View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF9661A_low_30 (Length: 384)

Name: NF9661A_low_30
Description: NF9661A
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF9661A_low_30
NF9661A_low_30
[»] chr1 (30 HSPs)
chr1 (12-235)||(44241355-44241579)
chr1 (13-235)||(29001730-29001953)
chr1 (9-235)||(9869100-9869327)
chr1 (12-235)||(31072316-31072540)
chr1 (13-235)||(6238654-6238877)
chr1 (13-235)||(39053338-39053561)
chr1 (13-235)||(39059710-39059933)
chr1 (13-235)||(42091895-42092118)
chr1 (13-235)||(45015780-45016003)
chr1 (13-237)||(4599527-4599753)
chr1 (13-235)||(1174604-1174828)
chr1 (13-235)||(26621468-26621692)
chr1 (13-235)||(41305514-41305738)
chr1 (13-204)||(27240161-27240354)
chr1 (13-235)||(44916329-44916560)
chr1 (13-235)||(43686626-43686851)
chr1 (13-235)||(41297515-41297739)
chr1 (18-235)||(11913262-11913479)
chr1 (13-149)||(23764518-23764655)
chr1 (13-235)||(41299188-41299412)
chr1 (13-235)||(32797735-32797945)
chr1 (14-235)||(1115982-1116206)
chr1 (13-171)||(5445028-5445186)
chr1 (13-230)||(28413678-28413897)
chr1 (145-235)||(23762336-23762426)
chr1 (13-138)||(2824918-2825042)
chr1 (13-213)||(38672788-38672991)
chr1 (14-230)||(39806057-39806274)
chr1 (100-214)||(47646755-47646871)
chr1 (13-213)||(23251342-23251552)
[»] scaffold0343 (1 HSPs)
scaffold0343 (12-235)||(2643-2867)
[»] chr7 (34 HSPs)
chr7 (12-235)||(37026046-37026270)
chr7 (13-235)||(15914637-15914860)
chr7 (13-235)||(15949158-15949381)
chr7 (13-235)||(26601911-26602134)
chr7 (13-235)||(39432907-39433129)
chr7 (13-235)||(3924093-3924316)
chr7 (13-235)||(5049912-5050135)
chr7 (13-235)||(14287714-14287937)
chr7 (13-235)||(36875544-36875767)
chr7 (14-235)||(14298900-14299122)
chr7 (13-235)||(6795437-6795660)
chr7 (13-235)||(8185392-8185616)
chr7 (13-235)||(8192952-8193176)
chr7 (13-235)||(48353480-48353704)
chr7 (13-235)||(2446645-2446868)
chr7 (13-235)||(23612388-23612611)
chr7 (31-235)||(21642535-21642740)
chr7 (13-235)||(1948633-1948857)
chr7 (13-235)||(48347096-48347320)
chr7 (13-235)||(9642916-9643141)
chr7 (13-235)||(5056307-5056531)
chr7 (13-235)||(6020864-6021088)
chr7 (13-235)||(19089806-19090030)
chr7 (13-235)||(1378946-1379169)
chr7 (12-232)||(45433583-45433805)
chr7 (13-235)||(8142446-8142669)
chr7 (14-235)||(33850643-33850865)
chr7 (233-378)||(42422112-42422257)
chr7 (13-213)||(10831147-10831349)
chr7 (13-213)||(11024939-11025141)
chr7 (161-235)||(13774130-13774204)
chr7 (13-230)||(21901193-21901413)
chr7 (12-64)||(1942043-1942095)
chr7 (169-230)||(27954243-27954303)
[»] chr6 (22 HSPs)
chr6 (13-235)||(13671817-13672040)
chr6 (16-235)||(27670096-27670316)
chr6 (13-235)||(1428423-1428646)
chr6 (13-235)||(32328493-32328716)
chr6 (13-235)||(34711557-34711780)
chr6 (13-235)||(4186684-4186907)
chr6 (13-235)||(11058150-11058373)
chr6 (13-235)||(31547894-31548117)
chr6 (13-235)||(4020235-4020459)
chr6 (13-235)||(4026661-4026885)
chr6 (13-235)||(34655249-34655473)
chr6 (13-235)||(9864760-9864984)
chr6 (13-235)||(34648798-34649022)
chr6 (16-235)||(21262574-21262795)
chr6 (13-235)||(4738323-4738547)
chr6 (23-235)||(7069702-7069916)
chr6 (12-168)||(29906888-29907045)
chr6 (12-168)||(30117335-30117492)
chr6 (13-140)||(7062578-7062707)
chr6 (92-184)||(1167538-1167630)
chr6 (173-235)||(7062516-7062578)
chr6 (37-230)||(10081567-10081762)
[»] chr5 (19 HSPs)
chr5 (13-235)||(22359963-22360186)
chr5 (14-235)||(4973563-4973785)
chr5 (14-235)||(5876218-5876440)
chr5 (13-235)||(22313829-22314052)
chr5 (13-235)||(34357288-34357511)
chr5 (13-235)||(34359079-34359302)
chr5 (13-235)||(2957857-2958081)
chr5 (13-235)||(2966326-2966550)
chr5 (13-235)||(29980458-29980681)
chr5 (13-235)||(30041244-30041467)
chr5 (13-235)||(25894649-25894873)
chr5 (13-235)||(40958617-40958840)
chr5 (12-235)||(2438799-2439022)
chr5 (13-233)||(42150817-42151039)
chr5 (13-235)||(12505765-12505996)
chr5 (13-235)||(29414669-29414892)
chr5 (13-213)||(33794091-33794292)
chr5 (13-230)||(9843348-9843566)
chr5 (13-230)||(2156125-2156341)
[»] chr2 (22 HSPs)
chr2 (16-235)||(2021448-2021668)
chr2 (13-235)||(21341882-21342105)
chr2 (13-235)||(21331994-21332217)
chr2 (13-235)||(12950795-12951018)
chr2 (13-235)||(16856487-16856709)
chr2 (13-235)||(16817330-16817552)
chr2 (13-235)||(34834812-34835035)
chr2 (13-235)||(34841256-34841479)
chr2 (13-235)||(42931372-42931595)
chr2 (13-235)||(29484925-29485149)
chr2 (13-235)||(45011981-45012205)
chr2 (12-235)||(2164026-2164250)
chr2 (13-235)||(15852548-15852772)
chr2 (13-235)||(36782184-36782408)
chr2 (13-235)||(43267857-43268081)
chr2 (13-235)||(2157611-2157834)
chr2 (13-235)||(13901957-13902180)
chr2 (13-235)||(21067958-21068181)
chr2 (86-235)||(45700644-45700793)
chr2 (12-230)||(41455604-41455823)
chr2 (71-204)||(11909981-11910116)
chr2 (88-214)||(13162892-13163020)
[»] chr8 (18 HSPs)
chr8 (13-235)||(12768743-12768966)
chr8 (13-235)||(7311348-7311571)
chr8 (13-235)||(8013320-8013543)
chr8 (13-235)||(36005482-36005705)
chr8 (12-235)||(36075965-36076189)
chr8 (13-235)||(36425730-36425954)
chr8 (13-235)||(6464576-6464799)
chr8 (13-235)||(11358193-11358417)
chr8 (13-235)||(36021799-36022023)
chr8 (13-235)||(41242116-41242339)
chr8 (19-235)||(15012393-15012610)
chr8 (13-235)||(1238212-1238436)
chr8 (13-235)||(16710668-16710892)
chr8 (9-235)||(31017394-31017608)
chr8 (43-235)||(45068416-45068609)
chr8 (92-235)||(26250591-26250734)
chr8 (13-230)||(7933931-7934150)
chr8 (13-66)||(14393733-14393786)
[»] chr3 (19 HSPs)
chr3 (13-235)||(4311486-4311709)
chr3 (13-235)||(32746369-32746592)
chr3 (12-235)||(10941304-10941528)
chr3 (13-235)||(27501967-27502191)
chr3 (13-235)||(6036265-6036488)
chr3 (13-235)||(24179072-24179296)
chr3 (13-235)||(13014985-13015208)
chr3 (12-235)||(9570548-9570774)
chr3 (12-235)||(9577050-9577276)
chr3 (13-235)||(43995068-43995300)
chr3 (13-235)||(25893229-25893458)
chr3 (12-235)||(23068462-23068686)
chr3 (13-235)||(43931581-43931799)
chr3 (13-139)||(41353860-41353987)
chr3 (88-207)||(20651153-20651272)
chr3 (13-163)||(41354142-41354293)
chr3 (12-79)||(3577095-3577162)
chr3 (12-230)||(4590792-4591012)
chr3 (12-46)||(20952953-20952987)
[»] scaffold0053 (1 HSPs)
scaffold0053 (12-235)||(49689-49912)
[»] chr4 (18 HSPs)
chr4 (12-235)||(16405340-16405568)
chr4 (13-235)||(55462772-55462995)
chr4 (13-235)||(27590304-27590527)
chr4 (12-235)||(41372984-41373209)
chr4 (13-235)||(16838359-16838581)
chr4 (13-235)||(30238259-30238482)
chr4 (13-234)||(37368315-37368538)
chr4 (13-235)||(13594105-13594330)
chr4 (13-235)||(7780406-7780629)
chr4 (13-235)||(8103880-8104104)
chr4 (13-235)||(17456853-17457077)
chr4 (18-235)||(36754791-36755017)
chr4 (41-235)||(30211536-30211731)
chr4 (88-235)||(5660549-5660696)
chr4 (12-212)||(13003809-13004011)
chr4 (13-230)||(2947844-2948062)
chr4 (13-109)||(48914898-48914996)
chr4 (13-45)||(5660743-5660775)
[»] scaffold0936 (1 HSPs)
scaffold0936 (13-235)||(3264-3486)
[»] scaffold0043 (1 HSPs)
scaffold0043 (13-235)||(5005-5228)
[»] scaffold0060 (1 HSPs)
scaffold0060 (12-235)||(15169-15393)
[»] scaffold0510 (2 HSPs)
scaffold0510 (13-235)||(8881-9105)
scaffold0510 (13-235)||(2560-2784)
[»] scaffold0513 (2 HSPs)
scaffold0513 (94-235)||(12014-12155)
scaffold0513 (13-77)||(11949-12014)
[»] scaffold0002 (1 HSPs)
scaffold0002 (13-119)||(99913-100020)
[»] scaffold0173 (1 HSPs)
scaffold0173 (12-212)||(24268-24470)


Alignment Details
Target: chr1 (Bit Score: 177; Significance: 3e-95; HSPs: 30)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 177; E-Value: 3e-95
Query Start/End: Original strand, 12 - 235
Target Start/End: Original strand, 44241355 - 44241579
Alignment:
Q  12 agaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaa-tgataaagttgagattaataaggcgtg 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||    
T  44241355 agaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgtttgaataactaagttgcaaatgatgaagttgagattaataaggcgtg 44241454  T
Q  111 aaacttgttagtattagagttccttgatcaagcttcgcacttaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaa 210  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||||||||| || ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  44241455 aaacttgttaggattagagttcattgatcaagcgtcacacgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcga 44241554  T
Q  211 caaccccattcgtgtccaaacaata 235  Q
    |||| ||||||||||||||||||||    
T  44241555 caacaccattcgtgtccaaacaata 44241579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 160; E-Value: 4e-85
Query Start/End: Original strand, 13 - 235
Target Start/End: Original strand, 29001730 - 29001953
Alignment:
Q  13 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaa-tgataaagttgagattaataaggcgtga 111  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |    
T  29001730 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgtttgaataactaagttgcaaatgataaagttgagattaataaggcgtaa 29001829  T
Q  112 aacttgttagtattagagttccttgatcaagcttcgcacttaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaac 211  Q
    |||||||||| |||||||||||||| || ||| || ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  29001830 aacttgttaggattagagttccttggtcgagcgtcacacgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcgac 29001929  T
Q  212 aaccccattcgtgtccaaacaata 235  Q
    ||| | |||| |||||||| ||||    
T  29001930 aacactattcatgtccaaataata 29001953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 9 - 235
Target Start/End: Original strand, 9869100 - 9869327
Alignment:
Q  9 catagaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaa-tgataaagttgagattaataaggc 107  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||     
T  9869100 cataaaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaaagataattggtagtttgttttaatgactaagttgcaaatgataaaattgagattaataaggt 9869199  T
Q  108 gtgaaacttgttagtattagagttccttgatcaagcttcgcacttaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccct 207  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  9869200 gtgaaacttgttaggattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcatgtatccct 9869299  T
Q  208 caacaaccccattcgtgtccaaacaata 235  Q
    | |||||  | |||||||||||||||||    
T  9869300 cgacaacatctttcgtgtccaaacaata 9869327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 12 - 235
Target Start/End: Original strand, 31072316 - 31072540
Alignment:
Q  12 agaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgc-aatgataaagttgagattaataaggcgtg 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||| ||    
T  31072316 agaccgttcgacaccaaatatcattctaagctaaaagataatttgttgtttgttttagtaactaagttgcgaataataaaattgagattaataaggcatg 31072415  T
Q  111 aaacttgttagtattagagttccttgatcaagcttcgcacttaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaa 210  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| ||||||| || ||| ||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |    
T  31072416 aaacttgttaggattagagttccttaatcaagcgtcacacgtaacctaatgaccatacatggactctagcttttctttgatattatcatgtatccctcga 31072515  T
Q  211 caaccccattcgtgtccaaacaata 235  Q
    |||| ||||||||||||||||||||    
T  31072516 caacaccattcgtgtccaaacaata 31072540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 13 - 235
Target Start/End: Original strand, 6238654 - 6238877
Alignment:
Q  13 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaa-tgataaagttgagattaataaggcgtga 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||  |||||||||||| ||||||  |||||| ||||||| |||||||||||| ||||| |    
T  6238654 gaccgttcgacaccaaatatcatttcaagttaaacgatagttgattgtttgttttagtaactagattgcaaatgataaaattgagattaatagggcgtaa 6238753  T
Q  112 aacttgttagtattagagttccttgatcaagcttcgcacttaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaac 211  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  6238754 aacttgttaggattagagttccttgatcgagcgtcgcacgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcgac 6238853  T
Q  212 aaccccattcgtgtccaaacaata 235  Q
    ||| ||||||||||||||||||||    
T  6238854 aacaccattcgtgtccaaacaata 6238877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 13 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 39053561 - 39053338
Alignment:
Q  13 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaat-gataaagttgagattaataaggcgtga 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||  |||||||||||| ||||| | ||||||  |||||| |||||||||||| |||||||    
T  39053561 gaccgttcgacaccaaatatcatttcaagttaaacgatagttgattgtttgttttagtaactcatttgcaaacgataaaattgagattaatagggcgtga 39053462  T
Q  112 aacttgttagtattagagttccttgatcaagcttcgcacttaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaac 211  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  39053461 aacttgttaggattagagttccttgatcaagcgtcgcacgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcgac 39053362  T
Q  212 aaccccattcgtgtccaaacaata 235  Q
    ||| | ||||||||||||||||||    
T  39053361 aacactattcgtgtccaaacaata 39053338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 13 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 39059933 - 39059710
Alignment:
Q  13 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaat-gataaagttgagattaataaggcgtga 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||  |||||||||||| ||||| | ||||||  |||||| |||||||||||| |||||||    
T  39059933 gaccgttcgacaccaaatatcatttcaagttaaacgatagttgattgtttgttttagtaactcatttgcaaacgataaaattgagattaatagggcgtga 39059834  T
Q  112 aacttgttagtattagagttccttgatcaagcttcgcacttaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaac 211  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  39059833 aacttgttaggattagagttccttgatcaagcgtcgcacgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcgac 39059734  T
Q  212 aaccccattcgtgtccaaacaata 235  Q
    ||| | ||||||||||||||||||    
T  39059733 aacactattcgtgtccaaacaata 39059710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 13 - 235
Target Start/End: Original strand, 42091895 - 42092118
Alignment:
Q  13 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaa-tgataaagttgagattaataaggcgtga 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||  |||||||||||| ||||| | |||||| ||||||| |||||||||||| ||||| |    
T  42091895 gaccgttcgacaccaaatatcatttcaagttaaacgatagttgattgtttgttttagtaactgaattgcaaatgataaaattgagattaatagggcgtaa 42091994  T
Q  112 aacttgttagtattagagttccttgatcaagcttcgcacttaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaac 211  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  42091995 aacttgttaggattagagttccttgatcgagcgtcgcacgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcgac 42092094  T
Q  212 aaccccattcgtgtccaaacaata 235  Q
    ||| ||||||||||||||||||||    
T  42092095 aacaccattcgtgtccaaacaata 42092118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 13 - 235
Target Start/End: Original strand, 45015780 - 45016003
Alignment:
Q  13 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaa-tgataaagttgagattaataaggcgtga 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||  |||||||||||| ||||| | |||||| ||||||| |||||||||||| ||||| |    
T  45015780 gaccgttcgacaccaaatatcatttcaagttaaacgatagttgattgtttgttttagtaactgaattgcaaatgataaaattgagattaatagggcgtaa 45015879  T
Q  112 aacttgttagtattagagttccttgatcaagcttcgcacttaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaac 211  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  45015880 aacttgttaggattagagttccttgatcgagcgtcgcacgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcgac 45015979  T
Q  212 aaccccattcgtgtccaaacaata 235  Q
    ||| ||||||||||||||||||||    
T  45015980 aacaccattcgtgtccaaacaata 45016003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 143; E-Value: 5e-75
Query Start/End: Original strand, 13 - 237
Target Start/End: Original strand, 4599527 - 4599753
Alignment:
Q  13 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgtt-gtttgttttaataactaagttgcaatgataaa-gttgagattaataaggcgtg 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||   |||| ||||||| ||||| |||||     
T  4599527 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaaagataatttgtttgtttgttttagtaactaaattgcaaaagtaaaagttgagagtaatagggcgta 4599626  T
Q  111 aaacttgttagtattagagttccttgatcaagcttcgcacttaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaa 210  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| |||| || ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  4599627 aaacttgttaggattagagttccttgattaagcgtcacacgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcga 4599726  T
Q  211 caaccccattcgtgtccaaacaatact 237  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||    
T  4599727 caacaccattcgtgtccaaacaatact 4599753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 141; E-Value: 8e-74
Query Start/End: Original strand, 13 - 235
Target Start/End: Original strand, 1174604 - 1174828
Alignment:
Q  13 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgtt-gtttgttttaataactaagttgcaatgataaa-gttgagattaataaggcgtg 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||   |||| ||||||| ||||| ||||||    
T  1174604 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttgaaagataatttgtttgtttgttttagtaactaaattgcaaaagtaaaagttgagagtaatagggcgtg 1174703  T
Q  111 aaacttgttagtattagagttccttgatcaagcttcgcacttaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaa 210  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| ||||| || ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  1174704 aaacttgttaggattagagttccttgagcaagcgtcacacgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcga 1174803  T
Q  211 caaccccattcgtgtccaaacaata 235  Q
    |||| ||||||||||||||||||||    
T  1174804 caacaccattcgtgtccaaacaata 1174828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 133; E-Value: 5e-69
Query Start/End: Original strand, 13 - 235
Target Start/End: Original strand, 26621468 - 26621692
Alignment:
Q  13 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttg-ttgtttgttttaataactaagttgc-aatgataaagttgagattaataaggcgtg 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||| || | || |  |||||||||| ||||| |||||     
T  26621468 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaaagataatttgtttgtttgttttagtaactaaatttcaaaagtaaaagttgagagtaatagggcgta 26621567  T
Q  111 aaacttgttagtattagagttccttgatcaagcttcgcacttaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaa 210  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||||| |||| || ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  26621568 aaacttgttaggattagggttccttgattaagcgtcacacgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcga 26621667  T
Q  211 caaccccattcgtgtccaaacaata 235  Q
    |||| ||||||||||||||||||||    
T  26621668 caacaccattcgtgtccaaacaata 26621692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 13 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 41305738 - 41305514
Alignment:
Q  13 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgtt-gtttgttttaataactaagttgcaatgataaa-gttgagattaataaggcgtg 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||   |||| ||||||| ||||| |||||     
T  41305738 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagtttaaagataatttgtttgtttgttttagtaactaaattgcaaaagtaaaagttgagagtaatagggcgta 41305639  T
Q  111 aaacttgttagtattagagttccttgatcaagcttcgcacttaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaa 210  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| |||| || ||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  41305638 aaacttgttaggattagagttccttgattaagcgtcacacataacctaatgaccatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcga 41305539  T
Q  211 caaccccattcgtgtccaaacaata 235  Q
    |||| |||||| |||||||||||||    
T  41305538 caacaccattcatgtccaaacaata 41305514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 126; E-Value: 7e-65
Query Start/End: Original strand, 13 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 27240354 - 27240161
Alignment:
Q  13 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaac-gataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaat-gataaagttgagattaataaggcgtg 110  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||  ||||||| ||||||||||||| ||||| | ||||||  |||||| |||||||||||||||||||    
T  27240354 gaccgttcgacaccaaataccattccaagttaaaaagataattggttgtttgttttagtaactcatttgcaaacgataaaattgagattaataaggcgtg 27240255  T
Q  111 aaacttgttagtattagagttccttgatcaagcttcgcacttaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatc 204  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27240254 aaacttgttaggattagagttccttgatcaagcgtcgcacgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatc 27240161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 13 - 235
Target Start/End: Original strand, 44916329 - 44916560
Alignment:
Q  13 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagtt---------gcaatgataaagttgagattaata 103  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||         | ||||||||||||||||||||||    
T  44916329 gaccattcgacaccaaatatcattctaaattaaaagatagtttgttgtttgttttaaaaactaagttaactatgttgaaatgataaagttgagattaata 44916428  T
Q  104 aggcgtgaaacttgttagtattagagttccttgatcaagcttcgcacttaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtat 203  Q
    |||||||||||||||||| |||||| |||||| | ||| | || ||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  44916429 aggcgtgaaacttgttaggattagaattccttaaccaaacgtcacacgtaacctaatgaccatacatggattctagcttttctttgatattatcatgtat 44916528  T
Q  204 ccctcaacaaccccattcgtgtccaaacaata 235  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  44916529 ccctcgacaacaccattcgtgtccaaacaata 44916560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 13 - 235
Target Start/End: Original strand, 43686626 - 43686851
Alignment:
Q  13 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaac-gataatttgtt-gtttgttttaataactaagttgc-aatgataaagttgagattaataaggcgt 109  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||  |||||| |||| |||||||||| ||||||| |||| ||||  |||||||||||||| | |||||    
T  43686626 gaccgttcgacaccaaataccattccaagttaaaaagataatctgtttgtttgttttagtaactaaattgctaatgtaaaagttgagattaacagggcgt 43686725  T
Q  110 gaaacttgttagtattagagttccttgatcaagcttcgcacttaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctca 209  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||||| ||| || || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||     
T  43686726 aaaacttgttaggattagagttccttgatcgagcgtctcatttaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcatgtatccctcg 43686825  T
Q  210 acaaccccattcgtgtccaaacaata 235  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||    
T  43686826 acaacaccattcgtgtccaaacaata 43686851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 121; E-Value: 7e-62
Query Start/End: Original strand, 13 - 235
Target Start/End: Original strand, 41297515 - 41297739
Alignment:
Q  13 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgtt-gtttgttttaataactaagttgc-aatgataaagttgagattaataaggcgtg 110  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||| |||||| |||||||||| ||||||| |||| || |  |||||||||| ||||| |||||     
T  41297515 gaccgttcgactccaaatatcattctaagttgaaagatagtttgtttgtttgttttagtaactaaattgctaaagtaaaagttgagagtaatagggcgta 41297614  T
Q  111 aaacttgttagtattagagttccttgatcaagcttcgcacttaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaa 210  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| | | || ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |    
T  41297615 aaacttgttaggattagagttccttgatcgatcctcacacgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacatatccctcga 41297714  T
Q  211 caaccccattcgtgtccaaacaata 235  Q
    |||| ||||||||||||||||||||    
T  41297715 caacaccattcgtgtccaaacaata 41297739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 18 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 11913479 - 11913262
Alignment:
Q  18 ttcgacaccaaatatcattctaagtt-aaacgataatttgtt-gtttgttttaataactaagttgc-aatgataaagttgagattaataaggcgtgaaac 114  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||  ||||| |||||||| ||   ||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  11913479 ttcgacaccaaatatcattctaagtttaaaagatagattgtttgtttgtttaaa---ctaagttgcgaataataaaattgagattaataaggcgtgaaac 11913383  T
Q  115 ttgttagtattagagttccttgatcaagcttcgcacttaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaacaac 214  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||| || ||  ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  11913382 ttgttaggattagagttccttgaccaagcatcacatgtaacctaatgaccatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcgacaac 11913283  T
Q  215 cccattcgtgtccaaacaata 235  Q
     ||||||||||||||||||||    
T  11913282 accattcgtgtccaaacaata 11913262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 13 - 149
Target Start/End: Complemental strand, 23764655 - 23764518
Alignment:
Q  13 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgc-aatgataaagttgagattaataaggcgtga 111  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| |    
T  23764655 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgtttgaataactaagttgcaaatgataaagttgagattaatagggcgtaa 23764556  T
Q  112 aacttgttagtattagagttccttgatcaagcttcgca 149  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||    
T  23764555 aacttgttaggattagagttccttgatcaagcgtcgca 23764518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 13 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 41299412 - 41299188
Alignment:
Q  13 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgtt-gtttgttttaataactaagttgcaatgataaa-gttgagattaataaggcgtg 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||| ||||||| ||||||   |||| ||||||| ||||| |||||     
T  41299412 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaaagataatttatttgtttgttttagtaactaaattgcaaaagtaaaagttgagagtaatagggcgta 41299313  T
Q  111 aaacttgttagtattagagttccttgatcaagcttcgcacttaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaa 210  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| |||| || ||  ||| ||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| |    
T  41299312 aaacttgttaggattagagttccttgattaagcgtcacatataacctaatgaccattcatggattcaagcttttctttgatattatcatgtatccctcga 41299213  T
Q  211 caaccccattcgtgtccaaacaata 235  Q
    |||| |||||| | |||||||||||    
T  41299212 caacaccattcttttccaaacaata 41299188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 13 - 235
Target Start/End: Original strand, 32797735 - 32797945
Alignment:
Q  13 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaatgataaagttgagattaataaggcgtgaa 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||            || ||||| ||||| ||    
T  32797735 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaa-gataatttgttgtttgttttagaaactaagttgcaa------------gagtaatagggcgtaaa 32797821  T
Q  113 a-cttgttagtattagagttccttgatcaagcttcgcacttaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaac 211  Q
    | |||||||| ||||||||||||| ||||||| || ||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  32797822 aacttgttaggattagagttccttaatcaagcgtcacacgtaacctaatgaccatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcgac 32797921  T
Q  212 aaccccattcgtgtccaaacaata 235  Q
    ||| | ||||||||||||||||||    
T  32797922 aacacaattcgtgtccaaacaata 32797945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 104; E-Value: 9e-52
Query Start/End: Original strand, 14 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 1116206 - 1115982
Alignment:
Q  14 accgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaatgataaa-gttgagattaataaggcgtgaa 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| | ||||||||||||||   |||| ||||||| |||||||| |||||    
T  1116206 accgttcgacaccaaatatcattctaagttaaaagctaatttgttgtttgttt-agtaactaagttgcaagagtaaaagttgagagtaataaggtgtgaa 1116108  T
Q  113 acttgttagtattagagttccttgatcaagcttcgcacttaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaaca 212  Q
    |||| |||  ||||||||||||| ||||||| || ||| ||| |||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||    
T  1116107 acttcttatgattagagttccttaatcaagcgtcacacgtaacctaatgactatacatggattctaccttttctttgatattatcatgtatccctcgaca 1116008  T
Q  213 ac---cccattcgtgtccaaacaata 235  Q
    ||    ||||| ||||||||||||||    
T  1116007 acactaccatttgtgtccaaacaata 1115982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 96; E-Value: 6e-47
Query Start/End: Original strand, 13 - 171
Target Start/End: Complemental strand, 5445186 - 5445028
Alignment:
Q  13 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaatgataaa-gttgagattaataaggcgtga 111  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||   |||| |||||||||||||||| ||||    
T  5445186 gaccgttcgacaccaactatcattctaagttaaa-gataatttgttgtttgttttagtaactaagttgcaagagtaaaagttgagattaataaggtgtga 5445088  T
Q  112 aacttgttagtattagagttccttgatcaagcttcgcacttaatctaatgatcatacatg 171  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||| ||| ||||||| ||||||||    
T  5445087 aacttgttaggattagagttccttgatcaagcctcacacataacctaatgaccatacatg 5445028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 13 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 28413897 - 28413678
Alignment:
Q  13 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgc-aatgataaagttgagattaataaggcgtga 111  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||| || |  |||||||||| ||||||||||| |    
T  28413897 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaaagataatttgttgtttgttttagtaaccaagttgcaaaagtaaaagttgagagtaataaggcgt-a 28413799  T
Q  112 aacttgttagtattagagttccttgatcaagcttcgcacttaatctaatgat--catacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctca 209  Q
    ||   ||| | |||||||||||||||| |||| ||  || ||| ||||| ||  |||| |||||||||||| |||     ||||||||||||||| ||||    
T  28413798 aaaacgttggaattagagttccttgattaagcgtcaaacataacctaataatcacatatatggattctagcattttaccaatattatcacgtatcgctca 28413699  T
Q  210 acaaccccattcgtgtccaaa 230  Q
    ||||    |||||||||||||    
T  28413698 acaagattattcgtgtccaaa 28413678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 145 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 23762426 - 23762336
Alignment:
Q  145 tcgcacttaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaacaaccccattcgtgtccaaacaata 235  Q
    |||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||    
T  23762426 tcgcacataacctaatgaccatacatggattctagcttttctttgatattatcatgtatccctcgacaacactattcgtgtccaaacaata 23762336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 13 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 2825042 - 2824918
Alignment:
Q  13 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaatgataaagttgagattaataaggcgtgaa 112  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||| ||||   || |  |||||||||| ||||||||||| ||    
T  2825042 gaccattcgacaccaaatatcattctaagttaaaagataatatgttgtttgttttagtaaccaagtataaaagtgaaagttgagagtaataaggcgt-aa 2824944  T
Q  113 acttgttagtattagagttccttgat 138  Q
    |   ||| | ||||||||||||||||    
T  2824943 aaacgttggaattagagttccttgat 2824918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 13 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 38672991 - 38672788
Alignment:
Q  13 gaccgttcgacaccaaatatcattctaag-ttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaa-tgataaagttgagattaataaggcgtg 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||| ||||||  |||||||||||||  |  |||||||||| |||||||||||     
T  38672991 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagtttgaaagataatttgttgttcgttttagaaactaagttgcaagagtaaaagttgagagtaataaggcgt- 38672893  T
Q  111 aaacttgttagtattagagttccttgatcaagcttcgcacttaatctaatgat--catacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctc 208  Q
    |||    || | |||||||||||||||| |||| ||  || ||| || || ||  |||| |||||||||||| |||    |||||||||||||||| |||    
T  38672892 aaaaacattggaattagagttccttgattaagcgtcaaacataacctgataatcacatatatggattctagcgttttaccgatattatcacgtatcgctc 38672793  T
Q  209 aacaa 213  Q
    |||||    
T  38672792 aacaa 38672788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 14 - 230
Target Start/End: Original strand, 39806057 - 39806274
Alignment:
Q  14 accgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaa-tgataaagttgagattaataaggcgtgaa 112  Q
    |||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||  |||||||||||||  |  ||| |||||| ||||||||||| ||    
T  39806057 accgtttgacaccaaatatcattttaagttaaa-gataatttgttgttcgttttagaaactaagttgcaagagtaaaaattgagagtaataaggcgt-aa 39806154  T
Q  113 acttgttagtattagagttccttgatcaagcttcgcacttaatctaatgat--catacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaa 210  Q
    |   ||| | |||||||||||||||| |||| ||  || ||| ||||| ||  |||| |||||||| ||| |||    |||||||||||||||| |||||    
T  39806155 aaacgttggaattagagttccttgattaagcgtcaaacataacctaataatcacatatatggattccagcgttttaccgatattatcacgtatcgctcaa 39806254  T
Q  211 caaccccattcgtgtccaaa 230  Q
    |||    |||||||||||||    
T  39806255 caagattattcgtgtccaaa 39806274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 100 - 214
Target Start/End: Original strand, 47646755 - 47646871
Alignment:
Q  100 aataaggcgtgaaacttgttagtattagagttccttgatcaagcttcgcacttaatctaatgatcatacat--ggattctagcttttctttgatattatc 197  Q
    |||||||||| ||||||||||  |||||||||| |||| ||||  || ||  ||| |||||||||| | ||  ||||||||||||||  | |||||||||    
T  47646755 aataaggcgtaaaacttgttatgattagagttcgttgaccaagaatcacatataacctaatgatcacatatacggattctagcttttaatcgatattatc 47646854  T
Q  198 acgtatccctcaacaac 214  Q
    ||||||||||| |||||    
T  47646855 acgtatccctcgacaac 47646871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 13 - 213
Target Start/End: Original strand, 23251342 - 23251552
Alignment:
Q  13 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgtt-gtttgttt-----taa--taactaagttgcaatgataaa-gttgagattaata 103  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||  | ||||| ||||||||     |||  ||||||| | ||||  ||||| ||||||| |||||    
T  23251342 gaccgttcgacaccaaatatcattcgaagttaaaagagtagttgtttgtttgtttgtaactaagttaactaattcgcaagaataaaagttgagagtaata 23251441  T
Q  104 aggcgtgaaacttgttagtattagagttccttgatcaagcttcgcacttaatctaatgatc--atacatggattctagcttttctttgatattatcacgt 201  Q
    |||||| |||   ||| | |||||||||||||||| |||| ||  || ||| ||||| |||  ||| |||||||||||| |||    |||||||||||||    
T  23251442 aggcgtaaaaac-gttggaattagagttccttgattaagcgtcaaacataacctaataatcgcatatatggattctagcgttttaccgatattatcacgt 23251540  T
Q  202 atccctcaacaa 213  Q
    ||| ||||||||    
T  23251541 atcgctcaacaa 23251552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0343 (Bit Score: 169; Significance: 2e-90; HSPs: 1)
Name: scaffold0343
Description:

Target: scaffold0343; HSP #1
Raw Score: 169; E-Value: 2e-90
Query Start/End: Original strand, 12 - 235
Target Start/End: Original strand, 2643 - 2867
Alignment:
Q  12 agaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaa-tgataaagttgagattaataaggcgtg 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  2643 agaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgtttgaataactaagctgcaaatgataaagttgagattaataaggcgtg 2742  T
Q  111 aaacttgttagtattagagttccttgatcaagcttcgcacttaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaa 210  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| |    
T  2743 aaacttgttaggattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaacctaatgatcatacatggattatagcttttctttgatattatcatgtatccctcga 2842  T
Q  211 caaccccattcgtgtccaaacaata 235  Q
    |||| |||||||| |||||||||||    
T  2843 caacaccattcgtatccaaacaata 2867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 169; Significance: 2e-90; HSPs: 34)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 169; E-Value: 2e-90
Query Start/End: Original strand, 12 - 235
Target Start/End: Original strand, 37026046 - 37026270
Alignment:
Q  12 agaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaa-tgataaagttgagattaataaggcgtg 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||    
T  37026046 agaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgtttgactaactaagttgtaaatgataaagttgagattaataaggcgtg 37026145  T
Q  111 aaacttgttagtattagagttccttgatcaagcttcgcacttaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaa 210  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||| ||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |    
T  37026146 aaacttgttaggattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaacctaatgatcatacattgattctagtttttctttgatattatcacgtatccctcga 37026245  T
Q  211 caaccccattcgtgtccaaacaata 235  Q
    |||| ||||||||||||||||||||    
T  37026246 caacaccattcgtgtccaaacaata 37026270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 168; E-Value: 6e-90
Query Start/End: Original strand, 13 - 235
Target Start/End: Original strand, 15914637 - 15914860
Alignment:
Q  13 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaa-tgataaagttgagattaataaggcgtga 111  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |    
T  15914637 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgtttgaataactaagttgcaaatgataaagttgagattaatagggcgtaa 15914736  T
Q  112 aacttgttagtattagagttccttgatcaagcttcgcacttaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaac 211  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||    
T  15914737 aacttgttaggattagagttccttgatcaagcgtcgcacataacctaatgaccatacatggattctagcttttctttgatattatcacatatccctcgac 15914836  T
Q  212 aaccccattcgtgtccaaacaata 235  Q
    ||| | ||||||||||||||||||    
T  15914837 aacactattcgtgtccaaacaata 15914860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 13 - 235
Target Start/End: Original strand, 15949158 - 15949381
Alignment:
Q  13 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaa-tgataaagttgagattaataaggcgtga 111  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |    
T  15949158 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgtttgaataactaagttgcaaatgataaagttgagattaatagggcgtaa 15949257  T
Q  112 aacttgttagtattagagttccttgatcaagcttcgcacttaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaac 211  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||  ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||    
T  15949258 aacttgttaggattagagttccttgatcaagcgtcgcatataacctaatgaccatacatggattctagcttttctttgatattatcacatatccctcgac 15949357  T
Q  212 aaccccattcgtgtccaaacaata 235  Q
    ||| | ||||||||||||||||||    
T  15949358 aacactattcgtgtccaaacaata 15949381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 13 - 235
Target Start/End: Original strand, 26601911 - 26602134
Alignment:
Q  13 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaa-tgataaagttgagattaataaggcgtga 111  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |    
T  26601911 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgtttgaataactaagttgcaaatgataaagttgagattaatagggcgtaa 26602010  T
Q  112 aacttgttagtattagagttccttgatcaagcttcgcacttaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaac 211  Q
    |||||||||| |||||| |||||||||||||| || ||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  26602011 aacttgttaggattagaattccttgatcaagcgtcacacataacctaatgaacatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcgac 26602110  T
Q  212 aaccccattcgtgtccaaacaata 235  Q
    ||| | ||||||||||||||||||    
T  26602111 aacactattcgtgtccaaacaata 26602134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 13 - 235
Target Start/End: Original strand, 39432907 - 39433129
Alignment:
Q  13 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaatgataaagttgagattaataaggcgtgaa 112  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||   ||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  39432907 gaccgttcgacaacaaatatcattctaagttaaaagataatttgttgtttgttttagtaaccaagtgcaaatgataaagttgagattaataaggtgtgaa 39433006  T
Q  113 acttgttagtattagagttccttgatcaagcttcgcacttaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaaca 212  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  39433007 acttgttaggattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaacctaatgatcatacatgaattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcgaca 39433106  T
Q  213 accccattcgtgtccaaacaata 235  Q
    || ||||||||||||||||||||    
T  39433107 acgccattcgtgtccaaacaata 39433129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 148; E-Value: 5e-78
Query Start/End: Original strand, 13 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 3924316 - 3924093
Alignment:
Q  13 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaa-tgataaagttgagattaataaggcgtga 111  Q
    |||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||| |||||||||||| ||||| |    
T  3924316 gaccgttcgataccaaatatcattccaagttaaaagataattggttgtttgttttagtaactaaattgcaaatgataaaattgagattaatagggcgtaa 3924217  T
Q  112 aacttgttagtattagagttccttgatcaagcttcgcacttaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaac 211  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| ||| || ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  3924216 aacttgttaggattagagttccttgatcgagcgtcacacgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcgac 3924117  T
Q  212 aaccccattcgtgtccaaacaata 235  Q
    ||| ||||||||||||||||||||    
T  3924116 aacaccattcgtgtccaaacaata 3924093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 148; E-Value: 5e-78
Query Start/End: Original strand, 13 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 5050135 - 5049912
Alignment:
Q  13 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaa-tgataaagttgagattaataaggcgtga 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||  |||||||||||| ||||| | |||||| ||||||| |||||||||||| ||||| |    
T  5050135 gaccgttcgacaccaaatatcattccaagttaaacgatagttgattgtttgttttagtaactgaattgcaaatgataaaattgagattaatagggcgtaa 5050036  T
Q  112 aacttgttagtattagagttccttgatcaagcttcgcacttaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaac 211  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  5050035 aacttgttaggattagagttccttgatcgagcgtcgcacgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcgac 5049936  T
Q  212 aaccccattcgtgtccaaacaata 235  Q
    ||| ||||||||||||||||||||    
T  5049935 aacaccattcgtgtccaaacaata 5049912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 148; E-Value: 5e-78
Query Start/End: Original strand, 13 - 235
Target Start/End: Original strand, 14287714 - 14287937
Alignment:
Q  13 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaa-tgataaagttgagattaataaggcgtga 111  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||| |||||||||||| ||||| |    
T  14287714 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaaagataattggttgtttgttttagtaactaaattgcaaatgataaaattgagattaatagggcgtaa 14287813  T
Q  112 aacttgttagtattagagttccttgatcaagcttcgcacttaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaac 211  Q
    | |||||||| ||||||||||||||||| | | |||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  14287814 atcttgttaggattagagttccttgatcgaacgtcgcacgtaccctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcgac 14287913  T
Q  212 aaccccattcgtgtccaaacaata 235  Q
    ||| ||||||||||||||||||||    
T  14287914 aacaccattcgtgtccaaacaata 14287937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 148; E-Value: 5e-78
Query Start/End: Original strand, 13 - 235
Target Start/End: Original strand, 36875544 - 36875767
Alignment:
Q  13 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaa-tgataaagttgagattaataaggcgtga 111  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||| |||||||||||| ||||| |    
T  36875544 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaaagataattggttgtttgttttagtaactaaattgcaaatgataaaattgagattaatagggcgtaa 36875643  T
Q  112 aacttgttagtattagagttccttgatcaagcttcgcacttaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaac 211  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||| ||| || ||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  36875644 aacttgttaggattggagttccttgatcgagcgtcacacgtaacctaatgatcatatatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcgac 36875743  T
Q  212 aaccccattcgtgtccaaacaata 235  Q
    ||| ||||||||||||||||||||    
T  36875744 aacaccattcgtgtccaaacaata 36875767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 14 - 235
Target Start/End: Original strand, 14298900 - 14299122
Alignment:
Q  14 accgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaa-tgataaagttgagattaataaggcgtgaa 112  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||| |||||||||||| ||||| ||    
T  14298900 accgtttgacaccaaatatcattctaagttaaaagataattggttgtttgttttagtaactaaattgcaaatgataaaattgagattaatagggcgtaaa 14298999  T
Q  113 acttgttagtattagagttccttgatcaagcttcgcacttaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaaca 212  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| | | |||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  14299000 acttgttaggattagagttccttgatcgaacgtcgcacgtaccctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcgaca 14299099  T
Q  213 accccattcgtgtccaaacaata 235  Q
    || ||||||||||||||||||||    
T  14299100 acaccattcgtgtccaaacaata 14299122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 13 - 235
Target Start/End: Original strand, 6795437 - 6795660
Alignment:
Q  13 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaa-tgataaagttgagattaataaggcgtga 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||  |||||||||||| ||||| | |||||| ||||||| |||||||||||| ||||| |    
T  6795437 gaccgttcgacaccaaatatcatttcaagttaaacgatagttgattgtttgttttagtaactgaattgcaaatgataaaattgagattaatagggcgtaa 6795536  T
Q  112 aacttgttagtattagagttccttgatcaagcttcgcacttaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaac 211  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  6795537 aacttgttaggattagagttccttgatcgagcgtcgcacgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcgac 6795636  T
Q  212 aaccccattcgtgtccaaacaata 235  Q
    ||| ||||||||||||||||||||    
T  6795637 aacaccattcgtgtccaaacaata 6795660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 141; E-Value: 8e-74
Query Start/End: Original strand, 13 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 8185616 - 8185392
Alignment:
Q  13 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagtt-aaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaat-gataaagttgagattaataaggcgtg 110  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||| ||||||| ||||||||||||| ||||| | ||||||  |||||| |||||||||||| ||||||    
T  8185616 gaccgttcgacaccaaataccattccaagttgaaaagataattggttgtttgttttagtaactcatttgcaaacgataaaattgagattaatagggcgtg 8185517  T
Q  111 aaacttgttagtattagagttccttgatcaagcttcgcacttaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaa 210  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  8185516 aaacttgttaggattagagttccttgatcaagcgtcgcacgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcga 8185417  T
Q  211 caaccccattcgtgtccaaacaata 235  Q
    |||| | ||||||||||||||||||    
T  8185416 caacactattcgtgtccaaacaata 8185392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 141; E-Value: 8e-74
Query Start/End: Original strand, 13 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 8193176 - 8192952
Alignment:
Q  13 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagtt-aaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaat-gataaagttgagattaataaggcgtg 110  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||| ||||||| ||||||||||||| ||||| | ||||||  |||||| |||||||||||| ||||||    
T  8193176 gaccgttcgacaccaaataccattccaagttgaaaagataattggttgtttgttttagtaactcatttgcaaacgataaaattgagattaatagggcgtg 8193077  T
Q  111 aaacttgttagtattagagttccttgatcaagcttcgcacttaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaa 210  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  8193076 aaacttgttaggattagagttccttgatcaagcgtcgcacgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcga 8192977  T
Q  211 caaccccattcgtgtccaaacaata 235  Q
    |||| | ||||||||||||||||||    
T  8192976 caacactattcgtgtccaaacaata 8192952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 141; E-Value: 8e-74
Query Start/End: Original strand, 13 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 48353704 - 48353480
Alignment:
Q  13 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagtt-aaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaat-gataaagttgagattaataaggcgtg 110  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||| ||||||| ||||||||||||| ||||| | ||||||  |||||| |||||||||||| ||||||    
T  48353704 gaccgttcgacaccaaataccattccaagttgaaaagataattggttgtttgttttagtaactcatttgcaaacgataaaattgagattaatagggcgtg 48353605  T
Q  111 aaacttgttagtattagagttccttgatcaagcttcgcacttaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaa 210  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  48353604 aaacttgttaggattagagttccttgatcaagcgtcgcacgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcga 48353505  T
Q  211 caaccccattcgtgtccaaacaata 235  Q
    |||| | ||||||||||||||||||    
T  48353504 caacactattcgtgtccaaacaata 48353480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 13 - 235
Target Start/End: Original strand, 2446645 - 2446868
Alignment:
Q  13 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaa-tgataaagttgagattaataaggcgtga 111  Q
    |||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||  |||||||||||| ||||| | |||||| ||||||| |||||||||||| ||||| |    
T  2446645 gaccattcgacaccaaatatcatttcaagttaaacgatagttgattgtttgttttagtaactgaattgcaaatgataaaattgagattaatagggcgtaa 2446744  T
Q  112 aacttgttagtattagagttccttgatcaagcttcgcacttaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaac 211  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  2446745 aacttgttaggattagagttccttgatcgagcgtcgcacgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcgac 2446844  T
Q  212 aaccccattcgtgtccaaacaata 235  Q
    ||| ||||||||||||||||||||    
T  2446845 aacaccattcgtgtccaaacaata 2446868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 13 - 235
Target Start/End: Original strand, 23612388 - 23612611
Alignment:
Q  13 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaa-tgataaagttgagattaataaggcgtga 111  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||| || ||| ||||||| |||||||||||| ||||| |    
T  23612388 gaccgttcgacacgaaatatcattccaagttaaaagataattggttgtttgttttagtaactaaattacaaatgataaaattgagattaatagggcgtaa 23612487  T
Q  112 aacttgttagtattagagttccttgatcaagcttcgcacttaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaac 211  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  23612488 aacttgttaggattagagttccttgatcaagcgtcacacataacctaatgaccatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcgac 23612587  T
Q  212 aaccccattcgtgtccaaacaata 235  Q
    ||| | ||||||||||||||||||    
T  23612588 aacactattcgtgtccaaacaata 23612611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 138; E-Value: 5e-72
Query Start/End: Original strand, 31 - 235
Target Start/End: Original strand, 21642535 - 21642740
Alignment:
Q  31 atcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaa-tgataaagttgagattaataaggcgtgaaacttgttagtattagag 129  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  21642535 atcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttagtaactaaattgcaaatgataaaattgagattaatagggcgtgaaacttgttaggattagag 21642634  T
Q  130 ttccttgatcaagcttcgcacttaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaacaaccccattcgtgtccaa 229  Q
    |||||||||||||| || ||| ||| ||||||| || ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||    
T  21642635 ttccttgatcaagcatcacacataacctaatgaacaaacatggattctagcttttcattgatattatcacgtatccctcgacaacactattcgtgtccaa 21642734  T
Q  230 acaata 235  Q
    ||||||    
T  21642735 acaata 21642740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 13 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 1948857 - 1948633
Alignment:
Q  13 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgtt-gtttgttttaataactaagttgcaat-gataaagttgagattaataaggcgtg 110  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||  ||||||||||||||||||| ||||||    
T  1948857 gaccgttcaacaccaaatatcattctaagttaaaagataatttgtttgtttgttttagtaactaaattgcaaaagataaagttgagattaatagggcgtg 1948758  T
Q  111 aaacttgttagtattagagttccttgatcaagcttcgcacttaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaa 210  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| ||||||| || ||| ||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| |    
T  1948757 aaacttgttaggattagagttccttaatcaagcgtcacacataacctaatgaccatacatggattctagattttctttgagattatcacgtatccctcga 1948658  T
Q  211 caaccccattcgtgtccaaacaata 235  Q
    |||| | ||||||||||||||||||    
T  1948657 caacactattcgtgtccaaacaata 1948633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 13 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 48347320 - 48347096
Alignment:
Q  13 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagtt-aaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaat-gataaagttgagattaataaggcgtg 110  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||| ||||||| ||||||||||||| ||||| | ||||||  |||||| |||||||||||| ||| ||    
T  48347320 gaccgttcgacaccaaataccattccaagttgaaaagataattggttgtttgttttagtaactcatttgcaaacgataaaattgagattaatagggcatg 48347221  T
Q  111 aaacttgttagtattagagttccttgatcaagcttcgcacttaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaa 210  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  48347220 aaacttgttaggattagagttccttgatcaagcgtcgcacgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcga 48347121  T
Q  211 caaccccattcgtgtccaaacaata 235  Q
    |||| | ||||||||||||||||||    
T  48347120 caacactattcgtgtccaaacaata 48347096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 13 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 9643141 - 9642916
Alignment:
Q  13 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaac-gataatttgtt-gtttgttttaataactaagttgc-aatgataaagttgagattaataaggcgt 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||| |||||||||| ||||||| |||| ||||  |||||||||||||| | |||||    
T  9643141 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaaaagataatatgtttgtttgttttagtaactaaattgctaatgtaaaagttgagattaacagggcgt 9643042  T
Q  110 gaaacttgttagtattagagttccttgatcaagcttcgcacttaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctca 209  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||||| ||| || ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  9643041 aaaacttgttaggattagagttccttgatcgagcgtcacacgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcg 9642942  T
Q  210 acaaccccattcgtgtccaaacaata 235  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||    
T  9642941 acaacaccattcgtgtccaaacaata 9642916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 133; E-Value: 5e-69
Query Start/End: Original strand, 13 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 5056531 - 5056307
Alignment:
Q  13 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgtt-gtttgttttaataactaagttgcaa-tgataaagttgagattaataaggcgtg 110  Q
    |||||||||||||||| |||||||  |||| ||| ||||| ||||| |||||||||| ||||| | |||||| ||||||| |||||||||||| |||||     
T  5056531 gaccgttcgacaccaattatcatttcaagtaaaaagataagttgtttgtttgttttagtaactgaattgcaaatgataaaattgagattaatagggcgta 5056432  T
Q  111 aaacttgttagtattagagttccttgatcaagcttcgcacttaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaa 210  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  5056431 aaacttgttaggattagagttccttgatcgagcgtcgcacgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcga 5056332  T
Q  211 caaccccattcgtgtccaaacaata 235  Q
    |||| ||||||||||||||||||||    
T  5056331 caacaccattcgtgtccaaacaata 5056307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 133; E-Value: 5e-69
Query Start/End: Original strand, 13 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 6021088 - 6020864
Alignment:
Q  13 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaac-gataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaat-gataaagttgagattaataaggcgtg 110  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||  ||||||| ||||||||||||| ||||| | ||||||  |||||| |||||||||||| ||||||    
T  6021088 gaccgttcgacaccaaataccattccaagttaaaaagataattggttgtttgttttagtaactcaattgcaaacgataaaattgagattaatagggcgtg 6020989  T
Q  111 aaacttgttagtattagagttccttgatcaagcttcgcacttaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaa 210  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |    
T  6020988 aaacttgttaggattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacatatccctcga 6020889  T
Q  211 caaccccattcgtgtccaaacaata 235  Q
    |||| | ||||||||||||||||||    
T  6020888 caacactattcgtgtccaaacaata 6020864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 133; E-Value: 5e-69
Query Start/End: Original strand, 13 - 235
Target Start/End: Original strand, 19089806 - 19090030
Alignment:
Q  13 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgtt-gtttgttttaataactaagttgcaatgataaa-gttgagattaataaggcgtg 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||   |||| ||||||| ||||| |||||     
T  19089806 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaaagataatttgtttgtttgttttagtaactaaattgcaaaagtaaaagttgagagtaatagggcgta 19089905  T
Q  111 aaacttgttagtattagagttccttgatcaagcttcgcacttaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaa 210  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||| ||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  19089906 aaacttgttaggattagagttccttgatcaagcgtcacacataacctaatgaccatacatggattctaacttttctttgatattatcacgtatccctcga 19090005  T
Q  211 caaccccattcgtgtccaaacaata 235  Q
    |||| | ||||||||||||||||||    
T  19090006 caacactattcgtgtccaaacaata 19090030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 13 - 235
Target Start/End: Original strand, 1378946 - 1379169
Alignment:
Q  13 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaa-tgataaagttgagattaataaggcgtga 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||  |||||||||||| ||||| | |||||| ||||| | |||||||||||| ||||| |    
T  1378946 gaccgttcgacaccaaatatcatttcaagttaaacgatagttgattgtttgttttagtaactgaattgcaaatgatacaattgagattaatagggcgtaa 1379045  T
Q  112 aacttgttagtattagagttccttgatcaagcttcgcacttaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaac 211  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||    
T  1379046 aacttgttaggattagagttccttgatcgagcgtcgcacgtaacctaatgagcatacatggattctagcttgtctttgatattatcacgtatccctcgac 1379145  T
Q  212 aaccccattcgtgtccaaacaata 235  Q
    ||| ||||||||||||||||||||    
T  1379146 aacaccattcgtgtccaaacaata 1379169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 131; E-Value: 7e-68
Query Start/End: Original strand, 12 - 232
Target Start/End: Original strand, 45433583 - 45433805
Alignment:
Q  12 agaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaatgataaa-gttgagattaataaggcgtg 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||   |||| ||||||| |||||||||||     
T  45433583 agaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaaagataatttgttgtttgttttagtaactaagtttcaagagtaaaagttgagagtaataaggcgta 45433682  T
Q  111 aaa-cttgttagtattagagttccttgatcaagcttcgcacttaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctca 209  Q
    ||| |||||||| ||||||||||||| ||||||| || ||| ||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||     
T  45433683 aaaacttgttaggattagagttccttaatcaagcgtcacacgtaacctaatgaccatacatggattctagattttctttgatattatcatgtatccctcg 45433782  T
Q  210 acaaccccattcgtgtccaaaca 232  Q
    ||||| |||||||||||||||||    
T  45433783 acaacaccattcgtgtccaaaca 45433805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 128; E-Value: 4e-66
Query Start/End: Original strand, 13 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 8142669 - 8142446
Alignment:
Q  13 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaa-tgataaagttgagattaataaggcgtga 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||  |||||||||||| ||||| | || ||| ||||| | |||||||||||| ||||| |    
T  8142669 gaccgttcgacaccaaatatcatttcaagttaaacgatagttgattgtttgttttagtaactgaattacaaatgatacaattgagattaatagggcgtaa 8142570  T
Q  112 aacttgttagtattagagttccttgatcaagcttcgcacttaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaac 211  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||    
T  8142569 aacttgttaggattagagttccttgatcgagcgtcgcacgtaacctaatgagcatacatggattctagcttgtctttgatattatcacgtatccctcgac 8142470  T
Q  212 aaccccattcgtgtccaaacaata 235  Q
    ||| ||||||||||||||||||||    
T  8142469 aacaccattcgtgtccaaacaata 8142446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 14 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 33850865 - 33850643
Alignment:
Q  14 accgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaatgataaa-gttgagattaataaggcgtgaa 112  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||| ||||||| || |||||||| ||    
T  33850865 accgtttgacaccaaatatcattctaagttaaaagtcaatttgttgtttgttttagtaactaagttgcaatagtaaaagttgagagtagtaaggcgttaa 33850766  T
Q  113 acttgttagtattagagttccttgatcaagcttcgcacttaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaaca 212  Q
    ||||||||| ||||||||||||| ||||||| || ||| ||| |||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||    
T  33850765 acttgttaggattagagttccttaatcaagcgtcacacgtaacctaatgactatacatgtattctagcttttctttgatattatcatgtatccctcgaca 33850666  T
Q  213 accccattcgtgtccaaacaata 235  Q
    || ||||||||||||||||||||    
T  33850665 acaccattcgtgtccaaacaata 33850643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 233 - 378
Target Start/End: Original strand, 42422112 - 42422257
Alignment:
Q  233 atactataacttttaagattgacatttactttgtagaccaccaaggagtgataagcgttgtgttttatatataaacttcctctctattgtttaaaagctc 332  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||| ||| ||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42422112 atactataacttttaagattgccatttgctttgtaggccactaagaagtgataagcgctgcattttatatataaacttcctctctattgtttaaaagctc 42422211  T
Q  333 ccgatgttggactattttcaaagcagcacaagagctacatgctctc 378  Q
    ||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  42422212 ccgatgttggaatattttcacaacagcacaagagctacatgctctc 42422257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 13 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 10831349 - 10831147
Alignment:
Q  13 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgc-aatgataaagttgagattaataaggcgtga 111  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||| || |  |||||||||| ||||||||||| |    
T  10831349 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaaagataatttgttgtttgttttagtaaccaagttgcaaaagtaaaagttgagagtaataaggcgt-a 10831251  T
Q  112 aacttgttagtattagagttccttgatcaagcttcgcacttaatctaatgat--catacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctca 209  Q
    ||   ||| | |||||||||||||||| |||| ||  || ||| ||||| ||  |||| |||||||||||  |||    |||||||||||||||| ||||    
T  10831250 aaaacgttggaattagagttccttgattaagcgtcaaacataacctaataatcacatatatggattctagagttttaccgatattatcacgtatcgctca 10831151  T
Q  210 acaa 213  Q
    ||||    
T  10831150 acaa 10831147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 13 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 11025141 - 11024939
Alignment:
Q  13 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgc-aatgataaagttgagattaataaggcgtga 111  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||| || |  |||||||||| ||||||||||| |    
T  11025141 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaaagataatttgttgtttgttttagtaaccaagttgcaaaagtaaaagttgagagtaataaggcgt-a 11025043  T
Q  112 aacttgttagtattagagttccttgatcaagcttcgcacttaatctaatgat--catacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctca 209  Q
    ||   ||| | |||||||||||||||| |||| ||  || ||| ||||| ||  |||| |||||||||||  |||    |||||||||||||||| ||||    
T  11025042 aaaacgttggaattagagttccttgattaagcgtcaaacataacctaataatcacatatatggattctagagttttaccgatattatcacgtatcgctca 11024943  T
Q  210 acaa 213  Q
    ||||    
T  11024942 acaa 11024939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 161 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 13774204 - 13774130
Alignment:
Q  161 gatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaacaaccccattcgtgtccaaacaata 235  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||    
T  13774204 gatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcgacaacatcattcgtgtccaaacaata 13774130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 13 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 21901413 - 21901193
Alignment:
Q  13 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttg-ttgtttgttttaataactaagttgc-aatgataaagttgagattaataaggcgtg 110  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||| ||||||| || | || |  |||||||||| ||||| |||||     
T  21901413 gaccgttcgacaccatatatcattctaagttgaaagataatttgtttgtttgttttagtaactaaatttcaaaagtaaaagttgagagtaatagggcgt- 21901315  T
Q  111 aaacttgttagtattagagttccttgatcaagcttcgcacttaatctaatgat--catacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctc 208  Q
    |||   ||||| || ||||||||||||| |||| ||  || ||||||||| ||  |||| |||||||||||| |||    |||||||||||||||| |||    
T  21901314 aaaaacgttagaatcagagttccttgattaagcgtcaaacataatctaataatcacatatatggattctagcgttttaccgatattatcacgtatcgctc 21901215  T
Q  209 aacaaccccattcgtgtccaaa 230  Q
    |||||    |||||||||||||    
T  21901214 aacaagattattcgtgtccaaa 21901193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 12 - 64
Target Start/End: Original strand, 1942043 - 1942095
Alignment:
Q  12 agaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgt 64  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  1942043 agaccgttcgacaccaaatatcattataagttaaacgataatttgttgtttgt 1942095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 169 - 230
Target Start/End: Original strand, 27954243 - 27954303
Alignment:
Q  169 atggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaacaaccccattcgtgtccaaa 230  Q
    ||||||||||||||| ||  ||||||||||| ||| ||||||||||  ||||||||||||||    
T  27954243 atggattctagctttactc-gatattatcacatattcctcaacaacatcattcgtgtccaaa 27954303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 164; Significance: 1e-87; HSPs: 22)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 13 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 13672040 - 13671817
Alignment:
Q  13 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaa-tgataaagttgagattaataaggcgtga 111  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  13672040 gaccgttcgacaccaaatatcattataagttaaacgataatttgttgtttatttgaataactaagttgcaaatgataaagttgagattaataatgcgtga 13671941  T
Q  112 aacttgttagtattagagttccttgatcaagcttcgcacttaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaac 211  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  13671940 aacttgttaggattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcgac 13671841  T
Q  212 aaccccattcgtgtccaaacaata 235  Q
    ||| | ||| ||||||||||||||    
T  13671840 aacactattagtgtccaaacaata 13671817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 161; E-Value: 9e-86
Query Start/End: Original strand, 16 - 235
Target Start/End: Original strand, 27670096 - 27670316
Alignment:
Q  16 cgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaa-tgataaagttgagattaataaggcgtgaaac 114  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  27670096 cgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaaatgataaagttgagattaataaagtgtgaaac 27670195  T
Q  115 ttgttagtattagagttccttgatcaagcttcgcacttaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaacaac 214  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||  || ||| ||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  27670196 ttgttaggattagagttccttgatcaagtgtcacacgtaacctaataatcatacatgaattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcgacaac 27670295  T
Q  215 cccattcgtgtccaaacaata 235  Q
      |||||||||||||||||||    
T  27670296 atcattcgtgtccaaacaata 27670316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 148; E-Value: 5e-78
Query Start/End: Original strand, 13 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 1428646 - 1428423
Alignment:
Q  13 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaa-tgataaagttgagattaataaggcgtga 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||  |||||||||||| ||||| | |||||| ||||||| |||||||||||||||||| |    
T  1428646 gaccgttcgacaccaaatatcatttcaagttaaacgatagttgattgtttgttttagtaactgaattgcaaatgataaaattgagattaataaggcgtaa 1428547  T
Q  112 aacttgttagtattagagttccttgatcaagcttcgcacttaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaac 211  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  1428546 aacttgttaggattagagttccttgatcgagcgtcgcacgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcgac 1428447  T
Q  212 aaccccattcgtgtccaaacaata 235  Q
    ||| ||||||||||||||||||||    
T  1428446 aacaccattcgtgtccaaacaata 1428423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 148; E-Value: 5e-78
Query Start/End: Original strand, 13 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 32328716 - 32328493
Alignment:
Q  13 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaa-tgataaagttgagattaataaggcgtga 111  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||| |||||||||||| ||||| |    
T  32328716 gaccgttcgacaccagatatcattctaagttaaaagataattggttgtttgttttagtaactaaattgcaaatgataaaattgagattaatagggcgtaa 32328617  T
Q  112 aacttgttagtattagagttccttgatcaagcttcgcacttaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaac 211  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| ||| || ||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  32328616 aacttgttaggattagagttccttgatcgagcgtcacatataacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcgac 32328517  T
Q  212 aaccccattcgtgtccaaacaata 235  Q
    ||| ||||||||||||||||||||    
T  32328516 aacaccattcgtgtccaaacaata 32328493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 148; E-Value: 5e-78
Query Start/End: Original strand, 13 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 34711780 - 34711557
Alignment:
Q  13 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaa-tgataaagttgagattaataaggcgtga 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||  |||||||||||| ||||||| |||||| ||||||| |||||||||||| ||||| |    
T  34711780 gaccgttcgacaccaaatatcatttcaagttaaacgatagttgattgtttgttttagtaactaaattgcaaatgataaaattgagattaatagggcgtaa 34711681  T
Q  112 aacttgttagtattagagttccttgatcaagcttcgcacttaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaac 211  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  34711680 aacttgttaggattagagttccttgatcgagcgtcgcacgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcgac 34711581  T
Q  212 aaccccattcgtgtccaaacaata 235  Q
    ||| ||||||||||||||||||||    
T  34711580 aacaccattcgtgtccaaacaata 34711557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 13 - 235
Target Start/End: Original strand, 4186684 - 4186907
Alignment:
Q  13 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaa-tgataaagttgagattaataaggcgtga 111  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||| |||||||||||| |||||      
T  4186684 gaccgttcgacaccaaatataattctaagttaaaagataattggttgtttgttttagtaactaaattgcaaatgataaaattgagattaatagggcgtag 4186783  T
Q  112 aacttgttagtattagagttccttgatcaagcttcgcacttaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaac 211  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||    
T  4186784 aacttgttaggattagagttccttgatcgagcgtcgcacgtaacctaatgatcatacatggattctaacttttctttgatattatcatgtatccctcgac 4186883  T
Q  212 aaccccattcgtgtccaaacaata 235  Q
    ||| ||||||||||||||||||||    
T  4186884 aacaccattcgtgtccaaacaata 4186907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 13 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 11058373 - 11058150
Alignment:
Q  13 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaa-tgataaagttgagattaataaggcgtga 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||  |||||||||||| ||||| | |||||| ||||||| |||||||||||| ||||| |    
T  11058373 gaccgttcgacaccaaatatcatttcaagttaaacgatagttgattgtttgttttagtaactgaattgcaaatgataaaattgagattaatagggcgtaa 11058274  T
Q  112 aacttgttagtattagagttccttgatcaagcttcgcacttaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaac 211  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  11058273 aacttgttaggattagagttccttgatcgagcgtcgcacgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcgac 11058174  T
Q  212 aaccccattcgtgtccaaacaata 235  Q
    ||| ||||||||||||||||||||    
T  11058173 aacaccattcgtgtccaaacaata 11058150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 13 - 235
Target Start/End: Original strand, 31547894 - 31548117
Alignment:
Q  13 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaat-gataaagttgagattaataaggcgtga 111  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||| | ||||||  |||||| |||||||||||| |||||||    
T  31547894 gaccgttcgacaccaaatatcattcttagttaaaagataattggttgtttgttttagtaactcaattgcaaacgataaaattgagattaatagggcgtga 31547993  T
Q  112 aacttgttagtattagagttccttgatcaagcttcgcacttaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaac 211  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  31547994 aacttgttaggattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaacctaatgatcacacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcgac 31548093  T
Q  212 aaccccattcgtgtccaaacaata 235  Q
    ||| | ||||||||||||||||||    
T  31548094 aacactattcgtgtccaaacaata 31548117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 141; E-Value: 8e-74
Query Start/End: Original strand, 13 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 4020459 - 4020235
Alignment:
Q  13 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaac-gataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaat-gataaagttgagattaataaggcgtg 110  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||  ||||||| ||||||||||||| ||||| | ||||||  |||||| |||||||||||| ||||||    
T  4020459 gaccgttcgacaccaaataccattccaagttaaaaagataattggttgtttgttttagtaactcatttgcaaacgataaaattgagattaatagggcgtg 4020360  T
Q  111 aaacttgttagtattagagttccttgatcaagcttcgcacttaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaa 210  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  4020359 aaacttgttaggattagagttccttgatcaagcgtcgcacgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcga 4020260  T
Q  211 caaccccattcgtgtccaaacaata 235  Q
    |||| | ||||||||||||||||||    
T  4020259 caacactattcgtgtccaaacaata 4020235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 141; E-Value: 8e-74
Query Start/End: Original strand, 13 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 4026885 - 4026661
Alignment:
Q  13 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaac-gataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaat-gataaagttgagattaataaggcgtg 110  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||  ||||||| ||||||||||||| ||||| | ||||||  |||||| |||||||||||| ||||||    
T  4026885 gaccgttcgacaccaaataccattccaagttaaaaagataattggttgtttgttttagtaactcatttgcaaacgataaaattgagattaatagggcgtg 4026786  T
Q  111 aaacttgttagtattagagttccttgatcaagcttcgcacttaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaa 210  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  4026785 aaacttgttaggattagagttccttgatcaagcgtcgcacgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcga 4026686  T
Q  211 caaccccattcgtgtccaaacaata 235  Q
    |||| | ||||||||||||||||||    
T  4026685 caacactattcgtgtccaaacaata 4026661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 141; E-Value: 8e-74
Query Start/End: Original strand, 13 - 235
Target Start/End: Original strand, 34655249 - 34655473
Alignment:
Q  13 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaac-gataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaat-gataaagttgagattaataaggcgtg 110  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||  ||||||| ||||||||||||| ||||| | ||||||  |||||| |||||||||||| ||||||    
T  34655249 gaccgttcgacaccaaataccattccaagttaaaaagataattggttgtttgttttagtaactcatttgcaaacgataaaattgagattaatagggcgtg 34655348  T
Q  111 aaacttgttagtattagagttccttgatcaagcttcgcacttaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaa 210  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  34655349 aaacttgttaggattagagttccttgatcaagcgtcgcacgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcga 34655448  T
Q  211 caaccccattcgtgtccaaacaata 235  Q
    |||| | ||||||||||||||||||    
T  34655449 caacactattcgtgtccaaacaata 34655473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 13 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 9864984 - 9864760
Alignment:
Q  13 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaac-gataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaat-gataaagttgagattaataaggcgtg 110  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||| ||||| | ||||||  |||||| |||||||||||| ||||||    
T  9864984 gaccgttcgacaccaaataccattctaagttaaaaagataattggttgtttgttttagtaactcaattgcaaacgataaaattgagattaatagggcgtg 9864885  T
Q  111 aaacttgttagtattagagttccttgatcaagcttcgcacttaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaa 210  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9864884 aaacttgttaggattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaacttaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaa 9864785  T
Q  211 caaccccattcgtgtccaaacaata 235  Q
    |||  | ||||||||||||||||||    
T  9864784 caatactattcgtgtccaaacaata 9864760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 13 - 235
Target Start/End: Original strand, 34648798 - 34649022
Alignment:
Q  13 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaac-gataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaat-gataaagttgagattaataaggcgtg 110  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||  ||||||| ||||||||||||| || || | ||||||  |||||| |||||||||||| ||||||    
T  34648798 gaccgttcgacaccaaataccattccaagttaaaaagataattggttgtttgttttagtatctcatttgcaaacgataaaattgagattaatagggcgtg 34648897  T
Q  111 aaacttgttagtattagagttccttgatcaagcttcgcacttaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaa 210  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  34648898 aaacttgttaggattagagttccttgatcaagcgtcgcacgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcga 34648997  T
Q  211 caaccccattcgtgtccaaacaata 235  Q
    |||| | ||||||||||||||||||    
T  34648998 caacactattcgtgtccaaacaata 34649022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 16 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 21262795 - 21262574
Alignment:
Q  16 cgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgtt-gtttgttttaataactaagttgcaatgataaa-gttgagattaataaggcgtgaaa 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||   |||| ||||||| ||||| ||||| |||    
T  21262795 cgttcgacaccaaatatcattctaagttaaaagataatttgtttgtttgttttagtaactaaattgcaaaagtaaaagttgagagtaatagggcgtaaaa 21262696  T
Q  114 cttgttagtattagagttccttgatcaagcttcgcacttaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaacaa 213  Q
    |||||||| |||||||||||||||| |||| || ||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  21262695 cttgttaggattagagttccttgattaagcgtcacacgtaacctaatgatcatacatggattctagtttttctttgatattatcacgtatccctcgacaa 21262596  T
Q  214 ccccattcgtgtccaaacaata 235  Q
    | ||||||||||||||||||||    
T  21262595 caccattcgtgtccaaacaata 21262574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 133; E-Value: 5e-69
Query Start/End: Original strand, 13 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 4738547 - 4738323
Alignment:
Q  13 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaac-gataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaat-gataaagttgagattaataaggcgtg 110  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||  ||||||| ||||||||||||| ||||| | ||||||  |||||| |||||||||||| ||||||    
T  4738547 gaccgttcgacaccaaataccattccaagttaaaaagataattggttgtttgttttagtaactcatttgcaaacgataaaattgagattaatagggcgtg 4738448  T
Q  111 aaacttgttagtattagagttccttgatcaagcttcgcacttaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaa 210  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |    
T  4738447 aaacttgttaggattagagttccttgatcaagcgtcgcacgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcatgtatccctcga 4738348  T
Q  211 caaccccattcgtgtccaaacaata 235  Q
    |||| | ||||| ||||||||||||    
T  4738347 caacactattcgagtccaaacaata 4738323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 23 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 7069916 - 7069702
Alignment:
Q  23 caccaaatatcattctaagttaaac-gataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaat-gataaagttgagattaataaggcgtgaaacttgtta 120  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||  ||||||| ||||||||||||| ||||| | ||||||  |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  7069916 caccaaataccattccaagttaaaaagataattggttgtttgttttagtaactcatttgcaaacgataaaattgagattaatagggcgtgaaacttgtta 7069817  T
Q  121 gtattagagttccttgatcaagcttcgcacttaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaacaaccccatt 220  Q
    | ||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| | |||    
T  7069816 ggattagagttccttgatcaagcgtcgcacgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcatgtatccctcgacaacactatt 7069717  T
Q  221 cgtgtccaaacaata 235  Q
    |||||||||||||||    
T  7069716 cgtgtccaaacaata 7069702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 12 - 168
Target Start/End: Original strand, 29906888 - 29907045
Alignment:
Q  12 agaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgc-aatgataaagttgagattaataaggcgtg 110  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  29906888 agaccgttcgacactaaatatcattctaagttaaaatataatttgttgtttgttttagtaactaaattgctaataataaaattgagattaataaggcgtg 29906987  T
Q  111 aaacttgttagtattagagttccttgatcaagcttcgcacttaatctaatgatcatac 168  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||| ||| ||||||| |||||    
T  29906988 aaacttgttaggattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaacctaatgaccatac 29907045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 94; E-Value: 9e-46
Query Start/End: Original strand, 12 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 30117492 - 30117335
Alignment:
Q  12 agaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgc-aatgataaagttgagattaataaggcgtg 110  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  30117492 agaccgttcgacactaaatatcattctaagttaaaatataatttgttgtttgttttagtaactaaattgctaataataaaattgagattaataaggcgtg 30117393  T
Q  111 aaacttgttagtattagagttccttgatcaagcttcgcacttaatctaatgatcatac 168  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||| ||| |||| || |||||    
T  30117392 aaacttgttaggattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaacctaaggaccatac 30117335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 13 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 7062707 - 7062578
Alignment:
Q  13 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaac-gataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaat-gataaagttgagattaataaggcgtg 110  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||  ||||||| ||||||||||||| ||||| | ||||||  |||||| |||||||||||| ||||||    
T  7062707 gaccgttcgacaccaaataccattccaagttaaaaagataattggttgtttgttttagtaactcatttgcaaacgataaaattgagattaatagggcgtg 7062608  T
Q  111 aaacttgttagtattagagttccttgatca 140  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  7062607 aaacttgttaggattagagttccttgatca 7062578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 92 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 1167630 - 1167538
Alignment:
Q  92 ttgagattaataaggcgtgaaacttgttagtattagagttccttgatcaagcttcgcacttaatctaatgatcatacatggattctagctttt 184  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||| || ||| ||| || ||||||||| | ||||||||| ||||    
T  1167630 ttgagattaataaggcgtgaaacttgttaggattagaattctttgatcaagcgtcacacataacctgatgatcatatacggattctagttttt 1167538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 173 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 7062578 - 7062516
Alignment:
Q  173 attctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaacaaccccattcgtgtccaaacaata 235  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||    
T  7062578 attctagcttttctttgatattatcatgtatccctcgacaacactattcgtgtccaaacaata 7062516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 37 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 10081762 - 10081567
Alignment:
Q  37 ctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaa-tgataaagttgagattaataaggcgtgaaacttgttagtattagagttcctt 135  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||  |  ||| |||||| ||||||||||| |||   ||| | |||||||||||||    
T  10081762 ctaagttaaaagataatttgttgtttgttttagaaactaagttgcaagagtaaaatttgagagtaataaggcgt-aaaaacgttggaattagagttcctt 10081664  T
Q  136 gatcaagcttcgcacttaatctaatgat--catacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaacaaccccattcgtgtccaaa 230  Q
    ||| |||| ||  || ||| ||||| ||  |||| |||||||||||| |||    ||||||||||| |||| ||||||||    |||||||||||||    
T  10081663 gattaagcgtcaaacataacctaataatcacatatatggattctagcgttttaccgatattatcacatatcgctcaacaagattattcgtgtccaaa 10081567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 164; Significance: 1e-87; HSPs: 19)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 13 - 235
Target Start/End: Original strand, 22359963 - 22360186
Alignment:
Q  13 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaa-tgataaagttgagattaataaggcgtga 111  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |    
T  22359963 gaccgttcgacaccaaatattattctaagttaaacgataatttgttgtttgtttgaataactaagttgcaaatgataaagttgagattaatagggcgtaa 22360062  T
Q  112 aacttgttagtattagagttccttgatcaagcttcgcacttaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaac 211  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  22360063 aacttgttaggattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaacctaatgaccatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcgac 22360162  T
Q  212 aaccccattcgtgtccaaacaata 235  Q
    ||| | ||||||||||||||||||    
T  22360163 aacactattcgtgtccaaacaata 22360186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 163; E-Value: 6e-87
Query Start/End: Original strand, 14 - 235
Target Start/End: Original strand, 4973563 - 4973785
Alignment:
Q  14 accgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaa-tgataaagttgagattaataaggcgtgaa 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  4973563 accgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaaatgataaaattgagattaataaggggtgaa 4973662  T
Q  113 acttgttagtattagagttccttgatcaagcttcgcacttaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaaca 212  Q
    ||||||||| || |||||||||||||||||| || ||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||    
T  4973663 acttgttaggatcagagttccttgatcaagcgtcacacgtaacataatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacatatccctcgaca 4973762  T
Q  213 accccattcgtgtccaaacaata 235  Q
    ||  |||||||||||||||||||    
T  4973763 acatcattcgtgtccaaacaata 4973785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 163; E-Value: 6e-87
Query Start/End: Original strand, 14 - 235
Target Start/End: Original strand, 5876218 - 5876440
Alignment:
Q  14 accgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaa-tgataaagttgagattaataaggcgtgaa 112  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||    
T  5876218 accgttcaacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgtttgaataactaagttgcaaatgataaagttgagattaatagggcgtaaa 5876317  T
Q  113 acttgttagtattagagttccttgatcaagcttcgcacttaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaaca 212  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  5876318 acttgttaggattagagttccttgatcaagcgtcgcacataacctaatgaccatacatggattctagattttctttgatattatcacgtatccctcgaca 5876417  T
Q  213 accccattcgtgtccaaacaata 235  Q
    || | ||||||||||||||||||    
T  5876418 acactattcgtgtccaaacaata 5876440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 160; E-Value: 4e-85
Query Start/End: Original strand, 13 - 235
Target Start/End: Original strand, 22313829 - 22314052
Alignment:
Q  13 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaa-tgataaagttgagattaataaggcgtga 111  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |    
T  22313829 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttatttgtttgaataactaagttgcaaatgataaagttgagattaatagggcgtaa 22313928  T
Q  112 aacttgttagtattagagttccttgatcaagcttcgcacttaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaac 211  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||| ||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  22313929 aacttgttaggattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaacctaatgaccgtacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcgac 22314028  T
Q  212 aaccccattcgtgtccaaacaata 235  Q
    ||| | ||||||||||||||||||    
T  22314029 aacactattcgtgtccaaacaata 22314052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 13 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 34357511 - 34357288
Alignment:
Q  13 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaa-tgataaagttgagattaataaggcgtga 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||  |||||||||||| ||||| | |||||| ||||||| |||||||||||| ||||| |    
T  34357511 gaccgttcgacaccaaatatcatttcaagttaaacgatagttgattgtttgttttagtaactgaattgcaaatgataaaattgagattaatagggcgtaa 34357412  T
Q  112 aacttgttagtattagagttccttgatcaagcttcgcacttaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaac 211  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  34357411 aacttgttaggattagagttccttgatcgagcgtcgcacgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcgac 34357312  T
Q  212 aaccccattcgtgtccaaacaata 235  Q
    ||| ||||||||||||||||||||    
T  34357311 aacaccattcgtgtccaaacaata 34357288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 13 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 34359302 - 34359079
Alignment:
Q  13 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaa-tgataaagttgagattaataaggcgtga 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||  |||||||||||| ||||| | |||||| ||||||| |||||||||||| ||||| |    
T  34359302 gaccgttcgacaccaaatatcatttcaagttaaacgatagttgattgtttgttttagtaactgaattgcaaatgataaaattgagattaatagggcgtaa 34359203  T
Q  112 aacttgttagtattagagttccttgatcaagcttcgcacttaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaac 211  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  34359202 aacttgttaggattagagttccttgatcgagcgtcgcacgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcgac 34359103  T
Q  212 aaccccattcgtgtccaaacaata 235  Q
    ||| ||||||||||||||||||||    
T  34359102 aacaccattcgtgtccaaacaata 34359079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 141; E-Value: 8e-74
Query Start/End: Original strand, 13 - 235
Target Start/End: Original strand, 2957857 - 2958081
Alignment:
Q  13 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagtt-aaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaat-gataaagttgagattaataaggcgtg 110  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||| ||||||| ||||||||||||| ||||| | ||||||  |||||| |||||||||||| ||||||    
T  2957857 gaccgttcgacaccaaataccattccaagttgaaaagataattggttgtttgttttagtaactcatttgcaaacgataaaattgagattaatagggcgtg 2957956  T
Q  111 aaacttgttagtattagagttccttgatcaagcttcgcacttaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaa 210  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  2957957 aaacttgttaggattagagttccttgatcaagcgtcgcacgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcga 2958056  T
Q  211 caaccccattcgtgtccaaacaata 235  Q
    |||| | ||||||||||||||||||    
T  2958057 caacactattcgtgtccaaacaata 2958081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 141; E-Value: 8e-74
Query Start/End: Original strand, 13 - 235
Target Start/End: Original strand, 2966326 - 2966550
Alignment:
Q  13 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagtt-aaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaat-gataaagttgagattaataaggcgtg 110  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||| ||||||| ||||||||||||| ||||| | ||||||  |||||| |||||||||||| ||||||    
T  2966326 gaccgttcgacaccaaataccattccaagttgaaaagataattggttgtttgttttagtaactcatttgcaaacgataaaattgagattaatagggcgtg 2966425  T
Q  111 aaacttgttagtattagagttccttgatcaagcttcgcacttaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaa 210  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  2966426 aaacttgttaggattagagttccttgatcaagcgtcgcacgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcga 2966525  T
Q  211 caaccccattcgtgtccaaacaata 235  Q
    |||| | ||||||||||||||||||    
T  2966526 caacactattcgtgtccaaacaata 2966550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 13 - 235
Target Start/End: Original strand, 29980458 - 29980681
Alignment:
Q  13 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaa-tgataaagttgagattaataaggcgtga 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||  |||||||||||| ||||| | |||||| ||||| | |||||||||||| ||||| |    
T  29980458 gaccgttcgacaccaaatatcatttcaagttaaacgatagttgattgtttgttttagtaactgaattgcaaatgatacaattgagattaatagggcgtaa 29980557  T
Q  112 aacttgttagtattagagttccttgatcaagcttcgcacttaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaac 211  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  29980558 aacttgttaggattagagttccttgatcgagcgtcgcacgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcgac 29980657  T
Q  212 aaccccattcgtgtccaaacaata 235  Q
    ||| ||||||||||||||||||||    
T  29980658 aacaccattcgtgtccaaacaata 29980681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 13 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 30041467 - 30041244
Alignment:
Q  13 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaa-tgataaagttgagattaataaggcgtga 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||  |||||||||||| ||||| | |||||| ||||| | |||||||||||| ||||| |    
T  30041467 gaccgttcgacaccaaatatcatttcaagttaaacgatagttgattgtttgttttagtaactgaattgcaaatgatacaattgagattaatagggcgtaa 30041368  T
Q  112 aacttgttagtattagagttccttgatcaagcttcgcacttaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaac 211  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  30041367 aacttgttaggattagagttccttgatcgagcgtcgcacgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcgac 30041268  T
Q  212 aaccccattcgtgtccaaacaata 235  Q
    ||| ||||||||||||||||||||    
T  30041267 aacaccattcgtgtccaaacaata 30041244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 13 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 25894873 - 25894649
Alignment:
Q  13 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaac-gataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaat-gataaagttgagattaataaggcgtg 110  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||  ||||||| ||||||||||||| ||||| | ||||||  |||||| |||||||||||| ||||||    
T  25894873 gaccgttcgacaccaaataccattccaagttaaaaagataattggttgtttgttttagtaactcatttgcaaacgataaaattgagattaatagggcgtg 25894774  T
Q  111 aaacttgttagtattagagttccttgatcaagcttcgcacttaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaa 210  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  25894773 aaacttgttaggattagagttccttgatcaagcgtcgcacgtaacctaatgatcatacatcgattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcga 25894674  T
Q  211 caaccccattcgtgtccaaacaata 235  Q
    |||| | ||||||||||||||||||    
T  25894673 caacactattcgtgtccaaacaata 25894649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 136; E-Value: 7e-71
Query Start/End: Original strand, 13 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 40958840 - 40958617
Alignment:
Q  13 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaa-tgataaagttgagattaataaggcgtga 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||| ||||||||| ||||||| |||||| ||||||| |||||||||||| ||||| |    
T  40958840 gaccgttcgacaccaaatatcattccaagttaaaagataattggttatttgttttagtaactaaattgcaaatgataaaattgagattaatagggcgtaa 40958741  T
Q  112 aacttgttagtattagagttccttgatcaagcttcgcacttaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaac 211  Q
     ||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||    
T  40958740 cacttgttaggattagagttccttgatcaagcgtcacacataacctaatgaccatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtattcctcgac 40958641  T
Q  212 aaccccattcgtgtccaaacaata 235  Q
    ||| | ||||||||||||||||||    
T  40958640 aacactattcgtgtccaaacaata 40958617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 121; E-Value: 7e-62
Query Start/End: Original strand, 12 - 235
Target Start/End: Original strand, 2438799 - 2439022
Alignment:
Q  12 agaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgc-aatgataaagttgagattaataaggcgtg 110  Q
    ||||||| ||| |||||| |||||| ||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||  ||||||||||||||||||    
T  2438799 agaccgtccgataccaaaaatcattataagttaaaagaaaatttgttgtttgttttagtaactaagttgcgaataataaaagtgagattaataaggcgtg 2438898  T
Q  111 aaacttgttagtattagagttccttgatcaagcttcgcacttaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaa 210  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| ||||||| || ||| ||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |    
T  2438899 aaacttgttaggattagagttccttaatcaagcgtcacacgtaacctaatga-catgcatggattctagcttttctttgatattatcatgtatccctcga 2438997  T
Q  211 caaccccattcgtgtccaaacaata 235  Q
    ||||  |||| ||||||||||||||    
T  2438998 caacatcatttgtgtccaaacaata 2439022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 13 - 233
Target Start/End: Original strand, 42150817 - 42151039
Alignment:
Q  13 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgtt-gtttgttttaataactaagttgc-aatgataaagttgagattaataaggcgtg 110  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||| |||||| |||||||||| ||||||| |||| || |  |||||||||| ||||| |||||     
T  42150817 gaccgttcgactccaaatatcattctaagttgaaagatagtttgtttgtttgttttagtaactaaattgctaaagtaaaagttgagagtaatagggcgta 42150916  T
Q  111 aaacttgttagtattagagttccttgatcaagcttcgcacttaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaa 210  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| ||||||| || ||| ||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |    
T  42150917 aaacttgttaggattagagttccttaatcaagcgtcacacataacctaatgaccatacatggattctagtttttctttgatattatcacgtatccctcga 42151016  T
Q  211 caaccccattcgtgtccaaacaa 233  Q
    |||| | ||||||||||||||||    
T  42151017 caacactattcgtgtccaaacaa 42151039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 13 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 12505996 - 12505765
Alignment:
Q  13 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttt------taa--taactaagttgc-aatgataaagttgagattaata 103  Q
    |||| |||||||||||||| |||| ||||||||| |||| |||||||||| |||      |||  |||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  12505996 gacctttcgacaccaaataccattttaagttaaaagatagtttgttgtttatttagaaactaagttaactatgttgcgaataataaagttgagattaata 12505897  T
Q  104 aggcgtgaaacttgttagtattagagttccttgatcaagcttcgcacttaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtat 203  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  || ||| ||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  12505896 aggcgtgaaacttgttaggattagagttccttgatcaagagtcccacgtaacctaatgattatacatggattctagcttctctttgatattatcacgtat 12505797  T
Q  204 ccctcaacaaccccattcgtgtccaaacaata 235  Q
    ||||| |||||  |||||||||||||||||||    
T  12505796 ccctcgacaacatcattcgtgtccaaacaata 12505765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 13 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 29414892 - 29414669
Alignment:
Q  13 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgtt-gtttgttttaataactaagttgcaatgataaagttgagattaataaggcgtga 111  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||  || |   ||    ||||| |||| ||||| ||||| |    
T  29414892 gaccgttcaacaccaaatatcattctaagttaaaagataatttgtttgtttgttttagtaagcaaatataaaattgaaagtcgagagtaatagggcgtaa 29414793  T
Q  112 aacttgttagtattagagttccttgatcaagcttcgcacttaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaac 211  Q
    ||||| |||| |||||| || ||||||||||| || ||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  29414792 aacttattaggattagaatttcttgatcaagcgtcacacataacctaatgaccatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcgac 29414693  T
Q  212 aaccccattcgtgtccaaacaata 235  Q
    |||  ||||| ||| |||||||||    
T  29414692 aacatcattcatgttcaaacaata 29414669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 13 - 213
Target Start/End: Original strand, 33794091 - 33794292
Alignment:
Q  13 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaa-tgataaagttgagattaataaggcgtga 111  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||  |||||||||||||  |  |||||||||| ||||||||||| |    
T  33794091 gaccgtttgacaccaaatatcattctaagttaaa-gataatttgttgtatgttttagaaactaagttgcaagagtaaaagttgagagtaataaggcgt-a 33794188  T
Q  112 aacttgttagtattagagttccttgatcaagcttcgcacttaatctaatgat--catacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctca 209  Q
    ||  |||| | |||||||||| ||||| |||| ||  || ||| ||||| ||  |||| |||||||||||| |||   ||||||||||||||||| ||||    
T  33794189 aaaatgttggaattagagttctttgattaagcgtcaaacataacctaataatcacatatatggattctagcgttttactgatattatcacgtatcgctca 33794288  T
Q  210 acaa 213  Q
    ||||    
T  33794289 acaa 33794292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 13 - 230
Target Start/End: Original strand, 9843348 - 9843566
Alignment:
Q  13 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaatgataaagttgagattaataaggcgtgaa 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||| |||| || |   || |  |||||||||| ||||| ||||| ||    
T  9843348 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgatagttgattgtttgttttagtaaccaaatataaaagtgaaagttgagagtaatagggcgt-aa 9843446  T
Q  113 acttgttagtattagagttccttgatcaagcttcgcacttaatctaatgat--catacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaa 210  Q
    |    || | ||||||||||||||||||||| ||  |  ||||||||| ||  |||| |||||||||||| |||    |||||||||||||||| |||||    
T  9843447 aaacattggaattagagttccttgatcaagcatcaaatataatctaataatcacatatatggattctagcgttttaccgatattatcacgtatcgctcaa 9843546  T
Q  211 caaccccattcgtgtccaaa 230  Q
    |||    |||||||||||||    
T  9843547 caagattattcgtgtccaaa 9843566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 13 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 2156341 - 2156125
Alignment:
Q  13 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagtt-aaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaatgataaagttgagattaataaggcgtga 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||   ||||||| |||| ||||   || |  |||||||||| ||||||||||| |    
T  2156341 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagtttaaaagataatttgtt---tgttttagtaaccaagtgtaaaagtgaaagttgagagtaataaggcgt-a 2156246  T
Q  112 aacttgttagtattagagttccttgatcaagcttcgcacttaatctaatgat--catacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctca 209  Q
    ||   ||| | |||||||||||||||| |||| ||  || ||| ||||| ||  |||| |||||||||||  |||    |||||||||||||||| ||||    
T  2156245 aaaacgttggaattagagttccttgattaagcgtcaaacataacctaataatcacatatatggattctagtgttttaccgatattatcacgtatcgctca 2156146  T
Q  210 acaaccccattcgtgtccaaa 230  Q
    ||||    |||||||||||||    
T  2156145 acaagattattcgtgtccaaa 2156125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 161; Significance: 9e-86; HSPs: 22)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 161; E-Value: 9e-86
Query Start/End: Original strand, 16 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 2021668 - 2021448
Alignment:
Q  16 cgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaa-tgataaagttgagattaataaggcgtgaaac 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || || ||||    
T  2021668 cgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgtttgaataactaagttgcaaatgataaagttgagattaatagggtgtaaaac 2021569  T
Q  115 ttgttagtattagagttccttgatcaagcttcgcacttaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaacaac 214  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||| || ||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  2021568 ttgttaggattagagttccttgatcaagcgtcacacataacctaatgaccatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcgacaac 2021469  T
Q  215 cccattcgtgtccaaacaata 235  Q
     | ||||||||||||||||||    
T  2021468 actattcgtgtccaaacaata 2021448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 160; E-Value: 4e-85
Query Start/End: Original strand, 13 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 21342105 - 21341882
Alignment:
Q  13 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaa-tgataaagttgagattaataaggcgtga 111  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||| |||||||||||| |||||||    
T  21342105 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaaagataattggttgtttgttttaatgactaaattgcaaatgataaaattgagattaatagggcgtga 21342006  T
Q  112 aacttgttagtattagagttccttgatcaagcttcgcacttaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaac 211  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  21342005 aacttgttaggattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcgac 21341906  T
Q  212 aaccccattcgtgtccaaacaata 235  Q
    ||| |||||| |||||||||||||    
T  21341905 aacaccattcatgtccaaacaata 21341882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 13 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 21332217 - 21331994
Alignment:
Q  13 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaa-tgataaagttgagattaataaggcgtga 111  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||||||||| ||||| || ||| ||||||| |||||||||||| |||||||    
T  21332217 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaaagatagttggttgtttgttttaatgactaaatttcaaatgataaaattgagattaatagggcgtga 21332118  T
Q  112 aacttgttagtattagagttccttgatcaagcttcgcacttaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaac 211  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  21332117 aacttgttaggattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcgac 21332018  T
Q  212 aaccccattcgtgtccaaacaata 235  Q
    ||| |||||| |||||||||||||    
T  21332017 aacaccattcatgtccaaacaata 21331994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 148; E-Value: 5e-78
Query Start/End: Original strand, 13 - 235
Target Start/End: Original strand, 12950795 - 12951018
Alignment:
Q  13 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaa-tgataaagttgagattaataaggcgtga 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||  |||||||||||| ||||| | |||||| ||||||| |||||||||||||||||| |    
T  12950795 gaccgttcgacaccaaatatcatttcaagttaaacgatagttgattgtttgttttagtaactgaattgcaaatgataaaattgagattaataaggcgtaa 12950894  T
Q  112 aacttgttagtattagagttccttgatcaagcttcgcacttaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaac 211  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  12950895 aacttgttaggattagagttccttgatcgagcgtcgcacgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcgac 12950994  T
Q  212 aaccccattcgtgtccaaacaata 235  Q
    ||| ||||||||||||||||||||    
T  12950995 aacaccattcgtgtccaaacaata 12951018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 13 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 16856709 - 16856487
Alignment:
Q  13 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaa-tgataaagttgagattaataaggcgtga 111  Q
    |||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |    
T  16856709 gaccgttcgacagcaaatatcattcaaagttaaa-gataatttgttgtttgtttgaataactaagttgcaaatgataaagttgagattaatagggcgtaa 16856611  T
Q  112 aacttgttagtattagagttccttgatcaagcttcgcacttaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaac 211  Q
     ||||||||| ||||||||| ||||||||||| || ||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||    
T  16856610 nacttgttaggattagagtttcttgatcaagcgtcacacataacctaatgaccatacatggattctagcttttctttgatattatcacatatccctcgac 16856511  T
Q  212 aaccccattcgtgtccaaacaata 235  Q
    ||| ||||||||||||||||||||    
T  16856510 aacaccattcgtgtccaaacaata 16856487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 13 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 16817552 - 16817330
Alignment:
Q  13 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaa-tgataaagttgagattaataaggcgtga 111  Q
    |||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |    
T  16817552 gaccgttcgacagcaaatatcattcaaagttaaa-gataatttgttgtttgtttgaataactaagttgcaaatgataaagttgagattaatagggcgtaa 16817454  T
Q  112 aacttgttagtattagagttccttgatcaagcttcgcacttaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaac 211  Q
     ||||||||| ||||||||| ||||||||||| || ||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||    
T  16817453 cacttgttaggattagagtttcttgatcaagcgtcacacataacctaatgaccatacatggattctagcttttctttgatattatcacatatccctcgac 16817354  T
Q  212 aaccccattcgtgtccaaacaata 235  Q
    ||| ||||||||||||||||||||    
T  16817353 aacaccattcgtgtccaaacaata 16817330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 13 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 34835035 - 34834812
Alignment:
Q  13 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaa-tgataaagttgagattaataaggcgtga 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||  |||||||||||| ||||||  |||||| ||||||| |||||||||||| ||||| |    
T  34835035 gaccgttcgacaccaaatatcatttcaagttaaacgatagttgattgtttgttttagtaactagattgcaaatgataaaattgagattaatagggcgtaa 34834936  T
Q  112 aacttgttagtattagagttccttgatcaagcttcgcacttaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaac 211  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  34834935 aacttgttaggattagagttccttgatcgagcgtcgcacgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcgac 34834836  T
Q  212 aaccccattcgtgtccaaacaata 235  Q
    ||| ||||||||||||||||||||    
T  34834835 aacaccattcgtgtccaaacaata 34834812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 13 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 34841479 - 34841256
Alignment:
Q  13 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaa-tgataaagttgagattaataaggcgtga 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||  |||||||||||| ||||||  |||||| ||||||| |||||||||||| ||||| |    
T  34841479 gaccgttcgacaccaaatatcatttcaagttaaacgatagttgattgtttgttttagtaactagattgcaaatgataaaattgagattaatagggcgtaa 34841380  T
Q  112 aacttgttagtattagagttccttgatcaagcttcgcacttaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaac 211  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  34841379 aacttgttaggattagagttccttgatcgagcgtcgcacgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcgac 34841280  T
Q  212 aaccccattcgtgtccaaacaata 235  Q
    ||| ||||||||||||||||||||    
T  34841279 aacaccattcgtgtccaaacaata 34841256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 13 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 42931595 - 42931372
Alignment:
Q  13 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaa-tgataaagttgagattaataaggcgtga 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||| |||||||||||| |||||||    
T  42931595 gaccgttcgacaccaaatatcattccaagttaacagataattggttgtttgttttagtaactaaattgcaaatgataaaattgagattaatagggcgtga 42931496  T
Q  112 aacttgttagtattagagttccttgatcaagcttcgcacttaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaac 211  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||   || ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  42931495 aacttgttaggattagagttccttgatcaaatgtcacacgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcgac 42931396  T
Q  212 aaccccattcgtgtccaaacaata 235  Q
    ||| | ||||||||||||||||||    
T  42931395 aacactattcgtgtccaaacaata 42931372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 141; E-Value: 8e-74
Query Start/End: Original strand, 13 - 235
Target Start/End: Original strand, 29484925 - 29485149
Alignment:
Q  13 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaac-gataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaat-gataaagttgagattaataaggcgtg 110  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||  ||||||| ||||||||||||| ||||| | ||||||  |||||| |||||||||||| ||||||    
T  29484925 gaccgttcgacaccaaataccattccaagttaaaaagataattggttgtttgttttagtaactcatttgcaaacgataaaattgagattaatagggcgtg 29485024  T
Q  111 aaacttgttagtattagagttccttgatcaagcttcgcacttaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaa 210  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  29485025 aaacttgttaggattagagttccttgatcaagcgtcgcacgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcga 29485124  T
Q  211 caaccccattcgtgtccaaacaata 235  Q
    |||| | ||||||||||||||||||    
T  29485125 caacactattcgtgtccaaacaata 29485149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 141; E-Value: 8e-74
Query Start/End: Original strand, 13 - 235
Target Start/End: Original strand, 45011981 - 45012205
Alignment:
Q  13 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaac-gataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaat-gataaagttgagattaataaggcgtg 110  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||  ||||||| ||||||||||||| ||||| | ||||||  |||||| |||||||||||| ||||||    
T  45011981 gaccgttcgacaccaaataccattccaagttaaaaagataattggttgtttgttttagtaactcatttgcaaacgataaaattgagattaatagggcgtg 45012080  T
Q  111 aaacttgttagtattagagttccttgatcaagcttcgcacttaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaa 210  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  45012081 aaacttgttaggattagagttccttgatcaagcgtcgcacgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcga 45012180  T
Q  211 caaccccattcgtgtccaaacaata 235  Q
    |||| | ||||||||||||||||||    
T  45012181 caacactattcgtgtccaaacaata 45012205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 12 - 235
Target Start/End: Original strand, 2164026 - 2164250
Alignment:
Q  12 agaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaa-tgataaagttgagattaataaggcgtg 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||  |||||||||||| ||||| | |||||| ||||| | |||||||||||| |||||     
T  2164026 agaccgttcgacaccaaatatcatttcaagttaaacgatagttgattgtttgttttagtaactgaattgcaaatgatacaattgagattaatagggcgta 2164125  T
Q  111 aaacttgttagtattagagttccttgatcaagcttcgcacttaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaa 210  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||| ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  2164126 aaacttgttaggattagagttccttgatcgagcgtcgcacgtaacctaatgattatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcga 2164225  T
Q  211 caaccccattcgtgtccaaacaata 235  Q
    |||| ||||||||||||||||||||    
T  2164226 caacaccattcgtgtccaaacaata 2164250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 13 - 235
Target Start/End: Original strand, 15852548 - 15852772
Alignment:
Q  13 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaac-gataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaat-gataaagttgagattaataaggcgtg 110  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||  ||||||| ||||||||||||| ||||| | ||||||  |||||| |||||||||||| ||||||    
T  15852548 gaccgttcgacaccaaataccattccaagttaaaaagataattggttgtttgttttagtaactcaattgcaaacgataaaattgagattaatagggcgtg 15852647  T
Q  111 aaacttgttagtattagagttccttgatcaagcttcgcacttaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaa 210  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  15852648 aaacttgttaggattagagttccttgatcaagcgtcacacttaacctaatgatcacacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcga 15852747  T
Q  211 caaccccattcgtgtccaaacaata 235  Q
    |||| | ||||||||||||||||||    
T  15852748 caacactattcgtgtccaaacaata 15852772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 13 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 36782408 - 36782184
Alignment:
Q  13 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaac-gataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaa-tgataaagttgagattaataaggcgtg 110  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||  ||||||| ||||||||||||| ||||| | |||||| ||||||| |||||||||||| |||||     
T  36782408 gaccgttcgacaccaaataccattccaagttaaaaagataattggttgtttgttttagtaactcaattgcaaatgataaaattgagattaatagggcgta 36782309  T
Q  111 aaacttgttagtattagagttccttgatcaagcttcgcacttaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaa 210  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| ||| || ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  36782308 aaacttgttaggattagagttccttgatcgagcgtcacacgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcga 36782209  T
Q  211 caaccccattcgtgtccaaacaata 235  Q
    |||| ||||||||||||||||||||    
T  36782208 caacaccattcgtgtccaaacaata 36782184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 13 - 235
Target Start/End: Original strand, 43267857 - 43268081
Alignment:
Q  13 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgtt-gtttgttttaataactaagttgcaa-tgataaagttgagattaataaggcgtg 110  Q
    |||||||||||||||| |||||||  |||||||| ||||| ||||| |||||||||| ||||| | |||||| ||||||| |||||||||||| |||||     
T  43267857 gaccgttcgacaccaattatcatttcaagttaaaagataagttgtttgtttgttttagtaactgaattgcaaatgataaaattgagattaatagggcgta 43267956  T
Q  111 aaacttgttagtattagagttccttgatcaagcttcgcacttaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaa 210  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  43267957 aaacttgttaggattagagttccttgatcgagcgtcgcacgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcga 43268056  T
Q  211 caaccccattcgtgtccaaacaata 235  Q
    |||| ||||||||||||||||||||    
T  43268057 caacaccattcgtgtccaaacaata 43268081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 136; E-Value: 7e-71
Query Start/End: Original strand, 13 - 235
Target Start/End: Original strand, 2157611 - 2157834
Alignment:
Q  13 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaa-tgataaagttgagattaataaggcgtga 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||  |||||||||||| ||||| | |||||| ||||| | |||||||||||| ||||| |    
T  2157611 gaccgttcgacaccaaatatcatttcaagttaaacgatagttgattgtttgttttagtaactgaattgcaaatgatacaattgagattaatagggcgtaa 2157710  T
Q  112 aacttgttagtattagagttccttgatcaagcttcgcacttaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaac 211  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  2157711 aacttgttaggattagagttccttgatcgagcgtcgcacgtaacctaatgatcatacatggattctatcttttctttgatattatcacgtatccctcgac 2157810  T
Q  212 aaccccattcgtgtccaaacaata 235  Q
    ||| ||||||||||||||||||||    
T  2157811 aacaccattcgtgtccaaacaata 2157834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 13 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 13902180 - 13901957
Alignment:
Q  13 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaa-tgataaagttgagattaataaggcgtga 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||  |||||||||||| ||||| | |||||| ||||| | |||||||||||| ||||| |    
T  13902180 gaccgttcgacaccaaatatcatttcaagttaaacgatagttgattgtttgttttagtaactgaattgcaaatgatacaattgagattaatagggcgtaa 13902081  T
Q  112 aacttgttagtattagagttccttgatcaagcttcgcacttaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaac 211  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||    
T  13902080 aacttgttaggattagagttccttgatcgagcgtcgcacgtaacctaatgagcatacatggattctagcttgtctttgatattatcacgtatccctcgac 13901981  T
Q  212 aaccccattcgtgtccaaacaata 235  Q
    ||| ||||||||||||||||||||    
T  13901980 aacaccattcgtgtccaaacaata 13901957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 13 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 21068181 - 21067958
Alignment:
Q  13 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgtt-gtttgttttaataactaagttgcaatgataaa-gttgagattaataaggcgtg 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||| ||||||| ||||||   |||| ||||||| ||||| || |||    
T  21068181 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaaagataatttgtttgtttgtattagtaactaaattgcaaaagtaaaagttgagagtaatagggtgtg 21068082  T
Q  111 aaacttgttagtattagagttccttgatcaagcttcgcacttaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaa 210  Q
    |||||| |||| ||||||||||||||| || || || ||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21068081 aaactt-ttaggattagagttccttgagcaggcatcacacgtaacctaatgaccatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaa 21067983  T
Q  211 caaccccattcgtgtccaaacaata 235  Q
    |||| ||||||||||||||||||||    
T  21067982 caacaccattcgtgtccaaacaata 21067958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 86 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 45700793 - 45700644
Alignment:
Q  86 ataaagttgagattaataaggcgtgaaacttgttagtattagagttccttgatcaagcttcgcacttaatctaatgatcatacatggattctagcttttc 185  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | || ||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  45700793 ataaagttgagattaataaggcgtgaaacttgttagaattagagttccttgatcaaacgtcacacataacctaatgatcatacctggattctagcttttc 45700694  T
Q  186 tttgatattatcacgtatccctcaacaaccccattcgtgtccaaacaata 235  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||    
T  45700693 tttgatattatcacgtatccctcgacaacatcattcgtgtccaaacaata 45700644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 12 - 230
Target Start/End: Original strand, 41455604 - 41455823
Alignment:
Q  12 agaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaatgataaagttgagattaataaggcgtga 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||   || |  |||||||||| ||||||||||| |    
T  41455604 agaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaaagataatttgttgtttgttttagtaaccaagtgcaaaagtaaaagttgagagtaataaggcgt-a 41455702  T
Q  112 aacttgttagtattagagttccttgatcaagcttcgcacttaatctaatgat--catacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctca 209  Q
    ||   ||| | |||||||||||||||| |||| ||  || ||| ||||| ||  |||| |||||||| | | |||    |||||||||||||||| ||||    
T  41455703 aaaacgttggaattagagttccttgattaagcgtcaaacataacctaataatcacatatatggattccaccgttttaccgatattatcacgtatcactca 41455802  T
Q  210 acaaccccattcgtgtccaaa 230  Q
    ||||    |||||||||||||    
T  41455803 acaagattattcgtgtccaaa 41455823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 71 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 11910116 - 11909981
Alignment:
Q  71 aactaagttgcaatgataaagttgagattaataaggcgtgaaacttgttagtattagagttccttgatcaagcttcgcacttaatctaatga--tcatac 168  Q
    |||||| ||||||  |||||  ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||  ||||| |||||   ||||     
T  11910116 aactaatttgcaagaataaaagtgagattaataaggcgtaaaacttgttaggattagagttccttgatcaagcatcccatataatccaatgaccacatat 11910017  T
Q  169 atggattctagcttttctttgatattatcacgtatc 204  Q
    | ||||||||||||||  |  |||||||||||||||    
T  11910016 acggattctagcttttaatctatattatcacgtatc 11909981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 88 - 214
Target Start/End: Original strand, 13162892 - 13163020
Alignment:
Q  88 aaagttgagattaataaggcgtgaaacttgttagtattagagttccttgatcaagcttcgcacttaatctaatgat--catacatggattctagcttttc 185  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||| ||||  |||||  |||  |||||||  |||| |  |||||||||||||     
T  13162892 aaagttgagagtaataaggcgtaaaacttgttaggattagagttcattgaccaagaatcgcatataacataatgatcacatatacagattctagctttta 13162991  T
Q  186 tttgatattatcacgtatccctcaacaac 214  Q
     |  ||||||||||||||||||| |||||    
T  13162992 atcaatattatcacgtatccctcgacaac 13163020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 160; Significance: 4e-85; HSPs: 18)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 160; E-Value: 4e-85
Query Start/End: Original strand, 13 - 235
Target Start/End: Original strand, 12768743 - 12768966
Alignment:
Q  13 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaa-tgataaagttgagattaataaggcgtga 111  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  12768743 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaatgataattcgttgtttgttttaataactaaattgcaaatgataaagttgagattaataaggcgtga 12768842  T
Q  112 aacttgttagtattagagttccttgatcaagcttcgcacttaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaac 211  Q
    |||||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||| ||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||    
T  12768843 aacttgttaggattagagttctttgatcaagcttcacacgtaacctaatgattatacatggattctagattttctttgatattatcatgtatccctcgac 12768942  T
Q  212 aaccccattcgtgtccaaacaata 235  Q
    ||  ||||||||||||||||||||    
T  12768943 aagaccattcgtgtccaaacaata 12768966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 13 - 235
Target Start/End: Original strand, 7311348 - 7311571
Alignment:
Q  13 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaa-tgataaagttgagattaataaggcgtga 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||  |||||||||||| ||||| | |||||| ||||||| |||||||||||| ||||| |    
T  7311348 gaccgttcgacaccaaatatcatttcaagttaaacgatagttgattgtttgttttagtaactgaattgcaaatgataaaattgagattaatagggcgtaa 7311447  T
Q  112 aacttgttagtattagagttccttgatcaagcttcgcacttaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaac 211  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  7311448 aacttgttaggattagagttccttgatcgagcgtcgcacgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcgac 7311547  T
Q  212 aaccccattcgtgtccaaacaata 235  Q
    ||| ||||||||||||||||||||    
T  7311548 aacaccattcgtgtccaaacaata 7311571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 13 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 8013543 - 8013320
Alignment:
Q  13 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaa-tgataaagttgagattaataaggcgtga 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||  |||||||||||| ||||| | |||||| ||||||| |||||||||||| ||||| |    
T  8013543 gaccgttcgacaccaaatatcatttcaagttaaacgatagttgattgtttgttttagtaactgaattgcaaatgataaaattgagattaatagggcgtaa 8013444  T
Q  112 aacttgttagtattagagttccttgatcaagcttcgcacttaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaac 211  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  8013443 aacttgttaggattagagttccttgatcgagcgtcgcacgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcgac 8013344  T
Q  212 aaccccattcgtgtccaaacaata 235  Q
    ||| ||||||||||||||||||||    
T  8013343 aacaccattcgtgtccaaacaata 8013320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 13 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 36005705 - 36005482
Alignment:
Q  13 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaa-tgataaagttgagattaataaggcgtga 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||  |||||||||||| ||||| | |||||| ||||||| |||||||||||| ||||| |    
T  36005705 gaccgttcgacaccaaatatcatttcaagttaaacgatagttgattgtttgttttagtaactgaattgcaaatgataaaattgagattaatagggcgtaa 36005606  T
Q  112 aacttgttagtattagagttccttgatcaagcttcgcacttaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaac 211  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  36005605 aacttgttaggattagagttccttgatcgagcgtcgcacgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcgac 36005506  T
Q  212 aaccccattcgtgtccaaacaata 235  Q
    ||| ||||||||||||||||||||    
T  36005505 aacaccattcgtgtccaaacaata 36005482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 141; E-Value: 8e-74
Query Start/End: Original strand, 12 - 235
Target Start/End: Original strand, 36075965 - 36076189
Alignment:
Q  12 agaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaa-tgataaagttgagattaataaggcgtg 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||| ||  |||||||||||| ||||| | |||||| ||||||| |||||||||||| |||||     
T  36075965 agaccgttcgacaccaaatatcatttcaagttaaacaatagttgattgtttgttttagtaactgaattgcaaatgataaaattgagattaatagggcgta 36076064  T
Q  111 aaacttgttagtattagagttccttgatcaagcttcgcacttaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaa 210  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  36076065 aaacttgttaggattagagttccttgatcgagcgtcgcacgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcga 36076164  T
Q  211 caaccccattcgtgtccaaacaata 235  Q
    |||| ||||||||||||||||||||    
T  36076165 caacaccattcgtgtccaaacaata 36076189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 141; E-Value: 8e-74
Query Start/End: Original strand, 13 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 36425954 - 36425730
Alignment:
Q  13 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaac-gataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaat-gataaagttgagattaataaggcgtg 110  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||  ||||||| ||||||||||||| ||||| | ||||||  |||||| |||||||||||| ||||||    
T  36425954 gaccgttcgacaccaaataccattccaagttaaaaagataattggttgtttgttttagtaactcatttgcaaacgataaaattgagattaatagggcgtg 36425855  T
Q  111 aaacttgttagtattagagttccttgatcaagcttcgcacttaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaa 210  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  36425854 aaacttgttaggattagagttccttgatcaagcgtcgcacgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcga 36425755  T
Q  211 caaccccattcgtgtccaaacaata 235  Q
    |||| | ||||||||||||||||||    
T  36425754 caacactattcgtgtccaaacaata 36425730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 13 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 6464799 - 6464576
Alignment:
Q  13 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaa-tgataaagttgagattaataaggcgtga 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||  |||||||||||| ||||| | |||||| ||||||| |||||||||||| ||||| |    
T  6464799 gaccgttcgacaccaaatatcatttcaagttaaacgatagttgattgtttgttttagtaactgaattgcaaatgataaaattgagattaatagggcgtaa 6464700  T
Q  112 aacttgttagtattagagttccttgatcaagcttcgcacttaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaac 211  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||| ||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  6464699 aactcgttaggattagagttccttgatcgagcgtcgcacgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcgac 6464600  T
Q  212 aaccccattcgtgtccaaacaata 235  Q
    ||| ||||||||||||||||||||    
T  6464599 aacaccattcgtgtccaaacaata 6464576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 13 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 11358417 - 11358193
Alignment:
Q  13 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaac-gataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaat-gataaagttgagattaataaggcgtg 110  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||  ||||||| ||||||||||||| ||||| | ||||||  |||||| |||||||||||| ||||||    
T  11358417 gaccgttcgacaccaaataccattccaagttaaaaagataattggttgtttgttttagtaactcaattgcaaacgataaaattgagattaatagggcgtg 11358318  T
Q  111 aaacttgttagtattagagttccttgatcaagcttcgcacttaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaa 210  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  11358317 aaacttgttaggattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcga 11358218  T
Q  211 caaccccattcgtgtccaaacaata 235  Q
    |||| | ||||||||||||||||||    
T  11358217 caacactattcgtgtccaaacaata 11358193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 133; E-Value: 5e-69
Query Start/End: Original strand, 13 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 36022023 - 36021799
Alignment:
Q  13 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgtt-gtttgttttaataactaagttgcaa-tgataaagttgagattaataaggcgtg 110  Q
    |||||||||||||||| |||||||  |||| ||| ||||| ||||| |||||||||| ||||| | |||||| ||||||| |||||||||||| |||||     
T  36022023 gaccgttcgacaccaattatcatttcaagtaaaaagataagttgtttgtttgttttagtaactgaattgcaaatgataaaattgagattaatagggcgta 36021924  T
Q  111 aaacttgttagtattagagttccttgatcaagcttcgcacttaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaa 210  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  36021923 aaacttgttaggattagagttccttgatcgagcgtcgcacgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcga 36021824  T
Q  211 caaccccattcgtgtccaaacaata 235  Q
    |||| ||||||||||||||||||||    
T  36021823 caacaccattcgtgtccaaacaata 36021799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 13 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 41242339 - 41242116
Alignment:
Q  13 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaa-tgataaagttgagattaataaggcgtga 111  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||  |||||||| |||| ||  |||||||||||| ||||| | |||||| ||||||| |||||||||||| ||||| |    
T  41242339 gaccgtttgacaccaaatatcttttcaagttaaatgatagttgattgtttgttttagtaactgaattgcaaatgataaaattgagattaatagggcgtaa 41242240  T
Q  112 aacttgttagtattagagttccttgatcaagcttcgcacttaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaac 211  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  41242239 aacttgttaggattagagttccttgatcgagcgtcgcacgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcgac 41242140  T
Q  212 aaccccattcgtgtccaaacaata 235  Q
    ||| ||||||||||||||||||||    
T  41242139 aacaccattcgtgtccaaacaata 41242116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 126; E-Value: 7e-65
Query Start/End: Original strand, 19 - 235
Target Start/End: Original strand, 15012393 - 15012610
Alignment:
Q  19 tcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaatgataaa-gttgagattaataaggcgtgaaacttg 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||   |||| ||||||| ||||| || ||||||||||    
T  15012393 tcgacaccaaatatcattctaagttaaaagataatttgttgtttgttttagttactaagttgcaagagtaaaagttgagagtaatagggtgtgaaacttg 15012492  T
Q  118 ttagtattagagttccttgatcaagcttcgcacttaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaacaacccc 217  Q
    |||| ||||||||||||| ||||||| || |||  || |||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||    
T  15012493 ttaggattagagttccttaatcaagcgtcacacggaacctaatgactatacatggattctatcttttctttgatattatcacgtatccctcgacaacacc 15012592  T
Q  218 attcgtgtccaaacaata 235  Q
    ||||||||||||||||||    
T  15012593 attcgtgtccaaacaata 15012610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 13 - 235
Target Start/End: Original strand, 1238212 - 1238436
Alignment:
Q  13 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttg-ttgtttgttttaataactaagttg-caatgataaagttgagattaataaggcgtg 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||| ||||||| |||  || |  |||||||||| |||||  ||||     
T  1238212 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaaaaataatttgtttgtttgttttagtaactaaattgaaaaagtaaaagttgagagtaatagagcgta 1238311  T
Q  111 aaacttgttagtattagagttccttgatcaagcttcgcacttaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaa 210  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||  ||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  1238312 aaacttgttaggattagagttccttgatcaagcgtcacaaataacctgatgaccatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcga 1238411  T
Q  211 caaccccattcgtgtccaaacaata 235  Q
    |||| | ||||||||||||||||||    
T  1238412 caacactattcgtgtccaaacaata 1238436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 13 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 16710892 - 16710668
Alignment:
Q  13 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgtt-gtttgttttaataactaagttgc-aatgataaagttgagattaataaggcgtg 110  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||| | |||| |||||||||| ||||||| |||| || |  ||||||||||  |||| ||| |     
T  16710892 gaccgttcgactccaaatatcattctaagttgaaagatagtatgtttgtttgttttagtaactaaattgctaaagtaaaagttgagagcaatagggcata 16710793  T
Q  111 aaacttgttagtattagagttccttgatcaagcttcgcacttaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaa 210  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| ||| || ||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  16710792 aaacttgttaggattagagttccttgatcgagcgtcacacgtaacctaatgatcatacatgaattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcga 16710693  T
Q  211 caaccccattcgtgtccaaacaata 235  Q
    |||| ||||||||||||||||||||    
T  16710692 caacaccattcgtgtccaaacaata 16710668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 9 - 235
Target Start/End: Original strand, 31017394 - 31017608
Alignment:
Q  9 catagaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaatgataaagttgagattaataaggcg 108  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||||              || ||||||||||    
T  31017394 catagaccgttcgacaccaaatatcattttaagttaaaagataatttgttgtttgttttagtaacaaagttgc--------------gaataataaggcg 31017479  T
Q  109 tgaaacttgttagtattagagttccttgatcaagcttcgcacttaatctaatgatcata--catggattctagcttttctttgatattatcacgtatccc 206  Q
    ||||||| ||||| |||||||||| || ||||||| || ||  ||| ||||||| ||||  |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  31017480 tgaaactagttaggattagagttctttaatcaagcgtcacatgtaacctaatgaccatatacatggattctaatttttctttgatattatcacgtatccc 31017579  T
Q  207 tcaacaaccccattcgtgtccaaacaata 235  Q
    || ||||| ||||||||||||||| ||||    
T  31017580 tcgacaacaccattcgtgtccaaaaaata 31017608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 43 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 45068609 - 45068416
Alignment:
Q  43 taaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaatgataaa-gttgagattaataaggcgtgaaacttgttagtattagagttccttgatcaa 141  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||   |||| ||||||| ||||||  ||| ||| ||||||| |||||||||| || |||||    
T  45068609 taaaagataatttgttgtttgttttagtaactaagttgcaagagtaaaagttgagagtaataaaacgtaaaatttgttaggattagagttctttaatcaa 45068510  T
Q  142 gcttcgcacttaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaacaaccccattcgtgtccaaacaata 235  Q
    || |||||| ||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||| | ||| |||||||||||| |||||||    
T  45068509 gcgtcgcacgtaacctaatgaccatacatggattctagtttttctttgatattatcatgtaaccctcgataacaccattcgtgtccgaacaata 45068416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 92 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 26250734 - 26250591
Alignment:
Q  92 ttgagattaataaggcgtgaaacttgttagtattagagttccttgatcaagcttcgcacttaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgat 191  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||| || ||| ||||||||| | ||||||||| || |||||||||||||||    
T  26250734 ttgagattaataaggcgtgaaatttgttaggattagagttccttaatcaagcgtcacacgtaatctaataaccatacatggtttatagcttttctttgat 26250635  T
Q  192 attatcacgtatccctcaacaaccccattcgtgtccaaacaata 235  Q
    ||||||||||||||||| ||||   |||||||||||||||||||    
T  26250634 attatcacgtatccctcgacaatatcattcgtgtccaaacaata 26250591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 13 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 7934150 - 7933931
Alignment:
Q  13 gaccgttcgacaccaaatatcattctaa-gttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaatgataaagttgagattaataaggcgtga 111  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||  | |||||||||| |||| || |   || |  |||||||||| ||||| ||||| |    
T  7934150 gaccgttcgacaccaaatatcattctaaggttaaacgatagttgatggtttgttttagtaaccaaatataaaagtgaaagttgagagtaatagggcgt-a 7934052  T
Q  112 aacttgttagtattagagttccttgatcaagcttcgcacttaatctaatgat--catacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctca 209  Q
    ||    || | ||||||||||||||||||||| ||  |  ||||||||| ||  |||| |||||||||||| |||    |||||||||||||||| ||||    
T  7934051 aaaacattggaattagagttccttgatcaagcatcaaatataatctaataatcacatatatggattctagcgttttaccgatattatcacgtatcgctca 7933952  T
Q  210 acaaccccattcgtgtccaaa 230  Q
    ||||    |||||||||||||    
T  7933951 acaagattattcgtgtccaaa 7933931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 13 - 66
Target Start/End: Original strand, 14393733 - 14393786
Alignment:
Q  13 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttt 66  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||| | | ||| |||||||||||    
T  14393733 gaccgttcgacaccaaatatcattttaagttaaaggttgattggttgtttgttt 14393786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 160; Significance: 4e-85; HSPs: 19)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 160; E-Value: 4e-85
Query Start/End: Original strand, 13 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 4311709 - 4311486
Alignment:
Q  13 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaa-tgataaagttgagattaataaggcgtga 111  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |    
T  4311709 gaccgttcaacaccaaatatcattctaagttaaatgataatttgttgtttgtttgaataactaagttgcaaatgataaagttgagattaatagggcgtaa 4311610  T
Q  112 aacttgttagtattagagttccttgatcaagcttcgcacttaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaac 211  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  4311609 aacttgttaggattagagttccttgatcaatcgtcgcacataacctaatgaccatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcgac 4311510  T
Q  212 aaccccattcgtgtccaaacaata 235  Q
    ||| | ||||||||||||||||||    
T  4311509 aacactattcgtgtccaaacaata 4311486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 148; E-Value: 5e-78
Query Start/End: Original strand, 13 - 235
Target Start/End: Original strand, 32746369 - 32746592
Alignment:
Q  13 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaa-tgataaagttgagattaataaggcgtga 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||| |||||||||||| ||||| |    
T  32746369 gaccgttcgacaccaaatatcattccaagttaaaagataattggttgtttgttttagtaactaaattgcaaatgataaaattgagattaatagggcgtaa 32746468  T
Q  112 aacttgttagtattagagttccttgatcaagcttcgcacttaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaac 211  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  32746469 aacttgttaggattagagttccttgatcaagcgtcacacataacctaatgaccatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcgac 32746568  T
Q  212 aaccccattcgtgtccaaacaata 235  Q
    ||| | ||||||||||||||||||    
T  32746569 aacactattcgtgtccaaacaata 32746592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 12 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 10941528 - 10941304
Alignment:
Q  12 agaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgc-aatgataaagttgagattaataaggcgtg 110  Q
    |||||||| |||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  10941528 agaccgtttgacacctaatataattctaagttaaaagataatttgttgtttgttttagtaactaagttgcgaataataaaattgagattaataaggcgtg 10941429  T
Q  111 aaacttgttagtattagagttccttgatcaagcttcgcacttaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaa 210  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| ||||||| || ||| ||| ||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  10941428 aaacttgttaggattagagttccttaatcaagcgtcacacgtaacctaatgaccatatatggattctaacttttctttgatattatcacgtatccctcga 10941329  T
Q  211 caaccccattcgtgtccaaacaata 235  Q
    |||| ||||||||||||||||||||    
T  10941328 caacaccattcgtgtccaaacaata 10941304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 141; E-Value: 8e-74
Query Start/End: Original strand, 13 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 27502191 - 27501967
Alignment:
Q  13 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagtt-aaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaat-gataaagttgagattaataaggcgtg 110  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||| ||||||| ||||||||||||| ||||| | ||||||  |||||| |||||||||||| ||||||    
T  27502191 gaccgttcgacaccaaataccattccaagttgaaaagataattggttgtttgttttagtaactcatttgcaaacgataaaattgagattaatagggcgtg 27502092  T
Q  111 aaacttgttagtattagagttccttgatcaagcttcgcacttaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaa 210  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  27502091 aaacttgttaggattagagttccttgatcaagcgtcgcacgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcga 27501992  T
Q  211 caaccccattcgtgtccaaacaata 235  Q
    |||| | ||||||||||||||||||    
T  27501991 caacactattcgtgtccaaacaata 27501967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 13 - 235
Target Start/End: Original strand, 6036265 - 6036488
Alignment:
Q  13 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaa-tgataaagttgagattaataaggcgtga 111  Q
    ||||||| |||||||||||| |||| |||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||| ||| || ||||||| |||||||||||| |||||||    
T  6036265 gaccgtttgacaccaaatataattccaagttaaaagataattggttgtttgttttagtaactaaattgaaaatgataaaattgagattaatagggcgtga 6036364  T
Q  112 aacttgttagtattagagttccttgatcaagcttcgcacttaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaac 211  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| || | | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  6036365 aacttgttaggattagagttccttgatcaagcgtcactcgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcgac 6036464  T
Q  212 aaccccattcgtgtccaaacaata 235  Q
    ||| | ||||||||||||||||||    
T  6036465 aacactattcgtgtccaaacaata 6036488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 13 - 235
Target Start/End: Original strand, 24179072 - 24179296
Alignment:
Q  13 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaac-gataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaat-gataaagttgagattaataaggcgtg 110  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||  ||||||| ||||||||||||| ||||| | ||||||  |||||| |||||||||||| ||||||    
T  24179072 gaccgttcgacaccaaataccattccaagttaaaaagataattggttgtttgttttagtaactcaattgcaaacgataaaattgagattaatagggcgtg 24179171  T
Q  111 aaacttgttagtattagagttccttgatcaagcttcgcacttaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaa 210  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  24179172 aaacttgttaggattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcga 24179271  T
Q  211 caaccccattcgtgtccaaacaata 235  Q
    |||| | ||||||||||||||||||    
T  24179272 caacactattcgtgtccaaacaata 24179296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 136; E-Value: 7e-71
Query Start/End: Original strand, 13 - 235
Target Start/End: Original strand, 13014985 - 13015208
Alignment:
Q  13 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgc-aatgataaagttgagattaataaggcgtga 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||| |||| ||||  |||||||||||||| | ||||| |    
T  13014985 gaccgttcgacaccaaatatcattccaagttaaaagataattggttgtttgttttagtaactaaattgctaatgtaaaagttgagattaacagggcgtaa 13015084  T
Q  112 aacttgttagtattagagttccttgatcaagcttcgcacttaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaac 211  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||||||| || ||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  13015085 aacttgttaggattagagtttcttgatcaagcgtcacacataacctaatgaccatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcgac 13015184  T
Q  212 aaccccattcgtgtccaaacaata 235  Q
    ||| | ||||||||||||||||||    
T  13015185 aacactattcgtgtccaaacaata 13015208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 12 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 9570774 - 9570548
Alignment:
Q  12 agaccgttcgacaccaaatatcattctaagtt-aaacgataatttgtt-gtttgttttaataactaagttgca-atgataaagttgagattaataaggcg 108  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||| ||||| |||||||||| ||||||| ||||| |||||||| |||||||||||| ||||    
T  9570774 agaccgttcgacaccaattatcattctaagtttaaaagataagttgtttgtttgttttagtaactaaattgcagatgataaaattgagattaatagggcg 9570675  T
Q  109 tgaaacttgttagtattagagttccttgatcaagcttcgcacttaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctc 208  Q
    | ||||||||||| |||||| |||||||||| ||| || ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9570674 taaaacttgttaggattagaattccttgatcgagcgtcacacgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctc 9570575  T
Q  209 aacaaccccattcgtgtccaaacaata 235  Q
    |||||  ||||||||||||||||||||    
T  9570574 aacaataccattcgtgtccaaacaata 9570548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 131; E-Value: 7e-68
Query Start/End: Original strand, 12 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 9577276 - 9577050
Alignment:
Q  12 agaccgttcgacaccaaatatcattctaagtt-aaacgataatttgtt-gtttgttttaataactaagttgca-atgataaagttgagattaataaggcg 108  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||| ||||| ||||| |||||||||| ||||||| ||||| |||||||| |||||||||||| ||||    
T  9577276 agaccgttcgacaccaattattattctaagtttaaaagataagttgtttgtttgttttagtaactaaattgcagatgataaaattgagattaatagggcg 9577177  T
Q  109 tgaaacttgttagtattagagttccttgatcaagcttcgcacttaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctc 208  Q
    | ||||||||||| |||||| |||||||||| ||| || ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9577176 taaaacttgttaggattagaattccttgatcgagcgtcacacgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctc 9577077  T
Q  209 aacaaccccattcgtgtccaaacaata 235  Q
    |||||  ||||||||||||||||||||    
T  9577076 aacaataccattcgtgtccaaacaata 9577050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 121; E-Value: 7e-62
Query Start/End: Original strand, 13 - 235
Target Start/End: Original strand, 43995068 - 43995300
Alignment:
Q  13 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgc---------aatgataaagttgagattaata 103  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||  ||||||||||          ||||||||||||||||||||||    
T  43995068 gaccattcgacatcaaatatcattctaagttaaaagatagtttgttgtttgttttagaaactaagttgactatgttgaaatgataaagttgagattaata 43995167  T
Q  104 aggcgtgaaacttgttagtattagagttccttgatcaagcttcgcacttaatctaatgatcatacatggattctagcttttc-tttgatattatcacgta 202  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||||||| | ||||| || ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  43995168 aggcgtgaaacttgtcaggattagagttccttaaccaagcgtcacacgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttcttttgatattattacgta 43995267  T
Q  203 tccctcaacaaccccattcgtgtccaaacaata 235  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  43995268 tccctcgacaacaccattcgtgtccaaacaata 43995300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 13 - 235
Target Start/End: Original strand, 25893229 - 25893458
Alignment:
Q  13 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaac-gataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaat-gataaagttgagattaataaggcgtg 110  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||  | ||||| ||||||||||||| ||||| | ||||||  |||||| |||||||||||| ||||||    
T  25893229 gaccgttcgacaccaaataccattctaagttaaaaagttaattggttgtttgttttagtaactcaattgcaaacgataaaattgagattaatagggcgtg 25893328  T
Q  111 aaacttgttagtattagagtt-----ccttgatcaagcttcgcacttaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatcc 205  Q
    ||||||||||| |||||||||     |||||||||||| || ||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25893329 aaacttgttaggattagagttaaattccttgatcaagcgtcacacgtaacttaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatcc 25893428  T
Q  206 ctcaacaaccccattcgtgtccaaacaata 235  Q
    ||||||||  | ||||||||||||||||||    
T  25893429 ctcaacaatactattcgtgtccaaacaata 25893458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 12 - 235
Target Start/End: Original strand, 23068462 - 23068686
Alignment:
Q  12 agaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaac-gataatttgtt-gtttgttttaataactaagttgcaatgataaa-gttgagattaataaggcg 108  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||| |||| |||||||||| ||||||| ||||||   |||| ||||| ||||||| ||||    
T  23068462 agaccgttcgtcaccaaatatcattctaagttaaaaagataatctgtttgtttgttttagtaactaaattgcaaaagtaaaagttgaaattaatagggcg 23068561  T
Q  109 tgaaacttgttagtattagagttccttgatcaagcttcgcacttaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctc 208  Q
     |||||||||||| |||||||||| |||||| ||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  23068562 -gaaacttgttaggattagagttctttgatcgagcatcgcacgtaacctaatgatcatacatggattcta-cttttctttgatattatcacgtatccctc 23068659  T
Q  209 aacaaccccattcgtgtccaaacaata 235  Q
     ||||| ||||||||||||||||||||    
T  23068660 gacaacaccattcgtgtccaaacaata 23068686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 13 - 235
Target Start/End: Original strand, 43931581 - 43931799
Alignment:
Q  13 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgc-aatgataaagttgagattaataaggcgtga 111  Q
    |||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||  || ||||| ||||||||||||||||||||    
T  43931581 gaccgtccgacaccaaataccattctaagttaaaagataatttgttgtttgttttagtaactaagttgcggataataaaattgagattaataaggcgtga 43931680  T
Q  112 aacttgttagtattagagttccttgatcaagcttcgc--acttaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctca 209  Q
    |||||||||| ||||||||||||| ||||||| || |  || ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||       ||||||||||||||||     
T  43931681 aacttgttaggattagagttccttaatcaagcgtcacatacgtaacctaatgaccatacatggattctagcttttc-------ttatcacgtatccctcg 43931773  T
Q  210 acaaccccattcgtgtccaaacaata 235  Q
    ||||| |||||||||| |||||||||    
T  43931774 acaacaccattcgtgttcaaacaata 43931799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 96; E-Value: 6e-47
Query Start/End: Original strand, 13 - 139
Target Start/End: Original strand, 41353860 - 41353987
Alignment:
Q  13 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgc-aatgataaagttgagattaataaggcgtga 111  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||| |    
T  41353860 gaccgttcgacaccaaatatcattttaagttaaacgataatttgttgtttgtttgaataactaagttgcaaatgataaagttgagattaataggacgtaa 41353959  T
Q  112 aacttgttagtattagagttccttgatc 139  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||    
T  41353960 aacttgttaggattagagttccttgatc 41353987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 84; E-Value: 8e-40
Query Start/End: Original strand, 88 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 20651272 - 20651153
Alignment:
Q  88 aaagttgagattaataaggcgtgaaacttgttagtattagagttccttgatcaagcttcgcacttaatctaatgatcatacatggattctagcttttctt 187  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| || ||| |||| ||||||||||| | |||||||| ||||||||    
T  20651272 aaagttgagattaataaggcgtgaaactcgttaggattagagttccttgatcaagcatcacacgtaatttaatgatcatatacggattctaccttttctt 20651173  T
Q  188 tgatattatcacgtatccct 207  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  20651172 tgatattatcacgtatccct 20651153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 13 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 41354293 - 41354142
Alignment:
Q  13 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgtt-gtttgttttaataactaagttgcaatgataaa-gttgagattaataaggcgtg 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||   |||| ||||||| ||||| ||||||    
T  41354293 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttgaaa-ataatttgtttgtttgttttagtaactaaattgcaaaagtaaaagttgagagtaatagggcgtg 41354195  T
Q  111 aaacttgttagtattagagttccttgatcaagcttcgcacttaatctaatgat 163  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| ||||| || ||| ||| ||||||||    
T  41354194 aaacttgttaggattagagttccttgagcaagcgtcacacgtaacctaatgat 41354142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 12 - 79
Target Start/End: Complemental strand, 3577162 - 3577095
Alignment:
Q  12 agaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagtt 79  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  3577162 agaccgttcgacaccaaatattattctaagttaaatgataatttgttgtttgtttgaataactaagtt 3577095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 12 - 230
Target Start/End: Original strand, 4590792 - 4591012
Alignment:
Q  12 agaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttg-ttgtttgttttaataactaagttgcaatgataaagttgagattaataaggcgtg 110  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| ||| |||||||||||| |||| || |   || | ||||||||||| ||||| |||||     
T  4590792 agaccgttcgacaccaattatcattccaagttaaaagataagttgtttgtttgttttagtaaccaaatataaaagttaaagttgagagtaatagggcgt- 4590890  T
Q  111 aaacttgttagtattagagttccttgatcaagcttcgcacttaatctaatgat--catacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctc 208  Q
    |||   ||| | ||||||||||||||||||||| ||  |  ||||||||| ||  |||| |||||||||||| |||    |||||||||||||||| |||    
T  4590891 aaaaacgttggaattagagttccttgatcaagcatcaaatataatctaataatcacatatatggattctagcgttttaccgatattatcacgtatcgctc 4590990  T
Q  209 aacaaccccattcgtgtccaaa 230  Q
    |||||    |||||||||||||    
T  4590991 aacaagattattcgtgtccaaa 4591012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 12 - 46
Target Start/End: Complemental strand, 20952987 - 20952953
Alignment:
Q  12 agaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaa 46  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20952987 agaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaa 20952953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0053 (Bit Score: 157; Significance: 2e-83; HSPs: 1)
Name: scaffold0053
Description:

Target: scaffold0053; HSP #1
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 12 - 235
Target Start/End: Original strand, 49689 - 49912
Alignment:
Q  12 agaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaa-tgataaagttgagattaataaggcgtg 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||     
T  49689 agaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaa-gataatttgttgtttgtttgaataactaagttgcaaatgataaagttgagattaatagggcgta 49787  T
Q  111 aaacttgttagtattagagttccttgatcaagcttcgcacttaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaa 210  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||| ||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  49788 aaacttgttaggattagagttccttcatcaagcgtcgcacataacctaatgaccatacacggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcga 49887  T
Q  211 caaccccattcgtgtccaaacaata 235  Q
    |||| | ||||||||||||||||||    
T  49888 caacactattcgtgtccaaacaata 49912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 156; Significance: 9e-83; HSPs: 18)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 156; E-Value: 9e-83
Query Start/End: Original strand, 12 - 235
Target Start/End: Original strand, 16405340 - 16405568
Alignment:
Q  12 agaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaa-tgataaagttgagattaataaggcgtg 110  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||     
T  16405340 agaccgttcgacaccaaatatcgttctaagttaaacgataatttgttgtttgtttgaataactaagttgcaaatgataaagttgagattaataaggcgta 16405439  T
Q  111 aaacttgttagtattagagttccttgatcaagcttcgcacttaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttg----atattatcacgtatccc 206  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    ||||||| | |||||||    
T  16405440 aaacttgttaggattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatatatattataatgtatccc 16405539  T
Q  207 tcaacaaccccattcgtgtccaaacaata 235  Q
    || ||||| ||||||||||||||||||||    
T  16405540 tcgacaacaccattcgtgtccaaacaata 16405568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 156; E-Value: 9e-83
Query Start/End: Original strand, 13 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 55462995 - 55462772
Alignment:
Q  13 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaa-tgataaagttgagattaataaggcgtga 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||| |||||||||||| |||||||    
T  55462995 gaccgttcgacaccaaatatcattccaagttaaaagataattggttgtttgttttagtaactaaattgcaaatgataaaattgagattaatagggcgtga 55462896  T
Q  112 aacttgttagtattagagttccttgatcaagcttcgcacttaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaac 211  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  55462895 aacttgttaggattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcgac 55462796  T
Q  212 aaccccattcgtgtccaaacaata 235  Q
    ||| | ||||||||||||||||||    
T  55462795 aacactattcgtgtccaaacaata 55462772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 148; E-Value: 5e-78
Query Start/End: Original strand, 13 - 235
Target Start/End: Original strand, 27590304 - 27590527
Alignment:
Q  13 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaat-gataaagttgagattaataaggcgtga 111  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||| | ||||||  |||||| |||||||||||| |||||||    
T  27590304 gaccgttcgacaccaaataccattccaagttaaaagataattggttgtttgttttagtaactcatttgcaaacgataaaattgagattaatagggcgtga 27590403  T
Q  112 aacttgttagtattagagttccttgatcaagcttcgcacttaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaac 211  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  27590404 aacttgttaggattagagttccttgatcaagcgtcgcacgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcgac 27590503  T
Q  212 aaccccattcgtgtccaaacaata 235  Q
    ||| | ||||||||||||||||||    
T  27590504 aacactattcgtgtccaaacaata 27590527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 146; E-Value: 8e-77
Query Start/End: Original strand, 12 - 235
Target Start/End: Original strand, 41372984 - 41373209
Alignment:
Q  12 agaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgtt-gtttgttttaataactaagttgcaa-tgataaagttgagattaataaggcgt 109  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||| ||||||| |||||| ||||||| |||||||||||| |||||    
T  41372984 agaccgttcgacaccaattatcattctaagttaaaagataagttgtttgtttgttttagtaactaaattgcaaatgataaaattgagattaatagggcgt 41373083  T
Q  110 gaaacttgttagtattagagttccttgatcaagcttcgcacttaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctca 209  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  41373084 aaaacttgttaggattagagttccttgatcgagcgtcgcacgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcg 41373183  T
Q  210 acaaccccattcgtgtccaaacaata 235  Q
    |||||  |||||||||||||||||||    
T  41373184 acaacatcattcgtgtccaaacaata 41373209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 13 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 16838581 - 16838359
Alignment:
Q  13 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaatgataaa-gttgagattaataaggcgtga 111  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||   |||| |||||||||||||||||||||    
T  16838581 gaccgttagacaccaaatatcattctaagttaaa-gatgatttgttgtttgttttagtaactaagttgcaagagtaaaagttgagattaataaggcgtga 16838483  T
Q  112 aacttgttagtattagagttccttgatcaagcttcgcacttaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaac 211  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||| ||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||    
T  16838482 aacttgttaggattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaacctaatgaccatacatggattctatcttttctttgatattatcatgtatccctcgac 16838383  T
Q  212 aaccccattcgtgtccaaacaata 235  Q
    ||| ||||||||||||||||||||    
T  16838382 aacaccattcgtgtccaaacaata 16838359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 136; E-Value: 7e-71
Query Start/End: Original strand, 13 - 235
Target Start/End: Original strand, 30238259 - 30238482
Alignment:
Q  13 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaa-tgataaagttgagattaataaggcgtga 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||| |||||||||||| ||||| |    
T  30238259 gaccgttcgacaccaaatatcattccaagttaaaagataattggttgtttgttttagtaactaaattgcaaatgataaaattgagattaatagggcgtaa 30238358  T
Q  112 aacttgttagtattagagttccttgatcaagcttcgcacttaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaac 211  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||| ||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||    
T  30238359 aacttgttaggattagagttccttgatcaagcgtcacacataacctaatgaccatacatgtattctagcttttctttgatattatcatttatccctcgac 30238458  T
Q  212 aaccccattcgtgtccaaacaata 235  Q
    ||| | ||||||||||||||||||    
T  30238459 aacactattcgtgtccaaacaata 30238482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 136; E-Value: 7e-71
Query Start/End: Original strand, 13 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 37368538 - 37368315
Alignment:
Q  13 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaac-gataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaat-gataaagttgagattaataaggcgtg 110  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||  ||||||| ||||||||||||| ||||| | ||||||  |||||| |||||||||||| ||||||    
T  37368538 gaccgttcgacaccaaataccattccaagttaaaaagataattggttgtttgttttagtaactcaattgcaaacgataaaattgagattaatagggcgtg 37368439  T
Q  111 aaacttgttagtattagagttccttgatcaagcttcgcacttaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaa 210  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  37368438 aaacttgttaggattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcga 37368339  T
Q  211 caaccccattcgtgtccaaacaat 234  Q
    |||| | |||||||||||||||||    
T  37368338 caacactattcgtgtccaaacaat 37368315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 13 - 235
Target Start/End: Original strand, 13594105 - 13594330
Alignment:
Q  13 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaac-gataatttgtt-gtttgttttaataactaagttgc-aatgataaagttgagattaataaggcgt 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||| |||||||||| ||||||| |||| ||||  |||||||||||||| | |||||    
T  13594105 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaaaagataatatgtttgtttgttttagtaactaaattgctaatgtaaaagttgagattaacagggcgt 13594204  T
Q  110 gaaacttgttagtattagagttccttgatcaagcttcgcacttaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctca 209  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||||| ||| || ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  13594205 aaaacttgttaggattagagttccttgatcgagcgtcacacgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcg 13594304  T
Q  210 acaaccccattcgtgtccaaacaata 235  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||    
T  13594305 acaacaccattcgtgtccaaacaata 13594330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 133; E-Value: 5e-69
Query Start/End: Original strand, 13 - 235
Target Start/End: Original strand, 7780406 - 7780629
Alignment:
Q  13 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaa-tgataaa-gttgagattaataaggcgtg 110  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||| || |||||| ||||||| ||||||| ||||| |||||     
T  7780406 gaccgttcgacactaaatatcattctaagttaaa-gatgatttgttgtttgttttagtaacgaaattgcaaatgataaaagttgagagtaatagggcgta 7780504  T
Q  111 aaacttgttagtattagagttccttgatcaagcttcgcacttaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaa 210  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| |||| || ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  7780505 aaacttgttaggattagagttccttgattaagcgtcacacgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcga 7780604  T
Q  211 caaccccattcgtgtccaaacaata 235  Q
    ||||  |||||||||||||||||||    
T  7780605 caacatcattcgtgtccaaacaata 7780629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 133; E-Value: 5e-69
Query Start/End: Original strand, 13 - 235
Target Start/End: Original strand, 8103880 - 8104104
Alignment:
Q  13 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaac-gataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaat-gataaagttgagattaataaggcgtg 110  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||  ||||||| ||||||||||||| ||||| | ||||||  |||||| |||||||||||| ||||||    
T  8103880 gaccgttcgacaccaaataccattccaagttaaaaagataattggttgtttgttttagtaactcaattgcaaacgataaaattgagattaatagggcgtg 8103979  T
Q  111 aaacttgttagtattagagttccttgatcaagcttcgcacttaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaa 210  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  8103980 aaacttgttaggattagagttccttgatcaagcgtcacacgtaacctaatgatcacacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcga 8104079  T
Q  211 caaccccattcgtgtccaaacaata 235  Q
    |||| | ||||||||||||||||||    
T  8104080 caacactattcgtgtccaaacaata 8104104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 133; E-Value: 5e-69
Query Start/End: Original strand, 13 - 235
Target Start/End: Original strand, 17456853 - 17457077
Alignment:
Q  13 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagtt-aaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaat-gataaagttgagattaataaggcgtg 110  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||| ||||||| ||||||||||||| ||||| | ||||||  || ||| |||||||||||| ||||||    
T  17456853 gaccgttcgacaccaaataccattccaagttgaaaagataattggttgtttgttttagtaactcatttgcaaacgacaaaattgagattaatagggcgtg 17456952  T
Q  111 aaacttgttagtattagagttccttgatcaagcttcgcacttaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaa 210  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  17456953 aaacttgttaggattagagttccttgatcaagcgtcgcacgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcga 17457052  T
Q  211 caaccccattcgtgtccaaacaata 235  Q
    |||| | |||| |||||||||||||    
T  17457053 caacactattcatgtccaaacaata 17457077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 18 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 36755017 - 36754791
Alignment:
Q  18 ttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagtt---------gcaatgataaagttgagattaataaggcg 108  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||         | |||||||||||||||||||||||||||    
T  36755017 ttcgacaccaaatatcattctaaattaaaagatagtttgttgtttgttttagtaactaagttaactatattgaaatgataaagttgagattaataaggcg 36754918  T
Q  109 tgaaacttgttagtattagagttccttgatcaagcttcgcacttaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctc 208  Q
    |||||||| |||| |||  |||||||| ||||||| || ||| | | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  36754917 tgaaacttattaggattgaagttccttaatcaagcgtcacacattacctaatgaccatacatggattctagcttttctttgatattatcatgtatccctc 36754818  T
Q  209 aacaaccccattcgtgtccaaacaata 235  Q
     ||||| ||||||||||||||||||||    
T  36754817 gacaacaccattcgtgtccaaacaata 36754791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 116; E-Value: 6e-59
Query Start/End: Original strand, 41 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 30211731 - 30211536
Alignment:
Q  41 gttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgc-aatgataaagttgagattaataaggcgtgaaacttgttagtattagagttccttgatc 139  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||| |||    
T  30211731 gttaaaagataatttgttgtttgttttagtaactaagttgcgaataataaaattgagattaataaggcatgaaacttgttatgattagagttccttaatc 30211632  T
Q  140 aagcttcgcacttaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaacaaccccattcgtgtccaaacaata 235  Q
    |||| || ||| |||  |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||    
T  30211631 aagcgtcacacataacttaatgaccatacatggattctagattttctttgatattatcacgtatccctcgacaacaccattcgtgtccaaaaaata 30211536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 88 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 5660696 - 5660549
Alignment:
Q  88 aaagttgagattaataaggcgtgaaacttgttagtattagagttccttgatcaagcttcgcacttaatctaatgatcatacatggattctagcttttctt 187  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||  ||| |||||||||||| | |||||||| ||||||||    
T  5660696 aaagttgagattaataaggcgtgaaacttgttaggattagagttccttgatcaagcatcacatgtaacctaatgatcatatacggattctaacttttctt 5660597  T
Q  188 tgatattatcacgtatccctcaacaaccccattcgtgtccaaacaata 235  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||   |||||||||||||| ||||    
T  5660596 tgatataatcacgtatccctcgacaatatcattcgtgtccaaataata 5660549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 12 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 13004011 - 13003809
Alignment:
Q  12 agaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaa-tgataaagttgagattaataaggcgtg 110  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||| |||| |||||||||  |  |||||||||| |||||||||||     
T  13004011 agactgttcgacaccaaatatcattataagttaaaagacaatttgttgtttgttttagtaacaaagttgcaagagtaaaagttgagagtaataaggcgt- 13003913  T
Q  111 aaacttgttagtattagagttccttgatcaagcttcgcacttaatctaatgat--catacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctc 208  Q
    |||   ||| | |||||||||| ||||| |||| ||  || ||| ||||| ||  |||| |||||||||||| |||    |||||||||||||||| |||    
T  13003912 aaaaacgttggaattagagttctttgattaagcgtcaaacataacctaataatcacatatatggattctagcgttttaccgatattatcacgtatcactc 13003813  T
Q  209 aaca 212  Q
    ||||    
T  13003812 aaca 13003809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 13 - 230
Target Start/End: Original strand, 2947844 - 2948062
Alignment:
Q  13 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaatgataaagttgagattaataaggcgtgaa 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||| |||| || |   || |  |||||||||| ||||| ||||| ||    
T  2947844 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgatagttgattgtttgttttagtaaccaaatataaaagtgaaagttgagagtaatagggcgt-aa 2947942  T
Q  113 acttgttagtattagagttccttgatcaagcttcgcacttaatctaatgat--catacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaa 210  Q
    |    || | ||||||||||||||||||||| ||  |  ||||||||| ||  |||| |||||||||||| |||    |||||||||||||||| |||||    
T  2947943 aaacattggaattagagttccttgatcaagcatcaaatataatctaataatcacatatatggattctagcgttttaccgatattatcacgtatcgctcaa 2948042  T
Q  211 caaccccattcgtgtccaaa 230  Q
    |||    |||||||||||||    
T  2948043 caagattattcgtgtccaaa 2948062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 13 - 109
Target Start/End: Original strand, 48914898 - 48914996
Alignment:
Q  13 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagtt-aaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgc-aatgataaagttgagattaataaggcgt 109  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||| ||||||| ||||||||||||| ||||| | |||| || |||||| |||||||||||| |||||    
T  48914898 gaccgttcgacaccaaataccattccaagttgaaaagataattggttgtttgttttagtaactcatttgcaaacgataaaattgagattaatagggcgt 48914996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 13 - 45
Target Start/End: Complemental strand, 5660775 - 5660743
Alignment:
Q  13 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaa 45  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  5660775 gaccgttcgacaccaaatatcattttaagttaa 5660743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0936 (Bit Score: 148; Significance: 5e-78; HSPs: 1)
Name: scaffold0936
Description:

Target: scaffold0936; HSP #1
Raw Score: 148; E-Value: 5e-78
Query Start/End: Original strand, 13 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 3486 - 3264
Alignment:
Q  13 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaatgataaa-gttgagattaataaggcgtga 111  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||   |||| |||||||||||||||||||||    
T  3486 gaccattcgacactaaatatcattctaagttaaa-gatgatttgttgtttgttttagtaactaagttgcaagagtaaaagttgagattaataaggcgtga 3388  T
Q  112 aacttgttagtattagagttccttgatcaagcttcgcacttaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaac 211  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  3387 aacttgttaggattagagttccttgatcaagcttcacacttaacctaattaccatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcgac 3288  T
Q  212 aaccccattcgtgtccaaacaata 235  Q
    |||  |||||||||||||||||||    
T  3287 aacatcattcgtgtccaaacaata 3264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0043 (Bit Score: 144; Significance: 1e-75; HSPs: 1)
Name: scaffold0043
Description:

Target: scaffold0043; HSP #1
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 13 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 5228 - 5005
Alignment:
Q  13 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaa-tgataaagttgagattaataaggcgtga 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||  |||||||||||| ||||| | |||||| ||||||| |||||||||||| ||||| |    
T  5228 gaccgttcgacaccaaatatcatttcaagttaaacgatagttgattgtttgttttagtaactgaattgcaaatgataaaattgagattaatagggcgtaa 5129  T
Q  112 aacttgttagtattagagttccttgatcaagcttcgcacttaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaac 211  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  5128 aacttgttaggattagagttccttgatcgagcgtcgcacgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcgac 5029  T
Q  212 aaccccattcgtgtccaaacaata 235  Q
    ||| ||||||||||||||||||||    
T  5028 aacaccattcgtgtccaaacaata 5005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0060 (Bit Score: 137; Significance: 2e-71; HSPs: 1)
Name: scaffold0060
Description:

Target: scaffold0060; HSP #1
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 12 - 235
Target Start/End: Original strand, 15169 - 15393
Alignment:
Q  12 agaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgc-aatgataaagttgagattaataaggcgtg 110  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||  |||| |||||||||||||||||||    
T  15169 agacctttcgacacaaaatatcattctaacttaaaagataatttgttgtttgttttagtaactaagttgcgaatagtaaaattgagattaataaggcgtg 15268  T
Q  111 aaacttgttagtattagagttccttgatcaagcttcgcacttaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaa 210  Q
    ||||||||||| |||||||||||||  || ||| || ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |    
T  15269 aaacttgttaggattagagttccttattccagcgtcacacgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcatgtatccctcga 15368  T
Q  211 caaccccattcgtgtccaaacaata 235  Q
    |||| || |||||||||||||||||    
T  15369 caacaccgttcgtgtccaaacaata 15393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0510 (Bit Score: 121; Significance: 7e-62; HSPs: 2)
Name: scaffold0510
Description:

Target: scaffold0510; HSP #1
Raw Score: 121; E-Value: 7e-62
Query Start/End: Original strand, 13 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 9105 - 8881
Alignment:
Q  13 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgtt-gtttgttttaataactaagttgc-aatgataaagttgagattaataaggcgtg 110  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||| |||||| |||||||||| ||||||| |||| || |  |||||||||| ||||| |||||     
T  9105 gaccgttcgactccaaatatcattctaagttgaaagatagtttgtttgtttgttttagtaactaaattgctaaagtaaaagttgagagtaatagggcgta 9006  T
Q  111 aaacttgttagtattagagttccttgatcaagcttcgcacttaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaa 210  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| | | || ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |    
T  9005 aaacttgttaggattagagttccttgatcgatcctcacacgtaacctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacatatccctcga 8906  T
Q  211 caaccccattcgtgtccaaacaata 235  Q
    |||| ||||||||||||||||||||    
T  8905 caacaccattcgtgtccaaacaata 8881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0510; HSP #2
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 13 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 2784 - 2560
Alignment:
Q  13 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgtt-gtttgttttaataactaagttgcaatgataaa-gttgagattaataaggcgtg 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||| ||||||| ||||||   |||| ||||||| ||||| |||||     
T  2784 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaaagataatttatttgtttgttttagtaactaaattgcaaaagtaaaagttgagagtaatagggcgta 2685  T
Q  111 aaacttgttagtattagagttccttgatcaagcttcgcacttaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctcaa 210  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| |||| || ||  ||| ||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| |    
T  2684 aaacttgttaggattagagttccttgattaagcgtcacatataacctaatgaccattcatggattcaagcttttctttgatattatcatgtatccctcga 2585  T
Q  211 caaccccattcgtgtccaaacaata 235  Q
    |||| |||||| |||||||||||||    
T  2584 caacaccattcatgtccaaacaata 2560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0513 (Bit Score: 94; Significance: 9e-46; HSPs: 2)
Name: scaffold0513
Description:

Target: scaffold0513; HSP #1
Raw Score: 94; E-Value: 9e-46
Query Start/End: Original strand, 94 - 235
Target Start/End: Original strand, 12014 - 12155
Alignment:
Q  94 gagattaataaggcgtgaaacttgttagtattagagttccttgatcaagcttcgcacttaatctaatgatcatacatggattctagcttttctttgatat 193  Q
    |||| ||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||| || ||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  12014 gagagtaatagggcgtaaaacttgttaggattagagttccttgatcgagcgtcacacgtaacctaatgatcataaatggattctagcttttctttgatat 12113  T
Q  194 tatcacgtatccctcaacaaccccattcgtgtccaaacaata 235  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  12114 tatcacgtatccctcgacaacaccattcgtgtccaaacaata 12155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0513; HSP #2
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 13 - 77
Target Start/End: Original strand, 11949 - 12014
Alignment:
Q  13 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttg-ttgtttgttttaataactaag 77  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||| |||| |||||||||||| ||||||||    
T  11949 gaccgttcgactccaaatatcattctaagttgaaagatagtttgtttgtttgttttagtaactaag 12014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0002 (Bit Score: 92; Significance: 1e-44; HSPs: 1)
Name: scaffold0002
Description:

Target: scaffold0002; HSP #1
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 13 - 119
Target Start/End: Original strand, 99913 - 100020
Alignment:
Q  13 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgc-aatgataaagttgagattaataaggcgtga 111  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  99913 gaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgtttgaataactaagttgcaaatgataaagttgagattaatagggcgtga 100012  T
Q  112 aacttgtt 119  Q
    ||||||||    
T  100013 aacttgtt 100020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0173 (Bit Score: 57; Significance: 1e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0173
Description:

Target: scaffold0173; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 12 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 24470 - 24268
Alignment:
Q  12 agaccgttcgacaccaaatatcattctaagttaaacgataatttgttgtttgttttaataactaagttgcaa-tgataaagttgagattaataaggcgtg 110  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||| |||| |||||||||  |  |||||||||| |||||||||||     
T  24470 agactgttcgacaccaaatatcattataagttaaaagacaatttgttgtttgttttagtaacaaagttgcaagagtaaaagttgagagtaataaggcgt- 24372  T
Q  111 aaacttgttagtattagagttccttgatcaagcttcgcacttaatctaatgat--catacatggattctagcttttctttgatattatcacgtatccctc 208  Q
    |||   ||| | |||||||||| ||||| |||| ||  || ||| ||||| ||  |||| |||||||||||| |||    |||||||||||||||| |||    
T  24371 aaaaacgttggaattagagttctttgattaagcgtcaaacataacctaataatcacatatatggattctagcgttttaccgatattatcacgtatcactc 24272  T
Q  209 aaca 212  Q
    ||||    
T  24271 aaca 24268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University