View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF9666_low_20 (Length: 256)

Name: NF9666_low_20
Description: NF9666
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF9666_low_20
NF9666_low_20
[»] chr5 (50 HSPs)
chr5 (28-225)||(41740574-41740771)
chr5 (19-192)||(32454504-32454677)
chr5 (25-192)||(40885177-40885345)
chr5 (28-168)||(39987948-39988088)
chr5 (28-192)||(40495339-40495502)
chr5 (28-174)||(8049032-8049178)
chr5 (19-177)||(13253055-13253212)
chr5 (28-192)||(3667821-3667985)
chr5 (28-192)||(16158446-16158610)
chr5 (28-187)||(22482161-22482320)
chr5 (28-174)||(7385913-7386059)
chr5 (28-192)||(35760156-35760320)
chr5 (28-180)||(3060205-3060355)
chr5 (28-180)||(41834871-41835023)
chr5 (19-176)||(2430269-2430425)
chr5 (26-187)||(7714912-7715073)
chr5 (28-177)||(10058056-10058205)
chr5 (28-187)||(40791051-40791209)
chr5 (28-187)||(42146280-42146438)
chr5 (12-180)||(9275449-9275617)
chr5 (28-187)||(24045803-24045961)
chr5 (19-173)||(5710358-5710511)
chr5 (28-177)||(32030698-32030845)
chr5 (28-180)||(4292128-4292280)
chr5 (25-180)||(33953880-33954034)
chr5 (26-168)||(34106926-34107068)
chr5 (31-187)||(27021100-27021256)
chr5 (28-177)||(7178760-7178908)
chr5 (134-180)||(16843517-16843563)
chr5 (28-79)||(35847871-35847922)
chr5 (91-157)||(28869547-28869613)
chr5 (140-185)||(3747683-3747728)
chr5 (28-81)||(16843607-16843660)
chr5 (140-181)||(40979996-40980037)
chr5 (19-79)||(2694732-2694792)
chr5 (28-112)||(23914235-23914319)
chr5 (139-181)||(33082423-33082465)
chr5 (28-69)||(4295606-4295647)
chr5 (140-181)||(7071503-7071544)
chr5 (140-181)||(8957979-8958020)
chr5 (140-181)||(11017912-11017953)
chr5 (140-181)||(20069163-20069204)
chr5 (140-181)||(27738036-27738077)
chr5 (140-181)||(31906018-31906059)
chr5 (140-181)||(33386955-33386996)
chr5 (28-69)||(41741604-41741645)
chr5 (38-70)||(4295635-4295667)
chr5 (19-79)||(19203977-19204036)
chr5 (137-181)||(25256313-25256357)
chr5 (137-181)||(25320102-25320146)
[»] chr8 (56 HSPs)
chr8 (15-225)||(29023167-29023361)
chr8 (28-192)||(44926802-44926965)
chr8 (19-177)||(28425447-28425605)
chr8 (28-177)||(3097190-3097339)
chr8 (28-192)||(4941765-4941929)
chr8 (28-178)||(25697944-25698093)
chr8 (19-177)||(27649722-27649879)
chr8 (28-192)||(33627018-33627182)
chr8 (28-177)||(36114025-36114173)
chr8 (28-180)||(6399092-6399244)
chr8 (28-185)||(41289042-41289199)
chr8 (41-187)||(42148971-42149117)
chr8 (19-174)||(3467512-3467667)
chr8 (28-180)||(40742279-40742429)
chr8 (19-187)||(22936768-22936936)
chr8 (28-187)||(440173-440332)
chr8 (28-179)||(8124945-8125095)
chr8 (19-166)||(42143339-42143486)
chr8 (28-148)||(26243129-26243249)
chr8 (41-192)||(40742085-40742236)
chr8 (28-167)||(24897572-24897710)
chr8 (58-180)||(43550864-43550986)
chr8 (28-177)||(38152159-38152307)
chr8 (26-124)||(31201655-31201752)
chr8 (26-181)||(3619051-3619205)
chr8 (28-177)||(38114421-38114569)
chr8 (28-179)||(15206670-15206821)
chr8 (23-77)||(6876602-6876656)
chr8 (63-177)||(34342873-34342985)
chr8 (91-180)||(26125545-26125634)
chr8 (28-81)||(30085623-30085676)
chr8 (22-79)||(40792182-40792239)
chr8 (28-124)||(25497721-25497816)
chr8 (19-79)||(36121520-36121580)
chr8 (19-79)||(36779465-36779524)
chr8 (130-174)||(41981136-41981180)
chr8 (28-79)||(3465424-3465475)
chr8 (19-174)||(30081626-30081780)
chr8 (28-79)||(30759289-30759340)
chr8 (141-179)||(26243065-26243103)
chr8 (144-181)||(37458403-37458440)
chr8 (28-68)||(35615794-35615834)
chr8 (41-79)||(2071565-2071603)
chr8 (140-174)||(24297687-24297721)
chr8 (28-70)||(26125840-26125882)
chr8 (139-181)||(26575807-26575849)
chr8 (140-174)||(41408169-41408203)
chr8 (140-181)||(2026093-2026134)
chr8 (140-181)||(17073707-17073748)
chr8 (140-181)||(17574522-17574563)
chr8 (28-69)||(26575902-26575943)
chr8 (140-181)||(35801788-35801829)
chr8 (28-69)||(45275779-45275820)
chr8 (91-175)||(11126494-11126578)
chr8 (140-180)||(41891915-41891955)
chr8 (116-192)||(45147322-45147398)
[»] chr2 (51 HSPs)
chr2 (39-222)||(23358190-23358373)
chr2 (28-200)||(44619043-44619215)
chr2 (19-192)||(7472647-7472819)
chr2 (28-200)||(2215208-2215378)
chr2 (28-193)||(9988483-9988648)
chr2 (15-180)||(31562656-31562818)
chr2 (25-187)||(36548167-36548328)
chr2 (19-177)||(39141443-39141600)
chr2 (28-192)||(2213468-2213632)
chr2 (28-198)||(28127269-28127439)
chr2 (25-179)||(32501961-32502114)
chr2 (28-173)||(1945021-1945166)
chr2 (14-187)||(7296122-7296295)
chr2 (19-180)||(14821137-14821297)
chr2 (28-180)||(5916224-5916375)
chr2 (28-180)||(36312251-36312402)
chr2 (28-143)||(2213658-2213773)
chr2 (28-187)||(7295330-7295487)
chr2 (28-187)||(28261261-28261420)
chr2 (19-193)||(26207902-26208076)
chr2 (19-187)||(8170280-8170447)
chr2 (12-144)||(31224690-31224822)
chr2 (25-181)||(42515955-42516110)
chr2 (13-153)||(42089495-42089639)
chr2 (19-79)||(34433279-34433339)
chr2 (70-192)||(25940265-25940387)
chr2 (28-192)||(25747864-25748027)
chr2 (26-192)||(8041242-8041406)
chr2 (28-174)||(16467066-16467212)
chr2 (28-113)||(45714650-45714735)
chr2 (28-180)||(3853874-3854026)
chr2 (28-179)||(18511077-18511228)
chr2 (43-174)||(27911386-27911517)
chr2 (26-180)||(28641616-28641770)
chr2 (56-175)||(43436291-43436410)
chr2 (19-79)||(12110949-12111008)
chr2 (28-112)||(41580692-41580776)
chr2 (28-79)||(30007535-30007586)
chr2 (28-116)||(38600425-38600513)
chr2 (28-79)||(23267346-23267397)
chr2 (25-81)||(34997215-34997271)
chr2 (130-181)||(2234900-2234950)
chr2 (19-174)||(3602433-3602587)
chr2 (139-178)||(15283350-15283389)
chr2 (142-181)||(37640236-37640275)
chr2 (140-181)||(7474113-7474154)
chr2 (140-181)||(17481374-17481415)
chr2 (28-69)||(32496583-32496624)
chr2 (140-181)||(43341747-43341788)
chr2 (140-181)||(43695614-43695655)
chr2 (19-79)||(26806229-26806288)
[»] chr6 (24 HSPs)
chr6 (19-192)||(13739159-13739331)
chr6 (19-192)||(13744659-13744831)
chr6 (19-192)||(29409226-29409399)
chr6 (28-180)||(33898989-33899141)
chr6 (11-177)||(31132432-31132597)
chr6 (28-180)||(17829982-17830134)
chr6 (19-180)||(6208038-6208198)
chr6 (28-174)||(10826062-10826208)
chr6 (28-185)||(699518-699673)
chr6 (41-193)||(16442347-16442499)
chr6 (56-180)||(16548104-16548228)
chr6 (19-79)||(5584024-5584084)
chr6 (28-79)||(21254863-21254914)
chr6 (28-79)||(32599446-32599497)
chr6 (25-79)||(1312420-1312474)
chr6 (23-79)||(26274606-26274662)
chr6 (28-68)||(29399777-29399817)
chr6 (28-79)||(15151489-15151540)
chr6 (28-79)||(16121985-16122036)
chr6 (26-79)||(3605734-3605786)
chr6 (19-77)||(21455948-21456006)
chr6 (28-69)||(10683843-10683884)
chr6 (140-181)||(31745486-31745527)
chr6 (140-180)||(2935695-2935735)
[»] chr4 (70 HSPs)
chr4 (19-192)||(43781494-43781666)
chr4 (19-187)||(30842075-30842242)
chr4 (21-187)||(48407675-48407840)
chr4 (22-193)||(51922877-51923048)
chr4 (19-180)||(39636735-39636896)
chr4 (19-193)||(13183025-13183199)
chr4 (12-174)||(43772091-43772253)
chr4 (28-187)||(9889319-9889477)
chr4 (28-193)||(26651832-26651997)
chr4 (28-180)||(16566255-16566407)
chr4 (28-192)||(29149291-29149455)
chr4 (28-173)||(6138604-6138749)
chr4 (28-188)||(9893653-9893813)
chr4 (28-192)||(15603298-15603462)
chr4 (28-192)||(19592215-19592379)
chr4 (28-192)||(49136460-49136624)
chr4 (28-187)||(6505144-6505303)
chr4 (28-187)||(14564130-14564289)
chr4 (25-179)||(28986972-28987123)
chr4 (19-180)||(46830044-46830205)
chr4 (28-180)||(14072453-14072604)
chr4 (28-192)||(54150464-54150628)
chr4 (12-174)||(25312671-25312833)
chr4 (19-180)||(32238034-32238194)
chr4 (41-193)||(48550424-48550576)
chr4 (25-177)||(48908228-48908378)
chr4 (28-193)||(42944882-42945047)
chr4 (56-192)||(56241847-56241983)
chr4 (28-187)||(26426099-26426257)
chr4 (28-174)||(49519686-49519832)
chr4 (58-187)||(2175161-2175290)
chr4 (26-179)||(13167476-13167629)
chr4 (19-175)||(48550172-48550328)
chr4 (28-180)||(54735635-54735786)
chr4 (43-180)||(4954050-4954187)
chr4 (19-180)||(54152995-54153155)
chr4 (28-180)||(14054801-14054953)
chr4 (28-180)||(14075965-14076116)
chr4 (28-124)||(46926054-46926150)
chr4 (28-114)||(39187750-39187836)
chr4 (12-79)||(55638723-55638790)
chr4 (28-182)||(38693996-38694150)
chr4 (20-81)||(5835799-5835859)
chr4 (35-79)||(19599487-19599531)
chr4 (28-180)||(31520355-31520506)
chr4 (28-79)||(53532028-53532079)
chr4 (90-180)||(30887199-30887289)
chr4 (34-79)||(33574229-33574274)
chr4 (140-181)||(45106357-45106398)
chr4 (135-180)||(54655200-54655245)
chr4 (12-108)||(41866176-41866272)
chr4 (130-178)||(55638873-55638921)
chr4 (140-175)||(5025484-5025519)
chr4 (28-111)||(16202504-16202585)
chr4 (28-67)||(48556616-48556655)
chr4 (25-75)||(38263954-38264004)
chr4 (28-66)||(48407572-48407610)
chr4 (25-114)||(523166-523255)
chr4 (140-181)||(16202614-16202655)
chr4 (28-69)||(22605745-22605786)
chr4 (140-181)||(22605838-22605879)
chr4 (28-69)||(28963244-28963285)
chr4 (140-181)||(28963339-28963380)
chr4 (28-69)||(29385432-29385473)
chr4 (140-181)||(30417876-30417917)
chr4 (140-181)||(39733396-39733437)
chr4 (140-177)||(50523350-50523387)
chr4 (28-69)||(51677641-51677682)
chr4 (28-68)||(4649913-4649953)
chr4 (136-180)||(15619567-15619610)
[»] chr3 (56 HSPs)
chr3 (19-187)||(42318288-42318455)
chr3 (19-193)||(10334090-10334264)
chr3 (19-187)||(38125417-38125584)
chr3 (28-180)||(10853251-10853403)
chr3 (35-192)||(53179802-53179958)
chr3 (28-180)||(35930703-35930855)
chr3 (25-179)||(53074869-53075022)
chr3 (19-180)||(3348208-3348369)
chr3 (28-193)||(38172291-38172456)
chr3 (19-180)||(35425299-35425459)
chr3 (28-192)||(26519617-26519781)
chr3 (12-180)||(52966777-52966945)
chr3 (28-180)||(20813111-20813262)
chr3 (40-180)||(44224727-44224867)
chr3 (19-187)||(48189417-48189584)
chr3 (19-192)||(50664712-50664884)
chr3 (19-179)||(15511351-15511510)
chr3 (19-177)||(23207043-23207199)
chr3 (12-174)||(42475680-42475842)
chr3 (28-187)||(23496282-23496434)
chr3 (19-180)||(30811507-30811667)
chr3 (28-176)||(8424714-8424861)
chr3 (28-180)||(38340771-38340922)
chr3 (28-193)||(16246080-16246243)
chr3 (39-192)||(21224943-21225096)
chr3 (19-180)||(44939391-44939550)
chr3 (41-178)||(31084175-31084311)
chr3 (88-191)||(31618931-31619034)
chr3 (22-79)||(19877483-19877540)
chr3 (28-124)||(4984602-4984698)
chr3 (17-181)||(45423742-45423905)
chr3 (28-79)||(55154567-55154618)
chr3 (25-79)||(34561174-34561228)
chr3 (28-180)||(49526653-49526805)
chr3 (26-79)||(52813281-52813334)
chr3 (28-79)||(14651086-14651137)
chr3 (117-180)||(22736946-22737009)
chr3 (140-181)||(30811288-30811329)
chr3 (28-69)||(48253879-48253920)
chr3 (135-172)||(55087593-55087630)
chr3 (32-79)||(29716674-29716721)
chr3 (90-177)||(32357479-32357566)
chr3 (130-180)||(14959684-14959734)
chr3 (139-181)||(33329436-33329478)
chr3 (90-192)||(37117556-37117658)
chr3 (140-174)||(37698485-37698519)
chr3 (139-181)||(44610311-44610352)
chr3 (25-79)||(53567998-53568051)
chr3 (140-181)||(11264277-11264318)
chr3 (140-181)||(28884258-28884299)
chr3 (140-181)||(39252061-39252102)
chr3 (140-181)||(42074914-42074955)
chr3 (28-69)||(45488485-45488526)
chr3 (140-181)||(48253974-48254015)
chr3 (140-181)||(51230284-51230325)
chr3 (140-180)||(53078323-53078363)
[»] scaffold0369 (1 HSPs)
scaffold0369 (28-192)||(8402-8566)
[»] chr7 (49 HSPs)
chr7 (28-192)||(9456079-9456242)
chr7 (25-187)||(47217509-47217671)
chr7 (19-180)||(3622422-3622583)
chr7 (24-180)||(48134566-48134721)
chr7 (14-177)||(34010329-34010491)
chr7 (19-177)||(39391099-39391257)
chr7 (28-193)||(37562543-37562708)
chr7 (28-192)||(43737910-43738074)
chr7 (28-178)||(3342778-3342928)
chr7 (28-180)||(37639416-37639568)
chr7 (28-180)||(3375476-3375628)
chr7 (28-176)||(44967370-44967518)
chr7 (28-179)||(10371929-10372080)
chr7 (28-190)||(43631667-43631828)
chr7 (28-174)||(48459702-48459848)
chr7 (28-180)||(38230054-38230206)
chr7 (19-175)||(41715648-41715804)
chr7 (19-174)||(39977544-39977699)
chr7 (28-177)||(34365953-34366101)
chr7 (28-180)||(47021905-47022057)
chr7 (28-180)||(12632054-12632206)
chr7 (19-175)||(32186931-32187087)
chr7 (32-174)||(3750678-3750820)
chr7 (47-180)||(32205913-32206044)
chr7 (24-181)||(40903135-40903291)
chr7 (130-187)||(47301630-47301687)
chr7 (28-177)||(34010932-34011082)
chr7 (19-154)||(37008313-37008447)
chr7 (33-168)||(42904551-42904686)
chr7 (28-172)||(36920149-36920293)
chr7 (28-79)||(19097484-19097535)
chr7 (88-177)||(19095926-19096013)
chr7 (26-79)||(46541687-46541740)
chr7 (26-174)||(386450-386597)
chr7 (22-67)||(12964697-12964742)
chr7 (28-69)||(25472152-25472193)
chr7 (37-174)||(42740384-42740521)
chr7 (19-79)||(24770873-24770933)
chr7 (140-181)||(4035919-4035960)
chr7 (19-79)||(2839377-2839437)
chr7 (28-192)||(42752162-42752326)
chr7 (26-69)||(25472135-25472178)
chr7 (141-192)||(37886854-37886905)
chr7 (28-78)||(12212440-12212490)
chr7 (140-181)||(26826952-26826993)
chr7 (28-69)||(37371339-37371380)
chr7 (28-109)||(39634136-39634217)
chr7 (140-181)||(41065340-41065381)
chr7 (119-193)||(12964412-12964483)
[»] scaffold0983 (1 HSPs)
scaffold0983 (19-175)||(2243-2399)
[»] chr1 (53 HSPs)
chr1 (56-222)||(291730-291884)
chr1 (35-192)||(12468190-12468346)
chr1 (28-192)||(43728863-43729026)
chr1 (19-177)||(35536064-35536221)
chr1 (19-180)||(42850195-42850356)
chr1 (28-193)||(31223350-31223515)
chr1 (28-187)||(35569187-35569346)
chr1 (19-177)||(40229446-40229604)
chr1 (26-192)||(47123363-47123529)
chr1 (28-187)||(20800262-20800421)
chr1 (25-179)||(11023312-11023465)
chr1 (19-180)||(45710038-45710198)
chr1 (12-180)||(7826323-7826491)
chr1 (28-179)||(6166100-6166250)
chr1 (19-177)||(1199819-1199977)
chr1 (19-177)||(12247412-12247569)
chr1 (19-179)||(13055988-13056147)
chr1 (28-193)||(48510884-48511049)
chr1 (19-180)||(50977316-50977476)
chr1 (19-175)||(26058235-26058391)
chr1 (28-180)||(36205180-36205332)
chr1 (19-181)||(10470578-10470739)
chr1 (28-178)||(5410631-5410780)
chr1 (17-180)||(6464597-6464759)
chr1 (28-179)||(15884216-15884368)
chr1 (19-154)||(27801628-27801763)
chr1 (19-181)||(50406118-50406280)
chr1 (43-180)||(4369803-4369939)
chr1 (19-176)||(25230000-25230156)
chr1 (26-168)||(34718452-34718594)
chr1 (29-178)||(13931614-13931762)
chr1 (130-180)||(31933716-31933766)
chr1 (13-79)||(15576544-15576610)
chr1 (41-109)||(16556295-16556362)
chr1 (19-174)||(25061221-25061376)
chr1 (28-79)||(29441274-29441325)
chr1 (71-180)||(11051339-11051447)
chr1 (22-79)||(43134540-43134597)
chr1 (140-181)||(46033210-46033251)
chr1 (19-79)||(7765260-7765319)
chr1 (28-75)||(49242967-49243014)
chr1 (19-169)||(9447533-9447681)
chr1 (26-79)||(4347064-4347116)
chr1 (137-174)||(36118120-36118157)
chr1 (140-181)||(41512729-41512770)
chr1 (28-69)||(41512823-41512864)
chr1 (140-181)||(42137170-42137211)
chr1 (25-65)||(6061246-6061286)
chr1 (19-79)||(13344863-13344922)
chr1 (19-79)||(30557624-30557683)
chr1 (19-79)||(40352481-40352540)
chr1 (136-180)||(40821814-40821858)
chr1 (26-66)||(46033129-46033169)
[»] scaffold0381 (1 HSPs)
scaffold0381 (28-187)||(9069-9227)
[»] scaffold0217 (1 HSPs)
scaffold0217 (14-178)||(1997-2161)
[»] scaffold0005 (1 HSPs)
scaffold0005 (28-187)||(253086-253245)
[»] scaffold0007 (1 HSPs)
scaffold0007 (28-180)||(29107-29258)
[»] scaffold0041 (1 HSPs)
scaffold0041 (24-181)||(46727-46883)
[»] scaffold0172 (1 HSPs)
scaffold0172 (19-79)||(15233-15292)
[»] scaffold0014 (1 HSPs)
scaffold0014 (28-116)||(118394-118482)
[»] scaffold0394 (2 HSPs)
scaffold0394 (28-79)||(5814-5865)
scaffold0394 (136-180)||(5918-5967)
[»] scaffold0184 (1 HSPs)
scaffold0184 (140-181)||(9254-9295)
[»] scaffold0168 (1 HSPs)
scaffold0168 (28-65)||(32058-32095)
[»] scaffold0097 (2 HSPs)
scaffold0097 (28-69)||(32446-32487)
scaffold0097 (140-181)||(32541-32582)
[»] scaffold0068 (1 HSPs)
scaffold0068 (28-69)||(38384-38425)
[»] scaffold0003 (1 HSPs)
scaffold0003 (140-181)||(301745-301786)


Alignment Details
Target: chr5 (Bit Score: 150; Significance: 2e-79; HSPs: 50)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 28 - 225
Target Start/End: Original strand, 41740574 - 41740771
Alignment:
Q  28 aattgattttgatagaattgagtttgacagaattgattttgattaaaagtgaatatgagatgaattggtttatatttggatacacttgtttaaaagtagt 127  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||| | |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||  |    
T  41740574 aattgattttgatagaattgagtttgagagaattgattttgattataggtgagtttgagatgaattggtttatgtttgaatacacttgtttaaaagtgat 41740673  T
Q  128 tgttatgagttgatgttgtttggatagtttaaatcaaaattgattttgaatgtaaaatgatcaaacgcccctaaatatagaatttcttatattttgtc 225  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  41740674 tgttatgagttgatgttgtttggatagtttaaatcaaaattgattttgaatgtaaaatgaccaaacacccctaaacatagaatttcttatattttgtc 41740771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 99; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 19 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 32454677 - 32454504
Alignment:
Q  19 ggtgacgaaaattgattttgat-agaattgagtttgacagaattgattttgattaaaagtgaatatgagatgaattggtttatatttggatacacttgtt 117  Q
    |||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| | |||| ||||||| || || ||||||||||||||||    
T  32454677 ggtggcgagaattgattttgattagaattgagtttgagagaattgattttggttaaaagtgagtttgaggtgaattgatt-atgtttggatacacttgtt 32454579  T
Q  118 taaaagtagttgttatgagttgatgttgtttggatagtttaaatcaaaattgattttgaatgtaaaatgatcaaa 192  Q
    |||||||  || |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  32454578 taaaagtgattcttatgagttgatgttgtttggatagtttgaatcaaaattaattttgaatgtaaaatgaccaaa 32454504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 25 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 40885345 - 40885177
Alignment:
Q  25 gaaaattgattttgatagaattgagtttgacagaattgattttgattaaaagtgaatatgagatgaattggtttatatttggatacacttgtttaaaagt 124  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| |  ||  ||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  40885345 gaaaattgattttgttagaattgagtttaagagaattgattttgattaaaagtgagttggatgtgaattgatttatgtttggacacacttgtttaaaagt 40885246  T
Q  125 -agttgttatgagttgatgttgtttggatagtttaaatcaaaattgattttgaatgtaaaatgatcaaa 192  Q
     |||| |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |  ||||||||||    
T  40885245 gagtttttatgagttgatattgtttggatagtttgaatcaaaattgattttgaatatgtaatgatcaaa 40885177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 28 - 168
Target Start/End: Original strand, 39987948 - 39988088
Alignment:
Q  28 aattgattttgatagaattgagtttgacagaattgattttgattaaaagtgaatatgagatgaattggtttatatttggatacacttgtttaaaagtagt 127  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| | |||| ||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||  |    
T  39987948 aattgattttgatagaattgagtttgagagaattgattttggttaaaagtgagtttgaggtgaattgatttatgtttggatacacttatttaaaagtgat 39988047  T
Q  128 tgttatgagttgatgttgtttggatagtttaaatcaaaatt 168  Q
    | |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  39988048 tcttatgagttgatgttgtttggatgatttaaatcaaaatt 39988088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 28 - 192
Target Start/End: Original strand, 40495339 - 40495502
Alignment:
Q  28 aattgattttgatagaattgagtttgacagaattgattttgattaaaagtgaatatgagatgaattggtttatatttggatacacttgtttaaaagtagt 127  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||| | |||  | ||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||  |    
T  40495339 aattgattttgatagaattgagtttgatataattgattttggttaaaagtgagtttgatgtaaattgatttatgtttggatacacttttttaaaagtgat 40495438  T
Q  128 tgttatgagttgatgttgtttggatagtttaaatcaaaattgattttgaatgtaaaatgatcaaa 192  Q
    | |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  40495439 ttttatgagttgat-ttgtttgaatagtttaaatcaaaattgatttggaatgtacaatgatcaaa 40495502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 28 - 174
Target Start/End: Original strand, 8049032 - 8049178
Alignment:
Q  28 aattgattttgatagaattgagtttgacagaattgattttgattaaaagtgaatatgagatgaattggtttatatttggatacacttgtttaaaagtagt 127  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| | |||| | ||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||  |    
T  8049032 aattgattttgatagaattgagtttgagagaattgattttggttaaaagtgagtttgaggttaattgatttatgtttggatacacttatttaaaagtgat 8049131  T
Q  128 tgttatgagttgatgttgtttggatagtttaaatcaaaattgatttt 174  Q
    | |||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||| ||||    
T  8049132 tcttatgagttgttgttgtttggatgatttaaatcaaaattgctttt 8049178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 19 - 177
Target Start/End: Original strand, 13253055 - 13253212
Alignment:
Q  19 ggtgacgaaaattgattttgatagaattgagtttgacagaattgattttgattaaaagtgaatatgagatgaattggtttatatttggatacacttgttt 118  Q
    |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |   | |||||||| || || ||||||||||||  |||    
T  13253055 ggtggcgagaattgattttgatagaattgagtttgaaagaattgattttggttaaaagtgagttgaatatgaattgatt-atgtttggatacactcattt 13253153  T
Q  119 aaaagtagttgttatgagttgatgttgtttggatagtttaaatcaaaattgattttgaa 177  Q
    ||||||  || |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  13253154 aaaagtgattcttatgagttgatgttgtttgaatagtttgaatcaaaattgattttgaa 13253212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 77; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 28 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 3667985 - 3667821
Alignment:
Q  28 aattgattttgatagaattgagtttgacagaattgattttgattaaaagtgaatatgagatgaattggtttatatttggatacacttgtttaaaagtagt 127  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||| |   |  ||||||| ||||| ||||||||||||   ||||||||  |    
T  3667985 aattgattttgatagaattgagtttgagagaattgattttgttaaaaagtgagttgaatgtgaattgatttatgtttggatacactcaattaaaagtgat 3667886  T
Q  128 tgttatgagttgatgttgtttggatagtttaaatcaaaattgattttgaatgtaaaatgatcaaa 192  Q
    | |||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  3667885 ttttattagttgatattgtttggatagtttgaatcaaaattgattttaaatgtaaaatgaccaaa 3667821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 77; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 28 - 192
Target Start/End: Original strand, 16158446 - 16158610
Alignment:
Q  28 aattgattttgatagaattgagtttgacagaattgattttgattaaaagtgaatatgagatgaattggtttatatttggatacacttgtttaaaagtagt 127  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| | |||  ||||||  ||||||||||||| ||||| |||||||||  |    
T  16158446 aattgatttttatagatttgagtttgaaagaattgattttgattaaaagtgagtttgatgtgaattaatttatatttggatgcacttttttaaaagtgat 16158545  T
Q  128 tgttatgagttgatgttgtttggatagtttaaatcaaaattgattttgaatgtaaaatgatcaaa 192  Q
    | ||| || |||||||| |||||||  ||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  16158546 tcttaggaattgatgttctttggatgatttgaatcaaaattgattttgaatgtgtaatgatcaaa 16158610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 28 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 22482320 - 22482161
Alignment:
Q  28 aattgattttgatagaattgagtttgacagaattgattttgattaaaagtgaatatgagatgaattggtttatatttggatacacttgtttaaaagtagt 127  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||| |   |  ||||||| ||||| |||||||||||||  ||||||||  |    
T  22482320 aattgattttgatagaattgattttgagagaattgattttggttaaaagtgagttgaatgtgaattgatttatgtttggatacactttattaaaagtgat 22482221  T
Q  128 tgttatgagttgatgttgtttggatagtttaaatcaaaattgattttgaatgtaaaatga 187  Q
    |  | || |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  22482220 tcatgtgggttgatgttgtttggatagtttgaatcaaaattgattttgaatgtataatga 22482161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 28 - 174
Target Start/End: Original strand, 7385913 - 7386059
Alignment:
Q  28 aattgattttgatagaattgagtttgacagaattgattttgattaaaagtgaatatgagatgaattggtttatatttggatacacttgtttaaaagtagt 127  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||| |||||||||  | |||| ||||||| ||||| |||  |||||||| |||||||||  |    
T  7385913 aattgattttgatagaattaagttttagagaattgattttggttaaaagtgggtttgaggtgaattgatttatgtttaaatacacttatttaaaagtgat 7386012  T
Q  128 tgttatgagttgatgttgtttggatagtttaaatcaaaattgatttt 174  Q
    | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  7386013 tcttatgagttgatgttgtttggataatttaaatcaaaattgctttt 7386059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 28 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 35760320 - 35760156
Alignment:
Q  28 aattgattttgatagaattgagtttgacagaattgattttgattaaaagtgaatatgagatgaattggtttatatttggatacacttgtttaaaagtagt 127  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||| |   |  ||||||| ||||| ||||||||||||   |||||| |  |    
T  35760320 aattgattttgatagaattgagtttgagagaattgattttgctaaaaagtgagttgaatgtgaattgatttatgtttggatacactcaattaaaactgat 35760221  T
Q  128 tgttatgagttgatgttgtttggatagtttaaatcaaaattgattttgaatgtaaaatgatcaaa 192  Q
    | |||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  35760220 ttttattagttgatattgtttggatagtttgaatcaaaattgattttaaatgtaaaatgaccaaa 35760156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 28 - 180
Target Start/End: Original strand, 3060205 - 3060355
Alignment:
Q  28 aattgattttgatagaattgagtttgacagaattgattttgattaaaagtgaatatgagatgaattggtttatatttggatacacttgtttaaaagtagt 127  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| | | | |||||||  ||||| |||||||| |||   || |||||  |    
T  3060205 aattgattttgatagaattaagtttgagagaattgattttgattaaaagtgagttttatatgaattaatttatgtttggatatactcactt-aaagtgat 3060303  T
Q  128 tgttatgagttgatgttgtttggatagtttaaatcaaaattgattttgaatgt 180  Q
    | ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  3060304 tcttatgagtt-atgttgtttggatagtttgaatcaaaattgattttgaatgt 3060355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 28 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 41835023 - 41834871
Alignment:
Q  28 aattgattttgatagaattgagtttgacagaattgattttgattaaaagtgaatatgagatgaattggtttatatttggatacacttgtttaaaagtagt 127  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||| |  ||  ||||||| ||||| |||||||||||||   || ||||  |    
T  41835023 aattgattttgatagaattcagtttgagagaattgattttggttaaaagtgagttggaagtgaattgatttatgtttggatacactttactagaagtgat 41834924  T
Q  128 tgttatgagttgatgttgtttggatagtttaaatcaaaattgattttgaatgt 180  Q
    | ||| || ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  41834923 tcttacgaattgatgttgtttggatagtttgaatgaaaattgattttgaatgt 41834871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 19 - 176
Target Start/End: Original strand, 2430269 - 2430425
Alignment:
Q  19 ggtgacgaaaattgattttgatagaattgagtttgacagaattgattttgattaaaagtgaatatgagatgaattggtttatatttggatacacttgttt 118  Q
    |||| ||| |||| |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |   | |||||||| || || |||||||||||||   |    
T  2430269 ggtggcgagaattcattttgatggaattgagtttgagagaattgattttggttaaaagtgagttgaacatgaattgatt-atgtttggatacacttcaat 2430367  T
Q  119 aaaagtagttgttatgagttgatgttgtttggatagtttaaatcaaaattgattttga 176  Q
    | ||||  || |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  2430368 agaagtgattcttatgagttgatgttgtttggatagtttgaatcaaaattgattttga 2430425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 26 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 7715073 - 7714912
Alignment:
Q  26 aaaattgattttgatagaattgagtttgacagaattgattttgattaaaagtgaatatgagatgaattggtttatatttggatacacttgtttaaaagta 125  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |  || |||||||| | ||| ||| || |||||   || ||| |     
T  7715073 aaaattgattttgatagaattgagtttgagagaattgattttggttaaaagtgagttagatatgaattgatatatgttttgacacactcacttgaaattg 7714974  T
Q  126 gttgttatgagttgatgttgtttggatagtttaaatcaaaattgattttgaatgtaaaatga 187  Q
     || |||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||| |||||    
T  7714973 attcttataagttgatgttgtttggatagtttgaattaaaattgattttgaaagtataatga 7714912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 28 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 10058205 - 10058056
Alignment:
Q  28 aattgattttgatagaattgagtttgacagaattgattttgattaaaagtgaatatgagatgaattggtttatatttggatacacttgtttaaaagtagt 127  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| || |||||||||| |||||||||| |  || |||||||| ||||| |||||||||||||   || ||||  |    
T  10058205 aattgattttgatataattgagtttgagagtattgattttggttaaaagtgagttggaaatgaattgatttatgtttggatacactttactagaagtgat 10058106  T
Q  128 tgttatgagttgatgttgtttggatagtttaaatcaaaattgattttgaa 177  Q
    | ||| || ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  10058105 tcttacgaattgatgttgtttggatagtttgaatgaaaattgattttgaa 10058056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 28 - 187
Target Start/End: Original strand, 40791051 - 40791209
Alignment:
Q  28 aattgattttgatagaattgagtttgacagaattgattttgattaaaagtgaatatgagatgaattggtttatatttggatacacttgtttaaaagtagt 127  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||| |  || ||||||| | |||| ||||||||| |||  ||||||||  |    
T  40791051 aattgattttgatagaattgagtttgagaaaattgattttggttaaaagtgagttagatatgaatt-gattatgtttggatacgcttaattaaaagtgat 40791149  T
Q  128 tgttatgagttgatgttgtttggatagtttaaatcaaaattgattttgaatgtaaaatga 187  Q
    | || ||||||||| |||||||||||  || |||||||||||||| |||||||| |||||    
T  40791150 tcttttgagttgatattgtttggatacattgaatcaaaattgattgtgaatgtataatga 40791209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 28 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 42146438 - 42146280
Alignment:
Q  28 aattgattttgatagaattgagtttgacagaattgattttgattaaaagtgaatatgagatgaattggtttatatttggatacacttgtttaaaagtagt 127  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||| |  || ||||||| | |||| ||||||||| |||  ||||||||  |    
T  42146438 aattgattttgatagaattgagtttgagaaaattgattttggttaaaagtgagttagatatgaatt-gattatgtttggatacgcttaattaaaagtgat 42146340  T
Q  128 tgttatgagttgatgttgtttggatagtttaaatcaaaattgattttgaatgtaaaatga 187  Q
    | || ||||||||| |||||||||||  || |||||||||||||| |||||||| |||||    
T  42146339 tcttttgagttgatattgtttggatacattgaatcaaaattgattgtgaatgtataatga 42146280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 12 - 180
Target Start/End: Original strand, 9275449 - 9275617
Alignment:
Q  12 gtttggtggtgacgaaaattgattttgatagaattgagtttgacagaattgattttgattaaaagtgaatatgagatgaattggtttatatttggataca 111  Q
    |||||| ||||  ||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||| |||||||||| |  ||  | ||||| ||||| ||||||||||    
T  9275449 gtttggcggtggggaaaattgattttgataaaattgagtttaagagaattgattttggttaaaagtgagttagatgttaattgatttatgtttggataca 9275548  T
Q  112 cttgtttaaaagtagttgttatgagttgatgttgtttggatagtttaaatcaaaattgattttgaatgt 180  Q
    |||   ||||| |  || |||||||||||||||||||||||  ||| ||| ||| ||||||||||||||    
T  9275549 ctttaataaaattgattcttatgagttgatgttgtttggatgatttgaatgaaacttgattttgaatgt 9275617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 28 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 24045961 - 24045803
Alignment:
Q  28 aattgattttgatagaattgagtttgacagaattgattttgattaaaagtgaatatgagatgaattggtttatatttggatacacttgtttaaaagtagt 127  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||| | |||  ||||||| ||||| ||||||| | ||   |||||| |  |    
T  24045961 aattgattttgatagaattgaatttgagagaattgattttggttaaaagtgagtctgatgtgaattgatttatgtttggatgctctcacttaaaa-tgat 24045863  T
Q  128 tgttatgagttgatgttgtttggatagtttaaatcaaaattgattttgaatgtaaaatga 187  Q
    | ||||| |||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||| ||| |||||    
T  24045862 ttttatgggttgatgttgtttggataatttgaattaaaattgattttgaacgtacaatga 24045803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 19 - 173
Target Start/End: Original strand, 5710358 - 5710511
Alignment:
Q  19 ggtgacgaaaattgattttgatagaattgagtttgacagaattgattttgattaaaagtgaatatgagatgaattggtttatatttggatacacttgttt 118  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| |||||||||| | ||   ||||||| ||||| ||||||||| |||  ||    
T  5710358 ggtggcgagaattgattttgatagaatggagtttgaaagaattgattttggttaaaagtgagtttggtgtgaattgctttatgtttggatacgctt-att 5710456  T
Q  119 aaaagtagttgttatgagttgatgttgtttggatagtttaaatcaaaattgattt 173  Q
    | ||||  || |||||||| ||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  5710457 acaagtgatttttatgagtagatattgtttggatagtttgaataaaaattgattt 5710511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 28 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 32030845 - 32030698
Alignment:
Q  28 aattgattttgatagaattgagtttgacagaattgattttgattaaaagtgaatatgagatgaattggtttatatttggatacacttgtttaaaagtagt 127  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| | |  ||  ||||||| ||| | ||| |||| |||| || ||||||  |    
T  32030845 aattgattttgatagaattgagtttgagagaattgattttggttaaaagtaagttagatgtgaattgatttttgttttgatatacttattcaaaagtgat 32030746  T
Q  128 tgttatgagttgatgttgtttggatagtttaaatcaaaattgattttgaa 177  Q
    | ||||  |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  32030745 tcttat--gttgatgttgtttgaatagtttgaatcaaaattgattttgaa 32030698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 28 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 4292280 - 4292128
Alignment:
Q  28 aattgattttgatagaattgagtttgacagaattgattttgattaaaagtgaatatgagatgaattggtttatatttggatacacttgtttaaaagtagt 127  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| | | |   |  ||||||| ||||| |||||||||||||  ||| ||||  |    
T  4292280 aattgattttgatagaattaagtttgagagaattgattttgattaaaaataagttgaatgtgaattgatttatgtttggatacacttaattagaagtgat 4292181  T
Q  128 tgttatgagttgatgttgtttggatagtttaaatcaaaattgattttgaatgt 180  Q
    | || |  |||||| ||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||    
T  4292180 tcttgttggttgatattgtttggataatttgaatcaaaattaattttgaatgt 4292128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 25 - 180
Target Start/End: Original strand, 33953880 - 33954034
Alignment:
Q  25 gaaaattgattttgatagaattgagtttgacagaattgattttgattaaaagtgaatatgagatgaattggtttatatttggatacacttgtttaaaagt 124  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||| | |||    || | | |||| |||||||||||||   || ||||    
T  33953880 gaaaattgattttggtagaattgagtttgagagaattgattttatttaaaagtgagt-tgaacgtaaattgattatgtttggatacactttaatagaagt 33953978  T
Q  125 agttgttatgagttgatgttgtttggatagtttaaatcaaaattgattttgaatgt 180  Q
      || | |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  33953979 gattctgatgagttgatgttgttcggatagtttgaatcaaaattaattttgaatgt 33954034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 26 - 168
Target Start/End: Original strand, 34106926 - 34107068
Alignment:
Q  26 aaaattgattttgatagaattgagtttgacagaattgattttgattaaaagtgaatatgagatgaattggtttatatttggatacacttgtttaaaagta 125  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||| |||||||||| |  ||  ||||||| || || |||  ||||| |  ||||||||||    
T  34106926 aaaattgattttgatagaattgagtttaaaagaattgtttttggttaaaagtgagttagatgtgaattgattaatgtttaaatacattcatttaaaagta 34107025  T
Q  126 gttgttatgagttgatgttgtttggatagtttaaatcaaaatt 168  Q
     || |||||| || |||||||||| |||| || ||||||||||    
T  34107026 attcttatgaattaatgttgtttgaataggttgaatcaaaatt 34107068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 31 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 27021256 - 27021100
Alignment:
Q  31 tgattttgatagaattgagtttgacagaattgattttgattaaaagtgaatatgagatgaattggtttatatttggatacacttgtttaaaagtagttgt 130  Q
    ||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||| |||||| ||| |   |  ||||||| ||||| ||||| || |||   ||||||||  || |    
T  27021256 tgattttgatataattgagtttgagaaaattgattttggttaaaaatgagttaaatgtgaattgatttatgtttgg-tatactcacttaaaagtgattct 27021158  T
Q  131 tatgagttgatgttgtttggata-gtttaaatcaaaattgattttgaatgtaaaatga 187  Q
    ||  ||||||||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  27021157 tagaagttgatgttgtttggataagattgaatcaaaattgattttgaatgtataatga 27021100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 28 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 7178908 - 7178760
Alignment:
Q  28 aattgattttgatagaattgagtttgacagaattgattttgattaaaagtgaatatgagatg-aattggtttatatttggatacacttgtttaaaagtag 126  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||| | ||| ||| ||||| ||||| |||||||||| |    ||||| |      
T  7178908 aattgagtttgatagaattgagtttgagagaattaattttgactaaaagtgagt-tga-atgtaattgatttatgtttggatacaataacctaaaattga 7178811  T
Q  127 ttgttatgagttgatgttgtttggatagtttaaatcaaaattgattttgaa 177  Q
    || |||| | || ||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||    
T  7178810 ttcttatcaatttatgttgtttgggtagtttgaatcaaaattgcttttgaa 7178760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 134 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 16843563 - 16843517
Alignment:
Q  134 gagttgatgttgtttggatagtttaaatcaaaattgattttgaatgt 180  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  16843563 gagttgatgttgtttggatagtttaaatgataattgattttgaatgt 16843517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 28 - 79
Target Start/End: Original strand, 35847871 - 35847922
Alignment:
Q  28 aattgattttgatagaattgagtttgacagaattgattttgattaaaagtga 79  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||| ||||||    
T  35847871 aattgattttgatagaattgagtttgagtgaattgattttggttagaagtga 35847922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 91 - 157
Target Start/End: Original strand, 28869547 - 28869613
Alignment:
Q  91 attggtttatatttggatacacttgtttaaaagtagttgttatgagttgatgttgtttggatagttt 157  Q
    |||| ||||| |||| ||||||||  ||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  28869547 attgatttatgtttgaatacacttacttaaaagtgattcttatgagttgatgttgtttggatagttt 28869613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 140 - 185
Target Start/End: Original strand, 3747683 - 3747728
Alignment:
Q  140 atgttgtttggatagtttaaatcaaaattgattttgaatgtaaaat 185  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||    
T  3747683 atgttgtttggatagttttaatcaaaattgattttacatgtaaaat 3747728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 28 - 81
Target Start/End: Complemental strand, 16843660 - 16843607
Alignment:
Q  28 aattgattttgatagaattgagtttgacagaattgattttgattaaaagtgaat 81  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||  |||| ||||||| ||||||||||||    
T  16843660 aattgattttgatataattgagtttgaacgaatagattttggttaaaagtgaat 16843607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 140 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 40980037 - 40979996
Alignment:
Q  140 atgttgtttggatagtttaaatcaaaattgattttgaatgta 181  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  40980037 atgttgtttggatagttttgatcaaaattgattttgaatgta 40979996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 19 - 79
Target Start/End: Original strand, 2694732 - 2694792
Alignment:
Q  19 ggtgacgaaaattgattttgatagaattgagtttgacagaattgattttgattaaaagtga 79  Q
    |||||||| |||||||||||  |||||||| |||||  |||||||||||| ||||||||||    
T  2694732 ggtgacgagaattgattttgtcagaattgattttgattgaattgattttggttaaaagtga 2694792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 28 - 112
Target Start/End: Original strand, 23914235 - 23914319
Alignment:
Q  28 aattgattttgatagaattgagtttgacagaattgattttgattaaaagtgaatatgagatgaattggtttatatttggatacac 112  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |  |||||| ||| |  || |||||||| ||||  |||||||||||    
T  23914235 aattgattttgatagaattgattttgagagaattgattatacttaaaattgagttggatatgaattgatttacgtttggatacac 23914319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 139 - 181
Target Start/End: Original strand, 33082423 - 33082465
Alignment:
Q  139 gatgttgtttggatagtttaaatcaaaattgattttgaatgta 181  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||    
T  33082423 gatgttgtttggatagttttgatcaaaattgcttttgaatgta 33082465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 28 - 69
Target Start/End: Complemental strand, 4295647 - 4295606
Alignment:
Q  28 aattgattttgatagaattgagtttgacagaattgattttga 69  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||    
T  4295647 aattgattttgatagaattgattctgacataattgattttga 4295606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 140 - 181
Target Start/End: Original strand, 7071503 - 7071544
Alignment:
Q  140 atgttgtttggatagtttaaatcaaaattgattttgaatgta 181  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||    
T  7071503 atgttgtttggatagttttgatcaaaattgtttttgaatgta 7071544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 140 - 181
Target Start/End: Original strand, 8957979 - 8958020
Alignment:
Q  140 atgttgtttggatagtttaaatcaaaattgattttgaatgta 181  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||    
T  8957979 atgttgtttggatagtttttatcaaaattgcttttgaatgta 8958020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 140 - 181
Target Start/End: Original strand, 11017912 - 11017953
Alignment:
Q  140 atgttgtttggatagtttaaatcaaaattgattttgaatgta 181  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||    
T  11017912 atgttgtttggatagttttcatcaaaattgtttttgaatgta 11017953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 140 - 181
Target Start/End: Original strand, 20069163 - 20069204
Alignment:
Q  140 atgttgtttggatagtttaaatcaaaattgattttgaatgta 181  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||    
T  20069163 atgttgtttggatagttttgatcaaaattgtttttgaatgta 20069204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 140 - 181
Target Start/End: Original strand, 27738036 - 27738077
Alignment:
Q  140 atgttgtttggatagtttaaatcaaaattgattttgaatgta 181  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||    
T  27738036 atgttgtttggatagtttttatcaaaattgcttttgaatgta 27738077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 140 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 31906059 - 31906018
Alignment:
Q  140 atgttgtttggatagtttaaatcaaaattgattttgaatgta 181  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||    
T  31906059 atgttgtttggatagtttttatcaaaattgcttttgaatgta 31906018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 140 - 181
Target Start/End: Original strand, 33386955 - 33386996
Alignment:
Q  140 atgttgtttggatagtttaaatcaaaattgattttgaatgta 181  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||    
T  33386955 atgttgtttggatagttttgatcaaaattgtttttgaatgta 33386996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 28 - 69
Target Start/End: Original strand, 41741604 - 41741645
Alignment:
Q  28 aattgattttgatagaattgagtttgacagaattgattttga 69  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  41741604 aattgattctgatagaattgattttgatagaattgattttga 41741645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 38 - 70
Target Start/End: Complemental strand, 4295667 - 4295635
Alignment:
Q  38 gatagaattgagtttgacagaattgattttgat 70  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  4295667 gatagaattgattttgacagaattgattttgat 4295635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 19 - 79
Target Start/End: Original strand, 19203977 - 19204036
Alignment:
Q  19 ggtgacgaaaattgattttgatagaattgagtttgacagaattgattttgattaaaagtga 79  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||||||| ||| ||| |||||||| ||| |||||||||    
T  19203977 ggtgacgagaattgattttggtagaattga-ttttacataattgattatgaataaaagtga 19204036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 137 - 181
Target Start/End: Original strand, 25256313 - 25256357
Alignment:
Q  137 ttgatgttgtttggatagtttaaatcaaaattgattttgaatgta 181  Q
    |||||||||||| ||||||||  |||||||||| |||||||||||    
T  25256313 ttgatgttgtttagatagttttgatcaaaattgtttttgaatgta 25256357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 137 - 181
Target Start/End: Original strand, 25320102 - 25320146
Alignment:
Q  137 ttgatgttgtttggatagtttaaatcaaaattgattttgaatgta 181  Q
    |||||||||||| ||||||||  |||||||||| |||||||||||    
T  25320102 ttgatgttgtttagatagttttgatcaaaattgtttttgaatgta 25320146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 122; Significance: 1e-62; HSPs: 56)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 15 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 29023361 - 29023167
Alignment:
Q  15 tggtggtgacgaaaattgattttgatagaattgagtttgacagaattgattttgattaaaagtgaatatgagatgaattggtttatatttggatacactt 114  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||                |||||||||||||||||||||||||||||    
T  29023361 tggtggtggcgaaaattgattttgatagaattgagtttgagagaattgattttga----------------gatgaattggtttatatttggatacactt 29023278  T
Q  115 gtttaaaagtagttgttatgagttgatgttgtttggatagtttaaatcaaaattgattttgaatgtaaaatgatcaaacgcccctaaatatagaatttct 214  Q
    |||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||    
T  29023277 gtttaaaattgattgttatgagttgatgttgtttggatagtttgaatcaaaattgattttgaatgtaaaatgaccaaacacccctaaaaatagaatttct 29023178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 97; E-Value: 9e-48
Query Start/End: Original strand, 28 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 44926965 - 44926802
Alignment:
Q  28 aattgattttgatagaattgagtttgacagaattgattttgattaaaagtgaatatgagatgaattggtttatatttggatacacttgtttaaaagtagt 127  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| | |||| ||||||| || || |||||||||||||||||||||||  |    
T  44926965 aattgagtttgatagaattgagtttgagagaattgattttggttaaaagtgagtttgaggtgaattgatt-atgtttggatacacttgtttaaaagtgat 44926867  T
Q  128 tgttatgagttgatgttgtttggatagtttaaatcaaaattgattttgaatgtaaaatgatcaaa 192  Q
    | ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  44926866 tcttatgagttgatgttatttggatagtttgaatcaaaattaattttgaatgtaaaatgaccaaa 44926802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 87; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 19 - 177
Target Start/End: Original strand, 28425447 - 28425605
Alignment:
Q  19 ggtgacgaaaattgattttgatagaattgagtttgacagaattgattttgattaaaagtgaatatgagatgaattggtttatatttggatacacttgttt 118  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||| |||||||||| | |||| ||||||| ||||| |||||||||||||  ||    
T  28425447 ggtggcgaaaattgattttgatagaattgattttgttagaattgattttggttaaaagtgagtttgaggtgaattgatttatgtttggatacactttctt 28425546  T
Q  119 aaaagtagttgttatgagttgatgttgtttggatagtttaaatcaaaattgattttgaa 177  Q
    | ||||  || ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  28425547 acaagtgattcttatgagttgacgttgtttggatagtttgaatcaaaattgattttgaa 28425605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 28 - 177
Target Start/End: Original strand, 3097190 - 3097339
Alignment:
Q  28 aattgattttgatagaattgagtttgacagaattgattttgattaaaagtgaatatgagatgaattggtttatatttggatacacttgtttaaaagtagt 127  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| | ||| |||||||| ||||| |||||||| |||   ||||||||  |    
T  3097190 aattaattttgatagaattgagtttgagagaattgattttggttaaaagtgagtttgatatgaattgatttatgtttggatatactcacttaaaagtgat 3097289  T
Q  128 tgttatgagttgatgttgtttggatagtttaaatcaaaattgattttgaa 177  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  3097290 tcttatgagttgatgttgtttggatagtttgaatcaaaattgattttgaa 3097339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 28 - 192
Target Start/End: Original strand, 4941765 - 4941929
Alignment:
Q  28 aattgattttgatagaattgagtttgacagaattgattttgattaaaagtgaatatgagatgaattggtttatatttggatacacttgtttaaaagtagt 127  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||| ||||| |||||||| | || ||||||||   |    
T  4941765 aattgattctgatataattgagtttgagagaattgattttgattaaaagtgagtttgaggtgaattgatttatgtttggataaaattatttaaaagcgat 4941864  T
Q  128 tgttatgagttgatgttgtttggatagtttaaatcaaaattgattttgaatgtaaaatgatcaaa 192  Q
    | |||||||||||||||||||| ||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  4941865 tcttatgagttgatgttgtttgaataatttgaattaaaattgattttgaatgtaaaatgaccaaa 4941929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 28 - 178
Target Start/End: Original strand, 25697944 - 25698093
Alignment:
Q  28 aattgattttgatagaattgagtttgacagaattgattttgattaaaagtgaatatgagatgaattggtttatatttggatacacttgtttaaaagtagt 127  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |  ||  ||||||| || || |||||||| |||| |||||||||  |    
T  25697944 aattgattttgatagaattgagtttgagagaattgattttgcttaaaagtgagttggatgtgaattgatt-atgtttggataaacttatttaaaagtgat 25698042  T
Q  128 tgttatgagttgatgttgtttggatagtttaaatcaaaattgattttgaat 178  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  25698043 tcttatgagttgatgttgtttggatagtttgaatcaaaattgattttgaat 25698093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 19 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 27649879 - 27649722
Alignment:
Q  19 ggtgacgaaaattgattttgatagaattgagtttgacagaattgattttgattaaaagtgaatatgagatgaattggtttatatttggatacacttgttt 118  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |  || ||||||| |  ||| ||| ||||||||  |||    
T  27649879 ggtgacgagaattgattttgatagaattgagtttgaaagaattgattttggttaaaagtgatttggatatgaatt-gaatatgtttagatacactcattt 27649781  T
Q  119 aaaagtagttgttatgagttgatgttgtttggatagtttaaatcaaaattgattttgaa 177  Q
    ||||||  || |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  27649780 aaaagtgattcttatgagttgatgttgtttggatagtttgaatcaaaattgattttgaa 27649722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 28 - 192
Target Start/End: Original strand, 33627018 - 33627182
Alignment:
Q  28 aattgattttgatagaattgagtttgacagaattgattttgattaaaagtgaatatgagatgaattggtttatatttggatacacttgtttaaaagtagt 127  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||| ||| |  || | |||||| ||||| |||||||||||||   |||||||  |    
T  33627018 aattgattttgatagaattgagtttgaaagaattgattttatttaaaactgagttggataagaattgatttatgtttggatacactttactaaaagtgat 33627117  T
Q  128 tgttatgagttgatgttgtttggatagtttaaatcaaaattgattttgaatgtaaaatgatcaaa 192  Q
    | ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  33627118 tcttatgagttaatgttgtttggatagtttgaatcaaaatcgattttgaatgtaaaattatcaaa 33627182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 28 - 177
Target Start/End: Original strand, 36114025 - 36114173
Alignment:
Q  28 aattgattttgatagaattgagtttgacagaattgattttgattaaaagtgaatatgagatgaattggtttatatttggatacacttgtttaaaagtagt 127  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | | |||  |  ||||||| || |||||||||||| ||||||||||  |    
T  36114025 aattgattttgatagaattgagtttgagagaattgattttgattaaaagtaagtttgatgtagattggtt-atgtttggatacactcgtttaaaagtgat 36114123  T
Q  128 tgttatgagttgatgttgtttggatagtttaaatcaaaattgattttgaa 177  Q
    | |||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  36114124 tcttatgagttgatattgtttggataatttgaatcaaaattgattttgaa 36114173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 28 - 180
Target Start/End: Original strand, 6399092 - 6399244
Alignment:
Q  28 aattgattttgatagaattgagtttgacagaattgattttgattaaaagtgaatatgagatgaattggtttatatttggatacacttgtttaaaagtagt 127  Q
    |||||||| || ||||||||||||||| |||||||||| || |||||||||| | |||  ||||||| ||||| ||| ||||||||   ||||||||  |    
T  6399092 aattgattctggtagaattgagtttgatagaattgattatggttaaaagtgagtttgatgtgaattgatttatgtttcgatacactcacttaaaagtgat 6399191  T
Q  128 tgttatgagttgatgttgtttggatagtttaaatcaaaattgattttgaatgt 180  Q
    | |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||    
T  6399192 tcttatgagttgatgttgtttggataattttaatcaaaattgattttgaatgt 6399244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 28 - 185
Target Start/End: Original strand, 41289042 - 41289199
Alignment:
Q  28 aattgattttgatagaattgagtttgacagaattgattttgattaaaagtgaatatgaga-tgaattggtttatatttggatacacttgtttaaaagtag 126  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| | |||   ||||||| ||||| |||||||||||||   |||||||      
T  41289042 aattgattttgacagaattgagtttgagagaattgattttaattaaaagtgagt-tgattgtgaattgatttatgtttggatacactttactaaaagtga 41289140  T
Q  127 ttgttatgagttgatgttgtttggatagtttaaatcaaaattgattttgaatgtaaaat 185  Q
    || ||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||    
T  41289141 ttcttataggttgatgttgtttggatagtttgaatcaaaattgattttgaatgcaaaat 41289199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 41 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 42149117 - 42148971
Alignment:
Q  41 agaattgagtttgacagaattgattttgattaaaagtgaatatgagatgaattggtttatatttggatacacttgtttaaaagtagttgttatgagttga 140  Q
    |||||||| | ||| | ||||||||||| |||||||||| | |||| ||||||| ||||| |||||||| |||| |||||||||  ||  ||||||||||    
T  42149117 agaattgattctgatataattgattttggttaaaagtgagtttgaggtgaattgatttatgtttggatagacttatttaaaagtgattcgtatgagttga 42149018  T
Q  141 tgttgtttggatagtttaaatcaaaattgattttgaatgtaaaatga 187  Q
    |||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  42149017 tgttgtttagataatttgaatcaaaattgattttgaatgtaaaatga 42148971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 19 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 3467667 - 3467512
Alignment:
Q  19 ggtgacgaaaattgattttgatagaattgagtttgacagaattgattttgattaaaagtgaatatgagatgaattggtttatatttggatacacttgttt 118  Q
    |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |   |  ||||||| ||| | |||||||| | || |||    
T  3467667 ggtggcgagaattgattttgatagaattgagtttgagagaattgattttggttaaaagtgagttgaatgtgaattgatttctgtttggatatatttattt 3467568  T
Q  119 aaaagtagttgttatgagttgatgttgtttggatagtttaaatcaaaattgatttt 174  Q
    ||||||  || |||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  3467567 aaaagtgattcttatgaattgatgttggttggatagtttgaatcaaaattgatttt 3467512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 28 - 180
Target Start/End: Original strand, 40742279 - 40742429
Alignment:
Q  28 aattgattttgatagaattgagtttgacagaattgattttgattaaaagtgaatatgagatgaattggtttatatttggatacacttgtttaaaagtagt 127  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||  |||||||||| | |||  ||||||| ||||| ||||||||||||  | |  ||||  |    
T  40742279 aattgattttgatagaattgagtttaaaagaattgattttcgttaaaagtgagtttgatctgaattgatttatgtttggatacactaatgt--aagtgat 40742376  T
Q  128 tgttatgagttgatgttgtttggatagtttaaatcaaaattgattttgaatgt 180  Q
    | ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  40742377 tcttatgagttgatgatgtttggatattttaaatcaaaattgattttaaatgt 40742429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 19 - 187
Target Start/End: Original strand, 22936768 - 22936936
Alignment:
Q  19 ggtgacgaaaattgattttgatagaattgagtttgacagaattgattttgattaaaagtgaatatgagatgaattggtttatatttggatacacttgttt 118  Q
    |||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||| |   |  ||||||| ||||| |||||||||||||  ||    
T  22936768 ggtggcgagaattgattttgatagaattaagtttgagagaattgattttggttaaaagtgagttgaatgtgaattgatttatgtttggatacactttatt 22936867  T
Q  119 aaaagtagttgttatgagttgatgttgtttggatagtttaaatcaaaattgattttgaatgtaaaatga 187  Q
    | ||||  || || ||  ||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||| || |||||    
T  22936868 agaagtgattcttgtggattgatgttgtttggatagtttgaatcaaatttggttttgaatatataatga 22936936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 28 - 187
Target Start/End: Original strand, 440173 - 440332
Alignment:
Q  28 aattgattttgatagaattgagtttgacagaattgattttgattaaaagtgaatatgagatgaattggtttatatttggatacacttgtttaaaagtagt 127  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||| |||| |  ||  ||||||| ||||| |||||||||| |   |||||| |  |    
T  440173 aattgattttgatagaattgagtctgagagaattgattttggttaaatgtgagttggatgtgaattgatttatgtttggatacattcagttaaaaatgat 440272  T
Q  128 tgttatgagttgatgttgtttggatagtttaaatcaaaattgattttgaatgtaaaatga 187  Q
    | ||||||||| | ||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||| |||||    
T  440273 tcttatgagttaacgttgtttggatagattgaatcaaaactgattttgaatgtataatga 440332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 28 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 8125095 - 8124945
Alignment:
Q  28 aattgattttgatagaattgagtttgacagaattgattttgattaaaagtgaatatgagatgaattggtttatatttggatacacttgtttaaaagtagt 127  Q
    ||||||||||| | |||| |||||||| ||||||||||||| ||| |||||| | |||  ||||||| || || ||||||||||||  |||||||||  |    
T  8125095 aattgattttggttgaatcgagtttgagagaattgattttggttagaagtgagtttgatgtgaattgatt-atgtttggatacactcatttaaaagtgat 8124997  T
Q  128 tgttatgagttgatgttgtttggatagtttaaatcaaaattgattttgaatg 179  Q
    | ||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  8124996 tcttaggagttgaagttgtttggatagtttgaatcaaaattgattttaaatg 8124945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 19 - 166
Target Start/End: Original strand, 42143339 - 42143486
Alignment:
Q  19 ggtgacgaaaattgattttgatagaattgagtttgacagaattgattttgattaaaagtgaatatgagatgaattggtttatatttggatacacttgttt 118  Q
    |||| ||| |||||||| ||||| |||||||||||| | ||||||||||  |||||||||| | |||| ||||||| ||||| |||||||| |||| |||    
T  42143339 ggtggcgagaattgattatgatataattgagtttgagaaaattgattttagttaaaagtgagtttgaggtgaattgatttatgtttggataaacttattt 42143438  T
Q  119 aaaagtagttgttatgagttgatgttgtttggatagtttaaatcaaaa 166  Q
    ||||||  || ||||||||||| |||||||||||| ||| || |||||    
T  42143439 aaaagtgattcttatgagttgacgttgtttggataatttgaaacaaaa 42143486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 28 - 148
Target Start/End: Complemental strand, 26243249 - 26243129
Alignment:
Q  28 aattgattttgatagaattgagtttgacagaattgattttgattaaaagtgaatatgagatgaattggtttatatttggatacacttgtttaaaagtagt 127  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||  |||||||||| | ||| |||||||| ||||| |||||||| | ||||||||||||  |    
T  26243249 aattgattttgatagaattgagtttaagagaattgatttttgttaaaagtgagtttgatatgaattgatttatgtttggatataattgtttaaaagtgat 26243150  T
Q  128 tgttatgagttgatgttgttt 148  Q
    | |||||||||| || |||||    
T  26243149 tcttatgagttggtgatgttt 26243129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 41 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 40742236 - 40742085
Alignment:
Q  41 agaattgagtttgacagaattgattttgattaaaagtgaatatgagatgaattggtttatatttggatacacttgtttaaaagtagttgttatgagttga 140  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |  ||  ||||||| ||||| |||||||||||||   ||||| |  || |||||||||||    
T  40742236 agaattgagtttgagagaattgattttggttaaaagtgagttggatgtgaattgatttatgtttggatacactttaataaaattgattcttatgagttga 40742137  T
Q  141 tgttgtttggatagtttaaatcaaaattgattttgaatgtaaaatgatcaaa 192  Q
    | ||||||||||  ||| ||| ||| ||||||||||||||  ||||||||||    
T  40742136 tattgtttggatgatttgaatgaaacttgattttgaatgtgtaatgatcaaa 40742085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 28 - 167
Target Start/End: Original strand, 24897572 - 24897710
Alignment:
Q  28 aattgattttgatagaattgagtttgacagaattgattttgattaaaagtgaatatgagatgaattggtttatatttggatacacttgtttaaaagtagt 127  Q
    |||||||||||||| ||||||||||   ||||||||||||| |||||||||| |  || |||||| |  |||| |||||||||| || ||||||| |  |    
T  24897572 aattgattttgataaaattgagtttatgagaattgattttggttaaaagtgagttggatatgaat-gaattatgtttggatacatttatttaaaattgat 24897670  T
Q  128 tgttatgagttgatgttgtttggatagtttaaatcaaaat 167  Q
    | |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  24897671 tcttatgagttgatgttgtttggataatttgaatcaaaat 24897710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 58 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 43550986 - 43550864
Alignment:
Q  58 aattgattttgattaaaagtgaatatgagatgaattggtttatatttggatacacttgtttaaaagtagttgttatgagttgatgttgtttggatagttt 157  Q
    ||||||||||| |||||||||| |   |  ||||||| ||||| |||||||||||||  ||||||||  || || || |||||||||||||||||| |||    
T  43550986 aattgattttggttaaaagtgagttgaatgtgaattgatttatgtttggatacactttattaaaagtgattcttgtgggttgatgttgtttggataattt 43550887  T
Q  158 aaatcaaaattgattttgaatgt 180  Q
     ||||||||||||||||||||||    
T  43550886 gaatcaaaattgattttgaatgt 43550864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 28 - 177
Target Start/End: Original strand, 38152159 - 38152307
Alignment:
Q  28 aattgattttgatagaattgagtttgacagaattgattttgattaaaagtgaatatgagatgaattggtttatatttggatacacttgtttaaaagtagt 127  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||  ||||| |||| | |||  | ||||| ||||| |||||| | | ||  |||||| |  |    
T  38152159 aattgattttgatagaattaagtttgagaaaattgattttagttaaa-gtgagtttgatgtaaattgatttatgtttggaaatatttacttaaaaatgat 38152257  T
Q  128 tgttatgagttgatgttgtttggatagtttaaatcaaaattgattttgaa 177  Q
    | |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  38152258 tcttatgagttgatgtggtttggatactttaaatcaaaattgattttgaa 38152307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 26 - 124
Target Start/End: Complemental strand, 31201752 - 31201655
Alignment:
Q  26 aaaattgattttgatagaattgagtttgacagaattgattttgattaaaagtgaatatgagatgaattggtttatatttggatacacttgtttaaaagt 124  Q
    |||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| | |||||||||| ||||| ||||||| || ||| ||||||||    
T  31201752 aaaattgagttttataaaattgagtttgacagaattgattttaattaaaagcgaat-taagatgaattgatttatgtttggattcatttgcttaaaagt 31201655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 26 - 181
Target Start/End: Original strand, 3619051 - 3619205
Alignment:
Q  26 aaaattgattttgatagaattgagtttgacagaattgattttgattaaaagtgaatatgagatgaattggtttatatttggatacacttgtttaaaagta 125  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||| |||| |||||||| | ||||   ||||| ||| | |||||||||| |  | | |||||     
T  3619051 aaaattgattttgatagaattgattttgaatgaattgattctgatcaaaagtgagt-tgagtgaaattgatttgtgtttggatacattaatatgaaagtg 3619149  T
Q  126 gttgttatgagttgatgttgtttggatagtttaaatcaaaattgattttgaatgta 181  Q
     || |||| | |  |||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  3619150 attcttatcaatgtatgttgtttggatagtttgaatcaaaattgattttaaatgta 3619205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 28 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 38114569 - 38114421
Alignment:
Q  28 aattgattttgatagaattgagtttgacagaattgattttgattaaaagtgaatatgagatgaattggtttatatttggatacacttgtttaaaagtagt 127  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| | |  ||  |||||| | |||| |||||||||||| | ||  ||||  |    
T  38114569 aatttattttgatagaattgagtttgagagaattgattttggttaaaagtaagttggatgtgaatt-gattatgtttggatacactcggtttcaagtgat 38114471  T
Q  128 tgttatgagttgatgttgtttggatagtttaaatcaaaattgattttgaa 177  Q
    | ||||||||||| |||||||| ||| ||  ||  |||||||||||||||    
T  38114470 tcttatgagttgaggttgtttgaatatttcgaacaaaaattgattttgaa 38114421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 28 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 15206821 - 15206670
Alignment:
Q  28 aattgattttgatagaattgagtttgacagaattgattttgattaaaagtgaatatgagatgaattggtttatatttggatacacttgtttaaaagtagt 127  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||| |   |  ||||||| ||||| |||||||||| |   ||| ||||  |    
T  15206821 aattaattttgatagaattgagtttgacaaaattgattttgggtaaaagtgagttgaatgtgaattgatttatgtttggatacattgacttagaagtgat 15206722  T
Q  128 tgttatgagttgatgttgtttggatagtttaaatcaaaattgattttgaatg 179  Q
    | |||  | || ||||||||||||||||||    ||||||||||||||||||    
T  15206721 tcttaaaaattcatgttgtttggatagtttggcccaaaattgattttgaatg 15206670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 23 - 77
Target Start/End: Original strand, 6876602 - 6876656
Alignment:
Q  23 acgaaaattgattttgatagaattgagtttgacagaattgattttgattaaaagt 77  Q
    ||||||||| || || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  6876602 acgaaaattaatctttatagaattgagtttaacagaattgattttgattaaaagt 6876656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 63 - 177
Target Start/End: Original strand, 34342873 - 34342985
Alignment:
Q  63 attttgattaaaagtgaatatgagatgaattggtttatatttggatacacttgtttaaaagtagttgttatgagttgatgttgtttggatagtttaaatc 162  Q
    |||||| |||||||||| || || |||||||| ||| | |||||||| | || |||||||||  || |||| ||| ||||||||||||||| ||| ||||    
T  34342873 attttggttaaaagtgagta-gatatgaattgatttttgtttggataaatttatttaaaagtgattcttat-agtggatgttgtttggataatttgaatc 34342970  T
Q  163 aaaattgattttgaa 177  Q
    |||||||||||||||    
T  34342971 aaaattgattttgaa 34342985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 91 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 26125634 - 26125545
Alignment:
Q  91 attggtttatatttggatacacttgtttaaaagtagttgttatgagttgatgttgtttggatagtttaaatcaaaattgattttgaatgt 180  Q
    |||| ||||| ||||||||||||  | ||||| |  || ||||||||||||  ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  26125634 attgatttatgtttggatacactaatgtaaaaatgattcttatgagttgataatgtttggacggtttaaatcaaaattgattttgaatgt 26125545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 28 - 81
Target Start/End: Original strand, 30085623 - 30085676
Alignment:
Q  28 aattgattttgatagaattgagtttgacagaattgattttgattaaaagtgaat 81  Q
    |||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||    
T  30085623 aattgattttgatataattgagtttaagagaattgattttggttaaaagtgaat 30085676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 22 - 79
Target Start/End: Original strand, 40792182 - 40792239
Alignment:
Q  22 gacgaaaattgattttgatagaattgagtttgacagaattgattttgattaaaagtga 79  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  40792182 gacgaaaattgattttaataaaattgattttgatataattgattttgattaaaagtga 40792239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 28 - 124
Target Start/End: Complemental strand, 25497816 - 25497721
Alignment:
Q  28 aattgattttgatagaattgagtttgacagaattgattttgattaaaagtgaatatgagatgaattggtttatatttggatacacttgtttaaaagt 124  Q
    |||||||||||||| ||||||||||   ||||||||||||| |||||||||| |  ||  |||||| | |||| ||||||||||||| |||||||||    
T  25497816 aattgattttgataaaattgagtttaggagaattgattttggttaaaagtgagttggatgtgaatt-gattatgtttggatacacttatttaaaagt 25497721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 19 - 79
Target Start/End: Original strand, 36121520 - 36121580
Alignment:
Q  19 ggtgacgaaaattgattttgatagaattgagtttgacagaattgattttgattaaaagtga 79  Q
    |||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||| ||||||||||    
T  36121520 ggtgtcgagaattgattttgatagaattgagtttaagtgaattgattttggttaaaagtga 36121580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 19 - 79
Target Start/End: Complemental strand, 36779524 - 36779465
Alignment:
Q  19 ggtgacgaaaattgattttgatagaattgagtttgacagaattgattttgattaaaagtga 79  Q
    |||||||| |||||||||||||| |||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  36779524 ggtgacgagaattgattttgatataattgattttgt-agaattgattttgattaaaagtga 36779465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 130 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 41981180 - 41981136
Alignment:
Q  130 ttatgagttgatgttgtttggatagtttaaatcaaaattgatttt 174  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  41981180 ttatgagttgatgttgtttggatactttgaatcaaaattgatttt 41981136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 28 - 79
Target Start/End: Original strand, 3465424 - 3465475
Alignment:
Q  28 aattgattttgatagaattgagtttgacagaattgattttgattaaaagtga 79  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||| ||||||    
T  3465424 aattgattttgatagaattgagtttgagtgaattgattttggttagaagtga 3465475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 19 - 174
Target Start/End: Original strand, 30081626 - 30081780
Alignment:
Q  19 ggtgacgaaaattgattttgatagaattgagtttgacagaattgattttgattaaaagtgaatatgagatgaattggtttatatttggatacacttgttt 118  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||  | ||||||||||  |||||||||| | | |  ||||||| ||||| ||||||||  ||         
T  30081626 ggtgacgaaaattgattttgataaaattgattttgtgaaaattgattttagttaaaagtgagt-taaagtgaattgatttatgtttggataagctgacac 30081724  T
Q  119 aaaagtagttgttatgagttgatgttgtttggatagtttaaatcaaaattgatttt 174  Q
    ||||| | || ||||| | ||||||||||||||||||||   ||||||||||||||    
T  30081725 aaaagcaattcttatgggctgatgttgtttggatagtttgtttcaaaattgatttt 30081780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 28 - 79
Target Start/End: Original strand, 30759289 - 30759340
Alignment:
Q  28 aattgattttgatagaattgagtttgacagaattgattttgattaaaagtga 79  Q
    |||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  30759289 aattgattttaatataattgagtttgagagaattgattttggttaaaagtga 30759340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 141 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 26243103 - 26243065
Alignment:
Q  141 tgttgtttggatagtttaaatcaaaattgattttgaatg 179  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  26243103 tgttgtttggatagtttgaatcaaaattgattttgaatg 26243065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 144 - 181
Target Start/End: Original strand, 37458403 - 37458440
Alignment:
Q  144 tgtttggatagtttaaatcaaaattgattttgaatgta 181  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  37458403 tgtttggatagtttgaatcaaaattgattttgaatgta 37458440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 28 - 68
Target Start/End: Complemental strand, 35615834 - 35615794
Alignment:
Q  28 aattgattttgatagaattgagtttgacagaattgattttg 68  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  35615834 aattgattttgatagaattgagtttgacaagattgattttg 35615794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 41 - 79
Target Start/End: Original strand, 2071565 - 2071603
Alignment:
Q  41 agaattgagtttgacagaattgattttgattaaaagtga 79  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  2071565 agaattgattttgacagaattgattttgactaaaagtga 2071603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 140 - 174
Target Start/End: Original strand, 24297687 - 24297721
Alignment:
Q  140 atgttgtttggatagtttaaatcaaaattgatttt 174  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  24297687 atgttgtttggatagtttgaatcaaaattgatttt 24297721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 28 - 70
Target Start/End: Complemental strand, 26125882 - 26125840
Alignment:
Q  28 aattgattttgatagaattgagtttgacagaattgattttgat 70  Q
    |||| |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  26125882 aattaattttgatagaattgagtttaagagaattgattttgat 26125840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 139 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 26575849 - 26575807
Alignment:
Q  139 gatgttgtttggatagtttaaatcaaaattgattttgaatgta 181  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||    
T  26575849 gatgttgtttggatagttttgatcaaaattgcttttgaatgta 26575807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 140 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 41408203 - 41408169
Alignment:
Q  140 atgttgtttggatagtttaaatcaaaattgatttt 174  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  41408203 atgttgtttgaatagtttaaatcaaaattgatttt 41408169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 140 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 2026134 - 2026093
Alignment:
Q  140 atgttgtttggatagtttaaatcaaaattgattttgaatgta 181  Q
    |||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||    
T  2026134 atgttgtttggatagttttaaaaaaaattgattttgaatgta 2026093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 140 - 181
Target Start/End: Original strand, 17073707 - 17073748
Alignment:
Q  140 atgttgtttggatagtttaaatcaaaattgattttgaatgta 181  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||    
T  17073707 atgttgtttggatagtttttatcaaaattgtttttgaatgta 17073748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 140 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 17574563 - 17574522
Alignment:
Q  140 atgttgtttggatagtttaaatcaaaattgattttgaatgta 181  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||    
T  17574563 atgttgtttggatagtttttatcaaaattgtttttgaatgta 17574522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #51
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 28 - 69
Target Start/End: Complemental strand, 26575943 - 26575902
Alignment:
Q  28 aattgattttgatagaattgagtttgacagaattgattttga 69  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||    
T  26575943 aattgattttgatagaattgattctgatagaattgattttga 26575902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #52
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 140 - 181
Target Start/End: Original strand, 35801788 - 35801829
Alignment:
Q  140 atgttgtttggatagtttaaatcaaaattgattttgaatgta 181  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||    
T  35801788 atgttgtttggatagtttttatcaaaattgtttttgaatgta 35801829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #53
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 28 - 69
Target Start/End: Original strand, 45275779 - 45275820
Alignment:
Q  28 aattgattttgatagaattgagtttgacagaattgattttga 69  Q
    |||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  45275779 aattgattctgatagaattgattctgacagaattgattttga 45275820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #54
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 91 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 11126578 - 11126494
Alignment:
Q  91 attggtttatatttggatacacttgtttaaaagtagttgttatgagttgatgttgtttggatagtttaaatcaaaattgattttg 175  Q
    |||| ||||| ||||||||||||| |  | ||||  || | |||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  11126578 attgatttatgtttggatacacttataaataagtgattttcatgagtttgtgttgtttggatagtttgaatcaaaattgagtttg 11126494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #55
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 140 - 180
Target Start/End: Original strand, 41891915 - 41891955
Alignment:
Q  140 atgttgtttggatagtttaaatcaaaattgattttgaatgt 180  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  41891915 atgttgtttggacagtttgaatcaaaattgattttggatgt 41891955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #56
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 116 - 192
Target Start/End: Original strand, 45147322 - 45147398
Alignment:
Q  116 tttaaaagtagttgttatgagttgatgttgtttggatagtttaaatcaaaattgattttgaatgtaaaatgatcaaa 192  Q
    |||||||||  || |||| ||||||| ||||||| |||  || |||||||||||||||||||  | |||||||||||    
T  45147322 tttaaaagtgattcttataagttgatattgtttgaataacttgaatcaaaattgattttgaacattaaatgatcaaa 45147398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 116; Significance: 4e-59; HSPs: 51)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 39 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 23358373 - 23358190
Alignment:
Q  39 atagaattgagtttgacagaattgattttgattaaaagtgaatatgagatgaattggtttatatttggatacacttgtttaaaagtagttgttatgagtt 138  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||||||| | |||||| |||||||||||||||||||||||  |||| |||||||    
T  23358373 atagaattgagtttgagagaattgattttgattaaaagtgagtttgagatgaaatagtttatgtttggatacacttgtttaaaagtgattgtgatgagtt 23358274  T
Q  139 gatgttgtttggatagtttaaatcaaaattgattttgaatgtaaaatgatcaaacgcccctaaatatagaatttcttatatttt 222  Q
     |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||  |||||||| || ||||||    
T  23358273 aatgttgtttggatagtttgaatcaaaattgattttgaatgtaaaatgaccaaacacccctaaacgtagaatttgttgtatttt 23358190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 28 - 200
Target Start/End: Original strand, 44619043 - 44619215
Alignment:
Q  28 aattgattttgatagaattgagtttgacagaattgattttgattaaaagtgaatatgagatgaattggtttatatttggatacacttgtttaaaagtagt 127  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| | ||||  |||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |  |    
T  44619043 aattgattttgatagaattgagtttgagagaattgattttggttaaaagtgagtttgaggggaattgatttatgtttggatacacttgtttaaaaatgat 44619142  T
Q  128 tgttatgagttgatgttgtttggatagtttaaatcaaaattgattttgaatgtaaaatgatcaaacgccccta 200  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  44619143 tattatgagttgatgttgtttggatagtttgaattaaaatcgattttgaatgtaaaatgaccaaacaccccta 44619215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 102; E-Value: 9e-51
Query Start/End: Original strand, 19 - 192
Target Start/End: Original strand, 7472647 - 7472819
Alignment:
Q  19 ggtgacgaaaattgattttgatagaattgagtttgacagaattgattttgattaaaagtgaatatgagatgaattggtttatatttggatacacttgttt 118  Q
    |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| | |||  ||||||| || || ||||||||||||| |||    
T  7472647 ggtggcgagaattgattttgatagaattgagtttgagagaattgattttggttaaaagtgagtttgatgtgaattgatt-atgtttggatacacttattt 7472745  T
Q  119 aaaagtagttgttatgagttgatgttgtttggatagtttaaatcaaaattgattttgaatgtaaaatgatcaaa 192  Q
    ||||||  || |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  7472746 aaaagtgattcttatgagttgatgttgtttggatagtttgaatcaaaattgattttgaatgtaaaatgaccaaa 7472819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 28 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 2215378 - 2215208
Alignment:
Q  28 aattgattttgatagaattgagtttgacagaattgattttgattaaaagtgaatatgagatgaattggtttatatttggatacacttgtttaaaagtagt 127  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||| | |||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| || |    
T  2215378 aattgattttgatagaattgagcttgagagaattgattttggttaaaagtgagtttgaggtgaattgatttatgtttggatacacttgtttaaaaataat 2215279  T
Q  128 tgttatgagttgatgttgtttggatagtttaaatcaaaattgattttgaatgtaaaatgatcaaacgccccta 200  Q
      || ||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  2215278 --ttttgagttgatgttgtttggataatttaaattagaattgattttgaatgtaaaatgaccaaacaccccta 2215208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 28 - 193
Target Start/End: Original strand, 9988483 - 9988648
Alignment:
Q  28 aattgattttgatagaattgagtttgacagaattgattttgattaaaagtgaatatgagatgaattggtttatatttggatacacttgtttaaaagtagt 127  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||| |  ||  ||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||  |    
T  9988483 aattgattttgatagaattgagtttgagagaattgatttttgttaaaagtgagttggatgtgaattgatttatgtttggatacacttatttaaaagtgat 9988582  T
Q  128 tgttatgagttgatgttgtttggatagtttaaatcaaaattgattttgaatgtaaaatgatcaaac 193  Q
    |  ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||  ||||| |||||    
T  9988583 tcatatgagttgatgttgtttggatagtttgaatgaaaattgattttgaatgtgtaatgaccaaac 9988648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 15 - 180
Target Start/End: Original strand, 31562656 - 31562818
Alignment:
Q  15 tggtggtgacgaaaattgattttgatagaattgagtttgacagaattgattttgattaaaagtgaatatgagatgaattggtttatatttggatacactt 114  Q
    |||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||| | |||| |||||  |||||     
T  31562656 tggtggtggcgagaattgattttgataaaattgagtttgagagaattgattttggttaaaagtgaatttgaggtgaatt-gattatgtttgg--acactc 31562752  T
Q  115 gtttaaaagtagttgttatgagttgatgttgtttggatagtttaaatcaaaattgattttgaatgt 180  Q
    ||||||||||  || ||||||||| || ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||    
T  31562753 gtttaaaagtgattcttatgagtttatattgtttggataatttgaatcaaaattgattttgaatgt 31562818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 25 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 36548328 - 36548167
Alignment:
Q  25 gaaaattgattttgatagaattgagtttgacagaattgattttgattaaaagtgaatatgagatgaattggtttatatttggatacacttgtttaaaagt 124  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | |||  ||||||| ||||| ||||||||| ||   |||||| |    
T  36548328 gaaaattgattttgatagaattgagtttgagagaattgattttgattaaaagtgagtctgatgtgaattgatttatgtttggatactctcacttaaaa-t 36548230  T
Q  125 agttgttatgagttgatgttgtttggatagtttaaatcaaaattgattttgaatgtaaaatga 187  Q
      || ||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||| |||||    
T  36548229 gatttttatgggttgatgttgtttggataatttaaattaaaattgattttgaacgtacaatga 36548167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 19 - 177
Target Start/End: Original strand, 39141443 - 39141600
Alignment:
Q  19 ggtgacgaaaattgattttgatagaattgagtttgacagaattgattttgattaaaagtgaatatgagatgaattggtttatatttggatacacttgttt 118  Q
    |||| ||| |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |  || |||||||| || || ||||||||||||  |||    
T  39141443 ggtggcgagaattgattttgatataattgagtttgaaagaattgattttggttaaaagtgagttggatatgaattgatt-atgtttggatacactcattt 39141541  T
Q  119 aaaagtagttgttatgagttgatgttgtttggatagtttaaatcaaaattgattttgaa 177  Q
    |||| |  || |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  39141542 aaaaatgattcttatgagttgatgttgtttggatagtttgaatcaaaattgattttgaa 39141600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 77; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 28 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 2213632 - 2213468
Alignment:
Q  28 aattgattttgatagaattgagtttgacagaattgattttgattaaaagtgaatatgagatgaattggtttatatttggatacacttgtttaaaagtagt 127  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||| |   |  ||||||| ||||| ||||||||||||   ||||||||  |    
T  2213632 aattgattttgatagaattgagtttgagagaattgattttgctaaaaagtgagttgaatgtgaattgatttatgtttggatacactcaattaaaagtgat 2213533  T
Q  128 tgttatgagttgatgttgtttggatagtttaaatcaaaattgattttgaatgtaaaatgatcaaa 192  Q
    | |||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  2213532 ttttattagttgatattgtttggatagtttgaatcaaaattgattttaaatgtaaaatgaccaaa 2213468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 28 - 198
Target Start/End: Original strand, 28127269 - 28127439
Alignment:
Q  28 aattgattttgatagaattgagtttgacagaattgattttgattaaaagtgaatatgagatgaattggtttatatttggatacacttgtttaaaagtagt 127  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| | |||||||| |   |  ||||||| ||||| ||||||||||||   ||||||||  |    
T  28127269 aattgattttgatagaatttagtttgagagaattgattttgctaaaaagtgagttgaatgtgaattgatttatgtttggatacactcaattaaaagtgat 28127368  T
Q  128 tgttatgagttgatgttgtttggatagtttaaatcaaaattgattttgaatgtaaaatgatcaaacgcccc 198  Q
    | |||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||    
T  28127369 ttttattagttgatattgtttggatagtttgaatcaaaattgattttaaatgtaaaatgaccaaacacccc 28127439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 25 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 32502114 - 32501961
Alignment:
Q  25 gaaaattgattttgatagaattgagtttgacagaattgattttgattaaaagtgaatatgagatgaattggtttatatttggatacacttgtttaaaagt 124  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| | | || |||||| | |||| |||||||||| |   ||||||||    
T  32502114 gaaaattgattttgatagaattgagtttgagagaattgattttggttaaaagtgagttttaggtgaatt-gattatgtttggatacattcaattaaaagt 32502016  T
Q  125 agttgttatgagttgatgttgtttggatagtttaaatcaaaattgattttgaatg 179  Q
    | || ||| |||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||    
T  32502015 aatttttacgagttgatattgtttgggtagtttgaatcaaaattgattttaaatg 32501961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 28 - 173
Target Start/End: Original strand, 1945021 - 1945166
Alignment:
Q  28 aattgattttgatagaattgagtttgacagaattgattttgattaaaagtgaatatgagatgaattggtttatatttggatacacttgtttaaaagtagt 127  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |   |  ||||||| ||||| |||||||||||||  ||||||||  |    
T  1945021 aattgattttgatagaattgagtttgagagaattgattttggttaaaagtgagttgaatgtgaattgatttatgtttggatacactttattaaaagtgat 1945120  T
Q  128 tgttatgagttgatgttgtttggatagtttaaatcaaaattgattt 173  Q
    |  | || |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  1945121 tcatgtgggttgatgttgtttggatagtttgaatcaaaattgattt 1945166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 14 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 7296295 - 7296122
Alignment:
Q  14 ttggtggtgacgaaaattgattttgatagaattgagtttgacagaattgattttgattaaaagtgaatatgagatgaattggtttatatttggatacact 113  Q
    ||||||| | ||| |||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||| | |||  ||||||| ||||| ||||||||||||    
T  7296295 ttggtggcgccgataattgactttgatataattgagtttgagagaattgattttggttaaaaatgagtttgatgtgaattgatttatgtttggatacact 7296196  T
Q  114 tgtttaaaagtagttgttatgagttgatgttgtttggatagtttaaatcaaaattgattttgaatgtaaaatga 187  Q
      | |||||||  || | |||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| || |||||    
T  7296195 catataaaagtgattatcatgacttgatgttatttggatagtttaagtcaaaattgattttgaatatataatga 7296122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 19 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 14821297 - 14821137
Alignment:
Q  19 ggtgacgaaaattgattttgatagaattgagtttgacagaattgattttgattaaaagtgaatatgagatgaattggtttatatttggatacacttgttt 118  Q
    |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||  |||||||||| | | |  ||||||| || || |||||||||||||   |    
T  14821297 ggtgacgataattaattttgatagaattgagtttgagtgaattgattttagttaaaagtgagtttaatgtgaattgatt-atgtttggatacactttact 14821199  T
Q  119 aaaagtagttgttatgagttgatgttgtttggatagtttaaatcaaaattgattttgaatgt 180  Q
    | ||||  || |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||    
T  14821198 agaagtgattcttatgagttgatgttgtttggatattttgaatcaaaattgattttgaatgt 14821137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 28 - 180
Target Start/End: Original strand, 5916224 - 5916375
Alignment:
Q  28 aattgattttgatagaattgagtttgacagaattgattttgattaaaagtgaatatgagatgaattggtttatatttggatacacttgtttaaaagtagt 127  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||| |||||||||| |   |  ||||||| || || |||||||||||||  ||||||||  |    
T  5916224 aattgattttgatagaattaattttgagagaattgattttggttaaaagtgagttgaatgtgaattgatt-atgtttggatacactttattaaaagtgat 5916322  T
Q  128 tgttatgagttgatgttgtttggatagtttaaatcaaaattgattttgaatgt 180  Q
    |  | ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  5916323 tcatgtgagttgatgttgtttggatagtttgaatcaaaattgattttgaatgt 5916375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 28 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 36312402 - 36312251
Alignment:
Q  28 aattgattttgatagaattgagtttgacagaattgattttgattaaaagtgaatatgagatgaattggtttatatttggatacacttgtttaaaagtagt 127  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||| |||||||||| |   |  ||||||| || || |||||||||||||  ||||||||  |    
T  36312402 aattgattttgatagaattaattttgagagaattgattttggttaaaagtgagttgaatgtgaattgatt-atgtttggatacactttattaaaagtgat 36312304  T
Q  128 tgttatgagttgatgttgtttggatagtttaaatcaaaattgattttgaatgt 180  Q
    |  | ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  36312303 tcatgtgagttgatgttgtttggatagtttgaatcaaaattgattttgaatgt 36312251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 28 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 2213773 - 2213658
Alignment:
Q  28 aattgattttgatagaattgagtttgacagaattgattttgattaaaagtgaatatgagatgaattggtttatatttggatacacttgtttaaaagtagt 127  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| | |||  ||||||| ||| | ||||||||||||| |||||||||  |    
T  2213773 aattgattttgatagaattgagtttgagagaattgattttggttaaaagtgagtttgatgtgaattgatttgtctttggatacacttatttaaaagtgat 2213674  T
Q  128 tgttatgagttgatgt 143  Q
    | ||||||||||||||    
T  2213673 tcttatgagttgatgt 2213658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 28 - 187
Target Start/End: Original strand, 7295330 - 7295487
Alignment:
Q  28 aattgattttgatagaattgagtttgacagaattgattttgattaaaagtgaatatgagatgaattggtttatatttggatacacttgtttaaaagtagt 127  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| || |||||| ||| | |||  | ||||| ||||| ||||||||||| | |  ||||||  |    
T  7295330 aattaattttgatagaattgagtttgagagaattgattctggttaaaaatgagtttgacgtaaattgatttatgtttggatacacatat--aaaagtgat 7295427  T
Q  128 tgttatgagttgatgttgtttggatagtttaaatcaaaattgattttgaatgtaaaatga 187  Q
    | | |||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| || |||||    
T  7295428 tatcatgagttgatgttgtttggatagtttaagtcaaacttgattttgaatatataatga 7295487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 28 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 28261420 - 28261261
Alignment:
Q  28 aattgattttgatagaattgagtttgacagaattgattttgattaaaagtgaatatgagatgaattggtttatatttggatacacttgtttaaaagtagt 127  Q
    |||| ||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |  ||  ||||||| ||||||||||||||| ||    || ||||  |    
T  28261420 aattaattttaatacaattgagtttgagagaattgattttgcttaaaagtgagttggatgtgaattgatttatatttggatactctcacatagaagtgat 28261321  T
Q  128 tgttatgagttgatgttgtttggatagtttaaatcaaaattgattttgaatgtaaaatga 187  Q
    | |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||| |||||| |||||    
T  28261320 tcttatgagttgatgttgtttgaatagtttgaatcaaaattaattttaaatgtataatga 28261261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 19 - 193
Target Start/End: Original strand, 26207902 - 26208076
Alignment:
Q  19 ggtgacgaaaattgattttgatagaattgagtttgacagaattgattttgattaaaagtgaatatgagatgaattggtttatatttggatacacttgttt 118  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||| ||||| |||||||| | |  ||  ||||||| ||||| ||| |||||||||  ||    
T  26207902 ggtgacgaaaattgattttgatagaattaattttgagagaattggttttggttaaaagtcagttggatgtgaattgatttatgttttgatacacttaatt 26208001  T
Q  119 aaaagtagttgttatgagttgatgttgtttggatagtttaaatcaaaattgattttgaatgtaaaatgatcaaac 193  Q
    |||| |  || |||  ||||||||||||||||||  | | |||||||||||||||| |||||| ||||| |||||    
T  26208002 aaaattgattcttacaagttgatgttgtttggattatatgaatcaaaattgattttaaatgtacaatgaccaaac 26208076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 19 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 8170447 - 8170280
Alignment:
Q  19 ggtgacgaaaattgattttgatagaattgagtttgacagaattgattttgattaaaagtgaatatgagatg-aattggtttatatttggatacacttgtt 117  Q
    |||| ||| |||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||| ||| || | | |||| ||||||||||| |       
T  8170447 ggtggcgagaattaattttgatagaattgagtttgagagaattgattttgattaaaagtgagt-tga-atgtaaattgattatgtttggatacacgttaa 8170350  T
Q  118 taaaagtagttgttatgagttgatgttgtttggatagtttaaatcaaaattgattttgaatgtaaaatga 187  Q
     | | ||  || |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  8170349 cagatgtgattcttatgagttgatgttgtttggatagtttgaattaaaattgattttgaatgtataatga 8170280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 12 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 31224822 - 31224690
Alignment:
Q  12 gtttggtggtgacgaaaattgattttgatagaattgagtttgacagaattgattttgattaaaagtgaatatgagatgaattggtttatatttggataca 111  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||| |  ||  ||||||| ||||| |||||||| |    
T  31224822 gtttggcggtgacgaaaattgattttgatagaattgagtttgaaagaattgattttagttaaaagtgagttggatgtgaattgatttatgtttggatata 31224723  T
Q  112 cttgtttaaaagtagttgttatgagttgatgtt 144  Q
     ||   |||||||  || |||||||||||||||    
T  31224722 ttttactaaaagtgattcttatgagttgatgtt 31224690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 25 - 181
Target Start/End: Original strand, 42515955 - 42516110
Alignment:
Q  25 gaaaattgattttgatagaattgagtttgacagaattgattttgattaaaagtgaatatgagatgaattggtttatatttggatacacttgtttaaaagt 124  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||  |||||||||| | |||  ||||||| || || |||| ||| |||  || |||| |    
T  42515955 gaaaattgattttgatataattgagtttgagagaattgattttagttaaaagtgagtttgatgtgaattgatt-atgtttgaatatactcattaaaaaat 42516053  T
Q  125 agttgttatgagttgatgttgtttggatagtttaaatcaaaattgattttgaatgta 181  Q
      || ||  |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  42516054 gattctttcgagttgatgttgtttggatagtttgaattaaaattgattttgaatgta 42516110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 13 - 153
Target Start/End: Original strand, 42089495 - 42089639
Alignment:
Q  13 tttggtggtgacgaaaattgattttgatagaattgagtttgacagaattgattttgattaaaagtgaatatgagatgaattggtttatatttg----gat 108  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||||  | |||||||||||||||||||||||| |   |  ||||||| ||||| ||||    |||    
T  42089495 tttggcggtgatgaaaattgattttgatagaattaagttcaagagaattgattttgattaaaagtgagttgaatgtgaattgatttatgtttggatagat 42089594  T
Q  109 acacttgtttaaaagtagttgttatgagttgatgttgtttggata 153  Q
    |||||| |||||||||  || ||||||||||||||||||||||||    
T  42089595 acacttatttaaaagtgattcttatgagttgatgttgtttggata 42089639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 19 - 79
Target Start/End: Original strand, 34433279 - 34433339
Alignment:
Q  19 ggtgacgaaaattgattttgatagaattgagtttgacagaattgattttgattaaaagtga 79  Q
    ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34433279 ggtgaagagaattgattttgatagaattgagtttgacagaattgattttgattaaaagtga 34433339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 70 - 192
Target Start/End: Original strand, 25940265 - 25940387
Alignment:
Q  70 ttaaaagtgaatatgagatgaattggtttatatttggatacacttgtttaaaagtagttgttatgagttgatgttgtttggatagtttaaatcaaaattg 169  Q
    |||||||||| | |||  ||||||| |||||||||| ||||||| || || ||||  || ||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  25940265 ttaaaagtgagtttgatgtgaattgatttatatttgaatacactcgtatagaagtgattattatgagatgatgttgtttggacagtttgaatcaaaattg 25940364  T
Q  170 attttgaatgtaaaatgatcaaa 192  Q
    ||||||||| || ||||| ||||    
T  25940365 attttgaatatataatgaccaaa 25940387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 28 - 192
Target Start/End: Original strand, 25747864 - 25748027
Alignment:
Q  28 aattgattttgatagaattgagtttgacagaattgattttgattaaaagtgaatatgagatg-aattggtttatatttggatacacttgtttaaaagtag 126  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||| ||| ||||| ||||| |||||||||| |    ||||| |      
T  25747864 aattgagtttgatagaattgagtttgagagaattgattttgattaaaagtgagt-tga-atgtaattgatttatgtttggatacaataacctaaaattga 25747961  T
Q  127 ttgttatgagttgatgttgtttggatagtttaaatcaaaattgattttgaatgtaaaatgatcaaa 192  Q
    || |||| | || ||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||| ||| ||| ||||||    
T  25747962 ttcttatcaatttatgttgtttgggtagtttgaatcaaaattgcttttgaaagtataattatcaaa 25748027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 26 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 8041406 - 8041242
Alignment:
Q  26 aaaattgattttgatagaattgagtttgacagaattgattttgattaaaagtgaatatgagatg-aattggtttatatttggatacacttgtttaaaagt 124  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||| ||| ||||| ||||| ||||||| || ||  |||||| |    
T  8041406 aaaattgtgtttgatagaattgagtttgagagaattgattttgaataaaagtgaat-tga-atgtaattgatttatgtttggatgcaattacttaaaatt 8041309  T
Q  125 agttgttatgagttgatgttgtttggatagtttaaatcaaaattgattttgaatgtaaaatgatcaaa 192  Q
      || |||| | || ||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||| ||| ||| ||||||    
T  8041308 tatttttatcaatttatgttgtttgg-tagtttgaatcaaaattgtttttgaaagtataattatcaaa 8041242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 28 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 16467212 - 16467066
Alignment:
Q  28 aattgattttgatagaattgagtttgacagaattgattttgattaaaagtgaatatgagatgaattggtttatatttggatacacttgtttaaaagtagt 127  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||||| |||||||||| |  ||  | ||||| ||||| ||||||||   |  | |||||||  |    
T  16467212 aattgattttgatagaattgattttggcataattgattttggttaaaagtgagttagatgtaaattgatttatgtttggatatgataatgtaaaagtgat 16467113  T
Q  128 tgttatgagttgatgttgtttggatagtttaaatcaaaattgatttt 174  Q
    | ||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  16467112 tcttatgggttgatgtagtttggatagtttagatcaaaattaatttt 16467066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 28 - 113
Target Start/End: Original strand, 45714650 - 45714735
Alignment:
Q  28 aattgattttgatagaattgagtttgacagaattgattttgattaaaagtgaatatgagatgaattggtttatatttggatacact 113  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |  ||  ||||||| ||||| ||||||||||||    
T  45714650 aattgattttgatataattgagtttgagagaattgattttgattaaaaatgagttcgatgtgaattgatttatgtttggatacact 45714735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 28 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 3854026 - 3853874
Alignment:
Q  28 aattgattttgatagaattgagtttgacagaattgattttgattaaaagtgaatatgagatgaattggtttatatttggatacacttgtttaaaagtagt 127  Q
    |||||| |||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |   |  | ||||| ||||| |||||||||| |  | ||||| |  |    
T  3854026 aattgagtttgatggaattgattttgatagaattgattttgattaaaagtgagttgaatgtaaattgatttatgtttggatacattcatgtaaaattgat 3853927  T
Q  128 tgttatgagttgatgttgtttggatagtttaaatcaaaattgattttgaatgt 180  Q
    | |||| | |  |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  3853926 tcttatcaatctatgttgtttggatagtttgaatcaaaattgcttttgaatgt 3853874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 28 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 18511228 - 18511077
Alignment:
Q  28 aattgattttgatagaattgagtttgacagaattgattttgattaaaagtgaatatgagatgaattggtttatatttggatacacttgtttaaaagtagt 127  Q
    |||||||||||||| |||||| ||||| | ||||||||||| |||||||||| |   |  | ||||| ||||| ||||||||||    | ||||| |  |    
T  18511228 aattgattttgataaaattgattttgatataattgattttggttaaaagtgatttaaatgttaattgatttatgtttggatacatcaatgtaaaaatgat 18511129  T
Q  128 tgttatgagttgatgttgtttggatagtttaaatcaaaattgattttgaatg 179  Q
    | |||| |  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  18511128 tcttataaagtgatgttgtttggataatttaaatcaaaattgattttgaatg 18511077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 43 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 27911517 - 27911386
Alignment:
Q  43 aattgagtttgacagaattgattttgattaaaagtgaatatgagatgaattggtttatatttggatacacttgtttaaaagtagttgttatgagttgatg 142  Q
    |||||| ||||| |||||||| |||| |||||||||| | |||  ||||||| ||||| |||||||| |||  |||||||||  || ||   ||||||||    
T  27911517 aattgattttgatagaattgagtttggttaaaagtgagtttgatgtgaattgatttatgtttggatatactcatttaaaagtgattatttcaagttgatg 27911418  T
Q  143 ttgtttggatagtttaaatcaaaattgatttt 174  Q
    || |||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  27911417 ttatttggatactttaaattaaaattgatttt 27911386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 26 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 28641770 - 28641616
Alignment:
Q  26 aaaattgattttgatagaattgagtttgacagaattgattttgattaaaagtgaatatgagatgaattggtttatatttggatacacttg-tttaaaagt 124  Q
    |||||||||||| || ||||||| | ||| ||||||||||||| ||||| |||| |  ||  ||||||| ||||||||||| || ||||  |||||||||    
T  28641770 aaaattgattttaattgaattgattctgagagaattgattttggttaaatgtgagttggatgtgaattgatttatatttgggta-acttcatttaaaagt 28641672  T
Q  125 agttgttatgagttgatgttgtttggatagtttaaatcaaaattgattttgaatgt 180  Q
      || |||| |||||||||||||||||||  || ||| |||||||||||| |||||    
T  28641671 gattattataagttgatgttgtttggatatgttgaattaaaattgattttaaatgt 28641616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 56 - 175
Target Start/End: Original strand, 43436291 - 43436410
Alignment:
Q  56 agaattgattttgattaaaagtgaatatgagatgaattggtttatatttggatacacttgtttaaaagtagttgttatgagttgatgttgtttggatagt 155  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  ||  | ||||| ||||| ||| ||| ||||  |||||||||| ||  ||||| ||||||||||||||||||     
T  43436291 agaattgattttgattaaaagtgaattagatgtaaattgatttatgttttgatgcactcatttaaaagtaattcatatgaattgatgttgtttggataga 43436390  T
Q  156 ttaaatcaaaattgattttg 175  Q
    ||  || |||||||||||||    
T  43436391 ttggattaaaattgattttg 43436410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 19 - 79
Target Start/End: Complemental strand, 12111008 - 12110949
Alignment:
Q  19 ggtgacgaaaattgattttgatagaattgagtttgacagaattgattttgattaaaagtga 79  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||||| ||||||||||    
T  12111008 ggtgacgaaaattgattttgatagaattgattttgtca-aattgattttggttaaaagtga 12110949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 28 - 112
Target Start/End: Original strand, 41580692 - 41580776
Alignment:
Q  28 aattgattttgatagaattgagtttgacagaattgattttgattaaaagtgaatatgagatgaattggtttatatttggatacac 112  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| | |||  | ||||  ||||| |||||||||||    
T  41580692 aattgattttgatcgaattgagtttgagagaattgattttggttaaaagtgagtttgatgtaaattaatttatgtttggatacac 41580776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 28 - 79
Target Start/End: Original strand, 30007535 - 30007586
Alignment:
Q  28 aattgattttgatagaattgagtttgacagaattgattttgattaaaagtga 79  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||    
T  30007535 aattgattttgatagaattgagtttgagagaattaattttggttaaaagtga 30007586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 28 - 116
Target Start/End: Original strand, 38600425 - 38600513
Alignment:
Q  28 aattgattttgatagaattgagtttgacagaattgattttgattaaaagtgaatatgagatgaattggtttatatttggatacacttgt 116  Q
    |||| |||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||| | |||  | ||||| ||||| |||| ||||||||||    
T  38600425 aattaattttgatcgaattaagtttgagagaattgattttggttaaaagtgagtttgatgtaaattgatttatgtttgaatacacttgt 38600513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 28 - 79
Target Start/End: Original strand, 23267346 - 23267397
Alignment:
Q  28 aattgattttgatagaattgagtttgacagaattgattttgattaaaagtga 79  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||| ||||||    
T  23267346 aattgattttgatagaattgagtttgagtgaattgattttggttagaagtga 23267397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 25 - 81
Target Start/End: Original strand, 34997215 - 34997271
Alignment:
Q  25 gaaaattgattttgatagaattgagtttgacagaattgattttgattaaaagtgaat 81  Q
    ||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||  |||||| |||||    
T  34997215 gaaaattgattttgataaaatttagtttgacaaaattgatttttgttaaaaatgaat 34997271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 130 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 2234950 - 2234900
Alignment:
Q  130 ttatgagttgatgttgtttggatagtttaaatcaaaattgattttgaatgta 181  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||    
T  2234950 ttatgagtt-atgttgtttggatagtttgaatcaaaattaattttaaatgta 2234900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 19 - 174
Target Start/End: Original strand, 3602433 - 3602587
Alignment:
Q  19 ggtgacgaaaattgattttgatagaattgagtttgacagaattgattttgattaaaagtgaatatgagatgaattggtttatatttggatacacttgttt 118  Q
    ||||| ||||||||||||| |  ||||||| ||||| |||||||||||||  ||||||||| | |||  | |||||  |||| |||||||| | |    |    
T  3602433 ggtgatgaaaattgatttttactgaattgattttgatagaattgattttgtctaaaagtgagt-tgaacttaattgaattatgtttggatatattaaaat 3602531  T
Q  119 aaaagtagttgttatgagttgatgttgtttggatagtttaaatcaaaattgatttt 174  Q
    ||||||  || |||| | || |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||    
T  3602532 aaaagtgatttttattaattcatgttgtttggatagtttgaattaaaattgatttt 3602587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 139 - 178
Target Start/End: Original strand, 15283350 - 15283389
Alignment:
Q  139 gatgttgtttggatagtttaaatcaaaattgattttgaat 178  Q
    |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  15283350 gatgttgtttggatagtttagattaaaattgattttgaat 15283389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 142 - 181
Target Start/End: Original strand, 37640236 - 37640275
Alignment:
Q  142 gttgtttggatagtttaaatcaaaattgattttgaatgta 181  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  37640236 gttgtttggatagtttttatcaaaattgattttgaatgta 37640275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 140 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 7474154 - 7474113
Alignment:
Q  140 atgttgtttggatagtttaaatcaaaattgattttgaatgta 181  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||    
T  7474154 atgttgtttggatagtttttatcaaaattgcttttgaatgta 7474113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 140 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 17481415 - 17481374
Alignment:
Q  140 atgttgtttggatagtttaaatcaaaattgattttgaatgta 181  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||    
T  17481415 atgttgtttggatagtttttatcaaaattgcttttgaatgta 17481374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 28 - 69
Target Start/End: Original strand, 32496583 - 32496624
Alignment:
Q  28 aattgattttgatagaattgagtttgacagaattgattttga 69  Q
    |||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  32496583 aattgattctgatagaattgattatgacagaattgattttga 32496624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #49
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 140 - 181
Target Start/End: Original strand, 43341747 - 43341788
Alignment:
Q  140 atgttgtttggatagtttaaatcaaaattgattttgaatgta 181  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||    
T  43341747 atgttgtttggatagtttttatcaaaattgcttttgaatgta 43341788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #50
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 140 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 43695655 - 43695614
Alignment:
Q  140 atgttgtttggatagtttaaatcaaaattgattttgaatgta 181  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||    
T  43695655 atgttgtttggatagtttcgatcaaaattgtttttgaatgta 43695614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #51
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 19 - 79
Target Start/End: Original strand, 26806229 - 26806288
Alignment:
Q  19 ggtgacgaaaattgattttgatagaattgagtttgacagaattgattttgattaaaagtga 79  Q
    |||||| | ||||||||||| | ||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  26806229 ggtgacaataattgattttggttgaattaatttt-acagaattgattttgattaaaagtga 26806288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 106; Significance: 4e-53; HSPs: 24)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 19 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 13739331 - 13739159
Alignment:
Q  19 ggtgacgaaaattgattttgatagaattgagtttgacagaattgattttgattaaaagtgaatatgagatgaattggtttatatttggatacacttgttt 118  Q
    |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| | |||| ||||||| || || |||||||||||||||||    
T  13739331 ggtggcgagaattgattttgatagaattgagtttgagagaattgattttggttaaaagtgagtttgaggtgaattgatt-atgtttggatacacttgttt 13739233  T
Q  119 aaaagtagttgttatgagttgatgttgtttggatagtttaaatcaaaattgattttgaatgtaaaatgatcaaa 192  Q
    ||||||  || |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  13739232 aaaagtgattcttatgagttgatgttgtttggatagtttgaatcaaaattaattttgaatgtaaaatgaccaaa 13739159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 19 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 13744831 - 13744659
Alignment:
Q  19 ggtgacgaaaattgattttgatagaattgagtttgacagaattgattttgattaaaagtgaatatgagatgaattggtttatatttggatacacttgttt 118  Q
    |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| | |||| ||||||| || || |||||||||||||||||    
T  13744831 ggtggcgagaattgattttgatagaattgagtttgagagaattgattttggttaaaagtgagtttgaggtgaattgatt-atgtttggatacacttgttt 13744733  T
Q  119 aaaagtagttgttatgagttgatgttgtttggatagtttaaatcaaaattgattttgaatgtaaaatgatcaaa 192  Q
    ||||||  || |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  13744732 aaaagtgattcttatgagttgatgttgtttggatagtttgaatcaaaattaattttgaatgtaaaatgaccaaa 13744659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 19 - 192
Target Start/End: Original strand, 29409226 - 29409399
Alignment:
Q  19 ggtgacgaaaattgattttgatagaattgagtttgacagaattgattttgattaaaagtgaatatgagatgaattggtttatatttggatacacttgttt 118  Q
    |||| |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | |||  ||||||| ||||| |||||||||| || |||    
T  29409226 ggtggcgaaaattgattttaatagaattgagtttgaaagaattgattttgattaaaagtgagtttgatgtgaattgatttatgtttggatacagtttttt 29409325  T
Q  119 aaaagtagttgttatgagttgatgttgtttggatagtttaaatcaaaattgattttgaatgtaaaatgatcaaa 192  Q
    |||| |  || |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||| ||||    
T  29409326 aaaaatgattcttatgagttgatgttgtttggatagtttgaatcaaaattaattttgaatgtataatgaccaaa 29409399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 28 - 180
Target Start/End: Original strand, 33898989 - 33899141
Alignment:
Q  28 aattgattttgatagaattgagtttgacagaattgattttgattaaaagtgaatatgagatgaattggtttatatttggatacacttgtttaaaagtagt 127  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||| ||||| ||||||||||||  | |||||||  |    
T  33898989 aattgattttgatagaattgagtttgagagaattgattttgattaaaagtgagtttgatatgaattgatttatgtttggatacactaatgtaaaagtgat 33899088  T
Q  128 tgttatgagttgatgttgtttggatagtttaaatcaaaattgattttgaatgt 180  Q
    | ||||||||| ||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  33899089 tcttatgagttaataatgtttggatggtttaaatcaaaattgattttgaatgt 33899141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 11 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 31132597 - 31132432
Alignment:
Q  11 agtttggtggtgacgaaaattgattttgatagaattgagtttgacagaattgattttgattaaaagtgaatatgagatgaattggtttatatttggatac 110  Q
    ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||  ||||| ||| |  ||  | |||| ||| || |||||||||    
T  31132597 agtttggcggtgacgataattgattttgatagaattgagtttgagataatttattttggctaaaaatgagttggatgttaattcgtt-atttttggatac 31132499  T
Q  111 acttgtttaaaagtagttgttatgagttgatgttgtttggatagtttaaatcaaaattgattttgaa 177  Q
    |||| |||||||||  || ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  31132498 acttatttaaaagtgattcttatgggttgatgttgtttggatagtttgaatcaaaattgattttgaa 31132432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 28 - 180
Target Start/End: Original strand, 17829982 - 17830134
Alignment:
Q  28 aattgattttgatagaattgagtttgacagaattgattttgattaaaagtgaatatgagatgaattggtttatatttggatacacttgtttaaaagtagt 127  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |   |  ||||||| ||||| ||| | |||| ||  ||| |||| ||    
T  17829982 aattgattttgatagaattgagtttgagagaattgattttggttaaaagtgagttgaatgtgaattgatttatgtttagttacagtttattagaagtcgt 17830081  T
Q  128 tgttatgagttgatgttgtttggatagtttaaatcaaaattgattttgaatgt 180  Q
    | || || |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  17830082 tcttgtgggttgatgttgtttggatagtttgaatcaaaattgattttgaatgt 17830134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 19 - 180
Target Start/End: Original strand, 6208038 - 6208198
Alignment:
Q  19 ggtgacgaaaattgattttgatagaattgagtttgacagaattgattttgattaaaagtgaatatgagatgaattggtttatatttggatacacttgttt 118  Q
    |||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||| |   |  ||||||| || || |||||||||||||   |    
T  6208038 ggtggcgataattgattttgatagaattgattttgagtgaattgattttgattaaaagtgagttgaatgtgaattgatt-atgtttggatacactttact 6208136  T
Q  119 aaaagtagttgttatgagttgatgttgtttggatagtttaaatcaaaattgattttgaatgt 180  Q
    ||||||  || ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  6208137 aaaagtgattcttatgagttgatgttgtttagatagtttgaatcaaaattaattttgaatgt 6208198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 28 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 10826208 - 10826062
Alignment:
Q  28 aattgattttgatagaattgagtttgacagaattgattttgattaaaagtgaatatgagatgaattggtttatatttggatacacttgtttaaaagtagt 127  Q
    |||| ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |   |  ||||||| ||| | |||||||| |||| |||||||||  |    
T  10826208 aattaattttgataaaattgagtttgagagaattgattttggttaaaagtgagttgaatttgaattgatttttgtttggatatacttatttaaaagtgat 10826109  T
Q  128 tgttatgagttgatgttgtttggatagtttaaatcaaaattgatttt 174  Q
    | |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  10826108 tcttatgagttgattttgtttggatagtttgaatcaaaattaatttt 10826062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 28 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 699673 - 699518
Alignment:
Q  28 aattgattttgatagaattgagtttgacagaattgattttgattaaaagtgaatatgagatgaattggtttatatttggatacacttgtttaaaagtagt 127  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | | ||||||| |  || | |||||| ||||| ||||||| |||||   |||||||| |    
T  699673 aattgattttgatagaattgagtttgaaagaattgatttt-agttaaagtgagttggataagaattgatttatgtttggatgcactttactaaaagtaat 699575  T
Q  128 tgttatgagttgatgttgtttggatagtttaaatcaaaattgattttgaatgtaaaat 185  Q
    | |||| |||| |||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||    
T  699574 tcttataagttaatgttg-ttggatagtttgaatcaaaatcgattttgaatataaaat 699518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 41 - 193
Target Start/End: Original strand, 16442347 - 16442499
Alignment:
Q  41 agaattgagtttgacagaattgattttgattaaaagtgaatatgagatgaattggtttatatttggatacacttgtttaaaagtagttgttatgagttga 140  Q
    |||||||| ||||| ||||||||||||  ||| |||||| |   |  ||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||  ||  ||||||||||    
T  16442347 agaattgattttgagagaattgattttagttacaagtgagttgaatgtgaattgatttatgtttggatacacttatttaaaagtgattcatatgagttga 16442446  T
Q  141 tgttgtttggatagtttaaatcaaaattgattttgaatgtaaaatgatcaaac 193  Q
    | ||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||  ||||| |||||    
T  16442447 tattgtttggataatttgaatgaaaattgattttgaatgtgtaatgaccaaac 16442499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 56 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 16548228 - 16548104
Alignment:
Q  56 agaattgattttgattaaaagtgaatatgagatgaattggtttatatttggatacacttgtttaaaagtagttgttatgagttgatgttgtttggatagt 155  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |   |  ||||||| ||||| |||||||||||||  ||||||||  ||  | || ||||||||||||||||||||    
T  16548228 agaattgattttggttaaaagtgagttgaatgtgaattgatttatgtttggatacactttattaaaagtgattcatgtgggttgatgttgtttggatagt 16548129  T
Q  156 ttaaatcaaaattgattttgaatgt 180  Q
    || ||||||||||||||||||||||    
T  16548128 ttgaatcaaaattgattttgaatgt 16548104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 19 - 79
Target Start/End: Original strand, 5584024 - 5584084
Alignment:
Q  19 ggtgacgaaaattgattttgatagaattgagtttgacagaattgattttgattaaaagtga 79  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  5584024 ggtgacgagaattgattttgatagaattgattttgacagaattgattttgactaaaagtga 5584084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 28 - 79
Target Start/End: Original strand, 21254863 - 21254914
Alignment:
Q  28 aattgattttgatagaattgagtttgacagaattgattttgattaaaagtga 79  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  21254863 aattgagtttgatagaattgagtttgagagaattgaatttgattaaaagtga 21254914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 28 - 79
Target Start/End: Original strand, 32599446 - 32599497
Alignment:
Q  28 aattgattttgatagaattgagtttgacagaattgattttgattaaaagtga 79  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  32599446 aattgattttgatagaattgaatttaagagaattgattttgattaaaagtga 32599497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 25 - 79
Target Start/End: Original strand, 1312420 - 1312474
Alignment:
Q  25 gaaaattgattttgatagaattgagtttgacagaattgattttgattaaaagtga 79  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||| ||||||||||    
T  1312420 gaaaattgattttgatagaatcgagtttgataaaattgattttggttaaaagtga 1312474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 23 - 79
Target Start/End: Original strand, 26274606 - 26274662
Alignment:
Q  23 acgaaaattgattttgatagaattgagtttgacagaattgattttgattaaaagtga 79  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||| |||||||||    
T  26274606 acgagaattgattttgatagaattgattttgacataattgattctgactaaaagtga 26274662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 28 - 68
Target Start/End: Original strand, 29399777 - 29399817
Alignment:
Q  28 aattgattttgatagaattgagtttgacagaattgattttg 68  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  29399777 aattgattttgatagaattgagtttgatagaattgattttg 29399817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 28 - 79
Target Start/End: Original strand, 15151489 - 15151540
Alignment:
Q  28 aattgattttgatagaattgagtttgacagaattgattttgattaaaagtga 79  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||| ||||||    
T  15151489 aattgattttgatagaattgagtttgagtgaattgattttggttagaagtga 15151540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 28 - 79
Target Start/End: Original strand, 16121985 - 16122036
Alignment:
Q  28 aattgattttgatagaattgagtttgacagaattgattttgattaaaagtga 79  Q
    |||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  16121985 aattgattttgataaaattgattttgatagaattgattttggttaaaagtga 16122036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 26 - 79
Target Start/End: Original strand, 3605734 - 3605786
Alignment:
Q  26 aaaattgattttgatagaattgagtttgacagaattgattttgattaaaagtga 79  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  3605734 aaaattgattttgatataattgattttgt-agaattgattttgattaaaagtga 3605786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 19 - 77
Target Start/End: Complemental strand, 21456006 - 21455948
Alignment:
Q  19 ggtgacgaaaattgattttgatagaattgagtttgacagaattgattttgattaaaagt 77  Q
    |||||||  |||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||  ||||||||    
T  21456006 ggtgacgggaattgattttgatataattgagtttgtaagaattgattttagttaaaagt 21455948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 28 - 69
Target Start/End: Complemental strand, 10683884 - 10683843
Alignment:
Q  28 aattgattttgatagaattgagtttgacagaattgattttga 69  Q
    |||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||    
T  10683884 aattgattttgatataattgattctgacagaattgattttga 10683843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 140 - 181
Target Start/End: Original strand, 31745486 - 31745527
Alignment:
Q  140 atgttgtttggatagtttaaatcaaaattgattttgaatgta 181  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||    
T  31745486 atgttgtttggatagttttgatcaaaattgcttttgaatgta 31745527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 140 - 180
Target Start/End: Original strand, 2935695 - 2935735
Alignment:
Q  140 atgttgtttggatagtttaaatcaaaattgattttgaatgt 180  Q
    |||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||    
T  2935695 atgttgtttggataatttagatcaaaattgtttttgaatgt 2935735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 106; Significance: 4e-53; HSPs: 70)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 19 - 192
Target Start/End: Original strand, 43781494 - 43781666
Alignment:
Q  19 ggtgacgaaaattgattttgatagaattgagtttgacagaattgattttgattaaaagtgaatatgagatgaattggtttatatttggatacacttgttt 118  Q
    |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| | |||| ||||||| || || |||||||||||||||||    
T  43781494 ggtggcgagaattgattttgatagaattgagtttgagagaattgattttggttaaaagtgagtttgaggtgaattgatt-atgtttggatacacttgttt 43781592  T
Q  119 aaaagtagttgttatgagttgatgttgtttggatagtttaaatcaaaattgattttgaatgtaaaatgatcaaa 192  Q
    ||||||  || |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  43781593 aaaagtgattcttatgagttgatgttgtttggatagtttgaatcaaaattaattttgaatgtaaaatgaccaaa 43781666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 19 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 30842242 - 30842075
Alignment:
Q  19 ggtgacgaaaattgattttgatagaattgagtttgacagaattgattttgattaaaagtgaatatgagatgaattggtttatatttggatacacttgttt 118  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | |||| |||||| | |||| |||||||||||||||||    
T  30842242 ggtgacgagaattgattttgatagaattgagtttgagagaattgattttgattaaaagtgagtttgaggtgaatt-gattatgtttggatacacttgttt 30842144  T
Q  119 aaaagtagttgttatgagttgatgttgtttggatagtttaaatcaaaattgattttgaatgtaaaatga 187  Q
     |||||  || |||||||||||| |  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  30842143 gaaagtgattcttatgagttgatttcatttggatagtttgaatcaaaattgattttgaatgtaaaatga 30842075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 21 - 187
Target Start/End: Original strand, 48407675 - 48407840
Alignment:
Q  21 tgacgaaaattgattttgatagaattgagtttgacagaattgattttgattaaaagtgaatatgagatgaattggtttatatttggatacacttgtttaa 120  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| | |||| ||||||| || || ||||||||||||||||| |    
T  48407675 tgacgagaattgattttgatagaattgagtttgagagaattgattttggttaaaagtgagtttgaggtgaattgatt-atgtttggatacacttgtttga 48407773  T
Q  121 aagtagttgttatgagttgatgttgtttggatagtttaaatcaaaattgattttgaatgtaaaatga 187  Q
    ||||  || |||||||||||| |  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  48407774 aagtgattcttatgagttgatttcatttggatagtttgaatcaaaattgattttgaatgtaaaatga 48407840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 92; E-Value: 9e-45
Query Start/End: Original strand, 22 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 51923048 - 51922877
Alignment:
Q  22 gacgaaaattgattttgatagaattgagtttgacagaattgattttgattaaaagtgaatatgagatgaattggtttatatttggatacacttgtttaaa 121  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |   |  ||||||| ||||| |||||||||||||   ||||    
T  51923048 gacgagaattgattttgttagaattgagtttgagagaattgattttggttaaaagtgagttgaatctgaattgatttatgtttggatacactttactaaa 51922949  T
Q  122 agtagttgttatgagttgatgttgtttggatagtttaaatcaaaattgattttgaatgtaaaatgatcaaac 193  Q
    |||| || |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  51922948 agtaattcttatgagttgatgttgtttggatagtttgaatcaaaattgattttgaatgtataatgaccaaac 51922877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 19 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 39636896 - 39636735
Alignment:
Q  19 ggtgacgaaaattgattttgatagaattgagtttgacagaattgattttgattaaaagtgaatatgagatgaattggtttatatttggatacacttgttt 118  Q
    |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |  ||  ||||||| ||||| |||||||||||||  ||    
T  39636896 ggtggcgagaattgattttgatagaattgagtttgagagaattgattttgattaaaagtgagttggatgtgaattgatttatgtttggatacacttactt 39636797  T
Q  119 aaaagtagttgttatgagttgatgttgtttggatagtttaaatcaaaattgattttgaatgt 180  Q
    ||||||  || ||| |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| |||||    
T  39636796 aaaagtgattcttacgagttgatgttgtttggatagtatgaatcaaaattgattttaaatgt 39636735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 19 - 193
Target Start/End: Original strand, 13183025 - 13183199
Alignment:
Q  19 ggtgacgaaaattgattttgatagaattgagtttgacagaattgattttgattaaaagtgaatatgagatgaattggtttatatttggatacacttgttt 118  Q
    |||||||| |||||||||||||| |||||||| ||| | ||||||||||| |||||||  | | | || ||||||| ||||| ||||||||||||| |||    
T  13183025 ggtgacgataattgattttgataaaattgagtctgagataattgattttggttaaaagcaagtttaaggtgaattgatttatgtttggatacacttattt 13183124  T
Q  119 aaaagtagttgttatgagttgatgttgtttggatagtttaaatcaaaattgattttgaatgtaaaatgatcaaac 193  Q
    |||| |  || |||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  13183125 aaaaatgatttttataagttgatgttttttggataatttaaatcaaaattgattttgaatgtaaaatgaccaaac 13183199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 12 - 174
Target Start/End: Original strand, 43772091 - 43772253
Alignment:
Q  12 gtttggtggtgacgaaaattgattttgatagaattgagtttgacagaattgattttgattaaaagtgaatatgagatgaattggtttatatttggataca 111  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |  ||  ||||| | ||||| ||||||||||    
T  43772091 gtttggtggtgacgataattgattttgatagaattgagtttgagagaattgattttggttaaaagtgagttggatgtgaatcgatttatgtttggataca 43772190  T
Q  112 cttgtttaaaagtagttgttatgagttgatgttgtttggatagtttaaatcaaaattgatttt 174  Q
    ||| |||| ||||  || ||| |||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||    
T  43772191 cttttttagaagtgattcttacgagttgatgttgtttggataatatgaatcaaaattgatttt 43772253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 28 - 187
Target Start/End: Original strand, 9889319 - 9889477
Alignment:
Q  28 aattgattttgatagaattgagtttgacagaattgattttgattaaaagtgaatatgagatgaattggtttatatttggatacacttgtttaaaagtagt 127  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |  || ||||||| || ||| ||||||||||||   || |||||  |    
T  9889319 aattgattttgatagaattgagtttgagagaattgattttgattaaaagtgagttagatatgaatt-gtatatgtttggatacactcacttgaaagtgat 9889417  T
Q  128 tgttatgagttgatgttgtttggatagtttaaatcaaaattgattttgaatgtaaaatga 187  Q
    | |||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  9889418 tcttatgagtagatgttgtttggatagtttgaattaaaattgattttgaatgtataatga 9889477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 28 - 193
Target Start/End: Original strand, 26651832 - 26651997
Alignment:
Q  28 aattgattttgatagaattgagtttgacagaattgattttgattaaaagtgaatatgagatgaattggtttatatttggatacacttgtttaaaagtagt 127  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||| |   |  ||||||| ||||| ||| |||||||||   |||||||| |    
T  26651832 aattgattttgatagaattaagtttgagagaattgattttggttaaaagtgagttgaatgtgaattgatttatgtttagatacactttactaaaagtaat 26651931  T
Q  128 tgttatgagttgatgttgtttggatagtttaaatcaaaattgattttgaatgtaaaatgatcaaac 193  Q
    | |||||||| |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  26651932 tcttatgagtcgatgttatttggatagtttgaatcaaaattgattttgaatgtataatgaccaaac 26651997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 77; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 28 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 16566407 - 16566255
Alignment:
Q  28 aattgattttgatagaattgagtttgacagaattgattttgattaaaagtgaatatgagatgaattggtttatatttggatacacttgtttaaaagtagt 127  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |   |  ||||||| ||||| |||||||||||||  ||||||||  |    
T  16566407 aattgattttgatagaattgagtttgagagaattgattttggttaaaagtgagttgaatgtgaattgatttatgtttggatacactttattaaaagtgat 16566308  T
Q  128 tgttatgagttgatgttgtttggatagtttaaatcaaaattgattttgaatgt 180  Q
    |  | || |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  16566307 tcatgtgggttgatgttgtttggatagtttgaatcaaaattgattttgaatgt 16566255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 77; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 28 - 192
Target Start/End: Original strand, 29149291 - 29149455
Alignment:
Q  28 aattgattttgatagaattgagtttgacagaattgattttgattaaaagtgaatatgagatgaattggtttatatttggatacacttgtttaaaagtagt 127  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||| |   |  ||||||| ||||| ||||||||||||   ||||||||  |    
T  29149291 aattgattttgatagaattgagtttgagagaattgattttgctaaaaagtgagttgaatgtgaattgatttatgtttggatacactcaattaaaagtgat 29149390  T
Q  128 tgttatgagttgatgttgtttggatagtttaaatcaaaattgattttgaatgtaaaatgatcaaa 192  Q
    | |||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  29149391 ttttattagttgatattgtttggatagtttgaatcaaaattgattttaaatgtaaaatgaccaaa 29149455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 28 - 173
Target Start/End: Original strand, 6138604 - 6138749
Alignment:
Q  28 aattgattttgatagaattgagtttgacagaattgattttgattaaaagtgaatatgagatgaattggtttatatttggatacacttgtttaaaagtagt 127  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||| |  ||  ||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||| |  |    
T  6138604 aattgattttgatagaattgagtttgaaataattgattttggttaaaagtgagttggatgtgaattgatttatgtttggatacacttatttaaaaatgat 6138703  T
Q  128 tgttatgagttgatgttgtttggatagtttaaatcaaaattgattt 173  Q
    |  ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  6138704 tcatatgagttgatgttgtttggatagtttgaatgaaaattgattt 6138749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 28 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 9893813 - 9893653
Alignment:
Q  28 aattgattttgatagaattgagtttgacagaattgattttgattaaaagtgaatatgagatgaattggtttatatttggatacacttgtttaaaagtagt 127  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||  | |||||||| |  || |||||||| | ||| |||||||||||    || |||||  |    
T  9893813 aattgattttgatagaattgaatttgagagaattgatttttgtcaaaagtgagttagatatgaattgatatatgtttggatacacccacttgaaagtgat 9893714  T
Q  128 tgttatgagttgatgttgtttggatagtttaaatcaaaattgattttgaatgtaaaatgat 188  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||    
T  9893713 tcttatgagttgatgttgtttggatagtttaaattaaaattgattttgaatgtataatgat 9893653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 28 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 15603462 - 15603298
Alignment:
Q  28 aattgattttgatagaattgagtttgacagaattgattttgattaaaagtgaatatgagatgaattggtttatatttggatacacttgtttaaaagtagt 127  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| || | |||||||| | |||  ||||||| ||| | ||| |||| ||||| |||||| |  |    
T  15603462 aattgattttgatagaattgagtttgagataattgattatggtaaaaagtgagtttgatgtgaattgatttgtgtttagatatacttgcttaaaaatgat 15603363  T
Q  128 tgttatgagttgatgttgtttggatagtttaaatcaaaattgattttgaatgtaaaatgatcaaa 192  Q
    | |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  15603362 tcttatgagttgatgttgtttggataatttaagtcaaaattgattttgaatgcacaatgatcaaa 15603298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 28 - 192
Target Start/End: Original strand, 19592215 - 19592379
Alignment:
Q  28 aattgattttgatagaattgagtttgacagaattgattttgattaaaagtgaatatgagatgaattggtttatatttggatacacttgtttaaaagtagt 127  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||| |  ||  ||||||| ||||| |||||||||||||   |||||||  |    
T  19592215 aattgattttgatagaattgagttttagagaattgattttggttaaaagtgagttggaagtgaattgatttatgtttggatacactttactaaaagtgat 19592314  T
Q  128 tgttatgagttgatgttgtttggatagtttaaatcaaaattgattttgaatgtaaaatgatcaaa 192  Q
    | ||| || |||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  19592315 tcttacgaattgacgttgtttggatagtttgaatgaaaattgattttgaatgtacaatgaccaaa 19592379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 28 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 49136624 - 49136460
Alignment:
Q  28 aattgattttgatagaattgagtttgacagaattgattttgattaaaagtgaatatgagatgaattggtttatatttggatacacttgtttaaaagtagt 127  Q
    |||||||| || || |||||||||||| |||||||||| || |||||||||| | |||  ||||||| ||||| ||||||||||||   ||||||||  |    
T  49136624 aattgattctggtataattgagtttgagagaattgattatggttaaaagtgagtttgatgtgaattgatttatgtttggatacactcacttaaaagtgat 49136525  T
Q  128 tgttatgagttgatgttgtttggatagtttaaatcaaaattgattttgaatgtaaaatgatcaaa 192  Q
    | |||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  49136524 tcttatgagttgatgttgtttgaataattttaatcaaaattgattttgaatgtacaatgaccaaa 49136460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 72; E-Value: 8e-33
Query Start/End: Original strand, 28 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 6505303 - 6505144
Alignment:
Q  28 aattgattttgatagaattgagtttgacagaattgattttgattaaaagtgaatatgagatgaattggtttatatttggatacacttgtttaaaagtagt 127  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||| | |||  ||||||| ||||| ||| ||||||||  | |||||||  |    
T  6505303 aattgactttgatagaattgagtttgagagaattgattttggttaaaaatgagtttgatgtgaattgatttatgtttagatacactcatataaaagtgat 6505204  T
Q  128 tgttatgagttgatgttgtttggatagtttaaatcaaaattgattttgaatgtaaaatga 187  Q
    | | |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || |||||    
T  6505203 tatcatgacttgatgttgtttggatagtttaagtcaaaattgattttgaatatataatga 6505144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 72; E-Value: 8e-33
Query Start/End: Original strand, 28 - 187
Target Start/End: Original strand, 14564130 - 14564289
Alignment:
Q  28 aattgattttgatagaattgagtttgacagaattgattttgattaaaagtgaatatgagatgaattggtttatatttggatacacttgtttaaaagtagt 127  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||| |  || |||||||| ||||| |||||||||  |   ||||||||  |    
T  14564130 aattgattttgatagaattgagtttgagagaattgattttggttaaatgtgagttggatatgaattgatttatgtttggataccttcagttaaaagtgat 14564229  T
Q  128 tgttatgagttgatgttgtttggatagtttaaatcaaaattgattttgaatgtaaaatga 187  Q
    | ||||||||| ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| || |||||    
T  14564230 tcttatgagttaatgttgtttggatagattgaatcaaaattgattttgaatatataatga 14564289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 72; E-Value: 8e-33
Query Start/End: Original strand, 25 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 28987123 - 28986972
Alignment:
Q  25 gaaaattgattttgatagaattgagtttgacagaattgattttgattaaaagtgaatatgagatgaattggtttatatttggatacacttgtttaaaagt 124  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| | |||| |||||| | |||| |||| |||||||   ||  ||||    
T  28987123 gaaaattgattttgatagaattgagtttgagagaattgattttggttaaaagtgagtttgaggtgaatt-gattatgtttgaatacactcactt--aagt 28987027  T
Q  125 agttgttatgagttgatgttgtttggatagtttaaatcaaaattgattttgaatg 179  Q
      || |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  28987026 gatttttatgagttgatgttgtttggatagtttgaatcaaaattgattttaaatg 28986972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 19 - 180
Target Start/End: Original strand, 46830044 - 46830205
Alignment:
Q  19 ggtgacgaaaattgattttgatagaattgagtttgacagaattgattttgattaaaagtgaatatgagatgaattggtttatatttggatacacttgttt 118  Q
    |||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||| |||||||||| |  ||  ||||||| ||||| |||||||||||||  ||    
T  46830044 ggtggcgagaattgattttgatagaattgagtttaagtgaattgattttggttaaaagtgagttggatgtgaattgatttatgtttggatacactttctt 46830143  T
Q  119 aaaagtagttgttatgagttgatgttgtttggatagtttaaatcaaaattgattttgaatgt 180  Q
    |||| |  || |||||||||||||||||||||||| | || ||||||||||||||| |||||    
T  46830144 aaaattgattcttatgagttgatgttgtttggatattctacatcaaaattgattttaaatgt 46830205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 28 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 14072604 - 14072453
Alignment:
Q  28 aattgattttgatagaattgagtttgacagaattgattttgattaaaagtgaatatgagatgaattggtttatatttggatacacttgtttaaaagtagt 127  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |   || | ||||| || || |||||||||||||   || ||||  |    
T  14072604 aattgattttgatagaattgagtttgagagaattgattttgtttaaaagtgagttgaaggtaaattgatt-atgtttggatacactttaatagaagtgat 14072506  T
Q  128 tgttatgagttgatgttgtttggatagtttaaatcaaaattgattttgaatgt 180  Q
    | | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  14072505 tctaatgagttgatgttgtttggatagtttgaatcaaaattgattttgaatgt 14072453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 28 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 54150628 - 54150464
Alignment:
Q  28 aattgattttgatagaattgagtttgacagaattgattttgattaaaagtgaatatgagatgaattggtttatatttggatacacttgtttaaaagtagt 127  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |  ||  ||||||| ||| | |||||||||||||  |||||| |  |    
T  54150628 aattgattttgatagaattgagtttgagagaattgattttgattaaaagtgagttagatgtgaattgatttttgtttggatacacttcgttaaaaatgat 54150529  T
Q  128 tgttatgagttgatgttgtttggatagtttaaatcaaaattgattttgaatgtaaaatgatcaaa 192  Q
    | |||| ||||| |||||||||||||  |||||||||||||| ||||  ||||| ||| ||||||    
T  54150528 tcttataagttggtgttgtttggatacattaaatcaaaattgcttttagatgtataattatcaaa 54150464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 12 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 25312833 - 25312671
Alignment:
Q  12 gtttggtggtgacgaaaattgattttgatagaattgagtttgacagaattgattttgattaaaagtgaatatgagatgaattggtttatatttggataca 111  Q
    |||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |  ||  ||||||| ||| | ||||||||||    
T  25312833 gtttggcggtaacgagaattgattttgatagaattgagtttgagagaattgattttgattaaaagtgagttagatgtgaattgatttttgtttggataca 25312734  T
Q  112 cttgtttaaaagtagttgttatgagttgatgttgtttggatagtttaaatcaaaattgatttt 174  Q
    |||  |||||||   || |||||| ||| |||||||||||||  || ||||||||||| ||||    
T  25312733 ctttgttaaaagcgattcttatgaattgttgttgtttggatacattgaatcaaaattgctttt 25312671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 19 - 180
Target Start/End: Original strand, 32238034 - 32238194
Alignment:
Q  19 ggtgacgaaaattgattttgatagaattgagtttgacagaattgattttgattaaaagtgaatatgagatgaattggtttatatttggatacacttgttt 118  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||| |   |  |||||||||| || ||||||||||||   ||    
T  32238034 ggtggcgataattgattttgatagaattgagtttgagtgaattgattttggttaaaagtgagttgaatgtgaattggtt-atgtttggatacactatatt 32238132  T
Q  119 aaaagtagttgttatgagttgatgttgtttggatagtttaaatcaaaattgattttgaatgt 180  Q
    | ||||  ||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  32238133 agaagtgattcatatgagttgatgttgtttggatagtttgaatcaaaactgattttgaatgt 32238194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 41 - 193
Target Start/End: Original strand, 48550424 - 48550576
Alignment:
Q  41 agaattgagtttgacagaattgattttgattaaaagtgaatatgagatgaattggtttatatttggatacacttgtttaaaagtagttgttatgagttga 140  Q
    |||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||| |  ||  ||||||| ||||| |||||||| ||||   || ||||  || |||||||||||    
T  48550424 agaattgattttgatagaattgattttggttaaaagtgagttggatgtgaattgatttatgtttggataaactttaatagaagtgattcttatgagttga 48550523  T
Q  141 tgttgtttggatagtttaaatcaaaattgattttgaatgtaaaatgatcaaac 193  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||  |||||||||||    
T  48550524 tgttgtttggatagtttgaatcaaaattgattttaaatgtgtaatgatcaaac 48550576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 25 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 48908378 - 48908228
Alignment:
Q  25 gaaaattgattttgatagaattgagtttgacagaattgattttgattaaaagtgaatatgagatgaattggtttatatttggatacacttgtttaaaagt 124  Q
    ||||||||||||| |||  ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| | |||  |||||||||| || ||||||||| || | ||||||||    
T  48908378 gaaaattgattttaatattattgagtttgagagaattgattttggttaaaagtgagtttgatgtgaattggtt-atgtttggatac-ctcgcttaaaagt 48908281  T
Q  125 agttgttatgagttgatgttgtttggatagtttaaatcaaaattgattttgaa 177  Q
    | ||  ||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  48908280 aattcatataagttgatgttgtttggatagcttgaatcaaaattgattttgaa 48908228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 28 - 193
Target Start/End: Original strand, 42944882 - 42945047
Alignment:
Q  28 aattgattttgatagaattgagtttgacagaattgattttgattaaaagtgaatatgagatgaattggtttatatttggatacacttgtttaaaagtagt 127  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||| |   |  ||||||| ||||| ||| |||| ||||  ||||||||  |    
T  42944882 aatttattttgatagaattgattttgagagaattgattttggttaaaagtgagttgaatgtgaattgatttatgtttagatatacttacttaaaagtgat 42944981  T
Q  128 tgttatgagttgatgttgtttggatagtttaaatcaaaattgattttgaatgtaaaatgatcaaac 193  Q
    | ||||| |||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||| |||||| ||||| |||||    
T  42944982 tcttatgtgttgatgttgtttggatagtatgtatcaaaattgattttaaatgtataatgaccaaac 42945047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 56 - 192
Target Start/End: Original strand, 56241847 - 56241983
Alignment:
Q  56 agaattgattttgattaaaagtgaatatgagatgaattggtttatatttggatacacttgtttaaaagtagttgttatgagttgatgttgtttggatagt 155  Q
    |||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||| ||||| |||||||||| |  | |||||||  || ||||||||||||  ||||| |||  |    
T  56241847 agaattgattttgattaaaagtgagtttgatatgaattgatttatgtttggatacattaatgtaaaagtgattcttatgagttgataatgtttagatgat 56241946  T
Q  156 ttaaatcaaaattgattttgaatgtaaaatgatcaaa 192  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  56241947 ttaaatcaaaattgattttgaatgtataatgaccaaa 56241983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 28 - 187
Target Start/End: Original strand, 26426099 - 26426257
Alignment:
Q  28 aattgattttgatagaattgagtttgacagaattgattttgattaaaagtgaatatgagatgaattggtttatatttggatacacttgtttaaaagtagt 127  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||| |  || || |||| | |||| ||||||||| |||  ||||||||  |    
T  26426099 aattgattttgatagaattgagtttgagaaaattgattttggttaaaagtgagttagatataaatt-gattatgtttggatacgcttaattaaaagtgat 26426197  T
Q  128 tgttatgagttgatgttgtttggatagtttaaatcaaaattgattttgaatgtaaaatga 187  Q
    | || ||||||||| |||||||||||  || |||||||||||||| |||||||| |||||    
T  26426198 tcttttgagttgatattgtttggatacattgaatcaaaattgattgtgaatgtataatga 26426257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 28 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 49519832 - 49519686
Alignment:
Q  28 aattgattttgatagaattgagtttgacagaattgattttgattaaaagtgaatatgagatgaattggtttatatttggatacacttgtttaaaagtagt 127  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |  ||  ||||||  ||||| |||||||||||||| |||||| |  |    
T  49519832 aattggttttgatagaattgagtttgagagaattgattttggttaaaagtgagttggatgtgaatttatttatgtttggatacacttgcttaaaaatgat 49519733  T
Q  128 tgttatgagttgatgttgtttggatagtttaaatcaaaattgatttt 174  Q
    | |||||| ||||| ||||||||||||| |  || ||||||||||||    
T  49519732 tcttatgaattgatattgtttggatagtatgtattaaaattgatttt 49519686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 58 - 187
Target Start/End: Original strand, 2175161 - 2175290
Alignment:
Q  58 aattgattttgattaaaagtgaatatgagatgaattggtttatatttggatacacttgtttaaaagtagttgttatgagttgatgttgtttggatagttt 157  Q
    |||||||||||||||||||||| | |||  ||||||| ||||| ||||||| |||| | ||||||||  || | ||| ||||||||||||||||||||||    
T  2175161 aattgattttgattaaaagtgagtttgatgtgaattgatttatgtttggatgcactcgcttaaaagtgattttgatgggttgatgttgtttggatagttt 2175260  T
Q  158 aaatcaaaattgattttgaatgtaaaatga 187  Q
     ||| ||||||||||||||| ||| |||||    
T  2175261 gaattaaaattgattttgaacgtacaatga 2175290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 26 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 13167629 - 13167476
Alignment:
Q  26 aaaattgattttgatagaattgagtttgacagaattgattttgattaaaagtgaatatgagatgaattggtttatatttggatacacttgtttaaaagta 125  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |   |  ||||||| |||||||||||||||||   |||||||||     
T  13167629 aaaattgattttgatataattgagtttgagagaattgattttggttaaaagtgagttgaatgtgaattgatttatatttggatacacccatttaaaagtg 13167530  T
Q  126 gttgttatgagttgatgttgtttggatagtttaaatcaaaattgattttgaatg 179  Q
     || |||||  || ||| ||||||||||| || ||||||||||| |||| ||||    
T  13167529 attcttatgtattaatgatgtttggatagattgaatcaaaattgcttttaaatg 13167476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 19 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 48550328 - 48550172
Alignment:
Q  19 ggtgacgaaaattgattttgatagaattgagtttgacagaattgattttgattaaaagtgaatatgagatgaattggtttatatttggatacacttgttt 118  Q
    |||| ||| ||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||| |  ||  | ||||| ||||| ||||||| ||||  |||    
T  48550328 ggtggcgagaattgattttgatagaattgattttaagagaattgattttgattaaaagtgagttagatgtaaattgatttatgtttggatgcactcattt 48550229  T
Q  119 aaaagtagttgttatgagttgatgttgtttggatagtttaaatcaaaattgattttg 175  Q
    ||||||| ||  ||||| ||||| |||||||||||| ||  || |||||||||||||    
T  48550228 aaaagtaattcatatgaattgatattgtttggatagattggattaaaattgattttg 48550172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 28 - 180
Target Start/End: Original strand, 54735635 - 54735786
Alignment:
Q  28 aattgattttgatagaattgagtttgacagaattgattttgattaaaagtgaatatgagatgaattggtttatatttggatacacttgtttaaaagtagt 127  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||  ||| | |||  | ||||||||||| |||||| |||  |  ||||||||  |    
T  54735635 aattgattttgatagaattgagtttgagaaaattgattttggttaaat-tgagtttgatgtaaattggtttatgtttggaaacatatacttaaaagtgat 54735733  T
Q  128 tgttatgagttgatgttgtttggatagtttaaatcaaaattgattttgaatgt 180  Q
    | ||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||| ||||||||    
T  54735734 tcttatgagttgatgttgtttgagtattttaaatcaaaattgatcttgaatgt 54735786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 43 - 180
Target Start/End: Original strand, 4954050 - 4954187
Alignment:
Q  43 aattgagtttgacagaattgattttgattaaaagtgaatatgagatgaattggtttatatttggatacacttgtttaaaagtagttgttatgagttgatg 142  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||| | |||  ||||||| ||||| ||||| ||| ||   ||||||||  || |||||||||||||    
T  4954050 aattgattttgagagaattgattttggttaaaagtgagtttgatgtgaattgatttatgtttgggtaccctcacttaaaagtgattcttatgagttgatg 4954149  T
Q  143 ttgtttggatagtttaaatcaaaattgattttgaatgt 180  Q
    |||||||||||| || |||||||||| ||||| |||||    
T  4954150 ttgtttggataggttgaatcaaaattaattttaaatgt 4954187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 19 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 54153155 - 54152995
Alignment:
Q  19 ggtgacgaaaattgattttgatagaattgagtttgacagaattgattttgattaaaagtgaatatgagatgaattggtttatatttggatacacttgttt 118  Q
    |||| ||| |||||||||| ||| ||||||||||||  |||||||||||| |||||||||| |   |  ||||||| || || |||| ||||||||   |    
T  54153155 ggtggcgataattgattttaatataattgagtttgagtgaattgattttggttaaaagtgagttgaatgtgaattgatt-atgtttgaatacactttact 54153057  T
Q  119 aaaagtagttgttatgagttgatgttgtttggatagtttaaatcaaaattgattttgaatgt 180  Q
    | ||||  || | |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  54153056 agaagtgattctcatgagttgatgttgtttgaatagtttgaatcaaaattgattttgaatgt 54152995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 28 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 14054953 - 14054801
Alignment:
Q  28 aattgattttgatagaattgagtttgacagaattgattttgattaaaagtgaatatgagatgaattggtttatatttggatacacttgtttaaaagtagt 127  Q
    |||||||||||| | |||||||||||| |||||||| |||  | |||||||| | |||  ||||||| ||||| |||||||| |||| | |||||||  |    
T  14054953 aattgattttgacataattgagtttgaaagaattgagtttagtcaaaagtgagtttgatgtgaattgatttatgtttggataaacttatataaaagtgat 14054854  T
Q  128 tgttatgagttgatgttgtttggatagtttaaatcaaaattgattttgaatgt 180  Q
    | ||   ||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||| ||||    
T  14054853 tatttcaagttgatgttgtttgaatactttaaattaaaattgattttggatgt 14054801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 28 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 14076116 - 14075965
Alignment:
Q  28 aattgattttgatagaattgagtttgacagaattgattttgattaaaagtgaatatgagatgaattggtttatatttggatacacttgtttaaaagtagt 127  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| || ||||||| | |||  | ||||| ||||| |||||| |||  |  ||||||||  |    
T  14076116 aattgattttgatagaattgagtttgagaaaattgattttggtt-aaagtgagtttgatgtaaattgatttatgtttggaaacatatacttaaaagtgat 14076018  T
Q  128 tgttatgagttgatgttgtttggatagtttaaatcaaaattgattttgaatgt 180  Q
    | |||||| |||||||||||||  || |||||||||||||| || ||||||||    
T  14076017 tcttatgaattgatgttgtttgagtactttaaatcaaaattaatcttgaatgt 14075965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 28 - 124
Target Start/End: Complemental strand, 46926150 - 46926054
Alignment:
Q  28 aattgattttgatagaattgagtttgacagaattgattttgattaaaagtgaatatgagatgaattggtttatatttggatacacttgtttaaaagt 124  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||| |||||||||| |  ||  ||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  46926150 aattgattttgatagaattgagtttgagaaaattgtttttggttaaaagtgagttagatgtgaattgatttatgtttggatacactcgtttaaaagt 46926054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 28 - 114
Target Start/End: Complemental strand, 39187836 - 39187750
Alignment:
Q  28 aattgattttgatagaattgagtttgacagaattgattttgattaaaagtgaatatg-agatgaattggtttatatttggatacactt 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||| || |  ||||||| ||||| |||||||||||||    
T  39187836 aattgattttgatagaattgagtttgagagaattgattttggttaaaagt-aatttgaatgtgaattgatttatgtttggatacactt 39187750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 12 - 79
Target Start/End: Original strand, 55638723 - 55638790
Alignment:
Q  12 gtttggtggtgacgaaaattgattttgatagaattgagtttgacagaattgattttgattaaaagtga 79  Q
    ||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||    
T  55638723 gtttggtggcggcgagaattgattttgatagaattgagtttgagagaattgatttttgttaaaagtga 55638790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 28 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 38694150 - 38693996
Alignment:
Q  28 aattgattttgatagaattgagtttgacagaattgattttgattaaaagtgaatatgagatg--aattggtttatatttggatacacttgtttaaaagta 125  Q
    |||| |||||||||  ||||||||| | |||||||||||||  ||||||| | | |||| ||  |||| |||||| |||||||||||| | ||||||||     
T  38694150 aattaattttgatatgattgagtttaaaagaattgattttgtctaaaagtaagt-tgag-tgcaaattagtttatgtttggatacactcgcttaaaagtg 38694053  T
Q  126 gttgttatgagttgatgttgtttggatagtttaaatcaaaattgattttgaatgtaa 182  Q
     || ||||| |||||| ||| ||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  38694052 attcttatgggttgatcttgcttgaataatttaaatcaaaattaattttgaatgtaa 38693996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 20 - 81
Target Start/End: Complemental strand, 5835859 - 5835799
Alignment:
Q  20 gtgacgaaaattgattttgatagaattgagtttgacagaattgattttgattaaaagtgaat 81  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||  |||||||||||||||||||| |||||    
T  5835859 gtgacgaaaattgattttgattgaattgattttg-tagaattgattttgattaaaactgaat 5835799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 35 - 79
Target Start/End: Original strand, 19599487 - 19599531
Alignment:
Q  35 tttgatagaattgagtttgacagaattgattttgattaaaagtga 79  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  19599487 tttgatagaattgagtttgagagaattgattttgaataaaagtga 19599531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 28 - 180
Target Start/End: Original strand, 31520355 - 31520506
Alignment:
Q  28 aattgattttgatagaattgagtttgacagaattgattttgattaaaagtgaatatgagatgaattggtttatatttggatacacttgtttaaaagtagt 127  Q
    ||||||||||| ||||||  ||||||| |||||| |||||| |||||||||| |  |   ||||| | ||||| ||| ||||  ||| || ||||||  |    
T  31520355 aattgattttggtagaatgaagtttgaaagaattaattttggttaaaagtgagttgggtgtgaatggatttatgtttagatatgcttatt-aaaagtgat 31520453  T
Q  128 tgttatgagttgatgttgtttggatagtttaaatcaaaattgattttgaatgt 180  Q
    | ||||||||||||||| ||||| |||||| ||| |||||||||||| |||||    
T  31520454 ttttatgagttgatgttttttgggtagtttgaataaaaattgattttaaatgt 31520506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 28 - 79
Target Start/End: Complemental strand, 53532079 - 53532028
Alignment:
Q  28 aattgattttgatagaattgagtttgacagaattgattttgattaaaagtga 79  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||    
T  53532079 aattgattttgataaaattgagtttgacataattgattttagttaaaagtga 53532028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 90 - 180
Target Start/End: Original strand, 30887199 - 30887289
Alignment:
Q  90 aattggtttatatttggatacacttgtttaaaagtagttgttatgagttgatgttgtttggatagtttaaatcaaaattgattttgaatgt 180  Q
    ||||| ||||| |||||||||||   | |||||||  || ||||||||| ||| ||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||    
T  30887199 aattgatttatgtttggatacaccaatataaaagtgattcttatgagttaatgatgtttggatggtttgtatcaaaattgattttgaatgt 30887289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 34 - 79
Target Start/End: Complemental strand, 33574274 - 33574229
Alignment:
Q  34 ttttgatagaattgagtttgacagaattgattttgattaaaagtga 79  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||    
T  33574274 ttttgatagaattgagtttgagagaattaattttggttaaaagtga 33574229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 140 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 45106398 - 45106357
Alignment:
Q  140 atgttgtttggatagtttaaatcaaaattgattttgaatgta 181  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  45106398 atgttgtttggatagtttttatcaaaattgattttgaatgta 45106357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 135 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 54655245 - 54655200
Alignment:
Q  135 agttgatgttgtttggatagtttaaatcaaaattgattttgaatgt 180  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||    
T  54655245 agttgatgttgtttggatactttaaattaaaattgattttggatgt 54655200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 12 - 108
Target Start/End: Complemental strand, 41866272 - 41866176
Alignment:
Q  12 gtttggtggtgacgaaaattgattttgatagaattgagtttgacagaattgattttgattaaaagtgaatatgagatgaattggtttatatttggat 108  Q
    |||||| |||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||  ||||||| |||  |||||||||| |  ||  ||||||| ||||| |||||||    
T  41866272 gtttggcggtggcgataattgattttgataaaattgagtttgagggaattgagtttagttaaaagtgagttggatgtgaattgatttatgtttggat 41866176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 130 - 178
Target Start/End: Original strand, 55638873 - 55638921
Alignment:
Q  130 ttatgagttgatgttgtttggatagtttaaatcaaaattgattttgaat 178  Q
    |||||||||||| ||||||||||| | | ||||||||||||||||||||    
T  55638873 ttatgagttgatattgtttggataatatgaatcaaaattgattttgaat 55638921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 140 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 5025519 - 5025484
Alignment:
Q  140 atgttgtttggatagtttaaatcaaaattgattttg 175  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  5025519 atgttgtttggatagtttgaatcaaaattgattttg 5025484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 28 - 111
Target Start/End: Original strand, 16202504 - 16202585
Alignment:
Q  28 aattgattttgatagaattgagtttgacagaattgattttgattaaaagtgaatatgagatgaattggtttatatttggataca 111  Q
    |||||||| |||| ||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| ||| | ||||| |||||| ||||| ||||||||||    
T  16202504 aattgattctgattgaattgattttgatagaattgattttga-taaaattgattttgaga-gaattgatttatgtttggataca 16202585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 28 - 67
Target Start/End: Complemental strand, 48556655 - 48556616
Alignment:
Q  28 aattgattttgatagaattgagtttgacagaattgatttt 67  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  48556655 aattgattttgatagaattgagtttgataaaattgatttt 48556616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 25 - 75
Target Start/End: Complemental strand, 38264004 - 38263954
Alignment:
Q  25 gaaaattgattttgatagaattgagtttgacagaattgattttgattaaaa 75  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||| | |||| |||||| ||||||    
T  38264004 gaaaattgattttgatataattgagtttgagaaaattaattttgcttaaaa 38263954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 28 - 66
Target Start/End: Complemental strand, 48407610 - 48407572
Alignment:
Q  28 aattgattttgatagaattgagtttgacagaattgattt 66  Q
    ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  48407610 aattgattttgatagaattgattgtgacagaattgattt 48407572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 25 - 114
Target Start/End: Complemental strand, 523255 - 523166
Alignment:
Q  25 gaaaattgattttgatagaattgagtttgacagaattgattttgattaaaagtgaatatgagatgaattggtttatatttggatacactt 114  Q
    ||||||||||||||||  ||||||| |||||| |||||||||||   |||||||| |   | |||||||| ||||| ||||||| |||||    
T  523255 gaaaattgattttgatttaattgagcttgacaaaattgattttgggaaaaagtgagttcaatatgaattgatttatgtttggattcactt 523166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #59
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 140 - 181
Target Start/End: Original strand, 16202614 - 16202655
Alignment:
Q  140 atgttgtttggatagtttaaatcaaaattgattttgaatgta 181  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||    
T  16202614 atgttgtttggatagttttgatcaaaattgcttttgaatgta 16202655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #60
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 28 - 69
Target Start/End: Original strand, 22605745 - 22605786
Alignment:
Q  28 aattgattttgatagaattgagtttgacagaattgattttga 69  Q
    ||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||    
T  22605745 aattgattttgatagaattgattgggacagaattgattttga 22605786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #61
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 140 - 181
Target Start/End: Original strand, 22605838 - 22605879
Alignment:
Q  140 atgttgtttggatagtttaaatcaaaattgattttgaatgta 181  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||    
T  22605838 atgttgtttggatagtttttatcaaaattgcttttgaatgta 22605879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #62
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 28 - 69
Target Start/End: Original strand, 28963244 - 28963285
Alignment:
Q  28 aattgattttgatagaattgagtttgacagaattgattttga 69  Q
    |||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  28963244 aattgattctgatagaattgattctgacagaattgattttga 28963285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #63
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 140 - 181
Target Start/End: Original strand, 28963339 - 28963380
Alignment:
Q  140 atgttgtttggatagtttaaatcaaaattgattttgaatgta 181  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||    
T  28963339 atgttgtttggatagtttttatcaaaattgcttttgaatgta 28963380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #64
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 28 - 69
Target Start/End: Original strand, 29385432 - 29385473
Alignment:
Q  28 aattgattttgatagaattgagtttgacagaattgattttga 69  Q
    |||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  29385432 aattgattctaatagaattgattttgacagaattgattttga 29385473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #65
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 140 - 181
Target Start/End: Original strand, 30417876 - 30417917
Alignment:
Q  140 atgttgtttggatagtttaaatcaaaattgattttgaatgta 181  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||    
T  30417876 atgttgtttggatagtttttatcaaaattgcttttgaatgta 30417917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #66
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 140 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 39733437 - 39733396
Alignment:
Q  140 atgttgtttggatagtttaaatcaaaattgattttgaatgta 181  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||    
T  39733437 atgttgtttggatagttttgatcaaaattaattttgaatgta 39733396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #67
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 140 - 177
Target Start/End: Original strand, 50523350 - 50523387
Alignment:
Q  140 atgttgtttggatagtttaaatcaaaattgattttgaa 177  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  50523350 atgttgtttggatagttttgatcaaaattgattttgaa 50523387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #68
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 28 - 69
Target Start/End: Complemental strand, 51677682 - 51677641
Alignment:
Q  28 aattgattttgatagaattgagtttgacagaattgattttga 69  Q
    |||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  51677682 aattgattctgatagaattgattctgacagaattgattttga 51677641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #69
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 28 - 68
Target Start/End: Original strand, 4649913 - 4649953
Alignment:
Q  28 aattgattttgatagaattgagtttgacagaattgattttg 68  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||    
T  4649913 aattgattttgataaaattgagtttgagtgaattgattttg 4649953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #70
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 136 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 15619610 - 15619567
Alignment:
Q  136 gttgatgttgtttggatagtttaaatcaaaattgattttgaatgt 180  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||    
T  15619610 gttgatgttgtttggatagtttgaatcaaaa-tgatcttgaatgt 15619567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 101; Significance: 4e-50; HSPs: 56)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 19 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 42318455 - 42318288
Alignment:
Q  19 ggtgacgaaaattgattttgatagaattgagtttgacagaattgattttgattaaaagtgaatatgagatgaattggtttatatttggatacacttgttt 118  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| | |||| ||||||| || || |||||||||||||||||    
T  42318455 ggtgacgataattgattttgatagaattgagtttgagagaattgattttggttaaaagtgagtttgaggtgaattgatt-atgtttggatacacttgttt 42318357  T
Q  119 aaaagtagttgttatgagttgatgttgtttggatagtttaaatcaaaattgattttgaatgtaaaatga 187  Q
     |||||  || |||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  42318356 gaaagtgattcttatgagttgatttcgtttggatagtttgaatcaaaattgattttgaatgtaaaatga 42318288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 19 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 10334264 - 10334090
Alignment:
Q  19 ggtgacgaaaattgattttgatagaattgagtttgacagaattgattttgattaaaagtgaatatgagatgaattggtttatatttggatacacttgttt 118  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| | |   | |||||||| ||||| |||||||||||||   |    
T  10334264 ggtgacgagaattgattttgatagaattgagtttgagagaattgattttggttaaaagtcagttgaatatgaattgatttatgtttggatacactttact 10334165  T
Q  119 aaaagtagttgttatgagttgatgttgtttggatagtttaaatcaaaattgattttgaatgtaaaatgatcaaac 193  Q
    ||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||| |||||    
T  10334164 aaaagtaattcttatgagttgacgttgtttggatagtttgaatcaaaattgattttgaatttataatgaccaaac 10334090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 19 - 187
Target Start/End: Original strand, 38125417 - 38125584
Alignment:
Q  19 ggtgacgaaaattgattttgatagaattgagtttgacagaattgattttgattaaaagtgaatatgagatgaattggtttatatttggatacacttgttt 118  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||  | |||| ||||||| || || |||||||||||||||||    
T  38125417 ggtgacgagaattgattttgatagaattgaatttgagagaattgattttggttaaaagtgggtttgaggtgaattgatt-atgtttggatacacttgttt 38125515  T
Q  119 aaaagtagttgttatgagttgatgttgtttggatagtttaaatcaaaattgattttgaatgtaaaatga 187  Q
     |||||  || |||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  38125516 gaaagtgattcttatgagttgatttcgtttggatagtttgaatcaaaattaattttgaatgtaaaatga 38125584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 28 - 180
Target Start/End: Original strand, 10853251 - 10853403
Alignment:
Q  28 aattgattttgatagaattgagtttgacagaattgattttgattaaaagtgaatatgagatgaattggtttatatttggatacacttgtttaaaagtagt 127  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| | | | || ||||| ||||| |||||||| |||   ||||||||  |    
T  10853251 aattgattttgatagaattgagtttgagagaattgattttggttaaaagtgagtttaatataaattgatttatgtttggatatactcacttaaaagtgat 10853350  T
Q  128 tgttatgagttgatgttgtttggatagtttaaatcaaaattgattttgaatgt 180  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  10853351 tcttatgagttgatgttgtttggatagtttgaatcaaaattgattttgaatgt 10853403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 82; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 35 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 53179958 - 53179802
Alignment:
Q  35 tttgatagaattgagtttgacagaattgattttgattaaaagtgaatatgagatgaattggtttatatttggatacacttgtttaaaagtagttgttatg 134  Q
    |||||||||||||||||| | | ||||||||||| |||||||||| | |||  | ||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||  || |||||    
T  53179958 tttgatagaattgagttttatataattgattttggttaaaagtgagtttgatgtaaattgatttatgtttggatacacttttttaaaagtgatttttatg 53179859  T
Q  135 agttgatgttgtttggatagtttaaatcaaaattgattttgaatgtaaaatgatcaaa 192  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  53179858 agttgat-ttgtttggatagtttaaatcaaaattgattttgaatgtacaatgaccaaa 53179802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 28 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 35930855 - 35930703
Alignment:
Q  28 aattgattttgatagaattgagtttgacagaattgattttgattaaaagtgaatatgagatgaattggtttatatttggatacacttgtttaaaagtagt 127  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| | ||| |||||||| |||||  |||||||||||  | || ||||  |    
T  35930855 aattgattttgatagaattgagtttgagagaattgatttttattaaaagtgagtttgatatgaattgatttatgcttggatacactaatgtataagtcat 35930756  T
Q  128 tgttatgagttgatgttgtttggatagtttaaatcaaaattgattttgaatgt 180  Q
    | ||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  35930755 tcttatgagttgataatgtttggatggtttaaatcaaaattgattttgaatgt 35930703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 25 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 53075022 - 53074869
Alignment:
Q  25 gaaaattgattttgatagaattgagtttgacagaattgattttgattaaaagtgaatatgagatgaattggtttatatttggatacacttgtttaaaagt 124  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| | |||| |||||| | |||| ||||||||||||   ||||||||    
T  53075022 gaaaattgattttgatataattgagtttgagagaattgattttggttaaaagtgagtttgaggtgaatt-gattatgtttggatacactcacttaaaagt 53074924  T
Q  125 agttgttatgagttgatgttgtttggatagtttaaatcaaaattgattttgaatg 179  Q
      || |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  53074923 gattcttatgagtggatgttgtttggatagtttgaatcaaaattgattttaaatg 53074869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 19 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 3348369 - 3348208
Alignment:
Q  19 ggtgacgaaaattgattttgatagaattgagtttgacagaattgattttgattaaaagtgaatatgagatgaattggtttatatttggatacacttgttt 118  Q
    |||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||| ||| |||||| |  ||  | ||||| ||||| |||||||||||||  ||    
T  3348369 ggtggcgagaattgattttgatagaattgagtttaagtgaattgattttggttagaagtgagttggatgtaaattgatttatgtttggatacacttcctt 3348270  T
Q  119 aaaagtagttgttatgagttgatgttgtttggatagtttaaatcaaaattgattttgaatgt 180  Q
    ||||||| || |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||    
T  3348269 aaaagtaattcttatgagttgatgttgtttggatattttatatcaaaattgattttgaatgt 3348208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 28 - 193
Target Start/End: Original strand, 38172291 - 38172456
Alignment:
Q  28 aattgattttgatagaattgagtttgacagaattgattttgattaaaagtgaatatgagatgaattggtttatatttggatacacttgtttaaaagtagt 127  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |  ||  ||||||| ||||| |||||||||||||   || ||||  |    
T  38172291 aattgattttaatagaattgagtttgagagaattgattttggttaaaagtgagtgggatgtgaattgatttatgtttggatacactttaatagaagtgat 38172390  T
Q  128 tgttatgagttgatgttgtttggatagtttaaatcaaaattgattttgaatgtaaaatgatcaaac 193  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||  ||||| |||||    
T  38172391 tcttatgagttgatgttgtttggatagtttgaattaaaattgattttgaatgtgtaatgaccaaac 38172456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 19 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 35425459 - 35425299
Alignment:
Q  19 ggtgacgaaaattgattttgatagaattgagtttgacagaattgattttgattaaaagtgaatatgagatgaattggtttatatttggatacacttgttt 118  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |   |  |||||| | |||| |||||||||||||        
T  35425459 ggtgacgagaattgattttgatagaattgagtttgagagaattgattttgattaaaagtgagttgaatgtgaatt-gattatgtttggatacactttaac 35425361  T
Q  119 aaaagtagttgttatgagttgatgttgtttggatagtttaaatcaaaattgattttgaatgt 180  Q
    | ||||  || |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  35425360 agaagtgattcttatgagttgatattgtttggatagtttgaatcaaaattgattttgaatgt 35425299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 28 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 26519781 - 26519617
Alignment:
Q  28 aattgattttgatagaattgagtttgacagaattgattttgattaaaagtgaatatgagatgaattggtttatatttggatacacttgtttaaaagtagt 127  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||| |   |  ||||||| ||||| ||||||||||||   ||||||||  |    
T  26519781 aattgattttgatagaattgagtttgagagaattgattttgctaaaaagtgagttgaatgtgaattgatttatgtttggatacactcaattaaaagtgat 26519682  T
Q  128 tgttatgagttgatgttgtttggatagtttaaatcaaaattgattttgaatgtaaaatgatcaaa 192  Q
    | |||| ||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  26519681 ttttattagttgatattgtttggatagtttgaaacaaaattgattttaaatgtaaaatgaccaaa 26519617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 12 - 180
Target Start/End: Original strand, 52966777 - 52966945
Alignment:
Q  12 gtttggtggtgacgaaaattgattttgatagaattgagtttgacagaattgattttgattaaaagtgaatatgagatgaattggtttatatttggataca 111  Q
    |||||| ||||  |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||| | |||  ||||||| ||||| ||||| |||     
T  52966777 gtttggaggtggagaaaattgattttgatagaattgattttgagagaattgattttggttaaaagtgactttgatgtgaattgatttatgtttgggtacc 52966876  T
Q  112 cttgtttaaaagtagttgttatgagttgatgttgtttggatagtttaaatcaaaattgattttgaatgt 180  Q
    ||   ||||||||  || ||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||| |||||    
T  52966877 ctcacttaaaagtgattcttatgagttgatgttgtttagataggttgaatcaaaattgattttaaatgt 52966945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 28 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 20813262 - 20813111
Alignment:
Q  28 aattgattttgatagaattgagtttgacagaattgattttgattaaaagtgaatatgagatgaattggtttatatttggatacacttgtttaaaagtagt 127  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| |||||||  |||| |||||||||| |  ||  ||||||| ||| | |||||||| |||| || ||||||  |    
T  20813262 aattgattttgatagaat-gagtttgagagaattgtgtttggttaaaagtgagttggatttgaattgatttttgtttggatatacttattcaaaagtgat 20813164  T
Q  128 tgttatgagttgatgttgtttggatagtttaaatcaaaattgattttgaatgt 180  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  20813163 tcttatgagttgatgttgtttggatagtttgaatcaaaattgattttgaatgt 20813111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 40 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 44224867 - 44224727
Alignment:
Q  40 tagaattgagtttgacagaattgattttgattaaaagtgaatatgagatgaattggtttatatttggatacacttgtttaaaagtagttgttatgagttg 139  Q
    ||||||||||||||| | |||||||| || |||||||||| | ||| |||||||| ||||| ||||||||||||   ||||||||  || ||||||||||    
T  44224867 tagaattgagtttgagataattgattatggttaaaagtgagtttgatatgaattgatttatgtttggatacactcacttaaaagtgattcttatgagttg 44224768  T
Q  140 atgttgtttggatagtttaaatcaaaattgattttgaatgt 180  Q
    |||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||    
T  44224767 atgttgtttggataattttagtcaaaattgattttgaatgt 44224727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 19 - 187
Target Start/End: Original strand, 48189417 - 48189584
Alignment:
Q  19 ggtgacgaaaattgattttgatagaattgagtttgacagaattgattttgattaaaagtgaatatgagatg-aattggtttatatttggatacacttgtt 117  Q
    |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||| ||| || | | |||| ||||||||||| |       
T  48189417 ggtggcgataattgattttgatagaattgagtttgagagaattgattttgattaaaagtgagt-tga-atgtaaattgattatgtttggatacacgttaa 48189514  T
Q  118 taaaagtagttgttatgagttgatgttgtttggatagtttaaatcaaaattgattttgaatgtaaaatga 187  Q
     | ||||  || |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  48189515 cagaagtgattcttatgagttgatgttgtttggatagtttgaattaaaattgattttgaatgtataatga 48189584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 19 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 50664884 - 50664712
Alignment:
Q  19 ggtgacgaaaattgattttgatagaattgagtttgacagaattgattttgattaaaagtgaatatgagatgaattggtttatatttggatacacttgttt 118  Q
    |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |   |  ||||||| ||||| |||||||||||    ||    
T  50664884 ggtggcgagaattgattttgatagaattgagtttgagagaattgattttggttaaaagtgagttgaatgtgaattgatttatgtttggatacacacactt 50664785  T
Q  119 aaaagtagttgttatgagttgatgttgtttggatagtttaaatcaaaattgattttgaatgtaaaatgatcaaa 192  Q
    | ||||  || ||| ||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  50664784 agaagtgattcttaagagtt-atgttgtttagatagtttaaattaaaattgattttgaatgtgtaatgatcaaa 50664712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 19 - 179
Target Start/End: Original strand, 15511351 - 15511510
Alignment:
Q  19 ggtgacgaaaattgattttgatagaattgagtttgacagaattgattttgattaaaagtgaatatgagatgaattggtttatatttggatacacttgttt 118  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||| |||||||||| |  |   ||||||| ||||| ||||||||| ||| ||     
T  15511351 ggtggcgataattgattttgatagaacggagtttgaaagaattgattttggttaaaagtgagttgggtgtgaattgatttatgtttggatacgcttatt- 15511449  T
Q  119 aaaagtagttgttatgagttgatgttgtttggatagtttaaatcaaaattgattttgaatg 179  Q
    ||||||  || |||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  15511450 aaaagtgatttttatgagttgatattgtttggatagtttgaataaaaattgattttgaatg 15511510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 19 - 177
Target Start/End: Original strand, 23207043 - 23207199
Alignment:
Q  19 ggtgacgaaaattgattttgatagaattgagtttgacagaattgattttgattaaaagtgaatatgagatgaattggtttatatttggatacacttgttt 118  Q
    |||| |||||||||||||||||| |||||| ||||  | ||||||||||| |||||| ||| | |||  ||||||| ||||| ||||||||||||| |||    
T  23207043 ggtggcgaaaattgattttgatataattgattttgttataattgattttggttaaaaatgagtttgatgtgaattgatttatgtttggatacactttttt 23207142  T
Q  119 aaaagtagttgttatgagttgatgttgtttggatagtttaaatcaaaattgattttgaa 177  Q
    | |||| | | ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||    
T  23207143 acaagt-gattttatgagttgatgttgttt-gatagtttgaatcaaaattaattttgaa 23207199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 12 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 42475842 - 42475680
Alignment:
Q  12 gtttggtggtgacgaaaattgattttgatagaattgagtttgacagaattgattttgattaaaagtgaatatgagatgaattggtttatatttggataca 111  Q
    |||||| |||||||| |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |  ||  ||||||| ||| | |||| |||||    
T  42475842 gtttggcggtgacgagaattgatttttatagaattgagtttgagagaattgattttgattaaaagtgagttagatgtgaattgatttttgtttgaataca 42475743  T
Q  112 cttgtttaaaagtagttgttatgagttgatgttgtttggatagtttaaatcaaaattgatttt 174  Q
    |||  |||||||   || |||||| ||| |||||||||||||  || ||||||||||| ||||    
T  42475742 ctttgttaaaagcgattcttatgaattgttgttgtttggatacattgaatcaaaattgctttt 42475680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 28 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 23496434 - 23496282
Alignment:
Q  28 aattgattttgatagaattgagtttgacagaattgattttgattaaaagtgaatatgagatgaattggtttatatttggatacacttgtttaaaagtagt 127  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |   |  ||||||| ||||| |||||||||       |||||||  |    
T  23496434 aattgattttgatagaattgagtttgagagaattgattttggttaaaagtgagttgaatgtgaattgatttatgtttggatac-------taaaagtgat 23496342  T
Q  128 tgttatgagttgatgttgtttggatagtttaaatcaaaattgattttgaatgtaaaatga 187  Q
    | ||  | |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  23496341 tcttgcgggttgatgttgtttggatagtttgaatcaaaattgattttgaatgtataatga 23496282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 19 - 180
Target Start/End: Original strand, 30811507 - 30811667
Alignment:
Q  19 ggtgacgaaaattgattttgatagaattgagtttgacagaattgattttgattaaaagtgaatatgagatgaattggtttatatttggatacacttgttt 118  Q
    |||||||| |||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |   |  |||||| | |||| |||||||||||||        
T  30811507 ggtgacgagaattgattttgatataattgaatttgagagaattgattttgattaaaagtgagttgaatgtgaatt-gattatgtttggatacactttaac 30811605  T
Q  119 aaaagtagttgttatgagttgatgttgtttggatagtttaaatcaaaattgattttgaatgt 180  Q
    | ||||  || |||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  30811606 agaagtgattcttatgacttgatattgtttggatagtttgaatcaaaattgattttgaatgt 30811667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 28 - 176
Target Start/End: Original strand, 8424714 - 8424861
Alignment:
Q  28 aattgattttgatagaattgagtttgacagaattgattttgattaaaagtgaatatgagatgaattggtttatatttggatacacttgtttaaaagtagt 127  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |   |  |||||| | |||| |||||||||||||   || ||||  |    
T  8424714 aattgaatttgatagaattgagtttgagagaattgattttggttaaaagtgagttgaacgtgaatt-gattatgtttggatacacttcaatagaagtgat 8424812  T
Q  128 tgttatgagttgatgttgtttggatagtttaaatcaaaattgattttga 176  Q
    | |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  8424813 tcttatgagttgatgttgtttgaatagtttgaatcaaaattgattttga 8424861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 28 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 38340922 - 38340771
Alignment:
Q  28 aattgattttgatagaattgagtttgacagaattgattttgattaaaagtgaatatgagatgaattggtttatatttggatacacttgtttaaaagtagt 127  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||| |||||||||| |  ||  ||||||| ||||| ||||||||  ||| || ||||||| |    
T  38340922 aattgattttgatagaatgaagtttgaaagaattgattttggttaaaagtgagttggatgtgaattgatttatgtttggatatgcttatt-aaaagtaat 38340824  T
Q  128 tgttatgagttgatgttgtttggatagtttaaatcaaaattgattttgaatgt 180  Q
    | |||| |||||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||    
T  38340823 ttttataagttgacgttgtttggatagtttgaataaaaattgattttaaatgt 38340771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 28 - 193
Target Start/End: Original strand, 16246080 - 16246243
Alignment:
Q  28 aattgattttgatagaattgagtttgacagaattgattttgattaaaagtgaatatgagatgaattggtttatatttggatacacttgtttaaaagtagt 127  Q
    ||||||| || ||||||||||||||||  |||||||||||  |||||||||| |  ||  | ||||| ||||| |||||| ||||||   || ||||  |    
T  16246080 aattgatattaatagaattgagtttga--gaattgattttagttaaaagtgagttagatgtaaattgatttatgtttggaaacactttaatagaagtgat 16246177  T
Q  128 tgttatgagttgatgttgtttggatagtttaaatcaaaattgattttgaatgtaaaatgatcaaac 193  Q
    | ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  16246178 tcttaggagttgatgttgtttggatagtttgaatcaaaattgattttgaatgtgtaatgatcaaac 16246243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 39 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 21225096 - 21224943
Alignment:
Q  39 atagaattgagtttgacagaattgattttgattaaaagtgaatatgagatgaattggtttatatttggatacacttgtttaaaagtagttgttatgagtt 138  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| | |||  | ||||| | ||| |||||||||||||  |||||||   || ||| |||||    
T  21225096 atagaattgagtttgagagaattgattttggttaaaagtgagtttgatgtaaattgatatatgtttggatacactttcttaaaagcgattcttacgagtt 21224997  T
Q  139 gatgttgtttggatagtttaaatcaaaattgattttgaatgtaaaatgatcaaa 192  Q
    ||||| |||| |||||||| |||||||||||||| ||| |||| ||||| ||||    
T  21224996 gatgtcgttttgatagtttgaatcaaaattgattatgagtgtataatgaccaaa 21224943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 19 - 180
Target Start/End: Original strand, 44939391 - 44939550
Alignment:
Q  19 ggtgacgaaaattgattttgatagaattgagtttgacagaattgattttgattaaaagtgaatatgagatgaattggtttatatttggatacacttgttt 118  Q
    |||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||| |   | ||||||| | |||| |||||||||| ||   |    
T  44939391 ggtggcgataattgattttgatagaattgaatttgagtgaattgattttgattaaaagtgagttgaatatgaatt-gattatgtttggataca-tttact 44939488  T
Q  119 aaaagtagttgttatgagttgatgttgtttggatagtttaaatcaaaattgattttgaatgt 180  Q
    | ||||  || |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  44939489 ataagtgattcttatgagttgatgttgtttgaatagttttaatcaaaattaattttgaatgt 44939550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 41 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 31084311 - 31084175
Alignment:
Q  41 agaattgagtttgacagaattgattttgattaaaagtgaatatgagatgaattggtttatatttggatacacttgtttaaaagtagttgttatgagttga 140  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |   |  ||||||| ||||| ||||||||||||| || ||||||  || |||||| ||||    
T  31084311 agaattgattttgaaagaattgattttgattaaaagtgagttgaatgtgaattgatttatgtttggatacacttctt-aaaagtgattcttatgacttga 31084213  T
Q  141 tgttgtttggatagtttaaatcaaaattgattttgaat 178  Q
    | || |||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  31084212 tattatttggatagtttgaatcataattgattttgaat 31084175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 88 - 191
Target Start/End: Original strand, 31618931 - 31619034
Alignment:
Q  88 tgaattggtttatatttggatacacttgtttaaaagtagttgttatgagttgatgttgtttggatagtttaaatcaaaattgattttgaatgtaaaatga 187  Q
    ||||||| ||||| ||||||||| ||   ||| ||||  || |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||    
T  31618931 tgaattgatttatgtttggatactctcacttagaagtgattcttatgagttgatgttgtttggatagtttgaatcaaaattaattttgaatgtataatga 31619030  T
Q  188 tcaa 191  Q
    ||||    
T  31619031 tcaa 31619034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 22 - 79
Target Start/End: Complemental strand, 19877540 - 19877483
Alignment:
Q  22 gacgaaaattgattttgatagaattgagtttgacagaattgattttgattaaaagtga 79  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  19877540 gacgaaaatttattttgatagaattgagtttgaaagaattgattttggttaaaagtga 19877483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 28 - 124
Target Start/End: Complemental strand, 4984698 - 4984602
Alignment:
Q  28 aattgattttgatagaattgagtttgacagaattgattttgattaaaagtgaatatgagatgaattggtttatatttggatacacttgtttaaaagt 124  Q
    |||||||||||||| |||||| ||||| | ||||||||||| |||||||||| |  ||  ||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  4984698 aattgattttgatataattgaatttgagaaaattgattttggttaaaagtgagttagatgtgaattgatttatgtttggatacactcgtttaaaagt 4984602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 17 - 181
Target Start/End: Original strand, 45423742 - 45423905
Alignment:
Q  17 gtggtgacgaaaattgattttgatagaattgagtttgacagaattgattttgattaaaagtgaatatgagatgaattggtttatatttggatacacttgt 116  Q
    |||||| |||||||||||||||  | |||||| | ||| |||||||||||||  ||||||||| | |||  | ||||||||||| |||||||| | |       
T  45423742 gtggtggcgaaaattgattttggcataattgattctgatagaattgattttgcctaaaagtgagt-tgaacttaattggtttatgtttggatatattaaa 45423840  T
Q  117 ttaaaagtagttgttatgagttgatgttgtttggatagtttaaatcaaaattgattttgaatgta 181  Q
     |||||||  || |||| | || ||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||    
T  45423841 gtaaaagtgattcttatcaattcatgttgtttggatagcttgaatcaaaattgattttggatgta 45423905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 28 - 79
Target Start/End: Complemental strand, 55154618 - 55154567
Alignment:
Q  28 aattgattttgatagaattgagtttgacagaattgattttgattaaaagtga 79  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||    
T  55154618 aattgattttgatagaattgagtttgagagaattgattttagttaaaagtga 55154567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 25 - 79
Target Start/End: Complemental strand, 34561228 - 34561174
Alignment:
Q  25 gaaaattgattttgatagaattgagtttgacagaattgattttgattaaaagtga 79  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||| ||||||||||    
T  34561228 gaaaattgattttgatagaattaagtttgataaaattgattttggttaaaagtga 34561174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 28 - 180
Target Start/End: Original strand, 49526653 - 49526805
Alignment:
Q  28 aattgattttgatagaattgagtttgacagaattgattttgattaaaagtgaatatga-gatgaattggtttatatttggatacacttgtttaaaagtag 126  Q
    |||||| ||||||  |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||   | ||||| ||||| |||||||||| |  | ||||| |      
T  49526653 aattgagtttgatgaaattgattttgatagaattgattttgattaaaagtgaat-tgattgtaaattgatttatgtttggatacattcatgtaaaattga 49526751  T
Q  127 ttgttatgagttgatgttgtttggatagtttaaatcaaaattgattttgaatgt 180  Q
    || |||| | || |||||||||  ||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  49526752 ttcttatcaatttatgttgtttaaatagtctaaatcaaaattgcttttgaatgt 49526805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 26 - 79
Target Start/End: Complemental strand, 52813334 - 52813281
Alignment:
Q  26 aaaattgattttgatagaattgagtttgacagaattgattttgattaaaagtga 79  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||| ||||||    
T  52813334 aaaattgattttgatagaattgagtttgagtgaattgattttggttagaagtga 52813281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 28 - 79
Target Start/End: Original strand, 14651086 - 14651137
Alignment:
Q  28 aattgattttgatagaattgagtttgacagaattgattttgattaaaagtga 79  Q
    |||||||||| ||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  14651086 aattgattttaataaaattgattttgatagaattgattttgattaaaagtga 14651137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 117 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 22737009 - 22736946
Alignment:
Q  117 ttaaaagtagttgttatgagttgatgttgtttggatagtttaaatcaaaattgattttgaatgt 180  Q
    ||||||||  || ||||||||| |||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||    
T  22737009 ttaaaagtgattattatgagttaatgttgttgggatggtttgaatcaaaattgattttgaatgt 22736946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 140 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 30811329 - 30811288
Alignment:
Q  140 atgttgtttggatagtttaaatcaaaattgattttgaatgta 181  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  30811329 atgttgtttggatagttttgatcaaaattgattttgaatgta 30811288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 28 - 69
Target Start/End: Original strand, 48253879 - 48253920
Alignment:
Q  28 aattgattttgatagaattgagtttgacagaattgattttga 69  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  48253879 aattgattttgatagaattgattctgacagaattgattttga 48253920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 135 - 172
Target Start/End: Original strand, 55087593 - 55087630
Alignment:
Q  135 agttgatgttgtttggatagtttaaatcaaaattgatt 172  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  55087593 agttgatgttgtttggatagtttgaatcaaaattgatt 55087630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 32 - 79
Target Start/End: Original strand, 29716674 - 29716721
Alignment:
Q  32 gattttgatagaattgagtttgacagaattgattttgattaaaagtga 79  Q
    |||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  29716674 gattttgataaaattgaatttgagagaattgattttggttaaaagtga 29716721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 90 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 32357566 - 32357479
Alignment:
Q  90 aattggtttatatttggatacacttgtttaaaagtagttgttatgagttgatgttgtttggatagtttaaatcaaaattgattttgaa 177  Q
    ||||| ||||| |||| | |||||  |||||||||  || ||||| ||||||||||||||| || ||| ||| |||||||||||||||    
T  32357566 aattgatttatgtttgaaaacactcatttaaaagtgattcttatgtgttgatgttgtttgggtactttgaattaaaattgattttgaa 32357479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 130 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 14959734 - 14959684
Alignment:
Q  130 ttatgagttgatgttgtttggatagtttaaatcaaaattgattttgaatgt 180  Q
    ||||||||||||||||||| |||  ||| ||||||| ||||||||||||||    
T  14959734 ttatgagttgatgttgtttagatgatttgaatcaaacttgattttgaatgt 14959684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 139 - 181
Target Start/End: Original strand, 33329436 - 33329478
Alignment:
Q  139 gatgttgtttggatagtttaaatcaaaattgattttgaatgta 181  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||    
T  33329436 gatgttgtttggatagtttcgatcaaaattgcttttgaatgta 33329478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 90 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 37117658 - 37117556
Alignment:
Q  90 aattggtttatatttggatacacttgtttaaaagtagttgttatgagttgatgttgtttggatagtttaaatcaaaattgattttgaatgtaaaatgatc 189  Q
    ||||| |||||||||| ||| |||  ||||||| | ||| |||| | || || || |||| ||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||| |    
T  37117658 aattgatttatatttgaatatactcatttaaaaatggttattataatttaatattatttgaatagtttaaattaaaattaattttaaatgtaaaatgagc 37117559  T
Q  190 aaa 192  Q
    |||    
T  37117558 aaa 37117556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 140 - 174
Target Start/End: Original strand, 37698485 - 37698519
Alignment:
Q  140 atgttgtttggatagtttaaatcaaaattgatttt 174  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  37698485 atgttgtttggatagtttgaatcaaaattgatttt 37698519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 139 - 181
Target Start/End: Original strand, 44610311 - 44610352
Alignment:
Q  139 gatgttgtttggatagtttaaatcaaaattgattttgaatgta 181  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  44610311 gatgttgtttggatagtttga-tcaaaattgattttgaatgta 44610352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 25 - 79
Target Start/End: Complemental strand, 53568051 - 53567998
Alignment:
Q  25 gaaaattgattttgatagaattgagtttgacagaattgattttgattaaaagtga 79  Q
    |||||||||||||||  ||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||    
T  53568051 gaaaattgattttgagtgaattgatttt-acaaaattgattttgattaaaagtga 53567998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 140 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 11264318 - 11264277
Alignment:
Q  140 atgttgtttggatagtttaaatcaaaattgattttgaatgta 181  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||    
T  11264318 atgttgtttggatagtttttatcaaaattgcttttgaatgta 11264277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 140 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 28884299 - 28884258
Alignment:
Q  140 atgttgtttggatagtttaaatcaaaattgattttgaatgta 181  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||    
T  28884299 atgttgtttggatagttttaatcaaaattatttttgaatgta 28884258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 140 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 39252102 - 39252061
Alignment:
Q  140 atgttgtttggatagtttaaatcaaaattgattttgaatgta 181  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||    
T  39252102 atgttgtttggatagtttttatcaaaattgcttttgaatgta 39252061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 140 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 42074955 - 42074914
Alignment:
Q  140 atgttgtttggatagtttaaatcaaaattgattttgaatgta 181  Q
    |||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||    
T  42074955 atgttgtttggatagttcttatcaaaattgattttgaatgta 42074914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 28 - 69
Target Start/End: Original strand, 45488485 - 45488526
Alignment:
Q  28 aattgattttgatagaattgagtttgacagaattgattttga 69  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  45488485 aattgattatgatagaattgattttgaaagaattgattttga 45488526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 140 - 181
Target Start/End: Original strand, 48253974 - 48254015
Alignment:
Q  140 atgttgtttggatagtttaaatcaaaattgattttgaatgta 181  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||    
T  48253974 atgttgtttggatagtttttatcaaaattgcttttgaatgta 48254015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 140 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 51230325 - 51230284
Alignment:
Q  140 atgttgtttggatagtttaaatcaaaattgattttgaatgta 181  Q
    ||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||    
T  51230325 atgttgtttggatagtttttatcaaatttgattttgaatgta 51230284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 140 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 53078363 - 53078323
Alignment:
Q  140 atgttgtttggatagtttaaatcaaaattgattttgaatgt 180  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  53078363 atgttgtttggacagtttgaatcaaaattgattttggatgt 53078323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0369 (Bit Score: 97; Significance: 9e-48; HSPs: 1)
Name: scaffold0369
Description:

Target: scaffold0369; HSP #1
Raw Score: 97; E-Value: 9e-48
Query Start/End: Original strand, 28 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 8566 - 8402
Alignment:
Q  28 aattgattttgatagaattgagtttgacagaattgattttgattaaaagtgaatatgagatgaattggtttatatttggatacacttgtttaaaagtagt 127  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||| | |||  ||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||| |  |    
T  8566 aattgattttgatagaattgagtttgatataattgattttggttaaaagtgagtttgatgtgaattgatttatgtttggatacacttttttaaaaatgat 8467  T
Q  128 tgttatgagttgatgttgtttggatagtttaaatcaaaattgattttgaatgtaaaatgatcaaa 192  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  8466 ttttatgagttgatgttgtttggatagtttgaatcaaaattgattttgaatgtacaatgaccaaa 8402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 93; Significance: 2e-45; HSPs: 49)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 28 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 9456242 - 9456079
Alignment:
Q  28 aattgattttgatagaattgagtttgacagaattgattttgattaaaagtgaatatgagatgaattggtttatatttggatacacttgtttaaaagtagt 127  Q
    ||||||||||||||||||| |||| || ||||||||||||| |||||||||| | |||| | ||||| || || |||||||||||||||||||||||  |    
T  9456242 aattgattttgatagaattaagttcgagagaattgattttggttaaaagtgagtttgaggtaaattgatt-atgtttggatacacttgtttaaaagtgat 9456144  T
Q  128 tgttatgagttgatgttgtttggatagtttaaatcaaaattgattttgaatgtaaaatgatcaaa 192  Q
    | |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  9456143 tcttatgagttgatcttgtttggatagtttgaatcaaaattgattttgaatgtaaaatgaccaaa 9456079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 87; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 25 - 187
Target Start/End: Original strand, 47217509 - 47217671
Alignment:
Q  25 gaaaattgattttgatagaattgagtttgacagaattgattttgattaaaagtgaatatgagatgaattggtttatatttggatacacttgtttaaaagt 124  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | |||  ||||||| ||||| ||||||| |||| | ||||||||    
T  47217509 gaaaattgattttgatagaattgagtttgagagaattgattttgattaaaagtgagtttgatgtgaattgatttatgtttggatgcactcgcttaaaagt 47217608  T
Q  125 agttgttatgagttgatgttgtttggatagtttaaatcaaaattgattttgaatgtaaaatga 187  Q
      || | ||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||| |||||    
T  47217609 gattttgatgggttgatgttgtttggatagtttgaattaaaattgattttgaacgtacaatga 47217671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 19 - 180
Target Start/End: Original strand, 3622422 - 3622583
Alignment:
Q  19 ggtgacgaaaattgattttgatagaattgagtttgacagaattgattttgattaaaagtgaatatgagatgaattggtttatatttggatacacttgttt 118  Q
    |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |  ||  ||||||| ||||| |||||||||||||  ||    
T  3622422 ggtggcgagaattgattttgatagaattgagtttgagagaattgattttggttaaaagtgagttggatgtgaattgatttatgtttggatacacttactt 3622521  T
Q  119 aaaagtagttgttatgagttgatgttgtttggatagtttaaatcaaaattgattttgaatgt 180  Q
    ||||||  || ||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  3622522 aaaagtgattcttacgagttgatgttgtttggatagtataaatcaaaattgattttaaatgt 3622583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 24 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 48134721 - 48134566
Alignment:
Q  24 cgaaaattgattttgatagaattgagtttgacagaattgattttgattaaaagtgaatatgagatgaattggtttatatttggatacacttgtttaaaag 123  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||  | ||||  |||||| || || |||||||| |||||||||||||    
T  48134721 cgaaaattaattttgatagaattgagtttgagagaattgatttttgttaaaagtgggtttgaggagaattgatt-atgtttggataaacttgtttaaaag 48134623  T
Q  124 tagttgttatgagttgatgttgtttggatagtttaaatcaaaattgattttgaatgt 180  Q
    |  || |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  48134622 tgatttttataagttgatgttgtttggatagtttgaatcaaaattgattttgaatgt 48134566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 14 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 34010491 - 34010329
Alignment:
Q  14 ttggtggtgacgaaaattgattttgatagaattgagtttgacagaattgattttgattaaaagtgaatatgagatgaattggtttatatttggatacact 113  Q
    |||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |  || ||||| || || || |||| |||||||    
T  34010491 ttggcggtggcgagaattgattttgatagaattgagtttgaaagaattgattttggttaaaagtgagttggatatgaactgatt-atgtttgaatacact 34010393  T
Q  114 tgtttaaaagtagttgttatgagttgatgttgtttggatagtttaaatcaaaattgattttgaa 177  Q
      ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  34010392 catttaaaagtggttcttatgagttgatgttgtttggatagtttgaatcaaaattaattttgaa 34010329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 19 - 177
Target Start/End: Original strand, 39391099 - 39391257
Alignment:
Q  19 ggtgacgaaaattgattttgatagaattgagtttgacagaattgattttgattaaaagtgaatatgagatgaattggtttatatttggatacacttgttt 118  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||| |||   ||||||||||||| |||||||||| | |||| ||||||| ||||| |||||||||||||  ||    
T  39391099 ggtggcgaaaattgattttgatagaattgatttttttagaattgattttggttaaaagtgagtttgaggtgaattgatttatgtttggatacactttctt 39391198  T
Q  119 aaaagtagttgttatgagttgatgttgtttggatagtttaaatcaaaattgattttgaa 177  Q
    | ||||  || |||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  39391199 acaagtgattcttatgaattgatgttgtttgaatagtttgaatcaaaattgattttgaa 39391257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 28 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 37562708 - 37562543
Alignment:
Q  28 aattgattttgatagaattgagtttgacagaattgattttgattaaaagtgaatatgagatgaattggtttatatttggatacacttgtttaaaagtagt 127  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||  |||||||||| |  ||  ||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||  |    
T  37562708 aattgattttgatagaattgagtttaagagaattgatttttgttaaaagtgagttggatgtgaattgatttatgtttggatacacttatttaaaagtgat 37562609  T
Q  128 tgttatgagttgatgttgtttggatagtttaaatcaaaattgattttgaatgtaaaatgatcaaac 193  Q
    |  ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||  ||||| |||||    
T  37562608 tcatatgagttgatgttgtttggatagtttgaatgaaaattgattttgtatgtgtaatgaccaaac 37562543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 77; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 28 - 192
Target Start/End: Original strand, 43737910 - 43738074
Alignment:
Q  28 aattgattttgatagaattgagtttgacagaattgattttgattaaaagtgaatatgagatgaattggtttatatttggatacacttgtttaaaagtagt 127  Q
    |||||||||| | | |||||||||| | |||||||||||||||||||||| | |  || |||||||| ||| | |||||||| |||| |||||||||  |    
T  43737910 aattgattttaacataattgagtttaagagaattgattttgattaaaagttagttagatatgaattgatttttgtttggataaacttatttaaaagtgat 43738009  T
Q  128 tgttatgagttgatgttgtttggatagtttaaatcaaaattgattttgaatgtaaaatgatcaaa 192  Q
    | |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  43738010 tcttatgagtggatgttgtttggatagtttgaatcaaaattgattttgaatgtgaaatgaccaaa 43738074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 28 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 3342928 - 3342778
Alignment:
Q  28 aattgattttgatagaattgagtttgacagaattgattttgattaaaagtgaatatgagatgaattggtttatatttggatacacttgtttaaaagtagt 127  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||| |  || |||||||| ||||| |||||||||||||   || ||||  |    
T  3342928 aattaattttgatagaattgagtttgagagaattgattttagttaaaagtgagttggatatgaattgatttatgtttggatacactttaatagaagtgat 3342829  T
Q  128 tgttatgagttgatgttgtttggatagtttaaatcaaaattgattttgaat 178  Q
    | |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  3342828 tcttatgagttgatgttgtttgaatagtttgaatcaaaattgattttgaat 3342778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 28 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 37639568 - 37639416
Alignment:
Q  28 aattgattttgatagaattgagtttgacagaattgattttgattaaaagtgaatatgagatgaattggtttatatttggatacacttgtttaaaagtagt 127  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||   |  ||||||| ||||| |||||| | ||||  ||||||||  |    
T  37639568 aattgattttgatagaattgagtttgagagaattgattttggttaaaagtgaattgaatgtgaattgatttatgtttggagaaactttattaaaagtgat 37639469  T
Q  128 tgttatgagttgatgttgtttggatagtttaaatcaaaattgattttgaatgt 180  Q
    | || || |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||    
T  37639468 tcttgtgggttgatgttgtttggatagtttgaatcaaaattaattttaaatgt 37639416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 28 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 3375628 - 3375476
Alignment:
Q  28 aattgattttgatagaattgagtttgacagaattgattttgattaaaagtgaatatgagatgaattggtttatatttggatacacttgtttaaaagtagt 127  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||| | ||   ||||||| ||| | ||||||||||||   ||||||||  |    
T  3375628 aattgattttgatagaattgagtttgagagaattaattttggttaaaagtgagtttggtgtgaattgatttgtgtttggatacactcacttaaaagtgat 3375529  T
Q  128 tgttatgagttgatgttgtttggatagtttaaatcaaaattgattttgaatgt 180  Q
    | |||||||| ||||||||||||||  |||  |||||||||||||||||||||    
T  3375528 tcttatgagtcgatgttgtttggatgatttggatcaaaattgattttgaatgt 3375476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 28 - 176
Target Start/End: Original strand, 44967370 - 44967518
Alignment:
Q  28 aattgattttgatagaattgagtttgacagaattgattttgattaaaagtgaatatgagatgaattggtttatatttggatacacttgtttaaaagtagt 127  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |   |  ||||||| ||||| |||| ||||||||   || ||||  |    
T  44967370 aattgattttgatataattgagtttgagagaattgattttggttaaaagtgagttgaatgtgaattgatttatgtttgaatacactttaatagaagtgat 44967469  T
Q  128 tgttatgagttgatgttgtttggatagtttaaatcaaaattgattttga 176  Q
    | |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  44967470 tcttatgagttgatgttgtttggataatttgaatcaaaattgattttga 44967518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 28 - 179
Target Start/End: Original strand, 10371929 - 10372080
Alignment:
Q  28 aattgattttgatagaattgagtttgacagaattgattttgattaaaagtgaatatgagatgaattggtttatatttggatacacttgtttaaaagtagt 127  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |   |  ||||||| ||||| ||||| |||| ||  ||| ||||  |    
T  10371929 aattgattttgatagaattgagtttgagagaattgattttggttaaaagtgagttgaatgtgaattgatttatgtttggttacagtttattagaagtgat 10372028  T
Q  128 tgttatgagttgatgttgtttggatagtttaaatcaaaattgattttgaatg 179  Q
    | || || |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  10372029 tcttgtgggttgatgttgttcggatagtttgaatcaaaattgattttgaatg 10372080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 28 - 190
Target Start/End: Original strand, 43631667 - 43631828
Alignment:
Q  28 aattgattttgatagaattgagtttgacagaattgattttgattaaaagtgaatatgagatgaattggtttatatttggatacacttgtttaaaagtagt 127  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |  || ||||||| | |||| ||||||||  |||  ||||||||  |    
T  43631667 aattgattttgatagaattgagtttgagagaattgattttggttaaaagtgagttagatatgaatt-gattatgtttggatatgcttaattaaaagtgat 43631765  T
Q  128 tgttatgagttgatgttgtttggatagtttaaatcaaaattgattttgaatgtaaaatgatca 190  Q
    | || ||||||||| |||||||||||  || |||||||||||||| |||||||| ||| ||||    
T  43631766 tcttttgagttgatattgtttggatatattgaatcaaaattgattgtgaatgtataattatca 43631828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 28 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 48459848 - 48459702
Alignment:
Q  28 aattgattttgatagaattgagtttgacagaattgattttgattaaaagtgaatatgagatgaattggtttatatttggatacacttgtttaaaagtagt 127  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |   |  ||||||| ||||| |||||||||||||  ||||||||  |    
T  48459848 aattgattttgatagaattgagtttgagagaattgattttggttaaaagtgagttgaatgtgaattgatttatgtttggatacacttacttaaaagtgat 48459749  T
Q  128 tgttatgagttgatgttgtttggatagtttaaatcaaaattgatttt 174  Q
    | |||||| | ||||||||||||||||| |  || ||||||||||||    
T  48459748 tcttatgaatggatgttgtttggatagtatgtattaaaattgatttt 48459702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 28 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 38230206 - 38230054
Alignment:
Q  28 aattgattttgatagaattgagtttgacagaattgattttgattaaaagtgaatatgagatgaattggtttatatttggatacacttgtttaaaagtagt 127  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||| |||||||||| |   |  ||||||| ||||| |||||||||| ||  ||||||||  |    
T  38230206 aattgattttgatagaattgaatttaagagaattgattttggttaaaagtgagttgaatgtgaattgatttatgtttggatacattttattaaaagtgat 38230107  T
Q  128 tgttatgagttgatgttgtttggatagtttaaatcaaaattgattttgaatgt 180  Q
    |  | || |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  38230106 tcatgtgggttgatgttgtttggatagtttgaatcaaaattgattttaaatgt 38230054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 19 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 41715804 - 41715648
Alignment:
Q  19 ggtgacgaaaattgattttgatagaattgagtttgacagaattgattttgattaaaagtgaatatgagatgaattggtttatatttggatacacttgttt 118  Q
    |||| ||| ||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||| |  ||  | ||||| ||||| ||||||| ||||  |||    
T  41715804 ggtggcgagaattgattttgatagaattgattttaagagaattgattttgattaaaagtgagttagatgtaaattgatttatgtttggatgcactcattt 41715705  T
Q  119 aaaagtagttgttatgagttgatgttgtttggatagtttaaatcaaaattgattttg 175  Q
    ||||||| ||  ||||| |||||||||||||||||| ||  || |||||||||||||    
T  41715704 aaaagtaattcatatgaattgatgttgtttggatagattggattaaaattgattttg 41715648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 19 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 39977699 - 39977544
Alignment:
Q  19 ggtgacgaaaattgattttgatagaattgagtttgacagaattgattttgattaaaagtgaatatgagatgaattggtttatatttggatacacttgttt 118  Q
    |||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||  | |||||||| | ||| |||||||| ||||| |||||||| |||  | |    
T  39977699 ggtggcgataattgattttgatagaatttagtttgaaagaattgattttagtcaaaagtgagtttgatatgaattgatttatttttggataaactcatat 39977600  T
Q  119 aaaagtagttgttatgagttgatgttgtttggatagtttaaatcaaaattgatttt 174  Q
    ||||||  || ||   ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  39977599 aaaagttattatttcaagttgatgttgtttggatactttaaattaaaattgatttt 39977544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 28 - 177
Target Start/End: Original strand, 34365953 - 34366101
Alignment:
Q  28 aattgattttgatagaattgagtttgacagaattgattttgattaaaagtgaatatgagatgaattggtttatatttggatacacttgtttaaaagtagt 127  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||  |||||||| | |  |   ||||||| ||||| ||||||||| ||| || ||||||  |    
T  34365953 aattgattttgatataatggagtttgaaagaattgattttagttaaaagttagttgggtgtgaattgatttatgtttggatacgcttatt-aaaagtgat 34366051  T
Q  128 tgttatgagttgatgttgtttggatagtttaaatcaaaattgattttgaa 177  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  34366052 ttttatgagttgatgttgtttggatagtttgaataaaaattgattttgaa 34366101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 28 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 47022057 - 47021905
Alignment:
Q  28 aattgattttgatagaattgagtttgacagaattgattttgattaaaagtgaatatgaga-tgaattggtttatatttggatacacttgtttaaaagtag 126  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||  ||| | ||||||| ||||| |||||||||||||   || | ||      
T  47022057 aattgattttgatagaattgagtttgagagaattgattttggttaaaagt-aagttgaaagtgaattgatttatgtttggatacactttactagatgtga 47021959  T
Q  127 ttgttatgagttgatgttgtttggatagtttaaatcaaaattgattttgaatgt 180  Q
    || ||| || ||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||    
T  47021958 ttcttacgaattgatgttgtttggataatttgaatgaaaattgattttgaatgt 47021905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 28 - 180
Target Start/End: Original strand, 12632054 - 12632206
Alignment:
Q  28 aattgattttgatagaattgagtttgacagaattgattttgattaaaagtgaatatgagatgaattggtttatatttggatacacttgtttaaaagtagt 127  Q
    |||||||||||||||||||  |||||| ||||| ||||||| |||||||||| |  ||  ||||||| ||||| ||||  |  ||| | ||||||||  |    
T  12632054 aattgattttgatagaattttgtttgagagaatagattttggttaaaagtgagttagatgtgaattgatttatgtttgagtgtactcgcttaaaagtgat 12632153  T
Q  128 tgttatgagttgatgttgtttggatagtttaaatcaaaattgattttgaatgt 180  Q
    | |||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||||    
T  12632154 tcttatgagttgatgttgtttgaattgtttgaatcaaaattgattttgaatgt 12632206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 19 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 32187087 - 32186931
Alignment:
Q  19 ggtgacgaaaattgattttgatagaattgagtttgacagaattgattttgattaaaagtgaatatgagatgaattggtttatatttggatacacttgttt 118  Q
    |||| ||| ||||||||||||||||||| | ||| | |||||||||||||||||||||||| |  ||  | ||||| ||||| ||||||| ||||  |||    
T  32187087 ggtggcgagaattgattttgatagaattaattttaagagaattgattttgattaaaagtgagttagatgtaaattgatttatgtttggatgcactcattt 32186988  T
Q  119 aaaagtagttgttatgagttgatgttgtttggatagtttaaatcaaaattgattttg 175  Q
    ||||||| ||  ||||| |||||||||||||||||| ||  || |||||||||||||    
T  32186987 aaaagtaattcatatgaattgatgttgtttggatagattggattaaaattgattttg 32186931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 32 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 3750820 - 3750678
Alignment:
Q  32 gattttgatagaattgagtttgacagaattgattttgattaaaagtgaatatgagatgaattggtttatatttggatacacttgtttaaaagtagttgtt 131  Q
    |||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |  ||  ||||||| ||||| |||||||||||||   || || |   | ||    
T  3750820 gattttaataaaattgagtttgagagaattgattttggttaaaagtgagttggatgtgaattgatttatgtttggatacactttaatataattgaatctt 3750721  T
Q  132 atgagttgatgttgtttggatagtttaaatcaaaattgatttt 174  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  3750720 atgaattgatgttgtttggatagtttaaatcaaaattaatttt 3750678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 47 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 32206044 - 32205913
Alignment:
Q  47 gagtttgacagaattgattttgattaaaagtgaatatgagatgaattggtttatatttggatacacttgtttaaaagtagttgttatgagttgatgttgt 146  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||||||||  | |||  ||||||| ||||| |||||||||||||  ||||||||  || ||||||||| |||||||    
T  32206044 gagtttgaaagaattgattttaattaaaagtgggtttgatgtgaattgatttatgtttggatacacttacttaaaagtgattcttatgagtt-atgttgt 32205946  T
Q  147 ttggatagtttaaatcaaaattgattttgaatgt 180  Q
    || |||||| | |||||||||||||||| |||||    
T  32205945 tt-gatagtatgaatcaaaattgattttaaatgt 32205913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 24 - 181
Target Start/End: Original strand, 40903135 - 40903291
Alignment:
Q  24 cgaaaattgattttgatagaattgagtttgacagaattgattttgattaaaagtgaatatgagatgaattggtttatatttggatacacttgtttaaaag 123  Q
    |||||||||||||||| | |||||| ||||| |||||||||||||  ||||||||| | |||  | ||||||||||| |||||||| | |    ||||||    
T  40903135 cgaaaattgattttgacataattgattttgatagaattgattttgcctaaaagtgagt-tgaacttaattggtttatgtttggatatattaaagtaaaag 40903233  T
Q  124 tagttgttatgagttgatgttgtttggatagtttaaatcaaaattgattttgaatgta 181  Q
    |  || |||| | || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  40903234 tgatttttatcaattcatgttgtttggatagttcaaatcaaaattgattttggatgta 40903291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 130 - 187
Target Start/End: Original strand, 47301630 - 47301687
Alignment:
Q  130 ttatgagttgatgttgtttggatagtttaaatcaaaattgattttgaatgtaaaatga 187  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  47301630 ttatgggttgatgttgtttggatagtttgaatcaaaattgattttgaatgtaaaatga 47301687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 28 - 177
Target Start/End: Original strand, 34010932 - 34011082
Alignment:
Q  28 aattgattttgatagaattgagtttgacagaattgattttgattaaaagtgaatatgag-atgaattggtttatatttggatacacttgtttaaaagtag 126  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| || ||||||| | ||||  | ||||  ||||| |||||| ||| |   ||||||||      
T  34010932 aattgattttgatagaattgagtttgagaaaattgattttggtt-aaagtgagtttgagtgtaaattaatttatgtttggaaacattcacttaaaagtga 34011030  T
Q  127 ttgttatgagttgatgttgttt-ggatagtttaaatcaaaattgattttgaa 177  Q
    || ||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||    
T  34011031 ttcttatgagttgatgttgtttggggtactttaaatcaaaattgattttgaa 34011082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 19 - 154
Target Start/End: Original strand, 37008313 - 37008447
Alignment:
Q  19 ggtgacgaaaattgattttgatagaattgagtttgacagaattgattttgattaaaagtgaatatgagatgaattggtttatatttggatacacttgttt 118  Q
    |||| |||||| ||||||| |||||||||| ||||   |||||||||||| |||||||||| | |||| || |||| ||||| |||||| ||||||  ||    
T  37008313 ggtggcgaaaactgatttttatagaattgattttgttggaattgattttggttaaaagtgagtttgaggtg-attgatttatgtttggagacactttctt 37008411  T
Q  119 aaaagtagttgttatgagttgatgttgtttggatag 154  Q
    | ||||  || |||||||||||||||||||||||||    
T  37008412 ataagtgattcttatgagttgatgttgtttggatag 37008447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 33 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 42904686 - 42904551
Alignment:
Q  33 attttgatagaattgagtttgacagaattgattttgattaaaagtgaatatgagatgaattggtttatatttggatacacttgtttaaaagtagttgtta 132  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||  ||||| ||| |  ||  ||||||| ||||| ||| |||||||| ||||||||||  || |||    
T  42904686 attttgatagaattgagtttgagagaattgtttttggataaaaatgagttagatgtgaattgatttatgttttgatacactcgtttaaaagtgattctta 42904587  T
Q  133 tgagttgatgttgtttggatagtttaaatcaaaatt 168  Q
    ||| || || ||||||| ||| ||||||||||||||    
T  42904586 tgaattaattttgtttgtatattttaaatcaaaatt 42904551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 28 - 172
Target Start/End: Original strand, 36920149 - 36920293
Alignment:
Q  28 aattgattttgatagaattgagtttgacagaattgattttgattaaaagtgaatatgagatgaattggtttatatttggatacacttgtttaaaagtagt 127  Q
    |||| ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |  || || ||||| ||||| |||| ||||  ||  ||||| ||  |    
T  36920149 aattaattttgataaaattgagtttgaaagaattgattttggttaaaagtgagttagatataaattgatttatgtttgaatacgtttaattaaaggtgat 36920248  T
Q  128 tgttatgagttgatgttgtttggatagtttaaatcaaaattgatt 172  Q
    | || |||||||||||||||||| ||  || ||||||||||||||    
T  36920249 tcttttgagttgatgttgtttgggtacattgaatcaaaattgatt 36920293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 28 - 79
Target Start/End: Complemental strand, 19097535 - 19097484
Alignment:
Q  28 aattgattttgatagaattgagtttgacagaattgattttgattaaaagtga 79  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  19097535 aattaattttgatagaattgagtttgaaagaattgattttgattaaaagtga 19097484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 88 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 19096013 - 19095926
Alignment:
Q  88 tgaattggtttatatttggatacacttgtttaaaagtagttgttatgagttgatgttgtttggatagtttaaatcaaaattgattttgaa 177  Q
    |||||||||| || |||||||||||| |||||||| |  || ||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  19096013 tgaattggtt-atgtttggatacactcgtttaaaaatgattcttatgagtt-atgttgtttggataatttgaatcaaaattgattttgaa 19095926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 26 - 79
Target Start/End: Complemental strand, 46541740 - 46541687
Alignment:
Q  26 aaaattgattttgatagaattgagtttgacagaattgattttgattaaaagtga 79  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||    
T  46541740 aaaattgattttgatagaattgagtttgagagaattgattttggttagaagtga 46541687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 26 - 174
Target Start/End: Original strand, 386450 - 386597
Alignment:
Q  26 aaaattgattttgatagaattgagtttgacagaattgattttgattaaaagtgaatatgagatgaattggtttatatttggatacacttgtttaaaagta 125  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||| || |||||||||| |||||||| |     |  ||||||| ||||| |||||||| |||     ||||||     
T  386450 aaaattgattttgatataattgagtttgagagtattgattttggttaaaagttagctgaatgtgaattgatttatgtttggatatactaaccgaaaagtg 386549  T
Q  126 gttgttatgagttgatgttgtttggatagtttaaatcaaaattgatttt 174  Q
     || |||||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  386550 attcttatga-ttgatgttgtttggatagattgaatcaaaattgatttt 386597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 22 - 67
Target Start/End: Complemental strand, 12964742 - 12964697
Alignment:
Q  22 gacgaaaattgattttgatagaattgagtttgacagaattgatttt 67  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  12964742 gacgaaaattgattttgatagaattgagtttgagataattgatttt 12964697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 28 - 69
Target Start/End: Original strand, 25472152 - 25472193
Alignment:
Q  28 aattgattttgatagaattgagtttgacagaattgattttga 69  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  25472152 aattgattttgatagaattgattttgacagaattgattttga 25472193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 37 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 42740521 - 42740384
Alignment:
Q  37 tgatagaattgagtttgacagaattgattttgattaaaagtgaatatgagatgaattggtttatatttggatacacttgtttaaaagtagttgttatgag 136  Q
    ||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||||||| | |   |  | ||||| ||||| ||| |||| ||||  ||||||||  || ||||| |    
T  42740521 tgatataattgagtttgagagaattgattttggttaaaagtaagttgaatgttaattgatttatgtttagatatacttacttaaaagtgattcttatgtg 42740422  T
Q  137 ttgatgttgtttggatagtttaaatcaaaattgatttt 174  Q
    ||||| ||||||||||||| |  |||||||||||||||    
T  42740421 ttgatattgtttggatagtatgtatcaaaattgatttt 42740384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 19 - 79
Target Start/End: Original strand, 24770873 - 24770933
Alignment:
Q  19 ggtgacgaaaattgattttgatagaattgagtttgacagaattgattttgattaaaagtga 79  Q
    |||||||| |||| |||||||||||||| ||||||| | ||||||||||| ||||||||||    
T  24770873 ggtgacgagaattaattttgatagaattaagtttgagataattgattttggttaaaagtga 24770933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 140 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 4035960 - 4035919
Alignment:
Q  140 atgttgtttggatagtttaaatcaaaattgattttgaatgta 181  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  4035960 atgttgtttggatagttttaatcaaaattgcttttgaatgta 4035919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 19 - 79
Target Start/End: Complemental strand, 2839437 - 2839377
Alignment:
Q  19 ggtgacgaaaattgattttgatagaattgagtttgacagaattgattttgattaaaagtga 79  Q
    ||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||| ||||| |||||| || ||||||||    
T  2839437 ggtgacgaaaattgattatgattgaattgattttgatagaatagatttttatgaaaagtga 2839377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 28 - 192
Target Start/End: Original strand, 42752162 - 42752326
Alignment:
Q  28 aattgattttgatagaattgagtttgacagaattgattttgattaaaagtgaatatgagatgaattggtttatatttggatacacttgtttaaaagtagt 127  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||  ||||||||||||  |||||||||| |   |  ||||||| ||||| |||||||||  |     |||| || |    
T  42752162 aattgattttgacagaattgattttgttagaattgatttttgttaaaagtgagttgaatgtgaattgatttatgtttggataccttaaagcaaaaataat 42752261  T
Q  128 tgttatgagttgatgttgtttggatagtttaaatcaaaattgattttgaatgtaaaatgatcaaa 192  Q
    | |||| | || ||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||| | ||| ||||||    
T  42752262 tcttataaattcatgttgtttggataacttagatcaaaattgattttgaatgcataattatcaaa 42752326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 26 - 69
Target Start/End: Original strand, 25472135 - 25472178
Alignment:
Q  26 aaaattgattttgatagaattgagtttgacagaattgattttga 69  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  25472135 aaaattgattctgatagaattgattttgatagaattgattttga 25472178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 141 - 192
Target Start/End: Original strand, 37886854 - 37886905
Alignment:
Q  141 tgttgtttggatagtttaaatcaaaattgattttgaatgtaaaatgatcaaa 192  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| || ||| ||||||    
T  37886854 tgttgtttggatagtttgaatcaaaattgattttaaatatataattatcaaa 37886905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 28 - 78
Target Start/End: Original strand, 12212440 - 12212490
Alignment:
Q  28 aattgattttgatagaattgagtttgacagaattgattttgattaaaagtg 78  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||| ||| |||||    
T  12212440 aattgattttgatagaattgagcttgagtgaattgattttggttagaagtg 12212490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 140 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 26826993 - 26826952
Alignment:
Q  140 atgttgtttggatagtttaaatcaaaattgattttgaatgta 181  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||    
T  26826993 atgttgtttggatagtttttatcaaaattgcttttgaatgta 26826952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 28 - 69
Target Start/End: Complemental strand, 37371380 - 37371339
Alignment:
Q  28 aattgattttgatagaattgagtttgacagaattgattttga 69  Q
    ||||||||||||||||||||| | |||| |||||||||||||    
T  37371380 aattgattttgatagaattgattctgacggaattgattttga 37371339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 28 - 109
Target Start/End: Original strand, 39634136 - 39634217
Alignment:
Q  28 aattgattttgatagaattgagtttgacagaattgattttgattaaaagtgaatatgagatgaattggtttatatttggata 109  Q
    ||||||||| || |||||||| ||||  ||||||||||||| |||||||||| |   | |||||||| ||||| ||||||||    
T  39634136 aattgatttggacagaattgattttgttagaattgattttggttaaaagtgagttgaatatgaattgatttatgtttggata 39634217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 140 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 41065381 - 41065340
Alignment:
Q  140 atgttgtttggatagtttaaatcaaaattgattttgaatgta 181  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||    
T  41065381 atgttgtttggatagttttgatcaaaattgcttttgaatgta 41065340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 119 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 12964483 - 12964412
Alignment:
Q  119 aaaagtagttgttatgagttgatgttgtttggatagtttaaatcaaaattgattttgaatgtaaaatgatcaaac 193  Q
    ||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||| | |||| |   |||||||||||  |||||||||||    
T  12964483 aaaagtaattattatgagttaatgttgtttggatagtttgagtcaaca---attttgaatgtgtaatgatcaaac 12964412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0983 (Bit Score: 89; Significance: 5e-43; HSPs: 1)
Name: scaffold0983
Description:

Target: scaffold0983; HSP #1
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 19 - 175
Target Start/End: Original strand, 2243 - 2399
Alignment:
Q  19 ggtgacgaaaattgattttgatagaattgagtttgacagaattgattttgattaaaagtgaatatgagatgaattggtttatatttggatacacttgttt 118  Q
    |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| | |||| ||||||| ||||| |||||| ||||||||||    
T  2243 ggtggcgaaaattgattttgacagaattgagtttgacataattgattttggttaaaagtgagtttgaggtgaattgatttatgtttggacacacttgttt 2342  T
Q  119 aaaagtagttgttatgagttgatgttgtttggatagtttaaatcaaaattgattttg 175  Q
    |||||| ||| |||  |||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  2343 aaaagtggtttttacaagttgacgttgtttagatagtttgaatcaaaattgattttg 2399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 89; Significance: 5e-43; HSPs: 53)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 56 - 222
Target Start/End: Original strand, 291730 - 291884
Alignment:
Q  56 agaattgattttgattaaaagtgaatatgagatgaattggtttatatttggatacacttgtttaaaagtagttgttatgagttgatgttgtttggatagt 155  Q
    |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||   |||||||||          
T  291730 agaattgattttgattaaaagtgagtttgagatgaattggtttatgtttggatacacttgtttaaaagtgattgttatgagt---tgttgtttg------ 291820  T
Q  156 ttaaatcaaaattgattttgaatgtaaaatgatcaaacgcccctaaatatagaatttcttatatttt 222  Q
       ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||    
T  291821 ---aatcaaaattgattttgaatgtaaaatgaccaaacacccctaaacatagaatttcttatatttt 291884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 35 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 12468346 - 12468190
Alignment:
Q  35 tttgatagaattgagtttgacagaattgattttgattaaaagtgaatatgagatgaattggtttatatttggatacacttgtttaaaagtagttgttatg 134  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||| | |||  | ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||  || |||||    
T  12468346 tttgatagaattgagtttgatataattgattttggttaaaagtgagtttgatgtaaattgatttatatttggatacacttttttaaaagtgatttttatg 12468247  T
Q  135 agttgatgttgtttggatagtttaaatcaaaattgattttgaatgtaaaatgatcaaa 192  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  12468246 agttgat-ttgtttggatagtttgaatcaaaattgattttgaatgtacaatgaccaaa 12468190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 28 - 192
Target Start/End: Original strand, 43728863 - 43729026
Alignment:
Q  28 aattgattttgatagaattgagtttgacagaattgattttgattaaaagtgaatatgagatgaattggtttatatttggatacacttgtttaaaagtagt 127  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |  ||  ||||||| || || |||||||| |||| |||||||||  |    
T  43728863 aattgattttgatagaattgagtttgagagaattgattttgcttaaaagtgagttggatgtgaattgatt-atgtttggataaacttatttaaaagtgat 43728961  T
Q  128 tgttatgagttgatgttgtttggatagtttaaatcaaaattgattttgaatgtaaaatgatcaaa 192  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | |||||| ||||    
T  43728962 tcttatgagttgatgttgtttggatagtttgaatcaaaattgattttgaatattaaatgaccaaa 43729026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 19 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 35536221 - 35536064
Alignment:
Q  19 ggtgacgaaaattgattttgatagaattgagtttgacagaattgattttgattaaaagtgaatatgagatgaattggtttatatttggatacacttgttt 118  Q
    ||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| | |||  |||||||||| || ||| |||||||| ||||    
T  35536221 ggtgatgaaaattaattttaatagaattgagtttgagagaattaattttgattaaaagtgactttgacgtgaattggtt-atgtttagatacactcgttt 35536123  T
Q  119 aaaagtagttgttatgagttgatgttgtttggatagtttaaatcaaaattgattttgaa 177  Q
    ||||||  || |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  35536122 aaaagtgattcttatgagttgatgttgtttggataatttgaatcaaaattgattttgaa 35536064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 82; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 19 - 180
Target Start/End: Original strand, 42850195 - 42850356
Alignment:
Q  19 ggtgacgaaaattgattttgatagaattgagtttgacagaattgattttgattaaaagtgaatatgagatgaattggtttatatttggatacacttgttt 118  Q
    |||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||| |||||||||| |  ||  ||||||| ||||| |||||||||||||  ||    
T  42850195 ggtggcgagaattgattttgatagaattgagtttaagtgaattgattttggttaaaagtgagttggatgtgaattgatttatgtttggatacacttcctt 42850294  T
Q  119 aaaagtagttgttatgagttgatgttgtttggatagtttaaatcaaaattgattttgaatgt 180  Q
    ||||||  || |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||    
T  42850295 aaaagtgattcttatgagttgatgttgtttggatattttacatcaaaattgattttgaatgt 42850356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 28 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 31223515 - 31223350
Alignment:
Q  28 aattgattttgatagaattgagtttgacagaattgattttgattaaaagtgaatatgagatgaattggtttatatttggatacacttgtttaaaagtagt 127  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |  ||  ||||||| ||||| |||||||||||||   || ||||  |    
T  31223515 aattgattttaatagaattgagtttgagagaattgattttggttaaaagtgagttggatgtgaattgatttatgtttggatacactttaatagaagtgat 31223416  T
Q  128 tgttatgagttgatgttgtttggatagtttaaatcaaaattgattttgaatgtaaaatgatcaaac 193  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||  ||||| |||||    
T  31223415 tcttatgagttgatgttgtttggatagtttgaattaaaattgattttgaatgtgtaatgaccaaac 31223350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 28 - 187
Target Start/End: Original strand, 35569187 - 35569346
Alignment:
Q  28 aattgattttgatagaattgagtttgacagaattgattttgattaaaagtgaatatgagatgaattggtttatatttggatacacttgtttaaaagtagt 127  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||| |   |  ||||||| ||||| |||||||||||||  ||||||||  |    
T  35569187 aattgattttgatagaattgattttgagagaattgattttggttaaaagtgagttgaatgtgaattgatttatgtttggatacactttattaaaagtgat 35569286  T
Q  128 tgttatgagttgatgttgtttggatagtttaaatcaaaattgattttgaatgtaaaatga 187  Q
    |  | || |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  35569287 tcatgtgggttgatgttgtttggatagtttgaatcaaaattgattttgaatgtataatga 35569346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 19 - 177
Target Start/End: Original strand, 40229446 - 40229604
Alignment:
Q  19 ggtgacgaaaattgattttgatagaattgagtttgacagaattgattttgattaaaagtgaatatgagatgaattggtttatatttggatacacttgttt 118  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||   |||||||||||| |||||||||| | |||| ||||||| ||||| |||||||||||||  ||    
T  40229446 ggtgatgaaaattgattttgatagaattgattttgttggaattgattttggttaaaagtgagtttgaggtgaattgatttatgtttggatacactttctt 40229545  T
Q  119 aaaagtagttgttatgagttgatgttgtttggatagtttaaatcaaaattgattttgaa 177  Q
    | | ||  || || ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  40229546 acaggtgattcttctgagttgatgttgtttggataatttgaatcaaaattgattttgaa 40229604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 26 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 47123529 - 47123363
Alignment:
Q  26 aaaattgattttgatagaattgagtttgacagaattgattttgattaaaagtgaatatgagatgaattggtttatatttggatacacttgtttaaaagta 125  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |  ||  ||||||| ||| | |||||||||||||  ||||||||     
T  47123529 aaaattgattttgatagaattgagtttgagagaattgattttgattaaaagtgagttagatgtgaattgatttttgtttggatacacttcgttaaaagtg 47123430  T
Q  126 gttgttatgagttgatgttgtttggatagtttaaatcaaaattgattttgaatgtaaaatgatcaaa 192  Q
     || |||| ||||| |||||||||||||  |||||||||||||| ||||  ||||| ||| ||||||    
T  47123429 attcttataagttggtgttgtttggatacattaaatcaaaattgcttttagatgtataattatcaaa 47123363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 72; E-Value: 8e-33
Query Start/End: Original strand, 28 - 187
Target Start/End: Original strand, 20800262 - 20800421
Alignment:
Q  28 aattgattttgatagaattgagtttgacagaattgattttgattaaaagtgaatatgagatgaattggtttatatttggatacacttgtttaaaagtagt 127  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||| |   |  ||||||| ||||| |||||||||||||  ||||||||  |    
T  20800262 aattgattttgatagaattgattttgagagaattgattttggttaaaagtgagttgaatgtgaattgatttatgtttggatacactttattaaaagtgat 20800361  T
Q  128 tgttatgagttgatgttgtttggatagtttaaatcaaaattgattttgaatgtaaaatga 187  Q
    |  | || |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||    
T  20800362 tcatgtgggttgatgttgtttggatagtttgaatcaatattgattttgaatgtataatga 20800421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 25 - 179
Target Start/End: Original strand, 11023312 - 11023465
Alignment:
Q  25 gaaaattgattttgatagaattgagtttgacagaattgattttgattaaaagtgaatatgagatgaattggtttatatttggatacacttgtttaaaagt 124  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| | | || |||||| | |||| |||||||||| |   ||||||||    
T  11023312 gaaaattgattttgatagaattgagtttgagagaattgattttggttaaaagtgagttttaggtgaatt-gattatgtttggatacattcaattaaaagt 11023410  T
Q  125 agttgttatgagttgatgttgtttggatagtttaaatcaaaattgattttgaatg 179  Q
    | || ||| |||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||    
T  11023411 aatttttacgagttgatattgtttgggtagtttgaatcaaaattgattttaaatg 11023465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 19 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 45710198 - 45710038
Alignment:
Q  19 ggtgacgaaaattgattttgatagaattgagtttgacagaattgattttgattaaaagtgaatatgagatgaattggtttatatttggatacacttgttt 118  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |   |  ||||||| || || |||| ||||||||   |    
T  45710198 ggtggcgataattgattttgatagaattgagtttgagtgaattgattttgattaaaagtgagttgtatgtgaattgatt-atgtttgaatacactttact 45710100  T
Q  119 aaaagtagttgttatgagttgatgttgtttggatagtttaaatcaaaattgattttgaatgt 180  Q
    | ||||  || |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  45710099 agaagtgattcttatgagttgatgttgtttggatagtttgaatcaaaattgattttgaatgt 45710038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 12 - 180
Target Start/End: Original strand, 7826323 - 7826491
Alignment:
Q  12 gtttggtggtgacgaaaattgattttgatagaattgagtttgacagaattgattttgattaaaagtgaatatgagatgaattggtttatatttggataca 111  Q
    |||||| ||||  |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||   |||  ||||||| ||||| ||||| |||     
T  7826323 gtttggcggtggagaaaattgattttgatagaattgattttgagagaattgattttggttaaaagtgagcttgatgtgaattgatttatgtttgggtacc 7826422  T
Q  112 cttgtttaaaagtagttgttatgagttgatgttgtttggatagtttaaatcaaaattgattttgaatgt 180  Q
    ||   ||||||||  || |||||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||||| |||||    
T  7826423 ctcacttaaaagtgattcttatgaattgatgttgtttggataggttgaatcaaaattgattttaaatgt 7826491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 28 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 6166250 - 6166100
Alignment:
Q  28 aattgattttgatagaattgagtttgacagaattgattttgattaaaagtgaatatgagatgaattggtttatatttggatacacttgtttaaaagtagt 127  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||| |||||| | |||  ||||||| || || ||||||||||||  |||||||||  |    
T  6166250 aattgattttgatagaattgaatttgagagaattgattttggttagaagtgagtttgatctgaattgatt-atgtttggatacactcatttaaaagtgat 6166152  T
Q  128 tgttatgagttgatgttgtttggatagtttaaatcaaaattgattttgaatg 179  Q
    | ||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||    
T  6166151 tcttaggagttgatgttgtttgggtagtttgaatcaaaattgattttaaatg 6166100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 19 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 1199977 - 1199819
Alignment:
Q  19 ggtgacgaaaattgattttgatagaattgagtttgacagaattgattttgattaaaagtgaatatgagatgaattggtttatatttggatacacttgttt 118  Q
    |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||| |   |  ||||||| ||||| |||||||||||||  ||    
T  1199977 ggtggcgagaattgattttgatagaattgagtttgagagaattaattttggttaaaagtgagttgaatgtgaattgatttatgtttggatacactttatt 1199878  T
Q  119 aaaagtagttgttatgagttgatgttgtttggatagtttaaatcaaaattgattttgaa 177  Q
    | ||||  || || ||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  1199877 agaagtgattcttgtggattgatgttgtttggatagtttgaatcaaaattgattttgaa 1199819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 19 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 12247569 - 12247412
Alignment:
Q  19 ggtgacgaaaattgattttgatagaattgagtttgacagaattgattttgattaaaagtgaatatgagatgaattggtttatatttggatacacttgttt 118  Q
    ||||| ||||||||||||| |||||||||||||| | |||||||||| || |||||||||| |  ||  | ||||  || || |||||||||||||||||    
T  12247569 ggtgatgaaaattgattttaatagaattgagtttaagagaattgattctggttaaaagtgagttggatgtaaattaatt-atgtttggatacacttgttt 12247471  T
Q  119 aaaagtagttgttatgagttgatgttgtttggatagtttaaatcaaaattgattttgaa 177  Q
    ||||||  || |||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||    
T  12247470 aaaagtgatttttatgagttgatgttgtttggagaatttgaatcaaaattgattttgaa 12247412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 19 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 13056147 - 13055988
Alignment:
Q  19 ggtgacgaaaattgattttgatagaattgagtttgacagaattgattttgattaaaagtgaatatgag-atgaattggtttatatttggatacacttgtt 117  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| |||||||||| | ||||  ||||||| ||||| |||| |||| |||  |    
T  13056147 ggtggcgataattgattttgatagaatggagtttgaaagaattgattttggttaaaagtgagt-tgagtgtgaattgatttatgtttgaatacgctt-at 13056050  T
Q  118 taaaagtagttgttatgagttgatgttgtttggatagtttaaatcaaaattgattttgaatg 179  Q
    |||||||  || |||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  13056049 taaaagtgatttttatgagttgatattgtttggatagtttgaataaaaattgattttgaatg 13055988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 28 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 48511049 - 48510884
Alignment:
Q  28 aattgattttgatagaattgagtttgacagaattgattttgattaaaagtgaatatgagatgaattggtttatatttggatacacttgtttaaaagtagt 127  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||| |   |  ||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||  |    
T  48511049 aattgattttgattgaattgagtttgagataattgattttggttaaaagtgagttgaatgtgaattgatttatgtttggatacacttgcttaaaagtgat 48510950  T
Q  128 tgttatgagttgatgttgtttggatagtttaaatcaaaattgattttgaatgtaaaatgatcaaac 193  Q
    | |||||| ||||||||||||| ||||| |  ||||||||||||||| | |||  |||||||||||    
T  48510949 tcttatgaattgatgttgtttgaatagtatgtatcaaaattgattttaagtgtgtaatgatcaaac 48510884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 19 - 180
Target Start/End: Original strand, 50977316 - 50977476
Alignment:
Q  19 ggtgacgaaaattgattttgatagaattgagtttgacagaattgattttgattaaaagtgaatatgagatgaattggtttatatttggatacacttgttt 118  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| |||||||||| | ||   ||||||| ||||| ||||||||| |||  ||    
T  50977316 ggtggcgagaattgattttgatagaatggagtttgaaagaattgattttggttaaaagtgagtttggtgtgaattgttttatgtttggatacgctt-att 50977414  T
Q  119 aaaagtagttgttatgagttgatgttgtttggatagtttaaatcaaaattgattttgaatgt 180  Q
    | ||||  || |||||||| ||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  50977415 acaagtgatttttatgagtagatattgtttggatagtttgaataaaaattgattttgaatgt 50977476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 19 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 26058391 - 26058235
Alignment:
Q  19 ggtgacgaaaattgattttgatagaattgagtttgacagaattgattttgattaaaagtgaatatgagatgaattggtttatatttggatacacttgttt 118  Q
    |||| ||| ||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||  ||  | ||||| ||||| ||||||| ||||  |||    
T  26058391 ggtggcgagaattgattttgatagaattgattttaagagaattgattttgattaaaagtgaattagatgtaaattgatttatgtttggatgcactcattt 26058292  T
Q  119 aaaagtagttgttatgagttgatgttgtttggatagtttaaatcaaaattgattttg 175  Q
    ||||||| ||  ||||| |||||||||||||||||| ||  || |||||||||||||    
T  26058291 aaaagtaattcatatgaattgatgttgtttggatagattggattaaaattgattttg 26058235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 28 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 36205332 - 36205180
Alignment:
Q  28 aattgattttgatagaattgagtttgacagaattgattttgattaaaagtgaatatgagatgaattggtttatatttggatacacttgtttaaaagtagt 127  Q
    |||||||||| |  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |  || |||||||||||| |  ||||||| |||| |||||||||  |    
T  36205332 aattgattttaacggaattgagtttgagagaattgattttgattaaaagtgggttagatatgaattggtttttgattggataaacttatttaaaagtgat 36205233  T
Q  128 tgttatgagttgatgttgtttggatagtttaaatcaaaattgattttgaatgt 180  Q
    | ||| ||||  |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  36205232 tcttacgagtgaatgttgcttggatagtttgaatcaaaattgattttgaatgt 36205180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 19 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 10470739 - 10470578
Alignment:
Q  19 ggtgacgaaaattgattttgatagaattgagtttgacagaattgattttgattaaaagtgaatatgagatg-aattggtttatatttggatacacttgtt 117  Q
    |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||| ||| || | | |||| ||||||||||| |       
T  10470739 ggtggcgagaattgattttgatagaattgagtttgagagaattgattttgattaaaagtgagt-tga-atgtaaattgattatgtttggatacacgttaa 10470642  T
Q  118 taaaagtagttgttatgagttgatgttgtttggatagtttaaatcaaaattgattttgaatgta 181  Q
     | ||||  || |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  10470641 cagaagtgattcttatgagttgatgttgtttggatagtttgaattaaaattgattttgaatgta 10470578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 28 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 5410780 - 5410631
Alignment:
Q  28 aattgattttgatagaattgagtttgacagaattgattttgattaaaagtgaatatgagatgaattggtttatatttggatacacttgtttaaaagtagt 127  Q
    |||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |  ||  | ||||| ||||| |||| |||||| |  ||||||||  |    
T  5410780 aattgattttgatataattgaatttgaaagaattgattttgattaaaagtgagttggatgtaaattgatttatgtttgaatacac-tacttaaaagtgat 5410682  T
Q  128 tgttatgagttgatgttgtttggatagtttaaatcaaaattgattttgaat 178  Q
    | |||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  5410681 tcttatgacttgatgttgtttggatagtttgaatcataattgattttgaat 5410631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 17 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 6464759 - 6464597
Alignment:
Q  17 gtggtgacgaaaattgattttgatagaattgagtttgacagaattgattttgattaaaagtgaatatgagatgaattggtttatatttggatacacttgt 116  Q
    |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||  || || |||||| |||||||||| | | |  ||||||| || || |||  ||||||||      
T  6464759 gtggtgacgagaattgattttgatataattgagtttgagtgagttcattttggttaaaagtgagtttaatgtgaattgatt-atgtttttatacacttta 6464661  T
Q  117 ttaaaagtagttgttatgagttgatgttgtttggatagtttaaatcaaaattgattttgaatgt 180  Q
     || ||||  || |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  6464660 ctagaagtgattcttatgagttgatgttgtttggatagtttgaatcaaaattgattttgaatgt 6464597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 28 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 15884368 - 15884216
Alignment:
Q  28 aattgattttgatagaattgagtttgacagaattgattttgattaaaagtgaatatgagatgaattggtttatatttggatacact-tgtttaaaagtag 126  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  ||  ||||||| ||||| |||||||||| |    | ||||||      
T  15884368 aattgattttgatagagttgagtttgacagaattgattttggttaaaagtgagttggatgtgaattgatttatgtttggatacaataaagtaaaaagtga 15884269  T
Q  127 ttgttatgagttgatgttgtttggatagtttaaatcaaaattgattttgaatg 179  Q
    || |||| | || ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  15884268 tttttataaattcatgttgtttggatagtttggatcaaaattgattttgaatg 15884216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 19 - 154
Target Start/End: Original strand, 27801628 - 27801763
Alignment:
Q  19 ggtgacgaaaattgattttgatagaattgagtttgacagaattgattttgattaaaagtgaatatgagatgaattggtttatatttggatacacttgttt 118  Q
    |||| ||| ||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||| |  ||  | ||||| ||||| ||||||| ||||  |||    
T  27801628 ggtggcgagaattgattttgatagaattgattttaagagaattgattttgattaaaagtgagttagatgtaaattgatttatgtttggatgcactcattt 27801727  T
Q  119 aaaagtagttgttatgagttgatgttgtttggatag 154  Q
    ||||||| ||  ||||| ||||||||||||||||||    
T  27801728 aaaagtaattcatatgaattgatgttgtttggatag 27801763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 19 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 50406280 - 50406118
Alignment:
Q  19 ggtgacgaaaattgattttgatagaattgagtttgacagaattgattttgattaaaagtgaatatgagatgaattggtttatatttggatacacttgttt 118  Q
    |||| ||| |||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |  ||  ||||||| ||| | ||||||| |||||  ||    
T  50406280 ggtggcgagaattgattttgataaaattgagtttgaaagatttgattttgattaaaagtgagttagatgtgaattgatttttgtttggatgcacttcgtt 50406181  T
Q  119 aaaagtagttgttatgagttgatgttgtttggatagtttaaatcaaaattgattttgaatgta 181  Q
    |||| |  || |||| ||||| |||||||||||||  || ||||||||||| |||| ||||||    
T  50406180 aaaaatgattcttataagttgttgttgtttggatacattgaatcaaaattgtttttaaatgta 50406118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 43 - 180
Target Start/End: Original strand, 4369803 - 4369939
Alignment:
Q  43 aattgagtttgacagaattgattttgattaaaagtgaatatgagatgaattggtttatatttggatacacttgtttaaaagtagttgttatgagttgatg 142  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||| | |||  ||||||| ||||| ||||| ||| ||   ||||||||  || |||||||||||||    
T  4369803 aattgattttgagagaattgattttggttaaaagtgagt-tgatgtgaattgatttatgtttgggtaccctcacttaaaagtgattcttatgagttgatg 4369901  T
Q  143 ttgtttggatagtttaaatcaaaattgattttgaatgt 180  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||||| |||||    
T  4369902 ttgtttggataggttgaatcaaaattgattttaaatgt 4369939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 19 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 25230156 - 25230000
Alignment:
Q  19 ggtgacgaaaattgattttgatagaattgagtttgacagaattgattttgattaaaagtgaatatgagatgaattggtttatatttggatacacttgttt 118  Q
    |||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||  |||||||||| |   |  |||||| | |||| |||||||||||||   |    
T  25230156 ggtggcgagaattgattttgatagaactgagtttgagagaattgattttagttaaaagtgagttgaatgtgaatt-gattatgtttggatacactttaat 25230058  T
Q  119 aaaagtagttgttatgagttgatgttgtttggatagtttaaatcaaaattgattttga 176  Q
    | ||||  || |||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  25230057 agaagtgattcttattagttgatgttgtttggatagtttgaatgaaaattgattttga 25230000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 26 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 34718594 - 34718452
Alignment:
Q  26 aaaattgattttgatagaattgagtttgacagaattgattttgattaaaagtgaatatgagatgaattggtttatatttggatacacttgtttaaaagta 125  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||| |||||||||| | ||| || ||||| ||||| |||| ||||||||||  ||||||     
T  34718594 aaaattgattttgatagaattgagtttgagataattaattttggttaaaagtgagtttgatataaattgatttatgtttgaatacacttgtacaaaagtg 34718495  T
Q  126 gttgttatgagttgatgttgtttggatagtttaaatcaaaatt 168  Q
     || |||||| ||   |||||||||||| ||| ||| ||||||    
T  34718494 attcttatgaattatagttgtttggatactttgaattaaaatt 34718452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 29 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 13931762 - 13931614
Alignment:
Q  29 attgattttgatagaattgagtttgacagaattgattttgattaaaagtgaatatgagatgaattggtttatatttggatacacttgtttaaaagtagtt 128  Q
    ||||||||||||||||||||||||   | ||||||||||| |||||| ||| | |||  ||||||| || || |||||||| |||   |||||  |  ||    
T  13931762 attgattttgatagaattgagtttccaaaaattgattttgtttaaaaatgagtttgatgtgaattgatt-atgtttggatatactcacttaaacatgatt 13931664  T
Q  129 gttatgagttgatgttgtttggatagtttaaatcaaaattgattttgaat 178  Q
     |||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  13931663 cttacaagttgatgttgtttggatagtttgaatcaaaattgattttgaat 13931614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 130 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 31933766 - 31933716
Alignment:
Q  130 ttatgagttgatgttgtttggatagtttaaatcaaaattgattttgaatgt 180  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||    
T  31933766 ttatgagttgatgttgtttggatattttacatcaaaattgattttgaatgt 31933716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 13 - 79
Target Start/End: Complemental strand, 15576610 - 15576544
Alignment:
Q  13 tttggtggtgacgaaaattgattttgatagaattgagtttgacagaattgattttgattaaaagtga 79  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| ||  |||||||||| | |||||||||||| |||||||||||    
T  15576610 tttggcggtgacgaaaattgattttaattaaattgagtttaagagaattgattttaattaaaagtga 15576544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 41 - 109
Target Start/End: Complemental strand, 16556362 - 16556295
Alignment:
Q  41 agaattgagtttgacagaattgattttgattaaaagtgaatatgagatgaattggtttatatttggata 109  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||| || ||||| ||||||||    
T  16556362 agaattgaatttgacataattgattttggttaaaagtgaat-tgagatgaagtgatttatgtttggata 16556295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 19 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 25061376 - 25061221
Alignment:
Q  19 ggtgacgaaaattgattttgatagaattgagtttgacagaattgattttgattaaaagtgaatatgagatgaattggtttatatttggatacacttgttt 118  Q
    |||||| ||||||||||||| || |||||| ||||   |||||||||||| |||||||||| |   | || ||||| ||||| |||||||||  |    |    
T  25061376 ggtgacaaaaattgattttgttaaaattgattttggttgaattgattttggttaaaagtgagttgaacataaattgatttatgtttggataccttaacat 25061277  T
Q  119 aaaagtagttgttatgagttgatgttgtttggatagtttaaatcaaaattgatttt 174  Q
    ||||||  || |||| | |||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  25061276 aaaagtgattcttatcaattgatgatgtttggataatttgaatcaaaattgatttt 25061221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 28 - 79
Target Start/End: Complemental strand, 29441325 - 29441274
Alignment:
Q  28 aattgattttgatagaattgagtttgacagaattgattttgattaaaagtga 79  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||| ||||||    
T  29441325 aattgattttgatagaattgagtttgagtgaattgattttggttagaagtga 29441274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 71 - 180
Target Start/End: Original strand, 11051339 - 11051447
Alignment:
Q  71 taaaagtgaatatgagatgaattggtttatatttggatacacttgtttaaaagtagttgttatgagttgatgttgtttggatagtttaaatcaaaattga 170  Q
    ||||||||| | |||  ||||||| ||||| |||| ||||||    |||||| | ||| ||| ||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  11051339 taaaagtgagtttgatgtgaattgatttatgtttgaatacacacacttaaaaatggttcttaagagtt-atgttgtttggatagtttgaataaaaattga 11051437  T
Q  171 ttttgaatgt 180  Q
    ||||||||||    
T  11051438 ttttgaatgt 11051447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 22 - 79
Target Start/End: Complemental strand, 43134597 - 43134540
Alignment:
Q  22 gacgaaaattgattttgatagaattgagtttgacagaattgattttgattaaaagtga 79  Q
    ||||| |||| |||| ||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||    
T  43134597 gacgagaatttatttggatagaattgagtttaagagaattgattttggttaaaagtga 43134540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 140 - 181
Target Start/End: Original strand, 46033210 - 46033251
Alignment:
Q  140 atgttgtttggatagtttaaatcaaaattgattttgaatgta 181  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  46033210 atgttgtttggatagtttttatcaaaattgattttgaatgta 46033251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 19 - 79
Target Start/End: Original strand, 7765260 - 7765319
Alignment:
Q  19 ggtgacgaaaattgattttgatagaattgagtttgacagaattgattttgattaaaagtga 79  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||| ||| |||||||||    
T  7765260 ggtgacgagaattgattttgatagaattga-ttttacataattgattatgaataaaagtga 7765319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 28 - 75
Target Start/End: Original strand, 49242967 - 49243014
Alignment:
Q  28 aattgattttgatagaattgagtttgacagaattgattttgattaaaa 75  Q
    |||| ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  49242967 aattaattttgatataattgagtttgagagaattgattttggttaaaa 49243014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 19 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 9447681 - 9447533
Alignment:
Q  19 ggtgacgaaaattgattttgatagaattgagtttgacagaattgattttgattaaaagtgaatatgagatgaattggtttatatttggatacacttgttt 118  Q
    ||||| || |||||||||| ||| |||||| ||||| |||| || ||| | |||||||||| | |||  ||||| || |||| ||| |||| |||  |||    
T  9447681 ggtgaagagaattgattttaataaaattgaatttgagagaaatggtttgg-ttaaaagtgagtttgatgtgaat-ggattatgtttagatatactcattt 9447584  T
Q  119 aaaagtagttgttatgagttgatgttgtttggatagtttaaatcaaaattg 169  Q
    ||||||  || ||  |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  9447583 aaaagtgattctttcgagttgatgttgtttggatagtttgaattaaaattg 9447533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 26 - 79
Target Start/End: Complemental strand, 4347116 - 4347064
Alignment:
Q  26 aaaattgattttgatagaattgagtttgacagaattgattttgattaaaagtga 79  Q
    ||||||||||||| ||||||||| ||||  ||||||||||||| ||||||||||    
T  4347116 aaaattgattttggtagaattgattttgt-agaattgattttggttaaaagtga 4347064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 137 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 36118157 - 36118120
Alignment:
Q  137 ttgatgttgtttggatagtttaaatcaaaattgatttt 174  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  36118157 ttgatattgtttggatagtttaaaccaaaattgatttt 36118120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 140 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 41512770 - 41512729
Alignment:
Q  140 atgttgtttggatagtttaaatcaaaattgattttgaatgta 181  Q
    ||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||    
T  41512770 atgttgtttggattgttttgatcaaaattgattttgaatgta 41512729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 28 - 69
Target Start/End: Complemental strand, 41512864 - 41512823
Alignment:
Q  28 aattgattttgatagaattgagtttgacagaattgattttga 69  Q
    |||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  41512864 aattgattctgatagaattgattctgacagaattgattttga 41512823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 140 - 181
Target Start/End: Original strand, 42137170 - 42137211
Alignment:
Q  140 atgttgtttggatagtttaaatcaaaattgattttgaatgta 181  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||    
T  42137170 atgttgtttggatagttttgatcaaaattgcttttgaatgta 42137211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 25 - 65
Target Start/End: Complemental strand, 6061286 - 6061246
Alignment:
Q  25 gaaaattgattttgatagaattgagtttgacagaattgatt 65  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||    
T  6061286 gaaaattgattttgatagaattgaatttgagataattgatt 6061246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #49
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 19 - 79
Target Start/End: Complemental strand, 13344922 - 13344863
Alignment:
Q  19 ggtgacgaaaattgattttgatagaattgagtttgacagaattgattttgattaaaagtga 79  Q
    ||||| || ||||||||||||| ||||||| ||||  ||||||||||||| ||||||||||    
T  13344922 ggtgaagataattgattttgattgaattgattttgt-agaattgattttggttaaaagtga 13344863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #50
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 19 - 79
Target Start/End: Complemental strand, 30557683 - 30557624
Alignment:
Q  19 ggtgacgaaaattgattttgatagaattgagtttgacagaattgattttgattaaaagtga 79  Q
    ||||| || ||||||||||||||||||||| | ||  ||||||||||||| ||||||||||    
T  30557683 ggtgaggagaattgattttgatagaattgattctg-tagaattgattttggttaaaagtga 30557624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #51
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 19 - 79
Target Start/End: Complemental strand, 40352540 - 40352481
Alignment:
Q  19 ggtgacgaaaattgattttgatagaattgagtttgacagaattgattttgattaaaagtga 79  Q
    ||||| || ||||||||||||||||||||| ||||   |||||||||||| ||||||||||    
T  40352540 ggtgaggagaattgattttgatagaattgattttg-tggaattgattttggttaaaagtga 40352481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #52
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 136 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 40821858 - 40821814
Alignment:
Q  136 gttgatgttgtttggatagtttaaatcaaaattgattttgaatgt 180  Q
    ||||||||| |||||||| ||| |||||||||||| |||||||||    
T  40821858 gttgatgttatttggataatttgaatcaaaattgagtttgaatgt 40821814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #53
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 26 - 66
Target Start/End: Original strand, 46033129 - 46033169
Alignment:
Q  26 aaaattgattttgatagaattgagtttgacagaattgattt 66  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  46033129 aaaattgattctgatagaattgattttgaaagaattgattt 46033169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0381 (Bit Score: 80; Significance: 1e-37; HSPs: 1)
Name: scaffold0381
Description:

Target: scaffold0381; HSP #1
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 28 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 9227 - 9069
Alignment:
Q  28 aattgattttgatagaattgagtttgacagaattgattttgattaaaagtgaatatgagatgaattggtttatatttggatacacttgtttaaaagtagt 127  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |  || ||||||| || ||| ||||||||||||   || |||||  |    
T  9227 aattgattttgatagaattgagtttgagagaattgattttgattaaaagtgagttagatatgaatt-gtatatgtttggatacactcacttgaaagtgat 9129  T
Q  128 tgttatgagttgatgttgtttggatagtttaaatcaaaattgattttgaatgtaaaatga 187  Q
    | |||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  9128 tcttatgagtagatgttgtttggatagtttgaattaaaattgattttgaatgtataatga 9069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0217 (Bit Score: 73; Significance: 2e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold0217
Description:

Target: scaffold0217; HSP #1
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 14 - 178
Target Start/End: Original strand, 1997 - 2161
Alignment:
Q  14 ttggtggtgacgaaaattgattttgatagaattgagtttgacagaattgattttgattaaaagtgaatatgagatgaattggtttatatttggatacact 113  Q
    |||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||| ||| | ||| |||||||| ||||| ||||||| ||||    
T  1997 ttggcggtgtcgataattgattttgatagaattgagtttgaaagaattgattttggttcaaaatgagtttgatatgaattgatttatgtttggatgcact 2096  T
Q  114 tgtttaaaagtagttgttatgagttgatgttgtttggatagtttaaatcaaaattgattttgaat 178  Q
      | |||||||  || | |||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  2097 catataaaagtgattatcatggcttgatgttgtttggatagtttaagtcaaaattgattttgaat 2161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005 (Bit Score: 72; Significance: 8e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold0005
Description:

Target: scaffold0005; HSP #1
Raw Score: 72; E-Value: 8e-33
Query Start/End: Original strand, 28 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 253245 - 253086
Alignment:
Q  28 aattgattttgatagaattgagtttgacagaattgattttgattaaaagtgaatatgagatgaattggtttatatttggatacacttgtttaaaagtagt 127  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||| |  || |||||||| ||||| |||||||||  |   ||||||||  |    
T  253245 aattgattttgatagaattgagtttgagagaattgattttggttaaatgtgagttggatatgaattgatttatgtttggataccttcagttaaaagtgat 253146  T
Q  128 tgttatgagttgatgttgtttggatagtttaaatcaaaattgattttgaatgtaaaatga 187  Q
    | ||||||||| ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| || |||||    
T  253145 tcttatgagttaatgttgtttggatagattgaatcaaaattgattttgaatatataatga 253086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0007 (Bit Score: 65; Significance: 1e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0007
Description:

Target: scaffold0007; HSP #1
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 28 - 180
Target Start/End: Original strand, 29107 - 29258
Alignment:
Q  28 aattgattttgatagaattgagtttgacagaattgattttgattaaaagtgaatatgagatgaattggtttatatttggatacacttgtttaaaagtagt 127  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||| |   |  ||||||| || || |||||||||||||   || ||||  |    
T  29107 aattgattttgatagaattaagtttgaaagaattgattttggttaaaagtgagttgaatgtgaattgatt-atgtttggatacactttaatagaagttat 29205  T
Q  128 tgttatgagttgatgttgtttggatagtttaaatcaaaattgattttgaatgt 180  Q
    | |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  29206 tcttatgaattgatgttgtttggatagtttgaatcaaaattgattttgaatgt 29258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0041 (Bit Score: 50; Significance: 1e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0041
Description:

Target: scaffold0041; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 24 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 46883 - 46727
Alignment:
Q  24 cgaaaattgattttgatagaattgagtttgacagaattgattttgattaaaagtgaatatgagatgaattggtttatatttggatacacttgtttaaaag 123  Q
    |||||||||||||||| | |||||| ||||| |||||||||||||  ||||||||| | |||  | ||||||||||| |||||||| | |    ||||||    
T  46883 cgaaaattgattttgacataattgattttgatagaattgattttgcctaaaagtgagt-tgaacttaattggtttatgtttggatatattaaagtaaaag 46785  T
Q  124 tagttgttatgagttgatgttgtttggatagtttaaatcaaaattgattttgaatgta 181  Q
    |  || |||| | || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  46784 tgatttttatcaattcatgttgtttggatagttcaaatcaaaattgattttggatgta 46727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0172 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0172
Description:

Target: scaffold0172; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 19 - 79
Target Start/End: Original strand, 15233 - 15292
Alignment:
Q  19 ggtgacgaaaattgattttgatagaattgagtttgacagaattgattttgattaaaagtga 79  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||||| ||||||||||    
T  15233 ggtgacgaaaattgattttgatagaattgattttgtca-aattgattttggttaaaagtga 15292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0014 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0014
Description:

Target: scaffold0014; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 28 - 116
Target Start/End: Original strand, 118394 - 118482
Alignment:
Q  28 aattgattttgatagaattgagtttgacagaattgattttgattaaaagtgaatatgagatgaattggtttatatttggatacacttgt 116  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||  |||||||||| | |||  | ||||| ||||| |||||||||||||||    
T  118394 aattgattttgatcgaattgagtttgatagaatagatttttgttaaaagtgagtttgatgtaaattgatttatgtttggatacacttgt 118482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0394 (Bit Score: 40; Significance: 0.00000000000009; HSPs: 2)
Name: scaffold0394
Description:

Target: scaffold0394; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 28 - 79
Target Start/End: Original strand, 5814 - 5865
Alignment:
Q  28 aattgattttgatagaattgagtttgacagaattgattttgattaaaagtga 79  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  5814 aattgattttgatataattgagtttgagagaattgattttggttaaaagtga 5865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0394; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 136 - 180
Target Start/End: Original strand, 5918 - 5967
Alignment:
Q  136 gttgatgttgtttggatagttta-----aatcaaaattgattttgaatgt 180  Q
    |||||||||||||||||||||||     ||||||||||||||||||||||    
T  5918 gttgatgttgtttggatagtttaatttgaatcaaaattgattttgaatgt 5967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0184 (Bit Score: 30; Significance: 0.00000009; HSPs: 1)
Name: scaffold0184
Description:

Target: scaffold0184; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 140 - 181
Target Start/End: Original strand, 9254 - 9295
Alignment:
Q  140 atgttgtttggatagtttaaatcaaaattgattttgaatgta 181  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||    
T  9254 atgttgtttggatagttttgatcaaaattgattttaaatgta 9295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0168 (Bit Score: 30; Significance: 0.00000009; HSPs: 1)
Name: scaffold0168
Description:

Target: scaffold0168; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 28 - 65
Target Start/End: Complemental strand, 32095 - 32058
Alignment:
Q  28 aattgattttgatagaattgagtttgacagaattgatt 65  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  32095 aattgattttgatagaattgattttgatagaattgatt 32058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0097 (Bit Score: 30; Significance: 0.00000009; HSPs: 2)
Name: scaffold0097
Description:

Target: scaffold0097; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 28 - 69
Target Start/End: Original strand, 32446 - 32487
Alignment:
Q  28 aattgattttgatagaattgagtttgacagaattgattttga 69  Q
    |||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  32446 aattgattatgatagaattgattgtgacagaattgattttga 32487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0097; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 140 - 181
Target Start/End: Original strand, 32541 - 32582
Alignment:
Q  140 atgttgtttggatagtttaaatcaaaattgattttgaatgta 181  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||    
T  32541 atgttgtttggatagtttttatcaaaattgcttttgaatgta 32582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0068 (Bit Score: 30; Significance: 0.00000009; HSPs: 1)
Name: scaffold0068
Description:

Target: scaffold0068; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 28 - 69
Target Start/End: Complemental strand, 38425 - 38384
Alignment:
Q  28 aattgattttgatagaattgagtttgacagaattgattttga 69  Q
    |||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  38425 aattgattctaatagaattgattttgacagaattgattttga 38384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003 (Bit Score: 30; Significance: 0.00000009; HSPs: 1)
Name: scaffold0003
Description:

Target: scaffold0003; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 140 - 181
Target Start/End: Original strand, 301745 - 301786
Alignment:
Q  140 atgttgtttggatagtttaaatcaaaattgattttgaatgta 181  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||    
T  301745 atgttgtttggatagttttgatcaaaattgtttttgaatgta 301786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University