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 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF9658_low_1 (Length: 756)

Name: NF9658_low_1
Description: NF9658
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF9658_low_1
NF9658_low_1
[»] chr3 (4 HSPs)
chr3 (20-738)||(40146420-40147137)
chr3 (47-557)||(8103025-8103537)
chr3 (20-240)||(40409413-40409631)
chr3 (593-734)||(8102812-8102953)
[»] chr4 (7 HSPs)
chr4 (20-560)||(7637613-7638155)
chr4 (20-560)||(7629167-7629709)
chr4 (56-560)||(7615778-7616284)
chr4 (325-592)||(7655475-7655742)
chr4 (20-565)||(7606777-7607324)
chr4 (54-220)||(7655205-7655371)
chr4 (623-661)||(39082796-39082834)
[»] chr7 (3 HSPs)
chr7 (20-592)||(8935132-8935706)
chr7 (36-485)||(8934207-8934655)
chr7 (279-416)||(8929994-8930131)
[»] chr6 (3 HSPs)
chr6 (20-559)||(6501058-6501595)
chr6 (304-464)||(11969553-11969713)
chr6 (589-647)||(11969370-11969428)


Alignment Details
Target: chr3 (Bit Score: 687; Significance: 0; HSPs: 4)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 687; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 20 - 738
Target Start/End: Original strand, 40146420 - 40147137
Alignment:
Q  20 atgggatctccggtacctactaattgcacccaccaaaaagggtcttctttatcaccatcctctagtgccaaaccaaattcaacatctgaaacactctcta 119  Q
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T  40146420 atgggatctccggtacctactaattgcacccaccaaaaagggtcttctttatcaccatcctctagtgccaaaccaaattcaacatctgaaacactctcta 40146519  T
Q  120 tcttctacccttgcctttttcccaccacttgcaggccgtctagaaataacagatcacaaggacaacaccgtttcatgttccgtcacatgcaacaatgcag 219  Q
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T  40146520 tcttctacccttgcctttttcccaccacttgcaggccgtctagaaataacagatcacaaggacaacaccgtttcatgttccgtcacatgcaacaatgcag 40146619  T
Q  220 gcgcgctctttgtccatgccgcggcagagaaacacttgtgtaggtgacatacttggatgcacctacgttcctcccatcgtcgattcattttttccattaa 319  Q
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T  40146620 gcgcgctctttgtccatgctgcggcagagaa-cacttgtgtaggtgacatacttggatgcacctacgttcctcccatcgtcgattcattttttccattaa 40146718  T
Q  320 ccagagttaaaaattacgaaggcacatcacaaccattgttagttgtgcaagtgacagagttagttgacggcttcttcattggttttacatttaaccatgc 419  Q
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T  40146719 ccagagttaaaaattacgaaggcacatcacaaccattgttagctgtgcaagtgacagagttagttgacggcttcttcattggttttacatttaaccatgc 40146818  T
Q  420 ggttgttgacggagagtccacatggcttttcattaactcatgggcgaaaatctcgcgtggttgttgcaatcaagtatccaaactcataacgctagaacgt 519  Q
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T  40146819 ggttgttgacggagagtccacatggcttttcattaattcatgggcgaaaatctcgcgtggttgttgcaatcaagtatccaaactcataacgctagaacgt 40146918  T
Q  520 tggtttccaagtggtattcaacatcccatacgatttccttttactatagagtcacaaaagaatgactctgatgataacgaaaaattcaattcatcagaga 619  Q
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T  40146919 tggtttccaagtggtattcaacatcccatacgatttccttttactatagagccacaaaagaatgactctgatgataacgaaaagttcaatccatcagaga 40147018  T
Q  620 ggttattccatttcacaaaggagaaaatcgctcaactgaaattgaaagccaacatggagattggtaccaacaaaatatcatccctccaatcactttttac 719  Q
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T  40147019 ggttattccatttcacaaaggagaaaatcgctcaactgaaattgaaagccaacatggagattggtaccaacaaaatatcatccctccaatcactttttac 40147118  T
Q  720 acatctttggcgctctgtg 738  Q
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T  40147119 acatctttggcgctctgtg 40147137  T

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Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 47 - 557
Target Start/End: Complemental strand, 8103537 - 8103025
Alignment:
Q  47 acccaccaaaaagggtcttctttatcaccatcctctagtgccaaaccaaattcaacatctgaaacactctctatcttctacccttgcctttttcccacca 146  Q
    ||||||| | |||||||| ||||| ||||||||||||| | |||||||||||| ||| || ||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||||| |    
T  8103537 acccacccataagggtctcctttaccaccatcctctagagtcaaaccaaattccacagctaaaacaatctctatcatctactcttgcttttttcccacta 8103438  T
Q  147 cttgcaggccgtctagaaataacagatcacaaggacaacaccgtttcatgttccgtcacatgcaacaatgcaggcgcgctctttgtccatgccgcggcag 246  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||  | ||||||||| | || ||||| ||||| ||||||||||| || |  ||||||||||||||  |  | |    
T  8103437 cttgcaggccgtctagaaataacagaccatgaagacaacaccatgtcgtgttcggtcacgtgcaacaatgccggtgtactctttgtccatgctacaactg 8103338  T
Q  247 agaaacacttgtgtaggtgacatacttggatgcacctacgttcctcccatcgtcgattcattttttccattaaccagagttaaaaattacgaaggcacat 346  Q
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T  8103337 ag-aacacttgtgtaggtgacatacttggatgcacctatattcctcccattctcaattcattttatccactgaacggaatcaaaaactacgaaggcacat 8103239  T
Q  347 cacaaccattgttagttgtgcaagtgacagagttagttgacggcttcttcattggttttacatttaaccatgcggttgttgacggagagtccacatggct 446  Q
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T  8103238 cacaaccattgtttgccgtgcaagtgacagagttagttgacggcatctttattggttttacttttaaccatgtggttgttgatggaacttcggcatggta 8103139  T
Q  447 tttcattaactcatgggcgaaaatctcgc---gtggttgttgcaatcaagtatccaaactcataacgctagaacgttggtttccaagtggtattcaacat 543  Q
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T  8103138 tttcattaattcgtgggctgaaatctcacgtggtggttgttgcaatcaaacatccaaactctcaacacttgaacgttggtttccagatggtattcaatgt 8103039  T
Q  544 cccatacgatttcc 557  Q
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T  8103038 cccatacgatttcc 8103025  T

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Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 138; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 20 - 240
Target Start/End: Original strand, 40409413 - 40409631
Alignment:
Q  20 atgggatctccggtacctactaattgcacccaccaaaaagggtcttctttatcaccatcctctagtgccaaaccaaattcaacatctgaaacactctcta 119  Q
    ||||||||||| || ||||||| |||||| ||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40409413 atgggatctccagttcctactagttgcacgcaccaaaaag--tcttcttcatcaccatcctctagtgccaaaccaaattcaacatctgaaacactctcta 40409510  T
Q  120 tcttctacccttgcctttttcccaccacttgcaggccgtctagaaataacagatcacaaggacaacaccgtttcatgttccgtcacatgcaacaatgcag 219  Q
    || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| || || ||||||||| |||| ||||  |||||||||||||||||||    
T  40409511 tcctctgcccttgcctttttcccaccacttgcaggccgtctagagagaacagaccataaagacaacaccatttcgtgttgtgtcacatgcaacaatgcag 40409610  T
Q  220 gcgcgctctttgtccatgccg 240  Q
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T  40409611 gtgcgctctttgtgcatgccg 40409631  T

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Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 593 - 734
Target Start/End: Complemental strand, 8102953 - 8102812
Alignment:
Q  593 ataacgaaaaattcaattcatcagagaggttattccatttcacaaaggagaaaatcgctcaactgaaattgaaagccaacatggagattggtaccaacaa 692  Q
    ||||||||||| ||||  ||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| | || |  ||||| |||||    
T  8102953 ataacgaaaaactcaacccatcagttaggttatttcatttcacaaaggagaaaatctctcaattgaaattgaaagccaacttagaaacgggtacgaacaa 8102854  T
Q  693 aatatcatccctccaatcactttttacacatctttggcgctc 734  Q
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T  8102853 aatatcttcccttcaagcactttttgcacacctttggtgctc 8102812  T

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Target: chr4 (Bit Score: 93; Significance: 7e-45; HSPs: 7)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 93; E-Value: 7e-45
Query Start/End: Original strand, 20 - 560
Target Start/End: Complemental strand, 7638155 - 7637613
Alignment:
Q  20 atgggatctccggtacctactaattgcacccaccaaaaagggtcttctttatcaccatcctctagtgccaaaccaaattcaacatctgaaacactctcta 119  Q
    ||||||||||||||| |||||  ||  | ||| ||||||||| |||||||||| ||||||  | ||  | |||||||| ||||  |||| |||||||||     
T  7638155 atgggatctccggtatctacttgttttaaccaacaaaaagggccttctttatcgccatccggttgtagctaaccaaatccaacggctgagacactctctg 7638056  T
Q  120 tcttctacccttgcctttttcccaccacttgcaggccgtctagaaataacagatcacaaggacaacaccgtttcatgttccgtcacatgcaacaatgcag 219  Q
    || ||  ||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||  ||||||| || ||||  |||||||| ||||| |||||||| | ||||||||||||||    
T  7638055 tcctcagcccttgcctttttccaacctcttgccggccgtctcaaaataacggaacacagagacaacactgtttcgtgttccgttatatgcaacaatgcag 7637956  T
Q  220 gcgcgctctttgtccatgccgcggcagagaaacacttgtgtaggtgacatacttggatgcacctacgttcctcccatcgtcgattcattttttccattaa 319  Q
    | |  ||||||||||||||||| |||||| || |||||||| |  ||||| || | |  ||||||||| ||||| || || |||| ||| ||| | |||     
T  7637955 gtgtactctttgtccatgccgcagcagag-aatacttgtgttgcagacatcctagaacccacctacgtacctccaattgttgatttattatttgctttat 7637857  T
Q  320 ccagagttaaaaattacgaaggcacatcacaaccattgttagttgtgcaagtgacagagttagttgacggcttcttcattggttttacatttaaccatgc 419  Q
    ||  ||| | ||  || |||||||||||| |||||||||| |  || ||||| || ||| ||||||||||  | ||||||||||   ||||||||||||     
T  7637856 ccgaagtaagaagctatgaaggcacatcaaaaccattgttggcagttcaagtaacggagctagttgacggtattttcattggttgctcatttaaccatgt 7637757  T
Q  420 ggttgttgacggagagtccacatggcttttcattaactcatgggcgaaaatctcgcgtggttgttg-ca--atcaagtatccaaactcataacgctagaa 516  Q
     || ||||||||| |||||   |||| |||||| || || |||||  ||||||| ||| ||||||| ||  ||||| |||| |||| |  ||| |||||     
T  7637756 tgtcgttgacggaaagtccgtgtggcatttcatcaattcctgggctgaaatctcacgtagttgttgtcatcatcaaatatctaaacccccaacactagag 7637657  T
Q  517 cgttggtttccaagtggtattcaacatcccatacgatttccttt 560  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||  || ||||||||||||||    
T  7637656 cgttggtttccaaatggtgttcaacggcctatacgatttccttt 7637613  T

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Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 20 - 560
Target Start/End: Complemental strand, 7629709 - 7629167
Alignment:
Q  20 atgggatctccggtacctactaattgcacccaccaaaaagggtcttctttatcaccatcctctagtgccaaaccaaattcaacatctgaaacactctcta 119  Q
    |||||||||||| |  |||||  || || ||| ||||||||| |||||||||| ||||||  | ||  ||| |||||| ||||  |||| ||||||||||    
T  7629709 atgggatctccgctttctacttgtttcaaccaacaaaaagggccttctttatcgccatccggttgtagcaacccaaatccaacggctgagacactctcta 7629610  T
Q  120 tcttctacccttgcctttttcccaccacttgcaggccgtctagaaataacagatcacaaggacaacaccgtttcatgttccgtcacatgcaacaatgcag 219  Q
    || ||| ||||| ||||||| | ||| ||||| |||||||| |||||||| || ||||||||||| || || || ||||| || | ||||||||||||||    
T  7629609 tcctctgccctttccttttttcaacctcttgctggccgtcttgaaataacggaacacaaggacaatactgtctcgtgttctgttatatgcaacaatgcag 7629510  T
Q  220 gcgcgctctttgtccatgccgcggcagagaaacacttgtgtaggtgacatacttggatgcacctacgttcctcccatcgtcgattcattttttccattaa 319  Q
    | |  |||||| |||| || || || ||| || |||||||| | |||||| || | |     |||||| ||||  || ||||||||| | ||| | || |    
T  7629509 gtgtactctttatccacgctgcagccgag-aatacttgtgttgctgacatcctagaaccggtctacgtacctcaaattgtcgattcactatttgccttta 7629411  T
Q  320 ccagagttaaaaattacgaaggcacatcacaaccattgttagttgtgcaagtgacagagttagttgacggcttcttcattggttttacatttaaccatgc 419  Q
       ||| |||||  ||||||||||| ||| |||||||||| | ||| ||||| || ||| ||||||||||  |||| |||||||  ||||| |||||||     
T  7629410 taggagataaaagctacgaaggcacgtcaaaaccattgttggctgttcaagtaacggagctagttgacggtgtctttattggttgcacattcaaccatgt 7629311  T
Q  420 ggttgttgacggagagtccacatggcttttcattaactcatgggcgaaaatctcgcgtggttgttg-ca--atcaagtatccaaactcataacgctagaa 516  Q
     |||||||||||| |||||   |||| |||||| || ||||||||  ||||||| ||| ||||||| ||  ||||| |||| ||||    |||    |||    
T  7629310 tgttgttgacggaaagtccgtgtggcatttcatcaattcatgggctgaaatctcacgtagttgttgtcatcatcaaatatctaaacctccaacatctgaa 7629211  T
Q  517 cgttggtttccaagtggtattcaacatcccatacgatttccttt 560  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  7629210 cgttggtttccaaatggtattcaacttcccatacgatttccttt 7629167  T

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Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 73; E-Value: 6e-33
Query Start/End: Original strand, 56 - 560
Target Start/End: Complemental strand, 7616284 - 7615778
Alignment:
Q  56 aaagggtcttctttatcaccatcctctagtgccaaaccaaattcaacatctgaaacactctctatcttctacccttgcctttttcccaccacttgcaggc 155  Q
    ||||||||||||||||||||||||  | |   | |||||||| ||||  |||| ||||||| | || ||| ||||||||||||||| ||| ||| | |||    
T  7616284 aaagggtcttctttatcaccatccagttgaagctaaccaaatccaacggctgagacactctttgtcctctgcccttgcctttttccaacctctttccggc 7616185  T
Q  156 cgtctagaaataacagatcacaaggacaacaccgtttcatgttccgtcacatgcaacaatgcaggcgcgctctttgtccatgccgcggcagagaaacact 255  Q
    |||||  ||||||| || ||||| ||||||||||| || ||||| || | ||||||||||||||| |  |||||| ||||||| || || ||| || |||    
T  7616184 cgtctcaaaataacggagcacaatgacaacaccgtctcgtgttctgttatatgcaacaatgcaggtgtactctttatccatgctgcagctgag-aatact 7616086  T
Q  256 tgtgtaggtgacatacttggatgcacctacgttcctcccatcgtcgattcattttttccattaaccagagttaaaaattacgaaggcacatcacaaccat 355  Q
    ||||| | |||||| || | |   ||||| || ||||| || || |||||||||||  | |||||| | ||| |||  ||||||||||| ||| |||| |    
T  7616085 tgtgttgctgacatcctagaacctacctatgtacctccaattgttgattcatttttcgctttaaccggggttgaaagctacgaaggcacctcaaaaccgt 7615986  T
Q  356 tgttagttgtgcaagtgacagagttagttgacggcttcttcattggttttacatttaaccatgcggttgttgacggagagtccacatggcttttcattaa 455  Q
    |||| |  || ||||| || ||| ||||||||||  | || |||||||   | || |||||||  || ||||||||||||||    |||| |||||| ||    
T  7615985 tgttggcagttcaagtaacggagctagttgacggtatttttattggttgctcgttcaaccatgttgtcgttgacggagagtctgtgtggcatttcatcaa 7615886  T
Q  456 ctcatgggcgaaaatctcgcgtggttgttg-ca--atcaagtatccaaactcataacgctagaacgttggtttccaagtggtattcaacatcccatacga 552  Q
     ||||||||  |||| || ||| ||||||| ||  ||||| |||| |||| |  ||| ||||| ||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||    
T  7615885 ttcatgggctgaaatatcacgtagttgttgtcatcatcaaatatctaaacccccaacactagagcgttggtttccaaatggtgttcaacagcccatacga 7615786  T
Q  553 tttccttt 560  Q
    ||||||||    
T  7615785 tttccttt 7615778  T

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Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 325 - 592
Target Start/End: Original strand, 7655475 - 7655742
Alignment:
Q  325 gttaaaaattacgaaggcacatcacaaccattgttagttgtgcaagtgacagagttagttgacggcttcttcattggttttacatttaaccatgcggttg 424  Q
    |||| ||| ||||||||||||||| |||||||||| | ||| ||||| || ||| ||||||||||| |||||||||| ||||  || |||||||  || |    
T  7655475 gttagaaactacgaaggcacatcaaaaccattgttggctgttcaagtcacggagctagttgacggcatcttcattggctttaatttcaaccatgtcgtag 7655574  T
Q  425 ttgacggagagtccacatggcttttcattaactcatgggcgaaaatctcgcgtggttgttgcaatcaagtatccaaactcataacgctagaacgttggtt 524  Q
     ||||||| ||||||| |||| |||||| || || |||||  |||| || |||||||||    ||||| |||| ||   |  |||||| || ||||||||    
T  7655575 ctgacggacagtccacgtggcatttcatcaattcgtgggctgaaatgtcacgtggttgtcatcatcaaatatctaactccccaacgctggagcgttggtt 7655674  T
Q  525 tccaagtggtattcaacatcccatacgatttccttttactatagagtcacaaaagaatgactctgatg 592  Q
    ||||| ||| |||||||  || |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  7655675 tccaaatggaattcaacgacctatacgatttcctttaactatagagccacaaaagaatcactctgatg 7655742  T

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Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 63; E-Value: 5e-27
Query Start/End: Original strand, 20 - 565
Target Start/End: Complemental strand, 7607324 - 7606777
Alignment:
Q  20 atgggatctccggtacctactaattgcacccaccaaaaagggtcttctttatcaccatcctctagtgccaaaccaaattcaacatctgaaacactctcta 119  Q
    |||||||||||| |  |||||  || || ||| ||||||||| ||||||||||| |||||  | ||  ||| |||||| ||||   ||| ||||||||||    
T  7607324 atgggatctccgttttctacttgtttcaaccaacaaaaagggccttctttatcatcatccggtggttgcaacccaaatccaacggttgagacactctcta 7607225  T
Q  120 tcttctacccttgcctttttcccaccacttgcaggccgtctagaaataacagatcacaaggacaacaccgtttcatgttccgtcacatgcaacaatgcag 219  Q
    || ||| ||||| ||||||||| ||| ||||| ||||| || |||||||| || || |  |||||||  || ||||||||||| | |||||| |||||||    
T  7607224 tcctctgccctttcctttttccaacctcttgccggccgccttgaaataacggaacatagagacaacattgtctcatgttccgttatatgcaataatgcag 7607125  T
Q  220 gcgcgctctttgtccatgccgcggcagagaaacacttgtgtaggtgacatacttggatgcacctacgttcctcccatcgtcgattcattttttccattaa 319  Q
    | |  |||||| |||| || |  ||||||||  | | |||| | |||||| || | |     |||||| ||||  || ||||||||||||||| | || |    
T  7607124 gtgtactctttatccacgctgtagcagagaat-attcgtgttgctgacatcctggaaccggtctacgtacctctaattgtcgattcattttttgccttca 7607026  T
Q  320 ccagagttaaaaattacgaaggcacatcacaaccattgttagttgtgcaagtgacagagttagttgacggcttcttcattggttttacatttaaccatgc 419  Q
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T  7607025 tcggagataaaaactatgaaggcacgtcaaaaccattgttggctgttcaaataacggagctagttgacggtattttcattggttgctccttcaaccatgt 7606926  T
Q  420 ggttgttgacggagagtccacatggcttttcattaactcatgggcgaaaatctcgcgtggttgttgca---atcaagtatccaaactcataacgctagaa 516  Q
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T  7606925 tgtcgttgacggaaagtccgtgtggcatttcatcaattcatgggctgaaatatcacgcggttgttgtggtgatcaaatatccaaacccccaacactagag 7606826  T
Q  517 cgttggtttccaagtggtattcaacatcccatacgatttccttttacta 565  Q
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T  7606825 cgttggtttccaaatggtattcaacttcccatacgatttcctttcacta 7606777  T

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Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 54 - 220
Target Start/End: Original strand, 7655205 - 7655371
Alignment:
Q  54 aaaaagggtcttctttatcaccatcctctagtgccaaaccaaattcaacatctgaaacactctctatcttctacccttgcctttttcccaccacttgcag 153  Q
    ||||| || |||||||||||||||||| |||   || ||||||||||||  |||| ||||||| |||| ||  ||||| ||||||||| ||| ||||| |    
T  7655205 aaaaaaggccttctttatcaccatcctttagcatcagaccaaattcaacggctgacacactctttatcctcagccctttcctttttccaacctcttgccg 7655304  T
Q  154 gccgtctagaaataacagatcacaaggacaacaccgtttcatgttccgtcacatgcaacaatgcagg 220  Q
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T  7655305 gtcgtctcaaaattacagaacacgaagacagcattgtctcgtgttctgtaacatgcaataatgcagg 7655371  T

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Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 623 - 661
Target Start/End: Complemental strand, 39082834 - 39082796
Alignment:
Q  623 tattccatttcacaaaggagaaaatcgctcaactgaaat 661  Q
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T  39082834 tattccatttcacaaaggagaaaatcgcggaactgaaat 39082796  T

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Target: chr7 (Bit Score: 89; Significance: 2e-42; HSPs: 3)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 89; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 20 - 592
Target Start/End: Original strand, 8935132 - 8935706
Alignment:
Q  20 atgggatctccggtacctactaattgcacccaccaaaaagggtcttctttatcaccatcctctagtgccaaaccaaattcaacatctgaaacactctcta 119  Q
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T  8935132 atgggatctccggtcactacttattccaaccaacaaaaagggccttttttatcaccatccggttgtatctaaccaaatccaacggctgagacactctcta 8935231  T
Q  120 tcttctacccttgcctttttcccaccacttgcaggccgtctagaaataacagatcacaaggacaacaccgtttcatgttccgtcacatgcaacaatgcag 219  Q
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T  8935232 tcttcaacccttgcctttttccaacctcttgccggccgtctcaaaataacggaataccaagacaaaactgtctcgtgctccgttatatgcaacaatgcag 8935331  T
Q  220 gcgcgctctttgtccatgccgcggcagagaaacacttgtgtaggtgacatacttggatgcacctacgttcctcccatcgtcgattcattttttccattaa 319  Q
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T  8935332 gtgtactctttgtccatgccagatcagag-aatacttgtgttgctgacattctagaacccacctacgtaccaccaattgttgattcattttttgctttaa 8935430  T
Q  320 ccagagttaaaaattacgaaggcacatcacaaccattgttagttgtgcaagtgacagagttagttgacggcttcttcattggttttacatttaaccatgc 419  Q
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T  8935431 ccgatgttagaagctacgaaggcacatcaaaaccattgttggcagttcaagtaactgagttaattgacggtattttcattggttgctcatttaaccacgc 8935530  T
Q  420 ggttgttgacggagagtccacatggcttttcattaactcatgggcgaaaatctcgcgtggttgttg-ca--atcaagtatccaaactcataacgctagaa 516  Q
     ||  |||||||| ||||    |||| |||||| || || |||||  ||||||| ||| ||||||| ||  ||||| |||| ||||    ||| ||||||    
T  8935531 tgtcattgacggaaagtctgtgtggcatttcatcaattcttgggctgaaatctcacgtagttgttgtcatcatcaaatatctaaacctccaacactagaa 8935630  T
Q  517 cgttggtttccaagtggtattcaacatcccatacgatttccttttactatagagtcacaaaagaatgactctgatg 592  Q
    |||||||||||   |||| ||||||  || |||||||||||||| ||| | |||  |||||||||| |||||||||    
T  8935631 cgttggtttccggatggtgttcaacggccaatacgatttcctttcactttggagcaacaaaagaatcactctgatg 8935706  T

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Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 70; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 36 - 485
Target Start/End: Original strand, 8934207 - 8934655
Alignment:
Q  36 ctactaattgcacccaccaaaaagggtcttctttatcaccatcctctagtgccaaaccaaattcaacatctgaaacactctctatcttctacccttgcct 135  Q
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T  8934207 ctacttattccaaccaacaaaaagggccttctttattaccatccggttgtatctaaccaaatccaacagctaagacactctctatcttcaacccttgcct 8934306  T
Q  136 ttttcccaccacttgcaggccgtctagaaataacagatcacaaggacaacaccgtttcatgttccgtcacatgcaacaatgcaggcgcgctctttgtcca 235  Q
    |||||| ||| ||||  || |||||  ||||||| ||  || | ||||| || || || || ||||| | ||||||||||||||  |  |||||||||||    
T  8934307 ttttccaacctcttgtcggtcgtctcaaaataacggaataccaagacaaaactgtctcgtgctccgttatatgcaacaatgcagatgtactctttgtcca 8934406  T
Q  236 tgccgcggcagagaaacacttgtgtaggtgacatacttggatgcacctacgttcctcccatcgtcgattcattttttccattaaccagagttaaaaatta 335  Q
    ||||    ||||| || |||||||| | |||||| || | |  ||||||||| ||||| || || |||||||||||| | |||||| | |||| ||  ||    
T  8934407 tgccagatcagag-aatacttgtgttgctgacattctagaacccacctacgtacctccaattgttgattcattttttgctttaaccggtgttagaagcta 8934505  T
Q  336 cgaaggcacatcacaaccattgttagttgtgcaagtgacagagttagttgacggcttcttcattggttttacatttaaccatgcggttgttgacggagag 435  Q
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T  8934506 cgaaggcacatcaaaaccattgttggcagttcaagtaacggagttaattgacggtattttcattggttgctcatttaaccacgctgtcattgacggaaag 8934605  T
Q  436 tccacatggcttttcattaactcatgggcgaaaatctcgcgtggttgttg 485  Q
    ||    |||| |||||| || ||||||||  ||||||| ||| |||||||    
T  8934606 tctgtgtggcatttcatcaattcatgggctgaaatctcacgtagttgttg 8934655  T

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Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 279 - 416
Target Start/End: Original strand, 8929994 - 8930131
Alignment:
Q  279 cacctacgttcctcccatcgtcgattcattttttccattaaccagagttaaaaattacgaaggcacatcacaaccattgttagttgtgcaagtgacagag 378  Q
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T  8929994 cacctacgtacctccaattgttgattcattttttgctttaaccggtgttagaagctacgaagtcacatcaaaaccattgttggcatttcaagtaactgag 8930093  T
Q  379 ttagttgacggcttcttcattggttttacatttaacca 416  Q
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T  8930094 ttaattgacggtattttcattggttgctcatttaacca 8930131  T

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Target: chr6 (Bit Score: 88; Significance: 7e-42; HSPs: 3)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 88; E-Value: 7e-42
Query Start/End: Original strand, 20 - 559
Target Start/End: Complemental strand, 6501595 - 6501058
Alignment:
Q  20 atgggatctccggtacctactaattgcacccaccaaaaagggtcttctttatcaccatcctctagtgccaaaccaaattcaacatctgaaacactctcta 119  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||  |||||| | ||| ||||| || ||||    ||||||||  |||  || | ||||||| ||    
T  6501595 atgggatctccagttcctactaattgcacccaccaaaataggtcttttctatgaccattctttagtagtcaaccaaatagaacgccttagacactcttta 6501496  T
Q  120 tcttctacccttgcctttttcccaccacttgcaggccgtctagaaataacagatcacaaggacaacaccgtttcatgttccgtcacatgcaacaatgcag 219  Q
    || |||  |||||||||||||| ||||||||| ||||||||  |||| || ||  || | |||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  6501495 tcctctgtccttgcctttttccaaccacttgcgggccgtctcaaaatgacggaaaacgaagacaacaatgtttcatgttccatcacatgcaacaatgcag 6501396  T
Q  220 gcgcgctctttgtccatgccgcggcagagaaacacttgtgtaggtgacatacttggatgcacctacgttcctcccatcgtcgattcattttttccattaa 319  Q
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T  6501395 gtgtactctttgtccacgctgcaatagag-gacacacgtgatgttgacatcgttggacccacctaccttcctcttatcgtccattcattttttcctttca 6501297  T
Q  320 ccagagttaaaaattacgaaggcacatcacaaccattgttagttgtgcaagtgacagagttagttgacggcttcttcattggttttacatttaaccatgc 419  Q
     | | | || ||| |||||||||| |||| |||||||| | |  |||||||||||||||||||||| |||  |||| ||||| |||| ||| |||||||     
T  6501296 acggggctagaaactacgaaggcatatcaaaaccattgcttgcagtgcaagtgacagagttagttggcggtgtctttattgggtttagattcaaccatgt 6501197  T
Q  420 ggttgttgacggagagtccacatggcttttcattaactcatgggcgaaaatctcgcgtggttgttgcaatcaagtatccaaactcataacgctagaacgt 519  Q
    |||   ||  ||| ||||||  |||| ||| || |  || |||||  |||| || ||||||||||| |||||| |||||||||||  | | |||||||||    
T  6501196 ggtcactggtggaaagtccatgtggcattttatcagttcctgggctgaaatttcacgtggttgttgtaatcaaatatccaaactcccatcactagaacgt 6501097  T
Q  520 tggtttccaagtggtattcaacatcccatacgatttcctt 559  Q
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T  6501096 t-gtttccaaatgatattcagcgttccatacgatttcctt 6501058  T

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Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 304 - 464
Target Start/End: Complemental strand, 11969713 - 11969553
Alignment:
Q  304 tcattttttccattaaccagagttaaaaattacgaaggcacatcacaaccattgttagttgtgcaagtgacagagttagttgacggcttcttcattggtt 403  Q
    |||||||||||| | | | |||||| ||| || ||||| |||||| | |||||| | |  || ||||| |||||||||||||| ||| |||||||||| |    
T  11969713 tcattttttccacttaacggagttagaaactatgaagggacatcagagccattgcttgcagtccaagtaacagagttagttgatggcatcttcattggct 11969614  T
Q  404 ttacatttaaccatgcggttgttgacggagagtccacatggcttttcattaactcatgggc 464  Q
    ||||| | || ||||  |  |||||||||| |||||| |||| |||||| || ||||||||    
T  11969613 ttacaatcaatcatgtcgccgttgacggagtgtccacttggcatttcatcaattcatgggc 11969553  T

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Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 589 - 647
Target Start/End: Complemental strand, 11969428 - 11969370
Alignment:
Q  589 gatgataacgaaaaattcaattcatcagagaggttattccatttcacaaaggagaaaat 647  Q
    ||||| || |||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  11969428 gatgaaaaagaaaaactcaatccaccagagaggttattccatttcacaaagcagaaaat 11969370  T

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