View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF9661A_low_57 (Length: 328)

Name: NF9661A_low_57
Description: NF9661A
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF9661A_low_57
NF9661A_low_57
[»] chr5 (16 HSPs)
chr5 (7-288)||(41317117-41317398)
chr5 (7-318)||(41325181-41325491)
chr5 (7-318)||(41329158-41329468)
chr5 (7-318)||(41311322-41311631)
chr5 (7-261)||(41333091-41333344)
chr5 (19-219)||(41369967-41370167)
chr5 (10-213)||(31177513-31177716)
chr5 (10-213)||(31187576-31187779)
chr5 (7-195)||(41287283-41287471)
chr5 (10-213)||(31225999-31226202)
chr5 (7-152)||(41337898-41338043)
chr5 (7-192)||(41367270-41367455)
chr5 (7-195)||(41305429-41305617)
chr5 (91-144)||(41311706-41311759)
chr5 (91-158)||(41333428-41333497)
chr5 (25-130)||(41329489-41329594)
[»] chr4 (1 HSPs)
chr4 (7-158)||(17248448-17248599)
[»] scaffold0059 (1 HSPs)
scaffold0059 (88-119)||(62054-62085)
[»] chr1 (1 HSPs)
chr1 (88-119)||(12609806-12609837)


Alignment Details
Target: chr5 (Bit Score: 234; Significance: 1e-129; HSPs: 16)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 7 - 288
Target Start/End: Original strand, 41317117 - 41317398
Alignment:
Q  7 tttggtgttggaaggaggatgtgtccaggtattgcatttgccttacccaatattgagttgcctcttgctagtttactttaccactttgattggaagcttc 106  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||    
T  41317117 tttggtgctggaaggaggatgtgtccaggtattgcatttgccttgcccaatgttgagctgcctcttgctaagttactttatcactttgattggaagcttc 41317216  T
Q  107 ccaatggaatgaagaatgaagaacttgatatgactgagtcatttgggattactgcaggtagaaaacacgatctatgcttaattcctattcctcgtcgttt 206  Q
    ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  41317217 ccaatggaatgaagaatgaagaattggatatgactgagtcatttgggattactgcaggtagaaaacacgatctatgcttaattcctatccctcgtcgttt 41317316  T
Q  207 ttaatatttattgtctaagcaaacaagttcagaaacgatgttcctaataaaatttgtattggttatctttacatataggttt 288  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  41317317 ttaatatgtattgtctaagcaaacaagttcagaaacgatgttcctaataaaatttgtattggttatctttacatataagttt 41317398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 7 - 318
Target Start/End: Original strand, 41325181 - 41325491
Alignment:
Q  7 tttggtgttggaaggaggatgtgtccaggtattgcatttgccttacccaatattgagttgcctcttgctagtttactttaccactttgattggaagcttc 106  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41325181 tttggtgctggaagaaggatgtgtcccggaattgcatttgccttacccaacgttgaattgcctcttgctagtttactttaccactttgattggaagcttc 41325280  T
Q  107 ccaatggaatgaagaatgaagaacttgatatgactgagtcatttgggattactgcaggtagaaaacacgatctatgcttaattcctattcctcgtcgttt 206  Q
    |||||  |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||| |    
T  41325281 ccaataaaatgaagaatgaagaactagatatgaccgagtcatttgggattactgcaggtagaaagcacaatctatgcttaattcctattactcgtcgtct 41325380  T
Q  207 ttaatatttattgtctaagcaaacaagttcagaaacgatgttcctaataaaatttgtattggttatctttacatataggtttactataatgtcgtctaaa 306  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||| |||||||    
T  41325381 ttaatatgtattgtctaagcaaacaagttcagaaacgacgttcctaataaaatttgtattggttatctttacgtataggttcactat-atgttgtctaaa 41325479  T
Q  307 atttgtgtatga 318  Q
    ||||||||||||    
T  41325480 atttgtgtatga 41325491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 7 - 318
Target Start/End: Original strand, 41329158 - 41329468
Alignment:
Q  7 tttggtgttggaaggaggatgtgtccaggtattgcatttgccttacccaatattgagttgcctcttgctagtttactttaccactttgattggaagcttc 106  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||    
T  41329158 tttggtgctggaagaaggatgtgtccaggtatttcatttgccatacccaatgttgagctgcctcttgctaagttactttatcactttgattggaagcttc 41329257  T
Q  107 ccaatggaatgaagaatgaagaacttgatatgactgagtcatttgggattactgcaggtagaaaacacgatctatgcttaattcctattcctcgtcgttt 206  Q
    ||||||||||||   || |||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||| | |||||||| |    
T  41329258 ccaatggaatgagccatcaagaacttgatatgactgagttttttgggattactgtaggtagaaaacacgacctatgtttaattcctactactcgtcgtct 41329357  T
Q  207 ttaatatttattgtctaagcaaacaagttcagaaacgatgttcctaataaaatttgtattggttatctttacatataggtttactataatgtcgtctaaa 306  Q
    ||||| | |||| ||||||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  41329358 ttaatgtgtattatctaagcaaacaaattcaaaaacaatgttcctaataaaatttgtaatggtaaactttacatataggtttactat-atgtcgtctaaa 41329456  T
Q  307 atttgtgtatga 318  Q
    ||||||||||||    
T  41329457 atttgtgtatga 41329468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 168; E-Value: 5e-90
Query Start/End: Original strand, 7 - 318
Target Start/End: Original strand, 41311322 - 41311631
Alignment:
Q  7 tttggtgttggaaggaggatgtgtccaggtattgcatttgccttacccaatattgagttgcctcttgctagtttactttaccactttgattggaagcttc 106  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||||| |||| || |||||| | |||||||||   ||||||||||  ||||||||||||||||    
T  41311322 tttggtgctggaaggaggatgtgtcccggaattgcatttgccctaccaaacattgagctacctcttgctcaattactttaccggtttgattggaagcttc 41311421  T
Q  107 ccaatggaatgaagaatgaagaacttgatatgactgagtcatttgggattactgcaggtagaaaacacgatctatgcttaattcctattcctcgtcgttt 206  Q
    |||||  |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||  |||||| |||||  ||||| | |    
T  41311422 ccaataaaatgaagaatgaagaactagatatggctgagtcatttgggattactgtaggtagaaaacacgacctatatttaattgctattaatcgtc-tct 41311520  T
Q  207 ttaatatttattgtctaagcaaacaagttcagaaacgatgttcctaataaaatttgtattggttatctttacatataggtttactataatgtcgtctaaa 306  Q
     |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  41311521 gtaatatgtattatctaagcaaacaagttcagaaacgatgttcctaataaaatttgtagtggtaaactttacatataggtttactat-atgtcgtctaaa 41311619  T
Q  307 atttgtgtatga 318  Q
    |||| |||||||    
T  41311620 atttatgtatga 41311631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 7 - 261
Target Start/End: Original strand, 41333091 - 41333344
Alignment:
Q  7 tttggtgttggaaggaggatgtgtccaggtattgcatttgccttacccaatattgagttgcctcttgctagtttactttaccactttgattggaagcttc 106  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||||| |||| || |||||| | |||||||||   ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  41333091 tttggtgctggaaggaggatgtgtcccggaattgcatttgccctaccaaacattgagctacctcttgctcaattactttgccactttgattggaagcttc 41333190  T
Q  107 ccaatggaatgaagaatgaagaacttgatatgactgagtcatttgggattactgcaggtagaaaacacgatctatgcttaattcctattcctcgtcgttt 206  Q
    |||||  |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||| |    
T  41333191 ccaataaaatgaagaatgaagaactagatatgaccgagtcatttgggattactgtaggaagaaagcacgatctatgtttaattcctattactcgtcgtct 41333290  T
Q  207 ttaatatttattgtctaagcaaacaagttcagaaacgatgttcctaataaaattt 261  Q
    ||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  41333291 ttaatatgtattttctaagcaaacaagttcag-aacgatgttccttataaaattt 41333344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 19 - 219
Target Start/End: Original strand, 41369967 - 41370167
Alignment:
Q  19 aggaggatgtgtccaggtattgcatttgccttacccaatattgagttgcctcttgctagtttactttaccactttgattggaagcttcccaatggaatga 118  Q
    ||||||||||||||||| |||   |||| |||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  41369967 aggaggatgtgtccaggcattatgtttggcttacctaacgttgagttgcctcttgctagtttactttaccactttgattggaagcttcccaatgaaatga 41370066  T
Q  119 agaatgaagaacttgatatgactgagtcatttgggattactgcaggtagaaaacacgatctatgcttaattcctattcctcgtcgtttttaatatttatt 218  Q
    ||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||| ||||  |||||| | ||| ||||||| |||||||||  ||||||| ||| |||| ||||    
T  41370067 agaatgaagaattggatatgactgaatcatttgggattacagcagtaagaaaatatgatttatgcttgattcctattattcgtcgtatttgatatgtatt 41370166  T
Q  219 g 219  Q
    |    
T  41370167 g 41370167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 104; E-Value: 8e-52
Query Start/End: Original strand, 10 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 31177716 - 31177513
Alignment:
Q  10 ggtgttggaaggaggatgtgtccaggtattgcatttgccttacccaatattgagttgcctcttgctagtttactttaccactttgattggaagcttccca 109  Q
    |||| |||||| || ||||||||||| || ||||||| |||| |||| |||||| |||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  31177716 ggtgctggaagaagaatgtgtccaggcatggcatttggcttatccaacattgagctgcctcttgctcagttactttaccactttgattggaagcttccta 31177617  T
Q  110 atggaatgaagaatgaagaacttgatatgactgagtcatttgggattactgcaggtagaaaacacgatctatgcttaattcctattcctcgtcgttttta 209  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||| ||  |||||||| || |||||||| ||||||||  |||||||| ||||    
T  31177616 atggaatgaagaatgaagaactagatatgactgagtcatttgggcttgctgtagtaagaaaacatgacctatgcttgattcctataactcgtcgtcttta 31177517  T
Q  210 atat 213  Q
    ||||    
T  31177516 atat 31177513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 104; E-Value: 8e-52
Query Start/End: Original strand, 10 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 31187779 - 31187576
Alignment:
Q  10 ggtgttggaaggaggatgtgtccaggtattgcatttgccttacccaatattgagttgcctcttgctagtttactttaccactttgattggaagcttccca 109  Q
    |||| |||||| || ||||||||||| || ||||||| |||| |||| |||||| |||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  31187779 ggtgctggaagaagaatgtgtccaggcatggcatttggcttatccaacattgagctgcctcttgctcagttactttaccactttgattggaagcttccta 31187680  T
Q  110 atggaatgaagaatgaagaacttgatatgactgagtcatttgggattactgcaggtagaaaacacgatctatgcttaattcctattcctcgtcgttttta 209  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||  ||| |||||||| || |||||||| ||||||||| ||||||||  |||    
T  31187679 atggaatgaagaatgaagaactagatatgactgagtcatttgggatggctataggaagaaaacatgacctatgcttgattcctattactcgtcgtcctta 31187580  T
Q  210 atat 213  Q
    ||||    
T  31187579 atat 31187576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 7 - 195
Target Start/End: Original strand, 41287283 - 41287471
Alignment:
Q  7 tttggtgttggaaggaggatgtgtccaggtattgcatttgccttacccaatattgagttgcctcttgctagtttactttaccactttgattggaagcttc 106  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||| || | | |||||||  ||||| | |||||||||   |||||||| |||||||||||||||||||    
T  41287283 tttggtgctggaaggaggatgtgcccaggcattgccttcggcatacccaacgttgagcttcctcttgctgaattactttatcactttgattggaagcttc 41287382  T
Q  107 ccaatggaatgaagaatgaagaacttgatatgactgagtcatttgggattactgcaggtagaaaacacgatctatgcttaattcctatt 195  Q
     |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| || ||||| ||||||||||||    
T  41287383 tcaatggaatgaagtgtgaagaacttgatatgactgagtcatttgggattactgtaggaagaaaacatgacctatgattaattcctatt 41287471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 10 - 213
Target Start/End: Original strand, 31225999 - 31226202
Alignment:
Q  10 ggtgttggaaggaggatgtgtccaggtattgcatttgccttacccaatattgagttgcctcttgctagtttactttaccactttgattggaagcttccca 109  Q
    |||| |||||| || ||||||||||| || ||||||| |||| |||| |||||| |||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  31225999 ggtgctggaagaagaatgtgtccaggcatggcatttggcttatccaacattgagctgcctcttgctcagttactttaccactttgattggaagcttccta 31226098  T
Q  110 atggaatgaagaatgaagaacttgatatgactgagtcatttgggattactgcaggtagaaaacacgatctatgcttaattcctattcctcgtcgttttta 209  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||| ||| |||||| | || || ||||| ||||||||  ||||||||  |||    
T  31226099 atggaatgaagaatgaagaactagatatgactgagtcatttgggctttctgtaggaagaaaaaatgacctgtgcttgattcctatcactcgtcgtcctta 31226198  T
Q  210 atat 213  Q
    ||||    
T  31226199 atat 31226202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 7 - 152
Target Start/End: Original strand, 41337898 - 41338043
Alignment:
Q  7 tttggtgttggaaggaggatgtgtccaggtattgcatttgccttacccaatattgagttgcctcttgctagtttactttaccactttgattggaagcttc 106  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||  || ||||| |||||||||||||| ||||    
T  41337898 tttggtgctggaagaaggatgtgtccaggtattgcatttgccttgcccaatgttgagctgcctcttgctaagttgctttatcactttgattggaaacttc 41337997  T
Q  107 ccaatggaatgaagaatgaagaacttgatatgactgagtcatttgg 152  Q
    | ||||||||||   || ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  41337998 caaatggaatgagccatcaagaacttgatatgactgaatcatttgg 41338043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 7 - 192
Target Start/End: Original strand, 41367270 - 41367455
Alignment:
Q  7 tttggtgttggaaggaggatgtgtccaggtattgcatttgccttacccaatattgagttgcctcttgctagtttactttaccactttgattggaagcttc 106  Q
    ||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| || ||| | ||| | |||   ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  41367270 tttggtgctggaaggaggatgtgtctgggtattgcatttgccttacccaacatagagctacctttagctcagttactttaccattttgattggaagcttc 41367369  T
Q  107 ccaatggaatgaagaatgaagaacttgatatgactgagtcatttgggattactgcaggtagaaaacacgatctatgcttaattcct 192  Q
    | ||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||| || | | ||| |||||||| ||  ||||||| ||||||    
T  41367370 caaatggaatgaagaatgaagaattagatatgacggagtcatttgggcttgcagtaggaagaaaacatgacttatgcttgattcct 41367455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 7 - 195
Target Start/End: Original strand, 41305429 - 41305617
Alignment:
Q  7 tttggtgttggaaggaggatgtgtccaggtattgcatttgccttacccaatattgagttgcctcttgctagtttactttaccactttgattggaagcttc 106  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||| | ||| ||||  | |||||||||   ||||||||  ||||||||||||||||||    
T  41305429 tttggtgctggaaggaggatgtgtccgggcattgcatttgccttatcaaatgttgaacttcctcttgctgaattactttataactttgattggaagcttc 41305528  T
Q  107 ccaatggaatgaagaatgaagaacttgatatgactgagtcatttgggattactgcaggtagaaaacacgatctatgcttaattcctatt 195  Q
    |||| |||||||   || |||||||||||||||| |||||||||||| ||| || ||| ||||||||||| ||||| || |||||||||    
T  41305529 ccaacggaatgagccatcaagaacttgatatgaccgagtcatttgggcttagtgtaggaagaaaacacgacctatgtttgattcctatt 41305617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 91 - 144
Target Start/End: Original strand, 41311706 - 41311759
Alignment:
Q  91 tttgattggaagcttcccaatggaatgaagaatgaagaacttgatatgactgag 144  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  41311706 tttgattgaaagcttcccaatggaatgaataatgaagaacttgatatgactgag 41311759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 91 - 158
Target Start/End: Original strand, 41333428 - 41333497
Alignment:
Q  91 tttgattggaagcttcccaatggaatgaagaatgaagaacttgatatgact--gagtcatttgggattac 158  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |  |||||||||||| ||||    
T  41333428 tttgattgaaagcttcccaatggaatgaataatgaagaacttgatatgattgagagtcatttgggcttac 41333497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 25 - 130
Target Start/End: Original strand, 41329489 - 41329594
Alignment:
Q  25 atgtgtccaggtattgcatttgccttacccaatattgagttgcctcttgctagtttactttaccactttgattggaagcttcccaatggaatgaagaatg 124  Q
    ||||||||| | ||||||||||  ||| ||||| ||||  ||| |||||||   ||||||||  |||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||    
T  41329489 atgtgtccaagcattgcatttggtttagccaatgttgaactgcgtcttgctgaattactttatgactttgattgaaagctttccaatggaatgaataatg 41329588  T
Q  125 aagaac 130  Q
    ||||||    
T  41329589 aagaac 41329594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 92; Significance: 1e-44; HSPs: 1)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 7 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 17248599 - 17248448
Alignment:
Q  7 tttggtgttggaaggaggatgtgtccaggtattgcatttgccttacccaatattgagttgcctcttgctagtttactttaccactttgattggaagcttc 106  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||| || |||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||   ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  17248599 tttggtgctggaaggaggatttgtccgggcattgcatttggcatacccaacattgagttgcctcttgctcaattactttaccattttgattggaagcttc 17248500  T
Q  107 ccaatggaatgaagaatgaagaacttgatatgactgagtcatttgggattac 158  Q
    |||||| ||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||    
T  17248499 ccaatgaaatgaagaatgaagatctagatatgaccgagtcatttgggattac 17248448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0059 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0059
Description:

Target: scaffold0059; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 88 - 119
Target Start/End: Complemental strand, 62085 - 62054
Alignment:
Q  88 cactttgattggaagcttcccaatggaatgaa 119  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  62085 cactttgattggaagcttcccaatggaatgaa 62054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000007; HSPs: 1)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 88 - 119
Target Start/End: Complemental strand, 12609837 - 12609806
Alignment:
Q  88 cactttgattggaagcttcccaatggaatgaa 119  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12609837 cactttgattggaagcttcccaatggaatgaa 12609806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University