |    
T  3244015 agcagagataaggatgttgcgttggatgagtagtaagactacacatgataggattatgaatgacaccattagagagagtgggggtagcacctatagtaaa 3243916  T
Q  111 aaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaatggagaagaaccaggtt 210  Q
    ||||||| | |||||||| |||||||| ||| |  ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||  ||||||||||||| |||  || |||    
T  3243915 aaagttgatggaaaataggcttagatggtttgggaatgtagagagaagacccgtagatgccgtggtaagaagaatagatcaaatggaggagagtcaagtt 3243816  T
Q  211 aaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacac 310  Q
    |||||||| ||||||||| ||| |||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| | |||| | |||||||||||    
T  3243815 aaaagaggcagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaagtttggtgtatgatagaacac 3243716  T
Q  311 tatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttg 372  Q
    |||| | |||||||||||| |||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  3243715 tatggcgtcatttgatccaggtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttg 3243654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 193; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 11 - 380
Target Start/End: Original strand, 36183369 - 36183740
Alignment:
Q  11 agcagagatgatgatgttgcgctggatgagtggtaagactagacatgataggattaagaatgacatcattagagagaatg--ggggtagcacctatagta 108  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||  |  ||||||||||||||||||    
T  36183369 agcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagactagacatgataggattaggaatgacacaattagagagagagtaggggtagcacctatagta 36183468  T
Q  109 gaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaatggagaagaaccagg 208  Q
    |||||||||||||||||||  ||||| || ||| | |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| |||| |||||||| |||  || |    
T  36183469 gaaaagttggtagaaaataatcttagttggtttcggcatgtagagagaagacccgtagatgccgtggtaagaagagtagataaaatggaggagagtcaag 36183568  T
Q  209 ttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaac 308  Q
    |||||||||||||||||||| ||| |||||| ||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||| || | | |||||||||    
T  36183569 ttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaagtcaatgagttggatccaaatttgatgtatgatagaac 36183668  T
Q  309 actatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgtcgtc 380  Q
    ||||||    |||||||||||||||||||| || |||||||  ||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  36183669 actatggtgccatttgatccatgtagccgaccccacttagtaggataaggcttggttgttgttgtcgtcgtc 36183740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 11 - 371
Target Start/End: Original strand, 8180698 - 8181060
Alignment:
Q  11 agcagagatgatgatgttgcgctggatgagtggtaagactagacatgataggattaagaatgacatcattagagagaa--tgggggtagcacctatagta 108  Q
    ||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||   ||||||||||||||||||||    
T  8180698 agcagagatgaggatgttgtgttggatgagtggtaagactagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgggggtagcacctatagta 8180797  T
Q  109 gaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaatggagaagaaccagg 208  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||| ||| | ||||||||||||||||| || ||| |||| |||||||||| ||||||||||||| |||  || |    
T  8180798 gaaaagttggtagaaaataagcttagatggtttgggcatgtagagagaagacctgtggatgccgtggtaagaagagtagatcaaatggaggagagtcaag 8180897  T
Q  209 ttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaac 308  Q
    ||||||| ||||||||||||  || |||||| ||| || ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||| | |||||||||    
T  8180898 ttaaaagcggtagaggaagacataggaaaactattagataaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaac 8180997  T
Q  309 actatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgtt 371  Q
    |||||    ||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||| |||||||||    
T  8180998 actatagtgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttcgttgttgtt 8181060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 11 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 38453053 - 38452686
Alignment:
Q  11 agcagagatgatgatgttgcgctggatgagtggtaagactagacatgataggattaagaatgacatcattagagagaa------tgggggtagcacctat 104  Q
    |||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||       ||||||||||| ||||    
T  38453053 agcagacatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagactagacatcataggattaggaatgacaccattagagagagagagagtgggggtagcatctat 38452954  T
Q  105 agtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaatggagaagaac 204  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| | |||||||||||| | |      
T  38452953 agtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacccgtagatgccgtggtaagaagata-gatcaaatggaggaaagt 38452855  T
Q  205 caggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgata 304  Q
    || ||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||| | |||||    
T  38452854 caagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgata 38452755  T
Q  305 gaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgt 373  Q
     |||||||||   ||||| ||||||||||||||| || |||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  38452754 aaacactatggtgtcattcgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 38452686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 177; E-Value: 3e-95
Query Start/End: Original strand, 11 - 376
Target Start/End: Original strand, 4807510 - 4807880
Alignment:
Q  11 agcagagatgatgatgttgcgctggatgagtggtaagactagacatgataggattaagaatgacatcattagagagaa------tgggggtagcacctat 104  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||       ||||||||||||||||    
T  4807510 agcagagatgaggatgttgcgttggatgaatggtaagaatagacatgataggattatgaatgacatcattagagagagagagagtgggggtagcacctat 4807609  T
Q  105 agtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaatggagaagaac 204  Q
    |||||||||||||||||||| ||| |||||||  ||| | ||| |||||||||||| |||||||  ||| |||||||||| |||||||||| || |||      
T  4807610 agtagaaaagttggtagaaa-taggcttagatagtttcggcatatagagagaagactcgtagatgtcgtggtaagaagagtagatcaaatgaaggagagt 4807708  T
Q  205 caggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgata 304  Q
    || ||||||||||||||| ||||| ||| |||||| ||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||  ||| |  ||||    
T  4807709 caagttaaaagaggtagatgaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaagtatttagaggtcaatgagttggatccaaattcggtgtacgata 4807808  T
Q  305 gaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 376  Q
    |||||||||| | ||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  4807809 gaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttgt 4807880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 173; E-Value: 8e-93
Query Start/End: Original strand, 81 - 376
Target Start/End: Original strand, 25834671 - 25834963
Alignment:
Q  81 agagagaatgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaaga 180  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||    
T  25834671 agagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttggacatgtagagagaagacctgtggatgccgttgtaaga 25834770  T
Q  181 agagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagt 280  Q
    |||| ||||||||||||| ||    ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||  ||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  25834771 agagtagatcaaatggaggagtt--aggttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaact-ttaaagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagt 25834867  T
Q  281 tagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 376  Q
    | |||||||||||||||| |||||||||||| || | ||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  25834868 tggatccaaatatggtttatgatagaacactgtggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttgt 25834963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 172; E-Value: 3e-92
Query Start/End: Original strand, 34 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 18424716 - 18424378
Alignment:
Q  34 ggatgagtggtaagactagacatgataggattaagaatgacatcattagagagaatgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagactta 133  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| | ||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  18424716 ggatgagtggtaagactagatatgatatgattaagaatgataccattagagagagtgggtgtagcatctatagtagaaaagttggtagaaaataggctta 18424617  T
Q  134 gatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaa 233  Q
    |||| ||| |||||||||||||| ||||||||||| |||  |||||||||  ||||||| ||||  |||  ||||||||||||||||||||||||  ||     
T  18424616 gatggtttggacatgtagagagacgacccgtagatgccgacgtaagaagattagatcaattggatgagagtcaggttaaaagaggtagaggaagacatag 18424517  T
Q  234 gaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgta 333  Q
    |||||| ||| |||||||||||| ||| ||||||||| ||||| |||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  18424516 gaaaactattagagaaaccattataaaggatttagagatcaataagtttgatccgaatatggtttatgatagaacactatgacgtcatttgatccatgta 18424417  T
Q  334 gccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgt 373  Q
     |||  || |||||||| |||||  |||||||||||||||    
T  18424416 -ccgtccccacttagtgggataagacttggttgttgttgt 18424378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 165; E-Value: 5e-88
Query Start/End: Original strand, 81 - 377
Target Start/End: Original strand, 2610578 - 2610874
Alignment:
Q  81 agagagaatgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaaga 180  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||| | |||||||||||||||| |||||||  ||| ||||||    
T  2610578 agagagagtgggggtagcacctatagtggaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacacgtagatgtcgtggtaaga 2610677  T
Q  181 agagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagt 280  Q
    |||| ||||||||||||  |||  || ||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  2610678 agagtagatcaaatggatgagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctatgaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagt 2610777  T
Q  281 tagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgtc 377  Q
    | ||||||||| |||| | ||||||||||||||| | | |||||||||||||| |||| || |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  2610778 tggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgttatttgatccatgtaaccgaccccacttagtgagataaggcttggttgttgttgttgtc 2610874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 153; E-Value: 7e-81
Query Start/End: Original strand, 15 - 347
Target Start/End: Original strand, 23997539 - 23997858
Alignment:
Q  15 gagatgatgatgttgcgctggatgagtggtaagactagacatgataggattaagaatgacatcattagaga--gaatgggggtagcacctatagtagaaa 112  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||  || |||| |||||||||||||   |||    
T  23997539 gagatgaagatgttgcgctggatgagtggtaagactagacatgatcggattaggaatgacaccattagagatagagtgggtgtagcacctatag---aaa 23997635  T
Q  113 agttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaatggagaagaaccaggttaa 212  Q
    | |||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||| |||  ||||||||    
T  23997636 atttggtagaaaatagccttagatggttttgacatgtagaaagaagacccgtagatgtcgttgtaagaagagtagatcaaatggaggagagtcaggttaa 23997735  T
Q  213 aagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacacta 312  Q
    ||||||| || ||||| ||||||            |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  23997736 aagaggtggaagaagacctaaga------------aaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttttgataaaacacta 23997823  T
Q  313 tgacatcatttgatccatgtagccgatccaactta 347  Q
    || | | ||||||| |||||| |||| || |||||    
T  23997824 tggcgttatttgattcatgtatccgaccccactta 23997858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 141; E-Value: 1e-73
Query Start/End: Original strand, 112 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 451909 - 451645
Alignment:
Q  112 aagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaatggagaagaaccaggtta 211  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| ||| | |||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||| |||  || ||||    
T  451909 aagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagaaaagacccgtagatgccgtggtaagaagagtagatcaaatggaggagagtcaagtta 451810  T
Q  212 aaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacact 311  Q
    ||| ||||||||||||| ||| |||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||| | || | ||||||||||||    
T  451809 aaaaaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcagtgagttggatccaaatttagtgtatgatagaacact 451710  T
Q  312 atgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 376  Q
    ||| | ||||||||||||||||||||| || |||||||| || || |||||||||||||||||||    
T  451709 atggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggacaaggcttggttgttgttgttgt 451645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 128; E-Value: 6e-66
Query Start/End: Original strand, 145 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 7326388 - 7326157
Alignment:
Q  145 catgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccattt 244  Q
    ||||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||| |||||||||| || |||  || |||||||||||||||||||||  || |||||| |||     
T  7326388 catgtagagagaagacctgtagatgccgtggtaagaagagtagatcaaatgaaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacataggaaaactatta 7326289  T
Q  245 gagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaac 344  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||| | ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| | || ||    
T  7326288 gagaaaccattagaaatgatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccaaccccac 7326189  T
Q  345 ttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 376  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  7326188 ttagtgggataaggcttggttgttgttgttgt 7326157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 128; E-Value: 6e-66
Query Start/End: Original strand, 148 - 376
Target Start/End: Original strand, 39029638 - 39029872
Alignment:
Q  148 gtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgag 247  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||| | |  ||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||    
T  39029638 gtagagaggagacccgtagatgccgttgtaagaagagtagatcaattggaggaaagtcaggtaaaaagaggtagaggaagacctaagaaaaacattcgag 39029737  T
Q  248 aaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatcca------tgtagccgatcc 341  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||      ||||||||| ||    
T  39029738 aaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttttgatagaacattatggcgtcatttgatccatgtaggtgtagccgaccc 39029837  T
Q  342 aacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 376  Q
     |||||||| ||||| |||||||||||||| ||||    
T  39029838 cacttagtgggataaggcttggttgttgttcttgt 39029872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 121; E-Value: 9e-62
Query Start/End: Original strand, 162 - 374
Target Start/End: Original strand, 28508749 - 28508961
Alignment:
Q  162 cgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaa 261  Q
    ||||||| |||| |||| ||||| ||||||||||||| |||  || ||||||||| ||||||||||| ||| |||||| ||| ||||||||||||||||     
T  28508749 cgtagatgccgtggtaataagagtagatcaaatggaggagagtcaagttaaaagatgtagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaag 28508848  T
Q  262 gatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgctt 361  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| ||||    
T  28508849 gatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtttatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggctt 28508948  T
Q  362 ggttgttgttgtt 374  Q
    |||||||||||||    
T  28508949 ggttgttgttgtt 28508961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 111; E-Value: 8e-56
Query Start/End: Original strand, 98 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 24583907 - 24583630
Alignment:
Q  98 cacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaatgga 197  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||| | || |||||||||| ||||||||||||    
T  24583907 cacctataatagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacccgtagatgctgtcgtaagaagagtagatcaaatgga 24583808  T
Q  198 gaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatg-gt 296  Q
    | |||  || |||||||||| |||| |||||   || ||||| | | |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||| || ||    
T  24583807 ggagagtcaagttaaaagagatagatgaagacaaaaaaaaactaatagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggat-caaatttgagt 24583709  T
Q  297 ttt-tgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgtt 374  Q
    ||| |||||| |||||||||| | |||| ||| |||| ||||| || ||||| || ||||| |||||||||||||||||    
T  24583708 tttgtgatagcacactatgacgtaatttaatcaatgttgccgaccccacttaatgagataaggcttggttgttgttgtt 24583630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 105; E-Value: 3e-52
Query Start/End: Original strand, 208 - 376
Target Start/End: Original strand, 35643065 - 35643233
Alignment:
Q  208 gttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaa 307  Q
    |||||||||||||||| |||| ||| |||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||| | ||||||||    
T  35643065 gttaaaagaggtagagaaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaa 35643164  T
Q  308 cactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 376  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  35643165 cactatgacatcatttaatacatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttgt 35643233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 23 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 6238106 - 6237750
Alignment:
Q  23 gatgttgcgctggatgagtggtaagactagacatgataggattaagaatgacatcattag-agagaatgggggtagcacctatagta--gaaaagttggt 119  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||||| || | | ||||| |||   ||||||||| |  |  || ||||||||    
T  6238106 gatgttgcgctggatgagcggtaagactagacatgatagaattaggaatgacaccaatgggagagagtggacatagcacctaaaaaaaagataagttggt 6238007  T
Q  120 agaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggt 219  Q
    |||||| |  |||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||| |   ||| |||||||||| |||||| |||||| |||  || || |||||||||    
T  6238006 agaaaacatgcttagatggtttggacatgtagagagtagacccgtaaacgtcgtcgtaagaagagtagatcagatggaggagagacatgtcaaaagaggt 6237907  T
Q  220 agaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatc 319  Q
    |||| |||| |||  ||||| |   || ||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||| ||||||| |||| |||||||||||||||  ||     
T  6237906 agagtaagacctagaaaaactagaagataaaccattagaaatgatttagaggtcaatcagttggattcaaatatagtttatgatagaacactatgggatg 6237807  T
Q  320 atttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 376  Q
    |||||||| || ||| ||| || ||||| ||  | || ||||  |||||||||||||    
T  6237806 atttgatctatatagtcgaccccacttaatggaagaaagcttaattgttgttgttgt 6237750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 205 - 373
Target Start/End: Original strand, 31959635 - 31959803
Alignment:
Q  205 caggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgata 304  Q
    ||||| ||||||| |||  ||||| ||| |||||| ||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  31959635 caggtcaaaagagttaggcgaagacctaggaaaactataagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttatgata 31959734  T
Q  305 gaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgt 373  Q
    |||||||||| ||| |||||||||||||||| || || |||||||  ||||| ||||||||||||||||    
T  31959735 gaacactatggcataatttgatccatgtagcagaccccacttagtaggataaggcttggttgttgttgt 31959803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 249 - 376
Target Start/End: Original strand, 30306190 - 30306317
Alignment:
Q  249 aaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttag 348  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  30306190 aaccattagaaaggatttagaggtcattgagttggatccaaatttggtttatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttag 30306289  T
Q  349 tgtgataatgcttggttgttgttgttgt 376  Q
    || ||||| |||||||||||||||||||    
T  30306290 tgggataaggcttggttgttgttgttgt 30306317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 271 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 3635425 - 3635320
Alignment:
Q  271 gtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgt 370  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||    
T  3635425 gtcaatgagttggatccaaatatggtttttgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgt 3635326  T
Q  371 tgttgt 376  Q
    ||||||    
T  3635325 tgttgt 3635320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 76; E-Value: 6e-35
Query Start/End: Original strand, 15 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 16097350 - 16097192
Alignment:
Q  15 gagatgatgatgttgcgctggatgagtggtaagactagacatgataggattaagaatgacatcattagagagaat------gggggtagcacctatagta 108  Q
    ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||   |||| |||||  ||||||| | ||||||||| |      |||||||||||||||| ||    
T  16097350 gagatgaggatgttgcactggatgagtggtaagactagatgggatatgattagaaatgacaccgttagagagagttagagtgggggtagcacctataata 16097251  T
Q  109 gaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtaga 167  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  16097250 gaaaagttggtagaaaataggcttagatgatttggacatgtagagagaagacctgtaga 16097192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 262 - 376
Target Start/End: Original strand, 227360 - 227474
Alignment:
Q  262 gatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgctt 361  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| |||| | ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| ||||    
T  227360 gatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggctt 227459  T
Q  362 ggttgttgttgttgt 376  Q
    |||||||||||||||    
T  227460 ggttgttgttgttgt 227474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 211 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 45543234 - 45543074
Alignment:
Q  211 aaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacac 310  Q
    |||||||||||||||||| ||   ||||| ||  ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||     
T  45543234 aaaagaggtagaggaagacctggaaaaactataagagaaactattagaaaagatttagaggt-aatgagttcgatccaaatatggtttatgatagaacat 45543136  T
Q  311 tatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttg 372  Q
    |||| | |  ||||||| |||||||||| || |||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  45543135 tatggcgtactttgatctatgtagccgaccccacttagtgggataatgcttgcttgttgttg 45543074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 71; E-Value: 6e-32
Query Start/End: Original strand, 15 - 373
Target Start/End: Original strand, 38434873 - 38435234
Alignment:
Q  15 gagatgatgatgttgcgctggatgagtggtaagactagacatgataggattaagaatgacatcattagagaga--atgggggtagcacctatagtagaaa 112  Q
    ||||||| ||||||||  |||||| ||||||| |||||||  || | |||||  ||||||| |||||||||||  || ||||||||||||||||||||||    
T  38434873 gagatgaggatgttgcattggatgcgtggtaaaactagacgagagaagattagaaatgacaacattagagagagaattggggtagcacctatagtagaaa 38434972  T
Q  113 agttggtagaaaatagacttaga-tgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaatggagaagaaccaggtta 211  Q
    || |||| |||| ||||||| |  || ||| | |||||| |||||||||  |||||| |  | ||||| |||| |||||| |||||| | |  ||| | |    
T  38434973 agatggtggaaactagactttgggtggtttgggcatgtaaagagaagacttgtagatgctttagtaaggagagtagatcatatggaggatagtcagatca 38435072  T
Q  212 aaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacact 311  Q
      ||||| ||||| ||| |||  ||||| |   ||||||| ||||  |||||| ||||| | |||| ||| |||| |||| |||||| |||| ||||| |    
T  38435073 ctagaggcagaggtagacctagaaaaactacaagagaaactattaagaaagatctagagattaatgtgttggatcgaaatttggtttatgattgaacatt 38435172  T
Q  312 atgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgt 373  Q
    ||| | | |||||||||||||||||||||| ||||||||  |||| ||||||||||||||||    
T  38435173 atggcgtaatttgatccatgtagccgatcccacttagtggcataaggcttggttgttgttgt 38435234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 91 - 376
Target Start/End: Original strand, 12141544 - 12141829
Alignment:
Q  91 ggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatc 190  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| ||||| || ||||| || ||| | || ||||| |||||||| |||||| |  | ||||| |||| |||||    
T  12141544 ggggtagcacctatagtagaaaagatggtggaaaagaggcttaggtggtttgggcacgtagaaagaagacctgtagattctctagtaaggagagtagatc 12141643  T
Q  191 aaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaa 290  Q
    | || ||| | |  ||  ||| |||||||||||||||| |||  ||| | ||  ||||||| ||||| ||||| |||||| | ||||| || ||||||||    
T  12141644 agattgaggatagtcaaattacaagaggtagaggaagacctagaaaagctataggagaaactattaggaaagacttagagattaatgacttggatccaaa 12141743  T
Q  291 tatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 376  Q
    |||||| | |||||||||| |||| ||| |||||||| |||||||| | || | |||||| | ||| ||||| |||||||||||||    
T  12141744 tatggtatatgatagaacattatggcatgatttgatcgatgtagccaaccccatttagtggggtaaggcttgattgttgttgttgt 12141829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 66; E-Value: 6e-29
Query Start/End: Original strand, 259 - 376
Target Start/End: Original strand, 9496034 - 9496151
Alignment:
Q  259 aaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatg 358  Q
    |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||||| |||| | | ||||||||||||||||| | || |||||||| || || |    
T  9496034 aaagatttagaggttaatgagttggatccaaatatggtttatgatagaacattatggcgtaatttgatccatgtagccaaccccacttagtgggacaagg 9496133  T
Q  359 cttggttgttgttgttgt 376  Q
    ||||||||||||||||||    
T  9496134 cttggttgttgttgttgt 9496151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 66; E-Value: 6e-29
Query Start/End: Original strand, 245 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 9996754 - 9996623
Alignment:
Q  245 gagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaac 344  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||  ||||||||| ||| ||||||||||||||||||| || ||    
T  9996754 gagaaaccattagaaaggatttagaggtcaacgagttggatccaaatatggtttatgattaaacactatggcataatttgatccatgtagccgaccccac 9996655  T
Q  345 ttagt---gtgataatgcttggttgttgttgt 373  Q
    ||||    | ||||| ||||||||||||||||    
T  9996654 ttagaagagggataaggcttggttgttgttgt 9996623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 252 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 38328489 - 38328367
Alignment:
Q  252 cattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgt 351  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||    ||||||||| ||||   ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| || ||||||||     
T  38328489 cattagaaaggatttagaggtcaatgaag--gatccaaatttggtgcatgatagaacactatggcttcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgg 38328392  T
Q  352 gataatgcttggttgttgttgttgt 376  Q
    ||||| |||||||||||||||||||    
T  38328391 gataaggcttggttgttgttgttgt 38328367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 245 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 12882173 - 12882042
Alignment:
Q  245 gagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaac 344  Q
    ||||||| | ||| ||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||||| | || | | ||||||||||||||||| | |  ||    
T  12882173 gagaaactactaggaaatatttagaggttaatgagttggatccaaatatggtttgtgatagaacattttggcgtaatttgatccatgtagcctacctcac 12882074  T
Q  345 ttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 376  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  12882073 ttagtgggataaggcttggttgttgttgttgt 12882042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 81 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 43752239 - 43751944
Alignment:
Q  81 agagagaatgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaaga 180  Q
    ||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||  |||||   || ||| |     
T  43752239 agagagagttggggtagcacctatagtagaaaaggtggtagaaaataggcttaggtgatttggacatgtagagagaagacctatagattatgtagtaggg 43752140  T
Q  181 agagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagt 280  Q
    |||| |||||| |||||| | |  ||| | |   |||| | ||||||| |||  ||||| ||  ||||||| ||||| |||||||| ||  | |||||||    
T  43752139 agagtagatcagatggaggatactcagatcactggaggcataggaagacctagaaaaactatcagagaaactattaggaaagatttggaaattaatgagt 43752040  T
Q  281 tagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 376  Q
    | || | ||| ||||| | |||||||||||||||   | ||||||||||||| ||||| |  |||||||  || || |||  ||||||||||||||    
T  43752039 tggaccgaaagatggtgtatgatagaacactatgttgtaatttgatccatgtggccgacctcacttagttggaaaaggctcagttgttgttgttgt 43751944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 295 - 376
Target Start/End: Original strand, 15025698 - 15025779
Alignment:
Q  295 gtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 376  Q
    |||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  15025698 gtttttgatagaacactatggcatcgtttgattcatgtagccgatgcaacttagtgggataaggcttggttgttgttgttgt 15025779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 215 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 43573287 - 43573127
Alignment:
Q  215 gaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatg 314  Q
    |||||||||||||| |||  ||||| ||  || |||| | ||| ||||||||| |||| |||||||| |||||||||||| ||| |||| ||||  ||||    
T  43573287 gaggtagaggaagacctagaaaaactataagaaaaacaactaggaaagattta-aggttaatgagttggatccaaatatgatttatgatcgaacgttatg 43573189  T
Q  315 acatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 376  Q
     | | ||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  43573188 gcgtaatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttgt 43573127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 259 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 19337007 - 19336896
Alignment:
Q  259 aaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatg 358  Q
    |||||||||||| | |||||||| |||| ||||||||||| |||||||||| |||| | | ||||||||||||||||| |||| ||||| || ||||| |    
T  19337007 aaagatttagagattaatgagttggatcgaaatatggtttatgatagaacattatggcgtaatttgatccatgtagccaatcccacttattgggataaag 19336908  T
Q  359 cttggttgttgt 370  Q
    ||||||||||||    
T  19336907 cttggttgttgt 19336896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 248 - 374
Target Start/End: Original strand, 30743686 - 30743812
Alignment:
Q  248 aaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaactta 347  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||| | |||||||| |||| ||| ||||||||| || || ||| |  |||||    
T  30743686 aaaccattagaaatgatttagaggtcaatgagttgaatccaaatatgatttataatagaacaatatgtcataatttgatccttgcagtcgaactcactta 30743785  T
Q  348 gtgtgataatgcttggttgttgttgtt 374  Q
    ||| ||||| |||| ||||||||||||    
T  30743786 gtgagataaggctttgttgttgttgtt 30743812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 11 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 4598928 - 4598775
Alignment:
Q  11 agcagagatgatgatgttgcgctggatgagtggtaagactagacatgataggattaagaatgacatcattagagagaatg----ggggtagcacctatag 106  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||  ||||| ||| | ||||||  |||||||||||  |    ||||||||||||||||    
T  4598928 agcagaaatgatgatgttgcgttggatgtgtggtaagactagacgggatagaattcaaaatgacgacattagagagagagagttggggtagcacctatag 4598829  T
Q  107 tagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagac 160  Q
    ||| |||| ||||||||| ||||||| | || ||| ||||| |||| |||||||    
T  4598828 tagtaaagatggtagaaactagactttggtggtttggacatatagaaagaagac 4598775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 23 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 9556720 - 9556366
Alignment:
Q  23 gatgttgcgctggatgagtggtaagactagacatgataggattaagaatgacatcattagagagaatg--ggggtagcacctatagtagaaaagttggta 120  Q
    ||||||| | |||||| ||||||||| |||||  |||| |||||  ||||||| |||||||||||| |  |||||| ||| |||||||||||| | |||     
T  9556720 gatgttgtgttggatgtgtggtaagattagacgggatatgattagaaatgacaacattagagagaaagttggggtaacacttatagtagaaaaat-ggtg 9556622  T
Q  121 gaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggta 220  Q
    |||||||| ||||| || ||||| ||||||||||||||||  |||||| | || ||||||| || | |||| |||||| | |  ||   ||  ||||| |    
T  9556621 gaaaataggcttaggtggtttaggcatgtagagagaagacaagtagattctgtagtaagaaaagtatatcagatggaggatagtcaaactactagaggca 9556522  T
Q  221 gaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatca 320  Q
     ||||||| ||   ||||| ||  || |||| ||||  |||||| ||| | | |||||||| |||| | ||||||||| |||||||||| || |   | |    
T  9556521 aaggaagaccttgaaaaactataagataaactattaagaaagatctagtgattaatgagttggatcaagatatggtttatgatagaacattagggtgtaa 9556422  T
Q  321 tttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 376  Q
    |||||| |||||||||||  | |||||||| ||| | |||||||||||||||||||    
T  9556421 tttgatacatgtagccgactccacttagtgggatgaggcttggttgttgttgttgt 9556366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 91 - 372
Target Start/End: Original strand, 18958907 - 18959192
Alignment:
Q  91 ggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttaga----catgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaa 186  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||| || ||| |     |||| |||||||||||| | || |   || ||||| |||| |    
T  18958907 ggggtagcacctatagtagaaaagatggtggaaaataggcttaggtggtttggttgggcatgcagagagaagacctgcagcttttgtagtaaggagagta 18959006  T
Q  187 gatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatc 286  Q
    ||||| |||||| | |  ||| | |  ||||| ||||||||| |||  ||||| |   ||||||| || || ||||| || ||| | |||||||| ||||    
T  18959007 gatcagatggaggatagtcagatcatcagaggcagaggaagacctagaaaaactacaagagaaactataaggaaagacttggagattaatgagttggatc 18959106  T
Q  287 caaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttg 372  Q
     ||||||||| | |||||||||| |||| ||| |||||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||| ||||||    
T  18959107 aaaatatggtctatgatagaacattatggcataatttgatccatgtagctgaccccacttagtgggataaggcttggttattgttg 18959192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 89 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 43238377 - 43238305
Alignment:
Q  89 tgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacc 161  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| | |||||| ||||||||||    
T  43238377 tgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtaaagagaagacc 43238305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 285 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 9531688 - 9531597
Alignment:
Q  285 tccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 376  Q
    |||||||||||||| |||| ||||| |||| | | ||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  9531688 tccaaatatggtttatgatggaacattatggcgtaatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttgt 9531597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 89 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 44438005 - 44437718
Alignment:
Q  89 tgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaaga 188  Q
    |||||||| | ||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||| || ||| | ||||||||||||||||  || ||| | ||  |||| ||   |||    
T  44438005 tgggggtaacccctatagtagaaaagatggtagaaactagacataggtggtttcggcatgtagagagaagacttgtggattctgtaataaggagtataga 44437906  T
Q  189 tcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatcca 288  Q
    | | ||||||  ||  ||| | |  |||||||| || ||| |||  ||||| || |||||||| ||||  || ||| ||||| | |||||||| ||   |    
T  44437905 tgagatggaggggagtcagatcactagaggtaggggtagacctagaaaaactatatgagaaactattaagaaggatctagagataaatgagttggagaaa 44437806  T
Q  289 aatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 376  Q
    || ||||||||||||||||||||||| | |  ||| || ||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  44437805 aacatggtttttgatagaacactatggcgttgtttaattcatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttgt 44437718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 23 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 9579053 - 9578915
Alignment:
Q  23 gatgttgcgctggatgagtggtaagactagacatgataggattaagaatgacatcattagagagaatgggggtagcacctatagtagaaaagttggtaga 122  Q
    ||||||||| |||||| ||||||||| |||| ||||||| ||||| |||||||   ||||||||| | |||||  ||| |||||||| |||| || |  |    
T  9579053 gatgttgcgttggatgtgtggtaagaatagatatgatagaattaaaaatgacaatgttagagagagttggggtgacacatatagtagtaaagatgatgta 9578954  T
Q  123 aaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacc 161  Q
    |||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||    
T  9578953 aaatagacttaggtggtttggacatgtagagagaagacc 9578915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 289 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 12520146 - 12520060
Alignment:
Q  289 aatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttg 375  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||| | | ||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  12520146 aatatggtttatgataaaacactatggcgtaatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 12520060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #49
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 300 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 12475000 - 12474927
Alignment:
Q  300 tgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgt 373  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  12475000 tgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 12474927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #50
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 303 - 376
Target Start/End: Original strand, 17670680 - 17670753
Alignment:
Q  303 tagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 376  Q
    |||||||||||| | ||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  17670680 tagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttgt 17670753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #51
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 289 - 374
Target Start/End: Original strand, 19863432 - 19863517
Alignment:
Q  289 aatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgtt 374  Q
    |||||||||| |||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||  || |||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  19863432 aatatggtttatgatagaacattatggcatgatttgatccatgtagccgtccccacttagtgggataaagcttggttgttgttgtt 19863517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #52
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 289 - 374
Target Start/End: Original strand, 19867764 - 19867849
Alignment:
Q  289 aatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgtt 374  Q
    |||||||||| |||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||  || |||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  19867764 aatatggtttatgatagaacattatggcatgatttgatccatgtagccgtccccacttagtgggataaagcttggttgttgttgtt 19867849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #53
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 289 - 374
Target Start/End: Original strand, 19872665 - 19872750
Alignment:
Q  289 aatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgtt 374  Q
    |||||||||| |||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||  || |||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  19872665 aatatggtttatgatagaacattatggcatgatttgatccatgtagccgtccccacttagtgggataaagcttggttgttgttgtt 19872750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #54
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 11 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 23714622 - 23714474
Alignment:
Q  11 agcagagatgatgatgttgcgctggatgagtggtaagactagacatgataggattaagaatgacatcattagagagaatgggggtagcacctatagtaga 110  Q
    ||||||||| |  |||||| | |||||| ||||||||||||||||  |||||||||| ||||||  ||||||| ||| | ||| |||||| |||||||||    
T  23714622 agcagagattagaatgttgtgttggatgtgtggtaagactagacaaaataggattaaaaatgacgacattagatagagttggg-tagcacatatagtaga 23714524  T
Q  111 aaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagac 160  Q
    |||| |||| |||| ||||||||  |  ||||| ||||||||||||||||    
T  23714523 aaagatggtggaaactagacttatgtagtttaggcatgtagagagaagac 23714474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #55
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 11 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 24102294 - 24102146
Alignment:
Q  11 agcagagatgatgatgttgcgctggatgagtggtaagactagacatgataggattaagaatgacatcattagagagaatgggggtagcacctatagtaga 110  Q
    ||||||||| |  |||||| | |||||| ||||||||||||||||  |||||||||| ||||||  ||||||| ||| | ||| |||||| |||||||||    
T  24102294 agcagagattagaatgttgtgttggatgtgtggtaagactagacaaaataggattaaaaatgacgacattagatagagttggg-tagcacatatagtaga 24102196  T
Q  111 aaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagac 160  Q
    |||| |||| |||| ||||||||  |  ||||| ||||||||||||||||    
T  24102195 aaagatggtggaaactagacttatgtagtttaggcatgtagagagaagac 24102146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #56
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 219 - 376
Target Start/End: Original strand, 33287549 - 33287706
Alignment:
Q  219 tagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacat 318  Q
    |||||||||| |||  ||||| ||  ||||||| ||||  |||||| ||||  | ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  33287549 tagaggaagacctagaaaaactataagagaaactattaagaaagatctagaaattaatgagttagatcgaaatatggtttatgatagaacattatgacat 33287648  T
Q  319 catttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 376  Q
      |||||||| ||||||| |  | |||||||| || ||  ||||||||||||||||||    
T  33287649 agtttgatccttgtagccaactccacttagtgggacaagacttggttgttgttgttgt 33287706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #57
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 246 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 35755376 - 35755242
Alignment:
Q  246 agaaaccattagaaaagatttagaggtcaatga----gttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatcc 341  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||| ||| |    ||| |||||||||||||||| |||||||||| | || | | |||||||||||| |||||| ||    
T  35755376 agaaactattaggaaagatttagaggttaattaatgggttggatccaaatatggtttatgatagaacattgtgccgtaatttgatccatgcagccgaccc 35755277  T
Q  342 aacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 376  Q
     |||||||| ||||| |||||||||||||| ||||    
T  35755276 tacttagtgggataaggcttggttgttgttcttgt 35755242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #58
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 11 - 87
Target Start/End: Original strand, 2610446 - 2610522
Alignment:
Q  11 agcagagatgatgatgttgcgctggatgagtggtaagactagacatgataggattaagaatgacatcattagagaga 87  Q
    ||||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||| |||||||||||    
T  2610446 agcagagatgaggatgctgcgttggatgagtggtaagactagacaggacaggattaggaatgacaccattagagaga 2610522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #59
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 219 - 371
Target Start/End: Original strand, 13149460 - 13149612
Alignment:
Q  219 tagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacat 318  Q
    ||||||||||  || |||||| ||  ||||||| ||||  |||||||||||||| |||||||   |||||||||| |||  |||||||||| ||||||||    
T  13149460 tagaggaagacttaggaaaactataagagaaactattatgaaagatttagaggttaatgagtagaatccaaatatcgttgatgatagaacattatgacat 13149559  T
Q  319 catttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgtt 371  Q
     ||||||||||| |||||||||  | ||| || |||||  |||||||||||||    
T  13149560 aatttgatccatatagccgatctcaattaatgagataagacttggttgttgtt 13149612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #60
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 276 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 39709298 - 39709202
Alignment:
Q  276 tgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttg 372  Q
    |||||| |||| ||||||||||| |||| |||||||||| | | ||||||||||||||||||| || |||||||| ||||  |||||||||||||||    
T  39709298 tgagttggatcaaaatatggtttatgattgaacactatggcgtaatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggatatggcttggttgttgttg 39709202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #61
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 245 - 357
Target Start/End: Original strand, 41545559 - 41545671
Alignment:
Q  245 gagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaac 344  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||  || |||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||  || |||||||||  ||    
T  41545559 gagaaaccattataaaagatgtagaggtccatgagttgaattcaaatatggtttatgatagaacactatgacttaatttgatttatttagccgatctcac 41545658  T
Q  345 ttagtgtgataat 357  Q
    ||| || ||||||    
T  41545659 ttaatgagataat 41545671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #62
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 245 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 8197669 - 8197538
Alignment:
Q  245 gagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaac 344  Q
    ||||||| ||||  |||||| || || | |||||||| |||  ||||||| | | |||||||| | |||| | || |||||||||||||||||| || ||    
T  8197669 gagaaactattaagaaagatctaaagattaatgagttggatagaaatatgatatatgatagaatattatggcgtcgtttgatccatgtagccgaccctac 8197570  T
Q  345 ttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 376  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  8197569 ttagtgggataatgcttggttgttgttgttgt 8197538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #63
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 245 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 8202429 - 8202298
Alignment:
Q  245 gagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaac 344  Q
    ||||||| ||||  |||||| || || | |||||||| |||  ||||||| | | |||||||| | |||| | || |||||||||||||||||| || ||    
T  8202429 gagaaactattaagaaagatctaaagattaatgagttggatagaaatatgatatatgatagaatattatggcgtcgtttgatccatgtagccgaccctac 8202330  T
Q  345 ttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 376  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  8202329 ttagtgggataatgcttggttgttgttgttgt 8202298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #64
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 11 - 158
Target Start/End: Original strand, 42092437 - 42092584
Alignment:
Q  11 agcagagatgatgatgttgcgctggatgagtggtaagactagacatgataggattaagaatgacatcattagagagaatgggggtagcacctatagtaga 110  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||| || ||||||||||||  |||| |||||  |||||||   ||||||||| | |||||||| |||||| ||||    
T  42092437 agcagagatgatgatgttgcattggatgtgtagtaagactagacgggatatgattagaaatgacaatgttagagagagttggggtagcgcctatactaga 42092536  T
Q  111 aaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaag 158  Q
    |||| ||||||||| ||   |||| |||| | | ||||||||||||||    
T  42092537 aaagatggtagaaactaagattaggtgatctgggcatgtagagagaag 42092584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #65
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 302 - 376
Target Start/End: Original strand, 43832309 - 43832383
Alignment:
Q  302 atagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 376  Q
    |||||||| ||||||  ||||||||||||||||| || |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  43832309 atagaacattatgacggcatttgatccatgtagctgacccaacttagtttgataaggcttggttgttgttgttgt 43832383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #66
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 235 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 12489940 - 12489799
Alignment:
Q  235 aaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtag 334  Q
    ||||| || |||||||| ||||| || ||| ||||| | |||||||| ||   | | ||||||||||||| |||||| || | || |||||| |||||||    
T  12489940 aaaactatatgagaaactattaggaaggatctagagataaatgagttggagaaagacatggtttttgatataacactttggcgtcgtttgattcatgtag 12489841  T
Q  335 ccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 376  Q
    |||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  12489840 ccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttgt 12489799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #67
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 300 - 373
Target Start/End: Original strand, 17429259 - 17429332
Alignment:
Q  300 tgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgt 373  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||| || |||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  17429259 tgatagaacattatgacataatttgattcatgtagccgaccccacttagtgagataaggcttggttgttgttgt 17429332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #68
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 303 - 376
Target Start/End: Original strand, 17626284 - 17626357
Alignment:
Q  303 tagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 376  Q
    |||||||||||| | ||||||| ||||||||||||| ||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  17626284 tagaacactatggcgtcatttgttccatgtagccgaaccaactttgtgggataaggcttggttgttgttgttgt 17626357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #69
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 15 - 127
Target Start/End: Complemental strand, 19337209 - 19337096
Alignment:
Q  15 gagatgatgatgttgcgctggatgagtggtaagact-agacatgataggattaagaatgacatcattagagagaatgggggtagcacctatagtagaaaa 113  Q
    ||||||| |||||| || |||||| ||||||||||| || || ||||||||||  ||||| | ||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||    
T  19337209 gagatgaggatgttacgttggatgtgtggtaagacttaggcaggataggattataaatgagaacattagagagagttggggtagcacctatagtagtaaa 19337110  T
Q  114 gttggtagaaaata 127  Q
    | |||| |||||||    
T  19337109 gatggtggaaaata 19337096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #70
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 11 - 75
Target Start/End: Complemental strand, 24583970 - 24583906
Alignment:
Q  11 agcagagatgatgatgttgcgctggatgagtggtaagactagacatgataggattaagaatgaca 75  Q
    ||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  24583970 agcagagatgaagatgttgtgcgggatgagtggtaagactaaacatgatatgattaagaatgaca 24583906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #71
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 11 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 9647969 - 9647814
Alignment:
Q  11 agcagagatgatgatgttgcgctggatgagtggtaagactagacatgataggattaagaatgacatcattagagagaatgggggtagcacctatagtaga 110  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||  ||||| |||||  |||| || ||||| ||||  | |||| || ||||||||||||    
T  9647969 agcagagatgaggatgttgcgttggatgtgtggtaagactagatgtgataagattagaaatgtcaacattatagag--ttggggcagtacctatagtaga 9647872  T
Q  111 aaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagat 168  Q
    || | |||| |||| |||  |||| || ||| |||||||| | |||||||| ||||||    
T  9647871 aatgatggtggaaactagctttaggtggtttggacatgtaaaaagaagacctgtagat 9647814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #72
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 259 - 370
Target Start/End: Original strand, 45077895 - 45078008
Alignment:
Q  259 aaagatttagaggtcaatgag--ttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataa 356  Q
    |||||||||||| | ||||||  || |||| |||||| |||| ||||||||||  ||| ||| |||||||||||||| |||| || |||||||| |||||    
T  45077895 aaagatttagagattaatgagagttggatcgaaatatagtttatgatagaacataatggcataatttgatccatgtaaccgaccccacttagtgagataa 45077994  T
Q  357 tgcttggttgttgt 370  Q
     |||||||||||||    
T  45077995 agcttggttgttgt 45078008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #73
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 252 - 376
Target Start/End: Original strand, 6219126 - 6219250
Alignment:
Q  252 cattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgt 351  Q
    |||||| |||||||||||| | | |||||| || | ||||||||||| |||||||||| ||||   | ||||||||||||||||| | || || ||||      
T  6219126 cattaggaaagatttagagattagtgagttggaccgaaatatggtttatgatagaacattatggtgtaatttgatccatgtagccaaccccacctagttg 6219225  T
Q  352 gataatgcttggttgttgttgttgt 376  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||    
T  6219226 gataaggcttggttgttattgttgt 6219250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #74
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 11 - 66
Target Start/End: Complemental strand, 451986 - 451931
Alignment:
Q  11 agcagagatgatgatgttgcgctggatgagtggtaagactagacatgataggatta 66  Q
    |||||||||||  |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  451986 agcagagatgagtatgttgcgttagatgagtggtaagactagacatgataggatta 451931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #75
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 248 - 373
Target Start/End: Original strand, 11412865 - 11412992
Alignment:
Q  248 aaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatag---aacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaac 344  Q
    |||| ||||| ||||||| |||| | |||||||| |||||||||||||||| ||||||   |||| ||||   | ||||||||||||||||||| |  ||    
T  11412865 aaactattaggaaagatt-agagattaatgagttggatccaaatatggtttatgatagtagaacattatggtgtaatttgatccatgtagccgaactcac 11412963  T
Q  345 ttagtgtgataatgcttggttgttgttgt 373  Q
    |||||  ||||| ||||||||||||||||    
T  11412964 ttagtaggataaggcttggttgttgttgt 11412992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #76
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 292 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 19334233 - 19334187
Alignment:
Q  292 atggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccga 338  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  19334233 atggtttttgatagaacactatgacgtcatttgattcatgtagccga 19334187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #77
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 295 - 376
Target Start/End: Original strand, 15015149 - 15015230
Alignment:
Q  295 gtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 376  Q
    ||||||||||||||||| ||   || |||||| |||||||||||  |||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||    
T  15015149 gtttttgatagaacactctggtttcgtttgattcatgtagccgacgcaacttagtgggataaggcttggttgctgttgttgt 15015230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #78
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 15 - 137
Target Start/End: Original strand, 30743545 - 30743668
Alignment:
Q  15 gagatgatgatgttgcgctggatgagtggtaagactagacatgataggattaagaatgacatcattag--agagaatgggggtagcacctatagtagaaa 112  Q
    ||||||| ||||||||||  |||||||| |||||||||||  |||||||||  ||||| || | ||||  ||||| | |||||||||| ||| |||||||    
T  30743545 gagatgaggatgttgcgcatgatgagtgctaagactagacgggataggattgggaatgtcaccgttaggaagagagt-ggggtagcacttatggtagaaa 30743643  T
Q  113 agttggtagaaaatagacttagatg 137  Q
    | |||||||||| |||| |||||||    
T  30743644 aattggtagaaattagaattagatg 30743668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #79
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 288 - 369
Target Start/End: Original strand, 33504421 - 33504502
Alignment:
Q  288 aaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttg 369  Q
    ||||||||| | |||||||||| |||| | | ||||||||||| ||||||| || |||||||| ||||| ||||||||||||    
T  33504421 aaatatggtatatgatagaacattatggcgtaatttgatccatctagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttg 33504502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #80
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 290 - 371
Target Start/End: Original strand, 34931631 - 34931712
Alignment:
Q  290 atatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgtt 371  Q
    ||||||||| |||||||||| |||| ||| ||||||||||| ||||||| |  |||||||| || || ||||||||||||||    
T  34931631 atatggtttatgatagaacattatggcataatttgatccatatagccgaccgtacttagtgggacaaggcttggttgttgtt 34931712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #81
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 288 - 376
Target Start/End: Original strand, 3481351 - 3481439
Alignment:
Q  288 aaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 376  Q
    ||||||||| | |||||||||| |||| | | |||||||||||||||| || || |||||||  || || |||||||||||||||||||    
T  3481351 aaatatggtctatgatagaacattatggcgtaatttgatccatgtagctgaccccacttagttggaaaaggcttggttgttgttgttgt 3481439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #82
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 286 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 13443995 - 13443907
Alignment:
Q  286 ccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgtt 374  Q
    ||||||||||||| | |||||||| |||| | |||||||||| |||||||||| || | |||||| ||||| |||| ||| ||||||||    
T  13443995 ccaaatatggtttattatagaacattatggcgtcatttgatcgatgtagccgaccccatttagtgggataaggcttagttattgttgtt 13443907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #83
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 259 - 335
Target Start/End: Original strand, 36650610 - 36650686
Alignment:
Q  259 aaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagc 335  Q
    |||||| ||||| | ||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||| || | ||||||||| ||||||    
T  36650610 aaagatctagagattaatgagttagatcaaaatatagtttatgatagaacactataacgtaatttgatccgtgtagc 36650686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #84
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 296 - 376
Target Start/End: Original strand, 42543440 - 42543520
Alignment:
Q  296 tttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 376  Q
    ||||||||||||| ||||| | |  |||||| ||||||||||  || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  42543440 tttttgatagaacgctatggcgttgtttgattcatgtagccggccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttgt 42543520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #85
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 81 - 128
Target Start/End: Original strand, 227312 - 227359
Alignment:
Q  81 agagagaatgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatag 128  Q
    ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  227312 agagagagtgggggtagcacctatggtagaaaagtttgtagaaaatag 227359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #86
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 293 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 42549917 - 42549834
Alignment:
Q  293 tggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 376  Q
    |||||| ||||||||||  ||| | | ||||||| ||||||||| | || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  42549917 tggtttatgatagaacatcatggcgtaatttgattcatgtagccaaccccacttagtgggataaagcttggttgttgttgttgt 42549834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #87
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 302 - 376
Target Start/End: Original strand, 25384680 - 25384754
Alignment:
Q  302 atagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 376  Q
    ||||||||||||| | | ||||||||||||||||| | |  |||||||| ||||| ||||||| |||||||||||    
T  25384680 atagaacactatggcgtaatttgatccatgtagccaacctcacttagtgggataaggcttggtggttgttgttgt 25384754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #88
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 311 - 373
Target Start/End: Original strand, 36993755 - 36993816
Alignment:
Q  311 tatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgt 373  Q
    |||||| | ||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  36993755 tatgacgtaatttgatccatgtagccta-ccaacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 36993816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #89
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 295 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 624764 - 624687
Alignment:
Q  295 gtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttg 372  Q
    |||||||||||||| |||||  ||  |||||| ||||||||||| ||  ||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  624764 gtttttgatagaacgctatggtatagtttgattcatgtagccgaccccgcttagtgggataaggcttggttgttgttg 624687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #90
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 297 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 4598638 - 4598569
Alignment:
Q  297 ttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttg 366  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||||| |||||| ||||| | |||||| | ||||| |||||||||    
T  4598638 ttttgatagaacactatggcgtcatttgattcatgtaaccgattccacttagcgggataaggcttggttg 4598569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #91
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 292 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 5759076 - 5758995
Alignment:
Q  292 atggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgt 373  Q
    |||||||||||||||||||||||   || |||||| || ||||| || || |||||||  ||||| ||||||||||||||||    
T  5759076 atggtttttgatagaacactatggtgtcgtttgattcaggtagctgaccccacttagttggataaggcttggttgttgttgt 5758995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #92
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 327 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 8560852 - 8560803
Alignment:
Q  327 ccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 376  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||    
T  8560852 ccatgtagccgacccaacttagtgggataagacttggttgttgttgttgt 8560803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #93
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 320 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 10516802 - 10516749
Alignment:
Q  320 atttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgt 373  Q
    |||||||||||||||| ||||  |||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  10516802 atttgatccatgtagctgatctcacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 10516749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #94
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 320 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 16521060 - 16521007
Alignment:
Q  320 atttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgt 373  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| ||| ||||||||||||    
T  16521060 atttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggctcggttgttgttgt 16521007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #95
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 275 - 380
Target Start/End: Original strand, 17581643 - 17581748
Alignment:
Q  275 atgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgtt 374  Q
    |||||||  ||| ||||||| ||| |||||||||| ||||||||  || | || |||||| |||||| |||||||  ||||| | ||||| |||||||||    
T  17581643 atgagttgaatctaaatatgatttatgatagaacaatatgacatatttcggtctatgtagtcgatcccacttagtaggataaagtttggtggttgttgtt 17581742  T
Q  375 gtcgtc 380  Q
    ||||||    
T  17581743 gtcgtc 17581748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #96
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 11 - 87
Target Start/End: Original strand, 7825276 - 7825352
Alignment:
Q  11 agcagagatgatgatgttgcgctggatgagtggtaagactagacatgataggattaagaatgacatcattagagaga 87  Q
    ||||||||| | ||||||||| |||||| |||||||||||||||  |||| |||||  |||||||  ||||||||||    
T  7825276 agcagagattaggatgttgcgttggatgtgtggtaagactagactggatatgattagaaatgacactattagagaga 7825352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #97
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 292 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 12470978 - 12470894
Alignment:
Q  292 atggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 376  Q
    ||||||||||||| | ||||||| | || |||| | ||||||||||| || | |||||| ||||| ||||||| |||||||||||    
T  12470978 atggtttttgatatatcactatggcgtcgtttgcttcatgtagccgaccccatttagtgggataaggcttggtggttgttgttgt 12470894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #98
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 320 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 15775898 - 15775842
Alignment:
Q  320 atttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 376  Q
    ||||| ||||||||||||| || ||||||||  |||| |||||||||||||||||||    
T  15775898 atttggtccatgtagccgaccccacttagtggaataaggcttggttgttgttgttgt 15775842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #99
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 290 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 28960294 - 28960210
Alignment:
Q  290 atatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgtt 374  Q
    ||||||||||||||||| |||||||   || |||||| ||||||| |||  | | |||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  28960294 atatggtttttgatagagcactatggtgtcgtttgattcatgtagtcgactccatttagtgggataaggcttggttgttgttgtt 28960210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #100
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 258 - 374
Target Start/End: Original strand, 32402667 - 32402783
Alignment:
Q  258 aaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataat 357  Q
    ||||||| ||||| | |||||||| |||  ||||| ||| | |||||||||| ||||   |||||||||||| |||| ||||||  ||||||| |||||     
T  32402667 aaaagatctagagattaatgagttggatagaaataaggtatatgatagaacattatggtttcatttgatccacgtagacgatcctgcttagtgggataag 32402766  T
Q  358 gcttggttgttgttgtt 374  Q
     ||||| ||||||||||    
T  32402767 acttggctgttgttgtt 32402783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #101
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 300 - 376
Target Start/End: Original strand, 33393319 - 33393394
Alignment:
Q  300 tgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 376  Q
    |||||||||| |||| |||  ||||||||||||| |||| || ||||| || ||||| |||||||||||||||||||    
T  33393319 tgatagaaca-tatgtcatagtttgatccatgtaaccgaccccacttactgggataaagcttggttgttgttgttgt 33393394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #102
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 217 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 37470289 - 37470124
Alignment:
Q  217 ggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgac 316  Q
    |||||||||||| || | ||||| ||  ||||||| ||||| | |||| ||||| | |||||||| |||| ||||||||  | |||||||||| ||||      
T  37470289 ggtagaggaagacctgaaaaaactataagagaaactattaggacagatctagagattaatgagttggatcgaaatatggcatatgatagaacattatggt 37470190  T
Q  317 atcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatg----cttggttgttgttgttgtcg 378  Q
     |  |||||||||||||||  |||| |||||||| ||||| |    || |||||||||||||||||    
T  37470189 gtagtttgatccatgtagctaatcccacttagtgggataaggctctctcggttgttgttgttgtcg 37470124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #103
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 275 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 186230 - 186135
Alignment:
Q  275 atgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgt 370  Q
    ||||||| ||||||||||  ||||  |||||||||  ||| ||| ||||||| ||||| ||||| |  |||||||| ||||| |||||||||||||    
T  186230 atgagttggatccaaataaagtttaagatagaacatcatgtcataatttgattcatgtggccgacctcacttagtgggataaagcttggttgttgt 186135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #104
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 81 - 198
Target Start/End: Original strand, 3481134 - 3481248
Alignment:
Q  81 agagagaatgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaaga 180  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||   ||| |||| ||||| || ||||| || ||| |||||||||||||||||||  ||||| | || | |||     
T  3481134 agagggaattggggtagcacctatagta---aagatggtggaaaacaggcttaggtggtttggacatgtagagagaagacctatagattctgtagcaagg 3481230  T
Q  181 agagaagatcaaatggag 198  Q
    |||| |||||| ||||||    
T  3481231 agagtagatcagatggag 3481248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #105
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 45 - 152
Target Start/End: Original strand, 7615251 - 7615358
Alignment:
Q  45 aagactagacatgataggattaagaatgacatcattagagagaatgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttaga 144  Q
    ||||||||||  ||||||| ||  ||||||  ||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||| ||||  ||| |||  |||| |  ||||||    
T  7615251 aagactagacgggataggactagaaatgaccacattagagagacttggggtaacacctatagtagaaaagatggtgcaaactagggttaggttgtttaga 7615350  T
Q  145 catgtaga 152  Q
    ||||||||    
T  7615351 catgtaga 7615358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #106
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 321 - 376
Target Start/End: Original strand, 14444899 - 14444954
Alignment:
Q  321 tttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 376  Q
    ||||||||||||||||   || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  14444899 tttgatccatgtagccatccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttgt 14444954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #107
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 299 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 887139 - 887065
Alignment:
Q  299 ttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataat-gcttggttgttgttg 372  Q
    ||||||||||| |||| | | |||||||||||||||| || || |||| ||| |||||| |||||||||||||||    
T  887139 ttgatagaacattatggcgtaatttgatccatgtagctgaccccacttggtgggataatggcttggttgttgttg 887065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #108
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 259 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 4682291 - 4682253
Alignment:
Q  259 aaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtt 297  Q
    |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  4682291 aaagatttagaggttaatgagttggatccaaatatggtt 4682253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #109
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 301 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 14197279 - 14197205
Alignment:
Q  301 gatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttg 375  Q
    |||||| || ||||||||| |||||| |||||| |||| |  ||||| || | ||||||||||||||||||||||    
T  14197279 gatagagcattatgacatcgtttgattcatgtacccgacctcacttactggggtaatgcttggttgttgttgttg 14197205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #110
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 292 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 33594354 - 33594272
Alignment:
Q  292 atggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgat-ccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgt 373  Q
    |||||||| |||||||||||||||  || |||||  ||||||| |||| || ||||| |||||||| |||| |||||||||||    
T  33594354 atggttttggatagaacactatgatgtcgtttgactcatgtagtcgatccccacttaatgtgataaagctttgttgttgttgt 33594272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #111
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 259 - 313
Target Start/End: Original strand, 36616856 - 36616910
Alignment:
Q  259 aaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactat 313  Q
    |||||| ||||| | ||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||    
T  36616856 aaagatctagagattaatgagttagatcaaaatatagtttatgatagaacactat 36616910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #112
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 83 - 161
Target Start/End: Original strand, 38860165 - 38860243
Alignment:
Q  83 agagaatgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacc 161  Q
    ||||| |||||| |||||| |||||||||||| | || |||||||| ||||| || ||||| ||| |||| ||||||||    
T  38860165 agagagtgggggcagcacccatagtagaaaagattgtggaaaataggcttaggtggtttaggcatttagaaagaagacc 38860243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #113
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 78 - 155
Target Start/End: Original strand, 6218954 - 6219031
Alignment:
Q  78 attagagagaatgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagag 155  Q
    |||||| ||| | |||||||||| ||||||||||||| | || || ||||| ||||| || ||| |||||||||||||    
T  6218954 attagatagagttggggtagcacttatagtagaaaagatagtggataataggcttaggtggtttggacatgtagagag 6219031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #114
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 81 - 134
Target Start/End: Original strand, 11412711 - 11412764
Alignment:
Q  81 agagagaatgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttag 134  Q
    ||||||| | |||||||||||||||||||||||  |||| |||||||| |||||    
T  11412711 agagagagttggggtagcacctatagtagaaaatatggtggaaaataggcttag 11412764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #115
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 343 - 376
Target Start/End: Original strand, 14530532 - 14530565
Alignment:
Q  343 acttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 376  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  14530532 acttagtgggataatgcttggttgttgttgttgt 14530565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #116
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 300 - 349
Target Start/End: Original strand, 19224990 - 19225039
Alignment:
Q  300 tgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagt 349  Q
    ||||||||||||||||  || |||||||||||||||||| || |||||||    
T  19224990 tgatagaacactatgatgtcgtttgatccatgtagccgaccccacttagt 19225039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #117
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 320 - 373
Target Start/End: Original strand, 32706472 - 32706525
Alignment:
Q  320 atttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgt 373  Q
    |||||||  |||||| |||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  32706472 atttgatggatgtagtcgattccacttagtgggataatgcttggttgttgttgt 32706525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #118
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 320 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 45483038 - 45482989
Alignment:
Q  320 atttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttg 369  Q
    |||||||| |||||||||| || |||||||| ||||| ||||||||||||    
T  45483038 atttgatctatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttg 45482989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #119
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 307 - 371
Target Start/End: Original strand, 522445 - 522509
Alignment:
Q  307 acactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgtt 371  Q
    |||||||| | |||||||||||||||||| ||||  ||||| || ||||| |||| |||||||||    
T  522445 acactatggcgtcatttgatccatgtagcagatcacacttaatgggataaggctttgttgttgtt 522509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #120
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 94 - 134
Target Start/End: Original strand, 786833 - 786873
Alignment:
Q  94 gtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttag 134  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||    
T  786833 gtagcacctatagtagaaaagatggcagaaactagacttag 786873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #121
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 278 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 3720510 - 3720438
Alignment:
Q  278 agttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtg 350  Q
    |||| |||| ||| ||||||| |||||||||| ||||   | ||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  3720510 agttggatcgaaaaatggtttatgatagaacattatggtgtaatttgatccatgtagccgaccccacttagtg 3720438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #122
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 306 - 350
Target Start/End: Original strand, 9078792 - 9078836
Alignment:
Q  306 aacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtg 350  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||||||||| || ||||||||    
T  9078792 aacattatgacatcatatgatccatgtagccgagcccacttagtg 9078836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #123
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 104 - 160
Target Start/End: Original strand, 41858744 - 41858800
Alignment:
Q  104 tagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagac 160  Q
    ||||||||||| |||| |||| | | |||||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  41858744 tagtagaaaagatggtggaaactgggcttagatggtttggacatgtagagagaagac 41858800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 234; Significance: 1e-129; HSPs: 168)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 15 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 27450533 - 27450180
Alignment:
Q  15 gagatgatgatgttgcgctggatgagtggtaagactagacatgataggattaagaatgacatcattagagagaatgggggtagcacctatagtagaaaag 114  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  27450533 gagatgaggatgttgcgctggatgagtggtaagactagacatgatagaat----aatgacaccattagagagagtgggggtagcacctatagtagaaaag 27450438  T
Q  115 ttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaa 214  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  27450437 ttggtagaaaataggcttagatggttttgacatgtagagagaagacccgtagatgccgttgtaagaagagtagatcaaatggagtagaatcaggttaaaa 27450338  T
Q  215 gaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatg 314  Q
    |||||| ||||||| ||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  27450337 gaggtaaaggaagacctaagaaaatcattcgagaaaccattggaaaagatttagaggtcaatgagttggatccaaatat-gattttgatagaacactatg 27450239  T
Q  315 acatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgt 373  Q
     | ||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| ||||||||| ||||||    
T  27450238 gcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgctgttgt 27450180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 11 - 376
Target Start/End: Original strand, 436147 - 436514
Alignment:
Q  11 agcagagatgatgatgttgcgctggatgagtggtaagactagacatgataggattaagaatgacatcattagagagaa--tgggggtagcacctatagta 108  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||   ||||||||||||||||||||    
T  436147 agcagagatgaggatgttgcgttggatgagtcgtaagactagacatgataggattaagaatgacaccattagagagagagtgggggtagcacctatagta 436246  T
Q  109 gaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaatggagaagaaccagg 208  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||| ||||||||||||| |||  || |    
T  436247 gaaaagttggtagaaaataggcttagatgatttgggcatgtagagagaagacctgtagatgccgtggtaagaagagtagatcaaatggaggagagtcaag 436346  T
Q  209 ttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaac 308  Q
    |||||||||||||||||||| ||| |||||| ||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||  |||||||| |||| | |||||||||    
T  436347 ttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccactagaaaggatttagaggtcaatgagttgaatccaaatttggtgtatgatagaac 436446  T
Q  309 actatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 376  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  436447 actatggcatcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttgt 436514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 223; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 11 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 48622905 - 48622543
Alignment:
Q  11 agcagagatgatgatgttgcgctggatgagtggtaagactagacatgataggattaagaatgacatcattagagagaatgggggtagcacctatagtaga 110  Q
    ||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  48622905 agcagagatgaggatgttgctttggatgagtggtaagactagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagtgggggtagcacccatagtaga 48622806  T
Q  111 aaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaatggagaagaaccaggtt 210  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| ||| | ||||||||||||||||||||| || |||| ||||||| |||||||||||||||| |||  || |||    
T  48622805 aaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacccgtaaatgccgtggtaagaaaagaagatcaaatggaggagagtcaagtt 48622706  T
Q  211 aaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacac 310  Q
    |||||||||||||||||| ||| |||||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| | |||||||||||    
T  48622705 aaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaatcattagaaaagatttagaggtcaatgagtttgatccaaatttggtgtatgatagaacac 48622606  T
Q  311 tatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgt 373  Q
    |||| | |||||| |||||||||||||| || |||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  48622605 tatggcgtcatttaatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 48622543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 11 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 31960178 - 31959814
Alignment:
Q  11 agcagagatgatgatgttgcgctggatgagtggtaagactagacatgataggattaagaatgacatcattagagagaa--tgggggtagcacctatagta 108  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||   ||||||||||||||||||||    
T  31960178 agcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagactagacaggataggattaggaatgacaccattagagagagagtgggggtagcacctatagta 31960079  T
Q  109 gaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaatggagaagaaccagg 208  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||| |||  || |    
T  31960078 gaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacccgtagatgccgtggtaagaagagtagatcaaatggaggagagtcaag 31959979  T
Q  209 ttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaac 308  Q
    |||||||||||||||||||| ||| |||||| ||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||| | |||||||||    
T  31959978 ttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaactattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaac 31959879  T
Q  309 actatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgt 373  Q
    |||||| | ||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  31959878 actatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 31959814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 11 - 376
Target Start/End: Original strand, 33227127 - 33227494
Alignment:
Q  11 agcagagatgatgatgttgcgctggatgagtggtaagactagacatgataggattaagaatgacatcattagagagaa--tgggggtagcacctatagta 108  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||   ||||||||||||||||||||    
T  33227127 agcagagatgaggatgttgcgctggatgagtggtaagactagacatgataggattaagaatgacaccattagagagagagtgggggtagcacctatagta 33227226  T
Q  109 gaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaatggagaagaaccagg 208  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||  ||| | |||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||| ||||||||||||  |||  || |    
T  33227227 gaaaagttggtagaaaataggcttagattgtttgggcatgtagagagaagacccgtagatgccgtgttaagaagagtagatcaaatggaagagagtcaag 33227326  T
Q  209 ttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaac 308  Q
    |||||||||||||| ||||| ||| |||||| ||| || ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||| | |||||||||    
T  33227327 ttaaaagaggtagatgaagacctaggaaaactattagaaaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaac 33227426  T
Q  309 actatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 376  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||  |||| ||||||||||| |||||||    
T  33227427 actatgacgtcatttgatccatgtagccgatcccacctagtggaataaggcttggttgtttttgttgt 33227494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 11 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 48174457 - 48174090
Alignment:
Q  11 agcagagatgatgatgttgcgctggatgagtggtaagactagacatgataggattaagaatgacatcattagagagaa--tgggggtagcacctatagta 108  Q
    |||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||   |||||||| |||||||||||    
T  48174457 agcaaagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagactagacatgatatgattaggaatgacaccattagagagagagtgggggtaacacctatagta 48174358  T
Q  109 gaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaatggagaagaaccagg 208  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||| |||  || |    
T  48174357 gaaaagttggtagaaaataggcttagatgatttgggcatgtagagagaagacccgtagatgccgtggtaagaagagtagatcaaatggaggagagtcaag 48174258  T
Q  209 ttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaac 308  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||| | ||||| |||    
T  48174257 ttaaaagaggtagaggaagacctaagaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgataaaac 48174158  T
Q  309 actatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 376  Q
    | |||| | |||||||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  48174157 attatggcgtcatttgatccatgtagcagaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttgt 48174090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 213; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 11 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 52569879 - 52569512
Alignment:
Q  11 agcagagatgatgatgttgcgctggatgagtggtaagactagacatgataggattaagaatgacatcattagagagaa--tgggggtagcacctatagta 108  Q
    ||||||||| | ||||||| | |||||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||   ||||||||||||||||||||    
T  52569879 agcagagatcaggatgttgtgttggatgaggggtaagactagacaggataggattaggaatgacaccattagagagagagtgggggtagcacctatagta 52569780  T
Q  109 gaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaatggagaagaaccagg 208  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||| |||  || |    
T  52569779 gaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacccgtagatgccgtggtaagaagagtagatcaaatggaggagagtcaag 52569680  T
Q  209 ttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaac 308  Q
    |||||||||||||||||||| ||| |||||| |||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||| | |||||||||    
T  52569679 ttaaaagaggtagaggaagacctacgaaaactattaaagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaac 52569580  T
Q  309 actatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 376  Q
    |||||| | ||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  52569579 actatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttgt 52569512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 208; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 11 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 1777379 - 1777016
Alignment:
Q  11 agcagagatgatgatgttgcgctggatgagtggtaagactagacatgataggattaagaatgacatcattagagagaatgggggtagcacctatagtaga 110  Q
    |||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||   |||||||||||||| |    
T  1777379 agcaaagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagactagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagtggaaatagcacctatagtaaa 1777280  T
Q  111 aaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaatggagaagaaccaggtt 210  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||| |||||||||||| | ||||| |||| |||||||||| ||||||||||||| |||  || |||    
T  1777279 aaagttggtagaaaataggcttagatggtttggacatctagagagaagactcatagatgccgtggtaagaagagtagatcaaatggaggagagtcaagtt 1777180  T
Q  211 aaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacac 310  Q
    |||||||||||||||||| ||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| | ||||||||||     
T  1777179 aaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacag 1777080  T
Q  311 tatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgtt 374  Q
    |||| | ||||||||||||||||||||| || ||||| || ||||| |||||||||||||||||    
T  1777079 tatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttaatgggataaggcttggttgttgttgtt 1777016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 208; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 11 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 33191212 - 33190846
Alignment:
Q  11 agcagagatgatgatgttgcgctggatgagtggtaagactagacatgataggattaagaatgacatcattagagagaa--tgggggtagcacctatagta 108  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||| |||||||| |||||||||||   ||||||||||||||||||||    
T  33191212 agcagagatgaggatgttgcgctggatgagtggtaagattagataggataggattaggaatgacaccattagagagagagtgggggtagcacctatagta 33191113  T
Q  109 gaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaatggagaagaaccagg 208  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  ||| | |||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||| | |||||||||||||||||  || |    
T  33191112 gaaaagttggtagaaaatagacttagattgtttgggcatgtagagagaagacccgtagatgccgtgttaagaagggtagatcaaatggagaagagtcaag 33191013  T
Q  209 ttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaac 308  Q
    |||||||||||||||||||| ||| |||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||| |||| | |||||||||    
T  33191012 ttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttgaatccaaatttggtgtatgatagaac 33190913  T
Q  309 actatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttg 375  Q
    |||||||| |||||||| |||||||||||| || || ||||| ||||| ||||||||||| ||||||    
T  33190912 actatgacgtcatttgacccatgtagccgaccccacctagtgggataaggcttggttgtttttgttg 33190846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 11 - 376
Target Start/End: Original strand, 4440773 - 4441138
Alignment:
Q  11 agcagagatgatgatgttgcgctggatgagtggtaagactagacatgataggattaagaatgacatcattagagagaatgggggtagcacctatagtaga 110  Q
    ||||||||| | ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  4440773 agcagagattaggatgttgcgttcgatgagtggtaagactagacatgataggattaggaatggcaccattagagagagtgggggcagcacctatagtaga 4440872  T
Q  111 aaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaatggagaagaaccaggtt 210  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| ||| | ||| |||||||||||||||||||| | || |||||||||| ||||||||||||| |||  || |||    
T  4440873 aaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatctagagagaagacccgtagatgctgtggtaagaagagtagatcaaatggaggagagtcaagtt 4440972  T
Q  211 aaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacac 310  Q
    |||||||||||||||||| ||| |||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||| | |||||||||||    
T  4440973 aaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacac 4441072  T
Q  311 tatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 376  Q
    |||| | ||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||| || || ||||||||    
T  4441073 tatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttcgtcgtcgttgttgt 4441138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 203; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 11 - 374
Target Start/End: Original strand, 56375208 - 56375573
Alignment:
Q  11 agcagagatgatgatgttgcgctggatgagtggtaagactagacatgataggattaagaatgacatcattagagagaatg--ggggtagcacctatagta 108  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||| |||||||||||  |  ||||||||||||||| ||    
T  56375208 agcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagactagacaagataagattaggaatgacaccattagagagagagtaggggtagcacctataata 56375307  T
Q  109 gaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaatggagaagaaccagg 208  Q
    ||||||||||||||||| || |||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| |||| |||||||| |||  || |    
T  56375308 gaaaagttggtagaaaacaggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacccgtagatgccgtggtaagaagagtagataaaatggaggagagtcaag 56375407  T
Q  209 ttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaac 308  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||| |||| | |||||||||    
T  56375408 ttaaaagaggtagaggaagacctaagaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtgaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaac 56375507  T
Q  309 actatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgtt 374  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||| |  |||||||| |||||  ||||||||||||||||    
T  56375508 actatgacgtcatttgatccatgtagccgacctcacttagtgggataagacttggttgttgttgtt 56375573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 193; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 11 - 376
Target Start/End: Original strand, 53707712 - 53708079
Alignment:
Q  11 agcagagatgatgatgttgcgctggatgagtggtaagactagacatgataggattaagaatgacatcattaga--gagaatgggggtagcacctatagta 108  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||  |||| ||| ||||||||||||||||    
T  53707712 agcagagatgaggatgttgcgttggatgagtagtaagactagacatgataggactaggaatgacaccattagaaagagagtggaggtagcacctatagta 53707811  T
Q  109 gaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaatggagaagaaccagg 208  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| | ||||||||||| | |  || |    
T  53707812 gaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacccgtagatgccgtggtaagaagagtatatcaaatggaggatagtcaag 53707911  T
Q  209 ttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaac 308  Q
    |||||||||||||||||||| | | |||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||| | |||||||||    
T  53707912 ttaaaagaggtagaggaagaccgaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaac 53708011  T
Q  309 actatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 376  Q
    |||||||| ||||||||||||| ||| |||    |||||||| ||||| ||||| |||||||||||||    
T  53708012 actatgacgtcatttgatccatttagtcgacatcacttagtgggataaggcttgattgttgttgttgt 53708079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 182; E-Value: 3e-98
Query Start/End: Original strand, 15 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 39100893 - 39100533
Alignment:
Q  15 gagatgatgatgttgcgctggatgagtggtaagactagacatgataggattaagaatgacatcattagagagaatgggggtagcacctatagtagaaaag 114  Q
    ||||||| ||||||||||   |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||    
T  39100893 gagatgaggatgttgcgccaaatgagtggtaagactagaaatgataggattaggaatgacaccattagagagagtgggggtagcacctatagaagaaaag 39100794  T
Q  115 ttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaa 214  Q
    ||| |||||||||| |||||||| |||  |||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||| |||||| |||||  | |  ||||||||||    
T  39100793 ttgatagaaaataggcttagatggtttgaacatgtagagagaagatccgtagat-gcgttgtaagaagagtagatcagatggaagatagtcaggttaaaa 39100695  T
Q  215 gaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatg 314  Q
    |||||||||||||| ||| |||||| ||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||| | |||||||| ||||    
T  39100694 gaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttggaggtcaatgagttggatccaaatattgtttatcatagaacattatg 39100595  T
Q  315 acatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 376  Q
     | | || | |||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  39100594 gcgtaatataatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttgt 39100533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 181; E-Value: 1e-97
Query Start/End: Original strand, 11 - 376
Target Start/End: Original strand, 43433836 - 43434209
Alignment:
Q  11 agcagagatgatgatgttgcgctggatgagtggtaagactagacatgataggattaagaatgacatcattagagagaa--------tgggggtagcacct 102  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||         ||||||||||||||    
T  43433836 agcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggcaagactagacaagataggattaggaatgacaccattagagagagagagagagtgggggtagcacct 43433935  T
Q  103 atagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaatggagaaga 202  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| | ||||||||||| |||    
T  43433936 atagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacccgtagatgccgtggtaagaagagtaaatcaaatggaggaga 43434035  T
Q  203 accaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttga 302  Q
      || ||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||| |||||||||||  ||| |||||||||||||||||||  ||||||||| || | |  ||    
T  43434036 gtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattgaaaatgatttagaggtcaatgagtcggatccaaatttgatgtagga 43434135  T
Q  303 tagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 376  Q
    |||||||||| | | ||||||||||||||||| ||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  43434136 tagaacactacggcgtcatttgatccatgtagtcgagcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttgt 43434209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 173; E-Value: 8e-93
Query Start/End: Original strand, 15 - 374
Target Start/End: Original strand, 27983122 - 27983476
Alignment:
Q  15 gagatgatgatgttgcgctggatgagtggtaagactagacatgataggattaagaatgacatcattagagagaa--tgggggtagcacctatagtagaaa 112  Q
    ||||||| ||| ||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||   || |||||||||||||||||||||    
T  27983122 gagatgaggatattgtgctagatgagtggtaagactatacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgagggtagcacctatagtagaaa 27983221  T
Q  113 agttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaatggagaagaaccaggttaa 212  Q
    |||||||||        |||||||| |||  ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||| |||  ||||||||    
T  27983222 agttggtagg-------cttagatggtttgaacatgtagagagaagactcgtagatgccgttgtaagaagagtatatcaaatggaggagagtcaggttaa 27983314  T
Q  213 aagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacacta 312  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||| ||||||| || |||| |||||||| |||| |||||||||||    
T  27983315 aagaggtagaggaagacataagaaaaccattcgataaacctttagaaaagatttagagttcaatgaattggatcaaaatatggatttttatagaacacta 27983414  T
Q  313 tgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgtt 374  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| | ||| || ||||| | |||||||||||||||    
T  27983415 tgacgtcatttgatccatgtagccgatcccaattaatgggataaggtttggttgttgttgtt 27983476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 172; E-Value: 3e-92
Query Start/End: Original strand, 24 - 376
Target Start/End: Original strand, 37797783 - 37798136
Alignment:
Q  24 atgttgcgctggatgagtggtaagactagacatgataggattaagaatgacatcattagagagaa--tgggggtagcacctatagtagaaaagttggtag 121  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| |||||  ||||||| |||||||||||   ||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  37797783 atgttgcgttggatgagtgataagactagacatgataagattagaaatgacaccattagagagagagtggaggtagcacctatagtagaaaagttggtag 37797882  T
Q  122 aaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtag 221  Q
    ||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||  ||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||  |||  ||||||||||||  |||    
T  37797883 aaaataggcttagatggtttggacatgtagagagaagattcgtagatgccgtcgtaagaagagtagatcaaatggatgagagtcaggttaaaaga-ttag 37797981  T
Q  222 aggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcat 321  Q
    ||||||| ||| |||||| ||| |||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||    
T  37797982 aggaagatctaggaaaactattagagaaatcattagaaaggatttagaagtcaatgagttgaatccaaatatggtttatgatagaacaatatgacgtcat 37798081  T
Q  322 ttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 376  Q
    |||||| ||||||||||  | | |||||| ||||| |||||||| ||||||||||    
T  37798082 ttgatcaatgtagccgactccatttagtgggataaggcttggttattgttgttgt 37798136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 169; E-Value: 2e-90
Query Start/End: Original strand, 110 - 374
Target Start/End: Original strand, 32479057 - 32479321
Alignment:
Q  110 aaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaatggagaagaaccaggt 209  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||| ||||| |||||  ||||||||||||||| ||||||||||||| |||  |||||    
T  32479057 aaaagttggtagaaaataggcttagatggtttggacatgtagagaggagacctgtagaggccgttgtaagaagagtagatcaaatggaggagagacaggt 32479156  T
Q  210 taaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaaca 309  Q
    | ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||    
T  32479157 tgaaagaggtagaggaagacctaagaaaaccattcgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttggatcaaaatatggtttttgatagaaca 32479256  T
Q  310 ctatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgtt 374  Q
    ||||| | ||||||||||||||||||||| || ||||||||  | || |||||||||||||||||    
T  32479257 ctatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtggaaaaaggcttggttgttgttgtt 32479321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 167; E-Value: 3e-89
Query Start/End: Original strand, 11 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 23906665 - 23906297
Alignment:
Q  11 agcagagatgatgatgttgcgctggatgagtggtaagactagacatgataggattaagaatgacatcattagagagaa--------tgggggtagcacct 102  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||         ||||||||||||||    
T  23906665 agcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggcaagactagacaagataggattaggaatgacaccattagagagagagagagagtgggggtagcacct 23906566  T
Q  103 atagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaatggagaaga 202  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||   ||||||||||||||||  |||||| |||| |||||||||| |||| |||||||| |||    
T  23906565 atagtagaaaagtttgtagaaaataggcttagatggtttgagcatgtagagagaagac--gtagatgccgtggtaagaagagtagattaaatggaggaga 23906468  T
Q  203 accaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttga 302  Q
      || ||||||| ||||| | ||||| |||  ||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||| | |||    
T  23906467 gtcaagttaaaaaaggtaaatgaagacctagaaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatga 23906368  T
Q  303 tagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgt 373  Q
    |||||||||||| | |||||||||||||||||| || || |||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  23906367 tagaacactatggcgtcatttgatccatgtagctgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 23906297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 160; E-Value: 5e-85
Query Start/End: Original strand, 11 - 378
Target Start/End: Original strand, 28236103 - 28236469
Alignment:
Q  11 agcagagatgatgatgttgcgctggatgagtggtaagactagacatgataggattaagaatgacatcattagagagaatgggggtagcacctatagtaga 110  Q
    ||||||||| |||||| |||  ||||||| |||||||| |||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  28236103 agcagagattatgatgctgcattggatgaatggtaagattagatatgataggattaggaatgacaccattagagagagtgggggtagcacctatagtaga 28236202  T
Q  111 aaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaatggagaagaaccaggtt 210  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||| ||| | ||||||||||||||||  ||||||  ||| ||||||||||  |||||||||| | |||| || |||    
T  28236203 aaagttggtggaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacttgtagatgtcgtcgtaagaagagttgatcaaatggcggagaatcaagtt 28236302  T
Q  211 aaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacac 310  Q
    ||||  |||||||||||| ||| |||||| ||| |||||| | ||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||| |     
T  28236303 aaaa-tggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaatctttataaatgatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtttatgatagaatat 28236401  T
Q  311 tatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgtcg 378  Q
    ||||   | |||||||| |||||||||| || |||||||| |||||  ||||||||||||||||||||    
T  28236402 tatggtgtaatttgatctatgtagccgaccccacttagtgggataagacttggttgttgttgttgtcg 28236469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 158; E-Value: 7e-84
Query Start/End: Original strand, 14 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 37773811 - 37773486
Alignment:
Q  14 agagatgatgatgttgcgctggatgagtggtaagactagacatgataggattaagaatgacatcattagagagaatg-ggggtagcacctatagtagaaa 112  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| | ||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||    
T  37773811 agagatgagaatgttgcgctggatgagtggtaagactagacatgatagaattatgaatgataccattagagagagtaaggggtagcacctatagtagaaa 37773712  T
Q  113 agttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaatggagaagaaccaggttaa 212  Q
    ||| |||||||||||| |||||||| ||| | |||||||| ||| |||||||| ||| ||||||||| |||| ||||||||||||  |||  ||  ||||    
T  37773711 agtcggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagatagacgacccgtaaatatcgttgtaagtagagtagatcaaatggatgagagtcaatttaa 37773612  T
Q  213 aagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacacta 312  Q
    |||||||||| ||| | ||| |||||| ||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||| || |||||| |||||||||||||    
T  37773611 aagaggtagatgaatacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttggaggtcaatgagttggatccagatttggtttatgatagaacacta 37773512  T
Q  313 tgacatcatttgatccatgtagccga 338  Q
    |||||| |||||||| || |||||||    
T  37773511 tgacataatttgatctatatagccga 37773486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 157; E-Value: 3e-83
Query Start/End: Original strand, 11 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 47265566 - 47265193
Alignment:
Q  11 agcagagatgatgatgttgcgctggatgagtggtaagactagacatgataggattaagaatgacatcat--tagagagaatgggggtagcacctatagta 108  Q
    |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||  |||||||| |||||||| |||||||||||    
T  47265566 agcaaagatgaggatgttgcgctggatgagtggtaagactagacatgataagattatgaatgacaccattatagagagagtgggggtaacacctatagta 47265467  T
Q  109 gaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagac-------ccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaatggagaag 201  Q
    |||||| | |||||||||||  ||||||||||| | ||||||||||||||||       |||||||| |||| |||||||||| |||  |||||||| ||    
T  47265466 gaaaaggtagtagaaaataggtttagatgatttgggcatgtagagagaagacacgtagtccgtagatgccgtcgtaagaagagtagactaaatggaggag 47265367  T
Q  202 aaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttg 301  Q
    |  |  ||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||| || | | ||    
T  47265366 attctagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaagaatttagaggtcaatgagttggatccaaatttgatctatg 47265267  T
Q  302 atagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttg 375  Q
    ||||||||||||    | ||||||||||||||||||| |  |||||||| ||||| |||||||| |||||||||    
T  47265266 atagaacactatagtgtaatttgatccatgtagccgacctcacttagtgggataaggcttggttattgttgttg 47265193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 155; E-Value: 5e-82
Query Start/End: Original strand, 11 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 46583188 - 46582823
Alignment:
Q  11 agcagagatgatgatgttgcgctggatgagtggtaagactagacatgataggattaagaatgacatcatt--agagagaatgggggtagcacctatagta 108  Q
    ||||||||||| ||||||||  | ||  |||||||||||||||||  ||||||||| |||||||| ||||  ||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  46583188 agcagagatgaggatgttgcattagagaagtggtaagactagacagcataggattaggaatgacaccattcgagagagagtggggatagcacctatagta 46583089  T
Q  109 gaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagaccc-gtagataccgttgtaagaagagaagatcaaatggagaagaaccag 207  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||  || | ||||||||||  |||||| ||||||  ||| |||||||||| ||||||||||||| |||  ||     
T  46583088 gaaaagttggtagaaaataggcttagatgggttgggcatgtagaga--agaccccgtagatgtcgtggtaagaagagtagatcaaatggaggagagtcaa 46582991  T
Q  208 gttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaa 307  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||| ||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||| ||||||||| |||| | ||||||||    
T  46582990 gttaaaagaggtagaggaagacctatgaaaactattagagaaaccattggaaaggatttaaaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaa 46582891  T
Q  308 cactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 376  Q
    | ||||| | ||||||||||||||||||| | || |||||||  ||||| |||||||||||||||||||    
T  46582890 ccctatggcgtcatttgatccatgtagccta-cccacttagtaggataaggcttggttgttgttgttgt 46582823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 146; E-Value: 1e-76
Query Start/End: Original strand, 11 - 347
Target Start/End: Original strand, 50286889 - 50287217
Alignment:
Q  11 agcagagatgatgatgttgcgctggatgagtggtaagactagacatgataggattaagaatgacatcattagagagaatgggggtagcacctatagtaga 110  Q
    ||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||   ||||    ||||||||||||    
T  50286889 agcagagatgaggaagttgcgttggatgagtggtaagactagacatgataggattaggaatgacaccattagagaga---gggg----acctatagtaga 50286981  T
Q  111 aaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaatggagaagaaccaggtt 210  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| ||| | |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||| ||||||| |||  || |||    
T  50286982 aaagttggtagaaaatagacttggatggtttgggcatgtagagagaagacccgtagatgccgtggtaagaagagtagatcgaatggaggagagtcaagtt 50287081  T
Q  211 aaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacac 310  Q
    |||||||||||| ||||| ||| |||||| ||| ||| || ||||| ||| |||||||||||||||||||| |||| |||| || | | |||||||||||    
T  50287082 aaaagaggtagaagaagacctatgaaaactattagagtaatcattataaaggatttagaggtcaatgagttggatctaaatttgatgtatgatagaacac 50287181  T
Q  311 tatgacatcatttgatccatgtagccgatccaactta 347  Q
    ||||    |||||||||||||||| ||| || |||||    
T  50287182 tatg-ggccatttgatccatgtagtcgaccccactta 50287217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 115 - 376
Target Start/End: Original strand, 8286455 - 8286724
Alignment:
Q  115 ttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaa 214  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| |||| |||||||| |||  || |||| ||    
T  8286455 ttggtagaaaataggcttagatggtttaggcatgtagagagaagacccgtagatgccgtcgtaagaagagtagatgaaatggaggagagtcaagttagaa 8286554  T
Q  215 ga--------ggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgataga 306  Q
    ||        |||||||||||| ||| |||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||    
T  8286555 gaggacaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtttatgataga 8286654  T
Q  307 acactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 376  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||  || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  8286655 acactatgacgtcatttgatccatgtagccgcccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttgt 8286724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 81 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 26037797 - 26037506
Alignment:
Q  81 agagagaatgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatg-tagagagaagacccgtagataccgttgtaag 179  Q
    ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| || ||  ||||||||||||| ||| || |||| |||||    
T  26037797 agagagagtgagggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggttt-gatattatagagagaagacctgtaaatgccgtcgtaag 26037699  T
Q  180 aagagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgag 279  Q
    ||||| |||||| |||||| |||  |||||||||||||| ||||||| | ||| |||||||||  ||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||    
T  26037698 aagagtagatcagatggaggagagtcaggttaaaagaggcagaggaaaacctaggaaaaccataagagaaactattaggaaagatttagaggtgaatgag 26037599  T
Q  280 ttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttg 372  Q
    || |||||||||||||||| ||||||||||||||| | | ||| ||||||||||||||| || |||||||| ||||| | |||||||||||||    
T  26037598 ttggatccaaatatggtttatgatagaacactatggcgtaattggatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggtttggttgttgttg 26037506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 133; E-Value: 6e-69
Query Start/End: Original strand, 82 - 366
Target Start/End: Original strand, 39708424 - 39708708
Alignment:
Q  82 gagagaatgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaa 181  Q
    |||||| || ||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||   |||||| ||||||||| | ||||| |||| |||||||    
T  39708424 gagagagtgagggtagctcctgtagtataaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgagcatgtatagagaagacacatagatgccgtcgtaagaa 39708523  T
Q  182 gagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagtt 281  Q
    ||| |||||| |||||| |||  ||||| |||||||||||||||||| ||| |||||| ||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  39708524 gagtagatcagatggaggagagtcaggtcaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactataagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagtt 39708623  T
Q  282 agatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttg 366  Q
     |||||||||||||||| ||||||||||||||| | | ||||||||||||||| ||| || |||||||| |||||  ||||||||    
T  39708624 ggatccaaatatggtttatgatagaacactatgtcgtaatttgatccatgtagtcgaccccacttagtgggataagacttggttg 39708708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 83 - 370
Target Start/End: Original strand, 20192025 - 20192311
Alignment:
Q  83 agagaatgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaag 182  Q
    ||||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||  |||||||  ||| | |||||||||||||||||||||||| | || ||||||||    
T  20192025 agagagtgggggtagcacttatagtagaaaagttgatagaaaataagcttagatagtttgggcatgtagagagaagacccgtagatgctgtggtaagaag 20192124  T
Q  183 agaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagtta 282  Q
    || | ||||||||||| |||  || |||||||||||||| |||||| || | ||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||| || |||     
T  20192125 agtatatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagtggaagacctgaaaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcagtgggttg 20192224  T
Q  283 gatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgt 370  Q
    ||||||||| || | | |||||||||| |||||| | ||||||| || |||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||    
T  20192225 gatccaaatttgatgtatgatagaacattatgacgttatttgat-caagtagccgaccctacttagtgggataaagcttggttgttgt 20192311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 27 - 374
Target Start/End: Original strand, 51421666 - 51422013
Alignment:
Q  27 ttgcgctggatgagtggtaagactagacatgataggattaagaatgacatcattagagagaatgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaat 126  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||||||  |||||||||| |||||||| ||||||||||  | |||||||||| |||||||||  || || ||||||||    
T  51421666 ttgcgttggatgagtagtaagactagacgagataggattatgaatgacaccattagagagtgttggggtagcacatatagtagattagatgatagaaaat 51421765  T
Q  127 agacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaa 226  Q
    || ||||| || ||| | ||| || |||||||||| ||||||   ||  || |||||| |||||||||||||      ||| | ||||||||||||||||    
T  51421766 aggcttaggtggtttgggcatatacagagaagaccggtagatgttgtaatacgaagagtagatcaaatggaggtttgtcagatcaaaagaggtagaggaa 51421865  T
Q  227 gaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgat 326  Q
    ||  ||  ||||| ||  ||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||||| |||||||||| |||||| | |||||||    
T  51421866 gatttagaaaaactataagagaaactattaggaaagatttagaggttaatgaattggatccaaaaatggtttatgatagaacattatgacgtaatttgat 51421965  T
Q  327 ccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgtt 374  Q
    |||||||||| |||  |||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  51421966 ccatgtagccaatctcacttagtgggataaagcttggttgttgttgtt 51422013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 219 - 376
Target Start/End: Original strand, 21528416 - 21528573
Alignment:
Q  219 tagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacat 318  Q
    |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||        
T  21528416 tagaggaagacctaagaaaaccattcgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttggattcaaatatggtttttgatagaacactatggtgg 21528515  T
Q  319 catttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 376  Q
    |||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  21528516 catttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttgt 21528573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 15 - 370
Target Start/End: Original strand, 1793382 - 1793741
Alignment:
Q  15 gagatgatgatgttgcgctggatgagtggtaagactagacatgataggattaagaatgacatcattag--agagaatgggggtagcacctatagtagaaa 112  Q
    ||||||| ||||||| | |||||||  |||||||||  ||  |||| ||||| |||||||| ||||||  |||||  ||||||||||||||||||| |||    
T  1793382 gagatgaggatgttgtgttggatgaacggtaagacttaacgggataagattaggaatgacaccattagggagagagcgggggtagcacctatagtaaaaa 1793481  T
Q  113 agttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaatggagaagaaccaggttaa 212  Q
    |||||||||||||||  |||||||| ||| ||||||||||||||||||  || |||  ||| ||||||| || |||||| |||||| ||    |  | ||    
T  1793482 agttggtagaaaataagcttagatggtttggacatgtagagagaagacttgttgatgtcgtcgtaagaatagtagatcagatggaggagtcgta--tcaa 1793579  T
Q  213 aagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccatta----gaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaac 308  Q
    ||||||||||| |||| ||   ||||| ||  ||||||||||||    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||| |    
T  1793580 aagaggtagagaaagacctcgaaaaactataagagaaaccattaattagaaaagatttagaggtcaatgagttggatccaaatatgatttatgatagagc 1793679  T
Q  309 actatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgt 370  Q
    |||||||| | ||||||| |||||||||||||  |||||||| ||||| |||| ||||||||    
T  1793680 actatgacgtaatttgattcatgtagccgatctcacttagtgagataaggcttagttgttgt 1793741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 103; E-Value: 5e-51
Query Start/End: Original strand, 186 - 376
Target Start/End: Original strand, 21236953 - 21237143
Alignment:
Q  186 agatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagat 285  Q
    ||||||||||||| |||  || ||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  21236953 agatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggat 21237052  T
Q  286 ccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 376  Q
    |||||| |||| | ||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||| | || |||||||| ||||| | |||||||||||||||||    
T  21237053 ccaaatttggtatatgatagaacactatggcgtcatttgatacatgtagccaaccccacttagtgggataaggattggttgttgttgttgt 21237143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 219 - 376
Target Start/End: Original strand, 6957726 - 6957883
Alignment:
Q  219 tagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacat 318  Q
    |||||||||| ||| |||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| || | | ||||||||||||||||| |    
T  6957726 tagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttgatgtatgatagaacactatgacgt 6957825  T
Q  319 catttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 376  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  6957826 catttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttgt 6957883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 18 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 41009707 - 41009414
Alignment:
Q  18 atgatgatgttgcgctggatgagtggtaagactagacatgataggattaagaatgacatcatta--gagagaatgggggtagcacctatagtagaaaagt 115  Q
    |||| ||||||||| |||||||  |||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  41009707 atgaggatgttgcgttggatgatcggtaagactagacatggtaggattagaaatgacatcattagggagataatgggggtagcacctatagtagaaaagt 41009608  T
Q  116 tggt-agaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaa 214  Q
    |||| | |||||||||||||||| |||   |||||||| |||||||  || ||| | || ||||||| |  |||||| |||||| |||  ||||| ||||    
T  41009607 tggtaaaaaaatagacttagatggtttgtgcatgtagaaagaagacatgttgatgcagtcgtaagaaaaatagatcagatggaggagagtcaggtcaaaa 41009508  T
Q  215 gaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaaca 309  Q
    | |||||||||||| ||  |||||| ||  ||||||| |||||||| |||||||| ||||||||| | ||| |||||||||||| ||||| ||||    
T  41009507 gtggtagaggaagacct-ggaaaactataagagaaactattagaaatgatttagaagtcaatgagatggattcaaatatggtttatgatataaca 41009414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 98; E-Value: 5e-48
Query Start/End: Original strand, 15 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 45205208 - 45204837
Alignment:
Q  15 gagatgatgatgttgcgctggatgagtggtaagactagacatgataggattaagaatgacatcatta--gagagaat-gggggtagcacctatagtagaa 111  Q
    ||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||| |||||  |||||| | ||||||||  ||||||||||||    
T  45205208 gagatgaggatgttgtgttggatgagtggtaagactagacgggataggattaggaatgacaccattaacgagagagttgggggtagtgcctatagtagaa 45205109  T
Q  112 aagttggtagaaaatagactt--agatgatttagacatgtagagagaagacccgtag-------ataccgttgtaagaagagaagatcaaatggagaaga 202  Q
    ||| |||||||||||||||||  || || |||   || |||||||||||||| ||||       ||   |||||| |||||| |||||| |||||| |||    
T  45205108 aagatggtagaaaatagacttttaggtggtttgtgcacgtagagagaagacctgtagtctgtagatgatgttgtacgaagagtagatcagatggaggaga 45205009  T
Q  203 accaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttga 302  Q
     | || | ||||||||| |||||||| |||  ||||| ||  ||||||| ||||| |||||||||||| | ||| |||| |||||||||||||||| |||    
T  45205008 gc-agatcaaaagaggtggaggaagacctagaaaaactataagagaaactattaggaaagatttagagtttaataagttggatccaaatatggtttatga 45204910  T
Q  303 tagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 376  Q
    ||||||| || | | | |||||||| |||||||| | ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  45204909 tagaacatta-ggcgtaatttgatctatgtagcccacccaacttagtgggataaggcttggttgttgttgttgt 45204837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 96; E-Value: 7e-47
Query Start/End: Original strand, 13 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 20591662 - 20591353
Alignment:
Q  13 cagagatgatgatgttgcgctggatgagtggtaagactagacatgataggattaagaatgacatcattag--agagaatgggggtagcacctatagtaga 110  Q
    |||| |||| ||||||| ||||||||| | ||||||||||||   ||  |||| ||||||||| ||||||  ||||| |||||||||||| |||||||||    
T  20591662 cagatatgaggatgttgtgctggatgaatagtaagactagacggaattagattgagaatgacaccattagggagagagtgggggtagcacttatagtaga 20591563  T
Q  111 aaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaatggagaagaaccaggtt 210  Q
    |||||||||||||||||   ||||||| ||| | |||||||||||||||| | |||||  || ||||||||||| | |||| |||||| |||  || ||     
T  20591562 aaagttggtagaaaataagattagatggtttgggcatgtagagagaagactcatagatgtcg-tgtaagaagagtatatcagatggaggagagtcaagt- 20591465  T
Q  211 aaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacac 310  Q
       ||||||||||||||| |||||||||| ||  ||||  |||||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||| || |||||||||||    
T  20591464 ---agaggtagaggaagacctaagaaaactataagagaccccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggattcaaatatgg-ttatgatagaacac 20591369  T
Q  311 tatgacatcatttgat 326  Q
     ||||| | |||||||    
T  20591368 aatgacgtaatttgat 20591353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 219 - 376
Target Start/End: Original strand, 12494791 - 12494948
Alignment:
Q  219 tagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacat 318  Q
    |||||||||| ||| |||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||| | ||||||||||||||||| |    
T  12494791 tagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatgacgt 12494890  T
Q  319 catttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 376  Q
    ||||| ||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  12494891 catttaatccatgtagcggaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttgt 12494948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 18 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 20602003 - 20601669
Alignment:
Q  18 atgatgatgttgcgctggatgagtggtaagactagacatgataggattaagaatgacatcattag--agagaatgggggtagcacctatagtagaaaagt 115  Q
    |||| |||||||||||||||||| | |||||| | ||||||||| ||| ||||||||| || |||  ||||| ||| | || ||| ||||||||||||||    
T  20602003 atgaggatgttgcgctggatgagcgctaagacaatacatgatagaattgagaatgacaccactagggagagagtggagataacacttatagtagaaaagt 20601904  T
Q  116 tggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaag 215  Q
    |||||||||||||  ||||||| |||   ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| | || | |||||| |||  ||||| |||||    
T  20601903 tggtagaaaataggattagatggtttgtgcatgtagagagaagacctgtagatgccgttgtaagaagagtatataagatggaggagagtcaggtcaaaag 20601804  T
Q  216 aggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatga 315  Q
    ||||||| ||||| ||  |||||| ||  ||||||||||||||||        ||||||||||||| ||| |||||||| ||| |||||||||| |||||    
T  20601803 aggtagaagaagacct-tgaaaactataagagaaaccattagaaa-----gtcaggtcaatgagttggattcaaatatgatttatgatagaacattatga 20601710  T
Q  316 catcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataa 356  Q
    | | ||||||| |||||| | || || |||||||| |||||    
T  20601709 cgtaatttgattcatgtaactgaacccacttagtgggataa 20601669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 11 - 135
Target Start/End: Original strand, 12494668 - 12494794
Alignment:
Q  11 agcagagatgatgatgttgcgctggatgagtggtaagactagacatgataggattaagaatgacatcatt--agagagaatgggggtagcacctatagta 108  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||  ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  12494668 agcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagactagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgggggtagcacctatagta 12494767  T
Q  109 gaaaagttggtagaaaatagacttaga 135  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||    
T  12494768 gaaaagttggtagaaaataggcttaga 12494794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 18 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 1211747 - 1211389
Alignment:
Q  18 atgatgatgttgcgctggatgagtggtaagactagacatgataggattaagaatgacatcattagagagaatgggggtagcacctatagtagaaaagttg 117  Q
    |||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||| |||| |||||| |||| | ||||||||||||| | ||||||    
T  1211747 atgaggatgttgcactggatgagtggtaaaactagacatgatatgattaggaatgacaccattcgagagagtgggagcagcacctatagtaaacaagttg 1211648  T
Q  118 gtagaaaataga--cttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaag 215  Q
    |||| ||||| |  |||| ||| ||| |  ||||||||||||||||  ||||||  || |||||||||| |||||| |||||| |||  | | | |||||    
T  1211647 gtaggaaatatatgcttaaatggtttgggaatgtagagagaagacctatagatattgtcgtaagaagagtagatcagatggagtagagtcggatcaaaag 1211548  T
Q  216 aggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatga 315  Q
    || ||||||||||  || || ||| ||  || |||  ||||||||| | ||||||||||||||||| |||||  || |||||| | ||||||||||| |     
T  1211547 agatagaggaagacataggagaactataagataaattattagaaaa-aattagaggtcaatgagttggatcc--atttggtttctcatagaacactaagg 1211451  T
Q  316 cat-catttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 376  Q
    | |  ||||||| ||||||||||| || ||||| || |||||  ||||||||||||||||||    
T  1211450 cgtaaatttgattcatgtagccgaccccacttaatgggataagacttggttgttgttgttgt 1211389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 86; E-Value: 7e-41
Query Start/End: Original strand, 20 - 330
Target Start/End: Original strand, 16002854 - 16003165
Alignment:
Q  20 gatgatgttgcgctggatgagtggtaagactagacatgataggattaagaatgacatcat--tagagagaatgggggtagcacctatagtagaaaagttg 117  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||   ||||||||| |||||||| |||  ||||| || || || | |||||||| ||| ||||||||    
T  16002854 gatgatgttgtgctggatgagtggtaagactagacgaaataggattaggaatgacaccattatagagtgagtgaggatggcacctatggtataaaagttg 16002953  T
Q  118 gtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagag 217  Q
     |||||||||| |||||||| || | |||| |||||||||||||||||||| ||||  ||||||| | | |||| |||||  | |   | || ||||||     
T  16002954 atagaaaatagtcttagatggttga-acatttagagagaagacccgtagatgccgtcataagaagggtaaatcagatggatgaaagttatgtcaaaagaa 16003052  T
Q  218 gtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgaca 317  Q
     |||||||| | |  | ||||| ||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||| ||||| |||||||||||     
T  16003053 atagaggaataccgtaaaaaactataagagaaaccattagaaaaaatttagaggtcaatgagttggatctaaatatgatttatgataaaacactatgacg 16003152  T
Q  318 tcatttgatccat 330  Q
    | |||| ||||||    
T  16003153 taatttaatccat 16003165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 209 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 51811442 - 51811280
Alignment:
Q  209 ttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaac 308  Q
    |||||||| ||||| ||||| ||||||||| |||  |||||| ||||||||||  ||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  51811442 ttaaaagaagtagatgaagacctaagaaaatcatccgagaaatcattagaaaaagtttcgagctcaatgagtttgatccaaatatggtttttgatagaac 51811343  T
Q  309 actatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgt 373  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||| |||||||||||    
T  51811342 actatgacgtcatttgatccatgtagccga-cccacttagtgggataaggctt-gttgttgttgt 51811280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 219 - 368
Target Start/End: Original strand, 7947065 - 7947214
Alignment:
Q  219 tagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacat 318  Q
    |||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||| ||||||||| || ||| |||||||||||||| |  |    
T  7947065 tagaggaagacctaagaaaactattagagaaaccatttgaaaggatttagaggtcaatcagttggatccaaatttgatttatgatagaacactatcatgt 7947164  T
Q  319 catttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgtt 368  Q
     ||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||    
T  7947165 aatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgtt 7947214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 175 - 323
Target Start/End: Original strand, 50679588 - 50679736
Alignment:
Q  175 gtaagaagagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtca 274  Q
    |||||||||| |||| |||||||| |||  || |||| |||||||||||||||| ||| |||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  50679588 gtaagaagagtagattaaatggaggagagtcaagttagaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtca 50679687  T
Q  275 atgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcattt 323  Q
    ||||||| ||||||||| |||||| ||||| || |||||||| ||||||    
T  50679688 atgagttggatccaaatttggtttatgataaaatactatgacgtcattt 50679736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 209 - 372
Target Start/End: Original strand, 4548140 - 4548303
Alignment:
Q  209 ttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaac 308  Q
    |||||| ||| |||||| || ||| |||||| ||| |||||| |||||||||   ||||||||||||| |||| |||| |||| |||||| |||||||||    
T  4548140 ttaaaaaaggcagaggaggacctacgaaaactattagagaaatcattagaaatattttagaggtcaataagttggatctaaatttggtttatgatagaac 4548239  T
Q  309 actatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttg 372  Q
    |||| | | | ||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  4548240 actaaggcgtaatttgatccatgtagccaacccaacttagtgggataatgcttggttgttgttg 4548303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 11 - 159
Target Start/End: Original strand, 31458946 - 31459098
Alignment:
Q  11 agcagagatgatgatgttgcgctggatgagtggtaagactagacatgataggattaagaatgacatcattagag----agaatgggggtagcacctatag 106  Q
    |||| |||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | ||||||||    ||| | | ||||||||||||||    
T  31458946 agcacagatgaggatgttgcgttggttgagtggtaagactagacatgataggattaggaatgataccattagagagacagagtcgaggtagcacctatag 31459045  T
Q  107 tagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaaga 159  Q
    |||||||| ||||||||||||| ||||| || ||| | |||||| ||||||||    
T  31459046 tagaaaagatggtagaaaataggcttaggtggtttgggcatgtaaagagaaga 31459098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 125 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 20821255 - 20821001
Alignment:
Q  125 atagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagagg 224  Q
    |||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||| || |  ||| || || |||| | |||||| |||| ||| | |||||||||||| |    
T  20821255 ataggcttagatggtttaggcatgtagagagaagacctgtagatgccttcataacaaaagtagattagatggagcagaatcagatcaaaagaggtagatg 20821156  T
Q  225 aagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgata----gaacactatgacatca 320  Q
    |||| ||| |||||| ||  ||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||| ||| |||||||| ||| |||||    |||||||||  ||| |    
T  20821155 aagacctaggaaaactataagagaaac-attagaaaggatttaaaggtcaatgagttggattcaaatatgatttatgatagaacgaacactatatcataa 20821057  T
Q  321 tttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 376  Q
    || |||||||||||| ||||  |||||||  ||||| | |||||| ||||||||||    
T  20821056 ttcgatccatgtagctgatcttacttagtaagataaggtttggttattgttgttgt 20821001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 66; E-Value: 6e-29
Query Start/End: Original strand, 263 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 19154973 - 19154860
Alignment:
Q  263 atttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttg 362  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||| | | |||||||||||| ||| || || |||||||| ||||| |||||    
T  19154973 atttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtttatgatagaacactatggcgttatttgatccatgcagctgaccccacttagtgggataaggcttg 19154874  T
Q  363 gttgttgttgttgt 376  Q
    ||||||||||||||    
T  19154873 gttgttgttgttgt 19154860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 268 - 376
Target Start/End: Original strand, 19969358 - 19969466
Alignment:
Q  268 gaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgt 367  Q
    |||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| ||| ||||||    
T  19969358 gaggtcaatgagttggatccaaatttggtttatgatagaacgctatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggctcggttgt 19969457  T
Q  368 tgttgttgt 376  Q
    |||||||||    
T  19969458 tgttgttgt 19969466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 211 - 376
Target Start/End: Original strand, 35690391 - 35690556
Alignment:
Q  211 aaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacac 310  Q
    |||||||||||||||||| |||  ||||| ||  ||||||| ||||  ||| |||||||||| |||||||| |||||||  | ||||| ||||||||||     
T  35690391 aaaagaggtagaggaagacctagaaaaactataagagaaactattacgaaaaatttagaggttaatgagtttgatccaatcagggtttatgatagaacat 35690490  T
Q  311 tatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 376  Q
    |||| | | ||||||||||||||||||| || |||||||| |||||  ||||||| ||||||||||    
T  35690491 tatggcgtaatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataagacttggtttttgttgttgt 35690556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 259 - 376
Target Start/End: Original strand, 55007914 - 55008031
Alignment:
Q  259 aaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatg 358  Q
    |||||||||||| | |||||||| || | ||||||||||| ||||||| || |||||| | ||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |    
T  55007914 aaagatttagagattaatgagttggaccgaaatatggtttatgatagatcattatgacgtaatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataagg 55008013  T
Q  359 cttggttgttgttgttgt 376  Q
    ||||||||||||||||||    
T  55008014 cttggttgttgttgttgt 55008031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 245 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 28550583 - 28550455
Alignment:
Q  245 gagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaac 344  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||  || |||||||| ||||||| || || ||    
T  28550583 gagaaactattaggaaagatttagaggttaatgagtttgatccaaatatggtttttgatagaaagctatgttataatttgatcaatgtagctgaccccac 28550484  T
Q  345 ttagtgtgataatgcttggttgttgttgt 373  Q
    ||| || ||||| | ||||||||||||||    
T  28550483 ttattgggataaggtttggttgttgttgt 28550455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 245 - 376
Target Start/End: Original strand, 31043226 - 31043357
Alignment:
Q  245 gagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaac 344  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||  ||| ||||||||| || ||| || || ||    
T  31043226 gagaaactattaggaaagatttagagattaatgagttggatccaaatatggtttgtgatagaacactattgcataatttgatccttgcagctgaccccac 31043325  T
Q  345 ttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 376  Q
    ||||||  |||| |||| ||| ||||||||||    
T  31043326 ttagtgcaataaagcttagttattgttgttgt 31043357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 54; E-Value: 8e-22
Query Start/End: Original strand, 149 - 374
Target Start/End: Original strand, 28351617 - 28351842
Alignment:
Q  149 tagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgaga 248  Q
    ||||||||||||| |||||  | || ||||| |||| |||||| |||||| | |  ||| ||| ||||||||||| |||| |||  ||||| ||  ||||    
T  28351617 tagagagaagacctgtagactctgtagtaaggagagtagatcagatggaggatagtcagattacaagaggtagagaaagacctagaaaaactataagaga 28351716  T
Q  249 aaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttag 348  Q
    ||| ||||  |||||||||||| | | |||||| ||||||||||| |||| |  ||||||  ||||  || ||||||||||||||||||| || ||||||    
T  28351717 aactattacgaaagatttagagattattgagttggatccaaatatagtttatagtagaaccttatggaattatttgatccatgtagccgaccccacttag 28351816  T
Q  349 tgtgataatgcttggttgttgttgtt 374  Q
    || | ||| |||||| ||||||||||    
T  28351817 tggggtaaggcttggctgttgttgtt 28351842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 11 - 159
Target Start/End: Original strand, 33709837 - 33709992
Alignment:
Q  11 agcagagatgatgatgttgcgctggatgagtggtaagactagacat-----gataggattaagaatgacatcatt--agagagaatgggggtagcaccta 103  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||     ||||||||||  |||| || ||||  ||||||| | |||||| ||||||    
T  33709837 agcagagatgatgatgttgcgttggatgtgtggtaagactagacatgataggataggattagaaatggcaacattagagagagagttggggtaacaccta 33709936  T
Q  104 tagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaaga 159  Q
    ||||||||||| |||| |||| |||  |||| || ||||| ||||| |||||||||    
T  33709937 tagtagaaaagatggtggaaactaggtttaggtggtttaggcatgtggagagaaga 33709992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 285 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 883448 - 883357
Alignment:
Q  285 tccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 376  Q
    |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||| || |  ||||||||||||| ||||||||||    
T  883448 tccaaatataatttttgatagaacactatgacatcatttaatccatgtagccgaccccactcagggatataatgcttggttattgttgttgt 883357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 245 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 31961394 - 31961263
Alignment:
Q  245 gagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaac 344  Q
    ||||||| ||||| |||||| ||||| | |||||||| ||   | | |||||| |||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||| |  ||    
T  31961394 gagaaactattaggaaagatctagagataaatgagttggagaaagacatggttgttgatagaacactatgacgtcgtttgattcatgtagccgacctcac 31961295  T
Q  345 ttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 376  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  31961294 ttagtgggataaggcttggttgttgttgttgt 31961263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 291 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 19062017 - 19061932
Alignment:
Q  291 tatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 376  Q
    |||||| | ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| || || ||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  19062017 tatggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacctagtgggataaggcttggttgttgttgttgt 19061932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 33 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 25257921 - 25257756
Alignment:
Q  33 tggatgagtggtaagactagacatgataggattaagaatgacatcattagagagaatgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagactt 132  Q
    |||||| || ||||||||||||||||||| ||||  ||||||| ||||||||||| | | |||| |||||| | || ||||| ||||||||  |||||||    
T  25257921 tggatgtgtagtaagactagacatgatagaattagaaatgacaacattagagagagttgaggtaacacctacaatataaaagatggtagaagctagactt 25257822  T
Q  133 agatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaatggag 198  Q
    || || |||   ||||||||||||||||| ||  || | |||||||| |||| |||||| ||||||    
T  25257821 aggtggtttgagcatgtagagagaagacctgtgaatgctgttgtaaggagagtagatcagatggag 25257756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #59
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 15 - 113
Target Start/End: Original strand, 35690226 - 35690326
Alignment:
Q  15 gagatgatgatgttgcgctggatgagtggtaagactagacatgataggattaagaatgacatcatt--agagagaatgggggtagcacctatagtagaaa 112  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||||  |||||||||| |||||||| | ||  ||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  35690226 gagatgaggatgttgcgttggatgagtagtaagactagacgagataggattaggaatgacacctttaaagagagagttggggtagcacctatagtagaaa 35690325  T
Q  113 a 113  Q
    |    
T  35690326 a 35690326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #60
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 11 - 376
Target Start/End: Original strand, 56224983 - 56225353
Alignment:
Q  11 agcagagatgatgatgttgcgctggatgagtggtaagact---agacatgataggattaagaatgacatcattagagagaatgggggtagcacctatagt 107  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||    |||||||||| ||||| |||||||| ||| ||||| | | ||| ||  |||||||||    
T  56224983 agcagagatgatgatgttgtggtggatgagtggtaagacactaagacatgatatgattaggaatgacaccataagagaaagttgggataatacctatagt 56225082  T
Q  108 agaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaatggagaagaaccag 207  Q
    | ||||| ||||||||||||| ||||| || |||    |||||||||||||   | |||||   || ||| | |||| | |||| |||||| |||  |      
T  56225083 ataaaagatggtagaaaataggcttaggtggtttgagtatgtagagagaaggaacatagatgttgtagtacgtagagtatatcatatggaggagagtcta 56225182  T
Q  208 gttaaaagaggtagaggaagaactaaga--aaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatag 305  Q
     | || | || ||||| |||| |||| |  |||| ||  | | ||| ||||  |||| ||||||||| ||| | || |||||||||||||| ||| ||||    
T  56225183 atcaagaaagttagagaaagatctaaaaagaaactataaggggaactattatgaaagttttagaggttaataaatttgatccaaatatggtattttatag 56225282  T
Q  306 aacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 376  Q
    ||||||||||  | ||||||||||||| | ||| || |||||||| ||||| | | |||||||||||||||    
T  56225283 aacactatgatgtaatttgatccatgtggtcgaccccacttagtgggataaggatcggttgttgttgttgt 56225353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #61
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 298 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 49939809 - 49939733
Alignment:
Q  298 tttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgtt 374  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| ||| |||||||||||||    
T  49939809 tttgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggctcggttgttgttgtt 49939733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #62
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 212 - 298
Target Start/End: Original strand, 50862764 - 50862851
Alignment:
Q  212 aaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttga-gaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggttt 298  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||| |||  | |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  50862764 aaagaggtagaggaagacctaggaaaactattaaaagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggttt 50862851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #63
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 213 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 53518483 - 53518325
Alignment:
Q  213 aagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacacta 312  Q
    |||||||||||||||  |||  ||||| ||  || |||| | ||| |||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  53518483 aagaggtagaggaaggcctagaaaaactatgagaaaaactaataggaaagatttagaggttaatgagttggatctaaatatggtttatgatagaacacta 53518384  T
Q  313 tgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttg 372  Q
    || | | |||||||||||| || ||| || |||||||| ||||   || |||||||||||    
T  53518383 tggcgtaatttgatccatgcag-cgaccccacttagtgggataggactcggttgttgttg 53518325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #64
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 274 - 376
Target Start/End: Original strand, 2589255 - 2589357
Alignment:
Q  274 aatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgt 373  Q
    |||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||| | || |||||| ||||||||  | || | |||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  2589255 aatgagttggatgaaaatatggtttttgatagaacactatggcgtcgtttgattcatgtagctaaccccagttagtgggataaggcttggttgttgttgt 2589354  T
Q  374 tgt 376  Q
    |||    
T  2589355 tgt 2589357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #65
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 11 - 130
Target Start/End: Complemental strand, 10775786 - 10775665
Alignment:
Q  11 agcagagatgatgatgttgcgctggatgagtggtaagactagacatgataggattaagaatgacatcattagagagaatg--ggggtagcacctatagta 108  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||| |||| | ||| ||||| || || ||||  ||||||| ||||||||||| ||  |||||| |||||||||||    
T  10775786 agcagagatgatgatgttgtgttggatgcgtggcaggaccagacaggaaagaattagaaatgacaacattagagagagtgttggggtaacacctatagta 10775687  T
Q  109 gaaaagttggtagaaaatagac 130  Q
    |||||| ||||||||| |||||    
T  10775686 gaaaagatggtagaaactagac 10775665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #66
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 259 - 376
Target Start/End: Original strand, 25574992 - 25575109
Alignment:
Q  259 aaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatg 358  Q
    |||||| ||||| | |||||||| |||| ||||||||||| |||||||||| | ||   | |||||||||||||||| || || | |||||| ||||| |    
T  25574992 aaagatctagagattaatgagttggatcgaaatatggtttatgatagaacattgtggtgtaatttgatccatgtagcagaccccatttagtgggataagg 25575091  T
Q  359 cttggttgttgttgttgt 376  Q
    ||||||||||||||||||    
T  25575092 cttggttgttgttgttgt 25575109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #67
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 43 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 51252791 - 51252674
Alignment:
Q  43 gtaagactagacatgataggattaagaatgacatcattagagagaatgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgattta 142  Q
    ||||||||||||  ||||||||||  ||||||  ||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||| |||| |||| ||| ||||| || | |     
T  51252791 gtaagactagacgagataggattagaaatgactacattagagagagttggggtagcacctctagtagaaaagatggtggaaactaggcttaggtggtatg 51252692  T
Q  143 gacatgtagagagaagac 160  Q
    | ||||||||||||||||    
T  51252691 ggcatgtagagagaagac 51252674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #68
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 14 - 160
Target Start/End: Original strand, 54470128 - 54470276
Alignment:
Q  14 agagatgatgatgttgcgctggatgagtggtaagactagacatgataggattaagaatgacatcattagagagaatg--ggggtagcacctatagtagaa 111  Q
    |||||||| ||||||||  |||||| ||||||||||||||   |||| ||||   ||| ||| |||||||||||  |  |||||||||||||||||||||    
T  54470128 agagatgaggatgttgcattggatgtgtggtaagactagatgggatatgatttgaaataacaacattagagagagagttggggtagcacctatagtagaa 54470227  T
Q  112 aagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagac 160  Q
    ||| |||| |||| ||||||||  || ||| | ||||||||||||||||    
T  54470228 aagatggtggaaactagacttaagtggtttgggcatgtagagagaagac 54470276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #69
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 288 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 13805350 - 13805262
Alignment:
Q  288 aaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 376  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||  || ||||||||||||||||| | || |||||||| ||||  |||||||||||||||||||    
T  13805350 aaatatggtttatgatagaacattatgggataatttgatccatgtagccaaccccacttagtgggatatggcttggttgttgttgttgt 13805262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #70
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 248 - 376
Target Start/End: Original strand, 31459151 - 31459279
Alignment:
Q  248 aaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaactta 347  Q
    |||| ||||| |||||||||||| | |||||||| ||||| |||||||| | |||| ||||| |||| |   | |||||||||||| |||| || |||||    
T  31459151 aaactattaggaaagatttagagattaatgagttggatcccaatatggtgtgtgattgaacattatggcggaacttgatccatgtacccgaccccactta 31459250  T
Q  348 gtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 376  Q
    ||| ||||| ||||||||||||| |||||    
T  31459251 gtgggataaggcttggttgttgtcgttgt 31459279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #71
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 264 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 34208378 - 34208266
Alignment:
Q  264 tttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttgg 363  Q
    ||||||| | |||||||| |||||||||||||||| |||||||||| |||| |   ||||||||||||||  ||| ||  |||| || ||||| ||||||    
T  34208378 tttagagattaatgagttggatccaaatatggtttatgatagaacattatggcgcaatttgatccatgtactcgaccccccttattgggataaggcttgg 34208279  T
Q  364 ttgttgttgttgt 376  Q
    |||||||||||||    
T  34208278 ttgttgttgttgt 34208266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #72
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 23 - 168
Target Start/End: Original strand, 41192764 - 41192913
Alignment:
Q  23 gatgttgcgctggatgagtggtaagactagacatgataggattaagaatgacatcattagagagaatg----ggggtagcacctatagtagaaaagttgg 118  Q
    ||||||||| |||||| |||||| || |||||| ||||  ||||  ||||||| | |||||||||  |    ||||||||||||| |||||||||| |||    
T  41192764 gatgttgcgttggatgtgtggtatgattagacaggatacaattataaatgacagcgttagagagagagagttggggtagcacctacagtagaaaagatgg 41192863  T
Q  119 tagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagat 168  Q
    | |||| ||||||||| ||||||   ||||||||||||||||| ||||||    
T  41192864 tggaaactagacttaggtgatttgtgcatgtagagagaagacctgtagat 41192913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #73
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 288 - 375
Target Start/End: Original strand, 12443292 - 12443379
Alignment:
Q  288 aaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttg 375  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||| |  | ||  ||||| ||||||||||||||||||    
T  12443292 aaatatggtttatgatagaacattatggcataatttgatccatgtagccgatcccaaatcgtaggataaggcttggttgttgttgttg 12443379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #74
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 297 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 32633482 - 32633403
Alignment:
Q  297 ttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 376  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||| | || |||||||| || || |||||||||||||||||||    
T  32633482 ttttgatagaacactatggcgtcatttgatacatgtagccaaccccacttagtgggaaaaggcttggttgttgttgttgt 32633403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #75
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 309 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 50238679 - 50238612
Alignment:
Q  309 actatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 376  Q
    |||||| | ||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  50238679 actatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttgt 50238612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #76
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 309 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 50238765 - 50238698
Alignment:
Q  309 actatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 376  Q
    |||||| | ||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  50238765 actatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttgt 50238698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #77
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 292 - 370
Target Start/End: Original strand, 13262413 - 13262491
Alignment:
Q  292 atggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgt 370  Q
    |||||||||||||||| |||||||| || |||||| |||||||||||  | |||||||||||||| |||| ||||||||    
T  13262413 atggtttttgatagaaaactatgacgtcgtttgattcatgtagccgactccacttagtgtgataaggcttagttgttgt 13262491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #78
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 235 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 26024988 - 26024846
Alignment:
Q  235 aaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtag 334  Q
    ||||| || |||||||| ||||  |||||| ||||| | |||||||| |||| | | ||||||| |||||||||| ||||   | |||| ||||||||||    
T  26024988 aaaactatatgagaaactattaagaaagatctagagattaatgagttggatcgagacatggtttatgatagaacattatggtgtaattttatccatgtag 26024889  T
Q  335 ccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgtc 377  Q
    |||| |  |||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||    
T  26024888 ccgacctcacttagtgggataaggcttggttgttgttgctgtc 26024846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #79
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 11 - 112
Target Start/End: Complemental strand, 43070128 - 43070029
Alignment:
Q  11 agcagagatgatgatgttgcgctggatgagtggtaagactagacatgataggattaagaatgacatcattagagagaatgggggtagcacctatagtaga 110  Q
    |||||||||||| |||||| | |||||| ||||||||| |||||| ||||||||||  ||||||| ||||||||||  | | |||||| |||||||||||    
T  43070128 agcagagatgatcatgttgggttggatgtgtggtaagattagacaggataggattagaaatgacaacattagagag--ttgaggtagcgcctatagtaga 43070031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #80
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 11 - 134
Target Start/End: Original strand, 49987346 - 49987471
Alignment:
Q  11 agcagagatgatgatgttgcgctggatgagtggtaagactagacatgataggattaagaatgacatcattag--agagaatgggggtagcacctatagta 108  Q
    ||||||||||| ||||||| | || |||  | ||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||  ||||| |  ||||  |||||||||||    
T  49987346 agcagagatgaggatgttgtgttgaatgtttagtaagactagacatgataggattagaaatgacaacattagatagagagtctgggtcacacctatagta 49987445  T
Q  109 gaaaagttggtagaaaatagacttag 134  Q
    |||||| |||| |||||||| |||||    
T  49987446 gaaaagatggtggaaaataggcttag 49987471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #81
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 33 - 161
Target Start/End: Original strand, 10208978 - 10209104
Alignment:
Q  33 tggatgagtggtaagactagacatgataggattaagaatgacatcattagagagaatgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagactt 132  Q
    |||||| ||||||||||||||   ||||| ||||  ||||||| ||||||||||  | ||||||| |||||||||||||||| ||| ||||| || ||||    
T  10208978 tggatgtgtggtaagactagatgggatagaattagaaatgacaacattagagag--ttggggtagaacctatagtagaaaagatggcagaaactaaactt 10209075  T
Q  133 agatgatttagacatgtagagagaagacc 161  Q
    || || ||| | ||||||| |||||||||    
T  10209076 agttggtttgggcatgtagcgagaagacc 10209104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #82
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 11 - 161
Target Start/End: Original strand, 17900398 - 17900550
Alignment:
Q  11 agcagagatgatgatgttgcgctggatgagtggtaagactagacatgataggattaagaatgacatcattagaga--gaatgggggtagcacctatagta 108  Q
    |||||| |||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||   ||||  ||||  ||||||  |||||||||  || | ||||||||||||||||||    
T  17900398 agcagaaatgaggatgttgcgttggatgtgtggtaagactagatgggataaaattagaaatgacgacattagagacggagttggggtagcacctatagta 17900497  T
Q  109 gaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacc 161  Q
    ||||||  |||||||| |||||| |  || ||| | || ||||||||||||||    
T  17900498 gaaaagacggtagaaactagactcatgtggtttgggcacgtagagagaagacc 17900550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #83
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 92 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 35555928 - 35555859
Alignment:
Q  92 gggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacc 161  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| || ||| | ||| |||||||||||||    
T  35555928 gggtagcacctatagtagaaaagatggtagaaactagacttaggtggtttgggcatttagagagaagacc 35555859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #84
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 245 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 37042792 - 37042667
Alignment:
Q  245 gagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaac 344  Q
    ||||||| ||||  |||||| ||||| | | |||||| |||  ||||| ||| |||||||||||| ||||   || |||||||||||||||||| || ||    
T  37042792 gagaaactattaagaaagatctagagattattgagttggatagaaatacggtatttgatagaacattatggtgtcgtttgatccatgtagccgacccgac 37042693  T
Q  345 ttagtgtgataatgcttggttgttgt 370  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||    
T  37042692 ttagtgggataaggcttggttgttgt 37042667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #85
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 292 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 50869961 - 50869876
Alignment:
Q  292 atggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgtc 377  Q
    |||||||||| |||||||||||| | || |||||| |||| ||| || || |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  50869961 atggtttttggtagaacactatggcgtcgtttgattcatgcagctgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttgtc 50869876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #86
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 288 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 6958323 - 6958236
Alignment:
Q  288 aaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 376  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| | || |||||| ||||||||||| || |||||||| |||||   |||||||||||||||||    
T  6958323 aaatatggttttggatagaacactatggcgtcgtttgattcatgtagccgaccctacttagtgggataa-cattggttgttgttgttgt 6958236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #87
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 296 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 7066575 - 7066496
Alignment:
Q  296 tttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 376  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||| || || | |||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  7066575 tttttgatagaacactatg-cgtcatttgattcatgtagctgaccccatttagtgggataaggcttggttgttgttgttgt 7066496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #88
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 11 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 7092583 - 7092465
Alignment:
Q  11 agcagagatgatgatgttgcgctggatgagtggtaagactagacatgataggattaagaatgacatcattagaga--gaatgggggtagcacctatagta 108  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||   |||| ||||| ||||||||| ||||||||  || | ||  ||||||||||||||    
T  7092583 agcagagatgaggatgttgtgctggatgagtggtaagtctagaagggatatgatta-gaatgacatgattagagacagagttggaatagcacctatagta 7092485  T
Q  109 gaaaagttggtagaaaatag 128  Q
    |||||  || ||||||||||    
T  7092484 gaaaatatgatagaaaatag 7092465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #89
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 320 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 30634159 - 30634103
Alignment:
Q  320 atttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 376  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  30634159 atttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttgt 30634103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #90
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 288 - 376
Target Start/End: Original strand, 51438642 - 51438730
Alignment:
Q  288 aaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 376  Q
    ||||||||||| | ||| |||| |||| | | |||||||||||||||| || ||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  51438642 aaatatggtttataatataacattatggcgtaatttgatccatgtagctgacccaactttgtgggataaggcttggttgttgttgttgt 51438730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #91
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 259 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 55388325 - 55388213
Alignment:
Q  259 aaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatg 358  Q
    |||||||| ||| | ||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||| | ||   | ||||||||||||| | ||| || |||||||| ||||| |    
T  55388325 aaagatttggagattaatgagttagatcgaaatatgatttatgatagaacattgtggtgtaatttgatccatgttgtcgaccccacttagtgggataagg 55388226  T
Q  359 cttggttgttgtt 371  Q
    |||||||||||||    
T  55388225 cttggttgttgtt 55388213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #92
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 245 - 376
Target Start/End: Original strand, 37488245 - 37488376
Alignment:
Q  245 gagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaac 344  Q
    ||||||| ||||  |||||| ||||  | ||| |||| |||| ||||||||||  ||||||| || |||| | | |||||||||||||||||   || ||    
T  37488245 gagaaactattaagaaagatctagaaattaataagtttgatcaaaatatggttaatgatagagcattatggcgtaatttgatccatgtagccagccccac 37488344  T
Q  345 ttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 376  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  37488345 ttagtgggataaggcttggttgttgttgttgt 37488376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #93
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 81 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 44047640 - 44047553
Alignment:
Q  81 agagagaatgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagat 168  Q
    ||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||| ||||| || ||| |||||||||||  |||||| ||||||    
T  44047640 agagagagttggggtagcacctatagtagaaaaggtggtagaatctaggcttaggtggtttggacatgtagagttaagacctgtagat 44047553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #94
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 321 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 45209257 - 45209202
Alignment:
Q  321 tttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 376  Q
    |||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  45209257 tttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttgt 45209202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #95
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 302 - 373
Target Start/End: Original strand, 47372915 - 47372986
Alignment:
Q  302 atagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgt 373  Q
    |||||||| ||||||||| | |||||||||||||||| || |||||||| ||||| ||||| ||||||||||    
T  47372915 atagaacattatgacatcgtctgatccatgtagccgaccctacttagtgggataaggcttgattgttgttgt 47372986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #96
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 274 - 376
Target Start/End: Original strand, 5306479 - 5306581
Alignment:
Q  274 aatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgt 373  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||| | |||| |||| | | ||||||||||| ||||  | || |||| ||| ||||| ||||||||||||||||    
T  5306479 aatgagttggatccaaatatggtttatgacataacattatggcgtaatttgatccatatagctaaccccacttggtgggataaggcttggttgttgttgt 5306578  T
Q  374 tgt 376  Q
    |||    
T  5306579 tgt 5306581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #97
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 15 - 85
Target Start/End: Complemental strand, 20105831 - 20105761
Alignment:
Q  15 gagatgatgatgttgcgctggatgagtggtaagactagacatgataggattaagaatgacatcattagaga 85  Q
    ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||  |||| |||||  ||||||| |||||||||    
T  20105831 gagatgatgatgttgcgatggatgtgtggtaagactagacgagatatgattagaaatgacaacattagaga 20105761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #98
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 16 - 157
Target Start/End: Original strand, 45423542 - 45423681
Alignment:
Q  16 agatgatgatgttgcgctggatgagtggtaagactagacatgataggattaagaatgacatcattagagagaatgggggtagcacctatagtagaaaagt 115  Q
    |||||| ||||||| | ||| || |||||||||||||||  ||||| ||||  ||||||| ||||| ||||  | | ||||||||||||| ||||||||     
T  45423542 agatgaggatgttgtgttggttgtgtggtaagactagacgggatagaattagaaatgacaacattatagag--ttgaggtagcacctataatagaaaaga 45423639  T
Q  116 tggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaa 157  Q
    ||||||||| | ||||||  || ||| |||||||||| ||||    
T  45423640 tggtagaaacttgacttacgtggttttgacatgtagaaagaa 45423681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #99
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 91 - 373
Target Start/End: Original strand, 46372024 - 46372306
Alignment:
Q  91 ggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatc 190  Q
    ||||||||||||||||| |||||  | ||||||| ||||||||| || |||   ||||||||||||||||  || ||| | ||  ||||||||| |||||    
T  46372024 ggggtagcacctatagtcgaaaatattgtagaaactagacttaggtggtttgtgcatgtagagagaagacatgtggattctgtactaagaagagcagatc 46372123  T
Q  191 aaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaa 290  Q
    | || |||  || |||| | |  |||||||| || ||| |||  ||||| ||  ||||||| ||||| || ||| ||||| | |||||||| ||   | |    
T  46372124 agatagaggggagccagatcactagaggtaggggtagacctagaaaaactataagagaaactattaggaaggatctagagataaatgagttggagaaaga 46372223  T
Q  291 tatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgt 373  Q
     |||||||||||||||||||  |  | || |||||| |||||||| || || |||||||  | ||| ||||||||||||||||    
T  46372224 catggtttttgatagaacaccgtagcgtcctttgattcatgtagctgaccccacttagttgggtaaggcttggttgttgttgt 46372306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #100
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 214 - 376
Target Start/End: Original strand, 53540413 - 53540575
Alignment:
Q  214 agaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactat 313  Q
    ||||| ||||||||| |||  ||||| ||  || |||| ||||| ||||| || ||| | |||||||| ||   ||||||||||| |||||||||| |||    
T  53540413 agaggcagaggaagacctagaaaaactataagataaactattaggaaagacttggagattaatgagttggacaaaaatatggtttatgatagaacattat 53540512  T
Q  314 gacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 376  Q
    | ||| ||||||||||| ||||| | || ||| |||| |||||  |||||||||| |||||||    
T  53540513 ggcataatttgatccatatagccaaccccactgagtgggataagacttggttgttattgttgt 53540575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #101
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 323 - 376
Target Start/End: Original strand, 46153940 - 46153993
Alignment:
Q  323 tgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 376  Q
    |||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  46153940 tgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttgt 46153993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #102
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 320 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 1328667 - 1328611
Alignment:
Q  320 atttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 376  Q
    |||||||||||||| ||||||| || ||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  1328667 atttgatccatgtatccgatcctacctagtgggataaggcttggttgttgttgttgt 1328611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #103
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 23 - 87
Target Start/End: Complemental strand, 25967619 - 25967555
Alignment:
Q  23 gatgttgcgctggatgagtggtaagactagacatgataggattaagaatgacatcattagagaga 87  Q
    ||||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||||  ||||||  |||||||||||    
T  25967619 gatgttgcgatggatgtgtggtaagactagacatggtaggattagaaatgactacattagagaga 25967555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #104
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 288 - 376
Target Start/End: Original strand, 29399001 - 29399089
Alignment:
Q  288 aaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 376  Q
    ||||| ||||| |||||||||| |||| | | ||||||| |||||||| || || |||||||| || || |||||||||||||||||||    
T  29399001 aaataaggtttatgatagaacattatggcgtaatttgattcatgtagctgaccccacttagtgggaaaaggcttggttgttgttgttgt 29399089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #105
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 292 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 35622757 - 35622673
Alignment:
Q  292 atggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 376  Q
    ||||||||||||||||| ||| | |||| |||||| || ||||| || || |||||||| ||||| ||||||| |||||||||||    
T  35622757 atggtttttgatagaacgctagggcatcgtttgattcaggtagctgaccccacttagtgggataaggcttggtcgttgttgttgt 35622673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #106
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 321 - 373
Target Start/End: Original strand, 38017319 - 38017371
Alignment:
Q  321 tttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgt 373  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||| |||||||||    
T  38017319 tttgatccatgtagccgatcctacttagtgggataaggcttgggtgttgttgt 38017371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #107
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 292 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 42285784 - 42285700
Alignment:
Q  292 atggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 376  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||  |||||| ||||||||| | || |||||||  |||||  ||||||||||||||||||    
T  42285784 atggtttttgatagaatactatggcattgtttgattcatgtagccaaccccacttagttggataagacttggttgttgttgttgt 42285700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #108
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 294 - 374
Target Start/End: Original strand, 44360289 - 44360369
Alignment:
Q  294 ggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgtt 374  Q
    ||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||| || ||||| |  ||||| ||||| || ||||||||    
T  44360289 ggtttttgatagaacactatgacgtcgtttgattcatgtagccgaccccacttaataggataaggcttgtttattgttgtt 44360369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #109
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 325 - 377
Target Start/End: Original strand, 56130404 - 56130456
Alignment:
Q  325 atccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgtc 377  Q
    |||||||||||||| || |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  56130404 atccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttgtc 56130456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #110
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 259 - 374
Target Start/End: Original strand, 41192229 - 41192344
Alignment:
Q  259 aaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatg 358  Q
    |||||| ||||| | |||||||| |||  ||||||||| | || ||||||| |||| | || || ||||||||||||||| || || ||||  ||||| |    
T  41192229 aaagatctagagattaatgagttggatagaaatatggtatatggtagaacattatggcttcgttcgatccatgtagccgacccgacatagttggataagg 41192328  T
Q  359 cttggttgttgttgtt 374  Q
    ||||||||||||||||    
T  41192329 cttggttgttgttgtt 41192344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #111
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 321 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 44719413 - 44719358
Alignment:
Q  321 tttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 376  Q
    |||||||||||||||||| || |||||||| |||||  ||||||||||||||||||    
T  44719413 tttgatccatgtagccgaccctacttagtgggataagacttggttgttgttgttgt 44719358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #112
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 215 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 55809148 - 55809061
Alignment:
Q  215 gaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttga 302  Q
    |||||||||||||| |||  ||||| ||  |||||||  |||| |||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||| |||||    
T  55809148 gaggtagaggaagacctagaaaaactataagagaaactgttaggaaagatttagaggttaatgagttggatccagatatggtatttga 55809061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #113
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 91 - 157
Target Start/End: Original strand, 2588991 - 2589056
Alignment:
Q  91 ggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaa 157  Q
    ||||||| ||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||| || ||||| |||||||||||||    
T  2588991 ggggtagtacctatagt-gaaaagatggtagaaactagacttaggtggtttaggcatgtagagagaa 2589056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #114
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 320 - 374
Target Start/End: Original strand, 15665330 - 15665384
Alignment:
Q  320 atttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgtt 374  Q
    |||||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  15665330 atttgatccatgtagctgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgtt 15665384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #115
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 98 - 160
Target Start/End: Original strand, 26356626 - 26356688
Alignment:
Q  98 cacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagac 160  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||| | ||  ||||||||||||    
T  26356626 cacctatagtagaaaagatggtagaaaatagacttaggtggtttgggcacttagagagaagac 26356688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #116
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 272 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 41729551 - 41729509
Alignment:
Q  272 tcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatg 314  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  41729551 tcaatgagttggatccaaatatggtttatgatagaacactatg 41729509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #117
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 101 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 42285972 - 42285882
Alignment:
Q  101 ctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatca 191  Q
    |||||||||||||| ||||||||| ||||||||| || ||| | |||||| |||||||||| || ||| | || || ||||||| ||||||    
T  42285972 ctatagtagaaaagatggtagaaactagacttaggtggtttgggcatgtatagagaagacctgtggattctgtagtcagaagagcagatca 42285882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #118
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 222 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 42293416 - 42293262
Alignment:
Q  222 aggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcat 321  Q
    |||| ||||||| ||||| ||  ||||||| ||||  |||||| ||||  | ||||||||||||  | ||||||| | ||||||| || || || |||||    
T  42293416 aggatgaactaaaaaaactataagagaaactattaagaaagatctagaaattaatgagttagatagacatatggtatatgatagagcattacgatatcat 42293317  T
Q  322 ttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 376  Q
    || ||| |||||||||  || ||||||||  |||| || ||||||||||||||||    
T  42293316 ttaatctatgtagccggccccacttagtggaataaggcctggttgttgttgttgt 42293262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #119
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 34 - 195
Target Start/End: Original strand, 50662330 - 50662492
Alignment:
Q  34 ggatgagtggtaagactagacatgataggattaagaatgacatcattagagagaatgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagactta 133  Q
    ||||| |||||||||||| |   |||||||||   ||||||| ||||||||||| |  ||| | ||||||||||||||||| |||| |||| ||| ||||    
T  50662330 ggatgtgtggtaagactatatgagataggattggaaatgacagcattagagagagtttgggcaacacctatagtagaaaagatggtggaaagtaggctta 50662429  T
Q  134 gat-gatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaatg 195  Q
    | | | ||| | ||||||||||||||||  |||||| |  ||||||| |||| ||||| ||||    
T  50662430 ggtggttttgggcatgtagagagaagacttgtagattctattgtaaggagagtagatctaatg 50662492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #120
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 290 - 376
Target Start/End: Original strand, 54935348 - 54935434
Alignment:
Q  290 atatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 376  Q
    ||||||||| |||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||| | || |||| ||| || |  ||||||||||| |||||||    
T  54935348 atatggtttatgatagaacattataacataatttgatccatgtagcctaccccacttggtgggacagggcttggttgttattgttgt 54935434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #121
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 295 - 372
Target Start/End: Original strand, 3979124 - 3979201
Alignment:
Q  295 gtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttg 372  Q
    |||| |||||||||| |||||| | ||||||||||||||||| |  | || ||||| ||||| |||||||||||||||    
T  3979124 gtttatgatagaacattatgacgtaatttgatccatgtagcctactccacatagtgggataaggcttggttgttgttg 3979201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #122
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 274 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 22873698 - 22873601
Alignment:
Q  274 aatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgtt 371  Q
    |||||||| | ||||||||||| || |||||||||| ||| || | |||| |||||||||||| | || | |||||| ||||| ||||||| ||||||    
T  22873698 aatgagttggttccaaatatgggttatgatagaacattataacgtaatttaatccatgtagccaaccccatttagtgggataaggcttggtagttgtt 22873601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #123
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 11 - 113
Target Start/End: Complemental strand, 31403384 - 31403276
Alignment:
Q  11 agcagagatgatgatgttgcgctggatgagtggtaagactagacatgataggattaagaatgacatcattagag------agaatgggggtagcacctat 104  Q
    ||||||||||||||||||| | || ||| ||||| ||| |||||  ||||||||||  ||||||| ||||||||      ||| | ||||||||||||||    
T  31403384 agcagagatgatgatgttgagttgaatgtgtggtgagattagacgggataggattagaaatgacaacattagagacagatagagttggggtagcacctat 31403285  T
Q  105 agtagaaaa 113  Q
    |||||||||    
T  31403284 agtagaaaa 31403276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #124
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 292 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 31897509 - 31897428
Alignment:
Q  292 atggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgt 373  Q
    |||||| ||||||||||||||||||  | |||||| ||||||||| | |  |||||||| ||||| ||| ||||||||||||    
T  31897509 atggttgttgatagaacactatgacgccgtttgattcatgtagccaacctcacttagtgggataaggctcggttgttgttgt 31897428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #125
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 15 - 113
Target Start/End: Complemental strand, 34233393 - 34233291
Alignment:
Q  15 gagatgatgatgttgcgctggatgagtggtaagactagacatgataggattaagaatgacatcattagaga----gaatgggggtagcacctatagtaga 110  Q
    ||||||||||||||| | |||||| ||| ||||||||||  |||||||||||  || |||| |||||||||    || | ||| ||||||||||||||||    
T  34233393 gagatgatgatgttgtgttggatgtgtgataagactagatgtgataggattagaaacgacaacattagagatagagagttgggatagcacctatagtaga 34233294  T
Q  111 aaa 113  Q
    |||    
T  34233293 aaa 34233291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #126
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 44 - 161
Target Start/End: Original strand, 50471479 - 50471596
Alignment:
Q  44 taagactagacatgataggattaagaatgacatcattagagagaatgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttag 143  Q
    ||||||| ||| | |||||||||   |||||| ||||||||||| | ||||||||||  |||||||||||| |||| |||| |||  |||  || ||| |    
T  50471479 taagacttgacgtaataggattagagatgacaacattagagagactcggggtagcactaatagtagaaaagatggtggaaactaggtttaagtggtttgg 50471578  T
Q  144 acatgtagagagaagacc 161  Q
     |||||||||||||||||    
T  50471579 gcatgtagagagaagacc 50471596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #127
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 320 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 4879162 - 4879106
Alignment:
Q  320 atttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 376  Q
    ||||||||||||||||||| |  ||||| || ||||| |||||||||||||||||||    
T  4879162 atttgatccatgtagccgacctcacttactgggataaggcttggttgttgttgttgt 4879106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #128
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 320 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 15661925 - 15661869
Alignment:
Q  320 atttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 376  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| | ||||||||||| |||||    
T  15661925 atttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggtttggttgttgtcgttgt 15661869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #129
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 288 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 20105603 - 20105515
Alignment:
Q  288 aaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 376  Q
    ||||||||| | |||||| ||| |||| | ||||||||||||||||||| |||  |||||||  || || ||||||| |||||||||||    
T  20105603 aaatatggtatatgataggacattatggcgtcatttgatccatgtagccaatctcacttagtaggacaaggcttggtggttgttgttgt 20105515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #130
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 91 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 30621486 - 30621418
Alignment:
Q  91 ggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaaga 159  Q
    |||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||  |||| |||||| | || ||||||||||||    
T  30621486 ggggtagcacttatagtagaaaagatggtggaaaataggtttaggtgatttgggcacgtagagagaaga 30621418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #131
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 300 - 376
Target Start/End: Original strand, 32339768 - 32339844
Alignment:
Q  300 tgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 376  Q
    |||||||| | |||| | || |||||||||||||| | || | |||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  32339768 tgatagaaaattatggcgtcgtttgatccatgtagtctattctacttagtgggataaggcttggttgttgttgttgt 32339844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #132
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 274 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 34233123 - 34233031
Alignment:
Q  274 aatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttg 366  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||| | |  | | |||||||||||||||||||  | ||| |||| || ||||||||||||    
T  34233123 aatgagttagatcaaaataaggtttatgatagaacattgtagcgtaatttgatccatgtagccgacgccactcagtgggacaatgcttggttg 34233031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #133
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 245 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 41009347 - 41009283
Alignment:
Q  245 gagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaaca 309  Q
    ||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||| ||| |||||||| ||| ||||| ||||    
T  41009347 gagaaacaattagaaatgatttagaagtcaatgagttggattcaaatatgttttatgatataaca 41009283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #134
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 92 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 42639301 - 42639233
Alignment:
Q  92 gggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagac 160  Q
    |||| |||||||||||||||||| |||| ||||  || ||||| || ||| ||||||||||||||||||    
T  42639301 gggttgcacctatagtagaaaagatggtggaaaccaggcttaggtggtttggacatgtagagagaagac 42639233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #135
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 321 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 49738602 - 49738550
Alignment:
Q  321 tttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgt 373  Q
    |||||||||||||||||| || | |||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  49738602 tttgatccatgtagccgaccccatttagtgggataaggcttggttgttgttgt 49738550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #136
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 320 - 368
Target Start/End: Original strand, 50862860 - 50862908
Alignment:
Q  320 atttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgtt 368  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||    
T  50862860 atttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgtt 50862908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #137
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 288 - 371
Target Start/End: Original strand, 1095642 - 1095725
Alignment:
Q  288 aaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgtt 371  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||| | | |||||||| ||||| |||| ||   |||||| ||||| ||||||||||||||    
T  1095642 aaatatggtttatgatagaacattatggcgttatttgatcgatgtacccgaccccgtttagtgggataaggcttggttgttgtt 1095725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #138
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 321 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 4136795 - 4136744
Alignment:
Q  321 tttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttg 372  Q
    |||||||||||||||||| || |||||||| |||||  ||||||||||||||    
T  4136795 tttgatccatgtagccgaccctacttagtgagataaaacttggttgttgttg 4136744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #139
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 300 - 371
Target Start/End: Original strand, 34585691 - 34585762
Alignment:
Q  300 tgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgtt 371  Q
    ||||| |||| |||| | ||||||||||||||||||  | || |||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  34585691 tgataaaacattatggcgtcatttgatccatgtagcttaacccacttagtgggataaggcttggttgttgtt 34585762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #140
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 290 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 36799740 - 36799657
Alignment:
Q  290 atatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgt 373  Q
    ||||||||| |||| ||||| |||  ||| ||||||||||||||| ||| || |||||||| ||||| ||||  ||||||||||    
T  36799740 atatggtttatgattgaacaatatcgcataatttgatccatgtagacgaccccacttagtgggataaagcttaattgttgttgt 36799657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #141
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 81 - 160
Target Start/End: Original strand, 44360077 - 44360155
Alignment:
Q  81 agagagaatgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagac 160  Q
    ||||||| | |||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||| |  ||| | ||||||||||||||||    
T  44360077 agagagagttggggtatcacctatagtagaaaagatggtagaaactaga-ttaggttgtttgggcatgtagagagaagac 44360155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #142
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 253 - 335
Target Start/End: Original strand, 36198977 - 36199059
Alignment:
Q  253 attagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagc 335  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||| ||| ||||||||||||   ||| |||| ||||||   | ||||||||||||||    
T  36198977 attagaaaagatttagaggttattgagtttgattcaaatatggtttcaaataaaacattatgacgaaacttgatccatgtagc 36199059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #143
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 98 - 195
Target Start/End: Original strand, 50680746 - 50680844
Alignment:
Q  98 cacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgattta-gacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaatg 195  Q
    |||||||||| |||||| |||| |||||||| ||||| || |||| | |||||||||||||| |  |||||| |||| ||||| |||| ||||| ||||    
T  50680746 cacctatagttgaaaagatggtggaaaataggcttaggtggtttatggcatgtagagagaaggcttgtagattccgtagtaaggagagtagatccaatg 50680844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #144
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 320 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 50967081 - 50967027
Alignment:
Q  320 atttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgtt 374  Q
    ||||||||||||||||||| |  ||||||||  |||| |||||||||||||||||    
T  50967081 atttgatccatgtagccgacctcacttagtggaataaagcttggttgttgttgtt 50967027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #145
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 91 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 55768783 - 55768717
Alignment:
Q  91 ggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaa 157  Q
    |||||||||||||||||||||||| |  | ||||||||  |||| || |||||||||||| ||||||    
T  55768783 ggggtagcacctatagtagaaaagatcatggaaaataggtttaggtggtttagacatgtaaagagaa 55768717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #146
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 91 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 55833039 - 55832973
Alignment:
Q  91 ggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaa 157  Q
    |||||||||||||||||||||||| |  | ||||||||  |||| || |||||||||||| ||||||    
T  55833039 ggggtagcacctatagtagaaaagatcatggaaaataggtttaggtggtttagacatgtaaagagaa 55832973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #147
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 17 - 82
Target Start/End: Original strand, 2588905 - 2588970
Alignment:
Q  17 gatgatgatgttgcgctggatgagtggtaagactagacatgataggattaagaatgacatcattag 82  Q
    ||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||   ||||||||||  ||||||| ||||||    
T  2588905 gatgaggatgttgcgttggatgtgtggtaagactagaagggataggattagaaatgacaacattag 2588970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #148
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 343 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 3601449 - 3601416
Alignment:
Q  343 acttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 376  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  3601449 acttagtgtgataaggcttggttgttgttgttgt 3601416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #149
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 300 - 373
Target Start/End: Original strand, 8284348 - 8284421
Alignment:
Q  300 tgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgt 373  Q
    ||||||| || |||| | ||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||| | ||||| ||| ||||||    
T  8284348 tgatagatcattatggcgtcatttgatccatatagccgatcctacttagtgggattaggcttgattgatgttgt 8284421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #150
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 292 - 376
Target Start/End: Original strand, 10209237 - 10209319
Alignment:
Q  292 atggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 376  Q
    |||||||||||||||||||  || | || |||||| || |||||||| || |||||||| ||||| || ||||||||| ||||||    
T  10209237 atggtttttgatagaacac--tggcgtcgtttgattcaagtagccgaccccacttagtgggataaggcgtggttgttgctgttgt 10209319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #151
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 292 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 10775550 - 10775468
Alignment:
Q  292 atggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 376  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||  ||||||  |||| ||||| || || ||||| ||||| |||||||||||||| ||||    
T  10775550 atggtttttgatagaacact--gacattgtttgatttatgtcgccgaccccacatagtgggataaggcttggttgttgtttttgt 10775468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #152
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 261 - 314
Target Start/End: Original strand, 26510558 - 26510611
Alignment:
Q  261 agatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatg 314  Q
    |||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||  ||||||||| ||||    
T  26510558 agatttagagattaatgagttggatccaaatatggtttgcgatagaacattatg 26510611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #153
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 81 - 198
Target Start/End: Original strand, 28497480 - 28497596
Alignment:
Q  81 agagagaatgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaaga 180  Q
    ||||||| | |||||||||||| ||||||||||| | || ||||| || ||||| || ||| | ||||||||||||||||  ||||||   || |||||     
T  28497480 agagagagttggggtagcacctttagtagaaaagattgtggaaaa-aggcttaggtggtttgggcatgtagagagaagacttgtagattatgtagtaagg 28497578  T
Q  181 agagaagatcaaatggag 198  Q
    |||| |||||| ||||||    
T  28497579 agagtagatcagatggag 28497596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #154
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 81 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 36557321 - 36557268
Alignment:
Q  81 agagagaatgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttag 134  Q
    ||||||| | |||| |||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||    
T  36557321 agagagagttggggcagcacccatagtagaaaagatggtagaaactagacttag 36557268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #155
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 91 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 49738886 - 49738809
Alignment:
Q  91 ggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagat 168  Q
    |||||||||||||| ||||||||| ||||||||| | | ||||| ||||||   | |||| ||||||||||| |||||    
T  49738886 ggggtagcacctattgtagaaaagatggtagaaactcggcttaggtgatttgagcgtgtaaagagaagacccatagat 49738809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #156
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 320 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 7544584 - 7544528
Alignment:
Q  320 atttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 376  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||| |||||  ||||||||| ||| ||||    
T  7544584 atttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataagccttggttgtcgttattgt 7544528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #157
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 321 - 373
Target Start/End: Original strand, 28348287 - 28348339
Alignment:
Q  321 tttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgt 373  Q
    ||||| |||||||||||| ||  ||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  28348287 tttgaaccatgtagccgaccccgcttagtgggataaggcttggttgttgttgt 28348339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #158
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 259 - 335
Target Start/End: Original strand, 28486089 - 28486165
Alignment:
Q  259 aaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagc 335  Q
    |||||||||||| | |||||||| |||||||||||| |||   || ||||| |||| | | ||||||||||||||||    
T  28486089 aaagatttagagattaatgagttggatccaaatatgatttacaattgaacaatatggcgtaatttgatccatgtagc 28486165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #159
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 245 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 30621329 - 30621241
Alignment:
Q  245 gagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgta 333  Q
    ||||||| ||||  |||||||||||| | |||| ||| || | ||||||||||| |||||||||| |||| | | | ||||||||||||    
T  30621329 gagaaactattaagaaagatttagagattaatgtgttggaccgaaatatggtttatgatagaacattatggcttaacttgatccatgta 30621241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #160
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 310 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 30662106 - 30662042
Alignment:
Q  310 ctatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgtt 374  Q
    |||||||||||||| ||||| || || || || |||||||| |||||  ||||||||||||||||    
T  30662106 ctatgacatcatttaatccaagtggctgaccctacttagtgggataagacttggttgttgttgtt 30662042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #161
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 292 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 35555731 - 35555647
Alignment:
Q  292 atggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 376  Q
    |||||||||||||| ||| |||| | || |||||| |||||||||||  | | |||||| || || ||||||||||| |||||||    
T  35555731 atggtttttgatagtacagtatggcgtcgtttgattcatgtagccgactccatttagtgggacaaggcttggttgtttttgttgt 35555647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #162
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 292 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 36556841 - 36556757
Alignment:
Q  292 atggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 376  Q
    |||||||||||||| |||||||| | |  |||||| | |||| |||| || |||| ||| |||||  ||||||||||||||||||    
T  36556841 atggtttttgataggacactatggcgttgtttgattcgtgtacccgaccccactttgtgggataagacttggttgttgttgttgt 36556757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #163
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 300 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 40932997 - 40932921
Alignment:
Q  300 tgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 376  Q
    |||||||||| |||| |  | |||||| ||||||||||| || |||| ||| ||||| ||||| |||||||||||||    
T  40932997 tgatagaacattatggcggcgtttgatgcatgtagccgaccccacttggtgggataaggcttgattgttgttgttgt 40932921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #164
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 292 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 45184214 - 45184130
Alignment:
Q  292 atggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 376  Q
    ||||||| | ||| |||| |||||| | ||| ||| ||||||||||| || |||||||| ||||| |||| ||||||||| ||||    
T  45184214 atggtttataataaaacattatgacgtaattcgattcatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttagttgttgttattgt 45184130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #165
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 321 - 373
Target Start/End: Original strand, 46236719 - 46236771
Alignment:
Q  321 tttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgt 373  Q
    |||||||||||||||||| || |||||||  ||||| ||||||| ||||||||    
T  46236719 tttgatccatgtagccgaccccacttagtaggataaggcttggtggttgttgt 46236771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #166
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 321 - 373
Target Start/End: Original strand, 50471757 - 50471809
Alignment:
Q  321 tttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgt 373  Q
    |||||||||||||  ||| || |||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  50471757 tttgatccatgtaatcgaccccacttagtgggataacgcttggttgttgttgt 50471809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #167
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 288 - 376
Target Start/End: Original strand, 54963648 - 54963735
Alignment:
Q  288 aaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 376  Q
    ||||||||| | |||||||||| |||| | | |||| ||||||||| | || ||||||||||| |||||  ||| ||||||||||||||    
T  54963648 aaatatggtatatgatagaaca-tatggcctaattttatccatgtacctgacccaacttagtgggataagacttagttgttgttgttgt 54963735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #168
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 259 - 355
Target Start/End: Original strand, 55579200 - 55579295
Alignment:
Q  259 aaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgata 355  Q
    ||||||||| ||||  ||||||| |||  ||| | ||||| ||||| |||| ||||| || ||||||||||||||||| | || |||||||||||||    
T  55579200 aaagatttaaaggttcatgagttggatttaaacaaggtttatgata-aacattatgatataatttgatccatgtagccaaccccacttagtgtgata 55579295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 225; Significance: 1e-124; HSPs: 129)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 15 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 42854364 - 42854001
Alignment:
Q  15 gagatgatgatgttgcgctggatgagtggtaagactagacatgataggattaagaatgacatcattagagagaa--tgggggtagcacctatagtagaaa 112  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||| |||||||| ||| |||||||   |||||||| ||||||||| ||| |    
T  42854364 gagatgacgatgttgcgctggataagtggtaagactagacagaataggattaggaatgacaccatcagagagagagtgggggtaacacctatagcagaga 42854265  T
Q  113 agttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaatggagaagaaccaggttaa 212  Q
    |||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| |||  ||||||||    
T  42854264 agttggtagaaaataggcttagatggtttggacatgtagagagaagacccgtagatgccgttgtaagaagagtagatcaaatggaggagagtcaggttaa 42854165  T
Q  213 aagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacacta 312  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  42854164 aagaggtagaggaagacctaagaaaaccattcgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttttgatataacacta 42854065  T
Q  313 tgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 376  Q
    || | ||||||||||||||||||||| || | |||||| ||||| | ||||| |||||||||||    
T  42854064 tggcgtcatttgatccatgtagccgaccccatttagtgggataaggtttggtggttgttgttgt 42854001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 11 - 376
Target Start/End: Original strand, 36545065 - 36545434
Alignment:
Q  11 agcagagatgatgatgttgcgctggatgagtggtaagactagacatgataggattaagaatgacatcattagagagaa----tgggggtagcacctatag 106  Q
    ||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||     |||||||| |||||||||    
T  36545065 agcagagatgaggatgttgtgttggatgagtggtaagactagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagagtgggggtaacacctatag 36545164  T
Q  107 tagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaatggagaagaacca 206  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||| | |  ||    
T  36545165 tagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacccgtagatgccgtggtaagaagagtagatcaaatggaggatagtca 36545264  T
Q  207 ggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgataga 306  Q
     ||||||||| ||||||||||| ||| |||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||| | |||||||    
T  36545265 agttaaaagacgtagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgataga 36545364  T
Q  307 acactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 376  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  36545365 acactatgacgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttgt 36545434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 208; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 11 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 36565605 - 36565239
Alignment:
Q  11 agcagagatgatgatgttgcgctggatgagtggtaagactagacatgataggattaagaatgacatcattagagagaa--tgggggtagcacctatagta 108  Q
    ||||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||   ||||||||||||||||||||    
T  36565605 agcagagatgaggatgatgcgttggatgagtggtaagactagacaggataggattaggaatgacaccattagagagagagtgggggtagcacctatagta 36565506  T
Q  109 gaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaatggagaagaaccagg 208  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| ||| | ||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||| | ||||||||||||| |||  || |    
T  36565505 gaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaatacccgtagatgccgtggtaagaagggtagatcaaatggaggagagtcaag 36565406  T
Q  209 ttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaac 308  Q
    |||||||||||||||||||| ||| |||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||| | |||||||||    
T  36565405 ttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaac 36565306  T
Q  309 actatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttg 375  Q
    |||||| | | ||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| ||| ||||||||||||||    
T  36565305 actatggcgttatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggctcggttgttgttgttg 36565239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 11 - 376
Target Start/End: Original strand, 40813240 - 40813609
Alignment:
Q  11 agcagagatgatgatgttgcgctggatgagtggtaagactagacatgataggattaagaatgacatcattagagagaa----tgggggtagcacctatag 106  Q
    ||||||||| | ||||||| | |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||     ||||||||||||||||||    
T  40813240 agcagagattaggatgttgtgttggatgagtggtaagactagacataataggattaagaatgacaccattagagagagagagtgggggtagcacctatag 40813339  T
Q  107 tagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaatggagaagaacca 206  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||| ||| | ||||||||||||||| | |||||| |||| |||||||||| ||||||||||||| |||  ||    
T  40813340 tagaaaagttggtagaaaataggtttagatggtttgggcatgtagagagaagatctgtagatgccgtggtaagaagagtagatcaaatggaggagagtca 40813439  T
Q  207 ggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgataga 306  Q
     ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||| |||| | |||||||    
T  40813440 agttaaaagaggtagaggaagacctaagaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcagtgagttggatccaaatttggtgtgtgataga 40813539  T
Q  307 acactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 376  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| | || |||||||| |||||  ||| ||||||||||||||    
T  40813540 acactatgacatcatttgatccatgtagccaaccccacttagtgggataaaacttcgttgttgttgttgt 40813609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 11 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 36395314 - 36394949
Alignment:
Q  11 agcagagatgatgatgttgcgctggatgagtggtaagactagacatgataggattaagaatgacatcattagagagaa--tgggggtagcacctatagta 108  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||   ||||||||||||||||||||    
T  36395314 agcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagactagacaggataggattaggaatgacaccattagagagagagtgggggtagcacctatagta 36395215  T
Q  109 gaaaagttggtagaaaatagactt-agatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaatggagaagaaccag 207  Q
    |||||||||||||||||||| ||| ||||| ||| | ||||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||| ||||||||||||| | |  ||     
T  36395214 gaaaagttggtagaaaataggctttagatggtttgggcatgtagagagaagacctgtagatgccgtggtaagaagagtagatcaaatggaggaaagtcaa 36395115  T
Q  208 gttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaa 307  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||| |||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||    
T  36395114 gttaaaagaggtataggaagacctaggaaaactatttgagaaaccgttagaaaggatttagaggtcaatgagttagatccaaatttggtgtatgatagaa 36395015  T
Q  308 cacta---tgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttg 372  Q
    |||||   || |||  |||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||| ||||||||||    
T  36395014 cactattgtggcat--tttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttcgttgttgttg 36394949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 178; E-Value: 8e-96
Query Start/End: Original strand, 59 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 11524040 - 11523720
Alignment:
Q  59 taggattaagaatgacatcattagagagaa--tgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagactt-agatgatttagacatgtagagag 155  Q
    |||||||| |||||||| |||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||| ||||| ||| | |||||||||||    
T  11524040 taggattaggaatgacaccattagagagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagttaataggctttagatggtttgggcatgtagagag 11523941  T
Q  156 aagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccatt 255  Q
    ||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||| |||  || ||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||| |||||||||||    
T  11523940 aagacccgtagatgccgtggtaagaagagtagatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccatt 11523841  T
Q  256 agaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgata 355  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||| | ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||    
T  11523840 agaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggata 11523741  T
Q  356 atgcttggttgttgttgttgt 376  Q
    | |||||||||||||||||||    
T  11523740 aggcttggttgttgttgttgt 11523720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 178; E-Value: 8e-96
Query Start/End: Original strand, 11 - 325
Target Start/End: Original strand, 39946775 - 39947091
Alignment:
Q  11 agcagagatgatgatgttgcgctggatgagtggtaagactagacatgataggattaagaatgacatcattagaga--gaatgggggtagcacctatagta 108  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||  || ||||||||||||||||||||    
T  39946775 agcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagactagacatgataggattatgaatgacaccattatagaaagagtgggggtagcacctatagta 39946874  T
Q  109 gaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaatggagaagaaccagg 208  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||| |||||||| |||||| |||| |||||||||| ||||||||||||| |||  || |    
T  39946875 gaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttggacatgtagaaagaagacctgtagatgccgtcgtaagaagagtagatcaaatggaggagactcaag 39946974  T
Q  209 ttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaac 308  Q
    ||| ||||||||||||| || |||  ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||| |||||||||    
T  39946975 ttagaagaggtagaggacgacctagaaaaactattagagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttgaatccaaatttggtttatgatagaac 39947074  T
Q  309 actatgacatcatttga 325  Q
     ||||| | ||||||||    
T  39947075 gctatggcgtcatttga 39947091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 168; E-Value: 8e-90
Query Start/End: Original strand, 15 - 374
Target Start/End: Original strand, 18125097 - 18125454
Alignment:
Q  15 gagatgatgatgttgcgctggatgagtggtaagactagacatgataggattaagaatgacatcattagagagaatgggggtagcacctatagtagaaaag 114  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  18125097 gagatgagcatgttgcgctggatgagtgacaagacgagacatgataggattagaaatgacaccattagagagagtgggggtagcacctatagtagaaaag 18125196  T
Q  115 ttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaa 214  Q
    |||||||||||||| |||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| || ||||||||||||| |||  | |||| |||    
T  18125197 ttggtagaaaataggcttagatggtttgaacatgtagagagaagacccgtagatgccgtcgtaagaatagtagatcaaatggaggagagtcgggtt-aaa 18125295  T
Q  215 gaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatg 314  Q
    |||||||||| ||| |||  ||||| ||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||| ||||||    
T  18125296 gaggtagagggagacctagaaaaactattagagaaaccattagaaaagatttaaaagtcaatgagttggatccaaatatgatttatgatagaatactatg 18125395  T
Q  315 acatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgtt 374  Q
       | |||||||| |||||| | | || |||||||| |||||  ||||||||||||||||    
T  18125396 gtgt-atttgatcaatgtagtcaacccgacttagtgggataaaacttggttgttgttgtt 18125454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 162; E-Value: 3e-86
Query Start/End: Original strand, 93 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 12491418 - 12491141
Alignment:
Q  93 ggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaa 192  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||||    
T  12491418 ggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacccgtagatgccgtggtaagaagagtagatcaa 12491319  T
Q  193 atggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaata 292  Q
    ||| || |||  || ||||||||||||||| ||||| ||| |||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||     
T  12491318 atgaaggagagtcaagttaaaagaggtagatgaagacctatgaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatt 12491219  T
Q  293 tggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgt 370  Q
    |||| | ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||| ||||||||    
T  12491218 tggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttagttgttgt 12491141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 159; E-Value: 2e-84
Query Start/End: Original strand, 11 - 356
Target Start/End: Original strand, 2796473 - 2796818
Alignment:
Q  11 agcagagatgatgatgttgcgctggatgagtggtaagacta--gacatgataggattaagaatgacatcattagagagaa--tgggggtagcacctatag 106  Q
    |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||   |||||||||| |||||||    
T  2796473 agcaaagatgaggatgttgcgctggatgagtggtaagactatagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgggggtagcgcctatag 2796572  T
Q  107 tagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaatggagaagaacca 206  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| ||| | ||||||||||||    | |||||| || |||||||||||| | ||||||||||| |||  ||    
T  2796573 tagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagaga----ctgtagatgccattgtaagaagagtaaatcaaatggaggagagtca 2796668  T
Q  207 ggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgataga 306  Q
     ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||  |  ||||| ||||||||||||||    
T  2796669 tgttaaaagaggtagaggaagacctaagaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaattagttgaactcaaatttggtttttgataga 2796768  T
Q  307 acactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataa 356  Q
    ||| |||| | | ||||||| ||||||| ||| || |||||||| |||||    
T  2796769 acagtatggcgtaatttgattcatgtagacgaccccacttagtgggataa 2796818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 158; E-Value: 7e-84
Query Start/End: Original strand, 43 - 370
Target Start/End: Original strand, 8932653 - 8932982
Alignment:
Q  43 gtaagactagacatgataggat-taagaatgacatcattagagagaatgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgattt 141  Q
    ||||||||||||||||||  |  || |||||||| ||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||    
T  8932653 gtaagactagacatgatacaaaataggaatgacaccattagagagagtgggggtagcacatacagtagaaaagttggtagaaaatagatttagatggttt 8932752  T
Q  142 agacatgtagagagaagacccgt-agataccgttgtaagaagagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaacc 240  Q
     |||||||||| |||||| |||| | || || |||||||||||| | ||||||||||  |||  || ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  8932753 ggacatgtagaaagaagatccgttaaatgccattgtaagaagagtaaatcaaatggaagagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaagaaaacc 8932852  T
Q  241 atttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatc 340  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||| |||||||| |||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||| || |    
T  8932853 attcgagaaaccattagaaaagatttaaaggttaatgagttggatcaaaatatggcttttgataaaacactatggcgtcatttgatccatgtagctgacc 8932952  T
Q  341 caacttagtgtgataatgcttggttgttgt 370  Q
    | ||||||||  |||| |||||||||||||    
T  8932953 ccacttagtgaaataaagcttggttgttgt 8932982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 148; E-Value: 7e-78
Query Start/End: Original strand, 165 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 42469935 - 42469724
Alignment:
Q  165 agataccgttgtaagaagagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagat 264  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  42469935 agatgccgttgtaagaagagtagatcaaatggaggagagtcaggttaaaagaggtagaggaagacctaagaaaaccattcgagaaaccattagaaaagat 42469836  T
Q  265 ttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggt 364  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| || || ||||| || ||||| |||||||    
T  42469835 ttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttttgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagctgaccccacttattgggataaggcttggt 42469736  T
Q  365 tgttgttgttgt 376  Q
    ||||||||||||    
T  42469735 tgttgttgttgt 42469724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 122 - 376
Target Start/End: Original strand, 21121177 - 21121430
Alignment:
Q  122 aaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtag 221  Q
    |||||||  ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||  |||   ||||||||||||||||    
T  21121177 aaaataggtttagatggtttggacatgtagagagaagacccgtagatgccgtcgtaagaagagtagatcaaatggacgagagttaggttaaaagaggtag 21121276  T
Q  222 aggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcat 321  Q
    ||| ||| |||||||| | ||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||| | | ||    
T  21121277 agggagacctaagaaatctattagagaaaccattagaaaggatttagaagtcaatgagttggatcctaatatggtttatgatagaacactatggcgtaat 21121376  T
Q  322 ttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 376  Q
    ||||| ||||||||||| || |||||||| || || |||||||||||||||||||    
T  21121377 ttgat-catgtagccgaccccacttagtgggaaaaggcttggttgttgttgttgt 21121430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 121; E-Value: 9e-62
Query Start/End: Original strand, 10 - 373
Target Start/End: Original strand, 45419156 - 45419517
Alignment:
Q  10 aagcagagatgatgatgttgcgctggatgagtggtaagactagacatgataggattaagaatgacatcattagagagaatgggggtagcacctatagtag 109  Q
    |||| ||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||   |||| ||||| |||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  45419156 aagcggagatgaagatgttgcgttggattagtggtaagactagaagggataagattaggaatgacaccattagagagaattggggtagcacctatagtag 45419255  T
Q  110 aaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaatggagaagaaccaggt 209  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||| || ||| | |||||||||| |||||| |||||  |  | ||| |||||| |||||| |||||| |||  ||| |    
T  45419256 aaaagatggtataaaatagacttaggtggtttgggcatgtagagataagacctgtagaggc--tagtatgaagagtagatcagatggaggagagtcagat 45419353  T
Q  210 taaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaaca 309  Q
       |||||||||||||||| |||  ||||| ||  ||||||| ||||| |||| |||| |    |||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||    
T  45419354 ctgaagaggtagaggaagacctagaaaaactataagagaaactattaggaaaggtttaaatcataatgagtttgatccaaatttggtttatgatagaaca 45419453  T
Q  310 ctatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgt 373  Q
     ||||   | ||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  45419454 ttatggtgtaatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 45419517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 111; E-Value: 8e-56
Query Start/End: Original strand, 15 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 18752233 - 18751996
Alignment:
Q  15 gagatgatgatgttgcgctggatgagtggtaagactagacatgataggattaagaatgacatcattagagagaatgggggtagcacctatagtagaaaag 114  Q
    |||||||  ||||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||| | |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  18752233 gagatgagaatgttgcgctgaatgagtgttaagactagacataataggattagggatgacaccattagagagagtgggggtagcacctatagtagaaaag 18752134  T
Q  115 ttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaa 214  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||| || || ||||| ||||||| | |||||  ||||||||||| || |   || ||||||    
T  18752133 ttggtagaaaatag-cttagatggtttggacatgtagagagaggatccatagatgccgttgttaaaagagtggatcaaatggaaaatagttagattaaaa 18752035  T
Q  215 gaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaacca 253  Q
    |||||||||||| | |||| ||||||||| | |||||||    
T  18752034 gaggtagaggaatacctaaaaaaaccattagcgaaacca 18751996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 106; E-Value: 8e-53
Query Start/End: Original strand, 15 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 8879800 - 8879446
Alignment:
Q  15 gagatgatgatgttgcgctggatgagtggtaagactagacatgataggattaagaatgacatcattagagaga--atgggggtagcacctatagtagaaa 112  Q
    |||||||  ||||||| || ||| |||||||||||| |||  |||||||||| ||||||||  ||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||    
T  8879800 gagatgagaatgttgcacttgataagtggtaagactggactagataggattaggaatgacacaattagagagagaatgggggaagcacctatagtagaaa 8879701  T
Q  113 agttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaatggagaagaaccaggttaa 212  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||    | |||| ||||||||||  ||||| |||||| ||   | |||  |    
T  8879700 agttggtagaaaatagacttagatgatttgggtatgtagagagaagacccg----tgccgtcgtaagaagagttgatcagatggaggagggtcgggtcca 8879605  T
Q  213 aagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacacta 312  Q
    ||||| | |||| |||  || |||||| ||  |||||||||||| ||| |||||||| |||||| ||||  ||||||||||||||| ||||| |||||      
T  8879604 aagagcttgagggagacgtaggaaaactataagagaaaccattaaaaatgatttagaagtcaataagttgaatccaaatatggtttatgatataacac-- 8879507  T
Q  313 tgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgt 373  Q
    |||| | |||| ||||||||||||||  | ||||| |  ||||| ||||||||||||||||    
T  8879506 tgacgtaatttaatccatgtagccgactccacttattaggataaagcttggttgttgttgt 8879446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 105; E-Value: 3e-52
Query Start/End: Original strand, 218 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 14742234 - 14742079
Alignment:
Q  218 gtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgaca 317  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||   ||||||||||||||||||| |     
T  14742234 gtagaggaagacctaagaaaaccattcgagaaaccattagaaaagatttagaagtcaatgagttggatccaaata---tttttgatagaacactatggcg 14742138  T
Q  318 tcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 376  Q
    ||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  14742137 tcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttgt 14742079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 15 - 376
Target Start/End: Original strand, 37077687 - 37078034
Alignment:
Q  15 gagatgatgatgttgcgctggatgagtggtaagactagacatgataggattaagaatgacatcattag--agagaatgggggtagcacctatagtagaaa 112  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||| |||||||| |||| |  ||||| || ||||||            |||    
T  37077687 gagatgaggatgttgcgctggatgagtggtaaaactagacgagataggattaggaatgacaccattcggaagagagtgagggtag------------aaa 37077774  T
Q  113 agttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaatggagaagaaccaggttaa 212  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||  ||||| ||||| |||| |||||||||| ||||||||||||| |||  | ||| ||    
T  37077775 agttggtagaaaatagacttagatggtttgggcatgtagagag--gacccatagatgccgtcgtaagaagagtagatcaaatggaggagagtcgggtcaa 37077872  T
Q  213 aagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacacta 312  Q
    || ||||||| ||||| ||| |||||  ||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||   |    ||||||||||      
T  37077873 aataggtagatgaagacctaggaaaattataagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatactttggaagatagaacac-- 37077970  T
Q  313 tgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 376  Q
    |||| | |||||||||||| |||||| || ||||| || |||||  ||||||||||||||||||    
T  37077971 tgacgtaatttgatccatgcagccgaccccacttaatgggataaaacttggttgttgttgttgt 37078034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 111 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 26905168 - 26904950
Alignment:
Q  111 aaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaatggagaagaaccaggtt 210  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| || | || || ||||||||||||||| ||||||||||||  |||  ||| |     
T  26905168 aaagttggtagaaaataggcttagatgatttagatatgtagagagaaaactcatacatgccgttgtaagaagagtagatcaaatggaagagagtcagata 26905069  T
Q  211 aaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacac 310  Q
    |||||||||||||| ||| ||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||||||| |||| | ||| |||||    
T  26905068 aaaagaggtagagggagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaagatttagaggtcaataagttgga-ccaaatatagtttataataaaacac 26904970  T
Q  311 tatgacatcatttgatccat 330  Q
    |||| | | |||||||||||    
T  26904969 tatgtcgtaatttgatccat 26904950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 98; E-Value: 5e-48
Query Start/End: Original strand, 192 - 376
Target Start/End: Original strand, 2027631 - 2027815
Alignment:
Q  192 aatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaat 291  Q
    ||||||| |||  |||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||||    
T  2027631 aatggaggagagtcaggttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaatgatttagaggtcaatgagttatattcaaat 2027730  T
Q  292 atggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccga-tccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 376  Q
    ||||||| |||||||||||||||||  |||||||||| ||||||| |  || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  2027731 atggtttatgatagaacactatgacgccatttgatcc-tgtagccaacccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttgt 2027815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 149 - 369
Target Start/End: Original strand, 12025847 - 12026058
Alignment:
Q  149 tagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgaga 248  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||||  |||||||||||||||| | ||||| ||||||||||             
T  12025847 tagagagaagatccgtagatgccgttgtaagaagagtagatcaaatagagaagagtcaggttaaaagaggtaaatgaagacctaagaaaac--------- 12025937  T
Q  249 aaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatga---catcatttgatccatgtagccgatccaact 345  Q
       ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||   | |||||||||||||||| |||| || |||    
T  12025938 ---cattagaaaagatttagaggtcaataagttggatccaaatatggtttttgatagaacactatgacgtcgtcatttgatccatgtaaccgaccctact 12026034  T
Q  346 tagtgtgataatgcttggttgttg 369  Q
    |||||  |||| | ||||||||||    
T  12026035 tagtggaataaggtttggttgttg 12026058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 252 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 15215533 - 15215409
Alignment:
Q  252 cattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgt 351  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| || |||||||      
T  15215533 cattagaaaagatttagagatcaatgagtttgatccaaatatggtttttaatagaacactatgacgtcatatgatccatgtagccgaccccacttagtag 15215434  T
Q  352 gataatgcttggttgttgttgttgt 376  Q
    ||||| |||||||||||||||||||    
T  15215433 gataaggcttggttgttgttgttgt 15215409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 245 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 25473531 - 25473402
Alignment:
Q  245 gagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaac 344  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||| | ||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||| || ||    
T  25473531 gagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagtttgatccaaatttggtgtatgatagaacactatagcgtcatttgatccatgtagccgaccccac 25473432  T
Q  345 ttagtgtgataatgcttggttgttgttgtt 374  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  25473431 ttagtgggataaggcttggttgttgttgtt 25473402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 81; E-Value: 7e-38
Query Start/End: Original strand, 261 - 373
Target Start/End: Original strand, 44529395 - 44529507
Alignment:
Q  261 agatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgct 360  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||    
T  44529395 agatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtttatgatagaacactatggcatcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggct 44529494  T
Q  361 tggttgttgttgt 373  Q
    |||||||||||||    
T  44529495 tggttgttgttgt 44529507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 71; E-Value: 6e-32
Query Start/End: Original strand, 11 - 101
Target Start/End: Complemental strand, 12492206 - 12492116
Alignment:
Q  11 agcagagatgatgatgttgcgctggatgagtggtaagactagacatgataggattaagaatgacatcattagagagaatgggggtagcacc 101  Q
    |||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  12492206 agcagatatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagactagacatgataggattatgaatgacaccattagagagaatgggggtagcacc 12492116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 69; E-Value: 9e-31
Query Start/End: Original strand, 264 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 44047641 - 44047529
Alignment:
Q  264 tttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttgg 363  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||| ||| | |||||||||||||||||| || || |||||||| ||||| ||||||    
T  44047641 tttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtttatgatagaacaccatggcgtcatttgatccatgtagctgaccccacttagtgggataaggcttgg 44047542  T
Q  364 ttgttgttgttgt 376  Q
    |||||||||||||    
T  44047541 ttgttgttgttgt 44047529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 64; E-Value: 9e-28
Query Start/End: Original strand, 245 - 372
Target Start/End: Original strand, 25288918 - 25289045
Alignment:
Q  245 gagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaac 344  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||| |||||||| || |||| || || ||    
T  25288918 gagaaacctttagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttatgatataactctatgacataatttgatctatttagctgaccccac 25289017  T
Q  345 ttagtgtgataatgcttggttgttgttg 372  Q
     |||||  |||| |||||||||||||||    
T  25289018 ctagtggtataaggcttggttgttgttg 25289045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 64; E-Value: 9e-28
Query Start/End: Original strand, 245 - 372
Target Start/End: Original strand, 25300253 - 25300380
Alignment:
Q  245 gagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaac 344  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||| || || ||    
T  25300253 gagaaacctttagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttatgatataacactatgacataatttgatctatgtagctgaccccac 25300352  T
Q  345 ttagtgtgataatgcttggttgttgttg 372  Q
     |||||  | || ||||||| |||||||    
T  25300353 ctagtggaacaaggcttggtggttgttg 25300380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 259 - 376
Target Start/End: Original strand, 490503 - 490620
Alignment:
Q  259 aaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatg 358  Q
    |||||||||||| |  ||||||| |||||||||||||||| |||||||||| |||| | | ||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |    
T  490503 aaagatttagagattgatgagttggatccaaatatggtttatgatagaacattatggcgtaatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataagg 490602  T
Q  359 cttggttgttgttgttgt 376  Q
    |||| |||||||||||||    
T  490603 cttgtttgttgttgttgt 490620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 245 - 373
Target Start/End: Original strand, 29520803 - 29520931
Alignment:
Q  245 gagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaac 344  Q
    |||||||  |||| || ||||||||| | |||||||| |||||||||||||||| |||||||||| |||| | | ||||||||||||||||| | || |     
T  29520803 gagaaactgttaggaacgatttagagattaatgagttggatccaaatatggtttatgatagaacattatggcgtaatttgatccatgtagcccaccccat 29520902  T
Q  345 ttagtgtgataatgcttggttgttgttgt 373  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  29520903 ttagtgggataatgcttggttgttgttgt 29520931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 17 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 6510784 - 6510617
Alignment:
Q  17 gatgatgatgttgcgctggatgagtggtaagactagacatgataggattaagaatgacatcattagagagaatgggggtagcacctatagtagaaaagtt 116  Q
    ||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||   |||| |||||  ||||||| ||||  |||||  | | |||||||||||| ||||||||||    
T  6510784 gatgatgatgttgtgttggataagtggtaagactagatgagatatgattagaaatgacaccattgaagagagagagcgtagcacctataatagaaaagtt 6510685  T
Q  117 ggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagag 184  Q
    ||||||||| | | ||||||| ||| | ||||||||||||||| | |||||| |||| ||||||||||    
T  6510684 ggtagaaaacaaatttagatggtttgggcatgtagagagaagatctgtagatgccgtcgtaagaagag 6510617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 62 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 12797011 - 12796894
Alignment:
Q  62 gattaagaatgacatcattagagagaatgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacc 161  Q
    ||||| |||| ||| ||||||| ||| ||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| |||||||||||     
T  12797011 gattaggaataacaccattagaaagagtggaggtaacacctatagaagaaaagttggtagaaaataggcttagatgatttaggcatgcagagagaagact 12796912  T
Q  162 cgtagataccgttgtaag 179  Q
    ||| ||| |||| |||||    
T  12796911 cgttgattccgtcgtaag 12796894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 25 - 376
Target Start/End: Original strand, 32043522 - 32043872
Alignment:
Q  25 tgttgcgctggatgagtggtaagactagacatgataggattaagaatgacatcattagagagaatg--ggggtagcacctatagtagaaaagttggtaga 122  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||||||  ||||| ||||  ||||||| |||||||||||  |  |||||| ||||||||||| ||||| |||||||    
T  32043522 tgttgcgttggatgtgtggtaagactagacgggatagaattagaaatgacaacattagagagagagttggggtatcacctatagtacaaaagatggtaga 32043621  T
Q  123 aaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtaga 222  Q
    || ||||||| | || ||| | ||||||||||||||||| || |||   || ||||| |||  |||||| ||||||  |   ||  | |  ||||||||     
T  32043622 aactagactttggtggtttggccatgtagagagaagacctgtggatgttgtagtaaggagaatagatcagatggaggggtgtcaaatcactagaggtagg 32043721  T
Q  223 ggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatt 322  Q
    |||||| |||| ||||| ||| ||||||| || |  || ||| || || |||||||||| ||   | | ||||||||||||||||||||||| |  | ||    
T  32043722 ggaagacctaaaaaaactattagagaaactatcaagaaggatctaaagatcaatgagttggagaaagacatggtttttgatagaacactatggc--cgtt 32043819  T
Q  323 tgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 376  Q
    |||| |||||| | || || |||||||| ||||| ||||| |||||||||||||    
T  32043820 tgattcatgta-ctgaccccacttagtgggataaggcttgattgttgttgttgt 32043872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 214 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 35643765 - 35643605
Alignment:
Q  214 agaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactat 313  Q
    ||||| ||||||||| |||  ||||| ||  ||||||  ||||  |||||| ||||| | |||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||      
T  35643765 agaggcagaggaagacctagaaaaactataagagaaattattaagaaagatctagagattaatgagttggatcgaaatatggtttatgatagaacact-- 35643668  T
Q  314 gacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 376  Q
    | |||  |||||||||||||||| | || |||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  35643667 gccatattttgatccatgtagcctaccccacttagtgggataatgcttggttgttgttgttgt 35643605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 54; E-Value: 8e-22
Query Start/End: Original strand, 245 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 45041443 - 45041315
Alignment:
Q  245 gagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaac 344  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||| ||||||  || |||| | | |||||||||||||||| || || ||    
T  45041443 gagaaactattaggaaagatttagaggttaatgagttggatccaa-tatggtttatgatagcgcattatggcgtaatttgatccatgtagctgaccccac 45041345  T
Q  345 ttagtgtgataatgcttggttgttgttgtt 374  Q
    |||||| ||||| |||||||||||| ||||    
T  45041344 ttagtgggataaggcttggttgttgatgtt 45041315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 245 - 376
Target Start/End: Original strand, 30559847 - 30559983
Alignment:
Q  245 gagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgta-----gccgat 339  Q
    ||||||| || || |||||||||||| | |||||||| |||||| ||||||||| |||||||||| |||||| | ||||||||||||||     |||||     
T  30559847 gagaaactatcaggaaagatttagagattaatgagttggatccatatatggtttatgatagaacattatgacgtaatttgatccatgtaatgtagccgac 30559946  T
Q  340 ccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 376  Q
    || | |||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  30559947 cccagttagtgggataaggcttggttgttgttgttgt 30559983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 100 - 376
Target Start/End: Original strand, 32930970 - 32931245
Alignment:
Q  100 cctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaatggaga 199  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||| |  ||||| |||||| |||||||||| |||| | |  ||||| | || ||||| |||  |||||| ||||||     
T  32930970 cctatagtagaaaaggtggcagaaaacatgcttaggtgatttggacatgtagaaagaaaatctatagattctgtagtaaggagactagatcagatggagg 32931069  T
Q  200 agaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttt 299  Q
    | |  ||  | |  ||||| ||||||||| |||| ||||| ||  ||||||| ||||| |||||||| ||  | |||||||| || | ||||||||| |     
T  32931070 atagtcatatcactagaggcagaggaagacctaaaaaaactatcagagaaactattaggaaagattttgaaattaatgagttgga-cgaaatatggtgta 32931168  T
Q  300 tgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 376  Q
    |||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||| || |||||||| || ||  ||||||||||| ||||||    
T  32931169 tgatagaacattatggcataatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggaaaagccttggttgttgatgttgt 32931245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 11 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 39953628 - 39953263
Alignment:
Q  11 agcagagatgatgatgttgcgctggatgagtggtaagactagacatgataggatta---agaatgacatcattagagagaatgggggtagcacctatagt 107  Q
    |||||||||||  |||||||| |||||| ||||||||| || ||||||||  ||||   | |||||||| |  ||||||| | ||| |||||||||||      
T  39953628 agcagagatgagaatgttgcgttggatgtgtggtaagattaaacatgatataattagaaataatgacattag-agagagagttgggatagcacctatatg 39953530  T
Q  108 agaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaatggagaagaaccag 207  Q
    ||||||| ||||||||| |||| |||| || ||||| |||||||||||  ||||  | |||   || ||||| |||| |||||| ||| ||  ||| |||    
T  39953529 agaaaagatggtagaaactagatttaggtggtttaggcatgtagagaggtgacctatggattatgtagtaaggagagtagatcagatgaaggcgaatcag 39953430  T
Q  208 gttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaa 307  Q
     | |  |||||||| || ||| ||| |||||| |   ||||||| ||||| || ||| ||||| | |||||||||||   ||| |||||||||||| | |    
T  39953429 atcactagaggtaggggtagacctaggaaaactaaaagagaaactattaggaaggatctagagataaatgagttagagaaaaacatggtttttgatggga 39953330  T
Q  308 cactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgtt 374  Q
    |||||||   |  |||||| ||||||||||| || |||||||| |||||  ||||||||||||||||    
T  39953329 cactatggagttgtttgattcatgtagccgaccccacttagtgggataagacttggttgttgttgtt 39953263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 34 - 132
Target Start/End: Original strand, 25985462 - 25985560
Alignment:
Q  34 ggatgagtggtaagactagacatgataggattaagaatgacatcattagagagaatgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagactt 132  Q
    ||||| |||||||||| ||||| ||||| ||||  || |||| ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  25985462 ggatgtgtggtaagacaagacaggatagaattagaaacgacaacattagagagagttggggtagcacctatagtagaaaagatggtagaaactagactt 25985560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 58 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 43904984 - 43904700
Alignment:
Q  58 ataggattaagaatgacatcattagagaga-atgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataga---cttagatgatttagacatgtagag 153  Q
    ||||||| || ||||||| ||||||||||  || || |||||| |||||||||||||| |||  |||||||     ||||| || ||| |||||||||||    
T  43904984 ataggataaaaaatgacaacattagagaggtattggcgtagcatctatagtagaaaagatggaggaaaataataagcttaggtggtttggacatgtagag 43904885  T
Q  154 agaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaacca 253  Q
    ||||||||  |||||   || |||||||||  |||||| |||||| | |  ||  ||| |||||||| ||||||| |||  || || ||  |||||||      
T  43904884 agaagacctatagatgttgtagtaagaagaatagatcagatggaggatagtcaaattacaagaggtacaggaagacctagaaatactataagagaaacgg 43904785  T
Q  254 ttagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccga 338  Q
    |||  | |||||||||| | |||||||| |||| ||||||||||| |||||||||| |||| | | |||||||||||||||||||    
T  43904784 ttatgagagatttagagattaatgagttggatctaaatatggtttatgatagaacattatggcgtaatttgatccatgtagccga 43904700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 15 - 133
Target Start/End: Original strand, 13986416 - 13986536
Alignment:
Q  15 gagatgatgatgttgcgctggatgagtggtaagactagacatgataggattaagaatgacatcatt--agagagaatgggggtagcacctatagtagaaa 112  Q
    ||||||| |||||| | ||||||||||||||| |||||||  ||||  |||| |||||||||||||  |||| || | |||||||||||||||||| |||    
T  13986416 gagatgaggatgttacactggatgagtggtaatactagacgagatataattaggaatgacatcattaaagagggatttggggtagcacctatagtacaaa 13986515  T
Q  113 agttggtagaaaatagactta 133  Q
    |  ||||||||||||||||||    
T  13986516 atatggtagaaaatagactta 13986536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 214 - 373
Target Start/End: Original strand, 2216411 - 2216568
Alignment:
Q  214 agaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactat 313  Q
    ||||||||||||||| |||  |||| |||  ||||||| |||| | ||||||||||| |||||||||| ||||| |||||| ||| |||||||||| |||    
T  2216411 agaggtagaggaagacctagaaaaaacataagagaaactatta-agaagatttagagatcaatgagttggatcctaatatg-tttatgatagaacattat 2216508  T
Q  314 gacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgt 373  Q
        | ||||||||||||||||||| || ||| |||| ||||| ||||||| ||||||||    
T  2216509 agtgtaatttgatccatgtagccgaccccactcagtgagataaggcttggtggttgttgt 2216568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 9 - 87
Target Start/End: Complemental strand, 15215637 - 15215559
Alignment:
Q  9 gaagcagagatgatgatgttgcgctggatgagtggtaagactagacatgataggattaagaatgacatcattagagaga 87  Q
    ||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||  ||||||| |||||||||||    
T  15215637 gaagcggagatgaggatgttgtgctggatgagtggtaagactatacaggataggattagaaatgacaccattagagaga 15215559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 321 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 39967551 - 39967497
Alignment:
Q  321 tttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttg 375  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  39967551 tttgatccatgtagccgatcccacttattgtgataatgcttggttgttgttgttg 39967497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 11 - 168
Target Start/End: Original strand, 30748377 - 30748534
Alignment:
Q  11 agcagagatgatgatgttgcgctggatgagtggtaagactagacatgataggattaagaatgacatcattagagagaatgggggtagcacctatagtaga 110  Q
    |||||| |||| |||||| || |||||| ||||| ||| |||||||||||||||||  ||||||| ||||| ||||| | | ||| |||||  |||||||    
T  30748377 agcagatatgaggatgtttcgttggatgtgtggttagattagacatgataggattagaaatgacaacattacagagagttgtggtcgcaccagtagtaga 30748476  T
Q  111 aaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagat 168  Q
    |||| |||| |||   || ||||| || ||| | ||||||||||||||||| ||||||    
T  30748477 aaagatggtggaatcaaggcttaggtggtttgggcatgtagagagaagacctgtagat 30748534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 259 - 376
Target Start/End: Original strand, 42584527 - 42584643
Alignment:
Q  259 aaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatg 358  Q
    |||||| || |||| ||||| || |||||||||||||||| |||||||||| |||||| | ||||||| | ||||||||| || |||||||| |||||      
T  42584527 aaagatctataggttaatgatttggatccaaatatggtttatgatagaacattatgacgtaatttgat-cttgtagccgaccccacttagtgggataaga 42584625  T
Q  359 cttggttgttgttgttgt 376  Q
    |||| |||||||||||||    
T  42584626 cttgattgttgttgttgt 42584643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 300 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 27556375 - 27556299
Alignment:
Q  300 tgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 376  Q
    |||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||| || |||||||| | ||| |||||||||||||||||||    
T  27556375 tgatagaacattatggcataatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggttaaagcttggttgttgttgttgt 27556299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 295 - 379
Target Start/End: Original strand, 30689939 - 30690023
Alignment:
Q  295 gtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgtcgt 379  Q
    |||| ||||| |||| |||||| | ||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||| || ||||||||||    
T  30689939 gtttatgatataacattatgacgtaatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataatgcttggtttttattgttgtcgt 30690023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 245 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 35914729 - 35914601
Alignment:
Q  245 gagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaac 344  Q
    ||||||| ||||| ||||| ||  || | |||||||| || | ||||||||||| |||||||||| |||| | | |||||||||||||||| || || ||    
T  35914729 gagaaactattaggaaagacttgaagattaatgagttggaccaaaatatggtttatgatagaacattatggcgtaatttgatccatgtagctgaccccac 35914630  T
Q  345 ttagtgtgataatgcttggttgttgttgt 373  Q
    |||||| |||||  |||||||||||||||    
T  35914629 ttagtgagataagacttggttgttgttgt 35914601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 288 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 41031505 - 41031417
Alignment:
Q  288 aaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 376  Q
    ||||||||||| | | |||||| ||||| || ||||||||||| ||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  41031505 aaatatggtttatcacagaacattatgagataatttgatccatatagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttgt 41031417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #51
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 288 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 41031611 - 41031523
Alignment:
Q  288 aaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 376  Q
    ||||||||||| | | |||||| ||||| || ||||||||||| ||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  41031611 aaatatggtttatcacagaacattatgagataatttgatccatatagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttgt 41031523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #52
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 284 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 8255622 - 8255528
Alignment:
Q  284 atccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatcca--acttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 376  Q
    ||||||||||||||| ||||||| || |||| | | |||||||||||||||||||  ||  |||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  8255622 atccaaatatggtttatgatagaccaatatggcgtaatttgatccatgtagccgagacaccacttagtgggataaagcttggttgttgttgttgt 8255528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #53
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 213 - 376
Target Start/End: Original strand, 28169514 - 28169676
Alignment:
Q  213 aagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacacta 312  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||| ||  ||||||| ||||| |||||||| ||| | |||||||| ||| |||||||||||| ||||| || | ||    
T  28169514 aagaggtagaggaagacctaaaaaaactataagagaaactattaggaaagattttgagattaatgagttggattcaaatatggtttatgataaaatatta 28169613  T
Q  313 tgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 376  Q
    ||   | |||| |||||| || || | || |||||||| ||||| ||||||||| |||||||||    
T  28169614 tggtgtaattttatccatataaccaaccccacttagtg-gataaggcttggttgatgttgttgt 28169676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #54
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 301 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 1928659 - 1928585
Alignment:
Q  301 gatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttg 375  Q
    ||||||||| |||| | | ||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  1928659 gatagaacattatggcgtaatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 1928585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #55
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 301 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 10668569 - 10668495
Alignment:
Q  301 gatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttg 375  Q
    |||||||||||||||  |||||||||| |||||||||| |  |||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  10668569 gatagaacactatgaggtcatttgatcgatgtagccgacctcacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 10668495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #56
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 259 - 376
Target Start/End: Original strand, 21425214 - 21425331
Alignment:
Q  259 aaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatg 358  Q
    |||||| ||||| | |||||||| |||| ||||||| ||| ||||||| || |||| ||| |||||||||||||||| || || ||||||||  |||  |    
T  21425214 aaagatatagagattaatgagttggatcgaaatatgatttatgatagaccattatggcataatttgatccatgtagcagaccctacttagtggaatatgg 21425313  T
Q  359 cttggttgttgttgttgt 376  Q
    ||||||| ||||||||||    
T  21425314 cttggttattgttgttgt 21425331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #57
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 274 - 375
Target Start/End: Original strand, 23492217 - 23492318
Alignment:
Q  274 aatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgt 373  Q
    |||||||| |||  ||||||| | | |||||||||||||||   |||||| |||||||||||||| || |||||||| ||||| ||||| ||||||||||    
T  23492217 aatgagttggatagaaatatgatatatgatagaacactatggtgtcatttaatccatgtagccgaccccacttagtgagataaggcttgtttgttgttgt 23492316  T
Q  374 tg 375  Q
    ||    
T  23492317 tg 23492318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #58
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 11 - 105
Target Start/End: Original strand, 25288820 - 25288916
Alignment:
Q  11 agcagagatgatgatgttgcgctggatgagtggtaagactagacatgataggattaagaatgacatcattagagaga--atgggggtagcacctata 105  Q
    |||||| |||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||   |||||||||| ||| |||| |||||||||||   |||||||||||||||||    
T  25288820 agcagatatgaggatgttgagctggattagtggtaagactagatgagataggattaggaaggacaccattagagagagtgtgggggtagcacctata 25288916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #59
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 11 - 105
Target Start/End: Original strand, 25300155 - 25300251
Alignment:
Q  11 agcagagatgatgatgttgcgctggatgagtggtaagactagacatgataggattaagaatgacatcattagagaga--atgggggtagcacctata 105  Q
    |||||| |||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||   |||||||||| ||| |||| |||||||||||   |||||||||||||||||    
T  25300155 agcagatatgaggatgttgagctggattagtggtaagactagatgagataggattaggaaggacaccattagagagagtgtgggggtagcacctata 25300251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #60
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 294 - 379
Target Start/End: Original strand, 36042401 - 36042486
Alignment:
Q  294 ggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgtcgt 379  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || || | ||| || || ||   ||||||||||||||||||||    
T  36042401 ggtttttgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtagcggaccccaattaatgggaaaagatttggttgttgttgttgtcgt 36042486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #61
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 245 - 372
Target Start/End: Original strand, 14459049 - 14459177
Alignment:
Q  245 gagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccga-tccaa 343  Q
    ||||||| ||||| |||||||| ||| | ||||||||||| | ||||||||||| |||| ||||| ||||   | |||||||||||||||||||  || |    
T  14459049 gagaaactattaggaaagatttggagattaatgagttagaccaaaatatggtttatgatggaacattatggtgtaatttgatccatgtagccgaccccca 14459148  T
Q  344 cttagtgtgataatgcttggttgttgttg 372  Q
    ||| ||| |||||  ||||||||||||||    
T  14459149 ctttgtgggataagccttggttgttgttg 14459177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #62
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 263 - 376
Target Start/End: Original strand, 31715992 - 31716107
Alignment:
Q  263 atttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatcca--acttagtgtgataatgct 360  Q
    |||||||| | ||| |||| ||||||||||||||||  ||||||||| |||| | | ||||||||||||||||    |||  |||||||| ||||| |||    
T  31715992 atttagagattaattagttggatccaaatatggtttaagatagaacattatggcgtaatttgatccatgtagcgtcaccaccacttagtgggataaggct 31716091  T
Q  361 tggttgttgttgttgt 376  Q
    ||||||||||||||||    
T  31716092 tggttgttgttgttgt 31716107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #63
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 300 - 376
Target Start/End: Original strand, 32276894 - 32276970
Alignment:
Q  300 tgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 376  Q
    |||||||||| |||| | | ||||||||||||||| ||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  32276894 tgatagaacattatggcgtaatttgatccatgtagacgaacccacttagtgggataaagcttggttgttgttgttgt 32276970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #64
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 300 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 32569783 - 32569707
Alignment:
Q  300 tgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 376  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||| || | |||||| |||||  ||||||||||||||||||    
T  32569783 tgatagaacactatgacgtcatttgatttatgtagccgaccccatttagtgggataagacttggttgttgttgttgt 32569707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #65
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 288 - 372
Target Start/End: Original strand, 36143538 - 36143622
Alignment:
Q  288 aaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttg 372  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||| || || ||||  || || |||||||||||||||    
T  36143538 aaatatggtttatgatagaacattatgacgtcatctgatccatgtagccgaccccacctagtcggaaaaggcttggttgttgttg 36143622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #66
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 292 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 30812897 - 30812814
Alignment:
Q  292 atggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttg 375  Q
    |||||||||||||||||||||||   || |||||| ||||||||||| || |||||||| || || ||||||| ||||||||||    
T  30812897 atggtttttgatagaacactatggtgtcgtttgattcatgtagccgaccccacttagtgggaaaaggcttggtggttgttgttg 30812814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #67
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 33 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 44681381 - 44681251
Alignment:
Q  33 tggatgagtggtaagactagacatgataggattaagaatgacatcattagagagaatg--ggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagac 130  Q
    |||||| |||||||||||||||  |||| |||||  ||||||| |||||||||||  |  | ||||||||||||| |||||||| |||| |||||||  |    
T  44681381 tggatgtgtggtaagactagacgagataagattagaaatgacaacattagagagacagttgtggtagcacctataatagaaaagatggtggaaaataagc 44681282  T
Q  131 ttagatgatttagacatgtagagagaagacc 161  Q
    ||||| | ||| || || |||||||||||||    
T  44681281 ttagaaggtttggaaatctagagagaagacc 44681251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #68
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 44 - 191
Target Start/End: Original strand, 7046285 - 7046434
Alignment:
Q  44 taagactagacatgataggattaagaatgacatcattagagagaatgg--gggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgattt 141  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||  ||  |||||||||| || ||||||||| |||| |||  | | ||||| || |||    
T  7046285 taagactagacatgataggattagaaatgacaacattagagagagaggctgggtagcaccaatcgtagaaaagatggtggaacctcggcttagctggttt 7046384  T
Q  142 agacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatca 191  Q
     | ||||||||||||| || ||||| | | || ||||| |||| ||||||    
T  7046385 gggcatgtagagagaaaacacgtagcttctgtagtaaggagagtagatca 7046434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #69
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 45 - 168
Target Start/End: Original strand, 9695583 - 9695708
Alignment:
Q  45 aagactagacatgataggattaagaatgacatcattagagagaa--tgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgattta 142  Q
    ||||||||||| ||||| ||||  ||||||| ||||| |||||   | |||||||||||||||||||||||| |||| |||| | | ||||| || |||     
T  9695583 aagactagacaggatagaattagaaatgacaacattatagagatatttggggtagcacctatagtagaaaagatggtggaaactcggcttaggtggtttg 9695682  T
Q  143 gacatgtagagagaagacccgtagat 168  Q
    | |||||||||||||| || ||||||    
T  9695683 ggcatgtagagagaagtcctgtagat 9695708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #70
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 290 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 18474055 - 18473973
Alignment:
Q  290 atatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttg 372  Q
    ||||||| |||||||||||| |||||| || |||||| |||||||||||  | |||||||| |||||  ||||||||||||||    
T  18474055 atatggtatttgatagaacattatgacttcgtttgattcatgtagccgacaccacttagtgggataagacttggttgttgttg 18473973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #71
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 13 - 127
Target Start/End: Complemental strand, 13172011 - 13171895
Alignment:
Q  13 cagagatgatgatgttgcgctggatgagtggtaagactagacatgataggattaagaatgacatcattagagagaatg--ggggtagcacctatagtaga 110  Q
    |||||||||  |||||||  |||||| || ||||||||||||  ||||||||||  |||||||  ||||||||||  |  |||| |||||||||||||||    
T  13172011 cagagatgagaatgttgcattggatgtgtagtaagactagacgggataggattagaaatgacaagattagagagagagttggggaagcacctatagtaga 13171912  T
Q  111 aaagttggtagaaaata 127  Q
    |||| |||| |||||||    
T  13171911 aaagatggtggaaaata 13171895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #72
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 292 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 7531725 - 7531641
Alignment:
Q  292 atggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 376  Q
    |||||||||||||||||||||||   || |||||| ||||||||||| |  |||||||  ||||| |||||||||||||| ||||    
T  7531725 atggtttttgatagaacactatggtgtcgtttgattcatgtagccgaactcacttagtaggataaggcttggttgttgttcttgt 7531641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #73
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 321 - 373
Target Start/End: Original strand, 12611727 - 12611779
Alignment:
Q  321 tttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgt 373  Q
    ||||||||||||||||||||| | |||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  12611727 tttgatccatgtagccgatcccaattagtgggataaggcttggttgttgttgt 12611779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #74
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 321 - 369
Target Start/End: Original strand, 26055651 - 26055699
Alignment:
Q  321 tttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttg 369  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||    
T  26055651 tttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttg 26055699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #75
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 15 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 30113557 - 30113442
Alignment:
Q  15 gagatgatgatgttgcgctggatgagtggtaagactagacatgataggattaagaatgacatcattagagagaatg--ggggtagcacctatagtagaaa 112  Q
    |||||||  |||||| ||| ||||  || ||||| |||| |||||| ||||| ||||||||| ||||||||||  |  |||||| ||| |||||||||||    
T  30113557 gagatgagaatgttgtgctagatgtttgttaagaatagatatgataagattatgaatgacattattagagagagagtcggggtaacacatatagtagaaa 30113458  T
Q  113 agttggtagaaaatag 128  Q
    || |||||||||||||    
T  30113457 agatggtagaaaatag 30113442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #76
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 311 - 375
Target Start/End: Original strand, 35323993 - 35324057
Alignment:
Q  311 tatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttg 375  Q
    |||||| | |||||||||| |||||||| || |||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  35323993 tatgacgtaatttgatccacgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 35324057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #77
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 220 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 35362803 - 35362651
Alignment:
Q  220 agaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatc 319  Q
    ||||||||| |||  ||||| ||  ||||||| ||||| |||||||| ||  | |||||||| ||   ||||||||| | |||||||||| |||| | |     
T  35362803 agaggaagacctagaaaaactatcggagaaactattaggaaagatttggaaattaatgagttggactgaaatatggtgtatgatagaacattatggcgta 35362704  T
Q  320 atttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttg 372  Q
    |||||||||||| |||| | || |||||||| || || |||||||||||||||    
T  35362703 atttgatccatgcagccaaccccacttagtgggaaaaggcttggttgttgttg 35362651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #78
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 11 - 198
Target Start/End: Original strand, 36143287 - 36143472
Alignment:
Q  11 agcagagatgatgatgttgcgctggatgagtggtaagactagacatgataggattaagaatgacatcattagagagaatgggggtagcacctatagtaga 110  Q
    ||||||||||| ||||||| | |||  | ||||||||||||||   ||||||||||  || || |  |||||||||  | | |||||||||||||| |||    
T  36143287 agcagagatgaggatgttgtgttggtcgtgtggtaagactagatgagataggattagaaaggaaaagattagagag--tcgaggtagcacctatagcaga 36143384  T
Q  111 aaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaatggag 198  Q
    | || |||| |||||||||||||| || ||| | ||| |||||| ||||||  ||||| | || ||| | |||| |||||||||||||    
T  36143385 atagatggtggaaaatagacttaggtggtttgggcatttagagaaaagacctatagattctgtagtatggagagtagatcaaatggag 36143472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #79
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 256 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 41444456 - 41444336
Alignment:
Q  256 agaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgata 355  Q
    ||||||| ||||||| | |||| ||| |||| ||||||||||| ||||| |||| ||  || | |||||| |||||||||| | || ||||| ||  |||    
T  41444456 agaaaaggtttagagattaatgggtttgatcaaaatatggtttatgatataacattacaacgtaatttgaaccatgtagccaaacccacttaatggaata 41444357  T
Q  356 atgcttggttgttgttgttgt 376  Q
    ||||||||| |||||||||||    
T  41444356 atgcttggtcgttgttgttgt 41444336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #80
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 295 - 375
Target Start/End: Original strand, 43733410 - 43733490
Alignment:
Q  295 gtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttg 375  Q
    ||||| |||||||||||||| | || ||| || |||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||| | ||||||||    
T  43733410 gttttggatagaacactatggcgtcgtttcattcatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggtggctgttgttg 43733490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #81
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 274 - 370
Target Start/End: Original strand, 44699649 - 44699745
Alignment:
Q  274 aatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgt 370  Q
    ||||||||||| | |||||||||   ||||||||||||||| | | ||||||||| |||||| || || |||||||| || || |||||||||||||    
T  44699649 aatgagttagaccgaaatatggtgcatgatagaacactatggcgtaatttgatccctgtagcagaccccacttagtgggaaaaggcttggttgttgt 44699745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #82
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 89 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 2776513 - 2776434
Alignment:
Q  89 tgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagat 168  Q
    |||||||||||||||| ||||||| | ||||||||| | | ||||| || ||| | ||||| ||||||||||||||||||    
T  2776513 tgggggtagcacctatcgtagaaatgatggtagaaactcggcttaggtggtttgggcatgttgagagaagacccgtagat 2776434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #83
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 288 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 10824274 - 10824187
Alignment:
Q  288 aaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttg 375  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||  | | ||||||||||||||||| ||  | ||||  || || ||||||||||||||||||    
T  10824274 aaatatggtttttgatagaacattatgaagtaagttgatccatgtagccgaccccgcctagtcggaaaaggcttggttgttgttgttg 10824187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #84
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 292 - 367
Target Start/End: Original strand, 16351578 - 16351653
Alignment:
Q  292 atggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgt 367  Q
    ||||||||| ||||||||||||| |||| |||||| ||||||| ||| || ||||||||  |||| ||||||||||    
T  16351578 atggtttttaatagaacactatggcatcgtttgattcatgtagacgaccccacttagtggaataaggcttggttgt 16351653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #85
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 258 - 373
Target Start/End: Original strand, 26363655 - 26363768
Alignment:
Q  258 aaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataat 357  Q
    |||| ||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||| |||||||||||| |    | ||||||||||||||| ||| || ||| |||| |||||     
T  26363655 aaaatatttagaggtcaa-gagttggatctaaatatggtttatgatagaacact-tagtgtaatttgatccatgtagtcgaccccactcagtgggataag 26363752  T
Q  358 gcttggttgttgttgt 373  Q
     |||||||||||||||    
T  26363753 acttggttgttgttgt 26363768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #86
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 274 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 30198365 - 30198262
Alignment:
Q  274 aatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgt 373  Q
    |||||||| ||||  |||||||||| |||||||| | ||||   |  ||||||| |||| ||||| || |||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  30198365 aatgagttggatcggaatatggtttatgatagaatattatggtgtagtttgatctatgttgccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 30198266  T
Q  374 tgtc 377  Q
    ||||    
T  30198265 tgtc 30198262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #87
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 57 - 124
Target Start/End: Complemental strand, 33666814 - 33666748
Alignment:
Q  57 gataggattaagaatgacatcattagagagaatgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaa 124  Q
    |||||||||||||||||||| |  ||||||| | |||||||||||||| ||||||||| |||||||||    
T  33666814 gataggattaagaatgacataag-agagagagttggggtagcacctatcgtagaaaagatggtagaaa 33666748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #88
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 11 - 114
Target Start/End: Complemental strand, 42493668 - 42493565
Alignment:
Q  11 agcagagatgatgatgttgcgctggatgagtggtaagactagacatgataggattaagaatgacatcattagagagaatgggggtagcacctatagtaga 110  Q
    |||| |||||| ||||||||| ||| || ||||||||| ||| || ||| |||||   ||||||| |||| |||||| | |||||| |||||||||||||    
T  42493668 agcaaagatgaggatgttgcgttggttgtgtggtaagattagtcaagattggattgtaaatgacaacattggagagagttggggtaacacctatagtaga 42493569  T
Q  111 aaag 114  Q
    ||||    
T  42493568 aaag 42493565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #89
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 326 - 376
Target Start/End: Original strand, 1064955 - 1065005
Alignment:
Q  326 tccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 376  Q
    ||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  1064955 tccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttgt 1065005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #90
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 91 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 25985881 - 25985839
Alignment:
Q  91 ggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagactta 133  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  25985881 ggggtagcacctatagtagaaaagtttgtagaaactagactta 25985839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #91
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 291 - 369
Target Start/End: Original strand, 39702154 - 39702232
Alignment:
Q  291 tatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttg 369  Q
    ||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||| |||||||||| |  | |||||| |||||  |||||||||||    
T  39702154 tatggtttttgatagaacattatggtatcatttgatctatgtagccgaccacatttagtgggataaaacttggttgttg 39702232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #92
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 294 - 377
Target Start/End: Original strand, 41212064 - 41212149
Alignment:
Q  294 ggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgta--gccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgtc 377  Q
    ||||| |||||||||| |||| | | ||||||||||| ||  ||||| || |||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  41212064 ggtttatgatagaacattatggcgtaatttgatccatctatagccgaccccacttagtgggaaaatgcttggttgttgttgttgtc 41212149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #93
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 278 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 2518493 - 2518400
Alignment:
Q  278 agttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgtt 371  Q
    |||| |||| ||||||| ||| |||||||||| |||| ||| ||||||||| |||||| || || |||||||  ||||| | ||||||||||||    
T  2518493 agtttgatcgaaatatgatttctgatagaacattatggcataatttgatccttgtagctgaccccacttagtaagataaggtttggttgttgtt 2518400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #94
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 323 - 376
Target Start/End: Original strand, 16921451 - 16921504
Alignment:
Q  323 tgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 376  Q
    |||||||||||||||| |  |||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  16921451 tgatccatgtagccgaccgtacttagtgggataaagcttggttgttgttgttgt 16921504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #95
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 300 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 35647003 - 35646930
Alignment:
Q  300 tgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgt 373  Q
    |||||||||| |||| | | |||||||||||| |||||| || ||||||||| | || ||||||||||||||||    
T  35647003 tgatagaacattatggcgtaatttgatccatgcagccgaccccacttagtgtaacaaggcttggttgttgttgt 35646930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #96
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 292 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 38901900 - 38901815
Alignment:
Q  292 atggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgtc 377  Q
    ||||||||||||| ||||||||| |  |||||||| |||||||| || || |  ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||    
T  38901900 atggtttttgatataacactatggcggcatttgattcatgtagcggaccccatatagtgggataaggcttgattgttgttgttgtc 38901815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #97
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 95 - 147
Target Start/End: Original strand, 7103274 - 7103326
Alignment:
Q  95 tagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacat 147  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||| || |||||||||    
T  7103274 tagcacctatagtagaaaagatggtagaaactaggcttaggtgttttagacat 7103326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #98
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 16 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 10080264 - 10080119
Alignment:
Q  16 agatgatgatgttgcgctggatgagtggtaagactagacatgataggattaagaatgacatcattagagagaatg--ggggtagcacctatagtagaaaa 113  Q
    |||||||||||||||| ||| ||  ||||||||||||||  |||| |||||  ||||||| |||||||||||  |  | ||||||| ||| |||||||||    
T  10080264 agatgatgatgttgcgttgggtgtttggtaagactagacgagataagattagaaatgacaacattagagagagagttgaggtagcatcta-agtagaaaa 10080166  T
Q  114 gttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacc 161  Q
    | |||| |||| ||| | | |||| ||| | |||||||||||||||||    
T  10080165 gatggtggaaactaggcct-gatggtttgggcatgtagagagaagacc 10080119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #99
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 15 - 112
Target Start/End: Original strand, 16351312 - 16351411
Alignment:
Q  15 gagatgatgatgttgcgctggatgagtggtaagactagacatgataggattaagaatgacatcatt--agagagaatgggggtagcacctatagtagaaa 112  Q
    ||||||| ||||||||| |||||  |||||||||||||||   ||||  |||  ||||||| ||||  |||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  16351312 gagatgaagatgttgcgttggatatgtggtaagactagacggaatagagttagaaatgacaacattagagagagaattagggtagcacctatagtagaaa 16351411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #100
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 332 - 376
Target Start/End: Original strand, 32978115 - 32978159
Alignment:
Q  332 tagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 376  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  32978115 tagccgacccaacttagtgggataaggcttggttgttgttgttgt 32978159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #101
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 24 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 2518742 - 2518637
Alignment:
Q  24 atgttgcgctggatgagtggtaagactagacatgataggattaagaatgacatcattagagagaa--tgggggtagcacctatagtagaaaagttggtag 121  Q
    |||||||  |||||| ||||||||||||||   ||||||||||  |||||||  |||||||||||  | ||||||||||||  |||||||||| |||| |    
T  2518742 atgttgcattggatgtgtggtaagactagatgagataggattagaaatgacaa-attagagagaaaattggggtagcacctcaagtagaaaagatggtgg 2518644  T
Q  122 aaaatag 128  Q
    |||||||    
T  2518643 aaaatag 2518637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #102
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 260 - 371
Target Start/End: Original strand, 16917352 - 16917462
Alignment:
Q  260 aagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgc 359  Q
    ||||||||||| | |||||||| |||  ||||||||| | |||||||||| | ||||  | |||||||||||||||||  || |||||||| |||||  |    
T  16917352 aagatttagagattaatgagttggatagaaatatggtatatgatagaacatt-tgactgcttttgatccatgtagccgtccccacttagtgggataagac 16917450  T
Q  360 ttggttgttgtt 371  Q
    |||||| |||||    
T  16917451 ttggttattgtt 16917462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #103
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 40 - 108
Target Start/End: Original strand, 21121105 - 21121175
Alignment:
Q  40 gtggtaagactagacatgataggattaagaatgacatcattagagagaa--tgggggtagcacctatagta 108  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||  |||| || |||||||||||   ||||||||||||||||||||    
T  21121105 gtggtaagactagacgggataggattagaaatggcaccattagagagagagtgggggtagcacctatagta 21121175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #104
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 23 - 105
Target Start/End: Original strand, 25439397 - 25439477
Alignment:
Q  23 gatgttgcgctggatgagtggtaagactagacatgataggattaagaatgacatcattagagagaatgggggtagcacctata 105  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||   ||||||| || ||| || | ||||||||||  ||||||||||| |||||    
T  25439397 gatgttgcgctggattagtggtaagactagatgagataggaataggaacgataccattagagag--tgggggtagcaactata 25439477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #105
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 245 - 296
Target Start/End: Original strand, 25439479 - 25439530
Alignment:
Q  245 gagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggt 296  Q
    ||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||    
T  25439479 gagaaaccattcgaaaggatttagagatcaatgagttggattcaaatatggt 25439530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #106
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 16 - 87
Target Start/End: Original strand, 29520583 - 29520654
Alignment:
Q  16 agatgatgatgttgcgctggatgagtggtaagactagacatgataggattaagaatgacatcattagagaga 87  Q
    |||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||   ||||||||||  ||||| | |||||||||||    
T  29520583 agatgaggatgttgcgttggatgtgtggtaagactagatgggataggattagaaatgataccattagagaga 29520654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #107
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 220 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 38392046 - 38391919
Alignment:
Q  220 agaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatc 319  Q
    ||||||||| |||  ||||| || |||||||||||||  |||||| || || | |||||||  |||| ||||||||| | |||||||| | |||| | |     
T  38392046 agaggaagacctagaaaaactatatgagaaaccattaagaaagatctacagattaatgagtgggatcgaaatatggtatatgatagaatattatggcgta 38391947  T
Q  320 atttgatccatgtagccgatccaactta 347  Q
    |||| |||||||| |||||||| |||||    
T  38391946 atttcatccatgtggccgatcccactta 38391919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #108
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 320 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 39651081 - 39651026
Alignment:
Q  320 atttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttg 375  Q
    ||||||||||| || |||| || |||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  39651081 atttgatccatatacccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 39651026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #109
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 300 - 370
Target Start/End: Original strand, 1313773 - 1313843
Alignment:
Q  300 tgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgt 370  Q
    |||||||||| |||| | | |||| ||||||||||  || || |||||||| |||||||||||||||||||    
T  1313773 tgatagaacattatggcgtaattttatccatgtagttgaccccacttagtgggataatgcttggttgttgt 1313843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #110
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 321 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 11130004 - 11129951
Alignment:
Q  321 tttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttg 375  Q
    |||||||||||||||| | |||||||| || |||||| |||||||||||||||||    
T  11130004 tttgatccatgtagccta-ccaacttaatgagataatacttggttgttgttgttg 11129951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #111
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 259 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 12966428 - 12966347
Alignment:
Q  259 aaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgat--agaacactatgacatcatttgatccatgtagccga 338  Q
    |||||||||||| | ||||||||  || |||||||||||| ||||  ||| || |||||||| ||||||||||| |||||||    
T  12966428 aaagatttagagattaatgagttgaattcaaatatggtttatgatagagagcattatgacataatttgatccatatagccga 12966347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #112
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 274 - 376
Target Start/End: Original strand, 14903744 - 14903846
Alignment:
Q  274 aatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgt 373  Q
    ||||||||||| | ||||| ||||| |||||| ||| |||| | | ||||||||||||||||  | || |||||||| |  ||  |||||||||||||||    
T  14903744 aatgagttagaccaaaataaggtttatgataggacattatggcgtaatttgatccatgtagcttaccccacttagtggggaaaaacttggttgttgttgt 14903843  T
Q  374 tgt 376  Q
    |||    
T  14903844 tgt 14903846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #113
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 278 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 16035822 - 16035744
Alignment:
Q  278 agttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataa 356  Q
    |||| |||| ||||||||||| || ||||||| |||||| | ||||||| |||||||| || || |||||||| |||||    
T  16035822 agttggatcgaaatatggtttatggtagaacattatgacgtaatttgattcatgtagctgaccccacttagtgggataa 16035744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #114
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 11 - 114
Target Start/End: Complemental strand, 39760788 - 39760683
Alignment:
Q  11 agcagagatgatgatgttgcgctggatgagtggtaagactagacatgataggattaagaatgacatcattagag--agaatgggggtagcacctatagta 108  Q
    ||||||||||| ||||||| | |||||| |||||| || |||||| ||||||| ||  ||||| | ||||||||  ||| | ||| |||||||||| |||    
T  39760788 agcagagatgaggatgttgtgttggatgtgtggtaggattagacaagataggagtagaaatgataacattagagacagagttgggttagcacctatcgta 39760689  T
Q  109 gaaaag 114  Q
    ||||||    
T  39760688 gaaaag 39760683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #115
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 11 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 30456575 - 30456452
Alignment:
Q  11 agcagagatgatgatgttgcgctggatgagtggtaagactagacatgataggattaagaatgacatcattagagagaatgg--gggtagcacctatagta 108  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||| | |   ||||| ||||  ||||||  |||||||||||  |   | || ||||||||||||    
T  30456575 agcagagatgaggatgttgcgttggatgtgtggtaagacca-atgggatagaattagaaatgacgacattagagagatagttcgagttgcacctatagta 30456477  T
Q  109 gaaaagttggtagaaaatagactta 133  Q
    |||||| ||||||||| ||||||||    
T  30456476 gaaaagatggtagaaactagactta 30456452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #116
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 263 - 372
Target Start/End: Original strand, 36069774 - 36069883
Alignment:
Q  263 atttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttg 362  Q
    |||||||| | |||||||| | |  ||||||||||| |||||||||| || | | | ||||||||||| ||||| | || ||||| ||  ||||||||||    
T  36069774 atttagagattaatgagttgggtagaaatatggtttatgatagaacattacggcgtaatttgatccatatagccaaacccacttactggaataatgcttg 36069873  T
Q  363 gttgttgttg 372  Q
     |||||||||    
T  36069874 attgttgttg 36069883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #117
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 91 - 152
Target Start/End: Complemental strand, 41444608 - 41444547
Alignment:
Q  91 ggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtaga 152  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||  |||| || ||| ||||||||||    
T  41444608 ggggtagcacctatagtagaaaagatggtggaaactaggtttaggtggtttggacatgtaga 41444547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #118
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 322 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 4558259 - 4558207
Alignment:
Q  322 ttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgtt 374  Q
    ||||| ||||||||| | || |||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  4558259 ttgatacatgtagccaaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgtt 4558207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #119
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 245 - 373
Target Start/End: Original strand, 4955345 - 4955473
Alignment:
Q  245 gagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaac 344  Q
    ||||||| |||| |||||| |||||  | |||||||| |||  ||||||| ||| | ||| |||| || ||| | |||||||  |||||| |||||  ||    
T  4955345 gagaaactattaaaaaagacttagaaattaatgagtttgatttaaatatgatttataataaaacattacgacgtaatttgatttatgtagtcgatctcac 4955444  T
Q  345 ttagtgtgataatgcttggttgttgttgt 373  Q
    |||||| ||||| | ||||||||||||||    
T  4955445 ttagtgagataaggtttggttgttgttgt 4955473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #120
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 33 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 11129921 - 11129797
Alignment:
Q  33 tggatgagtggtaagactagacatgataggattaagaatgacatcattagagagaatgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagactt 132  Q
    |||||| ||||||||| ||||||| ||| |||||  || || | ||||| ||||| |   |||| || ||||||| |||||| | ||||||| ||| |||    
T  11129921 tggatgtgtggtaagattagacataataagattagaaacgataacattaaagagagttaaggtaacatctatagttgaaaagattgtagaaactagtctt 11129822  T
Q  133 agatgatttagacatgtagagagaa 157  Q
    |  || |||||||||||||||||||    
T  11129821 atgtgttttagacatgtagagagaa 11129797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #121
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 320 - 376
Target Start/End: Original strand, 12985919 - 12985975
Alignment:
Q  320 atttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 376  Q
    |||||||||||| |||||| || | |||| | ||||| |||||||||||||||||||    
T  12985919 atttgatccatgaagccgagcccatttagcgggataaggcttggttgttgttgttgt 12985975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #122
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 321 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 16971824 - 16971772
Alignment:
Q  321 tttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgt 373  Q
    |||||||||||||||||| |||| |||||| ||| | |||| |||||||||||    
T  16971824 tttgatccatgtagccgacccaatttagtgggattaggcttcgttgttgttgt 16971772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #123
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 290 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 30456377 - 30456329
Alignment:
Q  290 atatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccga 338  Q
    |||| |||||||||||||||||||| | || |||||| |||||||||||    
T  30456377 atattgtttttgatagaacactatggcgtcgtttgattcatgtagccga 30456329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #124
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 214 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 30783201 - 30783077
Alignment:
Q  214 agaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactat 313  Q
    ||||| ||||||||| |||  ||||||||  ||||||| |||   |||||| ||||| | |||||||| |||| ||||| ||||| | ||| |||| |||    
T  30783201 agaggcagaggaagatctagtaaaaccataagagaaactatttagaaagatctagagattaatgagttggatcgaaatacggtttataataaaacattat 30783102  T
Q  314 gacatcatttgatccatgtagccga 338  Q
    ||  |  ||||||||||||||||||    
T  30783101 gaggtagtttgatccatgtagccga 30783077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #125
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 324 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 35085186 - 35085134
Alignment:
Q  324 gatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 376  Q
    ||||||||||||||| || |||||||| ||||| | || ||||||||||||||    
T  35085186 gatccatgtagccgaccccacttagtgggataagggttagttgttgttgttgt 35085134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #126
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 320 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 40982949 - 40982893
Alignment:
Q  320 atttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 376  Q
    ||||||||||||| ||||| || | |||||| || || |||||||||||||||||||    
T  40982949 atttgatccatgttgccgaccccatttagtgggaaaaggcttggttgttgttgttgt 40982893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #127
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 289 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 42493514 - 42493426
Alignment:
Q  289 aatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgtc 377  Q
    |||||||| ||| |||||| |||||| |||| ||||||| |||||||| | || | |||||  || || |||||||||||| |||||||    
T  42493514 aatatggtatttaatagaaaactatggcatcgtttgatctatgtagccaaccccatttagtaggacaaggcttggttgttggtgttgtc 42493426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #128
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 214 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 45512654 - 45512558
Alignment:
Q  214 agaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaa-tatggtttttgatagaaca 309  Q
    ||||| ||||||||| |||  ||||| ||  ||||||| ||||| ||||| || ||| | |||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||    
T  45512654 agaggcagaggaagacctagaaaaactataagagaaactattaggaaagacttggagattaatgagttcgatccaaaatatggtttatgatagaaca 45512558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #129
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 91 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 45512777 - 45512709
Alignment:
Q  91 ggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaaga 159  Q
    |||||||||||||||||||||||| || | |||||||  |||||||| ||| | ||| || ||||||||    
T  45512777 ggggtagcacctatagtagaaaagatgatggaaaataagcttagatggtttgggcatataaagagaaga 45512709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 222; Significance: 1e-122; HSPs: 114)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 23 - 373
Target Start/End: Original strand, 3301774 - 3302126
Alignment:
Q  23 gatgttgcgctggatgagtggtaagactagacatgataggattaagaatgacatcattagagagaa--tgggggtagcacctatagtagaaaagttggta 120  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||   || ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  3301774 gatgttgcgcttgatgagtggtaagactagacatgataggattaggaatgtcaccattagagagagagtgagggtagcccctatagtagaaaagttggta 3301873  T
Q  121 gaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggta 220  Q
    |||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||    ||||||||||| |||  ||||||||||||||||    
T  3301874 gaaaataggcttagatggtttggacatgtagagagaagacccgtagatgccgttgttagaagaatgaatcaaatggaggagagtcaggttaaaagaggta 3301973  T
Q  221 gaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatca 320  Q
    |||||||| |||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | | |||    
T  3301974 gaggaagacctaagaaaaccattagagaaaccattataaaagatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttttgatagaacactacggcgtca 3302073  T
Q  321 tttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgt 373  Q
    |||||||||||||||||| || |||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  3302074 tttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 3302126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 11 - 374
Target Start/End: Original strand, 24178428 - 24178793
Alignment:
Q  11 agcagagatgatgatgttgcgctggatgagtggtaagactagacatgataggattaagaatgacatcattagagagaa--tgggggtagcacctatagta 108  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||   ||||||||||||||||||||    
T  24178428 agcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagactatacatgataggattaagaatgacaccattagagagagagtgggggtagcacctatagta 24178527  T
Q  109 gaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaatggagaagaaccagg 208  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| ||| | ||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||| |||  || |    
T  24178528 gaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtggagagaagacccgtagatgccgtggtaagaagagtagatcaaatggaggagagtcaag 24178627  T
Q  209 ttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaac 308  Q
    |||||||||||||||||||| ||| |||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||| | || | |||||||||    
T  24178628 ttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagagttcaatgagttggatccaaatttagtgtatgatagaac 24178727  T
Q  309 actatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgtt 374  Q
    |||||| |||||||||||| |||||||||| || ||||| ||  |||| |||||||||||||||||    
T  24178728 actatggcatcatttgatctatgtagccgaccccacttaatgaaataaggcttggttgttgttgtt 24178793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 208; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 23 - 376
Target Start/End: Original strand, 4496312 - 4496669
Alignment:
Q  23 gatgttgcgctggatgagtggtaagactagacat--gataggattaagaatgacatcattagagagaa--tgggggtagcacctatagtagaaaagttgg 118  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||   |||||||||| |||||||| | |||||||||   |||||||||||||||||||||||||| |||    
T  4496312 gatgttgcgttggatgagtggtaagactagacacaggataggattaggaatgacacctttagagagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagctgg 4496411  T
Q  119 tagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagagg 218  Q
    |||||||||| |||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||| |||  || |||||||||||    
T  4496412 tagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacccgtagatgccgtggtaagaagagtagatcaaatggaggagagtcaagttaaaagagg 4496511  T
Q  219 tagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacat 318  Q
    |||||||||| ||| |||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||| | ||||||||||||||| |||    
T  4496512 tagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcat 4496611  T
Q  319 catttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 376  Q
    |||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  4496612 catttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttgt 4496669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 11 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 28977221 - 28976856
Alignment:
Q  11 agcagagatgatgatgttgcgctggatgagtggtaagactagacatgataggattaagaatgacatcattagagagaatgggggtagcacctatagtaga 110  Q
    |||||||||||  |||||| | |||||||||||||| |||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  28977221 agcagagatgagtatgttgtgttggatgagtggtaaaactagaaatgataggattaggaatgacaccattagagagagtgggggtagcacctatagtaga 28977122  T
Q  111 aaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaatggagaagaaccaggtt 210  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| |||   ||||||||||||||||||||| || |||| |||||||| | ||||||||||||| |||  || |||    
T  28977121 aaagttggtagaaaataggcttagatggtttgtgcatgtagagagaagacccgtatatgccgtggtaagaagggtagatcaaatggaggagagtcaagtt 28977022  T
Q  211 aaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacac 310  Q
    |||||||||||||||||| ||| |||||| ||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||| | |||||||||||    
T  28977021 aaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattataaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacac 28976922  T
Q  311 tatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 376  Q
    |||| | ||||||||| ||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  28976921 tatggcgtcatttgattcatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttgt 28976856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 11 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 12492751 - 12492381
Alignment:
Q  11 agcagagatgatgatgttgcgctggatgagtggtaagactagacatgataggattaagaatgacatcattagagagaa--tgggggtagcaccta---ta 105  Q
    ||||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||| |||||||||||   |||||||||||||||   ||    
T  12492751 agcagagatgaggatgttacgttggatgagtggtaagactagacaggataagattaggaatgacaccattagagagagagtgggggtagcacctactata 12492652  T
Q  106 gtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaatggagaagaacc 205  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||| ||||||||||||| |||  |    
T  12492651 gtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacccgtagatgccgtgttaagaagagtagatcaaatggaggagagtc 12492552  T
Q  206 aggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatag 305  Q
    | ||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||| | ||||||    
T  12492551 aagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatag 12492452  T
Q  306 aacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 376  Q
    ||||||||| | ||||||||| ||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  12492451 aacactatggcgtcatttgatgcatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttgt 12492381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 58 - 366
Target Start/End: Original strand, 38684932 - 38685242
Alignment:
Q  58 ataggattaagaatgacatcattagagagaa--tgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagag 155  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||    
T  38684932 ataggattaggaatgacaccattagagagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttggacatgtagagag 38685031  T
Q  156 aagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccatt 255  Q
    ||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||| |||||||||||    
T  38685032 aagacccgtagatgccgtcgtaagaagagtagatcaaatggaggagagtcaggttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccatt 38685131  T
Q  256 agaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgata 355  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||    
T  38685132 agaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttatgatagaacaatatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggata 38685231  T
Q  356 atgcttggttg 366  Q
    | |||||||||    
T  38685232 aggcttggttg 38685242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 11 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 1287953 - 1287578
Alignment:
Q  11 agcagagatgatgatgttgcgctggatgagtggtaagactagacatgataggattaagaatgacatcattagagagaa------------tgggggtagc 98  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||             ||||||||||    
T  1287953 agcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagactagacatgataggattaggaatgacatcattagagagagagagagagagagtgggggtagc 1287854  T
Q  99 acctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaatggag 198  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| | |||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||    
T  1287853 acctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacacgtagatgccgtggtaagaagagtagatcaaatggag 1287754  T
Q  199 aagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggttt 298  Q
     |||  || ||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |    
T  1287753 gagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgt 1287654  T
Q  299 ttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgtt 374  Q
     |||||| |||||||| | ||| ||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||| ||| ||||    
T  1287653 atgatagtacactatggcgtcagttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttattgatgtt 1287578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 15 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 16347738 - 16347380
Alignment:
Q  15 gagatgatgatgttgcgctggatgagtggtaagactagacatgataggattaagaatgacatcattagagagaatg--ggggtagcacctatagtagaaa 112  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||| |||||| ||||| | |||||||||||  |  ||||||||||||||||||||||    
T  16347738 gagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagactagacaatatatgattaaaaatgaaaccattagagagagagcgggggtagcacctatagtagaaa 16347639  T
Q  113 agttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaatggagaagaaccaggttaa 212  Q
    |||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||| ||||||||||||| |||  ||||||||    
T  16347638 agttggtagaaaataggcttagatggtttggacatgtagagagaagacccgtagatgcctttgcaagaagagtagatcaaatggaggagagtcaggttaa 16347539  T
Q  213 aagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacacta 312  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||| |||||||||||      
T  16347538 aagaggtagaggaagacctaggaaaactattaaagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgatttggatacaaatatggtttatgatagaacac-- 16347441  T
Q  313 tgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgt 373  Q
    || | ||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||  |||||||||||||||    
T  16347440 tggcgtcatttgatccatgtagccgaccctacttagtgggataagacttggttgttgttgt 16347380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 11 - 376
Target Start/End: Original strand, 1275183 - 1275549
Alignment:
Q  11 agcagagatgatgatgttgcgctggatgagtggtaagactagacatgataggattaagaatgacatcattagagagaatg-ggggtagcacctatagtag 109  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||  | |||||||||||||||||||    
T  1275183 agcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagactagacatggtaggattaggaatgacaccattagagagagagtggggtagcacctatagtag 1275282  T
Q  110 aaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaatggagaagaaccaggt 209  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| ||| | ||||||||||||||| ||||| || |||| |||||||||| ||||||||||||| |||  || ||    
T  1275283 aaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagatccgtaaatgccgtggtaagaagagtagatcaaatggaggagagtcaagt 1275382  T
Q  210 taaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaaca 309  Q
    ||| || |||||||||||| |||  ||||| ||| |||||||||||| ||| ||||||||||| ||| ||||  |||||||| |||| ||||||||||||    
T  1275383 taacaggggtagaggaagacctagaaaaactattagagaaaccattataaaggatttagaggttaatcagttgaatccaaatttggtgtttgatagaaca 1275482  T
Q  310 ctatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 376  Q
     |||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| || | ||||||||||||||    
T  1275483 ttatgacgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcatagttgttgttgttgt 1275549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 11 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 2075838 - 2075475
Alignment:
Q  11 agcagagatgatgatgttgcgctggatgagtggtaagactagacatgataggattaagaatgacatcattagagagaa--tgggggtagcacctatagta 108  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||   |||||||| |||||| ||||    
T  2075838 agcagagatgaggatgttgcgttggatgagttgtaagactagacaagataggattaggaatgacaacattagagagagagtgggggtaacacctacagta 2075739  T
Q  109 gaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaatggagaagaaccagg 208  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||| |||  || |    
T  2075738 gaaaagttggtagacaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacccgtagatgccgtggtaagaagagtagatcaaatggaggagagtcaag 2075639  T
Q  209 ttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaa-gatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaa 307  Q
    |||||||||||||||||||| ||| || ||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||| | ||||||||    
T  2075638 ttaaaagaggtagaggaagacctaggataactattagagaaaccattagaaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaa 2075539  T
Q  308 cactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgtt 371  Q
     |||||| | ||||||||| ||||||||| | || |||||||| ||||| ||||| ||||||||    
T  2075538 tactatggcgtcatttgattcatgtagccaaccccacttagtgggataaggcttgattgttgtt 2075475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 179; E-Value: 2e-96
Query Start/End: Original strand, 11 - 376
Target Start/End: Original strand, 10639215 - 10639587
Alignment:
Q  11 agcagagatgatgatgttgcgctggatgagtggtaagactagacatgataggattaagaatgacatcattagagagaa--tgggggtagcacctatag-- 106  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||| |||||||||||   ||||| ||||||||||||      
T  10639215 agcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagactagacagaataggattaggaatgacaccattagagagagagtggggctagcacctatagac 10639314  T
Q  107 -----tagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaatggagaag 201  Q
         |||||||||||||||||||||| ||||||||| || | ||||||||||||||||| |||||| || | |||||||||| ||| ||||||||| ||    
T  10639315 tatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatgaattgggcatgtagagagaagacctgtagatgccatggtaagaagagtagaacaaatggaggag 10639414  T
Q  202 aaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttg 301  Q
       || ||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||| | ||    
T  10639415 t--caagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatg 10639512  T
Q  302 atagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 376  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| || |||| ||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  10639513 atagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccactttgtgggataaggcttggttgttgttgttgt 10639587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 164; E-Value: 2e-87
Query Start/End: Original strand, 41 - 376
Target Start/End: Original strand, 14665658 - 14665997
Alignment:
Q  41 tggtaagactagacatgataggattaagaatgacatcattagagagaa------tgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttag 134  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||       |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||    
T  14665658 tggtaagcctagacatgataggattagaaatgacaccattagagagagagagagtgggggtagcacctatagtagagaagttgatagaaaataggcttag 14665757  T
Q  135 atgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaag 234  Q
    ||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||| ||| ||| |    
T  14665758 atggtttggacatgtagagagaagacccgtagatgccgtcgtaagaagagtagatcaaatggagcagagtcaggttaaaagaggtagagggagacctagg 14665857  T
Q  235 aaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtag 334  Q
    ||||| ||| ||||||||||||| ||  ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||  | | | |||||||| ||||||    
T  14665858 aaaactattagagaaaccattaggaagaatttagaagtcaatgagttggatccaaatatggtttatgatagaactct--ggcgtaatttgatctatgtag 14665955  T
Q  335 ccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 376  Q
    |||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  14665956 ccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttgt 14665997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 151; E-Value: 1e-79
Query Start/End: Original strand, 94 - 372
Target Start/End: Original strand, 20456776 - 20457054
Alignment:
Q  94 gtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaa 193  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||    
T  20456776 gtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgaacatgtagagagaagacccgtagatgccgtggtaagaagagtagatcaaa 20456875  T
Q  194 tggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatat 293  Q
    ||||| |||  || ||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||  ||| |||| |    
T  20456876 tggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctacgaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaataagttgaatctaaattt 20456975  T
Q  294 ggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttg 372  Q
    | | | |||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| ||||| |||||||||    
T  20456976 gatgtatgatagaacattatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttgattgttgttg 20457054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 136; E-Value: 1e-70
Query Start/End: Original strand, 180 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 13561579 - 13561384
Alignment:
Q  180 aagagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgag 279  Q
    ||||| ||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13561579 aagagtagatcaaatggaggagagtcaggttaaaagaggtagaggaagacctaagaaaaccattcgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgag 13561480  T
Q  280 ttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttg 375  Q
    || ||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| ||||| ||||||||||||    
T  13561479 ttggatccaactatggtttttgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttgtttgttgttgttg 13561384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 149 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 2915719 - 2915493
Alignment:
Q  149 tagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgaga 248  Q
    |||||||||||||||||||| || | |||||||||| ||||||||||||| |||  || ||||||||||||||||||||| ||| || ||| ||| ||||    
T  2915719 tagagagaagacccgtagatgccttggtaagaagagtagatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggataactattagaga 2915620  T
Q  249 aaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttag 348  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||| || ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  2915619 aaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttgg-ttatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttag 2915521  T
Q  349 tgtgataatgcttggttgttgttgttgt 376  Q
    || ||||| |||||||| ||||||||||    
T  2915520 tgggataaggcttggttattgttgttgt 2915493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 11 - 375
Target Start/End: Original strand, 34272940 - 34273297
Alignment:
Q  11 agcagagatgatgatgttgcgctggatgagtggtaagactagacatgataggattaagaatgacatcattagagagaa------------tgggggtagc 98  Q
    ||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||     |||||| |||||||| |||||||||||             ||||||||||    
T  34272940 agcagagatgaggatgttgcattggatgagtggtaagactagaca-----ggattaggaatgacaccattagagagagagagagagagagtgggggtagc 34273034  T
Q  99 acctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaaga-tcaaatgga 197  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||| | ||||||||||||||||| | ||||  ||| |||||||||| ||| ||||         
T  34273035 acctataatagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacctgcagatgtcgtggtaagaagaggagagtcaa----- 34273129  T
Q  198 gaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtt 297  Q
              ||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||     
T  34273130 ----------gttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtg 34273219  T
Q  298 tttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttg 375  Q
    | ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| | |  |||||||| ||||| |||| |||||||||||||    
T  34273220 tatgatagaacactatgacgtcattcgatccatgtagccaacctcacttagtgagataaggcttagttgttgttgttg 34273297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 186 - 376
Target Start/End: Original strand, 14911267 - 14911457
Alignment:
Q  186 agatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagat 285  Q
    |||||||||| || |||  | |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||    
T  14911267 agatcaaatgaaggagagtcgggttaaaagaggtagaggaagacctaagaaaaccattcgagaaaccattagaaaagatttagaggttaatgagttggat 14911366  T
Q  286 ccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 376  Q
    ||||||||| |||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||| || ||||| ||  |||| | |||||||||||| ||||    
T  14911367 ccaaatatgatttttgatagaatactatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttaatggaataaggtttggttgttgttcttgt 14911457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 103; E-Value: 5e-51
Query Start/End: Original strand, 24 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 26885040 - 26884686
Alignment:
Q  24 atgttgcgctggatgagtggtaagactagacatgataggattaagaatgacatcattaga--gagaatgggggtagcacctatagtag-aaaagttggta 120  Q
    |||||||| |||||||||||||| |||||||  |||||||||| |||| ||| |||||||  |||| || ||||||||||||||| || |||||||||||    
T  26885040 atgttgcgttggatgagtggtaaaactagacgggataggattaggaataacaccattagaaagagagtgagggtagcacctatagcaggaaaagttggta 26884941  T
Q  121 gaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggta 220  Q
    |||||||| |||||  | ||| |||||||||||| ||||   ||||||   || |||||||||| |||||| |||||| |||  | ||| ||||||||||    
T  26884940 gaaaataggcttaggcggtttggacatgtagagataagatttgtagatgttgtcgtaagaagagtagatcagatggaggagagtcgggtcaaaagaggta 26884841  T
Q  221 gaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaa-tatggtttttgatagaacactatgacatc 319  Q
    ||||| || ||| |||||| |   || |||| ||||| |||||||||||||| |||| ||  |||||||| |||| ||| ||||||||||||| |||       
T  26884840 gaggatgagctaggaaaactaa--gaaaaactattaggaaagatttagaggttaatgggtcggatccaaaatatgatttatgatagaacactacgacgca 26884743  T
Q  320 atttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 376  Q
    ||||||||||||||||||| || ||||||||  |||| ||||| |||||||||||||    
T  26884742 atttgatccatgtagccgaccccacttagtggaataaggcttgattgttgttgttgt 26884686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 222 - 376
Target Start/End: Original strand, 29816513 - 29816667
Alignment:
Q  222 aggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcat 321  Q
    ||||||| ||| |||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||| | ||||||||||||||| | ||||    
T  29816513 aggaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcat 29816612  T
Q  322 ttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 376  Q
    ||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  29816613 ttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttgt 29816667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 235 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 16914021 - 16913882
Alignment:
Q  235 aaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtag 334  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||| ||| | |||||||||||||||||    
T  16914021 aaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttacgatagaacaccatggcgtcatttgatccatgtag 16913922  T
Q  335 ccga-tccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgt 373  Q
    ||||  || |||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  16913921 ccgacccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 16913882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 15 - 342
Target Start/End: Original strand, 32516480 - 32516806
Alignment:
Q  15 gagatgatgatgttgcgctggatgagtggtaagactagacatgataggattaagaatgacatcattagagagaatgggggtagcacctatagtagaaaag 114  Q
    ||||||||||||||| | |||||| |||||||||||||||| |||||  |||  ||||||| ||||||||||| | || ||| ||| |||||||||||||    
T  32516480 gagatgatgatgttgtgttggatgtgtggtaagactagacaggatagacttagaaatgacaacattagagagagttggagtaacacttatagtagaaaag 32516579  T
Q  115 ttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaa 214  Q
     |||| |||||||| ||||| || ||||||| |||| ||| || ||  |||||| | || ||| | |||| |||||  ||| || | || ||| ||| ||    
T  32516580 atggtggaaaataggcttaggtggtttagacttgtaaagaaaatacatgtagattctgtagtatggagagtagatcggatgaaggataatcagattacaa 32516679  T
Q  215 gaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatg 314  Q
    |||||||||||||| |||| ||||| ||  ||||||| ||||||  |||||||||| | ||  |||| ||| |||||||||||| |||||||| | ||||    
T  32516680 gaggtagaggaagacctaa-aaaactataagagaaactattagagcagatttagagattaacaagttggattcaaatatggtttatgatagaatattatg 32516778  T
Q  315 acatcatttgatccatgtagccgatcca 342  Q
    || | |||||||| || || ||||||||    
T  32516779 acgtaatttgatcgatataaccgatcca 32516806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 11 - 333
Target Start/End: Original strand, 36215418 - 36215730
Alignment:
Q  11 agcagagatgatgatgttgcgctggatgagtggtaagactagacatgataggattaagaatgacatcattag--agagaatgggggtagcacctatagta 108  Q
    |||||||||||  |||||||||| ||||||  |||| |||||| |||||| ||||| |||||||  ||||||  ||||| ||| ||||||| ||||||||    
T  36215418 agcagagatgagtatgttgcgctagatgagcagtaaaactagatatgatatgattatgaatgac--cattagggagagagtggaggtagcatctatagta 36215515  T
Q  109 gaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaatggagaagaaccagg 208  Q
    ||||||||||||| |||||  |||||||| ||| | || ||||| |||| || |||| ||  ||||| |||||||| |||||  |||||| |||  ||||    
T  36215516 gaaaagttggtaggaaatatgcttagatggtttcggcacgtagaaagaaaactcgtatatgtcgttgaaagaagagtagatcggatggaggagagtcagg 36215615  T
Q  209 ttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaac 308  Q
    | |||||||||||||          |||||| ||  |||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||  ||||||| |||  || |||||||||    
T  36215616 tcaaaagaggtagag----------gaaaactataagagaaaccattaaaaaagatttagaggtcaattaattgaatccaaacatgacttatgatagaac 36215705  T
Q  309 actatgacatcatttgatccatgta 333  Q
    |||||||  | ||||||| ||||||    
T  36215706 actatgatgtgatttgattcatgta 36215730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 71; E-Value: 6e-32
Query Start/End: Original strand, 264 - 374
Target Start/End: Original strand, 5558314 - 5558424
Alignment:
Q  264 tttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttgg 363  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| ||||||    
T  5558314 tttagaggtcaatgagtaggatccaaatatggtttatgatagaacactatggcataatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttgg 5558413  T
Q  364 ttgttgttgtt 374  Q
    |||| ||||||    
T  5558414 ttgtcgttgtt 5558424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 69; E-Value: 9e-31
Query Start/End: Original strand, 252 - 376
Target Start/End: Original strand, 2393038 - 2393161
Alignment:
Q  252 cattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgt 351  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||| | |||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||     
T  2393038 cattagaaaagatttagaggtcaatgaattagacccaaatatagtttctaatagaatactatggtatcatttgatccatgtagccgatcccacttaatgg 2393137  T
Q  352 gataatgcttggttgttgttgttgt 376  Q
    ||||| |||| ||||||||||||||    
T  2393138 gataaagctt-gttgttgttgttgt 2393161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 69; E-Value: 9e-31
Query Start/End: Original strand, 11 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 31636278 - 31636129
Alignment:
Q  11 agcagagatgatgatgttgcgctggatgagtggtaagactagacatgataggattaagaatgacatcattagagagaatgggggtagcacctatagtaga 110  Q
    ||||||||||||||||||    |||||  |||||||||||||||  ||||| ||||  ||||||| ||||||||| | | ||||||||||||||||||||    
T  31636278 agcagagatgatgatgtt----tggatttgtggtaagactagactggatagaattataaatgacagcattagagaaagttggggtagcacctatagtaga 31636183  T
Q  111 aaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgt 164  Q
    |||| ||||||||| ||||||||| || ||| | ||||||||||||||||||||    
T  31636182 aaagatggtagaaactagacttaggtggtttgggcatgtagagagaagacccgt 31636129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 81 - 326
Target Start/End: Original strand, 14749297 - 14749542
Alignment:
Q  81 agagagaatgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaaga 180  Q
    ||||||| | || |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| || ||| | ||||||||     
T  14749297 agagagagttggtgtagcacctatagtagaaaaattggtagaaactagacttagatggtttggacatgtagagagaagacctgtggattctgttgtaagg 14749396  T
Q  181 agagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagt 280  Q
    ||||  ||||| ||||||  ||  ||  | |  | ||| ||||||||| |||  ||||| ||  ||||||| || |  || ||| ||||| | || ||||    
T  14749397 agagtcgatcagatggaggggagtcaaatcactaaaggcagaggaagacctagaaaaactataagagaaactatcaagaaggatctagagattaacgagt 14749496  T
Q  281 tagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgat 326  Q
    | |||  ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  14749497 tggatagaaatatggtttttgatagaacactatggcgtcatttgat 14749542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 271 - 376
Target Start/End: Original strand, 30213755 - 30213860
Alignment:
Q  271 gtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgt 370  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||| | ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| ||||||||||| |    
T  30213755 gtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgtttt 30213854  T
Q  371 tgttgt 376  Q
    ||||||    
T  30213855 tgttgt 30213860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 211 - 374
Target Start/End: Original strand, 28002 - 28165
Alignment:
Q  211 aaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacac 310  Q
    ||||||||| |||||||| |||  ||||| ||  ||||||| ||||| |||||||||||||| ||| |||| |||||||||||| ||| |||||||||||    
T  28002 aaaagaggttgaggaagacctagaaaaactataagagaaactattaggaaagatttagaggttaataagttggatccaaatatgatttctgatagaacac 28101  T
Q  311 tatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgtt 374  Q
    |||| ||| ||||||| |||||||| || || | |||||  |||||  ||||||| ||||||||    
T  28102 tatggcataatttgatacatgtagctgaccccatttagttagataagacttggtttttgttgtt 28165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 59; E-Value: 9e-25
Query Start/End: Original strand, 131 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 38501660 - 38501422
Alignment:
Q  131 ttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaac 230  Q
    ||||||| ||| |||||||| |||||||||  |||||| |||| |||||||||| |||| | |||||| |||  | | | ||||||| | || ||||| |    
T  38501660 ttagatggtttggacatgtaaagagaagacttgtagatgccgtcgtaagaagagtagattagatggaggagagtcggatcaaaagagatggatgaagacc 38501561  T
Q  231 taagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccat 330  Q
    || || ||| ||   |||||| ||||||||  |||||||||||||| |||| |||||||||||| ||| |||||||| |||||    | || ||||| ||    
T  38501560 taggagaactataaaagaaactattagaaagtatttagaggtcaataagttggatccaaatatgatttatgatagaaaactatagtgtaatatgatcgat 38501461  T
Q  331 gtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttg 369  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||  |||||||||||    
T  38501460 gtagccgatcccacttagtgggataagacttggttgttg 38501422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 11 - 151
Target Start/End: Complemental strand, 11002785 - 11002645
Alignment:
Q  11 agcagagatgatgatgttgcgctggatgagtggtaagactagacatgataggattaagaatgacatcattagagagaatgggggtagcacctatagtaga 110  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| |||   ||||| ||||  ||||||| ||||||||||| |  |||||||||||| ||||||    
T  11002785 agcagagatgaggatgttgcgctggatgtgtggtaagacgagatgggatagaattagaaatgacaacattagagagagttcgggtagcacctacagtaga 11002686  T
Q  111 aaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtag 151  Q
    |||  ||||||||| ||||||||| || ||| | |||||||    
T  11002685 aaacatggtagaaactagacttaggtggtttgggcatgtag 11002645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 245 - 376
Target Start/End: Original strand, 28276392 - 28276523
Alignment:
Q  245 gagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaac 344  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||||||| |||| ||| ||||||| |||| |||||||| ||||||   | ||||||||||||||||| |  | ||    
T  28276392 gagaaaccattagaaagaatttagaggtcaataagttggattcaaatattgtttatgatagaaaactatggtgtaatttgatccatgtagccaactccac 28276491  T
Q  345 ttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 376  Q
    |||| | ||||| |||||||||||||||||||    
T  28276492 ttagcgggataaggcttggttgttgttgttgt 28276523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 283 - 374
Target Start/End: Original strand, 18855799 - 18855890
Alignment:
Q  283 gatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgtt 374  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| |||  ||| ||||||||||||||||||| || |||||||| |||||  ||||||||||||||||    
T  18855799 gatccaaatatggtttatgatagaacattatagcataatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataagacttggttgttgttgtt 18855890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 253 - 376
Target Start/End: Original strand, 39040918 - 39041041
Alignment:
Q  253 attagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtg 352  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||  ||| ||||||||||||||||| ||||| ||    ||||||||||||||||||||| || ||||| || |    
T  39040918 attagaaaagatttagaggtcaataagttgcatctaaatatggtttttgatataacaccatagtgtcatttgatccatgtagccgaccccacttaatggg 39041017  T
Q  353 ataatgcttggttgttgttgttgt 376  Q
    ||||  |||| ||||||| |||||    
T  39041018 ataagacttgattgttgtagttgt 39041041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 254 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 418153 - 418031
Alignment:
Q  254 ttagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtga 353  Q
    |||| |||||||||||| | |||||||| ||||||||| |||||| |||||||||| |||| | | ||||||||||||||||||| || |||| ||| ||    
T  418153 ttaggaaagatttagagattaatgagttggatccaaatgtggtttatgatagaacattatggcgtaatttgatccatgtagccgaccccacttggtggga 418054  T
Q  354 taatgcttggttgttgttgttgt 376  Q
    ||  |||||  ||||||||||||    
T  418053 tatggcttgaatgttgttgttgt 418031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 57 - 168
Target Start/End: Original strand, 15168756 - 15168869
Alignment:
Q  57 gataggattaagaatgacatcattagagagaat--gggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagaga 154  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| || |  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || || || ||| ||||||| ||||    
T  15168756 gataggattaagaatgacaccattagagggagttggggggtagcacctatagtagaaaagatggtagaaaataggctaaggtggtttggacatgttgaga 15168855  T
Q  155 gaagacccgtagat 168  Q
     | |||| ||||||    
T  15168856 aatgacctgtagat 15168869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 274 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 32442224 - 32442123
Alignment:
Q  274 aatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgt 373  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||| | | |||||||||||||||||||  | |||||||| ||||| |||||||| |||||||    
T  32442224 aatgagttggatccaaatatggttttggatagaacattatggcgtaatttgatccatgtagccgactccacttagtgggataa-gcttggttattgttgt 32442126  T
Q  374 tgt 376  Q
    |||    
T  32442125 tgt 32442123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 69 - 161
Target Start/End: Original strand, 33667194 - 33667286
Alignment:
Q  69 aatgacatcattagagagaatgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacc 161  Q
    ||||||| |||||  |||| | |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| || ||| | |||||||||||||||||    
T  33667194 aatgacaacattaacgagagttggggtagcacctatagtagaaaagatggtagaaactagacttaggtggtttgggcatgtagagagaagacc 33667286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 259 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 43557947 - 43557833
Alignment:
Q  259 aaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatg 358  Q
    |||||||| ||| | | |||||| |||| ||||||||||| |||||||||| |||||| | | |||||| |||||||||| || |||||||| ||||| |    
T  43557947 aaagatttggagattattgagttggatcgaaatatggtttatgatagaacattatgacttaagttgatctatgtagccgaccccacttagtgggataagg 43557848  T
Q  359 cttggttgttgttgt 373  Q
    | |||||||||||||    
T  43557847 cctggttgttgttgt 43557833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 302 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 408565 - 408492
Alignment:
Q  302 atagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttg 375  Q
    |||||| |||||| | ||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  408565 atagaatactatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 408492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 259 - 376
Target Start/End: Original strand, 14667939 - 14668056
Alignment:
Q  259 aaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatg 358  Q
    |||||| ||||| | |||||||| ||||||| |||||||| |||||||||| ||||   | |||||||||||||| |||| || |||||||| |||||      
T  14667939 aaagatctagagattaatgagttggatccaagtatggtttatgatagaacattatggtgtaatttgatccatgtaaccgaccccacttagtgggataaga 14668038  T
Q  359 cttggttgttgttgttgt 376  Q
    ||||||||| ||||||||    
T  14668039 cttggttgtagttgttgt 14668056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 245 - 361
Target Start/End: Original strand, 9235201 - 9235316
Alignment:
Q  245 gagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaac 344  Q
    ||||||| ||||  |||||| ||||| | |||||| | |||| ||||||||||| |||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||| || ||    
T  9235201 gagaaactattaagaaagatatagagattaatgagctggatcgaaatatggtttatgatagaacattatggcataatttgatccatgtagccga-cccac 9235299  T
Q  345 ttagtgtgataatgctt 361  Q
    |||||| ||||| ||||    
T  9235300 ttagtgggataaggctt 9235316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 35 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 10083079 - 10082952
Alignment:
Q  35 gatgagtggtaagactagacatgataggattaagaatgacatcattagagaga--atgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagactt 132  Q
    |||| |||||||||||||||  ||||| ||||  ||||| | |||||| ||||  || |||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  10083079 gatgtgtggtaagactagacgggatagaattagaaatgagaacattagggagagcattggggtatcacctatagtagaaaagatggtagaaactagactt 10082980  T
Q  133 agatgatttagacatgtagagagaagac 160  Q
    |  || ||| | ||||||||||||||||    
T  10082979 aagtggtttcggcatgtagagagaagac 10082952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 292 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 3442952 - 3442873
Alignment:
Q  292 atggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgtt 371  Q
    ||||||||||||||||||||||| | || |||||| ||||||||||| || ||||||||  |||| ||||||||||||||    
T  3442952 atggtttttgatagaacactatggcgtcgtttgattcatgtagccgaccccacttagtggcataaggcttggttgttgtt 3442873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 245 - 375
Target Start/End: Original strand, 11675683 - 11675814
Alignment:
Q  245 gagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatcc-aaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaa 343  Q
    ||||||| ||||| | |||||||||| | |||||||| |||   ||||||||||| |||||||||| |||| | |  ||| |||||||||||||| || |    
T  11675683 gagaaactattaggacagatttagagattaatgagttggattttaaatatggtttatgatagaacattatggcgtagtttaatccatgtagccgacccca 11675782  T
Q  344 cttagtgtgataatgcttggttgttgttgttg 375  Q
    ||||||  ||||| ||||||||||||||||||    
T  11675783 cttagttggataaggcttggttgttgttgttg 11675814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 254 - 373
Target Start/End: Original strand, 31220546 - 31220664
Alignment:
Q  254 ttagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtga 353  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||| |||| ||||||| |||||||||| | | |||||  ||||||||||||| ||| |||||| | ||| || ||    
T  31220546 ttagaaaagattttgagatcaatgagttggatctaaatatgatttttgatag-atattatgatgtcatttgatccatatagtcgatcctatttaatgaga 31220644  T
Q  354 taatgcttggttgttgttgt 373  Q
    ||| | ||||||||||||||    
T  31220645 taaggtttggttgttgttgt 31220664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 42 - 124
Target Start/End: Complemental strand, 418318 - 418236
Alignment:
Q  42 ggtaagactagacatgataggattaagaatgacatcattagagagaatgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaa 124  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||  ||||||| ||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||| ||| |||||    
T  418318 ggtaagacgagacatgatagaattagaaatgacaacattagagagagttggggtagcacctatggtagaaaagatggcagaaa 418236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 288 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 7640592 - 7640510
Alignment:
Q  288 aaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgt 370  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| | | | |||||||||||||||||||||| ||||||||  |||| ||| |||||||||    
T  7640592 aaatatggtttatgatagaacactacggcgtaatttgatccatgtagccgatcccacttagtggaataaggctcggttgttgt 7640510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 274 - 376
Target Start/End: Original strand, 20367076 - 20367178
Alignment:
Q  274 aatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgt 373  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||| | |||| |||||| | ||||||||||| ||||| | || |||| ||  ||||| ||||||||||||||||    
T  20367076 aatgagttggatccaaatatggtttatgacataacattatgacgtaatttgatccatatagccaaccccacttggtaggataaggcttggttgttgttgt 20367175  T
Q  374 tgt 376  Q
    |||    
T  20367176 tgt 20367178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 81 - 198
Target Start/End: Original strand, 79503 - 79620
Alignment:
Q  81 agagagaatgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaaga 180  Q
    ||||||| | ||||||| |||||||||||||||| |||| ||||| | | |||| || ||| |||||||||||||||||||  ||||| | || |||||     
T  79503 agagagagttggggtagtacctatagtagaaaagatggtggaaaacataattaggtggtttggacatgtagagagaagacctatagattctgtagtaagg 79602  T
Q  181 agagaagatcaaatggag 198  Q
    ||||  ||||||||||||    
T  79603 agagtcgatcaaatggag 79620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 253 - 374
Target Start/End: Original strand, 2090575 - 2090696
Alignment:
Q  253 attagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtg 352  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||| | ||||||||||| |||| ||||  |||| |||| | | |||||||||||||| |||| || | | |||| |    
T  2090575 attaggaaagatttagaggttaatgagcttgatccaaatatagtttatgatccaacattatggcgtaatttgatccatgtacccgaccccattgagtggg 2090674  T
Q  353 ataatgcttggttgttgttgtt 374  Q
    |||| |||| ||||||||||||    
T  2090675 ataaggctttgttgttgttgtt 2090696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 265 - 374
Target Start/End: Original strand, 36551320 - 36551429
Alignment:
Q  265 ttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggt 364  Q
    |||||| | ||||||||  ||||||||||||||| |  |||| || || |  || ||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||    
T  36551320 ttagagattaatgagttgcatccaaatatggtttgtattagatcattacggtataatttgatccatgtagccgaccccacttagtgagataaggcttggt 36551419  T
Q  365 tgttgttgtt 374  Q
    ||||||||||    
T  36551420 tgttgttgtt 36551429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 262 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 42504358 - 42504293
Alignment:
Q  262 gatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatc 327  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||| | ||||||||    
T  42504358 gatttagatgtcaatgagttatatccaaatatggtttatgatagaacattatgacgtaatttgatc 42504293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 98 - 373
Target Start/End: Original strand, 1525651 - 1525923
Alignment:
Q  98 cacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaatgga 197  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||| ||  || ||||||||||||||||||||||  || | |  || || |||| |||||| |||||    
T  1525651 cacctattgtagaaaagatggtagaaactagacttaggtggcttggacatgtagagagaagacccgtgaattctgcagttaggagagtagatcagatgga 1525750  T
Q  198 gaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtt 297  Q
    | |||  ||| | |  |||||||| || ||| |||  ||||| |   ||||||| ||||| || |||  |||| | |||||||| ||   | | ||||||    
T  1525751 ggagagtcagatcactagaggtaggggtagacctagaaaaactacaagagaaactattaggaaggatccagagataaatgagttggagaaagacatggtt 1525850  T
Q  298 tttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgt 373  Q
    ||||||||||| ||||| | |  |||||| ||||||||||| |||  |||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  1525851 tttgatagaacgctatggcgttgtttgattcatgtagccga-cca--ttagtgagataaggcttggttgttgttgt 1525923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 288 - 376
Target Start/End: Original strand, 6859578 - 6859666
Alignment:
Q  288 aaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 376  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||| ||| |||| |||||||| || || || |||||||| ||||| ||||||| |||||||||||    
T  6859578 aaatatggtttatgatagaacattatggcataattttatccatgttgctgaccccacttagtgggataaggcttggtagttgttgttgt 6859666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #55
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 214 - 374
Target Start/End: Original strand, 7678601 - 7678760
Alignment:
Q  214 agaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactat 313  Q
    ||||| ||||||||| |||  ||||||||  ||||||| |||   |||||| ||||| | |||||||| |||| ||||| ||||| | ||| |||| |||    
T  7678601 agaggcagaggaagatctagtaaaaccataagagaaactatttagaaagatctagagattaatgagttggatcgaaatacggtttataata-aacattat 7678699  T
Q  314 gacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgtt 374  Q
    ||  |  |||||||||||||||||| || |||||||| |||||  ||||||||||||||||    
T  7678700 gaggtagtttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaaacttggttgttgttgtt 7678760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #56
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 300 - 376
Target Start/End: Original strand, 28411885 - 28411961
Alignment:
Q  300 tgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 376  Q
    ||||||||||||||| | |  |||||| ||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  28411885 tgatagaacactatggcgttgtttgattcatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttgt 28411961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #57
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 320 - 376
Target Start/End: Original strand, 42576239 - 42576295
Alignment:
Q  320 atttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 376  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  42576239 atttgatccatgtagccgacccgacttagtgggataaggcttggttgttgttgttgt 42576295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #58
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 301 - 368
Target Start/End: Original strand, 2713146 - 2713213
Alignment:
Q  301 gatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgtt 368  Q
    |||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||    
T  2713146 gatagaacactatggcatcgtttgattcatgtagccgagcccacttagtgggataaggcttggttgtt 2713213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #59
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 274 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 8082059 - 8081967
Alignment:
Q  274 aatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccga-tccaacttagtgtgataatgcttggttgttg 369  Q
    |||||||||||||| ||||||||||     |||||| |||||||| |||||||||||||||||||  || |||||||| ||||| ||||||||||||    
T  8082059 aatgagttagatccgaatatggttta----agaacattatgacatgatttgatccatgtagccgacccccacttagtgggataaggcttggttgttg 8081967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #60
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 295 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 11002499 - 11002424
Alignment:
Q  295 gtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgt 370  Q
    |||||||||||||||||||| |||  |||||| ||||||| ||| || |||||||| ||||| |||||||||||||    
T  11002499 gtttttgatagaacactatggcattgtttgattcatgtagtcgaccctacttagtgggataaggcttggttgttgt 11002424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #61
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 13 - 88
Target Start/End: Complemental strand, 28187030 - 28186955
Alignment:
Q  13 cagagatgatgatgttgcgctggatgagtggtaagactagacatgataggattaagaatgacatcattagagagaa 88  Q
    |||||||||  |||||||  |||||| |||||||||||||||||| ||||||||  ||||||| ||||||||||||    
T  28187030 cagagatgagaatgttgcattggatgtgtggtaagactagacatggtaggattagaaatgacaacattagagagaa 28186955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #62
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 81 - 199
Target Start/End: Original strand, 42199278 - 42199394
Alignment:
Q  81 agagagaatgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaaga 180  Q
    ||||||||| |||||||||| ||  ||||||||| |||| |||| ||||||||| || ||| | ||||||||||||||||  |||||| | || |||||     
T  42199278 agagagaattggggtagcactta--gtagaaaagatggtggaaactagacttaggtggtttgggcatgtagagagaagacatgtagattctgtagtaagg 42199375  T
Q  181 agagaagatcaaatggaga 199  Q
    |||| |||||| |||||||    
T  42199376 agagtagatcacatggaga 42199394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #63
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 288 - 374
Target Start/End: Original strand, 2645187 - 2645273
Alignment:
Q  288 aaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgtt 374  Q
    |||| |||| ||||||| |||| |||  |||| |||||||||||||||||  || |||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  2645187 aaatgtggtatttgataaaacattatagcatcgtttgatccatgtagccggccctacttagtgggataaggcttggttgttgttgtt 2645273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #64
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 300 - 374
Target Start/End: Original strand, 38132545 - 38132619
Alignment:
Q  300 tgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgtt 374  Q
    |||||||||| |||| | | ||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  38132545 tgatagaacattatggcgtaatttgatccatgtggccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgtt 38132619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #65
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 296 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 9121155 - 9121078
Alignment:
Q  296 tttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgt 373  Q
    ||||||| ||||||||||| |||| |||||| ||||||||||| |  |||||||| ||||| |||||||||| |||||    
T  9121155 tttttgacagaacactatggcatcgtttgattcatgtagccgacctcacttagtgggataaggcttggttgtcgttgt 9121078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #66
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 81 - 134
Target Start/End: Original strand, 14667753 - 14667806
Alignment:
Q  81 agagagaatgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttag 134  Q
    ||||||| | |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  14667753 agagagagttggggtagcacctatagtagaaaagatggtggaaaatagacttag 14667806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #67
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 92 - 161
Target Start/End: Original strand, 28676596 - 28676665
Alignment:
Q  92 gggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacc 161  Q
    |||||||| |||||||||||||| |||| |||||||| ||||| || ||| | |||||||||||||||||    
T  28676596 gggtagcagctatagtagaaaagatggtggaaaatagtcttaggtggtttcggcatgtagagagaagacc 28676665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #68
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 259 - 356
Target Start/End: Original strand, 30588615 - 30588712
Alignment:
Q  259 aaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataa 356  Q
    |||||| ||||| | |||||||| |||| ||||||||||| | |||||||| |||||| | || ||||||||||||||||  | |||||||| |||||    
T  30588615 aaagatctagagatgaatgagttggatcgaaatatggtttataatagaacattatgacgtgatatgatccatgtagccgactccacttagtgggataa 30588712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #69
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 42 - 161
Target Start/End: Original strand, 2712897 - 2713014
Alignment:
Q  42 ggtaagactagacatgataggattaagaatgacatcattagagagaatgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgattt 141  Q
    |||||||||||||  | ||| ||||  ||||||| ||| ||||||  | |||||||||||||||||  ||||| ||||||| | ||||||||| || |||    
T  2712897 ggtaagactagacggggtagaattagaaatgacaacatcagagag--ttggggtagcacctatagtctaaaagatggtagagactagacttaggtggttt 2712994  T
Q  142 agacatgtagagagaagacc 161  Q
     | |||||||||||||||||    
T  2712995 gggcatgtagagagaagacc 2713014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #70
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 288 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 21193737 - 21193649
Alignment:
Q  288 aaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 376  Q
    ||||||||||| ||||||| || |||||||| ||||||| |||||| |||| || || |||||  |||| |||||||| ||||||||||    
T  21193737 aaatatggtttatgatagatcattatgacataatttgattcatgtatccgaccccacgtagtggaataaggcttggttattgttgttgt 21193649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #71
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 95 - 159
Target Start/End: Original strand, 37065533 - 37065597
Alignment:
Q  95 tagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaaga 159  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| | | |||| | |||||||||||||||    
T  37065533 tagcacctatagtagaaaagatggtagaaactagacttgggtcatttgggcatgtagagagaaga 37065597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #72
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 292 - 375
Target Start/End: Original strand, 5860035 - 5860118
Alignment:
Q  292 atggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttg 375  Q
    ||||||| ||||||| || |||| | | |||||||| |||||||||| || |||||||| ||||| ||||| ||||||||||||    
T  5860035 atggtttatgatagaccattatggcgtaatttgatctatgtagccgaccctacttagtgggataaggcttgattgttgttgttg 5860118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #73
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 93 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 7359539 - 7359259
Alignment:
Q  93 ggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaa 192  Q
    |||| ||||||||||||||||  |||| ||||||||  |||| || ||| | |||||||||||||||   |||||| | || ||||| |||| ||||||     
T  7359539 ggtaacacctatagtagaaaatatggtggaaaataggtttaggtggtttgg-catgtagagagaagatatgtagattctgtagtaaggagagtagatcag 7359441  T
Q  193 atggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccatt-agaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaat 291  Q
    |||||| | |  ||  | |  ||||| |||||||   |||  ||||||||  ||||||| ||| |||||| || ||||| | ||| |||| |||| ||||    
T  7359440 atggaggatagtcatatcactagaggcagaggaaagcctagaaaaaccataagagaaactatttagaaaa-atctagagattaataagttggatcgaaat 7359342  T
Q  292 atggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttg 375  Q
    |||||||  |||| |||| |||||| | |||||||||||||||| || || |||||||| || ||  |||||||||||||||||    
T  7359341 atggtttacgata-aacattatgacgtaatttgatccatgtagctgaccccacttagtgggacaagacttggttgttgttgttg 7359259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #74
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 300 - 375
Target Start/End: Original strand, 32366187 - 32366262
Alignment:
Q  300 tgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttg 375  Q
    |||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||| | || |  ||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  32366187 tgatagaacattatgacgtcatttgatccatgtggccaaccccatgtagtgggataaggcttggttgttgttgttg 32366262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #75
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 245 - 311
Target Start/End: Original strand, 2552936 - 2553002
Alignment:
Q  245 gagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacact 311  Q
    |||||| ||||| ||| |||||||| ||||||||||| ||||||||| |||| | ||||||||||||    
T  2552936 gagaaagcattaaaaaggatttagatgtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacact 2553002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #76
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 311 - 373
Target Start/End: Original strand, 9234106 - 9234168
Alignment:
Q  311 tatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgt 373  Q
    |||||||| |||||||||||||| |||| || |||||||| ||||| ||||| ||||||||||    
T  9234106 tatgacataatttgatccatgtaaccgaccccacttagtgggataaggcttgattgttgttgt 9234168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #77
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 259 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 17340550 - 17340500
Alignment:
Q  259 aaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaaca 309  Q
    |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||    
T  17340550 aaagatttagaggttaatgagtttgatccaaatatggtttatgatataaca 17340500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #78
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 91 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 18351190 - 18351112
Alignment:
Q  91 ggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagaca-tgtagagagaagacccgtagat 168  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||| ||||| || ||| | || ||||||||||||||| ||||||    
T  18351190 ggggtagcacctatagtagaaaatatggtagaaactaggcttaggtggtttgggcattgtagagagaagacctgtagat 18351112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #79
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 11 - 85
Target Start/End: Original strand, 20318905 - 20318974
Alignment:
Q  11 agcagagatgatgatgttgcgctggatgagtggtaagactagacatgataggattaagaatgacatcattagaga 85  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||      |||||||||| |||||||| |||||||||    
T  20318905 agcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagact-----ggataggattaggaatgacaccattagaga 20318974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #80
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 24 - 159
Target Start/End: Original strand, 31906592 - 31906729
Alignment:
Q  24 atgttgcgctggatgagtggtaagactagacatgataggattaagaatgacatcattag--agagaatgggggtagcacctatagtagaaaagttggtag 121  Q
    |||||||| | |||||  ||||| |||||||   ||||||||| |||||||||||||||  ||||| || | ||  |||||| | ||||||||||||| |    
T  31906592 atgttgcgttcgatgaacggtaaaactagacggaataggattaggaatgacatcattagggagagagtgagagtgacacctacaatagaaaagttggtcg 31906691  T
Q  122 aaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaaga 159  Q
     |||||  |||||||  |||||||||||||| ||||||    
T  31906692 gaaatattcttagatagtttagacatgtagatagaaga 31906729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #81
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 248 - 376
Target Start/End: Original strand, 14725675 - 14725803
Alignment:
Q  248 aaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatcca-actt 346  Q
    |||| |||| |||||||||| |||| |||||||| |||| ||||||||||| |||| ||||| || ||||| ||| |||| ||| || | ||||| ||||    
T  14725675 aaactattataaaagatttaaaggttaatgagttggatcaaaatatggtttatgatcgaacaatacgacataattcgatctatgcagtc-atccacactt 14725773  T
Q  347 agtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 376  Q
    | | ||||||  ||| ||||||||||||||    
T  14725774 aatatgataagactttgttgttgttgttgt 14725803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #82
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 274 - 379
Target Start/End: Original strand, 23980127 - 23980232
Alignment:
Q  274 aatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgt 373  Q
    |||||||| |||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||  ||  |||||||||  | | || |||||||| ||||||  ||| || |||||||    
T  23980127 aatgagttggatctaaatatggtttatgatagaacaatatgacatatttcaatccatgtaatcaaccccacttagtgggataatatttgatttttgttgt 23980226  T
Q  374 tgtcgt 379  Q
    ||||||    
T  23980227 tgtcgt 23980232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #83
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 320 - 373
Target Start/End: Original strand, 27386569 - 27386622
Alignment:
Q  320 atttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgt 373  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| || |||||||||||||    
T  27386569 atttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcatggttgttgttgt 27386622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #84
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 299 - 376
Target Start/End: Original strand, 27800036 - 27800113
Alignment:
Q  299 ttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 376  Q
    ||||||||||| ||||  || ||||||| ||||||||| | || |||||||| ||||| |||||||||||||| ||||    
T  27800036 ttgatagaacattatggtataatttgatacatgtagccaaccccacttagtgggataaggcttggttgttgtttttgt 27800113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #85
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 301 - 374
Target Start/End: Original strand, 42272687 - 42272760
Alignment:
Q  301 gatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgtt 374  Q
    ||||||||| |||| | |||||||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||  ||||||||||||    
T  42272687 gatagaacattatggcgtcatttgatccatgtagctgaccccacttagtgggataaggctaagttgttgttgtt 42272760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #86
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 11 - 124
Target Start/End: Complemental strand, 219817 - 219702
Alignment:
Q  11 agcagagatgatgatgttgcgctggatgagtggtaagactagacatgataggattaagaatgacatcatt--agagagaatgggggtagcacctatagta 108  Q
    |||| ||||||  |||||||| |||||| ||| |||||| ||||  |||| ||||| |||||||| ||||  ||||||| | |||||||||||||| ||     
T  219817 agcaaagatgagaatgttgcgttggatgcgtgttaagacaagacgagataagattacgaatgacaacattggagagagagttggggtagcacctatcgtt 219718  T
Q  109 gaaaagttggtagaaa 124  Q
    |||||| |||| ||||    
T  219717 gaaaaggtggtggaaa 219702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #87
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 23 - 87
Target Start/End: Original strand, 5305546 - 5305610
Alignment:
Q  23 gatgttgcgctggatgagtggtaagactagacatgataggattaagaatgacatcattagagaga 87  Q
    ||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||| ||||  ||| ||| |||||||||||    
T  5305546 gatgttgcgttggatgtgtggtaagactagacaagatagaattagaaataacaacattagagaga 5305610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #88
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 274 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 18351001 - 18350937
Alignment:
Q  274 aatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccga 338  Q
    |||||||| |||  ||||||||| |||| ||||||| |||||| || ||||||||||||||||||    
T  18351001 aatgagttggatagaaatatggtatttgttagaacattatgacgtcgtttgatccatgtagccga 18350937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #89
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 98 - 158
Target Start/End: Original strand, 21952364 - 21952424
Alignment:
Q  98 cacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaag 158  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||| |||||| || || ||| ||||||||||||||||    
T  21952364 cacctatagtagaaaagatggcagaaactagactcaggtggtttggacatgtagagagaag 21952424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #90
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 300 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 41200419 - 41200343
Alignment:
Q  300 tgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 376  Q
    |||||||||  |||| ||||||||||||||||||||| | || |||||||| ||||| || | | ||||||||||||    
T  41200419 tgatagaacgttatggcatcatttgatccatgtagcctaccccacttagtgggataaggccttgctgttgttgttgt 41200343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #91
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 11 - 86
Target Start/End: Original strand, 9234987 - 9235062
Alignment:
Q  11 agcagagatgatgatgttgcgctggatgagtggtaagactagacatgataggattaagaatgacatcattagagag 86  Q
    ||||||||||   |||||||  |||||| |||||||||||||||  ||||||||||  ||||||| ||||||||||    
T  9234987 agcagagatggaaatgttgcattggatgtgtggtaagactagacgggataggattataaatgacaacattagagag 9235062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #92
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 288 - 375
Target Start/End: Original strand, 9400708 - 9400795
Alignment:
Q  288 aaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttg 375  Q
    |||| |||||| ||||| || |||||| | |||||||||||| |||||||| || | |||||| ||| | |||||||| |||||||||    
T  9400708 aaatttggtttatgatataatactatggcgtcatttgatccaggtagccgaccccatttagtgggattaggcttggttattgttgttg 9400795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #93
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 293 - 368
Target Start/End: Original strand, 28985285 - 28985360
Alignment:
Q  293 tggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgtt 368  Q
    |||||| |||||||||| |||  | | ||||||||||||||||||| || |||||||| || || |||||||||||    
T  28985285 tggtttgtgatagaacattatagcttaatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggacaaggcttggttgtt 28985360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #94
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 16 - 87
Target Start/End: Original strand, 34039960 - 34040031
Alignment:
Q  16 agatgatgatgttgcgctggatgagtggtaagactagacatgataggattaagaatgacatcattagagaga 87  Q
    |||||| ||||| ||| ||||||| || ||| |||||| ||||||||||||| ||| ||| |||||||||||    
T  34039960 agatgaggatgtcgcgttggatgaatgataaaactagatatgataggattaaaaattacaccattagagaga 34040031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #95
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 259 - 374
Target Start/End: Original strand, 38684648 - 38684763
Alignment:
Q  259 aaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatg 358  Q
    |||||| ||||| | ||| |||| |||  |||||||||  ||||||||||| |||| | | ||||||| |||||||  || || ||||||||  |||| |    
T  38684648 aaagatctagagattaattagttggatagaaatatggtacttgatagaacattatggcgttatttgattcatgtagttgaccccacttagtggaataaag 38684747  T
Q  359 cttggttgttgttgtt 374  Q
    ||||||||||||||||    
T  38684748 cttggttgttgttgtt 38684763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #96
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 274 - 349
Target Start/End: Original strand, 41808105 - 41808180
Alignment:
Q  274 aatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagt 349  Q
    |||||||| |||  ||||||| | | |||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||  |||||||    
T  41808105 aatgagttggatataaatatgatgtatgatagaacattatgacatcgtttgatccatgtagtcgatctgacttagt 41808180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #97
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 254 - 376
Target Start/End: Original strand, 41894229 - 41894358
Alignment:
Q  254 ttagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggt-------ttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaactt 346  Q
    |||| |||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||       || ||||| |||| ||||   | ||||||||||||||||| | || ||||    
T  41894229 ttaggaaagatttagagattaatgagttggatccaaatatggtttatgaattatgatacaacattatggtgtaatttgatccatgtagccaaccccactt 41894328  T
Q  347 agtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 376  Q
    |||| |||||  ||| ||||||||||||||    
T  41894329 agtgggataagactttgttgttgttgttgt 41894358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #98
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 33 - 160
Target Start/End: Original strand, 6888933 - 6889062
Alignment:
Q  33 tggatgagtggtaagactagacatgataggattaagaatgacatcattagaga--gaatgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagac 130  Q
    |||||| ||||||||||||||   |||| |||||  |||||||  |||| |||  || | |||||||||| |||||  |||||| |||| |||||||| |    
T  6888933 tggatgtgtggtaagactagatgagatatgattagaaatgacaatattacagaaagagttggggtagcacgtatagaggaaaagatggtggaaaataggc 6889032  T
Q  131 ttagatgatttagacatgtagagagaagac 160  Q
    |||  || ||| ||||||||||||||||||    
T  6889033 ttaagtggtttggacatgtagagagaagac 6889062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #99
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 245 - 335
Target Start/End: Original strand, 6889147 - 6889237
Alignment:
Q  245 gagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagc 335  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||| | ||| |||| |  | ||||||||||| |||||||||| |||| | | |||| |||||||||||    
T  6889147 gagaaactattaggaaagatttagagattaattagttgggccaaaatatggtttatgatagaacattatggcgtaatttaatccatgtagc 6889237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #100
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 13 - 55
Target Start/End: Original strand, 27998343 - 27998385
Alignment:
Q  13 cagagatgatgatgttgcgctggatgagtggtaagactagaca 55  Q
    ||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  27998343 cagagatgaggatgttgcgttggatgtgtggtaagactagaca 27998385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #101
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 320 - 373
Target Start/End: Original strand, 3000968 - 3001021
Alignment:
Q  320 atttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgt 373  Q
    |||||||  |||||||||| || |||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  3000968 atttgatggatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 3001021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #102
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 315 - 376
Target Start/End: Original strand, 4653476 - 4653537
Alignment:
Q  315 acatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 376  Q
    |||| ||||||| |||||| |||| || |||||||| |||||  ||||||||||||||||||    
T  4653476 acataatttgattcatgtatccgaccccacttagtgagataagacttggttgttgttgttgt 4653537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #103
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 325 - 374
Target Start/End: Original strand, 5303681 - 5303730
Alignment:
Q  325 atccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgtt 374  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| |||||  | ||||||||||||||    
T  5303681 atccatgtagccgatcccacttagtgggataagtcctggttgttgttgtt 5303730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #104
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 300 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 9917530 - 9917458
Alignment:
Q  300 tgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttg 375  Q
    |||||||||| ||| ||||| |||||   |||||||||| || |||||||| | ||| ||||||||||||||||||    
T  9917530 tgatagaacagtataacatcgtttga---atgtagccgaccccacttagtgggttaaggcttggttgttgttgttg 9917458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #105
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 259 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 12576974 - 12576861
Alignment:
Q  259 aaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatg 358  Q
    |||||| ||||| | ||||||||  ||  ||||||||| | ||||||| || ||||   |||||| || ||||||||||| || | |||||| ||||| |    
T  12576974 aaagatctagagattaatgagttgaatagaaatatggtatatgatagaccattatggtgtcattttatacatgtagccgaccccaattagtgggataaag 12576875  T
Q  359 cttggttgttgttg 372  Q
    ||||||||||||||    
T  12576874 cttggttgttgttg 12576861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #106
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 300 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 28186855 - 28186782
Alignment:
Q  300 tgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgt 373  Q
    |||||||||| |||| | || ||||||||||| |||||| || ||| | || ||||| ||||||||||||||||    
T  28186855 tgatagaacattatggcgtcgtttgatccatgcagccgaccctactcaatgggataaggcttggttgttgttgt 28186782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #107
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 248 - 297
Target Start/End: Original strand, 36200886 - 36200935
Alignment:
Q  248 aaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtt 297  Q
    |||| |||| ||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  36200886 aaactattataaaagatatagaggttaatgagttggatccaaatatggtt 36200935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #108
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 325 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 7367220 - 7367172
Alignment:
Q  325 atccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgt 373  Q
    |||||||||||||| || |||||||| ||||| ||||||||||| ||||    
T  7367220 atccatgtagccgacccgacttagtgggataaggcttggttgttattgt 7367172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #109
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 260 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 15588503 - 15588399
Alignment:
Q  260 aagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgc 359  Q
    |||||||||||   |||||||| |||  ||| ||||| | ||| |||||| |||| | || ||||||| |||||||||| || |||||||| ||||| ||    
T  15588503 aagatttagagagaaatgagttggataaaaacatggtatatgacagaacattatggcgtcgtttgatctatgtagccgaccctacttagtgggataaggc 15588404  T
Q  360 ttggt 364  Q
    |||||    
T  15588403 ttggt 15588399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #110
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 321 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 36123234 - 36123178
Alignment:
Q  321 tttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgtc 377  Q
    |||||||||||||  || ||| |||||||| |||||  |||||||||||||||||||    
T  36123234 tttgatccatgtaatcggtcccacttagtgggataagacttggttgttgttgttgtc 36123178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #111
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 292 - 375
Target Start/End: Original strand, 37065677 - 37065761
Alignment:
Q  292 atggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccga-tccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttg 375  Q
    ||||||||||||||| ||||||||  || |||||| |||||||||||  ||| ||||||| |||||  || ||| ||||||||||    
T  37065677 atggtttttgatagagcactatgaagtcgtttgattcatgtagccgaccccagcttagtgggataagactaggtcgttgttgttg 37065761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #112
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 320 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 39322132 - 39322096
Alignment:
Q  320 atttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataa 356  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  39322132 atttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataa 39322096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #113
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 214 - 314
Target Start/End: Original strand, 43035104 - 43035204
Alignment:
Q  214 agaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactat 313  Q
    ||||| |||||||||||||  |||||||| |||||||| ||||| ||| |||| ||  |  ||||||| || | ||||||||| | |||||||||| |||    
T  43035104 agaggcagaggaagaactagaaaaaccatctgagaaactattaggaaaaatttggaaatttatgagttggaccgaaatatggtgtatgatagaacattat 43035203  T
Q  314 g 314  Q
    |    
T  43035204 g 43035204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #114
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 94 - 198
Target Start/End: Original strand, 43475243 - 43475347
Alignment:
Q  94 gtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaa 193  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| |||| ||| ||||| || ||| |  ||  |||||||||||| ||||||   || ||||| |||| |||||| |    
T  43475243 gtagcacctatagtagaaaagatggtggaaactaggcttaggtggtttgggtattcagagagaagacctgtagatgttgtagtaaggagagtagatcaga 43475342  T
Q  194 tggag 198  Q
    |||||    
T  43475343 tggag 43475347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 221; Significance: 1e-121; HSPs: 67)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 11 - 376
Target Start/End: Original strand, 28085294 - 28085661
Alignment:
Q  11 agcagagatgatgatgttgcgctggatgagtggtaagactagacatgataggattaagaatgacatcattagagagaa--tgggggtagcacctatagta 108  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||   ||||||||||||||||||||    
T  28085294 agcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagactagacatgataggattacgaatgacaccattagagagagagtgggggtagcacctatagta 28085393  T
Q  109 gaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaatggagaagaaccagg 208  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| ||| | ||||||||||||||||||||| |||  || |||||||||| ||||||||||||| |||  || |    
T  28085394 gaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttggccatgtagagagaagacccgtaaataaagtggtaagaagagtagatcaaatggagtagagtcaag 28085493  T
Q  209 ttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaac 308  Q
    |||||||||||||||||||| ||| |||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||| | |||||||||    
T  28085494 ttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaac 28085593  T
Q  309 actatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 376  Q
    ||||||   ||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  28085594 actatggtgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttgt 28085661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 24 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 5258501 - 5258145
Alignment:
Q  24 atgttgcgctggatgagtggtaagactagacatgataggattaagaatgacatcattagagagaa----tgggggtagcacctatagtagaaaagttggt 119  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| | |||||||||     |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5258501 atgttgcgttggatgagtggtaagactagacaagataggattatgaatgacaccgttagagagagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggt 5258402  T
Q  120 agaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggt 219  Q
    ||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| |||  || ||||||||||||    
T  5258401 agaaaataggcttagatggtttggacatgtagagagaagacccgtagattccgttgtaagaagagtagatcaaatggaggagagtcatgttaaaagaggt 5258302  T
Q  220 agaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatc 319  Q
    |||| |||| |||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||| | ||    
T  5258301 agagaaagacctaagaaaaccattcgagaaatcattagacaagatttagaggtcaatgagctagatccaaatatggtttttgattaaacactatggcgtc 5258202  T
Q  320 atttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 376  Q
    |||||||||| |||||||| || |||||||| |||||  ||||||||||||||||||    
T  5258201 atttgatccacgtagccgaccccacttagtgggataagtcttggttgttgttgttgt 5258145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 15 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 35043801 - 35043441
Alignment:
Q  15 gagatgatgatgttgcgctggatgagtggtaagactagacatgataggattaagaatgacatcattagag--agaatgggggtagcacctatagtagaaa 112  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||  ||| || |||||| ||||| ||||||||    
T  35043801 gagatgaagatgttgcgctggatgattggtaagattagacatgataggattatgaatgacaccattagagggagagtgagggtagtacctaaagtagaaa 35043702  T
Q  113 agttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaatggagaagaaccaggttaa 212  Q
    ||||||| |||||||| |||||||  ||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||  |||  ||||||||    
T  35043701 agttggttgaaaataggcttagattgtttggacatgtagagagaatacccgtagatgccgttgtaagaaaagtagatcaaatggacgagagtcaggttaa 35043602  T
Q  213 aagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacacta 312  Q
    |||| ||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35043601 aagaagtagatgaagacctaagaaaaccattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgtgttggatccaaatatggtttttgatagaacacta 35043502  T
Q  313 tgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgt 373  Q
    |||| |||||||||| ||||||| ||||| |||||  | ||||| ||||||||||||||||    
T  35043501 tgacgtcatttgatcaatgtagctgatcccacttaaagagataaggcttggttgttgttgt 35043441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 15 - 372
Target Start/End: Original strand, 608081 - 608442
Alignment:
Q  15 gagatgatgatgttgcgctggatgagtggtaagactagacatgataggattaagaatgacatcattagagagaatgggggtagcacctatagtagaaaag 114  Q
    ||||||| |||||| || ||||||||||||||||||||| | |||||||||| |||||||| ||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||    
T  608081 gagatgaggatgttccgttggatgagtggtaagactagataggataggattaggaatgacaccattagagagagtgagggtatcacctatagtagaaaag 608180  T
Q  115 ttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaa 214  Q
    ||| |||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||  |||||||||||| |||  ||| ||||||    
T  608181 ttgatagaaaataggcttagatggtttggacatgtagagagaagacctgtagatgcctttgtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcagattaaaa 608280  T
Q  215 gaggtagaggaag----aactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacac 310  Q
    ||||| || ||||    || ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||    
T  608281 gaggttgatgaagacctaattaagaaaactattcgagaaaccattagaaaagatttagagttcaatgagttggatccaaatatggtttttgatagaatac 608380  T
Q  311 tatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttg 372  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||  ||||||||||||||    
T  608381 tatgacgtcatttgatccatgtagccgaccctacttagtgggataagacttggttgttgttg 608442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 15 - 373
Target Start/End: Original strand, 9706698 - 9707052
Alignment:
Q  15 gagatgatgatgttgcgctggatgagtggtaagactagacatgataggattaagaatgacatcattagagagaa--tgggggtagcacctatagtagaaa 112  Q
    ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||   ||| |||||||||||| |||||||    
T  9706698 gagatgaggatgttgcactggatgagtggtaagactagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtggaggtagcacctattgtagaaa 9706797  T
Q  113 agttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaatggagaagaaccaggttaa 212  Q
    |||||||||||||||| |||||||| |||      ||||||||||||||| ||||  ||||||| ||||||| |||||||||||||||||  ||||||||    
T  9706798 agttggtagaaaataggcttagatggttt------gtagagagaagacccatagaagccgttgttagaagagtagatcaaatggagaagagtcaggttaa 9706891  T
Q  213 aagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacacta 312  Q
    ||||||||  |||||  ||||| |||||||| || ||||| |||| || ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9706892 aagaggtacgggaagggctaagtaaaccattagataaaccgttaggaaggatttagaggttaatgagttggatccaaatatggtttttgatagaacacta 9706991  T
Q  313 tgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgt 373  Q
    || ||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  9706992 tggcatcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 9707052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 193; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 11 - 376
Target Start/End: Original strand, 32755837 - 32756206
Alignment:
Q  11 agcagagatgatgatgttgcgctggatgagtggtaagactagacatgataggattaagaatgacatcattagagagaa----tgggggtagcacctatag 106  Q
    ||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||| |||||||||||     ||||||||||||||||||    
T  32755837 agcagagatgaggatgttgtgttggatgagtggtaagactagacatgataatattaggaatgacaccattagagagagagagtgggggtagcacctatag 32755936  T
Q  107 tagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaatggagaagaacca 206  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| ||| | ||||||||| ||||||||| ||||  |||  ||||||||| ||||||||||||| |||  ||    
T  32755937 tagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttggtcatgtagagggaagacccgaagatgtcgtaataagaagagtagatcaaatggaggagagtca 32756036  T
Q  207 ggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgataga 306  Q
     |||||||||||||||| |||| ||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| | |||||||    
T  32756037 agttaaaagaggtagagaaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgataga 32756136  T
Q  307 acactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 376  Q
    |||||||| | |||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||  ||||| ||||||||||||    
T  32756137 acactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtggggtaagacttggatgttgttgttgt 32756206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 27 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 21352183 - 21351872
Alignment:
Q  27 ttgcgctggatgagtggtaagactagacatgataggattaagaatgacatcattagagagaatgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaat 126  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  21352183 ttgcgctagataagtggtaagactagatatgataggattaggaataacatcgttagagagagtggaggtagcacctatagtagaaaaattggtagaaaat 21352084  T
Q  127 agacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaa 226  Q
    || |||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||| || |||| ||||||  ||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  21352083 aggcttagatgatttggacatgtagagagaagacctgtcgatgccattgttagaagaatagaacaaatggagaagagtcaggttaaaagaggtagaggaa 21351984  T
Q  227 gaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgat 326  Q
    || |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||||| | | |||||    
T  21351983 gacctaagaaaaccaatagagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagctggatccaaatatgatttttgatagaacactatgacgttaattgat 21351884  T
Q  327 ccatgtagccga 338  Q
    ||||||||||||    
T  21351883 ccatgtagccga 21351872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 15 - 370
Target Start/End: Original strand, 30031178 - 30031535
Alignment:
Q  15 gagatgatgatgttgcgctggatgagtggtaagactagacatgataggattaagaatgacatcattagagag--aatgggggtagcacctatagtagaaa 112  Q
    ||||||| | ||||| | ||||||||||||||||||||||  ||||||||||  |||| || ||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||    
T  30031178 gagatgaggttgttgtgttggatgagtggtaagactagacgggataggattagaaatgtcaccattagagagggagtgggggtagcacctatagtagaaa 30031277  T
Q  113 agttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaatggagaagaaccaggttaa 212  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||||||| ||||||||||||| |||  ||||||||    
T  30031278 agttggtagaaaataggcttagatgagttggacatgtagagagaagacccatagatgccgtcgtaagaagagtagatcaaatggaggagagtcaggttaa 30031377  T
Q  213 aagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacacta 312  Q
    |||||||||||| ||| ||| |||||| ||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||  ||||||||||| |||||||||||||    
T  30031378 aagaggtagagggagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatttaaatatggtttatgatagaacacta 30031477  T
Q  313 tgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgt 370  Q
    || | | ||||||||||||||||||| |  |||||||| ||||| |||||||||||||    
T  30031478 tggcgtaatttgatccatgtagccgacctcacttagtgggataaggcttggttgttgt 30031535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 182; E-Value: 3e-98
Query Start/End: Original strand, 15 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 20427996 - 20427633
Alignment:
Q  15 gagatgatgatgttgcgctggatgagtggtaagactagacatgataggattaagaatgacatcattagagagaa--tgggggtagcacctatagtagaaa 112  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||   ||||||||||||||||||||||||    
T  20427996 gagatgaggatgttgcgctggatgagtggtaggacaagacaggataggattaggaatgacaccattagagagagagtgggggtagcacctatagtagaaa 20427897  T
Q  113 agttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaatggagaagaaccaggttaa 212  Q
    |||||||||||||||| |||||||| |||  || |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||| |||  ||  |||||||     
T  20427896 agttggtagaaaataggcttagatggtttgaacgtgtatagagaagacccgtagatgccgttgtaagaagagtaaatcaaatagaggggagtcaggttac 20427797  T
Q  213 aagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacacta 312  Q
    ||||||| |||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  20427796 aagaggttgaggaagacctaagaaaactattagagaaaccattagaaaa-atttagaggttaatgagttggatccaaatatggtttttaatagaatacta 20427698  T
Q  313 tgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatg-cttggttgttgttgttgt 376  Q
    || |  ||||| ||| |||||||||| || |||||||| ||||| | ||||||||||||||||||    
T  20427697 tggcgacatttaatcaatgtagccgacccgacttagtgggataaagacttggttgttgttgttgt 20427633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 173; E-Value: 8e-93
Query Start/End: Original strand, 16 - 333
Target Start/End: Original strand, 5631741 - 5632064
Alignment:
Q  16 agatgatgatgttgcgctggatgagtggtaagactagacatgataggattaagaatgacatcattagagagaa------tgggggtagcacctatagtag 109  Q
    |||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||  |||| ||||| |||||||| |||||||||||       |||||||| ||||||||||||    
T  5631741 agatgaggatgttgtgttggatgagtggtaagactagaccggatatgattaggaatgacaccattagagagagagagagtgggggtaacacctatagtag 5631840  T
Q  110 aaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaatggagaagaaccaggt 209  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| || | ||||||| || ||||||||||||| |||  ||| |    
T  5631841 aaaagttggtagaaaatatgcttagatggtttggacatgtagagagaagacccgtagatgccttcgtaagaatagtagatcaaatggaggagagtcagat 5631940  T
Q  210 taaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaaca 309  Q
    ||||||||  | |||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  5631941 taaaagagacaaaggaagacttaagaaaaccattcgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttttgatataaca 5632040  T
Q  310 ctatgacatcatttgatccatgta 333  Q
    ||||||| ||||||||||||||||    
T  5632041 ctatgacgtcatttgatccatgta 5632064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 153; E-Value: 7e-81
Query Start/End: Original strand, 11 - 376
Target Start/End: Original strand, 14030724 - 14031080
Alignment:
Q  11 agcagagatgatgatgttgcgctggatgagtggt-aagactagacatgataggattaagaatgacatcattagagagaa--tgggggtagcacctatagt 107  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||   |||||||||||||||||||    
T  14030724 agcagagatgaggatgttgcgatggatgagtggttaagactagacaggataggattaggaatgacaccattagagagatagtgggggtagcacctatagt 14030823  T
Q  108 agaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaatggagaagaaccag 207  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||| ||| ||| |||||||| |||||||||  ||| || ||||||||||||||| ||||||||| | | |||  | |    
T  14030824 agaaaagttggtagataataggcttaaatggtttggacatgtatagagaagacatgtaaatgccgttgtaagaagagtagatcaaatagtggagagtcgg 14030923  T
Q  208 gttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaa 307  Q
     |||||||||||||||||||| ||||||            ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  14030924 attaaaagaggtagaggaagacctaaga------------aaaacattagaaaagatttagaggtcaatgggttagatccaaatatgatttttgatagaa 14031011  T
Q  308 cactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 376  Q
     ||||| || ||||||||||||| || |||| || | |||||| ||||| | |||||||||||||||||    
T  14031012 tactataacgtcatttgatccatataaccgaccctatttagtgggataaagtttggttgttgttgttgt 14031080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 136; E-Value: 1e-70
Query Start/End: Original strand, 68 - 376
Target Start/End: Original strand, 12890559 - 12890860
Alignment:
Q  68 gaatgacatcattag--agagaatgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgta 165  Q
    |||||||| ||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||| | ||||||         ||| ||    
T  12890559 gaatgacaccattagggagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttacatggtttgggcatgta---------cccata 12890649  T
Q  166 gataccgttgtaagaagagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatt 265  Q
    ||| |||| |||||||||| |||||| |||||| |||   |||| |||||||||||| ||||| ||| |||||| ||  |||||||||||||||| ||||    
T  12890650 gatgccgtcgtaagaagagtagatcagatggaggagagtaaggtcaaaagaggtagatgaagacctaggaaaactataagagaaaccattagaaaggatt 12890749  T
Q  266 tagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggtt 365  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| ||||||||    
T  12890750 tagacgtcaatgagttagatccaaatatggtttatgatagaacactatggcgtaatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggtt 12890849  T
Q  366 gttgttgttgt 376  Q
    |||||||||||    
T  12890850 gttgttgttgt 12890860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 121; E-Value: 9e-62
Query Start/End: Original strand, 15 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 10100217 - 10099993
Alignment:
Q  15 gagatgatgatgttgcgctggatgagtggtaagactagacatgataggattaagaatgacatcattagagagaatgggggtagcacctatagtagaaaag 114  Q
    ||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||  ||| |||||  ||||||| ||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||    
T  10100217 gagatgaggatgttgcgttagatgagtggtaagactagacaatatatgattagaaatgacaccattagagagagtgggggtcgcacatatagtagaaaag 10100118  T
Q  115 ttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaa 214  Q
    |||||||||||||  |||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||| || |||  ||| ||||||    
T  10100117 ttggtagaaaataagcttagatggtttggacatgtagagagaagactcgtagatgccgttgtaagaagagtagatcaaatgaaggagagtcagtttaaaa 10100018  T
Q  215 gaggtagaggaagaactaagaaaac 239  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||    
T  10100017 gaggtagaggaagacctaggaaaac 10099993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 102 - 375
Target Start/End: Original strand, 30679417 - 30679680
Alignment:
Q  102 tatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaatggagaag 201  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||  ||| ||||||| || ||||||||||||| ||    
T  30679417 tatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatgatttgggcatgtagagaggagacccgtagatgtcgtcgtaagaatagtagatcaaatggagtag 30679516  T
Q  202 aaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttg 301  Q
    |  || |||| |||||||| ||||||          || ||| |||||||||||| ||| |||||||| |||||| |||| |||||||||  ||| | ||    
T  30679517 agtcaagttataagaggtataggaag----------actattagagaaaccattaaaaaggatttagaagtcaataagttggatccaaattcggtctatg 30679606  T
Q  302 atagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttg 375  Q
    |||||||| ||| || |||||||||| ||||||||||||| ||||| || |||||  |||||||||||||||||    
T  30679607 atagaacattataacgtcatttgatctatgtagccgatcccacttaatgggataagacttggttgttgttgttg 30679680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 15 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 9594072 - 9593709
Alignment:
Q  15 gagatgatgatgttgcgctggatgagtggtaagactagacatgataggattaagaatgacatcattagaga--------gaatgggggtagcacctatag 106  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||| |||||||||        || | |||||||||||  |||    
T  9594072 gagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagactagacgggataggattaggaatgacaccattagagagagagagggagttggggtagcaccattag 9593973  T
Q  107 tagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaatggagaagaacca 206  Q
    |||||||| ||||||||||||| ||||| || ||| | ||||||||||||||||  |||||| | || |||||||||| |||||| |||||| |||  ||    
T  9593972 tagaaaagatggtagaaaataggcttaggtggtttgggcatgtagagagaagacatgtagatgctgtagtaagaagagtagatcagatggaggagagtca 9593873  T
Q  207 ggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgataga 306  Q
      |   |||||||||||||||| |||  ||||  ||  ||||||| ||||| ||||| |||||| | |||||||| ||||| |||||||||| |||||||    
T  9593872 aat--caagaggtagaggaagacctagaaaaattataagagaaactattaggaaagacttagagattaatgagttggatcccaatatggtttatgataga 9593775  T
Q  307 acactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgtt 374  Q
    ||| ||||   | ||||||||||| |||| || |  ||||||||  |||| |||||||||||||||||    
T  9593774 acattatg--gtaatttgatccatatagctgaccacacttagtggcataaggcttggttgttgttgtt 9593709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 91; E-Value: 7e-44
Query Start/End: Original strand, 214 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 34143924 - 34143762
Alignment:
Q  214 agaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactat 313  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||| ||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||| | ||||||||||||||    
T  34143924 agaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattacaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactat 34143825  T
Q  314 gacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 376  Q
    | | ||||||||||||||||| ||| || ||||| || ||||| |||||||||||||||||||    
T  34143824 ggcgtcatttgatccatgtagtcgaccccacttattgggataaggcttggttgttgttgttgt 34143762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 91; E-Value: 7e-44
Query Start/End: Original strand, 214 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 34156540 - 34156378
Alignment:
Q  214 agaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactat 313  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||| ||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||| | ||||||||||||||    
T  34156540 agaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattacaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactat 34156441  T
Q  314 gacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 376  Q
    | | ||||||||||||||||| ||| || ||||| || ||||| |||||||||||||||||||    
T  34156440 ggcgtcatttgatccatgtagtcgaccccacttattgggataaggcttggttgttgttgttgt 34156378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 93 - 330
Target Start/End: Original strand, 33496963 - 33497198
Alignment:
Q  93 ggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaa-tagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatca 191  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||| |  | || |||||||||||||||||    
T  33496963 ggtagcacctatggtagaaaagttagtagaaaaataggcttagatggtttggacatgtagagagaagacc-gtaaacgctgtcgtaagaagagaagatca 33497061  T
Q  192 aatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaat 291  Q
    |||| || ||   || ||||||||||||||||| ||| |||  ||||| ||| |||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  33497062 aatgaaggagt--caagttaaaagaggtagagggagatctagaaaaactattagagaaacctttagaaaggatttaaaggtcaatgagttggatccaaat 33497159  T
Q  292 atggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccat 330  Q
    ||| ||| ||||| ||||||||  | | |||||||||||    
T  33497160 atgatttatgatataacactatagcgtaatttgatccat 33497198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 254 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 3206578 - 3206456
Alignment:
Q  254 ttagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtga 353  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| || |||||||| ||    
T  3206578 ttagaaaagatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttttaatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtggga 3206479  T
Q  354 taatgcttggttgttgttgttgt 376  Q
    |||  ||||||| ||||||||||    
T  3206478 taagacttggttattgttgttgt 3206456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 11 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 28027189 - 28026896
Alignment:
Q  11 agcagagatgatgatgttgcgctggatgagtggtaagactagacatgataggattaagaatgacatcattaga--gagaatgggggtagcacctatagta 108  Q
    |||||||| || ||||||  | |||||||||||||||||||||    ||||||||| ||||||| || |||||  |||||||||| ||||||||||||||    
T  28027189 agcagagacgaggatgttatgttggatgagtggtaagactagatggcataggattaggaatgacgtcgttagatagagaatgggg-tagcacctatagta 28027091  T
Q  109 gaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaatggagaagaaccagg 208  Q
    |||||  ||||||||||||| ||| | || ||| |||||||||||| || ||| |||||| | || ||| |||||| | |||| |||||| |||  |||     
T  28027090 gaaaatgtggtagaaaataggcttgg-tggtttggacatgtagagataacacctgtagatgcggtagtacgaagagtatatcagatggaggagagtcaga 28026992  T
Q  209 ttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgata 304  Q
    ||| |||||||||||||||| |||| ||||| ||  || |||||||||  ||||||||| |||| ||||| ||  || |||||||||||| |||||    
T  28026991 ttagaagaggtagaggaagacctaaaaaaactataagaaaaaccattatgaaagatttacaggttaatgatttgtattcaaatatggtttatgata 28026896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 264 - 376
Target Start/End: Original strand, 31819004 - 31819116
Alignment:
Q  264 tttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttgg 363  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| |||| | ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||    
T  31819004 tttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataatgcttgg 31819103  T
Q  364 ttgttgttgttgt 376  Q
    |||| ||||||||    
T  31819104 ttgtggttgttgt 31819116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 262 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 34934941 - 34934830
Alignment:
Q  262 gatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgctt 361  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| |||| | ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| ||||    
T  34934941 gatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcctcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggctt 34934842  T
Q  362 ggttgttgttgt 373  Q
    ||||||||||||    
T  34934841 ggttgttgttgt 34934830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 71; E-Value: 6e-32
Query Start/End: Original strand, 156 - 334
Target Start/End: Original strand, 5080905 - 5081083
Alignment:
Q  156 aagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccatt 255  Q
    ||||||||||||| | || |||||||||| | ||||||||||| |||  |  |||||||||| |||| ||||| ||| |||||| ||| |||||| ||||    
T  5080905 aagacccgtagatgctgtcgtaagaagagtaaatcaaatggaggagagtctcgttaaaagagatagatgaagacctaggaaaactattagagaaatcatt 5081004  T
Q  256 agaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtag 334  Q
      |||  ||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  5081005 caaaattatttagaggtcaatgagttggatacaaatatgatttatgatagaacactataacgtcatttgatccatgtag 5081083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 145 - 268
Target Start/End: Original strand, 7133800 - 7133923
Alignment:
Q  145 catgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccattt 244  Q
    ||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||| ||||||||||||| |||  || ||||||||||||||||||||| |||  ||||| |||     
T  7133800 catgtagagagaagacccgaagatgccgtggtaagaagagtagatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctagaaaaactatta 7133899  T
Q  245 gagaaaccattagaaaagatttag 268  Q
    |||||||||||||||| |||||||    
T  7133900 gagaaaccattagaaatgatttag 7133923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 145 - 268
Target Start/End: Original strand, 7136723 - 7136846
Alignment:
Q  145 catgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccattt 244  Q
    ||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||| ||||||||||||| |||  || ||||||||||||||||||||| |||  ||||| |||     
T  7136723 catgtagagagaagacccgaagatgccgtggtaagaagagtagatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctagaaaaactatta 7136822  T
Q  245 gagaaaccattagaaaagatttag 268  Q
    |||||||||||||||| |||||||    
T  7136823 gagaaaccattagaaatgatttag 7136846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 66; E-Value: 6e-29
Query Start/End: Original strand, 97 - 373
Target Start/End: Original strand, 2689646 - 2689915
Alignment:
Q  97 gcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaatgg 196  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||   ||||||||||||||||  |||||| ||||  ||||||||| |||||| || |    
T  2689646 gcacctatagttgaaaagtttgtagaaaataggcttagatgatttgagcatgtagagagaagacatgtagatgccgtcataagaagagtagatcagatag 2689745  T
Q  197 agaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggt 296  Q
    || |||  || || |||||||||      ||| |||  ||||| ||  |||||||||||| |||||||||||||||||  || || ||| ||||||| ||    
T  2689746 agtagagtcatgtcaaaagaggt------agacctagaaaaactataagagaaaccattaaaaaagatttagaggtcagcgaattggatgcaaatattgt 2689839  T
Q  297 ttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgt 373  Q
    || | |||||| |||||||| | ||||||| ||| ||  ||| |  ||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  2689840 ttat-atagaatactatgacgtaatttgattcatataatcgaccttacttagtatgataatgtttggttgttgttgt 2689915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 213 - 373
Target Start/End: Original strand, 5095956 - 5096116
Alignment:
Q  213 aagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacacta 312  Q
    |||||||||||||||| |||  ||||| |   |||||||  |||| |||||||||| ||| |||||||| |||| ||||||||||| |||||||||| ||    
T  5095956 aagaggtagaggaagacctagaaaaactagaagagaaactcttaggaaagatttagtggttaatgagttggatcaaaatatggtttatgatagaacatta 5096055  T
Q  313 tgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgt 373  Q
    || | | |||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||| | ||||||||||||||    
T  5096056 tggcgtaatttgatctatgtagccgatcccacttagtgggataaggtttggttgttgttgt 5096116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 292 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 30789155 - 30789071
Alignment:
Q  292 atggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 376  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||| ||||    
T  30789155 atggtttttgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtagccgatcctacttagtgggataaggcttggttgttgttcttgt 30789071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 15 - 124
Target Start/End: Original strand, 5080777 - 5080888
Alignment:
Q  15 gagatgatgatgttgcgctggatgagtggtaagactagacatgataggattaagaatgacatcattagaga--gaatgggggtagcacctatagtagaaa 112  Q
    ||||||| ||||||||||||||| | |||||||| ||||||| ||| ||||| |||||||| |||||||||  || |||||||| |||||||||||||||    
T  5080777 gagatgaggatgttgcgctggataactggtaagattagacataataagattaggaatgacaccattagagaacgagtgggggtatcacctatagtagaaa 5080876  T
Q  113 agttggtagaaa 124  Q
    ||||||||||||    
T  5080877 agttggtagaaa 5080888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 245 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 10099022 - 10098893
Alignment:
Q  245 gagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaac 344  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||| | |||||||||||||  || ||||||||||||||||  ||| || ||    
T  10099022 gagaaaccattaaaaaagatttagaggtcaatgagttggatttaaatatggtgtatgatagaacacta--acgtcatttgatccatgtaatcgaccccac 10098925  T
Q  345 ttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 376  Q
    |||||| |||||  |||| |||||||||||||    
T  10098924 ttagtgggataagacttgattgttgttgttgt 10098893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 214 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 34664 - 34502
Alignment:
Q  214 agaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactat 313  Q
    ||||| ||||||||| |||  ||||| ||  ||||||||||||  |||||| || || | |||||||| |||  ||||||||||| |||||||||| |||    
T  34664 agaggcagaggaagacctagaaaaactataagagaaaccattaagaaagatctaaagattaatgagttggattgaaatatggtttatgatagaacattat 34565  T
Q  314 gacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 376  Q
    | | | |||||||||||||||| || || |||||||| |||||  ||||||||||||||||||    
T  34564 ggcgtaatttgatccatgtagctgaccccacttagtgggataagacttggttgttgttgttgt 34502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 23 - 113
Target Start/End: Complemental strand, 6056122 - 6056032
Alignment:
Q  23 gatgttgcgctggatgagtggtaagactagacatgataggattaagaatgacatcattagagagaatgggggtagcacctatagtagaaaa 113  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||  |||||||||||||| ||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||    
T  6056122 gatgttgcgttggatgagtggtaagactagaaaggatgtgattaagaatgacaccattagagagagttggggtaacacctatagtagaaaa 6056032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 288 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 4245957 - 4245869
Alignment:
Q  288 aaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 376  Q
    ||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||| || |||||||| ||||| ||||||||||| |||||||    
T  4245957 aaatatggtatttgatagaacattatgacatcgtttgatccaagtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgtttttgttgt 4245869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 253 - 375
Target Start/End: Original strand, 5897619 - 5897741
Alignment:
Q  253 attagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtg 352  Q
    |||||||||||||||||  | |||| ||| |||| ||||||||| | || ||||| | |||||| | |||||||||||||||| ||||| |||||||| |    
T  5897619 attagaaaagatttagatattaatgtgttggatcaaaatatggtatatggtagaatattatgacgtaatttgatccatgtagcggatcccacttagtggg 5897718  T
Q  353 ataatgcttggttgttgttgttg 375  Q
    |||| ||||| ||||||||||||    
T  5897719 ataaggcttgattgttgttgttg 5897741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 245 - 373
Target Start/End: Original strand, 31818685 - 31818813
Alignment:
Q  245 gagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaac 344  Q
    ||||||| ||||| |||| ||| ||| | |||||||| |||| || |||||||| |||||||||| |||| | | ||||||||||||||||||| || ||    
T  31818685 gagaaactattaggaaaggtttggagattaatgagttggatcaaagtatggtttatgatagaacattatgtcgtaatttgatccatgtagccgaccccac 31818784  T
Q  345 ttagtgtgataatgcttggttgttgttgt 373  Q
    |||| | || || ||||||||||||||||    
T  31818785 ttagcgggaaaaagcttggttgttgttgt 31818813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 245 - 338
Target Start/End: Original strand, 24665965 - 24666058
Alignment:
Q  245 gagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccga 338  Q
    ||||||| ||||  ||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||| |||||| | ||||||||  |||||||||    
T  24665965 gagaaactattaagaaatatttagaggtcaatgagttggatcgaaatatggtttatgatagaacattatgacttaatttgatctgtgtagccga 24666058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 11 - 161
Target Start/End: Original strand, 33083976 - 33084128
Alignment:
Q  11 agcagagatgatgatgttgcgctggatgagtggtaagactagacatgataggattaagaatgacatcattagagagaatg--ggggtagcacctatagta 108  Q
    |||||| |||| |||| |||| |||||| ||||||||||||||   ||||| ||||  ||||||   ||||||||||  |  |||||||||||||| |||    
T  33083976 agcagaaatgaggatgctgcgttggatgtgtggtaagactagatgggatagaattagaaatgacgatattagagagagagttggggtagcacctatggta 33084075  T
Q  109 gaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacc 161  Q
    |||||| ||||||||| ||||||||| || ||| |  ||||||||||||||||    
T  33084076 gaaaagatggtagaaactagacttaggtggtttgggaatgtagagagaagacc 33084128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 211 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 6055933 - 6055806
Alignment:
Q  211 aaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacac 310  Q
    |||| ||||||||||||| |||  |||||  |  ||||||| ||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||| || | | ||||||||     
T  6055933 aaaaaaggtagaggaagacctataaaaactttaagagaaactattatgaaagatttagaggttaatgagttagatccaaatatagtgtataatagaacat 6055834  T
Q  311 tatgacatcatttgatccatgtagccga 338  Q
    || ||| | ||||||| |||||||||||    
T  6055833 tacgacgtaatttgatgcatgtagccga 6055806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 252 - 371
Target Start/End: Original strand, 7492550 - 7492669
Alignment:
Q  252 cattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgt 351  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||  ||||||||| |||  | | |||||  ||| |||||||| || ||||||||     
T  7492550 cattaggaaagatttagaggttaatgagttttatccaaatatggtttcggatagaacattatagcgttatttgtaccaagtagccgaccccacttagtgg 7492649  T
Q  352 gataatgcttggttgttgtt 371  Q
    ||||| | ||||||||||||    
T  7492650 gataaggattggttgttgtt 7492669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 287 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 12119729 - 12119642
Alignment:
Q  287 caaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccga-tccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgt 373  Q
    |||||||| ||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||  || |||||||| ||||| ||||||||||| ||||    
T  12119729 caaatatgatttttaatagaacattatgacgtcatttgatccatgtagccgacccccacttagtgggataaggcttggttgttattgt 12119642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 300 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 1615296 - 1615223
Alignment:
Q  300 tgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgt 373  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |  | |||||| |||||  |||||||||||||||    
T  1615296 tgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtagccgacctcatttagtgggataagacttggttgttgttgt 1615223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 23 - 137
Target Start/End: Original strand, 9568590 - 9568708
Alignment:
Q  23 gatgttgcgctggatgagtggtaagactagacatgataggattaagaatgacatcattagag----agaatgggggtagcacctatagtagaaaagttgg 118  Q
    ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||  ||||||| ||||||||    ||  | | |||||||| ||||||||||||| ||     
T  9568590 gatgttgcgttggatgtgtggtaagactagacatgatagaattataaatgacaacattagagcgccagtgttgaggtagcacttatagtagaaaagatga 9568689  T
Q  119 tagaaaatagacttagatg 137  Q
    | |||||| ||||||||||    
T  9568690 tggaaaatggacttagatg 9568708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 99 - 168
Target Start/End: Original strand, 24665818 - 24665887
Alignment:
Q  99 acctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagat 168  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||||| ||||| || ||| ||||||||||||||||||| ||||||    
T  24665818 acctatagtagaaaatatggtagaaaataggcttaggtggtttggacatgtagagagaagacctgtagat 24665887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 288 - 376
Target Start/End: Original strand, 579615 - 579703
Alignment:
Q  288 aaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 376  Q
    ||||||||||| |||  ||| | |||| | | |||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  579615 aaatatggtttctgaaggaaaattatggcgtaatttgatctatgtagccgatcccacttagtgggataaagcttggttgttgttgttgt 579703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 11 - 87
Target Start/End: Complemental strand, 33998368 - 33998292
Alignment:
Q  11 agcagagatgatgatgttgcgctggatgagtggtaagactagacatgataggattaagaatgacatcattagagaga 87  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||  |||||||||||  ||||||  |||||||||||    
T  33998368 agcagagatgaagatgttgcgttggatgtgtggtaagactagatgtgataggattagaaatgactacattagagaga 33998292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 302 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 12133973 - 12133901
Alignment:
Q  302 atagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgtt 374  Q
    |||||||| |||| ||| || |||||||||||||||| || |||||||| || || |||||||||||||||||    
T  12133973 atagaacattatggcataatctgatccatgtagccgaccccacttagtgagaaaaggcttggttgttgttgtt 12133901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 300 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 9109582 - 9109507
Alignment:
Q  300 tgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttg 375  Q
    |||||||| |||||||  |  |||||||||||||||||| || | |||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  9109582 tgatagaatactatgaagtagtttgatccatgtagccgaccccagttagtgagataatgcttagttgttgttgttg 9109507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 274 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 6293491 - 6293389
Alignment:
Q  274 aatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgt 373  Q
    ||||||||||||  ||||||||| | ||||||| || |||| || | |||| || |||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||  |||||    
T  6293491 aatgagttagatagaaatatggtatatgatagagcattatggcaacgtttggtcaatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgcggttgt 6293392  T
Q  374 tgt 376  Q
    |||    
T  6293391 tgt 6293389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 259 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 14389275 - 14389202
Alignment:
Q  259 aaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgt 332  Q
    |||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||| || | | | |||||||||||||    
T  14389275 aaagatttagagattaataagttagatccaaatatggtttatgatataacattagggcgtaatttgatccatgt 14389202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #50
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 301 - 370
Target Start/End: Original strand, 21886314 - 21886383
Alignment:
Q  301 gatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgt 370  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| || | ||||||  |||| |||| ||||||||    
T  21886314 gatagaacacaatgacgtcatttgatccatgtagccgaccccatttagtggtataaggcttagttgttgt 21886383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #51
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 320 - 373
Target Start/End: Original strand, 33730194 - 33730247
Alignment:
Q  320 atttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgt 373  Q
    |||| |||||||||||||| || |||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  33730194 atttcatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 33730247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #52
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 296 - 376
Target Start/End: Original strand, 38976 - 39056
Alignment:
Q  296 tttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 376  Q
    ||||||||||||||||||| | |  |||||| |||||||||||  | ||| |||| ||||| ||| |||||||||||||||    
T  38976 tttttgatagaacactatggcgttgtttgattcatgtagccgagtccactaagtgggataaggctcggttgttgttgttgt 39056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #53
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 214 - 374
Target Start/End: Original strand, 8364679 - 8364839
Alignment:
Q  214 agaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactat 313  Q
    ||||| ||| ||||| |||| ||||| ||  ||||||| ||||  |||||||||||  | ||| |||| ||   ||| ||||||| |||||||||| |||    
T  8364679 agaggaagatgaagacctaaaaaaactataagagaaactattaagaaagatttagaaattaataagttggactgaaacatggtttatgatagaacattat 8364778  T
Q  314 gacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgtt 374  Q
    | | | ||||||||||||||||||| ||  ||||||| || || ||||  |||||||||||    
T  8364779 ggcgtaatttgatccatgtagccgaccccgcttagtgggaaaaggctttattgttgttgtt 8364839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #54
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 41 - 124
Target Start/End: Complemental strand, 21870403 - 21870322
Alignment:
Q  41 tggtaagactagacatgataggattaagaatgacatcattagagagaatgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaa 124  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||||  |||| ||  |||||||||  | |||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  21870403 tggtatgactagacatgatagaattagaaatgtcaatattagagag--ttggggtagcacctgtagtagaaaagatggtagaaa 21870322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #55
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 92 - 159
Target Start/End: Original strand, 2079341 - 2079408
Alignment:
Q  92 gggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaaga 159  Q
    |||||||| |||||||||||||| |||| |||||||| ||||  || |||||  ||||||||||||||    
T  2079341 gggtagcatctatagtagaaaagatggtggaaaataggcttaagtggtttaggtatgtagagagaaga 2079408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #56
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 36 - 128
Target Start/End: Original strand, 5095816 - 5095910
Alignment:
Q  36 atgagtggtaagactagacatgataggattaagaatgacatcattagagagaatg--ggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatag 128  Q
    ||||||||||||||| ||   |||||||||| |||||||  |||||||| || ||  ||| || |||||||||||||| || |||||||||||||    
T  5095816 atgagtggtaagactggaagggataggattaggaatgactacattagagggagtgttgggatatcacctatagtagaatagatggtagaaaatag 5095910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #57
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 322 - 381
Target Start/End: Complemental strand, 6906878 - 6906819
Alignment:
Q  322 ttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgtcgtct 381  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||  ||| | ||||||||| |||||||    
T  6906878 ttgatccatgtagccgacccaacttagtgcgataagactttgatgttgttgtcgtcgtct 6906819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #58
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 40 - 154
Target Start/End: Original strand, 8364523 - 8364635
Alignment:
Q  40 gtggtaagactagacatgataggattaagaatgacatcattagagagaatgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgat 139  Q
    ||||||||||||||   ||||||||||  |||||||  |||||| ||  | || |||||| |||||||||||||| |||| |||||||| ||||| || |    
T  8364523 gtggtaagactagatgggataggattagaaatgacaatattagacag--ttggagtagcaactatagtagaaaaggtggttgaaaataggcttaggtggt 8364620  T
Q  140 ttagacatgtagaga 154  Q
    || | ||||||||||    
T  8364621 ttgggcatgtagaga 8364635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #59
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 78 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 14389462 - 14389380
Alignment:
Q  78 attagagagaatgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacc 161  Q
    |||||||||| | | |||||||||||| ||||||||| |||| | ||| | |||||| || ||| |||||||||||||||||||    
T  14389462 attagagagagttgaggtagcacctatcgtagaaaagatggt-ggaaacaaacttaggtggtttggacatgtagagagaagacc 14389380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #60
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 300 - 370
Target Start/End: Original strand, 21089606 - 21089676
Alignment:
Q  300 tgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgt 370  Q
    |||||||||| |||| |||  ||||||||||||||| |  || |||||||| ||||| |||||||||||||    
T  21089606 tgatagaacattatggcattgtttgatccatgtagctgcccccacttagtgggataaggcttggttgttgt 21089676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #61
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 343 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 3127306 - 3127273
Alignment:
Q  343 acttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 376  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  3127306 acttagtgtgataaggcttggttgttgttgttgt 3127273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #62
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 343 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 4878327 - 4878294
Alignment:
Q  343 acttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 376  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  4878327 acttagtgtgataaggcttggttgttgttgttgt 4878294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #63
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 91 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 6641691 - 6641650
Alignment:
Q  91 ggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagactt 132  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  6641691 ggggtatcacctatagtagaaaagatggtagaaactagactt 6641650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #64
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 15 - 83
Target Start/End: Complemental strand, 2065116 - 2065048
Alignment:
Q  15 gagatgatgatgttgcgctggatgagtggtaagactagacatgataggattaagaatgacatcattaga 83  Q
    ||||||| |||| | | ||||||||| |||||||||| | ||||||||||||  ||||||| |||||||    
T  2065116 gagatgaggatgctaccctggatgagcggtaagactacatatgataggattagtaatgacaccattaga 2065048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #65
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 11 - 87
Target Start/End: Complemental strand, 7150682 - 7150606
Alignment:
Q  11 agcagagatgatgatgttgcgctggatgagtggtaagactagacatgataggattaagaatgacatcattagagaga 87  Q
    |||||||||| | |||||||  |||||| |||||||||||||||  |||||||||  ||| || | |||||||||||    
T  7150682 agcagagatgctaatgttgctttggatgtgtggtaagactagacgagataggatttggaacgaaaacattagagaga 7150606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #66
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 276 - 376
Target Start/End: Original strand, 9568884 - 9568983
Alignment:
Q  276 tgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttg 375  Q
    |||||| |||||||||||||||| ||||||| |  |||| | | ||||||||||| ||||| | || ||||| || ||||  ||||| ||||||||||||    
T  9568884 tgagttggatccaaatatggtttatgatagaccgttatggcgtaatttgatccatatagcc-aacccacttaatgggatagagcttgtttgttgttgttg 9568982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #67
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 320 - 376
Target Start/End: Original strand, 30642998 - 30643054
Alignment:
Q  320 atttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 376  Q
    |||||||| |||||||||| || |||||| | | ||| |||||||||||||||||||    
T  30642998 atttgatctatgtagccgaccccacttagcgggttaaggcttggttgttgttgttgt 30643054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0018 (Bit Score: 205; Significance: 1e-112; HSPs: 2)
Name: scaffold0018
Description:

Target: scaffold0018; HSP #1
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 11 - 376
Target Start/End: Original strand, 31386 - 31753
Alignment:
Q  11 agcagagatgatgatgttgcgctggatgagtggtaagactagacatgataggattaagaatgacatcattagagagaa--tgggggtagcacctatagta 108  Q
    ||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||| |||||||||||   ||||||||||||||||||||    
T  31386 agcagagattaggatgttgcgttggatgagtggtaagactagacaggataagattaggaatgacaccattagagagagagtgggggtagcacctatagta 31485  T
Q  109 gaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaatggagaagaaccagg 208  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||| || | |||||||||| ||||||||||||| |||  || |    
T  31486 gaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacccgtagatgccatggtaagaagagtagatcaaatggaggagagtcaag 31585  T
Q  209 ttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaac 308  Q
    |||||||| ||||||||||| | | |||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||| | |||||||||    
T  31586 ttaaaagatgtagaggaagacccaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaac 31685  T
Q  309 actatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 376  Q
    ||| |||  ||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  31686 actgtgaagtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttgt 31753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0018; HSP #2
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 91 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 44150 - 44080
Alignment:
Q  91 ggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacc 161  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||  |||||||| ||||| || ||| | |||||||||||||||||    
T  44150 ggggtagcacctatagtagaaaagatggcggaaaataggcttaggtggtttgggcatgtagagagaagacc 44080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0570 (Bit Score: 195; Significance: 1e-106; HSPs: 1)
Name: scaffold0570
Description:

Target: scaffold0570; HSP #1
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 50 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 1271 - 945
Alignment:
Q  50 tagacatgataggattaagaatgacatcattagagagaatgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgt 149  Q
    |||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| | |||||    
T  1271 tagacaggataggattatgaatgacaccattagagagagtgagggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttggccatgt 1172  T
Q  150 agagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaa 249  Q
    ||||||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||  ||  |||||||||||||||||||| ||| |||||| ||| |||||    
T  1171 agagagaagacccgtagatgccgtggtaagaagagtagatcaaatggagaagagtcaaattaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaa 1072  T
Q  250 accattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagt 349  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| | ||||||||||||||| | |||||||||||||||||| || || | |||||    
T  1071 accattaaaaaagatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagctgaccccatttagt 972  T
Q  350 gtgataatgcttggttgttgttgttgt 376  Q
    | ||||| |||||||||||||||||||    
T  971 gggataaggcttggttgttgttgttgt 945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0024 (Bit Score: 187; Significance: 1e-101; HSPs: 1)
Name: scaffold0024
Description:

Target: scaffold0024; HSP #1
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 15 - 373
Target Start/End: Original strand, 82643 - 83000
Alignment:
Q  15 gagatgatgatgttgcgctggatgagtggtaagactagacatgataggattaagaatgacatcattagagagaa--tgggggtagcacctatagtagaaa 112  Q
    ||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||   ||||||||||||||||||||||||    
T  82643 gagatgaggatgttgcactggatgagtagtaagactagacatgataggattaagaatgacaccattagagagagagtgggggtagcacctatagtagaaa 82742  T
Q  113 agttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaatggagaagaaccaggttaa 212  Q
    |||||||||||||| | |||||||||||| ||||| ||||||||||| || ||||| | || |||||||| | | ||||||||||| |||    ||||||    
T  82743 agttggtagaaaatgggcttagatgatttggacatatagagagaagatccatagatgcagtcgtaagaagggtatatcaaatggaggagagt--ggttaa 82840  T
Q  213 aagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacacta 312  Q
     ||||||||||||||| ||| |||||| ||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  82841 gagaggtagaggaagacctaggaaaactata-gagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatatgatttatgatagaacacta 82939  T
Q  313 tgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgt 373  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| || ||||| ||  |||| ||||||||||||||||    
T  82940 tgacgtcatttgatccatgtagccgaccccacttaatggaataaggcttggttgttgttgt 83000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0036 (Bit Score: 131; Significance: 9e-68; HSPs: 1)
Name: scaffold0036
Description:

Target: scaffold0036; HSP #1
Raw Score: 131; E-Value: 9e-68
Query Start/End: Original strand, 13 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 4634 - 4277
Alignment:
Q  13 cagagatgatgatgttgcgctggatgagtggtaagactagacatgataggattaagaatgacatcattagagagaatg---ggggtagcacctatagtag 109  Q
    |||| |||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||  |   ||||| |||||||||||||    
T  4634 cagatatgaggatgttgcgttggatgaatggtaagactagacatgataggattataaatgacaccattagagagagagagtggggtggcacctatagtag 4535  T
Q  110 aaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaatggagaagaaccaggt 209  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||||  ||| | |||||||| ||||||| ||||||  | || |||||||||| ||||||||||||| |||| || ||    
T  4534 aaaagttggtaaaaaataggcttagatagtttgggcatgtagaaagaagactcgtagaagctgtggtaagaagagtagatcaaatggaggagaatcaagt 4435  T
Q  210 taaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaaca 309  Q
    |||||||||||          || |||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| |||| |||||| | ||||||||    
T  4434 taaaagaggta----------taggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatctaaatttggtttataatagaaca 4345  T
Q  310 ctatgacatcatttgatccatgtagccga-tccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 376  Q
    ||||||| | ||||||||||||||| |||  || | ||| || ||||| |||||||| ||||||||||    
T  4344 ctatgacgttatttgatccatgtaggcgacccccatttaatgggataaggcttggttcttgttgttgt 4277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0041 (Bit Score: 125; Significance: 4e-64; HSPs: 1)
Name: scaffold0041
Description:

Target: scaffold0041; HSP #1
Raw Score: 125; E-Value: 4e-64
Query Start/End: Original strand, 205 - 373
Target Start/End: Original strand, 16692 - 16860
Alignment:
Q  205 caggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgata 304  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  16692 caggttaaaagaggtagaggaagacctaagaaaaccattcgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttttgata 16791  T
Q  305 gaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgt 373  Q
    |||||||||| | |||||||||| ||||||||||  | |||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  16792 gaacactatggcgtcatttgatctatgtagccgactccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 16860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0045 (Bit Score: 122; Significance: 2e-62; HSPs: 1)
Name: scaffold0045
Description:

Target: scaffold0045; HSP #1
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 15 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 86967 - 86606
Alignment:
Q  15 gagatgatgatgttgcgctggatgagtggtaagactagacatgataggattaagaatgacatcattagagagaatgggggtagcacctatagtagaaaag 114  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||| |||||  ||||||| |||||||||||  | | |    |   | ||||||||||    
T  86967 gagatgaggatgttgcgctggatgagtggtaagaccagaaaggataagattagaaatgacaccattagagagagagagagagagagagagagtagaaaag 86868  T
Q  115 ttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaa 214  Q
    |||||||||||||| |||||||  ||| |||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||| |||  ||||||||||    
T  86867 ttggtagaaaatagtcttagatagtttggacatgtaaagagaagacccgtagatgccgtcgtaagaagagtagatcaaatggaggagagtcaggttaaaa 86768  T
Q  215 gaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatg 314  Q
    |||||||| | ||| ||| ||||||  || ||||||||| |||||| |||||||||||| |   ||| |||||||||||| | | |||||||||||||||    
T  86767 gaggtagatggagacctaggaaaactgttagagaaaccactagaaaggatttagaggtcgacaggttggatccaaatatgatgtatgatagaacactatg 86668  T
Q  315 acatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 376  Q
    || | ||||||||||||||| ||   | |||||||| ||||   |||| |||||||||||||    
T  86667 acgtaatttgatccatgtagtcggctccacttagtgggatacgacttgtttgttgttgttgt 86606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0692 (Bit Score: 100; Significance: 3e-49; HSPs: 1)
Name: scaffold0692
Description:

Target: scaffold0692; HSP #1
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 161 - 376
Target Start/End: Original strand, 4706 - 4921
Alignment:
Q  161 ccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaa 260  Q
    |||||||| |||| |||||||||| |||||| |||||| |||   || |||||||||||||| ||||   || |||||||||  ||||||||||||||||    
T  4706 ccgtagatgccgtcgtaagaagagtagatcagatggaggagagtaagattaaaagaggtagatgaaggcgtaggaaaaccataagagaaaccattagaaa 4805  T
Q  261 agatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgct 360  Q
     |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| | | ||||||||| ||||||||| || |||| ||| ||||| |||    
T  4806 ggatttagacgtcaatgagttaaatccaaatatggtttatgatagaacactatggcgtaatttgatccgtgtagccgaccccactttgtgggataacgct 4905  T
Q  361 tggttgttgttgttgt 376  Q
    ||||||||||||||||    
T  4906 tggttgttgttgttgt 4921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0157 (Bit Score: 94; Significance: 1e-45; HSPs: 2)
Name: scaffold0157
Description:

Target: scaffold0157; HSP #1
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 219 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 25686 - 25529
Alignment:
Q  219 tagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacat 318  Q
    |||||||||| ||| |||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||| | ||||||||||||||||| |    
T  25686 tagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatgacgt 25587  T
Q  319 catttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 376  Q
    ||||| ||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  25586 catttaatccatgtagcggaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttgt 25529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0157; HSP #2
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 11 - 135
Target Start/End: Complemental strand, 25809 - 25683
Alignment:
Q  11 agcagagatgatgatgttgcgctggatgagtggtaagactagacatgataggattaagaatgacatcattaga--gagaatgggggtagcacctatagta 108  Q
    ||||||||| | ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||  |||| ||||||||||||||||||||    
T  25809 agcagagattaggatgttgtgttggatgagtggtaagactagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgggggtagcacctatagta 25710  T
Q  109 gaaaagttggtagaaaatagacttaga 135  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||    
T  25709 gaaaagttggtagaaaataggcttaga 25683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0113 (Bit Score: 92; Significance: 2e-44; HSPs: 2)
Name: scaffold0113
Description:

Target: scaffold0113; HSP #1
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 11 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 11962 - 11810
Alignment:
Q  11 agcagagatgatgatgttgcgctggatgagtggtaagactagacatgataggattaagaatgacatcattagagagaa----tgggggtagcacctatag 106  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||| |||||||     ||||||||||||||||||    
T  11962 agcagagatgaggatgttgcgctggatgagcggtaagactagacataataggattaggaatgacaccatcagagagagatagtgggggtagcacctatag 11863  T
Q  107 tagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaaga 159  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||| | |||||||| ||||||    
T  11862 tagaaaagttggtagaaaataggcttagatgatttgggcatgtagacagaaga 11810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0113; HSP #2
Raw Score: 81; E-Value: 7e-38
Query Start/End: Original strand, 133 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 11787 - 11546
Alignment:
Q  133 agatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaacta 232  Q
    ||||||||| | ||||||||| |||||||||||||| ||||  ||||||||| ||||||||||||  |||  || |||| |||||||||| ||| | |||    
T  11787 agatgatttgggcatgtagagcgaagacccgtagatgccgtcataagaagagtagatcaaatggatgagagtcaagttagaagaggtagacgaataccta 11688  T
Q  233 agaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgt 332  Q
     |||||| ||| |||||| | |||||||  ||||||| ||||||  ||| ||||||||| |||  |||||||||  |||||||| |||||||||||||||    
T  11687 ggaaaactattagagaaatcgttagaaagaatttagaagtcaattggttggatccaaatttgg--tttgatagagtactatgacgtcatttgatccatgt 11590  T
Q  333 agccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 376  Q
    |||||| || |||||||  ||||| | ||||||| |||||||||    
T  11589 agccgaccccacttagtaggataaggtttggttgctgttgttgt 11546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1318 (Bit Score: 74; Significance: 1e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold1318
Description:

Target: scaffold1318; HSP #1
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 245 - 374
Target Start/End: Original strand, 485 - 614
Alignment:
Q  245 gagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaac 344  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  | |||||| |||| | ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| || ||    
T  485 gagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttgtacccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccac 584  T
Q  345 ttagtgtgataatgcttggttgttgttgtt 374  Q
    |||||| ||||| ||||| |||||||||||    
T  585 ttagtgggataaggcttgattgttgttgtt 614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0199 (Bit Score: 68; Significance: 4e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold0199
Description:

Target: scaffold0199; HSP #1
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 245 - 376
Target Start/End: Original strand, 14737 - 14868
Alignment:
Q  245 gagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaac 344  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||| |||| |||||||||| | | ||||||||||||||||| | || ||    
T  14737 gagaaaccattagaaaggatttaaaggtcaatgagttggattcaaatatggtttatgattgaacactatggcgtaatttgatccatgtagccaaccccac 14836  T
Q  345 ttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 376  Q
     ||||| |||||  ||||||||||||||||||    
T  14837 gtagtgggataaatcttggttgttgttgttgt 14868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0168 (Bit Score: 58; Significance: 3e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0168
Description:

Target: scaffold0168; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 283 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 28979 - 28886
Alignment:
Q  283 gatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 376  Q
    ||||||||| |||| | ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  28979 gatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttgt 28886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0050 (Bit Score: 47; Significance: 1e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0050
Description:

Target: scaffold0050; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 214 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 58385 - 58223
Alignment:
Q  214 agaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactat 313  Q
    ||||| ||||||||| |||  ||||| ||  |||||||  |||| ||| | || ||| |||||||||| || | | ||||||||| |||||||||| |||    
T  58385 agaggcagaggaagacctagaaaaacgataagagaaactgttaggaaaaacttggagatcaatgagttggaccaagatatggtttatgatagaacattat 58286  T
Q  314 gacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 376  Q
    | | | ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||  || ||||||||||    
T  58285 gtcgtaatttgatccatgtagccgacccaacttagtgggataaggcttcattattgttgttgt 58223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0171 (Bit Score: 46; Significance: 5e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0171
Description:

Target: scaffold0171; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 231 - 371
Target Start/End: Original strand, 7580 - 7720
Alignment:
Q  231 taagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccat 330  Q
    ||||||||| ||  || |||| ||||||||||||| |||||||| | |||| ||| |||||||||||   |||||||||||||| | | |||||||||||    
T  7580 taagaaaactataagataaactattagaaaagattcagaggtcatttagttggattcaaatatggttcacgatagaacactatggcgtaatttgatccat 7679  T
Q  331 gtagccgatc-caacttagtgtgataatgcttggttgttgtt 371  Q
    | |||| ||| | |||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  7680 gcagcc-atctccacttagtgggataaagcttggttgttgtt 7720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1259 (Bit Score: 42; Significance: 0.00000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold1259
Description:

Target: scaffold1259; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 245 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 1647 - 1519
Alignment:
Q  245 gagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaac 344  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||  |   |||| |  ||||||||| |||||| | |||||||| ||||||| || || ||    
T  1647 gagaaactattagaaaagatttaaaggttaatgagttagatctga---tggtatgagatagaacattatgacgtaatttgatcaatgtagctgaccccac 1551  T
Q  345 ttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 376  Q
    ||| |  ||||| |||||||||||||||||||    
T  1550 ttattaagataaagcttggttgttgttgttgt 1519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0010
Description:

Target: scaffold0010; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 245 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 160452 - 160325
Alignment:
Q  245 gagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaac 344  Q
    ||||||| ||||| ||||||| |||  | |||||||| || | ||||||||||| |||||||||| |||| | | ||||||  ||||||||| | || ||    
T  160452 gagaaactattaggaaagattaagaaattaatgagttcgaccgaaatatggtttatgatagaacattatggcgtaatttgaatcatgtagccaaccccac 160353  T
Q  345 ttagtgtgataatgcttggttgttgttg 372  Q
    |||||| || || |||||||||||||||    
T  160352 ttagtgggaaaaggcttggttgttgttg 160325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0245 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0245
Description:

Target: scaffold0245; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 285 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 16524 - 16438
Alignment:
Q  285 tccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgtt 371  Q
    |||||||||||||| |||||||||| |||| ||| ||||||||||||| ||||| || ||| |||  ||||| |||| |||||||||    
T  16524 tccaaatatggtttatgatagaacattatggcataatttgatccatgtggccgaccccactcagttggataaggcttagttgttgtt 16438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0392 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0392
Description:

Target: scaffold0392; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 288 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 6857 - 6771
Alignment:
Q  288 aaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgtt 374  Q
    ||||||||| | ||||| |||| |||| ||| ||||||||||||||||| | || |||||||| ||||| |||||| |||| |||||    
T  6857 aaatatggtatatgatataacattatggcataatttgatccatgtagccaaccccacttagtgggataaggcttggctgttattgtt 6771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0221 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0221
Description:

Target: scaffold0221; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 323 - 376
Target Start/End: Original strand, 19149 - 19202
Alignment:
Q  323 tgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 376  Q
    ||||||| |||||||| || |||||||| ||||| | |||||||||||||||||    
T  19149 tgatccacgtagccgaccccacttagtgagataaagtttggttgttgttgttgt 19202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0025
Description:

Target: scaffold0025; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 253 - 309
Target Start/End: Original strand, 39481 - 39537
Alignment:
Q  253 attagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaaca 309  Q
    ||||| ||||||||||| |  |||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||    
T  39481 attaggaaagatttagatggtaatgagttggatccaaatgtggtttatgatagaaca 39537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University