View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF9682_low_27 (Length: 233)

Name: NF9682_low_27
Description: NF9682
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF9682_low_27
NF9682_low_27
[»] chr8 (37 HSPs)
chr8 (14-224)||(22031080-22031290)
chr8 (14-216)||(18859562-18859764)
chr8 (14-216)||(19115385-19115587)
chr8 (14-216)||(20015857-20016059)
chr8 (14-224)||(30310738-30310948)
chr8 (14-224)||(32603122-32603332)
chr8 (14-216)||(17671616-17671818)
chr8 (14-216)||(22126553-22126755)
chr8 (16-224)||(21164134-21164342)
chr8 (14-224)||(22042804-22043014)
chr8 (14-216)||(22117769-22117971)
chr8 (16-216)||(19980952-19981152)
chr8 (14-216)||(19481666-19481868)
chr8 (14-215)||(15536369-15536570)
chr8 (17-224)||(22129214-22129421)
chr8 (14-224)||(22421486-22421696)
chr8 (14-224)||(22990022-22990232)
chr8 (40-215)||(22523532-22523707)
chr8 (14-224)||(21253922-21254132)
chr8 (14-206)||(22245609-22245801)
chr8 (14-206)||(22246027-22246219)
chr8 (14-224)||(21391455-21391665)
chr8 (14-224)||(21780781-21780991)
chr8 (31-205)||(22375065-22375239)
chr8 (64-224)||(21785999-21786159)
chr8 (19-206)||(16268823-16269010)
chr8 (37-216)||(21928413-21928592)
chr8 (19-226)||(22373844-22374051)
chr8 (19-206)||(28983906-28984093)
chr8 (37-226)||(19985155-19985344)
chr8 (19-206)||(28989125-28989312)
chr8 (19-206)||(29301025-29301212)
chr8 (19-226)||(31414131-31414338)
chr8 (19-216)||(20391071-20391268)
chr8 (19-215)||(22027879-22028075)
chr8 (37-206)||(22053858-22054027)
chr8 (72-206)||(27357531-27357665)
[»] scaffold0017 (3 HSPs)
scaffold0017 (14-224)||(17220-17430)
scaffold0017 (17-216)||(194995-195194)
scaffold0017 (18-212)||(24258-24452)
[»] chr5 (42 HSPs)
chr5 (14-224)||(18781957-18782167)
chr5 (14-216)||(41773693-41773895)
chr5 (14-216)||(16359353-16359555)
chr5 (14-216)||(27521257-27521459)
chr5 (14-216)||(27613207-27613409)
chr5 (14-216)||(34569345-34569547)
chr5 (14-216)||(40711631-40711833)
chr5 (14-216)||(19772811-19773013)
chr5 (14-216)||(22137519-22137721)
chr5 (22-216)||(22330228-22330422)
chr5 (14-216)||(27682733-27682935)
chr5 (14-216)||(29473406-29473608)
chr5 (14-216)||(27665823-27666025)
chr5 (14-216)||(37288829-37289031)
chr5 (16-216)||(14997074-14997274)
chr5 (16-216)||(22350770-22350970)
chr5 (17-224)||(21882617-21882824)
chr5 (16-214)||(23460824-23461022)
chr5 (91-224)||(21342824-21342957)
chr5 (64-216)||(20803448-20803600)
chr5 (17-224)||(25429264-25429471)
chr5 (14-224)||(26736060-26736270)
chr5 (14-206)||(23474056-23474248)
chr5 (18-206)||(21631736-21631924)
chr5 (16-166)||(23525952-23526102)
chr5 (15-126)||(21332320-21332431)
chr5 (19-206)||(14884329-14884516)
chr5 (19-226)||(21983515-21983722)
chr5 (19-226)||(23078243-23078450)
chr5 (19-215)||(20824287-20824483)
chr5 (19-215)||(20778747-20778943)
chr5 (19-206)||(28892280-28892467)
chr5 (19-206)||(20345125-20345312)
chr5 (19-226)||(21561363-21561570)
chr5 (39-206)||(22505522-22505689)
chr5 (22-215)||(22464784-22464977)
chr5 (37-206)||(25850915-25851084)
chr5 (19-206)||(23563506-23563693)
chr5 (14-212)||(21409989-21410187)
chr5 (39-206)||(17266692-17266859)
chr5 (130-205)||(21336743-21336818)
chr5 (163-212)||(20311705-20311754)
[»] scaffold0109 (2 HSPs)
scaffold0109 (14-224)||(13278-13488)
scaffold0109 (16-216)||(41103-41303)
[»] chr7 (42 HSPs)
chr7 (14-216)||(8710513-8710715)
chr7 (14-216)||(14335304-14335506)
chr7 (14-224)||(17703615-17703825)
chr7 (14-224)||(9591264-9591474)
chr7 (14-216)||(15158217-15158419)
chr7 (14-216)||(18587331-18587533)
chr7 (14-216)||(44788511-44788713)
chr7 (14-216)||(13688949-13689151)
chr7 (14-216)||(11234373-11234575)
chr7 (14-216)||(18180651-18180853)
chr7 (14-216)||(11550262-11550464)
chr7 (26-216)||(14957462-14957652)
chr7 (16-214)||(15146085-15146283)
chr7 (14-216)||(12690410-12690611)
chr7 (98-216)||(8200956-8201074)
chr7 (14-157)||(16726601-16726744)
chr7 (16-206)||(14042613-14042803)
chr7 (16-206)||(14352643-14352833)
chr7 (18-204)||(15627444-15627630)
chr7 (19-226)||(16947615-16947822)
chr7 (19-206)||(40924960-40925147)
chr7 (18-226)||(19149910-19150118)
chr7 (18-226)||(20749309-20749517)
chr7 (19-206)||(26091941-26092128)
chr7 (19-206)||(49155220-49155407)
chr7 (37-206)||(18051114-18051283)
chr7 (21-206)||(13676370-13676555)
chr7 (152-216)||(10873598-10873662)
chr7 (18-226)||(14261388-14261596)
chr7 (19-206)||(13024264-13024450)
chr7 (19-206)||(13965811-13965998)
chr7 (19-206)||(15099746-15099933)
chr7 (19-206)||(21755331-21755518)
chr7 (19-206)||(26115733-26115920)
chr7 (19-215)||(12459538-12459734)
chr7 (18-206)||(12798643-12798831)
chr7 (37-216)||(11385590-11385769)
chr7 (37-216)||(14140588-14140767)
chr7 (37-216)||(15343340-15343519)
chr7 (19-226)||(12203943-12204150)
chr7 (37-216)||(14283535-14283714)
chr7 (15-84)||(11984032-11984101)
[»] chr6 (38 HSPs)
chr6 (14-216)||(16574673-16574875)
chr6 (14-216)||(16620505-16620707)
chr6 (14-216)||(28260493-28260695)
chr6 (14-216)||(28285221-28285423)
chr6 (14-216)||(28339242-28339444)
chr6 (14-216)||(2872098-2872300)
chr6 (14-216)||(29589735-29589937)
chr6 (14-216)||(24293078-24293280)
chr6 (14-224)||(27559265-27559475)
chr6 (14-216)||(28312413-28312615)
chr6 (16-216)||(22436652-22436852)
chr6 (22-224)||(16924944-16925146)
chr6 (16-216)||(25115335-25115535)
chr6 (15-224)||(18405241-18405450)
chr6 (37-216)||(27190219-27190398)
chr6 (37-216)||(27258842-27259021)
chr6 (14-224)||(23081198-23081408)
chr6 (16-216)||(19867470-19867670)
chr6 (19-216)||(5836529-5836726)
chr6 (14-224)||(23085121-23085331)
chr6 (14-215)||(18182663-18182864)
chr6 (24-132)||(22829692-22829800)
chr6 (21-216)||(18797473-18797668)
chr6 (18-206)||(30678324-30678512)
chr6 (23-206)||(19437795-19437978)
chr6 (37-206)||(19455816-19455985)
chr6 (19-215)||(10466149-10466345)
chr6 (19-206)||(15462129-15462316)
chr6 (19-226)||(21474373-21474580)
chr6 (37-194)||(19465973-19466130)
chr6 (37-226)||(25770617-25770806)
chr6 (37-224)||(34642905-34643092)
chr6 (19-206)||(24367193-24367380)
chr6 (19-216)||(19486595-19486792)
chr6 (146-216)||(21567419-21567489)
chr6 (21-206)||(24515717-24515902)
chr6 (37-206)||(14377235-14377404)
chr6 (149-215)||(20010885-20010951)
[»] chr4 (38 HSPs)
chr4 (14-216)||(12479519-12479721)
chr4 (14-216)||(8050514-8050716)
chr4 (14-216)||(8389331-8389533)
chr4 (14-216)||(14300870-14301072)
chr4 (14-216)||(16233883-16234085)
chr4 (14-224)||(18224337-18224547)
chr4 (14-216)||(19635055-19635257)
chr4 (14-216)||(23958666-23958868)
chr4 (14-216)||(27714255-27714457)
chr4 (16-216)||(40475959-40476159)
chr4 (14-216)||(17092040-17092242)
chr4 (16-224)||(16350447-16350655)
chr4 (14-216)||(19775684-19775886)
chr4 (20-216)||(14683486-14683682)
chr4 (14-224)||(16250741-16250951)
chr4 (16-216)||(15144785-15144985)
chr4 (14-200)||(13513285-13513471)
chr4 (16-224)||(15928-16136)
chr4 (14-206)||(14697030-14697222)
chr4 (16-215)||(14162390-14162589)
chr4 (14-139)||(16219184-16219309)
chr4 (14-139)||(16222504-16222629)
chr4 (37-206)||(51603966-51604135)
chr4 (37-206)||(53750644-53750813)
chr4 (19-206)||(3261950-3262137)
chr4 (19-206)||(29450693-29450880)
chr4 (130-224)||(14188417-14188511)
chr4 (19-216)||(20892950-20893147)
chr4 (21-206)||(16154711-16154896)
chr4 (19-215)||(27903305-27903501)
chr4 (19-206)||(15073288-15073475)
chr4 (19-206)||(44659022-44659209)
chr4 (21-206)||(16150565-16150750)
chr4 (19-206)||(11204388-11204575)
chr4 (15-101)||(18604711-18604797)
chr4 (18-206)||(14993522-14993710)
chr4 (19-111)||(7357291-7357383)
chr4 (145-206)||(15354322-15354383)
[»] chr3 (60 HSPs)
chr3 (14-216)||(10008138-10008340)
chr3 (14-216)||(10908748-10908950)
chr3 (14-216)||(12889247-12889449)
chr3 (14-216)||(13255228-13255430)
chr3 (14-216)||(15345635-15345837)
chr3 (14-216)||(15586782-15586984)
chr3 (14-216)||(15713446-15713648)
chr3 (14-216)||(16754091-16754293)
chr3 (14-216)||(20059444-20059646)
chr3 (14-216)||(43165213-43165415)
chr3 (14-216)||(48427985-48428187)
chr3 (14-216)||(53382408-53382610)
chr3 (14-223)||(16804337-16804546)
chr3 (14-216)||(16638311-16638513)
chr3 (14-224)||(16694694-16694904)
chr3 (16-216)||(15358621-15358821)
chr3 (17-216)||(6603273-6603472)
chr3 (14-216)||(3688481-3688683)
chr3 (16-216)||(15399909-15400109)
chr3 (14-216)||(26790803-26791005)
chr3 (14-216)||(24185728-24185930)
chr3 (14-216)||(5422320-5422522)
chr3 (16-216)||(14873960-14874160)
chr3 (16-216)||(15065609-15065809)
chr3 (14-224)||(15262160-15262370)
chr3 (14-224)||(12843493-12843703)
chr3 (16-224)||(14578800-14579008)
chr3 (37-206)||(47126502-47126671)
chr3 (37-216)||(17188922-17189101)
chr3 (37-216)||(24189852-24190031)
chr3 (19-206)||(28756877-28757064)
chr3 (37-206)||(8744792-8744961)
chr3 (37-206)||(13944582-13944751)
chr3 (19-216)||(16327093-16327290)
chr3 (37-206)||(10408526-10408695)
chr3 (21-206)||(12357913-12358098)
chr3 (19-132)||(23079412-23079525)
chr3 (19-206)||(10417429-10417616)
chr3 (14-86)||(19727428-19727500)
chr3 (18-216)||(14290915-14291113)
chr3 (130-224)||(17492381-17492475)
chr3 (21-206)||(31692571-31692756)
chr3 (14-96)||(11861032-11861114)
chr3 (19-216)||(11958565-11958762)
chr3 (56-206)||(16825702-16825852)
chr3 (37-202)||(11949327-11949492)
chr3 (37-206)||(12180902-12181071)
chr3 (19-216)||(12509867-12510064)
chr3 (37-226)||(12857897-12858086)
chr3 (21-206)||(31941461-31941646)
chr3 (37-216)||(16831930-16832109)
chr3 (56-206)||(12272896-12273046)
chr3 (37-206)||(17494204-17494374)
chr3 (21-206)||(18131733-18131917)
chr3 (39-226)||(15230141-15230328)
chr3 (39-226)||(15236009-15236196)
chr3 (18-212)||(15013152-15013346)
chr3 (145-206)||(14575544-14575605)
chr3 (37-187)||(13317936-13318086)
chr3 (56-206)||(16378355-16378505)
[»] chr2 (38 HSPs)
chr2 (14-216)||(22323033-22323235)
chr2 (14-216)||(24712584-24712786)
chr2 (14-216)||(9338132-9338334)
chr2 (14-216)||(9486766-9486968)
chr2 (14-216)||(10871400-10871602)
chr2 (14-216)||(16983790-16983992)
chr2 (14-216)||(17001550-17001752)
chr2 (14-216)||(27373819-27374021)
chr2 (14-216)||(44383261-44383463)
chr2 (16-215)||(24874443-24874642)
chr2 (16-213)||(22742659-22742856)
chr2 (18-223)||(45673707-45673912)
chr2 (17-224)||(23029155-23029362)
chr2 (14-221)||(24705173-24705380)
chr2 (37-216)||(27220566-27220745)
chr2 (14-216)||(24264920-24265122)
chr2 (14-224)||(24657349-24657559)
chr2 (16-216)||(21322959-21323159)
chr2 (14-216)||(11351402-11351604)
chr2 (64-216)||(21142782-21142934)
chr2 (14-212)||(23204868-23205066)
chr2 (14-224)||(24678029-24678239)
chr2 (14-224)||(23074405-23074615)
chr2 (14-206)||(23064973-23065165)
chr2 (15-206)||(24817532-24817723)
chr2 (14-206)||(22733465-22733657)
chr2 (16-224)||(23105421-23105629)
chr2 (86-216)||(41606155-41606279)
chr2 (39-226)||(19716733-19716920)
chr2 (19-206)||(20848149-20848336)
chr2 (39-226)||(23113263-23113450)
chr2 (21-206)||(23274153-23274338)
chr2 (56-216)||(23097751-23097911)
chr2 (37-206)||(12576913-12577082)
chr2 (14-102)||(23676582-23676670)
chr2 (18-212)||(19817401-19817595)
chr2 (18-199)||(30208615-30208796)
chr2 (39-101)||(19721296-19721358)
[»] chr1 (34 HSPs)
chr1 (14-224)||(17042238-17042448)
chr1 (14-216)||(16347818-16348020)
chr1 (14-216)||(51330715-51330917)
chr1 (14-216)||(21833236-21833438)
chr1 (16-216)||(22496481-22496681)
chr1 (14-216)||(41350891-41351093)
chr1 (14-216)||(33388252-33388454)
chr1 (16-216)||(20081601-20081801)
chr1 (14-216)||(21842146-21842348)
chr1 (16-182)||(21228781-21228947)
chr1 (14-216)||(24785080-24785282)
chr1 (14-216)||(19109302-19109504)
chr1 (16-206)||(21751991-21752181)
chr1 (14-224)||(16379020-16379230)
chr1 (19-226)||(21739264-21739471)
chr1 (19-206)||(20074937-20075124)
chr1 (19-206)||(20297356-20297543)
chr1 (14-121)||(22401621-22401728)
chr1 (19-206)||(52988716-52988903)
chr1 (37-206)||(31537243-31537412)
chr1 (19-206)||(48425848-48426035)
chr1 (21-206)||(19857249-19857434)
chr1 (14-95)||(21045347-21045428)
chr1 (19-206)||(38910054-38910241)
chr1 (37-206)||(37680024-37680193)
chr1 (18-206)||(22015972-22016160)
chr1 (22-215)||(20853991-20854184)
chr1 (37-226)||(24096861-24097050)
chr1 (18-216)||(21742779-21742977)
chr1 (21-206)||(18710360-18710545)
chr1 (14-89)||(22435956-22436031)
chr1 (145-206)||(12200493-12200554)
chr1 (21-206)||(20833130-20833315)
chr1 (14-42)||(22116876-22116904)
[»] scaffold0431 (1 HSPs)
scaffold0431 (16-216)||(10316-10516)
[»] scaffold0042 (2 HSPs)
scaffold0042 (16-216)||(36976-37176)
scaffold0042 (14-206)||(26310-26502)
[»] scaffold2059 (1 HSPs)
scaffold2059 (14-216)||(923-1125)
[»] scaffold0181 (1 HSPs)
scaffold0181 (14-224)||(29082-29292)
[»] scaffold0080 (5 HSPs)
scaffold0080 (14-224)||(10392-10602)
scaffold0080 (14-224)||(13047-13257)
scaffold0080 (37-216)||(31831-32010)
scaffold0080 (37-216)||(37297-37476)
scaffold0080 (15-224)||(54577-54786)
[»] scaffold0055 (1 HSPs)
scaffold0055 (14-216)||(22195-22397)
[»] scaffold0052 (1 HSPs)
scaffold0052 (14-216)||(7184-7386)
[»] scaffold0410 (1 HSPs)
scaffold0410 (15-224)||(81-290)
[»] scaffold0333 (1 HSPs)
scaffold0333 (16-224)||(18590-18798)
[»] scaffold0079 (1 HSPs)
scaffold0079 (16-224)||(36438-36646)
[»] scaffold0010 (4 HSPs)
scaffold0010 (14-224)||(14364-14574)
scaffold0010 (14-215)||(4864-5065)
scaffold0010 (21-206)||(39494-39679)
scaffold0010 (145-206)||(44712-44773)
[»] scaffold0044 (2 HSPs)
scaffold0044 (14-215)||(17109-17310)
scaffold0044 (14-216)||(3372-3574)
[»] scaffold0023 (4 HSPs)
scaffold0023 (16-216)||(30730-30930)
scaffold0023 (16-215)||(47139-47337)
scaffold0023 (130-224)||(152021-152115)
scaffold0023 (37-206)||(164578-164747)
[»] scaffold0177 (1 HSPs)
scaffold0177 (14-224)||(11510-11720)
[»] scaffold0993 (1 HSPs)
scaffold0993 (16-212)||(934-1130)
[»] scaffold0102 (2 HSPs)
scaffold0102 (16-216)||(50501-50701)
scaffold0102 (19-206)||(42656-42843)
[»] scaffold0259 (1 HSPs)
scaffold0259 (20-216)||(8206-8402)
[»] scaffold1881 (1 HSPs)
scaffold1881 (14-212)||(634-832)
[»] scaffold0028 (4 HSPs)
scaffold0028 (16-216)||(11417-11617)
scaffold0028 (37-216)||(17885-18064)
scaffold0028 (16-172)||(54996-55152)
scaffold0028 (168-216)||(53675-53723)
[»] scaffold0022 (3 HSPs)
scaffold0022 (16-216)||(34871-35071)
scaffold0022 (16-224)||(41572-41780)
scaffold0022 (16-224)||(75292-75500)
[»] scaffold0476 (2 HSPs)
scaffold0476 (15-226)||(10724-10935)
scaffold0476 (37-216)||(722-901)
[»] scaffold0273 (1 HSPs)
scaffold0273 (16-203)||(1-188)
[»] scaffold0130 (2 HSPs)
scaffold0130 (14-222)||(7933-8143)
scaffold0130 (71-215)||(4100-4244)
[»] scaffold1459 (1 HSPs)
scaffold1459 (14-216)||(1186-1388)
[»] scaffold0550 (1 HSPs)
scaffold0550 (14-216)||(10312-10514)
[»] scaffold0003 (2 HSPs)
scaffold0003 (14-206)||(424266-424458)
scaffold0003 (34-216)||(203329-203511)
[»] scaffold0011 (2 HSPs)
scaffold0011 (14-215)||(23687-23888)
scaffold0011 (34-206)||(151525-151697)
[»] scaffold0081 (2 HSPs)
scaffold0081 (16-216)||(21552-21752)
scaffold0081 (16-216)||(36976-37176)
[»] scaffold0331 (1 HSPs)
scaffold0331 (14-204)||(15133-15323)
[»] scaffold0621 (2 HSPs)
scaffold0621 (16-224)||(4374-4582)
scaffold0621 (16-180)||(1-165)
[»] scaffold0120 (3 HSPs)
scaffold0120 (16-215)||(14033-14232)
scaffold0120 (14-121)||(11307-11414)
scaffold0120 (56-100)||(25242-25286)
[»] scaffold0324 (1 HSPs)
scaffold0324 (16-224)||(1929-2137)
[»] scaffold0122 (1 HSPs)
scaffold0122 (15-215)||(40662-40862)
[»] scaffold0001 (3 HSPs)
scaffold0001 (14-206)||(441611-441803)
scaffold0001 (14-206)||(495978-496170)
scaffold0001 (19-206)||(514512-514699)
[»] scaffold0084 (1 HSPs)
scaffold0084 (14-224)||(8163-8373)
[»] scaffold0077 (1 HSPs)
scaffold0077 (14-224)||(57768-57978)
[»] scaffold0075 (1 HSPs)
scaffold0075 (16-206)||(55626-55816)
[»] scaffold0006 (1 HSPs)
scaffold0006 (22-224)||(104167-104369)
[»] scaffold0412 (1 HSPs)
scaffold0412 (16-175)||(15735-15894)
[»] scaffold0040 (2 HSPs)
scaffold0040 (16-215)||(111063-111262)
scaffold0040 (31-224)||(17818-18011)
[»] scaffold0018 (2 HSPs)
scaffold0018 (15-206)||(9506-9697)
scaffold0018 (17-215)||(23455-23653)
[»] scaffold0243 (2 HSPs)
scaffold0243 (23-224)||(24108-24309)
scaffold0243 (21-206)||(9933-10118)
[»] scaffold1423 (1 HSPs)
scaffold1423 (17-224)||(535-742)
[»] scaffold0423 (1 HSPs)
scaffold0423 (14-224)||(2417-2627)
[»] scaffold0074 (2 HSPs)
scaffold0074 (14-224)||(6053-6263)
scaffold0074 (19-206)||(15081-15268)
[»] scaffold0007 (1 HSPs)
scaffold0007 (16-178)||(48651-48813)
[»] scaffold0305 (1 HSPs)
scaffold0305 (14-167)||(2861-3014)
[»] scaffold0403 (1 HSPs)
scaffold0403 (14-202)||(14873-15061)
[»] scaffold0207 (1 HSPs)
scaffold0207 (16-224)||(7895-8103)
[»] scaffold0278 (1 HSPs)
scaffold0278 (16-191)||(3524-3699)
[»] scaffold0270 (2 HSPs)
scaffold0270 (14-224)||(6813-7023)
scaffold0270 (14-224)||(13943-14153)
[»] scaffold0282 (1 HSPs)
scaffold0282 (14-206)||(13633-13825)
[»] scaffold0411 (1 HSPs)
scaffold0411 (14-224)||(8350-8560)
[»] scaffold0342 (1 HSPs)
scaffold0342 (14-206)||(14420-14612)
[»] scaffold0540 (1 HSPs)
scaffold0540 (14-224)||(11034-11244)
[»] scaffold0012 (1 HSPs)
scaffold0012 (14-224)||(216574-216784)
[»] scaffold0529 (1 HSPs)
scaffold0529 (18-206)||(5046-5234)
[»] scaffold0358 (1 HSPs)
scaffold0358 (14-224)||(8890-9097)
[»] scaffold0218 (1 HSPs)
scaffold0218 (14-224)||(24866-25076)
[»] scaffold0293 (1 HSPs)
scaffold0293 (14-224)||(15362-15560)
[»] scaffold0575 (1 HSPs)
scaffold0575 (55-203)||(4544-4692)
[»] scaffold0114 (2 HSPs)
scaffold0114 (14-224)||(17503-17713)
scaffold0114 (34-215)||(40007-40188)
[»] scaffold0165 (1 HSPs)
scaffold0165 (18-216)||(11908-12106)
[»] scaffold0104 (1 HSPs)
scaffold0104 (18-226)||(43577-43785)
[»] scaffold0192 (1 HSPs)
scaffold0192 (19-226)||(29465-29672)
[»] scaffold0041 (1 HSPs)
scaffold0041 (19-206)||(41693-41880)
[»] scaffold0029 (2 HSPs)
scaffold0029 (19-206)||(94053-94240)
scaffold0029 (37-216)||(115510-115689)
[»] scaffold0335 (1 HSPs)
scaffold0335 (18-216)||(4462-4660)
[»] scaffold0020 (2 HSPs)
scaffold0020 (56-226)||(175926-176096)
scaffold0020 (39-206)||(98762-98929)
[»] scaffold0865 (1 HSPs)
scaffold0865 (19-226)||(1431-1638)
[»] scaffold0133 (1 HSPs)
scaffold0133 (19-226)||(28444-28651)
[»] scaffold0108 (1 HSPs)
scaffold0108 (18-206)||(50063-50251)
[»] scaffold0046 (2 HSPs)
scaffold0046 (64-216)||(60687-60839)
scaffold0046 (18-193)||(70079-70254)
[»] scaffold1288 (1 HSPs)
scaffold1288 (19-206)||(14-201)
[»] scaffold0501 (2 HSPs)
scaffold0501 (149-216)||(12611-12678)
scaffold0501 (16-87)||(1-72)
[»] scaffold0309 (1 HSPs)
scaffold0309 (56-215)||(12676-12835)
[»] scaffold0118 (1 HSPs)
scaffold0118 (19-206)||(419-606)
[»] scaffold0067 (4 HSPs)
scaffold0067 (19-206)||(29582-29769)
scaffold0067 (37-215)||(64779-64957)
scaffold0067 (37-215)||(49357-49535)
scaffold0067 (37-215)||(58391-58569)
[»] scaffold1056 (1 HSPs)
scaffold1056 (18-204)||(1681-1867)
[»] scaffold0507 (1 HSPs)
scaffold0507 (14-120)||(11072-11178)
[»] scaffold0148 (1 HSPs)
scaffold0148 (18-204)||(1959-2145)
[»] scaffold0068 (1 HSPs)
scaffold0068 (19-216)||(67267-67464)
[»] scaffold0035 (2 HSPs)
scaffold0035 (18-204)||(41266-41452)
scaffold0035 (37-206)||(5763-5932)
[»] scaffold0203 (1 HSPs)
scaffold0203 (21-206)||(1015-1200)
[»] scaffold0009 (2 HSPs)
scaffold0009 (37-226)||(251560-251749)
scaffold0009 (14-101)||(230006-230093)
[»] scaffold0004 (2 HSPs)
scaffold0004 (19-216)||(200627-200824)
scaffold0004 (21-206)||(325665-325850)
[»] scaffold0405 (1 HSPs)
scaffold0405 (18-206)||(5560-5748)
[»] scaffold1530 (1 HSPs)
scaffold1530 (23-206)||(541-724)
[»] scaffold0708 (1 HSPs)
scaffold0708 (19-206)||(5304-5491)
[»] scaffold0443 (1 HSPs)
scaffold0443 (19-206)||(11767-11954)
[»] scaffold0053 (1 HSPs)
scaffold0053 (37-215)||(65475-65653)
[»] scaffold0005 (1 HSPs)
scaffold0005 (34-216)||(263174-263356)
[»] scaffold0054 (1 HSPs)
scaffold0054 (18-216)||(63677-63875)
[»] scaffold0664 (1 HSPs)
scaffold0664 (21-206)||(6996-7181)
[»] scaffold0585 (1 HSPs)
scaffold0585 (19-204)||(4248-4433)
[»] scaffold0523 (1 HSPs)
scaffold0523 (37-226)||(2809-2998)
[»] scaffold0420 (1 HSPs)
scaffold0420 (21-206)||(8572-8757)
[»] scaffold0088 (1 HSPs)
scaffold0088 (19-192)||(29906-30079)
[»] scaffold0751 (1 HSPs)
scaffold0751 (18-206)||(5139-5327)
[»] scaffold1032 (1 HSPs)
scaffold1032 (39-206)||(994-1161)
[»] scaffold0765 (1 HSPs)
scaffold0765 (56-206)||(6453-6603)
[»] scaffold0706 (1 HSPs)
scaffold0706 (21-206)||(5370-5555)
[»] scaffold0235 (2 HSPs)
scaffold0235 (21-206)||(8623-8808)
scaffold0235 (21-206)||(18837-19022)
[»] scaffold0222 (3 HSPs)
scaffold0222 (37-206)||(20772-20941)
scaffold0222 (145-215)||(772-842)
scaffold0222 (19-95)||(646-722)
[»] scaffold0167 (1 HSPs)
scaffold0167 (37-206)||(1078-1247)
[»] scaffold0072 (1 HSPs)
scaffold0072 (21-206)||(54005-54190)
[»] scaffold0034 (2 HSPs)
scaffold0034 (37-206)||(2129-2298)
scaffold0034 (19-215)||(70321-70517)
[»] scaffold0239 (1 HSPs)
scaffold0239 (37-216)||(9963-10142)
[»] scaffold0156 (1 HSPs)
scaffold0156 (39-206)||(36897-37064)
[»] scaffold0117 (1 HSPs)
scaffold0117 (145-224)||(3455-3534)
[»] scaffold0019 (1 HSPs)
scaffold0019 (14-105)||(171177-171268)
[»] scaffold0261 (2 HSPs)
scaffold0261 (56-206)||(20724-20874)
scaffold0261 (56-206)||(12544-12694)
[»] scaffold0031 (1 HSPs)
scaffold0031 (56-206)||(110568-110718)
[»] scaffold1433 (1 HSPs)
scaffold1433 (37-206)||(1488-1657)
[»] scaffold0404 (1 HSPs)
scaffold0404 (37-206)||(7702-7871)
[»] scaffold0076 (2 HSPs)
scaffold0076 (145-226)||(53708-53789)
scaffold0076 (37-101)||(53600-53664)
[»] scaffold0090 (1 HSPs)
scaffold0090 (145-216)||(21799-21870)
[»] scaffold0100 (2 HSPs)
scaffold0100 (88-206)||(21413-21531)
scaffold0100 (18-91)||(16767-16840)
[»] scaffold0056 (1 HSPs)
scaffold0056 (37-206)||(1060-1229)
[»] scaffold0509 (1 HSPs)
scaffold0509 (19-216)||(11778-11973)
[»] scaffold0413 (2 HSPs)
scaffold0413 (143-224)||(3541-3622)
scaffold0413 (23-70)||(3636-3683)
[»] scaffold0348 (2 HSPs)
scaffold0348 (19-215)||(17643-17839)
scaffold0348 (37-206)||(5026-5195)
[»] scaffold0298 (1 HSPs)
scaffold0298 (21-206)||(9388-9573)
[»] scaffold0310 (1 HSPs)
scaffold0310 (19-216)||(10925-11122)
[»] scaffold0206 (1 HSPs)
scaffold0206 (145-215)||(26061-26131)
[»] scaffold0190 (1 HSPs)
scaffold0190 (19-216)||(30485-30682)
[»] scaffold0049 (1 HSPs)
scaffold0049 (71-216)||(49088-49233)
[»] scaffold1373 (1 HSPs)
scaffold1373 (37-216)||(11-190)
[»] scaffold0198 (1 HSPs)
scaffold0198 (16-80)||(30371-30435)
[»] scaffold0106 (1 HSPs)
scaffold0106 (19-194)||(34307-34482)
[»] scaffold0058 (1 HSPs)
scaffold0058 (19-206)||(22080-22267)
[»] scaffold0789 (1 HSPs)
scaffold0789 (14-101)||(1-88)
[»] scaffold0367 (1 HSPs)
scaffold0367 (21-111)||(9182-9272)
[»] scaffold1299 (1 HSPs)
scaffold1299 (37-113)||(2025-2101)


Alignment Details
Target: chr8 (Bit Score: 171; Significance: 6e-92; HSPs: 37)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 171; E-Value: 6e-92
Query Start/End: Original strand, 14 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 22031290 - 22031080
Alignment:
Q  14 cagagaatgaggatcgattgattagaggtacatgttattttgatagtacacctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgcttt 113  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||| || ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22031290 cagagaatgaggatcgtttgatcagaggtacttgttatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgcttt 22031191  T
Q  114 cgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcagtgactacttctctcgtatgt 213  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  22031190 cgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccaactaagggttcggtgactacttctctcgtatgt 22031091  T
Q  214 ttgtgatgtcc 224  Q
    ||| |||||||    
T  22031090 ttgcgatgtcc 22031080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 163; E-Value: 3e-87
Query Start/End: Original strand, 14 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 18859764 - 18859562
Alignment:
Q  14 cagagaatgaggatcgattgattagaggtacatgttattttgatagtacacctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgcttt 113  Q
    ||||||| |||||||| ||||| |||||||| || ||| || ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18859764 cagagaacgaggatcgcttgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgcttt 18859665  T
Q  114 cgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcagtgactacttctctcgtatgt 213  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  18859664 cgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgt 18859565  T
Q  214 ttg 216  Q
    |||    
T  18859564 ttg 18859562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 163; E-Value: 3e-87
Query Start/End: Original strand, 14 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 19115587 - 19115385
Alignment:
Q  14 cagagaatgaggatcgattgattagaggtacatgttattttgatagtacacctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgcttt 113  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||||| || ||| || ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  19115587 cagagaatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgcttt 19115488  T
Q  114 cgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcagtgactacttctctcgtatgt 213  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19115487 cgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcaaaactccagctaagggttcagtgactacttctctcgtatgt 19115388  T
Q  214 ttg 216  Q
    |||    
T  19115387 ttg 19115385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 163; E-Value: 3e-87
Query Start/End: Original strand, 14 - 216
Target Start/End: Original strand, 20015857 - 20016059
Alignment:
Q  14 cagagaatgaggatcgattgattagaggtacatgttattttgatagtacacctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgcttt 113  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||||| || ||| || ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  20015857 cagagaatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgcttt 20015956  T
Q  114 cgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcagtgactacttctctcgtatgt 213  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  20015957 cgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgt 20016056  T
Q  214 ttg 216  Q
    |||    
T  20016057 ttg 20016059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 163; E-Value: 3e-87
Query Start/End: Original strand, 14 - 224
Target Start/End: Original strand, 30310738 - 30310948
Alignment:
Q  14 cagagaatgaggatcgattgattagaggtacatgttattttgatagtacacctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgcttt 113  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||||| || ||| || ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  30310738 cagagaatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacacattgctttattgcttt 30310837  T
Q  114 cgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcagtgactacttctctcgtatgt 213  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  30310838 cgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgagactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgt 30310937  T
Q  214 ttgtgatgtcc 224  Q
    ||| |||||||    
T  30310938 ttgcgatgtcc 30310948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 163; E-Value: 3e-87
Query Start/End: Original strand, 14 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 32603332 - 32603122
Alignment:
Q  14 cagagaatgaggatcgattgattagaggtacatgttattttgatagtacacctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgcttt 113  Q
    |||||| ||||||||| ||||| |||||||| || ||| || ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  32603332 cagagactgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgcttt 32603233  T
Q  114 cgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcagtgactacttctctcgtatgt 213  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  32603232 cgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgt 32603133  T
Q  214 ttgtgatgtcc 224  Q
    ||| |||||||    
T  32603132 ttgcgatgtcc 32603122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 159; E-Value: 8e-85
Query Start/End: Original strand, 14 - 216
Target Start/End: Original strand, 17671616 - 17671818
Alignment:
Q  14 cagagaatgaggatcgattgattagaggtacatgttattttgatagtacacctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgcttt 113  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||||| || ||| || ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  17671616 cagagaatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgcttt 17671715  T
Q  114 cgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcagtgactacttctctcgtatgt 213  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  17671716 cgattgtgtttctgctttgggtcttgttttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgt 17671815  T
Q  214 ttg 216  Q
    |||    
T  17671816 ttg 17671818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 159; E-Value: 8e-85
Query Start/End: Original strand, 14 - 216
Target Start/End: Original strand, 22126553 - 22126755
Alignment:
Q  14 cagagaatgaggatcgattgattagaggtacatgttattttgatagtacacctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgcttt 113  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||||| || ||| || ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  22126553 cagagaatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgcttt 22126652  T
Q  114 cgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcagtgactacttctctcgtatgt 213  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  22126653 cgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgattacttctctcgtatgt 22126752  T
Q  214 ttg 216  Q
    |||    
T  22126753 ttg 22126755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 16 - 224
Target Start/End: Original strand, 21164134 - 21164342
Alignment:
Q  16 gagaatgaggatcgattgattagaggtacatgttattttgatagtacacctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcg 115  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||  ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||     
T  21164134 gagaatgaggatcgcttgatcagaggtacatgttatattgatcatactcctttagttgctattattgatactgatgctacgcattgttttattgctttca 21164233  T
Q  116 attgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcagtgactacttctctcgtatgttt 215  Q
    |||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21164234 attgtgcttcttctttgggtcttgttttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcagtgactacttctctcgtatgttt 21164333  T
Q  216 gtgatgtcc 224  Q
    | |||||||    
T  21164334 gagatgtcc 21164342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 155; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 14 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 22043014 - 22042804
Alignment:
Q  14 cagagaatgaggatcgattgattagaggtacatgttattttgatagtacacctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgcttt 113  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||||| || ||| || ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  22043014 cagagaatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttatttcttt 22042915  T
Q  114 cgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcagtgactacttctctcgtatgt 213  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  22042914 tgattgtgtttctgctttgggtcttgatttttctgatatgattggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgt 22042815  T
Q  214 ttgtgatgtcc 224  Q
    ||| |||||||    
T  22042814 ttgcgatgtcc 22042804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 155; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 14 - 216
Target Start/End: Original strand, 22117769 - 22117971
Alignment:
Q  14 cagagaatgaggatcgattgattagaggtacatgttattttgatagtacacctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgcttt 113  Q
    |||||||||||||||  ||||| |||||||| || ||| || ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  22117769 cagagaatgaggatcatttgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgcttt 22117868  T
Q  114 cgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcagtgactacttctctcgtatgt 213  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  22117869 cgatcgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgt 22117968  T
Q  214 ttg 216  Q
    |||    
T  22117969 ttg 22117971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 153; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 16 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 19981152 - 19980952
Alignment:
Q  16 gagaatgaggatcgattgattagaggtacatgttattttgatagtacacctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcg 115  Q
    ||||||||||||||  |||| ||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  19981152 gagaatgaggatcggctgatcagaggtacatgttatattgataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcg 19981053  T
Q  116 attgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcagtgactacttctctcgtatgttt 215  Q
    |||||| |||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  19981052 attgtgcttctactttgggtcttgttatgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgttt 19980953  T
Q  216 g 216  Q
    |    
T  19980952 g 19980952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 151; E-Value: 5e-80
Query Start/End: Original strand, 14 - 216
Target Start/End: Original strand, 19481666 - 19481868
Alignment:
Q  14 cagagaatgaggatcgattgattagaggtacatgttattttgatagtacacctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgcttt 113  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||||| || ||| || ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19481666 cagagaatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgcttt 19481765  T
Q  114 cgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcagtgactacttctctcgtatgt 213  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||    
T  19481766 cgattgtgtttctgctttgggtcttgagttgtctgatatgaacggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgcttacttctctcgtatgt 19481865  T
Q  214 ttg 216  Q
    |||    
T  19481866 ttg 19481868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 14 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 15536570 - 15536369
Alignment:
Q  14 cagagaatgaggatcgattgattagaggtacatgttattttgatagtacacctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgcttt 113  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||||| || ||| || ||  ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15536570 cagagaatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattaatgatactccgttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgcttt 15536471  T
Q  114 cgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcagtgactacttctctcgtatgt 213  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  15536470 cgattatgtttctgccttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgt 15536371  T
Q  214 tt 215  Q
    ||    
T  15536370 tt 15536369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 148; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 17 - 224
Target Start/End: Original strand, 22129214 - 22129421
Alignment:
Q  17 agaatgaggatcgattgattagaggtacatgttattttgatagtacacctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcga 116  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||||| || ||  || ||| |||  ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  22129214 agaatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctagattaataatactgctttagttgctattattgatactggtgttacacattgctttattgctttcga 22129313  T
Q  117 ttgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcagtgactacttctctcgtatgtttg 216  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  22129314 ttgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggacagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttg 22129413  T
Q  217 tgatgtcc 224  Q
     |||||||    
T  22129414 cgatgtcc 22129421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 123; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 14 - 224
Target Start/End: Original strand, 22421486 - 22421696
Alignment:
Q  14 cagagaatgaggatcgattgattagaggtacatgttattttgatagtacacctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgcttt 113  Q
    ||||||| |||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |    
T  22421486 cagagaacgaggatcgtttgatcagaggtacttgttattttgatagtacacctttagctgctattattgatactggtgctacacattgttttattgctat 22421585  T
Q  114 cgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcagtgactacttctctcgtatgt 213  Q
     ||||||| ||||   |||||||||| | ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||    
T  22421586 tgattgtgcttctaagttgggtcttgctatgtcaaatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctcttgtgtgt 22421685  T
Q  214 ttgtgatgtcc 224  Q
    ||  |||||||    
T  22421686 ttaagatgtcc 22421696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 119; E-Value: 6e-61
Query Start/End: Original strand, 14 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 22990232 - 22990022
Alignment:
Q  14 cagagaatgaggatcgattgattagaggtacatgttattttgatagtacacctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgcttt 113  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||| ||||||||| |    
T  22990232 cagagaatgaggatcgtttgatcagaggtacatgttattttgacagtacacctttagttgctattattgatactagtgctaaacattgttttattgctat 22990133  T
Q  114 cgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcagtgactacttctctcgtatgt 213  Q
     ||||||| |||    |||||||||| | ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  22990132 tgattgtgcttcaaagttgggtcttgctatgtcaaatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagcgaagggttcggtgactacttctcttgtatgt 22990033  T
Q  214 ttgtgatgtcc 224  Q
    ||  |||||||    
T  22990032 ttaagatgtcc 22990022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 40 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 22523707 - 22523532
Alignment:
Q  40 ggtacatgttattttgatagtacacctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttg 139  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| | ||||||| ||||   ||||||||||    
T  22523707 ggtacatgttattttgatagtacacctttagttgctattattgatactggtgctacacattgttttattgctattgattgtgcttctaagttgggtcttg 22523608  T
Q  140 atttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcagtgactacttctctcgtatgttt 215  Q
     | ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||    
T  22523607 ctatgtcaaatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctcttgtgtgttt 22523532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 115; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 14 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 21254132 - 21253922
Alignment:
Q  14 cagagaatgaggatcgattgattagaggtacatgttattttgatagtacacctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgcttt 113  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||||| || ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||     
T  21254132 cagagaatgaggatcgcttgatcagaggtacttgctatattgataatacacctttagttgctattattgatactggtgctacgcattattttattgctta 21254033  T
Q  114 cgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcagtgactacttctctcgtatgt 213  Q
     ||||||| | ||   ||||||||||   ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||    
T  21254032 tgattgtgctactaagttgggtcttgtcatgtctgatatgaatggagaaatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctcttgtgtgt 21253933  T
Q  214 ttgtgatgtcc 224  Q
    ||  |||||||    
T  21253932 ttaagatgtcc 21253922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 109; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 14 - 206
Target Start/End: Original strand, 22245609 - 22245801
Alignment:
Q  14 cagagaatgaggatcgattgattagaggtacatgttattttgatagtacacctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgcttt 113  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||| ||| | ||||||| ||||| ||||||||| |    
T  22245609 cagagaatgaggatcgtttgattagaggtacatgttattttgatagtacacctttaatttatattattcatattagtgctacacattgttttattgctat 22245708  T
Q  114 cgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcagtgactacttctct 206  Q
     ||||||| ||||   |||||||||| | ||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  22245709 tgattgtgcttctaagttgggtcttgctatgtcgaatatgaatggatagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctct 22245801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 109; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 14 - 206
Target Start/End: Original strand, 22246027 - 22246219
Alignment:
Q  14 cagagaatgaggatcgattgattagaggtacatgttattttgatagtacacctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgcttt 113  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||| ||| | ||||||| ||||| ||||||||| |    
T  22246027 cagagaatgaggatcgtttgattagaggtacatgttattttgatagtacacctttaatttatattattcatattagtgctacacattgttttattgctat 22246126  T
Q  114 cgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcagtgactacttctct 206  Q
     ||||||| ||||   |||||||||| | ||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  22246127 tgattgtgcttctaagttgggtcttgctatgtcgaatatgaatggatagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctct 22246219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 14 - 224
Target Start/End: Original strand, 21391455 - 21391665
Alignment:
Q  14 cagagaatgaggatcgattgattagaggtacatgttattttgatagtacacctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgcttt 113  Q
    ||||||| |||||||| ||||| |||||||| || ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||     
T  21391455 cagagaacgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattgataatacacctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttatttctta 21391554  T
Q  114 cgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcagtgactacttctctcgtatgt 213  Q
     ||||||| | ||   ||||||||||   ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| || |||    
T  21391555 tgattgtgctactaagttgggtcttgtcatgtctgatatgaatggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcggtgaccacttctcttgtgtgt 21391654  T
Q  214 ttgtgatgtcc 224  Q
    ||  |||||||    
T  21391655 ttaagatgtcc 21391665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 14 - 224
Target Start/End: Original strand, 21780781 - 21780991
Alignment:
Q  14 cagagaatgaggatcgattgattagaggtacatgttattttgatagtacacctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgcttt 113  Q
    ||||||| |||||||| ||||| |||||||| || ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||     
T  21780781 cagagaacgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattgataatacacctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttatttctta 21780880  T
Q  114 cgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcagtgactacttctctcgtatgt 213  Q
     ||||||| | ||   ||||||||||   ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| || |||    
T  21780881 tgattgtgctactaagttgggtcttgtcatgtctgatatgaatggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcggtgaccacttctcttgtgtgt 21780980  T
Q  214 ttgtgatgtcc 224  Q
    ||  |||||||    
T  21780981 ttaagatgtcc 21780991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 99; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 31 - 205
Target Start/End: Original strand, 22375065 - 22375239
Alignment:
Q  31 ttgattagaggtacatgttattttgatagtacacctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctt 130  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| | | ||||||| ||||   |    
T  22375065 ttgattagaggtacatgttactttgatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctacacattgttttattgatattgattgtgcttctaagt 22375164  T
Q  131 tgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcagtgactacttctc 205  Q
    ||||||||| | ||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  22375165 tgggtcttgctatgtcgaatatgaatggagagatggtcgtcgaaactccaactaagggttcggtgactacttctc 22375239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 64 - 224
Target Start/End: Original strand, 21785999 - 21786159
Alignment:
Q  64 cctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagaga 163  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||  ||||||| | ||   ||||||||||   ||||||||||||||||||| |    
T  21785999 cctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttatttcttatgattgtgctactaagttgggtcttgtcatgtctgatatgaatggagaaa 21786098  T
Q  164 tggttgtcgaaactccagctaagggttcagtgactacttctctcgtatgtttgtgatgtcc 224  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| || |||||  |||||||    
T  21786099 tggttgttgaaactccagctaagggttcggtgaccacttctcttgtgtgtttaagatgtcc 21786159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 19 - 206
Target Start/End: Original strand, 16268823 - 16269010
Alignment:
Q  19 aatgaggatcgattgattagaggtacatgttattttgatagtacacctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgatt 118  Q
    |||||||| ||| | || |||||||| ||||  ||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| | || |    
T  16268823 aatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgctattgaat 16268922  T
Q  119 gtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcagtgactacttctct 206  Q
    |||  | |   |||||| | ||| | ||||||||||| || || |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  16268923 gtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctct 16269010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 37 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 21928592 - 21928413
Alignment:
Q  37 agaggtacatgttattttgatagtacacctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtc 136  Q
    |||||||| ||||  ||| ||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||| || |||||| | |||||||  | |   |||||||    
T  21928592 agaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgggtc 21928493  T
Q  137 ttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcagtgactacttctctcgtatgtttg 216  Q
    | | | | |||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||    
T  21928492 tggttatatctgatatgaatggcgaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtttg 21928413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 19 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 22374051 - 22373844
Alignment:
Q  19 aatgaggatcgattgattagaggtacatgttattttgatagtacacctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgatt 118  Q
    |||||||| ||| | || |||||||| ||||  ||| ||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||| ||| | || |||| | | ||||    
T  22374051 aatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcatagtttcattgatgttgatt 22373952  T
Q  119 gtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcagtgactacttctctcgtatgtttgtg 218  Q
    |||  | |   |||||||| | | | ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||| |    
T  22373951 gtgcatataagttgggtctagttatatctgatatgaatggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtttgag 22373852  T
Q  219 atgtccat 226  Q
     |||||||    
T  22373851 ttgtccat 22373844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 19 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 28984093 - 28983906
Alignment:
Q  19 aatgaggatcgattgattagaggtacatgttattttgatagtacacctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgatt 118  Q
    |||||||| ||| | || |||||||| ||||  ||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||| | || |    
T  28984093 aatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcactgttttattgctattgaat 28983994  T
Q  119 gtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcagtgactacttctct 206  Q
    ||| || |   |||||| | ||| | ||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  28983993 gtgcttataagttgggtttggatatatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctct 28983906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 37 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 19985344 - 19985155
Alignment:
Q  37 agaggtacatgttattttgatagtacacctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtc 136  Q
    |||||||| ||||  ||| ||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||| || |||| | | |||||||  | |   ||||||     
T  19985344 agaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgttgttgattgtgcatataagttgggtt 19985245  T
Q  137 ttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcagtgactacttctctcgtatgtttgtgatgtccat 226  Q
    | | | | ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||| | |||||||    
T  19985244 tggttatatctgatatgaatggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtttgagttgtccat 19985155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 19 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 28989312 - 28989125
Alignment:
Q  19 aatgaggatcgattgattagaggtacatgttattttgatagtacacctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgatt 118  Q
    |||||||| ||| | || |||||||| ||||  ||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||| | || |    
T  28989312 aatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcactgttttattgctattgaat 28989213  T
Q  119 gtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcagtgactacttctct 206  Q
    ||| || |   |||||| | ||| | ||||||||||| ||||| |||||||| || |||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  28989212 gtgcttataagttgggtttggatatatctgatatgaaaggagaaatggttgttgatactccagctaagggttcagtaaccacttctct 28989125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 19 - 206
Target Start/End: Original strand, 29301025 - 29301212
Alignment:
Q  19 aatgaggatcgattgattagaggtacatgttattttgatagtacacctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgatt 118  Q
    |||||||| ||| | || |||||||| ||||  ||| ||||||| |||||| |||||||||| || ||||||||||||||||| || |||||||| || |    
T  29301025 aatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtgctacgcattgtttcattgctttagaat 29301124  T
Q  119 gtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcagtgactacttctct 206  Q
    |||  | |   ||||||||   | | ||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  29301125 gtgcatataagttgggtctgcttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctct 29301212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 19 - 226
Target Start/End: Original strand, 31414131 - 31414338
Alignment:
Q  19 aatgaggatcgattgattagaggtacatgttattttgatagtacacctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgatt 118  Q
    |||||||| ||| | || |||||||| ||||  ||| ||||||| |||||| |||||||||| |||| ||||||||| ||||| || ||||||   || |    
T  31414131 aatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatattggtgctactcattgtttcattgctaatgaat 31414230  T
Q  119 gtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcagtgactacttctctcgtatgtttgtg 218  Q
    ||| || |   |||||| | ||| | ||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || ||| |    
T  31414231 gtgcttataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctctagtttgcttgag 31414330  T
Q  219 atgtccat 226  Q
    ||||||||    
T  31414331 atgtccat 31414338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 19 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 20391268 - 20391071
Alignment:
Q  19 aatgaggatcgattgattagaggtacatgttattttgatagtacacctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgatt 118  Q
    |||||||| ||| | || |||||||| ||||  ||| ||||||| |||||| || |||||||||||||||||||||| ||||| || |||||| |  |||    
T  20391268 aatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaatttctattattgatactggtgctacacattgattcattgctgttaatt 20391169  T
Q  119 gtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcagtgactacttctctcgtatgtttg 216  Q
    |||  | |   |||||||| | | ||||   ||| | |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  20391168 gtgaatataagttgggtctggttatgtcaagtattagtggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctctcgtttgtttg 20391071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 19 - 215
Target Start/End: Original strand, 22027879 - 22028075
Alignment:
Q  19 aatgaggatcgattgattagaggtacatgttattttgatagtacacctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgatt 118  Q
    |||||||| ||| | || |||||||| ||||  ||| ||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||| || |||||| | || |    
T  22027879 aatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattgaat 22027978  T
Q  119 gtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcagtgactacttctctcgtatgttt 215  Q
    |||  | |   |||||| | | ||| ||| ||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| || |||||    
T  22027979 gtgcatataagttgggtttggttttatcttatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggtttagtaactacttctcttgtttgttt 22028075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 55; E-Value: 9e-23
Query Start/End: Original strand, 37 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 22054027 - 22053858
Alignment:
Q  37 agaggtacatgttattttgatagtacacctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtc 136  Q
    |||||||| ||||  ||| ||||||| |||||| |||||||||| || ||||||||||| ||||| || |||||||| ||  |||  | |   |||||||    
T  22054027 agaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtgctactcattgtttcattgctttagaaagtgcatataagttgggtc 22053928  T
Q  137 ttgatt-tgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcagtgactacttctct 206  Q
    | |||| | ||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  22053927 t-gattgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctct 22053858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 72 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 27357665 - 27357531
Alignment:
Q  72 tgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtc 171  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| | || ||||  | |   |||||| | ||| | ||||||||||| || || ||||||||     
T  27357665 tgctattattgatactggtgctactcattgttttattgctattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgtt 27357566  T
Q  172 gaaactccagctaagggttcagtgactacttctct 206  Q
    ||||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  27357565 gaaactccagctaagggttcagtaaccacttctct 27357531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017 (Bit Score: 167; Significance: 1e-89; HSPs: 3)
Name: scaffold0017
Description:

Target: scaffold0017; HSP #1
Raw Score: 167; E-Value: 1e-89
Query Start/End: Original strand, 14 - 224
Target Start/End: Original strand, 17220 - 17430
Alignment:
Q  14 cagagaatgaggatcgattgattagaggtacatgttattttgatagtacacctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgcttt 113  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||| || ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  17220 cagagaatgaggatcgcttgatcagaggtacttgttatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacacattgctttattgcttt 17319  T
Q  114 cgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcagtgactacttctctcgtatgt 213  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  17320 cgattgtgtttctactttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgt 17419  T
Q  214 ttgtgatgtcc 224  Q
    ||| |||||||    
T  17420 ttgagatgtcc 17430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017; HSP #2
Raw Score: 148; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 17 - 216
Target Start/End: Original strand, 194995 - 195194
Alignment:
Q  17 agaatgaggatcgattgattagaggtacatgttattttgatagtacacctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcga 116  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  194995 agaatgaggatcgcctgattagaggtacatgttatattgataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcga 195094  T
Q  117 ttgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcagtgactacttctctcgtatgtttg 216  Q
    ||||| |||| |||||||||||| | |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  195095 ttgtgcttctactttgggtcttgttatgtctgatatgattggagagatagttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttg 195194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017; HSP #3
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 18 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 24452 - 24258
Alignment:
Q  18 gaatgaggatcgattgattagaggtacatgttattttgatagtacacctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgat 117  Q
    |||||||||||   |||| |||||||||||||   || ||||||| || ||| || ||||||| |||||| | ||||| ||||| ||||||| | | |||    
T  24452 gaatgaggatcatctgataagaggtacatgtttcattaatagtactcccttaattactattatagatactagggctacacattgttttattgttgttgat 24353  T
Q  118 tgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcagtgactacttctctcgtatg 212  Q
    ||||||||    |||| ||||| | ||||  ||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  24352 tgtgtttcgaaattggatcttgttatgtcatatatgaatggagaaatggttgtcgaaaccccggctaagggttcagtgactacttctctagtatg 24258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 167; Significance: 1e-89; HSPs: 42)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 167; E-Value: 1e-89
Query Start/End: Original strand, 14 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 18782167 - 18781957
Alignment:
Q  14 cagagaatgaggatcgattgattagaggtacatgttattttgatagtacacctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgcttt 113  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||||| || ||| || ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18782167 cagagaatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgcttt 18782068  T
Q  114 cgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcagtgactacttctctcgtatgt 213  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  18782067 cgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgttgaaactccagctaagggttccgtgactacttctctcgtatgt 18781968  T
Q  214 ttgtgatgtcc 224  Q
    ||| |||||||    
T  18781967 ttgcgatgtcc 18781957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 163; E-Value: 3e-87
Query Start/End: Original strand, 14 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 41773895 - 41773693
Alignment:
Q  14 cagagaatgaggatcgattgattagaggtacatgttattttgatagtacacctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgcttt 113  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||||| || ||| || ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  41773895 cagagaatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgcttt 41773796  T
Q  114 cgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcagtgactacttctctcgtatgt 213  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  41773795 cgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgt 41773696  T
Q  214 ttg 216  Q
    |||    
T  41773695 ttg 41773693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 159; E-Value: 8e-85
Query Start/End: Original strand, 14 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 16359555 - 16359353
Alignment:
Q  14 cagagaatgaggatcgattgattagaggtacatgttattttgatagtacacctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgcttt 113  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||||| || ||| || ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  16359555 cagagaatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgcttt 16359456  T
Q  114 cgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcagtgactacttctctcgtatgt 213  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  16359455 cgattgtgtttctgctttgggtcttgttttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgt 16359356  T
Q  214 ttg 216  Q
    |||    
T  16359355 ttg 16359353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 159; E-Value: 8e-85
Query Start/End: Original strand, 14 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 27521459 - 27521257
Alignment:
Q  14 cagagaatgaggatcgattgattagaggtacatgttattttgatagtacacctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgcttt 113  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||||| || ||| || ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  27521459 cagagaatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgcttt 27521360  T
Q  114 cgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcagtgactacttctctcgtatgt 213  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  27521359 cgattgtgtttctgctttgggtcttggtttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgt 27521260  T
Q  214 ttg 216  Q
    |||    
T  27521259 ttg 27521257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 159; E-Value: 8e-85
Query Start/End: Original strand, 14 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 27613409 - 27613207
Alignment:
Q  14 cagagaatgaggatcgattgattagaggtacatgttattttgatagtacacctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgcttt 113  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||||| || ||| || ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  27613409 cagagaatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgcttt 27613310  T
Q  114 cgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcagtgactacttctctcgtatgt 213  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  27613309 cgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccggctaagggttcggtgactacttctctcgtatgt 27613210  T
Q  214 ttg 216  Q
    |||    
T  27613209 ttg 27613207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 159; E-Value: 8e-85
Query Start/End: Original strand, 14 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 34569547 - 34569345
Alignment:
Q  14 cagagaatgaggatcgattgattagaggtacatgttattttgatagtacacctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgcttt 113  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||||| || ||| || ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  34569547 cagagaatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgcttt 34569448  T
Q  114 cgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcagtgactacttctctcgtatgt 213  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  34569447 cgattgtgtttctgctttgggtcttgttttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgt 34569348  T
Q  214 ttg 216  Q
    |||    
T  34569347 ttg 34569345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 159; E-Value: 8e-85
Query Start/End: Original strand, 14 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 40711833 - 40711631
Alignment:
Q  14 cagagaatgaggatcgattgattagaggtacatgttattttgatagtacacctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgcttt 113  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||||| || ||| || ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  40711833 cagagaatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatcttaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgcttt 40711734  T
Q  114 cgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcagtgactacttctctcgtatgt 213  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  40711733 cgattgtgtttctgctttgggtcttgttttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgt 40711634  T
Q  214 ttg 216  Q
    |||    
T  40711633 ttg 40711631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 155; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 14 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 19773013 - 19772811
Alignment:
Q  14 cagagaatgaggatcgattgattagaggtacatgttattttgatagtacacctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgcttt 113  Q
    |||||||||||||||  ||||| |||||||| || ||| || ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  19773013 cagagaatgaggatcttttgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgcttt 19772914  T
Q  114 cgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcagtgactacttctctcgtatgt 213  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  19772913 cgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccggctaagggttcggtgactacttctctcgtatgt 19772814  T
Q  214 ttg 216  Q
    |||    
T  19772813 ttg 19772811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 155; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 14 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 22137721 - 22137519
Alignment:
Q  14 cagagaatgaggatcgattgattagaggtacatgttattttgatagtacacctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgcttt 113  Q
    ||||||| |||||||| ||||| |||||||| || ||| || ||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  22137721 cagagaacgaggatcgcttgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgataatggtgatacgcattgctttattgcttt 22137622  T
Q  114 cgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcagtgactacttctctcgtatgt 213  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  22137621 cgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgt 22137522  T
Q  214 ttg 216  Q
    |||    
T  22137521 ttg 22137519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 155; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 22 - 216
Target Start/End: Original strand, 22330228 - 22330422
Alignment:
Q  22 gaggatcgattgattagaggtacatgttattttgatagtacacctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtg 121  Q
    |||||||| ||||| |||||||| || ||| || ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  22330228 gaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtg 22330327  T
Q  122 tttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcagtgactacttctctcgtatgtttg 216  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  22330328 tttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttg 22330422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 155; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 14 - 216
Target Start/End: Original strand, 27682733 - 27682935
Alignment:
Q  14 cagagaatgaggatcgattgattagaggtacatgttattttgatagtacacctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgcttt 113  Q
    ||||||| |||||||| ||||| |||||||| || ||| || ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  27682733 cagagaacgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgcttt 27682832  T
Q  114 cgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcagtgactacttctctcgtatgt 213  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  27682833 cgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtttgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgt 27682932  T
Q  214 ttg 216  Q
    |||    
T  27682933 ttg 27682935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 155; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 14 - 216
Target Start/End: Original strand, 29473406 - 29473608
Alignment:
Q  14 cagagaatgaggatcgattgattagaggtacatgttattttgatagtacacctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgcttt 113  Q
    ||||||| |||||||| ||||| |||||||| || ||| || ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  29473406 cagagaacgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgcttt 29473505  T
Q  114 cgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcagtgactacttctctcgtatgt 213  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  29473506 cgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagaaatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgt 29473605  T
Q  214 ttg 216  Q
    |||    
T  29473606 ttg 29473608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 151; E-Value: 5e-80
Query Start/End: Original strand, 14 - 216
Target Start/End: Original strand, 27665823 - 27666025
Alignment:
Q  14 cagagaatgaggatcgattgattagaggtacatgttattttgatagtacacctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgcttt 113  Q
    |||||||||| ||||| ||||| |||||||| || ||| || ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  27665823 cagagaatgacgatcgtttgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgcttt 27665922  T
Q  114 cgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcagtgactacttctctcgtatgt 213  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  27665923 cgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccgactaagggttcggtgactacttctctcgtatgt 27666022  T
Q  214 ttg 216  Q
    |||    
T  27666023 ttg 27666025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 151; E-Value: 5e-80
Query Start/End: Original strand, 14 - 216
Target Start/End: Original strand, 37288829 - 37289031
Alignment:
Q  14 cagagaatgaggatcgattgattagaggtacatgttattttgatagtacacctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgcttt 113  Q
    ||||||| |||||||| ||||| |||||||| || ||| || ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  37288829 cagagaacgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacacattgttttattgcttt 37288928  T
Q  114 cgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcagtgactacttctctcgtatgt 213  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  37288929 cgattgtgtttctgctttgggtcttgatttttctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgt 37289028  T
Q  214 ttg 216  Q
    |||    
T  37289029 ttg 37289031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 16 - 216
Target Start/End: Original strand, 14997074 - 14997274
Alignment:
Q  16 gagaatgaggatcgattgattagaggtacatgttattttgatagtacacctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcg 115  Q
    ||||| |||||||| ||||| |||||||| || ||| || ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |    
T  14997074 gagaacgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacacattgttttattgcttttg 14997173  T
Q  116 attgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcagtgactacttctctcgtatgttt 215  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  14997174 attgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccggctaagggttcggtgactacttctctcgtatgttt 14997273  T
Q  216 g 216  Q
    |    
T  14997274 g 14997274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 16 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 22350970 - 22350770
Alignment:
Q  16 gagaatgaggatcgattgattagaggtacatgttattttgatagtacacctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcg 115  Q
    ||||| || ||||| ||||| |||||||| || ||| || ||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  22350970 gagaacgatgatcgcttgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactagtgctacgcattgctttattgctttcg 22350871  T
Q  116 attgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcagtgactacttctctcgtatgttt 215  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  22350870 attgtgtttctactttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttatctcgtatgttt 22350771  T
Q  216 g 216  Q
    |    
T  22350770 g 22350770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 144; E-Value: 7e-76
Query Start/End: Original strand, 17 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 21882824 - 21882617
Alignment:
Q  17 agaatgaggatcgattgattagaggtacatgttattttgatagtacacctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcga 116  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||||| || ||| || ||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  21882824 agaatgaggatcgcttgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttggtattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcga 21882725  T
Q  117 ttgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcagtgactacttctctcgtatgtttg 216  Q
    ||||| |||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  21882724 ttgtgcttctactttgggtcttgctatgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttg 21882625  T
Q  217 tgatgtcc 224  Q
     |||||||    
T  21882624 agatgtcc 21882617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 16 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 23461022 - 23460824
Alignment:
Q  16 gagaatgaggatcgattgattagaggtacatgttattttgatagtacacctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcg 115  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||| || | | || ||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||   |||||||||||||    
T  23461022 gagaatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctgtattaataatactcctttagttgctattattgatattggtgctacccatgtttttattgctttcg 23460923  T
Q  116 attgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcagtgactacttctctcgtatgtt 214  Q
    |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  23460922 attgtgcttctactttgggtcttgatttgtctgatatgaatgaagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtt 23460824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 126; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 91 - 224
Target Start/End: Original strand, 21342824 - 21342957
Alignment:
Q  91 gctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggtt 190  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21342824 gctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggtt 21342923  T
Q  191 cagtgactacttctctcgtatgtttgtgatgtcc 224  Q
    | |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  21342924 cggtgactacttctctcgtatgtttgcgatgtcc 21342957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 64 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 20803600 - 20803448
Alignment:
Q  64 cctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagaga 163  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||| |||    
T  20803600 cctttagttgctattattgatactagtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctactttgggtctcgctttgtctgatatgaatggaaaga 20803501  T
Q  164 tggttgtcgaaactccagctaagggttcagtgactacttctctcgtatgtttg 216  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  20803500 tggttgtcgaaactccagctaagggtttggtgactacttctctcgtatgtttg 20803448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 17 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 25429471 - 25429264
Alignment:
Q  17 agaatgaggatcgattgattagaggtacatgttattttgatagtacacctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcga 116  Q
    |||| |||||||| ||||| |||||||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||    
T  25429471 agaacgaggatcgcttgatcagaggtacttgttatattgataatacacctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgcttttga 25429372  T
Q  117 ttgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcagtgactacttctctcgtatgtttg 216  Q
    || || | ||   |||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||     
T  25429371 ttttgctactaagttgggtcttgttatgtttgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctcttgtgtgttta 25429272  T
Q  217 tgatgtcc 224  Q
     |||||||    
T  25429271 agatgtcc 25429264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 119; E-Value: 6e-61
Query Start/End: Original strand, 14 - 224
Target Start/End: Original strand, 26736060 - 26736270
Alignment:
Q  14 cagagaatgaggatcgattgattagaggtacatgttattttgatagtacacctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgcttt 113  Q
    ||||||| |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| || |    
T  26736060 cagagaacgaggatcgtttgatcagaggtacttgttattttgatagtacacctttagttgctattattgatactggtgctacacattgttttatttctat 26736159  T
Q  114 cgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcagtgactacttctctcgtatgt 213  Q
     ||||||| ||||   |||||||||| | ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||| ||||||    
T  26736160 tgattgtgcttctatgttgggtcttgctatgtcaaatatgaatggagagatggttgtcgaaactccaactaagggtttggtgactacttctcttgtatgt 26736259  T
Q  214 ttgtgatgtcc 224  Q
    ||  |||||||    
T  26736260 ttaagatgtcc 26736270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 117; E-Value: 9e-60
Query Start/End: Original strand, 14 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 23474248 - 23474056
Alignment:
Q  14 cagagaatgaggatcgattgattagaggtacatgttattttgatagtacacctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgcttt 113  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||| |    
T  23474248 cagaaaatgaggatcgattgattagaggtacatgttattttgattgtacacctttagttgctattattgataccggtgctacacattgttttattgctat 23474149  T
Q  114 cgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcagtgactacttctct 206  Q
     ||||||  ||||   |||||||| | | || |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  23474148 tgattgtacttctaagttgggtctggctatgacgaatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctct 23474056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 109; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 18 - 206
Target Start/End: Original strand, 21631736 - 21631924
Alignment:
Q  18 gaatgaggatcgattgattagaggtacatgttattttgatagtacacctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgat 117  Q
    ||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| | |||    
T  21631736 gaatgaggaccggttgattagaggtacatgttactttgatagtactcctttaattgctattattaatactggtgctacgcattgttttattgctgttgat 21631835  T
Q  118 tgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcagtgactacttctct 206  Q
    |||| ||||   |||||||||| | ||||  |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  21631836 tgtgcttctaagttgggtcttgttatgtcgaatatgaatggggaaatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctct 21631924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 16 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 23526102 - 23525952
Alignment:
Q  16 gagaatgaggatcgattgattagaggtacatgttattttgatagtacacctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcg 115  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||| || ||| || ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||    
T  23526102 gagaatgaggatcgcttgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgcaacacattgttttattgctttcg 23526003  T
Q  116 attgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatgg 166  Q
    |||||| |||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  23526002 attgtgcttctacgttgggtcttgatatgtctgatatgaatggagagatgg 23525952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 15 - 126
Target Start/End: Original strand, 21332320 - 21332431
Alignment:
Q  15 agagaatgaggatcgattgattagaggtacatgttattttgatagtacacctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttc 114  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |     
T  21332320 agagaatgaggatcgtttgatcagaggtacatgttattttgatagtacacctttagttgctattattgatactggtgctacacattgttttattgctatt 21332419  T
Q  115 gattgtgtttct 126  Q
    ||||||| ||||    
T  21332420 gattgtgcttct 21332431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 19 - 206
Target Start/End: Original strand, 14884329 - 14884516
Alignment:
Q  19 aatgaggatcgattgattagaggtacatgttattttgatagtacacctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgatt 118  Q
    |||||||| ||| | || |||||||| ||||  ||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| | || |    
T  14884329 aatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgctattgaat 14884428  T
Q  119 gtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcagtgactacttctct 206  Q
    |||  | |   |||||| | ||| ||||||||||||| || || |||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  14884429 gtgcatataagttgggtttagatgtgtctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctct 14884516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 19 - 226
Target Start/End: Original strand, 21983515 - 21983722
Alignment:
Q  19 aatgaggatcgattgattagaggtacatgttattttgatagtacacctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgatt 118  Q
    |||||||| ||| | || |||||||| ||||  ||| ||||||| |||||| || |||||||||||||||||||||| ||||| || |||||| | ||||    
T  21983515 aatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattactattattgatactggtgctacacattgtttcattgctgttgatt 21983614  T
Q  119 gtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcagtgactacttctctcgtatgtttgtg 218  Q
    |||  | |   |||||||| | | ||||   ||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| |    
T  21983615 gtgcatataagttgggtctggttatgtcaagtatgagtggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctctcgtttgtttgag 21983714  T
Q  219 atgtccat 226  Q
     |||||||    
T  21983715 ttgtccat 21983722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 19 - 226
Target Start/End: Original strand, 23078243 - 23078450
Alignment:
Q  19 aatgaggatcgattgattagaggtacatgttattttgatagtacacctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgatt 118  Q
    |||||||| ||| | || |||||||| ||||  ||| ||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||| || |||||  | || |    
T  23078243 aatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgcaattgaat 23078342  T
Q  119 gtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcagtgactacttctctcgtatgtttgtg 218  Q
    ||| || |   |||||| | ||| | ||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || ||| |    
T  23078343 gtgcttataagttgggtttggatgtatctgatatgaagggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctctagtttgcttgag 23078442  T
Q  219 atgtccat 226  Q
    ||||||||    
T  23078443 atgtccat 23078450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 62; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 19 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 20824483 - 20824287
Alignment:
Q  19 aatgaggatcgattgattagaggtacatgttattttgatagtacacctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgatt 118  Q
    |||||||||||| | || |||||||| ||||  ||| ||||||| |||||| |||||||||| || ||||||||||| ||||| || |||||||| || |    
T  20824483 aatgaggatcgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtgctacacattgtttcattgctttagagt 20824384  T
Q  119 gtgtttctgctttgggtcttgatt-tgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcagtgactacttctctcgtatgttt 215  Q
    |||  | |   |||||||| |||| | ||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| || |||||    
T  20824383 gtgcatataagttgggtct-gattatatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagccaagggttcagtaactacttctctggtgtgttt 20824287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 61; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 19 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 20778943 - 20778747
Alignment:
Q  19 aatgaggatcgattgattagaggtacatgttattttgatagtacacctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgatt 118  Q
    |||||||||||| | || |||||||| ||||  ||| ||||||| |||||| |||||||||| || ||||||||||| ||||| || |||||||| || |    
T  20778943 aatgaggatcgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtgctacacattgtttcattgctttagaat 20778844  T
Q  119 gtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcagtgactacttctctcgtatgttt 215  Q
    |||  | |   ||||| ||   | | ||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  20778843 gtgcatataagttgggcctaattgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagccaagggttcagtgactacttctcttgtgtgttt 20778747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 61; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 19 - 206
Target Start/End: Original strand, 28892280 - 28892467
Alignment:
Q  19 aatgaggatcgattgattagaggtacatgttattttgatagtacacctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgatt 118  Q
    |||||||||||| | || |||||||| ||||  ||| || |||| |||||| |||||||||| || ||||||||||||||||| || |||||||| || |    
T  28892280 aatgaggatcgacttatcagaggtacttgtttctttaatggtactcctttaattgctattatagacactggtgctacgcattgtttcattgctttagaat 28892379  T
Q  119 gtgtttctgctttgggtcttgatt-tgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcagtgactacttctct 206  Q
    |||  | |   |||||||| |||| | ||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  28892380 gtgcatataagttgggtct-gattgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagccaagggttcagtaactacttctct 28892467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 19 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 20345312 - 20345125
Alignment:
Q  19 aatgaggatcgattgattagaggtacatgttattttgatagtacacctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgatt 118  Q
    |||||||| ||| | || |||||||| ||||  ||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| | || |    
T  20345312 aatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgctattgaat 20345213  T
Q  119 gtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcagtgactacttctct 206  Q
    |||  | |   |||||| | ||| | ||||||||||| || || |||||||| ||||||||||||||||||||| | || ||||||||    
T  20345212 gtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcaataaccacttctct 20345125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 19 - 226
Target Start/End: Original strand, 21561363 - 21561570
Alignment:
Q  19 aatgaggatcgattgattagaggtacatgttattttgatagtacacctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgatt 118  Q
    |||||||| ||| | || |||||||| ||||  ||| |||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||| | ||||    
T  21561363 aatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtacttctttaattgctattattgatactggtgctacacattgtttcattgctgttgatt 21561462  T
Q  119 gtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcagtgactacttctctcgtatgtttgtg 218  Q
    |||  | |   || ||| | | | ||||   ||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| |    
T  21561463 gtgcatataagttaggtatggttatgtcaagtatgagtggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctctcgtttgtttgag 21561562  T
Q  219 atgtccat 226  Q
     |||||||    
T  21561563 ttgtccat 21561570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 39 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 22505689 - 22505522
Alignment:
Q  39 aggtacatgttattttgatagtacacctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtctt 138  Q
    |||||| ||||  ||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| | || |||| || |   |||||| |     
T  22505689 aggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgctattgaatgtgcttataagttgggtttg 22505590  T
Q  139 gatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcagtgactacttctct 206  Q
    ||| | ||| ||||||| || || |||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  22505589 gatgtatctaatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcaataactacttctct 22505522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 22 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 22464977 - 22464784
Alignment:
Q  22 gaggatcgattgattagaggtacatgttattttgatagtacacctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtg 121  Q
    ||||||||| | || |||||||| ||||  ||| ||||||| |||||| |||||||||| || ||||||||||||||||| || |||||||| || ||||    
T  22464977 gaggatcgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtgctacgcattgtttcattgctttagaatgtg 22464878  T
Q  122 tttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcagtgactacttctctcgtatgttt 215  Q
      | |   ||||| ||   | | ||||||||||| || || |||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| || |||||    
T  22464877 catataagttgggcctaattgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagccaagggttcagtaactacttctcttgtgtgttt 22464784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 37 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 25851084 - 25850915
Alignment:
Q  37 agaggtacatgttattttgatagtacacctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtc 136  Q
    |||||||| ||||  ||| ||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| | || ||||  | |   ||||||     
T  25851084 agaggtacttgtttctttaatagtactcatttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgctattgaatgtgcctataagttgggtt 25850985  T
Q  137 ttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcagtgactacttctct 206  Q
    | ||| | ||||||||||| || || |||||||| |||||||||||||| |||||||| || ||||||||    
T  25850984 tggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaaaggttcagtaaccacttctct 25850915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 19 - 206
Target Start/End: Original strand, 23563506 - 23563693
Alignment:
Q  19 aatgaggatcgattgattagaggtacatgttattttgatagtacacctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgatt 118  Q
    |||||||| ||| | || |||||||| ||||  ||| ||||||| |||||| ||| |||||| || ||||||||||| || || || |||||| | || |    
T  23563506 aatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgatattatagaaactggtgctactcaatgtttaattgctattgaat 23563605  T
Q  119 gtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcagtgactacttctct 206  Q
    |||  | |   |||||| | ||| | ||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  23563606 gtgcatataagttgggtatggatatatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctct 23563693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 14 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 21410187 - 21409989
Alignment:
Q  14 cagagaatgaggatcgattgattagaggtacatgttattttgatagtacacctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgcttt 113  Q
    ||||||||||||||||  |||| |||||||||||||   || ||||||| || ||| || |||| || ||||||||||||||  |||| |||||||||      
T  21410187 cagagaatgaggatcgtctgatcagaggtacatgtttcattaatagtactcccttaattactatcatagatactggtgctacatattgttttattgctgc 21410088  T
Q  114 cgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcagtgactacttctctcgtatg 212  Q
     |||||||||||    |||||||||| | ||||   ||| ||||| || |||||||||||||| || ||||||| ||| ||||||| |||||| |||||    
T  21410087 tgattgtgtttcgaaattgggtcttgttatgtcatctattaatggggaaatggttgtcgaaaccccggctaaggcttcggtgactagttctctagtatg 21409989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 39 - 206
Target Start/End: Original strand, 17266692 - 17266859
Alignment:
Q  39 aggtacatgttattttgatagtacacctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtctt 138  Q
    |||||| ||||  ||| ||||||| |||||| |||||||||| || ||||||||||| ||||| || |||||||| ||  |||  | |   |||||| ||    
T  17266692 aggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtgctactcattgtttcattgctttagaaagtgcatataggttgggt-tt 17266790  T
Q  139 gatt-tgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcagtgactacttctct 206  Q
    | || ||||| | ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17266791 gtttgtgtctaacatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtgactacttctct 17266859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 130 - 205
Target Start/End: Original strand, 21336743 - 21336818
Alignment:
Q  130 ttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcagtgactacttctc 205  Q
    |||||||||| | ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||    
T  21336743 ttgggtcttgctatgtcaaatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagttaagggtttggtgactacttctc 21336818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 163 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 20311754 - 20311705
Alignment:
Q  163 atggttgtcgaaactccagctaagggttcagtgactacttctctcgtatg 212  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  20311754 atggttgtcgaaaccccaactaagggttcggtgactacttctctagtatg 20311705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109 (Bit Score: 163; Significance: 3e-87; HSPs: 2)
Name: scaffold0109
Description:

Target: scaffold0109; HSP #1
Raw Score: 163; E-Value: 3e-87
Query Start/End: Original strand, 14 - 224
Target Start/End: Original strand, 13278 - 13488
Alignment:
Q  14 cagagaatgaggatcgattgattagaggtacatgttattttgatagtacacctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgcttt 113  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||||| || ||| || ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13278 cagagaatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgcttt 13377  T
Q  114 cgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcagtgactacttctctcgtatgt 213  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  13378 cgattgtgtttctggtttgggtcttgatttgtctgatatgaatgaagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgt 13477  T
Q  214 ttgtgatgtcc 224  Q
    ||| |||||||    
T  13478 ttgcgatgtcc 13488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109; HSP #2
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 16 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 41303 - 41103
Alignment:
Q  16 gagaatgaggatcgattgattagaggtacatgttattttgatagtacacctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcg 115  Q
    ||||| |||||||| ||||| |||||||| || ||| || ||| ||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |    
T  41303 gagaacgaggatcgcttgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgacactggggctacgcattgctttattgctttgg 41204  T
Q  116 attgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcagtgactacttctctcgtatgttt 215  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  41203 attatgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgttt 41104  T
Q  216 g 216  Q
    |    
T  41103 g 41103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 163; Significance: 3e-87; HSPs: 42)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 163; E-Value: 3e-87
Query Start/End: Original strand, 14 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 8710715 - 8710513
Alignment:
Q  14 cagagaatgaggatcgattgattagaggtacatgttattttgatagtacacctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgcttt 113  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||||| || ||| || ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  8710715 cagagaatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgcttt 8710616  T
Q  114 cgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcagtgactacttctctcgtatgt 213  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  8710615 cgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgt 8710516  T
Q  214 ttg 216  Q
    |||    
T  8710515 ttg 8710513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 163; E-Value: 3e-87
Query Start/End: Original strand, 14 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 14335506 - 14335304
Alignment:
Q  14 cagagaatgaggatcgattgattagaggtacatgttattttgatagtacacctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgcttt 113  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||||| || ||| || ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  14335506 cagagaatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgcttt 14335407  T
Q  114 cgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcagtgactacttctctcgtatgt 213  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  14335406 cgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgt 14335307  T
Q  214 ttg 216  Q
    |||    
T  14335306 ttg 14335304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 163; E-Value: 3e-87
Query Start/End: Original strand, 14 - 224
Target Start/End: Original strand, 17703615 - 17703825
Alignment:
Q  14 cagagaatgaggatcgattgattagaggtacatgttattttgatagtacacctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgcttt 113  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||| || ||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  17703615 cagagaatgaggatcgtttgatcagaggtacttgttatattaataatactcctttagttgctattattgatactagtgctacacattgctttattgcttt 17703714  T
Q  114 cgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcagtgactacttctctcgtatgt 213  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  17703715 cgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagttaagggttcggtgactacttctctcgtatgt 17703814  T
Q  214 ttgtgatgtcc 224  Q
    ||| |||||||    
T  17703815 ttgcgatgtcc 17703825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 159; E-Value: 8e-85
Query Start/End: Original strand, 14 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 9591474 - 9591264
Alignment:
Q  14 cagagaatgaggatcgattgattagaggtacatgttattttgatagtacacctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgcttt 113  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||||| || ||| || ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  9591474 cagagaatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacacattgctttattgcttt 9591375  T
Q  114 cgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcagtgactacttctctcgtatgt 213  Q
    | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  9591374 caattgtgtttctgcttcgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgt 9591275  T
Q  214 ttgtgatgtcc 224  Q
    ||| |||||||    
T  9591274 ttgagatgtcc 9591264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 159; E-Value: 8e-85
Query Start/End: Original strand, 14 - 216
Target Start/End: Original strand, 15158217 - 15158419
Alignment:
Q  14 cagagaatgaggatcgattgattagaggtacatgttattttgatagtacacctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgcttt 113  Q
    ||||||| |||||||| ||||| |||||||| || ||| || ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15158217 cagagaacgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgcttt 15158316  T
Q  114 cgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcagtgactacttctctcgtatgt 213  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  15158317 cgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccggctaagggttcggtgactacttctctcgtatgt 15158416  T
Q  214 ttg 216  Q
    |||    
T  15158417 ttg 15158419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 159; E-Value: 8e-85
Query Start/End: Original strand, 14 - 216
Target Start/End: Original strand, 18587331 - 18587533
Alignment:
Q  14 cagagaatgaggatcgattgattagaggtacatgttattttgatagtacacctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgcttt 113  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||||| || ||| || ||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  18587331 cagagaatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgttattattgatactggtgctacgcattgttttattgcttt 18587430  T
Q  114 cgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcagtgactacttctctcgtatgt 213  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  18587431 cgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgt 18587530  T
Q  214 ttg 216  Q
    |||    
T  18587531 ttg 18587533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 159; E-Value: 8e-85
Query Start/End: Original strand, 14 - 216
Target Start/End: Original strand, 44788511 - 44788713
Alignment:
Q  14 cagagaatgaggatcgattgattagaggtacatgttattttgatagtacacctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgcttt 113  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||||| || ||| || ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  44788511 cagagaatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgcttt 44788610  T
Q  114 cgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcagtgactacttctctcgtatgt 213  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  44788611 cgattgtgtttctgctttgggtcttgatttatctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgt 44788710  T
Q  214 ttg 216  Q
    |||    
T  44788711 ttg 44788713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 155; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 14 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 13689151 - 13688949
Alignment:
Q  14 cagagaatgaggatcgattgattagaggtacatgttattttgatagtacacctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgcttt 113  Q
    ||||||| |||||||| ||||| |||||||| || ||| || ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  13689151 cagagaacgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgcttt 13689052  T
Q  114 cgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcagtgactacttctctcgtatgt 213  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  13689051 cgattgtgtgtctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgt 13688952  T
Q  214 ttg 216  Q
    |||    
T  13688951 ttg 13688949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 151; E-Value: 5e-80
Query Start/End: Original strand, 14 - 216
Target Start/End: Original strand, 11234373 - 11234575
Alignment:
Q  14 cagagaatgaggatcgattgattagaggtacatgttattttgatagtacacctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgcttt 113  Q
    ||||||| |||||||| ||||| |||||||| || ||| || ||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  11234373 cagagaacgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattaatactggtgctacgcattgttttattgcttt 11234472  T
Q  114 cgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcagtgactacttctctcgtatgt 213  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  11234473 cgattgtgtttctgctttgggtcttgatttttctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgt 11234572  T
Q  214 ttg 216  Q
    |||    
T  11234573 ttg 11234575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 151; E-Value: 5e-80
Query Start/End: Original strand, 14 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 18180853 - 18180651
Alignment:
Q  14 cagagaatgaggatcgattgattagaggtacatgttattttgatagtacacctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgcttt 113  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||||| || ||| || ||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18180853 cagagaatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgttattattgatactggtgctacgcattgctttattgcttt 18180754  T
Q  114 cgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcagtgactacttctctcgtatgt 213  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  18180753 cgattgtgtttctgctttgggtcttgagttatctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctcttgtatgt 18180654  T
Q  214 ttg 216  Q
    |||    
T  18180653 ttg 18180651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 14 - 216
Target Start/End: Original strand, 11550262 - 11550464
Alignment:
Q  14 cagagaatgaggatcgattgattagaggtacatgttattttgatagtacacctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgcttt 113  Q
    ||||| |||||||||| ||||| |||||||| || ||| || ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  11550262 cagaggatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctactcattgctttattgcttt 11550361  T
Q  114 cgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcagtgactacttctctcgtatgt 213  Q
     |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  11550362 tgattgtgtatctgccttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgt 11550461  T
Q  214 ttg 216  Q
    |||    
T  11550462 ttg 11550464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 26 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 14957652 - 14957462
Alignment:
Q  26 atcgattgattagaggtacatgttattttgatagtacacctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttc 125  Q
    |||| ||||| |||||||| || ||| || ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  14957652 atcgtttgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctactcattgctttattgctttcgattgtgtttc 14957553  T
Q  126 tgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcagtgactacttctctcgtatgtttg 216  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14957552 tgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggtcgttgaaactccagctaagggttcagtgactacttctctcgtatgtttg 14957462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 16 - 214
Target Start/End: Original strand, 15146085 - 15146283
Alignment:
Q  16 gagaatgaggatcgattgattagaggtacatgttattttgatagtacacctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcg 115  Q
    |||||||||||||| ||||  ||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | |    
T  15146085 gagaatgaggatcgcttgagcagaggtacatgttatattaatagaacacctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctcttg 15146184  T
Q  116 attgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcagtgactacttctctcgtatgtt 214  Q
    |||||| ||||   |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  15146185 attgtgcttctaagttgggtcttgctttgtcggatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtt 15146283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 131; E-Value: 4e-68
Query Start/End: Original strand, 14 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 12690611 - 12690410
Alignment:
Q  14 cagagaatgaggatcgattgattagaggtacatgttattttgatagtacacctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgcttt 113  Q
    ||||| |||||||||| ||||| |||||||| || ||| || ||| ||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  12690611 cagaggatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattatt-atactagtgctactcattgctttattgcttt 12690513  T
Q  114 cgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcagtgactacttctctcgtatgt 213  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  12690512 cgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgagttgagagatggtcgttgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgt 12690413  T
Q  214 ttg 216  Q
    |||    
T  12690412 ttg 12690410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 107; E-Value: 9e-54
Query Start/End: Original strand, 98 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 8201074 - 8200956
Alignment:
Q  98 attgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcagtgac 197  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  8201074 attgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgttttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgac 8200975  T
Q  198 tacttctctcgtatgtttg 216  Q
    |||||||||||||||||||    
T  8200974 tacttctctcgtatgtttg 8200956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 104; E-Value: 5e-52
Query Start/End: Original strand, 14 - 157
Target Start/End: Original strand, 16726601 - 16726744
Alignment:
Q  14 cagagaatgaggatcgattgattagaggtacatgttattttgatagtacacctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgcttt 113  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||||| || ||| || ||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  16726601 cagagaatgaggatcgtttgatcagaggtacttgatatattaataatactcctttagttgctattattgatactagtgctacacattgctttattgcttt 16726700  T
Q  114 cgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatg 157  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16726701 cgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatg 16726744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 16 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 14042803 - 14042613
Alignment:
Q  16 gagaatgaggatcgattgattagaggtacatgttattttgatagtacacctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcg 115  Q
    |||| ||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | |    
T  14042803 gagagtgaggatcacttgatcagaggtacatgttattttgatagtacacctttagttgttattattgatactggtgctacgcattgttttattgctattg 14042704  T
Q  116 attgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcagtgactacttctct 206  Q
    |||||| |  |   |||||||||| | ||||  |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||    
T  14042703 attgtgctattaagttgggtcttgctatgtcaaatataaatggagagatggttgtcgaaactcaagctaagggttttgtgactacttctct 14042613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 16 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 14352833 - 14352643
Alignment:
Q  16 gagaatgaggatcgattgattagaggtacatgttattttgatagtacacctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcg 115  Q
    |||| ||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | |    
T  14352833 gagagtgaggatcacttgatcagaggtacatgttattttgatagtacacctttagttgttattattgatactggtgctacgcattgttttattgctattg 14352734  T
Q  116 attgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcagtgactacttctct 206  Q
    |||||| |  |   |||||||||| | ||||  |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||    
T  14352733 attgtgctattaagttgggtcttgctatgtcaaatataaatggagagatggttgtcgaaactcaagctaagggttttgtgactacttctct 14352643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 18 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 15627630 - 15627444
Alignment:
Q  18 gaatgaggatcgattgattagaggtacatgttattttgatagtacacctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgat 117  Q
    ||||||||| || ||||||| ||||||||| |  ||||||||||| |||||| || |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||  | |||    
T  15627630 gaatgaggaccggttgattataggtacatgcttctttgatagtactcctttaattactattattgatactggtgatacgcattgttttattgccgttgat 15627531  T
Q  118 tgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcagtgactacttct 204  Q
    |||| | ||   |||||||||||| ||||   ||||||||  || |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  15627530 tgtgctcctatgttgggtcttgatatgtcgagtatgaatgaggaaatggttttcgaaactccagctaagggttcggtgactacttct 15627444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 19 - 226
Target Start/End: Original strand, 16947615 - 16947822
Alignment:
Q  19 aatgaggatcgattgattagaggtacatgttattttgatagtacacctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgatt 118  Q
    |||||||| ||| | || |||||||| ||||  ||| ||||||| | |||| |||||||||| |||||||||||||| ||||| || |||||| | || |    
T  16947615 aatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcatttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattgaat 16947714  T
Q  119 gtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcagtgactacttctctcgtatgtttgtg 218  Q
    ||| || |   |||||| | ||| | ||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || ||| |    
T  16947715 gtgcttataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctctagtttgcttgag 16947814  T
Q  219 atgtccat 226  Q
    ||||||||    
T  16947815 atgtccat 16947822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 19 - 206
Target Start/End: Original strand, 40924960 - 40925147
Alignment:
Q  19 aatgaggatcgattgattagaggtacatgttattttgatagtacacctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgatt 118  Q
    |||||||| ||| | || |||||||| ||||  ||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| | || |    
T  40924960 aatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgctattgaat 40925059  T
Q  119 gtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcagtgactacttctct 206  Q
    ||| || |   |||||| | ||| | ||||||||||| || || |||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  40925060 gtgcttataagttgggtttggatatatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctct 40925147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 18 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 19150118 - 19149910
Alignment:
Q  18 gaatgaggatcgattgattagaggtacatgttattttgatagtacacctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgat 117  Q
    ||||||||| ||| | || |||||||| ||||  ||| ||||||| |||||| |||||||||| ||||||||| |||| ||||| || |||| | | |||    
T  19150118 gaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggttctactcattgtttcattgttgttgat 19150019  T
Q  118 tgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcagtgactacttctctcgtatgtttgt 217  Q
    ||||  | |   || ||||| | | | ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||     
T  19150018 tgtgcatataagttaggtctggttgtatctgatatgaatggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtttga 19149919  T
Q  218 gatgtccat 226  Q
    | |||||||    
T  19149918 gttgtccat 19149910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 18 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 20749517 - 20749309
Alignment:
Q  18 gaatgaggatcgattgattagaggtacatgttattttgatagtacacctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgat 117  Q
    ||||||||| ||| | || |||||||| ||||  ||| ||||||| |||||| |||||||||| ||||||||| |||| ||||| || |||| | | |||    
T  20749517 gaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggttctactcattgtttcattgttgttgat 20749418  T
Q  118 tgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcagtgactacttctctcgtatgtttgt 217  Q
    ||||  | |   || ||||| | | | ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||     
T  20749417 tgtgcatataagttaggtctggttgtatctgatatgaatggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtttga 20749318  T
Q  218 gatgtccat 226  Q
    | |||||||    
T  20749317 gttgtccat 20749309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 19 - 206
Target Start/End: Original strand, 26091941 - 26092128
Alignment:
Q  19 aatgaggatcgattgattagaggtacatgttattttgatagtacacctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgatt 118  Q
    |||||||| ||| | || |||||||| ||||  ||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| | || |    
T  26091941 aatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgctattgaat 26092040  T
Q  119 gtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcagtgactacttctct 206  Q
    |||  | |   |||||| | ||| | ||||||||||| || || |||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  26092041 gtgcatataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctct 26092128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 19 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 49155407 - 49155220
Alignment:
Q  19 aatgaggatcgattgattagaggtacatgttattttgatagtacacctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgatt 118  Q
    |||||||| ||| | || |||||||| ||||  ||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| | || |    
T  49155407 aatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgctattgaat 49155308  T
Q  119 gtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcagtgactacttctct 206  Q
    |||  | |   |||||| | ||| | ||||||||||| || || |||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  49155307 gtgcatataagttgggtttggatatatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctct 49155220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 37 - 206
Target Start/End: Original strand, 18051114 - 18051283
Alignment:
Q  37 agaggtacatgttattttgatagtacacctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtc 136  Q
    |||||||| ||||  ||| ||||||| |||||| |||||||||| || ||||||||||| ||||| || |||||||| ||  |||  | |   ||||||     
T  18051114 agaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtgctactcattgtttcattgctttagaaagtgcatataggttgggt- 18051212  T
Q  137 ttgatt-tgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcagtgactacttctct 206  Q
    |||||| ||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18051213 ttgattgtgtctgatatgaagggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtgactacttctct 18051283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 62; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 21 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 13676555 - 13676370
Alignment:
Q  21 tgaggatcgattgattagaggtacatgttattttgatagtacacctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgt 120  Q
    |||||||||| | || |||||||| ||||  ||| ||||||| |||||| |||||||||| ||  |||||||||| ||||| || |||||| | || |||    
T  13676555 tgaggatcgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacgctggtgctactcattgtttcattgctattgaatgt 13676456  T
Q  121 gtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcagtgactacttctct 206  Q
    | || |   |||||||| | | | ||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  13676455 gcttataagttgggtctggttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctct 13676370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 61; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 152 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 10873662 - 10873598
Alignment:
Q  152 tgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcagtgactacttctctcgtatgtttg 216  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  10873662 tgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttg 10873598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 61; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 18 - 226
Target Start/End: Original strand, 14261388 - 14261596
Alignment:
Q  18 gaatgaggatcgattgattagaggtacatgttattttgatagtacacctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgat 117  Q
    ||||||||| ||| | || |||||||| | ||  ||| ||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||| || |||| | | |||    
T  14261388 gaatgaggaccgacttatcagaggtacttatttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgttgttgat 14261487  T
Q  118 tgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcagtgactacttctctcgtatgtttgt 217  Q
    || |  | |   |||||||| | | | ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| || ||||||     
T  14261488 tgagcatataagttgggtctggttgtatctgatatgaatggagaaatggttgttgaaactccagctaagggtttagtaactacttctcttgtttgtttga 14261587  T
Q  218 gatgtccat 226  Q
    | |||||||    
T  14261588 gttgtccat 14261596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 19 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 13024450 - 13024264
Alignment:
Q  19 aatgaggatcgattgattagaggtacatgttattttgatagtacacctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgatt 118  Q
    |||||||| ||| | || |||||||| ||||  ||| |||| || |||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||| || |||||||| ||      
T  13024450 aatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatag-actcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctttagaaa 13024352  T
Q  119 gtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcagtgactacttctct 206  Q
    ||| || |   |||||| | ||| | ||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  13024351 gtgcttataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctct 13024264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 19 - 206
Target Start/End: Original strand, 13965811 - 13965998
Alignment:
Q  19 aatgaggatcgattgattagaggtacatgttattttgatagtacacctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgatt 118  Q
    |||||||| ||| | || |||||||| ||||  ||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| | || |    
T  13965811 aatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgctattgaat 13965910  T
Q  119 gtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcagtgactacttctct 206  Q
    |||  | |   |||||| | ||| | ||||||||||| || || |||||||| ||||||||||||||||||||| | || ||||||||    
T  13965911 gtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcaataaccacttctct 13965998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 19 - 206
Target Start/End: Original strand, 15099746 - 15099933
Alignment:
Q  19 aatgaggatcgattgattagaggtacatgttattttgatagtacacctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgatt 118  Q
    |||||||| ||| | || ||| |||| ||||  ||| ||||||| |||||| |||||||||| |||||||||| ||| ||||| || |||||| | ||||    
T  15099746 aatgaggaccgacttatcagatgtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgatactcattgtttcattgctgttgatt 15099845  T
Q  119 gtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcagtgactacttctct 206  Q
    |||  | |   |||||||| | | | ||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  15099846 gtgcatataagttgggtctagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctct 15099933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 19 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 21755518 - 21755331
Alignment:
Q  19 aatgaggatcgattgattagaggtacatgttattttgatagtacacctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgatt 118  Q
    |||||||| ||| | || |||||||| ||||  ||| ||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||| | || |    
T  21755518 aatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattattgatattggtgctactcattgttttattgctattgaat 21755419  T
Q  119 gtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcagtgactacttctct 206  Q
    ||| || |   |||||| | ||| | ||||||||| | || || |||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  21755418 gtgcttataagttgggtttggatgtatctgatatggaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctct 21755331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 19 - 206
Target Start/End: Original strand, 26115733 - 26115920
Alignment:
Q  19 aatgaggatcgattgattagaggtacatgttattttgatagtacacctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgatt 118  Q
    |||||||| ||| | || |||||||| ||||  ||| ||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||| | || |    
T  26115733 aatgaggaccgactcatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattattgatattggtgctactcattgttttattgctattgaat 26115832  T
Q  119 gtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcagtgactacttctct 206  Q
    |||  | |   |||||| | ||| | ||||||||||| || || |||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  26115833 gtgcatataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctct 26115920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 19 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 12459734 - 12459538
Alignment:
Q  19 aatgaggatcgattgattagaggtacatgttattttgatagtacacctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgatt 118  Q
    |||||||| ||| | || |||||||| ||||  ||| ||||||| |||||| |||||||||| ||||||| ||||||  |||| ||||||||| | || |    
T  12459734 aatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactgatgctactaattgttttattgctattgaat 12459635  T
Q  119 gtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcagtgactacttctctcgtatgttt 215  Q
    |||  | |   |||||| | ||| | ||||||||||| || || |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||    
T  12459634 gtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtctgttt 12459538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 18 - 206
Target Start/End: Original strand, 12798643 - 12798831
Alignment:
Q  18 gaatgaggatcgattgattagaggtacatgttattttgatagtacacctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgat 117  Q
    ||||||||| ||| | || |||||||| ||||  ||| ||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||| || |||| | | |||    
T  12798643 gaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgttgttgat 12798742  T
Q  118 tgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcagtgactacttctct 206  Q
    ||||  | |   |||||||| | | | ||||||||||| ||| | |||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||    
T  12798743 tgtgcatataagttgggtctggttgtatctgatatgaaaggaaaaatggttgttgaaactcaagctaagggttcagtaactacttctct 12798831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 37 - 216
Target Start/End: Original strand, 11385590 - 11385769
Alignment:
Q  37 agaggtacatgttattttgatagtacacctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtc 136  Q
    |||||||| ||||  ||| ||||||| |||||| |||||||||| || |||| |||||| ||||| || |||||||| || ||||  | |   |||||||    
T  11385590 agaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactgatgctactcattgtttcattgctttagaatgtgcatataagttgggtc 11385689  T
Q  137 ttgatt-tgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcagtgactacttctctcgtatgtttg 216  Q
    | |||| | | ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||| || ||||||    
T  11385690 t-gattgtatttgatatgaaaggagagatggttgttgaaactccagctaagggttcaggaactacttctcttgtttgtttg 11385769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 37 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 14140767 - 14140588
Alignment:
Q  37 agaggtacatgttattttgatagtacacctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtc 136  Q
    |||||||| ||||  ||| ||||||| |||||| |||||||||| || ||||||||||| ||||| || |||||||| ||  |||  | |   ||||||     
T  14140767 agaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtgctactcattgtttcattgctttagaaagtgcatataagttgggt- 14140669  T
Q  137 ttgatt-tgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcagtgactacttctctcgtatgtttg 216  Q
    |||| | | ||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||    
T  14140668 ttgagtgtatctgatatgaagggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtttg 14140588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 37 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 15343519 - 15343340
Alignment:
Q  37 agaggtacatgttattttgatagtacacctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtc 136  Q
    |||||||| ||||  ||| ||||||| |||||| |||||||||| || ||||||||||| ||||| || |||||||| ||  |||  | |   ||||||     
T  15343519 agaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtgctactcattgtttcattgctttagaaagtgcatataagttgggt- 15343421  T
Q  137 ttgatt-tgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcagtgactacttctctcgtatgtttg 216  Q
    |||||| | ||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||  ||| ||||||||||| || ||||||    
T  15343420 ttgattgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggtaaagtaactacttctcttgtttgtttg 15343340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 19 - 226
Target Start/End: Original strand, 12203943 - 12204150
Alignment:
Q  19 aatgaggatcgattgattagaggtacatgttattttgatagtacacctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgatt 118  Q
    |||||||||||| | || |||||||| ||||  ||| ||||||  |||||| |||||||||| || ||||||||||| ||||| || |||| | | ||||    
T  12203943 aatgaggatcgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtaatcctttaattgctattatagacactggtgctacacattgtttcattgttgttgatt 12204042  T
Q  119 gtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcagtgactacttctctcgtatgtttgtg 218  Q
    |||  | |   |||||||| | | ||||   ||||| |||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||| | ||||||||||| || |||||| |    
T  12204043 gtgcatataagttgggtctggttatgtcaagtatgagtggagaaatggttgttgaaactctagctaagggttcaataactacttctcttgtttgtttgag 12204142  T
Q  219 atgtccat 226  Q
     |||||||    
T  12204143 ttgtccat 12204150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 37 - 216
Target Start/End: Original strand, 14283535 - 14283714
Alignment:
Q  37 agaggtacatgttattttgatagtacacctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtc 136  Q
    |||||||| ||||  ||| ||||||| |||||  |||||||||| || | ||||||||| ||||| || |||||| | || ||||  | |   ||||||     
T  14283535 agaggtacttgtttctttaatagtactcctttcattgctattatagacattggtgctactcattgtttcattgctattgaatgtgcatataagttgggt- 14283633  T
Q  137 ttgatt-tgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcagtgactacttctctcgtatgtttg 216  Q
    |||||| | ||||||||||| ||||| |||||||| ||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||| || ||||||    
T  14283634 ttgattgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactctagccaagggttcagtaactacttctcttgtttgtttg 14283714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 15 - 84
Target Start/End: Complemental strand, 11984101 - 11984032
Alignment:
Q  15 agagaatgaggatcgattgattagaggtacatgttattttgatagtacacctttagttgctattattgat 84  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||||||| || ||| || ||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  11984101 agagaatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgat 11984032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 163; Significance: 3e-87; HSPs: 38)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 163; E-Value: 3e-87
Query Start/End: Original strand, 14 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 16574875 - 16574673
Alignment:
Q  14 cagagaatgaggatcgattgattagaggtacatgttattttgatagtacacctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgcttt 113  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||||| || ||| || ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  16574875 cagagaatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgcttt 16574776  T
Q  114 cgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcagtgactacttctctcgtatgt 213  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  16574775 cgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgt 16574676  T
Q  214 ttg 216  Q
    |||    
T  16574675 ttg 16574673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 163; E-Value: 3e-87
Query Start/End: Original strand, 14 - 216
Target Start/End: Original strand, 16620505 - 16620707
Alignment:
Q  14 cagagaatgaggatcgattgattagaggtacatgttattttgatagtacacctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgcttt 113  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||||| || ||| || ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  16620505 cagagaatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgcttt 16620604  T
Q  114 cgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcagtgactacttctctcgtatgt 213  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  16620605 cgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgt 16620704  T
Q  214 ttg 216  Q
    |||    
T  16620705 ttg 16620707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 163; E-Value: 3e-87
Query Start/End: Original strand, 14 - 216
Target Start/End: Original strand, 28260493 - 28260695
Alignment:
Q  14 cagagaatgaggatcgattgattagaggtacatgttattttgatagtacacctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgcttt 113  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||||| || ||| || ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28260493 cagagaatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattaataatacccctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgcttt 28260592  T
Q  114 cgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcagtgactacttctctcgtatgt 213  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  28260593 cgattgtgtttctgctttgggtcttgagttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgt 28260692  T
Q  214 ttg 216  Q
    |||    
T  28260693 ttg 28260695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 163; E-Value: 3e-87
Query Start/End: Original strand, 14 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 28285423 - 28285221
Alignment:
Q  14 cagagaatgaggatcgattgattagaggtacatgttattttgatagtacacctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgcttt 113  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||||| || ||| || ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28285423 cagagaatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattaataatacccctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgcttt 28285324  T
Q  114 cgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcagtgactacttctctcgtatgt 213  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  28285323 cgattgtgtttctgctttgggtcttgagttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgt 28285224  T
Q  214 ttg 216  Q
    |||    
T  28285223 ttg 28285221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 163; E-Value: 3e-87
Query Start/End: Original strand, 14 - 216
Target Start/End: Original strand, 28339242 - 28339444
Alignment:
Q  14 cagagaatgaggatcgattgattagaggtacatgttattttgatagtacacctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgcttt 113  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||||| || ||| || ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28339242 cagagaatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattaataatacccctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgcttt 28339341  T
Q  114 cgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcagtgactacttctctcgtatgt 213  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  28339342 cgattgtgtttctgctttgggtcttgagttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgt 28339441  T
Q  214 ttg 216  Q
    |||    
T  28339442 ttg 28339444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 159; E-Value: 8e-85
Query Start/End: Original strand, 14 - 216
Target Start/End: Original strand, 2872098 - 2872300
Alignment:
Q  14 cagagaatgaggatcgattgattagaggtacatgttattttgatagtacacctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgcttt 113  Q
    ||||||| |||||||| ||||| |||||||| || ||| || ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  2872098 cagagaacgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgcttt 2872197  T
Q  114 cgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcagtgactacttctctcgtatgt 213  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  2872198 cgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgt 2872297  T
Q  214 ttg 216  Q
    |||    
T  2872298 ttg 2872300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 159; E-Value: 8e-85
Query Start/End: Original strand, 14 - 216
Target Start/End: Original strand, 29589735 - 29589937
Alignment:
Q  14 cagagaatgaggatcgattgattagaggtacatgttattttgatagtacacctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgcttt 113  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||||| || ||| || ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  29589735 cagagaatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgcttt 29589834  T
Q  114 cgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcagtgactacttctctcgtatgt 213  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  29589835 cgattgtgtttctgctttgggtcttgttttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgt 29589934  T
Q  214 ttg 216  Q
    |||    
T  29589935 ttg 29589937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 155; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 14 - 216
Target Start/End: Original strand, 24293078 - 24293280
Alignment:
Q  14 cagagaatgaggatcgattgattagaggtacatgttattttgatagtacacctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgcttt 113  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||||| || ||| || ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||    
T  24293078 cagagaatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcacggttttattgcttt 24293177  T
Q  114 cgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcagtgactacttctctcgtatgt 213  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  24293178 cgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgt 24293277  T
Q  214 ttg 216  Q
    |||    
T  24293278 ttg 24293280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 155; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 14 - 224
Target Start/End: Original strand, 27559265 - 27559475
Alignment:
Q  14 cagagaatgaggatcgattgattagaggtacatgttattttgatagtacacctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgcttt 113  Q
    |||||||||||||| | ||||| |||||||| |||||| || ||| ||| || || |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||    
T  27559265 cagagaatgaggatggtttgatcagaggtacttgttatattaataatactccatttgttgctattattgataatggtgctacgcattgttttattgcttt 27559364  T
Q  114 cgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcagtgactacttctctcgtatgt 213  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  27559365 cgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgt 27559464  T
Q  214 ttgtgatgtcc 224  Q
    ||| |||||||    
T  27559465 ttgagatgtcc 27559475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 151; E-Value: 5e-80
Query Start/End: Original strand, 14 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 28312615 - 28312413
Alignment:
Q  14 cagagaatgaggatcgattgattagaggtacatgttattttgatagtacacctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgcttt 113  Q
    |||| ||||||||||| ||||| |||||||| || ||| || ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28312615 cagaaaatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgcttt 28312516  T
Q  114 cgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcagtgactacttctctcgtatgt 213  Q
    | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |    
T  28312515 caattgtgtttctgctttgggtcttgagttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtattt 28312416  T
Q  214 ttg 216  Q
    |||    
T  28312415 ttg 28312413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 149; E-Value: 8e-79
Query Start/End: Original strand, 16 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 22436852 - 22436652
Alignment:
Q  16 gagaatgaggatcgattgattagaggtacatgttattttgatagtacacctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcg 115  Q
    ||||||||||| || ||||| ||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  22436852 gagaatgaggaccgcttgatcagaggtacatgttatattgataatactcctttagttgctattattgatactagtgctacgcattgttttattgctttcg 22436753  T
Q  116 attgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcagtgactacttctctcgtatgttt 215  Q
    |||||| |||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  22436752 attgtgcttctactttgggtcttgttatgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgttt 22436653  T
Q  216 g 216  Q
    |    
T  22436652 g 22436652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 22 - 224
Target Start/End: Original strand, 16924944 - 16925146
Alignment:
Q  22 gaggatcgattgattagaggtacatgttattttgatagtacacctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtg 121  Q
    |||||||| ||||| |||||||| |||||| || ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  16924944 gaggatcgcttgatcagaggtacttgttatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacacattgttttattgctttcgattgtg 16925043  T
Q  122 tttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcagtgactacttctctcgtatgtttgtgatg 221  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||    
T  16925044 tttctactttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggtcgtcgaaactccagctaagggatcggtgactacttctctcgtatgtttgagatg 16925143  T
Q  222 tcc 224  Q
    |||    
T  16925144 tcc 16925146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 16 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 25115535 - 25115335
Alignment:
Q  16 gagaatgaggatcgattgattagaggtacatgttattttgatagtacacctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcg 115  Q
    ||||| |||||||| ||||| |||||||| || ||| || ||| ||| |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  25115535 gagaacgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatattggtactacgcattgctttattgctttcg 25115436  T
Q  116 attgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcagtgactacttctctcgtatgttt 215  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  25115435 attgtgtttctgcttcgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatgattgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgttt 25115336  T
Q  216 g 216  Q
    |    
T  25115335 g 25115335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 134; E-Value: 7e-70
Query Start/End: Original strand, 15 - 224
Target Start/End: Original strand, 18405241 - 18405450
Alignment:
Q  15 agagaatgaggatcgattgattagaggtacatgttattttgatagtacacctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttc 114  Q
    |||||| |||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||     
T  18405241 agagaacgaggatcgcttgatcagaggtacttgttattttgatagtacacctttagctgctattattgatactggtgctatgcattgttttattgctttt 18405340  T
Q  115 gattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcagtgactacttctctcgtatgtt 214  Q
    ||||||| | ||   |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||    
T  18405341 gattgtgctactaagttgggtcttgctatgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctcttgtgtgtt 18405440  T
Q  215 tgtgatgtcc 224  Q
    || |||||||    
T  18405441 tgagatgtcc 18405450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 37 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 27190398 - 27190219
Alignment:
Q  37 agaggtacatgttattttgatagtacacctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtc 136  Q
    |||||||| || ||| || ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  27190398 agaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctggtttgggtc 27190299  T
Q  137 ttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcagtgactacttctctcgtatgtttg 216  Q
    |||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  27190298 ttgagttgtcagatatgaatggggagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttg 27190219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 37 - 216
Target Start/End: Original strand, 27258842 - 27259021
Alignment:
Q  37 agaggtacatgttattttgatagtacacctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtc 136  Q
    |||||||| || ||| || ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  27258842 agaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctggtttgggtc 27258941  T
Q  137 ttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcagtgactacttctctcgtatgtttg 216  Q
    |||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  27258942 ttgagttgtcagatatgaatggggagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttg 27259021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 131; E-Value: 4e-68
Query Start/End: Original strand, 14 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 23081408 - 23081198
Alignment:
Q  14 cagagaatgaggatcgattgattagaggtacatgttattttgatagtacacctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgcttt 113  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |    
T  23081408 cagagaatgaggatcgtttgatcagaggtacatgttattttgatagtacacctttagttgctattattgatactggtgctacacattgttttattgctat 23081309  T
Q  114 cgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcagtgactacttctctcgtatgt 213  Q
     ||||||| ||||   |||||| ||| | ||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||    
T  23081308 tgattgtgcttctaagttgggttttgctatgtcaaatattaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcagtgactacttctcttgtgtgt 23081209  T
Q  214 ttgtgatgtcc 224  Q
    ||  |||||||    
T  23081208 ttaagatgtcc 23081198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 129; E-Value: 7e-67
Query Start/End: Original strand, 16 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 19867670 - 19867470
Alignment:
Q  16 gagaatgaggatcgattgattagaggtacatgttattttgatagtacacctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcg 115  Q
    ||||| |||||||| ||||| | ||||||||||||| |||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  19867670 gagaacgaggatcgcttgatcaaaggtacatgttatattgataatactcctttagtttctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcg 19867571  T
Q  116 attgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcagtgactacttctctcgtatgttt 215  Q
    |||||| |||| | ||||| |||| | ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  19867570 attgtgcttctaccttgggccttgttatgtcttatatgaatgaagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgttt 19867471  T
Q  216 g 216  Q
    |    
T  19867470 g 19867470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 19 - 216
Target Start/End: Original strand, 5836529 - 5836726
Alignment:
Q  19 aatgaggatcgattgattagaggtacatgttattttgatagtacacctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgatt 118  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||| || ||| || ||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  5836529 aatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatattggtgctacgcattgttttattgcttttgatt 5836628  T
Q  119 gtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcagtgactacttctctcgtatgtttg 216  Q
    ||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||  |||| |||||||||    
T  5836629 gtgcttatactttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtaactaccactctagtatgtttg 5836726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 107; E-Value: 9e-54
Query Start/End: Original strand, 14 - 224
Target Start/End: Original strand, 23085121 - 23085331
Alignment:
Q  14 cagagaatgaggatcgattgattagaggtacatgttattttgatagtacacctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgcttt 113  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||| | |    
T  23085121 cagagaatgaggaccgattgattagaggtacatgttattttgatagtactcctttagtttctattattgaaactggtgctacacattgttttattgttgt 23085220  T
Q  114 cgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcagtgactacttctctcgtatgt 213  Q
     |||| || ||||   |||||||||  | ||||   |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||    
T  23085221 tgattatgcttctaagttgggtcttactatgtcaagtatgaatggagaaatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctagtgtgt 23085320  T
Q  214 ttgtgatgtcc 224  Q
    ||  |||||||    
T  23085321 ttaagatgtcc 23085331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 106; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 14 - 215
Target Start/End: Original strand, 18182663 - 18182864
Alignment:
Q  14 cagagaatgaggatcgattgattagaggtacatgttattttgatagtacacctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgcttt 113  Q
    |||| ||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||| | |||||||| |    
T  18182663 cagataatgaggatcatttgattagaggtacatgttactttgatagtactcctttaattgctattattgatattggtgctacacatttccttattgctat 18182762  T
Q  114 cgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcagtgactacttctctcgtatgt 213  Q
     ||||||| ||||   |||||||||| | ||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||    
T  18182763 tgattgtgcttctaagttgggtcttgctatgtcaaatatgaatggagagatggtagtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctcttgtttgt 18182862  T
Q  214 tt 215  Q
    ||    
T  18182863 tt 18182864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 24 - 132
Target Start/End: Original strand, 22829692 - 22829800
Alignment:
Q  24 ggatcgattgattagaggtacatgttattttgatagtacacctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtt 123  Q
    |||||| ||||| |||||||| || ||| || ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  22829692 ggatcgcttgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgcgttattgctttcgattgtgtt 22829791  T
Q  124 tctgctttg 132  Q
    |||||||||    
T  22829792 tctgctttg 22829800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 21 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 18797668 - 18797473
Alignment:
Q  21 tgaggatcgattgattagaggtacatgttattttgatagtacacctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgt 120  Q
    |||||||||| | || |||||||| ||||  ||| ||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||| || |||||||| || |||    
T  18797668 tgaggatcgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctttagaatgt 18797569  T
Q  121 gtttctgctttgggtcttgatt-tgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcagtgactacttctctcgtatgtttg 216  Q
    |  | |   |||||| |||||| | ||||| ||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  18797568 gcatataagttgggt-ttgattgtatctgacatgaaaggagagatggttgttgaaactctagctaagggttcagtgactacttctcttgtttgtttg 18797473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 18 - 206
Target Start/End: Original strand, 30678324 - 30678512
Alignment:
Q  18 gaatgaggatcgattgattagaggtacatgttattttgatagtacacctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgat 117  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||||||||  ||| |||||||  ||||| ||||||||||||||| | ||||||||| ||| |||||||||   |||    
T  30678324 gaatgaggatcggttgatcagaggtacatgtttctttaatagtacttctttaattgctattattgatatttgtgctacgcgttgttttattgctactgat 30678423  T
Q  118 tgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcagtgactacttctct 206  Q
    |||| ||||   |||||||||| | ||||   |||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||    
T  30678424 tgtgcttctaagttgggtcttgttatgtcatgtatggatggggaaatggttgtcgaaactccagctaagggtttggttactacttctct 30678512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 23 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 19437978 - 19437795
Alignment:
Q  23 aggatcgattgattagaggtacatgttattttgatagtacacctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgt 122  Q
    |||||||| | || |||||||| ||||  ||| ||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||| || |||||| | || ||||     
T  19437978 aggatcgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattgaatgtgc 19437879  T
Q  123 ttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcagtgactacttctct 206  Q
    || |   ||| |||| | | | ||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  19437878 ttataagttgagtctagttgtatctgatatgaagggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctct 19437795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 62; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 37 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 19455985 - 19455816
Alignment:
Q  37 agaggtacatgttattttgatagtacacctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtc 136  Q
    |||||||| ||||  ||| ||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||| || |||||| | || |||| || |   |||||||    
T  19455985 agaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattgaatgtgcttataagttgggtc 19455886  T
Q  137 ttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcagtgactacttctct 206  Q
    | | | | ||||||||||| || || |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  19455885 tggttgtatctgatatgaaaggtgaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctct 19455816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 61; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 19 - 215
Target Start/End: Original strand, 10466149 - 10466345
Alignment:
Q  19 aatgaggatcgattgattagaggtacatgttattttgatagtacacctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgatt 118  Q
    |||||||| ||| | || |||||||| ||||  ||| ||||||| |||||| |||||||||| ||||||| |||||| ||||| ||||||||| | || |    
T  10466149 aatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactgttgctactcattgttttattgctattgaat 10466248  T
Q  119 gtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcagtgactacttctctcgtatgttt 215  Q
    |||  | |   |||||| | ||| | ||||||||||| || || |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||    
T  10466249 gtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtctgttt 10466345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 61; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 19 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 15462316 - 15462129
Alignment:
Q  19 aatgaggatcgattgattagaggtacatgttattttgatagtacacctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgatt 118  Q
    |||||||||||| | || |||||||| ||||  ||| ||||||| |||||| |||||||||| || ||||||||||| ||||| || |||||||| || |    
T  15462316 aatgaggatcgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtgctacacattgtttcattgctttagaat 15462217  T
Q  119 gtgtttctgctttgggtcttgatt-tgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcagtgactacttctct 206  Q
    |||  | |   |||||||| |||| | ||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  15462216 gtgcatataagttgggtct-gattgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagccaagggttcagtaactacttctct 15462129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 19 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 21474580 - 21474373
Alignment:
Q  19 aatgaggatcgattgattagaggtacatgttattttgatagtacacctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgatt 118  Q
    |||||||| ||| | || |||||||  ||||  ||| ||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||| || |||| | | ||||    
T  21474580 aatgaggaccgacttatcagaggtatttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttgattgttgttgatt 21474481  T
Q  119 gtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcagtgactacttctctcgtatgtttgtg 218  Q
    |||  | |   |||||||| | | |||||||||||||| || | |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||  || |||||| |    
T  21474480 gtgcatataagttgggtctggttatgtctgatatgaatagaaaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcatgtttgtttgag 21474381  T
Q  219 atgtccat 226  Q
     |||||||    
T  21474380 ttgtccat 21474373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 37 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 19466130 - 19465973
Alignment:
Q  37 agaggtacatgttattttgatagtacacctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtc 136  Q
    |||||||| ||||  ||| ||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||| || |||||| | || |||| || |   |||||||    
T  19466130 agaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattgaatgtgcttataagttgggtc 19466031  T
Q  137 ttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcagt 194  Q
    | | | | ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  19466030 tggttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagt 19465973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 37 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 25770806 - 25770617
Alignment:
Q  37 agaggtacatgttattttgatagtacacctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtc 136  Q
    |||||||| ||||  ||| ||||||| |||||| |||||||||| |||| ||||||||  ||||| || |||| | | ||||||| || |   |||||||    
T  25770806 agaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatattggtgctattcattgtttcattgttgttgattgtgcttataagttgggtc 25770707  T
Q  137 ttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcagtgactacttctctcgtatgtttgtgatgtccat 226  Q
    | | | ||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||| ||||||||| | ||||||||||| || |||||| | |||||||    
T  25770706 tggttatgtctgatatgaatggagaaatggttgttgaatctccagcaaagggttcaatcactacttctcttgtttgtttgagttgtccat 25770617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 37 - 224
Target Start/End: Original strand, 34642905 - 34643092
Alignment:
Q  37 agaggtacatgttattttgatagtacacctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtc 136  Q
    |||||||| ||||  ||| ||||||  |||||| | |||||||| || ||||||||||| ||||| || |||||||| || |||| || |    |||||     
T  34642905 agaggtacttgtttctttaatagtatccctttaatcgctattatagacactggtgctacacattgtttcattgctttagagtgtgcttataaactgggt- 34643003  T
Q  137 ttgatt-tgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcagtgactacttctctcgtatgtttgtgatgtcc 224  Q
    |||||| ||||||||||||| ||||| ||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||    
T  34643004 ttgattgtgtctgatatgaaaggagaaatggtcgttgaaactccggctaagggttcagtgactacttctcttgtttgtttgagatgtcc 34643092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 19 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 24367380 - 24367193
Alignment:
Q  19 aatgaggatcgattgattagaggtacatgttattttgatagtacacctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgatt 118  Q
    |||||||| ||| | || |||||||| ||||  ||| ||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||| | || |    
T  24367380 aatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattattaatactggtgctactcattgttttattgctattgaat 24367281  T
Q  119 gtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcagtgactacttctct 206  Q
    |||  | |   |||||||  ||| | ||||||||||| || || |||||||| |||||||||||||||| |||||| || ||||||||    
T  24367280 gtgcatatcagttgggtccggatatatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaaggattcagtaaccacttctct 24367193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 50; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 19 - 216
Target Start/End: Original strand, 19486595 - 19486792
Alignment:
Q  19 aatgaggatcgattgattagaggtacatgttattttgatagtacacctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgatt 118  Q
    |||||||| ||| | || |||||||| ||||  ||| ||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||| || |||||| | ||||    
T  19486595 aatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgttattattgatactggtgctacacattgtttcattgctgttgatt 19486694  T
Q  119 gtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcagtgactacttctctcgtatgtttg 216  Q
    |||  | |   |||||||| |   ||||   ||||| | |||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| || ||||||    
T  19486695 gtgcatataagttgggtctggtcatgtcaagtatgagtagagaaatggttgttgaaactccagctaagggtttagtaactacttctcttgtttgtttg 19486792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 146 - 216
Target Start/End: Original strand, 21567419 - 21567489
Alignment:
Q  146 ctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcagtgactacttctctcgtatgtttg 216  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||    
T  21567419 ctgacatgaaaggagagatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtttg 21567489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 21 - 206
Target Start/End: Original strand, 24515717 - 24515902
Alignment:
Q  21 tgaggatcgattgattagaggtacatgttattttgatagtacacctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgt 120  Q
    |||||||||| | || |||||||| ||||  ||| ||||||| |||||| |||||||||| || ||||||||||| ||||| || |||| | | || |||    
T  24515717 tgaggatcgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtgctactcattgtttcattgttattgaatgt 24515816  T
Q  121 gtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcagtgactacttctct 206  Q
    | || |   |||||||| | | | ||||||||||| || || |||||||| |||||||||| |||| ||||| | |||||||||||    
T  24515817 gcttataagttgggtctggttgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagttaagtgttcattaactacttctct 24515902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 37 - 206
Target Start/End: Original strand, 14377235 - 14377404
Alignment:
Q  37 agaggtacatgttattttgatagtacacctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtc 136  Q
    |||||||| ||||  ||| ||||||  |||||| |||||||||| || ||||||| ||| ||||| || |||||| | || |||| || |   ||||||     
T  14377235 agaggtacttgtttctttaatagtaatcctttaattgctattatagacactggtgttactcattgtttcattgctattgaatgtgcttataagttgggtt 14377334  T
Q  137 ttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcagtgactacttctct 206  Q
    | | | | ||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| ||||||| |||  ||||||||||    
T  14377335 tggttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagcaaagggtttagtagctacttctct 14377404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 149 - 215
Target Start/End: Original strand, 20010885 - 20010951
Alignment:
Q  149 atatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcagtgactacttctctcgtatgttt 215  Q
    ||||||| || || |||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| || |||||    
T  20010885 atatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagccaagggttcagtaactacttctcttgtgtgttt 20010951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 163; Significance: 3e-87; HSPs: 38)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 163; E-Value: 3e-87
Query Start/End: Original strand, 14 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 12479721 - 12479519
Alignment:
Q  14 cagagaatgaggatcgattgattagaggtacatgttattttgatagtacacctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgcttt 113  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||||| || ||| || ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  12479721 cagagaatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgcttt 12479622  T
Q  114 cgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcagtgactacttctctcgtatgt 213  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  12479621 cgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgt 12479522  T
Q  214 ttg 216  Q
    |||    
T  12479521 ttg 12479519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 159; E-Value: 8e-85
Query Start/End: Original strand, 14 - 216
Target Start/End: Original strand, 8050514 - 8050716
Alignment:
Q  14 cagagaatgaggatcgattgattagaggtacatgttattttgatagtacacctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgcttt 113  Q
    ||||||| |||||||| ||||| |||||||| || ||| || ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  8050514 cagagaacgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgcttt 8050613  T
Q  114 cgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcagtgactacttctctcgtatgt 213  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  8050614 cgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgt 8050713  T
Q  214 ttg 216  Q
    |||    
T  8050714 ttg 8050716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 159; E-Value: 8e-85
Query Start/End: Original strand, 14 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 8389533 - 8389331
Alignment:
Q  14 cagagaatgaggatcgattgattagaggtacatgttattttgatagtacacctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgcttt 113  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||||| || ||| || ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  8389533 cagagaatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgcttt 8389434  T
Q  114 cgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcagtgactacttctctcgtatgt 213  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  8389433 cgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttcactcgtatgt 8389334  T
Q  214 ttg 216  Q
    |||    
T  8389333 ttg 8389331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 159; E-Value: 8e-85
Query Start/End: Original strand, 14 - 216
Target Start/End: Original strand, 14300870 - 14301072
Alignment:
Q  14 cagagaatgaggatcgattgattagaggtacatgttattttgatagtacacctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgcttt 113  Q
    ||||||| |||||||| ||||| |||||||| || ||| || ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  14300870 cagagaacgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgcttt 14300969  T
Q  114 cgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcagtgactacttctctcgtatgt 213  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  14300970 cgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgt 14301069  T
Q  214 ttg 216  Q
    |||    
T  14301070 ttg 14301072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 159; E-Value: 8e-85
Query Start/End: Original strand, 14 - 216
Target Start/End: Original strand, 16233883 - 16234085
Alignment:
Q  14 cagagaatgaggatcgattgattagaggtacatgttattttgatagtacacctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgcttt 113  Q
    |||||| ||||||||| ||||| |||||||| || ||| || ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  16233883 cagagagtgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgcttt 16233982  T
Q  114 cgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcagtgactacttctctcgtatgt 213  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  16233983 cgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgt 16234082  T
Q  214 ttg 216  Q
    |||    
T  16234083 ttg 16234085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 159; E-Value: 8e-85
Query Start/End: Original strand, 14 - 224
Target Start/End: Original strand, 18224337 - 18224547
Alignment:
Q  14 cagagaatgaggatcgattgattagaggtacatgttattttgatagtacacctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgcttt 113  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||  | || ||| || ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  18224337 cagagaatgaggatcgtttgatcagaggatcttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacacattgctttattgcttt 18224436  T
Q  114 cgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcagtgactacttctctcgtatgt 213  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  18224437 cgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgt 18224536  T
Q  214 ttgtgatgtcc 224  Q
    ||| |||||||    
T  18224537 ttgcgatgtcc 18224547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 159; E-Value: 8e-85
Query Start/End: Original strand, 14 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 19635257 - 19635055
Alignment:
Q  14 cagagaatgaggatcgattgattagaggtacatgttattttgatagtacacctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgcttt 113  Q
    ||||||| |||||||| ||||| |||||||| || ||| || ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  19635257 cagagaacgaggatcgcttgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgcttt 19635158  T
Q  114 cgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcagtgactacttctctcgtatgt 213  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  19635157 cgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgt 19635058  T
Q  214 ttg 216  Q
    |||    
T  19635057 ttg 19635055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 159; E-Value: 8e-85
Query Start/End: Original strand, 14 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 23958868 - 23958666
Alignment:
Q  14 cagagaatgaggatcgattgattagaggtacatgttattttgatagtacacctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgcttt 113  Q
    |||||||||| ||||| ||||| |||||||| || ||| || ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  23958868 cagagaatgacgatcgtttgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgcttt 23958769  T
Q  114 cgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcagtgactacttctctcgtatgt 213  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  23958768 cgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgt 23958669  T
Q  214 ttg 216  Q
    |||    
T  23958668 ttg 23958666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 159; E-Value: 8e-85
Query Start/End: Original strand, 14 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 27714457 - 27714255
Alignment:
Q  14 cagagaatgaggatcgattgattagaggtacatgttattttgatagtacacctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgcttt 113  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||||| || ||| || ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  27714457 cagagaatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgcttt 27714358  T
Q  114 cgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcagtgactacttctctcgtatgt 213  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  27714357 cgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccggctaagggttcggtgactacttctctcgtatgt 27714258  T
Q  214 ttg 216  Q
    |||    
T  27714257 ttg 27714255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 16 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 40476159 - 40475959
Alignment:
Q  16 gagaatgaggatcgattgattagaggtacatgttattttgatagtacacctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcg 115  Q
    ||||| |||||||| ||||| |||||||| || ||| || ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40476159 gagaacgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcg 40476060  T
Q  116 attgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcagtgactacttctctcgtatgttt 215  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  40476059 attgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggtggtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgttt 40475960  T
Q  216 g 216  Q
    |    
T  40475959 g 40475959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 155; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 14 - 216
Target Start/End: Original strand, 17092040 - 17092242
Alignment:
Q  14 cagagaatgaggatcgattgattagaggtacatgttattttgatagtacacctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgcttt 113  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||||| || ||| || ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  17092040 cagagaatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgcttt 17092139  T
Q  114 cgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcagtgactacttctctcgtatgt 213  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  17092140 cgattgtgtttctgccttgggtcttgttttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgt 17092239  T
Q  214 ttg 216  Q
    |||    
T  17092240 ttg 17092242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 153; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 16 - 224
Target Start/End: Original strand, 16350447 - 16350655
Alignment:
Q  16 gagaatgaggatcgattgattagaggtacatgttattttgatagtacacctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcg 115  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||| |||||| || ||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||    
T  16350447 gagaatgaggatcgcttgatcagaggtacttgttatattaataatactcctttagttgctattattgatactagtgctatgcattgttttattgctttcg 16350546  T
Q  116 attgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcagtgactacttctctcgtatgttt 215  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  16350547 attgtgtttctactttgggtcttgatttgtcggatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgttt 16350646  T
Q  216 gtgatgtcc 224  Q
    | |||||||    
T  16350647 gagatgtcc 16350655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 151; E-Value: 5e-80
Query Start/End: Original strand, 14 - 216
Target Start/End: Original strand, 19775684 - 19775886
Alignment:
Q  14 cagagaatgaggatcgattgattagaggtacatgttattttgatagtacacctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgcttt 113  Q
    |||||||||| ||||| ||||| |||||||| || ||| || ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  19775684 cagagaatgacgatcgtttgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgcttt 19775783  T
Q  114 cgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcagtgactacttctctcgtatgt 213  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  19775784 cgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccggctaagggttcggtgactacttctctcatatgt 19775883  T
Q  214 ttg 216  Q
    |||    
T  19775884 ttg 19775886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 149; E-Value: 8e-79
Query Start/End: Original strand, 20 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 14683682 - 14683486
Alignment:
Q  20 atgaggatcgattgattagaggtacatgttattttgatagtacacctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattg 119  Q
    |||||||||| ||||| |||||||| || ||| || ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  14683682 atgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctactcattgctttattgctttcgattg 14683583  T
Q  120 tgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcagtgactacttctctcgtatgtttg 216  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  14683582 tgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggtcgttgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttg 14683486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 14 - 224
Target Start/End: Original strand, 16250741 - 16250951
Alignment:
Q  14 cagagaatgaggatcgattgattagaggtacatgttattttgatagtacacctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgcttt 113  Q
    |||||||||| ||| | ||||| |||||||| || ||| || ||| ||| | ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  16250741 cagagaatgacgattgtttgataagaggtacttgctatattaataatactcatttagttgctattattgatactaatgctacgcattgctttattgcttt 16250840  T
Q  114 cgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcagtgactacttctctcgtatgt 213  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  16250841 cgattgtgtttctgccttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgt 16250940  T
Q  214 ttgtgatgtcc 224  Q
    ||| |||||||    
T  16250941 ttgcgatgtcc 16250951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 141; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 16 - 216
Target Start/End: Original strand, 15144785 - 15144985
Alignment:
Q  16 gagaatgaggatcgattgattagaggtacatgttattttgatagtacacctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcg 115  Q
    |||||||||||||| ||||| | ||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||    
T  15144785 gagaatgaggatcgcttgatcaaaggtacatgttatattgataatactcctttagttgctattattgatactggtgctaagcattgttttattgttttcg 15144884  T
Q  116 attgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcagtgactacttctctcgtatgttt 215  Q
    |||||| |||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  15144885 attgtgcttctactttgggtcttgttatgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacgtctctcgtatgttt 15144984  T
Q  216 g 216  Q
    |    
T  15144985 g 15144985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 139; E-Value: 7e-73
Query Start/End: Original strand, 14 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 13513471 - 13513285
Alignment:
Q  14 cagagaatgaggatcgattgattagaggtacatgttattttgatagtacacctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgcttt 113  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||||| || ||| || ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  13513471 cagagaatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacacattgctttattgcttt 13513372  T
Q  114 cgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcagtgactac 200  Q
    | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  13513371 caattgtgtttctgcttcgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactac 13513285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 16 - 224
Target Start/End: Original strand, 15928 - 16136
Alignment:
Q  16 gagaatgaggatcgattgattagaggtacatgttattttgatagtacacctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcg 115  Q
    ||||| |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| | |    
T  15928 gagaacgaggatcgcttgatcagaggtacttgttattttgatagtacacctttagttgctattattgatactggtgctacgcatttttttattgctattg 16027  T
Q  116 attgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcagtgactacttctctcgtatgttt 215  Q
    |||||| | ||   |||||||||  | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||    
T  16028 attgtgctactaagttgggtcttactatgtctaatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctcttgtgtgttt 16127  T
Q  216 gtgatgtcc 224  Q
      |||||||    
T  16128 aagatgtcc 16136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 14 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 14697222 - 14697030
Alignment:
Q  14 cagagaatgaggatcgattgattagaggtacatgttattttgatagtacacctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgcttt 113  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |    
T  14697222 cagagaatgaggatcgtttgattataggtacatgttactttgatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctacacattgttttattgctat 14697123  T
Q  114 cgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcagtgactacttctct 206  Q
     ||||||| ||||   |||||||||| | ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  14697122 tgattgtgcttctaagttgggtcttgctatgtcgaatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctct 14697030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 16 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 14162589 - 14162390
Alignment:
Q  16 gagaatgaggatcgattgattagaggtacatgttattttgatagtacacctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcg 115  Q
    ||||| ||||||||  |||| |||||||| || ||| || ||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||| | |    
T  14162589 gagaacgaggatcgcctgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgataccggtgctacgcatagttttattgctcttg 14162490  T
Q  116 attgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcagtgactacttctctcgtatgttt 215  Q
    |||||| ||||   |||| ||||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| || |||||    
T  14162489 attgtgcttctaagttggatcttgctatgtctgatatgaatggagaaatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtaactacttctcttgtgtgttt 14162390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 74; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 14 - 139
Target Start/End: Complemental strand, 16219309 - 16219184
Alignment:
Q  14 cagagaatgaggatcgattgattagaggtacatgttattttgatagtacacctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgcttt 113  Q
    |||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || || ||||||||| |    
T  16219309 cagaaaatgaggatcgtttgatcagaggtacatgttattttgatagtacacctttagttgctattattgatattggtgctacacactgttttattgctat 16219210  T
Q  114 cgattgtgtttctgctttgggtcttg 139  Q
     ||||||| ||||   ||||||||||    
T  16219209 tgattgtgcttctaagttgggtcttg 16219184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 74; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 14 - 139
Target Start/End: Complemental strand, 16222629 - 16222504
Alignment:
Q  14 cagagaatgaggatcgattgattagaggtacatgttattttgatagtacacctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgcttt 113  Q
    |||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || || ||||||||| |    
T  16222629 cagaaaatgaggatcgtttgatcagaggtacatgttattttgatagtacacctttagttgctattattgatattggtgctacacactgttttattgctat 16222530  T
Q  114 cgattgtgtttctgctttgggtcttg 139  Q
     ||||||| ||||   ||||||||||    
T  16222529 tgattgtgcttctaagttgggtcttg 16222504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 37 - 206
Target Start/End: Original strand, 51603966 - 51604135
Alignment:
Q  37 agaggtacatgttattttgatagtacacctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtc 136  Q
    |||||||| ||||  ||| ||||||| |||||| |||||||||| || ||||||||||| ||||| || |||||||| || |||| || |    |||||     
T  51603966 agaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtgctactcattgtttcattgctttagaatgtgcttataaactgggt- 51604064  T
Q  137 ttgatt-tgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcagtgactacttctct 206  Q
    |||||| ||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51604065 ttgattgtgtctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtgactacttctct 51604135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 37 - 206
Target Start/End: Original strand, 53750644 - 53750813
Alignment:
Q  37 agaggtacatgttattttgatagtacacctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtc 136  Q
    |||||||| ||||  ||| ||||||| |||||| |||||||||| || ||||||||||| ||||| || |||||||| || |||| || |    |||||     
T  53750644 agaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtgctactcattgtttcattgctttagaatgtgcttataaactgggt- 53750742  T
Q  137 ttgatt-tgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcagtgactacttctct 206  Q
    |||||| ||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  53750743 ttgattgtgtctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtgactacttctct 53750813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 19 - 206
Target Start/End: Original strand, 3261950 - 3262137
Alignment:
Q  19 aatgaggatcgattgattagaggtacatgttattttgatagtacacctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgatt 118  Q
    |||||||| ||| | || |||||||| ||||  ||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| | || |    
T  3261950 aatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgctattgaat 3262049  T
Q  119 gtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcagtgactacttctct 206  Q
    |||  | |   |||||| | ||| | ||||||||||| || || |||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  3262050 gtgcatataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctct 3262137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 19 - 206
Target Start/End: Original strand, 29450693 - 29450880
Alignment:
Q  19 aatgaggatcgattgattagaggtacatgttattttgatagtacacctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgatt 118  Q
    |||||||| ||| | || |||||||| ||||  ||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| | || |    
T  29450693 aatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgctattgaat 29450792  T
Q  119 gtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcagtgactacttctct 206  Q
    |||  | |   |||||| | ||| | ||||||||||| || || |||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  29450793 gtgcatataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctct 29450880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 130 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 14188511 - 14188417
Alignment:
Q  130 ttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcagtgactacttctctcgtatgtttgtgatgtcc 224  Q
    |||||||||| | ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  14188511 ttgggtcttgctatgtctaatattaatggagagatggttgtcgaaactccagctaaaggttcggttactacttctctcgtatgtttgagatgtcc 14188417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 19 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 20893147 - 20892950
Alignment:
Q  19 aatgaggatcgattgattagaggtacatgttattttgatagtacacctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgatt 118  Q
    |||||||| ||| | || |||||||| ||||  ||| ||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||| || |||||||| ||      
T  20893147 aatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctttagaaa 20893048  T
Q  119 gtgtttctgctttgggtcttgatt-tgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcagtgactacttctctcgtatgtttg 216  Q
    |||  | |   |||||| |||||| | ||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||    
T  20893047 gtgcatataagttgggt-ttgattgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtttg 20892950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 62; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 21 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 16154896 - 16154711
Alignment:
Q  21 tgaggatcgattgattagaggtacatgttattttgatagtacacctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgt 120  Q
    |||||||||| | || ||| |||| ||||  ||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| || |||||| | || |||    
T  16154896 tgaggatcgacttatcagatgtacttgtttctttaatagtactcctttagttgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattgaatgt 16154797  T
Q  121 gtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcagtgactacttctct 206  Q
    |  | |   |||||| | | | ||||||||||||| || || |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  16154796 gcatataagttgggtttggttgtgtctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctct 16154711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 62; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 19 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 27903501 - 27903305
Alignment:
Q  19 aatgaggatcgattgattagaggtacatgttattttgatagtacacctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgatt 118  Q
    |||||||||||| | || |||||||||||||  ||| ||||||| |||||| |||||||||| || ||||||||||| ||||| || |||||||| || |    
T  27903501 aatgaggatcgacttatcagaggtacatgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtgctactcattgtttcattgctttagaat 27903402  T
Q  119 gtgtttctgctttgggtcttgatt-tgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcagtgactacttctctcgtatgttt 215  Q
    |||  | |   ||||||| ||||| | ||||||||||| ||||| ||||| || ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| || |||||    
T  27903401 gtgcatataagttgggtc-tgattatatctgatatgaaaggagaaatggtcgttgaaactccagccaagggttcagtaactacttctctagtttgttt 27903305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 19 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 15073475 - 15073288
Alignment:
Q  19 aatgaggatcgattgattagaggtacatgttattttgatagtacacctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgatt 118  Q
    |||||||| ||| | || |||||||| ||||  ||| ||| ||| |||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||| || |||||| | ||||    
T  15073475 aatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaataatactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgatt 15073376  T
Q  119 gtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcagtgactacttctct 206  Q
    |||    |   |||| ||| | | | ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  15073375 gtgcacataagttggctctggttatatctgatatgaatggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctct 15073288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 19 - 206
Target Start/End: Original strand, 44659022 - 44659209
Alignment:
Q  19 aatgaggatcgattgattagaggtacatgttattttgatagtacacctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgatt 118  Q
    |||||||| ||| | || |||||||| ||||  ||| ||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||| | || |    
T  44659022 aatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgttttattgctattgaat 44659121  T
Q  119 gtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcagtgactacttctct 206  Q
    |||  | |   |||||| | ||| | ||||||||||| || || |||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  44659122 gtgcatataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctct 44659209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 21 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 16150750 - 16150565
Alignment:
Q  21 tgaggatcgattgattagaggtacatgttattttgatagtacacctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgt 120  Q
    |||||||||| | || ||| |||| ||||  ||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| || |||||| | || |||    
T  16150750 tgaggatcgacttatcagatgtacttgtttctttaatagtactcctttagttgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattgaatgt 16150651  T
Q  121 gtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcagtgactacttctct 206  Q
    |  | |   |||||| | | | | ||||||||||| || || |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  16150650 gcatataagttgggtttggttgtttctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctct 16150565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 19 - 206
Target Start/End: Original strand, 11204388 - 11204575
Alignment:
Q  19 aatgaggatcgattgattagaggtacatgttattttgatagtacacctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgatt 118  Q
    |||||||| ||| | || |||||||| ||||  ||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| | || |    
T  11204388 aatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgctattgaat 11204487  T
Q  119 gtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcagtgactacttctct 206  Q
    |||  | |   || ||| | ||| | |||| |||||| || || |||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  11204488 gtgcctataagttaggtttggatgtatctggtatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctct 11204575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 55; E-Value: 9e-23
Query Start/End: Original strand, 15 - 101
Target Start/End: Original strand, 18604711 - 18604797
Alignment:
Q  15 agagaatgaggatcgattgattagaggtacatgttattttgatagtacacctttagttgctattattgatactggtgctacgcattg 101  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||||| || ||| || ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18604711 agagaatgaggatcatttgattagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattg 18604797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 18 - 206
Target Start/End: Original strand, 14993522 - 14993710
Alignment:
Q  18 gaatgaggatcgattgattagaggtacatgttattttgatagtacacctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgat 117  Q
    ||||||||| ||| | || |||||||| ||||  ||| ||||||| |||||| |||||||||| |||||| |||||   ||||  || |||||| | |||    
T  14993522 gaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactagtgctcttcattatttcattgctgttgat 14993621  T
Q  118 tgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcagtgactacttctct 206  Q
    ||||  | |   |||||||| | | | ||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  14993622 tgtgcatataagttgggtctagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcactaactacttctct 14993710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 19 - 111
Target Start/End: Complemental strand, 7357383 - 7357291
Alignment:
Q  19 aatgaggatcgattgattagaggtacatgttattttgatagtacacctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgct 111  Q
    |||||||| ||| | || |||||||| ||||  ||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  7357383 aatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgct 7357291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 145 - 206
Target Start/End: Original strand, 15354322 - 15354383
Alignment:
Q  145 tctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcagtgactacttctct 206  Q
    ||||||||||| || || |||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  15354322 tctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctacgggttcagtaactacttctct 15354383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 163; Significance: 3e-87; HSPs: 60)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 163; E-Value: 3e-87
Query Start/End: Original strand, 14 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 10008340 - 10008138
Alignment:
Q  14 cagagaatgaggatcgattgattagaggtacatgttattttgatagtacacctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgcttt 113  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||||| || ||| || ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  10008340 cagagaatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgcttt 10008241  T
Q  114 cgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcagtgactacttctctcgtatgt 213  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  10008240 cgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgt 10008141  T
Q  214 ttg 216  Q
    |||    
T  10008140 ttg 10008138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 163; E-Value: 3e-87
Query Start/End: Original strand, 14 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 10908950 - 10908748
Alignment:
Q  14 cagagaatgaggatcgattgattagaggtacatgttattttgatagtacacctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgcttt 113  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||||| || ||| || ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  10908950 cagagaatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgcttt 10908851  T
Q  114 cgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcagtgactacttctctcgtatgt 213  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  10908850 cgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgt 10908751  T
Q  214 ttg 216  Q
    |||    
T  10908750 ttg 10908748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 163; E-Value: 3e-87
Query Start/End: Original strand, 14 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 12889449 - 12889247
Alignment:
Q  14 cagagaatgaggatcgattgattagaggtacatgttattttgatagtacacctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgcttt 113  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||||| || ||| || ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  12889449 cagagaatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgcttt 12889350  T
Q  114 cgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcagtgactacttctctcgtatgt 213  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  12889349 cgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgt 12889250  T
Q  214 ttg 216  Q
    |||    
T  12889249 ttg 12889247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 163; E-Value: 3e-87
Query Start/End: Original strand, 14 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 13255430 - 13255228
Alignment:
Q  14 cagagaatgaggatcgattgattagaggtacatgttattttgatagtacacctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgcttt 113  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||||| || ||| || ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  13255430 cagagaatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgcttt 13255331  T
Q  114 cgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcagtgactacttctctcgtatgt 213  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  13255330 cgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgt 13255231  T
Q  214 ttg 216  Q
    |||    
T  13255230 ttg 13255228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 159; E-Value: 8e-85
Query Start/End: Original strand, 14 - 216
Target Start/End: Original strand, 15345635 - 15345837
Alignment:
Q  14 cagagaatgaggatcgattgattagaggtacatgttattttgatagtacacctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgcttt 113  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||||| || ||| || ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  15345635 cagagaatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgcttt 15345734  T
Q  114 cgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcagtgactacttctctcgtatgt 213  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  15345735 cgattgtgtttctgctttgggtcttgttttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgt 15345834  T
Q  214 ttg 216  Q
    |||    
T  15345835 ttg 15345837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 159; E-Value: 8e-85
Query Start/End: Original strand, 14 - 216
Target Start/End: Original strand, 15586782 - 15586984
Alignment:
Q  14 cagagaatgaggatcgattgattagaggtacatgttattttgatagtacacctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgcttt 113  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||||| || ||| || ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  15586782 cagagaatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgcttt 15586881  T
Q  114 cgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcagtgactacttctctcgtatgt 213  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  15586882 cgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccggctaagggttcggtgactacttctctcgtatgt 15586981  T
Q  214 ttg 216  Q
    |||    
T  15586982 ttg 15586984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 159; E-Value: 8e-85
Query Start/End: Original strand, 14 - 216
Target Start/End: Original strand, 15713446 - 15713648
Alignment:
Q  14 cagagaatgaggatcgattgattagaggtacatgttattttgatagtacacctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgcttt 113  Q
    ||||||| |||||||| ||||| |||||||| || ||| || ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  15713446 cagagaacgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgcttt 15713545  T
Q  114 cgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcagtgactacttctctcgtatgt 213  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  15713546 cgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgt 15713645  T
Q  214 ttg 216  Q
    |||    
T  15713646 ttg 15713648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 159; E-Value: 8e-85
Query Start/End: Original strand, 14 - 216
Target Start/End: Original strand, 16754091 - 16754293
Alignment:
Q  14 cagagaatgaggatcgattgattagaggtacatgttattttgatagtacacctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgcttt 113  Q
    |||| ||||||||||| ||||| |||||||| || ||| || ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16754091 cagaaaatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgcttt 16754190  T
Q  114 cgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcagtgactacttctctcgtatgt 213  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  16754191 cgattgtgtttctgctttgggtcttgagttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgt 16754290  T
Q  214 ttg 216  Q
    |||    
T  16754291 ttg 16754293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 159; E-Value: 8e-85
Query Start/End: Original strand, 14 - 216
Target Start/End: Original strand, 20059444 - 20059646
Alignment:
Q  14 cagagaatgaggatcgattgattagaggtacatgttattttgatagtacacctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgcttt 113  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||||| || ||| || ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20059444 cagagaatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgcttt 20059543  T
Q  114 cgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcagtgactacttctctcgtatgt 213  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  20059544 cgattgtgtttctgctttgggtcttgagttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctagtatgt 20059643  T
Q  214 ttg 216  Q
    |||    
T  20059644 ttg 20059646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 159; E-Value: 8e-85
Query Start/End: Original strand, 14 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 43165415 - 43165213
Alignment:
Q  14 cagagaatgaggatcgattgattagaggtacatgttattttgatagtacacctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgcttt 113  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||||| || ||| || ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  43165415 cagagaatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgcttt 43165316  T
Q  114 cgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcagtgactacttctctcgtatgt 213  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  43165315 cgattgtgtttctgctttgggtcttgttttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgt 43165216  T
Q  214 ttg 216  Q
    |||    
T  43165215 ttg 43165213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 159; E-Value: 8e-85
Query Start/End: Original strand, 14 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 48428187 - 48427985
Alignment:
Q  14 cagagaatgaggatcgattgattagaggtacatgttattttgatagtacacctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgcttt 113  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||||| || ||| || ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  48428187 cagagaatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgcttt 48428088  T
Q  114 cgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcagtgactacttctctcgtatgt 213  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  48428087 cgattgtgtttctgctttgggtcttgttttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgt 48427988  T
Q  214 ttg 216  Q
    |||    
T  48427987 ttg 48427985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 159; E-Value: 8e-85
Query Start/End: Original strand, 14 - 216
Target Start/End: Original strand, 53382408 - 53382610
Alignment:
Q  14 cagagaatgaggatcgattgattagaggtacatgttattttgatagtacacctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgcttt 113  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||||| || ||| || ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  53382408 cagagaatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgcttt 53382507  T
Q  114 cgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcagtgactacttctctcgtatgt 213  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  53382508 cgattgtgtttctgctttgggtcttgagttgtctgatatgaatggagagatgattgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgt 53382607  T
Q  214 ttg 216  Q
    |||    
T  53382608 ttg 53382610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 158; E-Value: 3e-84
Query Start/End: Original strand, 14 - 223
Target Start/End: Original strand, 16804337 - 16804546
Alignment:
Q  14 cagagaatgaggatcgattgattagaggtacatgttattttgatagtacacctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgcttt 113  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||| |||| |||||| || ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16804337 cagagaatgaggatcgtttgatcagatgtacttgttatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgcttt 16804436  T
Q  114 cgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcagtgactacttctctcgtatgt 213  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||     
T  16804437 cgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtttgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggtttggtgactacttctctcgtatgc 16804536  T
Q  214 ttgtgatgtc 223  Q
    ||| ||||||    
T  16804537 ttgcgatgtc 16804546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 155; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 14 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 16638513 - 16638311
Alignment:
Q  14 cagagaatgaggatcgattgattagaggtacatgttattttgatagtacacctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgcttt 113  Q
    |||| ||||||||||| ||||| |||||||| || ||| || ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16638513 cagaaaatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgcttt 16638414  T
Q  114 cgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcagtgactacttctctcgtatgt 213  Q
     ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  16638413 tgattgtgtttctgctttgggtcttgttttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgt 16638314  T
Q  214 ttg 216  Q
    |||    
T  16638313 ttg 16638311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 155; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 14 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 16694904 - 16694694
Alignment:
Q  14 cagagaatgaggatcgattgattagaggtacatgttattttgatagtacacctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgcttt 113  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||||| || ||| || ||| ||| || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16694904 cagagaatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattaataatactcccttagttgttattattgatactggtgctacgcattgctttattgcttt 16694805  T
Q  114 cgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcagtgactacttctctcgtatgt 213  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  16694804 cgattgtgtttctgcgttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgagactccagctaagggttctgtgactacttctctcgtatgt 16694705  T
Q  214 ttgtgatgtcc 224  Q
    ||| |||||||    
T  16694704 ttgcgatgtcc 16694694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 153; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 16 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 15358821 - 15358621
Alignment:
Q  16 gagaatgaggatcgattgattagaggtacatgttattttgatagtacacctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcg 115  Q
    ||||| |||||||  ||||| |||||||| || ||| || ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  15358821 gagaacgaggatcatttgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcg 15358722  T
Q  116 attgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcagtgactacttctctcgtatgttt 215  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  15358721 attgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgttt 15358622  T
Q  216 g 216  Q
    |    
T  15358621 g 15358621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 152; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 17 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 6603472 - 6603273
Alignment:
Q  17 agaatgaggatcgattgattagaggtacatgttattttgatagtacacctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcga 116  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||||| || ||| || ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  6603472 agaatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacccattgctttattgctttcga 6603373  T
Q  117 ttgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcagtgactacttctctcgtatgtttg 216  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  6603372 ttgtgtttctgctttgggtcttgagttgtctgatatgaatggagagatggttgtcaaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttg 6603273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 151; E-Value: 5e-80
Query Start/End: Original strand, 14 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 3688683 - 3688481
Alignment:
Q  14 cagagaatgaggatcgattgattagaggtacatgttattttgatagtacacctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgcttt 113  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||||| || ||| || ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||     
T  3688683 cagagaatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgcttc 3688584  T
Q  114 cgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcagtgactacttctctcgtatgt 213  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  3688583 cgattgtgtttctgctttgggtcttgttttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccggctaagggttcggtgactacttctctcgtatgt 3688484  T
Q  214 ttg 216  Q
    |||    
T  3688483 ttg 3688481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 149; E-Value: 8e-79
Query Start/End: Original strand, 16 - 216
Target Start/End: Original strand, 15399909 - 15400109
Alignment:
Q  16 gagaatgaggatcgattgattagaggtacatgttattttgatagtacacctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcg 115  Q
    ||||| |||||||| ||||| |||||||| || ||| || ||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  15399909 gagaacgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttggttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcg 15400008  T
Q  116 attgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcagtgactacttctctcgtatgttt 215  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  15400009 attgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagcttagggttcggtgactacttctctcgtatgttt 15400108  T
Q  216 g 216  Q
    |    
T  15400109 g 15400109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 14 - 216
Target Start/End: Original strand, 26790803 - 26791005
Alignment:
Q  14 cagagaatgaggatcgattgattagaggtacatgttattttgatagtacacctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgcttt 113  Q
    ||||||| |||||||| ||||| |||||||| || ||| || ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||    
T  26790803 cagagaacgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgtttt 26790902  T
Q  114 cgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcagtgactacttctctcgtatgt 213  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  26790903 cgattgtgtttccgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccggctaagggttcggtgactacttctctcgtatgt 26791002  T
Q  214 ttg 216  Q
    |||    
T  26791003 ttg 26791005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 143; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 14 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 24185930 - 24185728
Alignment:
Q  14 cagagaatgaggatcgattgattagaggtacatgttattttgatagtacacctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgcttt 113  Q
    ||||| |||||||||| ||||| |||||||| || ||| || ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  24185930 cagaggatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctactcattgctttattgcttt 24185831  T
Q  114 cgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcagtgactacttctctcgtatgt 213  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  24185830 cgattgtgtttctactttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggtcgttgaaactccagctaagggtttggtgactacttctctcgtatgt 24185731  T
Q  214 ttg 216  Q
    |||    
T  24185730 ttg 24185728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 139; E-Value: 7e-73
Query Start/End: Original strand, 14 - 216
Target Start/End: Original strand, 5422320 - 5422522
Alignment:
Q  14 cagagaatgaggatcgattgattagaggtacatgttattttgatagtacacctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgcttt 113  Q
    |||||| ||| ||||| ||||| | |||||| || ||| || ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  5422320 cagagagtgacgatcgtttgatcaaaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgcttt 5422419  T
Q  114 cgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcagtgactacttctctcgtatgt 213  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  5422420 cgattgcgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccgactaagggttcggtgactacttctctcgtatgt 5422519  T
Q  214 ttg 216  Q
    |||    
T  5422520 ttg 5422522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 16 - 216
Target Start/End: Original strand, 14873960 - 14874160
Alignment:
Q  16 gagaatgaggatcgattgattagaggtacatgttattttgatagtacacctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcg 115  Q
    |||||||||||||| ||||| | ||||||||||||| || ||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||| || ||||| |||||||||||||    
T  14873960 gagaatgaggatcgcttgatcataggtacatgttatattaataatactcctttagttgctattattgatattggtgcaacacattgttttattgctttcg 14874059  T
Q  116 attgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcagtgactacttctctcgtatgttt 215  Q
    |||||| |||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  14874060 attgtgcttctactttgggtcttgatatgtctaatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgttt 14874159  T
Q  216 g 216  Q
    |    
T  14874160 g 14874160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 16 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 15065809 - 15065609
Alignment:
Q  16 gagaatgaggatcgattgattagaggtacatgttattttgatagtacacctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcg 115  Q
    |||||||||||||| ||||| | |||||| || ||| || ||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  15065809 gagaatgaggatcgcttgatcaaaggtacttgctatattaataatactcatttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcg 15065710  T
Q  116 attgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcagtgactacttctctcgtatgttt 215  Q
    |||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  15065709 attgtgcttcttctttgggtcttgttttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaatctccagctaagggttcggtgactacttctctcgtttgttt 15065610  T
Q  216 g 216  Q
    |    
T  15065609 g 15065609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 14 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 15262370 - 15262160
Alignment:
Q  14 cagagaatgaggatcgattgattagaggtacatgttattttgatagtacacctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgcttt 113  Q
    ||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |    
T  15262370 cagagaacgaggatcgtttgatcagaggtacatgttattttgatagtacacctttagttgctattattgatactggtgctacacattgttttattgctat 15262271  T
Q  114 cgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcagtgactacttctctcgtatgt 213  Q
     ||||||| ||||   |||||||||| | ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| || |||    
T  15262270 tgattgtgcttctaagttgggtcttgctatgtcaaatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaatggttcggtgactacttctcttgtgtgt 15262171  T
Q  214 ttgtgatgtcc 224  Q
    ||  |||||||    
T  15262170 ttaagatgtcc 15262160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 119; E-Value: 6e-61
Query Start/End: Original strand, 14 - 224
Target Start/End: Original strand, 12843493 - 12843703
Alignment:
Q  14 cagagaatgaggatcgattgattagaggtacatgttattttgatagtacacctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgcttt 113  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |    
T  12843493 cagagaatgaggatcgtttgatcagaggtacttgttattttgatagtatacctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctat 12843592  T
Q  114 cgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcagtgactacttctctcgtatgt 213  Q
     ||||||| ||||   |||| ||||| | ||||  ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||    
T  12843593 tgattgtgcttctaagttggatcttgctatgtcaaatatgaatggagagatgattgttgaaactccagctaatggttcagtgactacttctcttgtgtgt 12843692  T
Q  214 ttgtgatgtcc 224  Q
    ||  |||||||    
T  12843693 ttaagatgtcc 12843703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 16 - 224
Target Start/End: Original strand, 14578800 - 14579008
Alignment:
Q  16 gagaatgaggatcgattgattagaggtacatgttattttgatagtacacctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcg 115  Q
    |||||||||||||  ||||| |||| |||||||| | |||||| ||||||||||||| ||||||||||| || ||||||| ||||| ||||||||| | |    
T  14578800 gagaatgaggatcatttgatcagagctacatgttttattgataatacacctttagttactattattgatcctagtgctacacattgttttattgctattg 14578899  T
Q  116 attgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcagtgactacttctctcgtatgttt 215  Q
    |||||| ||||   |||||||||    ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||    
T  14578900 attgtgcttctaagttgggtcttcccatgtcaaatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcagtaactacttctatagtatgttt 14578999  T
Q  216 gtgatgtcc 224  Q
      |||||||    
T  14579000 aagatgtcc 14579008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 37 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 47126671 - 47126502
Alignment:
Q  37 agaggtacatgttattttgatagtacacctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtc 136  Q
    |||||||| ||||  ||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| | || |||| || |   ||||||     
T  47126671 agaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgctattgaatgtgcttataagttgggtt 47126572  T
Q  137 ttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcagtgactacttctct 206  Q
    | ||| | ||||||||||| || || |||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  47126571 tggatatatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctct 47126502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 37 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 17189101 - 17188922
Alignment:
Q  37 agaggtacatgttattttgatagtacacctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtc 136  Q
    |||||||| ||||  ||| ||||||| |||||| |||||||||| || || |||||||| ||||| || |||||||| || ||||  | |   ||||||     
T  17189101 agaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacacgggtgctactcattgtttcattgctttagaatgtgcatataaattgggt- 17189003  T
Q  137 ttgatt-tgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcagtgactacttctctcgtatgtttg 216  Q
    |||||| | ||||||||| | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  17189002 ttgattgtatctgatatggagggagagatggttgttgaaactccagctaagggttcagtgactacttctctcgtttgtttg 17188922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 37 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 24190031 - 24189852
Alignment:
Q  37 agaggtacatgttattttgatagtacacctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtc 136  Q
    |||||||| ||||  ||| ||||||| |||||| |||||||||| || ||||||||||| ||||| || |||||||| || ||||  | |   ||||||     
T  24190031 agaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtgctactcattgtttcattgctttagaatgtgcatataaattgggt- 24189933  T
Q  137 ttgatt-tgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcagtgactacttctctcgtatgtttg 216  Q
    |||||| | ||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  24189932 ttgattgtatctgatatgaagggagagatggttgttgagactccagctaagggttcagtgactacttttctcgtttgtttg 24189852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 19 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 28757064 - 28756877
Alignment:
Q  19 aatgaggatcgattgattagaggtacatgttattttgatagtacacctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgatt 118  Q
    |||||||| ||| | || |||||||| ||||  ||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| | || |    
T  28757064 aatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgctattgaat 28756965  T
Q  119 gtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcagtgactacttctct 206  Q
    |||  | |   |||||| | ||| | ||||||||||| || || |||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  28756964 gtgcatataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctct 28756877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 37 - 206
Target Start/End: Original strand, 8744792 - 8744961
Alignment:
Q  37 agaggtacatgttattttgatagtacacctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtc 136  Q
    |||||||| ||||  ||| ||||||| |||||| |||||||||| || ||||||||||| ||||| || |||||||| ||  |||  | |   ||||||     
T  8744792 agaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtgctactcattgtttcattgctttagaaagtgcatataggttgggt- 8744890  T
Q  137 ttgatt-tgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcagtgactacttctct 206  Q
    |||||| ||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8744891 ttgattgtgtctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtgactacttctct 8744961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 37 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 13944751 - 13944582
Alignment:
Q  37 agaggtacatgttattttgatagtacacctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtc 136  Q
    |||||||| ||||  ||| ||||||| |||||| |||||||||| || ||||||||||| ||||| || |||||||| || |||| || |    |||||     
T  13944751 agaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtgctactcattgtttcattgctttagaatgtgcttataaactgggt- 13944653  T
Q  137 ttgatt-tgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcagtgactacttctct 206  Q
    |||||| ||||||||||| | ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13944652 ttgattgtgtctgatatggaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtgactacttctct 13944582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 19 - 216
Target Start/End: Original strand, 16327093 - 16327290
Alignment:
Q  19 aatgaggatcgattgattagaggtacatgttattttgatagtacacctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgatt 118  Q
    |||||||| ||| | ||||||||||| ||||  ||| ||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||| || |||||||| ||      
T  16327093 aatgaggaccgacttattagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctttagaaa 16327192  T
Q  119 gtgtttctgctttgggtcttgatt-tgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcagtgactacttctctcgtatgtttg 216  Q
    |||  | |   |||||| |||||| | ||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| || ||||||    
T  16327193 gtgcatataagttgggt-ttgattgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccaactaagggttcagtaactacttctcttgtttgtttg 16327290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 62; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 37 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 10408695 - 10408526
Alignment:
Q  37 agaggtacatgttattttgatagtacacctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtc 136  Q
    |||||||| ||||  ||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| | || ||||  | |   ||||||     
T  10408695 agaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgctattgaatgtgcatataagttgggtt 10408596  T
Q  137 ttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcagtgactacttctct 206  Q
    | ||| | ||||||||||| || || |||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  10408595 tggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctct 10408526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 62; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 21 - 206
Target Start/End: Original strand, 12357913 - 12358098
Alignment:
Q  21 tgaggatcgattgattagaggtacatgttattttgatagtacacctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgt 120  Q
    |||||||||| | || |||||||| ||||  ||| |||||||||||||| |||||||||| || ||| ||||||| ||||| || |||||| | || |||    
T  12357913 tgaggatcgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtacacctttaattgctattatagacactagtgctactcattgtttcattgctattgaatgt 12358012  T
Q  121 gtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcagtgactacttctct 206  Q
    | || |   |||||||| | | | ||||||||||| ||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  12358013 gcttataagttgggtctggttgtatctgatatgaaaggaaaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctct 12358098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 62; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 19 - 132
Target Start/End: Original strand, 23079412 - 23079525
Alignment:
Q  19 aatgaggatcgattgattagaggtacatgttattttgatagtacacctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgatt 118  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||| || ||| || ||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||| || ||||| ||||||||||||||||    
T  23079412 aatgaggatcgcttgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatacttgtgcaacacattgttttattgctttcgatt 23079511  T
Q  119 gtgtttctgctttg 132  Q
    ||| ||||||||||    
T  23079512 gtgcttctgctttg 23079525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 61; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 19 - 206
Target Start/End: Original strand, 10417429 - 10417616
Alignment:
Q  19 aatgaggatcgattgattagaggtacatgttattttgatagtacacctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgatt 118  Q
    |||||||||||| | || |||||||| ||||  ||| ||||||| |||||| |||||||||| || || |||||||| ||||| || |||||||| || |    
T  10417429 aatgaggatcgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacaccggtgctacacattgtttcattgctttagagt 10417528  T
Q  119 gtgtttctgctttgggtcttgatt-tgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcagtgactacttctct 206  Q
    |||  | |   |||||||| |||| | ||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  10417529 gtgcatataagttgggtct-gattgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagccaagggttcagtgactacttctct 10417616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 61; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 14 - 86
Target Start/End: Complemental strand, 19727500 - 19727428
Alignment:
Q  14 cagagaatgaggatcgattgattagaggtacatgttattttgatagtacacctttagttgctattattgatac 86  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  19727500 cagagaatgaggatcgtttgattagaggtacatgttattttgatagtacacctatagttgctattattcatac 19727428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 18 - 216
Target Start/End: Original strand, 14290915 - 14291113
Alignment:
Q  18 gaatgaggatcgattgattagaggtacatgttattttgatagtacacctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgat 117  Q
    ||||||||| ||| | || |||||||| ||||  ||| ||||||| | |||| |||||||||| || ||| ||||||| ||||| || |||||| | |||    
T  14290915 gaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcatttaattgctattatagacactagtgctactcattgtttcattgctgttgat 14291014  T
Q  118 tgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcagtgactacttctctcgtatgtttg 216  Q
    ||||  | |   |||||||| | | | ||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||    
T  14291015 tgtgcatataagttgggtctggttatatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtttg 14291113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 130 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 17492475 - 17492381
Alignment:
Q  130 ttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcagtgactacttctctcgtatgtttgtgatgtcc 224  Q
    |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||| || |||||  |||||||    
T  17492475 ttgggtcttgttatgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagcgaagagttcggtgactacttctcttgtgtgtttaagatgtcc 17492381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 21 - 206
Target Start/End: Original strand, 31692571 - 31692756
Alignment:
Q  21 tgaggatcgattgattagaggtacatgttattttgatagtacacctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgt 120  Q
    |||||||||| | || |||||||| ||||  ||| ||||||| |||||| |||||||||| |||| ||||||||| ||||| || |||||| | || |||    
T  31692571 tgaggatcgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatattggtgctactcattgtttcattgctattgaatgt 31692670  T
Q  121 gtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcagtgactacttctct 206  Q
    | || |   | |||||| | | | ||||||||||| ||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  31692671 gcttataagtcgggtctggttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaacttcagctaagggttcagtaactacttctct 31692756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 55; E-Value: 9e-23
Query Start/End: Original strand, 14 - 96
Target Start/End: Complemental strand, 11861114 - 11861032
Alignment:
Q  14 cagagaatgaggatcgattgattagaggtacatgttattttgatagtacacctttagttgctattattgatactggtgctacg 96  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||| || ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11861114 cagagaatgaggatcgcttgatcagaggtacttgttatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacg 11861032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 55; E-Value: 9e-23
Query Start/End: Original strand, 19 - 216
Target Start/End: Original strand, 11958565 - 11958762
Alignment:
Q  19 aatgaggatcgattgattagaggtacatgttattttgatagtacacctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgatt 118  Q
    |||||||| ||| | || |||||||| ||||  ||| ||||||  |||||| |||||||||| || ||||||||||| ||||| || |||||||| ||      
T  11958565 aatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtaatcctttaattgctattatagacactggtgctactcattgtttcattgctttagaaa 11958664  T
Q  119 gtgtttctgctttgggtcttgatt-tgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcagtgactacttctctcgtatgtttg 216  Q
    |||  | |   |||||| |||||| | ||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||    
T  11958665 gtgcatataagttgggt-ttgattgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtttg 11958762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 55; E-Value: 9e-23
Query Start/End: Original strand, 56 - 206
Target Start/End: Original strand, 16825702 - 16825852
Alignment:
Q  56 atagtacacctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaa 155  Q
    ||||||| |||||| |||||||||| |||||| ||||||| ||||| || |||||| | |||||||  | |   |||||||| | | | |||||||||||    
T  16825702 atagtactcctttaattgctattatagatactagtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgggtctggttgtatctgatatgaa 16825801  T
Q  156 tggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcagtgactacttctct 206  Q
     ||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  16825802 aggataaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctct 16825852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 37 - 202
Target Start/End: Original strand, 11949327 - 11949492
Alignment:
Q  37 agaggtacatgttattttgatagtacacctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtc 136  Q
    |||||||| ||||  ||| ||||||| |||||| |||||||||| || ||||||||||| ||||| || |||||| | || |||| || |   |||||||    
T  11949327 agaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtgctactcattgtttcattgctattgaatgtggttataagttgggtc 11949426  T
Q  137 ttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcagtgactactt 202  Q
    | | | | ||||||||||| || || |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  11949427 tggttgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactactt 11949492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 37 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 12181071 - 12180902
Alignment:
Q  37 agaggtacatgttattttgatagtacacctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtc 136  Q
    |||||||| ||||  ||| ||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||| || |||||| | || |||| || |   |||||||    
T  12181071 agaggtacttgtttctttaatagtactcctttagttgctattatagacactggtgctactcattgtttcattgctattgaatgtgcttataagttgggtc 12180972  T
Q  137 ttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcagtgactacttctct 206  Q
    |   | | ||| ||||||| ||||| |||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  12180971 tgtttgtatctaatatgaaaggagaaatggttgttgacactccagctaagggttcagtaactacttctct 12180902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 19 - 216
Target Start/End: Original strand, 12509867 - 12510064
Alignment:
Q  19 aatgaggatcgattgattagaggtacatgttattttgatagtacacctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgatt 118  Q
    |||||||| ||| | || |||||||| ||||  ||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| | || |    
T  12509867 aatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgctattgaat 12509966  T
Q  119 gtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcagtgactacttctctcgtatgtttg 216  Q
    |||  | |   |||||| | ||| | ||||||||||| || || |||||||| |||||||||||||||  |||||  || |||||||| || ||||||    
T  12509967 gtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagatttcagcaaccacttctctggtttgtttg 12510064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 37 - 226
Target Start/End: Original strand, 12857897 - 12858086
Alignment:
Q  37 agaggtacatgttattttgatagtacacctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtc 136  Q
    |||||||| ||||  ||| ||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||   |||| || |||||| | | |||||  | |   |||| ||    
T  12857897 agaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctagttattgtttcattgctgtggtttgtgcatataagttggttc 12857996  T
Q  137 ttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcagtgactacttctctcgtatgtttgtgatgtccat 226  Q
    | | | | ||||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||| | |||||||    
T  12857997 tggttatatctgatatgaatggagaaacggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtttgagttgtccat 12858086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 21 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 31941646 - 31941461
Alignment:
Q  21 tgaggatcgattgattagaggtacatgttattttgatagtacacctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgt 120  Q
    |||||||||| | || |||||||| ||||  ||| ||||||| |||||| |||||||||| ||||||| |||||| ||||  || |||||| | || |||    
T  31941646 tgaggatcgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactgatgctactcattttttcattgctattgaatgt 31941547  T
Q  121 gtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcagtgactacttctct 206  Q
    | || |   |||||||| | | | ||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||  ||| |||||||||||    
T  31941546 gcttataagttgggtctggttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggtctagtaactacttctct 31941461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 37 - 216
Target Start/End: Original strand, 16831930 - 16832109
Alignment:
Q  37 agaggtacatgttattttgatagtacacctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtc 136  Q
    |||||||| ||||  ||| ||||||| |||||| |||||||||| || ||||||||||| ||||| || |||||||| ||  |||  | |   ||||||     
T  16831930 agaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtgctactcattgtttcattgctttagaaagtgcatataagttgggt- 16832028  T
Q  137 ttgatt-tgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcagtgactacttctctcgtatgtttg 216  Q
    |||||| | ||||||||||| | ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||    
T  16832029 ttgattgtatctgatatgaaagaagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtttg 16832109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 56 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 12273046 - 12272896
Alignment:
Q  56 atagtacacctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaa 155  Q
    ||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||| || |||| | | || | ||  | |   |||||||| | | | |||||||||||    
T  12273046 atagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgttgttgactatgcatttaagttgggtctggttgtatctgatatgaa 12272947  T
Q  156 tggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcagtgactacttctct 206  Q
     ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  12272946 aggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctct 12272896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 37 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 17494374 - 17494204
Alignment:
Q  37 agaggtacatgttattttgatagtacacctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtc 136  Q
    |||||||| ||||  ||| ||||||| |||||| |||||||||| || ||||||||||| ||||| || |||||| | || |||| || |   |||||||    
T  17494374 agaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtgctactcattgtttcattgctattgaatgtgcttataaattgggtc 17494275  T
Q  137 ttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcg-aaactccagctaagggttcagtgactacttctct 206  Q
    | | | | ||||||||||| ||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  17494274 tggttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaaactccagctaagggttcagtaactaattctct 17494204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 50; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 21 - 206
Target Start/End: Original strand, 18131733 - 18131917
Alignment:
Q  21 tgaggatcgattgattagaggtacatgttattttgatagtacacctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgt 120  Q
    |||||||||| | || |||||||| ||||  ||| ||||||| |||||| |||||||||| ||  |||||||||| ||||| || |||||| | || |||    
T  18131733 tgaggatcgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagac-ctggtgctactcattgtttcattgctattgaatgt 18131831  T
Q  121 gtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcagtgactacttctct 206  Q
    | || |   |||||||| | | | ||||||||||| || || | |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  18131832 gcttataagttgggtctggttgtatctgatatgaaaggggaaacggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctct 18131917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 39 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 15230328 - 15230141
Alignment:
Q  39 aggtacatgttattttgatagtacacctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtctt 138  Q
    |||||| ||||  ||| ||||||| |||||| |||||||||| || ||||||||||| ||||| || |||||| | |||| ||  | |   ||||||||     
T  15230328 aggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtgctacacattgtttcattgctgttgattttgcatataagttgggtctg 15230229  T
Q  139 gatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcagtgactacttctctcgtatgtttgtgatgtccat 226  Q
    | | ||||   ||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||| || |||||| | |||||||    
T  15230228 gttatgtcaagtatgagtggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcattaactacttctcttgtttgtttgagttgtccat 15230141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 39 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 15236196 - 15236009
Alignment:
Q  39 aggtacatgttattttgatagtacacctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtctt 138  Q
    |||||| ||||  ||| ||||||| |||||| |||||||||| || ||||||||||| ||||| || |||||| | |||| ||  | |   ||||||||     
T  15236196 aggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtgctacacattgtttcattgctgttgattttgcatataagttgggtctg 15236097  T
Q  139 gatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcagtgactacttctctcgtatgtttgtgatgtccat 226  Q
    | | ||||   ||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||| || |||||| | |||||||    
T  15236096 gttatgtcaagtatgagtggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcattaactacttctcttgtttgtttgagttgtccat 15236009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 18 - 212
Target Start/End: Original strand, 15013152 - 15013346
Alignment:
Q  18 gaatgaggatcgattgattagaggtacatgttattttgatagtacacctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgat 117  Q
    ||||||||||||  | || |||||||||||||   || |||| || |||||| || ||||||| |||||| ||| ||| ||||  ||||||| |   |||    
T  15013152 gaatgaggatcgtctaatcagaggtacatgtttcattaatagcactcctttaattactattatagatactagtgttacacatttttttattgttgctgat 15013251  T
Q  118 tgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcagtgactacttctctcgtatg 212  Q
    |||| | ||   |||||||||| | ||||   ||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  15013252 tgtgctactaagttgggtcttgttatgtcgtctatgaatggggaaatggttgtcgaaaccccagctaagggttcggtgactacttctctagtatg 15013346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 145 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 14575605 - 14575544
Alignment:
Q  145 tctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcagtgactacttctct 206  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  14575605 tctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctct 14575544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 37 - 187
Target Start/End: Original strand, 13317936 - 13318086
Alignment:
Q  37 agaggtacatgttattttgatagtacacctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtc 136  Q
    |||||||| ||||  ||| ||||||| |||||| |||||||||| || ||||||||||| ||||| || |||||||| || ||||  | |   ||||| |    
T  13317936 agaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtgctactcattgtttcattgctttagaatgtgcatataagttggg-c 13318034  T
Q  137 ttgatt-tgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagg 187  Q
    |||||| | ||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  13318035 ttgattgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagg 13318086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 56 - 206
Target Start/End: Original strand, 16378355 - 16378505
Alignment:
Q  56 atagtacacctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatt-tgtctgatatga 154  Q
    ||||||| |||||| ||||||| || || ||||||||||| ||||| || |||||||| ||  |||  | |   |||||| |||||| | |||||||| |    
T  16378355 atagtactcctttaattgctatcatagacactggtgctactcattgtttcattgctttagaaagtgcatataagttgggt-ttgattgtatctgatatta 16378453  T
Q  155 atggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcagtgactacttctct 206  Q
    | ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  16378454 aaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctct 16378505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 163; Significance: 3e-87; HSPs: 38)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 163; E-Value: 3e-87
Query Start/End: Original strand, 14 - 216
Target Start/End: Original strand, 22323033 - 22323235
Alignment:
Q  14 cagagaatgaggatcgattgattagaggtacatgttattttgatagtacacctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgcttt 113  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||||| || ||| || ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  22323033 cagagaatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgcttt 22323132  T
Q  114 cgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcagtgactacttctctcgtatgt 213  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  22323133 cgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgt 22323232  T
Q  214 ttg 216  Q
    |||    
T  22323233 ttg 22323235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 163; E-Value: 3e-87
Query Start/End: Original strand, 14 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 24712786 - 24712584
Alignment:
Q  14 cagagaatgaggatcgattgattagaggtacatgttattttgatagtacacctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgcttt 113  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||||| || ||| || ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  24712786 cagagaatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgcttt 24712687  T
Q  114 cgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcagtgactacttctctcgtatgt 213  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  24712686 cgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgt 24712587  T
Q  214 ttg 216  Q
    |||    
T  24712586 ttg 24712584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 159; E-Value: 8e-85
Query Start/End: Original strand, 14 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 9338334 - 9338132
Alignment:
Q  14 cagagaatgaggatcgattgattagaggtacatgttattttgatagtacacctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgcttt 113  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||||| || ||| || ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  9338334 cagagaatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgcttt 9338235  T
Q  114 cgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcagtgactacttctctcgtatgt 213  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  9338234 cgattgtgtttctgctttgggtcttgttttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgt 9338135  T
Q  214 ttg 216  Q
    |||    
T  9338134 ttg 9338132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 159; E-Value: 8e-85
Query Start/End: Original strand, 14 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 9486968 - 9486766
Alignment:
Q  14 cagagaatgaggatcgattgattagaggtacatgttattttgatagtacacctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgcttt 113  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||||| || ||| || ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  9486968 cagagaatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgcttt 9486869  T
Q  114 cgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcagtgactacttctctcgtatgt 213  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  9486868 cgattgtgtttctgctttgggtcttgttttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgt 9486769  T
Q  214 ttg 216  Q
    |||    
T  9486768 ttg 9486766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 159; E-Value: 8e-85
Query Start/End: Original strand, 14 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 10871602 - 10871400
Alignment:
Q  14 cagagaatgaggatcgattgattagaggtacatgttattttgatagtacacctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgcttt 113  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||||| || ||| || ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  10871602 cagagaatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgcttt 10871503  T
Q  114 cgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcagtgactacttctctcgtatgt 213  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  10871502 cgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccggctaagggttcggtgactacttctctcgtatgt 10871403  T
Q  214 ttg 216  Q
    |||    
T  10871402 ttg 10871400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 159; E-Value: 8e-85
Query Start/End: Original strand, 14 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 16983992 - 16983790
Alignment:
Q  14 cagagaatgaggatcgattgattagaggtacatgttattttgatagtacacctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgcttt 113  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||||| || ||| || ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  16983992 cagagaatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgcttt 16983893  T
Q  114 cgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcagtgactacttctctcgtatgt 213  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  16983892 cgattgtgtttctgctttgggtcttgttttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgt 16983793  T
Q  214 ttg 216  Q
    |||    
T  16983792 ttg 16983790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 159; E-Value: 8e-85
Query Start/End: Original strand, 14 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 17001752 - 17001550
Alignment:
Q  14 cagagaatgaggatcgattgattagaggtacatgttattttgatagtacacctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgcttt 113  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||||| || ||| || ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  17001752 cagagaatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgcttt 17001653  T
Q  114 cgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcagtgactacttctctcgtatgt 213  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  17001652 cgattgtgtttctgctttgggtcttgatttatctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgt 17001553  T
Q  214 ttg 216  Q
    |||    
T  17001552 ttg 17001550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 159; E-Value: 8e-85
Query Start/End: Original strand, 14 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 27374021 - 27373819
Alignment:
Q  14 cagagaatgaggatcgattgattagaggtacatgttattttgatagtacacctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgcttt 113  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||| |||| || ||| || ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  27374021 cagagaatgaggatcgtttgatcagatgtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgcttt 27373922  T
Q  114 cgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcagtgactacttctctcgtatgt 213  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  27373921 cgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgt 27373822  T
Q  214 ttg 216  Q
    |||    
T  27373821 ttg 27373819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 159; E-Value: 8e-85
Query Start/End: Original strand, 14 - 216
Target Start/End: Original strand, 44383261 - 44383463
Alignment:
Q  14 cagagaatgaggatcgattgattagaggtacatgttattttgatagtacacctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgcttt 113  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||||| || ||| || ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  44383261 cagagaatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgcttt 44383360  T
Q  114 cgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcagtgactacttctctcgtatgt 213  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  44383361 cgattgtgtttctgttttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgt 44383460  T
Q  214 ttg 216  Q
    |||    
T  44383461 ttg 44383463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 152; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 16 - 215
Target Start/End: Original strand, 24874443 - 24874642
Alignment:
Q  16 gagaatgaggatcgattgattagaggtacatgttattttgatagtacacctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcg 115  Q
    ||||| |||||||| ||||| |||||||| || ||| || ||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24874443 gagaacgaggatcgcttgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagtttctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcg 24874542  T
Q  116 attgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcagtgactacttctctcgtatgttt 215  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  24874543 attgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaaggtttcggtgactacttctctcgtatgttt 24874642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 16 - 213
Target Start/End: Original strand, 22742659 - 22742856
Alignment:
Q  16 gagaatgaggatcgattgattagaggtacatgttattttgatagtacacctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcg 115  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  22742659 gagaatgaggatcgcttgatcagaggtacatgttatattgataatactcctttagttgctattattggtactggtgctacgcattgttttattgctttcg 22742758  T
Q  116 attgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcagtgactacttctctcgtatgt 213  Q
    |||||| |||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  22742759 attgtgcttctactttgggtcttgttatgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgt 22742856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 18 - 223
Target Start/End: Original strand, 45673707 - 45673912
Alignment:
Q  18 gaatgaggatcgattgattagaggtacatgttattttgatagtacacctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgat 117  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| || ||| || ||| ||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  45673707 gaatgaggatcgattgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgataatggagctacgcattgttttattgctttcgat 45673806  T
Q  118 tgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcagtgactacttctctcgtatgtttgt 217  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||     
T  45673807 tgtgattctgctttgggtcttgttttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttga 45673906  T
Q  218 gatgtc 223  Q
    ||||||    
T  45673907 gatgtc 45673912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 148; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 17 - 224
Target Start/End: Original strand, 23029155 - 23029362
Alignment:
Q  17 agaatgaggatcgattgattagaggtacatgttattttgatagtacacctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcga 116  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||||||| |||| || ||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  23029155 agaatgaggatcgcttgatcagaggtacatcttatattaataatactcccttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcga 23029254  T
Q  117 ttgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcagtgactacttctctcgtatgtttg 216  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  23029255 ttgtgcttctgctttgggtcttgttttgtctgatatgaatggagtgatggttgtcgaaaatccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttg 23029354  T
Q  217 tgatgtcc 224  Q
     |||||||    
T  23029355 agatgtcc 23029362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 148; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 14 - 221
Target Start/End: Original strand, 24705173 - 24705380
Alignment:
Q  14 cagagaatgaggatcgattgattagaggtacatgttattttgatagtacacctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgcttt 113  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||| || ||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  24705173 cagagaatgaggatcgcttgatcagaggtacttgttatattaataatactcctttagttgatattattgatactggtgctacgcattgttttattgcttt 24705272  T
Q  114 cgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcagtgactacttctctcgtatgt 213  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||    
T  24705273 cgattgtgtttctactttgggtcttgatttgtctgatatgaatgcagagatggttgtcgaaactccagctaagggtttggtaactacttctctcgtatgt 24705372  T
Q  214 ttgtgatg 221  Q
    ||| ||||    
T  24705373 ttgagatg 24705380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 148; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 37 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 27220745 - 27220566
Alignment:
Q  37 agaggtacatgttattttgatagtacacctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtc 136  Q
    |||||||| || ||| || ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27220745 agaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtc 27220646  T
Q  137 ttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcagtgactacttctctcgtatgtttg 216  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  27220645 ttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttg 27220566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 14 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 24265122 - 24264920
Alignment:
Q  14 cagagaatgaggatcgattgattagaggtacatgttattttgatagtacacctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgcttt 113  Q
    ||||||| |||||||| ||||| |||||||| || ||| || ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  24265122 cagagaacgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgcttt 24265023  T
Q  114 cgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcagtgactacttctctcgtatgt 213  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  24265022 cgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgagtggatagatggttgtcgaaactccggctaagggttcggtgactacttctctcgtatgt 24264923  T
Q  214 ttg 216  Q
    |||    
T  24264922 ttg 24264920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 14 - 224
Target Start/End: Original strand, 24657349 - 24657559
Alignment:
Q  14 cagagaatgaggatcgattgattagaggtacatgttattttgatagtacacctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgcttt 113  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||||| || ||| || ||| ||| || |||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||||    
T  24657349 cagagaatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattaataatactccattagttgctattattgatacagctgctacgcattgttttattgcttt 24657448  T
Q  114 cgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcagtgactacttctctcgtatgt 213  Q
    ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  24657449 cgattgtgtttctactttggatcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgt 24657548  T
Q  214 ttgtgatgtcc 224  Q
    ||| |||||||    
T  24657549 ttgagatgtcc 24657559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 16 - 216
Target Start/End: Original strand, 21322959 - 21323159
Alignment:
Q  16 gagaatgaggatcgattgattagaggtacatgttattttgatagtacacctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcg 115  Q
    ||||||||||||||  | || ||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  21322959 gagaatgaggatcgcctaatcagaggtacatgttatattgataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcg 21323058  T
Q  116 attgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcagtgactacttctctcgtatgttt 215  Q
    |||||| |||| |||||||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  21323059 attgtgcttctactttgggtcttgttatgtctgatatgattggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgttt 21323158  T
Q  216 g 216  Q
    |    
T  21323159 g 21323159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 143; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 14 - 216
Target Start/End: Original strand, 11351402 - 11351604
Alignment:
Q  14 cagagaatgaggatcgattgattagaggtacatgttattttgatagtacacctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgcttt 113  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||||| || ||| || ||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  11351402 cagagaatgaggatcgcttgatcagaggtacttgctatattaataatactcatttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgcttt 11351501  T
Q  114 cgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcagtgactacttctctcgtatgt 213  Q
    |||||||| |||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  11351502 cgattgtgcttctactttgggtctagatatgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgt 11351601  T
Q  214 ttg 216  Q
    |||    
T  11351602 ttg 11351604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 64 - 216
Target Start/End: Original strand, 21142782 - 21142934
Alignment:
Q  64 cctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagaga 163  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21142782 cctttagttgctattattgatattggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgttttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagaga 21142881  T
Q  164 tggttgtcgaaactccagctaagggttcagtgactacttctctcgtatgtttg 216  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  21142882 tggttgtcgaaactccagctaagggttcgatgactacttctctcgtatgtttg 21142934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 14 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 23205066 - 23204868
Alignment:
Q  14 cagagaatgaggatcgattgattagaggtacatgttattttgatagtacacctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgcttt 113  Q
    |||||||||||||||  ||||| |||||||| || ||| || ||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||    
T  23205066 cagagaatgaggatcatttgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactagtgctacgcattgcatttttgcttt 23204967  T
Q  114 cgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcagtgactacttctctcgtatg 212  Q
    | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  23204966 ccattgtgtttctgctttgggtcttgatgtgtctgatatgaatggagagatggttgtcgatactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatg 23204868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 14 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 24678239 - 24678029
Alignment:
Q  14 cagagaatgaggatcgattgattagaggtacatgttattttgatagtacacctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgcttt 113  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||||| || ||| |  ||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||    
T  24678239 cagagaatgaggatcgcttgatcagaggtacttgctatatgaataatactcctttagttgctattaatgatactggtgctaggcattgttttattgcttt 24678140  T
Q  114 cgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcagtgactacttctctcgtatgt 213  Q
    |||||||| |||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  24678139 cgattgtgcttctactttgggtctagatatgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaacttcagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgt 24678040  T
Q  214 ttgtgatgtcc 224  Q
    ||| |||||||    
T  24678039 ttgagatgtcc 24678029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 119; E-Value: 6e-61
Query Start/End: Original strand, 14 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 23074615 - 23074405
Alignment:
Q  14 cagagaatgaggatcgattgattagaggtacatgttattttgatagtacacctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgcttt 113  Q
    ||||||| |||||||| ||||| |||||||| |||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  23074615 cagagaacgaggatcgcttgatcagaggtacttgttatattgataatacacatttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgcttt 23074516  T
Q  114 cgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcagtgactacttctctcgtatgt 213  Q
     ||||||| |  |   |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||    
T  23074515 tgattgtgctattaagttgggtcttgctatgtctgatatgaatggagagatggttatcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctcttgtgtgt 23074416  T
Q  214 ttgtgatgtcc 224  Q
    ||  |||||||    
T  23074415 ttaagatgtcc 23074405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 117; E-Value: 9e-60
Query Start/End: Original strand, 14 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 23065165 - 23064973
Alignment:
Q  14 cagagaatgaggatcgattgattagaggtacatgttattttgatagtacacctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgcttt 113  Q
    ||||||| |||||||| ||||| |||||||| |||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  23065165 cagagaacgaggatcgcttgatcagaggtacttgttatattgataatacacatttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgcttt 23065066  T
Q  114 cgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcagtgactacttctct 206  Q
     ||||||| |  |   |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  23065065 tgattgtgctattaagttgggtcttgctatgtctgatatgaatggagagatggttatcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctct 23064973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 15 - 206
Target Start/End: Original strand, 24817532 - 24817723
Alignment:
Q  15 agagaatgaggatcgattgattagaggtacatgttattttgatagtacacctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttc 114  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |     
T  24817532 agagaatgaggatcgattgattagaggtacatgtcattttgaaagtactcctttagttgatattattgatactggtgctacgcattgttttattgctctt 24817631  T
Q  115 gattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcagtgactacttctct 206  Q
    ||||||| ||||   |||||||||    ||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  24817632 gattgtgcttctaagttgggtcttacaatgtcgaatatgaatggagaaatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctct 24817723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 113; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 14 - 206
Target Start/End: Original strand, 22733465 - 22733657
Alignment:
Q  14 cagagaatgaggatcgattgattagaggtacatgttattttgatagtacacctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgcttt 113  Q
    ||||||| |||||||| ||||| |||||||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  22733465 cagagaacgaggatcgcttgatcagaggtacttgttatattgataatacacctttagttgctattattgatactggtgctacgcgttgatttattgcttt 22733564  T
Q  114 cgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcagtgactacttctct 206  Q
     ||||||| | ||   ||||||||||   ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  22733565 tgattgtgctactaagttgggtcttgtcatgtctgatatgaatggagaaatggttgtcgaaactccaactaagggttcggtgactacttctct 22733657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 101; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 16 - 224
Target Start/End: Original strand, 23105421 - 23105629
Alignment:
Q  16 gagaatgaggatcgattgattagaggtacatgttattttgatagtacacctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcg 115  Q
    ||||| |||||||| ||||  |||||||| || ||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||  |    
T  23105421 gagaacgaggatcgtttgaccagaggtacttgctatattgataatacacctttagttgctattattgttactggtgctacgcattgttttatttcttatg 23105520  T
Q  116 attgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcagtgactacttctctcgtatgttt 215  Q
    |||||| | ||   ||||||||||   ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||    
T  23105521 attgtgctactaagttgggtcttgtcatgtctgatatgaatggagaaatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctcttgtgtgttt 23105620  T
Q  216 gtgatgtcc 224  Q
      |||||||    
T  23105621 aagatgtcc 23105629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 86 - 216
Target Start/End: Original strand, 41606155 - 41606279
Alignment:
Q  86 ctggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaa 185  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||| || | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  41606155 ctggtgctacgcat-gctttat-gctttcgat-gtgtttctgctttgtgtct-gagt-gtctgatatgaatggagagatggt-gtcgaaactccggctaa 41606248  T
Q  186 gggttcagtgactacttctctcgtatgtttg 216  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  41606249 gggttcggtgactacttctctcgtatgtttg 41606279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 39 - 226
Target Start/End: Original strand, 19716733 - 19716920
Alignment:
Q  39 aggtacatgttattttgatagtacacctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtctt 138  Q
    |||||| ||||  ||| ||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||| || |||||| | || |||| || |   |||||| |     
T  19716733 aggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattgaatgtgcttataagttgggttta 19716832  T
Q  139 gatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcagtgactacttctctcgtatgtttgtgatgtccat 226  Q
    | | | |||||| |||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || ||| |||||||||    
T  19716833 gttgtatctgatttgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgcttgagatgtccat 19716920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 19 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 20848336 - 20848149
Alignment:
Q  19 aatgaggatcgattgattagaggtacatgttattttgatagtacacctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgatt 118  Q
    |||||||| ||| | || |||||||| ||||  ||| ||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||| | || |    
T  20848336 aatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgttttattgctattgaat 20848237  T
Q  119 gtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcagtgactacttctct 206  Q
    |||  | |   |||||| | ||| | ||||||||||| || || |||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  20848236 gtgcatataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctct 20848149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 39 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 23113450 - 23113263
Alignment:
Q  39 aggtacatgttattttgatagtacacctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtctt 138  Q
    |||||| ||||  ||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||| | | |||||||  | |   ||||||||     
T  23113450 aggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctacacattgtttcattgttgttgattgtgcatataaattgggtctg 23113351  T
Q  139 gatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcagtgactacttctctcgtatgtttgtgatgtccat 226  Q
    | | ||||   ||||| |||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| |||||| | |||||||    
T  23113350 gttatgtcaagtatgagtggagaaatggttgttgaaactccaactaagggttcagtaactacttctctcgtttgtttgagttgtccat 23113263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 21 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 23274338 - 23274153
Alignment:
Q  21 tgaggatcgattgattagaggtacatgttattttgatagtacacctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgt 120  Q
    |||||||||| | || |||||||| ||||  ||| ||||||| |||||| |||||||||| || || |||||||| ||||| || |||||| | || |||    
T  23274338 tgaggatcgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacaccggtgctactcattgtttcattgctattgaatgt 23274239  T
Q  121 gtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcagtgactacttctct 206  Q
    | || |   |||||||| | | | ||||||||||| || || |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  23274238 gcttataagttgggtctggttgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctct 23274153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 56 - 216
Target Start/End: Original strand, 23097751 - 23097911
Alignment:
Q  56 atagtacacctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaa 155  Q
    ||||||| |||||| |||||||||| || ||||||||||| ||||| || |||||||| || ||||  | |   |||||||| | | |  |||| |||||    
T  23097751 atagtactcctttaattgctattatagacactggtgctactcattgtttcattgctttagaatgtgcatttaagttgggtctggttgtaactgacatgaa 23097850  T
Q  156 tggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcagtgactacttctctcgtatgtttg 216  Q
     |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||    
T  23097851 aggagagatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtttg 23097911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 55; E-Value: 9e-23
Query Start/End: Original strand, 37 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 12577082 - 12576913
Alignment:
Q  37 agaggtacatgttattttgatagtacacctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtc 136  Q
    |||||||| ||||  ||| ||||||  |||||| |||||||||| || ||||||||||| ||||| || |||||||| || ||||  | |    |||||     
T  12577082 agaggtacttgtttctttaatagtattcctttaattgctattatagacactggtgctactcattgtttcattgctttagaatgtgcctataaactgggt- 12576984  T
Q  137 ttgatt-tgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcagtgactacttctct 206  Q
    |||||| ||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  12576983 ttgattgtgtctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcaatgactacttctct 12576913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 14 - 102
Target Start/End: Complemental strand, 23676670 - 23676582
Alignment:
Q  14 cagagaatgaggatcgattgattagaggtacatgttattttgatagtacacctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgc 102  Q
    |||||||||||||||  ||||| |||||||| || ||| || ||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  23676670 cagagaatgaggatcatttgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactagtgctacgcattgc 23676582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 18 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 19817595 - 19817401
Alignment:
Q  18 gaatgaggatcgattgattagaggtacatgttattttgatagtacacctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgat 117  Q
    ||||||||||||  |||| |||||||||||||   || ||||||| || ||| || ||| ||  |||||||||||||| |||||||||||||||   |||    
T  19817595 gaatgaggatcgtctgatcagaggtacatgtttcattaatagtactcccttaattactactacagatactggtgctacacattgctttattgctgcggat 19817496  T
Q  118 tgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcagtgactacttctctcgtatg 212  Q
    ||||||||    || ||||||| | ||||   || ||||||  | ||||||||| |||  || ||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  19817495 tgtgtttcgaaattaggtcttgttatgtcatctacgaatgggcaaatggttgtcaaaaacccggctaagggttcggtgactacttctctagtatg 19817401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 18 - 199
Target Start/End: Original strand, 30208615 - 30208796
Alignment:
Q  18 gaatgaggatcgattgattagaggtacatgttattttgatagtacacctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgat 117  Q
    |||||||||||   |||| | |||||||||||   || ||||||| || ||| || ||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||   |||    
T  30208615 gaatgaggatcatctgatcaaaggtacatgtttcattaatagtactcccttaattactattatagatactggtgctacacattgttttattgctgctgat 30208714  T
Q  118 tgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcagtgacta 199  Q
    ||||||||    |||||||||| | ||||   |||||| || || |||||||||||||| || || |||||||| |||||||    
T  30208715 tgtgtttcgaaattgggtcttgttatgtcgtctatgaaaggggaaatggttgtcgaaaccccggcaaagggttcggtgacta 30208796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 39 - 101
Target Start/End: Original strand, 19721296 - 19721358
Alignment:
Q  39 aggtacatgttattttgatagtacacctttagttgctattattgatactggtgctacgcattg 101  Q
    |||||| ||||  ||| ||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  19721296 aggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattg 19721358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 163; Significance: 3e-87; HSPs: 34)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 163; E-Value: 3e-87
Query Start/End: Original strand, 14 - 224
Target Start/End: Original strand, 17042238 - 17042448
Alignment:
Q  14 cagagaatgaggatcgattgattagaggtacatgttattttgatagtacacctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgcttt 113  Q
    |||||| ||||||||| ||||| |||||||| |||||| || ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  17042238 cagagactgaggatcgtttgatcagaggtacttgttatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacacattgctttattgcttt 17042337  T
Q  114 cgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcagtgactacttctctcgtatgt 213  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  17042338 cgattgtgtttctgctttgggccttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgt 17042437  T
Q  214 ttgtgatgtcc 224  Q
    ||| |||||||    
T  17042438 ttgcgatgtcc 17042448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 159; E-Value: 8e-85
Query Start/End: Original strand, 14 - 216
Target Start/End: Original strand, 16347818 - 16348020
Alignment:
Q  14 cagagaatgaggatcgattgattagaggtacatgttattttgatagtacacctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgcttt 113  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||||| || ||| || ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  16347818 cagagaatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgcttt 16347917  T
Q  114 cgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcagtgactacttctctcgtatgt 213  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  16347918 cgattgtgtttctgctttgggtcttgttttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgt 16348017  T
Q  214 ttg 216  Q
    |||    
T  16348018 ttg 16348020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 159; E-Value: 8e-85
Query Start/End: Original strand, 14 - 216
Target Start/End: Original strand, 51330715 - 51330917
Alignment:
Q  14 cagagaatgaggatcgattgattagaggtacatgttattttgatagtacacctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgcttt 113  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||||| || ||| || ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  51330715 cagagaatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgcttt 51330814  T
Q  114 cgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcagtgactacttctctcgtatgt 213  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  51330815 cgattgtgtttctgctttgggtcttgttttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgt 51330914  T
Q  214 ttg 216  Q
    |||    
T  51330915 ttg 51330917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 155; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 14 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 21833438 - 21833236
Alignment:
Q  14 cagagaatgaggatcgattgattagaggtacatgttattttgatagtacacctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgcttt 113  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||||| || ||| || ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  21833438 cagagaatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttatggcttt 21833339  T
Q  114 cgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcagtgactacttctctcgtatgt 213  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||    
T  21833338 cgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtctgt 21833239  T
Q  214 ttg 216  Q
    |||    
T  21833238 ttg 21833236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 153; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 16 - 216
Target Start/End: Original strand, 22496481 - 22496681
Alignment:
Q  16 gagaatgaggatcgattgattagaggtacatgttattttgatagtacacctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcg 115  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  22496481 gagaatgaggatcgcttgatcagaggtacatgttatattgataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcg 22496580  T
Q  116 attgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcagtgactacttctctcgtatgttt 215  Q
    |||||| |||| | |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  22496581 attgtgcttctacattgggtcttgttatgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgttt 22496680  T
Q  216 g 216  Q
    |    
T  22496681 g 22496681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 151; E-Value: 5e-80
Query Start/End: Original strand, 14 - 216
Target Start/End: Original strand, 41350891 - 41351093
Alignment:
Q  14 cagagaatgaggatcgattgattagaggtacatgttattttgatagtacacctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgcttt 113  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||||| || ||| || ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41350891 cagagaatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgcttt 41350990  T
Q  114 cgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcagtgactacttctctcgtatgt 213  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||    
T  41350991 cgattgtgtttctgctttgggtcttgagttgtctgatatgaacggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgcttacttctctcgtatgt 41351090  T
Q  214 ttg 216  Q
    |||    
T  41351091 ttg 41351093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 148; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 14 - 216
Target Start/End: Original strand, 33388252 - 33388454
Alignment:
Q  14 cagagaatgaggatcgattgattagagg-tacatgttattttgatagtacacctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctt 112  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||| ||| || ||| || ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  33388252 cagagaatgaggatcg-ttgatcagagggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctt 33388350  T
Q  113 tcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcagtgactacttctctcgtatg 212  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  33388351 tcgattgtgtttctgctttgggtcttgttttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatg 33388450  T
Q  213 tttg 216  Q
    ||||    
T  33388451 tttg 33388454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 16 - 216
Target Start/End: Original strand, 20081601 - 20081801
Alignment:
Q  16 gagaatgaggatcgattgattagaggtacatgttattttgatagtacacctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcg 115  Q
    |||||| |||||||  |||| ||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  20081601 gagaataaggatcgcctgatcagaggtacatgttatattgataatactcctttagttgctattattgatactggtactacgcattgttttattgctttcg 20081700  T
Q  116 attgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcagtgactacttctctcgtatgttt 215  Q
    |||||| |||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  20081701 attgtgcttctactttgggtcttgttatgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgttt 20081800  T
Q  216 g 216  Q
    |    
T  20081801 g 20081801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 143; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 14 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 21842348 - 21842146
Alignment:
Q  14 cagagaatgaggatcgattgattagaggtacatgttattttgatagtacacctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgcttt 113  Q
    ||||||| |||||||| ||||| |||||||| || ||| || ||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||    
T  21842348 cagagaacgaggatcgcttgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatattggtgctacgcattgttttattgcttt 21842249  T
Q  114 cgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcagtgactacttctctcgtatgt 213  Q
     ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  21842248 tgattgtgtttctgctttaggtcttgatttgtctgatatgaatggagagattgttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgt 21842149  T
Q  214 ttg 216  Q
    |||    
T  21842148 ttg 21842146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 131; E-Value: 4e-68
Query Start/End: Original strand, 16 - 182
Target Start/End: Original strand, 21228781 - 21228947
Alignment:
Q  16 gagaatgaggatcgattgattagaggtacatgttattttgatagtacacctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcg 115  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||| || ||| || ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21228781 gagaatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattaatattactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcg 21228880  T
Q  116 attgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagc 182  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21228881 attgtgtttctggtttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagc 21228947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 131; E-Value: 4e-68
Query Start/End: Original strand, 14 - 216
Target Start/End: Original strand, 24785080 - 24785282
Alignment:
Q  14 cagagaatgaggatcgattgattagaggtacatgttattttgatagtacacctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgcttt 113  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||||| || ||| || ||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||    
T  24785080 cagagaatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatacttgtgctacacattgttttattgcttt 24785179  T
Q  114 cgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcagtgactacttctctcgtatgt 213  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  24785180 cgattgtgcttctgctttgggtcttgttttatctgatatgaatggagagatggtcgttgaaattccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgt 24785279  T
Q  214 ttg 216  Q
    |||    
T  24785280 ttg 24785282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 14 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 19109504 - 19109302
Alignment:
Q  14 cagagaatgaggatcgattgattagaggtacatgttattttgatagtacacctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgcttt 113  Q
    ||||||| |||||||| ||||| |||||||| || ||| || ||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||| |     
T  19109504 cagagaacgaggatcgcttgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgacactggtgctatgcattgttttattgccta 19109405  T
Q  114 cgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcagtgactacttctctcgtatgt 213  Q
     ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  19109404 tgattgtgcttctgctttgagtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctagtatgt 19109305  T
Q  214 ttg 216  Q
    |||    
T  19109304 ttg 19109302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 115; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 16 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 21752181 - 21751991
Alignment:
Q  16 gagaatgaggatcgattgattagaggtacatgttattttgatagtacacctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcg 115  Q
    ||||| |||||||  ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| | |    
T  21752181 gagaacgaggatcacttgatcagaggtacttgttattttgatagtacacctttagttgctattattgatattggtgctacgcattgttttattgctattg 21752082  T
Q  116 attgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcagtgactacttctct 206  Q
    |||||| | ||   |||||||||| | ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  21752081 attgtgctactaagttgggtcttgctatgtctaatatgaatgaagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctct 21751991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 14 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 16379230 - 16379020
Alignment:
Q  14 cagagaatgaggatcgattgattagaggtacatgttattttgatagtacacctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgcttt 113  Q
    ||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||| |||||| |||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| |    
T  16379230 cagagaacgaggatcgtttgatcagaggtacatgttactttgatggtactcctttaattgctattattgatattggtgctacgcattgttttattgctat 16379131  T
Q  114 cgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcagtgactacttctctcgtatgt 213  Q
     ||||||| ||||   ||||||| || | ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||    
T  16379130 tgattgtgcttctaagttgggtcatgctatgtcaaatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctcttgtttgt 16379031  T
Q  214 ttgtgatgtcc 224  Q
    ||  |||||||    
T  16379030 ttaagatgtcc 16379020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 19 - 226
Target Start/End: Original strand, 21739264 - 21739471
Alignment:
Q  19 aatgaggatcgattgattagaggtacatgttattttgatagtacacctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgatt 118  Q
    |||||||| ||| | || |||||||| ||||  ||| ||||||| |||||| || ||||||| |||||||||||||| ||||| || |||||| | ||||    
T  21739264 aatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaatttctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgatt 21739363  T
Q  119 gtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcagtgactacttctctcgtatgtttgtg 218  Q
    |||  | |   |||||||||| ||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| || |||||| |    
T  21739364 gtgcatataagttgggtcttgttttatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttttcttgtttgtttgag 21739463  T
Q  219 atgtccat 226  Q
     |||||||    
T  21739464 ttgtccat 21739471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 19 - 206
Target Start/End: Original strand, 20074937 - 20075124
Alignment:
Q  19 aatgaggatcgattgattagaggtacatgttattttgatagtacacctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgatt 118  Q
    |||||||| ||| | || |||||||| ||||  ||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| | || |    
T  20074937 aatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgctattgaat 20075036  T
Q  119 gtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcagtgactacttctct 206  Q
    |||  | |   |||||| | ||| | ||||||||||| || || |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  20075037 gtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctct 20075124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 19 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 20297543 - 20297356
Alignment:
Q  19 aatgaggatcgattgattagaggtacatgttattttgatagtacacctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgatt 118  Q
    |||||||| ||| | || ||||||||  |||  ||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| | || |    
T  20297543 aatgaggaccgacttatcagaggtactggtttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgctattgaat 20297444  T
Q  119 gtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcagtgactacttctct 206  Q
    ||| || |   |||||| | ||| | ||||||||||| || || |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  20297443 gtgcttataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctct 20297356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 14 - 121
Target Start/End: Complemental strand, 22401728 - 22401621
Alignment:
Q  14 cagagaatgaggatcgattgattagaggtacatgttattttgatagtacacctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgcttt 113  Q
    ||||||| |||||||| ||||| |||| ||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||     
T  22401728 cagagaacgaggatcgcttgatcagagatacttgttatattgataatacacctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctta 22401629  T
Q  114 cgattgtg 121  Q
     |||||||    
T  22401628 agattgtg 22401621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 19 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 52988903 - 52988716
Alignment:
Q  19 aatgaggatcgattgattagaggtacatgttattttgatagtacacctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgatt 118  Q
    |||||||| ||| | || |||||||| ||||  ||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| | || |    
T  52988903 aatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgctattgaat 52988804  T
Q  119 gtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcagtgactacttctct 206  Q
    ||| || |   |||||| | ||| | ||||||||||| || || |||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  52988803 gtgcttataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctct 52988716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 37 - 206
Target Start/End: Original strand, 31537243 - 31537412
Alignment:
Q  37 agaggtacatgttattttgatagtacacctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtc 136  Q
    |||||||| ||||  ||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| | || ||||  | |   ||||||     
T  31537243 agaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgctattgaatgtgcatataagttgggtt 31537342  T
Q  137 ttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcagtgactacttctct 206  Q
    | ||| ||||||||||||| || || |||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  31537343 tggatgtgtctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctct 31537412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 19 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 48426035 - 48425848
Alignment:
Q  19 aatgaggatcgattgattagaggtacatgttattttgatagtacacctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgatt 118  Q
    |||||||| ||| | || |||||||| ||||  ||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| | || |    
T  48426035 aatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgctattgaat 48425936  T
Q  119 gtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcagtgactacttctct 206  Q
    |||  | |   |||||| | ||| | ||||||||||| || || |||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  48425935 gtgcatataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctct 48425848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 62; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 21 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 19857434 - 19857249
Alignment:
Q  21 tgaggatcgattgattagaggtacatgttattttgatagtacacctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgt 120  Q
    |||||||||| | ||||||||||| ||||  ||| ||||||| ||||||  ||||||||| |||||||||||||| ||||| || |||| | | || |||    
T  19857434 tgaggatcgacttattagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaactgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgttattgaatgt 19857335  T
Q  121 gtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcagtgactacttctct 206  Q
    | || |   |||||| | | | | ||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  19857334 gcttataagttgggtatggttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctct 19857249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 62; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 14 - 95
Target Start/End: Original strand, 21045347 - 21045428
Alignment:
Q  14 cagagaatgaggatcgattgattagaggtacatgttattttgatagtacacctttagttgctattattgatactggtgctac 95  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  21045347 cagagaatgaggatcgtttgattataggtacatgttactttgatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctac 21045428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 19 - 206
Target Start/End: Original strand, 38910054 - 38910241
Alignment:
Q  19 aatgaggatcgattgattagaggtacatgttattttgatagtacacctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgatt 118  Q
    |||||||| ||| | || |||||||| ||||  ||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| | || |    
T  38910054 aatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgctattgaat 38910153  T
Q  119 gtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcagtgactacttctct 206  Q
    |||  | |   |||||| | ||| | ||||||||||| ||  | |||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  38910154 gtgcatataagttgggtttggatgtatctgatatgaaagggaaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctct 38910241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 37 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 37680193 - 37680024
Alignment:
Q  37 agaggtacatgttattttgatagtacacctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtc 136  Q
    |||||||| ||||  ||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||| | || ||||  | |   ||||||     
T  37680193 agaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctattcattgttttattgctattgaatgtgcatataagttgggtt 37680094  T
Q  137 ttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcagtgactacttctct 206  Q
    | ||| | ||||||||||| || || |||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  37680093 tggatatatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctct 37680024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 18 - 206
Target Start/End: Original strand, 22015972 - 22016160
Alignment:
Q  18 gaatgaggatcgattgattagaggtacatgttattttgatagtacacctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgat 117  Q
    ||||||||| ||| | || |||||||| ||||  ||| ||||||| | |||| |||||||||| |||||||||| ||| ||||| || |||| | | |||    
T  22015972 gaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcatttaattgctattatagatactggtgatactcattgtttcattgatgttgat 22016071  T
Q  118 tgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcagtgactacttctct 206  Q
    ||||  | |   |||||||| | | | ||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  22016072 tgtgcatataagttgggtctggttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctct 22016160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 22 - 215
Target Start/End: Original strand, 20853991 - 20854184
Alignment:
Q  22 gaggatcgattgattagaggtacatgttattttgatagtacacctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtg 121  Q
    ||||||||| | || |||||||| ||||  ||| ||||||| |||||| |||||||||| || ||||||||||||||||| || |||||||| || ||||    
T  20853991 gaggatcgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtgctacgcattgtttcattgctttagaatgtg 20854090  T
Q  122 tttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcagtgactacttctctcgtatgttt 215  Q
      | |   ||||| ||   | | ||||||||||| || || |||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| || |||||    
T  20854091 catataagttgggcctaattgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagccaagggttcagtaactacttctcttgtgtgttt 20854184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 37 - 226
Target Start/End: Original strand, 24096861 - 24097050
Alignment:
Q  37 agaggtacatgttattttgatagtacacctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtc 136  Q
    |||||||| ||||  ||| ||| ||| |||||| |||||||||| |||||| ||||||| ||||| || |||||| | || |||| || |   ||||||     
T  24096861 agaggtacttgtttctttaataatactcctttaattgctattatagatactagtgctactcattgtttcattgctattgaatgtgcttataagttgggtt 24096960  T
Q  137 ttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcagtgactacttctctcgtatgtttgtgatgtccat 226  Q
    | ||| | ||| ||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||| || || ||| |||||||||    
T  24096961 tggatgtatctaatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaattacttctcttgtttgcttgagatgtccat 24097050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 18 - 216
Target Start/End: Original strand, 21742779 - 21742977
Alignment:
Q  18 gaatgaggatcgattgattagaggtacatgttattttgatagtacacctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgat 117  Q
    ||||||||| ||| | || |||||||| ||||  ||| ||||||| | |||| |||||||||| || ||||||||||| ||||| || |||| | | |||    
T  21742779 gaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcatttaattgctattatagacactggtgctactcattgtttcattgttgttgat 21742878  T
Q  118 tgtgtttctgctttgggtcttgatt-tgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcagtgactacttctctcgtatgtttg 216  Q
    ||||  | |   |||||||| |||| | ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||| ||||| || ||||||    
T  21742879 tgtgcatataagttgggtct-gattgtatctgatatgaatggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcggtaactacgtctcttgtttgtttg 21742977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 50; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 21 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 18710545 - 18710360
Alignment:
Q  21 tgaggatcgattgattagaggtacatgttattttgatagtacacctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgt 120  Q
    |||||||||| | || |||||||| ||||  ||| ||||||| |||||| ||||||||||  | ||||||||||| ||||| || |||||| | || |||    
T  18710545 tgaggatcgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattataaacactggtgctactcattgtttcattgctattgaatgt 18710446  T
Q  121 gtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcagtgactacttctct 206  Q
    | || |   ||| |||| | | | ||||||||||  || || |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  18710445 gcttataagttgcgtctggttgtatctgatatgagaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctct 18710360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 14 - 89
Target Start/End: Original strand, 22435956 - 22436031
Alignment:
Q  14 cagagaatgaggatcgattgattagaggtacatgttattttgatagtacacctttagttgctattattgatactgg 89  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||| || ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  22435956 cagagaatgaggatcgcttgatcagaggtacttgttatattaataatactcctttagttgctattattgatactgg 22436031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 145 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 12200554 - 12200493
Alignment:
Q  145 tctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcagtgactacttctct 206  Q
    ||||||||||| || || |||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  12200554 tctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctct 12200493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 21 - 206
Target Start/End: Original strand, 20833130 - 20833315
Alignment:
Q  21 tgaggatcgattgattagaggtacatgttattttgatagtacacctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgt 120  Q
    |||||||||| | || |||||||| ||||  ||| ||| ||  |||||| |||||||||| || ||||||||||| ||||| || |||| | | || |||    
T  20833130 tgaggatcgacttatcagaggtacttgtttctttaatattattcctttaattgctattatagacactggtgctactcattgtttcattgttattgaatgt 20833229  T
Q  121 gtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcagtgactacttctct 206  Q
      || |   |||||||| | | | ||||||||||| || || |||||||| |||||||||| |||||||||| | |||||||||||    
T  20833230 tcttataagttgggtctggttgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagataagggttcattaactacttctct 20833315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 14 - 42
Target Start/End: Complemental strand, 22116904 - 22116876
Alignment:
Q  14 cagagaatgaggatcgattgattagaggt 42  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  22116904 cagagaatgaggatcgattgattagaggt 22116876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0431 (Bit Score: 161; Significance: 5e-86; HSPs: 1)
Name: scaffold0431
Description:

Target: scaffold0431; HSP #1
Raw Score: 161; E-Value: 5e-86
Query Start/End: Original strand, 16 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 10516 - 10316
Alignment:
Q  16 gagaatgaggatcgattgattagaggtacatgttattttgatagtacacctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcg 115  Q
    ||||| |||||||| ||||| |||||||| || ||| || ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10516 gagaacgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcg 10417  T
Q  116 attgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcagtgactacttctctcgtatgttt 215  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  10416 attgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgttt 10317  T
Q  216 g 216  Q
    |    
T  10316 g 10316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0042 (Bit Score: 161; Significance: 5e-86; HSPs: 2)
Name: scaffold0042
Description:

Target: scaffold0042; HSP #1
Raw Score: 161; E-Value: 5e-86
Query Start/End: Original strand, 16 - 216
Target Start/End: Original strand, 36976 - 37176
Alignment:
Q  16 gagaatgaggatcgattgattagaggtacatgttattttgatagtacacctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcg 115  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  36976 gagaatgaggatcgcttgatcagaggtacatgttatattgatcatactcctttagttgctattattgatactggtgctacacattgttttattgctttcg 37075  T
Q  116 attgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcagtgactacttctctcgtatgttt 215  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  37076 attgtgtttctgctttgggtcttgatttatctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgttt 37175  T
Q  216 g 216  Q
    |    
T  37176 g 37176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0042; HSP #2
Raw Score: 113; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 14 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 26502 - 26310
Alignment:
Q  14 cagagaatgaggatcgattgattagaggtacatgttattttgatagtacacctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgcttt 113  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||||| | |    
T  26502 cagagaatgaggatcgattgattagaggtaaatgttattttgatagtactcttttagttgctattattgatattggtgctacgcaatgttttattgttgt 26403  T
Q  114 cgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcagtgactacttctct 206  Q
     ||||||| ||||   |||||||||  | ||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  26402 tgattgtgcttctaagttgggtcttactatgtcgaatatgaatggagaaatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctct 26310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold2059 (Bit Score: 159; Significance: 8e-85; HSPs: 1)
Name: scaffold2059
Description:

Target: scaffold2059; HSP #1
Raw Score: 159; E-Value: 8e-85
Query Start/End: Original strand, 14 - 216
Target Start/End: Original strand, 923 - 1125
Alignment:
Q  14 cagagaatgaggatcgattgattagaggtacatgttattttgatagtacacctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgcttt 113  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||||| || ||| || ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  923 cagagaatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgcttt 1022  T
Q  114 cgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcagtgactacttctctcgtatgt 213  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  1023 cgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgacatgaatggagagatggttgtcgaaactctagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgt 1122  T
Q  214 ttg 216  Q
    |||    
T  1123 ttg 1125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0181 (Bit Score: 159; Significance: 8e-85; HSPs: 1)
Name: scaffold0181
Description:

Target: scaffold0181; HSP #1
Raw Score: 159; E-Value: 8e-85
Query Start/End: Original strand, 14 - 224
Target Start/End: Original strand, 29082 - 29292
Alignment:
Q  14 cagagaatgaggatcgattgattagaggtacatgttattttgatagtacacctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgcttt 113  Q
    ||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||| || ||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||    
T  29082 cagagaatgaggatcaattgatcagaggtacttgttatattaataatactcctttagttgctattattgataatggtgctacgcattgatttattgcttt 29181  T
Q  114 cgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcagtgactacttctctcgtatgt 213  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  29182 cgattgtgtttctactttgggtcttgatttatctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgt 29281  T
Q  214 ttgtgatgtcc 224  Q
    ||| |||||||    
T  29282 ttgagatgtcc 29292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080 (Bit Score: 159; Significance: 8e-85; HSPs: 5)
Name: scaffold0080
Description:

Target: scaffold0080; HSP #1
Raw Score: 159; E-Value: 8e-85
Query Start/End: Original strand, 14 - 224
Target Start/End: Original strand, 10392 - 10602
Alignment:
Q  14 cagagaatgaggatcgattgattagaggtacatgttattttgatagtacacctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgcttt 113  Q
    |||||||||||||| | ||||| |||||||| || ||| || |||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  10392 cagagaatgaggattgtttgatcagaggtacttgctatattaataacactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattacttt 10491  T
Q  114 cgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcagtgactacttctctcgtatgt 213  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  10492 cgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgt 10591  T
Q  214 ttgtgatgtcc 224  Q
    ||| |||||||    
T  10592 ttgagatgtcc 10602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080; HSP #2
Raw Score: 143; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 14 - 224
Target Start/End: Original strand, 13047 - 13257
Alignment:
Q  14 cagagaatgaggatcgattgattagaggtacatgttattttgatagtacacctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgcttt 113  Q
    |||||||||||||| | ||||| |||||||| || ||| || |||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||   | |    
T  13047 cagagaatgaggattgtttgatcagaggtacttgctatattaataaaactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgatttataaatat 13146  T
Q  114 cgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcagtgactacttctctcgtatgt 213  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  13147 cgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgt 13246  T
Q  214 ttgtgatgtcc 224  Q
    ||| |||||||    
T  13247 ttgcgatgtcc 13257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080; HSP #3
Raw Score: 124; E-Value: 6e-64
Query Start/End: Original strand, 37 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 32010 - 31831
Alignment:
Q  37 agaggtacatgttattttgatagtacacctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtc 136  Q
    |||||||| || ||| || ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  32010 agaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgttacgcattattttattgctttcgattgtgcttctgctttgggtc 31911  T
Q  137 ttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcagtgactacttctctcgtatgtttg 216  Q
    ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  31910 ttgttttgtttgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtaactacttctctcgtatgtttg 31831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080; HSP #4
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 37 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 37476 - 37297
Alignment:
Q  37 agaggtacatgttattttgatagtacacctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtc 136  Q
    |||||||| || ||| || ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  37476 agaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgttacgcattattttattgctttcgattgtgcttctgctttgggtc 37377  T
Q  137 ttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcagtgactacttctctcgtatgtttg 216  Q
    ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||    
T  37376 ttgttttgtttgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttctgttactacttctctcttatgtttg 37297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080; HSP #5
Raw Score: 102; E-Value: 8e-51
Query Start/End: Original strand, 15 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 54786 - 54577
Alignment:
Q  15 agagaatgaggatcgattgattagaggtacatgttattttgatagtacacctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttc 114  Q
    |||||| |||||||| ||||| |||||||| || ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||      
T  54786 agagaacgaggatcgcttgatcagaggtacttgctatattgataatacacctttagttgctattattgatattggtgctacgcattgttttattgcttat 54687  T
Q  115 gattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcagtgactacttctctcgtatgtt 214  Q
    ||||||| | ||   |||||||||    ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||    
T  54686 gattgtgctactaagttgggtcttttcatgtctaatatgaatggagaaatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctcttgtgtgtt 54587  T
Q  215 tgtgatgtcc 224  Q
    |  |||||||    
T  54586 taagatgtcc 54577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0055 (Bit Score: 159; Significance: 8e-85; HSPs: 1)
Name: scaffold0055
Description:

Target: scaffold0055; HSP #1
Raw Score: 159; E-Value: 8e-85
Query Start/End: Original strand, 14 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 22397 - 22195
Alignment:
Q  14 cagagaatgaggatcgattgattagaggtacatgttattttgatagtacacctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgcttt 113  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||||| || ||| || ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  22397 cagagaatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgcttt 22298  T
Q  114 cgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcagtgactacttctctcgtatgt 213  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  22297 cgattgtgtttctgctttgggtcttgttttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgt 22198  T
Q  214 ttg 216  Q
    |||    
T  22197 ttg 22195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0052 (Bit Score: 159; Significance: 8e-85; HSPs: 1)
Name: scaffold0052
Description:

Target: scaffold0052; HSP #1
Raw Score: 159; E-Value: 8e-85
Query Start/End: Original strand, 14 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 7386 - 7184
Alignment:
Q  14 cagagaatgaggatcgattgattagaggtacatgttattttgatagtacacctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgcttt 113  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||||| || ||| || ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  7386 cagagaatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgcttt 7287  T
Q  114 cgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcagtgactacttctctcgtatgt 213  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  7286 cgattgtgtttctgctttgggtcttgttttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgt 7187  T
Q  214 ttg 216  Q
    |||    
T  7186 ttg 7184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0410 (Bit Score: 158; Significance: 3e-84; HSPs: 1)
Name: scaffold0410
Description:

Target: scaffold0410; HSP #1
Raw Score: 158; E-Value: 3e-84
Query Start/End: Original strand, 15 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 290 - 81
Alignment:
Q  15 agagaatgaggatcgattgattagaggtacatgttattttgatagtacacctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttc 114  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| || ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  290 agagaatgaggatcgtttgattagaggtacttgttatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgtttttttgctttc 191  T
Q  115 gattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcagtgactacttctctcgtatgtt 214  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  190 gattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggtcgtcgaaacttcagctaagggtttggtgactacttctctcgtatgtt 91  T
Q  215 tgtgatgtcc 224  Q
    || |||||||    
T  90 tgagatgtcc 81  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0333 (Bit Score: 157; Significance: 1e-83; HSPs: 1)
Name: scaffold0333
Description:

Target: scaffold0333; HSP #1
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 16 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 18798 - 18590
Alignment:
Q  16 gagaatgaggatcgattgattagaggtacatgttattttgatagtacacctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcg 115  Q
    ||||| |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  18798 gagaacgaggatcgcttgatcagaggtacttgttattttgatagtacacctttagttgatattattgatactagtgctacgcattgttttattgctttcg 18699  T
Q  116 attgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcagtgactacttctctcgtatgttt 215  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  18698 attgtgtttctgctttgggtcttgagttgtctgatatgaacggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtgtgttt 18599  T
Q  216 gtgatgtcc 224  Q
      |||||||    
T  18598 aagatgtcc 18590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0079 (Bit Score: 157; Significance: 1e-83; HSPs: 1)
Name: scaffold0079
Description:

Target: scaffold0079; HSP #1
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 16 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 36646 - 36438
Alignment:
Q  16 gagaatgaggatcgattgattagaggtacatgttattttgatagtacacctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcg 115  Q
    |||||||||||||  ||||| |||||||| |||||| || ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  36646 gagaatgaggatcacttgatcagaggtacttgttatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgtttcattgctttcg 36547  T
Q  116 attgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcagtgactacttctctcgtatgttt 215  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  36546 attgtgtttctactttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgttt 36447  T
Q  216 gtgatgtcc 224  Q
    | |||||||    
T  36446 gagatgtcc 36438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010 (Bit Score: 155; Significance: 2e-82; HSPs: 4)
Name: scaffold0010
Description:

Target: scaffold0010; HSP #1
Raw Score: 155; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 14 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 14574 - 14364
Alignment:
Q  14 cagagaatgaggatcgattgattagaggtacatgttattttgatagtacacctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgcttt 113  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||||| || ||| || ||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  14574 cagagaatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatattggtgctacgcattgctttattgcttt 14475  T
Q  114 cgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcagtgactacttctctcgtatgt 213  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |    
T  14474 cgattgcgtttctgctttgggtcttgatttgtctggtatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtattt 14375  T
Q  214 ttgtgatgtcc 224  Q
    ||| |||||||    
T  14374 ttgcgatgtcc 14364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010; HSP #2
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 14 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 5065 - 4864
Alignment:
Q  14 cagagaatgaggatcgattgattagaggtacatgttattttgatagtacacctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgcttt 113  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| || |    
T  5065 cagagaatgaggatcgattaattagaggtacatgttattttgatagtatacctttagttgctattattgatactggtgctacacattgttttatttctat 4966  T
Q  114 cgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcagtgactacttctctcgtatgt 213  Q
     ||||||| ||||   |||||| ||| | ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| || |||    
T  4965 tgattgtgcttctaagttgggttttgttatgtcaaatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggtttagtaactacttctcttgtgtgt 4866  T
Q  214 tt 215  Q
    ||    
T  4865 tt 4864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010; HSP #3
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 21 - 206
Target Start/End: Original strand, 39494 - 39679
Alignment:
Q  21 tgaggatcgattgattagaggtacatgttattttgatagtacacctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgt 120  Q
    |||||||||| | || |||||||| ||||  ||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| | || |||    
T  39494 tgaggatcgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgctattgaatgt 39593  T
Q  121 gtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcagtgactacttctct 206  Q
    |  | |   |||||| | ||| | ||||||||||| || || |||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  39594 gcatataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctct 39679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010; HSP #4
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 145 - 206
Target Start/End: Original strand, 44712 - 44773
Alignment:
Q  145 tctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcagtgactacttctct 206  Q
    ||||||||||| || || |||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  44712 tctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccaactaagggttcagtaactacttctct 44773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044 (Bit Score: 154; Significance: 8e-82; HSPs: 2)
Name: scaffold0044
Description:

Target: scaffold0044; HSP #1
Raw Score: 154; E-Value: 8e-82
Query Start/End: Original strand, 14 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 17310 - 17109
Alignment:
Q  14 cagagaatgaggatcgattgattagaggtacatgttattttgatagtacacctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgcttt 113  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||| || |||  || ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  17310 cagagaatgaggatcgtttgatcagaggtacttgttatattaataaaactcctttagtttctattattgatactggtgctacgcattgttttattgcttt 17211  T
Q  114 cgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcagtgactacttctctcgtatgt 213  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  17210 cgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcgatgactacttctctcgtatgt 17111  T
Q  214 tt 215  Q
    ||    
T  17110 tt 17109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044; HSP #2
Raw Score: 151; E-Value: 5e-80
Query Start/End: Original strand, 14 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 3574 - 3372
Alignment:
Q  14 cagagaatgaggatcgattgattagaggtacatgttattttgatagtacacctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgcttt 113  Q
    ||||||| |||||||| ||||| |||||||| || ||| || ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  3574 cagagaacgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgcttt 3475  T
Q  114 cgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcagtgactacttctctcgtatgt 213  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  3474 cgattgtgtttctgccttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcgatgactacttctctcgtatgt 3375  T
Q  214 ttg 216  Q
    |||    
T  3374 ttg 3372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023 (Bit Score: 153; Significance: 3e-81; HSPs: 4)
Name: scaffold0023
Description:

Target: scaffold0023; HSP #1
Raw Score: 153; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 16 - 216
Target Start/End: Original strand, 30730 - 30930
Alignment:
Q  16 gagaatgaggatcgattgattagaggtacatgttattttgatagtacacctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcg 115  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||  |||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |    
T  30730 gagaatgaggatcgcttgatcagaggagcatgttatattgataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgcttttg 30829  T
Q  116 attgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcagtgactacttctctcgtatgttt 215  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  30830 attgtgcttctgctttgggtcttgttttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgttt 30929  T
Q  216 g 216  Q
    |    
T  30930 g 30930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #2
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 16 - 215
Target Start/End: Original strand, 47139 - 47337
Alignment:
Q  16 gagaatgaggatcgattgattagaggtacatgttattttgatagtacacctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcg 115  Q
    ||||| |||||||| || || |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||| | |    
T  47139 gagaacgaggatcgctttatcagaggtacttgttattttaatagtacacctttagttactattattgattctggtgctacacattgttttattgctattg 47238  T
Q  116 attgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcagtgactacttctctcgtatgttt 215  Q
    |||||| | ||   |||||||||  | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||| || |||||    
T  47239 attgtgctactaagttgggtctttctatgtctaatatgaatggagagatggttgtcgaaactccatctaa-ggttcggtgactacttctcttgtgtgttt 47337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #3
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 130 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 152115 - 152021
Alignment:
Q  130 ttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcagtgactacttctctcgtatgtttgtgatgtcc 224  Q
    ||||||||||   ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||  |||||||    
T  152115 ttgggtcttgtcatgtctgatatgaatggagaaatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctcttgtgtgtttaagatgtcc 152021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #4
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 37 - 206
Target Start/End: Original strand, 164578 - 164747
Alignment:
Q  37 agaggtacatgttattttgatagtacacctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtc 136  Q
    |||||||| ||||  ||| ||||||| |||||| |||||||||| || ||||||||||| ||||| || |||||  | || |||| || |   |||||||    
T  164578 agaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtgctactcattgtttcattgccattgaatgtgcttataagttgggtc 164677  T
Q  137 ttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcagtgactacttctct 206  Q
    | | | | ||||||| ||| || || |||||||| ||||||||||| || |||||| | |||||||||||    
T  164678 tggttatatctgataagaaaggggaaatggttgttgaaactccagcaaatggttcaataactacttctct 164747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0177 (Bit Score: 151; Significance: 5e-80; HSPs: 1)
Name: scaffold0177
Description:

Target: scaffold0177; HSP #1
Raw Score: 151; E-Value: 5e-80
Query Start/End: Original strand, 14 - 224
Target Start/End: Original strand, 11510 - 11720
Alignment:
Q  14 cagagaatgaggatcgattgattagaggtacatgttattttgatagtacacctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgcttt 113  Q
    |||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||| || ||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11510 cagagattgaggatcgtttgattagaggtacttgttatattaataatactcctttagtttctattattgatactggtgctacgcattgctttattgcttt 11609  T
Q  114 cgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcagtgactacttctctcgtatgt 213  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |  ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  11610 cgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagatatggttttttaaactccagctaagggttcggtgactacttgtctcgtatgt 11709  T
Q  214 ttgtgatgtcc 224  Q
    ||| |||||||    
T  11710 ttgagatgtcc 11720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0993 (Bit Score: 149; Significance: 8e-79; HSPs: 1)
Name: scaffold0993
Description:

Target: scaffold0993; HSP #1
Raw Score: 149; E-Value: 8e-79
Query Start/End: Original strand, 16 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 1130 - 934
Alignment:
Q  16 gagaatgaggatcgattgattagaggtacatgttattttgatagtacacctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcg 115  Q
    ||||| |||||||| |||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |    
T  1130 gagaacgaggatcgcttgattagagatacatgttatattaatagtacacctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgcttttg 1031  T
Q  116 attgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcagtgactacttctctcgtatg 212  Q
    |||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  1030 attgtgtttcttttttgggtcttgttttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctgtcgtatg 934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0102 (Bit Score: 149; Significance: 8e-79; HSPs: 2)
Name: scaffold0102
Description:

Target: scaffold0102; HSP #1
Raw Score: 149; E-Value: 8e-79
Query Start/End: Original strand, 16 - 216
Target Start/End: Original strand, 50501 - 50701
Alignment:
Q  16 gagaatgaggatcgattgattagaggtacatgttattttgatagtacacctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcg 115  Q
    ||||||||||||||  |||| ||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  50501 gagaatgaggatcgcctgatcagaggtacatgttatattgataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcg 50600  T
Q  116 attgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcagtgactacttctctcgtatgttt 215  Q
    |||||| |||| | |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  50601 attgtgcttctaccttgggtcttgttatgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcagtgactacttctctcatatgttt 50700  T
Q  216 g 216  Q
    |    
T  50701 g 50701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0102; HSP #2
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 19 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 42843 - 42656
Alignment:
Q  19 aatgaggatcgattgattagaggtacatgttattttgatagtacacctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgatt 118  Q
    |||||||| ||| | || |||||||| ||||  ||| ||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||| || ||||   | ||||    
T  42843 aatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttatttgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgtagttgatt 42744  T
Q  119 gtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcagtgactacttctct 206  Q
    |||  | |   |||||||| | | | ||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  42743 gtgcatataagttgggtctggttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcaataactacttctct 42656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0259 (Bit Score: 145; Significance: 2e-76; HSPs: 1)
Name: scaffold0259
Description:

Target: scaffold0259; HSP #1
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 20 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 8402 - 8206
Alignment:
Q  20 atgaggatcgattgattagaggtacatgttattttgatagtacacctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattg 119  Q
    |||||||||| ||||| |||||||| || ||| || ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  8402 atgaggatcgcttgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctactcattgctttattgctttcgattg 8303  T
Q  120 tgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcagtgactacttctctcgtatgtttg 216  Q
    ||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  8302 tgtatctgctttaggtcttgaattgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttg 8206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1881 (Bit Score: 143; Significance: 3e-75; HSPs: 1)
Name: scaffold1881
Description:

Target: scaffold1881; HSP #1
Raw Score: 143; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 14 - 212
Target Start/End: Original strand, 634 - 832
Alignment:
Q  14 cagagaatgaggatcgattgattagaggtacatgttattttgatagtacacctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgcttt 113  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||||| || |||  | ||| ||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  634 cagagaatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatactaataatactcattaagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgcttt 733  T
Q  114 cgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcagtgactacttctctcgtatg 212  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||    
T  734 cgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttaggtaactacttctctcgtatg 832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028 (Bit Score: 141; Significance: 5e-74; HSPs: 4)
Name: scaffold0028
Description:

Target: scaffold0028; HSP #1
Raw Score: 141; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 16 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 11617 - 11417
Alignment:
Q  16 gagaatgaggatcgattgattagaggtacatgttattttgatagtacacctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcg 115  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||| || ||| || ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |  |    
T  11617 gagaatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctactcattgctttattgcctatg 11518  T
Q  116 attgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcagtgactacttctctcgtatgttt 215  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  11517 attgtgtttctgctttgagtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctcttgtatgttt 11418  T
Q  216 g 216  Q
    |    
T  11417 g 11417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #2
Raw Score: 124; E-Value: 6e-64
Query Start/End: Original strand, 37 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 18064 - 17885
Alignment:
Q  37 agaggtacatgttattttgatagtacacctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtc 136  Q
    |||||||| || ||| || ||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |  |||||||||||||||||| |||    
T  18064 agaggtacttgctatattaataatactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgctttattgcctatgattgtgtttctgctttgagtc 17965  T
Q  137 ttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcagtgactacttctctcgtatgtttg 216  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  17964 ttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctcttgtatgtttg 17885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #3
Raw Score: 105; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 16 - 172
Target Start/End: Complemental strand, 55152 - 54996
Alignment:
Q  16 gagaatgaggatcgattgattagaggtacatgttattttgatagtacacctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcg 115  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||| || ||| || ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |  |    
T  55152 gagaatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctactcattgctttattgcctatg 55053  T
Q  116 attgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcg 172  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  55052 attgtgtttctgctttgagtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcg 54996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #4
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 168 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 53723 - 53675
Alignment:
Q  168 tgtcgaaactccagctaagggttcagtgactacttctctcgtatgtttg 216  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  53723 tgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctcttgtatgtttg 53675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022 (Bit Score: 141; Significance: 5e-74; HSPs: 3)
Name: scaffold0022
Description:

Target: scaffold0022; HSP #1
Raw Score: 141; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 16 - 216
Target Start/End: Original strand, 34871 - 35071
Alignment:
Q  16 gagaatgaggatcgattgattagaggtacatgttattttgatagtacacctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcg 115  Q
    |||||||||||||| ||||| | ||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||    
T  34871 gagaatgaggatcgcttgatcaaaggtacatgttatattgataatactcctttagttgctattattgatactggtgctaagcattgttttattgttttcg 34970  T
Q  116 attgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcagtgactacttctctcgtatgttt 215  Q
    |||||| |||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  34971 attgtgcttctactttgggtcttgttatgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacgtctctcgtatgttt 35070  T
Q  216 g 216  Q
    |    
T  35071 g 35071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #2
Raw Score: 117; E-Value: 9e-60
Query Start/End: Original strand, 16 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 41780 - 41572
Alignment:
Q  16 gagaatgaggatcgattgattagaggtacatgttattttgatagtacacctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcg 115  Q
    |||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| | |    
T  41780 gagaatgaggatcacttgatcagaggtacatgttattttgatagtacacctttagttgctattattgatactggtgctacacattgttttattgctattg 41681  T
Q  116 attgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcagtgactacttctctcgtatgttt 215  Q
    |||||| | ||   |||||||||| | |||   |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  41680 attgtgctactaagttgggtcttgctatgtaaaatatgaatagagagatggttgtcaaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtgtgttt 41581  T
Q  216 gtgatgtcc 224  Q
      |||||||    
T  41580 aagatgtcc 41572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #3
Raw Score: 117; E-Value: 9e-60
Query Start/End: Original strand, 16 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 75500 - 75292
Alignment:
Q  16 gagaatgaggatcgattgattagaggtacatgttattttgatagtacacctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcg 115  Q
    |||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| | |    
T  75500 gagaatgaggatcacttgatcagaggtacatgttattttgatagtacacctttagttgctattattgatactggtgctacacattgttttattgctattg 75401  T
Q  116 attgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcagtgactacttctctcgtatgttt 215  Q
    |||||| | ||   |||||||||| | |||   |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  75400 attgtgctactaagttgggtcttgctatgtaaaatatgaatagagagatggttgtcaaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtgtgttt 75301  T
Q  216 gtgatgtcc 224  Q
      |||||||    
T  75300 aagatgtcc 75292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0476 (Bit Score: 136; Significance: 4e-71; HSPs: 2)
Name: scaffold0476
Description:

Target: scaffold0476; HSP #1
Raw Score: 136; E-Value: 4e-71
Query Start/End: Original strand, 15 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 10935 - 10724
Alignment:
Q  15 agagaatgaggatcgattgattagaggtacatgttattttgatagtacacctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttc 114  Q
    |||||| |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| | |     
T  10935 agagaacgaggatcgtttgatcagaggtacttgttattttgatagtacacctttagttgctattattgatattggtgctacgcattgttttattgttatt 10836  T
Q  115 gattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcagtgactacttctctcgtatgtt 214  Q
    ||||||| | ||   |||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  10835 gattgtgctactaagttgggtcttgctatgtctaatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtt 10736  T
Q  215 tgtgatgtccat 226  Q
    || |||||||||    
T  10735 tgagatgtccat 10724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0476; HSP #2
Raw Score: 61; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 37 - 216
Target Start/End: Original strand, 722 - 901
Alignment:
Q  37 agaggtacatgttattttgatagtacacctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtc 136  Q
    |||||||| ||||  ||| ||||||| |||||| |||||||||| || ||||||||||| ||||| || |||||||| || ||||  | |   ||||||     
T  722 agaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtgctacacattgtttcattgctttagaatgtgcatataagttgggt- 820  T
Q  137 ttgatt-tgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcagtgactacttctctcgtatgtttg 216  Q
    |||||| | ||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| || || ||||||    
T  821 ttgattgtatctgatatgaaaggagagatggttgttgaaacttcagctaagggttcagtgactacttcccttgtttgtttg 901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0273 (Bit Score: 136; Significance: 4e-71; HSPs: 1)
Name: scaffold0273
Description:

Target: scaffold0273; HSP #1
Raw Score: 136; E-Value: 4e-71
Query Start/End: Original strand, 16 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 188 - 1
Alignment:
Q  16 gagaatgaggatcgattgattagaggtacatgttattttgatagtacacctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcg 115  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||| |||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  188 gagaatgaggatcgcttgatcagaggttcatgttatattgataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcg 89  T
Q  116 attgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcagtgactacttc 203  Q
    ||| || |||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  88 attatgcttctactttgggtcttgttatgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttc 1  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0130 (Bit Score: 136; Significance: 4e-71; HSPs: 2)
Name: scaffold0130
Description:

Target: scaffold0130; HSP #1
Raw Score: 136; E-Value: 4e-71
Query Start/End: Original strand, 14 - 222
Target Start/End: Original strand, 7933 - 8143
Alignment:
Q  14 cagagaatgaggatcgattgattagaggtacatgttattttgatagtacacctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgcttt 113  Q
    |||| ||||||||||| ||||| |||| ||| || ||| || ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7933 cagaaaatgaggatcgtttgatcagagttacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgcttt 8032  T
Q  114 cgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcagtgactact--tctctcgtat 211  Q
     ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||  ||||||||||    
T  8033 tgattgggtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaaacgttcggtgactacttctctctcgtat 8132  T
Q  212 gtttgtgatgt 222  Q
    ||||| |||||    
T  8133 gtttgcgatgt 8143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0130; HSP #2
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 71 - 215
Target Start/End: Original strand, 4100 - 4244
Alignment:
Q  71 ttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgt 170  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| | ||| || |||||| | |||||||  | |   |||||||| | | ||||   ||||| |||||| ||||||||    
T  4100 ttgctattattgacactggtgctacactttgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgggtctggttatgtcaagtatgagtggagaaatggttgt 4199  T
Q  171 cgaaactccagctaagggttcagtgactacttctctcgtatgttt 215  Q
     ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| || |||||    
T  4200 tgaaactccagctaagggttcagtaactacttatcttgtttgttt 4244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1459 (Bit Score: 135; Significance: 2e-70; HSPs: 1)
Name: scaffold1459
Description:

Target: scaffold1459; HSP #1
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 14 - 216
Target Start/End: Original strand, 1186 - 1388
Alignment:
Q  14 cagagaatgaggatcgattgattagaggtacatgttattttgatagtacacctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgcttt 113  Q
    |||||||||||||||   | || ||||| || |||||| || ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  1186 cagagaatgaggatctcctaatcagaggaacttgttatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgtattgctttattgcttt 1285  T
Q  114 cgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcagtgactacttctctcgtatgt 213  Q
    ||| | ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  1286 cgactttgtttctactttgggtcttgatttttctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgt 1385  T
Q  214 ttg 216  Q
    |||    
T  1386 ttg 1388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0550 (Bit Score: 135; Significance: 2e-70; HSPs: 1)
Name: scaffold0550
Description:

Target: scaffold0550; HSP #1
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 14 - 216
Target Start/End: Original strand, 10312 - 10514
Alignment:
Q  14 cagagaatgaggatcgattgattagaggtacatgttattttgatagtacacctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgcttt 113  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||| || ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  10312 cagagaatgaggatcgcttgatcagaggtacttgttatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgccacgcattgttttattgcttt 10411  T
Q  114 cgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcagtgactacttctctcgtatgt 213  Q
    |||||||| |||| ||||||||||  || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  10412 cgattgtgcttctactttgggtctacatatgtctggtatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtaactacttctctcgtatgt 10511  T
Q  214 ttg 216  Q
    |||    
T  10512 ttg 10514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003 (Bit Score: 133; Significance: 3e-69; HSPs: 2)
Name: scaffold0003
Description:

Target: scaffold0003; HSP #1
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 14 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 424458 - 424266
Alignment:
Q  14 cagagaatgaggatcgattgattagaggtacatgttattttgatagtacacctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgcttt 113  Q
    ||||||| |||||||| ||||| |||||||| || ||| || ||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |     
T  424458 cagagaacgaggatcgcttgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagtttctattattgatactggtgctacgcattgttttattgccta 424359  T
Q  114 cgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcagtgactacttctct 206  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  424358 cgattgtgtttctgctttgagtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctct 424266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003; HSP #2
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 34 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 203511 - 203329
Alignment:
Q  34 attagaggtacatgttattttgatagtacacctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgg 133  Q
    ||||||||||| ||||  ||| ||||||| |||||| |||||||||| || ||||||||||| ||||| || |||||||| ||  ||| || |   ||||    
T  203511 attagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtgctactcattgtttcattgctttagaaagtgcttataagttgg 203412  T
Q  134 gtcttgatt-tgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcagtgactacttctctcgtatgtttg 216  Q
    || |||||| | ||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||    
T  203411 gt-ttgattgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtttg 203329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011 (Bit Score: 130; Significance: 2e-67; HSPs: 2)
Name: scaffold0011
Description:

Target: scaffold0011; HSP #1
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 14 - 215
Target Start/End: Original strand, 23687 - 23888
Alignment:
Q  14 cagagaatgaggatcgattgattagaggtacatgttattttgatagtacacctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgcttt 113  Q
    |||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |    
T  23687 cagagaatgaggatcatttgatcagaggtacatgttattttgatagtacacctttagttgctattattgatactggtgctacacattgttttattgctat 23786  T
Q  114 cgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcagtgactacttctctcgtatgt 213  Q
     ||||||| ||||   |||||||||| | ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||    
T  23787 tgattgtgcttctaagttgggtcttgctatgtcaaatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctcttgtgtgt 23886  T
Q  214 tt 215  Q
    ||    
T  23887 tt 23888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #2
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 34 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 151697 - 151525
Alignment:
Q  34 attagaggtacatgttattttgatagtacacctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgg 133  Q
    ||||||||||  ||||  ||| ||||||| |||||| |||||||||| |||||| ||||||| ||||| || |||||| | || |||| || |   ||||    
T  151697 attagaggtatttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactagtgctactcattgtttcattgctattgaatgtgcttataagttgg 151598  T
Q  134 gtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcagtgactacttctct 206  Q
    || | | | | ||| ||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  151597 gtttggttgtatcttatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctct 151525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0081 (Bit Score: 129; Significance: 7e-67; HSPs: 2)
Name: scaffold0081
Description:

Target: scaffold0081; HSP #1
Raw Score: 129; E-Value: 7e-67
Query Start/End: Original strand, 16 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 21752 - 21552
Alignment:
Q  16 gagaatgaggatcgattgattagaggtacatgttattttgatagtacacctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcg 115  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| || ||| ||| || |||||||||||||||||||  |||||||||||||  |||||||||||||    
T  21752 gagaatgaggatcgcttgatcagaggtacatgttatattaataatactcccttagttgctattattgatatcggtgctacgcattattttattgctttcg 21653  T
Q  116 attgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcagtgactacttctctcgtatgttt 215  Q
    |||||| |||| |||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  21652 attgtgcttctactttgggtcttgttatgtctgatttgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttatctcgtatgttt 21553  T
Q  216 g 216  Q
    |    
T  21552 g 21552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0081; HSP #2
Raw Score: 129; E-Value: 7e-67
Query Start/End: Original strand, 16 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 37176 - 36976
Alignment:
Q  16 gagaatgaggatcgattgattagaggtacatgttattttgatagtacacctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcg 115  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| || ||| ||| || |||||||||||||||||||  |||||||||||||  |||||||||||||    
T  37176 gagaatgaggatcgcttgatcagaggtacatgttatattaataatactcccttagttgctattattgatatcggtgctacgcattattttattgctttcg 37077  T
Q  116 attgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcagtgactacttctctcgtatgttt 215  Q
    |||||| |||| |||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  37076 attgtgcttctactttgggtcttgttatgtctgatttgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttatctcgtatgttt 36977  T
Q  216 g 216  Q
    |    
T  36976 g 36976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0331 (Bit Score: 127; Significance: 1e-65; HSPs: 1)
Name: scaffold0331
Description:

Target: scaffold0331; HSP #1
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 14 - 204
Target Start/End: Original strand, 15133 - 15323
Alignment:
Q  14 cagagaatgaggatcgattgattagaggtacatgttattttgatagtacacctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgcttt 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |    
T  15133 cagagaatgaggatcgattgattagaggtacatgttattttgatagtactcctttagttgctattattaatactggtgctacgcattgttttattgctct 15232  T
Q  114 cgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcagtgactacttct 204  Q
     ||||||| ||||   |||||||||  | ||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  15233 tgattgtgcttctaagttgggtcttactatgtcaaatatgaatggagaaatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttct 15323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0621 (Bit Score: 125; Significance: 2e-64; HSPs: 2)
Name: scaffold0621
Description:

Target: scaffold0621; HSP #1
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 16 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 4582 - 4374
Alignment:
Q  16 gagaatgaggatcgattgattagaggtacatgttattttgatagtacacctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcg 115  Q
    ||||| |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | |    
T  4582 gagaacgaggatcgcttgatcagaggtacttgttattttgatagtacacctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctattg 4483  T
Q  116 attgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcagtgactacttctctcgtatgttt 215  Q
    |||||| | ||   |||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| || |||||    
T  4482 attgtgctactaagttgggtcttgctatgtctaatatgaatggagagatggttgtcgaaactccatctaagggttcggtgactacttctcttgtgtgttt 4383  T
Q  216 gtgatgtcc 224  Q
      |||||||    
T  4382 aagatgtcc 4374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0621; HSP #2
Raw Score: 105; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 16 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 165 - 1
Alignment:
Q  16 gagaatgaggatcgattgattagaggtacatgttattttgatagtacacctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcg 115  Q
    ||||| |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | |    
T  165 gagaacgaggatcgcttgatcagaggtacttgttattttgatagtacacctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctattg 66  T
Q  116 attgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactcca 180  Q
    |||||| | ||   |||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  65 attgtgctactaagttgggtcttgctatgtctaatatgaatggagagatggttgtcgaaactcca 1  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120 (Bit Score: 124; Significance: 6e-64; HSPs: 3)
Name: scaffold0120
Description:

Target: scaffold0120; HSP #1
Raw Score: 124; E-Value: 6e-64
Query Start/End: Original strand, 16 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 14232 - 14033
Alignment:
Q  16 gagaatgaggatcgattgattagaggtacatgttattttgatagtacacctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcg 115  Q
    ||||| |||||||| ||| | ||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |    
T  14232 gagaacgaggatcgcttggtcagaggtacatgttatataaatagtacacctttagttgctattattgatagtggtgctacgcattgttttattgcttttg 14133  T
Q  116 attgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcagtgactacttctctcgtatgttt 215  Q
    |||||| | ||   |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  14132 attgtgctactaagttgggtcttgctatgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctcttgtatgttt 14033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120; HSP #2
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 14 - 121
Target Start/End: Complemental strand, 11414 - 11307
Alignment:
Q  14 cagagaatgaggatcgattgattagaggtacatgttattttgatagtacacctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgcttt 113  Q
    ||||||| |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  11414 cagagaacgaggatcgcttgatcagaggtacttgttattttgatagtacacctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgcttt 11315  T
Q  114 cgattgtg 121  Q
     |||||||    
T  11314 tgattgtg 11307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120; HSP #3
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 56 - 100
Target Start/End: Complemental strand, 25286 - 25242
Alignment:
Q  56 atagtacacctttagttgctattattgatactggtgctacgcatt 100  Q
    ||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  25286 atagtactcctttaattgcaattattgatactggtgctactcatt 25242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0324 (Bit Score: 121; Significance: 4e-62; HSPs: 1)
Name: scaffold0324
Description:

Target: scaffold0324; HSP #1
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 16 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 2137 - 1929
Alignment:
Q  16 gagaatgaggatcgattgattagaggtacatgttattttgatagtacacctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcg 115  Q
    ||||| |||||||| ||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |    
T  2137 gagaacgaggatcgcttgatcagaagtacttgttattttgatagtacacctttagttgctattattgatactggtgctacgcatttttttattgcttttg 2038  T
Q  116 attgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcagtgactacttctctcgtatgttt 215  Q
    |||||| | ||   |||||||||  | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||    
T  2037 attgtgctactaagttgggtctttctatgtctaatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctcttgtgtgttt 1938  T
Q  216 gtgatgtcc 224  Q
      |||||||    
T  1937 aagatgtcc 1929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0122 (Bit Score: 121; Significance: 4e-62; HSPs: 1)
Name: scaffold0122
Description:

Target: scaffold0122; HSP #1
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 15 - 215
Target Start/End: Original strand, 40662 - 40862
Alignment:
Q  15 agagaatgaggatcgattgattagaggtacatgttattttgatagtacacctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttc 114  Q
    |||||| |||||||| ||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||     
T  40662 agagaacgaggatcgcttgatcagaggtacttgctattttgatagtacacctttagttgccattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttt 40761  T
Q  115 gattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcagtgactacttctctcgtatgtt 214  Q
    ||||||| | ||   |||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| || ||||    
T  40762 gattgtgctactaagttgggtcttgttatgtctaatatgaatggagagatggttgtcgaaactccaactaagggttcggtgactacttctcttgtgtgtt 40861  T
Q  215 t 215  Q
    |    
T  40862 t 40862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001 (Bit Score: 121; Significance: 4e-62; HSPs: 3)
Name: scaffold0001
Description:

Target: scaffold0001; HSP #1
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 14 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 441803 - 441611
Alignment:
Q  14 cagagaatgaggatcgattgattagaggtacatgttattttgatagtacacctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgcttt 113  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| |    
T  441803 cagagaatgaggatcgattgattagaagtacatgttattttgacagtactcctttagttgctattattgatactggtgctacggattgttttattgctct 441704  T
Q  114 cgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcagtgactacttctct 206  Q
     ||||||| ||||   |||||||||  | ||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  441703 tgattgtgcttctaaattgggtcttactatgtcaaatatgaatggagaaatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctct 441611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #2
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 14 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 496170 - 495978
Alignment:
Q  14 cagagaatgaggatcgattgattagaggtacatgttattttgatagtacacctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgcttt 113  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||| |    
T  496170 cagagaatgaggatcgtttgatcagaggtacatgttattttgatagtagacctttagttgctattattgatactagtgctacacattgttttattgctat 496071  T
Q  114 cgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcagtgactacttctct 206  Q
     ||||||| |||    |||||||||| | ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  496070 tgattgtgcttcgaagttgggtcttgctatgtcaaatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctct 495978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #3
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 19 - 206
Target Start/End: Original strand, 514512 - 514699
Alignment:
Q  19 aatgaggatcgattgattagaggtacatgttattttgatagtacacctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgatt 118  Q
    |||||||| ||| | || |||||||| ||||  ||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| | || |    
T  514512 aatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgctattgaat 514611  T
Q  119 gtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcagtgactacttctct 206  Q
    ||| || |   |||||| | ||| | ||||||||||| || || |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  514612 gtgcttataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctct 514699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0084 (Bit Score: 119; Significance: 6e-61; HSPs: 1)
Name: scaffold0084
Description:

Target: scaffold0084; HSP #1
Raw Score: 119; E-Value: 6e-61
Query Start/End: Original strand, 14 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 8373 - 8163
Alignment:
Q  14 cagagaatgaggatcgattgattagaggtacatgttattttgatagtacacctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgcttt 113  Q
    ||||||| |||||||| ||||| |||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||    
T  8373 cagagaacgaggatcgcttgatcagaggtacttgttattgtgatagtacgcctttagttgctattattgatactagtgctacacattgttttattgcttt 8274  T
Q  114 cgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcagtgactacttctctcgtatgt 213  Q
     ||||||| | ||   | ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||    
T  8273 tgattgtgctacttagtcgggacttgatatgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctcttgtgtgt 8174  T
Q  214 ttgtgatgtcc 224  Q
    ||  |||||||    
T  8173 ttaagatgtcc 8163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0077 (Bit Score: 119; Significance: 6e-61; HSPs: 1)
Name: scaffold0077
Description:

Target: scaffold0077; HSP #1
Raw Score: 119; E-Value: 6e-61
Query Start/End: Original strand, 14 - 224
Target Start/End: Original strand, 57768 - 57978
Alignment:
Q  14 cagagaatgaggatcgattgattagaggtacatgttattttgatagtacacctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgcttt 113  Q
    |||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| | |    
T  57768 cagagaatgaggctcgtttgatcagaggtacatgttattttgatagtacacctttagttgctattattgatactggtgctacacattgttttattgttat 57867  T
Q  114 cgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcagtgactacttctctcgtatgt 213  Q
     ||||||| ||||   || ||||||| | ||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||    
T  57868 tgattgtgcttctaagttaggtcttgctatgtcgaatatgaatggaaagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctcttgtgtgt 57967  T
Q  214 ttgtgatgtcc 224  Q
    ||  |||||||    
T  57968 ttaagatgtcc 57978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0075 (Bit Score: 119; Significance: 6e-61; HSPs: 1)
Name: scaffold0075
Description:

Target: scaffold0075; HSP #1
Raw Score: 119; E-Value: 6e-61
Query Start/End: Original strand, 16 - 206
Target Start/End: Original strand, 55626 - 55816
Alignment:
Q  16 gagaatgaggatcgattgattagaggtacatgttattttgatagtacacctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcg 115  Q
    ||||| |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| | |    
T  55626 gagaacgaggatcgcttgatcagaggtacttgttattttgatagtacacctttagttgctattattgatactggtgctacgcatttttttattgctattg 55725  T
Q  116 attgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcagtgactacttctct 206  Q
    |||||| | ||   |||||||||  | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  55726 attgtgctactaagttgggtcttactatgtctaatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctct 55816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006 (Bit Score: 119; Significance: 6e-61; HSPs: 1)
Name: scaffold0006
Description:

Target: scaffold0006; HSP #1
Raw Score: 119; E-Value: 6e-61
Query Start/End: Original strand, 22 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 104369 - 104167
Alignment:
Q  22 gaggatcgattgattagaggtacatgttattttgatagtacacctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtg 121  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| | |||||||    
T  104369 gaggatcgtttgattagaggtacatgttattttgatagtacacctttagtttctattattgataatggtgctacgcattgttttattgctattgattgtg 104270  T
Q  122 tttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcagtgactacttctctcgtatgtttgtgatg 221  Q
     ||||  |||||||| || | ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||| || |||||  ||||    
T  104269 cttctaatttgggtcctgttatgtcaaatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttaggtaactacttctcttgtgtgtttaagatg 104170  T
Q  222 tcc 224  Q
    |||    
T  104169 tcc 104167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0412 (Bit Score: 116; Significance: 4e-59; HSPs: 1)
Name: scaffold0412
Description:

Target: scaffold0412; HSP #1
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 16 - 175
Target Start/End: Original strand, 15735 - 15894
Alignment:
Q  16 gagaatgaggatcgattgattagaggtacatgttattttgatagtacacctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcg 115  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||| |||||| || ||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  15735 gagaatgaggatcgcttgatcagaggtacttgttatattaataatactcctttagttgcaattattgatactggtgctacgcattgtttaattgctttcg 15834  T
Q  116 attgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaa 175  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15835 attgtgtttctactttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaa 15894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0040 (Bit Score: 116; Significance: 4e-59; HSPs: 2)
Name: scaffold0040
Description:

Target: scaffold0040; HSP #1
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 16 - 215
Target Start/End: Original strand, 111063 - 111262
Alignment:
Q  16 gagaatgaggatcgattgattagaggtacatgttattttgatagtacacctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcg 115  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | |    
T  111063 gagaatgaggatcgcttgatcagaggtacatgttattttaatagtacacctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctattg 111162  T
Q  116 attgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcagtgactacttctctcgtatgttt 215  Q
    |||||| | ||   |||||||||| | ||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||| || |||||    
T  111163 attgtgctactaagttgggtcttgctatgtcaaatatgaatggagtgatggttgtcgaaactccagctaagggtttgttgactacttctcttgtgtgttt 111262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0040; HSP #2
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 31 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 18011 - 17818
Alignment:
Q  31 ttgattagaggtacatgttattttgatagtacacctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctt 130  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| | |||||||  |||   |    
T  18011 ttgattagaggtacatgttactttgatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctacacattgttttattgctgttgattgtgcgtctaagt 17912  T
Q  131 tgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcagtgactacttctctcgtatgtttgtgatgtcc 224  Q
    ||||||||  | ||||  |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| || |||||  |||||||    
T  17911 tgggtcttactatgtcgaatatgaatggggaaatggttgtcgaaactccagctaagggtttggtgactacttctcttgtgtgtttaagatgtcc 17818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0018 (Bit Score: 116; Significance: 4e-59; HSPs: 2)
Name: scaffold0018
Description:

Target: scaffold0018; HSP #1
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 15 - 206
Target Start/End: Original strand, 9506 - 9697
Alignment:
Q  15 agagaatgaggatcgattgattagaggtacatgttattttgatagtacacctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttc 114  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |     
T  9506 agagaatgaggatcgattgattagaggtacatgtcattttgaaagtactcctttagttgatattattgatactggtgctacgcattgttttattgctctt 9605  T
Q  115 gattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcagtgactacttctct 206  Q
    ||||||| ||||   |||||||||    ||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  9606 gattgtgcttctaagttgggtcttacaatgtcgaatatgaatggagaaatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctct 9697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0018; HSP #2
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 17 - 215
Target Start/End: Original strand, 23455 - 23653
Alignment:
Q  17 agaatgaggatcgattgattagaggtacatgttattttgatagtacacctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcga 116  Q
    |||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||| | ||    
T  23455 agaatgaggatcgattaatcagaggtacgtgttattttgatagtactcctttagttgctattattgataatagtgctacgcattgttttattgctcttga 23554  T
Q  117 ttgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcagtgactacttctctcgtatgttt 215  Q
    | ||| ||||   |||||||||| | ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| || |||||    
T  23555 tagtgcttctaagttgggtcttgctatgtctaatatgaatggagaaatggttgtcgaaactccagctaagggttcggcgactacttctcttgtgtgttt 23653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0243 (Bit Score: 114; Significance: 6e-58; HSPs: 2)
Name: scaffold0243
Description:

Target: scaffold0243; HSP #1
Raw Score: 114; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 23 - 224
Target Start/End: Original strand, 24108 - 24309
Alignment:
Q  23 aggatcgattgattagaggtacatgttattttgatagtacacctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgt 122  Q
    ||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| | |||||||     
T  24108 aggatcgcttgatcagaggtacttgttattttgatagtacacctttagttgctattattgatactagtgctacgcattgttttattgctattgattgtgc 24207  T
Q  123 ttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcagtgactacttctctcgtatgtttgtgatgt 222  Q
    | ||   || ||||||| | ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||  ||||| |||||    
T  24208 tactaagttaggtcttgctatgtcaaatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctcttgtgcgtttgagatgt 24307  T
Q  223 cc 224  Q
    ||    
T  24308 cc 24309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0243; HSP #2
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 21 - 206
Target Start/End: Original strand, 9933 - 10118
Alignment:
Q  21 tgaggatcgattgattagaggtacatgttattttgatagtacacctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgt 120  Q
    |||||||||| | || | |||||| ||||  ||| ||||||| |||||| |||||||||| || ||||||||||| ||||| || |||||| | || | |    
T  9933 tgaggatcgacttatcaaaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtgctactcattgtttcattgctattgaattt 10032  T
Q  121 gtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcagtgactacttctct 206  Q
    | || |   |||||||| | | | ||||||||||| || || |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  10033 gcttataagttgggtctggttgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctct 10118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1423 (Bit Score: 112; Significance: 9e-57; HSPs: 1)
Name: scaffold1423
Description:

Target: scaffold1423; HSP #1
Raw Score: 112; E-Value: 9e-57
Query Start/End: Original strand, 17 - 224
Target Start/End: Original strand, 535 - 742
Alignment:
Q  17 agaatgaggatcgattgattagaggtacatgttattttgatagtacacctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcga 116  Q
    |||| |||||||| ||||| |||||||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||    
T  535 agaacgaggatcgcttgatcagaggtacttgttatattgataatacacctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgcttatga 634  T
Q  117 ttgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcagtgactacttctctcgtatgtttg 216  Q
    ||||| | ||   ||||||||||   ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || |||||     
T  635 ttgtgctactaaattgggtcttgtcatgtctgatatgaatggagaaatggttgtcgaaactccagctaagggttctgtgactacttcacttgtgtgttta 734  T
Q  217 tgatgtcc 224  Q
     |||||||    
T  735 agatgtcc 742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0423 (Bit Score: 111; Significance: 4e-56; HSPs: 1)
Name: scaffold0423
Description:

Target: scaffold0423; HSP #1
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 14 - 224
Target Start/End: Original strand, 2417 - 2627
Alignment:
Q  14 cagagaatgaggatcgattgattagaggtacatgttattttgatagtacacctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgcttt 113  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||||| || ||| || ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||     
T  2417 cagagaatgaggatcgcttgatcagaggtacttgctatattaataatacacctttagttgctattattgatactggtgctacgcattcttttattgctta 2516  T
Q  114 cgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcagtgactacttctctcgtatgt 213  Q
     || |||| | ||   |||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||    
T  2517 tgaatgtgctactaagttgggtcttgttatgtctgatatgaatggagacatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctcttgtgtgt 2616  T
Q  214 ttgtgatgtcc 224  Q
    ||  |||||||    
T  2617 ttaagatgtcc 2627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0074 (Bit Score: 111; Significance: 4e-56; HSPs: 2)
Name: scaffold0074
Description:

Target: scaffold0074; HSP #1
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 14 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 6263 - 6053
Alignment:
Q  14 cagagaatgaggatcgattgattagaggtacatgttattttgatagtacacctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgcttt 113  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||| |    
T  6263 cagagaatgaggatcgtttgattagaggtacatgttactttgatagtactcctttaattgctattattgatactgatgctacgcattgttttaatgctat 6164  T
Q  114 cgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcagtgactacttctctcgtatgt 213  Q
      |||||| ||||   |||||||||  | ||||  ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||    
T  6163 ttattgtgcttctaagttgggtcttactatgtcgaatatgaaaggagagatgattgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtgtgt 6064  T
Q  214 ttgtgatgtcc 224  Q
    ||  |||||||    
T  6063 ttaagatgtcc 6053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0074; HSP #2
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 19 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 15268 - 15081
Alignment:
Q  19 aatgaggatcgattgattagaggtacatgttattttgatagtacacctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgatt 118  Q
    |||||||||||| | || |||||||| ||||  ||| ||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||| || |||||| | || |    
T  15268 aatgaggatcgacttatcagaggtacttgtttcttttatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattgaat 15169  T
Q  119 gtgtttctgctttgggtcttgatt-tgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcagtgactacttctct 206  Q
    |||  | |   |||||| |||||| | | ||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  15168 gtgcatataagttgggt-ttgattgtatttgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagcaactacttctct 15081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0007 (Bit Score: 111; Significance: 4e-56; HSPs: 1)
Name: scaffold0007
Description:

Target: scaffold0007; HSP #1
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 16 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 48813 - 48651
Alignment:
Q  16 gagaatgaggatcgattgattagaggtacatgttattttgatagtacacctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcg 115  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||| || ||| || ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |  |    
T  48813 gagaatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctactcattgctttattgcctatg 48714  T
Q  116 attgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactc 178  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48713 attgtgtttctgctttgagtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactc 48651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0305 (Bit Score: 110; Significance: 1e-55; HSPs: 1)
Name: scaffold0305
Description:

Target: scaffold0305; HSP #1
Raw Score: 110; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 14 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 3014 - 2861
Alignment:
Q  14 cagagaatgaggatcgattgattagaggtacatgttattttgatagtacacctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgcttt 113  Q
    |||||| ||||||||| ||||| |||||||| |||||| || ||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  3014 cagagattgaggatcgtttgatcagaggtacttgttatattaataatactccattagttgctattattgatactggtgctacgcattgtttttttgcttt 2915  T
Q  114 cgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggt 167  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2914 cgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggt 2861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0403 (Bit Score: 109; Significance: 6e-55; HSPs: 1)
Name: scaffold0403
Description:

Target: scaffold0403; HSP #1
Raw Score: 109; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 14 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 15061 - 14873
Alignment:
Q  14 cagagaatgaggatcgattgattagaggtacatgttattttgatagtacacctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgcttt 113  Q
    ||||||| |||||||| ||||| |||||||| || ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||     
T  15061 cagagaacgaggatcgcttgatcagaggtacttgctatattgataatacacctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctta 14962  T
Q  114 cgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcagtgactactt 202  Q
     ||||||| | ||   ||||||||||   ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  14961 tgattgtgctactaagttgggtcttgtcatgtctgatatgaatggagaaatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactactt 14873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0207 (Bit Score: 109; Significance: 6e-55; HSPs: 1)
Name: scaffold0207
Description:

Target: scaffold0207; HSP #1
Raw Score: 109; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 16 - 224
Target Start/End: Original strand, 7895 - 8103
Alignment:
Q  16 gagaatgaggatcgattgattagaggtacatgttattttgatagtacacctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcg 115  Q
    ||||| |||||||  ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |    
T  7895 gagaacgaggatcacttgatcagaggtacttgttattttgatagtacacctttagttgctattattgatactggtgctacacattgctttattgctattg 7994  T
Q  116 attgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcagtgactacttctctcgtatgttt 215  Q
    |||||| | ||    ||||||||| | ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||| || |||||    
T  7995 attgtgctactaaggtgggtcttgctatgtctaatattaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgaaaacttctcttgtgtgttt 8094  T
Q  216 gtgatgtcc 224  Q
      |||||||    
T  8095 aagatgtcc 8103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0278 (Bit Score: 108; Significance: 2e-54; HSPs: 1)
Name: scaffold0278
Description:

Target: scaffold0278; HSP #1
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 16 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 3699 - 3524
Alignment:
Q  16 gagaatgaggatcgattgattagaggtacatgttattttgatagtacacctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcg 115  Q
    ||||| |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| | |    
T  3699 gagaacgaggatcgcttgatcagaggtacttgttattttgatagtacacctttagttgctatcattgatactggtgctacgcattgttttattgctattg 3600  T
Q  116 attgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttc 191  Q
    |||||| | ||   |||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  3599 attgtgctactaagttgggtcttgctatgtctaatatgaatggagagatggttgtcgaaactctagctaagggttc 3524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0270 (Bit Score: 107; Significance: 9e-54; HSPs: 2)
Name: scaffold0270
Description:

Target: scaffold0270; HSP #1
Raw Score: 107; E-Value: 9e-54
Query Start/End: Original strand, 14 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 7023 - 6813
Alignment:
Q  14 cagagaatgaggatcgattgattagaggtacatgttattttgatagtacacctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgcttt 113  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||| |||| ||||||  || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |    
T  7023 cagagaatgaggatcgtttgatcagaggtacatgttattgtgatcgtactcctttaactgttattattgatactggtgctacgcattgttttattgctat 6924  T
Q  114 cgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcagtgactacttctctcgtatgt 213  Q
     ||||||| ||||   |||||||||| | ||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| || |||    
T  6923 tgattgtgcttctaagttgggtcttgctatgtcgaatatgaatggagaaatggttgtcgaaactccagctaagggtttggtgactacttctcttgtgtgt 6824  T
Q  214 ttgtgatgtcc 224  Q
    ||  |||||||    
T  6823 ttaagatgtcc 6813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0270; HSP #2
Raw Score: 107; E-Value: 9e-54
Query Start/End: Original strand, 14 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 14153 - 13943
Alignment:
Q  14 cagagaatgaggatcgattgattagaggtacatgttattttgatagtacacctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgcttt 113  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||| |||| ||||||  || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |    
T  14153 cagagaatgaggatcgtttgatcagaggtacatgttattgtgatcgtactcctttaactgttattattgatactggtgctacgcattgttttattgctat 14054  T
Q  114 cgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcagtgactacttctctcgtatgt 213  Q
     ||||||| ||||   |||||||||| | ||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| || |||    
T  14053 tgattgtgcttctaagttgggtcttgctatgtcgaatatgaatggagaaatggttgtcgaaactccagctaagggtttggtgactacttctcttgtgtgt 13954  T
Q  214 ttgtgatgtcc 224  Q
    ||  |||||||    
T  13953 ttaagatgtcc 13943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0282 (Bit Score: 105; Significance: 1e-52; HSPs: 1)
Name: scaffold0282
Description:

Target: scaffold0282; HSP #1
Raw Score: 105; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 14 - 206
Target Start/End: Original strand, 13633 - 13825
Alignment:
Q  14 cagagaatgaggatcgattgattagaggtacatgttattttgatagtacacctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgcttt 113  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||||| || |||||| ||||| | ||||||| |    
T  13633 cagagaatgaggatcgtttgatcagaggtacatgttactttgatagtactcctttaattgctattattgatattgatgctacacattgttctattgctat 13732  T
Q  114 cgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcagtgactacttctct 206  Q
     ||||||| ||||   |||||||||| | ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  13733 tgattgtgcttctaagttgggtcttgctatgtcgaatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagagttcggtgactacttctct 13825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0411 (Bit Score: 103; Significance: 2e-51; HSPs: 1)
Name: scaffold0411
Description:

Target: scaffold0411; HSP #1
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 14 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 8560 - 8350
Alignment:
Q  14 cagagaatgaggatcgattgattagaggtacatgttattttgatagtacacctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgcttt 113  Q
    ||||||| |||||| | ||||| |||||||| || ||| || ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||     
T  8560 cagagaacgaggattgcttgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctta 8461  T
Q  114 cgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcagtgactacttctctcgtatgt 213  Q
     ||||||| | ||   ||||||||||   ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| || |||    
T  8460 tgattgtgctactaagttgggtcttgtcatgtctgatatgaatggagaaatggttgtcgaaactccagttaagggttcggtgactacttctcttgtgtgt 8361  T
Q  214 ttgtgatgtcc 224  Q
    ||| |||||||    
T  8360 ttgagatgtcc 8350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0342 (Bit Score: 101; Significance: 3e-50; HSPs: 1)
Name: scaffold0342
Description:

Target: scaffold0342; HSP #1
Raw Score: 101; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 14 - 206
Target Start/End: Original strand, 14420 - 14612
Alignment:
Q  14 cagagaatgaggatcgattgattagaggtacatgttattttgatagtacacctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgcttt 113  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||| ||| |||||| | ||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||| || |    
T  14420 cagagaatgaggatcgtttgatcagaggtacatgttactttgatattactcctttaatagcttttattgatactggtgctacacattgttttatttctat 14519  T
Q  114 cgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcagtgactacttctct 206  Q
     ||||||| | ||   |||||||||| | ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  14520 tgattgtgctcctaagttgggtcttgctatgtcgaatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctct 14612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0540 (Bit Score: 99; Significance: 5e-49; HSPs: 1)
Name: scaffold0540
Description:

Target: scaffold0540; HSP #1
Raw Score: 99; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 14 - 224
Target Start/End: Original strand, 11034 - 11244
Alignment:
Q  14 cagagaatgaggatcgattgattagaggtacatgttattttgatagtacacctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgcttt 113  Q
    ||||||| |||||||  ||||| |||||||| || ||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||     
T  11034 cagagaacgaggatcatttgatcagaggtacttgctatattgataatacacctttagtttctattattgatactagtgctacacattgttttattgctta 11133  T
Q  114 cgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcagtgactacttctctcgtatgt 213  Q
     ||||||| | ||   ||||||||||   ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||    
T  11134 tgattgtgctactaagttgggtcttgtcatgtctgatatgaatggagaaatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctcttgtgtgt 11233  T
Q  214 ttgtgatgtcc 224  Q
    ||  |||||||    
T  11234 ttaagatgtcc 11244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012 (Bit Score: 99; Significance: 5e-49; HSPs: 1)
Name: scaffold0012
Description:

Target: scaffold0012; HSP #1
Raw Score: 99; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 14 - 224
Target Start/End: Original strand, 216574 - 216784
Alignment:
Q  14 cagagaatgaggatcgattgattagaggtacatgttattttgatagtacacctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgcttt 113  Q
    ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| | |    
T  216574 cagagaatgaggatcaattgatcagaggtacatgttactttgatagtactactttaattgctattattgatactggtgctacacattgttttattgttat 216673  T
Q  114 cgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcagtgactacttctctcgtatgt 213  Q
     ||||||  |||    || ||||||| | ||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||    
T  216674 tgattgtacttcaaagttaggtcttgctatgtcgaatatgaatggagagatggttgtagaaactccagctaagggttcggtgactacttctcttgtgtgt 216773  T
Q  214 ttgtgatgtcc 224  Q
    ||  |||||||    
T  216774 ttcagatgtcc 216784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0529 (Bit Score: 97; Significance: 8e-48; HSPs: 1)
Name: scaffold0529
Description:

Target: scaffold0529; HSP #1
Raw Score: 97; E-Value: 8e-48
Query Start/End: Original strand, 18 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 5234 - 5046
Alignment:
Q  18 gaatgaggatcgattgattagaggtacatgttattttgatagtacacctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgat 117  Q
    |||| |||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | | |||    
T  5234 gaataaggaccggttgattagaggtacatgttactttgatagtactcttttaattgctattattgatactggtgctacgcattgttttattggtgttgat 5135  T
Q  118 tgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcagtgactacttctct 206  Q
    |||| ||||   |||||||||| | |||   ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  5134 tgtgcttctaagttgggtcttgttatgttaaatatgaatggagatatggtcgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctct 5046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0358 (Bit Score: 97; Significance: 8e-48; HSPs: 1)
Name: scaffold0358
Description:

Target: scaffold0358; HSP #1
Raw Score: 97; E-Value: 8e-48
Query Start/End: Original strand, 14 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 9097 - 8890
Alignment:
Q  14 cagagaatgaggatcgattgattagaggtacatgttattttgatagtacacctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgcttt 113  Q
    ||||||| |||||||| ||||| |||||||| || ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||   |||||||||     
T  9097 cagagaacgaggatcgcttgatcagaggtacttgctatattgataatacacctttagttgctattattgatactggtgctacacatt---ttattgctta 9001  T
Q  114 cgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcagtgactacttctctcgtatgt 213  Q
      |||||| | ||   ||||||||||   ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||    
T  9000 ttattgtgctactaagttgggtcttgtcatgtctgatatgaatggagaaatggttgtcgaaactccagccaagggttcagtgactacttctcttgtgtgt 8901  T
Q  214 ttgtgatgtcc 224  Q
    ||  |||||||    
T  8900 ttaagatgtcc 8890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0218 (Bit Score: 91; Significance: 3e-44; HSPs: 1)
Name: scaffold0218
Description:

Target: scaffold0218; HSP #1
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 14 - 224
Target Start/End: Original strand, 24866 - 25076
Alignment:
Q  14 cagagaatgaggatcgattgattagaggtacatgttattttgatagtacacctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgcttt 113  Q
    ||||||| |||||||  ||||| |||||||| || ||| |||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||     
T  24866 cagagaacgaggatcacttgatcagaggtacttgctatattgacaatacgcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctta 24965  T
Q  114 cgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcagtgactacttctctcgtatgt 213  Q
     ||||||| | ||   |  |||||||   ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| || |||    
T  24966 tgattgtgctactaagtcaggtcttgtcatgtctgatatgaatggagaaatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacatctcttgtgtgt 25065  T
Q  214 ttgtgatgtcc 224  Q
    ||  |||||||    
T  25066 ttaagatgtcc 25076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0293 (Bit Score: 90; Significance: 1e-43; HSPs: 1)
Name: scaffold0293
Description:

Target: scaffold0293; HSP #1
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 14 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 15560 - 15362
Alignment:
Q  14 cagagaatgaggatcgattgattagaggtacatgttattttgatagtacacctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgcttt 113  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| |    
T  15560 cagagaatgaggatcgattgatcagaggtacatgttactttgatagtactcctttaattgctattattgatattggtgctacgcattgttttattgctat 15461  T
Q  114 cgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcagtgactacttctctcgtatgt 213  Q
     ||||||| |||            | | |||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| || |||    
T  15460 tgattgtgcttc------------taagttgtcaaatatgaaaggagagatggttgtcgaaactccaactaagggttcggtgactacttctcttgtgtgt 15373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0575 (Bit Score: 89; Significance: 5e-43; HSPs: 1)
Name: scaffold0575
Description:

Target: scaffold0575; HSP #1
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 55 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 4692 - 4544
Alignment:
Q  55 gatagtacacctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatga 154  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| | | ||||||| | ||   |||||||||| | ||||| ||||||    
T  4692 gatagtacacctttagttgctattattgatattggtgctacgcattgttttattgttattgattgtgctactaagttgggtcttgctatgtctaatatga 4593  T
Q  155 atggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcagtgactacttc 203  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  4592 atggagagatggttgtcgaaactccagctgagggttcggtgactacttc 4544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0114 (Bit Score: 87; Significance: 8e-42; HSPs: 2)
Name: scaffold0114
Description:

Target: scaffold0114; HSP #1
Raw Score: 87; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 14 - 224
Target Start/End: Original strand, 17503 - 17713
Alignment:
Q  14 cagagaatgaggatcgattgattagaggtacatgttattttgatagtacacctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgcttt 113  Q
    |||| ||||||||||| ||||| |||||||| |||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||| |||     
T  17503 cagaaaatgaggatcgcttgatcagaggtacttgttatattaataatacacctttagttgctattattgatacaggtgctacgcattgtttcatttctta 17602  T
Q  114 cgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcagtgactacttctctcgtatgt 213  Q
     ||||||| | ||   |||||||||    || |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||| || |||    
T  17603 tgattgtgctactaagttgggtcttatcatgcctgatatgaatggagaaatggttgtcgaaactccagctaagggctcgctgactacttctcttgtgtgt 17702  T
Q  214 ttgtgatgtcc 224  Q
    ||  |||||||    
T  17703 ttaagatgtcc 17713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0114; HSP #2
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 34 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 40188 - 40007
Alignment:
Q  34 attagaggtacatgttattttgatagtacacctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgg 133  Q
    ||||||||||| ||||  ||| ||||||| |||||| |||||||||| || || |||||||| ||||| ||||||||||| ||  |||  | |   ||||    
T  40188 attagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacacaggtgctactcattgttttattgctttagaaagtgcatataagttgg 40089  T
Q  134 gtcttgatt-tgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcagtgactacttctctcgtatgttt 215  Q
    |  |||||| | ||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||| || |||||    
T  40088 gg-ttgattgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagccaagggtttagtaactacttctcttgtctgttt 40007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0165 (Bit Score: 75; Significance: 1e-34; HSPs: 1)
Name: scaffold0165
Description:

Target: scaffold0165; HSP #1
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 18 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 12106 - 11908
Alignment:
Q  18 gaatgaggatcgattgattagaggtacatgttattttgatagtacacctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgat 117  Q
    ||||||||| ||| | || |||||||| ||||  ||| ||||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||| ||||| || |||||| | |||    
T  12106 gaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggcgctactcattgtttcattgctgttgat 12007  T
Q  118 tgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcagtgactacttctctcgtatgtttg 216  Q
    ||||  | |   |||||||| | | ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||    
T  12006 tgtgcatataagttgggtctggttatgtctgatatgaatggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtttg 11908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0104 (Bit Score: 69; Significance: 4e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0104
Description:

Target: scaffold0104; HSP #1
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 18 - 226
Target Start/End: Original strand, 43577 - 43785
Alignment:
Q  18 gaatgaggatcgattgattagaggtacatgttattttgatagtacacctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgat 117  Q
    ||||||||| ||| | || |||||||| ||||  ||| ||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||| || |||| | | |||    
T  43577 gaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgttgttgat 43676  T
Q  118 tgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcagtgactacttctctcgtatgtttgt 217  Q
    ||||  | |   |||||||| | | ||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| || ||||||     
T  43677 tgtgcatataagttgggtctggttatgtctgatatgaatggaaaaatggttgttgaaactccagctaagggtttagtaactacttctcttgtttgtttga 43776  T
Q  218 gatgtccat 226  Q
    | |||||||    
T  43777 gttgtccat 43785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0192 (Bit Score: 68; Significance: 2e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold0192
Description:

Target: scaffold0192; HSP #1
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 19 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 29672 - 29465
Alignment:
Q  19 aatgaggatcgattgattagaggtacatgttattttgatagtacacctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgatt 118  Q
    |||||||| ||| | || |||||||| ||||  ||| ||||||| |||||| |||||||||| |||||| ||||||| ||||| || |||||  | ||||    
T  29672 aatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactagtgctactcattgtttcattgcagttgatt 29573  T
Q  119 gtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcagtgactacttctctcgtatgtttgtg 218  Q
    |||  | |   |||||||| | | ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| || || |||||| |    
T  29572 gtgcatataagttgggtctggttatgtctgatatgaatggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttcacttgtttgtttgag 29473  T
Q  219 atgtccat 226  Q
     |||||||    
T  29472 ttgtccat 29465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0041 (Bit Score: 68; Significance: 2e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold0041
Description:

Target: scaffold0041; HSP #1
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 19 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 41880 - 41693
Alignment:
Q  19 aatgaggatcgattgattagaggtacatgttattttgatagtacacctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgatt 118  Q
    |||||||| ||| | || |||||||| ||||  ||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| | || |    
T  41880 aatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgctattgaat 41781  T
Q  119 gtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcagtgactacttctct 206  Q
    ||| || |   |||||| | ||| | ||||||||||| || || |||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  41780 gtgcttataagttgggtttggatatatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctct 41693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029 (Bit Score: 68; Significance: 2e-30; HSPs: 2)
Name: scaffold0029
Description:

Target: scaffold0029; HSP #1
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 19 - 206
Target Start/End: Original strand, 94053 - 94240
Alignment:
Q  19 aatgaggatcgattgattagaggtacatgttattttgatagtacacctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgatt 118  Q
    |||||||||||| | || |||||||| ||||  ||| ||||||| |||||| |||||||||| || ||||||||||||||||| || |||||||| || |    
T  94053 aatgaggatcgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtgctacgcattgtttcattgctttagaat 94152  T
Q  119 gtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcagtgactacttctct 206  Q
    |||  | |   ||||||||   | | ||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  94153 gtgcatataagttgggtctgcttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctct 94240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029; HSP #2
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 37 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 115689 - 115510
Alignment:
Q  37 agaggtacatgttattttgatagtacacctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtc 136  Q
    |||||||| ||||  ||| ||||||  |||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||| || |||||||| || ||||  | |    | |||     
T  115689 agaggtacttgtttctttaatagtatccctttaattgctattatagatactggtgctacacattgtttcattgctttagagtgtgcatataaactaggt- 115591  T
Q  137 ttgatt-tgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcagtgactacttctctcgtatgtttg 216  Q
    |||||| | ||||||||||| ||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  115590 ttgattgtatctgatatgaaaggagaaatggtcgttgaaactccagctaagggttcagtgactacttctcttgtttgtttg 115510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0335 (Bit Score: 67; Significance: 7e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold0335
Description:

Target: scaffold0335; HSP #1
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 18 - 216
Target Start/End: Original strand, 4462 - 4660
Alignment:
Q  18 gaatgaggatcgattgattagaggtacatgttattttgatagtacacctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgat 117  Q
    ||||||||| ||| | || |||||||| ||||  ||| ||||||| | |||| || ||||||| |||||||||||||| ||||| || |||||| | |||    
T  4462 gaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcatttaatttctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgat 4561  T
Q  118 tgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcagtgactacttctctcgtatgtttg 216  Q
    ||||  | |   |||||||  | | | ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  4562 tgtgcatataagttgggtcgggttatatctgatatgaatggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctctagtatgtttg 4660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0020 (Bit Score: 67; Significance: 7e-30; HSPs: 2)
Name: scaffold0020
Description:

Target: scaffold0020; HSP #1
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 56 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 176096 - 175926
Alignment:
Q  56 atagtacacctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaa 155  Q
    ||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||| || |||||| | |||||||  | |   |||||||| | | | |||||||||||    
T  176096 atagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgggtctggttatatctgatatgaa 175997  T
Q  156 tggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcagtgactacttctctcgtatgtttgtgatgtccat 226  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||| || |||||| | |||||||    
T  175996 tggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcactaactacttctcttgtttgtttgagttgtccat 175926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0020; HSP #2
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 39 - 206
Target Start/End: Original strand, 98762 - 98929
Alignment:
Q  39 aggtacatgttattttgatagtacacctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtctt 138  Q
    |||||| ||||  ||| ||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||| || ||| || | || |||| || |   ||||||||     
T  98762 aggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattactattgaatgtgcttataagttgggtctg 98861  T
Q  139 gatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcagtgactacttctct 206  Q
    | | | ||| ||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  98862 gttgtatctaatatgaagggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctct 98929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0865 (Bit Score: 65; Significance: 1e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0865
Description:

Target: scaffold0865; HSP #1
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 19 - 226
Target Start/End: Original strand, 1431 - 1638
Alignment:
Q  19 aatgaggatcgattgattagaggtacatgttattttgatagtacacctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgatt 118  Q
    |||||||| ||| | || |||||||| ||||  ||| ||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||| || |||| | |  |||    
T  1431 aatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctacacattgtttcattgttgttaatt 1530  T
Q  119 gtgtttctgctttgggtcttgatt-tgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcagtgactacttctctcgtatgtttgt 217  Q
    |||  | |   |||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||| || ||||||     
T  1531 gtgcatataagttgggtct-gattatgtctgatatgaatggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaattacttctcttgtttgtttga 1629  T
Q  218 gatgtccat 226  Q
    | |||||||    
T  1630 gttgtccat 1638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0133 (Bit Score: 65; Significance: 1e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0133
Description:

Target: scaffold0133; HSP #1
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 19 - 226
Target Start/End: Original strand, 28444 - 28651
Alignment:
Q  19 aatgaggatcgattgattagaggtacatgttattttgatagtacacctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgatt 118  Q
    |||||||| ||| | || |||||||| ||||  ||| ||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||| || |||| | |  |||    
T  28444 aatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctacacattgtttcattgttgttaatt 28543  T
Q  119 gtgtttctgctttgggtcttgatt-tgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcagtgactacttctctcgtatgtttgt 217  Q
    |||  | |   |||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||| || ||||||     
T  28544 gtgcatataagttgggtct-gattatgtctgatatgaatggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaattacttctcttgtttgtttga 28642  T
Q  218 gatgtccat 226  Q
    | |||||||    
T  28643 gttgtccat 28651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0108 (Bit Score: 65; Significance: 1e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0108
Description:

Target: scaffold0108; HSP #1
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 18 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 50251 - 50063
Alignment:
Q  18 gaatgaggatcgattgattagaggtacatgttattttgatagtacacctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgat 117  Q
    ||||||||| ||| | ||||||||||| ||||  ||| ||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||| || |||||| | |||    
T  50251 gaatgaggaccgacttattagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgat 50152  T
Q  118 tgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcagtgactacttctct 206  Q
    ||||  | |   ||||| || | | | ||||||||||| ||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  50151 tgtgcatataagttggggctagttgtatctgatatgaaaggagaaattgttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctct 50063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0046 (Bit Score: 65; Significance: 1e-28; HSPs: 2)
Name: scaffold0046
Description:

Target: scaffold0046; HSP #1
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 64 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 60839 - 60687
Alignment:
Q  64 cctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagaga 163  Q
    |||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||| || |||||| | |||||||  | |   |||||||| | | | ||||||||||||||||| |    
T  60839 cctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgggtctagttatatctgatatgaatggagaaa 60740  T
Q  164 tggttgtcgaaactccagctaagggttcagtgactacttctctcgtatgtttg 216  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||    
T  60739 tggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtttg 60687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0046; HSP #2
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 18 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 70254 - 70079
Alignment:
Q  18 gaatgaggatcgattgattagaggtacatgttattttgatagtacacctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgat 117  Q
    ||||||||| ||| | || |||||||| ||||  ||| ||||||  |||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||| || |||||| | |||    
T  70254 gaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtattcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgat 70155  T
Q  118 tgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcag 193  Q
    ||||  | |   |||||||| | | | ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  70154 tgtgcatataagttgggtctagttatatctgatatgaatggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcag 70079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1288 (Bit Score: 64; Significance: 4e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold1288
Description:

Target: scaffold1288; HSP #1
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 19 - 206
Target Start/End: Original strand, 14 - 201
Alignment:
Q  19 aatgaggatcgattgattagaggtacatgttattttgatagtacacctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgatt 118  Q
    |||||||| ||| | || |||||||| ||||  ||| ||||||| |||||| |||||||||| ||||| |||||||| ||||| || |||||| | ||||    
T  14 aatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatacgggtgctactcattgtttcattgctgttgatt 113  T
Q  119 gtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcagtgactacttctct 206  Q
    |||  | |   |||||||| | | | ||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  114 gtgcatataagttgggtctggttatatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctct 201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0501 (Bit Score: 64; Significance: 4e-28; HSPs: 2)
Name: scaffold0501
Description:

Target: scaffold0501; HSP #1
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 149 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 12678 - 12611
Alignment:
Q  149 atatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcagtgactacttctctcgtatgtttg 216  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  12678 atatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttg 12611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0501; HSP #2
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 16 - 87
Target Start/End: Complemental strand, 72 - 1
Alignment:
Q  16 gagaatgaggatcgattgattagaggtacatgttattttgatagtacacctttagttgctattattgatact 87  Q
    ||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  72 gagaacgaggatcgcttgatcagaggtacatgttatattgataatactcctttagttgctattattgatact 1  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0309 (Bit Score: 64; Significance: 4e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0309
Description:

Target: scaffold0309; HSP #1
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 56 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 12835 - 12676
Alignment:
Q  56 atagtacacctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaa 155  Q
    ||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||| || |||||| | |||||||  | |   |||||||| | | | |||||||||||    
T  12835 atagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgggtctggttgtatctgatatgaa 12736  T
Q  156 tggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcagtgactacttctctcgtatgttt 215  Q
     ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||    
T  12735 aggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgttt 12676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0118 (Bit Score: 64; Significance: 4e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0118
Description:

Target: scaffold0118; HSP #1
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 19 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 606 - 419
Alignment:
Q  19 aatgaggatcgattgattagaggtacatgttattttgatagtacacctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgatt 118  Q
    |||||||| ||| | || |||||||| ||||  ||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||| | || |    
T  606 aatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctagtcattgttttattgctattgaat 507  T
Q  119 gtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcagtgactacttctct 206  Q
    ||| || |   |||||| | ||| | ||||||||||| || || ||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  506 gtgcttataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggtcgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctct 419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0067 (Bit Score: 64; Significance: 4e-28; HSPs: 4)
Name: scaffold0067
Description:

Target: scaffold0067; HSP #1
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 19 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 29769 - 29582
Alignment:
Q  19 aatgaggatcgattgattagaggtacatgttattttgatagtacacctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgatt 118  Q
    |||||||| ||| | || |||||||| ||||  ||| ||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||| || || || |||||| | ||||    
T  29769 aatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcaatgtttgattgctgttgatt 29670  T
Q  119 gtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcagtgactacttctct 206  Q
    |||  | |   |||||||| | | | ||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  29669 gtgcatataagttgggtctagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctct 29582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0067; HSP #2
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 37 - 215
Target Start/End: Original strand, 64779 - 64957
Alignment:
Q  37 agaggtacatgttattttgatagtacacctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtc 136  Q
    |||||||| ||||  ||| ||||||| |||||| |||||||||| || ||||||||||| ||||| || |||||||| || ||||  | |   |||  |     
T  64779 agaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtgctactcattgtttcattgctttagaatgtgcgtataagttgaat- 64877  T
Q  137 ttgatt-tgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcagtgactacttctctcgtatgttt 215  Q
    |||||| | ||||||||||| ||||| |||| ||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| || |||||    
T  64878 ttgattgtatctgatatgaaaggagaaatggctgttgaaactccagcaaagggttcagtaactacttctcttgtttgttt 64957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0067; HSP #3
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 37 - 215
Target Start/End: Original strand, 49357 - 49535
Alignment:
Q  37 agaggtacatgttattttgatagtacacctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtc 136  Q
    |||||||| ||||  ||| ||||||| |||||| |||||||||| || ||||| ||||| ||||| || |||||||| || ||||  | |   |||  |     
T  49357 agaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggagctactcattgtttcattgctttagaatgtgcgtataagttgaat- 49455  T
Q  137 ttgatt-tgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcagtgactacttctctcgtatgttt 215  Q
    |||||| | ||||||||||| ||||| |||| ||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| || |||||    
T  49456 ttgattgtatctgatatgaaaggagaaatggctgttgaaactccagccaagggttcagtaactacttctcttgtttgttt 49535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0067; HSP #4
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 37 - 215
Target Start/End: Original strand, 58391 - 58569
Alignment:
Q  37 agaggtacatgttattttgatagtacacctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtc 136  Q
    |||||||| ||||  ||| ||||||| |||||| |||||||||| || ||||| ||||| ||||| || |||||||| || ||||  | |   |||  |     
T  58391 agaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggagctactcattgtttcattgctttagaatgtgcgtataagttgaat- 58489  T
Q  137 ttgatt-tgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcagtgactacttctctcgtatgttt 215  Q
    |||||| | ||||||||||| ||||| |||| ||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| || |||||    
T  58490 ttgattgtatctgatatgaaaggagaaatggctgttgaaactccagccaagggttcagtaactacttctcttgtttgttt 58569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1056 (Bit Score: 63; Significance: 2e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold1056
Description:

Target: scaffold1056; HSP #1
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 18 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 1867 - 1681
Alignment:
Q  18 gaatgaggatcgattgattagaggtacatgttattttgatagtacacctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgat 117  Q
    ||||||||| ||| | || | |||||| ||||  ||| ||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||| || |||| | | |||    
T  1867 gaatgaggaccgacttatcaaaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgttgttgat 1768  T
Q  118 tgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcagtgactacttct 204  Q
    ||||  | |   |||||||| | | ||||||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  1767 tgtgcatataagttgggtctggttatgtctgatatgaatggagaaatggttcttgaaactccagctaagggttcagtaactacttct 1681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0507 (Bit Score: 63; Significance: 2e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold0507
Description:

Target: scaffold0507; HSP #1
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 14 - 120
Target Start/End: Complemental strand, 11178 - 11072
Alignment:
Q  14 cagagaatgaggatcgattgattagaggtacatgttattttgatagtacacctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgcttt 113  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||| ||| |||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||| |    
T  11178 cagagaatgaggatcgtttgattagaggtacatgttactttgatagtactcatttaattgttattattgatactggtactactcattgttttattgctat 11079  T
Q  114 cgattgt 120  Q
     ||||||    
T  11078 tgattgt 11072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0148 (Bit Score: 63; Significance: 2e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold0148
Description:

Target: scaffold0148; HSP #1
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 18 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 2145 - 1959
Alignment:
Q  18 gaatgaggatcgattgattagaggtacatgttattttgatagtacacctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgat 117  Q
    ||||||||||||  | || |||||||||||||   || ||||||| |||||| || ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| |   |||    
T  2145 gaatgaggatcgtctaatcagaggtacatgtttcattaatagtactcctttaattactattatagatactggtgctacgcattgttttattgttgctgat 2046  T
Q  118 tgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcagtgactacttct 204  Q
    |||| | ||   |||||||||  | ||||  |||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||    
T  2045 tgtgctactaagttgggtcttattatgtcatatatgaatggggaaatggttgtcgaaaccccagctaagggttcggtgactacttct 1959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0068 (Bit Score: 63; Significance: 2e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold0068
Description:

Target: scaffold0068; HSP #1
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 19 - 216
Target Start/End: Original strand, 67267 - 67464
Alignment:
Q  19 aatgaggatcgattgattagaggtacatgttattttgatagtacacctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgatt 118  Q
    |||||||| ||| | || |||||||| ||||  ||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| || ||      
T  67267 aatgaggaccgactcatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgccttagaaa 67366  T
Q  119 gtgtttctgctttgggtcttgatt-tgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcagtgactacttctctcgtatgtttg 216  Q
    |||  | |   |||||| |||||| | || |||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||    
T  67367 gtgcatataagttgggt-ttgattgtatccgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtttg 67464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0035 (Bit Score: 63; Significance: 2e-27; HSPs: 2)
Name: scaffold0035
Description:

Target: scaffold0035; HSP #1
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 18 - 204
Target Start/End: Original strand, 41266 - 41452
Alignment:
Q  18 gaatgaggatcgattgattagaggtacatgttattttgatagtacacctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgat 117  Q
    |||||||||||   |||| ||||||||||||||  || ||||||| || ||| || ||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||   |||    
T  41266 gaatgaggatcatctgatcagaggtacatgttacattaatagtactcccttaattactattatagatactggtgctacacattgttttattgctgctgat 41365  T
Q  118 tgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcagtgactacttct 204  Q
    ||||||||    |||||||||| | ||||   ||||||||| || ||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||    
T  41366 tgtgtttcgaaattgggtcttgttatgtcatctatgaatggggaaatggttgtcgaaacttcggctaagggttcggtgactacttct 41452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0035; HSP #2
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 37 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 5932 - 5763
Alignment:
Q  37 agaggtacatgttattttgatagtacacctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtc 136  Q
    |||||||| ||||  ||| ||||||| |||||| ||| |||||| |||||| ||||||| ||||| || |||||| |  | ||||  | |   |||||||    
T  5932 agaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgttattatagatactagtgctactcattgtttcattgctatttaatgtgcatataagttgggtc 5833  T
Q  137 ttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcagtgactacttctct 206  Q
    | | | | ||||||||||| | ||| |||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  5832 tggttgtatctgatatgaaagaagaaatggttgttgaaactccagctatgggttcagtaactacttctct 5763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0203 (Bit Score: 62; Significance: 6e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold0203
Description:

Target: scaffold0203; HSP #1
Raw Score: 62; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 21 - 206
Target Start/End: Original strand, 1015 - 1200
Alignment:
Q  21 tgaggatcgattgattagaggtacatgttattttgatagtacacctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgt 120  Q
    |||||||||| | || |||||||| ||||  ||| ||||||| |||||| |||||||||| || ||||||||||| ||||| || |||||| | || |||    
T  1015 tgaggatcgaattatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtgctactcattgtttcattgctattgaatgt 1114  T
Q  121 gtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcagtgactacttctct 206  Q
    | || |   |||||||| | | | | ||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  1115 gcttataagttgggtctggttgtatatgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctct 1200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009 (Bit Score: 62; Significance: 6e-27; HSPs: 2)
Name: scaffold0009
Description:

Target: scaffold0009; HSP #1
Raw Score: 62; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 37 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 251749 - 251560
Alignment:
Q  37 agaggtacatgttattttgatagtacacctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtc 136  Q
    |||||||| ||||  ||| |||||||  ||||| |||||||||| |||||| ||||||| ||||| || |||||| | || |||| || |   ||||||     
T  251749 agaggtacttgtttctttaatagtacttctttaattgctattatagatactagtgctactcattgtttcattgctattgaatgtgcttataagttgggtt 251650  T
Q  137 ttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcagtgactacttctctcgtatgtttgtgatgtccat 226  Q
    | ||| | ||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || ||| |||||||||    
T  251649 tggatgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctctagtttgcttgagatgtccat 251560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009; HSP #2
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 14 - 101
Target Start/End: Original strand, 230006 - 230093
Alignment:
Q  14 cagagaatgaggatcgattgattagaggtacatgttattttgatagtacacctttagttgctattattgatactggtgctacgcattg 101  Q
    ||||||| |||||||| ||||| |||||||| || ||| || ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  230006 cagagaacgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattg 230093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004 (Bit Score: 62; Significance: 6e-27; HSPs: 2)
Name: scaffold0004
Description:

Target: scaffold0004; HSP #1
Raw Score: 62; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 19 - 216
Target Start/End: Original strand, 200627 - 200824
Alignment:
Q  19 aatgaggatcgattgattagaggtacatgttattttgatagtacacctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgatt 118  Q
    |||||||| ||| | || |||||||| ||||  ||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||| || |||| | | ||||    
T  200627 aatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactagtgctacacattgtttcattgttgttgatt 200726  T
Q  119 gtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcagtgactacttctctcgtatgtttg 216  Q
    |||  | |   |||||||| | | ||||   ||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  200727 gtgcatataagttgggtctggttatgtcaagtatgagtggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctctcgtttgtttg 200824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #2
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 21 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 325850 - 325665
Alignment:
Q  21 tgaggatcgattgattagaggtacatgttattttgatagtacacctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgt 120  Q
    |||||||||| | || |||||||| ||||  ||| ||| ||| |||||| |||||||||| || ||||||||||| ||||| || |||||| | || |||    
T  325850 tgaggatcgacttatcagaggtacttgtttctttaatattactcctttaattgctattatagacactggtgctactcattgtttcattgctattgaatgt 325751  T
Q  121 gtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcagtgactacttctct 206  Q
    | || |   |||||||| | | | ||||||||||| || || |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  325750 gcttataagttgggtctggttgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctct 325665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0405 (Bit Score: 61; Significance: 2e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold0405
Description:

Target: scaffold0405; HSP #1
Raw Score: 61; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 18 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 5748 - 5560
Alignment:
Q  18 gaatgaggatcgattgattagaggtacatgttattttgatagtacacctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgat 117  Q
    ||||||||| ||| | || |||||||| ||||  ||| ||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||| || |||| | | | |    
T  5748 gaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgttgttgtt 5649  T
Q  118 tgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcagtgactacttctct 206  Q
    | ||  | |   |||||||| | | ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  5648 tatgcatataagttgggtctggttatgtctgatatgaatggagaaatggttgttgaaactccagctaagggtttagtaactacttctct 5560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1530 (Bit Score: 60; Significance: 1e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold1530
Description:

Target: scaffold1530; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 23 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 724 - 541
Alignment:
Q  23 aggatcgattgattagaggtacatgttattttgatagtacacctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgt 122  Q
    |||||||| | || |||||||| ||||  ||| ||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||| || |||||| | || ||||     
T  724 aggatcgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattgaatgtgc 625  T
Q  123 ttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcagtgactacttctct 206  Q
    || |   |||||||| | | | ||||||||||| || || |||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  624 ttataagttgggtctggttgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccatctaagggttcagtaactacttctct 541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0708 (Bit Score: 60; Significance: 1e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0708
Description:

Target: scaffold0708; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 19 - 206
Target Start/End: Original strand, 5304 - 5491
Alignment:
Q  19 aatgaggatcgattgattagaggtacatgttattttgatagtacacctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgatt 118  Q
    |||||||| ||| | || |||||||| ||||  ||| ||||||| | |||| |||||||||| |||||||||||||| ||||| || |||||| | || |    
T  5304 aatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcatttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattgaat 5403  T
Q  119 gtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcagtgactacttctct 206  Q
    ||| || |   |||||| | ||| | |||||||||||  |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  5404 gtgcttataagttgggtatggatgtatctgatatgaaaagagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctct 5491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0443 (Bit Score: 60; Significance: 1e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0443
Description:

Target: scaffold0443; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 19 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 11954 - 11767
Alignment:
Q  19 aatgaggatcgattgattagaggtacatgttattttgatagtacacctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgatt 118  Q
    |||||||| ||| | || |||||||| ||||  ||| ||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||| | || |    
T  11954 aatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgttttattgctattgaat 11855  T
Q  119 gtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcagtgactacttctct 206  Q
    |||  | |   |||||| | ||| | ||||||||||| || || |||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  11854 gtgcatataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctct 11767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0053 (Bit Score: 60; Significance: 1e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0053
Description:

Target: scaffold0053; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 37 - 215
Target Start/End: Original strand, 65475 - 65653
Alignment:
Q  37 agaggtacatgttattttgatagtacacctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtc 136  Q
    |||||||| ||||  ||| |||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||| ||||| ||  ||||||| || ||||  | |   ||||||     
T  65475 agaggtacttgtttctttaatagtacacctttaattgctattatagacactggtgctactcattgtttccttgctttagaatgtgcatataagttgggt- 65573  T
Q  137 ttgatt-tgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcagtgactacttctctcgtatgttt 215  Q
    |||||| | ||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||    
T  65574 ttgattgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgttt 65653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005 (Bit Score: 60; Significance: 1e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0005
Description:

Target: scaffold0005; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 34 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 263356 - 263174
Alignment:
Q  34 attagaggtacatgttattttgatagtacacctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgg 133  Q
    ||||||||||| ||||  ||| ||||||| |||||| |||||||||| || ||||||||||| ||||| || |||||||| ||  |||  | |   ||||    
T  263356 attagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtgctactcattgtttcattgctttagaaagtgcatataagttgg 263257  T
Q  134 gtcttgatt-tgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcagtgactacttctctcgtatgtttg 216  Q
    || |||||| | ||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||    
T  263256 gt-ttgattgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtttg 263174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0054 (Bit Score: 59; Significance: 4e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0054
Description:

Target: scaffold0054; HSP #1
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 18 - 216
Target Start/End: Original strand, 63677 - 63875
Alignment:
Q  18 gaatgaggatcgattgattagaggtacatgttattttgatagtacacctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgat 117  Q
    ||||||||| ||| | || |||||||| ||||  ||| ||||||| | |||| |||||||||| |||||||||| ||| ||||| || |||| | | |||    
T  63677 gaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcttttaattgctattatagatactggtgttactcattgtttcattgttgttgat 63776  T
Q  118 tgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcagtgactacttctctcgtatgtttg 216  Q
    ||||  | |   |||||||| | | | ||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||    
T  63777 tgtgcatataagttgggtctggttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtttg 63875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0664 (Bit Score: 58; Significance: 2e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0664
Description:

Target: scaffold0664; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 21 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 7181 - 6996
Alignment:
Q  21 tgaggatcgattgattagaggtacatgttattttgatagtacacctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgt 120  Q
    |||||||||| | || |||||||| ||||  ||| ||||||| |||||| |||||||||| || ||||||||||| ||||| || |||||| | || |||    
T  7181 tgaggatcgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtgctactcattgtttcattgctattgaatgt 7082  T
Q  121 gtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcagtgactacttctct 206  Q
    | || |   |||||| | | | | ||||||||||| || || |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  7081 gcttataagttgggtttggttgtttctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctct 6996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0585 (Bit Score: 58; Significance: 2e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0585
Description:

Target: scaffold0585; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 19 - 204
Target Start/End: Original strand, 4248 - 4433
Alignment:
Q  19 aatgaggatcgattgattagaggtacatgttattttgatagtacacctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgatt 118  Q
    |||||||| ||| | || |||||||| ||||  ||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||| | ||||    
T  4248 aatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgtttcattgctgttgatt 4347  T
Q  119 gtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcagtgactacttct 204  Q
    |||  | |   ||||||||   | ||||   ||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  4348 gtgcatataagttgggtctacttatgtcaagtatgagtggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttct 4433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0523 (Bit Score: 58; Significance: 2e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0523
Description:

Target: scaffold0523; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 37 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 2998 - 2809
Alignment:
Q  37 agaggtacatgttattttgatagtacacctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtc 136  Q
    |||||||| ||||  ||| ||||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||| ||||| || |||| | | | |||||  | |   |||||||    
T  2998 agaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggggctactcattgtttcattgttgttgcttgtgcatataagttgggtc 2899  T
Q  137 ttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcagtgactacttctctcgtatgtttgtgatgtccat 226  Q
    | | | | ||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||| | |||||||    
T  2898 tggttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtttgagttgtccat 2809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0420 (Bit Score: 58; Significance: 2e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0420
Description:

Target: scaffold0420; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 21 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 8757 - 8572
Alignment:
Q  21 tgaggatcgattgattagaggtacatgttattttgatagtacacctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgt 120  Q
    |||||||||| | || |||||||| ||||  ||| ||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||| || |||||| | || |||    
T  8757 tgaggatcgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattgaatgt 8658  T
Q  121 gtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcagtgactacttctct 206  Q
    |  | |   |||||| | | | | |||||||| || ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  8657 gcatataagttgggtttggttgtatctgatataaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctct 8572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0088 (Bit Score: 58; Significance: 2e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0088
Description:

Target: scaffold0088; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 19 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 30079 - 29906
Alignment:
Q  19 aatgaggatcgattgattagaggtacatgttattttgatagtacacctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgatt 118  Q
    |||||||| ||| | || |||||||| ||||  ||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| | || |    
T  30079 aatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgctattgaat 29980  T
Q  119 gtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttca 192  Q
    |||  | |   |||||| | ||| | ||||||||||| || || |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  29979 gtgcatataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttca 29906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0751 (Bit Score: 57; Significance: 6e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0751
Description:

Target: scaffold0751; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 18 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 5327 - 5139
Alignment:
Q  18 gaatgaggatcgattgattagaggtacatgttattttgatagtacacctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgat 117  Q
    ||||||||| ||| | || |||||||| ||||  ||| ||||||| | |||| |||||||||| |||||||||||||| ||||| || |||||| | |||    
T  5327 gaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcatttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgat 5228  T
Q  118 tgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcagtgactacttctct 206  Q
    ||||  | |   |||||||| | | ||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||| ||| |||||| |||| ||||||    
T  5227 tgtgcatataagttgggtctggttatgtctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctgaggtttcagtaactatttctct 5139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1032 (Bit Score: 56; Significance: 2e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold1032
Description:

Target: scaffold1032; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 39 - 206
Target Start/End: Original strand, 994 - 1161
Alignment:
Q  39 aggtacatgttattttgatagtacacctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtctt 138  Q
    |||||| ||||  ||| ||||||| || ||| |||||||||| || ||| ||||||| ||||| ||||||||| | |||||||  | |   ||||||||     
T  994 aggtacttgtttctttaatagtactcccttaattgctattatagacactagtgctactcattgttttattgctattgattgtgcatataagttgggtctg 1093  T
Q  139 gatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcagtgactacttctct 206  Q
    | | | ||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  1094 gctgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctct 1161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0765 (Bit Score: 56; Significance: 2e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0765
Description:

Target: scaffold0765; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 56 - 206
Target Start/End: Original strand, 6453 - 6603
Alignment:
Q  56 atagtacacctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatt-tgtctgatatga 154  Q
    ||||||| |||||| |||||||||| || ||||||||||| ||||| || |||||||| ||  ||| || |   |||||| |||||| | ||||||||||    
T  6453 atagtactcctttaattgctattatagacactggtgctactcattgtttcattgctttagaaagtgcttataagttgggt-ttgattgtatctgatatga 6551  T
Q  155 atggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcagtgactacttctct 206  Q
    | ||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  6552 aaggagaaatggttgttgaaactccggctaagggttcagtgactacttctct 6603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0706 (Bit Score: 54; Significance: 4e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0706
Description:

Target: scaffold0706; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 21 - 206
Target Start/End: Original strand, 5370 - 5555
Alignment:
Q  21 tgaggatcgattgattagaggtacatgttattttgatagtacacctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgt 120  Q
    |||||||||| | || |||||||| ||||  ||| ||||||| |||||| |||||||||| ||  |||||||||| ||||| || |||||| | || |||    
T  5370 tgaggatcgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacgctggtgctactcattgtttcattgctattgaatgt 5469  T
Q  121 gtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcagtgactacttctct 206  Q
    | || |   |||||||| | | | ||| ||||||| || || |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  5470 gcttataagttgggtctggttgtatctaatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctct 5555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0235 (Bit Score: 54; Significance: 4e-22; HSPs: 2)
Name: scaffold0235
Description:

Target: scaffold0235; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 21 - 206
Target Start/End: Original strand, 8623 - 8808
Alignment:
Q  21 tgaggatcgattgattagaggtacatgttattttgatagtacacctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgt 120  Q
    |||||||||| | || |||||||| ||||  ||| ||||||  |||||| |||||||||| || ||| ||||||| || || || |||||| |||| |||    
T  8623 tgaggatcgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtaatcctttaattgctattatagacactagtgctactcaatgtttcattgctatcgaatgt 8722  T
Q  121 gtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcagtgactacttctct 206  Q
    | || |   || ||||| | | | ||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  8723 gcttataagttaggtctggttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctct 8808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0235; HSP #2
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 21 - 206
Target Start/End: Original strand, 18837 - 19022
Alignment:
Q  21 tgaggatcgattgattagaggtacatgttattttgatagtacacctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgt 120  Q
    |||||||||| | || |||||||| ||||  ||| ||||||  |||||| |||||||||| || ||| ||||||| || || || |||||| |||| |||    
T  18837 tgaggatcgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtaatcctttaattgctattatagacactagtgctactcaatgtttcattgctatcgaatgt 18936  T
Q  121 gtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcagtgactacttctct 206  Q
    | || |   || ||||| | | | ||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  18937 gcttataagttaggtctggttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctct 19022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0222 (Bit Score: 54; Significance: 4e-22; HSPs: 3)
Name: scaffold0222
Description:

Target: scaffold0222; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 37 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 20941 - 20772
Alignment:
Q  37 agaggtacatgttattttgatagtacacctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtc 136  Q
    |||||||| ||||  ||| ||||||| |||||| |||||||||| || ||||||||||| ||||| || |||||| | || |||| || |   |||||||    
T  20941 agaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtgctactcattgtttcattgctattgaatgtgcttataagttgggtc 20842  T
Q  137 ttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcagtgactacttctct 206  Q
    | |   | ||||||||||| || || |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  20841 tggtcgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctct 20772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0222; HSP #2
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 145 - 215
Target Start/End: Original strand, 772 - 842
Alignment:
Q  145 tctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcagtgactacttctctcgtatgttt 215  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||    
T  772 tctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtgtgttt 842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0222; HSP #3
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 19 - 95
Target Start/End: Original strand, 646 - 722
Alignment:
Q  19 aatgaggatcgattgattagaggtacatgttattttgatagtacacctttagttgctattattgatactggtgctac 95  Q
    |||||||| ||| | || |||||||| ||||  ||| ||||||| |||||| |||||||||| || |||||||||||    
T  646 aatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagaaactggtgctac 722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0167 (Bit Score: 54; Significance: 4e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0167
Description:

Target: scaffold0167; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 37 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 1247 - 1078
Alignment:
Q  37 agaggtacatgttattttgatagtacacctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtc 136  Q
    |||||||| ||||  ||| ||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||| || |||||| | || |||| || |   |||||||    
T  1247 agaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattgaatgtgcttataagttgggtc 1148  T
Q  137 ttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcagtgactacttctct 206  Q
    | | | | ||||||||||| || || || ||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  1147 tggttgtatctgatatgaaaggggaaattgttgttgaaactccagttaagggttcagtaactacttctct 1078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0072 (Bit Score: 54; Significance: 4e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0072
Description:

Target: scaffold0072; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 21 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 54190 - 54005
Alignment:
Q  21 tgaggatcgattgattagaggtacatgttattttgatagtacacctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgt 120  Q
    |||||||||| | || |||||||| ||||  ||| ||||||| |||||| |||||||||| || ||||||| ||| ||||| || |||||| | || |||    
T  54190 tgaggatcgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtgttactcattgtttcattgctattgaatgt 54091  T
Q  121 gtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcagtgactacttctct 206  Q
    | || |   ||| |||| | | | ||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  54090 gcttataagttgtgtctggttgtatctgatatgaatgtagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcattaactacttctct 54005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034 (Bit Score: 54; Significance: 4e-22; HSPs: 2)
Name: scaffold0034
Description:

Target: scaffold0034; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 37 - 206
Target Start/End: Original strand, 2129 - 2298
Alignment:
Q  37 agaggtacatgttattttgatagtacacctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtc 136  Q
    |||||||| ||||  ||| ||||||  |||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||| || |||||| | || |||  || |   |||||||    
T  2129 agaggtacttgtttctttaatagtattcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattgaatgttcttataagttgggtc 2228  T
Q  137 ttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcagtgactacttctct 206  Q
    | | | | ||||||||||| || || |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  2229 tggttgtatctgatatgaaaggggatatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctct 2298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034; HSP #2
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 19 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 70517 - 70321
Alignment:
Q  19 aatgaggatcgattgattagaggtacatgttattttgatagtacacctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgatt 118  Q
    |||||||||||| | || |||||||| ||||  ||| ||||||| |||||| |||||||||| || ||||||| ||| ||||| ||  ||||||| || |    
T  70517 aatgaggatcgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtgttactcattgtttctttgctttagaat 70418  T
Q  119 gtgtttctgctttgggtcttgatt-tgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcagtgactacttctctcgtatgttt 215  Q
    |||  | |   |||||||| |||| | ||||||||||| ||||| || ||||| ||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||| || |||||    
T  70417 gtgcatataagttgggtct-gattgtatctgatatgaaaggagaaattgttgttgaaactctagccaagggttcagtaactacttctctagtttgttt 70321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0239 (Bit Score: 53; Significance: 1e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0239
Description:

Target: scaffold0239; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 37 - 216
Target Start/End: Original strand, 9963 - 10142
Alignment:
Q  37 agaggtacatgttattttgatagtacacctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtc 136  Q
    |||||||| ||||  ||| ||||||| |||||| |||||||||| || ||||||||||| ||||| || |||||||| ||  |||  | |   ||||||     
T  9963 agaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtgctactcattgtttcattgctttagaaagtgcatataagttgggt- 10061  T
Q  137 ttgatt-tgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcagtgactacttctctcgtatgtttg 216  Q
    |||||| | ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||||| || ||||||    
T  10062 ttgattgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggtacagtaactacttctcttgtttgtttg 10142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0156 (Bit Score: 52; Significance: 6e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0156
Description:

Target: scaffold0156; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 39 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 37064 - 36897
Alignment:
Q  39 aggtacatgttattttgatagtacacctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtctt 138  Q
    |||||| ||||  ||| ||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||| || |||| | | |||||||  |     ||||||||     
T  37064 aggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgatgttgattgtgcatacaagttgggtctg 36965  T
Q  139 gatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcagtgactacttctct 206  Q
    | | | ||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  36964 gttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcaataactacttctct 36897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0117 (Bit Score: 52; Significance: 6e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0117
Description:

Target: scaffold0117; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 145 - 224
Target Start/End: Original strand, 3455 - 3534
Alignment:
Q  145 tctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcagtgactacttctctcgtatgtttgtgatgtcc 224  Q
    ||||||||||| ||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||    
T  3455 tctgatatgaaaggagaaatggtcgttgaaactccagctaagggttcagtgactacttctcttgtttgtttgagatgtcc 3534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0019 (Bit Score: 52; Significance: 6e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0019
Description:

Target: scaffold0019; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 14 - 105
Target Start/End: Complemental strand, 171268 - 171177
Alignment:
Q  14 cagagaatgaggatcgattgattagaggtacatgttattttgatagtacacctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgcttt 105  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||| ||| || ||| || ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  171268 cagagaatgaggatcgtttgatcagagttacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctatgcattgcttt 171177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0261 (Bit Score: 51; Significance: 2e-20; HSPs: 2)
Name: scaffold0261
Description:

Target: scaffold0261; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 56 - 206
Target Start/End: Original strand, 20724 - 20874
Alignment:
Q  56 atagtacacctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaa 155  Q
    ||||||| ||||||  || |||||| |||||||||||||| ||||| || |||||| | |||||||  | |   |||||||| | | | |||||||||||    
T  20724 atagtactcctttaaatgttattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataaattgggtctggttgtatctgatatgaa 20823  T
Q  156 tggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcagtgactacttctct 206  Q
     || || |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  20824 aggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctct 20874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0261; HSP #2
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 56 - 206
Target Start/End: Original strand, 12544 - 12694
Alignment:
Q  56 atagtacacctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaa 155  Q
    ||||||| ||||||  || |||||| |||||||||||||| ||||| || |||||| | |||||||  | |   |||| ||| | | | ||  |||||||    
T  12544 atagtactcctttaaatgttattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataaattggatctggttgtatcaaatatgaa 12643  T
Q  156 tggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcagtgactacttctct 206  Q
     ||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  12644 aggagaaatggttgttgaaactccaactaagggttcagtaactacttctct 12694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031 (Bit Score: 51; Significance: 2e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0031
Description:

Target: scaffold0031; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 56 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 110718 - 110568
Alignment:
Q  56 atagtacacctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaa 155  Q
    ||||||| |||||| ||||| |||| |||||||||||||| ||||| || |||| | | |||||||  | |   |||||||| | | |||||||||||||    
T  110718 atagtactcctttaattgctgttatagatactggtgctactcattgtttcattgttgttgattgtgcatataagttgggtctggttgtgtctgatatgaa 110619  T
Q  156 tggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcagtgactacttctct 206  Q
     ||||| ||||||||  ||||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  110618 aggagaaatggttgttaaaactccggctaagggttcagtaactacttctct 110568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1433 (Bit Score: 50; Significance: 9e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold1433
Description:

Target: scaffold1433; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 37 - 206
Target Start/End: Original strand, 1488 - 1657
Alignment:
Q  37 agaggtacatgttattttgatagtacacctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtc 136  Q
    |||||||| ||||  ||| ||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||| || |||||| | || ||||  | |   |||||||    
T  1488 agaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattgactgtgcatataagttgggtc 1587  T
Q  137 ttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcagtgactacttctct 206  Q
    | | | | ||||||| ||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || | |||||||||    
T  1588 tggttgtatctgatacgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcggtaattacttctct 1657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0404 (Bit Score: 50; Significance: 9e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0404
Description:

Target: scaffold0404; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 37 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 7871 - 7702
Alignment:
Q  37 agaggtacatgttattttgatagtacacctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtc 136  Q
    |||||||| ||||  ||| ||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||| || |||||| | || ||||  | |   |||||||    
T  7871 agaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattgactgtgcatataagttgggtc 7772  T
Q  137 ttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcagtgactacttctct 206  Q
    | | | | ||||||| ||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || | |||||||||    
T  7771 tggttgtatctgatacgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcggtaattacttctct 7702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0076 (Bit Score: 50; Significance: 9e-20; HSPs: 2)
Name: scaffold0076
Description:

Target: scaffold0076; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 145 - 226
Target Start/End: Original strand, 53708 - 53789
Alignment:
Q  145 tctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcagtgactacttctctcgtatgtttgtgatgtccat 226  Q
    ||||| ||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||| |||||||||    
T  53708 tctgaaatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtgactacttctcttgtttgcttgagatgtccat 53789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0076; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 37 - 101
Target Start/End: Original strand, 53600 - 53664
Alignment:
Q  37 agaggtacatgttattttgatagtacacctttagttgctattattgatactggtgctacgcattg 101  Q
    |||||||| ||||  ||| ||||||| |||||| |||||||||| || ||||||||||| |||||    
T  53600 agaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagaaactggtgctactcattg 53664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0090 (Bit Score: 48; Significance: 1e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0090
Description:

Target: scaffold0090; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 145 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 21870 - 21799
Alignment:
Q  145 tctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcagtgactacttctctcgtatgtttg 216  Q
    ||||||||||| ||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  21870 tctgatatgaaaggagaaatggtcgttgaaactccagctaagggttcagtgactacttctcttgtttgtttg 21799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0100 (Bit Score: 47; Significance: 6e-18; HSPs: 2)
Name: scaffold0100
Description:

Target: scaffold0100; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 88 - 206
Target Start/End: Original strand, 21413 - 21531
Alignment:
Q  88 ggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagg 187  Q
    |||||||||||||| |||||||||   ||||||| ||||   ||||| |||| | ||||   |||| |||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  21413 ggtgctacgcattgttttattgctactgattgtgcttctaagttgggccttgttatgtcatgtatggatggggaaatggttgtcgaaactccagctaagg 21512  T
Q  188 gttcagtgactacttctct 206  Q
    |||| ||||||||||||||    
T  21513 gttcggtgactacttctct 21531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0100; HSP #2
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 18 - 91
Target Start/End: Original strand, 16767 - 16840
Alignment:
Q  18 gaatgaggatcgattgattagaggtacatgttattttgatagtacacctttagttgctattattgatactggtg 91  Q
    ||||||||| || ||||| |||||||||||||  ||| || |||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  16767 gaatgaggaccggttgatcagaggtacatgtttctttaattgtactcctttaattgctattattgatactggtg 16840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0056 (Bit Score: 47; Significance: 6e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0056
Description:

Target: scaffold0056; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 37 - 206
Target Start/End: Original strand, 1060 - 1229
Alignment:
Q  37 agaggtacatgttattttgatagtacacctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtc 136  Q
    |||||||| ||||  ||| ||||||| |||||| |||||||||| | |||||||||||| ||||  || |||| | | |||||||    |   |||||||    
T  1060 agaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagctactggtgctactcattatttcattgttgttgattgtgcgcataagttgggtc 1159  T
Q  137 ttgatt-tgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcagtgactacttctct 206  Q
    | |||| | ||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  1160 t-gattgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctct 1229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0509 (Bit Score: 46; Significance: 2e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0509
Description:

Target: scaffold0509; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 19 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 11973 - 11778
Alignment:
Q  19 aatgaggatcgattgattagaggtacatgttattttgatagtacacctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgatt 118  Q
    |||||||| ||| | ||||||| ||| ||||  ||| ||||||| |||||| |||||||||| ||   ||||||||| ||||| || |||||| | ||||    
T  11973 aatgaggaccgacttattagagatacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagaccatggtgctacacattgtttcattgctattgatt 11874  T
Q  119 gtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcagtgactacttctctcgtatgtttg 216  Q
    |||  | |   |||||||| |||| ||| | ||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||| || ||||||    
T  11873 gtgcatataagttgggtct-gatt-gtcaggtatgagtggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcaataactacttctcttgtttgtttg 11778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0413 (Bit Score: 46; Significance: 2e-17; HSPs: 2)
Name: scaffold0413
Description:

Target: scaffold0413; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 143 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 3622 - 3541
Alignment:
Q  143 tgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcagtgactacttctctcgtatgtttgtgatgtcc 224  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| || |||| |||||| || |||||  |||||||    
T  3622 tgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactgcagctaaggtttcggtaactatttctcttgtgtgtttaagatgtcc 3541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0413; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 23 - 70
Target Start/End: Complemental strand, 3683 - 3636
Alignment:
Q  23 aggatcgattgattagaggtacatgttattttgatagtacacctttag 70  Q
    ||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  3683 aggatcgcttgatcagaggtacttgttattttgataatacacctttag 3636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0348 (Bit Score: 46; Significance: 2e-17; HSPs: 2)
Name: scaffold0348
Description:

Target: scaffold0348; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 19 - 215
Target Start/End: Original strand, 17643 - 17839
Alignment:
Q  19 aatgaggatcgattgattagaggtacatgttattttgatagtacacctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgatt 118  Q
    |||||||||||  | || |||||||| ||||  ||| ||||||| |||||| |||||||||| || | |||||||||  |||| || |||||||| ||      
T  17643 aatgaggatcgtcttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacattggtgctacttattgtttcattgctttagaaa 17742  T
Q  119 gtgtttctgctttgggtcttgatt-tgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcagtgactacttctctcgtatgttt 215  Q
    |||  | |   |||||| |||||| | ||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| || |||||    
T  17743 gtgcatataagttgggt-ttgattgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagccaagggttcagtaactacttctcttgtctgttt 17839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0348; HSP #2
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 37 - 206
Target Start/End: Original strand, 5026 - 5195
Alignment:
Q  37 agaggtacatgttattttgatagtacacctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtc 136  Q
    |||||||| ||||  ||| ||| ||| |||||| ||| |||||| || ||||||||||| ||||| || |||||||| ||  |||  | |   ||||||     
T  5026 agaggtacttgtttctttaatactactcctttaattgatattatagacactggtgctacacattgtttcattgctttagaaagtgcatataagttgggt- 5124  T
Q  137 ttgatt-tgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcagtgactacttctct 206  Q
    |||||| | ||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  5125 ttgattgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagccaagggttcagtaactacttctct 5195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0298 (Bit Score: 46; Significance: 2e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0298
Description:

Target: scaffold0298; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 21 - 206
Target Start/End: Original strand, 9388 - 9573
Alignment:
Q  21 tgaggatcgattgattagaggtacatgttattttgatagtacacctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgt 120  Q
    |||||||||| | || |||||||| ||||   || ||||||| |||||| |||||||||| || ||||||||||| ||||| || |||||| | || |||    
T  9388 tgaggatcgacttatcagaggtacttgtttcattaatagtactcctttaattgctattatagacactggtgctactcattgtttcattgctattgaatgt 9487  T
Q  121 gtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcagtgactacttctct 206  Q
      || |   |||||||| | | | |||||||||||  | || || ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  9488 acttataagttgggtctggttgtatctgatatgaaacgggaaatagttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctct 9573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0310 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0310
Description:

Target: scaffold0310; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 19 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 11122 - 10925
Alignment:
Q  19 aatgaggatcgattgattagaggtacatgttattttgatagtacacctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgatt 118  Q
    |||||||| ||| | || |||||||| ||||  ||| ||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||| || |||  ||| ||      
T  11122 aatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcatttttttagaaa 11023  T
Q  119 gtgtttctgctttgggtcttgatt-tgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcagtgactacttctctcgtatgtttg 216  Q
    |||  | |   |||||| |||||| | ||||||||||| ||||| ||  |||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| || ||||||    
T  11022 gtgcatataagttgggt-ttgattgtatctgatatgaaaggagaaatacttgttgaaactccaactaagggttcagtaactacttctcttgtttgtttg 10925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0206 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0206
Description:

Target: scaffold0206; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 145 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 26131 - 26061
Alignment:
Q  145 tctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcagtgactacttctctcgtatgttt 215  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| || |||||    
T  26131 tctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagccaagggttcagtaactacttctctagtttgttt 26061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0190 (Bit Score: 42; Significance: 0.000000000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0190
Description:

Target: scaffold0190; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 19 - 216
Target Start/End: Original strand, 30485 - 30682
Alignment:
Q  19 aatgaggatcgattgattagaggtacatgttattttgatagtacacctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgatt 118  Q
    |||||||| ||| | || |||||||| ||||  ||| | ||||| |||||| |||||||||| |||| ||||||||| ||||| || |||| | | || |    
T  30485 aatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaaaagtactcctttaattgctattatagatattggtgctactcattgtttcattgatattgaat 30584  T
Q  119 gtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcagtgactacttctctcgtatgtttg 216  Q
    |||  | |   |||||| | | | | ||||||||||| || |  |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||    
T  30585 gtgcatataagttgggtttggttgtatctgatatgaaaggggtaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtttg 30682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0049 (Bit Score: 42; Significance: 0.000000000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0049
Description:

Target: scaffold0049; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 71 - 216
Target Start/End: Original strand, 49088 - 49233
Alignment:
Q  71 ttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgt 170  Q
    |||||||||| |||||| ||||||| ||||| || |||| | | |||||||  | |   |||||||| | | | ||||||||||| ||||| ||||||||    
T  49088 ttgctattatagatactagtgctactcattgtttcattgatgttgattgtgcatataagttgggtctggttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgt 49187  T
Q  171 cgaaactccagctaagggttcagtgactacttctctcgtatgtttg 216  Q
     |||| || ||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||    
T  49188 tgaaaatcaagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtttg 49233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1373 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold1373
Description:

Target: scaffold1373; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 37 - 216
Target Start/End: Original strand, 11 - 190
Alignment:
Q  37 agaggtacatgttattttgatagtacacctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtc 136  Q
    |||||||| ||||  ||| ||||||| |||||| |||||||||| |||||| ||||||  ||||| || |||||||| ||  |||  | |   ||| ||     
T  11 agaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactagtgctattcattgtttcattgctttagaaagtgcatataagttgagt- 109  T
Q  137 ttgatt-tgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcagtgactacttctctcgtatgtttg 216  Q
    |||||| | ||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||| || ||||||    
T  110 ttgattgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccaactaagggtttagtaactacttctcttgtttgtttg 190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0198 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0198
Description:

Target: scaffold0198; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 16 - 80
Target Start/End: Complemental strand, 30435 - 30371
Alignment:
Q  16 gagaatgaggatcgattgattagaggtacatgttattttgatagtacacctttagttgctattat 80  Q
    ||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||    
T  30435 gagaacgaggatcgcttgatcagaggtacatgttatattgataatactcctttagttgctattat 30371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106 (Bit Score: 40; Significance: 0.00000000000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0106
Description:

Target: scaffold0106; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 19 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 34482 - 34307
Alignment:
Q  19 aatgaggatcgattgattagaggtacatgttattttgatagtacacctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgatt 118  Q
    |||||||| ||| | ||||||||||| ||||  ||| ||||||| ||||||  ||||||||| |||||||||||||| ||||| || |||||| | || |    
T  34482 aatgaggaccgacttattagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaactgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgaat 34383  T
Q  119 gtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcagt 194  Q
     ||| | |   |||||||  | | | ||||||||||| |  || |||||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  34382 atgtatataagttgggtccggttgtatctgatatgaaagtggaaatggttgttgaaattccagctaagggttcagt 34307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0058 (Bit Score: 40; Significance: 0.00000000000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0058
Description:

Target: scaffold0058; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 19 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 22267 - 22080
Alignment:
Q  19 aatgaggatcgattgattagaggtacatgttattttgatagtacacctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgatt 118  Q
    |||||||| ||| | || |||||||| ||||  ||| ||||||| |||||| ||| |||||| |||||||||| ||| ||||| || |||||| | || |    
T  22267 aatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattggtattatagatactggtgttactcattgtttcattgctattgaat 22168  T
Q  119 gtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcagtgactacttctct 206  Q
    |||  | |   |||||| | | | | ||||||||||| ||||| |||||||| ||||||  ||||||| ||||||| |||||||||||    
T  22167 gtgcatatatgttgggtttggttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactttagctaagtgttcagtaactacttctct 22080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0789 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0789
Description:

Target: scaffold0789; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 14 - 101
Target Start/End: Complemental strand, 88 - 1
Alignment:
Q  14 cagagaatgaggatcgattgattagaggtacatgttattttgatagtacacctttagttgctattattgatactggtgctacgcattg 101  Q
    ||||||| |||||||| ||||| |||||||| || ||| || ||| ||| ||||||  |||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  88 cagagaacgaggatcgcttgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttaagtgctataattgatagtggtgctacgcattg 1  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0367 (Bit Score: 35; Significance: 0.00000000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0367
Description:

Target: scaffold0367; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 21 - 111
Target Start/End: Original strand, 9182 - 9272
Alignment:
Q  21 tgaggatcgattgattagaggtacatgttattttgatagtacacctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgct 111  Q
    |||||||||| | || |||||||| ||||  ||| ||||||| |||||| |||||||||| || ||||||||||| ||||| || ||||||    
T  9182 tgaggatcgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtgctactcattgtttcattgct 9272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1299 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold1299
Description:

Target: scaffold1299; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 37 - 113
Target Start/End: Original strand, 2025 - 2101
Alignment:
Q  37 agaggtacatgttattttgatagtacacctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgcttt 113  Q
    |||||||| ||||  ||| ||||||| |||||| |||||||||| || ||||||||||| ||||| || ||||||||    
T  2025 agaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtgctactcattgtttcattgcttt 2101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University